NM_001109227 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 33 (Tspan33), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56748444:56771953:1 gene:ENSRNOG00000007900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56748647:56771025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT039289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT039292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_012807 // RefSeq // Rattus norvegicus smoothened, frizzled class receptor (Smo), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// XM_006236179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus smoothened, frizzled family receptor (Smo), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56787102:56808940:1 gene:ENSRNOG00000008332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U84402 // GenBank // Rattus norvegicus smoothened mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56787102:56808940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT039293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT039294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001173510 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosylhomocysteinase-like 2 (Ahcyl2), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosylhomocysteinase-like 2 (Ahcyl2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosylhomocysteinase-like 2 (Ahcyl2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56817402:56967031:1 gene:ENSRNOG00000039300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56909210:56949893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT039299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
XM_006224896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus striatin-interacting proteins 2-like (LOC500066), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006236249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus striatin-interacting proteins 2-like (LOC500066), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036735 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:56972105:57009583:1 gene:ENSRNOG00000028742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066068 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:56972105:57017628:1 gene:ENSRNOG00000028742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56972105:57009583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0
NONRATT039303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000054074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57028455:57036261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001100708 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear respiratory factor 1 (Nrf1), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear respiratory factor 1 (Nrf1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear respiratory factor 1 (Nrf1), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57139899:57198685:1 gene:ENSRNOG00000008752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC161956 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear respiratory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:187757 IMAGE:9027258), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57139932:57198667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT039308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001017456 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch domain containing 10 (Klhdc10), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57477673:57531126:1 gene:ENSRNOG00000010267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC085351 // GenBank // Rattus norvegicus kelch domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:105857 IMAGE:7115168), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57477747:57530977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NONRATT039312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109228 // RefSeq // Rattus norvegicus serine-rich single-pass membrane protein 1 (Ssmem1), mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006236228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine-rich single-pass membrane protein 1 (Ssmem1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57585320:57595615:1 gene:ENSRNOG00000010345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013083 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase A2 (pancreatic) (Cpa2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006236189 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxypeptidase A2 (pancreatic) (Cpa2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000029608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57616943:57640152:1 gene:ENSRNOG00000028092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57597852:57640104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001109346 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase A4 (Cpa4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57644770:57667613:1 gene:ENSRNOG00000010463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57644788:57667246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001002808 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase A5 (Cpa5), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// XM_006236215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxypeptidase A5 (Cpa5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// XM_006236219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxypeptidase A5 (Cpa5), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57687448:57705973:1 gene:ENSRNOG00000010467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC085840 // GenBank // Rattus norvegicus carboxypeptidase A5, mRNA (cDNA clone MGC:94525 IMAGE:7135802), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57687863:57705632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT039317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0
NM_016998 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase A1 (pancreatic) (Cpa1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57713899:57720026:1 gene:ENSRNOG00000010725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ233540 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YH01 mRNA sequence. // chr4 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57710515:57719961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_031359 // RefSeq // Rattus norvegicus muskelin 1, intracellular mediator containing kelch motifs (Mkln1), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:58448153:58570396:1 gene:ENSRNOG00000011524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB046442 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for muskelin, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:58469416:58570163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000017015 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:58951833:58952172:1 gene:ENSRNOG00000012758 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:58950170:58952172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XR_145928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689042 (LOC689042), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_146920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689042 (LOC689042), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034929 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:59111876:59117863:1 gene:ENSRNOG00000027055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:59106267:59117863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT039337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSRNOT00000038047 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:59796091:59796426:1 gene:ENSRNOG00000027692 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:59796091:59813635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053875 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 4 (Exoc4), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:60287465:61081401:1 gene:ENSRNOG00000046023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000075621 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:60287465:61081401:1 gene:ENSRNOG00000046023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:60299740:60385637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61012207:61080820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT039339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT039340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
GENSCAN00000056182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61127255:61162023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000043493 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:61127255:61127822:1 gene:ENSRNOG00000032928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
NM_001106589 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and guanylate kinase domain containing (Lrguk), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006236252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and guanylate kinase domain containing (Lrguk), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and guanylate kinase domain containing (Lrguk), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006236255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and guanylate kinase domain containing (Lrguk), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006236256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and guanylate kinase domain containing (Lrguk), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006236257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and guanylate kinase domain containing (Lrguk), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61143344:61248921:1 gene:ENSRNOG00000008775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000056165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61173704:61215097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_173136 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B8 (Akr1b8), mRNA. // chr4 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000013073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61491248:61503814:1 gene:ENSRNOG00000009734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000057044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61473011:61503814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001013084 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B10 (aldose reductase) (Akr1b10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003749714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldose reductase-related protein 1-like (LOC100910708), partial mRNA. // chr4 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// XM_006236258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B10 (aldose reductase) (Akr1b10), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XR_353240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B10 (aldose reductase) (Akr1b10), transcript variant X2, misc_RNA. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61753266:61764466:1 gene:ENSRNOG00000027433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61552494:61565880:1 gene:ENSRNOG00000046247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC079133 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B10 (aldose reductase), mRNA (cDNA clone MGC:94143 IMAGE:7127413), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ215899 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YC07 mRNA sequence. // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT039352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61749907:61773079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000057046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61552632:61574789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_053781 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B7 (Akr1b7), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61587867:61600045:1 gene:ENSRNOG00000009875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086563 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B7, mRNA (cDNA clone MGC:105361 IMAGE:7307075), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF182168 // GenBank // Rattus norvegicus aldose-reductase-like protein MVDP/AKR1-B7 mRNA, complete cds. // chr4 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT039354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61588027:61599741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT039355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_199382 // RefSeq // Rattus norvegicus 2,3-bisphosphoglycerate mutase (Bpgm), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 2,3-bisphosphoglycerate mutase (Bpgm), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61650881:61679068:1 gene:ENSRNOG00000010133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY325190 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-098 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC062240 // GenBank // Rattus norvegicus 2,3-bisphosphoglycerate mutase, mRNA (cDNA clone MGC:72978 IMAGE:6887677), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT039358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000057045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61662684:61713110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_013146 // RefSeq // Rattus norvegicus caldesmon 1 (Cald1), mRNA. // chr4 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// XM_006236260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caldesmon 1 (Cald1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caldesmon 1 (Cald1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caldesmon 1 (Cald1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caldesmon 1 (Cald1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61952324:62021827:1 gene:ENSRNOG00000010233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61971540:62020019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// U18419 // GenBank // Rattus norvegicus nonmuscle caldesmon mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT039359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001009709 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 140 (Tmem140), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62112723:62123502:1 gene:ENSRNOG00000026965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC088293 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 140, mRNA (cDNA clone MGC:109491 IMAGE:7322541), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231806 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YB24 mRNA sequence. // chr4 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0 /// FQ234459 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YO11 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62114991:62123124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT039372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001067836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stimulated by retinoic acid 8 (Stra8), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006224864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stimulated by retinoic acid 8 (Stra8), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stimulated by retinoic acid 8 (Stra8), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014093 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:62185921:62201587:1 gene:ENSRNOG00000010573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62185921:62194646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001108620 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 205 (Nup205), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000014832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62430061:62496858:1 gene:ENSRNOG00000010852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000010693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62388940:62459414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000040155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62461128:62496673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 49 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0
NM_001195503 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689574 (LOC689574), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001195504 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689574 (LOC689574), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62503531:62513357:1 gene:ENSRNOG00000046109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_032737 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 490 (Mir490), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000054395 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:63056490:63056573:1 gene:ENSRNOG00000036272 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-490 // miRBase Micro RNA Database // MI0012585 Rattus norvegicus miR-490 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031016 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, muscarinic 2 (Chrm2), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:63803012:63915500:1 gene:ENSRNOG00000011928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:63799533:63800933:1 gene:ENSRNOG00000046972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AB017655 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for muscarinic receptor m2, complete cds. // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// J03025 // GenBank // Rat muscarinic cholinergic receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:63905342:63914902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000050397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:63791373:63800933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_138884 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member D1 (Akr1d1), mRNA. // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006236285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member D1 (Akr1d1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:64933165:64964862:1 gene:ENSRNOG00000013004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// D17309 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for delta-4-3-ketosteroid 5-beta-reductase, complete cds. // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// FQ211413 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA11YC04 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:64917392:64956417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001044266 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 24 (Trim24), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000047954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:65457120:65504094:1 gene:ENSRNOG00000013251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// BC107915 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 24, mRNA (cDNA clone IMAGE:7459236), partial cds. // chr4 // 100 // 50 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65460291:65478659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65404907:65457219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT039384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// NONRATT039385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// NONRATT039387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
XM_006236342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 213 (Tmem213), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:65619011:65624666:1 gene:ENSRNOG00000013616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65608128:65624666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65635610:65640391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001025045 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 26 (Ttc26), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// XM_006236330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 26 (Ttc26), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 95 // 81 // 40 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000031193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:65904583:65960064:1 gene:ENSRNOG00000027617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// BC085935 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 26, mRNA (cDNA clone MGC:94982 IMAGE:7115235), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT039390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000027190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65911791:65957299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 27 // 52 // 1 /// NONRATT039391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 24 // 52 // 1
NM_001134553 // RefSeq // Rattus norvegicus ubinuclein 2 (Ubn2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006236309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubinuclein 2 (Ubn2), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubinuclein 2 (Ubn2), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:65977908:66044679:1 gene:ENSRNOG00000005564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ212455 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA54YD24 mRNA sequence. // chr4 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000025397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65978152:66073270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000007406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:66072884:66073270:1 gene:ENSRNOG00000005603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65978152:66073270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 59 // 15 // 17 // 0
NM_001037795 // RefSeq // Rattus norvegicus formation of mitochondrial complexes 1 homolog (S. cerevisiae) (Fmc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66088284:66096317:1 gene:ENSRNOG00000005618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098843 // GenBank // Rattus norvegicus formation of mitochondrial complexes 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112899 IMAGE:7379283), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ217101 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA35YJ04 mRNA sequence. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT039396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66088333:66145395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001107853 // RefSeq // Rattus norvegicus LUC7-like 2 (S. cerevisiae) (Luc7l2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LUC7-like 2 (S. cerevisiae) (Luc7l2), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LUC7-like 2 (S. cerevisiae) (Luc7l2), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66101838:66165880:1 gene:ENSRNOG00000006001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166855 // GenBank // Rattus norvegicus LUC7-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188761 IMAGE:9099059), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66150934:66164748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT039398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66088333:66145395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT039400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001044233 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member L (Clec2l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member L (Clec2l), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66216161:66232497:1 gene:ENSRNOG00000029644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161812 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member L, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131290), partial cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// DQ630549 // GenBank // Rattus norvegicus CD69-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT039406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000025383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66204925:66230546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_012687 // RefSeq // Rattus norvegicus thromboxane A synthase 1, platelet (Tbxas1), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006236287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thromboxane A synthase 1, platelet (Tbxas1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thromboxane A synthase 1, platelet (Tbxas1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66481264:66651601:1 gene:ENSRNOG00000007918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D28773 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for thromboxane synthase, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// D31798 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for thromboxane synthase, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66513109:66651483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001024326 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB19, member RAS oncogene family (Rab19), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66972872:66982889:1 gene:ENSRNOG00000009030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC088443 // GenBank // Rattus norvegicus RAB19, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:95086 IMAGE:7126386), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000039745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66975174:66985177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001107855 // RefSeq // Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 2 (Adck2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 2 (Adck2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:67166683:67179568:1 gene:ENSRNOG00000010005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC161918 // GenBank // Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:187657 IMAGE:8369971), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:67137314:67179342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT039415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001108624 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 2 (Ndufb2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:67185340:67192418:1 gene:ENSRNOG00000026616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC166901 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 2, mRNA (cDNA clone MGC:188862 IMAGE:6922162), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_001195277 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 178B (Tmem178b), mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:67816889:67864206:1 gene:ENSRNOG00000047635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:67782905:67831378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001127497 // RefSeq // Rattus norvegicus acylglycerol kinase (Agk), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133268922:133346790:1 gene:ENSRNOG00000011509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000054166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133169996:133345883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
XM_001070431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WEE1 homolog 2 (S. pombe) (Wee2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036398 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:133393416:133415625:1 gene:ENSRNOG00000026446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133391484:133415625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_183328 // RefSeq // Rattus norvegicus single-stranded DNA binding protein 1, mitochondrial (Ssbp1), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133421333:133430764:1 gene:ENSRNOG00000012100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133418725:133427505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001025149 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 137 (Tas2r137), mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133439121:133440071:1 gene:ENSRNOG00000030413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0
NM_001024686 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 108 (Tas2r108), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133442680:133443594:1 gene:ENSRNOG00000012195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY916510 // GenBank // Rattus norvegicus strain W T2R16 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133443055:133443594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT039436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000854 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 799 (Olr799), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133592039:133592983:1 gene:ENSRNOG00000012214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133592039:133592983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maltase-glucoamylase (Mgam), mRNA. // chr4 // 100 // 43 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000016912 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:133643837:133783434:1 gene:ENSRNOG00000026177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 39 // 30 // 37 // 0 /// XM_006224888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maltase-glucoamylase, intestinal-like (LOC679818), mRNA. // chr4 // 50 // 50 // 47 // 94 // 1 /// GENSCAN00000014286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133621018:133903167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 99 // 97 // 90 // 91 // 0
XM_006224888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maltase-glucoamylase, intestinal-like (LOC679818), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000016912 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:133643837:133783434:1 gene:ENSRNOG00000026177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 100 // 27 // 37 // 0 /// GENSCAN00000014286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133621018:133903167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000054166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133169996:133345883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// NONRATT039438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT039440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0
XM_006224888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maltase-glucoamylase, intestinal-like (LOC679818), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000016912 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:133643837:133783434:1 gene:ENSRNOG00000026177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 100 // 28 // 42 // 0 /// GENSCAN00000014286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133621018:133903167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// GENSCAN00000054166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133169996:133345883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT039438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// NONRATT039440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0
NM_012635 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 1 (trypsin 1) (Prss1), mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135566020:135569226:1 gene:ENSRNOG00000032156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// FQ211333 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YJ24 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135566035:135627650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT039455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000018852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135480753:135485832:1 gene:ENSRNOG00000032916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000066789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135416061:135421085:-1 gene:ENSRNOG00000049576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// L00131 // GenBank // Rattus norvegicus trypsinogen II mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// V01274 // GenBank // Rat mRNA encoding pancreatic trypsinogen II. // chr4 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135416061:135421085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135480753:135485777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT039454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000029319 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:135519121:135522183:1 gene:ENSRNOG00000045612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135519121:135522183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NONRATT039456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107857 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor B6 (Ephb6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000019720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135690323:135705579:1 gene:ENSRNOG00000014367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000018781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135681772:135705154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT039465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1 /// NONRATT039467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// NONRATT039470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
NM_001109392 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680112 (LOC680112), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680112 (LOC680112), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031984 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:135764621:135765912:1 gene:ENSRNOG00000025618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135764709:135765592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022708 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin induced protein (Pip), mRNA. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136110485:136114779:1 gene:ENSRNOG00000016076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF054270 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-inducible protein (PIP) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT039473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133291 // RefSeq // Rattus norvegicus seminal vesicle antigen-like 2 (Sval2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136130300:136134264:1 gene:ENSRNOG00000025541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB051831 // GenBank // Rattus norvegicus rSLP-M mRNA for SVA like protein, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_133292 // RefSeq // Rattus norvegicus seminal vesicle antigen-like 1 (Sval1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136166302:136174042:1 gene:ENSRNOG00000025519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001080905 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 139 (Tas2r139), mRNA. // chr4 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000037220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136302670:136303629:1 gene:ENSRNOG00000028135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT039475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001025150 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 144 (Tas2r144), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136395381:136396340:1 gene:ENSRNOG00000028130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181371 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase kappa 1 (Gstk1), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136427310:136431704:1 gene:ENSRNOG00000016484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FJ179400 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase kappa mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// FQ211030 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YK08 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ214179 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YG20 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136427427:136431530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
XM_006224890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 139 (Tmem139), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006224891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 139 (Tmem139), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 139 (Tmem139), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 139 (Tmem139), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136452936:136453799:1 gene:ENSRNOG00000028024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136452936:136453799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_022522 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 2 (Casp2), mRNA. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136454793:136469010:1 gene:ENSRNOG00000016707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136454793:136474624:1 gene:ENSRNOG00000016707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF136231 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF136232 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-2s mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// U77933 // GenBank // Rattus norvegicus Nedd2/Ich-1 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT039480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT039481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000023295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136454799:136507087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_013147 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel, voltage-sensitive 1 (Clcn1), mRNA. // chr4 // 98 // 96 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000051265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136479780:136507216:1 gene:ENSRNOG00000016917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// AY112737 // GenBank // Rattus norvegicus chloride channel isoform 2 (Clcn1) mRNA, partial cds. // chr4 // 95 // 90 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000023295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136454799:136507087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT039482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT039483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 16 // 49 // 1
NM_053761 // RefSeq // Rattus norvegicus zyxin (Zyx), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zyxin (Zyx), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136544930:136553784:1 gene:ENSRNOG00000017354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136521316:136553109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT039486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT039487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT039488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT039489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001025061 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 143 (Tas2r143), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 143 (Tas2r143), mRNA. // chr9 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000031943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:117794965:117795849:1 gene:ENSRNOG00000026817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136592956:136593438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:117794965:117795849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025062 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 135 (Tas2r135), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136597609:136598574:1 gene:ENSRNOG00000026811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139335 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 126 (Tas2r126), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136637499:136638425:1 gene:ENSRNOG00000017881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF240768 // GenBank // Rattus norvegicus taste receptor rT2R12 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000041612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137001377:137017297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001000976 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 806 (Olr806), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137016075:137017297:1 gene:ENSRNOG00000018173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137001377:137017297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001000851 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 807 (Olr807), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137034736:137035686:1 gene:ENSRNOG00000032535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000850 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 808 (Olr808), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000048987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137065540:137066496:1 gene:ENSRNOG00000029299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000849 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 809 (Olr809), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137084992:137085927:1 gene:ENSRNOG00000026333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137085091:137085927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000975 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 810 (Olr810), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137099938:137100870:1 gene:ENSRNOG00000005398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137099929:137125487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000848 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 811 (Olr811), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137124552:137125487:1 gene:ENSRNOG00000005403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137099929:137125487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000847 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 812 (Olr812), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137178372:137179304:1 gene:ENSRNOG00000005407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137178372:137179304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000846 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 813 (Olr813), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137200767:137201708:1 gene:ENSRNOG00000005412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137200830:137201708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000007183 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:137221005:137221935:1 gene:ENSRNOG00000005415 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137221405:137246386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001000845 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 816 (Olr816), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137264622:137265554:1 gene:ENSRNOG00000005431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137264829:137265554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT039501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109347 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 437 (Olr437), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137287397:137306191:1 gene:ENSRNOG00000049389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000041608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137287460:137288326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000844 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 818 (Olr818), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137287397:137306191:1 gene:ENSRNOG00000049389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// NONRATT039501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0
NM_001000843 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 819 (Olr819), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000007235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137339021:137340131:1 gene:ENSRNOG00000005469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000041620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137339021:137341373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT039504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000030730 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:137340374:137341373:1 gene:ENSRNOG00000026045 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 76 // 94 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000041620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137339021:137341373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0
NM_001000974 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 820 (Olr820), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000047359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137358111:137359073:1 gene:ENSRNOG00000046810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000041618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137358129:137375349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT039505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000842 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 821 (Olr821), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137372529:137373491:1 gene:ENSRNOG00000046688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137358129:137375349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000044780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137420814:137437155:1 gene:ENSRNOG00000005506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137420814:137437155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT039509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
GENSCAN00000006059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:139216894:139217508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
XM_006224904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus contactin associated protein-like 2 (Cntnap2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006236400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus contactin associated protein-like 2 (Cntnap2), mRNA. // chr4 // 100 // 46 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:141164125:141540241:1 gene:ENSRNOG00000006617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000037450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:140269376:140395335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// NONRATT039513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001108627 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin 1 (Cul1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006236410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cullin 1 (Cul1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000007620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:141883675:141951628:1 gene:ENSRNOG00000005310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC161932 // GenBank // Rattus norvegicus cullin 1, mRNA (cDNA clone MGC:187713 IMAGE:9021933), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000037259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:141920033:141951208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT039516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT039519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
FQ223410 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA11YK02 mRNA sequence. // chr4 // 82 // 94 // 14 // 17 // 0 /// AF188753 // GenBank // Rattus norvegicus Y3 small cytoplasmic RNA, partial sequence. // chr4 // 61 // 100 // 11 // 18 // 0 /// NONRATT039523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 61 // 100 // 11 // 18 // 0
NM_001109230 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 398 (Zfp398), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142188819:142215380:1 gene:ENSRNOG00000006703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142192177:142214086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001106592 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 282 (Zfp282), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142223904:142250349:1 gene:ENSRNOG00000026981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142224209:142272861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT039526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT039527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
ENSRNOT00000009054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142261651:142273942:1 gene:ENSRNOG00000006711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC094301 // GenBank // Rattus norvegicus Zinc finger protein 212, mRNA (cDNA clone IMAGE:7319492), partial cds. // chr4 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// GENSCAN00000037251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142224209:142272861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001014056 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 956 (Zfp956), mRNA. // chr4 // 100 // 47 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000059263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142293173:142304997:1 gene:ENSRNOG00000026874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 20 // 20 // 0 /// BC089951 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Zinc finger protein 398 (Zinc finger DNA binding protein p52/p71), mRNA (cDNA clone MGC:109278 IMAGE:7312211), complete cds. // chr4 // 100 // 47 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142276470:142333249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT039533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
GENSCAN00000037269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142276470:142333249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
XM_006224909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KRAB-A domain containing 1 (Krba1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// XM_006236448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KRAB-A domain containing 1 (Krba1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// ENSRNOT00000010111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142688497:142709419:1 gene:ENSRNOG00000007405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 58 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000043856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142695958:142709419:1 gene:ENSRNOG00000007405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 59 // 59 // 0 /// GENSCAN00000057582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142694591:142729525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 38 // 61 // 1 /// NONRATT039538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 21 // 61 // 1 /// NONRATT039536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 18 // 18 // 11 // 61 // 1
NM_001007016 // RefSeq // Rattus norvegicus SCO-spondin (Sspo), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 102 // 102 // 0 /// ENSRNOT00000035906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142744002:142797351:1 gene:ENSRNOG00000025848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 99 // 98 // 101 // 102 // 0 /// NONRATT039539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 104 // 104 // 0 /// GENSCAN00000057584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142745901:142868867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 67 // 104 // 1
XM_006224911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 862 (Zfp862), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006224914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 862 (Zfp862), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006236450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 862 (Zfp862), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 862 (Zfp862), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048576 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:142804180:142826031:1 gene:ENSRNOG00000024795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142745901:142868867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001002253 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting V0 subunit e2 (Atp6v0e2), mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142831842:142835730:1 gene:ENSRNOG00000008218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC089958 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting V0 subunit e2, mRNA (cDNA clone MGC:109294 IMAGE:7312897), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// FQ212114 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA68YP20 mRNA sequence. // chr4 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// NONRATT039542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000057584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142745901:142868867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT039543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NM_001109231 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236435 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 61 (Lrrc61), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142850801:142870502:1 gene:ENSRNOG00000008234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142745901:142868867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005893 // RefSeq // Rattus norvegicus replication initiator 1 (Repin1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus replication initiator 1 (Repin1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142898415:142900127:1 gene:ENSRNOG00000008239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY691175 // GenBank // Rattus norvegicus replication initiator 1 (Repin1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142896400:142900077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107859 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 775 (Zfp775), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 775 (Zfp775), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142904069:142922229:1 gene:ENSRNOG00000008362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142912126:142920092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_027235 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Zinc finger and SCAN domain containing protein 2 (Zinc finger protein 29) (RGD1559747), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000033807 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:142927550:142928740:1 gene:ENSRNOG00000024617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142928208:142928819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NONRATT039570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 90 // 90 // 18 // 20 // 1
NM_001033923 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 8 (Gimap8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142947117:142958521:1 gene:ENSRNOG00000020169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099228 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 8, mRNA (cDNA clone MGC:116406 IMAGE:7389353), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ125335 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(+/+) GIMAP8 (Gimap8) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ125336 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(lyp/lyp) GIMAP8 (Gimap8) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142947276:142957639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001008398 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 9 (Gimap9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142998500:143001327:1 gene:ENSRNOG00000024569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ633684 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ian7 protein, strain BN. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC103635 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 9, mRNA (cDNA clone MGC:124918 IMAGE:7100941), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ125337 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(+/+) GIMAP9 (Gimap9) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// DQ125338 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(lyp/lyp) GIMAP9 (Gimap9) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142999708:143014830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_173153 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 4 (Gimap4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143008388:143015293:1 gene:ENSRNOG00000008369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY070268 // GenBank // Rattus norvegicus immune-associated nucleotide 1 (Ian1) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC070952 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:91425 IMAGE:7100695), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// DQ125339 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(+/+) GIMAP4 (Gimap4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// DQ125340 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(lyp/lyp) GIMAP4 (Gimap4) mRNA, complete cds. // chr4 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// NONRATT039560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142999708:143014830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001024328 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 7 (Gimap7), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143042469:143046669:1 gene:ENSRNOG00000038740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AJ633682 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ian3 protein, strain BN. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091210 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 7, mRNA (cDNA clone MGC:108919 IMAGE:7381387), complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// DQ125348 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(+/+) GIMAP7 (Gimap7) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// DQ125349 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(lyp/lyp) GIMAP7 (Gimap7) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT039561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001034849 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 1 (Gimap1), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143059564:143063606:1 gene:ENSRNOG00000042229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AJ633681 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ian2 protein, strain BN. // chr4 // 92 // 79 // 24 // 26 // 0 /// BC127453 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:156493 IMAGE:7386337), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// DQ125350 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(+/+) GIMAP1 (Gimap1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// DQ125351 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(lyp/lyp) GIMAP1 (Gimap1) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// FQ225168 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YO15 mRNA sequence. // chr4 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// FQ230294 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YJ14 mRNA sequence. // chr4 // 91 // 70 // 21 // 23 // 0 /// FQ233950 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YL22 mRNA sequence. // chr4 // 52 // 70 // 12 // 23 // 0 /// NONRATT039563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143061483:143086521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NONRATT039567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001039008 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 176A (Tmem176a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143146281:143150058:1 gene:ENSRNOG00000023708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098714 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 176A, mRNA (cDNA clone MGC:112703 IMAGE:7323021), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ210479 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA28YA10 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143145771:143149840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022935 // RefSeq // Rattus norvegicus amine oxidase, copper containing 1 (Aoc1), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006236472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amine oxidase, copper containing 1 (Aoc1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143183686:143203220:1 gene:ENSRNOG00000008575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC100144 // GenBank // Rattus norvegicus amiloride binding protein 1 (amine oxidase, copper-containing), mRNA (cDNA clone MGC:114316 IMAGE:7460184), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// X73912 // GenBank // R.norvegicus mRNA for amiloride binding protein (short form). // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143199340:143202888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_199233 // RefSeq // Rattus norvegicus diamine oxidase-like protein 1 (Doxl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143250914:143254530:1 gene:ENSRNOG00000023612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143250914:143254359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT039573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_199291 // RefSeq // Rattus norvegicus diamine oxidase-like protein 2 (Doxl2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000043790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143306110:143309896:1 gene:ENSRNOG00000032432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC098900 // GenBank // Rattus norvegicus diamine oxidase-like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:114229 IMAGE:7443671), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143306292:143309791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_199095 // RefSeq // Rattus norvegicus seminal vesicle secretory protein 1 (Svs1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143327094:143331992:1 gene:ENSRNOG00000008714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D00921 // GenBank // Rattus norvegicus androgen-responsive mRNA, clone:pSv-2. // chr4 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000045910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143319564:143357018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_133298 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein (transmembrane) nmb (Gpnmb), mRNA. // chr4 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000011945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143383026:143404102:1 gene:ENSRNOG00000008816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF184983 // GenBank // Rattus norvegicus osteoactivin mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// BC061725 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein (transmembrane) nmb, mRNA (cDNA clone MGC:72320 IMAGE:5598392), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143383140:143403629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT039577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001106593 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1 (Malsu1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143423969:143432792:1 gene:ENSRNOG00000009035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143424179:143432764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000043628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143445141:143453005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001109232 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 126 (Ccdc126), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000012490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143671032:143692061:1 gene:ENSRNOG00000009322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC168861 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 126, mRNA (cDNA clone MGC:189096 IMAGE:7129053), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_006236467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 221, member A (Fam221a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 221, member A (Fam221a), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143710942:143732809:1 gene:ENSRNOG00000009447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143710942:143732809:1 gene:ENSRNOG00000009447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097434 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D330028D13, mRNA (cDNA clone MGC:114484 IMAGE:7455430), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143707341:143732424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT039581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001191971 // RefSeq // Rattus norvegicus serine threonine kinase 31 (Stk31), mRNA. // chr4 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000012822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143743909:143842638:1 gene:ENSRNOG00000009591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000043619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143766839:143842479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 29 // 29 // 0
NM_012614 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide Y (Npy), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:144233780:144240952:1 gene:ENSRNOG00000009768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M15880 // GenBank // Rat neuropeptide Y mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M20373 // GenBank // Rat neuropeptide Y mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074351 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:144248690:144255000:1 gene:ENSRNOG00000046449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:144169700:144345303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001134982 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 6 (MAGUK p55 subfamily member 6) (Mpp6), mRNA. // chr4 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// XM_006236497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 6 (MAGUK p55 subfamily member 6) (Mpp6), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:144519340:144598644:1 gene:ENSRNOG00000021579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// BC169025 // GenBank // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 6 (MAGUK p55 subfamily member 6), mRNA (cDNA clone MGC:189400 IMAGE:9027949), complete cds. // chr4 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:144517303:144597822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT039585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT039586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT039587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
GENSCAN00000040907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:144926133:144926309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000047997 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:144925990:144926573:1 gene:ENSRNOG00000032641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 100 // 16 // 22 // 0
XM_006224943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor erythroid 2-related factor 3-like (LOC102557123), mRNA. // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_231763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 3 (Nfe2l3), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:145871588:145898997:1 gene:ENSRNOG00000010886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006224944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog (RGD1561341), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006236540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog (RGD1561341), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000020546 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:145967959:145968396:1 gene:ENSRNOG00000015328 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:145967992:145968396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001013085 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 10 (Snx10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 10 (Snx10), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 10 (Snx10), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 10 (Snx10), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:145977454:146040122:1 gene:ENSRNOG00000011944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091290 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 10, mRNA (cDNA clone MGC:109202 IMAGE:7306793), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:145977767:146125385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT039602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000045746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146718180:146727653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000045744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146803970:146804497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053757 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:38544:39071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0
NM_001191972 // RefSeq // Rattus norvegicus even-skipped homeobox 1 (Evx1), mRNA. // chr4 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010605 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:186548:189839:1 gene:ENSRNOG00000007950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:147037772:147042149:1 gene:ENSRNOG00000046734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146999399:147041063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000053755 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:148179:189839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001047977 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00062 (LOC685406), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:147303775:147310286:1 gene:ENSRNOG00000033407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
AY387050 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00064 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001004199 // RefSeq // Rattus norvegicus Tax1 (human T-cell leukemia virus type I) binding protein 1 (Tax1bp1), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000011371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:147442105:147497941:1 gene:ENSRNOG00000008393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000041988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:147442105:147499135:1 gene:ENSRNOG00000008393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// AF509819 // GenBank // Rattus norvegicus liver regeneration-related protein 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// AY318959 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa1076 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// BC081949 // GenBank // Rattus norvegicus Tax1 (human T-cell leukemia virus type I) binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94031 IMAGE:7122283), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// FQ234714 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YO19 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 37 // 16 // 16 // 0 /// FQ232704 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YL14 mRNA sequence. // chr4 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// GENSCAN00000025466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:147449045:147497571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 16 // 43 // 1 /// NONRATT039614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1 /// NONRATT039609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1 /// NONRATT039610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
ENSRNOT00000011389 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:147761202:147761907:1 gene:ENSRNOG00000008611 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001134621 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 5 (Creb5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 5 (Creb5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000031365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:148056324:148499530:1 gene:ENSRNOG00000008622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:148477165:148497166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_032084 // RefSeq // Rattus norvegicus chimerin 2 (Chn2), mRNA. // chr4 // 96 // 63 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149084636:149113928:1 gene:ENSRNOG00000009411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// L07494 // GenBank // Rat beta-chimaerin (bch) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 63 // 23 // 24 // 0 /// FQ210509 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YH23 mRNA sequence. // chr4 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1 /// GENSCAN00000038994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:148991117:149113879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1 /// NONRATT039624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// NONRATT039621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// NONRATT039625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1
NM_001104527 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 15 (Prr15), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149139528:149142572:1 gene:ENSRNOG00000009564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC127529 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA E130201N16, mRNA (cDNA clone MGC:156783 IMAGE:7126230), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147211 // RefSeq // Rattus norvegicus WAS/WASL interacting protein family, member 3 (Wipf3), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149287016:149335996:1 gene:ENSRNOG00000009571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149287016:149335996:1 gene:ENSRNOG00000009571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000074054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149287016:149329827:1 gene:ENSRNOG00000009571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// U25281 // GenBank // Rattus norvegicus SH3 domain binding protein (CR16) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// U31159 // GenBank // Rattus norvegicus SH3 domain binding protein (CR16) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149296945:149320460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_001109235 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 8 (Plekha8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 8 (Plekha8), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149430315:149480827:1 gene:ENSRNOG00000009971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149430482:149475900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT039633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001007645 // RefSeq // Rattus norvegicus maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog (Xenopus) (Mturn), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149514309:149531680:1 gene:ENSRNOG00000010205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083875 // GenBank // Rattus norvegicus similar to B230212L03Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:95152 IMAGE:7129817), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maturin, neural progenitor differentiation regulator homolog (Xenopus) (Mturn), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT039636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149514354:149549273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT039637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001108628 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc and ring finger 2 (Znrf2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149666569:149748158:1 gene:ENSRNOG00000049057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149588240:149774475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001108629 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-glutamyl cyclotransferase (Ggct), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149842892:149850088:-1 gene:ENSRNOG00000034084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233046 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YG21 mRNA sequence. // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT041420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149846615:149849974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT041422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT041423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_001058587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 188, member B (Fam188b), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_231787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 188, member B (Fam188b), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015469 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:150080080:150184008:1 gene:ENSRNOG00000011530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064923 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:150080080:150146254:1 gene:ENSRNOG00000011530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000065400 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:150080080:150146344:1 gene:ENSRNOG00000011530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074425 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:150080080:150159907:1 gene:ENSRNOG00000011530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 55 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:150080080:150195461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// NONRATT039654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT039656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_012778 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 1 (Aqp1), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:150203461:150215641:1 gene:ENSRNOG00000011648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090068 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93653 IMAGE:7190406), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L07268 // GenBank // Rattus norvegicus water channel (CHIP28) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT039658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:150203520:150213886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_012850 // RefSeq // Rattus norvegicus growth hormone releasing hormone receptor (Ghrhr), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006236544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth hormone releasing hormone receptor (Ghrhr), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:150240647:150253620:1 gene:ENSRNOG00000011808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000044578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:150240647:150253620:1 gene:ENSRNOG00000011808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AF122055 // GenBank // Rattus norvegicus GHRH receptor beta GHRHr mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// L01407 // GenBank // Rat growth hormone-releasing hormone receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006236542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth hormone releasing hormone receptor (Ghrhr), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// AF409106 // GenBank // Rattus norvegicus putative growth hormone-releasing hormone receptor-related protein precursor, mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// NONRATT039659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000039716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:150240669:150253289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_001191973 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 129 (Ccdc129), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 129 (Ccdc129), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000045930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:150777721:150886047:1 gene:ENSRNOG00000012165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:150860201:150885988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000006706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:150777727:150806206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
NM_153467 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 17 (Ppp1r17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:150928122:150944836:1 gene:ENSRNOG00000012235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF294688 // GenBank // Rattus norvegicus G-substrate phosphatase inhibitor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213688 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YF03 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:150916610:151020418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000032377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:151029279:151037354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
XM_006224938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AVL9 homolog (S. cerevisiase) (Avl9), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006224939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AVL9 homolog (S. cerevisiase) (Avl9), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006236564 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AVL9 homolog (S. cerevisiase) (Avl9), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AVL9 homolog (S. cerevisiase) (Avl9), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XR_345855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AVL9 homolog (S. cerevisiase) (Avl9), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XR_353353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AVL9 homolog (S. cerevisiase) (Avl9), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000018425 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:151679026:151718420:1 gene:ENSRNOG00000013314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:151671182:151719225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// NONRATT039671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// FQ234399 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YC02 mRNA sequence. // chr4 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001007646 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 9 (Fkbp9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:151819739:151885185:1 gene:ENSRNOG00000005478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081961 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 9, 63 kDa, mRNA (cDNA clone MGC:94086 IMAGE:7124723), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:151819856:151884013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT039674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
XM_006224947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 65 (Vom1r65), partial mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// XM_006236567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 65 (Vom1r65), partial mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000058702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:151963617:151964685:1 gene:ENSRNOG00000047851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001008945 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 66 (Vom1r66), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY510310 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc19 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152160964:152292484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_001008912 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 67 (Vom1r67), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY510295 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc20 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000040442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:151963752:152003540:1 gene:ENSRNOG00000047851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152002884:152092751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 86 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT039675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000008357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152002629:152055469:1 gene:ENSRNOG00000047851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 100 // 10 // 20 // 0
NM_001008906 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 68 (Vom1r68), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000073670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152002629:152092754:1 gene:ENSRNOG00000047851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// AY510275 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT039676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001009531 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 69 (Vom1r69), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510330 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc40 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009519 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 70 (Vom1r70), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104133688:104134587:1 gene:ENSRNOG00000047591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510318 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009523 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 71 (Vom1r71), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY510326 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc5 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000052126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152105845:152250356:1 gene:ENSRNOG00000047851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 100 // 12 // 20 // 0 /// NONRATT039679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001009521 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 72 (Vom1r72), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY510329 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc39 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001008922 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 73 (Vom1r73), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510289 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc34 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152388647:152399218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008911 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 74 (Vom1r74), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152878035:152879126:1 gene:ENSRNOG00000048346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY510285 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc16 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001008972 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 75 (Vom1r75), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000040992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152890876:152891808:1 gene:ENSRNOG00000047987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY510283 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc29 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152467957:152468634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152891131:152902943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001009520 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 76 (Vom1r76), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510327 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc27 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152493124:152493768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008924 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 78 (Vom1r78), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152398301:152584189:1 gene:ENSRNOG00000045592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AY510292 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc36 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152583527:152584189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009518 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 80 (Vom1r80), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152666613:152667512:1 gene:ENSRNOG00000046199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AY510323 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc38 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT039686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001008970 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 81 (Vom1r81), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152688847:152689779:1 gene:ENSRNOG00000048807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510288 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000052314 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:152723438:152724345:1 gene:ENSRNOG00000031729 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152972751:153097688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001009515 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 82 (Vom1r82), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000040059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152760168:152761064:1 gene:ENSRNOG00000029435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AY510313 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc41 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073173 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:153009462:153155014:1 gene:ENSRNOG00000046296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT039688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001008956 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 83 (Vom1r83), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510314 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc18 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009528 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 84 (Vom1r84), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152813690:152814598:1 gene:ENSRNOG00000046351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510312 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc43 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009530 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 85 (Vom1r85), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000050154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152838574:152839482:1 gene:ENSRNOG00000050376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AY510325 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc44 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001009513 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 88 (Vom1r88), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:153248616:153249509:1 gene:ENSRNOG00000031987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510324 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc28 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108630 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1 (Vopp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006236578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1 (Vopp1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000008885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:153266271:153337776:1 gene:ENSRNOG00000006646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC168709 // GenBank // Rattus norvegicus EGFR-coamplified and overexpressed protein, mRNA (cDNA clone MGC:188680 IMAGE:8363599), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 92 // 11 // 12 // 1
NM_001024370 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y (Pigy), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:153407117:153409393:1 gene:ENSRNOG00000006858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086361 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Y, mRNA (cDNA clone MGC:105675 IMAGE:7304702), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:153407206:153408706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT039695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107863 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1K (Ppm1k), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_353357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1K (Ppm1k), transcript variant X3, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_353358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1K (Ppm1k), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:153516057:153540007:1 gene:ENSRNOG00000006893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211521 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA90YF24 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:153509806:153538791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000037571 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:153575461:153575927:1 gene:ENSRNOG00000023880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0
NM_181381 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 2 (Abcg2), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006236572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 2 (Abcg2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006236577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 2 (Abcg2), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:153655672:153712128:1 gene:ENSRNOG00000007041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AB094089 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP-binding cassette transporter ABCG2, complete cds. // chr4 // 90 // 86 // 27 // 30 // 0 /// AB105817 // GenBank // Rattus norvegicus abcg2 mRNA for ABC transporter ABCG2, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AY089996 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein G2 transcript variant B (Abcg2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AY089997 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein G2 transcript variant C (Abcg2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AY089998 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein G2 transcript variant A (Abcg2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:153674201:153779738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001108631 // RefSeq // Rattus norvegicus HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 (Herc3), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:153899767:153990202:1 gene:ENSRNOG00000007304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006236585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 (Herc3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:153911555:153965429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000058581 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:154355197:154356777:1 gene:ENSRNOG00000038449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001065496 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multimerin 1 (Mmrn1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_001071128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multimerin 1 (Mmrn1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000030320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:155798439:155844631:1 gene:ENSRNOG00000024986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:155820120:155844078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:155798484:155818617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
NM_001134622 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil serine-rich protein 1 (Ccser1), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006236593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil serine-rich protein 1 (Ccser1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil serine-rich protein 1 (Ccser1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:156183029:156605322:1 gene:ENSRNOG00000029321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:156183070:156337262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NONRATT039714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 89 // 11 // 17 // 0 /// NONRATT016813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 89 // 11 // 17 // 0 /// NONRATT041322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0
ENSRNOT00000049438 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:157238559:157239203:1 gene:ENSRNOG00000038437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000006279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:157238559:157239203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_024379 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, delta 2 (Grid2), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:159485887:160229216:1 gene:ENSRNOG00000006174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// U08256 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley glutamate receptor delta-2 subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// XM_006236604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, delta 2 (Grid2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// GENSCAN00000051294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:159904220:160013677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT039718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT039716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000015803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:159608396:159680056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001109238 // RefSeq // Rattus norvegicus atonal homolog 1 (Drosophila) (Atoh1), mRNA. // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000008358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:160284441:160286536:1 gene:ENSRNOG00000006383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:160230744:160285692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001107864 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 (Smarcad1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006236601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF-related, matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin, subfamily a, containing DEAD/H box 1 (Smarcad1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000008585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:160672979:160733484:1 gene:ENSRNOG00000006391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000049019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:160658798:160723134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:160724522:160731814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_001109239 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C130060K24 gene (RGD1560028), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:161039644:161117914:1 gene:ENSRNOG00000006782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:161066032:161269333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_006224951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 3 (Tnip3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006224953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 3 (Tnip3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 3 (Tnip3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 3 (Tnip3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034326 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:161236306:161261819:1 gene:ENSRNOG00000023725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071363 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:161236306:161245544:1 gene:ENSRNOG00000023725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:161066032:161269333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
XM_006236609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuron-derived neurotrophic factor (Ndnf), mRNA. // chr4 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:161341072:161348902:1 gene:ENSRNOG00000006857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:161341072:161348902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
XM_001072014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 5 (Prdm5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_002726382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 5 (Prdm5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006224954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 5 (Prdm5), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006236608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 5 (Prdm5), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009569 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:161443647:161572269:1 gene:ENSRNOG00000023679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009675 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:161443647:161572269:1 gene:ENSRNOG00000023679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074542 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:161443647:161572269:1 gene:ENSRNOG00000023679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:161494761:161604547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_182670 // RefSeq // Rattus norvegicus RSA-14-44 protein (RSA-14-44), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:161616873:161617993:1 gene:ENSRNOG00000042954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY149343 // GenBank // Rattus norvegicus RSA-14-44 mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// BC083656 // GenBank // Rattus norvegicus RSA-14-44 protein, mRNA (cDNA clone MGC:94489 IMAGE:7135210), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:161616972:161617553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT039728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106594 // RefSeq // Rattus norvegicus MAD2 mitotic arrest deficient-like 1 (yeast) (Mad2l1), mRNA. // chr4 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_006236621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAD2 mitotic arrest deficient-like 1 (yeast) (Mad2l1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:162316426:162322429:1 gene:ENSRNOG00000005376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT039731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:162264533:162321296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT039732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_053661 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 12 (Gng12), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:162543862:162545626:1 gene:ENSRNOG00000050231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ223368 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YC13 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:162539889:162545626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_145086 // RefSeq // Rattus norvegicus Serpine1 mRNA binding protein 1 (Serbp1), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:162813203:162830522:1 gene:ENSRNOG00000005890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC079337 // GenBank // Rattus norvegicus Serpine1 mRNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94773 IMAGE:7106027), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// FQ213573 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YA11 mRNA sequence. // chr4 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// FQ233179 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YO02 mRNA sequence. // chr4 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// U21718 // GenBank // Rattus norvegicus clone C426 intestinal epithelium proliferating cell-associated mRNA sequence. // chr4 // 76 // 83 // 22 // 29 // 0 /// FQ227901 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YF06 mRNA sequence. // chr4 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000005820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:162748337:162829978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT039741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT039746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
GENSCAN00000003632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:158554135:158589535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 92 // 7 // 11 // 0
ENSRNOT00000048461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:166489699:166490154:1 gene:ENSRNOG00000030372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000049969 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:96770089:96770550:1 gene:ENSRNOG00000047560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
ENSRNOT00000051723 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:120092709:120093164:-1 gene:ENSRNOG00000051001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 76 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166568768:166635192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 48 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:96847483:96895943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 48 // 9 // 10 // 0
ENSRNOT00000050573 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:120039801:120040209:-1 gene:ENSRNOG00000049406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051084 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:120039675:120040209:-1 gene:ENSRNOG00000049406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166568768:166635192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:120039898:120174123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000009969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166304636:166395002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
BC062802 // GenBank // Rattus norvegicus similar to NGF-binding Ig light chain, mRNA (cDNA clone MGC:73014 IMAGE:6890409), complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000072591 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:166397806:166398150:1 gene:ENSRNOG00000049073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 59 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT039825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166304636:166395002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 59 // 12 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000048263 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:166872232:166872972:-1 gene:ENSRNOG00000030177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 85 // 14 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166757508:166872972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 85 // 14 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166397365:166532883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT005129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// NONRATT005130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
GENSCAN00000003647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:158476684:158477123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 69 // 14 // 18 // 0
GENSCAN00000016607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88096276:88096764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:167540685:167541173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000003632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:158554135:158589535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0
GENSCAN00000003646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:158597582:158598070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000016609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88107623:88108111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:167551452:167551940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000043961 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:167622384:167622845:1 gene:ENSRNOG00000033851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000003649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:158677870:158678358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:167622378:167622866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000058437 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:158748367:158749112:1 gene:ENSRNOG00000038376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000003636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:158692343:158853425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000019281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166397365:166532883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0
ENSRNOT00000044699 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:25811522:25910715:1 gene:ENSRNOG00000048065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 68 // 8 // 17 // 0 /// FQ228219 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YB05 mRNA sequence. // chr3 // 36 // 88 // 8 // 22 // 0 /// NONRATT034708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 68 // 8 // 17 // 0
ENSRNOT00000045584 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:241092334:241092823:1 gene:ENSRNOG00000030575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
GENSCAN00000012256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25627936:25628437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:25730860:25731339:-1 gene:ENSRNOG00000047999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:241169073:241169573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25730839:25769427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25811720:25840983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
GENSCAN00000012260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25890518:25937954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
ENSRNOT00000072306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:25944047:25944337:-1 gene:ENSRNOG00000047162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 61 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25944026:25944527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25708394:25708895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000073407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:25730860:25731339:-1 gene:ENSRNOG00000047999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 100 // 10 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25730839:25769427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 100 // 12 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25647008:25647507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 100 // 12 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25670068:25670568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 100 // 12 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25648988:25667928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
ENSRNOT00000072306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:25944047:25944337:-1 gene:ENSRNOG00000047162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 64 // 10 // 18 // 0 /// GENSCAN00000012255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25944026:25944527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 100 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25670068:25670568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25708394:25708895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 100 // 20 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:25730860:25731339:-1 gene:ENSRNOG00000047999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 100 // 11 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25730839:25769427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25647008:25647507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 86 // 11 // 24 // 0
ENSRNOT00000043673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:24585556:24586167:-1 gene:ENSRNOG00000047836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:24585556:24586167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000040689 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23514092:23514384:-1 gene:ENSRNOG00000029562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 68 // 11 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23514077:23520150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001017510 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC005537 (LOC498750), mRNA. // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059564 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:44124794:44134878:-1 gene:ENSRNOG00000018456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC085940 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC005537, mRNA (cDNA clone MGC:95046 IMAGE:7123624), complete cds. // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC089212 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC005537, mRNA (cDNA clone MGC:105535 IMAGE:7302835), complete cds. // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007034 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23251475:23252078:-1 gene:ENSRNOG00000005305 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44125968:44134579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT025091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23248338:23252078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT025092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT037061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000026203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22375683:22382702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT037060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_002729377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to immunoglobulin kappa-chain VK-1 (RGD1563231), mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:22295204:22295792:-1 gene:ENSRNOG00000047571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22295183:22295786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22143303:22143908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 75 // 17 // 21 // 0 /// NONRATT037060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074266 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22143297:22143887:1 gene:ENSRNOG00000046715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 75 // 14 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22434685:22435309:1 gene:ENSRNOG00000049909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 75 // 10 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22434685:22435369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 75 // 10 // 21 // 0 /// FQ225348 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YE07 mRNA sequence. // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// FQ225497 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YO04 mRNA sequence. // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
FQ225348 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YE07 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ225497 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YO04 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000048523 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:21833711:21834237:-1 gene:ENSRNOG00000043155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 50 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21833573:21840981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000042394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21751882:21752703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000047784 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:21737043:21738072:-1 gene:ENSRNOG00000049009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21737758:21738364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000031991 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:163239971:163240567:1 gene:ENSRNOG00000038248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042165 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:163239971:163240534:1 gene:ENSRNOG00000038248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163239989:163240639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_031599 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 (Eif2ak3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006236624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 3 (Eif2ak3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163428182:163488913:1 gene:ENSRNOG00000006069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF096835 // GenBank // Rattus norvegicus pancreatic eukaryotic initiation factor 2 alpha-subunit kinase (PEK) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163428393:163505535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT039750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001109349 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box I3 (Foxi3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163554654:163558828:1 gene:ENSRNOG00000006491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163554579:163558825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012556 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 1, liver (Fabp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163840320:163844102:1 gene:ENSRNOG00000006675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086947 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 1, liver, mRNA (cDNA clone MGC:108756 IMAGE:7325407), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M35991 // GenBank // Rat fatty liver acid binding protein (FABP) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163840367:163844038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001009413 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine-rich coiled-coil 1 (Krcc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine-rich coiled-coil 1 (Krcc1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163912884:163925867:1 gene:ENSRNOG00000007124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087628 // GenBank // Rattus norvegicus lysine-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:105762 IMAGE:7317897), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163924540:163947204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XR_345875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552663 (LOC102552663), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_353375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552663 (LOC102552663), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058186 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:163946626:163947204:1 gene:ENSRNOG00000038215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163924540:163947204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031539 // RefSeq // Rattus norvegicus CD8b molecule (Cd8b), mRNA. // chr4 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163964375:163980435:1 gene:ENSRNOG00000007129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC059127 // GenBank // Rattus norvegicus CD8b molecule, mRNA (cDNA clone MGC:72771 IMAGE:6888323), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163967453:163982036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_031538 // RefSeq // Rattus norvegicus CD8a molecule (Cd8a), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD8a molecule (Cd8a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164017633:164021869:1 gene:ENSRNOG00000007178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC088126 // GenBank // Rattus norvegicus CD8a molecule, mRNA (cDNA clone MGC:108655 IMAGE:7381324), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164017639:164018738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT039760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053438 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 103 (Rnf103), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000064374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164177797:164194495:1 gene:ENSRNOG00000007272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF306394 // GenBank // Rattus norvegicus Kf-1 protein (Adgr34) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC100629 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 103, mRNA (cDNA clone MGC:124587 IMAGE:7938106), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_172331 // RefSeq // Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 3 (Chmp3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 3 (Chmp3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164228440:164274202:1 gene:ENSRNOG00000007356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY150169 // GenBank // Rattus norvegicus Vps24p mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234202 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YM23 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164206777:164273828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT039766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108633 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor accessory protein 1 (Reep1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164396528:164513460:1 gene:ENSRNOG00000008481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ217879 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA15YC18 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164396765:164483067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001034928 // RefSeq // Rattus norvegicus inner membrane protein, mitochondrial (Immt), mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164531449:164567175:1 gene:ENSRNOG00000009097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC083835 // GenBank // Rattus norvegicus inner membrane protein, mitochondrial, mRNA (cDNA clone IMAGE:7113049). // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC105841 // GenBank // Rattus norvegicus inner membrane protein, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:125092 IMAGE:7454026), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// FQ217458 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA25YN11 mRNA sequence. // chr4 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164492465:164567481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT039774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT039773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT039777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_031772 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) I polypeptide A (Polr1a), mRNA. // chr4 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000013587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164601148:164665028:1 gene:ENSRNOG00000009545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AF025425 // GenBank // Rattus norvegicus RNA polymerase I 194 kDa subunit (RPA1) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164600594:164664214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_031337 // RefSeq // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5 (St3gal5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5 (St3gal5), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000050249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164713253:164769522:1 gene:ENSRNOG00000010284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB018049 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GM3 synthase, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC078798 // GenBank // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5, mRNA (cDNA clone MGC:93367 IMAGE:7106217), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164667056:164768560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT039785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT039786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT039787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_138842 // RefSeq // Rattus norvegicus surfactant protein B (Sftpb), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000014505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164937657:164946701:1 gene:ENSRNOG00000010761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC072466 // GenBank // Rattus norvegicus surfactant protein B, mRNA (cDNA clone MGC:91491 IMAGE:7100971), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164935481:164946653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT039791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT039792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
XM_001076881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691113 (LOC691113), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691113 (LOC691113), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015807 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:164980910:164982685:1 gene:ENSRNOG00000011713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164980970:164992383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT039793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_139107 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 150A (Tmem150a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164989421:164992889:1 gene:ENSRNOG00000011899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF186469 // GenBank // Rattus norvegicus TM6P1 (TM6P1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC072517 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 150, mRNA (cDNA clone MGC:91474 IMAGE:7103745), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000013991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164980970:164992383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
BC100621 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-glutamyl carboxylase, mRNA (cDNA clone IMAGE:5598395), complete cds. // chr4 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// NM_031756 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-glutamyl carboxylase (Ggcx), mRNA. // chr4 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000017927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165047672:165063176:1 gene:ENSRNOG00000012975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 35 // 40 // 1 /// AF065387 // GenBank // Rattus norvegicus vitamin K-dependent gamma-glutamyl carboxylase mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// BC168647 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-glutamyl carboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:187360 IMAGE:9102306), complete cds. // chr4 // 93 // 93 // 37 // 40 // 1 /// BC060553 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-glutamyl carboxylase, mRNA (cDNA clone IMAGE:6918496), complete cds. // chr4 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// GENSCAN00000013970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165047747:165065661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1 /// NONRATT039803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT039804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT039805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
NM_145084 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol saturase (all trans retinol 13,14 reductase) (Retsat), mRNA. // chr4 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165235748:165244511:1 gene:ENSRNOG00000014090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165219069:165244486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_053752 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate-CoA ligase, alpha subunit (Suclg1), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 57 // 62 // 0 /// ENSRNOT00000007624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165937918:165967275:1 gene:ENSRNOG00000005587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// BC061537 // GenBank // Rattus norvegicus succinate-CoA ligase, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:72737 IMAGE:6920009), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 57 // 62 // 0 /// FQ216826 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YA23 mRNA sequence. // chr4 // 82 // 100 // 51 // 62 // 0 /// FQ217244 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA31YG08 mRNA sequence. // chr4 // 97 // 98 // 59 // 61 // 0 /// GENSCAN00000009971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165942796:166001564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 81 // 47 // 50 // 0 /// J03621 // GenBank // Rat mitochondrial succinyl-CoA synthetase alpha subunit (cytoplasmic precursor) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0 /// NONRATT039820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// NONRATT039822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 21 // 62 // 1 /// NONRATT039823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 19 // 62 // 1 /// NONRATT039821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 16 // 16 // 10 // 62 // 1
ENSRNOT00000007669 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:168744619:168746281:1 gene:ENSRNOG00000005835 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:168744619:168746281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000051286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:169035587:169036831:1 gene:ENSRNOG00000029080 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000003516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:169035563:169036831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001106451 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 15 (Tbx15), mRNA. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000067358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220812286:220855072:1 gene:ENSRNOG00000019565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220863184:220868824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT030060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220812235:220854252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000007730 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:172045136:172045577:1 gene:ENSRNOG00000005891 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 73 // 96 // 16 // 22 // 0
NM_001109374 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 (LRRTM1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat transmembrane neuronal 1 (LRRTM1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:173006774:173022018:1 gene:ENSRNOG00000006093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:172970998:173028106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT039837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053289 // RefSeq // Rattus norvegicus regenerating islet-derived 3 beta (Reg3b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:174173099:174176337:1 gene:ENSRNOG00000006151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ233015 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YI22 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M55149 // GenBank // Rat pancreatitis associated protein (pap) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// M98049 // GenBank // Rattus norvegicus pancreatitis-associated protein precursor (pap) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// S77413 // GenBank // Rattus norvegicus peptide 23 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:174173417:174196370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT039844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001145846 // RefSeq // Rattus norvegicus regenerating islet-derived 3 alpha (Reg3a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_172077 // RefSeq // Rattus norvegicus regenerating islet-derived 3 alpha (Reg3a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:174183721:174186489:1 gene:ENSRNOG00000006360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// D23676 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for regeneRattus norvegicusing protein III (reg III), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// L10229 // GenBank // Rat pancreatitis-associated protein (PAPII) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT039846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:174173417:174196370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_012641 // RefSeq // Rattus norvegicus regenerating islet-derived 1 alpha (Reg1a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:174199391:174202509:1 gene:ENSRNOG00000006486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ219465 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YB05 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M18962 // GenBank // Rat islet of Langerhans regenerating protein (reg) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M62930 // GenBank // Rat pancreatic stone protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:174199737:174223531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NONRATT041592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134746 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat transmembrane neuronal 4 (Lrrtm4), mRNA. // chr4 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000030588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:175391879:175393435:1 gene:ENSRNOG00000021938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// BC168219 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, mRNA (cDNA clone MGC:188202 IMAGE:7319359), complete cds. // chr4 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
NM_001134554 // RefSeq // Rattus norvegicus GC-rich sequence DNA-binding factor 2 (Gcfc2), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:177350363:177387465:1 gene:ENSRNOG00000006888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:177350366:177387067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001109243 // RefSeq // Rattus norvegicus eva-1 homolog A (Eva1a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eva-1 homolog A (Eva1a), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006236709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eva-1 homolog A (Eva1a), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:177462081:177511382:1 gene:ENSRNOG00000007118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eva-1 homolog A (Eva1a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT039856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:177402706:177510455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_012667 // RefSeq // Rattus norvegicus tachykinin receptor 1 (Tacr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:177782405:178095041:1 gene:ENSRNOG00000005853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// J05097 // GenBank // Rat substance P receptor (SPR) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M31477 // GenBank // Rattus norvegicus substance P receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:177926653:178093406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006224965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus meiosis 1 associated protein (M1ap), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus meiosis 1 associated protein (M1ap), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009701 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:178458161:178523256:1 gene:ENSRNOG00000007288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178515300:178548347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001107866 // RefSeq // Rattus norvegicus lysyl oxidase-like 3 (Loxl3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178552500:178568813:1 gene:ENSRNOG00000007638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178553804:178568381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001079899 // RefSeq // Rattus norvegicus ancient ubiquitous protein 1 (Aup1), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000010602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178572182:178575201:1 gene:ENSRNOG00000007842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// BC127544 // GenBank // Rattus norvegicus ancient ubiquitous protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:156826 IMAGE:7319831), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// FQ228919 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YI14 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 87 // 30 // 34 // 0 /// NONRATT039865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT039866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000014317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178572111:178584063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 28 // 39 // 1 /// NONRATT039868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 21 // 39 // 1 /// NONRATT039867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// NONRATT039871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
NM_001109407 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAQ box RNA-dependent ATPase 1 (Dqx1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178575609:178584448:1 gene:ENSRNOG00000008062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178572111:178584063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000011173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178596101:178598690:1 gene:ENSRNOG00000008360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001007000 // RefSeq // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 1 (Pcgf1), mRNA. // chr4 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// AY662670 // GenBank // Rattus norvegicus Nspc1-like protein (Nspc1) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// NONRATT039875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT039876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178589649:178600777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001109244 // RefSeq // Rattus norvegicus ladybird homeobox 2 (Lbx2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178603652:178605537:1 gene:ENSRNOG00000008466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178603712:178606992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT039879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001072498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 142 (Ccdc142), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_232111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 142 (Ccdc142), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178620221:178626252:1 gene:ENSRNOG00000022326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC168168 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9021877. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178620221:178630080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT039881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT039882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_001072498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 142 (Ccdc142), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_232111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 142 (Ccdc142), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178620221:178626252:1 gene:ENSRNOG00000022326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178620221:178630080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168168 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9021877. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108635 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L53 (Mrpl53), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000011427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178627009:178627896:1 gene:ENSRNOG00000008477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC166928 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L53, mRNA (cDNA clone MGC:188919 IMAGE:6920305), complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC168168 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9021877. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT039883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178620221:178630080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_031749 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosidase 1 (Gcs1), mRNA. // chr4 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178633399:178636808:1 gene:ENSRNOG00000008648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF087431 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein processing glucosidase I mRNA, complete cds. // chr4 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178633306:178636618:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_184046 // RefSeq // Rattus norvegicus rhotekin (Rtkn), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006236729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhotekin (Rtkn), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000031964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179424134:179439771:1 gene:ENSRNOG00000009022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY348867 // GenBank // Rattus norvegicus rhotekin isoform 1 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY348868 // GenBank // Rattus norvegicus rhotekin isoform 2 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr4 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// XM_006236730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhotekin (Rtkn), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// XM_006236732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhotekin (Rtkn), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000042909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179424134:179439771:1 gene:ENSRNOG00000009022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000051983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179422796:179439468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT039886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT039888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT039890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT039891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001024330 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical gene supported by BC079424 (LOC500227), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical gene supported by BC079424 (LOC500227), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013312 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:179443528:179449747:1 gene:ENSRNOG00000009917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179445756:179485326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT039892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_024130 // RefSeq // Rattus norvegicus dynactin 1 (Dctn1), mRNA. // chr4 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179465836:179485632:1 gene:ENSRNOG00000010048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179445756:179485326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT039902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_212512 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 5 (Slc4a5), mRNA. // chr4 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179507406:179590667:1 gene:ENSRNOG00000010378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB118905 // GenBank // Rattus norvegicus SLC4A5 mRNA for sodium bicarbonate transporter 4 isoform g, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY496959 // GenBank // Rattus norvegicus electrogenic sodium bicarbonate cotransporter NBC4c mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179511623:179590687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001033891 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB kinase activator 1A (Mob1a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000064479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179612702:179631467:1 gene:ENSRNOG00000042657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC101879 // GenBank // Rattus norvegicus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 1B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:124888 IMAGE:7929996), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001033891 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB kinase activator 1A (Mob1a), mRNA. // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179612702:179631467:1 gene:ENSRNOG00000042657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC101879 // GenBank // Rattus norvegicus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 1B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:124888 IMAGE:7929996), complete cds. // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071404 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:4236446:4237096:1 gene:ENSRNOG00000050498 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075124 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:4137595:4138245:1 gene:ENSRNOG00000046528 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179605197:179627855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4236446:4237096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4137595:4138245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001106601 // RefSeq // Rattus norvegicus bolA family member 3 (Bola3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179636751:179646197:1 gene:ENSRNOG00000021866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179636771:179645457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_345908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548361 (LOC102548361), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XR_345909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548361 (LOC102548361), transcript variant X2, ncRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XR_353409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548361 (LOC102548361), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XR_353410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548361 (LOC102548361), transcript variant X2, ncRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_022637 // RefSeq // Rattus norvegicus ventral anterior homeobox 2 (Vax2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179975806:180001477:1 gene:ENSRNOG00000013261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF113516 // GenBank // Rattus norvegicus ventral anterior homeobox 2 (Vax2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179975806:180001477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107867 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit B1 (Atp6v1b1), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit B1 (Atp6v1b1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:180005842:180024878:1 gene:ENSRNOG00000013573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180005903:180023994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XR_345915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 53 (Ankrd53), partial misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_353413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 53 (Ankrd53), partial misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033234 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:180029358:180035420:1 gene:ENSRNOG00000021402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073274 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:180029540:180035420:1 gene:ENSRNOG00000021402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC160898 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7453244. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180028240:180035361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037768 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylglucosamine kinase (Nagk), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:180063236:180070557:1 gene:ENSRNOG00000013911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC079456 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylglucosamine kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7121526). // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC107647 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylglucosamine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:124788 IMAGE:7930414), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180065058:180070444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// NONRATT039921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
ENSRNOT00000044612 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:180060624:180061023:-1 gene:ENSRNOG00000029480 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 80 // 65 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180038266:180063392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001107868 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 638 (Zfp638), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:180188991:180278179:1 gene:ENSRNOG00000014501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180189235:180345791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT039926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT039928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NM_001107869 // RefSeq // Rattus norvegicus dysferlin (Dysf), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0 /// XM_006236755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dysferlin (Dysf), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 98 // 100 // 52 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000064536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:180300911:180487010:1 gene:ENSRNOG00000032788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000002886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180389626:180585849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180346487:180386133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 16 // 53 // 1
ENSRNOT00000057552 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:181387442:181410706:1 gene:ENSRNOG00000037879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 78 // 18 // 21 // 0
GENSCAN00000024189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181453175:181488189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONRATT039936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// NONRATT039937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
XM_003753913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sepiapterin reductase-like (RGD1560795), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000020786 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:181547461:181563885:1 gene:ENSRNOG00000015493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212435 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA54YP19 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181547872:181563495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001192014 // RefSeq // Rattus norvegicus notochord homeobox (Noto), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181783984:181788485:1 gene:ENSRNOG00000037863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181758033:181788485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107870 // RefSeq // Rattus norvegicus SMYD family member 5 (Smyd5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181792679:181807488:1 gene:ENSRNOG00000015589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181792699:181806570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_001106603 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 7 (eta) (Cct7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000021030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181812638:181829880:1 gene:ENSRNOG00000015630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ218957 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YM14 mRNA sequence. // chr4 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// GENSCAN00000024183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181820839:181829678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT039944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001106604 // RefSeq // Rattus norvegicus Alstrom syndrome 1 (Alms1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181947469:182048235:1 gene:ENSRNOG00000022343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181886642:182022785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT039948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001013926 // RefSeq // Rattus norvegicus Tp53rk binding protein (Tprkb), mRNA. // chr4 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182164105:182177471:1 gene:ENSRNOG00000050645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC087060 // GenBank // Rattus norvegicus Tp53rk binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:94108 IMAGE:7125830), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Tp53rk binding protein (Tprkb), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// XM_006236806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53RK-binding protein-like (LOC100910911), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000021211 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:182353058:182358701:1 gene:ENSRNOG00000015818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// FQ234910 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YD05 mRNA sequence. // chr4 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT039957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT039958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT039959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006236744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Tp53rk binding protein (Tprkb), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53RK-binding protein-like (LOC100910911), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231666 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YK11 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_575589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus folliculogenesis specific basic helix-loop-helix (Figla), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021272 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:182253856:182257781:1 gene:ENSRNOG00000015877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182236741:182257781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001109880 // RefSeq // Rattus norvegicus adducin 2 (beta) (Add2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NM_012491 // RefSeq // Rattus norvegicus adducin 2 (beta) (Add2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182317207:182454565:1 gene:ENSRNOG00000015903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// M63894 // GenBank // Rat adducin mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182405110:182490964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT039960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// NONRATT039961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_012671 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor alpha (Tgfa), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transforming growth factor alpha (Tgfa), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000057441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182534326:182616713:1 gene:ENSRNOG00000016182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M31076 // GenBank // Rat transforming growth factor alpha (TGF-alpha) mRNA, complete cds, clone 22A1/22A3. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// KF366251 // GenBank // Rattus norvegicus strain SD transforming growth factor alpha (Tgfa) mRNA, complete cds. // chr4 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000019457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182602875:182614294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106605 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 136, member A (Fam136a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000022014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182731397:182737312:1 gene:ENSRNOG00000016273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC158733 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 136, member A, mRNA (cDNA clone MGC:187893 IMAGE:9092974), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182731446:182736171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NONRATT039965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001012096 // RefSeq // Rattus norvegicus TIA1 cytotoxic granule-associated RNA binding protein (Tia1), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182779170:182806468:1 gene:ENSRNOG00000016813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC087064 // GenBank // Rattus norvegicus TIA1 cytotoxic granule-associated RNA binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:94287 IMAGE:7132038), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182779351:182814836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// NONRATT039972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT039974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT039977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001107872 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC25529 (RGD1306746), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182814382:182843018:1 gene:ENSRNOG00000017380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182820460:182853501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XR_008965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartic peptidase, retroviral-like 1 (Asprv1), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_086234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartic peptidase, retroviral-like 1 (Asprv1), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183001771:183002794:1 gene:ENSRNOG00000017710 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183002030:183002794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001173450 // RefSeq // Rattus norvegicus AP2 associated kinase 1 (Aak1), mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 42 // 47 // 1 /// ENSRNOT00000043082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183225152:183365259:1 gene:ENSRNOG00000018317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 89 // 42 // 47 // 1 /// GENSCAN00000042137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183281173:183370346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1 /// NONRATT039990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 18 // 47 // 1 /// NONRATT039991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1 /// NONRATT039993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1
NM_001106606 // RefSeq // Rattus norvegicus NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog (S. cerevisiae) (Nfu1), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183383769:183404239:1 gene:ENSRNOG00000018410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000055915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183389632:183467684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001005879 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamine fructose-6-phosphate transaminase 1 (Gfpt1), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000025070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183421403:183467041:1 gene:ENSRNOG00000018507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC083889 // GenBank // Rattus norvegicus glutamine fructose-6-phosphate transaminase 1, mRNA (cDNA clone MGC:95214 IMAGE:7132442), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000055915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183389632:183467684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT040006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT040004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1 /// NONRATT040007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NM_001039686 // RefSeq // Rattus norvegicus gastrokine 2 (Gkn2), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gastrokine 2 (Gkn2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006236825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gastrokine 2 (Gkn2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006236826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gastrokine 2 (Gkn2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183740289:183746373:1 gene:ENSRNOG00000009256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY943907 // GenBank // Rattus norvegicus blottin precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gastrokine 2 (Gkn2), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000055919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183733292:183746238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT040008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001031824 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 10 (Bmp10), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006236835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 10 (Bmp10), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183788758:183793766:1 gene:ENSRNOG00000009316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB158417 // GenBank // Rattus norvegicus Bmp10 mRNA for bone morphogenetic protein 10, complete cds, strain:F344/DuCrj. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AB158418 // GenBank // Rattus norvegicus Bmp10 mRNA for bone morphogenetic protein 10, complete cds, strain:LEC/Crj. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183788758:183793766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001163921 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand and coiled-coil domain containing 1 (Efcc1), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184885752:184913115:1 gene:ENSRNOG00000009787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184885680:184913115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001163921 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand and coiled-coil domain containing 1 (Efcc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184885752:184913115:1 gene:ENSRNOG00000009787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184885680:184913115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001031825 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein IX (platelet) (Gp9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184931999:184933334:1 gene:ENSRNOG00000010015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB158423 // GenBank // Rattus norvegicus Gp9 mRNA for glycoprotein 9, complete cds, strain:F344/DuCrj. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB158424 // GenBank // Rattus norvegicus Gp9 mRNA for glycoprotein 9, complete cds, strain:LEC/Crj. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184932894:184933334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT040028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001031822 // RefSeq // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit gamma 1 (Copg1), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185062828:185087265:1 gene:ENSRNOG00000010474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AB158425 // GenBank // Rattus norvegicus Copg mRNA for coatomer protein complex, subunit gamma, complete cds, strain:F344/DuCrj. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AB158426 // GenBank // Rattus norvegicus Copg mRNA for coatomer protein complex, subunit gamma, complete cds, strain:LEC/Crj. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC129074 // GenBank // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit gamma, mRNA (cDNA clone MGC:156513 IMAGE:7107382), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185064251:185111265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025047 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxymethylcytosine (hmC) binding, ES cell-specific (Hmces), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000057286 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:185089595:185111626:1 gene:ENSRNOG00000037738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FQ213680 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YG10 mRNA sequence. // chr4 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// GENSCAN00000008656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185064251:185111265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT040036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT040035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1
NM_033442 // RefSeq // Rattus norvegicus GATA binding protein 2 (Gata2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185375167:185383942:1 gene:ENSRNOG00000012347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB102789 // GenBank // Rattus norvegicus Gata2 mRNA for GATA-binding protein 2, complete cds, strain:F344/DuCrj. // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AB102790 // GenBank // Rattus norvegicus Gata2 mRNA for GATA-binding protein 2, complete cds, strain:LEC/Crj. // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF345897 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor GATA-2 mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// AY032734 // GenBank // Rattus norvegicus GATA2 (Gata2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061745 // GenBank // Rattus norvegicus GATA binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72369 IMAGE:5599740), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ212304 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA61YA11 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185376578:185382417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT040041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001109248 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8 (Dnajb8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_353457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 8 (Dnajb8), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185398126:185399121:1 gene:ENSRNOG00000034088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185387439:185399034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_147177 // RefSeq // Rattus norvegicus RuvB-like AAA ATPase 1 (Ruvbl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000018339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185652325:185687382:1 gene:ENSRNOG00000013195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB001581 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DNA helicase p50, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// AB002406 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TIP49, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC072511 // GenBank // Rattus norvegicus RuvB-like 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:91456 IMAGE:7104777), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC086531 // GenBank // Rattus norvegicus RuvB-like 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:105307 IMAGE:7304521), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185660150:185687205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT040047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_138502 // RefSeq // Rattus norvegicus monoglyceride lipase (Mgll), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185912083:186013125:1 gene:ENSRNOG00000014508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY081195 // GenBank // Rattus norvegicus monoglyceride lipase (Mgl2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC107920 // GenBank // Rattus norvegicus monoglyceride lipase, mRNA (cDNA clone MGC:124942 IMAGE:7446100), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ227013 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YJ14 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT040049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185895273:186012574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT040052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_053534 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein, adipocyte asscociated 1 (Tpra1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein, adipocyte asscociated 1 (Tpra1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186084105:186095214:1 gene:ENSRNOG00000016665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ228747 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YD11 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF292116 // GenBank // Rattus norvegicus TPRA40 protein mRNA, complete cds. // chr4 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186090347:186094907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT040056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT040058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT040061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
XM_001064548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685621 (LOC685621), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_002726411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685621 (LOC685621), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039058 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:186286193:186292576:1 gene:ENSRNOG00000026675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186279574:186292576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001106609 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin reductase 3 (Txnrd3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_001184712 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin reductase 3 (Txnrd3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184220133:184280633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// NONRATT040014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
GENSCAN00000001450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184298502:184301206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001008968 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 92 (Vom1r92), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184381495:184382421:1 gene:ENSRNOG00000030117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY510279 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rb6 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184382017:184382390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT040016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001008971 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 93 (Vom1r93), mRNA. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000023849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184392032:184399439:1 gene:ENSRNOG00000017735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY510293 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rb5 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// U36896 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor VN4 mRNA, complete cds. // chr4 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// NONRATT040017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184398861:184466379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001008927 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 96 (Vom1r96), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184488792:184489751:1 gene:ENSRNOG00000032691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510296 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rb14 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173297 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 97 (Vom1r97), mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184517396:184518328:1 gene:ENSRNOG00000030026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// AY510281 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rb12 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// U36897 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor VN5, complete cds. // chr4 // 88 // 74 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT040019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
NM_001008948 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 98 (Vom1r98), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184530456:184531400:1 gene:ENSRNOG00000026073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510365 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1ra8 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173296 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 100 (Vom1r100), mRNA. // chr4 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184623838:184626267:1 gene:ENSRNOG00000047408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// AY510294 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1ra12 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// U36895 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor VN3 mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT040021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_001167553 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 103 (Vom1r103), mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// NM_173113 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 105 (Vom1r105), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000052101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186665286:186672513:1 gene:ENSRNOG00000049645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// U36785 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor VN1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT040064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
U36899 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor VN2 mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0
NM_173298 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 102 (Vom1r102), mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// AY510305 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1ra15 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// U36899 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor VN2 mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT040022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
NM_001166761 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 104 (Vom1r104), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000049591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186710385:186711350:1 gene:ENSRNOG00000031140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186532797:186765061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT040064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001109489 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685964 (LOC685964), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685964 (LOC685964), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006236881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685964 (LOC685964), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000030426 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:186758874:186763368:1 gene:ENSRNOG00000025934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186532797:186765061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSRNOT00000024295 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:186786154:186816038:1 gene:ENSRNOG00000043404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000038244 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:186823293:186853893:1 gene:ENSRNOG00000025818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000038251 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:186786154:186816038:1 gene:ENSRNOG00000043404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// XM_001066120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus urocanate hydratase 1 (Uroc1), mRNA. // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// XM_002729395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ZXD family zinc finger C (Zxdc), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// XM_006225014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus urocanate hydratase 1 (Uroc1), mRNA. // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186782989:186853893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT040070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_053536 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 15 (Klf15), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186906050:186918645:1 gene:ENSRNOG00000017808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB020759 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Kruppel-like transcription factor, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB102791 // GenBank // Rattus norvegicus Klf15 mRNA for Kruppel-like factor 15, complete cds, strain:F344/DuCrj. // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AB102792 // GenBank // Rattus norvegicus Klf15 mRNA for Kruppel-like factor 15, complete cds, strain:LEC/Crj. // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// BC089782 // GenBank // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 15, mRNA (cDNA clone MGC:108619 IMAGE:7325036), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186909873:186917714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT040076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001008927 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 96 (Vom1r96), mRNA. // chr4 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184488792:184489751:1 gene:ENSRNOG00000032691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// AY510296 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rb14 mRNA, complete cds. // chr4 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// NM_173297 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 97 (Vom1r97), mRNA. // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000043496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184517396:184518328:1 gene:ENSRNOG00000030026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// AY510281 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rb12 mRNA, complete cds. // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000026000 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:186725800:186726991:-1 gene:ENSRNOG00000019158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT040018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// NONRATT040019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001106610 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 11 (Hdac11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase 11 (Hdac11), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:187747332:187764590:-1 gene:ENSRNOG00000006824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166430 // GenBank // Rattus norvegicus histone deacetylase 11, mRNA (cDNA clone MGC:187453 IMAGE:7131565), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase 11 (Hdac11), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:187748729:187769762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000009696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:187651235:187690477:-1 gene:ENSRNOG00000007338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000037256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:187651235:187690477:-1 gene:ENSRNOG00000007338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB074423 // GenBank // Rattus norvegicus fib-2 mRNA for fibulin-2, partial cds. // chr4 // 85 // 38 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:187559537:187690477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT041755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT041756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001007745 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 43 (Tmem43), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:187412093:187427232:-1 gene:ENSRNOG00000007519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083626 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:94413 IMAGE:7134239), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ221746 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YF20 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:187413660:187427147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106611 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM3 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:187377370:187383614:-1 gene:ENSRNOG00000008733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ222680 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YF10 mRNA sequence. // chr4 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT041751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_017206 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 6 (Slc6a6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 6 (Slc6a6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 6 (Slc6a6), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:188176251:188245992:-1 gene:ENSRNOG00000009019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M96601 // GenBank // Rattus norvegicus taurine transporter mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:188172757:188193400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT041768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001009659 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 174 (Ccdc174), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:189474031:189501549:-1 gene:ENSRNOG00000010090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC087050 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C130022K22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:93974 IMAGE:7114831), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:189385078:189501477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT041787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001134623 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to chromosome 3 open reading frame 20 (RGD1560289), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:189423813:189460874:-1 gene:ENSRNOG00000022155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:189385078:189501477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT041783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_006224993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5 (Fgd5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000051022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:189299931:189387281:-1 gene:ENSRNOG00000010213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000072925 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:189299931:189387281:-1 gene:ENSRNOG00000010213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000036665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:189232018:189374459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1 /// NONRATT041778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 76 // 76 // 34 // 45 // 1
XM_006224993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 5 (Fgd5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017323 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 2, group C, member 2 (Nr2c2), mRNA. // chr4 // 84 // 94 // 27 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:189231911:189256038:-1 gene:ENSRNOG00000010536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// L27513 // GenBank // Rat TR4 orphan receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 84 // 94 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:189232018:189374459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT041777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XR_345991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554570 (LOC102554570), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001108638 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (S-adenosylmethionine carrier), member 26 (Slc25a26), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:191036169:191129236:1 gene:ENSRNOG00000012831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001109250 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 8 (Kbtbd8), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000017889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:191675891:191687447:1 gene:ENSRNOG00000013390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// BC160902 // GenBank // Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:188628 IMAGE:7454217), complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:191652926:191685787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000033831 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:191837412:191842477:1 gene:ENSRNOG00000021926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000039555 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:191837412:191838622:1 gene:ENSRNOG00000021926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:191829977:191842405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_023972 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 5 (Arl6ip5), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:194077679:194100520:1 gene:ENSRNOG00000006818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF240182 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate transporter EAAC1 interacting protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC061548 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation-like factor 6 interacting protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:72809 IMAGE:6922366), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ228780 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YN09 mRNA sequence. // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// FQ218920 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YB17 mRNA sequence. // chr4 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:194061208:194105302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// FQ233065 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YF16 mRNA sequence. // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// FQ233160 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YP11 mRNA sequence. // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001191089 // RefSeq // Rattus norvegicus microphthalmia-associated transcription factor (Mitf), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000051121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:194667979:194918737:1 gene:ENSRNOG00000008658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF029886 // GenBank // Rattus norvegicus microphthalmia associated transcription factor (microphthalmia) mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000040887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:194884108:194918294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT040124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT040125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_023099 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 27 (Gpr27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:196629031:196630164:1 gene:ENSRNOG00000010880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB040802 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SREB1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:196629031:196630164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047956 // RefSeq // Rattus norvegicus 796 (LOC500270), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:196632040:196642981:1 gene:ENSRNOG00000030004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:196632845:196642981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000034844 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:197620974:197622075:1 gene:ENSRNOG00000024816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
XM_001066466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucoside xylosyltransferase 2 (Gxylt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003753928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucoside xylosyltransferase 2 (Gxylt2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007419 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:197660979:197744356:1 gene:ENSRNOG00000005621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:197660513:197744356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
GENSCAN00000023546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:197660513:197744356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NONRATT040131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106613 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 4, regulatory subunit 2 (Ppp4r2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:197767067:197805270:1 gene:ENSRNOG00000024647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC167050 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 4, regulatory subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:189338 IMAGE:7114402), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:197767289:197801886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
ENSRNOT00000031255 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:199461638:199462167:1 gene:ENSRNOG00000024386 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 77 // 96 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054565 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:4:199462077:199462185:1 gene:ENSRNOG00000036454 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:199394378:199467592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_013225 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin 6 (Cntn6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000051645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:201062012:201373876:1 gene:ENSRNOG00000032517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// D87248 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NB-3, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000025817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:201057064:201372855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1
NM_053879 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin 4 (Cntn4), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006236980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus contactin 4 (Cntn4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006236983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus contactin 4 (Cntn4), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000007788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:202737092:203254911:1 gene:ENSRNOG00000005652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U35371 // GenBank // Rattus norvegicus neural cell adhesion protein BIG-2 precursor (BIG-2) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:203225294:203253801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT040139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001024261 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1 (Trnt1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000008526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:203326023:203339605:1 gene:ENSRNOG00000006432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC095841 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1, mRNA (cDNA clone MGC:112668 IMAGE:7387807), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC105612 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1, mRNA (cDNA clone MGC:124985 IMAGE:7135310), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001037363 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat neuronal 1 (Lrrn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:204141294:204144345:1 gene:ENSRNOG00000006802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107902 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat neuronal 1, mRNA (cDNA clone MGC:124972 IMAGE:7109029), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:204141371:204143521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025048 // RefSeq // Rattus norvegicus SET domain without mariner transposase fusion (Setmar), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain without mariner transposase fusion (Setmar), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:204560093:204571717:1 gene:ENSRNOG00000006806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088181 // GenBank // Rattus norvegicus SET domain and mariner transposase fusion gene, mRNA (cDNA clone MGC:108826 IMAGE:7364937), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:204568474:204632094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_053328 // RefSeq // Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member e40 (Bhlhe40), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:205170129:205175829:1 gene:ENSRNOG00000007152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF009330 // GenBank // Rattus norvegicus enhancer-of-split and hairy-related protein 2 (SHARP-2) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:205134844:205175008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT040155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001024332 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 8B (Arl8b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:217450494:217494706:1 gene:ENSRNOG00000007312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081947 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 8B, mRNA (cDNA clone MGC:94020 IMAGE:7121584), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:217450677:217492814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT040344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT040343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_001075943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 1 (Edem1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_238366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 1 (Edem1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010810 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:217499573:217528646:1 gene:ENSRNOG00000007944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000075308 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:217499573:217523980:1 gene:ENSRNOG00000007944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:217499573:217528646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_031040 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 7 (Grm7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000056570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:206090084:206680107:1 gene:ENSRNOG00000005662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// D16817 // GenBank // Rattus norvegicus mGluR7 mRNA for metabotropic glutamate receptor, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U06832 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley metabotropic glutamate receptor 7 (MGLUR7) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT040160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001008562 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM and cysteine-rich domains 1 (Lmcd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:207494655:207554217:1 gene:ENSRNOG00000005690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079071 // GenBank // Rattus norvegicus LIM and cysteine-rich domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:94025 IMAGE:7121826), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:207526253:207553763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_019155 // RefSeq // Rattus norvegicus caveolin 3 (Cav3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:207683202:207699174:1 gene:ENSRNOG00000005798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC084692 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin 3, mRNA (cDNA clone MGC:105449 IMAGE:7103841), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214918 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YI08 mRNA sequence. // chr4 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0 /// U31968 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin-3 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT040165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:207634577:207698412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001170546 // RefSeq // Rattus norvegicus THUMP domain containing 3 (Thumpd3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001170547 // RefSeq // Rattus norvegicus THUMP domain containing 3 (Thumpd3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NM_001170548 // RefSeq // Rattus norvegicus THUMP domain containing 3 (Thumpd3), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000009464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208284225:208307188:1 gene:ENSRNOG00000006941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC166466 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9035087. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NONRATT040168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001106614 // RefSeq // Rattus norvegicus SET domain containing 5 (Setd5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006237013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain containing 5 (Setd5), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000066723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208315965:208393602:1 gene:ENSRNOG00000007472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000044442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208347913:208364423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208370573:208415204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT040172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT040174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001107880 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 14 (Mtmr14), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006237025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 14 (Mtmr14), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000010723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208492229:208535256:1 gene:ENSRNOG00000007881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000050186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208492345:208534663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT040180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT040181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001024982 // RefSeq // Rattus norvegicus copine family member IX (Cpne9), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_006237022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine family member IX (Cpne9), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000067396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208536106:208559592:1 gene:ENSRNOG00000023077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// BC091347 // GenBank // Rattus norvegicus copine family member IX, mRNA (cDNA clone MGC:109370 IMAGE:7316601), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000050201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208536193:208559384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT040185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT040186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
NM_001191572 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain and PHD finger containing, 1 (Brpf1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208561603:208578030:1 gene:ENSRNOG00000008142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000050179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208563860:208586281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT040188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT040189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_030870 // RefSeq // Rattus norvegicus 8-oxoguanine DNA glycosylase (Ogg1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208580193:208586457:1 gene:ENSRNOG00000008522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AF029690 // GenBank // Rattus norvegicus 8-oxoguanine-DNA-glycosylase (rogg1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166807 // GenBank // Rattus norvegicus 8-oxoguanine DNA glycosylase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7320288), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208563860:208586281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT040193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001106615 // RefSeq // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 4 (Arpc4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208627502:208638029:1 gene:ENSRNOG00000008994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC167049 // GenBank // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:189336 IMAGE:7442696), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208629099:208637312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108640 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 3 (Ttll3), mRNA. // chr4 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208639199:208662542:1 gene:ENSRNOG00000009032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208641149:208662964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT040197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001004091 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17 receptor E (Il17re), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000056508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208711257:208723904:1 gene:ENSRNOG00000009204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC078742 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 17 receptor E, mRNA (cDNA clone MGC:93201 IMAGE:7123764), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// AF456232 // GenBank // Rattus norvegicus MK1 mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 79 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT040202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000050195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208697411:208723282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1
NM_001170565 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17 receptor C (Il17rc), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000037788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208724712:208737142:1 gene:ENSRNOG00000027376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000050194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208724891:208737060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 81 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT040204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1 /// NONRATT040205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// NONRATT040206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// NONRATT040203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001024783 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich with EGF-like domains 1 (Creld1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine-rich with EGF-like domains 1 (Creld1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000013052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208737583:208747189:1 gene:ENSRNOG00000009414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC097951 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich with EGF-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:116074 IMAGE:7442421), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208737924:208746751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC085830 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7134196, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT040210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001001719 // RefSeq // Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group D2 (Fancd2), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000033580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208787164:208847877:1 gene:ENSRNOG00000024475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// AY621075 // GenBank // Rattus norvegicus Fanconi anemia D2 protein (Fancd2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000050204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208784474:208847877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT040212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// NONRATT040214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
NM_001195476 // RefSeq // Rattus norvegicus BRICK1, SCAR/WAVE actin-nucleating complex subunit (Brk1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208855604:208870836:1 gene:ENSRNOG00000010184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213578 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YP18 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ223036 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YC13 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ231993 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YG15 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208855625:208856140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT040216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208869662:208882104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_052801 // RefSeq // Rattus norvegicus von Hippel-Lindau tumor suppressor, E3 ubiquitin protein ligase (Vhl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208877266:208884234:1 gene:ENSRNOG00000010258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U14746 // GenBank // Rattus norvegicus VHL protein (VHL) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208869662:208882104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT040218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001025422 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-associated kinase 2 (Irak2), mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// NM_001109252 // RefSeq // Rattus norvegicus TatD DNase domain containing 2 (Tatdn2), mRNA. // chr4 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000029819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208890974:208947452:1 gene:ENSRNOG00000021817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208950001:208965742:1 gene:ENSRNOG00000042482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// BC098060 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-associated kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:116221 IMAGE:7458113), complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208891009:208964855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT040221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 65 // 30 // 46 // 1 /// NONRATT040224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1
NM_024372 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 11 (Slc6a11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:209399630:209516970:1 gene:ENSRNOG00000005697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M95738 // GenBank // Rattus norvegicus (clone pGAT-B) beta-alanine-sensitive neuronal GABA transporter mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// M95763 // GenBank // Rattus norvegicus GABA transporter GAT-3 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:209479603:209516807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:209399645:209472636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_024371 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 1 (Slc6a1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 1 (Slc6a1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:209570471:209585792:1 gene:ENSRNOG00000006527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M59742 // GenBank // Rat GABA transporter protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:209530107:209583688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_017018 // RefSeq // Rattus norvegicus histamine receptor H 1 (Hrh1), mRNA. // chr4 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_006237006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histamine receptor H 1 (Hrh1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:209749004:209750533:1 gene:ENSRNOG00000007420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:209668334:209750498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF387882 // GenBank // Rattus norvegicus strain BUF/Cr histamine receptor H1 mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// AF387883 // GenBank // Rattus norvegicus strain COP/Cr histamine receptor H1 mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// AF387884 // GenBank // Rattus norvegicus strain LeR histamine receptor H1 mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// AF387885 // GenBank // Rattus norvegicus strain Lew/Cr histamine receptor H1 mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// AF387886 // GenBank // Rattus norvegicus strain Noble/Cr histamine receptor H1 mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// AF387887 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/Cr histamine receptor H1 mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// AF387888 // GenBank // Rattus norvegicus strain WF/NCr histamine receptor H1 mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// AF387889 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY/Cr histamine receptor H1 mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0
NM_001012097 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 7 (Atg7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006237031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autophagy related 7 (Atg7), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006237033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autophagy related 7 (Atg7), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006237034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autophagy related 7 (Atg7), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:209889721:210066748:1 gene:ENSRNOG00000007486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC082059 // GenBank // Rattus norvegicus ATG7 autophagy related 7 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95213 IMAGE:7132421), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:209889736:209895696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000037620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:209916315:209956255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001034020 // RefSeq // Rattus norvegicus synapsin II (Syn2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 92 // 95 // 35 // 38 // 0 /// NM_019159 // RefSeq // Rattus norvegicus synapsin II (Syn2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 92 // 90 // 33 // 36 // 0 /// M27925 // GenBank // Rat synapsin 2a mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 95 // 35 // 38 // 0 /// M27926 // GenBank // Rat synapsin 2b mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 90 // 33 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210326340:210483842:1 gene:ENSRNOG00000008157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 93 // 37 // 40 // 1 /// GENSCAN00000045102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210434678:210444952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000045106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210453508:210483086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT040240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1
NM_001014057 // RefSeq // Rattus norvegicus TSEN2 tRNA splicing endonuclease subunit (Tsen2), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000056429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210742791:210778835:1 gene:ENSRNOG00000027158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC087631 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA splicing endonuclease 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105632 IMAGE:7319546), complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210701858:210778505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001008314 // RefSeq // Rattus norvegicus makorin, ring finger protein, 2 (Mkrn2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210801433:210819192:1 gene:ENSRNOG00000009176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083870 // GenBank // Rattus norvegicus makorin, ring finger protein, 2, mRNA (cDNA clone MGC:95133 IMAGE:7128406), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210801438:210818242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_181362 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin-associated and neddylation-dissociated 2 (putative) (Cand2), mRNA. // chr4 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210970266:210998144:1 gene:ENSRNOG00000010473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB029324 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TIP120-family protein TIP120B, complete cds. // chr4 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// AB029341 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TIP120-family protein TIP120B, alternatiely spliced form, complete cds. // chr4 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// AB029342 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TIP120-family protein TIP120B, short form, complete cds. // chr4 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210970266:210998144:1 gene:ENSRNOG00000010473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000037544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210970321:210997598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1 /// NONRATT040250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT040251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONRATT040252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
XM_006225020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 122 homolog (Chlamydomonas) (Ift122), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 122 homolog (Chlamydomonas) (Ift122), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211040406:211095866:1 gene:ENSRNOG00000010952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC087667 // GenBank // Rattus norvegicus intraflagellar transport 122 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:105616 IMAGE:7317105), complete cds. // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000037543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211045407:211110325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT040256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_033441 // RefSeq // Rattus norvegicus rhodopsin (Rho), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211115847:211121009:1 gene:ENSRNOG00000011144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211115930:211121818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT040260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109351 // RefSeq // Rattus norvegicus H1 histone family, member O, oocyte-specific (H1foo), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211128369:211133490:1 gene:ENSRNOG00000025251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211128407:211133378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031119 // RefSeq // Rattus norvegicus Sjogren syndrome antigen B (Ssb), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006234321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sjogren syndrome antigen B (Ssb), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62727509:62737009:1 gene:ENSRNOG00000007998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015427 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:211213267:211214475:1 gene:ENSRNOG00000011606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081780 // GenBank // Rattus norvegicus Sjogren syndrome antigen B, mRNA (cDNA clone MGC:93380 IMAGE:7192454), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC097252 // GenBank // Rattus norvegicus Sjogren syndrome antigen B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7458071), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62729110:62737092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211213267:211214475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT034934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT034935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT034937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_199207 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 21, member C (Fam21c), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214084983:214143362:1 gene:ENSRNOG00000011653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY257251 // GenBank // Rattus norvegicus NP61201 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214056690:214108385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000007998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214112239:214239652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_173332 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 4 (Zfand4), mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006237141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 4 (Zfand4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 4 (Zfand4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214154261:214214383:1 gene:ENSRNOG00000011791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AF315467 // GenBank // Rattus norvegicus RSD-7 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC078692 // GenBank // Rattus norvegicus AN1, ubiquitin-like, homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone IMAGE:7112281), complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC162051 // GenBank // Rattus norvegicus AN1, ubiquitin-like, homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:188031 IMAGE:7112072), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000007998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214112239:214239652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT040292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT040293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001107882 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 8, E3 ubiquitin protein ligase (March8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 8, E3 ubiquitin protein ligase (March8), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 8, E3 ubiquitin protein ligase (March8), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000017294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214232834:214345405:1 gene:ENSRNOG00000012297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214330573:214342252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000992 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 823 (Olr823), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214423986:214424912:1 gene:ENSRNOG00000013247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214423986:214424912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000905 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 824 (Olr824), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214460597:214461580:1 gene:ENSRNOG00000047994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000904 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 825 (Olr825), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214485503:214486486:1 gene:ENSRNOG00000048952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214485503:214532582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT040301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000903 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 826 (Olr826), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000047844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214505621:214506604:1 gene:ENSRNOG00000048404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214485503:214532582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT040302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000902 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 827 (Olr827), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000044870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214527379:214528362:1 gene:ENSRNOG00000050604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000991 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 828 (Olr828), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214561230:214562213:1 gene:ENSRNOG00000048689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214561173:214562213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000901 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 829 (Olr829), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214586687:214587670:1 gene:ENSRNOG00000048761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214566487:214587670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000900 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 830 (Olr830), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000017843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214602414:214603376:1 gene:ENSRNOG00000013367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000025338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214602438:214603376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001024334 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC6835 (LOC500300), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214721214:214723297:1 gene:ENSRNOG00000023465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY931022 // GenBank // Rattus norvegicus DEPP-like mRNA, complete cds. // chr4 // 75 // 64 // 12 // 16 // 0 /// FQ218823 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YL13 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ219011 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YG09 mRNA sequence. // chr4 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT040308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001134908 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 637 (Zfp637), mRNA. // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000038521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:215807099:215812034:1 gene:ENSRNOG00000023065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC158822 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 637, mRNA (cDNA clone MGC:188263 IMAGE:7376045), complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT040319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:215747627:215853778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XR_145959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909657 (LOC100909657), transcript variant 2, misc_RNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019504 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:215837491:215838096:1 gene:ENSRNOG00000014552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT040322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_006237210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RasGEF domain family, member 1A (Rasgef1a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RasGEF domain family, member 1A (Rasgef1a), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_232315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RasGEF domain family, member 1A (Rasgef1a), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216061395:216070484:1 gene:ENSRNOG00000031671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216061371:216070484:1 gene:ENSRNOG00000031671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_001077186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RasGEF domain family, member 1A (Rasgef1a), partial mRNA. // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000000664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:216036821:216070510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENSRNOT00000052259 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:216127595:216128056:1 gene:ENSRNOG00000030647 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000000634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:216127628:216128056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_001057512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus decapping mRNA 1B (Dcp1b), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_575654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus decapping mRNA 1B (Dcp1b), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009832 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:217165863:217200852:1 gene:ENSRNOG00000007340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:217165863:217291209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT040335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT040336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT040337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT040338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001191751 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, alpha 2/delta subunit 4 (Cacna2d4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000010746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:217213923:217324172:1 gene:ENSRNOG00000008031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:217165863:217291209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0
NM_001271276 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 14 (Fbxl14), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000000022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219073024:219074225:1 gene:ENSRNOG00000000021 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:79284367:79472300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 69 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219059306:219085523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0
XR_346083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552625 (LOC102552625), ncRNA. // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XR_353590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552625 (LOC102552625), ncRNA. // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000039752 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:219465345:219465772:1 gene:ENSRNOG00000028671 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT040350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001106617 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD52 homolog (S. cerevisiae) (Rad52), mRNA. // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// XM_006237234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD52 homolog (S. cerevisiae) (Rad52), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219523669:219536494:1 gene:ENSRNOG00000009742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT040352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219497232:219534896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSRNOT00000052241 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:219628736:219629134:1 gene:ENSRNOG00000029083 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219628769:219629134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_021595 // RefSeq // Rattus norvegicus ninjurin 2 (Ninj2), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006237276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ninjurin 2 (Ninj2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006237277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ninjurin 2 (Ninj2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000013721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219723675:219823286:1 gene:ENSRNOG00000010282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB040815 // GenBank // Rattus norvegicus Ninj2 mRNA for ninjurin2, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF250322 // GenBank // Rattus norvegicus ninjurin 2 (Ninj2) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT040356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219794974:219826281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001277177 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 5A (Kdm5a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_001277178 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 5A (Kdm5a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000056198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219981483:220015022:1 gene:ENSRNOG00000010591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// BC169044 // GenBank // Rattus norvegicus jumonji, AT rich interactive domain 1A (Rbp2 like), mRNA (cDNA clone MGC:189432 IMAGE:9034472), complete cds. // chr4 // 93 // 44 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000013036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219981125:220054347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT040359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT040362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107883 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17 receptor A (Il17ra), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000014885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220083472:220106001:1 gene:ENSRNOG00000011153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220083572:220104863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT040370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000054564 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:4:220187954:220188072:1 gene:ENSRNOG00000036453 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001044280 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (glutamate carrier), member 18 (Slc25a18), mRNA. // chr4 // 100 // 62 // 32 // 32 // 0 /// NM_001191977 // RefSeq // Rattus norvegicus cat eye syndrome chromosome region, candidate 2 (Cecr2), mRNA. // chr4 // 100 // 35 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000015499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220306982:220412138:1 gene:ENSRNOG00000011566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 35 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000015560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220420268:220440655:1 gene:ENSRNOG00000042731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 32 // 32 // 0 /// BC094517 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier), member 18, mRNA (cDNA clone MGC:105602 IMAGE:7314749), complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220363539:220439930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT040376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 33 // 52 // 1
NM_001107885 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-like 13 (apoptosis facilitator) (Bcl2l13), mRNA. // chr4 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220475338:220525622:1 gene:ENSRNOG00000012394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220472520:220526121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT040378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001014058 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 18 (Usp18), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220895597:220922138:1 gene:ENSRNOG00000037198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079101 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 18, mRNA (cDNA clone MGC:94088 IMAGE:7124857), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ233818 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YE11 mRNA sequence. // chr4 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220897475:220921855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_133623 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 13 (Slc6a13), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 13 (Slc6a13), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 13 (Slc6a13), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006237223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 13 (Slc6a13), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220964174:220999991:1 gene:ENSRNOG00000012876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// FQ210229 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA31YP04 mRNA sequence. // chr4 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// M95762 // GenBank // Rattus norvegicus GABA transporter GAT-2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220965595:221028872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT040386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_017335 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 12 (Slc6a12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:221009338:221029242:1 gene:ENSRNOG00000013547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// U28927 // GenBank // Rattus norvegicus liver Na+/Cl- betaine/GABA transporter mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220965595:221028872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_012488 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-2-macroglobulin (A2m), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000019346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:221393211:221442944:1 gene:ENSRNOG00000028896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC098922 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-2-macroglobulin, mRNA (cDNA clone MGC:114358 IMAGE:7458629), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ228339 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA9YJ21 mRNA sequence. // chr4 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// J02635 // GenBank // Rat liver alpha-2-macroglobulin mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000075799 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:221506328:221565692:1 gene:ENSRNOG00000045772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000045945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:221393274:221447331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000045970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:221506328:221560543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT040394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NM_001037975 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-1-inhibitor III (A1i3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000044408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:221588945:221648095:1 gene:ENSRNOG00000005599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// J03552 // GenBank // Rat plasma proteinase inhibitor alpha-1-inhibitor III mRNA, complete cds. // chr4 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000045997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:221588945:221650824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT040394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT040395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_023103 // RefSeq // Rattus norvegicus murinoglobulin 1 (Mug1), mRNA. // chr4 // 89 // 90 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000019969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:221759546:221812407:1 gene:ENSRNOG00000037188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000045980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:221759597:221813727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT040398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001002826 // RefSeq // Rattus norvegicus murinoglobulin 2 (Mug2), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000072465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:221300447:221378176:1 gene:ENSRNOG00000033245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0
NM_001007700 // RefSeq // Rattus norvegicus mannose-6-phosphate receptor, cation dependent (M6pr), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000020364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:88235941:88245064:-1 gene:ENSRNOG00000014992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000074291 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:222115904:222120215:1 gene:ENSRNOG00000050076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// BC079226 // GenBank // Rattus norvegicus mannose-6-phosphate receptor, cation dependent, mRNA (cDNA clone MGC:94300 IMAGE:7132318), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// FQ234966 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YP16 mRNA sequence. // chr4 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// GENSCAN00000003287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222098655:222120215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000010524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:88237190:88241501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT059881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT059882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
NM_001108644 // RefSeq // Rattus norvegicus microfibrillar associated protein 5 (Mfap5), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222339036:222361316:1 gene:ENSRNOG00000015505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// FQ229611 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YF09 mRNA sequence. // chr4 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT040400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222345170:222354965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001100779 // RefSeq // Rattus norvegicus activation-induced cytidine deaminase (aicda), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activation-induced cytidine deaminase (aicda), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activation-induced cytidine deaminase (aicda), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000020762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222384487:222394546:1 gene:ENSRNOG00000015478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222371905:222414547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001100781 // RefSeq // Rattus norvegicus Nanog homeobox (Nanog), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222552995:222560653:1 gene:ENSRNOG00000008368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB275459 // GenBank // Rattus norvegicus Nanog mRNA for Nanog, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222553198:222559437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT040404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109352 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box J2 (Foxj2), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box J2 (Foxj2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222674597:222700672:1 gene:ENSRNOG00000009000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222623915:222698228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001029919 // RefSeq // Rattus norvegicus NECAP endocytosis associated 1 (Necap1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222730478:222745559:1 gene:ENSRNOG00000009236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097496 // GenBank // Rattus norvegicus NECAP endocytosis associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:114570 IMAGE:7461823), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222730497:222762014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT040408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001005890 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member A1 (Clec4a1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222969397:222981511:-1 gene:ENSRNOG00000042139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY397672 // GenBank // Rattus norvegicus dendritic cell inhibitory receptor 4 (Dcir4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// AY494063 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA dendritic cell inhibitory receptor 4 (Dcir4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC098830 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member a1, mRNA (cDNA clone MGC:112884 IMAGE:7378545), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_001005891 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member A3 (Clec4a3), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006237321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member A3 (Clec4a3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222933146:222943344:-1 gene:ENSRNOG00000010018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY397671 // GenBank // Rattus norvegicus dendritic cell inhibitory receptor 3 (Dcir3) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// AY494062 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA dendritic cell inhibitory receptor 3 (Dcir3) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// FQ234061 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YF04 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT042137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222880432:223012502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001005880 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member A2 (Clec4a2), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222810976:222885995:-1 gene:ENSRNOG00000030012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY397670 // GenBank // Rattus norvegicus dendritic cell inhibitory receptor 2 (Dcir2) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AY494061 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA dendritic cell inhibitory receptor 2 (Dcir2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY581052 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW dendritic cell inhibitory receptor 2 (Dcir2) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT042136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222773213:222823066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001005899 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member A (Clec4a), mRNA. // chr4 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// XM_006237324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member A (Clec4a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223068541:223086020:1 gene:ENSRNOG00000010045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY363176 // GenBank // Rattus norvegicus dendritic cell inhibitory receptor (Clecsf6) mRNA, complete cds. // chr4 // 81 // 87 // 21 // 26 // 0 /// AY494060 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA dendritic cell inhibitory receptor 1 (Dcir1) mRNA, complete cds. // chr4 // 81 // 87 // 21 // 26 // 0 /// AY581051 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW dendritic cell inhibitory receptor 1 (Dcir1) mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT040410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223066845:223289688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
ENSRNOT00000038297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223124392:223147898:1 gene:ENSRNOG00000027655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001005896 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member B2 (Clec4b2), mRNA. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// AY365132 // GenBank // Rattus norvegicus antigen presenting cell lectin-like receptor A1 (Aplra1) mRNA, complete cds. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// AY494066 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA truncated antigen presenting cell lectin-like receptor A1 (Aplra1) mRNA, complete cds. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// AY581050 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW antigen presenting cell lectin-like receptor A1 (Aplra1) mRNA, complete cds. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT040412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT040413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223066845:223289688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000013330 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:223202952:223236018:1 gene:ENSRNOG00000010057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067105 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:223204818:223236018:1 gene:ENSRNOG00000010057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000068661 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:223202952:223236018:1 gene:ENSRNOG00000010057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NONRATT040414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223066845:223289688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_001003707 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member D (Clec4d), mRNA. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223270168:223279220:1 gene:ENSRNOG00000010181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071095 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:223270168:223282584:1 gene:ENSRNOG00000010181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY339882 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage C-type lectin (Clecsf8) mRNA, complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// AY494065 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA macrophage C-type lectin (Clecsf8) mRNA, complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT040415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223066845:223289688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001099514 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 48 (Vom2r48), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223341786:223383441:1 gene:ENSRNOG00000028538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223366841:223383441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT040416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001099515 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 49 (Vom2r49), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000049498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:66337127:66379765:-1 gene:ENSRNOG00000050003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:66359693:66448874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_001099507 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 50 (Vom2r50), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223498145:223520517:1 gene:ENSRNOG00000049200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223499621:223520517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001107887 // RefSeq // Rattus norvegicus CD163 molecule (Cd163), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD163 molecule (Cd163), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223769351:223802725:1 gene:ENSRNOG00000010253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223755788:223798290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001002804 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, r subcomponent-like (C1rl), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224126653:224141154:1 gene:ENSRNOG00000011718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224109552:224154828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT040422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001134555 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, r subcomponent (C1r), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224144564:224154807:1 gene:ENSRNOG00000011796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC168673 // GenBank // Rattus norvegicus complement component 1, r subcomponent, mRNA (cDNA clone MGC:188466 IMAGE:7937381), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224109552:224154828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001012189 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidylcholine acyltransferase 3 (Lpcat3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224199925:224240592:1 gene:ENSRNOG00000012269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089869 // GenBank // Rattus norvegicus lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:108998 IMAGE:7324068), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224199975:224239659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013035 // RefSeq // Rattus norvegicus prohibitin 2 (Phb2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224248364:224252647:1 gene:ENSRNOG00000012999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC083705 // GenBank // Rattus norvegicus prohibitin 2, mRNA (cDNA clone MGC:94585 IMAGE:7190294), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224247983:224252647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// NONRATT040429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NONRATT040427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT040428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT040429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001009660 // RefSeq // Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 2 (Spsb2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_003750655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPRY domain-containing SOCS box protein 2-like (LOC100911548), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 2 (Spsb2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000020493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224344323:224345975:1 gene:ENSRNOG00000015125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:19093465:19094505:-1 gene:ENSRNOG00000047113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC088189 // GenBank // Rattus norvegicus splA/ryanodine receptor domain and SOCS box containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:108858 IMAGE:7371446), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224327626:224345764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19093465:19111603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001007648 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle associated 3 (Cdca3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006237342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle associated 3 (Cdca3), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000020803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224365696:224369280:1 gene:ENSRNOG00000015529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC079204 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle associated 3, mRNA (cDNA clone MGC:94266 IMAGE:7131776), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006237339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle associated 3 (Cdca3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 85 // 85 // 11 // 13 // 1 /// FQ235136 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YF08 mRNA sequence. // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// NONRATT040431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1 /// NONRATT040432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
XR_346097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557141 (LOC102557141), ncRNA. // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// XR_353609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553981 (LOC102553981), transcript variant X1, ncRNA. // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001107889 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid leukemia factor 2 (Mlf2), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myeloid leukemia factor 2 (Mlf2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224470532:224475061:1 gene:ENSRNOG00000016589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ211683 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA83YJ08 mRNA sequence. // chr4 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224470393:224474357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT040436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT040439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001014059 // RefSeq // Rattus norvegicus PILR alpha associated neural protein (Pianp), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224529480:224535510:1 gene:ENSRNOG00000017052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085924 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C530028O21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:94843 IMAGE:7109219), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224529468:224594667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001079887 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 4 (Ing4), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224572632:224581190:1 gene:ENSRNOG00000023363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC097942 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7383523. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC127511 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:156688 IMAGE:7376723), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224529468:224594667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT040453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT040455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT040456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT040457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT040458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001025049 // RefSeq // Rattus norvegicus acrosin binding protein (Acrbp), mRNA. // chr4 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acrosin binding protein (Acrbp), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000024618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224581828:224585861:1 gene:ENSRNOG00000017399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// BC079212 // GenBank // Rattus norvegicus acrosin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:94274 IMAGE:7131828), complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224529468:224594667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT040459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 67 // 31 // 46 // 1
ENSRNOT00000055970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224630792:224662765:1 gene:ENSRNOG00000018309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000002052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224623834:224662263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT040464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 25 // 42 // 1 /// NONRATT040461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT040465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_001191785 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP2 nucleolar protein (Nop2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224663955:224675686:1 gene:ENSRNOG00000018453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224664278:224675574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:108495404:108514164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 87 // 20 // 26 // 0 /// NONRATT040469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT040471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT040472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001108647 // RefSeq // Rattus norvegicus intermediate filament family orphan 1 (Iffo1), mRNA. // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224676331:224693515:1 gene:ENSRNOG00000018533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224675951:224692354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT040476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT040474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT040477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001106621 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L51 (Mrpl51), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_353598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L51 (Mrpl51), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224722975:224725933:1 gene:ENSRNOG00000019165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224723784:224724763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013090 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 1 (Vamp1), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224743851:224750439:1 gene:ENSRNOG00000019219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224743851:224748041:1 gene:ENSRNOG00000019219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// AF498262 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle associated membrane protein 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// BC092206 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105480 IMAGE:7313343), complete cds. // chr4 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// U74621 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein-1b (VAMP-1b) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// EF653274 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 1 (Vamp1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// M24104 // GenBank // Rat vesicle associated membrane protein (VAMP-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// EF653275 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 1 (Vamp1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT040480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_031548 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, non-voltage-gated 1 alpha subunit (Scnn1a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224853955:224877152:1 gene:ENSRNOG00000019368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC070902 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel, nonvoltage-gated, type I, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:91636 IMAGE:7100777), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// EU627515 // GenBank // Rattus norvegicus amiloride sensitive sodium channel alpha1 subunit (Scnn1a) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// U54699 // GenBank // Rattus norvegicus epithelial sodium channel alpha subunit (rEnaca) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U54700 // GenBank // Rattus norvegicus epithelial sodium channel alpha subunit (rEnaca) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224863482:224893595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT040486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_053889 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor (Vwf), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 50 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000026643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:225163215:225229122:1 gene:ENSRNOG00000019689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000074858 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:225100121:225138300:1 gene:ENSRNOG00000049795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 16 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000012207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:225130970:225314125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 40 // 58 // 1 /// NONRATT040494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 16 // 16 // 9 // 58 // 1
XM_003753944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 2-like (LOC100361584), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// XM_006225051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 2-like (LOC100361584), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000032112 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:225405108:225578879:1 gene:ENSRNOG00000023561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:225499329:225585884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// GENSCAN00000012200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:225323494:225355203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000030184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:225371308:225467337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001005557 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 3 (Akap3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232187482:232209492:-1 gene:ENSRNOG00000019783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081924 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:93915 IMAGE:7112940), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232187673:232198128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106623 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to DNA segment, Chr 6, Wayne State University 163, expressed (RGD1311164), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232097436:232130662:-1 gene:ENSRNOG00000019808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232094840:232131113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_131908 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 6 (Fgf6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232040999:232049534:-1 gene:ENSRNOG00000019836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB079674 // GenBank // Rattus norvegicus FGF6 mRNA for fibroblast growth factor, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232037368:232057232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT042298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130754 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 23 (Fgf23), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:231971932:231990610:-1 gene:ENSRNOG00000019855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB078777 // GenBank // Rattus norvegicus FGF23 mRNA for fibroblast growth factor 23, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231971932:231990610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 11 (Parp11), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_575674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 11 (Parp11), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027092 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:231553882:231572522:-1 gene:ENSRNOG00000020002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 11 (Parp11), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000039387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231553882:231626636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENSRNOT00000035938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:231419057:231444798:-1 gene:ENSRNOG00000025874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// XM_006225056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// XM_006225059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// XM_006237505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// XM_006237506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// XM_006237509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000039383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231367632:231455009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006225056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// XM_006237509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 4B (Efcab4b), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000035706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:231381726:231399703:-1 gene:ENSRNOG00000025751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231367632:231455009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001024262 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 11 (Tspan11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:231093059:231159271:-1 gene:ENSRNOG00000005188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092652 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 11, mRNA (cDNA clone MGC:109445 IMAGE:7320221), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231091523:231113515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_031633 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box M1 (Foxm1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000008003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226891344:226902363:1 gene:ENSRNOG00000005936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000008012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226891344:226902363:1 gene:ENSRNOG00000005936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226891344:226902363:1 gene:ENSRNOG00000005936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// U83112 // GenBank // Rattus norvegicus INS-1 winged helix mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226893469:226901376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT040501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT040502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
ENSRNOT00000008196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226926042:226934389:1 gene:ENSRNOG00000042939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000055886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226926042:226934733:1 gene:ENSRNOG00000042939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000055889 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:226902964:226911231:1 gene:ENSRNOG00000028279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// XM_006225069 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor interacting protein 2 (Nrip2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// XM_006237431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor interacting protein 2 (Nrip2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// XM_002729430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG30099-like (LOC100362909), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// XM_003753947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG30099-like (LOC100362909), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000024762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226904752:226911231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000024764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226916524:226934389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT040504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT040503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT040505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001024337 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to osteoclast inhibitory lectin (LOC500331), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227350266:227366539:1 gene:ENSRNOG00000030522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000049620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227279010:227288102:1 gene:ENSRNOG00000030823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// BC086997 // GenBank // Rattus norvegicus similar to osteoclast inhibitory lectin, mRNA (cDNA clone MGC:93238 IMAGE:7131139), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// XM_006237439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2 member D-related protein-like (LOC100910725), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
NM_130402 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member D (Clec2d), mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// XM_006237446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member D (Clec2d), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF321552 // GenBank // Rattus norvegicus osteoclast inhibitory lectin (Ocil) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// EF100688 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley CLEC2D5 (Clec2d5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000010098 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:227490523:227607361:1 gene:ENSRNOG00000048726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT040511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
NM_001085404 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2 member D-like 1 (Clec2dl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000047790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227592944:227600322:1 gene:ENSRNOG00000007866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// EF100689 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley CLEC2D6 (Clec2d6) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FJ404471 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2 member d6 (Clec2d6) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:227557223:227599034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_006225072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to osteoclast inhibitory lectin (LOC689800), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// EU128749 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin-related protein 7 (Clr7) mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001085403 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1C (Klrb1c), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227740338:227751968:1 gene:ENSRNOG00000007811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// EF100679 // GenBank // Rattus norvegicus strain WAG NKR-P1F (Klrb1c) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// EF100685 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley NKR-P1F (Klrb1c) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// X97477 // GenBank // R.norvegicus mRNA for NKR-P1B protein. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001085405 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily B, member 1 (Klrb1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211418707:211437402:1 gene:ENSRNOG00000031072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ113420 // GenBank // Rattus norvegicus natural killer lectin-like receptor protein 1 g (Nkrp1g) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ157011 // GenBank // Rattus norvegicus strain PVG immunoreceptor NKR-P1G (Nkrp1g) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ157012 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA immunoreceptor NKR-P1G (Nkrp1g) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// EF100680 // GenBank // Rattus norvegicus strain WAG NKR-P1G (Klrb1d) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211420605:211437756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001048075 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member G (Clec2g), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211578787:211587489:1 gene:ENSRNOG00000026511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// DQ168417 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW Ocil/Clrb-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// DQ168419 // GenBank // Rattus norvegicus strain WAG Ocil/Clrb-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// EF100690 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley CLEC2D11 (Clec2d11) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// EU128748 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin-related protein 11 (Clr11) mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// DQ168418 // GenBank // Rattus norvegicus strain TO Ocil/Clrb-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 50 // 92 // 12 // 24 // 0 /// XM_006237084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member G (Clec2g), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT040266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211581347:211598088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT040267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT040268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
FQ221495 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA35YH18 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT040268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001134716 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 12, member A (Clec12a), mRNA. // chrUn // 74 // 92 // 17 // 23 // 0 /// BC168186 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 12, member A, mRNA (cDNA clone MGC:187973 IMAGE:7100019), complete cds. // chrUn // 74 // 92 // 17 // 23 // 0 /// GU357484 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 12 member A mRNA, complete cds. // chrUn // 74 // 92 // 17 // 23 // 0
NM_001191978 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 1, member B (Clec1b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211806176:211814450:1 gene:ENSRNOG00000008107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211810774:211814382:1 gene:ENSRNOG00000008107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 48 // 9 // 12 // 0 /// FQ227184 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YJ10 mRNA sequence. // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// FQ227324 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YM06 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GU357482 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 1 member B mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT040271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211806395:211833694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001109354 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 9, member A (Clec9a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 9, member A (Clec9a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000055843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211818459:211833516:1 gene:ENSRNOG00000037069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GU357486 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 9 member A mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006237099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 9, member A (Clec9a), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT040273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211806395:211833694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001109560 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 52B (Tmem52b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 52B (Tmem52b), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211910993:211916188:1 gene:ENSRNOG00000008485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211911487:211934202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_001044294 // RefSeq // Rattus norvegicus GABA(A) receptor-associated protein like 1 (Gabarapl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211937460:211946619:1 gene:ENSRNOG00000008498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC105627 // GenBank // Rattus norvegicus GABA(A) receptor-associated protein like 1, mRNA (cDNA clone MGC:125167 IMAGE:7323087), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_181372 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, family E, member 1 (Klre1), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, family E, member 1 (Klre1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211991833:211997746:1 gene:ENSRNOG00000007961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF486185 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA KLRE1 short splice variant (Klre1) mRNA, Klre1-DA allele, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF486186 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA KLRE1 long splice variant (Klre1) mRNA, Klre1-DA allele, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF486187 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344 KLRE1 short splice variant (Klre1) mRNA, Klre1-F344 allele, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ221012 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YK12 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT040278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT040280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NONRATT040278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NONRATT040278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_012745 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily D, member 1 (Klrd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily D, member 1 (Klrd1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:212001272:212012720:1 gene:ENSRNOG00000043234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF009133 // GenBank // Rattus norvegicus CD94 (Cd94) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC086393 // GenBank // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:105493 IMAGE:7303354), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT040281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_006237459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690326 (LOC690326), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228296203:228301315:1 gene:ENSRNOG00000024508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC097487 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7460082. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228296246:228300478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT040517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_139184 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 21 (Prr21), mRNA. // chr4 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000063869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228606849:228611652:1 gene:ENSRNOG00000042164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// L08134 // GenBank // Rat proline-rich glycoprotein (sgp158) gene, complete cds. // chr4 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT040518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001013211 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich protein 2 (Prp2), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000007124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228642189:228644580:1 gene:ENSRNOG00000005379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT040519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000007139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228738622:228741215:1 gene:ENSRNOG00000005383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000045884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:228749426:228751540:1 gene:ENSRNOG00000028983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 83 // 71 // 20 // 24 // 0 /// M83567 // GenBank // Rat basic prolin-rich protein mRNA, 3 flank. // chrU // 64 // 82 // 18 // 28 // 0 /// NM_001024983 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1559532 (RGD1559532), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// NM_012632 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich protein 15 (Prp15), mRNA. // chrU // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000007119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228738622:228741215:1 gene:ENSRNOG00000005383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000057005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228738655:228741215:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000057009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228749426:228751540:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 83 // 71 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT040520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001080937 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 120 (Tas2r120), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229361929:229362816:1 gene:ENSRNOG00000021445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:229361929:229508238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001080938 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 124 (Tas2r124), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000030813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229440204:229441133:1 gene:ENSRNOG00000021430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_002729413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 145 (Tas2r145), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 145 (Tas2r145), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055734 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:229546512:229547444:1 gene:ENSRNOG00000037036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000075273 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:229747953:229749357:1 gene:ENSRNOG00000047309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ209596 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YK07 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_002729415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMR2 protein-like (LOC100363344), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_003753977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMR2 protein-like (LOC100363344), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046622 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:229880070:229882346:1 gene:ENSRNOG00000031330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:229858069:229882178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
ENSRNOT00000007826 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:230105498:230105847:1 gene:ENSRNOG00000005967 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:230082729:230129150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0
NM_001166678 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 136 (Tas2r136), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229507309:229508301:-1 gene:ENSRNOG00000029561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037353 // RefSeq // Rattus norvegicus ets variant 6 (Etv6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ets variant 6 (Etv6), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006237487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ets variant 6 (Etv6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000007889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:230278004:230512007:1 gene:ENSRNOG00000005984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105773 // GenBank // Rattus norvegicus ets variant 6, mRNA (cDNA clone MGC:124677 IMAGE:7930490), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:230458671:230518513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT040535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024338 // RefSeq // Rattus norvegicus Bcl2-like 14 (apoptosis facilitator) (Bcl2l14), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bcl2-like 14 (apoptosis facilitator) (Bcl2l14), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bcl2-like 14 (apoptosis facilitator) (Bcl2l14), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000032229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232426997:232465228:1 gene:ENSRNOG00000028632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC079010 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl2-like 14 (apoptosis facilitator), mRNA (cDNA clone MGC:93927 IMAGE:7113223), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232453862:232460578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT040568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108650 // RefSeq // Rattus norvegicus loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 1 (Loh12cr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 1 (Loh12cr1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000008645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232678816:232748292:1 gene:ENSRNOG00000006505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC160872 // GenBank // Rattus norvegicus loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 1 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:188238 IMAGE:7365768), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ211769 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YJ23 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus loss of heterozygosity, 12, chromosomal region 1 (Loh12cr1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// NONRATT040573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232694774:232744518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONRATT040572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// GENSCAN00000040516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232678927:232687183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_001015027 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein-like 2 (Crebl2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232891153:232893464:1 gene:ENSRNOG00000007115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC091323 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:109304 IMAGE:7313598), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AF015194 // GenBank // Rattus norvegicus P27kip1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AY623024 // GenBank // Rattus norvegicus clone E4-C cyclin kinase inhibitor (p27Kip1) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// D83792 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for p27, complete cds. // chr4 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// D86924 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for p27 kip1, complete cds. // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NM_031762 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 1B (Cdkn1b), mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000049848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232962327:232967128:1 gene:ENSRNOG00000007249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// AY623040 // GenBank // Rattus norvegicus clone E4-B cyclin dependent kinase inhibitor (p27Kip1) mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000053810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232939987:232963862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT040581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT040582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001003403 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein L domain containing 1 (Apold1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233025350:233028240:1 gene:ENSRNOG00000007830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY673969 // GenBank // Rattus norvegicus vascular early response gene protein (Verge) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001015005 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 47 (Ddx47), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233048048:233060507:1 gene:ENSRNOG00000007838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC091696 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 47, mRNA (cDNA clone MGC:105650 IMAGE:7301732), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233043796:233060164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT040588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001079890 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, class C, group 5, member A (Gprc5a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233105139:233123585:1 gene:ENSRNOG00000008412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086372 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:7125833), partial cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC128767 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member A, mRNA (cDNA clone MGC:156777 IMAGE:7124284), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233111769:233127040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108652 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein DKFZp761D0211 (RGD1306151), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein DKFZp761D0211 (RGD1306151), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233247179:233290087:1 gene:ENSRNOG00000008443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233247212:233290007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_012843 // RefSeq // Rattus norvegicus epithelial membrane protein 1 (Emp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233415324:233449254:1 gene:ENSRNOG00000008676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087031 // GenBank // Rattus norvegicus epithelial membrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93627 IMAGE:7192247), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233443143:233447591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT040596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001047957 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00139 (LOC500350), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:234608359:234640518:1 gene:ENSRNOG00000030158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT040597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075698 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:234605237:234606220:1 gene:ENSRNOG00000045774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_006225104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 7 interacting protein (Atf7ip), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// XM_006237573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 7 interacting protein (Atf7ip), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011803 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:234777034:234818058:1 gene:ENSRNOG00000008870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000055701 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:234803959:234818058:1 gene:ENSRNOG00000008870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000003170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234777034:234818058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT040599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// NONRATT040602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT040604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001109610 // RefSeq // Rattus norvegicus H2A histone family, member J (H2afj), mRNA. // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// XM_003749860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H2A.J-like (LOC100910152), mRNA. // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000044446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235025171:235025653:1 gene:ENSRNOG00000033045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000073287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:234409215:234409604:1 gene:ENSRNOG00000045819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// BC157816 // GenBank // Rattus norvegicus H2A histone family, member J, mRNA (cDNA clone MGC:187833 IMAGE:9034669), complete cds. // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000003177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234409215:234409604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000052453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235025205:235025594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
XM_006237567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to C030030A07Rik protein (LOC500354), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006237569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to C030030A07Rik protein (LOC500354), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000032568 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:235077941:235079342:1 gene:ENSRNOG00000027979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098929 // GenBank // Rattus norvegicus similar to C030030A07Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:114375 IMAGE:7133030), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083615 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7133780, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235078093:235078704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053688 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 6H, cGMP-specific, cone, gamma (Pde6h), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphodiesterase 6H, cGMP-specific, cone, gamma (Pde6h), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235214814:235219664:1 gene:ENSRNOG00000005947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF169390 // GenBank // Rattus norvegicus cone-like cGMP-phosphodiesterase 6 gamma subunit (cGMP-PDE6 gamma) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017336 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, O (Ptpro), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006237571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, O (Ptpro), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000040576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235508260:235718672:1 gene:ENSRNOG00000006231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D45412 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for brain-enriched membrane-associated protein tyrosine phosphatase (BSM)-1, partial cds. // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// U28938 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase D30 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235592385:235716632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001011969 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase receptor associated protein (Strap), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003749864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine-threonine kinase receptor-associated protein-like (LOC100910575), mRNA. // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235987501:236001739:1 gene:ENSRNOG00000007134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083714 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase receptor associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:94605 IMAGE:7190676), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:237365746:237375183:1 gene:ENSRNOG00000048985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT040613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235987289:236047965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:237365398:237395413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
ENSRNOT00000009998 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:236026964:236082651:1 gene:ENSRNOG00000007570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// FQ212862 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YP07 mRNA sequence. // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// FQ219539 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YJ17 mRNA sequence. // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT040614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT040615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235987289:236047965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_134349 // RefSeq // Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase 1 (Mgst1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:236372197:236387443:1 gene:ENSRNOG00000007743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC063150 // GenBank // Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:72699 IMAGE:6922267), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ179404 // GenBank // Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// FQ219464 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YB06 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// J03752 // GenBank // Rat glutathione S-transferase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT040618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:236354365:236387090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_053923 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase, catalytic subunit type 2 gamma (Pik3c2g), mRNA. // chr4 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:237973381:238354786:1 gene:ENSRNOG00000034228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AB009636 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphoinositide 3-kinase, complete cds. // chr4 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:238201581:238257748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_017164 // RefSeq // Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 3 (Capza3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:238434589:238435801:1 gene:ENSRNOG00000008727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078870 // GenBank // Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:93539 IMAGE:7133258), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:238433544:238458440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139340 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A member 5 (Plekha5), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000011770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:238925190:238962972:1 gene:ENSRNOG00000008747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000042291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:238838538:239007298:1 gene:ENSRNOG00000008747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AF468695 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositol 3-phosphate-binding protein-2-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 35 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:238925284:239002904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT040625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// NONRATT040627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// NONRATT040628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NONRATT040626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_006237594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AE binding protein 2 (Aebp2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AE binding protein 2 (Aebp2), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AE binding protein 2 (Aebp2), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001106626 // RefSeq // Rattus norvegicus AE binding protein 2 (Aebp2), mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000035507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:239043565:239094663:1 gene:ENSRNOG00000008929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:239032061:239072054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT040641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NONRATT040640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_017337 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 3A, cGMP inhibited (Pde3a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000032843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:239659270:239921900:1 gene:ENSRNOG00000025042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U38179 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic nucleotide phosphodiesterase (RNPDE3A) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:239898902:239921900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_053441 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1c1 (Slco1c1), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:239951726:239997943:1 gene:ENSRNOG00000009740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF306546 // GenBank // Rattus norvegicus blood-brain barrier specific anion transporter BSAT1 mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT040648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:239947150:240209038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_001270586 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1B2 (Slco1b2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_001270587 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1B2 (Slco1b2), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_031650 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1B2 (Slco1b2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000013409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240035323:240102727:1 gene:ENSRNOG00000030538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000013514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240035323:240102727:1 gene:ENSRNOG00000030538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// AF147740 // GenBank // Rattus norvegicus liver-specific organic anion transporter mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AF208545 // GenBank // Rattus norvegicus liver-specific organic anion transporter-1a mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF217450 // GenBank // Rattus norvegicus liver-specific organic anion transporter-1c mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT040650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000043646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:239947150:240209038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_012586 // RefSeq // Rattus norvegicus islet amyloid polypeptide (Iapp), mRNA. // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000016614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240724188:240729993:1 gene:ENSRNOG00000012417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J04544 // GenBank // Rat amylin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M25390 // GenBank // Rat islet amyloid polypeptide mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT040659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000000793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:240724563:240731957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001004234 // RefSeq // Rattus norvegicus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 (Pyroxd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1 (Pyroxd1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240779516:240795751:1 gene:ENSRNOG00000012472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079377 // GenBank // Rattus norvegicus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:94881 IMAGE:7110714), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:240779558:240795537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001113783 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi transport 1B (Golt1b), mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006237624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgi transport 1B (Golt1b), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000016937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240820452:240831667:1 gene:ENSRNOG00000012695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC158751 // GenBank // Rattus norvegicus golgi transport 1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187933 IMAGE:9102153), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT040668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000038661 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:240843585:240871585:1 gene:ENSRNOG00000028602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// AY383715 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00060 mRNA, complete cds. // chrU // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// NM_001083933 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691138 (LOC691138), mRNA. // chrU // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000073281 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:240843585:240849264:1 gene:ENSRNOG00000028602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000000799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:240843392:240848070:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001009419 // RefSeq // Rattus norvegicus cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase (Cmas), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241203361:241221675:1 gene:ENSRNOG00000013816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC087599 // GenBank // Rattus norvegicus cytidine monophosphate N-acetylneuraminic acid synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:105806 IMAGE:7313414), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ230721 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YF03 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:241203366:241224284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT040673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107894 // RefSeq // Rattus norvegicus ethanolamine kinase 1 (Etnk1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241606529:241650653:1 gene:ENSRNOG00000014856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:241602109:241645601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000029139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241839026:241840136:1 gene:ENSRNOG00000027943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:241761915:241840136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT040677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_006225123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphoid-restricted membrane protein (Lrmp), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006225125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphoid-restricted membrane protein (Lrmp), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006237674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphoid-restricted membrane protein (Lrmp), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000049474 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:243582231:243622022:1 gene:ENSRNOG00000029308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067506 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:243582249:243622022:1 gene:ENSRNOG00000029308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:243589137:243622022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1 /// NONRATT040680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT040682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1 /// NONRATT040683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1 /// NONRATT040684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
ENSRNOT00000021284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:243658583:243663698:1 gene:ENSRNOG00000015848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ215561 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YL24 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001024336 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, alpha 3B (Tuba3b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000052352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:244079934:244085481:1 gene:ENSRNOG00000032967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC079242 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, alpha 3B, mRNA (cDNA clone MGC:94324 IMAGE:7132665), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000051629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:244042655:244085392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT040691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001191753 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 8 (Rassf8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 8 (Rassf8), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 8 (Rassf8), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:244235300:244304646:1 gene:ENSRNOG00000015986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:244229243:244304646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT040694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001109255 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcospan (Sspn), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:244453710:244486642:1 gene:ENSRNOG00000001807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ217310 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA2YI10 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:244475079:244499984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_201421 // RefSeq // Rattus norvegicus FGFR1 oncogene partner 2 (Fgfr1op2), mRNA. // chr4 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245046889:245067828:1 gene:ENSRNOG00000001811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245046889:245067828:1 gene:ENSRNOG00000001811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY426739 // GenBank // Rattus norvegicus wound inducible transcript 3.0 alpha (Wit3.0) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// AY426740 // GenBank // Rattus norvegicus wound inducible transcript 3.0 beta (Wit3.0) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// BC087696 // GenBank // Rattus norvegicus FGFR1 oncogene partner 2, mRNA (cDNA clone MGC:105259 IMAGE:7312267), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245054438:245066065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT040698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1
NM_001107895 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 21 (Med21), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245120185:245126317:1 gene:ENSRNOG00000001820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT040702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245120219:245244164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT040701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001083336 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 38 like (Stk38l), mRNA. // chr4 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245208688:245245025:1 gene:ENSRNOG00000001828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// BC160812 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 38 like, mRNA (cDNA clone MGC:187219 IMAGE:7460150), complete cds. // chr4 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// EF444939 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 38-like (Stk38l) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245120219:245244164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT040706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_133391 // RefSeq // Rattus norvegicus aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like 2 (Arntl2), mRNA. // chr4 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// AY014837 // GenBank // Rattus norvegicus brain-muscle-ARNT-like protein 2b mRNA, partial cds; alternatively spliced. // chr4 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// AY014838 // GenBank // Rattus norvegicus brain-muscle-ARNT-like protein 2c mRNA, partial cds; alternatively spliced. // chr4 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// JQ361086 // GenBank // Rattus norvegicus brain and muscle Arnt-like protein 2 variant d (Bmal2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000055473 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:245261269:245310513:1 gene:ENSRNOG00000001830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000033754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245253619:245310513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
XM_003753960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361371 (LOC100361371), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361371 (LOC100361371), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034051 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:245395651:245418842:1 gene:ENSRNOG00000026883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245386301:245418842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245323376:245343053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_001107896 // RefSeq // Rattus norvegicus PTPRF interacting protein, binding protein 1 (liprin beta 1) (Ppfibp1), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PTPRF interacting protein, binding protein 1 (liprin beta 1) (Ppfibp1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006237679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PTPRF interacting protein, binding protein 1 (liprin beta 1) (Ppfibp1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000044147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245465652:245578035:1 gene:ENSRNOG00000031709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245522463:245576391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001109256 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB15 effector protein (Rep15), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245578542:245579615:1 gene:ENSRNOG00000001840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245578681:245579373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106628 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S35 (Mrps35), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245584690:245651496:1 gene:ENSRNOG00000001842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245590084:245613952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT040716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT040717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001109257 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family, member 42 (Klhl42), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000002523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245631025:245652794:1 gene:ENSRNOG00000001844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245645019:245651093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001014061 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 91 (Ccdc91), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006237685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 91 (Ccdc91), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// XM_006237686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 91 (Ccdc91), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000002527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:246022044:246189263:1 gene:ENSRNOG00000001847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC079135 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 91, mRNA (cDNA clone MGC:94147 IMAGE:7127603), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT040720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT040721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000033788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:246118212:246146417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 21 // 45 // 1
XM_001074438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acyl CoA reductase 2 (Far2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006225131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acyl CoA reductase 2 (Far2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006225132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acyl CoA reductase 2 (Far2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006225134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acyl CoA reductase 2 (Far2), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006237696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acyl CoA reductase 2 (Far2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006237697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acyl CoA reductase 2 (Far2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002528 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:246666586:246698258:1 gene:ENSRNOG00000001851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:246666586:246698934:1 gene:ENSRNOG00000001851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:246687546:246703489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000021718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:246620984:246678200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001109612 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S4, Y-linked 2 (Rps4y2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:246879802:246880735:1 gene:ENSRNOG00000031041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:246879856:246897477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009617 // RefSeq // Rattus norvegicus mesoderm specific transcript (Mest), mRNA. // chr4 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57816009:57821886:1 gene:ENSRNOG00000048088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// BC062800 // GenBank // Rattus norvegicus mesoderm specific transcript, mRNA (cDNA clone MGC:73011 IMAGE:6889877), complete cds. // chr4 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// NONRATT040725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57815987:57821795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 80 // 10 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:247746867:247790437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_198772 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 20 (Mettl20), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:247781172:247790913:1 gene:ENSRNOG00000036918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ231438 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YH20 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006237702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 20 (Mettl20), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT040726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT040727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT040728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:247746867:247790437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000055437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:248014738:248023483:1 gene:ENSRNOG00000036913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:248014738:248019036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT040735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006237713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinetochore-associated protein NSL1 homolog (LOC679582), partial mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000055436 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:248058534:248059374:1 gene:ENSRNOG00000036912 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0
NM_001108653 // RefSeq // Rattus norvegicus bicaudal D homolog 1 (Drosophila) (Bicd1), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:248136721:248283930:1 gene:ENSRNOG00000036911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:248227575:248337887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT040739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006225144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 729-like (LOC102547920), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006225144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 729-like (LOC102547920), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT040741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 75 // 13 // 24 // 0
NM_012589 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 6 (Il6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:3095536:3100112:1 gene:ENSRNOG00000010278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M26744 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 6 (IL6) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:3094779:3099767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_001013209 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 6 (Dnajb6), mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000035996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:2761869:2825295:1 gene:ENSRNOG00000010353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC078908 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:93667 IMAGE:7113862), complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT038912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT038913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
ENSRNOT00000015232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:2558988:2658633:1 gene:ENSRNOG00000010702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT038908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000020186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:2558448:2657851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 37 // 46 // 1 /// NONRATT038910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1
NONRATT038908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:2558448:2657851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001012095 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 32 (Rnf32), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:2108922:2122183:1 gene:ENSRNOG00000005691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000045086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:2109648:2122183:1 gene:ENSRNOG00000005691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC083635 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 32, mRNA (cDNA clone MGC:94450 IMAGE:7134691), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 32 (Rnf32), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// XM_006235856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 32 (Rnf32), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:2112712:2167780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT038904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT038905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000014357 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:1912567:1913658:1 gene:ENSRNOG00000010590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071168 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:1912600:1913658:1 gene:ENSRNOG00000010590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1901479:1913494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NONRATT038884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:567079:708782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001191859 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033377 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:587764:688265:1 gene:ENSRNOG00000006718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211558 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YH13 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:567079:708782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001191859 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033377 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:587764:688265:1 gene:ENSRNOG00000006718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211558 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YH13 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:567079:708782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001191859 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033377 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:587764:688265:1 gene:ENSRNOG00000006718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235848 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// XM_006235849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 33 (Rbm33), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000000834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:567079:708782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:850780:912838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001109214 // RefSeq // Rattus norvegicus engrailed homeobox 2 (En2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:433481:439314:1 gene:ENSRNOG00000006846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:433528:437627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000009233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:337380:345601:1 gene:ENSRNOG00000006859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC078827 // GenBank // Rattus norvegicus insulin induced gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:93442 IMAGE:7125208), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_022392 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin induced gene 1 (Insig1), mRNA. // chr4 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// L13619 // GenBank // Rattus norvegicus growth response protein (CL-6) mRNA, complete cds. // chr4 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// NONRATT038875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONRATT038877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0
NM_013148 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5A, G protein-coupled (Htr5a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235841 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5A, G protein-coupled (Htr5a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000009317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:193112:202795:1 gene:ENSRNOG00000007066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L10072 // GenBank // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine receptor (5HT5a) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:37089:202057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
M76427 // GenBank // Rattus norvegicus dipeptidyl aminopeptidase-related protein (dpp6) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NM_022850 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 6 (Dpp6), mRNA. // chr4 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// XM_006235879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 6 (Dpp6), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// XM_006235881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 6 (Dpp6), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000045773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:4062161:4724198:-1 gene:ENSRNOG00000030547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// M76426 // GenBank // Rattus norvegicus dipeptidyl aminopeptidase-related protein (dpp6) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000050464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:4062161:4077344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT040757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:4102648:4252984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001191860 // RefSeq // Rattus norvegicus ARP3 actin-related protein 3 homolog B (yeast) (Actr3b), mRNA. // chrU // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:5668135:5696597:1 gene:ENSRNOG00000031855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// XM_006235966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin-related protein 3B-like (LOC100910079), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:5661340:5696419:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT038922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT040766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000062053 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:6018627:6019984:-1 gene:ENSRNOG00000003548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000051374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6019718:6019984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001037794 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing TCP1, subunit 8 (theta)-like 1 (Cct8l1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6066975:6068660:-1 gene:ENSRNOG00000050369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000074846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6082936:6084621:-1 gene:ENSRNOG00000047114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC107458 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Gene model 443, mRNA (cDNA clone MGC:125233 IMAGE:7455506), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6066975:6084621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001271319 // RefSeq // Rattus norvegicus :polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 11 (Galnt11), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_199393 // RefSeq // Rattus norvegicus :polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 11 (Galnt11), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006235922 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 11 (GalNAc-T11) (Galnt11), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006235923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 11 (GalNAc-T11) (Galnt11), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6318189:6351691:-1 gene:ENSRNOG00000008117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC062004 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 11 (GalNAc-T11), mRNA (cDNA clone MGC:72620 IMAGE:5599809), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ223626 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA90YP22 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6317102:6338245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT040771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT040769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001025148 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 5 (Galntl5), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006235958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 5 (Galntl5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000062026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6353980:6469322:-1 gene:ENSRNOG00000040301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC078995 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:93899 IMAGE:7112721), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT040772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000051377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6447042:6487093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_001013925 // RefSeq // Rattus norvegicus negative regulator of ubiquitin-like proteins 1 (Nub1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6964481:6994708:-1 gene:ENSRNOG00000009282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC083586 // GenBank // Rattus norvegicus negative regulator of ubiquitin-like proteins 1, mRNA (cDNA clone MGC:94244 IMAGE:7131376), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6965088:6994700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT040782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
XM_001060681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Gpd1l protein (RGD1561560), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006224811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Gpd1l protein (RGD1561560), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Gpd1l protein (RGD1561560), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_578210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Gpd1l protein (RGD1561560), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032728 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:7064491:7065579:-1 gene:ENSRNOG00000025214 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7064461:7065641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT040785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001106574 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin polymerizing factor 2 (Chpf2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7120978:7126440:-1 gene:ENSRNOG00000010466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7121102:7125114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006235938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Agap3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NM_001108616 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Agap3), mRNA. // chr4 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000064386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7213697:7240039:-1 gene:ENSRNOG00000012764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// KF447874 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (AGAP3) mRNA, complete cds. // chr4 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// XM_006235943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Agap3), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// GENSCAN00000018380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7214808:7264720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT040791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 83 // 83 // 33 // 40 // 1 /// NONRATT040792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 83 // 83 // 33 // 40 // 1 /// NONRATT040795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_017048 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 2 (Slc4a2), mRNA. // chr4 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// XM_006235874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 2 (Slc4a2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006235877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 2 (Slc4a2), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000019666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7276047:7292587:-1 gene:ENSRNOG00000014347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AJ288902 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for putative anion exchanger isoform 2 (ae2 gene). // chr4 // 91 // 23 // 10 // 11 // 0 /// J05166 // GenBank // Rat band 3 Cl-/HCO3- exchanger (B3RP2) mRNA, complete cds. // chr4 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000018355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7276199:7289661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT040799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_173135 // RefSeq // Rattus norvegicus acid-sensing (proton-gated) ion channel 3 (Asic3), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7300219:7304265:-1 gene:ENSRNOG00000008380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF013598 // GenBank // Rattus norvegicus proton gated cation channel DRASIC mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7299010:7318799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT040804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001007796 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 8 (Abcb8), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7307908:7323157:-1 gene:ENSRNOG00000008557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC085781 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 8, mRNA (cDNA clone MGC:93731 IMAGE:7107433), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// DQ233644 // GenBank // Rattus norvegicus ABC transporter 8 mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// FQ216748 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YF19 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000018370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7299010:7318799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// NONRATT040806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT040807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_021838 // RefSeq // Rattus norvegicus nitric oxide synthase 3, endothelial cell (Nos3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7333452:7353763:-1 gene:ENSRNOG00000009348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB176831 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for nitric oxide synthase 3, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7333790:7352523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109217 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin like 2 (Nupl2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7524012:7540636:-1 gene:ENSRNOG00000010435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ235245 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YO17 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7525077:7540523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001012187 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 7 (Klhl7), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7544414:7593562:-1 gene:ENSRNOG00000010453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC083903 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 7 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:95261 IMAGE:7133606), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7545481:7595301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT040815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0
NM_001177905 // RefSeq // Rattus norvegicus hypercoagulability-related protein-like (LOC100364673), mRNA. // chr4 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// AY234417 // GenBank // Rattus norvegicus hypercoagulability-related protein (HCR2) mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT040815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD50 interactor 1 (Rint1), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035034 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:7860282:7893163:-1 gene:ENSRNOG00000022182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000050789 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:7860282:7893163:-1 gene:ENSRNOG00000022182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7860364:7897958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT040821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001100851 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific methyltransferase 2E (Kmt2e), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:8194698:8245002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_003749674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 3 (Lhfpl3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 3 (Lhfpl3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:8515425:8576735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000036164 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:8506571:8506900:-1 gene:ENSRNOG00000021533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:8506571:8506900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000046248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9045961:9063573:-1 gene:ENSRNOG00000031486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY383694 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00039 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_033236 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 2 (Psmc2), mRNA. // chr4 // 89 // 95 // 31 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000016450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9868268:9882578:-1 gene:ENSRNOG00000012026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC061542 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:72754 IMAGE:6918933), complete cds. // chr4 // 86 // 97 // 31 // 36 // 0 /// D50694 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proteasomal ATPase (MSS1), complete cds. // chr4 // 89 // 95 // 31 // 35 // 0 /// FQ216412 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YB09 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 70 // 23 // 26 // 0 /// FQ219079 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YN17 mRNA sequence. // chr4 // 78 // 73 // 21 // 27 // 0 /// FQ230973 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YM04 mRNA sequence. // chr4 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9868352:9884656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT040836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0
NM_022395 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidase (mitochondrial processing) beta (Pmpcb), mRNA. // chr4 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9909977:9922768:-1 gene:ENSRNOG00000012693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC078826 // GenBank // Rattus norvegicus peptidase (mitochondrial processing) beta, mRNA (cDNA clone MGC:93441 IMAGE:7113892), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// L12965 // GenBank // Rat mitochondrial processing peptidase beta-subunit (MPPB), complete cds. // chr4 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9910079:9922757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT040838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT040842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001106576 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 10 (Armc10), mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000044020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10006007:10021181:-1 gene:ENSRNOG00000012785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC161913 // GenBank // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:187647 IMAGE:8369555), complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10006867:10021033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001025155 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 17 (Lrrc17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10109708:10139147:-1 gene:ENSRNOG00000012817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079098 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:94077 IMAGE:7124390), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10110124:10121352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_053455 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrinogen-like 2 (Fgl2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10315675:10321309:-1 gene:ENSRNOG00000012881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF323608 // GenBank // Rattus norvegicus prothrombinase FGL2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000021674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10303479:10321286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107845 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-secretase activating protein (Gsap), mRNA. // chr4 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-secretase activating protein (Gsap), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10416405:10511054:-1 gene:ENSRNOG00000028801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-secretase activating protein (Gsap), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000021666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10417442:10492444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT040857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001191610 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 60 (Tmem60), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000018040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10810282:10815137:-1 gene:ENSRNOG00000013510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_053621 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 2 (Magi2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10987824:11595537:-1 gene:ENSRNOG00000013962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF034863 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic scaffolding molecule (S-SCAM) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF130819 // GenBank // Rattus norvegicus S-SCAM beta mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT040862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000036572 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:13323008:13323506:-1 gene:ENSRNOG00000024168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 61 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:13323155:13333591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 57 // 11 // 16 // 0
NM_173139 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein, alpha transducing 3 (Gnat3), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:13811218:13861527:-1 gene:ENSRNOG00000005268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X65747 // GenBank // R.norvegivus gnat-3 mRNA for gustducin. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:13811718:13861414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
ENSRNOT00000054573 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:4:13862296:13862370:-1 gene:ENSRNOG00000036463 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001106578 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3C (Sema3c), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:14293372:14464552:-1 gene:ENSRNOG00000006526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC169108 // GenBank // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3C, mRNA (cDNA clone MGC:189535 IMAGE:7096896), complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:14295868:14469784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// NONRATT040870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1 /// NONRATT040871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT040872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1
ENSRNOT00000035235 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:14543358:14543873:-1 gene:ENSRNOG00000024113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:14543358:14604096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_017017 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatocyte growth factor (Hgf), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006235978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hepatocyte growth factor (Hgf), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:15410059:15478680:-1 gene:ENSRNOG00000007027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// D90102 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for hepatocyte growth factor, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000045640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:15080471:15478538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NONRATT040880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001110797 // RefSeq // Rattus norvegicus piccolo (presynaptic cytomatrix protein) (Pclo), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// NM_020098 // RefSeq // Rattus norvegicus piccolo (presynaptic cytomatrix protein) (Pclo), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 94 // 94 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000007608 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:16428814:16643899:-1 gene:ENSRNOG00000005726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:16428814:16643899:-1 gene:ENSRNOG00000005726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// AF138789 // GenBank // Rattus norvegicus multidomain presynaptic cytomatrix protein Piccolo mRNA, complete cds, short splice variant. // chr4 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// AF227534 // GenBank // Rattus norvegicus multidomain presynaptic cytomatrix protein Piccolo mRNA, complete cds, long splice variant. // chr4 // 94 // 94 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:16503218:16660251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0
NM_001106579 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3E (Sema3e), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000008936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:17288508:17563239:-1 gene:ENSRNOG00000006631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000024305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:17290058:17328880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_006250506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD4-binding protein 1-like (RGD1564814), mRNA. // chr4 // 58 // 76 // 18 // 31 // 0 /// XM_006224825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD4-binding protein 1-like (LOC688874), mRNA. // chr4 // 32 // 76 // 10 // 31 // 0 /// XM_006235991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD4-binding protein 1-like (LOC688874), mRNA. // chr4 // 32 // 76 // 10 // 31 // 0 /// XM_006250507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD4-binding protein 1-like (LOC100912107), mRNA. // chr4 // 32 // 76 // 10 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:363944:447140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 78 // 18 // 32 // 0 /// NONRATT018073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 61 // 100 // 25 // 41 // 0 /// GENSCAN00000050476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:17819701:17820474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 68 // 10 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163967377:164069429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_017310 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3A (Sema3a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000034692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:18141779:18354542:-1 gene:ENSRNOG00000023337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:18097852:18358443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT040900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001104633 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3D (Sema3d), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:19169069:19359164:-1 gene:ENSRNOG00000007202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB288378 // GenBank // Rattus norvegicus Sema3d mRNA for semaphorin 3D, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:19171102:19187860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT040904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:19190106:19218844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000024130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:19236892:19283180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XR_085809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC287992 (LOC287992), misc_RNA. // chrU // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// AY383659 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00004 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046533 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:20371276:20402500:-1 gene:ENSRNOG00000030077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000042041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:20660926:20661573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0
NM_001109345 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9330182L06 (RGD1563349), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007723 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:21496030:21689226:-1 gene:ENSRNOG00000005818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:21498693:21603693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001047116 // RefSeq // Rattus norvegicus RUN domain containing 3B (Rundc3b), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000030224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22380551:22518349:1 gene:ENSRNOG00000008463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC107563 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Rap2-binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:124740 IMAGE:7938579), complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT039065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:22388841:22484898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT039066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_031987 // RefSeq // Rattus norvegicus carnitine O-octanoyltransferase (Crot), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// XM_006236004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carnitine O-octanoyltransferase (Crot), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000067462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22018242:22053050:1 gene:ENSRNOG00000006779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC074004 // GenBank // Rattus norvegicus carnitine O-octanoyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:91606 IMAGE:7098081), complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// J02844 // GenBank // Rat carnitine octanoyltransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// U26033 // GenBank // Rattus norvegicus carnitine octanoyltransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000053342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:22016989:22049716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001109345 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9330182L06 (RGD1563349), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007723 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:21496030:21689226:-1 gene:ENSRNOG00000005818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:21498693:21603693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001191748 // RefSeq // Rattus norvegicus DBF4 homolog (S. cerevisiae) (Dbf4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011351 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:22594201:22617462:1 gene:ENSRNOG00000008513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000072455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22833391:22848955:1 gene:ENSRNOG00000050482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// FQ233188 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YN09 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 63 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000000268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:22592310:22617462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT039071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:22725683:22848837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001044265 // RefSeq // Rattus norvegicus STEAP family member 4 (Steap4), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:23040112:23062780:-1 gene:ENSRNOG00000008602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:23017455:23062780:-1 gene:ENSRNOG00000008602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// AY325154 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-219 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// BC097353 // GenBank // Rattus norvegicus STEAP family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:114383 IMAGE:7387686), complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:23041653:23091068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT040921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
ENSRNOT00000011359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:23643951:23647246:-1 gene:ENSRNOG00000008594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC127528 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921511H03, mRNA (cDNA clone MGC:156771 IMAGE:7114751), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:23645822:23646583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT040924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000071904 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:24877696:24878388:-1 gene:ENSRNOG00000046749 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT040927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT058550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:24844443:24878049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENSRNOT00000061202 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:25523947:25524346:-1 gene:ENSRNOG00000039863 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_006224819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549548 (LOC102549548), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236075 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549548 (LOC102549548), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061068 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:26159531:26163860:-1 gene:ENSRNOG00000039860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031118 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:26159531:26163737:-1 gene:ENSRNOG00000039860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000054768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:26160059:26195092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001037093 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 9 (Akap9), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000010118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27098572:27234808:-1 gene:ENSRNOG00000026319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 67 // 67 // 0 /// DQ228948 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-B receptor-interacting scaffolding protein (Gisp) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 53 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000048382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27100678:27185108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 98 // 67 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000048390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27185874:27247969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 19 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT040936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 60 // 60 // 0 /// NONRATT040935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 38 // 70 // 1
XM_001068373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and death domain containing 1 (Lrrd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_216085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and death domain containing 1 (Lrrd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032529 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:27308002:27329338:-1 gene:ENSRNOG00000026196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27308002:27378126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0
NM_001108618 // RefSeq // Rattus norvegicus KRIT1, ankyrin repeat containing (Krit1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000032505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27341835:27376376:-1 gene:ENSRNOG00000007937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC168923 // GenBank // Rattus norvegicus KRIT1, ankyrin repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:189211 IMAGE:7105532), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27308002:27378126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT040944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSRNOT00000033335 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:27431754:27432472:-1 gene:ENSRNOG00000024332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27431754:27442743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000011377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27509304:27541902:-1 gene:ENSRNOG00000008585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC105862 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930500J03, mRNA (cDNA clone MGC:125025 IMAGE:7456982), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27498187:27601890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001109220 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 1 (Pex1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000038136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27562607:27601351:-1 gene:ENSRNOG00000025991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000052503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27498187:27601890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT040947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT040949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1
XM_006224821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1-like (LOC500007), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236077 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium-binding domain-containing protein 1-like (LOC500007), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068499 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:27612904:27619676:-1 gene:ENSRNOG00000009135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27611833:27630060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
ENSRNOT00000012253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27632197:27658496:-1 gene:ENSRNOG00000009163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC094528 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 133, member B, mRNA (cDNA clone MGC:105633 IMAGE:7320019), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ229101 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YH13 mRNA sequence. // chr4 // 79 // 86 // 15 // 19 // 0 /// NONRATT040952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1 /// NONRATT040956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1 /// NONRATT040958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// GENSCAN00000052518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27633365:27658417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// NONRATT040957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001191861 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 6 (Cdk6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27688961:27869534:-1 gene:ENSRNOG00000009258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT040964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000052509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27689476:27699985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001107847 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin A3 (Golga3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000056656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54248805:54295058:-1 gene:ENSRNOG00000037437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// BC089913 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7305004, containing frame-shift errors. // chr4 // 89 // 17 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54249658:54290117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 98 // 85 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000053429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28122691:28127154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT016174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 98 // 100 // 53 // 54 // 0 /// NONRATT016177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 97 // 67 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT016183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 14 // 54 // 1 /// NONRATT016175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 17 // 17 // 9 // 54 // 1 /// NONRATT016181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 17 // 17 // 9 // 54 // 1
ENSRNOT00000047419 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:28147627:28150754:-1 gene:ENSRNOG00000033874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000053431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28148394:28247315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000053431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28148394:28247315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// FQ235271 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YN09 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT040967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT040968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
XM_006236081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 9-like (Samd9l), partial mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_008617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC500013), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_085807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC684193), misc_RNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XR_353117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC102553883), misc_RNA. // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000013044 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:31134418:31206074:1 gene:ENSRNOG00000009841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000053431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28148394:28247315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:31128090:31138520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT039134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006236081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 9-like (Samd9l), partial mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_008617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC500013), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_085807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC684193), misc_RNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013044 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:31134418:31206074:1 gene:ENSRNOG00000009841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XR_353117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC102553883), misc_RNA. // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:31128090:31138520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000053431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28148394:28247315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT039134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006236081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 9-like (Samd9l), partial mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_008617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC500013), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_085807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC684193), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_353117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC102553883), misc_RNA. // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000013044 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:31134418:31206074:1 gene:ENSRNOG00000009841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:31128090:31138520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000053431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28148394:28247315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// NONRATT039134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006236081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 9-like (Samd9l), partial mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 36 // 36 // 0 /// XR_008617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC500013), misc_RNA. // chr4 // 90 // 100 // 44 // 49 // 0 /// XR_085807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC684193), misc_RNA. // chr4 // 85 // 98 // 41 // 48 // 0 /// XR_353117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif domain-containing protein 9-like (LOC102553883), misc_RNA. // chr4 // 96 // 55 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013044 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:31134418:31206074:1 gene:ENSRNOG00000009841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 73 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT039132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 76 // 34 // 37 // 0 /// GENSCAN00000053431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28148394:28247315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 37 // 49 // 1 /// GENSCAN00000019769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:31128090:31138520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 31 // 49 // 1 /// NONRATT039134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 22 // 49 // 1
NM_001106580 // RefSeq // Rattus norvegicus HEPACAM family member 2 (Hepacam2), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:28306779:28340882:-1 gene:ENSRNOG00000009711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC168741 // GenBank // Rattus norvegicus HEPACAM family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:188841 IMAGE:6919194), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28313796:28335543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001034015 // RefSeq // Rattus norvegicus calcitonin receptor (Calcr), transcript variant 1a, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_053816 // RefSeq // Rattus norvegicus calcitonin receptor (Calcr), transcript variant 1b, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:28532080:28607201:-1 gene:ENSRNOG00000010053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:28532080:28607201:-1 gene:ENSRNOG00000010053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// L13040 // GenBank // Rattus norvegicus calcitonin receptor C1b mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// L13041 // GenBank // Rattus norvegicus calcitonin receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// L14617 // GenBank // Rattus norvegicus C1a receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// L14618 // GenBank // Rattus norvegicus C1b receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT040974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28533765:28631453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NR_032751 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-653 (Mir653), microRNA. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054572 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:28563520:28563616:-1 gene:ENSRNOG00000036462 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT040973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-653 // miRBase Micro RNA Database // MI0012600 Rattus norvegicus miR-653 stem-loop // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NR_032105 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-489 (Mir489), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054394 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:28564161:28564266:-1 gene:ENSRNOG00000036271 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-489 // miRBase Micro RNA Database // MI0003477 Rattus norvegicus miR-489 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173141 // RefSeq // Rattus norvegicus tissue factor pathway inhibitor 2 (Tfpi2), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:28855875:28860297:-1 gene:ENSRNOG00000010513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28842752:28864069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT040979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_019251 // RefSeq // Rattus norvegicus Bet1 golgi vesicular membrane trafficking protein (Bet1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:28992532:29002927:-1 gene:ENSRNOG00000011008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC062408 // GenBank // Rattus norvegicus blocked early in transport 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72488 IMAGE:5621977), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ214230 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YA23 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// FQ215284 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YN06 mRNA sequence. // chr4 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// FQ223263 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YH07 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// U42755 // GenBank // Rattus norvegicus Bet1 homolog (rbet1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT040981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT040984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT040985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_032077 // RefSeq // Rattus norvegicus paraoxonase 1 (Pon1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:30156716:30183268:-1 gene:ENSRNOG00000008902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC091403 // GenBank // Rattus norvegicus paraoxonase 1, mRNA (cDNA clone MGC:109526 IMAGE:7324332), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ209429 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YM03 mRNA sequence. // chr4 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// FQ219478 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YP19 mRNA sequence. // chr4 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:30156951:30174489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001004086 // RefSeq // Rattus norvegicus paraoxonase 3 (Pon3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:30218889:30245586:-1 gene:ENSRNOG00000009096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079466 // GenBank // Rattus norvegicus paraoxonase 3, mRNA (cDNA clone MGC:95026 IMAGE:7122531), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ218136 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YM17 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:30219261:30245572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013082 // RefSeq // Rattus norvegicus paraoxonase 2 (Pon2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:30251593:30287330:-1 gene:ENSRNOG00000009112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079462 // GenBank // Rattus norvegicus paraoxonase 2, mRNA (cDNA clone MGC:95017 IMAGE:7122087), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:30252231:30287278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT040991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
ENSRNOT00000072153 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:30439034:30440228:-1 gene:ENSRNOG00000050175 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000020933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:30438199:30440285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_053551 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 4 (Pdk4), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000012760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:30451701:30463752:-1 gene:ENSRNOG00000009565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF034577 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase kinase isoenzyme 4 (PDK4) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// FQ216954 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA38YL23 mRNA sequence. // chr4 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:30453789:30463605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_001054092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (aspartate/glutamate carrier), member 13 (Slc25a13), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_342640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (aspartate/glutamate carrier), member 13 (Slc25a13), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013817 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:31041996:31598338:-1 gene:ENSRNOG00000009957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000019731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:31041996:31060054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:31505185:31529453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT041000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT040999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
GENSCAN00000005498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:31874184:31925367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
NM_001126090 // RefSeq // Rattus norvegicus split hand/foot malformation (ectrodactyly) type 1 (Shfm1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:31935396:31955552:-1 gene:ENSRNOG00000010420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012943 // RefSeq // Rattus norvegicus distal-less homeobox 5 (Dlx5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:32255323:32259589:-1 gene:ENSRNOG00000010905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D31734 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Dlx-3 hoemeobox protein, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L24443 // GenBank // Rat homeoprotein (rDlx) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:32249595:32259411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT041007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT041008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013079 // RefSeq // Rattus norvegicus asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing) (Asns), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:33608632:33626579:-1 gene:ENSRNOG00000007546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC081719 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:93148 IMAGE:7132312), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U07201 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine synthetase mRNA, secondary transcript, complete cds. // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// U07202 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine synthetase mRNA, predominant transcript, complete cds. // chr4 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:33609042:33622990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
XM_003749699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XXVIII, alpha 1 (Col28a1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003753867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XXVIII, alpha 1 (Col28a1), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000045270 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:33905045:34054973:-1 gene:ENSRNOG00000033618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:33905045:33977446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:33981022:34079465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001106584 // RefSeq // Rattus norvegicus replication protein A3 (Rpa3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000011123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:34139498:34142529:-1 gene:ENSRNOG00000008309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC168164 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8367557. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000017252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:34129060:34142498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_030844 // RefSeq // Rattus norvegicus islet cell autoantigen 1 (Ica1), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus islet cell autoantigen 1 (Ica1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus islet cell autoantigen 1 (Ica1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:34493597:34639858:-1 gene:ENSRNOG00000008628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC078812 // GenBank // Rattus norvegicus islet cell autoantigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:93403 IMAGE:7112043), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// L20900 // GenBank // Rattus norvegicus autoantigen p69 mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT041021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT041022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT041025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000032300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:34493744:34585108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT041026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000032308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:34592137:34628772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001007600 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S4, X-linked (Rps4x), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000004278 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:72916124:72919512:-1 gene:ENSRNOG00000003201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000051149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:35587341:35588132:-1 gene:ENSRNOG00000029574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC086560 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S4, X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:105788 IMAGE:7303578), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ229529 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YJ19 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000017797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:72916124:72952274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000044761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:35587341:35590457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ219012 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YG08 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// FQ220198 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YN05 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// FQ229741 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YN18 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// FQ233677 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YN22 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001107356 // RefSeq // Rattus norvegicus Yae1 domain containing 1 (Yae1d1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:35745595:35746269:-1 gene:ENSRNOG00000008962 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:47667539:47674056:1 gene:ENSRNOG00000013438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211942 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YM20 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:47572323:47671328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:35745595:35746269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
XM_001059675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-histone chromosomal protein HMG-14-like (LOC680964), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-histone chromosomal protein HMG-14-like (LOC680964), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071058 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:36606405:36607617:-1 gene:ENSRNOG00000047566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:36607250:36900437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001127684 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 4 (Ndufa4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:38070978:38078251:-1 gene:ENSRNOG00000005512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC167115 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 4, mRNA (cDNA clone MGC:189583 IMAGE:6922256), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001191970 // RefSeq // Rattus norvegicus thrombospondin, type I, domain containing 7A (Thsd7a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000052063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:38500796:38938890:-1 gene:ENSRNOG00000030151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:38496752:38604292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT041033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001004267 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 106B (Tmem106b), mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:39352537:39369348:1 gene:ENSRNOG00000006206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// AY387087 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00101 mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 66 // 28 // 29 // 0 /// BC079127 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 106B, mRNA (cDNA clone MGC:94135 IMAGE:7127112), complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:39334764:39370027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 64 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT039174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT039175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
XM_006224894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor D and EGF domains (Vwde), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor D and EGF domains (Vwde), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029602 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:39497970:39544226:-1 gene:ENSRNOG00000024709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000051415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:39475409:39529517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000060755 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:39560954:39561505:-1 gene:ENSRNOG00000039626 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:39543214:39561505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001014054 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 168 (Tmem168), mRNA. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// XM_006236101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 168 (Tmem168), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:39840557:39863946:-1 gene:ENSRNOG00000006690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC087124 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 168, mRNA (cDNA clone MGC:94827 IMAGE:7108688), complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:39842033:39873914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 50 // 10 // 13 // 0
NM_001109221 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG3570-PA (LOC500034), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009752 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:39890106:39963743:-1 gene:ENSRNOG00000007224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:39891453:39960883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022254 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 85 (Gpr85), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 85 (Gpr85), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 85 (Gpr85), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:43716135:43719803:-1 gene:ENSRNOG00000024636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB040803 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SREB2, complete cds. // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// AF203907 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein coupled receptor (Pkrcx1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC087727 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 85, mRNA (cDNA clone MGC:105281 IMAGE:7320496), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:43717478:43719801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT041045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NR_110645 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC100363521 (LOC100363521), long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158824 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7376484. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224908 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YI16 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109222 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3A (Ppp1r3a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:40763443:40804029:-1 gene:ENSRNOG00000021567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:40765164:40803969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107420 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein, X chromosome retrogene-like (Rbmxrtl), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:41774128:41775805:-1 gene:ENSRNOG00000028858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016184 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:43975806:43976912:1 gene:ENSRNOG00000012138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43975806:43976912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:41661280:41775568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT027365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_022379 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor EC (Tfec), mRNA. // chr4 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// XM_006236128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor EC (Tfec), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000008156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:44672398:44744984:-1 gene:ENSRNOG00000006066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:44587395:44703763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
ENSRNOT00000041594 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:45709338:45709805:-1 gene:ENSRNOG00000030995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:45709338:45715428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000010427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45896571:45936384:-1 gene:ENSRNOG00000007843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:45896571:45967107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT041054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_130750 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain containing 1 (Asz1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45962482:46018085:-1 gene:ENSRNOG00000008004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF461260 // GenBank // Rattus norvegicus GASZ (Gasz) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:45975437:46018066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT041055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001114401 // RefSeq // Rattus norvegicus cortactin binding protein 2 (Cttnbp2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000011135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:42516939:42680592:-1 gene:ENSRNOG00000008440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000020024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:42517908:42548313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000020030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:42553227:42594631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
ENSRNOT00000032671 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:42601824:42602166:-1 gene:ENSRNOG00000028419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:42601874:42602086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 39 // 9 // 11 // 0 /// NONRATT041043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001192012 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 7 (Ankrd7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 7 (Ankrd7), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000032633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:43029332:43047449:1 gene:ENSRNOG00000028409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:43029422:43080353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001106585 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated (Lsm8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:43016688:43022554:1 gene:ENSRNOG00000008504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC167094 // GenBank // Rattus norvegicus LSM8 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189529 IMAGE:7462085), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// FQ212479 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YL07 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT039190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001015026 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 12 (Tspan12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:48641397:48715044:-1 gene:ENSRNOG00000005272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC092623 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 12, mRNA (cDNA clone MGC:109305 IMAGE:7313631), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT041060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT041061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000032700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:48688628:48727942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT041059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT041062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_198771 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 3, member C (Fam3c), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000007886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:49179398:49231971:-1 gene:ENSRNOG00000005979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY228475 // GenBank // Rattus norvegicus FAM3C-like protein mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT041065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:49179920:49225433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_001100963 // RefSeq // Rattus norvegicus aminoadipate-semialdehyde synthase (Aass), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000060530 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:49938570:49985323:-1 gene:ENSRNOG00000039494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 95 // 36 // 37 // 0 /// BC128771 // GenBank // Rattus norvegicus aminoadipate-semialdehyde synthase, mRNA (cDNA clone MGC:156789 IMAGE:7130083), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000015588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:49939016:49967019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1 /// GENSCAN00000019802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:49973883:49985323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT041069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
NM_001109224 // RefSeq // Rattus norvegicus Fez family zinc finger 1 (Fezf1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:50092049:50095376:-1 gene:ENSRNOG00000007608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:50092742:50102743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XM_006224832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ca++-dependent secretion activator 2 (Cadps2), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ca++-dependent secretion activator 2 (Cadps2), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010537 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:50109970:50640382:-1 gene:ENSRNOG00000007636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064206 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:50109970:50640382:-1 gene:ENSRNOG00000007636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065088 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:50109970:50640382:-1 gene:ENSRNOG00000007636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067030 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:50254836:50640382:-1 gene:ENSRNOG00000007636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000068404 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:50109970:50640382:-1 gene:ENSRNOG00000007636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074651 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:50109970:50640382:-1 gene:ENSRNOG00000007636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001044278 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 133 (Rnf133), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079249 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ring finger protein 133, mRNA (cDNA clone MGC:94340 IMAGE:7133029), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:50462428:50463573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT041080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001191082 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 148 (Rnf148), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:50467749:50474307:-1 gene:ENSRNOG00000042462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:50467749:50468201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000044868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:50468436:50516888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_023994 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 118 (Tas2r118), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:50781192:50782091:-1 gene:ENSRNOG00000021799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF227141 // GenBank // Rattus norvegicus candidate taste receptor T2R3 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:50781192:50892139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_031651 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporter), member 1 (Slc13a1), mRNA. // chr4 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:50900832:50978269:-1 gene:ENSRNOG00000008121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// L19102 // GenBank // Rat sodium dependent sulfate transporter mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// U08031 // GenBank // Rattus norvegicus Na/Sulfate cotransporter (NaSi-2) mRNA, partial cds. // chr4 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT041084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000044876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:50901744:50952211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_001034130 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif and ubiquitin domain containing (Iqub), mRNA. // chr4 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000064983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51258446:51365176:-1 gene:ENSRNOG00000021729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// BC099086 // GenBank // Rattus norvegicus IQ motif and ubiquitin domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:116166 IMAGE:7454794), complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// DQ132434 // GenBank // Rattus norvegicus TRS4 mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000051968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51337363:51360596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT041088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0
NM_012985 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 5 (Ndufa5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000008325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51368669:51377027:-1 gene:ENSRNOG00000005698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC059148 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex 5, mRNA (cDNA clone MGC:72911 IMAGE:6919202), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// D86215 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NADH:ubiquinone oxidoreductase, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001034130 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif and ubiquitin domain containing (Iqub), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000064983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51258446:51365176:-1 gene:ENSRNOG00000021729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC099086 // GenBank // Rattus norvegicus IQ motif and ubiquitin domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:116166 IMAGE:7454794), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// DQ132434 // GenBank // Rattus norvegicus TRS4 mRNA, complete cds. // chr4 // 87 // 100 // 39 // 45 // 0 /// GENSCAN00000051965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51259062:51302947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT041086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
NM_001110365 // RefSeq // Rattus norvegicus Wiskott-Aldrich syndrome-like (Wasl), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51455978:51504468:-1 gene:ENSRNOG00000006975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51468323:51480383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT041091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109480 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 229A (Tmem229a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:52115167:52120186:-1 gene:ENSRNOG00000039464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:52118694:52336078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT041101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_057201 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 37 (Gpr37), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51598203:51620342:-1 gene:ENSRNOG00000002524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF087946 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor GPCR/CNS1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087728 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 37, mRNA (cDNA clone MGC:105347 IMAGE:7320414), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024322 // RefSeq // Rattus norvegicus protection of telomeres 1 (Pot1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006236161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1 (Pot1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1 (Pot1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XR_353175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protection of telomeres 1 (Pot1), transcript variant X6, misc_RNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000060459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51664674:51719559:-1 gene:ENSRNOG00000019986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC085834 // GenBank // Rattus norvegicus similar to POT1-like telomere end-binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:94460 IMAGE:7134840), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC090024 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7364876. // chr4 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51644223:51727922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT041096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT041095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
ENSRNOT00000024008 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:53177433:53178001:-1 gene:ENSRNOG00000017799 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:53177570:53177986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_022202 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 8 (Grm8), mRNA. // chr4 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000056996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:54229072:54397900:-1 gene:ENSRNOG00000021468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// U63288 // GenBank // Rattus norvegicus metabotropic glutamate receptor 8 (mGluR) mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000031714 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:54612860:54755351:-1 gene:ENSRNOG00000046130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT041103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:54740064:54908254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NONRATT041103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
NR_032747 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-592 (Mir592), microRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054571 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:54925353:54925448:-1 gene:ENSRNOG00000036461 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT041103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-592 // miRBase Micro RNA Database // MI0012596 Rattus norvegicus miR-592 stem-loop // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001109225 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 800 (Zfp800), mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000010223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:55246413:55267999:-1 gene:ENSRNOG00000007662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006236171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 800 (Zfp800), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55247952:55257303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_003753873 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRIP and coiled-coil domain containing 1 (Gcc1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006224846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRIP and coiled-coil domain containing 1 (Gcc1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006224847 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRIP and coiled-coil domain containing 1 (Gcc1), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRIP and coiled-coil domain containing 1 (Gcc1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRIP and coiled-coil domain containing 1 (Gcc1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010246 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:55457677:55461006:-1 gene:ENSRNOG00000007792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55457677:55461006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT041108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_031799 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 4 (Pax4), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:55483131:55488075:-1 gene:ENSRNOG00000008020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000052386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:55483131:55488075:-1 gene:ENSRNOG00000008020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AF053100 // GenBank // Rattus norvegicus Pax4a mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// AF053101 // GenBank // Rattus norvegicus Pax4b mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AF053102 // GenBank // Rattus norvegicus Pax4c mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// AF198155 // GenBank // Rattus norvegicus Pax4a mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// AF198156 // GenBank // Rattus norvegicus Pax4c mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// XM_006236232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box 4 (Pax4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// AF053103 // GenBank // Rattus norvegicus Pax4d mRNA, complete cds. // chr4 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// NONRATT041112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT041111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// GENSCAN00000016092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55481569:55493235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1
NM_001037336 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 4 (Lrrc4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:55859570:55861528:-1 gene:ENSRNOG00000008098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// DQ119102 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 4 protein precursor (Lrrc4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55837857:55896334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT041114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107850 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 28 (Rbm28), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006236191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 28 (Rbm28), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56166274:56204840:-1 gene:ENSRNOG00000005468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// FQ211470 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YL08 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000031648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56146029:56204840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT041116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1
NM_001109226 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 4 (Prrt4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 4 (Prrt4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56209884:56220344:-1 gene:ENSRNOG00000039388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56209884:56218554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108619 // RefSeq // Rattus norvegicus IMP (inosine 5-monophosphate) dehydrogenase 1 (Impdh1), mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56245546:56261085:-1 gene:ENSRNOG00000020032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56234748:56291096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT041119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_031015 // RefSeq // Rattus norvegicus opsin 1 (cone pigments), short-wave-sensitive (Opn1sw), mRNA. // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56420997:56424141:-1 gene:ENSRNOG00000006874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF051163 // GenBank // Rattus norvegicus blue cone opsin pigment mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// U63972 // GenBank // Rattus norvegicus blue cone opsin-like pigment mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56421556:56424103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001064164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kielin/chordin-like protein (Kcp), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000050644 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:56530637:56553915:-1 gene:ENSRNOG00000021855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 69 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000050795 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:56527381:56553915:-1 gene:ENSRNOG00000021855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000012050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56518094:56553915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 73 // 35 // 36 // 0
NM_001106587 // RefSeq // Rattus norvegicus transportin 3 (Tnpo3), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transportin 3 (Tnpo3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56587184:56664471:-1 gene:ENSRNOG00000021758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56589755:56664122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT041128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031854 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 96 (Mir96), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053747 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:57225167:57225272:-1 gene:ENSRNOG00000035624 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-96 // miRBase Micro RNA Database // MI0000881 Rattus norvegicus miR-96 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031901 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 183 (Mir183), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053574 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:57225370:57225479:-1 gene:ENSRNOG00000035451 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-183 // miRBase Micro RNA Database // MI0000928 Rattus norvegicus miR-183 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001172127 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2H (Ube2h), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57272127:57387292:-1 gene:ENSRNOG00000048205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000054075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57275798:57358039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT041134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0
NM_022857 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA binding protein N5 (N5), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// L31882 // GenBank // Rat DNA binding protein (N5) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT041134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001127293 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, C3HC-type containing 1 (Zc3hc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57445868:57468238:-1 gene:ENSRNOG00000010154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166834 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, C3HC-type containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188723 IMAGE:9022075), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57448215:57461752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT041138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001014055 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 209 (Tmem209), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 209 (Tmem209), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 209 (Tmem209), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 209 (Tmem209), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57558247:57585192:-1 gene:ENSRNOG00000028219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079399 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 209, mRNA (cDNA clone MGC:94930 IMAGE:7112633), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57539575:57583847:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT041143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT041144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001025770 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 41 (Cep41), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 41 (Cep41), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57728637:57743407:-1 gene:ENSRNOG00000010950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC098832 // GenBank // Rattus norvegicus testis specific, 14, mRNA (cDNA clone MGC:112886 IMAGE:7378587), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57730019:57743343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT041147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001108586 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulocalbin 1, EF-hand calcium binding domain (Rcn1), mRNA. // chr9 // 33 // 86 // 8 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:102026257:102040504:-1 gene:ENSRNOG00000013452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 86 // 8 // 24 // 0 /// NONRATT056080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 72 // 89 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:102027900:102040052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 33 // 86 // 8 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044814 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:11353698:11358164:1 gene:ENSRNOG00000039248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001106929 // RefSeq // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit gamma 2 (Copg2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000033706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57822384:57951143:-1 gene:ENSRNOG00000011014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57823490:57939263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT041149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001107851 // RefSeq // Rattus norvegicus testis specific, 13 (Tsga13), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis specific, 13 (Tsga13), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000015134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:57951387:57972674:-1 gene:ENSRNOG00000011108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57951482:57962884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:57964061:57995756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001135094 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 14 (Klf14), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:58005502:58006467:-1 gene:ENSRNOG00000027557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:58005502:58006467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NR_031836 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-29a (Mir29a), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-29a // miRBase Micro RNA Database // MI0000863 Rattus norvegicus miR-29a stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031837 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 29b-1 (Mir29b1), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000053586 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:58100053:58100133:-1 gene:ENSRNOG00000035463 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT041151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// rno-mir-29b-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000864 Rattus norvegicus miR-29b-1 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NONRATT041154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138848 // RefSeq // Rattus norvegicus podocalyxin-like (Podxl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:58581515:58628079:-1 gene:ENSRNOG00000012495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB020726 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for podocalyxin, complete cds. // chr4 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// AF109393 // GenBank // Rattus norvegicus podocalyxin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC070886 // GenBank // Rattus norvegicus podocalyxin-like, mRNA (cDNA clone MGC:91490 IMAGE:7098164), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:58585206:58645496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003749713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin A4, A (Plxna4a), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017536 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:59192168:59552548:-1 gene:ENSRNOG00000013072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:59192168:59370210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001106588 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 3 (Chchd3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:59822342:60099177:-1 gene:ENSRNOG00000013211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ215338 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YJ20 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ216356 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YF17 mRNA sequence. // chr4 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT041162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT041163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
ENSRNOT00000051232 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:61223016:61223498:-1 gene:ENSRNOG00000030979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61223016:61248678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_001106590 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35 (UDP-xylose/UDP-N-acetylglucosamine transporter), member B4 (Slc35b4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61271551:61293559:-1 gene:ENSRNOG00000008851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61273959:61293341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT041170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NONRATT041174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61373087:61440241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_012498 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B1 (aldose reductase) (Akr1b1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:61426190:61440279:-1 gene:ENSRNOG00000009513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC062034 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member B1 (aldose reductase), mRNA (cDNA clone MGC:72549 IMAGE:5623700), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:61373087:61440241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 19 // 22 // 1
NM_001024325 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110062M04 (LOC500077), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006236275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110062M04 (LOC500077), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000029818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62123742:62128007:-1 gene:ENSRNOG00000026958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC079043 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110062M04, mRNA (cDNA clone MGC:93977 IMAGE:7114933), complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62124461:62166431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001127298 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 91 (Wdr91), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62130769:62166447:-1 gene:ENSRNOG00000010421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC166785 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 91, mRNA (cDNA clone MGC:188566 IMAGE:7935588), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62124461:62166431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001270038 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Solute carrier family 23, member 2 (Sodium-dependent vitamin C transporter 2) (RGD1565367), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236264 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Solute carrier family 23, member 2 (Sodium-dependent vitamin C transporter 2) (RGD1565367), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006236266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Solute carrier family 23, member 2 (Sodium-dependent vitamin C transporter 2) (RGD1565367), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62208827:62254811:-1 gene:ENSRNOG00000026919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB511909 // GenBank // Rattus norvegicus slc23A4 mRNA for sodium-dependent nucleobase transporter 1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62196581:62280155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001037782 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 4 (Cnot4), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62288220:62389482:-1 gene:ENSRNOG00000010795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC100152 // GenBank // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:114505 IMAGE:7456520), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 4 (Cnot4), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62289276:62345899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001012621 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporter), member 4 (Slc13a4), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// XM_006236284 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 13 (sodium/sulfate symporter), member 4 (Slc13a4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62519695:62563986:-1 gene:ENSRNOG00000011184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY911718 // GenBank // Rattus norvegicus sodium sulfate cotransporter-2 (Slc13a4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// FQ212433 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA55YA08 mRNA sequence. // chr4 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// FQ229668 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YC13 mRNA sequence. // chr4 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62503630:62563297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT041195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// NONRATT041197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001108621 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 180, member A (Fam180a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62567994:62583301:-1 gene:ENSRNOG00000011750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62568818:62611818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NONRATT041201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024374 // RefSeq // Rattus norvegicus myotrophin (Mtpn), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:62731234:62760270:-1 gene:ENSRNOG00000011857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY951952 // GenBank // Rattus norvegicus myotrophin mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 93 // 24 // 27 // 0 /// BC088136 // GenBank // Rattus norvegicus myotrophin, mRNA (cDNA clone MGC:108675 IMAGE:7377576), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// D26179 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for V-1 protein, complete cds. // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// FQ228349 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA9YI01 mRNA sequence. // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// U21661 // GenBank // Rattus norvegicus myotrophin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT041201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:62733574:62825608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NONRATT041210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_198782 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, iota (Dgki), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, iota (Dgki), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006236335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, iota (Dgki), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000033268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:64199211:64653936:-1 gene:ENSRNOG00000026705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB058962 // GenBank // Rattus norvegicus rDGKi-1 mRNA for diacylglycerol kinase iota-1, complete cds. // chr4 // 88 // 94 // 28 // 32 // 0 /// AB058963 // GenBank // Rattus norvegicus rDGKi-2 mRNA for diacylglycerol kinase iota-2, complete cds. // chr4 // 88 // 94 // 28 // 32 // 0 /// AB058964 // GenBank // Rattus norvegicus rDGKi-3 mRNA for diacylglycerol kinase iota-3, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// NONRATT041210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000028842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:64350860:64437776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NONRATT041211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 90 // 90 // 26 // 29 // 1
NM_001012188 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 3-like 2 (Creb3l2), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:64691125:64803069:-1 gene:ENSRNOG00000012826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AY546001 // GenBank // Rattus norvegicus SCI-related protein (Ra69) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:64692515:64895016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT041213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT041215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// NONRATT041214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
XM_006224897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative transporter SVOPL-like (RGD1566053), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236337 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative transporter SVOPL-like (RGD1566053), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017909 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:65488043:65550507:-1 gene:ENSRNOG00000013378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65486030:65550507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001106591 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A4 (Atp6v0a4), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// XM_006236299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A4 (Atp6v0a4), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000064201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:65554091:65635822:-1 gene:ENSRNOG00000013428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000027197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65554582:65598293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT041218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// NONRATT041219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1
XM_006224868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF0606 protein KIAA1549-like (RGD1306271), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000040391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:65654521:65777795:-1 gene:ENSRNOG00000013729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000027193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65654521:65724667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0
XM_001069306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type, antiviral 1-like (Zc3hav1l), mRNA. // chr4 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// GENSCAN00000027181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65799264:65876153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1 /// NONRATT041226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// NONRATT041228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_173045 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type, antiviral 1 (Zc3hav1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:65836588:65876491:-1 gene:ENSRNOG00000013948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF521008 // GenBank // Rattus norvegicus CCCH-type zinc finger antiviral protein (Zap) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC131842 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type, antiviral 1, mRNA (cDNA clone MGC:156580 IMAGE:8372019), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:65799264:65876153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_022392 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin induced gene 1 (Insig1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:337380:345601:1 gene:ENSRNOG00000006859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078827 // GenBank // Rattus norvegicus insulin induced gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:93442 IMAGE:7125208), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L13619 // GenBank // Rattus norvegicus growth response protein (CL-6) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035326 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:66147623:66148381:-1 gene:ENSRNOG00000027445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:327630:383783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66147623:66148306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT038877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT038876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_001072378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 2 (Klrg2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726345 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 2 (Klrg2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006224871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 2 (Klrg2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006236345 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 2 (Klrg2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000009194 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:66182680:66191903:-1 gene:ENSRNOG00000006814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66182680:66191903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001108622 // RefSeq // Rattus norvegicus homeodomain interacting protein kinase 2 (Hipk2), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66255897:66435382:-1 gene:ENSRNOG00000007034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66251288:66317143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
XM_003749716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 12 (Parp12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006224872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 12 (Parp12), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66654422:66704543:-1 gene:ENSRNOG00000008196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000006809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66654422:66704543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT041241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
GENSCAN00000006817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66913131:66955371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 91 // 100 // 10 // 11 // 0
XM_003749718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 37, member 3 (Slc37a3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_003753878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 37, member 3 (Slc37a3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66927271:66959185:-1 gene:ENSRNOG00000008725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66942584:66959185:-1 gene:ENSRNOG00000008725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT041243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000006817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66913131:66955371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT041245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001004233 // RefSeq // Rattus norvegicus makorin ring finger protein 1 (Mkrn1), mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66994932:67013389:-1 gene:ENSRNOG00000009280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC079407 // GenBank // Rattus norvegicus makorin ring finger protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94941 IMAGE:7112867), complete cds. // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// FQ212797 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YF06 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 53 // 17 // 19 // 0 /// XM_006236303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus makorin ring finger protein 1 (Mkrn1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// XM_006236304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus makorin ring finger protein 1 (Mkrn1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// FQ226725 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YK05 mRNA sequence. // chr4 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// GENSCAN00000039760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66993370:67119047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
XM_006224880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 2A (Dennd2a), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006224881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 2A (Dennd2a), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006236352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 2A (Dennd2a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000034549 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:67050512:67107852:-1 gene:ENSRNOG00000026748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 88 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000039760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66993370:67119047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT041252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
ENSRNOT00000014604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:67206868:67327589:-1 gene:ENSRNOG00000010957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AF352172 // GenBank // Rattus norvegicus v-raf murine sarcoma viral oncogene B1-like protein mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// FQ232056 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YC19 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000039751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:67194044:67327950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT041259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT041260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001047863 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S33 (Mrps33), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:67414413:67417850:-1 gene:ENSRNOG00000026528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:67417619:67431092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT041263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000054570 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:4:67868941:67869028:-1 gene:ENSRNOG00000036460 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT041265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001044701 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA E330009J07 gene (RGD1563986), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133355168:133382858:-1 gene:ENSRNOG00000011854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ836251 // GenBank // Rattus norvegicus strain W LCHN protein mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133355168:133382858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108625 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 37 (Prss37), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133126537:133140428:-1 gene:ENSRNOG00000012201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133126644:133140448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033574 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:133166800:133167735:-1 gene:ENSRNOG00000026345 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133166929:133167612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
NM_001109377 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 5, member A (Clec5a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 5, member A (Clec5a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000033265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133598269:133607250:-1 gene:ENSRNOG00000026306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133594215:133606688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT041268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024685 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 138 (Tas2r138), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133618347:133619342:-1 gene:ENSRNOG00000026225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY916512 // GenBank // Rattus norvegicus strain W T2R38 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT041269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109229 // RefSeq // Rattus norvegicus monooxygenase, DBH-like 2 (Moxd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133906617:133915610:-1 gene:ENSRNOG00000012916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133906617:133915587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001009174 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 58 (Prss58), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133935460:133939416:-1 gene:ENSRNOG00000013132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133935460:133953817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009173 // RefSeq // Rattus norvegicus trypsin X5 (Tryx5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133947049:133953817:-1 gene:ENSRNOG00000028989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133935460:133953817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107856 // RefSeq // Rattus norvegicus Trypsin V-A (LOC312273), mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000017673 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:133978268:133984213:-1 gene:ENSRNOG00000013203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133978426:133999442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT041274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_173301 // RefSeq // Rattus norvegicus preprotrypsinogen IV (LOC286960), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:133995711:133999454:-1 gene:ENSRNOG00000013245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:133978426:133999442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 76 // 13 // 19 // 0
NM_173127 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 3 (Prss3), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006236365 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 3 (Prss3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:134050792:134054546:-1 gene:ENSRNOG00000013382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ235277 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YM24 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:134050883:134053671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT041276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108626 // RefSeq // Rattus norvegicus trypsin 4 (Try4), mRNA. // chr4 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// XM_006224901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG28262-like (LOC100365995), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG28262-like (LOC100365995), mRNA. // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000041100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135405339:135408813:1 gene:ENSRNOG00000031385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// FQ231537 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YC04 mRNA sequence. // chr4 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135339963:135363007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000022992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135405356:135408760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 74 // 19 // 23 // 0 /// NONRATT039453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0
NM_001004097 // RefSeq // Rattus norvegicus trypsin 10 (Try10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000048049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135447946:135451449:-1 gene:ENSRNOG00000050119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135447946:135451449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT041279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_006224902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anionic trypsin-2-like (LOC102554637), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006236386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anionic trypsin-2-like (LOC102554637), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000044960 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:135533107:135537203:-1 gene:ENSRNOG00000049855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135533107:135537203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000018789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135630137:135667150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X80523 // GenBank // R.norvegicus MBP13 Vbeta14 gene. // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_053686 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 6 (Trpv6), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 6 (Trpv6), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135705697:135721360:-1 gene:ENSRNOG00000014714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF160798 // GenBank // Rattus norvegicus calcium transporter CaT1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135706138:135763215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_053787 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 5 (Trpv5), mRNA. // chr4 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135734782:135761071:-1 gene:ENSRNOG00000015394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000051687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135734782:135761071:-1 gene:ENSRNOG00000015394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AB032019 // GenBank // Rattus norvegicus ECaC mRNA for epithelial calcium channel, complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// AF209196 // GenBank // Rattus norvegicus calcium transporter CaT2 (CaT2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AY762624 // GenBank // Rattus norvegicus TrpV5 calcium channel variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000018791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135706138:135763215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_001191611 // RefSeq // Rattus norvegicus Kell blood group, metallo-endopeptidase (Kel), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006236379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kell blood group, metallo-endopeptidase (Kel), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kell blood group, metallo-endopeptidase (Kel), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:135766569:135783460:-1 gene:ENSRNOG00000015682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000018787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135766686:135788782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT041285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1 /// NONRATT041286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// NONRATT041287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1
NM_001025046 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 131, member B (Fam131b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136508270:136517460:-1 gene:ENSRNOG00000017149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC092642 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 131, member B, mRNA (cDNA clone MGC:109395 IMAGE:7318030), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136511095:136515050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT041293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107858 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor A1 (Epha1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000024037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136553640:136568077:-1 gene:ENSRNOG00000017525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136553895:136568018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT041294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001001004 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 801 (Olr801), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136670500:136671500:-1 gene:ENSRNOG00000046378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136670500:136671399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000977 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 802 (Olr802), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136681938:136682879:-1 gene:ENSRNOG00000045828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136681938:136682879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000853 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 803 (Olr803), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000046121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136693143:136694217:-1 gene:ENSRNOG00000049273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000023301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136693279:136694205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT041297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001000852 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 804 (Olr804), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136752557:136753510:-1 gene:ENSRNOG00000017906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136752557:136753510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009534 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 115, member E (Fam115e), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136805323:136818688:-1 gene:ENSRNOG00000038872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC061995 // GenBank // Rattus norvegicus experimental autoimmune prostatitis antigen 2, mRNA (cDNA clone MGC:72615 IMAGE:5599703), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136805662:136815364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_003753879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM115C-like (LOC100912449), mRNA. // chr4 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071511 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:136840717:136867224:-1 gene:ENSRNOG00000050703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000050392 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:136000446:136019995:-1 gene:ENSRNOG00000030222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 100 // 11 // 19 // 0 /// XM_003749736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM115C-like (LOC100912372), mRNA. // chr4 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// GENSCAN00000023287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136829495:136888321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT041302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000056723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:135914772:136387592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 100 // 11 // 19 // 0
XM_001072497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 115, member A (Fam115a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_342675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 115, member A (Fam115a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136918079:136965939:-1 gene:ENSRNOG00000017911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:136915531:136965939:-1 gene:ENSRNOG00000017911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ211472 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YK12 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:136915835:136938440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT041306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001192013 // RefSeq // Rattus norvegicus NOBOX oogenesis homeobox (Nobox), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137454564:137460069:-1 gene:ENSRNOG00000025720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:137454564:137460248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1
NM_001134994 // RefSeq // Rattus norvegicus thiamin pyrophosphokinase 1 (Tpk1), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:137495338:137869961:-1 gene:ENSRNOG00000029922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC168695 // GenBank // Rattus norvegicus thiamin pyrophosphokinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:188595 IMAGE:7938123), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
ENSRNOT00000029982 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:140532120:140532843:-1 gene:ENSRNOG00000025135 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001134979 // RefSeq // Rattus norvegicus enhancer of zeste 2 polycomb repressive complex 2 subunit (Ezh2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006236401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of zeste homolog 2 (Drosophila) (Ezh2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000008149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:141955864:142018471:-1 gene:ENSRNOG00000006048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC169027 // GenBank // Rattus norvegicus enhancer of zeste homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:189404 IMAGE:8370550), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FQ230311 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YI16 mRNA sequence. // chr4 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// GENSCAN00000037256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:141952129:142001918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT041317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0
NONRATT039714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// NONRATT041322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT016812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 93 // 13 // 14 // 1 /// NONRATT016813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 93 // 13 // 14 // 1
NM_053849 // RefSeq // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 4 (Pdia4), mRNA. // chr4 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000008728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142140946:142159845:-1 gene:ENSRNOG00000006228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC061535 // GenBank // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:72734 IMAGE:6922170), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// M86870 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-binding protein mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000037265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142141127:142159629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT041324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NONRATT041324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001127594 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 786 (Zfp786), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142166950:142179995:-1 gene:ENSRNOG00000006925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166479 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 786, mRNA (cDNA clone MGC:187936 IMAGE:9102251), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142167339:142172649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109348 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 777 (Zfp777), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 777 (Zfp777), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142354004:142376510:-1 gene:ENSRNOG00000033639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142341169:142377312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001100852 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 746 (Zfp746), mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142392264:142416151:-1 gene:ENSRNOG00000007064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142393747:142409429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000057580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142411831:142570350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT041331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001024327 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 467 (Zfp467), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 467 (Zfp467), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142732565:142739034:-1 gene:ENSRNOG00000007707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086534 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 467, mRNA (cDNA clone MGC:105814 IMAGE:7097755), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142733531:142743540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT041333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013427 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 2 (Rarres2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 2 (Rarres2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 2 (Rarres2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:142869496:142872500:-1 gene:ENSRNOG00000024705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091177 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 2, mRNA (cDNA clone MGC:108804 IMAGE:7323591), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ209660 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YD17 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ228347 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA9YI10 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:142869751:142872090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001011968 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 6 (Gimap6), mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000049038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143024593:143031005:-1 gene:ENSRNOG00000033338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ633683 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ian6 protein, strain BN. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC089859 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase, IMAP family member 6, mRNA (cDNA clone MGC:108948 IMAGE:7384582), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ125342 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(+/+) GIMAP6 (Gimap6) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// DQ125343 // GenBank // Rattus norvegicus strain BBDR.lyp-(lyp/lyp) GIMAP6 (Gimap6) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143025945:143036012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT041341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001126296 // RefSeq // Rattus norvegicus transformer 2 alpha homolog (Drosophila) (Tra2a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:143594598:143613358:-1 gene:ENSRNOG00000009156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC161978 // GenBank // Rattus norvegicus transformer-2 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:187790 IMAGE:9029930), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143581585:143613187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT041359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NONRATT041356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109170 // RefSeq // Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 7 (Gemin7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 7 (Gemin7), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 7 (Gemin7), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000040934 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:143643764:143644162:-1 gene:ENSRNOG00000034168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81739987:81749508:-1 gene:ENSRNOG00000049772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81740345:81740734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143643764:143644153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001056309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S11-like (RGD1563352), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_575471 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S11-like (RGD1563352), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012694 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:143740963:143741439:-1 gene:ENSRNOG00000009583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143740963:143741439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191749 // RefSeq // Rattus norvegicus deafness, autosomal dominant 5 (human) (Dfna5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:144606016:144619346:-1 gene:ENSRNOG00000009970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:144606828:144760979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT041368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT041369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
XM_006224924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 3 (Osbpl3), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006236516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 3 (Osbpl3), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 3 (Osbpl3), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013828 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:144700488:144778606:-1 gene:ENSRNOG00000010011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:144700488:144778606:-1 gene:ENSRNOG00000010011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:144606828:144760979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
XM_575475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L27a-like (RGD1565415), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000041621 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:144982529:144982975:-1 gene:ENSRNOG00000033274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000040912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:144982529:144982975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000014331 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:145013636:145038535:-1 gene:ENSRNOG00000010594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC078992 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921507P07, mRNA (cDNA clone MGC:93890 IMAGE:7112600), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:145002964:145062893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT041376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT041377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT041378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_023952 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide VF precursor (Npvf), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:145061114:145064806:-1 gene:ENSRNOG00000010806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AB040288 // GenBank // Rattus norvegicus RFRP mRNA for RFamide-related peptide precursor, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF330059 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide NPVF precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT041379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001104613 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1 (Hnrnpa2b1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000015152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:145901254:145907466:-1 gene:ENSRNOG00000011175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000015325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:145901254:145909847:-1 gene:ENSRNOG00000011175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000072743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:145901254:145909847:-1 gene:ENSRNOG00000011175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// AB006815 // GenBank // Rattus norvegicus hnRNP mRNA for heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2, complete cds. // chr4 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// AB006816 // GenBank // Rattus norvegicus hnRNP mRNA for heterogeneous nuclear ribonucleoprotein B1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AB006817 // GenBank // Rattus norvegicus hnRNP mRNA for heterogeneous nuclear ribonucleoprotein B0a, complete cds. // chr4 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// AB006818 // GenBank // Rattus norvegicus hnRNP mRNA for heterogeneous nuclear ribonucleoprotein B0b, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ217950 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA13YD13 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000025002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:145901613:145907330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT041386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_130413 // RefSeq // Rattus norvegicus src kinase associated phosphoprotein 2 (Skap2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146485400:146635663:-1 gene:ENSRNOG00000012228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF302132 // GenBank // Rattus norvegicus putative SKAP55 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070949 // GenBank // Rattus norvegicus src kinase associated phosphoprotein 2, mRNA (cDNA clone MGC:91521 IMAGE:7099436), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146535124:146635531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT041394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT041395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_013075 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box A1 (Hoxa1), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U93092 // GenBank // Rattus norvegicus homeobox-plus HoxA1 protein (HoxA1) mRNA, alternatively spliced form, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U93093 // GenBank // Rattus norvegicus homeobox-minus HoxA1 protein (HoxA1) mRNA, alternatively spliced form, complete cds. // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000007807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146792237:146793897:-1 gene:ENSRNOG00000005628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000072867 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:26966:28456:-1 gene:ENSRNOG00000046750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146792392:146793867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000053749 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:26966:28441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_012581 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box A2 (Hoxa2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146798160:146800436:-1 gene:ENSRNOG00000005968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073928 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:33092:34853:-1 gene:ENSRNOG00000049993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// M91802 // GenBank // Rattus norvegicus homeobox protein (Hox 1.11) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146798518:146800279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000053753 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:33092:34853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
XM_006224929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox A3 (Hoxa3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006236527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox A3 (Hoxa3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006257707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A3-like (LOC100911474), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:146805514:146808216:-1 gene:ENSRNOG00000006281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000071203 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:40088:42790:-1 gene:ENSRNOG00000047858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000045720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146805514:146827065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053759 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:40088:61639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSRNOT00000038775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146825723:146827071:-1 gene:ENSRNOG00000027365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073606 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:60297:61645:-1 gene:ENSRNOG00000048957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146825723:146827071:-1 gene:ENSRNOG00000027365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000075419 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:60297:61645:-1 gene:ENSRNOG00000048957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// L03557 // GenBank // Rat (clone RAHB2 9/15) hox1.4 protein (hox1.4) mRNA, 3 end. // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146805514:146827065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000053759 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:40088:61639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
XM_003749749 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box A5 (Hoxa5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003749755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A5-like (LOC100909641), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A5-like (LOC100911546), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box A5 (Hoxa5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146923613:146925596:-1 gene:ENSRNOG00000006466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073187 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:72607:74376:-1 gene:ENSRNOG00000045996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074167 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:146838033:146839801:-1 gene:ENSRNOG00000047951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// L03556 // GenBank // Rat (clone RAHB2 8/10) hox1.3 protein (hox1.3) mRNA, 3 end. // chr4 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146923827:146925929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146838033:146840134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000053752 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:72607:74709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_001191087 // RefSeq // Rattus norvegicus homeobox A6 (Hoxa6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006236513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox A6 (Hoxa6), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// XM_006236531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A6-like (LOC100909604), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// XM_006257703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A6-like (LOC100911511), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000008542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146927669:146929948:-1 gene:ENSRNOG00000006530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146841798:146844251:-1 gene:ENSRNOG00000048917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075553 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:76449:78728:-1 gene:ENSRNOG00000048620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146927669:146929948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146841874:146844153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053748 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:76449:78728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001109233 // RefSeq // Rattus norvegicus homeobox A9 (Hoxa9), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_003749756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A7-like (LOC100909678), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A7-like (LOC100911622), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox A9 (Hoxa9), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071729 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:146851152:146852929:-1 gene:ENSRNOG00000046361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072436 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:85825:87504:-1 gene:ENSRNOG00000050515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000075005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146937045:146938824:-1 gene:ENSRNOG00000049858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146937045:146947553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146851250:146861758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000053756 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:85825:96333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
XM_001057018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox A9-like (Hoxa9l), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_003749751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox A9-like (Hoxa9l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_003749758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A9-like (LOC100909740), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_003752183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A9-like (LOC100911710), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071668 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:146945589:146947553:-1 gene:ENSRNOG00000048146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072302 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:146859794:146861758:-1 gene:ENSRNOG00000047484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073457 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:94369:96333:-1 gene:ENSRNOG00000050685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146937045:146947553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146851250:146861758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053756 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:85825:96333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_031946 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 196b (Mir196b), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071351 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:146951682:146951766:-1 gene:ENSRNOG00000049663 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071717 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:146865887:146865971:-1 gene:ENSRNOG00000049258 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073013 // ENSEMBL // ncrna:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:100462:100546:-1 gene:ENSRNOG00000047707 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-196b // miRBase Micro RNA Database // MI0001152 Rattus norvegicus miR-196b stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006236522 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A10-like (LOC100912608), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// XM_006236523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A10-like (LOC100912608), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A10-like (LOC100909714), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// XM_006257710 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-A10-like (LOC100911668), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000036394 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:146954086:146956498:-1 gene:ENSRNOG00000027246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000071761 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:102866:105278:-1 gene:ENSRNOG00000047352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000073730 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:146868291:146870974:-1 gene:ENSRNOG00000050252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000000744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146954086:146956447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000045735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146868291:146870923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000053758 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:102866:105227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001129878 // RefSeq // Rattus norvegicus homeobox A11 (Hoxa11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146878196:146881858:-1 gene:ENSRNOG00000007627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146963721:146967425:-1 gene:ENSRNOG00000047691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071837 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:113763:116114:-1 gene:ENSRNOG00000048466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC166717 // GenBank // Rattus norvegicus homeo box A10, mRNA (cDNA clone MGC:188427 IMAGE:7932029), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ229839 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YI06 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146964983:146982256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000045730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146879459:146896320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053747 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:113763:131036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001271355 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box A13 (Hoxa13), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:146894848:146896369:-1 gene:ENSRNOG00000007928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000073681 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:146980372:146982208:-1 gene:ENSRNOG00000047580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000073782 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:129152:130988:-1 gene:ENSRNOG00000046614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000000730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146964983:146982256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000053747 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109730.1:113763:131036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:146879459:146896320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSRNOT00000035078 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:4:147099472:147099581:-1 gene:ENSRNOG00000027186 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_022243 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase (Hibadh), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000011069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:147270737:147368793:-1 gene:ENSRNOG00000008063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC127442 // GenBank // Rattus norvegicus 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:156473 IMAGE:7308860), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:147184282:147282944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000000743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:147315749:147358934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001047976 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00063 (LOC685391), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:147314467:147321149:-1 gene:ENSRNOG00000043170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001065610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus JAZF zinc finger 1 (Jazf1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus JAZF zinc finger 1 (Jazf1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006236535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus JAZF zinc finger 1 (Jazf1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:147501616:147547058:-1 gene:ENSRNOG00000027026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001034010 // RefSeq // Rattus norvegicus TLR4 interactor with leucine-rich repeats (Tril), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100659 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1200009O22; EST AI316813, mRNA (cDNA clone MGC:124837 IMAGE:7935751), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:148632281:148665723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT041401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029927 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase, vitellogenic-like (Cpvl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxypeptidase, vitellogenic-like (Cpvl), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:148689023:148793199:-1 gene:ENSRNOG00000009172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097471 // GenBank // Rattus norvegicus carboxypeptidase, vitellogenic-like, mRNA (cDNA clone MGC:114536 IMAGE:7457768), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:148690125:148831355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NONRATT041411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001025063 // RefSeq // Rattus norvegicus secernin 1 (Scrn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006236512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secernin 1 (Scrn1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149342036:149400634:-1 gene:ENSRNOG00000009636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC079152 // GenBank // Rattus norvegicus secernin 1, mRNA (cDNA clone MGC:94172 IMAGE:7128646), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149327838:149385349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001013210 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 14 (Fkbp14), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149413605:149428266:-1 gene:ENSRNOG00000009886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC083746 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:94670 IMAGE:7192246), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ216652 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YM02 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// XM_006236500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 14 (Fkbp14), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149414198:149428107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT041415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109236 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleotide-binding oligomerization domain containing 1 (Nod1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149781209:149832175:-1 gene:ENSRNOG00000010629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149782229:149804980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001108629 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-glutamyl cyclotransferase (Ggct), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149842892:149850088:-1 gene:ENSRNOG00000034084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233046 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YG21 mRNA sequence. // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT041420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149846615:149849974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT041422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT041423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001271139 // RefSeq // Rattus norvegicus glycyl-tRNA synthetase (Gars), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000014780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149892437:149933270:1 gene:ENSRNOG00000011052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149906442:149933128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT039647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_022714 // RefSeq // Rattus norvegicus corticotropin releasing hormone receptor 2 (Crhr2), mRNA. // chr4 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// XM_006236556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus corticotropin releasing hormone receptor 2 (Crhr2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149944720:149986473:-1 gene:ENSRNOG00000011145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:149944720:149971916:-1 gene:ENSRNOG00000011145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// EF078964 // GenBank // Rattus norvegicus CRF2a variant form 5 mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// U16253 // GenBank // Rattus norvegicus corticotropin-releasing factor receptor subtype 2 (CRF2R) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:149944896:149971701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001109022 // RefSeq // Rattus norvegicus indolethylamine N-methyltransferase (Inmt), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:150039151:150043447:-1 gene:ENSRNOG00000011250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214615 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YP15 mRNA sequence. // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:150039363:150043392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT041426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109237 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal differentiation 6 (Neurod6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:150564266:150567512:-1 gene:ENSRNOG00000026055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168855 // GenBank // Rattus norvegicus neurogenic differentiation 6, mRNA (cDNA clone MGC:189088 IMAGE:8365463), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:150548323:150566029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT041427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031078 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 1C (Pde1c), mRNA. // chr4 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// XM_006236560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphodiesterase 1C (Pde1c), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// XM_006236562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphodiesterase 1C (Pde1c), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000017531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:151012763:151485371:-1 gene:ENSRNOG00000012337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// L41045 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic nucleotide phosphodiesterase (PDE1C2) mRNA, complete cds. // chr4 // 98 // 93 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000032384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:151048766:151126907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
GENSCAN00000042465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:151497240:151603306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_001107289 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000065625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:151668265:151671481:-1 gene:ENSRNOG00000042126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// FQ224115 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA76YF13 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT041432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001107861 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 2 (Kbtbd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 2 (Kbtbd2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:151741021:151763287:-1 gene:ENSRNOG00000013809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:151742196:151752414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107862 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IIIA (Nt5c3a), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IIIA (Nt5c3a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IIIA (Nt5c3a), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000058703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:151889319:151932147:-1 gene:ENSRNOG00000005981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC166444 // GenBank // Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic III, mRNA (cDNA clone MGC:187586 IMAGE:8363316), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:151886951:151900222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
XM_006229261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPT2, Suppressor of Ty, domain containing 1-like (LOC100365259), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075006 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:104183116:104194154:-1 gene:ENSRNOG00000050806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104132066:104154615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104183092:104194154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000031091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152512450:152531736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000038083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152908517:152909261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT041441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001008926 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 77 (Vom1r77), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:152512450:152513367:-1 gene:ENSRNOG00000032672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY510297 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc37 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152512450:152531736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001009508 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 79 (Vom1r79), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY510284 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc35 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:152621872:152663407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT041441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 100 // 11 // 29 // 0
NM_001014187 // RefSeq // Rattus norvegicus LanC lantibiotic synthetase component C-like 2 (bacterial) (Lancl2), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006236581 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LanC lantibiotic synthetase component C-like 2 (bacterial) (Lancl2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:153348313:153387979:-1 gene:ENSRNOG00000006810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC079412 // GenBank // Rattus norvegicus LanC lantibiotic synthetase component C-like 2 (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:94952 IMAGE:7113320), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:153335640:153387919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// NONRATT041446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENSRNOT00000058626 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:153429563:153471906:-1 gene:ENSRNOG00000023969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC085921 // GenBank // Rattus norvegicus potential ubiquitin ligase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7108839), partial cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:153430681:153457270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NR_073161 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 40S ribosomal protein S7 (S8) (LOC500148), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009001 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:153496637:153505890:-1 gene:ENSRNOG00000038471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC079164 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 40S ribosomal protein S7 (S8), mRNA (cDNA clone MGC:94194 IMAGE:7129532), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001044293 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleosome assembly protein 1-like 5 (Nap1l5), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:153970373:153972240:-1 gene:ENSRNOG00000007808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087702 // GenBank // Rattus norvegicus nucleosome assembly protein 1-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:105733 IMAGE:7313964), complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:153971650:153972727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT041452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001100862 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 13, member A (Fam13a), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:154006120:154102125:-1 gene:ENSRNOG00000007947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC088230 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 13, member A1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7323947), partial cds. // chr4 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:154006276:154147999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT041455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
XM_002726370 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GPRIN family member 3 (Gprin3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002729315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GPRIN family member 3 (Gprin3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GPRIN family member 3 (Gprin3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GPRIN family member 3 (Gprin3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:154510003:154512291:-1 gene:ENSRNOG00000023657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:154510003:154579735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019169 // RefSeq // Rattus norvegicus synuclein, alpha (non A4 component of amyloid precursor) (Snca), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000039247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:155592411:155690420:-1 gene:ENSRNOG00000008656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000042485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:155612580:155690420:-1 gene:ENSRNOG00000008656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// AF007758 // GenBank // Rattus norvegicus synuclein 1 mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// AY550005 // GenBank // Rattus norvegicus line iP alpha synuclein (Snca) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// AY550006 // GenBank // Rattus norvegicus line iNP alpha synuclein (Snca) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC087682 // GenBank // Rattus norvegicus synuclein, alpha (non A4 component of amyloid precursor), mRNA (cDNA clone MGC:105443 IMAGE:7321273), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006236591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synuclein, alpha (non A4 component of amyloid precursor) (Snca), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT041463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:155562763:155691970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
ENSRNOT00000030421 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:156889990:156890453:-1 gene:ENSRNOG00000046612 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:156825774:156890287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
GENSCAN00000050458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:158242169:158242651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_031644 // RefSeq // Rattus norvegicus hematopoietic prostaglandin D synthase (Hpgds), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:160734261:160758902:-1 gene:ENSRNOG00000006583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF021882 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione-dependent prostaglandin D synthase mRNA, partial cds. // chr4 // 81 // 62 // 13 // 16 // 0 /// BC087590 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin D2 synthase 2, hematopoietic, mRNA (cDNA clone MGC:105397 IMAGE:7307804), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D82071 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for hematopoietic prostaglandin D synthase, complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT041469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000008848 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:160849536:160850258:-1 gene:ENSRNOG00000006765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
NM_001109269 // RefSeq // Rattus norvegicus lin-28 homolog A (C. elegans) (Lin28a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_073158 // RefSeq // Rattus norvegicus lin-28 homolog C (C. elegans) (Lin28c), non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-28 homolog A (C. elegans) (Lin28a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155921629:155935517:-1 gene:ENSRNOG00000038409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155920245:155935442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:161781483:161783179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000050161 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:162107212:162108120:-1 gene:ENSRNOG00000038405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:162107719:162108311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0
NM_001008928 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 89 (Vom1r89), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000042169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:162352270:162353187:-1 gene:ENSRNOG00000030085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY510298 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rc15 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT041472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_024127 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest and DNA-damage-inducible, alpha (Gadd45a), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:162568471:162570782:-1 gene:ENSRNOG00000005615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB102787 // GenBank // Rattus norvegicus Gadd45a mRNA for growth arrest and DNA-damage-inducible 45 alpha, complete cds, strain:F344/DuCrj. // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AB102788 // GenBank // Rattus norvegicus Gadd45a mRNA for growth arrest and DNA-damage-inducible 45 alpha, complete cds, strain:LEC/Crj. // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC081795 // GenBank // Rattus norvegicus growth arrest and DNA-damage-inducible, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93414 IMAGE:7110642), complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ216523 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YG11 mRNA sequence. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// L32591 // GenBank // Rattus norvegicus GADD45 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:162560869:162570624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001191750 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 12 receptor, beta 2 (Il12rb2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:162838651:162904433:-1 gene:ENSRNOG00000007270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:162838651:162894023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_001072576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 23 receptor (Il23r), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_003753910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 23 receptor (Il23r), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010151 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:162989572:163090787:-1 gene:ENSRNOG00000007544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:162989572:163093238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163191207:163199240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
XM_001072576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 23 receptor (Il23r), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_003753910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 23 receptor (Il23r), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010151 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:162989572:163090787:-1 gene:ENSRNOG00000007544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:162989572:163093238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
XM_001072576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 23 receptor (Il23r), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 23 receptor (Il23r), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010151 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:162989572:163090787:-1 gene:ENSRNOG00000007544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009540 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor-associated calcium signal transducer 2 (Tacstd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY185508 // GenBank // Rattus norvegicus PRP1 (Prp1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060519 // GenBank // Rattus norvegicus tumor-associated calcium signal transducer 2, mRNA (cDNA clone MGC:72570 IMAGE:5597863), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000040075 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:171010527:171011645:1 gene:ENSRNOG00000049268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:170956498:171089255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
GENSCAN00000011120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33514569:33583556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
GENSCAN00000011116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33588334:33618603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000071312 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:33597274:33597552:-1 gene:ENSRNOG00000047534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 8 // 12 // 0
ENSRNOT00000058388 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:33670022:33670808:-1 gene:ENSRNOG00000045599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33652301:33670808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000011108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33706422:33722923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 85 // 46 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:168302244:168381615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 64 // 9 // 18 // 0 /// FQ231113 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YE11 mRNA sequence. // chr17 // 68 // 68 // 13 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000058388 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:33670022:33670808:-1 gene:ENSRNOG00000045599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 45 // 71 // 9 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33652301:33670808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
GENSCAN00000011108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33706422:33722923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// FQ231113 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YE11 mRNA sequence. // chr17 // 79 // 68 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:168302244:168381615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 64 // 9 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000058388 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:33670022:33670808:-1 gene:ENSRNOG00000045599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 45 // 71 // 9 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33652301:33670808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
GENSCAN00000017116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33841178:33858853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:167174178:167341323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000070884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:168067605:168068318:-1 gene:ENSRNOG00000045946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071431 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:167151590:167152303:1 gene:ENSRNOG00000049904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075004 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:168370597:168371310:-1 gene:ENSRNOG00000047417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075683 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:52496333:52497046:-1 gene:ENSRNOG00000048452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:167900082:168142467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000016288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:168302244:168381615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:167037153:167152312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000049162 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:167008822:167009121:1 gene:ENSRNOG00000031980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000064645 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:168495846:168496145:-1 gene:ENSRNOG00000042063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:168495825:168525588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:168197921:168232923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166896060:167009142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NONRATT034708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25811720:25840983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 67 // 15 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25800798:25810615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 44 // 8 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000044699 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:25811522:25910715:1 gene:ENSRNOG00000048065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 56 // 8 // 20 // 0 /// FQ228219 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YB05 mRNA sequence. // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
FQ225725 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YA21 mRNA sequence. // chr3 // 89 // 82 // 8 // 9 // 0 /// FQ231704 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YI02 mRNA sequence. // chr3 // 89 // 82 // 8 // 9 // 0
ENSRNOT00000058331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:25513006:25513483:1 gene:ENSRNOG00000049561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25471860:25513504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 50 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT034706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0
GENSCAN00000018171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:24913907:24951455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:25471860:25513504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
FQ211116 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA17YD21 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSRNOT00000040102 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:24539610:24540161:1 gene:ENSRNOG00000048182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:24473464:24540167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000053930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:24014042:24014561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
GENSCAN00000053931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23970054:23970536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// X55180 // GenBank // Rattua norvegicus mRNA for monoclonal antibody Y13-259 Vk. // chr3 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0
GENSCAN00000052605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23904925:23916342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000044455 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23584979:23585453:1 gene:ENSRNOG00000050889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 90 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23584979:23585480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006954 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23585169:23585963:1 gene:ENSRNOG00000050889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 57 // 8 // 12 // 0
BC098746 // GenBank // Rattus norvegicus similar to NGF-binding Ig light chain, mRNA (cDNA clone MGC:112745 IMAGE:7388228), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// FQ226818 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YE18 mRNA sequence. // chr3 // 50 // 100 // 15 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23334708:23350890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23769670:23792462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000070966 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23768266:23768816:1 gene:ENSRNOG00000045906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000075075 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23333304:23333854:1 gene:ENSRNOG00000049386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000052610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23702143:23756438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NONRATT034703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
FQ231665 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YK12 mRNA sequence. // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// L17078 // GenBank // Rattus norvegicus NGF-binding Ig rearranged L-chain mRNA, V-region, partial cds. // chr3 // 38 // 100 // 12 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000074650 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23144141:23144637:1 gene:ENSRNOG00000049284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006954 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23585169:23585963:1 gene:ENSRNOG00000050889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 75 // 9 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044455 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:23584979:23585453:1 gene:ENSRNOG00000050889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 75 // 9 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22935646:22936135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 25 // 100 // 8 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23478528:23486677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 25 // 100 // 8 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23827636:23828130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 25 // 100 // 8 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23584979:23585480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 75 // 9 // 24 // 0 /// X75533 // GenBank // R.norvegicus mRNA for V kappa 21/61. // chr3 // 42 // 97 // 13 // 31 // 0 /// GENSCAN00000053931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:23970054:23970536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// X55180 // GenBank // Rattua norvegicus mRNA for monoclonal antibody Y13-259 Vk. // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
GENSCAN00000043984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22899467:22899935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000007136 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22887240:22890665:1 gene:ENSRNOG00000005324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22889760:22890607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000036375 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:18969811:18970353:-1 gene:ENSRNOG00000048017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000042671 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22802806:22803375:1 gene:ENSRNOG00000031292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22796880:22814295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18969825:19051254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0
ENSRNOT00000073021 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22716132:22716482:1 gene:ENSRNOG00000049024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22710862:22716524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000058260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:22475160:22475747:1 gene:ENSRNOG00000048936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000043991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22475455:22475768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000073316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22434685:22435309:1 gene:ENSRNOG00000049909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22434685:22435369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000043097 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22403206:22403816:1 gene:ENSRNOG00000048070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// FQ234151 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YP20 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
XM_002729376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ig kappa chain V19-17-like (RGD1564696), mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22305170:22319464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21907227:21907890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0
ENSRNOT00000048829 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22180349:22180872:1 gene:ENSRNOG00000046289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22146548:22180893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_002729377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to immunoglobulin kappa-chain VK-1 (RGD1563231), mRNA. // chr3 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:22295204:22295792:-1 gene:ENSRNOG00000047571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074266 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22143297:22143887:1 gene:ENSRNOG00000046715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22295183:22295786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22143303:22143908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:22434685:22435309:1 gene:ENSRNOG00000049909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 100 // 10 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22434685:22435369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 100 // 10 // 26 // 0 /// FQ225348 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YE07 mRNA sequence. // chr3 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// FQ225497 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YO04 mRNA sequence. // chr3 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0
ENSRNOT00000073229 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:21939467:21940068:1 gene:ENSRNOG00000049499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21939467:21940086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ234145 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YA05 mRNA sequence. // chr3 // 76 // 74 // 13 // 17 // 0
GENSCAN00000042405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21860499:21886197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000048351 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:21867886:21868493:1 gene:ENSRNOG00000049755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000042405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21860499:21886197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
GENSCAN00000042398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21845718:21846262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 85 // 13 // 17 // 0
XM_002729383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64257-like (LOC100361052), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_003753712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64257-like (LOC100361052), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000046231 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:21792544:21793105:1 gene:ENSRNOG00000048167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21792559:21793216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000040386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21710414:21710966:1 gene:ENSRNOG00000049299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000042409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21665266:21711083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// FQ231172 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YB01 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT034699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
NM_001108632 // RefSeq // Rattus norvegicus ribose 5-phosphate isomerase A (Rpia), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163347716:163373352:-1 gene:ENSRNOG00000005576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ231857 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YO16 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT041476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT041478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT041479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163337346:163397158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT041480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001109240 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 37 (Tex37), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163507328:163514565:-1 gene:ENSRNOG00000006476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163507519:163534523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009658 // RefSeq // Rattus norvegicus threonine synthase-like 2 (S. cerevisiae) (Thnsl2), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163753104:163771684:-1 gene:ENSRNOG00000006508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC088454 // GenBank // Rattus norvegicus threonine synthase-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95104 IMAGE:7127050), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163753342:163768707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT041483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106595 // RefSeq // Rattus norvegicus SET and MYND domain containing 1 (Smyd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:163851683:163904153:-1 gene:ENSRNOG00000006776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:163852307:163885759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000038912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164031739:164084227:-1 gene:ENSRNOG00000028422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164018897:164084227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ231069 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YG18 mRNA sequence. // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_175764 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 3A (Kdm3a), mRNA. // chr4 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// XM_006236640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 3A (Kdm3a), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164282438:164325750:-1 gene:ENSRNOG00000007814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// FQ222223 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA27YA09 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164282701:164334789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT041494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106596 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L35 (Mrpl35), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164516933:164524701:-1 gene:ENSRNOG00000008546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT041498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// NONRATT041499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
NM_001134718 // RefSeq // Rattus norvegicus Pentatricopeptide repeat domain 3 (Ptcd3), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Pentatricopeptide repeat domain 3 (Ptcd3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164573542:164600825:-1 gene:ENSRNOG00000009484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC098732 // GenBank // Rattus norvegicus Pentatricopeptide repeat domain 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7384824), complete cds. // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164574062:164595007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT041500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT041501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109241 // RefSeq // Rattus norvegicus atonal homolog 8 (Drosophila) (Atoh8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164837904:164870076:-1 gene:ENSRNOG00000010716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164813494:164869658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007647 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 181 (Rnf181), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164992852:164999568:-1 gene:ENSRNOG00000012035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079313 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 181, mRNA (cDNA clone MGC:94464 IMAGE:7134895), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ230185 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YP15 mRNA sequence. // chr4 // 57 // 84 // 12 // 21 // 0 /// NONRATT041513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT041514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164993733:165012316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT041515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT041516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT041517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001106597 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 39 (Usp39), mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:164952387:164984619:-1 gene:ENSRNOG00000010930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC166516 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 39, mRNA (cDNA clone MGC:188093 IMAGE:7131845), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164952335:164978493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT041512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_053555 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 5 (Vamp5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165002077:165013304:-1 gene:ENSRNOG00000012659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF054826 // GenBank // Rattus norvegicus VAMP5 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217123 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YN12 mRNA sequence. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:164993733:165012316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT041519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_031827 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 8 (Vamp8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165020594:165023049:-1 gene:ENSRNOG00000012748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF132812 // GenBank // Rattus norvegicus endobrevin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165020594:165030749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_134351 // RefSeq // Rattus norvegicus methionine adenosyltransferase II, alpha (Mat2a), mRNA. // chr4 // 89 // 88 // 33 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000018170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165067990:165073559:-1 gene:ENSRNOG00000013520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000070847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:3174791:3176001:-1 gene:ENSRNOG00000050173 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 88 // 81 // 30 // 34 // 0 /// BC062394 // GenBank // Rattus norvegicus methionine adenosyltransferase II, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:72314 IMAGE:5622019), complete cds. // chr4 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000036417 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:35629032:35630218:-1 gene:ENSRNOG00000028513 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 91 // 79 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165067076:165074133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT041524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 95 // 52 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT041526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 93 // 39 // 42 // 1 /// GENSCAN00000018663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:3140737:3176052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// GENSCAN00000026113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:35620429:35674746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 29 // 42 // 1 /// NONRATT041527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
XM_006224957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691161 (LOC691161), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006224958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691161 (LOC691161), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006224959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691161 (LOC691161), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006236686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691161 (LOC691161), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006236687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691161 (LOC691161), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006236688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691161 (LOC691161), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000018251 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:165144447:165150929:-1 gene:ENSRNOG00000013605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000013993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165144447:165166812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001013087 // RefSeq // Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 3 (Elmod3), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000057989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165194110:165235495:-1 gene:ENSRNOG00000038102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC083623 // GenBank // Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:94399 IMAGE:7134106), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006236670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 3 (Elmod3), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// XM_006236671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 3 (Elmod3), transcript variant X5, mRNA. // chrU // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT041531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000013986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165193320:165211185:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT041532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT041533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001107865 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 7-like 1 (T-cell specific, HMG-box) (Tcf7l1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165263183:165426980:-1 gene:ENSRNOG00000014753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165420034:165426975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001128192 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel modulatory factor 1 (Kcmf1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165526163:165549472:-1 gene:ENSRNOG00000015097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC167075 // GenBank // Rattus norvegicus similar to potassium channel modulatory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:189416 IMAGE:9093013), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165526515:165716980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT041542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NONRATT041542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1
NM_138840 // RefSeq // Rattus norvegicus trans-golgi network protein 2 (Tgoln2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165245799:165253551:-1 gene:ENSRNOG00000014617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098512 // GenBank // Rattus norvegicus trans-golgi network protein, mRNA (cDNA clone MGC:108592 IMAGE:7382894), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165247355:165253538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107865 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 7-like 1 (T-cell specific, HMG-box) (Tcf7l1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165263183:165426980:-1 gene:ENSRNOG00000014753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107865 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 7-like 1 (T-cell specific, HMG-box) (Tcf7l1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000020005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165263183:165426980:-1 gene:ENSRNOG00000014753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165264150:165283237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT041536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT041537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000041880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165645789:165646605:-1 gene:ENSRNOG00000042499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// M58404 // GenBank // R.norvegicus thymosin beta-10 (testis-specific) gene, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000020894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165697844:165895140:-1 gene:ENSRNOG00000015581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 57 // 57 // 0 /// GENSCAN00000019284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165718431:165895141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 51 // 51 // 0
XM_006224964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prohibitin-like (LOC102550335), mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 13 // 19 // 0 /// XM_006236693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prohibitin-like (LOC102550335), mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 13 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000020754 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:165716350:165716980:-1 gene:ENSRNOG00000015470 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 78 // 82 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165526515:165716980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
NM_001109242 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931417E11 (RGD1562515), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:166147862:166148779:-1 gene:ENSRNOG00000024604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:166147862:166159651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000011165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:170796728:170797312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000007700 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:171691536:171692312:-1 gene:ENSRNOG00000005867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:171691536:171692377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001106598 // RefSeq // Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), alpha 2 (Ctnna2), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006236697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), alpha 2 (Ctnna2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:172588005:173519137:-1 gene:ENSRNOG00000006003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT041551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:172588005:172725141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
GENSCAN00000000172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:173741892:173847503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
FQ217715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA1YA02 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222890 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YF20 mRNA sequence. // chr4 // 45 // 80 // 9 // 20 // 0
XM_003749781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361595 (LOC100361595), partial mRNA. // chr4 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// XM_003753934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361595 (LOC100361595), partial mRNA. // chr4 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068166 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:174180063:174181383:-1 gene:ENSRNOG00000042570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_173097 // RefSeq // Rattus norvegicus regenerating islet-derived 3 gamma (Reg3g), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:174231310:174233865:-1 gene:ENSRNOG00000006579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L20869 // GenBank // Rattus norvegicus pancreatitis associated protein III (PAPIII0) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:174231533:174233564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000057854 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:177045797:177046201:-1 gene:ENSRNOG00000038024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001029898 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L19 (Mrpl19), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:177390795:177395024:-1 gene:ENSRNOG00000006968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ235078 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YI22 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:177391083:177395022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT041558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108634 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), epsilon 4, accessory subunit (Pole4), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006236714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), epsilon 4, accessory subunit (Pole4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178170534:178176345:-1 gene:ENSRNOG00000006102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC166842 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), epsilon 4 (p12 subunit), mRNA (cDNA clone MGC:188734 IMAGE:9028705), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178136296:178176284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT041559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_012735 // RefSeq // Rattus norvegicus hexokinase 2 (Hk2), mRNA. // chr4 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000008813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178239350:178288251:-1 gene:ENSRNOG00000006116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF027179 // GenBank // Rattus norvegicus mutant type II hexokinase mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 90 // 32 // 36 // 0 /// M68971 // GenBank // Rat hexokinase type II (HKII) mRNA, complete cds. // chr4 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// M68972 // GenBank // Rat hexokinase II (HKII) mRNA, 3 end. // chr4 // 95 // 50 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178240033:178357455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT041563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT041562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
ENSRNOT00000008850 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:177901980:177902454:-1 gene:ENSRNOG00000006768 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000044587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:177902128:177902460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NM_019272 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4F (Sema4f), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178414272:178440640:-1 gene:ENSRNOG00000006784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB002563 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for semaphorin W, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178415842:178438210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT041564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000009519 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:178486488:178486867:-1 gene:ENSRNOG00000007263 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178486688:178486867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 77 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT041566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
NM_001025416 // RefSeq // Rattus norvegicus docking protein 1 (Dok1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178549317:178551776:-1 gene:ENSRNOG00000007412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097972 // GenBank // Rattus norvegicus docking protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116102 IMAGE:7442066), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178549594:178553351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT041567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106599 // RefSeq // Rattus norvegicus HtrA serine peptidase 2 (Htra2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178568773:178571933:-1 gene:ENSRNOG00000022448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158760 // GenBank // Rattus norvegicus HtrA serine peptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:187990 IMAGE:7103492), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178568954:178571909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT041572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT041573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT041574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT041575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001172125 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell leukemia homeobox 2 (Tlx2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178585975:178587437:-1 gene:ENSRNOG00000008343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178585975:178587223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT041577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT041578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT041579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT041580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001106600 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain binding protein 1 (Wbp1), mRNA. // chr4 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000039966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178636944:178639343:-1 gene:ENSRNOG00000008720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC098709 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7310221. // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// BC158831 // GenBank // Rattus norvegicus WW domain binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:188276 IMAGE:7379825), complete cds. // chr4 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT041583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT041585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT041587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT041588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT041589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT041590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000014321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178637157:178697939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001048233 // RefSeq // Rattus norvegicus INO80 complex subunit B (Ino80b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:178639684:178643232:-1 gene:ENSRNOG00000008873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105625 // GenBank // Rattus norvegicus INO80 complex subunit B, mRNA (cDNA clone MGC:125108 IMAGE:7364756), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214280 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YK07 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:178637157:178697939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT041592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001109245 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 54 (Wdr54), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 54 (Wdr54), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 54 (Wdr54), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 54 (Wdr54), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179436792:179443385:-1 gene:ENSRNOG00000009324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098022 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455578. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179439948:179442937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT041598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001109398 // RefSeq // Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase (Mthfd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000014603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179592814:179604331:-1 gene:ENSRNOG00000010833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ234580 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YG19 mRNA sequence. // chr4 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// FQ234392 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YC09 mRNA sequence. // chr4 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000057772 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:124738254:124739298:1 gene:ENSRNOG00000037974 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// GENSCAN00000051985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179593750:179604256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT041601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000017731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124738254:124739298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONRATT041602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
XM_006224966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tet methylcytosine dioxygenase 3 (Tet3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_006224969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tet methylcytosine dioxygenase 3 (Tet3), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// XM_006236794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tet methylcytosine dioxygenase 3 (Tet3), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179656564:179696869:-1 gene:ENSRNOG00000011387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000031521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179658189:179665174:-1 gene:ENSRNOG00000011387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179656564:179700985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179743265:179798628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001106602 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxyguanosine kinase (Dguok), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyguanosine kinase (Dguok), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyguanosine kinase (Dguok), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006236738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyguanosine kinase (Dguok), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179770727:179798683:-1 gene:ENSRNOG00000011617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168743 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyguanosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:188845 IMAGE:6919887), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179743265:179798628:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT041612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT041609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT041610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_012893 // RefSeq // Rattus norvegicus actin, gamma 2, smooth muscle, enteric (Actg2), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000042699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179805783:179830338:-1 gene:ENSRNOG00000029401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC087689 // GenBank // Rattus norvegicus actin, gamma 2, smooth muscle, enteric, mRNA (cDNA clone MGC:105507 IMAGE:7310913), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ223160 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA14YM05 mRNA sequence. // chr4 // 86 // 100 // 30 // 35 // 0 /// M22323 // GenBank // Rat gamma-enteric smooth muscle actin isoform mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179805858:179865478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_138531 // RefSeq // Rattus norvegicus Stam binding protein (Stambp), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179839859:179864344:-1 gene:ENSRNOG00000012227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY083159 // GenBank // Rattus norvegicus AMSH mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC061711 // GenBank // Rattus norvegicus Stam binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:72308 IMAGE:5597943), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179805858:179865478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT041618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NONRATT041621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_053753 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member F (Clec4f), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179911569:179921321:-1 gene:ENSRNOG00000013137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098661 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member f, mRNA (cDNA clone MGC:112607 IMAGE:7384948), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// J03734 // GenBank // Rat Kupffer cell receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179911753:179921239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT041622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_002726425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD207 molecule, langerin (Cd207), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_578352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD207 molecule, langerin (Cd207), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017691 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:179938234:179944063:-1 gene:ENSRNOG00000013222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179934133:179972039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001017537 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 261 (Tex261), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 261 (Tex261), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000065847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:180035951:180042794:-1 gene:ENSRNOG00000013712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091302 // GenBank // Rattus norvegicus testis expressed 261, mRNA (cDNA clone MGC:109238 IMAGE:7309682), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ218231 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA7YC24 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT041626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180038266:180063392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// U76419 // GenBank // Rattus norvegicus steroidogenic acute regulatory protein (StAR) mRNA, complete cds. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000044612 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:180060624:180061023:-1 gene:ENSRNOG00000029480 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
XM_001073206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 2B (Paip2b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_232121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 2B (Paip2b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019399 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:180076627:180082198:-1 gene:ENSRNOG00000014092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000010371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180076627:180115297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT041628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_181087 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 26, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp26b1), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:180848038:180864857:-1 gene:ENSRNOG00000015076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY245532 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450RAI-2 (Cyp26b1) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT041630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:180798155:180864701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001109246 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 6B (Exoc6b), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:180900780:181368585:-1 gene:ENSRNOG00000028359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181074095:181368514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001109246 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 6B (Exoc6b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:180900780:181368585:-1 gene:ENSRNOG00000028359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168850 // GenBank // Rattus norvegicus exocyst complex component 6B, mRNA (cDNA clone MGC:189077 IMAGE:8362904), complete cds. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000057040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181074095:181368514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_019181 // RefSeq // Rattus norvegicus sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase) (Spr), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sepiapterin reductase-like (RGD1560795), mRNA. // chr4 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// XM_006236796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sepiapterin reductase-like (RGD1560795), mRNA. // chr4 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181492883:181496612:-1 gene:ENSRNOG00000015455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166809 // GenBank // Rattus norvegicus sepiapterin reductase (7,8-dihydrobiopterin:NADP+ oxidoreductase), mRNA (cDNA clone MGC:188618 IMAGE:8373837), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211209 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA15YF14 mRNA sequence. // chr4 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031768 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:181513140:181515820:1 gene:ENSRNOG00000028235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181493280:181496597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181501932:181515820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT041637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153298 // RefSeq // Rattus norvegicus sideroflexin 5 (Sfxn5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000057537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181575048:181691696:-1 gene:ENSRNOG00000037871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// AB056724 // GenBank // Rattus norvegicus BBG-TCC mRNA for tricarboxylate carrier, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000024199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181575065:181691647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT041639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 31 // 50 // 1 /// NONRATT041643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 12 // 50 // 1
NONRATT041639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 83 // 96 // 20 // 24 // 0
XM_003753914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 5 (class I) (Rab11fip5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020860 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:181695212:181731936:-1 gene:ENSRNOG00000015575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000042360 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:181695212:181706958:-1 gene:ENSRNOG00000015575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181695212:181736192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
ENSRNOT00000073250 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:181735861:181736895:-1 gene:ENSRNOG00000046402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT041647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
XM_003749786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease-associated domain containing 1 (Pradc1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181808148:181812369:-1 gene:ENSRNOG00000050483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181808148:181812369:-1 gene:ENSRNOG00000050483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181808305:181812369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_001107871 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 41 (Fbxo41), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000043201 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:181834385:181844668:-1 gene:ENSRNOG00000033202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181834110:181846894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_019137 // RefSeq // Rattus norvegicus early growth response 4 (Egr4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:181870041:181872503:-1 gene:ENSRNOG00000015719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M65008 // GenBank // Rattus rattus zinc finger transcriptional activator (NGFI-C) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:181870558:181872309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT041653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006236724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus camello-like 5 (Cml5), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000021103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182065698:182067356:-1 gene:ENSRNOG00000015763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// AF187100 // GenBank // Rattus norvegicus putative N-acetyltransferase CML5 (Cml5) mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// FQ213004 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YE04 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// NM_080884 // RefSeq // Rattus norvegicus camello-like 5 (Cml5), mRNA. // chr4 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// XM_006236720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus camello-like 5 (Cml5), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000021120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182082608:182107208:-1 gene:ENSRNOG00000015768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// BC158648 // GenBank // Rattus norvegicus camello-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:187618 IMAGE:8367103), complete cds. // chr4 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 /// GENSCAN00000020432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182050505:182083369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT041655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT041656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_022635 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 8 (Nat8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006236789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetyltransferase 8 (Nat8), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF185570 // GenBank // Rattus norvegicus putative N-acetyltransferase Camello 4 (cml 4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182101786:182102454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT041656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001173449 // RefSeq // Rattus norvegicus camello-like 2 (Cml2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182142644:182143324:-1 gene:ENSRNOG00000047507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_006224979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable N-acetyltransferase CML2-like (LOC102556908), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006236802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable N-acetyltransferase CML2-like (LOC102556148), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000075813 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:182149010:182149690:-1 gene:ENSRNOG00000045933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_021668 // RefSeq // Rattus norvegicus camello-like 1 (Cml1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus camello-like 1 (Cml1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006236809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable N-acetyltransferase CML1-like (LOC100910868), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182157295:182163978:-1 gene:ENSRNOG00000015799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF185569 // GenBank // Rattus norvegicus putative N-acetyltransferase Camello 2 (cml 2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC078836 // GenBank // Rattus norvegicus camello-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:93464 IMAGE:7106831), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182107539:182181320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182304255:182362315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_133558 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 8B (Nat8b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006236812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable N-acetyltransferase CML6-like (LOC100910982), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000021243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182180536:182362875:-1 gene:ENSRNOG00000015851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AF163318 // GenBank // Rattus norvegicus putative N-acetyltransferase Camello 1 (cml1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC081733 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 8B, mRNA (cDNA clone MGC:93215 IMAGE:7109438), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ212935 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YK02 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182107539:182181320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// GENSCAN00000020440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182304255:182362315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001025650 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 11 (RNA/RNP complex 1-interacting) (Dusp11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 11 (RNA/RNP complex 1-interacting) (Dusp11), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA/RNP complex-1-interacting phosphatase-like (LOC100911499), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182373238:182387183:-1 gene:ENSRNOG00000022082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182192158:182206124:-1 gene:ENSRNOG00000045539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098712 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 11 (RNA/RNP complex 1-interacting), mRNA (cDNA clone MGC:112701 IMAGE:7321787), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182194899:182206124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182375894:182384859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_145085 // RefSeq // Rattus norvegicus prenylcysteine oxidase 1 (Pcyox1), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:182758202:182769261:-1 gene:ENSRNOG00000016704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF332142 // GenBank // Rattus norvegicus chloride ion pump-associated 55 kDa protein (Clp55) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078719 // GenBank // Rattus norvegicus prenylcysteine oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93150 IMAGE:7127920), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182759061:182769239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
XM_002726408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 1 (Pcbp1), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000023806 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:182898783:182899852:-1 gene:ENSRNOG00000017708 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:182898783:182914226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT041662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0
NM_001100749 // RefSeq // Rattus norvegicus max dimerization protein 1 (Mxd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183021767:183042167:-1 gene:ENSRNOG00000017720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183011200:183184286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001108636 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 27 (U4/U6.U5) (Snrnp27), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000068093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183046290:183057647:-1 gene:ENSRNOG00000017747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// FQ224589 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA60YP16 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000042139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183011200:183184286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001010956 // RefSeq // Rattus norvegicus germ cell-less, spermatogenesis associated 1 (Gmcl1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY862308 // GenBank // Rattus norvegicus germ cell-less protein short isoform (Gcl) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_001033931 // RefSeq // Rattus norvegicus germ cell-less, spermatogenesis associated 1 (Gmcl1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000024414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183065019:183104409:-1 gene:ENSRNOG00000017838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// AY862307 // GenBank // Rattus norvegicus germ cell-less protein (Gcl) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT041671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183011200:183184286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT041672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1 /// NONRATT041674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_024155 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A4 (Anxa4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183108906:183164898:-1 gene:ENSRNOG00000018159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085688 // GenBank // Rattus norvegicus annexin A4, mRNA (cDNA clone MGC:93088 IMAGE:7191458), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D38224 // GenBank // Rattus norvegicus ZAP36 mRNA for zymogen granule membrane associated protein, complete cds. // chr4 // 82 // 79 // 18 // 22 // 0 /// NONRATT041675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183011200:183184286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT041677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT041678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001044249 // RefSeq // Rattus norvegicus anthrax toxin receptor 1 (Antxr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183514052:183699805:-1 gene:ENSRNOG00000008678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC131853 // GenBank // Rattus norvegicus anthrax toxin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:156827 IMAGE:7320366), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// DQ789143 // GenBank // Rattus norvegicus anthrax toxin receptor (Antxr1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183551851:183699412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT041680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_198972 // RefSeq // Rattus norvegicus gastrokine 1 (Gkn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183711680:183717243:-1 gene:ENSRNOG00000008838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY456958 // GenBank // Rattus norvegicus foveolin precursor (Fov) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183711796:183717259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gastrokine 3 (Gkn3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gastrokine 3 (Gkn3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057350 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:183750932:183756555:-1 gene:ENSRNOG00000037782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183749568:183767385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT041683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001109247 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 25 (Arhgap25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006236836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 25 (Arhgap25), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 25 (Arhgap25), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 25 (Arhgap25), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 25 (Arhgap25), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183812925:183891522:-1 gene:ENSRNOG00000009347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183814017:183867261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_138977 // RefSeq // Rattus norvegicus prokineticin receptor 1 (Prokr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183940576:183948041:-1 gene:ENSRNOG00000009556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB158419 // GenBank // Rattus norvegicus Gpr73 mRNA for G protein-coupled receptor 73, complete cds, strain:F344/DuCrj. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB158420 // GenBank // Rattus norvegicus Gpr73 mRNA for G protein-coupled receptor 73, complete cds, strain:LEC/Crj. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY089974 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor ZAQ mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183940576:183948041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hCG20001-like (LOC100362908), mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// XM_006236856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hCG20001-like (LOC100362908), mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000002485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184776998:184879080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001173382 // RefSeq // Rattus norvegicus aprataxin and PNKP like factor (Aplf), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184767521:184819739:-1 gene:ENSRNOG00000043059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC099186 // GenBank // Rattus norvegicus aprataxin and PNKP like factor, mRNA (cDNA clone MGC:116357 IMAGE:7383333), complete cds. // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000002485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184776998:184879080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT041696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT041695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006224983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hCG20001-like (LOC100362908), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// XM_006236856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hCG20001-like (LOC100362908), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000048768 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:184825861:184842834:-1 gene:ENSRNOG00000031408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184776998:184879080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 75 // 14 // 15 // 0
NM_001024331 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB43, member RAS oncogene family (Rab43), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184946341:184965637:-1 gene:ENSRNOG00000037768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AY593256 // GenBank // Rattus norvegicus Ras-related protein RAB43 (Rab43) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184946559:184993603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT041703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001014188 // RefSeq // Rattus norvegicus ISY1 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (Isy1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000013571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184972995:184993684:-1 gene:ENSRNOG00000010021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC079119 // GenBank // Rattus norvegicus ISY1 splicing factor homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94120 IMAGE:7126525), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ218201 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA7YJ13 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184946559:184993603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// NONRATT041705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
XM_001075299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus H1 histone family, member X (H1fx), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_575600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus H1 histone family, member X (H1fx), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185137082:185137660:-1 gene:ENSRNOG00000027722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185115300:185147298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT041714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023950 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB7A, member RAS oncogene family (Rab7a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB7A, member RAS oncogene family (Rab7a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185158361:185205835:-1 gene:ENSRNOG00000012247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB158427 // GenBank // Rattus norvegicus Rab7 mRNA for RAB7, complete cds, strain:F344/DuCrj. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AB158428 // GenBank // Rattus norvegicus Rab7 mRNA for RAB7, complete cds, strain:LEC/Crj. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF286535 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein RAB7 (Rab7) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC072470 // GenBank // Rattus norvegicus RAB7A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:91396 IMAGE:7098657), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185159644:185200105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000046568 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:185398611:185398931:-1 gene:ENSRNOG00000034129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012670 // RefSeq // Rattus norvegicus t-complex 1 (Tcp1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51719055:51726734:1 gene:ENSRNOG00000014160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// D90345 // GenBank // Rattus norvegicus Tcp-1 mRNA for t complex polypeptide 1, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ219229 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YM03 mRNA sequence. // chr4 // 60 // 52 // 9 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185422156:185496440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51722489:51726651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT041719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT000365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
FQ225819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA42YN15 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT000363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000017323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185436316:185630463:-1 gene:ENSRNOG00000012954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168694 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific, mRNA (cDNA clone MGC:188583 IMAGE:7937199), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001109249 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic elongation factor, selenocysteine-tRNA-specific (Eefsec), mRNA. // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000063950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185435789:185630486:-1 gene:ENSRNOG00000012954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT041720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185422156:185496440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000035500 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:185643161:185643478:-1 gene:ENSRNOG00000027211 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185643161:185643478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_199256 // RefSeq // Rattus norvegicus Sec61 alpha 1 subunit (S. cerevisiae) (Sec61a1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185693508:185707859:-1 gene:ENSRNOG00000013743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC094530 // GenBank // Rattus norvegicus Sec61 alpha 1 subunit (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105264 IMAGE:7320508), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185689478:185716127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT041726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_003749799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 12 (Kbtbd12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003753919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 12 (Kbtbd12), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000057264 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:185736887:185800053:-1 gene:ENSRNOG00000014498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000048469 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:185792262:185800053:-1 gene:ENSRNOG00000014498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185736887:185800053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_003749799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 12 (Kbtbd12), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 12 (Kbtbd12), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019428 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:185798902:185800053:-1 gene:ENSRNOG00000014498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048469 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:185792262:185800053:-1 gene:ENSRNOG00000014498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057264 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:185736887:185800053:-1 gene:ENSRNOG00000014498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185736887:185800053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_001005902 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1 (Abtb1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006236862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1 (Abtb1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186019189:186025416:-1 gene:ENSRNOG00000015762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083579 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94157 IMAGE:7128126), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186019573:186058581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001106607 // RefSeq // Rattus norvegicus podocalyxin-like 2 (Podxl2), mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000021826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186026104:186057984:-1 gene:ENSRNOG00000016255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC161970 // GenBank // Rattus norvegicus podocalyxin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:187779 IMAGE:9028963), complete cds. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186019573:186058581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107873 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 2 (Mcm2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006236863 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 2 (Mcm2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186066380:186080792:-1 gene:ENSRNOG00000016316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186066889:186080758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT041737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_002729398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin A1 (Plxna1), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186458289:186495366:-1 gene:ENSRNOG00000017003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186458289:186500274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001106608 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 6 (Chchd6), mRNA. // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:183964605:184187039:-1 gene:ENSRNOG00000017115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT041687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:184158463:184186946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:183965830:184053102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT041688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_153729 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 90 (Vom1r90), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000023832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184297337:184306351:-1 gene:ENSRNOG00000017726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY510354 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1ra16 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// U36898 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor VN6 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
NM_001008915 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 94 (Vom1r94), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000047687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184428239:184429454:-1 gene:ENSRNOG00000030746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY510286 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1ra13 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001008950 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 95 (Vom1r95), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184439872:184440816:-1 gene:ENSRNOG00000017743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510341 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1ra7 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173112 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 101 (Vom1r101), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000042796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:184653012:184653944:-1 gene:ENSRNOG00000029263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AY510287 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rb13 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// U36786 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor VN7 mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT041693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001191974 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13 (Chst13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 13 (Chst13), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000029915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:186765904:186779123:-1 gene:ENSRNOG00000025930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186765904:186779123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0
XM_006236885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 37 (Ccdc37), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024222 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:186855629:186870548:-1 gene:ENSRNOG00000017959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:186855629:186873152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_053322 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 210 (Nup210), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000008888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:187804480:187901455:1 gene:ENSRNOG00000005390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// Y00826 // GenBank // Rat mRNA for integral membrane glycoprotein gp210. // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000001948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:187804509:187880973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000057937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:187882344:187949091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001100473 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 7A (Wnt7a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:187505391:187551604:1 gene:ENSRNOG00000048782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:187448258:187549760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT040085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT040084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107874 // RefSeq // Rattus norvegicus xeroderma pigmentosum, complementation group C (Xpc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000011490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:187383715:187411243:1 gene:ENSRNOG00000008274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:187383774:187410471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT040078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_138535 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor interacting protein 2 (Grip2), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate receptor interacting protein 2 (Grip2), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:188120214:188159466:1 gene:ENSRNOG00000009726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000049657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:188120214:188170081:1 gene:ENSRNOG00000009726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:188120214:188170081:1 gene:ENSRNOG00000009726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AF072509 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor interacting protein 2 (GRIP2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF090113 // GenBank // Rattus norvegicus AMPA receptor binding protein mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// AF112182 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor interacting protein 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AF205193 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor interacting protein 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:188132685:188168130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT040089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_001025408 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S25 (Mrps25), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:189213384:189225146:1 gene:ENSRNOG00000010912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC097381 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S25, mRNA (cDNA clone MGC:114419 IMAGE:7445826), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT040106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:189213422:189229089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_001107875 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 20 (Zfyve20), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:189180786:189209501:1 gene:ENSRNOG00000011391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:189183753:189207146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_013046 // RefSeq // Rattus norvegicus thyrotropin releasing hormone (Trh), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thyrotropin releasing hormone (Trh), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:189148794:189151289:1 gene:ENSRNOG00000011824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161830 // GenBank // Rattus norvegicus thyrotropin releasing hormone, mRNA (cDNA clone MGC:187310 IMAGE:9091055), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ228762 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YB05 mRNA sequence. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// M12138 // GenBank // Rat thyrotropin-releasing hormone (TRH) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ222264 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA25YN07 mRNA sequence. // chr4 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:189127891:189150808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT040101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107876 // RefSeq // Rattus norvegicus prickle homolog 2 (Drosophila) (Prickle2), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prickle homolog 2 (Drosophila) (Prickle2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prickle homolog 2 (Drosophila) (Prickle2), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:188925956:189025114:1 gene:ENSRNOG00000012364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:188925764:189020022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001107877 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 9 (Adamts9), mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000057045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:188409401:188604215:1 gene:ENSRNOG00000023257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000007908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:188400098:188495396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT040093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 91 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000007912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:188512779:188628508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 28 // 28 // 15 // 54 // 1
GENSCAN00000011385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:190175964:190176898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001030045 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 1 (Magi1), mRNA. // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AY598952 // GenBank // Rattus norvegicus membrane associated guanylate kinase 1 b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000051360 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:190572188:190812193:-1 gene:ENSRNOG00000030542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT041799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000035922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:190809931:190812193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000036057 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:190818112:190818472:-1 gene:ENSRNOG00000022003 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:190818112:190818472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 70 // 14 // 16 // 0
ENSRNOT00000017099 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:191034224:191034681:-1 gene:ENSRNOG00000012822 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:191034341:191046132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
XM_001076882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 1 (Lrig1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000017384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:191131078:191158729:-1 gene:ENSRNOG00000012952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000072624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:191131078:191158729:-1 gene:ENSRNOG00000012952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 79 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:191123803:191166932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 79 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT041802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// NONRATT041803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 15 // 39 // 1 /// NONRATT041806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
GENSCAN00000026086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:191688181:191705088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001100750 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate-CoA ligase, GDP-forming, beta subunit (Suclg2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000068274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:192061201:192333899:-1 gene:ENSRNOG00000005686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC160886 // GenBank // Rattus norvegicus succinate-CoA ligase, GDP-forming, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:188299 IMAGE:7385389), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT041808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT041811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000011508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:192160890:192295706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT041812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// NONRATT041814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSRNOT00000039549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:192772220:192774184:-1 gene:ENSRNOG00000024560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079001 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear pore associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:93910 IMAGE:7112814), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000050382 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:193332283:193442038:1 gene:ENSRNOG00000030367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// XM_001077118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A1 (Fam19a1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// XM_006224995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A1 (Fam19a1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// XM_006236976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A1 (Fam19a1), partial mRNA. // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001134700 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (Fam19a4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (Fam19a4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4 (Fam19a4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:193702285:193933576:-1 gene:ENSRNOG00000005830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC160856 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A4, mRNA (cDNA clone MGC:187609 IMAGE:8364977), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009502 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF domain-specific O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase (Eogt), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006236964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EGF domain-specific O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase (Eogt), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006236965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EGF domain-specific O-linked N-acetylglucosamine (GlcNAc) transferase (Eogt), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000039353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:193983250:194019171:-1 gene:ENSRNOG00000024533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000011128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:193983250:194019171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT041821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT041822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
NM_053671 // RefSeq // Rattus norvegicus TATA element modulatory factor 1 (Tmf1), mRNA. // chr4 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000065696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:194025430:194047939:-1 gene:ENSRNOG00000005851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// AF107843 // GenBank // Rattus norvegicus TATA element modulatory factor mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000011130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:194025510:194047862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT041826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NONRATT041828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
NM_057205 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 3 (Uba3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006236936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 3 (Uba3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000008893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:194051849:194072884:-1 gene:ENSRNOG00000006221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF336829 // GenBank // Rattus norvegicus NEDD8-activating enzyme mRNA, complete cds. // chr4 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// BC081743 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 3, mRNA (cDNA clone MGC:93250 IMAGE:7124631), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT041830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT041831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// NONRATT041832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
XM_003753924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leiomodin 3 (fetal) (Lmod3), mRNA. // chr4 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// XM_006236972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leiomodin 3 (fetal) (Lmod3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047453 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:194114498:194119959:-1 gene:ENSRNOG00000032443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:194112638:194119959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT041833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 54 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT041834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_003749805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM domain containing 4B (Frmd4b), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006236974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM domain containing 4B (Frmd4b), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_232212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM domain containing 4B (Frmd4b), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:194159317:194342877:-1 gene:ENSRNOG00000007764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:194159317:194350151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000011804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:194393412:194393786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 69 // 18 // 20 // 0
NM_001034131 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box P1 (Foxp1), mRNA. // chr4 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// XM_006236955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P1 (Foxp1), transcript variant X14, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:195858738:196089931:-1 gene:ENSRNOG00000009184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// BC100267 // GenBank // Rattus norvegicus forkhead box P1, mRNA (cDNA clone MGC:116362 IMAGE:7383433), complete cds. // chr4 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000009158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:195883369:195965950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT041842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000036229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:195858794:195875995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// NONRATT041841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1 /// NONRATT041844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// NONRATT041845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_001106612 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E family member 3 (Eif4e3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:196560131:196602330:-1 gene:ENSRNOG00000010301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168936 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E member 3, mRNA (cDNA clone MGC:189235 IMAGE:7124999), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:196520139:196602307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001037541 // RefSeq // Rattus norvegicus prokineticin 2 (Prok2), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// NM_138852 // RefSeq // Rattus norvegicus prokineticin 2 (Prok2), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:196648794:196662391:-1 gene:ENSRNOG00000010898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:196648794:196662391:-1 gene:ENSRNOG00000010898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// AY089984 // GenBank // Rattus norvegicus prokineticin 2 precursor, mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// AY348322 // GenBank // Rattus norvegicus prokineticin 2 beta (PK2beta) mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// XM_006236938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prokineticin 2 (Prok2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000030408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:196658764:196662391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
XM_001077597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor-like (RGD1560513), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_575621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor-like (RGD1560513), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000052326 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:196787304:196787651:-1 gene:ENSRNOG00000033673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:196787304:196787651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107879 // RefSeq // Rattus norvegicus RING1 and YY1 binding protein (Rybp), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:197180863:197228554:-1 gene:ENSRNOG00000005353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:197023673:197275490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001134713 // RefSeq // Rattus norvegicus SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor (Shq1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000057758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:197520939:197616582:-1 gene:ENSRNOG00000005433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC168172 // GenBank // Rattus norvegicus SHQ1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187748 IMAGE:9026449), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000023548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:197549334:197610508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001271251 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing RING finger 3 (Pdzrn3), mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:198195671:198429459:-1 gene:ENSRNOG00000005632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:198166957:198250994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 55 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT041863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// NONRATT041864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000005077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:198406161:198446880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_019329 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin 3 (plasmacytoma associated) (Cntn3), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000008221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:199262482:199546616:-1 gene:ENSRNOG00000006144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// U11031 // GenBank // Rattus norvegicus neural cell adhesion molecule BIG-1 protein (BIG-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// GENSCAN00000004372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:199266740:199373637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT041866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
ENSRNOT00000048672 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:200550953:200552341:1 gene:ENSRNOG00000032820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:200502580:200589693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1
NM_053645 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 5 receptor, alpha (Il5ra), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:203266844:203297786:-1 gene:ENSRNOG00000005954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB056101 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for interleukin-5 receptor alpha chain, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// AF324153 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-5 receptor alpha mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:203282055:203311889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001015003 // RefSeq // Rattus norvegicus cereblon (Crbn), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:203337149:203355944:-1 gene:ENSRNOG00000006534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY973953 // GenBank // Rattus norvegicus cereblon (Crbn) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC127455 // GenBank // Rattus norvegicus cereblon, mRNA (cDNA clone MGC:156503 IMAGE:7112865), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:203338209:203359249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_001108639 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfatase modifying factor 1 (Sumf1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006236995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfatase modifying factor 1 (Sumf1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:204606895:204688360:-1 gene:ENSRNOG00000006813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000052210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:206579621:206586171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_001078533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ssu-2 homolog (Ssuh2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_002729443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ssu-2 homolog (Ssuh2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007591 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:207608748:207623060:-1 gene:ENSRNOG00000005734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:207558599:207624814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0
NM_012871 // RefSeq // Rattus norvegicus oxytocin receptor (Oxtr), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:207703615:207716373:-1 gene:ENSRNOG00000005806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF257237 // GenBank // Rattus norvegicus oxytocin receptor mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AY338194 // GenBank // Rattus norvegicus oxytocin receptor (Oxtr) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L81169 // GenBank // Rattus norvegicus oxytocin receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:207703636:207716343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001077673 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD18 homolog (S. cerevisiae) (Rad18), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD18 homolog (S. cerevisiae) (Rad18), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:207836648:207920030:-1 gene:ENSRNOG00000005907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC127510 // GenBank // Rattus norvegicus RAD18 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156682 IMAGE:8366167), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// EF395817 // GenBank // Rattus norvegicus RAD18 transcript variant (Rad18) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:207884211:207928903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT041880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT041882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NONRATT041886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191975 // RefSeq // Rattus norvegicus SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 3 (Srgap3), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:207938831:208167482:-1 gene:ENSRNOG00000006509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:207939202:207976179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000044449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:207983008:208078583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_181387 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 4 (Lhfpl4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208415890:208445642:-1 gene:ENSRNOG00000007727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY278321 // GenBank // Rattus norvegicus HMGIC fusion partner-like protein 4 (Lhfpl4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208418936:208466726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001044272 // RefSeq // Rattus norvegicus jagunal homolog 1 (Drosophila) (Jagn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000012177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208697312:208701997:1 gene:ENSRNOG00000009175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC098749 // GenBank // Rattus norvegicus jagunal homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:112769 IMAGE:7365215), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006237053 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus jagunal homolog 1 (Drosophila) (Jagn1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000050195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208697411:208723282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT040201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_134468 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase I (Camk1), mRNA. // chrU // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000029728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208586463:208596796:-1 gene:ENSRNOG00000021781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC071177 // GenBank // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase I, mRNA (cDNA clone MGC:91494 IMAGE:7098592), complete cds. // chrU // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// FQ213485 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YI22 mRNA sequence. // chrU // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// L24907 // GenBank // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase I mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// L26288 // GenBank // Rattus norvegicus CaM-like protein kinase mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208586636:208596158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT041898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 81 // 81 // 30 // 37 // 1
NM_001025734 // RefSeq // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 3 (Tada3), mRNA. // chr4 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208615470:208626923:-1 gene:ENSRNOG00000008597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// BC097414 // GenBank // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 3 (NGG1 homolog, yeast)-like, mRNA (cDNA clone MGC:114459 IMAGE:7454313), complete cds. // chr4 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208615813:208628037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// NONRATT041899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT041902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT041901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT041903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108641 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA pseudouridylate synthase domain containing 3 (Rpusd3), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA pseudouridylate synthase domain containing 3 (Rpusd3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208663811:208668038:-1 gene:ENSRNOG00000009084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA pseudouridylate synthase domain containing 3 (Rpusd3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT041905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208664016:208687569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT041906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT041909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001024333 // RefSeq // Rattus norvegicus cell death-inducing DFFA-like effector c (Cidec), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001244797 // RefSeq // Rattus norvegicus cell death-inducing DFFA-like effector c (Cidec), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001244798 // RefSeq // Rattus norvegicus cell death-inducing DFFA-like effector c (Cidec), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208674529:208687192:-1 gene:ENSRNOG00000009153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083860 // GenBank // Rattus norvegicus cell death-inducing DFFA-like effector c, mRNA (cDNA clone MGC:95093 IMAGE:7126532), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208664016:208687569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XM_006225005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 3 (Prrt3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 3 (Prrt3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 3 (Prrt3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 3 (Prrt3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208748160:208752133:-1 gene:ENSRNOG00000009863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208750681:208752133:-1 gene:ENSRNOG00000009863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208748160:208752133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// NONRATT041914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT041915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001008355 // RefSeq // Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 3 (Emc3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208768761:208784670:-1 gene:ENSRNOG00000009934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085846 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 111, mRNA (cDNA clone MGC:94540 IMAGE:7189020), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208769762:208774406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT041916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001109251 // RefSeq // Rattus norvegicus FANCD2 opposite strand (Fancd2os), mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006237051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FANCD2 opposite strand (Fancd2os), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FANCD2 opposite strand (Fancd2os), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000013503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208848668:208852146:-1 gene:ENSRNOG00000010177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000050196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208849395:208852163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT041917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT041918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_021669 // RefSeq // Rattus norvegicus ghrelin/obestatin prepropeptide (Ghrl), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208970556:208974465:-1 gene:ENSRNOG00000010349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB029433 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ghrelin precursor, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AB035699 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prepro-des-Gln14-ghrelin, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT041919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:208971432:208975471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001006978 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC13 homolog (S. cerevisiae) (Sec13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000014377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:208982590:208995976:-1 gene:ENSRNOG00000010628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC084705 // GenBank // Rattus norvegicus SEC13 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105923 IMAGE:7301091), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ212944 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YJ09 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT041921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NONRATT041441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 75 // 80 // 15 // 20 // 0 /// NONRATT041929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT041441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001015004 // RefSeq // Rattus norvegicus vestigial-like family member 4 (Vgll4), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210069605:210129654:-1 gene:ENSRNOG00000007822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC091399 // GenBank // Rattus norvegicus vestigial like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:109514 IMAGE:7323935), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// FQ220379 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YB20 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT041935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:209984583:210129289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT041934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT041937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT041938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT041936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001108642 // RefSeq // Rattus norvegicus TAM41, mitochondrial translocator assembly and maintenance protein, homolog (S. cerevisiae) (Tamm41), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210211579:210243653:-1 gene:ENSRNOG00000007874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ216439 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YO09 mRNA sequence. // chr4 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210207642:210243562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109393 // RefSeq // Rattus norvegicus tissue inhibitor of metalloproteinase 4 (Timp4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210445694:210452213:-1 gene:ENSRNOG00000007955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210446356:210451849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT041941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_012639 // RefSeq // Rattus norvegicus v-raf-leukemia viral oncogene 1 (Raf1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210819150:210836805:-1 gene:ENSRNOG00000010153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC062071 // GenBank // Rattus norvegicus v-raf-leukemia viral oncogene 1, mRNA (cDNA clone MGC:72519 IMAGE:5599540), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M15427 // GenBank // Rat c-raf protooncogene mRNA encoding raf protein, complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210819857:210842751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// M15428 // GenBank // Rat activated c-raf oncogene mRNA encoding a fused protein, complete cds. // chr4 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT041950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT041945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT041949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001191573 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 40 (Tmem40), mRNA. // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:210929394:210942266:-1 gene:ENSRNOG00000010430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:210909514:210956251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT041951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
NONRATT041953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT041954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
XM_003749810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 12 (Efcab12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// XM_003753940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 12 (Efcab12), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// XM_006225018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 12 (Efcab12), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// XM_006225019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 12 (Efcab12), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// XM_006237065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 12 (Efcab12), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211004604:211025825:-1 gene:ENSRNOG00000026176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211004604:211040700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
XM_001059437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 4 (Mbd4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_002726448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 4 (Mbd4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014537 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:211029615:211040005:-1 gene:ENSRNOG00000010919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC158892 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455805. // chr4 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000071994 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:211029615:211031701:-1 gene:ENSRNOG00000010919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000037550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211004604:211040700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT041956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_001107881 // RefSeq // Rattus norvegicus plexin D1 (Plxnd1), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000032158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211138020:211177703:-1 gene:ENSRNOG00000025209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211135893:211177835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT041959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT041960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1
NONRATT041962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
XM_006225022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 1 (Tmcc1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 1 (Tmcc1), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006237070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 1 (Tmcc1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000042418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211205163:211332130:-1 gene:ENSRNOG00000011614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000056393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211328853:211332130:-1 gene:ENSRNOG00000011614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// XM_006225026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 1 (Tmcc1), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XM_006237072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 1 (Tmcc1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211205163:211208549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211231012:211332022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT041964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006225028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L23a-like (LOC680441), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006237158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L23a-like (LOC680441), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000051510 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:214307794:214308258:-1 gene:ENSRNOG00000033439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214307794:214308258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_012822 // RefSeq // Rattus norvegicus arachidonate 5-lipoxygenase (Alox5), mRNA. // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214346150:214393226:-1 gene:ENSRNOG00000012972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// J03960 // GenBank // Rat 5-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr4 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214346575:214364629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0
NM_001000899 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 831 (Olr831), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214627158:214628090:-1 gene:ENSRNOG00000050429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214620006:214628090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT042013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000898 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 832 (Olr832), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214647990:214648922:-1 gene:ENSRNOG00000048539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214647990:214648922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001012745 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 422 (Zfp422), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006237187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 422 (Zfp422), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006237188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 422 (Zfp422), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214696098:214700282:-1 gene:ENSRNOG00000013379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF281635 // GenBank // Rattus norvegicus Kruppel-type zinc finger protein KROX-25 mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// AY724498 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cpw-m-06-0-UI unknown mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC090354 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 422, mRNA (cDNA clone MGC:105332 IMAGE:7319307), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214697463:214698176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT042015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT042016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
NM_001024275 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 4 (Rassf4), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006237191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 4 (Rassf4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214707827:214742088:-1 gene:ENSRNOG00000013526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC093620 // GenBank // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:105606 IMAGE:7315142), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000025335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214709203:214720233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001108643 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 72 (Tmem72), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214757519:214782812:-1 gene:ENSRNOG00000023340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214741441:214782474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
ENSRNOT00000018151 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:214887668:214888712:-1 gene:ENSRNOG00000023285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:214887762:214888712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT042022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000028918 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:215708079:215708573:-1 gene:ENSRNOG00000023121 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:215708126:215708743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 95 // 18 // 20 // 0
GENSCAN00000000654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:215886629:215887759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_022388 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 4 (Fxyd4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 4 (Fxyd4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000019649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:215913322:215917183:-1 gene:ENSRNOG00000014578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L41254 // GenBank // Rattus norvegicus corticosteroid-induced protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:215913486:215944714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT042027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006237209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H2A.V-like (LOC685069), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000056335 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:215957948:215958334:-1 gene:ENSRNOG00000037266 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:215957948:215958334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_001106616 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Csgalnact2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006237180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Csgalnact2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Csgalnact2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000019778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216081812:216113012:-1 gene:ENSRNOG00000014713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000038090 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54392863:54394490:1 gene:ENSRNOG00000023101 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:216083440:216104886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54251160:54394490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT042029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001110099 // RefSeq // Rattus norvegicus ret proto-oncogene (Ret), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NM_012643 // RefSeq // Rattus norvegicus ret proto-oncogene (Ret), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000047685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216130625:216172348:-1 gene:ENSRNOG00000014751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000000647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:216133071:216217404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT042032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT042033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 87 // 87 // 40 // 46 // 1
NM_001100751 // RefSeq // Rattus norvegicus BMS1 ribosome biogenesis factor (Bms1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008741 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:216359881:216395631:-1 gene:ENSRNOG00000006576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC166492 // GenBank // Rattus norvegicus BMS1 homolog, ribosome assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:188019 IMAGE:7110317), complete cds. // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:216369124:216392403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT042036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006225034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 248 (Zfp248), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216407426:216429195:-1 gene:ENSRNOG00000037251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY724530 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cqa-k-03-0-UI unknown mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:216394346:216540555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001127635 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 9 (Zfp9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216439332:216446212:-1 gene:ENSRNOG00000006726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001127635 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 9 (Zfp9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216441791:216444635:-1 gene:ENSRNOG00000006726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216439332:216446212:-1 gene:ENSRNOG00000006726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166539 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:188133 IMAGE:7191896), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001057458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 26 (Ankrd26), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_232319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 26 (Ankrd26), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000056301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216472895:216540555:-1 gene:ENSRNOG00000006717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216472889:216540555:-1 gene:ENSRNOG00000006717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:216394346:216540555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_001109430 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and transmembrane domains 2 (Lrtm2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:217290883:217305501:-1 gene:ENSRNOG00000007508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:217293007:217302491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT042058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037979 // RefSeq // Rattus norvegicus adiponectin receptor 2 (Adipor2), mRNA. // chr4 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:217328527:217363832:-1 gene:ENSRNOG00000007990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// DQ148392 // GenBank // Rattus norvegicus adiponectin receptor 2 (Adipor2) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// FQ232508 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YH14 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 95 // 31 // 35 // 0 /// GENSCAN00000057677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:217329791:217343933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT042059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT042060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0
NM_001100489 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 5B (Wnt5b), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:217413755:217429687:-1 gene:ENSRNOG00000008168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC161860 // GenBank // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 5B, mRNA (cDNA clone MGC:187394 IMAGE:7096336), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:217394953:217428511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT042061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
XM_006237224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 (Erc1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006237224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 (Erc1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_170788 // RefSeq // Rattus norvegicus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 (Erc1), mRNA. // chr4 // 97 // 80 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000012397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219179492:219465108:-1 gene:ENSRNOG00000009264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 80 // 34 // 35 // 0 /// AF541926 // GenBank // Rattus norvegicus ERC1b mRNA, complete cds; alternatively splice. // chr4 // 91 // 80 // 32 // 35 // 0 /// AY174115 // GenBank // Rattus norvegicus CAST2a mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 80 // 34 // 35 // 0 /// XM_006237224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 1 (Erc1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 39 // 44 // 1 /// GENSCAN00000027606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219369374:219440841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 30 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT042068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000053128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219236846:219361403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1
NM_001002823 // RefSeq // Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 1 (Wnk1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_001199095 // RefSeq // Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 1 (Wnk1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_053794 // RefSeq // Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 1 (Wnk1), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000013355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219537467:219662816:-1 gene:ENSRNOG00000009956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219537467:219662816:-1 gene:ENSRNOG00000009956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AF227741 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase WNK1 (WNK1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219539894:219620602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001002823 // RefSeq // Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 1 (Wnk1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NM_001199095 // RefSeq // Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 1 (Wnk1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219537467:219662816:-1 gene:ENSRNOG00000009956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219537467:219662816:-1 gene:ENSRNOG00000009956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219539894:219620602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT042073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191976 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 3 (B4galnt3), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006237268 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 3 (B4galnt3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000036721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219826817:219924277:-1 gene:ENSRNOG00000010344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000027608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219826828:219859931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0
NM_001191752 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 77 (Ccdc77), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006237236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 77 (Ccdc77), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 77 (Ccdc77), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000056200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219949770:219972305:-1 gene:ENSRNOG00000037206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219939273:219969757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT042088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT042090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
XM_006225148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cat eye syndrome chromosome region, candidate 6 (Cecr6), mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_575656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cat eye syndrome chromosome region, candidate 6 (Cecr6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074558 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:220114018:220115736:-1 gene:ENSRNOG00000046851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000013030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220114018:220115736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001107884 // RefSeq // Rattus norvegicus cat eye syndrome chromosome region, candidate 5 (Cecr5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220134732:220167528:-1 gene:ENSRNOG00000011338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220135348:220167514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT042093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT042094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_198745 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit E1 (Atp6v1e1), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220441645:220463709:-1 gene:ENSRNOG00000011905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC059155 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit E1, mRNA (cDNA clone MGC:72933 IMAGE:6887702), complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// FQ213667 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YH14 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ224527 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA63YB05 mRNA sequence. // chr4 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220442088:220463587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_022684 // RefSeq // Rattus norvegicus BH3 interacting domain death agonist (Bid), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220531877:220554316:-1 gene:ENSRNOG00000012439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF136282 // GenBank // Rattus norvegicus apoptotic death agonist BID (BID) mRNA, complete cds. // chr4 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// AF259503 // GenBank // Rattus norvegicus BID protein (Bid) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// D89804 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for desmocollin type 4, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT042098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220527362:220553895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001191085 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated monoxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220573991:220682835:-1 gene:ENSRNOG00000027841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220573991:220682759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001191085 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated monoxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006237250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000038551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220573991:220682835:-1 gene:ENSRNOG00000027841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220573991:220682759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_001191085 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated monoxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC083659 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule associated monoxygenase, calponin and LIM domain containing 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7135281), complete cds. // chr4 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// BC160830 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule associated monoxygenase, calponin and LIM domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:187522 IMAGE:7453653), complete cds. // chr4 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// XM_006237250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 3 (Mical3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000038551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220573991:220682835:-1 gene:ENSRNOG00000027841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000034081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220573991:220682759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT042106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_207617 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif and Sec7 domain 3 (Iqsec3), mRNA. // chr4 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// XR_353587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif and Sec7 domain 3 (Iqsec3), transcript variant X1, misc_RNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:221035990:221132460:-1 gene:ENSRNOG00000014083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AB057643 // GenBank // Rattus norvegicus sag mRNA for synArfGEF, complete cds. // chr4 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:221033805:221104255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000045955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:221660132:221661129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:221732624:221758308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1
NM_001271376 // RefSeq // Rattus norvegicus C3 and PZP-like, alpha-2-macroglobulin domain containing 8 (Cpamd8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_031649 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily G, member 1 (Klrg1), mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000020094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222068697:222080497:-1 gene:ENSRNOG00000014918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// X79812 // GenBank // R.norvegicus mafa mRNA for mast cell function associated antigen. // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222064314:222080525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// NONRATT042117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1 /// NONRATT042118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NM_001107886 // RefSeq // Rattus norvegicus polyhomeotic homolog 1 (Drosophila) (Phc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222121225:222143340:-1 gene:ENSRNOG00000015191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222121963:222140757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT042123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
XM_006225038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal modification protein rimK-like family member B (Rimklb), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal modification protein rimK-like family member B (Rimklb), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000055433 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:248214033:248215196:-1 gene:ENSRNOG00000036910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020866 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:222281854:222293504:-1 gene:ENSRNOG00000023814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000032690 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:222285403:222293504:-1 gene:ENSRNOG00000023814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222285403:222303735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:248214033:248215196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT042126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_012907 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1 (Apobec1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1 (Apobec1), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222411176:222425679:-1 gene:ENSRNOG00000015411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085335 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:105503 IMAGE:7301703), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L07114 // GenBank // Rat apolipoprotein B mRNA editing protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1 (Apobec1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// XM_006237293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1 (Apobec1), transcript variant X9, mRNA. // chr4 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT042129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006237285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1 (Apobec1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109671 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 3 (Gdf3), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222441203:222445535:-1 gene:ENSRNOG00000015331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ372084 // GenBank // Rattus norvegicus growth differentiation factor 3 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222425223:222445436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSRNOT00000056103 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:222491273:222491698:-1 gene:ENSRNOG00000037170 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222491273:222509889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000013067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222516896:222539431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
BC063168 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:72866 IMAGE:6887820), complete cds. // chr4 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// D13962 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neuron glucose transporter. // chr4 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NM_017102 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 3 (Slc2a3), mRNA. // chr4 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// XM_006237297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 3 (Slc2a3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// XM_006237298 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 3 (Slc2a3), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000011298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222573369:222584541:-1 gene:ENSRNOG00000008376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000071745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222773213:222784266:-1 gene:ENSRNOG00000049298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// U17978 // GenBank // Rattus norvegicus glucose transporter-3 (GLUT3) mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000013055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222773213:222823066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222573369:222584416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000013052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222604265:222604720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000056097 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:222604265:222604720:-1 gene:ENSRNOG00000008910 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 60 // 68 // 9 // 15 // 0
NM_032060 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 3a receptor 1 (C3ar1), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222704908:222711635:-1 gene:ENSRNOG00000009211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U86379 // GenBank // Rattus norvegicus anaphylatoxin C3a receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222705388:222706728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT042134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L31-like (RGD1563551), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006237318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L31-like (RGD1563551), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000047507 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:222723412:222723786:-1 gene:ENSRNOG00000030657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222723412:222723786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001287617 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00188 (LOC102550396), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:222748634:222760959:-1 gene:ENSRNOG00000030870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005897 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member E (Clec4e), mRNA. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006237323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member E (Clec4e), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223287986:223293143:-1 gene:ENSRNOG00000010203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY363175 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage-inducible C-type lectin (Clecsf9) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AY494064 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA macrophage-inducible C-type lectin (Clecsf9) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AY581049 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW macrophage-inducible C-type lectin (Mincle) mRNA, complete cds. // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT042142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001099510 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 51 (Vom2r51), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000045305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223530998:223579137:-1 gene:ENSRNOG00000037155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT042143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001099510 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 51 (Vom2r51), mRNA. // chr4 // 89 // 90 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000045305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223530998:223579137:-1 gene:ENSRNOG00000037155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 90 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223543811:223644709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 89 // 90 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT042143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001099503 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 52 (Vom2r52), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000042249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223613422:223645983:-1 gene:ENSRNOG00000033494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223543811:223644709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT042144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
NM_001108645 // RefSeq // Rattus norvegicus LOC362433 (RGD1307916), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223841837:223964250:-1 gene:ENSRNOG00000042494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223841947:223842077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT042146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223924544:223977098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001170584 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 5 (Pex5), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 5 (Pex5), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224003342:224029468:-1 gene:ENSRNOG00000049203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224003342:224029468:-1 gene:ENSRNOG00000049203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223418716:223443454:-1 gene:ENSRNOG00000010407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:223418716:223443454:-1 gene:ENSRNOG00000010407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224004491:224028729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:223419865:223497719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_134376 // RefSeq // Rattus norvegicus calsyntenin 3 (Clstn3), mRNA. // chr4 // 83 // 88 // 30 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224064529:224097591:-1 gene:ENSRNOG00000011156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224064533:224072647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000021595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224083053:224097450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT042150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT042151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT042154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
ENSRNOT00000016330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224162096:224174113:-1 gene:ENSRNOG00000011971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000056058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224162699:224174113:-1 gene:ENSRNOG00000011971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC062042 // GenBank // Rattus norvegicus complement component 1, s subcomponent, mRNA (cDNA clone MGC:72298 IMAGE:5598051), complete cds. // chr4 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// NM_138900 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, s subcomponent (C1s), mRNA. // chr4 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0 /// D88250 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for serine protease, complete cds. // chr4 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224162678:224173052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT042157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001107888 // RefSeq // Rattus norvegicus EMG1 N1-specific pseudouridine methyltransferase (Emg1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224239981:224248243:-1 gene:ENSRNOG00000012828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224240944:224246177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NR_031887 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-141 (Mir141), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053700 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:224253942:224254035:-1 gene:ENSRNOG00000035577 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-141 // miRBase Micro RNA Database // MI0000914 Rattus norvegicus miR-141 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_031915 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-200c (Mir200c), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-200c // miRBase Micro RNA Database // MI0000942 Rattus norvegicus miR-200c stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053908 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6 (Ptpn6), mRNA. // chr4 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224256737:224281486:-1 gene:ENSRNOG00000014294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC099824 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6, mRNA (cDNA clone MGC:124580 IMAGE:7932620), complete cds. // chr4 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// FQ232747 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YJ09 mRNA sequence. // chr4 // 95 // 57 // 20 // 21 // 0 /// U77038 // GenBank // Rattus norvegicus protein-tyrosine phosphatase (SHP-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224254185:224321547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT042164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// NONRATT042165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1 /// NONRATT042166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001198725 // RefSeq // Rattus norvegicus gene rich cluster, C10 gene (Grcc10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006244638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein C10-like (LOC100911713), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000019570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224281979:224283614:-1 gene:ENSRNOG00000025810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075612 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:19155914:19157171:1 gene:ENSRNOG00000050660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000021591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224254185:224321547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19117682:19173886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_017228 // RefSeq // Rattus norvegicus atrophin 1 (Atn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224284992:224298835:-1 gene:ENSRNOG00000014611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051841 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:19146878:19153732:1 gene:ENSRNOG00000049575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// U31777 // GenBank // Rattus norvegicus atrophin-1 (DRPLA) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// GENSCAN00000021591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224254185:224321547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19117682:19173886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_139325 // RefSeq // Rattus norvegicus enolase 2, gamma, neuronal (Eno2), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:19128876:19135596:1 gene:ENSRNOG00000048365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000005601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224302789:224311633:-1 gene:ENSRNOG00000013141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF019973 // GenBank // Rattus norvegicus neuron-specific enolase (NSE) mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC060310 // GenBank // Rattus norvegicus enolase 2, gamma, neuronal, mRNA (cDNA clone MGC:72663 IMAGE:6888358), complete cds. // chr4 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// FQ212835 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YB19 mRNA sequence. // chr4 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// M11931 // GenBank // Rat brain neuron-specific enolase mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224254185:224321547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000028350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19117682:19173886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_022922 // RefSeq // Rattus norvegicus triosephosphate isomerase 1 (Tpi1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000020647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224346077:224349539:-1 gene:ENSRNOG00000015290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC061781 // GenBank // Rattus norvegicus triosephosphate isomerase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5623367), partial cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC126087 // GenBank // Rattus norvegicus triosephosphate isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:156639 IMAGE:8368624), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ212773 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YH15 mRNA sequence. // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// FQ214607 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YA12 mRNA sequence. // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// FQ215529 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YN23 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// FQ215810 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YI17 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ215834 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YG10 mRNA sequence. // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// FQ228894 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YL21 mRNA sequence. // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// L36250 // GenBank // Rattus norvegicus (clone 71) triosephosphate isomerase mRNA, complete cds. // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// FQ212675 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YP11 mRNA sequence. // chr4 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
NM_001106619 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 5 (isopeptidase T) (Usp5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006244623 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5-like (LOC100911959), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224350336:224365479:-1 gene:ENSRNOG00000015409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FQ225065 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YE04 mRNA sequence. // chr4 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// GENSCAN00000002034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224359193:224365403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT042167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000021578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224346645:224358260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// GENSCAN00000028340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:19066535:19092584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1
NM_021858 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 3 (Gnb3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224370235:224375938:-1 gene:ENSRNOG00000015541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086422 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:105437 IMAGE:7193131), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 3 (Gnb3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT042169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224370656:224396631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT042170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT042171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT042172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT042173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001106620 // RefSeq // Rattus norvegicus leprecan-like 2 (Leprel2), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leprecan-like 2 (Leprel2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224377008:224390639:-1 gene:ENSRNOG00000016071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC168992 // GenBank // Rattus norvegicus leprecan-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:189333 IMAGE:9031491), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224370656:224396631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001108646 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 162 (Gpr162), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 162 (Gpr162), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224392962:224398883:-1 gene:ENSRNOG00000016143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224370656:224396631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT042180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_012705 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd4 molecule (Cd4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224400830:224425954:-1 gene:ENSRNOG00000016294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// M15768 // GenBank // Rat W3/25 antigen (homologue of human CD4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224401714:224418074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_212513 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte-activation gene 3 (Lag3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte-activation gene 3 (Lag3), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224443424:224451161:-1 gene:ENSRNOG00000021334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY230414 // GenBank // Rattus norvegicus LAG-3 mRNA, complete cds. // chr4 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// BC091201 // GenBank // Rattus norvegicus lymphocyte-activation gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:108901 IMAGE:7380279), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224443514:224451039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT042184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT042187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_031975 // RefSeq // Rattus norvegicus parathymosin (Ptms), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224453141:224457317:-1 gene:ENSRNOG00000016386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC167753 // GenBank // Rattus norvegicus parathymosin, mRNA (cDNA clone MGC:187356 IMAGE:7371571), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M20616 // GenBank // Rat spleen parathymosin-alpha mRNA, 3 end. // chr4 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// M33025 // GenBank // Rattus norvegicus parathymosin mRNA, 3 end. // chr4 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT042188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224453846:224463646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001047098 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7A (Cops7a), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006237368 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7A (Cops7a), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006237369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7A (Cops7a), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224497387:224504671:-1 gene:ENSRNOG00000016778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB259153 // GenBank // Rattus norvegicus ZH11 mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// FQ215513 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YO20 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ216290 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YK12 mRNA sequence. // chr4 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NM_001164091 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 7A (Cops7a), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000038281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224498490:224504671:-1 gene:ENSRNOG00000016778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT042190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224490196:224524567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT042189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NONRATT042194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000025889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224700041:224722925:-1 gene:ENSRNOG00000018771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ227797 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YN03 mRNA sequence. // chr4 // 80 // 31 // 8 // 10 // 0 /// FQ231221 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA77YH24 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224693779:224721781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT042205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_001106622 // RefSeq // Rattus norvegicus TAP binding protein-like (Tapbpl), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224752544:224759995:-1 gene:ENSRNOG00000027552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224752832:224766821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_001024335 // RefSeq // Rattus norvegicus CD27 molecule (Cd27), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD27 molecule (Cd27), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224761678:224766884:-1 gene:ENSRNOG00000027466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC095844 // GenBank // Rattus norvegicus CD27 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:112688 IMAGE:7389613), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224752832:224766821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT042212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT042211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT042214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001040008 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, alpha 3A (Tuba3a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000044425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224806670:224815559:-1 gene:ENSRNOG00000031707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC079395 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, alpha 3A, mRNA (cDNA clone MGC:94913 IMAGE:7112099), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224806761:224846095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001008315 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphotoxin beta receptor (TNFR superfamily, member 3) (Ltbr), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224839883:224846284:-1 gene:ENSRNOG00000019264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC085880 // GenBank // Rattus norvegicus lymphotoxin beta receptor (TNFR superfamily, member 3), mRNA (cDNA clone MGC:94657 IMAGE:7191913), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224806761:224846095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT042218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
XM_006225049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 6 (Plekhg6), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 6 (Plekhg6), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026441 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:224894466:224910903:-1 gene:ENSRNOG00000019528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224894466:225022502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_053018 // RefSeq // Rattus norvegicus CD9 molecule (Cd9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224989642:225022649:-1 gene:ENSRNOG00000019556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC161804 // GenBank // Rattus norvegicus CD9 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:187212 IMAGE:9101765), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ213846 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YE22 mRNA sequence. // chr4 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// FQ220843 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YH24 mRNA sequence. // chr4 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// FQ230141 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YH23 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// KC162232 // GenBank // Rattus norvegicus CD9 alternative transcript B mRNA sequence. // chr4 // 85 // 46 // 11 // 13 // 0 /// KC162233 // GenBank // Rattus norvegicus CD9 alternative transcript C mRNA sequence. // chr4 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000012180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:224894466:225022502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001270868 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant 3, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NM_001270869 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NM_001270870 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant 4, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NM_031073 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophin 3 (Ntf3), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:225638802:225707718:-1 gene:ENSRNOG00000019716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC070504 // GenBank // Rattus norvegicus neurotrophin 3, mRNA (cDNA clone MGC:91650 IMAGE:7097740), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M34643 // GenBank // Rat neurotrophin-3 (HDNF/NT-3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT042222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_012972 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 5 (Kcna5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226075051:226076859:-1 gene:ENSRNOG00000019719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226075051:226076859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173095 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 1 (Kcna1), mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000026731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226189075:226190562:-1 gene:ENSRNOG00000019750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// M26161 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226189075:226190562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT042227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_023954 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage gated channel, shaker related subfamily, member 6 (Kcna6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232324385:232357644:1 gene:ENSRNOG00000047736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000034412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232326031:232327623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
NM_001100752 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 9 (Ndufa9), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000037176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232213354:232241728:1 gene:ENSRNOG00000026930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC168777 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 9, mRNA (cDNA clone MGC:188930 IMAGE:6922152), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ229898 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YE23 mRNA sequence. // chr4 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// FQ229931 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YD03 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// FQ233877 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YA12 mRNA sequence. // chr4 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232213385:232241643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT040557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001079711 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD51 associated protein 1 (Rad51ap1), mRNA. // chr4 // 97 // 52 // 29 // 30 // 0 /// XM_006225054 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 4 (Dyrk4), mRNA. // chr4 // 100 // 48 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD51 associated protein 1 (Rad51ap1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 43 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026796 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:232159206:232185653:1 gene:ENSRNOG00000024774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232130924:232143989:1 gene:ENSRNOG00000042647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049662 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:232145838:232185653:1 gene:ENSRNOG00000024774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 26 // 26 // 0 /// BC128747 // GenBank // Rattus norvegicus RAD51 associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:156698 IMAGE:7099220), complete cds. // chr4 // 97 // 52 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232137360:232185653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT040553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 30 // 58 // 1 /// NONRATT040554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 26 // 58 // 1 /// NONRATT040555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 13 // 58 // 1
NM_001025064 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC502894 (LOC502894), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000049991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:231948824:231966866:1 gene:ENSRNOG00000021565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ217296 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA2YP08 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_022267 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin D2 (Ccnd2), mRNA. // chr4 // 75 // 88 // 21 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:231905237:231927558:1 gene:ENSRNOG00000019939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// D16308 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cyclin D2, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FQ233117 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YC07 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FQ234359 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YE06 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// L09752 // GenBank // Rat cyclin D2 (VIN1) mRNA, complete cds. // chr4 // 75 // 88 // 21 // 28 // 0 /// NONRATT040546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231901943:231965007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT040547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001271385 // RefSeq // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 8 (Prmt8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:231280525:231360197:1 gene:ENSRNOG00000005140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231212664:231352315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT040545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001107890 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 9 (Tspan9), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 9 (Tspan9), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 9 (Tspan9), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:231011142:231085237:1 gene:ENSRNOG00000005442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:231078443:231082124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT040543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT040540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT040539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT040541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT040542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001002834 // RefSeq // Rattus norvegicus Sumo1/sentrin/SMT3 specific peptidase 18 (Senp18), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000044405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:230818138:230819565:1 gene:ENSRNOG00000050861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000043708 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:226300957:226302383:-1 gene:ENSRNOG00000030159 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226300957:226302353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 82 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:230818168:230819565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001002833 // RefSeq // Rattus norvegicus Sumo1/sentrin/SMT3 specific peptidase 17 (Senp17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006225060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TEA domain family member 4 (Tead4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TEA domain family member 4 (Tead4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TEA domain family member 4 (Tead4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TEA domain family member 4 (Tead4), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007510 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:226750625:226793470:-1 gene:ENSRNOG00000005608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050834 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:226750625:226793470:-1 gene:ENSRNOG00000005608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226750625:226808245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT042230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
XM_006225067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubby-like protein 3 (Tulp3), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// XM_006237434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubby-like protein 3 (Tulp3), mRNA. // chrU // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000007634 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:226844164:226883755:-1 gene:ENSRNOG00000005767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT042235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NR_027366 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 5930416I19Rik protein (MGC94282), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NR_027367 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 5930416I19Rik protein (MGC94282), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr4 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000039086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226885736:226891055:-1 gene:ENSRNOG00000028517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC079219 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 5930416I19Rik protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131947). // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 83 // 60 // 5 // 6 // 0
NM_001108648 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin alpha FG-GAP repeat containing 2 (Itfg2), mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin alpha FG-GAP repeat containing 2 (Itfg2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226936891:226949388:-1 gene:ENSRNOG00000006264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226936182:226949437:-1 gene:ENSRNOG00000006264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC158714 // GenBank // Rattus norvegicus integrin alpha FG-GAP repeat containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:187852 IMAGE:9088606), complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226936989:227109321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001191863 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 4 (Fkbp4), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000008737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226954534:226962988:-1 gene:ENSRNOG00000006444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226936989:227109321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_145779 // RefSeq // Rattus norvegicus pregnancy-zone protein (Pzp), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006237407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pregnancy-zone protein (Pzp), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000009467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227010998:227056787:-1 gene:ENSRNOG00000006709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ210288 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA30YN23 mRNA sequence. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// FQ218543 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YH15 mRNA sequence. // chr4 // 75 // 33 // 9 // 12 // 0 /// M77183 // GenBank // R.norvegicus alpha-1-macroglobulin mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// M84000 // GenBank // Rat alpha-1-macrogloculin mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226936989:227109321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT042248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
XM_001066684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to ovostatin-2 (RGD1565709), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009557 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:227068060:227109321:-1 gene:ENSRNOG00000007247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226936989:227109321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_001085402 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2 member D2 (Clec2d2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000038801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227636211:227644397:1 gene:ENSRNOG00000007866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072064 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:227479767:227697509:1 gene:ENSRNOG00000007866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// EF100686 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley CLEC2D2 (Clec2d2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ221935 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YO07 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT040515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:227603957:227643753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
NM_001101019 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to osteoclast inhibitory lectin (LOC689757), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006237449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to osteoclast inhibitory lectin (LOC689757), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006237450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to osteoclast inhibitory lectin (LOC689757), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000042872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227379693:227427294:-1 gene:ENSRNOG00000037076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000045501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227379693:227387859:-1 gene:ENSRNOG00000037076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// EF100687 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley CLEC2D3 (Clec2d3) mRNA, complete cds. // chr4 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// FJ404472 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2 member d3 (Clec2d3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT042258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT042259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001142304 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to osteoclast inhibitory lectin (LOC689770), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FJ404474 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2 member d4 (Clec2d4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ229900 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YE20 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000029183 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:227656207:227656605:-1 gene:ENSRNOG00000027063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000026285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:227656207:227668838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
XM_003753949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688980 (LOC688980), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000044407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:227695120:227696928:-1 gene:ENSRNOG00000049557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000026276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:227696295:227696846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006225073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member H (Clec2h), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006237103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member H (Clec2h), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT041968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006225073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member H (Clec2h), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// XM_006237103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member H (Clec2h), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041967 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:211456201:211460958:-1 gene:ENSRNOG00000026682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211456186:211464675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT041968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001191570 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 13C (Ankrd13c), mRNA. // chr4 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283426167:283473209:1 gene:ENSRNOG00000011340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000034614 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:136459509:136461051:1 gene:ENSRNOG00000023004 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 87 // 97 // 27 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:136459509:136461051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 78 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211475002:211476690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039164 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:211475002:211476581:-1 gene:ENSRNOG00000026718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000050970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:283426456:283471202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT030589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT030590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006225073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member H (Clec2h), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// XM_006237103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member H (Clec2h), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// NONRATT041968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0
NM_001177689 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2, member E (Clec2e), mRNA. // chr4 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000037596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211495903:211501065:-1 gene:ENSRNOG00000037073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// FJ404473 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2 member d10 (Clec2d10) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211495903:211501065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_134327 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd69 molecule (Cd69), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd69 molecule (Cd69), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000010422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211685115:211693033:-1 gene:ENSRNOG00000007909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF440759 // GenBank // Rattus norvegicus CD69 mRNA, partial cds. // chr4 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC088219 // GenBank // Rattus norvegicus Cd69 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:108945 IMAGE:7384461), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GU357488 // GenBank // Rattus norvegicus CD69 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT041975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT041976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211658249:211693289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001194985 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CD69 antigen (p60, early T-cell activation antigen) (RGD1564770), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211728662:211739563:-1 gene:ENSRNOG00000026361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158621 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7453172. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GU357487 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 2 member M mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109353 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 12, member B (Clec12b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237094 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 12, member B (Clec12b), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 12, member B (Clec12b), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 12, member B (Clec12b), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211785651:211797131:-1 gene:ENSRNOG00000037070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GU357483 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 12 member B mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211786297:211797118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109253 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 1, member A (Clec1a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211835489:211858230:-1 gene:ENSRNOG00000008259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GU357481 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 1 member A mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211837693:211861491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT041979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001173386 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 7, member A (Clec7a), mRNA. // chr4 // 84 // 91 // 26 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000052373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211861365:211870886:-1 gene:ENSRNOG00000033879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 83 // 85 // 24 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211859715:211870794:-1 gene:ENSRNOG00000033879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 91 // 26 // 31 // 0 /// AB455106 // GenBank // Rattus norvegicus Clec7a mRNA for C-type lectin domain family 7 member A transcript variant 1, complete cds. // chr4 // 84 // 91 // 26 // 31 // 0 /// AB455107 // GenBank // Rattus norvegicus Clec7a mRNA for C-type lectin domain family 7 member A transcript variant 2, complete cds. // chr4 // 83 // 85 // 24 // 29 // 0 /// GU357485 // GenBank // Rattus norvegicus dectin-1 mRNA, complete cds. // chr4 // 84 // 91 // 26 // 31 // 0 /// NONRATT041981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0
NM_133306 // RefSeq // Rattus norvegicus oxidized low density lipoprotein (lectin-like) receptor 1 (Olr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:211883405:211905489:-1 gene:ENSRNOG00000008375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB005900 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for endothelial receptor for oxidized low-density lipoprotein, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC097290 // GenBank // Rattus norvegicus oxidized low density lipoprotein (lectin-like) receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:114271 IMAGE:7458637), complete cds. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211885476:211905398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT041982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_133512 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily K, member 1 (Klrk1), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:212036250:212044121:-1 gene:ENSRNOG00000009638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF009511 // GenBank // Rattus norvegicus NKR-P2 (Nkrp2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001029908 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 3 (Klrc3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000044301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:212061500:212065900:-1 gene:ENSRNOG00000009477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AY197774 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA natural killer cell receptor family C member 3 (Klrc3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000045273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212060296:212152983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// NONRATT041987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_019261 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 2 (Klrc2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000012743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:212074147:212085286:-1 gene:ENSRNOG00000009509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF021349 // GenBank // Rattus norvegicus natural killer cell protein group 2-C (NKG2C) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006237080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 1 (Klrc1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1 /// NONRATT041987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT041988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT041989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_001037441 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 1 (Klrc1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF021350 // GenBank // Rattus norvegicus natural killer cell protein group 2-A (NKG2A) mRNA, partial cds. // chrU // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// XM_006237080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily C, member 1 (Klrc1), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000012586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:212061509:212089511:-1 gene:ENSRNOG00000009477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// XM_006237111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NKG2-A/NKG2-B type II integral membrane protein-like (LOC100910089), mRNA. // chrU // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000055818 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:212175371:212179316:-1 gene:ENSRNOG00000033712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONRATT041989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212060296:212152983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_001012649 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor family I member 1 (Klri1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000067678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:212120724:212156441:-1 gene:ENSRNOG00000037064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY286494 // GenBank // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor family I member 1 (Klri1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ233804 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YF14 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT041990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212060296:212152983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001012648 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor family I member 2 (Klri2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor family I member 2 (Klri2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:212197874:212206516:-1 gene:ENSRNOG00000025403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY324871 // GenBank // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor family I member 2 (Klri2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212197935:212206484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT041991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_139187 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily H, member 1 (Klrh1), mRNA. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// AF416564 // GenBank // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily H, member 1 (Klrh1) mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT041992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001072955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor 2-like (LOC690020), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_002726437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor 2-like (LOC690020), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006225079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor 2-like (LOC690020), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor 2-like (LOC690020), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000051629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:212275805:212294426:-1 gene:ENSRNOG00000025346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212283528:212294426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
NM_001172088 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 17 (Klra17), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000047838 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:212391502:212415101:-1 gene:ENSRNOG00000028915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212407101:212415101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT041995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006225086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 58 // 58 // 32 // 55 // 1 /// XM_006237117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 58 // 58 // 32 // 55 // 1 /// XM_006237118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 58 // 58 // 32 // 55 // 1 /// XM_006237119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 58 // 58 // 32 // 55 // 1 /// XM_006237120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 58 // 58 // 32 // 55 // 1 /// GENSCAN00000013379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212488901:212538477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 29 // 55 // 1 /// NONRATT041999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 58 // 58 // 32 // 55 // 1 /// NONRATT042000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 58 // 58 // 32 // 55 // 1 /// NONRATT042007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 15 // 15 // 8 // 55 // 1
NONRATT042002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001009497 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoreceptor Ly49si1 (Ly49si1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XR_353560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoreceptor Ly49si1 (Ly49si1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr4 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// AY659935 // GenBank // Rattus norvegicus immunoreceptor Ly49si1 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT041999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_173291 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor subfamily A, member 22 (Klra22), mRNA. // chr4 // 48 // 47 // 14 // 29 // 0 /// AY649838 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 2 (Ly49s2) mRNA, complete cds. // chr4 // 38 // 47 // 11 // 29 // 0 /// U56822 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 2 (Ly49s2) mRNA, complete cds. // chr4 // 48 // 47 // 14 // 29 // 0 /// XM_006225086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 47 // 47 // 29 // 62 // 1 /// XM_006237117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 47 // 47 // 29 // 62 // 1 /// XM_006237118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 47 // 47 // 29 // 62 // 1 /// XM_006237119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 47 // 47 // 29 // 62 // 1 /// XM_006237120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 47 // 47 // 29 // 62 // 1 /// GENSCAN00000013379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212488901:212538477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 29 // 62 // 1 /// NONRATT041999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 29 // 62 // 1 /// NONRATT042000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 29 // 62 // 1 /// NONRATT042005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 18 // 18 // 11 // 62 // 1 /// NONRATT042007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 19 // 19 // 12 // 62 // 1
XM_006225086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006237117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006237118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006237119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006237120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212488901:212538477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT041999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT042000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006225086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006237117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006237118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006237119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006237120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212488901:212538477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT041999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006225086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006237120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC502907), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212488901:212538477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT041999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001009488 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 6 (Ly49s6), mRNA. // chrU // 83 // 71 // 10 // 12 // 0 /// AY649837 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 6 (Ly49s6) mRNA, complete cds. // chrU // 83 // 71 // 10 // 12 // 0 /// BC088257 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:109079 IMAGE:7375677), complete cds. // chrU // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
NM_001012749 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 5 (Ly49s5), mRNA. // chr4 // 55 // 76 // 12 // 22 // 0 /// AY649832 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 5 (Ly49s5) mRNA, complete cds. // chr4 // 55 // 76 // 12 // 22 // 0 /// NM_001009501 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly49 inhibitory receptor 5 (Ly49i5), mRNA. // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// XR_353571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546785 (LOC102546785), ncRNA. // chr4 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000071660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:212933523:213004416:-1 gene:ENSRNOG00000048627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// AY649836 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 inhibitory receptor 5 (Ly49i5) mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// AY846264 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN Ly49 inhibitory receptor 5 (Ly49i5) mRNA, complete cds. // chr4 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT042003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001009487 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 4 (Ly49s4), mRNA. // chr4 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// AY649831 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 stimulatory receptor 4 (Ly49s4) mRNA, complete cds. // chr4 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// NONRATT042006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 67 // 90 // 6 // 9 // 0
XM_006237131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC689512), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT042007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_006237131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell surface glycoprotein YE1/48-like (LOC689512), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:213255975:213316525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT042007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 53 // 94 // 8 // 15 // 0
NM_001009499 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoreceptor Ly49i3 (Ly49i3), mRNA. // chr4 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// AY659932 // GenBank // Rattus norvegicus immunoreceptor Ly49i3 mRNA, complete cds. // chr4 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
GENSCAN00000007411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:213479458:213573745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_152848 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly49 inhibitory receptor 2 (Ly49i2), mRNA. // chr4 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// AY115572 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 inhibitory receptor 2 (Ly49i2) mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// XM_006237128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ly49 inhibitory receptor 4 (Ly49i4), mRNA. // chr4 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000050861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227796160:227845162:-1 gene:ENSRNOG00000046046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// NONRATT042006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT042007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_001009718 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 2 (Klra2), mRNA. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:213680202:213700891:-1 gene:ENSRNOG00000031551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY651018 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 inhibitory receptor 6 (Ly49i6) mRNA, complete cds. // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0
NM_198746 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 5 (Klra5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006237137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor 5-like (LOC100911234), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000048476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:213972803:213990851:-1 gene:ENSRNOG00000033260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000071421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227853270:227878224:-1 gene:ENSRNOG00000046046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000073118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227841357:227878280:-1 gene:ENSRNOG00000046046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 77 // 8 // 10 // 0 /// U56863 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 inhibitory receptor 1 (Ly49i1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006237139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor 5-like (LOC100911234), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// NONRATT042008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0