NM_001077669 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 4 (Slc39a4), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000040422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117663814:117667986:-1 gene:ENSRNOG00000014314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117663814:117667986:-1 gene:ENSRNOG00000014314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 84 // 30 // 32 // 0 /// BC127514 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:156705 IMAGE:7100017), complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117649943:117667891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT051973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT051974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001130492 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae) (Vps28), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae) (Vps28), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117672422:117676270:-1 gene:ENSRNOG00000014633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC168742 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188842 IMAGE:6919204), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117672567:117693423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT051978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT051980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001130572 // RefSeq // Rattus norvegicus tonsoku-like, DNA repair protein (Tonsl), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117676480:117691180:-1 gene:ENSRNOG00000014703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117672567:117693423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT051981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001130493 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box H1 (Foxh1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117718390:117720470:-1 gene:ENSRNOG00000015371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117718897:117720462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001130494 // RefSeq // Rattus norvegicus RecQ protein-like 4 (Recql4), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000045135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117753871:117761035:-1 gene:ENSRNOG00000032446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000048821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117754046:117761001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT051990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT051991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT051992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0
NM_001135896 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 24 (Lrrc24), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000030517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117767712:117774850:-1 gene:ENSRNOG00000016204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC127521 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Peroxidasin CG12002-PA, mRNA (cDNA clone MGC:156747 IMAGE:7110443), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117767798:117771468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT051993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENSRNOT00000021775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117774185:117776528:-1 gene:ENSRNOG00000045765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081992 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C030006K11, mRNA (cDNA clone MGC:94207 IMAGE:7130152), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117775267:117835095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_173122 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 39 (Arhgap39), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000052227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117776694:117869344:-1 gene:ENSRNOG00000016566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117775267:117835095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001191911 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 251 (Zfp251), mRNA. // chrU // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// XM_006241854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 251 (Zfp251), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000028184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117899537:117924579:-1 gene:ENSRNOG00000030308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117903224:117931421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT052000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
XM_006226141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 647 (Zfp647), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 250-like (LOC102555083), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_343279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 647 (Zfp647), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074262 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:117959056:117963565:-1 gene:ENSRNOG00000050661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075636 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:118506346:118510855:-1 gene:ENSRNOG00000050651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118506014:118511813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117958724:117964523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_003750375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein L3-like (LOC100910885), partial mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// XM_003754314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein L3-like (LOC100910885), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118465707:118466719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// NONRATT052013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// GENSCAN00000022832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118935806:118964940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_001025066 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein L 9a (Apol9a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:118924874:118931634:-1 gene:ENSRNOG00000023410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083768 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein L 9a, mRNA (cDNA clone MGC:94714 IMAGE:7193209), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118925311:118932197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_086305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein L3-like (RGD1565356), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118892998:118910010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_003754315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein L 11a (Apol11a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006241949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein L 11a (Apol11a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006241950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein L 11a (Apol11a), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031568 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:118832285:118836376:-1 gene:ENSRNOG00000023122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118832295:118841448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0
NM_013194 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 9, non-muscle (Myh9), mRNA. // chr7 // 85 // 98 // 33 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000007398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:118738702:118790053:-1 gene:ENSRNOG00000004860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000037611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:118988231:119039294:-1 gene:ENSRNOG00000049236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// U31463 // GenBank // Rattus norvegicus nonmuscle myosin heavy chain-A mRNA, complete cds. // chr7 // 85 // 98 // 33 // 39 // 0 /// GENSCAN00000022843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118975275:119039294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000022853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118726157:118790035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT052013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT052014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_053331 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin 2 (Txn2), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119138949:119152970:-1 gene:ENSRNOG00000005614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC081760 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:93312 IMAGE:7190504), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// FQ215775 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YL04 mRNA sequence. // chr7 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// U73525 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119139651:119159378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT052020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001191787 // RefSeq // Rattus norvegicus FAD-dependent oxidoreductase domain containing 2 (Foxred2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119167570:119179999:-1 gene:ENSRNOG00000005749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119166199:119240188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT052022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001004283 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit D (Eif3d), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006241938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit D (Eif3d), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119182951:119195340:-1 gene:ENSRNOG00000005804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC079005 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit D, mRNA (cDNA clone MGC:93918 IMAGE:7113045), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119166199:119240188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT052024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT052027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT052025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT052026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_053351 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2 (Cacng2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 2 (Cacng2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119222819:119343985:-1 gene:ENSRNOG00000006226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF118818 // GenBank // Rattus norvegicus IPR328 protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF361339 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit (Cacng2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119166199:119240188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001130495 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 27 homolog (Chlamydomonas) (Ift27), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119384971:119401297:-1 gene:ENSRNOG00000006440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168150 // GenBank // Rattus norvegicus RAB, member of RAS oncogene family-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:187558 IMAGE:7457249), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ213751 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YO11 mRNA sequence. // chr7 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0 /// NONRATT052036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119374606:119409195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_022499 // RefSeq // Rattus norvegicus parvalbumin (Pvalb), mRNA. // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119419896:119435231:-1 gene:ENSRNOG00000006471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC126090 // GenBank // Rattus norvegicus parvalbumin, mRNA (cDNA clone MGC:156648 IMAGE:7321065), complete cds. // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// FQ215367 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YI05 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ215681 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YD10 mRNA sequence. // chr7 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// FQ215956 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YK11 mRNA sequence. // chr7 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// FQ216260 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YM08 mRNA sequence. // chr7 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// FQ217132 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YJ05 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// FQ217446 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA26YE01 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// FQ217743 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA19YA17 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// M12725 // GenBank // Rat parvalbumin mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ215806 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YJ02 mRNA sequence. // chr7 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// FQ215975 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YI10 mRNA sequence. // chr7 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000022339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119420798:119433062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_012808 // RefSeq // Rattus norvegicus thiosulfate sulfurtransferase (Tst), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119606996:119613809:-1 gene:ENSRNOG00000000186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088449 // GenBank // Rattus norvegicus thiosulfate sulfurtransferase, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:95094 IMAGE:7126617), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224444 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA65YP11 mRNA sequence. // chr7 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// FQ216517 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YG24 mRNA sequence. // chr7 // 32 // 100 // 8 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119588417:119613716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130556 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 6 (Tmprss6), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000000200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119649832:119680257:-1 gene:ENSRNOG00000000184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119650359:119675981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001034932 // RefSeq // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 6 (C1qtnf6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119734790:119741304:-1 gene:ENSRNOG00000007300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC101907 // GenBank // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:124704 IMAGE:7933909), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119736244:119747057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_133522 // RefSeq // Rattus norvegicus somatostatin receptor 3 (Sstr3), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119749198:119756392:-1 gene:ENSRNOG00000007332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008384 // RefSeq // Rattus norvegicus ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2) (Rac2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119772955:119786171:-1 gene:ENSRNOG00000007350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086399 // GenBank // Rattus norvegicus ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 (rho family, small GTP binding protein Rac2), mRNA (cDNA clone MGC:105983 IMAGE:7303112), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ230979 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YL21 mRNA sequence. // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// FQ228077 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YJ14 mRNA sequence. // chr7 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119773999:119786236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT052053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
XM_006242041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1 regulatory subunit 29-like (LOC100910536), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010609 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:119883205:119885667:-1 gene:ENSRNOG00000007934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119876657:119885667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_199110 // RefSeq // Rattus norvegicus MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase (Mfng), mRNA. // chr7 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119970579:119988416:-1 gene:ENSRNOG00000008133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC061801 // GenBank // Rattus norvegicus MFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:72576 IMAGE:5598335), complete cds. // chr7 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT052059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119969080:120049093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_001130554 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase recruitment domain family, member 10 (Card10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006241986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caspase recruitment domain family, member 10 (Card10), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119991064:120018980:-1 gene:ENSRNOG00000008401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119969080:120049093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
XR_348106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549536 (LOC102549536), ncRNA. // chr7 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// XR_355837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549536 (LOC102549536), ncRNA. // chr7 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// GENSCAN00000019345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119969080:120049093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_133599 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 2 (Lgals2), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120062257:120069133:-1 gene:ENSRNOG00000008539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB001075 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for galectin-2 related protein, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120062445:120063788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001025285 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 54 (Ankrd54), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120275642:120286573:-1 gene:ENSRNOG00000010821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC093616 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 54, mRNA (cDNA clone MGC:105715 IMAGE:7311744), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006242012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 54 (Ankrd54), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120276585:120286512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006241993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700088E04 (RGD1359634), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120366954:120374272:-1 gene:ENSRNOG00000011170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079039 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700088E04, mRNA (cDNA clone MGC:93972 IMAGE:7114722), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120367431:120372432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_019193 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 10 (Sox10), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120387071:120397340:-1 gene:ENSRNOG00000011305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ001029 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Sox10 protein. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC062067 // GenBank // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 10, mRNA (cDNA clone MGC:72475 IMAGE:5599259), complete cds. // chr7 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT052076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120388118:120449282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_031744 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 8 (Slc16a8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 8 (Slc16a8), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120479963:120483707:-1 gene:ENSRNOG00000012090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF059258 // GenBank // Rattus norvegicus monocarboxylate transporter MCT3 mRNA, complete cds. // chr7 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120480057:120511030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001271220 // RefSeq // Rattus norvegicus BAI1-associated protein 2-like 2 (Baiap2l2), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120486375:120511795:-1 gene:ENSRNOG00000012215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120480057:120511030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001270796 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group VI (cytosolic, calcium-independent) (Pla2g6), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006241997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group VI (cytosolic, calcium-independent) (Pla2g6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// XM_006242001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group VI (cytosolic, calcium-independent) (Pla2g6), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120512623:120552754:-1 gene:ENSRNOG00000012295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// U51898 // GenBank // Rattus norvegicus Ca2+-independent phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr7 // 85 // 85 // 29 // 34 // 0 /// NM_001005560 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group VI (cytosolic, calcium-independent) (Pla2g6), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000017108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120512623:120552754:-1 gene:ENSRNOG00000012295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// BC081916 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A2, group VI (cytosolic, calcium-independent), mRNA (cDNA clone MGC:93880 IMAGE:7112407), complete cds. // chr7 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// GENSCAN00000049185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120513181:120552961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT052081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT052083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1
NM_001173370 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 184B (Tmem184b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 184B (Tmem184b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120586166:120629422:-1 gene:ENSRNOG00000022802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001173370 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 184B (Tmem184b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006242014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 184B (Tmem184b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120586166:120629422:-1 gene:ENSRNOG00000022802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120588096:120630131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031617 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 1, epsilon (Csnk1e), mRNA. // chr7 // 95 // 54 // 18 // 19 // 0 /// XM_006242034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase 1, epsilon (Csnk1e), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120646909:120665180:-1 gene:ENSRNOG00000013076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 54 // 18 // 19 // 0 /// AB042191 // GenBank // Rattus norvegicus rCK1e mRNA for casein kinase 1 epsilon, complete cds. // chr7 // 95 // 54 // 18 // 19 // 0 /// AB042192 // GenBank // Rattus norvegicus rCK1e-3 mRNA for casein kinase 1 epsilon-3, complete cds. // chr7 // 88 // 69 // 21 // 24 // 0 /// AB056113 // GenBank // Rattus norvegicus Ck1e-2 mRNA for casein kinase1 epsilon-2, complete cds. // chr7 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120643900:120660667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 69 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT052094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT052093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT052095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001127546 // RefSeq // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 3 (Kdelr3), mRNA. // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000056169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120748515:120753160:1 gene:ENSRNOG00000013577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// BC162033 // GenBank // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:187945 IMAGE:9103157), complete cds. // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120745517:120753589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT050142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT050143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_053870 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 (Kcnj4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 113 // 113 // 0 /// XM_006241964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 (Kcnj4), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 113 // 113 // 0 /// XM_006241965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 4 (Kcnj4), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 113 // 113 // 0 /// ENSRNOT00000018564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120710791:120738030:-1 gene:ENSRNOG00000013869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 113 // 113 // 0 /// U27582 // GenBank // Rattus norvegicus brain inwardly rectifying K+ channel 2 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 99 // 108 // 112 // 0 /// X87635 // GenBank // R.norvegicus mRNA for inwardly rectifying potassium channel. // chr7 // 96 // 100 // 108 // 113 // 0 /// GENSCAN00000012346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120711509:120713447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 113 // 113 // 0 /// NONRATT052098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 113 // 113 // 0
NM_001025009 // RefSeq // Rattus norvegicus Josephin domain containing 1 (Josd1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000019612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120895716:120910124:-1 gene:ENSRNOG00000014440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC091280 // GenBank // Rattus norvegicus Josephin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:109161 IMAGE:7384518), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT052113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000020852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120941356:120958528:-1 gene:ENSRNOG00000015177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000046399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120941356:120958528:-1 gene:ENSRNOG00000015177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// FQ224496 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA64YC15 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000012341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120942718:120981993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT052114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_001009666 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, light chain 4 (Dnal4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120978397:120991231:-1 gene:ENSRNOG00000015583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087688 // GenBank // Rattus norvegicus dynein, axonemal, light chain 4, mRNA (cDNA clone MGC:105573 IMAGE:7311257), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120942718:120981993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_030841 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal pentraxin receptor (Nptxr), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121002639:121020713:-1 gene:ENSRNOG00000016156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF005099 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal pentraxin receptor mRNA, complete cds. // chr7 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONRATT052118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120992761:121048976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001012119 // RefSeq // Rattus norvegicus chromobox homolog 6 (Cbx6), mRNA. // chr7 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121041261:121048988:-1 gene:ENSRNOG00000046955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC087122 // GenBank // Rattus norvegicus chromobox homolog 6, mRNA (cDNA clone MGC:94814 IMAGE:7108347), complete cds. // chr7 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT052119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000012336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120992761:121048976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
XM_006242023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 7 (Cbx7), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC062392 // GenBank // Rattus norvegicus chromobox homolog 7, mRNA (cDNA clone MGC:72633 IMAGE:5621139), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_199117 // RefSeq // Rattus norvegicus chromobox homolog 7 (Cbx7), mRNA. // chr7 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000022631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121126405:121143721:-1 gene:ENSRNOG00000016875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT052122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT052123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121128915:121185868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT052124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT052126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_031524 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet-derived growth factor beta polypeptide (Pdgfb), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121205506:121223140:-1 gene:ENSRNOG00000017197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121206417:121230814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_198753 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L3 (Rpl3), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121287085:121292461:-1 gene:ENSRNOG00000016896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058494 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L3, mRNA (cDNA clone MGC:72934 IMAGE:6887923), complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// FQ228916 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YI20 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ223182 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA14YI19 mRNA sequence. // chr7 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// FQ228708 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YJ07 mRNA sequence. // chr7 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121287136:121292575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
GENSCAN00000025506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121473869:121476870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001135913 // RefSeq // Rattus norvegicus ENTH domain containing 1 (Enthd1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121659505:121773566:-1 gene:ENSRNOG00000025344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC167764 // GenBank // Rattus norvegicus ENTH domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187523 IMAGE:7453894), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121660117:121689861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006226162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus megakaryoblastic leukemia (translocation) 1 (Mkl1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus megakaryoblastic leukemia (translocation) 1 (Mkl1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032232 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:122218547:122313356:-1 gene:ENSRNOG00000018803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064515 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:122218547:122231476:-1 gene:ENSRNOG00000018803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB588919 // GenBank // Rattus norvegicus MKL1met mRNA for megakaryoblastic leukemia 1 met, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB588920 // GenBank // Rattus norvegicus BSAC mRNA for basic, SAP, and coiled-coil domain containing protein, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB588921 // GenBank // Rattus norvegicus MELODY mRNA for MKL1-elongated derivative of yield protein, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122218547:122229613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT052144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001126269 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, peroxisomal membrane protein), member 17 (Slc25a17), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122515166:122557399:-1 gene:ENSRNOG00000018920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166457 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; peroxisomal membrane protein, 34kDa), member 17, mRNA (cDNA clone MGC:187738 IMAGE:9025369), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122515872:122531583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
FQ212434 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA54YP22 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130510 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 7 (Dnajb7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122619555:122620466:-1 gene:ENSRNOG00000019187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122619555:122620466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000054624 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:122667599:122667694:-1 gene:ENSRNOG00000048207 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_003750388 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroadherin-like (Chadl), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// XM_003754320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroadherin-like (Chadl), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// XM_006226167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroadherin-like (Chadl), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006242133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroadherin-like (Chadl), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000205 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:122895768:122900832:-1 gene:ENSRNOG00000024631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000046192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122896518:122902233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// FQ220329 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YE19 mRNA sequence. // chr7 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT052158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT052159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// NONRATT052161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1 /// NONRATT052163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1
NM_001244855 // RefSeq // Rattus norvegicus RAN GTPase activating protein 1 (Rangap1), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006242101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN GTPase activating protein 1 (Rangap1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000052098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122915003:122942464:-1 gene:ENSRNOG00000031789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC082056 // GenBank // Rattus norvegicus RAN GTPase activating protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95209 IMAGE:7132303), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122915792:122938536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT052165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_001007146 // RefSeq // Rattus norvegicus transducer of ERBB2, 2 (Tob2), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC085117 // GenBank // Rattus norvegicus transducer of ERBB2, 2, mRNA (cDNA clone MGC:105824 IMAGE:7107186), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_138888 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 5A (Phf5a), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000005837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123070683:123077281:-1 gene:ENSRNOG00000024170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF495522 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor INI (Ini) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// AY321339 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-246 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// BC168144 // GenBank // Rattus norvegicus PHD finger protein 5A, mRNA (cDNA clone MGC:187333 IMAGE:8372591), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
NM_001127295 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide H (Polr3h), mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123121661:123131987:-1 gene:ENSRNOG00000004471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC167088 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide H (22.9kD), mRNA (cDNA clone MGC:189505 IMAGE:5621972), complete cds. // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XR_348124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549144 (LOC102549144), transcript variant X2, ncRNA. // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// XR_355857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549144 (LOC102549144), transcript variant X2, ncRNA. // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123122148:123131646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NONRATT052174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT052175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XR_338491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr7 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// XR_357468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr7 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// FQ217911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA14YD18 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT059021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 62 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 26 // 63 // 1
NM_001008323 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphomannomutase 1 (Pmm1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000007164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123158887:123169142:-1 gene:ENSRNOG00000005358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC086346 // GenBank // Rattus norvegicus phosphomannomutase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105960 IMAGE:7302298), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT052178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001025703 // RefSeq // Rattus norvegicus desumoylating isopeptidase 1 (Desi1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123223023:123244325:-1 gene:ENSRNOG00000005577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098857 // GenBank // Rattus norvegicus PPPDE peptidase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:112918 IMAGE:7380029), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123226904:123239273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001207022 // RefSeq // Rattus norvegicus shisa family member 8 (Shisa8), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000070937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123423854:123429304:-1 gene:ENSRNOG00000049407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123424051:123432600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_001077542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c (Tnfrsf13c), mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_576316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 13c (Tnfrsf13c), mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010086 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:123438655:123439920:-1 gene:ENSRNOG00000007664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000056037 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:123438655:123439920:-1 gene:ENSRNOG00000007664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123438655:123439920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001130504 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein M (Cenpm), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein M (Cenpm), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000036917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123449521:123460809:-1 gene:ENSRNOG00000023262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123449784:123473468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT052191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001012120 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyl galactosaminidase, alpha (Naga), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123547945:123556139:-1 gene:ENSRNOG00000008064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC082084 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetyl galactosaminidase, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:95262 IMAGE:7133636), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123547152:123556087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT052196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001130505 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 6 (B14) (Ndufa6), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123567781:123571638:-1 gene:ENSRNOG00000008569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ223548 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA9YO07 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ209534 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YB21 mRNA sequence. // chr7 // 72 // 93 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123567887:123568745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_138515 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 4 (Cyp2d4), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123583985:123593008:-1 gene:ENSRNOG00000032261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB008425 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CYP2D4, complete cds. // chr7 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC093609 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:105324 IMAGE:7319137), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M22331 // GenBank // Rat cytochrome P450 isozyme CMF3 mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// U48219 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 2D18 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U48220 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 2D18 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123584053:123614583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT052201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_173304 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 5 (Cyp2d5), mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000046024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123601169:123605722:-1 gene:ENSRNOG00000029128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC088097 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:108540 IMAGE:7369436), complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// J02869 // GenBank // Rat cytochrome P-450 IID5 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// M22329 // GenBank // Rat cytochrome P450 isozyme CMF1b mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000035054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123584053:123614583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// M25143 // GenBank // Rat cytochrome P450CMF1b mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_153313 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 1 (Cyp2d1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000050002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123610227:123614683:-1 gene:ENSRNOG00000030182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AB008422 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CYP2D1, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC078696 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:93082 IMAGE:7126263), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ219613 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YB23 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// J02867 // GenBank // Rat cytochrome P-450 IID1 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M16654 // GenBank // Rat cytochrome P450-db1 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M22328 // GenBank // Rat cytochrome P450 isozyme CMF1a mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123584053:123614583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// NONRATT052204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_173093 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 3 (Cyp2d3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123619363:123623725:-1 gene:ENSRNOG00000029179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB008424 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CYP2D3, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC089769 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:108561 IMAGE:7372283), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211032 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YJ21 mRNA sequence. // chr7 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// J02868 // GenBank // Rat cytochrome P-450 IID3 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ219169 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YC22 mRNA sequence. // chr7 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123619432:123623664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_012730 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 2 (Cyp2d2), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123636789:123640858:-1 gene:ENSRNOG00000008988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB008423 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CYP2D2, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC078897 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:93631 IMAGE:7109496), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// M16655 // GenBank // Rat cytochrome P450-db2 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// M22330 // GenBank // Rat cytochrome P450 isozyme CMF2 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123636860:123640758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT052207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT052209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001130574 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 20 (Tcf20), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006242110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor 20 (Tcf20), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123655990:123753836:-1 gene:ENSRNOG00000009585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123659877:123707787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NONRATT052212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
ENSRNOT00000037681 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:123842487:123861991:-1 gene:ENSRNOG00000022975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// XM_006226175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NFAT activating protein with ITAM motif 1 (Nfam1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// XM_006226177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NFAT activating protein with ITAM motif 1 (Nfam1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XM_006242140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NFAT activating protein with ITAM motif 1 (Nfam1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// XM_006242142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NFAT activating protein with ITAM motif 1 (Nfam1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000035067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123842487:123892591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001130568 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 7 homolog A (S. cerevisiae) (Rrp7a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123962950:123972838:-1 gene:ENSRNOG00000022896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123966606:124003418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT052220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001130506 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta interacting protein 3 (Poldip3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006242089 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta interacting protein 3 (Poldip3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123974866:124003513:-1 gene:ENSRNOG00000022877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123966606:124003418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_138877 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 3 (Cyb5r3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124006942:124022794:-1 gene:ENSRNOG00000009592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124006942:124024519:-1 gene:ENSRNOG00000009592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC062066 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72299 IMAGE:5599255), complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// J03867 // GenBank // Rat NADH-cytochrome b-5 reductase mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124007891:124024465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_022240 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha 1,4-galactosyltransferase (A4galt), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha 1,4-galactosyltransferase (A4galt), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha 1,4-galactosyltransferase (A4galt), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124072305:124075856:-1 gene:ENSRNOG00000009736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF248544 // GenBank // Rattus norvegicus Gb3 synthase mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC097323 // GenBank // Rattus norvegicus alpha 1,4-galactosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:114326 IMAGE:7459302), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124072843:124082107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT052226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053704 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing) (Bik), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BCL2-interacting killer (apoptosis-inducing) (Bik), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124380347:124399141:1 gene:ENSRNOG00000010359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF372501 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl2-interacting killer-like protein (Biklk) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124362973:124399077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001135922 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 12 (Ttll12), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124461238:124479484:-1 gene:ENSRNOG00000022623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124461717:124479471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001134884 // RefSeq // Rattus norvegicus signal peptide, CUB domain, EGF-like 1 (Scube1), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal peptide, CUB domain, EGF-like 1 (Scube1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124490468:124608680:-1 gene:ENSRNOG00000010617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124491565:124545495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT052246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006226178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 6 (Efcab6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006242145 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 6 (Efcab6), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:124748217:124910667:-1 gene:ENSRNOG00000011094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055945 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:124748217:124800491:-1 gene:ENSRNOG00000011094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000016552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124770806:124945674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001130497 // RefSeq // Rattus norvegicus patatin-like phospholipase domain containing 5 (Pnpla5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124976939:124987552:-1 gene:ENSRNOG00000022296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124977468:124989758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT052257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001078061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1644 protein (RGD1566029), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1644 protein (RGD1566029), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006241416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1644 protein (RGD1566029), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006241417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1644 protein (RGD1566029), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006241418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1644 protein (RGD1566029), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000015686 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:63359409:63373749:-1 gene:ENSRNOG00000011788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000011514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63357510:63376732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
XM_006226184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper, down-regulated in cancer 1-like (Ldoc1l), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper, down-regulated in cancer 1-like (Ldoc1l), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039588 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:125195454:125196185:-1 gene:ENSRNOG00000021671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125195454:125216939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130680 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 21B (Phf21b), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125370846:125438318:1 gene:ENSRNOG00000013067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125371214:125438191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001271047 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG9646-PA (RGD1304694), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000042070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125571736:125607106:-1 gene:ENSRNOG00000031269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC098850 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG9646-PA, mRNA (cDNA clone IMAGE:7379645), partial cds. // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000003788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125572980:125627781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001130498 // RefSeq // Rattus norvegicus structural maintenance of chromosomes 1B (Smc1b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125680603:125742470:-1 gene:ENSRNOG00000032570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125680862:125738615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009695 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 7B (Wnt7b), mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126136632:126178957:-1 gene:ENSRNOG00000015750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AB197137 // GenBank // Rattus norvegicus Wnt7b mRNA for wingless-related MMTV integration site 7B, complete cds. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126091658:126181446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT052277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_001130696 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 2210021J22Rik protein (RGD1306001), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000055909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126398401:126402228:-1 gene:ENSRNOG00000032846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126398833:126402070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001134866 // RefSeq // Rattus norvegicus polycystin (PKD) family receptor for egg jelly (Pkdrej), mRNA. // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000041057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126406503:126412868:-1 gene:ENSRNOG00000029591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000044247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126406503:126412868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT052283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
GENSCAN00000044218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126485547:126530473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_001134861 // RefSeq // Rattus norvegicus ceramide kinase (Cerk), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126726021:126768650:-1 gene:ENSRNOG00000017022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126727818:126768392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034260 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:JH620349.1:276:16795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT052286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000055893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126792542:126792820:-1 gene:ENSRNOG00000037087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126792542:126800598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ219065 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YP24 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108103 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain containing 1 (Brd1), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000006034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129366021:129413531:-1 gene:ENSRNOG00000004538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006242197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain containing 1 (Brd1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000040811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129367291:129413589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108104 // RefSeq // Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 12, alpha-1,6-mannosyltransferase (Alg12), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 12, alpha-1,6-mannosyltransferase (Alg12), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 12, alpha-1,6-mannosyltransferase (Alg12), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129487375:129501100:-1 gene:ENSRNOG00000004591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161934 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 12 homolog (yeast, alpha-1,6-mannosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:187715 IMAGE:9022144), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129487908:129498573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT052293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XR_348217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700019P01 (RGD1306462), misc_RNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064326 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:129597599:129634762:-1 gene:ENSRNOG00000032311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC097453 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700019P01, mRNA (cDNA clone IMAGE:7456915), complete cds. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129571458:129655297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT052298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT052299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001108105 // RefSeq // Rattus norvegicus megalencephalic leukoencephalopathy with subcortical cysts 1 (Mlc1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000055879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129636392:129656289:-1 gene:ENSRNOG00000032871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC098771 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7373467, containing frame-shift errors. // chr7 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129571458:129655297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// NONRATT052301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001108748 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, gamma complex associated protein 6 (Tubgcp6), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin, gamma complex associated protein 6 (Tubgcp6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000007954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129766841:129787647:-1 gene:ENSRNOG00000006028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129767993:129862463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001035000 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 10 (Hdac10), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000055865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129788136:129793226:-1 gene:ENSRNOG00000031915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// BC092573 // GenBank // Rattus norvegicus histone deacetylase 10, mRNA (cDNA clone MGC:108767 IMAGE:7323327), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT052307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 72 // 72 // 31 // 43 // 1 /// GENSCAN00000057501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129767993:129862463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 47 // 47 // 20 // 43 // 1 /// NONRATT052310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// NONRATT052311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// NONRATT052312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// NONRATT052308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// NONRATT052309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// NONRATT052313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_021746 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 12 (Mapk12), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC062396 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:5623226), partial cds. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC081950 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:7122406), partial cds. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC127549 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:7367277), complete cds. // chr7 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000044376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129795269:129805662:-1 gene:ENSRNOG00000031233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// NONRATT052315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000057501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129767993:129862463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT052314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// NONRATT052316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001109532 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 11 (Mapk11), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129807476:129814393:-1 gene:ENSRNOG00000006984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC162032 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 11, mRNA (cDNA clone MGC:187942 IMAGE:9102947), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129767993:129862463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001108106 // RefSeq // Rattus norvegicus plexin B2 (Plxnb2), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006242206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin B2 (Plxnb2), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129821099:129836927:-1 gene:ENSRNOG00000007133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129767993:129862463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001108749 // RefSeq // Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 6B (Dennd6b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006242222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 6B (Dennd6b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000051347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129850713:129862537:-1 gene:ENSRNOG00000029866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000057501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129767993:129862463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT052332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT052333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// NONRATT052334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
NM_001271173 // RefSeq // Rattus norvegicus SET binding factor 1 (Sbf1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000041023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129946917:129973401:-1 gene:ENSRNOG00000008392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000072955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129946917:129973401:-1 gene:ENSRNOG00000008392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000057490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129943939:129973401:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT052335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT052339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT052342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_001079939 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase maturation factor 2 (Lmf2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130007321:130011771:-1 gene:ENSRNOG00000030633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC129102 // GenBank // Rattus norvegicus lipase maturation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:156704 IMAGE:7099869), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130007778:130011623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001012122 // RefSeq // Rattus norvegicus thymidine phosphorylase (Tymp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000040541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130029367:130032479:-1 gene:ENSRNOG00000032394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC089830 // GenBank // Rattus norvegicus thymidine phosphorylase, mRNA (cDNA clone MGC:108801 IMAGE:7323197), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130027705:130035751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT052358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001191992 // RefSeq // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 3B (Odf3b), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 3B (Odf3b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// XM_006242238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 3B (Odf3b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130033126:130035751:-1 gene:ENSRNOG00000037060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000057489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130027705:130035751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT052360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_013200 // RefSeq // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase 1b, muscle (Cpt1b), mRNA. // chr7 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000013985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130080033:130089083:-1 gene:ENSRNOG00000010438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC085761 // GenBank // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase 1b, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:93637 IMAGE:7193798), complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// D43623 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for carnitine palmitoyltransferase I like protein (CPTI like protein), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000040337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130053634:130092730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT052364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// NONRATT052365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT052366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_017177 // RefSeq // Rattus norvegicus choline kinase beta (Chkb), mRNA. // chr7 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus choline kinase beta (Chkb), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130089653:130093008:-1 gene:ENSRNOG00000011404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AB006607 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for choline/ethanolamine kinase, complete cds. // chr7 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC060515 // GenBank // Rattus norvegicus choline kinase beta, mRNA (cDNA clone MGC:72507 IMAGE:5598184), complete cds. // chr7 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT052370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT052372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT052369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// GENSCAN00000040337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130053634:130092730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// NONRATT052371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001034933 // RefSeq // Rattus norvegicus arylsulfatase A (Arsa), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130132039:130137458:-1 gene:ENSRNOG00000012953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC105852 // GenBank // Rattus norvegicus arylsulfatase A, mRNA (cDNA clone MGC:125207 IMAGE:7452956), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// FQ212178 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA66YN04 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130129041:130135638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT052375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001013221 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB, member of RAS oncogene family-like 2A (Rabl2a), mRNA. // chr7 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// XM_006242228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB, member of RAS oncogene family-like 2A (Rabl2a), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000044262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130241551:130250156:-1 gene:ENSRNOG00000013947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// BC083624 // GenBank // Rattus norvegicus RAB, member of RAS oncogene family-like 2B, mRNA (cDNA clone MGC:94400 IMAGE:7134121), complete cds. // chr7 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// NONRATT052380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000040334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130242344:130285267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT052383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT052382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_031666 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin X (Syt10), mRNA. // chr7 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130452003:130510521:-1 gene:ENSRNOG00000014296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF375463 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 10 mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// DQ437524 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 10 mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// U85513 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin X mRNA, partial cds. // chr7 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130408324:130531085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001108750 // RefSeq // Rattus norvegicus copine VIII (Cpne8), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006242229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine VIII (Cpne8), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000039857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131298537:131472968:-1 gene:ENSRNOG00000026128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC168840 // GenBank // Rattus norvegicus copine VIII, mRNA (cDNA clone MGC:189063 IMAGE:7125016), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT052386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:131234254:131390598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT052388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
XM_006226215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 21A (Kif21a), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131746524:131818878:-1 gene:ENSRNOG00000014844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000044092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131746524:131818878:-1 gene:ENSRNOG00000014844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000045553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131746524:131818878:-1 gene:ENSRNOG00000014844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000046744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131746524:131818878:-1 gene:ENSRNOG00000014844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000055742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131792017:131874044:-1 gene:ENSRNOG00000014844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000066528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131746524:131818878:-1 gene:ENSRNOG00000014844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:131739650:131767114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000013695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:131773148:131821672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_033352 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily D (ALD), member 2 (Abcd2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131968473:132017044:-1 gene:ENSRNOG00000015538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF131294 // GenBank // Rattus norvegicus adrenoleukodystrophy related protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:132004082:132016842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:131971563:131999371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT052395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_133611 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 13 (Slc2a13), mRNA. // chr7 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:132108134:132430525:-1 gene:ENSRNOG00000015741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT052398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:132144171:132208615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT052397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001100887 // RefSeq // Rattus norvegicus glucoside xylosyltransferase 1 (Gxylt1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000058349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:134118984:134166045:-1 gene:ENSRNOG00000005234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY623036 // GenBank // Rattus norvegicus clone S33-D hypothetical protein mRNA, partial cds. // chr7 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC167068 // GenBank // Rattus norvegicus glycosyltransferase 8 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:189392 IMAGE:8363586), complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:134058551:134165996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT052405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT052406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT052407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001134871 // RefSeq // Rattus norvegicus YY1 associated factor 2 (Yaf2), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000006621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:134175947:134178051:-1 gene:ENSRNOG00000004773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:134177037:134184838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001034940 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCHC-type and RNA binding motif 1 (Zcrb1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:134255943:134269279:-1 gene:ENSRNOG00000004996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099747 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger CCHC-type and RNA binding motif 1, mRNA (cDNA clone MGC:124878 IMAGE:5598773), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:134256461:134269453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT052413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_199396 // RefSeq // Rattus norvegicus prickle homolog 1 (Drosophila) (Prickle1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prickle homolog 1 (Drosophila) (Prickle1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prickle homolog 1 (Drosophila) (Prickle1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000036750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:134370195:134389446:-1 gene:ENSRNOG00000022772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF399843 // GenBank // Rattus norvegicus REST/NRSF-interacting lim domain protein (Rilp) mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000014047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:134371556:134469875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
XM_006226241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 20 (Adamts20), mRNA. // chr7 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// XM_006242275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 20 (Adamts20), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000047388 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:135127520:135291531:-1 gene:ENSRNOG00000033397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000074793 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:135194287:135291531:-1 gene:ENSRNOG00000033397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:135127431:135291531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0
XM_006226236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 7 homolog (S. cerevisiae)-like (Pus7l), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006226237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 7 homolog (S. cerevisiae)-like (Pus7l), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 7 homolog (S. cerevisiae)-like (Pus7l), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006242273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 7 homolog (S. cerevisiae)-like (Pus7l), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029097 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:135424411:135458044:-1 gene:ENSRNOG00000022570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:135424411:135459713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001008521 // RefSeq // Rattus norvegicus twinfilin actin-binding protein 1 (Twf1), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144276852:144277908:1 gene:ENSRNOG00000012595 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:135495110:135507004:-1 gene:ENSRNOG00000022507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC086536 // GenBank // Rattus norvegicus twinfilin, actin-binding protein, homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:105817 IMAGE:7106678), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000054628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:135496926:135506999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144276852:144277908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
GENSCAN00000054636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:135512246:135526377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_031070 // RefSeq // Rattus norvegicus NEL-like 2 (chicken) (Nell2), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000008985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:136173239:136494641:-1 gene:ENSRNOG00000006235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AY089719 // GenBank // Rattus norvegicus neuron-specific epidermal growth factor-like repeat domain-containing protein mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 91 // 37 // 40 // 0 /// BC093617 // GenBank // Rattus norvegicus NEL-like 2 (chicken), mRNA (cDNA clone MGC:105410 IMAGE:7312010), complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// EF110908 // GenBank // Rattus norvegicus nel-like 2 splice variant (Nell2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GQ376510 // GenBank // Rattus norvegicus nel-like 2 variant (Nell2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 93 // 34 // 14 // 15 // 0 /// U48245 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C-binding protein NELL2 mRNA, complete cds. // chr7 // 90 // 91 // 36 // 40 // 0 /// NONRATT052430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000008308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:136323110:136401876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT052431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// GENSCAN00000008296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:136180295:136203294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// NONRATT052432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
XM_001053826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developing brain homeobox 2 (Dbx2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_001058743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developing brain homeobox 2 (Dbx2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:136605951:136636284:-1 gene:ENSRNOG00000006885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB121147 // GenBank // Rattus norvegicus Dbx2 mRNA for homeodomain protein Dbx2, partial cds. // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:136573375:136636095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
GENSCAN00000014396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:137072667:137081999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001271170 // RefSeq // Rattus norvegicus SR-related CTD-associated factor 11 (Scaf11), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000007003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:137439150:137471025:-1 gene:ENSRNOG00000005263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000014417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:137439141:137506329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT052444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONRATT052442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// NONRATT052443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONRATT052447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
FQ220555 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YH08 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 100 // 11 // 26 // 0
NM_138832 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 1 (Slc38a1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:137603305:137667386:-1 gene:ENSRNOG00000005291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF075704 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal glutamine transporter mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC097283 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:114262 IMAGE:7444889), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:137603381:137648830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT052454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_181090 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 2 (Slc38a2), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000039002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:137716131:137728300:-1 gene:ENSRNOG00000006305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF173682 // GenBank // Rattus norvegicus system A transporter isoform 2 (SAT2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF249673 // GenBank // Rattus norvegicus amino acid transporter system A (ATA2) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// AF273024 // GenBank // Rattus norvegicus amino acid system A transporter mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:137718700:137727331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT052456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_130748 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 4 (Slc38a4), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:138083409:138105509:-1 gene:ENSRNOG00000006653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF295535 // GenBank // Rattus norvegicus amino acid transport system A3 (Ata3) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC097292 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:114273 IMAGE:7462761), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138083636:138105487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT052459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_182816 // RefSeq // Rattus norvegicus adhesion molecule with Ig like domain 2 (Amigo2), mRNA. // chr7 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:138328447:138330009:-1 gene:ENSRNOG00000007032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AB078879 // GenBank // Rattus norvegicus ali 1 mRNA for Alivin 1, complete cds. // chr7 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// AY237730 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein AMIGO2 (Amigo2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138328447:138329919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT052467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0
XM_001060204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translationally-controlled tumor protein-like (RGD1565798), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_576332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translationally-controlled tumor protein-like (RGD1565798), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000003348 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:138517314:138517832:-1 gene:ENSRNOG00000002475 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138508614:138517832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT052469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001004243 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 3 (Rpap3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009326 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:139359860:139386634:-1 gene:ENSRNOG00000007065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC079414 // GenBank // Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:94954 IMAGE:7113336), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ219014 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YG01 mRNA sequence. // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000023173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139300464:139415142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT052486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT052488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT052491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001191069 // RefSeq // Rattus norvegicus endonuclease, poly(U)-specific (Endou), mRNA. // chr7 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000009416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139393949:139414672:-1 gene:ENSRNOG00000007130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// NONRATT052494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139300464:139415142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_021690 // RefSeq // Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 3 (Rapgef3), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139423980:139445473:-1 gene:ENSRNOG00000007199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107667 // GenBank // Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 3, mRNA (cDNA clone MGC:124613 IMAGE:7936411), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U78167 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP-regulated guanine nucleotide exchange factor I (cAMP-GEFI) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139424483:139445828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000011159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139472968:139490046:-1 gene:ENSRNOG00000008308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139472968:139490022:-1 gene:ENSRNOG00000008308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139472968:139490022:-1 gene:ENSRNOG00000008308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000072948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139472968:139490022:-1 gene:ENSRNOG00000008308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139472968:139515529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_017058 // RefSeq // Rattus norvegicus vitamin D (1,25- dihydroxyvitamin D3) receptor (Vdr), mRNA. // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139536241:139585928:-1 gene:ENSRNOG00000008574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// J04147 // GenBank // Rat 1,25-dihydroxyvitamin D-3 receptor mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT052505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139536917:139578159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_012929 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type II, alpha 1 (Col2a1), mRNA. // chr7 // 98 // 96 // 52 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000016044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139646995:139675750:-1 gene:ENSRNOG00000022282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 53 // 53 // 0 /// L48440 // GenBank // Rattus norvegicus collagen type II mRNA, complete cds. // chr7 // 98 // 96 // 52 // 53 // 0 /// GENSCAN00000032075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139644555:139675609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT052506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 67 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT052509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 45 // 45 // 25 // 55 // 1
XM_006226252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SUMO1/sentrin specific peptidase 1 (Senp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006242359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SUMO1/sentrin specific peptidase 1 (Senp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000030943 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:138765842:138811222:-1 gene:ENSRNOG00000022260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ230816 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA88YO11 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138665607:138833728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0
NM_001108109 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 8 (Asb8), mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000013704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:138859490:138867223:-1 gene:ENSRNOG00000010099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC168888 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:189146 IMAGE:9102161), complete cds. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138860613:138870149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT052476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT052479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006226281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor, family 10, subfamily AD, member 1 (Or10ad1), mRNA. // chrU // 82 // 73 // 9 // 11 // 0
XM_001061122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1102 (Olr1102), mRNA. // chrU // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
XM_006226253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1877 (Olr1877), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// XM_006242360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1877 (Olr1877), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000014258 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:138979148:138980116:-1 gene:ENSRNOG00000010749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// XM_006226256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1877 (Olr1877), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// XM_006242363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1877 (Olr1877), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// GENSCAN00000001293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138979148:138983725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_001024356 // RefSeq // Rattus norvegicus H1 histone family, member N, testis-specific (H1fnt), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139015895:139017151:-1 gene:ENSRNOG00000029545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC085950 // GenBank // Rattus norvegicus H1 histone family, member N, testis-specific, mRNA (cDNA clone MGC:95218 IMAGE:7132484), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139015895:139017151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT052480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106792 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 641 (Zfp641), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 641 (Zfp641), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 641 (Zfp641), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006242318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 641 (Zfp641), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139044646:139049328:-1 gene:ENSRNOG00000032447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139044646:139049328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000906 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1104 (Olr1104), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139072444:139073403:-1 gene:ENSRNOG00000031284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139072444:139073403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001078 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1105 (Olr1105), mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000051304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139096884:139097801:-1 gene:ENSRNOG00000032839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139096884:139097801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001000423 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1106 (Olr1106), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139121433:139122362:-1 gene:ENSRNOG00000033022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139106318:139122362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT052484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000014456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139230986:139233459:-1 gene:ENSRNOG00000010811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_012594 // RefSeq // Rattus norvegicus lactalbumin, alpha (Lalba), mRNA. // chr7 // 68 // 76 // 17 // 25 // 0 /// V01251 // GenBank // Fragment of rat messenger RNA coding for alpha-lactalbumin. // chr7 // 74 // 82 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139231203:139233459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001004244 // RefSeq // Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 2 (Kansl2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006257341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 2 (Kansl2), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006257342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 2 (Kansl2), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000014875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114700526:114716824:-1 gene:ENSRNOG00000010904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC169120 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9099997. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT059987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT059988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NONRATT059987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT059988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NONRATT059987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT059988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 48 // 100 // 13 // 27 // 0 /// NONRATT029664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 48 // 100 // 13 // 27 // 0
NM_001108110 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin T1 (Ccnt1), mRNA. // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000058606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114723350:114749903:-1 gene:ENSRNOG00000011512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114702101:114749903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT059992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001270785 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 6 (Adcy6), transcript variant 1, mRNA. // chrX // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NM_012821 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 6 (Adcy6), transcript variant 2, mRNA. // chrX // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000016623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114774390:114794509:-1 gene:ENSRNOG00000011587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// L01115 // GenBank // Rattus norvegicus adenylyl cyclase type VI mRNA, complete cds. // chrX // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// M96160 // GenBank // Rattus norvegicus adenylyl cyclase type VI mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000037066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114776712:114789257:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT059993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 96 // 46 // 46 // 0
NM_001106793 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 23 (Ddx23), mRNA. // chrX // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000055529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114828731:114845972:-1 gene:ENSRNOG00000036954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC099148 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7365621, containing frame-shift errors. // chrX // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// GENSCAN00000037100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114829287:114840970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT059995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT059999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT060000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT059997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001013222 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho family GTPase 1 (Rnd1), mRNA. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114852416:114859487:-1 gene:ENSRNOG00000013621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC089994 // GenBank // Rattus norvegicus Rho family GTPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:109441 IMAGE:7320068), complete cds. // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114853234:114860364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT060001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001013105 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 11 (Fkbp11), mRNA. // chrX // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114908415:114911848:-1 gene:ENSRNOG00000014566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// BC084709 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:105524 IMAGE:7301886), complete cds. // chrX // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// XM_006257344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 11 (Fkbp11), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// GENSCAN00000037095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114908434:114911756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 38 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT060002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT060003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT060004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT060005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT060006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_080904 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 3 (Arf3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114922631:114927693:-1 gene:ENSRNOG00000033155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325223 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1-253 mRNA, complete cds. // chrX // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC088865 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:105341 IMAGE:7319260), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L12382 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 3 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000040458 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109980.1:10536:13534:-1 gene:ENSRNOG00000048089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074120 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109980.1:7148:12932:-1 gene:ENSRNOG00000048089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012613 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109980.1:10538:12859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000037090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114925298:114927620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT060005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT060008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT060008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NM_001108111 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 10B (Wnt10b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006257359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 10B (Wnt10b), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114958628:114963223:-1 gene:ENSRNOG00000014393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000064417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114958628:114960978:-1 gene:ENSRNOG00000014393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114959361:114965462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT060010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_030993 // RefSeq // Rattus norvegicus dendrin (Ddn), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114727118:114993826:-1 gene:ENSRNOG00000014789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// X96589 // GenBank // R.norvegicus mRNA for dendrin. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114991295:114993826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT060011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013010 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 1 non-catalytic subunit (Prkag1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006257331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 1 non-catalytic subunit (Prkag1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114999624:115017043:-1 gene:ENSRNOG00000014813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085749 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 1 non-catalytic subunit, mRNA (cDNA clone IMAGE:7189512). // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097940 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 1 non-catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:116060 IMAGE:7454478), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U42413 // GenBank // Rattus norvegicus 5-AMP-activated protein kinase, gamma-1 subunit mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT060012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT060013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115000198:115067094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// NONRATT060014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT060015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006257392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific methyltransferase 2D (Kmt2d), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT060016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006257392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific methyltransferase 2D (Kmt2d), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 97 // 68 // 68 // 0 /// ENSRNOT00000040635 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:X:115020064:115052804:-1 gene:ENSRNOG00000015107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 96 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000037073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115000198:115067094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 66 // 66 // 0
NM_182825 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras homolog enriched in brain like 1 (Rhebl1), mRNA. // chrX // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000035659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115063116:115066994:-1 gene:ENSRNOG00000021571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AY327411 // GenBank // Rattus norvegicus Ras homolog enriched in brain-like 1 (Rhebl1) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT060030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT060031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115000198:115067094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_053367 // RefSeq // Rattus norvegicus desert hedgehog (Dhh), mRNA. // chrX // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000020563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115082778:115088273:-1 gene:ENSRNOG00000015175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115083771:115087978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT060033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT060032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001013950 // RefSeq // Rattus norvegicus limb region 1 like (Lmbr1l), mRNA. // chrX // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// XM_006257345 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus limb region 1 like (Lmbr1l), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000046287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115098755:115107826:-1 gene:ENSRNOG00000033667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// BC089929 // GenBank // Rattus norvegicus limb region 1-like homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:109220 IMAGE:7308748), complete cds. // chrX // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115093320:115107703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT060036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// NONRATT060034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// NONRATT060035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 26 // 26 // 12 // 46 // 1
BC076379 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, alpha 1B, mRNA (cDNA clone MGC:93444 IMAGE:7106502), complete cds. // chr1 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// FQ213187 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YD13 mRNA sequence. // chr1 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// FQ214460 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YJ08 mRNA sequence. // chr1 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115121924:115147454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 78 // 5 // 7 // 0 /// NONRATT060037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NM_022298 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, alpha 1A (Tuba1a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000006322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115143855:115147552:-1 gene:ENSRNOG00000004559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC062238 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, alpha 1A, mRNA (cDNA clone MGC:72947 IMAGE:6922126), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC078830 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, alpha 1A, mRNA (cDNA clone MGC:93446 IMAGE:7115494), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115121924:115147454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT060037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT060040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001271242 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent-like 4 (C1ql4), mRNA. // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// XM_006257349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent-like 4 (C1ql4), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115272678:115275588:-1 gene:ENSRNOG00000002316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115272678:115281128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001013106 // RefSeq // Rattus norvegicus microspherule protein 1 (Mcrs1), mRNA. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115414777:115423588:-1 gene:ENSRNOG00000029879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC091366 // GenBank // Rattus norvegicus microspherule protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:109421 IMAGE:7319183), complete cds. // chrX // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT060045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115415088:115471793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT060047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001134633 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 186, member B (Fam186b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115439999:115455425:-1 gene:ENSRNOG00000033806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115415088:115471793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT060049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_003752125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formin-like 3 (Fmnl3), mRNA. // chrX // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_003754350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formin-like protein 3-like (LOC100912815), mRNA. // chrX // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000031996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115486806:115536581:-1 gene:ENSRNOG00000021503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000055448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115486141:115536581:-1 gene:ENSRNOG00000021503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000013563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115485971:115536581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT060050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// NONRATT060052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// NONRATT060051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_001271369 // RefSeq // Rattus norvegicus NCK-associated protein 5-like (Nckap5l), mRNA. // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000022937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115586236:115597266:-1 gene:ENSRNOG00000017033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115586236:115621466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001108751 // RefSeq // Rattus norvegicus BCDIN3 domain containing (Bcdin3d), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115635413:115639979:-1 gene:ENSRNOG00000032608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115635744:115648711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT060056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144756 // RefSeq // Rattus norvegicus Fas apoptotic inhibitory molecule 2 (Faim2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000048934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115663276:115689093:-1 gene:ENSRNOG00000029015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF044201 // GenBank // Rattus norvegicus neural membrane protein 35 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC087606 // GenBank // Rattus norvegicus Fas apoptotic inhibitory molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:105316 IMAGE:7314068), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006242293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein lifeguard 2-like (LOC102551901), mRNA. // chrX // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000072309 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:138668122:138684013:-1 gene:ENSRNOG00000045554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT060057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000001299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138665607:138833728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 79 // 79 // 27 // 34 // 1 /// GENSCAN00000013578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115663737:115697474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 85 // 85 // 29 // 34 // 1
NM_001108112 // RefSeq // Rattus norvegicus Rac GTPase-activating protein 1 (Racgap1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115782548:115811946:-1 gene:ENSRNOG00000018187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC166473 // GenBank // Rattus norvegicus Rac GTPase-activating protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187874 IMAGE:9090730), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000071885 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:138713514:138728274:-1 gene:ENSRNOG00000049033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115782506:115802777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT060058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT060059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138665607:138833728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001108993 // RefSeq // Rattus norvegicus ceramide synthase 5 (Cers5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000042981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115891039:115929134:-1 gene:ENSRNOG00000019380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC166794 // GenBank // Rattus norvegicus LAG1 homolog, ceramide synthase 5, mRNA (cDNA clone MGC:188589 IMAGE:7937721), complete cds. // chrX // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115892208:115928998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 89 // 58 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT060061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT060062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT060064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT060065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// BC094956 // GenBank HTC // Rattus norvegicus serine/arginine repetitive matrix 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7368168), **** WARNING: chimeric clone ****. // chrX // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001191615 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain and actin binding 1 (Lima1), mRNA. // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000066908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115932904:115999574:-1 gene:ENSRNOG00000019393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115934840:115982536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT060070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006226257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC503171 (RGD1561408), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// XM_006257411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Protein FAM186A-like (LOC100362820), mRNA. // chrX // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000008781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:116074564:116131461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000008781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:116074564:116131461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_013173 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporter), member 2 (Slc11a2), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006242312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporter), member 2 (Slc11a2), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139837654:139870639:-1 gene:ENSRNOG00000019550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AF008439 // GenBank // Rattus norvegicus natural resistance-associated macrophage protein 2 (Nramp2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// AF029757 // GenBank // Rattus norvegicus natural resistance associated macrophage protein-2 (Nramp2) mRNA, C-terminal exon alternative splice variant, complete cds. // chr7 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// BC097338 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporters), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:114348 IMAGE:7460406), complete cds. // chr7 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139840195:139895704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT052513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT052517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1
NM_001108113 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-serine-rich nuclear protein 2 (Csrnp2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine-serine-rich nuclear protein 2 (Csrnp2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139923806:139939644:-1 gene:ENSRNOG00000019653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139926197:139933423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134714 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor CP2 (Tfcp2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor CP2 (Tfcp2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor CP2 (Tfcp2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor CP2 (Tfcp2), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000037447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139946315:139988265:-1 gene:ENSRNOG00000032395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC168176 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor CP2, mRNA (cDNA clone MGC:187831 IMAGE:9034655), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139947830:139987936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT052522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT052523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_006242297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POU class 6 homeobox 1 (Pou6f1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006242300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POU class 6 homeobox 1 (Pou6f1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// XM_006242301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POU class 6 homeobox 1 (Pou6f1), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NM_001105746 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 6 homeobox 1 (Pou6f1), mRNA. // chr7 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000006095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140008707:140015389:-1 gene:ENSRNOG00000004595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// GENSCAN00000032090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140009216:140013980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140014537:140025117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT052525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_182817 // RefSeq // Rattus norvegicus small cell adhesion glycoprotein (Smagp), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006242323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small cell adhesion glycoprotein (Smagp), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140049630:140066357:-1 gene:ENSRNOG00000048932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC101910 // GenBank // Rattus norvegicus small cell adhesion glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:124543 IMAGE:7933976), complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// NONRATT052530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140050095:140123423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001012223 // RefSeq // Rattus norvegicus bridging integrator 2 (Bin2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000048262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140078979:140105528:-1 gene:ENSRNOG00000031930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC079406 // GenBank // Rattus norvegicus bridging integrator 2, mRNA (cDNA clone MGC:94939 IMAGE:7112822), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000042090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140050095:140123423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT052534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONRATT052535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_012552 // RefSeq // Rattus norvegicus chymotrypsin-like elastase family, member 1 (Cela1), mRNA. // chr7 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140110484:140123445:-1 gene:ENSRNOG00000004725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ227752 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YA04 mRNA sequence. // chr7 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140050095:140123423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT052537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001172063 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6 (Galnt6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6 (GalNAc-T6) (Galnt6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140128435:140157211:-1 gene:ENSRNOG00000033059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211776 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YH07 mRNA sequence. // chr7 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140130881:140153056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
XM_001065624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fidgetin-like 2 (Fignl2), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative fidgetin-like protein 2-like (LOC102555469), partial mRNA. // chrU // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000044982 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:140496239:140497827:-1 gene:ENSRNOG00000032026 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9214304:9216238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000042096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140496239:140508540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
ENSRNOT00000040061 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:140572335:140572866:-1 gene:ENSRNOG00000030740 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 74 // 100 // 17 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140565696:140572619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_001008815 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 80 (Krt80), mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140796567:140816784:-1 gene:ENSRNOG00000025994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140777601:140816784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000074411 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:140853558:140853912:-1 gene:ENSRNOG00000046625 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 70 // 100 // 16 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140829814:140854465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001101675 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 83 (Krt83), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_003754354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 83 (Krt83), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000031257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140880242:140887079:-1 gene:ENSRNOG00000032859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AB354637 // GenBank // Rattus norvegicus LOC681126 mRNA, complete cds, similar to keratin complex 2, basic, gene 25. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140880242:140887079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001008814 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 81 (Krt81), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000012845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140908543:140913443:-1 gene:ENSRNOG00000036871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000068748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140908543:140913443:-1 gene:ENSRNOG00000036871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB355638 // GenBank // Rattus norvegicus Kb21 mRNA for type II keratin Kb21, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140908726:140913443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001008813 // RefSeq // Rattus norvegicus type II keratin 23 (Kb23), mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000068505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140935551:140942066:-1 gene:ENSRNOG00000030814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AB355639 // GenBank // Rattus norvegicus Kb23 mRNA for type II keratin Kb23, complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT052553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140935774:140942066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001008811 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 85 (Krt85), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140961712:140968249:-1 gene:ENSRNOG00000008436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AB355640 // GenBank // Rattus norvegicus Kb25 mRNA for type II keratin Kb25, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140961712:141006690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008812 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 84 (Krt84), mRNA. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 84 (Krt84), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140982317:140988077:-1 gene:ENSRNOG00000008819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140961712:141006690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001008803 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 82 (Krt82), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140996765:141006621:-1 gene:ENSRNOG00000033403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140961712:141006690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001008825 // RefSeq // Rattus norvegicus type II keratin Kb15 (Kb15), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000038242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141009311:141017951:-1 gene:ENSRNOG00000009105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000014987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141011266:141017951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT052558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001008828 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 75 (Krt75), mRNA. // chr7 // 100 // 55 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000012640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141019966:141028601:-1 gene:ENSRNOG00000043203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039417 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:141038993:141074910:-1 gene:ENSRNOG00000009160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 40 // 18 // 24 // 0 /// NM_183333 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 5 (Krt5), mRNA. // chr7 // 18 // 18 // 11 // 60 // 1 /// ENSRNOT00000011644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141118202:141122455:-1 gene:ENSRNOG00000050420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 17 // 17 // 10 // 60 // 1 /// AY342389 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 5 mRNA, complete cds. // chr7 // 18 // 18 // 11 // 60 // 1 /// BC062086 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 5, mRNA (cDNA clone MGC:72626 IMAGE:5599969), complete cds. // chr7 // 20 // 20 // 12 // 60 // 1 /// GENSCAN00000014985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141020023:141028601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT052560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 34 // 60 // 1 /// GENSCAN00000015005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141038993:141218154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 27 // 60 // 1
NM_001008809 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 72 (Krt72), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141180801:141190972:-1 gene:ENSRNOG00000030876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141038993:141218154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008808 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 73 (Krt73), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141198447:141206471:-1 gene:ENSRNOG00000025087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141038993:141218154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001008899 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 2 (Krt2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141211466:141218154:-1 gene:ENSRNOG00000009563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141038993:141218154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001008802 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 1 (Krt1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141245848:141251072:-1 gene:ENSRNOG00000028996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC127464 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 1, mRNA (cDNA clone MGC:156535 IMAGE:8370075), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141246324:141251024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001008807 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 77 (Krt77), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141259822:141271225:-1 gene:ENSRNOG00000036865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141260089:141321166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001008805 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 76 (Krt76), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141286688:141294636:-1 gene:ENSRNOG00000031785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141260089:141321166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT052567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001008806 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 4 (Krt4), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141315719:141321166:-1 gene:ENSRNOG00000032332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141260089:141321166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_001067238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 78 (Krt78), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000047751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141343736:141350527:-1 gene:ENSRNOG00000024909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141343959:141350527:-1 gene:ENSRNOG00000024909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141326318:141403991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_199370 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 8 (Krt8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000038480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141393012:141400521:-1 gene:ENSRNOG00000009779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY464139 // GenBank // Rattus norvegicus cytokeratin 8 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC091106 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 8, mRNA (cDNA clone MGC:108522 IMAGE:7381703), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC097497 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 8, mRNA (cDNA clone MGC:114571 IMAGE:7462062), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// M63482 // GenBank // Rat cytokeratin 8 polypeptide mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141326318:141403991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT052575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
NM_001191790 // RefSeq // Rattus norvegicus SPRY domain containing 3 (Spryd3), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000055320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141517639:141534847:-1 gene:ENSRNOG00000010793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141518724:141532772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_013171 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, beta 7 (Itgb7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141618049:141630487:-1 gene:ENSRNOG00000012208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141618250:141678908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001135249 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid receptor, gamma (Rarg), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001135250 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid receptor, gamma (Rarg), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141637841:141649041:-1 gene:ENSRNOG00000012499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141637841:141660460:-1 gene:ENSRNOG00000012499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141618250:141678908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001106795 // RefSeq // Rattus norvegicus achalasia, adrenocortical insufficiency, alacrimia (Aaas), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141733241:141751976:-1 gene:ENSRNOG00000013445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141733684:141746294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001037632 // RefSeq // Rattus norvegicus Sp7 transcription factor (Sp7), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NM_181374 // RefSeq // Rattus norvegicus Sp7 transcription factor (Sp7), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sp7 transcription factor (Sp7), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000018828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141754166:141762169:-1 gene:ENSRNOG00000014082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY177399 // GenBank // Rattus norvegicus osterix mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141754166:141756869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_013055 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase 12 (Map3k12), mRNA. // chr7 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000020437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141894814:141901161:-1 gene:ENSRNOG00000015134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// D49785 // GenBank // Rattus norvegicus MUK mRNA for protein kinase, complete cds. // chr7 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// FQ211695 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA83YF19 mRNA sequence. // chr7 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// FQ212412 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA55YP05 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141895451:141906008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001108115 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 7 (Atf7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141928320:142016018:-1 gene:ENSRNOG00000015269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC158605 // GenBank // Rattus norvegicus activating transcription factor 7, mRNA (cDNA clone MGC:187467 IMAGE:7135404), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141928971:141955337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_133556 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit C2 (subunit 9) (Atp5g2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000020676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142056432:142064809:-1 gene:ENSRNOG00000015320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC128726 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit C2 (subunit 9), mRNA (cDNA clone MGC:156595 IMAGE:7321526), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ209535 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YB13 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142056575:142061677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_139190 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding and coiled coil domain 1 (Calcoco1), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:143218503:143233218:-1 gene:ENSRNOG00000015447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000070855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142100563:142112022:-1 gene:ENSRNOG00000048982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY078385 // GenBank // Rattus norvegicus KIAA1536 protein mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC081722 // GenBank // Rattus norvegicus calcium binding and coiled coil domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:93160 IMAGE:7124320), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142092738:142144915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:143204341:143250388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
XR_348285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547409 (LOC102547409), ncRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547409 (LOC102547409), transcript variant X2, ncRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177934 // RefSeq // Rattus norvegicus single-strand-selective monofunctional uracil-DNA glycosylase 1 (Smug1), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142562646:142564771:-1 gene:ENSRNOG00000036842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY191521 // GenBank // Rattus norvegicus single-strand selective monofunctional uracil-DNA glycosylase (Smug1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142562646:142591872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT052619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 93 // 48 // 13 // 14 // 0
NM_001106797 // RefSeq // Rattus norvegicus chromobox homolog 5 (Cbx5), mRNA. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006242391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 5 (Cbx5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006242394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 5 (Cbx5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000055289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142605589:142623004:-1 gene:ENSRNOG00000036841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC166908 // GenBank // Rattus norvegicus chromobox homolog 5 (HP1 alpha homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188878 IMAGE:6889335), complete cds. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC168739 // GenBank // Rattus norvegicus chromobox homolog 5 (HP1 alpha homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188838 IMAGE:6918617), complete cds. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142605985:142621191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT052623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT052625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001012224 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2 (Nfe2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid derived 2 (Nfe2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006242433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid derived 2 (Nfe2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000055281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142654122:142661467:-1 gene:ENSRNOG00000036837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078925 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid derived 2, mRNA (cDNA clone MGC:93715 IMAGE:7106450), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142654344:142661477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006226285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102554992), mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// XM_006242466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102554992), mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000051929 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:142667705:142668301:-1 gene:ENSRNOG00000036836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142667687:142668301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
NM_001109509 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 84 (Gpr84), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142714632:142716825:-1 gene:ENSRNOG00000036834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142714819:142716009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108118 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha 5 (fibronectin receptor, alpha polypeptide) (Itga5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006242401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha 5 (fibronectin receptor, alpha polypeptide) (Itga5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000055277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142750121:142773323:-1 gene:ENSRNOG00000036832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142742583:142773054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001079707 // RefSeq // Rattus norvegicus gametocyte specific factor 1 (Gtsf1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gametocyte specific factor 1 (Gtsf1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006242405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gametocyte specific factor 1 (Gtsf1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006242406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gametocyte specific factor 1 (Gtsf1), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000055275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142809280:142826369:-1 gene:ENSRNOG00000036831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128778 // GenBank // Rattus norvegicus gametocyte specific factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:156809 IMAGE:7134533), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142795881:142839988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSRNOT00000055274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142835835:142841993:-1 gene:ENSRNOG00000036830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167768 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CDNA sequence BC048502, mRNA (cDNA clone MGC:187544 IMAGE:7456523), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142795881:142839988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022676 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1A (Ppp1r1a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142925731:142933381:-1 gene:ENSRNOG00000036827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY648296 // GenBank // Rattus norvegicus PP1 inhibitor 1 (Ppp1r1a) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC078820 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1A, mRNA (cDNA clone MGC:93431 IMAGE:7127505), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ217772 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA18YD21 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// J05592 // GenBank // Rat protein phosphatase inhibitor-1 protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142926630:142933247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT052642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_012794 // RefSeq // Rattus norvegicus glycosylation dependent cell adhesion molecule 1 (Glycam1), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142951738:142953998:-1 gene:ENSRNOG00000036826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L08100 // GenBank // Rat glycam 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT052644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142940533:142953977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001108753 // RefSeq // Rattus norvegicus UHRF1 binding protein 1-like (Uhrf1bp1l), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_003750307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UHRF1-binding protein 1-like (LOC100910056), mRNA. // chr7 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:30505665:30553762:1 gene:ENSRNOG00000050317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000044141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30197943:30229295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30505284:30551352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0
NM_001134466 // RefSeq // Rattus norvegicus XRCC6 binding protein 1 (Xrcc6bp1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70360825:70375828:-1 gene:ENSRNOG00000045629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70361101:70375764:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001039333 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 25 (Zdhhc25), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129286073:129287305:1 gene:ENSRNOG00000046044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY886541 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC26 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129286254:129287066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_001037355 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 7A (Mettl7a), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000052075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139783755:139790601:1 gene:ENSRNOG00000001376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// BC104688 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase like 7A, mRNA (cDNA clone IMAGE:7100736), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC105760 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase like 7A, mRNA (cDNA clone MGC:124657 IMAGE:5623503), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000032089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139783787:139795971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
NM_023956 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 2 (Gucy1a2), mRNA. // chr8 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000046058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:417940:903205:1 gene:ENSRNOG00000029876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB096080 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for soluble guanlate cyclase alpha 2 subunit, complete cds. // chr8 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// AB097860 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for soluble guanylyl cyclase alpha 2 subunit E219G mutant, complete cds. // chr8 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// AF109963 // GenBank // Rattus norvegicus soluble guanylyl cyclase alpha2 subunit (GUCY1A2) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// XM_006242470 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 2 (Gucy1a2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// XM_006242472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 2 (Gucy1a2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000016816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:515431:903205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT052650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NONRATT052653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001108121 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 3 (Kbtbd3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 3 (Kbtbd3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:1458405:1472634:1 gene:ENSRNOG00000022252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:1470813:1472396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001024357 // RefSeq // Rattus norvegicus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 4 with coiled-coils (Msantd4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:1497145:1507753:1 gene:ENSRNOG00000022245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:1503445:1506175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_012762 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 1 (Casp1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:2627973:2636854:1 gene:ENSRNOG00000007372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D85899 // GenBank // Rattus norvegicus ICE mRNA for caspase-1, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// U14647 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-1 beta converting enzyme (IL1BCE) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:2627420:2703967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_053736 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 4, apoptosis-related cysteine peptidase (Casp4), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:2658133:2673885:1 gene:ENSRNOG00000033697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY029283 // GenBank // Rattus norvegicus caspase 11 (Casp11) mRNA, complete cds. // chrU // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC104720 // GenBank // Rattus norvegicus caspase 4, apoptosis-related cysteine peptidase, mRNA (cDNA clone MGC:124949 IMAGE:7382967), complete cds. // chrU // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:2627420:2703967:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT052662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT052663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_130422 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 12 (Casp12), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:2682098:2708341:1 gene:ENSRNOG00000033434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF317633 // GenBank // Rattus norvegicus capsase-12 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FJ465154 // GenBank // Rattus norvegicus pro-caspase-12 splice variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:2627420:2703967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_023962 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet derived growth factor D (Pdgfd), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000049325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:4454510:4682165:1 gene:ENSRNOG00000029148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// AB052170 // GenBank // Rattus norvegicus rSCDGF-B mRNA for spinal-cord derived growth factor-B, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000034264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4589079:4682052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 39 // 52 // 1 /// NONRATT052675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 75 // 75 // 39 // 52 // 1
NM_001009696 // RefSeq // Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 5 (Dcun1d5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000061916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5444079:5465187:1 gene:ENSRNOG00000008390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC087627 // GenBank // Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 5 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105763 IMAGE:7318159), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ215259 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YO15 mRNA sequence. // chr8 // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// NONRATT052677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5458034:5464941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_133530 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 13 (Mmp13), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5527980:5538259:1 gene:ENSRNOG00000008478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// M60616 // GenBank // Rat collagenase (UMRCase) mRNA, 3 end. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5527990:5542205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT052680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_053963 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 12 (Mmp12), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5610392:5620293:1 gene:ENSRNOG00000030187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC088120 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 12, mRNA (cDNA clone MGC:108621 IMAGE:7380302), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5610436:5619945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_133523 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 3 (Mmp3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012310 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:5680439:5701146:1 gene:ENSRNOG00000032626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT052682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5680439:5725882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_001134530 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 1 (interstitial collagenase) (Mmp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5706054:5726439:1 gene:ENSRNOG00000032353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC169019 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 1a (interstitial collagenase), mRNA (cDNA clone MGC:189393 IMAGE:9091657), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5680439:5725882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_133514 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 10 (stromelysin 2) (Mmp10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5737185:5745085:1 gene:ENSRNOG00000032832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M65253 // GenBank // Rat transformation-associated protein (34A) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5737219:5803133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_022221 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 8 (Mmp8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242496 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 8 (Mmp8), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5771724:5780576:1 gene:ENSRNOG00000009907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5737219:5803133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106799 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 27 (Mmp27), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5793237:5803156:1 gene:ENSRNOG00000040208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5737219:5803133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106800 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 20 (Mmp20), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5836699:5877372:1 gene:ENSRNOG00000021896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5845982:5863197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_012864 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 7 (Mmp7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5895393:5903099:1 gene:ENSRNOG00000010507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC064657 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 7, mRNA (cDNA clone MGC:72527 IMAGE:5623517), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L24374 // GenBank // Rattus norvegicus matrilysin (MMP-7) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5895421:5903002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT052688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001014205 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 123 (Tmem123), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5995680:5999126:1 gene:ENSRNOG00000010584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC089103 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 123, mRNA (cDNA clone MGC:105690 IMAGE:7307876), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5980679:5997646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
GENSCAN00000013951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6059772:6134271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
ENSRNOT00000030115 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:6756509:6756867:1 gene:ENSRNOG00000027052 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6750765:6756867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_053559 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 6 (Trpc6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:6799564:6904624:1 gene:ENSRNOG00000006324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:6799564:6904624:1 gene:ENSRNOG00000006324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ212829 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YC08 mRNA sequence. // chr8 // 85 // 50 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000022781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6859146:6904624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022847 // RefSeq // Rattus norvegicus progesterone receptor (Pgr), mRNA. // chr8 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:7113895:7172761:1 gene:ENSRNOG00000006831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// HM037361 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN progesterone receptor (Pgr) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// HM037362 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS progesterone receptor (Pgr) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// L16922 // GenBank // Rat progesteron receptor gene, complete cds. // chr8 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:7113895:7169259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000010872 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:10113375:10114277:1 gene:ENSRNOG00000008114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:10091246:10114052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000061696 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:11431395:11431868:1 gene:ENSRNOG00000040111 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:11370696:11431646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001007660 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 82 (Ccdc82), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:11846685:11885449:1 gene:ENSRNOG00000005713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081989 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 82, mRNA (cDNA clone MGC:94183 IMAGE:7129126), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:11850710:11884242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001072241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mastermind like 2 (Drosophila) (Maml2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726984 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mastermind like 2 (Drosophila) (Maml2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006226302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mastermind like 2 (Drosophila) (Maml2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006242536 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mastermind like 2 (Drosophila) (Maml2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000036338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:12115651:12201338:1 gene:ENSRNOG00000005879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12163965:12201338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT052709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001108123 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 2 (Mtmr2), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242522 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 2 (Mtmr2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:12233929:12284288:1 gene:ENSRNOG00000005923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ217011 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA37YL03 mRNA sequence. // chr8 // 84 // 83 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12234916:12283395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108994 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 76, member B (Fam76b), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 76, member B (Fam76b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006242528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 76, member B (Fam76b), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:12306043:12324965:1 gene:ENSRNOG00000024863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 76, member B (Fam76b), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000021654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12309173:12322562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001108125 // RefSeq // Rattus norvegicus sestrin 3 (Sesn3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:12768653:12818203:1 gene:ENSRNOG00000008173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12743234:12816910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001024987 // RefSeq // Rattus norvegicus CWC15 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae) (Cwc15), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000011855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:12939501:12950303:1 gene:ENSRNOG00000008490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC091396 // GenBank // Rattus norvegicus CWC15 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109502 IMAGE:7323256), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT052726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT052727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_022279 // RefSeq // Rattus norvegicus MRE11 meiotic recombination 11 homolog A (S. cerevisiae) (Mre11a), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000012940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13245885:13289958:1 gene:ENSRNOG00000009506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF218574 // GenBank // Rattus norvegicus MRE11 (MRE11) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13245894:13314647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_080411 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 83 (Gpr83), mRNA. // chr8 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13306230:13316717:1 gene:ENSRNOG00000030318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AY029071 // GenBank // Rattus norvegicus glucocorticoid-induced receptor mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT052733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13245894:13314647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_001069195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S24-like (RGD1562937), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_578706 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S24-like (RGD1562937), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012849 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:13603797:13604192:1 gene:ENSRNOG00000009695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13603800:13618500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_001144870 // RefSeq // Rattus norvegicus V-set and transmembrane domain containing 5 (Vstm5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13735551:13755647:1 gene:ENSRNOG00000010480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13653923:13757424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001014207 // RefSeq // Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, D (Taf1d), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// XM_006242543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, D (Taf1d), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// XM_006242546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, D (Taf1d), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000014605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13802188:13810920:1 gene:ENSRNOG00000010921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC087647 // GenBank // Rattus norvegicus TATA box binding protein (TBP)-associated factor, RNA polymerase I, D, 41kDa, mRNA (cDNA clone MGC:105574 IMAGE:7311303), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT019716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 94 // 9 // 31 // 0 /// NONRATT019719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 94 // 9 // 31 // 0 /// NONRATT019720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 94 // 9 // 31 // 0
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071775 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77034553:77034617:-1 gene:ENSRNOG00000049815 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 74 // 63 // 14 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073033 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77034042:77034106:-1 gene:ENSRNOG00000046559 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 74 // 63 // 14 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073553 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:13809372:13809436:1 gene:ENSRNOG00000050012 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 74 // 63 // 14 // 19 // 0 /// NONRATT055368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 73 // 100 // 22 // 30 // 0
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AJ240059 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Z40 snoRNA. // chr8 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001134584 // RefSeq // Rattus norvegicus single-pass membrane protein with coiled-coil domains 4 (Smco4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:14139544:14159122:1 gene:ENSRNOG00000011162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT052757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:14105900:14158695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001108127 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 4 (Slc36a4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006242558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 4 (Slc36a4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:14330657:14360233:1 gene:ENSRNOG00000011455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:14330682:14438756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001047979 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00142 (LOC689840), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:14897700:14902804:1 gene:ENSRNOG00000031522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:14897700:14902804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_053691 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 2 (Nek2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:115071864:115082965:1 gene:ENSRNOG00000004487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016174 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:16016211:16017544:1 gene:ENSRNOG00000012119 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114958814:115082965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:16016211:16017544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT052764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 86 // 44 // 12 // 14 // 0
NM_001108128 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine and histidine-rich domain (CHORD)-containing 1 (Chordc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000030569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:17494921:17518882:1 gene:ENSRNOG00000026643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:17494854:17517463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
ENSRNOT00000061364 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:17602403:17603542:1 gene:ENSRNOG00000039943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT052774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
XM_001075118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 3-like 2 (Mbd3l2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_235852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 3-like 2 (Mbd3l2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000029911 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:18003749:18005098:1 gene:ENSRNOG00000026629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:18000019:18122283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_001106803 // RefSeq // Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 3-like 1 (Mbd3l1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 3-like 1 (Mbd3l1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 3-like 1 (Mbd3l1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 3-like 1 (Mbd3l1), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18497209:18501602:1 gene:ENSRNOG00000006363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:18500894:18501454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000039451 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:18526425:18526966:1 gene:ENSRNOG00000026540 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 79 // 93 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:18526272:18526966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_001000426 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1124 (Olr1124), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18862485:18863446:1 gene:ENSRNOG00000046796 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:18862836:18976784:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT052778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000881 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1125 (Olr1125), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18913855:18914793:1 gene:ENSRNOG00000026489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000987 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1128 (Olr1128), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18994694:18995629:1 gene:ENSRNOG00000029054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000877 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1142 (Olr1142), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19342731:19343669:1 gene:ENSRNOG00000045713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001017 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1143 (Olr1143), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044135 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:19357782:19358675:1 gene:ENSRNOG00000048354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19358022:19451171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
NM_001000875 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1148 (Olr1148), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19614772:19615714:1 gene:ENSRNOG00000006584 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000873 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1156 (Olr1156), mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19889933:19890871:1 gene:ENSRNOG00000029802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19889933:19969117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001134634 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 317 (Zfp317), mRNA. // chrU // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000034254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19964735:19983504:1 gene:ENSRNOG00000006684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT052786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT052789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19889933:19969117:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001000871 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1159 (Olr1159), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20052081:20053010:1 gene:ENSRNOG00000049191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000985 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1160 (Olr1160), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20074286:20075215:1 gene:ENSRNOG00000049729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000870 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1162 (Olr1162), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20128073:20129002:1 gene:ENSRNOG00000047533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000045980 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:20205935:20206941:1 gene:ENSRNOG00000006713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:20206157:20255599:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_001000984 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1164 (Olr1164), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20286414:20287355:1 gene:ENSRNOG00000030965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000868 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1165 (Olr1165), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000044463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20303387:20304316:1 gene:ENSRNOG00000047835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000867 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1166 (Olr1166), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20339316:20340254:1 gene:ENSRNOG00000046909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000434 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1169 (Olr1169), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20431368:20432324:1 gene:ENSRNOG00000047916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21106122:21107078:1 gene:ENSRNOG00000048711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21106122:21116485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000042797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:20431368:20441731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001001016 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1174 (Olr1174), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20608969:20609964:1 gene:ENSRNOG00000049712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT052797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000008863 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:20693068:20693587:1 gene:ENSRNOG00000006781 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:20499217:20724087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
GENSCAN00000001640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:20499217:20724087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001000864 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1179 (Olr1179), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20801782:20802711:1 gene:ENSRNOG00000033150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to olfactory receptor Olr1185 (LOC690821), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000052197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:20852451:20853562:1 gene:ENSRNOG00000049623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
FQ226910 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA17YP10 mRNA sequence. // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// FQ222240 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA26YJ09 mRNA sequence. // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// FQ226144 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA35YK05 mRNA sequence. // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// FQ226164 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA34YB22 mRNA sequence. // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// FQ226888 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA19YO14 mRNA sequence. // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// FQ228271 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA103YC23 mRNA sequence. // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONRATT003223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONRATT003224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONRATT003226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0
NM_001000862 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1186 (Olr1186), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21051765:21052763:1 gene:ENSRNOG00000030613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000982 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1185 (Olr1185), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000061271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21236331:21237299:1 gene:ENSRNOG00000039892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006226343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to olfactory receptor Olr1185 (LOC690821), mRNA. // chr8 // 51 // 96 // 22 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000052197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:20852451:20853562:1 gene:ENSRNOG00000049623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 51 // 96 // 22 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000047245 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:20911870:20920599:1 gene:ENSRNOG00000045942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 100 // 42 // 45 // 0 /// NONRATT052801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
NM_001000862 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1186 (Olr1186), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21051765:21052763:1 gene:ENSRNOG00000030613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003754375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor Olr1192-like (LOC100361194), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21335428:21336355:1 gene:ENSRNOG00000033839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001000859 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1192 (Olr1192), mRNA. // chr8 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21402841:21403803:-1 gene:ENSRNOG00000033025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NM_001000594 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1193 (Olr1193), mRNA. // chr8 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NM_001000981 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1191 (Olr1191), mRNA. // chr8 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21367597:21368559:1 gene:ENSRNOG00000028864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NONRATT052802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21367597:21368559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NONRATT052803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_001000981 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1191 (Olr1191), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000859 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1192 (Olr1192), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21402841:21403803:-1 gene:ENSRNOG00000033025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134585 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 846 (Zfp846), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 846 (Zfp846), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21667380:21674450:1 gene:ENSRNOG00000020356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NONRATT052809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001048243 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like 5 (Ubl5), mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21719386:21721099:1 gene:ENSRNOG00000020442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC157818 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:188356 IMAGE:7936655), complete cds. // chr8 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// XM_006242661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-like 5 (Ubl5), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// NONRATT052810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT052812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT052813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0
NM_001106701 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 (Pin1), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000027818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21725297:21736676:1 gene:ENSRNOG00000020474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC158867 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1, mRNA (cDNA clone MGC:188496 IMAGE:5623763), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// FQ219403 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YI01 mRNA sequence. // chr8 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// NONRATT052815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000018669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21725303:21736255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// NONRATT052817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001168593 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 8 (all-trans) (Rdh8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21891192:21898463:1 gene:ENSRNOG00000025767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21893242:21904843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001025054 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC500956 (LOC500956), mRNA. // chr8 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// XM_006242662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC500956 (LOC500956), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027949 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:21946553:21952190:1 gene:ENSRNOG00000020580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21943136:21951802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT052822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001011980 // RefSeq // Rattus norvegicus peter pan homolog (Drosophila) (Ppan), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21962180:21966157:1 gene:ENSRNOG00000020608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC089842 // GenBank // Rattus norvegicus peter pan homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:108837 IMAGE:7366262), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21962268:21967590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT052824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT052825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT052828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT052827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT052826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000018677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21962268:21967590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0
NM_001108754 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L4 (Mrpl4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22078081:22084096:1 gene:ENSRNOG00000020659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22078279:22090344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT052833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_012967 // RefSeq // Rattus norvegicus intercellular adhesion molecule 1 (Icam1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22092135:22103927:1 gene:ENSRNOG00000020679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081837 // GenBank // Rattus norvegicus intercellular adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:93596 IMAGE:7122397), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ225444 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA52YH03 mRNA sequence. // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000042704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22092185:22105630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001172079 // RefSeq // Rattus norvegicus intercellular adhesion molecule 5, telencephalin (Icam5), mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22107090:22114077:1 gene:ENSRNOG00000020694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22107319:22113943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0
ENSRNOT00000040903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:22120138:22120335:1 gene:ENSRNOG00000033655 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000042665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22115543:22120335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_001134715 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 44 (choline transporter), member 2 (Slc44a2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000049973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22422933:22439983:1 gene:ENSRNOG00000031824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC168183 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 44, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187957 IMAGE:7098013), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// FQ231292 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA71YO12 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000042703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22405728:22438747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT052849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT052847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// NONRATT052848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// NONRATT052851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT052852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// NONRATT052853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT052854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001134715 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 44 (choline transporter), member 2 (Slc44a2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22422933:22439983:1 gene:ENSRNOG00000031824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168183 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 44, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187957 IMAGE:7098013), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231292 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA71YO12 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053412 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin enhancer binding factor 3 (Ilf3), mRNA. // chr8 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000009354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22478044:22494771:1 gene:ENSRNOG00000022741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AF220102 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin enhancer binding factor 3 mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// FQ227292 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YN23 mRNA sequence. // chr8 // 85 // 33 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT052856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT052857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// GENSCAN00000042682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22440854:22490215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// NONRATT052855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT052858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
NM_022250 // RefSeq // Rattus norvegicus queuine tRNA-ribosyltransferase 1 (Qtrt1), mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22501169:22508439:1 gene:ENSRNOG00000007158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AB034634 // GenBank // Rattus norvegicus tgt mRNA for tRNA-guanine transglycosylase, complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC097321 // GenBank // Rattus norvegicus queuine tRNA-ribosyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:114324 IMAGE:7387393), complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22501133:22508256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT052860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
NM_013199 // RefSeq // Rattus norvegicus dynamin 2 (Dnm2), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006242609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynamin 2 (Dnm2), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000010947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22513045:22594143:1 gene:ENSRNOG00000007649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000065028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22513045:22594143:1 gene:ENSRNOG00000007649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000066007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22513045:22594143:1 gene:ENSRNOG00000007649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// L24562 // GenBank // Rattus norvegicus dynamin isoform (DYN2) mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 89 // 37 // 42 // 0 /// L25605 // GenBank // Rat dynamin IIaa and IIab mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000046743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22513159:22593404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT052862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT052864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 13 // 47 // 1 /// NONRATT052866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 47 // 47 // 22 // 47 // 1 /// NONRATT052871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1
ENSRNOT00000041091 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:22613207:22630263:1 gene:ENSRNOG00000033256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227025 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YI21 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ230556 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YP10 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22613308:22675218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001030041 // RefSeq // Rattus norvegicus coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (Carm1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000048245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22631820:22676514:1 gene:ENSRNOG00000031129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AB201114 // GenBank // Rattus norvegicus CARM1-v1 mRNA for coactivator-associated arginine methyltransferase 1 variant 1, complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AB201115 // GenBank // Rattus norvegicus CARM1-v2 mRNA for coactivator-associated arginine methyltransferase 1 variant 2, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB201116 // GenBank // Rattus norvegicus CARM1-v3 mRNA for coactivator-associated arginine methyltransferase 1 variant 3, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001034088 // RefSeq // Rattus norvegicus coactivator-associated arginine methyltransferase 1 (Carm1), transcript variant 4, mRNA. // chr8 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000041577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22631820:22676514:1 gene:ENSRNOG00000031129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// AB201117 // GenBank // Rattus norvegicus CARM1-v4 mRNA for coactivator-associated arginine methyltransferase 1 variant 4, complete cds. // chr8 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// NONRATT052874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22613308:22675218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// NONRATT052877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001108129 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein BC011833 (RGD1309188), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22679828:22682797:1 gene:ENSRNOG00000009255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22680063:22826955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_134368 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4 (Smarca4), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000013165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22702277:22793519:1 gene:ENSRNOG00000009271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000046728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22680063:22826955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT052881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT052883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// NONRATT052885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_175762 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor (Ldlr), mRNA. // chr8 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000013496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22804325:22827199:1 gene:ENSRNOG00000009946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000046728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22680063:22826955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT052887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001271710 // RefSeq // Rattus norvegicus rCG31799-like (LOC100361444), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015381 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:22911000:22912745:1 gene:ENSRNOG00000011490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC160867 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7325074. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT052893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_006226315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 159 (Ccdc159), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// XM_006242680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 159 (Ccdc159), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22992813:23001006:1 gene:ENSRNOG00000011799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// BC088314 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing-like, mRNA (cDNA clone MGC:109537 IMAGE:7324729), complete cds. // chr8 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// NONRATT052894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT052895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000054250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22994772:23023016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT052897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_001005881 // RefSeq // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphatase-related protein type 2 (Lppr2), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23003383:23013242:1 gene:ENSRNOG00000012164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY310911 // GenBank // Rattus norvegicus plasticity related protein PRG-4 mRNA, complete cds. // chr8 // 37 // 90 // 10 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22994772:23023016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT052900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT052899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001108755 // RefSeq // Rattus norvegicus SWIM-type zinc finger 7 associated protein 1 (Swsap1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23021536:23024064:1 gene:ENSRNOG00000012604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23021576:23024064:1 gene:ENSRNOG00000012604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC168995 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2310047B19Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:189345 IMAGE:7193660), complete cds. // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT052902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22994772:23023016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT052903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001106806 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C substrate 80K-H (Prkcsh), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23069740:23081287:1 gene:ENSRNOG00000013360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC161987 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C substrate 80K-H, mRNA (cDNA clone MGC:187806 IMAGE:9030870), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23070127:23080171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT052905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_031747 // RefSeq // Rattus norvegicus calponin 1, basic, smooth muscle (Cnn1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23167863:23176532:1 gene:ENSRNOG00000027736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061809 // GenBank // Rattus norvegicus calponin 1, basic, smooth muscle, mRNA (cDNA clone MGC:72389 IMAGE:5598777), complete cds. // chrU // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// D14437 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for calponin, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23167927:23176034:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT052909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT052911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_001077807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9530077C05 (RGD1561444), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006226333 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9530077C05 (RGD1561444), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006242703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9530077C05 (RGD1561444), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_235936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9530077C05 (RGD1561444), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000031893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23479700:23498785:1 gene:ENSRNOG00000026979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// FQ217109 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA35YF20 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23463304:23491419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT052916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSRNOT00000020481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23813100:23909695:1 gene:ENSRNOG00000015189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// XM_006226335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 9 (Bbs9), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 80 // 80 // 33 // 41 // 1 /// ENSRNOT00000060758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23909630:24113782:1 gene:ENSRNOG00000015189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// GENSCAN00000053264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23903865:23928426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23805214:23901270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT052917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1
ENSRNOT00000060753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:24123071:24124124:1 gene:ENSRNOG00000039627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// NONRATT052919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 80 // 53 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:24112782:24138666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_001135799 // RefSeq // Rattus norvegicus BMP-binding endothelial regulator (Bmper), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BMP-binding endothelial regulator (Bmper), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:24409998:24655248:1 gene:ENSRNOG00000015357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:24544493:24557488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT052921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000047102 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:25170002:25171177:1 gene:ENSRNOG00000029548 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000037707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:25169888:25171172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NM_001106808 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide S receptor 1 (Npsr1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:25280185:25514199:1 gene:ENSRNOG00000015863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:25497335:25512924:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:25415940:25486643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
GENSCAN00000025936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:26037314:26058667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001113740 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 7 (Sept7), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_022616 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 7 (Sept7), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006242729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 7 (Sept7), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// XM_006242730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 7 (Sept7), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000008838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:26435007:26498715:1 gene:ENSRNOG00000006545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000063967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:26435007:26498715:1 gene:ENSRNOG00000006545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF142759 // GenBank // Rattus norvegicus CDC10 (CDC10) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// BC128738 // GenBank // Rattus norvegicus septin 7, mRNA (cDNA clone MGC:156646 IMAGE:7381331), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT052927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001014088 // RefSeq // Rattus norvegicus endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1 (Eepd1), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:26673119:26779323:1 gene:ENSRNOG00000006931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC083816 // GenBank // Rattus norvegicus endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94880 IMAGE:7110630), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC099214 // GenBank // Rattus norvegicus endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:116390 IMAGE:7384643), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:26763675:26778825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT052931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001198725 // RefSeq // Rattus norvegicus gene rich cluster, C10 gene (Grcc10), mRNA. // chr8 // 70 // 95 // 14 // 20 // 0 /// XM_006244638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein C10-like (LOC100911713), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224281979:224283614:-1 gene:ENSRNOG00000025810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 95 // 14 // 20 // 0 /// FQ231953 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YJ01 mRNA sequence. // chr8 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0 /// FQ234499 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YL19 mRNA sequence. // chr8 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0
NM_054003 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-1,3-glucuronyltransferase 1 (glucuronosyltransferase P) (B3gat1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:27797386:27823230:1 gene:ENSRNOG00000007142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// D88035 // GenBank // Rattus norvegicus GlcAT-P mRNA for glycoprotein specific UDP-glucuronyltransferase, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:27797450:27821323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001034000 // RefSeq // Rattus norvegicus non-SMC condensin II complex, subunit D3 (Ncapd3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 125 // 125 // 0 /// ENSRNOT00000012078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:28095382:28164187:1 gene:ENSRNOG00000008932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 125 // 125 // 0 /// BC101928 // GenBank // Rattus norvegicus non-SMC condensin II complex, subunit D3, mRNA (cDNA clone MGC:124743 IMAGE:7939116), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 125 // 125 // 0 /// GENSCAN00000036343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:28098750:28163710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 121 // 121 // 0 /// NONRATT052934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 125 // 125 // 0 /// NONRATT052935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 10 // 10 // 12 // 125 // 1 /// NONRATT052937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 7 // 7 // 9 // 125 // 1
XM_006226347 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 9B (Igsf9b), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006226348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 9B (Igsf9b), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 9B (Igsf9b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 9B (Igsf9b), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012391 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:28371761:28406211:1 gene:ENSRNOG00000009253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:28377182:28417043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_134384 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 19 (Spata19), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:28477550:28478888:1 gene:ENSRNOG00000031438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB057408 // GenBank // Rattus norvegicus spergen-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC081729 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 19, mRNA (cDNA clone MGC:93204 IMAGE:7132055), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_053848 // RefSeq // Rattus norvegicus opioid binding protein/cell adhesion molecule-like (Opcml), mRNA. // chr8 // 83 // 79 // 19 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000042890 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:29724777:29974284:1 gene:ENSRNOG00000023809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// M88709 // GenBank // Rattus norvegicus cell adhesion-like molecule mRNA, complete CDS. // chr8 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// M88710 // GenBank // Rattus norvegicus cell adhesion-like molecule mRNA, complete cds. // chr8 // 86 // 76 // 19 // 22 // 0 /// M88711 // GenBank // Rattus norvegicus cell adhesion-like molecule mRNA, complete cds. // chr8 // 83 // 79 // 19 // 23 // 0 /// NONRATT052941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:29916555:29960710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001108131 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 19 (Snx19), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006242746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 19 (Snx19), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006242747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 19 (Snx19), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:31526777:31563215:1 gene:ENSRNOG00000014719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:31502386:31560559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_003750455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 8 (Adamts8), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_003754395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 8 (Adamts8), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32044798:32063464:1 gene:ENSRNOG00000005574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32044798:32063464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT052951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_001034942 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 44 (Zbtb44), mRNA. // chr8 // 100 // 49 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32191761:32243080:1 gene:ENSRNOG00000005578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 49 // 25 // 25 // 0 /// BC104680 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 44, mRNA (cDNA clone MGC:125242 IMAGE:7456912), complete cds. // chr8 // 100 // 49 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 10 (Prdm10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 45 // 45 // 23 // 51 // 1 /// ENSRNOT00000010423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32477808:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 45 // 45 // 23 // 51 // 1 /// ENSRNOT00000060621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32480197:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 45 // 45 // 23 // 51 // 1 /// GENSCAN00000003761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32214710:32242173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 45 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32490027:32548005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 45 // 45 // 23 // 51 // 1 /// NONRATT052956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 16 // 51 // 1
ENSRNOT00000029566 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:32441839:32442364:1 gene:ENSRNOG00000023413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32442000:32442319:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
XM_006242770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 10 (Prdm10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32477808:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32480197:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32461768:32486535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32490027:32548005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006242770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 10 (Prdm10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32477808:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32480197:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32490027:32548005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006242770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 10 (Prdm10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32477808:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32480197:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32490027:32548005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006242770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 10 (Prdm10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32477808:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32480197:32548005:1 gene:ENSRNOG00000007853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32490027:32548005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108133 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor related to kappa B binding protein (Nfrkb), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor related to kappa B binding protein (Nfrkb), transcript variant X10, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32555212:32586755:1 gene:ENSRNOG00000008278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32558032:32585601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017025 // RefSeq // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A (Ldha), mRNA. // chr8 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// BC060587 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A, mRNA (cDNA clone MGC:72944 IMAGE:6919582), complete cds. // chr8 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// BC168737 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A, mRNA (cDNA clone MGC:188833 IMAGE:6917937), complete cds. // chr8 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000012585 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:33096207:33097816:1 gene:ENSRNOG00000009373 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT052965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006226362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 32 (Arhgap32), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 32 (Arhgap32), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33257762:33406716:1 gene:ENSRNOG00000008709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC168683 // GenBank // Rattus norvegicus Rho GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5623901), partial cds. // chr8 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33385092:33406716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT052969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT052966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_017023 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 1 (Kcnj1), mRNA. // chr8 // 93 // 74 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33560608:33564732:1 gene:ENSRNOG00000008779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000042493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33550962:33564732:1 gene:ENSRNOG00000008779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33560608:33564732:1 gene:ENSRNOG00000008779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// AF081365 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-regulated K+ channel ROMK1.1 isoform mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 54 // 19 // 21 // 0 /// AF081366 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-regulated K+ channel ROMK2.1 isoform mRNA, complete cds. // chr8 // 75 // 41 // 12 // 16 // 0 /// AF081367 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-regulated K+ channel ROMK3.1 isoform mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 49 // 17 // 19 // 0 /// AF081368 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-regulated K+ channel ROMK6.1 isoform mRNA, complete cds. // chr8 // 91 // 59 // 21 // 23 // 0 /// L29403 // GenBank // Rattus norvegicus (clone ROMK2) epithelial K+ channel mRNA, complete cds. // chr8 // 71 // 62 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33560757:33564009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 41 // 13 // 16 // 0 /// NONRATT052971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT052973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0
NM_012555 // RefSeq // Rattus norvegicus v-ets avian erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 1 (Ets1), mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// XM_006242750 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-ets avian erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 1 (Ets1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33858347:33921593:1 gene:ENSRNOG00000008941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33858338:33921560:1 gene:ENSRNOG00000008941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// BC101927 // GenBank // Rattus norvegicus v-ets erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 1 (avian), mRNA (cDNA clone MGC:124638 IMAGE:7939228), complete cds. // chr8 // 97 // 70 // 30 // 31 // 0 /// L20681 // GenBank // Rat proto-oncogene (Ets-1) mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 82 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33881938:33918167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 95 // 91 // 38 // 40 // 0
GENSCAN00000051823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33989143:34081215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NONRATT052974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001048215 // RefSeq // Rattus norvegicus kin of IRRE like 3 (Drosophila) (Kirrel3), mRNA. // chr8 // 97 // 75 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000013036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36148052:36273790:1 gene:ENSRNOG00000009772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// DQ902828 // GenBank // Rattus norvegicus membrane protein KIRRE mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 75 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT052977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// GENSCAN00000025321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36209293:36272761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 24 // 48 // 1 /// NONRATT052982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 24 // 48 // 1 /// NONRATT052983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_001034150 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle receptor (docking protein) (Srpr), mRNA. // chr8 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36428866:36434332:1 gene:ENSRNOG00000010543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC105782 // GenBank // Rattus norvegicus signal recognition particle receptor (docking protein), mRNA (cDNA clone MGC:124867 IMAGE:5599400), complete cds. // chr8 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36428976:36434058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT052988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT052989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001025284 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA pseudouridylate synthase domain containing 4 (Rpusd4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36485875:36495292:1 gene:ENSRNOG00000011567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098023 // GenBank // Rattus norvegicus RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:116175 IMAGE:7455606), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36485882:36486602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT052992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36488566:36532139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_017358 // RefSeq // Rattus norvegicus cell adhesion associated, oncogene regulated (Cdon), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000016248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36673132:36725976:1 gene:ENSRNOG00000011789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000065358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36673132:36725976:1 gene:ENSRNOG00000011789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF004840 // GenBank // Rattus norvegicus CDO (cdo) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000028797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36670064:36725204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT052995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NONRATT052995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001108134 // RefSeq // Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 3 (Pus3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36783458:36785648:1 gene:ENSRNOG00000012994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087674 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7319261. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158693 // GenBank // Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:187724 IMAGE:9023160), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36783492:36785431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT052999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0
NM_001267781 // RefSeq // Rattus norvegicus prostate and testis expressed 2 (Pate2), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostate and testis expressed 2 (Pate2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000060448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36867584:36868869:1 gene:ENSRNOG00000033981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// HQ687476 // GenBank // Rattus norvegicus prostate and testis expressed 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
ENSRNOT00000030635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:38252137:38253524:1 gene:ENSRNOG00000046489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// HQ840742 // GenBank // Rattus norvegicus spleen protein 3 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:38219078:38409854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0
NM_001034950 // RefSeq // Rattus norvegicus urinary protein 2 (Rup2), mRNA. // chr8 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000042860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41643250:41646813:1 gene:ENSRNOG00000045799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF198441 // GenBank // Rattus norvegicus urinary protein 2 precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT053042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT053043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41643287:41756595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
AF368860 // GenBank // Rattus norvegicus 3 non-translated beta-F1-ATPase mRNA-binding protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XR_147089 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus urinary protein 3-like (LOC680406), misc_RNA. // chr8 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// FQ209981 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YM04 mRNA sequence. // chr8 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_138537 // RefSeq // Rattus norvegicus spleen protein 1 precursor (LOC171573), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41430647:41433490:-1 gene:ENSRNOG00000008563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF198442 // GenBank // Rattus norvegicus spleen protein 1 precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222501 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA22YI21 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41432570:41433444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT054761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021747 // RefSeq // Rattus norvegicus acrosomal vesicle protein 1 (Acrv1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39167849:39173426:1 gene:ENSRNOG00000008508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39167871:39178434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT053005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031066 // RefSeq // Rattus norvegicus fasciculation and elongation protein zeta 1 (zygin I) (Fez1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39307654:39353312:1 gene:ENSRNOG00000006075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC087740 // GenBank // Rattus norvegicus fasciculation and elongation protein zeta 1 (zygin I), mRNA (cDNA clone MGC:105385 IMAGE:7314065), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ212529 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YN05 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// U48249 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C-binding protein Zeta1 (Fez1) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// U63740 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin binding zyginI mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39316753:39351023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_001008325 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 218 (Tmem218), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39687930:39703272:1 gene:ENSRNOG00000008757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085342 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 218, mRNA (cDNA clone MGC:105984 IMAGE:7303171), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214300 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YI10 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39698383:39702698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT053012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_002729891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hepatocyte cell adhesion molecule-like (RGD1306811), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012248 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:39849601:39866016:1 gene:ENSRNOG00000009219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT053015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39861931:39866016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_181375 // RefSeq // Rattus norvegicus roundabout, axon guidance receptor, homolog 4 (Drosophila) (Robo4), mRNA. // chr8 // 94 // 85 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000043344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39089746:39099696:-1 gene:ENSRNOG00000049289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000060300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39879854:39889804:1 gene:ENSRNOG00000050964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AY277635 // GenBank // Rattus norvegicus ROBO4 (Robo4) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 85 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000022622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39037044:39100944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39869332:39890182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
ENSRNOT00000013370 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:39961366:39994454:1 gene:ENSRNOG00000009950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39987907:40034278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39961102:39962283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
FQ226820 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YE16 mRNA sequence. // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT053019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004245 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelial cell adhesion molecule (Esam), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39998699:40009620:1 gene:ENSRNOG00000033217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079093 // GenBank // Rattus norvegicus endothelial cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:94065 IMAGE:7123905), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39987907:40034278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT053022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001106812 // RefSeq // Rattus norvegicus V-set and immunoglobulin domain containing 2 (Vsig2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40010515:40015558:1 gene:ENSRNOG00000033490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39987907:40034278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108759 // RefSeq // Rattus norvegicus sialic acid acetylesterase (Siae), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000044293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40079093:40114338:1 gene:ENSRNOG00000031266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC162050 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7111713. // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40079134:40112548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001000435 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1196 (Olr1196), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40254992:40255924:1 gene:ENSRNOG00000048325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001120 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1197 (Olr1197), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000049660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40258838:40259770:1 gene:ENSRNOG00000048941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT053028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT053029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000436 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1198 (Olr1198), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001001120 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1197 (Olr1197), mRNA. // chr8 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000049660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40258838:40259770:1 gene:ENSRNOG00000048941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// NM_001000435 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1196 (Olr1196), mRNA. // chr8 // 64 // 100 // 21 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000044652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40254992:40255924:1 gene:ENSRNOG00000048325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 100 // 21 // 33 // 0 /// NM_001000819 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1199 (Olr1199), mRNA. // chr8 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000015369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40281644:40282579:1 gene:ENSRNOG00000011563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT053028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// NONRATT053029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// NONRATT053027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 100 // 21 // 33 // 0
NM_001000819 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1199 (Olr1199), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000015369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40281644:40282579:1 gene:ENSRNOG00000011563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000966 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1200 (Olr1200), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000818 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1201 (Olr1201), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40382352:40446228:1 gene:ENSRNOG00000031929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000074825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40341164:40596853:1 gene:ENSRNOG00000031929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONRATT053032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000817 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1202 (Olr1202), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40341167:40522117:1 gene:ENSRNOG00000031929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40382352:40446228:1 gene:ENSRNOG00000031929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT053033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001082 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1203 (Olr1203), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40444887:40446237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000437 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1204 (Olr1204), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000816 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1206 (Olr1206), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40518563:40519489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000031056 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:40564665:40566651:1 gene:ENSRNOG00000011626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40557624:40655791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000074528 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:40557515:40558552:-1 gene:ENSRNOG00000043384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000075779 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:40557514:40558537:-1 gene:ENSRNOG00000043384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40557624:40655791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001000815 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1213 (Olr1213), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40685793:40686722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000438 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1214 (Olr1214), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40701325:40702396:1 gene:ENSRNOG00000031929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40445290:40702400:1 gene:ENSRNOG00000031929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40701704:40702396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT053038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000439 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1217 (Olr1217), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40758428:40760286:1 gene:ENSRNOG00000047328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40759354:40809673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000488 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1218 (Olr1218), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41224985:41225917:1 gene:ENSRNOG00000049877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41884310:41885242:1 gene:ENSRNOG00000049356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060027 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:42234634:42236017:1 gene:ENSRNOG00000047382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072247 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:42234634:42236015:1 gene:ENSRNOG00000047382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42234640:42236021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41224985:41225917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41884310:41885242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000965 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1219 (Olr1219), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41896690:41897643:1 gene:ENSRNOG00000047398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41237365:41238318:1 gene:ENSRNOG00000047723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42247846:42248799:1 gene:ENSRNOG00000046384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42248197:42284703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41237716:41243226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41897041:41902551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001000814 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1220 (Olr1220), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000071412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41901610:41902551:1 gene:ENSRNOG00000048510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42252766:42253707:1 gene:ENSRNOG00000045793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41237716:41243226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41897041:41902551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42248197:42284703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001000440 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1222 (Olr1222), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41922645:41923583:1 gene:ENSRNOG00000030341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41275636:41276217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000049115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41923002:41923583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001000441 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1223 (Olr1223), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000049709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41939826:41940767:1 gene:ENSRNOG00000046892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000048397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41292460:41293401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41939826:41940767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001001083 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1225 (Olr1225), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41326166:41327104:1 gene:ENSRNOG00000050319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41973532:41974470:1 gene:ENSRNOG00000048010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41326169:41327152:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41973535:41974518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000442 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1226 (Olr1226), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41987598:41988539:1 gene:ENSRNOG00000048285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1347072:1348013:1 gene:ENSRNOG00000049320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41340232:41341173:1 gene:ENSRNOG00000046760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1285629:1355914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 100 // 9 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41988088:41996440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 100 // 9 // 23 // 0
NM_001000443 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1227 (Olr1227), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41348136:41349074:1 gene:ENSRNOG00000049658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41995502:41996440:1 gene:ENSRNOG00000046963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1354976:1355914:1 gene:ENSRNOG00000046807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1285629:1355914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41988088:41996440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41331149:41349074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000964 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1228 (Olr1228), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1362653:1363594:1 gene:ENSRNOG00000046328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42003179:42004120:1 gene:ENSRNOG00000048344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41355813:41356754:1 gene:ENSRNOG00000049796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001000444 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1229 (Olr1229), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:41384713:41385654:1 gene:ENSRNOG00000047425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42032079:42033020:1 gene:ENSRNOG00000047286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1391553:1392494:1 gene:ENSRNOG00000049467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1391532:1392494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42032058:42033020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41384692:41385654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000595 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1230 (Olr1230), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1409149:1409730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT038886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT038887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001000813 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1231 (Olr1231), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1422272:1423213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001000445 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1232 (Olr1232), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1427920:1450489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001001084 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1233 (Olr1233), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1452946:1454275:1 gene:ENSRNOG00000050045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT038890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000446 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1234 (Olr1234), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000072547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1408789:1450489:1 gene:ENSRNOG00000049352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// NONRATT038887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1427920:1450489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001000447 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1235 (Olr1235), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1475356:1476297:1 gene:ENSRNOG00000029086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1475356:1476297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000812 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1236 (Olr1236), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000035054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1487111:1488058:1 gene:ENSRNOG00000050733 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1487126:1488061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT038892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000963 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1237 (Olr1237), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000043810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42272125:42273054:1 gene:ENSRNOG00000048942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1501581:1502510:1 gene:ENSRNOG00000047869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001001013 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1238 (Olr1238), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000044272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42283774:42284703:1 gene:ENSRNOG00000049454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000075478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1513028:1513957:1 gene:ENSRNOG00000045672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1502136:1513957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42248197:42284703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0
NM_001000811 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1239 (Olr1239), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42288943:42289875:1 gene:ENSRNOG00000049421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1518197:1519129:1 gene:ENSRNOG00000046099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1518548:1519129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42289294:42289875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001000448 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1240 (Olr1240), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42296425:42297357:1 gene:ENSRNOG00000048549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1525679:1526611:1 gene:ENSRNOG00000049725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1526147:1526611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000038577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42296893:42297357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001000449 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1241 (Olr1241), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42310284:42311216:1 gene:ENSRNOG00000048854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1535978:1536910:1 gene:ENSRNOG00000050355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1593218:1594150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1535978:1536910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42310284:42311216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000450 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1242 (Olr1242), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1558477:1559412:1 gene:ENSRNOG00000050448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1558828:1588103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1616212:1670333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001000451 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1243 (Olr1243), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000810 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1244 (Olr1244), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000809 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1245 (Olr1245), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000807 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1247 (Olr1247), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1669413:1670333:1 gene:ENSRNOG00000050613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42335282:42336202:1 gene:ENSRNOG00000050017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1616212:1670333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42326121:42336202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000044242 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:1588094:1660845:1 gene:ENSRNOG00000047777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_001000806 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1250 (Olr1250), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1717333:1718265:1 gene:ENSRNOG00000046504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1717801:1731253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001000453 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1251 (Olr1251), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1730324:1731253:1 gene:ENSRNOG00000046136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1717801:1731253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT038900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001001086 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1256 (Olr1256), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1789274:1790206:1 gene:ENSRNOG00000049321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1768968:1790206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42376353:42397690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000057254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165155757:165177094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_198755 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5A (Vwa5a), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5A (Vwa5a), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5A (Vwa5a), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006242839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5A (Vwa5a), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006242840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5A (Vwa5a), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000000211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165209768:165232682:1 gene:ENSRNOG00000046414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42434018:42452423:1 gene:ENSRNOG00000000195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AB121446 // GenBank // Rattus norvegicus masa-1 mRNA for mast cell surface antigen-1, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42434018:42452812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000057258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165213422:165232216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000047328 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:42471904:42472835:1 gene:ENSRNOG00000033882 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073505 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:164997183:165065533:1 gene:ENSRNOG00000048029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073941 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:164997183:165063921:1 gene:ENSRNOG00000048029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_001000455 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1259 (Olr1259), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000042974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42499303:42500250:1 gene:ENSRNOG00000032383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073226 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:65098325:65099272:1 gene:ENSRNOG00000048474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000962 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1260 (Olr1260), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000050959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42537713:42538645:1 gene:ENSRNOG00000047324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000075251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165067225:165068157:1 gene:ENSRNOG00000046762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071502 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:164997183:165063921:1 gene:ENSRNOG00000048029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073941 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:164997183:165063921:1 gene:ENSRNOG00000048029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073505 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:164997183:165065533:1 gene:ENSRNOG00000048029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 100 // 10 // 19 // 0
NM_001000804 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1261 (Olr1261), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165103201:165104142:1 gene:ENSRNOG00000049172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000803 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1262 (Olr1262), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:65171998:65172939:1 gene:ENSRNOG00000045981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000456 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1264 (Olr1264), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42601384:42602319:1 gene:ENSRNOG00000030000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:65217646:65218581:1 gene:ENSRNOG00000047334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:54409392:54410327:1 gene:ENSRNOG00000047687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42538064:42639174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54409392:54410327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000802 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1266 (Olr1266), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000048537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42651416:42652351:1 gene:ENSRNOG00000031054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:54433670:54434605:1 gene:ENSRNOG00000048588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42651656:42652351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54433910:54434605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000042523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54447727:54448656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_173300 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1271 (Olr1271), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000016117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42767328:42768257:1 gene:ENSRNOG00000012079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000072517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:54301989:54302918:1 gene:ENSRNOG00000049554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000072964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:134935147:135004514:-1 gene:ENSRNOG00000049136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000072622 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:42805947:42834796:-1 gene:ENSRNOG00000046661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000031017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135000342:135001268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000031021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:134935455:134936381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000041511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42767331:42768257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000041517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42833879:42834805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000048039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54301992:54302918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
ENSRNOT00000075039 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:134855206:134858686:-1 gene:ENSRNOG00000050470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:134993031:134993825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:134928144:134928938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:134855524:134856318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42826570:42827364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42774774:42775568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000042532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54515800:54516594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000048037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54309435:54310229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000072217 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:54508177:54516570:1 gene:ENSRNOG00000047601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 100 // 9 // 16 // 0
NM_001000795 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1308 (Olr1308), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43335485:43336417:1 gene:ENSRNOG00000005997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000466 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1309 (Olr1309), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000043206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43341572:43342516:1 gene:ENSRNOG00000050335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000467 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1311 (Olr1311), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43368688:43369632:1 gene:ENSRNOG00000048548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43369033:43369632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT053048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000794 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1313 (Olr1313), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43395147:43396082:1 gene:ENSRNOG00000031942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43395492:43396082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000793 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1316 (Olr1316), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61953022:61953960:-1 gene:ENSRNOG00000046842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61953022:61953960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000470 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1319 (Olr1319), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61912818:61913756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000471 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1320 (Olr1320), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000048785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61891331:61930275:-1 gene:ENSRNOG00000051018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 88 // 6 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000074038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61891359:61930275:-1 gene:ENSRNOG00000051018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61891328:61901075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT055134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000792 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1321 (Olr1321), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000045171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61874969:61892266:-1 gene:ENSRNOG00000049899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 62 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61859069:61875798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT055133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001000472 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1323 (Olr1323), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61844522:61845457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT055132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000473 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1325 (Olr1325), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61755755:61875918:-1 gene:ENSRNOG00000049226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 86 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61797831:61798754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT055131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NM_001000474 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1326 (Olr1326), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000042351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61786058:61787437:-1 gene:ENSRNOG00000049226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61786058:61787437:-1 gene:ENSRNOG00000049226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61786058:61787437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT055130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000475 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1327 (Olr1327), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61772057:61772752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT055129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000599 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1328 (Olr1328), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61645136:61875918:-1 gene:ENSRNOG00000049226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 96 // 11 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61755755:61875918:-1 gene:ENSRNOG00000049226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 96 // 8 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61755758:61756747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001000791 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1329 (Olr1329), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61737687:61742036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000480 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1337 (Olr1337), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61618353:61666152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_001024359 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 225 (Tmem225), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61532196:61534754:-1 gene:ENSRNOG00000024537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AY634367 // GenBank // Rattus norvegicus PMP22 claudin domain-containing protein (Pmp22cd) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001000482 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1341 (Olr1341), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61493310:61494248:-1 gene:ENSRNOG00000006303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61493310:61494248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109290 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 202 (Zfp202), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61469449:61489701:-1 gene:ENSRNOG00000006312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61437699:61475307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_139097 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type III, beta subunit (Scn3b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61379752:61402266:-1 gene:ENSRNOG00000006937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF378093 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel beta 3 subunit (SCN3B) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// BC070899 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type III, beta, mRNA (cDNA clone MGC:91409 IMAGE:7100476), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61382946:61401526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT055118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT055119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_173154 // RefSeq // Rattus norvegicus CXADR-like membrane protein (Clmp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:46020808:46148061:-1 gene:ENSRNOG00000007476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF302047 // GenBank // Rattus norvegicus adipocyte adhesion molecule (Acam) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:46003723:46140347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NONRATT053050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0
NONRATT053051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT053050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1
NONRATT053050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001191995 // RefSeq // Rattus norvegicus brain specific homeobox (Bsx), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43548484:43552239:1 gene:ENSRNOG00000024438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43545513:43552114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NR_031858 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 100 (Mir100), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053625 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:44222150:44222229:1 gene:ENSRNOG00000035502 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-100 // miRBase Micro RNA Database // MI0000885 Rattus norvegicus miR-100 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_031801 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7a-2 (Mirlet7a-2), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-let-7a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000828 Rattus norvegicus let-7a-2 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT053054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555262 (LOC102555262), mRNA. // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006242852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555262 (LOC102555262), mRNA. // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000059997 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:44271901:44281224:1 gene:ENSRNOG00000039200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT053055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT053058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT053064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NR_031869 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 125b-1 (Mir125b1), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053673 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:44272846:44272932:1 gene:ENSRNOG00000035550 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-125b-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000896 Rattus norvegicus miR-125b-1 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_037614 // RefSeq // Rattus norvegicus ischemia related factor vof-16 (Vof16), long non-coding RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB089206 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ischemia related factor vof-16, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT053054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106815 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 29 (Trim29), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:46295150:46319894:1 gene:ENSRNOG00000021771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:46295268:46318944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_236210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 1 (Pvrl1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:46715098:46774064:1 gene:ENSRNOG00000006403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000025371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:46715098:46826705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT053078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000025371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:46715098:46826705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_012673 // RefSeq // Rattus norvegicus Thy-1 cell surface antigen (Thy1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:46998623:47003437:1 gene:ENSRNOG00000006604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212850 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YA10 mRNA sequence. // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT053080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:46998930:47007929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT053084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_053774 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 2 (Usp2), mRNA. // chr8 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47022640:47046713:1 gene:ENSRNOG00000006663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47037865:47046713:1 gene:ENSRNOG00000006663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF106658 // GenBank // Rattus norvegicus deubiquitinating enzyme Ubp45 (ubp45) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// AF106659 // GenBank // Rattus norvegicus deubiquitinating enzyme Ubp69 (ubp69) mRNA, complete cds. // chr8 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// AF202453 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific processing protease mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF202454 // GenBank // Rattus norvegicus testis ubiquitin specific processing protease mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC085719 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93284 IMAGE:7193298), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47013113:47046626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT053089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001108137 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane frizzled-related protein (Mfrp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47054088:47059250:1 gene:ENSRNOG00000039107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47054238:47061094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012123 // RefSeq // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 5 (C1qtnf5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47059596:47061466:1 gene:ENSRNOG00000007613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089992 // GenBank // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:109436 IMAGE:7319641), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47054238:47061094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT053096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001034009 // RefSeq // Rattus norvegicus melanoma cell adhesion molecule (Mcam), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_023983 // RefSeq // Rattus norvegicus melanoma cell adhesion molecule (Mcam), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47091209:47099626:1 gene:ENSRNOG00000007726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB035506 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for l-gicerin/MUC18, complete cds. // chr8 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// AB035507 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for s-gicerin/MUC18, complete cds. // chr8 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC070916 // GenBank // Rattus norvegicus melanoma cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:91447 IMAGE:7105099), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47091227:47106506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001013953 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 153 (Ccdc153), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 153 (Ccdc153), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 153 (Ccdc153), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000059776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47189965:47196423:1 gene:ENSRNOG00000039086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089910 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 153, mRNA (cDNA clone MGC:109180 IMAGE:7304742), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47190280:47195985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT053102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_199388 // RefSeq // Rattus norvegicus dolichyl-phosphate (UDP-N-acetylglucosamine) N-acetylglucosaminephosphotransferase 1 (GlcNAc-1-P transferase) (Dpagt1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006242921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dolichyl-phosphate (UDP-N-acetylglucosamine) N-acetylglucosaminephosphotransferase 1 (GlcNAc-1-P transferase) (Dpagt1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000013134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47277020:47283503:1 gene:ENSRNOG00000009799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063184 // GenBank // Rattus norvegicus dolichyl-phosphate (UDP-N-acetylglucosamine) N-acetylglucosaminephosphotransferase 1 (GlcNAc-1-P transferase), mRNA (cDNA clone MGC:72990 IMAGE:6887995), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ213783 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YL09 mRNA sequence. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT053106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47277223:47285102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT053108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT053105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT053107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT053109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT053111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001109291 // RefSeq // Rattus norvegicus H2A histone family, member X (H2afx), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000059715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47284623:47285952:1 gene:ENSRNOG00000010386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47277223:47285102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001034028 // RefSeq // Rattus norvegicus hypoxia up-regulated 1 (Hyou1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_138867 // RefSeq // Rattus norvegicus hypoxia up-regulated 1 (Hyou1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypoxia up-regulated 1 (Hyou1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47318957:47330880:1 gene:ENSRNOG00000010944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC065310 // GenBank // Rattus norvegicus hypoxia up-regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:72301 IMAGE:5621638), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U41853 // GenBank // Rattus norvegicus 150 kDa oxygen regulated protein (ORP150) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47318758:47329611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031589 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 4 (Slc37a4), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 4 (Slc37a4), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47335910:47341992:1 gene:ENSRNOG00000011361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF080468 // GenBank // Rattus norvegicus putative glycogen storage disease type 1b protein mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// BC070889 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:91631 IMAGE:7098680), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47337496:47341486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_001106817 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 9-like (Bcl9l), mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 9-like (Bcl9l), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000064041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47424070:47452698:1 gene:ENSRNOG00000012420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47408772:47452114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001136141 // RefSeq // Rattus norvegicus trehalase (brush-border membrane glycoprotein) (Treh), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47602121:47615939:1 gene:ENSRNOG00000013049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47602144:47615708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001024760 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 46 homolog (Chlamydomonas) (Ift46), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006242929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 46 homolog (Chlamydomonas) (Ift46), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XM_006242930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 46 homolog (Chlamydomonas) (Ift46), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XM_006242931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 46 homolog (Chlamydomonas) (Ift46), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47699718:47716194:1 gene:ENSRNOG00000013919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT053139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT053140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000054848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47694782:47719796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// NONRATT053141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT053142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// NONRATT053144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_013169 // RefSeq // Rattus norvegicus CD3 molecule, delta (Cd3d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47900377:47905113:1 gene:ENSRNOG00000015994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47903377:47905032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT053145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001106818 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin protein zero-like 2 (Mpzl2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47959127:47980096:1 gene:ENSRNOG00000016085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47959524:47976454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108760 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin protein zero-like 3 (Mpzl3), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47981273:48001460:1 gene:ENSRNOG00000026753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47987963:48079143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT053149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_236198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adhesion molecule, interacts with CXADR antigen 1 (Amica1), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007588 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:48010657:48035243:1 gene:ENSRNOG00000026702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47987963:48079143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT053152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENSRNOT00000052626 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:48029625:48029725:1 gene:ENSRNOG00000034503 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_012877 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type II, beta subunit (Scn2b), mRNA. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006242895 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type II, beta (Scn2b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000021819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48045393:48053999:1 gene:ENSRNOG00000016221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U37026 // GenBank // Rattus norvegicus brain sodium channel beta 2 subunit (SCNB2) mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT053153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47987963:48079143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001008880 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type IV, beta subunit (Scn4b), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48067555:48082728:1 gene:ENSRNOG00000026679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47987963:48079143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001127528 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 13 (Tmprss13), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48247921:48277211:1 gene:ENSRNOG00000016397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC166801 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 13, mRNA (cDNA clone MGC:188601 IMAGE:7938493), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48254532:48275730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_022005 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 6 (Fxyd6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48323326:48326136:1 gene:ENSRNOG00000016412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB030908 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for vascular endothelial cell specific protein VESP6, complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AF142439 // GenBank // Rattus norvegicus phosphohippolin (PHP) mRNA, complete cds. // chr8 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// BC072528 // GenBank // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 6, mRNA (cDNA clone MGC:91694 IMAGE:7096832), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48323326:48342640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT053158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017349 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 2 (Fxyd2), transcript variant b, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NM_145717 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 2 (Fxyd2), transcript variant a, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AF129400 // GenBank // Rattus norvegicus sodium/potassium-transporting ATPase gamma chain mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AF233060 // GenBank // Rattus norvegicus Na,K-ATPase gamma subunit FXYD-2b mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48338917:48343346:1 gene:ENSRNOG00000016469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000064611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48336166:48343346:1 gene:ENSRNOG00000016469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// X70062 // GenBank // R.norvegicus mRNA for gamma subunit of sodium potassium ATPase. // chr8 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT053162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48323326:48342640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT053164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT053165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NM_001108141 // RefSeq // Rattus norvegicus Down syndrome cell adhesion molecule-like 1 (Dscaml1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000022476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48363433:48679606:1 gene:ENSRNOG00000016502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000050665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48586918:48689618:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_019204 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-site APP cleaving enzyme 1 (Bace1), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48766005:48788272:1 gene:ENSRNOG00000016847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF190727 // GenBank // Rattus norvegicus beta-site APP cleaving enzyme (Bace) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000050674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48766432:48788047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_019246 // RefSeq // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 7 (Pcsk7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000023677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48824388:48847099:1 gene:ENSRNOG00000017478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U36580 // GenBank // Rattus norvegicus serine proteinase rPC7 precursor (Pcsk7) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000050670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48826769:48846243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000032188 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:48910606:48911214:1 gene:ENSRNOG00000025841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48901727:48948979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 75 // 7 // 9 // 0
NM_012737 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein A-IV (Apoa4), mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000073593 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:49163147:49165176:1 gene:ENSRNOG00000046608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC091159 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein A-IV, mRNA (cDNA clone MGC:108730 IMAGE:7373033), complete cds. // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// M00002 // GenBank // Rat apolipoprotein A-IV mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001277264 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein A-V (Apoa5), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_080576 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein A-V (Apoa5), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:49185440:49187493:1 gene:ENSRNOG00000018436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF202887 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein A5 (ApoA5) mRNA, complete cds, alternative transcript. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF202888 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein A5 (ApoA5) mRNA, complete cds, alternative transcript. // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC089780 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein A-V, mRNA (cDNA clone MGC:108612 IMAGE:7371817), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ219463 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YB08 mRNA sequence. // chr8 // 86 // 73 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT053177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:49163147:49214576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001137646 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 259 (Zfp259), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:49189009:49198583:1 gene:ENSRNOG00000018481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:49163147:49214576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT053178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001025277 // RefSeq // Rattus norvegicus BUD13 homolog (S. cerevisiae) (Bud13), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:49198988:49214820:1 gene:ENSRNOG00000018665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC097995 // GenBank // Rattus norvegicus BUD13 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116139 IMAGE:7446660), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:49163147:49214576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT053178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001012201 // RefSeq // Rattus norvegicus cell adhesion molecule 1 (Cadm1), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000052392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:50460915:50788814:1 gene:ENSRNOG00000018778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AB114443 // GenBank // Rattus norvegicus sgigsf mRNA for spermatogenic immunoglobulin superfamily, complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AB257091 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for secretory isoform of TSLC1, complete cds. // chr8 // 86 // 48 // 12 // 14 // 0 /// BC078966 // GenBank // Rattus norvegicus cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:93845 IMAGE:7111523), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:50715674:50788814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT053188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001134635 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to protein of unknown function (RGD1566243), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to protein of unknown function (RGD1566243), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51347097:51357486:1 gene:ENSRNOG00000027730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51167314:51357486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109293 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20010 (RGD1563941), mRNA. // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000007754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51422579:51422993:1 gene:ENSRNOG00000005918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT053200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001108144 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 28 (Usp28), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 28 (Usp28), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51909370:51969623:1 gene:ENSRNOG00000007325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51909370:51969623:1 gene:ENSRNOG00000007325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// GENSCAN00000051668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51924551:51968695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001024801 // RefSeq // Rattus norvegicus zw10 kinetochore protein (Zw10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51980064:52005883:1 gene:ENSRNOG00000007661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097452 // GenBank // Rattus norvegicus ZW10, kinetochore associated, homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:114513 IMAGE:7456845), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51984709:52135049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_153311 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 5 (Tmprss5), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:52026465:52048471:1 gene:ENSRNOG00000008058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF537098 // GenBank // Rattus norvegicus adrenal mitochondrial protease long variant (Amp) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product; alternatively spliced. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AF537099 // GenBank // Rattus norvegicus adrenal mitochondrial protease short variant (Amp) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product; alternatively spliced. // chr8 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT053207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51984709:52135049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_012547 // RefSeq // Rattus norvegicus dopamine receptor D2 (Drd2), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// M36831 // GenBank // Rat dopamine receptor subtype D2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:52298097:52363812:1 gene:ENSRNOG00000008428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:52331840:52362744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000046064 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:52890852:52892296:1 gene:ENSRNOG00000032069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 73 // 94 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:52867939:52944360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001014209 // RefSeq // Rattus norvegicus placenta expressed transcript 1 (Plet1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53522655:53534384:1 gene:ENSRNOG00000024346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088858 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1600029D21, mRNA (cDNA clone MGC:105694 IMAGE:7308076), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ228964 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YB20 mRNA sequence. // chr8 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53522694:53533830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_019165 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 18 (Il18), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53606988:53613610:1 gene:ENSRNOG00000009848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AJ222813 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for precursor interleukin 18 (IL-18), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AY077842 // GenBank // Rattus norvegicus IFN-gamma-inducing factor IL-18 (Il18) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AY258448 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-18 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// U77776 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-gamma inducing factor precursor (IGIF) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// U77777 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-gamma inducing factor isoform alpha precursor (IGIF) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53601594:53636230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_022541 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 8 homolog b (yeast) (Timm8b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53635064:53636450:1 gene:ENSRNOG00000009888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF196315 // GenBank // Rattus norvegicus small zinc finger-like protein DDP2 (Ddp2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ217024 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA37YF02 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53601594:53636230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_001191793 // RefSeq // Rattus norvegicus PIH1 domain containing 2 (Pih1d2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PIH1 domain containing 2 (Pih1d2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53647606:53655845:1 gene:ENSRNOG00000009965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53648837:53658762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT053221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT053223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_012935 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, alpha B (Cryab), mRNA. // chr8 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000059127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53775525:53779781:1 gene:ENSRNOG00000010524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220032 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YH07 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// M55534 // GenBank // Rat alpha-crystallin B chain mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53776108:53782466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT053225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT053226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT053227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001108145 // RefSeq // Rattus norvegicus ferredoxin-fold anticodon binding domain containing 1 (Fdxacb1), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000065879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53793837:53798266:1 gene:ENSRNOG00000010743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT053228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53793928:53798217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001109000 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-1,2-mannosyltransferase (Alg9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-1,2-mannosyltransferase (Alg9), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53799792:53862451:1 gene:ENSRNOG00000010877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53799884:53866196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001025418 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit A, beta (Ppp2r1b), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit A, beta (Ppp2r1b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53876377:53897403:1 gene:ENSRNOG00000010922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC098007 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit A (PR 65), beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:116153 IMAGE:7453957), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit A, beta (Ppp2r1b), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// GENSCAN00000014789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53876379:53897811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_001013176 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell translocation gene 4 (Btg4), mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// XM_006243036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell translocation gene 4 (Btg4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AY960132 // GenBank // Rattus norvegicus SCIR-27 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// BC088755 // GenBank // Rattus norvegicus B-cell translocation gene 4, mRNA (cDNA clone MGC:105553 IMAGE:7307514), complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000059086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:54100716:54104451:1 gene:ENSRNOG00000011277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// GENSCAN00000055408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:54101274:54104139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001109599 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 2 associating factor 1 (Pou2af1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:54198726:54226204:1 gene:ENSRNOG00000011500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:54216684:54224544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_213629 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 20 (Arhgap20), mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// XM_006243047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 20 (Arhgap20), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:54764682:54845836:1 gene:ENSRNOG00000025624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000059078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:54764816:54845836:1 gene:ENSRNOG00000025624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY501475 // GenBank // Rattus norvegicus RA and RhoGAP domain containing protein mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:54762592:54884634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001005889 // RefSeq // Rattus norvegicus radixin (Rdx), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:55167300:55194096:1 gene:ENSRNOG00000012237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY428868 // GenBank // Rattus norvegicus radixin mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC087147 // GenBank // Rattus norvegicus radixin, mRNA (cDNA clone MGC:95168 IMAGE:7130553), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// KF307742 // GenBank // Rattus norvegicus radixin isoform (Rdx) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:55158697:55214797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
XM_001072028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exophilin 5 (Exph5), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exophilin 5 (Exph5), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006243095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exophilin 5 (Exph5), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_236272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exophilin 5 (Exph5), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56463112:56541322:1 gene:ENSRNOG00000025115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56531352:56541322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001025123 // RefSeq // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2 (Kdelc2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56547250:56564862:1 gene:ENSRNOG00000007177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC093594 // GenBank // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:105740 IMAGE:7314531), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC100617 // GenBank // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:124830 IMAGE:7934552), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56547258:56562650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006243078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930550C14 (RGD1311251), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56565829:56594510:1 gene:ENSRNOG00000007266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC092578 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930550C14, mRNA (cDNA clone MGC:108787 IMAGE:7321330), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56576819:56599631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT053265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001108147 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear protein, ataxia-telangiectasia locus (Npat), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000049076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56703321:56740923:1 gene:ENSRNOG00000024934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000051347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56702895:56738166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0
NM_001106822 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member F2 (Slc35f2), mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56929088:56972651:1 gene:ENSRNOG00000009014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56949011:56971412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001013247 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcolipin (Sln), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57012681:57016928:1 gene:ENSRNOG00000009047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY456000 // GenBank // Rattus norvegicus sarcolipin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56989896:57016823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_181382 // RefSeq // Rattus norvegicus gliomedin (Gldn), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57446589:57490037:1 gene:ENSRNOG00000024082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY266116 // GenBank // Rattus norvegicus gliomedin (Gldn) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57482628:57489476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000057771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57446761:57481436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT053275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000013168 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:57621212:57622318:1 gene:ENSRNOG00000009844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 82 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57621212:57622423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000029413 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:57692267:57701978:1 gene:ENSRNOG00000023870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_001072462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 7 (Sh2d7), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// XM_236252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 7 (Sh2d7), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57692267:57701978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_053638 // RefSeq // Rattus norvegicus isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) alpha (Idh3a), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000015102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57745463:57764540:1 gene:ENSRNOG00000010277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB047541 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NAD+-specific isocitrate dehydrogenase a-subunit, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000024376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57745445:57763470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT053276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT053277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONRATT053278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT053279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_001025411 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4 (Dnaja4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000017053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57859314:57875055:1 gene:ENSRNOG00000012106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC082010 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:94264 IMAGE:7131770), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC097438 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:114488 IMAGE:7455678), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000024386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57834027:57874972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT053281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001105716 // RefSeq // Rattus norvegicus cellular retinoic acid binding protein 1 (Crabp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57926233:57934271:1 gene:ENSRNOG00000023633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57926340:57934037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT053285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022863 // RefSeq // Rattus norvegicus iron responsive element binding protein 2 (Ireb2), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000017900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58039175:58083277:1 gene:ENSRNOG00000013271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC081798 // GenBank // Rattus norvegicus iron responsive element binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93423 IMAGE:7130997), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// U20181 // GenBank // Rattus norvegicus iron-regulatory protein 2 (IRP2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000048229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58037964:58082978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
NM_001106823 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxylysine kinase (Hykk), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006243072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxylysine kinase (Hykk), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000018003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58090149:58111525:1 gene:ENSRNOG00000013419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58093029:58110750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT053289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_017281 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 4 (Psma4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 4 (Psma4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58114599:58122076:1 gene:ENSRNOG00000013493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063170 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 4, mRNA (cDNA clone MGC:72878 IMAGE:6921964), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211164 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA16YF14 mRNA sequence. // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58116270:58121836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT053293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_017078 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 5 (neuronal) (Chrna5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58143974:58172330:1 gene:ENSRNOG00000013610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY574255 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha5 subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// J05231 // GenBank // Rat neuronal nicotinic acetylcholine receptor-related protein mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// NONRATT053294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000019539 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:58292998:58348188:1 gene:ENSRNOG00000014529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_001072896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family member 2 (Ube2q2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// XM_006243101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family member 2 (Ube2q2), mRNA. // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT053295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58282496:58366804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT053297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT053296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001037770 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 22 (Fbxo22), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58351331:58367359:1 gene:ENSRNOG00000022702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC107670 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 22, mRNA (cDNA clone MGC:124731 IMAGE:7937607), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58282496:58366804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT053299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT053300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// NONRATT053302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT053303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT053304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001109294 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AI118078 (RGD1562084), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58480570:58593993:1 gene:ENSRNOG00000015201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58532767:58593350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_020471 // RefSeq // Rattus norvegicus ISL LIM homeobox 2 (Isl2), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006243089 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ISL LIM homeobox 2 (Isl2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58696062:58700544:1 gene:ENSRNOG00000015336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L35571 // GenBank // Rattus norvegicus (clone 1.6kB) islet-2 mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58693724:58700408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT053309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT053308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
ENSRNOT00000050067 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59009015:59009470:1 gene:ENSRNOG00000029840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 100 // 18 // 23 // 0
NM_012913 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide (Atp1b3), mRNA. // chr8 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:103638324:103669634:-1 gene:ENSRNOG00000011501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// BC061719 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:72545 IMAGE:5598284), complete cds. // chr8 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// D84450 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Na+,K+-ATPase beta-3 subunit, complete cds. // chr8 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036260 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59189374:59190239:1 gene:ENSRNOG00000022382 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59163222:59190145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:103639157:103678386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 71 // 16 // 20 // 0 /// NONRATT055601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NONRATT055602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0
ENSRNOT00000072407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:138003285:138004567:-1 gene:ENSRNOG00000051005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072776 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14596908:14598190:1 gene:ENSRNOG00000048504 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072845 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:9184976:9186258:1 gene:ENSRNOG00000046314 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54940686:54941968:-1 gene:ENSRNOG00000047509 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59271854:59273136:1 gene:ENSRNOG00000048192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:172047210:172048492:1 gene:ENSRNOG00000050867 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165832069:165833351:-1 gene:ENSRNOG00000050976 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// U15425 // GenBank // Rattus norvegicus membrane- and microfilament-associated protein p58 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_017132 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulocalbin 2, EF-hand calcium binding domain (Rcn2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000021817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:59280470:59297530:1 gene:ENSRNOG00000015780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC061962 // GenBank // Rattus norvegicus reticulocalbin 2, EF-hand calcium binding domain, mRNA (cDNA clone MGC:72495 IMAGE:5598390), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// U15734 // GenBank // Rattus norvegicus taipoxin-associated calcium binding protein-49 precursor mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59283760:59296696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001106824 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1 (Pstpip1), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1 (Pstpip1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1 (Pstpip1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000063930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:59330962:59369982:1 gene:ENSRNOG00000016413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC158859 // GenBank // Rattus norvegicus proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:188412 IMAGE:7930643), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59327143:59377949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT053314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001108150 // RefSeq // Rattus norvegicus high mobility group 20A (Hmg20a), mRNA. // chr8 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000022976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:59650251:59727759:1 gene:ENSRNOG00000016905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59649333:59720965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT053317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006243143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lethal (2) 06225-like (LOC100360369), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
NM_031022 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin sulfate proteoglycan 4 (Cspg4), mRNA. // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60101160:60136205:1 gene:ENSRNOG00000017208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60101230:60150727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001108152 // RefSeq // Rattus norvegicus IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein (Imp3), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000023456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60176548:60177436:1 gene:ENSRNOG00000017460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// BC166985 // GenBank // Rattus norvegicus IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:189107 IMAGE:7322293), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT053323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000045421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60173518:60177111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
NM_001004270 // RefSeq // Rattus norvegicus snurportin 1 (Snupn), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006243127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus snurportin 1 (Snupn), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000007261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60185056:60217869:1 gene:ENSRNOG00000005426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC079451 // GenBank // Rattus norvegicus snurportin 1, mRNA (cDNA clone MGC:95000 IMAGE:7121061), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT053324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT053326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_001013040 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9 (Ptpn9), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006243106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9 (Ptpn9), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60228924:60308849:1 gene:ENSRNOG00000017600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082041 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 9, mRNA (cDNA clone MGC:95185 IMAGE:7131532), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60228946:60308597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT053328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001108761 // RefSeq // Rattus norvegicus SIN3 transcription regulator family member A (Sin3a), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000058685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60332843:60373239:1 gene:ENSRNOG00000032254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60332879:60372432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT053331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT053332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_139256 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 2C, member 1 (Man2c1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60375817:60386940:1 gene:ENSRNOG00000030654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC086989 // GenBank // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 2C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93158 IMAGE:7193864), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M57547 // GenBank // Rat endoplasmic reticulum alpha-mannosidase mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60375850:60386653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000033209 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:60469984:60478980:1 gene:ENSRNOG00000038477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60434774:60477364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001012124 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 25 subunit (Rpp25), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62060880:62062260:1 gene:ENSRNOG00000018812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087592 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease P 25 subunit (human), mRNA (cDNA clone MGC:105790 IMAGE:7309941), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62022971:62061664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT053360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145783 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit Va (Cox5a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62075284:62087001:1 gene:ENSRNOG00000018816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ211124 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA17YB04 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ220977 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YA08 mRNA sequence. // chr8 // 52 // 100 // 15 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000033253 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:14460819:14461259:-1 gene:ENSRNOG00000022490 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62075356:62086235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14460819:14461259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT036880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT053361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001108764 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 219, member B (Fam219b), mRNA. // chr8 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000032543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62094551:62097943:1 gene:ENSRNOG00000026622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 82 // 81 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62094639:62097934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// FQ212448 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA54YI01 mRNA sequence. // chr8 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT053364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT053365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_023955 // RefSeq // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 2 (Scamp2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62119185:62145786:1 gene:ENSRNOG00000019136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085862 // GenBank // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94592 IMAGE:7190371), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62119281:62144542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001271135 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-51 like kinase 3 (Ulk3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62146623:62151819:1 gene:ENSRNOG00000038459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62146623:62151286:1 gene:ENSRNOG00000038459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62146623:62151725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0
NM_012540 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp1a1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62249046:62255076:1 gene:ENSRNOG00000019500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X17160 // GenBank // R.norvegicus mRNA for cytochrome P-450c. // chr8 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT053374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62251598:62304387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
XM_001072079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of mRNA decapping 3 (Edc3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_002729908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of mRNA decapping 3 (Edc3), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026492 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:62263516:62302963:1 gene:ENSRNOG00000019579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62251598:62304387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT053375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001004247 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like 7 (Ubl7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000010083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62472012:62489306:1 gene:ENSRNOG00000007442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079221 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like 7 (bone marrow stromal cell-derived), mRNA (cDNA clone MGC:94284 IMAGE:7131980), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ212102 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA69YD22 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62480295:62489191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT053380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT053379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT053382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000031702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62449286:62479881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT053381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001108153 // RefSeq // Rattus norvegicus semaphorin 7A, GPI membrane anchor (Sema7a), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62499077:62521157:1 gene:ENSRNOG00000007687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62499082:62546497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001029924 // RefSeq // Rattus norvegicus stimulated by retinoic acid 6 (Stra6), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62701447:62720527:1 gene:ENSRNOG00000008312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC097373 // GenBank // Rattus norvegicus stimulated by retinoic acid gene 6, mRNA (cDNA clone MGC:114408 IMAGE:7444462), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62695343:62719878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_001074725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stomatin (EPB72)-like 1 (Stoml1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_236297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stomatin (EPB72)-like 1 (Stoml1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011383 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:62813283:62820361:1 gene:ENSRNOG00000008530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62813283:62820361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000033397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63057200:63067429:1 gene:ENSRNOG00000026238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158644 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6030419C18 gene, mRNA (cDNA clone MGC:187587 IMAGE:8363324), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62987159:63067371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT053398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_019380 // RefSeq // Rattus norvegicus neuroplastin (Nptn), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuroplastin (Nptn), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63149055:63213749:1 gene:ENSRNOG00000009029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63149055:63213749:1 gene:ENSRNOG00000009029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC070947 // GenBank // Rattus norvegicus neuroplastin, mRNA (cDNA clone MGC:91715 IMAGE:7103647), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// X99337 // GenBank // R.norvegicus mRNA for glycoprotein 55. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63149194:63211966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_021658 // RefSeq // Rattus norvegicus hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 4 (Hcn4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63367893:63405326:1 gene:ENSRNOG00000009450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF247453 // GenBank // Rattus norvegicus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated potassium channel 4 (HCN4) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63368118:63408058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001100723 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-dependent glucokinase (Adpgk), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63850863:63878782:1 gene:ENSRNOG00000026178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63850901:63877732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004443 // RefSeq // Rattus norvegicus hexosaminidase A (Hexa), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hexosaminidase A (Hexa), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:64087247:64112585:1 gene:ENSRNOG00000010252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082097 // GenBank // Rattus norvegicus hexosaminidase A, mRNA (cDNA clone MGC:95289 IMAGE:7134440), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64087278:64112415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001106827 // RefSeq // Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 6 (Celf6), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:64126553:64191454:1 gene:ENSRNOG00000010817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64187270:64265442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001106828 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 6 (Parp6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006243191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 6 (Parp6), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006243193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 6 (Parp6), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000058339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:64203227:64235456:1 gene:ENSRNOG00000011199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC167025 // GenBank // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:189249 IMAGE:7365328), complete cds. // chr8 // 100 // 63 // 30 // 30 // 0 /// FQ223826 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA85YJ20 mRNA sequence. // chr8 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// NONRATT053419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000033364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64187270:64265442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 38 // 48 // 1 /// NONRATT053420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 63 // 63 // 30 // 48 // 1 /// NONRATT053422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 22 // 48 // 1 /// NONRATT053421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1 /// NONRATT053423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
XM_001073229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 2 (Gramd2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006226416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 2 (Gramd2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006226419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 2 (Gramd2), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006226420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 2 (Gramd2), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 2 (Gramd2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 2 (Gramd2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XR_356356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 2 (Gramd2), transcript variant X7, misc_RNA. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036798 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:64294321:64301385:1 gene:ENSRNOG00000025979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64283034:64303295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_134335 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IXA (Myo9a), mRNA. // chr8 // 100 // 99 // 142 // 142 // 0 /// ENSRNOT00000015963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:64373611:64534630:1 gene:ENSRNOG00000011619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 99 // 142 // 142 // 0 /// GENSCAN00000033363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64373611:64473057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 86 // 86 // 0 /// NONRATT053433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 143 // 143 // 0 /// GENSCAN00000011101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64487134:64534630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 19 // 19 // 27 // 143 // 1
NM_001108154 // RefSeq // Rattus norvegicus La ribonucleoprotein domain family, member 6 (Larp6), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:65362299:65382759:1 gene:ENSRNOG00000012438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:65362392:65394860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001195564 // RefSeq // Rattus norvegicus uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats (Uaca), mRNA. // chr8 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000017233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:65436328:65524224:1 gene:ENSRNOG00000012868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// FQ216984 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA38YD11 mRNA sequence. // chr8 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// GENSCAN00000045976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:65480508:65524098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 76 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT053437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT053439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_053400 // RefSeq // Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 3 (Tle3), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000018467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:66038798:66084091:1 gene:ENSRNOG00000013013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AF186092 // GenBank // Rattus norvegicus transducin-like enhancer 3 (Esp3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC097419 // GenBank // Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 3 (E(sp1) homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:114465 IMAGE:7454629), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000001066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:66039861:66082351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT053444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT053446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
NM_012903 // RefSeq // Rattus norvegicus acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member A (Anp32a), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006234422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A-like (LOC100909983), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69745835:69780603:1 gene:ENSRNOG00000045651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087686 // GenBank // Rattus norvegicus acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member A, mRNA (cDNA clone MGC:105504 IMAGE:7308609), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D32209 // GenBank // Rattus norvegicus LANP mRNA for leucine-rich acidic nuclear protein, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020443 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:67058674:67066371:1 gene:ENSRNOG00000014846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 68 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT053449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:69745928:69780384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:67029438:67072647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT035035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001108156 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha 11 (Itga11), mRNA. // chr8 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:67356796:67412933:1 gene:ENSRNOG00000006723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:67307654:67411582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001191794 // RefSeq // Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 6, late infantile, variant (Cln6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:67461962:67476917:1 gene:ENSRNOG00000007164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:67461978:67475902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001127575 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin-like 4 (Calml4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:67482026:67494105:1 gene:ENSRNOG00000038202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158759 // GenBank // Rattus norvegicus calmodulin-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:187971 IMAGE:7099908), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:67482001:67498452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
GENSCAN00000037725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68073100:68073393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_134398 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha- and gamma-adaptin binding protein (Aagab), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000011385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68247490:68284415:1 gene:ENSRNOG00000008424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF178669 // GenBank // Rattus norvegicus p34 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ224819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA53YG05 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001108158 // RefSeq // Rattus norvegicus lactase-like (Lctl), mRNA. // chr8 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000012308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68780402:68792222:1 gene:ENSRNOG00000009193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68777047:68796519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0
NONRATT036902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022510 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L4 (Rpl4), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000013461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68827907:68833042:1 gene:ENSRNOG00000009378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC063811 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:72833 IMAGE:6919340), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC081801 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L4, mRNA (cDNA clone MGC:93439 IMAGE:7192390), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// FQ228779 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YN10 mRNA sequence. // chr8 // 53 // 100 // 9 // 17 // 0 /// FQ211151 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA16YI04 mRNA sequence. // chr8 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0 /// FQ228767 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YP10 mRNA sequence. // chr8 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68827969:68836902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT053465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT053466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NONRATT053466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1
NONRATT053465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NONRATT053465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NONRATT053465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT053466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT053467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT053468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NONRATT053465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001109643 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 5 (Snapc5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68833944:68837775:1 gene:ENSRNOG00000010156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68827969:68836902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000016260 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:70023053:70104119:1 gene:ENSRNOG00000011739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70023053:70104119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_001007663 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 9 (Vwa9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006243303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 9 (Vwa9), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70146546:70170129:1 gene:ENSRNOG00000012469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC082006 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2010321M09Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:94254 IMAGE:7131624), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000004585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70148920:70170686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT053488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001108159 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 8 (Dpp8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006243256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 8 (Dpp8), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70219642:70273860:1 gene:ENSRNOG00000019105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000004568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70238896:70322185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 24 // 43 // 1 /// NONRATT053493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 23 // 43 // 1 /// NONRATT053496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 51 // 51 // 22 // 43 // 1
XM_006226446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 4 (Igdcc4), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// XM_006243295 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 4 (Igdcc4), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000044706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70300509:70322185:1 gene:ENSRNOG00000033496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000067016 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70300509:70322185:1 gene:ENSRNOG00000033496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// BC168991 // GenBank // Rattus norvegicus neighbor of Punc E11, mRNA (cDNA clone IMAGE:9026431), partial cds. // chr8 // 100 // 42 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000004568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70238896:70322185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT053501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT053502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1
XM_003750528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, DCC subclass, member 3 (Igdcc3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70327832:70377787:1 gene:ENSRNOG00000030800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70327832:70390465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
XM_006227381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein (peptidylprolyl cis/trans isomerase) NIMA-interacting, 4 (parvulin) (Pin4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006257122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein (peptidylprolyl cis/trans isomerase) NIMA-interacting, 4 (parvulin) (Pin4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:72849383:72856079:1 gene:ENSRNOG00000050051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// FQ222828 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA19YH19 mRNA sequence. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:72810664:72856064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT053503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT058945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT003651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONRATT003654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 62 // 84 // 13 // 21 // 0
ENSRNOT00000048196 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70389888:70390459:1 gene:ENSRNOG00000034090 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 80 // 42 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000004584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70327832:70390465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
NM_001014093 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16 (Parp16), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70401838:70424172:1 gene:ENSRNOG00000029127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY387095 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00109 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC085908 // GenBank // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 16, mRNA (cDNA clone MGC:94751 IMAGE:7096186), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70406098:70422950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
NM_001108161 // RefSeq // Rattus norvegicus cartilage intermediate layer protein, nucleotide pyrophosphohydrolase (Cilp), mRNA. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70452358:70467298:1 gene:ENSRNOG00000029911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70453726:70466866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT053509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001007803 // RefSeq // Rattus norvegicus caseinolytic mitochondrial matrix peptidase chaperone subunit (Clpx), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70480810:70535360:1 gene:ENSRNOG00000030225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085867 // GenBank // Rattus norvegicus ClpX caseinolytic peptidase X homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:94617 IMAGE:7190926), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70480936:70573682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT053512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001108768 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 7 (Pdcd7), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70553737:70568103:1 gene:ENSRNOG00000014340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70480936:70573682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001108162 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS-like, family 12 (Rasl12), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000046914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70607875:70622101:1 gene:ENSRNOG00000032339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006243260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS-like, family 12 (Rasl12), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000056374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70607972:70620559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001009697 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase (Mtfmt), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70644131:70674636:1 gene:ENSRNOG00000014602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088470 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial methionyl-tRNA formyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:95129 IMAGE:7128152), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70644095:70674421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT053520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001006987 // RefSeq // Rattus norvegicus spastic paraplegia 21 homolog (human) (Spg21), mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70682806:70710180:1 gene:ENSRNOG00000015019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC083760 // GenBank // Rattus norvegicus spastic paraplegia 21 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:94700 IMAGE:7192933), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70686925:70709681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001044253 // RefSeq // Rattus norvegicus PIF1 5-to-3 DNA helicase (Pif1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000021265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70811353:70818568:1 gene:ENSRNOG00000015878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// DQ489562 // GenBank // Rattus norvegicus Pif1/Rrm3 DNA-helicase-like protein (Pif1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000056359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70811354:70827837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT053524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001173426 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding protein with multiple splicing 2 (Rbpms2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006243273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding protein with multiple splicing 2 (Rbpms2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000021337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70852852:70883668:1 gene:ENSRNOG00000015896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC169038 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding protein with multiple splicing 2, mRNA (cDNA clone MGC:189424 IMAGE:9090232), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70852531:70912095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT053527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT053528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001109899 // RefSeq // Rattus norvegicus ornithine decarboxylase antizyme 2 (Oaz2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70899390:70913165:1 gene:ENSRNOG00000015953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ214772 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YC10 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT053530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70852531:70912095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_201418 // RefSeq // Rattus norvegicus NS5A (hepatitis C virus) transactivated protein 9 (Ns5atp9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000022256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71186635:71199152:1 gene:ENSRNOG00000016561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY496944 // GenBank // Rattus norvegicus NS5ATP9 (Ns5atp9) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT053532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT053533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000022812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71186712:71394288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
NONRATT053532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022288 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 1, gamma 1 (Csnk1g1), mRNA. // chr8 // 89 // 78 // 25 // 28 // 0 /// XM_006243312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase 1, gamma 1 (Csnk1g1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71219632:71347691:1 gene:ENSRNOG00000016620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC078831 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 1, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:93447 IMAGE:7134461), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// U22296 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 1 gamma 1 isoform mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 78 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT053534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71186712:71394288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// NONRATT053535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT053536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_022536 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase B (Ppib), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71388458:71394501:1 gene:ENSRNOG00000016781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF071225 // GenBank // Rattus norvegicus cyclophilin B mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC061971 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase B, mRNA (cDNA clone MGC:72443 IMAGE:5623342), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ222696 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YC23 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ230004 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YP05 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT053538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000022812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71186712:71394288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT053540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT053541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001008327 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 96, member A (Fam96a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71455205:71467170:1 gene:ENSRNOG00000017119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086524 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 96, member A, mRNA (cDNA clone MGC:105538 IMAGE:7303322), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ218618 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YP10 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ219127 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YH18 mRNA sequence. // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71455382:71466645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT053542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013109 // RefSeq // Rattus norvegicus death-associated protein kinase 2 (Dapk2), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death-associated protein kinase 2 (Dapk2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71583273:71610443:1 gene:ENSRNOG00000017332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC091410 // GenBank // Rattus norvegicus death-associated kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:109553 IMAGE:7325495), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death-associated protein kinase 2 (Dapk2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// XM_006243309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death-associated protein kinase 2 (Dapk2), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT053545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71556361:71594688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT053543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT053544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT053546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000018011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71602919:71657714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT053547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
ENSRNOT00000023646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71775427:71862567:1 gene:ENSRNOG00000043162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 65 // 51 // 53 // 0 /// GENSCAN00000018020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71719378:71865625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 99 // 88 // 71 // 72 // 0 /// NONRATT053562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 16 // 16 // 13 // 82 // 1
NM_001080756 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anyhydrase 12 (Car12), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:72072135:72125119:1 gene:ENSRNOG00000017766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// EF187255 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-bound carbonic anhydrase 12 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:72104642:72116486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
XM_001056441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 4B (C2cd4b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000012048 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77923036:77924058:1 gene:ENSRNOG00000009106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000026665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:77923036:77924058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XR_356426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 13 homolog C (S. cerevisiae) (Vps13c), misc_RNA. // chr8 // 100 // 97 // 88 // 88 // 0 /// ENSRNOT00000029132 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:78012253:78174561:1 gene:ENSRNOG00000030213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 87 // 87 // 0 /// ENSRNOT00000057522 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:78012253:78174561:1 gene:ENSRNOG00000030213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 88 // 88 // 0 /// GENSCAN00000028972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:78012253:78136160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000028993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:78148612:78174567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 20 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 13 // 13 // 12 // 91 // 1
ENSRNOT00000013142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:79750705:79934499:1 gene:ENSRNOG00000027145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:79891276:79970227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT053627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001191108 // RefSeq // Rattus norvegicus interactor of little elongator complex ELL subunit 2 (Ice2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_356428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NMDA receptor regulated 2 (Narg2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:79953562:79993266:1 gene:ENSRNOG00000010160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:79976165:79993100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000029336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:79891276:79970227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_019905 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A2 (Anxa2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:80014371:80050842:1 gene:ENSRNOG00000010362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC059136 // GenBank // Rattus norvegicus annexin A2, mRNA (cDNA clone MGC:72849 IMAGE:6920034), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// L13039 // GenBank // Rattus norvegicus annexin II mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:80023885:80082297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 87 // 87 // 20 // 23 // 1 /// NONRATT053632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1
NM_001106835 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2/adenovirus E1B interacting protein 2 (Bnip2), mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000064312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:76662499:76675895:-1 gene:ENSRNOG00000010790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76641065:76707277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT055360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT055361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// NONRATT055363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT055359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NONRATT055356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT055357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_173101 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IE (Myo1e), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:76241676:76323566:-1 gene:ENSRNOG00000011886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76242323:76357346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT055354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT055355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENSRNOT00000054641 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:76400651:76400745:-1 gene:ENSRNOG00000036534 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT055354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XR_005468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAFB-like, transcription modulator (Sltm), transcript variant X1, misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XR_009637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAFB-like, transcription modulator (Sltm), transcript variant X1, misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000019984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:76059827:76065681:-1 gene:ENSRNOG00000013708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// BC092633 // GenBank // Rattus norvegicus similar to modulator of estrogen induced transcription, mRNA (cDNA clone MGC:109335 IMAGE:7314918), complete cds. // chr8 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76060414:76104802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT055347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT055350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1 /// NONRATT055351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// NONRATT055348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
ENSRNOT00000057419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:75993416:75993631:-1 gene:ENSRNOG00000037811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000047948 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:75656526:75657532:-1 gene:ENSRNOG00000034285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000020464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:75656526:75680898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_053896 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member A2 (Aldh1a2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:75363285:75442554:-1 gene:ENSRNOG00000016042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098910 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:114283 IMAGE:7455646), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U60063 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:75340347:75428115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108165 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 280D (Zfp280d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000041453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:74134797:74211059:-1 gene:ENSRNOG00000005842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// FQ222707 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YB11 mRNA sequence. // chr8 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:74136065:74225287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// NONRATT055335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT055337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT055338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
GENSCAN00000004861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:74049140:74049418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 68 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT055332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000013976 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:74049067:74049418:-1 gene:ENSRNOG00000010525 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 56 // 95 // 10 // 18 // 0
NM_001007752 // RefSeq // Rattus norvegicus meiosis-specific nuclear structural 1 (Mns1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000007941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:74012279:74033156:-1 gene:ENSRNOG00000006009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079390 // GenBank // Rattus norvegicus meiosis-specific nuclear structural 1, mRNA (cDNA clone MGC:94906 IMAGE:7111791), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:74012444:74046621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001127490 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory factor X, 7 (Rfx7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000030629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73807892:73927996:-1 gene:ENSRNOG00000006614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC158676 // GenBank // Rattus norvegicus regulatory factor X, 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:8372216), complete cds. // chr8 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73734703:73820665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT055326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT055327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73823346:73968235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_012986 // RefSeq // Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4, E3 ubiquitin protein ligase (Nedd4), mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000064818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73679021:73716822:-1 gene:ENSRNOG00000006683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73681635:73732022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT055322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
GENSCAN00000007520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73681635:73732022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AY387067 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00081 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NONRATT047755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0
NM_001037651 // RefSeq // Rattus norvegicus protogenin (Prtg), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000034288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73495451:73599817:-1 gene:ENSRNOG00000023957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// AY630256 // GenBank // Rattus norvegicus shen-dan mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000007521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73497137:73560891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 41 // 41 // 0
NM_001007010 // RefSeq // Rattus norvegicus dyslexia susceptibility 1 candidate 1 (Dyx1c1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243329 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dyslexia susceptibility 1 candidate 1 (Dyx1c1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dyslexia susceptibility 1 candidate 1 (Dyx1c1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73438098:73451286:-1 gene:ENSRNOG00000023906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY428506 // GenBank // Rattus norvegicus EKN1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085838 // GenBank // Rattus norvegicus dyslexia susceptibility 1 candidate 1 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:94521 IMAGE:7135744), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dyslexia susceptibility 1 candidate 1 (Dyx1c1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73438739:73451196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT055316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 1
NM_001108770 // RefSeq // Rattus norvegicus cell cycle progression 1 (Ccpg1), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006243340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell cycle progression 1 (Ccpg1), transcript variant X9, mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73397117:73429325:-1 gene:ENSRNOG00000023573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73397176:73429546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT055311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NR_032749 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-628 (Mir628), microRNA. // chr8 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000054640 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:73409615:73409698:-1 gene:ENSRNOG00000036533 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT055310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-628 // miRBase Micro RNA Database // MI0012598 Rattus norvegicus miR-628 stem-loop // chr8 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NM_017317 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB27A, member RAS oncogene family (Rab27a), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73311542:73366647:-1 gene:ENSRNOG00000007533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098667 // GenBank // Rattus norvegicus RAB27A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:112618 IMAGE:7384913), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT055307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73304202:73335066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001191117 // RefSeq // Rattus norvegicus pygopus 1 (Pygo1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73464585:73482239:-1 gene:ENSRNOG00000023540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73464585:73465703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001106837 // RefSeq // Rattus norvegicus KH domain containing 3, subcortical maternal complex member (Khdc3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH domain containing 3, subcortical maternal complex member (Khdc3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73303949:73305847:-1 gene:ENSRNOG00000023460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73304202:73335066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014212 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal L24 domain containing 1 (Rsl24d1), mRNA. // chr8 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73286446:73295207:-1 gene:ENSRNOG00000007630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// BC062237 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ribosomal protein L24-like; 60S ribosomal protein L30 isolog; my024 protein; homolog of yeast ribosomal like protein 24, mRNA (cDNA clone MGC:72943 IMAGE:6919069), complete cds. // chr8 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// FQ213779 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YL17 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73287164:73295417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// NONRATT055305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
XM_003750533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L27-like (LOC100912027), mRNA. // chr8 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// XM_003754434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L27-like (LOC100912027), mRNA. // chr8 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// XM_213135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L27-like (RGD1565900), mRNA. // chr8 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000071909 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:72432072:72432518:-1 gene:ENSRNOG00000048538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000073647 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:72311404:72311850:-1 gene:ENSRNOG00000046210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:72432093:72441460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:72311425:72320792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0
NM_001135719 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 72 (Wdr72), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000064173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:80586841:80744090:1 gene:ENSRNOG00000007876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000053793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:80586841:80616853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1
XR_348619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549203 (LOC102549203), ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549203 (LOC102549203), ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022671 // RefSeq // Rattus norvegicus one cut homeobox 1 (Onecut1), mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81384924:81412253:1 gene:ENSRNOG00000008095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000032280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81384924:81412253:1 gene:ENSRNOG00000008095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81385161:81411550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT053639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001106838 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 214, member A (Fam214a), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000052158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81535953:81559190:1 gene:ENSRNOG00000008150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// FQ212313 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA59YI03 mRNA sequence. // chr8 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000051967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81532831:81585210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_031660 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP-regulated phosphoprotein 19 (Arpp19), mRNA. // chr8 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118444306:118444644:-1 gene:ENSRNOG00000020977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC058461 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic AMP phosphoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:72767 IMAGE:6919944), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ213926 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YM08 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// FQ221182 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA39YI22 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81566087:81585228:1 gene:ENSRNOG00000023086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81532831:81585210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_022178 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin VA (Myo5a), mRNA. // chr8 // 90 // 95 // 35 // 39 // 0 /// AB035736 // GenBank // Rattus norvegicus Myo5a mRNA for myosin-Va, complete cds. // chr8 // 90 // 95 // 35 // 39 // 0 /// GENSCAN00000051962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81634994:81759907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT053654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
XM_006243411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin VC (Myo5c), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000011768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81775089:81850114:1 gene:ENSRNOG00000008356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000051975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81766416:81860213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT053658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT053661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_031770 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta 5 (Gnb5), mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011963 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:81880465:81889635:1 gene:ENSRNOG00000008926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// AY552803 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein beta 5 subunit (Gnb5) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC089221 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:105255 IMAGE:7320619), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000075708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81861124:82010315:1 gene:ENSRNOG00000047799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000051969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81861124:81890719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_053733 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-like 10 (apoptosis facilitator) (Bcl2l10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81891899:81897938:1 gene:ENSRNOG00000009308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY029163 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2L10 (Bcl2l10) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005548 // RefSeq // Rattus norvegicus Leo1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae) (Leo1), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000013512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81983992:82008425:1 gene:ENSRNOG00000010116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC082098 // GenBank // Rattus norvegicus Leo1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95290 IMAGE:7134452), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// FQ229860 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YH02 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81975765:82008292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT053669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001106839 // RefSeq // Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2 (Lysmd2), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:82162170:82177806:1 gene:ENSRNOG00000010642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC167017 // GenBank // Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:189223 IMAGE:7302522), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ212868 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YO07 mRNA sequence. // chr8 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// XM_006243406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 2 (Lysmd2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT053673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// NONRATT053675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82148101:82181760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108168 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 5 (Bmp5), mRNA. // chrU // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000014846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:82266949:82526447:1 gene:ENSRNOG00000010917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000045748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82498031:82524124:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT053676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82443730:82465874:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001276472 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase-like 1 (Hmgcll1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase-like 1 (Hmgcll1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_356437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase-like 1 (Hmgcll1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:82645962:82780148:1 gene:ENSRNOG00000011193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211656 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YH04 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82706924:82718331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_001005549 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulointerstitial nephritis antigen (Tinag), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC081887 // GenBank // Rattus norvegicus tubulointerstitial nephritis antigen, mRNA (cDNA clone MGC:93772 IMAGE:7109073), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000028564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:83846735:83892295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_001108170 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 31 (Klhl31), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:84514686:84537779:1 gene:ENSRNOG00000006224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:84528646:84533602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108170 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 31 (Klhl31), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:84514686:84537779:1 gene:ENSRNOG00000006224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012815 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate-cysteine ligase, catalytic subunit (Gclc), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000033196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:84627768:84666185:1 gene:ENSRNOG00000006302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC081702 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate-cysteine ligase, catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93096 IMAGE:7110739), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// J05181 // GenBank // Rat gamma-glutamylcysteine synthetase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:84624010:84671257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT053686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_134382 // RefSeq // Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 5 (Elovl5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 5 (Elovl5), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:84825602:84851400:1 gene:ENSRNOG00000006331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB071985 // GenBank // Rattus norvegicus rELO1 mRNA for fatty acid elongase 1, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// HQ404314 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA elongation of long chain fatty acids family member 5 (Elovl5) mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:84827774:84851400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT053688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017186 // RefSeq // Rattus norvegicus glial cells missing homolog 1 (Drosophila) (Gcm1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000010583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:84920654:84933890:1 gene:ENSRNOG00000007932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF081557 // GenBank // Rattus norvegicus glial cells missing protein homolog (Gcm1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:84922469:84933859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT053690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_138886 // RefSeq // Rattus norvegicus intestinal cell kinase (Ick), mRNA. // chr8 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:84982701:85037684:1 gene:ENSRNOG00000008691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D26178 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for serine/threonine protein kinase, complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85001221:85049533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106840 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase alpha 4 (Gsta4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000012348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:85067703:85078443:1 gene:ENSRNOG00000030449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC157819 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:188402 IMAGE:5621777), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FJ179399 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase alpha 4 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// FQ233840 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YD04 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85054543:85078443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT053697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000015115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85132081:85132767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001106841 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial tRNA translation optimization 1 (Mto1), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057138 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:85357705:85381270:1 gene:ENSRNOG00000037659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85357789:85381270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003750546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD109 molecule (Cd109), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037665 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:85501109:85614760:1 gene:ENSRNOG00000025332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85542507:85593466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT053704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000033714 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:86549996:86550764:1 gene:ENSRNOG00000025186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:86550219:86550692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001177825 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00022-like (LOC100363289), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:86749196:86757691:1 gene:ENSRNOG00000010657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:86738308:86757691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001106842 // RefSeq // Rattus norvegicus SUMO1/sentrin specific peptidase 6 (Senp6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000015741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:87025318:87101909:1 gene:ENSRNOG00000024336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// FQ213152 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YH02 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000040086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:87021759:87101025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT053707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
XM_006226497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin VI (Myo6), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000016428 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:87169192:87264964:1 gene:ENSRNOG00000011852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064856 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:87169192:87264964:1 gene:ENSRNOG00000011852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:87169192:87267343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// FQ212346 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA58YC17 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT053718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// NONRATT053712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_001109378 // RefSeq // Rattus norvegicus meiosis-specific 4 homolog (S. cerevisiae) (Mei4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:88901854:89087426:1 gene:ENSRNOG00000023794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:88938985:88965881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENSRNOT00000001195 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:89832413:89832919:1 gene:ENSRNOG00000000896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:89812470:89832718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001277283 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-associated kinase 1 binding protein 1 (Irak1bp1), mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC159433 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-associated kinase 1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:188759 IMAGE:9093094), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// FQ229432 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YO21 mRNA sequence. // chr8 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:89866731:89888096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT053726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
XR_146127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta-like (LOC679916), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XR_147102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta-like (LOC679916), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000012682 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:90250001:90250676:1 gene:ENSRNOG00000009551 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0
XM_006243468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2-like (LOC102554622), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001137647 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain binding glutamate-rich protein like 2 (Sh3bgrl2), mRNA. // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000012904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:90589261:90680680:1 gene:ENSRNOG00000009613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT053731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:90618376:90626686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000041852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:90795417:90796097:1 gene:ENSRNOG00000030586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 86 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:90776795:90796056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0
XM_006243469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L32-like (RGD1561944), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:90818853:90826377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001108172 // RefSeq // Rattus norvegicus Ttk protein kinase (Ttk), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006243466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ttk protein kinase (Ttk), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:90886762:90924325:1 gene:ENSRNOG00000029055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:90855591:90931592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_019267 // RefSeq // Rattus norvegicus branched chain keto acid dehydrogenase E1, beta polypeptide (Bckdhb), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:90982519:91173704:1 gene:ENSRNOG00000009928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC158861 // GenBank // Rattus norvegicus branched chain keto acid dehydrogenase E1, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:188428 IMAGE:7932093), complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// FQ214589 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YC08 mRNA sequence. // chr8 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000030117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:91021381:91045316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT053735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000030113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:90976058:90996422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
GENSCAN00000030125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:91057070:91057660:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT053735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001013426 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L41 (Mrpl41), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003750552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 39S ribosomal protein L41, mitochondrial-like (RGD1560917), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003754443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 39S ribosomal protein L41, mitochondrial-like (RGD1560917), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043351 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:91338436:91338840:1 gene:ENSRNOG00000034128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000044802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2162293:2163210:-1 gene:ENSRNOG00000029875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091293 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L41, mRNA (cDNA clone MGC:109209 IMAGE:7307323), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2162423:2162827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:91338436:91338840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT036620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT053737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000013596 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:92639618:92639956:1 gene:ENSRNOG00000010250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:92609796:92711598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000011487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:92955202:92958540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_031807 // RefSeq // Rattus norvegicus trophoblast glycoprotein (Tpbg), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:93006542:93009911:1 gene:ENSRNOG00000010694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF063939 // GenBank // Rattus norvegicus 5T4 oncofetal antigen homolog (5T4) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC087011 // GenBank // Rattus norvegicus trophoblast glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:93332 IMAGE:7193411), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006226506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopey family member 1 (Dopey1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006243500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopey family member 1 (Dopey1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XR_348661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopey family member 1 (Dopey1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr8 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// XR_356481 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopey family member 1 (Dopey1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr8 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000014783 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:93665370:93737976:1 gene:ENSRNOG00000022847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000056913 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:93665370:93737976:1 gene:ENSRNOG00000022847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067330 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:93665370:93737976:1 gene:ENSRNOG00000022847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000074053 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:93708254:93727331:1 gene:ENSRNOG00000022847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 27 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000046316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:93665370:93737976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_001108773 // RefSeq // Rattus norvegicus RWD domain containing 2A (Rwdd2a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RWD domain containing 2A (Rwdd2a), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RWD domain containing 2A (Rwdd2a), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:93756515:93759639:1 gene:ENSRNOG00000009599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:93757368:93759270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT053751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008560 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 35 (Prss35), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:93934402:93951097:1 gene:ENSRNOG00000025184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB180912 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for novel serine protease like protein, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:93948338:93949558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ripply transcriptional repressor 2 (Ripply2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006226511 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ripply transcriptional repressor 2 (Ripply2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006243504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ripply transcriptional repressor 2 (Ripply2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ripply transcriptional repressor 2 (Ripply2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013285 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:94195165:94199268:1 gene:ENSRNOG00000010004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000014221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:94195165:94225122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_133427 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 4 (Cyb5r4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000013908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:94201539:94266045:1 gene:ENSRNOG00000010024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000013975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:94201539:94266045:1 gene:ENSRNOG00000010024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF307840 // GenBank // Rattus norvegicus hemoflavoprotein b5/b5r mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// AY321370 // GenBank // Rattus norvegicus flavohemoprotein b5/b5R mRNA, complete cds. // chr8 // 87 // 88 // 26 // 30 // 0 /// AY321371 // GenBank // Rattus norvegicus flavohemoprotein b5/b5R variant mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 82 // 82 // 23 // 28 // 0 /// BC080240 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 4, mRNA (cDNA clone MGC:91492 IMAGE:7099950), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT053755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT053757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000014217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:94233527:94289299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT053756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_001108774 // RefSeq // Rattus norvegicus melanocortin 2 receptor accessory protein 2 (Mrap2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus melanocortin 2 receptor accessory protein 2 (Mrap2), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000014007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:94308773:94364872:1 gene:ENSRNOG00000010545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:94345938:94364366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_021576 // RefSeq // Rattus norvegicus 5 nucleotidase, ecto (Nt5e), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:95464241:95508297:1 gene:ENSRNOG00000011071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081806 // GenBank // Rattus norvegicus 5 nucleotidase, ecto, mRNA (cDNA clone MGC:93467 IMAGE:7134340), complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC098665 // GenBank // Rattus norvegicus 5 nucleotidase, ecto, mRNA (cDNA clone MGC:112615 IMAGE:7322840), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// J05214 // GenBank // Rat 5-nucleotidase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:95472733:95506916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001142944 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 43A (Trim43a), mRNA. // chr8 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000044521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:95889016:95895160:1 gene:ENSRNOG00000010699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// NM_001134531 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 949 (Zfp949), mRNA. // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// XM_006243509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 949 (Zfp949), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000032976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:95849787:95874469:1 gene:ENSRNOG00000043223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// GENSCAN00000048120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:95849711:95901409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT053764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_133416 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-related protein A1 (Bcl2a1), mRNA. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:96059040:96067299:1 gene:ENSRNOG00000047606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF378332 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2-related protein A1 (Bcl2a1) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:96024153:96067148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001009349 // RefSeq // Rattus norvegicus 5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase (5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase) (Mthfs), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:96071796:96121083:1 gene:ENSRNOG00000013229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087144 // GenBank // Rattus norvegicus 5,10-methenyltetrahydrofolate synthetase (5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase), mRNA (cDNA clone MGC:95139 IMAGE:7128624), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:96071802:96076752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT053767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170531 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 1 (Rasgrf1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:96778646:96905924:1 gene:ENSRNOG00000014025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:96859917:96905610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000057211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:96778646:96857087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// NONRATT053770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// NONRATT053771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_012939 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin H (Ctsh), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:96939705:96958827:1 gene:ENSRNOG00000014064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC085352 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin H, mRNA (cDNA clone MGC:105498 IMAGE:7115929), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ209410 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YO18 mRNA sequence. // chr8 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// FQ227275 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YO23 mRNA sequence. // chr8 // 86 // 97 // 30 // 35 // 0 /// FQ228686 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YN06 mRNA sequence. // chr8 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:96939743:96958589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT053774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001047101 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 7 (Adamts7), mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 7 (Adamts7), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:97036903:97074365:1 gene:ENSRNOG00000028036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:97035311:97074365:1 gene:ENSRNOG00000028036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AY257482 // GenBank // Rattus norvegicus ADAMTS7B preproprotein (ADAMTS7B) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AY327121 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN COMPase precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:97036116:97074149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
GENSCAN00000000784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:98080948:98217310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_001108176 // RefSeq // Rattus norvegicus Zic family member 4 (Zic4), mRNA. // chr8 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000019938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:98243374:98252520:1 gene:ENSRNOG00000014871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000056562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:98246887:98252520:1 gene:ENSRNOG00000014871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:98233493:98259952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT053779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT053781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_057194 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 1 (Plscr1), mRNA. // chr8 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:99108914:99129250:1 gene:ENSRNOG00000008048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:99108971:99129250:1 gene:ENSRNOG00000008048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AY024347 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipid scramblase PLSCR mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC085715 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93252 IMAGE:7109899), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:99047039:99333036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT053784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT053786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001014094 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 2 (Plscr2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000044371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:99199389:99210702:1 gene:ENSRNOG00000033412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC079090 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94059 IMAGE:7123519), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT053788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:99047039:99333036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
XM_006226523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipid scramblase 1-like (LOC102551265), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006243544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipid scramblase 1-like (LOC102551265), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipid scramblase 1-like (LOC102551265), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipid scramblase 1-like (LOC102551265), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XR_356497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipid scramblase 1-like (LOC102551265), transcript variant X5, misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042834 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:99255103:99268339:1 gene:ENSRNOG00000030551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:99047039:99333036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001012000 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 4 (Plscr4), mRNA. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:99364963:99403085:1 gene:ENSRNOG00000008151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY548832 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipid scramblase 4 (Pls4) mRNA, complete cds. // chr8 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:99380134:99403206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT053789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001142915 // RefSeq // Rattus norvegicus procollagen lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 (Plod2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_175869 // RefSeq // Rattus norvegicus procollagen lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2 (Plod2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000041859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:99462925:99545578:1 gene:ENSRNOG00000030183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000056704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:99462925:99545578:1 gene:ENSRNOG00000030183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AJ430860 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, long variant (plod2 gene). // chr8 // 88 // 100 // 37 // 42 // 0 /// NONRATT053790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000029866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:99484881:99592080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// NONRATT053791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
GENSCAN00000029868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:99621252:99746989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000011090 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:99745958:99746989:1 gene:ENSRNOG00000008363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001271438 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE9, cation proton antiporter 9), member 9 (Slc9a9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011358 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:101787033:102485049:1 gene:ENSRNOG00000008554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001271152 // RefSeq // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member IX (Paqr9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:102795907:102797028:1 gene:ENSRNOG00000032374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:102795907:102799653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047965 // RefSeq // Rattus norvegicus Ab2-060 (LOC501038), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:102801222:102809973:1 gene:ENSRNOG00000033654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:102801222:102809973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003750558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-3 exoribonuclease 1-like (LOC100911537), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 14 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000014481 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:103225041:103329228:1 gene:ENSRNOG00000042951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 49 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000049967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:103124135:103220823:1 gene:ENSRNOG00000010027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000074705 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:103225041:103329048:1 gene:ENSRNOG00000042951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 40 // 40 // 0 /// XM_006226526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-3 exoribonuclease 1 (Xrn1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 51 // 51 // 42 // 83 // 1 /// XM_006243594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-3 exoribonuclease 1 (Xrn1), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 51 // 51 // 42 // 83 // 1 /// XM_003754445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxia telangiectasia and Rad3 related (Atr), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 47 // 47 // 39 // 83 // 1 /// GENSCAN00000014480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:103124135:103378473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 99 // 83 // 68 // 69 // 0 /// NONRATT053805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 23 // 23 // 19 // 83 // 1
XM_006226533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerol kinase 5 (putative) (Gk5), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_345971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerol kinase 5 (putative) (Gk5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014905 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:103378039:103448596:1 gene:ENSRNOG00000010942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067835 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:103378039:103448352:1 gene:ENSRNOG00000010942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:103411489:103448352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT053808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001106847 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor Dp-2 (E2F dimerization partner 2) (Tfdp2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor Dp-2 (E2F dimerization partner 2) (Tfdp2), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor Dp-2 (E2F dimerization partner 2) (Tfdp2), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor Dp-2 (E2F dimerization partner 2) (Tfdp2), transcript variant X14, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:103555032:103624736:1 gene:ENSRNOG00000011241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168961 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor Dp-2 (E2F dimerization partner 2), mRNA (cDNA clone MGC:189277 IMAGE:7444676), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ227571 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YN13 mRNA sequence. // chr8 // 73 // 96 // 19 // 26 // 0 /// NONRATT053809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:103526701:103600896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT053810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
ENSRNOT00000037171 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:104395629:104395910:1 gene:ENSRNOG00000023330 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000006571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:104383062:104395946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
NM_134377 // RefSeq // Rattus norvegicus calsyntenin 2 (Clstn2), mRNA. // chr8 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000066731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:104768408:105478061:-1 gene:ENSRNOG00000043085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000031373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:104777421:104817223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT055624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_001013224 // RefSeq // Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3 (Nmnat3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:105760763:105871366:1 gene:ENSRNOG00000013585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083725 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:94624 IMAGE:7191168), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_012733 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol binding protein 1, cellular (Rbp1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:105891148:105912684:1 gene:ENSRNOG00000013794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ210835 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA21YE24 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M16459 // GenBank // Rat cellular retinol binding protein (CRBP) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT053824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:105891255:105957952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_012640 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol binding protein 2, cellular (Rbp2), mRNA. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:105949255:105969562:1 gene:ENSRNOG00000013932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M13949 // GenBank // Rat cellular retinol binding protein II (CRBPII) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT053825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:105891255:105957952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_001064056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685501 (LOC685501), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_003754475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685501 (LOC685501), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106580155:106583506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
XM_003750571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box L2 (Foxl2), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_003754448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box L2 (Foxl2), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001017470 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 70 (Cep70), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006243640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 70 (Cep70), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000056590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:106921077:106973347:1 gene:ENSRNOG00000022845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC087075 // GenBank // Rattus norvegicus centrosomal protein 70kDa, mRNA (cDNA clone MGC:94447 IMAGE:7134655), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106942934:106964299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000013328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106969031:106973347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT053829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT053828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT053830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT053831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XM_006226649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NME/NM23 family member 9 (Nme9), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NME/NM23 family member 9 (Nme9), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048864 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:107125065:107142310:1 gene:ENSRNOG00000031523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:107113584:107144210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001109437 // RefSeq // Rattus norvegicus debranching RNA lariats 1 (Dbr1), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:107251356:107262731:1 gene:ENSRNOG00000014588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC166797 // GenBank // Rattus norvegicus debranching enzyme homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188596 IMAGE:7938214), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:107251459:107262545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT053838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_001014095 // RefSeq // Rattus norvegicus DAZ interacting zinc finger protein 1-like (Dzip1l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006243627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DAZ interacting zinc finger protein 1-like (Dzip1l), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:107305974:107339593:1 gene:ENSRNOG00000014746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083786 // GenBank // Rattus norvegicus DAZ interacting protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:94765 IMAGE:7097259), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:107283912:107338453:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
GENSCAN00000000422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:108108008:108108256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0
NM_001108179 // RefSeq // Rattus norvegicus stromal antigen 1 (Stag1), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000066917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:108373849:108760291:1 gene:ENSRNOG00000015389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:108501713:108774017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENSRNOT00000039593 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:108873511:108895784:1 gene:ENSRNOG00000023021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:108890164:108895784:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT053850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001108180 // RefSeq // Rattus norvegicus kyphoscoliosis peptidase (Ky), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006243657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kyphoscoliosis peptidase (Ky), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kyphoscoliosis peptidase (Ky), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:110380954:110420390:1 gene:ENSRNOG00000008210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:110387313:110434207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT053853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT053854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
NM_001173983 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 13 (Anapc13), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 13 (Anapc13), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 13 (Anapc13), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 13 (Anapc13), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:110505168:110513584:1 gene:ENSRNOG00000008459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_031717 // RefSeq // Rattus norvegicus angiomotin like 2 (Amotl2), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:110604450:110619840:1 gene:ENSRNOG00000008487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:110578257:110622090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
XR_356551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549628 (LOC102549628), ncRNA. // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_080402 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor-like tyrosine kinase (Ryk), mRNA. // chr8 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:110718666:110790096:1 gene:ENSRNOG00000008593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY669340 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase-related protein (Ryk) mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC099232 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-like tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7443396), partial cds. // chr8 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000054572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:110646086:110790096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_022667 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 2a1 (Slco2a1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 2a1 (Slco2a1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:110886314:110967442:1 gene:ENSRNOG00000009005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M64862 // GenBank // Rat matrin F/G mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:110886400:110963206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_022667 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 2a1 (Slco2a1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006243655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 2a1 (Slco2a1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108775 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB6B, member RAS oncogene family (Rab6b), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111018332:111059791:1 gene:ENSRNOG00000009198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:110991076:111055772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
XM_001072207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) II binding protein 1 (Topbp1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) II binding protein 1 (Topbp1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_236578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) II binding protein 1 (Topbp1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013265 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:111183198:111226187:1 gene:ENSRNOG00000009789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111176269:111226187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT053870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT053871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108181 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA dehydrogenase family, member 11 (Acad11), mRNA. // chr8 // 100 // 42 // 20 // 20 // 0 /// NM_001191882 // RefSeq // Rattus norvegicus nephronophthisis 3 (adolescent) (Nphp3), mRNA. // chr8 // 100 // 56 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111913834:111963488:1 gene:ENSRNOG00000048978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111982416:112062756:1 gene:ENSRNOG00000010940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 20 // 20 // 0 /// BC167762 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-Coenzyme A dehydrogenase family, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:187508 IMAGE:7443858), complete cds. // chr8 // 100 // 42 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111991357:112030833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000049435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111913834:111962288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 48 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT053880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 20 // 48 // 1
NM_001109003 // RefSeq // Rattus norvegicus copine IV (Cpne4), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006243676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine IV (Cpne4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine IV (Cpne4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006243678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine IV (Cpne4), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:112491426:112972591:1 gene:ENSRNOG00000026577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:112835746:112957088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001106852 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L3 (Mrpl3), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:112989706:113013066:1 gene:ENSRNOG00000012650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:112985232:113012651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT053886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT053888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT053887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001040156 // RefSeq // Rattus norvegicus asteroid homolog 1 (Drosophila) (Aste1), mRNA. // chr8 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// XM_006243673 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus asteroid homolog 1 (Drosophila) (Aste1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// XM_006243674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus asteroid homolog 1 (Drosophila) (Aste1), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:113322528:113333049:1 gene:ENSRNOG00000013059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// BC083913 // GenBank // Rattus norvegicus asteroid homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7134393), complete cds. // chr8 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113324175:113332926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT053891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT053892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001108777 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 4 (Pik3r4), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000018654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:113675822:113725967:1 gene:ENSRNOG00000013669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC168984 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 4, p150, mRNA (cDNA clone MGC:189323 IMAGE:7103631), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000028636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113659330:113717471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113720460:113729132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT053893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT053894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001271182 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 4 (Col6a4), mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000047563 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:114039958:114137875:-1 gene:ENSRNOG00000031782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114112723:114157468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001271182 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 4 (Col6a4), mRNA. // chr8 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000047563 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:114039958:114137875:-1 gene:ENSRNOG00000031782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000030862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114041589:114104500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 17 // 47 // 1
NM_001271182 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 4 (Col6a4), mRNA. // chr8 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000047563 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:114039958:114137875:-1 gene:ENSRNOG00000031782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114041589:114104500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
XM_003754477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 5 (Col6a5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038160 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:113904374:113991799:-1 gene:ENSRNOG00000010663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113967123:114018818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109296 // RefSeq // Rattus norvegicus POC1 centriolar protein A (Poc1a), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114351523:114399635:1 gene:ENSRNOG00000037295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ233502 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YJ13 mRNA sequence. // chr8 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114343953:114415183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001100547 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 7 (Dusp7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114436772:114442403:1 gene:ENSRNOG00000010789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114436811:114441942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001007664 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 14b (Abhd14b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114514600:114518645:1 gene:ENSRNOG00000012073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114515724:114518645:1 gene:ENSRNOG00000012073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC076385 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 14b, mRNA (cDNA clone MGC:93766 IMAGE:7108802), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ213592 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YN17 mRNA sequence. // chr8 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114515631:114517783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT053905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 87 // 87 // 20 // 23 // 1 /// NONRATT053907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_001191883 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 4 (Pcbp4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114519757:114529993:1 gene:ENSRNOG00000012406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114519406:114529403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001108778 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (Rrp9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114544186:114552838:1 gene:ENSRNOG00000012927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC158778 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 9, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:188107 IMAGE:7134304), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114544229:114585375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT053916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001109361 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif containing F1 (Iqcf1), mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006243838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing F1 (Iqcf1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000056391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114557460:114559884:1 gene:ENSRNOG00000037289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000036949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114544229:114585375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT053919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001145072 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif containing F5 (Iqcf5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114577756:114579141:1 gene:ENSRNOG00000013164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114544229:114585375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
NM_001191798 // RefSeq // Rattus norvegicus Vpr (HIV-1) binding protein (Vprbp), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000018932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114907024:114974112:1 gene:ENSRNOG00000013841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// FQ217045 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA36YN19 mRNA sequence. // chr8 // 86 // 45 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114890705:114961407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT053921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 47 // 47 // 22 // 47 // 1
NM_031804 // RefSeq // Rattus norvegicus cytokine inducible SH2-containing protein (Cish), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115411027:115415970:1 gene:ENSRNOG00000029543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC161930 // GenBank // Rattus norvegicus cytokine inducible SH2-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:187704 IMAGE:8375557), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115406558:115415005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
XM_006243731 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6430571L13 gene; similar to g20 protein (RGD1307461), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115451318:115461002:1 gene:ENSRNOG00000015718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224195 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA74YC15 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115450703:115461200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT053927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175592 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, alpha 2/delta subunit 2 (Cacna2d2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000021218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115510989:115640006:1 gene:ENSRNOG00000015835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF486277 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel alpha-2 delta-2 subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000012307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115568194:115650111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_001108779 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 115 (Tmem115), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115646345:115650714:1 gene:ENSRNOG00000021899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT053931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115568194:115650111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001025744 // RefSeq // Rattus norvegicus nitrogen permease regulator-like 2 (S. cerevisiae) (Nprl2), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115654210:115657382:1 gene:ENSRNOG00000021660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC098932 // GenBank HTC // Rattus norvegicus tumor suppressor candidate 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7386309). // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT053935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT053936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 94 // 50 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115654345:115677259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT053933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_001004284 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 10 (Zmynd10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000039258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115658773:115663130:1 gene:ENSRNOG00000021602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079255 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:94352 IMAGE:7133212), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115654345:115677259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT053938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT053940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT053941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT053942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001007754 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 1 (Rassf1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NM_001037555 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 1 (Rassf1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115667338:115674549:1 gene:ENSRNOG00000021548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115663409:115673930:1 gene:ENSRNOG00000021548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AB202124 // GenBank // Rattus norvegicus Rassf1 mRNA for Ras association domain family 1 isoform A, complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC079237 // GenBank // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:94319 IMAGE:7132629), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// FQ233012 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YJ01 mRNA sequence. // chr8 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT053944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115654345:115677259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// NONRATT053943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// NONRATT053945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_001109297 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor suppressor candidate 2 (Tusc2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115675223:115678441:1 gene:ENSRNOG00000021528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082798 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7303104. // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT053946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115654345:115677259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_172040 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 2 (Hyal2), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 2 (Hyal2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115681546:115685238:1 gene:ENSRNOG00000031420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF034218 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronidase (Hyal2) mRNA, complete cds. // chr8 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// AF535141 // GenBank // Rattus norvegicus GPI-anchored cell-surface protein hyaluronidase 2 (Hyal2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC062410 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:72280 IMAGE:5623650), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115682583:115698380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT053947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_207616 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 1 (Hyal1), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115689184:115691497:1 gene:ENSRNOG00000015858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AB100600 // GenBank // Rattus norvegicus hyal1 mRNA for hyaluronidase 1, complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115682583:115698380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
BC105845 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:125023 IMAGE:7456327), complete cds. // chr8 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// NM_207599 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 3 (Hyal3), mRNA. // chr8 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000021590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115692772:115698406:1 gene:ENSRNOG00000016093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// BC097259 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:114226 IMAGE:7453545), complete cds. // chr8 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// NONRATT053950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT053951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT053953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT053956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115682583:115698380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT053952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT053954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT053955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001047871 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon-related developmental regulator 2 (Ifrd2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115699356:115704574:1 gene:ENSRNOG00000016150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC161810 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-related developmental regulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:187242 IMAGE:9023096), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115699582:115704170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT053958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001126284 // RefSeq // Rattus norvegicus MON1 secretory trafficking family member A (Mon1a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116011554:116036515:1 gene:ENSRNOG00000018502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161958 // GenBank // Rattus norvegicus MON1 homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:187760 IMAGE:9027405), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115997182:116036396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106855 // RefSeq // Rattus norvegicus macrophage stimulating 1 receptor (c-met-related tyrosine kinase) (Mst1r), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000066104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116040918:116054449:1 gene:ENSRNOG00000032618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000031665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116040918:116058465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT053961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001024788 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-like 11 (Actl11), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116062361:116066050:1 gene:ENSRNOG00000032642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY635905 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific actin-related protein 3 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116062367:116082377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024000 // RefSeq // Rattus norvegicus CaM kinase-like vesicle-associated (Camkv), mRNA. // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000025311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116070039:116084385:1 gene:ENSRNOG00000018641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// L22557 // GenBank // Rattus norvegicus vesicla-associate calmodulin-binding protein mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// NONRATT053964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116062367:116082377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT053965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001109004 // RefSeq // Rattus norvegicus TRAF-interacting protein (Traip), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000052289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116085076:116104850:1 gene:ENSRNOG00000030101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC162006 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF-interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:187865 IMAGE:9089897), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT053966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116085157:116117197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT053968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001106856 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 7 (Uba7), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 7 (Uba7), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 7 (Uba7), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000068295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116108502:116117308:1 gene:ENSRNOG00000029195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116085157:116117197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
XM_006226562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-related family member 4 (Cdhr4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006226563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-related family member 4 (Cdhr4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006243871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-related family member 4 (Cdhr4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006243872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-related family member 4 (Cdhr4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006226567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-related family member 4 (Cdhr4), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006243878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-related family member 4 (Cdhr4), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT053974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116125911:116183157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_053316 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol hexakisphosphate kinase 1 (Ip6k1), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000041402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116136333:116180472:1 gene:ENSRNOG00000019932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB049151 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for inositol hexakisphosphate kinase, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078702 // GenBank // Rattus norvegicus inositol hexakisphosphate kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93102 IMAGE:7132706), complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// FQ211545 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YM18 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116125911:116183157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT053978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT053981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001108781 // RefSeq // Rattus norvegicus GDP-mannose pyrophosphorylase B (Gmppb), mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GDP-mannose pyrophosphorylase B (Gmppb), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116181002:116210240:1 gene:ENSRNOG00000037229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116125911:116183157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT053986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_178144 // RefSeq // Rattus norvegicus adhesion molecule with Ig like domain 3 (Amigo3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY237731 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein AMIGO3 (Amigo3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116185095:116186621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024352 // RefSeq // Rattus norvegicus Macrophage stimulating 1 (hepatocyte growth factor-like) (Mst1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116211797:116216367:1 gene:ENSRNOG00000019680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC089796 // GenBank // Rattus norvegicus Macrophage stimulating 1 (hepatocyte growth factor-like), mRNA (cDNA clone MGC:108677 IMAGE:7322260), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116211809:116216308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT053989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT053988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_001134532 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamine-rich 1 (Qrich1), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamine-rich 1 (Qrich1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamine-rich 1 (Qrich1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116652041:116691239:1 gene:ENSRNOG00000025071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116653220:116690461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_199099 // RefSeq // Rattus norvegicus IMP (inosine 5-monophosphate) dehydrogenase 2 (Impdh2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116691532:116696120:1 gene:ENSRNOG00000031965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060585 // GenBank // Rattus norvegicus IMP (inosine monophosphate) dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:72938 IMAGE:6891123), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116691583:116696070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NR_031907 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-191 (Mir191), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-191a // miRBase Micro RNA Database // MI0000934 Rattus norvegicus miR-191a stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032277 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 425 (Mir425), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053607 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:116699324:116699406:1 gene:ENSRNOG00000035484 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-425 // miRBase Micro RNA Database // MI0006146 Rattus norvegicus miR-425 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014214 // RefSeq // Rattus norvegicus DALR anticodon binding domain containing 3 (Dalrd3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006243812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DALR anticodon binding domain containing 3 (Dalrd3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116700446:116703321:1 gene:ENSRNOG00000020159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC082046 // GenBank // Rattus norvegicus DALR anticodon binding domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:95192 IMAGE:7131735), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000056601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116700452:116703208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT054003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT054004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT054005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NM_053965 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (carnitine/acylcarnitine translocase), member 20 (Slc25a20), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116800146:116821558:1 gene:ENSRNOG00000020288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081749 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (carnitine/acylcarnitine translocase), member 20, mRNA (cDNA clone MGC:93269 IMAGE:7134670), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116800246:116820810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_019264 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II alpha (Prkar2a), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116830969:116890072:1 gene:ENSRNOG00000020284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF533978 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory chain mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116831080:116889846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT054009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NONRATT054010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021660 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol hexakisphosphate kinase 2 (Ip6k2), mRNA. // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_006243853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inositol hexakisphosphate kinase 2 (Ip6k2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000027584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116921872:116944749:1 gene:ENSRNOG00000020361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// BC083574 // GenBank // Rattus norvegicus inositol hexakisphosphate kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93905 IMAGE:7112777), complete cds. // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT054012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116934587:116956125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// AB015723 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PiUS, complete cds. // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT054013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT054014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT054017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106857 // RefSeq // Rattus norvegicus NCK interacting protein with SH3 domain (Nckipsd), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NCK interacting protein with SH3 domain (Nckipsd), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116946761:116956823:1 gene:ENSRNOG00000031816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116934587:116956125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_031320 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 3 (Celsr3), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000040661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116964621:116991765:1 gene:ENSRNOG00000034005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AB011528 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MEGF2, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000037000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116964904:117005669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT054023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001143817 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 6 (Slc26a6), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// XM_006243758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 6 (Slc26a6), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116993106:117003173:1 gene:ENSRNOG00000020450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000037000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116964904:117005669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT054028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 70 // 70 // 30 // 43 // 1 /// NONRATT054027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// NONRATT054029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NONRATT054028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163477 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 89 (Tmem89), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117004788:117005682:1 gene:ENSRNOG00000031141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116964904:117005669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001004250 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase core protein I (Uqcrc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117030911:117042818:1 gene:ENSRNOG00000032134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078923 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase core protein I, mRNA (cDNA clone MGC:93712 IMAGE:7106265), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ229052 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA4YC01 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// FQ218056 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA10YD09 mRNA sequence. // chr8 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117030934:117042698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001106858 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type VII, alpha 1 (Col7a1), mRNA. // chr8 // 98 // 100 // 110 // 112 // 0 /// ENSRNOT00000027994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117046351:117078589:1 gene:ENSRNOG00000020579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 98 // 100 // 110 // 112 // 0 /// GENSCAN00000037012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117046351:117079970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 98 // 80 // 88 // 90 // 0
NM_133385 // RefSeq // Rattus norvegicus urocortin 2 (Ucn2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117079640:117080023:1 gene:ENSRNOG00000020655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY044835 // GenBank // Rattus norvegicus urocortin II mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF078966 // GenBank // Rattus norvegicus urocortin 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117046351:117079970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001006989 // RefSeq // Rattus norvegicus shisa family member 5 (Shisa5), mRNA. // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shisa family member 5 (Shisa5), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117145034:117147664:1 gene:ENSRNOG00000020667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC083710 // GenBank // Rattus norvegicus scotin, mRNA (cDNA clone MGC:94600 IMAGE:7190608), complete cds. // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// FQ231597 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YO19 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117132870:117146691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT054045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// NONRATT054047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// NONRATT054049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// NONRATT054046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT054050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_001014098 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 51 (Ccdc51), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 51 (Ccdc51), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006243790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 51 (Ccdc51), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006243791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 51 (Ccdc51), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006243792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 51 (Ccdc51), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117172283:117182587:1 gene:ENSRNOG00000020688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087581 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 51, mRNA (cDNA clone MGC:105598 IMAGE:7314505), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117179240:117182370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT054053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_006226571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006226573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006226574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006243883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006243885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006243886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin B1 (Plxnb1), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000043345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117190501:117208237:1 gene:ENSRNOG00000029510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000037018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117190501:117208237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001106860 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 8 (Spink8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117258705:117270334:1 gene:ENSRNOG00000037199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166531 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7189955. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117261511:117280336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001191884 // RefSeq // Rattus norvegicus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 6 (Nme6), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006243851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 6 (Nme6), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117273929:117280642:1 gene:ENSRNOG00000020721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF051943 // GenBank // Rattus norvegicus type 6 nucleoside diphosphate kinase NM23-R6 (Nm23-R6) mRNA, partial cds. // chr8 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// FQ225386 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YC10 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117261511:117280336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT054062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_133571 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 25A (Cdc25a), mRNA. // chr8 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117306200:117324072:1 gene:ENSRNOG00000020737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// D16236 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cdc25A, complete cds. // chr8 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117306200:117380031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001024278 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 4 (Map4), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC088405 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:93812 IMAGE:7110394), complete cds. // chr8 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000056166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117366079:117515387:1 gene:ENSRNOG00000020748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117412522:117461996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117462657:117514295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1 /// NONRATT054067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// NONRATT054065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// NONRATT054068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1 /// NONRATT054069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
ENSRNOT00000056161 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:117462403:117465614:1 gene:ENSRNOG00000037194 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117462657:117514295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106861 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 1 (Smarcc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 1 (Smarcc1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily c, member 1 (Smarcc1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117561617:117675013:1 gene:ENSRNOG00000020804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117561703:117699181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_019284 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin sulfate proteoglycan 5 (neuroglycan C) (Cspg5), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// NM_133652 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin sulfate proteoglycan 5 (neuroglycan C) (Cspg5), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117686009:117699634:1 gene:ENSRNOG00000020833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF292102 // GenBank // Rattus norvegicus CALEB isoform b (Caleb) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// U33553 // GenBank // Rattus norvegicus neuroglycan C precursor mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117561703:117699181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT054083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 92 // 86 // 11 // 12 // 0
NM_001108782 // RefSeq // Rattus norvegicus elongator acetyltransferase complex subunit 6 (Elp6), mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117869570:117884873:1 gene:ENSRNOG00000020847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC166773 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 103, mRNA (cDNA clone MGC:188548 IMAGE:7934150), complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000056822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117812731:117962100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001100966 // RefSeq // Rattus norvegicus SREBF chaperone (Scap), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000028295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117914034:117972289:1 gene:ENSRNOG00000020853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC131852 // GenBank // Rattus norvegicus SREBF chaperone, mRNA (cDNA clone MGC:156813 IMAGE:7189794), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000011567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117962434:117972130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT054085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// GENSCAN00000056822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117812731:117962100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001106862 // RefSeq // Rattus norvegicus neutrophilic granule protein (Ngp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118006028:118009392:1 gene:ENSRNOG00000024330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118006041:118008813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT054089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001192000 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 9 (Kif9), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000028364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118086487:118136590:1 gene:ENSRNOG00000020891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000011577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118086214:118228761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT054090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1
NM_001108189 // RefSeq // Rattus norvegicus SET domain containing 2 (Setd2), mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000028409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118163197:118229411:1 gene:ENSRNOG00000020915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000011577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118086214:118228761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT054092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT054093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// NONRATT054096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001108783 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 12 (Ccdc12), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118267351:118317922:1 gene:ENSRNOG00000020946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118267409:118317670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_012606 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light chain 3, alkali; ventricular, skeletal, slow (Myl3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118370061:118376219:1 gene:ENSRNOG00000020955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081832 // GenBank // Rattus norvegicus myosin, light chain 3, alkali; ventricular, skeletal, slow, mRNA (cDNA clone MGC:93574 IMAGE:7192037), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ216255 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YM16 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ217222 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA32YB10 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118364865:118375841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001106863 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 42 (Prss42), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118404135:118409334:1 gene:ENSRNOG00000031971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118387771:118409227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT054102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109298 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 44 (Prss44), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000048655 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:118423196:118427024:1 gene:ENSRNOG00000030073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000051947 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:118423196:118436016:1 gene:ENSRNOG00000030073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC168977 // GenBank // Rattus norvegicus similar to testis specific serine proteinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:189314 IMAGE:7453880), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118423196:118456548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
GENSCAN00000011573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118423196:118456548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001008864 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 45 (Prss45), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118451036:118456674:1 gene:ENSRNOG00000029649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118423196:118456548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001008865 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 46 (Prss46), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118464794:118471679:1 gene:ENSRNOG00000020981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118464684:118479558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 71 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT054108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
XM_003750592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable threonine protease PRSS50-like (LOC100910205), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003754460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable threonine protease PRSS50-like (LOC100910205), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000056114 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:118473423:118479558:1 gene:ENSRNOG00000037175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118464684:118479558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
XM_001076120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ALS2 C-terminal like (Als2cl), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ALS2 C-terminal like (Als2cl), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ALS2 C-terminal like (Als2cl), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ALS2 C-terminal like (Als2cl), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ALS2 C-terminal like (Als2cl), transcript variant X9, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_236654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ALS2 C-terminal like (Als2cl), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118499106:118513205:1 gene:ENSRNOG00000033921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118499106:118513205:1 gene:ENSRNOG00000033921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118490041:118512827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_001076168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (RGD1564138), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118546174:118554502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_001012001 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 2 (Lrrc2), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006243926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 2 (Lrrc2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 2 (Lrrc2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118567954:118602409:1 gene:ENSRNOG00000030688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC085884 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:94665 IMAGE:7192145), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118575752:118628763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT054115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT054116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT054118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_006226590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1565653), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006226591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1565653), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1565653), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1565653), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_345990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1565653), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010249 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:118628407:118628763:1 gene:ENSRNOG00000007803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118575752:118628763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001106864 // RefSeq // Rattus norvegicus lactotransferrin (Ltf), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000047752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118632730:118655575:1 gene:ENSRNOG00000031779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118635360:118653573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001024761 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2 (Lrrfip2), mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000056060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118723098:118824560:1 gene:ENSRNOG00000021047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// BC097955 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:116078 IMAGE:7456701), complete cds. // chr8 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// FQ233539 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YH02 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2 (Lrrfip2), transcript variant X20, mRNA. // chr8 // 57 // 57 // 26 // 46 // 1 /// XM_006243953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 2 (Lrrfip2), transcript variant X23, mRNA. // chr8 // 57 // 57 // 26 // 46 // 1 /// GENSCAN00000022123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118742124:118824401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 98 // 87 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT054121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT054122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// NONRATT054123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1
NM_001191799 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat and ankyrin repeat containing 1 (Trank1), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118916156:118993803:1 gene:ENSRNOG00000021091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118980840:118993803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001191800 // RefSeq // Rattus norvegicus doublecortin-like kinase 3 (Dclk3), mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000044742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:119040830:119093605:1 gene:ENSRNOG00000033026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:119040830:119161626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT054130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT054131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_053722 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoplasmic linker associated protein 2 (Clasp2), mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// XM_006243908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytoplasmic linker associated protein 2 (Clasp2), transcript variant X14, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// XM_006243909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytoplasmic linker associated protein 2 (Clasp2), transcript variant X15, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// XM_006243914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytoplasmic linker associated protein 2 (Clasp2), transcript variant X20, mRNA. // chr8 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000012545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121390289:121499025:1 gene:ENSRNOG00000009161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121317447:121443060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 50 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121464012:121497422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT054135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0
NM_001191819 // RefSeq // Rattus norvegicus upstream binding protein 1 (LBP-1a) (Ubp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006243963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus upstream binding protein 1 (LBP-1a) (Ubp1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XR_356596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus upstream binding protein 1 (LBP-1a) (Ubp1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121510557:121553887:1 gene:ENSRNOG00000009729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000027279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121510553:121551834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT054140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT054142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT054141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001108807 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7B (Cops7b), mRNA. // chr8 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// XM_006245414 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7B (Cops7b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// XM_006245415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7B (Cops7b), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93335413:93361000:1 gene:ENSRNOG00000018723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029331 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:121594711:121595291:1 gene:ENSRNOG00000037135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93334830:93460021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121594813:121681222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_001076682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi domain containing 5 (Susd5), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_236674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi domain containing 5 (Susd5), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121644437:121681222:1 gene:ENSRNOG00000026951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121594813:121681222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_001108192 // RefSeq // Rattus norvegicus galactosidase, beta 1 (Glb1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121752182:121824793:1 gene:ENSRNOG00000010196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121755685:121823988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT054150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT054151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006244023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein with metallophosphoesterase domain-like (LOC102555172), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121755685:121823988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT054148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145772 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein cytoplasmic 1 light intermediate chain 1 (Dync1li1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:122055379:122088910:1 gene:ENSRNOG00000010434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF181992 // GenBank // Rattus norvegicus dynein light intermediate chain 1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:122055398:122088775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NONRATT054154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 1
NM_001007802 // RefSeq // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6 (Cmtm6), mRNA. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000014585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:122101557:122119645:1 gene:ENSRNOG00000010951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107930 // GenBank // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:124920 IMAGE:7130158), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:122101590:122116999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT054159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_243980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 10 (Osbpl10), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006244025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 10 (Osbpl10), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_243980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 10 (Osbpl10), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:122389491:122448833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 10 (Osbpl10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 10 (Osbpl10), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 10 (Osbpl10), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_243980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 10 (Osbpl10), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:122531508:122593466:1 gene:ENSRNOG00000011435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:122575841:122593466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT054161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT054163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
GENSCAN00000031800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:123019829:123037558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_001076997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate decarboxylase-like 1 (Gadl1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006226598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate decarboxylase-like 1 (Gadl1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate decarboxylase-like 1 (Gadl1), partial mRNA. // chr8 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000017696 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:123318257:123502481:1 gene:ENSRNOG00000013221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:123314365:123367185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_138833 // RefSeq // Rattus norvegicus SNF related kinase (Snrk), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000005422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129932817:129971319:1 gene:ENSRNOG00000004050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129960700:129970718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NM_212524 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 5 (Abhd5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 5 (Abhd5), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:130136517:130163114:1 gene:ENSRNOG00000000221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY550934 // GenBank // Rattus norvegicus CGI-58-like protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC127470 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132142), partial cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:130136488:130208694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 71 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT054314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001025705 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-azacytidine induced 2 (Azi2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:125653644:125677999:1 gene:ENSRNOG00000010096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098680 // GenBank // Rattus norvegicus 5-azacytidine induced 2, mRNA (cDNA clone MGC:112644 IMAGE:7384893), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ221679 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA33YB22 mRNA sequence. // chr8 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT054175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000027018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:125643308:125691650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT054176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001191080 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin A4 (Golga4), mRNA. // chr8 // 100 // 35 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015113 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:126493595:126791845:1 gene:ENSRNOG00000043167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:126393942:126483268:1 gene:ENSRNOG00000029910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 23 // 23 // 0 /// XM_006226655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha 9 (Itga9), mRNA. // chr8 // 39 // 39 // 27 // 69 // 1 /// GENSCAN00000051153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:126408945:126458753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 26 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT054180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000038897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:126493595:126610153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 22 // 22 // 15 // 69 // 1 /// GENSCAN00000038900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:126635206:126791845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 16 // 16 // 11 // 69 // 1 /// NONRATT054189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 14 // 14 // 10 // 69 // 1
NM_001106865 // RefSeq // Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase-like (Ctdspl), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:126933361:126939913:1 gene:ENSRNOG00000046257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT054180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:126920722:126958948:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT054197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NR_031830 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-26a (Mir26a), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053705 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:126931592:126931681:1 gene:ENSRNOG00000035582 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-26a // miRBase Micro RNA Database // MI0000857 Rattus norvegicus miR-26a stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191617 // RefSeq // Rattus norvegicus villin-like (Vill), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000015888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:126956703:126970430:1 gene:ENSRNOG00000011446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000006454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:126960327:126970351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// NONRATT054203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000038898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:126920722:126958948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// NONRATT054205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
ENSRNOT00000052275 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:126998530:127010322:1 gene:ENSRNOG00000032085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC079413 // GenBank // Rattus norvegicus deleted in lung and esophageal cancer 1 isoform DLEC1-N1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7113334), complete cds. // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// XM_006226610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deleted in lung and esophageal cancer 1 (Dlec1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:126998623:127044344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
ENSRNOT00000041352 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:127183390:127184328:1 gene:ENSRNOG00000030469 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127181389:127184328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT054210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012489 // RefSeq // Rattus norvegicus acetyl-CoA acyltransferase 1 (Acaa1a), mRNA. // chr8 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// BC089821 // GenBank // Rattus norvegicus acetyl-Coenzyme A acyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:108766 IMAGE:7122340), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// M32801 // GenBank // Rat 3-ketoacyl-CoA thiolase 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127234654:127242997:1 gene:ENSRNOG00000032908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// ENSRNOT00000055919 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:127234654:127242582:1 gene:ENSRNOG00000032908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1 /// FQ219270 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YH06 mRNA sequence. // chr8 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// NONRATT054213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001033704 // RefSeq // Rattus norvegicus xylulokinase homolog (H. influenzae) (Xylb), mRNA. // chr8 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// XR_356707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xylulokinase homolog (H. influenzae) (Xylb), transcript variant X5, misc_RNA. // chr8 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127250936:127283699:1 gene:ENSRNOG00000014168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC101852 // GenBank // Rattus norvegicus xylulokinase homolog (H. influenzae), mRNA (cDNA clone MGC:124790 IMAGE:7930657), complete cds. // chr8 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// NONRATT054217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000006426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127234749:127325468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// NONRATT054218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
NM_031554 // RefSeq // Rattus norvegicus activin A receptor, type IIB (Acvr2b), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000019777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127293865:127325514:1 gene:ENSRNOG00000014477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC097358 // GenBank // Rattus norvegicus activin A receptor, type IIB, mRNA (cDNA clone MGC:114390 IMAGE:7442221), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// L10640 // GenBank // Rat activin type IIB receptor (ActRIIB) mRNA, partial cds. // chr8 // 92 // 65 // 22 // 24 // 0 /// M87067 // GenBank // R.norvegicus activin type IIB receptor mRNA. // chr8 // 86 // 95 // 30 // 35 // 0 /// GENSCAN00000006426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127234749:127325468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT054221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001106866 // RefSeq // Rattus norvegicus endo/exonuclease (5-3), endonuclease G-like (Exog), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127340145:127359922:1 gene:ENSRNOG00000014801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127340188:127357138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135895 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 48 (Wdr48), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000024172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127778763:127811970:1 gene:ENSRNOG00000016942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000028473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127778938:127810224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT054232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1 /// NONRATT054231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT054233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
XM_003750604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 21A (Ttc21a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003754465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 21A (Ttc21a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000043831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127824200:127857313:1 gene:ENSRNOG00000034089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127825820:127857313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
XM_001077746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 8 (Ccr8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_236704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 8 (Ccr8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029766 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:127982292:127983353:1 gene:ENSRNOG00000026759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127971696:127983353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001030032 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 38 (Slc25a38), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006244089 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 38 (Slc25a38), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000025142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127991043:128003671:1 gene:ENSRNOG00000018552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC099762 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 38, mRNA (cDNA clone MGC:124671 IMAGE:7930329), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT054239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000005392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127991130:128003073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// NONRATT054240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NONRATT054243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0
NONRATT054243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT054243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_182844 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin VIIA and Rab interacting protein (Myrip), mRNA. // chr8 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// XM_006244112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin VIIA and Rab interacting protein (Myrip), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin VIIA and Rab interacting protein (Myrip), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128203900:128335868:1 gene:ENSRNOG00000018797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AY331984 // GenBank // Rattus norvegicus myosin VIIA and Rab interacting protein (Myrip) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:128203900:128370465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001106867 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1B (Eif1b), mRNA. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128356683:128359302:1 gene:ENSRNOG00000018848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC169125 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1B, mRNA (cDNA clone MGC:189571 IMAGE:6919533), complete cds. // chr8 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// FQ214080 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YA01 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// FQ232948 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YM17 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT054264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:128203900:128370465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT054265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_178106 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (Entpd3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006244097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (Entpd3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 3 (Entpd3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128400253:128430331:1 gene:ENSRNOG00000018982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:128398700:128429067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_022949 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L14 (Rpl14), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000063787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128438421:128441259:1 gene:ENSRNOG00000019007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC168728 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L14, mRNA (cDNA clone MGC:188811 IMAGE:6918710), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:128438317:128441259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// NONRATT054269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_053357 // RefSeq // Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), beta 1 (Ctnnb1), mRNA. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006244138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), beta 1 (Ctnnb1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128798559:128825828:1 gene:ENSRNOG00000019139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF121265 // GenBank // Rattus norvegicus beta-catenin mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ222424 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YK02 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:128798969:128856638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001134565 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein, kinesin binding 1 (Trak1), mRNA. // chr8 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// XM_006244099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein, kinesin binding 1 (Trak1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein, kinesin binding 1 (Trak1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein, kinesin binding 1 (Trak1), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein, kinesin binding 1 (Trak1), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129205675:129298643:1 gene:ENSRNOG00000019262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129219635:129296675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT054283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// NONRATT054287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// NONRATT054288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// NONRATT054289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001009437 // RefSeq // Rattus norvegicus protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 2 (beta 1,4-) (Pomgnt2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129791153:129792895:-1 gene:ENSRNOG00000019492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129791153:129792895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT056011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129744273:129745268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 88 // 5 // 7 // 0
NM_031241 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 8, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp8b1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129724334:129725833:-1 gene:ENSRNOG00000019481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// AB009686 // GenBank // Rattus norvegicus CYP8B mRNA for sterol 12alpha-hydroxylase P450, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB018596 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sterol 12-alpha hydroxylase, complete cds. // chr8 // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129724334:129725833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT056010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080902 // RefSeq // Rattus norvegicus HIG1 hypoxia inducible domain family, member 1A (Higd1a), mRNA. // chr8 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000064114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129660260:129669650:-1 gene:ENSRNOG00000019428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY062253 // GenBank // Rattus norvegicus putative hypoxia induced gene HIG1 mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 57 // 11 // 12 // 0 /// BC059118 // GenBank // Rattus norvegicus HIG1 domain family, member 1A, mRNA (cDNA clone MGC:72714 IMAGE:6890532), complete cds. // chr8 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT056007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// NONRATT056008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
XM_006226658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 13 (Ccdc13), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006244177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 13 (Ccdc13), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000055863 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:129634004:129642273:-1 gene:ENSRNOG00000025643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000075439 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:129616116:129648663:-1 gene:ENSRNOG00000025643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129602006:129653267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001106868 // RefSeq // Rattus norvegicus hedgehog acyltransferase-like (Hhatl), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006244090 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hedgehog acyltransferase-like (Hhatl), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129601907:129608906:-1 gene:ENSRNOG00000019404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129602006:129653267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT056005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT056002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT056003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NR_031885 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 138-1 (Mir138-1), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053764 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:130886768:130886866:1 gene:ENSRNOG00000035641 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:130872325:130887101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-138-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000912 Rattus norvegicus miR-138-1 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006226659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis and ovary specific PAZ domain containing 1 (Topaz1), mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006244206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis and ovary specific PAZ domain containing 1 (Topaz1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036545 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:130944810:130998644:1 gene:ENSRNOG00000025601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:130893063:130956150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001110838 // RefSeq // Rattus norvegicus T cell activation inhibitor, mitochondrial (Tcaim), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T cell activation inhibitor, mitochondrial (Tcaim), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244196 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T cell activation inhibitor, mitochondrial (Tcaim), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131000653:131031922:1 gene:ENSRNOG00000004085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ210480 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YP17 mRNA sequence. // chr8 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// FQ211645 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YK16 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ230528 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA92YG21 mRNA sequence. // chr8 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT054323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// NONRATT054324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// GENSCAN00000054423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:130971181:131032300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT054322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT054325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT054326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
GENSCAN00000054431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131057965:131058417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
NM_001170577 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 167 (Zfp167), mRNA. // chrU // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000043784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131088429:131105818:1 gene:ENSRNOG00000004104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// BC169026 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 167, mRNA (cDNA clone MGC:189403 IMAGE:9029490), complete cds. // chrU // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONRATT054327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001012128 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 105 (Zfp105), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131156987:131164782:1 gene:ENSRNOG00000032919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088185 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 105, mRNA (cDNA clone MGC:108847 IMAGE:7367875), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131157061:131165353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT054331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181635 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 15 (Kif15), mRNA. // chr8 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000035119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131187617:131258348:1 gene:ENSRNOG00000025407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY291580 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-like protein KIF15 mRNA, complete cds. // chr8 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// AY291581 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-like protein KIF15 mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131189165:131310289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0
NM_001191886 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 42 (Tmem42), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131260785:131263282:1 gene:ENSRNOG00000032027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT054335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_022713 // RefSeq // Rattus norvegicus transglutaminase 4 (Tgm4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// ENSRNOT00000055822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131275399:131311091:1 gene:ENSRNOG00000004320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// BC066665 // GenBank // Rattus norvegicus transglutaminase 4 (prostate), mRNA (cDNA clone MGC:72437 IMAGE:5623927), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// M32725 // GenBank // Rat dorsal protein 1 mRNA, 3 end. // chr8 // 97 // 80 // 64 // 66 // 0 /// GENSCAN00000054441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131189165:131310289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 69 // 69 // 0 /// M90310 // GenBank // Rat dorsal protein 1 (DP1) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 80 // 83 // 0 /// NONRATT054338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// NONRATT054340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 98 // 81 // 81 // 0 /// NONRATT054339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 35 // 83 // 1 /// NONRATT054341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 35 // 83 // 1 /// NONRATT054342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 37 // 83 // 1 /// NONRATT054343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 37 // 83 // 1 /// NONRATT054344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 23 // 83 // 1 /// NONRATT054347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 10 // 10 // 8 // 83 // 1
NM_001100725 // RefSeq // Rattus norvegicus exosome component 7 (Exosc7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131357731:131383561:1 gene:ENSRNOG00000004413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131357743:131400180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_003750609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetranectin-like (LOC100912012), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetranectin-like (LOC100912012), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006055 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:131394766:131400452:1 gene:ENSRNOG00000004540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131357743:131400180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ234406 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YB17 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT054350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001108787 // RefSeq // Rattus norvegicus leucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Lars2), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000068233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131594014:131689033:1 gene:ENSRNOG00000004760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131604107:131750110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT054353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001112737 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domains containing 1 (Limd1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131705918:131751522:1 gene:ENSRNOG00000004837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC168666 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domains containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188436 IMAGE:7933386), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131604107:131750110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT054358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_053798 // RefSeq // Rattus norvegicus SAC1 suppressor of actin mutations 1-like (yeast) (Sacm1l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000007223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131759866:131816202:1 gene:ENSRNOG00000005149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000000446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131759907:131811626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// AF251186 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositide phosphatase SAC1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT054359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT054360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT054361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// NONRATT054362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NM_172329 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 9 (Ccr9), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006244179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 9 (Ccr9), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000008269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131979177:131993257:1 gene:ENSRNOG00000006311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF458780 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine receptor CCR9 (Ccr9) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC091115 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 9, mRNA (cDNA clone MGC:108562 IMAGE:7381553), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131968084:131991876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT054363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000036238 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:132006102:132007462:1 gene:ENSRNOG00000026117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073086 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:132006102:132007456:1 gene:ENSRNOG00000026117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT054364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001102587 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) receptor 6 (Cxcr6), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:132020812:132021867:1 gene:ENSRNOG00000006319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ132631 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine receptor CXCR6 (Cxcr6) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132020812:132025159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT054365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053958 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 3 (Ccr3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 3 (Ccr3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:132189181:132190300:1 gene:ENSRNOG00000006736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT054366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENSRNOT00000020468 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:132186227:132187109:1 gene:ENSRNOG00000015252 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT054366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132183041:132187122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_021866 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 2 (Ccr2), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_001068983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4-like (LOC688963), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_002727088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4-like (LOC688963), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_053960 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 5 (Ccr5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000075564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:132349212:132366437:1 gene:ENSRNOG00000049115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// BC078756 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 5, mRNA (cDNA clone MGC:93260 IMAGE:7109679), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// Y12009 // GenBank // R.norvegicus mRNA for chemokine co-receptor CKR5. // chr8 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000002656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132343115:132366437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
XM_006226642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102553278), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006244215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102553278), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000063989 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:132437326:132437718:1 gene:ENSRNOG00000042372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT054368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
NM_001106798 // RefSeq // Rattus norvegicus aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase (Aasdhppt), mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:1433781:1444562:-1 gene:ENSRNOG00000005795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC098729 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7383240. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC166800 // GenBank // Rattus norvegicus aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase, mRNA (cDNA clone MGC:188599 IMAGE:7938259), complete cds. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006242473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase (Aasdhppt), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT054375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:1357709:1456927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT054372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001113184 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, AMPA 4 (Gria4), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NM_001113185 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, AMPA 4 (Gria4), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 56 // 25 // 25 // 0 /// NM_017263 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, AMPA 4 (Gria4), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000009542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:1542037:2069626:-1 gene:ENSRNOG00000006957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// BC093608 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, AMPA4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7318251), complete cds. // chr8 // 100 // 56 // 25 // 25 // 0 /// M36421 // GenBank // Rat glutamate receptor (GluR-D) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 71 // 31 // 32 // 0 /// M85037 // GenBank // Rat glutamate receptor subunit 4 (GLUR4) non-NMDA mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 78 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000047305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:1543002:1744549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT054379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT054380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 56 // 25 // 45 // 1
ENSRNOT00000009641 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:2113575:2114813:-1 gene:ENSRNOG00000007358 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT054381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0
XM_006226339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (LOC684822), mRNA. // chr8 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000040365 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:3290342:3290698:-1 gene:ENSRNOG00000033199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// GENSCAN00000022800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:3290342:3290683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// NONRATT054383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0
NM_001085475 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA-damage inducible 1 homolog 1 (S. cerevisiae) (Ddi1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:4561962:4563189:-1 gene:ENSRNOG00000022081 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// BC127531 // GenBank // Rattus norvegicus DDI1, DNA-damage inducible 1, homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156792 IMAGE:7131649), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4561962:4564513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_023024 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 (Dync2h1), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 85 // 88 // 0 /// ENSRNOT00000044174 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:5224356:5436622:-1 gene:ENSRNOG00000032070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 99 // 97 // 84 // 85 // 0 /// AB041881 // GenBank // Rattus norvegicus dnchc2 mRNA for cytoplasmic dynein heavy chain, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 85 // 88 // 0 /// XM_006242483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein cytoplasmic 2 heavy chain 1 (Dync2h1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 24 // 24 // 21 // 88 // 1 /// GENSCAN00000029061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5161964:5444747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 99 // 83 // 72 // 73 // 0 /// NONRATT054390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 9 // 9 // 8 // 88 // 1 /// NONRATT054391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 10 // 10 // 9 // 88 // 1
XM_006242513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 1b (interstitial collagenase) (Mmp1b), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:5626998:5634814:-1 gene:ENSRNOG00000008881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5161964:5444747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:5626998:5634844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000042838 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:5912975:5913891:-1 gene:ENSRNOG00000027743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 81 // 13 // 22 // 0
NM_021752 // RefSeq // Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 2 (Birc2), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 2 (Birc2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:6015753:6033822:-1 gene:ENSRNOG00000010602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF183431 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of apoptosis protein 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AF190020 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of apoptosis protein 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC062055 // GenBank // Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:72464 IMAGE:5598786), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6000907:6058145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT054395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_023987 // RefSeq // Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 3 (Birc3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006242500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 3 (Birc3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006242501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 3 (Birc3), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006242502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 3 (Birc3), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:6047455:6058253:-1 gene:ENSRNOG00000005731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF183430 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of apoptosis protein 1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC083555 // GenBank // Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:93416 IMAGE:7112819), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6000907:6058145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT054397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001034002 // RefSeq // Rattus norvegicus yes-associated protein 1 (Yap1), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:6138909:6202218:-1 gene:ENSRNOG00000005933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000008074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:6138909:6202218:-1 gene:ENSRNOG00000005933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000031189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:6138909:6202218:-1 gene:ENSRNOG00000005933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// DQ186896 // GenBank // Rattus norvegicus neuron-specific YAPdeltaC insert13 isoform (Yap) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// DQ186897 // GenBank // Rattus norvegicus neuron-specific YAPdeltaC insert25 isoform (Yap) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// DQ186898 // GenBank // Rattus norvegicus neuron-specific YAPdeltaC insert61 isoform (Yap) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// DQ376007 // GenBank // Rattus norvegicus yes-associated protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6135656:6171400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT054400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_001039174 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC654482 (LOC654482), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC654482 (LOC654482), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC654482 (LOC654482), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068290 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:6217032:6234606:-1 gene:ENSRNOG00000043410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6213399:6303198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
XM_006226292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006226295 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006226296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006226300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X9, mRNA. // chr8 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// XM_006242504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242508 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XR_348318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X10, misc_RNA. // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XR_356061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1377 protein (RGD1563556), transcript variant X10, misc_RNA. // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000029887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:6254657:6302976:-1 gene:ENSRNOG00000021839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6213399:6303198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000013950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:6311530:6311898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
XM_001073215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 42 (Arhgap42), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006226301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 42 (Arhgap42), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_576354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 42 (Arhgap42), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000031492 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:7198985:7426476:-1 gene:ENSRNOG00000026821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000041555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:7197938:7276581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT054411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1
XM_001073215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 42 (Arhgap42), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_576354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 42 (Arhgap42), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009167 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:7327372:7426476:-1 gene:ENSRNOG00000026821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031492 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:7198985:7426476:-1 gene:ENSRNOG00000026821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006226301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 42 (Arhgap42), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT054413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:7306165:7396994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_053746 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin 5 (Cntn5), mRNA. // chr8 // 98 // 97 // 56 // 57 // 0 /// ENSRNOT00000009418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:7793982:8501166:-1 gene:ENSRNOG00000007038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 97 // 55 // 57 // 0 /// D87212 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NB-2, complete cds. // chr8 // 98 // 97 // 56 // 57 // 0 /// GENSCAN00000014937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:8056173:8162020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 21 // 59 // 1 /// GENSCAN00000014941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:8251657:8313234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 17 // 17 // 10 // 59 // 1 /// GENSCAN00000036596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:7739837:7876654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 17 // 17 // 10 // 59 // 1 /// GENSCAN00000036598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:7902055:7972247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 17 // 17 // 10 // 59 // 1
GENSCAN00000036598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:7902055:7972247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
GENSCAN00000014937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:8056173:8162020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
GENSCAN00000027035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:9009632:9159204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
ENSRNOT00000061711 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:9192267:9193094:-1 gene:ENSRNOG00000040124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108122 // RefSeq // Rattus norvegicus jerky-like (Jrkl), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:11843756:11845330:-1 gene:ENSRNOG00000047133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108124 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 57 (Cep57), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006242523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 57 (Cep57), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:12285708:12305367:-1 gene:ENSRNOG00000006792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC079415 // GenBank // Rattus norvegicus centrosomal protein 57, mRNA (cDNA clone IMAGE:7113445). // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC168198 // GenBank // Rattus norvegicus centrosomal protein 57kDa, mRNA (cDNA clone MGC:188037 IMAGE:7113061), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12286152:12305214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT054433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT054434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
FQ213676 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YG24 mRNA sequence. // chr8 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT054437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:12846527:12873120:-1 gene:ENSRNOG00000024757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12846527:12873120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT054437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001079712 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 4D (Kdm4d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:12913539:12939399:-1 gene:ENSRNOG00000024726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13454692:13456224:-1 gene:ENSRNOG00000045905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC128760 // GenBank // Rattus norvegicus similar to jumonji domain containing 2D, mRNA (cDNA clone MGC:156756 IMAGE:7112650), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12913991:12915523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000020665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13454692:13456224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT054440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiomotin-like 1 (Amotl1), mRNA. // chr8 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiomotin-like 1 (Amotl1), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061616 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:12987687:13029539:-1 gene:ENSRNOG00000008990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12996230:13100149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:12984684:12995685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001271133 // RefSeq // Rattus norvegicus piwi-like RNA-mediated gene silencing 4 (Piwil4), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049724 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:13150650:13192599:-1 gene:ENSRNOG00000009043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13151257:13192806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_022219 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosyltransferase 4 (alpha (1,3) fucosyltransferase, myeloid-specific) (Fut4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13201865:13203166:-1 gene:ENSRNOG00000009157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AB049938 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for alpha1,3-fucosyltransferase, complete cds. // chr8 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// BC061776 // GenBank // Rattus norvegicus fucosyltransferase 4 (alpha (1,3) fucosyltransferase, myeloid-specific), mRNA (cDNA clone MGC:72456 IMAGE:5621698), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT054448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13201865:13211428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001109289 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700012B09 (RGD1561795), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13215950:13231433:-1 gene:ENSRNOG00000009203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001126283 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 49 (Ankrd49), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13240207:13244890:-1 gene:ENSRNOG00000009233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC161982 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 49, mRNA (cDNA clone MGC:187797 IMAGE:9030206), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13241504:13243208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT054452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
XM_001072998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus folate receptor 4 (delta) (Folr4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// XM_002726986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus folate receptor 4 (delta) (Folr4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT054454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001270548 // RefSeq // Rattus norvegicus Pannexin 1 (Panx1), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_199397 // RefSeq // Rattus norvegicus Pannexin 1 (Panx1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13507955:13547151:-1 gene:ENSRNOG00000010060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ557015 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Pannexin 1 (px1 gene). // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GQ499839 // GenBank // Rattus norvegicus pannexin 1c mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GQ499840 // GenBank // Rattus norvegicus pannexin 1d mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// NM_001270549 // RefSeq // Rattus norvegicus Pannexin 1 (Panx1), transcript variant 4, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// NONRATT054454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13503067:13595233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001191993 // RefSeq // Rattus norvegicus hephaestin-like 1 (Hephl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000043669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13555911:13622279:-1 gene:ENSRNOG00000022515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000039160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13503067:13595233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT054454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NONRATT054454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1
NM_001106801 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 17 (Med17), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13759090:13774832:-1 gene:ENSRNOG00000010496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC083809 // GenBank // Rattus norvegicus cofactor required for Sp1 transcriptional activation, subunit 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:7109944). // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13759027:13776422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001014206 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931406C07 (RGD1309534), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13778080:13800657:-1 gene:ENSRNOG00000010887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085915 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931406C07, mRNA (cDNA clone MGC:94800 IMAGE:7107444), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13779431:13846009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT054462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001271048 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to KIAA1731 protein (RGD1311723), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029634 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:13810931:13846024:-1 gene:ENSRNOG00000010999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13779431:13846009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT054463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001014087 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 67 (Ccdc67), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006242554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 67 (Ccdc67), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 67 (Ccdc67), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:14190848:14252439:-1 gene:ENSRNOG00000011172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085333 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 67, mRNA (cDNA clone MGC:105854 IMAGE:7114511), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:14161878:14272183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT054473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT054475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001100641 // RefSeq // Rattus norvegicus melatonin receptor 1B (Mtnr1b), mRNA. // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000011883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:14446990:14461614:-1 gene:ENSRNOG00000008972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// AB377275 // GenBank // Rattus norvegicus Mtnr1b mRNA for melatonin receptor 1b, complete cds. // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:14449966:14461499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_138544 // RefSeq // Rattus norvegicus FAT atypical cadherin 3 (Fat3), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:14504021:14593187:-1 gene:ENSRNOG00000011585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AB076401 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for fat3, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:14504562:14629368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001047964 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00073 (LOC500948), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:16353646:16421352:-1 gene:ENSRNOG00000031660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT054478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 67 // 96 // 16 // 24 // 0
XM_003754371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase 2A-like (LOC690235), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000033223 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:16558602:16560110:-1 gene:ENSRNOG00000024200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:16507639:16591897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_001106802 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2 (Naalad2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000007855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:17527491:17599206:-1 gene:ENSRNOG00000005955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC168965 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7111574), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:17527902:17593649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT054484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT054485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XM_001075066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus upstream-binding factor 1-like protein 1-like (RGD1304745), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_001075304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus upstream binding transcription factor, RNA polymerase I-like 1 (Ubtfl1), mRNA. // chrU // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006242570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus upstream-binding factor 1-like protein 1-like (RGD1304745), mRNA. // chrU // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:17611870:17634474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 78 // 24 // 25 // 0
NONRATT052775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006242569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho GTPase-activating protein 20-like (LOC102555809), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NONRATT039965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 100 // 9 // 34 // 0
NM_001000885 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1115 (Olr1115), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:17847629:17848567:-1 gene:ENSRNOG00000050583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000884 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1117 (Olr1117), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000049758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:17908500:17909438:-1 gene:ENSRNOG00000049455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:17908500:17909351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT054488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000883 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1118 (Olr1118), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:17935048:17936013:-1 gene:ENSRNOG00000030856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000988 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1119 (Olr1119), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18184535:18185482:-1 gene:ENSRNOG00000034283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000040032 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:18467942:18475086:-1 gene:ENSRNOG00000039933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
XM_003754373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 16, cell surface associated (Muc16), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_235886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 16, cell surface associated (Muc16), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:18527694:18781565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_003754373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 16, cell surface associated (Muc16), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// XM_235886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 16, cell surface associated (Muc16), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:18527694:18781565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000516 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1121 (Olr1121), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18786219:18787160:-1 gene:ENSRNOG00000006428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:18786219:18787160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000882 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1122 (Olr1122), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18828765:18829703:-1 gene:ENSRNOG00000006439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000880 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1126 (Olr1126), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18978175:18979113:-1 gene:ENSRNOG00000030845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000879 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1129 (Olr1129), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000061326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19061175:19062137:1 gene:ENSRNOG00000039922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT052782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000428 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1130 (Olr1130), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19037754:19038692:1 gene:ENSRNOG00000050565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19038105:19239100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001000986 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1132 (Olr1132), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000061323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19087686:19088654:-1 gene:ENSRNOG00000039919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT054497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001000878 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1135 (Olr1135), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18035707:18036645:-1 gene:ENSRNOG00000045969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19149816:19150754:-1 gene:ENSRNOG00000049064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001079 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1137 (Olr1137), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19222179:19223108:-1 gene:ENSRNOG00000047576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18108072:18109001:-1 gene:ENSRNOG00000048946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001001080 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1138 (Olr1138), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19235513:19236454:-1 gene:ENSRNOG00000050182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18121414:18122355:-1 gene:ENSRNOG00000050764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000427 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1139 (Olr1139), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000035560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19247323:19248297:-1 gene:ENSRNOG00000048018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000045739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:18133224:18134198:-1 gene:ENSRNOG00000045903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:18133224:18213968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19247323:19311965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000072278 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:18166188:18167122:-1 gene:ENSRNOG00000049680 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000074246 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:19281256:19282190:-1 gene:ENSRNOG00000049300 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000876 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1144 (Olr1144), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19400511:19401449:-1 gene:ENSRNOG00000032512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000429 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1145 (Olr1145), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19453950:19454867:-1 gene:ENSRNOG00000050124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19453950:19467955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000431 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1147 (Olr1147), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19592859:19593797:-1 gene:ENSRNOG00000006577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19592859:19593797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000874 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1149 (Olr1149), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT054501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000040848 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:19654354:19929412:-1 gene:ENSRNOG00000030753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0
NM_001000432 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1151 (Olr1151), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19740486:19741403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000026250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:19780796:19820164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001000433 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1155 (Olr1155), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT054503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000872 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1158 (Olr1158), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:19994809:19995750:-1 gene:ENSRNOG00000026232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000869 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1163 (Olr1163), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20245474:20246412:-1 gene:ENSRNOG00000030569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001005 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1171 (Olr1171), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000073018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:20471168:20555176:-1 gene:ENSRNOG00000046003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 89 // 5 // 8 // 0 /// NONRATT054506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001000983 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1172 (Olr1172), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000865 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1177 (Olr1177), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_002727007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 873 (Olfr873), partial mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// XM_002729880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 873 (Olfr873), partial mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000071833 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:21066283:21067200:-1 gene:ENSRNOG00000046516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
XM_006242581 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor, family 7, subfamily E, member 24 (Or7e24), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067321 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:21207914:21278764:-1 gene:ENSRNOG00000046041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 92 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21277832:21363428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001000594 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1193 (Olr1193), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21367597:21368559:1 gene:ENSRNOG00000028864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21367597:21368559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000071010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21444670:21453959:-1 gene:ENSRNOG00000048394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ211567 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YE04 mRNA sequence. // chr8 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21411137:21473615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT054510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001108995 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 26 (Zfp26), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 26 (Zfp26), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 26 (Zfp26), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21503262:21515604:-1 gene:ENSRNOG00000025937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166711 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 26, mRNA (cDNA clone MGC:188409 IMAGE:7930337), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001079943 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 426 (Zfp426), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006242666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 426 (Zfp426), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 426 (Zfp426), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 426 (Zfp426), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 426 (Zfp426), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21534980:21550452:-1 gene:ENSRNOG00000033624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC129125 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 426, mRNA (cDNA clone MGC:156802 IMAGE:7133611), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000018670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21530149:21580886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT054521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001135018 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 266 (Zfp266), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21569186:21580886:-1 gene:ENSRNOG00000034037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079105 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 426-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7125187), partial cds. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT054525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21530149:21580886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001025700 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 12 (Fbxl12), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 12 (Fbxl12), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000068308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21712700:21717320:-1 gene:ENSRNOG00000020368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098684 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 12, mRNA (cDNA clone MGC:112648 IMAGE:7385284), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21713311:21717119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT054528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001015017 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactomedin 2 (Olfm2), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006242641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactomedin 2 (Olfm2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006242642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactomedin 2 (Olfm2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006242643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactomedin 2 (Olfm2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21740369:21799373:-1 gene:ENSRNOG00000020519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC092647 // GenBank // Rattus norvegicus olfactomedin 2, mRNA (cDNA clone MGC:109424 IMAGE:7319232), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21740774:21799218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_021760 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type V, alpha 3 (Col5a3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000027897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21842413:21887757:-1 gene:ENSRNOG00000020525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// AF272661 // GenBank // Rattus norvegicus alpha 4 type V collagen mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000018696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21843196:21887702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 98 // 85 // 56 // 57 // 0 /// NONRATT054534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0
NM_001106702 // RefSeq // Rattus norvegicus angiopoietin-like 6 (Angptl6), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006242618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiopoietin-like 6 (Angptl6), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21951839:21958144:-1 gene:ENSRNOG00000020603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166828 // GenBank // Rattus norvegicus angiopoietin-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:188711 IMAGE:8373153), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21951916:21957014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001013095 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit G (Eif3g), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21967952:21971979:-1 gene:ENSRNOG00000020619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086383 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit G, mRNA (cDNA clone MGC:105936 IMAGE:7301572), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ213005 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YE03 mRNA sequence. // chr8 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21968228:21976327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053354 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 1 (Dnmt1), mRNA. // chr8 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000064304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21978830:22024656:-1 gene:ENSRNOG00000039859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21978830:22024656:-1 gene:ENSRNOG00000039859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000064978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21978830:22024656:-1 gene:ENSRNOG00000039859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000067325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:21978830:22024656:-1 gene:ENSRNOG00000039859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21979801:21991735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:21993514:22024576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0
ENSRNOT00000061186 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:22031623:22036121:-1 gene:ENSRNOG00000039857 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22031602:22033156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_017192 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate receptor 2 (S1pr2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22041267:22052351:-1 gene:ENSRNOG00000020653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB016931 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for AGR16, complete cds. // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// U10699 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein coupled receptor pH218 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22040160:22052603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006226312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, GATA-like protein 1 (Zglp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, GATA-like protein 1 (Zglp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068598 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:22138372:22142767:-1 gene:ENSRNOG00000042601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22139018:22142767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001108002 // RefSeq // Rattus norvegicus ferredoxin 1-like (Fdx1l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22143206:22148122:-1 gene:ENSRNOG00000023020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22143435:22148105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001013939 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonucleoprotein, PTB-binding 1 (Raver1), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22148766:22168037:-1 gene:ENSRNOG00000020710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC083865 // GenBank // Rattus norvegicus ribonucleoprotein, PTB-binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:95117 IMAGE:7127766), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22149948:22168021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001257347 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine kinase 2 (Tyk2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XR_356113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosine kinase 2 (Tyk2), transcript variant X6, misc_RNA. // chr8 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000041678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22180760:22201861:-1 gene:ENSRNOG00000032948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000042684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22181734:22201849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT054558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 59 // 59 // 27 // 46 // 1 /// NONRATT054561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONRATT054565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 13 // 46 // 1 /// NONRATT054557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NM_053743 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 37 (Cdc37), mRNA. // chr8 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22217096:22229971:-1 gene:ENSRNOG00000033426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB097113 // GenBank // Rattus norvegicus Cdc37 mRNA for kinase-associated HSP90 co-chaperone, complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC061720 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 37 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72349 IMAGE:5598479), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D26564 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA, complete cds, similar to cdc37. // chr8 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22217473:22230040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT054568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_057152 // RefSeq // Rattus norvegicus Kelch-like ECH-associated protein 1 (Keap1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22306484:22313655:-1 gene:ENSRNOG00000020878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF304364 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic inhibitor of Nrf2 (INrf2) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22306741:22313514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_021775 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate receptor 5 (S1pr5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22323891:22328878:-1 gene:ENSRNOG00000020901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF115249 // GenBank // Rattus norvegicus growth factor-regulated G protein-coupled receptor Nrg-1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF233649 // GenBank // Rattus norvegicus sphingosine 1-phosphate receptor Edg-8 (Edg-8) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// FQ214303 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YI06 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22324624:22337365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT054574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013432 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 1 (Tmed1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22594535:22597120:-1 gene:ENSRNOG00000008037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091167 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:108769 IMAGE:7324543), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ223034 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YC16 mRNA sequence. // chr8 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22595176:22597100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT054578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014208 // RefSeq // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 2 (Yipf2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22675736:22679913:-1 gene:ENSRNOG00000022043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083587 // GenBank // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:94285 IMAGE:7131986), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ234363 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YD24 mRNA sequence. // chr8 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22676689:22679661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT054583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT054580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_003750448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPC24, NDC80 kinetochore complex component (Spc24), mRNA. // chr8 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// XM_003754376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPC24, NDC80 kinetochore complex component (Spc24), mRNA. // chr8 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045384 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:22834762:22839400:-1 gene:ENSRNOG00000029862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 77 // 14 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22835702:22839400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT054587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT054589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001270413 // RefSeq // Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 2 (Kank2), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014135 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:22848264:22872959:-1 gene:ENSRNOG00000010643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045488 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:22853934:22872959:-1 gene:ENSRNOG00000010643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 47 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22840653:22872959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT054591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT054592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// NONRATT054590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001108997 // RefSeq // Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// XM_006242660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 6 (Dock6), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000064551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22876566:22928936:-1 gene:ENSRNOG00000010652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000046760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22877106:22928907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT054597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 12 // 50 // 1
NM_080580 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB3D, member RAS oncogene family (Rab3d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB3D, member RAS oncogene family (Rab3d), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22975024:22984052:-1 gene:ENSRNOG00000011582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC081741 // GenBank // Rattus norvegicus RAB3D, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:93243 IMAGE:7110109), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// M83681 // GenBank // Sprague-Dawley (clone LRB2) RAB16 mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 69 // 18 // 20 // 0 /// U90206 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein rab3d (rab3d) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 69 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22976457:22981893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT054603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001106804 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 205 (Tmem205), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 205 (Tmem205), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:22986957:22992693:-1 gene:ENSRNOG00000011747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:22986996:22991543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017002 // RefSeq // Rattus norvegicus erythropoietin receptor (Epor), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus erythropoietin receptor (Epor), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23024529:23029105:-1 gene:ENSRNOG00000012619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC089810 // GenBank // Rattus norvegicus erythropoietin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:108723 IMAGE:7375416), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// D13566 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for erythropoietin receptor, complete cds. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// D83509 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for intron 5-inserted form of erythropoietin receptor, complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23024691:23029023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT054609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT054611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001106805 // RefSeq // Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3 (Rgl3), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006242630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 3 (Rgl3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23035692:23055269:-1 gene:ENSRNOG00000013027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23036038:23055359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
XM_006226322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 151 (Ccdc151), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 151 (Ccdc151), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23055948:23069138:-1 gene:ENSRNOG00000013263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23055948:23064924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_172324 // RefSeq // Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 3 (Elavl3), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23085036:23117799:-1 gene:ENSRNOG00000013752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB097198 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for HuC, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23085494:23103409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT054619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001106807 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 653 (Zfp653), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23121360:23139663:-1 gene:ENSRNOG00000014065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23121663:23139659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001006986 // RefSeq // Rattus norvegicus ECSIT signalling integrator (Ecsit), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23140382:23153830:-1 gene:ENSRNOG00000014128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083762 // GenBank // Rattus norvegicus ECSIT homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94704 IMAGE:7193076), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ212584 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YI10 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23140456:23148056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT054624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_006242676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongation factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Elof1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NM_001126098 // RefSeq // Rattus norvegicus elongation factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Elof1), mRNA. // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XM_006242675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongation factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Elof1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000019140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23180772:23185661:-1 gene:ENSRNOG00000014284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT054627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT054628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23181311:23199728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006226330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG31861-like (LOC100361503), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG31861-like (LOC100361503), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23288429:23364018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT054630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT054631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000019204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23330592:23337875:-1 gene:ENSRNOG00000014331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_006222448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anillin, actin binding protein-like 1 (Anlnl1), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// XM_006242714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anillin, actin binding protein (Anln), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000024361 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:68294574:68297703:1 gene:ENSRNOG00000018113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 98 // 91 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000019601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23389798:23442950:-1 gene:ENSRNOG00000014343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000071846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23389798:23442950:-1 gene:ENSRNOG00000014343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000052578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:68294634:68297703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000054251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23375151:23442167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226779690:226783929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1 /// NONRATT054638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 40 // 40 // 18 // 45 // 1
NM_001108756 // RefSeq // Rattus norvegicus retinitis pigmentosa 9 (human) (Rp9), mRNA. // chr8 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000065367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23502288:23522452:-1 gene:ENSRNOG00000029456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23511610:23547864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191791 // RefSeq // Rattus norvegicus dpy-19-like 1 (C. elegans) (Dpy19l1), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000036738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:25615337:25700570:-1 gene:ENSRNOG00000026589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000019118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:25665891:25700148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT054645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000019131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:25623083:25661068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 23 // 43 // 1
XM_006226346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 2 (C. elegans) (Dpy19l2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 2 (C. elegans) (Dpy19l2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:25742615:25859551:-1 gene:ENSRNOG00000045585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:25714930:25859551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0
NM_001108132 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 20 (Tbx20), mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 20 (Tbx20), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:25894567:25934681:-1 gene:ENSRNOG00000016181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:25881138:25886361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:25909006:25951294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001024988 // RefSeq // Rattus norvegicus HERPUD family member 2 (Herpud2), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:26290107:26335056:-1 gene:ENSRNOG00000029995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC081861 // GenBank // Rattus norvegicus HERPUD family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:93672 IMAGE:7134757), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT054653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT054655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001033072 // RefSeq // Rattus norvegicus triosephosphate isomerase (LOC500959), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY461585 // GenBank // Rattus norvegicus triosephosphate isomerase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000041892 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:26363810:26364559:-1 gene:ENSRNOG00000031706 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:26363810:26364559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT054657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XR_348373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553658 (LOC102553658), ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XR_356138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553658 (LOC102553658), ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001192018 // RefSeq // Rattus norvegicus galactosidase, beta 1-like 2 (Glb1l2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000037790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:27827460:27872964:-1 gene:ENSRNOG00000007561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000029784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:27824564:27872964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT054661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001024358 // RefSeq // Rattus norvegicus galactosidase, beta 1-like 3 (Glb1l3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000010045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:27885459:27927733:-1 gene:ENSRNOG00000031469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC083665 // GenBank // Rattus norvegicus galactosidase, beta 1-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:94507 IMAGE:7135489), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000029792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:27885738:27926970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT054662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
ENSRNOT00000054317 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:27953310:27953407:-1 gene:ENSRNOG00000036194 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001009524 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-galactosidase-like protein (Bin2a), mRNA. // chr8 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000037757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:27955137:27994017:-1 gene:ENSRNOG00000032461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF299297 // GenBank // Rattus norvegicus beta-galactosidase-like protein isoform 1 mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// AF299298 // GenBank // Rattus norvegicus beta-galactosidase-like protein isoform 2 mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// AF414431 // GenBank // Rattus norvegicus Bin2a isomer mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// AY040870 // GenBank // Rattus norvegicus beta-galactosidase-like protein mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000029793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:27955982:27986119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001004269 // RefSeq // Rattus norvegicus junctional adhesion molecule 3 (Jam3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:28166276:28227631:-1 gene:ENSRNOG00000009149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079429 // GenBank // Rattus norvegicus junctional adhesion molecule 3, mRNA (cDNA clone MGC:94974 IMAGE:7114667), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:28167207:28227614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_017354 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrimin (Ntm), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_006242748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurotrimin (Ntm), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000035454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:30074875:30510958:-1 gene:ENSRNOG00000023720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// FQ231395 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YK11 mRNA sequence. // chr8 // 82 // 71 // 14 // 17 // 0 /// U16845 // GenBank // Rattus norvegicus neurotrimin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:30070678:30104131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001106810 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 15 (Adamts15), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32003564:32026941:-1 gene:ENSRNOG00000009892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32006454:32026620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_053635 // RefSeq // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 14 (colon carcinoma) (St14), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000009139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32266159:32305925:-1 gene:ENSRNOG00000005903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB037898 // GenBank // Rattus norvegicus MBSP mRNA for membrane bound serine protease, complete cds. // chr8 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// AB049189 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for membrane bound arginine specific serine protease, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC097271 // GenBank // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 14 (colon carcinoma), mRNA (cDNA clone MGC:114245 IMAGE:7445508), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000003775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32246496:32312092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT054676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NONRATT054678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001033067 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 45b (Tmem45b), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32588674:32633861:-1 gene:ENSRNOG00000008515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100635 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 45b, mRNA (cDNA clone MGC:124767 IMAGE:5621332), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32591063:32603095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT054679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000060581 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:32713240:32714153:-1 gene:ENSRNOG00000039521 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32664809:32714222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
XM_003750457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BARX homeobox 2 (Barx2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BARX homeobox 2 (Barx2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:32974173:33040278:-1 gene:ENSRNOG00000008592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32883980:32987079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001245924 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00010-like (LOC100362981), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000047211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33124968:33141259:-1 gene:ENSRNOG00000034226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33107662:33140720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_002727020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L35-like (LOC367050), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_345916 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L35-like (LOC367050), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33361498:33363220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
NM_017297 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 5 (Kcnj5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 101 // 101 // 0 /// ENSRNOT00000041038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33325087:33510036:-1 gene:ENSRNOG00000033796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 101 // 101 // 0 /// BC087022 // GenBank // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:93525 IMAGE:7192366), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 101 // 101 // 0 /// D50135 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for inward rectifying K channel, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 97 // 101 // 0 /// L35771 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 100 // 99 // 101 // 0 /// GENSCAN00000044346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33489316:33498962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 35 // 31 // 35 // 0 /// NONRATT054685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 101 // 101 // 0 /// GENSCAN00000036841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33414817:33489057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 35 // 35 // 35 // 101 // 1
NM_001017381 // RefSeq // Rattus norvegicus Fli-1 proto-oncogene, ETS transcription factor (Fli1), mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// XM_006242763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fli-1 proto-oncogene, ETS transcription factor (Fli1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// XM_006242765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fli-1 proto-oncogene, ETS transcription factor (Fli1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// XM_006242766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fli-1 proto-oncogene, ETS transcription factor (Fli1), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:33587488:33703195:-1 gene:ENSRNOG00000008904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// AY972521 // GenBank // Rattus norvegicus Friend leukemia integration 1 (Fli1) mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// XM_006242780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Friend leukemia integration 1 transcription factor-like (LOC100910769), partial mRNA. // chr8 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000011812 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:33467682:33483486:-1 gene:ENSRNOG00000050980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 82 // 33 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000044368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33587685:33645214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 70 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT054686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000036841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:33414817:33489057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_203337 // RefSeq // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4 (St3gal4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36283787:36333597:-1 gene:ENSRNOG00000009850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC089057 // GenBank // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 4, mRNA (cDNA clone MGC:105257 IMAGE:7315905), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ226042 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YD19 mRNA sequence. // chr8 // 80 // 30 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000025323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36284608:36317659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT054692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT054689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_153302 // RefSeq // Rattus norvegicus decapping enzyme, scavenger (Dcps), mRNA. // chr8 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36340779:36393331:-1 gene:ENSRNOG00000009993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AF411249 // GenBank // Rattus norvegicus histidine triad protein member 5 (Hint5) mRNA, complete cds. // chr8 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// BC089773 // GenBank // Rattus norvegicus decapping enzyme, scavenger, mRNA (cDNA clone IMAGE:7382111), partial cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC105900 // GenBank // Rattus norvegicus decapping enzyme, scavenger, mRNA (cDNA clone MGC:124934 IMAGE:7377732), complete cds. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36340972:36393323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT054695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT054694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_001055833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain-containing adaptor protein (Tirap), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_002727021 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain-containing adaptor protein (Tirap), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006226363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain-containing adaptor protein (Tirap), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain-containing adaptor protein (Tirap), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_348402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain-containing adaptor protein (Tirap), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XR_356166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-interleukin 1 receptor (TIR) domain-containing adaptor protein (Tirap), transcript variant X3, misc_RNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038312 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:36396804:36406884:-1 gene:ENSRNOG00000021420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000025314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36404437:36416593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000013984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36423198:36428627:-1 gene:ENSRNOG00000010372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000037521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36421216:36428580:-1 gene:ENSRNOG00000010372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC089114 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7320023, with apparent retained intron. // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000025320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36421875:36428580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT054698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// NONRATT054700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT054701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT054702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT054703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT054704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001025283 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 118, member B (Fam118b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 118, member B (Fam118b), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36435180:36456913:-1 gene:ENSRNOG00000011543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098017 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 118, member B, mRNA (cDNA clone MGC:116168 IMAGE:7454942), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ216651 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YM03 mRNA sequence. // chr8 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36436873:36456905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_031630 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 25 (Ddx25), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36761173:36777206:-1 gene:ENSRNOG00000012260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF142629 // GenBank // Rattus norvegicus gonadotropin-regulated testicular RNA helicase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC078791 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 25, mRNA (cDNA clone MGC:93350 IMAGE:7112991), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36761313:36780869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT054711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT054712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
XM_002727022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrolethalus syndrome 1 (Hyls1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_002727023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrolethalus syndrome 1 (Hyls1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_002729924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrolethalus syndrome 1 (Hyls1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_002729925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrolethalus syndrome 1 (Hyls1), transcript variant 3, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36779967:36780908:-1 gene:ENSRNOG00000012980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT054711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108757 // RefSeq // Rattus norvegicus prostate and testis expressed 4 (Pate4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36832267:36835007:-1 gene:ENSRNOG00000039447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:36788395:36834984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001270389 // RefSeq // Rattus norvegicus prostate and testis expressed 1 (Pate1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:36891542:36893773:-1 gene:ENSRNOG00000049600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// JF412808 // GenBank // Rattus norvegicus prostate and testis expressed protein (Pate) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000060446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:37038199:37039978:-1 gene:ENSRNOG00000039445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// HQ687475 // GenBank // Rattus norvegicus prostate and testis expressed C mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:37028629:37107108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001270387 // RefSeq // Rattus norvegicus prostate and testis expressed family member-like (LOC100362078), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:37080129:37085280:-1 gene:ENSRNOG00000024026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// JF412804 // GenBank // Rattus norvegicus prostate and testis expressed protein A (Pate-A) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:37028629:37107108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000040783 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:37139752:37140835:-1 gene:ENSRNOG00000030188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:37139746:37224104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000060443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:37222493:37224104:-1 gene:ENSRNOG00000048885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// JF412807 // GenBank // Rattus norvegicus prostate and testis expressed protein Q (Pate-Q) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:37139746:37224104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
ENSRNOT00000030776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:37362110:37363720:-1 gene:ENSRNOG00000046322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// JQ031758 // GenBank // Rattus norvegicus prostate and testis expressed protein P mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:37362110:37363720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_080400 // RefSeq // Rattus norvegicus checkpoint kinase 1 (Chek1), mRNA. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39184021:39204447:-1 gene:ENSRNOG00000008181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF414135 // GenBank // Rattus norvegicus checkpoint kinase 1 (Chk1) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// AF414136 // GenBank // Rattus norvegicus checkpoint kinase isoform (Cil) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 58 // 19 // 21 // 0 /// AF443592 // GenBank // Rattus norvegicus cell cycle checkpoint protein kinase mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT054726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39184883:39273434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// NONRATT054727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT054728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
ENSRNOT00000052735 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:39199547:39199665:-1 gene:ENSRNOG00000034612 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001134749 // RefSeq // Rattus norvegicus STT3A, subunit of the oligosaccharyltransferase complex (catalytic) (Stt3a), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000043518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39207076:39246422:-1 gene:ENSRNOG00000031896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC168223 // GenBank // Rattus norvegicus STT3, subunit of the oligosaccharyltransferase complex, homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188229 IMAGE:7324965), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000022628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39184883:39273434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1
NM_001025660 // RefSeq // Rattus norvegicus etoposide induced 2.4 (Ei24), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000046590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39257606:39269673:-1 gene:ENSRNOG00000030391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// BC098721 // GenBank // Rattus norvegicus etoposide induced 2.4 mRNA, mRNA (cDNA clone MGC:112713 IMAGE:7370909), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// GENSCAN00000022628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39184883:39273434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
GENSCAN00000022630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39302976:39307405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001271278 // RefSeq // Rattus norvegicus PBX/knotted 1 homeobox 2 (Pknox2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001271279 // RefSeq // Rattus norvegicus PBX/knotted 1 homeobox 2 (Pknox2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39366205:39463886:-1 gene:ENSRNOG00000028856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ221048 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YE19 mRNA sequence. // chr8 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39359145:39440247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001191994 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 2 (Slc37a2), mRNA. // chr8 // 94 // 92 // 33 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000040106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39713122:39734767:-1 gene:ENSRNOG00000039390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 92 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000048639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39704825:39830897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// NONRATT054739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
XM_006226368 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 15 (Ccdc15), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000040901 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:39763344:39831052:-1 gene:ENSRNOG00000032180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39704825:39830897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001108135 // RefSeq // Rattus norvegicus roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila) (Robo3), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus roundabout, axon guidance receptor, homolog 3 (Drosophila) (Robo3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:39893678:39908364:-1 gene:ENSRNOG00000030016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:39893798:39928834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_024140 // RefSeq // Rattus norvegicus neurogranin (Nrgn), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40015873:40024017:-1 gene:ENSRNOG00000010688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L09119 // GenBank // Rattus norvegicus C kinase substrate calmodulin-binding protein (RC3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U22062 // GenBank // Rattus norvegicus neurogranin/RC3 protein (Ng/RC3) gene, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053482 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm autoantigenic protein 17 (Spa17), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006242812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm autoantigenic protein 17 (Spa17), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40067946:40077019:-1 gene:ENSRNOG00000010934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40039504:40077019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001009344 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor beta regulator 1 (Tbrg1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000039729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40115616:40123274:-1 gene:ENSRNOG00000023850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087142 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor beta regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:95119 IMAGE:7127799), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000045139 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:34956668:34964019:1 gene:ENSRNOG00000033891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34956714:34957931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34962610:34963827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40115811:40123189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_199398 // RefSeq // Rattus norvegicus pannexin 3 (Panx3), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40127203:40138214:-1 gene:ENSRNOG00000031675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40128106:40149484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000041862 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:40160481:40161388:-1 gene:ENSRNOG00000030252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT054757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000820 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1194 (Olr1194), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40192726:40193655:-1 gene:ENSRNOG00000045972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40192726:40200306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001081 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1195 (Olr1195), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40219891:40220820:-1 gene:ENSRNOG00000047801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40219891:40223085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000038578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42178226:42228523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000048386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41089612:41218868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000049134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:41801471:41878193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_001000454 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1252 (Olr1252), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42352358:42353290:-1 gene:ENSRNOG00000049051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1744968:1745900:-1 gene:ENSRNOG00000046234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000074921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165131762:165132694:-1 gene:ENSRNOG00000046241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1744968:1761732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42352358:42369117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000057266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165025029:165148521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001000805 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1253 (Olr1253), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000044859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42363796:42364728:-1 gene:ENSRNOG00000046873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1756411:1757343:-1 gene:ENSRNOG00000049493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165143200:165144132:-1 gene:ENSRNOG00000050632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001001085 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1254 (Olr1254), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42368536:42369468:-1 gene:ENSRNOG00000050688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1761151:1762083:-1 gene:ENSRNOG00000050484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165147940:165148872:-1 gene:ENSRNOG00000049807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1744968:1761732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42352358:42369117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000057266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165025029:165148521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000015914 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:42376148:42377112:-1 gene:ENSRNOG00000011974 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072211 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:165155552:165156516:-1 gene:ENSRNOG00000047718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001000596 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1257 (Olr1257), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165196779:165197714:-1 gene:ENSRNOG00000046510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1810693:1811628:-1 gene:ENSRNOG00000048360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:42417375:42418310:-1 gene:ENSRNOG00000045625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1810693:1852443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:42417375:42418316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165196779:165197720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_173129 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1278 (Olr1278), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:54621210:54627120:-1 gene:ENSRNOG00000046359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072814 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:39825209:39826144:1 gene:ENSRNOG00000048508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000074413 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:43042023:43042958:-1 gene:ENSRNOG00000050717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000074937 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:134822810:134823745:1 gene:ENSRNOG00000048445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// AF010293 // GenBank // Rattus norvegicus olfactory receptor (U131) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:134823050:134823745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000039464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43042023:43042718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54621305:54622000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39825449:39826144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT030895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000961 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1279 (Olr1279), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:134789283:134790230:1 gene:ENSRNOG00000049310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071711 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:39791871:39792814:1 gene:ENSRNOG00000050842 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000517 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1280 (Olr1280), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:134771364:134772323:1 gene:ENSRNOG00000050953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39773355:39774314:1 gene:ENSRNOG00000046648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:134771613:134772323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54672727:54673437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39773604:39774314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT030895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000518 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1283 (Olr1283), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39697298:39698350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000459 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1285 (Olr1285), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39672718:39673653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000799 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1286 (Olr1286), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39644657:39645625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000798 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1288 (Olr1288), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40016282:40072697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000056414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39468330:39565485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0
XM_003751483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 144-like (LOC100911015), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000071850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40054844:40144435:-1 gene:ENSRNOG00000047068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 53 // 100 // 9 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39468330:39526921:1 gene:ENSRNOG00000050571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 53 // 100 // 9 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40016282:40072697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39468330:39565485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0
NM_001000797 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1291 (Olr1291), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39468330:39510154:1 gene:ENSRNOG00000050571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40039557:40144435:-1 gene:ENSRNOG00000047068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 96 // 16 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39978462:40144426:-1 gene:ENSRNOG00000047068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 74 // 92 // 17 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40016282:40072697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39468330:39565485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001000960 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1292 (Olr1292), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39468330:39565485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
NM_001000460 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1293 (Olr1293), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073106 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:39453082:39478226:1 gene:ENSRNOG00000045710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40158740:40159684:-1 gene:ENSRNOG00000047227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40158740:40159684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39416297:39454026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000597 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1294 (Olr1294), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000075732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39431619:39432563:1 gene:ENSRNOG00000050283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT020483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000598 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1295 (Olr1295), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39416288:39417232:1 gene:ENSRNOG00000049652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39416297:39454026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000461 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1297 (Olr1297), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001000462 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1301 (Olr1301), mRNA. // chr15 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39387182:39388126:1 gene:ENSRNOG00000046553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39387422:39388126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000462 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1301 (Olr1301), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43153670:43179413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0
NM_001000463 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1302 (Olr1302), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000060101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43178478:43179422:-1 gene:ENSRNOG00000039244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43153670:43179413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT054763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001000796 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1303 (Olr1303), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43194825:43195751:-1 gene:ENSRNOG00000046665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43069805:43070731:-1 gene:ENSRNOG00000049512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43194825:43195751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43069805:43130773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000464 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1304 (Olr1304), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43220785:43221720:-1 gene:ENSRNOG00000039239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43220785:43221720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000959 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1305 (Olr1305), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43235446:43236399:-1 gene:ENSRNOG00000039238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43235446:43236399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000465 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1306 (Olr1306), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43269340:43270278:-1 gene:ENSRNOG00000039236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43245951:43269927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT054767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000519 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1307 (Olr1307), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43290137:43291072:-1 gene:ENSRNOG00000048037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43290137:43291072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000007843 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:43303075:43322826:-1 gene:ENSRNOG00000005960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 84 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000036054 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:43303140:43322826:-1 gene:ENSRNOG00000005960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000066669 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:43303140:43322826:-1 gene:ENSRNOG00000005960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// FQ223043 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YA23 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000039461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43303140:43326148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT054771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT054772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001000468 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1314 (Olr1314), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000007901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43429126:43430043:-1 gene:ENSRNOG00000006035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000039452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43429126:43430043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT054773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000469 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1315 (Olr1315), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43455954:43456889:-1 gene:ENSRNOG00000048263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43455954:43456655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000476 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1330 (Olr1330), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61724316:61725245:1 gene:ENSRNOG00000006183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61724385:61725245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000790 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1331 (Olr1331), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61716594:61717532:1 gene:ENSRNOG00000047486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61716663:61717532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000477 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1332 (Olr1332), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61704397:61705335:1 gene:ENSRNOG00000047263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61704466:61705335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000478 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1334 (Olr1334), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61671500:61672428:1 gene:ENSRNOG00000046215 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61671569:61672270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT053356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001000479 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1335 (Olr1335), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61665625:61666630:1 gene:ENSRNOG00000049567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT053355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000789 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1338 (Olr1338), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61618335:61619282:1 gene:ENSRNOG00000006271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT053354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000481 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1339 (Olr1339), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61606829:61607773:1 gene:ENSRNOG00000042278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61562093:61607773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT053353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001064058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1340 (Olr1340), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_003750514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1340 (Olr1340), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046656 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:61561742:61562677:1 gene:ENSRNOG00000029633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61562093:61607773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_001191616 // RefSeq // Rattus norvegicus GRAM domain containing 1B (Gramd1b), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006243108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 1B (Gramd1b), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000009685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61211947:61373438:1 gene:ENSRNOG00000007166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000013897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61172237:61373332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT053347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT053348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1
ENSRNOT00000060003 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:43537157:43537956:-1 gene:ENSRNOG00000039205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43537157:43537600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000014565 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:43539365:43539776:-1 gene:ENSRNOG00000010961 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43539462:43539776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT054775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_001064888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ23554 (RGD1309108), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242847 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ23554 (RGD1309108), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010743 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:43571129:43623841:-1 gene:ENSRNOG00000008138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43571129:43694462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106813 // RefSeq // Rattus norvegicus cytotoxic and regulatory T cell molecule (Crtam), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43634852:43694465:-1 gene:ENSRNOG00000008153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43571129:43694462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT054778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001191792 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, B (Ubash3b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006242849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, B (Ubash3b), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, B (Ubash3b), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, B (Ubash3b), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:43705720:43853558:-1 gene:ENSRNOG00000008187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ221553 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA34YJ03 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT054781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:43717423:43890387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT054783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_053519 // RefSeq // Rattus norvegicus sortilin-related receptor, LDLR class A repeats-containing (Sorl1), mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000059974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:44702383:44872500:-1 gene:ENSRNOG00000024374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000057723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:44706273:44872500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT054791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// NONRATT054792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1
NM_053642 // RefSeq // Rattus norvegicus sterol-C5-desaturase (Sc5d), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:45001503:45010434:-1 gene:ENSRNOG00000008305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB052846 // GenBank // Rattus norvegicus C5D mRNA for sterol C5-desaturase, complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC081704 // GenBank // Rattus norvegicus sterol-C5-desaturase (ERG3 delta-5-desaturase homolog, S. cerevisiae)-like, mRNA (cDNA clone MGC:93101 IMAGE:7131154), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45002637:45148634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001106814 // RefSeq // Rattus norvegicus tectorin alpha (Tecta), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000052293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:45076279:45150292:-1 gene:ENSRNOG00000031126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000051325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45002637:45148634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT054797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001014089 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor E-like (Tbcel), mRNA. // chr8 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// XM_006242857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin folding cofactor E-like (Tbcel), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000059951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:45168898:45224997:-1 gene:ENSRNOG00000032364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// BC087163 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor E-like, mRNA (cDNA clone MGC:95318 IMAGE:7135124), complete cds. // chr8 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// FQ230557 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YP09 mRNA sequence. // chr8 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000051327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45168939:45231962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_012572 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, kainate 4 (Grik4), mRNA. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000048347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:45279686:45568161:-1 gene:ENSRNOG00000030910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U08257 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley glutamate receptor KA1 subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// NONRATT054803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45280059:45308213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000051328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45416569:45481724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000051329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45337390:45403804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT054804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001013246 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 12 (Arhgef12), mRNA. // chr8 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000059868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:45745243:45863838:-1 gene:ENSRNOG00000008924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AY935257 // GenBank // Rattus norvegicus leukemia-associated Rho guanine nucleotide exchange factor (Larg) mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// GENSCAN00000024289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45745242:45854578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0
NM_001108136 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 136 (Tmem136), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000038647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:45867546:45874816:-1 gene:ENSRNOG00000021793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ212295 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA61YG09 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45870052:45932263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001105745 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 2 homeobox 3 (Pou2f3), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POU class 2 homeobox 3 (Pou2f3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:45882859:45963908:-1 gene:ENSRNOG00000009118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// L23863 // GenBank // Rat Skn1i mRNA. // chr8 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45870052:45932263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001014090 // RefSeq // Rattus norvegicus OAF homolog (Drosophila) (Oaf), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:45980602:45998572:-1 gene:ENSRNOG00000009243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079082 // GenBank // Rattus norvegicus OAF homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94042 IMAGE:7122787), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:45981282:45984493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT054816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001113748 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 26 (Rnf26), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47063866:47065140:-1 gene:ENSRNOG00000007720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158712 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 26, mRNA (cDNA clone MGC:187841 IMAGE:9035415), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47063866:47065140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001066453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cbl proto-oncogene, E3 ubiquitin protein ligase (Cbl), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000067902 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:47107861:47183368:-1 gene:ENSRNOG00000008444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47107861:47183265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001191996 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing 3 (Pdzd3), mRNA. // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000011582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47196475:47200923:-1 gene:ENSRNOG00000008526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47197275:47237495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT054831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT054832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001025010 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family member X1 (Nlrx1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47202129:47218106:-1 gene:ENSRNOG00000008771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC089834 // GenBank // Rattus norvegicus NLR family member X1, mRNA (cDNA clone MGC:108817 IMAGE:7325650), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000048410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47197275:47237495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001106816 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 4 (Abcg4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242916 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 4 (Abcg4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47222818:47238385:-1 gene:ENSRNOG00000008862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47197275:47237495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// NONRATT054836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
XM_002727050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H4 transcription factor (Hinfp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002729915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H4 transcription factor (Hinfp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012868 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:47246470:47252624:-1 gene:ENSRNOG00000009499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47246442:47252624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001011996 // RefSeq // Rattus norvegicus C2CD2-like (C2cd2l), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006242920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2CD2-like (C2cd2l), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47259704:47269967:-1 gene:ENSRNOG00000009719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC085925 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 24, mRNA (cDNA clone MGC:94851 IMAGE:7109537), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47260561:47269610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT054841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_013168 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxymethylbilane synthase (Hmbs), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47286249:47293618:-1 gene:ENSRNOG00000010390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088162 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxymethylbilane synthase, mRNA (cDNA clone MGC:108753 IMAGE:7375228), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ231091 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YF13 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// FQ234870 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YF18 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47286571:47311227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT054845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT054846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT054847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT054849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001108138 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 11 homolog (S. cerevisiae) (Vps11), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47296463:47311266:-1 gene:ENSRNOG00000010733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47286571:47311227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001003708 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 4 (Trappc4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47342732:47345957:-1 gene:ENSRNOG00000011904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY373378 // GenBank // Rattus norvegicus synbindin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098628 // GenBank // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 4, mRNA (cDNA clone MGC:112553 IMAGE:7311789), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ229310 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YF24 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47342993:47345927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_001060013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 84 (Ccdc84), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_003754411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 84 (Ccdc84), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016227 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:47348806:47355477:-1 gene:ENSRNOG00000012137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000048377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47348930:47393808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT054860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONRATT054857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT054858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT054861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT054862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
GENSCAN00000048377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47348930:47393808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NM_053303 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) receptor 5 (Cxcr5), mRNA. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006242902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) receptor 5 (Cxcr5), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47455500:47468884:-1 gene:ENSRNOG00000012430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47455540:47468884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT054868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191578 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family B, member 1 (Phldb1), mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006242875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family B, member 1 (Phldb1), transcript variant X10, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006242878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family B, member 1 (Phldb1), transcript variant X13, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XR_356229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family B, member 1 (Phldb1), transcript variant X19, misc_RNA. // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000047303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47615943:47656917:-1 gene:ENSRNOG00000026985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC092599 // GenBank HTC // Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family B, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7104217), with apparent retained intron. // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47617189:47656917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT054870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT054872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT054873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NONRATT054870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001007662 // RefSeq // Rattus norvegicus archain 1 (Arcn1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000018598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47670185:47694935:-1 gene:ENSRNOG00000013843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC081979 // GenBank // Rattus norvegicus archain 1, mRNA (cDNA clone MGC:94158 IMAGE:7128203), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ229375 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YC11 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000054852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47671988:47686520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001109528 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 25 (Tmem25), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 25 (Tmem25), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47719267:47724685:-1 gene:ENSRNOG00000014218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47720572:47724148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001005546 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 36 (Ttc36), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47724882:47728489:-1 gene:ENSRNOG00000014700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082024 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:95155 IMAGE:7129913), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47724952:47728340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT054881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000020573 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:47733498:47777433:-1 gene:ENSRNOG00000015133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47733498:47807329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT054882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NONRATT054882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NM_212516 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit G (Atp5l), mRNA. // chr8 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000050878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47838601:47845456:-1 gene:ENSRNOG00000028884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC058497 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit G, mRNA (cDNA clone MGC:72942 IMAGE:6918545), complete cds. // chr8 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// FQ214576 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA1YD16 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ224067 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA77YO02 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ229120 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YC23 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47838734:47845398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT054887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT054888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_207610 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitination factor E4A (Ube4a), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000021321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47847869:47887561:-1 gene:ENSRNOG00000026833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC061761 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitination factor E4A, mRNA (cDNA clone MGC:72632 IMAGE:5621078), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// FQ231663 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YK14 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47850525:47883091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT054889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT054892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001077646 // RefSeq // Rattus norvegicus CD3 molecule, gamma (Cd3g), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47892831:47898776:-1 gene:ENSRNOG00000015945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47889349:47898723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT054895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_001108140 // RefSeq // Rattus norvegicus CD3 molecule, epsilon (Cd3e), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000047291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47915626:47926788:-1 gene:ENSRNOG00000016069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ228137 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YF18 mRNA sequence. // chr8 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47916184:47929219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT054900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT054899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NONRATT056675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT056676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT056677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001108998 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 4 (Tmprss4), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000040313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48096487:48129085:-1 gene:ENSRNOG00000026650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48096269:48160574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_057193 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 10 receptor, alpha (Il10ra), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48186327:48200179:-1 gene:ENSRNOG00000016308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ223464 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA11YA08 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48186683:48205711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006226388 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 164 (Cep164), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006242975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 164 (Cep164), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022583 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:48694831:48751727:-1 gene:ENSRNOG00000029826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000071752 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:48694831:48720412:-1 gene:ENSRNOG00000029826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072712 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:48694831:48751727:-1 gene:ENSRNOG00000029826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000050671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48695023:48751727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000023382 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:48792588:48817852:-1 gene:ENSRNOG00000017151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000023459 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:48792588:48817852:-1 gene:ENSRNOG00000017151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066551 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:48793957:48817852:-1 gene:ENSRNOG00000017151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000073488 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:48812965:48822370:-1 gene:ENSRNOG00000017151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000050676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48790155:48825606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT054917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT054918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_031549 // RefSeq // Rattus norvegicus transgelin (Tagln), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006242894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transgelin (Tagln), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48847018:48852863:-1 gene:ENSRNOG00000017628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061770 // GenBank // Rattus norvegicus transgelin, mRNA (cDNA clone MGC:72401 IMAGE:5621257), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ220668 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YB08 mRNA sequence. // chr8 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// FQ228729 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YF22 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// FQ228868 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YP07 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M83107 // GenBank // Rat SM22 mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ229463 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YN04 mRNA sequence. // chr8 // 52 // 92 // 12 // 23 // 0 /// FQ233006 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YJ09 mRNA sequence. // chr8 // 71 // 84 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48847757:48849153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT054919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108142 // RefSeq // Rattus norvegicus SID1 transmembrane family, member 2 (Sidt2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48854808:48871125:-1 gene:ENSRNOG00000017871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48854808:48871125:-1 gene:ENSRNOG00000017871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48856169:48870307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT054922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT054923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT054924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_022387 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, catalytic subunit 2 (Pafah1b2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, catalytic subunit 2 (Pafah1b2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// XM_006242958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, catalytic subunit 2 (Pafah1b2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000024828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:48884455:48902445:-1 gene:ENSRNOG00000018032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AF016048 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase alpha 2 subunit (PAF-AH alpha 2) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// BC081714 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93124 IMAGE:7108923), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ212439 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA54YO03 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:48885040:48894488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT054930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
XM_006242955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931429L15 (LOC500990), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_356237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931429L15 (LOC500990), transcript variant X9, misc_RNA. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059386 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:49219170:49234325:-1 gene:ENSRNOG00000038867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC105843 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931429L15, mRNA (cDNA clone MGC:125235 IMAGE:7455643), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT054933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT054934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
XM_003754424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 2 (Nxpe2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037353 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:58910946:58935378:-1 gene:ENSRNOG00000027847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58910946:58947329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT055075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003754424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 2 (Nxpe2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000037353 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:58910946:58935378:-1 gene:ENSRNOG00000027847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000003553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58910946:58947329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008326 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA exonuclease 2 (Rexo2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51395457:51407172:-1 gene:ENSRNOG00000018939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC086420 // GenBank // Rattus norvegicus REX2, RNA exonuclease 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105914 IMAGE:7300740), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT054939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51368276:51406925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT054940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT054941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT054942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT054943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001108143 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 7 (Rbm7), mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC166987 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:189117 IMAGE:7442233), complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// FQ229819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YJ09 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007736 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:51415941:51421071:-1 gene:ENSRNOG00000005710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT054945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT054946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000001127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51416332:51422273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT054947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001106819 // RefSeq // Rattus norvegicus nicotinamide N-methyltransferase (Nnmt), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nicotinamide N-methyltransferase (Nnmt), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// XM_006243003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nicotinamide N-methyltransferase (Nnmt), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000007789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51518448:51531215:-1 gene:ENSRNOG00000005930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ210320 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA30YF02 mRNA sequence. // chr8 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// FQ218924 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YB11 mRNA sequence. // chr8 // 52 // 92 // 12 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51517178:51531020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT054949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001013181 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 16 (Zbtb16), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51578440:51739786:-1 gene:ENSRNOG00000029980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY781102 // GenBank // Rattus norvegicus strain PD/Cub promyelocytic leukemia zinc finger protein (Zfp145) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY781103 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/Cub promyelocytic leukemia zinc finger protein (Zfp145) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY781104 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/OlaIpcv promyelocytic leukemia zinc finger protein (Zfp145) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51578589:51602103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT054951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_024394 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3A, ionotropic (Htr3a), mRNA. // chr8 // 80 // 91 // 24 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51803897:51816207:-1 gene:ENSRNOG00000006595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51804338:51816098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// U59672 // GenBank // Rattus norvegicus 5HT3 receptor mRNA, complete cds. // chr8 // 80 // 91 // 24 // 30 // 0
NM_022189 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 3B, ionotropic (Htr3b), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:51862878:51892032:-1 gene:ENSRNOG00000006920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF155044 // GenBank // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine 3 receptor B subunit precursor, mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AF303447 // GenBank // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine 3 receptor B subunit splice variant mRNA, partial cds. // chr8 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000051661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51862878:51909423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT054959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT054961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NONRATT054959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// NONRATT054960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT054961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_002727056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claudin 25-like (LOC100360390), mRNA. // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_002729920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claudin 25-like (LOC100360390), mRNA. // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:51975500:51976189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
XM_006226457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and kinase domain containing 1 (Ankk1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and kinase domain containing 1 (Ankk1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068040 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:52371261:52378944:-1 gene:ENSRNOG00000025037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:52371174:52477353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT054963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004246 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 12 (Ttc12), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000011454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:52390859:52436391:-1 gene:ENSRNOG00000008595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC079409 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:94947 IMAGE:7113087), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000042304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:52371174:52477353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT054965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// NONRATT054964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1
NM_031521 // RefSeq // Rattus norvegicus neural cell adhesion molecule 1 (Ncam1), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// XM_006242996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neural cell adhesion molecule 1 (Ncam1), transcript variant X17, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000042281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:52458775:52522326:-1 gene:ENSRNOG00000031890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000047666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:52458775:52522326:-1 gene:ENSRNOG00000031890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC101924 // GenBank // Rattus norvegicus neural cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:124601 IMAGE:7936825), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000026296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:52486135:52546771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT054969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT054973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// GENSCAN00000042304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:52371174:52477353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT054972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NONRATT054972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_017220 // RefSeq // Rattus norvegicus 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase (Pts), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53551584:53558594:-1 gene:ENSRNOG00000009250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059140 // GenBank // Rattus norvegicus 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase, mRNA (cDNA clone MGC:72872 IMAGE:6888665), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ223297 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YP12 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M77850 // GenBank // Rat 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53552276:53558544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT054978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_001127712 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-carotene oxygenase 2 (Bco2), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53565347:53596186:-1 gene:ENSRNOG00000038746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000059192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53562904:53587926:-1 gene:ENSRNOG00000038746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AY325176 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-079 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC133725 // GenBank // Rattus norvegicus beta-carotene oxygenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:156714 IMAGE:7100438), complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53565347:53594540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT054980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001191106 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 12 (Tex12), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53590163:53592193:-1 gene:ENSRNOG00000049470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_198788 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex, subunit D, integral membrane protein (Sdhd), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000059169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53625447:53634926:-1 gene:ENSRNOG00000022980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC059160 // GenBank // Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex, subunit D, integral membrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:72971 IMAGE:6887444), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ214315 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YG12 mRNA sequence. // chr8 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT054983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001127503 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC100151767 (LOC100151767), mRNA. // chr8 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000013197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53637061:53647516:-1 gene:ENSRNOG00000009958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// GENSCAN00000014785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53638461:53644570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT054985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_031025 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrolipoamide S-acetyltransferase (Dlat), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:37265515:37268822:1 gene:ENSRNOG00000017095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000032152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53659922:53685238:-1 gene:ENSRNOG00000009994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC107440 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrolipoamide S-acetyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:125038 IMAGE:7115402), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT000255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 77 // 61 // 17 // 22 // 0 /// NONRATT054989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53660613:53768837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// GENSCAN00000035847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:37220672:37316506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001037654 // RefSeq // Rattus norvegicus DIX domain containing 1 (Dixdc1), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// XM_006243040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DIX domain containing 1 (Dixdc1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// XM_006243042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DIX domain containing 1 (Dixdc1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000039045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53688641:53740876:-1 gene:ENSRNOG00000010260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// AY770507 // GenBank // Rattus norvegicus dixin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT054990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000014791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53660613:53768837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 34 // 48 // 1
NM_001109559 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689959 (LOC689959), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035618 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:53761298:53768954:-1 gene:ENSRNOG00000028416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53660613:53768837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT054994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_130431 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein B2 (Hspb2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53774083:53775054:-1 gene:ENSRNOG00000010402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock protein beta 2 (Hspb2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53774083:53775054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134636 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110032A03 (RGD1564937), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53788280:53791771:-1 gene:ENSRNOG00000030962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53789142:53790680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 50 // 11 // 14 // 0 /// NONRATT055001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
XR_348492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus salt-inducible kinase 2 (Sik2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XR_348494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus salt-inducible kinase 2 (Sik2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XR_356287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus salt-inducible kinase 2 (Sik2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr8 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066893 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:53905730:54005174:-1 gene:ENSRNOG00000043498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// DQ188032 // GenBank // Rattus norvegicus salt-inducible kinase 2 (Snf1lk2) mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XR_356286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus salt-inducible kinase 2 (Sik2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr8 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53900028:53942242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_001191997 // RefSeq // Rattus norvegicus layilin (Layn), mRNA. // chr8 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// XM_006226392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG58364-like (LOC100359479), mRNA. // chr8 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// XM_006243054 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG58364-like (LOC100359479), mRNA. // chr8 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000014965 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:54068224:54087317:-1 gene:ENSRNOG00000043383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000040162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:54047076:54063936:-1 gene:ENSRNOG00000011228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:54042291:54087317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0
NR_031849 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 34c (Mir34c), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:54088381:54088457:-1 gene:ENSRNOG00000035478 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-34c // miRBase Micro RNA Database // MI0000876 Rattus norvegicus miR-34c stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031848 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 34b (Mir34b), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053684 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:54088899:54088982:-1 gene:ENSRNOG00000035561 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-34b // miRBase Micro RNA Database // MI0000875 Rattus norvegicus miR-34b stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1562914 (RGD1562914), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1562914 (RGD1562914), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016127 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:54289587:54291384:-1 gene:ENSRNOG00000012022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:54289587:54292285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017126 // RefSeq // Rattus norvegicus ferredoxin 1 (Fdx1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:54958315:54977222:-1 gene:ENSRNOG00000012123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D50436 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for adrenodoxin, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:54958521:54977158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108146 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 12C (Zc3h12c), mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:55222440:55277181:-1 gene:ENSRNOG00000012470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:55222440:55265870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000019296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:55460215:55461077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 48 // 9 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000035438 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:55459060:55461077:-1 gene:ENSRNOG00000027199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0
NM_001103354 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100125362 (LOC100125362), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100125362 (LOC100125362), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028972 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:55822041:55828684:-1 gene:ENSRNOG00000025463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC092621 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100125362, mRNA (cDNA clone MGC:109299 IMAGE:7313228), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:55815741:55845574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001106820 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 10 (Ddx10), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56244977:56407666:-1 gene:ENSRNOG00000012500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56245572:56296521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000025037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56360010:56407530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001106821 // RefSeq // Rattus norvegicus ATM serine/threonine kinase (Atm), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENSRNOT00000050555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56600855:56702765:-1 gene:ENSRNOG00000029773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// GENSCAN00000051340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56601192:56617647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 16 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000051356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56619986:56700244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT055023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0
NM_017075 // RefSeq // Rattus norvegicus acetyl-CoA acetyltransferase 1 (Acat1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56750515:56778323:-1 gene:ENSRNOG00000007862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// D13921 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mitochondrial acetoacetyl-CoA thiolase, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56750684:56778248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_022683 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin 5 (Cul5), mRNA. // chr8 // 95 // 98 // 37 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000010956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56785487:56835567:-1 gene:ENSRNOG00000008039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// AF135115 // GenBank // Rattus norvegicus vasopressin-activated calcium-mobilizing receptor protein mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 98 // 37 // 39 // 0 /// GENSCAN00000051339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56785705:56845810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT055032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT055033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1
NM_001108148 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB39A, member RAS oncogene family (Rab39a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:56857848:56874859:-1 gene:ENSRNOG00000009008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:56857848:56902727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191579 // RefSeq // Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 1 (Elmod1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000012041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57066609:57123000:-1 gene:ENSRNOG00000009054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000057770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57067882:57174499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT055040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NONRATT055039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006226402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3 (Tnfaip8l3), mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006243096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 3 (Tnfaip8l3), mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000038830 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:57183192:57226987:-1 gene:ENSRNOG00000024230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000057773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57183192:57184283:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_017085 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 19, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp19a1), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000000212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57321085:57348101:-1 gene:ENSRNOG00000000196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57321824:57341454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// M33986 // GenBank // Rat aromatase cytochrome P450 mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0
XM_006226403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L37a-like (LOC100909816), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L37a-like (LOC100909816), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000013017 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:57509282:57571056:-1 gene:ENSRNOG00000009170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:57509282:57571056:-1 gene:ENSRNOG00000009170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57509282:57613722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 62 // 25 // 26 // 0
NM_001015010 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium and integrin binding family member 2 (Cib2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57704422:57720624:-1 gene:ENSRNOG00000009942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC092630 // GenBank // Rattus norvegicus calcium and integrin binding family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:109329 IMAGE:7314828), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57704422:57720445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT055055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_134389 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 (Acsbg1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006243065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 1 (Acsbg1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57764975:57820724:-1 gene:ENSRNOG00000011381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF208125 // GenBank // Rattus norvegicus gonadotropin-regulated long chain acyl-CoA synthetase (GR-LACS) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57765458:57820819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001025743 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 61 (Wdr61), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006243084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 61 (Wdr61), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// XM_006243085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 61 (Wdr61), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000017239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57877398:57894572:-1 gene:ENSRNOG00000012803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC098059 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 61, mRNA (cDNA clone MGC:116220 IMAGE:7458076), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ216058 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YA05 mRNA sequence. // chr8 // 71 // 89 // 12 // 17 // 0 /// NONRATT055061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57877579:57922619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// NONRATT055063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// NONRATT055060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
GENSCAN00000048242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58114337:58115295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000031386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:58159884:58161095:-1 gene:ENSRNOG00000023038 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58159884:58166026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000019307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58175886:58189161:-1 gene:ENSRNOG00000013829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// L31621 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinic acetylcholine receptor alpha 3 subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// X03440 // GenBank // Rat mRNA for neuronal acetylcholine receptor alpha-3 chain subunit. // chr8 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// NM_052805 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 3 (neuronal) (Chrna3), mRNA. // chr8 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// AY574254 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha3 subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT055065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000048238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58178483:58189008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT055066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_052806 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, beta 4 (neuronal) (Chrnb4), mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58192309:58211019:-1 gene:ENSRNOG00000014427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000040753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58192309:58211019:-1 gene:ENSRNOG00000014427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// AY574260 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta4 subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// U42976 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor subunit beta4 mRNA, complete cds. // chr8 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// X15834 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for muscle like nicotinic acetylcholine receptor subunit (nAChR gene). // chr8 // 84 // 89 // 26 // 31 // 0 /// GENSCAN00000048233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58192375:58208185:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT055068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1
NM_001191109 // RefSeq // Rattus norvegicus neuregulin 4 (Nrg4), mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58364273:58430726:-1 gene:ENSRNOG00000015149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006243094 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuregulin 4 (Nrg4), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT055069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58370096:58388885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001009668 // RefSeq // Rattus norvegicus electron-transfer-flavoprotein, alpha polypeptide (Etfa), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58608433:58665406:-1 gene:ENSRNOG00000015233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC088412 // GenBank // Rattus norvegicus electron-transfer-flavoprotein, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:94813 IMAGE:7108329), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58599171:58665305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT055072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006226406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S-phase cyclin A-associated protein in the ER (Scaper), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58788796:59138175:-1 gene:ENSRNOG00000006864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:58788796:59138175:-1 gene:ENSRNOG00000006864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58983354:59141377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58701154:58865456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT055078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NONRATT055075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:58910946:58947329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
XM_006243139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC501003 (RGD1563578), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC501003 (RGD1563578), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001076514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 3-like 1 (Dppa3l1), mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// XM_002727039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 3-like 1 (Dppa3l1), mRNA. // chr8 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000036219 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59253778:59254230:-1 gene:ENSRNOG00000022376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59253778:59254230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
NM_001005547 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 3 (Tspan3), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:59377470:59400900:-1 gene:ENSRNOG00000016474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC082102 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 3, mRNA (cDNA clone MGC:95296 IMAGE:7134588), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59385266:59391144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT055083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001108149 // RefSeq // Rattus norvegicus pseudopodium-enriched atypical kinase 1 (Peak1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:59437967:59649674:-1 gene:ENSRNOG00000042519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59465569:59472313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001108149 // RefSeq // Rattus norvegicus pseudopodium-enriched atypical kinase 1 (Peak1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:59437967:59649674:-1 gene:ENSRNOG00000042519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212315 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA59YD21 mRNA sequence. // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59487868:59490977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT055085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001100722 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and Ig domain containing 1 (Lingo1), mRNA. // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006243118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat and Ig domain containing 1 (Lingo1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000023084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:59844165:59860388:-1 gene:ENSRNOG00000017193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59860413:59866302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:59844528:59846348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT055089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT055091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001108151 // RefSeq // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 3-like 1 (Odf3l1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60084944:60087987:-1 gene:ENSRNOG00000027109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60085093:60087987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001127488 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 33 (Snx33), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 33 (Snx33), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60154183:60164559:-1 gene:ENSRNOG00000017382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60155499:60163651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025754 // RefSeq // Rattus norvegicus nei endonuclease VIII-like 1 (E. coli) (Neil1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006243134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nei endonuclease VIII-like 1 (E. coli) (Neil1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000058645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60387398:60393242:-1 gene:ENSRNOG00000018577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC099125 // GenBank // Rattus norvegicus nei endonuclease VIII-like 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:116267 IMAGE:7445605), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT055097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60388724:60419762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT055098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT055099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT055100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001108762 // RefSeq // Rattus norvegicus COMM domain containing 4 (Commd4), mRNA. // chr8 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60403480:60406936:-1 gene:ENSRNOG00000018671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// FQ213793 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YK09 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT055103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT055105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60388724:60419762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT055109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001025011 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to human chromosome 15 open reading frame 39 (RGD1305464), mRNA. // chrU // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000064830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60482444:60488730:-1 gene:ENSRNOG00000018689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC089935 // GenBank // Rattus norvegicus similar to human chromosome 15 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone IMAGE:7309152), complete cds. // chrU // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 70 // 70 // 30 // 43 // 1 /// GENSCAN00000047732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60483313:60517245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 42 // 42 // 18 // 43 // 1 /// NONRATT055112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 26 // 26 // 11 // 43 // 1
NM_001108763 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphopantothenoylcysteine decarboxylase (Ppcdc), mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60649506:60673125:-1 gene:ENSRNOG00000018711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ219777 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YB21 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60651489:60886062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61970294:61977609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT055116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_031726 // RefSeq // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 5 (Scamp5), mRNA. // chrU // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:61999367:62006968:-1 gene:ENSRNOG00000026638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// AF240784 // GenBank // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 5 mRNA, complete cds. // chrU // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:61999543:62008081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001004081 // RefSeq // Rattus norvegicus mannose phosphate isomerase (mapped) (Mpi), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000025783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62101461:62109361:-1 gene:ENSRNOG00000018898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC079111 // GenBank // Rattus norvegicus mannose phosphate isomerase (mapped), mRNA (cDNA clone MGC:94106 IMAGE:7125738), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62101572:62109351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// NONRATT055143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1
NM_001109295 // RefSeq // Rattus norvegicus complexin 3 (Cplx3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62157074:62163836:-1 gene:ENSRNOG00000019317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62159604:62181906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001012465 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, mannose-binding, 1 like (Lman1l), mRNA. // chr8 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62164378:62177220:-1 gene:ENSRNOG00000019355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB188302 // GenBank // Rattus norvegicus slamp mRNA for sublingual acinar membrane protein, complete cds. // chr8 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62159604:62181906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001030039 // RefSeq // Rattus norvegicus c-src tyrosine kinase (Csk), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006243164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus c-src tyrosine kinase (Csk), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62183287:62187910:-1 gene:ENSRNOG00000019374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC098863 // GenBank // Rattus norvegicus c-src tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:112926 IMAGE:7380519), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62183966:62187863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT055149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT055150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_012541 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 2 (Cyp1a2), mRNA. // chrU // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62228271:62235203:-1 gene:ENSRNOG00000016173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC127476 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 1, subfamily a, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:156566 IMAGE:7373253), complete cds. // chrU // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// K02422 // GenBank // Rat cytochrome P-450d methylcholanthrene-inducible gene, complete cds. // chrU // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62191168:62234109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_134340 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC-like kinase 3 (Clk3), mRNA. // chr8 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// XM_006243147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC-like kinase 3 (Clk3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC-like kinase 3 (Clk3), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62305184:62318918:-1 gene:ENSRNOG00000030126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC070891 // GenBank // Rattus norvegicus CDC-like kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:91497 IMAGE:7099115), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62305417:62391034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT055156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT055159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT055157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT055158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001109001 // RefSeq // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 3B (Bright like) (Arid3b), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000068340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62346554:62391111:-1 gene:ENSRNOG00000019677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62305417:62391034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014091 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 33 (Ccdc33), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 44 // 44 // 0 /// XM_006243166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 33 (Ccdc33), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000058490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62586936:62669085:-1 gene:ENSRNOG00000008219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 44 // 44 // 0 /// BC083609 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 33, mRNA (cDNA clone MGC:94366 IMAGE:7133493), complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000041002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62587016:62685887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT055164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT055163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 28 // 28 // 14 // 50 // 1
XM_006226413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus promyelocytic leukemia (Pml), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// XM_006243183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus promyelocytic leukemia (Pml), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000043434 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:62781117:62810211:-1 gene:ENSRNOG00000008400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071610 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:62781117:62810211:-1 gene:ENSRNOG00000008400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62781117:62810118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_001012125 // RefSeq // Rattus norvegicus lysyl oxidase-like 1 (Loxl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62843791:62868157:-1 gene:ENSRNOG00000008680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC089224 // GenBank // Rattus norvegicus lysyl oxidase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:105563 IMAGE:7309311), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006257717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysyl oxidase-like 1 (Loxl1), partial mRNA. // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000041003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62823384:62867844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001014210 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 21 (Tbc1d21), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62913982:62925874:-1 gene:ENSRNOG00000008737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC078987 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:93884 IMAGE:7112482), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT055169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62903385:62918463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1