NM_001000204 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 229 (Olr229), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000074866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178166921:178167865:-1 gene:ENSRNOG00000047136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000075443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177698759:177699703:-1 gene:ENSRNOG00000046061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177698759:177728140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001001035 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 232 (Olr232), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178200625:178201572:-1 gene:ENSRNOG00000049748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178200625:178201572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000207 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 233 (Olr233), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178213426:178214373:-1 gene:ENSRNOG00000046869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178213426:178214373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014244 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 2 (Cyb5r2), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 2 (Cyb5r2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 2 (Cyb5r2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 2 (Cyb5r2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178970105:178978337:-1 gene:ENSRNOG00000019751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC079235 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94317 IMAGE:7132617), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178970334:179027399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT006142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1
XM_003748959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ovochymase 2 (Ovch2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ovochymase 2 (Ovch2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026807 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:179007230:179027399:-1 gene:ENSRNOG00000019794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178970334:179027399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001000210 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 237 (Olr237), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179055443:179056387:-1 gene:ENSRNOG00000046456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179055443:179056456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000211 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 239 (Olr239), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179072435:179073373:-1 gene:ENSRNOG00000030863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179072435:179073352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000016289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179132971:179133976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT006146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
NM_001000214 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 244 (Olr244), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179210503:179211447:-1 gene:ENSRNOG00000045879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179210503:179211447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000075318 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:179317573:179318538:-1 gene:ENSRNOG00000046628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000024684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179286117:179320259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_001000218 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 251 (Olr251), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179364314:179365258:-1 gene:ENSRNOG00000050593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000219 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 252 (Olr252), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179390644:179391615:-1 gene:ENSRNOG00000036787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179390644:179391615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000230 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 272 (Olr272), mRNA. // chr1 // 62 // 100 // 18 // 29 // 0 /// NM_001000947 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 255 (Olr255), mRNA. // chr1 // 43 // 97 // 12 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179473925:179474896:-1 gene:ENSRNOG00000034216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 97 // 12 // 28 // 0 /// NM_001000214 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 244 (Olr244), mRNA. // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000055175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179210503:179211447:-1 gene:ENSRNOG00000045879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000036279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179812344:179813288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 100 // 18 // 29 // 0 /// NONRATT002144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 100 // 18 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179423295:179474896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 90 // 10 // 26 // 0 /// NONRATT006150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 97 // 12 // 28 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179210503:179211447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT006147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001000947 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 255 (Olr255), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000042607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179473925:179474896:-1 gene:ENSRNOG00000034216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001000219 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 252 (Olr252), mRNA. // chr1 // 29 // 97 // 9 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000055174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179390644:179391615:-1 gene:ENSRNOG00000036787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 97 // 9 // 31 // 0 /// NM_001000228 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 267 (Olr267), mRNA. // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NM_001000999 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 264 (Olr264), mRNA. // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000075297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179713669:179969176:1 gene:ENSRNOG00000049197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179423295:179474896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179390644:179391615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 97 // 9 // 31 // 0 /// NONRATT006149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 97 // 9 // 31 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
ENSRNOT00000072359 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:179500868:179501821:-1 gene:ENSRNOG00000046861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 100 // 11 // 16 // 0
NM_001001038 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 257 (Olr257), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000047020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179540471:179541415:-1 gene:ENSRNOG00000045878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179540471:179557161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT006151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000222 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 259 (Olr259), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179556220:179557161:-1 gene:ENSRNOG00000009791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179540471:179557161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000221 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 262 (Olr262), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179604375:179605331:-1 gene:ENSRNOG00000009748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179604375:179605331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000055170 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:179704376:179704660:-1 gene:ENSRNOG00000036784 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179704376:179704693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_002725653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1875 (Olr1875), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_002728787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1875 (Olr1875), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000033009 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:179876857:179877783:-1 gene:ENSRNOG00000021727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179876818:179880873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
ENSRNOT00000048478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179929579:179930523:-1 gene:ENSRNOG00000034061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179929579:179968406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0
NM_001000730 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 278 (Olr278), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179940925:179941869:-1 gene:ENSRNOG00000046162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179929579:179968406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000226 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 279 (Olr279), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180116734:180117679:-1 gene:ENSRNOG00000049516 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180116734:180117615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001277302 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit F (Eif3f), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180523036:180532243:1 gene:ENSRNOG00000015221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// FQ213714 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YC14 mRNA sequence. // chr1 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180523053:180531856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001115045 // RefSeq // Rattus norvegicus RIC3 acetylcholine receptor chaperone (Ric3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001277069 // RefSeq // Rattus norvegicus RIC3 acetylcholine receptor chaperone (Ric3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RIC3 acetylcholine receptor chaperone (Ric3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180623994:180672685:-1 gene:ENSRNOG00000014691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180644794:180672683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_139112 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain only 1 (Lmo1), mRNA. // chr1 // 98 // 100 // 60 // 61 // 0 /// XM_006229969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain only 1 (Lmo1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000019690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180718643:180753889:-1 gene:ENSRNOG00000014629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000051512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180718947:180739407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 46 // 46 // 0 /// AF353304 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal specific transcription factor DAT1 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 58 // 61 // 0 /// NONRATT006165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0
XM_006223449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 33 (Stk33), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 33 (Stk33), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 33 (Stk33), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 33 (Stk33), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 33 (Stk33), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 33 (Stk33), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180898553:180940208:-1 gene:ENSRNOG00000014590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180805390:180939169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001191839 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 66 (Trim66), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000019368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181055797:181108418:-1 gene:ENSRNOG00000014373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000055519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181054767:181093963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 35 // 40 // 1 /// NONRATT006171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// NONRATT006170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_001107547 // RefSeq // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 5 (St5), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006229976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 5 (St5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006229979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 5 (St5), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XR_350603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 5 (St5), transcript variant X7, misc_RNA. // chr1 // 97 // 79 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181125790:181275226:-1 gene:ENSRNOG00000013934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000055510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181126475:181159758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT006172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
XM_006229996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to predicted gene ICRFP703B1614Q5.5 (LOC499240), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001024287 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to predicted gene ICRFP703B1614Q5.5 (LOC499240), mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000055158 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:181324235:181335547:-1 gene:ENSRNOG00000013713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT006174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181329788:181363930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001271234 // RefSeq // Rattus norvegicus achaete-scute family bHLH transcription factor 3 (Ascl3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181336885:181337409:-1 gene:ENSRNOG00000013702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181329788:181363930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT006175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
NM_001106289 // RefSeq // Rattus norvegicus TMEM9 domain family, member B (Tmem9b), mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000067388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181347009:181364639:-1 gene:ENSRNOG00000013591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT006176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181329788:181363930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT006177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001108498 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor interacting protein 3 (Nrip3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181370497:181396068:-1 gene:ENSRNOG00000013290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181370578:181429297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_003748970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal peptide, CUB domain, EGF-like 2 (Scube2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000052377 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:181421062:181479784:-1 gene:ENSRNOG00000013123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181437598:181466442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001107546 // RefSeq // Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 5A (Dennd5a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181508456:181572938:-1 gene:ENSRNOG00000012206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181491803:181572698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT006180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_001012358 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 41B (Tmem41b), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181591182:181605545:-1 gene:ENSRNOG00000010752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC089866 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 41B, mRNA (cDNA clone MGC:108971 IMAGE:7321590), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ228941 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YF12 mRNA sequence. // chr1 // 72 // 91 // 21 // 29 // 0 /// NONRATT006184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001134970 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to SET binding factor 2 (RGD1559442), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000013126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181947530:182408115:-1 gene:ENSRNOG00000009812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC168698 // GenBank // Rattus norvegicus similar to SET binding factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:188607 IMAGE:7938988), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// FQ209802 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA39YP08 mRNA sequence. // chr1 // 36 // 36 // 15 // 42 // 1 /// GENSCAN00000051515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181949038:182080787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT006188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT006190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1
NM_001134970 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to SET binding factor 2 (RGD1559442), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181947530:182408115:-1 gene:ENSRNOG00000009812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC168698 // GenBank // Rattus norvegicus similar to SET binding factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:188607 IMAGE:7938988), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:182179642:182245000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001001800 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 141 (rnf141), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 141 (rnf141), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:182622487:182645144:-1 gene:ENSRNOG00000017900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY621087 // GenBank // Rattus norvegicus RNF141 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:182619060:182638331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001106286 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 (Lyve1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphatic vessel endothelial hyaluronan receptor 1 (Lyve1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000030474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:182650925:182664312:-1 gene:ENSRNOG00000026902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:182652704:182740363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001105210 // RefSeq // Rattus norvegicus murine retrovirus integration site 1 homolog (Mrvi1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NM_001105211 // RefSeq // Rattus norvegicus murine retrovirus integration site 1 homolog (Mrvi1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_006230049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus murine retrovirus integration site 1 homolog (Mrvi1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000024060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:182668663:182780828:-1 gene:ENSRNOG00000017767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000035124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:182652704:182740363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT006197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT006198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
ENSRNOT00000047044 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:183063225:183064130:-1 gene:ENSRNOG00000029082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:183063376:183084894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT006208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001079884 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18 (Galnt18), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:183278639:183588615:-1 gene:ENSRNOG00000017021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC128745 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:156692 IMAGE:7097705), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT006209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000035644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:183278913:183434216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1
NONRATT006209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_138519 // RefSeq // Rattus norvegicus dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 3 (Dkk3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:183922626:183961795:-1 gene:ENSRNOG00000016343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF245040 // GenBank // Rattus norvegicus substrate binding subunit of type II 5-deiodinase D2p29 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC160821 // GenBank // Rattus norvegicus dickkopf homolog 3 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:187335 IMAGE:7321198), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:183923908:183961789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT006213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001014022 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 10 (Btbd10), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 10 (Btbd10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006230035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 10 (Btbd10), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006230037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 10 (Btbd10), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006230040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 10 (Btbd10), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000067170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:185106509:185164263:-1 gene:ENSRNOG00000014341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC090330 // GenBank // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:105916 IMAGE:7300759), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:185107280:185173252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_017044 // RefSeq // Rattus norvegicus parathyroid hormone (Pth), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:185183456:185186388:-1 gene:ENSRNOG00000014318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// S80127 // GenBank // Rattus norvegicus hypothalamic parathyroid hormone (PTH-(1-84)) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT006219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:185183694:185223844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000050823 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:185334667:185335860:-1 gene:ENSRNOG00000033924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000043922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:185335576:185335860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001013434 // RefSeq // Rattus norvegicus related RAS viral (r-ras) oncogene homolog 2 (Rras2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000017199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:185908264:185978450:-1 gene:ENSRNOG00000012258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC091333 // GenBank // Rattus norvegicus related RAS viral (r-ras) oncogene homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:109327 IMAGE:7314509), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT006221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000037179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:190548827:190601338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
ENSRNOT00000036330 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:190600377:190601347:-1 gene:ENSRNOG00000025122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:190548827:190601338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000037185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:190620713:190648127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_080781 // RefSeq // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit beta 1 (Copb1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006230074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit beta 1 (Copb1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000016292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:190670321:190704747:-1 gene:ENSRNOG00000012000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC061882 // GenBank // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:72331 IMAGE:5599357), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000037171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:190666154:190699791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT006224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT006225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_017278 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 1 (Psma1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000015946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:190708745:190719764:-1 gene:ENSRNOG00000011745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC062233 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 1, mRNA (cDNA clone MGC:72880 IMAGE:6919336), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ218243 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA6YP23 mRNA sequence. // chr1 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// M29859 // GenBank // Rat proteasomes C2 component mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000037176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:190709039:190719860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XR_347572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 6.8 kDa mitochondrial proteolipid-like (LOC100912557), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_355163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 6.8 kDa mitochondrial proteolipid-like (LOC100912557), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:190738267:190738449:-1 gene:ENSRNOG00000032130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142179893:142180455:1 gene:ENSRNOG00000031802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145534566:145536613:-1 gene:ENSRNOG00000043144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211017 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YO06 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ224630 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA5YJ08 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145530783:145569821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT048774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
XM_006230085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-like protein FUBI-like (LOC102548890), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071979 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:190886598:190886998:-1 gene:ENSRNOG00000031044 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:190886598:190942855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_006230082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily r, polypeptide 1 (Cyp2r1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// XM_006230083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily r, polypeptide 1 (Cyp2r1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// XM_006230084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily r, polypeptide 1 (Cyp2r1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC168986 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7323027, partial cds. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// FQ219437 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YE07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NM_001108499 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily r, polypeptide 1 (Cyp2r1), mRNA. // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000067609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:191066155:191078364:-1 gene:ENSRNOG00000011367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000039853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:191066255:191078350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_017338 // RefSeq // Rattus norvegicus calcitonin-related polypeptide alpha (Calca), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 96 // 64 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:191160232:191162954:-1 gene:ENSRNOG00000011130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 56 // 21 // 22 // 0 /// M11597 // GenBank // Rat alpha-type calcitonin gene-related peptide mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 64 // 21 // 25 // 0 /// M26137 // GenBank // Rat calcitonin mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// NM_001033955 // RefSeq // Rattus norvegicus calcitonin-related polypeptide alpha (Calca), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1 /// NM_001033956 // RefSeq // Rattus norvegicus calcitonin-related polypeptide alpha (Calca), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000055124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:191158063:191162954:-1 gene:ENSRNOG00000011130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1 /// GENSCAN00000039842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:191160232:191161891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 51 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT006233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT006234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT006235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// NONRATT006236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1
NM_001024751 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 6 (Sox6), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006230087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 6 (Sox6), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:192644288:193151614:1 gene:ENSRNOG00000020514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC097403 // GenBank // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 6, mRNA (cDNA clone MGC:114448 IMAGE:7453944), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:193028914:193101264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000032618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:192816105:192989078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000032613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:193115250:193171645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
GENSCAN00000008059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:192417246:192514317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NONRATT002242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108500 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase, catalytic subunit type 2 alpha (Pik3c2a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000055120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:192182647:192297034:1 gene:ENSRNOG00000020479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT002241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:192232895:192386938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
NM_001024261 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1 (Trnt1), mRNA. // chr1 // 90 // 100 // 36 // 40 // 0 /// XM_003748980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial-like (LOC100911093), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_003753334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial-like (LOC100911093), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000008526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:203326023:203339605:1 gene:ENSRNOG00000006432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 100 // 36 // 40 // 0 /// BC095841 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1, mRNA (cDNA clone MGC:112668 IMAGE:7387807), complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 36 // 40 // 0 /// BC105612 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1, mRNA (cDNA clone MGC:124985 IMAGE:7135310), complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 36 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000027758 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:192143319:192144623:1 gene:ENSRNOG00000020477 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:203326735:203336439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 70 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:192143406:192144623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 35 // 40 // 0 /// NONRATT040141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
NM_198737 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 1 (Arl6ip1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:194724270:194733783:-1 gene:ENSRNOG00000017751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY316590 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation-like factor 6-interacting protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC099071 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116042 IMAGE:7381266), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT006251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:194731061:194839549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT006252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000072266 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:194739745:194836241:-1 gene:ENSRNOG00000047386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 97 // 59 // 60 // 0 /// GENSCAN00000057423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:194731061:194839549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 46 // 46 // 0 /// FQ226191 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA31YI21 mRNA sequence. // chr1 // 86 // 23 // 12 // 14 // 0
NM_138849 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin XVII (Syt17), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006230101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin XVII (Syt17), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin XVII (Syt17), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:194982174:195048211:-1 gene:ENSRNOG00000017136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U30831 // GenBank // Rattus norvegicus B/K protein mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195004294:195044043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT006268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001127303 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein-like 2 (Itpripl2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195087795:195089402:-1 gene:ENSRNOG00000036762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166746 // GenBank // Rattus norvegicus inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:188482 IMAGE:5598710), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195087795:195089402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012785 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q7 homolog, ubiquinone (yeast) (Coq7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coenzyme Q7 homolog, ubiquinone (yeast) (Coq7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195121560:195137541:-1 gene:ENSRNOG00000017012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ225865 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YO05 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// U46149 // GenBank // Rattus norvegicus COQ7 mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 89 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195122883:195137954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001191950 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane channel-like 7 (Tmc7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195142160:195191670:-1 gene:ENSRNOG00000016679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000057430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195142160:195191670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001134611 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine-rich nucleolar protein 1 (Knop1), mRNA. // chr1 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195509710:195514700:-1 gene:ENSRNOG00000046147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195311679:195316669:-1 gene:ENSRNOG00000048270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195499297:195512382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 64 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195299138:195350129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
XM_006230109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member B (Gprc5b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC166986 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7316858), partial cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NM_001106304 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, class C, group 5, member B (Gprc5b), mRNA. // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000065892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195631489:195656026:-1 gene:ENSRNOG00000016013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195634261:195680061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT006276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001024241 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 139 (Gpr139), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195796295:195837147:-1 gene:ENSRNOG00000023863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB196531 // GenBank // Rattus norvegicus GPRg1 mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195796295:195845850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_134418 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein 2 (zymogen granule membrane) (Gp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000021249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196108659:196124218:-1 gene:ENSRNOG00000015716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// M58716 // GenBank // R.norvegicus zymogen granule membrane protein GP-2 mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 31 // 35 // 0 /// GENSCAN00000041522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196003995:196123050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_017082 // RefSeq // Rattus norvegicus uromodulin (Umod), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196127949:196141294:-1 gene:ENSRNOG00000015557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081814 // GenBank // Rattus norvegicus uromodulin, mRNA (cDNA clone MGC:93496 IMAGE:7109450), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M63510 // GenBank // Rat Tamm-Horsfall protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196134560:196141264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196128200:196131577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT006281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001013902 // RefSeq // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase-like, testis expressed (Pdilt), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196149077:196179939:-1 gene:ENSRNOG00000015368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC083897 // GenBank // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase-like protein of the testis, mRNA (cDNA clone MGC:95251 IMAGE:7133354), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000041516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196149214:196171720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001009688 // RefSeq // Rattus norvegicus THUMP domain containing 1 (Thumpd1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196394580:197295841:-1 gene:ENSRNOG00000014946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC087659 // GenBank // Rattus norvegicus THUMP domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105734 IMAGE:7314010), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196394580:196399271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT006286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197294320:197314418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT006297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001191114 // RefSeq // Rattus norvegicus ERI1 exoribonuclease family member 2 (Eri2), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// XR_350641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ERI1 exoribonuclease family member 2 (Eri2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196474508:196484254:-1 gene:ENSRNOG00000014673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
NM_001024886 // RefSeq // Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 3 (Dcun1d3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196562335:196600712:-1 gene:ENSRNOG00000014037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC097462 // GenBank // Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114527 IMAGE:7457575), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000030796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70926444:70927360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000054060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196562580:196565234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT006294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
GENSCAN00000054051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196623144:196723823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
XM_006223539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal type-2 receptor 26-like (LOC691511), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000030910 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:197309398:197315452:-1 gene:ENSRNOG00000022616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1313557:1328905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// GENSCAN00000001963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197294320:197314418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001024777 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing 9 (Pdzd9), mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000044384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197510331:197523570:-1 gene:ENSRNOG00000016292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC097426 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC50721, mRNA (cDNA clone MGC:114473 IMAGE:7455141), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197511607:197521879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// NONRATT006303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
ENSRNOT00000021848 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:197560288:197560952:-1 gene:ENSRNOG00000016319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197560310:197560952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0
NM_001025682 // RefSeq // Rattus norvegicus cerebellar degeneration-related protein 2 (Cdr2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197815831:197840738:-1 gene:ENSRNOG00000017260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098028 // GenBank // Rattus norvegicus cerebellar degeneration-related 2, mRNA (cDNA clone MGC:116181 IMAGE:7456103), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197816738:197840660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023483 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:197883912:197891408:-1 gene:ENSRNOG00000017330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133542 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 6 (Igsf6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197923322:197933796:-1 gene:ENSRNOG00000017277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ223184 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DORA protein. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000032588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:198269223:198320877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_001107548 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 31 (Usp31), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000055048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:198532743:198568863:-1 gene:ENSRNOG00000025793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:198452922:198598936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_001033889 // RefSeq // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 7 (Cog7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:198858776:199170252:1 gene:ENSRNOG00000018751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC101931 // GenBank // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 7, mRNA (cDNA clone MGC:124861 IMAGE:7938773), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:198858873:198926523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001100519 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2 (Gga2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:198729100:198856172:1 gene:ENSRNOG00000018599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:198831761:198855253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001159493 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamyl-tRNA synthetase 2 mitochondrial (putative) (Ears2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006223722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamyl-tRNA synthetase 2-like 1 (Ears2l1), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamyl-tRNA synthetase 2-like 1 (Ears2l1), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260515289:260516839:-1 gene:ENSRNOG00000018925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035800 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:198699311:198715517:1 gene:ENSRNOG00000025353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000071946 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:198699311:198716100:1 gene:ENSRNOG00000025353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260515289:260516836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:198624392:198716100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT002318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT002319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001106294 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, alpha/beta subcomplex, 1 (Ndufab1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199110335:199120094:-1 gene:ENSRNOG00000018129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// FQ212475 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YM24 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// XM_001067919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl carrier protein, mitochondrial-like (LOC683884), mRNA. // chr1 // 74 // 83 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000039409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199111126:199120030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT006315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1
NM_001191603 // RefSeq // Rattus norvegicus partner and localizer of BRCA2 (Palb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199127042:199151114:-1 gene:ENSRNOG00000025126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211178 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA16YB14 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199124904:199149108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001108919 // RefSeq // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum to nucleus signaling 2 (Ern2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000025699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199188292:199205123:-1 gene:ENSRNOG00000018974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000039404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199188361:199205098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT006322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
GENSCAN00000045809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200407664:200412474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
ENSRNOT00000020281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:200499515:200517858:-1 gene:ENSRNOG00000024245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC086362 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7304707), partial cds. // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000045800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200494355:200517858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001039611 // RefSeq // Rattus norvegicus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:203844089:203869649:-1 gene:ENSRNOG00000015218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099757 // GenBank // Rattus norvegicus non-SMC element 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124662 IMAGE:5623851), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:203844207:203865464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT006352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_133541 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 1, alpha (Gtf3c1), mRNA. // chr1 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000022271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204017341:204083109:-1 gene:ENSRNOG00000016218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// L28801 // GenBank // Rat transcription factor IIIC alpha-subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000002752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204017477:204091743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT006354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT006353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1
XM_002725684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GSG1-like (Gsg1l), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_574558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GSG1-like (Gsg1l), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204256603:204329093:-1 gene:ENSRNOG00000016702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204263750:204338609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT006362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001011935 // RefSeq // Rattus norvegicus exportin 6 (Xpo6), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exportin 6 (Xpo6), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000022502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204484096:204573897:-1 gene:ENSRNOG00000016722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204531977:204573897:-1 gene:ENSRNOG00000016722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC083625 // GenBank // Rattus norvegicus exportin 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134124), complete cds. // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000025823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204484630:204555924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_030853 // RefSeq // Rattus norvegicus linker for activation of T cells (Lat), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006230343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus linker for activation of T cells (Lat), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204747720:204752745:-1 gene:ENSRNOG00000017429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC088130 // GenBank // Rattus norvegicus linker for activation of T cells, mRNA (cDNA clone MGC:108666 IMAGE:7382238), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ227247 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YB15 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 87 // 22 // 33 // 0 /// NONRATT006370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT006371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT006372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1 /// GENSCAN00000018400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204748099:204760205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// NONRATT006373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1
ENSRNOT00000024185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204753275:204760552:-1 gene:ENSRNOG00000017621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC110048 // GenBank // Rattus norvegicus similar to spinster-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:125152 IMAGE:7315879), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001039208 // RefSeq // Rattus norvegicus spinster homolog 1 (Drosophila) (Spns1), mRNA. // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT006374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204748099:204760205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT006375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001007692 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2 interacting protein (Nfatc2ip), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000042992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204767892:204782663:-1 gene:ENSRNOG00000017994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079050 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:93987 IMAGE:7115323), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204767577:204793482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001013237 // RefSeq // Rattus norvegicus CD19 molecule (Cd19), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204797142:204803557:-1 gene:ENSRNOG00000018311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC090026 // GenBank // Rattus norvegicus CD19 molecule, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365041), complete cds. // chr1 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000018438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204798987:204803523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT006386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_001130097 // RefSeq // Rattus norvegicus ataxin 2-like (Atxn2l), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_006230300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 2-like (Atxn2l), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000068529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204886854:204898240:-1 gene:ENSRNOG00000018686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC167761 // GenBank // Rattus norvegicus ataxin 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:187506 IMAGE:7442195), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000018435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204887274:204903710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT006390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT006394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 33 // 44 // 1 /// NONRATT006395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 31 // 44 // 1 /// NONRATT006391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT006396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT006397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001100662 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit C (Eif3c), mRNA. // chr1 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000025782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204943167:204961361:-1 gene:ENSRNOG00000018761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// BC103728 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit C, mRNA (cDNA clone IMAGE:7380580), partial cds. // chr1 // 97 // 70 // 30 // 31 // 0 /// BC169011 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit C, mRNA (cDNA clone MGC:189377 IMAGE:9090822), complete cds. // chr1 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000018397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204943256:204977313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT006399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// NONRATT006405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
NM_001006971 // RefSeq // Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 3 (Cln3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006230228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 3 (Cln3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006230229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 3 (Cln3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006230230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 3 (Cln3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204965145:204976424:-1 gene:ENSRNOG00000019103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC083704 // GenBank // Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 3, mRNA (cDNA clone MGC:94583 IMAGE:7190222), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT006406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204943256:204977313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT006409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT006410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT006407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT006408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT006411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
ENSRNOT00000025950 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:204982443:204987653:-1 gene:ENSRNOG00000019170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// XM_002725687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 27 (Il27), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// XM_006223501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 27 (Il27), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// XM_006230357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 27 (Il27), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// XM_344962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 27 (Il27), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000018405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204982443:205018897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
NM_053611 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear protein, transcriptional regulator, 1 (Nupr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:201816734:201818736:-1 gene:ENSRNOG00000019206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205023244:205023826:-1 gene:ENSRNOG00000050922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF014503 // GenBank // Rattus norvegicus p8 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// FQ221101 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YK05 mRNA sequence. // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205023244:205023826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:201799238:201818682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_031834 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family, cytosolic, 1A, phenol-preferring, member 1 (Sult1a1), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205079584:205083124:-1 gene:ENSRNOG00000019342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AF394783 // GenBank // Rattus norvegicus sulfotransferase SULT1A1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// FQ210886 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA20YH19 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// FQ218506 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YL09 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// FQ219542 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YJ09 mRNA sequence. // chr1 // 90 // 83 // 26 // 29 // 0 /// L19998 // GenBank // Rat minoxidil sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205079859:205082323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT006413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
NM_001009292 // RefSeq // Rattus norvegicus SLX1 structure-specific endonuclease subunit homolog B (S. cerevisiae) (Slx1b), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205093520:205099060:-1 gene:ENSRNOG00000019369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AY383713 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00058 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC087090 // GenBank // Rattus norvegicus GIY-YIG domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:94602 IMAGE:7190632), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205091244:205096546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT006414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT006418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT006415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT006417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_130411 // RefSeq // Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 1A (Coro1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006230204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 1A (Coro1a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205102883:205107856:-1 gene:ENSRNOG00000019430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF416730 // GenBank // Rattus norvegicus CORO1A protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF495469 // GenBank // Rattus norvegicus tryptophane aspartate-containing coat protein (Taco) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC086971 // GenBank // Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 1A, mRNA (cDNA clone MGC:93041 IMAGE:7124429), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ226290 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YL03 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// FQ226941 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YO22 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// FQ234699 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YA03 mRNA sequence. // chr1 // 69 // 100 // 25 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205102992:205167077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT006421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT006422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
GENSCAN00000018437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205102992:205167077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_134359 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 4, catalytic subunit (Ppp4c), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205198901:205205448:-1 gene:ENSRNOG00000019813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC091574 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 4, catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:94490 IMAGE:7135215), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ216602 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YO24 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205199197:205205267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT006424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT006425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001109155 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930451I11 (RGD1563217), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000047477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205246276:205247261:-1 gene:ENSRNOG00000036713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930451I11 (RGD1563217), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT006436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013900 // RefSeq // Rattus norvegicus INO80 complex subunit E (Ino80e), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205267670:205278256:-1 gene:ENSRNOG00000019960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079045 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 95, mRNA (cDNA clone MGC:93981 IMAGE:7115071), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ223207 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA14YB17 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT006438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205268857:205278135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT006442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT006443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_022702 // RefSeq // Rattus norvegicus TAO kinase 2 (Taok2), mRNA. // chr1 // 94 // 82 // 34 // 36 // 0 /// XM_006230334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TAO kinase 2 (Taok2), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 97 // 86 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000064985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205281971:205300874:-1 gene:ENSRNOG00000019964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AB290408 // GenBank // Rattus norvegicus tao2 beta mRNA for thousand and one amino acid protein kinase 2 beta, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// AF140556 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine protein kinase TAO2 (tao2) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 82 // 34 // 36 // 0 /// BC101922 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7937179, with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// FQ223093 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YI03 mRNA sequence. // chr1 // 84 // 84 // 37 // 44 // 1 /// GENSCAN00000018259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205282686:205314881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT006444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT006447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0
XM_003748988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 219 (Tmem219), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 219 (Tmem219), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205305037:205334839:-1 gene:ENSRNOG00000020000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC166576 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 219, mRNA (cDNA clone MGC:188214 IMAGE:7321704), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ216353 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YG02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205282686:205314881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT006452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT006453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_001078017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartate beta-hydroxylase domain containing 1 (Asphd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_215083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartate beta-hydroxylase domain containing 1 (Asphd1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055016 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:205359580:205362551:-1 gene:ENSRNOG00000027213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205359580:205362158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_022715 // RefSeq // Rattus norvegicus major vault protein (Mvp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205401191:205428861:-1 gene:ENSRNOG00000020182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC071174 // GenBank // Rattus norvegicus major vault protein, mRNA (cDNA clone MGC:91677 IMAGE:7099451), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U09870 // GenBank // Rattus norvegicus major vault protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205401300:205417041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT006458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001013901 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2900092E17 (RGD1305592), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205429226:205431124:-1 gene:ENSRNOG00000020217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC088203 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2900092E17, mRNA (cDNA clone MGC:108897 IMAGE:7379842), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205429476:205472541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001276470 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 2 (Prrt2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006230308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 2 (Prrt2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000049044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205431761:205435296:-1 gene:ENSRNOG00000029366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205429476:205472541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT006464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001110319 // RefSeq // Rattus norvegicus MYC-associated zinc finger protein (purine-binding transcription factor) (Maz), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205437135:205440514:-1 gene:ENSRNOG00000020273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// EF059745 // GenBank // Rattus norvegicus Myc-associated zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205429476:205472541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT006468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001009645 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 22 (Kif22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205441133:205449441:-1 gene:ENSRNOG00000020281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205456384:205467610:-1 gene:ENSRNOG00000047950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC088421 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin family member 22, mRNA (cDNA clone MGC:95045 IMAGE:7123493), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin-like protein KIF22-like (LOC102553262), mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205429476:205472541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_134409 // RefSeq // Rattus norvegicus zymogen granule protein 16 (Zg16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zymogen granule protein 16 (Zg16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205474985:205477337:-1 gene:ENSRNOG00000016857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB095177 // GenBank // Rattus norvegicus ZG16 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// Z30584 // GenBank // R.norvegicus (wistar) mRNA for ZG-16p. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205475077:205478702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT006474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001009646 // RefSeq // Rattus norvegicus quinolinate phosphoribosyltransferase (Qprt), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus quinolinate phosphoribosyltransferase (Qprt), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230247 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus quinolinate phosphoribosyltransferase (Qprt), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus quinolinate phosphoribosyltransferase (Qprt), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205534751:205550041:-1 gene:ENSRNOG00000016980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088177 // GenBank // Rattus norvegicus quinolinate phosphoribosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:108807 IMAGE:7323872), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ209866 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YL15 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205534990:205549993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0
NM_001271086 // RefSeq // Rattus norvegicus sialophorin (Spn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000055013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205566250:205567422:-1 gene:ENSRNOG00000036711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205566250:205567428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001106297 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd2 (cytoplasmic tail) binding protein 2 (Cd2bp2), mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000023285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205629178:205632675:-1 gene:ENSRNOG00000017201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC168174 // GenBank // Rattus norvegicus Cd2 (cytoplasmic tail) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:187821 IMAGE:9032868), complete cds. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205631046:205646348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001108921 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 10b (Tbc1d10b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205634749:205646405:-1 gene:ENSRNOG00000017349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205631046:205646348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001012460 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 1 (Sept1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006230253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 1 (Sept1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205652476:205656341:-1 gene:ENSRNOG00000017804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC089897 // GenBank // Rattus norvegicus septin 1, mRNA (cDNA clone MGC:109124 IMAGE:7381516), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205652749:205656298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT006491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT006492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT006493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT006490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT006494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT006495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_138892 // RefSeq // Rattus norvegicus dCTP pyrophosphatase 1 (Dctpp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000024074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205696307:205699698:-1 gene:ENSRNOG00000017850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF331839 // GenBank // Rattus norvegicus RS21-C6-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// AY029335 // GenBank // Rattus norvegicus RS21-C6 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205696386:205699614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT006496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001079889 // RefSeq // Rattus norvegicus selenophosphate synthetase 2 (Sephs2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205712722:205714893:-1 gene:ENSRNOG00000048397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128783 // GenBank // Rattus norvegicus selenophosphate synthetase 2, mRNA (cDNA clone MGC:156840 IMAGE:7378558), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000024639 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:205791203:205793534:-1 gene:ENSRNOG00000029490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205791203:205793180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ217404 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA27YG22 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006230369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 764-like (LOC102553866), mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// XM_006223514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KRAB domain-containing protein ZNF747-like (LOC102553962), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// XM_006230370 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KRAB domain-containing protein ZNF747-like (LOC102553962), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// ENSRNOT00000052100 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:205835438:205837482:-1 gene:ENSRNOG00000031003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000014441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205835438:205869555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// ENSRNOT00000074435 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:205828271:205830240:-1 gene:ENSRNOG00000046480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000014472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205804066:205830240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
XM_006223518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 688-like (LOC102554302), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006230372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 688-like (LOC102554302), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000024858 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:205864686:205867558:-1 gene:ENSRNOG00000018379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205835438:205869555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT006506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_173330 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 689 (Zfp689), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205892549:205898917:-1 gene:ENSRNOG00000029821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF277902 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein HIT-39 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168646 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 689, mRNA (cDNA clone MGC:187317 IMAGE:9098465), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205893198:205898657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT006510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT006511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001134694 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691909 (LOC691909), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000045581 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:206054803:206059914:-1 gene:ENSRNOG00000028771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206054803:206059475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT006516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107551 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 629 (Zfp629), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206078605:206084317:-1 gene:ENSRNOG00000018877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206081583:206102254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT006518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001106298 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 7C (Bcl7c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 7C (Bcl7c), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206178926:206182756:-1 gene:ENSRNOG00000018916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206178998:206182496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT006524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001135800 // RefSeq // Rattus norvegicus cardiotrophin 2 (Ctf2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206192653:206200996:-1 gene:ENSRNOG00000030907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206192653:206205429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012700 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 1B (Stx1b), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206274272:206293050:-1 gene:ENSRNOG00000019193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// M95735 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin B mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206277496:206299806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1
NM_001107553 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 668 (Zfp668), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 668 (Zfp668), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 668 (Zfp668), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 668 (Zfp668), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 668 (Zfp668), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 668 (Zfp668), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 668 (Zfp668), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206334471:206336683:-1 gene:ENSRNOG00000016683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206334471:206338200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001109156 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 53 (Prss53), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 53 (Prss53), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206354407:206358841:-1 gene:ENSRNOG00000026040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC161977 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9029896. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206354182:206358723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_203335 // RefSeq // Rattus norvegicus vitamin K epoxide reductase complex, subunit 1 (Vkorc1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206361382:206363943:-1 gene:ENSRNOG00000050828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY423047 // GenBank // Rattus norvegicus vitamin K epoxide reductase complex subunit 1 (Vkorc1) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC166413 // GenBank // Rattus norvegicus vitamin K epoxide reductase complex, subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:187297 IMAGE:9100951), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ210919 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA1YL15 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206361614:206363879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138836 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 8 (Prss8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206395299:206399592:-1 gene:ENSRNOG00000019616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AB017638 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prostasin precursor, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF202076 // GenBank // Rattus norvegicus prostasin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC061800 // GenBank // Rattus norvegicus protease, serine, 8 (prostasin), mRNA (cDNA clone MGC:72305 IMAGE:5598332), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206395791:206399592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT006538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001011560 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 36 (Prss36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000026587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206402346:206418143:-1 gene:ENSRNOG00000033343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000040504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206402346:206418143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AJ784938 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for polyserase-2 protein. // chr1 // 39 // 100 // 15 // 38 // 0
NM_172322 // RefSeq // Rattus norvegicus PYD and CARD domain containing (Pycard), mRNA. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206460801:206462095:-1 gene:ENSRNOG00000019675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB053165 // GenBank // Rattus norvegicus rASC mRNA for apoptosis-associated speck-like protein, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// FQ227544 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YP13 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206460883:206461916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012812 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIa polypeptide 2 (Cox6a2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_037674 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIa polypeptide 2 (Cox6a2), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206669984:206670730:-1 gene:ENSRNOG00000019851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// X12554 // GenBank // Rat mRNA for heart cytochrome c oxidase subunit VIa. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206670095:206701094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
ENSRNOT00000026979 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:206700081:206701094:-1 gene:ENSRNOG00000019884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000040475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206670095:206701094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSRNOT00000027290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206733725:206763393:-1 gene:ENSRNOG00000020144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099813 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC017158, mRNA (cDNA clone MGC:124784 IMAGE:7930179), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206734845:206763361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT006548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001039608 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC025641 (RGD1306730), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000027644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:207165765:207210643:-1 gene:ENSRNOG00000020394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// BC111072 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC025641, mRNA (cDNA clone MGC:125204 IMAGE:7445757), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 26 // 26 // 0 /// BC160884 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC025641, mRNA (cDNA clone MGC:188292 IMAGE:7383399), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000010500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:207165652:207200002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT006565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0
NONRATT006566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 1
NM_001106300 // RefSeq // Rattus norvegicus arginyltransferase 1 (Ate1), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:207845503:208113961:-1 gene:ENSRNOG00000024414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000043358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208090547:208114396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT006576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001106301 // RefSeq // Rattus norvegicus non-SMC element 4 homolog A (S. cerevisiae) (Nsmce4a), mRNA. // chr1 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000027721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208135294:208142382:-1 gene:ENSRNOG00000020452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000043368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208128590:208142274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT006579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT006578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT006581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
ENSRNOT00000031258 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:208733480:208736444:-1 gene:ENSRNOG00000022900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC098034 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700022C21, mRNA (cDNA clone IMAGE:7456478), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208733664:208736418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1
NM_054005 // RefSeq // Rattus norvegicus CUB and zona pellucida-like domains 1 (Cuzd1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208914610:208927737:-1 gene:ENSRNOG00000029945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF022147 // GenBank // Rattus norvegicus uterus-ovary specific putative transmembrane protein (uo) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF167170 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen-regulated protein (ERG1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC107927 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7131384. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208915476:208921470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT006586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT006588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT006589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001109157 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700063I17 (RGD1560958), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700063I17 (RGD1560958), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208937740:208939067:-1 gene:ENSRNOG00000026419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208937893:208939067:-1 gene:ENSRNOG00000026419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// BC091569 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455854. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208937893:208939608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
XM_006230400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310057M21 (RGD1305014), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208958026:208974579:-1 gene:ENSRNOG00000020597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083846 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310057M21, mRNA (cDNA clone MGC:95007 IMAGE:7121351), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208958398:208982835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001107555 // RefSeq // Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 5 (Ikzf5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208995435:209013481:-1 gene:ENSRNOG00000025651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208996635:209013444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT006596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106306 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase X (M14 family), member 2 (Cpxm2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211049000:211083066:-1 gene:ENSRNOG00000015902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:210998338:211157979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT006601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT006604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_173310 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-sulfate 6-O) sulfotransferase 15 (Chst15), mRNA. // chr1 // 79 // 74 // 22 // 28 // 0 /// XM_006230431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-sulfate 6-O) sulfotransferase 15 (Chst15), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XM_006230432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-sulfate 6-O) sulfotransferase 15 (Chst15), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XM_006230433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-sulfate 6-O) sulfotransferase 15 (Chst15), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211242707:211272037:-1 gene:ENSRNOG00000016267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211258847:211272037:-1 gene:ENSRNOG00000016267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// AB086953 // GenBank // Rattus norvegicus GalNAc4S6ST mRNA for N-acetylgalactosamine 4-sulfate 6-O-sulfotransferase, complete cds. // chr1 // 79 // 74 // 22 // 28 // 0 /// BC085687 // GenBank // Rattus norvegicus B cell RAG associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:93074 IMAGE:7189319), complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1 /// GENSCAN00000015165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211220559:211301084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT006607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1
NM_022521 // RefSeq // Rattus norvegicus ornithine aminotransferase (Oat), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211555927:211575708:-1 gene:ENSRNOG00000016807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC061551 // GenBank // Rattus norvegicus ornithine aminotransferase (gyrate atrophy), mRNA (cDNA clone MGC:72829 IMAGE:6890520), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// M11842 // GenBank // Rat ornithine aminotransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211556649:211568976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001170476 // RefSeq // Rattus norvegicus NK1 homeobox 2 (Nkx1-2), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211596785:211599221:-1 gene:ENSRNOG00000017006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211596785:211602144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001107556 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member B (Fam53b), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211708688:211798528:-1 gene:ENSRNOG00000017125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001108504 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 10 (Mettl10), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 10 (Mettl10), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000023121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211824330:211848437:-1 gene:ENSRNOG00000017137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XR_350777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 10 (Mettl10), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT006616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053335 // RefSeq // Rattus norvegicus C-terminal binding protein 2 (Ctbp2), mRNA. // chr1 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211993864:212023077:-1 gene:ENSRNOG00000017326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF222712 // GenBank // Rattus norvegicus ribeye mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211993864:212033074:-1 gene:ENSRNOG00000017326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000014611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211994470:212023031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT006625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT006626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT006628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
GENSCAN00000014772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212222822:212240571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000023740 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:212222822:212223468:-1 gene:ENSRNOG00000017661 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001024288 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 36 (Tex36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:212603756:212618068:-1 gene:ENSRNOG00000026848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT006632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212583164:212631023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106308 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 21 (Mmp21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:212694186:212699853:-1 gene:ENSRNOG00000017756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212694318:212699838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001012068 // RefSeq // Rattus norvegicus uroporphyrinogen III synthase (Uros), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006230438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uroporphyrinogen III synthase (Uros), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:212705708:212726235:-1 gene:ENSRNOG00000017810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083730 // GenBank // Rattus norvegicus uroporphyrinogen III synthase, mRNA (cDNA clone MGC:94633 IMAGE:7191339), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212706329:212720130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT006636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001130039 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 32 (Dhx32), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006230443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 32 (Dhx32), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000024655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:212738509:212790818:-1 gene:ENSRNOG00000018119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212739048:212773225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT006637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006223550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 12 (Adam12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006230446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 12 (Adam12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000024974 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:212904287:213226787:-1 gene:ENSRNOG00000018384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000022249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212898442:213042786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0
NM_001163214 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC100302465 (LOC100302465), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC167765 // GenBank // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:187524 IMAGE:7454005), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:213272094:213306797:-1 gene:ENSRNOG00000027542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT006642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:213268957:213362721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// BC095905 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 22, mRNA (cDNA clone MGC:95306 IMAGE:7134939), complete cds. // chr1 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_001143803 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100233213 (LOC100233213), mRNA. // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// XM_006230448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 196, member A (Fam196a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:214053082:214108141:-1 gene:ENSRNOG00000033881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:214065089:214107694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001014026 // RefSeq // Rattus norvegicus clarin 3 (Clrn3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:214683450:214698947:-1 gene:ENSRNOG00000028288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC078942 // GenBank // Rattus norvegicus clarin 3, mRNA (cDNA clone MGC:93776 IMAGE:7109328), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:214684658:214698854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT006645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001271366 // RefSeq // Rattus norvegicus marker of proliferation Ki-67 (Mki67), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038176 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:214925928:214952235:-1 gene:ENSRNOG00000028137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:214926196:214944016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_001108506 // RefSeq // Rattus norvegicus early B-cell factor 3 (Ebf3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:216447390:216565356:-1 gene:ENSRNOG00000016102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:216432847:216497893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000000573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:216554864:216564826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT006659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001130077 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription elongation regulator 1-like (Tcerg1l), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:217478056:217666989:-1 gene:ENSRNOG00000016737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:217478214:217598060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001122782 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 (Mapk1ip1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 (Mapk1ip1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1 (Mapk1ip1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218122520:218123311:-1 gene:ENSRNOG00000016935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158819 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:188260 IMAGE:7374980), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108922 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 32C (Stk32c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006230485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 32C (Stk32c), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218367084:218446952:-1 gene:ENSRNOG00000006962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT006679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218368643:218455025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1
NM_001107558 // RefSeq // Rattus norvegicus NK6 homeobox 2 (Nkx6-2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000054887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218846384:218847924:-1 gene:ENSRNOG00000017748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218844656:218847686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
XM_006223554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat protein 40-like (LOC102557198), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006223555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat protein 40-like (LOC102557198), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006230504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat protein 40-like (RGD1559985), mRNA. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000054886 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:218867080:218881262:-1 gene:ENSRNOG00000005953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 63 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073477 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:218867080:218882831:-1 gene:ENSRNOG00000005953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 68 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218867080:218984464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
XM_006223698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat protein 40-like (RGD1559985), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat protein 40-like (RGD1559985), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000029027 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:218907327:218943716:-1 gene:ENSRNOG00000027374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074298 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:218915949:218944361:-1 gene:ENSRNOG00000027374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218867080:218984464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000068604 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:219230245:219236189:-1 gene:ENSRNOG00000036648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219214603:219272412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT006688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
XM_006223556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 8 (Adam8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006230499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 8 (Adam8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000024369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219236991:219248402:-1 gene:ENSRNOG00000017897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000056757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219214603:219272412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0
NM_001107560 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, gamma complex associated protein 2 (Tubgcp2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000024573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219251912:219272444:-1 gene:ENSRNOG00000018137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC166857 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, gamma complex associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:188764 IMAGE:9100036), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000056757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219214603:219272412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT006700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_053712 // RefSeq // Rattus norvegicus msh homeobox 3 (Msx3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219428377:219431305:-1 gene:ENSRNOG00000046776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219429984:219431217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001190399 // RefSeq // Rattus norvegicus calcyon neuron-specific vesicular protein (Caly), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_138915 // RefSeq // Rattus norvegicus calcyon neuron-specific vesicular protein (Caly), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219452504:219463693:-1 gene:ENSRNOG00000018337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF303658 // GenBank // Rattus norvegicus calcyon mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219452960:219482436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT006704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_001106310 // RefSeq // Rattus norvegicus fucose mutarotase (Fuom), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219478363:219482873:-1 gene:ENSRNOG00000018476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073302 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:142788965:142791739:1 gene:ENSRNOG00000047000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212771 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YH19 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142788984:142797188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219452960:219482436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_078623 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase, short chain, 1, mitochondrial (Echs1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219484863:219493689:-1 gene:ENSRNOG00000018522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142777748:142786555:1 gene:ENSRNOG00000047565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC064655 // GenBank // Rattus norvegicus enoyl Coenzyme A hydratase, short chain, 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:72336 IMAGE:5599860), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ215925 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YA07 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142777748:142785986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219485434:219493672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001031845 // RefSeq // Rattus norvegicus shadow of prion protein homolog (zebrafish) (Sprn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219536513:219536956:-1 gene:ENSRNOG00000018927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219536513:219548208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000554 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 286 (Olr286), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219547270:219548208:-1 gene:ENSRNOG00000018955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219536513:219548208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000231 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 288 (Olr288), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219592778:219593734:-1 gene:ENSRNOG00000021485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219575318:219593734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000233 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 295 (Olr295), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219840418:219841350:-1 gene:ENSRNOG00000033387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219840418:219841350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000234 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 297 (Olr297), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219869515:219870438:-1 gene:ENSRNOG00000046995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219869515:219870408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000235 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 298 (Olr298), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000236 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 299 (Olr299), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219936292:219937221:-1 gene:ENSRNOG00000031394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219936292:219937278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000239 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 303 (Olr303), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220018978:220019901:-1 gene:ENSRNOG00000047015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025058 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptonemal complex central element protein 1 (Syce1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220418170:220429340:-1 gene:ENSRNOG00000024073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220418600:220429665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XR_350837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551927 (LOC102551927), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_350838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical gene supported by X51706 (RGD1559948), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ214090 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YP02 mRNA sequence. // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_019368 // RefSeq // Rattus norvegicus Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein-like (Bet1l), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220528199:220530992:-1 gene:ENSRNOG00000013165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF003998 // GenBank // Rattus norvegicus Golgi SNARE GS15 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC059138 // GenBank // Rattus norvegicus blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae) like, mRNA (cDNA clone MGC:72857 IMAGE:6890305), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// FQ228853 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YB20 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// FQ214090 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YP02 mRNA sequence. // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000042785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220529195:220530944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001106313 // RefSeq // Rattus norvegicus sirtuin 3 (Sirt3), mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000018861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220539135:220561047:-1 gene:ENSRNOG00000013828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC167006 // GenBank // Rattus norvegicus sirtuin (silent mating type information regulation 2 homolog) 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189177 IMAGE:7314283), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// EU886468 // GenBank // Rattus norvegicus SIRT3L mitochondrial precursor (Sirt3) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// FQ218084 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA9YK17 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// FQ213357 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YE16 mRNA sequence. // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000042757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220539556:220561042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT006725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0
NM_012786 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIIIb (Cox8b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220574321:220575819:-1 gene:ENSRNOG00000014656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217767 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA18YF23 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220574370:220575724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0
NONRATT006728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000020023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220665959:220666911:-1 gene:ENSRNOG00000014923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// EU380256 // GenBank // Rattus norvegicus bone-restricted interferon induced transmembrane protein-like (Bril) mRNA, partial cds. // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT006731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_030833 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 2 (Ifitm2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000020216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220671382:220672562:-1 gene:ENSRNOG00000014936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF164040 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-inducible protein 16 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC060563 // GenBank // Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72804 IMAGE:6918334), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT006732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT006733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 79 // 11 // 14 // 1
AF164039 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-inducible protein variant 10 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000020265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220730714:220731861:-1 gene:ENSRNOG00000015078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// NM_001136124 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 3 (Ifitm3), mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// BC168774 // GenBank // Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:188925 IMAGE:6921753), complete cds. // chr1 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// FQ221958 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YK02 mRNA sequence. // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// NONRATT006735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220730853:220731772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
XM_219476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 6 (Ifitm6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220737291:220738225:-1 gene:ENSRNOG00000036645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220737276:220738225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024887 // RefSeq // Rattus norvegicus single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain (Sigirr), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain (Sigirr), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000054874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220817754:220826497:-1 gene:ENSRNOG00000015593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC097488 // GenBank // Rattus norvegicus single immunoglobulin and toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain, mRNA (cDNA clone MGC:114558 IMAGE:7460323), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220817919:220888872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT006739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
XM_006223564 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 9 (Ano9), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// XM_006230590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 9 (Ano9), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// XR_350839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 9 (Ano9), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000044393 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:220828335:220840561:-1 gene:ENSRNOG00000015830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000015530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220817919:220888872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT006742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 19 // 45 // 1
NM_001270762 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease/angiogenin inhibitor 1 (Rnh1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_001270763 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease/angiogenin inhibitor 1 (Rnh1), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_139105 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease/angiogenin inhibitor 1 (Rnh1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022241 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:221068622:221076550:-1 gene:ENSRNOG00000016416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB296102 // GenBank // Rattus norvegicus rnase-inh mRNA for ribonuclease inhibitor, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC070501 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease/angiogenin inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:91475 IMAGE:7096144), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221068787:221099180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONRATT006746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001098241 // RefSeq // Rattus norvegicus Harvey rat sarcoma virus oncogene (Hras), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NM_001130441 // RefSeq // Rattus norvegicus Harvey rat sarcoma virus oncogene (Hras), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// XM_006230535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Harvey rat sarcoma virus oncogene (Hras), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000022363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221095946:221099225:-1 gene:ENSRNOG00000016611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC099130 // GenBank // Rattus norvegicus Harvey rat sarcoma virus oncogene, mRNA (cDNA clone IMAGE:7380273), partial cds. // chr1 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// XM_006230536 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Harvey rat sarcoma virus oncogene (Hras), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// NONRATT006749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001127540 // RefSeq // Rattus norvegicus lamin tail domain containing 2 (Lmntd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221114668:221118709:-1 gene:ENSRNOG00000017050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221114748:221118704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031923 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-210 (Mir210), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-210 // miRBase Micro RNA Database // MI0000950 Rattus norvegicus miR-210 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033691 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 7 (Irf7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221166927:221169993:-1 gene:ENSRNOG00000017414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC104686 // GenBank // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 7, mRNA (cDNA clone MGC:125013 IMAGE:7442863), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ232130 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YO08 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221167114:221169590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_138525 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin-related family member 5 (Cdhr5), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// AF221952 // GenBank // Rattus norvegicus mu-protocadherin mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// BC098904 // GenBank // Rattus norvegicus mucin and cadherin like, mRNA (cDNA clone MGC:114263 IMAGE:7444666), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT006755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000044238 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:221172658:221181061:-1 gene:ENSRNOG00000017762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// GENSCAN00000015549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221172724:221181021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONRATT006757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_022670 // RefSeq // Rattus norvegicus secretin (Sct), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006230518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretin (Sct), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221182402:221183204:-1 gene:ENSRNOG00000017873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M31495 // GenBank // Rat secretin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221182487:221183181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031801 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAF1 transcription factor (Deaf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAF1 transcription factor (Deaf1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006230582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAF1 transcription factor (Deaf1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221201338:221234579:-1 gene:ENSRNOG00000017960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF055884 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear DEAF-1 related transcriptional regulator (NUDR) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U59659 // GenBank // Rattus norvegicus suppressin (SPN) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221213716:221236432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001107563 // RefSeq // Rattus norvegicus Parkinson disease 7 domain containing 1 (Pddc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221306160:221311533:-1 gene:ENSRNOG00000046382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000073220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220869370:220874744:-1 gene:ENSRNOG00000045795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221304971:221325661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220817919:220888872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001014163 // RefSeq // Rattus norvegicus cell cycle exit and neuronal differentiation 1 (Cend1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220887403:220890392:-1 gene:ENSRNOG00000018448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB290916 // GenBank // Rattus norvegicus C38 mRNA, complete cds, homologue of BM8. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC089963 // GenBank // Rattus norvegicus cell cycle exit and neuronal differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:109325 IMAGE:7314412), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial glutamate carrier 1-like (LOC100911440), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230557 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, glutamate), member 22 (Slc25a22), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_001014027 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, glutamate), member 22 (Slc25a22), mRNA. // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000054869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220890718:220898559:-1 gene:ENSRNOG00000018450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// BC090010 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, glutamate), member 22, mRNA (cDNA clone MGC:109527 IMAGE:7324394), complete cds. // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000025240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221328849:221331875:-1 gene:ENSRNOG00000049944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221328849:221340993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000015554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220892060:220904204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001106318 // RefSeq // Rattus norvegicus p53-induced death domain protein 1 (Pidd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025290 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:221336352:221340993:-1 gene:ENSRNOG00000018710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000072774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220899074:220904282:-1 gene:ENSRNOG00000049179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221328849:221340993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220892060:220904204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000026113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220932291:220935362:-1 gene:ENSRNOG00000019293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY325138 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-108 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_003749020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5-like (LOC100911840), mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// FQ217592 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA22YM11 mRNA sequence. // chr1 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// GENSCAN00000007373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221369239:221377882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220932450:220941093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006230605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 6, oligomeric mucus/gel-forming (Muc6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000026749 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:221525647:221547124:-1 gene:ENSRNOG00000019764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 97 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000065279 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:221525819:221547124:-1 gene:ENSRNOG00000019764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 6, oligomeric mucus/gel-forming (Muc6), mRNA. // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// GENSCAN00000007345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221525647:221547124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_001109668 // RefSeq // Rattus norvegicus toll interacting protein (Tollip), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221737399:221758265:-1 gene:ENSRNOG00000019861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC133067 // GenBank // Rattus norvegicus toll interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:156818 IMAGE:7193007), complete cds. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221740176:221783296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001109159 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB kinase activator 2 (Mob2), mRNA. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221867617:221924073:-1 gene:ENSRNOG00000020044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC167008 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7311954, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221867898:221924040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT006771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT006772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT006773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001108510 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 8 (Dusp8), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000044565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221943575:221950984:-1 gene:ENSRNOG00000029394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221943939:221950984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006223708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 10 (Ifitm10), mRNA. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_006230965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 10 (Ifitm10), mRNA. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222417535:222448687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_134334 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin D (Ctsd), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222436922:222448798:-1 gene:ENSRNOG00000020206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC062032 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin D, mRNA (cDNA clone MGC:72315 IMAGE:5623627), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222417535:222448687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT006782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT006780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_001064406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685580 (LOC685580), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002725732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685580 (LOC685580), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223575 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685580 (LOC685580), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685580 (LOC685580), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222554503:222560482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027324 // RefSeq // Rattus norvegicus H19, imprinted maternally expressed transcript (non-protein coding) (H19), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ224162 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA75YB23 mRNA sequence. // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222639743:222685344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT006787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_027324 // RefSeq // Rattus norvegicus H19, imprinted maternally expressed transcript (non-protein coding) (H19), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT006791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NR_032112 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-483 (Mir483), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000054369 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:222726907:222726979:-1 gene:ENSRNOG00000036246 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-483 // miRBase Micro RNA Database // MI0003485 Rattus norvegicus miR-483 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_019130 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin 2 (Ins2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulin 2 (Ins2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222751790:222752853:-1 gene:ENSRNOG00000020405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222751846:222752677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_012740 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine hydroxylase (Th), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222935459:222942715:-1 gene:ENSRNOG00000020410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M10244 // GenBank // Rat tyrosine hydroxylase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222935717:222959926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// L22651 // GenBank // Rat tyrosine hydroxylase (TH) mRNA, 5 flank and complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031503 // RefSeq // Rattus norvegicus achaete-scute family bHLH transcription factor 2 (Ascl2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223012687:223015038:-1 gene:ENSRNOG00000020434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223013783:223015410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT006812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191896 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 5 (Trpm5), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223119451:223136561:-1 gene:ENSRNOG00000020484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223119497:223154623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
NM_001100521 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family A, member 2 (Phlda2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001170480 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family A, member 2 (Phlda2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223562823:223563762:-1 gene:ENSRNOG00000020614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223562931:223611717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT006822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012170 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleosome assembly protein 1-like 4 (Nap1l4), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XR_350849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleosome assembly protein 1-like 4 (Nap1l4), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000054862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223575634:223611023:-1 gene:ENSRNOG00000020615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC085801 // GenBank // Rattus norvegicus nucleosome assembly protein 1-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:93819 IMAGE:7110617), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT006824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000025056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223562931:223611717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 31 // 37 // 1 /// NONRATT006826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// NONRATT006823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NONRATT006826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001106319 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteinyl-tRNA synthetase (Cars), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000050721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223619594:223661823:-1 gene:ENSRNOG00000020651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000025049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223620243:223679591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT006828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT006829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT006830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 83 // 40 // 48 // 1 /// NONRATT006831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001108511 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 26 (Tnfrsf26), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223668849:223688760:-1 gene:ENSRNOG00000043486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100250 // GenBank HTC // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 26, mRNA (cDNA clone IMAGE:7444920), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223620243:223679591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 22 (Tnfrsf22), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// XM_006223581 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 22 (Tnfrsf22), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// XM_003753403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 22 (Tnfrsf22), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000054861 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:223706713:223714178:-1 gene:ENSRNOG00000036644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000025634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223694762:223751902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT006836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000072999 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:223705814:223714115:-1 gene:ENSRNOG00000036644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001015024 // RefSeq // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 5 (Osbpl5), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223725412:223779450:-1 gene:ENSRNOG00000020713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 5 (Osbpl5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223694762:223751902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001066085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to MAS-related G-protein coupled receptor, member G (RGD1562011), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000049057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223797558:223798460:-1 gene:ENSRNOG00000046394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 72 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000025636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223797555:223822884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 83 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT006837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_203470 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member G (Mrgprg), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028126 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:223809194:223827625:-1 gene:ENSRNOG00000047908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT006843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223797555:223822884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// FQ228925 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YI01 mRNA sequence. // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001002288 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member E (Mrgpre), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS-related GPR, member E (Mrgpre), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223826747:223827631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181480 // RefSeq // Rattus norvegicus NAD synthetase 1 (Nadsyn1), mRNA. // chr1 // 86 // 100 // 36 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000028175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223843327:223869684:-1 gene:ENSRNOG00000020736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// AB090805 // GenBank // Rattus norvegicus rQNS1 mRNA for NAD+ synthetase, complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 36 // 42 // 0 /// BC101923 // GenBank HTC // Rattus norvegicus NAD synthetase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7937501), with apparent retained intron. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// BC161832 // GenBank // Rattus norvegicus NAD synthetase 1, mRNA (cDNA clone MGC:187314 IMAGE:9092240), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000025646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223837148:223869610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT006838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0
NM_021868 // RefSeq // Rattus norvegicus cortactin (Cttn), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000028283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222159089:222194541:-1 gene:ENSRNOG00000050994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AF054618 // GenBank // Rattus norvegicus cortactin isoform C mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 73 // 25 // 27 // 0 /// AF054619 // GenBank // Rattus norvegicus cortactin isoform B mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 76 // 25 // 28 // 0 /// BC081802 // GenBank // Rattus norvegicus cortactin, mRNA (cDNA clone MGC:93456 IMAGE:7107292), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000047669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222159089:222194541:-1 gene:ENSRNOG00000050994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// ENSRNOT00000054859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224459486:224494902:-1 gene:ENSRNOG00000047280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 34 // 37 // 1 /// GENSCAN00000006862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224460729:224494975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000041235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222160332:222188251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 30 // 37 // 1
NM_001106320 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, f polypeptide (PTPRF), interacting protein (liprin), alpha 1 (Ppfia1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039677 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:224501043:224577428:-1 gene:ENSRNOG00000020857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224505068:224605923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000006865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224505068:224605923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT006848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 100 // 8 // 24 // 0 /// NONRATT057723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 100 // 8 // 24 // 0
NM_152937 // RefSeq // Rattus norvegicus Fas (TNFRSF6)-associated via death domain (Fadd), mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000075089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224600338:224606008:-1 gene:ENSRNOG00000047035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF406779 // GenBank // Rattus norvegicus FADD/MORT1 protein with death effector domain mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// FQ223214 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YP21 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT006852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224505068:224605923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT006853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001107564 // RefSeq // Rattus norvegicus anoctamin 1, calcium activated chloride channel (Ano1), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224612597:224760372:-1 gene:ENSRNOG00000020865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224614069:224681279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
GENSCAN00000030040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224955393:224961823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045006 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:224954794:224955917:-1 gene:ENSRNOG00000032983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 100 // 12 // 24 // 0
NM_171992 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin D1 (Ccnd1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224960136:224969658:-1 gene:ENSRNOG00000020918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AB256048 // GenBank // Rattus norvegicus ZH17 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// FQ226502 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA29YK24 mRNA sequence. // chr1 // 76 // 64 // 16 // 21 // 0 /// NONRATT006857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000030052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224962932:224991648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
NM_145088 // RefSeq // Rattus norvegicus mammary cancer associated protein RMT-1 (Rmt1), mRNA. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225236071:225241739:-1 gene:ENSRNOG00000013373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF308611 // GenBank // Rattus norvegicus mammary cancer associated protein RMT-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT006858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001107566 // RefSeq // Rattus norvegicus two pore segment channel 2 (Tpcn2), mRNA. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000017914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225292406:225316612:-1 gene:ENSRNOG00000013387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000054857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225286482:225316676:-1 gene:ENSRNOG00000013387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC166782 // GenBank // Rattus norvegicus two pore segment channel 2, mRNA (cDNA clone MGC:188562 IMAGE:7935012), complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225187517:225316596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT006859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT006860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_031586 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin mu binding protein 2 (Ighmbp2), mRNA. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225376771:225399917:-1 gene:ENSRNOG00000013456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF199411 // GenBank // Rattus norvegicus antifreeze-enhancer binding protein AEP mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC099790 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin mu binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:124598 IMAGE:7934952), complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225377273:225400167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_033237 // RefSeq // Rattus norvegicus galanin/GMAP prepropeptide (Gal), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225520966:225525829:-1 gene:ENSRNOG00000015156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// J03624 // GenBank // Rat galanin (a neuropeptide) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M18102 // GenBank // Rat galanin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225521146:225525486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001287134 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 6, regulatory subunit 3 (Ppp6r3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000020886 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:225564228:225682638:-1 gene:ENSRNOG00000015540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000065950 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:225564228:225682638:-1 gene:ENSRNOG00000015540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ221104 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YJ22 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000015899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225548645:225682480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT006871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT006870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001106321 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 5 (Lrp5), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000022213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225689356:225793030:-1 gene:ENSRNOG00000015911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC166786 // GenBank // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:188568 IMAGE:7935737), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// GENSCAN00000009987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225689556:225769238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT006875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
ENSRNOT00000022226 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:225846366:225846971:-1 gene:ENSRNOG00000016597 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225846366:225876801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_199089 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell, immune regulator 1, ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A3 (Tcirg1), mRNA. // chr1 // 95 // 91 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000023425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226000345:226009795:-1 gene:ENSRNOG00000017220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC061859 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell, immune regulator 1, ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A3, mRNA (cDNA clone MGC:72583 IMAGE:5598499), complete cds. // chr1 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// DQ286426 // GenBank // Rattus norvegicus v-H+ATPase subunit a3 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 91 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000009962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226000406:226041242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT006879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC078964 // GenBank HTC // Rattus norvegicus T-cell, immune regulator 1, ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 protein A3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7111385), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr1 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT006881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT006884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// NONRATT006886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT006880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// NONRATT006885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001106322 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8 (Ndufs8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8 (Ndufs8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8 (Ndufs8), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226013897:226017215:-1 gene:ENSRNOG00000017446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158791 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:188164 IMAGE:7311183), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ213239 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YP01 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226000406:226041242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001006998 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 3 family, member B1 (Aldh3b1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226018064:226038888:-1 gene:ENSRNOG00000017512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083850 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 3 family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:95025 IMAGE:7122451), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ212890 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YN01 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226000406:226041242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001006972 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 1 (Ndufv1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226124946:226130037:-1 gene:ENSRNOG00000018117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083709 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94599 IMAGE:7190583), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ212198 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YO13 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// FQ217076 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA36YB16 mRNA sequence. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226125018:226129967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT006893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_012577 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase pi 1 (Gstp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226162330:226164798:-1 gene:ENSRNOG00000018237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC058439 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione-S-transferase, pi 1, mRNA (cDNA clone MGC:72668 IMAGE:6889675), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC058440 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione-S-transferase, pi 1, mRNA (cDNA clone MGC:72669 IMAGE:6917961), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FJ179407 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase pi mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226162396:226182215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT006896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001134508 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC37914 (RGD1307603), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006230737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC37914 (RGD1307603), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226180244:226182891:-1 gene:ENSRNOG00000018287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// FQ219091 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YM07 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226162396:226182215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_172327 // RefSeq // Rattus norvegicus aryl-hydrocarbon receptor-interacting protein (Aip), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aryl-hydrocarbon receptor-interacting protein (Aip), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226232510:226240238:-1 gene:ENSRNOG00000022289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF543560 // GenBank // Rattus norvegicus immunophilin XAP2 (XAP2) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC089110 // GenBank // Rattus norvegicus aryl-hydrocarbon receptor-interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:105297 IMAGE:7311852), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ213075 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YN22 mRNA sequence. // chr1 // 75 // 86 // 18 // 24 // 0 /// FQ214270 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YL09 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226233337:226240233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001108926 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding protein 4 (Cabp4), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226254103:226258660:-1 gene:ENSRNOG00000022044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226254673:226258603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001010962 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 2 (Rps6kb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226276853:226283539:-1 gene:ENSRNOG00000021689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089102 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:105678 IMAGE:7305323), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226277074:226283467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT006909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
XM_006230928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carnosine synthase 1 (Carns1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006230929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carnosine synthase 1 (Carns1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226285566:226292919:-1 gene:ENSRNOG00000018603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226285566:226292919:-1 gene:ENSRNOG00000018603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226285566:226309215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT006912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0
NM_001081980 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 10C (Tbc1d10c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226302644:226309430:-1 gene:ENSRNOG00000021510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC160813 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 10C, mRNA (cDNA clone MGC:187222 IMAGE:7385853), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ226277 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YL16 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226285566:226309215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT006922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_006223605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD9 homolog A (S. pombe) (Rad9a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD9 homolog A (S. pombe) (Rad9a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025317 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:226314743:226321102:-1 gene:ENSRNOG00000018729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226314743:226321102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT006923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001012217 // RefSeq // Rattus norvegicus slingshot protein phosphatase 3 (Ssh3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226382006:226389511:-1 gene:ENSRNOG00000018878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC083600 // GenBank // Rattus norvegicus slingshot homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94343 IMAGE:7133065), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226378167:226427801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT006932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001108514 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 13 family, member D (Ankrd13d), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226390565:226402786:-1 gene:ENSRNOG00000028247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226378167:226427801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_012776 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenergic, beta, receptor kinase 1 (Adrbk1), mRNA. // chr1 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000025847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226406333:226414442:-1 gene:ENSRNOG00000018985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// M87854 // GenBank // Rattus norvegicus beta-adrenergic receptor kinase 1 (beta-ARK1) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000013202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226378167:226427801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT006939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT006938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NM_001108515 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 2A (Kdm2a), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// XM_006230843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 2A (Kdm2a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000054850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226436269:226508225:-1 gene:ENSRNOG00000019145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000013215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226439179:226478789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT006940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0
NM_001106323 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member D (Rhod), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226536283:226550218:-1 gene:ENSRNOG00000019220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226537043:226617260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT006945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_138835 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin XII (Syt12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226557953:226587017:-1 gene:ENSRNOG00000019306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U71294 // GenBank // Rattus norvegicus Srg1 (Sytr1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT006946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226537043:226617260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_001109521 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689065 (LOC689065), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054848 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:226611405:226613312:-1 gene:ENSRNOG00000036641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000037636 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:226616255:226617340:-1 gene:ENSRNOG00000027267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226537043:226617260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001109508 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 4 (Lrfn4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226716517:226719809:-1 gene:ENSRNOG00000019356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226716804:226719190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001100585 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras converting CAAX endopeptidase 1 (Rce1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000026454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226727307:226730406:-1 gene:ENSRNOG00000019468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000066455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226727307:226730406:-1 gene:ENSRNOG00000019468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC158593 // GenBank // Rattus norvegicus RCE1 homolog, prenyl protein peptidase (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187388 IMAGE:8369432), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT006952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT006953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226727720:226755121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// NONRATT006954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT006955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
XR_145784 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ22531 (RGD1563323), misc_RNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XR_146769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ22531 (RGD1563323), misc_RNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036769 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:226730593:226778314:-1 gene:ENSRNOG00000026579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226727720:226755121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
GENSCAN00000029714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226808128:226830373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT006957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001170484 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 4 (Rbm4), mRNA. // chr1 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000026611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226903519:226913778:-1 gene:ENSRNOG00000048141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// FQ212306 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA60YH02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC086338 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 4B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301680), complete cds. // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// GENSCAN00000029727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226907194:226961260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT006959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NONRATT006959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053425 // RefSeq // Rattus norvegicus copper chaperone for superoxide dismutase (Ccs), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226940134:226961606:-1 gene:ENSRNOG00000019691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000064728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226940134:226961606:-1 gene:ENSRNOG00000019691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227006391:227027316:-1 gene:ENSRNOG00000047816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF255305 // GenBank // Rattus norvegicus superoxide dismutase copper chaperone mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC158586 // GenBank // Rattus norvegicus copper chaperone for superoxide dismutase, mRNA (cDNA clone MGC:187351 IMAGE:9099085), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// EU340033 // GenBank // Rattus norvegicus copper chaperone of superoxide dismutase (CCS) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ219139 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YG19 mRNA sequence. // chr1 // 87 // 94 // 26 // 30 // 0 /// NONRATT006959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226974507:227026919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226907194:226961260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_133424 // RefSeq // Rattus norvegicus actinin alpha 3 (Actn3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000026812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227051531:227067458:-1 gene:ENSRNOG00000019745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF450248 // GenBank // Rattus norvegicus skeletal muscle-specific alpha-actinin 3 (Actn3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AY096238 // GenBank // Rattus norvegicus truncated alpha-actinin (Actn3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC166600 // GenBank // Rattus norvegicus actinin alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:188376 IMAGE:7930544), complete cds. // chr1 // 36 // 100 // 16 // 44 // 0 /// GENSCAN00000029740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227051657:227067420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT006965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001107569 // RefSeq // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 1 (Bbs1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227078590:227096525:-1 gene:ENSRNOG00000019832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227080515:227133876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT006967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT006968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT006970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_053748 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 3 (Dpp3), mRNA. // chr1 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000026968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227097125:227120710:-1 gene:ENSRNOG00000031485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// BC107673 // GenBank // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:124585 IMAGE:7938129), complete cds. // chr1 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// D89340 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for dipeptidyl peptidase III, complete cds. // chr1 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227080515:227133876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0 /// NONRATT006972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT006971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_001127542 // RefSeq // Rattus norvegicus pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 3 (Peli3), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227124426:227135055:-1 gene:ENSRNOG00000019950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC161922 // GenBank // Rattus norvegicus pellino 3, mRNA (cDNA clone MGC:187667 IMAGE:8370772), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227080515:227133876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153626 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal PAS domain protein 4 (Npas4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal PAS domain protein 4 (Npas4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227192031:227196795:-1 gene:ENSRNOG00000020009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB050103 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for bHLH PAS type transcription factor NXF, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227192048:227196761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107570 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 151A (Tmem151a), mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// BC168914 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 151A, mRNA (cDNA clone MGC:189198 IMAGE:7313547), complete cds. // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227393722:227398224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000054553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227304476:227308978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_001025132 // RefSeq // Rattus norvegicus cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 2 (Cnih2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006230845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 2 (Cnih2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000027421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227405547:227411186:-1 gene:ENSRNOG00000020247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC091325 // GenBank // Rattus norvegicus cornichon homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:109307 IMAGE:7313787), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000054551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227406337:227413663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT006977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001109979 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB1B, member RAS oncogene family (Rab1b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227413058:227413663:-1 gene:ENSRNOG00000050510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227415763:227500801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227406337:227413663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT006978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENSRNOT00000041238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227423230:227433026:-1 gene:ENSRNOG00000020299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC166555 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin light chain 2, mRNA (cDNA clone MGC:188165 IMAGE:7311621), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227415763:227500801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT006982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT006983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT006984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_134406 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 (Pacs1), mRNA. // chr1 // 96 // 98 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000027632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227445874:227574749:-1 gene:ENSRNOG00000020350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 98 // 47 // 48 // 0 /// AF076183 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic sorting protein PACS-1a (PACS-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 98 // 46 // 48 // 0 /// AF076184 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic sorting protein PACS-1b (PACS-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 55 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT006989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000054534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227415763:227500801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 40 // 49 // 1
NM_001106326 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 3b, subunit 2 (Sf3b2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000068497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227575699:227595347:-1 gene:ENSRNOG00000020412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000054547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227573681:227595293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
XM_006245671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus igE-binding protein-like (LOC102556423), partial mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF057564 // GenBank // Rattus norvegicus putative retrovirus-related gag protein mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0
NM_133566 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin E/M (Cst6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227656559:227658267:-1 gene:ENSRNOG00000020455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY046415 // GenBank // Rattus norvegicus cystatin N mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227656670:227657993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053631 // RefSeq // Rattus norvegicus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006230630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006230632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus barrier to autointegration factor 1 (Banf1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000027734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227673553:227675550:-1 gene:ENSRNOG00000020460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AB024333 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for L2BP1, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC084726 // GenBank // Rattus norvegicus barrier to autointegration factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:105365 IMAGE:7320690), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ224698 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA57YN05 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT006993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_031596 // RefSeq // Rattus norvegicus squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells (Sart1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000027811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227691827:227700489:-1 gene:ENSRNOG00000020475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AB014722 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for rSALT-1(806), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// BC083551 // GenBank // Rattus norvegicus squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells, mRNA (cDNA clone MGC:93355 IMAGE:7134496), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000029394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227691879:227735559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT006994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT006995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1
NM_001004278 // RefSeq // Rattus norvegicus testis specific 10 interacting protein (Tsga10ip), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001270736 // RefSeq // Rattus norvegicus testis specific 10 interacting protein (Tsga10ip), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_001270737 // RefSeq // Rattus norvegicus testis specific 10 interacting protein (Tsga10ip), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227701925:227715984:-1 gene:ENSRNOG00000027564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY690667 // GenBank // Rattus norvegicus Tsga10 interacting protein (Tsga10ip) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC097254 // GenBank // Rattus norvegicus testis specific 10 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:114211 IMAGE:7453704), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227691879:227735559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001077668 // RefSeq // Rattus norvegicus Dr1 associated protein 1 (negative cofactor 2 alpha) (Drap1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230741 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Dr1 associated protein 1 (negative cofactor 2 alpha) (Drap1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227733127:227735764:-1 gene:ENSRNOG00000020527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127524 // GenBank // Rattus norvegicus Dr1 associated protein 1 (negative cofactor 2 alpha), mRNA (cDNA clone MGC:156767 IMAGE:7114598), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227691879:227735559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT007000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
XM_006223613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 85B (Ccdc85b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 85B (Ccdc85b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071617 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:227765419:227765831:-1 gene:ENSRNOG00000046560 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 75 // 48 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227765223:227765831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024242 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin W (Ctsw), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000037404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227773906:227777294:-1 gene:ENSRNOG00000027096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC093401 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin W, mRNA (cDNA clone MGC:112764 IMAGE:7389584), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227774030:227777289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT007004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001025645 // RefSeq // Rattus norvegicus MUS81 structure-specific endonuclease subunit (Mus81), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227791797:227797070:-1 gene:ENSRNOG00000020617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC098853 // GenBank // Rattus norvegicus MUS81 endonuclease homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112911 IMAGE:7379711), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227791905:227796938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT007007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT007008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
XM_006223614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 32 (Snx32), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 32 (Snx32), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 32 (Snx32), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 32 (Snx32), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036745 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:227804038:227820073:-1 gene:ENSRNOG00000026527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ222518 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA22YF19 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227804038:227812362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT007011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT007010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT007012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_006223691 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus melanoma-associated antigen G1-like (LOC102551929), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006230963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus melanoma-associated antigen G1-like (LOC102551929), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227804038:227812362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0 /// NONRATT007009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT007011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT007012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT007013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001107572 // RefSeq // Rattus norvegicus ovo-like zinc finger 1 (Ovol1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ovo-like zinc finger 1 (Ovol1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227857057:227868558:-1 gene:ENSRNOG00000020669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227858935:227874312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001005872 // RefSeq // Rattus norvegicus K(lysine) acetyltransferase 5 (Kat5), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus K(lysine) acetyltransferase 5 (Kat5), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227898846:227906149:-1 gene:ENSRNOG00000020707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227898846:227906149:-1 gene:ENSRNOG00000020707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC083879 // GenBank // Rattus norvegicus K(lysine) acetyltransferase 5, mRNA (cDNA clone MGC:95167 IMAGE:7130366), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227899246:227906144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT007018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT007019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT007020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT007021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT007022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001004089 // RefSeq // Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 (Sipa1), mRNA. // chr1 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227941671:227953682:-1 gene:ENSRNOG00000020726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB091474 // GenBank // Rattus norvegicus SPA-1 mRNA for GTPase-activating protein, complete cds. // chr1 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// FQ223350 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YG01 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227941861:227976723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT007025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT007026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT007027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSRNOT00000028170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227954413:227976723:-1 gene:ENSRNOG00000020742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227954413:227976723:-1 gene:ENSRNOG00000020742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227941861:227976723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001015013 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 89, member B (Fam89b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228018858:228020412:-1 gene:ENSRNOG00000024239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093377 // GenBank // Rattus norvegicus mammary tumor virus receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:112670 IMAGE:7388027), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228019361:228020295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT007041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001109537 // RefSeq // Rattus norvegicus Sjogren syndrome/scleroderma autoantigen 1 (Sssca1), mRNA. // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000017034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228020766:228022549:-1 gene:ENSRNOG00000012736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT007044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT007043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001109537 // RefSeq // Rattus norvegicus Sjogren syndrome/scleroderma autoantigen 1 (Sssca1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228020766:228022549:-1 gene:ENSRNOG00000012736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228021936:228022452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT007044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0
NM_001011938 // RefSeq // Rattus norvegicus SCY1-like 1 (S. cerevisiae) (Scyl1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// XM_006230749 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SCY1-like 1 (S. cerevisiae) (Scyl1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000032387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228048825:228062617:-1 gene:ENSRNOG00000023668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC087141 // GenBank // Rattus norvegicus SCY1-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95113 IMAGE:7127562), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// FQ217187 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA32YP04 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228049102:228086689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// NONRATT007047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT007046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
BC090353 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7313591. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008348 // RefSeq // Rattus norvegicus FERM domain containing 8 (Frmd8), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228146287:228166935:-1 gene:ENSRNOG00000020881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC085896 // GenBank // Rattus norvegicus FERM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:94709 IMAGE:7193163), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// FQ211651 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YI07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228147609:228167954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT007059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
NM_001107573 // RefSeq // Rattus norvegicus tigger transposable element derived 3 (Tigd3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000031678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228181887:228184306:-1 gene:ENSRNOG00000023318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228181887:228204964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001108516 // RefSeq // Rattus norvegicus D4, zinc and double PHD fingers family 2 (Dpf2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228186741:228201255:-1 gene:ENSRNOG00000020892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ231977 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YH17 mRNA sequence. // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228181887:228204964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT007064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001009689 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 2 (Cdc42ep2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 2 (Cdc42ep2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228203835:228212662:-1 gene:ENSRNOG00000020904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087091 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 2, mRNA (cDNA clone MGC:94615 IMAGE:7190911), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233746 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YJ15 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT007070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT007071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT007072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053480 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), alpha 2, accessory subunit (Pola2), mRNA. // chr1 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228231867:228255908:-1 gene:ENSRNOG00000020906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// BC097300 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:114291 IMAGE:7457570), complete cds. // chr1 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228219355:228255777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT007075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1 /// NONRATT007077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1
NM_001106327 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 20 (Slc22a20), mRNA. // chr1 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228263159:228278524:-1 gene:ENSRNOG00000022673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228262119:228326084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_019152 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 1, (mu/I) large subunit (Capn1), mRNA. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// XM_006230703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 1, (mu/I) large subunit (Capn1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006230704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 1, (mu/I) large subunit (Capn1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006230705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 1, (mu/I) large subunit (Capn1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000028431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228280719:228304852:-1 gene:ENSRNOG00000020935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC061880 // GenBank // Rattus norvegicus calpain 1, mRNA (cDNA clone MGC:72486 IMAGE:5599301), complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// U53858 // GenBank // Rattus norvegicus mu-calpain large subunit (cls1) mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// XM_006230706 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 1, (mu/I) large subunit (Capn1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// GENSCAN00000025414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228262119:228326084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// NONRATT007082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// NONRATT007084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1
NM_001047883 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L49 (Mrpl49), mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228351856:228355562:-1 gene:ENSRNOG00000020975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// FQ235268 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YN13 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// FQ213572 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YA14 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 95 // 24 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228352772:228355543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001013071 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 7 superfamily member 2 (Tm7sf2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228361453:228365792:-1 gene:ENSRNOG00000020989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC091237 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane 7 superfamily member 2, mRNA (cDNA clone MGC:108990 IMAGE:7323367), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// FQ218409 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YF24 mRNA sequence. // chr1 // 87 // 91 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228361575:228365263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
ENSRNOT00000028495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228365960:228375920:-1 gene:ENSRNOG00000020996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228359230:228375920:-1 gene:ENSRNOG00000020996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000025420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228366084:228375903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// FQ209756 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA3YP09 mRNA sequence. // chr1 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// FQ210630 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA25YG16 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT007090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0
XR_145790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAC3 domain containing 1 (Sac3d1), misc_RNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XR_146775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAC3 domain containing 1 (Sac3d1), misc_RNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028509 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:228418634:228420960:-1 gene:ENSRNOG00000021003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228418634:228430442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT007092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT007091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001024752 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 15 (Snx15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228421392:228430527:-1 gene:ENSRNOG00000021007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097481 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 15, mRNA (cDNA clone MGC:114550 IMAGE:7459091), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228418634:228430442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT007094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT007095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_031711 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 2 (Arl2), mRNA. // chr1 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// XM_006230899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 2 (Arl2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228438709:228451114:-1 gene:ENSRNOG00000021010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// FQ213929 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YL24 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT007096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000025366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228438998:228451083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// NONRATT007097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_181379 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, beta (Ppp2r5b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228534440:228541618:-1 gene:ENSRNOG00000021025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228581375:228587865:-1 gene:ENSRNOG00000048905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AY251278 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2A regulatory subunit B beta isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// BC090324 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:105291 IMAGE:7128996), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228581375:228587865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228535081:228541571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NONRATT007101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT007102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001034943 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion/urate transporter), member 12 (Slc22a12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion/urate transporter), member 12 (Slc22a12), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228902089:228909194:-1 gene:ENSRNOG00000021108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC103638 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion/urate transporter), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:124974 IMAGE:7109619), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228902317:228929617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
GENSCAN00000009340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228984680:229030875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001108517 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 4 (Rps6ka4), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000028678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229077912:229088867:-1 gene:ENSRNOG00000021117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229078643:229108891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT007109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_001072042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 88B (Ccdc88b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_215206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 88B (Ccdc88b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229093436:229108891:-1 gene:ENSRNOG00000024931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229093436:229108891:-1 gene:ENSRNOG00000024931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229078643:229108891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_053610 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxiredoxin 5 (Prdx5), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229155316:229158301:-1 gene:ENSRNOG00000021125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050964 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:229155316:229156818:-1 gene:ENSRNOG00000021125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF110732 // GenBank // Rattus norvegicus antioxidant enzyme B166 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC078771 // GenBank // Rattus norvegicus peroxiredoxin 5, mRNA (cDNA clone MGC:93296 IMAGE:7193191), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229155451:229157127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT007112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT007117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT007116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001008511 // RefSeq // Rattus norvegicus estrogen related receptor, alpha (Esrra), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000028697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229159584:229169579:-1 gene:ENSRNOG00000021139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY280663 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen receptor-related receptor alpha (Esrra) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 79 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT007119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229160353:229176562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// NONRATT007120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
XM_006223630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 40 (Tex40), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000009368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229160353:229176562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT007122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_053804 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 4 (Kcnk4), mRNA. // chr1 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229174130:229180458:-1 gene:ENSRNOG00000021140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF259502 // GenBank // Rattus norvegicus two pore K+ channel KT4.1 mRNA, partial cds. // chr1 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// AF302842 // GenBank // Rattus norvegicus mechanosensitive tandem pore potassium channel mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229160353:229176562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT007125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001109562 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 137 (Gpr137), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229185120:229188106:-1 gene:ENSRNOG00000021145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC167037 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 137, mRNA (cDNA clone MGC:189294 IMAGE:7462064), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229185461:229191818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT007126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_033350 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, beta 3 (phosphatidylinositol-specific) (Plcb3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229200438:229215707:-1 gene:ENSRNOG00000021150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// DQ120507 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY phospholipase C beta 3 (Plcb3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// DQ120508 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR phospholipase C beta 3 (Plcb3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M99567 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase C beta-3 mRNA, partial cds. // chr1 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000056660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229200441:229215695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001134428 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 2 (Fkbp2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001134429 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 2 (Fkbp2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229223204:229225877:-1 gene:ENSRNOG00000021153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229223280:229224533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT007131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_053549 // RefSeq // Rattus norvegicus vascular endothelial growth factor B (Vegfb), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229229801:229233423:-1 gene:ENSRNOG00000021156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC076395 // GenBank // Rattus norvegicus vascular endothelial growth factor B, mRNA (cDNA clone MGC:94837 IMAGE:7109119), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF022952 // GenBank // Rattus norvegicus vascular endothelial growth factor B mRNA, partial cds. // chr1 // 63 // 53 // 10 // 16 // 0 /// XM_006230910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vascular endothelial growth factor B (Vegfb), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT007137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229228238:229241376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT007139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT007136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT007140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001013196 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4 (Dnajc4), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006230858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4 (Dnajc4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006230859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4 (Dnajc4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4 (Dnajc4), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229233670:229237835:-1 gene:ENSRNOG00000043060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC088201 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:108892 IMAGE:7378025), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229228238:229241376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// NONRATT007143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// NONRATT007144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// NONRATT007142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT007145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_199090 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 22 (Nudt22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229238281:229241759:-1 gene:ENSRNOG00000021158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC060593 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 22, mRNA (cDNA clone MGC:72981 IMAGE:6887766), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229228238:229241376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT007146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT007148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT007149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT007150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001127543 // RefSeq // Rattus norvegicus fermitin family member 3 (Fermt3), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229244963:229263064:-1 gene:ENSRNOG00000021161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166607 // GenBank // Rattus norvegicus fermitin family homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188389 IMAGE:5598287), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229245311:229283710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_138911 // RefSeq // Rattus norvegicus stress-induced phosphoprotein 1 (Stip1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229264912:229291272:-1 gene:ENSRNOG00000021164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC061529 // GenBank // Rattus norvegicus stress-induced phosphoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72684 IMAGE:6887497), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229245311:229283710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109160 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1 (Flrt1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_350858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibronectin leucine rich transmembrane protein 1 (Flrt1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229338914:229340938:-1 gene:ENSRNOG00000022428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229338914:229340938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106332 // RefSeq // Rattus norvegicus OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 1 (Otub1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000028752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229442242:229450521:-1 gene:ENSRNOG00000021175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC166771 // GenBank // Rattus norvegicus OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:188546 IMAGE:7934088), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ233987 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YJ12 mRNA sequence. // chr1 // 79 // 82 // 11 // 14 // 0 /// FQ233072 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YF01 mRNA sequence. // chr1 // 71 // 82 // 10 // 14 // 0 /// FQ229739 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YN23 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 82 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT007158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229443088:229459406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
NM_134345 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIIa (Cox8a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000028754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229457140:229459465:-1 gene:ENSRNOG00000021177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC126066 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIIIa, mRNA (cDNA clone MGC:156494 IMAGE:7385046), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// FQ213112 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YK04 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// X06146 // GenBank // R.norvegicus mRNA for mitochondrial cytochrome c oxidase subunit VIc. // chr1 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT007159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001108518 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 40, NatD catalytic subunit (Naa40), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229468108:229485469:-1 gene:ENSRNOG00000021179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229470335:229485227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_021699 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 2 (Mark2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// XM_006230880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 2 (Mark2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006230882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 2 (Mark2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000028763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229515236:229578049:-1 gene:ENSRNOG00000021184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000056638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229515574:229528908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT007164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 21 // 39 // 1 /// NONRATT007165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
NM_001134575 // RefSeq // Rattus norvegicus LOC361719 (RGD1308106), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XR_350851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LOC361719 (RGD1308106), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229594278:229616177:-1 gene:ENSRNOG00000025061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229595342:229647630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_006230970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sororin-like (LOC686151), partial mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001115042 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle associated 5 (Cdca5), mRNA. // chr1 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228384097:228394999:1 gene:ENSRNOG00000046635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// BC158663 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cell division cycle associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:187653 IMAGE:8369770), complete cds. // chr1 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// BC158764 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cell division cycle associated 5, mRNA (cDNA clone MGC:188023 IMAGE:7111047), complete cds. // chr1 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028794 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:229798107:229798442:-1 gene:ENSRNOG00000021204 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000015147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229950072:230002208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228384205:228394171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0
NM_001106333 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 12 (Lgals12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 12 (Lgals12), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 12 (Lgals12), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229878714:229889408:-1 gene:ENSRNOG00000021207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229884613:229888944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_173302 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22, member 24 (Slc22a24), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:230475205:230498963:-1 gene:ENSRNOG00000021214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AB051836 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for organic anion transporter 5, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:230464132:230498843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT007181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229950072:230002208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_134379 // RefSeq // Rattus norvegicus integral membrane transport protein UST4r (UST4r), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000050010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231267925:231332743:-1 gene:ENSRNOG00000049826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC100065 // GenBank // Rattus norvegicus integral membrane transport protein UST4r, mRNA (cDNA clone MGC:112602 IMAGE:7373541), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// FQ218143 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YK08 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT007185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231181647:231361793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000035732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231370397:231637688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_134380 // RefSeq // Rattus norvegicus integral membrane transport protein UST5r (Ust5r), mRNA. // chr1 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231268678:231477585:-1 gene:ENSRNOG00000049826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 89 // 20 // 25 // 0 /// BC081730 // GenBank // Rattus norvegicus integral membrane transport protein UST5r, mRNA (cDNA clone IMAGE:7107967). // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC098905 // GenBank // Rattus norvegicus integral membrane transport protein UST5r, mRNA (cDNA clone MGC:114265 IMAGE:7325342), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_138908 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22, member 25 (Slc22a25), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231539313:231635293:-1 gene:ENSRNOG00000017964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// Y09945 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for putative integral membrane transport protein (UST1r). // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231370397:231637688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENSRNOT00000024317 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:231718843:231719219:-1 gene:ENSRNOG00000018030 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// NONRATT007188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001271089 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 3 (amino acid transporter heavy chain), member 2 (Slc3a2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_019283 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 3 (amino acid transporter heavy chain), member 2 (Slc3a2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231843827:231858251:-1 gene:ENSRNOG00000018487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB015433 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 4F2 heavy chain (4F2hc), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC061989 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 3 (activators of dibasic and neutral amino acid transport), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:72480 IMAGE:5599495), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// U59324 // GenBank // Rattus norvegicus intestinal type II membrane glycoprotein 4F2hc mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231843987:231858809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT007191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT007192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT007193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001109572 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 179B (Tmem179b), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000065694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231910394:231912376:-1 gene:ENSRNOG00000019341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// FQ225083 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YD06 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231910725:231912349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT007197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001107575 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF6-like RNA polymerase II, p300/CBP-associated factor (PCAF)-associated factor (Taf6l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231912413:231922611:-1 gene:ENSRNOG00000019419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC168911 // GenBank // Rattus norvegicus TAF6-like RNA polymerase II, p300/CBP-associated factor (PCAF)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:189193 IMAGE:7458553), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231912448:231932849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT007202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT007203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT007204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_053948 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide G (Polr2g), mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006230972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide G (Polr2g), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000026313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231929424:231932948:-1 gene:ENSRNOG00000019439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC060550 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:72732 IMAGE:6890594), complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC060595 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide G, mRNA (cDNA clone MGC:72993 IMAGE:6888231), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ224086 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA77YG06 mRNA sequence. // chr1 // 86 // 73 // 19 // 22 // 0 /// FQ230390 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YE06 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT007205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231912448:231932849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT007207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT007208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001007693 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 9C (Ttc9c), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006230984 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 9C (Ttc9c), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231942033:231952730:-1 gene:ENSRNOG00000019464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062803 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 9C, mRNA (cDNA clone MGC:73022 IMAGE:6890943), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ211550 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YL09 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231944436:231952384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT007212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT007213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_053658 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 3 (Gng3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231972086:231973852:-1 gene:ENSRNOG00000019570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212152 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA67YK16 mRNA sequence. // chr1 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0 /// NONRATT007214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001168661 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Protein UNQ655/PRO1286 homolog precursor (LOC690344), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000074747 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:232013921:232014699:-1 gene:ENSRNOG00000045561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT007215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT007216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001009690 // RefSeq // Rattus norvegicus retinal outer segment membrane protein 1 (Rom1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232064354:232066360:-1 gene:ENSRNOG00000019858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY212508 // GenBank // Rattus norvegicus rod outer segment membrane protein 1 (Rom1), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC087605 // GenBank // Rattus norvegicus retinal outer segment membrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105717 IMAGE:7312188), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232064628:232066144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT007220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013051 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 1A, member 1 (uteroglobin) (Scgb1a1), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232216740:232220289:-1 gene:ENSRNOG00000020196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC069174 // GenBank // Rattus norvegicus secretoglobin, family 1A, member 1 (uteroglobin), mRNA (cDNA clone MGC:91765 IMAGE:7096714), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J05536 // GenBank // Rat PCB-binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT007222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232193479:232220232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_145089 // RefSeq // Rattus norvegicus asparaginase like 1 (Asrgl1), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232246223:232267037:-1 gene:ENSRNOG00000020202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF329099 // GenBank // Rattus norvegicus asparaginase-like sperm autoantigen mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AJ427914 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for glial asparaginase (gliap gene). // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232247253:232266981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT007224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000072322 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:232535029:232535690:-1 gene:ENSRNOG00000050732 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 71 // 95 // 15 // 21 // 0
NM_177482 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 1D, member 2 (Scgb1d2), mRNA. // chr1 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232544485:232547492:-1 gene:ENSRNOG00000020294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099696 // GenBank // Rattus norvegicus prostatic steroid binding protein C1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7930045), partial cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// J00774 // GenBank // Rat prostatic steroid-binding protein C1 mRNA exons 2-3, complete cds. // chr1 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// V01255 // GenBank // Rat messenger RNA for prostatic steroid binding protein (subunit C1). // chr1 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT007225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232423345:232583975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_002725736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PBPC1BS-like (LOC100362601), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049011 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:232712784:232717299:1 gene:ENSRNOG00000028909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT003156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 92 // 14 // 24 // 0 /// NONRATT003157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 92 // 14 // 24 // 0
NM_001106335 // RefSeq // Rattus norvegicus inner centromere protein (Incenp), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000043387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232874537:232900880:-1 gene:ENSRNOG00000032929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000024237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232874861:232896982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT007228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT007231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT007230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
NM_001011940 // RefSeq // Rattus norvegicus bestrophin 1 (Best1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232981480:232998041:-1 gene:ENSRNOG00000020346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC079048 // GenBank // Rattus norvegicus bestrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93985 IMAGE:7115295), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232981541:232993488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT007228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT007233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_031344 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid desaturase 2 (Fads2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000027756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232857120:233097150:-1 gene:ENSRNOG00000020440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 99 // 66 // 66 // 0 /// AB021980 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for delta-6 fatty acid desaturase, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// BC081776 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid desaturase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93365 IMAGE:7128630), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// HQ909027 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid desaturase 2 (Fads2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 99 // 66 // 66 // 0 /// GENSCAN00000024226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233057734:233097150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 53 // 53 // 0 /// NONRATT007228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000024231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232854459:232857643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 12 // 12 // 8 // 67 // 1
NM_053430 // RefSeq // Rattus norvegicus flap structure-specific endonuclease 1 (Fen1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233196202:233200570:-1 gene:ENSRNOG00000020531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF281018 // GenBank // Rattus norvegicus flag structure-specific endonuclease (Fen-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC083630 // GenBank // Rattus norvegicus flap structure-specific endonuclease 1, mRNA (cDNA clone MGC:94425 IMAGE:7134402), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001170487 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin regulatory factor (Myrf), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233205242:233237427:-1 gene:ENSRNOG00000028274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233207344:233237427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001005886 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol lipase, alpha (Dagla), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000037624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233241963:233298558:-1 gene:ENSRNOG00000027264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY275375 // GenBank // Rattus norvegicus neural stem cell-derived dendrite regulator (Nsddr) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000007890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233244302:233266810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001107577 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 10B (Lrrc10b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233448640:233449518:-1 gene:ENSRNOG00000030180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233448640:233473856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145786 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 32 (Ppp1r32), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233464614:233473161:-1 gene:ENSRNOG00000020620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY032664 // GenBank // Rattus norvegicus IIIG9 short form mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AY032665 // GenBank // Rattus norvegicus IIIG9 long form mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081718 // GenBank // Rattus norvegicus IIIG9 protein, mRNA (cDNA clone MGC:93144 IMAGE:7112534), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233448640:233473856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001008371 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 (Sdhaf2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 (Sdhaf2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006231043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 (Sdhaf2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233493738:233518545:-1 gene:ENSRNOG00000020646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC076396 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20487, mRNA (cDNA clone IMAGE:7109588). // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex assembly factor 2 (Sdhaf2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT007246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT007250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233494658:233518495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001271039 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 216 (Tmem216), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 216 (Tmem216), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233548121:233551813:-1 gene:ENSRNOG00000020692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC168207 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 216, mRNA (cDNA clone MGC:188088 IMAGE:7131074), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233548817:233552380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT007254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000053169 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:233556462:233556579:-1 gene:ENSRNOG00000035046 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198777 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 138 (Tmem138), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 138 (Tmem138), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233569913:233576952:-1 gene:ENSRNOG00000020693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061578 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 138, mRNA (cDNA clone IMAGE:6889055), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC161808 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 138, mRNA (cDNA clone MGC:187227 IMAGE:9035805), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT007257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT007258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT007259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000007888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233564266:233574660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT007260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT007261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001039031 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydroxyacetone kinase 2 homolog (S. cerevisiae) (Dak), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006231057 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydroxyacetone kinase 2 homolog (S. cerevisiae) (Dak), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233590129:233603337:-1 gene:ENSRNOG00000020704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC098925 // GenBank // Rattus norvegicus dihydroxyacetone kinase 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114371 IMAGE:7112371), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000007878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233590482:233598701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT007263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT007264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT007266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// NONRATT007265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1 /// NONRATT007267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT007268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
NM_021753 // RefSeq // Rattus norvegicus pepsinogen 5, group I (Pga5), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233666684:233677343:-1 gene:ENSRNOG00000022121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233787021:233797410:-1 gene:ENSRNOG00000047279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233666833:233673022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000033313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233673944:233677343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233787021:233797390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_019295 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd5 molecule (Cd5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028330 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:233715534:233735903:-1 gene:ENSRNOG00000046935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000054812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233835586:233856535:-1 gene:ENSRNOG00000020872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233835650:233856507:-1 gene:ENSRNOG00000020872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC098918 // GenBank // Rattus norvegicus Cd5 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:114334 IMAGE:7384975), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// D10728 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for lymphocyte antigen CD5, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X78985 // GenBank // R.norvegicus CD5 mRNA. // chr1 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233716999:233729345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233837051:233888266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT007270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_175577 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd6 molecule (Cd6), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// XM_006231017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd6 molecule (Cd6), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233913077:233951758:-1 gene:ENSRNOG00000020884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000054809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233913077:233951758:-1 gene:ENSRNOG00000020884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF488727 // GenBank // Rattus norvegicus CD6 antigen mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 79 // 28 // 30 // 0 /// BC089767 // GenBank // Rattus norvegicus Cd6 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:108551 IMAGE:7383438), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000054811 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:234235664:234241972:-1 gene:ENSRNOG00000046782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 34 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000004808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234238454:234248662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233913923:233940477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 74 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT007271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT007272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// NONRATT007273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_178021 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 132A (Tmem132a), mRNA. // chr1 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000028971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233978360:233989649:-1 gene:ENSRNOG00000021338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY216677 // GenBank // Rattus norvegicus GRP78 binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233978360:233989649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT007277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001007736 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 109 (Tmem109), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 109 (Tmem109), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233990666:234001285:-1 gene:ENSRNOG00000028017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078955 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 109, mRNA (cDNA clone MGC:93811 IMAGE:7110380), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225946 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YJ19 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233991753:233994393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT007278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT007280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT007281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_053509 // RefSeq // Rattus norvegicus zona pellucida glycoprotein 1 (sperm receptor) (Zp1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234032054:234038434:-1 gene:ENSRNOG00000020907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB000928 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for zona pellucida 1 glycoprotein, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234030202:234038399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_001006974 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 86 (Ccdc86), mRNA. // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234061778:234067753:-1 gene:ENSRNOG00000020925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083770 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 86, mRNA (cDNA clone MGC:94720 IMAGE:7193350), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ501253 // GenBank // Rattus norvegicus cyclon mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234062123:234067704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT007282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106336 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 10 (Ms4a10), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234082491:234095631:-1 gene:ENSRNOG00000020932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234079401:234112989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191897 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 15 (Ms4a15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234099484:234112978:-1 gene:ENSRNOG00000026957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234079401:234112989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108519 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 8 (Ms4a8), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000063879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234203005:234216599:-1 gene:ENSRNOG00000020939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234203379:234236008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_006231098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12-like (LOC100912336), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_006231105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 13, pseudogene 1 (Ms4a13-ps1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048354 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:234430928:234456941:-1 gene:ENSRNOG00000033714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000054806 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:234430928:234456941:-1 gene:ENSRNOG00000033714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234444416:234482566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_006223643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 12 (Ms4a12), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223646 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 12 (Ms4a12), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006231100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 12 (Ms4a12), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 12 (Ms4a12), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000036564 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:234470383:234477761:-1 gene:ENSRNOG00000026387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234444416:234482566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001107578 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 1 (Ms4a1), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234494130:234506331:-1 gene:ENSRNOG00000020945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098745 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7387276. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ226425 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YD20 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT007297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234494682:234522516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT007299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_003749066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 5 (Ms4a5), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_003753388 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 5 (Ms4a5), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035910 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:234514846:234522516:-1 gene:ENSRNOG00000025857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073770 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:234514846:234522516:-1 gene:ENSRNOG00000025857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234494682:234522516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 74 // 17 // 20 // 0
NM_181082 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 14 (Ms4a14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234536327:234551836:-1 gene:ENSRNOG00000025805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY258290 // GenBank // Rattus norvegicus sperm protein SSP3111 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234536569:234575297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT007300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106338 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 7 (Ms4a7), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234555660:234570068:-1 gene:ENSRNOG00000020953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234536569:234575297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT007303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
XR_343418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D-like (LOC690836), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234713787:234964230:1 gene:ENSRNOG00000020980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234940060:234975147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// FQ227673 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YF23 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
XM_001075462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6A (Ms4a6a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// XM_006223654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6A (Ms4a6a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// XM_006231110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6A (Ms4a6a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000032937 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:234871932:234881646:1 gene:ENSRNOG00000036627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000047316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234868199:234881646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001006975 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6B-like (Ms4a6bl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234821272:234833097:1 gene:ENSRNOG00000030689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234307343:234321124:1 gene:ENSRNOG00000050395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC083691 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6B, mRNA (cDNA clone MGC:94557 IMAGE:7189412), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ230476 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA98YI12 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234309203:234318678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234823130:234832605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0
XM_006223652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6C (Ms4a6c), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// XM_006223653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 6C (Ms4a6c), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072077 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:234734823:234744792:1 gene:ENSRNOG00000047349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT003216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001106339 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 4C (Ms4a4c), mRNA. // chrU // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000033613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234714289:234725777:1 gene:ENSRNOG00000020997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234680998:234814203:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT003215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
XM_006223655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 3 (Ms4a3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 3 (Ms4a3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028493 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:235041899:235057983:-1 gene:ENSRNOG00000036625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235041899:235119405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
XM_006223656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oocyte secreted protein 2 (Oosp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oocyte secreted protein 2 (Oosp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042091 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:235063939:235080272:-1 gene:ENSRNOG00000036624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235041899:235119405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000028498 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:235098960:235119405:-1 gene:ENSRNOG00000020998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235041899:235119405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_031124 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 3 (Stx3), mRNA. // chr1 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// XM_006231091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 3 (Stx3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 3 (Stx3), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 3 (Stx3), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235218151:235262711:-1 gene:ENSRNOG00000021013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// BC168246 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 3, mRNA (cDNA clone MGC:188380 IMAGE:5600098), complete cds. // chr1 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// L20820 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235221508:235227875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT007312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001000505 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 318 (Olr318), mRNA. // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// XM_002742442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1874 (Olr1874), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235328700:235329656:-1 gene:ENSRNOG00000046620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235291856:235292812:-1 gene:ENSRNOG00000049602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235328700:235329656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235291856:235292812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_001000505 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 318 (Olr318), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235328700:235329656:-1 gene:ENSRNOG00000046620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235291856:235292812:-1 gene:ENSRNOG00000049602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235328700:235329656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235291856:235292812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000003249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235515353:235515676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NM_001000244 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 321 (Olr321), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235539045:235539977:-1 gene:ENSRNOG00000021065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235539045:235539842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000762 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 322 (Olr322), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235568412:235569343:-1 gene:ENSRNOG00000021066 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235568408:235569277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT007318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000245 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 323 (Olr323), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235587344:235588279:-1 gene:ENSRNOG00000021069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235587344:235588213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT007319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000246 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 324 (Olr324), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235600405:235601340:-1 gene:ENSRNOG00000021070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235589012:235601205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT007320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000247 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 325 (Olr325), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235609179:235610123:-1 gene:ENSRNOG00000021071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235609179:235610123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000248 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 326 (Olr326), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235620906:235621859:-1 gene:ENSRNOG00000021072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235620906:235621859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000249 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 327 (Olr327), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235672961:235673926:-1 gene:ENSRNOG00000021073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235672961:235673878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT007323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000760 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 331 (Olr331), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236633959:236634905:1 gene:ENSRNOG00000030201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001000109 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 387 (Olr387), mRNA. // chr1 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236634288:236634905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT003249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001000250 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 332 (Olr332), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236614913:236615872:1 gene:ENSRNOG00000024746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236613091:236615872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000050690 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:236600214:236603422:1 gene:ENSRNOG00000024713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 89 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236572484:236603422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001001041 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 334 (Olr334), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236597409:236598350:1 gene:ENSRNOG00000042023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001047855 // RefSeq // Rattus norvegicus deltex 4, E3 ubiquitin ligase (Dtx4), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deltex homolog 4 (Drosophila) (Dtx4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235895198:235915304:-1 gene:ENSRNOG00000021086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235895198:235932543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1
XM_006231117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM111A-like (LOC100910386), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// XM_006231119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM111A-like (LOC100910386), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235954373:235955876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000006933 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:236180347:236181361:-1 gene:ENSRNOG00000005208 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236180411:236187078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT007328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
NM_013166 // RefSeq // Rattus norvegicus ciliary neurotrophic factor (Cntf), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236752366:236754389:-1 gene:ENSRNOG00000012460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ214544 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YA22 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236752780:236754312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT007333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001169120 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 91 (Zfp91), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006231127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 91 (Zfp91), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236755856:236792548:-1 gene:ENSRNOG00000012524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236758999:236792512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT007337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001001042 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 341 (Olr341), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236913043:236913963:-1 gene:ENSRNOG00000050798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236913043:236913963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000075607 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:236932085:236933005:-1 gene:ENSRNOG00000046407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236932085:236933005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000254 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 343 (Olr343), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236952486:236953428:-1 gene:ENSRNOG00000029027 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236952486:236953085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001019 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 349 (Olr349), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000072035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237074404:237240099:-1 gene:ENSRNOG00000046233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT007342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001000756 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 358 (Olr358), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT007343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000755 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 360 (Olr360), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237258018:237258932:-1 gene:ENSRNOG00000013077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000039465 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:237279667:237280699:-1 gene:ENSRNOG00000023732 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237280161:237350363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001001276 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 377 (Olr377), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237787242:237788186:-1 gene:ENSRNOG00000013198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237787242:237788054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001286 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 378 (Olr378), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237802715:237803677:-1 gene:ENSRNOG00000031224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000261 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 379 (Olr379), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237813020:237813955:-1 gene:ENSRNOG00000023530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237813020:237813712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT007347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001277 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 380 (Olr380), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237824454:237825401:-1 gene:ENSRNOG00000045761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237824454:237868554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001278 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 382 (Olr382), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237867610:237868554:-1 gene:ENSRNOG00000013208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237824454:237868554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 92 // 17 // 22 // 0 /// NONRATT007349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000262 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 383 (Olr383), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237904168:237905115:-1 gene:ENSRNOG00000050605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237904168:237905115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus periphilin-1-like (RGD1561986), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006231133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus periphilin-1-like (RGD1561986), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000061680 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:238500130:238501014:-1 gene:ENSRNOG00000005112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:238500130:238500993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_019141 // RefSeq // Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 4 (Tle4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_019141 // RefSeq // Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 4 (Tle4), mRNA. // chr1 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:238531404:238665281:-1 gene:ENSRNOG00000013239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 97 // 33 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:238531404:238666772:-1 gene:ENSRNOG00000013239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// L14463 // GenBank // Rattus norvegicus R-esp2 mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 95 // 30 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:238531548:238560137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:238610149:238665299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT007352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0
NM_198738 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoserine aminotransferase 1 (Psat1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006231135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphoserine aminotransferase 1 (Psat1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC079352 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoserine aminotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94809 IMAGE:7108218), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000018763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:240241244:240263046:-1 gene:ENSRNOG00000013971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// GENSCAN00000003602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:240246789:240315178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
ENSRNOT00000018951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:240303398:240331196:-1 gene:ENSRNOG00000014041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// FQ222521 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA22YF07 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:240320194:240324698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT007356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:240246789:240315178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT007355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
ENSRNOT00000037913 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:242525927:242526928:-1 gene:ENSRNOG00000027424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000041310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:242581428:242609374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_001100975 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 13 homolog A (S. cerevisiae) (Vps13a), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 74 // 74 // 0 /// ENSRNOT00000014800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:242966101:243128666:-1 gene:ENSRNOG00000025539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 50 // 50 // 0 /// AY325251 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Da1-12 mRNA, complete cds. // chr1 // 29 // 29 // 22 // 77 // 1 /// ENSRNOT00000071578 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:242705000:242723675:-1 gene:ENSRNOG00000046420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 16 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:242950561:243117588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 55 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT007375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 27 // 77 // 1 /// ENSRNOT00000015108 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:242690781:242723627:-1 gene:ENSRNOG00000046420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 23 // 23 // 18 // 77 // 1 /// GENSCAN00000037796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:242671463:242794320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 17 // 77 // 1
NM_001168584 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box B2 (Foxb2), mRNA. // chrU // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000052350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:244368839:244369682:1 gene:ENSRNOG00000032137 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000043008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:243232823:243243758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:244367961:244560237:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_022276 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 (Gcnt1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006231149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 (Gcnt1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 1, core 2 (Gcnt1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:243883283:243887809:1 gene:ENSRNOG00000050534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:243884080:243885366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT003306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000016164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:243339733:243618637:1 gene:ENSRNOG00000012036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// NM_053823 // RefSeq // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 (Pcsk5), mRNA. // chr1 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1 /// GENSCAN00000043009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:243577125:243627474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT003302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_148892 // RefSeq // Rattus norvegicus osteoclast stimulating factor 1 (Ostf1), mRNA. // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// AF523266 // GenBank // Rattus norvegicus osteoclast stimulating factor mRNA, complete cds. // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC062400 // GenBank // Rattus norvegicus osteoclast stimulating factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:72286 IMAGE:5621572), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT003291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
NM_001270958 // RefSeq // Rattus norvegicus RAR-related orphan receptor B (Rorb), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_002728869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAR-related orphan receptor B (Rorb), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:241465471:241535552:1 gene:ENSRNOG00000013413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:241434070:241577515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006223716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like (RGD1561881), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000050860 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:241285497:241286504:1 gene:ENSRNOG00000029732 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:241241283:241286504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_012904 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A1 (Anxa1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000023664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:245192877:245208910:-1 gene:ENSRNOG00000017469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC061710 // GenBank // Rattus norvegicus annexin A1, mRNA (cDNA clone MGC:72548 IMAGE:5598112), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ213489 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YI14 mRNA sequence. // chr1 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// FQ216134 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YI05 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// M19967 // GenBank // Rat calpactin II (LCI) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:245178653:245255088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT007398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// NONRATT007399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT007400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
ENSRNOT00000033598 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:245342700:245343163:-1 gene:ENSRNOG00000036618 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
XM_006223675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A7 (Aldh1a7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000024093 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:247847960:247887886:-1 gene:ENSRNOG00000017878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// NM_017272 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase family 1, subfamily A7 (Aldh1a7), mRNA. // chr1 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// M23995 // GenBank // Rat aldehyde dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr1 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:247848432:247887970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_001108521 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane channel-like 1 (Tmc1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT007402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:245671830:245826372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
ENSRNOT00000011249 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:246080113:246081110:-1 gene:ENSRNOG00000008262 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000021946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:245929569:246082007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_031776 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine deaminase (Gda), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:246270809:246346023:-1 gene:ENSRNOG00000018282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AF026472 // GenBank // Rattus norvegicus guanine aminohydrolase (GAH) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF245172 // GenBank // Rattus norvegicus guanine deaminase (Gda) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:246235312:246302634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
ENSRNOT00000037500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:246496970:246553306:-1 gene:ENSRNOG00000027161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC079346 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110059E24, mRNA (cDNA clone MGC:94797 IMAGE:7107242), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC093390 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110059E24, mRNA (cDNA clone MGC:112742 IMAGE:7388009), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000029509 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:111575736:111576203:-1 gene:ENSRNOG00000024197 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111575736:111576203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:246497811:246537199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT007411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT007414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1
GENSCAN00000034213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:246596672:246607052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
ENSRNOT00000027014 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:247132141:247132707:-1 gene:ENSRNOG00000019952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:247132141:247132707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NONRATT007416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:247259211:247393860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001106357 // RefSeq // Rattus norvegicus structural maintenance of chromosomes 5 (Smc5), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:248263018:248331369:-1 gene:ENSRNOG00000030572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// FQ232653 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YO10 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000008910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:248222092:248331304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000034216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:248356247:248440749:-1 gene:ENSRNOG00000024620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:248356247:248440758:-1 gene:ENSRNOG00000024620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC079474 // GenBank // Rattus norvegicus MAM domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7122818), partial cds. // chr1 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000008915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:248349617:248476671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT007428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
NM_001109164 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700028P14 (RGD1560242), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000054776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:248620547:248742394:-1 gene:ENSRNOG00000036615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:248657474:248742305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT007430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000029109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:249102133:249155546:-1 gene:ENSRNOG00000015011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166504 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Friedreich ataxia region gene X123, mRNA (cDNA clone IMAGE:7122643), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249102772:249145974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XR_350970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554467 (LOC102554467), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249192741:249271231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_053773 // RefSeq // Rattus norvegicus tight junction protein 2 (Tjp2), mRNA. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// XM_006231178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tight junction protein 2 (Tjp2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// XM_006231179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tight junction protein 2 (Tjp2), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:249224596:249358699:-1 gene:ENSRNOG00000015030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC103479 // GenBank // Rattus norvegicus tight junction protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:124724 IMAGE:7936785), complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// U75916 // GenBank // Rattus norvegicus zonula occludens 2 protein (ZO-2) mRNA, partial cds. // chr1 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249192741:249271231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT007437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT007440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0
NM_001191952 // RefSeq // Rattus norvegicus frataxin (Fxn), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020412 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:249400582:249426597:-1 gene:ENSRNOG00000015213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000071614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:249400582:249426597:-1 gene:ENSRNOG00000015213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249400582:249426597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001012743 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, beta (Pip5k1b), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, beta (Pip5k1b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:249441815:249714561:-1 gene:ENSRNOG00000015232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC090349 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, beta, mRNA (cDNA clone MGC:105713 IMAGE:7311399), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249447650:249574026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
BC078922 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 122A, mRNA (cDNA clone MGC:93708 IMAGE:7106028), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249646049:249646909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT007449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191953 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 5 (Pgm5), mRNA. // chr1 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:249856475:250039462:-1 gene:ENSRNOG00000015406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249985530:250039432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// NONRATT007451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
NM_133535 // RefSeq // Rattus norvegicus COBW domain containing 1 (Cbwd1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COBW domain containing 1 (Cbwd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COBW domain containing 1 (Cbwd1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:250093369:250134935:-1 gene:ENSRNOG00000015516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF353305 // GenBank // Rattus norvegicus dopamine responsive protein mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC086376 // GenBank // Rattus norvegicus COBW domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105334 IMAGE:7135348), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250093544:250147931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 48 // 12 // 14 // 0 /// NONRATT007456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001012172 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory factor X, 3 (influences HLA class II expression) (Rfx3), mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// XM_006231230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulatory factor X, 3 (influences HLA class II expression) (Rfx3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000023762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:253103266:253254214:-1 gene:ENSRNOG00000014486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// BC085953 // GenBank // Rattus norvegicus regulatory factor X, 3 (influences HLA class II expression), mRNA (cDNA clone MGC:95287 IMAGE:7134397), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:253148470:253285066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:253103542:253144805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT007479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 21 // 44 // 1
NONRATT007478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1
GENSCAN00000000663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:253385968:253409863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
XM_003753390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLIS family zinc finger 3 (Glis3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006231251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLIS family zinc finger 3 (Glis3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000019816 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:253622233:254026042:-1 gene:ENSRNOG00000014768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073656 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:253709508:254026042:-1 gene:ENSRNOG00000014768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// XM_003753390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLIS family zinc finger 3 (Glis3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001014165 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 6-like (Spata6l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 6-like (Spata6l), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254286410:254327754:-1 gene:ENSRNOG00000015137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254303172:254313779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT007483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT007486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT007485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT007487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000020744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254383052:254408286:-1 gene:ENSRNOG00000015273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC064656 // GenBank // Rattus norvegicus adenylate kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72552 IMAGE:5621289), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_013218 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate kinase 3 (Ak3), mRNA. // chr1 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// D13062 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for adenylate kinase 3, complete cds. // chr1 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// FQ221271 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA38YH24 mRNA sequence. // chr1 // 73 // 96 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254383399:254408230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT007491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_022583 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like 6 (Insl6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254721416:254724951:-1 gene:ENSRNOG00000015868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF159506 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like protein 6 (INSL6) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254721506:254724865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT007493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013413 // RefSeq // Rattus norvegicus relaxin 1 (Rln1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254731581:254734488:-1 gene:ENSRNOG00000015920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254731776:254734445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT007494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106347 // RefSeq // Rattus norvegicus plasminogen receptor, C-terminal lysine transmembrane protein (Plgrkt), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plasminogen receptor, C-terminal lysine transmembrane protein (Plgrkt), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254750915:254763185:-1 gene:ENSRNOG00000015932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0
NM_184050 // RefSeq // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 (Ermp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255038060:255072206:-1 gene:ENSRNOG00000010915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY364634 // GenBank // Rattus norvegicus FXNA mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255038827:255072189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
ENSRNOT00000039428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255151574:255211033:-1 gene:ENSRNOG00000026942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255151574:255196368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000039428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255151574:255211033:-1 gene:ENSRNOG00000026942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ225240 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YK05 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000033118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255151574:255196368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT007503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255209875:255228914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107584 // RefSeq // Rattus norvegicus RAN binding protein 6 (Ranbp6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255232607:255235924:-1 gene:ENSRNOG00000026931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255232607:255235924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1
NM_001107583 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine dehydrogenase (decarboxylating) (Gldc), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_003749086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycine dehydrogenase [decarboxylating], mitochondrial-like (LOC100911814), mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006231211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycine dehydrogenase (decarboxylating) (Gldc), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255544864:255624575:-1 gene:ENSRNOG00000011599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000015456 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:255912140:255958009:-1 gene:ENSRNOG00000050147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000033130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255545388:255584955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT007507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT007506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000054411 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:255719314:255719402:-1 gene:ENSRNOG00000036288 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106350 // RefSeq // Rattus norvegicus dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 1 (Dkk1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:256133073:256195607:-1 gene:ENSRNOG00000011692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:256134421:256136623:-1 gene:ENSRNOG00000048688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// JN966752 // GenBank // Rattus norvegicus dickkopf-like protein 1 (DKK1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:256133809:256138461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:256181531:256195474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001105731 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, cGMP-dependent, type 1 (Prkg1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:256221067:256702284:-1 gene:ENSRNOG00000033641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// EU251189 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic GMP-dependent protein kinase (Pkg) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:256222263:256283105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001105731 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, cGMP-dependent, type 1 (Prkg1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU251189 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic GMP-dependent protein kinase (Pkg) mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:257524544:257556128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053646 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acylsphingosine amidohydrolase (non-lysosomal ceramidase) 2 (Asah2), mRNA. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// XM_006231262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acylsphingosine amidohydrolase (non-lysosomal ceramidase) 2 (Asah2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000016688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:257793172:257864321:-1 gene:ENSRNOG00000012196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// AB057433 // GenBank // Rattus norvegicus pAPkCD mRNA for ceramidase, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000033294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:257754876:257860307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 83 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT007515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0
NM_181386 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin synthase 1 (Sgms1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000054761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:257923301:258182226:-1 gene:ENSRNOG00000012536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// AY280961 // GenBank // Rattus norvegicus MOB protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// BC078690 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93062 IMAGE:7113038), complete cds. // chr1 // 100 // 44 // 17 // 17 // 0 /// BC081693 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93063 IMAGE:7132545), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT007521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// NONRATT007522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT007524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
NM_001035002 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase family, AAA domain containing 1 (Atad1), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:258466603:258609714:-1 gene:ENSRNOG00000010861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// AY325215 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-088 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 76 // 31 // 32 // 0 /// BC094514 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase family, AAA domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105686 IMAGE:7307334), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// EF688601 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:258467776:258511875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 55 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT007527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT007528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000040218 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:258895231:258895714:-1 gene:ENSRNOG00000033829 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:258895219:258896645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001014167 // RefSeq // Rattus norvegicus renalase, FAD-dependent amine oxidase (Rnls), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006231295 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus renalase, FAD-dependent amine oxidase (Rnls), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:259052393:259323697:-1 gene:ENSRNOG00000020705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006231293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus renalase, FAD-dependent amine oxidase (Rnls), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// GENSCAN00000001780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259056445:259126362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259298169:259323479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT007532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT007533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
XM_001079846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gastric triacylglycerol lipase-like (RGD1565682), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_220070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gastric triacylglycerol lipase-like (RGD1565682), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:259326243:259337816:-1 gene:ENSRNOG00000025444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259326243:259352495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001191638 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 22 (Ankrd22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:259654478:259685074:-1 gene:ENSRNOG00000019190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259651461:259666102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001025415 // RefSeq // Rattus norvegicus cholesterol 25-hydroxylase (Ch25h), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cholesterol 25-hydroxylase (Ch25h), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260029123:260030019:-1 gene:ENSRNOG00000019141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC097964 // GenBank // Rattus norvegicus cholesterol 25-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:116092 IMAGE:7387594), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012732 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase A, lysosomal acid, cholesterol esterase (Lipa), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260038182:260071430:-1 gene:ENSRNOG00000019077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC072532 // GenBank // Rattus norvegicus lipase A, lysosomal acid, cholesterol esterase, mRNA (cDNA clone MGC:91515 IMAGE:7099460), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260037328:260068981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT007539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSRNOT00000054756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260137069:260138325:-1 gene:ENSRNOG00000036603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_020096 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 (Ifit1), mRNA. // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000025770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260165588:260166976:1 gene:ENSRNOG00000019050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260136934:260138391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260160478:260166976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT003464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001191637 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 12 (Slc16a12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 12 (Slc16a12), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260199459:260222109:-1 gene:ENSRNOG00000021916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260199874:260214022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001106373 // RefSeq // Rattus norvegicus pantothenate kinase 1 (Pank1), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pantothenate kinase 1 (Pank1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260338636:260404074:-1 gene:ENSRNOG00000018944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260307077:260378003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT007543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT007545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NR_031863 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-107 (Mir107), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053762 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:260347511:260347597:-1 gene:ENSRNOG00000035639 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260307077:260378003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-107 // miRBase Micro RNA Database // MI0000890 Rattus norvegicus miR-107 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001159493 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamyl-tRNA synthetase 2 mitochondrial (putative) (Ears2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamyl-tRNA synthetase 2-like 1 (Ears2l1), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamyl-tRNA synthetase 2-like 1 (Ears2l1), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260515289:260516839:-1 gene:ENSRNOG00000018925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035800 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:198699311:198715517:1 gene:ENSRNOG00000025353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071946 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:198699311:198716100:1 gene:ENSRNOG00000025353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260515289:260516836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:198624392:198716100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT002317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT002318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT002319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_022938 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 7, adenylate cyclase-coupled (Htr7), mRNA. // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000025450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:261764180:261879737:-1 gene:ENSRNOG00000018827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:261758785:261879737:-1 gene:ENSRNOG00000018827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// L22558 // GenBank // Rattus norvegicus adenylyl cyclase-activated serotonin receptor (5-HT7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// U68489 // GenBank // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine7 receptor isoform b mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// U68490 // GenBank // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine7 receptor isoform c mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// X69663 // GenBank // R.norvegicus mRNA for serotonin receptor. // chr1 // 92 // 74 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:261759668:261814133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT007548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_013220 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 1 (Ankrd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:262038137:262046691:1 gene:ENSRNOG00000018598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC072699 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 1 (cardiac muscle), mRNA (cDNA clone MGC:91764 IMAGE:7105899), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// L81174 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin-repeat protein (Carp) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U50736 // GenBank // Rattus norvegicus cardiac adriamycin responsive protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:262038194:262053811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT003473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001012072 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3C (Ppp1r3c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:262628941:262633940:-1 gene:ENSRNOG00000018494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085894 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3C, mRNA (cDNA clone MGC:94701 IMAGE:7192942), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:262671064:262686610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001109165 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor binding protein 3 (Fgfbp3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:263030909:263032914:-1 gene:ENSRNOG00000022796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263031741:263032493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000003226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263048706:263049236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT007556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
ENSRNOT00000047387 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:263170252:263287406:-1 gene:ENSRNOG00000020689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067976 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:263170252:263287406:-1 gene:ENSRNOG00000020689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_013159 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin degrading enzyme (Ide), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulin degrading enzyme (Ide), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:263390397:263488576:-1 gene:ENSRNOG00000016833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263389355:263451484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT007566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_130408 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 26, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp26a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:263865215:263869103:1 gene:ENSRNOG00000016750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF439720 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid hydroxylase (CYP26A1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ266888 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid hydroxylase (CYP26A1) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// DQ317305 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid hydroxylase (CYP26A1) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263865328:263868913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001080197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 26, subfamily C, polypeptide 1 (Cyp26c1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_217935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 26, subfamily C, polypeptide 1 (Cyp26c1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030962 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:263853274:263860759:1 gene:ENSRNOG00000030698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263853304:263860759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019277 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 6 (Exoc6), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000054748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:263708964:263850916:1 gene:ENSRNOG00000036601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF032668 // GenBank // Rattus norvegicus rsec15 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263709007:263843723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000055076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263849284:263851492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001191636 // RefSeq // Rattus norvegicus myoferlin (Myof), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000021546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264066287:264215424:-1 gene:ENSRNOG00000016117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000032940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264132378:264179281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263966543:264129256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 16 // 56 // 1 /// NONRATT007575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 11 // 56 // 1
NM_013162 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol binding protein 4, plasma (Rbp4), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// XM_006231317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinol binding protein 4, plasma (Rbp4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000021055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264287001:264294216:-1 gene:ENSRNOG00000015518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC167099 // GenBank // Rattus norvegicus retinol binding protein 4, plasma, mRNA (cDNA clone MGC:189543 IMAGE:7369314), complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264287227:264296383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001014246 // RefSeq // Rattus norvegicus fragile site, folic acid type, rare, fra(10)(q23.3) or fra(10)(q24.2) candidate 1 (Fra10ac1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fragile site, folic acid type, rare, fra(10)(q23.3) or fra(10)(q24.2) candidate 1 (Fra10ac1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264362189:264394030:-1 gene:ENSRNOG00000015235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC090036 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 10 open reading frame 4; similar to putative acid phosphatase F26C11.1, mRNA (cDNA clone MGC:109644 IMAGE:7368097), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT007582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
ENSRNOT00000054746 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:264716729:264717602:-1 gene:ENSRNOG00000036600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264716766:264732029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001108523 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar complex associated 3 homolog (S. cerevisiae) (Noc3l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000019056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264962014:264990545:-1 gene:ENSRNOG00000013965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264962451:264990446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001271354 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 24 (Cyp2c24), mRNA. // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT003515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:265526402:265590441:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT003516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_003753416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450 2C26-like (LOC100912265), partial mRNA. // chrU // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
XM_003749104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 55-like (LOC100361492), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_003753396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 55-like (LOC100361492), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:265662098:265704202:1 gene:ENSRNOG00000001466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:265662098:265828566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_138514 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 13 (Cyp2c13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:266244627:266324943:-1 gene:ENSRNOG00000049464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088105 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 2c13, mRNA (cDNA clone MGC:108565 IMAGE:7372890), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098903 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 2c13, mRNA (cDNA clone MGC:114253 IMAGE:7373446), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// J02861 // GenBank // Rat polymorphic, male-specific cytochrome P-450g mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// M32277 // GenBank // Rat cytochrome P-450g mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M33994 // GenBank // Rat male-specific liver cytochrome P-450 g mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:266244863:266324910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_138512 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 22 (Cyp2c22), mRNA. // chr1 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000054724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:266701173:266731622:-1 gene:ENSRNOG00000021924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EU861213 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley cytochrome P450 2C22 (Cyp2c22) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ218628 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YN15 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// M58041 // GenBank // Rat P49 cytochrome P450 mRNA, complete cds. // chr1 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:266703559:266730256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT007591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_017365 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 1 (Pdlim1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:266752410:266800857:-1 gene:ENSRNOG00000016166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC072465 // GenBank // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:91751 IMAGE:7100446), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ214797 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YP13 mRNA sequence. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// FQ227333 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YL19 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// U23769 // GenBank // Rattus norvegicus CLP36 (clp36) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:266752751:266761032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT007592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000013737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:266770318:266807663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT007595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT007594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001108524 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 18 family, member A1 (Aldh18a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000020940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:266505499:266537718:-1 gene:ENSRNOG00000015267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000075605 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:267086303:267114928:-1 gene:ENSRNOG00000047305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267084483:267111335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:266506404:266555049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_001053561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tectonic family member 3 (Tctn3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003749109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tectonic-3-like (LOC100912537), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_220007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tectonic family member 3 (Tctn3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074364 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:267125447:267134940:-1 gene:ENSRNOG00000045584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074429 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:266545541:266555034:-1 gene:ENSRNOG00000047112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:266506404:266555049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267128445:267134955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001025767 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell linker (Blnk), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006231402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell linker (Blnk), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267630227:267697917:-1 gene:ENSRNOG00000013967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098790 // GenBank // Rattus norvegicus B-cell linker, mRNA (cDNA clone MGC:112831 IMAGE:7375523), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267630478:267681961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT007613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT007615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT007614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001017386 // RefSeq // Rattus norvegicus oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein (Opalin), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein (Opalin), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000030656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267766695:267784339:-1 gene:ENSRNOG00000022386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092200 // GenBank // Rattus norvegicus oligodendrocytic myelin paranodal and inner loop protein, mRNA (cDNA clone MGC:105773 IMAGE:7319643), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267765621:267782085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT007618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001191898 // RefSeq // Rattus norvegicus tolloid-like 2 (Tll2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267791567:267916973:-1 gene:ENSRNOG00000013519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000011691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267791567:267874284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000018043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267924051:267973774:-1 gene:ENSRNOG00000013443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267940470:267973774:-1 gene:ENSRNOG00000013443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267927171:267973774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// FQ209899 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YC20 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001106368 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1 (Pik3ap1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267982552:268093804:-1 gene:ENSRNOG00000013309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267983941:268093777:-1 gene:ENSRNOG00000013309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC169055 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase adaptor protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:189448 IMAGE:7930052), complete cds. // chr1 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267987939:268109846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_022953 // RefSeq // Rattus norvegicus slit homolog 1 (Drosophila) (Slit1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000034758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268298680:268445090:-1 gene:ENSRNOG00000026065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000035415 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:268298921:268445090:-1 gene:ENSRNOG00000026065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000070968 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:268298680:268445090:-1 gene:ENSRNOG00000026065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AB011530 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MEGF4, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB073214 // GenBank // Rattus norvegicus SLIT1 mRNA for SLIT1-Sb splicing product, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AB073215 // GenBank // Rattus norvegicus SLIT1 mRNA for SLIT1-La splicing product, partial cds. // chr1 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// AF133730 // GenBank // Rattus norvegicus Slit1 mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 97 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268290351:268364021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
GENSCAN00000023158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270995997:271057552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0
NM_001108525 // RefSeq // Rattus norvegicus cutC copper transporter (Cutc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:270956594:270971364:1 gene:ENSRNOG00000017298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT003580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT003581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT003582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT003583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001107595 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 (Entpd7), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023111 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:270433133:270445430:1 gene:ENSRNOG00000045548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000064510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:270893394:270935069:1 gene:ENSRNOG00000016883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 7 (Entpd7), partial mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000023167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270894766:270939458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000015823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270409455:270445737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001107594 // RefSeq // Rattus norvegicus NK2 homeobox 3 (Nkx2-3), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000054714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:270812400:270815353:1 gene:ENSRNOG00000016656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270809255:270814971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107593 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin M1 (Cnnm1), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:270631411:270687644:1 gene:ENSRNOG00000016302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270630645:270686951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT003571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
XM_006223798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain and coiled-coil containing 1-like (R3hcc1l), mRNA. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// XM_006231422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain and coiled-coil containing 1-like (R3hcc1l), mRNA. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:269254695:269256494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT003564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0
XM_001055463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgin A7 family, member B (Golga7b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006223761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgin A7 family, member B (Golga7b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgin A7 family, member B (Golga7b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_219889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgin A7 family, member B (Golga7b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020390 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:268961980:268966788:1 gene:ENSRNOG00000015051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268947491:268965624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT003562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_199104 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 27 (Zfyve27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000040740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268867697:268888292:1 gene:ENSRNOG00000014903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC061741 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:72597 IMAGE:5599023), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000039000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268868564:268887149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT003553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT003555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT003556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT003557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
ENSRNOT00000038870 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:268842009:268842530:1 gene:ENSRNOG00000028096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268842009:268842530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053735 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 alpha (Pi4k2a), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268790066:268814981:1 gene:ENSRNOG00000014675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY029199 // GenBank // Rattus norvegicus 55 kDa type II phosphatidylinositol 4-kinase mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268790101:268814855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT003545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT003547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT003548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT003549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106355 // RefSeq // Rattus norvegicus 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase 1 (Hoga1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase 1 (Hoga1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268744342:268771456:1 gene:ENSRNOG00000029501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ218423 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YE10 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ219115 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YJ08 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT003539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268734341:268770871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1
NM_001044281 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC682010 (MGC93861), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268734341:268770871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001107589 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 2 (stretch responsive muscle) (Ankrd2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268734319:268743779:1 gene:ENSRNOG00000013840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ216609 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YO16 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268734341:268770871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001013153 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin domain containing 1 (Ubtd1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// XM_006231391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin domain containing 1 (Ubtd1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000018485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268681819:268733008:1 gene:ENSRNOG00000013813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// BC079260 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94363 IMAGE:7133433), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT003536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000038999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268689672:268732339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 20 // 48 // 1
NM_139192 // RefSeq // Rattus norvegicus stearoyl-Coenzyme A desaturase 1 (Scd1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000018447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271602887:271615702:-1 gene:ENSRNOG00000013552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// AF509568 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN stearoyl-coenzyme A desaturase 1 (Scd1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// AF509569 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344 stearoyl-coenzyme A desaturase 1 (Scd1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// J02585 // GenBank // Rat liver stearyl-CoA desaturase mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 80 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271606398:271615600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT007715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001135713 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC31 homolog B (S. cerevisiae) (Sec31b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC31 homolog B (S. cerevisiae) (Sec31b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271712190:271737734:-1 gene:ENSRNOG00000025781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271712190:271735704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001106360 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex 8 (Ndufb8), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271741825:271746891:-1 gene:ENSRNOG00000014078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC166889 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex 8, mRNA (cDNA clone MGC:188832 IMAGE:6891455), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC166905 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex 8, mRNA (cDNA clone MGC:188870 IMAGE:6887475), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC166906 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex 8, mRNA (cDNA clone MGC:188872 IMAGE:6888064), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ223847 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA85YB20 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271741918:271746867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT007728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT007729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001107598 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L43 (Mrpl43), mRNA. // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000020020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272197964:272198767:-1 gene:ENSRNOG00000014890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272198070:272198745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT007731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_001106362 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing 7 (Pdzd7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272218787:272237327:-1 gene:ENSRNOG00000032946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272219467:272237196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106362 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing 7 (Pdzd7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000043623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272218787:272237327:-1 gene:ENSRNOG00000032946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000048431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272219467:272237196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001047108 // RefSeq // Rattus norvegicus ladybird homeobox 1 (Lbx1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272413944:272415761:-1 gene:ENSRNOG00000025520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB197923 // GenBank // Rattus norvegicus Lbx1 mRNA for lady bird-like homeobox 1 homolog, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272414247:272455512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT007736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001014168 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), lambda (Poll), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000023137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272729885:272738343:-1 gene:ENSRNOG00000016748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC085841 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), lambda, mRNA (cDNA clone MGC:94526 IMAGE:7135812), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272730413:272738771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT007742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT007744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107600 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 4 (Fbxw4), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box/WD repeat-containing protein 4-like (LOC100911855), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006231574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box/WD repeat-containing protein 4-like (LOC100911855), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000023299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272756541:272852823:-1 gene:ENSRNOG00000017343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box/WD repeat-containing protein 4-like (LOC100911855), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000072223 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:270475080:270500257:1 gene:ENSRNOG00000046211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272757078:272853142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT007748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT007749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000015819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270475017:270559846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
XM_006231437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor 8 (Fgf8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NM_133286 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 8 (Fgf8), mRNA. // chr1 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000023558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272923589:272929296:-1 gene:ENSRNOG00000017524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// AB079113 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FGF8, complete cds. // chr1 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// GENSCAN00000017911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272923589:272936286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_001058548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleophosmin/nucleoplasmin, 3 (Npm3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_577868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleophosmin/nucleoplasmin, 3 (Npm3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272934815:272936286:-1 gene:ENSRNOG00000017622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272923589:272936286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_131904 // RefSeq // Rattus norvegicus meningioma expressed antigen 5 (hyaluronidase) (Mgea5), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000054704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272938859:272971539:-1 gene:ENSRNOG00000017822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272938859:272971539:-1 gene:ENSRNOG00000017822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272938859:272971539:-1 gene:ENSRNOG00000017822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AY039679 // GenBank // Rattus norvegicus O-GlcNAcase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// XM_003749127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bifunctional protein NCOAT-like (LOC100911700), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// XM_006231426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bifunctional protein NCOAT-like (LOC100911700), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000017921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272938859:272990682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT007756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT007760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NONRATT007758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001058595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 9130011E15Rik protein (RGD1564887), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 9130011E15Rik protein (RGD1564887), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 9130011E15Rik protein (RGD1564887), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_574677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 9130011E15Rik protein (RGD1564887), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273132695:273170809:-1 gene:ENSRNOG00000025523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000054703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273006527:273165932:-1 gene:ENSRNOG00000025523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273125629:273170809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT007767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107601 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain binding 1 (Ldb1), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain binding 1 (Ldb1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000040904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273215591:273223127:-1 gene:ENSRNOG00000018468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC166757 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domain binding 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7930401), partial cds. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273216101:273224215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT007770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000046365 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:273284499:273286069:-1 gene:ENSRNOG00000033738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273284499:273285714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 75 // 8 // 9 // 0
NM_019247 // RefSeq // Rattus norvegicus paired-like homeodomain 3 (Pitx3), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006231478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired-like homeodomain 3 (Pitx3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000026013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273317589:273330317:-1 gene:ENSRNOG00000019194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273317861:273333535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT007778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_134370 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing (Psd), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273490272:273505122:-1 gene:ENSRNOG00000019435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AB040468 // GenBank // Rattus norvegicus EFA6 mRNA for exchange factor for ARF6, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273490915:273503482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
GENSCAN00000050529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273527961:273528590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001106364 // RefSeq // Rattus norvegicus ARP1 actin-related protein 1 homolog A, centractin alpha (yeast) (Actr1a), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273554811:273573479:-1 gene:ENSRNOG00000019725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XR_351086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ARP1 actin-related protein 1 homolog A, centractin alpha (yeast) (Actr1a), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// XR_351088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ARP1 actin-related protein 1 homolog A, centractin alpha (yeast) (Actr1a), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT007801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273556383:273591010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// NONRATT007803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_022700 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 3 (Arl3), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 3 (Arl3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273718181:273753577:-1 gene:ENSRNOG00000019973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC084722 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:105425 IMAGE:7310623), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U12568 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like protein 3 (rard3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// X76921 // GenBank // R.norvegicus ARF-like mRNA 3. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NONRATT007805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273702133:273754630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_012753 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 17, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp17a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273852190:273858192:-1 gene:ENSRNOG00000020035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC078898 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 17, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:93633 IMAGE:7111017), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M22204 // GenBank // Rat P-450-17-alpha protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M31681 // GenBank // Rat 17-alpha hydroxylase (CYP17) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273845319:273858152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT007811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
XM_006223765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic II (LOC100363253), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic II (LOC100363253), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic II (LOC100363253), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic II (LOC100363253), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274089443:274123321:-1 gene:ENSRNOG00000020179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274089443:274105043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT007817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// NONRATT007818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// NONRATT007819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001013154 // RefSeq // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 6 (Pcgf6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274241831:274261387:-1 gene:ENSRNOG00000020250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC083820 // GenBank // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 6, mRNA (cDNA clone MGC:94892 IMAGE:7111130), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274237472:274261267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT007824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_133544 // RefSeq // Rattus norvegicus up-regulated during skeletal muscle growth 5 homolog (mouse) (Usmg5), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274290376:274297223:-1 gene:ENSRNOG00000020296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064931 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:43262511:43262819:-1 gene:ENSRNOG00000042869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072203 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70214461:70214766:1 gene:ENSRNOG00000046781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// FQ217509 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA24YL02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027754 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:88985767:88985943:-1 gene:ENSRNOG00000020473 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008306 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium homeostasis modulator 2 (Calhm2), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274338780:274344504:-1 gene:ENSRNOG00000020325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC086540 // GenBank // Rattus norvegicus calcium homeostasis modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:105861 IMAGE:7122173), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274339270:274342214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT007830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001109168 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium homeostasis modulator 1 (Calhm1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274346723:274349442:-1 gene:ENSRNOG00000030682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274346723:274349442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191956 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium homeostasis modulator 3 (Calhm3), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006231556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium homeostasis modulator 3 (Calhm3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000036202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274359710:274364661:-1 gene:ENSRNOG00000026086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274359710:274383331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000036121 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:274413419:274416113:-1 gene:ENSRNOG00000026031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274397874:274440948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONRATT007833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:88367333:88551722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001107606 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 and PX domains 2A (Sh3pxd2a), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274477469:274636784:-1 gene:ENSRNOG00000020353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274477539:274523828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001011943 // RefSeq // Rattus norvegicus oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 1 (Obfc1), mRNA. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// XM_006231473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 1 (Obfc1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006231475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 1 (Obfc1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274714591:274748404:-1 gene:ENSRNOG00000020376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC079096 // GenBank // Rattus norvegicus oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94071 IMAGE:7124109), complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT007840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT007841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT007842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000052968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274714696:274779445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT007843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// NONRATT007847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// NONRATT007848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// NONRATT007849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001106366 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XVII, alpha 1 (Col17a1), mRNA. // chr1 // 98 // 90 // 51 // 52 // 0 /// XM_006231476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XVII, alpha 1 (Col17a1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 98 // 93 // 53 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000016645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274850656:274896696:-1 gene:ENSRNOG00000012110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 90 // 51 // 52 // 0 /// GENSCAN00000052972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274849461:274916033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 79 // 45 // 46 // 0 /// NONRATT007850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0
XM_006231588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274944315:275031132:-1 gene:ENSRNOG00000036585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC092207 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 10 open reading frame 79, mRNA (cDNA clone IMAGE:7313272), partial cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274944498:275031159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
XM_006231588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274944315:275031132:-1 gene:ENSRNOG00000036585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274944498:275031159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006231588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274944315:275031132:-1 gene:ENSRNOG00000036585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274944498:275031159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006231588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 96 (Wdr96), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000031925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274944315:275031132:-1 gene:ENSRNOG00000036585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000052964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274944498:275031159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0
ENSRNOT00000075143 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:275083366:275085039:-1 gene:ENSRNOG00000049808 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075570 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:278682489:278684162:-1 gene:ENSRNOG00000046036 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:278682489:278721464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:275083366:275112159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191563 // RefSeq // Rattus norvegicus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 1 (Sorcs1), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231519 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 1 (Sorcs1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 1 (Sorcs1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015979 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:277412523:277912038:-1 gene:ENSRNOG00000011313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:277424882:277540963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
XM_001066157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RCC1 domain containing 1 (Rccd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1_AABR06109386_random // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// XM_006229455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RCC1 domain containing 1 (Rccd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1_AABR06109386_random // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// XM_218819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RCC1 domain containing 1 (Rccd1), transcript variant X4, mRNA. // chr1_AABR06109386_random // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000029471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143061512:143066894:-1 gene:ENSRNOG00000042059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1_AABR06109386_random // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000038101 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109386.1:440:1176:-1 gene:ENSRNOG00000025884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1_AABR06109386_random // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_131913 // RefSeq // Rattus norvegicus X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 1, soluble (Xpnpep1), mRNA. // chr1 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000033148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281121567:281171495:-1 gene:ENSRNOG00000012084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF038591 // GenBank // Rattus norvegicus cytoplasmic aminopeptidase P (APP) mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// BC061758 // GenBank // Rattus norvegicus X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 1, soluble, mRNA (cDNA clone MGC:72323 IMAGE:5600093), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000052938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281121972:281159381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT007861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT007862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT007860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT007865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT007866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1
NM_013160 // RefSeq // Rattus norvegicus MAX interactor 1 (Mxi1), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0 /// XM_006231606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAX interactor 1 (Mxi1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000042822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281463334:281503728:1 gene:ENSRNOG00000034078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0 /// AF003008 // GenBank // Rattus norvegicus Mxi1 protein (rMxi1) mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 80 // 33 // 41 // 0 /// AY495712 // GenBank // Rattus norvegicus Max interacting protein 1 short isoform (Mxi1) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr1 // 90 // 20 // 9 // 10 // 0 /// BC081824 // GenBank // Rattus norvegicus MAX interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:93544 IMAGE:7133853), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0 /// U44728 // GenBank // Rattus norvegicus Mxi1 protein (MXI1) mRNA, partial cds. // chr1 // 78 // 45 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281444372:281502185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT003775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT003778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 69 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT003776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 34 // 51 // 1 /// NONRATT003777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 34 // 51 // 1 /// NONRATT003773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 19 // 51 // 1
NONRATT003773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164103 // RefSeq // Rattus norvegicus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_031552 // RefSeq // Rattus norvegicus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adducin 3 (gamma) (Add3), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281267469:281375203:1 gene:ENSRNOG00000012820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281267469:281375203:1 gene:ENSRNOG00000012820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U35775 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-adducin mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// FQ234561 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YI02 mRNA sequence. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000052947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281228360:281392729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT003771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NONRATT007874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BBSome-interacting protein 1-like (LOC100910342), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BBSome-interacting protein 1-like (LOC100910342), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BBSome-interacting protein 1-like (LOC100910342), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BBSome-interacting protein 1-like (LOC100910342), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074341 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:282062619:282076548:-1 gene:ENSRNOG00000047019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ215762 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YM03 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:282063006:282063891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017274 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate acyltransferase, mitochondrial (Gpam), mRNA. // chr1 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000047903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:283249329:283278757:-1 gene:ENSRNOG00000015124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF021348 // GenBank // Rattus norvegicus sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase (GPAT) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// U36771 // GenBank // Rattus norvegicus sn-glycerol 3-phosphate acyltransferase mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 85 // 93 // 33 // 39 // 0 /// GENSCAN00000016283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:283249427:283278757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT007897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT007898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_139042 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase 2G (Gucy2g), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000021746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:283584438:283625770:-1 gene:ENSRNOG00000015724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// AF024622 // GenBank // Rattus norvegicus guanylyl cyclase-G (GC-G) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 88 // 38 // 42 // 0 /// U33847 // GenBank // Rattus norvegicus ksGC mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 46 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:283607107:283653313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT007900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000016281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:283550551:283602446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 15 // 48 // 1
NM_001037652 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 6 (Zdhhc6), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000054681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:283686772:283703450:-1 gene:ENSRNOG00000036576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY886524 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC6 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC107928 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:125041 IMAGE:7130799), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:283689141:283703363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT007902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001107443 // RefSeq // Rattus norvegicus nebulin-related anchoring protein (Nrap), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NM_001113743 // RefSeq // Rattus norvegicus nebulin-related anchoring protein (Nrap), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000038017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284485970:284562973:-1 gene:ENSRNOG00000016714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000038038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284485970:284562973:-1 gene:ENSRNOG00000016714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000044168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284486117:284562821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT007905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT007906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001106201 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA cross-link repair 1A (Dclre1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284716585:284735397:-1 gene:ENSRNOG00000026204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284718754:284735268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003753427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC361773 (RGD1307158), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022886 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:284987105:285009140:-1 gene:ENSRNOG00000017018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284923453:285009113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT007913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT007916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
XM_006231656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin filament associated protein 1-like 2 (Afap1l2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000023113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:285111675:285148312:-1 gene:ENSRNOG00000017164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000073346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:285111675:285205944:-1 gene:ENSRNOG00000017164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// AB568258 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol 3-kinase-associated protein, partial cds. // chr1 // 97 // 85 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000044918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:285111649:285151712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT007919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
XM_003753430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin-binding LIM protein 1 (Ablim1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// ENSRNOT00000018693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:285260913:285379156:-1 gene:ENSRNOG00000013687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 39 // 29 // 30 // 0 /// BC105867 // GenBank // Rattus norvegicus actin-binding LIM protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7461996), complete cds. // chr1 // 86 // 86 // 65 // 76 // 1 /// ENSRNOT00000054679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:285233699:285247448:-1 gene:ENSRNOG00000046333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 41 // 76 // 1 /// GENSCAN00000044927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:285237651:285333399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 61 // 61 // 0 /// NONRATT007922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 92 // 70 // 76 // 1 /// NONRATT007921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 40 // 76 // 1
XM_002728900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681006 (LOC681006), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_003753432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681006 (LOC681006), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039453 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:287300845:287306351:-1 gene:ENSRNOG00000025953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287292874:287306348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001107445 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 12A (Hspa12a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000024548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287309702:287379109:-1 gene:ENSRNOG00000018019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000057595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287313299:287378403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT007930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001079705 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 4930506M07Rik protein (RGD1311558), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287509273:287581588:-1 gene:ENSRNOG00000018350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// EF055485 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley shootin1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// EF055488 // GenBank // Rattus norvegicus strain W shootin2 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287520426:287560403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT007934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT007935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT007932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_022636 // RefSeq // Rattus norvegicus ventral anterior homeobox 1 (Vax1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287695646:287699562:-1 gene:ENSRNOG00000008824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF113515 // GenBank // Rattus norvegicus ventral anterior homeobox 1 (Vax1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287695646:287699541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107446 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing 8 (Pdzd8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287818525:287876134:-1 gene:ENSRNOG00000009460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287822012:287875897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107447 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 2 (class I) (Rab11fip2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:288422015:288457832:-1 gene:ENSRNOG00000009523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC098050 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7457459. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:288422036:288457828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT007942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001107448 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 204, member A (Fam204a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231673 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 204, member A (Fam204a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:288701239:288730895:-1 gene:ENSRNOG00000009830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:288682004:288756651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT007945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT007946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_139193 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin releasing hormone receptor (Prlhr), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:289097316:289099003:-1 gene:ENSRNOG00000009922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289097645:289108194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT007947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014248 // RefSeq // Rattus norvegicus CDK2-associated, cullin domain 1 (Cacul1), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000050617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:289157890:289215140:-1 gene:ENSRNOG00000009954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC083839 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2700078E11Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:94968 IMAGE:7114271), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289166608:289198386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT007948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT007949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001047087 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit A (Eif3a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000066947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:289478273:289508516:-1 gene:ENSRNOG00000010117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AB259154 // GenBank // Rattus norvegicus ZH12 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// FQ221906 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA30YE07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000045755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289479250:289508384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT007950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NONRATT007950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 1
NM_001108527 // RefSeq // Rattus norvegicus sideroflexin 4 (Sfxn4), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sideroflexin 4 (Sfxn4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:289552169:289574442:-1 gene:ENSRNOG00000036572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ215895 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YC11 mRNA sequence. // chr1 // 81 // 96 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289551866:289590031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT007952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_022540 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxiredoxin 3 (Prdx3), mRNA. // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:289577331:289589744:-1 gene:ENSRNOG00000010958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF106944 // GenBank // Rattus norvegicus PRx III (PRx III) mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC060567 // GenBank // Rattus norvegicus peroxiredoxin 3, mRNA (cDNA clone MGC:72824 IMAGE:6922338), complete cds. // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// FQ212902 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YM03 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// FQ213677 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YG23 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// FQ219351 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YO11 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT007956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289551866:289590031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT007955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XR_351222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 658-like (LOC102550291), transcript variant X5, misc_RNA. // chrU // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XR_351225 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 658-like (LOC102550291), transcript variant X8, misc_RNA. // chrU // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006231688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 658-like (LOC102550291), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// XM_006231691 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 658-like (LOC102550291), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// XR_351226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 658-like (LOC102550291), transcript variant X9, misc_RNA. // chrU // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000047645 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:289833560:289833952:-1 gene:ENSRNOG00000042665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001013125 // RefSeq // Rattus norvegicus bifunctional apoptosis regulator (Bfar), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000004217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:361895:394572:1 gene:ENSRNOG00000003151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC087103 // GenBank // Rattus norvegicus bifunctional apoptosis regulator, mRNA (cDNA clone MGC:94697 IMAGE:7192877), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:377445:393336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
ENSRNOT00000004346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:2286740:2443752:1 gene:ENSRNOG00000003198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC089943 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2900011O08, mRNA (cDNA clone MGC:109261 IMAGE:7311457), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT007980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// GENSCAN00000047711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:2432653:2440738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001108261 // RefSeq // Rattus norvegicus FGFR1OP N-terminal like (Fopnl), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:11412943:11433757:1 gene:ENSRNOG00000003146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC158662 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610037P05, mRNA (cDNA clone MGC:187652 IMAGE:8369763), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// FQ228837 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YE10 mRNA sequence. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// NONRATT008105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
NM_001170600 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 11, smooth muscle (Myh11), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000044317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:11444267:11538406:1 gene:ENSRNOG00000000029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000007710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:11472075:11537918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT008109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 23 // 43 // 1 /// NONRATT008112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 20 // 43 // 1
NM_133421 // RefSeq // Rattus norvegicus meiosis arrest female 1 (Marf1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000003193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:28243:72905:1 gene:ENSRNOG00000002314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000020327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:11593640:11631507:1 gene:ENSRNOG00000050065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AB012133 // GenBank // Rattus norvegicus LKAP mRNA for Limkain b1, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:11595044:11683657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// GENSCAN00000036214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34228:70680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
XM_006220554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MKL/myocardin-like 2 (Mkl2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000003115 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:11892969:11899527:1 gene:ENSRNOG00000002286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
XM_006238781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTP synthase 1 (Ctps1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 77 // 100 // 27 // 35 // 0 /// NM_001134873 // RefSeq // Rattus norvegicus CTP synthase 1 (Ctps1), mRNA. // chr10 // 74 // 100 // 26 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000013899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143259189:143288320:-1 gene:ENSRNOG00000009963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 100 // 26 // 35 // 0 /// BC161954 // GenBank // Rattus norvegicus CTP synthase, mRNA (cDNA clone MGC:187755 IMAGE:9027103), complete cds. // chr10 // 74 // 100 // 26 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000072057 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:823988:825668:-1 gene:ENSRNOG00000046218 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT010355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143261980:143285287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 54 // 14 // 19 // 0 /// NONRATT045393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 74 // 100 // 26 // 35 // 0 /// GENSCAN00000006255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:768642:825668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
XM_003752286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mpv17 transgene, kidney disease mutant-like (predicted)-like (LOC100362572), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:2215802:2234250:1 gene:ENSRNOG00000003285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// XR_338405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mpv17 transgene, kidney disease mutant-like (predicted)-like (LOC100362572), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XR_357358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mpv17 transgene, kidney disease mutant-like (predicted)-like (LOC100362572), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT007975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001270415 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A)-specific ribonuclease (Parn), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// XM_006245692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(A)-specific ribonuclease (Parn), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000061644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:207050:358235:-1 gene:ENSRNOG00000002912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// HQ123458 // GenBank // Rattus norvegicus strain W poly(A)-specific ribonuclease (Parn) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT010349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// GENSCAN00000036210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:305337:362179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// NONRATT010350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1
ENSRNOT00000072296 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:808559:840635:1 gene:ENSRNOG00000050955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:840327:862379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000041674 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:963429:963782:1 gene:ENSRNOG00000030214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_006234663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase 3-like (LOC102550998), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:98797207:98798646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT035324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT035325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001013963 // RefSeq // Rattus norvegicus calcineurin-like phosphoesterase domain containing 1 (Cpped1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:2523592:2643424:1 gene:ENSRNOG00000015118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC081991 // GenBank // Rattus norvegicus similar to C530044N13Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:94195 IMAGE:7129542), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:2600844:2642349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT007981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001003978 // RefSeq // Rattus norvegicus G1 to S phase transition 1 (Gspt1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3277695:3312136:1 gene:ENSRNOG00000002335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3179171:3213292:1 gene:ENSRNOG00000046271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC079092 // GenBank // Rattus norvegicus G1 to S phase transition 1, mRNA (cDNA clone MGC:94063 IMAGE:7123818), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3179365:3213292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT007982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3277695:3465214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
ENSRNOT00000044593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3214338:3256101:1 gene:ENSRNOG00000032439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// NM_001008876 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal L1 domain containing 1 (Rsl1d1), mRNA. // chr10 // 83 // 83 // 40 // 48 // 1 /// ENSRNOT00000074890 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:3313219:3324552:1 gene:ENSRNOG00000048608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3241479:3256101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT007984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000007713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3277695:3465214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 30 // 48 // 1
NM_001108262 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 7 A (Zc3h7a), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// XM_006245715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 7 A (Zc3h7a), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XR_357361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 7 A (Zc3h7a), transcript variant X4, misc_RNA. // chr10 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000003309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3366355:3405540:1 gene:ENSRNOG00000002420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT007985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000007713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3277695:3465214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 51 // 51 // 23 // 45 // 1 /// NONRATT007987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1
NONRATT007985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001127532 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 11 (Txndc11), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000003332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3408243:3465319:1 gene:ENSRNOG00000002452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC166713 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:188414 IMAGE:7930724), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3277695:3465214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT007990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001105735 // RefSeq // Rattus norvegicus lipopolysaccharide-induced TNF factor (Litaf), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000003412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3548079:3589969:1 gene:ENSRNOG00000002520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166851 // GenBank // Rattus norvegicus lipopolysaccharide-induced TNF factor, mRNA (cDNA clone MGC:188754 IMAGE:9091522), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U53184 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen-responsive uterine mRNA, partial sequence. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT007994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3559356:3588505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001002850 // RefSeq // Rattus norvegicus protamine 1 (Prm1), mRNA. // chr10 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3772397:3772883:1 gene:ENSRNOG00000002532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC126070 // GenBank // Rattus norvegicus protamine 1, mRNA (cDNA clone MGC:156539 IMAGE:7134211), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT007997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000030612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3763028:3772764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1
NM_012873 // RefSeq // Rattus norvegicus protamine 2 (Prm2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3776970:3777406:1 gene:ENSRNOG00000002539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3776970:3778477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT007998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001002855 // RefSeq // Rattus norvegicus protamine 3 (Prm3), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3778043:3778557:1 gene:ENSRNOG00000002564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3776970:3778477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_017057 // RefSeq // Rattus norvegicus transition protein 2 (Tnp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3780384:3781110:1 gene:ENSRNOG00000002566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078849 // GenBank // Rattus norvegicus transition protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93497 IMAGE:7131008), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U52958 // GenBank // Rattus norvegicus transition protein 2 (TP2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// X14776 // GenBank // Rat mRNA for transition protein 2 (TP2). // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT008000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3780438:3783574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_145879 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 1 (Socs1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3782936:3783574:1 gene:ENSRNOG00000002568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3780438:3783574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109026 // RefSeq // Rattus norvegicus dexamethasone-induced transcript (Dexi), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553347 (LOC102553347), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000003544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4022544:4035231:1 gene:ENSRNOG00000002635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108263 // RefSeq // Rattus norvegicus trans-golgi network vesicle protein 23 homolog A (S. cerevisiae) (Tvp23a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trans-golgi network vesicle protein 23 homolog A (S. cerevisiae) (Tvp23a), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245726 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trans-golgi network vesicle protein 23 homolog A (S. cerevisiae) (Tvp23a), transcript variant X10, mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000029359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4123748:4158380:1 gene:ENSRNOG00000025545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// FQ211935 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YA22 mRNA sequence. // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:4085670:4155412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT008006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014224 // RefSeq // Rattus norvegicus tektin 5 (Tekt5), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4175003:4211706:1 gene:ENSRNOG00000002571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB294402 // GenBank // Rattus norvegicus Tek5 mRNA for Tektin5, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079040 // GenBank // Rattus norvegicus tektin 5, mRNA (cDNA clone MGC:93973 IMAGE:7114771), complete cds. // chrU // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:4175075:4241271:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001007721 // RefSeq // Rattus norvegicus epithelial membrane protein 2 (Emp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4254720:4288862:1 gene:ENSRNOG00000002664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081865 // GenBank // Rattus norvegicus epithelial membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93695 IMAGE:7096470), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:4276729:4286413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_012573 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 2A (Grin2a), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 2A (Grin2a), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4527220:4936773:1 gene:ENSRNOG00000033942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// M91561 // GenBank // Rattus norvegicus NMDA receptor subtype 2A mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// AF001423 // GenBank // Rattus norvegicus N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR2A subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT008011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:4752229:4870246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENSRNOT00000044585 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:5458409:5458992:1 gene:ENSRNOG00000032663 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0
NM_001024790 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 7 (herpes virus-associated) (Usp7), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006245758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 7 (herpes virus-associated) (Usp7), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 7 (herpes virus-associated) (Usp7), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:5776625:5821051:1 gene:ENSRNOG00000025496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AY641530 // GenBank // Rattus norvegicus HAUSP (Hausp) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:5737334:5853920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT008016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT008015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT008017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT008018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_152790 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium regulated heat stable protein 1 (Carhsp1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006245751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium regulated heat stable protein 1 (Carhsp1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000003514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:5842867:5856458:1 gene:ENSRNOG00000002610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC071173 // GenBank // Rattus norvegicus calcium regulated heat stable protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:91454 IMAGE:7099252), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT008020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:5737334:5853920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT008021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001025756 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 186 (Tmem186), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:5878822:5882132:1 gene:ENSRNOG00000027087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC098933 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 186, mRNA (cDNA clone MGC:114379 IMAGE:7386881), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:5878165:5880897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT008024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_001134638 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 114 (Tmem114), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:6082816:6098029:1 gene:ENSRNOG00000002768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:6083355:6097788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000011521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:6848963:6850244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT008028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
AF435963 // GenBank // Rattus norvegicus ligand-independent activating molecule for estrogen receptor mRNA, partial cds. // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
NM_001108984 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 25 (Rbm25), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_003750770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 25-like 1 (Rbm25l1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000003832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9231938:9233329:1 gene:ENSRNOG00000002871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000042940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9231938:9234391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000051435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118378579:118413587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 53 // 8 // 9 // 0
NM_001106975 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 86, member A (Fam86a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006245785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 86, member A (Fam86a), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 86, member A (Fam86a), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9300229:9310292:1 gene:ENSRNOG00000002876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9240332:9309649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT008029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT008030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_001105762 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to MGC45438 protein (RGD1565166), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to MGC45438 protein (RGD1565166), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000032495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9325201:9334297:1 gene:ENSRNOG00000021796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9325237:9333932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001108265 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase (Nagpa), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9342962:9351287:1 gene:ENSRNOG00000002895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC168968 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase, mRNA (cDNA clone MGC:189290 IMAGE:7323102), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9342993:9350732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT008035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT008037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT008038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001106976 // RefSeq // Rattus norvegicus periplakin (Ppl), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000004026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9411587:9457238:1 gene:ENSRNOG00000002930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000042903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9411664:9456299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT008039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001007800 // RefSeq // Rattus norvegicus glyoxylate reductase 1 homolog (Arabidopsis) (Glyr1), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9492832:9528292:1 gene:ENSRNOG00000003065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC085931 // GenBank // Rattus norvegicus cytokine-like nuclear factor n-pac, mRNA (cDNA clone MGC:94905 IMAGE:7111787), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000042349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9492002:9526484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001024864 // RefSeq // Rattus norvegicus rogdi homolog (Drosophila) (Rogdi), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000004176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9528490:9533108:1 gene:ENSRNOG00000003125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC083789 // GenBank // Rattus norvegicus leucine zipper domain protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7106105). // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC098001 // GenBank // Rattus norvegicus rogdi homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:116147 IMAGE:7453517), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// FQ213298 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YK06 mRNA sequence. // chr10 // 76 // 85 // 22 // 29 // 0 /// NONRATT008043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000042356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9528680:9551056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// NONRATT008046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT008044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT008045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001100865 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 12 (Sept12), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006245825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 12 (Sept12), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9541630:9551203:1 gene:ENSRNOG00000003137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9528680:9551056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001009676 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 (Anks3), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 (Anks3), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3 (Anks3), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9575751:9596420:1 gene:ENSRNOG00000003186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC087062 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:94228 IMAGE:7131099), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000042366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9578866:9595940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT008051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT008052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT008053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
GENSCAN00000042357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9652710:9653493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT008055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000004434 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:9652576:9653493:1 gene:ENSRNOG00000003324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 70 // 9 // 16 // 0
NM_001007668 // RefSeq // Rattus norvegicus UBA-like domain containing 1 (Ubald1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10100924:10105720:1 gene:ENSRNOG00000027368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9656418:9660397:1 gene:ENSRNOG00000046295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC079459 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 100, member A, mRNA (cDNA clone MGC:95014 IMAGE:7121902), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214502 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YF07 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9656418:9666050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000052140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10101014:10110646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001008360 // RefSeq // Rattus norvegicus cell death-inducing p53 target 1 (Cdip1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell death-inducing p53 target 1 (Cdip1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell death-inducing p53 target 1 (Cdip1), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000004999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9734342:9756549:1 gene:ENSRNOG00000003328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085860 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 16 open reading frame 5, mRNA (cDNA clone MGC:94589 IMAGE:7190340), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9753215:9754858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT008058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// NONRATT008057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001191588 // RefSeq // Rattus norvegicus NmrA-like family domain containing 1 (Nmral1), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000005109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9811579:9820512:1 gene:ENSRNOG00000003794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9811579:9820414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001191639 // RefSeq // Rattus norvegicus coronin 7 (Coro7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9866591:9909647:1 gene:ENSRNOG00000004146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000042365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9897268:9919224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT008067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001100136 // RefSeq // Rattus norvegicus presequence translocase-associated motor 16 homolog (S. cerevisiae) (Pam16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000006314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9911717:9919294:1 gene:ENSRNOG00000004608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ220566 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YG17 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9897268:9919224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT008071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT008072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT008073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001108267 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor AP-4 (Tfap4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-4 (Tfap4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-4 (Tfap4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-4 (Tfap4), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-4 (Tfap4), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-4 (Tfap4), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-4 (Tfap4), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9969937:9986048:1 gene:ENSRNOG00000005227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9977967:9985131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000048687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10002599:10045904:1 gene:ENSRNOG00000005269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10002599:10045904:1 gene:ENSRNOG00000005269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// FQ217932 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA13YJ19 mRNA sequence. // chr10 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10002599:10043595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
GENSCAN00000052137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10220080:10272299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT008084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_133381 // RefSeq // Rattus norvegicus CREB binding protein (Crebbp), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000007079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10350046:10473909:1 gene:ENSRNOG00000005330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AY462245 // GenBank // Rattus norvegicus CREB-binding protein (Crebbp) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10280664:10472005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT008086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_133381 // RefSeq // Rattus norvegicus CREB binding protein (Crebbp), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039001 // RefSeq // Rattus norvegicus TNF receptor-associated protein 1 (Trap1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10478499:10512148:1 gene:ENSRNOG00000005418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC083909 // GenBank // Rattus norvegicus TNF receptor-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95278 IMAGE:7134204), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10478517:10512052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT008088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006220566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLX4 structure-specific endonuclease subunit (Slx4), partial mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLX4 structure-specific endonuclease subunit (Slx4), partial mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000033919 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:10544331:10562666:1 gene:ENSRNOG00000024445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10542250:10562666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT008090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
XM_006220565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, CARD domain containing 3 (Nlrc3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006245834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, CARD domain containing 3 (Nlrc3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000036189 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:10565862:10597397:1 gene:ENSRNOG00000024210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000001456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10576250:10597397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_153732 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 597 (Zfp597), mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10668906:10674261:1 gene:ENSRNOG00000007576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// AF277900 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein HIT-4 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC078709 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 597, mRNA (cDNA clone MGC:93126 IMAGE:7113822), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_031634 // RefSeq // Rattus norvegicus Mediterranean fever (Mefv), mRNA. // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10804440:10813961:1 gene:ENSRNOG00000008134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AF143410 // GenBank // Rattus norvegicus pyrin (Mefv) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT008099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000001469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10804475:10858813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_214822 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1358 (Olr1358), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000060987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10857872:10858813:1 gene:ENSRNOG00000048133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000001469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10804475:10858813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT008100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_173333 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1361 (Olr1361), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000071686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12146832:12147773:1 gene:ENSRNOG00000049716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000073280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12150219:12151160:1 gene:ENSRNOG00000046341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// M64377 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000058004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12150219:12151160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000058008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12146832:12147773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0
NM_214830 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1373 (Olr1373), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000060989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12426322:12427263:1 gene:ENSRNOG00000039760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000058011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12426322:12427263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT008122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001106981 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 10 (Zscan10), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006245870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 10 (Zscan10), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12750768:12760732:1 gene:ENSRNOG00000021782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12755850:12760549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT008124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106982 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 64B (Ccdc64b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12803741:12812178:1 gene:ENSRNOG00000003457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161878 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 64B, mRNA (cDNA clone MGC:187441 IMAGE:7123846), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12805044:12811823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT008126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001100492 // RefSeq // Rattus norvegicus host cell factor C1 regulator 1 (XPO1-dependent) (Hcfc1r1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001185047 // RefSeq // Rattus norvegicus host cell factor C1 regulator 1 (XPO1-dependent) (Hcfc1r1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus host cell factor C1 regulator 1 (XPO1-dependent) (Hcfc1r1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000004702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12817362:12818424:1 gene:ENSRNOG00000003542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// FQ217778 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA17YP02 mRNA sequence. // chr10 // 75 // 92 // 18 // 24 // 0 /// NONRATT008127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT008131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT008129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT008132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001102364 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 6 (Cldn6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claudin 6 (Cldn6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12823135:12825907:1 gene:ENSRNOG00000003648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168250 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 6, mRNA (cDNA clone MGC:188391 IMAGE:5598970), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12824491:12825150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105766 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, membrane associated tyrosine/threonine 1 (Pkmyt1), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, membrane associated tyrosine/threonine 1 (Pkmyt1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12880557:12891739:1 gene:ENSRNOG00000003657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC169008 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, membrane associated tyrosine/threonine 1, mRNA (cDNA clone MGC:189370 IMAGE:7387434), complete cds. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12887479:12891601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001277154 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine repetitive matrix 2 (Srrm2), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000006370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12965077:12982440:1 gene:ENSRNOG00000004478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// FQ234799 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YK02 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// FQ217119 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YP02 mRNA sequence. // chr10 // 69 // 35 // 9 // 13 // 0 /// GENSCAN00000019213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12966182:12971929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT008141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1 /// BC094956 // GenBank HTC // Rattus norvegicus serine/arginine repetitive matrix 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7368168), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr10 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001106983 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 32 (Prss32), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000030078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13016685:13021240:1 gene:ENSRNOG00000029223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13016685:13021357:1 gene:ENSRNOG00000029223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13016931:13053125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT008150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_013024 // RefSeq // Rattus norvegicus spermine binding protein (Sbp), mRNA. // chrU // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// J02675 // GenBank // Rat prostatic spermine-binding protein (SBP) mRNA, complete cds. // chrU // 94 // 83 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000065914 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:13122304:13125182:1 gene:ENSRNOG00000016026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 41 // 71 // 12 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000068532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13122304:13125182:1 gene:ENSRNOG00000016026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 41 // 71 // 12 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000072912 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:13136253:13136681:-1 gene:ENSRNOG00000046066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 89 // 22 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13122304:13155668:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// NONRATT008152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// NONRATT010520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 37 // 37 // 15 // 41 // 1
NM_182949 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine 27 (Prss27), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13226705:13234066:1 gene:ENSRNOG00000005336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000070981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13226705:13234066:1 gene:ENSRNOG00000005336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB101677 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for marapsin, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13226769:13233963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006220590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3 (Abca3), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006246039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 3 (Abca3), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13543818:13596695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_001011890 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonucleic acid binding protein S1 (Rnps1), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006245933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonucleic acid binding protein S1 (Rnps1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000010915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13603389:13613703:1 gene:ENSRNOG00000008703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC079014 // GenBank // Rattus norvegicus ribonucleic acid binding protein S1, mRNA (cDNA clone MGC:93935 IMAGE:7113485), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13602999:13613078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT008159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT008161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT008162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT008163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_017306 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl-CoA delta isomerase 1 (Eci1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13614548:13627899:1 gene:ENSRNOG00000008843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078705 // GenBank // Rattus norvegicus dodecenoyl-Coenzyme A delta isomerase (3,2 trans-enoyl-Coenzyme A isomerase), mRNA (cDNA clone MGC:93116 IMAGE:7129389), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M61112 // GenBank // Rat delta-3,delta-2-enoyl-CoA isomerase mRNA, complete cds. // chr10 // 64 // 100 // 18 // 28 // 0 /// D00729 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for delta3, delta2-enoyl-CoA isomerase, complete cds. // chr10 // 45 // 71 // 9 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13614564:13627812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001169152 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglycolate phosphatase (Pgp), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13653091:13655717:1 gene:ENSRNOG00000009536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000033965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13649231:13658004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENSRNOT00000012794 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:13656942:13658004:1 gene:ENSRNOG00000009611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT008170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000033965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13649231:13658004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_080690 // RefSeq // Rattus norvegicus CASK interacting protein 1 (Caskin1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13671324:13691236:1 gene:ENSRNOG00000003195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13671347:13691239:1 gene:ENSRNOG00000003195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF451975 // GenBank // Rattus norvegicus cask-interacting protein 1 (Caskin1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13677979:13689792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001257352 // RefSeq // Rattus norvegicus polycystic kidney disease 1 homolog (human) (Pkd1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000015092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13732199:13779017:1 gene:ENSRNOG00000010771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000033947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13732199:13778059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0
NM_001105728 // RefSeq // Rattus norvegicus nth (endonuclease III)-like 1 (E.coli) (Nthl1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13813645:13819807:1 gene:ENSRNOG00000012213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13814691:13819692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT008186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT008187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001105770 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 598 (Zfp598), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13852129:13864076:1 gene:ENSRNOG00000012434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13852141:13863522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001106986 // RefSeq // Rattus norvegicus NADPH oxidase organizer 1 (Noxo1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADPH oxidase organizer 1 (Noxo1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADPH oxidase organizer 1 (Noxo1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13879313:13883141:1 gene:ENSRNOG00000025117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13880869:13883027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001191589 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L3-like (Rpl3l), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13910497:13921040:1 gene:ENSRNOG00000014641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ224678 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA58YH18 mRNA sequence. // chr10 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13910399:13924693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001044285 // RefSeq // Rattus norvegicus methionine sulfoxide reductase B1 (Msrb1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC094309 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein X, 1, mRNA (cDNA clone MGC:105753 IMAGE:7316479), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ220312 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YF22 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT008205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13910399:13924693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001109450 // RefSeq // Rattus norvegicus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 6 (Hs3st6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13938606:13944711:1 gene:ENSRNOG00000014672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13938649:13944604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000036334 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:13987487:13988268:1 gene:ENSRNOG00000025024 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13987478:14028069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
BC098928 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7132828. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001115033 // RefSeq // Rattus norvegicus meiosis specific with OB domains (Meiob), mRNA. // chr10 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// XM_006246032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus meiosis specific with OB domains (Meiob), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// XM_006246033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus meiosis specific with OB domains (Meiob), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000060551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13990748:14022040:1 gene:ENSRNOG00000014711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// BC158604 // GenBank // Rattus norvegicus similar to holdem CG15329-PA, mRNA (cDNA clone MGC:187464 IMAGE:7134815), complete cds. // chr10 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT008208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13987478:14028069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT008209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_033349 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxyacyl glutathione hydrolase (Hagh), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006245899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxyacyl glutathione hydrolase (Hagh), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000020192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14032159:14046519:1 gene:ENSRNOG00000014743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ229806 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YJ24 mRNA sequence. // chr10 // 89 // 100 // 34 // 38 // 0 /// GENSCAN00000005218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14032262:14059352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT008210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT008211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// NONRATT008212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_053329 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein, acid labile subunit (Igfals), mRNA. // chr10 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14057544:14059352:1 gene:ENSRNOG00000015061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000005218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14032262:14059352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT008213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106988 // RefSeq // Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 3 (Spsb3), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14064726:14069831:1 gene:ENSRNOG00000015300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ224866 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YM03 mRNA sequence. // chr10 // 81 // 78 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14065053:14069381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT008214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT008215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT008219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001105771 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S34 (Mrps34), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14073017:14074148:1 gene:ENSRNOG00000015479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ230451 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YA21 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14073064:14075218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_053507 // RefSeq // Rattus norvegicus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3 (Nme3), mRNA. // chr10 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14074396:14075352:1 gene:ENSRNOG00000015749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY017337 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoside diphosphate kinase DR-nm23 mRNA, complete cds. // chr10 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14073064:14075218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT008222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
XM_006246054 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 140 (Ift140), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14192092:14276393:1 gene:ENSRNOG00000016545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14214809:14231022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000005208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14264702:14276393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0
XM_001059245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pentraxin 4, long (Ptx4), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_220237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pentraxin 4, long (Ptx4), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022697 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:14296824:14301348:1 gene:ENSRNOG00000016918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14296824:14343712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_031568 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel, voltage-sensitive 7 (Clcn7), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14308276:14332371:1 gene:ENSRNOG00000016976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// Z67744 // GenBank // R.norvegicus mRNA for CLC-7 chloride channel protein. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14296824:14343712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT008231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_006220606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 154 (Ccdc154), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006246056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 154 (Ccdc154), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000046884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14334641:14343754:1 gene:ENSRNOG00000030541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14296824:14343712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001109028 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1565784 (RGD1565784), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14358284:14359586:1 gene:ENSRNOG00000029415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ220296 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YG21 mRNA sequence. // chr10 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14358324:14358813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT008234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000023642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14362585:14410684:1 gene:ENSRNOG00000017598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14387710:14410684:1 gene:ENSRNOG00000017598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// XM_006220608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus unkempt family zinc finger-like (Unkl), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// XM_006246059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus unkempt family zinc finger-like (Unkl), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14362585:14408160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ211597 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YF16 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0
NM_001108268 // RefSeq // Rattus norvegicus TSR3, 20S rRNA accumulation (Tsr3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14415604:14418166:1 gene:ENSRNOG00000017858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC167035 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:189287 IMAGE:7371642. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14415673:14417865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001105772 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 34 (Prss34), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14474511:14476268:1 gene:ENSRNOG00000018466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14463365:14476109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_003750795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease 28-like (LOC685321), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease 28-like (LOC685321), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14482652:14508825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_001059716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 29 (Prss29), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_220240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 29 (Prss29), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060387 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:14497870:14499706:1 gene:ENSRNOG00000039405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14482652:14508825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
XM_001059769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to implantation serine proteinase 2 (RGD1559662), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_577076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to implantation serine proteinase 2 (RGD1559662), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000036630 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:14506837:14508825:1 gene:ENSRNOG00000028926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14482652:14508825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_019180 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptase beta 2 (Tpsb2), mRNA. // chr10 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14539009:14540808:1 gene:ENSRNOG00000018611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// D38455 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mast cell tryptase precursor, complete cds. // chr10 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// U67909 // GenBank // Rattus norvegicus mast cell protease 6 precursor (RMCP-6) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14539255:14540562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_175593 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptase gamma 1 (Tpsg1), mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14543704:14547610:1 gene:ENSRNOG00000018701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AY196208 // GenBank // Rattus norvegicus tryptase gamma 1 (Tpsg1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14543704:14547433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013965 // RefSeq // Rattus norvegicus tektin 4 (Tekt4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14644898:14650074:1 gene:ENSRNOG00000018792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB194013 // GenBank // Rattus norvegicus Tek4 mRNA for Tektin4, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC079304 // GenBank // Rattus norvegicus tektin 4, mRNA (cDNA clone MGC:94442 IMAGE:7134598), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14645013:14650018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_001060521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipase maturation factor 1 (Lmf1), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_340769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipase maturation factor 1 (Lmf1), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14758811:14844833:1 gene:ENSRNOG00000000230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14815088:14844833:1 gene:ENSRNOG00000000230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14828109:14844358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000021189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14754802:14818546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT008245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001135918 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13 (Gng13), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 13 (Gng13), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14901656:14903560:1 gene:ENSRNOG00000039350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14852556:14903485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001105774 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA pseudouridylate synthase domain containing 1 (Rpusd1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14911834:14915688:1 gene:ENSRNOG00000023639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC161966 // GenBank // Rattus norvegicus RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187772 IMAGE:9028415), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14912379:14931904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT008247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT008250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT008251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_006220609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mesothelin-like (Mslnl), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mesothelin-like (Mslnl), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060286 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:14920793:14931904:1 gene:ENSRNOG00000039339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14912379:14931904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001013183 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear prelamin A recognition factor-like (Narfl), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14956675:14965648:1 gene:ENSRNOG00000019522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC091240 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear prelamin A recognition factor-like, mRNA (cDNA clone MGC:109005 IMAGE:7325087), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14961860:14965095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT008255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14956675:14959798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT008254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT008256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
XM_006220612 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 78 (Ccdc78), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 78 (Ccdc78), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14969085:14972980:1 gene:ENSRNOG00000022331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC168182 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7097510, partial cds. // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14969592:14972675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT008260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001009504 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 16 (Fbxl16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14996746:14999921:1 gene:ENSRNOG00000022248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY823669 // GenBank // Rattus norvegicus spinal cord injury and regeneration related protein 1 (Scirr1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14996746:14999921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191084 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 24 (Wdr24), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15004021:15008803:1 gene:ENSRNOG00000019713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC098800 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 24, mRNA (cDNA clone IMAGE:7376043), complete cds. // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15004242:15010381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001014116 // RefSeq // Rattus norvegicus jumonji domain containing 8 (Jmjd8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15008912:15011811:1 gene:ENSRNOG00000019729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079205 // GenBank // Rattus norvegicus jumonji domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:94267 IMAGE:7131778), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT008269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT008270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT008272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT008273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15004242:15010381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT008265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT008271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSRNOT00000037372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15054533:15065356:1 gene:ENSRNOG00000021615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// BC100622 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG18661-PA, mRNA (cDNA clone MGC:124879 IMAGE:5598832), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// XM_006245966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG18661-PA (RGD1307155), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// XM_006245967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG18661-PA (RGD1307155), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// ENSRNOT00000037381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15054533:15055850:1 gene:ENSRNOG00000021615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// GENSCAN00000049694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15054537:15055558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT008275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
ENSRNOT00000065937 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15134507:15136064:1 gene:ENSRNOG00000042216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 96 // 17 // 26 // 0
ENSRNOT00000027500 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:15200896:15201640:1 gene:ENSRNOG00000020303 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15197752:15206786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001106991 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 8A (Tmem8a), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245973 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 8A (Tmem8a), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 8A (Tmem8a), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15299605:15309077:1 gene:ENSRNOG00000020374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15309344:15312226:1 gene:ENSRNOG00000042720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// FQ219872 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YA19 mRNA sequence. // chr10 // 80 // 28 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT008278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15299738:15308074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT008280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_024405 // RefSeq // Rattus norvegicus axin 1 (Axin1), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15324330:15376252:1 gene:ENSRNOG00000020414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF017756 // GenBank // Rattus norvegicus GSK-3beta interacting protein rAxin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15328146:15375517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_019338 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 11 (Rgs11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15383438:15391694:1 gene:ENSRNOG00000020459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15383448:15390952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001024269 // RefSeq // Rattus norvegicus LUC7-like (S. cerevisiae) (Luc7l), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15435862:15462627:1 gene:ENSRNOG00000020488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC089960 // GenBank // Rattus norvegicus LUC7-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109310 IMAGE:7313914), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LUC7-like (S. cerevisiae) (Luc7l), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15434105:15457068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT008291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001030034 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid 5 homolog 1 (Drosophila) (Rhbdf1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006245977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid 5 homolog 1 (Drosophila) (Rhbdf1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15567525:15580427:1 gene:ENSRNOG00000020594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099777 // GenBank // Rattus norvegicus rhomboid 5 homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:124815 IMAGE:7933232), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15573642:15580201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_017021 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 9 receptor (Il9r), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 9 receptor (Il9r), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15592370:15602654:1 gene:ENSRNOG00000020630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// L36459 // GenBank // Rattus norvegicus gfi-2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15592396:15601552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT008308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013854 // RefSeq // Rattus norvegicus biorientation of chromosomes in cell division 1 (Bod1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_073160 // RefSeq // Rattus norvegicus biorientation of chromosomes in cell division 1 (Bod1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:16152118:16158451:1 gene:ENSRNOG00000020717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079025 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 44, member B, mRNA (cDNA clone MGC:93951 IMAGE:7113945), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16152365:16156894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT008310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000028121 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:16198283:16199152:1 gene:ENSRNOG00000020724 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
NM_022230 // RefSeq // Rattus norvegicus stanniocalcin 2 (Stc2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:16432189:16441955:1 gene:ENSRNOG00000020729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB030707 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for stanniocalcin-2, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16432201:16448970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053651 // RefSeq // Rattus norvegicus NK2 homeobox 5 (Nkx2-5), mRNA. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:16524991:16527475:1 gene:ENSRNOG00000020747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// AF006664 // GenBank // Rattus norvegicus tinman homolog (rNKx-2.5) mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16460612:16527475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT008314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053769 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 1 (Dusp1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:16867370:16870162:1 gene:ENSRNOG00000003977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U02553 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// X84004 // GenBank // R.norvegicus mRNA for dual specificity phosphate. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16867521:16869481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006220626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 and PX domains 2B (Sh3pxd2b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:17157195:17187475:1 gene:ENSRNOG00000004063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000073675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:17104828:17168228:1 gene:ENSRNOG00000004063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:17104782:17187475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006220990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin domain containing 2 (Ubtd2), mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// XM_006246115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin domain containing 2 (Ubtd2), mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000005486 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:17267426:17282835:1 gene:ENSRNOG00000004137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000022772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:17235465:17282835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT008326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
NM_019206 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 10 (Stk10), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000047011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:17316681:17409678:1 gene:ENSRNOG00000004217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// U33472 // GenBank // Rattus norvegicus type 1 astrocyte and olfactory-limbic associated protein AT1-46 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:17362679:17403609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NM_001106993 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 11 (Fbxw11), mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006246095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 11 (Fbxw11), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:17430246:17528590:1 gene:ENSRNOG00000004395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:17493159:17524592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT008332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT008333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_019273 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 1 (Kcnmb1), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:18790595:18797982:1 gene:ENSRNOG00000005465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000007408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:18790595:18798296:1 gene:ENSRNOG00000005465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB010963 // GenBank // Rattus norvegicus KCNMB1b mRNA for calcium activated potassium channel beta1 subunit spliced variant, complete cds. // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AB050745 // GenBank // Rattus norvegicus KCNMB1c mRNA for calcium activated potassium channel beta1c subunit, complete cds. // chr10 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AF020712 // GenBank // Rattus norvegicus Maxi potassium channel beta subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FJ154955 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley large-conductance calcium-activated potassium channel beta 1 (Kcnmb1) mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// U54498 // GenBank // Rattus norvegicus large-conductance calcium-activated potassium channel beta subunit (rBKb) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// U40602 // GenBank // Rattus norvegicus rat-slowpoke-beta mRNA, complete cds. // chr10 // 67 // 69 // 12 // 18 // 0 /// GENSCAN00000051362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:18792257:18797918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT008340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_130421 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte cytosolic protein 2 (Lcp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000046135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:18875179:18921942:1 gene:ENSRNOG00000005620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AB072980 // GenBank // Rattus norvegicus SLP76 mRNA for SLP-76 adaptor ptotein, complete cds. // chr10 // 94 // 90 // 33 // 35 // 0 /// BC100066 // GenBank // Rattus norvegicus lymphocyte cytosolic protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:112603 IMAGE:7387128), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT008343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000051364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:18850125:18913103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// NONRATT008344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
XM_002727760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 196, member B (Fam196b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:19244625:19262447:1 gene:ENSRNOG00000032329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:19227957:19262447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_031321 // RefSeq // Rattus norvegicus slit homolog 3 (Drosophila) (Slit3), mRNA. // chr10 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:20195980:20392415:1 gene:ENSRNOG00000007377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AB011531 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MEGF5, complete cds. // chr10 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:20250080:20437070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0
NR_031930 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-218-2 (Mir218-2), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053604 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:20303158:20303267:1 gene:ENSRNOG00000035481 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-218a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000957 Rattus norvegicus miR-218a-2 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108272 // RefSeq // Rattus norvegicus pantothenate kinase 3 (Pank3), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000059780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:20465020:20484497:1 gene:ENSRNOG00000007419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:20453742:20492691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT008354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NR_031861 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-103-1 (Mir103-1), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053626 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:20480351:20480436:1 gene:ENSRNOG00000035503 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-103-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000888 Rattus norvegicus miR-103-1 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative proline-rich protein 21-like (LOC102551063), mRNA. // chrU // 93 // 93 // 13 // 14 // 1 /// GENSCAN00000057181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:20992174:20993061:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 93 // 93 // 13 // 14 // 1
FQ220874 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YF23 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000004233 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:22108808:22109415:-1 gene:ENSRNOG00000003173 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000028007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:22108808:22184110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001009621 // RefSeq // Rattus norvegicus NudC domain containing 2 (Nudcd2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:25741398:25746616:1 gene:ENSRNOG00000003225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// BC088299 // GenBank // Rattus norvegicus NudC domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:109498 IMAGE:7323100), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT008366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000019441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:25740924:25743639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONRATT008366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1
NM_012957 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, beta 2 (Gabrb2), mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:27818095:28026899:1 gene:ENSRNOG00000003680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AY574251 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-A receptor beta2 subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:27961524:28011846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000036576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:27771528:27898077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NONRATT008371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000004981 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:28154666:28155503:1 gene:ENSRNOG00000003744 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0
XM_006220635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class V, type 10B (Atp10b), mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// XM_006246129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class V, type 10B (Atp10b), mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000029118 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:28527558:28704605:1 gene:ENSRNOG00000003781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000043846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:28530764:28654912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0
NM_001100550 // RefSeq // Rattus norvegicus SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (Slu7), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:28871472:28886424:1 gene:ENSRNOG00000003822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC158865 // GenBank // Rattus norvegicus SLU7 splicing factor homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188474 IMAGE:7938574), complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000043856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:28875905:28886002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0
NM_001191918 // RefSeq // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 2 (C1qtnf2), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 2 (C1qtnf2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000005161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:28909018:28925541:1 gene:ENSRNOG00000003870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:28908980:28922006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT008373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:28924735:29018285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001037773 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin J-like (Ccnjl), mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006246134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin J-like (Ccnjl), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000005171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:28961987:29020105:1 gene:ENSRNOG00000003893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC099113 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin J-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7461886), complete cds. // chr10 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT008374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:28924735:29018285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENSRNOT00000034352 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:29119356:29120025:1 gene:ENSRNOG00000028046 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29119465:29120043:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
XM_006246135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PWWP domain containing 2A (Pwwp2a), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006246138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PWWP domain containing 2A (Pwwp2a), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NM_001127296 // RefSeq // Rattus norvegicus PWWP domain containing 2A (Pwwp2a), mRNA. // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000067013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:29129861:29174706:1 gene:ENSRNOG00000003936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// BC166858 // GenBank // Rattus norvegicus PWWP domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:188765 IMAGE:9100439), complete cds. // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29159263:29160864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT008378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29129871:29130725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT008379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
GENSCAN00000030591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29729565:29738130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0
ENSRNOT00000005752 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:29814338:29814959:1 gene:ENSRNOG00000004348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT008381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29814338:29848787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_022611 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 12B (Il12b), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:29872453:29881829:1 gene:ENSRNOG00000004380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF133197 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-12 p40 precursor, mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29867380:29881829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT008382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000048698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29924438:29924968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000039834 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:29924366:29925024:1 gene:ENSRNOG00000027881 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0
NM_001105778 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 145 (Rnf145), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:30002561:30040956:1 gene:ENSRNOG00000004602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC168651 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 145, mRNA (cDNA clone MGC:187825 IMAGE:9033412), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29960898:30100232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT008385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT008383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
ENSRNOT00000059557 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:23523130:23523524:1 gene:ENSRNOG00000038963 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT008360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:23516068:23568166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_053820 // RefSeq // Rattus norvegicus early B-cell factor 1 (Ebf1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006246120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus early B-cell factor 1 (Ebf1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus early B-cell factor 1 (Ebf1), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006246122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus early B-cell factor 1 (Ebf1), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// L24051 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor (Olf-1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000047970 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:23523960:23550261:1 gene:ENSRNOG00000028845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071435 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:23776010:23830230:1 gene:ENSRNOG00000047239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT008361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// GENSCAN00000027786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:23516068:23568166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000027798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:23866129:23901038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001002022 // RefSeq // Rattus norvegicus clathrin interactor 1 (Clint1), mRNA. // chr10 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// ENSRNOT00000035346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:30656516:30825797:1 gene:ENSRNOG00000005406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// BC076397 // GenBank // Rattus norvegicus enthoprotin, mRNA (cDNA clone MGC:94862 IMAGE:7109965), complete cds. // chr10 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// XM_006246149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus clathrin interactor 1 (Clint1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NONRATT008389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT008391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT008392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000006848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:30794785:30828377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001160228 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 19 (Adam19), mRNA. // chr10 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000008184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:30966982:31059793:1 gene:ENSRNOG00000042980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000056191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:30967073:31056361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_003750803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 9 (Fndc9), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 9 (Fndc9), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008559 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:31143625:31144305:1 gene:ENSRNOG00000006549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31143625:31144305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025031 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member B (Fam71b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000031580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31323995:31327229:1 gene:ENSRNOG00000021425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// NONRATT008402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31324051:31327123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001286183 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 7 (Med7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003750804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 7 (Med7), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 7 (Med7), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 7 (Med7), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 7 (Med7), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 7 (Med7), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246159 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 7 (Med7), transcript variant X10, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 7 (Med7), transcript variant X13, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009238 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:31347710:31351847:1 gene:ENSRNOG00000007053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31350912:31351613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// FQ231187 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YA05 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT008404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100762 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatitis A virus cellular receptor 2 (Havcr2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hepatitis A virus cellular receptor 2 (Havcr2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000048485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31377042:31403296:1 gene:ENSRNOG00000031443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31377112:31401452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000029105 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:31601723:31602684:1 gene:ENSRNOG00000021333 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31601872:31602684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_173149 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatitis A virus cellular receptor 1 (Havcr1), mRNA. // chr10 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// XM_006246163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hepatitis A virus cellular receptor 1 (Havcr1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000009573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31644784:31668180:1 gene:ENSRNOG00000007243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF035963 // GenBank // Rattus norvegicus kidney injury molecule-1 (KIM-1) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// BC061820 // GenBank // Rattus norvegicus hepatitis A virus cellular receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:72269 IMAGE:5599247), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006246164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hepatitis A virus cellular receptor 1 (Havcr1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// NONRATT008408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31645384:31667190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
XM_006220637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 (Timd4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006220638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 (Timd4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 (Timd4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 4 (Timd4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31702248:31736488:1 gene:ENSRNOG00000038894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31698034:31778906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT008411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_130734 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2 like 1 (Gnb2l1), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000003334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:33920288:33939018:1 gene:ENSRNOG00000002390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// BC063809 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2 like 1, mRNA (cDNA clone MGC:72712 IMAGE:6919982), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// FQ221196 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA39YH17 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// FQ229413 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YA07 mRNA sequence. // chr10 // 87 // 94 // 13 // 15 // 0 /// U03390 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley protein kinase C receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:33920302:33938732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT008414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
AJ240056 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Z38 snoRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
AJ240056 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Z38 snoRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001070008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 7 (Trim7), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_220359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 7 (Trim7), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:33969595:33982976:1 gene:ENSRNOG00000002469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:33969595:33982976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172019 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon gamma inducible protein 47 (Ifi47), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34059639:34067269:1 gene:ENSRNOG00000002470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34059639:34067269:1 gene:ENSRNOG00000002470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF508023 // GenBank HTC // Rattus norvegicus interferon gamma inducible protein 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// BC066660 // GenBank // Rattus norvegicus interferon gamma inducible protein 47, mRNA (cDNA clone MGC:72279 IMAGE:5623225), complete cds. // chr10 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34065567:34066829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006224645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 98, member B (Fam98b), mRNA. // chr10 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// XM_006234792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 98, member B (Fam98b), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_343883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM98B-like (RGD1560464), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034950 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:115501131:115533474:1 gene:ENSRNOG00000005366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073403 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:34098573:34098900:1 gene:ENSRNOG00000050786 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 80 // 33 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000052579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34098540:34108627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:115471798:115538735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT035457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_214834 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1386 (Olr1386), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34161966:34162913:1 gene:ENSRNOG00000046838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34161966:34162913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220646 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 62-like (RGD1560191), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006246191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 62-like (RGD1560191), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
NM_030861 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase (Mgat1), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34296107:34313527:1 gene:ENSRNOG00000031208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC074010 // GenBank // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:91661 IMAGE:7100030), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D16302 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for N-acetylglucosaminyltransferase I, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001000001 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1387 (Olr1387), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34329601:34330536:1 gene:ENSRNOG00000048858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34329601:34407172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000788 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1388 (Olr1388), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34340398:34341333:1 gene:ENSRNOG00000046425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34329601:34407172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000000 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1389 (Olr1389), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34355124:34356059:1 gene:ENSRNOG00000050601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34329601:34407172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT008433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000003363 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:34368918:34369855:1 gene:ENSRNOG00000002486 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34329601:34407172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_001001089 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1391 (Olr1391), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34406243:34407172:1 gene:ENSRNOG00000045932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34329601:34407172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT008434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001090 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1392 (Olr1392), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34420224:34421159:1 gene:ENSRNOG00000046072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34420224:34421159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000524 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1393 (Olr1393), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34435795:34436730:1 gene:ENSRNOG00000047749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34435795:34436730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT008436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001001091 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1394 (Olr1394), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34446335:34447264:1 gene:ENSRNOG00000047636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34446335:34447264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001092 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1395 (Olr1395), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34465828:34466757:1 gene:ENSRNOG00000046182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34465828:34466757:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001094 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1397 (Olr1397), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34499895:34500827:1 gene:ENSRNOG00000029739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34499895:34578147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000002 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1398 (Olr1398), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34517214:34518149:1 gene:ENSRNOG00000045940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34499895:34578147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT008442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001095 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1399 (Olr1399), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001001096 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1400 (Olr1400), mRNA. // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000050554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34529249:34530184:1 gene:ENSRNOG00000049535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001000003 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1401 (Olr1401), mRNA. // chr10 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000043954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34577212:34578147:1 gene:ENSRNOG00000033524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34499895:34578147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0
NM_001000003 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1401 (Olr1401), mRNA. // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// NM_001001095 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1399 (Olr1399), mRNA. // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// NM_001001096 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1400 (Olr1400), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000043954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34577212:34578147:1 gene:ENSRNOG00000033524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000050554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34529249:34530184:1 gene:ENSRNOG00000049535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34499895:34578147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// NONRATT008444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// NONRATT008445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0
NM_001000003 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1401 (Olr1401), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000043954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34577212:34578147:1 gene:ENSRNOG00000033524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_053652 // RefSeq // Rattus norvegicus fms-related tyrosine kinase 4 (Flt4), mRNA. // chr10 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34850707:34892141:1 gene:ENSRNOG00000002511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000059341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34850707:34882937:1 gene:ENSRNOG00000002511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AF402785 // GenBank // Rattus norvegicus receptor tyrosine kinase VEGFR-3 (Vegfr3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// AF402786 // GenBank // Rattus norvegicus receptor tyrosine kinase VEGFR-3kt (Vegfr3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 87 // 97 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34850707:34891875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001013180 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 3A, member 1 (Scgb3a1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34905080:34906387:1 gene:ENSRNOG00000002718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF436841 // GenBank // Rattus norvegicus pneumo secretory protein 2 (Pnsp2) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34905092:34906131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102555243), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102555243), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001002819 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2 (Gfpt2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000003770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35051132:35097280:1 gene:ENSRNOG00000002810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC098630 // GenBank // Rattus norvegicus glutamine-fructose-6-phosphate transaminase 2, mRNA (cDNA clone MGC:112555 IMAGE:7105780), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000057574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35031997:35104678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NR_031780 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-336 (Mir336), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053582 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:35121530:35121625:1 gene:ENSRNOG00000035459 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-336 // miRBase Micro RNA Database // MI0000613 Rattus norvegicus miR-336 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108273 // RefSeq // Rattus norvegicus RasGEF domain family, member 1C (Rasgef1c), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RasGEF domain family, member 1C (Rasgef1c), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35164536:35230687:1 gene:ENSRNOG00000003005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35171636:35271246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001108274 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 9B (with GRAM domain) (Tbc1d9b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000043085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35397655:35436143:1 gene:ENSRNOG00000003050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC166483 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 9B, mRNA (cDNA clone MGC:187963 IMAGE:7099086), complete cds. // chr10 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// GENSCAN00000027561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35407054:35434256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT008459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT008461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1 /// NONRATT008463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
ENSRNOT00000004111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35439501:35463124:1 gene:ENSRNOG00000003068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC166832 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3010026O09, mRNA (cDNA clone MGC:188720 IMAGE:8375915), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35439612:35463022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT008464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1
NM_001127533 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, isozyme B (Mgat4b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, isozyme B (Mgat4b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35487146:35496940:1 gene:ENSRNOG00000003235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166514 // GenBank // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, isozyme B, mRNA (cDNA clone MGC:188084 IMAGE:7130556), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35487407:35496756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT008473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006220653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chibby homolog 3 (Drosophila) (Cby3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chibby homolog 3 (Drosophila) (Cby3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004517 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:35626296:35631272:1 gene:ENSRNOG00000003395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35622061:35652139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001137622 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 2 (Adamts2), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006246246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 2 (Adamts2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006246247 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 2 (Adamts2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000065477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35868734:36072447:1 gene:ENSRNOG00000003572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000050113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36000787:36072238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT008489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// NONRATT008488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
ENSRNOT00000063478 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:10:36076999:36077115:1 gene:ENSRNOG00000041725 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_022920 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 6 (Grm6), mRNA. // chr10 // 87 // 91 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36116940:36133439:1 gene:ENSRNOG00000000233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// D13963 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for metabotropic glutamate receptor subtype, complete cds. // chr10 // 87 // 91 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36116878:36131795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0
NM_001000787 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1404 (Olr1404), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36239004:36239951:1 gene:ENSRNOG00000003668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36187891:36239951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001012 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1405 (Olr1405), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000044464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36250467:36251390:1 gene:ENSRNOG00000047313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36250488:36251390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT008495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000786 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1406 (Olr1406), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36258273:36259280:1 gene:ENSRNOG00000029930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36258381:36259292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000005 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1407 (Olr1407), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36272137:36273060:1 gene:ENSRNOG00000047056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36269341:36273060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000785 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1408 (Olr1408), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36289950:36290891:1 gene:ENSRNOG00000047426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36289950:36290891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000004 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1409 (Olr1409), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36303500:36304441:1 gene:ENSRNOG00000047344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36303500:36304441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000784 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1410 (Olr1410), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000050096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36327197:36387329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_001000783 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1411 (Olr1411), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36339981:36340913:1 gene:ENSRNOG00000032495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36327197:36387329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT008501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_052798 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 354A (Zfp354a), mRNA. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36359537:36370635:1 gene:ENSRNOG00000003634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC078777 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 354A, mRNA (cDNA clone MGC:93316 IMAGE:7127868), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// M96548 // GenBank // Rat zinc finger protein (kid-1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT008504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT008503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000050096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36327197:36387329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_181636 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XXIII, alpha 1 (Col23a1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004510 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:34675683:34705887:1 gene:ENSRNOG00000046785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36513061:36800649:1 gene:ENSRNOG00000003349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY158896 // GenBank // Rattus norvegicus alpha 1 type XXIII collagen (Col23a1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34613811:34705441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36706187:36798749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001105779 // RefSeq // Rattus norvegicus NHP2 ribonucleoprotein (Nhp2), mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000005688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34748364:34751665:1 gene:ENSRNOG00000004247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000064984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34748309:34751683:1 gene:ENSRNOG00000004247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC162010 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar protein family A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187877 IMAGE:9091322), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// FQ222023 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YO22 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000073317 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:36841743:36845032:1 gene:ENSRNOG00000049622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// GENSCAN00000001834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34748376:34751450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36841743:36844817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
XR_338595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546896 (LOC102546896), ncRNA. // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XR_357559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554064 (LOC102554064), ncRNA. // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XR_357576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546896 (LOC102546896), ncRNA. // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001009622 // RefSeq // Rattus norvegicus secretion associated, Ras related GTPase 1B (Sar1b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36988854:37018530:1 gene:ENSRNOG00000004820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088842 // GenBank // Rattus norvegicus SAR1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105988 IMAGE:7303357), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217751 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA18YL17 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37008827:37018057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT008518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001008278 // RefSeq // Rattus norvegicus CDKN2A interacting protein N-terminal like (Cdkn2aipnl), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37195757:37205191:1 gene:ENSRNOG00000005024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086396 // GenBank // Rattus norvegicus CDKN2A interacting protein N-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:105666 IMAGE:7303530), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37187508:37203769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_017039 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, catalytic subunit, alpha isozyme (Ppp2ca), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37324233:37343983:1 gene:ENSRNOG00000005389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC070914 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:91735 IMAGE:7104697), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC072531 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:91734 IMAGE:7096821), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M33114 // GenBank // Rat type-2A protein phosphatase catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002599 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:89521819:89522884:1 gene:ENSRNOG00000001893 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89521958:89522887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37304470:37343222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT008531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_001073356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM162A-like (RGD1306484), mRNA. // chr10 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// XM_343890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM162A-like (RGD1306484), mRNA. // chr10 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007630 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:37356179:37356640:1 gene:ENSRNOG00000005821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 75 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37356179:37368033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0
NM_001007608 // RefSeq // Rattus norvegicus S-phase kinase-associated protein 1 (Skp1), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37373099:37383454:1 gene:ENSRNOG00000005828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC058152 // GenBank // Rattus norvegicus S-phase kinase-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72936 IMAGE:6890712), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ214470 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YI09 mRNA sequence. // chr10 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// FQ216265 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YL24 mRNA sequence. // chr10 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// FQ219088 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YM19 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// FQ229788 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YK24 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37373099:37382332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NONRATT008535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT008536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT008534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT008537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106999 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to HTGN29 protein; keratinocytes associated transmembrane protein 2 (RGD1310352), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37530138:37542768:1 gene:ENSRNOG00000006148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37530200:37541170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT008539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001107000 // RefSeq // Rattus norvegicus follistatin-like 4 (Fstl4), mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37877767:38313673:1 gene:ENSRNOG00000006565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38181421:38376308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// NONRATT008544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
XM_006220670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S2-like (LOC690875), mRNA. // chr10 // 70 // 91 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000041408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38426567:38427387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001271026 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 10 (Zcchc10), mRNA. // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000009098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38445574:38455988:1 gene:ENSRNOG00000006943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC158679 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:8372843), partial cds. // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// FQ227271 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YP06 mRNA sequence. // chr10 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0 /// NONRATT008547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001107001 // RefSeq // Rattus norvegicus AF4/FMR2 family, member 4 (Aff4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000009440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38473786:38555300:1 gene:ENSRNOG00000006965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000041437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38481441:38548898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT008548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT008551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NM_021672 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 9 (Gdf9), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth differentiation factor 9 (Gdf9), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38570721:38574669:1 gene:ENSRNOG00000007301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF099912 // GenBank // Rattus norvegicus growth differentiation factor-9 (GDF-9) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38570721:38606043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT008555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shroom family member 1 (Shroom1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shroom family member 1 (Shroom1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38602412:38606043:1 gene:ENSRNOG00000007431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000074769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38602412:38606043:1 gene:ENSRNOG00000007431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38570721:38606043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XM_006246265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 8 (Sept8), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246268 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 8 (Sept8), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006246270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 8 (Sept8), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 8 (Sept8), transcript variant X9, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC158796 // GenBank // Rattus norvegicus septin 8, mRNA (cDNA clone MGC:188183 IMAGE:7314654), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NM_001107002 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 8 (Sept8), mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// XM_006246271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 8 (Sept8), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000065229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38659245:38682851:1 gene:ENSRNOG00000007462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000041423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38659360:38738373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT008561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT008562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// NONRATT008563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT008566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_053377 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 3a (Kif3a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006246348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 3a (Kif3a), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38700476:38733694:1 gene:ENSRNOG00000007515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38659360:38738373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT008569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_021834 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 5 (Il5), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38848654:38851525:1 gene:ENSRNOG00000008111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38848229:38851525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012591 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 1 (Irf1), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38891468:38898469:1 gene:ENSRNOG00000008144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC076382 // GenBank // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:93592 IMAGE:7099391), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M34253 // GenBank // Rat interferon regulatory factor 1 (IRF-1) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38891326:38895628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001108275 // RefSeq // Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, alpha polypeptide II (P4ha2), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39214791:39243698:1 gene:ENSRNOG00000033663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// FQ228519 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YF16 mRNA sequence. // chr10 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000003195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39200884:39264332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT008574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT008575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT008576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_130739 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase long-chain family member 6 (Acsl6), mRNA. // chr10 // 98 // 94 // 45 // 46 // 0 /// XM_006246224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase long-chain family member 6 (Acsl6), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000030760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39442541:39488943:1 gene:ENSRNOG00000026745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000058817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39431075:39488943:1 gene:ENSRNOG00000026745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// AY625254 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase isoform 6 variant2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 40 // 40 // 0 /// D10041 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for long-chain acyl-CoA synthetase, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000033599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39445882:39521107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT008581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT008580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 49 // 49 // 24 // 49 // 1 /// NONRATT008579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// NONRATT008582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1
XM_006220674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC497904 (RGD1566120), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC497904 (RGD1566120), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036822 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:39510620:39548448:1 gene:ENSRNOG00000026596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39445882:39521107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT008587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001271163 // RefSeq // Rattus norvegicus folliculin interacting protein 1 (Fnip1), mRNA. // chr10 // 97 // 97 // 35 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000012671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39559860:39640089:1 gene:ENSRNOG00000009104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// GENSCAN00000033611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39525211:39640089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT008590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001107003 // RefSeq // Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6 (Rapgef6), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6 (Rapgef6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6 (Rapgef6), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39648119:39812677:1 gene:ENSRNOG00000009995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39691719:39783743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39789016:39832389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_022525 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione peroxidase 3 (Gpx3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062227 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione peroxidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72828 IMAGE:6921653), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D00680 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for plasma glutathione peroxidase precursor, complete cds. // chr10 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// FQ228545 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YC06 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228693 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YL11 mRNA sequence. // chr10 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// FQ228850 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YC17 mRNA sequence. // chr10 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// FQ229131 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YA17 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40019772:40026968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT008600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_172335 // RefSeq // Rattus norvegicus GM2 ganglioside activator (Gm2a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40277005:40289541:1 gene:ENSRNOG00000011864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB051391 // GenBank // Rattus norvegicus rGM2AP mRNA for GM2 activator protein, complete cds. // chr10 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC072474 // GenBank // Rattus norvegicus GM2 ganglioside activator, mRNA (cDNA clone MGC:91430 IMAGE:7100875), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40277046:40288176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130415 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 1 (Slc36a1), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006246374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 1 (Slc36a1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40381908:40411783:1 gene:ENSRNOG00000012356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF361239 // GenBank // Rattus norvegicus lysosomal amino acid transporter 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40397404:40411546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT008603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_133565 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase activating protein (SH3 domain) binding protein 1 (G3bp1), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000018149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40644334:40678457:1 gene:ENSRNOG00000013186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// FQ217639 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA21YF11 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// FQ217678 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA20YF11 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40643354:40685332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NONRATT008606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_031608 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, AMPA 1 (Gria1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:42257921:42571220:1 gene:ENSRNOG00000045816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:42257921:42571220:1 gene:ENSRNOG00000045816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:42257921:42260995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007609 // RefSeq // Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 3 (Mfap3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 3 (Mfap3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:42738203:42750690:1 gene:ENSRNOG00000002443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079064 // GenBank // Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:94011 IMAGE:7121173), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU000470 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 10 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:42747566:42750024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT008619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130742 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 10 (Galnt10), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000003447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:42867364:43008297:1 gene:ENSRNOG00000002488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF241241 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase T9 mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:42947585:43008297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT008626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
ENSRNOT00000053294 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:10:42987657:42987772:1 gene:ENSRNOG00000035171 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_340803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAP30-like (Sap30l), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003473 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:43023625:43030967:1 gene:ENSRNOG00000002575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43023625:43030967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT008628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
XM_006220678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus La ribonucleoprotein domain family, member 1 (Larp1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000036959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43275068:43293843:1 gene:ENSRNOG00000031544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000038324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43241680:43293843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT008634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT008635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0
NM_001008382 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8 (Cnot8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8 (Cnot8), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000003555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43336562:43345136:1 gene:ENSRNOG00000002630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC085856 // GenBank // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 8, mRNA (cDNA clone MGC:94581 IMAGE:7190112), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43336652:43344095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT008644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT008645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001105781 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L22 (Mrpl22), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43395542:43405875:1 gene:ENSRNOG00000027039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43395465:43405787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001008765 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon gamma induced GTPase (Igtp), mRNA. // chr10 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000039335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43407161:43446882:1 gene:ENSRNOG00000027008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 68 // 24 // 25 // 0 /// AY321344 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-233 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 68 // 24 // 25 // 0 /// BC129105 // GenBank // Rattus norvegicus interferon gamma induced GTPase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7100456), complete cds. // chr10 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// BC166569 // GenBank // Rattus norvegicus interferon gamma induced GTPase, mRNA (cDNA clone MGC:188200 IMAGE:7319275), complete cds. // chr10 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000012628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43407687:43447092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 57 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT008653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NONRATT008654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001126272 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 692 (Zfp692), mRNA. // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// XM_006246385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 692 (Zfp692), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// XM_006246386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 692 (Zfp692), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43537190:43544617:1 gene:ENSRNOG00000002682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC166433 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 692, mRNA (cDNA clone MGC:187471 IMAGE:7191618), complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43537535:43545087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT008660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT008662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT008661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001127581 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 binding domain protein 5 like (Sh3bp5l), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43561167:43575473:1 gene:ENSRNOG00000002737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166447 // GenBank // Rattus norvegicus SH3 binding domain protein 5 like, mRNA (cDNA clone MGC:187599 IMAGE:8364461), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43562081:43574154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109632 // RefSeq // Rattus norvegicus LY6/PLAUR domain containing 8 (Lypd8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43610295:43621157:1 gene:ENSRNOG00000026844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ229863 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YG22 mRNA sequence. // chr10 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43596789:43620999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001109633 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Robo-1 (LOC691277), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058534 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:43644178:43649137:1 gene:ENSRNOG00000038430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031537 // RefSeq // Rattus norvegicus RoBo-1 (LOC24906), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006246376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RoBo-1 (LOC24906), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003797 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:43664047:43672276:1 gene:ENSRNOG00000002820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF041083 // GenBank // Rattus norvegicus RoBo-1 mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006246377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RoBo-1 (LOC24906), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT008673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001000011 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1428 (Olr1428), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000778 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1431 (Olr1431), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44033985:44034932:1 gene:ENSRNOG00000031194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001191641 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 58 (Trim58), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44076388:44087527:1 gene:ENSRNOG00000026430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44076388:44099059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001000525 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1433 (Olr1433), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44098151:44099178:1 gene:ENSRNOG00000038413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44076388:44099059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001000013 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1434 (Olr1434), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44619850:44620770:1 gene:ENSRNOG00000047820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44136991:44137911:1 gene:ENSRNOG00000045616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44136991:44137911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44619850:44620770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000015 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1437 (Olr1437), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000071556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44220845:44221765:1 gene:ENSRNOG00000048938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44212195:44213115:1 gene:ENSRNOG00000046488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44212195:44213115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44220845:44221765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000016 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1439 (Olr1439), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44716233:44717153:1 gene:ENSRNOG00000045886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44691263:44692183:1 gene:ENSRNOG00000046634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44716233:44717153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44691263:44692183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000776 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1442 (Olr1442), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44289552:44290466:1 gene:ENSRNOG00000031246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000018 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1443 (Olr1443), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000047914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44309647:44310567:1 gene:ENSRNOG00000046777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT008679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000958 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1445 (Olr1445), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000073040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44329793:44330713:1 gene:ENSRNOG00000046040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000074062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44772377:44773297:1 gene:ENSRNOG00000046315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000000702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44329793:44358071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44772377:44773297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000019 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1448 (Olr1448), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000048241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44391403:44392321:1 gene:ENSRNOG00000030600 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT008680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000775 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1449 (Olr1449), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44409785:44410705:1 gene:ENSRNOG00000046934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44391403:44410705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT008681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000774 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1450 (Olr1450), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44439047:44439964:1 gene:ENSRNOG00000033659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44439047:44439964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000771 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1455 (Olr1455), mRNA. // chr11 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// NM_001000772 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1453 (Olr1453), mRNA. // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NM_001000957 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1451 (Olr1451), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:58640251:58641177:1 gene:ENSRNOG00000029615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:58662665:58663594:1 gene:ENSRNOG00000045676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:58569295:58641177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44465959:44466678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT013110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0
NM_001000773 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1452 (Olr1452), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44473427:44474416:1 gene:ENSRNOG00000033492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44473427:44493048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000771 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1455 (Olr1455), mRNA. // chr11 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// NM_001000772 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1453 (Olr1453), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000040655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:58640251:58641177:1 gene:ENSRNOG00000029615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000070882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:58662665:58663594:1 gene:ENSRNOG00000045676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// NM_001000957 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1451 (Olr1451), mRNA. // chr11 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:58569295:58641177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT013110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44465959:44466678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 71 // 15 // 22 // 0
NM_001000020 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1454 (Olr1454), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000771 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1455 (Olr1455), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:58662665:58663594:1 gene:ENSRNOG00000045676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000956 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1456 (Olr1456), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000052167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44490659:44491651:1 gene:ENSRNOG00000046792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44473427:44493048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000021 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1458 (Olr1458), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44534585:44535511:1 gene:ENSRNOG00000049953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44534585:44535511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000770 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1459 (Olr1459), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000052329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44549522:44550448:1 gene:ENSRNOG00000050291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44549522:44550448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000769 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1460 (Olr1460), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44564936:44565862:1 gene:ENSRNOG00000046759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44555460:44565862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000022 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1461 (Olr1461), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44916888:44917814:1 gene:ENSRNOG00000047410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44916888:44969705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1561277 (RGD1561277), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44916888:44969705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
XM_006220685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 39-like (LOC102555635), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_006246532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 39-like (LOC102555635), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000043575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44916888:44969705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_022798 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 17 (Trim17), mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 17 (Trim17), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45063620:45071506:1 gene:ENSRNOG00000022983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// AF156272 // GenBank // Rattus norvegicus RING finger protein terf mRNA, complete cds. // chr10 // 90 // 78 // 26 // 29 // 0 /// BC078819 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:93428 IMAGE:7113511), complete cds. // chr10 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45061326:45090612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// NONRATT008699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1
NM_001111127 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 3, H2ba (Hist3h2ba), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45047288:45047917:1 gene:ENSRNOG00000043419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45047318:45047698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_021840 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 3, H2a (Hist3h2a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45054233:45055784:1 gene:ENSRNOG00000042988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099140 // GenBank // Rattus norvegicus histone cluster 3, H2a, mRNA (cDNA clone MGC:116285 IMAGE:7457173), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109642 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 3, H3 (Hist3h3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45061326:45061736:1 gene:ENSRNOG00000042045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45061326:45090612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT008698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108276 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 11 (Trim11), mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45078796:45091444:1 gene:ENSRNOG00000002915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC160894 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 11, mRNA (cDNA clone MGC:188334 IMAGE:7446534), complete cds. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45061326:45090612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT008700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001105782 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L55 (Mrpl55), mRNA. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// XM_006246446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L55 (Mrpl55), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45308880:45312028:1 gene:ENSRNOG00000002943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT008707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT008709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001100551 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310033P09 (RGD1304587), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310033P09 (RGD1304587), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45315048:45317467:1 gene:ENSRNOG00000002944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC162001 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310033P09, mRNA (cDNA clone MGC:187851 IMAGE:9088363), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45315110:45317047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001105783 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 9A (Wnt9a), mRNA. // chr10 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000058327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45414117:45441637:1 gene:ENSRNOG00000003066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45395894:45439493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001105784 // RefSeq // Rattus norvegicus jumonji domain containing 4 (Jmjd4), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45554645:45559869:1 gene:ENSRNOG00000022438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45554645:45559869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT008717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000014807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45574859:45578261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000038803 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:45577509:45578412:1 gene:ENSRNOG00000032593 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 74 // 100 // 17 // 23 // 0
NM_001191642 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 3 (Nlrp3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 3 (Nlrp3), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45649991:45674234:1 gene:ENSRNOG00000003170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45672382:45679149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000014819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45650427:45662842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT008720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT008719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSRNOT00000067584 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45723829:45725210:1 gene:ENSRNOG00000021988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45717521:45725880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001105785 // RefSeq // Rattus norvegicus 5,3-nucleotidase, mitochondrial (Nt5m), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45972898:45999748:1 gene:ENSRNOG00000003332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC167058 // GenBank // Rattus norvegicus 5,3-nucleotidase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:189363 IMAGE:7310205), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45972954:45999152:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001127302 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 9 (Med9), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46071310:46086080:1 gene:ENSRNOG00000003341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166759 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Mediator of RNA polymerase II transcription, subunit 9 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:188511 IMAGE:7930828), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46075494:46084631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT008738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001271207 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid induced 1 (Rai1), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006246493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid induced 1 (Rai1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006246494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid induced 1 (Rai1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46311520:46328065:1 gene:ENSRNOG00000021537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46311520:46326391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT008741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
GENSCAN00000009875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46428223:46467217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001013857 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 48 (Lrrc48), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 48 (Lrrc48), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 48 (Lrrc48), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 48 (Lrrc48), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000032685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46477106:46517577:1 gene:ENSRNOG00000021303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083838 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 48, mRNA (cDNA clone MGC:94955 IMAGE:7113397), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46482403:46517463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_003750840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GID complex subunit 4 (Gid4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46539787:46563377:1 gene:ENSRNOG00000003847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC169088 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7936896, partial cds. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46539845:46562629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001076012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmentally regulated GTP binding protein 2 (Drg2), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_573102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmentally regulated GTP binding protein 2 (Drg2), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005101 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:46573720:46587107:1 gene:ENSRNOG00000003729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46573720:46587107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT008752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
XM_001077498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin XVA (Myo15a), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// XM_006246550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin XVA (Myo15a), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 61 // 61 // 0 /// ENSRNOT00000023018 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:46595731:46659668:1 gene:ENSRNOG00000028597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 62 // 62 // 0 /// ENSRNOT00000045700 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:46600968:46659668:1 gene:ENSRNOG00000028597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 59 // 59 // 0 /// ENSRNOT00000058047 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:46595731:46659668:1 gene:ENSRNOG00000028597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000009872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46595719:46608665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 15 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46612140:46659668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 71 // 45 // 46 // 0 /// NONRATT008754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 15 // 65 // 1
NM_001191643 // RefSeq // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 5 (E. coli) (Alkbh5), mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000034006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46679920:46700727:1 gene:ENSRNOG00000028341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46663468:46700160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_152844 // RefSeq // Rattus norvegicus lethal giant larvae homolog 1 (Drosophila) (Llgl1), mRNA. // chr10 // 83 // 95 // 35 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000005366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46714014:46727304:1 gene:ENSRNOG00000003948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AF356187 // GenBank // Rattus norvegicus RGL1 (Rgl1) mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 95 // 35 // 42 // 0 /// GENSCAN00000009869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46714014:46727472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT008759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT008760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
XM_001077609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial elongation factor 2 (Mief2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006220693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial elongation factor 2 (Mief2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial elongation factor 2 (Mief2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_573103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial elongation factor 2 (Mief2), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46743660:46747788:1 gene:ENSRNOG00000028208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46745478:46747602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// FQ215263 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YO06 mRNA sequence. // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT008763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001191919 // RefSeq // Rattus norvegicus Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 8 (Smcr8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46791502:46798641:1 gene:ENSRNOG00000005165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46791624:46798297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001100674 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 3 (Map2k3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46955909:46977241:1 gene:ENSRNOG00000006612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44847306:44867354:1 gene:ENSRNOG00000049132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC160839 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:187561 IMAGE:7458293), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44847090:44867354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46955855:46976119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_053981 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12 (Kcnj12), mRNA. // chr10 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000057953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47055582:47114620:1 gene:ENSRNOG00000002303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// BC127487 // GenBank // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:156606 IMAGE:8364361), complete cds. // chr10 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000055417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47112590:47113978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT008776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000003139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47184940:47193309:1 gene:ENSRNOG00000002304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47181928:47193309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_031972 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 3 family, member A1 (Aldh3a1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000003182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47264967:47274685:1 gene:ENSRNOG00000002331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC070924 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 3 family, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:91608 IMAGE:7096634), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// J03637 // GenBank // Rat aldehyde dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47264167:47274505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001034124 // RefSeq // Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 4 (Mfap4), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 4 (Mfap4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006246560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microfibril-associated glycoprotein 4-like (LOC102553715), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47538040:47540977:1 gene:ENSRNOG00000002382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC100616 // GenBank // Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:124818 IMAGE:7933452), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057880 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:48785893:48787895:1 gene:ENSRNOG00000045683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48778521:48787895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47527874:47540279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001105786 // RefSeq // Rattus norvegicus B9 protein domain 1 (B9d1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48805171:48812716:1 gene:ENSRNOG00000002462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48805171:48812716:1 gene:ENSRNOG00000002462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47557572:47564973:1 gene:ENSRNOG00000047790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC169130 // GenBank // Rattus norvegicus B9 protein domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:189582 IMAGE:6889289), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B9 domain-containing protein 1-like (LOC100911746), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// XM_006246553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B9 protein domain 1 (B9d1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48805188:48812589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47557572:47564973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001025749 // RefSeq // Rattus norvegicus GRB2-related adaptor protein (Grap), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47723737:47742915:1 gene:ENSRNOG00000002599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098740 // GenBank // Rattus norvegicus GRB2-related adaptor protein, mRNA (cDNA clone MGC:112733 IMAGE:7386199), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233550 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YG13 mRNA sequence. // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT008781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47646139:47742098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT008782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_002724502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member G (Fam83g), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002727718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member G (Fam83g), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027312 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:47754388:47776668:1 gene:ENSRNOG00000027924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47753783:47776594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001039017 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 (Specc1), mRNA. // chr10 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 (Specc1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 (Specc1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1 (Specc1), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000057798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48031612:48234767:1 gene:ENSRNOG00000002903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// BC099105 // GenBank // Rattus norvegicus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:116245 IMAGE:7460369), complete cds. // chr10 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48208416:48327201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48100329:48129897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// NONRATT008787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// NONRATT008788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
GENSCAN00000042009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48208416:48327201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_017161 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine A2B receptor (Adora2b), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48358060:48374870:1 gene:ENSRNOG00000002922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161854 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine A2B receptor, mRNA (cDNA clone MGC:187380 IMAGE:9024632), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M91466 // GenBank // Rattus norvegicus A2b-adenosine receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT008791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109644 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 19 (Ttc19), mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48387826:48415743:1 gene:ENSRNOG00000002977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48387862:48414644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_138901 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class L (Pigl), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48560057:48618520:1 gene:ENSRNOG00000003070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC074020 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class L, mRNA (cDNA clone MGC:91484 IMAGE:7104008), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// D88364 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PIG-L, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48560446:48617647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000072548 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:48673948:48780459:1 gene:ENSRNOG00000046598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 70 // 6 // 7 // 0
NM_001270797 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 2 (Trpv2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_001270798 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 2 (Trpv2), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_017207 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 2 (Trpv2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48686568:48707994:1 gene:ENSRNOG00000003104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AB022332 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ion channel from kidney, complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// AB029330 // GenBank // Rattus norvegicus rSAC2b mRNA for stretch activated channel 2B, complete cds. // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AF129113 // GenBank // Rattus norvegicus vanilloid receptor-like protein 1 (VRL-1) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC089215 // GenBank // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:105451 IMAGE:7302251), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000007010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48673977:48707398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NONRATT008802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT008802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001013967 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane magnesium transporter 2 (Mmgt2), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48771452:48773235:1 gene:ENSRNOG00000003214 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT008806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001135033 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 16 (Trim16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:49011305:49033990:1 gene:ENSRNOG00000003219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48991009:49031894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000004390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:49038559:49066581:1 gene:ENSRNOG00000003287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC081860 // GenBank HTC // Rattus norvegicus similar to Charcot-Marie-Tooth duplicated region transcript 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132990), containing frame-shift errors. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:49038709:49075286:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
XM_006220696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CMT1A duplicated region transcript 4 (Cdrt4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CMT1A duplicated region transcript 4 (Cdrt4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004392 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:49177492:49178569:1 gene:ENSRNOG00000003294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000034648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:49167181:49178611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001024739 // RefSeq // Rattus norvegicus tektin 3 (Tekt3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:49250932:49284884:1 gene:ENSRNOG00000027212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097398 // GenBank // Rattus norvegicus tektin 3, mRNA (cDNA clone MGC:114443 IMAGE:7453601), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:49258408:49284766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT008812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT008813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_017037 // RefSeq // Rattus norvegicus peripheral myelin protein 22 (Pmp22), mRNA. // chr10 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// XM_006246585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peripheral myelin protein 22 (Pmp22), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:49319543:49346994:1 gene:ENSRNOG00000003338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M69139 // GenBank // Rat SR13 myelin protein mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// FQ225129 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YA18 mRNA sequence. // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT008814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:49321126:49345867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT008815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT008816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT008817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
GENSCAN00000049940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:50638925:50700062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_172326 // RefSeq // Rattus norvegicus elaC ribonuclease Z 2 (Elac2), mRNA. // chr10 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000004722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:51236364:51259151:1 gene:ENSRNOG00000003424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AY149902 // GenBank // Rattus norvegicus ELAC2 mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000001654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:51236402:51260258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT008821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT008822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// NONRATT008823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1
ENSRNOT00000005583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52103139:52465432:-1 gene:ENSRNOG00000004171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000055972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52103139:52176621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52179454:52337597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000034884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:52832986:52833830:1 gene:ENSRNOG00000025316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52833037:52833845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
GENSCAN00000057225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52864445:52864969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000004447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:53081756:53082314:1 gene:ENSRNOG00000003327 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT008835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000057223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53081927:53100630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001109032 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-interacting regulator of transient receptor potential channels (Pirt), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphoinositide-interacting regulator of transient receptor potential channels (Pirt), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000057503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53218153:53232957:1 gene:ENSRNOG00000037852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53232431:53232844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 50 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT008837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000004516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53322013:53330915:1 gene:ENSRNOG00000003367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000064764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53322013:53330915:1 gene:ENSRNOG00000003367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// FQ219853 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YB18 mRNA sequence. // chr10 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// FQ227969 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YA09 mRNA sequence. // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000057226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53322022:53330354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT008842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001173374 // RefSeq // Rattus norvegicus SCO1 cytochrome c oxidase assembly protein (Sco1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53346887:53359468:1 gene:ENSRNOG00000028699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ209701 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YA19 mRNA sequence. // chr10 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53341774:53353619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT008844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012604 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 3, skeletal muscle, embryonic (Myh3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000004147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53372408:53396227:1 gene:ENSRNOG00000046276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000004070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53373148:53396105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT008845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001135157 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 2, skeletal muscle, adult (Myh2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53467097:53491312:1 gene:ENSRNOG00000045551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53467097:53491193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001135158 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 1, skeletal muscle, adult (Myh1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53493997:53517766:1 gene:ENSRNOG00000049695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53495715:53517659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_019325 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 4, skeletal muscle (Myh4), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000045718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53530953:53553894:1 gene:ENSRNOG00000049898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC113948 // GenBank // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 4, skeletal muscle, mRNA (cDNA clone MGC:124733 IMAGE:7937870), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// FQ224129 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA75YN18 mRNA sequence. // chr10 // 85 // 42 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000004082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53533530:53564128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001100485 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 8, skeletal muscle, perinatal (Myh8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057260 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:53572584:53599954:1 gene:ENSRNOG00000050042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53572578:53798720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000043412 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:53623690:53677967:1 gene:ENSRNOG00000031400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53572578:53798720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_053484 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest specific 7 (Gas7), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest specific 7 (Gas7), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53904693:53988130:1 gene:ENSRNOG00000049361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53885814:53988130:1 gene:ENSRNOG00000049361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AJ131902 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GAS-7 protein. // chr10 // 79 // 85 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53891873:53982600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_080901 // RefSeq // Rattus norvegicus recoverin (Rcvrn), mRNA. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53992826:54000571:1 gene:ENSRNOG00000003633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY063482 // GenBank // Rattus norvegicus recoverin (Rcvrn) mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53992826:54000319:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000014234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54073380:54087647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001271597 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7C (Dhrs7c), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NM_001271598 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7C (Dhrs7c), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54098519:54116881:1 gene:ENSRNOG00000026548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ216485 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YJ08 mRNA sequence. // chr10 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54098859:54116833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT008864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031656 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 8 (Stx8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XR_357670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 8 (Stx8), transcript variant X1, misc_RNA. // chr10 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000005204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54258230:54498841:1 gene:ENSRNOG00000003849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF033109 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 8 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54258182:54320203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
NONRATT008868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191923 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 5 (Pik3r5), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000032785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54802425:54822854:1 gene:ENSRNOG00000023428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54802425:54853450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1
NM_001081444 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 6 (Pik3r6), mRNA. // chr10 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// XM_006246775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 6 (Pik3r6), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54844591:54878389:1 gene:ENSRNOG00000003992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// EF207569 // GenBank // Rattus norvegicus p87 phosphoinositide 3-kinase gamma adapter protein (Pik3r6) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000009936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54854821:54878389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT008872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT008873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT008875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000024460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54802425:54853450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001105787 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 6-like (Mfsd6l), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54882592:54884685:1 gene:ENSRNOG00000037712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54882732:54884522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107009 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 42 (Ccdc42), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54913271:54923448:1 gene:ENSRNOG00000004075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54913438:54949228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000009943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54913438:54949228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_031520 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 10, non-muscle (Myh10), mRNA. // chr10 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000065895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55017314:55148294:1 gene:ENSRNOG00000002886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// AF139055 // GenBank // Rattus norvegicus nonmuscle myosin heavy chain-B mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000009966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54994973:55146783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT008879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001108828 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 222 (Rnf222), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 222 (Rnf222), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55220480:55227022:1 gene:ENSRNOG00000022964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55224625:55237881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT008882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109033 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 35 (Slc25a35), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 35 (Slc25a35), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55297129:55301122:1 gene:ENSRNOG00000004668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158839 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 35, mRNA (cDNA clone MGC:188303 IMAGE:7387741), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55297528:55300720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT008889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001107010 // RefSeq // Rattus norvegicus CTS telomere maintenance complex component 1 (Ctc1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000007447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55339019:55359673:1 gene:ENSRNOG00000005357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000009950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55339239:55351949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT008892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT008893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// GENSCAN00000056202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55353343:55386313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1
NM_053749 // RefSeq // Rattus norvegicus aurora kinase B (Aurkb), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aurora kinase B (Aurkb), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aurora kinase B (Aurkb), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55369628:55375183:1 gene:ENSRNOG00000005659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC097297 // GenBank // Rattus norvegicus aurora kinase B, mRNA (cDNA clone MGC:114286 IMAGE:7454285), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// D89731 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for AIM-1, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT008896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55353343:55386313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT008897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001017474 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20014 (LOC497934), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008507 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:55385181:55387034:1 gene:ENSRNOG00000006513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55353343:55386313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001109648 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 107 (Tmem107), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 107 (Tmem107), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55397006:55399330:1 gene:ENSRNOG00000006519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 107 (Tmem107), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT008899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55397137:55452678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT008901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
FQ225891 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YM20 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M11057 // GenBank // Rat U8 small nuclear RNA from Novikoff hepatoma cells. // chr10 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XM_006246593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 2 (Vamp2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AJ133104 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for vesicle associated membrane protein 2B. // chr10 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// M24105 // GenBank // Rat vesicle associated membrane protein (VAMP-2) mRNA, complete cds. // chr10 // 90 // 67 // 18 // 20 // 0 /// NM_012663 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 2 (Vamp2), mRNA. // chr10 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000057295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55418597:55422463:1 gene:ENSRNOG00000006989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// BC074003 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:91770 IMAGE:7097683), complete cds. // chr10 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT008903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55397137:55452678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT008904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT008905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001034125 // RefSeq // Rattus norvegicus period circadian clock 1 (Per1), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000057136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55430184:55439080:1 gene:ENSRNOG00000007387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// AY903228 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/Cub period-like protein 1 (Per1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// AY903229 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/OlaIpcv period-like protein 1 (Per1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// AY903230 // GenBank // Rattus norvegicus strain WHD period-like protein 1 (Per1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// BC100085 // GenBank // Rattus norvegicus period homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7369128), complete cds. // chr10 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT008906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000056204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55397137:55452678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 43 // 49 // 1 /// NONRATT008907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1
NM_001105792 // RefSeq // Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 7 (Hes7), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 7 (Hes7), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55450224:55452747:1 gene:ENSRNOG00000007391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55397137:55452678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT008908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001105793 // RefSeq // Rattus norvegicus arachidonate lipoxygenase 3 (Aloxe3), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arachidonate lipoxygenase 3 (Aloxe3), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006246621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arachidonate lipoxygenase 3 (Aloxe3), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55455906:55478970:1 gene:ENSRNOG00000007454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55455294:55478607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT008909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001039377 // RefSeq // Rattus norvegicus arachidonate 12-lipoxygenase, 12R type (Alox12b), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 51 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000039535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55487702:55499580:1 gene:ENSRNOG00000022210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// AY903231 // GenBank // Rattus norvegicus strain WHD arachidonate 12-lipoxygenase 12R type (Alox12b) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 51 // 53 // 0 /// AY903232 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/Cub arachidonate 12-lipoxygenase 12R type (Alox12b) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// AY903233 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/OlaIpcv arachidonate 12-lipoxygenase 12R type (Alox12b) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 51 // 53 // 0 /// GENSCAN00000056209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55487843:55499559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// NONRATT008913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0
NM_001039378 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 1 (Trappc1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55667071:55668657:1 gene:ENSRNOG00000037627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY903234 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHRSP trafficking protein particle complex 1 (Trappc1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY903235 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/OlaIpcv trafficking protein particle complex 1 (Trappc1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY903236 // GenBank // Rattus norvegicus strain WHD trafficking protein particle complex 1 (Trappc1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY903237 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/Cub trafficking protein particle complex 1 (Trappc1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY903238 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY trafficking protein particle complex 1 (Trappc1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166871 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6919266. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_031652 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 3 (Kcnab3), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55669298:55675728:1 gene:ENSRNOG00000008480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55669682:55683280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
ENSRNOT00000012061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55682608:55684564:1 gene:ENSRNOG00000021540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC159420 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8370798. // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55669682:55683280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001105794 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 38, NatC auxiliary subunit (Naa38), mRNA. // chr10 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000013071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55739689:55740766:1 gene:ENSRNOG00000009823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0 /// FQ230021 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YO11 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006246622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM domain containing 1 (Lsmd1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// NONRATT008920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 92 // 71 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT008924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT008926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
NM_030989 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein p53 (Tp53), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000046490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55932658:55944086:1 gene:ENSRNOG00000010756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF209191 // GenBank // Rattus norvegicus p53 alternative splice isoform p35/HAS mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC081788 // GenBank // Rattus norvegicus tumor protein p53, mRNA (cDNA clone MGC:93394 IMAGE:7193583), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC098663 // GenBank // Rattus norvegicus tumor protein p53, mRNA (cDNA clone MGC:112612 IMAGE:7384467), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// U90328 // GenBank // Rattus norvegicus mutant p53 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// X13058 // GenBank // Rat mRNA for nuclear oncoprotein p53. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AY009504 // GenBank // Rattus norvegicus mutant p53 (p53) mRNA, complete cds. // chr10 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55939504:55943638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT008931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT008928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT008929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT008932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT008933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001108278 // RefSeq // Rattus norvegicus spermidine/spermine N1-acetyltransferase family member 2 (Sat2), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermidine/spermine N1-acetyltransferase family member 2 (Sat2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermidine/spermine N1-acetyltransferase family member 2 (Sat2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55973620:55975433:1 gene:ENSRNOG00000011714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// FQ218736 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA4YP03 mRNA sequence. // chr10 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT008935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT008936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55973832:56006452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT008938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001100647 // RefSeq // Rattus norvegicus fragile X mental retardation, autosomal homolog 2 (Fxr2), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55983452:56003515:1 gene:ENSRNOG00000011876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC160929 // GenBank // Rattus norvegicus fragile X mental retardation, autosomal homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:188778 IMAGE:8364923), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55973832:56006452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT008939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT008942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT008943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001108830 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 15 (Sox15), mRNA. // chr10 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000016177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56006152:56009141:1 gene:ENSRNOG00000012155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// GENSCAN00000046788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55973832:56006452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT008944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
XM_006220703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 4 (Zbtb4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006220704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 4 (Zbtb4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 4 (Zbtb4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 4 (Zbtb4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019687 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:56127304:56130811:1 gene:ENSRNOG00000014689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56127304:56130811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001170549 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 256 (Tmem256), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 256 (Tmem256), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56191141:56192248:1 gene:ENSRNOG00000037540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56191167:56203281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001012139 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 3 (Plscr3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000031640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56198996:56203509:1 gene:ENSRNOG00000027914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY548831 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 3 (Pls3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC098055 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 3, mRNA (cDNA clone MGC:116213 IMAGE:7457695), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56191167:56203281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107013 // RefSeq // Rattus norvegicus neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4 (Neurl4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56257734:56269348:1 gene:ENSRNOG00000016109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56257740:56271691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT008955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001017477 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein pathway suppressor 2 (Gps2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56269587:56272106:1 gene:ENSRNOG00000016360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083699 // GenBank // Rattus norvegicus G protein pathway suppressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:94576 IMAGE:7190067), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ233878 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YA10 mRNA sequence. // chr10 // 83 // 97 // 24 // 29 // 0 /// NONRATT008959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT008960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56257740:56271691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT008958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT008963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_220618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Y box binding protein 2 (Ybx2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56291867:56296950:1 gene:ENSRNOG00000017117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56292310:56296950:1 gene:ENSRNOG00000017117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000056838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56291867:56297098:1 gene:ENSRNOG00000017117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56291867:56296626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000046741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56306566:56306997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_031702 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 7 (Cldn7), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56321561:56323745:1 gene:ENSRNOG00000017325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101892 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 7, mRNA (cDNA clone MGC:124679 IMAGE:7930797), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC159404 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 7, mRNA (cDNA clone MGC:188662 IMAGE:7458165), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56321946:56323568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT008967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001100494 // RefSeq // Rattus norvegicus CTD nuclear envelope phosphatase 1 (Ctdnep1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56336411:56345351:1 gene:ENSRNOG00000017352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006246641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTD nuclear envelope phosphatase 1 (Ctdnep1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000046790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56327438:56348921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_172036 // RefSeq // Rattus norvegicus GABA(A) receptor-associated protein (Gabarap), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000023724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56346337:56349340:1 gene:ENSRNOG00000017417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF161588 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-A receptor-associated protein (Gabarap) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC058441 // GenBank // Rattus norvegicus GABA(A) receptor-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:72672 IMAGE:6918795), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ234949 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YA21 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// FQ212169 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA67YE05 mRNA sequence. // chr10 // 56 // 100 // 9 // 16 // 0 /// FQ213154 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YG24 mRNA sequence. // chr10 // 63 // 100 // 10 // 16 // 0 /// NONRATT008971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56327438:56348921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// NONRATT008972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_001004272 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 23 (Phf23), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 23 (Phf23), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56350259:56354352:1 gene:ENSRNOG00000017657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC079162 // GenBank // Rattus norvegicus similar to PHD zinc finger containing protein JUNE1, mRNA (cDNA clone MGC:94192 IMAGE:7129493), complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56350419:56353820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT008974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT008975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT008976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001172056 // RefSeq // Rattus norvegicus dishevelled 2 (Dvl2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56355170:56364388:1 gene:ENSRNOG00000017915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56355204:56363848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT008979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT008977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT008980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NR_031771 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 324 (Mir324), microRNA. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053642 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:56366243:56366331:1 gene:ENSRNOG00000035519 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// rno-mir-324 // miRBase Micro RNA Database // MI0000594 Rattus norvegicus miR-324 stem-loop // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0
NM_019621 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large homolog 4 (Drosophila) (Dlg4), mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// XM_006246679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus discs, large homolog 4 (Drosophila) (Dlg4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000068493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56372666:56398718:1 gene:ENSRNOG00000018526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// M96853 // GenBank // Rat postsynaptic density protein (PSD-95), homologue of discs-large tumor supressor protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000057404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56378099:56410942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// NONRATT008985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 21 // 46 // 1 /// NONRATT008989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1
NM_012503 // RefSeq // Rattus norvegicus asialoglycoprotein receptor 1 (Asgr1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56407588:56411197:1 gene:ENSRNOG00000018693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC088154 // GenBank // Rattus norvegicus asialoglycoprotein receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:108731 IMAGE:7372227), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ219710 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YI12 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT008994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT008995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56378099:56410942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT008996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_017189 // RefSeq // Rattus norvegicus asialoglycoprotein receptor 2 (Asgr2), mRNA. // chr10 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56452189:56465315:1 gene:ENSRNOG00000030726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000065370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56452189:56465315:1 gene:ENSRNOG00000030726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AF230645 // GenBank // Rattus norvegicus testis-type galactosyl receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// BC088099 // GenBank // Rattus norvegicus asialoglycoprotein receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:108546 IMAGE:7322417), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// J02762 // GenBank // Rat asialoglycoprotein receptor (hepatic lectin-2/3) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// X07636 // GenBank // Rat mRNA for hepatic lectin. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// M16347 // GenBank // Rat asialoglycoprotein receptor (RHL2) mRNA, complete cds. // chr10 // 71 // 82 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56452679:56465011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 59 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT008999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT008998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT009000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_022393 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 10, member A (Clec10a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56506747:56511257:1 gene:ENSRNOG00000018715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC091151 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage galactose N-acetyl-galactosamine specific lectin 1, mRNA (cDNA clone MGC:108693 IMAGE:7375234), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// J05495 // GenBank // Rat Gal/GalNAc-specific lectin mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT009002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000057390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56508345:56571073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT009003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT009004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001105797 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 11 (Slc16a11), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 11 (Slc16a11), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56567392:56571115:1 gene:ENSRNOG00000018748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56567392:56571115:1 gene:ENSRNOG00000018748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC169003 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylic acid transporters), member 11, mRNA (cDNA clone MGC:189362 IMAGE:7122746), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56508345:56571073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NR_032144 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 497 (Mir497), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054383 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:56589141:56589209:1 gene:ENSRNOG00000036260 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-497 // miRBase Micro RNA Database // MI0003724 Rattus norvegicus miR-497 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031912 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 195 (Mir195), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053761 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:56589465:56589551:1 gene:ENSRNOG00000035638 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-195 // miRBase Micro RNA Database // MI0000939 Rattus norvegicus miR-195 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012911 // RefSeq // Rattus norvegicus arrestin, beta 2 (Arrb2), mRNA. // chr10 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000026207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56797480:56805282:1 gene:ENSRNOG00000019308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// BC087578 // GenBank // Rattus norvegicus arrestin, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:105502 IMAGE:7311618), complete cds. // chr10 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// M91590 // GenBank // Rat beta-arrestin2 mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT009014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000057401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56785020:56804960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1
NM_001105799 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 11 (Med11), mRNA. // chr10 // 86 // 88 // 18 // 21 // 0 /// FQ221563 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA34YH20 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56814847:56816361:1 gene:ENSRNOG00000019384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 79 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56814904:56816147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT009018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001105800 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 15 (Zmynd15), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 15 (Zmynd15), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56821719:56828333:1 gene:ENSRNOG00000019477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56822761:56828201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107015 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 4 L six family member 5 (Tm4sf5), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56869487:56875879:1 gene:ENSRNOG00000019510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56854892:56875571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001115030 // RefSeq // Rattus norvegicus glycolipid transfer protein domain containing 2 (Gltpd2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56883712:56885374:1 gene:ENSRNOG00000026488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158886 // GenBank // Rattus norvegicus glycolipid transfer protein domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:188616 IMAGE:8372488), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212076 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA70YF09 mRNA sequence. // chr10 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56883737:56885008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_057099 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 6 (Psmb6), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// XM_002729028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome subunit beta type 6-like (LOC100360846), mRNA. // chr10 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// XM_003753554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome subunit beta type 6-like (LOC100360846), mRNA. // chr10 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000015746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:115773840:115774556:-1 gene:ENSRNOG00000011827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56888980:56891231:1 gene:ENSRNOG00000019551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// BC058451 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 6, mRNA (cDNA clone MGC:72726 IMAGE:6891542), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// FQ217385 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA28YB21 mRNA sequence. // chr10 // 89 // 100 // 31 // 35 // 0 /// GENSCAN00000026198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:115773840:115775362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56888980:56891231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT009025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT009026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_033299 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase D2 (Pld2), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB003172 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase D2, complete cds. // chr10 // 79 // 86 // 19 // 24 // 0 /// D88672 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase D, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056998 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:56909460:56926683:1 gene:ENSRNOG00000019604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56908416:56925273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT009029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001271136 // RefSeq // Rattus norvegicus misshapen-like kinase 1 (Mink1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000040488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56963630:56984070:1 gene:ENSRNOG00000033508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 97 // 33 // 34 // 1 /// GENSCAN00000026991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56964258:56983318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT009032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT009035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT009036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001109654 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein Ib (platelet), alpha polypeptide (Gp1ba), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57006274:57009140:1 gene:ENSRNOG00000025959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57006555:57008251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001008361 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 167 (Rnf167), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57013969:57018254:1 gene:ENSRNOG00000003879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083670 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 167, mRNA (cDNA clone MGC:94514 IMAGE:7135651), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ233664 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YO23 mRNA sequence. // chr10 // 86 // 76 // 19 // 22 // 0 /// FQ216790 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YD03 mRNA sequence. // chr10 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000026985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57014581:57018057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_145877 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 1C (Kif1c), mRNA. // chr10 // 87 // 94 // 39 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000041493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57067764:57097459:1 gene:ENSRNOG00000031364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 96 // 43 // 46 // 0 /// GENSCAN00000026992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57063741:57096912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT009055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT009056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1
NONRATT009055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NONRATT009055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001109034 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 3 (Zfp3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57132328:57140571:1 gene:ENSRNOG00000005009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019124 // RefSeq // Rattus norvegicus rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 (Rabep1), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// XM_006246795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 1 (Rabep1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000041443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57207873:57324847:1 gene:ENSRNOG00000005015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// D85844 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for rabaptin-5, complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// U70777 // GenBank // Rattus norvegicus rabaptin mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000026957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57244268:57324015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
NM_001033060 // RefSeq // Rattus norvegicus RPA interacting protein (Rpain), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RPA interacting protein (Rpain), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57351862:57358959:1 gene:ENSRNOG00000006913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000044363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57351862:57358831:1 gene:ENSRNOG00000006913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY775322 // GenBank // Rattus norvegicus RAP interaction protein alpha mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57351862:57358831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047972 // RefSeq // Rattus norvegicus MIS12 kinetochore complex component (Mis12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MIS12 kinetochore complex component (Mis12), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006246791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MIS12 kinetochore complex component (Mis12), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000010144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57405280:57405900:1 gene:ENSRNOG00000007725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57405280:57405900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024234 // RefSeq // Rattus norvegicus WSC domain containing 1 (Wscd1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58084069:58112877:1 gene:ENSRNOG00000007869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC094520 // GenBank // Rattus norvegicus WSC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105510 IMAGE:7316275), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58075312:58112227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001113781 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 64, member A (Fam64a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006246760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 64, member A (Fam64a), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58354690:58359530:1 gene:ENSRNOG00000008040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC158692 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 64, member A, mRNA (cDNA clone MGC:187719 IMAGE:9022735), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_001105805 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 17 (Txndc17), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58517203:58520175:1 gene:ENSRNOG00000014072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC159408 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:188676 IMAGE:8362552), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912483 (LOC100912483), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912483 (LOC100912483), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019925 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:58525071:58525478:1 gene:ENSRNOG00000014865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_006220721 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus XIAP associated factor-1 (XAF1), mRNA. // chr10 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006246855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus XIAP associated factor-1 (XAF1), mRNA. // chr10 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000056551 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:58601351:58612582:1 gene:ENSRNOG00000037371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000074523 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:58601351:58614067:1 gene:ENSRNOG00000037371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT009077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58601351:58618647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001039018 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 39 (Fbxo39), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58616224:58618833:1 gene:ENSRNOG00000014953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC100079 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 39, mRNA (cDNA clone MGC:112697 IMAGE:7132945), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58601351:58618647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001002820 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-glutamyl transferase 6 (Ggt6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58734595:58737072:1 gene:ENSRNOG00000015210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58734595:58737072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031668 // RefSeq // Rattus norvegicus MYB binding protein (P160) 1a (Mybbp1a), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58739483:58749744:1 gene:ENSRNOG00000015236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U83590 // GenBank // Rattus norvegicus PAR interacting protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58739483:58749744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_022690 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (Ube2g1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58911569:58992363:1 gene:ENSRNOG00000010041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF099093 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme UBC7 mRNA, complete cds. // chr10 // 79 // 88 // 22 // 28 // 0 /// BC086980 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (UBC7 homolog, C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:93103 IMAGE:7192141), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58911873:58993581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT009091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001107018 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and FYVE domain containing 1 (Ankfy1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59017118:59065842:1 gene:ENSRNOG00000016212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58997888:59065842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, ZZ-type with EF hand domain 1 (Zzef1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// XM_006246857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, ZZ-type with EF hand domain 1 (Zzef1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// ENSRNOT00000036278 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:59099083:59235227:1 gene:ENSRNOG00000024535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000050911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59099083:59235227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 55 // 55 // 0
NM_012914 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Ca++ transporting, ubiquitous (Atp2a3), mRNA. // chr10 // 93 // 95 // 38 // 41 // 0 /// XM_006246598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, Ca++ transporting, ubiquitous (Atp2a3), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000064840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59269279:59299899:1 gene:ENSRNOG00000017912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000065181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59269279:59296567:1 gene:ENSRNOG00000017912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// M30581 // GenBank // Rat organellar Ca-2+ pump mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 95 // 38 // 41 // 0 /// GENSCAN00000050922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59268493:59298558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT009107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001142367 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1 (P2rx1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NM_001285415 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1 (P2rx1), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NM_012997 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1 (P2rx1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59305745:59320794:1 gene:ENSRNOG00000017606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AF231010 // GenBank // Rattus norvegicus P2X1 receptor isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC061742 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 1, mRNA (cDNA clone MGC:72526 IMAGE:5599053), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FJ424511 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X1 ligand-gated ion channel variant b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// M80602 // GenBank // Rat transmembrane protein (RP-2) mRNA, 3 end. // chr10 // 77 // 46 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000050921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59305946:59319727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT009108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT009109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_031662 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, alpha (Camkk1), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006246799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, alpha (Camkk1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59324561:59347636:1 gene:ENSRNOG00000018242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AB023658 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ca/calmodulin-dependent protein kinase kinase alpha, CaM-kinase kinase alpha, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// L42810 // GenBank // Rattus norvegicus Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase kinase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59342141:59346687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000050906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59330439:59339737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT009110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT009111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_001108281 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1200014J11 (RGD1308139), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59352867:59382579:1 gene:ENSRNOG00000018550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59352889:59433496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_080780 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 5 (P2rx5), mRNA. // chr10 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59464489:59476095:1 gene:ENSRNOG00000019208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59438203:59475239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001025419 // RefSeq // Rattus norvegicus Tax1 (human T-cell leukemia virus type I) binding protein 3 (Tax1bp3), mRNA. // chr10 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59482718:59487235:1 gene:ENSRNOG00000019357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC097976 // GenBank // Rattus norvegicus Tax1 (human T-cell leukemia virus type I) binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:116109 IMAGE:7442643), complete cds. // chr10 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// FQ209970 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YP14 mRNA sequence. // chr10 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// FQ220071 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YE23 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ220331 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YE17 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59485329:59486432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT009115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001033682 // RefSeq // Rattus norvegicus sedoheptulokinase (Shpk), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59504502:59528848:1 gene:ENSRNOG00000019458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC101914 // GenBank // Rattus norvegicus sedoheptulokinase, mRNA (cDNA clone MGC:124840 IMAGE:7935768), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59504531:59599669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_031982 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 1 (Trpv1), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000026456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59538296:59563441:1 gene:ENSRNOG00000019486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59538296:59563441:1 gene:ENSRNOG00000019486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// AB040873 // GenBank // Rattus norvegicus VR1L1 mRNA for vanilloid receptor type 1 like protein 1, complete cds. // chr10 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// AB041029 // GenBank // Rattus norvegicus VR1L2 mRNA for vanilloid receptor type 1 like protein 2, complete cds. // chr10 // 93 // 68 // 26 // 28 // 0 /// AF029310 // GenBank // Rattus norvegicus vanilloid receptor subtype 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// AF158248 // GenBank // Rattus norvegicus vanilloid receptor splice variant mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 71 // 28 // 29 // 0 /// AB015231 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for stretch-inhibitable nonselective channel (SIC), complete cds. // chr10 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT009119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000038251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59504531:59599669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 30 // 41 // 1
NM_001025757 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 3 (Trpv3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59570474:59600221:1 gene:ENSRNOG00000019606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY325813 // GenBank // Rattus norvegicus heat sensitive channel TRPV3 (Trpv3) mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59504531:59599669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_001191824 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 22 (Spata22), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000056443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59633751:59649996:1 gene:ENSRNOG00000037307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB236891 // GenBank // Rattus norvegicus Spata22 mRNA for spermatogenesis-associated protein 22, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0
NM_001000024 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1466 (Olr1466), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59662422:59663372:1 gene:ENSRNOG00000031835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59662428:59663372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000025 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1467 (Olr1467), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000045221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59673326:59674279:1 gene:ENSRNOG00000028878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59673326:59674279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT009123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001000944 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1472 (Olr1472), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59782497:59783432:1 gene:ENSRNOG00000047936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59782497:59783432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT009124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000026 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1482 (Olr1482), mRNA. // chr10 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NM_001006609 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor gene Olr1493 (Olr1493), mRNA. // chr10 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// M64387 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr10 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000010570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59972996:59973589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60142939:60193056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001000719 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1488 (Olr1488), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60100710:60101648:1 gene:ENSRNOG00000046651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000718 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1490 (Olr1490), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60128736:60129674:1 gene:ENSRNOG00000050244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT009126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000010572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60235074:60236009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0
NM_001000715 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1501 (Olr1501), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000041085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60465195:60466130:1 gene:ENSRNOG00000031966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001000032 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1505 (Olr1505), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60548569:60573967:1 gene:ENSRNOG00000029537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT009128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60548569:60549903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001000034 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1511 (Olr1511), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000042349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60707668:60708615:1 gene:ENSRNOG00000050608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60698022:60731890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT009129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT009131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001001350 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1512 (Olr1512), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048935 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:60731039:60731890:1 gene:ENSRNOG00000049417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60698022:60731890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001000035 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1513 (Olr1513), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000043016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60765095:60766033:1 gene:ENSRNOG00000034227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000050977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60765095:60766033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001001098 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1515 (Olr1515), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62140916:62141887:1 gene:ENSRNOG00000048395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62140916:62141887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000038 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1516 (Olr1516), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000073002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60802063:60803034:1 gene:ENSRNOG00000048690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60797277:60798248:1 gene:ENSRNOG00000047153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075322 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:62128070:62129040:1 gene:ENSRNOG00000047607 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000014762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62081471:62129040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000050978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60802063:60803034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000050983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60797277:60798248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001000037 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1519 (Olr1519), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000714 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1520 (Olr1520), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60891355:60892290:1 gene:ENSRNOG00000045565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60891355:60892290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// NONRATT009133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// NONRATT009134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
XM_006221008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to novel protein (RGD1562276), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056427 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:61132535:61150418:1 gene:ENSRNOG00000037300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61132675:61152966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001080615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus clustered mitochondria (cluA/CLU1) homolog (Cluh), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus clustered mitochondria (cluA/CLU1) homolog (Cluh), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246863 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus clustered mitochondria (cluA/CLU1) homolog (Cluh), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus clustered mitochondria (cluA/CLU1) homolog (Cluh), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003687 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:61161917:61182201:1 gene:ENSRNOG00000002669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:61168709:61182201:1 gene:ENSRNOG00000002669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61161917:61182201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT009140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
XR_085968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 16 (Mettl16), transcript variant X1, misc_RNA. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XR_338707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 16 (Mettl16), transcript variant X1, misc_RNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XR_338708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 16 (Mettl16), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XR_357715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 16 (Mettl16), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003750 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:61348499:61393511:1 gene:ENSRNOG00000002764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056415 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:61348499:61393511:1 gene:ENSRNOG00000002764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056416 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:61348499:61393511:1 gene:ENSRNOG00000002764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166885 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6888322, containing frame-shift errors. // chr10 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT009142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000037190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61345279:61393511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001105807 // RefSeq // Rattus norvegicus MAX network transcriptional repressor (Mnt), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61406977:61422227:1 gene:ENSRNOG00000002894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61407381:61419838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_002724518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSR1, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae) (Tsr1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_002727774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSR1, 20S rRNA accumulation, homolog (S. cerevisiae) (Tsr1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61467842:61479252:1 gene:ENSRNOG00000002980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC086519 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7302535, with apparent retained intron. // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000037212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61466278:61478375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT009148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT009150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT009152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001105808 // RefSeq // Rattus norvegicus SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg6), mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 44 // 44 // 0 /// XM_006246867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg6), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 23 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000004058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61493274:61555359:1 gene:ENSRNOG00000003041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 34 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000072335 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:61249761:61263633:1 gene:ENSRNOG00000048863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 26 // 16 // 16 // 0 /// AY383695 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00040 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 39 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMG6 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg6), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 26 // 26 // 16 // 62 // 1 /// ENSRNOT00000052412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61679950:61702356:1 gene:ENSRNOG00000049565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 39 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61493855:61569783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61236517:61299715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 26 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT009154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// GENSCAN00000037188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61583564:61719916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 35 // 35 // 22 // 62 // 1
NR_031925 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 212 (Mir212), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053599 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:61729092:61729202:1 gene:ENSRNOG00000035476 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-212 // miRBase Micro RNA Database // MI0000952 Rattus norvegicus miR-212 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031878 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 132 (Mir132), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053639 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:61729385:61729485:1 gene:ENSRNOG00000035516 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61728233:61729614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-132 // miRBase Micro RNA Database // MI0000905 Rattus norvegicus miR-132 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181377 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulon 4 receptor-like 1 (Rtn4rl1), mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61748820:61822593:1 gene:ENSRNOG00000003121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AF532861 // GenBank // Rattus norvegicus Nogo-66 receptor homolog-2 (Ngrh2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// AY311478 // GenBank // Rattus norvegicus Nogo-66 receptor homolog 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// BC129084 // GenBank // Rattus norvegicus reticulon 4 receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:156572 IMAGE:8363864), complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61818697:61820956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT009161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001105810 // RefSeq // Rattus norvegicus SET and MYND domain containing 4 (Smyd4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET and MYND domain containing 4 (Smyd4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61904769:61951108:1 gene:ENSRNOG00000026783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61930302:61950535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_031824 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 22 (Mir22), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053743 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:62013642:62013736:1 gene:ENSRNOG00000035620 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225953 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YJ10 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-22 // miRBase Micro RNA Database // MI0000851 Rattus norvegicus miR-22 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT009163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000056355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62017702:62019907:1 gene:ENSRNOG00000037275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ219135 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YH06 mRNA sequence. // chr10 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62017826:62067040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT009168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001191590 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 8 (Prpf8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000005016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64348558:64371667:-1 gene:ENSRNOG00000003495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000041478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64332029:64371395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT011570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT011577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001105811 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab interacting lysosomal protein (Rilp), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64344730:64347883:-1 gene:ENSRNOG00000003784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ230353 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YG07 mRNA sequence. // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT011568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64332029:64371395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT011569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001107022 // RefSeq // Rattus norvegicus scavenger receptor class F, member 1 (Scarf1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64331642:64343951:-1 gene:ENSRNOG00000037268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ234496 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YM01 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC166488 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:187992 IMAGE:7104708. // chr10 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// BC088259 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7375764. // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64332029:64371395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT011566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT011567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001105812 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 43 (amino acid system L transporter), member 2 (Slc43a2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 43 (amino acid system L transporter), member 2 (Slc43a2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 43 (amino acid system L transporter), member 2 (Slc43a2), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64285713:64327600:-1 gene:ENSRNOG00000003835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64288384:64326670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_017231 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, alpha (Pitpna), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64232947:64273229:-1 gene:ENSRNOG00000003846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC070945 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:91736 IMAGE:7103390), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// M25758 // GenBank // Rat phosphatidylinositol transfer protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64186087:64272920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT011555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001013859 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase K (Inpp5k), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000048371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64209551:64228728:-1 gene:ENSRNOG00000004041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC083572 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase K, mRNA (cDNA clone MGC:93897 IMAGE:7112698), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ228522 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YF08 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000021423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64186087:64272920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// NONRATT011547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT011549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT011550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT011551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_023092 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IC (Myo1c), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000036666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64185628:64201933:-1 gene:ENSRNOG00000004072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64186087:64272920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT011541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0
NM_019302 // RefSeq // Rattus norvegicus v-crk avian sarcoma virus CT10 oncogene homolog (Crk), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64149258:64175516:-1 gene:ENSRNOG00000025792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006246913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-crk avian sarcoma virus CT10 oncogene homolog (Crk), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// FQ210506 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YI19 mRNA sequence. // chr10 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000021425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64152659:64175294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 70 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT011538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 89 // 58 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT011540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0
NM_031603 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, epsilon (Ywhae), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64084523:64121823:-1 gene:ENSRNOG00000005290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063163 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, epsilon polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:72769 IMAGE:6921685), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// FQ220393 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YA23 mRNA sequence. // chr10 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// M84416 // GenBank // Rat 14-3-3 protein epsilon isoform mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U53882 // GenBank // Rattus norvegicus 14-3-3 protein epsilon isoform mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64085679:64121727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001110155 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1565611 (RGD1565611), mRNA. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63834295:63837955:-1 gene:ENSRNOG00000025287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63834379:63837867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT011528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000010168 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:63647911:63653810:-1 gene:ENSRNOG00000007722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63647911:63659565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT011524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT011525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_021596 // RefSeq // Rattus norvegicus diazepam binding inhibitor-like 5 (Dbil5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63636586:63637600:-1 gene:ENSRNOG00000007771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF128531 // GenBank // Rattus norvegicus endozepine-like peptide (ELP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63636718:63636981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT011523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108282 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA methyltransferase like 1 (Rnmtl1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63609355:63616033:-1 gene:ENSRNOG00000037238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232324 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YD13 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63609559:63616022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT011522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003750867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2 (Nufip2), mRNA. // chr10 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// XM_006220733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2 (Nufip2), mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000030501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66425460:66448921:1 gene:ENSRNOG00000024964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000056276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66425460:66451772:1 gene:ENSRNOG00000024964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// GENSCAN00000039260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66388736:66448921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0
NM_001172137 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin XVIIIa (Myo18a), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000043448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66559668:66646100:1 gene:ENSRNOG00000033101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000039257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66559668:66645484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT009302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 26 // 45 // 1 /// NONRATT009300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// NONRATT009303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1
NM_001105754 // RefSeq // Rattus norvegicus seizure related 6 homolog (mouse) (Sez6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66710425:66759039:1 gene:ENSRNOG00000009350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66710442:66764937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT009309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT009313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_003750866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase SDR family member 13-like (RGD1305508), mRNA. // chrU // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_003752432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase SDR family member 13-like (RGD1305508), mRNA. // chrU // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66299994:66302981:1 gene:ENSRNOG00000009673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000053151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66282965:66302981:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001013117 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 12 (Phf12), mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006246960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 12 (Phf12), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 12 (Phf12), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000056234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66762563:66810434:1 gene:ENSRNOG00000009566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66772683:66809549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT009317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT009322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT009323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT009318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NR_031890 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 144 (Mir144), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053770 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:66340681:66340763:1 gene:ENSRNOG00000035647 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233014 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YI23 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-144 // miRBase Micro RNA Database // MI0000917 Rattus norvegicus miR-144 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031955 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-451 (Mir451), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054381 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:66340853:66340924:1 gene:ENSRNOG00000036258 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233014 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YI23 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-451 // miRBase Micro RNA Database // MI0001731 Rattus norvegicus miR-451 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100648 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box N1 (Foxn1), mRNA. // chr10 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66004940:66018336:1 gene:ENSRNOG00000010870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66002852:66018074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001191820 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of Ty 6 homolog (S. cerevisiae) (Supt6h), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66129656:66166766:1 gene:ENSRNOG00000012240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ222439 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YH08 mRNA sequence. // chr10 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000053144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66140569:66165933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT009275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT009274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NONRATT009282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT009282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NM_001105804 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA-related kinase 8 (Nek8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66197474:66208846:1 gene:ENSRNOG00000012866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66197534:66208192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107017 // RefSeq // Rattus norvegicus Tnf receptor associated factor 4 (Traf4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66209815:66215917:1 gene:ENSRNOG00000013169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC162047 // GenBank // Rattus norvegicus Tnf receptor associated factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:188008 IMAGE:7107394), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66209894:66215405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001013969 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 46 (folate transporter), member 1 (Slc46a1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 46 (folate transporter), member 1 (Slc46a1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65901910:65909255:-1 gene:ENSRNOG00000010291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089868 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 46, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:108986 IMAGE:7322786), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231269 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA73YK16 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65904816:65909191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT011618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019156 // RefSeq // Rattus norvegicus vitronectin (Vtn), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000039954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65872582:65875673:-1 gene:ENSRNOG00000010031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC105821 // GenBank // Rattus norvegicus vitronectin, mRNA (cDNA clone MGC:124961 IMAGE:7371104), complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// FQ219102 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YK22 mRNA sequence. // chr10 // 75 // 97 // 21 // 28 // 0 /// U44845 // GenBank // Rattus norvegicus vitronectin mRNA, complete cds. // chr10 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// FQ218900 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YD06 mRNA sequence. // chr10 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000053141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65872661:65875581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_023951 // RefSeq // Rattus norvegicus SEBOX homeobox (Sebox), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65870306:65871177:-1 gene:ENSRNOG00000009979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001105816 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta interacting protein 2 (Poldip2), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65852787:65861626:-1 gene:ENSRNOG00000009252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FJ515740 // GenBank // Rattus norvegicus DNA-directed polymerase delta interacting protein 2 (Poldip2) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65850318:65861567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT011609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001105815 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 20 homolog (Chlamydomonas) (Ift20), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 20 homolog (Chlamydomonas) (Ift20), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65832269:65837760:-1 gene:ENSRNOG00000008891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65832581:65838867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001173471 // RefSeq // Rattus norvegicus LYR motif containing 9 (Lyrm9), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65531688:65545716:-1 gene:ENSRNOG00000037204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC167116 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1562012, mRNA (cDNA clone MGC:189584 IMAGE:6922274), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65423441:65542517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_012611 // RefSeq // Rattus norvegicus nitric oxide synthase 2, inducible (Nos2), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// XM_006246949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nitric oxide synthase, inducible-like (LOC497963), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000016133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65335228:65363144:-1 gene:ENSRNOG00000011023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// D14051 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for nitric oxide synthase, complete cds. // chr10 // 79 // 82 // 11 // 14 // 0 /// D44591 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for inducible nitric oxide synthase, complete cds. // chr10 // 86 // 82 // 12 // 14 // 0 /// L12562 // GenBank // Rat nitric oxide synthase mRNA, complete cds. // chr10 // 81 // 94 // 13 // 16 // 0 /// U03699 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley inducible nitric oxide synthase (NOS) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 82 // 13 // 14 // 0 /// U26686 // GenBank // Rattus norvegicus nitric oxide synthase (NOS2) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000073138 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:65423626:65455464:-1 gene:ENSRNOG00000049980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// GENSCAN00000051063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65423441:65542517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT011601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000051048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65335387:65366353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
NONRATT011601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
ENSRNOT00000017230 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:65139576:65139968:-1 gene:ENSRNOG00000023182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65139576:65139968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012609 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofibromin 1 (Nf1), mRNA. // chr10 // 98 // 98 // 57 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000046262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64719521:64958999:-1 gene:ENSRNOG00000013780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 98 // 57 // 58 // 0 /// D45201 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neurofibromin, complete cds. // chr10 // 98 // 98 // 57 // 58 // 0 /// GENSCAN00000014745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64831644:64947098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64720058:64760115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT011595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 19 // 19 // 11 // 59 // 1
NM_001107023 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 4 (class II) (Rab11fip4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 4 (class II) (Rab11fip4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64601743:64705829:-1 gene:ENSRNOG00000014135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64602911:64642764:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_031909 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-193 (Mir193), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-193 // miRBase Micro RNA Database // MI0000936 Rattus norvegicus miR-193 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031952 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-365 (Mir365), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053778 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:64570072:64570157:-1 gene:ENSRNOG00000035655 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-365 // miRBase Micro RNA Database // MI0001656 Rattus norvegicus miR-365 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000050325 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:64400765:64402272:-1 gene:ENSRNOG00000029091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_173327 // RefSeq // Rattus norvegicus TAO kinase 1 (Taok1), mRNA. // chr10 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000021368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62271616:62327224:1 gene:ENSRNOG00000015692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// AF084205 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine protein kinase TAO1 mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000014753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62271616:62327038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 57 // 20 // 21 // 0
NM_001105818 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible protein 13 (Tp53i13), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible protein 13 (Tp53i13), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62347593:62352210:1 gene:ENSRNOG00000022615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158678 // GenBank // Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:187684 IMAGE:8372780), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62347656:62352048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT009178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT009181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT009176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT009180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006246919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 13B (Ankrd13b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62372014:62388287:1 gene:ENSRNOG00000014742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000056110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62372014:62388298:1 gene:ENSRNOG00000014742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62380428:62388414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT009186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT009187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT009182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT009183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT009184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT009185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
ENSRNOT00000015673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:62664570:62665127:-1 gene:ENSRNOG00000011753 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000013459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62632595:62664902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
XM_006220730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 5 (Efcab5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 5 (Efcab5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000030805 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:62678113:62783653:1 gene:ENSRNOG00000022536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031618 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:62678455:62783659:1 gene:ENSRNOG00000022536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62702070:62829433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001037189 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear speckle splicing regulatory protein 1 (Nsrp1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000030749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62796501:62829730:1 gene:ENSRNOG00000022502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC099120 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 55, mRNA (cDNA clone MGC:116261 IMAGE:7462721), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62702070:62829433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
NR_032276 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-423 (Mir423), microRNA. // chr10 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000053660 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:62796746:62796839:1 gene:ENSRNOG00000035537 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-423 // miRBase Micro RNA Database // MI0006145 Rattus norvegicus miR-423 stem-loop // chr10 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0
NM_012836 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase D (Cpd), mRNA. // chr10 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000005262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63024264:63088488:1 gene:ENSRNOG00000003873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AF284830 // GenBank // Rattus norvegicus carboxypeptidase D isoform CPD-N mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// U62897 // GenBank // Rattus norvegicus carboxypeptidase D precursor (Cpd) mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000037935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63024309:63088294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT009194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT009195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT009197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_053584 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi SNAP receptor complex member 1 (Gosr1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63104268:63261223:1 gene:ENSRNOG00000003971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC126068 // GenBank // Rattus norvegicus golgi SNAP receptor complex member 1, mRNA (cDNA clone MGC:156530 IMAGE:7387185), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U49099 // GenBank // Rattus norvegicus cis-Golgi p28 (p28) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1
NM_001105814 // RefSeq // Rattus norvegicus active BCR-related (Abr), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// XM_006246901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus active BCR-related (Abr), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000032861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63306286:63449250:1 gene:ENSRNOG00000022216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000051384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63372169:63446906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 88 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT009206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 54 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT009203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// NONRATT009207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001108285 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoredoxin (Nxn), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63464227:63601539:1 gene:ENSRNOG00000008178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63464297:63601372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// NONRATT009212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_001080963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase family, AAA domain containing 5 (Atad5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_220750 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase family, AAA domain containing 5 (Atad5), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000035642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67086230:67131964:1 gene:ENSRNOG00000021903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000065727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67086230:67131964:1 gene:ENSRNOG00000021903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000046746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67086248:67131964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT009325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
ENSRNOT00000005330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67142374:67143132:1 gene:ENSRNOG00000004002 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT009328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_020101 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with dual PH domains 2 (Adap2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000056273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67176545:67184296:1 gene:ENSRNOG00000037148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT009330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67141430:67183015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001012010 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 135 (Rnf135), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67189251:67207113:1 gene:ENSRNOG00000050951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087718 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 135, mRNA (cDNA clone MGC:105754 IMAGE:7316530), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY539935 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00184 mRNA, complete cds. // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT009333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67189127:67216749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
AY539935 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00184 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT009335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1
NM_001107026 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member T1 (Rhot1), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006246985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras homolog gene family, member T1 (Rhot1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67216682:67297278:1 gene:ENSRNOG00000004093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC129123 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member T1, mRNA (cDNA clone MGC:156790 IMAGE:7130774), complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ211576 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA87YM03 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67231056:67296407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT009337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT009338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
AY539935 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00184 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67231056:67296407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
AY539935 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00184 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000046742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67231056:67296407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT009336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001105819 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid, veinlet-like 3 (Drosophila) (Rhbdl3), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006246981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid, veinlet-like 3 (Drosophila) (Rhbdl3), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006246982 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid, veinlet-like 3 (Drosophila) (Rhbdl3), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67333796:67387701:1 gene:ENSRNOG00000005515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67334047:67385417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001039020 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 207 (Zfp207), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006247001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 207 (Zfp207), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XR_357758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 207 (Zfp207), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000000253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67418703:67430464:1 gene:ENSRNOG00000000236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC100269 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 207, mRNA (cDNA clone MGC:116398 IMAGE:7387460), complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// FQ221862 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA30YM17 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT009344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT009346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1 /// NONRATT009345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// GENSCAN00000039592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67418824:67509642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1 /// NONRATT009347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001107027 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 11 (Psmd11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246987 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 11 (Psmd11), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67465213:67510908:1 gene:ENSRNOG00000005538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ225888 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YM23 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67418824:67509642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT009355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_053891 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 1 (p35) (Cdk5r1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67515764:67516965:1 gene:ENSRNOG00000021685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U50707 // GenBank // Rattus norvegicus P35 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67515947:67518691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007672 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 98 (Tmem98), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67842260:67853166:1 gene:ENSRNOG00000021316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078932 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 98, mRNA (cDNA clone MGC:93733 IMAGE:7107480), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ214419 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YM19 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67844442:67852567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001105820 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm acrosome associated 3 (Spaca3), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67900142:67903343:1 gene:ENSRNOG00000006994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67899664:67903228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// NONRATT009362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000049614 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:68251558:68251890:1 gene:ENSRNOG00000030217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000026341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:68251558:68251890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000051237 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:68339640:68340486:1 gene:ENSRNOG00000029282 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:68336972:68340486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_031530 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 2 (Ccl2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69047091:69048889:1 gene:ENSRNOG00000007159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF058786 // GenBank // Rattus norvegicus JE/MCP-1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M57441 // GenBank // Rat chemoattractant protein-1 (MCP-1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69020064:69050665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001007612 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 7 (Ccl7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69058109:69059959:1 gene:ENSRNOG00000000239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69058197:69059534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT009365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019205 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 11 (Ccl11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69069783:69074383:1 gene:ENSRNOG00000007335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U96637 // GenBank // Rattus norvegicus eotaxin mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69069817:69073734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT009366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105822 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 12 (Ccl12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69111876:69113426:1 gene:ENSRNOG00000029768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69111927:69113234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT009367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
FQ211483 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YD12 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NM_001134410 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 132E (Tmem132e), mRNA. // chr10 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000055999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69370778:69428365:1 gene:ENSRNOG00000007455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// GENSCAN00000012493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69377522:69427362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001037360 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 830 (Zfp830), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69748958:69750421:1 gene:ENSRNOG00000007578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104717 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 830, mRNA (cDNA clone MGC:125001 IMAGE:7381762), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69748965:69750077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT009369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012011 // RefSeq // Rattus norvegicus ligase III, DNA, ATP-dependent (Lig3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006246991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligase III, DNA, ATP-dependent (Lig3), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000055982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69765475:69786585:1 gene:ENSRNOG00000021815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC085959 // GenBank // Rattus norvegicus ligase III, DNA, ATP-dependent, mRNA (cDNA clone MGC:95328 IMAGE:7135421), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000012490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69767829:69786138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT009370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001107030 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 8 (Fndc8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69874015:69882153:1 gene:ENSRNOG00000008264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69877364:69880784:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107028 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-45 homolog B (C. elegans) (Unc45b), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006246996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus unc-45 homolog B (C. elegans) (Unc45b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000064625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69893524:69920936:1 gene:ENSRNOG00000009466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000010770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69892709:69920278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT009374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT009375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
ENSRNOT00000035730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69938083:69939729:1 gene:ENSRNOG00000021719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69933182:69943680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000019503 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:69959764:69960739:1 gene:ENSRNOG00000014534 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69959863:69962214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000055958 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:69997357:69997850:1 gene:ENSRNOG00000037114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69985100:70030613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
NM_001107031 // RefSeq // Rattus norvegicus schlafen 2 (Slfn2), mRNA. // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000055957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70001084:70007628:1 gene:ENSRNOG00000037113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// BC168853 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8372250. // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// FQ230461 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YA03 mRNA sequence. // chr10 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69985100:70030613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT009380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT009381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_053687 // RefSeq // Rattus norvegicus schlafen 3 (Slfn3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70042620:70069233:1 gene:ENSRNOG00000048673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF168795 // GenBank // Rattus norvegicus schlafen-4 (SLFN-4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_006220740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen 4 (Slfn4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006220741 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen 4 (Slfn4), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006220742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen 4 (Slfn4), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006220743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen 4 (Slfn4), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006247006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen 4 (Slfn4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006247024 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen 4 (Slfn4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000055954 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:70981966:70992017:1 gene:ENSRNOG00000037111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071656 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:70106091:70112568:1 gene:ENSRNOG00000021357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70063747:70116553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70890012:70997926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000055955 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:70106184:70110436:1 gene:ENSRNOG00000021357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
XR_338756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909847 (LOC100909847), ncRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_357780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912181 (LOC100912181), ncRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_357785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909847 (LOC100909847), ncRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000013687 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:70264079:70270710:1 gene:ENSRNOG00000010302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// XM_006220746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-like protein family member 10B-like (LOC100912246), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// XM_006247016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-like protein family member 10B-like (LOC100912246), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// XM_006247030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS-like, family 10, member B (Rasl10b), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NM_001191648 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS-like, family 10, member B (Rasl10b), mRNA. // chr10 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// XM_006220747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-like protein family member 10B-like (LOC100912246), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000074094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71089431:71099354:1 gene:ENSRNOG00000045705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000010765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70264079:70270710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71092274:71098905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70259289:70261471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000026317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71087484:71089666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
XM_001069291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689039 (LOC689039), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003750878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912283 (LOC100912283), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689039 (LOC689039), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073592 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:71120462:71121113:1 gene:ENSRNOG00000046543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074839 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:70291477:70292128:1 gene:ENSRNOG00000049757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70288965:70292128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71117950:71121113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000042963 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:70322950:70355479:1 gene:ENSRNOG00000010604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000064396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71159197:71182350:1 gene:ENSRNOG00000048528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// BC166769 // GenBank // Rattus norvegicus TAF15 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:188542 IMAGE:7933997), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NM_001105824 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF15 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf15), mRNA. // chr10 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// ENSRNOT00000067630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70322902:70355481:1 gene:ENSRNOG00000010604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// GENSCAN00000016798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70328751:70355639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000026325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71157736:71185821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT009391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_053858 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 4 (Ccl4), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70516588:70518060:1 gene:ENSRNOG00000011406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF121996 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS small inducible cytokine A4 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// EF121997 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW small inducible cytokine A4 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// U06434 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage inflammatory protein-1 beta (MIP-1 beta) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70516588:70518060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_002727786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 17 (Wfdc17), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_003750885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus extracellular peptidase inhibitor-like (LOC100912616), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_003752359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 17 (Wfdc17), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000003376 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:70623541:70624388:1 gene:ENSRNOG00000002497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_133537 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 18 (Wfdc18), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000055923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70632470:70634624:1 gene:ENSRNOG00000037097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// EF121998 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS extracellular peptidase inhibitor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// EF121999 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW extracellular peptidase inhibitor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT009398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001003706 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 21 (Wfdc21), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000042643 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:70671071:70676952:1 gene:ENSRNOG00000029668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB101676 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for WDNM1-like protein, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// EF122000 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS WDNM1-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// EF122001 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW WDNM1-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001079897 // RefSeq // Rattus norvegicus HEAT repeat containing 6 (Heatr6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000003492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70678105:70706990:1 gene:ENSRNOG00000002542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// EF122002 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS 2700008B19Rik-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// EF122003 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW 2700008B19Rik-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000016813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70632476:70706990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT009400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT009401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0
NM_013103 // RefSeq // Rattus norvegicus HNF1 homeobox B (Hnf1b), mRNA. // chrU // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// BC081826 // GenBank // Rattus norvegicus HNF1 homeobox B, mRNA (cDNA clone MGC:93549 IMAGE:7109422), complete cds. // chrU // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// EF121973 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW transcription factor 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrU // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// EF121974 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW transcription factor 2 splice variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrU // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// EF122006 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS transcription factor 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrU // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000047427 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:70778377:70829124:1 gene:ENSRNOG00000002598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// GENSCAN00000016808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70778522:70794101:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// GENSCAN00000026310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70813636:70829483:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT009403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
ENSRNOT00000040771 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:69731799:69732372:1 gene:ENSRNOG00000030291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_053525 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 52 (Ddx52), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006247003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 52 (Ddx52), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70864589:70887723:1 gene:ENSRNOG00000002612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB055628 // GenBank // Rattus norvegicus rROK1L mRNA for ROK1-like protein, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC089107 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 52, mRNA (cDNA clone MGC:105350 IMAGE:7310368), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// EF121975 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS ATP-dependent RNA helicase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// EF121976 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW ATP-dependent RNA helicase mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// FQ234208 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YM16 mRNA sequence. // chr10 // 80 // 78 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70864597:70887354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_022193 // RefSeq // Rattus norvegicus acetyl-CoA carboxylase alpha (Acaca), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 54 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000041140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71459842:71630271:1 gene:ENSRNOG00000034013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 47 // 47 // 0 /// EF121986 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS acetyl-coenzyme A carboxylase alpha mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 54 // 54 // 0 /// EF121987 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW acetyl-coenzyme A carboxylase alpha mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 54 // 54 // 0 /// J03808 // GenBank // Rat acetyl-coenzyme A carboxylase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 54 // 54 // 0 /// GENSCAN00000043049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71420091:71555630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT009414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000043055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71571243:71632504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 25 // 25 // 15 // 59 // 1
NM_001163736 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin XIX (Myo19), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000003886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72105466:72134751:1 gene:ENSRNOG00000002852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000030319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72107712:72134290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT009422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// NONRATT009425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1
NM_019174 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 4 (Car4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 4 (Car4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72179405:72188138:1 gene:ENSRNOG00000002916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097329 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 4, mRNA (cDNA clone MGC:114335 IMAGE:7445156), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ222059 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YJ01 mRNA sequence. // chr10 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT009428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72179068:72190145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT009429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
ENSRNOT00000070950 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:10:72190116:72190211:1 gene:ENSRNOG00000046383 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_001081077 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1 (CHD-1) (RGD1310166), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_220804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1 (CHD-1) (RGD1310166), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000004193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72391463:72402105:1 gene:ENSRNOG00000003143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72310450:72412038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT009433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001105825 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1D (Ppm1d), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72813803:72849854:1 gene:ENSRNOG00000003329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC162058 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1D magnesium-dependent, delta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:188052 IMAGE:7115026), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72809951:72848960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001173430 // RefSeq // Rattus norvegicus breast carcinoma amplified sequence 3 (Bcas3), mRNA. // chrU // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72660660:72944206:1 gene:ENSRNOG00000003419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 94 // 55 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT009439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT009440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000030270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72669861:72793164:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT009434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT009435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001107033 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 2 (Tbx2), mRNA. // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73184218:73192261:1 gene:ENSRNOG00000003517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73103448:73267474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001107034 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 4 (Tbx4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006247037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 4 (Tbx4), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73235440:73265104:1 gene:ENSRNOG00000003544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000051431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73103448:73267474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT009453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001013860 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidyl-tRNA hydrolase 2 (Ptrh2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:76088309:76098333:-1 gene:ENSRNOG00000004288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083801 // GenBank // Rattus norvegicus peptidyl-tRNA hydrolase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94834 IMAGE:7108916), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:76090587:76105640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NR_031770 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-301a (Mir301a), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053709 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:75682818:75682917:-1 gene:ENSRNOG00000035586 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-301a // miRBase Micro RNA Database // MI0000593 Rattus norvegicus miR-301a stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108288 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 37 (Trim37), mRNA. // chr10 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// XM_006247099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 37 (Trim37), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006247102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 37 (Trim37), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000008298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75532170:75677779:-1 gene:ENSRNOG00000006248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// BC168955 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 37, mRNA (cDNA clone MGC:189264 IMAGE:7135665), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000042452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75561494:75686409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT011832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT011833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
XM_006220768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 14 (Tex14), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// XM_006220771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 14 (Tex14), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009077 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:75253102:75355211:-1 gene:ENSRNOG00000023698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75302993:75322892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
FQ229993 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YP18 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// V01267 // GenBank // Rattus norvegicus U3 snRNA. // chr10 // 52 // 92 // 12 // 23 // 0 /// NONRATT011379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// NONRATT011380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
FQ229993 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YP18 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// V01267 // GenBank // Rattus norvegicus U3 snRNA. // chr10 // 52 // 92 // 12 // 23 // 0 /// NONRATT011379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// NONRATT011380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
FQ229993 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YP18 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// V01267 // GenBank // Rattus norvegicus U3 snRNA. // chr10 // 52 // 92 // 12 // 23 // 0 /// NONRATT011379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// NONRATT011380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
NM_001105827 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 4 (Mtmr4), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75192507:75215438:-1 gene:ENSRNOG00000007496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75151070:75229429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 89 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT011815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0
XM_001081169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock transcription factor family member 5 (Hsf5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock transcription factor family member 5 (Hsf5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009981 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:75151070:75191422:-1 gene:ENSRNOG00000007579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75151070:75229429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001135921 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 43 (Rnf43), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 43 (Rnf43), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247094 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 43 (Rnf43), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000010296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75073437:75143103:-1 gene:ENSRNOG00000007606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75064509:75143103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001105828 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of Ty 4 homolog 1 (S. cerevisiae) (Supt4h1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000010448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75063840:75070031:-1 gene:ENSRNOG00000007845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC168730 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of Ty 4 homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188814 IMAGE:6887426), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// FQ224188 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA74YF17 mRNA sequence. // chr10 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1 /// NONRATT011809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT011810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000021512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75064509:75143103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1 /// NONRATT011811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1 /// NONRATT011812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1
XM_006247112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus benzodiazapine receptor (peripheral) associated protein 1 (Bzrap1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// XM_006247113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus benzodiazapine receptor (peripheral) associated protein 1 (Bzrap1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75025954:75047368:-1 gene:ENSRNOG00000007957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000046668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75025954:75047368:-1 gene:ENSRNOG00000007957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// AF199337 // GenBank // Rattus norvegicus RIM binding protein 1A (Rbp1A) mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75023730:75051480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 15 // 43 // 1
XM_006247095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myeloperoxidase (Mpo), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myeloperoxidase (Mpo), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75004455:75012460:-1 gene:ENSRNOG00000008310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NM_001107036 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloperoxidase (Mpo), mRNA. // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000065910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75004128:75014496:-1 gene:ENSRNOG00000008310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000021501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75004546:75013770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001034917 // RefSeq // Rattus norvegicus Meckel syndrome, type 1 (Mks1), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XR_357798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Meckel syndrome, type 1 (Mks1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74942158:74952824:-1 gene:ENSRNOG00000008635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099806 // GenBank // Rattus norvegicus Meckel syndrome, type 1, mRNA (cDNA clone MGC:124860 IMAGE:7938236), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74942937:74952824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0