NM_001000515 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 856 (Olr856), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141301171:141302109:-1 gene:ENSRNOG00000031027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141511814:141512752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141301171:141302109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000583 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 857 (Olr857), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141524717:141525665:-1 gene:ENSRNOG00000048280 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141313647:141314595:-1 gene:ENSRNOG00000048621 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141524717:141525584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141313647:141314514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_001000822 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 860 (Olr860), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000051470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141370080:141371027:-1 gene:ENSRNOG00000045867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141370080:141371027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0 /// NONRATT045359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0
NM_001001071 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 862 (Olr862), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000072067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141388949:141389896:-1 gene:ENSRNOG00000046223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000049900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141388949:141394394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT045360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001000410 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 865 (Olr865), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141596575:141597702:-1 gene:ENSRNOG00000049089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141596575:141630490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000821 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 868 (Olr868), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141711463:141712410:-1 gene:ENSRNOG00000047897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141706944:141712410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000413 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 869 (Olr869), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000048274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141737979:141738926:-1 gene:ENSRNOG00000048408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141735823:141738926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 95 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT045365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001107968 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 691 (Zfp691), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142027715:142032377:-1 gene:ENSRNOG00000007398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC166565 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 691, mRNA (cDNA clone MGC:188194 IMAGE:7316740), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT045366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_006225491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus erythroblast membrane-associated protein (Ermap), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus erythroblast membrane-associated protein (Ermap), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000039305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142037663:142049164:-1 gene:ENSRNOG00000000335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142028298:142049198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001134627 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1563015 (RGD1563015), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008726 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:142065488:142076407:-1 gene:ENSRNOG00000006658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000039709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142066301:142080124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001107969 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to chromosome 1 open reading frame 50 (RGD1564804), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142085034:142091328:-1 gene:ENSRNOG00000027455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ209773 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA3YK19 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// FQ234867 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YG01 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142085676:142091313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT045370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001039010 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphopantothenoylcysteine synthetase (Ppcs), mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000011392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142276594:142279846:-1 gene:ENSRNOG00000008572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC099208 // GenBank // Rattus norvegicus phosphopantothenoylcysteine synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:116383 IMAGE:7384489), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142269871:142279780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_146988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal modification protein rimK-like family member A (Rimkla), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142327166:142350279:-1 gene:ENSRNOG00000008625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142327166:142350279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// NONRATT045389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_022284 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase activator 2B (Guca2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142497885:142499935:-1 gene:ENSRNOG00000008979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U41322 // GenBank // Rattus norvegicus uroguanylin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U73898 // GenBank // Rattus norvegicus preprouroguanylin mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// U75186 // GenBank // Rattus norvegicus prepro-uroguanylin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142498054:142499899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT045390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box O6 (Foxo6), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box O6 (Foxo6), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000050941 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:142994406:143013378:-1 gene:ENSRNOG00000032639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142994671:143013378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001134873 // RefSeq // Rattus norvegicus CTP synthase 1 (Ctps1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006238781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTP synthase 1 (Ctps1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000013899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143259189:143288320:-1 gene:ENSRNOG00000009963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC161954 // GenBank // Rattus norvegicus CTP synthase, mRNA (cDNA clone MGC:187755 IMAGE:9027103), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT045393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143261980:143285287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
XM_001053765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 4 (Kcnq4), partial mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014231 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:143423766:143472408:-1 gene:ENSRNOG00000010576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143382404:143472489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0
U17607 // GenBank // Rattus norvegicus CCAAT binding transcription factor CBF subunit C mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// NM_012866 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor-Y gamma (Nfyc), mRNA. // chr5 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// XM_006238787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear transcription factor-Y gamma (Nfyc), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000056651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143482583:143542254:-1 gene:ENSRNOG00000010735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// BC093619 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear transcription factor-Y gamma, mRNA (cDNA clone MGC:105489 IMAGE:7314492), complete cds. // chr5 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// NONRATT045399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000005737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143482027:143524350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// NONRATT045403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// NONRATT045400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1 /// NONRATT045402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// NONRATT045401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NR_031839 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-30c-1 (Mir30c-1), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000053690 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:143494757:143494845:-1 gene:ENSRNOG00000035567 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT045399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT045403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// rno-mir-30c-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000866 Rattus norvegicus miR-30c-1 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NR_031840 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-30e (Mir30e), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053763 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:143497752:143497843:-1 gene:ENSRNOG00000035640 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-30e // miRBase Micro RNA Database // MI0000867 Rattus norvegicus miR-30e stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107973 // RefSeq // Rattus norvegicus exonuclease 5 (Exo5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143643134:143646451:-1 gene:ENSRNOG00000037432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143643478:143644599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 69 (Zfp69), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 69 (Zfp69), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030016 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:143651014:143656994:-1 gene:ENSRNOG00000028662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001100669 // RefSeq // Rattus norvegicus small ArfGAP2 (Smap2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143678526:143724570:-1 gene:ENSRNOG00000011421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161927 // GenBank // Rattus norvegicus small ArfGAP2, mRNA (cDNA clone MGC:187696 IMAGE:8374170), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143679710:143726968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT045407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENSRNOT00000015278 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:143726192:143726968:-1 gene:ENSRNOG00000011484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143679710:143726968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
NM_001107974 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc metallopeptidase STE24 (Zmpste24), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143777121:143808982:-1 gene:ENSRNOG00000012054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211274 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA13YP07 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143777568:143808661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NONRATT045410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_003754095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 2 (Tmco2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016492 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:143813397:143817335:-1 gene:ENSRNOG00000012340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000023633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143813397:143817548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_002726636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rearranged L-myc fusion (Rlf), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_233485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rearranged L-myc fusion (Rlf), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143900361:143938190:-1 gene:ENSRNOG00000027921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143900361:143955038:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_022383 // RefSeq // Rattus norvegicus CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast) (Cap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast) (Cap1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144350205:144376518:-1 gene:ENSRNOG00000013492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089801 // GenBank // Rattus norvegicus CAP, adenylate cyclase-associated protein 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:108691 IMAGE:7381845), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L11930 // GenBank // Rattus norvegicus cyclase-associated protein homologue (MCH1) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT045419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144351221:144429182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT045421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT045423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT045424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT045425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001106683 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 2A (Mfsd2a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144433450:144448324:-1 gene:ENSRNOG00000014008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC161915 // GenBank // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:187650 IMAGE:8369688), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144433836:144448168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT045429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001047868 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase E (cyclophilin E) (Ppie), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000043799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144615833:144625430:-1 gene:ENSRNOG00000014762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// BC158560 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase E (cyclophilin E), mRNA (cDNA clone MGC:187240 IMAGE:9102303), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144615833:144625425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT045431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
ENSRNOT00000048224 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:144626641:144627122:-1 gene:ENSRNOG00000034099 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000057980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144626826:144627122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001109432 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 8a (Bmp8a), mRNA. // chr5 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000045922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144797125:144823640:-1 gene:ENSRNOG00000030155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144797729:144997304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT045435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001012221 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-oxoacid CoA transferase 2A (Oxct2a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083681 // GenBank // Rattus norvegicus 3-oxoacid CoA transferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:94532 IMAGE:7135892), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144797729:144997304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000057978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144593378:144615067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT043565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135758 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-actin crosslinking factor 1 (Macf1), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 96 // 96 // 0 /// XM_006238805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule-actin crosslinking factor 1 (Macf1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 97 // 97 // 0 /// XM_006238825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule-actin crosslinking factor 1 (Macf1), transcript variant X21, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 96 // 96 // 0 /// ENSRNOT00000045400 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:144830885:145151309:-1 gene:ENSRNOG00000016047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 92 // 92 // 0 /// GENSCAN00000048664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144797729:144997304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 88 // 88 // 0 /// NONRATT045436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 23 // 23 // 24 // 104 // 1 /// NONRATT045439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 11 // 11 // 11 // 104 // 1
NM_001291383 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC100361083 (LOC100361083), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144887273:144890597:-1 gene:ENSRNOG00000050727 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144797729:144997304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001030052 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006238827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// XM_006238828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000036389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:145178506:145195972:-1 gene:ENSRNOG00000026646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000042985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215419281:215419757:1 gene:ENSRNOG00000029339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// BC168721 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:188795 IMAGE:6920432), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000049342 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:113694684:113712891:-1 gene:ENSRNOG00000030585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 87 // 100 // 34 // 39 // 0 /// NONRATT045450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT045451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 77 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:145178612:145221898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// NONRATT045452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
NM_001030054 // RefSeq // Rattus norvegicus akirin 1 (Akirin1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:145205746:145221146:-1 gene:ENSRNOG00000026610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:145178612:145221898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001107978 // RefSeq // Rattus norvegicus UTP11-like, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, (yeast) (Utp11l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146437400:146452289:-1 gene:ENSRNOG00000007174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC168964 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CGI-94 protein, mRNA (cDNA clone MGC:189285 IMAGE:7130611), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000057471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146437888:146452221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT045455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT045458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001108678 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1559909 (RGD1559909), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146614723:146615760:-1 gene:ENSRNOG00000042421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146615030:146615701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT045459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT045461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
XM_006238913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mannosidase, endo-alpha-like (Maneal), mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000038055 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:146622170:146627751:-1 gene:ENSRNOG00000025349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146622170:146627751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_001025050 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle associated 8 (Cdca8), mRNA. // chrU // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000048293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146680981:146700100:-1 gene:ENSRNOG00000031431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// BC079274 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle associated 8, mRNA (cDNA clone MGC:94394 IMAGE:7134027), complete cds. // chrU // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC079293 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle associated 8, mRNA (cDNA clone MGC:94429 IMAGE:7134482), complete cds. // chrU // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000057461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146681499:146691715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT045463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 97 // 76 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT045466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// NONRATT045465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_001031647 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, light intermediate chain 1 (Dnali1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146821951:146830810:-1 gene:ENSRNOG00000024957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC099087 // GenBank // Rattus norvegicus dynein, axonemal, light intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:116176 IMAGE:7455645), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146823395:146830785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001077671 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 12A (Zc3h12a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 12A (Zc3h12a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146878973:146887760:-1 gene:ENSRNOG00000009131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127516 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 12A, mRNA (cDNA clone MGC:156729 IMAGE:7102954), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146873831:146886920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT045466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT045470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146154999:146186551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001162535 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain containing 21 (Sh3d21), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000045841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147930891:147945520:-1 gene:ENSRNOG00000024566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147931325:148035559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT045474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001009693 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor associated protein 3 (Thrap3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147947769:147989301:-1 gene:ENSRNOG00000009977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088415 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:94882 IMAGE:7110766), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147931325:148035559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT045478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001109438 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP7 domain containing 1 (Map7d1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148018369:148042648:-1 gene:ENSRNOG00000010237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ216284 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YK22 mRNA sequence. // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147931325:148035559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT045481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT045484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT045487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT045488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001108680 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylhydrolase like 2 (Adprhl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148103569:148108843:-1 gene:ENSRNOG00000010849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC159416 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylhydrolase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:188700 IMAGE:8368851), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148104089:148108810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT045491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001011977 // RefSeq // Rattus norvegicus tektin 2 (testicular) (Tekt2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006238860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tektin 2 (testicular) (Tekt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148109214:148112751:-1 gene:ENSRNOG00000011033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC078990 // GenBank // Rattus norvegicus tektin 2 (testicular), mRNA (cDNA clone MGC:93888 IMAGE:7112575), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148109297:148232653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001271193 // RefSeq // Rattus norvegicus argonaute RISC catalytic component 3 (Ago3), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000037178 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:148131830:148191160:-1 gene:ENSRNOG00000034269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000042371 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:148131830:148191172:-1 gene:ENSRNOG00000034269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000071137 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:148156577:148191172:-1 gene:ENSRNOG00000034269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000041706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148109297:148232653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1
NM_001191765 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2C, 1 (Eif2c1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000037728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148214328:148246407:-1 gene:ENSRNOG00000027320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT045500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148233094:148344385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1 /// GENSCAN00000041706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148109297:148232653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1
NM_001106686 // RefSeq // Rattus norvegicus argonaute RISC catalytic component 4 (Ago4), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000035373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148272608:148328239:-1 gene:ENSRNOG00000025596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006227682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein argonaute-4-like (LOC102554576), mRNA. // chr5 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// NONRATT045501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000005646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148233094:148344385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// GENSCAN00000039346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:21120675:21141116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001191764 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor AP-2 epsilon (Tfap2e), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148511487:148532318:-1 gene:ENSRNOG00000027595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148512010:148595988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_053543 // RefSeq // Rattus norvegicus neurochondrin (Ncdn), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurochondrin (Ncdn), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurochondrin (Ncdn), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148539983:148549743:-1 gene:ENSRNOG00000011751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087000 // GenBank // Rattus norvegicus neurochondrin, mRNA (cDNA clone MGC:93259 IMAGE:7190905), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB006461 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NORBIN, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148512010:148595988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT045504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
GENSCAN00000005648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148512010:148595988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
NM_001107982 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 4 (Zmym4), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006238874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 4 (Zmym4), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 4 (Zmym4), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148648498:148766683:-1 gene:ENSRNOG00000012397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148650776:148690445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT045506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000012172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148832036:148843018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000042573 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:148832036:148832826:-1 gene:ENSRNOG00000031602 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_001107983 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 1 (Zmym1), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 1 (Zmym1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148876980:148894226:-1 gene:ENSRNOG00000013855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC160845 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:8362201), partial cds. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_021654 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 4 (Gja4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:149142704:149145235:-1 gene:ENSRNOG00000014357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078837 // GenBank // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:93465 IMAGE:7128770), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086576 // GenBank // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:105441 IMAGE:7306623), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:149143213:149144214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019240 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, beta 3 (Gjb3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:149159320:149160132:-1 gene:ENSRNOG00000014372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:149159320:149160132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_053984 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, beta 4 (Gjb4), mRNA. // chr5 // 81 // 75 // 17 // 21 // 0 /// X76168 // GenBank // R.norvegicus mRNA for connexin 30.3. // chr5 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// XM_006238844 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gap junction protein, beta 4 (Gjb4), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT045520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0
NM_019241 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, beta 5 (Gjb5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:149190332:149191313:-1 gene:ENSRNOG00000014408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:149190332:149227216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109463 // RefSeq // Rattus norvegicus high-mobility group box 4 (Hmgb4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150186055:150186600:-1 gene:ENSRNOG00000032889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150146305:150186600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT045525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191612 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 362 (Zfp362), mRNA. // chr5 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000007761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150689530:150711442:-1 gene:ENSRNOG00000043364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000008887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150501908:150520675:-1 gene:ENSRNOG00000005886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// XM_006225535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 20 (Zscan20), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// XM_006225537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 20 (Zscan20), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// XM_006238979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 20 (Zscan20), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// XM_006238981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 20 (Zscan20), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150497377:150587222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150688583:150723050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT045534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001108682 // RefSeq // Rattus norvegicus toll-like receptor 12 (Tlr12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150531666:150534380:-1 gene:ENSRNOG00000042455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150497377:150587222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017122 // RefSeq // Rattus norvegicus hippocalcin (Hpca), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006238921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hippocalcin (Hpca), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151030063:151038262:-1 gene:ENSRNOG00000006979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AY442172 // GenBank // Rattus norvegicus hippocalcin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC087632 // GenBank // Rattus norvegicus hippocalcin, mRNA (cDNA clone MGC:105450 IMAGE:7319524), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// D12573 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neuron specific calcium-binding protein hippocalcin, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT045543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151030750:151043985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001134628 // RefSeq // Rattus norvegicus S100P binding protein (S100pbp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006238957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S100P binding protein (S100pbp), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006238960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S100P binding protein (S100pbp), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151069683:151109626:-1 gene:ENSRNOG00000007099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151071207:151102031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001134629 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to mKIAA1522 protein (RGD1561149), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1522 protein (RGD1561149), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151141119:151147606:-1 gene:ENSRNOG00000008113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151141478:151158013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001107913 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 8a (Zbtb8a), mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000010983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151276506:151303640:-1 gene:ENSRNOG00000008300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC161892 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 8a, mRNA (cDNA clone MGC:187470 IMAGE:7191093), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151276831:151314444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1
NM_001109265 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 8b (Zbtb8b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151348210:151355100:-1 gene:ENSRNOG00000026898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151349411:151355054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT045553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007650 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 3 (Tssk3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 3 (Tssk3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000011887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151411347:151412996:-1 gene:ENSRNOG00000008693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY346102 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 22C (Stk22c) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151411412:151416109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT045554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001025409 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 1 (Hdac1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000012854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151445686:151472652:-1 gene:ENSRNOG00000009568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC097943 // GenBank // Rattus norvegicus histone deacetylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:116064 IMAGE:7458532), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC107476 // GenBank // Rattus norvegicus histone deacetylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:125110 IMAGE:7443793), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC059156 // GenBank // Rattus norvegicus histone deacetylase 1 (predicted), mRNA (cDNA clone IMAGE:6921765). // chr5 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1 /// NONRATT045556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151446229:151472634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 14 // 16 // 1
NM_001015029 // RefSeq // Rattus norvegicus karyopherin alpha 6 (importin alpha 7) (Kpna6), mRNA. // chr5 // 98 // 100 // 52 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000000139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151581763:151594918:-1 gene:ENSRNOG00000000127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 100 // 52 // 53 // 0 /// AY779030 // GenBank // Rattus norvegicus karyopherin alpha 6 (Kpna6) mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 100 // 52 // 53 // 0 /// BC105813 // GenBank // Rattus norvegicus karyopherin alpha 6 (importin alpha 7), mRNA (cDNA clone MGC:124892 IMAGE:7112648), complete cds. // chr5 // 98 // 100 // 52 // 53 // 0 /// GENSCAN00000026576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151582266:151725382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 89 // 46 // 47 // 0 /// NONRATT045564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 20 // 53 // 1 /// NONRATT045565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 15 // 53 // 1 /// NONRATT045566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 13 // 53 // 1
NM_001100709 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein tyrosine kinase (Lck), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006238933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein tyrosine kinase (Lck), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151480223:151491490:-1 gene:ENSRNOG00000009705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC160881 // GenBank // Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:188286 IMAGE:7381544), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151480636:151491482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT045559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT045560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT045561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT045562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT045563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001014192 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 39b (Tmem39b), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 53 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000032558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151617692:151634824:-1 gene:ENSRNOG00000023746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 53 // 53 // 0 /// BC082025 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 39b, mRNA (cDNA clone MGC:95156 IMAGE:7129968), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 53 // 53 // 0 /// GENSCAN00000026576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151582266:151725382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 95 // 50 // 52 // 0 /// NONRATT045569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 11 // 55 // 1
NM_130405 // RefSeq // Rattus norvegicus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1 (Khdrbs1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151655537:151680547:-1 gene:ENSRNOG00000046794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF305619 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear RNA binding protein Sam68 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AF393783 // GenBank // Rattus norvegicus src associated in mitosis SAM68 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC061987 // GenBank // Rattus norvegicus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:72326 IMAGE:5599491), complete cds. // chr5 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151582266:151725382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT045571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT045572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_013064 // RefSeq // Rattus norvegicus hypocretin (orexin) receptor 1 (Hcrtr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152064507:152073884:-1 gene:ENSRNOG00000013838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF041244 // GenBank // Rattus norvegicus orexin receptor-1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152065146:152073953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053582 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulointerstitial nephritis antigen-like 1 (Tinagl1), mRNA. // chr5 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152101199:152110578:-1 gene:ENSRNOG00000013179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB050717 // GenBank // Rattus norvegicus gis5 mRNA for glucocorticoid-inducible protein, complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// BC097299 // GenBank // Rattus norvegicus tubulointerstitial nephritis antigen-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:114289 IMAGE:7445067), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152101659:152110574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT045578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT045579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT045580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
XM_001062262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to ornithine decarboxylase (RGD1562036), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_232777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to ornithine decarboxylase (RGD1562036), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033929 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:152151354:152161965:-1 gene:ENSRNOG00000024788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071585 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:152150793:152161965:-1 gene:ENSRNOG00000024788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152119255:152161965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001031656 // RefSeq // Rattus norvegicus serine incorporator 2 (Serinc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152187838:152210009:-1 gene:ENSRNOG00000012989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC099093 // GenBank // Rattus norvegicus serine incorporator 2, mRNA (cDNA clone MGC:116219 IMAGE:7457983), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// DQ103709 // GenBank // Rattus norvegicus serine incorporator 2 (Serinc2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152188247:152224881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NONRATT045585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT045586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109267 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 17 (Zcchc17), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152252915:152294518:-1 gene:ENSRNOG00000012266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152254148:152283797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000016257 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:152331463:152332076:-1 gene:ENSRNOG00000012102 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 77 // 96 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152330761:152332076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 57 // 11 // 13 // 0
NM_053893 // RefSeq // Rattus norvegicus syndecan 3 (Sdc3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000048781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152628005:152658676:1 gene:ENSRNOG00000011927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// U52825 // GenBank // Rattus norvegicus syndecan-3 mRNA, complete cds. // chr5 // 86 // 61 // 19 // 22 // 0 /// U73184 // GenBank // Rattus norvegicus N-syndecan mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152628046:152657120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108684 // RefSeq // Rattus norvegicus pumilio RNA-binding family member 1 (Pum1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000015831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152491280:152616529:1 gene:ENSRNOG00000011709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000032186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152540108:152615180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0
NONRATT043725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT043725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_006225646 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Na+/K+ transporting ATPase interacting 1 (Nkain1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Na+/K+ transporting ATPase interacting 1 (Nkain1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056229 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:152374954:152381791:1 gene:ENSRNOG00000011445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152350484:152397872:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT043724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT043723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001191575 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, U (Ptpru), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000036148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:153601583:153675513:-1 gene:ENSRNOG00000013515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U66566 // GenBank // Rattus norvegicus receptor type protein tyrosine phosphatase psi (RPTPpsi) mRNA, partial cds. // chr5 // 85 // 42 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000038926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:153580266:153675376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_012617 // RefSeq // Rattus norvegicus opioid receptor, delta 1 (Oprd1), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:153962767:153997858:-1 gene:ENSRNOG00000010531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D16348 // GenBank // Rattus norvegicus ROR-A mRNA for opioid receptor A, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// U00475 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley delta opioid receptor (dor1) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:153962960:153997753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047099 // RefSeq // Rattus norvegicus YTH domain family, member 2 (Ythdf2), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154038417:154062397:-1 gene:ENSRNOG00000010892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// AB259152 // GenBank // Rattus norvegicus ZH3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC166407 // GenBank // Rattus norvegicus YTH domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187247 IMAGE:7453874), complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154033223:154075469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001109268 // RefSeq // Rattus norvegicus glucocorticoid modulatory element binding protein 1 (Gmeb1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154078313:154108562:-1 gene:ENSRNOG00000010910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC158640 // GenBank // Rattus norvegicus glucocorticoid modulatory element binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187572 IMAGE:8362091), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ214484 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YG24 mRNA sequence. // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000050694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154078434:154108531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001270959 // RefSeq // Rattus norvegicus GPN-loop GTPase 2 (Gpn2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155495838:155503005:1 gene:ENSRNOG00000007083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155486208:155503115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT043779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XM_001065500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 3 (Gpatch3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_342933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 3 (Gpatch3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155486208:155495158:1 gene:ENSRNOG00000007097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155486208:155503115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033332 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:155476901:155477258:1 gene:ENSRNOG00000026841 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155465408:155477258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
NM_057133 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2 (Nr0b2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155465275:155468590:1 gene:ENSRNOG00000007229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088117 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 0, group B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:108613 IMAGE:7324177), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D86580 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for small heterodimer partner homolog, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155465408:155477258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001004268 // RefSeq // Rattus norvegicus keratinocyte differentiation factor 1 (Kdf1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to chromosome 1 open reading frame 172 (RGD1303271), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006239018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to chromosome 1 open reading frame 172 (RGD1303271), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006239114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911383 (LOC100911383), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006239117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911383 (LOC100911383), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000040785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156105382:156116410:1 gene:ENSRNOG00000007572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155439212:155441431:1 gene:ENSRNOG00000050577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC079148 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 1 open reading frame 172, mRNA (cDNA clone MGC:94165 IMAGE:7128510), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156113503:156115985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155439212:155441431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000010487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155354242:155361518:1 gene:ENSRNOG00000007888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC158863 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 46, member B, mRNA (cDNA clone MGC:188454 IMAGE:7935820), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000043227 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:15937518:15939702:1 gene:ENSRNOG00000029763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:15937675:15971432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 66 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000042837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155354399:155365497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT043775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0
NM_012652 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE1, cation proton antiporter 1), member 1 (Slc9a1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155237482:155290406:1 gene:ENSRNOG00000007982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M85299 // GenBank // Rat sodium/hydrogen exchange protein-isoform 1 (NHE-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF462063 // GenBank // Rattus norvegicus chloride-dependent sodium/hydrogen exchanger (Nhe) mRNA, complete cds. // chr5 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000042835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155238243:155289056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001107909 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 6 (Map3k6), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239021 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 6 (Map3k6), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 6 (Map3k6), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155101637:155113501:1 gene:ENSRNOG00000008936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155101908:155113212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001271259 // RefSeq // Rattus norvegicus sialomucin core protein 24-like (LOC100359977), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialomucin core protein 24-like (LOC100359977), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155079244:155082300:1 gene:ENSRNOG00000009505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialomucin core protein 24-like (LOC100359977), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000050684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155062587:155082695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT043769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001013167 // RefSeq // Rattus norvegicus WAS protein family, member 2 (Wasf2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000067801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155028091:155046935:1 gene:ENSRNOG00000009805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC089207 // GenBank // Rattus norvegicus WAS protein family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:105905 IMAGE:7135528), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000050678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155028136:155046935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT043767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
NM_001025737 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B (Smpdl3b), mRNA. // chrU // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154592756:154614208:-1 gene:ENSRNOG00000042326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC097983 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B, mRNA (cDNA clone MGC:116117 IMAGE:7443444), complete cds. // chrU // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154593171:154607903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT045617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT045618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
NM_024145 // RefSeq // Rattus norvegicus feline Gardner-Rasheed sarcoma viral oncogene (Fgr), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// XM_006239079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus feline Gardner-Rasheed sarcoma viral oncogene (Fgr), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154839096:154866416:1 gene:ENSRNOG00000009912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062025 // GenBank // Rattus norvegicus Gardner-Rasheed feline sarcoma viral (v-fgr) oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:72428 IMAGE:5623501), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// X57018 // GenBank // R.norvegicus FGR mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154847037:154865745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT043764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
GENSCAN00000050680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154739617:154740681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_021582 // RefSeq // Rattus norvegicus replication protein A2 (Rpa2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus replication protein A2 (Rpa2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154624086:154634563:1 gene:ENSRNOG00000013005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079180 // GenBank // Rattus norvegicus replication protein A2, mRNA (cDNA clone MGC:94218 IMAGE:7130711), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154623372:154634018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT043760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT043758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001013168 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 8 (Dnajc8), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000017740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154393926:154411983:1 gene:ENSRNOG00000013255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC081863 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:93685 IMAGE:7191298), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154394042:154411372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// NONRATT043745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// NONRATT043747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// NONRATT043749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// NONRATT043744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// NONRATT043748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// NONRATT043752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001107910 // RefSeq // Rattus norvegicus EYA transcriptional coactivator and phosphatase 3 (Eya3), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000056170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154501299:154581358:1 gene:ENSRNOG00000010396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000014482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154513543:154579225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0
NM_053321 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet-activating factor receptor (Ptafr), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet-activating factor receptor (Ptafr), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154421912:154443795:1 gene:ENSRNOG00000013231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC072491 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-activating factor receptor, mRNA (cDNA clone MGC:91594 IMAGE:7097307), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ233765 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YI10 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// U04740 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley platelet-activating factor receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000014489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154440583:154441608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT043754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025624 // RefSeq // Rattus norvegicus high mobility group nucleosome binding domain 2 (Hmgn2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000067624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:33775173:33776354:1 gene:ENSRNOG00000043004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 97 // 25 // 30 // 0 /// BC099178 // GenBank // Rattus norvegicus high mobility group nucleosomal binding domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:116347 IMAGE:7383003), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC099815 // GenBank // Rattus norvegicus high mobility group nucleosomal binding domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:124667 IMAGE:7929654), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ219745 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YE17 mRNA sequence. // chr16 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// XM_006221156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-histone chromosomal protein HMG-17-like (LOC102549131), partial mRNA. // chr16 // 55 // 94 // 16 // 29 // 0 /// XM_006248440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-histone chromosomal protein HMG-17-like (LOC102549131), partial mRNA. // chr16 // 55 // 94 // 16 // 29 // 0 /// NONRATT045664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:33775288:33775560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 39 // 8 // 12 // 0 /// FQ214356 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YC22 mRNA sequence. // chr16 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// NONRATT045665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001011978 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrodolichyl diphosphate synthase (Dhdds), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_354305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrodolichyl diphosphate synthase (Dhdds), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155884756:155912508:-1 gene:ENSRNOG00000014665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085875 // GenBank // Rattus norvegicus dehydrodolichyl diphosphate synthase, mRNA (cDNA clone MGC:94641 IMAGE:7191470), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT045668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155875298:155912041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT045669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT045670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT045671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001109269 // RefSeq // Rattus norvegicus lin-28 homolog A (C. elegans) (Lin28a), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// XM_006239061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-28 homolog A (C. elegans) (Lin28a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// XM_006240815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein lin-28 homolog A-like (LOC503116), mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000058500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155921629:155935517:-1 gene:ENSRNOG00000038409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000026662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155920245:155935442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000006286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6136720:6144666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_053983 // RefSeq // Rattus norvegicus CD52 molecule (Cd52), mRNA. // chr5 // 77 // 96 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156008870:156010423:-1 gene:ENSRNOG00000015403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ221815 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA31YI11 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156009044:156010359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106688 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain binding glutamate-rich protein like 3 (Sh3bgrl3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156043499:156044872:-1 gene:ENSRNOG00000015967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167002 // GenBank // Rattus norvegicus SH3 domain binding glutamic acid-rich protein-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:189168 IMAGE:7443117), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156043840:156086406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001080151 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 85kDa (Cep85), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156045929:156165672:-1 gene:ENSRNOG00000016249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC129108 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 21, mRNA (cDNA clone MGC:156732 IMAGE:7104019), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT045677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156043840:156086406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156118742:156205692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_001066690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Uromoduilin-like (Umodl), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_002729550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Uromoduilin-like (Umodl), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000056143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156170768:156182776:-1 gene:ENSRNOG00000037191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156118742:156205692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT045681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
XM_002726602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel, sperm associated 4 (Catsper4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_342941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel, sperm associated 4 (Catsper4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021919 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:156189425:156205692:-1 gene:ENSRNOG00000016312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065208 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:156196277:156205692:-1 gene:ENSRNOG00000016312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000065425 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:156189425:156205692:-1 gene:ENSRNOG00000016312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 83 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156118742:156205692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT045682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001039011 // RefSeq // Rattus norvegicus connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1 (Cnksr1), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000031225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156206365:156217020:-1 gene:ENSRNOG00000022838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC099788 // GenBank // Rattus norvegicus connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mRNA (cDNA clone MGC:124829 IMAGE:7934518), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// GENSCAN00000026724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156206697:156217098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001106689 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 593 (Zfp593), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156221537:156223865:-1 gene:ENSRNOG00000016392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166512 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 593, mRNA (cDNA clone MGC:188081 IMAGE:7128768), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156223029:156223752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT045684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109270 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 110, member D (Fam110d), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156229920:156232883:-1 gene:ENSRNOG00000016491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156230156:156240127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT045685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107984 // RefSeq // Rattus norvegicus PDLIM1 interacting kinase 1 like (Pdik1l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDLIM1 interacting kinase 1 like (Pdik1l), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDLIM1 interacting kinase 1 like (Pdik1l), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156253978:156265698:-1 gene:ENSRNOG00000016536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156257357:156266135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001107985 // RefSeq // Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 1 (Extl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156370680:156385881:-1 gene:ENSRNOG00000016776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156371967:156385817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001013935 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial fission regulator 1-like (Mtfr1l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial fission regulator 1-like (Mtfr1l), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156522183:156532186:-1 gene:ENSRNOG00000016937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083692 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 54, member B, mRNA (cDNA clone MGC:94559 IMAGE:7189448), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156523026:156558729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT045693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT045694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT045695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_006239132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selenoprotein N, 1 (Sepn1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156523026:156558729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006239132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selenoprotein N, 1 (Sepn1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:156535882:156547763:-1 gene:ENSRNOG00000017078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT045696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156523026:156558729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_006239132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selenoprotein N, 1 (Sepn1), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:156535882:156547763:-1 gene:ENSRNOG00000017078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156523026:156558729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001108687 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 1C, member 1 (Man1c1), mRNA. // chr5 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156559978:156703434:-1 gene:ENSRNOG00000017087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// NONRATT045697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156561867:156663447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1
NM_001109271 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor adaptor protein 1 (Ldlrap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156742863:156765855:-1 gene:ENSRNOG00000000151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156745160:156846359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT045699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_001025699 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 57 (Tmem57), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// XM_006239181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 57 (Tmem57), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000032623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156896212:156958442:-1 gene:ENSRNOG00000021448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// AY845021 // GenBank // Rattus norvegicus macoilin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// BC097999 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 57, mRNA (cDNA clone MGC:116145 IMAGE:7453136), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000010393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156897450:156958261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// NONRATT045700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0
NM_001127525 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 50A (Tmem50a), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157006370:157021310:-1 gene:ENSRNOG00000017279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC161895 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 50A, mRNA (cDNA clone MGC:187478 IMAGE:7304509), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006239148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 50A (Tmem50a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT045701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157006514:157021148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_031818 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 4 (Clic4), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157335185:157394574:-1 gene:ENSRNOG00000018109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF104119 // GenBank // Rattus norvegicus intracellular chloride ion channel protein p64H1 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// EF397567 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial chloride intracellular channel 4 (Clic4) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// FQ222737 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YJ16 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157338299:157394464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107986 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine repetitive matrix 1 (Srrm1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157444419:157476909:-1 gene:ENSRNOG00000018194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC166715 // GenBank // Rattus norvegicus serine/arginine repetitive matrix 1, mRNA (cDNA clone MGC:188416 IMAGE:7930852), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157465665:157476883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT045706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT045707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT045711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001253918 // RefSeq // Rattus norvegicus noncompact myelin associated protein (Ncmap), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157500153:157501359:-1 gene:ENSRNOG00000048139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000056074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157500202:157561435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001012746 // RefSeq // Rattus norvegicus RCAN family member 3 (Rcan3), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RCAN family member 3 (Rcan3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157542942:157551147:-1 gene:ENSRNOG00000018576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY919305 // GenBank // Rattus norvegicus Down syndrome critical region gene 1-like 2 (Dscr1l2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157500202:157561435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT045719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000064350 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:157571436:157606377:-1 gene:ENSRNOG00000037165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// XM_006225647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIPA-like domain containing 3 (Nipal3), mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// XM_578498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIPA-like domain containing 3 (Nipal3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000025075 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:157577172:157606377:-1 gene:ENSRNOG00000037165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157577172:157612205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT045721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_001106690 // RefSeq // Rattus norvegicus grainyhead-like 3 (Drosophila) (Grhl3), mRNA. // chr5 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157659406:157691263:-1 gene:ENSRNOG00000029427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157660160:157686594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001103360 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich nuclear receptor coactivator 2 (Pnrc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157985391:157988374:-1 gene:ENSRNOG00000009248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081903 // GenBank // Rattus norvegicus proline-rich nuclear receptor coactivator 2, mRNA (cDNA clone MGC:93828 IMAGE:7110880), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551628 (LOC102551628), mRNA. // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT045724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031342 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophospholipase II (Lypla2), mRNA. // chr5 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158079858:158084485:-1 gene:ENSRNOG00000010067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB021645 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for lysophospholipase II, complete cds. // chr5 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// BC070503 // GenBank // Rattus norvegicus lysophospholipase 2, mRNA (cDNA clone MGC:91643 IMAGE:7096587), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158080171:158097947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT045729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT045730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
XM_001068778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PITH (C-terminal proteasome-interacting domain of thioredoxin-like) domain containing 1 (Pithd1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_216543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PITH (C-terminal proteasome-interacting domain of thioredoxin-like) domain containing 1 (Pithd1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014458 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:158088178:158097818:-1 gene:ENSRNOG00000010873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT045731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158080171:158097947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT045732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_017103 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3 (Tceb3), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158112243:158128181:-1 gene:ENSRNOG00000010902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC081815 // GenBank // Rattus norvegicus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:93501 IMAGE:7110428), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// L46816 // GenBank // Rattus norvegicus elongin A mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158113341:158158896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT045735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001025739 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L11 (Rpl11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC097372 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L11, mRNA (cDNA clone MGC:114407 IMAGE:7444187), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000030043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158155378:158158916:-1 gene:ENSRNOG00000026260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// FQ218104 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA9YG08 mRNA sequence. // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// FQ222336 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YO17 mRNA sequence. // chr5 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// NONRATT045736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT045737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000017024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158113341:158158896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_001130098 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 1A (Kdm1a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000055992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158674383:158730522:-1 gene:ENSRNOG00000022372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// EF688598 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000050045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158672140:158706708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT045743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT045742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001127319 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor B2 (Ephb2), mRNA. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006239133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Eph receptor B2 (Ephb2), partial mRNA. // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000016983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158789192:158907250:-1 gene:ENSRNOG00000012531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// DQ011670 // GenBank // Rattus norvegicus Eph receptor B2 (Ephb2) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT045748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158788920:158838725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156745160:156846359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_019262 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent, B chain (C1qb), mRNA. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159008941:159014494:-1 gene:ENSRNOG00000012749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234810 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YJ15 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ226212 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YP11 mRNA sequence. // chr5 // 60 // 80 // 12 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159009089:159020834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT045749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008524 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent, C chain (C1qc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159017515:159021135:-1 gene:ENSRNOG00000012804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086409 // GenBank // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent, C chain, mRNA (cDNA clone MGC:105681 IMAGE:7306579), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228978 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YA05 mRNA sequence. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT045750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159009089:159020834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001008515 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent, A chain (C1qa), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159023754:159026611:-1 gene:ENSRNOG00000012807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086605 // GenBank // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:105755 IMAGE:7316796), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220086 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YE05 mRNA sequence. // chr5 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0 /// FQ214296 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YI17 mRNA sequence. // chr5 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159023980:159036587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000017559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159057429:159078493:-1 gene:ENSRNOG00000013036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// X59290 // GenBank // Rat eek mRNA for eph and elk-related kinase. // chr5 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159057429:159144194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0
NM_001191871 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 40 (Zbtb40), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006239229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 40 (Zbtb40), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006239233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 40 (Zbtb40), transcript variant X8, mRNA. // chr5 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000033670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159109614:159144251:-1 gene:ENSRNOG00000022039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159057429:159144194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NONRATT045762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_171994 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 42 (Cdc42), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159449003:159485241:-1 gene:ENSRNOG00000013536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF491841 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// BC060535 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 42 (GTP binding protein), mRNA (cDNA clone MGC:72646 IMAGE:6920523), complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ234623 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YE04 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF205635 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 42 (cdc42) mRNA, complete cds. // chr5 // 63 // 80 // 15 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159447307:159485241:-1 gene:ENSRNOG00000013536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// FQ213007 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YE01 mRNA sequence. // chr5 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// FQ227894 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YF17 mRNA sequence. // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// FQ231846 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YP12 mRNA sequence. // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT045762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159428452:159485201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001106692 // RefSeq // Rattus norvegicus chymotrypsin-like elastase family, member 3B (Cela3b), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159520758:159528921:-1 gene:ENSRNOG00000021619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159495713:159528883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
XM_001070032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 2 (Ldlrad2), mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_578500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 2 (Ldlrad2), mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159670995:159673153:-1 gene:ENSRNOG00000033503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159670139:159677999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_013059 // RefSeq // Rattus norvegicus alkaline phosphatase, liver/bone/kidney (Alpl), mRNA. // chr5 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000019004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159841923:159897413:-1 gene:ENSRNOG00000013954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC088399 // GenBank // Rattus norvegicus alkaline phosphatase, liver/bone/kidney, mRNA (cDNA clone MGC:93545 IMAGE:7128677), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// J03572 // GenBank // Rat alkaline phosphatase mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000009650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159842602:159868795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT045769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT045770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
ENSRNOT00000065497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160426051:160437821:-1 gene:ENSRNOG00000015385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 34 // 10 // 11 // 0 /// BC169047 // GenBank // Rattus norvegicus PTEN induced putative kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189438 IMAGE:7190543), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_001106694 // RefSeq // Rattus norvegicus PTEN induced putative kinase 1 (Pink1), mRNA. // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000003556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160426245:160437791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001108688 // RefSeq // Rattus norvegicus cytidine deaminase (Cda), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160452101:160482729:-1 gene:ENSRNOG00000015677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075128 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:160505257:160529504:-1 gene:ENSRNOG00000049700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160447862:160482692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160500551:160529504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006239294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 43, member B (Fam43b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068065 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:160558871:160559863:-1 gene:ENSRNOG00000043113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160558871:160564338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107988 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5B1 (Vwa5b1), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_006239199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5B1 (Vwa5b1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000022282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160746778:160801678:-1 gene:ENSRNOG00000016553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000009397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160731024:160836865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT045779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
NM_001013093 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 10 (Ubxn10), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160901917:160907746:-1 gene:ENSRNOG00000027731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079223 // GenBank // Rattus norvegicus UBX domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:94296 IMAGE:7132226), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160902684:160903532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109587 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IIF (Pla2g2f), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006239271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IIF (Pla2g2f), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160934862:160941249:-1 gene:ENSRNOG00000016798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160929036:160958032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_017174 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group V (Pla2g5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group V (Pla2g5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006239141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group V (Pla2g5), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160988969:161010285:-1 gene:ENSRNOG00000016838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY651028 // GenBank // Rattus norvegicus group V phospholipase A2 precursor, mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC085745 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A2, group V, mRNA (cDNA clone MGC:93513 IMAGE:7192819), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U03763 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160990184:160996950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT045785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NONRATT045785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191983 // RefSeq // Rattus norvegicus OTU deubiquitinase 3 (Otud3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000023143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161086486:161108351:-1 gene:ENSRNOG00000017037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161086835:161108351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT045788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT045789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT045790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT045791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT045792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
GENSCAN00000009401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161128084:161128272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 42 // 9 // 11 // 0
NM_001173556 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial inner membrane organizing system 1 (Minos1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000064418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161285672:161311999:-1 gene:ENSRNOG00000042696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT045797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0
NM_001108689 // RefSeq // Rattus norvegicus PQ loop repeat containing 2 (Pqlc2), mRNA. // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000023896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161489691:161497053:-1 gene:ENSRNOG00000017706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC158607 // GenBank // Rattus norvegicus PQ loop repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:187473 IMAGE:7192223), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161490027:161497002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001106697 // RefSeq // Rattus norvegicus mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae) (Mrto4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000024326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161555067:161560580:-1 gene:ENSRNOG00000017979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC168898 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA turnover 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:9026258), partial cds. // chr5 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161555275:161559313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT045803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001191984 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 7 (Pax7), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161947625:162044971:-1 gene:ENSRNOG00000018739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161968259:162044971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT045807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006225586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch domain containing 7A (Klhdc7a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025517 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:162164870:162167191:-1 gene:ENSRNOG00000018867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:162164870:162167191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000001314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:162184950:162185216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043630 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:162185000:162185216:-1 gene:ENSRNOG00000031644 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 62 // 100 // 13 // 21 // 0
NM_001271454 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobin superfamily, member 21 (Igsf21), mRNA. // chrU // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:162230228:162245527:-1 gene:ENSRNOG00000049959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// GENSCAN00000006584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:162230228:162285064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// NONRATT045811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001191766 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidyl arginine deiminase, type VI (Padi6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000055867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:162948121:162963407:-1 gene:ENSRNOG00000037079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:162948121:163001277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_017227 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidyl arginine deiminase, type IV (Padi4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:162967383:163001293:-1 gene:ENSRNOG00000006855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB008803 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peptidylarginine deiminase type IV, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AB010999 // GenBank // Rattus norvegicus PAD-R4 mRNA for peptidylarginine deiminase type IV, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:162948121:163001277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_017230 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidyl arginine deiminase, type III (Padi3), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163015782:163042857:-1 gene:ENSRNOG00000006950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D88034 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peptidylarginine deiminase type III, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163016845:163045498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_019332 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidyl arginine deiminase, type I (Padi1), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163045278:163077738:-1 gene:ENSRNOG00000007067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB010998 // GenBank // Rattus norvegicus PAD-R11 mRNA for Peptidylarginine deiminase type I, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163046899:163077608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107990 // RefSeq // Rattus norvegicus ciliary rootlet coiled-coil, rootletin (Crocc), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163253158:163288260:-1 gene:ENSRNOG00000008334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000055839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163253158:163286544:-1 gene:ENSRNOG00000008334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163253158:163293650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT045817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1
NM_199096 // RefSeq // Rattus norvegicus NECAP endocytosis associated 2 (Necap2), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000011394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163302214:163314566:-1 gene:ENSRNOG00000008427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC061826 // GenBank // Rattus norvegicus NECAP endocytosis associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:72598 IMAGE:5599028), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006239180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NECAP endocytosis associated 2 (Necap2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163303997:163314528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_053327 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel, voltage-sensitive Ka (Clcnka), mRNA. // chr5 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000013103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163648374:163667008:-1 gene:ENSRNOG00000009680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC081761 // GenBank // Rattus norvegicus chloride channel Ka, mRNA (cDNA clone MGC:93313 IMAGE:7108273), complete cds. // chr5 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// D13927 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ClC-K1 protein, complete cds. // chr5 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000025099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163648374:163681970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
XM_006225653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC298602 (RGD1566083), mRNA. // chrU // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006239333 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC298602 (RGD1566083), mRNA. // chrU // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163702076:163704578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT045842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001271495 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Msx2-interacting protein (SPEN homolog) (SMART/HDAC1-associated repressor protein) (LOC690911), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163736425:163790133:-1 gene:ENSRNOG00000033556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163736425:163790133:-1 gene:ENSRNOG00000033556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163736425:163790133:-1 gene:ENSRNOG00000033556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163736425:163811460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001007554 // RefSeq // Rattus norvegicus filamin binding LIM protein 1 (Fblim1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163841377:163867441:-1 gene:ENSRNOG00000011774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC086398 // GenBank // Rattus norvegicus filamin binding LIM protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105665 IMAGE:7303205), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163843044:163894266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT045849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT045852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT045853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
XM_006225589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 82 (Tmem82), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 82 (Tmem82), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016176 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:163885410:163888944:-1 gene:ENSRNOG00000011970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163843044:163894266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001013936 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 34 (Slc25a34), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163890565:163894419:-1 gene:ENSRNOG00000021526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083723 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 34, mRNA (cDNA clone MGC:94620 IMAGE:7191003), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163843044:163894266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001191767 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 2 (Plekhm2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000016333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163897199:163934413:-1 gene:ENSRNOG00000012163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000048525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163897371:164010969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT045860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT045865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001034149 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA-damage inducible protein 2 (Ddi2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA-damage inducible protein 2 (Ddi2), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163951352:163995207:-1 gene:ENSRNOG00000012274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097361 // GenBank // Rattus norvegicus DNA-damage inducible protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:114394 IMAGE:7442573), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163897371:164010969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001014194 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 16 (Dnajc16), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164037421:164064397:-1 gene:ENSRNOG00000012503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089875 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 16, mRNA (cDNA clone MGC:109011 IMAGE:7325475), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164037639:164064706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_012553 // RefSeq // Rattus norvegicus chymotrypsin-like elastase family, member 2A (Cela2a), mRNA. // chr5 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// XM_006239302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chymotrypsin-like elastase family, member 2A (Cela2a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164085554:164095305:-1 gene:ENSRNOG00000013628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ227652 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YH13 mRNA sequence. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000048521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164085625:164115270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001077649 // RefSeq // Rattus norvegicus chymotrypsin C (caldecrin) (Ctrc), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164106200:164115282:-1 gene:ENSRNOG00000013745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164085625:164115270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001031648 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand domain family, member D2 (Efhd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164119687:164135720:-1 gene:ENSRNOG00000013783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098936 // GenBank // Rattus norvegicus EF-hand domain family, member D2, mRNA (cDNA clone MGC:114423 IMAGE:7446346), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT045876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164116379:164135693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
XM_006225590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead-associated (FHA) phosphopeptide binding domain 1 (Fhad1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 54 // 54 // 0 /// XM_006239328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead-associated (FHA) phosphopeptide binding domain 1 (Fhad1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 54 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000018953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164150671:164215873:-1 gene:ENSRNOG00000028064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 45 // 45 // 0 /// BC098024 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2900090M10, mRNA (cDNA clone MGC:116177 IMAGE:7455859), complete cds. // chr5 // 100 // 78 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000007565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164209559:164226551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 19 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164152142:164199892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 47 // 58 // 1 /// NONRATT045879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 19 // 19 // 11 // 58 // 1
NM_001109273 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 51 (Tmem51), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 51 (Tmem51), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 51 (Tmem51), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 51 (Tmem51), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 51 (Tmem51), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 51 (Tmem51), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164281861:164331199:-1 gene:ENSRNOG00000014197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164282556:164476262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001014070 // RefSeq // Rattus norvegicus kazrin, periplakin interacting protein (Kazn), mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// XM_006239312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kazrin, periplakin interacting protein (Kazn), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 62 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164350465:164739758:-1 gene:ENSRNOG00000014322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// BC089223 // GenBank // Rattus norvegicus kazrin, mRNA (cDNA clone MGC:105638 IMAGE:7320330), complete cds. // chr5 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// XM_006239310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kazrin, periplakin interacting protein (Kazn), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 82 // 82 // 37 // 45 // 1 /// XM_006239311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kazrin, periplakin interacting protein (Kazn), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1 /// NONRATT045886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 69 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164282556:164476262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1 /// NONRATT045887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 49 // 49 // 22 // 45 // 1
XM_006239339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein C1orf196-like (LOC102555278), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165418189:165460094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001077648 // RefSeq // Rattus norvegicus PR domain containing 2, with ZNF domain (Prdm2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000041175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:165469844:165578324:-1 gene:ENSRNOG00000033522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165481642:165573788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT045889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NONRATT045890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_019358 // RefSeq // Rattus norvegicus podoplanin (Pdpn), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006239338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus podoplanin (Pdpn), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:165646114:165679595:-1 gene:ENSRNOG00000014961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC072492 // GenBank // Rattus norvegicus podoplanin, mRNA (cDNA clone MGC:91718 IMAGE:7097186), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U07797 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley (T1-alpha) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// U32115 // GenBank // Rattus norvegicus E11 antigen epitope (OTS-8) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// U96449 // GenBank // Rattus norvegicus podoplanin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165637431:165657527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000072407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:138003285:138004567:-1 gene:ENSRNOG00000051005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000072776 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14596908:14598190:1 gene:ENSRNOG00000048504 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000072845 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:9184976:9186258:1 gene:ENSRNOG00000046314 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000073409 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165803130:165804413:-1 gene:ENSRNOG00000047371 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000073903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54940686:54941968:-1 gene:ENSRNOG00000047509 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000074538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59271854:59273136:1 gene:ENSRNOG00000048192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000075406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:172047210:172048492:1 gene:ENSRNOG00000050867 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000075541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165832069:165833351:-1 gene:ENSRNOG00000050976 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0 /// U15425 // GenBank // Rattus norvegicus membrane- and microfilament-associated protein p58 mRNA, complete cds. // chr5 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0
XM_006225655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oogenesin 3 (Oog3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006238357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oogenesin 3 (Oog3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000055741 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:103073889:103079725:-1 gene:ENSRNOG00000033000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:103064225:103076463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NR_111961 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich coiled-coil 2C (Prrc2c), non-coding RNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004410 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004513 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000030419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234578369:234580234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:103221144:103223357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102704547:102743756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 76 // 18 // 22 // 0 /// NONRATT017569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT017570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25841585:25849583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
ENSRNOT00000033718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:103044062:103210798:1 gene:ENSRNOG00000037039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// BC090317 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930569K13, mRNA (cDNA clone MGC:105679 IMAGE:7305376), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT043103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:103137714:103210504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
XM_001077012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 20 (Pramef20), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 20 (Pramef20), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166097294:166101846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_006225597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 12 (Pramef12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 12 (Pramef12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048232 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:166075868:166079315:1 gene:ENSRNOG00000037035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166075868:166095673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001191768 // RefSeq // Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 3 (Aadacl3), mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000033150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:166016068:166024293:1 gene:ENSRNOG00000026613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NM_001109629 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691162 (LOC691162), mRNA. // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000065471 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:166041716:166060682:1 gene:ENSRNOG00000043039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000002107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166016068:166024293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT044030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSRNOT00000020612 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165949070:165949479:-1 gene:ENSRNOG00000015363 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074113 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:166048917:166049326:1 gene:ENSRNOG00000049752 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165949126:165949497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000002102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166048899:166049270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT044030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000002084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166170525:166174248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_001074331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 4 (Aadacl4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_233640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 4 (Aadacl4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034394 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:166360641:166370329:-1 gene:ENSRNOG00000037030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166360641:166361812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
XM_001077182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 4-like (LOC691196), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_002726650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 4-like (LOC691196), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000040763 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:169940510:169983029:-1 gene:ENSRNOG00000037027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166449460:166480048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000041104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169940510:169942490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_001108006 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 13 homolog D (S. cerevisiae) (Vps13d), mRNA. // chr5 // 100 // 99 // 69 // 69 // 0 /// ENSRNOT00000022185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:166572596:166798221:-1 gene:ENSRNOG00000016443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 99 // 69 // 69 // 0 /// GENSCAN00000024316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166704730:166798069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 51 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166575170:166699300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 70 // 70 // 0 /// NONRATT045901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 14 // 14 // 10 // 70 // 1
NM_130426 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 1b (Tnfrsf1b), mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:166812970:166845910:-1 gene:ENSRNOG00000016575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF498039 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor type II mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY191268 // GenBank // Rattus norvegicus TNFR2 transcript variant 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AY191269 // GenBank // Rattus norvegicus TNFR2 transcript variant 3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166816772:166845841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_019135 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 8 (Tnfrsf8), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006239348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 8 (Tnfrsf8), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:166864888:166910610:-1 gene:ENSRNOG00000016782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// D42117 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CD30, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166866706:166910526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006225599 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 624-like (LOC102551014), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT045908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 11 // 11 // 1
XR_354407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase I isoform gamma-3-like (LOC691266), misc_RNA. // chr5 // 67 // 100 // 22 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055690 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:167885824:167887884:-1 gene:ENSRNOG00000037013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 73 // 16 // 24 // 0 /// NONRATT045909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 70 // 100 // 23 // 33 // 0
XR_346868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 845-like (LOC691257), misc_RNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XR_346869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 53-like (LOC100362123), misc_RNA. // chr5 // 34 // 97 // 11 // 32 // 0 /// XR_346870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase I isoform gamma-3-like (LOC691266), misc_RNA. // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// FQ231232 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA76YF22 mRNA sequence. // chr5 // 75 // 97 // 24 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:167985932:167992799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 94 // 17 // 31 // 0 /// BC099078 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7442534. // chr5 // 62 // 88 // 18 // 29 // 0 /// BC168232 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7442581. // chr5 // 62 // 88 // 18 // 29 // 0 /// NONRATT045909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 88 // 21 // 29 // 0 /// NONRATT045912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 88 // 21 // 29 // 0 /// NONRATT045913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 66 // 88 // 19 // 29 // 0 /// NONRATT045914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 59 // 88 // 17 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168026378:168178159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 26 // 94 // 8 // 31 // 0
XR_354407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase I isoform gamma-3-like (LOC691266), misc_RNA. // chr5 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000055690 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:167885824:167887884:-1 gene:ENSRNOG00000037013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// NM_022855 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 1, gamma 3 (Csnk1g3), mRNA. // chr5 // 32 // 100 // 10 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:48065995:48126390:1 gene:ENSRNOG00000016677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 97 // 10 // 30 // 0 /// NONRATT045909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// U22321 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 1 gamma 3 isoform mRNA, complete cds. // chr5 // 32 // 100 // 10 // 31 // 0
XR_346868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 845-like (LOC691257), misc_RNA. // chrU // 87 // 100 // 33 // 38 // 0 /// XR_346869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 53-like (LOC100362123), misc_RNA. // chrU // 47 // 100 // 18 // 38 // 0 /// XR_346870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase I isoform gamma-3-like (LOC691266), misc_RNA. // chrU // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// XR_346872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1565622 (RGD1565622), misc_RNA. // chrU // 24 // 24 // 9 // 38 // 1 /// FQ231232 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA76YF22 mRNA sequence. // chrU // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT045909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 89 // 95 // 32 // 36 // 0 /// NONRATT045908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 37 // 100 // 14 // 38 // 0 /// GENSCAN00000041637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:167985932:167992799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// BC099078 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7442534. // chrU // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// BC168232 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7442581. // chrU // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT045912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// NONRATT045913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// NONRATT045914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NONRATT045912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:167985932:167992799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
GENSCAN00000041637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:167985932:167992799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC099078 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7442534. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC168232 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7442581. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006225610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 658-like (LOC102557232), mRNA. // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// XM_006239410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC691280), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC691280), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC691280), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT045917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001017450 // RefSeq // Rattus norvegicus migration and invasion inhibitory protein (Miip), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus migration and invasion inhibitory protein (Miip), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus migration and invasion-inhibitory protein-like (LOC100911456), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168331162:168338117:-1 gene:ENSRNOG00000024139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000075212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168215527:168220810:-1 gene:ENSRNOG00000047911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC079047 // GenBank // Rattus norvegicus invasion inhibitory protein 45, mRNA (cDNA clone MGC:93984 IMAGE:7115212), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// FJ618907 // GenBank // Rattus norvegicus invasion inhibitory protein 45 (IIP45) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168216097:168220801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168229012:168336208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_130894 // RefSeq // Rattus norvegicus mitofusin 2 (Mfn2), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_003750086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitofusin-2-like (LOC100911485), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006239403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitofusin 2 (Mfn2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000055680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168342974:168372608:-1 gene:ENSRNOG00000046424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000065985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168227300:168252497:-1 gene:ENSRNOG00000046447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AB084165 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mitochondrial transmembrane GTPase FZO1A, complete cds. // chr5 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// BC070880 // GenBank // Rattus norvegicus mitofusin 2, mRNA (cDNA clone MGC:91421 IMAGE:7096620), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// U41803 // GenBank // Rattus norvegicus HSG protein mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// GENSCAN00000010868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168344419:168373991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT045919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000010850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168229012:168336208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1
NM_053827 // RefSeq // Rattus norvegicus procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1 (Plod1), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000010433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168379097:168405535:-1 gene:ENSRNOG00000007763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000010893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168379752:168405486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// L25331 // GenBank // Rattus norvegicus lysyl hydroxylase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT045921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
NM_001106479 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel, voltage-sensitive 6 (Clcn6), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// XM_006239378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chloride channel, voltage-sensitive 6 (Clcn6), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000011287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168471564:168502323:-1 gene:ENSRNOG00000008345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168472226:168502504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
XM_006225617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551309 (LOC102551309), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551309 (LOC102551309), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001007654 // RefSeq // Rattus norvegicus angiotensin II receptor-associated protein (Agtrap), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168546220:168556520:-1 gene:ENSRNOG00000008619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC082019 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensin II receptor-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:95145 IMAGE:7129329), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168523593:168553385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
XM_001077678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dorsal inhibitory axon guidance protein (Draxin), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002726653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dorsal inhibitory axon guidance protein (Draxin), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dorsal inhibitory axon guidance protein (Draxin), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dorsal inhibitory axon guidance protein (Draxin), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dorsal inhibitory axon guidance protein (Draxin), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dorsal inhibitory axon guidance protein (Draxin), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012080 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:168572013:168585976:-1 gene:ENSRNOG00000008911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168572013:168592466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_138917 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 6 (Fbxo6), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168614323:168617886:-1 gene:ENSRNOG00000009217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF393484 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein FBG2 (Fbg2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC063148 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:72682 IMAGE:6921385), complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ232698 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YL20 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168614474:168617864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT045934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001191576 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 44 (Fbxo44), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 44 (Fbxo44), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168620959:168629964:-1 gene:ENSRNOG00000009298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168620959:168644538:-1 gene:ENSRNOG00000009298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// FQ213337 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YG12 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168621710:168628725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT045939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_003750087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patched domain containing 2 (Ptchd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_003754115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patched domain containing 2 (Ptchd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000036647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168710726:168741342:-1 gene:ENSRNOG00000026447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000040594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168710726:168741342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT045942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT045944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001107993 // RefSeq // Rattus norvegicus UbiA prenyltransferase domain containing 1 (Ubiad1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168904231:168915829:-1 gene:ENSRNOG00000009575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214534 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YB21 mRNA sequence. // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// FQ232952 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YM13 mRNA sequence. // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168905889:168915526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT045947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
FQ232952 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YM13 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiopoietin-related protein 7-like (LOC102552055), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiopoietin-related protein 7-like (LOC102552055), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168968930:168972842:-1 gene:ENSRNOG00000009589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168968930:168972842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001011979 // RefSeq // Rattus norvegicus TAR DNA binding protein (Tardbp), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TAR DNA binding protein (Tardbp), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TAR DNA binding protein (Tardbp), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169088696:169098491:-1 gene:ENSRNOG00000012455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC083752 // GenBank // Rattus norvegicus TAR DNA binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:94685 IMAGE:7192591), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169088793:169097393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT045952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT045954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT045955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT045951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NONRATT045952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
GENSCAN00000040600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169098740:169120045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT045958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_172063 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 14 (Pex14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169433225:169568626:-1 gene:ENSRNOG00000013498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB017544 // GenBank // Rattus norvegicus Pex14 mRNA for peroxisomal membrane anchor protein, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081708 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 14, mRNA (cDNA clone MGC:93110 IMAGE:7191447), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169433981:169568610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT045964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT045963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT045965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000030302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169588757:169647890:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169590863:169691158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY325247 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cc2-27 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_012835 // RefSeq // Rattus norvegicus cortistatin (Cort), mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169592961:169594402:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// U51919 // GenBank // Rattus norvegicus preprocortistatin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// NM_001204879 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis-inducing, TAF9-like domain 1 (Apitd1), mRNA. // chr5 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000030302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169588757:169647890:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000074436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169596287:169605817:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// NONRATT045970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1 /// GENSCAN00000024840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169590863:169691158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// AY325247 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cc2-27 mRNA, complete cds. // chr5 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT045969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1
XM_006225658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein YIL169C-like (LOC102553292), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006239428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein YIL169C-like (LOC102553292), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169588757:169647890:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169590863:169691158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY325247 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cc2-27 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_002729565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating-like (LOC100360180), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_003754118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating-like (LOC100360180), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169615289:169630813:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169588757:169647890:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169590863:169691158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AY325247 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cc2-27 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT045974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_057200 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 1B (Kif1b), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// XM_006239371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 1B (Kif1b), transcript variant X9, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000041937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169643637:169741761:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000042768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169643637:169741761:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000067514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169707421:169780881:-1 gene:ENSRNOG00000030317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 22 // 22 // 0 /// AB070355 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for kinesin-family protein 1Bp204, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// AB120429 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for kinesin-family protein KIF1Bbeta3, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000041094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169700288:169780739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// GENSCAN00000024840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169590863:169691158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 24 // 54 // 1
NM_001271198 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitination factor E4B (Ube4b), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000055572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169804688:169890811:-1 gene:ENSRNOG00000014986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169843231:169878051:-1 gene:ENSRNOG00000014986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169804688:169877819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT045989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001108693 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol binding protein 7, cellular (Rbp7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169925571:169930189:-1 gene:ENSRNOG00000015850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037556 // RefSeq // Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 (Nmnat1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 (Nmnat1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006239431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 (Nmnat1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006239432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 (Nmnat1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000048914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170057407:170076545:-1 gene:ENSRNOG00000015962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY788917 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinamide mononucleotide adenylyl transferase 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC127446 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:156478 IMAGE:7383226), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 1 (Nmnat1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170058556:170070443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108978 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit delta (Pik3cd), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000066179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170248202:170274177:-1 gene:ENSRNOG00000016846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// BC099153 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7381254. // chr5 // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170249875:170263174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT046000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
XM_001078224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 201 (Tmem201), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_002726661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 201 (Tmem201), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000047763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170318703:170339591:-1 gene:ENSRNOG00000023152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170326481:170339591:-1 gene:ENSRNOG00000023152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170318703:170339591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT046003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT046005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001127574 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (pyrimidine nucleotide carrier), member 33 (Slc25a33), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000022799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170345879:170371208:-1 gene:ENSRNOG00000016949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC167066 // GenBank // Rattus norvegicus similar to mitochondrial carrier protein MGC4399, mRNA (cDNA clone MGC:189383 IMAGE:8376338), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170346142:170363339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_001107994 // RefSeq // Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 (Spsb1), mRNA. // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XM_006239462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1 (Spsb1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000023287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170557219:170568525:-1 gene:ENSRNOG00000017212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC158603 // GenBank // Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187459 IMAGE:7133644), complete cds. // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT046011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001106698 // RefSeq // Rattus norvegicus hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase) (H6pd), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hexose-6-phosphate dehydrogenase (glucose 1-dehydrogenase) (H6pd), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170640289:170671849:-1 gene:ENSRNOG00000017523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170631315:170658344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001134841 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 6 (Car6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000051309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170854181:170872721:-1 gene:ENSRNOG00000021355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170854591:170872695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT046015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_144747 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 45, member 1 (Slc45a1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:171300141:171322391:-1 gene:ENSRNOG00000018229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AB075229 // GenBank // Rattus norvegicus past-A mRNA for proton-associated sugar transporter A, complete cds. // chr5 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// BC093599 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 45, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:105314 IMAGE:7315729), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:171300276:171322434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_023978 // RefSeq // Rattus norvegicus period circadian clock 3 (Per3), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// XM_006239500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus period circadian clock 3 (Per3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000024932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:171665221:171700125:-1 gene:ENSRNOG00000018413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// AB092512 // GenBank // Rattus norvegicus rper3 mRNA for period3, complete cds. // chr5 // 95 // 96 // 41 // 43 // 0 /// AB092513 // GenBank // Rattus norvegicus rper3-A2 mRNA for period3-A2, complete cds. // chr5 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:171667405:171686851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT046038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1 /// NONRATT046039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
NM_057097 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 3 (Vamp3), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:171703254:171713723:-1 gene:ENSRNOG00000030055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC088119 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:108618 IMAGE:7366421), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ217862 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA15YJ14 mRNA sequence. // chr5 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT046041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:171705681:171829480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001195559 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin binding transcription activator 1 (Camta1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000066120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:171715302:171964129:-1 gene:ENSRNOG00000018602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000026775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:171705681:171829480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001195560 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin binding transcription activator 1 (Camta1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172507291:172577540:-1 gene:ENSRNOG00000042627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC106025 // GenBank // Rattus norvegicus similar to KIAA0833 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7386266), complete cds. // chr5 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// NM_001195559 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin binding transcription activator 1 (Camta1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT046051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108695 // RefSeq // Rattus norvegicus THAP domain containing, apoptosis associated protein 3 (Thap3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172713824:172719572:-1 gene:ENSRNOG00000026840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC159427 // GenBank // Rattus norvegicus THAP domain containing, apoptosis associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:188747 IMAGE:9088591), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172714240:172719453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_001107995 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 13 (Phf13), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000012407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172719997:172726441:-1 gene:ENSRNOG00000009046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172721973:172726568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT046058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001013216 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 48 (Zbtb48), mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172750035:172758372:-1 gene:ENSRNOG00000009595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC091214 // GenBank // Rattus norvegicus GLI-Kruppel family member HKR3, mRNA (cDNA clone MGC:108933 IMAGE:7383542), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ211844 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA78YH15 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172750076:172757788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_053305 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 1, member 1 (Tas1r1), mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172758655:172770376:-1 gene:ENSRNOG00000009708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172758811:172770376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT046063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_022687 // RefSeq // Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 3 (Hes3), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 3 (Hes3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173018613:173020507:-1 gene:ENSRNOG00000010893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// D13418 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for HES-3 factor, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:173018068:173019944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_002726663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 207 (Rnf207), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000046552 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:173040220:173052658:-1 gene:ENSRNOG00000033722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:173040495:173052612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT046069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT046071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_017304 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 2 (Kcnab2), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173126375:173212638:-1 gene:ENSRNOG00000011550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// X76724 // GenBank // R.norvegicus RCK beta2 mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 2 (Kcnab2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// XM_006239454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 2 (Kcnab2), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// XM_006239455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 2 (Kcnab2), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000032517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:173126379:173161419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT046079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT046078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT046080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_053362 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA fragmentation factor, 40kDa, beta polypeptide (caspase-activated DNase) (Dffb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000032825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174741404:174753526:-1 gene:ENSRNOG00000025030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF136598 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-activated deoxyribonuclease (CAD) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC129091 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8364572. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:174742441:174754051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT046083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT046085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001163723 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 1 (Smim1), mRNA. // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000063779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174800870:174803561:-1 gene:ENSRNOG00000043193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT046088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT046090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001191063 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 27 (Ccdc27), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000041283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174804328:174818985:-1 gene:ENSRNOG00000031732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000054891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:174798453:174826092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_001108696 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein p73 (Tp73), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174843033:174901875:-1 gene:ENSRNOG00000024707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:174845724:174911290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013937 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-related protein T2 (Actrt2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175534298:175535431:-1 gene:ENSRNOG00000012586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC083677 // GenBank // Rattus norvegicus actin-related protein T2, mRNA (cDNA clone MGC:94528 IMAGE:7135827), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175534298:175535431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT046099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108697 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 213, member B (Fam213b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175760762:175763365:-1 gene:ENSRNOG00000013468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175760905:175763096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT046100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001015034 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 14 (Tnfrsf14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_354472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 14 (Tnfrsf14), transcript variant X4, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_354473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 14 (Tnfrsf14), transcript variant X5, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_354476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 14 (Tnfrsf14), transcript variant X8, misc_RNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175784225:175791855:-1 gene:ENSRNOG00000013820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC091202 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 14 (herpesvirus entry mediator), mRNA (cDNA clone MGC:108903 IMAGE:7380378), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175785355:175789118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT046103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
ENSRNOT00000019096 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:175845318:175871527:-1 gene:ENSRNOG00000014226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000065585 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:175857793:175871527:-1 gene:ENSRNOG00000014226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 18 // 18 // 0 /// XM_006225661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, eta 2 (Plch2), mRNA. // chr5 // 95 // 95 // 42 // 44 // 1 /// XM_006239620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, eta 2 (Plch2), mRNA. // chr5 // 95 // 95 // 42 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000038789 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:175842863:175871527:-1 gene:ENSRNOG00000014226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 93 // 41 // 44 // 1 /// GENSCAN00000023806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175842863:175882418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001039012 // RefSeq // Rattus norvegicus retention in endoplasmic reticulum sorting receptor 1 (Rer1), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175932626:175944701:-1 gene:ENSRNOG00000014270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC100270 // GenBank // Rattus norvegicus RER1 retention in endoplasmic reticulum 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116413 IMAGE:7444634), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175933791:175940397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT046112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000020560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176018126:176082844:-1 gene:ENSRNOG00000015007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000075457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176018126:176083961:-1 gene:ENSRNOG00000015007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176014905:176032651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_022507 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, zeta (Prkcz), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000021285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176118465:176228206:-1 gene:ENSRNOG00000015480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// J04532 // GenBank // rat protein kinase C zeta-subspecies mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U27191 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C, zeta subspecies (psi-PKC-zeta) pseudogene mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176054160:176163583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// NONRATT046121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_017289 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta (Gabrd), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176255724:176267624:-1 gene:ENSRNOG00000016385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087714 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, delta, mRNA (cDNA clone MGC:105467 IMAGE:7317154), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M35162 // GenBank // Rat GABA-A receptor delta subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176218532:176271628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_019383 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit d (Atp5h), mRNA. // chr5 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// BC059139 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit d, mRNA (cDNA clone MGC:72861 IMAGE:6921557), complete cds. // chr5 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// BC078846 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit d, mRNA (cDNA clone MGC:93491 IMAGE:7133871), complete cds. // chr5 // 83 // 95 // 15 // 18 // 0 /// D10021 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for subunit d of mitochondrial H-ATP synthase, complete cds. // chr5 // 65 // 89 // 11 // 17 // 0 /// D13120 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP synthase subunit d, complete cds. // chr5 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// NONRATT046123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001013938 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 1 (Vwa1), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176692353:176697535:-1 gene:ENSRNOG00000018338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC081983 // GenBank // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94170 IMAGE:7128587), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176693390:176697488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT046141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_053606 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 23 (Mmp23), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 23 (Mmp23), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 23 (Mmp23), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 23 (Mmp23), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000066880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176554526:176557315:-1 gene:ENSRNOG00000017477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB010960 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MIFR, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086586 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 23, mRNA (cDNA clone MGC:105366 IMAGE:7309721), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT046127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176554578:176581092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT046124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT046125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT046128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT046129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001005901 // RefSeq // Rattus norvegicus mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 (Mib2), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// XM_006239589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2 (Mib2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000023696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176558731:176565084:-1 gene:ENSRNOG00000017564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000023734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176554578:176581092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT046130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 16 // 43 // 1 /// NONRATT046132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 16 // 43 // 1 /// NONRATT046134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// NONRATT046131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
NM_001034922 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase family, AAA domain containing 3A (Atad3a), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000045053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176665202:176685381:-1 gene:ENSRNOG00000018118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC105762 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase family, AAA domain containing 3A, mRNA (cDNA clone MGC:124646 IMAGE:7929859), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000023735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176665299:176680373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT046137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
NM_001109426 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 88B (Tmem88b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176705977:176708801:-1 gene:ENSRNOG00000036869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176707124:176708386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_130818 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 1, member 3 (Tas1r3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176784486:176787639:-1 gene:ENSRNOG00000019589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF456324 // GenBank // Rattus norvegicus taste receptor T1R3 (Tas1r3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY032620 // GenBank // Rattus norvegicus sweet taste receptor T1R3 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176784486:176787639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001007703 // RefSeq // Rattus norvegicus glycolipid transfer protein domain containing 1 (Gltpd1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176789844:176793929:-1 gene:ENSRNOG00000022455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083599 // GenBank // Rattus norvegicus glycolipid transfer protein domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94339 IMAGE:7133008), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176790882:176791742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT046144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT046146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001108699 // RefSeq // Rattus norvegicus pseudouridylate synthase-like 1 (Pusl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176811652:176815508:-1 gene:ENSRNOG00000022354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079468 // GenBank // Rattus norvegicus similar to pseudouridylate synthase-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7122692). // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC168864 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9027038. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176812795:176816329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT046151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT046152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001106699 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGal beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 6 (B3galt6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176900220:176901197:-1 gene:ENSRNOG00000019979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176900220:176901197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024758 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 10 (Ttll10), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NM_001170533 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 10 (Ttll10), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176945044:176959008:-1 gene:ENSRNOG00000020132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176945044:176957433:-1 gene:ENSRNOG00000020132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC083833 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:7112846), partial cds. // chr5 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC097417 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 10, mRNA (cDNA clone MGC:114462 IMAGE:7454407), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176945115:176957531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT046157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT046159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NR_031949 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 429 (Mir429), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053718 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:176962353:176962437:-1 gene:ENSRNOG00000035595 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-429 // miRBase Micro RNA Database // MI0001643 Rattus norvegicus miR-429 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031916 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-200a (Mir200a), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-200a // miRBase Micro RNA Database // MI0000943 Rattus norvegicus miR-200a stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031917 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 200b (Mir200b), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053631 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:176964166:176964260:-1 gene:ENSRNOG00000035508 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-200b // miRBase Micro RNA Database // MI0000944 Rattus norvegicus miR-200b stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175754 // RefSeq // Rattus norvegicus agrin (Agrn), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000042726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177063801:177085091:-1 gene:ENSRNOG00000020205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000045678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177063801:177085091:-1 gene:ENSRNOG00000020205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000046315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177063801:177085091:-1 gene:ENSRNOG00000020205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000047854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177063801:177085091:-1 gene:ENSRNOG00000020205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// M64780 // GenBank // Rat agrin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000032208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:177065053:177096606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT046164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT046166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1
NM_001106700 // RefSeq // Rattus norvegicus ISG15 ubiquitin-like modifier (Isg15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177098680:177099967:-1 gene:ENSRNOG00000021802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:177098719:177099829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134523 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family N member 1 (Plekhn1), mRNA. // chr5 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000038556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177120235:177127945:-1 gene:ENSRNOG00000020295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// NONRATT046172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000032200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:177120791:177132925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// NONRATT046171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
XM_006239522 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 17 (Klhl17), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// XM_006239526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 17 (Klhl17), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177128900:177133715:-1 gene:ENSRNOG00000020302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 88 // 36 // 37 // 0 /// NM_145671 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 17 (Klhl17), mRNA. // chr5 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// AF505655 // GenBank // Rattus norvegicus actinfilin mRNA, complete cds. // chr5 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// GENSCAN00000032200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:177120791:177132925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 79 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT046177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
XM_006225640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 11-like (LOC102549710), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 11-like (LOC102549710), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 11-like (LOC102549710), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027564 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:177146850:177154330:-1 gene:ENSRNOG00000020342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:177146850:177168109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT046178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001003929 // RefSeq // Rattus norvegicus ciliary neurotrophic factor receptor (Cntfr), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62566649:62594369:-1 gene:ENSRNOG00000047307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62545002:62620998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
XM_006225540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 62 (Trim62), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072908 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:150800021:150826717:1 gene:ENSRNOG00000049496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150799430:150826717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024365 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 6, G protein-coupled (Htr6), mRNA. // chr5 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161242626:161257707:-1 gene:ENSRNOG00000049761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// L03202 // GenBank // Rattus norvegicus serotoinin receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// L19656 // GenBank // Rat serotonin receptor (5HT6) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// L41146 // GenBank // Rattus norvegicus (clone St-B17) 5-HT6 serotonin receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161242621:161267318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_031609 // RefSeq // Rattus norvegicus neuroblastoma 1, DAN family BMP antagonist (Nbl1), mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161263767:161274897:-1 gene:ENSRNOG00000049402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061833 // GenBank // Rattus norvegicus neuroblastoma, suppression of tumorigenicity 1, mRNA (cDNA clone MGC:72398 IMAGE:5599381), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161242621:161267318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000005566 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:676977:677392:1 gene:ENSRNOG00000004202 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 75 // 89 // 6 // 8 // 0
NM_001169103 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine rich transmembrane BMP regulator 1 (chordin like) (Crim1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:780568:952528:1 gene:ENSRNOG00000004208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ217152 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA33YM23 mRNA sequence. // chr6 // 82 // 82 // 23 // 28 // 0 /// NONRATT046183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000048067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:896366:936946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT046184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT046185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000048077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:946006:952720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_001064219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vitrin (Vit), mRNA. // chr6 // 96 // 63 // 25 // 26 // 0 /// XM_233802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vitrin (Vit), mRNA. // chr6 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006360 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:1127877:1199126:1 gene:ENSRNOG00000004706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1161089:1199126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
NM_001108700 // RefSeq // Rattus norvegicus G patch domain containing 11 (Gpatch11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1401794:1411973:1 gene:ENSRNOG00000025317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1404124:1412330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT046190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT046191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSRNOT00000062031 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:1506267:1507727:1 gene:ENSRNOG00000040303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// NONRATT046192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001008318 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 7 (Ndufaf7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006239627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 7 (Ndufaf7), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000007000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1524703:1535937:1 gene:ENSRNOG00000005279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC083810 // GenBank // Rattus norvegicus similar to PRO1853 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:94867 IMAGE:7110144), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1527436:1534896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT046195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
ENSRNOT00000049672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1647589:1679763:1 gene:ENSRNOG00000005705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// FQ228724 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YG17 mRNA sequence. // chr6 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1647601:1679312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XM_001054040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit g, mitochondrial-like (LOC679690), mRNA. // chr6 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// XM_002726679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit g, mitochondrial-like (LOC679690), mRNA. // chr6 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NM_001037200 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of microtubule dynamics 2 (Rmdn2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2200625:2264456:1 gene:ENSRNOG00000006082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC100261 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 82, member A, mRNA (cDNA clone MGC:116304 IMAGE:7368645), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2177547:2272736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT046209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT046205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT046207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
GENSCAN00000055144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2536655:2537337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001007704 // RefSeq // Rattus norvegicus galactose mutarotase (aldose 1-epimerase) (Galm), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2785889:2837634:1 gene:ENSRNOG00000007023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081876 // GenBank // Rattus norvegicus galactose mutarotase (aldose 1-epimerase), mRNA (cDNA clone MGC:93738 IMAGE:7107751), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2785941:2836551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191906 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 39D (Ttc39d), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2863657:2872011:1 gene:ENSRNOG00000027343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2869992:2871806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT046217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001009466 // RefSeq // Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 6 (Gemin6), mRNA. // chr6 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006239647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 6 (Gemin6), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2884038:2888452:1 gene:ENSRNOG00000027332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158565 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9036173. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ227213 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YF16 mRNA sequence. // chr6 // 42 // 70 // 8 // 19 // 0
NM_001126086 // RefSeq // Rattus norvegicus MORN repeat containing 2 (Morn2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001145449 // RefSeq // Rattus norvegicus MORN repeat containing 2 (Morn2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2948609:2953694:1 gene:ENSRNOG00000030319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166893 // GenBank // Rattus norvegicus MORN repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:188844 IMAGE:6919817), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006225697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061980 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:2991537:3072513:1 gene:ENSRNOG00000007061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006239653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), partial mRNA. // chr6 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// XM_003750100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 33 (Arhgef33), partial mRNA. // chr6 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000040009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:3001704:3068959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006225690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1-like (LOC102551744), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006239678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1-like (LOC102551744), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000045349 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:3345126:3345455:1 gene:ENSRNOG00000033125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:3341399:3359730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0
NM_001004282 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 178A (Tmem178a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:3625175:3683554:1 gene:ENSRNOG00000007907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC079338 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 178, mRNA (cDNA clone MGC:94782 IMAGE:7106500), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:3671493:3687378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000005562 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:6138495:6139261:1 gene:ENSRNOG00000004199 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT046233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000014452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6048383:6139261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
NM_001108007 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase domain containing, cytoplasmic (Pkdcc), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:6384829:6394146:1 gene:ENSRNOG00000004205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC166535 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase-like protein SgK493, mRNA (cDNA clone MGC:188128 IMAGE:7191008), complete cds. // chr6 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT046235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6335806:6393379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NM_001108008 // RefSeq // Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 4 (Eml4), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000042307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:6573579:6629032:1 gene:ENSRNOG00000030294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000020519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6568960:6635656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT046236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_001108008 // RefSeq // Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 4 (Eml4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:6573579:6629032:1 gene:ENSRNOG00000030294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6568960:6635656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT046236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000020523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6777873:6792156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006225683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metastasis associated 1 family, member 3 (Mta3), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_006225684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metastasis associated 1 family, member 3 (Mta3), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006225686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metastasis associated 1 family, member 3 (Mta3), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006225689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metastasis associated 1 family, member 3 (Mta3), transcript variant X9, mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061921 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:6899431:6981336:1 gene:ENSRNOG00000004685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6857408:6972360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
XM_006225686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metastasis associated 1 family, member 3 (Mta3), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191770 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 2 (Plekhh2), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7731647:7830438:1 gene:ENSRNOG00000005124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:7696463:7830438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001013940 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 (Dync2li1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1 (Dync2li1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7837943:7869291:1 gene:ENSRNOG00000005151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7837943:7869291:1 gene:ENSRNOG00000005151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079201 // GenBank // Rattus norvegicus dynein cytoplasmic 2 light intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:94260 IMAGE:7131728), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:7838336:7876456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT046252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_130414 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 8 (Abcg8), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7897005:7916593:1 gene:ENSRNOG00000005420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7897005:7916593:1 gene:ENSRNOG00000005420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF351785 // GenBank // Rattus norvegicus sterolin-2 (Abcg8) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:7892076:7916224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_017216 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 3, member 1 (Slc3a1), mRNA. // chr6 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:8217523:8251124:1 gene:ENSRNOG00000007006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC078852 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 3, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93505 IMAGE:7110514), complete cds. // chr6 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// M77345 // GenBank // Rat L-type neutral amino acid transporter mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000054312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:8217587:8248155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001134463 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin-lysine N-methyltransferase (Camkmt), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006239704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calmodulin-lysine N-methyltransferase (Camkmt), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000048550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:8279200:8656790:1 gene:ENSRNOG00000030629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:8560837:8684751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:8278458:8342759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
GENSCAN00000006810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:8502997:8503710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 63 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT046265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_023990 // RefSeq // Rattus norvegicus SIX homeobox 3 (Six3), mRNA. // chr6 // 99 // 99 // 81 // 82 // 0 /// ENSRNOT00000036034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:8811894:8814540:1 gene:ENSRNOG00000024544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 99 // 99 // 81 // 82 // 0 /// AB030833 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for homeobox protein Six3, complete cds. // chr6 // 99 // 99 // 81 // 82 // 0 /// GENSCAN00000006822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:8799443:8815701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 78 // 78 // 0 /// NONRATT046267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0
NM_017171 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, epsilon (Prkce), mRNA. // chr6 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:9404742:9883579:1 gene:ENSRNOG00000015603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AY642593 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C epsilon mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:9681868:9730828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:9847626:9883291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_198751 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit H (Eif3h), mRNA. // chr6 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// XR_346968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H-like (LOC362695), misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20146737:20231688:1 gene:ENSRNOG00000004252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000061786 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:116799061:116809296:-1 gene:ENSRNOG00000040153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 69 // 17 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073812 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:116799067:116809296:-1 gene:ENSRNOG00000040153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 69 // 17 // 20 // 0 /// BC060586 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit H, mRNA (cDNA clone MGC:72941 IMAGE:6918037), complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116799061:116872447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 86 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:20146766:20231533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// NONRATT046275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// NONRATT046276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT046277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_023090 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelial PAS domain protein 1 (Epas1), mRNA. // chr6 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// XM_006239709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endothelial PAS domain protein 1 (Epas1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20299621:20377837:1 gene:ENSRNOG00000021318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:20324805:20377811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT046280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_053522 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member Q (Rhoq), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000020822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20521668:20557098:1 gene:ENSRNOG00000015415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// AB031482 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GTP-binding protein tc10, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC061760 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member Q, mRNA (cDNA clone MGC:72358 IMAGE:5621223), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT046281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0
NM_019907 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich PDZ-binding protein (Cript), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20582635:20590644:1 gene:ENSRNOG00000015215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF047384 // GenBank // Rattus norvegicus postsynaptic protein CRIPT mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ213014 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YD11 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// FQ222669 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YH09 mRNA sequence. // chr6 // 83 // 52 // 10 // 12 // 0 /// FQ230603 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YM10 mRNA sequence. // chr6 // 73 // 48 // 8 // 11 // 0 /// NONRATT046284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001109274 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 5 (Socs5), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006239718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 5 (Socs5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000020337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20665943:20696549:1 gene:ENSRNOG00000028504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001100756 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 7A (Ttc7a), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// XM_006239712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 7A (Ttc7a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// XM_006239713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 7A (Ttc7a), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000061747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20900469:21002055:1 gene:ENSRNOG00000014879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC168226 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:188251 IMAGE:7371309), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT046288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000041378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:20936617:20982582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// GENSCAN00000041382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:20900153:20926914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_138541 // RefSeq // Rattus norvegicus epithelial cell adhesion molecule (Epcam), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:21264138:21280102:-1 gene:ENSRNOG00000015667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ001044 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for EGP-314 protein homologue. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061787 // GenBank // Rattus norvegicus tumor-associated calcium signal transducer 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5623760). // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC072691 // GenBank // Rattus norvegicus tumor-associated calcium signal transducer 1, mRNA (cDNA clone MGC:91434 IMAGE:7098920), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21264561:21280011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031058 // RefSeq // Rattus norvegicus mutS homolog 2 (Msh2), mRNA. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:21198374:21256854:-1 gene:ENSRNOG00000015796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC161846 // GenBank // Rattus norvegicus mutS homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:187365 IMAGE:9029023), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21178963:21256838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006225669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mutS homolog 6 (LOC100360342), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:21616774:21634251:1 gene:ENSRNOG00000016134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21627253:21637126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT046296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT046297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006225666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box N2 (Foxn2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// XM_006225667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box N2 (Foxn2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// XM_006239739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box N2 (Foxn2), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// XM_237502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box N2 (Foxn2), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000061693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:22145314:22167316:1 gene:ENSRNOG00000040110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:22124181:22167316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT046298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001271305 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 21 (Ppp1r21), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:22275066:22281276:1 gene:ENSRNOG00000016528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000061675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:22219236:22281276:1 gene:ENSRNOG00000016528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:22219236:22285989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_182954 // RefSeq // Rattus norvegicus stonin 1 (Ston1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stonin 1 (Ston1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:22325769:22342414:1 gene:ENSRNOG00000016688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY300793 // GenBank // Rattus norvegicus stonin mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:22335606:22341809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 85 // 46 // 11 // 13 // 0
NM_001012136 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIA, 1-like (Gtf2a1l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus general transcription factor IIA, 1-like (Gtf2a1l), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:22378517:22431362:1 gene:ENSRNOG00000016703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC082104 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIA, 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:95300 IMAGE:7134703), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:22414756:22431208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT046305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000061631 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:24307961:24308568:1 gene:ENSRNOG00000040076 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001191930 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-N-acteylglucosamine pyrophosphorylase 1 (Uap1), mRNA. // chr6 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000058560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93089458:93123827:-1 gene:ENSRNOG00000002926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050986 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:27665903:27667471:1 gene:ENSRNOG00000031342 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93089934:93116294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:27666020:27667471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT017677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSRNOT00000061587 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:28503921:28504360:1 gene:ENSRNOG00000040044 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 70 // 100 // 14 // 20 // 0
XM_006225815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12-like (LOC100910710), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001014073 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 98, member A (Fam98a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000052131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:30945057:30959716:1 gene:ENSRNOG00000030328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC089217 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 98, member A, mRNA (cDNA clone MGC:106015 IMAGE:7304253), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:30865370:30958669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
XM_003750109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, CARD domain containing 4 (Nlrc4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, CARD domain containing 4 (Nlrc4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000007655 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:32062740:32081534:1 gene:ENSRNOG00000005810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:32060775:32084111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001170545 // RefSeq // Rattus norvegicus dpy-30 homolog (C. elegans) (Dpy30), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_173117 // RefSeq // Rattus norvegicus dpy-30 homolog (C. elegans) (Dpy30), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:32188946:32203027:1 gene:ENSRNOG00000027126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY129401 // GenBank // Rattus norvegicus AIP1 mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// BC059112 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6920646, partial cds. // chr6 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT046324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001029917 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator of cell motility 1 (Memo1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:32248023:32295274:1 gene:ENSRNOG00000006340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098061 // GenBank // Rattus norvegicus mediator of cell motility 1, mRNA (cDNA clone MGC:116222 IMAGE:7458219), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:32232351:32294790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT046330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT046332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENSRNOT00000008714 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:32343030:32343379:1 gene:ENSRNOG00000006668 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:32301676:32343379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000036701 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:32450370:32450955:1 gene:ENSRNOG00000027062 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:32427595:32450955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_017154 // RefSeq // Rattus norvegicus xanthine dehydrogenase (Xdh), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000009634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:34996983:35059195:-1 gene:ENSRNOG00000007081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// J05579 // GenBank // Rat xanthine dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000020376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:34991807:35059169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_022711 // RefSeq // Rattus norvegicus steroid-5-alpha-reductase, alpha polypeptide 2 (3-oxo-5 alpha-steroid delta 4-dehydrogenase alpha 2) (Srd5a2), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:35106013:35163408:-1 gene:ENSRNOG00000027042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M95058 // GenBank // Rattus rattus steroid 5-alpha-reductase 2 mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT047791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:35081603:35355926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001012109 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 (Galnt14), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 (GalNAc-T14) (Galnt14), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:34618799:34832960:-1 gene:ENSRNOG00000007951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC079128 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 14 (GalNAc-T14), mRNA (cDNA clone MGC:94136 IMAGE:7127183), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000031557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:34557408:34766886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_001025133 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 13 (Capn13), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006239776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 13 (Capn13), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000047853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:34429088:34525105:-1 gene:ENSRNOG00000032375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC091250 // GenBank // Rattus norvegicus calpain 13, mRNA (cDNA clone MGC:109045 IMAGE:7368359), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XR_354597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 13 (Capn13), transcript variant X5, misc_RNA. // chr6 // 72 // 72 // 31 // 43 // 1 /// GENSCAN00000009812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:34452860:34477112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000009802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:34413242:34450561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1
ENSRNOT00000074294 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:34412620:34413818:-1 gene:ENSRNOG00000051000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:34413242:34450561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000026311 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:33794539:33795469:-1 gene:ENSRNOG00000019392 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000015053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33794539:33837948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
ENSRNOT00000011630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:32580734:33082961:1 gene:ENSRNOG00000008683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 28 // 28 // 0 /// NM_001169101 // RefSeq // Rattus norvegicus anaplastic lymphoma receptor tyrosine kinase (Alk), mRNA. // chr6 // 62 // 62 // 28 // 45 // 1 /// GENSCAN00000040246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33029547:33082375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT046333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
XM_006225702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC313891 (RGD1304963), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC313891 (RGD1304963), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011832 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:33204235:33211837:1 gene:ENSRNOG00000008942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33204235:33211837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000006211 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:35775558:35776185:1 gene:ENSRNOG00000004694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 84 // 13 // 16 // 0 /// NONRATT046357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:35775558:35832177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_001108703 // RefSeq // Rattus norvegicus ribokinase (Rbks), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006239805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribokinase (Rbks), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribokinase (Rbks), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:35875927:35953018:1 gene:ENSRNOG00000004710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ209797 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA3YB08 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:35875961:35926554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT046361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
ENSRNOT00000006485 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:36032930:36033859:1 gene:ENSRNOG00000004876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
NM_001108010 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of Ty 7 (S. cerevisiae)-like (Supt7l), mRNA. // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36065222:36075359:1 gene:ENSRNOG00000004927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC168944 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of Ty 7 (S. cerevisiae)-like, mRNA (cDNA clone MGC:189248 IMAGE:8371512), complete cds. // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36068828:36074948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_147209 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1G (Ppm1g), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36336359:36355553:1 gene:ENSRNOG00000026905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF525687 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase PP2C gamma mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC062083 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1G (formerly 2C), magnesium-dependent, gamma isoform, mRNA (cDNA clone MGC:72287 IMAGE:5599833), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36336483:36358977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001012110 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 513 (Zfp513), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36355970:36359311:1 gene:ENSRNOG00000005298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC089202 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 513, mRNA (cDNA clone MGC:105911 IMAGE:7192688), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36336483:36358977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT046371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT046370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_053950 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 4 delta (Eif2b4), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36364317:36369267:1 gene:ENSRNOG00000005301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36364324:36369267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT046374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT046376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001025120 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 2, beta (Gtf3c2), mRNA. // chr6 // 80 // 80 // 43 // 54 // 1 /// BC087088 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 2, beta, mRNA (cDNA clone MGC:94586 IMAGE:7190300), complete cds. // chr6 // 80 // 80 // 43 // 54 // 1 /// ENSRNOT00000061036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36383331:36401257:1 gene:ENSRNOG00000005938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 40 // 54 // 1 /// GENSCAN00000041211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36375841:36412980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT046380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 24 // 54 // 1 /// NONRATT046381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 17 // 17 // 9 // 54 // 1 /// NONRATT046383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 15 // 15 // 8 // 54 // 1
NM_019150 // RefSeq // Rattus norvegicus urocortin (Ucn), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36418524:36419354:1 gene:ENSRNOG00000006090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U33935 // GenBank // Rattus norvegicus corticotensin mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36418833:36419201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT046392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013243 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 3 (Slc30a3), mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36457851:36464874:1 gene:ENSRNOG00000006204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AY538655 // GenBank // Rattus norvegicus zinc transporter ZnT-3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC086513 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:105899 IMAGE:7134069), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36444146:36464432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// NONRATT046393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT046395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_130746 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/multivitamin and iodide cotransporter), member 6 (Slc5a6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000009042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36500814:36512084:1 gene:ENSRNOG00000006556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF026554 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-dependent multi-vitamin transporter (SMVT) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF081204 // GenBank // Rattus norvegicus small intestine sodium dependent multivitamin transporter (SMVT) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AF081205 // GenBank // Rattus norvegicus kidney sodium dependent multivitamin transporter (SMVT) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// BC168145 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium-dependent vitamin transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:187340 IMAGE:8371761), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36505029:36511337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT046399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT046401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// NONRATT046403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT046398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001170709 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 30 (Prr30), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009916 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:36595967:36598479:1 gene:ENSRNOG00000025726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT046406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36594116:36602922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT046404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001170708 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin regulatory element binding (Preb), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36599703:36603487:1 gene:ENSRNOG00000007141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF061817 // GenBank // Rattus norvegicus DNA-binding protein PREB (Preb) mRNA, complete cds. // chr6 // 87 // 97 // 26 // 30 // 0 /// BC078936 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin regulatory element binding, mRNA (cDNA clone MGC:93749 IMAGE:7108249), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36594116:36602922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT046407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT046409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_139087 // RefSeq // Rattus norvegicus cell growth regulator with EF hand domain 1 (Cgref1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36612741:36624744:1 gene:ENSRNOG00000007923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U66470 // GenBank // Rattus norvegicus cell growth regulator rCGR11 mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36612744:36624397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134690 // RefSeq // Rattus norvegicus oligosaccharyltransferase 4 homolog (S. cerevisiae) (Ost4), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_001134691 // RefSeq // Rattus norvegicus oligosaccharyltransferase 4 homolog (S. cerevisiae) (Ost4), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000011373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36651859:36653055:1 gene:ENSRNOG00000008605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC157814 // GenBank // Rattus norvegicus dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:187574 IMAGE:8362186), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000071311 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:37026308:37026866:1 gene:ENSRNOG00000048177 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
XM_001068424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium and integrin binding family member 4 (Cib4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003754153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium and integrin binding family member 4 (Cib4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37058459:37115825:1 gene:ENSRNOG00000009898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37058459:37114725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001276720 // RefSeq // Rattus norvegicus otoferlin (Otof), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000044278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37140887:37236346:1 gene:ENSRNOG00000009967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000053186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37161354:37233982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0
NM_001106712 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 113 (Gpr113), mRNA. // chr6 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// XM_006239800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 113 (Gpr113), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37346855:37357114:1 gene:ENSRNOG00000024766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37345708:37365229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_130826 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/3-ketoacyl-CoA thiolase/enoyl-CoA hydratase (trifunctional protein), alpha subunit (Hadha), mRNA. // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000038649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37400511:37439591:1 gene:ENSRNOG00000024629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// BC091697 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase/3-ketoacyl-Coenzyme A thiolase/enoyl-Coenzyme A hydratase (trifunctional protein), alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:105338 IMAGE:7301707), complete cds. // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// D16478 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mitochondrial long-chain enoyl-CoA hydRattus norvegicusase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase alpha-subunit of mitochondrial trifunctional protein, complete cds. // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// FQ224949 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YF11 mRNA sequence. // chr6 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT046424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37400527:37439389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_130826 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/3-ketoacyl-CoA thiolase/enoyl-CoA hydratase (trifunctional protein), alpha subunit (Hadha), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000038649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37400511:37439591:1 gene:ENSRNOG00000024629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC091697 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase/3-ketoacyl-Coenzyme A thiolase/enoyl-Coenzyme A hydratase (trifunctional protein), alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:105338 IMAGE:7301707), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// D16478 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mitochondrial long-chain enoyl-CoA hydRattus norvegicusase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase alpha-subunit of mitochondrial trifunctional protein, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ224949 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YF11 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000053189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37400527:37439389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_053486 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 3C (Kif3c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37579445:37625883:1 gene:ENSRNOG00000011394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF083330 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-like protein KIF3C (KIF3C) mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// AJ223599 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for kinesin-related polypeptide KIF3C, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37579523:37628740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
XM_006225712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus additional sex combs like 2 (Drosophila) (Asxl2), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// XM_006225714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus additional sex combs like 2 (Drosophila) (Asxl2), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// XM_006225715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus additional sex combs like 2 (Drosophila) (Asxl2), transcript variant X8, mRNA. // chr6 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000015827 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:37646074:37728356:1 gene:ENSRNOG00000011908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000061505 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:37646074:37728356:1 gene:ENSRNOG00000011908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37673730:37728356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0
NM_001012191 // RefSeq // Rattus norvegicus dystrobrevin, beta (Dtnb), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006239816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dystrobrevin, beta (Dtnb), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000060810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37788347:37986143:1 gene:ENSRNOG00000011914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC081889 // GenBank // Rattus norvegicus dystrobrevin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:93784 IMAGE:7109493), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT046439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT046440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT046437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// NONRATT046441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// NONRATT046442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT046443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT046444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// GENSCAN00000016335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37976238:37985505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000033600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37923221:37965522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// NONRATT046438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT046445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001003957 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha (Dnmt3a), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NM_001003958 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 alpha (Dnmt3a), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000047210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:38044960:38149613:1 gene:ENSRNOG00000026649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT046450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38128966:38197700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_139326 // RefSeq // Rattus norvegicus proopiomelanocortin (Pomc), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:38191989:38197809:1 gene:ENSRNOG00000012686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF510391 // GenBank // Rattus norvegicus proopiomelanocortin precursor (Pomc) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC058443 // GenBank // Rattus norvegicus proopiomelanocortin, mRNA (cDNA clone MGC:72676 IMAGE:6919050), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38128966:38197700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT046458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_206845 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 27 (Dnajc27), mRNA. // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XR_354627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 27 (Dnajc27), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000005317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:38322002:38351682:1 gene:ENSRNOG00000003988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AY539931 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00180 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38321951:38348102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_130779 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 3 (Adcy3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000005389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:38378060:38454925:1 gene:ENSRNOG00000003999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// M55075 // GenBank // R.norvegicus type III adenylyl cyclase mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000016347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38415379:38454190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT046463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT046465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001134524 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1 (Ptrhd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:38469515:38472900:1 gene:ENSRNOG00000004059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38469525:38472417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025151 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase family, AAA domain containing 2B (Atad2b), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000052041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:40825203:40889050:-1 gene:ENSRNOG00000005036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:40797786:40865933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1
GENSCAN00000021631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:40704155:40776877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
GENSCAN00000021631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:40704155:40776877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// NONRATT047898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NONRATT047895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001004270 // RefSeq // Rattus norvegicus snurportin 1 (Snupn), mRNA. // chr6 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// XM_006243127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus snurportin 1 (Snupn), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:60185056:60217869:1 gene:ENSRNOG00000005426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// BC079451 // GenBank // Rattus norvegicus snurportin 1, mRNA (cDNA clone MGC:95000 IMAGE:7121061), complete cds. // chr6 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// XM_006243128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus snurportin 1 (Snupn), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000017319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:42142860:42144002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 61 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:60192249:60217632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 92 // 28 // 33 // 0 /// NONRATT053324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// NONRATT053325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT053326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_019287 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein B (Apob), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000007371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:42956324:42995487:1 gene:ENSRNOG00000005542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000046811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:42956324:43004541:1 gene:ENSRNOG00000005542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:42972032:43004541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT046484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:42929966:42970710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
ENSRNOT00000030244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43191256:43276852:1 gene:ENSRNOG00000021475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ210061 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA35YE12 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43147408:43252488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT046485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000007991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43302693:43333012:1 gene:ENSRNOG00000006062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ224595 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA60YM06 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43302587:43331188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT046487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001106715 // RefSeq // Rattus norvegicus pumilio RNA-binding family member 2 (Pum2), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000008359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43569102:43648162:1 gene:ENSRNOG00000006180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000023807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43568951:43645336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT046491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// NONRATT046490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_013026 // RefSeq // Rattus norvegicus syndecan 1 (Sdc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43667444:43689898:1 gene:ENSRNOG00000006396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061834 // GenBank // Rattus norvegicus syndecan 1, mRNA (cDNA clone MGC:72516 IMAGE:5600086), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M81785 // GenBank // Rattus norvegicus syndecan mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43667652:43688048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_199384 // RefSeq // Rattus norvegicus lysosomal protein transmembrane 4 alpha (Laptm4a), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43822827:43841070:1 gene:ENSRNOG00000006865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC063179 // GenBank // Rattus norvegicus lysosomal protein transmembrane 4 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:72951 IMAGE:6890564), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// FQ212732 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YK22 mRNA sequence. // chr6 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// FQ229677 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YB23 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43797083:43840557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT046497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001108013 // RefSeq // Rattus norvegicus matrilin 3 (Matn3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43852755:43870024:1 gene:ENSRNOG00000007388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43852868:43875590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT046501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001099340 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 35-like (Wdr35l), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43875471:43932450:1 gene:ENSRNOG00000028783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// EF613262 // GenBank // Rattus norvegicus naofen mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43879587:43931873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT046506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001106716 // RefSeq // Rattus norvegicus odd-skipped related transciption factor 1 (Osr1), mRNA. // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// XM_006239887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus odd-skipped related transciption factor 1 (Osr1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000005666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:45083960:45086318:1 gene:ENSRNOG00000004210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// BC159410 // GenBank // Rattus norvegicus odd-skipped related 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188687 IMAGE:8366695), complete cds. // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:45068752:45085749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001011982 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IB (Nt5c1b), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:45851471:45868642:1 gene:ENSRNOG00000004296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC079437 // GenBank // Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IB, mRNA (cDNA clone MGC:94985 IMAGE:7115294), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:45853071:45868611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001109276 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 14 (all-trans/9-cis/11-cis) (Rdh14), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:45868730:45873873:1 gene:ENSRNOG00000039551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:45869184:45873467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT046512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108014 // RefSeq // Rattus norvegicus structural maintenance of chromosomes 6 (Smc6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:46691346:46744578:1 gene:ENSRNOG00000004908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:46697079:46744182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106718 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 49, member A (Fam49a), mRNA. // chr6 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000007701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:50682248:50788037:1 gene:ENSRNOG00000005836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// BC158700 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 49, member A, mRNA (cDNA clone MGC:187774 IMAGE:9028479), complete cds. // chr6 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:50768294:50815224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000049436 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:47214867:47215662:1 gene:ENSRNOG00000029257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:47213112:47236560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuroblastoma amplified sequence (Nbas), mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 52 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000009779 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:47240439:47541152:1 gene:ENSRNOG00000024503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000036374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:47240439:47424293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 19 // 19 // 10 // 53 // 1
ENSRNOT00000044011 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:47337555:47338105:1 gene:ENSRNOG00000029714 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 85 // 62 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT046519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001100717 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F transcription factor 6 (E2f6), mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000060499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:51811952:51828124:1 gene:ENSRNOG00000004449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AY211264 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor E2F6b mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// FQ216870 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA40YF04 mRNA sequence. // chr6 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:51811952:51821503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT046532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT046533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_013022 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho-associated coiled-coil containing protein kinase 2 (Rock2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006239910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho-associated coiled-coil containing protein kinase 2 (Rock2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:51952278:52006294:1 gene:ENSRNOG00000004496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// U38481 // GenBank // Rattus norvegicus ROK-alpha mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:51970642:52004105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000038391 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:52505670:52506440:1 gene:ENSRNOG00000024118 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 90 // 77 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52505670:52506378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
NM_001014076 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar protein 10 (Nol10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000007169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:52376044:52460900:1 gene:ENSRNOG00000005344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC081954 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:94045 IMAGE:7122941), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000021681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52376117:52464371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT046540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_012615 // RefSeq // Rattus norvegicus ornithine decarboxylase 1 (Odc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:52565188:52571771:1 gene:ENSRNOG00000005424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC078882 // GenBank // Rattus norvegicus ornithine decarboxylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93569 IMAGE:7115603), complete cds. // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// J04791 // GenBank // Rattus norvegicus ornithine decarboxylase (ODC) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M16982 // GenBank // Rat ornithine decarboxylase (ODC) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52567559:52571057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT046545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT046546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT046548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NONRATT046544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT046545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT046546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT046547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT046548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT046543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1
XM_001074453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L35-like (RGD1563157), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_233992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L35-like (RGD1563157), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000041376 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:52658829:52659200:1 gene:ENSRNOG00000032523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52658829:52659200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_017356 // RefSeq // Rattus norvegicus hippocalcin-like 1 (Hpcal1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:52713426:52818871:1 gene:ENSRNOG00000005492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088759 // GenBank // Rattus norvegicus hippocalcin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:105459 IMAGE:7317905), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D13126 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neural visinin-like Ca2+-binding protein type 3 (NVP-3), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// FQ214068 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YA24 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52811801:52818108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT046551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT046555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
XM_006225818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 (Asap2), partial mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// XM_006239999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 2 (Asap2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000008173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60104140:60213869:1 gene:ENSRNOG00000006056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60104140:60213869:1 gene:ENSRNOG00000006056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000060408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60104140:60213869:1 gene:ENSRNOG00000006056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60104140:60213869:1 gene:ENSRNOG00000006056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60115941:60213869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT046620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0
NM_001030030 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 3, 73kDa (Cpsf3), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000009652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60231498:60259421:1 gene:ENSRNOG00000007194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC099817 // GenBank // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specificity factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:124885 IMAGE:7929543), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000017728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60227832:60259340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
NONRATT046625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001100540 // RefSeq // Rattus norvegicus isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog (S. cerevisiae) (Iah1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60260794:60268037:1 gene:ENSRNOG00000007379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AJ344542 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for hypertrophic agonist responsive protein (harpB64 gene). // chr6 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// BC168771 // GenBank // Rattus norvegicus isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188914 IMAGE:6919650), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ232084 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YB04 mRNA sequence. // chr6 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60260835:60267888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001191107 // RefSeq // Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, B (Taf1b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60512955:60589982:1 gene:ENSRNOG00000004506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60512955:60542631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT046633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_002726727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus grainyhead-like 1 (Drosophila) (Grhl1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_234006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus grainyhead-like 1 (Drosophila) (Grhl1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038519 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:60611761:60662227:1 gene:ENSRNOG00000023316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000070985 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:60606789:60616769:1 gene:ENSRNOG00000023316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60576055:60665828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000005053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60678078:60710906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001037354 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 11 (Klf11), mRNA. // chr6 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// XM_006239983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 11 (Klf11), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XR_354724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 11 (Klf11), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60701428:60713134:1 gene:ENSRNOG00000000216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ232764 // GenBank // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 11 mRNA, complete cds. // chr6 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// XM_006239984 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 11 (Klf11), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT046642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60678078:60710906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001025740 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonucleotide reductase M2 (Rrm2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36367878:36370407:1 gene:ENSRNOG00000008450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000037387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60756211:60761048:1 gene:ENSRNOG00000023272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099082 // GenBank // Rattus norvegicus ribonucleotide reductase M2, mRNA (cDNA clone MGC:116120 IMAGE:7443729), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60756211:60761048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36367929:36369101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0
NM_001108016 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 (Mboat2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane bound O-acyltransferase domain containing 2 (Mboat2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60881777:61003918:1 gene:ENSRNOG00000006777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60984911:61043176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT046647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_053795 // RefSeq // Rattus norvegicus kinase D-interacting substrate 220 (Kidins220), mRNA. // chr6 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:52955625:53048254:1 gene:ENSRNOG00000023176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:52955625:53048254:1 gene:ENSRNOG00000023176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF239045 // GenBank // Rattus norvegicus KIDINS220 (Kidins220) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// AF313464 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat-rich membrane-spanning protein (ARMS) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52966914:53046519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT046558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001108017 // RefSeq // Rattus norvegicus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 2, mitochondrial (Cmpk2), mRNA. // chr6 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000052003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:54403782:54414584:1 gene:ENSRNOG00000007690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT046568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:54403775:54412867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
ENSRNOT00000010875 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:56386872:56387352:1 gene:ENSRNOG00000008228 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001013097 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease H1 (Rnaseh1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NM_001286938 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease H1 (Rnaseh1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000011819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56618249:56627607:1 gene:ENSRNOG00000008584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC091209 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease H1, mRNA (cDNA clone MGC:108918 IMAGE:7381386), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56623030:56653472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_199097 // RefSeq // Rattus norvegicus acireductone dioxygenase 1 (Adi1), mRNA. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56642239:56649206:1 gene:ENSRNOG00000008950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY346335 // GenBank // Rattus norvegicus ARD-like protein mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC092562 // GenBank // Rattus norvegicus acireductone dioxygenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:108527 IMAGE:7326245), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ210879 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA20YL07 mRNA sequence. // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// FQ216451 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YM01 mRNA sequence. // chr6 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT046576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56623030:56653472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT046577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001012192 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor suppressing subtransferable candidate 1 (Tssc1), mRNA. // chr6 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56832526:56837116:1 gene:ENSRNOG00000009285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC087633 // GenBank // Rattus norvegicus tumor suppressing subtransferable candidate 1, mRNA (cDNA clone MGC:105636 IMAGE:7320156), complete cds. // chr6 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT046579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56723879:56744490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000005441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56793165:56836770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT046578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT046580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT046581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_053888 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin transcription factor 1-like (Myt1l), mRNA. // chr6 // 89 // 93 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005905 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:57146288:57529924:1 gene:ENSRNOG00000004269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:57146288:57529924:1 gene:ENSRNOG00000004269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// U48809 // GenBank // Rattus norvegicus neural zinc finger factor-1 (NZF-1) mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 93 // 24 // 27 // 0 /// U67081 // GenBank // Rattus norvegicus C2-HC type zinc finger protein r-MyT2 mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT046584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:57463996:57531190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT046585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT046586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001271261 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxidasin homolog (Drosophila) (Pxdn), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:57551669:57661402:1 gene:ENSRNOG00000004508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:57551669:57614359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT046587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT046588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
GENSCAN00000029502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:58073625:58073882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT046590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001007748 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 18 (Tmem18), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:58209471:58215201:1 gene:ENSRNOG00000005144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC076388 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 18, mRNA (cDNA clone MGC:93786 IMAGE:7109513), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001109372 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 150, member B (Fam150b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 150, member B (Fam150b), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:58505391:58514834:1 gene:ENSRNOG00000005154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:58505871:58516480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
NM_001108705 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 and SYLF domain containing 1 (Sh3yl1), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:58531557:58574823:1 gene:ENSRNOG00000005522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC158742 // GenBank // Rattus norvegicus SH3 domain containing, Ysc84-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187919 IMAGE:9100399), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:58539045:58573404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT046598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT046599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT046600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001025051 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 110, member C (Fam110c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:58647800:58654055:1 gene:ENSRNOG00000005660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085778 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 110, member C, mRNA (cDNA clone MGC:93717 IMAGE:7106593), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:58647655:58648809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT046602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003750137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus laminin, beta 1 (Lamb1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008321 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:59204204:59271185:1 gene:ENSRNOG00000005678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000039536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59180592:59271185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_053755 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 3 (Slc26a3), mRNA. // chr6 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000009473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59395885:59437100:1 gene:ENSRNOG00000006878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF337809 // GenBank // Rattus norvegicus down-regulated in adenoma protein mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000039535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59407182:59436730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT046610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
XM_006225740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus conserved oligomeric Golgi complex subunit 5-like (RGD1563296), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59615559:59901353:1 gene:ENSRNOG00000008827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59615559:59681916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59745806:59881010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT046616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT046617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSRNOT00000065561 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:61299592:61300029:1 gene:ENSRNOG00000043366 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0 /// NONRATT046649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_177928 // RefSeq // Rattus norvegicus nicotinamide phosphoribosyltransferase (Nampt), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:61753125:61787574:1 gene:ENSRNOG00000009754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AB081730 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for pre-B-cell colony-enhancing factor, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AY831728 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinamide phosphoribosyltransferase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC085681 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinamide phosphoribosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93053 IMAGE:7192109), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:61753303:61789491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1
NM_001014263 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptophysin-like 1 (Sypl1), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:61891964:61910838:1 gene:ENSRNOG00000009856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC082078 // GenBank // Rattus norvegicus synaptophysin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:95246 IMAGE:7133263), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT046653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT046655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT046657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:61892026:61916826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT046654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT046656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT046659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
ENSRNOT00000013474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62083390:62181811:1 gene:ENSRNOG00000030911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000073277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62083390:62181811:1 gene:ENSRNOG00000030911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// BC166538 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7191876, partial cds. // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XM_006225742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XM_006225743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XM_006240007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:62074953:62196415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT046661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
XM_006225742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006225753 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X12, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 4 (Atxn7l4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62284571:62294041:1 gene:ENSRNOG00000010415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000014054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62253461:62294041:1 gene:ENSRNOG00000010415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000052394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:62261032:62305836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001108706 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 10 (Efcab10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62323316:62330235:1 gene:ENSRNOG00000010730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:62323554:62327061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108707 // RefSeq // Rattus norvegicus TWIST neighbor (Twistnb), mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62372118:62389586:1 gene:ENSRNOG00000010750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// FQ234148 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YP24 mRNA sequence. // chr6 // 53 // 68 // 9 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:62372218:62387095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT046669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_212519 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae) (Tomm70a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48672524:48706365:-1 gene:ENSRNOG00000001640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62442691:62444516:-1 gene:ENSRNOG00000011040 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB162856 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TOM70, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC098640 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112570 IMAGE:7099109), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ228582 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YI05 mRNA sequence. // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48667975:48706228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:62442691:62445023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT048035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_001108980 // RefSeq // Rattus norvegicus Fer3-like bHLH transcription factor (Ferd3l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62993988:62994866:1 gene:ENSRNOG00000011091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:62994044:62994544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053530 // RefSeq // Rattus norvegicus twist family bHLH transcription factor 1 (Twist1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:63023391:63025505:1 gene:ENSRNOG00000011101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC166412 // GenBank // Rattus norvegicus twist homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:187265 IMAGE:9033082), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:63000824:63024312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
NM_001105678 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1-like 1 (Prps1l1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000052356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:64038717:64040407:1 gene:ENSRNOG00000032513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:64038846:64039802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT046672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001108708 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 13 (Snx13), mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000005637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:64112186:64212889:1 gene:ENSRNOG00000004186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:64145053:64222091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT046673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106724 // RefSeq // Rattus norvegicus anterior gradient 3 (Agr3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:64991885:65039747:1 gene:ENSRNOG00000004994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106725 // RefSeq // Rattus norvegicus anterior gradient 2 (Agr2), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anterior gradient 2 (Agr2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:65081213:65102517:1 gene:ENSRNOG00000005023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:65094719:65102340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT046681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001108019 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and MYND domain containing 2 (Ankmy2), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and MYND domain containing 2 (Ankmy2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and MYND domain containing 2 (Ankmy2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:65262213:65303138:1 gene:ENSRNOG00000005623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:65268407:65302283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_153737 // RefSeq // Rattus norvegicus sclerostin domain containing 1 (Sostdc1), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:65423740:65427920:1 gene:ENSRNOG00000005770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF411056 // GenBank // Rattus norvegicus uterine sensitization-associated gene 1 (Usag1) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC081710 // GenBank // Rattus norvegicus sclerostin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:93115 IMAGE:7191839), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:65423807:65426984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT046688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001008386 // RefSeq // Rattus norvegicus isoprenoid synthase domain containing (Ispd), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:65492817:65769833:1 gene:ENSRNOG00000006199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY769991 // GenBank // Rattus norvegicus notch1-induced protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY769992 // GenBank // Rattus norvegicus notch1-induced protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isoprenoid synthase domain containing (Ispd), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000007279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:65501115:65623244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_017149 // RefSeq // Rattus norvegicus mesenchyme homeobox 2 (Meox2), mRNA. // chr6 // 93 // 93 // 13 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000008803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:66231863:66293008:1 gene:ENSRNOG00000006588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT046691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001135899 // RefSeq // Rattus norvegicus alkylglycerol monooxygenase (Agmo), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:66448763:66793162:1 gene:ENSRNOG00000023116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127545 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 195, mRNA (cDNA clone MGC:156828 IMAGE:7321962), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ211046 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YF24 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
GENSCAN00000018507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:66981357:66981796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0
NM_019304 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, beta (Dgkb), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000063874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:67113446:67868708:1 gene:ENSRNOG00000030771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// D16100 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 90kDa-diacylglycerol kinase, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// GENSCAN00000018505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:67306422:67447297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// NONRATT046695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1
ENSRNOT00000036337 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:67980152:67980835:1 gene:ENSRNOG00000022450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:67980458:67980835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_001108709 // RefSeq // Rattus norvegicus ets variant 1 (Etv1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_001163156 // RefSeq // Rattus norvegicus ets variant 1 (Etv1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006240047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ets variant 1 (Etv1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006240050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ets variant 1 (Etv1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:68061144:68152515:1 gene:ENSRNOG00000006867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC168860 // GenBank // Rattus norvegicus ets variant 1, mRNA (cDNA clone MGC:189094 IMAGE:7121808), complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:68025117:68147393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT046701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENSRNOT00000006709 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:70153948:70369085:1 gene:ENSRNOG00000004823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000075193 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:70153948:70369085:1 gene:ENSRNOG00000004823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// XM_006240053 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 4 (Dock4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 65 // 65 // 33 // 51 // 1 /// GENSCAN00000016105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:70142494:70440205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 82 // 42 // 51 // 1
XM_002726737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP2 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp2l), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_002729645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP2 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp2l), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP2 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp2l), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP2 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp2l), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP2 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp2l), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP2 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp2l), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:71131942:71221878:1 gene:ENSRNOG00000048173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000001718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:70589077:70725550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT046716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENSRNOT00000008681 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:72374321:72374891:1 gene:ENSRNOG00000006634 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:72374321:72374891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0
ENSRNOT00000047296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:73841473:73876145:1 gene:ENSRNOG00000039091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// FQ211866 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YN01 mRNA sequence. // chr6 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000047650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:73841590:73900122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_001061861 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leydig cell tumor 10 kDa protein homolog (LOC685003), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_002726696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Leydig cell tumor 10 kDa protein-like (LOC100364934), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_003750154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Leydig cell tumor 10 kDa protein-like (LOC100364934), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_003750155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leydig cell tumor 10 kDa protein homolog (LOC100912520), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074730 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:79834845:79848737:1 gene:ENSRNOG00000048806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000048273 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:79186979:79187503:1 gene:ENSRNOG00000032861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:79834851:79835761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:79848088:79854653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:79186979:79193544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_001078383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial-like (RGD1559629), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_576027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial-like (RGD1559629), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049500 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:79512128:79512526:1 gene:ENSRNOG00000031317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:79499507:79550762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_012560 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box G1 (Foxg1), mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:79532855:79535665:1 gene:ENSRNOG00000047891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// M87634 // GenBank // Rat BF-1 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:79499507:79550762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
XR_347217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546421 (LOC102546421), ncRNA. // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// XR_354802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546421 (LOC102546421), ncRNA. // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000040719 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:79550301:79550848:1 gene:ENSRNOG00000030912 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:79499507:79550762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106726 // RefSeq // Rattus norvegicus G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase (G2e3), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G2/M-phase specific E3 ubiquitin protein ligase (G2e3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:81659540:81685196:1 gene:ENSRNOG00000004232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ221669 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA33YD22 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:81587591:81683607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_019364 // RefSeq // Rattus norvegicus sec1 family domain containing 1 (Scfd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sec1 family domain containing 1 (Scfd1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:81688281:81766841:1 gene:ENSRNOG00000031203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D79221 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for vesicle transport-related protein (RA410), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U35364 // GenBank // Rattus norvegicus r-sly1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U57687 // GenBank // Rattus norvegicus rsly1p mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108710 // RefSeq // Rattus norvegicus cochlin (Coch), mRNA. // chr6 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000007365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:81924200:81928193:1 gene:ENSRNOG00000005286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// BC160874 // GenBank // Rattus norvegicus coagulation factor C homolog, cochlin (Limulus polyphemus), mRNA (cDNA clone MGC:188242 IMAGE:7367398), complete cds. // chr6 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// FQ221314 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA37YP20 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:81876821:81937134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT046741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT046739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001130999 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 4, sigma 1 subunit (Ap4s1), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:82026136:82066641:1 gene:ENSRNOG00000005765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ217797 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA17YI12 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC158697 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex AP-4, sigma 1, mRNA (cDNA clone MGC:187750 IMAGE:9026544), complete cds. // chr6 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// FQ214180 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YG16 mRNA sequence. // chr6 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT046743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82038830:82062552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001185025 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleotide binding protein-like (Nubpl), mRNA. // chr6 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:82453613:82709215:1 gene:ENSRNOG00000027444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ210674 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA24YI16 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82453641:82462218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSRNOT00000038715 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:82492207:82495474:1 gene:ENSRNOG00000027492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82489253:82511350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT046749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000059590 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:82756713:82757788:1 gene:ENSRNOG00000038982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82586326:82757788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_001047869 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 5 (Arhgap5), mRNA. // chr6 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:82918712:82926533:1 gene:ENSRNOG00000004696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82946938:82966879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000055053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82918712:82936904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 57 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0
NM_022618 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 6 (Akap6), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:83111482:83545576:1 gene:ENSRNOG00000004841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF139518 // GenBank // Rattus norvegicus A-kinase anchor protein mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006225768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal PAS domain protein 3 (Npas3), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000049945 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:84015921:84456422:1 gene:ENSRNOG00000032407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:84449119:84456422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0
NONRATT039965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 100 // 9 // 31 // 0
NM_019352 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast) (Timm23), mRNA. // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8241068:8267099:-1 gene:ENSRNOG00000019811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000048004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:84786045:84787147:-1 gene:ENSRNOG00000031285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB006451 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Tim23, complete cds. // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// BC083559 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:93478 IMAGE:7135081), complete cds. // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// FQ216447 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YM11 mRNA sequence. // chr6 // 62 // 100 // 18 // 29 // 0 /// NONRATT022958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NONRATT022959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051579 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:89672367:89672996:1 gene:ENSRNOG00000032900 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 73 // 76 // 16 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8241437:8267756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT022960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_053871 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle 54A (Srp54a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000052076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85532345:85572105:1 gene:ENSRNOG00000032776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079117 // GenBank // Rattus norvegicus signal recognition particle 54a, mRNA (cDNA clone MGC:94117 IMAGE:7126297), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ211580 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA87YK14 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85541551:85570044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_003754174 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 177, member A1 (Fam177a1), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039829 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:85578014:85590447:1 gene:ENSRNOG00000046391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85581877:85590447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001106730 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 1110008L16Rik protein (RGD1305089), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 1110008L16Rik protein (RGD1305089), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85615614:85708813:1 gene:ENSRNOG00000007043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168878 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 1110008L16Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:189132 IMAGE:7382020), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85705914:85708755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT046773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017283 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 6 (Psma6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006240098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 6 (Psma6), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000009666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85725314:85742471:1 gene:ENSRNOG00000007114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC062232 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 6, mRNA (cDNA clone MGC:72876 IMAGE:6888689), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ212808 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YE08 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ213294 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YK10 mRNA sequence. // chr6 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT046775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT046776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85725402:85755058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_001013943 // RefSeq // Rattus norvegicus aldolase 1 A retrogene 2 (Aldoart2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000043224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85883180:85884869:1 gene:ENSRNOG00000030869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC079243 // GenBank // Rattus norvegicus aldolase A-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94327 IMAGE:7132739), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85883241:85884335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT046777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_006240111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulinoma-associated 2 (Insm2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85917264:85918751:1 gene:ENSRNOG00000007754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85907116:85918751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT046778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000014851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:86161499:86161874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000036733 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:86161347:86161932:1 gene:ENSRNOG00000050397 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 57 // 88 // 4 // 7 // 0
ENSRNOT00000010876 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:86193465:86193876:1 gene:ENSRNOG00000008225 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// NONRATT046779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001106731 // RefSeq // Rattus norvegicus breast cancer metastasis-suppressor 1-like (Brms1l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:86207478:86240310:1 gene:ENSRNOG00000008249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC162034 // GenBank // Rattus norvegicus breast cancer metastasis-suppressor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:187949 IMAGE:7096422), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:86207590:86238846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
ENSRNOT00000011370 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:86457052:86458035:1 gene:ENSRNOG00000008366 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:86457052:86458035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 59 // 12 // 13 // 0
NM_001039539 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 9 (Pax9), mRNA. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:87133943:87150691:1 gene:ENSRNOG00000008826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB248957 // GenBank // Rattus norvegicus Pax9 mRNA for paired box protein 9, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT046783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000059408 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:87205437:87206922:1 gene:ENSRNOG00000022942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 89 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:87205927:87244421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001009694 // RefSeq // Rattus norvegicus ribose-phosphate pyrophosphokinase I -like (LOC314140), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000040360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:87689010:87697170:1 gene:ENSRNOG00000031938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// BC088149 // GenBank // Rattus norvegicus ribose-phosphate pyrophosphokinase I -like, mRNA (cDNA clone MGC:108713 IMAGE:7380332), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT046788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
XM_006225772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mirror-image polydactyly 1 (Mipol1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mirror-image polydactyly 1 (Mipol1), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_354844 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mirror-image polydactyly 1 (Mipol1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:87786212:88024568:1 gene:ENSRNOG00000009151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:87776732:87870346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006225772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mirror-image polydactyly 1 (Mipol1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mirror-image polydactyly 1 (Mipol1), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XR_354844 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mirror-image polydactyly 1 (Mipol1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:87786212:88024568:1 gene:ENSRNOG00000009151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ220776 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YL14 mRNA sequence. // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000024158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:87776732:87870346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001108983 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to C14orf25 protein (RGD1560556), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:88092531:88155706:1 gene:ENSRNOG00000022791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:88114132:88230612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000006363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:88231834:88303344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT046792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT046794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_012719 // RefSeq // Rattus norvegicus somatostatin receptor 1 (Sstr1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:88784408:88787878:1 gene:ENSRNOG00000048145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// M97656 // GenBank // Rattus norvegicus somatostatin receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// X62314 // GenBank // R.norvegicus mRNA for somatostatin receptor subtype 1. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:88778601:88785729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT046796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000005365 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:89028853:89029141:1 gene:ENSRNOG00000004034 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 86 // 96 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89028877:89032833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_199372 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4A1 (Eif4a1), mRNA. // chr6 // 21 // 100 // 8 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000049048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56016895:56022402:-1 gene:ENSRNOG00000030628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 21 // 100 // 8 // 38 // 0 /// BC063812 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4A1, mRNA (cDNA clone MGC:72964 IMAGE:6921521), complete cds. // chr6 // 21 // 100 // 8 // 38 // 0 /// FQ225866 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YO04 mRNA sequence. // chr6 // 21 // 100 // 8 // 38 // 0 /// FQ232549 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YF03 mRNA sequence. // chr6 // 21 // 100 // 8 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000071997 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:89548485:89549704:1 gene:ENSRNOG00000046740 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000040441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89548485:89549423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT046797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001109023 // RefSeq // Rattus norvegicus pinin, desmosome associated protein (Pnn), mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:89685236:89693549:1 gene:ENSRNOG00000004061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ234501 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YL16 mRNA sequence. // chr6 // 83 // 77 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89685254:89692936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_053389 // RefSeq // Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 2 (Gemin2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:89634623:89648253:1 gene:ENSRNOG00000004360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF176072 // GenBank // Rattus norvegicus SMN-interacting protein 1 (SIP1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098662 // GenBank // Rattus norvegicus survival of motor neuron protein interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:112609 IMAGE:7386123), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89634702:89645298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT046798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT046799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT046802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
XM_006225781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTAGE family, member 5 (Ctage5), mRNA. // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006240134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTAGE family, member 5 (Ctage5), mRNA. // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000059335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:89714815:89727425:1 gene:ENSRNOG00000038832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000040426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89714815:89812332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT046808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000040025 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:90882967:90884374:1 gene:ENSRNOG00000033497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_001108024 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 (Lrfn5), mRNA. // chr6 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:92602956:92952468:1 gene:ENSRNOG00000005550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// XR_354848 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 5 (Lrfn5), transcript variant X1, misc_RNA. // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000055743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:92942217:92947019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000055745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:93211917:93212640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000075627 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:95020104:95020506:-1 gene:ENSRNOG00000047025 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:95020104:95020728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000059286 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:96053480:96053908:1 gene:ENSRNOG00000038802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 56 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:96040122:96054220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001108025 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC314168 (RGD1307621), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034756 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:96145979:96154792:1 gene:ENSRNOG00000023230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:96142407:96177224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT046829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT046830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT046831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_002726743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 179, member B (Fam179b), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000005861 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:96205062:96268221:1 gene:ENSRNOG00000004415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000059271 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:96205062:96268221:1 gene:ENSRNOG00000004415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000008552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:96205062:96274819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT046837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// NONRATT046832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// NONRATT046836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// NONRATT046839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
XM_006225785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 39 (Prpf39), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 39 (Prpf39), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:96274790:96299787:1 gene:ENSRNOG00000004521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC166472 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9089277. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:96293590:96299787:1 gene:ENSRNOG00000004521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000008544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:96281216:96299097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XR_347274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C730036B14 gene (RGD1307897), transcript variant X4, misc_RNA. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XR_354855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C730036B14 gene (RGD1307897), transcript variant X4, misc_RNA. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000006574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:96312761:96335514:1 gene:ENSRNOG00000049286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC091339 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C730036B14 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:7315080), complete cds. // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000059244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:96348000:96362690:1 gene:ENSRNOG00000023098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:96312761:96365385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT046847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
GENSCAN00000009827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:21932275:21932936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NONRATT046848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000049734 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:98058742:98059691:1 gene:ENSRNOG00000033401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:98058742:98059691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
ENSRNOT00000005458 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:98602720:98603698:1 gene:ENSRNOG00000004108 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000057218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:98459907:98603698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
ENSRNOT00000071341 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:100155123:100155698:1 gene:ENSRNOG00000045805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074687 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:100427763:100428338:1 gene:ENSRNOG00000049626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100380353:100428090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// GENSCAN00000028270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:99988776:100155450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NM_001025064 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC502894 (LOC502894), mRNA. // chr6 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// XM_006240188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR-like (RGD1308005), mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000049991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:231948824:231966866:1 gene:ENSRNOG00000021565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// FQ217296 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA2YP08 mRNA sequence. // chr6 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071048 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:100793784:100794314:1 gene:ENSRNOG00000046064 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100793823:100794314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT040550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231901943:231965007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT040551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001109483 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat protein 1 (Lrr1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:100922215:100931215:1 gene:ENSRNOG00000004216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100922427:100928158:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT046849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053604 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase (Mgat2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:100935605:100938090:1 gene:ENSRNOG00000004234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081754 // GenBank // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93297 IMAGE:7130336), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U21662 // GenBank // Rattus norvegicus beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase II (Gnt II) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100935313:100937375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006240169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch domain containing 1 (Klhdc1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:100991376:101041810:1 gene:ENSRNOG00000004425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC159403 // GenBank // Rattus norvegicus kelch domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188657 IMAGE:7457550), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001108027 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch domain containing 1 (Klhdc1), mRNA. // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT046854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100991402:101013205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT046855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001034133 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch domain containing 2 (Klhdc2), mRNA. // chr6 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000004086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:73290437:73292013:1 gene:ENSRNOG00000003062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 38 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000006223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101054620:101068438:1 gene:ENSRNOG00000004474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC105756 // GenBank // Rattus norvegicus kelch domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:124658 IMAGE:5623547), complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000017780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:73290613:73291833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 91 // 34 // 39 // 0 /// NONRATT046857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000004257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101054620:101063913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 15 // 43 // 1 /// NONRATT046858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1
NM_024152 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 6 (Arf6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101150428:101151574:1 gene:ENSRNOG00000004791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091146 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:108680 IMAGE:7309902), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L12385 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 6 mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000004265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101150580:101196288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001007749 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit s (factor B) (Atp5s), mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit s (factor B) (Atp5s), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101507336:101525541:1 gene:ENSRNOG00000004893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC083655 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit s (factor B), mRNA (cDNA clone MGC:94488 IMAGE:7135201), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101516195:101524469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT046861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_001009831 // RefSeq // Rattus norvegicus atlastin GTPase 1 (Atl1), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000046085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101678899:101819541:1 gene:ENSRNOG00000005063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AY581896 // GenBank // Rattus norvegicus atlastin-like protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC092645 // GenBank // Rattus norvegicus spastic paraplegia 3A homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:109404 IMAGE:7318365), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101700436:101818851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT046863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001003928 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 12B (Abhd12b), mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102016360:102043712:1 gene:ENSRNOG00000026855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:102023281:102043712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0
NM_001024800 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin-related transmembrane protein 1 (Tmx1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102311253:102321357:1 gene:ENSRNOG00000007318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC094308 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105752 IMAGE:7316392), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000008573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:102311288:102374923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT046870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001271054 // RefSeq // Rattus norvegicus FERM domain containing 6 (Frmd6), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM domain containing 6 (Frmd6), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102768949:102802463:1 gene:ENSRNOG00000007329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102775491:102802463:1 gene:ENSRNOG00000007329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:102768988:102857282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001271054 // RefSeq // Rattus norvegicus FERM domain containing 6 (Frmd6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM domain containing 6 (Frmd6), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT046876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009602 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-related protein 10 homolog (S. cerevisiae) (Actr10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102831244:102857628:1 gene:ENSRNOG00000007504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087143 // GenBank // Rattus norvegicus actin-related protein 10 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95127 IMAGE:7128051), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228754 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YB23 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:102768988:102857282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_017280 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 3 (Psma3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000010753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102868534:102898750:1 gene:ENSRNOG00000007851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC081817 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 3, mRNA (cDNA clone MGC:93511 IMAGE:7110009), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ224319 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA6YH03 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT046880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001108029 // RefSeq // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 4A (Rbp1 like) (Arid4a), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000031595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102917436:102998489:1 gene:ENSRNOG00000026239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// FQ233288 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YH06 mRNA sequence. // chr6 // 83 // 56 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:102934070:102997196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT046885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT046887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
XR_347313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast)-like (Tomm20l), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_354899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast)-like (Tomm20l), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:103004859:103015507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT046891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT046892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
XM_006240190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein TALPID3-like (LOC690035), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011056 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:103029034:103132204:1 gene:ENSRNOG00000008244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050558 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:103029034:103132204:1 gene:ENSRNOG00000008244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:103029079:103109266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT046896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_576044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled-binding antagonist of beta-catenin 1 (Dact1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011466 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:103201967:103211190:1 gene:ENSRNOG00000008445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:103160668:103237720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT046899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT046900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
XR_086274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC503029 (RGD1559545), ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046038 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:103251622:103251955:1 gene:ENSRNOG00000032924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:103251727:103251930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT046904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_001108030 // RefSeq // Rattus norvegicus dishevelled associated activator of morphogenesis 1 (Daam1), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006240211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled associated activator of morphogenesis 1 (Daam1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:104080527:104183583:1 gene:ENSRNOG00000004345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104130328:104181099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT046914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106738 // RefSeq // Rattus norvegicus JNK1/MAPK8-associated membrane protein (Jkamp), mRNA. // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:104280504:104294443:1 gene:ENSRNOG00000004751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT046921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104279737:104294264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001191613 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 9 (Lrrc9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006240200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 9 (Lrrc9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000007339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:104657254:104712038:1 gene:ENSRNOG00000005409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000040228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104657254:104735017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0
XM_006225831 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pecanex-like 4 (Drosophila) (Pcnxl4), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007369 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:104761251:104792348:1 gene:ENSRNOG00000005568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC166574 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 14 open reading frame 135, mRNA (cDNA clone IMAGE:7320613), partial cds. // chrU // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// XM_002729652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pecanex-like 4 (Drosophila) (Pcnxl4), mRNA. // chrU // 72 // 83 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104761260:104797915:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000042226 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:104996556:104997110:1 gene:ENSRNOG00000029172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_017038 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1A (Ppm1a), mRNA. // chr6 // 89 // 77 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:103918826:103929711:1 gene:ENSRNOG00000005916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC097333 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1A, magnesium dependent, alpha isoform, mRNA (cDNA clone IMAGE:7457811), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// J04503 // GenBank // Rat protein phosphatase 2c mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 77 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:103915398:103929956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 63 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT046907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT046908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT046910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT046911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001108032 // RefSeq // Rattus norvegicus SIX homeobox 6 (Six6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:105253949:105258929:1 gene:ENSRNOG00000006296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153472 // RefSeq // Rattus norvegicus MNAT CDK-activating kinase assembly factor 1 (Mnat1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:105442513:105587332:1 gene:ENSRNOG00000007267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY135567 // GenBank // Rattus norvegicus menage a trois 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC078712 // GenBank // Rattus norvegicus menage a trois homolog 1, cyclin H assembly factor (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:93132 IMAGE:7128354), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT046934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:105491969:105583466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001013099 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 6 (Slc38a6), mRNA. // chrU // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// XM_006240209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 6 (Slc38a6), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 6 (Slc38a6), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:105603543:105670544:1 gene:ENSRNOG00000022622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY266018 // GenBank // Rattus norvegicus Na+-dependent neutral amino acid transporter (Snat6) mRNA, complete cds. // chrU // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT046936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT046938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_031085 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, eta (Prkch), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:105972486:106109232:1 gene:ENSRNOG00000004873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC061763 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C, eta, mRNA (cDNA clone IMAGE:5621110). // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC081782 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C, eta, mRNA (cDNA clone MGC:93383 IMAGE:7123785), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:105932935:106047992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_024359 // RefSeq // Rattus norvegicus hypoxia-inducible factor 1, alpha subunit (basic helix-loop-helix transcription factor) (Hif1a), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:106242730:106287704:1 gene:ENSRNOG00000008292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF057308 // GenBank // Rattus norvegicus hypoxia-inducible factor-1 alpha (Hif1a) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:106227096:106289177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT046946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_001108033 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 1 (Snapc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:106302977:106324704:1 gene:ENSRNOG00000009296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161969 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:187778 IMAGE:9028949), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:106307937:106322810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006225800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin XVI (Syt16), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006225801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin XVI (Syt16), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_234300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin XVI (Syt16), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012374 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:106540441:106629182:1 gene:ENSRNOG00000009344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064208 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:106506534:106629182:1 gene:ENSRNOG00000009344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:106596814:106629182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XR_347334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551114 (LOC102551114), ncRNA. // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// XR_354918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551114 (LOC102551114), ncRNA. // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONRATT046952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000012868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:106640809:106657492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NONRATT046950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000024313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:107329902:107330402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001008320 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member J (Rhoj), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:107702937:107785229:1 gene:ENSRNOG00000021919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC086525 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member J, mRNA (cDNA clone MGC:106003 IMAGE:7303905), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:107763018:107792407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT046956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
XM_006240256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spectrin repeat containing, nuclear envelope 2 (Syne2), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000007046 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:108326951:108353338:1 gene:ENSRNOG00000005220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 19 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000008814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108300755:108419099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 45 // 45 // 0
XM_006240256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spectrin repeat containing, nuclear envelope 2 (Syne2), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000058735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108535166:108565605:1 gene:ENSRNOG00000005323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC098809 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7377044, partial cds. // chr6 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000007070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108493028:108565605:1 gene:ENSRNOG00000005323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT046965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108430052:108564739:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NM_022508 // RefSeq // Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase, formyltetrahydrofolate synthetase (Mthfd1), mRNA. // chr6 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// XM_006240249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase, formyltetrahydrofolate synthetase (Mthfd1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000008374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108694405:108761891:1 gene:ENSRNOG00000005602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC089800 // GenBank // Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase, formyltetrahydrofolate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:108690 IMAGE:7323085), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// J05519 // GenBank // Rat C1-tetrahydrofolate synthase mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT046967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108694712:108759981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NM_133515 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 5 (Akap5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108768066:108773454:1 gene:ENSRNOG00000006410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U67136 // GenBank // Rattus norvegicus A-kinase anchoring protein AKAP150 mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108771286:108773430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT046968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001004444 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108825981:108828652:1 gene:ENSRNOG00000030397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY693992 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 1 (Zbtb1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108812810:108833424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_021863 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 2 (Hspa2), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108843800:108846300:1 gene:ENSRNOG00000006472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC081803 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93458 IMAGE:7112083), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108843916:108845817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT046970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT046971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT046972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001013944 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 36 (Ppp1r36), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_006240230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 36 (Ppp1r36), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 36 (Ppp1r36), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108854061:108874065:1 gene:ENSRNOG00000038480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC079166 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 14 open reading frame 50, mRNA (cDNA clone MGC:94197 IMAGE:7129668), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108854084:108896082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT046970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT046977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT046976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001106741 // RefSeq // Rattus norvegicus churchill domain containing 1 (Churc1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:109213899:109228029:1 gene:ENSRNOG00000007336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC168770 // GenBank // Rattus norvegicus churchill domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188902 IMAGE:6918115), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT046986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT046987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:109142277:109224047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT046988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NONRATT046973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_172034 // RefSeq // Rattus norvegicus farnesyltransferase, CAAX box, beta (Fntb), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:109278424:109361572:1 gene:ENSRNOG00000007660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087675 // GenBank // Rattus norvegicus farnesyltransferase, CAAX box, beta, mRNA (cDNA clone MGC:105303 IMAGE:7319293), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M69056 // GenBank // Rat farnesyltransferase beta subunit mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:109278469:109360345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001002289 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosyltransferase 8 (alpha (1,6) fucosyltransferase) (Fut8), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:109693324:109922266:1 gene:ENSRNOG00000008451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FN668936 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for alpha-1,6-fucosyltransferase protein (fut8 gene), T1 transcript, strain AO. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FN668937 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for alpha-1,6-fucosyltransferase protein (fut8 gene) T2 transcript, strain AO. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ227928 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YD09 mRNA sequence. // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:109727760:109898645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001134630 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1562540 (RGD1562540), mRNA. // chr6 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:110670593:110685862:1 gene:ENSRNOG00000033423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:110670667:110685437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
GENSCAN00000018126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:110973862:111236795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT046998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_022865 // RefSeq // Rattus norvegicus gephyrin (Gphn), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000030470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:110978550:111237656:1 gene:ENSRNOG00000028366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068469 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:110978550:111237656:1 gene:ENSRNOG00000028366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075054 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:110978550:111237656:1 gene:ENSRNOG00000028366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// EU735541 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley gephyrin isoform mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X66366 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for gephyrin. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:110973862:111236795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT046999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT047001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
XM_006240267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member D (Fam71d), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member D (Fam71d), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// XM_006240272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member D (Fam71d), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XR_354933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member D (Fam71d), transcript variant X9, misc_RNA. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111244409:111280621:1 gene:ENSRNOG00000028351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC078980 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member D, mRNA (cDNA clone MGC:93867 IMAGE:7112035), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111259823:111299516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT047003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001108034 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 5 (MAGUK p55 subfamily member 5) (Mpp5), mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111299906:111403406:1 gene:ENSRNOG00000008788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC168247 // GenBank // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 5 (MAGUK p55 subfamily member 5), mRNA (cDNA clone MGC:188387 IMAGE:5597968), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111349075:111401426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_019356 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 1 alpha (Eif2s1), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000013375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111422340:111447066:1 gene:ENSRNOG00000009432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC087019 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93488 IMAGE:7191037), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// J02646 // GenBank // Rat translational initiation factor (eIF-2) alpha subunit mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111437943:111446664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001108036 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 1 (Plekhh1), mRNA. // chr6 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111585028:111633992:1 gene:ENSRNOG00000010650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111559170:111631868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT047008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0
NM_019168 // RefSeq // Rattus norvegicus arginase 2 (Arg2), mRNA. // chr6 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:114998810:115025299:1 gene:ENSRNOG00000011139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U90887 // GenBank // Rattus norvegicus arginase II mRNA, complete cds. // chr6 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:115004471:115025036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108037 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 12 (all-trans/9-cis/11-cis) (Rdh12), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:115079502:115092424:1 gene:ENSRNOG00000011930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:115079635:115091834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006225809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD51 paralog B (Rad51b), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD51 paralog B (Rad51b), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016459 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:115162984:115198429:1 gene:ENSRNOG00000012332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073189 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:115162984:115706613:1 gene:ENSRNOG00000012332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000071996 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:115185036:115689437:1 gene:ENSRNOG00000012332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT047081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT047082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
XM_001080948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription initiation factor TFIID subunit 8-like (RGD1562299), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_234348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription initiation factor TFIID subunit 8-like (RGD1562299), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000006043 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:111815126:111816052:1 gene:ENSRNOG00000004582 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000052771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111801915:111816052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000058373 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:111999838:112000320:1 gene:ENSRNOG00000038335 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111999838:112000320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT047015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001047959 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC500684 (LOC500684), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000037684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:71298090:71346652:-1 gene:ENSRNOG00000012651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000058354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112106426:112109120:-1 gene:ENSRNOG00000038322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ231274 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA73YC01 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// FQ231579 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC07 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112108377:112109120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 58 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:71298326:71352141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112106953:112108311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSRNOT00000040693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:112004210:112005512:-1 gene:ENSRNOG00000031145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 53 // 8 // 17 // 0 /// NONRATT047014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 97 // 15 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112001560:112016419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000052768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111828272:111887193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001047959 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC500684 (LOC500684), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000037684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:71298090:71346652:-1 gene:ENSRNOG00000012651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 45 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000058354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112106426:112109120:-1 gene:ENSRNOG00000038322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 100 // 47 // 51 // 0 /// FQ231274 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA73YC01 mRNA sequence. // chr6 // 88 // 100 // 45 // 51 // 0 /// FQ231579 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC07 mRNA sequence. // chr6 // 88 // 100 // 45 // 51 // 0 /// GENSCAN00000013289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112106953:112108311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 53 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112108377:112109120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 35 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:71298326:71352141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 90 // 40 // 46 // 0 /// NONRATT037398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 21 // 51 // 1 /// NONRATT037399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 14 // 51 // 1
ENSRNOT00000058328 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:111983154:111983774:-1 gene:ENSRNOG00000038308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000013284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111983367:111983774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT048338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT048339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT048340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
ENSRNOT00000048596 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:111978176:111980245:-1 gene:ENSRNOG00000038307 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 46 // 97 // 13 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111936513:111947920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001108715 // RefSeq // Rattus norvegicus exonuclease 3-5 domain containing 2 (Exd2), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112192710:112226140:1 gene:ENSRNOG00000027707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC166432 // GenBank // Rattus norvegicus exonuclease 3-5 domain-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:187466 IMAGE:7135396), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112203808:112225028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001100863 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16 (Galnt16), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112246063:112422114:1 gene:ENSRNOG00000004589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112246222:112302025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112370229:112416323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT047019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_001034929 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39, member 9 (Slc39a9), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112463008:112498488:1 gene:ENSRNOG00000005052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC105849 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:125246 IMAGE:7457541), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112472321:112521544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT047023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001127566 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family D (with coiled-coil domains) member 1 (Plekhd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family D (with coiled-coil domains) member 1 (Plekhd1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000058301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112512063:112543110:1 gene:ENSRNOG00000038297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC161896 // GenBank // Rattus norvegicus similar to pleckstrin homology domain protein (5V327), mRNA (cDNA clone MGC:187480 IMAGE:7319876), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112525556:112568044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001002835 // RefSeq // Rattus norvegicus SPARC related modular calcium binding 1 (Smoc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112880630:113039729:1 gene:ENSRNOG00000005998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ222878 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YK11 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112933532:113038099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001134731 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 9 (Ttc9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:113510909:113545657:1 gene:ENSRNOG00000007254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC166802 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:188603 IMAGE:7938663), complete cds. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:113510912:113544301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT047051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001170347 // RefSeq // Rattus norvegicus pecanex homolog (Drosophila) (Pcnx), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000010022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:113754112:113886060:1 gene:ENSRNOG00000007459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000024366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:113754120:113887708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 83 // 31 // 33 // 0 /// NONRATT047060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT047057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// NONRATT047058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_139330 // RefSeq // Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 1 (Sipa1l1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000058195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:114214346:114304630:1 gene:ENSRNOG00000007646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// AF026504 // GenBank // Rattus norvegicus SPA-1 like protein p1294 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AY043226 // GenBank // Rattus norvegicus serine-rich synapse associated protein SERSAP1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000010994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:114195301:114304404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT047066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT047068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 58 // 58 // 28 // 48 // 1 /// NONRATT047069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// NONRATT047067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
ENSRNOT00000054610 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:6:114284828:114284934:1 gene:ENSRNOG00000036502 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000038534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:114427185:114499087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_019342 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 6 (Rgs6), mRNA. // chr6 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:114479664:114735956:1 gene:ENSRNOG00000008082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:114602661:114713133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000051024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117761011:117875549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001108716 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 4 (Dcaf4), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118513786:118539582:-1 gene:ENSRNOG00000008399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118509748:118594034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT048486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108984 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 25 (Rbm25), mRNA. // chr6 // 91 // 85 // 10 // 11 // 0 /// XM_003750770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 25-like 1 (Rbm25l1), mRNA. // chr6 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// ENSRNOT00000003834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118377074:118391069:-1 gene:ENSRNOG00000002874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT048478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000074607 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:9233444:9234391:1 gene:ENSRNOG00000050179 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// GENSCAN00000042940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9231938:9234391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// GENSCAN00000051435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118378579:118413587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// NONRATT048480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// NONRATT048481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// NONRATT048482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
NM_019163 // RefSeq // Rattus norvegicus presenilin 1 (Psen1), mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000012495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118325068:118373047:-1 gene:ENSRNOG00000009110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC070887 // GenBank // Rattus norvegicus presenilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:91716 IMAGE:7098018), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D82363 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for presenilin-1, complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// D82578 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for S182 protein, complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// FQ231303 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA71YA19 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT048475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118334511:118366436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT048477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006225840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus papilin, proteoglycan-like sulfated glycoprotein (Papln), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus papilin, proteoglycan-like sulfated glycoprotein (Papln), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118266310:118293920:-1 gene:ENSRNOG00000009448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118266310:118293920:-1 gene:ENSRNOG00000009448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118266310:118293920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108040 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2410016O06 (RGD1307704), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118113409:118115202:-1 gene:ENSRNOG00000010126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118113409:118115202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138907 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 2 (Acot2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118076658:118083477:-1 gene:ENSRNOG00000010134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC072540 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:91482 IMAGE:7104319), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118051461:118083318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_031315 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 1 (Acot1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AB010428 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for acyl-CoA hydrolase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000013729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118051433:118059103:-1 gene:ENSRNOG00000028870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1 /// NONRATT048465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 88 // 94 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118051461:118083318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
NM_001108041 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 3 (Acot3), mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000051235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118006796:118012735:-1 gene:ENSRNOG00000033887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NM_001109440 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 4 (Acot4), mRNA. // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000013753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118021372:118026536:-1 gene:ENSRNOG00000046864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118007453:118026613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT048462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT048464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001079709 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 5 (Acot5), mRNA. // chr6 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000013760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117987407:117994244:-1 gene:ENSRNOG00000032508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC128770 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 5, mRNA (cDNA clone MGC:156788 IMAGE:7127435), complete cds. // chr6 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117987531:117993771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT048461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109477 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, light chain 1 (Dnal1), mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000058101 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:117946129:117963486:-1 gene:ENSRNOG00000029637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XM_006240352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein, axonemal, light chain 1 (Dnal1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000036430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117911562:117933171:-1 gene:ENSRNOG00000042333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// BC161941 // GenBank // Rattus norvegicus dynein, axonemal, light chain 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:9023798), complete cds. // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// XM_002726768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 6 (Acot6), mRNA. // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// XM_234402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 6 (Acot6), mRNA. // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117939554:117963486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT048459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT048460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001015009 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin reductase 2 (Ptgr2), mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// XM_006240328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostaglandin reductase 2 (Ptgr2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006240329 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostaglandin reductase 2 (Ptgr2), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117514754:117546551:-1 gene:ENSRNOG00000038166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000059073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117514754:117546551:-1 gene:ENSRNOG00000038166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC091173 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin reductase 2, mRNA (cDNA clone MGC:108784 IMAGE:7189599), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT048452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT048453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 92 // 92 // 34 // 37 // 1 /// GENSCAN00000051025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117491739:117539672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
ENSRNOT00000037885 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:117539064:117540063:-1 gene:ENSRNOG00000027866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT048452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT048453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001108042 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 410 (Zfp410), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006240338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 410 (Zfp410), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006240339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 410 (Zfp410), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_354977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 410 (Zfp410), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117487588:117513541:-1 gene:ENSRNOG00000010985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC168180 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 410, mRNA (cDNA clone MGC:187920 IMAGE:9100560), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117491739:117539672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT048451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001011983 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q6 monooxygenase (Coq6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000014913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117458618:117469955:-1 gene:ENSRNOG00000011164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079342 // GenBank // Rattus norvegicus coenzyme Q6 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:94790 IMAGE:7106851), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ228932 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YG18 mRNA sequence. // chr6 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000051019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117458897:117464658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT048447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT048449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT048446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001134631 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 176 (Ccdc176), mRNA. // chr6 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000063900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117396790:117422542:-1 gene:ENSRNOG00000011376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117399933:117403360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT048440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT048441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117413108:117422427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT048442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001004445 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 113A2 (Rnf113a2), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC100134 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 113A2, mRNA (cDNA clone MGC:114206 IMAGE:7133304), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AY363109 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 183 mRNA, complete cds. // chr6 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117413108:117422427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT048440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
XM_006225846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225847 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_354978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-52 homolog (C. elegans) (Lin52), transcript variant X6, misc_RNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064426 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:117298279:117378681:-1 gene:ENSRNOG00000043441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001169128 // RefSeq // Rattus norvegicus visual system homeobox 2 (Vsx2), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117237657:117260423:-1 gene:ENSRNOG00000011918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117239566:117260331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
FQ217715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA1YA02 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222890 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YF20 mRNA sequence. // chr6 // 45 // 80 // 9 // 20 // 0
NONRATT048437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001044235 // RefSeq // Rattus norvegicus FCF1 rRNA-processing protein (Fcf1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000006297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116748859:116760725:-1 gene:ENSRNOG00000004723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AB256045 // GenBank // Rattus norvegicus ZH10 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT048431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116748936:116767334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001271258 // RefSeq // Rattus norvegicus YLP motif containing 1 (Ylpm1), mRNA. // chr6 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000006492 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:116659702:116735987:-1 gene:ENSRNOG00000027317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000027977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116660435:116725799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 74 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT048422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 29 // 47 // 1 /// NONRATT048423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1
ENSRNOT00000038594 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:116724111:116725799:-1 gene:ENSRNOG00000027305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116660435:116725799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001006981 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrolipoamide S-succinyltransferase (E2 component of 2-oxo-glutarate complex) (Dlst), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000007298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116597173:116620312:-1 gene:ENSRNOG00000005061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AB504752 // GenBank // Rattus norvegicus DLST mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// BC083858 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrolipoamide S-succinyltransferase (E2 component of 2-oxo-glutarate complex), mRNA (cDNA clone MGC:95077 IMAGE:7125734), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// FQ217447 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA26YB18 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 87 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116598544:116620269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT048418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// NONRATT048419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1 /// NONRATT048420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1 /// NONRATT048416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_032058 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2 beta (Eif2b2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116505786:116512219:-1 gene:ENSRNOG00000006467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC070506 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 2 beta, mRNA (cDNA clone MGC:91604 IMAGE:7097686), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ232990 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YK07 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// U31880 // GenBank // Rattus norvegicus eIF-2B beta subunit mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// U83914 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic initiation factor eIF-2B beta subunit mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116506155:116512717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001014079 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, C2HC-type containing 1C (Zc2hc1c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116437584:116445658:-1 gene:ENSRNOG00000027115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC078967 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 164, member C, mRNA (cDNA clone MGC:93847 IMAGE:7111557), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116437875:116445616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT048414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_053467 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24-like trafficking protein 10 (yeast) (Tmed10), mRNA. // chr6 // 75 // 100 // 18 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116347918:116383215:1 gene:ENSRNOG00000007901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// FQ212056 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YF09 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// FQ230076 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YL18 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116326854:116382589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_022197 // RefSeq // Rattus norvegicus FBJ osteosarcoma oncogene (Fos), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116249742:116252608:-1 gene:ENSRNOG00000008015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116250036:116259137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053894 // RefSeq // Rattus norvegicus Jun dimerization protein 2 (Jdp2), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118780172:118988281:1 gene:ENSRNOG00000008224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U53449 // GenBank // Rattus norvegicus jun dimerization protein 2 (jdp-2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118771347:118810301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001106748 // RefSeq // Rattus norvegicus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like (Batf), mRNA. // chr6 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000011563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118868534:118890808:1 gene:ENSRNOG00000008588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118841946:118872050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// NONRATT047159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_199109 // RefSeq // Rattus norvegicus feline leukemia virus subgroup C cellular receptor family, member 2 (Flvcr2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118926357:118989790:1 gene:ENSRNOG00000008754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY260573 // GenBank // Rattus norvegicus transporter mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC101899 // GenBank // Rattus norvegicus feline leukemia virus subgroup C cellular receptor family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124539 IMAGE:7932187), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118926357:118988325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
XM_006225856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 5 (Ttll5), mRNA. // chr6 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// XM_006240373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 5 (Ttll5), mRNA. // chr6 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012895 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:119073228:119102361:1 gene:ENSRNOG00000009318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000029862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119002198:119190592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT047165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001134525 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 43 homolog (Chlamydomonas) (Ift43), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 43 homolog (Chlamydomonas) (Ift43), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000013560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:119247640:119323931:1 gene:ENSRNOG00000010194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FQ222650 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YK10 mRNA sequence. // chr6 // 88 // 53 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT047169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119297113:119323770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT047170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT047171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001134559 // RefSeq // Rattus norvegicus G patch domain containing 2-like (Gpatch2l), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:119400117:119527025:1 gene:ENSRNOG00000010227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ212324 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA58YO18 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119391698:119420828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119424002:119428644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT047173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001008516 // RefSeq // Rattus norvegicus estrogen-related receptor beta (Esrrb), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus estrogen-related receptor beta (Esrrb), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006240375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus estrogen-related receptor beta (Esrrb), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:119708426:119754191:1 gene:ENSRNOG00000010259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY383731 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen receptor-related receptor beta mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119577793:119787269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
XM_578575 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vasohibin 1 (Vash1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014017 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:119922878:119934446:1 gene:ENSRNOG00000010457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119931646:119934446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000009957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119922878:119928211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001037783 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 74 (Lrrc74), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050463 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:119978629:120072002:1 gene:ENSRNOG00000025056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC098927 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 14 open reading frame 166B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132014). // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC127444 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 14 open reading frame 166B, mRNA (cDNA clone MGC:156476 IMAGE:7135116), complete cds. // chr6 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119978865:120087943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT047182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT047183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT047184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT047187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT047188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001108044 // RefSeq // Rattus norvegicus CLOCK-interacting pacemaker (Cipc), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1737 protein (RGD1309492), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006240379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1737 protein (RGD1309492), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000014980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120260096:120281691:1 gene:ENSRNOG00000011111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120266528:120279113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT047192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT047195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001108045 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 63c (Tmem63c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XR_354997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 63c (Tmem63c), transcript variant X11, misc_RNA. // chr6 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000015571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120339455:120404855:1 gene:ENSRNOG00000011334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// FQ212398 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA56YI13 mRNA sequence. // chr6 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000009961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120310242:120404233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// NONRATT047197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001109507 // RefSeq // Rattus norvegicus SRA stem-loop interacting RNA binding protein (Slirp), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120757482:120766753:1 gene:ENSRNOG00000012314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166913 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6890613. // chr6 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT047200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT047200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 7 // 7 // 1
XM_006240405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoporin GLE1-like (RGD1565693), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:120851498:120853663:-1 gene:ENSRNOG00000012652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120851498:120853897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120765017:120796089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 60 // 12 // 15 // 0 /// NONRATT047172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT047173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001108985 // RefSeq // Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 1 (Adck1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 1 (Adck1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120923362:121019893:1 gene:ENSRNOG00000012685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212472 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YN20 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120923408:121315363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053817 // RefSeq // Rattus norvegicus neurexin 3 (Nrxn3), mRNA. // chr6 // 88 // 81 // 22 // 25 // 0 /// L14851 // GenBank // Rattus norvegicus neurexin III mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:123170183:123336622:1 gene:ENSRNOG00000047574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT047203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
ENSRNOT00000053416 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:6:123599076:123599203:1 gene:ENSRNOG00000035293 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000030355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:123773693:123774136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 76 // 63 // 13 // 17 // 0
NM_012888 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid stimulating hormone receptor (Tshr), mRNA. // chr6 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000005671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:124425325:124561154:1 gene:ENSRNOG00000003972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// M34842 // GenBank // Rat thyroid stimulating hormone receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT047212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000030301 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:127332632:127333042:1 gene:ENSRNOG00000021721 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:127332572:127333042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001106750 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 (Flrt2), mRNA. // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_006240416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibronectin leucine rich transmembrane protein 2 (Flrt2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000004955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:128739108:128828633:1 gene:ENSRNOG00000003732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000052156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:128826561:128828480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT047216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
GENSCAN00000000440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:130813719:130816622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106751 // RefSeq // Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 65 (Gpr65), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:131470143:131471156:1 gene:ENSRNOG00000003806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF405799 // GenBank // Rattus norvegicus T cell death associated protein 8 (Tdag8) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131470143:131471156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138862 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 7 (Spata7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 74 // 74 // 0 /// ENSRNOT00000005297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:131817567:131862859:1 gene:ENSRNOG00000003955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 71 // 71 // 0 /// BC078728 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 7, mRNA (cDNA clone MGC:93176 IMAGE:7114267), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 62 // 62 // 0 /// GENSCAN00000021830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131822484:131862820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 57 // 57 // 0 /// AF094609 // GenBank // Rattus norvegicus fertility related protein WMP1 mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 96 // 69 // 71 // 0 /// NONRATT047220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 74 // 74 // 0 /// NONRATT047221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 27 // 74 // 1 /// NONRATT047222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 19 // 74 // 1 /// NONRATT047223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 49 // 49 // 36 // 74 // 1 /// NONRATT047224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 28 // 74 // 1 /// NONRATT047225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 42 // 42 // 31 // 74 // 1 /// NONRATT047226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 20 // 20 // 15 // 74 // 1
GENSCAN00000021837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131867828:131868216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000035283 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:131867828:131868353:1 gene:ENSRNOG00000028488 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0
NM_001106752 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 8 (Ttc8), mRNA. // chr6 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// XM_006240424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 8 (Ttc8), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:132140830:132207106:1 gene:ENSRNOG00000004542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// BC161880 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 8, mRNA (cDNA clone MGC:187444 IMAGE:7126409), complete cds. // chr6 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:132184605:132206596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:132140903:132169895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT047237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_178104 // RefSeq // Rattus norvegicus candidate plasticity gene 1 (Cpg1), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_347472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550790 (LOC102550790), ncRNA. // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// XR_355059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550790 (LOC102550790), ncRNA. // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000057577 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:132590613:132605626:1 gene:ENSRNOG00000037891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001031657 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (Tdp1), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (Tdp1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:133127134:133187079:1 gene:ENSRNOG00000003831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC098739 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:112732 IMAGE:7385935), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:133127076:133246910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_022293 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 13 (Kcnk13), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000075794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:133202980:133305227:1 gene:ENSRNOG00000047363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF287301 // GenBank // Rattus norvegicus tandem pore domain potassium channel THIK-1 (Kcnk13) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000005229 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:133189627:133189968:1 gene:ENSRNOG00000003926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000041466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:133127076:133246910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_057123 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 1 (Psmc1), mRNA. // chr6 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:133350565:133362938:1 gene:ENSRNOG00000003951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC063157 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 1, mRNA (cDNA clone MGC:72724 IMAGE:6919865), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// D50696 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proteasomal ATPase (S4), complete cds. // chr6 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:133348713:133362731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT047253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_031969 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin 1 (Calm1), mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000064679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:133444274:133454391:1 gene:ENSRNOG00000004060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF178845 // GenBank // Rattus norvegicus calmodulin mRNA, complete cds. // chr6 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// FQ213227 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YA07 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// FQ214030 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YD16 mRNA sequence. // chr6 // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// FQ225380 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YC18 mRNA sequence. // chr6 // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// FQ212721 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YM02 mRNA sequence. // chr6 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// NONRATT047255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:133443992:133506513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
ENSRNOT00000005854 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:133914216:133915077:1 gene:ENSRNOG00000004432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NM_001173557 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20950 (RGD1311756), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20950 (RGD1311756), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20950 (RGD1311756), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20950 (RGD1311756), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134008151:134091103:1 gene:ENSRNOG00000004442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ221290 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA38YE23 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134047116:134081422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT047263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT047264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSRNOT00000052363 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:134336972:134337804:1 gene:ENSRNOG00000032793 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134336972:134337804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
XM_006225862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 4B (Kif4b), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134354730:134357711:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000024418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134429421:134430680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_001134464 // RefSeq // Rattus norvegicus LLP homolog, long-term synaptic facilitation (Aplysia) (Llph), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:65224652:65227684:1 gene:ENSRNOG00000004316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135075500:135076578:1 gene:ENSRNOG00000005718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158738 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1190005P17, mRNA (cDNA clone MGC:187906 IMAGE:9099223), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135075512:135126834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:65206786:65227684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106753 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 2, 100kDa (Cpsf2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 2, 100kDa (Cpsf2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135081852:135109466:1 gene:ENSRNOG00000005733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135075512:135126834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT047273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108051 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 4 (Slc24a4), mRNA. // chr6 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// BC168870 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:189120 IMAGE:7104573), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135252727:135364932:1 gene:ENSRNOG00000006729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 24 // 43 // 1 /// NONRATT047274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000001343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135292851:135364304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 29 // 43 // 1 /// NONRATT047275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 72 // 72 // 31 // 43 // 1
NM_001108052 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras and Rab interactor 3 (Rin3), mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras and Rab interactor 3 (Rin3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135381785:135490155:1 gene:ENSRNOG00000007062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135416027:135489427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT047278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT047280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001033065 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin A5 (Golga5), mRNA. // chr6 // 89 // 97 // 31 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000010385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135563809:135589329:1 gene:ENSRNOG00000007699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY144587 // GenBank // Rattus norvegicus golgin-84 mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 97 // 31 // 35 // 0 /// GENSCAN00000011764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135563809:135656039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT047281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_021655 // RefSeq // Rattus norvegicus chromogranin A (parathyroid secretory protein 1) (Chga), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010592 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:135645155:135656039:1 gene:ENSRNOG00000007912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// AF145445 // GenBank // Rattus norvegicus chromogranin A precursor (Chga) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// BC087703 // GenBank // Rattus norvegicus chromogranin A, mRNA (cDNA clone MGC:105435 IMAGE:7313842), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000011764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135563809:135656039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT047284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
ENSRNOT00000010672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135828702:135829916:1 gene:ENSRNOG00000008101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// FQ228859 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YA15 mRNA sequence. // chr6 // 80 // 45 // 8 // 10 // 0
NM_001007705 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 7 (putative) (Ubr7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135842580:135862537:1 gene:ENSRNOG00000008108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081966 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 7 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:94098 IMAGE:7125402), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135842607:135860598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_183055 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIIIc (Cox8c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000052296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135972917:135974240:1 gene:ENSRNOG00000031106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY161005 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIII isoform 3 precursor, mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001271253 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-79 homolog (C. elegans) (Unc79), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000011775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136066167:136268033:1 gene:ENSRNOG00000008728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000066306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136066167:136268033:1 gene:ENSRNOG00000008728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000051581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136119766:136278243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT047297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 14 // 52 // 1
NM_001291359 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA A830059I20 (RGD1309028), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM181A-like (RGD1309028), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM181A-like (RGD1309028), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136421190:136422068:1 gene:ENSRNOG00000046677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138171878:138172756:1 gene:ENSRNOG00000048412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136411170:136422068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138149092:138172756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108053 // RefSeq // Rattus norvegicus OTU deubiquitinase, ubiquitin aldehyde binding 2 (Otub2), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136503051:136521614:1 gene:ENSRNOG00000009117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC168869 // GenBank // Rattus norvegicus OTU domain, ubiquitin aldehyde binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:189118 IMAGE:7104604), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ211938 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YO18 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136511413:136519731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_203410 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon, alpha-inducible protein 27 (Ifi27), mRNA. // chr6 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000012296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136548421:136554959:1 gene:ENSRNOG00000009263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000063970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136548421:136554855:1 gene:ENSRNOG00000009263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 83 // 32 // 34 // 0 /// BC060548 // GenBank // Rattus norvegicus interferon, alpha-inducible protein 27-like, mRNA (cDNA clone MGC:72711 IMAGE:6919535), complete cds. // chr6 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// FQ220098 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YD10 mRNA sequence. // chr6 // 95 // 90 // 35 // 37 // 0 /// FQ226050 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YD10 mRNA sequence. // chr6 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// AF154572 // GenBank // Rattus norvegicus ERG2 protein mRNA, complete cds. // chr6 // 66 // 71 // 19 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136552401:136554786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 37 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT047304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT047305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 63 // 63 // 26 // 41 // 1 /// NONRATT047306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 23 // 41 // 1
NM_145097 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 4 (Serpina4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136962816:136972494:1 gene:ENSRNOG00000009788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088111 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:108582 IMAGE:7368874), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ219393 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YJ04 mRNA sequence. // chr6 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// FQ219429 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YE22 mRNA sequence. // chr6 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// FQ219656 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YM17 mRNA sequence. // chr6 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// U51017 // GenBank // Rattus norvegicus kallistatin mRNA, complete cds. // chr6 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// FQ209838 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA39YE10 mRNA sequence. // chr6 // 71 // 89 // 17 // 24 // 0 /// FQ218735 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA4YP06 mRNA sequence. // chr6 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136965473:136972291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT047309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001244739 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 5 (Serpina5), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_022957 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 5 (Serpina5), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136986360:136990807:1 gene:ENSRNOG00000009855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AB013128 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein C inhibitor, complete cds. // chr6 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC081797 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:93420 IMAGE:7112069), complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC097315 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:114315 IMAGE:7453034), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136986841:137017042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT047310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000003990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137050865:137053274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
XM_006225870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease inhibitor A3F-like (LOC100909605), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240519 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease inhibitor A3F-like (LOC100909605), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000057271 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:137140465:137144223:1 gene:ENSRNOG00000048191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044152 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:138250452:138254213:1 gene:ENSRNOG00000029949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000004003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137140495:137163549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000057407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138248775:138254213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000033897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137152361:137175423:1 gene:ENSRNOG00000025856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY325155 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-233 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT047313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_031531 // RefSeq // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3N (Serpina3n), mRNA. // chr6 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137283364:137292168:1 gene:ENSRNOG00000010527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC078796 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3N, mRNA (cDNA clone MGC:93363 IMAGE:7129287), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// D00753 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for contrapsin-like protease inhibitor related protein, complete cds, clone: CPi-26. // chr6 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// FQ209856 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YN22 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// HM448398 // GenBank // Rattus norvegicus serpina3n-like protein mRNA, complete cds. // chr6 // 73 // 65 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137285294:137290200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT047320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001108722 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaredoxin 5 (Glrx5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240482 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutaredoxin 5 (Glrx5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137947875:137957960:1 gene:ENSRNOG00000004206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137947906:138081034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000057413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137947906:138081034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001270713 // RefSeq // Rattus norvegicus bradykinin receptor B2 (Bdkrb2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_173100 // RefSeq // Rattus norvegicus bradykinin receptor B2 (Bdkrb2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000071735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138615812:138619882:1 gene:ENSRNOG00000047300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138617712:138619882:1 gene:ENSRNOG00000047300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// M59967 // GenBank // Rattus norvegicus B2 bradykinin receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 37 // 39 // 0 /// X69681 // GenBank // R.norvegicus mRNA for bradykinin receptor. // chr6 // 96 // 64 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138607278:138619668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 33 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT047327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1
NM_030851 // RefSeq // Rattus norvegicus bradykinin receptor B1 (Bdkrb1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138631450:138633866:1 gene:ENSRNOG00000004488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U66107 // GenBank // Rattus norvegicus B1 bradykinin receptor (BKR) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138632694:138633707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014198 // RefSeq // Rattus norvegicus GSK3B interacting protein (Gskip), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GSK3B interacting protein (Gskip), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GSK3B interacting protein (Gskip), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GSK3B interacting protein (Gskip), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138712664:138728642:1 gene:ENSRNOG00000042427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC087681 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933433P14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:105785 IMAGE:7321205), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138725611:138727531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001108055 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate kinase 7 (Ak7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000050752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138732026:138804714:1 gene:ENSRNOG00000004762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138732151:138880058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT047334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001108056 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (A) polymerase alpha (Papola), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006240526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (A) polymerase alpha (Papola), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000064957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138807510:138859620:1 gene:ENSRNOG00000004827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// FQ227825 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YK22 mRNA sequence. // chr6 // 88 // 57 // 21 // 24 // 0 /// FQ229237 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YK04 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// BC167010 // GenBank // Rattus norvegicus poly (A) polymerase alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:7388719), complete cds. // chr6 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT047336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000020559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138732151:138880058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// NONRATT047337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT047338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT047340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT047341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1
NM_001012194 // RefSeq // Rattus norvegicus vaccinia related kinase 1 (Vrk1), mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vaccinia related kinase 1 (Vrk1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:139031649:139098523:1 gene:ENSRNOG00000005274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// BC079130 // GenBank // Rattus norvegicus vaccinia related kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94140 IMAGE:7127355), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vaccinia related kinase 1 (Vrk1), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// NONRATT047346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138987935:139105763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// NONRATT047344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// NONRATT047345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1 /// NONRATT047347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT047348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1
NM_001109672 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin K (Ccnk), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin K (Ccnk), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin K (Ccnk), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141261013:141283937:1 gene:ENSRNOG00000006985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC129121 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin K, mRNA (cDNA clone MGC:156782 IMAGE:7125896), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141259528:141277306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT047356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_343107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HHIP-like 1 (Hhipl1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141389361:141410629:1 gene:ENSRNOG00000028390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141389361:141407469:1 gene:ENSRNOG00000028390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141359560:141404092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001108723 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 46, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp46a1), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141416875:141443679:1 gene:ENSRNOG00000007147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC162019 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 46, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:187896 IMAGE:9098323), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141416969:141470295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_024147 // RefSeq // Rattus norvegicus Enah/Vasp-like (Evl), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141721470:141760317:1 gene:ENSRNOG00000014476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U70211 // GenBank // Rattus norvegicus RNB6 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141706608:141758859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT047368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NR_031786 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-342 (Mir342), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053735 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:141731245:141731343:1 gene:ENSRNOG00000035612 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-342 // miRBase Micro RNA Database // MI0000626 Rattus norvegicus miR-342 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000067498 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:141822860:141824010:1 gene:ENSRNOG00000011939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000032956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141822856:141824043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0
NM_173290 // RefSeq // Rattus norvegicus YY1 transcription factor (Yy1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YY1 transcription factor (Yy1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000005743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141872657:141896924:1 gene:ENSRNOG00000004339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB080317 // GenBank // Rattus norvegicus yy1 mRNA for transcription factor YY1, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141867753:141896924:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NR_031789 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 345 (Mir345), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053741 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:141919044:141919139:1 gene:ENSRNOG00000035618 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-345 // miRBase Micro RNA Database // MI0000631 Rattus norvegicus miR-345 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001509 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 47 (Slc25a47), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141932322:141938021:1 gene:ENSRNOG00000003020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY603424 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial hepatocellular carcinoma-downregulated carrier protein (HDMCP) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089874 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial hepatocellular carcinoma-downregulated carrier protein, mRNA (cDNA clone MGC:109010 IMAGE:7325453), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ210432 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA28YN01 mRNA sequence. // chr6 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// FQ210765 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA22YM06 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141924049:141937437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001135894 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like (Wdr25l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100363570 (LOC100363570), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006240544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like (Wdr25l), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141975870:142103153:1 gene:ENSRNOG00000004733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166712 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like, mRNA (cDNA clone MGC:188413 IMAGE:7930656), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141976373:141989932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:26481820:26535092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001111115 // RefSeq // Rattus norvegicus brain-enriched guanylate kinase-associated (Begain), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_024163 // RefSeq // Rattus norvegicus brain-enriched guanylate kinase-associated (Begain), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:142107881:142129457:-1 gene:ENSRNOG00000004650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF064868 // GenBank // Rattus norvegicus brain-enriched guanylate kinase-associated protein 2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF064869 // GenBank // Rattus norvegicus brain-enriched guanylate kinase-associated protein 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT048707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:142108799:142143949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_053744 // RefSeq // Rattus norvegicus delta-like 1 homolog (Drosophila) (Dlk1), mRNA. // chr6 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:142742285:142749166:1 gene:ENSRNOG00000019584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// BC167752 // GenBank // Rattus norvegicus delta-like 1 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:187346 IMAGE:8365650), complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// D84336 // GenBank // Rattus norvegicus ZOG mRNA, complete cds. // chr6 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// U25680 // GenBank // Rattus norvegicus preadipocyte factor 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:142741602:142749079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// NONRATT047377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 82 // 73 // 18 // 22 // 0
XR_347536 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to GTL2, imprinted maternally expressed untranslated (RGD1566401), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_347538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to GTL2, imprinted maternally expressed untranslated (RGD1566401), transcript variant X5, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158675 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8372043. // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT047382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT047386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT047388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT047390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT047391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT047385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT047393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT047394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT047384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NR_032296 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 770 (Mir770), microRNA. // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000062137 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142845041:142845134:1 gene:ENSRNOG00000040384 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-770 // miRBase Micro RNA Database // MI0006165 Rattus norvegicus miR-770 stem-loop // chr6 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0
NR_032289 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-673 (Mir673), microRNA. // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000062107 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142853465:142853547:1 gene:ENSRNOG00000040354 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// rno-mir-673 // miRBase Micro RNA Database // MI0006158 Rattus norvegicus miR-673 stem-loop // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NR_032123 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-493 (Mir493), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054366 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142861686:142861769:1 gene:ENSRNOG00000036243 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-493 // miRBase Micro RNA Database // MI0003540 Rattus norvegicus miR-493 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031781 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 337 (Mir337), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053650 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142868097:142868193:1 gene:ENSRNOG00000035527 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-337 // miRBase Micro RNA Database // MI0000614 Rattus norvegicus miR-337 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032118 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-540 (Mir540), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054607 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142868379:142868462:1 gene:ENSRNOG00000036499 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-540 // miRBase Micro RNA Database // MI0003524 Rattus norvegicus miR-540 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032757 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 665 (Mir665), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000062108 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142868634:142868727:1 gene:ENSRNOG00000040355 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-665 // miRBase Micro RNA Database // MI0012606 Rattus norvegicus miR-665 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031953 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 431 (Mir431), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054606 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142873602:142873715:1 gene:ENSRNOG00000036498 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// antiPeg11 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,182,037-134,187,063 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-431 // miRBase Micro RNA Database // MI0001722 Rattus norvegicus miR-431 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031954 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 433 (Mir433), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054605 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142874511:142874603:1 gene:ENSRNOG00000036497 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// antiPeg11 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,182,037-134,187,063 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-433 // miRBase Micro RNA Database // MI0001724 Rattus norvegicus miR-433 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031872 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 127 (Mir127), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054604 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142875607:142875703:1 gene:ENSRNOG00000036496 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// antiPeg11 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,182,037-134,187,063 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-127 // miRBase Micro RNA Database // MI0000899 Rattus norvegicus miR-127 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031882 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 136 (Mir136), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054601 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142878938:142879019:1 gene:ENSRNOG00000036493 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// antiPeg11 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,182,037-134,187,063 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-136 // miRBase Micro RNA Database // MI0000909 Rattus norvegicus miR-136 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054390 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142895410:142895505:1 gene:ENSRNOG00000036267 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-341 // miRBase Micro RNA Database // MI0000624 Rattus norvegicus miR-341 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_032113 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 370 (Mir370), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053738 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:142902086:142902164:1 gene:ENSRNOG00000035615 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-370 // miRBase Micro RNA Database // MI0003486 Rattus norvegicus miR-370 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT047414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 61 // 100 // 14 // 23 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 61 // 100 // 14 // 23 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 61 // 100 // 14 // 23 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 61 // 100 // 14 // 23 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 61 // 100 // 14 // 23 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT047414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
AB014881 // GenBank // Rattus norvegicus non-coding RNA expressed in the brain, repeat sequence, clone: 2. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONRATT047429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONRATT047427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
AB014881 // GenBank // Rattus norvegicus non-coding RNA expressed in the brain, repeat sequence, clone: 2. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chrUn // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chrUn // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chrUn // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chrUn // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chrUn // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chrUn // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
Bsr // lncRNA Db // rn4 chr6:134,198,113-134,328,710 // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AB014882 // GenBank // Rattus norvegicus non-coding RNA expressed in the brain, repeat sequence, clone: 46. // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1 /// NONRATT047436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1
NR_032124 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-379 (Mir379), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053679 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143019871:143019955:1 gene:ENSRNOG00000035556 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-379 // miRBase Micro RNA Database // MI0003541 Rattus norvegicus miR-379 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_032275 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-411 (Mir411), microRNA. // chr6 // 75 // 86 // 18 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000053697 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143021015:143021110:1 gene:ENSRNOG00000035574 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-411 // miRBase Micro RNA Database // MI0006144 Rattus norvegicus miR-411 stem-loop // chr6 // 75 // 86 // 18 // 24 // 0
NR_031943 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-299 (Mir299), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-299a // miRBase Micro RNA Database // MI0000970 Rattus norvegicus miR-299 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032272 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-380 (Mir380), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-380 // miRBase Micro RNA Database // MI0006141 Rattus norvegicus miR-380 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031769 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-323 (Mir323), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053577 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143023370:143023455:1 gene:ENSRNOG00000035454 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-323 // miRBase Micro RNA Database // MI0000591 Rattus norvegicus miR-323 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032294 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-758 (Mir758), microRNA. // chr6 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000062139 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143023667:143023747:1 gene:ENSRNOG00000040386 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// rno-mir-758 // miRBase Micro RNA Database // MI0006163 Rattus norvegicus miR-758 stem-loop // chr6 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0
NR_031776 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-329 (Mir329), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053610 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143024339:143024435:1 gene:ENSRNOG00000035487 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:143011808:143047657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-329 // miRBase Micro RNA Database // MI0000604 Rattus norvegicus miR-329 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032125 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 494 (Mir494), microRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000054367 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143026540:143026624:1 gene:ENSRNOG00000036244 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// rno-mir-494 // miRBase Micro RNA Database // MI0003542 Rattus norvegicus miR-494 stem-loop // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000054600 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143026735:143026871:1 gene:ENSRNOG00000036492 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-679 // miRBase Micro RNA Database // MI0021857 Rattus norvegicus miR-679 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_032767 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-666 (Mir666), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000062111 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143028694:143028792:1 gene:ENSRNOG00000040358 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-666 // miRBase Micro RNA Database // MI0012617 Rattus norvegicus miR-666 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032119 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-543 (Mir543), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054599 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143028831:143028910:1 gene:ENSRNOG00000036491 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-543 // miRBase Micro RNA Database // MI0003525 Rattus norvegicus miR-543 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032283 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-495 (Mir495), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000054386 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143030626:143030705:1 gene:ENSRNOG00000036263 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// rno-mir-495 // miRBase Micro RNA Database // MI0006152 Rattus norvegicus miR-495 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_032764 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-667 (Mir667), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000062104 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143031908:143031999:1 gene:ENSRNOG00000040351 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-667 // miRBase Micro RNA Database // MI0012614 Rattus norvegicus miR-667 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_032126 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-376c (Mir376c), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053593 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143034796:143034879:1 gene:ENSRNOG00000035470 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-376c // miRBase Micro RNA Database // MI0003543 Rattus norvegicus miR-376c stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_032127 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-376b (Mir376b), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000054598 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143035452:143035537:1 gene:ENSRNOG00000036490 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// rno-mir-376b // miRBase Micro RNA Database // MI0003544 Rattus norvegicus miR-376b stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NR_032128 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-376a (Mir376a), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-376a // miRBase Micro RNA Database // MI0003545 Rattus norvegicus miR-376a stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_031944 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 300 (Mir300), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000053757 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143036501:143036590:1 gene:ENSRNOG00000035634 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:143011808:143047657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// rno-mir-300 // miRBase Micro RNA Database // MI0000971 Rattus norvegicus miR-300 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NR_032129 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-381 (Mir381), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053616 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143038943:143039050:1 gene:ENSRNOG00000035493 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-381 // miRBase Micro RNA Database // MI0003546 Rattus norvegicus miR-381 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_032130 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 487b (Mir487b), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054597 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143039481:143039562:1 gene:ENSRNOG00000036489 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-487b // miRBase Micro RNA Database // MI0003547 Rattus norvegicus miR-487b stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032120 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-539 (Mir539), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-539 // miRBase Micro RNA Database // MI0003526 Rattus norvegicus miR-539 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032744 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-544 (Mir544), microRNA. // chr6 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000054595 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143041526:143041603:1 gene:ENSRNOG00000036487 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// rno-mir-544 // miRBase Micro RNA Database // MI0012593 Rattus norvegicus miR-544 stem-loop // chr6 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0
NR_032131 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-382 (Mir382), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-382 // miRBase Micro RNA Database // MI0003548 Rattus norvegicus miR-382 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031880 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 134 (Mir134), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053749 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143046904:143046976:1 gene:ENSRNOG00000035626 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-134 // miRBase Micro RNA Database // MI0000907 Rattus norvegicus miR-134 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032752 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-668 (Mir668), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000062113 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143047473:143047578:1 gene:ENSRNOG00000040360 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-668 // miRBase Micro RNA Database // MI0012601 Rattus norvegicus miR-668 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032132 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-485 (Mir485), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054372 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143047656:143047734:1 gene:ENSRNOG00000036249 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-485 // miRBase Micro RNA Database // MI0003549 Rattus norvegicus miR-485 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031896 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 154 (Mir154), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053723 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143050943:143051026:1 gene:ENSRNOG00000035600 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-154 // miRBase Micro RNA Database // MI0000923 Rattus norvegicus miR-154 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032114 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 377 (Mir377), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053733 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143053047:143053118:1 gene:ENSRNOG00000035610 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-377 // miRBase Micro RNA Database // MI0003487 Rattus norvegicus miR-377 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032121 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 541 (Mir541), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054594 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143055012:143055101:1 gene:ENSRNOG00000036486 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-541 // miRBase Micro RNA Database // MI0003527 Rattus norvegicus miR-541 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032133 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-409 (Mir409), microRNA. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// rno-mir-409a // miRBase Micro RNA Database // MI0003550 Rattus norvegicus miR-409 stem-loop // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NR_032115 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 412 (Mir412), microRNA. // chr6 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000053613 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143055922:143056001:1 gene:ENSRNOG00000035490 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// rno-mir-412 // miRBase Micro RNA Database // MI0003488 Rattus norvegicus miR-412 stem-loop // chr6 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0
NR_032134 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-369 (Mir369), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-369 // miRBase Micro RNA Database // MI0003551 Rattus norvegicus miR-369 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_032274 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 410 (Mir410), microRNA. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000053680 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:143056350:143056430:1 gene:ENSRNOG00000035557 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// MEG9 // lncRNA Db // rn4 chr6:134,410,685-134,431,542 // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-410 // miRBase Micro RNA Database // MI0006143 Rattus norvegicus miR-410 stem-loop // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
ENSRNOT00000051650 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:143127406:143128595:1 gene:ENSRNOG00000030448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:143127406:143174859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
ENSRNOT00000041930 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:143803672:143804703:1 gene:ENSRNOG00000029967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 80 // 8 // 12 // 0
ENSRNOT00000047432 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:143898839:143899080:1 gene:ENSRNOG00000032807 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:143898880:143899116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001191112 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r5c), mRNA. // chr6 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r5c), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:143982521:144075381:1 gene:ENSRNOG00000004973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r5c), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// XM_006240560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r5c), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// GENSCAN00000043246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:143982632:144075381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT047461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
NONRATT047460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019226 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1 (Dync1h1), mRNA. // chr6 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// ENSRNOT00000009377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144094996:144159980:1 gene:ENSRNOG00000006178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 74 // 74 // 0 /// ENSRNOT00000073950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144094996:144159980:1 gene:ENSRNOG00000006178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 74 // 74 // 0 /// L08505 // GenBank // Rattus norvegicus cytoplasmic dynein heavy chain (MAP 1C), mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// GENSCAN00000043262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144094996:144155798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 67 // 67 // 0 /// D13896 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytoplasmic dynein heavy chain, complete cds. // chr6 // 97 // 99 // 73 // 75 // 0 /// NONRATT047466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 91 // 69 // 69 // 0
NM_001100894 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 20 (Wdr20), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 20 (Wdr20), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145187523:145256218:-1 gene:ENSRNOG00000007333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 20 (Wdr20), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// XM_006240584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 20 (Wdr20), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145193791:145256088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000072010 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:144196044:144196365:1 gene:ENSRNOG00000050633 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144187765:144196365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006225878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 839 (Zfp839), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 839 (Zfp839), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 839 (Zfp839), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145126873:145143286:-1 gene:ENSRNOG00000031661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145126873:145143286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
XM_006225874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tectonin beta-propeller repeat containing 2 (Tecpr2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000030864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145009992:145099887:-1 gene:ENSRNOG00000021904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000049274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145009992:145099887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
XM_006240612 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus REST corepressor 1-like (LOC102554884), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010676 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:144866567:144901118:-1 gene:ENSRNOG00000008067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144857969:144886110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001108724 // RefSeq // Rattus norvegicus Tnf receptor-associated factor 3 (Traf3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Tnf receptor-associated factor 3 (Traf3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144695911:144803845:-1 gene:ENSRNOG00000008145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144699400:144724963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT048753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108061 // RefSeq // Rattus norvegicus amnion associated transmembrane protein (Amn), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000012469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144682579:144690020:-1 gene:ENSRNOG00000009050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144682889:144689951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT048750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT048751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001106759 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 4 (Exoc3l4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006240573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 4 (Exoc3l4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006240574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 4 (Exoc3l4), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006240575 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 4 (Exoc3l4), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144534911:144548933:-1 gene:ENSRNOG00000010111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC166426 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1600013K19, mRNA (cDNA clone MGC:187405 IMAGE:7100899), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ230530 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA92YE13 mRNA sequence. // chr6 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144535720:144571168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT048746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT048745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001137633 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 2 (Tnfaip2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144512073:144524703:-1 gene:ENSRNOG00000010165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144513515:144522150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT048742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NONRATT048733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1
NM_130749 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 (Mark3), mRNA. // chr6 // 95 // 93 // 35 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000014395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144287323:144374797:-1 gene:ENSRNOG00000010330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// AF465412 // GenBank // Rattus norvegicus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 (Mark3) mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 93 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000043248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144287550:144348833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT048726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// NONRATT048729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1
NM_001007706 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 61 homolog A (S. cerevisiae) (Trmt61a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144259958:144265948:-1 gene:ENSRNOG00000011398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079198 // GenBank // Rattus norvegicus GCD14/PCMT domain containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:94251 IMAGE:7131557), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144260856:144267046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001037769 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptogenic 1, mitochondrial (Apopt1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144205803:144230967:-1 gene:ENSRNOG00000011542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107661 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810002N01, mRNA (cDNA clone MGC:124853 IMAGE:7936717), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144205966:144221472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001081972 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin light chain 1 (Klc1), transcript variant A, mRNA. // chr6 // 96 // 71 // 26 // 27 // 0 /// NM_001081973 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin light chain 1 (Klc1), transcript variant B, mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// NM_001081974 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin light chain 1 (Klc1), transcript variant C, mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin light chain 1 (Klc1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// XM_006240624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin light chain 1 (Klc1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 93 // 74 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145338402:145370499:1 gene:ENSRNOG00000011572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145338402:145366114:1 gene:ENSRNOG00000011572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 74 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145350314:145371276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// NONRATT047502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
XM_006240637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 21 (Zfyve21), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 21 (Zfyve21), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_001108725 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 21 (Zfyve21), mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000063865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145388967:145408787:1 gene:ENSRNOG00000012185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145397095:145405003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
XM_003750235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100363116 (LOC100363116), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003754243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100363116 (LOC100363116), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110040N11 (RGD1305713), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144544564:144551617:-1 gene:ENSRNOG00000019514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC094529 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110040N11, mRNA (cDNA clone MGC:105635 IMAGE:7320095), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016905 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:145482536:145482916:1 gene:ENSRNOG00000012677 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145479598:145482916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144547033:144596889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT005625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT047512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058133 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:162604569:162604945:1 gene:ENSRNOG00000038186 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0
ENSRNOT00000036284 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:145305030:145305431:1 gene:ENSRNOG00000046432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058267 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:145497736:145498137:1 gene:ENSRNOG00000049566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145302472:145340081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000004316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145495178:145498031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_001072421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 9 (Tdrd9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_001078318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 9 (Tdrd9), mRNA. // chr6 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// XM_006225882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 9 (Tdrd9), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017118 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:145545219:145659868:1 gene:ENSRNOG00000012792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000064451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145620613:145659868:1 gene:ENSRNOG00000012792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// BC087164 // GenBank // Rattus norvegicus tudor domain containing 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7135228). // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC104675 // GenBank // Rattus norvegicus tudor domain containing 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7383197), complete cds. // chr6 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000004292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145576286:145659663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
GENSCAN00000004292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145576286:145659663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0
NM_144750 // RefSeq // Rattus norvegicus asparaginase (Aspg), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145692075:145711786:1 gene:ENSRNOG00000012843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB009372 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Lysophospholipase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098655 // GenBank // Rattus norvegicus asparaginase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112599 IMAGE:7373402), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145692153:145714587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NR_031918 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-203 (Mir203), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-203a // miRBase Micro RNA Database // MI0000945 Rattus norvegicus miR-203a stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170348 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 26A (Kif26a), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145729938:145764118:1 gene:ENSRNOG00000013661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145727874:145764118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
XM_001078490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691485 (LOC691485), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_002726771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691485 (LOC691485), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691485 (LOC691485), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017504 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:146076796:146079875:1 gene:ENSRNOG00000013097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006225897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inverted formin, FH2 and WH2 domain containing (Inf2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inverted formin, FH2 and WH2 domain containing (Inf2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146172025:146187666:1 gene:ENSRNOG00000028650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146172025:146187666:1 gene:ENSRNOG00000028650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146132183:146187299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006225897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inverted formin, FH2 and WH2 domain containing (Inf2), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006240655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inverted formin, FH2 and WH2 domain containing (Inf2), mRNA. // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146172025:146187666:1 gene:ENSRNOG00000028650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146172025:146187666:1 gene:ENSRNOG00000028650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC088245 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC13251, mRNA (cDNA clone IMAGE:7368069), partial cds. // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146132183:146187299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT047527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_001100982 // RefSeq // Rattus norvegicus SIVA1, apoptosis-inducing factor (Siva1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SIVA1, apoptosis-inducing factor (Siva1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146217298:146221441:1 gene:ENSRNOG00000028640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000065213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146217298:146221553:1 gene:ENSRNOG00000028640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088866 // GenBank // Rattus norvegicus SIVA1, apoptosis-inducing factor, mRNA (cDNA clone MGC:105767 IMAGE:7318866), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001126302 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 42 (Zbtb42), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 42 (Zbtb42), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006240648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 42 (Zbtb42), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000030879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146250223:146252352:1 gene:ENSRNOG00000037562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161864 // GenBank // Rattus norvegicus similar to zinc finger protein 238, mRNA (cDNA clone MGC:187402 IMAGE:7099191), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146250767:146252029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002726778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 170B (Cep170b), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// XM_002729727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 170B (Cep170b), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000030235 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:146294896:146315899:1 gene:ENSRNOG00000033688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000030246 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:146294896:146315899:1 gene:ENSRNOG00000033688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000045533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146302706:146315899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT047535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT047534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001126288 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase D family, member 4 (Pld4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146329774:146337292:1 gene:ENSRNOG00000028566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161906 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase D family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:187627 IMAGE:8367484), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ230808 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA89YL19 mRNA sequence. // chr6 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146332237:146336913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000018568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146389788:146396583:1 gene:ENSRNOG00000013690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086564 // GenBank // Rattus norvegicus LOC362793, mRNA (cDNA clone MGC:105548 IMAGE:7305233), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001077683 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 6 (Btbd6), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000019768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146782164:146784616:1 gene:ENSRNOG00000014693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC127548 // GenBank // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:156832 IMAGE:7365801), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146782251:146784197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT047544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENSRNOT00000020027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146820376:146881865:1 gene:ENSRNOG00000014744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000056880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146820376:146881865:1 gene:ENSRNOG00000014744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000005029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146847282:146881865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT047546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 29 // 47 // 1 /// NONRATT047548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1
XM_003750240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 22 (Tex22), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 22 (Tex22), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034995 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:146885358:146897935:1 gene:ENSRNOG00000028158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146884477:146897907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_022588 // RefSeq // Rattus norvegicus metastasis associated 1 (Mta1), mRNA. // chr6 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000006521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146938211:146944409:1 gene:ENSRNOG00000004711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000046456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146918907:146944409:1 gene:ENSRNOG00000004711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AJ132046 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ZG29p. // chr6 // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// U02522 // GenBank // Rattus norvegicus Mta1 (mta1) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000023304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146917238:146943876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT047553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT047554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 76 // 76 // 31 // 41 // 1 /// NONRATT047552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// NONRATT047555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT047557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// NONRATT047559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_022501 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich protein 2 (Crip2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000006804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146947874:146952833:1 gene:ENSRNOG00000005041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC061774 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72447 IMAGE:5621903), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// D17512 // GenBank // Rattus norvegicus CRP2 mRNA for cysteine-rich protein 2, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// FQ233584 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YE13 mRNA sequence. // chr6 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146947944:146952362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// NONRATT047564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
NM_001134933 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich protein 1 (intestinal) (Crip1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001244867 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich protein 1 (intestinal) (Crip1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146959581:146961385:1 gene:ENSRNOG00000027990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146959643:147037355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001072932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690422 (LOC690422), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_002726781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690422 (LOC690422), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000029223 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:146963710:146970406:1 gene:ENSRNOG00000005153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000023314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146959643:147037355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT047568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT047567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT047569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
XM_001079243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 121 (Tmem121), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002726782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 121 (Tmem121), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_347582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 121 (Tmem121), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_355174 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 121 (Tmem121), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006872 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:146991739:146992695:1 gene:ENSRNOG00000005174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146959643:147037355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000037944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:147180935:147182439:1 gene:ENSRNOG00000027874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 91 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:147150021:147182359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000070980 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:147559626:147560043:-1 gene:ENSRNOG00000047785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 54 // 8 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000072990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:148190669:148191100:1 gene:ENSRNOG00000049265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 79 // 8 // 22 // 0 /// NONRATT048824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 100 // 11 // 28 // 0
NM_138906 // RefSeq // Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 6 (Adam6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:147426645:147429130:1 gene:ENSRNOG00000037524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:147426704:147428938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106391 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosome production factor 2 homolog (S. cerevisiae) (Rpf2), mRNA. // chr6 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47041320:47062618:-1 gene:ENSRNOG00000000587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// BC158719 // GenBank // Rattus norvegicus brix domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187864 IMAGE:9089752), complete cds. // chr6 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// FQ213429 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YO09 mRNA sequence. // chr6 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008286 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:149904144:149905028:1 gene:ENSRNOG00000006321 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47041586:47076090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 67 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149904144:149905028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 80 // 93 // 20 // 25 // 0
NM_022799 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1 (Nucks1), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_003750251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinases substrate-like (LOC100909491), partial mRNA. // chr6 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000075674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53753077:53778581:1 gene:ENSRNOG00000047287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC078818 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear casein kinase and cyclin-dependent kinase substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:93427 IMAGE:7128528), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// FQ228159 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YE14 mRNA sequence. // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000005634 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:152603420:152604228:1 gene:ENSRNOG00000004262 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT047579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152542346:152604151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152442899:152453542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53718282:53777779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_019620 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 386 (Kruppel-like) (Zfp386), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:152840231:152854884:1 gene:ENSRNOG00000004268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC078841 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 386 (Kruppel-like), mRNA (cDNA clone MGC:93475 IMAGE:7115131), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U67082 // GenBank // Rattus norvegicus KRAB-zinc finger protein KZF-1 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_017238 // RefSeq // Rattus norvegicus vasoactive intestinal peptide receptor 2 (Vipr2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vasoactive intestinal peptide receptor 2 (Vipr2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:152876207:152945274:1 gene:ENSRNOG00000004317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U09631 // GenBank // Rattus norvegicus VIP2 vasoactive intestinal peptide receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152922698:153007721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_006225899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547216 (LOC102547216), mRNA. // chrU // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:153010958:153011860:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 92 // 92 // 12 // 13 // 1 /// ENSRNOT00000056743 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:153010160:153011830:1 gene:ENSRNOG00000037486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
ENSRNOT00000006582 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:153092828:153181968:1 gene:ENSRNOG00000032391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// XM_002726849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus extended synaptotagmin-like protein 2 (Esyt2), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 43 // 45 // 1 /// GENSCAN00000001612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:153127570:153177812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:153178718:153181820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 20 // 45 // 1 /// NONRATT047588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
XM_006225900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC condensin II complex, subunit G2 (Ncapg2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC condensin II complex, subunit G2 (Ncapg2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:153221967:153288508:1 gene:ENSRNOG00000004968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:153205811:153352004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_031600 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, N polypeptide 2 (Ptprn2), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:153312968:154056676:1 gene:ENSRNOG00000005003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U73458 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase (PTPNE6) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:153490986:153672140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NR_031895 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-153 (Mir153), microRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053638 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:154028732:154028818:1 gene:ENSRNOG00000035515 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-153 // miRBase Micro RNA Database // MI0000922 Rattus norvegicus miR-153 stem-loop // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001047915 // RefSeq // Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 5 (Rapgef5), mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// XM_006240696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 5 (Rapgef5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000007112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:154462518:154541111:1 gene:ENSRNOG00000005271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// FQ211964 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA74YN03 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 77 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:154404919:154537512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 31 // 44 // 1 /// NONRATT047601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001034953 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006240704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000064868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:154655200:154699230:1 gene:ENSRNOG00000005410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC098734 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 like, mRNA (cDNA clone MGC:112726 IMAGE:7385105), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:154692630:154698027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
XM_001061918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L19-like (RGD1562420), mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// XM_003750253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L19-like (RGD1562420), mRNA. // chr6 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001191774 // RefSeq // Rattus norvegicus Sp8 transcription factor (Sp8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:155693431:155696034:1 gene:ENSRNOG00000005943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:155687729:155695984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191775 // RefSeq // Rattus norvegicus metastasis associated in colon cancer 1 (Macc1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:156283467:156301994:1 gene:ENSRNOG00000037436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:156277928:156301755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000002375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:156649389:156651411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001044269 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 196 (Tmem196), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:156784820:156847093:1 gene:ENSRNOG00000037435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089997 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 196, mRNA (cDNA clone MGC:109451 IMAGE:7320460), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211598 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YE10 mRNA sequence. // chr6 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT047613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:156802205:156855127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053600 // RefSeq // Rattus norvegicus fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II) (Fez2), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:956475:995426:-1 gene:ENSRNOG00000004577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AB076183 // GenBank // Rattus norvegicus FEZ2 mRNA for fasciculation and elongation protein zeta 2, complete cds. // chr6 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// AB080086 // GenBank // Rattus norvegicus zyginII mRNA for fasciculation and elongation protein zeta 2 splicing variant 2, complete cds. // chr6 // 87 // 77 // 20 // 23 // 0 /// AF120109 // GenBank // Rattus norvegicus zygin-related protein type I (Zrp1) mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AF120111 // GenBank // Rattus norvegicus zygin-related protein type III (Zrp3) mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC100060 // GenBank // Rattus norvegicus fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II), mRNA (cDNA clone MGC:112579 IMAGE:7128839), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fasciculation and elongation protein zeta 2 (zygin II) (Fez2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT047614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:958257:995477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT047615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT047616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_019148 // RefSeq // Rattus norvegicus striatin, calmodulin binding protein (Strn), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000006527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1228267:1309977:-1 gene:ENSRNOG00000004806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1228872:1307011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// X99326 // GenBank // R.norvegicus mRNA for striatin. // chr6 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0
NM_001191064 // RefSeq // Rattus norvegicus HEAT repeat containing 5B (Heatr5b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000035905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1321469:1401571:-1 gene:ENSRNOG00000025926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000016135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1322032:1400418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0
NM_001108701 // RefSeq // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein zeta (Cebpz), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000006824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1506913:1524597:-1 gene:ENSRNOG00000005087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ223432 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA11YG10 mRNA sequence. // chr6 // 92 // 39 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1507768:1524586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT047631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001024263 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase D3 (Prkd3), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006239628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase D3 (Prkd3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006239630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase D3 (Prkd3), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006239631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase D3 (Prkd3), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000007492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1537626:1604551:-1 gene:ENSRNOG00000005289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC092663 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase D3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7368569), complete cds. // chr6 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000037353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1538722:1614620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT047634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1
NM_001048044 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3 (Cdc42ep3), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1912346:1932818:-1 gene:ENSRNOG00000032136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC105615 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 3, mRNA (cDNA clone MGC:125211 IMAGE:7453181), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000018736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2053457:2102963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
GENSCAN00000018736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2053457:2102963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_012940 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 1, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp1b1), mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000066363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2298849:2300644:-1 gene:ENSRNOG00000040287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2292319:2295746:-1 gene:ENSRNOG00000047433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// U09540 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley cytochrome P450 (CYP1B1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2276245:2299892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT047637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001100671 // RefSeq // Rattus norvegicus atlastin GTPase 2 (Atl2), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus atlastin GTPase 2 (Atl2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2548708:2590119:1 gene:ENSRNOG00000006523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2548708:2600446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT046213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_233805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like (Hnrnpll), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009175 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:2678572:2708005:-1 gene:ENSRNOG00000006929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2680474:2762865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT047639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
BC099175 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine-rich 7, mRNA (cDNA clone MGC:116344 IMAGE:7382701), complete cds. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// FQ229134 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YA08 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ233827 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YD23 mRNA sequence. // chr6 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// NM_001039035 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 7 (Srsf7), mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000038448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2857412:2863365:-1 gene:ENSRNOG00000027360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT047643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT047644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2857628:2863263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT047645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001191907 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-Asp/His) box polypeptide 57 (Dhx57), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:2898233:2941135:-1 gene:ENSRNOG00000027329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:2875154:2997435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NONRATT047655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_001100716 // RefSeq // Rattus norvegicus Son of sevenless homolog 1 (Drosophila) (Sos1), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000009359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:3082456:3159445:-1 gene:ENSRNOG00000007106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000039993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:3070863:3322948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT047657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT047658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
XM_001062504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 4 (Cdkl4), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:3203271:3223505:-1 gene:ENSRNOG00000040266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:3070863:3322948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT047660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_133407 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 3 (Map4k3), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000010366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:3247187:3414716:-1 gene:ENSRNOG00000007172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AF312224 // GenBank // Rattus norvegicus germinal center kinase-like kinase mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT047661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:3070863:3322948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// NONRATT047664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1
NM_001012108 // RefSeq // Rattus norvegicus THUMP domain containing 2 (Thumpd2), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_001163506 // RefSeq // Rattus norvegicus THUMP domain containing 2 (Thumpd2), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006239674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus THUMP domain containing 2 (Thumpd2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus THUMP domain containing 2 (Thumpd2), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:3710781:3762198:-1 gene:ENSRNOG00000008291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC089870 // GenBank // Rattus norvegicus THUMP domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:108999 IMAGE:7324079), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:3692338:3762186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT047666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT047667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001106704 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2 like (Cox7a2l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:6650357:6664094:-1 gene:ENSRNOG00000004526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC166896 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2 like, mRNA (cDNA clone MGC:188853 IMAGE:6921504), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ219925 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YN18 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6651022:6734740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001033957 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 3 (Kcng3), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NM_133426 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 3 (Kcng3), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:6749225:6797238:-1 gene:ENSRNOG00000004535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AB070605 // GenBank // Rattus norvegicus Kv6.3 mRNA for voltage-gated K+ channel 6.3, complete cds. // chr6 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AF454549 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated potassium channel subunit Kv10.1a mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF454550 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated potassium channel subunit Kv10.1b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000020521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6749467:6752606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000020524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6796520:6797179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_020076 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase (Haao), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase (Haao), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:6994176:7007338:-1 gene:ENSRNOG00000031263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085739 // GenBank // Rattus norvegicus 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:93472 IMAGE:7108551), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// D28339 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase, partial cds. // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// D44494 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ219702 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YJ06 mRNA sequence. // chr6 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:6996481:7007250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001036626 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 36, C3H type-like 2 (Zfp36l2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7357987:7362018:-1 gene:ENSRNOG00000005067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074873 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:2329849:2331791:-1 gene:ENSRNOG00000050108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2329849:2351763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:7359843:7361785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191769 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid adenoma associated (Thada), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000038246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7364891:7677173:-1 gene:ENSRNOG00000025899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000025535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:7548753:7690942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_053754 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 5 (Abcg5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7871269:7896799:-1 gene:ENSRNOG00000005250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF312714 // GenBank // Rattus norvegicus sterolin (Abcg5) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:7879986:7891547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT047688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008519 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich pentatricopeptide repeat containing (Lrpprc), mRNA. // chr6 // 95 // 95 // 35 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000008200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:7919929:8001949:-1 gene:ENSRNOG00000005877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// AY293808 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich protein 157 precursor (Lrpprc) mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 95 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000025534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:7920622:7966782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000025548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:7980702:7990206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT047693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001010951 // RefSeq // Rattus norvegicus prolyl endopeptidase-like (Prepl), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolyl endopeptidase-like (Prepl), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolyl endopeptidase-like (Prepl), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:8251542:8277070:-1 gene:ENSRNOG00000007326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:8251542:8278693:-1 gene:ENSRNOG00000007326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC089111 // GenBank // Rattus norvegicus prolyl endopeptidase-like, mRNA (cDNA clone MGC:105586 IMAGE:7312962), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ221039 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YG05 mRNA sequence. // chr6 // 67 // 40 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:8251659:8277070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT047697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001191908 // RefSeq // Rattus norvegicus SIX homeobox 2 (Six2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:8875432:8878687:-1 gene:ENSRNOG00000024511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:8875868:8882837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT047704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000019894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:9187408:9376698:-1 gene:ENSRNOG00000014720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000073363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:9187408:9376698:-1 gene:ENSRNOG00000014720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// FQ212138 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA68YC11 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000028669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:9261893:9393075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1 /// NONRATT047706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// GENSCAN00000028665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:9141550:9237643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT047707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001108979 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit E2 (Atp6v1e2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit E2 (Atp6v1e2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit E2 (Atp6v1e2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit E2 (Atp6v1e2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20499969:20503887:-1 gene:ENSRNOG00000015566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:20500148:20500828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT016535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139253 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple coagulation factor deficiency 2 (Mcfd2), mRNA. // chr6 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// AF475282 // GenBank // Rattus norvegicus neural stem cell derived neuronal survival protein precursor (Sdnsf) mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// BC071179 // GenBank // Rattus norvegicus multiple coagulation factor deficiency 2, mRNA (cDNA clone MGC:91471 IMAGE:7100216), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ212530 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YN04 mRNA sequence. // chr6 // 86 // 88 // 12 // 14 // 0 /// NONRATT047721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001163562 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681766 (LOC681766), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061746 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:21009850:21051287:-1 gene:ENSRNOG00000040136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681766 (LOC681766), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21009915:21161787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_022292 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 12 (Kcnk12), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:21346993:21464940:-1 gene:ENSRNOG00000016110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF287300 // GenBank // Rattus norvegicus tandem pore domain potassium channel THIK-2 (Kcnk12) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239731 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 12 (Kcnk12), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT047731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000012004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21385950:21465466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21304556:21348047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_181631 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 11 (Fbxo11), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000021998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:21634307:21658631:-1 gene:ENSRNOG00000016396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006239732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 11 (Fbxo11), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1 /// ENSRNOT00000075262 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:21397996:21412341:-1 gene:ENSRNOG00000050882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21639083:21665234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000012004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21385950:21465466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1
ENSRNOT00000052280 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:21831388:21832743:-1 gene:ENSRNOG00000031564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:21831373:21872459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NM_012978 // RefSeq // Rattus norvegicus luteinizing hormone/choriogonadotropin receptor (Lhcgr), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:22455216:22516387:-1 gene:ENSRNOG00000016712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048394 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:22455216:22516387:-1 gene:ENSRNOG00000016712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073504 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:22455216:22516387:-1 gene:ENSRNOG00000016712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074508 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:22455216:22516387:-1 gene:ENSRNOG00000016712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// M26199 // GenBank // Rat lutropin-choriogonadotropic hormone receptor mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000045535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:22456785:22516387:-1 gene:ENSRNOG00000016712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000064845 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:22477723:22516387:-1 gene:ENSRNOG00000016712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:22455977:22481299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_199237 // RefSeq // Rattus norvegicus follicle stimulating hormone receptor (Fshr), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus follicle stimulating hormone receptor (Fshr), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000022802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:22754761:22955080:-1 gene:ENSRNOG00000016783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT047737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_021767 // RefSeq // Rattus norvegicus neurexin 1 (Nrxn1), mRNA. // chrU // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000035388 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:24408199:24715174:-1 gene:ENSRNOG00000027796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000041278 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:24408199:24715174:-1 gene:ENSRNOG00000027796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000050128 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:24408199:24715174:-1 gene:ENSRNOG00000027796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000061624 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:24408199:24715174:-1 gene:ENSRNOG00000027796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// M96374 // GenBank // Rattus norvegicus non-processed neurexin I-alpha mRNA, complete cds. // chrU // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// M96375 // GenBank // Rattus norvegicus non-processed neurexin I-beta mRNA, complete cds. // chrU // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000021877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:24438528:24482070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 91 // 29 // 10 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000040745 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:23843134:24308904:-1 gene:ENSRNOG00000050220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000071402 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:23843134:24308904:-1 gene:ENSRNOG00000050220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
ENSRNOT00000018231 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:24257852:24258491:-1 gene:ENSRNOG00000013638 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:24257852:24258361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000046211 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:24625372:24626480:-1 gene:ENSRNOG00000031737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT047742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:24625570:24630582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NONRATT047742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// GENSCAN00000030995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:24625570:24630582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
M58436 // GenBank // Rat protein serine-threonine phosphatase catalytic subunit PP-1c, partial cds. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:27991063:27991839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_053797 // RefSeq // Rattus norvegicus crooked neck pre-mRNA splicing factor 1 (Crnkl1), mRNA. // chr6 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// XM_006224679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crooked neck-like protein 1-like (LOC102548514), mRNA. // chr6 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000014632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:146546963:146561830:-1 gene:ENSRNOG00000010587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// AF245018 // GenBank // Rattus norvegicus crooked neck protein mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// BC085718 // GenBank // Rattus norvegicus crooked neck pre-mRNA splicing factor-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:93283 IMAGE:7190212), complete cds. // chr6 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000061588 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:28249274:28251346:-1 gene:ENSRNOG00000040045 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:28249274:28251346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146547125:146561754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 61 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT038213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// NONRATT038212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT038214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 37 // 37 // 15 // 41 // 1
NM_001108009 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 3 (calcium and DAG-regulated) (Rasgrp3), mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 3 (calcium and DAG-regulated) (Rasgrp3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 3 (calcium and DAG-regulated) (Rasgrp3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:30966364:31029468:-1 gene:ENSRNOG00000032703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:30980725:31181983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT047748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT047750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
GENSCAN00000005152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:30980725:31181983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT047747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT047750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_021587 // RefSeq // Rattus norvegicus latent transforming growth factor beta binding protein 1 (Ltbp1), mRNA. // chr6 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000047674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:31097090:31491806:-1 gene:ENSRNOG00000033090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// M55431 // GenBank // Rat transforming growth factor-beta (TGF-beta) masking protein large subunit, complete cds. // chr6 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:30980725:31181983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT047751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT047752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001106706 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 27 (Ttc27), mRNA. // chr6 // 100 // 21 // 20 // 20 // 0 /// NM_001170596 // RefSeq // Rattus norvegicus baculoviral IAP repeat-containing 6 (Birc6), mRNA. // chr6 // 99 // 77 // 73 // 74 // 0 /// ENSRNOT00000006505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:31624976:31768786:-1 gene:ENSRNOG00000042932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 21 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:31524882:31980891:-1 gene:ENSRNOG00000027191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 57 // 57 // 0 /// GENSCAN00000033589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:31806414:31967197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 54 // 54 // 0 /// GENSCAN00000033607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:31596800:31768619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 19 // 19 // 18 // 96 // 1 /// NONRATT047753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 20 // 96 // 1 /// NONRATT047757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 17 // 17 // 16 // 96 // 1
NM_001009712 // RefSeq // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 4 (Yipf4), mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000000223 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:38176259:38178435:1 gene:ENSRNOG00000000207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 92 // 32 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:32015277:32026693:-1 gene:ENSRNOG00000005610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// BC088468 // GenBank // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:95126 IMAGE:7127993), complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000000495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:32012652:32026713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 41 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT047759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000016356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38128966:38197700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// NONRATT047760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1
NM_001277279 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 6 (Slc30a6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:32084819:32106886:-1 gene:ENSRNOG00000005856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:32084271:32113759:-1 gene:ENSRNOG00000005856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC167086 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:189486 IMAGE:5621310), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ209539 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YB03 mRNA sequence. // chr6 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:32084967:32119168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108702 // RefSeq // Rattus norvegicus spastin (Spast), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:32118321:32168698:-1 gene:ENSRNOG00000027136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC166846 // GenBank // Rattus norvegicus spastin, mRNA (cDNA clone MGC:188738 IMAGE:9030077), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:32121060:32168616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT047764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0
NM_138890 // RefSeq // Rattus norvegicus EH-domain containing 3 (Ehd3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:34923815:34948298:1 gene:ENSRNOG00000007744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF494093 // GenBank // Rattus norvegicus EH-domain containing protein 2 (Ehd2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:34898139:34963137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT046352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
XM_006225701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysocardiolipin acyltransferase 1 (Lclat1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043641 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:34278820:34364478:1 gene:ENSRNOG00000034026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:34252266:34364478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT046350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001129880 // RefSeq // Rattus norvegicus limb bud and heart development (Lbh), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:34010039:34031267:1 gene:ENSRNOG00000039902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001129880 // RefSeq // Rattus norvegicus limb bud and heart development (Lbh), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:34010039:34031267:1 gene:ENSRNOG00000039902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:34010504:34029171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC166725 // GenBank HTC // Rattus norvegicus similar to limb-bud and heart, mRNA (cDNA clone IMAGE:7933942), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
FQ229415 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YP24 mRNA sequence. // chr6 // 86 // 50 // 12 // 14 // 0 /// NM_001035221 // RefSeq // Rattus norvegicus yippee-like 5 (Drosophila) (Ypel5), mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000035362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:33915155:33935174:1 gene:ENSRNOG00000026742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT046341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT046347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT046348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT046342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT046345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT046343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT046344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT046346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000005553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:33617273:33618544:1 gene:ENSRNOG00000004188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// BC089860 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 14-3-3 protein sigma, mRNA (cDNA clone MGC:108952 IMAGE:7112967), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33617307:33618053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT046340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0
NM_001013942 // RefSeq // Rattus norvegicus CAP-GLY domain containing linker protein family, member 4 (Clip4), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:33101207:33150094:-1 gene:ENSRNOG00000008806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC081910 // GenBank // Rattus norvegicus CAP-GLY domain containing linker protein family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:93846 IMAGE:7111548), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33091793:33120050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT047767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_002726698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 179, member A (Fam179a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// XM_002729599 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 179, member A (Fam179a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000036374 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:33225433:33270376:-1 gene:ENSRNOG00000026344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33258095:33292279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000040255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33237516:33251266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_001037791 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 43 (Wdr43), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000035320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:33299540:33339177:-1 gene:ENSRNOG00000026316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC099168 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 43, mRNA (cDNA clone IMAGE:7382211), complete cds. // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// BC169117 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7106452. // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000040233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33300909:33339140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// NONRATT047772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT047773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT047775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// NONRATT047776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NONRATT047774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138855 // RefSeq // Rattus norvegicus speedy/RINGO cell cycle regulator family member A (Spdya), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus speedy/RINGO cell cycle regulator family member A (Spdya), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000006073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:33364981:33410446:-1 gene:ENSRNOG00000004534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF492385 // GenBank // Rattus norvegicus GS4 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078729 // GenBank // Rattus norvegicus speedy homolog A (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:93178 IMAGE:7134092), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// NONRATT047781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33361461:33448012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_013065 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, catalytic subunit, beta isozyme (Ppp1cb), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:33416541:33448276:-1 gene:ENSRNOG00000004612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC062033 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, catalytic subunit, beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:72523 IMAGE:5623630), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// D90164 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for catalytic subunit of protein phosphatase 1, complete cds, clone:PP-1 delta. // chr6 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// FQ212294 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA61YJ08 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// NONRATT047783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// GENSCAN00000040252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:33361461:33448012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_138898 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase B1 (Plb1), mRNA. // chr6 // 98 // 100 // 55 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000061176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:35202769:35331482:-1 gene:ENSRNOG00000026037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// D63648 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase B, complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 55 // 56 // 0 /// GENSCAN00000020399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:35081603:35355926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT047792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// NONRATT047797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 16 // 16 // 9 // 56 // 1
NM_199270 // RefSeq // Rattus norvegicus brain and reproductive organ-expressed (TNFRSF1A modulator) (Bre), mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brain and reproductive organ-expressed (TNFRSF1A modulator) (Bre), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:35490054:35875542:-1 gene:ENSRNOG00000004364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC061573 // GenBank // Rattus norvegicus brain and reproductive organ-expressed protein, mRNA (cDNA clone MGC:72967 IMAGE:6887072), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// FQ231263 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA74YE10 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// FQ224261 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA71YM06 mRNA sequence. // chr6 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT047798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT047799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT047800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT047801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NONRATT047798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrUn // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT047799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrUn // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT047800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrUn // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT047801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrUn // 100 // 100 // 4 // 4 // 1
XM_002726702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L33 (Mrpl33), mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// XM_002729600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L33 (Mrpl33), mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000034712 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:35954540:35962710:-1 gene:ENSRNOG00000025388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// FQ224256 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA72YA02 mRNA sequence. // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT047799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT047803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:35945534:35960168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001106709 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1, adaptor protein (Slc4a1ap), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36035092:36064887:-1 gene:ENSRNOG00000004901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36037790:36064887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001127572 // RefSeq // Rattus norvegicus GPN-loop GTPase 1 (Gpn1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36078633:36096305:-1 gene:ENSRNOG00000004941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC161949 // GenBank // Rattus norvegicus similar to XPA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187742 IMAGE:9025530), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36079163:36096288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XR_347048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930548H24 (RGD1560110), misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_354614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930548H24 (RGD1560110), misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36102051:36205064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XM_006225705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 512 (Zfp512), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 512 (Zfp512), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36109571:36137715:-1 gene:ENSRNOG00000039815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36102051:36205064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT047809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006225708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus titin-like (LOC102556504), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072707 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:36139878:36141566:-1 gene:ENSRNOG00000049398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36102051:36205064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001011981 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 17 (Snx17), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 64 // 64 // 0 /// ENSRNOT00000030518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36359401:36361303:-1 gene:ENSRNOG00000026884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 48 // 48 // 0 /// BC078931 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 17, mRNA (cDNA clone MGC:93729 IMAGE:7107232), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 64 // 64 // 0 /// GENSCAN00000041209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36359792:36363945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT047814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 70 // 70 // 48 // 69 // 1 /// NONRATT047816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 21 // 69 // 1
NM_001013217 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 54 (Trim54), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36419744:36439076:-1 gene:ENSRNOG00000006146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083706 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 54, mRNA (cDNA clone MGC:94590 IMAGE:7190356), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36420140:36438892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT047819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001013242 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 gamma (Dnajc5g), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 gamma (Dnajc5g), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// XM_006239825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 gamma (Dnajc5g), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000031244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36440654:36444716:-1 gene:ENSRNOG00000026578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC083671 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:94516 IMAGE:7135668), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_001105710 // RefSeq // Rattus norvegicus carbamoyl-phosphate synthetase 2, aspartate transcarbamylase, and dihydroorotase (Cad), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000039709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36472498:36495450:-1 gene:ENSRNOG00000026474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000027513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36476259:36501161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36472771:36475853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT047822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001127526 // RefSeq // Rattus norvegicus all-trans retinoic acid-induced differentiation factor (Atraid), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36495621:36500202:-1 gene:ENSRNOG00000006326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC166904 // GenBank // Rattus norvegicus similar to apoptosis related protein APR-3; p18 protein, mRNA (cDNA clone MGC:188868 IMAGE:6887237), complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// FQ214285 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YJ22 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36476259:36501161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000009090 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:36582104:36586628:-1 gene:ENSRNOG00000025736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// XM_001067558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor 23 (Tcf23), mRNA. // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// XM_003754152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor 23 (Tcf23), mRNA. // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000027536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36580996:36589151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001008520 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 1 (Abhd1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36603422:36608410:-1 gene:ENSRNOG00000025689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC086351 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105659 IMAGE:7302778), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36603508:36611689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031855 // RefSeq // Rattus norvegicus ketohexokinase (Khk), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ketohexokinase (Khk), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36626194:36636426:-1 gene:ENSRNOG00000008047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC078752 // GenBank // Rattus norvegicus ketohexokinase, mRNA (cDNA clone MGC:93239 IMAGE:7109062), complete cds. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// X63658 // GenBank // R.norvegicus mRNA for ketohexokinase. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ218346 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YP10 mRNA sequence. // chr6 // 62 // 87 // 16 // 26 // 0 /// NONRATT047831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36626380:36644145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT047832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT047834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001106710 // RefSeq // Rattus norvegicus elastin microfibril interfacer 1 (Emilin1), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// XM_006239794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elastin microfibril interfacer 1 (Emilin1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000010932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36636870:36644587:-1 gene:ENSRNOG00000008246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000027535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36626380:36644145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT047838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT047839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_001126372 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 5 (Agbl5), mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006239807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 5 (Agbl5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006239811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 5 (Agbl5), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006239812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 5 (Agbl5), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006239815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 5 (Agbl5), transcript variant X9, mRNA. // chr6 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36653651:36671181:-1 gene:ENSRNOG00000008612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36652005:36692253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_001014195 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 214 (Tmem214), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36684558:36692304:-1 gene:ENSRNOG00000008812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC085114 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 214, mRNA (cDNA clone MGC:105815 IMAGE:7106107), complete cds. // chr6 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC129115 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 214, mRNA (cDNA clone MGC:156758 IMAGE:7112909), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT047846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36652005:36692253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_001007656 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 3 (Mapre3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 3 (Mapre3), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 3 (Mapre3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36695665:36706479:-1 gene:ENSRNOG00000008961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083589 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:94312 IMAGE:7132546), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ215765 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YL18 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36696520:36730571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT047851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT047849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT047852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_023023 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydropyrimidinase-like 5 (Dpysl5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239841 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydropyrimidinase-related protein 5-like (LOC100911610), mRNA. // chr6 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000012273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36756090:36840626:-1 gene:ENSRNOG00000008996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:36246624:36265542:-1 gene:ENSRNOG00000050641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AB029432 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for dihydropyrimidinase-related protein, complete cds. // chr6 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36749554:36827457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36237061:36270068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT047853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38105555:38119424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001106711 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein A (Cenpa), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36888797:36896348:-1 gene:ENSRNOG00000032178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166997 // GenBank // Rattus norvegicus centromere protein A, mRNA (cDNA clone MGC:189150 IMAGE:8365241), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36890306:36896291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001017451 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member F6 (Slc35f6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36910714:36922551:-1 gene:ENSRNOG00000009459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC085904 // GenBank // Rattus norvegicus similar to putative protein, with at least 9 transmembrane domains, of eukaryotic origin (43.9 kD) (2G415), mRNA (cDNA clone MGC:94739 IMAGE:7193745), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:36912493:36922520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_033376 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 3 (Kcnk3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36969854:37005778:-1 gene:ENSRNOG00000009790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:36970424:37005695:-1 gene:ENSRNOG00000009790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AB048823 // GenBank // Rattus norvegicus KCNK3b mRNA for TASK1 splice bvariant (TASK1b), complete cds. // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// AB048824 // GenBank // Rattus norvegicus KCNK3c mRNA for TWIK-related acid-sensitive K+ channel sprice variant (TASK1c), complete cds. // chr6 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// AF031384 // GenBank // Rattus norvegicus TWIK-related acid-sensitive K+ channel (TASK) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37005329:37029521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001109275 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700001C02 (RGD1559683), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37117774:37136364:-1 gene:ENSRNOG00000009905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37119787:37136296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001007009 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein regulatory complex subunit 1 homolog (Chlamydomonas) (Drc1), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000036815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37237529:37272329:-1 gene:ENSRNOG00000024905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000053191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37237673:37290029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT047868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT047869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001134754 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein I (Seli), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC168235 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein I, mRNA (cDNA clone MGC:188326 IMAGE:7444430), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37285873:37297955:-1 gene:ENSRNOG00000010667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000074470 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:37299180:37323881:-1 gene:ENSRNOG00000048252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000053188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37303346:37324181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_133618 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/3-ketoacyl-CoA thiolase/enoyl-CoA hydratase (trifunctional protein), beta subunit (Hadhb), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/3-ketoacyl-CoA thiolase/enoyl-CoA hydratase (trifunctional protein), beta subunit (Hadhb), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37366083:37393666:-1 gene:ENSRNOG00000010800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC060545 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxyacyl-Coenzyme A dehydrogenase/3-ketoacyl-Coenzyme A thiolase/enoyl-Coenzyme A hydratase (trifunctional protein), beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:72701 IMAGE:6918791), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37366559:37396782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT047879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT047880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT047881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSRNOT00000033851 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:37835439:37835902:-1 gene:ENSRNOG00000024520 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37835439:37835899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
XM_006225717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EFR3 homolog B (S. cerevisiae) (Efr3b), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000039251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:38203470:38235681:-1 gene:ENSRNOG00000012950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000068214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:38203470:38235681:-1 gene:ENSRNOG00000012950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000016338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38203470:38272955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001108012 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 1 (Ncoa1), mRNA. // chr6 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// XM_006239845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 1 (Ncoa1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000068531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:38483478:38734322:-1 gene:ENSRNOG00000004068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000054799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38515654:38580595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT047888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT047891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// GENSCAN00000054800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:38479348:38514766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// NONRATT047890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
XM_002726722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 2B (Mfsd2b), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000032664 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:40919228:40929452:1 gene:ENSRNOG00000023508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000073979 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:40924835:40945328:1 gene:ENSRNOG00000023508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:40921508:40930778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_001109482 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 2A (Ubxn2a), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006239861 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UBX domain protein 2A (Ubxn2a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000006668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:40892611:40914105:1 gene:ENSRNOG00000004950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000014702 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:110032587:110033364:-1 gene:ENSRNOG00000011067 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041101 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:55675396:55676173:1 gene:ENSRNOG00000031969 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:110032587:110033364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:55675396:55676173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:40874385:40914105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT046480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
NM_001106713 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 29 (Klhl29), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 29 (Klhl29), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:40403632:40706610:1 gene:ENSRNOG00000005371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168973 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 29 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7454605), complete cds. // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000021633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:40680315:40702982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT046475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_006225725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain-containing protein 15-like (LOC102556253), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006225727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain-containing protein 15-like (LOC102556253), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006225728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain-containing protein 15-like (LOC102556253), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006239872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain-containing protein 15-like (LOC102556253), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006239875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain-containing protein 15-like (LOC102556253), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006239876 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain-containing protein 15-like (LOC102556253), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006239877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain-containing protein 15-like (LOC102556253), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:42851648:42890920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170350 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 7 (Gdf7), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43288343:43292667:-1 gene:ENSRNOG00000006046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43288632:43292646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_022542 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member B (Rhob), mRNA. // chr6 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43473992:43474582:-1 gene:ENSRNOG00000021403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// M74295 // GenBank // Rat rhoB gene mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43473992:43474582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT047907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106714 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 15 (Slc7a15), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:43511030:43521748:-1 gene:ENSRNOG00000006119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:43511966:43521726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_031778 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, delayed-rectifier, subfamily S, member 3 (Kcns3), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:46515729:46571013:-1 gene:ENSRNOG00000004899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF029056 // GenBank // Rattus norvegicus Shab-related delayed-rectifier K+ channel (Kv9.3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT047915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001109551 // RefSeq // Rattus norvegicus mesogenin 1 (Msgn1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:46626337:46626900:-1 gene:ENSRNOG00000028518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:46625106:46626900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106717 // RefSeq // Rattus norvegicus GEN1 Holliday junction 5 flap endonuclease (Gen1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GEN1 Holliday junction 5 flap endonuclease (Gen1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:46660788:46690981:-1 gene:ENSRNOG00000004667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:46628774:46686495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_012686 // RefSeq // Rattus norvegicus visinin-like 1 (Vsnl1), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:46751474:46872211:-1 gene:ENSRNOG00000005345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092197 // GenBank // Rattus norvegicus visinin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:105475 IMAGE:7313365), complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// D10666 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neural visinin-like protein (NVP), complete cds. // chr6 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT047920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:46752539:46781398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000054619 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:6:50452028:50452138:1 gene:ENSRNOG00000036512 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_234016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L27a-like (RGD1565679), mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000060587 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:51131049:51133336:-1 gene:ENSRNOG00000006081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:51126511:51155298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_001013096 // RefSeq // Rattus norvegicus v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene neuroblastoma derived homolog (Mycn), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:51348170:51353994:-1 gene:ENSRNOG00000006308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:51349096:51352513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT047942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000008672 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:51361324:51361841:-1 gene:ENSRNOG00000006626 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:51353363:51361820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_053414 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 1 (Ddx1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:47188699:47219567:-1 gene:ENSRNOG00000006652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082049 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:95195 IMAGE:7131804), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227615 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YK05 mRNA sequence. // chr6 // 77 // 52 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:47188891:47208150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001127299 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 84, member A (Fam84a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:48123855:48128328:-1 gene:ENSRNOG00000004084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166716 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 84, member A, mRNA (cDNA clone MGC:188417 IMAGE:7930888), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:48126092:48127849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108015 // RefSeq // Rattus norvegicus tribbles pseudokinase 2 (Trib2), mRNA. // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000005774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:49774736:49798090:-1 gene:ENSRNOG00000004110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC168939 // GenBank // Rattus norvegicus tribbles homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:189240 IMAGE:7103466), complete cds. // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// FQ231260 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA74YF17 mRNA sequence. // chr6 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT047931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT047932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:49776609:49806009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000036615 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:51465062:51465856:-1 gene:ENSRNOG00000024778 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:51465062:51466176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 65 // 9 // 11 // 0
NM_001012111 // RefSeq // Rattus norvegicus lipin 1 (Lpin1), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006239912 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipin 1 (Lpin1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000005863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:51534870:51602407:-1 gene:ENSRNOG00000004377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC083651 // GenBank // Rattus norvegicus lipin 1, mRNA (cDNA clone MGC:94481 IMAGE:7135110), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000052784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:51534909:51609526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT047944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT047945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// NONRATT047946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// NONRATT047947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
XM_003754164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth regulation by estrogen in breast cancer 1 (Greb1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000032417 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:51663027:51732012:-1 gene:ENSRNOG00000024651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:51663027:51804741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001034952 // RefSeq // Rattus norvegicus PQ loop repeat containing 3 (Pqlc3), mRNA. // chr6 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000007071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:52010004:52021578:-1 gene:ENSRNOG00000005126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// BC081879 // GenBank // Rattus norvegicus PQ loop repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:93745 IMAGE:7108131), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000021686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52018808:52021407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT047953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1
NM_001109573 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690276 (LOC690276), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006239919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690276 (LOC690276), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690276 (LOC690276), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033550 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:52026112:52032239:-1 gene:ENSRNOG00000024338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001169104 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily F, member 1 (Kcnf1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:52191821:52193338:-1 gene:ENSRNOG00000024310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52191821:52274437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000044716 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:52542988:52543450:-1 gene:ENSRNOG00000029872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000047047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52537512:52565649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
NM_001106719 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin beta 1 binding protein 1 (Itgb1bp1), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin beta 1 binding protein 1 (Itgb1bp1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60216649:60231041:-1 gene:ENSRNOG00000006358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC169104 // GenBank // Rattus norvegicus integrin beta 1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:189524 IMAGE:7386477), complete cds. // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ218542 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YH16 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// FQ229091 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YJ24 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60216342:60224687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT048012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT048015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT048016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT048013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT048018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_020306 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 17 (Adam17), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006239994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 17 (Adam17), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60268237:60315989:-1 gene:ENSRNOG00000007503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AJ012603 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TNF-alpha converting enzyme (TACE). // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000017747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60269607:60315750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT048019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_013053 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta (Ywhaq), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60331003:60361242:-1 gene:ENSRNOG00000008104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062409 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:72512 IMAGE:5623850), complete cds. // chr6 // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// D17614 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 14-3-3 protein theta-subtype, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60332279:60360787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT048022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT048024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NONRATT048023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000071295 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:52928567:52929187:-1 gene:ENSRNOG00000048040 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000075450 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:60440183:60440803:-1 gene:ENSRNOG00000048271 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0
ENSRNOT00000066205 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:60546725:60549283:-1 gene:ENSRNOG00000023341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60546725:60561933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0
NM_001109597 // RefSeq // Rattus norvegicus cystin 1 (Cys1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60716420:60733664:-1 gene:ENSRNOG00000006627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60718136:60749799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_013060 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of DNA binding 2 (Id2), mRNA. // chr6 // 95 // 51 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:53083849:53086239:-1 gene:ENSRNOG00000007237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// BC086391 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of DNA binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:105494 IMAGE:7303450), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// D10863 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ID2 protein, complete cds. // chr6 // 95 // 51 // 20 // 21 // 0 /// FQ212969 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YG24 mRNA sequence. // chr6 // 86 // 68 // 24 // 28 // 0 /// AY321351 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-300 mRNA, complete cds. // chr6 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1 /// NONRATT047964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// GENSCAN00000039262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:53082306:53086314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1
NM_001082410 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 144A (Rnf144a), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 144A (Rnf144a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:54234290:54348903:-1 gene:ENSRNOG00000007370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:54234785:54325347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_138881 // RefSeq // Rattus norvegicus radical S-adenosyl methionine domain containing 2 (Rsad2), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:54376868:54388860:-1 gene:ENSRNOG00000007539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:54338655:54388861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XR_347139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D3 (LOC100362486), ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_354716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D3 (LOC100362486), ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_053349 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 11 (Sox11), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:55343074:55345088:-1 gene:ENSRNOG00000030034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:55306591:55344786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000011186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56407970:56408822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
NM_001195807 // RefSeq // Rattus norvegicus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X10, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin domain containing 2C (Dcdc2c), transcript variant X12, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56476185:56513978:-1 gene:ENSRNOG00000008266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56466663:56541061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001013037 // RefSeq // Rattus norvegicus allantoicase (Allc), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56515119:56549952:-1 gene:ENSRNOG00000008299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF480062 // GenBank // Rattus norvegicus allantoicase mRNA, partial cds. // chr6 // 82 // 52 // 14 // 17 // 0 /// BC078971 // GenBank // Rattus norvegicus allantoicase, mRNA (cDNA clone MGC:93851 IMAGE:7111813), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT047976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56466663:56541061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT047975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_006225735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collectin sub-family member 11 (Colec11), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collectin sub-family member 11 (Colec11), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56560203:56586487:-1 gene:ENSRNOG00000008373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC158664 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8369817, partial cds. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56560203:56594360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000029859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56656859:56719823:-1 gene:ENSRNOG00000009039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000071594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56677335:56719823:-1 gene:ENSRNOG00000009039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000074154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:56687556:56722274:-1 gene:ENSRNOG00000009039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000005414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:56657545:56719823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// FQ225443 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA52YH05 mRNA sequence. // chr6 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT047982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT047984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
AJ601385 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for PE responsive protein c64 (perc64 gene). // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019353 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid peroxidase (Tpo), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:57702554:57770914:-1 gene:ENSRNOG00000004646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:57695131:57770200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_001106720 // RefSeq // Rattus norvegicus syntrophin, gamma 2 (Sntg2), mRNA. // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntrophin, gamma 2 (Sntg2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000066904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:57803704:58004693:-1 gene:ENSRNOG00000004928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:57804363:57880183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_199385 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrolipoamide dehydrogenase (Dld), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000008980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59273260:59293928:-1 gene:ENSRNOG00000006364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC062069 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrolipoamide dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:72602 IMAGE:5599215), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59273901:59293838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT047997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001108018 // RefSeq // Rattus norvegicus Cbl proto-oncogene-like 1, E3 ubiquitin protein ligase (Cbll1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59443728:59457590:-1 gene:ENSRNOG00000007253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59446224:59458426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_019214 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 4 (Slc26a4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006239978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 4 (Slc26a4), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59479855:59518321:-1 gene:ENSRNOG00000007314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF167412 // GenBank // Rattus norvegicus pendrin (Pds) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59464960:59546746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT048002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT048003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001006980 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell receptor-associated protein 29 (Bcap29), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59555828:59595518:-1 gene:ENSRNOG00000007884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083576 // GenBank // Rattus norvegicus B-cell receptor-associated protein 29, mRNA (cDNA clone MGC:93926 IMAGE:7113186), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000027146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59556799:59613178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001135803 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 4-like (S. cerevisiae) (Dus4l), mRNA. // chr6 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// XM_006239991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 4-like (S. cerevisiae) (Dus4l), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// XM_006239992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 4-like (S. cerevisiae) (Dus4l), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000068419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59601170:59615497:-1 gene:ENSRNOG00000008155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// GENSCAN00000027146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59556799:59613178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001106722 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 22 (Gpr22), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59683771:59690751:-1 gene:ENSRNOG00000008423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013221 // RefSeq // Rattus norvegicus HMG-box transcription factor 1 (Hbp1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59902129:59928239:-1 gene:ENSRNOG00000008927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091165 // GenBank // Rattus norvegicus HMG-box transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:108754 IMAGE:7097013), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ223257 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YI16 mRNA sequence. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// U09551 // GenBank // Rattus norvegicus HMG-box containing protein 1 (HBP1) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59900133:59932157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001030020 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II beta (Prkar2b), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_354723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II beta (Prkar2b), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:59936129:59968013:-1 gene:ENSRNOG00000009079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC099223 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type II beta, mRNA (cDNA clone MGC:116401 IMAGE:7388087), complete cds. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59938037:59953546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT048010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:59961751:60027028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_003750140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit gamma (Pik3cg), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012487 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:61110111:61139363:-1 gene:ENSRNOG00000009385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000045589 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:61110111:61139363:-1 gene:ENSRNOG00000009385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000003705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:61114247:61133979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
ENSRNOT00000037029 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:61214769:61215174:-1 gene:ENSRNOG00000025635 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:61214769:61291845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000013659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:61814277:61872116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XR_354745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547703 (LOC102547703), transcript variant X1, ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000054650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:63092263:63177466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000047238 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:63092231:63092974:-1 gene:ENSRNOG00000028973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0
NM_001200045 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 9 (Hdac9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase 9 (Hdac9), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase 9 (Hdac9), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:63111204:63679614:-1 gene:ENSRNOG00000004158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB558551 // GenBank // Rattus norvegicus HDAC9 mRNA for histone deacetylase 9, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ225774 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA46YK21 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001200045 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 9 (Hdac9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase 9 (Hdac9), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase 9 (Hdac9), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase 9 (Hdac9), transcript variant X15, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:63111204:63679614:-1 gene:ENSRNOG00000004158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB558551 // GenBank // Rattus norvegicus HDAC9 mRNA for histone deacetylase 9, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ225774 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA46YK21 mRNA sequence. // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:63459338:63546961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
GENSCAN00000045348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:64321616:64373370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_001013244 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 13 (Tspan13), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:65111579:65138717:-1 gene:ENSRNOG00000005046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC089906 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 13, mRNA (cDNA clone MGC:109170 IMAGE:7123552), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ215999 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YF20 mRNA sequence. // chr6 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// NONRATT048047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000035690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:65110992:65141389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT048046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_134402 // RefSeq // Rattus norvegicus basic leucine zipper and W2 domains 2 (Bzw2), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:65200722:65261870:-1 gene:ENSRNOG00000005096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF031483 // GenBank // Rattus norvegicus hfb2 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC063149 // GenBank // Rattus norvegicus basic leucine zipper and W2 domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:72696 IMAGE:6890706), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT048050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:65212053:65263217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
XM_001077099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 72 (Lrrc72), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_216698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 72 (Lrrc72), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000036996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:65308659:65327937:-1 gene:ENSRNOG00000025049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:65308659:65369162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
ENSRNOT00000046071 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:65680863:65681985:-1 gene:ENSRNOG00000023194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:65633089:65753399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000044298 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:66076470:66077356:-1 gene:ENSRNOG00000031972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 94 // 81 // 16 // 17 // 0
GENSCAN00000018511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:67177013:67223298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
XM_001077473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1-like (Smarce1l), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_234076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1-like (Smarce1l), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005643 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:68960832:68962009:-1 gene:ENSRNOG00000004248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:68961129:68961741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
XM_001077487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S10-like (RGD1560073), mRNA. // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042029 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:69123987:69124571:-1 gene:ENSRNOG00000034175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:69124046:69124543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_019186 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 4A (Arl4a), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 4A (Arl4a), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:69536689:69538783:-1 gene:ENSRNOG00000004282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC088148 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 4A, mRNA (cDNA clone MGC:108709 IMAGE:7373646), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:69537009:69636457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_198748 // RefSeq // Rattus norvegicus scinderin (Scin), mRNA. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:69564441:69641704:-1 gene:ENSRNOG00000004498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY324394 // GenBank // Rattus norvegicus scinderin (Scind) mRNA, complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:69537009:69636457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_001058983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich single-pass membrane protein 1 (Lsmem1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich single-pass membrane protein 1 (Lsmem1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059823 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:69703176:69708731:-1 gene:ENSRNOG00000039110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000008328 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:70571776:70573263:-1 gene:ENSRNOG00000006349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000001720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:70572292:70582949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_030856 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat neuronal 3 (Lrrn3), mRNA. // chr6 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:70956995:70987862:-1 gene:ENSRNOG00000006368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF291437 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal leucine-rich repeat protein-3 (Nlrr3) mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// BC081791 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat neuronal 3, mRNA (cDNA clone MGC:93401 IMAGE:7124169), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:70957259:70959382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT048061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_199495 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 10 (Ndufa10), mRNA. // chr6 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// XM_006245553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 10 (Ndufa10), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000022089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:99282166:99316927:-1 gene:ENSRNOG00000016470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// AY260163 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase 1 alpha subcomplex 10-like protein mRNA, complete cds. // chr6 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// BC061985 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 10, mRNA (cDNA clone MGC:72603 IMAGE:5599238), complete cds. // chr6 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// NONRATT048062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_012699 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 9 (Dnajb9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 9 (Dnajb9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 9 (Dnajb9), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000005363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:73754561:73758774:-1 gene:ENSRNOG00000004006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070915 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:91708 IMAGE:7104653), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000043562 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:74612931:74613921:-1 gene:ENSRNOG00000032651 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000012376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:74612931:74662596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_001191872 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin binding protein 6 (amisyn) (Stxbp6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin binding protein 6 (amisyn) (Stxbp6), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:74671542:74901751:-1 gene:ENSRNOG00000004198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:74675738:74713229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
XM_006240070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100541 // RefSeq // Rattus norvegicus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), mRNA. // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuro-oncological ventral antigen 1 (Nova1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000050372 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:76540824:76660498:-1 gene:ENSRNOG00000031440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:76540824:76565854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT048072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:76653400:76660498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT048073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000048148 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:80291565:80292564:-1 gene:ENSRNOG00000033797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0
NM_001276715 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase D1 (Prkd1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000068077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:80601006:80914043:-1 gene:ENSRNOG00000004165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:80612595:80767271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// NONRATT048078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NONRATT048081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000053560 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:6:81745250:81745370:-1 gene:ENSRNOG00000035437 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029897 // RefSeq // Rattus norvegicus striatin, calmodulin binding protein 3 (Strn3), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:81940488:82026817:-1 gene:ENSRNOG00000005585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000068293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:81940488:82026817:-1 gene:ENSRNOG00000005585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AY026526 // GenBank // Rattus norvegicus SG2NA mRNA, partial cds. // chr6 // 95 // 50 // 19 // 20 // 0 /// DQ473607 // GenBank // Rattus norvegicus striatin-3-gamma (Strn3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:81956185:82034968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT048084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1
XM_006240086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HECT domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (Hectd1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000008459 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:82073589:82157549:-1 gene:ENSRNOG00000006905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000018685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82065269:82134482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// FQ211070 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YB06 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// FQ211662 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YD16 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT048085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT048086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000035309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:82211313:82299967:-1 gene:ENSRNOG00000006483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000018701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82197831:82312117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// NONRATT048092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001108981 // RefSeq // Rattus norvegicus D-tyrosyl-tRNA deacylase 2 (Dtd2), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:82342355:82348642:-1 gene:ENSRNOG00000006727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82343138:82348628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001031823 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 33 (Gpr33), mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:82366716:82367721:-1 gene:ENSRNOG00000038990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GQ981324 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 33 (GPR33) pseudogene mRNA, complete sequence. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:82366716:82367727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0 /// NONRATT048094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT048098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_019371 // RefSeq // Rattus norvegicus egl-9 family hypoxia-inducible factor 3 (Egln3), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:84592894:84618360:-1 gene:ENSRNOG00000005053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U06713 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley SM-20 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:84563415:84618174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001078945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S19-like (RGD1559724), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_234128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S19-like (RGD1559724), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000047882 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:85009491:85009925:-1 gene:ENSRNOG00000034203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85009491:85009970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001047743 // RefSeq // Rattus norvegicus serine palmitoyltransferase, small subunit A (Sptssa), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85080146:85091608:-1 gene:ENSRNOG00000004292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC098829 // GenBank // Rattus norvegicus LOC500651, mRNA (cDNA clone IMAGE:7378302), complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// FQ218719 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YC05 mRNA sequence. // chr6 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// FQ221040 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YG04 mRNA sequence. // chr6 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// FQ209541 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YA20 mRNA sequence. // chr6 // 56 // 96 // 15 // 27 // 0 /// NONRATT048101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT048102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85060484:85091528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT048103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001106729 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F-associated phosphoprotein (Eapp), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NM_001134987 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F-associated phosphoprotein (Eapp), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006240100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E2F-associated phosphoprotein (Eapp), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85107699:85129236:-1 gene:ENSRNOG00000004509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// BC168880 // GenBank // Rattus norvegicus E2F-associated phosphoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:189134 IMAGE:9099474), complete cds. // chr6 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85107713:85129156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT048108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT048103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001108711 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 6 (Snx6), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85166825:85210033:-1 gene:ENSRNOG00000005249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC168856 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 6, mRNA (cDNA clone MGC:189089 IMAGE:7458822), complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85147120:85274680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT048109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108982 // RefSeq // Rattus norvegicus cofilin 2, muscle (Cfl2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cofilin 2, muscle (Cfl2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000072589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85300272:85304317:-1 gene:ENSRNOG00000045892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_001170568 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain adjacent to zinc finger domain, 1A (Baz1a), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85333776:85413029:-1 gene:ENSRNOG00000006828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85334511:85417755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001108022 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700097O09 (RGD1304624), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700097O09 (RGD1304624), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85483144:85531929:-1 gene:ENSRNOG00000006986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// FQ212699 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YN13 mRNA sequence. // chr6 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// FQ226302 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YK10 mRNA sequence. // chr6 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// XR_354818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556255 (LOC102556255), ncRNA. // chr6 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000007425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85483315:85531895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT048123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
GENSCAN00000007442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85577872:85578369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NM_001014196 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r3c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85593213:85615398:-1 gene:ENSRNOG00000023591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079257 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:94358 IMAGE:7133341), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ227548 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YP05 mRNA sequence. // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000007432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85593319:85614877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000009205 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:85648597:85649299:-1 gene:ENSRNOG00000007024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
GENSCAN00000007443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85703770:85705422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0
NM_001105720 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, alpha (Nfkbia), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85803991:85807223:-1 gene:ENSRNOG00000007390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC166886 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:188827 IMAGE:6890357), complete cds. // chr6 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85800043:85807104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT048129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT048132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_020083 // RefSeq // Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 1 (catalytic) (Ralgapa1), mRNA. // chr6 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000010824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85963144:86131756:-1 gene:ENSRNOG00000046256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000065230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:85920794:86131756:-1 gene:ENSRNOG00000046256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// AF041106 // GenBank // Rattus norvegicus tulip 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 51 // 20 // 21 // 0 /// AF041107 // GenBank // Rattus norvegicus tulip 2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 32 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:85957908:86154885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// NONRATT048134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1 /// NONRATT048139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_001108712 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP3K12 binding inhibitory protein 1 (Mbip), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:86758207:86775445:-1 gene:ENSRNOG00000008610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:86747179:86775375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT048141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_013093 // RefSeq // Rattus norvegicus NK2 homeobox 1 (Nkx2-1), mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006240116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NK2 homeobox 1 (Nkx2-1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006240117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NK2 homeobox 1 (Nkx2-1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:86945224:86948414:-1 gene:ENSRNOG00000008644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AB894119 // GenBank // Rattus norvegicus Nkx2-1 mRNA for NK2 homeobox 1, complete cds. // chr6 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// X53858 // GenBank // Rat TTF-1 mRNA for thyroid nuclear factor 1. // chr6 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:86946402:86964678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT048150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0
NM_001106732 // RefSeq // Rattus norvegicus NK2 homeobox 8 (Nkx2-8), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000011562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:87033998:87035701:-1 gene:ENSRNOG00000022970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:87029653:87035477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_133614 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial oxoadipate carrier), member 21 (Slc25a21), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:87152174:87636335:-1 gene:ENSRNOG00000008931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC089099 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial oxodicarboxylate carrier), member 21, mRNA (cDNA clone MGC:105329 IMAGE:7306738), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial oxoadipate carrier), member 21 (Slc25a21), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// XM_006240114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial oxoadipate carrier), member 21 (Slc25a21), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_012742 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box A1 (Foxa1), mRNA. // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:88070528:88074240:-1 gene:ENSRNOG00000009284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:88070528:88074682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0
ENSRNOT00000059394 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:88048005:88049854:-1 gene:ENSRNOG00000038871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:88047800:88058879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001014077 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 14, member A (Clec14a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:88834333:88835739:-1 gene:ENSRNOG00000022697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC081897 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 14, member a, mRNA (cDNA clone MGC:93813 IMAGE:7110446), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:88834333:88835739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT048161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105732 // RefSeq // Rattus norvegicus Sec23 homolog A (S. cerevisiae) (Sec23a), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000006369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:89586788:89633108:-1 gene:ENSRNOG00000004657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC169006 // GenBank // Rattus norvegicus Sec23 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189367 IMAGE:7189145), complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89586880:89612717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 47 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89618187:89628484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT048163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT048164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT048166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
GENSCAN00000040442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89653584:89654558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT048169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001106733 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 6B (Trappc6b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:89667998:89679088:-1 gene:ENSRNOG00000004103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89668503:89678910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001108023 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 33 (Fbxo33), mRNA. // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000059316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:89828089:89860308:-1 gene:ENSRNOG00000005285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:89829829:89867914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000007248 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:90576313:90577051:-1 gene:ENSRNOG00000005471 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:90576467:90589431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0
ENSRNOT00000037384 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:90796855:90797226:-1 gene:ENSRNOG00000021631 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:90796855:90797226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NONRATT004306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 80 // 100 // 4 // 5 // 0 /// NONRATT041809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 80 // 100 // 4 // 5 // 0 /// NONRATT027171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 60 // 100 // 3 // 5 // 0
NM_019351 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 17 homolog A (yeast) (Timm17a), mRNA. // chr6 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// XM_576033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 17a-like 1 (Timm17al1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007325 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:92771477:92772555:1 gene:ENSRNOG00000005541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57174166:57185658:-1 gene:ENSRNOG00000007040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// AB006450 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Tim17, complete cds. // chr6 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57174550:57183517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:92771481:92772159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT017313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT046821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT046822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001271107 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrous sheath CABYR binding protein (Fscb), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:95722889:95725327:-1 gene:ENSRNOG00000032241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:95722889:95725327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106735 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 28 (Klhl28), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 28 (Klhl28), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:96177047:96204629:-1 gene:ENSRNOG00000004218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:96178240:96195617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106736 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 3 (Fkbp3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:96299844:96311094:-1 gene:ENSRNOG00000004629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168873 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7104931), partial cds. // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ214685 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YI22 mRNA sequence. // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:96301387:96311071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT048180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109531 // RefSeq // Rattus norvegicus MIS18 binding protein 1 (Mis18bp1), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:96368090:96413264:-1 gene:ENSRNOG00000023093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:96368897:96403334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_003750173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L10-like (Rpl10l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L10-like (Rpl10l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047597 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:97714711:97715355:-1 gene:ENSRNOG00000032720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:97714711:97715355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006240136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 (Mdga2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199269 // RefSeq // Rattus norvegicus MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 (Mdga2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006240137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 (Mdga2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:97931875:98773148:-1 gene:ENSRNOG00000000618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AY371924 // GenBank // Rattus norvegicus MAM domain-containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 (Mdga2) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006240136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 2 (Mdga2), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// GENSCAN00000047386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:97942839:98045091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000047388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:98118657:98245712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT048184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT048185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSRNOT00000005511 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:99399798:99400307:-1 gene:ENSRNOG00000004163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:99399798:99411926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000001338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100844191:100889915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_001014197 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, assembly factor 2 (Dnaaf2), mRNA. // chr6 // 89 // 100 // 31 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000059187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:100940356:100949091:-1 gene:ENSRNOG00000028155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// BC089901 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 14 open reading frame 104, mRNA (cDNA clone MGC:109144 IMAGE:7383335), complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100941182:100949079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONRATT048194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_001169108 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), epsilon 2, accessory subunit (Pole2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:100953300:100977903:-1 gene:ENSRNOG00000004242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ231562 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YA16 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100953387:100971037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT048198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT048195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT048199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
XM_006225788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor BTF3-like (LOC102547663), mRNA. // chr6 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// XM_006240185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor BTF3-like (LOC102547663), mRNA. // chr6 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000034507 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:101039574:101040059:-1 gene:ENSRNOG00000028058 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000004244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101039574:101040044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0
NM_001170586 // RefSeq // Rattus norvegicus serologically defined colon cancer antigen 1 (Sdccag1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XR_354869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550586 (LOC102550586), ncRNA. // chr6 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000029880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101068662:101132662:-1 gene:ENSRNOG00000004716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000004268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101070193:101105455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 72 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85015833:85033911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 86 // 33 // 37 // 0 /// NONRATT048207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 60 // 60 // 26 // 43 // 1 /// NONRATT048206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 47 // 47 // 20 // 43 // 1
FQ227960 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YB07 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033412 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:101330637:101336068:-1 gene:ENSRNOG00000027693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000004249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101247594:101366437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// FQ209696 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YB06 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
NM_001135561 // RefSeq // Rattus norvegicus son of sevenless homolog 2 (Drosophila) (Sos2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006240184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus son of sevenless homolog 2 (Drosophila) (Sos2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000006425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101337035:101457492:-1 gene:ENSRNOG00000004826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000004246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101368987:101413604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 49 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101247594:101366437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1 /// NONRATT048215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1
ENSRNOT00000073949 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:101441781:101442506:-1 gene:ENSRNOG00000050631 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101441781:101457517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001108028 // RefSeq // Rattus norvegicus L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase (L2hgdh), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101466089:101507172:-1 gene:ENSRNOG00000004857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101467828:101508579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_001025121 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase) (Cdkl1), mRNA. // chrU // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase) (Cdkl1), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101526936:101570647:-1 gene:ENSRNOG00000038720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC081896 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 1 (CDC2-related kinase), mRNA (cDNA clone MGC:93810 IMAGE:7110321), complete cds. // chrU // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101529085:101538644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001192016 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 5 (Map4k5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000006705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101586288:101678374:-1 gene:ENSRNOG00000004923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101557014:101643103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT048224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT048226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT048228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001097581 // RefSeq // Rattus norvegicus salvador family WW domain containing protein 1 (Sav1), mRNA. // chr6 // 94 // 94 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000007314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101825584:101846408:-1 gene:ENSRNOG00000005264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 94 // 15 // 16 // 0 /// BC161803 // GenBank // Rattus norvegicus salvador homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:187211 IMAGE:8371277), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT048231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001106737 // RefSeq // Rattus norvegicus ninein (GSK3B interacting protein) (Nin), mRNA. // chr6 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// XM_006240147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ninein-like (LOC100911256), partial mRNA. // chr6 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ninein (GSK3B interacting protein) (Nin), transcript variant X13, mRNA. // chr6 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101880766:101975096:-1 gene:ENSRNOG00000005540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000052408 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:100670835:100728716:-1 gene:ENSRNOG00000049104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:100666569:100755828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101881036:101932329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_022268 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphorylase, glycogen, liver (Pygl), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000009183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102045139:102091169:-1 gene:ENSRNOG00000006388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC070901 // GenBank // Rattus norvegicus phosphorylase, glycogen, liver, mRNA (cDNA clone MGC:91696 IMAGE:7100896), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000008585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:102045288:102091104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT048237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_130420 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 9 (Trim9), mRNA. // chr6 // 97 // 79 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000009560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:102107774:102207427:-1 gene:ENSRNOG00000007031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// AF350422 // GenBank // Rattus norvegicus Spring mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 79 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:102104742:102172010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001276429 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 9 homolog (yeast) (Timm9), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001276430 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 9 homolog (yeast) (Timm9), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_133604 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 9 homolog (yeast) (Timm9), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 9 homolog (yeast) (Timm9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 9 homolog (yeast) (Timm9), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:103015075:103027902:-1 gene:ENSRNOG00000008222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ228524 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YF05 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_075101 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 9 homolog (yeast) (Timm9), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT048245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT048246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000072827 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:103775345:103776109:-1 gene:ENSRNOG00000047354 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 74 // 96 // 17 // 23 // 0
NM_181771 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 135 (Gpr135), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:104261635:104263008:-1 gene:ENSRNOG00000004499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY288430 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 135 (Gpr135) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104261635:104263008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108031 // RefSeq // Rattus norvegicus L-3-hydroxyproline dehydratase (trans-) (L3hypdh), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:104268771:104279567:-1 gene:ENSRNOG00000004503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104269236:104279260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001164400 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 175 (Ccdc175), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000006346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:104294725:104377617:-1 gene:ENSRNOG00000004774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC087160 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Centromeric protein E (CENP-E protein), mRNA (cDNA clone MGC:95302 IMAGE:7134746), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000041158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104294788:104385009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT048255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_053865 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulon 1 (Rtn1), mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// U17603 // GenBank // Rattus norvegicus rS-Rex-s mRNA, complete cds. // chr6 // 98 // 95 // 55 // 56 // 0 /// U17604 // GenBank // Rattus norvegicus rS-Rex-b mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000006373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:104395869:104424491:-1 gene:ENSRNOG00000004794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000072262 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:104395869:104615205:-1 gene:ENSRNOG00000004794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// NONRATT048257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// NONRATT048258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 85 // 22 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104396625:104424693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 33 // 59 // 1
ENSRNOT00000044725 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:104636756:104638763:-1 gene:ENSRNOG00000030484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000040222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104636865:104652072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001271394 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 precursor (Retinal short-chain dehydrogenase/reductase 4) (RGD1565002), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007645 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:104960581:104979170:-1 gene:ENSRNOG00000005589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:104961690:104979170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0
NONRATT048260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013098 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7 (Dhrs7), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000034289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:104917830:104940633:-1 gene:ENSRNOG00000025648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AB108671 // GenBank // Rattus norvegicus DR-NR#3 mRNA for Down-regulated in nephrectomized rat kidney #3, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC104713 // GenBank // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 7, mRNA (cDNA clone MGC:124901 IMAGE:7370181), complete cds. // chr6 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006225797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Six6 opposite strand transcript 1 (Six6os1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000041409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:105199542:105233712:-1 gene:ENSRNOG00000031655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:105055494:105233712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
NM_053759 // RefSeq // Rattus norvegicus SIX homeobox 1 (Six1), mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000034338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:105364372:105369608:-1 gene:ENSRNOG00000022777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:105366090:105368993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT048268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106739 // RefSeq // Rattus norvegicus SIX homeobox 4 (Six4), mRNA. // chr6 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000050138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:105420180:105433841:-1 gene:ENSRNOG00000007250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:105432212:105433545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000055865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:105423981:105430024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT048271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001108713 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 5 (Trmt5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 5 (Trmt5), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:105596366:105601887:-1 gene:ENSRNOG00000007785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:105586893:105601737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT048272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0
XM_006225799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L26-like (LOC688981), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046585 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:105633827:105634264:-1 gene:ENSRNOG00000032000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:105633827:105634264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080380 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 30B (Tmem30b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_133610 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 5 (Kcnh5), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:107294666:107578241:-1 gene:ENSRNOG00000009542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF185637 // GenBank // Rattus norvegicus potasium channel Eag2 (Eag2) mRNA, complete cds. // chr6 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// AJ250280 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for eag K+ channel isoform 2(eag2 gene). // chr6 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:107332906:107401132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:107472702:107563104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NONRATT048284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001007013 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein hormone beta 5 (Gphb5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:107798630:107801179:-1 gene:ENSRNOG00000021885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY437504 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein hormone subunit beta 5 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:107798630:107801179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106740 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, epsilon isoform (Ppp2r5e), mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, epsilon isoform (Ppp2r5e), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:107836104:107985205:-1 gene:ENSRNOG00000005045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:107846281:107866915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT048287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT048288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001014078 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 89 (Wdr89), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108017412:108023798:-1 gene:ENSRNOG00000021628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC089849 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 89, mRNA (cDNA clone MGC:108878 IMAGE:7375058), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
AY539932 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00181 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000006913 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:108094887:108114210:-1 gene:ENSRNOG00000005175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AF329638 // GenBank // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate phosphohydrolase mRNA, partial cds. // chr6 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000008808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108094887:108114210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT048290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001025658 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 21 (Tex21), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 21 (Tex21), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108648682:108685306:-1 gene:ENSRNOG00000038496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC097422 // GenBank // Rattus norvegicus testis expressed gene 21, mRNA (cDNA clone MGC:114468 IMAGE:7454996), complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108633928:108682665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT048292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_199496 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 25 (Zbtb25), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:108791852:108800583:-1 gene:ENSRNOG00000006441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061829 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 25, mRNA (cDNA clone MGC:72618 IMAGE:5599733), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:108793111:108799890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT048294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001080819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (RGD1562381), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// XM_234319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (RGD1562381), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000040565 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:108980943:108981350:-1 gene:ENSRNOG00000029835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
XM_006240245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spectrin, beta, erythrocytic (Sptb), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_212522 // RefSeq // Rattus norvegicus spectrin, beta, erythrocytic (Sptb), mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006240245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spectrin, beta, erythrocytic (Sptb), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:109073106:109181206:-1 gene:ENSRNOG00000006911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AY238343 // GenBank // Rattus norvegicus erythroid spectrin beta mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:109057870:109124822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT048303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
NM_183403 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione peroxidase 2 (Gpx2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_198749 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB15, member RAS oncogene family (Rab15), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:109242428:109266332:-1 gene:ENSRNOG00000007364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC094954 // GenBank // Rattus norvegicus RAB15, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:109360 IMAGE:7316003), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// M83679 // GenBank // Sprague-Dawley (clone LRB9) RAB15 mRNA, complete cds. // chr6 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT048306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:109236736:109250917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_022210 // RefSeq // Rattus norvegicus MYC associated factor X (Max), mRNA. // chr6 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000010954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:109378844:109403735:-1 gene:ENSRNOG00000008049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000041442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:109378844:109403735:-1 gene:ENSRNOG00000008049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC099778 // GenBank // Rattus norvegicus MYC associated factor X, mRNA (cDNA clone MGC:124611 IMAGE:7933028), complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// D14447 // GenBank // Rattus norvegicus Max mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// D14448 // GenBank // Rattus norvegicus Max mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT048307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT048312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT048313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:109380103:109427194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XR_146043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909680 (LOC100909680), ncRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_147024 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909680 (LOC100909680), ncRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY539952 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00201 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199386 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit D (Atp6v1d), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111407090:111421805:-1 gene:ENSRNOG00000009080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063177 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit D, mRNA (cDNA clone MGC:72940 IMAGE:6891415), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ213312 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YI21 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT048324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111405529:111422626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT048326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001114180 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin 2 (Plek2), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111450714:111468929:-1 gene:ENSRNOG00000010098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111451187:111478136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT048327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001109359 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 229B (Tmem229b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111524858:111565742:-1 gene:ENSRNOG00000010646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211952 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YF19 mRNA sequence. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111527668:111548399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108714 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class H (Pigh), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006240265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class H (Pigh), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006240266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class H (Pigh), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000014775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111632984:111642424:-1 gene:ENSRNOG00000010914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111634757:111642394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT048336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_003750196 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vesicle transport through interaction with t-SNAREs 1B (Vti1b), mRNA. // chr6 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:115026970:115040094:-1 gene:ENSRNOG00000011734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:115027787:115059858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// FQ229699 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YA15 mRNA sequence. // chr6 // 78 // 96 // 21 // 27 // 0 /// NONRATT048391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT048392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001012193 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 11 (all-trans/9-cis/11-cis) (Rdh11), mRNA. // chr6 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:115043173:115059292:-1 gene:ENSRNOG00000011902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:115043541:115059059:-1 gene:ENSRNOG00000011902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AY387097 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00111 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC079276 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 11 (all-trans/9-cis/11-cis), mRNA (cDNA clone MGC:94397 IMAGE:7134077), complete cds. // chr6 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// FQ211684 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA83YI16 mRNA sequence. // chr6 // 93 // 80 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT048394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:115027787:115059858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
NM_001108038 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 26 (Zfyve26), mRNA. // chr6 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000016380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:115096555:115158874:-1 gene:ENSRNOG00000028111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000008490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:115098274:115178226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT048396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
ENSRNOT00000016409 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:115194259:115195137:-1 gene:ENSRNOG00000012310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000008477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:115194259:115200571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_031005 // RefSeq // Rattus norvegicus actinin, alpha 1 (Actn1), mRNA. // chr6 // 93 // 92 // 41 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000068522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116056248:116149475:-1 gene:ENSRNOG00000004309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AF115386 // GenBank // Rattus norvegicus non-muscle alpha-actinin 1 mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 92 // 41 // 44 // 0 /// AY437436 // GenBank // Rattus norvegicus brain-specific alpha actinin 1 isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 93 // 90 // 40 // 43 // 0 /// BC074001 // GenBank // Rattus norvegicus actinin, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:91658 IMAGE:7099133), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000017681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116056316:116108746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT048405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT048406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_017172 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 36, C3H type-like 1 (Zfp36l1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:115988971:115992268:-1 gene:ENSRNOG00000030024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:115963206:115992268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001100718 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 5 (Dcaf5), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1- and CUL4-associated factor 5-like (LOC102553533), mRNA. // chr6 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000006005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:111691590:111780260:-1 gene:ENSRNOG00000004556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111694228:111780242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
XM_006225810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor-like (RGD1559921), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor-like (RGD1559921), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008621 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:111791371:111791709:-1 gene:ENSRNOG00000006599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111791371:111791703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000048596 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:111978176:111980245:-1 gene:ENSRNOG00000038307 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 32 // 63 // 10 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111936513:111947920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000040693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:112004210:112005512:-1 gene:ENSRNOG00000031145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// GENSCAN00000013292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112001560:112016419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// NONRATT047014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1
XM_001080956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dnaJ homolog subfamily C member 17-like (RGD1565752), mRNA. // chr6 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0 /// XM_234351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dnaJ homolog subfamily C member 17-like (RGD1565752), mRNA. // chr6 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000058376 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:111995972:111996883:1 gene:ENSRNOG00000038337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000387 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:111984163:112115715:-1 gene:ENSRNOG00000000345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112124538:112125449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 84 // 8 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111936513:111947920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 87 // 11 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111995972:111996883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112134122:112135033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 84 // 8 // 26 // 0 /// NONRATT046722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0 /// NONRATT046723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0 /// NONRATT047014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112113700:112115054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001047959 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC500684 (LOC500684), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000037684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:71298090:71346652:-1 gene:ENSRNOG00000012651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000058354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112106426:112109120:-1 gene:ENSRNOG00000038322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ231274 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA73YC01 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// FQ231579 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC07 mRNA sequence. // chr6 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112108377:112109120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:71298326:71352141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112106953:112108311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
ENSRNOT00000040693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:112004210:112005512:-1 gene:ENSRNOG00000031145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 28 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112001560:112016419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT047014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// GENSCAN00000052768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:111828272:111887193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
ENSRNOT00000047825 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:112123617:112124096:-1 gene:ENSRNOG00000032248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112133276:112133680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000013290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112120240:112124096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001109442 // RefSeq // Rattus norvegicus enhancer of rudimentary homolog (Drosophila) (Erh), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000066014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112452339:112461605:-1 gene:ENSRNOG00000004883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC166864 // GenBank // Rattus norvegicus enhancer of rudimentary homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188780 IMAGE:8367571), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112452732:112468504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
XM_006225839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 177 (Ccdc177), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040965 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:112578662:112580770:-1 gene:ENSRNOG00000033973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112578662:112580770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_017047 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter), member 1 (Slc10a1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:112782934:112796559:-1 gene:ENSRNOG00000005794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091152 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter family), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:108711 IMAGE:7370832), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// FQ218559 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YF15 mRNA sequence. // chr6 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// M77479 // GenBank // Rattus norvegicus sodium/bile acid cotransporter mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112783388:112826574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000007844 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:112860710:112861134:-1 gene:ENSRNOG00000005983 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:112860710:112861021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_078620 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 3 (Slc8a3), mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:113051975:113244454:-1 gene:ENSRNOG00000029871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// U53420 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-calcium exchanger form 3 (NCX3) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000053214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:113053211:113079715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT048355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT048357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT048358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_001109277 // RefSeq // Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 4-like 1 (Adam4l1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC079009 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7113140. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:113144414:113165122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT048355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONRATT048358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_020305 // RefSeq // Rattus norvegicus a disintegrin and metalloprotease domain 4 (Adam4), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:113305256:113307523:-1 gene:ENSRNOG00000038275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC107437 // GenBank // Rattus norvegicus a disintegrin and metalloprotease domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:125044 IMAGE:7132937), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000073136 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:113435726:113437974:-1 gene:ENSRNOG00000045659 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073216 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:113188259:113190430:-1 gene:ENSRNOG00000047682 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:113435726:113481430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:113183416:113201205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT048357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT048358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001106742 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 6 (Med6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:113448725:113462191:-1 gene:ENSRNOG00000006976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC158786 // GenBank // Rattus norvegicus mediator complex subunit 6, mRNA (cDNA clone MGC:188149 IMAGE:7303059), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:113435726:113481430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001100872 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9 (Map3k9), mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000009693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:113606221:113664859:-1 gene:ENSRNOG00000007271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:113606221:113664859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001191818 // RefSeq // Rattus norvegicus D4, zinc and double PHD fingers, family 3 (Dpf3), mRNA. // chrU // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:114855815:114948893:-1 gene:ENSRNOG00000008086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein DPF3-like (LOC102553599), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONRATT048388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:114855959:114884685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT048389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT048387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001106743 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 1 (Zfyve1), mRNA. // chr6 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000011662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118461006:118509830:1 gene:ENSRNOG00000008614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// GENSCAN00000013354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118463158:118508522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT047149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT047154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT047152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT047153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_006240363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HEAT repeat-containing protein 4-like (RGD1566220), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000058127 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:118090629:118120708:1 gene:ENSRNOG00000038183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000051427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118086566:118112051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000013737 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:118043437:118043903:1 gene:ENSRNOG00000010351 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000051447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118043437:118043874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_006240359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-coenzyme A thioesterase 5-like (LOC299192), mRNA. // chr6 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// XM_006225845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-coenzyme A thioesterase 5-like (LOC299192), mRNA. // chr6 // 55 // 100 // 6 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000051256 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:117966627:117967088:1 gene:ENSRNOG00000050896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NM_130820 // RefSeq // Rattus norvegicus paraneoplastic Ma antigen 1 (Pnma1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117903766:117905380:1 gene:ENSRNOG00000010553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF335505 // GenBank // Rattus norvegicus paraneoplastic onconeuronal protein MA1 (Ma1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097291 // GenBank // Rattus norvegicus paraneoplastic antigen MA1, mRNA (cDNA clone MGC:114272 IMAGE:7453131), complete cds. // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001169116 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to transcriptional regulating protein 132 (RGD1306119), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELM2 and Myb/SANT-like domain containing 1 (Elmsan1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240337 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELM2 and Myb/SANT-like domain containing 1 (Elmsan1), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117858477:117899444:1 gene:ENSRNOG00000010653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117877795:117899308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XR_146046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 161, member B (Fam161b), transcript variant X1, misc_RNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_347395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 161, member B (Fam161b), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_354981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 161, member B (Fam161b), transcript variant X2, misc_RNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117470211:117485334:1 gene:ENSRNOG00000011112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117469773:117489855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
NM_199394 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (Entpd5), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006240346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5 (Entpd5), transcript variant X7, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117425815:117455726:1 gene:ENSRNOG00000033206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC062044 // GenBank // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 5, mRNA (cDNA clone MGC:72569 IMAGE:5597848), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117425816:117455438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_031057 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 6 family, member A1 (Aldh6a1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000015545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117379212:117399815:1 gene:ENSRNOG00000011419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000016862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117379256:117398389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// M93401 // GenBank // Rattus norvegicus methylmalonate semialdehyde dehydrogenase gene, complete cds. // chr6 // 86 // 100 // 30 // 35 // 0 /// NONRATT047124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT047125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001013100 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily D (ALD), member 4 (Abcd4), mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// XM_006240330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily D (ALD), member 4 (Abcd4), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// XM_006240331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily D (ALD), member 4 (Abcd4), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117216244:117231218:1 gene:ENSRNOG00000011964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC089214 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, sub-family D (ALD), member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7302205), complete cds. // chr6 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117201641:117230567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT047120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT047117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 72 // 72 // 31 // 43 // 1 /// NONRATT047121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT047118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// NONRATT047119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001109485 // RefSeq // Rattus norvegicus synapse differentiation inducing 1-like (Syndig1l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synapse differentiation inducing 1-like (Syndig1l), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117134070:117155831:1 gene:ENSRNOG00000027645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117153123:117176833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT047116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_173118 // RefSeq // Rattus norvegicus Niemann-Pick disease, type C2 (Npc2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117060860:117081692:1 gene:ENSRNOG00000012062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058132 // GenBank // Rattus norvegicus Niemann-Pick disease, type C2, mRNA (cDNA clone MGC:72659 IMAGE:6920130), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ219367 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YM07 mRNA sequence. // chr6 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// FQ220225 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YL17 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// FQ220524 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YI21 mRNA sequence. // chr6 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// FQ220619 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YD24 mRNA sequence. // chr6 // 50 // 96 // 12 // 24 // 0 /// FQ229183 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YN03 mRNA sequence. // chr6 // 38 // 96 // 9 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117060964:117081078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT047115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021586 // RefSeq // Rattus norvegicus latent transforming growth factor beta binding protein 2 (Ltbp2), mRNA. // chr6 // 92 // 97 // 33 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116956933:117049306:1 gene:ENSRNOG00000012094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT047113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000016877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:117000075:117048273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 78 // 78 // 29 // 37 // 1
NM_001106744 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis resistant E3 ubiquitin protein ligase 1 (Arel1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000006240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116893001:116917829:1 gene:ENSRNOG00000004382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116885633:116915832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT047112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001191771 // RefSeq // Rattus norvegicus prospero homeobox 2 (Prox2), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116636209:116645271:1 gene:ENSRNOG00000005054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116636209:116652196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006225853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase-like 1 (Rps6kl1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase-like 1 (Rps6kl1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116581249:116594985:1 gene:ENSRNOG00000005530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116581249:116594498:1 gene:ENSRNOG00000005530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116581249:116595239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT047107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT047109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT047110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_053595 // RefSeq // Rattus norvegicus placental growth factor (Pgf), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116552660:116563240:1 gene:ENSRNOG00000005650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC087006 // GenBank // Rattus norvegicus placental growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:93298 IMAGE:7193034), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L40030 // GenBank // Rattus norvegicus placenta growth factor (PlGF) mRNA, complete cds. // chr6 // 78 // 79 // 18 // 23 // 0 /// NONRATT047106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116552964:116576748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001108043 // RefSeq // Rattus norvegicus mutL homolog 3 (Mlh3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006240311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mutL homolog 3 (Mlh3), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006240313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mutL homolog 3 (Mlh3), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// XM_006240314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mutL homolog 3 (Mlh3), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000033493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116461531:116497654:1 gene:ENSRNOG00000006699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116462908:116496684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT047105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001106746 // RefSeq // Rattus norvegicus acylphosphatase 1, erythrocyte (common) type (Acyp1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NM_001199167 // RefSeq // Rattus norvegicus acylphosphatase 1, erythrocyte (common) type (Acyp1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NM_001199168 // RefSeq // Rattus norvegicus acylphosphatase 1, erythrocyte (common) type (Acyp1), transcript variant 3, mRNA. // chr6 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// XM_006240307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acylphosphatase 1, erythrocyte (common) type (Acyp1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000009086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116453047:116459981:1 gene:ENSRNOG00000006744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116446870:116459783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT047102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT047103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT047104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001106747 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA-related kinase 9 (Nek9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000068017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116390547:116435517:1 gene:ENSRNOG00000007001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000017662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116390689:116421990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 51 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116424450:116432767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT047099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT047100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1
ENSRNOT00000010512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:116347918:116383215:1 gene:ENSRNOG00000007901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ212056 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YF09 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_053467 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24-like trafficking protein 10 (yeast) (Tmed10), mRNA. // chr6 // 65 // 92 // 15 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116326854:116382589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT047097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ230076 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YL18 mRNA sequence. // chr6 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001106749 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to HSPC288 (RGD1310769), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:118991548:119000513:-1 gene:ENSRNOG00000008781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:118991284:118997718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT048491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_013174 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta 3 (Tgfb3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:119222052:119243828:-1 gene:ENSRNOG00000009867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC092195 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:105479 IMAGE:7313608), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U03491 // GenBank // Rattus norvegicus Wistar transforming growth factor beta-3 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT048492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119194757:119294789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT048494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001108717 // RefSeq // Rattus norvegicus angel homolog 1 (Drosophila) (Angel1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angel homolog 1 (Drosophila) (Angel1), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:119941590:119966988:-1 gene:ENSRNOG00000010567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166827 // GenBank // Rattus norvegicus angel homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:8372804), partial cds. // chr6 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:119943312:119966924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001012470 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2 binding protein-like (Irf2bpl), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120193879:120196227:-1 gene:ENSRNOG00000011026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098759 // GenBank // Rattus norvegicus polyglutamine-containing protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7370440), partial cds. // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120192426:120208748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT048501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039325 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 22 (Zdhhc22), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120299219:120306482:-1 gene:ENSRNOG00000011285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY886537 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC22 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120297092:120304489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT048503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_033359 // RefSeq // Rattus norvegicus neuroglobin (Ngb), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120412242:120417308:-1 gene:ENSRNOG00000011719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB056656 // GenBank // Rattus norvegicus NGB-2 mRNA for neuroglobin-2, complete cds. // chr6 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// AF333245 // GenBank // Rattus norvegicus neuroglobin mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// AF334379 // GenBank // Rattus norvegicus neuroglobin (Ngb) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AY066001 // GenBank // Rattus norvegicus neuroglobin mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120413131:120417099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT048504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001047114 // RefSeq // Rattus norvegicus protein-O-mannosyltransferase 2 (Pomt2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// ENSRNOT00000016242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120423138:120461156:-1 gene:ENSRNOG00000012146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// AB246667 // GenBank // Rattus norvegicus pomt2 mRNA for protein O-mannosyltransferase 2, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// GENSCAN00000039580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120424600:120460675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT048506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT048507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 21 // 55 // 1 /// NONRATT048508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 18 // 18 // 10 // 55 // 1
NM_001037097 // RefSeq // Rattus norvegicus serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2 (Sptlc2), mRNA. // chr6 // 98 // 100 // 61 // 62 // 0 /// ENSRNOT00000016324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120620976:120699229:-1 gene:ENSRNOG00000012210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 100 // 60 // 62 // 0 /// BC107662 // GenBank // Rattus norvegicus serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:124851 IMAGE:7936642), complete cds. // chr6 // 98 // 100 // 61 // 62 // 0 /// GENSCAN00000039595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120620976:120699324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 98 // 74 // 45 // 46 // 0 /// NONRATT048509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// NONRATT048510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 18 // 18 // 11 // 62 // 1 /// NONRATT048511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 16 // 16 // 10 // 62 // 1
NM_001108718 // RefSeq // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 1 (E. coli) (Alkbh1), mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120737713:120757491:-1 gene:ENSRNOG00000012264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// FQ232964 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YL19 mRNA sequence. // chr6 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// FQ226790 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YG13 mRNA sequence. // chr6 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000039588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120739513:120757466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NR_106672 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-3068 (Mir3068), microRNA. // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000053532 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:6:120749446:120749521:-1 gene:ENSRNOG00000035409 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT048512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-3068 // miRBase Micro RNA Database // MI0021534 Rattus norvegicus miR-3068 stem-loop // chr6 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001109279 // RefSeq // Rattus norvegicus SNW domain containing 1 (Snw1), mRNA. // chr6 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000057807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:120764419:120788496:-1 gene:ENSRNOG00000037998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// FQ215071 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA4YG13 mRNA sequence. // chr6 // 78 // 86 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120765017:120796089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
XM_006240405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoporin GLE1-like (RGD1565693), mRNA. // chr6 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:120851498:120853663:-1 gene:ENSRNOG00000012652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120822372:120823052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 75 // 41 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000039600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120765017:120796089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:120851498:120853897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// NONRATT047172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 76 // 10 // 22 // 0 /// NONRATT047173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 45 // 76 // 10 // 22 // 0
XM_006225860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable ATP-dependent RNA helicase DDX41-like (LOC688894), mRNA. // chrU // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
ENSRNOT00000054609 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:6:121127010:121127092:-1 gene:ENSRNOG00000036501 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
AB200323 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Dsr-2, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSRNOT00000005162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:123739976:123740089:-1 gene:ENSRNOG00000003891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X53231 // GenBank // Rat mRNA for preoptic regulatory factor-1 (PORF-1). // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031720 // RefSeq // Rattus norvegicus deiodinase, iodothyronine, type II (Dio2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// U53505 // GenBank // Rattus norvegicus type II iodothyronine deiodinase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000057756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:124275260:124393300:-1 gene:ENSRNOG00000003908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// XR_355022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to chromosome 14 open reading frame 145 (LOC500700), misc_RNA. // chr6 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:124280108:124414872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_022208 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIA, 1 (Gtf2a1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:124579899:124607638:-1 gene:ENSRNOG00000004300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF000943 // GenBank // Rattus norvegicus TFIIA large subunit mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:124572107:124666518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001135874 // RefSeq // Rattus norvegicus stonin 2 (Ston2), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stonin 2 (Ston2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:124654250:124765198:-1 gene:ENSRNOG00000004458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:124572107:124666518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000005909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:124714657:124779805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT048531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_177933 // RefSeq // Rattus norvegicus sel-1 suppressor of lin-12-like (C. elegans) (Sel1l), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000006143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:124826559:124868279:-1 gene:ENSRNOG00000004464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000045870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:124826559:124868279:-1 gene:ENSRNOG00000004464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// AF304853 // GenBank // Rattus norvegicus SEL1L (Sel1l) mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 96 // 44 // 48 // 0 /// AF304855 // GenBank // Rattus norvegicus SEL1L (Sel1l) mRNA, partial cds. // chr6 // 16 // 16 // 8 // 50 // 1 /// FQ232300 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YE23 mRNA sequence. // chr6 // 22 // 22 // 11 // 50 // 1 /// GENSCAN00000005926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:124829788:124868188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 70 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT048532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0
ENSRNOT00000054608 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:6:125070068:125070176:-1 gene:ENSRNOG00000036500 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr6 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000075374 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:125070089:125070603:-1 gene:ENSRNOG00000050027 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:125068493:125070427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001047960 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00051 (LOC500702), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:125407477:125468757:-1 gene:ENSRNOG00000030420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000002781 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:126464884:126465892:-1 gene:ENSRNOG00000037940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:126464884:126468941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000032968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:127186119:127191025:-1 gene:ENSRNOG00000021751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:127161429:127191025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AY325158 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-334 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000038881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:127671181:127726886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000057620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:125172214:125183521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 91 // 50 // 10 // 11 // 0
NM_001005888 // RefSeq // Rattus norvegicus galactosylceramidase (Galc), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006240425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus galactosylceramidase (Galc), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006240452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus galactocerebrosidase-like (LOC100910182), mRNA. // chr6 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000005015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:131392303:131454533:-1 gene:ENSRNOG00000003759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY386370 // GenBank // Rattus norvegicus strain Wistar galactosylceramidase mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ223346 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YG16 mRNA sequence. // chr6 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131393903:131405719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT048539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131417379:131468596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// GENSCAN00000024414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134432757:134523916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT048540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONRATT048541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_023096 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 10 (Kcnk10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 10 (Kcnk10), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000005175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:131633746:131760720:-1 gene:ENSRNOG00000003813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF196965 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel TREK-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF385401 // GenBank // Rattus norvegicus tandem pore domain potassium channel TREK-2 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131634821:131650927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT048543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131674635:131704525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_133545 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 21 (Ptpn21), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:131870742:131920588:-1 gene:ENSRNOG00000003982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// U17971 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase 2E (PTP2E) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// U18293 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase 2E1 (PTP2E1) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT048545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000021838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131872493:131913164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001003402 // RefSeq // Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 5 (Eml5), mRNA. // chr6 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000057601 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:131991613:132118730:-1 gene:ENSRNOG00000004207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000036304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131991835:132108719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT048549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001003402 // RefSeq // Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 5 (Eml5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057601 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:131991613:132118730:-1 gene:ENSRNOG00000004207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131991835:132108719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001003402 // RefSeq // Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 5 (Eml5), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 5 (Eml5), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000057601 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:131991613:132118730:-1 gene:ENSRNOG00000004207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131991835:132108719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001003402 // RefSeq // Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 5 (Eml5), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006240445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 5 (Eml5), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000005978 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:132026038:132118730:-1 gene:ENSRNOG00000004207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057601 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:131991613:132118730:-1 gene:ENSRNOG00000004207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AY445136 // GenBank // Rattus norvegicus EML5 (Eml5) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:131991835:132108719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
BC087666 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7317367. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108047 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box N3 (Foxn3), mRNA. // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000006604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:132416694:132806362:-1 gene:ENSRNOG00000004709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT048554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:132418768:132497316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT048555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001024350 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 11 (Efcab11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 11 (Efcab11), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000005082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:132968496:133119919:-1 gene:ENSRNOG00000003823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079408 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 14 open reading frame 143, mRNA (cDNA clone MGC:94945 IMAGE:7113005), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:133073738:133122484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XM_001064833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NRDE-2, necessary for RNA interference, domain containing (Nrde2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_234465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NRDE-2, necessary for RNA interference, domain containing (Nrde2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:133365357:133404493:-1 gene:ENSRNOG00000004004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:133365357:133408506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
FQ210625 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA25YH21 mRNA sequence. // chr6 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NM_001108719 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 7B (Ttc7b), mRNA. // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000037902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:133541064:133653972:-1 gene:ENSRNOG00000027300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// BC168996 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 7B, mRNA (cDNA clone MGC:189346 IMAGE:7319639), complete cds. // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:133517308:133647181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT048562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT048563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT048564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108048 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 5 (Rps6ka5), mRNA. // chr6 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:133782184:133959292:-1 gene:ENSRNOG00000004362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:133785129:133901701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001108049 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 68 (Gpr68), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ovarian cancer G-protein coupled receptor 1-like (LOC102553138), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134097147:134098274:-1 gene:ENSRNOG00000046309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134532212:134533339:-1 gene:ENSRNOG00000049237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134532212:134533309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134097147:134098244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT048570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_001065209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 88C (Ccdc88c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_343096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 88C (Ccdc88c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134128636:134247012:-1 gene:ENSRNOG00000004482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000006054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134129454:134247012:-1 gene:ENSRNOG00000004482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134128636:134188123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_001108050 // RefSeq // Rattus norvegicus SMEK homolog 1, suppressor of mek1 (Dictyostelium) (Smek1), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NM_001271174 // RefSeq // Rattus norvegicus SMEK homolog 1, suppressor of mek1 (Dictyostelium) (Smek1), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000034961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134261555:134302289:-1 gene:ENSRNOG00000027773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134261555:134302289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT048585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
XM_006225869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel sperm-associated protein subunit beta-like (LOC100910102), mRNA. // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel sperm-associated protein subunit beta-like (LOC100910102), partial mRNA. // chrU // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// XM_003750620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel sperm-associated protein subunit beta-like (LOC100911278), mRNA. // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000004122 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:7026025:7026467:-1 gene:ENSRNOG00000003089 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:6995906:7026369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NM_001025152 // RefSeq // Rattus norvegicus tandem C2 domains, nuclear (Tc2n), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134651343:134801529:-1 gene:ENSRNOG00000004754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC088432 // GenBank // Rattus norvegicus tandem C2 domains, nuclear, mRNA (cDNA clone MGC:95063 IMAGE:7124658), complete cds. // chrU // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC168677 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:5598328, **** WARNING: chimeric clone ****. // chrU // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// FQ211170 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA16YD14 mRNA sequence. // chrU // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134736936:134801480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT048590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT048591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT048592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_019153 // RefSeq // Rattus norvegicus fibulin 5 (Fbln5), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibulin 5 (Fbln5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134856700:134935853:-1 gene:ENSRNOG00000050539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF112153 // GenBank // Rattus norvegicus developmental arteries and neural crest EGF-like protein mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF137350 // GenBank // Rattus norvegicus embryonic vascular EGF repeat-containing protein EVEC mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC078845 // GenBank // Rattus norvegicus fibulin 5, mRNA (cDNA clone MGC:93487 IMAGE:7123752), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134864603:134886224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT048594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001191772 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 11 (Trip11), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000007061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:134956635:135024177:-1 gene:ENSRNOG00000005292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000001323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134917871:135065047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0
NM_021702 // RefSeq // Rattus norvegicus ataxin 3 (Atxn3), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006240489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 3 (Atxn3), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 3 (Atxn3), transcript variant X6, mRNA. // chr6 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135031498:135065319:-1 gene:ENSRNOG00000005470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT048603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT048604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000001323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:134917871:135065047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
XR_347478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 1 (Ndufb1), ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XR_355069 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 1 (Ndufb1), transcript variant X1, ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ212372 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YH17 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// FQ224297 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA70YA22 mRNA sequence. // chr6 // 91 // 92 // 32 // 35 // 0 /// NONRATT048605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT048606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_022226 // RefSeq // Rattus norvegicus legumain (Lgmn), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135492944:135518919:-1 gene:ENSRNOG00000007089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB032766 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for legumain, complete cds. // chr6 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// AF154349 // GenBank // Rattus norvegicus legumain mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC087708 // GenBank // Rattus norvegicus legumain, mRNA (cDNA clone MGC:105274 IMAGE:7315308), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135493422:135518887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001191985 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol-tetrakisphosphate 1-kinase (Itpk1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135660943:135790645:-1 gene:ENSRNOG00000008051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135661312:135773227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT048613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001013101 // RefSeq // Rattus norvegicus modulator of apoptosis 1 (Moap1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000038816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135826374:135828304:-1 gene:ENSRNOG00000033970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC091310 // GenBank // Rattus norvegicus modulator of apoptosis 1, mRNA (cDNA clone MGC:109269 IMAGE:7311752), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 1 /// GENSCAN00000011757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135811704:135842348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_001142941 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100233176 (LOC100233176), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000063786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135837722:135842402:-1 gene:ENSRNOG00000046085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT048619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT048620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001108720 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 7 (Btbd7), mRNA. // chr6 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135867662:135916888:-1 gene:ENSRNOG00000008598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135868676:135897371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 87 // 50 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT048624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSRNOT00000011530 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:136114058:136115135:-1 gene:ENSRNOG00000008717 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136114058:136115135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NM_001108721 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich membrane anchor 1 (Prima1), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XR_355067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich membrane anchor 1 (Prima1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr6 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136279361:136330870:-1 gene:ENSRNOG00000008915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136284892:136330870:-1 gene:ENSRNOG00000008915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136281461:136330159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT048627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001011984 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 2 (Asb2), mRNA. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_003750225 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box protein 2-like (LOC100909439), partial mRNA. // chr6 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// XM_006240463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 2 (Asb2), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 2 (Asb2), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// XR_355066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 2 (Asb2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136425785:136469321:-1 gene:ENSRNOG00000009012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC085882 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:94662 IMAGE:7191983), complete cds. // chr6 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136426185:136444451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT048630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_199119 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 24 (Ddx24), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136522732:136539893:-1 gene:ENSRNOG00000009166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY341876 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD box polypeptide 24 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097262 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 24, mRNA (cDNA clone MGC:114231 IMAGE:7442976), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_003750226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-dependent RNA helicase DDX24-like (LOC100909476), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// XM_006240517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-dependent RNA helicase DDX24-like (LOC100909476), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136522438:136549670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT048634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138191667:138238069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT048635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_206846 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon, alpha-inducible protein 27 like 2B (Ifi27l2b), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136556836:136558324:-1 gene:ENSRNOG00000026605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166870 // GenBank // Rattus norvegicus putative ISG12(b) protein, mRNA (cDNA clone MGC:188792 IMAGE:6922110), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136556956:136562322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_133617 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 10 (Serpina10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136718788:136727224:-1 gene:ENSRNOG00000050761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138201352:138209788:-1 gene:ENSRNOG00000048988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088113 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:108600 IMAGE:7326099), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U55765 // GenBank // Rattus norvegicus RASP1 mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136718946:136724771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000057418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138191667:138238069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001009663 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 6 (Serpina6), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136742723:136753025:-1 gene:ENSRNOG00000009438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088300 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:109504 IMAGE:7323342), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ209977 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YM16 mRNA sequence. // chr6 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136742919:136750397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT048641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_181630 // RefSeq // Rattus norvegicus serine proteinase inhibitor HongrES1 (LOC299271), mRNA. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035035 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:136763547:136770923:-1 gene:ENSRNOG00000026297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY113703 // GenBank // Rattus norvegicus serine proteinase inhibitor HongrES1 mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT048643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136763631:136787684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001108054 // RefSeq // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 1F (Serpina1f), mRNA. // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// XM_001074075 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative alpha-1-antitrypsin-related protein-like (LOC690319), mRNA. // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// XM_002726767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative alpha-1-antitrypsin-related protein-like (LOC690319), mRNA. // chr6 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000057322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136783583:136789788:-1 gene:ENSRNOG00000037762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000036462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136793141:136817523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT048644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_022519 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 1 (Serpina1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136828869:136833261:-1 gene:ENSRNOG00000032669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC078824 // GenBank // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93438 IMAGE:7131535), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D00675 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for alpha-1-protease inhibitor, complete cds. // chr6 // 84 // 70 // 16 // 19 // 0 /// FQ218411 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YF18 mRNA sequence. // chr6 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// FQ219741 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YF08 mRNA sequence. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// M32247 // GenBank // Rat alpha-1-antitrypsin mRNA, complete cds. // chr6 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// FQ211121 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA17YD03 mRNA sequence. // chr6 // 56 // 59 // 9 // 16 // 0 /// FQ218467 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YO09 mRNA sequence. // chr6 // 56 // 59 // 9 // 16 // 0 /// FQ218492 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YM11 mRNA sequence. // chr6 // 53 // 70 // 10 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136828946:136833261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT048647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_138825 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 12 (Serpina12), mRNA. // chr6 // 100 // 47 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136915080:136930199:-1 gene:ENSRNOG00000042634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 47 // 26 // 26 // 0 /// AF245398 // GenBank // Rattus norvegicus visceral adipose tissue specific SERPIN (Vaspin) mRNA, complete cds. // chr6 // 92 // 47 // 24 // 26 // 0 /// NM_001106754 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 9 (Serpina9), mRNA. // chr6 // 53 // 53 // 29 // 55 // 1 /// ENSRNOT00000012861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136881410:136898530:-1 gene:ENSRNOG00000042391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 29 // 55 // 1 /// GENSCAN00000004002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136915110:136924229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 47 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136881770:136893374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 29 // 55 // 1 /// NONRATT048656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 53 // 53 // 29 // 55 // 1
NM_001106754 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade A (alpha-1 antiproteinase, antitrypsin), member 9 (Serpina9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:136881410:136898530:-1 gene:ENSRNOG00000042391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:136881770:136893374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001270982 // RefSeq // Rattus norvegicus serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade A, member 3M (Serpina3m), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137027393:137032673:-1 gene:ENSRNOG00000009921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137027717:137032664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT048658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
XM_001067560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease inhibitor A3B-like (LOC299277), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_001074308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease inhibitor A3B-like (LOC299277), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057298 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:137083644:137097524:-1 gene:ENSRNOG00000037743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137083644:137097524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_012657 // RefSeq // Rattus norvegicus serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade A, member 3C (Serpina3c), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000013896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137206188:137213445:-1 gene:ENSRNOG00000010410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC062236 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade A, member 3K, mRNA (cDNA clone MGC:72900 IMAGE:6888893), complete cds. // chr6 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// FQ210072 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA35YC10 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137200030:137211506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_001047975 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690435 (LOC690435), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137303495:137326682:-1 gene:ENSRNOG00000029253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137303495:137352693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT048663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191873 // RefSeq // Rattus norvegicus goosecoid homeobox (Gsc), mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000014204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137350766:137352805:-1 gene:ENSRNOG00000010605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137303495:137352693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSRNOT00000014405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137590054:137632237:-1 gene:ENSRNOG00000010711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137590208:137632207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001106755 // RefSeq // Rattus norvegicus calmin (Clmn), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// XM_006240468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calmin (Clmn), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137672546:137764455:-1 gene:ENSRNOG00000011044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137673444:137721031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106762 // RefSeq // Rattus norvegicus spectrin repeat containing, nuclear envelope family member 3 (Syne3), mRNA. // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:137837828:137913141:-1 gene:ENSRNOG00000005287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137837828:137893498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
XR_347501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556714 (LOC102556714), ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109601 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell leukemia/lymphoma 1A (Tcl1a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:138085869:138091862:-1 gene:ENSRNOG00000025233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138087611:138091801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT048680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000006131 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:138645992:138712125:-1 gene:ENSRNOG00000004519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC089882 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2410024A21Rik protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7368501), partial cds. // chr6 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138646269:138712922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT048683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000006131 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:138645992:138712125:-1 gene:ENSRNOG00000004519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT048684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:138646269:138712922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_001277287 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 11B (zinc finger protein) (Bcl11b), transcript variant 1, mRNA. // chr6 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NM_001277288 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 11B (zinc finger protein) (Bcl11b), transcript variant 2, mRNA. // chr6 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 11B (zinc finger protein) (Bcl11b), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000007602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141005579:141097519:-1 gene:ENSRNOG00000005776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// JF520428 // GenBank // Rattus norvegicus COUP-TF-interacting protein 2 short form (Ctip2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// JF520429 // GenBank // Rattus norvegicus COUP-TF-interacting protein 2 long form (Ctip2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr6 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT048689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NONRATT048690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000009120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141193723:141246255:-1 gene:ENSRNOG00000006587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000044312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141193723:141239793:-1 gene:ENSRNOG00000006587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC089108 // GenBank // Rattus norvegicus SET domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7311656), partial cds. // chr6 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// XM_006240552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone-lysine N-methyltransferase setd3-like (LOC100910833), mRNA. // chr6 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// NONRATT048691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141194325:141243413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// GENSCAN00000055920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:140773778:140821697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
XM_003750153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 85C-like (LOC100911871), partial mRNA. // chr6 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// XM_006240553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 85C (Ccdc85c), mRNA. // chr6 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000009851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141279637:141311208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000033644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:74306334:74320613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001017457 // RefSeq // Rattus norvegicus delta(4)-desaturase, sphingolipid 2 (Degs2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141762045:141778676:-1 gene:ENSRNOG00000011716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098701 // GenBank // Rattus norvegicus degenerative spermatocyte homolog 2, lipid desaturase (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:112667 IMAGE:7387212), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141760721:141778609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT048697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001010958 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier), member 29 (Slc25a29), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier), member 29 (Slc25a29), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141907050:141917838:-1 gene:ENSRNOG00000004351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089065 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 29, mRNA (cDNA clone MGC:105631 IMAGE:7319298), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141907977:141917763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT048703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000006128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141941386:141972286:-1 gene:ENSRNOG00000004359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// BC061752 // GenBank // Rattus norvegicus tryptophanyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:72556 IMAGE:5600013), complete cds. // chr6 // 93 // 77 // 28 // 30 // 0 /// NM_001013170 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptophanyl-tRNA synthetase (Wars), mRNA. // chr6 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000050350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141941104:141972286:-1 gene:ENSRNOG00000004359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// GENSCAN00000010270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141942433:141967683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT048705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 15 // 39 // 1
NM_001135894 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like (Wdr25l), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like (Wdr25l), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141975870:142103153:1 gene:ENSRNOG00000004733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC166712 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like, mRNA (cDNA clone MGC:188413 IMAGE:7930656), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:142014357:142103000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000072399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:142873331:142879024:-1 gene:ENSRNOG00000048751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:142873331:142903575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001134526 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC299330 (RGD1305298), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC299330 (RGD1305298), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144160696:144173213:-1 gene:ENSRNOG00000007184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144161446:144187363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001010965 // RefSeq // Rattus norvegicus MOK protein kinase (Mok), mRNA. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145154362:145185192:1 gene:ENSRNOG00000007850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC079440 // GenBank // Rattus norvegicus renal tumor antigen, mRNA (cDNA clone MGC:94988 IMAGE:7115407), complete cds. // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT047494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT047495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT047496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000049261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145147682:145191102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001106758 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 2-interacting protein (Cinp), mRNA. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000010598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145109734:145123627:1 gene:ENSRNOG00000008035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC158883 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:188587 IMAGE:7937483), complete cds. // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000049277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145108416:145122830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT047489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT047490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1
NM_001012112 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 9 (Ankrd9), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 9 (Ankrd9), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145000298:145002580:1 gene:ENSRNOG00000008056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061827 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:72596 IMAGE:5599008), complete cds. // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC079192 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 9, mRNA (cDNA clone MGC:94242 IMAGE:7131342), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145001512:145002492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT047486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT047485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053620 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 binding protein kinase beta (DMPK-like) (Cdc42bpb), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000039059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144585640:144667686:1 gene:ENSRNOG00000009675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF021936 // GenBank // Rattus norvegicus myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase MRCK-beta (MRCK-beta) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AY277590 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42-binding protein kinase beta (Cdc42bpb) mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000018256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144585728:144666543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT047479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
XM_001071789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-related protein Rap-2a-like (RGD1565168), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052237 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:144476186:144476788:1 gene:ENSRNOG00000033736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144470690:144476788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012529 // RefSeq // Rattus norvegicus creatine kinase, brain (Ckb), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144270887:144273773:1 gene:ENSRNOG00000010872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC065307 // GenBank // Rattus norvegicus creatine kinase, brain, mRNA (cDNA clone MGC:72258 IMAGE:5598839), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC070955 // GenBank // Rattus norvegicus creatine kinase, brain, mRNA (cDNA clone MGC:91404 IMAGE:7104205), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC099814 // GenBank // Rattus norvegicus creatine kinase, brain, mRNA (cDNA clone MGC:124546 IMAGE:7929525), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC127477 // GenBank // Rattus norvegicus creatine kinase, brain, mRNA (cDNA clone MGC:156567 IMAGE:8367180), complete cds. // chr6 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// M14400 // GenBank // Rat brain creatine kinase mRNA, complete cds. // chr6 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144271091:144273575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT047471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT047472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001008526 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 5 (Bag5), mRNA. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 5 (Bag5), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006240603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 5 (Bag5), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:144231051:144234393:1 gene:ENSRNOG00000011527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AY366364 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 5 mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// BC088418 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 5, mRNA (cDNA clone MGC:95040 IMAGE:7123242), complete cds. // chr6 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:144229595:144234210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT047468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006240649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA repair protein XRCC3-like (LOC102551085), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016208 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:145379532:145387325:-1 gene:ENSRNOG00000012141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145373412:145389080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0