AY190319 // GenBank // Rattus norvegicus B7-H3 (B7h3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NM_182824 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd276 molecule (Cd276), mRNA. // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000042681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63090340:63120668:-1 gene:ENSRNOG00000033608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// BC100064 // GenBank // Rattus norvegicus Cd276 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:112584 IMAGE:7104832), complete cds. // chr8 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT055173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63074419:63117622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001106825 // RefSeq // Rattus norvegicus REC114 meiotic recombination protein (Rec114), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC300751 (RGD1311874), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC300751 (RGD1311874), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63215248:63301532:-1 gene:ENSRNOG00000009332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63215362:63245045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63263198:63301478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT055176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000009312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63421646:63524303:-1 gene:ENSRNOG00000006490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63421646:63524303:-1 gene:ENSRNOG00000006490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63421646:63524303:-1 gene:ENSRNOG00000006490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// U68726 // GenBank // Rattus norvegicus neogenin mRNA, partial cds. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63422020:63475712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_001106826 // RefSeq // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 4 (Bbs4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63883342:63916346:-1 gene:ENSRNOG00000026171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63884260:63907474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001013108 // RefSeq // Rattus norvegicus ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1 (Arih1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000013581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:63928310:64030505:-1 gene:ENSRNOG00000009887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC083881 // GenBank // Rattus norvegicus ariadne ubiquitin-conjugating enzyme E2 binding protein homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:95181 IMAGE:7131418), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:63931483:63976947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 53 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT055192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
GENSCAN00000033353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64029616:64058942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 84 // 79 // 16 // 19 // 0
NM_001109636 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 202 (Tmem202), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000030199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:64061458:64067142:-1 gene:ENSRNOG00000026112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64061859:64073172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000050559 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:64281824:64282234:-1 gene:ENSRNOG00000029359 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64266460:64282234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001012355 // RefSeq // Rattus norvegicus SUMO/sentrin specific peptidase family member 8 (Senp8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:64321674:64335522:-1 gene:ENSRNOG00000011595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089939 // GenBank // Rattus norvegicus SUMO/sentrin specific peptidase family member 8, mRNA (cDNA clone MGC:109243 IMAGE:7310036), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227853 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YI24 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64321898:64322551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT055197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thrombospondin, type I, domain containing 4 (Thsd4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thrombospondin, type I, domain containing 4 (Thsd4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:64982991:65083688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001134469 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 49 (Lrrc49), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:65233821:65339662:-1 gene:ENSRNOG00000012015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC160848 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 49, mRNA (cDNA clone MGC:187588 IMAGE:8363379), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// FQ211943 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YL23 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:65234258:65340337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT055205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NONRATT055206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001108155 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 23 (Kif23), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000037028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:66598467:66624304:-1 gene:ENSRNOG00000014080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000050713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:66594564:66736266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0
NM_001014092 // RefSeq // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member V (Paqr5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member V (Paqr5), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member V (Paqr5), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000018988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:66632371:66711465:-1 gene:ENSRNOG00000014164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087040 // GenBank // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member V, mRNA (cDNA clone MGC:93711 IMAGE:7106223), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ088965 // GenBank // Rattus norvegicus progestin membrane receptor gamma (Pmrgamma) mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT055213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:66594564:66736266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT055214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_001073932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucuronic acid epimerase (Glce), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_343404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucuronic acid epimerase (Glce), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000038641 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:66744887:66757177:-1 gene:ENSRNOG00000025372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000050716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:66744887:66808151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT055216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001077682 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm equatorial segment protein 1 (Spesp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm equatorial segment protein 1 (Spesp1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000049441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:66952430:66966926:-1 gene:ENSRNOG00000025359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC127527 // GenBank // Rattus norvegicus sperm equatorial segment protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:156770 IMAGE:7114748), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:66944886:66953703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT055217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENSRNOT00000020951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:67107334:67177186:-1 gene:ENSRNOG00000015257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:67109207:67199277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001108157 // RefSeq // Rattus norvegicus fem-1 homolog b (C. elegans) (Fem1b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000009368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:67424001:67437273:-1 gene:ENSRNOG00000007077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000018263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:67424063:67437020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001106829 // RefSeq // Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 1 (Pias1), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:67500467:67597766:-1 gene:ENSRNOG00000034272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY644724 // GenBank // Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT-1 (Pias1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:67500693:67597750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT055230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT055231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_006226425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SKI family transcriptional corepressor 1 (Skor1), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SKI family transcriptional corepressor 1 (Skor1), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:67759513:67767425:-1 gene:ENSRNOG00000013959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:67759513:67779841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
XM_006243239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to ENSANGP00000021391 (RGD1309779), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// NM_001108766 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to ENSANGP00000021391 (RGD1309779), mRNA. // chr8 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000066106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68035524:68040147:-1 gene:ENSRNOG00000008340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// FQ234606 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YF02 mRNA sequence. // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68039651:68040085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 44 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT055236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// FQ230291 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YJ17 mRNA sequence. // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001106830 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif containing H (Iqch), mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006243233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing H (Iqch), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006243236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing H (Iqch), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68059764:68247321:-1 gene:ENSRNOG00000008353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000037719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68082600:68233318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
ENSRNOT00000039730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68274137:68397727:-1 gene:ENSRNOG00000008620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC064437 // GenBank // Rattus norvegicus SMAD family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:72529 IMAGE:5599910), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U66479 // GenBank // Rattus norvegicus mothers against dpp 3 homolog (Mad3) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NM_013095 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 3 (Smad3), mRNA. // chr8 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT055240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68268548:68318350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_001109002 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 6 (Smad6), mRNA. // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000012155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68608917:68676631:-1 gene:ENSRNOG00000009173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000005366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68635314:68679748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT055244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
XM_006226463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zwilch kinetochore protein (Zwilch), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006243248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zwilch kinetochore protein (Zwilch), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000012404 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:68798171:68827407:-1 gene:ENSRNOG00000009303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68798171:68818734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT055246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_031643 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 1 (Map2k1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000013933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68841356:69431569:-1 gene:ENSRNOG00000010176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC089772 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:108573 IMAGE:7382030), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// D13341 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MAP kinase kinase, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// D14591 // GenBank // Rattus norvegicus MEK1 mRNA for MAP kinase kinase, complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT055247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000005374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68841356:68900550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// NONRATT055249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// NONRATT055248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_001008380 // RefSeq // Rattus norvegicus DIS3-like exosome 3-5 exoribonuclease (Dis3l), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000014071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:69480088:69516482:-1 gene:ENSRNOG00000010537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC085932 // GenBank // Rattus norvegicus DIS3 mitotic control homolog (S. cerevisiae)-like, mRNA (cDNA clone MGC:94911 IMAGE:7112012), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:69480120:69516475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT055261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_031152 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB11a, member RAS oncogene family (Rab11a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:69896587:69919171:-1 gene:ENSRNOG00000011302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085727 // GenBank // Rattus norvegicus RAB11a, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:93374 IMAGE:7189729), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ220492 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YK19 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// M75153 // GenBank // R.norvegicus ras p21-like small GTP-binding protein (24KG) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:69898133:69919106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT055266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_020090 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 1 (Slc24a1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038156 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70111171:70136142:-1 gene:ENSRNOG00000026904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000045430 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70111171:70136142:-1 gene:ENSRNOG00000026904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000055087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70111171:70136142:-1 gene:ENSRNOG00000026904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055093 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70111171:70136142:-1 gene:ENSRNOG00000026904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF176688 // GenBank // Rattus norvegicus sodium/calcium/potassium exchanger NCKX1 (SLC24A1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70111171:70136138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001106831 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 1 (Ptplad1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70170452:70207419:-1 gene:ENSRNOG00000030232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70173915:70207218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
FQ234631 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YD18 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
K00783 // GenBank // Rat U5a small nuclear RNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000019269 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70600219:70601593:-1 gene:ENSRNOG00000014383 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70600219:70601593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
XM_238546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 51, beta subunit (Slc51b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70622266:70624908:-1 gene:ENSRNOG00000028889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70622266:70624908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT055272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006226448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and death domain containing 1A (Ankdd1a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006243300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and death domain containing 1A (Ankdd1a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000033512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70722541:70735706:-1 gene:ENSRNOG00000015554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70722175:70737636:-1 gene:ENSRNOG00000015554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000075734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70723377:70742752:-1 gene:ENSRNOG00000015554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70722408:70763384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
XM_006226466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family O member 2 (Plekho2), mRNA. // chr8 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// XM_236354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family O member 2 (Plekho2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000042633 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70781065:70804767:-1 gene:ENSRNOG00000029242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000056368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70781065:70804767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001173371 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 609 (Zfp609), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70914209:71016530:-1 gene:ENSRNOG00000015977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70915986:70964866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001134981 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 4 (Trip4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71051695:71205615:-1 gene:ENSRNOG00000016121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168748 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 4, mRNA (cDNA clone MGC:188852 IMAGE:6921198), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71140262:71182270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT055282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001106832 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 22 (Snx22), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 22 (Snx22), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71394713:71397593:-1 gene:ENSRNOG00000022852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71394906:71453387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_053411 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 1 (Snx1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006243317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 1 (Snx1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000022960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71414978:71453464:-1 gene:ENSRNOG00000017029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF218916 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 1 (Snx1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC092201 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:105373 IMAGE:7309531), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000018859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:31671068:31672312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71394906:71453387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT055286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT055287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1 /// NONRATT055289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1 /// NONRATT055288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_001108769 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 22 (Fbxl22), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71865760:71872447:-1 gene:ENSRNOG00000017684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71868861:71874407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT055292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001025424 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 3 (Usp3), mRNA. // chr8 // 83 // 83 // 25 // 30 // 0 /// BC129075 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:156515 IMAGE:7383067), complete cds. // chr8 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// DQ076481 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific protease 3 (Usp3) mRNA, complete cds. // chr8 // 83 // 83 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000057739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71875689:71890546:-1 gene:ENSRNOG00000017714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// GENSCAN00000018028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71876246:71904336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT055294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
XM_003750532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-secretase subunit APH-1B-like (RGD1559979), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006227202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-secretase subunit APH-1B-like (LOC102556838), mRNA. // chr8 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000024207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:72142803:72160730:-1 gene:ENSRNOG00000050648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006243318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-secretase subunit APH-1B-like (RGD1559979), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// GENSCAN00000017972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:72144995:72160595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT055301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001047090 // RefSeq // Rattus norvegicus APH1B gamma secretase subunit (Aph1b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_003750537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-secretase subunit APH-1B-like (LOC100911293), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000024176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:76942439:76963484:-1 gene:ENSRNOG00000027295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC166592 // GenBank // Rattus norvegicus anterior pharynx defective 1 homolog B (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:188357 IMAGE:7929867), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// DQ672552 // GenBank // Rattus norvegicus APH-1B (Aph-1b) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000057704 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:76926099:76933003:-1 gene:ENSRNOG00000037947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT055365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76942809:76963347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// GENSCAN00000044203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76882818:76933003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_153317 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB8B, member RAS oncogene family (Rab8b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:76975470:77047522:-1 gene:ENSRNOG00000018009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC158579 // GenBank // Rattus norvegicus RAB8B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:187328 IMAGE:9091689), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U53475 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase Rab8b (Rab8b) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ228864 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YP20 mRNA sequence. // chr8 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// FQ226447 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YC15 mRNA sequence. // chr8 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// FQ233175 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YO06 mRNA sequence. // chr8 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000055368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76979413:77000427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT055368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NONRATT055368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071775 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77034553:77034617:-1 gene:ENSRNOG00000049815 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 74 // 63 // 14 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073033 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77034042:77034106:-1 gene:ENSRNOG00000046559 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 74 // 63 // 14 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073553 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:13809372:13809436:1 gene:ENSRNOG00000050012 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 74 // 63 // 14 // 19 // 0 /// NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 77 // 13 // 23 // 0
NM_001106833 // RefSeq // Rattus norvegicus lactamase, beta (Lactb), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:77083026:77099150:-1 gene:ENSRNOG00000018081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:77083271:77098959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000012026 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77377033:77455788:-1 gene:ENSRNOG00000018373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024885 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77377033:77528139:-1 gene:ENSRNOG00000018373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000064613 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77377033:77528139:-1 gene:ENSRNOG00000018373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000031988 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:77377033:77497922:-1 gene:ENSRNOG00000018373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 49 // 49 // 28 // 57 // 1 /// GENSCAN00000026657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:77475214:77528139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 33 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000055374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:77346890:77475120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 61 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT055396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 11 // 57 // 1
NR_031906 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-190 (Mir190), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073924 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:80550805:80550889:1 gene:ENSRNOG00000050728 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075649 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:77362803:77362887:-1 gene:ENSRNOG00000047497 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// rno-mir-190a // miRBase Micro RNA Database // MI0000933 Rattus norvegicus miR-190 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT055400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NONRATT055404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000026660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:77950868:77951065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:167171157:167226816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 53 // 100 // 10 // 19 // 0
XM_002727087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 4A (C2cd4a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000043006 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:78001661:78002683:-1 gene:ENSRNOG00000034236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000028956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:78001661:78003726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
XM_006226475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A-kinase anchor protein 8-like (LOC691715), mRNA. // chr8 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// XM_006243401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A-kinase anchor protein 8-like (LOC691715), mRNA. // chr8 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:78251415:78257842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
XM_006226475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A-kinase anchor protein 8-like (LOC691715), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006243401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A-kinase anchor protein 8-like (LOC691715), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NM_001013946 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like (Akap8l), mRNA. // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// XM_006241055 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like (Akap8l), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000008560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14494266:14523993:-1 gene:ENSRNOG00000006355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// BC085785 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like, mRNA (cDNA clone MGC:93758 IMAGE:7108413), complete cds. // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:78251415:78257842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14479004:14523909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT051036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001013248 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box B1 (Foxb1), mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC089975 // GenBank // Rattus norvegicus forkhead box B1, mRNA (cDNA clone MGC:109378 IMAGE:7316995), complete cds. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:80317635:80320249:-1 gene:ENSRNOG00000010547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT055407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT055408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000013708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:80318594:80330517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_173312 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type (Gcnt3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 3, mucin type (Gcnt3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000014727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:76623714:76627187:1 gene:ENSRNOG00000011086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB098520 // GenBank // Rattus norvegicus dI/C2/C4GnT mRNA for beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76587932:76626758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000014748 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:76596305:76596581:1 gene:ENSRNOG00000011098 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
NM_001108163 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 81, member A (Fam81a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 81, member A (Fam81a), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 81, member A (Fam81a), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:76497582:76554483:1 gene:ENSRNOG00000011123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76512066:76553053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT053611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT053612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001009470 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin B2 (Ccnb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000017117 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:76221576:76233721:1 gene:ENSRNOG00000012678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// BC088212 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin B2, mRNA (cDNA clone MGC:108931 IMAGE:7383459), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC097952 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin B2, mRNA (cDNA clone MGC:116075 IMAGE:7454811), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:22625442:22651175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000035487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76177851:76241342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT053609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001106836 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 111 (Rnf111), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 111 (Rnf111), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:76142477:76218329:1 gene:ENSRNOG00000012842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76177851:76241342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT053608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
XM_006243382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 63, member B (Fam63b), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020089 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:75993155:76047318:1 gene:ENSRNOG00000014934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:75993155:76059557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT053601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_019254 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 10 (Adam10), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:75843846:75915593:-1 gene:ENSRNOG00000015038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:75844505:75974357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_012597 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase, hepatic (Lipc), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:75686408:75812457:1 gene:ENSRNOG00000015747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088160 // GenBank // Rattus norvegicus lipase, hepatic, mRNA (cDNA clone MGC:108746 IMAGE:7323251), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M16235 // GenBank // Rat hepatic lipase mRNA. // chr8 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:75762124:75812318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT053599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT053600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_022960 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 9 (Aqp9), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:75483006:75523420:1 gene:ENSRNOG00000015949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF016406 // GenBank // Rattus norvegicus neutral solute channel aquaporin 9 (AQP9) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC085731 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 9, mRNA (cDNA clone MGC:93419 IMAGE:7134715), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ214432 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YL16 mRNA sequence. // chr8 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// FQ218988 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YJ11 mRNA sequence. // chr8 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT053597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:75482308:75523056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT053598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_183402 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide M (Polr2m), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000023825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:75085452:75088146:1 gene:ENSRNOG00000017719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// AF326772 // GenBank // Rattus norvegicus GRINL1A downstream protein Gdown1 (Grinl1a) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC079379 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate-like 1A, mRNA (cDNA clone MGC:94885 IMAGE:7110855), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// JF440303 // GenBank // Rattus norvegicus GRINL1A combined protein 15 (Gcom1) mRNA, complete cds. // chr8 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000074273 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:75097274:75099328:1 gene:ENSRNOG00000045773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000018648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:75083415:75088146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:75095719:75099328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT053595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001014211 // RefSeq // Rattus norvegicus GRINL1A complex locus 1 (Gcom1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089899 // GenBank // Rattus norvegicus GRINL1A complex locus, mRNA (cDNA clone MGC:109137 IMAGE:7382871), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// JF440303 // GenBank // Rattus norvegicus GRINL1A combined protein 15 (Gcom1) mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000023153 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:74980451:75067085:1 gene:ENSRNOG00000017202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:74980451:75027493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT053591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001108164 // RefSeq // Rattus norvegicus cingulin-like 1 (Cgnl1), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006243355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cingulin-like 1 (Cgnl1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:74802444:74948694:1 gene:ENSRNOG00000017439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000002118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:74844496:74948155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_013176 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 12 (Tcf12), mRNA. // chr8 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:74682708:74733231:1 gene:ENSRNOG00000017472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 74 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:74682708:74733231:1 gene:ENSRNOG00000017472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 68 // 25 // 26 // 0 /// AJ973226 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for pancreas specific transcription factor, 1b (Ptf1b gene). // chr8 // 86 // 74 // 24 // 28 // 0 /// L09656 // GenBank // Rat salivary-specific cAMP response element-binding protein alpha mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:74682795:74734565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT053586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// NONRATT053587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1
XM_001054229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 9 (Tex9), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_002729938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 9 (Tex9), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006226467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 9 (Tex9), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006243343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 9 (Tex9), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000032268 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:73967971:74003852:1 gene:ENSRNOG00000024291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064388 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:73967971:74003852:1 gene:ENSRNOG00000024291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067571 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:73967926:73991280:1 gene:ENSRNOG00000024291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// BC160875 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7367814. // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT053581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT053583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// GENSCAN00000004868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73983485:74003712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT053582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT053584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
ENSRNOT00000009782 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:73644097:73644682:1 gene:ENSRNOG00000007451 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000007530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73644127:73659173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 83 // 14 // 15 // 0
NONRATT053575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108166 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class B (Pigb), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:73373909:73397749:1 gene:ENSRNOG00000007471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT053574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:73374018:73395757:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
XM_001079947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1-like (LOC691877), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_002727084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1-like (LOC691877), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000050501 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:73086192:73086533:1 gene:ENSRNOG00000029118 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000003643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:72985756:73165003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
NM_173146 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-13 homolog C (C. elegans) (Unc13c), mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:72463339:72889842:1 gene:ENSRNOG00000007694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// U75361 // GenBank // Rattus norvegicus Munc13-3 mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:72776098:72889260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000023868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:72631275:72764014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
ENSRNOT00000010988 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:81631592:81632380:-1 gene:ENSRNOG00000008311 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000051979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81631659:81632380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_031622 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 6 (Mapk6), mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000013053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81931190:81954196:-1 gene:ENSRNOG00000009381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC109380 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:124957 IMAGE:7446401), complete cds. // chr8 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// M64301 // GenBank // Rat extracellular signal-related kinase (ERK3) mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 76 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81932439:81954177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT055410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001011997 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomodulin 3 (Tmod3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:82035312:82095422:-1 gene:ENSRNOG00000032436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079290 // GenBank // Rattus norvegicus tropomodulin 3, mRNA (cDNA clone MGC:94421 IMAGE:7134366), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82038855:82067268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_031613 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomodulin 2 (Tmod2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tropomodulin 2 (Tmod2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:82109739:82135088:-1 gene:ENSRNOG00000010447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U59240 // GenBank // Rattus norvegicus N-tropomodulin mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82111198:82135031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT055421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_053856 // RefSeq // Rattus norvegicus secretogranin III (Scg3), mRNA. // chr8 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:82183497:82242336:-1 gene:ENSRNOG00000010784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U02983 // GenBank // Rattus norvegicus secretogranin III (SgIII) mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82183932:82254614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT055426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001191998 // RefSeq // Rattus norvegicus GDNF family receptor alpha like (Gfral), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006243416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GDNF family receptor alpha like (Gfral), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000052341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:82811571:82856410:-1 gene:ENSRNOG00000032063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82782436:82855260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_013074 // RefSeq // Rattus norvegicus hypocretin (orexin) receptor 2 (Hcrtr2), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:82883206:82998507:-1 gene:ENSRNOG00000011251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF041246 // GenBank // Rattus norvegicus orexin receptor-2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:82887314:82967804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108169 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member B (Fam83b), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:83193834:83271253:-1 gene:ENSRNOG00000011925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:83108542:83302219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006243423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus muscular LMNA-interacting protein (Mlip), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064754 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:84006332:84203965:-1 gene:ENSRNOG00000005934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// BC092625 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Protein C6orf142 homolog, mRNA (cDNA clone IMAGE:7314232), partial cds. // chr8 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// FQ224108 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA76YJ08 mRNA sequence. // chr8 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067627 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:84006332:84086298:-1 gene:ENSRNOG00000005934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000045393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:83976936:84089758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT055435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT055439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT055434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT055440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001014268 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 1 (Lrrc1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:84292834:84406002:-1 gene:ENSRNOG00000005970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079423 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94964 IMAGE:7114094), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000045418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:84236377:84347656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001011998 // RefSeq // Rattus norvegicus f-box protein 9 (Fbxo9), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus f-box protein 9 (Fbxo9), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:84953190:84978347:-1 gene:ENSRNOG00000008214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085831 // GenBank // Rattus norvegicus f-box protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:94411 IMAGE:7134220), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT055449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:84953661:84969645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
FQ226474 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YA23 mRNA sequence. // chr8 // 44 // 100 // 12 // 27 // 0 /// NONRATT055450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_017013 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase alpha 2 (Gsta2), mRNA. // chrU // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC078706 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase A2, mRNA (cDNA clone MGC:93118 IMAGE:7128611), complete cds. // chrU // 82 // 81 // 14 // 17 // 0 /// FQ217939 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA13YI14 mRNA sequence. // chrU // 82 // 81 // 14 // 17 // 0 /// FJ179397 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase alpha 2 mRNA, complete cds. // chrU // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
XM_001059859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 5 (Dppa5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006227666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100360362 (LOC100360362), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_236761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 5 (Dppa5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000000215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85265568:-1 gene:ENSRNOG00000000199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040010 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:70164190:70164543:-1 gene:ENSRNOG00000032335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000047129 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14646133:14646486:-1 gene:ENSRNOG00000031089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049144 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:43466258:43466611:1 gene:ENSRNOG00000029793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14646133:14646483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85273561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43466261:43466611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70164190:70164540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XR_348628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oocyte expressed protein (Ooep), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oocyte expressed protein (Ooep), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030609 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:85272542:85273552:-1 gene:ENSRNOG00000025957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000071049 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:85272557:85273561:-1 gene:ENSRNOG00000025957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85273561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009713 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 17 (acidic sugar transporter), member 5 (Slc17a5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000012474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:85440757:85475700:-1 gene:ENSRNOG00000009330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY800277 // GenBank // Rattus norvegicus sialin mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC097482 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 17 (anion/sugar transporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:114551 IMAGE:7459136), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT055462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000015131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85441913:85470978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_001047919 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2900055D03 (LOC367117), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000046322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:85826990:85832082:-1 gene:ENSRNOG00000031132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85826990:85832082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_002729942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein light chain 1-like (LOC100363141), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_003754442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein light chain 1-like (LOC100363141), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006243441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XII, alpha 1 (Col12a1), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 66 // 66 // 0 /// ENSRNOT00000043691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:86634619:86698440:-1 gene:ENSRNOG00000010510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 49 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000051159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:86584556:86659293:-1 gene:ENSRNOG00000010510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 49 // 49 // 0 /// U57362 // GenBank // Rattus norvegicus collagen XII alpha 1 (Col12a1) mRNA, partial cds. // chr8 // 90 // 14 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000031430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:86585363:86693020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 86 // 58 // 60 // 0 /// NONRATT055466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 73 // 73 // 51 // 70 // 1 /// NONRATT055465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 11 // 11 // 8 // 70 // 1 /// NONRATT055468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 13 // 70 // 1
NM_022503 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2 (Cox7a2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000038497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:52813655:52814107:1 gene:ENSRNOG00000027791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000066084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:86753412:86757509:-1 gene:ENSRNOG00000042903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC166880 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIIa 2, mRNA (cDNA clone MGC:188812 IMAGE:6888806), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// FQ228537 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YD11 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// FQ229029 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA4YG22 mRNA sequence. // chr8 // 88 // 100 // 42 // 48 // 0 /// FQ230547 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA90YH12 mRNA sequence. // chr8 // 81 // 100 // 39 // 48 // 0 /// GENSCAN00000017005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:52813694:52813945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT055474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT055475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000003022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:218078619:218078867:-1 gene:ENSRNOG00000002223 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 35 // 65 // 11 // 31 // 0
NM_001004248 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 30A (Tmem30a), mRNA. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:86767828:86789807:-1 gene:ENSRNOG00000010895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC079203 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 30A, mRNA (cDNA clone MGC:94262 IMAGE:7131766), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:86771036:86789513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_145682 // RefSeq // Rattus norvegicus filamin A interacting protein 1 (Filip1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus filamin A interacting protein 1 (Filip1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus filamin A interacting protein 1 (Filip1), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006243434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus filamin A interacting protein 1 (Filip1), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:86812192:86958261:-1 gene:ENSRNOG00000011521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB055759 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for filamin-interacting protein L-FILIP, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D87257 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for filamin-interacting protein S-FILIP, complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:86812812:86897875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT055480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_023958 // RefSeq // Rattus norvegicus interphotoreceptor matrix proteoglycan 1 (Impg1), mRNA. // chr8 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000017048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:87271174:87416431:-1 gene:ENSRNOG00000012479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB047843 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MLGAPC core protein, complete cds. // chr8 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000040078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:87305801:87390049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000040101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:87271501:87301269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_022225 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1B, G protein-coupled (Htr1b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:88666819:88667979:-1 gene:ENSRNOG00000013042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:88666819:88669278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000011864 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:89920884:90013180:-1 gene:ENSRNOG00000008652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:89920884:89969188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
FQ226910 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA17YP10 mRNA sequence. // chr8 // 79 // 100 // 34 // 43 // 0 /// FQ222240 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA26YJ09 mRNA sequence. // chr8 // 77 // 100 // 33 // 43 // 0 /// FQ226144 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA35YK05 mRNA sequence. // chr8 // 77 // 100 // 33 // 43 // 0 /// FQ226888 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA19YO14 mRNA sequence. // chr8 // 77 // 100 // 33 // 43 // 0 /// FQ228271 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA103YC23 mRNA sequence. // chr8 // 77 // 100 // 33 // 43 // 0 /// NONRATT003223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 77 // 100 // 33 // 43 // 0 /// NONRATT003224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 77 // 100 // 33 // 43 // 0 /// NONRATT003226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 77 // 100 // 33 // 43 // 0 /// FQ226164 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA34YB22 mRNA sequence. // chr8 // 51 // 100 // 22 // 43 // 0 /// NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 24 // 43 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 24 // 43 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 24 // 43 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 24 // 43 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 24 // 43 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 24 // 43 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 24 // 43 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 56 // 100 // 24 // 43 // 0
NM_001191796 // RefSeq // Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 4 (Elovl4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:90830571:90857120:-1 gene:ENSRNOG00000009773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:90826725:90853415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_001106844 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 46, member A (Fam46a), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:92451691:92455379:-1 gene:ENSRNOG00000010240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:92452538:92454983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_006243507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inhibitor of Bruton agammaglobulinemia tyrosine kinase (Ibtk), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038415 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:92839911:92905660:-1 gene:ENSRNOG00000027728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056930 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:92839911:92905660:-1 gene:ENSRNOG00000027728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:92840722:92948936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001039610 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3D (Ube3d), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006243478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3D (Ube3d), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3D (Ube3d), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:93463078:93633601:-1 gene:ENSRNOG00000010802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC101916 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2C binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:124836 IMAGE:7935691), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT055526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT055527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:93582532:93636872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1
NM_001108772 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 3 (Pgm3), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:93739288:93756358:-1 gene:ENSRNOG00000009515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC166838 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 3, mRNA (cDNA clone MGC:188729 IMAGE:9027278), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:93738958:93754918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_012600 // RefSeq // Rattus norvegicus malic enzyme 1, NADP(+)-dependent, cytosolic (Me1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:93769078:93863618:-1 gene:ENSRNOG00000009715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ228526 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YF02 mRNA sequence. // chr8 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:93770434:93879313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_031728 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein 91 (Snap91), mRNA. // chr8 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:93963290:94074083:-1 gene:ENSRNOG00000023861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// X68877 // GenBank // R.norvegicus mRNA for assembly protein 180 (AP180). // chr8 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:93995546:94064170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT055533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT055536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001277060 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 162 (Cep162), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:94370712:94427870:-1 gene:ENSRNOG00000010608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:94371940:94429850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001108173 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box18 (Tbx18), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:94860116:94888125:-1 gene:ENSRNOG00000010685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:94862470:94887707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT055545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000037012 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:95028233:95028637:-1 gene:ENSRNOG00000026808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:95028344:95028670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_001108174 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 14 (Snx14), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:95519167:95583948:-1 gene:ENSRNOG00000011348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC160909 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 14, mRNA (cDNA clone MGC:188644 IMAGE:7455732), complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:95510256:95583897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT055548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001047916 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein (Syncrip), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:95602783:95628111:-1 gene:ENSRNOG00000000204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:95602783:95628177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
XR_146130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909889 (LOC100909889), ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_356485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554001 (LOC102554001), transcript variant X1, ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_356489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910069 (LOC100910069), misc_RNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:95734133:95836299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:95664597:95697713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_001055454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF0258 protein KIAA1024-like (LOC501033), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_001066296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF0258 protein KIAA1024-like (LOC501033), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018553 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:96475723:96488337:-1 gene:ENSRNOG00000013399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068626 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:96475723:96488337:-1 gene:ENSRNOG00000013399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:96475723:96488337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004249 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 3 (Tmed3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:96576976:96584888:-1 gene:ENSRNOG00000013889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079220 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:94283 IMAGE:7131966), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:96577512:96584748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT055566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106845 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 34C (Ankrd34c), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:96606852:96616808:-1 gene:ENSRNOG00000013937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:96607283:96608887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031902 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 184 (Mir184), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053645 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:96677912:96677988:-1 gene:ENSRNOG00000035522 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-184 // miRBase Micro RNA Database // MI0000929 Rattus norvegicus miR-184 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108175 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 2B (Tbc1d2b), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 2B (Tbc1d2b), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000030645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:97076275:97145782:-1 gene:ENSRNOG00000014543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:97078088:97246427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT055574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000059791 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:97471386:97472385:-1 gene:ENSRNOG00000042301 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:97471507:97472301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_022677 // RefSeq // Rattus norvegicus Zic family member 1 (Zic1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:98226542:98229980:-1 gene:ENSRNOG00000014644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF221839 // GenBank // Rattus norvegicus zic protein (zic) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:98218586:98229980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
GENSCAN00000004368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:98609954:98704251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
GENSCAN00000004371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:98827498:98914357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
XM_006243549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ab2-095 (RGD1309079), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:101571619:101642463:-1 gene:ENSRNOG00000008519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AY325189 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-095 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NM_001134472 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Ab2-095 (RGD1309079), mRNA. // chr8 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// GENSCAN00000029935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:101556314:101629783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
ENSRNOT00000075305 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:102648882:102650474:-1 gene:ENSRNOG00000047734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:102648882:102652750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ230432 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YB21 mRNA sequence. // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSRNOT00000046873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:102704851:102757330:-1 gene:ENSRNOG00000008607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT055590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_053558 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 1 (Trpc1), mRNA. // chr8 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:102955430:103005393:-1 gene:ENSRNOG00000009601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF061266 // GenBank // Rattus norvegicus trp1 beta variant mRNA, complete cds. // chr8 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// DQ839447 // GenBank // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel subfamily C member 1 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:102970113:103005404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000014555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:102956667:102960816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT055595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT055594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001108178 // RefSeq // Rattus norvegicus plastin 1 (Pls1), mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// XM_006243574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plastin 1 (Pls1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plastin 1 (Pls1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:103009507:103046804:-1 gene:ENSRNOG00000009945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC168847 // GenBank // Rattus norvegicus plastin 1 (I isoform), mRNA (cDNA clone MGC:189074 IMAGE:7446132), complete cds. // chr8 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:103009998:103059406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT055597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_012913 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide (Atp1b3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000015476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:103638324:103669634:-1 gene:ENSRNOG00000011501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC061719 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 3 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:72545 IMAGE:5598284), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// D84450 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Na+,K+-ATPase beta-3 subunit, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT055601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000009120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:103709670:103713051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000051782 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:103712610:103713051:-1 gene:ENSRNOG00000032982 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
ENSRNOT00000073678 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:105066558:105066651:-1 gene:ENSRNOG00000047197 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074627 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:103737757:103737850:-1 gene:ENSRNOG00000049395 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106848 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 7 (Rnf7), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000015821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:103774031:103783041:-1 gene:ENSRNOG00000011663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC089890 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7374450, with apparent retained intron. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ233381 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YC02 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 63 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT055604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT055605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1
NM_001105724 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS p21 protein activator 2 (Rasa2), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006243555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS p21 protein activator 2 (Rasa2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000016327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:103860860:103988460:-1 gene:ENSRNOG00000011909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT055608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 96 // 46 // 48 // 1 /// GENSCAN00000009106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:103844601:103922083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 58 // 58 // 28 // 48 // 1 /// NONRATT055610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1 /// NONRATT055609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001012471 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 38 (Zbtb38), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 38 (Zbtb38), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006243580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 38 (Zbtb38), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006243583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 38 (Zbtb38), transcript variant X7, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006243585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 38 (Zbtb38), transcript variant X9, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:104036362:104039973:-1 gene:ENSRNOG00000012386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY623002 // GenBank // Rattus norvegicus zenon mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:104036362:104059535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT055615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007710 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-phosphoxylose phosphatase 1 (Pxylp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acid phosphatase-like 2 (Acpl2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006243593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acid phosphatase-like 2 (Acpl2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XR_356509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acid phosphatase-like 2 (Acpl2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000017085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:104171295:104237198:-1 gene:ENSRNOG00000012480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081981 // GenBank // Rattus norvegicus acid phosphatase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:94167 IMAGE:7128571), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:104172584:104196226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT055616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106849 // RefSeq // Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4 (Spsb4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:104287499:104359356:-1 gene:ENSRNOG00000012862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168912 // GenBank // Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:189194 IMAGE:7191741), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001065705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (pyrimidine nucleotide carrier ), member 36 (Slc25a36), mRNA. // chr8 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000037120 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:104412321:104441922:-1 gene:ENSRNOG00000013802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// NONRATT055620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000006558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:104412321:104441781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// NONRATT055619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NONRATT055625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_199406 // RefSeq // Rattus norvegicus coxsackie virus and adenovirus receptor-like 1 (Cxadrl1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041894 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:106673615:106696431:-1 gene:ENSRNOG00000029567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:106267371:106292926:-1 gene:ENSRNOG00000029029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063181 // GenBank // Rattus norvegicus coxsackie virus and adenovirus receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:72972 IMAGE:6887452), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106667173:106696431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106263577:106292837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_053481 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit beta (Pik3cb), mRNA. // chr8 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:106701471:106771882:-1 gene:ENSRNOG00000016384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106701471:106771852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT055633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT055632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSRNOT00000017658 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:106981123:107027925:-1 gene:ENSRNOG00000022704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// FQ211602 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YB21 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000013327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106978995:107027791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT055634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NM_012981 // RefSeq // Rattus norvegicus muscle RAS oncogene homolog (Mras), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:107054728:107082507:-1 gene:ENSRNOG00000014060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC085752 // GenBank // Rattus norvegicus muscle RAS oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:93575 IMAGE:7130510), complete cds. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// D89863 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for M-Ras, complete cds. // chr8 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT055635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:107033750:107101531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001173354 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 8 (Armc8), mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000019536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:107148284:107243975:-1 gene:ENSRNOG00000014521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC168192 // GenBank // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:7109136), partial cds. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT055637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000013334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:107146345:107248389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 75 // 75 // 33 // 44 // 1 /// NONRATT055639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1
NM_001014096 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 18 (Cldn18), mRNA. // chr8 // 95 // 89 // 37 // 39 // 0 /// XM_006243629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claudin 18 (Cldn18), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 97 // 77 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000052043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:107358630:107376300:-1 gene:ENSRNOG00000030386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 89 // 38 // 39 // 0 /// BC088427 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 18, mRNA (cDNA clone MGC:95056 IMAGE:7124060), complete cds. // chr8 // 95 // 89 // 37 // 39 // 0 /// GENSCAN00000013332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:107359349:107376268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 89 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT055640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0
NM_001106850 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 14 (Sox14), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:107532472:107533194:-1 gene:ENSRNOG00000022084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:107532472:107533194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001173438 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 20 receptor beta (Il20rb), mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:108165070:108194857:-1 gene:ENSRNOG00000023214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// DQ222846 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 20 receptor beta IL-20R2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:108153710:108183307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001106851 // RefSeq // Rattus norvegicus NCK adaptor protein 1 (Nck1), mRNA. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000020330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:108204373:108207897:-1 gene:ENSRNOG00000014917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC167009 // GenBank // Rattus norvegicus NCK adaptor protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:189191 IMAGE:9034703), complete cds. // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:108204856:108213816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT055644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001012126 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member G2 (Slc35g2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35, member G2 (Slc35g2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:108269640:108296902:-1 gene:ENSRNOG00000015370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088758 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 22, mRNA (cDNA clone MGC:105748 IMAGE:7315776), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:108269828:108347025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017030 // RefSeq // Rattus norvegicus propionyl CoA carboxylase, beta polypeptide (Pccb), mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus propionyl CoA carboxylase, beta polypeptide (Pccb), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:108785884:108836132:-1 gene:ENSRNOG00000015869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC078855 // GenBank // Rattus norvegicus propionyl coenzyme A carboxylase, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:93516 IMAGE:7108495), complete cds. // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// M14634 // GenBank // Rat mitochondrial propionyl-CoA carboxylase (PCCase) beta-subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:108778302:108836126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT055647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
BC087097 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit B, alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:7191961), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001012202 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, alpha (Ppp2r3a), mRNA. // chr8 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000010320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:108900011:108993750:-1 gene:ENSRNOG00000022999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:108901451:108950885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT055650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
NM_001104528 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor B1 (Ephb1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:109782848:110218328:-1 gene:ENSRNOG00000007865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:109787887:109880945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// M59814 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA sequence. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT055654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001013252 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle receptor, B subunit (Srprb), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC098951 // GenBank // Rattus norvegicus signal recognition particle receptor, B subunit, mRNA (cDNA clone MGC:114584 IMAGE:7324816), complete cds. // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// FQ214088 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YP05 mRNA sequence. // chr8 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// FQ229975 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YA23 mRNA sequence. // chr8 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111064527:111112746:-1 gene:ENSRNOG00000030625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// NONRATT055666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111064527:111112657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// NONRATT055667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001013110 // RefSeq // Rattus norvegicus transferrin (Tf), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000012725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111064527:111112746:-1 gene:ENSRNOG00000030625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000012946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111086148:111112746:-1 gene:ENSRNOG00000030625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111086148:111112746:-1 gene:ENSRNOG00000030625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC087021 // GenBank // Rattus norvegicus transferrin, mRNA (cDNA clone MGC:93500 IMAGE:7132382), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// D38380 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transferrin, complete cds. // chr8 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// FQ209524 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YC24 mRNA sequence. // chr8 // 89 // 49 // 17 // 19 // 0 /// FQ219664 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YM04 mRNA sequence. // chr8 // 90 // 26 // 9 // 10 // 0 /// M27966 // GenBank // Rat transferrin mRNA, 3 end. // chr8 // 89 // 23 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000034996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111064527:111112657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT055668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT055669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT055671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
NM_001047891 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1300017J02 (RGD1310507), mRNA. // chr8 // 100 // 63 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000056483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111134566:111154326:-1 gene:ENSRNOG00000009434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 63 // 32 // 33 // 0 /// AY325160 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-001 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 62 // 32 // 32 // 0 /// AY387063 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00077 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 29 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000052317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111119397:111169195:-1 gene:ENSRNOG00000049304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111115815:111169181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 98 // 88 // 45 // 46 // 0 /// NONRATT055672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 98 // 96 // 49 // 50 // 0 /// NONRATT055673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 98 // 92 // 47 // 48 // 0
NM_001014097 // RefSeq // Rattus norvegicus carnitine deficiency-associated gene expressed in ventricle 3 homolog (mouse) (Cdv3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006243660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carnitine deficiency-associated gene expressed in ventricle 3 homolog (mouse) (Cdv3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000044956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111231870:111242236:-1 gene:ENSRNOG00000010186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC083654 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CDV-3B, mRNA (cDNA clone MGC:94487 IMAGE:7135192), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT055675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001277434 // RefSeq // Rattus norvegicus beaded filament structural protein 2, phakinin (Bfsp2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111300035:111356748:-1 gene:ENSRNOG00000010899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111300035:111350306:-1 gene:ENSRNOG00000010899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// FQ228265 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA103YN19 mRNA sequence. // chr8 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111286411:111356727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT055679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT055680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006226543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 108 (Tmem108), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014519 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:111361212:111485621:-1 gene:ENSRNOG00000010911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000035003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111361212:111419893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT055681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001009669 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 5 (Uba5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:111967198:111981855:-1 gene:ENSRNOG00000011027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC088757 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 5, mRNA (cDNA clone MGC:105565 IMAGE:7309521), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:111967290:111981726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT055686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT055685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_006226544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus atypical chemokine receptor 4 (Ackr4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006243686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus atypical chemokine receptor 4 (Ackr4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015265 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:112031580:112032632:-1 gene:ENSRNOG00000011478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:112031580:112032632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003750580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 13 (Dnajc13), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000015344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:112084846:112177085:-1 gene:ENSRNOG00000011491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000015534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:112084846:112177085:-1 gene:ENSRNOG00000011491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000017551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:112076801:112221132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 53 // 53 // 0 /// NONRATT055690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 98 // 57 // 57 // 0
NM_001134901 // RefSeq // Rattus norvegicus acid phosphatase, prostate (Acpp), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 90 // 89 // 28 // 31 // 0 /// NM_020072 // RefSeq // Rattus norvegicus acid phosphatase, prostate (Acpp), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:112224762:112270036:-1 gene:ENSRNOG00000011820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// DQ826426 // GenBank // Rattus norvegicus prostatic acid phosphatase transcript variant 1 (Acpp) mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 89 // 28 // 31 // 0 /// M32397 // GenBank // Rat prostatic acid phosphatase (rPAP) mRNA, complete cds. // chr8 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:112224762:112269996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT055695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT055696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000034644 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:112276923:112277651:-1 gene:ENSRNOG00000026717 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:112276958:112323976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
ENSRNOT00000027961 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:112429873:112430369:-1 gene:ENSRNOG00000032747 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0
NM_001127554 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16 (Nudt16), mRNA. // chr8 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:113059261:113061297:-1 gene:ENSRNOG00000012962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC166915 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16, mRNA (cDNA clone MGC:188901 IMAGE:6917859), complete cds. // chr8 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113059915:113061295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT055697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001109516 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 16 (Nudix motif 16) (LOC688828), mRNA. // chr8 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000056435 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:113074156:113075830:-1 gene:ENSRNOG00000037305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113074236:113075730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT055699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001108182 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA-related kinase 11 (Nek11), mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006243664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 11 (Nek11), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XM_006243665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 11 (Nek11), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006243666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 11 (Nek11), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006243668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 11 (Nek11), transcript variant X8, mRNA. // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000046816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:113173030:113322634:-1 gene:ENSRNOG00000042432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT055700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT055701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_131907 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Ca++ transporting, type 2C, member 1 (Atp2c1), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:113331596:113398299:-1 gene:ENSRNOG00000013305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:113341078:113398299:-1 gene:ENSRNOG00000013305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC086994 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, Ca++ transporting, type 2C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93231 IMAGE:7106233), complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// M93018 // GenBank // Rat alternatively spliced mRNA. // chr8 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT055705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113342765:113458051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
ENSRNOT00000053061 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:8:113511844:113511962:-1 gene:ENSRNOG00000034938 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_002727098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 6 (Col6a6), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006226551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 6 (Col6a6), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_236593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 6 (Col6a6), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000056414 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:113729107:113825010:-1 gene:ENSRNOG00000023007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113733671:113962806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001005383 // RefSeq // Rattus norvegicus aminoacylase 1 (Acy1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006243714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aminoacylase 1 (Acy1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114498901:114503595:-1 gene:ENSRNOG00000011189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY580164 // GenBank // Rattus norvegicus kidney aminoacylase 1 mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC078930 // GenBank // Rattus norvegicus aminoacylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93728 IMAGE:7107165), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ232544 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YF09 mRNA sequence. // chr8 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// AY580165 // GenBank // Rattus norvegicus kidney aminoacylase IB mRNA, complete cds. // chr8 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114498992:114514204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT055718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001009670 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 14A (Abhd14a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 14A (Abhd14a), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 14A (Abhd14a), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114505677:114513516:-1 gene:ENSRNOG00000011936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088472 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 14A, mRNA (cDNA clone MGC:95137 IMAGE:7128506), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114498992:114514204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT055725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT055727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT055722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_001073569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 62 (Gpr62), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// XM_576464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 62 (Gpr62), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENSRNOT00000033018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114530697:114531773:-1 gene:ENSRNOG00000022567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// GENSCAN00000036965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114530697:114531773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// NONRATT055729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 21 // 62 // 1
XM_001073569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 62 (Gpr62), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_576464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 62 (Gpr62), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114530697:114531773:-1 gene:ENSRNOG00000022567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114530697:114531773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001073569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 62 (Gpr62), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_576464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 62 (Gpr62), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114530697:114531773:-1 gene:ENSRNOG00000022567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114530697:114531773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001008328 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 3 (Parp3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006243725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 3 (Parp3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114537740:114543478:-1 gene:ENSRNOG00000012865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC085863 // GenBank // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:94593 IMAGE:7190424), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114538129:114542810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT055731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT055732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001025153 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif containing F3 (Iqcf3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114611837:114623749:-1 gene:ENSRNOG00000022445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC079282 // GenBank // Rattus norvegicus IQ motif containing F3, mRNA (cDNA clone MGC:94409 IMAGE:7134209), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006243836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing F3 (Iqcf3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// XM_006243837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing F3 (Iqcf3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// NONRATT055733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114588824:114655664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
XM_006226556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ domain-containing protein F5-like (LOC102550160), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ domain-containing protein F5-like (LOC102550160), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056386 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:114632183:114634288:-1 gene:ENSRNOG00000037285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114588824:114655664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001105711 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 2 (Grm2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114705123:114718170:-1 gene:ENSRNOG00000013171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114701702:114716378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001007665 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 264 (Tex264), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243726 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 264 (Tex264), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006243727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 264 (Tex264), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114720831:114748300:-1 gene:ENSRNOG00000013201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083732 // GenBank // Rattus norvegicus testis expressed 264, mRNA (cDNA clone MGC:94635 IMAGE:7191345), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114719011:114745258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT055739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT055740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT055741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001134520 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD54-like 2 (S. cerevisiae) (Rad54l2), mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// XR_356566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase ARIP4-like (LOC102552166), misc_RNA. // chr8 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071868 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:113566122:113597907:-1 gene:ENSRNOG00000049489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000074641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:113566122:113597907:-1 gene:ENSRNOG00000049489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018475 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:114753015:114811529:-1 gene:ENSRNOG00000013570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000028657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:113565484:113597907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114755095:114811529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT055745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0
XM_006226650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 15B (Rbm15b), mRNA. // chr8 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000018995 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:114977385:114980224:-1 gene:ENSRNOG00000014161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114972085:114980224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001108183 // RefSeq // Rattus norvegicus mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor (Manf), mRNA. // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000019107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114982002:114985213:-1 gene:ENSRNOG00000014201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC166980 // GenBank // Rattus norvegicus arginine-rich, mutated in early stage tumors, mRNA (cDNA clone MGC:189069 IMAGE:7318164), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ232064 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YC08 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114982275:114985173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT055750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006243865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cyto-kinesis 3 (Dock3), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000019867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:114988609:115302046:-1 gene:ENSRNOG00000014576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000015250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114988609:115346950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT055752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0
NM_001012127 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 3 (Mapkapk3), mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115368435:115402229:-1 gene:ENSRNOG00000014832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC081974 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:94118 IMAGE:7126359), complete cds. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115369601:115401818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT055757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001106853 // RefSeq // Rattus norvegicus HemK methyltransferase family member 1 (Hemk1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HemK methyltransferase family member 1 (Hemk1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115438339:115448894:-1 gene:ENSRNOG00000015458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161944 // GenBank // Rattus norvegicus HemK methyltransferase family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:187733 IMAGE:9024451), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000015255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115428375:115447019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001007753 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b561 family, member D2 (Cyb561d2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115651589:115654110:-1 gene:ENSRNOG00000021887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082072 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b-561 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:95239 IMAGE:7133078), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome b561 family, member D2 (Cyb561d2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115651869:115653859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT055763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XR_348734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551360 (LOC102551360), transcript variant X1, ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_356582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551360 (LOC102551360), transcript variant X1, ncRNA. // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// NONRATT055768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
XM_002727102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich single-pass membrane protein 2 (Lsmem2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006226561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich single-pass membrane protein 2 (Lsmem2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// FQ225859 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YO13 mRNA sequence. // chr8 // 86 // 78 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115705041:115716936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001079942 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3B (Sema3b), mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006243810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3B (Sema3b), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000066296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115710332:115717175:-1 gene:ENSRNOG00000016512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC129103 // GenBank // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3B, mRNA (cDNA clone MGC:156709 IMAGE:7100098), complete cds. // chr8 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT055771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000012294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115705041:115716936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1 /// NONRATT055772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_145776 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 3 (Slc38a3), mRNA. // chr8 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115761371:115777467:-1 gene:ENSRNOG00000016827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF273025 // GenBank // Rattus norvegicus amino acid system N transporter mRNA, complete cds. // chr8 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC081717 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:93143 IMAGE:7127614), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115760390:115769708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT055778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT055779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT055780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001108780 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 1 (Gnat1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115788412:115793148:-1 gene:ENSRNOG00000017589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115789902:115793088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT055781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108185 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3 F (Sema3f), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006243777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3 F (Sema3f), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000024193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115795106:115824684:-1 gene:ENSRNOG00000017704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000012290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115796031:115853634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT055783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0
NM_001100548 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 5 (Rbm5), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006243740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 5 (Rbm5), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000024529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115857799:115886421:-1 gene:ENSRNOG00000018153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC166477 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:187934 IMAGE:9102173), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC089976 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7317347), partial cds. // chr8 // 35 // 35 // 17 // 48 // 1 /// FQ234167 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YO22 mRNA sequence. // chr8 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// FQ234674 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YB11 mRNA sequence. // chr8 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// GENSCAN00000012297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115858055:115885322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 73 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT055785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT055788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 71 // 71 // 34 // 48 // 1 /// NONRATT055787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT055789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// NONRATT055791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_001108186 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 6 (Rbm6), mRNA. // chr8 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// XM_006243781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 6 (Rbm6), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000024939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:115890040:115989941:-1 gene:ENSRNOG00000018333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000012296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:115890161:115928325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT055795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1
XM_006243781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 6 (Rbm6), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108187 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 212, member A (Fam212a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116117472:116119162:-1 gene:ENSRNOG00000019363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ215477 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YB15 mRNA sequence. // chr8 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116117521:116118998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191580 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 123 (Rnf123), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006243692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 123 (Rnf123), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006243694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 123 (Rnf123), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000043825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116183556:116210629:-1 gene:ENSRNOG00000033378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000050344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116183556:116210629:-1 gene:ENSRNOG00000033378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC128773 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7132640, partial cds. // chr8 // 96 // 61 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116187792:116209143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT055802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT055805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_012500 // RefSeq // Rattus norvegicus acylaminoacyl-peptide hydrolase (Apeh), mRNA. // chr8 // 95 // 98 // 39 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000045410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116216748:116225863:-1 gene:ENSRNOG00000029572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC166605 // GenBank // Rattus norvegicus N-acylaminoacyl-peptide hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:188384 IMAGE:7937766), complete cds. // chr8 // 95 // 98 // 39 // 41 // 0 /// J04733 // GenBank // Rat acyl-peptide hydrolase mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 98 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000031651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116216902:116314870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT055808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT055809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1
NM_019146 // RefSeq // Rattus norvegicus bassoon (presynaptic cytomatrix protein) (Bsn), mRNA. // chr8 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116227802:116319071:-1 gene:ENSRNOG00000030714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116216902:116314870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT055812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_053697 // RefSeq // Rattus norvegicus dystroglycan 1 (dystrophin-associated glycoprotein 1) (Dag1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116336544:116346738:-1 gene:ENSRNOG00000019400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116336544:116346738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT055814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033971 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 3 (Ndufaf3), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 94 // 79 // 29 // 31 // 0 /// NM_020080 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 3 (Ndufaf3), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 94 // 79 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000027262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116696132:116698175:-1 gene:ENSRNOG00000020068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 79 // 29 // 31 // 0 /// BC079306 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear protein E3-3, mRNA (cDNA clone MGC:94445 IMAGE:7134644), complete cds. // chr8 // 93 // 69 // 25 // 27 // 0 /// FQ223486 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA10YM12 mRNA sequence. // chr8 // 92 // 67 // 24 // 26 // 0 /// FQ233128 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YB17 mRNA sequence. // chr8 // 87 // 59 // 20 // 23 // 0 /// U95160 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear protein E3-3 orf1 mRNA, complete cds. // chr8 // 86 // 54 // 18 // 21 // 0 /// U95161 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear protein E3-3 orf2 mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 67 // 23 // 26 // 0 /// U95162 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear protein E3-3 orf3 mRNA, complete cds. // chr8 // 90 // 74 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116696531:116697484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 89 // 49 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT055816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT055818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001006988 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 6 (Wdr6), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116702848:116709264:-1 gene:ENSRNOG00000020185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC084708 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 6, mRNA (cDNA clone MGC:105944 IMAGE:7301769), complete cds. // chr8 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116703489:116784074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0
XM_001075237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, transmembrane (P4htm), mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_217285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, transmembrane (P4htm), mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116709604:116727218:-1 gene:ENSRNOG00000020249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116703489:116784074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001012275 // RefSeq // Rattus norvegicus ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 2 (Arih2), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 2 (Arih2), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116731513:116790857:-1 gene:ENSRNOG00000031827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116703489:116784074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// BC088394 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7112426, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr8 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT055827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT055828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT055830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
XM_001053597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit g, mitochondrial-like (LOC679586), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002727103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit g, mitochondrial-like (LOC679586), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048808 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:116823392:116823782:-1 gene:ENSRNOG00000031401 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116823471:116823839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001024989 // RefSeq // Rattus norvegicus three prime repair exonuclease 1 (Trex1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117147877:117149221:-1 gene:ENSRNOG00000022540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC091242 // GenBank // Rattus norvegicus three prime repair exonuclease 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7364750), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233170 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YO17 mRNA sequence. // chr8 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117147916:117172090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001106859 // RefSeq // Rattus norvegicus ATR interacting protein (Atrip), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003750589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATR-interacting protein-like (LOC100911807), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006243765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATR interacting protein (Atrip), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117149699:117163734:-1 gene:ENSRNOG00000020670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073395 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:117778189:117786985:-1 gene:ENSRNOG00000050492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117147916:117172090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT055837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117778162:117795340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT055838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_001075538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 12 (Fbxw12), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_236641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 12 (Fbxw12), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028113 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:117223248:117243469:-1 gene:ENSRNOG00000020720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117225349:117253635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000037023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117225349:117253635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028111 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:117225349:117225578:-1 gene:ENSRNOG00000020718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0
NM_001100724 // RefSeq // Rattus norvegicus cathelicidin antimicrobial peptide (Camp), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117283078:117284884:-1 gene:ENSRNOG00000020733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF484553 // GenBank // Rattus norvegicus CRAMP precursor, mRNA, partial cds. // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117283123:117284879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT055840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013249 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 30 (Dhx30), mRNA. // chr8 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006243826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 30 (Dhx30), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// XM_006243830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 30 (Dhx30), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000048764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117515770:117542943:-1 gene:ENSRNOG00000029194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// BC091359 // GenBank // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 30, mRNA (cDNA clone MGC:109411 IMAGE:7318733), complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000056818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117515842:117531834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT055842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT055843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1
NM_057204 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23 (Ptpn23), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000056145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:117972419:117994931:-1 gene:ENSRNOG00000020862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000011564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:117972591:117994900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AF077000 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase TD14 (PTP-TD14) mRNA, complete cds. // chr8 // 98 // 87 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT055851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0
XM_006226576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 18 (Klhl18), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006226577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 18 (Klhl18), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 18 (Klhl18), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 18 (Klhl18), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118015475:118039816:-1 gene:ENSRNOG00000020880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118015204:118079834:-1 gene:ENSRNOG00000020880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118013987:118079834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_139259 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophin receptor associated death domain (Nradd), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006243919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurotrophin receptor associated death domain (Nradd), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118231775:118234748:-1 gene:ENSRNOG00000020936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF497263 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley brain 14 day embryo p75-like apoptosis-inducing death domain protein long isoform mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AF497264 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley brain 14 day embryo p75-like apoptosis-inducing death domain protein short isoform mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr8 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AF534395 // GenBank // Rattus norvegicus death domain containing transmembrane protein NRADD mRNA, complete cds. // chr8 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118231775:118259602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT055864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_003754458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurobeachin-like 2 (Nbeal2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118235182:118264997:-1 gene:ENSRNOG00000027880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118235182:118264997:-1 gene:ENSRNOG00000027880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118231775:118259602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_003754458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurobeachin-like 2 (Nbeal2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118235182:118264997:-1 gene:ENSRNOG00000027880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118235182:118264997:-1 gene:ENSRNOG00000027880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118231775:118259602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_020073 // RefSeq // Rattus norvegicus parathyroid hormone 1 receptor (Pth1r), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus parathyroid hormone 1 receptor (Pth1r), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118328864:118348383:-1 gene:ENSRNOG00000020948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// L19475 // GenBank // Rat parathyroid hormone/parathyroid hormone related-peptide receptor mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// M77184 // GenBank // Rat parathyroid hormone receptor mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118328879:118348338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT055877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT055878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT055882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT055883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_031660 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP-regulated phosphoprotein 19 (Arpp19), mRNA. // chr8 // 85 // 94 // 28 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000028470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118444306:118444644:-1 gene:ENSRNOG00000020977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC058461 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic AMP phosphoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:72767 IMAGE:6919944), complete cds. // chr8 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// FQ213926 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YM08 mRNA sequence. // chr8 // 90 // 83 // 26 // 29 // 0 /// FQ221182 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA39YI22 mRNA sequence. // chr8 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000030221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:81566087:81585228:1 gene:ENSRNOG00000023086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000051967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:81532831:81585210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 94 // 31 // 33 // 0 /// NONRATT053646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// NONRATT053647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// NONRATT053648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// NONRATT053649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// NONRATT053651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 83 // 83 // 24 // 29 // 0 /// NONRATT053650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_001109299 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane inner ear (Tmie), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006243995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane inner ear (Tmie), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006243996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane inner ear (Tmie), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118480842:118495446:-1 gene:ENSRNOG00000027799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118481668:118488495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001056317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus teratocarcinoma-derived growth factor 1 (Tdgf1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002727105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus teratocarcinoma-derived growth factor 1 (Tdgf1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040840 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:118555010:118558562:-1 gene:ENSRNOG00000037171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118555005:118570723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001108190 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor (chemosensory) transporter protein 3 (Rtp3), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118603382:118607896:-1 gene:ENSRNOG00000037167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108191 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor-like 2 (Ccrl2), mRNA. // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006243967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor-like 2 (Ccrl2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000044467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118666369:118668671:-1 gene:ENSRNOG00000033234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000022149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118659633:118702457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT055889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_031053 // RefSeq // Rattus norvegicus mutL homolog 1, colon cancer, nonpolyposis type 2 (E. coli) (Mlh1), mRNA. // chr8 // 81 // 97 // 30 // 37 // 0 /// XM_006244003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mutL homolog 1, colon cancer, nonpolyposis type 2 (E. coli) (Mlh1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:118828405:118865320:-1 gene:ENSRNOG00000033809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// U80054 // GenBank // Rattus norvegicus mismatch repair protein (MLH1) mRNA, complete cds. // chr8 // 81 // 97 // 30 // 37 // 0 /// GENSCAN00000022151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:118828405:118865320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT055894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT055893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
XM_001076458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 and cysteine rich domain (Stac), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_343491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 and cysteine rich domain (Stac), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011780 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:119169640:119287534:-1 gene:ENSRNOG00000008865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:119169640:119261947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT055901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NR_031874 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-128-2 (Mir128-2), microRNA. // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053730 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:8:119718185:119718268:-1 gene:ENSRNOG00000035607 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT055905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT055907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-128-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000901 Rattus norvegicus miR-128-2 stem-loop // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001029910 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 6 interacting protein (Pdcd6ip), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121231794:121286785:-1 gene:ENSRNOG00000008981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121234829:121286653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001076670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 2 (Fbxl2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006226592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 2 (Fbxl2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244021 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 2 (Fbxl2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_343495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 2 (Fbxl2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033126 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:121556744:121594358:-1 gene:ENSRNOG00000027099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121552995:121584997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT055922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001108785 // RefSeq // Rattus norvegicus cartilage associated protein (Crtap), mRNA. // chr8 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// XM_006243992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cartilage associated protein (Crtap), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006244022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cartilage-associated protein-like (LOC102555086), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074238 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:121711130:121714981:-1 gene:ENSRNOG00000045836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121730386:121734309:-1 gene:ENSRNOG00000048343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000013519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121695471:121703895:-1 gene:ENSRNOG00000009878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121695889:121734238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_133532 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 4 (Ccr4), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006243916 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 4 (Ccr4), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121843660:121844742:-1 gene:ENSRNOG00000010315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF432872 // GenBank // Rattus norvegicus LEW C-C chemokine receptor 4 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121843660:121844742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191801 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif containing 71, E3 ubiquitin protein ligase (Trim71), mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121865609:121917140:-1 gene:ENSRNOG00000030098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121865609:121917140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001007003 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 10 (Cnot10), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000013815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121945850:122001591:-1 gene:ENSRNOG00000010334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// BC083782 // GenBank // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 10, mRNA (cDNA clone MGC:94752 IMAGE:7096219), complete cds. // chr8 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// FQ218254 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA6YN21 mRNA sequence. // chr8 // 72 // 72 // 28 // 39 // 1 /// GENSCAN00000027306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121946122:121959466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121969091:122029489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1 /// NONRATT055929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT055930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT055931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1
NM_001109300 // RefSeq // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 7 (Cmtm7), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:122126648:122153564:-1 gene:ENSRNOG00000010986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// FQ225980 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YH17 mRNA sequence. // chr8 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT055934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000043932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:122125442:122260692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT055933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_198754 // RefSeq // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8 (Cmtm8), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:122160586:122218002:-1 gene:ENSRNOG00000011201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF538323 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine-like related protein 8 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC088094 // GenBank // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:108531 IMAGE:7325894), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006243964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 8 (Cmtm8), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT055936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:122125442:122260692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001191885 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like (Gpd1l), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:122268134:122300375:-1 gene:ENSRNOG00000026455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ211779 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YE22 mRNA sequence. // chr8 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000043937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:122270749:122384499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT055940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001170539 // RefSeq // Rattus norvegicus STT3B, subunit of the oligosaccharyltransferase complex (catalytic) (Stt3b), mRNA. // chr8 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:122604522:122668755:-1 gene:ENSRNOG00000011922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// AY310157 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1573 mRNA, complete cds. // chr8 // 97 // 73 // 28 // 29 // 0 /// BC166740 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Oligosaccharyl transferase 3 CG7748-PA, mRNA (cDNA clone MGC:188469 IMAGE:7937421), complete cds. // chr8 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:122593665:122732864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 68 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT055942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT055941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1
NONRATT055943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222381 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YD07 mRNA sequence. // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_031132 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta receptor 2 (Tgfbr2), mRNA. // chr8 // 82 // 88 // 23 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:123585765:123671209:-1 gene:ENSRNOG00000013265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GU067683 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor beta receptor type II mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// L09653 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor-b type II receptor mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// S67770 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor-beta type II receptor (TGF-beta RII) mRNA, complete cds. // chr8 // 82 // 88 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:123585889:123634732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_002727143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 3 (Rbms3), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 3 (Rbms3), transcript variant X6, mRNA. // chr8 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XR_356669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 3 (Rbms3), transcript variant X8, misc_RNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:124107645:124353670:-1 gene:ENSRNOG00000025881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000036672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:124107645:124353670:-1 gene:ENSRNOG00000025881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000039904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:124107645:124353670:-1 gene:ENSRNOG00000025881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000041548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:124104381:124353670:-1 gene:ENSRNOG00000025881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT055947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:124160032:124248065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XM_001078269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 10 (Ano10), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_236774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 10 (Ano10), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000035371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:130005122:130077030:-1 gene:ENSRNOG00000000219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:130036911:130114928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT056019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
ENSRNOT00000013273 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:124991065:124991924:-1 gene:ENSRNOG00000009998 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT055951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 73 // 60 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:124991363:125047592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_006226599 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S16-like (RGD1559743), mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// XM_006244036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S16-like (RGD1559743), mRNA. // chr8 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000049805 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:125376537:125377020:-1 gene:ENSRNOG00000029347 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000028202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:125376537:125376978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT055953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
XM_006226603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (Zcwpw2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006226605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (Zcwpw2), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006226606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (Zcwpw2), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006244040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (Zcwpw2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CW type with PWWP domain 2 (Zcwpw2), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT055955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1
NM_001199225 // RefSeq // Rattus norvegicus COX assembly mitochondrial protein 1 (Cmc1), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COX assembly mitochondrial protein 1 (Cmc1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:125679760:125737762:-1 gene:ENSRNOG00000010149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001135259 // RefSeq // Rattus norvegicus COX assembly mitochondrial protein 1 (Cmc1), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT055957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:125713919:125716886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_017035 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, delta 1 (Plcd1), mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000045493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:126970655:126991422:-1 gene:ENSRNOG00000032238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// EF089258 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase C delta 1 long form mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:126970922:126984723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001108194 // RefSeq // Rattus norvegicus oxidative-stress responsive 1 (Oxsr1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127127110:127216712:-1 gene:ENSRNOG00000013136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000006447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127129757:127179607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT055967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT055968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_198130 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid differentiation primary response 88 (Myd88), mRNA. // chr8 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127229273:127233342:-1 gene:ENSRNOG00000013634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY191270 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid differentiation primary response gene 88 mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC097266 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid differentiation primary response gene 88, mRNA (cDNA clone MGC:114236 IMAGE:7459961), complete cds. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127230862:127233260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT055970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001160162 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type V, alpha subunit (Scn5a), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// NM_013125 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type V, alpha subunit (Scn5a), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127375781:127471879:-1 gene:ENSRNOG00000015049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127375781:127471879:-1 gene:ENSRNOG00000015049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AF353637 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel Nav1.5a mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// M27902 // GenBank // Rat cardiac specific sodium channel alpha-subunit mRNA, complete cds. // chr8 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127363428:127455814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// EF618549 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated sodium channel type V alpha subunit mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 36 // 90 // 10 // 28 // 0 /// EF618550 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated sodium channel type V alpha subunit variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr8 // 33 // 87 // 9 // 27 // 0
NM_017247 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type X, alpha subunit (Scn10a), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127503062:127619947:-1 gene:ENSRNOG00000032473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127503494:127573577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_019265 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type XI, alpha subunit (Scn11a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127654506:127724240:-1 gene:ENSRNOG00000032884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF059030 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated Na channel alpha subunit NaN mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127655033:127718374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_019385 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi reassembly stacking protein 1 (Gorasp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127811974:127824020:-1 gene:ENSRNOG00000018047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF015264 // GenBank // Rattus norvegicus golgi peripheral membrane protein p65 (GRASP65) mRNA, complete cds. // chr8 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// BC081809 // GenBank // Rattus norvegicus golgi reassembly stacking protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7112328). // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC161850 // GenBank // Rattus norvegicus golgi reassembly stacking protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187373 IMAGE:8369057), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127813094:127824225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT055984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT055985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001108786 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (Csrnp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (Csrnp1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006244119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (Csrnp1), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006244120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine-serine-rich nuclear protein 1 (Csrnp1), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000050543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127861112:127867216:-1 gene:ENSRNOG00000033433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127862128:127916206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT055987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xin actin-binding repeat-containing protein 1-like (LOC100910104), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// XM_006244151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xin actin-binding repeat-containing protein 1-like (LOC100910104), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// ENSRNOT00000055888 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:127905395:127909166:-1 gene:ENSRNOG00000037085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127862128:127916206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0
XM_006226620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xin actin-binding repeat-containing protein 1-like (LOC100910104), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xin actin-binding repeat-containing protein 1-like (LOC100910104), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127862128:127916206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xin actin-binding repeat-containing protein 1-like (LOC100910104), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xin actin-binding repeat-containing protein 1-like (LOC100910104), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055888 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:127905395:127909166:-1 gene:ENSRNOG00000037085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127862128:127916206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133534 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X3-C motif) receptor 1 (Cx3cr1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:127941653:127955411:-1 gene:ENSRNOG00000018509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U04808 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley putative G-protein coupled receptor (GCR) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT055992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:127935656:127942911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000025383 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:128143845:128144634:-1 gene:ENSRNOG00000018786 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000025628 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:128376548:128376967:-1 gene:ENSRNOG00000018961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:128376518:128382050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
ENSRNOT00000034355 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:128393016:128393360:-1 gene:ENSRNOG00000026168 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT055995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006244175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus unc-51 like kinase 4 (Ulk4), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128827983:129119610:-1 gene:ENSRNOG00000019271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000055871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129032916:129102823:-1 gene:ENSRNOG00000019271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000064688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128827983:129119610:-1 gene:ENSRNOG00000019271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129082297:129119610:-1 gene:ENSRNOG00000019271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000066757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129032817:129119610:-1 gene:ENSRNOG00000019271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128829700:129119610:-1 gene:ENSRNOG00000019271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129097935:129119610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 30 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000035323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:128976208:129081682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_012829 // RefSeq // Rattus norvegicus cholecystokinin (Cck), mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129312786:129319370:-1 gene:ENSRNOG00000019321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// M25942 // GenBank // Rat cholecystokinin mRNA, complete cds. // chr8 // 88 // 83 // 21 // 24 // 0 /// X01032 // GenBank // Rat brain mRNA for cholecystokinin (CCK) precursor. // chr8 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT056000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129313030:129339483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
XM_006244125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysozyme-like 4 (Lyzl4), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129406685:129411111:-1 gene:ENSRNOG00000019350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// HM125534 // GenBank // Rattus norvegicus strain W lysozyme like-4 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129361364:129411940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_001078210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 198, member A (Fam198a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_236724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 198, member A (Fam198a), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129772970:129787561:1 gene:ENSRNOG00000025676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000055866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129772970:129788337:1 gene:ENSRNOG00000025676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129754969:129787561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT054308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_078621 // RefSeq // Rattus norvegicus atypical chemokine receptor 2 (Ackr2), mRNA. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129716224:129717908:1 gene:ENSRNOG00000019472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC086449 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:105345 IMAGE:7304127), complete cds. // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus atypical chemokine receptor 2 (Ackr2), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// XM_006244055 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus atypical chemokine receptor 2 (Ackr2), transcript variant X10, mRNA. // chr8 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// U92803 // GenBank // Rattus norvegicus CC-chemokine-binding receptor JAB61 mRNA, complete cds. // chr8 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129716492:129717640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT054306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_001108195 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 40 (Klhl40), mRNA. // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129596190:129601706:1 gene:ENSRNOG00000019390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129596276:129601312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT054302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006226629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 47 (Zbtb47), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006244166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 47 (Zbtb47), transcript variant X2, mRNA. // chr8 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:129581305:129586826:1 gene:ENSRNOG00000019382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006244167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 47 (Zbtb47), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:129520231:129588235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT054297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001191802 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 445 (Zfp445), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131040161:131054065:-1 gene:ENSRNOG00000025554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131039848:131054065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT056026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001047920 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 60S RIBOSOMAL PROTEIN L7 (LOC367195), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131181081:131181491:-1 gene:ENSRNOG00000031912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131179914:131181491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT056027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000005502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131184119:131187503:-1 gene:ENSRNOG00000004135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085913 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110059G10, mRNA (cDNA clone MGC:94788 IMAGE:7106823), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ226096 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YA13 mRNA sequence. // chr8 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131184390:131187644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT056028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039014 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 3 (Zdhhc3), mRNA. // chr8 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000005817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131320550:131342691:-1 gene:ENSRNOG00000004344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AY886522 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC3 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC128697 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:156471 IMAGE:7444822), complete cds. // chr8 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// XM_006244184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 3 (Zdhhc3), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// XM_006244186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 3 (Zdhhc3), transcript variant X3, mRNA. // chr8 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// NONRATT056034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131313977:131342663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NONRATT056034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001106869 // RefSeq // Rattus norvegicus CUB domain containing protein 1 (Cdcp1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131412948:131449580:-1 gene:ENSRNOG00000004743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131415557:131449459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_057212 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 158 (Tmem158), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131497635:131498492:-1 gene:ENSRNOG00000004757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AB028891 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for brain specific binding protein, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131459276:131498492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT056038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133296 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (proline IMINO transporter), member 20 (Slc6a20), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000007467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131864860:131905953:-1 gene:ENSRNOG00000006010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ211786 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YC01 mRNA sequence. // chr8 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131865755:131943435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001024266 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine zipper transcription factor-like 1 (Lztfl1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper transcription factor-like 1 (Lztfl1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131928287:131943478:-1 gene:ENSRNOG00000006244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078913 // GenBank // Rattus norvegicus leucine zipper transcription factor-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7121316). // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC092585 // GenBank // Rattus norvegicus leucine zipper transcription factor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:108960 IMAGE:7127181), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ219473 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YA10 mRNA sequence. // chr8 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// NONRATT056046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:131865755:131943435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT056047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001106870 // RefSeq // Rattus norvegicus FYVE and coiled-coil domain containing 1 (Fyco1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000008630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:131995143:132061908:-1 gene:ENSRNOG00000006336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132029823:132058623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT056048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001106871 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C motif) receptor 1 (Xcr1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C motif) receptor 1 (Xcr1), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:132062477:132070113:-1 gene:ENSRNOG00000006620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132065624:132106634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000020256 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:132123052:132123386:-1 gene:ENSRNOG00000015100 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132130654:132130988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000002651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132123052:132123386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NM_020542 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 1 (Ccr1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:132147929:132153481:-1 gene:ENSRNOG00000006715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079207 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:94269 IMAGE:7131790), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132148357:132149424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT056052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132253474:132279427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001106872 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 1-like 1 (Ccr1l1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:132278357:132279427:-1 gene:ENSRNOG00000006730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:132253474:132279427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT056053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001106809 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 26 homolog B (S. pombe) (Vps26b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:28074137:28095244:-1 gene:ENSRNOG00000047235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161865 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 26 homolog B (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:187418 IMAGE:7105156), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:28076267:28095379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007661 // RefSeq // Rattus norvegicus thymocyte nuclear protein 1 (Thyn1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000073373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:28064823:28073704:1 gene:ENSRNOG00000047053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC064031 // GenBank // Rattus norvegicus thymocyte nuclear protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72984 IMAGE:6887845), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ213324 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YH20 mRNA sequence. // chr8 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:28069739:28073572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0
NM_001013955 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 42 (Trim42), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:104651864:104672890:-1 gene:ENSRNOG00000048975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC087151 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:95199 IMAGE:7131982), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:104652034:104672746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
NM_001029910 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 6 interacting protein (Pdcd6ip), mRNA. // chrU // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000012114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:121231794:121286785:-1 gene:ENSRNOG00000008981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// GENSCAN00000001662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:121234829:121286653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_012906 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor-like protein 2 (Aplp2), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_022520 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor-like protein 2 (Aplp2), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000070818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32323517:32353901:-1 gene:ENSRNOG00000047179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000074166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32323517:32353901:-1 gene:ENSRNOG00000047179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000074457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:32323517:32353901:-1 gene:ENSRNOG00000047179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:32324760:32358632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_053521 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/choline cotransporter), member 7 (Slc5a7), mRNA. // chr9 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// XM_006244252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/choline cotransporter), member 7 (Slc5a7), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:4343096:4379724:-1 gene:ENSRNOG00000010597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AB030947 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for high-affinity choline transporter CHT1, complete cds. // chr9 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:4346022:4467585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT057425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_031732 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 3 (Sult1c3), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfotransferase 1C1-like (LOC100910235), mRNA. // chr9 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000015189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:3978164:4025610:-1 gene:ENSRNOG00000011269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC088125 // GenBank // Rattus norvegicus sulfotransferase family, cytosolic, 1C, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:108652 IMAGE:7324981), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// FQ218678 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YG23 mRNA sequence. // chr9 // 87 // 89 // 27 // 31 // 0 /// L22339 // GenBank // Rat N-hydroxy-2-acetylaminofluorene (ST1C1) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// FQ209470 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YH24 mRNA sequence. // chr9 // 65 // 89 // 20 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000073468 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:3363066:3366615:-1 gene:ENSRNOG00000047720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 37 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000031086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3978371:3984200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 37 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT057424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3990364:4023804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000020368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3363066:3425579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
XM_002727150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfotransferase 1C2A-like (RGD1559960), mRNA. // chr9 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000047615 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:3910785:3935735:-1 gene:ENSRNOG00000040195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000065839 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:3910785:3935735:-1 gene:ENSRNOG00000040195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000031088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3910785:3972215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
XM_001065750 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shugoshin-like 1 (S. pombe) (Sgol1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_343514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shugoshin-like 1 (S. pombe) (Sgol1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000065721 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:3460288:3473013:1 gene:ENSRNOG00000022499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3467643:3473019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT056078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// NONRATT056079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
XM_003750615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brain acid soluble protein 1-like (LOC100910172), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000072233 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:3229471:3230130:1 gene:ENSRNOG00000046107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000020373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3229471:3317738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001134567 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (Pp2d1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006251083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2C-like domain containing 1 (Pp2d1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000006325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:72968271:72989251:-1 gene:ENSRNOG00000004719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:72929034:72996578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_001106879 // RefSeq // Rattus norvegicus EF hand domain family, member B (Efhb), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF hand domain family, member B (Efhb), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF hand domain family, member B (Efhb), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42946:114389:1 gene:ENSRNOG00000012618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42945:114388:1 gene:ENSRNOG00000012618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166482 // GenBank // Rattus norvegicus EF hand domain family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:187959 IMAGE:7098775), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42987:87770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT056055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001065275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S26-like (RGD1559808), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_236845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S26-like (RGD1559808), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:37318279:37318626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001012129 // RefSeq // Rattus norvegicus SATB homeobox 1 (Satb1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006244221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SATB homeobox 1 (Satb1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:2150780:2222014:1 gene:ENSRNOG00000012942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC085814 // GenBank // Rattus norvegicus SATB homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:94048 IMAGE:7123102), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:2157314:2169041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:2173187:2195610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT056067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT056068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
XR_338491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// XR_357468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// FQ217911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA14YD18 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT059021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 62 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 41 // 41 // 26 // 63 // 1
NM_001134762 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 5 (Tbc1d5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000014171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:1106437:1704245:1 gene:ENSRNOG00000010637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC162056 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7114456), complete cds. // chr9 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT056060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT056059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT056061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000053413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:1667950:1729900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001108586 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulocalbin 1, EF-hand calcium binding domain (Rcn1), mRNA. // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000018074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:102026257:102040504:-1 gene:ENSRNOG00000013452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT056080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 41 // 94 // 12 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:102027900:102040052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001109414 // RefSeq // Rattus norvegicus deleted in azoospermia-like (Dazl), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:11575025:11591973:1 gene:ENSRNOG00000023474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001135011 // RefSeq // Rattus norvegicus raftlin lipid raft linker 1 (Rftn1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:11679882:11880237:1 gene:ENSRNOG00000011321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:11766356:11906091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT056092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT056091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
XM_006226766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled associated activator of morphogenesis 2 (Daam2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000061713 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:12381132:12423558:1 gene:ENSRNOG00000023351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000035286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:12381132:12423558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT056094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT056095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 19 // 43 // 1 /// NONRATT056098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
NM_001106883 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 2 (Apobec2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13451685:13465230:1 gene:ENSRNOG00000012303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168177 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:187839 IMAGE:9035251), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224967 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YE05 mRNA sequence. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13451830:13461380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT056108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012865 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor-Y alpha (Nfya), mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000017157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13474260:13497400:1 gene:ENSRNOG00000012702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ223023 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YD20 mRNA sequence. // chr9 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// M34238 // GenBank // Rat CCAAT binding transcription factor-B subunit (CBF-B) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13483071:13497181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT056112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
XM_006226719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus natural cytotoxicity triggering receptor 2-like (LOC102555120), mRNA. // chr9 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// XM_006244501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus natural cytotoxicity triggering receptor 2-like (LOC102555120), mRNA. // chr9 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000065673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:13701131:13709143:1 gene:ENSRNOG00000042230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13701131:13709143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13768987:13946063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0
XM_006226720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells 1-like (LOC680920), mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// XM_006244494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells 1-like (LOC680920), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000066779 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:13773890:13787677:1 gene:ENSRNOG00000042468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13768987:13946063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_003750636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910668 (LOC100910668), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003750642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911489 (LOC100911489), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910668 (LOC100910668), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15055726:15057254:1 gene:ENSRNOG00000048233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13875029:13876557:1 gene:ENSRNOG00000046526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108788 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box P4 (Foxp4), mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P4 (Foxp4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006244461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P4 (Foxp4), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// XM_006244462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P4 (Foxp4), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13993012:14049324:1 gene:ENSRNOG00000022804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14004483:14054312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT056120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001109301 // RefSeq // Rattus norvegicus MyoD family inhibitor (Mdfi), mRNA. // chr9 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006244475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MyoD family inhibitor (Mdfi), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006244476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MyoD family inhibitor (Mdfi), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000020432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14090319:14108948:1 gene:ENSRNOG00000014987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// BC158727 // GenBank // Rattus norvegicus similar to inhibitor of MyoD family-a, mRNA (cDNA clone MGC:187880 IMAGE:9091612), complete cds. // chr9 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// NONRATT056121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14090181:14124167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006226724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prickle homolog 4 (Drosophila) (Prickle4), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prickle homolog 4 (Drosophila) (Prickle4), mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000019177 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:14234280:14237235:1 gene:ENSRNOG00000014180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14230865:14241264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_001060392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 6 homolog (yeast) (Tomm6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002727162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 6 homolog (yeast) (Tomm6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070805 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:14237733:14238645:1 gene:ENSRNOG00000046316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14230865:14241264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT056130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001108197 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF8 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000020499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14436067:14450890:1 gene:ENSRNOG00000015249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14436088:14446048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// GENSCAN00000023312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14446718:14454432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
XM_003754503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912849 (LOC100912849), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912849 (LOC100912849), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020640 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:14504411:14525748:1 gene:ENSRNOG00000015386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006226725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912849 (LOC100912849), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006226727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912849 (LOC100912849), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006226729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912849 (LOC100912849), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006226731 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912849 (LOC100912849), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14524247:14525757:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT056134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001106887 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase activator 1a (retina) (Guca1a), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate cyclase activator 1a (retina) (Guca1a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14530794:14541019:1 gene:ENSRNOG00000015402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14530794:14541019:1 gene:ENSRNOG00000015402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14531395:14540918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT056136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001178071 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2 (Ubr2), mRNA. // chr9 // 96 // 94 // 45 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000021158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14919790:14997035:1 gene:ENSRNOG00000015813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 94 // 46 // 47 // 0 /// BC107934 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7308717), partial cds. // chr9 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14945034:14997035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT056145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 26 // 26 // 13 // 50 // 1
ENSRNOT00000012007 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:15315677:15316074:1 gene:ENSRNOG00000022566 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001106888 // RefSeq // Rattus norvegicus GLTSCR1-like (Gltscr1l), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLTSCR1-like (Gltscr1l), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15372871:15401348:1 gene:ENSRNOG00000016229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XR_356861 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555718 (LOC102555718), ncRNA. // chr9 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15372766:15400156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT056150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15195889:15223208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
FQ214078 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YA05 mRNA sequence. // chr9 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT056152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NONRATT056152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT056153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000053092 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:54235952:54236020:1 gene:ENSRNOG00000045722 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 53 // 58 // 10 // 19 // 0 /// NONRATT027584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 73 // 100 // 24 // 33 // 0 /// FQ227960 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YB07 mRNA sequence. // chr9 // 36 // 100 // 12 // 33 // 0 /// NONRATT007950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 100 // 12 // 33 // 0 /// NONRATT048207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 100 // 12 // 33 // 0
NM_001106889 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine kinase 7 (Ptk7), mRNA. // chrU // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061432 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:15569249:15634049:1 gene:ENSRNOG00000039976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15569365:15649916:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT056185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001109302 // RefSeq // Rattus norvegicus serum response factor (c-fos serum response element-binding transcription factor) (Srf), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15642594:15652177:1 gene:ENSRNOG00000018232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15569365:15649916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT056187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001191582 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin 9 (Cul9), mRNA. // chr9 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000028786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15654761:15745377:1 gene:ENSRNOG00000018372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000052728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15654761:15677143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 61 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15730045:15745254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 37 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT056194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_001271230 // RefSeq // Rattus norvegicus tau tubulin kinase 1 (Ttbk1), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15761885:15798787:1 gene:ENSRNOG00000018416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15757814:15828364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_001271230 // RefSeq // Rattus norvegicus tau tubulin kinase 1 (Ttbk1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15761885:15798787:1 gene:ENSRNOG00000018416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15757814:15828364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NONRATT056199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053537 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 7 (Slc22a7), mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15822368:15828166:1 gene:ENSRNOG00000018420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AY816233 // GenBank // Rattus norvegicus organic anion transporter 2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// L27651 // GenBank // Rattus norvegicus liver-specific transport protein mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15757814:15828364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT056200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
NM_001034136 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L2 (Mrpl2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15550237:15554009:-1 gene:ENSRNOG00000018057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC100081 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L2, mRNA (cDNA clone MGC:112706 IMAGE:7325700), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ229593 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YG11 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15536182:15552556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT057499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
XM_006244574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cullin-7-like (LOC680835), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15536182:15548930:-1 gene:ENSRNOG00000017857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15536182:15552556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15233343:15309468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001044286 // RefSeq // Rattus norvegicus male-enhanced antigen 1 (Mea1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus male-enhanced antigen 1 (Mea1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006244567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus male-enhanced antigen 1 (Mea1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006244569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus male-enhanced antigen 1 (Mea1), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15516930:15518751:-1 gene:ENSRNOG00000017144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089978 // GenBank // Rattus norvegicus male-enhanced antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:109389 IMAGE:7317693), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15517166:15518189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT057491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
NM_057125 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 6 (Pex6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15475358:15487515:-1 gene:ENSRNOG00000016655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D63673 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peroxisome assembly factor-2, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15475570:15487495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001134710 // RefSeq // Rattus norvegicus canopy FGF signaling regulator 3 (Cnpy3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15450330:15465055:1 gene:ENSRNOG00000016315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166762 // GenBank // Rattus norvegicus canopy 3 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:188521 IMAGE:7931606), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15450352:15464138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT056158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_017084 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine N-methyltransferase (Gnmt), mRNA. // chr9 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// XM_006244506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycine N-methyltransferase-like (LOC100911564), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15471889:15475241:1 gene:ENSRNOG00000016349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072812 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:15229670:15232910:1 gene:ENSRNOG00000048623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ219064 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YA01 mRNA sequence. // chr9 // 83 // 67 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15229670:15233072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15471893:15475139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108201 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 10 (Abcc10), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15938028:15957940:1 gene:ENSRNOG00000018863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15941288:15957637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001108203 // RefSeq // Rattus norvegicus tight junction associated protein 1 (Tjap1), mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006244527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tight junction associated protein 1 (Tjap1), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006244532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tight junction associated protein 1 (Tjap1), transcript variant X9, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000025660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15983152:16007447:1 gene:ENSRNOG00000018980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// FQ221753 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YE23 mRNA sequence. // chr9 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// FQ221813 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA31YI17 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000033197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15983104:16006714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT056208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT056209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT056210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001008330 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) I polypeptide C (Polr1c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16017436:16021548:1 gene:ENSRNOG00000019079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY325219 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-127 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// BC086597 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) I polypeptide C, mRNA (cDNA clone MGC:105583 IMAGE:7312277), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16017492:16021355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT056212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108204 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), eta (Polh), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16059843:16093621:1 gene:ENSRNOG00000019195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16068709:16092822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001009699 // RefSeq // Rattus norvegicus MAD2L1 binding protein (Mad2l1bp), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16112968:16117289:1 gene:ENSRNOG00000019463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088268 // GenBank // Rattus norvegicus MAD2L1 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:109107 IMAGE:7379293), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16112974:16116894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_001108205 // RefSeq // Rattus norvegicus radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas) (Rsph9), mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006244538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus radial spoke head 9 homolog (Chlamydomonas) (Rsph9), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16120949:16140296:1 gene:ENSRNOG00000019474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16121003:16133117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT056216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
XM_003750650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 63B (Tmem63b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// XM_006226768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 63B (Tmem63b), mRNA. // chr9 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// XM_006244583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 63B (Tmem63b), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000026728 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:16593695:16613274:1 gene:ENSRNOG00000019743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000021958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16599665:16657896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT056235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1
NM_001002806 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 11 (Capn11), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006244556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 11 (Capn11), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000065754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16617252:16638760:1 gene:ENSRNOG00000026025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000067104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16617252:16638760:1 gene:ENSRNOG00000026025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC097256 // GenBank // Rattus norvegicus calpain 11, mRNA (cDNA clone MGC:114218 IMAGE:7457866), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT056239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000021958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16599665:16657896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 30 // 44 // 1
ENSRNOT00000064497 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:16670994:16671263:1 gene:ENSRNOG00000042497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16671009:16711766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001004082 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 90 alpha (cytosolic), class B member 1 (Hsp90ab1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16706486:16712003:1 gene:ENSRNOG00000019834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY695392 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/NHsdMcwi heat shock protein 90 (Hsp90) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY695393 // GenBank // Rattus norvegicus strain SS/JrHsdMcwi heat shock protein 90 (Hsp90) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC082009 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 90kDa alpha (cytosolic), class B member 1, mRNA (cDNA clone MGC:94263 IMAGE:7131767), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ227008 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YK03 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// FQ233455 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YM11 mRNA sequence. // chr9 // 75 // 50 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000021983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16671009:16711766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT056258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001191804 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 151B (Tmem151b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16732153:16734756:1 gene:ENSRNOG00000019958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16731994:16734756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_181376 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated, serine-rich 1 (Spats1), mRNA. // chr9 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16800670:16835204:1 gene:ENSRNOG00000019963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AY157978 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenic serine-rich protein (Srsp1) mRNA, complete cds. // chr9 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT056263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16796601:16876604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT056264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NONRATT056264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NM_053527 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 5-like (Cdc5l), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16838171:16876916:1 gene:ENSRNOG00000019975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF000578 // GenBank // Rattus norvegicus Cdc5-like protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC087007 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 5-like (S. pombe), mRNA (cDNA clone IMAGE:7125496). // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC161839 // GenBank // Rattus norvegicus CDC5 cell division cycle 5-like (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:187349 IMAGE:9101355), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16796601:16876604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001109479 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685722 (LOC685722), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:17376809:17377975:1 gene:ENSRNOG00000020166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:17370754:17377918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001278483 // RefSeq // Rattus norvegicus runt-related transcription factor 2 (Runx2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000061014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:17450988:17658363:1 gene:ENSRNOG00000020193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NM_001278484 // RefSeq // Rattus norvegicus runt-related transcription factor 2 (Runx2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:17529448:17550772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001106892 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (Enpp4), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006244598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 4 (Enpp4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18326766:18336443:1 gene:ENSRNOG00000010174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000065048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18326766:18336443:1 gene:ENSRNOG00000010174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000003003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18321037:18333386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_053500 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 27 (Slc25a27), mRNA. // chr9 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// XM_006244614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 27 (Slc25a27), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000052068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18758260:18783966:1 gene:ENSRNOG00000010592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AJ300163 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for uncoupling protein UCP-4 (Ucp-4 gene) isoform b. // chr9 // 90 // 83 // 27 // 30 // 0 /// AY512661 // GenBank // Rattus norvegicus NYGGF5 (Nyggf5) mRNA, complete cds. // chr9 // 89 // 75 // 24 // 27 // 0 /// AJ300164 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for uncoupling protein UCP-4 (Ucp-4 gene) isoform c. // chr9 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT056278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// GENSCAN00000008141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18763969:18781930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001191583 // RefSeq // Rattus norvegicus tudor domain containing 6 (Tdrd6), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18795408:18810346:1 gene:ENSRNOG00000025693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18794852:18812034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_013143 // RefSeq // Rattus norvegicus meprin 1 alpha (Mep1a), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18925166:18953891:1 gene:ENSRNOG00000011022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081834 // GenBank // Rattus norvegicus meprin 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93579 IMAGE:7128404), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18933285:18966185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT056284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_181475 // RefSeq // Rattus norvegicus CD2-associated protein (Cd2ap), mRNA. // chr9 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:19659500:19720953:1 gene:ENSRNOG00000011987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY114147 // GenBank // Rattus norvegicus CD2-associated protein mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// AY205155 // GenBank // Rattus norvegicus CD2AP/CMS mRNA, complete cds. // chr9 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19629256:19719822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_001069077 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 111 (Gpr111), mRNA. // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_236958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 111 (Gpr111), mRNA. // chr9 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000033075 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:19779970:19790176:1 gene:ENSRNOG00000025603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19751206:19792795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
XM_006226770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 115 (Gpr115), mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000016906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:19813518:19843613:1 gene:ENSRNOG00000012535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19805953:19916856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// FQ222190 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA27YH09 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0
NM_181772 // RefSeq // Rattus norvegicus opsin 5 (Opn5), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000031759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:19906290:19953530:1 gene:ENSRNOG00000012689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY288431 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 136 (Gpr136) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT056295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
XM_006226757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylmalonyl CoA mutase (Mut), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylmalonyl CoA mutase (Mut), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075279 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:22184294:22208962:-1 gene:ENSRNOG00000050843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22184294:22208962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT057577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001145062 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine-N-acyltransferase-like 3 (Glyatl3), mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22236745:22248032:1 gene:ENSRNOG00000050990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22237965:22248032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NONRATT056300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000073595 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:22278200:22282379:1 gene:ENSRNOG00000048967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ212996 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YE23 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22278243:22278761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001011710 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein 2 (Crisp2), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22361201:22385461:1 gene:ENSRNOG00000013225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB009662 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for testis specific protein, complete cds. // chrU // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC078799 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93370 IMAGE:7112769), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22364649:22372107:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// AF078552 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein-2 CRISP-2 (tpx-1) mRNA, complete cds. // chrU // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// NONRATT056309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
XM_006226758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548541 (LOC102548541), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22157348:22184929:1 gene:ENSRNOG00000049135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY310141 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1078 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001145062 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine-N-acyltransferase-like 3 (Glyatl3), mRNA. // chr9 // 100 // 49 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22236745:22248032:1 gene:ENSRNOG00000050990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 49 // 19 // 19 // 0 /// NM_001014215 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein Q (Cenpq), mRNA. // chr9 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// BC082113 // GenBank // Rattus norvegicus centromere protein Q, mRNA (cDNA clone MGC:95330 IMAGE:7135459), complete cds. // chr9 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// GENSCAN00000020601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22237965:22248032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT056297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT056298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT056299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1
ENSRNOT00000071630 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:22221885:22222164:1 gene:ENSRNOG00000047704 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT056296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22221937:22237461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NONRATT056300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000073595 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:22278200:22282379:1 gene:ENSRNOG00000048967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212996 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YE23 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22278243:22278761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006244646 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553880 (LOC102553880), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000060827 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:22417471:22419876:-1 gene:ENSRNOG00000039663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_022859 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein 1 (Crisp1), mRNA. // chr9 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22926874:22948639:1 gene:ENSRNOG00000013496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// M31173 // GenBank // Rat epididymal glycoprotein (AEG) mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// X04643 // GenBank // Rat mRNA for epididymal secretory glycoproteins. // chr9 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT056310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22930152:22942361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001012130 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglycerate kinase 2 (Pgk2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22956349:22957913:1 gene:ENSRNOG00000013600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083568 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglycerate kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93835 IMAGE:7111073), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22956395:23190954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT056312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000031811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:24063708:24064582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006244648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-2 delta (Tfap2d), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_001106895 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor AP-2 delta (Tfap2d), mRNA. // chrU // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000065053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:24167386:24227618:1 gene:ENSRNOG00000011642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT056313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000031801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:24168030:24227468:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001106896 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor AP-2 beta (Tfap2b), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-2 beta (Tfap2b), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:24273136:24302813:1 gene:ENSRNOG00000011823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:24273417:24310124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
NR_031921 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 206 (Mir206), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:9:25648214:25648297:1 gene:ENSRNOG00000035498 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-206 // miRBase Micro RNA Database // MI0000948 Rattus norvegicus miR-206 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25639591:25671415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_032117 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 133b (Mir133b), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053694 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:9:25652099:25652182:1 gene:ENSRNOG00000035571 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25639591:25671415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L33722 // GenBank // Rattus norvegicus synapse-specific noncoding (7H4) polyadenylated ssRNA, clone RACE12, CT1.5, CT3.6. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-133b // miRBase Micro RNA Database // MI0003490 Rattus norvegicus miR-133b stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106897 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17A (Il17a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:25696865:25700352:1 gene:ENSRNOG00000012467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25696923:25706012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT056321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_001070946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to class-alpha glutathione S-transferase (RGD1562107), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_343545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to class-alpha glutathione S-transferase (RGD1562107), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038486 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:26167103:26179396:1 gene:ENSRNOG00000024755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:26014397:26203583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_001108790 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 14A (Tmem14a), mRNA. // chr9 // 93 // 75 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000037489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:26187241:26204118:1 gene:ENSRNOG00000013238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// FQ213172 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YF04 mRNA sequence. // chr9 // 92 // 60 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT056332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// GENSCAN00000055313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:26014397:26203583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
BC100080 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase A3, mRNA (cDNA clone MGC:112704 IMAGE:7324340), complete cds. // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// FQ219719 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YH19 mRNA sequence. // chr9 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// NM_001009920 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase alpha 3 (Gsta3), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NM_001159739 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase alpha 3 (Gsta3), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NM_001287025 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase alpha 3 (Gsta3), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000040950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:26210313:26263967:1 gene:ENSRNOG00000029711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT056334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:26257526:26263702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000018392 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:26390796:26391986:1 gene:ENSRNOG00000013775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
XM_002727174 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH domain containing 1C (Khdc1c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002730010 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH domain containing 1C (Khdc1c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:26393821:26394888:1 gene:ENSRNOG00000028595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:26393821:26397160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000048965 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:26525502:26526055:1 gene:ENSRNOG00000030559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0
ENSRNOT00000049184 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:27715343:27716772:1 gene:ENSRNOG00000029917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:27716397:27716696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25152488:25353162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000060585 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:27991420:27995364:1 gene:ENSRNOG00000039525 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
ENSRNOT00000038782 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:28016586:28017386:1 gene:ENSRNOG00000028224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:27971231:28045700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NR_031843 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 30a (Mir30a), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053769 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:9:28377823:28377893:1 gene:ENSRNOG00000035646 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:28307992:28377935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-30a // miRBase Micro RNA Database // MI0000870 Rattus norvegicus miR-30a stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031844 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 30c-2 (Mir30c2), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000053685 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:9:28397564:28397647:1 gene:ENSRNOG00000035562 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// rno-mir-30c-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000871 Rattus norvegicus miR-30c-2 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001100842 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type IX, alpha 1 (Col9a1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:29243190:29325623:1 gene:ENSRNOG00000012920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:29235411:29312742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0
NM_139189 // RefSeq // Rattus norvegicus LMBR1 domain containing 1 (Lmbrd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:29762573:29854651:1 gene:ENSRNOG00000012178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY093598 // GenBank // Rattus norvegicus p53-related protein mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC078723 // GenBank // Rattus norvegicus LMBR1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:93159 IMAGE:7123105), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:29792800:29853805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
FQ217715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA1YA02 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222890 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YF20 mRNA sequence. // chr9 // 45 // 80 // 9 // 20 // 0
ENSRNOT00000014756 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:35215785:35216667:1 gene:ENSRNOG00000011100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:35215893:35301548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_181383 // RefSeq // Rattus norvegicus lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain (Lgsn), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lengsin, lens protein with glutamine synthetase domain (Lgsn), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000016316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:36267205:36294511:1 gene:ENSRNOG00000012205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY280501 // GenBank // Rattus norvegicus lengsin (Lgs) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:36266361:36294330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT056358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133318 // RefSeq // Rattus norvegicus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2 (Khdrbs2), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:39209750:39679399:-1 gene:ENSRNOG00000012284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF305618 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear RNA binding protein SLM-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XR_356942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 2 (Khdrbs2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT057666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001109005 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB23, member RAS oncogene family (Rab23), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB23, member RAS oncogene family (Rab23), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB23, member RAS oncogene family (Rab23), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:38152129:38175620:-1 gene:ENSRNOG00000012629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:38153254:38172480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009700 // RefSeq // Rattus norvegicus IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein (Imp4), mRNA. // chrU // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:37456907:37462041:-1 gene:ENSRNOG00000013285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY383672 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00017 mRNA, complete cds. // chrU // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// BC087066 // GenBank // Rattus norvegicus IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:94302 IMAGE:7132412), complete cds. // chrU // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:37457382:37461709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT057645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT057646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001013111 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18 (Ptpn18), mRNA. // chr9 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:40642586:40659435:1 gene:ENSRNOG00000013415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC093398 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:7389445), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC098788 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:7375352), complete cds. // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT056390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT056391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:40653768:40666857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT056392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001013226 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 39 (Prss39), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 39 (Prss39), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 39 (Prss39), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease 40-like (LOC102554718), mRNA. // chr9 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000034214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:40677390:40683058:1 gene:ENSRNOG00000023858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079254 // GenBank // Rattus norvegicus testicular serine protease 1, mRNA (cDNA clone MGC:94351 IMAGE:7133201), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:40677412:40692115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_006244725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus APC membrane recruitment protein 3 (Amer3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033700 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:40766583:40768937:1 gene:ENSRNOG00000023603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:40750197:40776087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000020876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:40810129:40823374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XM_006226792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 4 (Arhgef4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// XM_006244727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 4 (Arhgef4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// XM_006244728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 4 (Arhgef4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// ENSRNOT00000018935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:40964597:40972103:1 gene:ENSRNOG00000014035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1 /// FQ214569 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA1YI08 mRNA sequence. // chr9 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1 /// GENSCAN00000049374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:40861479:40977101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT056400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
NM_001106899 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family B (evectins) member 2 (Plekhb2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:41017135:41049780:1 gene:ENSRNOG00000014162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:41031286:41047284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT056401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NONRATT056401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001108210 // RefSeq // Rattus norvegicus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 1 (Hs6st1), mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42274321:42313302:1 gene:ENSRNOG00000014516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42274167:42311085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001034934 // RefSeq // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 5A (Mrf1 like) (Arid5a), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42534321:42538959:1 gene:ENSRNOG00000015382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC105777 // GenBank // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 5A (Mrf1 like), mRNA (cDNA clone MGC:124686 IMAGE:7931985), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42519126:42538110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
XM_006226793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fer-1-like 5 (C. elegans) (Fer1l5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// XM_006244854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fer-1-like 5 (C. elegans) (Fer1l5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000059806 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:42599347:42651825:1 gene:ENSRNOG00000024201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000008946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42599347:42651790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0
NM_001271050 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin M4 (Cnnm4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42703466:42740316:1 gene:ENSRNOG00000015886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42703466:42740316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT056412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001106901 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin M3 (Cnnm3), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42747044:42762392:1 gene:ENSRNOG00000016032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42747079:42758505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT056416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT056417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_053586 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit Vb (Cox5b), mRNA. // chr9 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000022487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42912193:42914547:1 gene:ENSRNOG00000016660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC083179 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit Vb, mRNA (cDNA clone MGC:105368 IMAGE:7300877), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// D10952 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytochrome c oxidase subunit Vb, complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000001593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42912230:42914467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NONRATT056420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012002 // RefSeq // Rattus norvegicus zeta-chain (TCR) associated protein kinase 70 (Zap70), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zeta-chain (TCR) associated protein kinase 70 (Zap70), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42980050:43002014:1 gene:ENSRNOG00000016995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC089855 // GenBank // Rattus norvegicus zeta-chain (TCR) associated protein kinase, mRNA (cDNA clone MGC:108902 IMAGE:7380367), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42989602:43001759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
XM_006226801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_349004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_356974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023617 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:43259992:43298525:1 gene:ENSRNOG00000017542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43223851:43335197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
XM_006226801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_349004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214716 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YG05 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43340519:43433686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006226801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_349004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214716 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YG05 mRNA sequence. // chr9 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43340519:43433686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_349004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214716 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YG05 mRNA sequence. // chr9 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0 /// NONRATT056424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_349004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214716 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YG05 mRNA sequence. // chr9 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43340519:43433686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_349004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_356974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43340519:43433686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006226801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_349004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43340519:43433686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XR_349004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XR_356974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3B (Vwa3b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000052054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43385706:43425208:1 gene:ENSRNOG00000023566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC083640 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC26733, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134858), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT056425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43340519:43433686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT056426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT056427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT056428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT056429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_053495 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclic nucleotide gated channel alpha 3 (Cnga3), mRNA. // chr9 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43476310:43497654:1 gene:ENSRNOG00000017582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AB002801 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cyclic nucleotide-gated channel, complete cds. // chr9 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// AJ272428 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cyclic nucleotide-gated channel 2b. // chr9 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43476891:43497290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_031002 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-4-phosphatase, type I (Inpp4a), mRNA. // chr9 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43533507:43706166:1 gene:ENSRNOG00000017660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43533507:43706166:1 gene:ENSRNOG00000017660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// U26397 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate 4-phosphatase mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43596746:43700759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENSRNOT00000051584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43701732:43714993:1 gene:ENSRNOG00000031651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY325222 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-193 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43704634:43733955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT056431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT056434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_138919 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-50 homolog (C. elegans) (Unc50), mRNA. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006244736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus unc-50 homolog (C. elegans) (Unc50), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43726249:43734121:1 gene:ENSRNOG00000018128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY017209 // GenBank // Rattus norvegicus UNC50 (Unc50) mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC061976 // GenBank // Rattus norvegicus unc-50 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:72256 IMAGE:5623807), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U96638 // GenBank // Rattus norvegicus unc-50 related protein (UNCL) mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT056435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43704634:43733955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT056436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001108212 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoyltransferase 1 (Lipt1), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipoyltransferase 1 (Lipt1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44164007:44169366:1 gene:ENSRNOG00000018464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44154932:44167853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106903 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L30 (Mrpl30), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003750682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 39S ribosomal protein L30, mitochondrial-like (LOC100910006), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000024990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44181255:44270174:1 gene:ENSRNOG00000018511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000075242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44181229:44191523:1 gene:ENSRNOG00000049330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC168851 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L30, mRNA (cDNA clone MGC:189079 IMAGE:7323830), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ224516 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA63YF15 mRNA sequence. // chr9 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44264586:44268641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44187468:44191523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001110141 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5B (Eif5b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44354656:44409587:1 gene:ENSRNOG00000023356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166424 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA (cDNA clone MGC:187399 IMAGE:7097275), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014877 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:62489112:62492094:-1 gene:ENSRNOG00000011187 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49210743:49214390:-1 gene:ENSRNOG00000046621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:62489112:62513838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44377033:44409268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49210743:49214390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT056445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001012233 // RefSeq // Rattus norvegicus neuromedin S (NMS), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244841 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuromedin S (NMS), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:45298734:45307150:1 gene:ENSRNOG00000038979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB164465 // GenBank // Rattus norvegicus NMS mRNA for neuromedin S precursor, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001025709 // RefSeq // Rattus norvegicus phosducin-like 3 (Pdcl3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:45362541:45371009:1 gene:ENSRNOG00000013286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099162 // GenBank // Rattus norvegicus phosducin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:116329 IMAGE:7381935), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211568 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YD24 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45362618:45370066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000054653 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:9:41480005:41480111:1 gene:ENSRNOG00000046105 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070128 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:9:45535732:45535838:1 gene:ENSRNOG00000049160 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108214 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal PAS domain protein 2 (Npas2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000059571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:45590021:45769792:1 gene:ENSRNOG00000013408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT056452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000038754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45696531:45778320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// NONRATT056455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1
BC062228 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L31, mRNA (cDNA clone MGC:72834 IMAGE:6921741), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT056457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001108794 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 11 (Cnot11), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:45958835:45968530:1 gene:ENSRNOG00000023220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC158750 // GenBank // Rattus norvegicus similar to DNA segment, Chr 1, Brigham & Womens Genetics 0212 expressed, mRNA (cDNA clone MGC:187932 IMAGE:9101674), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45959069:45968404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001106904 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 (Map4k4), mRNA. // chr9 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:46343468:46467917:1 gene:ENSRNOG00000014013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT056463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT056466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46371989:46478733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT056470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_053953 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 receptor, type II (Il1r2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:46526298:46566508:1 gene:ENSRNOG00000014378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091564 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 1 receptor, type II, mRNA (cDNA clone MGC:114281 IMAGE:7445971), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ229102 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YH03 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222740 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YI23 mRNA sequence. // chr9 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46533455:46566508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_013123 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 receptor, type I (Il1r1), mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 1 receptor, type I (Il1r1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:46681412:46720622:1 gene:ENSRNOG00000014504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB112436 // GenBank // Rattus norvegicus il1r1 mRNA for interleukin 1 beta receptor type 1 soluble form, complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AB112437 // GenBank // Rattus norvegicus il1r1 mRNA for interleukin 1 bete receptor type 1 long transmembrane form, complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AB112438 // GenBank // Rattus norvegicus il1r1 mRNA for interleukin 1 beta receptor type 1 short transmembrane form, complete cds. // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// M95578 // GenBank // Rattus notvegicus Sprague-Dawley interleukin-1 receptor type I mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// U14010 // GenBank // Rattus norvegicus soluble IL-1 receptor type I mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46686507:46720528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT056475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_133575 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 receptor-like 2 (Il1rl2), mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:46733619:46778352:1 gene:ENSRNOG00000014683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U49066 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-related protein mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46734421:46779046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001127689 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 receptor-like 1 (Il1rl1), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NM_013037 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 receptor-like 1 (Il1rl1), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244741 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 1 receptor-like 1 (Il1rl1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// XM_006244742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 1 receptor-like 1 (Il1rl1), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000020108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:46818261:46866353:1 gene:ENSRNOG00000014835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000020144 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:46818261:46866353:1 gene:ENSRNOG00000014835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// U04317 // GenBank // Rattus norvegicus Fit-1M (Fit-1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// U04319 // GenBank // Rattus norvegicus Fit-1S (Fit-1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 1 receptor-like 1 (Il1rl1), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 85 // 85 // 35 // 41 // 1 /// GENSCAN00000033853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46850536:46866319:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 49 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT056480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT056481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0
NM_001106905 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 18 receptor 1 (Il18r1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 18 receptor 1 (Il18r1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:46869486:46901586:1 gene:ENSRNOG00000015027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46875196:46901140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_003754525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 18 receptor accessory protein (Il18rap), mRNA. // chr9 // 98 // 81 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000020260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:46917784:46919233:1 gene:ENSRNOG00000015062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 28 // 28 // 0 /// AJ550893 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for interleukin-18 receptor accessory protein (small) (il-18R beta gene). // chr9 // 100 // 54 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46923917:46939876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 28 // 52 // 1
NM_173098 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE4, cation proton antiporter 4), member 4 (Slc9a4), mRNA. // chr9 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// XM_006244738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE4, cation proton antiporter 4), member 4 (Slc9a4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000065234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:46966185:47012387:1 gene:ENSRNOG00000015306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// M85301 // GenBank // Rat sodium-hydrogen exchange protein-isoform 4 (NHE-4) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46987755:47017118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_012653 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE2, cation proton antiporter 2), member 2 (Slc9a2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000066000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:47100080:47174866:1 gene:ENSRNOG00000015567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// L11004 // GenBank // Rat sodium-hydrogen exchange protein-isoform 2 (NHE-2) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// NM_001113335 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE2, cation proton antiporter 2), member 2 (Slc9a2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000021270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:47069438:47174866:1 gene:ENSRNOG00000015567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1 /// GENSCAN00000033862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:47147630:47178900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT056486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_001109305 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 182 (Tmem182), mRNA. // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:47219880:47271733:1 gene:ENSRNOG00000028945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT056488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000036248 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:49079376:49079747:1 gene:ENSRNOG00000024856 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49079376:49097584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_138837 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 3 homeobox 3 (Pou3f3), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:49151947:49153078:1 gene:ENSRNOG00000038909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49144154:49153279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
BC158704 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:187794 IMAGE:9030006), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NM_001100549 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S9 (Mrps9), mRNA. // chr9 // 97 // 97 // 31 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000021899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:49317820:49375391:1 gene:ENSRNOG00000016201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 97 // 31 // 32 // 1 /// BC088242 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7366193), partial cds. // chr9 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT056492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49342808:49425257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT056493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_001106906 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 45 (Gpr45), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:49508442:49511911:1 gene:ENSRNOG00000016446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49508685:49509806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT056494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008517 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AI597479 (RGD1310553), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:49573659:49584318:1 gene:ENSRNOG00000016447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086514 // GenBank // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AI597479, mRNA (cDNA clone MGC:105902 IMAGE:7134744), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49573671:49581701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108216 // RefSeq // Rattus norvegicus NCK adaptor protein 2 (Nck2), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000023029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:49915383:50040941:1 gene:ENSRNOG00000017155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT056497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50003363:50039799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
GENSCAN00000043344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50072021:50090322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT056499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_001271051 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1500015O10 (RGD1305645), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50191737:50212523:1 gene:ENSRNOG00000023576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000043345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50191737:50212523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031137 // RefSeq // Rattus norvegicus tripeptidyl peptidase II (Tpp2), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50328789:50409442:1 gene:ENSRNOG00000011194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// U50194 // GenBank // Rattus norvegicus tripeptidylpeptidase II mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006244870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripeptidyl peptidase II (Tpp2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000015161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50245873:50290437:1 gene:ENSRNOG00000048046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50327645:50415235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50244742:50309726:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT056504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006226865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 5 (Ercc5), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000059349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50592370:50637767:1 gene:ENSRNOG00000022812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50592051:50637593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
XM_001061373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 21C-like 1 (Mettl21cl1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 21C-like 1 (Mettl21cl1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039313 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:50666721:50680089:1 gene:ENSRNOG00000022762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 21C-like 1 (Mettl21cl1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006244883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 21C-like 1 (Mettl21cl1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000028085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50665224:50681167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001013171 // RefSeq // Rattus norvegicus GULP, engulfment adaptor PTB domain containing 1 (Gulp1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000004463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50936854:51211196:1 gene:ENSRNOG00000003242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000065212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50936854:51198997:1 gene:ENSRNOG00000003242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC087053 // GenBank // Rattus norvegicus GULP, engulfment adaptor PTB domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94062 IMAGE:7123670), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// DQ668344 // GenBank // Rattus norvegicus CED-6 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:51142378:51230088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
GENSCAN00000046276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:51311419:51402415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_032085 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type III, alpha 1 (Col3a1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000004956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:51689492:51725414:1 gene:ENSRNOG00000003357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// BC087039 // GenBank // Rattus norvegicus collagen, type III, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:93704 IMAGE:7097081), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000046284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:51689599:51725145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 80 // 37 // 41 // 0 /// NONRATT056517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 98 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT056519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 18 // 18 // 9 // 51 // 1
NM_001047889 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 75 (Wdr75), mRNA. // chr9 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000050275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:52359647:52383504:1 gene:ENSRNOG00000003825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// NONRATT056525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000038026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52345734:52383504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// NONRATT056522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1 /// NONRATT056523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT056524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
XM_003754517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteolipid protein 2-like (LOC685108), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006226867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin and armadillo repeat containing (Ankar), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000005313 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:52679229:52748446:1 gene:ENSRNOG00000003991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52679229:52748458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001106763 // RefSeq // Rattus norvegicus asparagine synthetase domain containing 1 (Asnsd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:52670315:52674870:1 gene:ENSRNOG00000003942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52666009:52674763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001009535 // RefSeq // Rattus norvegicus postmeiotic segregation increased 1 (S. cerevisiae) (Pms1), mRNA. // chr9 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000043714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:52784772:52871008:1 gene:ENSRNOG00000004076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC061722 // GenBank // Rattus norvegicus PMS1 postmeiotic segregation increased 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72584 IMAGE:5598508), complete cds. // chr9 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52806252:52932810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 57 // 15 // 17 // 0
XM_006226824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685203 (LOC685203), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685203 (LOC685203), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685203 (LOC685203), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685203 (LOC685203), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685203 (LOC685203), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small membrane A-kinase anchor protein-like (LOC102556334), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059159 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:53106666:53106989:1 gene:ENSRNOG00000038738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53106666:53106989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_357013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 7-like (LOC100912473), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53110618:53110842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 46 // 9 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000033079 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:53110618:53111288:1 gene:ENSRNOG00000028626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 92 // 14 // 22 // 0
NM_001012131 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-1-phosphatase (Inpp1), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inositol polyphosphate-1-phosphatase (Inpp1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:53229087:53240761:1 gene:ENSRNOG00000012375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC086600 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-1-phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:105596 IMAGE:7314378), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000029824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53229084:53281666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001106911 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 6 (Mfsd6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:53294987:53378134:1 gene:ENSRNOG00000012663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53314900:53376136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022856 // RefSeq // Rattus norvegicus Ngfi-A binding protein 1 (Nab1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:53571213:53610614:1 gene:ENSRNOG00000012959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ222344 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YL09 mRNA sequence. // chr9 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53571304:53703313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT056545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U17253 // GenBank // Rattus norvegicus transcriptional repressor NAB1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000039932 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:53850904:53852055:1 gene:ENSRNOG00000034205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53829010:53891136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53804267:53817004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
NM_001109968 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaminase (Gls), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NM_012569 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaminase (Gls), nuclear gene encoding mitochondrial protein, transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000032525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:53923145:53969091:1 gene:ENSRNOG00000013595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// M65150 // GenBank // Rat glutaminase mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// M22586 // GenBank // Rat glutaminase (Gls) mRNA, complete cds. // chr9 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// GENSCAN00000003377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53942122:53989794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_053986 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin Ib (Myo1b), mRNA. // chr9 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:54416222:54472391:1 gene:ENSRNOG00000048152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000034652 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:54267753:54414206:1 gene:ENSRNOG00000015227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045723 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:54267753:54414206:1 gene:ENSRNOG00000015227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066155 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:54267753:54414206:1 gene:ENSRNOG00000015227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:54443197:54474623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:54374479:54416496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NM_001014216 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleic acid binding protein 1 (Nabp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:54750053:54757517:1 gene:ENSRNOG00000015416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089852 // GenBank // Rattus norvegicus oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:108887 IMAGE:7377638), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// NONRATT056553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
ENSRNOT00000022262 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:55200283:55201145:1 gene:ENSRNOG00000016605 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
GENSCAN00000052190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:55376255:55377669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000022601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:56152627:56153717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000041143 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:59545548:59546618:1 gene:ENSRNOG00000030036 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0
XM_003750698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 10 (Slc39a10), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003754518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 10 (Slc39a10), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006226833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 10 (Slc39a10), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006226834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 10 (Slc39a10), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 10 (Slc39a10), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 10 (Slc39a10), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:59726979:59755749:1 gene:ENSRNOG00000011677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:59726979:59755749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001191806 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 150 (Ccdc150), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 150 (Ccdc150), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 150 (Ccdc150), transcript variant X10, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 150 (Ccdc150), transcript variant X14, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:60584270:60671208:1 gene:ENSRNOG00000013318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60619886:60671208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60526936:60606361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
XM_001053588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 258-like (LOC679583), mRNA. // chr9 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// XM_001074464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to UPF0197 protein C11orf10 homolog (RGD1560328), mRNA. // chr9 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// XM_574622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to UPF0197 protein C11orf10 homolog (RGD1560328), mRNA. // chr9 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000050090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61233464:61233703:1 gene:ENSRNOG00000032740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_002725983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG47273-like (LOC100363048), mRNA. // chr9 // 48 // 100 // 15 // 31 // 0 /// XM_002729047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG47273-like (LOC100363048), mRNA. // chr9 // 48 // 100 // 15 // 31 // 0 /// XM_003752111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 258-like (LOC680191), mRNA. // chr9 // 45 // 100 // 14 // 31 // 0 /// XM_006221647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 258-like (LOC690138), mRNA. // chr9 // 32 // 100 // 10 // 31 // 0 /// XM_006250601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 258-like (LOC690138), mRNA. // chr9 // 32 // 100 // 10 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61233464:61233703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT003176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// NONRATT056563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:106486162:106515229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 45 // 100 // 14 // 31 // 0
ENSRNOT00000018039 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:61252225:61252760:1 gene:ENSRNOG00000013487 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61252225:61252760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT056564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001009671 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q10 homolog B (S. cerevisiae) (Coq10b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61337179:61357089:1 gene:ENSRNOG00000014456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088273 // GenBank // Rattus norvegicus coenzyme Q10 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109115 IMAGE:7380093), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61333355:61356211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_012966 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 1 (chaperonin 10) (Hspe1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000020066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61372462:61375650:1 gene:ENSRNOG00000014868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC058492 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 1 (chaperonin 10), mRNA (cDNA clone MGC:72916 IMAGE:6887393), complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// FQ220992 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YO12 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// X71429 // GenBank // R.norvegicus mRNA for chaperonin 10. // chr9 // 71 // 78 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT056567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1 /// NONRATT056569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1
NM_133528 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB family member 4, phocein (Mob4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61403839:61427803:1 gene:ENSRNOG00000014980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085708 // GenBank // Rattus norvegicus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 3 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:93220 IMAGE:7193103), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT056572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
XM_001066991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Mars2), mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_003750699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methionine--tRNA ligase, mitochondrial-like (LOC100911305), mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_003750701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methionyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Mars2), mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000070844 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:61506808:61508568:1 gene:ENSRNOG00000048668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075508 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:64238341:64240101:1 gene:ENSRNOG00000050002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000035089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61506808:61508568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64238341:64240101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_053456 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C-like 1 (Plcl1), mRNA. // chr9 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61825029:62156595:1 gene:ENSRNOG00000032659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// D45920 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 130kDa-Ins(1,4,5)P3 binding protein, complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:62095640:62123237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT056573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XR_349048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549258 (LOC102549258), ncRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108219 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG31122-PA (RGD1306941), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:63871338:63881044:1 gene:ENSRNOG00000010185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:63871395:63879230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT056578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004251 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ22555 (MGC94335), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:63901497:63909426:1 gene:ENSRNOG00000015983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:63901828:64003699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001014102 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated, serine-rich 2-like (Spats2l), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006244992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated, serine-rich 2-like (Spats2l), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64543200:64641802:1 gene:ENSRNOG00000016012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC085874 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2810022L02Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:94640 IMAGE:7191441), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64619455:64641296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001271191 // RefSeq // Rattus norvegicus shugoshin-like 2 (S. pombe) (Sgol2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64698066:64714965:1 gene:ENSRNOG00000027035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64695626:64714965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_019363 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde oxidase 1 (Aox1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000068633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64726637:64804786:1 gene:ENSRNOG00000015354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AF110477 // GenBank // Rattus norvegicus liver aldehyde oxidase female form (AOX1) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// AF110478 // GenBank // Rattus norvegicus liver aldehyde oxidase male form (AOX1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000030298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64762667:64897970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// NONRATT056591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000041743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64726685:64758794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001008527 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde oxidase 3 (Aox3), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006245006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldehyde oxidase 3 (Aox3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldehyde oxidase 3 (Aox3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// AY665586 // GenBank // Rattus norvegicus strain CD aldehyde oxidase 1 (Aoh1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000030298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64762667:64897970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
AY325166 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-245 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64886563:64964046:1 gene:ENSRNOG00000014555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AY325166 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-245 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// ENSRNOT00000033068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64886563:64964046:1 gene:ENSRNOG00000014555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
AY325166 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-245 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000033068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64886563:64964046:1 gene:ENSRNOG00000014555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64762667:64897970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
AY325166 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-245 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64886563:64964046:1 gene:ENSRNOG00000014555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008523 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde oxidase 4 (Aox4), mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// AY665587 // GenBank // Rattus norvegicus strain CD aldehyde oxidase 2 (Aoh2) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// AY325166 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-245 mRNA, complete cds. // chr9 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000033068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64886563:64964046:1 gene:ENSRNOG00000014555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64912602:65059622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
AY325166 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-245 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64886563:64964046:1 gene:ENSRNOG00000014555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64912602:65059622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008522 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde oxidase 2 (Aox2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000048027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64973842:65072438:1 gene:ENSRNOG00000033923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY665588 // GenBank // Rattus norvegicus strain CD aldehyde oxidase 3 (Aoh3) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000030290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64912602:65059622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_198789 // RefSeq // Rattus norvegicus basic leucine zipper and W2 domains 1 (Bzw1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006245000 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basic leucine zipper and W2 domains 1 (Bzw1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000019486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65086973:65098942:1 gene:ENSRNOG00000013977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC061580 // GenBank // Rattus norvegicus basic leucine zipper and W2 domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:73015 IMAGE:6890414), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000030314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65087288:65098522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1
NM_001024763 // RefSeq // Rattus norvegicus NIF3 NGG1 interacting factor 3-like 1 (S. cerevisiae) (Nif3l1), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIF3 NGG1 interacting factor 3-like 1 (S. cerevisiae) (Nif3l1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIF3 NGG1 interacting factor 3-like 1 (S. cerevisiae) (Nif3l1), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65138584:65156220:1 gene:ENSRNOG00000013446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65138584:65156220:1 gene:ENSRNOG00000013446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC097437 // GenBank // Rattus norvegicus NIF3 NGG1 interacting factor 3-like 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:114487 IMAGE:7455562), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC097992 // GenBank // Rattus norvegicus NIF3 NGG1 interacting factor 3-like 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:116136 IMAGE:7446502), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65138692:65156035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT056606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001106912 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex 3 (Ndufb3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex 3 (Ndufb3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65285887:65296093:1 gene:ENSRNOG00000011825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT056609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT056610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000024850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251336519:251379020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000034698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65291398:65307050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_022277 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 8 (Casp8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caspase 8 (Casp8), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65420843:65468950:1 gene:ENSRNOG00000012331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF279308 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-8 (CASP8) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF288372 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-8 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FQ226407 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YE19 mRNA sequence. // chr9 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65360970:65468713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001109307 // RefSeq // Rattus norvegicus STE20-related kinase adaptor beta (Stradb), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000043558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65570181:65589257:1 gene:ENSRNOG00000010728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65582612:65590043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006226838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus frizzled family receptor 7 (Fzd7), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000033707 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:65866681:65952839:1 gene:ENSRNOG00000022899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000071819 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:65866681:65952839:1 gene:ENSRNOG00000022899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65866281:65968255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_001271185 // RefSeq // Rattus norvegicus rCG22430-like (LOC100360552), mRNA. // chr9 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000019946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66086808:66140852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
XM_006226839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC501150 (RGD1562029), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0 /// XM_006226841 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC501150 (RGD1562029), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 97 // 76 // 34 // 35 // 0 /// XM_006245017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC501150 (RGD1562029), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000037555 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:66141703:66253262:1 gene:ENSRNOG00000022723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000019958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66237859:66253209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 33 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66149655:66218060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// NONRATT056623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_021754 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP58 ribonucleoprotein (Nop58), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NOP58 ribonucleoprotein (Nop58), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:66300036:66323764:1 gene:ENSRNOG00000016486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF194371 // GenBank // Rattus norvegicus Nopp140 associated protein (NAP65) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC087637 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:105440 IMAGE:7309062), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66300197:66346010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT056628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT056629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_080407 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein receptor, type II (serine/threonine kinase) (Bmpr2), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000035238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:66371991:66479596:1 gene:ENSRNOG00000022196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66451811:66479216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0
NM_001108797 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 117, member B (Fam117b), mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:66520071:66596356:1 gene:ENSRNOG00000022066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66519827:66592772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT056636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001106915 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium responsive transcription factor (Carf), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium responsive transcription factor (Carf), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium responsive transcription factor (Carf), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:66702057:66739587:1 gene:ENSRNOG00000017491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66689211:66743177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT056638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
XM_006226842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurobeachin-like 1 (Nbeal1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006226843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurobeachin-like 1 (Nbeal1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000023678 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:66766280:66923953:1 gene:ENSRNOG00000021525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000021557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66764794:66923953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
NM_199401 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 20, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp20a1), mRNA. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:66943519:66993517:1 gene:ENSRNOG00000017631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061716 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 20, subfamily A, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:72579 IMAGE:5598443), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT056648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66943568:67096445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT056649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_173143 // RefSeq // Rattus norvegicus abl-interactor 2 (Abi2), mRNA. // chr9 // 87 // 79 // 27 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000050179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:67013845:67098832:1 gene:ENSRNOG00000017707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 87 // 30 // 34 // 0 /// BC097273 // GenBank // Rattus norvegicus abl-interactor 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7453520), partial cds. // chr9 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// FQ222350 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YJ16 mRNA sequence. // chr9 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// U94904 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone responsive protein mRNA, complete cds. // chr9 // 87 // 79 // 27 // 31 // 0 /// NONRATT056650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT056654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000021560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66943568:67096445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 34 // 39 // 1 /// NONRATT056652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 72 // 72 // 28 // 39 // 1 /// NONRATT056651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT056655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
NM_013121 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd28 molecule (Cd28), mRNA. // chr9 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// XM_006245022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd28 molecule (Cd28), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:67358994:67384458:1 gene:ENSRNOG00000010283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:67359740:67383862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT056659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031674 // RefSeq // Rattus norvegicus cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4 (Ctla4), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:67509842:67515369:1 gene:ENSRNOG00000010336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U37121 // GenBank // Rattus norvegicus cytotoxic T-lymphocyte associated protein-4 precursor (CTLA-4) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U90271 // GenBank // Rattus norvegicus CTLA-4 mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000043086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:67492605:67515317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191808 // RefSeq // Rattus norvegicus par-3 family cell polarity regulator beta (Pard3b), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000040778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:68228908:69236542:1 gene:ENSRNOG00000024345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000057985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:68753339:68841762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 20 // 20 // 0
NM_030869 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropilin 2 (Nrp2), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000042562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:69307750:69419329:1 gene:ENSRNOG00000031232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AF016297 // GenBank // Rattus norvegicus neuropilin-2 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:69253000:69400243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001108799 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 beta 2 (Eef1b2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000034740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:69762337:69765057:1 gene:ENSRNOG00000024186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC168738 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:188834 IMAGE:6918011), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ229130 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YA19 mRNA sequence. // chr9 // 79 // 93 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:69762104:69765021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT056676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NONRATT056675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT056675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT056676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT056677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006226848 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DBF-type containing 2 (Zdbf2), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DBF-type containing 2 (Zdbf2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016038 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:69879607:69894995:1 gene:ENSRNOG00000024114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:69868940:69895325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001029899 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 23 (Adam23), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:72283127:72437355:-1 gene:ENSRNOG00000012424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT058009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:72303494:72369184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
GENSCAN00000052900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:72220656:72221081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
NM_001009673 // RefSeq // Rattus norvegicus FAST kinase domains 2 (Fastkd2), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:72102979:72121685:-1 gene:ENSRNOG00000023923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC088416 // GenBank // Rattus norvegicus FAST kinase domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:94943 IMAGE:7112913), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:72103489:72121189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT058004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NONRATT058003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:71969416:71994666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_031017 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 1 (Creb1), transcript variant B, mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NM_134443 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 1 (Creb1), transcript variant A, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:71278917:71346034:-1 gene:ENSRNOG00000013412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:71278917:71346034:-1 gene:ENSRNOG00000013412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC097311 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455759. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ211925 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YE07 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:71282791:71328174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT058001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:25058753:25080217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT058002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000018326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:71278917:71346034:-1 gene:ENSRNOG00000013412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:71278917:71346034:-1 gene:ENSRNOG00000013412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211925 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YE07 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT057998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin Y-like 1 (Ccnyl1), partial mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin Y-like 1 (Ccnyl1), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049411 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:71146078:71167668:-1 gene:ENSRNOG00000023807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:71124241:71183210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT057996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
ENSRNOT00000020447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:70568996:70656647:-1 gene:ENSRNOG00000015158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000058045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:70568996:70656647:-1 gene:ENSRNOG00000015158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000013350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:70568996:70659873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0
BC089984 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7318263. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031089 // RefSeq // Rattus norvegicus parathyroid hormone 2 receptor (Pth2r), mRNA. // chr9 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:70414059:70518866:-1 gene:ENSRNOG00000015259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U55836 // GenBank // Rattus norvegicus parathyroid hormone receptor PTH2 mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:70414178:70531369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT057984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109557 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma F (Crygf), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_173289 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma E (Cryge), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:74363448:74365612:-1 gene:ENSRNOG00000032869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J00716 // GenBank // Rat gamma-E-crystallin (gamma 3-1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:74352948:74457082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:70771527:70887974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT056689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT058034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013066 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 2 (Map2), mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:73841103:73922677:-1 gene:ENSRNOG00000011841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000043627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:73841103:73922677:-1 gene:ENSRNOG00000011841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:73841103:73922677:-1 gene:ENSRNOG00000011841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC081835 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132792), complete cds. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73841244:73901438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT058029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT058030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0
GENSCAN00000011244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73841244:73901438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000074427 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:73791854:73807324:-1 gene:ENSRNOG00000048009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73782009:73807895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENSRNOT00000032430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:73619817:73692047:-1 gene:ENSRNOG00000028362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73619817:73718135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001033903 // RefSeq // Rattus norvegicus ribulose-5-phosphate-3-epimerase (Rpe), mRNA. // chr9 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:73595054:73615031:-1 gene:ENSRNOG00000038085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC101869 // GenBank // Rattus norvegicus ribulose-5-phosphate-3-epimerase, mRNA (cDNA clone MGC:124653 IMAGE:5621971), complete cds. // chr9 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73596522:73615024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT058017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT058018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT058019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT058021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_017072 // RefSeq // Rattus norvegicus carbamoyl-phosphate synthetase 1 (Cps1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000019023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:73072857:73183868:-1 gene:ENSRNOG00000013704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// M11710 // GenBank // Rattus norvegicus carbamyl phosphate synthetase I precursor (cps) mRNA, partial sequence. // chr9 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73124785:73183868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73072857:73113225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT058013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// U18419 // GenBank // Rattus norvegicus nonmuscle caldesmon mRNA, complete cds. // chr9 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
ENSRNOT00000019324 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:75766642:75767176:1 gene:ENSRNOG00000014421 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
XM_001054301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PC-esterase domain-containing protein 1B-like (RGD1562431), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_237227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PC-esterase domain-containing protein 1B-like (RGD1562431), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049479 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:76220105:76221132:1 gene:ENSRNOG00000032306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:76220150:76221551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000038509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:76718911:76766783:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// GENSCAN00000056848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:76693266:76709100:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001134728 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 16 (Spag16), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:76835645:77608300:1 gene:ENSRNOG00000042609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158602 // GenBank // Rattus norvegicus sperm associated antigen 16, mRNA (cDNA clone MGC:187457 IMAGE:7133303), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:77598777:77608300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109308 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like (Vwc2l), mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000033459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:77609107:77799130:1 gene:ENSRNOG00000027400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006245124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like (Vwc2l), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006245125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like (Vwc2l), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006245127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like (Vwc2l), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT056719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:77612084:77617169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_031014 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase (Atic), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_003750715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bifunctional purine biosynthesis protein PURH-like (LOC100910688), mRNA. // chr9 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000021105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:78636339:78656386:1 gene:ENSRNOG00000015511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC072496 // GenBank // Rattus norvegicus 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:91657 IMAGE:7096880), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// D89514 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 5-aminoimidazole-4-carboxamide ribonucleotide formyltransferase/IMP cyclohydrolase, complete cds. // chr9 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT056720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:78614632:78664634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT056721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSRNOT00000057584 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:78743208:78747362:1 gene:ENSRNOG00000037894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XR_349111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC501161 (RGD1563521), transcript variant X2, ncRNA. // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// XR_357098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC501161 (RGD1563521), transcript variant X2, ncRNA. // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NONRATT035379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001109574 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 169 (Tmem169), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 169 (Tmem169), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:79403626:79427523:1 gene:ENSRNOG00000016091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79422376:79425843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177419 // RefSeq // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (Xrcc5), mRNA. // chr9 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000021656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:79432205:79520611:1 gene:ENSRNOG00000016105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC061576 // GenBank // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5, mRNA (cDNA clone MGC:72979 IMAGE:6887693), complete cds. // chr9 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000001637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79435104:79519669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT056728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT056729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// NONRATT056731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// NONRATT056732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001108222 // RefSeq // Rattus norvegicus Swi/SNF related matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a-like 1 (Smarcal1), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:79716393:79762206:1 gene:ENSRNOG00000016503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000071856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:79716370:79762216:1 gene:ENSRNOG00000016503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC168154 // GenBank // Rattus norvegicus Swi/SNF related matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:187573 IMAGE:8362162), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79718879:79762133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT056734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_013122 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 2 (Igfbp2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:79888614:79915188:1 gene:ENSRNOG00000016957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC092570 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:108749 IMAGE:7308779), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// J04486 // GenBank // Rat insulin growth factor-binding protein mRNA, complete cds. // chr9 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// M31672 // GenBank // Rat insulin-like growth factor binding protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79888713:79914887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT056742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006226877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN and FYVE domain containing 4 (Rufy4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006245289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN and FYVE domain containing 4 (Rufy4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000046019 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:81169310:81186989:1 gene:ENSRNOG00000032991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81164849:81199221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_017183 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) receptor 2 (Cxcr2), mRNA. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81193442:81199814:1 gene:ENSRNOG00000014269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81164849:81199221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001106919 // RefSeq // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 2 (Arpc2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81285098:81320273:1 gene:ENSRNOG00000014289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ231064 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YH01 mRNA sequence. // chr9 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// FQ231947 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YJ09 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81285048:81327141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT056754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_177936 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled bile acid receptor 1 (Gpbar1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB086172 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for membrane bile acid receptor, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB089310 // GenBank // Rattus norvegicus TGR5 mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// JX534229 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled bile acid receptor (Gpbar1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81285048:81327141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134750 // RefSeq // Rattus norvegicus paroxysmal nonkinesigenic dyskinesia (Pnkd), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001134751 // RefSeq // Rattus norvegicus paroxysmal nonkinesigenic dyskinesia (Pnkd), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paroxysmal nonkinesigenic dyskinesia (Pnkd), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81381800:81400719:1 gene:ENSRNOG00000014806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81332621:81400719:1 gene:ENSRNOG00000014806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168228 // GenBank // Rattus norvegicus paroxysmal nonkinesiogenic dyskinesia, mRNA (cDNA clone MGC:188259 IMAGE:7374541), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001074457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690437 (LOC690437), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002727242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690437 (LOC690437), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057480 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:81409927:81416667:1 gene:ENSRNOG00000037835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071700 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:81409960:81416667:1 gene:ENSRNOG00000037835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ225177 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YN24 mRNA sequence. // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81381800:81431980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001031658 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporter), member 1 (Slc11a1), mRNA. // chr9 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// XM_006245219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporter), member 1 (Slc11a1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporter), member 1 (Slc11a1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000057472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81420635:81431331:1 gene:ENSRNOG00000014956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC100653 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 11 (proton-coupled divalent metal ion transporters), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:124692 IMAGE:7932285), complete cds. // chr9 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81381800:81431980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT056768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_001128079 // RefSeq // Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1 (Ctdsp1), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// XM_006245236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1 (Ctdsp1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000020646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81313441:81442524:1 gene:ENSRNOG00000015295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC161976 // GenBank // Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:187787 IMAGE:9029838), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81437399:81441132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NR_031831 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-26b (Mir26b), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053731 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:9:81439824:81439908:1 gene:ENSRNOG00000035608 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ226881 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YA13 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-26b // miRBase Micro RNA Database // MI0000858 Rattus norvegicus miR-26b stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108224 // RefSeq // Rattus norvegicus villin 1 (Vil1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81454351:81482170:1 gene:ENSRNOG00000015408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC168981 // GenBank // Rattus norvegicus villin 1, mRNA (cDNA clone MGC:189319 IMAGE:7462629), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT056774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81460207:81481543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1
NM_001009357 // RefSeq // Rattus norvegicus Rcd1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe) (Rqcd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245170 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rcd1 required for cell differentiation1 homolog (S. pombe) (Rqcd1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000021548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81547682:81573447:1 gene:ENSRNOG00000016034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC087134 // GenBank // Rattus norvegicus rcd1 (required for cell differentiation) homolog 1 (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:95021 IMAGE:7122272), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ234393 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YC08 mRNA sequence. // chr9 // 47 // 79 // 9 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81548099:81571415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_080688 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, delta 4 (Plcd4), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, delta 4 (Plcd4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, delta 4 (Plcd4), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81581514:81608512:1 gene:ENSRNOG00000016361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000041407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81581514:81608512:1 gene:ENSRNOG00000016361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000057430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81581514:81608512:1 gene:ENSRNOG00000016361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// D50455 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase C delta4, complete cds. // chr9 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// U16655 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase C delta-4 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81589391:81607809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT056780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001007666 // RefSeq // Rattus norvegicus BC1 (ubiquinol-cytochrome c reductase) synthesis-like (Bcs1l), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81630647:81634579:1 gene:ENSRNOG00000016754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC083660 // GenBank // Rattus norvegicus BCS1-like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:94495 IMAGE:7135331), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81628134:81634491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001173986 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 36 (Stk36), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81642557:81670395:1 gene:ENSRNOG00000016913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ218305 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA5YM21 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81643222:81687881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
XM_006226885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 4 (Ttll4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006245297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 4 (Ttll4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81703012:81717068:1 gene:ENSRNOG00000017129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81702131:81760508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT056788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_178847 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 27, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp27a1), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 27, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp27a1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XR_357087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 27, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp27a1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81731034:81760594:1 gene:ENSRNOG00000017188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061848 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 27, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:72265 IMAGE:5621918), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M38566 // GenBank // Rat mitochondrial cytochrome P450 (P450C27) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81702131:81760508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// M73231 // GenBank // Sprague-Dawley CYP 27 mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT056792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT056793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT056794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001108226 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 6 (Wnt6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81796069:81809694:1 gene:ENSRNOG00000017409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81806384:81808974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT056795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001108227 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 10A (Wnt10a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81816315:81829217:1 gene:ENSRNOG00000017455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81816775:81828655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001109309 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 5, regulatory subunit 2 (p39) (Cdk5r2), mRNA. // chr9 // 95 // 86 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000057368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81888640:81890108:1 gene:ENSRNOG00000037793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81888640:81889746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_002730041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase lipid-binding protein, mitochondrial-like (LOC100361833), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_003754538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase lipid-binding protein, mitochondrial-like (LOC100361833), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000051828 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:82022590:82023009:1 gene:ENSRNOG00000032518 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81989752:82023009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001100760 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 134, member A (Fam134a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82115051:82120826:1 gene:ENSRNOG00000018586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82115051:82142781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT056803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT056802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT056804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001025745 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, AN1 type domain 2B (Zfand2b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82140185:82143100:1 gene:ENSRNOG00000018639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099215 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, AN1 type domain 2B, mRNA (cDNA clone MGC:116391 IMAGE:7384656), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82115051:82142781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT056806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT056807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT056809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT056810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001014219 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and zinc finger domain containing 1 (Ankzf1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and zinc finger domain containing 1 (Ankzf1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82162933:82169791:1 gene:ENSRNOG00000019052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081973 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and zinc finger domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94116 IMAGE:7126276), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82164078:82169382:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_173142 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 16 (Stk16), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82180274:82183501:1 gene:ENSRNOG00000019294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D86220 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for F52, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ213827 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YG18 mRNA sequence. // chr9 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82180744:82183252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT056816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT056818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT056821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006245277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 2 (Dnajb2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166710 // GenBank // Rattus norvegicus similar to DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 10 isoform 2, mRNA (cDNA clone MGC:188408 IMAGE:7930287), complete cds. // chr9 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NM_001109541 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 2 (Dnajb2), mRNA. // chr9 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000026467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82205777:82213929:1 gene:ENSRNOG00000019506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82206188:82213092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT056822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT056825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT056829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSRNOT00000046658 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:82235673:82236654:1 gene:ENSRNOG00000022655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82236145:82237823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_022531 // RefSeq // Rattus norvegicus desmin (Des), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82325845:82333553:1 gene:ENSRNOG00000019810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061872 // GenBank // Rattus norvegicus desmin, mRNA (cDNA clone MGC:72444 IMAGE:5598951), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ216078 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YN13 mRNA sequence. // chr9 // 86 // 52 // 12 // 14 // 0 /// NONRATT056833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82308605:82396928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_001108802 // RefSeq // Rattus norvegicus SPEG complex locus (Speg), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_006245254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPEG complex locus (Speg), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// XM_006245255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPEG complex locus (Speg), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// XM_006245256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPEG complex locus (Speg), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// XM_006245257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPEG complex locus (Speg), transcript variant X9, mRNA. // chr9 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000026941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82340606:82397945:1 gene:ENSRNOG00000019850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000016239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82308605:82396928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT056834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001025056 // RefSeq // Rattus norvegicus GDP-mannose pyrophosphorylase A (Gmppa), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GDP-mannose pyrophosphorylase A (Gmppa), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82401645:82409071:1 gene:ENSRNOG00000019946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083763 // GenBank // Rattus norvegicus GDP-mannose pyrophosphorylase A, mRNA (cDNA clone MGC:94705 IMAGE:7193128), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82398022:82437338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT056844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT056846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_022234 // RefSeq // Rattus norvegicus acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 4 (Asic4), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 4 (Asic4), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82416332:82438181:1 gene:ENSRNOG00000019985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82398022:82437338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1
XM_002730042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 198 (Tmem198), mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_003754539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 198 (Tmem198), mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82444082:82448691:1 gene:ENSRNOG00000020061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82444082:82448691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_012590 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibin alpha (Inha), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82469743:82472643:1 gene:ENSRNOG00000020097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083564 // GenBank // Rattus norvegicus inhibin alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93593 IMAGE:7112717), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82469819:82472422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// M36453 // GenBank // Rat inhibin alpha-subunit mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT056854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001106922 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 11 interacting protein (Stk11ip), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000027256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82487970:82503147:1 gene:ENSRNOG00000020107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC168233 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 11 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:188315 IMAGE:7442632), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000016245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82481662:82546820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT056856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_017049 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 3 (Slc4a3), mRNA. // chr9 // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// XM_006245149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 3 (Slc4a3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000027337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82512289:82524380:1 gene:ENSRNOG00000020138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// J05167 // GenBank // Rat band 3 Cl-/HCO3- exchanger (B3RP3) mRNA, complete cds. // chr9 // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000016245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82481662:82546820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 90 // 42 // 43 // 0 /// NONRATT056859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT056861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
ENSRNOT00000017628 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:90375272:90375926:1 gene:ENSRNOG00000013185 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 81 // 95 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:90375343:90375768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0
NM_001191811 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate phosphatase 2 (Sgpp2), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:83961688:84075946:1 gene:ENSRNOG00000037695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:84036070:84075885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000043159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:83961688:83988770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001108803 // RefSeq // Rattus norvegicus monoacylglycerol O-acyltransferase 1 (Mogat1), mRNA. // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000019724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:84170150:84177700:1 gene:ENSRNOG00000014692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000043164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:84170201:84177622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT056868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT056869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XM_006226890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U3 small nucleolar RNA-associated protein 14 homolog B-like (LOC102556952), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U3 small nucleolar RNA-associated protein 14 homolog B-like (LOC102551819), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006672 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:84307442:84310603:1 gene:ENSRNOG00000025970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:84308321:84310603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U3 small nucleolar RNA-associated protein 14 homolog B-like (LOC102556952), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006245308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U3 small nucleolar RNA-associated protein 14 homolog B-like (LOC102551819), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006672 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:84307442:84310603:1 gene:ENSRNOG00000025970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:84308321:84310603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_057107 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase long-chain family member 3 (Acsl3), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:84327545:84351513:1 gene:ENSRNOG00000014718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D30666 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for brain acyl-CoA synthtase II, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ221868 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA30YL16 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:84317372:84365079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_212526 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 4 (Kcne4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:84443997:84447230:1 gene:ENSRNOG00000048478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF512994 // GenBank // Rattus norvegicus minK-related peptide 3 (Kcne4) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220973 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YA13 mRNA sequence. // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:84380876:84445340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT056873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000057143 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:85054385:85054973:1 gene:ENSRNOG00000037663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000021298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:85031115:85055030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001031650 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L44 (Mrpl44), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:85293975:85299104:1 gene:ENSRNOG00000015231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098715 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L44, mRNA (cDNA clone MGC:112705 IMAGE:7324407), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ215293 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YM19 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:85263332:85298968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT056876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006226907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 (Nyap2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006226908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 (Nyap2), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006226909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 (Nyap2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006245312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 2 (Nyap2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041337 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:86726986:86863468:1 gene:ENSRNOG00000023765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000043787 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:86726986:86799179:1 gene:ENSRNOG00000023765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000007674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:86750038:86799778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NONRATT056881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024891 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid domain containing 1 (Rhbdd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid domain containing 1 (Rhbdd1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:87882639:87975590:1 gene:ENSRNOG00000014620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097416 // GenBank // Rattus norvegicus rhomboid domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:114461 IMAGE:7454359), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:87877920:87933696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
XM_006245229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid domain containing 1 (Rhbdd1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135759 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type IV, alpha 3 (Col4a3), mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000020669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:88104688:88232032:1 gene:ENSRNOG00000015365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// XM_003750719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen alpha-3(IV) chain-like (LOC100911572), mRNA. // chr9 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000035808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:88176212:88265483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:90560206:90647783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT056908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001271284 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial fission factor (Mff), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001039015 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial fission factor (Mff), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1 /// NM_001276401 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial fission factor (Mff), transcript variant 3, mRNA. // chr9 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1 /// ENSRNOT00000020705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:90620315:90648466:1 gene:ENSRNOG00000015428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1 /// BC098682 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5230400G24, mRNA (cDNA clone MGC:112646 IMAGE:7385142), complete cds. // chr9 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1 /// FQ223111 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YF05 mRNA sequence. // chr9 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1 /// ENSRNOT00000020712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:88242332:88265483:1 gene:ENSRNOG00000048016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000035808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:88176212:88265483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:90560206:90647783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001135596 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with FG repeats 1 (Agfg1), mRNA. // chr9 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000021309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:88354885:88410583:1 gene:ENSRNOG00000015619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// BC099202 // GenBank // Rattus norvegicus ArfGAP with FG repeats 1, mRNA (cDNA clone MGC:116375 IMAGE:7384071), complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000035834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:88326844:88442998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT056895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT056897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_019233 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 20 (Ccl20), mRNA. // chr9 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:88662802:88665357:1 gene:ENSRNOG00000015992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF053312 // GenBank // Rattus norvegicus CC chemokine ST38 precursor, mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U90447 // GenBank // Rattus norvegicus CC chemokine MIP3 alpha/EXODUS mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:88662853:88664349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025025 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein assembly factor with WDR repeat domains 1 (Daw1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:88708692:88745302:1 gene:ENSRNOG00000016247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:88704145:88745108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT056903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001108804 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 36 (Fbxo36), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92168447:92231811:1 gene:ENSRNOG00000017053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92168476:92231506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT057084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_006226911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus component of Sp100-rs (Csprs), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226912 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus component of Sp100-rs (Csprs), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006226913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus component of Sp100-rs (Csprs), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006245488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus component of Sp100-rs (Csprs), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus component of Sp100-rs (Csprs), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000023184 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:92296396:92297310:1 gene:ENSRNOG00000017256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92296267:92297310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012133 // RefSeq // Rattus norvegicus SP140 nuclear body protein (Sp140), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000034603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92349344:92396014:1 gene:ENSRNOG00000022800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC081971 // GenBank // Rattus norvegicus SP140 nuclear body protein, mRNA (cDNA clone MGC:94109 IMAGE:7125855), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT057087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92348666:92403227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001014220 // RefSeq // Rattus norvegicus SP100 nuclear antigen (Sp100), mRNA. // chrU // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// BC083808 // GenBank // Rattus norvegicus SP100 nuclear antigen, mRNA (cDNA clone MGC:94860 IMAGE:7109918), complete cds. // chrU // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// FQ231842 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YP19 mRNA sequence. // chrU // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034152 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:92411664:92449071:1 gene:ENSRNOG00000022769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 71 // 48 // 15 // 21 // 0 /// FQ232797 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YG06 mRNA sequence. // chrU // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// XM_006245338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SP100 nuclear antigen (Sp100), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// XM_006245339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SP100 nuclear antigen (Sp100), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT057088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92408573:92488356:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT056908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// NONRATT057089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT057090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT057091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
NM_001106924 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding protein 39 (Cab39), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium binding protein 39 (Cab39), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium binding protein 39 (Cab39), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium binding protein 39 (Cab39), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92563873:92625079:1 gene:ENSRNOG00000017297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92589546:92622717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT057097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT057098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001009674 // RefSeq // Rattus norvegicus integral membrane protein 2C (Itm2c), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92645770:92659580:1 gene:ENSRNOG00000017359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC087127 // GenBank // Rattus norvegicus integral membrane protein 2C, mRNA (cDNA clone MGC:94903 IMAGE:7111761), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92645842:92656607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT057100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92657386:92685879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_006226919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal recognition particle 14 kDa protein-like (RGD1561755), mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006245496 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal recognition particle 14 kDa protein-like (RGD1561755), mRNA. // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000030314 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:92746902:92747231:1 gene:ENSRNOG00000022614 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000053236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92720355:92747306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001108805 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 3 (Spata3), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 3 (Spata3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92760028:92771945:1 gene:ENSRNOG00000017540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92759500:92768036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006226921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362216 (LOC100362216), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000023592 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:92791692:92797922:1 gene:ENSRNOG00000017557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92791692:92797922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
BC160866 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7324976. // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT057104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031978 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 1 (Psmd1), mRNA. // chr9 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000024306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92810407:92884819:1 gene:ENSRNOG00000017730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC087654 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7312674), partial cds. // chr9 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// FQ228875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YO11 mRNA sequence. // chr9 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1 /// GENSCAN00000053226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92810435:92838230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000053219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92859577:92882483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT057106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// NONRATT057107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
NM_001109663 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 9 (Armc9), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92901738:93029061:1 gene:ENSRNOG00000025418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC128749 // GenBank // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:156700 IMAGE:7099560), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92890082:93058778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001012134 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 7 (B3gnt7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93055878:93059828:1 gene:ENSRNOG00000018267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081994 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 7, mRNA (cDNA clone MGC:94211 IMAGE:7130315), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024364 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC35154 (LOC501180), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025029 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:93172940:93174358:1 gene:ENSRNOG00000018559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93172968:93174278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108807 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7B (Cops7b), mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// XM_006245414 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7B (Cops7b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000025411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93335413:93361000:1 gene:ENSRNOG00000018723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// XM_006245415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7B (Cops7b), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONRATT057129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93334830:93460021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001109007 // RefSeq // Rattus norvegicus DIS3-like 3-5 exoribonuclease 2 (Dis3l2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NM_001172159 // RefSeq // Rattus norvegicus DIS3-like 3-5 exoribonuclease 2 (Dis3l2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000025779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93387701:93886547:1 gene:ENSRNOG00000018931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000055428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93660171:93775662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT057130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93825761:93886201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// NONRATT057131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NONRATT057130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1
NM_022680 // RefSeq // Rattus norvegicus alkaline phosphatase 3, intestine, not Mn requiring (Akp3), mRNA. // chr9 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93954155:93957145:1 gene:ENSRNOG00000019375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000073454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93954155:93957145:1 gene:ENSRNOG00000019375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93943174:93963373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT057134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1
XM_003750730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 56 (Prss56), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 56 (Prss56), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94002751:94007515:1 gene:ENSRNOG00000029865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94002751:94018418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT057136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_019298 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, delta (muscle) (Chrnd), mRNA. // chr9 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// XM_006245472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, delta (muscle) (Chrnd), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94010141:94018560:1 gene:ENSRNOG00000019527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94002751:94018418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_019145 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, gamma (muscle) (Chrng), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, gamma (muscle) (Chrng), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006245355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, gamma (muscle) (Chrng), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000026529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94025810:94032183:1 gene:ENSRNOG00000019602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94025942:94071266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000026646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94039099:94050247:1 gene:ENSRNOG00000019634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC158817 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E member 2, mRNA (cDNA clone MGC:188257 IMAGE:7374173), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ220431 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YO09 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ230152 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YH11 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NM_001108808 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E family member 2 (Eif4e2), mRNA. // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000065743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94034066:94048590:1 gene:ENSRNOG00000019634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94025942:94071266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT057144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001109310 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand domain family, member D1 (Efhd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand domain family, member D1 (Efhd1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006245468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand domain family, member D1 (Efhd1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000021168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94084446:94131498:1 gene:ENSRNOG00000015596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94084534:94130477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NONRATT057148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003754543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRB10 interacting GYF protein 2 (Gigyf2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006226926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRB10 interacting GYF protein 2 (Gigyf2), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000029749 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:94256279:94270201:1 gene:ENSRNOG00000023577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000052877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94218228:94270201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0
NM_001134587 // RefSeq // Rattus norvegicus LOC363276 (RGD1311447), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LOC363276 (RGD1311447), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LOC363276 (RGD1311447), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000022308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94284282:94289755:1 gene:ENSRNOG00000016606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94284443:94289345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT057154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT057156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_017130 // RefSeq // Rattus norvegicus sialidase 2 (Neu2), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialidase 2 (Neu2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// XM_006245357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialidase 2 (Neu2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// XM_006245362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialidase 2 (Neu2), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000022818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94440842:94444057:1 gene:ENSRNOG00000016962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC091154 // GenBank // Rattus norvegicus sialidase 2 (cytosolic sialidase), mRNA (cDNA clone MGC:108717 IMAGE:7323285), complete cds. // chr9 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// D16300 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytosolic sialidase, complete cds. // chr9 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// FQ216178 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YD03 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94435987:94443722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT057158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_019311 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase D (Inpp5d), mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000051338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94464377:94569982:1 gene:ENSRNOG00000017020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U55192 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate 5 phosphatase Ship (SHIP) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94464579:94648069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108809 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 16-like 1 (S. cerevisiae) (Atg16l1), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000024445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94599373:94634548:1 gene:ENSRNOG00000017913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000052875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94464579:94648069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT057161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1
NM_013023 // RefSeq // Rattus norvegicus S-antigen; retina and pineal gland (arrestin) (Sag), mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006245351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S-antigen; retina and pineal gland (arrestin) (Sag), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94646554:94691388:1 gene:ENSRNOG00000018185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// M60737 // GenBank // Rat S-antigen mRNA, complete cds. // chr9 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94652703:94691388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_006245503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, delta (Dgkd), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006245506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, delta (Dgkd), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XR_357182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, delta (Dgkd), transcript variant X5, misc_RNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94730643:94790627:1 gene:ENSRNOG00000023238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ218774 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA4YD06 mRNA sequence. // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000056327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94730771:94788624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XR_357183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 2A (Mroh2a), transcript variant X1, misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000051438 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:94997059:95032615:1 gene:ENSRNOG00000042182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000056324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94997059:95033906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT057188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_134371 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 8 (Trpm8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:95085452:95170098:1 gene:ENSRNOG00000019035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY072788 // GenBank // Rattus norvegicus cold/menthol receptor 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:95128123:95145521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:95098255:95124534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053577 // RefSeq // Rattus norvegicus secreted phosphoprotein 2 (Spp2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000026108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:95188006:95207530:1 gene:ENSRNOG00000019224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC088193 // GenBank // Rattus norvegicus secreted phosphoprotein 2, mRNA (cDNA clone MGC:108864 IMAGE:7372900), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:95188156:95192865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT057190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT057191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_022693 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3-domain binding protein 4 (Sh3bp4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000026312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:95977039:95993098:1 gene:ENSRNOG00000019316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AJ278266 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SH3-domain binding protein 4 (SH3BP4 gene). // chr9 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:95977073:95992631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT057195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001108230 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1 (Agap1), mRNA. // chr9 // 97 // 70 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:96438897:96719918:1 gene:ENSRNOG00000019476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 70 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT057199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:96402075:96529789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1 /// NONRATT057200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// NONRATT057201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_053352 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) receptor 7 (Cxcr7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97046851:97058372:1 gene:ENSRNOG00000019622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF118816 // GenBank // Rattus norvegicus orphan chemokine receptor mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97056525:97057613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT057205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT057207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001013227 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 8 (Cops8), mRNA. // chr9 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97453701:97463536:1 gene:ENSRNOG00000019635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC063182 // GenBank // Rattus norvegicus COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 8 (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:72985 IMAGE:6887869), complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97453755:97462675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 67 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT057211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0
NM_001012135 // RefSeq // Rattus norvegicus melanophilin (Mlph), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97753779:97789585:1 gene:ENSRNOG00000019763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081894 // GenBank // Rattus norvegicus melanophilin, mRNA (cDNA clone MGC:93800 IMAGE:7110013), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97759782:97788750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_022222 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin releasing hormone (Prlh), mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97794503:97795405:1 gene:ENSRNOG00000019871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB015418 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for preproprolactin-releasing peptide, complete cds. // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AF521930 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-releasing peptide variant mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97794503:97795405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001014269 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (Lrrfip1), mRNA. // chr9 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// XM_006245444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (Lrrfip1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000050191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97871992:97939937:1 gene:ENSRNOG00000019892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// BC081883 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93757 IMAGE:7108398), complete cds. // chr9 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// FQ217006 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA37YM22 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 60 // 27 // 28 // 0 /// XM_006245461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (Lrrfip1), transcript variant X18, mRNA. // chr9 // 79 // 79 // 37 // 47 // 1 /// XM_006245459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat (in FLII) interacting protein 1 (Lrrfip1), transcript variant X16, mRNA. // chr9 // 68 // 68 // 32 // 47 // 1 /// NONRATT057218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT057220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000002957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97872156:97985757:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 36 // 47 // 1 /// NONRATT057219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 26 // 47 // 1 /// NONRATT057215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1 /// NONRATT057216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 45 // 45 // 21 // 47 // 1
XM_001066845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 44 (Rbm44), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_576610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 44 (Rbm44), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97965336:97985079:1 gene:ENSRNOG00000024878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97872156:97985757:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT057221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_031645 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor (G protein-coupled) activity modifying protein 1 (Ramp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus receptor (G protein-coupled) activity modifying protein 1 (Ramp1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97995669:98041718:1 gene:ENSRNOG00000019926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB030942 // GenBank // Rattus norvegicus RAMP1 mRNA for receptor activity modifying protein 1, complete cds. // chr9 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// AB042887 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for receptor activity modifying protein 1, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF181550 // GenBank // Rattus norvegicus receptor activity modifying protein 1 (Ramp1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97995708:98047429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001008381 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2F (putative) (Ube2f), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// XM_006245423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2F (putative) (Ube2f), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98074824:98105362:1 gene:ENSRNOG00000019953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98074824:98105362:1 gene:ENSRNOG00000019953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC086355 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2F (putative), mRNA (cDNA clone MGC:105540 IMAGE:7303709), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98096079:98134721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_001007755 // RefSeq // Rattus norvegicus selenocysteine lyase (Scly), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000027220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98115050:98135542:1 gene:ENSRNOG00000020083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC079358 // GenBank // Rattus norvegicus selenocysteine lyase, mRNA (cDNA clone MGC:94824 IMAGE:7108615), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT057228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98096079:98134721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT057229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT057230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001191812 // RefSeq // Rattus norvegicus espin-like (Espnl), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98136649:98159968:1 gene:ENSRNOG00000024717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98136649:98159968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000027232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98167151:98177317:1 gene:ENSRNOG00000020105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// FQ216966 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA38YI16 mRNA sequence. // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98165750:98176606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001060107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 132, member B (Fam132b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003754550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 132, member B (Fam132b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98181307:98187208:1 gene:ENSRNOG00000024688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98181307:98187270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001012204 // RefSeq // Rattus norvegicus TNF receptor-associated factor 3 interacting protein 1 (Traf3ip1), mRNA. // chr9 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// XM_006245434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNF receptor-associated factor 3 interacting protein 1 (Traf3ip1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000056612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98297553:98332869:1 gene:ENSRNOG00000024468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC083645 // GenBank // Rattus norvegicus TNF receptor-associated factor 3 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94473 IMAGE:7135023), complete cds. // chr9 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98307893:98332697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98297672:98304143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001108232 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 1 (Asb1), mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006245410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 1 (Asb1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98344295:98360345:1 gene:ENSRNOG00000020322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC168978 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189315 IMAGE:7455775), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98345010:98360048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_021691 // RefSeq // Rattus norvegicus twist family bHLH transcription factor 2 (Twist2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98599201:98642827:1 gene:ENSRNOG00000020355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98599201:98599683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT057247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000520 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1346 (Olr1346), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99385970:99386941:1 gene:ENSRNOG00000046219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001001121 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1347 (Olr1347), mRNA. // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99400125:99401096:1 gene:ENSRNOG00000047997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99386123:99386941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99400278:99401096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0 /// NONRATT057251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_001001121 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1347 (Olr1347), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99400125:99401096:1 gene:ENSRNOG00000047997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99400278:99401096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000484 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1349 (Olr1349), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99410828:99411787:1 gene:ENSRNOG00000016546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99409482:99419184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000752 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1350 (Olr1350), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99418213:99419184:1 gene:ENSRNOG00000030424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99409482:99419184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000751 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1351 (Olr1351), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99428882:99429847:1 gene:ENSRNOG00000032545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99428888:99442968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000953 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1352 (Olr1352), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99442000:99442968:1 gene:ENSRNOG00000037404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99428888:99442968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000750 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1353 (Olr1353), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99460792:99461846:1 gene:ENSRNOG00000046386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99460792:99469321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037359 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 35 (Gpr35), mRNA. // chr9 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// XM_006245537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 35 (Gpr35), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 35 (Gpr35), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 35 (Gpr35), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99800964:99801884:1 gene:ENSRNOG00000024030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// AB240684 // GenBank // Rattus norvegicus GPR35 mRNA for G protein-coupled receptor GPR35, complete cds. // chr9 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99796364:99801884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT057257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_001109009 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 12A (Aqp12a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99819237:99824384:1 gene:ENSRNOG00000004452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99819463:99824231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001270659 // RefSeq // Rattus norvegicus alanine-glyoxylate aminotransferase (Agxt), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NM_001276706 // RefSeq // Rattus norvegicus alanine-glyoxylate aminotransferase (Agxt), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_030656 // RefSeq // Rattus norvegicus alanine-glyoxylate aminotransferase (Agxt), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000029127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99939444:99949392:1 gene:ENSRNOG00000023856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// M35270 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial serine:pyruvate aminotransferase precursor, mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99939552:99949150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT057259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT057260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT057261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
XM_006226962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative ciliary rootlet coiled-coil protein-like 3 protein-like (LOC102551034), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99980357:100031089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0
NM_001167842 // RefSeq // Rattus norvegicus sushi, nidogen and EGF-like domains 1 (Sned1), mRNA. // chr9 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// XM_006245527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi, nidogen and EGF-like domains 1 (Sned1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100037560:100093411:1 gene:ENSRNOG00000023548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100037711:100072785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100074888:100094189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF439715 // GenBank // Rattus norvegicus isolate No:5 insulin responsive sequence DNA binding protein-1 mRNA, partial cds. // chr9 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001009825 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 7 (Ppp1r7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100146206:100160432:1 gene:ENSRNOG00000016974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC088868 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 7, mRNA (cDNA clone MGC:105784 IMAGE:7321115), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ233576 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YF01 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99226367:99281168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100138938:100205772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NONRATT057249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NM_001004071 // RefSeq // Rattus norvegicus anoctamin 7 (Ano7), mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XM_006245541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 7 (Ano7), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XM_006245543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 7 (Ano7), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000033233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100167965:100204826:1 gene:ENSRNOG00000023427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000029584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100138938:100205772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT057269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0
NM_057148 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 2 (Sept2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006245514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 2 (Sept2), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000024261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100277909:100311079:1 gene:ENSRNOG00000017952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC081745 // GenBank // Rattus norvegicus septin 2, mRNA (cDNA clone MGC:93254 IMAGE:7121592), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB027561 // GenBank // Rattus norvegicus VESP11 mRNA for vascular endothelial cell specific protein 11, complete cds. // chr9 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// NONRATT057273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000029593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100288185:100308300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// NONRATT057274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// NONRATT057275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001108233 // RefSeq // Rattus norvegicus FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 (Farp2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2 (Farp2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100313423:100421287:1 gene:ENSRNOG00000018051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100382896:100419535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT057282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100328999:100380629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_017312 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-related ovarian killer (Bok), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100482657:100493562:1 gene:ENSRNOG00000018214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100482657:100493562:1 gene:ENSRNOG00000018214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF027954 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl-2-related ovarian killer protein (Bok) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AF051093 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl-2-related ovarian killer protein (Bok) mRNA, alternatively spliced variant, complete cds. // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC078871 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2-related ovarian killer, mRNA (cDNA clone MGC:93540 IMAGE:7132448), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// HQ696784 // GenBank // Rattus norvegicus Bok-BH3, precursor RNA, complete cds. // chr9 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT057286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100448719:100492942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT057288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT057287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001025711 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 4B, cysteine peptidase (Atg4b), mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100564123:100573271:1 gene:ENSRNOG00000018403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC098833 // GenBank // Rattus norvegicus ATG4 autophagy related 4 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112887 IMAGE:7378703), complete cds. // chr9 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100541617:100571594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// NONRATT057292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1
NM_001108810 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 5 (Ing5), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100585744:100603189:1 gene:ENSRNOG00000018988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100586087:100603189:1 gene:ENSRNOG00000018988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC167048 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:189335 IMAGE:9100546), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100587377:100625815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001106926 // RefSeq // Rattus norvegicus D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase (D2hgdh), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006245521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase (D2hgdh), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000025711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100609556:100626136:1 gene:ENSRNOG00000019012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC166559 // GenBank // Rattus norvegicus D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:188172 IMAGE:7312233), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100587377:100625815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
XM_006245568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus galactose-3-O-sulfotransferase 2 (Gal3st2), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038687 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:100627597:100645572:1 gene:ENSRNOG00000022982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100628556:100645572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001108234 // RefSeq // Rattus norvegicus sialidase 4 (Neu4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialidase 4 (Neu4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100655816:100661472:1 gene:ENSRNOG00000019031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100651240:100660536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012350 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 174, member A (Fam174a), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 174, member A (Fam174a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000050494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:102475547:102493695:1 gene:ENSRNOG00000019087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC089835 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 174, member A, mRNA (cDNA clone MGC:108820 IMAGE:7326083), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001025775 // RefSeq // Rattus norvegicus diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 2 (Ppip5k2), mRNA. // chr9 // 70 // 70 // 44 // 63 // 1 /// ENSRNOT00000056439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:110786864:110800883:1 gene:ENSRNOG00000011613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 63 // 40 // 63 // 1 /// FQ223200 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA14YD20 mRNA sequence. // chr9 // 25 // 25 // 16 // 63 // 1 /// FQ232266 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YH01 mRNA sequence. // chr9 // 32 // 32 // 20 // 63 // 1 /// GENSCAN00000037654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:110818022:110835036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 14 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:110787044:110815676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT057313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 37 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 70 // 70 // 44 // 63 // 1 /// NONRATT057312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 37 // 37 // 23 // 63 // 1 /// NONRATT057315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 21 // 21 // 13 // 63 // 1 /// NONRATT057316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 13 // 13 // 8 // 63 // 1
NM_001109086 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to D1Ertd622e protein (RGD1562136), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to D1Ertd622e protein (RGD1562136), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006245610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to D1Ertd622e protein (RGD1562136), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006245611 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to D1Ertd622e protein (RGD1562136), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000045749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:110878815:110898589:1 gene:ENSRNOG00000032398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232173 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YM02 mRNA sequence. // chr9 // 62 // 52 // 8 // 13 // 0 /// NONRATT057319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (RGD1559955), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006245591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (RGD1559955), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000046179 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:106497329:106497791:-1 gene:ENSRNOG00000032765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:106478821:106497765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
XM_006245600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fer (fms/fps related) protein kinase, testis specific 2 (Fert2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006245602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fer (fms/fps related) protein kinase, testis specific 2 (Fert2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:111141130:111404714:1 gene:ENSRNOG00000015898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NM_001106928 // RefSeq // Rattus norvegicus fer (fms/fps related) protein kinase, testis specific 2 (Fert2), mRNA. // chr9 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// ENSRNOT00000056430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:111189884:111404714:1 gene:ENSRNOG00000015898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// NONRATT057321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT057322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// GENSCAN00000033154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:111163576:111256570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 19 // 41 // 1
AY325162 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-111 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 46 // 22 // 22 // 0 /// NM_012979 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 2A, member 1 (Man2a1), mRNA. // chr9 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// ENSRNOT00000020767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:111831033:111987870:1 gene:ENSRNOG00000015439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// GENSCAN00000044809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:111832017:111987191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT057327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
ENSRNOT00000033532 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:112764257:112764846:1 gene:ENSRNOG00000027972 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:112764257:112764846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_080907 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 4, regulatory subunit 1 (Ppp4r1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000066793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:113066545:113105527:1 gene:ENSRNOG00000013733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF332004 // GenBank // Rattus norvegicus putative protein serine/threonine phosphatase 4-associated protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// BC061726 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 4, regulatory subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:72329 IMAGE:5598703), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000007051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113066534:113078454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000035123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113086387:113104707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT057331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT057333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
NM_001127390 // RefSeq // Rattus norvegicus WAS protein family homolog (Wash), mRNA. // chrU // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000016588 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:113443347:113459271:1 gene:ENSRNOG00000012504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 87 // 75 // 13 // 15 // 0 /// BC166761 // GenBank // Rattus norvegicus WAS protein family homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:188513 IMAGE:7930951), complete cds. // chrU // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// XM_006227036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAS protein family homolog (Wash), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// XM_006227037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAS protein family homolog (Wash), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// BC101888 // GenBank // Rattus norvegicus WAS protein family homolog 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7930838), partial cds. // chrU // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// NONRATT057342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 87 // 75 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113414994:113458926:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// NONRATT057341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
XM_006227039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 (Ddx11), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD/H (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box helicase 11 (Ddx11), partial mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016536 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:113624115:113648909:1 gene:ENSRNOG00000012338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113585016:113659305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XR_147134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC367333 (LOC367333), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000041435 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:113504618:113505435:-1 gene:ENSRNOG00000032758 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113504594:113505238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 65 // 17 // 20 // 0
NM_001108237 // RefSeq // Rattus norvegicus laminin, alpha 1 (Lama1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENSRNOT00000023226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:115406905:115531632:1 gene:ENSRNOG00000017237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// AB425340 // GenBank // Rattus norvegicus Lama1 mRNA for laminin, alpha 1, complete cds, strain: WKY/NCrj. // chr9 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// AB425341 // GenBank // Rattus norvegicus Lama1 mRNA for laminin, alpha 1, complete cds, strain: BUF/Mna. // chr9 // 97 // 100 // 61 // 63 // 0 /// GENSCAN00000033104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:115407405:115535065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 59 // 59 // 0 /// NONRATT057358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT057359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 21 // 21 // 13 // 63 // 1
ENSRNOT00000031814 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:115681241:115681778:1 gene:ENSRNOG00000025351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0
XM_006226981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to l(3)mbt-like 3 (LOC689856), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to l(3)mbt-like 3 (LOC689856), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029210 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:116140537:116460374:1 gene:ENSRNOG00000025273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:116140697:116197427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001251926 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 200C (Tmem200c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:116518447:116524285:1 gene:ENSRNOG00000049880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:116508446:116523502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172325 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 161 (Zfp161), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:117205246:117206593:1 gene:ENSRNOG00000016719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY157624 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 161 (Zfp161) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:117187775:117206593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022946 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 1 (Dlgap1), mRNA. // chr9 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000022351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:118045333:118613312:1 gene:ENSRNOG00000016196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// AB003594 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PSD-95 binding protein, complete cds. // chr9 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// FQ212368 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YI19 mRNA sequence. // chr9 // 93 // 74 // 27 // 29 // 0 /// U67137 // GenBank // Rattus norvegicus PSD-95/SAP90-associated protein-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// U67987 // GenBank // Rattus norvegicus guanylate kinase associated protein (GKAP) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:118565456:118612383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT057376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
NM_001191584 // RefSeq // Rattus norvegicus myomesin 1 (Myom1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000029583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:118808061:118922531:1 gene:ENSRNOG00000026700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000033092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:118798726:118951424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT057381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
NM_001108236 // RefSeq // Rattus norvegicus lipin 2 (Lpin2), mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000020476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:118970173:119045052:1 gene:ENSRNOG00000014876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000033085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:118995681:119042037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT057384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0
ENSRNOT00000072907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:119138793:119139742:1 gene:ENSRNOG00000049654 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:119138793:119139742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001191814 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 4 (Mettl4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 4 (Mettl4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:119326955:119350223:1 gene:ENSRNOG00000026280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:119326955:119405458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT057389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_033298 // RefSeq // Rattus norvegicus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes) oncogene homolog 1 (Yes1), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes) oncogene homolog 1 (Yes1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:121252196:121323121:1 gene:ENSRNOG00000037227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:121252196:121327338:1 gene:ENSRNOG00000037227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB037472 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein tyrosine kinase c-Yes, partial cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079403 // GenBank // Rattus norvegicus Yamaguchi sarcoma viral (v-yes) oncogene homolog 1, mRNA (cDNA clone MGC:94936 IMAGE:7112783), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:121214695:121340021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
XR_349329 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100364304 (LOC100364304), misc_RNA. // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XR_357344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549695 (LOC102549695), ncRNA. // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_006227209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 729-like (LOC102548633), partial mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XR_349328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 91-like (LOC102557349), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XR_357346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 99-like (LOC102549831), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XR_358072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102547688), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ209527 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YC20 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006225158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102557117), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// XM_006227221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 665-like (LOC102557259), partial mRNA. // chr9 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// NONRATT042474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT042475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT057402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0
FQ223177 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA14YJ11 mRNA sequence. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000072923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:3416070:3432074:-1 gene:ENSRNOG00000046714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// NM_001025662 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4932415M13 (LOC301165), mRNA. // chr9 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061893 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:3772242:3774337:1 gene:ENSRNOG00000022509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 74 // 73 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3363066:3425579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3723964:3784482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0 /// NONRATT057415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 75 // 92 // 18 // 24 // 0
XM_003750617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus p300/CBP-associated factor (Pcaf), mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_006227005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus p300/CBP-associated factor (Pcaf), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000061882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:3479552:3527403:-1 gene:ENSRNOG00000011871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3488010:3531412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT057417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
XM_003750615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brain acid soluble protein 1-like (LOC100910172), mRNA. // chr9 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000072233 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:3229471:3230130:1 gene:ENSRNOG00000046107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002846 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:3089553:3090213:-1 gene:ENSRNOG00000002084 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3025439:3090213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:3229471:3317738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0
NM_022692 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB5A, member RAS oncogene family (Rab5a), mRNA. // chr14 // 96 // 69 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:72908161:72908809:1 gene:ENSRNOG00000005028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 85 // 69 // 23 // 27 // 0 /// AF072935 // GenBank // Rattus norvegicus small GTP-binding protein rab5 (RAB5) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 69 // 26 // 27 // 0 /// BC161848 // GenBank // Rattus norvegicus RAB5A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:187370 IMAGE:9025210), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC072495 // GenBank // Rattus norvegicus RAB5A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:7097094), complete cds. // chr14 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// GENSCAN00000014829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:72908162:72908809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 85 // 69 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT018563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 87 // 97 // 33 // 38 // 0 /// NONRATT018564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 87 // 97 // 33 // 38 // 0 /// NONRATT018565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 91 // 56 // 20 // 22 // 0
ENSRNOT00000074235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151532921:151541216:1 gene:ENSRNOG00000049326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 35 // 92 // 8 // 23 // 0 /// FQ229442 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YO07 mRNA sequence. // chr9 // 35 // 92 // 8 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000000136 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:104087:104326:-1 gene:ENSRNOG00000000124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:91884:104371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
GENSCAN00000035600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:37351792:37352130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:69355602:69355940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT055247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000035218 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:37351792:37352428:1 gene:ENSRNOG00000022275 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000075446 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:69355304:69355940:-1 gene:ENSRNOG00000046073 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0
NM_145095 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 8 (Kcnh8), mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:36863082:37426999:1 gene:ENSRNOG00000012711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF061957 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel (elk1) mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:37379868:37426617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT056359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:37047152:37281403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NONRATT056359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001106880 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C-like 2 (Plcl2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:1740384:1972816:-1 gene:ENSRNOG00000013368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:1828315:1852961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT057408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:1740961:1765706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
AF035952 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-related protein 3A (Krp3a) mRNA, partial cds. // chr9 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// AY035403 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-related protein 3B (Krp3b) mRNA, partial cds. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006226706 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 6 (Kif6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// XM_006226707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 6 (Kif6), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// XM_006244480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 6 (Kif6), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// XM_006244481 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 6 (Kif6), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000015584 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:11958961:12245887:-1 gene:ENSRNOG00000011453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:12102340:12168795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000035287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:12183426:12245830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT057436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001106881 // RefSeq // Rattus norvegicus molybdenum cofactor synthesis 1 (Mocs1), mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006244415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus molybdenum cofactor synthesis 1 (Mocs1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:12426598:12446849:-1 gene:ENSRNOG00000011784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006244417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus molybdenum cofactor synthesis 1 (Mocs1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT057438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:12427178:12450275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT057437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT057439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT057440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001039699 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 (Lrfn2), mRNA. // chr9 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// XM_006244429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 2 (Lrfn2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000015705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:12776272:12807638:-1 gene:ENSRNOG00000011803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000043029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:12760643:12812309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT057442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
XM_006244466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244471 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_001134596 // RefSeq // Rattus norvegicus O-acyl-ADP-ribose deacylase 1 (Oard1), mRNA. // chr9 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000067623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13467179:13474021:-1 gene:ENSRNOG00000012679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT057445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001192001 // RefSeq // Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 1 (Treml1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ232642 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YP09 mRNA sequence. // chrU // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13521178:13523576:-1 gene:ENSRNOG00000040109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13498025:13557322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT057448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001106884 // RefSeq // Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells 2 (Trem2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13532920:13539372:-1 gene:ENSRNOG00000013578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13498025:13557322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006226708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CMRF35-like molecule 7-like (RGD1307182), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006244483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CMRF35-like molecule 7-like (RGD1307182), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13567709:13575380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
XM_001059150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2 (Treml2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002727159 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2 (Treml2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006226718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2 (Treml2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2 (Treml2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XR_348908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2 (Treml2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// XR_356845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells-like 2 (Treml2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042404 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:13582097:13589656:-1 gene:ENSRNOG00000013554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13582097:13628150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001106885 // RefSeq // Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells 1 (Trem1), mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006244427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus triggering receptor expressed on myeloid cells 1 (Trem1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13649246:13660307:-1 gene:ENSRNOG00000022859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13649533:13664609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
XM_001059628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680955 (LOC680955), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13828791:13829527:-1 gene:ENSRNOG00000040095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073333 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:15011013:15011632:-1 gene:ENSRNOG00000050818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_001025707 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor EB (Tfeb), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor EB (Tfeb), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006244442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor EB (Tfeb), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006244444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor EB (Tfeb), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006244445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor EB (Tfeb), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006244446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor EB (Tfeb), transcript variant X8, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14132622:14139303:-1 gene:ENSRNOG00000014666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099102 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor EB, mRNA (cDNA clone MGC:116240 IMAGE:7460021), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14133210:14199067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT057461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_133284 // RefSeq // Rattus norvegicus progastricsin (pepsinogen C) (Pgc), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14191145:14199127:-1 gene:ENSRNOG00000014492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14133210:14199067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001017382 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor substrate 3 (Frs3), mRNA. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006244437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor substrate 3 (Frs3), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14222004:14228827:-1 gene:ENSRNOG00000014328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY972083 // GenBank // Rattus norvegicus suc1-associated neurotrophic factor target 2 (Snt2) mRNA, complete cds. // chr9 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14222435:14227547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT057464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001136470 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 49 (Usp49), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 49 (Usp49), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14241623:14299667:-1 gene:ENSRNOG00000013866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14242620:14253758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001013178 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 20 (Med20), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NM_001277367 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 20 (Med20), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000018523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14303845:14314475:-1 gene:ENSRNOG00000013852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC083734 // GenBank // Rattus norvegicus mediator complex subunit 20, mRNA (cDNA clone MGC:94642 IMAGE:7191561), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14304893:14312274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT057468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT057471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT057472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006226734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC301232 (RGD1561662), mRNA. // chr9 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000020516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14469566:14504403:-1 gene:ENSRNOG00000015297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14469726:14504403:-1 gene:ENSRNOG00000015297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000023309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14469839:14504403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001108198 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase activator 1B (Guca1b), mRNA. // chr9 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14542073:14550007:-1 gene:ENSRNOG00000015623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14543050:14551974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001008859 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S10 (Mrps10), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S10 (Mrps10), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000040204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14558418:14567371:-1 gene:ENSRNOG00000022609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14558418:14567371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001108199 // RefSeq // Rattus norvegicus transcriptional regulating factor 1 (Trerf1), mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcriptional regulating factor 1 (Trerf1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:14576728:14621302:-1 gene:ENSRNOG00000022598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:14572851:14621028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT057479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_013021 // RefSeq // Rattus norvegicus peripherin 2 (Prph2), mRNA. // chrU // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000061500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15002823:15006668:-1 gene:ENSRNOG00000033159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000049382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15003213:15006754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT057485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001108200 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor C (Tbcc), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15314178:15315200:-1 gene:ENSRNOG00000048291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166467 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor C, mRNA (cDNA clone MGC:187838 IMAGE:9035211), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15314178:15315200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681367 (LOC681367), partial mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681367 (LOC681367), partial mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072581 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:15426094:15426438:-1 gene:ENSRNOG00000046871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15426094:15426420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133525 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-deoxynucleoside 5-phosphate N-hydrolase 1 (Dnph1), mRNA. // chr9 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000024815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15747109:15749854:-1 gene:ENSRNOG00000018397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// U82591 // GenBank // Rattus norvegicus RCL (Rcl) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15747143:15749840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001109303 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich protein 3 (Crip3), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000061503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15828909:15831761:-1 gene:ENSRNOG00000018613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15829282:15872242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000025335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15845800:15875058:-1 gene:ENSRNOG00000018741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15839403:15875058:-1 gene:ENSRNOG00000018741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15829282:15872242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001009601 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin light chain 4 (Klc4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006244516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin light chain 4 (Klc4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000031625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15554537:15568069:1 gene:ENSRNOG00000018168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC087116 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin light chain 4, mRNA (cDNA clone MGC:94745 IMAGE:7193915), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000052743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15555794:15567677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT056177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT056182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_006226737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 36 homolog (S. cerevisiae) (Rrp36), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 36 homolog (S. cerevisiae) (Rrp36), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 36 homolog (S. cerevisiae) (Rrp36), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15525626:15532535:1 gene:ENSRNOG00000017836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15519510:15532230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ218501 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YL17 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT056171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001012203 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch domain containing 3 (Klhdc3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006244541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch domain containing 3 (Klhdc3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15519048:15525376:1 gene:ENSRNOG00000017495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079035 // GenBank // Rattus norvegicus kelch domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:93964 IMAGE:7114311), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15519510:15532230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// NONRATT056163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT056167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT056169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT056164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
XM_003750611 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform-like (LOC100909464), partial mRNA. // chr9 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// XM_006226735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, delta (Ppp2r5d), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, delta (Ppp2r5d), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15493418:15517044:1 gene:ENSRNOG00000016849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099800 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, delta isoform, mRNA (cDNA clone IMAGE:7936565), partial cds. // chr9 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15493500:15516048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000006021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:563436:623791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_057125 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 6 (Pex6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// ENSRNOT00000022582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15475358:15487515:-1 gene:ENSRNOG00000016655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// D63673 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peroxisome assembly factor-2, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// FQ210748 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA23YB20 mRNA sequence. // chr9 // 35 // 35 // 28 // 79 // 1 /// GENSCAN00000049396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15233343:15309468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 65 // 65 // 0 /// GENSCAN00000052742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15475570:15487495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 73 // 73 // 0 /// NONRATT057489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 43 // 79 // 1
NM_001108202 // RefSeq // Rattus norvegicus delta-like 2 homolog (Drosophila) (Dlk2), mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15957867:15962277:-1 gene:ENSRNOG00000018949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC169084 // GenBank // Rattus norvegicus delta-like 2 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7934405), partial cds. // chr9 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15958036:15961668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT057511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001024360 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 73 (Lrrc73), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16007854:16010854:-1 gene:ENSRNOG00000039856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB210855 // GenBank // Rattus norvegicus nod3l mRNA for NOD3-like protein, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC128712 // GenBank // Rattus norvegicus NOD3-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:156522 IMAGE:7133504), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16008114:16010754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001007801 // RefSeq // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 3 (Yipf3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16011992:16017295:-1 gene:ENSRNOG00000018998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087102 // GenBank // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:94695 IMAGE:7192818), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16013220:16017190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT057518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001108789 // RefSeq // Rattus norvegicus exportin 5 (Xpo5), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000025921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16021878:16059659:-1 gene:ENSRNOG00000019085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16022757:16066103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_001013225 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP binding protein 2 (Gtpbp2), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTP binding protein 2 (Gtpbp2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16095446:16103483:-1 gene:ENSRNOG00000019332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTP binding protein 2 (Gtpbp2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16096483:16103374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT057521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT057523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT057525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_198756 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S18A (Mrps18a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16133559:16150048:-1 gene:ENSRNOG00000019511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC058507 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S18A, mRNA (cDNA clone MGC:73006 IMAGE:6889538), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ215521 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YO09 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16133787:16150045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT057529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001106890 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L14 (Mrpl14), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001271131 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L14 (Mrpl14), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006244510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L14 (Mrpl14), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006244511 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L14 (Mrpl14), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L14 (Mrpl14), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000026716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16576229:16581660:-1 gene:ENSRNOG00000019734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16576320:16579147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT057531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037215 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35 (adenosine 3-phospho 5-phosphosulfate transporter), member B2 (Slc35b2), mRNA. // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16712121:16715753:-1 gene:ENSRNOG00000019900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AB197928 // GenBank // Rattus norvegicus dsm-1 mRNA for D-serine modulator-1, complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC100647 // GenBank // Rattus norvegicus D-serine modulator-1, mRNA (cDNA clone MGC:124695 IMAGE:7932661), complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT057534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16712572:16723780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_199111 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, epsilon (Nfkbie), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16717129:16723961:-1 gene:ENSRNOG00000019907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC061795 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:72568 IMAGE:5597840), complete cds. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16712572:16723780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001108206 // RefSeq // Rattus norvegicus t-complex-associated testis expressed 1 (Tcte1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16737240:16746455:-1 gene:ENSRNOG00000019961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16737516:16769589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106891 // RefSeq // Rattus norvegicus alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Aars2), mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// XM_006244513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Aars2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000031549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:16570774:16769589:-1 gene:ENSRNOG00000025808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC166719 // GenBank // Rattus norvegicus alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone IMAGE:7932249), partial cds. // chr9 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000021954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:16737516:16769589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT057540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
ENSRNOT00000061048 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:16832511:16835052:-1 gene:ENSRNOG00000039790 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0
XR_348929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557318 (LOC102557318), ncRNA. // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_053603 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 5 (Clic5), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18004700:18251818:-1 gene:ENSRNOG00000047218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF323174 // GenBank // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 5 mRNA, complete cds. // chr9 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18009520:18054052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT057555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT057554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001012744 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (Enpp5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5 (Enpp5), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18348413:18355062:-1 gene:ENSRNOG00000010232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090331 // GenBank // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 5, mRNA (cDNA clone MGC:105517 IMAGE:7300780), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18348735:18387549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT057558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_175578 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of calcineurin 2 (Rcan2), mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18397067:18626606:-1 gene:ENSRNOG00000010350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18397067:18491766:-1 gene:ENSRNOG00000010350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// AF459022 // GenBank // Rattus norvegicus ZAKI-4 alpha mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// AF459023 // GenBank // Rattus norvegicus ZAKI-4 beta mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// BC086974 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of calcineurin 2, mRNA (cDNA clone MGC:93057 IMAGE:7193921), complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18399453:18429635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT057560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT057562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT057561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001106893 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 39, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp39a1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006244604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 39, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp39a1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18681949:18758013:-1 gene:ENSRNOG00000010519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18738627:18751905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT057563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NONRATT057563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001009353 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group VII (platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma) (Pla2g7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006244606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group VII (platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma) (Pla2g7), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000038222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18813230:18855030:-1 gene:ENSRNOG00000025691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC088457 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A2, group VII (platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma), mRNA (cDNA clone MGC:95107 IMAGE:7127300), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000008160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18818818:18836685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NONRATT057564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1
NM_139110 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 116 (Gpr116), mRNA. // chr9 // 96 // 96 // 43 // 45 // 0 /// XM_006244594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 116 (Gpr116), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006244596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 116 (Gpr116), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000015223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:18970748:19071542:-1 gene:ENSRNOG00000011154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// AB019120 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for seven transmembrane receptor, complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 43 // 45 // 0 /// GENSCAN00000028332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:18971465:19033276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT057565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT057566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 15 // 47 // 1 /// NONRATT057568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
XM_003750660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 110 (Gpr110), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006226769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 110 (Gpr110), mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 110 (Gpr110), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:19202532:19237355:-1 gene:ENSRNOG00000025654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19183221:19254974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT057571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001108207 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 21 (Tnfrsf21), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:19419628:19494259:-1 gene:ENSRNOG00000011517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19435841:19477099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19421563:19424280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006226756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patched domain containing 4 (Ptchd4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patched domain containing 4 (Ptchd4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016940 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:20002092:20202925:-1 gene:ENSRNOG00000012708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:20002092:20076878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patched domain containing 4 (Ptchd4), mRNA. // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// XM_006244641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patched domain containing 4 (Ptchd4), mRNA. // chr9 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000016940 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:20002092:20202925:-1 gene:ENSRNOG00000012708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
ENSRNOT00000071630 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:22221885:22222164:1 gene:ENSRNOG00000047704 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT056296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22221937:22237461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006226758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548541 (LOC102548541), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22157348:22184929:1 gene:ENSRNOG00000049135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY310141 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1078 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily ac, polypeptide 1 (Cyp2ac1), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_236969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily ac, polypeptide 1 (Cyp2ac1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000072826 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:22289118:22311885:-1 gene:ENSRNOG00000048329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22289106:22311843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_023022 // RefSeq // Rattus norvegicus Rh-associated glycoprotein (Rhag), mRNA. // chr9 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000072144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22323162:22351046:-1 gene:ENSRNOG00000050121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB015194 // GenBank // Rattus norvegicus Rh50 mRNA for 50 kD glycoprotein, complete cds. // chr9 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// AF531097 // GenBank // Rattus norvegicus Rh blood group-associated glycoprotein (Rhag) mRNA, complete cds. // chr9 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// NONRATT057582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT057583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000020607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22326865:22357052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
XM_006226757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylmalonyl CoA mutase (Mut), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylmalonyl CoA mutase (Mut), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075279 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:22184294:22208962:-1 gene:ENSRNOG00000050843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22184294:22208962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT057577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_006226771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily ac, polypeptide 1 (Cyp2ac1), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_236969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily ac, polypeptide 1 (Cyp2ac1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072826 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:22289118:22311885:-1 gene:ENSRNOG00000048329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22289106:22311843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_023022 // RefSeq // Rattus norvegicus Rh-associated glycoprotein (Rhag), mRNA. // chr9 // 91 // 97 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000072144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:22323162:22351046:-1 gene:ENSRNOG00000050121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AB015194 // GenBank // Rattus norvegicus Rh50 mRNA for 50 kD glycoprotein, complete cds. // chr9 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// AF531097 // GenBank // Rattus norvegicus Rh blood group-associated glycoprotein (Rhag) mRNA, complete cds. // chr9 // 91 // 97 // 31 // 34 // 0 /// NONRATT057582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT057583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000020607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:22326865:22357052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NONRATT057584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000018011 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:22827822:22828156:-1 gene:ENSRNOG00000013488 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 63 // 100 // 10 // 16 // 0
NM_001039393 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein 4 (Crisp4), mRNA. // chr9 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:23218718:23245318:-1 gene:ENSRNOG00000013612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// DQ200907 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein 4 (Crisp4) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:23224125:23313913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001037527 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 49 (Defb49), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:23308742:23313913:-1 gene:ENSRNOG00000039651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY621372 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 49 (Defb49) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:23224125:23313913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037530 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 18 (Defb18), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:23329459:23330370:-1 gene:ENSRNOG00000039650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621349 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 18 (Defb18) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037534 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 17 (Defb17), mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NR_002707 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 16 pseudogene (Defb16-ps), non-coding RNA. // chr9 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000060793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:23368183:23371698:-1 gene:ENSRNOG00000039640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AY621348 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 17 (Defb17) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
GENSCAN00000003305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:23855685:23856068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
XM_001070557 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney and hepatic disease 1 (Pkhd1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 64 // 64 // 0 /// ENSRNOT00000060760 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:25493724:25564058:-1 gene:ENSRNOG00000025149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 22 // 68 // 1 /// GENSCAN00000019236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25363965:25389950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 12 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25152488:25353162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 21 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25412381:25598723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 26 // 68 // 1
GENSCAN00000016443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25714084:25788341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001015011 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17F (Il17f), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:25742094:25753605:-1 gene:ENSRNOG00000012509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091568 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 17F, mRNA (cDNA clone MGC:114402 IMAGE:7443410), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25714084:25788341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001191805 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 3 (Mcm3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000017081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:25770288:25788415:-1 gene:ENSRNOG00000012543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25714084:25788341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT057593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_002730009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocating chain-associating membrane protein 2 (LOC100361830), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017592 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:25973255:26047245:-1 gene:ENSRNOG00000013046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:25973255:26008177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001024361 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Glutathione S-transferase A1 (GTH1) (HA subunit 1) (GST-epsilon) (GSTA1-1) (GST class-alpha) (LOC501110), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Glutathione S-transferase A1 (GTH1) (HA subunit 1) (GST-epsilon) (GSTA1-1) (GST class-alpha) (LOC501110), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:26322566:26358469:-1 gene:ENSRNOG00000033402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079271 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Glutathione S-transferase A1 (GTH1) (HA subunit 1) (GST-epsilon) (GSTA1-1) (GST class-alpha), mRNA (cDNA clone MGC:94389 IMAGE:7133989), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ231207 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA78YI10 mRNA sequence. // chr9 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT057602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:26273125:26347161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT057603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT057604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001134643 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 5 (Kcnq5), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:26413937:26561055:-1 gene:ENSRNOG00000013781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:26413937:26561055:-1 gene:ENSRNOG00000013781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000008975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:26457870:26512499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_052829 // RefSeq // Rattus norvegicus regulating synaptic membrane exocytosis 1 (Rims1), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:27284840:27813498:-1 gene:ENSRNOG00000011000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AF007836 // GenBank // Rattus norvegicus rab3 effector (RIM) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AF199333 // GenBank // Rattus norvegicus RIM1B (Rim1B) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000000140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:27400628:27440622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
ENSRNOT00000018896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:28175208:28175651:-1 gene:ENSRNOG00000014123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC082106 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933415F23, mRNA (cDNA clone MGC:95304 IMAGE:7134835), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:28175208:28175651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT057614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025708 // RefSeq // Rattus norvegicus opioid growth factor receptor-like 1 (Ogfrl1), mRNA. // chr9 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:28469367:28483091:-1 gene:ENSRNOG00000014142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC099205 // GenBank // Rattus norvegicus opioid growth factor receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:116379 IMAGE:7384201), complete cds. // chr9 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:28438417:28483026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT057620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_003750669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685888 (LOC685888), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003750670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685888 (LOC685888), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685888 (LOC685888), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685888 (LOC685888), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035033 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:29068247:29076025:-1 gene:ENSRNOG00000028087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:29068247:29145765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001134597 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member A (Fam135a), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000018234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:29080802:29160296:-1 gene:ENSRNOG00000013587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// FQ222914 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA17YO23 mRNA sequence. // chr9 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000025731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:29068247:29145765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 76 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT057625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
XM_006226765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XIX, alpha 1 (Col19a1), mRNA. // chr9 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// XM_006244669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XIX, alpha 1 (Col19a1), mRNA. // chr9 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000017169 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:29339207:29668271:-1 gene:ENSRNOG00000012759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000025750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:29347950:29387727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0
NM_001106898 // RefSeq // Rattus norvegicus brain-specific angiogenesis inhibitor 3 (Bai3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brain-specific angiogenesis inhibitor 3 (Bai3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:30096276:30829729:-1 gene:ENSRNOG00000012045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:30427618:30579351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:30081989:30161792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSRNOT00000038108 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:30623999:30624361:-1 gene:ENSRNOG00000027364 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 83 // 82 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT057630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:30623762:30631137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
XM_001071792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31A6-like (LOC689725), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_003754509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31A6-like (LOC689725), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000038369 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:31669706:31675132:-1 gene:ENSRNOG00000026195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:31513337:31675060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000053539 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:9:33083062:33083180:-1 gene:ENSRNOG00000035416 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003750671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911971 (LOC100911971), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_003754510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911971 (LOC100911971), mRNA. // chr9 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000037765 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:34098845:34104443:1 gene:ENSRNOG00000026175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000060501 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:34098845:34104510:1 gene:ENSRNOG00000026175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000060503 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:34098866:34104443:1 gene:ENSRNOG00000026175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000025204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:34098917:34249647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000049646 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:33359942:33360685:1 gene:ENSRNOG00000033264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:33358429:33360685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
NM_001108791 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 3 (Phf3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:35878437:35948938:-1 gene:ENSRNOG00000011756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:35869163:35960425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000037392 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:40490043:40490486:1 gene:ENSRNOG00000022456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000020878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:40490043:40490246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_001009652 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 622 (Zfp622), mRNA. // chr9 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000066879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:97978551:97992639:1 gene:ENSRNOG00000049087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// AY310142 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1133 mRNA, complete cds. // chr9 // 78 // 79 // 18 // 23 // 0 /// BC088214 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 622, mRNA (cDNA clone MGC:108936 IMAGE:7383802), complete cds. // chr9 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000038901 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:38638815:38640205:1 gene:ENSRNOG00000024624 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:97930357:97992514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:38638815:38640125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 76 // 100 // 22 // 29 // 0
NM_001024762 // RefSeq // Rattus norvegicus primase, DNA, polypeptide 2 (Prim2), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus primase, DNA, polypeptide 2 (Prim2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:38217427:38424414:1 gene:ENSRNOG00000012486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:38217427:38424414:1 gene:ENSRNOG00000012486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AJ011607 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DNA polymerase alpha subunit III (primase), partial. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC097454 // GenBank // Rattus norvegicus primase, DNA, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:114515 IMAGE:7456950), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT056382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT056383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:38364638:38424079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:38223462:38324186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT056384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT056385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001128195 // RefSeq // Rattus norvegicus Bcl2-associated athanogene 2 (Bag2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:38145393:38147902:1 gene:ENSRNOG00000012709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158711 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl2-associated athanogene 2, mRNA (cDNA clone MGC:187837 IMAGE:9035120), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ228417 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA8YL19 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:38108981:38147008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033705 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 451 (Zfp451), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 451 (Zfp451), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:38077911:38133115:1 gene:ENSRNOG00000012718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC101930 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 451, mRNA (cDNA clone MGC:124741 IMAGE:7938755), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:38108981:38147008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT056374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000029184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:37968005:38091133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001108792 // RefSeq // Rattus norvegicus BEN domain containing 6 (Bend6), mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:37980049:38032680:1 gene:ENSRNOG00000030312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:37968005:38091133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000017722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:37462255:37466909:1 gene:ENSRNOG00000013234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166583 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 115, mRNA (cDNA clone MGC:188312 IMAGE:7442489), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001108793 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 115 (Ccdc115), mRNA. // chr9 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:37462271:37465677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT056360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT056362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT056363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108209 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 40 (Prss40), mRNA. // chr9 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000018758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:40731239:40739928:-1 gene:ENSRNOG00000014001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:40731408:40745062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT057668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_001271134 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 168, member B (Fam168b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006244720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 168, member B (Fam168b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NONRATT057672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:40978314:41006395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
ENSRNOT00000049151 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:42248444:42249252:-1 gene:ENSRNOG00000032065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42248444:42257674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_133596 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-glucose glycoprotein glucosyltransferase 1 (Uggt1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000020558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42350134:42459613:-1 gene:ENSRNOG00000014901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AF200359 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-glucose glycoprotein:glucosyltransferase precursor (Uggt) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000008940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42350566:42459613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT057674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001014100 // RefSeq // Rattus norvegicus neuralized E3 ubiquitin protein ligase 3 (Neurl3), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42485860:42494020:-1 gene:ENSRNOG00000015366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC088198 // GenBank // Rattus norvegicus lung-inducible neuralized-related C3HC4 RING domain protein, mRNA (cDNA clone MGC:108881 IMAGE:7376146), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// FQ227363 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YJ20 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42486239:42495059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT057681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001034835 // RefSeq // Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 3 (Kansl3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000020955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42553537:42597031:-1 gene:ENSRNOG00000015417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC105865 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4632411B12, mRNA (cDNA clone MGC:125261 IMAGE:7461395), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000008953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42568644:42595938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT057684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
ENSRNOT00000063781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42675165:42676878:-1 gene:ENSRNOG00000015699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// BC161950 // GenBank // Rattus norvegicus lectin, mannose-binding 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:187745 IMAGE:9025901), complete cds. // chr9 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NM_001106900 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, mannose-binding 2-like (Lman2l), mRNA. // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000008936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42654244:42676867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT057691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT057692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT057693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001108211 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 23 (Ankrd23), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42764892:42771491:-1 gene:ENSRNOG00000016151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42761120:42770235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001135014 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 39 (Ankrd39), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 39 (Ankrd39), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000021685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42773452:42781822:-1 gene:ENSRNOG00000023995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42773949:42781790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001106902 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42783321:42793776:-1 gene:ENSRNOG00000016254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106902 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006244758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4C (Sema4c), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42783321:42793776:-1 gene:ENSRNOG00000016254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42784212:42840848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006226794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022314 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:42797796:42819992:-1 gene:ENSRNOG00000046298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000008949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42784212:42840848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT057699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001122658 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 178, member B (Fam178b), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000037570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42832966:42903908:-1 gene:ENSRNOG00000023941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC160833 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 178, member B, mRNA (cDNA clone MGC:187539 IMAGE:7456084), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42856984:42882812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT057701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42784212:42840848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT057702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001039028 // RefSeq // Rattus norvegicus ARP1 actin-related protein 1 homolog B, centractin beta (yeast) (Actr1b), mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:42919562:42929225:-1 gene:ENSRNOG00000016789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// BC099152 // GenBank HTC // Rattus norvegicus ARP1 actin-related protein 1 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:7380320). // chr9 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// BC166803 // GenBank // Rattus norvegicus ARP1 actin-related protein 1 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:188605 IMAGE:7938869), complete cds. // chr9 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:42921501:42929120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT057704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1 /// NONRATT057706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// NONRATT057707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// NONRATT057708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
ENSRNOT00000023550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43006795:43103045:-1 gene:ENSRNOG00000017265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000001590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:43006427:43106193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// FQ223997 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA80YF01 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT057709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// NONRATT057714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
NM_001195488 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome C oxidase assembly factor 5 (Coa5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43716386:43726016:-1 gene:ENSRNOG00000018102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT057721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012225 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, isozyme A (Mgat4a), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// NM_001160155 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, isozyme A (Mgat4a), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000024701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:43734664:43828381:-1 gene:ENSRNOG00000018276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT057723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
NM_001030022 // RefSeq // Rattus norvegicus testis specific 10 (Tsga10), mRNA. // chr9 // 88 // 89 // 30 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44058082:44154707:-1 gene:ENSRNOG00000018376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC168202 // GenBank // Rattus norvegicus testis specific 10, mRNA (cDNA clone MGC:188055 IMAGE:7115410), complete cds. // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000034832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44047496:44118136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
NM_001009714 // RefSeq // Rattus norvegicus MIT, microtubule interacting and transport, domain containing 1 (Mitd1), mRNA. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006244828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MIT, microtubule interacting and transport, domain containing 1 (Mitd1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// XR_356960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MIT, microtubule interacting and transport, domain containing 1 (Mitd1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44169745:44181035:-1 gene:ENSRNOG00000018467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC088263 // GenBank // Rattus norvegicus MIT, microtubule interacting and transport, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:109091 IMAGE:7376620), complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44172530:44181007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT057734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT057735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006244886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysozyme g-like protein 2-like (LOC100910813), mRNA. // chr9 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071722 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:44274298:44283738:-1 gene:ENSRNOG00000048571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072642 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:44197180:44206581:-1 gene:ENSRNOG00000050591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000034844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44274298:44276579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000034854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44197180:44199461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
NM_001098838 // RefSeq // Rattus norvegicus lysozyme G-like 1 (Lyg1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44224976:44231421:-1 gene:ENSRNOG00000018534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074343 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:44302751:44314511:-1 gene:ENSRNOG00000047233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44205101:44231421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44282221:44309075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_172032 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 9 (Txndc9), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 9 (Txndc9), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44344165:44353711:-1 gene:ENSRNOG00000018593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088106 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:108568 IMAGE:7380129), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF508022 // GenBank HTC // Rattus norvegicus ES cell-related protein mRNA, complete cds. // chr9 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44344616:44355512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT057736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT057738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001108213 // RefSeq // Rattus norvegicus REV1, polymerase (DNA directed) (Rev1), mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// XM_006244819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus REV1, polymerase (DNA directed) (Rev1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000067197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44410206:44457118:-1 gene:ENSRNOG00000018623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000025650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44410498:44457106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT057740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001191887 // RefSeq // Rattus norvegicus AF4/FMR2 family, member 3 (Aff3), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000042227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44535656:44901101:-1 gene:ENSRNOG00000018830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44535784:44569828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000033964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:45165340:45186609:-1 gene:ENSRNOG00000023312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45165340:45213107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT057757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
GENSCAN00000012515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45165340:45213107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080397 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate sulfotransferase 10 (Chst10), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:45222143:45252322:-1 gene:ENSRNOG00000012815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF022729 // GenBank // Rattus norvegicus HNK-1 sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45223444:45239671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT057758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000038756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45406632:45431284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 82 // 13 // 14 // 0
NM_001191067 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 8 (Tbc1d8), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006244850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 8 (Tbc1d8), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000018640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:45778865:45893709:-1 gene:ENSRNOG00000013583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000038759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45779373:45813750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT057760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
ENSRNOT00000018684 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:45974158:45998057:-1 gene:ENSRNOG00000013946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC086427 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 149, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301405). // chr9 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:45972672:45998057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT057766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT057767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NONRATT057768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
XM_003754515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cellular repressor of E1A-stimulated genes 2 (Creg2), mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000046557 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:46047889:46088748:-1 gene:ENSRNOG00000013991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000002498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46047889:46088748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000047654 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:46101251:46161904:-1 gene:ENSRNOG00000032910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ230624 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YL01 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT057770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:46101401:46161904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
XM_001058987 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.3-like (RGD1564447), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_346041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.3-like (RGD1564447), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000051231 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:46636554:46636954:-1 gene:ENSRNOG00000032108 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
AY325136 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-055 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108215 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 9 (Mfsd9), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 9 (Mfsd9), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:47180040:47199516:-1 gene:ENSRNOG00000023129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:47181719:47199457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XR_349028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547353 (LOC102547353), transcript variant X1, ncRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_349029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547353 (LOC102547353), transcript variant X2, ncRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_357001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547353 (LOC102547353), transcript variant X1, ncRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_357002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547353 (LOC102547353), transcript variant X2, ncRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059478 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:49104098:49121583:-1 gene:ENSRNOG00000038911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001037767 // RefSeq // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 5-like (Arpc5l), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28523340:28530898:1 gene:ENSRNOG00000014317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC098820 // GenBank // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 5-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377370), complete cds. // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021996 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:49466038:49466499:-1 gene:ENSRNOG00000016444 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28527934:28530155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49466038:49466499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT034744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT034745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 93 // 82 // 26 // 28 // 0
NM_001106907 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta receptor associated protein 1 (Tgfbrap1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000037094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:49523134:49573517:-1 gene:ENSRNOG00000024562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000034328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49525563:49550737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT057779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_031677 // RefSeq // Rattus norvegicus four and a half LIM domains 2 (Fhl2), mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244848 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus four and a half LIM domains 2 (Fhl2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:49591627:49620648:-1 gene:ENSRNOG00000016866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AB008571 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DRAL, complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49591627:49633648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT057782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT057781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENSRNOT00000033216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:49746215:49748382:-1 gene:ENSRNOG00000003758 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 90 // 91 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49746154:49748382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0
NM_001106908 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 21C (Mettl21c), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 21C (Mettl21c), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 21C (Mettl21c), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50415610:50426721:-1 gene:ENSRNOG00000011591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ215023 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YB22 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50416882:50426212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT057787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006226811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548013 (LOC102548013), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006244871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548013 (LOC102548013), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050748 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:50480489:50487251:-1 gene:ENSRNOG00000023089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50481081:50500646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106909 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 30 (Tex30), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 30 (Tex30), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50525698:50535199:-1 gene:ENSRNOG00000011658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ230685 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YH06 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232543 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YF11 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50526626:50547119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001277228 // RefSeq // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 1 (Kdelc1), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:50539118:50551705:-1 gene:ENSRNOG00000011740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC085943 // GenBank // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7126740). // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC168987 // GenBank // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189327 IMAGE:9030170), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:50526626:50547119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT057796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT057797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT057799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_053488 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type V, alpha 2 (Col5a2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000005073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:51758657:51823228:-1 gene:ENSRNOG00000003736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// FQ222447 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YE08 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 49 // 51 // 0 /// GENSCAN00000046292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:51758916:51807909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT057804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 28 // 51 // 1
NM_133315 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 40 (iron-regulated transporter), member 1 (Slc40a1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_003750695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 40 member 1-like (LOC100911874), mRNA. // chr9 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// XM_006244891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 40 (iron-regulated transporter), member 1 (Slc40a1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:52560181:52578109:-1 gene:ENSRNOG00000003872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF394785 // GenBank // Rattus norvegicus ferroportin 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 97 // 27 // 30 // 0 /// U76714 // GenBank // Rattus norvegicus cell adhesion regulator (CAR1) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000073557 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:52486408:52496273:-1 gene:ENSRNOG00000049995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52486499:52526891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000038032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52561413:52615547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001024787 // RefSeq // Rattus norvegicus O-sialoglycoprotein endopeptidase-like 1 (Osgepl1), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus O-sialoglycoprotein endopeptidase-like 1 (Osgepl1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus O-sialoglycoprotein endopeptidase-like 1 (Osgepl1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:52711225:52762415:-1 gene:ENSRNOG00000004001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC078974 // GenBank // Rattus norvegicus O-sialoglycoprotein endopeptidase-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7111906), partial cds. // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC097950 // GenBank // Rattus norvegicus O-sialoglycoprotein endopeptidase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:116073 IMAGE:7389045), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52753350:52761293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT057811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NONRATT057811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT057812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1
NM_019151 // RefSeq // Rattus norvegicus myostatin (Mstn), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:52975922:52982322:-1 gene:ENSRNOG00000021294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF019624 // GenBank // Rattus norvegicus myostatin (MSTN) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224469 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA65YB06 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52977371:52982198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013112 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase (Hibch), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:53112588:53193104:-1 gene:ENSRNOG00000028557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:53112588:53193104:-1 gene:ENSRNOG00000028557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC083737 // GenBank // Rattus norvegicus 3-hydroxyisobutyryl-Coenzyme A hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:94647 IMAGE:7191666), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53114421:53155607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53157985:53220991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001134642 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 194B (Tmem194b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:53380915:53400175:-1 gene:ENSRNOG00000012924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53382848:53425745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT057822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000059129 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:53402377:53402738:-1 gene:ENSRNOG00000038723 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000003370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53932834:53937442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001034164 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 1 (Stat1), transcript variant beta, mRNA. // chr9 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NM_032612 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 1 (Stat1), transcript variant alpha, mRNA. // chr9 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:53998205:54038463:-1 gene:ENSRNOG00000014079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AF205604 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 1 (Stat1) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// BC062079 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 1, mRNA (cDNA clone MGC:72374 IMAGE:5599645), complete cds. // chr9 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:53999750:54043186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT057823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY325191 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-131 mRNA, complete cds. // chr9 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT057825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1
AY325191 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-131 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AY325191 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-131 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001012226 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 4 (Stat4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000020032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:54051157:54167491:-1 gene:ENSRNOG00000050942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC081938 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 4, mRNA (cDNA clone MGC:93993 IMAGE:7115387), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000003369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:54046860:54070036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 33 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT057828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000003373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:54076625:54126111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// AY325191 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-131 mRNA, complete cds. // chr9 // 42 // 42 // 20 // 48 // 1
NM_001007712 // RefSeq // Rattus norvegicus serum deprivation response (Sdpr), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:54940738:54952755:-1 gene:ENSRNOG00000025895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081956 // GenBank // Rattus norvegicus serum deprivation response, mRNA (cDNA clone MGC:94054 IMAGE:7123246), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:54941537:54952687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT057831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108795 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 2 (Tmeff2), mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006244907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 2 (Tmeff2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000066231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:55079810:55369414:-1 gene:ENSRNOG00000016623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:55347605:55369908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT057832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT057833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000016465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:59774372:60016299:-1 gene:ENSRNOG00000012223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 56 // 56 // 0 /// XM_006244944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein, axonemal, heavy chain 7 (Dnah7), mRNA. // chr9 // 14 // 14 // 10 // 69 // 1 /// GENSCAN00000023389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:59844250:60046801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000023390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:59779419:59841491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 17 // 12 // 12 // 0
NM_133392 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 17b (Stk17b), mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:60085947:60115674:-1 gene:ENSRNOG00000012502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB070349 // GenBank // Rattus norvegicus DRAK2 mRNA for death-associated protein kinase-related apoptosis inducing protein kinase, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000023394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60086823:60106525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT057852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001108218 // RefSeq // Rattus norvegicus HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (Hecw2), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244912 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (Hecw2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:60142808:60357086:-1 gene:ENSRNOG00000013257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60158933:60253579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NONRATT057853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000047517 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:60607386:60607763:-1 gene:ENSRNOG00000032947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60607386:60607763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001108239 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 3 (Gtf3c3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006244928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 3 (Gtf3c3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000002864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:60683825:60717610:-1 gene:ENSRNOG00000002091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000049605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60684619:60769224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT057858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_001066247 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC686030 (LOC686030), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC686030 (LOC686030), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60684619:60769224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_201990 // RefSeq // Rattus norvegicus post-GPI attachment to proteins 1 (Pgap1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:60749693:60818301:-1 gene:ENSRNOG00000013388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB116149 // GenBank // Rattus norvegicus PGAP1 mRNA for GPI deacylase, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT057864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60684619:60769224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001191807 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 44 (Ankrd44), mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:60910883:61210388:-1 gene:ENSRNOG00000021384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:60911679:61012853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61021526:61149901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT057866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_053426 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 3b, subunit 1 (Sf3b1), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61275836:61315726:-1 gene:ENSRNOG00000013516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// FQ234614 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YE13 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61276746:61308192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XM_343571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus raftlin family member 2 (Rftn2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020910 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:61439705:61493694:-1 gene:ENSRNOG00000015594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61470982:61493694:-1 gene:ENSRNOG00000015594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61439705:61486361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT057886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001113370 // RefSeq // Rattus norvegicus boule-like RNA-binding protein (Boll), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus boule-like RNA-binding protein (Boll), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// XM_006244943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein boule-like (LOC100911373), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// XR_357020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus boule-like RNA-binding protein (Boll), transcript variant X3, misc_RNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64317109:64377262:-1 gene:ENSRNOG00000015798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61656423:61765076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001012132 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock transcription factor, Y linked 2 (Hsfy2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:63097561:63098742:-1 gene:ENSRNOG00000038569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC083618 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock transcription factor, Y linked 2, mRNA (cDNA clone MGC:94387 IMAGE:7133881), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:63042514:63098721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109306 // RefSeq // Rattus norvegicus SATB homeobox 2 (Satb2), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SATB homeobox 2 (Satb2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:63264787:63441506:-1 gene:ENSRNOG00000010188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT057895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:63287295:63373688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000052922 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:9:63873567:63873677:-1 gene:ENSRNOG00000034799 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001170473 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA-yW synthesizing protein 5 (Tyw5), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NR_033170 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA-yW synthesizing protein 5 (Tyw5), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:63883692:63901784:-1 gene:ENSRNOG00000010100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:63883944:63890211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001106914 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 18 (Kctd18), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 18 (Kctd18), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:64649839:64714190:-1 gene:ENSRNOG00000027091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228496 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YL06 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:64650910:64662605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT057904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NONRATT057902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106913 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC-like kinase 1 (Clk1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000030934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65104058:65115299:-1 gene:ENSRNOG00000025768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC081942 // GenBank // Rattus norvegicus CDC-like kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7121242). // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000030315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65104258:65121546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT057907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT057908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT057909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT057912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT057913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_175707 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 3 (Ppil3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006244964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 3 (Ppil3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65122704:65136360:-1 gene:ENSRNOG00000013636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF315802 // GenBank // Rattus norvegicus CYP10L (Cyp10l) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC087645 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:105285 IMAGE:7311008), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ214147 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YJ08 mRNA sequence. // chr9 // 63 // 93 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65122927:65136411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT057914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT057915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001012003 // RefSeq // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 2 (Orc2), mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006244957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 2 (Orc2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000051843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65158929:65188753:-1 gene:ENSRNOG00000012558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AB164704 // GenBank // Rattus norvegicus Orc2 mRNA for origin recognition complex subunit 2, complete cds. // chr9 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC129076 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8363483. // chr9 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000030313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65158958:65194263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 93 // 93 // 37 // 40 // 1 /// NONRATT057916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT057918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1 /// NONRATT057920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
XM_006244979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 126, member B (Fam126b), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006244980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 126, member B (Fam126b), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006244986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 126, member B (Fam126b), transcript variant X9, mRNA. // chr9 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000037660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65213175:65249294:-1 gene:ENSRNOG00000025079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// BC097998 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 126, member B, mRNA (cDNA clone MGC:116143 IMAGE:7453086), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000030311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65202906:65249261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT057921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT057925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1 /// NONRATT057926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001014101 // RefSeq // Rattus norvegicus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) chromosome region, candidate 12 (Als2cr12), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65472508:65500565:-1 gene:ENSRNOG00000024917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC079241 // GenBank // Rattus norvegicus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) chromosome region, candidate 12 (human), mRNA (cDNA clone MGC:94323 IMAGE:7132659), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT057930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65488080:65577427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT057931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_133560 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein, kinesin binding 2 (Trak2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000014939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65505455:65570017:-1 gene:ENSRNOG00000010881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000015034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65505455:65570017:-1 gene:ENSRNOG00000010881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF474163 // GenBank // Rattus norvegicus O-GlcNAc transferase-interacting protein of 98 kDa mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 78 // 26 // 28 // 0 /// BC088393 // GenBank // Rattus norvegicus trafficking protein, kinesin binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:93214 IMAGE:7124967), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT057932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000034697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65488080:65577427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT057933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
XR_349098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552195 (LOC102552195), misc_RNA. // chr9 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65591236:65617650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001024363 // RefSeq // Rattus norvegicus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) chromosome region, candidate 11 (Als2cr11), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65640204:65686218:-1 gene:ENSRNOG00000012637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083917 // GenBank // Rattus norvegicus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) chromosome region, candidate 11 (human), mRNA (cDNA clone MGC:95303 IMAGE:7134752), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT057938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65633328:65737699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001108220 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 237 (Tmem237), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006244976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 237 (Tmem237), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006244977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 237 (Tmem237), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65691943:65724365:-1 gene:ENSRNOG00000024085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC166556 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7311912. // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65633328:65737699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT057940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT057941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_021265 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 4 (MAGUK p55 subfamily member 4) (Mpp4), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000038132 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:65750650:65764334:-1 gene:ENSRNOG00000010486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// AB030499 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DLG6 alpha, complete cds. // chr9 // 92 // 82 // 33 // 36 // 0 /// AB030500 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DLG6 beta, complete cds. // chr9 // 92 // 86 // 35 // 38 // 0 /// AB030501 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DLG6 gamma, complete cds. // chr9 // 91 // 77 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000014094 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:65725150:65764334:-1 gene:ENSRNOG00000010486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 86 // 38 // 44 // 1 /// NONRATT057942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT057943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 23 // 44 // 1 /// NONRATT057944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// GENSCAN00000034703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65741807:65756355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// GENSCAN00000034707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65633328:65737699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// GENSCAN00000019950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65757133:65833294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001013413 // RefSeq // Rattus norvegicus amyotrophic lateral sclerosis 2 (juvenile) (Als2), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000035209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:65769813:65823755:-1 gene:ENSRNOG00000023280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:65757133:65833294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT057947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT057946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001009672 // RefSeq // Rattus norvegicus small ubiquitin-like modifier 1 (Sumo1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000022047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:66258863:66288103:-1 gene:ENSRNOG00000016133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC088322 // GenBank // Rattus norvegicus SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109561 IMAGE:7325996), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ214389 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YP07 mRNA sequence. // chr9 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// NONRATT057953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XR_086340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pseudogene for diazepam binding inhibitor 1 (LOC301444), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AY321319 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1-130 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000025907 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:66515715:66515976:-1 gene:ENSRNOG00000019107 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0 /// GENSCAN00000047877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66494300:66515976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0
NM_199400 // RefSeq // Rattus norvegicus islet cell autoantigen 1-like (Ica1l), mRNA. // chr9 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000041546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:66602089:66639739:-1 gene:ENSRNOG00000017258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AY491990 // GenBank // Rattus norvegicus Ica69-related protein mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT057959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000047898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:66602089:66639739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// NONRATT057958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_199410 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 12 (Wdr12), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000023463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:66665604:66691636:-1 gene:ENSRNOG00000017340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC063180 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 12, mRNA (cDNA clone MGC:72960 IMAGE:6920424), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT057962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001108798 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1 (Raph1), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:67107597:67184496:-1 gene:ENSRNOG00000014722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:67107597:67233277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT057969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0
ENSRNOT00000029821 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:68093733:68095322:-1 gene:ENSRNOG00000024469 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_001191809 // RefSeq // Rattus norvegicus INO80 complex subunit D (Ino80d), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus INO80 complex subunit D (Ino80d), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:69639480:69677228:-1 gene:ENSRNOG00000024272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:69639490:69734734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001005550 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 1 (Ndufs1), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000015852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:69728736:69762079:-1 gene:ENSRNOG00000011849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC081892 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93795 IMAGE:7109875), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000048745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:69741920:69757457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT057980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT057981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_012961 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 1 (Gpr1), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:69767922:69768983:-1 gene:ENSRNOG00000045532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:69767922:69768983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000075066 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:69942496:69942879:-1 gene:ENSRNOG00000047597 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:70009806:70024932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:69942614:69945297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001108221 // RefSeq // Rattus norvegicus malate dehydrogenase 1B, NAD (soluble) (Mdh1b), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus malate dehydrogenase 1B, NAD (soluble) (Mdh1b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus malate dehydrogenase 1B, NAD (soluble) (Mdh1b), transcript variant X9, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus malate dehydrogenase 1B, NAD (soluble) (Mdh1b), transcript variant X10, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:72123074:72169151:1 gene:ENSRNOG00000012891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:72124972:72206660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT056699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000052899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:72124972:72206660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 85 // 68 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT056699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001108800 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 7 (ubiquitous) (Klf7), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000017901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:71787156:71787933:1 gene:ENSRNOG00000012961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000052897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:71786595:71787824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT056698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
XM_006226852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein N-lysine methyltransferase METTL21A-like (LOC102553119), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein N-lysine methyltransferase METTL21A-like (LOC102553119), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein N-lysine methyltransferase METTL21A-like (LOC102553119), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein N-lysine methyltransferase METTL21A-like (LOC102553119), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019670 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:71262621:71271320:1 gene:ENSRNOG00000014212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:71255932:71271320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ230736 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YE02 mRNA sequence. // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_173838 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled class receptor 5 (Fzd5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:71120245:71122004:1 gene:ENSRNOG00000014678 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB052909 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Frizzled 5, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:71113974:71123575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT056693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family M, member 3 (Plekhm3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family M, member 3 (Plekhm3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032782 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:70935176:71068434:1 gene:ENSRNOG00000023760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058075 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:70949652:71005923:1 gene:ENSRNOG00000023760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:70935176:70986450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT056690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_173289 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma E (Cryge), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// J00716 // GenBank // Rat gamma-E-crystallin (gamma 3-1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT056689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_033095 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma D (Crygd), mRNA. // chr9 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000050886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:70790369:70792124:1 gene:ENSRNOG00000032219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT056689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_001081660 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma C (Crygc), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NM_033483 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma C (Crygc), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000020078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:70780411:70782444:1 gene:ENSRNOG00000014950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// J00717 // GenBank // Rat lens gamma-C-crystallin (gamma 2-1) mRNA, complete cds. // chr9 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000044508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:70771527:70887974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT056684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT056685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT056686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_001109875 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma B (Crygb), mRNA. // chr9 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000043766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:70771494:70773555:1 gene:ENSRNOG00000032926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT056683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_031510 // RefSeq // Rattus norvegicus isocitrate dehydrogenase 1 (NADP+), soluble (Idh1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006245049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isocitrate dehydrogenase 1 (NADP+), soluble (Idh1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:70668272:70689957:1 gene:ENSRNOG00000015020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ214242 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YP14 mRNA sequence. // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// L35317 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic NADP-dependent isocitrate dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:70672046:70689151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT056681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000010488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:74241830:74242630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0
XM_006226870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 1-like (Kansl1l), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 1-like (Kansl1l), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006245111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 1-like (Kansl1l), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017257 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:73506962:73593827:1 gene:ENSRNOG00000028149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067589 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:73506962:73593827:1 gene:ENSRNOG00000028149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73506962:73593827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT056711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_012819 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA dehydrogenase, long chain (Acadl), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:73434321:73472895:1 gene:ENSRNOG00000012966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC062006 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, long-chain, mRNA (cDNA clone MGC:72554 IMAGE:5599828), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// J05029 // GenBank // Rat long chain acyl-CoA dehydrogenase (LCAD) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// L11276 // GenBank // Rattus norvegicus long chain acyl-CoA dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ215575 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YK22 mRNA sequence. // chr9 // 70 // 100 // 23 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73434377:73491289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT056708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_053723 // RefSeq // Rattus norvegicus LanC lantibiotic synthetase component C-like 1 (bacterial) (Lancl1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LanC lantibiotic synthetase component C-like 1 (bacterial) (Lancl1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:73260452:73290356:1 gene:ENSRNOG00000013557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ295233 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for lanthionine synthetase C-like protein 1 (Lancl1 gene). // chr9 // 83 // 44 // 10 // 12 // 0 /// BC085811 // GenBank // Rattus norvegicus LanC lantibiotic synthetase component C-like 1 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:93999 IMAGE:7115423), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:73256698:73292295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT056700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_021687 // RefSeq // Rattus norvegicus v-erb-b2 avian erythroblastic leukemia viral oncogene 4 (Erbb4), mRNA. // chr9 // 87 // 97 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:74804387:75550060:-1 gene:ENSRNOG00000014248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:74804387:75550060:-1 gene:ENSRNOG00000014248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF041838 // GenBank // Rattus norvegicus receptor tyrosine kinase (ERBB4) mRNA, complete cds. // chr9 // 87 // 97 // 26 // 30 // 0 /// AY375306 // GenBank // Rattus norvegicus receptor tyrosine kinase isoform JMa cyt1 (Erbb4) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr9 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AY375307 // GenBank // Rattus norvegicus receptor tyrosine kinase isoform JMa cyt2 (Erbb4) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr9 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:74781939:74843285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000044194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:74919416:75081991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001106916 // RefSeq // Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 2 (Ikzf2), mRNA. // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// XM_006245116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 2 (Ikzf2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 2 (Ikzf2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 2 (Ikzf2), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 2 (Ikzf2), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:76401302:76548695:-1 gene:ENSRNOG00000027430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000056852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:76412383:76453680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT058040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT058045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022622 // RefSeq // Rattus norvegicus BRCA1 associated RING domain 1 (Bard1), mRNA. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:78074908:78145962:-1 gene:ENSRNOG00000014960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF182946 // GenBank // Rattus norvegicus BRCA1-associated RING domain protein 1 (bard1) mRNA, complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AY583210 // GenBank // Rattus norvegicus BRCA1-associated RING domain protein 1 beta isoform (Bard1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr9 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:78075056:78145962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT058047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000038272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:78270468:78464362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
XM_001054709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 12 (Abca12), mRNA. // chr9 // 98 // 95 // 56 // 57 // 0 /// XM_237242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 12 (Abca12), mRNA. // chr9 // 98 // 95 // 56 // 57 // 0 /// ENSRNOT00000036359 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:78359875:78466160:-1 gene:ENSRNOG00000015248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 28 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000057672 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:78296839:78381138:-1 gene:ENSRNOG00000015248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 83 // 49 // 50 // 0 /// GENSCAN00000038272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:78270468:78464362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 87 // 51 // 52 // 0
NM_019143 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin 1 (Fn1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000019772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:78674439:78743407:-1 gene:ENSRNOG00000014288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000038280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:78668083:78707804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 49 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:78708524:78743198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 45 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT058050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000057585 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:78674439:78743407:-1 gene:ENSRNOG00000014288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 98 // 48 // 49 // 1 /// NONRATT058051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 51 // 51 // 25 // 49 // 1 /// NONRATT058052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1
NM_001192002 // RefSeq // Rattus norvegicus melanoregulin (Mreg), mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus melanoregulin (Mreg), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:79264980:79318250:-1 gene:ENSRNOG00000015774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79264980:79325617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_133299 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase (Pecr), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:79375180:79403569:-1 gene:ENSRNOG00000015809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF021854 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal 2,4-dienoyl CoA reductase px-2,4-DCR#1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF099742 // GenBank // Rattus norvegicus putative short-chain dehydrogenase/reductase mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC060546 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, mRNA (cDNA clone MGC:72708 IMAGE:6889831), complete cds. // chr9 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// FQ209657 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YE02 mRNA sequence. // chr9 // 80 // 50 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000001647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79393898:79403474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT058061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT058064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_001055311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 4, E3 ubiquitin protein ligase (March4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_001074008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 4, E3 ubiquitin protein ligase (March4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022076 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:79555877:79670952:-1 gene:ENSRNOG00000016472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79555877:79594068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000001646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79608870:79670946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_012817 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 5 (Igfbp5), mRNA. // chr9 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:79920613:79937408:-1 gene:ENSRNOG00000017206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC087030 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7110383). // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// M62781 // GenBank // Rat insulin-like growth factor binding protein 5 (IGFBP-5) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79924885:79936657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT058069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0
NM_017056 // RefSeq // Rattus norvegicus transition protein 1 (Tnp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:80066302:80066908:-1 gene:ENSRNOG00000017611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078850 // GenBank // Rattus norvegicus transition protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93498 IMAGE:7131725), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M17096 // GenBank // Rat transition protein 1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:79940799:80120654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000021350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:80136507:80191531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000046844 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:80823081:80823711:-1 gene:ENSRNOG00000030650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 70 // 8 // 16 // 0
NM_001191810 // RefSeq // Rattus norvegicus tensin 1 (Tns1), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:80960143:81166699:-1 gene:ENSRNOG00000014182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:80958508:81055813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_019310 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) receptor 1 (Cxcr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81232127:81233176:-1 gene:ENSRNOG00000048239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81232127:81233176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106920 // RefSeq // Rattus norvegicus angio-associated, migratory cell protein (Aamp), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angio-associated, migratory cell protein (Aamp), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81327383:81333189:-1 gene:ENSRNOG00000014399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81327781:81332180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT058079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT058080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT058081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001007713 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane BAX inhibitor motif containing 1 (Tmbim1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81335843:81353016:-1 gene:ENSRNOG00000014797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC079087 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94053 IMAGE:7123233), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000044989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81336918:81344438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT058084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT058083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
XM_006226880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 37 (Usp37), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006226881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 37 (Usp37), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006226882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 37 (Usp37), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006245292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 37 (Usp37), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006245293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 37 (Usp37), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006245294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 37 (Usp37), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000032706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81486028:81537301:-1 gene:ENSRNOG00000022720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000032719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81486028:81537301:-1 gene:ENSRNOG00000022720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000044988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81484300:81537301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT058090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001108225 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 142 (Zfp142), mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 142 (Zfp142), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81608286:81630468:-1 gene:ENSRNOG00000022414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC100153 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7457453. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81609427:81624952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT058094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT058095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001012004 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 25 (Rnf25), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// XM_006245173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 25 (Rnf25), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// ENSRNOT00000022677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81635676:81642487:-1 gene:ENSRNOG00000016886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000044991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81635751:81640423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT058096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// NONRATT058097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 75 // 75 // 46 // 61 // 1 /// NONRATT058098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 67 // 67 // 41 // 61 // 1 /// NONRATT058099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 61 // 61 // 37 // 61 // 1 /// NONRATT058100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 32 // 61 // 1 /// NONRATT058101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 15 // 15 // 9 // 61 // 1
NM_001106921 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 3 non-catalytic subunit (Prkag3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81761758:81771204:-1 gene:ENSRNOG00000017248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81763418:81779833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT058102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_144753 // RefSeq // Rattus norvegicus FEV (ETS oncogene family) (Fev), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81911561:81915454:-1 gene:ENSRNOG00000017856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81912149:81915252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT058104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U91679 // GenBank // Rattus norvegicus ETS domain transcription factor Pet-1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_173140 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, beta A2 (Cryba2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81919637:81922846:-1 gene:ENSRNOG00000017996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY158891 // GenBank // Rattus norvegicus betaA2-crystallin (Cryba2) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81919691:81971894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT058105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NR_032271 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 375 (Mir375), microRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053578 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:9:81930296:81930370:-1 gene:ENSRNOG00000035455 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81919691:81971894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// rno-mir-375 // miRBase Micro RNA Database // MI0006140 Rattus norvegicus miR-375 stem-loop // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 108-like (LOC301521), mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 108-like (LOC301521), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000036987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81931773:81964983:-1 gene:ENSRNOG00000028656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81919691:81971894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_053384 // RefSeq // Rattus norvegicus Indian hedgehog (Ihh), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81977484:81983701:-1 gene:ENSRNOG00000018059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:81978290:81983471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001014217 // RefSeq // Rattus norvegicus nonhomologous end-joining factor 1 (Nhej1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nonhomologous end-joining factor 1 (Nhej1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nonhomologous end-joining factor 1 (Nhej1), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:81999493:82096795:-1 gene:ENSRNOG00000018162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079033 // GenBank // Rattus norvegicus nonhomologous end-joining factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:93961 IMAGE:7114269), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82060123:82113699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001109006 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 23, member 3 (Slc23a3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006245260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 23, member 3 (Slc23a3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82097449:82106015:-1 gene:ENSRNOG00000018266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT058118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82060123:82113699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// NONRATT058117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NM_199112 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin Pas1/PHO80 domain containing 1 (Cnppd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82108127:82114523:-1 gene:ENSRNOG00000018325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT058119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT058120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82060123:82113699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// NONRATT058121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// NONRATT058122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NM_080582 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 6 (Abcb6), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000025627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82143209:82151515:-1 gene:ENSRNOG00000018697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AF106563 // GenBank // Rattus norvegicus P-glycoprotein-like ATP-binding cassette transporter mRNA, complete cds. // chr9 // 84 // 58 // 21 // 25 // 0 /// BC085712 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:93242 IMAGE:7190755), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000027556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82143389:82163233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT058123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT058124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 65 // 65 // 28 // 43 // 1
NM_001014218 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 9A (Atg9a), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82152061:82162643:-1 gene:ENSRNOG00000018975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC089204 // GenBank // Rattus norvegicus ATG9 autophagy related 9 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105908 IMAGE:7190326), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT058125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82143389:82163233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT058129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT058130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001127529 // RefSeq // Rattus norvegicus galactosidase, beta 1-like (Glb1l), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82169830:82180165:-1 gene:ENSRNOG00000019243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC161869 // GenBank // Rattus norvegicus galactosidase, beta 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:187425 IMAGE:7109779), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82169906:82178841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT058131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001007004 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, alpha 4A (Tuba4a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin, alpha 4A (Tuba4a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000004797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82184866:82188549:-1 gene:ENSRNOG00000003597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC083726 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, alpha 4A, mRNA (cDNA clone MGC:94628 IMAGE:7191229), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ212913 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YL06 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// FQ225180 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YN20 mRNA sequence. // chr9 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// FQ214970 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YF02 mRNA sequence. // chr9 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0 /// FQ224845 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YN22 mRNA sequence. // chr9 // 58 // 100 // 14 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82184933:82189086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT058132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT058133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_053881 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, N (Ptprn), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000026654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82215893:82231061:-1 gene:ENSRNOG00000019587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// D45414 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for brain-enriched membrane-associated protein tyrosine phosphatase (BEM)-3, complete cds. // chr9 // 97 // 67 // 31 // 32 // 0 /// FQ211652 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YI06 mRNA sequence. // chr9 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000016230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82216394:82231002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT058136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT058137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 73 // 73 // 35 // 48 // 1 /// NONRATT058138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// NONRATT058139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_019278 // RefSeq // Rattus norvegicus regulated endocrine-specific protein 18 (Resp18), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82240055:82246397:-1 gene:ENSRNOG00000019704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC058147 // GenBank // Rattus norvegicus regulated endocrine-specific protein 18, mRNA (cDNA clone MGC:72855 IMAGE:6922403), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// L25633 // GenBank // Rattus norvegicus neuroendocrine-specific protein (RESP18) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006245272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulated endocrine-specific protein 18 (Resp18), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT058141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82240159:82285925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT058142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// NONRATT058143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_001024879 // RefSeq // Rattus norvegicus aspartyl aminopeptidase (Dnpep), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartyl aminopeptidase (Dnpep), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82274791:82283660:-1 gene:ENSRNOG00000019772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081986 // GenBank // Rattus norvegicus aspartyl aminopeptidase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7128977). // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC097388 // GenBank // Rattus norvegicus aspartyl aminopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:114431 IMAGE:7453069), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ234491 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YM09 mRNA sequence. // chr9 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// FQ230742 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YD19 mRNA sequence. // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82240159:82285925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT058145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT058146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT058147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT058148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001005906 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin polymerizing factor (Chpf), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroitin polymerizing factor (Chpf), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000027165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82438465:82443159:-1 gene:ENSRNOG00000020038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083617 // GenBank // Rattus norvegicus chondroitin polymerizing factor, mRNA (cDNA clone MGC:94386 IMAGE:7133858), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82438863:82442953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT058152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001062053 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus obscurin-like 1 (Obsl1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_343599 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus obscurin-like 1 (Obsl1), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020673 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:82450335:82468812:-1 gene:ENSRNOG00000015346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82449645:82468812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT058159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001162411 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor A4 (Epha4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000041689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:82880599:83022444:-1 gene:ENSRNOG00000013213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000002158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:82868307:82949239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT058167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1
NM_053710 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 3 (Pax3), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box 3 (Pax3), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:83766337:83861379:-1 gene:ENSRNOG00000013670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:83824298:83860995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:83785271:83813078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT058174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001004252 // RefSeq // Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit (Farsb), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245189 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit (Farsb), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:84083346:84142523:-1 gene:ENSRNOG00000014119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC079364 // GenBank // Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:94847 IMAGE:7109296), complete cds. // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000043129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:84083723:84152219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_022669 // RefSeq // Rattus norvegicus secretogranin II (Scg2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:84991744:84997049:-1 gene:ENSRNOG00000015055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061549 // GenBank // Rattus norvegicus secretogranin II (chromogranin C), mRNA (cDNA clone MGC:72816 IMAGE:6919444), complete cds. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// M93669 // GenBank // Rat secretogranin II mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:84992145:84994004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT058180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001172150 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, sigma 3 subunit (Ap1s3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, sigma 3 subunit (Ap1s3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, sigma 3 subunit (Ap1s3), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245264 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, sigma 3 subunit (Ap1s3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:85139124:85197998:-1 gene:ENSRNOG00000049873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:85130061:85180919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001008331 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat and FYVE domain containing 1 (Wdfy1), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat and FYVE domain containing 1 (Wdfy1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000063834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:85231523:85280641:-1 gene:ENSRNOG00000015080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC085807 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat and FYVE domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:93914 IMAGE:7112886), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT058187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:85238384:85261524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT058188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT058185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT058186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT058189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_019197 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade E (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 2 (Serpine2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade E (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 2 (Serpine2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade E (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 2 (Serpine2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:85312143:85375551:-1 gene:ENSRNOG00000015461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:85317258:85349946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_001076121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 124B (Fam124b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002727248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 124B (Fam124b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003750712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 124B (Fam124b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072054 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:90528465:90546375:-1 gene:ENSRNOG00000050739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073128 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:85718087:85735859:-1 gene:ENSRNOG00000047099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:90544032:90551252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:85733577:85740736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001106923 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin 3 (Cul3), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:85794367:85853449:-1 gene:ENSRNOG00000015633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC168969 // GenBank // Rattus norvegicus cullin 3, mRNA (cDNA clone MGC:189292 IMAGE:9026830), complete cds. // chr9 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:85796391:85853443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT058194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT058195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT058197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1
NM_001012468 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB18, member RAS oncogene family (Rab18), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:61632853:61664236:1 gene:ENSRNOG00000018972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC089957 // GenBank // Rattus norvegicus RAB18, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:109292 IMAGE:7312864), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000038372 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:86003603:86004235:-1 gene:ENSRNOG00000027719 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:86003549:86004229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:61632897:61663161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT024377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT024378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT058201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000048758 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:86456153:86457746:-1 gene:ENSRNOG00000037633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 76 // 88 // 16 // 21 // 0
NM_001271224 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 11-like 1 (Rnf11l1), mRNA. // chr9 // 82 // 59 // 14 // 17 // 0 /// XM_006225456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 11 (Rnf11), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// XM_006245310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 11-like 2 (Rnf11l2), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:133132389:133132853:-1 gene:ENSRNOG00000042667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000071608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:86400189:86400653:-1 gene:ENSRNOG00000048819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// XM_006225457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 11 (Rnf11), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000003629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:86400189:86400653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000010179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:133132389:133132853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT045211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT058214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132931783:133001079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_012969 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin receptor substrate 1 (Irs1), mRNA. // chr9 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:87782499:87835248:-1 gene:ENSRNOG00000014597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:87830961:87837831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_001008332 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type IV, alpha 4 (Col4a4), mRNA. // chr9 // 100 // 44 // 31 // 31 // 0 /// XM_006226910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen alpha-4(IV) chain-like (LOC102557498), mRNA. // chr9 // 100 // 54 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000041176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:88062427:88104120:-1 gene:ENSRNOG00000014851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 31 // 31 // 0 /// BC086403 // GenBank // Rattus norvegicus procollagen, type IV, alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:105542 IMAGE:7304199), complete cds. // chr9 // 100 // 44 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:87994631:88083683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 37 // 71 // 1 /// NONRATT058224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 31 // 71 // 1
NM_001109618 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 4 L six family member 20 (Tm4sf20), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:88268849:88282366:-1 gene:ENSRNOG00000015460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:88269659:88283192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:90651959:90654609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT058225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108228 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 3 (Slc19a3), mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000021373 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:88510653:88561257:-1 gene:ENSRNOG00000015958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT058226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001127492 // RefSeq // Rattus norvegicus SPHK1 interactor, AKAP domain containing (Sphkap), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006245232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPHK1 interactor, AKAP domain containing (Sphkap), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:88793220:88894918:-1 gene:ENSRNOG00000016388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:88770398:88853622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT058228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT058231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001110493 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphotyrosine interaction domain containing 1 (Pid1), mRNA. // chr9 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000041550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:91403610:91419329:-1 gene:ENSRNOG00000029735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:91403610:91418940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT058233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
XM_001064351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus delta/notch-like EGF repeat containing (Dner), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_001077059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus delta/notch-like EGF repeat containing (Dner), mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:91700913:91800040:-1 gene:ENSRNOG00000016640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC086329 // GenBank // Rattus norvegicus delta/notch-like EGF repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:105904 IMAGE:7135168), complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT058237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:91705160:91948002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT058238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001031659 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 12 (Trip12), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000022822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92039803:92167938:-1 gene:ENSRNOG00000016963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC088304 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:7323776), partial cds. // chr9 // 100 // 25 // 11 // 11 // 0 /// BC100624 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 12, mRNA (cDNA clone MGC:124674 IMAGE:7930421), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC105889 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:7308486), complete cds. // chr9 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000019027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92061490:92138005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92040958:92060993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT058240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// NONRATT058241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT058242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001108229 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 14 (Slc16a14), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006245390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 14 (Slc16a14), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92237485:92261950:-1 gene:ENSRNOG00000017072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92238051:92255743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT058249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001034137 // RefSeq // Rattus norvegicus SP110 nuclear body protein (Sp110), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92324922:92346959:-1 gene:ENSRNOG00000033747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC105751 // GenBank // Rattus norvegicus SP110 nuclear body protein, mRNA (cDNA clone MGC:124651 IMAGE:5599224), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ226776 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YH08 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000014152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92305277:92345038:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT058253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
XR_349184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Nuclear autoantigen Sp-100 (Speckled 100 kDa) (RGD1563917), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_357175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Nuclear autoantigen Sp-100 (Speckled 100 kDa) (RGD1563917), misc_RNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92484254:92496292:-1 gene:ENSRNOG00000017273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088179 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7364885. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000014154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92494021:92523727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENSRNOT00000023217 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:92523328:92523798:-1 gene:ENSRNOG00000017287 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 67 // 90 // 12 // 18 // 0
NM_017250 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B, G protein-coupled (Htr2b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:92842597:92854806:-1 gene:ENSRNOG00000017625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2B, G protein-coupled (Htr2b), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT058257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:92842904:92854580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_012749 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolin (Ncl), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000024712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93097881:93106405:-1 gene:ENSRNOG00000018273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC085751 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolin, mRNA (cDNA clone MGC:93572 IMAGE:7109097), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FJ817497 // GenBank // Rattus norvegicus strain W nucleolin-like protein mRNA, complete cds. // chr9 // 91 // 83 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8232279:8234013:1 gene:ENSRNOG00000008664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 83 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000073823 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:8232345:8234013:1 gene:ENSRNOG00000008664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 78 // 27 // 31 // 0 /// GENSCAN00000053223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93098005:93106279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT020062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 89 // 90 // 32 // 36 // 0 /// NONRATT058261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000042806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8232279:8337504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// NONRATT058262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// NONRATT058264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// AF151373 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolin-related protein NRP (NRP) mRNA, complete cds. // chr9 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NONRATT058262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT058261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT058261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023100 // RefSeq // Rattus norvegicus neuromedin U receptor 1 (Nmur1), mRNA. // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93131274:93134679:-1 gene:ENSRNOG00000018521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB038649 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for G protein-coupled receptor FM-3, complete cds. // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// AF242873 // GenBank // Rattus norvegicus neuromedin U receptor 1 (NMU1R) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC081796 // GenBank // Rattus norvegicus neuromedin U receptor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7125834). // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93111347:93135372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT058266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001108806 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 6D, cGMP-specific, rod, delta (Pde6d), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93290037:93334964:-1 gene:ENSRNOG00000018610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ216262 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YM06 mRNA sequence. // chr9 // 77 // 52 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000007967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93290529:93297443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT058270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053750 // RefSeq // Rattus norvegicus natriuretic peptide C (Nppc), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93458753:93462953:-1 gene:ENSRNOG00000018854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D90219 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for C-type natriuretic peptide, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93462065:93462837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT058272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002727239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alkaline phosphatase, placental (Alpp), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_002730058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alkaline phosphatase, placental (Alpp), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025978 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:93915268:93918014:-1 gene:ENSRNOG00000033672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93915268:93918020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT058273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_022665 // RefSeq // Rattus norvegicus alkaline phosphatase, intestinal (Alpi), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93922819:93926285:-1 gene:ENSRNOG00000030020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT058273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT058274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93923377:93938361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1
NM_021776 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelin converting enzyme-like 1 (Ecel1), mRNA. // chr9 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000026387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93966150:93975953:-1 gene:ENSRNOG00000019447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AB023896 // GenBank // Rattus norvegicus DINE mRNA for metallopeptidase, complete cds. // chr9 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// AB026293 // GenBank // Rattus norvegicus DINE mRNA for metallopeptidase, complete cds. // chr9 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000055438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93969118:93975851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT058273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT058275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT058276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 75 // 75 // 30 // 40 // 1
NM_053608 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 13 (Kcnj13), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 13 (Kcnj13), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 13 (Kcnj13), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 13 (Kcnj13), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94208941:94217050:-1 gene:ENSRNOG00000016057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94208998:94212159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AB013890 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for inward rectifier potassium channel Kir7.1, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001136241 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal guanine nucleotide exchange factor (Ngef), mRNA. // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94290729:94323295:-1 gene:ENSRNOG00000016653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC078722 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal guanine nucleotide exchange factor, mRNA (cDNA clone IMAGE:7129889), partial cds. // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000052876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94336290:94359658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000052881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94291458:94323200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT058279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001134885 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 40 (Usp40), mRNA. // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_003750726 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40-like (LOC100911860), mRNA. // chr9 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94791220:94862200:-1 gene:ENSRNOG00000018395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AY387057 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00071 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000064642 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:90808445:90836261:-1 gene:ENSRNOG00000049962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000031053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:90799549:90836261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94792644:94864386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT058286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT058289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001109396 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 3 (Dnajb3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:94977349:94978074:-1 gene:ENSRNOG00000023172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:94977349:94978074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191813 // RefSeq // Rattus norvegicus Holliday junction recognition protein (Hjurp), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:95036301:95049229:-1 gene:ENSRNOG00000022911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:95037141:95049229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
XM_003754546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 4C (Arl4c), transcript variant 1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT016191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 83 // 67 // 5 // 6 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 83 // 67 // 5 // 6 // 0 /// NONRATT055400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 83 // 67 // 5 // 6 // 0
NM_053708 // RefSeq // Rattus norvegicus gastrulation brain homeobox 2 (Gbx2), mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:96754122:96756543:-1 gene:ENSRNOG00000019495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:96754454:96778178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT058302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_001108231 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 18 (Asb18), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:96775960:96842558:-1 gene:ENSRNOG00000019557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:96793077:96821144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000045253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:96754454:96778178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_001066515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing with AAA domain 1 (Iqca1), mRNA. // chrU // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006245510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing with AAA domain 1 (Iqca1), mRNA. // chrU // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:96873940:96982269:-1 gene:ENSRNOG00000019592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000056724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:96873940:96982269:-1 gene:ENSRNOG00000019592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:96965149:96982269:-1 gene:ENSRNOG00000019592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 90 // 28 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000045261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:96849935:97002889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT058304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT058305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSRNOT00000054650 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:9:97075668:97075773:-1 gene:ENSRNOG00000036543 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006226938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 3 (Col6a3), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000026707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97620136:97670009:-1 gene:ENSRNOG00000019648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97620136:97670009:-1 gene:ENSRNOG00000019648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000002948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97639091:97670009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000041643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97597149:97637633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 52 // 52 // 23 // 44 // 1
NM_001109363 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB17, member RAS oncogene family (Rab17), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:97800065:97807307:-1 gene:ENSRNOG00000019887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC167022 // GenBank // Rattus norvegicus RAB17, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:189241 IMAGE:7126868), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:97800794:97807274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_022606 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase (Ilkap), mRNA. // chr9 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98190648:98212635:-1 gene:ENSRNOG00000020115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AF095927 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2C mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// BC062010 // GenBank // Rattus norvegicus integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C, mRNA (cDNA clone MGC:72440 IMAGE:5621497), complete cds. // chr9 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98190762:98273734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT058317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT058322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// NONRATT058324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1 /// NONRATT058325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1 /// NONRATT058321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// NONRATT058323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT058326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// NONRATT058327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT058316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_001013179 // RefSeq // Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 6 (Hes6), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98225753:98227458:-1 gene:ENSRNOG00000020194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087597 // GenBank // Rattus norvegicus hairy and enhancer of split 6 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:105712 IMAGE:7311379), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT058329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT058332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT058333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98190762:98273734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_031678 // RefSeq // Rattus norvegicus period circadian clock 2 (Per2), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000027506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98231204:98273371:-1 gene:ENSRNOG00000020254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// AB016532 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for rPER2, complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT058334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000014651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98190762:98273734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 81 // 38 // 47 // 1 /// NONRATT058335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1
ENSRNOT00000029099 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:98277204:98277581:-1 gene:ENSRNOG00000021435 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr9 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98277204:98277581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
NM_053449 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 4 (Hdac4), mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:98731874:98973785:-1 gene:ENSRNOG00000020372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:98754638:98880837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT058341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
XM_001067793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36-like (RGD1564730), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_237400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36-like (RGD1564730), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047012 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:99038998:99039306:-1 gene:ENSRNOG00000030045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99038998:99039306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001088 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1343 (Olr1343), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000051686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99323601:99324539:-1 gene:ENSRNOG00000047906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99323601:99332803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT058346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000483 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1344 (Olr1344), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99331868:99332803:-1 gene:ENSRNOG00000033704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99323601:99332803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT058347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000753 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1345 (Olr1345), mRNA. // chr9 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000049347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99345155:99346093:-1 gene:ENSRNOG00000047633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99345155:99346093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT058348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001109044 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloma overexpressed 2 (Myeov2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99478497:99483427:-1 gene:ENSRNOG00000037402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC169124 // GenBank // Rattus norvegicus myeloma overexpressed 2, mRNA (cDNA clone MGC:189568 IMAGE:6890894), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99478794:99481202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT058349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT058350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_139188 // RefSeq // Rattus norvegicus otospiralin (Otos), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus otospiralin (Otos), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus otospiralin (Otos), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99485601:99487119:-1 gene:ENSRNOG00000016567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY062254 // GenBank // Rattus norvegicus otospiralin mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99485717:99486803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT058351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XM_006226955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 1A (Kif1a), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// XM_006245561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 1A (Kif1a), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000036061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99830371:99893950:-1 gene:ENSRNOG00000023993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000050557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99830371:99893950:-1 gene:ENSRNOG00000023993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 96 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000052345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99830371:99893950:-1 gene:ENSRNOG00000023993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000075007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99830371:99893950:-1 gene:ENSRNOG00000023993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000005853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99830371:99936890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT058354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 20 // 45 // 1 /// NONRATT058357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1
NM_001109311 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ22671 (RGD1563692), mRNA. // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000038563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99955427:99964934:-1 gene:ENSRNOG00000023557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:99952009:99974685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT058358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001037209 // RefSeq // Rattus norvegicus MTERF domain containing 2 (Mterfd2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100096825:100101536:-1 gene:ENSRNOG00000037376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098676 // GenBank // Rattus norvegicus MTERF domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:112635 IMAGE:7372734), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212705 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YN04 mRNA sequence. // chr9 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// FQ218478 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YN09 mRNA sequence. // chr9 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100097095:100100483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT058359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009362 // RefSeq // Rattus norvegicus PAS domain containing serine/threonine kinase (Pask), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100106951:100194898:-1 gene:ENSRNOG00000016888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// BC087047 // GenBank // Rattus norvegicus PAS domain containing serine/threonine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:93882 IMAGE:7112450), complete cds. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100107207:100128763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT058360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_172039 // RefSeq // Rattus norvegicus high density lipoprotein binding protein (Hdlbp), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100209420:100277671:-1 gene:ENSRNOG00000031479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC063147 // GenBank // Rattus norvegicus high density lipoprotein binding protein (vigilin), mRNA (cDNA clone IMAGE:6888152), complete cds. // chr9 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// BC105748 // GenBank // Rattus norvegicus high density lipoprotein binding protein (vigilin), mRNA (cDNA clone MGC:124559 IMAGE:5598374), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// U90725 // GenBank // Rattus norvegicus lipoprotein-binding protein mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100209823:100281293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT058367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT058368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001177817 // RefSeq // Rattus norvegicus Ac2-143-like (LOC100362040), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000042161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100310273:100352189:-1 gene:ENSRNOG00000030738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_184049 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 25 (Stk25), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000024487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100420926:100433656:-1 gene:ENSRNOG00000018181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY346152 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 25 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC087092 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 25 (STE20 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:94619 IMAGE:7190997), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100422304:100433333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT058371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT058372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// NONRATT058370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT058373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001005564 // RefSeq // Rattus norvegicus THAP domain containing 4 (Thap4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100501662:100541256:-1 gene:ENSRNOG00000018351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC081882 // GenBank // Rattus norvegicus THAP domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:93755 IMAGE:7108379), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100501841:100541217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT058376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT058378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT058379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001106925 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxythymidylate kinase (thymidylate kinase) (Dtymk), mRNA. // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XR_357227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxythymidylate kinase (thymidylate kinase) (Dtymk), transcript variant X2, misc_RNA. // chr9 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000025644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100574720:100583554:-1 gene:ENSRNOG00000018904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC159428 // GenBank // Rattus norvegicus deoxythymidylate kinase (thymidylate kinase), mRNA (cDNA clone MGC:188749 IMAGE:9088913), complete cds. // chr9 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100575090:100585620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT058381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT058383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT058384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT058385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001106927 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 1 (Pdcd1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100677679:100690991:-1 gene:ENSRNOG00000019043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074915 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:100938103:100950184:-1 gene:ENSRNOG00000049797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100660846:100681375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100936280:100940800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000071424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100759267:100759929:-1 gene:ENSRNOG00000045550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000071817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:101018496:101019158:-1 gene:ENSRNOG00000047203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NM_001015019 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2 (Chchd2), mRNA. // chr9 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// BC091550 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:112750 IMAGE:7388574), complete cds. // chr9 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// FQ221054 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YD09 mRNA sequence. // chr9 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:101018666:101019130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000036777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100759437:100759901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
NM_053914 // RefSeq // Rattus norvegicus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 (St8sia4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006245574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 4 (St8sia4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000026010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:102730314:102820583:-1 gene:ENSRNOG00000019128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT058395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000030440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:102730314:102808783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1
NM_001002024 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 4C1 (Slco4c1), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:103911906:103960233:-1 gene:ENSRNOG00000022711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF454761 // GenBank // Rattus norvegicus kidney-specific organic anion transporter mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT058397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:103911906:103981785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_133412 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 6b1 (Slco6b1), mRNA. // chr9 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006245576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 6b1 (Slco6b1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 6b1 (Slco6b1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF321415 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific transporter TST1 mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:104002882:104077902:-1 gene:ENSRNOG00000019252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000071358 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:104849071:104895707:-1 gene:ENSRNOG00000048837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:103998298:104077820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT058398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:104795388:104895625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT058399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
GENSCAN00000035385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:104088028:104088373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0
NM_173338 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 6c1 (Slco6c1), mRNA. // chr9 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// XM_006245578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 6c1 (Slco6c1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:104230346:104308881:-1 gene:ENSRNOG00000013792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF326113 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific transporter TST-2 mRNA, complete cds. // chr9 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:104271328:104325522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001014270 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 6d1 (Slco6d1), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:104376673:104475669:-1 gene:ENSRNOG00000031146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC083829 // GenBank // Rattus norvegicus similar to testis-specific transporter TST-2, mRNA (cDNA clone MGC:94921 IMAGE:7112354), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000043386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:104907651:104979037:-1 gene:ENSRNOG00000047903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT058401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001025012 // RefSeq // Rattus norvegicus gypsy retrotransposon integrase 1 (Gin1), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006245603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gypsy retrotransposon integrase 1 (Gin1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// XM_006245604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gypsy retrotransposon integrase 1 (Gin1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:110750668:110770901:-1 gene:ENSRNOG00000011962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC082058 // GenBank // Rattus norvegicus gypsy retrotransposon integrase 1, mRNA (cDNA clone MGC:95212 IMAGE:7132420), complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:110750761:110763347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT058429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT058430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XR_349259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 2610034M16Rik protein (RGD1560925), misc_RNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XR_357248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 2610034M16Rik protein (RGD1560925), misc_RNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014921 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:105131606:105256934:-1 gene:ENSRNOG00000011042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056434 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:105131606:105149251:-1 gene:ENSRNOG00000011042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC097996 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452995, partial cds. // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:105196170:105265606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT058404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000004634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:105112367:105160975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001109010 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 12 (Nudt12), mRNA. // chr9 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000066968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:105282133:105294901:-1 gene:ENSRNOG00000022576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000004636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:105284519:105292732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
GENSCAN00000007318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:107838894:107856242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000014649 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:107853859:107856242:1 gene:ENSRNOG00000011012 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_053903 // RefSeq // Rattus norvegicus ephrin A5 (Efna5), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006245592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ephrin A5 (Efna5), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006245593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ephrin A5 (Efna5), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000045096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:109627452:109897812:-1 gene:ENSRNOG00000034177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U69279 // GenBank // Rattus norvegicus eph-related receptor tyrosine kinase ligand (LERK7) mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT058411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:109627452:109664752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NONRATT058419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:110477549:110511052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 73 // 68 // 11 // 15 // 0 /// NONRATT058415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001277278 // RefSeq // Rattus norvegicus praja ring finger 2, E3 ubiquitin protein ligase (Pja2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_138896 // RefSeq // Rattus norvegicus praja ring finger 2, E3 ubiquitin protein ligase (Pja2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:111541401:111568364:-1 gene:ENSRNOG00000015528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC074015 // GenBank // Rattus norvegicus praja 2, RING-H2 motif containing, mRNA (cDNA clone MGC:91486 IMAGE:7105756), complete cds. // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D32249 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neurodegeneration associated protein 1, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT058436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:111416480:111572737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSRNOT00000052795 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:9:112440675:112440784:-1 gene:ENSRNOG00000047832 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr9 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001270390 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 232 (Tmem232), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:112543233:112771263:-1 gene:ENSRNOG00000031348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC161875 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:187433 IMAGE:7114733, complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:112589865:112734312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT058441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031631 // RefSeq // Rattus norvegicus VAMP (vesicle-associated membrane protein)-associated protein A (Vapa), mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:112833702:112863559:-1 gene:ENSRNOG00000014765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF086630 // GenBank // Rattus norvegicus VAMP-associated protein A (VAP-A) mRNA, complete cds. // chr9 // 79 // 73 // 19 // 24 // 0 /// BC061875 // GenBank // Rattus norvegicus VAMP (vesicle-associated membrane protein)-associated protein A, mRNA (cDNA clone MGC:72396 IMAGE:5598274), complete cds. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT058442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT058443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000007063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:112834325:112888507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT058445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT058444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001146004 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 2 (spermatozoa) (Txndc2), transcript variant 1, mRNA. // chr9 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:112886290:112888615:-1 gene:ENSRNOG00000027916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// BC079238 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 2 (spermatozoa), mRNA (cDNA clone MGC:94320 IMAGE:7132630), complete cds. // chr9 // 95 // 64 // 20 // 21 // 0 /// NM_001005559 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 2 (spermatozoa) (Txndc2), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000032330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:112886290:112890051:-1 gene:ENSRNOG00000027916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000065073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:112886290:112890766:-1 gene:ENSRNOG00000027916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// BC083924 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 2 (spermatozoa), mRNA (cDNA clone MGC:95324 IMAGE:7135313), complete cds. // chr9 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT058447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT058449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:112834325:112888507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_145094 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB31, member RAS oncogene family (Rab31), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000067974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:112902313:113037023:-1 gene:ENSRNOG00000042189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF254800 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein Rab0 mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC072698 // GenBank // Rattus norvegicus RAB31, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:91462 IMAGE:7105732), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT058450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000007053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:112895617:112948828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT058451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001108238 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 12 (Ankrd12), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_003750752 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 12-like (LOC100910483), mRNA. // chr9 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000017253 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:113343870:113375196:-1 gene:ENSRNOG00000048545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000017613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:113137358:113214157:1 gene:ENSRNOG00000012733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113137410:113229194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT057338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113342331:113412104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_032067 // RefSeq // Rattus norvegicus ralA binding protein 1 (Ralbp1), mRNA. // chr9 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000035606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:113111338:113130700:-1 gene:ENSRNOG00000013461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC089788 // GenBank // Rattus norvegicus ralA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:108645 IMAGE:7374343), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U28830 // GenBank // Rattus norvegicus RalBP1 mRNA, complete cds. // chr9 // 81 // 90 // 21 // 26 // 0 /// U82623 // GenBank // Rattus norvegicus cytocentrin mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113112877:113130644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT058452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000054647 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:9:113278183:113278275:1 gene:ENSRNOG00000047678 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001108811 // RefSeq // Rattus norvegicus twisted gastrulation BMP signaling modulator 1 (Twsg1), mRNA. // chr9 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000017915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:113230657:113263829:1 gene:ENSRNOG00000013340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113248090:113260898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT057339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_031064 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 2 (Ndufv2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:113404127:113424677:-1 gene:ENSRNOG00000042503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC058495 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72937 IMAGE:6891104), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ215131 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YK14 mRNA sequence. // chr9 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONRATT058458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// GENSCAN00000035145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113342331:113412104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENSRNOT00000044153 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:113667692:113669133:-1 gene:ENSRNOG00000031795 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113667688:113669133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113795099:113796544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006245629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SOGA family member 2 (Soga2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SOGA family member 2 (Soga2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// XM_006245631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SOGA family member 2 (Soga2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006245633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SOGA family member 2 (Soga2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:114014713:114125108:-1 gene:ENSRNOG00000025527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000050012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:113998705:114047920:-1 gene:ENSRNOG00000025527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113955766:114074942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:114107389:114129557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT058470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_013017 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB12, member RAS oncogene family (Rab12), mRNA. // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000026177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:114187499:114211152:-1 gene:ENSRNOG00000019295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT058472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:114175282:114211296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_003750754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689599 (LOC689599), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_003754558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689599 (LOC689599), mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016155 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:114247447:114284503:-1 gene:ENSRNOG00000012115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:114247447:114258460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000030745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:114175282:114211296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0
NM_001168632 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, M (Ptprm), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, M (Ptprm), transcript variant X10, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:114341760:115046974:-1 gene:ENSRNOG00000011700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT058473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:114342545:114375070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT058475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
XM_001054231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 30 (Lrrc30), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_237538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 30 (Lrrc30), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049720 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:115340303:115341205:-1 gene:ENSRNOG00000030389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:115340303:115341205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191815 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 28 (Arhgap28), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006245626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 28 (Arhgap28), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006245627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 28 (Arhgap28), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:115546748:115711949:-1 gene:ENSRNOG00000017065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:115547774:115568772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:115573319:115619603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT058481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_001015020 // RefSeq // Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 1 (Tgif1), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:118636412:118646122:-1 gene:ENSRNOG00000015906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091264 // GenBank // Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:109104 IMAGE:7379061), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC127461 // GenBank // Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:156525 IMAGE:7389058), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:118636892:118643836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT058489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_017343 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light chain 12B, regulatory (Myl12b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000048125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:118761460:118775834:-1 gene:ENSRNOG00000015733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC060577 // GenBank // Rattus norvegicus myosin regulatory light chain MRLC2, mRNA (cDNA clone MGC:72883 IMAGE:6889406), complete cds. // chr9 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// D14688 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for myosin regulatory light chain, complete cds. // chr9 // 80 // 71 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT058494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT058495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0
NM_001135017 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light chain 12A, regulatory, non-sarcomeric (Myl12a), mRNA. // chr9 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// XM_006245668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, light chain 12A, regulatory, non-sarcomeric (Myl12a), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000021048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:118779626:118787509:-1 gene:ENSRNOG00000015278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// FQ215776 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YL03 mRNA sequence. // chr9 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// FQ217558 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA23YI13 mRNA sequence. // chr9 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// FQ220614 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YE08 mRNA sequence. // chr9 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// FQ229140 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YP16 mRNA sequence. // chr9 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// NONRATT058498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT058499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
XM_006226977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elastin microfibril interfacer 2 (Emilin2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006245670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elastin microfibril interfacer 2 (Emilin2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:119048148:119106488:-1 gene:ENSRNOG00000014837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:119048148:119051581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:119062383:119127535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000019359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:119128952:119271724:-1 gene:ENSRNOG00000014319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000056786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:119140290:119271724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 42 // 42 // 0 /// FQ230906 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA80YP13 mRNA sequence. // chr9 // 97 // 63 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT058507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 33 // 33 // 17 // 52 // 1 /// NONRATT058511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 17 // 17 // 9 // 52 // 1
NM_001126270 // RefSeq // Rattus norvegicus NDC80 kinetochore complex component (Ndc80), mRNA. // chr9 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000018644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:119293740:119324796:-1 gene:ENSRNOG00000013727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC161935 // GenBank // Rattus norvegicus NDC80 homolog, kinetochore complex component (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187716 IMAGE:9022458), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:119293843:119323047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT058513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
XM_001056810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 114, member A1-like 1 (Fam114a1l1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_237514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 114, member A1-like 1 (Fam114a1l1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000002917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:119555072:119556772:-1 gene:ENSRNOG00000002110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:119555072:119556772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000020150 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:120297900:120298626:-1 gene:ENSRNOG00000015016 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:120297900:120298386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_019179 // RefSeq // Rattus norvegicus thymidylate synthetase (Tyms), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:121369214:121381507:-1 gene:ENSRNOG00000037225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC126093 // GenBank // Rattus norvegicus thymidylate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:156654 IMAGE:8362547), complete cds. // chr9 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// L12138 // GenBank // Rattus norvegicus thymidylate synthase mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ230822 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA88YF01 mRNA sequence. // chr9 // 67 // 75 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:121369483:121381493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0
NM_001033071 // RefSeq // Rattus norvegicus clusterin-like 1 (retinal) (Clul1), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY655707 // GenBank // Rattus norvegicus clusterin-like protein 1 (Clul1) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:121394938:121535205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001025287 // RefSeq // Rattus norvegicus timeless interacting protein (Tipin), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754721 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TIMELESS interacting protein like 1 (Tipinl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173082:173912:-1 gene:ENSRNOG00000037221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC097351 // GenBank // Rattus norvegicus timeless interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:114381 IMAGE:7387433), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066973 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:69463020:69477177:1 gene:ENSRNOG00000043068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:173082:173912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT053471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_016989 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase activating polypeptide 1 (Adcyap1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000073432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:121156295:121162350:-1 gene:ENSRNOG00000049882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:121156836:121163491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// M63006 // GenBank // Rat pituitary adenylate cyclase activating polypeptide precursor protein mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001106882 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-5 homolog C (C. elegans)-like (Unc5cl), mRNA. // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// XM_006244423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus unc-5 homolog C (C. elegans)-like (Unc5cl), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:13415344:13429324:-1 gene:ENSRNOG00000046601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:13356456:13428431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000041720 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:1:67:1 gene:ENSRNOG00000031780 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:1-67, tRNA-Phe // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X52757 // GenBank // R.norvegicus mitochondrial D-loop region. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
FQ235069 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YJ13 mRNA sequence. // chrUn // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000040038 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:68:1025:1 gene:ENSRNOG00000030478 gene_biotype:Mt_rRNA transcript_biotype:Mt_rRNA // chrUn // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ212565 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YJ20 mRNA sequence. // chrUn // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// FQ213234 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YP16 mRNA sequence. // chrUn // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// FQ213697 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YE11 mRNA sequence. // chrUn // 82 // 92 // 18 // 22 // 0 /// FQ213767 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YM19 mRNA sequence. // chrUn // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// FQ217084 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA35YP11 mRNA sequence. // chrUn // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// FQ224285 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA70YN10 mRNA sequence. // chrUn // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// FQ227309 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YN03 mRNA sequence. // chrUn // 86 // 92 // 19 // 22 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:69-1025, 12S ribosomal RNA // chrUn // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
FQ234008 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YI09 mRNA sequence. // chrUn // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045072 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:1026:1093:1 gene:ENSRNOG00000029171 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrUn // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:1026-1094, tRNA-Val // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:1095-2653, 16S ribosomal RNA // chrUn // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000069133 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:1094:2664:1 gene:ENSRNOG00000043866 gene_biotype:Mt_rRNA transcript_biotype:Mt_rRNA // chrUn // 50 // 98 // 21 // 42 // 0 /// BC158568 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7325933. // chrUn // 50 // 98 // 21 // 42 // 0 /// Y17323 // GenBank // Rattus norvegicus CDK109 mRNA. // chrUn // 57 // 33 // 8 // 14 // 0 /// FQ218437 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YC12 mRNA sequence. // chrUn // 40 // 81 // 14 // 35 // 0 /// FQ220636 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YD05 mRNA sequence. // chrUn // 40 // 81 // 14 // 35 // 0 /// FQ215539 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YN10 mRNA sequence. // chrUn // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
FQ215522 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YO08 mRNA sequence. // chrUn // 59 // 100 // 17 // 29 // 0 /// FQ217472 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA25YK15 mRNA sequence. // chrUn // 59 // 100 // 17 // 29 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:2654-2728, tRNA-Leu // chrUn // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000049156 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:2665:2739:1 gene:ENSRNOG00000032112 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrUn // 59 // 100 // 17 // 29 // 0 /// FQ214662 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YK20 mRNA sequence. // chrUn // 28 // 100 // 8 // 29 // 0
ENSRNOT00000047550 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:2740:3694:1 gene:ENSRNOG00000030644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 67 // 65 // 10 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000051008 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:3695:3763:1 gene:ENSRNOG00000029301 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrUn // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// NC_001665 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 1, Mitochondrion [Rattus norvegicus] // chrUn // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:3684-3752, tRNA-Ile // chrUn // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// FQ210463 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA28YD08 mRNA sequence. // chrUn // 64 // 61 // 9 // 14 // 0 /// FQ214662 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YK20 mRNA sequence. // chrUn // 67 // 65 // 10 // 15 // 0
FQ215619 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YH20 mRNA sequence. // chrUn // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ228537 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YD11 mRNA sequence. // chrUn // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042644 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:3835:3903:1 gene:ENSRNOG00000032274 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrUn // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ212929 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YK10 mRNA sequence. // chrUn // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ212930 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YK09 mRNA sequence. // chrUn // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ216446 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YM13 mRNA sequence. // chrUn // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ234025 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YH06 mRNA sequence. // chrUn // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:3824-3891, tRNA-Met // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000040993 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:3904:4942:1 gene:ENSRNOG00000031033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 79 // 70 // 15 // 19 // 0 /// FQ212929 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YK10 mRNA sequence. // chrM // 79 // 70 // 15 // 19 // 0 /// NC_001665 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 2, Mitochondrion [Rattus norvegicus] // chrM // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:4928-4993, tRNA-Trp // chrM // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// FQ216446 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YM13 mRNA sequence. // chrM // 47 // 70 // 9 // 19 // 0
NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:6922-6989, tRNA-Asp // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051129 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:6937:7004:1 gene:ENSRNOG00000031685 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// FQ211281 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA13YM22 mRNA sequence. // chrM // 56 // 100 // 14 // 25 // 0
ENSRNOT00000043693 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:7006:7689:1 gene:ENSRNOG00000030371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// FQ211281 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA13YM22 mRNA sequence. // chrM // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// FQ212695 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YN19 mRNA sequence. // chrM // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// FQ219035 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YD07 mRNA sequence. // chrM // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// NC_001665 // GenBank // cytochrome c oxidase subunit II, Mitochondrion [Rattus norvegicus] // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ229196 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YM09 mRNA sequence. // chrM // 52 // 100 // 13 // 25 // 0
ENSRNOT00000041978 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:7693:7756:1 gene:ENSRNOG00000029070 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ213558 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YC06 mRNA sequence. // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:7678-7741, tRNA-Lys // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AF504920 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase synthase subunit 6 mRNA, partial cds; cytochrome oxidase subunit III mRNA, complete cds; tRNA-Gly gene, complete sequence; and NADH dehydrogenase subunit III mRNA, complete cds; mitochondrial genes for mitochondrial products. // chrM // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
ENSRNOT00000052103 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:9800:9867:1 gene:ENSRNOG00000032320 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// K00160 // GenBank // Rat mt Morris hepatoma 5123d tumor Arg-tRNA. // chrM // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:9785-9852, tRNA-Arg // chrM // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000042928 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:10160:11537:1 gene:ENSRNOG00000029707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 77 // 50 // 10 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000044582 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:9870:10166:1 gene:ENSRNOG00000031053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// BC161988 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9032146. // chrM // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// FQ214204 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YD22 mRNA sequence. // chrM // 80 // 38 // 8 // 10 // 0 /// NC_001665 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 4L, Mitochondrion [Rattus norvegicus] // chrM // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NC_001665 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 4, Mitochondrion [Rattus norvegicus] // chrM // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000047162 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:11538:11605:1 gene:ENSRNOG00000033957 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:11523-11590, tRNA-His // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000045499 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:11606:11665:1 gene:ENSRNOG00000032578 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000050396 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:11665:11735:1 gene:ENSRNOG00000031667 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// K00241 // GenBank // Rat Morris hepatoma tumor 5123d mitochondrial Leu-tRNA. // chrM // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:11591-11650, tRNA-Ser // chrM // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:11650-11720, tRNA-Leu // chrM // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000048767 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:11736:13565:1 gene:ENSRNOG00000029971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 5, Mitochondrion [Rattus norvegicus] // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166474 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9099519. // chrM // 74 // 92 // 17 // 23 // 0 /// FQ233154 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YA03 mRNA sequence. // chrM // 60 // 80 // 12 // 20 // 0 /// FQ225498 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YO03 mRNA sequence. // chrM // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000042098 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:14136:15278:1 gene:ENSRNOG00000031766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AF295545 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b mRNA, complete cds; mitochondrial gene for mitochondrial product. // chrM // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC158811 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7370557. // chrM // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // cytochrome b, Mitochondrion [Rattus norvegicus] // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Y17319 // GenBank // Rattus norvegicus CDK110 mRNA. // chrM // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// FQ215169 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YH09 mRNA sequence. // chrM // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// FQ215634 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YG17 mRNA sequence. // chrM // 63 // 96 // 15 // 24 // 0 /// FQ216434 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YP05 mRNA sequence. // chrM // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// FQ229219 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YL04 mRNA sequence. // chrM // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// FQ229369 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YC18 mRNA sequence. // chrM // 71 // 96 // 17 // 24 // 0
NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:15268-15334, tRNA-Thr // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040611 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:15280:15346:1 gene:ENSRNOG00000030339 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:c3820-3750, tRNA-Gln // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049396 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:3761:3831:-1 gene:ENSRNOG00000033545 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrUn // 56 // 100 // 14 // 25 // 0
ENSRNOT00000044320 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:5010:5078:-1 gene:ENSRNOG00000033932 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ217761 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA18YJ01 mRNA sequence. // chrM // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:c5063-4995, tRNA-Ala // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:c5139-5066, tRNA-Asn // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000048525 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:5081:5152:-1 gene:ENSRNOG00000032609 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 50 // 100 // 11 // 22 // 0 /// FQ217761 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA18YJ01 mRNA sequence. // chrM // 50 // 100 // 11 // 22 // 0
FQ209595 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YK09 mRNA sequence. // chrM // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:c5238-5171, tRNA-Cys // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045310 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:5185:5252:-1 gene:ENSRNOG00000031333 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// FQ217761 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA18YJ01 mRNA sequence. // chrM // 48 // 100 // 12 // 25 // 0
ENSRNOT00000051860 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:5256:5321:-1 gene:ENSRNOG00000029954 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ217761 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA18YJ01 mRNA sequence. // chrM // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:c5307-5242, tRNA-Tyr // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:c6919-6850, tRNA-Ser // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040283 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:6865:6933:-1 gene:ENSRNOG00000032882 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrU // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// FQ229665 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YC16 mRNA sequence. // chrU // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
FQ214145 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YJ11 mRNA sequence. // chrM // 65 // 68 // 11 // 17 // 0
ENSRNOT00000051268 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:13543:14061:-1 gene:ENSRNOG00000029042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrM // 71 // 100 // 17 // 24 // 0 /// NC_001665 // GenBank // NADH dehydrogenase subunit 6, Mitochondrion [Rattus norvegicus] // chrM // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ214396 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YO16 mRNA sequence. // chrM // 67 // 100 // 16 // 24 // 0
ENSRNOT00000049806 // ENSEMBL // mt_genbank_import:novel chromosome:Rnor_5.0:MT:14062:14130:-1 gene:ENSRNOG00000032997 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:c14118-14050, tRNA-Glu // chrM // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NC_001665 // GenBank // gi|5835177|ref|NC_001665.1|:c15403-15336, tRNA-Pro // chrM // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000044639 // ENSEMBL // mt_genbank_import:known chromosome:Rnor_5.0:MT:15348:15415:-1 gene:ENSRNOG00000029145 gene_biotype:Mt_tRNA transcript_biotype:Mt_tRNA // chrM // 55 // 100 // 12 // 22 // 0 /// FQ218050 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA10YE14 mRNA sequence. // chrM // 50 // 100 // 11 // 22 // 0 /// FQ224084 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA77YH17 mRNA sequence. // chrM // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001025002 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC310926 (LOC310926), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000074325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:13553119:13558222:1 gene:ENSRNOG00000047746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000071549 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:46814998:46857206:1 gene:ENSRNOG00000049138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072620 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:13504948:13508160:-1 gene:ENSRNOG00000046170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:13489781:13508912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// FQ232338 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YC20 mRNA sequence. // chrU // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001015035 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-like 1 (B3gntl1), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XR_358051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-like 1 (B3gntl1), transcript variant X9, misc_RNA. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110385026:110443571:-1 gene:ENSRNOG00000049724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110385026:110443571:-1 gene:ENSRNOG00000049724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY634365 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-like 1 (B3gntl1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC111711 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:124891 IMAGE:7383845), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006247901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-like 1 (B3gntl1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006247902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase-like 1 (B3gntl1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110387215:110459161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0
NM_001109312 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor C domain containing 2 (Vwc2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000071558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:90987662:91137489:1 gene:ENSRNOG00000049076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:90989391:91029821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001109460 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 19 (Stx19), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:1138062:1138939:1 gene:ENSRNOG00000047893 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:1138062:1138871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031086 // RefSeq // Rattus norvegicus protein S (alpha) (Pros1), mRNA. // chr7 // 100 // 99 // 70 // 70 // 0 /// ENSRNOT00000073689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:1199864:1279990:1 gene:ENSRNOG00000048723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 99 // 70 // 70 // 0 /// GENSCAN00000039083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:1199948:1278860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 66 // 66 // 0 /// U06230 // GenBank // Rattus norvegicus protein S mRNA, partial cds. // chr7 // 44 // 44 // 31 // 71 // 1
NM_001024365 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase-like 1 (Cesl1), mRNA. // chr19 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000024187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26192035:26236467:1 gene:ENSRNOG00000015317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000074070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26192035:26236467:1 gene:ENSRNOG00000015317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// BC079129 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylesterase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94137 IMAGE:7127228), complete cds. // chr19 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// AB023630 // GenBank // Rattus norvegicus CESrRL1 mRNA for carboxylesterase RL1, complete cds. // chr19 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// U10698 // GenBank // Rattus norvegicus liver microsomal carboxylesterase mRNA, complete cds. // chr19 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT027121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26191613:26243295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001047967 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00080 (LOC501233), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_001069525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH domain containing 1B (Khdc1b), mRNA. // chr19 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// XM_002727186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH domain containing 1B (Khdc1b), mRNA. // chr19 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// XM_006222988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH homology domain-containing protein 1-like (LOC102552901), mRNA. // chr19 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006228125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH homology domain-containing protein 1-like (LOC102552901), mRNA. // chr19 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000074479 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:26248405:26253283:1 gene:ENSRNOG00000015438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020775 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:26248609:26290279:1 gene:ENSRNOG00000015438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:26403582:26404154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26248609:26253283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66408336:66455987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001109011 // RefSeq // Rattus norvegicus macrophage receptor with collagenous structure (Marco), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000075773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:84555641:84586980:-1 gene:ENSRNOG00000049303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:84549643:84576242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 70 // 21 // 23 // 0
NM_001100888 // RefSeq // Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 2 (St6gal2), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 2 (St6gal2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 2 (St6gal2), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 2 (St6gal2), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 2 (St6gal2), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 2 (St6gal2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 2 (St6gal2), transcript variant X10, mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:6048734:6101607:1 gene:ENSRNOG00000046515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:6048917:6102276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001007558 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-like module containing, mucin-like, hormone receptor-like sequence 4 (Emr4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:7134353:7239092:1 gene:ENSRNOG00000050325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY686633 // GenBank // Rattus norvegicus EMR4 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:7132000:7321564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_001106398 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial calcium uniporter (Mcu), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial calcium uniporter (Mcu), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:30842417:31003860:-1 gene:ENSRNOG00000045920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:30842718:30882406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001001507 // RefSeq // Rattus norvegicus oncoprotein induced transcript 3 (Oit3), mRNA. // chr20 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:30813656:30834231:-1 gene:ENSRNOG00000046365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY353853 // GenBank // Rattus norvegicus LZP (Lzp) mRNA, complete cds. // chr20 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// AY356356 // GenBank // Rattus norvegicus LZP (Lzp) mRNA, complete cds. // chr20 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:30814199:30834126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001014033 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 10 (Sept10), mRNA. // chr20 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 10 (Sept10), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:30530111:30621223:-1 gene:ENSRNOG00000049507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// BC087157 // GenBank // Rattus norvegicus septin 10, mRNA (cDNA clone MGC:95253 IMAGE:7133379), complete cds. // chr20 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:30536193:30603605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_138514 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 13 (Cyp2c13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000071633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:266244627:266324943:-1 gene:ENSRNOG00000049464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC088105 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 2c13, mRNA (cDNA clone MGC:108565 IMAGE:7372890), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC098903 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 2c13, mRNA (cDNA clone MGC:114253 IMAGE:7373446), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// J02861 // GenBank // Rat polymorphic, male-specific cytochrome P-450g mRNA, complete cds. // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// M32277 // GenBank // Rat cytochrome P-450g mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// M33994 // GenBank // Rat male-specific liver cytochrome P-450 g mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_031572 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 12 (Cyp2c12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:266157078:266215685:-1 gene:ENSRNOG00000047945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC089790 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 12, mRNA (cDNA clone MGC:108649 IMAGE:7371667), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// J03786 // GenBank // Rat cytochrome P-450 (female-specific and growth hormone-inducible) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:266157078:266215677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0
XR_358222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691666 (LOC691666), transcript variant X1, misc_RNA. // chr7 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// XR_358223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691666 (LOC691666), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// XR_358224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691666 (LOC691666), transcript variant X3, misc_RNA. // chr7 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038077 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:229142012:229144311:-1 gene:ENSRNOG00000027431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 62 // 9 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000073169 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:1705342:1708210:1 gene:ENSRNOG00000047912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 62 // 9 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:229141239:229168917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 62 // 9 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:1679783:1711462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 62 // 9 // 16 // 0 /// GENSCAN00000007027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:148687:186407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001106873 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 23 (Slc25a23), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 23 (Slc25a23), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8988686:9004247:1 gene:ENSRNOG00000047781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000058033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8988707:9012961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006244304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 23 (Slc25a23), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8988686:9004247:1 gene:ENSRNOG00000047781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106874 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 41 (Slc25a41), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9005494:9013189:1 gene:ENSRNOG00000048853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FM165287 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for mitochondrial ATP-Mg/Pi carrier protein (Slc25a41 gene), strain Wistar. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8988707:9012961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133602 // RefSeq // Rattus norvegicus KH-type splicing regulatory protein (Khsrp), mRNA. // chr9 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000072033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9014580:9023574:1 gene:ENSRNOG00000047628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// AF308818 // GenBank // Rattus norvegicus MAP2 RNA trans-acting protein MARTA1 mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000058044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9016473:9023556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0
NM_001007711 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIF, polypeptide 1 (Gtf2f1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus general transcription factor IIF, polypeptide 1 (Gtf2f1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9033678:9043039:1 gene:ENSRNOG00000047134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079136 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIF, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:94148 IMAGE:7127699), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000058020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9033804:9043017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_013014 // RefSeq // Rattus norvegicus persephin (Pspn), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9045406:9045964:1 gene:ENSRNOG00000049171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF040961 // GenBank // Rattus norvegicus persephin mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000058039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9045406:9045964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106875 // RefSeq // Rattus norvegicus alkaline ceramidase 1 (Acer1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alkaline ceramidase 1 (Acer1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9062245:9093261:1 gene:ENSRNOG00000047368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000058018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9062292:9091775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106876 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 1 (Mllt1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000071211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9110342:9154498:1 gene:ENSRNOG00000048736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000058035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9109888:9152623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_001080096 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 2 (Acsbg2), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 2 (Acsbg2), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9171074:9188642:1 gene:ENSRNOG00000045947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000074555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9171074:9201477:1 gene:ENSRNOG00000045947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC129110 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase bubblegum family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:156748 IMAGE:7111052), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000058037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9176308:9199226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001106877 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory factor X, 2 (influences HLA class II expression) (Rfx2), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9214191:9280395:1 gene:ENSRNOG00000045846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC166527 // GenBank // Rattus norvegicus regulatory factor X, 2 (influences HLA class II expression), mRNA (cDNA clone MGC:188120 IMAGE:7135787), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000058028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9219274:9279473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_053399 // RefSeq // Rattus norvegicus neurturin (Nrtn), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9302550:9303677:1 gene:ENSRNOG00000048651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY190603 // GenBank // Rattus norvegicus neurturin mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9297555:9303597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0
NM_001001720 // RefSeq // Rattus norvegicus vimentin-type intermediate filament associated coiled-coil protein (Vmac), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vimentin-type intermediate filament associated coiled-coil protein (Vmac), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9336155:9337409:1 gene:ENSRNOG00000048897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY521229 // GenBank // Rattus norvegicus VMAC (Vmac) mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000058038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9336155:9337409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133404 // RefSeq // Rattus norvegicus lon peptidase 1, mitochondrial (Lonp1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000074253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9425780:9438104:1 gene:ENSRNOG00000046502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AB064323 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Lon, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000058041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9425460:9438003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_001134533 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC301124 (LOC301124), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC301124 (LOC301124), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9443626:9446493:1 gene:ENSRNOG00000046002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158609 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7373801. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227593 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YL23 mRNA sequence. // chr9 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9443803:9445580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scaffold attachment factor B2 (Safb2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006226688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scaffold attachment factor B2 (Safb2), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006244366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scaffold attachment factor B2 (Safb2), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006244367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scaffold attachment factor B2 (Safb2), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XR_348872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scaffold attachment factor B2 (Safb2), transcript variant X9, misc_RNA. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XR_356797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scaffold attachment factor B2 (Safb2), transcript variant X9, misc_RNA. // chr9 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000072276 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:9476267:9489685:1 gene:ENSRNOG00000049511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072662 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:9476267:9484193:1 gene:ENSRNOG00000049511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 92 // 29 // 11 // 12 // 0 /// FQ221088 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YM22 mRNA sequence. // chr9 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// FQ212647 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YB22 mRNA sequence. // chr9 // 57 // 34 // 8 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9467716:9488913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0
NM_001024878 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc and ring finger 4 (Znrf4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9530159:9531347:1 gene:ENSRNOG00000048875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098025 // GenBank // Rattus norvegicus zinc and ring finger 4, mRNA (cDNA clone MGC:116178 IMAGE:7455918), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9530286:9531269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_019140 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, S (Ptprs), mRNA. // chr9 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000073991 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:9596330:9638569:1 gene:ENSRNOG00000047247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000074469 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:9596330:9638569:1 gene:ENSRNOG00000047247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 97 // 86 // 31 // 32 // 0 /// BC105753 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, D, mRNA (cDNA clone MGC:124537 IMAGE:5599711), complete cds. // chr9 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// L12329 // GenBank // Rat leukocyte common antigen-related phosphatase (LAR-PTP2) alternatively spliced mRNA (LAR-PTP2B), complete cds. // chr9 // 93 // 76 // 26 // 28 // 0 /// L19180 // GenBank // Rat receptor-linked protein tyrosine phosphatase (PTP-P1) mRNA, complete cds. // chr9 // 89 // 73 // 24 // 27 // 0 /// L19181 // GenBank // Rat receptor-linked protein tyrosine phosphatase (PTP-PS) mRNA, complete cds. // chr9 // 86 // 57 // 18 // 21 // 0 /// L19933 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 73 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9596330:9640079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// L11587 // GenBank // Rat leukocyte common antigen-related phosphatase (LAR-PTP2) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0
NM_001109408 // RefSeq // Rattus norvegicus arrestin domain containing 5 (Arrdc5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9751885:9757867:1 gene:ENSRNOG00000047223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9751885:9772777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000070978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9761439:9773323:1 gene:ENSRNOG00000048834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ230643 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YJ20 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9751885:9772777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_003750630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-like receptor adaptor molecule 1 (Ticam1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-like receptor adaptor molecule 1 (Ticam1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072501 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:9779123:9781187:1 gene:ENSRNOG00000048462 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9779360:9781174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_001061312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dipeptidyl peptidase 9 (Dpp9), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006226691 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dipeptidyl peptidase 9 (Dpp9), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000073485 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:9852506:9868688:1 gene:ENSRNOG00000050748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:9846698:9871136:1 gene:ENSRNOG00000050748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000005350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9846165:9871136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
XM_002727156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF0556 protein C19orf10 homolog (LOC501282), mRNA. // chr9 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_576697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF0556 protein C19orf10 homolog (LOC501282), transcript variant 2, mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072870 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:9874668:9882697:1 gene:ENSRNOG00000046883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9874671:9881519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228798 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YL01 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_053471 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B (Sema6b), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006244348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B (Sema6b), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006244349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6B (Sema6b), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000070794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9928560:9938199:1 gene:ENSRNOG00000045998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB000776 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for semaphorin Z, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9928772:9937228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_001009717 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich alpha-2-glycoprotein 1 (Lrg1), mRNA. // chr9 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000074993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9939360:9941597:1 gene:ENSRNOG00000049918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC088434 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich alpha-2-glycoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95065 IMAGE:7124833), complete cds. // chr9 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000005319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9939380:9941321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_001134637 // RefSeq // Rattus norvegicus perilipin 5 (Plin5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000073930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9943003:9948729:1 gene:ENSRNOG00000047860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9943263:9958783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
XM_006244372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus perilipin 4 (Plin4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075424 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:9950800:9958221:1 gene:ENSRNOG00000047046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9943263:9958783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001108812 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 6 (Ubxn6), mRNA. // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9982495:9987589:1 gene:ENSRNOG00000048509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000058061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9982433:9987242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001025026 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducing adaptor family member 2 (Stap2), mRNA. // chr9 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:10049873:10055402:1 gene:ENSRNOG00000047306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC091228 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducing adaptor family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:108972 IMAGE:7321609), complete cds. // chr9 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000058064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:10049913:10055178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0
XM_006226697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102555289), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006226699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102555289), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102555289), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006244396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102555289), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000041051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:38815348:38819296:-1 gene:ENSRNOG00000042971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// BC082068 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700081O22, mRNA (cDNA clone MGC:95230 IMAGE:7132781), complete cds. // chr19 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT028202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0
NM_001013907 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 12 (Dnajb12), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31249072:31266937:1 gene:ENSRNOG00000030408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC090076 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:94679 IMAGE:7192431), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ223748 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA87YP01 mRNA sequence. // chr20 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT033270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31258130:31271569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT033271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT033273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_002726680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002730133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_347061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_354643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 228, member B (Fam228b), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:39833656:39848460:-1 gene:ENSRNOG00000049615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:39790683:39843728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001014074 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 228, member A (Fam228a), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 228, member A (Fam228a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:39791234:39812825:-1 gene:ENSRNOG00000050114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:39790683:39843728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENSRNOT00000073470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107709166:107713518:1 gene:ENSRNOG00000047026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_001012466 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 7 (Enpp7), mRNA. // chr10 // 72 // 88 // 21 // 29 // 0 /// AY568760 // GenBank // Rattus norvegicus intestinal alkaline sphingomyelinase mRNA, complete cds. // chr10 // 72 // 88 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107712958:107713518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000024921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107709166:107711835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
NM_001107071 // RefSeq // Rattus norvegicus chromobox homolog 2 (Cbx2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107745908:107754738:1 gene:ENSRNOG00000049215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107745960:107752612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001134688 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 40 (Ccdc40), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000071618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107952498:108004475:1 gene:ENSRNOG00000050151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107957922:108004475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
NM_133314 // RefSeq // Rattus norvegicus STEAP family member 3, metalloreductase (Steap3), mRNA. // chr13 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:41363990:41380914:-1 gene:ENSRNOG00000049471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF238865 // GenBank // Rattus norvegicus tumor suppressor pHyde mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AF335281 // GenBank // Rattus norvegicus tumor suppressor pHyde mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC085696 // GenBank // Rattus norvegicus STEAP family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:93147 IMAGE:7190374), complete cds. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:41365186:41397130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_031853 // RefSeq // Rattus norvegicus diazepam binding inhibitor (GABA receptor modulator, acyl-CoA binding protein) (Dbi), mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000074685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:41256375:41263832:-1 gene:ENSRNOG00000046889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// BC084717 // GenBank // Rattus norvegicus diazepam binding inhibitor (GABA receptor modulator, acyl-Coenzyme A binding protein), mRNA (cDNA clone MGC:105272 IMAGE:7310272), complete cds. // chr13 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// M20268 // GenBank // Rat diazepam binding inhibitor (DBI) mRNA, complete cds. // chr13 // 75 // 71 // 9 // 12 // 0
NM_139095 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 37 (Tmem37), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:41205721:41211952:-1 gene:ENSRNOG00000047714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF361355 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma subunit-like protein mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:41205721:41290136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000041848 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:568236:569028:-1 gene:ENSRNOG00000033565 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_002727520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 300 (Zfp300), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 300 (Zfp300), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072087 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:902965:905718:1 gene:ENSRNOG00000046469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006256628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 182 (Zfp182), transcript variant X7, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073016 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:979734:994442:1 gene:ENSRNOG00000047132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ212312 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA59YM20 mRNA sequence. // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:916699:992999:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_053920 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 10 (Trip10), mRNA. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075822 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:8696543:8709634:-1 gene:ENSRNOG00000047448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AB006914 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for salt-tolerant protein, complete cds. // chr9 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC061840 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 10, mRNA (cDNA clone MGC:72345 IMAGE:5600051), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8696803:8709634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
NM_012759 // RefSeq // Rattus norvegicus vav 1 guanine nucleotide exchange factor (Vav1), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8626680:8682495:-1 gene:ENSRNOG00000050430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC091160 // GenBank // Rattus norvegicus vav 1 guanine nucleotide exchange factor, mRNA (cDNA clone MGC:108735 IMAGE:7373783), complete cds. // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U39476 // GenBank // Rattus norvegicus p95 Vav (Vav) proto-oncogene mRNA, complete cds. // chr9 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8626680:8663933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_001007557 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-like module containing, mucin-like, hormone receptor-like 1 (Emr1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000073926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8434335:8593090:-1 gene:ENSRNOG00000046254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY686632 // GenBank // Rattus norvegicus EMR1 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000022331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8473100:8578968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000046852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8132823:8147367:-1 gene:ENSRNOG00000033341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001014104 // RefSeq // Rattus norvegicus meteorin, glial cell differentiation regulator-like (Metrnl), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110473811:110487800:1 gene:ENSRNOG00000046202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB646250 // GenBank // Rattus norvegicus Metrnl mRNA for meteorin, glial cell differentiation regulator-like, complete cds. // chr10 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC086590 // GenBank // Rattus norvegicus meteorin, glial cell differentiation regulator-like, mRNA (cDNA clone MGC:105568 IMAGE:7310123), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110474007:110506512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001271364 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor D (Tbcd), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110229340:110380958:1 gene:ENSRNOG00000036658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110309898:110384323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107101 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 13B (Arl13b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 13B (Arl13b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:1111829:1181765:-1 gene:ENSRNOG00000047194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:1113786:1132679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001013889 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase-like (LOC291863), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_133295 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 1D (Ces1d), mRNA. // chr19 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26294247:26337106:1 gene:ENSRNOG00000015519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC061789 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylesterase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72259 IMAGE:5623732), complete cds. // chr19 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// BC078681 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylesterase-like, mRNA (cDNA clone MGC:93042 IMAGE:7123712), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// L81144 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylic ester hydrolase mRNA, complete cds. // chr19 // 75 // 93 // 21 // 28 // 0 /// L46791 // GenBank // Rattus norvegicus cholesterol esterase mRNA, complete cds. // chr19 // 70 // 100 // 21 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26300039:26336917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT027124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0
XM_001056699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus engrailed homeobox 1 (En1), transcript variant 1, partial mRNA. // chrU // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus engrailed homeobox 1 (En1), mRNA. // chrU // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074125 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:41633975:41638104:1 gene:ENSRNOG00000046462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:41621523:41638104:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_006226664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006226665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006226666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006226667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244268 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006244273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1B (Pot1b), transcript variant X7, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:6885290:6930692:-1 gene:ENSRNOG00000047439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:6885290:6941749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
XM_001053976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group XIIB (Pla2g12b), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_346131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group XIIB (Pla2g12b), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074524 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:30793920:30811874:1 gene:ENSRNOG00000046619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:30801501:30811874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_172062 // RefSeq // Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, alpha polypeptide I (P4ha1), mRNA. // chr20 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000070897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:30726604:30776292:1 gene:ENSRNOG00000050655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// BC078703 // GenBank // Rattus norvegicus procollagen-proline, 2-oxoglutarate 4-dioxygenase (proline 4-hydroxylase), alpha polypeptide I, mRNA (cDNA clone MGC:93107 IMAGE:7115543), complete cds. // chr20 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:30694664:30776011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0
NM_001109364 // RefSeq // Rattus norvegicus sosondowah ankyrin repeat domain family member C (Sowahc), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:30621651:30626117:1 gene:ENSRNOG00000048831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:30621742:30677425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003753477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 3 (Sh3rf3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006223892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 3 (Sh3rf3), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006223893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 3 (Sh3rf3), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 3 (Sh3rf3), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 3 (Sh3rf3), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 3 (Sh3rf3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 3 (Sh3rf3), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:30171737:30524777:1 gene:ENSRNOG00000046791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:30455094:30490560:1 gene:ENSRNOG00000046791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:30400335:30524777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001025661 // RefSeq // Rattus norvegicus crumbs family member 3 (Crb3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8981383:8984483:-1 gene:ENSRNOG00000047322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097382 // GenBank // Rattus norvegicus crumbs homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:114421 IMAGE:7446098), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crumbs homolog 3 (Drosophila) (Crb3), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// XM_006244303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crumbs homolog 3 (Drosophila) (Crb3), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// FQ223867 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA84YK03 mRNA sequence. // chr9 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006244300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crumbs homolog 3 (Drosophila) (Crb3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XM_006244301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crumbs homolog 3 (Drosophila) (Crb3), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001109384 // RefSeq // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 7 (E. coli) (Alkbh7), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244337 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 7 (E. coli) (Alkbh7), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9046025:9048157:-1 gene:ENSRNOG00000047089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000058034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9046324:9048131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000072001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9049368:9055012:-1 gene:ENSRNOG00000047052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231323 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YO19 mRNA sequence. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9049536:9055009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134566 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to gonadotropin-regulated long chain acyl-CoA synthetase (LOC316124), mRNA. // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to gonadotropin-regulated long chain acyl-CoA synthetase (LOC316124), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073048 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:9157944:9180918:-1 gene:ENSRNOG00000047549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074894 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:9:9157944:9180918:-1 gene:ENSRNOG00000047549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9156554:9169143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001034923 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 3-like (S. cerevisiae) (Dus3l), mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 3-like (S. cerevisiae) (Dus3l), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9286526:9291060:-1 gene:ENSRNOG00000050381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC105780 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 3-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124806 IMAGE:7932299), complete cds. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000058023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9284197:9291013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_212517 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 11 (Ndufa11), mRNA. // chr9 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000070862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9331184:9335243:-1 gene:ENSRNOG00000048320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY272059 // GenBank // Rattus norvegicus clone NYP-01 RE70703p-like protein mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000058043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9315404:9335195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
XM_006226678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3 (Ranbp3), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006226682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3 (Ranbp3), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3 (Ranbp3), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3 (Ranbp3), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9341273:9378345:-1 gene:ENSRNOG00000049785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9341273:9378345:-1 gene:ENSRNOG00000049785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9341273:9378345:-1 gene:ENSRNOG00000049785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ212208 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YK02 mRNA sequence. // chr9 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000058019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9341818:9378338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// U22321 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 1 gamma 3 isoform mRNA, complete cds. // chr9 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001134984 // RefSeq // Rattus norvegicus catsper channel auxiliary subunit delta (Catsperd), mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus catsper channel auxiliary subunit delta (Catsperd), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006244342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus catsper channel auxiliary subunit delta (Catsperd), transcript variant X4, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006244344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus catsper channel auxiliary subunit delta (Catsperd), transcript variant X6, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000071207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9387396:9424456:-1 gene:ENSRNOG00000048818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC169121 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 146, mRNA (cDNA clone MGC:189565 IMAGE:7133439), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000058029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9387495:9424418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_022394 // RefSeq // Rattus norvegicus scaffold attachment factor B (Safb), mRNA. // chr9 // 90 // 98 // 35 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000072868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9447353:9467936:-1 gene:ENSRNOG00000050543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AF056324 // GenBank // Rattus norvegicus scaffold attachment factor B mRNA, complete cds. // chr9 // 90 // 98 // 35 // 39 // 0 /// GENSCAN00000058032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9447328:9464412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
NM_001044236 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 4B (Kdm4b), mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// XM_006244320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 4B (Kdm4b), transcript variant X5, mRNA. // chr9 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000071199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9647772:9725845:-1 gene:ENSRNOG00000049221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// BC098860 // GenBank // Rattus norvegicus similar to jumonji domain containing 2B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7380411), complete cds. // chr9 // 100 // 50 // 28 // 28 // 0 /// FQ222090 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YD10 mRNA sequence. // chr9 // 97 // 59 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9648920:9702406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 49 // 49 // 0
NM_001008882 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like with PHD and ring finger domains 1 (Uhrf1), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006244325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-like with PHD and ring finger domains 1 (Uhrf1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006244326 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-like with PHD and ring finger domains 1 (Uhrf1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000075265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9731078:9749712:-1 gene:ENSRNOG00000048411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9731078:9749711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001025706 // RefSeq // Rattus norvegicus fem-1 homolog a (C. elegans) (Fem1a), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9790762:9792726:-1 gene:ENSRNOG00000050646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC097490 // GenBank // Rattus norvegicus feminization 1 homolog a (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:114562 IMAGE:7460827), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9790762:9841582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
XM_006226693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 1 (Tnfaip8l1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006244371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 1 (Tnfaip8l1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074502 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:9885791:9886351:-1 gene:ENSRNOG00000045999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9885791:9886351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133548 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatoma-derived growth factor-related protein 2 (Hdgfrp2), mRNA. // chr9 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000073011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9959298:9978830:-1 gene:ENSRNOG00000049142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AF355102 // GenBank // Rattus norvegicus hepatoma-derived growth factor 3 mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// BC071178 // GenBank // Rattus norvegicus hepatoma-derived growth factor, related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:91504 IMAGE:7100147), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC087695 // GenBank // Rattus norvegicus hepatoma-derived growth factor, related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:105333 IMAGE:7312553), complete cds. // chr9 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9959441:9962861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000058062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9963442:9978763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0
XM_001061702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromatin assembly factor 1, subunit A (p150) (Chaf1a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006226695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromatin assembly factor 1, subunit A (p150) (Chaf1a), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006244392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromatin assembly factor 1, subunit A (p150) (Chaf1a), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_343671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromatin assembly factor 1, subunit A (p150) (Chaf1a), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9988293:10013841:-1 gene:ENSRNOG00000046479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000058065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9988275:10013841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000072830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:10055588:10065298:-1 gene:ENSRNOG00000050318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC160924 // GenBank // Rattus norvegicus fibronectin type III and SPRY domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188678 IMAGE:8362685), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001106918 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type III and SPRY domain containing 1 (Fsd1), mRNA. // chr9 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000058060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:10055715:10066985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001108223 // RefSeq // Rattus norvegicus src homology 2 domain-containing transforming protein D (Shd), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:10075316:10081904:-1 gene:ENSRNOG00000049983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158646 // GenBank // Rattus norvegicus src homology 2 domain-containing transforming protein D, mRNA (cDNA clone MGC:187598 IMAGE:8364383), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:10075467:10081003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109421 // RefSeq // Rattus norvegicus Epstein-Barr virus induced 3 (Ebi3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:10096038:10100007:-1 gene:ENSRNOG00000050509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:10085179:10139214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_139336 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-glucuronate decarboxylase 1 (Uxs1), mRNA. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006244293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-glucuronate decarboxylase 1 (Uxs1), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-glucuronate decarboxylase 1 (Uxs1), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:10150139:10226865:-1 gene:ENSRNOG00000045605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF482705 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-glucuronate decarboxylase mRNA, complete cds. // chr9 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC086988 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-glucuronate decarboxylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93157 IMAGE:7192831), complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000058072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:10150836:10226865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001106930 // RefSeq // Rattus norvegicus EF hand calcium binding domain 1 (Efcab1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_358446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF hand calcium binding domain 1 (Efcab1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_358447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF hand calcium binding domain 1 (Efcab1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:93274702:93287932:-1 gene:ENSRNOG00000050091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ216783 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YD14 mRNA sequence. // chr11 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:93276068:93287810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
XM_006232136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid binding protein 5, epidermal (Fabp5), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 50 // 67 // 10 // 20 // 0 /// NM_145878 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 5, epidermal (Fabp5), mRNA. // chr20 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113735166:113738835:-1 gene:ENSRNOG00000049075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// FQ210725 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA23YJ14 mRNA sequence. // chr20 // 37 // 100 // 11 // 30 // 0 /// U13253 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley lipid-binding protein mRNA, complete cds. // chr20 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074647 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:31084864:31085258:-1 gene:ENSRNOG00000048535 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31049010:31085151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
XM_006232136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid binding protein 5, epidermal (Fabp5), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 50 // 67 // 10 // 20 // 0 /// NM_145878 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 5, epidermal (Fabp5), mRNA. // chr20 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113735166:113738835:-1 gene:ENSRNOG00000049075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// FQ210725 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA23YJ14 mRNA sequence. // chr20 // 37 // 100 // 11 // 30 // 0 /// U13253 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley lipid-binding protein mRNA, complete cds. // chr20 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074647 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:31084864:31085258:-1 gene:ENSRNOG00000048535 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31049010:31085151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001009503 // RefSeq // Rattus norvegicus profilin family, member 4 (Pfn4), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus profilin family, member 4 (Pfn4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:39849237:39859322:1 gene:ENSRNOG00000050386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AY682392 // GenBank // Rattus norvegicus profilin IV mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC107465 // GenBank // Rattus norvegicus profilin family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:124913 IMAGE:7453892), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:39845908:39883957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
XM_006239862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intersectin 2 (Itsn2), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000073870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:39701691:39789879:1 gene:ENSRNOG00000046741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000074150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:39701691:39789879:1 gene:ENSRNOG00000046741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000031886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:39697114:39789879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0
NM_012494 // RefSeq // Rattus norvegicus angiotensin II receptor, type 2 (Agtr2), mRNA. // chrX // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006257432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiotensin II receptor, type 2 (Agtr2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:119534835:119538664:1 gene:ENSRNOG00000050006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC161802 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensin II receptor, type 2, mRNA (cDNA clone MGC:187209 IMAGE:9102491), complete cds. // chrX // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:119535965:119537056:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_012897 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenergic, beta, receptor kinase 2 (Adrbk2), mRNA. // chr12 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:51457255:51510494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// M87855 // GenBank // Rattus norvegicus beta-adrenergic receptor kinase 2 (beta-ARK2) mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0
NM_001034078 // RefSeq // Rattus norvegicus chromobox homolog 8 (Cbx8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 8 (Cbx8), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107762003:107764441:-1 gene:ENSRNOG00000048113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099206 // GenBank // Rattus norvegicus chromobox homolog 8 (Pc class homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:116381 IMAGE:7384263), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107762246:107764427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
XM_001081757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 4 (Cbx4), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000075440 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:107803835:107809057:-1 gene:ENSRNOG00000046207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 4 (Cbx4), mRNA. // chr10 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// XR_358044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E3 SUMO-protein ligase CBX4-like (LOC100912558), misc_RNA. // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107803835:107815454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_002724580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 16 (Tbc1d16), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 16 (Tbc1d16), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000075171 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:107871279:107934334:-1 gene:ENSRNOG00000049758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107871279:107934334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006222888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative zinc finger protein 724-like (LOC501406), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative zinc finger protein 724-like (LOC501406), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070999 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:39953348:39957282:-1 gene:ENSRNOG00000046353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071758 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:39953348:39957282:-1 gene:ENSRNOG00000046353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_003749230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 43-like (LOC100909688), mRNA. // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000075247 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:106142139:106147092:-1 gene:ENSRNOG00000049662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001105949 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent-like 2 (C1ql2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:41484469:41486004:1 gene:ENSRNOG00000046863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:41479730:41486004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001134500 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC288978 (LOC288978), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC288978 (LOC288978), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC288978 (LOC288978), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC288978 (LOC288978), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071437 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:41264900:41329152:1 gene:ENSRNOG00000045570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:41294717:41362844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_031115 // RefSeq // Rattus norvegicus secretin receptor (Sctr), mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000072088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:41160339:41201369:1 gene:ENSRNOG00000049766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// BC081781 // GenBank // Rattus norvegicus secretin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:93381 IMAGE:7189388), complete cds. // chr13 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:41154643:41201120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 68 // 24 // 26 // 0
XM_006227253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative protein SSX6-like (LOC102551192), mRNA. // chrX // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// XM_006256606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative protein SSX6-like (LOC102551192), mRNA. // chrX // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// XM_006256607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative protein SSX6-like (LOC102551397), mRNA. // chrX // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_001108058 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm acrosome associated 5 (Spaca5), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:907618:910801:-1 gene:ENSRNOG00000045622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:888171:910801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106878 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd70 molecule (Cd70), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8844883:8848026:1 gene:ENSRNOG00000051015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8845036:8847949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191803 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 14 (Tnfsf14), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006244284 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 14 (Tnfsf14), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8768724:8772374:1 gene:ENSRNOG00000047730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8768724:8805041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_016994 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 3 (C3), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000073042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8728465:8754412:1 gene:ENSRNOG00000046834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000075494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8728465:8754405:1 gene:ENSRNOG00000046834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000022327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8728506:8754372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_199399 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 108 (Gpr108), mRNA. // chr9 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// XM_006244286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 108 (Gpr108), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000075403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:8711674:8722083:1 gene:ENSRNOG00000046128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC061996 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 108, mRNA (cDNA clone MGC:72562 IMAGE:5599699), complete cds. // chr9 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// GENSCAN00000022334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8711689:8725571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_001044253 // RefSeq // Rattus norvegicus PIF1 5-to-3 DNA helicase (Pif1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000021265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:70811353:70818568:1 gene:ENSRNOG00000015878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// DQ489562 // GenBank // Rattus norvegicus Pif1/Rrm3 DNA-helicase-like protein (Pif1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000056359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:70811354:70827837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT053524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_131914 // RefSeq // Rattus norvegicus caveolin 2 (Cav2), mRNA. // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45179465:45186995:1 gene:ENSRNOG00000006411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF439780 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin-2 mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0 /// BC062059 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin 2, mRNA (cDNA clone MGC:72322 IMAGE:5598269), complete cds. // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// FQ209775 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA3YJ04 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:45179642:45188403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT039199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001107941 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 12 (Dcaf12), mRNA. // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000038653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:131415634:131419442:-1 gene:ENSRNOG00000023458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:131417479:131433751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT060164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
XM_006227526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 2 (Dcaf12l2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006257510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 12-like 2 (Dcaf12l2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047171 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:130906504:130907916:-1 gene:ENSRNOG00000031533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:130906504:130907916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006227557 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group protein B4-like (LOC102554287), partial mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006257513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group protein B4-like (LOC102554287), partial mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006227555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus teneurin transmembrane protein 1 (Tenm1), mRNA. // chrX // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:129260264:129432678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000025373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:129010129:129101941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 31 // 10 // 10 // 0
NM_001191756 // RefSeq // Rattus norvegicus THO complex 2 (Thoc2), mRNA. // chrX // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XR_362562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus THO complex 2 (Thoc2), transcript variant X3, misc_RNA. // chrX // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:128246550:128361038:-1 gene:ENSRNOG00000007315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000003864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:128264338:128373264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT060155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
GENSCAN00000010363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:127919900:127982937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 79 // 56 // 11 // 14 // 0
XM_006227525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548479 (LOC102548479), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029433 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:X:59014348:59014905:1 gene:ENSRNOG00000028202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:59014348:59014905:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT058833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001030033 // RefSeq // Rattus norvegicus C1GALT1-specific chaperone 1 (C1galt1c1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006257487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1GALT1-specific chaperone 1 (C1galt1c1), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000003449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:125006189:125010692:-1 gene:ENSRNOG00000002536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC099818 // GenBank // Rattus norvegicus C1GALT1-specific chaperone 1, mRNA (cDNA clone MGC:124680 IMAGE:7930810), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ209423 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YN02 mRNA sequence. // chrX // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000053008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:125006472:125012129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT060150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT060151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001106951 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin 4B (Cul4b), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006257490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cullin 4B (Cul4b), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000065023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124917170:124954871:-1 gene:ENSRNOG00000002585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:124917957:124988408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT060147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017068 // RefSeq // Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein 2 (Lamp2), mRNA. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124809053:124852469:-1 gene:ENSRNOG00000000164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC061990 // GenBank // Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72499 IMAGE:5599402), complete cds. // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006257486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein 2 (Lamp2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000053010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:124809456:124852361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT060143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT060134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT060146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_182822 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 255A (Tmem255a), mRNA. // chrX // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006257479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 255A (Tmem255a), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000036472 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:X:124488633:124550919:-1 gene:ENSRNOG00000028085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AY327410 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical protein mRNA, complete cds. // chrX // 91 // 84 // 29 // 32 // 0 /// NONRATT060132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:124488633:124560641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 71 // 71 // 27 // 38 // 1
NM_001024901 // RefSeq // Rattus norvegicus reproductive homeobox 12 (Rhox12), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124332604:124337927:-1 gene:ENSRNOG00000040033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// DQ058659 // GenBank // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 12 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124301867:124337927:-1 gene:ENSRNOG00000040033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 67 // 46 // 8 // 12 // 0 /// NONRATT060131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:124326785:124337919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001024874 // RefSeq // Rattus norvegicus reproductive homeobox 9 (Rhox9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// DQ058656 // GenBank // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 9 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006257483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reproductive homeobox 9-like (LOC100364002), mRNA. // chrX // 61 // 75 // 11 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124086011:124088263:-1 gene:ENSRNOG00000050457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 61 // 75 // 11 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000009875 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:123932528:123934064:-1 gene:ENSRNOG00000007526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT060127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:124086011:124138874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 56 // 67 // 9 // 16 // 0 /// GENSCAN00000034116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:123910060:123934064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001025654 // RefSeq // Rattus norvegicus reproductive homeobox 7 (Rhox7), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124063140:124079732:-1 gene:ENSRNOG00000031534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// DQ058654 // GenBank // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 7 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006257476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 2 (Rhox2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 67 // 64 // 12 // 18 // 0 /// NM_001025746 // RefSeq // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 2 (Rhox2), mRNA. // chrX // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// XM_006227176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich extensin-like protein EPR1-like (LOC687652), partial mRNA. // chrX // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000034083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:123980343:123986752:-1 gene:ENSRNOG00000040013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// DQ058650 // GenBank // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 2 mRNA, complete cds. // chrX // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT060128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT060129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001025746 // RefSeq // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 2 (Rhox2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000034083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:123980343:123986752:-1 gene:ENSRNOG00000040013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// DQ058650 // GenBank // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 2 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:123976664:123986752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT060128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT060129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001135607 // RefSeq // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 3 (Rhox3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006257477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 3 (Rhox3), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006257478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 3 (Rhox3), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000041904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124657832:124662282:-1 gene:ENSRNOG00000040010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ058651 // GenBank // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 3 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT060134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT060140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:124644982:124662062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001024889 // RefSeq // Rattus norvegicus reproductive homeobox 4G (Rhox4g), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124646979:124652742:-1 gene:ENSRNOG00000027994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ058652 // GenBank // Rattus norvegicus reproductive homeobox on X chromosome 4 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT060134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT060139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:124644982:124662062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NONRATT060134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001109315 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1560927 (RGD1560927), mRNA. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:124616505:124618758:-1 gene:ENSRNOG00000040008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ221578 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA34YF04 mRNA sequence. // chrX // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:124617449:124618662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT060134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT060137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT060138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0