ENSRNOT00000048404 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:70359338:70469948:-1 gene:ENSRNOG00000021490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000034630 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:110955676:111000232:1 gene:ENSRNOG00000046767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073410 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:110955676:111000232:1 gene:ENSRNOG00000046767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000074428 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:110955676:111000232:1 gene:ENSRNOG00000046767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70359338:70365074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000009761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110863447:111000232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001099460 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 3 (Vom2r3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000050916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:141742416:141753496:-1 gene:ENSRNOG00000049837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:141678095:141753496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 90 // 5 // 9 // 0
NM_001099462 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 5 (Vom2r5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:792899:801554:-1 gene:ENSRNOG00000032365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072360 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:688298:696950:1 gene:ENSRNOG00000047964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000049266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:688298:696950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000049271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:704304:801554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001099459 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 6 (Vom2r6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:733501:743682:-1 gene:ENSRNOG00000050370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:733480:743682:-1 gene:ENSRNOG00000050370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:704304:801554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT003885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSRNOT00000044523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3243603:3244647:1 gene:ENSRNOG00000029897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AY389467 // GenBank // Rattus norvegicus unknown mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
FQ226910 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA17YP10 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// FQ222240 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA26YJ09 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// FQ226144 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA35YK05 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// FQ226164 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA34YB22 mRNA sequence. // chr1 // 59 // 100 // 23 // 39 // 0 /// FQ226888 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA19YO14 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// FQ228271 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA103YC23 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT003223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT003224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT003226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 26 // 39 // 0
XM_006222810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-alpha-like (LOC102548267), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000029038 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:2906208:2907972:1 gene:ENSRNOG00000023667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:2889388:2909978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000028945 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:3335062:3337317:1 gene:ENSRNOG00000023653 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000044082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3306675:3337317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001106217 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 11 (Lrp11), mRNA. // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000019181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3400376:3428890:1 gene:ENSRNOG00000014303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT000008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT000005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// GENSCAN00000044059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3400057:3419519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT000007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001134543 // RefSeq // Rattus norvegicus large tumor suppressor kinase 1 (Lats1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus large tumor suppressor kinase 1 (Lats1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus large tumor suppressor kinase 1 (Lats1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3492544:3510720:1 gene:ENSRNOG00000014916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3497084:3564181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001004217 // RefSeq // Rattus norvegicus katanin p60 (ATPase-containing) subunit A1 (Katna1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3522927:3564343:1 gene:ENSRNOG00000014996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY621629 // GenBank // Rattus norvegicus katanin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC097929 // GenBank // Rattus norvegicus katanin p60 (ATPase-containing) subunit A1, mRNA (cDNA clone MGC:116039 IMAGE:7444887), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3497084:3564181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108457 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 4 (Ppil4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3593965:3626926:1 gene:ENSRNOG00000015552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ225576 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YJ07 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT000013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000000037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3593994:3639439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001107469 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 12D (Zc3h12d), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3635034:3669533:1 gene:ENSRNOG00000016041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3647833:3701798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000000039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3972007:3972902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_001271254 // RefSeq // Rattus norvegicus negative elongation factor complex member C/D (Nelfcd), mRNA. // chr1 // 42 // 96 // 10 // 24 // 0 /// NONRATT000020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:178523957:178574252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001107470 // RefSeq // Rattus norvegicus SNF2 histone linker PHD RING helicase, E3 ubiquitin protein ligase (Shprh), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:6891253:6965104:1 gene:ENSRNOG00000014450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:6891703:6963409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001007690 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 30 (Fbxo30), mRNA. // chr1 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// XM_006227640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 30 (Fbxo30), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000019918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:7018429:7039842:1 gene:ENSRNOG00000014852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC083823 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 30, mRNA (cDNA clone MGC:94907 IMAGE:7111792), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:7025913:7039036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT000026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001276762 // RefSeq // Rattus norvegicus epilepsy, progressive myoclonus type 2A (Epm2a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:7100639:7224740:1 gene:ENSRNOG00000040242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF347030 // GenBank // Rattus norvegicus dual-specificity phosphatase laforin (Epm2a) mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:7100639:7215527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSRNOT00000031713 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:7706390:7707266:1 gene:ENSRNOG00000026291 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:7706390:7710318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NM_001126092 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 3b, subunit 5 (Sf3b5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:8739602:8740282:1 gene:ENSRNOG00000014908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:8739718:8739978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000020018 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:8808915:8809454:1 gene:ENSRNOG00000014913 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0
NM_012760 // RefSeq // Rattus norvegicus pleiomorphic adenoma gene-like 1 (Plagl1), mRNA. // chr1 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000030329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:8857033:8894012:1 gene:ENSRNOG00000025587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// U72620 // GenBank // Rattus norvegicus Lot1 mRNA, complete cds. // chr1 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:8890020:8893816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT000035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT000037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001004218 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosidase, alpha-L- 2, plasma (Fuca2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:9287057:9301800:1 gene:ENSRNOG00000015551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078933 // GenBank // Rattus norvegicus fucosidase, alpha-L- 2, plasma, mRNA (cDNA clone MGC:93735 IMAGE:7107565), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:9287146:9301631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001115028 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, tRNA-specific 2 (Adat2), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158616 // GenBank // Rattus norvegicus deaminase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187499 IMAGE:7388507), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073460 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:9354667:9371486:1 gene:ENSRNOG00000046983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:9350649:9370866:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT000042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT000043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_024137 // RefSeq // Rattus norvegicus human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 2 (Hivep2), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:9930383:9953696:1 gene:ENSRNOG00000011015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// D37951 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MIBP1 (c-myc intron binding protein 1), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:9931579:9952045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000016215 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:10550312:10560571:1 gene:ENSRNOG00000012103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NM_012799 // RefSeq // Rattus norvegicus neuromedin B receptor (Nmbr), mRNA. // chr1 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// U37058 // GenBank // Rattus norvegicus neuromedin-B receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// GENSCAN00000036025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:10549818:10587752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT000049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
NM_053698 // RefSeq // Rattus norvegicus Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 2 (Cited2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:14515629:14518063:1 gene:ENSRNOG00000012193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF361476 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor MRG1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC087005 // GenBank // Rattus norvegicus Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 2, mRNA (cDNA clone MGC:93288 IMAGE:7191504), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14488488:14517147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001135859 // RefSeq // Rattus norvegicus taxilin beta (Txlnb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006227658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taxilin beta (Txlnb), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:14609470:14655258:1 gene:ENSRNOG00000012249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14611154:14638092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000000716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14651363:14678239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT000057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENSRNOT00000072407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:138003285:138004567:-1 gene:ENSRNOG00000051005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072776 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14596908:14598190:1 gene:ENSRNOG00000048504 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072845 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:9184976:9186258:1 gene:ENSRNOG00000046314 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54940686:54941968:-1 gene:ENSRNOG00000047509 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59271854:59273136:1 gene:ENSRNOG00000048192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:172047210:172048492:1 gene:ENSRNOG00000050867 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165832069:165833351:-1 gene:ENSRNOG00000050976 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// U15425 // GenBank // Rattus norvegicus membrane- and microfilament-associated protein p58 mRNA, complete cds. // chrU // 88 // 96 // 21 // 24 // 0
NM_001106264 // RefSeq // Rattus norvegicus RALBP1 associated Eps domain containing 1 (Reps1), mRNA. // chr1 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// XM_003748651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ralBP1-associated Eps domain-containing protein 1-like (LOC100909392), partial mRNA. // chr1 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14938420:14974790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000017323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14979183:14987007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT000062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT000063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// NONRATT000064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// NONRATT000065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// GENSCAN00000028408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:13325522:13366125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
XM_002725449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NHS-like 1 (Nhsl1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NHS-like 1 (Nhsl1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222831 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NHS-like 1 (Nhsl1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NHS-like 1 (Nhsl1), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015115 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:15256105:15388904:1 gene:ENSRNOG00000011386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015145 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:15325223:15388904:1 gene:ENSRNOG00000011386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:15325223:15388904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001106265 // RefSeq // Rattus norvegicus PERP, TP53 apoptosis effector (Perp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:15786756:15799199:1 gene:ENSRNOG00000011994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166608 // GenBank // Rattus norvegicus PERP, TP53 apoptosis effector, mRNA (cDNA clone MGC:188392 IMAGE:5599021), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:15786860:15799571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000041472 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:16041917:16042523:1 gene:ENSRNOG00000031764 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16041951:16050068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_001106269 // RefSeq // Rattus norvegicus oligodendrocyte transcription factor 3 (Olig3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:16343568:16344930:1 gene:ENSRNOG00000012057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16303127:16360037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000073803 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:16400080:16400638:1 gene:ENSRNOG00000049106 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16394500:16400538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_053783 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon gamma receptor 1 (Ifngr1), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:16607955:16626390:1 gene:ENSRNOG00000012074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF201901 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-gamma receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC062039 // GenBank // Rattus norvegicus interferon gamma receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:72347 IMAGE:5598500), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ217040 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA36YP11 mRNA sequence. // chr1 // 83 // 60 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16608000:16617871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT000073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001003404 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 22 receptor, alpha 2 (Il22ra2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 22 receptor, alpha 2 (Il22ra2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000016354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:16641825:16655187:1 gene:ENSRNOG00000012259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ555485 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytokine receptor family II soluble 1 precursor (crf2-s1 gene). // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16641856:16653403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107521 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 20 receptor, alpha (Il20ra), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 20 receptor, alpha (Il20ra), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:16728324:16770911:1 gene:ENSRNOG00000012286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16728374:16803561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001277694 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 (Map3k5), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000051496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:16961080:17160990:1 gene:ENSRNOG00000031700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:16961080:17160990:1 gene:ENSRNOG00000031700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000006646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16980002:17160996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NM_001198638 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 7 (Map7), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:17239998:17290726:1 gene:ENSRNOG00000012701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NM_001106270 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 7 (Map7), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// GENSCAN00000006650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:17228088:17290967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT000082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT000081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
XR_349858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 5-like (LOC102551251), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047852 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-associated transcription factor 1 (Bclaf1), mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// XM_006227652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BCL2-associated transcription factor 1 (Bclaf1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000049492 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:17328181:17404737:1 gene:ENSRNOG00000013052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC161968 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2-associated transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:187775 IMAGE:9028507), complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:17354833:17416026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// AY325172 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-041 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT000092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001002277 // RefSeq // Rattus norvegicus Abelson helper integration site 1 (Ahi1), mRNA. // chr1 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000019076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:18958623:19080397:1 gene:ENSRNOG00000013969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AY647140 // GenBank // Rattus norvegicus AHI1 mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 96 // 43 // 44 // 0 /// FQ226565 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA24YM19 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 44 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000075461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:19126968:19149888:1 gene:ENSRNOG00000046617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000034073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:18958623:18970889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:18975135:19004576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT000116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT000117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONRATT000118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001011934 // RefSeq // Rattus norvegicus HBS1-like translational GTPase (Hbs1l), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:17974955:18051508:1 gene:ENSRNOG00000014531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC079463 // GenBank // Rattus norvegicus Hbs1-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95018 IMAGE:7122195), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:18014398:18051031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT000100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT000101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT000108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001191088 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 8 family, member A1 (Aldh8a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:18065379:18084260:1 gene:ENSRNOG00000014907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:18060000:18084260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000037771 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:18405821:18406639:1 gene:ENSRNOG00000023961 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
GENSCAN00000018899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:19844180:19852473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
XM_219866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus laminin, alpha 2 (Lama2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// GENSCAN00000037959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:20002827:20003723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// GENSCAN00000039348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:20999836:21000732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
XM_219866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus laminin, alpha 2 (Lama2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 62 // 62 // 0 /// ENSRNOT00000014917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:20155194:20597569:1 gene:ENSRNOG00000011134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000028211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:20471956:20558986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:20573314:20647042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:20241852:20466040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 16 // 64 // 1
NONRATT000127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
XM_006222843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus l(3)mbt-like 3 (Drosophila) (L3mbtl3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000015730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:21510156:21584250:1 gene:ENSRNOG00000011720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000061404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:21510156:21584250:1 gene:ENSRNOG00000011720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000042200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:21510156:21584476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 83 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT000128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT000130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1
ENSRNOT00000044222 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:21603257:21604069:1 gene:ENSRNOG00000033517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:21603344:21603862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT000133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001109135 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 200A (Tmem200a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 200A (Tmem200a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037259 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:21819548:21820021:1 gene:ENSRNOG00000011855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
FQ217715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA1YA02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222890 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YF20 mRNA sequence. // chr1 // 45 // 80 // 9 // 20 // 0
NM_001109135 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 200A (Tmem200a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 200A (Tmem200a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 200A (Tmem200a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:21895332:21896789:1 gene:ENSRNOG00000047783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:21895332:21896789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031969 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin 1 (Calm1), mRNA. // chr1 // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:133444274:133454391:1 gene:ENSRNOG00000004060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// AF178845 // GenBank // Rattus norvegicus calmodulin mRNA, complete cds. // chr1 // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// FQ225380 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YC18 mRNA sequence. // chr1 // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// FQ212721 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YM02 mRNA sequence. // chr1 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// FQ213227 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YA07 mRNA sequence. // chr1 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// FQ214030 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YD16 mRNA sequence. // chr1 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000016434 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:22211304:22211788:1 gene:ENSRNOG00000012334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:22211371:22211733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000032297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:22474711:22483755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001001801 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 7 (Akap7), mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:22621734:22744656:1 gene:ENSRNOG00000013202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AY350741 // GenBank // Rattus norvegicus AKAP18 delta isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC098632 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:112559 IMAGE:7315112), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_017134 // RefSeq // Rattus norvegicus arginase 1 (Arg1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23005317:23017705:1 gene:ENSRNOG00000013304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC091158 // GenBank // Rattus norvegicus arginase, liver, mRNA (cDNA clone MGC:108729 IMAGE:7368991), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ218591 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YB23 mRNA sequence. // chr1 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// J02720 // GenBank // Rat liver arginase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23010216:23017324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_019370 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 3 (Enpp3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23093113:23164279:1 gene:ENSRNOG00000013791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097326 // GenBank // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 3, mRNA (cDNA clone MGC:114330 IMAGE:7458431), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D30649 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphodiesterase I, complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// U78787 // GenBank // Rattus norvegicus alkaline phosphodiesterase mRNA, complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// U78788 // GenBank // Rattus norvegicus alkaline phosphodiesterase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23091458:23138320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_053535 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 1 (Enpp1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23228281:23291660:1 gene:ENSRNOG00000013994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF320054 // GenBank // Rattus norvegicus ecto-nucleotide pyrophosphatase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF340185 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW ecto-nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase-1 (Npps) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AF340186 // GenBank // Rattus norvegicus strain LOU ecto-nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase-1 (Npps) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT000149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23266554:23308943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_175602 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 9 (Taar9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23799510:23800526:1 gene:ENSRNOG00000026096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23799510:23842968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT000152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175600 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 8c (Taar8c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23813594:23827650:1 gene:ENSRNOG00000047463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT000153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
NM_175601 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 8b (Taar8b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:25037235:25038269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175585 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 7a (Taar7a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021545 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:24003685:24004677:1 gene:ENSRNOG00000016095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24003646:24004677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175584 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 6 (Taar6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000021529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24011180:24012169:1 gene:ENSRNOG00000016089 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000023082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24011141:24012178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT000155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NONRATT000158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001271317 // RefSeq // Rattus norvegicus EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4 (Eya4), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24878801:25079460:1 gene:ENSRNOG00000016627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC107460 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7454989, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:25068778:25077088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0
NM_001032397 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 21 (Tcf21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:25370183:25373032:1 gene:ENSRNOG00000016700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100106 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor 21, mRNA (cDNA clone MGC:112908 IMAGE:7379660), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001127201 // RefSeq // Rattus norvegicus TBP-like 1 (Tbpl1), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006227722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBP-like 1 (Tbpl1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:25441900:25466736:1 gene:ENSRNOG00000011114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ234587 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YG07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:25452368:25464219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000015702 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:25628504:25628989:1 gene:ENSRNOG00000011787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0
NM_001108459 // RefSeq // Rattus norvegicus clavesin 2 (Clvs2), mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:26725790:26756155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:26633320:26677938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000016518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:26631832:26756155:1 gene:ENSRNOG00000012122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT000183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT000184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
GENSCAN00000004847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:26815260:26817032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
XM_006222894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 2-like (LOC102551716), mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// XM_006227742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 2-like (LOC102551716), mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000047224 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:29390335:29610546:1 gene:ENSRNOG00000029608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001106204 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 217 (Rnf217), mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:29757234:29846858:1 gene:ENSRNOG00000013323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:29814575:29846283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT000188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001044295 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein D52-like 1 (Tpd52l1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006227739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein D52-like 1 (Tpd52l1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000030327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:29910327:30031363:1 gene:ENSRNOG00000021478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC099809 // GenBank // Rattus norvegicus tumor protein D52-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:124774 IMAGE:5621894), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT000189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT000191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT000190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000000993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:30004174:30035723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_130417 // RefSeq // Rattus norvegicus hes-related family bHLH transcription factor with YRPW motif 2 (Hey2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:30633675:30643762:1 gene:ENSRNOG00000013364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:30633740:30642426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000018849 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:30738090:30826132:1 gene:ENSRNOG00000014004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018871 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:30817272:30826132:1 gene:ENSRNOG00000014004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000066629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:30817272:30828265:1 gene:ENSRNOG00000014004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072506 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:30817272:30826026:1 gene:ENSRNOG00000014004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// XM_006222872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 7 (Ncoa7), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:30725743:30826343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001100825 // RefSeq // Rattus norvegicus histidine triad nucleotide binding protein 3 (Hint3), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001276433 // RefSeq // Rattus norvegicus histidine triad nucleotide binding protein 3 (Hint3), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000019047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:30852989:30862850:1 gene:ENSRNOG00000014190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ215151 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YI17 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006227743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histidine triad nucleotide binding protein 3 (Hint3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT000198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:30853019:30926881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT000200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001025411 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4 (Dnaja4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:57859314:57875055:1 gene:ENSRNOG00000012106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082010 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:94264 IMAGE:7131770), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097438 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:114488 IMAGE:7455678), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019470 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:31139719:31140690:1 gene:ENSRNOG00000014517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:57834027:57874972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:31140008:31140690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT053281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT053282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT053284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001246319 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein W (Cenpw), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000065677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:31347827:31352722:1 gene:ENSRNOG00000042944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ220188 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YN18 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT000203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001100990 // RefSeq // Rattus norvegicus R-spondin 3 (Rspo3), mRNA. // chr1 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000015395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32115843:32198978:1 gene:ENSRNOG00000011568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// EU030376 // GenBank // Rattus norvegicus R-spondin 3-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// XM_006227755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R-spondin 3 (Rspo3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT000205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000040773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32137679:32148044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001012060 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 146 (Rnf146), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 146 (Rnf146), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000015421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32297192:32307783:1 gene:ENSRNOG00000011588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083675 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 146, mRNA (cDNA clone MGC:94520 IMAGE:7135728), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_001059712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310057J18 (RGD1311933), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_217725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310057J18 (RGD1311933), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32835727:32851816:1 gene:ENSRNOG00000012581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32835727:32863372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
ENSRNOT00000038102 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:32862860:32863357:1 gene:ENSRNOG00000039788 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_003753161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bcl-2-like protein 13-like (LOC689660), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006227798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bcl-2-like protein 13-like (LOC689660), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061043 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:32932763:32935292:1 gene:ENSRNOG00000039785 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32869070:32935120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006222896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC100911237), mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// XM_006227808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC100911237), mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000048292 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:32940492:32944397:1 gene:ENSRNOG00000029219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109333 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 14B (Lrrc14b), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32957232:32961194:1 gene:ENSRNOG00000028357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ217859 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA15YL24 mRNA sequence. // chr1 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32957291:32960420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001024964 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 3 (Exoc3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 3 (Exoc3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33126575:33156980:1 gene:ENSRNOG00000039776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097993 // GenBank // Rattus norvegicus exocyst complex component 3, mRNA (cDNA clone MGC:116137 IMAGE:7446619), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U32575 // GenBank // Rattus norvegicus (rsec6) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33083355:33156898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_130428 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex, subunit A, flavoprotein (Fp) (Sdha), mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32971779:32996749:1 gene:ENSRNOG00000013331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB072907 // GenBank // Rattus norvegicus SDHA mRNA for flavoprotein subunit of succinate-ubiquinone reductase, complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32971820:33017164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT000217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_001107452 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 6 (Pdcd6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33002331:33017997:1 gene:ENSRNOG00000014485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168744 // GenBank // Rattus norvegicus programmed cell death 6, mRNA (cDNA clone MGC:188846 IMAGE:6920123), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT000226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32971820:33017164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001024285 // RefSeq // Rattus norvegicus aryl-hydrocarbon receptor repressor (Ahrr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33029445:33123739:1 gene:ENSRNOG00000014721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB174900 // GenBank // Rattus norvegicus ahrr mRNA for AhR repressor, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY367561 // GenBank // Rattus norvegicus aryl-hydrocarbon receptor repressor (Ahrr) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// NONRATT000227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33083355:33156898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_001056326 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 72 (Cep72), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_217737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 72 (Cep72), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020780 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:33259590:33288992:1 gene:ENSRNOG00000015465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33232981:33288992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001011930 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 13 (Trip13), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33392427:33437364:1 gene:ENSRNOG00000015810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC083900 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor interactor 13, mRNA (cDNA clone MGC:95258 IMAGE:7133557), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33393430:33410634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001107454 // RefSeq // Rattus norvegicus naked cuticle homolog 2 (Drosophila) (Nkd2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33482721:33509554:1 gene:ENSRNOG00000016103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33458187:33507100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001039722 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 19 (Slc6a19), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33624551:33643498:1 gene:ENSRNOG00000026501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ890206 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transporter for neutral amino acids (B0at1 gene). // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// EF474455 // GenBank // Rattus norvegicus amino acid transporter B0AT1 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33616802:33643025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_017163 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 18 (Slc6a18), mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// XM_006227771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 18 (Slc6a18), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 18 (Slc6a18), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// XM_006227774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 18 (Slc6a18), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33646636:33660461:1 gene:ENSRNOG00000016253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC083562 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 6, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:93507 IMAGE:7110794), complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// U12973 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley renal osmotic stress-induced Na-Cl organic solute cotransporter ROSIT mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000057636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33646666:33660921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006240804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-related protein Rab-1A-like (LOC680967), mRNA. // chr7 // 58 // 100 // 18 // 31 // 0 /// NM_031090 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB1A, member RAS oncogene family (Rab1a), mRNA. // chr7 // 39 // 100 // 12 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000021040 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:104208410:104236221:1 gene:ENSRNOG00000004992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 39 // 100 // 12 // 31 // 0 /// AY321327 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-048 mRNA, complete cds. // chr7 // 37 // 97 // 11 // 30 // 0 /// BC066662 // GenBank // Rattus norvegicus RAB1, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:72414 IMAGE:5623442), complete cds. // chr7 // 39 // 100 // 12 // 31 // 0 /// FQ213656 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YI16 mRNA sequence. // chr7 // 32 // 100 // 10 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000052370 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:2088703:2093233:-1 gene:ENSRNOG00000048784 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 65 // 100 // 20 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104186108:104234759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 37 // 97 // 11 // 30 // 0 /// NONRATT018865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0
XM_006227023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 antigen-like protein 2-like (LOC102557071), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 molecule-like 2 (Cd99l2), transcript variant X1, mRNA. // chrUn // 60 // 96 // 15 // 25 // 0 /// XR_342611 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nidogen-2-like (LOC100912792), transcript variant X4, ncRNA. // chrUn // 35 // 100 // 9 // 26 // 0
XM_006240804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-related protein Rab-1A-like (LOC680967), mRNA. // chr7 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// NM_031090 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB1A, member RAS oncogene family (Rab1a), mRNA. // chr7 // 50 // 86 // 12 // 24 // 0 /// AY321327 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-048 mRNA, complete cds. // chr7 // 52 // 75 // 11 // 21 // 0 /// BC066662 // GenBank // Rattus norvegicus RAB1, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:72414 IMAGE:5623442), complete cds. // chr7 // 50 // 86 // 12 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021040 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:104208410:104236221:1 gene:ENSRNOG00000004992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 100 // 12 // 28 // 0 /// FQ213656 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YI16 mRNA sequence. // chr7 // 42 // 86 // 10 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000052370 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:2088703:2093233:-1 gene:ENSRNOG00000048784 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104186108:104234759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 75 // 11 // 21 // 0 /// NONRATT018865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 86 // 11 // 24 // 0
NM_133425 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14c (Ppp1r14c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:41159898:41272168:1 gene:ENSRNOG00000016368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF407168 // GenBank // Rattus norvegicus PKC-potentiated PP1 inhibitory protein (Kepi) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC086978 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14c, mRNA (cDNA clone MGC:93087 IMAGE:7191557), complete cds. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT000273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001025000 // RefSeq // Rattus norvegicus iodotyrosine deiodinase (Iyd), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:41435347:41449794:1 gene:ENSRNOG00000016286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091241 // GenBank // Rattus norvegicus iodotyrosine deiodinase, mRNA (cDNA clone MGC:109018 IMAGE:7326298), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:41435356:41441451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:41442131:41449287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT000274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001190999 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Plekhg1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Plekhg1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Plekhg1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Plekhg1), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 1 (Plekhg1), transcript variant X9, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:41780838:41866419:1 gene:ENSRNOG00000016011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:41836665:41866172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001108462 // RefSeq // Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1-like (Mthfd1l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:41876363:42065388:1 gene:ENSRNOG00000019582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166462 // GenBank // Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:187798 IMAGE:9030223), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:41942419:42070625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NONRATT000278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000047908 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:42119714:42120296:1 gene:ENSRNOG00000030564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_001033653 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 12 (Akap12), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// NM_057103 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 12 (Akap12), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:42162319:42249711:1 gene:ENSRNOG00000019549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000060767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:42162163:42252614:1 gene:ENSRNOG00000019549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AY695056 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase anchoring protein 12 alpha (Akap12) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AY695057 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase anchoring protein 12 beta (Akap12) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// AY695058 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase anchoring protein 12 gamma (Akap12) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 23 // 23 // 0 /// U41453 // GenBank // Rattus norvegicus PKC binding protein and substrate mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 55 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42162319:42249983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT000280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0
XM_006227833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700052N19 (RGD1305235), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000026367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:42325061:42348565:1 gene:ENSRNOG00000019489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078920 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700052N19, mRNA (cDNA clone MGC:93699 IMAGE:7096641), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42325126:42347659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT000283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_001065531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 170 (Ccdc170), mRNA. // chr1 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// XM_003748692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 170 (Ccdc170), partial mRNA. // chr1 // 94 // 49 // 16 // 17 // 0 /// XM_214760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 170 (Ccdc170), mRNA. // chr1 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035962 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:42407843:42467962:1 gene:ENSRNOG00000024280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42446613:42493943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000049716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42407795:42438803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000003809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:43493843:43749351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT000285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_012689 // RefSeq // Rattus norvegicus estrogen receptor 1 (Esr1), mRNA. // chr1 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000026350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:42667185:42931332:1 gene:ENSRNOG00000019358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AB477039 // GenBank // Rattus norvegicus Esr1 mRNA for estrogen receptor alpha, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// X61098 // GenBank // Rat mRNA for estrogen receptor. // chr1 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT000287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000039113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42660971:42670285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 51 // 51 // 24 // 47 // 1 /// GENSCAN00000039125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42784424:42811665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1 /// NONRATT000288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1
NM_012689 // RefSeq // Rattus norvegicus estrogen receptor 1 (Esr1), mRNA. // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000026350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:42667185:42931332:1 gene:ENSRNOG00000019358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// AB477039 // GenBank // Rattus norvegicus Esr1 mRNA for estrogen receptor alpha, complete cds. // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// X61098 // GenBank // Rat mRNA for estrogen receptor. // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT000287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42864427:42931254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENSRNOT00000060666 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:43315071:43316772:1 gene:ENSRNOG00000039578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 93 // 93 // 14 // 15 // 1 /// GENSCAN00000004381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:43315065:43315634:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 93 // 93 // 14 // 15 // 1
NM_001106207 // RefSeq // Rattus norvegicus myc target 1 (Myct1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:43450909:43461462:1 gene:ENSRNOG00000018858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:43458930:43460591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_053991 // RefSeq // Rattus norvegicus vasoactive intestinal peptide (Vip), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:43498384:43506462:1 gene:ENSRNOG00000018808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC158798 // GenBank // Rattus norvegicus vasoactive intestinal peptide, mRNA (cDNA clone MGC:188192 IMAGE:7316540), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:43493843:43749351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
GENSCAN00000057551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:44174621:44324751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_139094 // RefSeq // Rattus norvegicus SR-related CTD-associated factor 8 (Scaf8), mRNA. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000065733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:45348476:45451204:1 gene:ENSRNOG00000016919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// U49055 // GenBank // Rattus norvegicus CTD-binding SR-like protein rA8 mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000004227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:45442674:45450558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:45374737:45431587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0
XM_006222901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell lymphoma invasion and metastasis 2 (LOC100362710), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006222904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell lymphoma invasion and metastasis 2 (LOC100362710), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell lymphoma invasion and metastasis 2 (LOC100362710), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006227904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell lymphoma invasion and metastasis 2 (LOC100362710), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:45659696:45762842:1 gene:ENSRNOG00000016728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000004222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:45659696:45762842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT000304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// NONRATT000306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001109394 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 20 (Cldn20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claudin 20 (Cldn20), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:45776856:45777515:1 gene:ENSRNOG00000023531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006227907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AT rich interactive domain 1B (Swi1 like) (Arid1b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000022939 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:47239545:47548532:1 gene:ENSRNOG00000017030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// AJ440711 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transcription factor 1 (smcf-1 gene). // chr1 // 50 // 90 // 18 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:47445551:47547280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT000309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001039343 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 14 (Zdhhc14), mRNA. // chr1 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// XM_006227885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 14 (Zdhhc14), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// XM_006227886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 14 (Zdhhc14), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// XR_349967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 14 (Zdhhc14), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// ENSRNOT00000043521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:47692788:47953571:1 gene:ENSRNOG00000029049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// AY886530 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC14 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// GENSCAN00000007479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:47687664:47693916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0
NM_001113371 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptojanin 2 (Synj2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// NM_001113372 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptojanin 2 (Synj2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// NM_032071 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptojanin 2 (Synj2), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48140615:48236028:1 gene:ENSRNOG00000017114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48140615:48236028:1 gene:ENSRNOG00000017114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48140615:48236028:1 gene:ENSRNOG00000017114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AY034050 // GenBank // Rattus norvegicus synaptojanin 2B1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// AY034051 // GenBank // Rattus norvegicus synaptojanin 2B2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// U90312 // GenBank // Rattus norvegicus synaptojanin II mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48198203:48235552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001126088 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIH, polypeptide 5 (Gtf2h5), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006227894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus general transcription factor IIH, polypeptide 5 (Gtf2h5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48280968:48287542:1 gene:ENSRNOG00000018007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC058501 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6886947, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212207 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YK09 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NONRATT000323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071277 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:48320559:48320673:1 gene:ENSRNOG00000050168 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 67 // 48 // 8 // 12 // 0
NM_001109137 // RefSeq // Rattus norvegicus tubby like protein 4 (Tulp4), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48334822:48430485:1 gene:ENSRNOG00000018012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48352072:48430485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001130939 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 181 (Tmem181), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48465874:48505759:1 gene:ENSRNOG00000018158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC168231 // GenBank // Rattus norvegicus similar to OTTHUMP00000040081, mRNA (cDNA clone MGC:188304 IMAGE:7387910), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// FQ211485 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YB11 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// FQ228553 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YA20 mRNA sequence. // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48455995:48505431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT000331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001127560 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin-like 3 (Sytl3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006227889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin-like 3 (Sytl3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48534303:48590470:1 gene:ENSRNOG00000018321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC166706 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:188395 IMAGE:5599231), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48519684:48590281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001038615 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 1 (Fndc1), mRNA. // chr1 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000034842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48905802:48987223:1 gene:ENSRNOG00000030210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// DQ256268 // GenBank // Rattus norvegicus activator of G-protein signaling 8 mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000049731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48937421:49011710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001113542 // RefSeq // Rattus norvegicus Wilms tumor 1 associated protein (Wtap), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006227892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wilms tumor 1 associated protein (Wtap), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51782341:51806765:-1 gene:ENSRNOG00000019091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001113543 // RefSeq // Rattus norvegicus Wilms tumor 1 associated protein (Wtap), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NM_001113544 // RefSeq // Rattus norvegicus Wilms tumor 1 associated protein (Wtap), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// FQ228682 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YO22 mRNA sequence. // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT004267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51726819:51806909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT004270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT004271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001006995 // RefSeq // Rattus norvegicus acetyl-CoA acetyltransferase 2 (Acat2), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003753176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic-like (RGD1562948), mRNA. // chrU // 75 // 80 // 18 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51757962:51776935:-1 gene:ENSRNOG00000019189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// BC083872 // GenBank // Rattus norvegicus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:95138 IMAGE:7128564), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY325187 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-076 mRNA, complete cds. // chrU // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT004261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// NONRATT004262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018934 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:51727309:51754861:-1 gene:ENSRNOG00000013975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 71 // 70 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51726819:51806909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT004265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001006995 // RefSeq // Rattus norvegicus acetyl-CoA acetyltransferase 2 (Acat2), mRNA. // chr1 // 75 // 89 // 18 // 24 // 0 /// XM_003753176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic-like (RGD1562948), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY325187 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-076 mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// BC083872 // GenBank // Rattus norvegicus acetyl-Coenzyme A acetyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:95138 IMAGE:7128564), complete cds. // chr1 // 75 // 89 // 18 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51757962:51776935:-1 gene:ENSRNOG00000019189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 89 // 17 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018934 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:51727309:51754861:-1 gene:ENSRNOG00000013975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51726819:51806909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 82 // 81 // 18 // 22 // 0 /// NONRATT004262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 77 // 81 // 17 // 22 // 0 /// NONRATT004265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001106205 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L18 (Mrpl18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51713678:51718630:-1 gene:ENSRNOG00000014582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167033 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L18, mRNA (cDNA clone MGC:189275 IMAGE:8372474), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51685549:51720174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001025724 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1 (Pnldc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006227880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1 (Pnldc1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000060412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51693999:51712435:-1 gene:ENSRNOG00000023140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC099137 // GenBank // Rattus norvegicus poly(A)-specific ribonuclease (PARN)-like domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:116282 IMAGE:7456056), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT004254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000030757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51685549:51720174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// NONRATT004255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// NONRATT004256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1 /// NONRATT004257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1
NM_012757 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS1 oncogene (Mas1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS1 oncogene (Mas1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006227863 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS1 oncogene (Mas1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006227864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS1 oncogene (Mas1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// XM_006227866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS1 oncogene (Mas1), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000020100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51644722:51675365:-1 gene:ENSRNOG00000014971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078884 // GenBank // Rattus norvegicus MAS1 oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:93580 IMAGE:7131760), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51645229:51656378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT004253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012756 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor 2 receptor (Igf2r), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000021840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51488769:51577141:-1 gene:ENSRNOG00000014997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// U59809 // GenBank // Rattus norvegicus mannose 6-phosphate/insulin-like growth factor II receptor (M6P/IGF2r) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// GENSCAN00000030770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51490026:51577057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT004248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_012697 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 1 (Slc22a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51452605:51479610:-1 gene:ENSRNOG00000016337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51452605:51479610:-1 gene:ENSRNOG00000016337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078883 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93570 IMAGE:7130305), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U76379 // GenBank // Rattus norvegicus organic cation transporter OCT1A mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51429686:51479573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT004246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT004247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_019230 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 3 (Slc22a3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000037369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51234472:51321364:-1 gene:ENSRNOG00000022946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF055286 // GenBank // Rattus norvegicus potential-sensitive polyspecific organic cation transporter OCT3 (OCT3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000051819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51235811:51320973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT004243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001107456 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase 4 (Map3k4), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51043920:51129819:-1 gene:ENSRNOG00000017419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51037824:51149404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000045929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:49791728:49799101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000040308 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:49791728:49792728:-1 gene:ENSRNOG00000030165 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_001077677 // RefSeq // Rattus norvegicus Park2 co-regulated (Pacrg), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus parkin coregulated gene protein-like (LOC100912128), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:49266490:49625133:-1 gene:ENSRNOG00000017122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC127534 // GenBank // Rattus norvegicus Park2 co-regulated, mRNA (cDNA clone MGC:156800 IMAGE:7133203), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000023290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:52259949:52326563:1 gene:ENSRNOG00000048297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000035402 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:52259949:52328929:1 gene:ENSRNOG00000048297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000071865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:52104976:52209819:1 gene:ENSRNOG00000017174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NM_001115021 // RefSeq // Rattus norvegicus quaking (Qk), mRNA. // chrU // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// BC158800 // GenBank // Rattus norvegicus quaking, mRNA (cDNA clone MGC:188205 IMAGE:7320367), complete cds. // chrU // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000023304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:52104976:52207882:1 gene:ENSRNOG00000017174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:52137244:52225889:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:52256354:52394738:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT000373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT000374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_001079870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D3 (Snrpd3), mRNA. // chr1 // 45 // 88 // 10 // 22 // 0 /// XM_003751948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D3 (Snrpd3), mRNA. // chr1 // 45 // 88 // 10 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000075517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16266053:16279075:-1 gene:ENSRNOG00000050410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 88 // 10 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000023316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:52424177:52425593:1 gene:ENSRNOG00000017363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000053918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:52424290:52424541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT000376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16264847:16281312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 88 // 8 // 22 // 0
NM_001106208 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 6 (Pabpc6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:52894340:52897407:1 gene:ENSRNOG00000017367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168959 // GenBank // Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 3, mRNA (cDNA clone MGC:189273 IMAGE:7135469), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:52894399:52896330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000026718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54042598:54137519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
XR_342684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L19-like (LOC102547568), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XR_350018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L19-like (LOC102547568), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000017331 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:54306671:54307275:1 gene:ENSRNOG00000012974 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0
NM_001106210 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease T2 (Rnaset2), mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000017601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54425133:54442302:1 gene:ENSRNOG00000013190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// BC168957 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease T2, mRNA (cDNA clone MGC:189268 IMAGE:9098746), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT000382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_057128 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase polypeptide 2 (Rps6ka2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// XM_006227917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase polypeptide 2 (Rps6ka2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000017809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54609625:54747731:1 gene:ENSRNOG00000013194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000045964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54664090:54761668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 38 // 48 // 1 /// NONRATT000385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 20 // 48 // 1
NM_001107461 // RefSeq // Rattus norvegicus t-complex protein 10b (Tcp10b), mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000018015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54778831:54801736:1 gene:ENSRNOG00000013374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC166440 // GenBank // Rattus norvegicus t-complex protein 10b, mRNA (cDNA clone MGC:187531 IMAGE:7455355), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54779702:54801262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT000389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT000391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001191619 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm motility kinase 2A (Smok2a), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// XM_006227950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase 3-like (RGD1560718), mRNA. // chr1 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000072895 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:55274512:55276017:-1 gene:ENSRNOG00000050459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 97 // 25 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000075019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:56065260:56066765:-1 gene:ENSRNOG00000049155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 97 // 27 // 31 // 0 /// XM_003754715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase 3-like (RGD1560718), partial mRNA. // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000041896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56039987:56111763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:55163649:55282292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 78 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT004306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT004318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:55325101:55414226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
GENSCAN00000055348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:55152664:55153235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT004306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000018945 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:55152664:55153271:-1 gene:ENSRNOG00000014157 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
NM_013217 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 4 (Mllt4), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 132 // 132 // 0 /// ENSRNOT00000032667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54957455:55043458:-1 gene:ENSRNOG00000023753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 94 // 125 // 127 // 0 /// ENSRNOT00000042807 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:54964872:55043458:-1 gene:ENSRNOG00000023753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 107 // 107 // 0 /// U83230 // GenBank // Rattus norvegicus l-Afadin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 132 // 132 // 0 /// U83231 // GenBank // Rattus norvegicus s-Afadin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 112 // 112 // 0 /// GENSCAN00000055346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54938255:55137346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 79 // 103 // 106 // 0 /// NONRATT004305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 98 // 96 // 128 // 130 // 0 /// NONRATT004306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 98 // 96 // 128 // 130 // 0 /// NONRATT004308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 7 // 7 // 9 // 135 // 1 /// NONRATT004309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 11 // 11 // 15 // 135 // 1 /// NONRATT004310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 11 // 11 // 15 // 135 // 1 /// NONRATT004311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 9 // 9 // 12 // 135 // 1 /// NONRATT004312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 9 // 9 // 12 // 135 // 1
NM_001099463 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 7 (Vom2r7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000047766 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:55837103:55853089:1 gene:ENSRNOG00000026000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NONRATT000397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001099464 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 8 (Vom2r8), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000049502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176189369:176229413:-1 gene:ENSRNOG00000031954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176151356:176230067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_001099465 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 9 (Vom2r9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000029537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:57065642:57099109:-1 gene:ENSRNOG00000013671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:57015151:57126260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
GENSCAN00000040369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:57015151:57126260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000053376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:55734389:55737937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0
XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 55 // 100 // 21 // 38 // 0 /// XM_006222917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 45 // 100 // 17 // 38 // 0 /// XM_006222918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 45 // 100 // 17 // 38 // 0 /// XM_006222919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 45 // 100 // 17 // 38 // 0 /// XM_001065293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000041610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87993184:1 gene:ENSRNOG00000030145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000040361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56945187:56963851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// NONRATT004336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT004337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT004338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000000945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87992977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
XM_003748704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// XM_003753182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006227967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561185), mRNA. // chr1 // 90 // 29 // 9 // 10 // 0 /// XM_001065293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 73 // 97 // 24 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000041610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87993184:1 gene:ENSRNOG00000030145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 97 // 24 // 33 // 0 /// XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 29 // 100 // 10 // 34 // 0 /// XM_006222917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// XM_006222918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// XM_006222919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000000945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87992977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 88 // 21 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56429032:56507062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 82 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56867158:56915367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
XM_001065293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 58 // 92 // 19 // 33 // 0 /// XM_003748704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 58 // 92 // 19 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000041610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87993184:1 gene:ENSRNOG00000030145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 92 // 19 // 33 // 0 /// XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 35 // 94 // 12 // 34 // 0 /// XM_003753182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 39 // 92 // 13 // 33 // 0 /// XM_006222917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 34 // 89 // 11 // 32 // 0 /// XM_006222918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 34 // 89 // 11 // 32 // 0 /// XM_006222919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 34 // 89 // 11 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87992977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 92 // 19 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56429032:56507062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 89 // 19 // 32 // 0 /// NONRATT004336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT004337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT004338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// XM_006222917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// XM_006222918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// XM_006222919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// NONRATT004336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT004337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT004338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 53 // 100 // 19 // 36 // 0 /// XM_006222917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 33 // 100 // 12 // 36 // 0 /// XM_006222918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 33 // 100 // 12 // 36 // 0 /// XM_006222919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 33 // 100 // 12 // 36 // 0 /// XM_001065293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// XM_003748704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000041610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87993184:1 gene:ENSRNOG00000030145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000040361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56945187:56963851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT004336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT004337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT004338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000000945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87992977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56429032:56507062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001106215 // RefSeq // Rattus norvegicus SPARC related modular calcium binding 2 (Smoc2), mRNA. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:57434174:57565314:1 gene:ENSRNOG00000014166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC168953 // GenBank // Rattus norvegicus SPARC related modular calcium binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:189261 IMAGE:7109706), complete cds. // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT000412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001103356 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100125364 (LOC100125364), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020889 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:58133058:58135240:1 gene:ENSRNOG00000015597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT000419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
NM_001107466 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 120B (Fam120b), mRNA. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:242134746:242181174:1 gene:ENSRNOG00000001487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT003294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// GENSCAN00000008206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:242147654:242159948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000041303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:242162896:242191079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT003297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001004198 // RefSeq // Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006227980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:58420201:58438561:1 gene:ENSRNOG00000001489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081939 // GenBank // Rattus norvegicus TATA box binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:93994 IMAGE:7115389), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:58420007:58435027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001107465 // RefSeq // Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 1 (Chd1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:58619223:58682200:1 gene:ENSRNOG00000014434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:58619378:58718906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000044998 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:60044904:60045902:1 gene:ENSRNOG00000031351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60045155:60050011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001009687 // RefSeq // Rattus norvegicus RIO kinase 2 (Riok2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:60057339:60073786:1 gene:ENSRNOG00000012692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC088297 // GenBank // Rattus norvegicus RIO kinase 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:109496 IMAGE:7322759), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ232861 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YC20 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60057350:60073665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106214 // RefSeq // Rattus norvegicus Lix1 homolog (chicken) (Lix1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000017442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:60083352:60139891:1 gene:ENSRNOG00000012988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT000440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT000441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000007563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60083785:60149557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 14 // 15 // 1 /// NONRATT000442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1
GENSCAN00000039666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60510252:60511965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 94 // 14 // 16 // 0
NR_031857 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 99b (Mir99b), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053777 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:60623874:60623943:1 gene:ENSRNOG00000035654 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-99b // miRBase Micro RNA Database // MI0000884 Rattus norvegicus miR-99b stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031805 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7e (Mirlet7e), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-let-7e // miRBase Micro RNA Database // MI0000832 Rattus norvegicus let-7e stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031868 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 125a (Mir125a), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053695 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:60624485:60624569:1 gene:ENSRNOG00000035572 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-125a // miRBase Micro RNA Database // MI0000895 Rattus norvegicus miR-125a stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135720 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688452 (LOC688452), mRNA. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000014598 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:60624656:60635421:1 gene:ENSRNOG00000039076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// FM212919 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SPACA6 protein, strain BN. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT000446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001135720 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688452 (LOC688452), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688452 (LOC688452), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006227990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688452 (LOC688452), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006227994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688452 (LOC688452), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000014598 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:60624656:60635421:1 gene:ENSRNOG00000039076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FM212919 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SPACA6 protein, strain BN. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60621134:60638438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT000449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001135720 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688452 (LOC688452), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688452 (LOC688452), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688452 (LOC688452), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014598 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:60624656:60635421:1 gene:ENSRNOG00000039076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FM212919 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SPACA6 protein, strain BN. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60621134:60638438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT000448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT000451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_001073508 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formyl peptide receptor 2 (Fpr2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041605 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:60719565:60720620:-1 gene:ENSRNOG00000031331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60719565:60720620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000064917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:117322293:117323333:-1 gene:ENSRNOG00000042605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:117322278:117323333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227508 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YB20 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001099469 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 10 (Vom2r10), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:87307429:87353451:1 gene:ENSRNOG00000011191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000018180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87318857:87352932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT001030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_001008903 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 2 (Vom1r2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:87567366:87568274:1 gene:ENSRNOG00000034119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510349 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re26 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009517 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 3 (Vom1r3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:87633289:87634194:1 gene:ENSRNOG00000048251 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510342 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re25 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009516 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 4 (Vom1r4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:87719103:87719999:1 gene:ENSRNOG00000045921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510338 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re24 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000050523 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87840446:87841349:1 gene:ENSRNOG00000031073 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001009512 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 6 (Vom1r6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510290 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:60960461:61033138:1 gene:ENSRNOG00000045958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT000455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008905 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 8 (Vom1r8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510276 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001167547 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 9 (Vom1r9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001167548 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 13 (Vom1r13), mRNA. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:61520835:61521785:1 gene:ENSRNOG00000046825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:61240565:61241515:1 gene:ENSRNOG00000050068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_057140 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit A, alpha (Ppp2r1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:61883998:61903234:1 gene:ENSRNOG00000011282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083859 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit A, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:95083 IMAGE:7126254), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:61883999:61906407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006222942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor, F4-like (LOC100365363), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor, F4-like (LOC100365363), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor, F4-like (LOC100365363), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor, F4-like (LOC100365363), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor, F4-like (LOC100365363), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:62035985:62372821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001009522 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 111 (Vom1r111), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_001167572 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 17 (Vom1r17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000015370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62384298:62385203:1 gene:ENSRNOG00000011565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY510366 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT000463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001008941 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 23 (Vom1r23), mRNA. // chr1 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// NM_001167572 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 17 (Vom1r17), mRNA. // chr1 // 50 // 96 // 12 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62384298:62385203:1 gene:ENSRNOG00000011565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 96 // 12 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63875694:63876641:-1 gene:ENSRNOG00000047128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// AY510359 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf5 mRNA, complete cds. // chr1 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// NM_001009522 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 111 (Vom1r111), mRNA. // chr1 // 42 // 96 // 10 // 24 // 0 /// NM_001167549 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 16 (Vom1r16), mRNA. // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62012404:62013342:-1 gene:ENSRNOG00000047522 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 46 // 96 // 11 // 24 // 0 /// AY510366 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf4 mRNA, complete cds. // chr1 // 42 // 96 // 10 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059671 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:61993727:61994674:-1 gene:ENSRNOG00000050623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT000463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 96 // 12 // 24 // 0 /// NONRATT004404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0
NM_001008954 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 19 (Vom1r19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62260118:62261059:1 gene:ENSRNOG00000032996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510367 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510368 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009506 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 20 (Vom1r20), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62297765:62298673:1 gene:ENSRNOG00000028807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY510344 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NONRATT041441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT041929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_001009510 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 21 (Vom1r21), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:39317209:39318078:1 gene:ENSRNOG00000039019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510339 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf3 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_212510 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L18A (Rpl18a), mRNA. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// XM_001060296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L18a-like (RGD1565566), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_574336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L18a-like (RGD1565566), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20150821:20152827:1 gene:ENSRNOG00000018795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068694 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:62626294:62626824:1 gene:ENSRNOG00000042547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058498 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L18A, mRNA (cDNA clone MGC:72957 IMAGE:6919102), complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// FQ210713 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA23YM11 mRNA sequence. // chr1 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// FQ226007 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YG01 mRNA sequence. // chr1 // 71 // 84 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:62448819:62626824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT022269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20141905:20164040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 88 // 16 // 22 // 0
NM_001099488 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 12 (Vom2r12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001099488 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 12 (Vom2r12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001099489 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 13 (Vom2r13), mRNA. // chr1 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// XM_006228090 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal type-2 receptor 26-like (LOC100910184), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:64550975:64573369:1 gene:ENSRNOG00000050836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:64572452:64637941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:64286028:64314992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT000506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT000506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001099489 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 13 (Vom2r13), mRNA. // chrU // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT000507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
XM_006222970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 182-like (LOC102555377), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006228091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 182-like (LOC102555377), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006228092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 182-like (LOC102555377), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034746 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:64950262:64962383:1 gene:ENSRNOG00000026569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT000508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001111321 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 80 (Vom2r80), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000042502 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:65293327:65296407:1 gene:ENSRNOG00000029008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 67 // 6 // 8 // 0 /// NONRATT000509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NM_001099655 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 16 (Vom2r16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:65624478:65642511:1 gene:ENSRNOG00000049871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:65540863:65858893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 100 // 11 // 24 // 0
NONRATT000513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 100 // 10 // 20 // 0 /// NONRATT000512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 44 // 90 // 8 // 18 // 0
NM_001099492 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 19 (Vom2r19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000046796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66226262:66239138:1 gene:ENSRNOG00000046198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66214301:66246430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66262635:66343523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT000512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000008681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:65540863:65858893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001099656 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 22 (Vom2r22), mRNA. // chr8 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1
NM_001099493 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 24 (Vom2r24), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:3991907:4021956:-1 gene:ENSRNOG00000049838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT054386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001099482 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 25 (Vom2r25), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000071085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:3857536:3900585:-1 gene:ENSRNOG00000046431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:3775641:3939368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT054384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000042050 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:3775647:3793007:-1 gene:ENSRNOG00000048635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:3775641:3939368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_001110141 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5B (Eif5b), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:44354656:44409587:1 gene:ENSRNOG00000023356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC166424 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5B, mRNA (cDNA clone MGC:187399 IMAGE:7097275), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014877 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:62489112:62492094:-1 gene:ENSRNOG00000011187 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49210743:49214390:-1 gene:ENSRNOG00000046621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:62489112:62513838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:44377033:44409268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49210743:49214390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT028326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT056441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT056443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT056445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001008953 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 110 (Vom1r110), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000043310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69504405:69505322:1 gene:ENSRNOG00000049672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY510352 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re18 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_001008952 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 27 (Vom1r27), mRNA. // chr1 // 55 // 100 // 11 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000072292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69316603:69436053:1 gene:ENSRNOG00000049847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 100 // 11 // 20 // 0 /// AY510351 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re19 mRNA, complete cds. // chr1 // 55 // 100 // 11 // 20 // 0 /// NONRATT000551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001008966 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 28 (Vom1r28), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:68964531:68965463:1 gene:ENSRNOG00000047610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69520817:69521749:1 gene:ENSRNOG00000049263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510353 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re16 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008946 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 29 (Vom1r29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69564386:69565303:1 gene:ENSRNOG00000048298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000075596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69009022:69009939:1 gene:ENSRNOG00000048033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY510346 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re10 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001009509 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 109 (Vom1r109), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000070823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69026941:69027801:1 gene:ENSRNOG00000047242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69582308:69583168:1 gene:ENSRNOG00000045590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY510360 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re17 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071347 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:69333169:69334028:1 gene:ENSRNOG00000049412 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001009511 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 30 (Vom1r30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69651853:69652746:1 gene:ENSRNOG00000025171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510321 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rl1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:69651874:69709753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT000552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000004443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70022615:70052554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000015054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:70045572:70053419:1 gene:ENSRNOG00000011236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NM_031713 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B (with TM and ITIM domains), member 3 (Lilrb3), mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AF082534 // GenBank // Rattus norvegicus type 1 one-pass transmembrane Ig-like receptor (NILR-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT000556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70022615:70052554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT000557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
GENSCAN00000004452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70071091:70101365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001191816 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 120A (Fam120a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:18167847:18257857:1 gene:ENSRNOG00000016779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:18168344:18256168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:62764200:62827005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_003748712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 3-like (LOC100912499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 90 // 91 // 9 // 10 // 0 /// XM_006228048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 3-like (LOC100912499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 90 // 91 // 9 // 10 // 0 /// XM_006228057 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 3-like (LOC690948), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000045952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62876239:62882940:1 gene:ENSRNOG00000045848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000059324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62912681:62919376:1 gene:ENSRNOG00000048654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000070798 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:62956410:62960607:1 gene:ENSRNOG00000050919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000046548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:62912681:63005393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000054521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:62834653:62882940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT000478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001134978 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane bound O-acyltransferase domain containing 7 (Mboat7), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006228028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane bound O-acyltransferase domain containing 7 (Mboat7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysophospholipid acyltransferase 7-like (LOC100909580), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63093299:63106717:1 gene:ENSRNOG00000038794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074360 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:63024114:63037747:1 gene:ENSRNOG00000048120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC169089 // GenBank // Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 4, mRNA (cDNA clone MGC:189503 IMAGE:5598892), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63024973:63073718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63093299:63118697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001034104 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane channel-like 4 (Tmc4), mRNA. // chr1 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63107003:63118858:1 gene:ENSRNOG00000012179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC100657 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane channel-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:124845 IMAGE:7936370), complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072643 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:63038642:63046325:1 gene:ENSRNOG00000046255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63093299:63118697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT000479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63024973:63073718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT000478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001106218 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 1 (Leng1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63119164:63124096:1 gene:ENSRNOG00000012816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63119204:63123073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_138870 // RefSeq // Rattus norvegicus TCF3 (E2A) fusion partner (Tfpt), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63155152:63164554:1 gene:ENSRNOG00000013980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB029495 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Amida, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63155621:63164554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001184973 // RefSeq // Rattus norvegicus osteoclast associated, immunoglobulin-like receptor (Oscar), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63173817:63180053:1 gene:ENSRNOG00000038776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63173872:63270887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT000488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
XM_006223029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T cell-interacting, activating receptor on myeloid cells 1 (Tarm1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006228077 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T cell-interacting, activating receptor on myeloid cells 1 (Tarm1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000059241 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:63233279:63245978:1 gene:ENSRNOG00000038775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002725507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus VSTM1 protein-like (LOC100360054), mRNA. // chr1 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// XM_002728681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus VSTM1 protein-like (LOC100360054), mRNA. // chr1 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63173872:63270887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001000538 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1-like (Olr1l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001000856 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 386 (Olr386), mRNA. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63478627:63479601:1 gene:ENSRNOG00000023767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63473416:63474072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000054699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63478627:63479601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
NM_001169142 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 12 (Nlrp12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000043650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63493720:63521353:1 gene:ENSRNOG00000014812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63493720:63521077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006228022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3 (LOC292543), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000059193 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:63610443:63624068:1 gene:ENSRNOG00000022795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC098062 // GenBank // Rattus norvegicus similar to solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:116223 IMAGE:7458331), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63603597:63623581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
AF016183 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN6) mRNA, complete cds. // chrU // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021046 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:70894707:70919605:1 gene:ENSRNOG00000015707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 90 // 62 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT000560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70902717:70920347:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001099472 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 28 (Vom2r28), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:70956193:70986046:1 gene:ENSRNOG00000002641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT000560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70962806:70986046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001191620 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 418 (Zfp418), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000020751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71012442:71026967:1 gene:ENSRNOG00000015271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// FQ212491 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YE06 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006228179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 418-like (LOC691135), mRNA. // chr1 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
NM_001106467 // RefSeq // Rattus norvegicus hippocampus abundant gene transcript 1 (Hiat1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hippocampus abundant transcript 1 (Hiat1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006233224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hippocampus abundant transcript 1 (Hiat1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000020907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237524843:237556087:1 gene:ENSRNOG00000015502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000075340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71185529:71217901:1 gene:ENSRNOG00000050407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC160912 // GenBank // Rattus norvegicus hippocampus abundant gene transcript 1, mRNA (cDNA clone MGC:188651 IMAGE:7456962), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000015846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237521905:237556087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71185658:71216781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_001107472 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 772 (Zfp772), mRNA. // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000042086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71250634:71256311:1 gene:ENSRNOG00000022742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000072231 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:71238918:71243045:1 gene:ENSRNOG00000047061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT000566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000020095 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:71615728:71625778:1 gene:ENSRNOG00000014791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000050180 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:71615728:71626512:1 gene:ENSRNOG00000014791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71603406:71626512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001107473 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, imprinted 1 (Zim1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71646069:71659128:1 gene:ENSRNOG00000015071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71646069:71850963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001000110 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 3 (Olr3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71833479:71834432:1 gene:ENSRNOG00000015254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71646069:71850963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT000577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000111 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 4 (Olr4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000072272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71850025:71850963:1 gene:ENSRNOG00000047512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71646069:71850963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000112 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 5 (Olr5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT000579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_001000539 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 6 (Olr6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71876783:71877721:1 gene:ENSRNOG00000045783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075418 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:72485868:72486594:1 gene:ENSRNOG00000049786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71860986:71886104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:72486019:72486594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT000580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134609 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 583 (Zfp583), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72645124:72656306:1 gene:ENSRNOG00000034184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72654591:72655508:1 gene:ENSRNOG00000034184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT000581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT000582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108904 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 787 (Zfp787), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 787 (Zfp787), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 787 (Zfp787), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72827317:72840114:1 gene:ENSRNOG00000015456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:72827334:72840747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT000587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
XM_002725524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1564651), mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// XM_002728684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1564651), mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// NONRATT000591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001008937 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 32 (Vom1r32), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73231686:73232603:1 gene:ENSRNOG00000048505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510337 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd24 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000053809 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:73299351:73299467:1 gene:ENSRNOG00000035686 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000020857 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:100891940:100892769:-1 gene:ENSRNOG00000015579 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100891940:100892769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001008923 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 37 (Vom1r37), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000058999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76325235:76326197:-1 gene:ENSRNOG00000038647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY510333 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001008964 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 38 (Vom1r38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76305195:76306118:-1 gene:ENSRNOG00000038644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510334 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd25 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000008444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76275667:76325888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000008444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76275667:76325888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_001166675 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS-like, family 2, locus 9 (Rasl2-9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76263550:76264200:-1 gene:ENSRNOG00000032913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF507943 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-ase Ran mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76250130:76264200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001106222 // RefSeq // Rattus norvegicus ret finger protein-like 4A (Rfpl4a), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000021077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76249814:76256273:-1 gene:ENSRNOG00000015743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76250130:76264200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001134544 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 865 (Zfp865), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76174719:76179197:-1 gene:ENSRNOG00000016279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76176075:76179164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106223 // RefSeq // Rattus norvegicus FLT3-interacting zinc finger 1 (Fiz1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76148778:76155738:-1 gene:ENSRNOG00000016574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// FQ224110 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA76YH07 mRNA sequence. // chr1 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76149766:76154270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT004576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001126276 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 579 (Zfp579), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76133750:76136920:-1 gene:ENSRNOG00000016608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC161912 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 579, mRNA (cDNA clone MGC:187645 IMAGE:8369301), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76134117:76141790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT004575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000066307 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:76113103:76115725:-1 gene:ENSRNOG00000042927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NM_001127539 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain binding kinase family, member 2 (Sbk2), mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// XM_001078116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain binding kinase family, member 3 (Sbk3), mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// XM_002725520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain binding kinase family, member 3 (Sbk3), mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000058956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76102585:76110349:-1 gene:ENSRNOG00000038625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// BC161893 // GenBank // Rattus norvegicus similar to protein kinase Bsk146, mRNA (cDNA clone MGC:187475 IMAGE:7193319), complete cds. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000008487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76100257:76123705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001008367 // RefSeq // Rattus norvegicus isochorismatase domain containing 2b (Isoc2b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75991121:76011769:-1 gene:ENSRNOG00000016829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085336 // GenBank // Rattus norvegicus isochorismatase domain containing 2b, mRNA (cDNA clone MGC:105521 IMAGE:7301753), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75991431:75999055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT004570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT004571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001145175 // RefSeq // Rattus norvegicus shisa family member 7 (Shisa7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shisa family member 7 (Shisa7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shisa family member 7 (Shisa7), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75971937:75990854:-1 gene:ENSRNOG00000016877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75976102:75983128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001145175 // RefSeq // Rattus norvegicus shisa family member 7 (Shisa7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shisa family member 7 (Shisa7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus shisa family member 7 (Shisa7), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75971937:75990854:-1 gene:ENSRNOG00000016877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106224 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2S (Ube2s), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000022977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75951968:75956026:-1 gene:ENSRNOG00000016930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC169077 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2S, mRNA (cDNA clone MGC:189478 IMAGE:5620985), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ232915 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YO21 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000008485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75940727:75955894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT004563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_001071740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 238 (Tmem238), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_574354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 238 (Tmem238), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023246 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:75903410:75910074:-1 gene:ENSRNOG00000017306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75909547:75910074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT004561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_133519 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 11 (Il11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 11 (Il11), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006228246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 11 (Il11), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000023489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75891524:75897820:-1 gene:ENSRNOG00000017386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF347935 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 11 precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT004560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001145401 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member E2 (Fam71e2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75874608:75890446:-1 gene:ENSRNOG00000033173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75874608:75890446:-1 gene:ENSRNOG00000033173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// BC161877 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930401F20 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:7115509), complete cds. // chr1 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000030669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75873334:75890449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001039085 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIb polypeptide 2 (Cox6b2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75873174:75874397:-1 gene:ENSRNOG00000038616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY152399 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIb testes-specific isoform precursor, mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC126062 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7457121. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107476 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 150B (Tmem150b), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006228267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 150B (Tmem150b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75833876:75842777:-1 gene:ENSRNOG00000028273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75834531:75842482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_139261 // RefSeq // Rattus norvegicus HSPA binding protein, cytoplasmic cochaperone 1 (Hspbp1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75779793:75803081:-1 gene:ENSRNOG00000017795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF187860 // GenBank // Rattus norvegicus Hsp70 binding protein HspBP mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC072541 // GenBank // Rattus norvegicus HSPA (heat shock 70kDa) binding protein, cytoplasmic cochaperone 1, mRNA (cDNA clone MGC:91470 IMAGE:7103744), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ232199 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YK18 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75652225:75803089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT004551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT004552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001135849 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 6, regulatory subunit 1 (Ppp6r1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006228276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 6, regulatory subunit 1 (Ppp6r1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006228277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 6, regulatory subunit 1 (Ppp6r1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000024400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75750758:75777986:-1 gene:ENSRNOG00000018090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000030653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75652225:75803089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT004542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT004544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// NONRATT004545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT004543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001109604 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 86B (Tmem86b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75747873:75750239:-1 gene:ENSRNOG00000038607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158795 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 86B, mRNA (cDNA clone MGC:188180 IMAGE:7314455), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75652225:75803089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001191945 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, H (Ptprh), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75692060:75720081:-1 gene:ENSRNOG00000018152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// D45413 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for brain-enriched membrane-associated protein tyrosine phosphatase (BEM)-2, complete cds. // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75652225:75803089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_019350 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin V (Syt5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin V (Syt5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75683291:75691003:-1 gene:ENSRNOG00000018217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC092198 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin V, mRNA (cDNA clone IMAGE:7313319), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U26402 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 5 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75652225:75803089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001271115 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, assembly factor 3 (Dnaaf3), mRNA. // chr1 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75669674:75677024:-1 gene:ENSRNOG00000038600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 74 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75652225:75803089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT004534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT004535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_017144 // RefSeq // Rattus norvegicus troponin I type 3 (cardiac) (Tnni3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006228251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus troponin I type 3 (cardiac) (Tnni3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75665121:75668699:-1 gene:ENSRNOG00000018250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// DQ062462 // GenBank // Rattus norvegicus troponin I mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// M57679 // GenBank // Rat cardiac troponin I mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// M92074 // GenBank // Rat troponin I mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// X58499 // GenBank // Rat cTNI mRNA for cardiac troponin I. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75652225:75803089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT004529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT004530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT004531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001191946 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 12C (Ppp1r12c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000032627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75625471:75648495:-1 gene:ENSRNOG00000027959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000030663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75626026:75645145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT004523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1 /// NONRATT004524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 15 // 43 // 1 /// NONRATT004525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1
NM_001108468 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 13 (all-trans/9-cis) (Rdh13), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75563122:75590916:-1 gene:ENSRNOG00000027919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75483476:75590776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008942 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 33 (Vom1r33), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_001167551 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor Vom1r39 (Vom1r39), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AY510340 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd22 mRNA, complete cds. // chrUn // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NM_001008947 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 34 (Vom1r34), mRNA. // chrUn // 61 // 98 // 25 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000064246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73342240:73343157:-1 gene:ENSRNOG00000049710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 61 // 98 // 25 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000074328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100877964:100878881:1 gene:ENSRNOG00000048104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 62 // 100 // 26 // 42 // 0 /// AY510347 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd23 mRNA, complete cds. // chrUn // 61 // 98 // 25 // 41 // 0
NM_001169149 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 9 (Nlrp9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73246708:73296649:-1 gene:ENSRNOG00000021913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:73246708:73296649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108469 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 5 (Cdc42ep5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:74828671:74829132:-1 gene:ENSRNOG00000018616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74825506:74853211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT004518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster member 9-like (LOC100912286), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster member 9-like (LOC100912286), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025138 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:74825506:74827023:-1 gene:ENSRNOG00000018621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74825506:74853211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT004515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT004516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT004517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001029928 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte-associated immunoglobulin-like receptor 1 (Lair1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:74679611:74710530:-1 gene:ENSRNOG00000027733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY863023 // GenBank // Rattus norvegicus leukocyte-associated immunoglobulin-like receptor 1 (Lair1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// DQ025756 // GenBank // Rattus norvegicus leukocyte-associated Ig-like receptor-1 (Lair1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74679936:74713353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT004513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001099496 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 29 (Vom2r29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040441 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:74285207:74306093:-1 gene:ENSRNOG00000038497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74285207:74299967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT004510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NONRATT004510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT004510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001099467 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 30 (Vom2r30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:73764568:73786425:-1 gene:ENSRNOG00000046339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 71 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT004510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0
NM_173319 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 31 (Vom2r31), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000047147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73554043:73579885:-1 gene:ENSRNOG00000031562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AF016184 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT004509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_173319 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 31 (Vom2r31), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000047147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73554043:73579885:-1 gene:ENSRNOG00000031562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// AF016184 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN7) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:73441955:73442869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:73555523:73576382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT004509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
NM_173315 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 32 (Vom2r32), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:68607184:68640948:-1 gene:ENSRNOG00000002628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AF016179 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_001008959 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 42 (Vom1r42), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 42 (Vom1r42), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// XM_006228153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 42 (Vom1r42), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000041518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:68081693:68082613:-1 gene:ENSRNOG00000028877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510306 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg16 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:68008151:68122311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_001079180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing protein 4C-like (LOC691661), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_002725499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing protein 4C-like (LOC691661), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:68008151:68122311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
NM_001008932 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 43 (Vom1r43), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67984540:67985457:-1 gene:ENSRNOG00000032226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510319 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg17 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008902 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 44 (Vom1r44), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67955363:67956367:-1 gene:ENSRNOG00000033483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510307 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008940 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 45 (Vom1r45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67915184:67916131:-1 gene:ENSRNOG00000028882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510328 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg10 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000073583 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:67874351:67876285:-1 gene:ENSRNOG00000047429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT004455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001008939 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 46 (Vom1r46), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67846750:67847700:-1 gene:ENSRNOG00000032817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510348 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg15 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008920 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 49 (Vom1r49), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY510303 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg8 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT000546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
XM_001063928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36a-like (RGD1564617), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043603 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:67748455:67748772:1 gene:ENSRNOG00000032062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072809 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:52059453:52059770:1 gene:ENSRNOG00000050463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:67748455:67794731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 89 // 83 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000056353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:52059453:52099983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 91 // 17 // 21 // 0 /// NONRATT000546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001008933 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 51 (Vom1r51), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67661326:67662279:-1 gene:ENSRNOG00000047370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY510370 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rm5 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001008930 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 52 (Vom1r52), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67574296:67575249:-1 gene:ENSRNOG00000049529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510373 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rm6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073322 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:67436406:67527002:-1 gene:ENSRNOG00000046823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 92 // 9 // 23 // 0
NM_001008934 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 53 (Vom1r53), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67192425:67193378:1 gene:ENSRNOG00000049902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY510369 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rm3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:67549135:67550087:1 gene:ENSRNOG00000049720 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072667 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:67165792:67187874:1 gene:ENSRNOG00000046802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:67474007:67550087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
XM_001063437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 606 (Zfp606), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67027751:67050977:-1 gene:ENSRNOG00000019127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67028097:67033489:-1 gene:ENSRNOG00000019127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// XM_006223002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 606 (Zfp606), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XM_006228139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 606 (Zfp606), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001024775 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 110 (Zfp110), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66553227:66567666:-1 gene:ENSRNOG00000031328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC097420 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 110, mRNA (cDNA clone MGC:114466 IMAGE:7454819), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT004450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
XM_006222989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 8-like (LOC102553002), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006222990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 8-like (LOC102553002), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 8-like (LOC102553002), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 8-like (LOC102553002), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 8-like (LOC102553002), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 8-like (LOC102553002), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006118 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:66504503:66516392:-1 gene:ENSRNOG00000031459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66504503:66584768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT004449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006222993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain-containing protein 22-like (LOC102553294), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain-containing protein 22-like (LOC102553294), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain-containing protein 22-like (LOC102553294), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain-containing protein 22-like (LOC102553294), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026305 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:66488759:66492578:-1 gene:ENSRNOG00000031113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000005246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66468059:66492578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001277243 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S5 (Rps5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001277244 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S5 (Rps5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66471610:66475879:-1 gene:ENSRNOG00000019453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158718 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S5, mRNA (cDNA clone MGC:187862 IMAGE:9089281), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ221071 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YA15 mRNA sequence. // chr1 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// FQ223194 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA14YF24 mRNA sequence. // chr1 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// FQ226702 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YL09 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66468059:66492578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109334 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to chromosome 6 open reading frame 148 (RGD1561909), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66468414:66471083:-1 gene:ENSRNOG00000038445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66468059:66492578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108470 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid zinc finger 1 (Mzf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myeloid zinc finger 1 (Mzf1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66333351:66344445:1 gene:ENSRNOG00000027550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66262635:66343523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001107478 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 45 (Zbtb45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66375406:66379533:1 gene:ENSRNOG00000027459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66367707:66379094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_024143 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 5 (Slc27a5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66387809:66398417:1 gene:ENSRNOG00000019626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF242189 // GenBank // Rattus norvegicus bile acid CoA ligase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091147 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:108681 IMAGE:7370589), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66387882:66398288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT000530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001008929 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 56 (Vom1r56), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000040738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67466252:67467208:1 gene:ENSRNOG00000033061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:187572876:187573832:1 gene:ENSRNOG00000050466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AY510280 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rj5 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001009507 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 58 (Vom1r58), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76498340:76499156:1 gene:ENSRNOG00000049668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AY510331 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rj6 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001008944 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 59 (Vom1r59), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76533961:76534908:1 gene:ENSRNOG00000030886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510282 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rj4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001167552 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 60 (Vom1r60), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76563183:76564296:1 gene:ENSRNOG00000047490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001008944 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 59 (Vom1r59), mRNA. // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76533961:76534908:1 gene:ENSRNOG00000030886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// AY510282 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rj4 mRNA, complete cds. // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT000668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_001008935 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 61 (Vom1r61), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76666343:76667296:1 gene:ENSRNOG00000014181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510336 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rj3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76666427:76687413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001008943 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 62 (Vom1r62), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76693838:76694785:1 gene:ENSRNOG00000032819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510309 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rk2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024268 // RefSeq // Rattus norvegicus ligase I, DNA, ATP-dependent (Lig1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003748768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA ligase 1-like (LOC100911727), partial mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76727601:76762379:1 gene:ENSRNOG00000014193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064178 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:76601704:76632294:1 gene:ENSRNOG00000047206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF276774 // GenBank // Rattus norvegicus DNA ligase I mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC093604 // GenBank // Rattus norvegicus ligase I, DNA, ATP-dependent, mRNA (cDNA clone MGC:105416 IMAGE:7317599), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76727640:76762230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76563796:76632294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108907 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding protein 5 (Cabp5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76998160:77010997:1 gene:ENSRNOG00000014787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76998666:77101201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
XR_342794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549368 (LOC102549368), ncRNA. // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// XR_350149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549368 (LOC102549368), ncRNA. // chr1 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001170601 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle 72 (Srp72), mRNA. // chr1 // 88 // 100 // 42 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000002862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33237745:33351416:-1 gene:ENSRNOG00000002100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 45 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000066382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33238263:33333716:-1 gene:ENSRNOG00000002100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 42 // 15 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:77940755:77942769:-1 gene:ENSRNOG00000048028 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 98 // 90 // 42 // 43 // 0 /// BC158784 // GenBank // Rattus norvegicus signal recognition particle 72, mRNA (cDNA clone MGC:188145 IMAGE:7302022), complete cds. // chr1 // 75 // 42 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33239304:33265550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000019393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:77940358:77959870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT004591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000011915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33326272:33388272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 29 // 48 // 1 /// NONRATT019315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 27 // 48 // 1 /// NONRATT019318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
NM_001191552 // RefSeq // Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (Whsc1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (Whsc1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (Whsc1), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82803450:82855797:-1 gene:ENSRNOG00000038140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029823 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:78395178:78395462:1 gene:ENSRNOG00000022227 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82805107:82855857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:78394488:78395462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000039628 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:78880325:78882765:-1 gene:ENSRNOG00000022151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// GENSCAN00000030176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:78880453:78887798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
ENSRNOT00000013436 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:79006279:79006849:1 gene:ENSRNOG00000010132 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0
XM_006223090 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 541 (Zfp541), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000058241 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:79234721:79258282:1 gene:ENSRNOG00000021800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79234721:79258282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1
XM_006223088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box protein Pax-7-like (LOC102553890), mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XM_006228341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box protein Pax-7-like (LOC102551565), mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XM_006228355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box protein Pax-7-like (LOC102553890), mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XM_006223089 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Crx opposite strand transcript 1 (Crxos1), mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// XM_006228340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Crx opposite strand transcript 1 (Crxos1), mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000058230 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:79047383:79053955:1 gene:ENSRNOG00000038251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:78778784:78779793:1 gene:ENSRNOG00000050187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:78783039:78785102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:78777879:78779827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000042899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79048571:79053961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80890390:80890830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 54 // 10 // 15 // 0 /// GENSCAN00000029495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80875636:80877600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_080585 // RefSeq // Rattus norvegicus N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein, alpha (Napa), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79260708:79279642:1 gene:ENSRNOG00000001494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC063156 // GenBank // Rattus norvegicus N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:72716 IMAGE:6921187), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ216375 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YE04 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79261069:79279062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT000684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT000680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT000683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT000685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT000686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSRNOT00000002043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79282539:79290168:1 gene:ENSRNOG00000001493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC166768 // GenBank // Rattus norvegicus kaptin (actin binding protein), mRNA (cDNA clone MGC:188540 IMAGE:7933544), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000042879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79282585:79320424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT000688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT000689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT000690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT000691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT000692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_078619 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 2 (Slc8a2), mRNA. // chr1 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000047289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79296259:79320748:1 gene:ENSRNOG00000001492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// U08141 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley Na-Ca exchanger NCX2 isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79282585:79320424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0
NM_001108472 // RefSeq // Rattus norvegicus Meis homeobox 3 (Meis3), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Meis homeobox 3 (Meis3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79335447:79346205:1 gene:ENSRNOG00000021390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79335696:79346210:1 gene:ENSRNOG00000021390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC160854 // GenBank // Rattus norvegicus Meis homeobox 3, mRNA (cDNA clone MGC:187606 IMAGE:8364874), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79336160:79345777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006228482 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 4 (Zc3h4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 4 (Zc3h4), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 4 (Zc3h4), transcript variant X11, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79607132:79641214:1 gene:ENSRNOG00000015229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037198 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:79622139:79640732:1 gene:ENSRNOG00000015229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000068268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79607132:79641214:1 gene:ENSRNOG00000015229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79607132:79641214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106227 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 160 (Tmem160), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79664960:79667668:1 gene:ENSRNOG00000015304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79665141:79667597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT000703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024377 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5 (Gng5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270886941:270895438:1 gene:ENSRNOG00000015936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79793253:79793459:1 gene:ENSRNOG00000038205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC058469 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5, mRNA (cDNA clone MGC:72806 IMAGE:6918279), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M95780 // GenBank // Rat G protein gamma-5 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50272135:50272338:1 gene:ENSRNOG00000039562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
ENSRNOT00000041287 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:79883619:79886517:1 gene:ENSRNOG00000034247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000058153 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:79883837:79886517:1 gene:ENSRNOG00000034247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_022952 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 2, sigma 1 subunit (Ap2s1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79918162:79929502:1 gene:ENSRNOG00000015865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC088138 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 2, sigma 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:108685 IMAGE:7374432), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ234449 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YO24 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// M37194 // GenBank // Rat clathrin-associated protein 17 (AP17) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// U75917 // GenBank // Rattus norvegicus clathrin-associated protein 17 (AP17) mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// NONRATT000705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT000707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79896995:79929226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// NONRATT000709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NM_175758 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (neutral amino acid transporter), member 5 (Slc1a5), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79957648:79971750:1 gene:ENSRNOG00000015948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79957648:79971750:1 gene:ENSRNOG00000015948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC080242 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (neutral amino acid transporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:91449 IMAGE:7100054), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79958039:79971221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107480 // RefSeq // Rattus norvegicus striatin, calmodulin binding protein 4 (Strn4), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_001161809 // RefSeq // Rattus norvegicus striatin, calmodulin binding protein 4 (Strn4), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000021976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79987125:80012887:1 gene:ENSRNOG00000016145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC168948 // GenBank // Rattus norvegicus striatin, calmodulin binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:189254 IMAGE:7308304), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT000713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT000715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79987579:80043175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// NONRATT000716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT000714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT000719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001013895 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase D2 (Prkd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80015015:80043543:1 gene:ENSRNOG00000016434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC083592 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase D2, mRNA (cDNA clone MGC:94325 IMAGE:7132731), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ218070 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA9YN15 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79987579:80043175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT000720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT000721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001191947 // RefSeq // Rattus norvegicus dapper, antagonist of beta-catenin, homolog 3 (Xenopus laevis) (Dact3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80048066:80059888:1 gene:ENSRNOG00000046360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80048168:80059020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_139185 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 8 (Gng8), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006228385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 8 (Gng8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000022441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80067667:80069629:1 gene:ENSRNOG00000016701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// L35921 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein gamma subunit (Ggamma8) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006228384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 8 (Gng8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80066605:80069503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT000726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001077644 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin I2 (prostacyclin) receptor (IP) (Ptgir), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80080854:80083237:1 gene:ENSRNOG00000016756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80080936:80084346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT000728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107481 // RefSeq // Rattus norvegicus paraneoplastic Ma antigen family-like 2 (Pnmal2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80123763:80126337:1 gene:ENSRNOG00000016863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80124113:80126116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108473 // RefSeq // Rattus norvegicus paraneoplastic Ma antigen family-like 1 (Pnmal1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80140829:80143488:1 gene:ENSRNOG00000027944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80141310:80190045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009533 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 8 (Ccdc8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060520 // GenBank // Rattus norvegicus similar to coiled-coil domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:72567 IMAGE:5597839), complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029810 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:80181380:80183335:1 gene:ENSRNOG00000027936 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT000739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80141310:80190045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_012525 // RefSeq // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen gene family 4 (Cgm4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80277513:80289710:1 gene:ENSRNOG00000034055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC097366 // GenBank // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen gene family 4, mRNA (cDNA clone MGC:114399 IMAGE:7443149), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80279271:80289710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT000742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025679 // RefSeq // Rattus norvegicus pregnancy specific glycoprotein 16 (Psg16), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000058060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80311450:80327327:1 gene:ENSRNOG00000042250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC097499 // GenBank // Rattus norvegicus similar to brain carcinoembryonic antigen, mRNA (cDNA clone MGC:114574 IMAGE:7462593), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80312721:80327241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT000743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_012702 // RefSeq // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3 (Ceacam3), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80368034:80380736:1 gene:ENSRNOG00000027607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC098921 // GenBank // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, mRNA (cDNA clone MGC:114355 IMAGE:7441743), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// M32474 // GenBank // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related protein (CGM1) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80359023:80379804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_021677 // RefSeq // Rattus norvegicus pregnancy-specific beta 1-glycoprotein (Psgb1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pregnancy-specific beta 1-glycoprotein (Psgb1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000037132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80428741:80437624:1 gene:ENSRNOG00000027288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U66292 // GenBank // Rattus norvegicus pregnancy-specific beta 1-glycoprotein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80388246:80464137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT000746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_006223308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5-like (LOC102550682), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006228530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5-like (LOC102550682), mRNA. // chr1 // 80 // 74 // 16 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024155 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:80534406:80544253:1 gene:ENSRNOG00000034000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80534292:80805469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT000748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XM_006223101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5-like (LOC102557244), mRNA. // chr1 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// XM_006228530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5-like (LOC102550682), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000058040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80570124:80603699:1 gene:ENSRNOG00000017519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 96 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80534292:80805469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_001025404 // RefSeq // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 11 (Ceacam11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80642416:80648652:1 gene:ENSRNOG00000017620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097990 // GenBank // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 11, mRNA (cDNA clone MGC:116133 IMAGE:7445748), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U66293 // GenBank // Rattus norvegicus pregnancy-specific beta 1-glycoprotein mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80534292:80805469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT000752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006223309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gene model 580 (LOC100362729), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006228531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gene model 580 (LOC100362729), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042613 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:80812028:80816291:1 gene:ENSRNOG00000032940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072039 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:80815431:80816246:1 gene:ENSRNOG00000032940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 78 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80812028:80828566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001011931 // RefSeq // Rattus norvegicus MHC I like leukocyte 1 (Mill1), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80887094:80914224:1 gene:ENSRNOG00000017699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB113960 // GenBank // Rattus norvegicus Mill1 mRNA for MHC class I-like located near the LRC, 1, complete cds, strain:WKAH/Hkm. // chrU // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB113962 // GenBank // Rattus norvegicus Mill1 mRNA for MHC class I-like located near the LRC, 1, complete cds, strain:BN/SsN. // chrU // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80899540:80912792:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000034790 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:80990003:80990519:1 gene:ENSRNOG00000026891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NONRATT000755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006228532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 13-like (LOC308401), mRNA. // chr1 // 77 // 72 // 10 // 13 // 0 /// XM_006223103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 13-like (LOC308401), mRNA. // chr1 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000031892 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:80991850:80994591:1 gene:ENSRNOG00000026810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80978613:81033448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 83 // 11 // 15 // 0
AB113963 // GenBank // Rattus norvegicus Mill2 mRNA for MHC class I-like located near the LRC, 2, complete cds, strain:BN/SsN. // chr1 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// NM_001017468 // RefSeq // Rattus norvegicus MHC class I polypeptide-related sequence B (Micb), mRNA. // chr1 // 71 // 90 // 20 // 28 // 0 /// NONRATT000757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB113961 // GenBank // Rattus norvegicus Mill2 mRNA for MHC class I-like located near the LRC, 2, complete cds, strain:WkA/Hkm. // chr1 // 71 // 90 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80978613:81033448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT000758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_053373 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidoglycan recognition protein 1 (Pglyrp1), mRNA. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81052612:81057412:1 gene:ENSRNOG00000013395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF154114 // GenBank // Rattus norvegicus peptidoglycan recognition protein PGRP (Pgrp) mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81043902:81057353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuro-oncological ventral antigen 2 (Nova2), partial mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006228533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuro-oncological ventral antigen 2 (Nova2), partial mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000057965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81109553:81126706:1 gene:ENSRNOG00000013847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81108065:81169187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001108908 // RefSeq // Rattus norvegicus nanos homolog 2 (Drosophila) (Nanos2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81155091:81156551:1 gene:ENSRNOG00000038088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81108065:81169187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001109139 // RefSeq // Rattus norvegicus Myb-related transcription factor, partner of profilin (Mypop), mRNA. // chr1 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// XM_006228452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Myb-related transcription factor, partner of profilin (Mypop), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81159192:81169783:1 gene:ENSRNOG00000014132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT000766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000041339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81108065:81169187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT000765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001107483 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2 binding protein 1 (Irf2bp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000019075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81171966:81174667:1 gene:ENSRNOG00000014252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000041329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81172339:81174093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT000768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001100830 // RefSeq // Rattus norvegicus symplekin (Sympk), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81190967:81219274:1 gene:ENSRNOG00000014353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81190813:81219190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT000770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001024748 // RefSeq // Rattus norvegicus radial spoke head 6 homolog A (Chlamydomonas) (Rsph6a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81219404:81242620:1 gene:ENSRNOG00000014788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC097421 // GenBank // Rattus norvegicus radial spokehead-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:114467 IMAGE:7454827), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81219465:81242472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006223311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dystrophia myotonica, WD repeat containing (Dmwd), mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000020134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81251348:81255534:1 gene:ENSRNOG00000014984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000071916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81250759:81255534:1 gene:ENSRNOG00000014984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC160851 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8364332. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81249304:81254588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000020428 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81257166:81267129:1 gene:ENSRNOG00000015085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038152 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81257166:81265748:1 gene:ENSRNOG00000015085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041817 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81257166:81267129:1 gene:ENSRNOG00000015085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000067933 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81257166:81267129:1 gene:ENSRNOG00000015085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// FQ224460 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA65YH07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81257166:81266418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT000782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT000783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT000785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT000784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_003753221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SIX homeobox 5 (Six5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// XR_342796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SIX homeobox 5 (Six5), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020597 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:81267940:81271004:1 gene:ENSRNOG00000015349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81267940:81271004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT000786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
NM_001025642 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 46 (Fbxo46), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 46 (Fbxo46), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81296298:81312721:1 gene:ENSRNOG00000008815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098945 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 46, mRNA (cDNA clone MGC:114545 IMAGE:7458607), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109399 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide (Snrpd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000021221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81324033:81326882:1 gene:ENSRNOG00000015844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC168781 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D2, mRNA (cDNA clone MGC:188937 IMAGE:6921356), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT000791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_138921 // RefSeq // Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 2 (Eml2), mRNA. // chr1 // 96 // 98 // 44 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000041215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81353763:81386605:1 gene:ENSRNOG00000030127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 98 // 45 // 46 // 0 /// AF335571 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein EMAP mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 98 // 44 // 46 // 0 /// BC062038 // GenBank // Rattus norvegicus echinoderm microtubule associated protein like 2, mRNA (cDNA clone MGC:72297 IMAGE:5598497), complete cds. // chr1 // 97 // 77 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000041319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81353665:81384409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 87 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT000794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 77 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT000792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1 /// NONRATT000793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
NR_031777 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 330 (Mir330), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053688 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:81358760:81358856:1 gene:ENSRNOG00000035565 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-330 // miRBase Micro RNA Database // MI0000606 Rattus norvegicus miR-330 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025680 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 4 (Gpr4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 4 (Gpr4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81401780:81403267:1 gene:ENSRNOG00000016362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099196 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:116369 IMAGE:7383735), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81402073:81403170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107486 // RefSeq // Rattus norvegicus optic atrophy 3 (Opa3), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000029552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81424764:81427718:1 gene:ENSRNOG00000025890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// BC168945 // GenBank // Rattus norvegicus optic atrophy 3 (human), mRNA (cDNA clone MGC:189251 IMAGE:8363074), complete cds. // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81408174:81425154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NONRATT000799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1
NM_201562 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulon 2 (Rtn2), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81461962:81474845:1 gene:ENSRNOG00000016603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AY279211 // GenBank // Rattus norvegicus reticulon 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC129079 // GenBank // Rattus norvegicus reticulon 2, mRNA (cDNA clone MGC:156538 IMAGE:8370402), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// FQ215784 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YK15 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 49 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81462077:81474468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT000802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1
NM_001106228 // RefSeq // Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1 (Ercc1), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1 (Ercc1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 1 (Ercc1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81523234:81534459:1 gene:ENSRNOG00000017839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// FQ225470 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YP19 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81523210:81533372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
XM_006223114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 13 like (Ppp1r13l), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006223115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 13 like (Ppp1r13l), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 13 like (Ppp1r13l), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000047105 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:81545967:81556717:1 gene:ENSRNOG00000025350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81545967:81572408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT000806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT000808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_012530 // RefSeq // Rattus norvegicus creatine kinase, muscle (Ckm), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81587880:81598112:1 gene:ENSRNOG00000016837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ214681 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YJ07 mRNA sequence. // chr1 // 75 // 63 // 15 // 20 // 0 /// FQ223789 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA86YK22 mRNA sequence. // chr1 // 77 // 81 // 20 // 26 // 0 /// FQ224968 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YE03 mRNA sequence. // chr1 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// M10140 // GenBank // Rat skeletal muscle creatine kinase composite mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ215261 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YO12 mRNA sequence. // chr1 // 66 // 100 // 21 // 32 // 0 /// FQ215615 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YI01 mRNA sequence. // chr1 // 65 // 97 // 20 // 31 // 0 /// FQ216087 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YM18 mRNA sequence. // chr1 // 65 // 81 // 17 // 26 // 0 /// BC062058 // GenBank // Rattus norvegicus creatine kinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:72543 IMAGE:5598226), complete cds. // chr1 // 34 // 91 // 10 // 29 // 0 /// FQ216665 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YL05 mRNA sequence. // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81591226:81597917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006223117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 2 (Exoc3l2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006228498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 2 (Exoc3l2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023451 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:81662876:81669062:1 gene:ENSRNOG00000017448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81644430:81668923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT000818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001109410 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 6A (Trappc6a), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81683535:81690450:1 gene:ENSRNOG00000017468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81683563:81690213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001057808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NTPase, KAP family P-loop domain containing 1 (Nkpd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002725545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NTPase, KAP family P-loop domain containing 1 (Nkpd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NTPase, KAP family P-loop domain containing 1 (Nkpd1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NTPase, KAP family P-loop domain containing 1 (Nkpd1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067272 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:81692939:81698896:1 gene:ENSRNOG00000043378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81692939:81698896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001172809 // RefSeq // Rattus norvegicus excision repair cross-complementation group 2 (Ercc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000024246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81559883:81573643:1 gene:ENSRNOG00000017753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000026411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81545967:81572408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT000813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// NONRATT000810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001170324 // RefSeq // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20 (Ceacam20), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// XM_006228406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20 (Ceacam20), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000026060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82145624:82177339:1 gene:ENSRNOG00000019260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82145658:82248225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT000828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_001271280 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant 2, mRNA. // chrU // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_144757 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant 1, mRNA. // chrU // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006228387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 180 (Zfp180), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82186002:82205285:1 gene:ENSRNOG00000029336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U41164 // GenBank // Rattus norvegicus Cys2/His2 zinc finger protein (rKr1) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82145658:82248225:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT000830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001107487 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 112 (Zfp112), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 112 (Zfp112), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82218532:82224354:1 gene:ENSRNOG00000029022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82145658:82248225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_006223122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 235-like (LOC102548230), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006223123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 235-like (LOC102548230), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006228505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 235-like (LOC102548230), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000026088 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:82234316:82239869:1 gene:ENSRNOG00000032625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82145658:82248225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
XR_342939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-related protein Rab-12-like (LOC102551479), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XR_350186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-related protein Rab-12-like (LOC102551479), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82145658:82248225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT000833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XR_342801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 235-like (LOC102548600), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_350187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 235-like (LOC102548600), misc_RNA. // chr1 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// NONRATT000836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82324002:82352562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// NONRATT000837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// NONRATT000838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
XM_574384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 108 (Zfp108), partial mRNA. // chrU // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XR_342800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 235-like (LOC102548503), misc_RNA. // chrU // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XR_350187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 235-like (LOC102548600), misc_RNA. // chrU // 68 // 100 // 13 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032723 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109309.1:2146:2919:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82362035:82363524:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 89 // 47 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT000837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 94 // 89 // 16 // 17 // 0
NM_001192010 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 5 (Lypd5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006228463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 5 (Lypd5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82471729:82476786:1 gene:ENSRNOG00000019432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82471729:82507354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001014243 // RefSeq // Rattus norvegicus SMG9 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMG9 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82523064:82545403:1 gene:ENSRNOG00000019596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087051 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1500002O20, mRNA (cDNA clone MGC:94007 IMAGE:7115791), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82528119:82545010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_017350 // RefSeq // Rattus norvegicus plasminogen activator, urokinase receptor (Plaur), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// NM_134352 // RefSeq // Rattus norvegicus plasminogen activator, urokinase receptor (Plaur), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82587228:82598439:1 gene:ENSRNOG00000037931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82587228:82602678:1 gene:ENSRNOG00000037931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82587228:82602678:1 gene:ENSRNOG00000037931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AF007789 // GenBank // Rattus norvegicus urokinase receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC127499 // GenBank // Rattus norvegicus plasminogen activator, urokinase receptor, mRNA (cDNA clone MGC:156661 IMAGE:7380245), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82587254:82630379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT000852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NM_001047107 // RefSeq // Rattus norvegicus cell adhesion molecule 4 (Cadm4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82625738:82630379:1 gene:ENSRNOG00000024243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// DQ272745 // GenBank // Rattus norvegicus nectin-like protein 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82587254:82630379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT000853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108476 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 428 (Zfp428), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000026814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82633765:82642244:1 gene:ENSRNOG00000019802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// FQ224206 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA73YO23 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82641604:82642244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT000855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT000856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT000857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001135742 // RefSeq // Rattus norvegicus immunity-related GTPase family, Q (Irgq), mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82656242:82664190:1 gene:ENSRNOG00000046500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82654914:82659990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_053435 // RefSeq // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1 (Xrcc1), mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82673671:82701080:1 gene:ENSRNOG00000019915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF290895 // GenBank // Rattus norvegicus x-ray repair cross-complementing group 1 protein XRCC1 (xrcc1) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC070894 // GenBank // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 1, mRNA (cDNA clone MGC:91581 IMAGE:7099372), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82673571:82700972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT000865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001106234 // RefSeq // Rattus norvegicus ethylmalonic encephalopathy 1 (Ethe1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82716410:82731463:1 gene:ENSRNOG00000019982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158848 // GenBank // Rattus norvegicus ethylmalonic encephalopathy 1, mRNA (cDNA clone MGC:188327 IMAGE:7444454), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82716462:82750033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191622 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family B, member 3 (Phldb3), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82733955:82750033:1 gene:ENSRNOG00000019994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82716462:82750033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT000872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_021759 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 3 (Lypd3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82757258:82761708:1 gene:ENSRNOG00000019999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82757374:82761210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT000874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000010740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82886766:82887589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000023293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84246505:84247328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0
NM_173339 // RefSeq // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 10 (Ceacam10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000027214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82900924:82907200:1 gene:ENSRNOG00000050105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000057384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84261181:84267457:1 gene:ENSRNOG00000046222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// U23056 // GenBank // Rattus norvegicus C-CAM4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NR_045097 // RefSeq // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6 (Ceacam6), long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000034553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82940615:82947057:1 gene:ENSRNOG00000030331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000057600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82940854:82956450:1 gene:ENSRNOG00000030331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// AB434131 // GenBank // Rattus norvegicus Ceacam6 mRNA for Ceacam6-Long (Ceacam6- L), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC078962 // GenBank // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, mRNA (cDNA clone MGC:93832 IMAGE:7111028), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071029 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:84301071:84316714:1 gene:ENSRNOG00000045673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074720 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:84301071:84307235:1 gene:ENSRNOG00000045673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 48 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82901005:82959257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000023297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84261262:84376504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 71 // 14 // 15 // 0
NM_001109140 // RefSeq // Rattus norvegicus DMRT-like family C2 (Dmrtc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003750648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublesex- and mab-3-related transcription factor C2-like (LOC100910371), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000027242 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:82993300:82998057:1 gene:ENSRNOG00000020109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15720043:15727264:-1 gene:ENSRNOG00000046142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82992868:83013551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15706519:15725613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XM_003753223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell antigen receptor complex-associated protein alpha chain-like (LOC100913063), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000027254 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:83020660:83024667:1 gene:ENSRNOG00000020125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:15698128:15700087:-1 gene:ENSRNOG00000049925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// XM_001060872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd79a molecule, immunoglobulin-associated alpha (Cd79a), mRNA. // chr1 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000010776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83020685:83053707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15698128:15700087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// BC088261 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7376563. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// FQ227070 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YF11 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// FQ234602 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YF07 mRNA sequence. // chr1 // 83 // 83 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT000877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NONRATT000878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 79 // 19 // 23 // 0
NM_021694 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1 (Arhgef1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83035506:83053988:1 gene:ENSRNOG00000020130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC078338 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7097192, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC091218 // GenBank // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mRNA (cDNA clone MGC:108950 IMAGE:7107802), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83020685:83053707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001024258 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 574 (Zfp574), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83212053:83217314:1 gene:ENSRNOG00000020362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094953 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 574, mRNA (cDNA clone MGC:109216 IMAGE:7308498), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83207566:83217070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT000889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT000890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001107490 // RefSeq // Rattus norvegicus capicua transcriptional repressor (Cic), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000057466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83415622:83427167:1 gene:ENSRNOG00000020432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000028032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83393007:83426556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT000891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// NONRATT000892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
XM_002725549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 145 (Tmem145), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_002728703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 145 (Tmem145), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006223139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 145 (Tmem145), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006228521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 145 (Tmem145), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83438613:83448233:1 gene:ENSRNOG00000020489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83438613:83447683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT000897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_053628 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple EGF-like-domains 8 (Megf8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006228364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multiple EGF-like-domains 8 (Megf8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000027831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83449539:83497902:1 gene:ENSRNOG00000020498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000028045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83449539:83495929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0
ENSRNOT00000027854 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:83516478:83517265:1 gene:ENSRNOG00000020538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT000904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000040905 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:83573959:83574555:1 gene:ENSRNOG00000021905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 81 // 10 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83561537:83574312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001009705 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP5S-like (Atp5sl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83674728:83680655:1 gene:ENSRNOG00000020596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088283 // GenBank // Rattus norvegicus ATP5S-like, mRNA (cDNA clone MGC:109149 IMAGE:7384054), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83676135:83684192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT000907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001107492 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 8 (B3gnt8), mRNA. // chr1 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// XM_006228434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 8 (B3gnt8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83681452:83684351:1 gene:ENSRNOG00000020606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83676135:83684192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT000909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001107493 // RefSeq // Rattus norvegicus exosome component 5 (Exosc5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83713977:83723114:1 gene:ENSRNOG00000020635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83714060:83722880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT000910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001107494 // RefSeq // Rattus norvegicus B9 protein domain 2 (B9d2), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83735614:83741208:1 gene:ENSRNOG00000028753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006228438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B9 protein domain 2 (B9d2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// XM_006228439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B9 protein domain 2 (B9d2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83735851:83740936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT000914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT000915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT000916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_021578 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta 1 (Tgfb1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83742151:83758471:1 gene:ENSRNOG00000020652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY550025 // GenBank // Rattus norvegicus TGF beta 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC076380 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:93466 IMAGE:7107411), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// X52498 // GenBank // Rat mRNA for transforming growth factor-beta 1. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83742296:83758333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_173294 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 3 (Cyp2b3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84417665:84491180:1 gene:ENSRNOG00000033164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105823 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450IIB3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7372728), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127479 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450IIB3, mRNA (cDNA clone MGC:156573 IMAGE:7372256), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M20406 // GenBank // Rat cytochrome P450IIB3 (P450IIB subfamily) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134844 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp2b1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000044127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:99752125:99775779:1 gene:ENSRNOG00000033680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC166502 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:188065 IMAGE:7122207), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:99736473:99775394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT049879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001198676 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 2 (Cyp2b2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000028196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84361236:84376889:1 gene:ENSRNOG00000020775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000047540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84361236:84376889:1 gene:ENSRNOG00000020775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// K01721 // GenBank // Rat P-450(1) variant (phenobarbital-inducible) cytochrome 3 end, flank. // chr1 // 67 // 75 // 6 // 9 // 0 /// NONRATT000918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0
NM_173294 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 3 (Cyp2b3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84417665:84491180:1 gene:ENSRNOG00000033164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC105823 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450IIB3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7372728), partial cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC127479 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450IIB3, mRNA (cDNA clone MGC:156573 IMAGE:7372256), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ210362 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA2YH02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M20406 // GenBank // Rat cytochrome P450IIB3 (P450IIB subfamily) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84417688:84636614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT000920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000040989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84049358:84570117:1 gene:ENSRNOG00000043320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84417688:84636614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_017156 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 12 (Cyp2b12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223146 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 12 (Cyp2b12), mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000041580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84763724:84830400:1 gene:ENSRNOG00000031529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT000922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84712411:84829532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001135668 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 15 (Cyp2b15), mRNA. // chr1 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:258557844:258570279:-1 gene:ENSRNOG00000020801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031923 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:258556946:258597345:-1 gene:ENSRNOG00000050823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_017156 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 12 (Cyp2b12), mRNA. // chr1 // 32 // 100 // 9 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84763724:84830400:1 gene:ENSRNOG00000031529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 100 // 10 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:258584870:258624583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:258557844:258568542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84712411:84829532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 96 // 12 // 27 // 0 /// NONRATT000922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 100 // 10 // 28 // 0
NM_012787 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily g, polypeptide 1 (Cyp2g1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84842671:84854186:1 gene:ENSRNOG00000020827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M33296 // GenBank // Rattus norvegicus olfactory-specific cytochrome P-450 (P-450olf1) mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84842671:84853812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_012542 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily a, polypeptide 3 (Cyp2a3), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84869280:84876599:1 gene:ENSRNOG00000028900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84869280:84876405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT000924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_012692 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp2a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84925733:84938423:1 gene:ENSRNOG00000020928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC081848 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 IIA1 (hepatic steroid hydroxylase IIA1) gene, mRNA (cDNA clone MGC:93632 IMAGE:7135880), complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// J02669 // GenBank // Rat cytochrome P-450a (3-methylchlanthrene-inducible; with high testosterone 7-alpha activity), mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84925752:84938234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NM_012693 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily a, polypeptide 2 (Cyp2a2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC089818 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, subfamily 2A, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:108758 IMAGE:7371951), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// J04187 // GenBank // Rat cytochrome P450 IIA2 protein (CYP2A2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028249 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:84957725:84980712:1 gene:ENSRNOG00000020817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84957725:84979941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 96 // 18 // 23 // 0
NM_019303 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily f, polypeptide 4 (Cyp2f4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85146274:85158524:1 gene:ENSRNOG00000032805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF017393 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P4502F4 (CYP4502F4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC070939 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily f, polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:91721 IMAGE:7099393), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85146286:85158264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT000930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT000932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT000933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT000934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_134369 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily t, polypeptide 1 (Cyp2t1), mRNA. // chr1 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// XM_006228558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily t, polypeptide 1 (Cyp2t1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85176736:85180403:1 gene:ENSRNOG00000028891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AF368269 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 monooxygenase CYP2T1 mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85176744:85180299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT000937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT000938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XR_086115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to FLJ41131 protein (RGD1560854), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057230 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:85220207:85226857:1 gene:ENSRNOG00000037715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85218950:85228527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001012065 // RefSeq // Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 4 (Adck4), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85255491:85278009:1 gene:ENSRNOG00000020848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC079227 // GenBank // Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:94304 IMAGE:7132453), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85255875:85277576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT000944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT000945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT000947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001033888 // RefSeq // Rattus norvegicus numb homolog (Drosophila)-like (Numbl), mRNA. // chr1 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// XM_006228568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus numb homolog (Drosophila)-like (Numbl), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000057213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85278881:85302554:1 gene:ENSRNOG00000020867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB210107 // GenBank // Rattus norvegicus Numbl mRNA for Numb-like, complete cds. // chr1 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// BC129073 // GenBank // Rattus norvegicus numb homolog (Drosophila)-like, mRNA (cDNA clone MGC:156511 IMAGE:7189989), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85284997:85301797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001106236 // RefSeq // Rattus norvegicus biliverdin reductase B (flavin reductase (NADPH)) (Blvrb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000031026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85468868:85491182:1 gene:ENSRNOG00000024410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC168943 // GenBank // Rattus norvegicus biliverdin reductase B (flavin reductase (NADPH)), mRNA (cDNA clone MGC:189247 IMAGE:7322093), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT000954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT000955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001017513 // RefSeq // Rattus norvegicus SERTA domain containing 3 (Sertad3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SERTA domain containing 3 (Sertad3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000057190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85498045:85501763:1 gene:ENSRNOG00000037690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091229 // GenBank // Rattus norvegicus similar to replication protein-binding trans-activator RBT1, mRNA (cDNA clone MGC:108974 IMAGE:7321753), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85478382:85501116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001007735 // RefSeq // Rattus norvegicus SERTA domain containing 1 (Sertad1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85510184:85513470:1 gene:ENSRNOG00000024363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061808 // GenBank // Rattus norvegicus SERTA domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:72577 IMAGE:5598343), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85512412:85541179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_023976 // RefSeq // Rattus norvegicus periaxin (Prx), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85529686:85541381:1 gene:ENSRNOG00000018369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000075815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85526345:85536892:1 gene:ENSRNOG00000018369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000053596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85512412:85541179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT000962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001024776 // RefSeq // Rattus norvegicus homeodomain interacting protein kinase 4 (Hipk4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85544935:85555304:1 gene:ENSRNOG00000020835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098070 // GenBank // Rattus norvegicus homeodomain interacting protein kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:116268 IMAGE:7455473), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85545188:85555010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT000964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109664 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG16812-PA (RGD1307554), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006228572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG16812-PA (RGD1307554), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000024829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85578686:85602677:1 gene:ENSRNOG00000018408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// BC127543 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG16812-PA, mRNA (cDNA clone MGC:156822 IMAGE:7314257), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85578258:85601401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_017093 // RefSeq // Rattus norvegicus v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 2 (Akt2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006228559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 2 (Akt2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 2 (Akt2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006228562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 2 (Akt2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85627946:85666362:1 gene:ENSRNOG00000018677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// D30041 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RAC protein kinase beta, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// DQ198085 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase B beta mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85644567:85666105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT000972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT000973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001108478 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 9B (Ttc9b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85683938:85686120:1 gene:ENSRNOG00000018850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85667532:85686024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003748802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 60-like (LOC100909824), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_003753226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 60-like (LOC100909824), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006223154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 60-like (LOC100909824), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073966 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:85760797:85774094:1 gene:ENSRNOG00000046338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_006223153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 60-like (LOC100910046), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006228602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 60-like (LOC100910046), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000032933 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:85810963:85824370:1 gene:ENSRNOG00000018885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072734 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:85986326:85988164:1 gene:ENSRNOG00000048489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
XM_006223149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 780B-like (LOC102554049), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006228604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 780B-like (LOC102554049), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000041861 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:85872398:85883615:1 gene:ENSRNOG00000050995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT000979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
XM_006228592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 780B (Zfp780b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// XM_006228598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 780B (Zfp780b), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// XM_006228600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 780B (Zfp780b), transcript variant X9, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000013469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85930443:85930787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_001164656 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG binding protein-like 1 (Fcgbpl1), mRNA. // chr1 // 90 // 50 // 19 // 21 // 0 /// NM_001164657 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG binding protein (Fcgbp), mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000057120 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:86274837:86312642:1 gene:ENSRNOG00000042899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 48 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000057122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86220276:86263136:1 gene:ENSRNOG00000019129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86208387:86378283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT000993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1
NM_001025643 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrillarin (Fbl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86319815:86328915:1 gene:ENSRNOG00000019229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC099198 // GenBank // Rattus norvegicus fibrillarin, mRNA (cDNA clone MGC:116371 IMAGE:7383920), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86208387:86378283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107496 // RefSeq // Rattus norvegicus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 1b (Dyrk1b), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 1b (Dyrk1b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86329130:86336571:1 gene:ENSRNOG00000019254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86208387:86378283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT000996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XM_002725554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EP300 interacting inhibitor of differentiation 2 (Eid2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026114 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:86727767:86728474:-1 gene:ENSRNOG00000019310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86727767:86733162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
XM_002725600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EP300 interacting inhibitor of differentiation 2B (Eid2b), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_574407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EP300 interacting inhibitor of differentiation 2B (Eid2b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86720613:86721255:-1 gene:ENSRNOG00000045545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86720288:86721228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT004875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001169146 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S16 (Rps16), mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// XM_006228612 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S16 (Rps16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000026576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86620608:86623553:-1 gene:ENSRNOG00000019578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC159438 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S16, mRNA (cDNA clone IMAGE:8375510), partial cds. // chr1 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// BC064030 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S16, mRNA (cDNA clone IMAGE:6887619), partial cds. // chr1 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// NONRATT004871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 90 // 19 // 21 // 1 /// NONRATT004873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 90 // 19 // 21 // 1 /// GENSCAN00000016569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86620914:86632913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_001108910 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Lrfn1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NM_001127694 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Lrfn1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006228629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Lrfn1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Lrfn1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Lrfn1), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86512305:86515938:-1 gene:ENSRNOG00000019869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000057073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86507668:86515938:-1 gene:ENSRNOG00000019869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86507668:86515904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT004861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001024898 // RefSeq // Rattus norvegicus Paf1, RNA polymerase II associated factor, homolog (S. cerevisiae) (Paf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86577752:86583329:-1 gene:ENSRNOG00000019746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097494 // GenBank // Rattus norvegicus Paf1, RNA polymerase II associated factor, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114568 IMAGE:7461781), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86577885:86583124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_181091 // RefSeq // Rattus norvegicus glia maturation factor, gamma (Gmfg), mRNA. // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// XM_006228608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glia maturation factor, gamma (Gmfg), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86528123:86533107:-1 gene:ENSRNOG00000019838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB007364 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for glia maturation factor homologous protein, complete cds. // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86528222:86540260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_139086 // RefSeq // Rattus norvegicus syncollin (Sycn), mRNA. // chr1 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86433248:86434684:-1 gene:ENSRNOG00000019879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF008197 // GenBank // Rattus norvegicus syncollin mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// AF012887 // GenBank // Rattus norvegicus sip9 mRNA, partial cds. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86434273:86452471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001110491 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 27 (Fbxo27), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071239 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:88055288:88069759:1 gene:ENSRNOG00000050453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0 /// BC091204 // GenBank // Rattus norvegicus similar to F-box only protein 27, mRNA (cDNA clone MGC:108905 IMAGE:7380540), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000000958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88019505:88099908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001013064 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 17 (Fbxo17), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// XM_006228648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 17 (Fbxo17), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// XM_006228649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 17 (Fbxo17), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88095269:88100368:1 gene:ENSRNOG00000019942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// BC079218 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:94281 IMAGE:7131902), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88019505:88099908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT001039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001106240 // RefSeq // Rattus norvegicus seryl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Sars2), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88104901:88116638:1 gene:ENSRNOG00000019962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// FQ212522 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YN13 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88104921:88116356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001106241 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras and Rab interactor-like (Rinl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006228653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras and Rab interactor-like (Rinl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006228657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras and Rab interactor-like (Rinl), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88153376:88164438:1 gene:ENSRNOG00000025354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88155066:88163251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT001053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_001134760 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L (Hnrnpl), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NM_032619 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L (Hnrnpl), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000027425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88176711:88187394:1 gene:ENSRNOG00000020235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88176711:88187394:1 gene:ENSRNOG00000020235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000057034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88180711:88187371:1 gene:ENSRNOG00000020235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// BC086392 // GenBank // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L, mRNA (cDNA clone IMAGE:7303348), complete cds. // chr1 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT001055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT001056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88176711:88196511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONRATT001054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// NONRATT001057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// NONRATT001058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_022594 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase 1, peroxisomal (Ech1), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88190403:88196621:1 gene:ENSRNOG00000020308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060565 // GenBank // Rattus norvegicus enoyl coenzyme A hydratase 1, peroxisomal, mRNA (cDNA clone IMAGE:6921895). // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC062226 // GenBank // Rattus norvegicus enoyl coenzyme A hydratase 1, peroxisomal, mRNA (cDNA clone MGC:72820 IMAGE:6890529), complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// U08976 // GenBank // Rattus norvegicus Wistar peroxisomal enoyl hydratase-like protein (PXEL) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88176711:88196511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT001067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT001068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT001069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_012975 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 4 (Lgals4), mRNA. // chr1 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000041205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88200593:88208309:1 gene:ENSRNOG00000020338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// M73553 // GenBank // Rat intestinal lactose-binding lectin (L-36) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88200605:88258298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT001070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_022582 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 7 (Lgals7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 7 (Lgals7), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88226424:88227839:1 gene:ENSRNOG00000020380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF036941 // GenBank // Rattus norvegicus galectin-7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U67883 // GenBank // Rattus norvegicus galectin-7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000000956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88200605:88258298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001110808 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 12 (Capn12), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000027645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88246907:88258966:1 gene:ENSRNOG00000020389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000000956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88200605:88258298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT001074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0
NM_001106243 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase kinase 1 (Map4k1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000027837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89114111:89135537:1 gene:ENSRNOG00000020505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89114216:89135427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT001092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT001093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_130824 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 4 (Rasgrp4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89253162:89269483:1 gene:ENSRNOG00000033744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF465263 // GenBank // Rattus norvegicus ras guanine nucleotide releasing protein 4 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF465264 // GenBank // Rattus norvegicus ras guanine nucleotide releasing protein 4 variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89253267:89269532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001013065 // RefSeq // Rattus norvegicus gametogenetin (Ggn), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gametogenetin (Ggn), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000056955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89288946:89292049:1 gene:ENSRNOG00000023931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC081922 // GenBank // Rattus norvegicus gametogenetin, mRNA (cDNA clone MGC:93898 IMAGE:7112701), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC100147 // GenBank // Rattus norvegicus gametogenetin, mRNA (cDNA clone MGC:114370 IMAGE:7111711), complete cds. // chr1 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000029192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89289325:89291994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT001101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0
NM_130403 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14A (Ppp1r14a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14A (Ppp1r14a), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14A (Ppp1r14a), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88407553:88411822:1 gene:ENSRNOG00000020676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF352572 // GenBank // Rattus norvegicus CPI17 (Cpi17) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY050673 // GenBank // Rattus norvegicus PKC-potentiated PP1 inhibitory protein (Cpi) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88407575:88411750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105729 // RefSeq // Rattus norvegicus D4, zinc and double PHD fingers family 1 (Dpf1), mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// XM_006228677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus D4, zinc and double PHD fingers family 1 (Dpf1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006228686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus D4, zinc and double PHD fingers family 1 (Dpf1), transcript variant X10, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000028091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88427539:88437120:1 gene:ENSRNOG00000020687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000046435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88427539:88437120:1 gene:ENSRNOG00000020687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// BC159415 // GenBank // Rattus norvegicus D4, zinc and double PHD fingers family 1, mRNA (cDNA clone MGC:188698 IMAGE:8368092), complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// X66022 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neuro-D4 protein. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000011135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88427614:88436010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT001085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT001087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// NONRATT001086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT001088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_001107500 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 84 (Zfp84), mRNA. // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// XM_006223164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 30-like (LOC100910007), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// XM_006228671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 84 (Zfp84), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// XM_006228696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 30-like (LOC100910007), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// XM_006228702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547413), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000035994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88824173:88839114:1 gene:ENSRNOG00000029043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88645662:88851424:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT001089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NONRATT004845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006223165 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 383 (Zfp383), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 383 (Zfp383), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420 (Zfp420), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032973 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:88938067:88939803:1 gene:ENSRNOG00000037556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89693361:89705585:1 gene:ENSRNOG00000049409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224550 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA62YG15 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547413), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547413), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547413), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547413), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547413), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000028158 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:88881496:88886634:1 gene:ENSRNOG00000033148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000045891 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:88891131:88893279:1 gene:ENSRNOG00000031240 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88884521:88899964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
XM_006223165 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 383 (Zfp383), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006228704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 383 (Zfp383), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006228766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420 (Zfp420), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032973 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:88938067:88939803:1 gene:ENSRNOG00000037556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89693361:89705585:1 gene:ENSRNOG00000049409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ224550 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA62YG15 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006228705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 383 (Zfp383), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 383 (Zfp383), transcript variant X8, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033361 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:88976789:88982700:1 gene:ENSRNOG00000020774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074580 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:88969115:88977718:1 gene:ENSRNOG00000020774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89366831:89378271:1 gene:ENSRNOG00000046305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89376368:89382279:1 gene:ENSRNOG00000046305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// FQ211400 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA11YE14 mRNA sequence. // chrU // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XM_006223173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547059), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228753 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547059), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102547059), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071023 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:89451994:89493400:1 gene:ENSRNOG00000046652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072762 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:89451994:89493400:1 gene:ENSRNOG00000046652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073521 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:89046661:89088270:1 gene:ENSRNOG00000048873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074299 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:89046661:89088270:1 gene:ENSRNOG00000048873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89451952:89520920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89021690:89093228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_017364 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 260 (Zfp260), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89623200:89626479:1 gene:ENSRNOG00000020762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89613406:89614982:1 gene:ENSRNOG00000046867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC099805 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 260, mRNA (cDNA clone MGC:124623 IMAGE:7937786), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U56862 // GenBank // Rattus norvegicus pancreas only zinc finger protein (POZF-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_144749 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 382 (Zfp382), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89737854:89763846:1 gene:ENSRNOG00000020777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127483 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 382, mRNA (cDNA clone MGC:156588 IMAGE:8365988), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U56732 // GenBank // Rattus norvegicus KRAB/zinc finger suppressor protein 1 (KS1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89743721:89793203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XR_350235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556280 (LOC102556280), ncRNA. // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001107501 // RefSeq // Rattus norvegicus CAP-GLY domain containing linker protein 3 (Clip3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89906480:89921238:1 gene:ENSRNOG00000020821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072819 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:92101623:92115597:-1 gene:ENSRNOG00000050104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89900581:89920951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92094443:92122385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001127450 // RefSeq // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 6 (E. coli) (Alkbh6), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006228800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase ABH6-like (LOC100912458), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89922890:89928260:1 gene:ENSRNOG00000025216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000071180 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:92094443:92098899:-1 gene:ENSRNOG00000047943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC098707 // GenBank // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 6 (E. coli), mRNA (cDNA clone IMAGE:7125434), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89926196:89928132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000044147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92094443:92122385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001009283 // RefSeq // Rattus norvegicus spectrin repeat containing, nuclear envelope family member 4 (Syne4), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spectrin repeat containing, nuclear envelope family member 4 (Syne4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89928922:89933017:1 gene:ENSRNOG00000049277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92089519:92093726:-1 gene:ENSRNOG00000020830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89928922:89933017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92089558:92093653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000074615 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:92086142:92086568:-1 gene:ENSRNOG00000050148 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074997 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:89936007:89936433:1 gene:ENSRNOG00000048447 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0
NM_212525 // RefSeq // Rattus norvegicus Tyro protein tyrosine kinase binding protein (Tyrobp), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90031117:90034967:1 gene:ENSRNOG00000020845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY247021 // GenBank // Rattus norvegicus DAP12 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ211365 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YD08 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90031132:90047524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_003748825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, delta (Nfkbid), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, delta (Nfkbid), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, delta (Nfkbid), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006228804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, delta (Nfkbid), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029719 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:90042899:90047524:1 gene:ENSRNOG00000025111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000075205 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:90039190:90041811:1 gene:ENSRNOG00000045834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000010826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90031132:90047524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_022628 // RefSeq // Rattus norvegicus nephrosis 1, congenital, Finnish type (nephrin) (Nphs1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000028358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90077824:90106424:1 gene:ENSRNOG00000020873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000045212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90077824:90106424:1 gene:ENSRNOG00000020873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF125521 // GenBank // Rattus norvegicus nephrin mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// AF161715 // GenBank // Rattus norvegicus nephrin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF172255 // GenBank // Rattus norvegicus nephrin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT001114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000010782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90078227:90132184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// NONRATT001115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001191623 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 62 (Wdr62), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000065011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89852234:89890241:-1 gene:ENSRNOG00000020807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000047120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92132727:92171690:1 gene:ENSRNOG00000049708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89876225:89890175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92132793:92178303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0
NM_001191623 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 62 (Wdr62), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000065011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89852234:89890241:-1 gene:ENSRNOG00000020807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000047120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92132727:92171690:1 gene:ENSRNOG00000049708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000010454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89845705:89872829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000044149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92132793:92178303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0
NM_001289820 // RefSeq // Rattus norvegicus ovo-like 3 (Drosophila) (Ovol3), mRNA. // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000041301 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:92176068:92178246:1 gene:ENSRNOG00000024880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072570 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:89845762:89847940:-1 gene:ENSRNOG00000047959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89845705:89872829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92132793:92178303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001040180 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor B (Tbcb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92179817:92185665:1 gene:ENSRNOG00000020781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000070921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89838452:89843952:-1 gene:ENSRNOG00000045655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB256046 // GenBank // Rattus norvegicus ZH14 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC126061 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor B, mRNA (cDNA clone MGC:156460 IMAGE:7113234), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ447885 // GenBank // Rattus norvegicus liver cancer-related protein mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89838452:89843952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92180056:92185556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_017118 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain, small subunit 1 (Capns1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 69 // 69 // 0 /// XM_003748836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain small subunit 1-like (LOC100911363), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 69 // 69 // 0 /// XM_006228796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain small subunit 1-like (LOC100912380), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 61 // 61 // 0 /// XM_006228871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain small subunit 1-like (LOC100911363), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 61 // 61 // 0 /// ENSRNOT00000072756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92195711:92201110:-1 gene:ENSRNOG00000045747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 69 // 69 // 0 /// ENSRNOT00000074211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89809820:89815219:-1 gene:ENSRNOG00000048194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 69 // 69 // 0 /// BC098068 // GenBank // Rattus norvegicus calpain, small subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:116259 IMAGE:7462537), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 69 // 69 // 0 /// U10861 // GenBank // Rattus norvegicus calpain small subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 55 // 55 // 0 /// GENSCAN00000010452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89801526:89816279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 67 // 69 // 0 /// GENSCAN00000044146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92195705:92209943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 67 // 69 // 0 /// GENSCAN00000044136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92056197:92086514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 41 // 69 // 1
NM_001038588 // RefSeq // Rattus norvegicus proline dehydrogenase (oxidase) 2 (Prodh2), mRNA. // chrU // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90110889:90123506:1 gene:ENSRNOG00000020900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC158806 // GenBank // Rattus norvegicus proline dehydrogenase (oxidase) 2, mRNA (cDNA clone MGC:188224 IMAGE:7324442), complete cds. // chrU // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90078227:90132184:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT001116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT001118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XM_006223187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inactive serine/threonine-protein kinase TEX14-like (RGD1560986), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006223190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inactive serine/threonine-protein kinase TEX14-like (RGD1560986), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006228807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inactive serine/threonine-protein kinase TEX14-like (RGD1560986), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006228810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inactive serine/threonine-protein kinase TEX14-like (RGD1560986), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90078227:90132184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_138887 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein, alpha-crystallin-related, B6 (Hspb6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90162903:90165073:1 gene:ENSRNOG00000020922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D29960 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for alphaB crystallin-related protein, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ215890 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YC16 mRNA sequence. // chr1 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90162937:90164255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT001121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008775 // RefSeq // Rattus norvegicus U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1-like 4 (U2af1l4), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U2 small nuclear RNA auxiliary factor 1-like 4 (U2af1l4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90172229:90174276:1 gene:ENSRNOG00000024497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90171104:90174276:1 gene:ENSRNOG00000024497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AY325237 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cb2-806 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90172355:90174276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT001126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT001127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001134610 // RefSeq // Rattus norvegicus IGF-like family receptor 1 (Igflr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90175156:90177034:1 gene:ENSRNOG00000020957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90175293:90176984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001109519 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688924 (LOC688924), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056742 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:90304994:90305787:1 gene:ENSRNOG00000037485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90305006:90305654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012509 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+/K+ exchanging, alpha polypeptide (Atp4a), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000028508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90317604:90330740:1 gene:ENSRNOG00000020985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000010816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90317629:90330433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// J02649 // GenBank // Rat stomach (H+,K+)-ATPase mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// NONRATT001130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
NM_001198590 // RefSeq // Rattus norvegicus suprabasin (Sbsn), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001044231 // RefSeq // Rattus norvegicus suprabasin (Sbsn), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000028526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90357212:90361688:1 gene:ENSRNOG00000021015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// BC107924 // GenBank // Rattus norvegicus suprabasin, mRNA (cDNA clone IMAGE:7444071), complete cds. // chr1 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// NM_001198591 // RefSeq // Rattus norvegicus suprabasin (Sbsn), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000010793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90357243:90361545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT001131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT001132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT001133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT001134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT001135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NM_001173357 // RefSeq // Rattus norvegicus dermokine (Dmkn), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000040607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90369376:90384906:1 gene:ENSRNOG00000024055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC166816 // GenBank // Rattus norvegicus dermokine, mRNA (cDNA clone MGC:188672 IMAGE:7462729), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90369492:90371026:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000025233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90374881:90393937:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT001136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92229423:92301060:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
XM_001069328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 187, member B (Fam187b), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_002725566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 187, member B (Fam187b), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000028593 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:90557858:90572141:1 gene:ENSRNOG00000021060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000075068 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:90564915:90572141:1 gene:ENSRNOG00000021060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000025228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90557858:90572141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199499 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat LGI family, member 4 (Lgi4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90647194:90656994:1 gene:ENSRNOG00000021087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC064659 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeat LGI family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:72559 IMAGE:5623799), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90647403:90656281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT001140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT001141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NONRATT001144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
GU269240 // GenBank // Rattus norvegicus androgen-binding protein (Abpbg1) mRNA, partial cds. // chrU // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_002728740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretoglobin, family 2B, member 2 (Scgb2b2), mRNA. // chrU // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// ENSRNOT00000030687 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:90875878:90878078:1 gene:ENSRNOG00000023367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// GENSCAN00000029809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90875878:90879819:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_001170400 // RefSeq // Rattus norvegicus lacrimal gland protein (LOC292801), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001170457 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to androgen-binding protein eta (LOC689199), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90936251:90937541:1 gene:ENSRNOG00000030828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001100859 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 1B, member 30 (Scgb1b30), mRNA. // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000052376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91099203:91100467:1 gene:ENSRNOG00000029116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90936267:90937621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90854524:90870192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91099203:91100560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT001145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001100859 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 1B, member 30 (Scgb1b30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000052376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91099203:91100467:1 gene:ENSRNOG00000029116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91099203:91100560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_001079625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4-like (RGD1560088), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_574423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4-like (RGD1560088), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000047207 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:91867262:91867654:1 gene:ENSRNOG00000032733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91867265:91867654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001009641 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidase D (Pepd), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidase D (Pepd), mRNA. // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000028701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92392878:92416063:1 gene:ENSRNOG00000021142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC088440 // GenBank // Rattus norvegicus peptidase D, mRNA (cDNA clone MGC:95081 IMAGE:7126171), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92377570:92415744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT001151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000044139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91909251:92042710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001287577 // RefSeq // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001287578 // RefSeq // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001287579 // RefSeq // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_012524 // RefSeq // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha (Cebpa), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92493857:92495245:1 gene:ENSRNOG00000010918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92493987:92495063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053726 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (neutral amino acid transporter light chain, asc system), member 10 (Slc7a10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000015205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92563400:92579262:1 gene:ENSRNOG00000010938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB126813 // GenBank // Rattus norvegicus slc7a10 mRNA for system asc amino acid transporter Asc-1, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC127467 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 7, (neutral amino acid transporter, y+ system) member 10, mRNA (cDNA clone MGC:156544 IMAGE:7313174), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92572074:92579031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001107505 // RefSeq // Rattus norvegicus rhophilin, Rho GTPase binding protein 2 (Rhpn2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92723895:92784983:1 gene:ENSRNOG00000011885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92723923:92783582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001127599 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 89kDa (Cep89), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006228882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 89kDa (Cep89), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XR_350255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 89kDa (Cep89), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000031236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92791362:92833455:1 gene:ENSRNOG00000012140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC161945 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 123, mRNA (cDNA clone MGC:187737 IMAGE:9025363), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000009512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92789508:92865651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 75 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT001159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT001161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_053929 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (amino acid transporter light chain, bo,+ system), member 9 (Slc7a9), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 7 (amino acid transporter light chain, bo,+ system), member 9 (Slc7a9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 7 (amino acid transporter light chain, bo,+ system), member 9 (Slc7a9), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92843758:92865756:1 gene:ENSRNOG00000012344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AB029559 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BAT1, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC081750 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7106998). // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC098909 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:114282 IMAGE:7109606), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92789508:92865651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT001166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
ENSRNOT00000017669 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:92990234:93006788:1 gene:ENSRNOG00000012882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NM_001271264 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 27 (VPS9 domain) (Ankrd27), mRNA. // chr1 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000071337 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:92990234:93089746:1 gene:ENSRNOG00000012882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000072931 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:92990234:93089746:1 gene:ENSRNOG00000012882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000074926 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:92990234:93089746:1 gene:ENSRNOG00000012882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92989540:93098406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT001169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001107506 // RefSeq // Rattus norvegicus teashirt zinc finger homeobox 3 (Tshz3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus teashirt zinc finger homeobox 3 (Tshz3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000018931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:93825019:93896294:-1 gene:ENSRNOG00000013938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:93826654:93829872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006228914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein C19orf12 homolog (LOC690000), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein C19orf12 homolog (LOC690000), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020079 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:95670340:95676490:1 gene:ENSRNOG00000014966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein C19orf12 homolog (LOC102556980), mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95631585:95676490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000033790 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:95730880:95731588:1 gene:ENSRNOG00000027720 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95730898:95731588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000049227 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:95798630:95800933:1 gene:ENSRNOG00000014998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000024441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95785162:95828416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
XM_006223216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102548133), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006228933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 420-like (LOC102548133), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000039649 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:96489118:96500809:1 gene:ENSRNOG00000037366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006228921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 850-like (LOC102548231), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001126089 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 small effector 2 (Cdc42se2), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// XM_006246334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC42 small effector 2 (Cdc42se2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 86 // 88 // 6 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000063891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39827148:39895658:-1 gene:ENSRNOG00000042449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC129107 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42 small effector 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7103559). // chr1 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC169039 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:189425 IMAGE:9027524, complete cds. // chr1 // 86 // 88 // 6 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000056539 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:96080935:96081189:1 gene:ENSRNOG00000037364 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_001108479 // RefSeq // Rattus norvegicus V-set and transmembrane domain containing 2B (Vstm2b), mRNA. // chr1 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// XR_350292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus V-set and transmembrane domain containing 2B (Vstm2b), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 88 // 53 // 15 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000023671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:98716586:98744919:1 gene:ENSRNOG00000017456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT001187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:98717428:98802575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:98597182:98676693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSRNOT00000027745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:98796112:98802648:1 gene:ENSRNOG00000027112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097443 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mRNA (cDNA clone MGC:114499 IMAGE:7456163), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:98717428:98802575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_001073960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690284 (LOC690284), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003753270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690284 (LOC690284), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000030895 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:98861227:98865019:1 gene:ENSRNOG00000027102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047233 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:98861227:98864376:1 gene:ENSRNOG00000027102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:98859655:98861752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000047515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:98861842:98865019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000019353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:99010778:99012014:1 gene:ENSRNOG00000014406 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 50 // 100 // 12 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99010778:99030409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
XM_006223229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 850-like (LOC102555672), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 850-like (LOC102555672), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 850-like (LOC102555672), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 850-like (LOC102555672), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019278 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99310759:99313940:1 gene:ENSRNOG00000014380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074698 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99307780:99312080:1 gene:ENSRNOG00000014380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT001191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001099487 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 37 (Vom2r37), mRNA. // chr1 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000023732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:99992978:100036919:-1 gene:ENSRNOG00000017648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000056515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100067149:100207955:-1 gene:ENSRNOG00000043280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// NM_001099476 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 38 (Vom2r38), mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// NONRATT005129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT005130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
GENSCAN00000032741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99771270:99834508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000056514 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:99834216:99834584:-1 gene:ENSRNOG00000037351 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
XM_006223232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100912683), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// XM_006228957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100912683), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
NM_001106249 // RefSeq // Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 5 (Siglec5), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 5 (Siglec5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XR_350302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 5 (Siglec5), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:99639156:99647531:-1 gene:ENSRNOG00000021474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99639843:99666376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106250 // RefSeq // Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 10 (Siglec10), mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:99589921:99598511:-1 gene:ENSRNOG00000037339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// BC168854 // GenBank // Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin G, mRNA (cDNA clone IMAGE:7376699), partial cds. // chr1 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT005125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99572161:99618457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_053771 // RefSeq // Rattus norvegicus lens intrinsic membrane protein 2 (Lim2), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:99571887:99578054:-1 gene:ENSRNOG00000017681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// L04191 // GenBank // Rattus norvegicus lens intrinsic membrane protein 19 (MP19) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// M87053 // GenBank // Rat lens membrane protein (MP20) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99572161:99618457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT005122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_133540 // RefSeq // Rattus norvegicus natural killer cell granule protein 7 (Nkg7), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:99569680:99570751:-1 gene:ENSRNOG00000017749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF082535 // GenBank // Rattus norvegicus type III multi-pass transmembrane protein mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ226323 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YJ07 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99564559:99570601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT005120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109143 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin domain containing 2 (Cldnd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:99564436:99567120:-1 gene:ENSRNOG00000037333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001004220 // RefSeq // Rattus norvegicus electron-transfer-flavoprotein, beta polypeptide (Etfb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:99549585:99563745:-1 gene:ENSRNOG00000017851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079351 // GenBank // Rattus norvegicus electron-transfer-flavoprotein, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:94808 IMAGE:7108112), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99536553:99563715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_218633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus V-set and immunoglobulin domain containing 10 like (Vsig10l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000039446 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99538138:99544067:-1 gene:ENSRNOG00000023411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// GENSCAN00000032748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99536553:99563715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT005112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
XM_006229214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546648 (LOC102546648), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032403 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:100555504:100565596:1 gene:ENSRNOG00000023233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074820 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:100555504:100565460:1 gene:ENSRNOG00000023233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169017 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9100848. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT001203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT001205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006223240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 484-like (LOC102556967), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006223246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 484-like (LOC102556967), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546648 (LOC102546648), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000024645 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:100574928:100581740:1 gene:ENSRNOG00000033729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// FQ229683 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YB13 mRNA sequence. // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001014017 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 819 (Zfp819), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 819 (Zfp819), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100601819:100608478:1 gene:ENSRNOG00000030160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// BC087070 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 819, mRNA (cDNA clone MGC:94396 IMAGE:7134052), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
XM_003748856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18 (Ceacam18), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_003753273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18 (Ceacam18), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006223251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18 (Ceacam18), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// XM_006229166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 18 (Ceacam18), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038229 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100630259:100644423:1 gene:ENSRNOG00000022701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067736 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100630244:100638257:1 gene:ENSRNOG00000022701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100574994:100643304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
NM_001106251 // RefSeq // Rattus norvegicus cytosolic thiouridylase subunit 1 (Ctu1), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100668356:100674148:1 gene:ENSRNOG00000018334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC161898 // GenBank // Rattus norvegicus ATP binding domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:187617 IMAGE:8367021), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100667374:100673146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001080394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 14 (Klk14), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_218641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 14 (Klk14), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100685183:100689773:1 gene:ENSRNOG00000033706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100678941:100689773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001170405 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 13 (Klk13), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100717394:100729013:1 gene:ENSRNOG00000022353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100718659:100728988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001107508 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 12 (Klk12), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000024758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100775621:100779762:1 gene:ENSRNOG00000034012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT001214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0
NM_001106252 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 11 (Klk11), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 11 (Klk11), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000025055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100780866:100785406:1 gene:ENSRNOG00000018742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT001215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100775146:100791042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001004100 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 10 (Klk10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100787665:100791042:1 gene:ENSRNOG00000030281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100775146:100791042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106253 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 9 (Klk9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100798462:100802754:1 gene:ENSRNOG00000022313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100798501:100802538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107509 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 8 (Klk8), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000025174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100803926:100810769:1 gene:ENSRNOG00000018580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100804403:100810727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT001218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106254 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein-related peptidase 7 (Klk7), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000025299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100820162:100823452:1 gene:ENSRNOG00000018664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100819290:100822624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_019175 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein related-peptidase 6 (Klk6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100831082:100838229:1 gene:ENSRNOG00000031927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF016269 // GenBank // Rattus norvegicus myelencephalon specific protease mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT001220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT001221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100832452:100854410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
XM_006223253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein-5-like (LOC102546758), mRNA. // chrU // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// XM_006229215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein-5-like (LOC102546758), mRNA. // chrU // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000025489 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:100849440:100854410:1 gene:ENSRNOG00000018831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100832452:100854410:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001004101 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein-related peptidase 4 (Klk4), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100897613:100902010:1 gene:ENSRNOG00000018864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100897616:100932264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000046254 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100369072:100370232:1 gene:ENSRNOG00000045810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000056467 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100931104:100932264:1 gene:ENSRNOG00000049860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100897616:100932264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000040724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100361428:100370232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001013067 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase C8 (Klk1c8), mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100424170:100427961:1 gene:ENSRNOG00000049279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072124 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101101949:101105740:1 gene:ENSRNOG00000048901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101074628:101155474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 83 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100426037:100473155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
XM_006229217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein 5-like (Klk5l), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100434333:100445333:1 gene:ENSRNOG00000046267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101112112:101123112:1 gene:ENSRNOG00000045980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostate-specific antigen-like (LOC102546874), mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100933072:101045488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101074628:101155474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000040744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100426037:100473155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101007191:101011185:-1 gene:ENSRNOG00000050893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 79 // 12 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100387582:100399987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101201288:101261392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSRNOT00000074968 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101145716:101148564:1 gene:ENSRNOG00000047900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 94 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101074628:101155474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_175759 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase C9 (Klk1c9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000025723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101151631:101155517:1 gene:ENSRNOG00000032857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC061771 // GenBank // Rattus norvegicus kallikrein, submaxillary gland S3, mRNA (cDNA clone MGC:72263 IMAGE:5621994), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// M11566 // GenBank // Rat submaxillary gland S3 kallikrein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101074628:101155474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT001225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_012593 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase C7 (Klk1c7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101196673:101200667:1 gene:ENSRNOG00000047527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000010118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101196673:101200667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT001226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001271315 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase C3 (Klk1c3), mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
XM_001080538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein-related peptidase 15 (Klk15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_002728759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein-related peptidase 15 (Klk15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein-15-like (LOC102553035), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038353 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101254626:101261392:1 gene:ENSRNOG00000033805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072699 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100459405:100473155:1 gene:ENSRNOG00000049445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101201288:101261392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100426037:100473155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_031523 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1 (Klk1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000025831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101264168:101268371:1 gene:ENSRNOG00000029221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC078784 // GenBank // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase b3, mRNA (cDNA clone MGC:93329 IMAGE:7128287), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// M11563 // GenBank // Rat submaxillary gland PS kallikrein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101264198:101268326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT001227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001014018 // RefSeq // Rattus norvegicus Friend virus susceptibility 1 (Fv1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101289512:101291836:1 gene:ENSRNOG00000019132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC060592 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2410002F23, mRNA (cDNA clone MGC:72969 IMAGE:6887297), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220903 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YE05 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT001229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT001234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_031751 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1 (Shank1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1 (Shank1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101362263:101409488:1 gene:ENSRNOG00000019207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101362263:101409488:1 gene:ENSRNOG00000019207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101387213:101409488:1 gene:ENSRNOG00000019207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000048805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101362263:101409488:1 gene:ENSRNOG00000019207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101362263:101407364:1 gene:ENSRNOG00000019207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF102855 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic SAPAP-interacting protein Synamon mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// AF131951 // GenBank // Rattus norvegicus Shank1a mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF159046 // GenBank // Rattus norvegicus SPANK-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101364746:101408496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
BC088145 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin III, mRNA (cDNA clone IMAGE:7323759), complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// NM_019122 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin III (Syt3), mRNA. // chr1 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// XM_006228979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin III (Syt3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000026251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101459652:101473304:1 gene:ENSRNOG00000019318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// D28512 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Synaptotagmin III, complete cds. // chr1 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// AF375464 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// EU441216 // GenBank // Rattus norvegicus strain W synaptotagmin III mRNA, complete cds. // chr1 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// NONRATT001243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000011917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101425966:101533767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// NONRATT001246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001271081 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 4B (Lrrc4b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101516007:101533767:1 gene:ENSRNOG00000019418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101425966:101533767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001009643 // RefSeq // Rattus norvegicus aspartate dehydrogenase domain containing (Aspdh), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartate dehydrogenase domain containing (Aspdh), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101536453:101538714:1 gene:ENSRNOG00000019424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088252 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610012D14, mRNA (cDNA clone MGC:109059 IMAGE:7372248), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101536473:101542592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106256 // RefSeq // Rattus norvegicus Josephin domain containing 2 (Josd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101539030:101542738:1 gene:ENSRNOG00000019442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101536473:101542592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT001254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
XM_006223261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006229179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000043724 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101567063:101571409:1 gene:ENSRNOG00000031739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006223262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// XM_006229180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member E1 (Fam71e1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101567190:101571044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT001261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT001262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_031670 // RefSeq // Rattus norvegicus napsin A aspartic peptidase (Napsa), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101642884:101655189:1 gene:ENSRNOG00000019854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078790 // GenBank // Rattus norvegicus napsin A aspartic peptidase, mRNA (cDNA clone MGC:93347 IMAGE:7109515), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101642923:101670526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053997 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 3 (Kcnc3), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 3 (Kcnc3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 95 // 51 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101659056:101669458:1 gene:ENSRNOG00000019959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 63 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101659056:101673261:1 gene:ENSRNOG00000019959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// AY179603 // GenBank // Rattus norvegicus Kv3.3c voltage gated potassium channel subunit splice variant C mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// AY179604 // GenBank // Rattus norvegicus Kv3.3d voltage gated potassium channel subunit splice variant mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 49 // 21 // 21 // 0 /// AY822673 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated potassium channel Kv3.3Es short variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 47 // 20 // 20 // 0 /// AY822674 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated potassium channel Kv3.3El long variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 47 // 20 // 20 // 0 /// M84210 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA sequence. // chr1 // 93 // 65 // 26 // 28 // 0 /// M84211 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel protein mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 42 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101642923:101670526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 49 // 49 // 21 // 43 // 1
XM_006223266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus izumo sperm-egg fusion protein 2-like (LOC100911976), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus izumo sperm-egg fusion protein 2-like (LOC100911976), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IZUMO family member 2 (Izumo2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100519590:100532148:1 gene:ENSRNOG00000045902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101774672:101787230:1 gene:ENSRNOG00000047254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101774672:101787230:1 gene:ENSRNOG00000047254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100519590:100532148:1 gene:ENSRNOG00000045902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101774672:101787230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100519590:100573282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001005561 // RefSeq // Rattus norvegicus vaccinia related kinase 3 (Vrk3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vaccinia related kinase 3 (Vrk3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XR_350317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vaccinia related kinase 3 (Vrk3), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XR_350318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vaccinia related kinase 3 (Vrk3), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101820326:101847648:1 gene:ENSRNOG00000026517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081928 // GenBank // Rattus norvegicus vaccinia related kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:93929 IMAGE:7113277), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ218807 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YM22 mRNA sequence. // chr1 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101820292:101846044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT001266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_023098 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 62 (Nup62), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101889514:101891781:1 gene:ENSRNOG00000048733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC128709 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin 62, mRNA (cDNA clone MGC:156514 IMAGE:8363131), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101889553:101891130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT001272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002728744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG53598-like (LOC100360621), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG53598-like (LOC100360621), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG53598-like (LOC100360621), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027320 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:101894734:101901347:1 gene:ENSRNOG00000020148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056364 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:101896994:101901347:1 gene:ENSRNOG00000020148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101896994:101901347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106259 // RefSeq // Rattus norvegicus AKT1 substrate 1 (proline-rich) (Akt1s1), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AKT1 substrate 1 (proline-rich) (Akt1s1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AKT1 substrate 1 (proline-rich) (Akt1s1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101913514:101916583:1 gene:ENSRNOG00000020289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101912895:101915893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT001276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT001277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001004259 // RefSeq // Rattus norvegicus polynucleotide kinase 3-phosphatase (Pnkp), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006229058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polynucleotide kinase 3-phosphatase (Pnkp), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101918528:101923538:1 gene:ENSRNOG00000020318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// BC079307 // GenBank // Rattus norvegicus polynucleotide kinase 3-phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:94448 IMAGE:7134659), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000001408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101918593:101923507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT001280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT001282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT001279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001037646 // RefSeq // Rattus norvegicus fuzzy planar cell polarity protein (Fuz), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101956485:101961425:1 gene:ENSRNOG00000020429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101956485:101961425:1 gene:ENSRNOG00000020429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC107809 // GenBank // Rattus norvegicus fuzzy homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:125220 IMAGE:7453736), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101956625:101961169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT001285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT001287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_199088 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase substrate (Tsks), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006229016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis-specific serine kinase substrate (Tsks), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102004257:102018331:1 gene:ENSRNOG00000020443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY346104 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific likely serine kinase substrate mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000001399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102004281:102018022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT001289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT001291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT001292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001108481 // RefSeq // Rattus norvegicus related RAS viral (r-ras) oncogene homolog (Rras), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102077759:102081668:1 gene:ENSRNOG00000037247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ211166 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA16YF04 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102077786:102081237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001106260 // RefSeq // Rattus norvegicus nitric oxide synthase interacting protein (Nosip), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nitric oxide synthase interacting protein (Nosip), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102120682:102135946:1 gene:ENSRNOG00000020543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098770 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7372434. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102132371:102135913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT001309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT001308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NR_031893 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 150 (Mir150), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053683 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:102181484:102181568:1 gene:ENSRNOG00000035560 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-150 // miRBase Micro RNA Database // MI0000920 Rattus norvegicus miR-150 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001024868 // RefSeq // Rattus norvegicus PIH1 domain containing 1 (Pih1d1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PIH1 domain containing 1 (Pih1d1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PIH1 domain containing 1 (Pih1d1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102217680:102221752:1 gene:ENSRNOG00000020634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097946 // GenBank // Rattus norvegicus PIH1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:116069 IMAGE:7366310), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102218009:102221727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT001318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_053859 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 17 (vesicular glutamate transporter), member 7 (Slc17a7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102226199:102238038:1 gene:ENSRNOG00000020650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102226199:102238038:1 gene:ENSRNOG00000020650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// EU253553 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley vesicular glutamate transporter 1 variant (Slc17a7) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// FQ211811 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA79YH16 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// U07609 // GenBank // Rattus norvegicus brain specific Na+-dependent inorganic phosphate cotransporter mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102226332:102237477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT001321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT001323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001109144 // RefSeq // Rattus norvegicus parathyroid hormone 2 (Pth2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus parathyroid hormone 2 (Pth2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102242977:102243626:1 gene:ENSRNOG00000020681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102243104:102243560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT001325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107512 // RefSeq // Rattus norvegicus TEA domain family member 2 (Tead2), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000028086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102279567:102295451:1 gene:ENSRNOG00000020695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// BC168947 // GenBank // Rattus norvegicus TEA domain family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:189253 IMAGE:9027778), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102280144:102294770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// NONRATT001329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
XM_006223286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6, member 16 (Slc6a16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6, member 16 (Slc6a16), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6, member 16 (Slc6a16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6, member 16 (Slc6a16), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033882 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:102313476:102325195:1 gene:ENSRNOG00000025220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102309641:102329485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000051280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102329501:102340478:1 gene:ENSRNOG00000037219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168918 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Orphan sodium- and chloride-dependent neurotransmitter transporter NTT5 (Solute carrier family 6 member 16), mRNA (cDNA clone MGC:189204 IMAGE:7131823), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102331820:102340478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT001330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_181369 // RefSeq // Rattus norvegicus histidine rich calcium binding protein (Hrc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102388222:102391945:1 gene:ENSRNOG00000020719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY277279 // GenBank // Rattus norvegicus histidine-rich calcium binding protein (Hrc) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ216289 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YK14 mRNA sequence. // chr1 // 82 // 37 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000012856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102388382:102391886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT001333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001108914 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 7 (Kcna7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102477238:102482730:1 gene:ENSRNOG00000020779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102477752:102481026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013184 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophin 4 (Ntf4), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102484724:102487555:1 gene:ENSRNOG00000020783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// S69323 // GenBank // Rattus norvegicus neurotrophin-5 mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102482340:102487065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT001335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033975 // RefSeq // Rattus norvegicus luteinizing hormone beta polypeptide (Lhb), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// NM_012858 // RefSeq // Rattus norvegicus luteinizing hormone beta polypeptide (Lhb), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102489429:102491422:1 gene:ENSRNOG00000020787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 30 // 13 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000067468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102492408:102493125:1 gene:ENSRNOG00000047040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// U25653 // GenBank // Rattus norvegicus testicular luteinizing hormone beta-subunit (TLHB1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// U25802 // GenBank // Rattus norvegicus testicular luteinizing hormone beta subunit (TLHB2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000012899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102489442:102493055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT001337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 67 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT001338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// U25803 // GenBank // Rattus norvegicus testicular luteinizing hormone beta-subunit (TLHB3) mRNA, complete cds. // chr1 // 54 // 54 // 25 // 46 // 1 /// NONRATT001336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 13 // 46 // 1
NM_001109615 // RefSeq // Rattus norvegicus glycogen synthase 1, muscle (Gys1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102506605:102526038:1 gene:ENSRNOG00000020812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC131849 // GenBank // Rattus norvegicus glycogen synthase 1, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:156743 IMAGE:7108272), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102506820:102524779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 88 // 14 // 22 // 0
NM_001012168 // RefSeq // Rattus norvegicus tubby-like protein 2 (Tulp2), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubby-like protein 2 (Tulp2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102553246:102590186:1 gene:ENSRNOG00000020927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// BC084696 // GenBank // Rattus norvegicus tubby-like protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:105856 IMAGE:7115051), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102581629:102590162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT001343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT001344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT001345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_199101 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 4 (Plekha4), mRNA. // chr1 // 98 // 93 // 39 // 40 // 0 /// XM_006229071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 4 (Plekha4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// XM_006229072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 4 (Plekha4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000028423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102596674:102619582:1 gene:ENSRNOG00000020942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 93 // 39 // 40 // 0 /// BC061738 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 4, mRNA (cDNA clone MGC:72599 IMAGE:5599064), complete cds. // chr1 // 98 // 93 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000012857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102597394:102616377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT001348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// NONRATT001350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1
NM_001191111 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 14 (Hsd17b14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102620046:102629839:1 gene:ENSRNOG00000020949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102620046:102650468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_022400 // RefSeq // Rattus norvegicus branched chain amino acid transaminase 2, mitochondrial (Bcat2), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006229148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus branched chain amino acid transaminase 2, mitochondrial (Bcat2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102633422:102650872:1 gene:ENSRNOG00000020956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC061790 // GenBank // Rattus norvegicus branched chain aminotransferase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:72449 IMAGE:5623666), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U68417 // GenBank // Rattus norvegicus heart branched chain aminotransferase precursor (BCATm) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102620046:102650468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_031236 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosyltransferase 1 (Fut1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102677798:102681216:1 gene:ENSRNOG00000020995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB006137 // GenBank // Rattus norvegicus FTA mRNA for alpha 1,2-fucosyltransferase, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102678979:102680109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT001355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001017514 // RefSeq // Rattus norvegicus izumo sperm-egg fusion 1 (Izumo1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102682002:102687756:1 gene:ENSRNOG00000024678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB195683 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Izumo, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC079244 // GenBank // Rattus norvegicus izumo sperm-egg fusion 1, mRNA (cDNA clone MGC:94329 IMAGE:7132791), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102682995:102706389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001106261 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras interacting protein 1 (Rasip1), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102689553:102700426:1 gene:ENSRNOG00000021004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// BC168876 // GenBank // Rattus norvegicus Ras interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:189129 IMAGE:7135603), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102682995:102706389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
XM_006223290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MEF2 activating motif and SAP domain containing transcriptional regulator (Mamstr), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MEF2 activating motif and SAP domain containing transcriptional regulator (Mamstr), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102702088:102706389:1 gene:ENSRNOG00000024580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102704570:102705892:1 gene:ENSRNOG00000024580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102682995:102706389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001173526 // RefSeq // Rattus norvegicus netrin 5 (Ntn5), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102747918:102756428:1 gene:ENSRNOG00000021016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102747770:102756428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_175708 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 11 (Car11), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102761012:102766123:1 gene:ENSRNOG00000021017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY075025 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase-related XI protein mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC086972 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 11, mRNA (cDNA clone MGC:93050 IMAGE:7190978), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102761244:102766020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT001360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT001362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_012543 // RefSeq // Rattus norvegicus D site of albumin promoter (albumin D-box) binding protein (Dbp), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102766762:102771674:1 gene:ENSRNOG00000021027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY518350 // GenBank // Rattus norvegicus D-binding protein 4 (Dbp) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC087668 // GenBank // Rattus norvegicus D site of albumin promoter (albumin D-box) binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:105474 IMAGE:7317132), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// J03179 // GenBank // Rat D-binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_001289982 // RefSeq // Rattus norvegicus D site of albumin promoter (albumin D-box) binding protein (Dbp), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NM_001289983 // RefSeq // Rattus norvegicus D site of albumin promoter (albumin D-box) binding protein (Dbp), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// AY518348 // GenBank // Rattus norvegicus D-binding protein 2 (Dbp) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// AY518349 // GenBank // Rattus norvegicus D-binding protein 3 (Dbp) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102767129:102771396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_031102 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L18 (Rpl18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000028555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102779721:102782381:1 gene:ENSRNOG00000021035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC084727 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L18, mRNA (cDNA clone MGC:105408 IMAGE:7308070), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ228615 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YB11 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ229993 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YP18 mRNA sequence. // chr1 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// M20156 // GenBank // Rat ribosomal protein L18 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000012878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102779757:102782343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT001373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_001079852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member E (Fam83e), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_218559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member E (Fam83e), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028564 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:102783578:102790211:1 gene:ENSRNOG00000021039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102783578:102785354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT001376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_006229213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase LMTK3-like (LOC691056), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102862636:102871754:1 gene:ENSRNOG00000021048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102856256:102871532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// D37934 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 5E5 antigen, complete cds. // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT001378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001017385 // RefSeq // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 1 (Kdelr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102938310:102949196:1 gene:ENSRNOG00000021082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC092600 // GenBank // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:109169 IMAGE:7121304), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ213542 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YD24 mRNA sequence. // chr1 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102938399:102948483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT001382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001107513 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 143 (Tmem143), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102962983:102979034:1 gene:ENSRNOG00000021096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC089092 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7109147. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102963086:102978226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT001385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001126277 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 114 (Ccdc114), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102985867:103016208:1 gene:ENSRNOG00000021109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC160835 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 114, mRNA (cDNA clone MGC:187543 IMAGE:7456475), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102990290:103015873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108484 // RefSeq // Rattus norvegicus nodal modulator 1 (Nomo1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103100473:103152080:1 gene:ENSRNOG00000021118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103100545:103176972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001106262 // RefSeq // Rattus norvegicus otogelin (Otog), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000068434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103342346:103411351:1 gene:ENSRNOG00000010983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000011870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103355837:103471833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000031150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103342141:103354001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 19 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT001395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0
NM_176079 // RefSeq // Rattus norvegicus myogenic differentiation 1 (Myod1), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103481604:103484314:1 gene:ENSRNOG00000011306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127480 // GenBank // Rattus norvegicus myogenic differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:156574 IMAGE:8366406), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103481814:103635393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_012856 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage gated channel, Shaw-related subfamily, member 1 (Kcnc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103500850:103541476:1 gene:ENSRNOG00000011380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// M68880 // GenBank // Rat neuronal delayed rectifier K+ channel (K-V-4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103481814:103635393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT001400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT001398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001108485 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIH, polypeptide 1 (Gtf2h1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103923952:103951992:1 gene:ENSRNOG00000012360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103923899:103951114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSRNOT00000017468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103975207:103984632:1 gene:ENSRNOG00000013009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC084698 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A, mRNA (cDNA clone MGC:105462 IMAGE:7122339), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// NM_017025 // RefSeq // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A (Ldha), mRNA. // chr1 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// BC060587 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A, mRNA (cDNA clone MGC:72944 IMAGE:6919582), complete cds. // chr1 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// BC168737 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A, mRNA (cDNA clone MGC:188833 IMAGE:6917937), complete cds. // chr1 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// NONRATT001403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT001404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000036517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103968684:103984134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 9 // 11 // 1
NM_017266 // RefSeq // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase C (Ldhc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103990391:104006578:1 gene:ENSRNOG00000013103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC078862 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase C, mRNA (cDNA clone MGC:93523 IMAGE:7131609), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// JQ173138 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase C isoform 1 (LDHC) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// JQ409364 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase C variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// JQ409366 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase C variant 3 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// JQ409367 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase C variant 4 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 95 // 59 // 18 // 19 // 0 /// U07177 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase-C (LDH-C) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// JQ409368 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase C variant 5 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// JQ409365 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase C variant 32 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103989818:104006514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001135016 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 86A (Tmem86a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104238667:104243015:1 gene:ENSRNOG00000013663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104211242:104242100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT001409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001002284 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related G protein-coupled receptor, member B5 (Mrgprb5), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000029958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104604822:104605883:1 gene:ENSRNOG00000022703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT001411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001039037 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 13 (Zdhhc13), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:105165499:105204298:1 gene:ENSRNOG00000014277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY886529 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC13 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000013945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:105165547:105203871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT001413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT001414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT001415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_138529 // RefSeq // Rattus norvegicus neuron navigator 2 (Nav2), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// XM_006229243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuron navigator 2 (Nav2), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// XM_006229244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuron navigator 2 (Nav2), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000046529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:105631322:105994388:1 gene:ENSRNOG00000014530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000026186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:105923424:105991201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:105772521:105848753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0
NM_001106263 // RefSeq // Rattus norvegicus HIV-1 Tat interactive protein 2 (Htatip2), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// XM_006229250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HIV-1 Tat interactive protein 2 (Htatip2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// XM_006229251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HIV-1 Tat interactive protein 2 (Htatip2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000036258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:106145091:106159700:1 gene:ENSRNOG00000022189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC158803 // GenBank // Rattus norvegicus HIV-1 tat interactive protein 2, homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:188215 IMAGE:7321759), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// FQ229069 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YO14 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT001426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:106144716:106321518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// NONRATT001427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_053557 // RefSeq // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 3 (Prmt3), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006229260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 3 (Prmt3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:106163844:106250508:1 gene:ENSRNOG00000014829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF059530 // GenBank // Rattus norvegicus protein arginine N-methyltransferase 3 (PRMT3) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT001429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:106144716:106321518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NONRATT001430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_203334 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 5 (Slc6a5), mRNA. // chr1 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:106335558:106385226:1 gene:ENSRNOG00000031662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AY547309 // GenBank // Rattus norvegicus sodium dependent glycine type 2b transporter (Glyt2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// L21672 // GenBank // Rattus norvegicus GLYT2a (Slc6a5) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 91 // 94 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:106324814:106345322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000027638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:106353461:106413040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_031069 // RefSeq // Rattus norvegicus NEL-like 1 (chicken) (Nell1), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000056030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:106540585:107260907:1 gene:ENSRNOG00000015675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// U48246 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C-binding protein NELL1 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// NONRATT001432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// GENSCAN00000050543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:107206484:107296918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001103363 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100125384 (LOC100125384), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074027 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:107446703:107448170:1 gene:ENSRNOG00000045720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:106965288:106983487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:107406694:107447923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000021365 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:107756658:107757179:1 gene:ENSRNOG00000015960 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 76 // 81 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000055376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:107739987:107757088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0
XM_006223325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 5 (Ano5), mRNA. // chr1 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000021583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:107938445:108010346:1 gene:ENSRNOG00000015972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000042952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:107922645:108010537:1 gene:ENSRNOG00000015972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000064193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:107938442:108010537:1 gene:ENSRNOG00000015972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:107915679:108010537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_053427 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 17 (vesicular glutamate transporter), member 6 (Slc17a6), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:108040511:108080510:1 gene:ENSRNOG00000016147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF271235 // GenBank // Rattus norvegicus differentation-associated Na-dependent inorganic phosphate cotransporter (DNPI) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:108060558:108078752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006229269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 (Gas2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006229270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 (Gas2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 (Gas2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 (Gas2), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 (Gas2), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_001127504 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 (Gas2), mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000022499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:108304939:108405240:1 gene:ENSRNOG00000016717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT001435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000013847 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:110124198:110125140:1 gene:ENSRNOG00000023294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075339 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:110124332:110125411:1 gene:ENSRNOG00000023294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 84 // 13 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:110119618:110125203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000056014 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:110685735:110687701:1 gene:ENSRNOG00000037133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:110685735:110796554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENSRNOT00000033811 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:114425908:114534783:1 gene:ENSRNOG00000021507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000035042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:114424838:114485536:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000056004 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:114744058:114744954:1 gene:ENSRNOG00000029569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
XM_006223334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC502339 (LOC502339), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006229287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC502339 (LOC502339), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT001447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:114744058:114761215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_001054672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin H (Siglech), mRNA. // chrU // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000032254 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:115055395:115156174:1 gene:ENSRNOG00000021499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// FQ232259 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YH10 mRNA sequence. // chrU // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006229305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin H (Siglech), mRNA. // chrU // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT001448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115045753:115153846:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_053522 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member Q (Rhoq), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20521668:20557098:1 gene:ENSRNOG00000015415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// AB031482 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GTP-binding protein tc10, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// BC061760 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member Q, mRNA (cDNA clone MGC:72358 IMAGE:5621223), complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032154 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:115180850:115181461:1 gene:ENSRNOG00000021484 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115180880:115181461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT046281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:20521974:20589566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT046283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001107516 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, gamma complex associated protein 5 (Tubgcp5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:115192961:115228228:1 gene:ENSRNOG00000011480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115196628:115335034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001107517 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoplasmic FMR1 interacting protein 1 (Cyfip1), mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000016376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:115265170:115353514:1 gene:ENSRNOG00000011945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000057239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115340200:115352979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT001451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115196628:115335034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT001452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001107520 // RefSeq // Rattus norvegicus HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (Herc2), mRNA. // chr1 // 100 // 99 // 91 // 91 // 0 /// ENSRNOT00000019245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:115459547:115658973:1 gene:ENSRNOG00000013718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 99 // 91 // 91 // 0 /// GENSCAN00000057243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115460035:115658314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 92 // 92 // 0 /// NONRATT001455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 92 // 92 // 0
NM_001271493 // RefSeq // Rattus norvegicus pink-eyed dilution-like (LOC100365773), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000019498 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:115683590:115991040:1 gene:ENSRNOG00000014465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AB191343 // GenBank // Rattus norvegicus p mRNA for pink-eyed dilution, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000057240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115670665:115772577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 26 // 46 // 1
GENSCAN00000057240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115670665:115772577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
GENSCAN00000033401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:113893522:113906498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000031497 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:113905888:113908193:1 gene:ENSRNOG00000028354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 100 // 13 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072831 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:113905934:113908193:1 gene:ENSRNOG00000028354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 95 // 12 // 18 // 0
NM_017065 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, beta 3 (Gabrb3), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:114022939:114275043:1 gene:ENSRNOG00000014938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:114029911:114275043:1 gene:ENSRNOG00000014938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// AY742860 // GenBank // Rattus norvegicus testis gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta 3 (Gabrb3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000033405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:114230169:114274540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT001440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:114041566:114092802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
ENSRNOT00000020006 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:114031986:114032597:1 gene:ENSRNOG00000014898 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0
NM_001141935 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, class V, type 10A (Atp10a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000023888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:117145830:117311749:1 gene:ENSRNOG00000022581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000030889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:117210575:117311067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT001461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
GENSCAN00000015968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:117541591:117618019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001191837 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3A (Ube3a), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006229309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3A (Ube3a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3A (Ube3a), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:117746227:117834011:1 gene:ENSRNOG00000015734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:117765946:117831302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001008558 // RefSeq // Rattus norvegicus necdin, melanoma antigen (MAGE) family member (Ndn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:124119141:124120755:1 gene:ENSRNOG00000010146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087630 // GenBank // Rattus norvegicus necdin homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:105768 IMAGE:7319134), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:124051287:124120185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT001470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001054803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAGE-like 2 (Magel2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_002725637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAGE-like 2 (Magel2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013483 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:124153364:124157140:1 gene:ENSRNOG00000010158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:124151161:124157140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001054803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAGE-like 2 (Magel2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002725637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAGE-like 2 (Magel2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013483 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:124153364:124157140:1 gene:ENSRNOG00000010158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:124151161:124157140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134706 // RefSeq // Rattus norvegicus high mobility group nucleosome binding domain 5B (Hmgn5b), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:125589858:125598422:1 gene:ENSRNOG00000029078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168165 // GenBank // Rattus norvegicus nucleosomal binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187664 IMAGE:8370295), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001276434 // RefSeq // Rattus norvegicus high mobility group nucleosome binding domain 5 (Hmgn5), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000071650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:80312440:80320033:-1 gene:ENSRNOG00000049192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// GENSCAN00000022923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:125565988:125597852:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT001474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT001475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:12215246:12219038:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 50 // 64 // 9 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:80312440:80348539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
XM_006229353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OTU domain containing 7A (Otud7a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000021068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:125738333:125766168:1 gene:ENSRNOG00000015503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:125726283:125766168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:125604034:125698806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT001476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_001037733 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1 (Trpm1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_001037734 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 1 (Trpm1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:126093051:126208623:1 gene:ENSRNOG00000015829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:126093051:126208623:1 gene:ENSRNOG00000015829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:126124931:126208623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_031924 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-211 (Mir211), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053771 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:126151169:126151274:1 gene:ENSRNOG00000035648 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-211 // miRBase Micro RNA Database // MI0000951 Rattus norvegicus miR-211 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100846 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 10 (Mtmr10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:126233793:126284907:1 gene:ENSRNOG00000016090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:126233804:126282590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT001489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106341 // RefSeq // Rattus norvegicus methylmalonyl CoA epimerase (Mcee), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylmalonyl CoA epimerase (Mcee), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylmalonyl CoA epimerase (Mcee), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:126338537:126361719:1 gene:ENSRNOG00000016327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:126346324:126412170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT001490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_031780 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family A, member 2 (Apba2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:126475687:126655813:1 gene:ENSRNOG00000016358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF029107 // GenBank // Rattus norvegicus Mint2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:126636035:126657874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT001494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001014020 // RefSeq // Rattus norvegicus threonyl-tRNA synthetase-like 2 (Tarsl2), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// XM_006229336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus threonyl-tRNA synthetase-like 2 (Tarsl2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000051000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:127615729:127651843:1 gene:ENSRNOG00000024460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 27 // 27 // 0 /// BC083878 // GenBank // Rattus norvegicus threonyl-tRNA synthetase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:95165 IMAGE:7130245), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// FQ224737 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA56YE17 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000004264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:127615773:127638059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT001496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT001499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001106267 // RefSeq // Rattus norvegicus TM2 domain containing 3 (Tm2d3), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:127666050:127679266:1 gene:ENSRNOG00000011290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000004250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:127669278:127707907:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT001499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT001500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
ENSRNOT00000015313 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:127744606:127745284:1 gene:ENSRNOG00000011510 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0
NM_012999 // RefSeq // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 6 (Pcsk6), mRNA. // chr1 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000015845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:127884080:128033742:1 gene:ENSRNOG00000011526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// L31894 // GenBank // Rattus norvegicus PACE4 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000009048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:127891072:127920600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:127928511:128060601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// NONRATT001503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// NONRATT001507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 19 // 41 // 1 /// NONRATT001505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_001271323 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A (Snrpa1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006229323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A (Snrpa1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:128047739:128060800:1 gene:ENSRNOG00000011932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000045742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:128047754:128057908:1 gene:ENSRNOG00000011932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// FQ219673 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YL13 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// FQ232647 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YO18 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:127928511:128060601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT001509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_173120 // RefSeq // Rattus norvegicus VCP-interacting membrane protein (Vimp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:128065919:128075694:1 gene:ENSRNOG00000012576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF367467 // GenBank // Rattus norvegicus Ratsg2 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC059111 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein S, mRNA (cDNA clone MGC:72657 IMAGE:6920258), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128065957:128075143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001106268 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin sulfate synthase 1 (Chsy1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:128095353:128156041:1 gene:ENSRNOG00000012698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128095355:128135232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
XM_001059713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lines homolog (Drosophila) (Lins), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lines homolog (Drosophila) (Lins), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lines homolog (Drosophila) (Lins), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_218748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lines homolog (Drosophila) (Lins), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018463 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:128695038:128700627:1 gene:ENSRNOG00000042776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128695062:128700627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001127561 // RefSeq // Rattus norvegicus ceramide synthase 3 (Cers3), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:128723370:128856461:1 gene:ENSRNOG00000013823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC160913 // GenBank // Rattus norvegicus LAG1 homolog, ceramide synthase 3, mRNA (cDNA clone MGC:188653 IMAGE:7457160), complete cds. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT001518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128732373:128815042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
XM_006229360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 17 (Adamts17), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055877 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:128878220:129192208:1 gene:ENSRNOG00000037080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128931202:129010818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000012555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128878220:128894196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT001519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001025681 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 23 (Ttc23), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:129702818:129753636:1 gene:ENSRNOG00000013877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// BC097953 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 23, mRNA (cDNA clone MGC:116076 IMAGE:7455883), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000073355 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:129686743:129693757:1 gene:ENSRNOG00000048911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT001522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT001524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1 /// NONRATT001525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// GENSCAN00000054857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:129718835:129753199:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// NONRATT001521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT001523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// GENSCAN00000054865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:129633842:129693793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_052807 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor 1 receptor (Igf1r), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000019267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:129985804:130265820:1 gene:ENSRNOG00000014187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// L29232 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor I receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000045164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:130150344:130265292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT001527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT001529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 13 // 44 // 1
XM_006223346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member B (Fam169b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223347 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member B (Fam169b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member B (Fam169b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member B (Fam169b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member B (Fam169b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member B (Fam169b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:130355958:130391392:1 gene:ENSRNOG00000022822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 69 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:130332096:130538263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NONRATT001535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:132498563:132503980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0
NM_001107524 // RefSeq // Rattus norvegicus repulsive guidance molecule family member A (Rgma), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus repulsive guidance molecule family member A (Rgma), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000068766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:135725212:135768408:1 gene:ENSRNOG00000012874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022615 // RefSeq // Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) I (Top1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF140782 // GenBank // Rattus norvegicus DNA topoisomerase I mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// FQ230605 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YM06 mRNA sequence. // chr1 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// GENSCAN00000007531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:162842106:162947076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000029101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:136004303:136023234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// NONRATT036212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1 /// NONRATT036213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1
XM_002728766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 174, member B (Fam174b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 174, member B (Fam174b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_343063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 174, member B (Fam174b), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_350493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 174, member B (Fam174b), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:136107322:136149232:1 gene:ENSRNOG00000012369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:136107322:136217549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT001541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_057156 // RefSeq // Rattus norvegicus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 2 (St8sia2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:136353283:136423629:-1 gene:ENSRNOG00000012031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L13445 // GenBank // Rat sialyltransferase gene family related mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:136323906:136393894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106271 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 13 (Akap13), mRNA. // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:138008286:138312523:1 gene:ENSRNOG00000010964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:138097529:138203355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT001550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106271 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 13 (Akap13), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:138008286:138312523:1 gene:ENSRNOG00000010964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:138205502:138295675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001039006 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 25 (Klhl25), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006229379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 25 (Klhl25), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006229380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 25 (Klhl25), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006229381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 25 (Klhl25), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000014553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:138329800:138354991:-1 gene:ENSRNOG00000010959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC099111 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 25 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:116251 IMAGE:7461562), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_006223351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 1 (Agbl1), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006229413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 1 (Agbl1), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000031334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:138937365:139454565:1 gene:ENSRNOG00000022610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:139326919:139617130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0
NM_001109148 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S11 (Mrps11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000025008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141453419:141462799:1 gene:ENSRNOG00000018531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ212451 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA54YH02 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT001567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NR_031809 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-7a-2 (Mir7a-2), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000053600 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:141551342:141551436:1 gene:ENSRNOG00000035477 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT001570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT001571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// rno-mir-7a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000836 Rattus norvegicus miR-7a-2 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001108487 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis enhancing nuclease (Aen), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141559326:141568691:1 gene:ENSRNOG00000018421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166435 // GenBank // Rattus norvegicus apoptosis enhancing nuclease, mRNA (cDNA clone MGC:187482 IMAGE:7324389), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:141536206:141582579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT001574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001008510 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon stimulated exonuclease gene 20 (Isg20), mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000024826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141576506:141582788:1 gene:ENSRNOG00000018151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC086557 // GenBank // Rattus norvegicus interferon stimulated exonuclease 20, mRNA (cDNA clone MGC:105645 IMAGE:7300717), complete cds. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// FQ234031 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YG22 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// FQ234316 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YG18 mRNA sequence. // chr1 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT001575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:141536206:141582579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_022190 // RefSeq // Rattus norvegicus aggrecan (Acan), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000047848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141732130:141793202:1 gene:ENSRNOG00000028992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000049681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141732130:141793202:1 gene:ENSRNOG00000028992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// J03485 // GenBank // Rat alternatively spliced aggrecan, large aggregating cartilage proteoglycan core protein mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000051592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:141760810:141793140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT001578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT001579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001106275 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 2 (Abhd2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141965576:142049687:1 gene:ENSRNOG00000017120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:141965618:142049168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT001582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1
XM_006229416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group I (Fanci), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022638 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:142082254:142109575:1 gene:ENSRNOG00000016689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000050759 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:142082254:142121329:1 gene:ENSRNOG00000016689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142082254:142133788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XR_347572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 6.8 kDa mitochondrial proteolipid-like (LOC100912557), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_355163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 6.8 kDa mitochondrial proteolipid-like (LOC100912557), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:190738267:190738449:-1 gene:ENSRNOG00000032130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142179893:142180455:1 gene:ENSRNOG00000031802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145534566:145536613:-1 gene:ENSRNOG00000043144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211017 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YO06 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ224630 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA5YJ08 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145530783:145569821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT048774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NR_031812 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-9-3 (Mir9-3), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-9a-3 // miRBase Micro RNA Database // MI0000839 Rattus norvegicus miR-9a-3 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_001065296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TOPBP1-interacting checkpoint and replication regulator (Ticrr), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_218829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TOPBP1-interacting checkpoint and replication regulator (Ticrr), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000031783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142352621:142393849:1 gene:ENSRNOG00000015520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000039184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142352642:142394863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000020690 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:142407615:142409485:1 gene:ENSRNOG00000015367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC083836 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7113098. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
NM_001191949 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 93 (Wdr93), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000034042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142449493:142488537:1 gene:ENSRNOG00000026514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142449493:142488537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_001106273 // RefSeq // Rattus norvegicus mesoderm posterior 2 homolog (mouse) (Mesp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142511695:142514301:1 gene:ENSRNOG00000014925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142511829:142513685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT001600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134563 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 710 (Zfp710), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006229426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 710 (Zfp710), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 710 (Zfp710), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000064034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142815665:142822208:1 gene:ENSRNOG00000014278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142815857:142825813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001105794 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 38, NatC auxiliary subunit (Naa38), mRNA. // chr1 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000013071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55739689:55740766:1 gene:ENSRNOG00000009823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071156 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:142884062:142884434:1 gene:ENSRNOG00000048153 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142884102:142905293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
NM_001170462 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4B (Sema4b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000030914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142941088:142963935:1 gene:ENSRNOG00000025167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ210687 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA24YF09 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000030587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142941154:142963935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT001608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
XM_006229449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GDP-D-glucose phosphorylase 1 (Gdpgp1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GDP-D-glucose phosphorylase 1 (Gdpgp1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GDP-D-glucose phosphorylase 1 (Gdpgp1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032429 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:142981854:142982647:1 gene:ENSRNOG00000025003 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142981854:142983011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001134962 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 13 (Ttll13), mRNA. // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000068523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142989465:143002432:1 gene:ENSRNOG00000013559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// BC169015 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:189386 IMAGE:7132705), complete cds. // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT001617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001134962 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 13 (Ttll13), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000068523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142989465:143002432:1 gene:ENSRNOG00000013559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC169015 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:189386 IMAGE:7132705), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT001617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000030565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142988956:143060017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT001618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001033900 // RefSeq // Rattus norvegicus neugrin, neurite outgrowth associated (Ngrn), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_028055 // RefSeq // Rattus norvegicus neugrin, neurite outgrowth associated (Ngrn), transcript variant 1, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143003297:143009170:1 gene:ENSRNOG00000013553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC101926 // GenBank // Rattus norvegicus neugrin, neurite outgrowth associated, mRNA (cDNA clone MGC:124865 IMAGE:7939318), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ214228 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YB03 mRNA sequence. // chr1 // 70 // 96 // 16 // 23 // 0 /// NONRATT001620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142988956:143060017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT001618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// NONRATT001621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_022286 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 33 homolog B (yeast) (Vps33b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143013798:143036705:1 gene:ENSRNOG00000013149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081707 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 33 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:93106 IMAGE:7128590), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U35245 // GenBank // Rat vacuolar protein sorting homolog r-vps33b mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142988956:143060017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107529 // RefSeq // Rattus norvegicus protein regulator of cytokinesis 1 (Prc1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143039960:143061006:1 gene:ENSRNOG00000013057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142988956:143060017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT001628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT001629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001107528 // RefSeq // Rattus norvegicus HD domain containing 3 (Hddc3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HD domain containing 3 (Hddc3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143088853:143091138:1 gene:ENSRNOG00000012236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143088872:143090115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT001630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
XM_006223366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 2 (Zscan2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006229466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 2 (Zscan2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034267 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:143633720:143646167:1 gene:ENSRNOG00000022164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143633720:143661588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT001636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001106272 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 592 (Zfp592), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143779196:143815984:1 gene:ENSRNOG00000011458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143800735:143814354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001191895 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-kinase 3 (Alpk3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143827686:143875321:1 gene:ENSRNOG00000011659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143827686:143936263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_053863 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 28 (concentrative nucleoside transporter), member 1 (Slc28a1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000025621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143895175:143936561:1 gene:ENSRNOG00000018940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U10279 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley sodium-dependent nucleoside transporter (rCNT1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143827686:143936263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_198767 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 8A (Pde8a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006229439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphodiesterase 8A (Pde8a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000025797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143980406:144101790:1 gene:ENSRNOG00000019005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AB092696 // GenBank // Rattus norvegicus RNPDE8A mRNA for cAMP-specific cyclic nucleotide phosphodiesterase PDE8, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000005540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144042691:144101764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT001647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT001645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
NR_106671 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-1839 (Mir1839), microRNA. // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000070161 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:144303949:144304012:1 gene:ENSRNOG00000044894 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT001650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-1839 // miRBase Micro RNA Database // MI0021533 Rattus norvegicus miR-1839 stem-loop // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
NM_001130728 // RefSeq // Rattus norvegicus WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules (Whamm), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144345711:144374081:1 gene:ENSRNOG00000028113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144345754:144373669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT001651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
BC089896 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 103, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:109122 IMAGE:7381229), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001127451 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 103, member A1 (Fam103a1), mRNA. // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000026385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144527225:144533106:1 gene:ENSRNOG00000019426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT001653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108490 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 6 superfamily member 1 (Tm6sf1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000063873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144605597:144647529:1 gene:ENSRNOG00000019662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144619605:144643792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_031238 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like 3 (Sh3gl3), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229481 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like 3 (Sh3gl3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:145001325:145131589:1 gene:ENSRNOG00000019776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB008159 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SH3P13S, complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AF009604 // GenBank // Rattus norvegicus SH3p13 mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AF227439 // GenBank // Rattus norvegicus tissue-type testis SH3P13 (SH3P13) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC078800 // GenBank // Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:93371 IMAGE:7135194), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like 3 (Sh3gl3), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT001658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:145025704:145131537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT001659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT001661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001107533 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAMTS-like 3 (Adamtsl3), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:145170122:145490043:1 gene:ENSRNOG00000010840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:145297975:145487412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107534 // RefSeq // Rattus norvegicus elongation factor Tu GTP binding domain containing 1 (Eftud1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000047408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:145530403:145668711:1 gene:ENSRNOG00000032723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000051775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:145551876:145584261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_001191626 // RefSeq // Rattus norvegicus mex-3 RNA binding family member B (Mex3b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:145760227:145764462:1 gene:ENSRNOG00000025142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:145752314:145763104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT001669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001170432 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane channel-like 3 (Tmc3), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000037996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:146644988:146689642:1 gene:ENSRNOG00000025088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000029527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:146632385:146689642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT001672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1
NM_001192011 // RefSeq // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 5 (Stard5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:146699180:146709472:1 gene:ENSRNOG00000025052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ230578 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YN23 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001008345 // RefSeq // Rattus norvegicus mesoderm development candidate 2 (Mesdc2), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006229509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mesoderm development candidate 2 (Mesdc2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000055583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:146966069:146971740:1 gene:ENSRNOG00000012366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC085892 // GenBank // Rattus norvegicus mesoderm development candidate 2, mRNA (cDNA clone MGC:94688 IMAGE:7192668), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:146966317:146970671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT001677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001000115 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 10 (Olr10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:95227379:95228326:1 gene:ENSRNOG00000046729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:95227379:95228326:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000114 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 11 (Olr11), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:95233091:95234038:1 gene:ENSRNOG00000050594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:95233091:95234038:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_006223528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102550685), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// XM_006229652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102550685), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// XM_006229653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102552288), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// XM_006229654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102552789), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000017521 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:156157016:156157489:1 gene:ENSRNOG00000013006 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 82 // 81 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000055567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:155933290:155973424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 95 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156117331:156210090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 71 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156000832:156068765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 95 // 17 // 20 // 0
ENSRNOT00000036482 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:156203321:156204251:1 gene:ENSRNOG00000013711 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000071448 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:156019931:156020925:1 gene:ENSRNOG00000013739 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000033859 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:156225811:156226800:1 gene:ENSRNOG00000024653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0
NM_001000118 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 20 (Olr20), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156265703:156266695:1 gene:ENSRNOG00000045648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072714 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109393.1:49210:50202:1 gene:ENSRNOG00000049702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024233 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109393.1:11404:50202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156226469:156266695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000041092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156307783:156340663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0
ENSRNOT00000018361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156339599:156340663:1 gene:ENSRNOG00000049621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001000119 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 23 (Olr23), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000052050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156308378:156373523:1 gene:ENSRNOG00000049621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 88 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000041091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156372926:156373573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT001791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001000692 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 25 (Olr25), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156435246:156436238:1 gene:ENSRNOG00000046609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156435246:156498857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000041100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156435246:156498857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
NM_001000120 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 30 (Olr30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156533564:156534493:1 gene:ENSRNOG00000029233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156516286:156534493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000689 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 34 (Olr34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156617852:156618790:1 gene:ENSRNOG00000030554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156617852:156618790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000047771 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:156799772:156830568:1 gene:ENSRNOG00000033507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156799772:156901617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
GENSCAN00000017425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156917664:157105014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_053524 // RefSeq // Rattus norvegicus NADPH oxidase 4 (Nox4), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000018990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:157106652:157285107:1 gene:ENSRNOG00000013925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// AB044086 // GenBank // Rattus norvegicus Kox-1 mRNA for kidney superoxide-producing NADPH oxidase, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// AY027527 // GenBank // Rattus norvegicus NADPH oxidase 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT001795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000017432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:157139926:157189207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
NM_017012 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 5 (Grm5), mRNA. // chr1 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// XM_006229656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 5 (Grm5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000022060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:157535334:158095289:1 gene:ENSRNOG00000016429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:157535334:158095289:1 gene:ENSRNOG00000016429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// D10891 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for metabotropic glutamate receptor mGluR5, complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// EU559292 // GenBank // Rattus norvegicus metabotropic glutamate receptor 5b (Grm5) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT001797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:157898173:158080845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NM_017097 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin C (Ctsc), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:158231466:158263672:1 gene:ENSRNOG00000016496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FQ218311 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA5YL12 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:158231583:158262719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT001799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT001800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_145774 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB38, member RAS oncogene family (Rab38), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:158385878:158466622:1 gene:ENSRNOG00000016769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC070513 // GenBank // Rattus norvegicus RAB38, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:91458 IMAGE:7099841), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M94043 // GenBank // Rattus norvegicus rab-related GTP-binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY907524 // GenBank // Rattus norvegicus Rab-related GTP-binding protein (Rab38) pseudogene mRNA, partial sequence. // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT001801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:158323051:158432742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_022623 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled class receptor 4 (Fzd4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:159893043:159896963:1 gene:ENSRNOG00000016848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF183910 // GenBank // Rattus norvegicus frizzled receptor 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:159891790:159909200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
ENSRNOT00000023216 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:159994860:159995377:1 gene:ENSRNOG00000017289 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:159994860:159995114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 50 // 9 // 11 // 0
NM_001108491 // RefSeq // Rattus norvegicus malic enzyme 3, NADP(+)-dependent, mitochondrial (Me3), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus malic enzyme 3, NADP(+)-dependent, mitochondrial (Me3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:160166289:160360861:1 gene:ENSRNOG00000017311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160301762:160364228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT001809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
ENSRNOT00000035257 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:160436420:160436824:1 gene:ENSRNOG00000022941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160436420:160436824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_053554 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein (Picalm), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000025415 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:160681971:160752079:1 gene:ENSRNOG00000018322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// AF041373 // GenBank // Rattus norvegicus clathrin assembly protein short form (CALM) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AF041374 // GenBank // Rattus norvegicus clathrin assembly protein long form (CALM) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// AY699717 // GenBank // Rattus norvegicus clathrin-assembly lymphoid myeloid leukemia protein (CALM) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// AY706215 // GenBank // Rattus norvegicus clathrin-assembly lymphoid leukemia protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// BC100142 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein, mRNA (cDNA clone MGC:114290 IMAGE:7456159), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000048808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160681989:160760175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT001811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT001812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT001813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1 /// NONRATT001814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
NONRATT001811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT001811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_003753316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin-like 2 (Sytl2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 38 // 43 // 1 /// XM_006229694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin-like protein 2-like (LOC100911824), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 88 // 88 // 38 // 43 // 1 /// XM_006229696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin-like protein 2-like (LOC100911824), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 47 // 47 // 20 // 43 // 1 /// ENSRNOT00000042163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162580505:162600491:-1 gene:ENSRNOG00000049878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// ENSRNOT00000045048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:160843924:160863405:1 gene:ENSRNOG00000030776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// BC168993 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:189337 IMAGE:9031555), complete cds. // chr1 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// GENSCAN00000049526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:162581401:162643431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000056344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160800938:160862509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT005831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001134833 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 89 (Ccdc89), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:160870465:160871577:1 gene:ENSRNOG00000022766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162572333:162573445:-1 gene:ENSRNOG00000048071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC167063 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 89, mRNA (cDNA clone MGC:189379 IMAGE:7453194), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:162572333:162573445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000056343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160870465:160871577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001271791 // RefSeq // Rattus norvegicus CREB/ATF bZIP transcription factor (Crebzf), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_073439 // RefSeq // Rattus norvegicus CREB/ATF bZIP transcription factor (Crebzf), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NR_073440 // RefSeq // Rattus norvegicus CREB/ATF bZIP transcription factor (Crebzf), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006229688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CREB/ATF bZIP transcription factor (Crebzf), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT005826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT005828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_022282 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large homolog 2 (Drosophila) (Dlg2), mRNA. // chr1 // 98 // 87 // 44 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000034416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162798344:163450340:1 gene:ENSRNOG00000022635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 52 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162798344:163464040:1 gene:ENSRNOG00000022635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162798344:163464040:1 gene:ENSRNOG00000022635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162798344:163514250:1 gene:ENSRNOG00000022635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000055402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162798344:163450340:1 gene:ENSRNOG00000022635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 27 // 27 // 0 /// U49049 // GenBank // Rattus norvegicus chapsyn-110 mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 87 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000048865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163439871:163514083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT001829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT001817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 19 // 19 // 10 // 52 // 1
GENSCAN00000048896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163403406:163416075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT001829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000042443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:162142571:162143385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 81 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163594818:163595632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 81 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT001817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001024885 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 90B (Ccdc90b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:163647743:163661295:1 gene:ENSRNOG00000009462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097480 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 90B, mRNA (cDNA clone MGC:114546 IMAGE:7458611), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163646290:163661028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT001836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001015012 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB30, member RAS oncogene family (Rab30), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB30, member RAS oncogene family (Rab30), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB30, member RAS oncogene family (Rab30), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:163889802:163905429:1 gene:ENSRNOG00000010224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC091182 // GenBank // Rattus norvegicus RAB30, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:108822 IMAGE:7326213), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ210359 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA2YI08 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163889889:163914402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT001840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT001839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001106281 // RefSeq // Rattus norvegicus prolylcarboxypeptidase (angiotensinase C) (Prcp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:163944735:163993907:1 gene:ENSRNOG00000010630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163967377:164069429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000026807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163967377:164069429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000014284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:164164156:164165644:1 gene:ENSRNOG00000010763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158703 // GenBank // Rattus norvegicus similar to A830059I20Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:187788 IMAGE:9029854), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:164164248:164165507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000014642 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:167023692:167024156:1 gene:ENSRNOG00000011004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
XM_006229707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus teneurin transmembrane protein 4 (Tenm4), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191628 // RefSeq // Rattus norvegicus teneurin transmembrane protein 4 (Tenm4), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:167615228:168094355:1 gene:ENSRNOG00000011151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus teneurin transmembrane protein 4 (Tenm4), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1 /// GENSCAN00000010465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:167880594:168100244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001034921 // RefSeq // Rattus norvegicus asparaginyl-tRNA synthetase 2 (mitochondrial)(putative) (Nars2), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168135529:168218290:1 gene:ENSRNOG00000011476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 86 // 33 // 36 // 0 /// BC104691 // GenBank // Rattus norvegicus asparaginyl-tRNA synthetase 2 (mitochondrial)(putative), mRNA (cDNA clone MGC:125113 IMAGE:7107607), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// BC088466 // GenBank // Rattus norvegicus asparaginyl-tRNA synthetase 2 (mitochondrial)(putative), mRNA (cDNA clone IMAGE:7127934), partial cds. // chr1 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// GENSCAN00000010458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168188292:168246185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168135772:168156030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT001853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT001854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1
NM_053417 // RefSeq // Rattus norvegicus GRB2-associated binding protein 2 (Gab2), mRNA. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168294282:168486053:1 gene:ENSRNOG00000011882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF230367 // GenBank // Rattus norvegicus Grb2-associated binder 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168294278:168486053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT001857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001109151 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 21 (Kctd21), mRNA. // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000035743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168528833:168529713:1 gene:ENSRNOG00000024793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168528833:168538035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT001859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168510975:168511840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001034127 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG8, alpha-1,3-glucosyltransferase (Alg8), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168548585:168568611:1 gene:ENSRNOG00000012292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC100614 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 8, alpha-1,3-glucosyltransferase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124750 IMAGE:5598102), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT001862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001009290 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, subcomplex unknown, 2 (Ndufc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168576229:168582496:1 gene:ENSRNOG00000012383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086952 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, subcomplex unknown, 2, mRNA (cDNA clone MGC:109009 IMAGE:7325437), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ220552 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YH11 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000010480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168600956:168602110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT001867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006223411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 14 (Kctd14), mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006229795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 14 (Kctd14), mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000016654 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:168624638:168630653:1 gene:ENSRNOG00000012494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168619474:168630653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT001870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001191629 // RefSeq // Rattus norvegicus integrator complex subunit 4 (Ints4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000016770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168654458:168718199:1 gene:ENSRNOG00000012552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// FQ218032 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA10YM15 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 87 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000010481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168654525:168718007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT001871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
ENSRNOT00000037050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168756403:168872097:1 gene:ENSRNOG00000024194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168776166:168872097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT001874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_031719 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel, nucleotide-sensitive, 1A (Clns1a), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168883053:168903321:1 gene:ENSRNOG00000012788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060555 // GenBank // Rattus norvegicus chloride channel, nucleotide-sensitive, 1A, mRNA (cDNA clone MGC:72762 IMAGE:6918578), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D13985 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for chloride channel RCL1, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ213672 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YH06 mRNA sequence. // chr1 // 80 // 71 // 16 // 20 // 0 /// L26450 // GenBank // Rat regulatory protein (ICLN) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ232466 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YK07 mRNA sequence. // chr1 // 50 // 71 // 10 // 20 // 0 /// NONRATT001878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168882599:168894507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168895537:168913254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000043552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168894137:168894507:1 gene:ENSRNOG00000033731 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168882599:168894507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT001878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017198 // RefSeq // Rattus norvegicus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 1 (Pak1), mRNA. // chr1 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// XM_006229754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 1 (Pak1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168974734:169089649:1 gene:ENSRNOG00000029784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// U23443 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine protein kinase (alpha-PAK) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// U49953 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase MUK2 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT001880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169006956:169089351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
ENSRNOT00000071602 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:169095626:169096118:1 gene:ENSRNOG00000045717 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169092472:169096755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_006223412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 (Gdpd4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006223416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 (Gdpd4), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// XM_006223417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 (Gdpd4), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006229796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 (Gdpd4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006229800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 (Gdpd4), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// XM_006229801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 4 (Gdpd4), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000034886 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:169114816:169178538:1 gene:ENSRNOG00000028470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169114816:169185974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NM_130737 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase 2d (Gucy2d), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000020513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:169603078:169637801:1 gene:ENSRNOG00000015058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// L37203 // GenBank // Rattus norvegicus guanylyl cyclase (GC-D) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// GENSCAN00000010846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169603171:169659188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT001883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT001884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1
NM_001170434 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 32 (Lrrc32), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 32 (Lrrc32), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:169649230:169661088:1 gene:ENSRNOG00000015310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169603171:169659188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001191630 // RefSeq // Rattus norvegicus protein-kinase, interferon-inducible double stranded RNA dependent inhibitor, repressor of (P58 repressor) (Prkrir), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:169866610:169882330:1 gene:ENSRNOG00000015808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169866613:169928024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT001889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_080401 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 11 (Wnt11), mRNA. // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// XM_006229720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 11 (Wnt11), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000021674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170000733:170016829:1 gene:ENSRNOG00000015982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169996937:170015566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT001893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_017204 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 6 (Map6), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 61 // 61 // 0 /// ENSRNOT00000034389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170429900:170494770:1 gene:ENSRNOG00000027204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 51 // 51 // 0 /// FQ211646 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YK05 mRNA sequence. // chr1 // 39 // 39 // 25 // 64 // 1 /// GENSCAN00000034511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170429110:170476652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000034513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170484975:170494636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 16 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT001898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 64 // 64 // 0
XM_006223419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 (Gdpd5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006229815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5 (Gdpd5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000055321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170582634:170619908:1 gene:ENSRNOG00000036859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC168913 // GenBank // Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7444427), partial cds. // chr1 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT001901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000034512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170582634:170636055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
XM_002725697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 35 (Klhl35), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 35 (Klhl35), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_218953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 35 (Klhl35), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170627335:170632794:1 gene:ENSRNOG00000017365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170582634:170636055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT001903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_012910 // RefSeq // Rattus norvegicus arrestin, beta 1 (Arrb1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006229734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arrestin, beta 1 (Arrb1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arrestin, beta 1 (Arrb1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arrestin, beta 1 (Arrb1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170706120:170772100:1 gene:ENSRNOG00000030404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M91589 // GenBank // Rat beta-arrestin1 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170762205:170772036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT001904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170693393:170761008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NR_031773 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-326 (Mir326), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053629 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:170722071:170722165:1 gene:ENSRNOG00000035506 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-326 // miRBase Micro RNA Database // MI0000599 Rattus norvegicus miR-326 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT001905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000121 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 35 (Olr35), mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170909946:170910865:1 gene:ENSRNOG00000030788 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// BC086526 // GenBank // Rattus norvegicus olfactory receptor 35, mRNA (cDNA clone MGC:105997 IMAGE:7303669), complete cds. // chr1 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1 /// NONRATT001915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170868823:170910806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1
NM_001000935 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 36 (Olr36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071384 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:170920699:170921607:1 gene:ENSRNOG00000047064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170920699:170958905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001000504 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 37 (Olr37), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170957940:170958905:1 gene:ENSRNOG00000018078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170920699:170958905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006229820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-like protein FUBI-like (LOC102553078), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000024338 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:171010026:171010409:1 gene:ENSRNOG00000018083 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000039717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171010026:171010409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_003748930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus X-ray radiation resistance associated 1 (Xrra1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_003753322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus X-ray radiation resistance associated 1 (Xrra1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000031908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171052578:171097583:1 gene:ENSRNOG00000026503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC158768 // GenBank // Rattus norvegicus X-ray radiation resistance associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:188056 IMAGE:7115524), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171054970:171116592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT001919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT001920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT001921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107537 // RefSeq // Rattus norvegicus chordin-like 2 (Chrdl2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chordin-like 2 (Chrdl2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171209852:171237286:1 gene:ENSRNOG00000018394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171210012:171237207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT001922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108917 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoyl(octanoyl) transferase 2 (putative) (Lipt2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171371500:171373827:1 gene:ENSRNOG00000016906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171371505:171397067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT001923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_022235 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 3 (Kcne3), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 3 (Kcne3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 3 (Kcne3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171390840:171397803:1 gene:ENSRNOG00000017054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AJ271742 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mink-related peptide 2 (Kcne3 gene). // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC086406 // GenBank // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:105432 IMAGE:7306835), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171371505:171397067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001109454 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 2-like 1 (Pgm2l1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171438702:171487835:1 gene:ENSRNOG00000017079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171438646:171483239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_198775 // RefSeq // Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, alpha polypeptide III (P4ha3), mRNA. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006229769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, alpha polypeptide III (P4ha3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, alpha polypeptide III (P4ha3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171496702:171531029:1 gene:ENSRNOG00000017118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY313450 // GenBank // Rattus norvegicus collagen prolyl 4-hydroxylase alpha III subunit (P4ha3) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171496727:171531029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT001932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191602 // RefSeq // Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 3 (C2cd3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006229750 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 3 (C2cd3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171583397:171680309:1 gene:ENSRNOG00000017608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171583397:171665626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
NM_013167 // RefSeq // Rattus norvegicus uncoupling protein 3 (mitochondrial, proton carrier) (Ucp3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171683566:171697137:1 gene:ENSRNOG00000017716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB006614 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for uncoupling protein-3, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF030163 // GenBank // Rattus norvegicus uncoupling protein-3 (UCP3) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// AF035943 // GenBank // Rattus norvegicus uncoupling protein-3 mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC072546 // GenBank // Rattus norvegicus uncoupling protein 3 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:91763 IMAGE:7105743), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U92069 // GenBank // Rattus norvegicus UCP3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171689723:171708614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT001945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_019354 // RefSeq // Rattus norvegicus uncoupling protein 2 (mitochondrial, proton carrier) (Ucp2), mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000024156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171707621:171713990:1 gene:ENSRNOG00000017854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB005143 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for uncoupling protein 2, complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// AB006613 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for uncoupling protein-2, complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// AB010743 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for UCP2, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF039033 // GenBank // Rattus norvegicus uncoupling protein 2 (UCP2) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 94 // 58 // 17 // 18 // 0 /// BC062230 // GenBank // Rattus norvegicus uncoupling protein 2 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:72850 IMAGE:6920447), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// FQ227097 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YC21 mRNA sequence. // chr1 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171710985:171713693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001127655 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly factor 4 (Coa4), mRNA. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XM_006229782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly factor 4 (Coa4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000038764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171750590:171753818:1 gene:ENSRNOG00000025385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// BC159412 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:188692 IMAGE:8367388), complete cds. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171745504:171752798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT001949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_053366 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB6A, member RAS oncogene family (Rab6a), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF148210 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase Rab6 mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000025104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171826278:171865057:1 gene:ENSRNOG00000018176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171826748:171861096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT001951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001108494 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 168, member A (Fam168a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171925496:172076149:1 gene:ENSRNOG00000018873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172015041:172072155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT001959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT001962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT001957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001107539 // RefSeq // Rattus norvegicus FCH and double SH3 domains 2 (Fchsd2), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000042524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172337554:172585548:1 gene:ENSRNOG00000019319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000018657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172503806:172583494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1
NM_001013069 // RefSeq // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 10 (Stard10), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 10 (Stard10), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 10 (Stard10), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172622995:172647498:1 gene:ENSRNOG00000019491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC091411 // GenBank // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:109555 IMAGE:7325640), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ210261 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA31YG10 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 63 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT001975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172639698:172647331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT001973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT001976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT001972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT001974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001143847 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 2A, cGMP-stimulated (Pde2a), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NM_001270604 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 2A, cGMP-stimulated (Pde2a), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NM_031079 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 2A, cGMP-stimulated (Pde2a), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172724783:172816712:1 gene:ENSRNOG00000019560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// U21101 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic GMP stimulated phosphodiesterase (PDE2A2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172759627:172815556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// FQ222940 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA17YH13 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT001987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0
NR_031886 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-139 (Mir139), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053724 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:172779847:172779914:1 gene:ENSRNOG00000035601 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-139 // miRBase Micro RNA Database // MI0000913 Rattus norvegicus miR-139 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022947 // RefSeq // Rattus norvegicus ClpB caseinolytic peptidase B homolog (E. coli) (Clpb), mRNA. // chr1 // 93 // 96 // 70 // 75 // 0 /// ENSRNOT00000026665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172929521:173055807:1 gene:ENSRNOG00000019693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 76 // 76 // 0 /// AB027570 // GenBank // Rattus norvegicus SKD3 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 96 // 70 // 75 // 0 /// BC070917 // GenBank // Rattus norvegicus ClpB caseinolytic peptidase B homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:91674 IMAGE:7105142), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 76 // 76 // 0 /// GENSCAN00000047496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172950029:173055744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 60 // 60 // 0 /// NONRATT001992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 78 // 78 // 0 /// NONRATT001995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 15 // 15 // 12 // 78 // 1
NM_053869 // RefSeq // Rattus norvegicus paired-like homeobox 2a (Phox2a), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173083448:173087400:1 gene:ENSRNOG00000019706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// U25967 // GenBank // Rattus norvegicus Arix1 homeodomain protein mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173083689:173087535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 42 // 9 // 11 // 0 /// NONRATT002000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT001999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001170435 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 15 (Anapc15), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 15 (Anapc15), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229861 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 15 (Anapc15), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 15 (Anapc15), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 15 (Anapc15), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173173929:173176117:1 gene:ENSRNOG00000019936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// GENSCAN00000047495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173159348:173175808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_199102 // RefSeq // Rattus norvegicus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 1 (Lamtor1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173182228:173187799:1 gene:ENSRNOG00000020016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005702 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:37574292:37574777:1 gene:ENSRNOG00000004319 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:37574247:37574777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173182287:173187272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001100691 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear mitotic apparatus protein 1 (Numa1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173249830:173279637:1 gene:ENSRNOG00000000417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173267013:173279637:1 gene:ENSRNOG00000000417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173258732:173281882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSRNOT00000045726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173368347:173381696:1 gene:ENSRNOG00000020188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173358337:173381696:1 gene:ENSRNOG00000020188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// AF136401 // GenBank // Rattus norvegicus TRP2 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 63 // 26 // 27 // 0 /// XM_006223433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short transient receptor potential channel 2-like (LOC102549471), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// XM_006229904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short transient receptor potential channel 2-like (LOC102549471), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// ENSRNOT00000027358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173347642:173368940:1 gene:ENSRNOG00000020188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// BC169022 // GenBank // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:189397 IMAGE:9091675), complete cds. // chr1 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// GENSCAN00000029778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173354799:173381008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 81 // 33 // 35 // 0 /// NONRATT002013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 15 // 43 // 1
NM_001107541 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 1 (Art1), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173390959:173395510:1 gene:ENSRNOG00000020251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173391003:173392212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT002015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001108496 // RefSeq // Rattus norvegicus stromal interaction molecule 1 (Stim1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006229888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stromal interaction molecule 1 (Stim1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173562502:173722020:1 gene:ENSRNOG00000020425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173650013:173713773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT002023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
GENSCAN00000046334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173840394:173841377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000126 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 41 (Olr41), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173846400:173847341:1 gene:ENSRNOG00000012071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000024998 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:173870214:173871156:1 gene:ENSRNOG00000018537 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000541 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 43 (Olr43), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173905380:173906330:1 gene:ENSRNOG00000018514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173905623:173906330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000124 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 45 (Olr45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173933533:173934486:1 gene:ENSRNOG00000018508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173933533:173934486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001001 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 46 (Olr46), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000024957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173944069:173945013:1 gene:ENSRNOG00000018506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT002032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000122 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 48 (Olr48), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000024945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173971766:173972838:1 gene:ENSRNOG00000018497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173971894:173972847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001000132 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 49 (Olr49), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174204248:174205174:-1 gene:ENSRNOG00000015444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174202472:174232293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT006002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_001000131 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 50 (Olr50), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174190055:174191029:-1 gene:ENSRNOG00000015432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174190055:174190849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001001008 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 53 (Olr53), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174145937:174146881:-1 gene:ENSRNOG00000031110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174145937:174146881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000025109 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:174093913:174094856:-1 gene:ENSRNOG00000018612 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0
NM_173293 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 59 (Olr59), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174082186:174088103:-1 gene:ENSRNOG00000018606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF079864 // GenBank // Rattus norvegicus putative G-protein coupled receptor RA1c mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001000129 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 62 (Olr62), mRNA. // chr1 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NM_001000748 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 60 (Olr60), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001001022 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 61 (Olr61), mRNA. // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174060379:174061341:-1 gene:ENSRNOG00000046732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174068497:174069459:-1 gene:ENSRNOG00000050496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174057703:174062858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174068497:174069459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT005997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT005998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001000129 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 62 (Olr62), mRNA. // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// NM_001000748 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 60 (Olr60), mRNA. // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// NM_001001022 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 61 (Olr61), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000040663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174060379:174061341:-1 gene:ENSRNOG00000046732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174068497:174069459:-1 gene:ENSRNOG00000050496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174057703:174062858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174068497:174069459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// NONRATT005996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT005998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0
NM_001000129 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 62 (Olr62), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174057703:174062858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0
NM_001000133 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 68 (Olr68), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001001279 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 67 (Olr67), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174311508:174312476:1 gene:ENSRNOG00000015649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174292075:174293013:1 gene:ENSRNOG00000034083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174292174:174293013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174311655:174312476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000133 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 68 (Olr68), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174311508:174312476:1 gene:ENSRNOG00000015649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174311655:174312476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000134 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 74 (Olr74), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174371239:174372183:1 gene:ENSRNOG00000015689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174371344:174380566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT002039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001001281 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 75 (Olr75), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000049036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174379607:174380566:1 gene:ENSRNOG00000050328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT002040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174371344:174380566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_001001287 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 77 (Olr77), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174398172:174399131:1 gene:ENSRNOG00000045576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174398181:174399131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000135 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 78 (Olr78), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174411847:174412794:1 gene:ENSRNOG00000015760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174411847:174412794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001002270 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 79 (Olr79), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174418785:174419726:1 gene:ENSRNOG00000015764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174419028:174434696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT002043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001271 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 81 (Olr81), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174467184:174468122:1 gene:ENSRNOG00000048540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174466184:174501601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000136 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 83 (Olr83), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174500663:174501601:1 gene:ENSRNOG00000050132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174466184:174501601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT002045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000137 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 84 (Olr84), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174515336:174516319:1 gene:ENSRNOG00000030275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174515336:174516319:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000138 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 85 (Olr85), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000021131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174522199:174523134:1 gene:ENSRNOG00000015785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001000747 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 86 (Olr86), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174552378:174553316:1 gene:ENSRNOG00000021332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174522397:174553316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000543 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 87 (Olr87), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174564356:174565294:1 gene:ENSRNOG00000021290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000746 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 88 (Olr88), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000016822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174577439:174578140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001000745 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 89 (Olr89), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174585043:174585993:1 gene:ENSRNOG00000050189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000016825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174585043:174585993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_001000139 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 91 (Olr91), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174620377:174621324:1 gene:ENSRNOG00000048810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174620356:174621324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001001025 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 96 (Olr96), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174661921:174662877:1 gene:ENSRNOG00000015832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174661921:174662877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000143 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 98 (Olr98), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174690696:174691643:1 gene:ENSRNOG00000033060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174691047:174691643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000744 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 101 (Olr101), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000039894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174717257:174718377:1 gene:ENSRNOG00000050285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000144 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 103 (Olr103), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174744385:174745335:1 gene:ENSRNOG00000045842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174744739:174745335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000148 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 107 (Olr107), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174792991:174793944:1 gene:ENSRNOG00000015901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174793225:174793944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT002057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000149 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 108 (Olr108), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174807849:174808790:1 gene:ENSRNOG00000015909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174803675:174808790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000743 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 110 (Olr110), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174824190:174825155:1 gene:ENSRNOG00000015924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174824190:174825155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000742 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 111 (Olr111), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174848753:174849700:1 gene:ENSRNOG00000015926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000150 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 112 (Olr112), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174860882:174861844:1 gene:ENSRNOG00000015933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000156 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 122 (Olr122), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000050333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174990532:174991482:1 gene:ENSRNOG00000029978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174990532:174991482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001000156 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 122 (Olr122), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 52A1-like (LOC102555197), mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000050333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174990532:174991482:1 gene:ENSRNOG00000029978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051398 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:175005185:175006125:1 gene:ENSRNOG00000032984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174990532:174991482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175005140:175006635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001273 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 132 (Olr132), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175230193:175231140:1 gene:ENSRNOG00000029051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175212483:175231140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000022332 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:175249688:175250645:1 gene:ENSRNOG00000016661 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175249865:175250551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001000160 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 136 (Olr136), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175283897:175284850:1 gene:ENSRNOG00000024877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175283897:175284850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001001288 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 135 (Olr135), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175271308:175272246:1 gene:ENSRNOG00000043392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175264327:175272246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047938 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC499219 (LOC499219), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000034019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175297761:175304351:1 gene:ENSRNOG00000024789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001001283 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 137 (Olr137), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175305613:175306578:1 gene:ENSRNOG00000049544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175305631:175306578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000161 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 139 (Olr139), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175335370:175336317:1 gene:ENSRNOG00000048713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175322600:175336317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000162 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 140 (Olr140), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175358547:175359494:1 gene:ENSRNOG00000049204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175358547:175359494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000163 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 143 (Olr143), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175390068:175391006:1 gene:ENSRNOG00000016964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175390068:175391006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000165 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 148 (Olr148), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175452981:175453952:1 gene:ENSRNOG00000016993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000055210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175577162:175583070:1 gene:ENSRNOG00000042686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NM_001170461 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif containing 6 (Trim6), mRNA. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NM_001276491 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 34 (Trim34), mRNA. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000023043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175550133:175563324:1 gene:ENSRNOG00000017147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175549122:175584312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001000546 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 152 (Olr152), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175692605:175693546:1 gene:ENSRNOG00000017211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175692605:175693546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000167 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 153 (Olr153), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175702365:175703339:1 gene:ENSRNOG00000017214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175702365:175703339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000547 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 154 (Olr154), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175715821:175728729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT002081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000168 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 155 (Olr155), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176527726:176528697:1 gene:ENSRNOG00000017234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175715821:175728729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176527876:176528697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001000169 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 157 (Olr157), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176608726:176609715:1 gene:ENSRNOG00000047558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023170 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:176553596:176554989:1 gene:ENSRNOG00000017252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000001853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175749251:175754295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 46 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000049560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176549222:176554525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176604412:176639614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000073794 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:175715869:175755018:1 gene:ENSRNOG00000049348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001000548 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 158 (Olr158), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176630233:176631192:1 gene:ENSRNOG00000049474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175774361:175775320:1 gene:ENSRNOG00000050668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175754925:175783742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176604412:176639614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001000170 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 159 (Olr159), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000074221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176638649:176639614:1 gene:ENSRNOG00000048158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000075036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175782777:175783742:1 gene:ENSRNOG00000046999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175754925:175783742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176604412:176639614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000738 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 160 (Olr160), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176673139:176674107:1 gene:ENSRNOG00000047881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175797523:175798491:1 gene:ENSRNOG00000049190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175797523:175798491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176673139:176674107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001001000 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 161 (Olr161), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176682587:176683546:1 gene:ENSRNOG00000046291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175806971:175807930:1 gene:ENSRNOG00000047359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175806971:175807930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176682587:176683546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000950 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 162 (Olr162), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175820754:175821713:1 gene:ENSRNOG00000047589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176696370:176697329:1 gene:ENSRNOG00000048983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175820754:175821713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176696370:176697329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001000171 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 163 (Olr163), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175834475:175835440:1 gene:ENSRNOG00000049233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000075652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176711382:176712347:1 gene:ENSRNOG00000046945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175834475:175835440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176711382:176712347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000737 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 164 (Olr164), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176754551:176755516:1 gene:ENSRNOG00000046718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175877604:175878569:1 gene:ENSRNOG00000048709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176754765:176779789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0
NM_001000174 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 168 (Olr168), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175976534:175977493:1 gene:ENSRNOG00000029647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175976534:175977493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001071809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to ubiquitin specific peptidase 17 (homolog) (LOC689730), mRNA. // chrU // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000023213 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:176733305:176734819:-1 gene:ENSRNOG00000043303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000042131 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:176019973:176021487:1 gene:ENSRNOG00000017288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000072889 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:175856282:175859803:-1 gene:ENSRNOG00000045716 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 80 // 63 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175856225:175859603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000046904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176019946:176021487:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176733305:176734846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176015155:176016178:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001000176 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 171 (Olr171), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176035349:176036299:1 gene:ENSRNOG00000031652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176035349:176036299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000070987 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:100900142:100901094:1 gene:ENSRNOG00000050471 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100900142:100901032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_001000179 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 178 (Olr178), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100918293:100919231:1 gene:ENSRNOG00000017331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100918365:100919231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT057301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000183 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 185 (Olr185), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176925562:176926515:1 gene:ENSRNOG00000017344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176925562:176926515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001031 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 186 (Olr186), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000050034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176932154:176933095:1 gene:ENSRNOG00000049981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176932352:176960155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001001032 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 188 (Olr188), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176959217:176960155:1 gene:ENSRNOG00000017351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176932352:176960155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000184 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 189 (Olr189), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001001031 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 186 (Olr186), mRNA. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176966521:176967462:1 gene:ENSRNOG00000049717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176932154:176933095:1 gene:ENSRNOG00000049981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176932352:176960155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176966521:176967462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT002090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000185 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 190 (Olr190), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176980798:176981745:1 gene:ENSRNOG00000017357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176980924:176981745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001033 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 198 (Olr198), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177117625:177118590:1 gene:ENSRNOG00000049227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000054599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177117625:177177695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT002092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001001034 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 199 (Olr199), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000046417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177133480:177134430:1 gene:ENSRNOG00000029755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000054599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177117625:177177695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT002093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000189 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 200 (Olr200), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177155185:177156150:1 gene:ENSRNOG00000048852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177117625:177177695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT002094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006229948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC34805 (RGD1561034), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177219835:177223009:1 gene:ENSRNOG00000030818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177213209:177222728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_053496 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclic nucleotide gated channel alpha 4 (Cnga4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006229945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide gated channel alpha 4 (Cnga4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006229946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide gated channel alpha 4 (Cnga4), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000023751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177249672:177253809:1 gene:ENSRNOG00000017609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U12425 // GenBank // Rattus norvegicus olfactory cyclic nucleotide-gated channel mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U12623 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley cyclic nucleotide gated cation channel mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177249779:177252177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_013165 // RefSeq // Rattus norvegicus cholecystokinin B receptor (Cckbr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177269044:177279480:1 gene:ENSRNOG00000017679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M99418 // GenBank // Rat brain cholecystokinin receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177269079:177278729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001006997 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal (Smpd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177389588:177393430:1 gene:ENSRNOG00000017977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083780 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase 1, acid lysosomal, mRNA (cDNA clone MGC:94748 IMAGE:7096039), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177361338:177393097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT002100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT002101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_053371 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 10 homolog B (Timm10b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF061242 // GenBank // Rattus norvegicus fracture callus 1 (FxC1) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// AF150106 // GenBank // Rattus norvegicus small zinc finger-like protein (TIM9b) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000075597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177477126:177478411:1 gene:ENSRNOG00000050846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1 /// FQ210619 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA25YJ07 mRNA sequence. // chr1 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1 /// NONRATT002103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT002102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1 /// GENSCAN00000004193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177477138:177570205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
XM_006223445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein heavy chain domain 1, pseudogene 1 (Dnhd1-ps1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006229949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein heavy chain domain 1, pseudogene 1 (Dnhd1-ps1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000004193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177477138:177570205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0
NM_133409 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin-linked kinase (Ilk), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177584793:177591044:1 gene:ENSRNOG00000018993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF329194 // GenBank // Rattus norvegicus integrin-linked kinase ILK mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC062406 // GenBank // Rattus norvegicus integrin linked kinase, mRNA (cDNA clone MGC:72318 IMAGE:5623251), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177588375:177590780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
GENSCAN00000036271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180181125:180183557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001000191 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 203 (Olr203), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180172055:180173002:-1 gene:ENSRNOG00000045907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180172055:180173083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000195 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 210 (Olr210), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000042820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177800340:177801290:1 gene:ENSRNOG00000029365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177800340:177801290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000197 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 214 (Olr214), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177867951:177868901:1 gene:ENSRNOG00000050279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177867951:177868901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001000198 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 215 (Olr215), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177891432:177892379:1 gene:ENSRNOG00000050698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177891432:177892379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001000552 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 220 (Olr220), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001001372 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 219 (Olr219), mRNA. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177967176:177968099:1 gene:ENSRNOG00000025755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177936806:177937729:-1 gene:ENSRNOG00000047623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177936806:177937729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177967116:177968125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT006132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001000203 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 227 (Olr227), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178100278:178101231:1 gene:ENSRNOG00000019594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:155165138:155166091:1 gene:ENSRNOG00000049285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:155165492:155166091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178100632:178101231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001000205 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 230 (Olr230), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178183990:178184943:1 gene:ENSRNOG00000019599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178183990:178184943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000206 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 231 (Olr231), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178193086:178194033:1 gene:ENSRNOG00000019600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178193086:178194033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000208 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 234 (Olr234), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178279343:178280287:1 gene:ENSRNOG00000033512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178279343:178280287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001072321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 14 (Nlrp14), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051854 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:178325007:178343076:1 gene:ENSRNOG00000023847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000071445 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:178325399:178338417:1 gene:ENSRNOG00000023847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178325007:178424090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000044538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:178415980:178424090:1 gene:ENSRNOG00000021946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006223536 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA-binding motif protein, X chromosome-like (LOC100911977), mRNA. // chrU // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178325007:178424090:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_053324 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin IX (Syt9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin IX (Syt9), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178591098:178768239:1 gene:ENSRNOG00000019613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF375461 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 5 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178612145:178745176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013192 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactomedin-like 1 (Olfml1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178792340:178816630:1 gene:ENSRNOG00000036790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081972 // GenBank // Rattus norvegicus olfactomedin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94110 IMAGE:7125978), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178792647:178815226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT002121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001100582 // RefSeq // Rattus norvegicus PTPRF interacting protein, binding protein 2 (liprin beta 2) (Ppfibp2), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PTPRF interacting protein, binding protein 2 (liprin beta 2) (Ppfibp2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006229954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PTPRF interacting protein, binding protein 2 (liprin beta 2) (Ppfibp2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006229956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PTPRF interacting protein, binding protein 2 (liprin beta 2) (Ppfibp2), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178818985:178964741:1 gene:ENSRNOG00000019667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178819119:178969005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001000209 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 235 (Olr235), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179048450:179049388:1 gene:ENSRNOG00000050756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179048450:179049388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000734 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 241 (Olr241), mRNA. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006223447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 240 (Olr240), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 240 (Olr240), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179126749:179127681:1 gene:ENSRNOG00000049483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049763 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:179097227:179098156:1 gene:ENSRNOG00000030648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179097464:179098156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT002131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179126989:179127681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 56 // 10 // 14 // 0
NM_001000734 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 241 (Olr241), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179126749:179127681:1 gene:ENSRNOG00000049483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179126989:179127681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000213 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 242 (Olr242), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179153427:179154359:1 gene:ENSRNOG00000050447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179152349:179154359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000213 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 242 (Olr242), mRNA. // chr1 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179153427:179154359:1 gene:ENSRNOG00000050447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179181506:179183166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179152349:179154359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// NONRATT002132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0
NM_001000215 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 245 (Olr245), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179238394:179239377:1 gene:ENSRNOG00000030215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000216 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 246 (Olr246), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179260363:179261301:1 gene:ENSRNOG00000050375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179260384:179261301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000217 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 247 (Olr247), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179279145:179280089:1 gene:ENSRNOG00000048525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179279145:179280089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001037 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 250 (Olr250), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179344326:179345273:1 gene:ENSRNOG00000028802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179344326:179345273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000946 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 260 (Olr260), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179588308:179589240:1 gene:ENSRNOG00000047602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT002137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001000220 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 263 (Olr263), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179614050:179614994:1 gene:ENSRNOG00000047215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179614050:179614994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000999 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 264 (Olr264), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000035046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179675638:179676574:1 gene:ENSRNOG00000021766 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 69 // 100 // 11 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179645503:179676574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_001000228 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 267 (Olr267), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:179713669:179969176:1 gene:ENSRNOG00000049197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0
NM_001000733 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 268 (Olr268), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179751365:179752309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000229 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 270 (Olr270), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179767908:179792767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT002142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000732 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 271 (Olr271), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179806159:179807103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000230 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 272 (Olr272), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179812344:179813288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_001077021 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 508-like (LOC687082), partial mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// XM_006229967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 508-like (LOC687082), mRNA. // chr1 // 83 // 71 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179821479:179860499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 71 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 71 // 10 // 12 // 0
NM_001000227 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 276 (Olr276), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:179891765:179892709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106291 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 10 (Nlrp10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180511615:180519172:-1 gene:ENSRNOG00000015082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180512060:180515666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000225 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 281 (Olr281), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180457835:180458815:-1 gene:ENSRNOG00000049832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000073864 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:180011055:180014331:1 gene:ENSRNOG00000047847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000075693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180120831:180121775:-1 gene:ENSRNOG00000047813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180011091:180014203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180120831:180121775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180456415:180458779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000224 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 282 (Olr282), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180444624:180445604:-1 gene:ENSRNOG00000047675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180444624:180445646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001010 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 283 (Olr283), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180431278:180432252:-1 gene:ENSRNOG00000030782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180431278:180432222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000223 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 285 (Olr285), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:180378259:180379194:-1 gene:ENSRNOG00000032092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180357966:180379194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT006158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT002156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033178 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:181162773:181163764:1 gene:ENSRNOG00000013848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001108497 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) interacting protein 1 (Akip1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A kinase (PRKA) interacting protein 1 (Akip1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181316274:181324845:1 gene:ENSRNOG00000013744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181316496:181328759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT002163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT002164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT002165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT002166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
GENSCAN00000046262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181630469:181694159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 83 // 16 // 20 // 0
NM_001107545 // RefSeq // Rattus norvegicus importin 7 (Ipo7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181641921:181696091:1 gene:ENSRNOG00000010427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181630469:181694159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NONRATT002168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001012169 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 143 (Zfp143), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 143 (Zfp143), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181702291:181738044:1 gene:ENSRNOG00000010087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC083578 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 143, mRNA (cDNA clone MGC:94144 IMAGE:7127506), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181711952:181738990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001012742 // RefSeq // Rattus norvegicus WEE1 G2 checkpoint kinase (Wee1), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181767890:181786292:1 gene:ENSRNOG00000010017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC090346 // GenBank // Rattus norvegicus wee 1 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:105683 IMAGE:7306767), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006229974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WEE1 G2 checkpoint kinase (Wee1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// GENSCAN00000051505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181767959:181808389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT002172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT002173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NONRATT002173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1
NM_001106288 // RefSeq // Rattus norvegicus SWAP switching B-cell complex 70 (Swap70), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000013276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:181861342:181922717:1 gene:ENSRNOG00000009910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT002177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:181819234:181927547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_012715 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenomedullin (Adm), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:182433109:182435280:1 gene:ENSRNOG00000027030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061775 // GenBank // Rattus norvegicus adrenomedullin, mRNA (cDNA clone MGC:72547 IMAGE:5621783), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D15069 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for adrenomedullin precursor, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U15419 // GenBank // Rattus norvegicus adrenomedullin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:182431214:182434622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031544 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 3 (Ampd3), mRNA. // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// XM_006230010 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 3 (Ampd3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 3 (Ampd3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 3 (Ampd3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 3 (Ampd3), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:182574033:182618403:1 gene:ENSRNOG00000018262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U90888 // GenBank // Rattus norvegicus AMP deaminase isoform C (AMPD3) mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:182583324:182616909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001100661 // RefSeq // Rattus norvegicus CTR9, Paf1/RNA polymerase II complex component (Ctr9), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:182823942:182853969:1 gene:ENSRNOG00000017195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:182801108:182853380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001107542 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 47 (Usp47), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:183834046:183917156:1 gene:ENSRNOG00000026754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:183858447:183915913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001139508 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 2 (Mical2), mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000021858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:184071797:184148676:1 gene:ENSRNOG00000016244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// FQ223505 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA10YH20 mRNA sequence. // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000007899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:184071797:184179436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT002207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_182669 // RefSeq // Rattus norvegicus MICAL C-terminal like (Micalcl), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000043017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:184172145:184211083:1 gene:ENSRNOG00000016210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AY149342 // GenBank // Rattus norvegicus RSB-11-77 mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 60 // 19 // 21 // 0 /// BC098647 // GenBank // Rattus norvegicus MICAL C-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:112586 IMAGE:7112444), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC100137 // GenBank // Rattus norvegicus MICAL C-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:114239 IMAGE:7457561), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000007907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:184190966:184210971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 37 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT002211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT002212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:184071797:184179436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_020656 // RefSeq // Rattus norvegicus parvin, alpha (Parva), mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000021671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:184227712:184383031:1 gene:ENSRNOG00000015713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF264765 // GenBank // Rattus norvegicus actopaxin mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// FQ228521 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YF09 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000039897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:184320204:184383031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT002214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001198589 // RefSeq // Rattus norvegicus TEA domain family member 1 (Tead1), mRNA. // chr1 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:184473372:184683039:1 gene:ENSRNOG00000015488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:184615578:184688905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT002216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
XM_006223455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase COOH-terminal interactor; peptidylglycine alpha-amidating monooxygenase COOH-terminal interactor protein-1 (RGD1309847), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037185 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:184739197:184740620:1 gene:ENSRNOG00000014847 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000039904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:184739197:184740720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001169139 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoskeleton associated protein 2 (Ckap2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_003753354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytoskeleton-associated protein 2-like (LOC691173), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000029266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74383677:74410206:1 gene:ENSRNOG00000024650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000039493 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:184890450:184891902:1 gene:ENSRNOG00000036773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:184870039:184891902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74383677:74409688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT022722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000030657 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:29820178:29822190:1 gene:ENSRNOG00000025795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 97 // 15 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:29820178:29822176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 90 // 15 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035509 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:67858406:67860357:-1 gene:ENSRNOG00000021282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 37 // 87 // 10 // 27 // 0 /// NONRATT022724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_024362 // RefSeq // Rattus norvegicus aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like (Arntl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB012600 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BMAL1b, complete cds. // chr1 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// AF015953 // GenBank // Rattus norvegicus TIC (TIC) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// BC099833 // GenBank // Rattus norvegicus aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like, mRNA (cDNA clone MGC:124556 IMAGE:7936079), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000019645 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:185007568:185105409:1 gene:ENSRNOG00000014448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000046313 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:185007568:185105409:1 gene:ENSRNOG00000014448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000004414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:185075244:185104905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT002225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// NONRATT002226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT002223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_001011933 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acyl CoA reductase 1 (Far1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:185332184:185377699:1 gene:ENSRNOG00000013176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC082015 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acyl CoA reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94292 IMAGE:7132096), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ221385 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA37YA18 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:185346824:185377584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1
GENSCAN00000043898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:185401899:185434585:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_172067 // RefSeq // Rattus norvegicus spondin 1, extracellular matrix protein (Spon1), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000042088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:185603830:185902796:1 gene:ENSRNOG00000034303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC107655 // GenBank // Rattus norvegicus spondin 1, extracellular matrix protein, mRNA (cDNA clone MGC:124557 IMAGE:7935103), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// M88469 // GenBank // Rattus norvegicus f-spondin mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT002230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT002233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:185823366:185904858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
NONRATT002230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_017229 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 3B, cGMP-inhibited (Pde3b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:190865614:191050207:1 gene:ENSRNOG00000011417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// Z22867 // GenBank // R.norvegicus adipocyte hormone-sensitive cyclic AMP phosphodiesterase mRNA, complete CDS. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:190979406:191049217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_138513 // RefSeq // Rattus norvegicus calcitonin-related polypeptide, beta (Calcb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:191246065:191249721:1 gene:ENSRNOG00000011074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// M11596 // GenBank // Rat beta-type calcitonin gene-related peptide mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:191246070:191248651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 43 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT002237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001106285 // RefSeq // Rattus norvegicus inscuteable homolog (Drosophila) (Insc), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006230079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inscuteable homolog (Drosophila) (Insc), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:191272625:191380855:1 gene:ENSRNOG00000024712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:191276156:191380416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001013898 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to sid2057p (RGD1311703), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to sid2057p (RGD1311703), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:192525001:192536714:-1 gene:ENSRNOG00000020436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089924 // GenBank // Rattus norvegicus similar to sid2057p, mRNA (cDNA clone MGC:109208 IMAGE:7307309), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YN18 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227559 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YO06 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT006243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:192525774:192592569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_021663 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleobindin 2 (Nucb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleobindin 2 (Nucb2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:192078547:192114979:-1 gene:ENSRNOG00000020456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF238223 // GenBank // Rattus norvegicus calcium binding protein NEFA mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// AF250142 // GenBank // Rattus norvegicus NEFA precursor (Nefa) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC061778 // GenBank // Rattus norvegicus nucleobindin 2, mRNA (cDNA clone MGC:72469 IMAGE:5621784), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:192031569:192119315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENSRNOT00000025007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:193935673:194215173:1 gene:ENSRNOG00000018459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AJ295748 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for xylosyltransferase I (XT-I gene). // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:194138081:194218391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000024698 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:194587444:194588441:1 gene:ENSRNOG00000018332 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_001012216 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane channel-like 5 (Tmc5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000055103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195234862:195282791:1 gene:ENSRNOG00000036760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000065601 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:195224593:195282791:1 gene:ENSRNOG00000036760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// BC088406 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane channel-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:93885 IMAGE:7112487), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000016143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195228890:195288624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT002257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT002256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 15 // 47 // 1
NM_001108501 // RefSeq // Rattus norvegicus centriolar coiled coil protein 110kDa (Ccp110), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:195365370:195387930:1 gene:ENSRNOG00000027405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195361277:195498394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSRNOT00000050393 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:195391543:195495011:1 gene:ENSRNOG00000016063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC083805 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9030624J02, mRNA (cDNA clone MGC:94842 IMAGE:7109216), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195361277:195498394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_006230148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing K (Iqck), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055096 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:195514699:195603567:1 gene:ENSRNOG00000036758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006223469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing K (Iqck), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// NONRATT002262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT002263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:195514699:195631449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT002264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001014162 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 5 (Acsm5), mRNA. // chrU // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 5 (Acsm5), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196175053:196205275:1 gene:ENSRNOG00000031211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000049380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196174780:196209980:1 gene:ENSRNOG00000031211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// AY325244 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cc1-38 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// BC078915 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:93686 IMAGE:7096091), complete cds. // chrU // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 5 (Acsm5), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// GENSCAN00000041512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196175053:196203968:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// AY325165 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-174 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 30 // 42 // 1
NM_144748 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 2A (Acsm2a), mRNA. // chr1 // 93 // 67 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196227765:196266992:1 gene:ENSRNOG00000014976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// AF062389 // GenBank // Rattus norvegicus kidney-specific protein (KS) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 67 // 26 // 28 // 0 /// BC078721 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:93153 IMAGE:7110246), complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// NM_001108502 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 1 (Acsm1), mRNA. // chr1 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000055083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196296872:196332415:1 gene:ENSRNOG00000042084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// BC168985 // GenBank // Rattus norvegicus butyryl Coenzyme A synthetase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189325 IMAGE:7323876), complete cds. // chr1 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// GENSCAN00000054050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196229192:196249637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT002268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196279068:196360215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// NONRATT002269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
ENSRNOT00000034610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196367995:196392439:1 gene:ENSRNOG00000014726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_181695 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 4 (Acsm4), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// AB096688 // GenBank // Rattus norvegicus o-macs mRNA for olfactory specific medium-chain acyl CoA synthetase, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196369015:196391683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_033231 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 3 (Acsm3), mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196449105:196475587:1 gene:ENSRNOG00000032246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC090325 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase medium-chain family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:105879 IMAGE:7128525), complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196433227:196475064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001079706 // RefSeq // Rattus norvegicus exonuclease NEF-sp (Exnef), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006230111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exonuclease NEF-sp (Exnef), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XM_006230115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exonuclease NEF-sp (Exnef), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006230116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exonuclease NEF-sp (Exnef), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196484323:196554085:1 gene:ENSRNOG00000014513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC128775 // GenBank // Rattus norvegicus similar to exonuclease NEF-sp, mRNA (cDNA clone MGC:156803 IMAGE:7133646), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006230121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exonuclease NEF-sp (Exnef), transcript variant X11, mRNA. // chr1 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// GENSCAN00000054054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196483899:196554080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_001276487 // RefSeq // Rattus norvegicus LYR motif containing 1 (Lyrm1), mRNA. // chr1 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// XM_006230131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LYR motif containing 1 (Lyrm1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// XM_006230134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LYR motif containing 1 (Lyrm1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// XM_006230135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LYR motif containing 1 (Lyrm1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// BC166909 // GenBank // Rattus norvegicus LYR motif containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188885 IMAGE:6889767), complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT002279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT002280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0
NONRATT002281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001106293 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 15 (Abca15), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000037026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197000155:197106548:1 gene:ENSRNOG00000027505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000043860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197005173:197066358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000043871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197068983:197106390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0
XM_006223476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 16 (Abca16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197127448:197283158:1 gene:ENSRNOG00000015783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197148872:197215931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000029603 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:197387781:197407377:1 gene:ENSRNOG00000036743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000030732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:197387781:197406462:1 gene:ENSRNOG00000036743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197387658:197407214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (LOC691519), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (LOC691519), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197462051:197510754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001006970 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquinol cytochrome c reductase core protein 2 (Uqcrc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197480625:197511182:1 gene:ENSRNOG00000036742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083610 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquinol cytochrome c reductase core protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94368 IMAGE:7133503), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197462051:197510754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT002290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT002288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT002289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_006230181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547219 (LOC102547219), partial mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036226 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:197530179:197596476:1 gene:ENSRNOG00000026107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197585295:197642394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001079885 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3A (Vwa3a), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 43 // 43 // 0 /// NM_001198653 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3A (Vwa3a), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// XR_350668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3A (Vwa3a), transcript variant X7, misc_RNA. // chr1 // 100 // 87 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000036175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197606342:197667768:1 gene:ENSRNOG00000025110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// BC128762 // GenBank // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 3A, mRNA (cDNA clone MGC:156760 IMAGE:7113062), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT002295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 43 // 54 // 1 /// GENSCAN00000001960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197585295:197642394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 26 // 54 // 1 /// GENSCAN00000001976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197644033:197693396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 17 // 54 // 1
XM_006230172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 2 (Sdr42e2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006223541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 2 (Sdr42e2), mRNA. // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197644033:197693396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_012947 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic elongation factor-2 kinase (Eef2k), mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic elongation factor-2 kinase (Eef2k), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic elongation factor-2 kinase (Eef2k), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197704704:197768158:1 gene:ENSRNOG00000016448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC061825 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic elongation factor-2 kinase, mRNA (cDNA clone MGC:72540 IMAGE:5599075), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// U93849 // GenBank // Rattus norvegicus elongation factor-2 kinase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// X96426 // GenBank // R.norvegicus mRNA for skeletal muscle elongation factor-2 kinase. // chr1 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000012675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197739902:197765825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1
NM_001108503 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide E (Polr3e), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000040963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197779117:197807240:1 gene:ENSRNOG00000016960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000012670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197771623:197812005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
XM_001078789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to F28B3.5a (LOC691551), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to F28B3.5a (LOC691551), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to F28B3.5a (LOC691551), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006223492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to F28B3.5a (LOC691551), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to F28B3.5a (LOC691551), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to F28B3.5a (LOC691551), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006230177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to F28B3.5a (LOC691551), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to F28B3.5a (LOC691551), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039447 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:197847747:197873009:1 gene:ENSRNOG00000028473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197849970:198031103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001163164 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 9 (Mettl9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000039186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197891178:197936219:1 gene:ENSRNOG00000025940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FJ889987 // GenBank // Rattus norvegicus truncated methyltransferase-like 9 protein (mettl9) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197849970:198031103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT002308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT002309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT002310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
XM_006223495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus otoancorin (Otoa), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus otoancorin (Otoa), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:197955647:198022468:1 gene:ENSRNOG00000017487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:197849970:198031103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_181370 // RefSeq // Rattus norvegicus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 2 (Hs3st2), mRNA. // chr1 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:198266876:198393452:1 gene:ENSRNOG00000017659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY240873 // GenBank // Rattus norvegicus 3-O-sulphotransferase 2 (HS3ST2) mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// BC128721 // GenBank // Rattus norvegicus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:156569 IMAGE:8364509), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017046 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, non-voltage-gated 1, gamma subunit (Scnn1g), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:198620974:198655013:1 gene:ENSRNOG00000017842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// EU627517 // GenBank // Rattus norvegicus amiloride sensitive sodium channel gamma1 subunit (Scnn1g) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// U37539 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHRSPHD epithelial sodium channel, gamma subunit (rEnacg) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U37540 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley epithelial sodium channel, gamma subunit (rEnacg) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// X77933 // GenBank // R.norvegicus mRNA for sodium channel, gamma subunit. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT002316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:198624392:198716100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_012648 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, non-voltage-gated 1, beta subunit (Scnn1b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:198932512:198953461:-1 gene:ENSRNOG00000030981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// EU627516 // GenBank // Rattus norvegicus amiloride sensitive sodium channel beta1 subunit (Scnn1b) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U35174 // GenBank // Rattus norvegicus WKY-1HD epithelial sodium channel, beta subunit (rEnac) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// U35175 // GenBank // Rattus norvegicus SHRSPHD epithelial sodium channel, beta subunit (rEnac) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// X77932 // GenBank // R.norvegicus mRNA for sodium channel, beta subunit. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:198932970:198953442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
BC101866 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin family domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:124863 IMAGE:7938969), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NM_001034911 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin family domain containing 1 (Ubfd1), mRNA. // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000025072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199088152:199099547:1 gene:ENSRNOG00000018243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000039393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199088162:199099270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001037778 // RefSeq // Rattus norvegicus dynactin 5 (p25) (Dctn5), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199151318:199167998:1 gene:ENSRNOG00000018048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098764 // GenBank // Rattus norvegicus dynactin 5, mRNA (cDNA clone MGC:112788 IMAGE:7371224), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199151372:199166997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_017100 // RefSeq // Rattus norvegicus polo-like kinase 1 (Plk1), mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000025629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199178259:199188238:1 gene:ENSRNOG00000018815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC083926 // GenBank // Rattus norvegicus polo-like kinase 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:95329 IMAGE:7135428), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// U10188 // GenBank // Rattus norvegicus polo like kinase (plk) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000039385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199178343:199187941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_182738 // RefSeq // Rattus norvegicus calcineurin-like EF hand protein 2 (Chp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000025832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199230968:199233950:1 gene:ENSRNOG00000019112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AB086189 // GenBank // Rattus norvegicus chp-2 mRNA for calcineurin homologous protein isoform 2, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000001661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199229872:199233526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT002331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001172305 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, beta (Prkcb), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NM_012713 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, beta (Prkcb), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199295067:199633331:1 gene:ENSRNOG00000012061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199295067:199639137:1 gene:ENSRNOG00000012061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// M13706 // GenBank // Rat protein kinase C type II mRNA, complete cds, clone PKC-II. // chr1 // 91 // 81 // 31 // 34 // 0 /// M19007 // GenBank // Rat protein kinase C beta-1 (PKC beta-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 81 // 32 // 34 // 0 /// X04139 // GenBank // Rat mRNA 3region fragment for protein kinase C. // chr1 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// X04440 // GenBank // Rat mRNA for protein kinase C type II. // chr1 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000001651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199471819:199604043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 31 // 42 // 1 /// NONRATT002333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_080691 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 3 (Cacng3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199676988:199771889:1 gene:ENSRNOG00000012362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF361340 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit (Cacng3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199724180:199771889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000035770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199993669:200024682:1 gene:ENSRNOG00000012806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000049430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:199993669:200024682:1 gene:ENSRNOG00000012806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000025203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:199967867:200040964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
NM_001107549 // RefSeq // Rattus norvegicus trinucleotide repeat containing 6a (Tnrc6a), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000017885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:200136262:200204255:1 gene:ENSRNOG00000024737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000025197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200155779:200206388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 30 // 44 // 1
NM_001100482 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 11 (Slc5a11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006230186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/inositol cotransporter), member 11 (Slc5a11), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:200246621:200285416:1 gene:ENSRNOG00000013407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200246643:200285369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC169028 // GenBank // Rattus norvegicus CD74 antigen (invariant polypeptide of major histocompatibility complex, class II antigen-associated), mRNA (cDNA clone MGC:189405 IMAGE:7110265), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0
NM_199405 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine carboxyl methyltransferase 1 (Lcmt1), mRNA. // chr1 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// XM_006230191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine carboxyl methyltransferase 1 (Lcmt1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:200394431:200450381:1 gene:ENSRNOG00000014565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC063186 // GenBank // Rattus norvegicus leucine carboxyl methyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:73013 IMAGE:6890062), complete cds. // chr1 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// NONRATT002355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT002354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// GENSCAN00000045805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200432991:200488148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_019158 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 8 (Aqp8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aquaporin 8 (Aqp8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:200483632:200489429:1 gene:ENSRNOG00000014652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB005547 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for aquaporin 8, complete cds. // chr1 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// AF007775 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin-pancreas and liver (AQP8) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC081812 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 8, mRNA (cDNA clone MGC:93492 IMAGE:7114305), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200432991:200488148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT002358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENSRNOT00000029967 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:200595901:200596773:1 gene:ENSRNOG00000024217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000045808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200551791:200596605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
ENSRNOT00000020314 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:200648796:200650366:1 gene:ENSRNOG00000015130 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200648796:200650366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_001079317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 4-like (LOC691700), partial mRNA. // chrU // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// XM_003753358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 4-like (LOC691700), mRNA. // chrU // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000074749 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:201294785:201303219:-1 gene:ENSRNOG00000049316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:201294781:201323357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENSRNOT00000071314 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:200756032:200757543:-1 gene:ENSRNOG00000048424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_001014148 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 2 (Paip2), mRNA. // chr1 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000026989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28123065:28129020:1 gene:ENSRNOG00000019934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// BC079261 // GenBank // Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94367 IMAGE:7133501), complete cds. // chr1 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:200747146:200757491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0
NM_001037196 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 8 (Kdm8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006230258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 8 (Kdm8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 8 (Kdm8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:203825919:203840778:1 gene:ENSRNOG00000015180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC100627 // GenBank // Rattus norvegicus jumonji domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:124735 IMAGE:7938034), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:203784248:203839851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT002379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT002380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_133380 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 4 receptor (Il4r), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:203940373:203952928:1 gene:ENSRNOG00000015441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AB015746 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for interleukin-4 receptor (soluble form), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB015747 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for inetrleukin-4 receptor (membrane-bound form), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:203870486:203952008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT002383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001012469 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 21 receptor (Il21r), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 21 receptor (Il21r), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 21 receptor (Il21r), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:203980785:204008629:1 gene:ENSRNOG00000015773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089857 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 21 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:108921 IMAGE:7381492), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ226709 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YL02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:203998185:204013205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001134574 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to K04F10.2 (LOC361646), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to K04F10.2 (LOC361646), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to K04F10.2 (LOC361646), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022365 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:204112871:204249196:1 gene:ENSRNOG00000016635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204094466:204205118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000025816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204217995:204248724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_147135 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain binding kinase 1 (Sbk1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000025808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:68159188:68181024:-1 gene:ENSRNOG00000019082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AB010154 // GenBank // Rattus norvegicus sbk mRNA for serine/threonine protein kinase with SH3 ligand, expressed in hippocampus, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC131843 // GenBank // Rattus norvegicus SH3-binding domain kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:156586 IMAGE:8363395), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075669 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:204658850:204661335:1 gene:ENSRNOG00000047346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 80 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:68161545:68263766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT004465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204573455:204660984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// NONRATT004466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_030585 // RefSeq // Rattus norvegicus rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 2 (Rabep2), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 47 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000025043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204820053:204836433:1 gene:ENSRNOG00000018462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// BC089795 // GenBank // Rattus norvegicus rabaptin, RAB GTPase binding effector protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:108671 IMAGE:7375879), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// U34932 // GenBank // Rattus norvegicus Fos-related antigen mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 47 // 51 // 0 /// GENSCAN00000018408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204806276:204835956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT002395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT002394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 21 // 51 // 1
NM_001106295 // RefSeq // Rattus norvegicus Tu translation elongation factor, mitochondrial (Tufm), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204882342:204885949:1 gene:ENSRNOG00000018604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204882688:204885770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001109154 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein B receptor (Apobr), mRNA. // chr1 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// XM_006230319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein B receptor (Apobr), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:204978096:204982599:1 gene:ENSRNOG00000017403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// FQ231657 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YK20 mRNA sequence. // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:204978125:204981514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001114502 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 101 (Ccdc101), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205046259:205079492:1 gene:ENSRNOG00000019245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205034708:205079400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT002406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_017347 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 3 (Mapk3), mRNA. // chr1 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205172641:205178843:1 gene:ENSRNOG00000019601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF155236 // GenBank // Rattus norvegicus extracellular signal-regulated kinase 1b (ERK1b) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205172665:205177831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT002412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT002415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT002416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_002725663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3 (Gdpd3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_002728806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 3 (Gdpd3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205179490:205189018:1 gene:ENSRNOG00000019685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205179490:205188990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT002417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001135698 // RefSeq // Rattus norvegicus yippee-like 3 (Drosophila) (Ypel3), mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006230233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus yippee-like 3 (Drosophila) (Ypel3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006230235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus yippee-like 3 (Drosophila) (Ypel3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000026755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205190393:205193684:1 gene:ENSRNOG00000019721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// FQ229460 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YN07 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000018402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205189604:205193294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT002421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT002422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001108920 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 6 (Tbx6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205194665:205198574:1 gene:ENSRNOG00000019771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205194689:205198183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001106296 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 57, member B (Fam57b), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// XM_006230237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 57, member B (Fam57b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XM_006230238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 57, member B (Fam57b), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000026955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205239664:205246007:1 gene:ENSRNOG00000019914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// XM_006230239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 57, member B (Fam57b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// XM_006230240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 57, member B (Fam57b), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// NONRATT002426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000018208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205239826:205268117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// NONRATT002425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_022937 // RefSeq // Rattus norvegicus double C2-like domains, alpha (Doc2a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus double C2-like domains, alpha (Doc2a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus double C2-like domains, alpha (Doc2a), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205264653:205268291:1 gene:ENSRNOG00000019920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205239826:205268117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U70779 // GenBank // Rattus norvegicus Doc2A mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001025725 // RefSeq // Rattus norvegicus HIRA interacting protein 3 (Hirip3), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205278318:205281341:1 gene:ENSRNOG00000029061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC099091 // GenBank // Rattus norvegicus HIRA interacting protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:116216 IMAGE:7457888), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205278812:205281117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0
NM_198736 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 13 (Kctd13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205341000:205359303:1 gene:ENSRNOG00000020010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY305029 // GenBank // Rattus norvegicus PDIP1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205341177:205358772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT002434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001107550 // RefSeq // Rattus norvegicus seizure related 6 homolog (mouse)-like 2 (Sez6l2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000037405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205363570:205383913:1 gene:ENSRNOG00000027098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000018247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205364466:205393039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT002437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_138899 // RefSeq // Rattus norvegicus CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase (Cdipt), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase (Cdipt), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205389729:205393866:1 gene:ENSRNOG00000024144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070876 // GenBank // Rattus norvegicus CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase (phosphatidylinositol synthase), mRNA (cDNA clone MGC:91485 IMAGE:7096385), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D82928 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol synthase, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000018247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205364466:205393039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001025001 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC308990 (LOC308990), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC308990 (LOC308990), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022765 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:205519720:205521652:1 gene:ENSRNOG00000016978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT002445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_012605 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin light chain, phosphorylatable, fast skeletal muscle (Mylpf), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205649522:205652320:1 gene:ENSRNOG00000017645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ217115 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA35YA02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// FQ217533 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA24YC18 mRNA sequence. // chr1 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205649607:205652227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006230383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 771 (Zfp771), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023995 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:205673587:205677062:1 gene:ENSRNOG00000017837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205671049:205677062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// FQ210015 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YD21 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// FQ212088 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA69YM03 mRNA sequence. // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT002451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001033998 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha L (Itgal), mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// XM_006230269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha L (Itgal), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000024404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205742369:205780279:1 gene:ENSRNOG00000017980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC101849 // GenBank // Rattus norvegicus integrin alpha L, mRNA (cDNA clone MGC:124736 IMAGE:7938065), complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205742446:205779481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT002457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
XM_006223516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 14 (Prr14), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// XM_006230384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 14 (Prr14), mRNA. // chr1 // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000055002 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:205910770:205914314:1 gene:ENSRNOG00000018518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000055003 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:205933261:205938141:1 gene:ENSRNOG00000042728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// XM_002725689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrosin (Fbrs), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000014455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205900227:206054416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT002462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT002463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT002465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
XM_002725689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrosin (Fbrs), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006230376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Snf2-related CREBBP activator protein (Srcap), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000054998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:205962862:205981323:1 gene:ENSRNOG00000018637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000054997 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:201774454:201781039:1 gene:ENSRNOG00000047840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:201750920:201797916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000014455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205900227:206054416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0
NM_080584 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphorylase kinase, gamma 2 (testis) (Phkg2), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_003748991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, testis/liver isoform-like (LOC100909429), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006223544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, testis/liver isoform-like (LOC100909429), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphorylase kinase, gamma 2 (testis) (Phkg2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206027400:206039924:1 gene:ENSRNOG00000018725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000071284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206042507:206054689:1 gene:ENSRNOG00000050421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC086982 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7192734, with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC107906 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455157. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC128715 // GenBank // Rattus norvegicus phosphorylase kinase, gamma 2 (testis), mRNA (cDNA clone MGC:156540 IMAGE:7456955), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// M73808 // GenBank // Rat phosphorylase kinase catalytic subunit mRNA, complete CDS. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:205900227:206054416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_153471 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 40, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000025499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206060191:206074819:1 gene:ENSRNOG00000018840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF352815 // GenBank // Rattus norvegicus staring mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000014466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206060396:206076297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT002476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
ENSRNOT00000054080 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:206109729:206109847:1 gene:ENSRNOG00000035957 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000062140 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:206182456:206182530:1 gene:ENSRNOG00000040387 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017129 // RefSeq // Rattus norvegicus cardiotrophin 1 (Ctf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206186717:206191927:1 gene:ENSRNOG00000018962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC072690 // GenBank // Rattus norvegicus cardiotrophin 1, mRNA (cDNA clone MGC:91750 IMAGE:7096800), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D78591 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cardiotrophin-1, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206186754:206191178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT002477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107552 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 19 (Fbxl19), mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006230276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 19 (Fbxl19), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006230280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 19 (Fbxl19), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206219421:206238674:1 gene:ENSRNOG00000018986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT002478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206214602:206269774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT002479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001014024 // RefSeq // Rattus norvegicus ORAI calcium release-activated calcium modulator 3 (Orai3), mRNA. // chr1 // 100 // 37 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206239787:206244645:1 gene:ENSRNOG00000039730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206257268:206270414:1 gene:ENSRNOG00000019045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 24 // 24 // 0 /// BC079355 // GenBank // Rattus norvegicus ORAI calcium release-activated calcium modulator 3, mRNA (cDNA clone MGC:94812 IMAGE:7108257), complete cds. // chr1 // 100 // 37 // 25 // 25 // 0 /// BC098812 // GenBank // Rattus norvegicus similar to KIAA0339 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377077), partial cds. // chr1 // 100 // 18 // 12 // 12 // 0 /// EU644751 // GenBank // Rattus norvegicus calcium release-activated calcium modulator 3 protein (ORAI3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 18 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000040477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206214602:206269774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT002480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 25 // 67 // 1 /// NONRATT002483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 18 // 18 // 12 // 67 // 1
NONRATT002481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_139329 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 7 (Hsd3b7), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206270898:206274168:1 gene:ENSRNOG00000019080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB000199 // GenBank // Rattus norvegicus cca2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206271353:206273497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT002486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_031125 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 4 (Stx4), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006230348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 4 (Stx4), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206310318:206317403:1 gene:ENSRNOG00000019302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L20821 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206305033:206317275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT002490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT002491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
XM_001080366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 646 (Zfp646), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 646 (Zfp646), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 646 (Zfp646), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_219364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 646 (Zfp646), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036187 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:206346140:206349456:1 gene:ENSRNOG00000026115 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206346149:206351524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// NONRATT002499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_019244 // RefSeq // Rattus norvegicus branched chain ketoacid dehydrogenase kinase (Bckdk), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206374937:206379462:1 gene:ENSRNOG00000019485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M93271 // GenBank // Rattus norvegicus branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenasekinase (BCKDHKIN) mRNA, complete cds. // chr1 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206375058:206378586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:114963281:114990670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 60 // 9 // 18 // 0 /// NONRATT002501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT002502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001017378 // RefSeq // Rattus norvegicus K (lysine) acetyltransferase 8 (Kat8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000026527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206383425:206395703:1 gene:ENSRNOG00000019585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC083891 // GenBank // Rattus norvegicus MYST histone acetyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:95220 IMAGE:7132551), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206383430:206395578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT002505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001012137 // RefSeq // Rattus norvegicus fused in sarcoma RNA binding protein (Fus), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000031891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206435552:206449420:1 gene:ENSRNOG00000023360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC087153 // GenBank // Rattus norvegicus fusion, derived from t(12;16) malignant liposarcoma (human), mRNA (cDNA clone MGC:95219 IMAGE:7132489), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT002509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001077675 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 72 (Trim72), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206472855:206480749:1 gene:ENSRNOG00000022099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC127539 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 72, mRNA (cDNA clone MGC:156817 IMAGE:7192024), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224850 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YN06 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT002514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206473417:206573171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_012711 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha M (Itgam), mRNA. // chr1 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206522889:206573171:1 gene:ENSRNOG00000019728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF268593 // GenBank // Rattus norvegicus integrin beta 2 alpha subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206473417:206573171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
XM_001080404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha X (Itgax), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006223526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha X (Itgax), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// XM_006230382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha X (Itgax), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// XM_574569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha X (Itgax), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000054983 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:206583799:206603987:1 gene:ENSRNOG00000036703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206583675:206669545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0
NM_031691 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha D (Itgad), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha D (Itgad), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006230328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha D (Itgad), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206632107:206669617:1 gene:ENSRNOG00000019782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF021334 // GenBank // Rattus norvegicus alpha D integrin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206583675:206669545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001009455 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 5 (Armc5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206701594:206708360:1 gene:ENSRNOG00000019935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087086 // GenBank // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:94568 IMAGE:7189809), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206701801:206710159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT002520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001191840 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor beta 1 induced transcript 1 (Tgfb1i1), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000054980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206710120:206716908:1 gene:ENSRNOG00000019965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF314960 // GenBank // Rattus norvegicus hic-5/ARA55 protein mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206711268:206716358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT002524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT002527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT002528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_022590 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 2 (Slc5a2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206728635:206734756:1 gene:ENSRNOG00000020039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AB070849 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for low affinity Na-dependent glucose transporter SGLT2 beta, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AB070850 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for low affinity Na-dependent glucose transporter SGLT2 gamma, complete cds. // chr1 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// AB070976 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for low affinity Na-dependent glucose transporter SGLT2 delta e trans, complete cds. // chr1 // 92 // 72 // 24 // 26 // 0 /// U29881 // GenBank // Rattus norvegicus low affinity Na-dependent glucose transporter (SGLT2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206728640:206734520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT002531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_001106299 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha hemoglobin stabilizing protein (Ahsp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206767226:206768198:1 gene:ENSRNOG00000020165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC157822 // GenBank // Rattus norvegicus erythroid associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:188714 IMAGE:8374205), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206767543:206768079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000075722 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:206904865:206905347:1 gene:ENSRNOG00000049463 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
NM_001011936 // RefSeq // Rattus norvegicus Bcl2-associated athanogene 3 (Bag3), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:206989244:207013176:1 gene:ENSRNOG00000020298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC085857 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl2-associated athanogene 3, mRNA (cDNA clone MGC:94584 IMAGE:7190249), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// DQ631552 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl-2-interacting death suppressor mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:206989345:207012675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT002534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107554 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase F (Inpp5f), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000027630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:207085286:207164061:1 gene:ENSRNOG00000020388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000010487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:207085576:207162950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000011084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:207365998:207451122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// NONRATT002537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NONRATT002535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
BC098824 // GenBank // Rattus norvegicus SEC23 interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377967), complete cds. // chr1 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// NM_001134859 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC23 interacting protein (Sec23ip), mRNA. // chr1 // 95 // 95 // 37 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000027665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:207214643:207257112:1 gene:ENSRNOG00000020411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 95 // 37 // 39 // 1 /// GENSCAN00000011076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:207220521:207253370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 77 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT002539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT002541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1 /// NONRATT002542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001191631 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 1A (Ppapdc1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000027681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:209449940:209577459:1 gene:ENSRNOG00000020424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT002577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000048827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:209510303:209577101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
XM_006223527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 11 (Wdr11), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006230424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 11 (Wdr11), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000027704 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:209788417:209832826:1 gene:ENSRNOG00000020430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:209745742:209849208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
GENSCAN00000043362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:207853315:207899085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000039565 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:208042283:208043285:1 gene:ENSRNOG00000019173 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 53 // 100 // 8 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000046989 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:207898086:207899085:1 gene:ENSRNOG00000042148 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 53 // 100 // 8 // 15 // 0
XM_001080526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein ZNRD1-AS1-like (RGD1563285), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_574571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein ZNRD1-AS1-like (RGD1563285), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208121763:208125493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT002545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001017464 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 16 (Btbd16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006230403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 16 (Btbd16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 16 (Btbd16), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208368884:208423112:1 gene:ENSRNOG00000036675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079317 // GenBank // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 16, mRNA (cDNA clone MGC:94475 IMAGE:7135047), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208309817:208453449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001079894 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 1 (Plekha1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006230414 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 1 (Plekha1), transcript variant X10, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 1 (Plekha1), transcript variant X13, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208462231:208513823:1 gene:ENSRNOG00000020497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC128752 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 1, mRNA (cDNA clone MGC:156706 IMAGE:7100072), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000026720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208475059:208581009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT002559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_031721 // RefSeq // Rattus norvegicus HtrA serine peptidase 1 (Htra1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208531988:208581539:1 gene:ENSRNOG00000020533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF179370 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 5 protease mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081767 // GenBank // Rattus norvegicus HtrA serine peptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93339 IMAGE:7121959), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ228875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YO11 mRNA sequence. // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208475059:208581009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
AY548057 // GenBank // Rattus norvegicus pancrin mRNA, complete cds. // chrU // 67 // 38 // 8 // 12 // 0 /// NM_022849 // RefSeq // Rattus norvegicus deleted in malignant brain tumors 1 (Dmbt1), mRNA. // chrU // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// AF540887 // GenBank // Rattus norvegicus DMBT1 4.7 kb transcript variant mRNA, complete cds. // chrU // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// XM_006230425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deleted in malignant brain tumors 1 (Dmbt1), mRNA. // chrU // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// U32681 // GenBank // Rattus norvegicus ebnerin mRNA, complete cds. // chrU // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT002576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:210208405:210434610:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
XM_006223693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative DMBT1-like protein-like (LOC691970), mRNA. // chr1 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// XM_006230422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative DMBT1-like protein-like (LOC691970), mRNA. // chr1 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039130 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:208783864:208873351:1 gene:ENSRNOG00000022737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000031747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208745790:208873360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0
XM_006223695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative ZP domain-containing protein LOC729800-like (LOC102556288), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208877847:208910097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006227223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 3-like (LOC100912196), partial mRNA. // chr1 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// XM_006257628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 3-like (LOC100912289), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036657 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:208934109:208934819:1 gene:ENSRNOG00000026440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_003748899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 3-like (LOC100912196), partial mRNA. // chr1 // 74 // 76 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:152196469:152214901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208934109:208934819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:151477174:151494463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001109158 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 24, member A (Fam24a), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000036128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208945988:208949090:1 gene:ENSRNOG00000026035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC161873 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 24, member A, mRNA (cDNA clone MGC:187431 IMAGE:7113177), complete cds. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC166439 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 24, member A, mRNA (cDNA clone MGC:187519 IMAGE:7453416), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001271229 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoseryl-tRNA kinase (Pstk), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:208982377:208992787:1 gene:ENSRNOG00000020605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC168162 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8365731. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT002568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT002569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT002570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT002572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:208987654:208995816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT002573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT002574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_013084 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA dehydrogenase, short/branched chain (Acadsb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:209013684:209048776:1 gene:ENSRNOG00000020624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// FQ210776 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA22YH22 mRNA sequence. // chr1 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// U64451 // GenBank // Rattus norvegicus short-branched chain acyl-CoA dehydrogenase precursor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:209032656:209072989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001106302 // RefSeq // Rattus norvegicus H6 family homeobox 3 (Hmx3), mRNA. // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000028007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:210520996:210522960:1 gene:ENSRNOG00000020637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:210463710:210522669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT002591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001106303 // RefSeq // Rattus norvegicus H6 family homeobox 2 (Hmx2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:210526870:210534531:1 gene:ENSRNOG00000020638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:210532279:210533948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT002592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047906 // RefSeq // Rattus norvegicus BUB3 mitotic checkpoint protein (Bub3), mRNA. // chrU // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:210535691:210567637:1 gene:ENSRNOG00000020643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 69 // 28 // 29 // 0 /// AY325173 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-050 mRNA, complete cds. // chrU // 96 // 67 // 27 // 28 // 0 /// BC099199 // GenBank // Rattus norvegicus budding uninhibited by benzimidazoles 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116372 IMAGE:7383928), complete cds. // chrU // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:210538340:210567186:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 55 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT002594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT002595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 30 // 42 // 1
XM_002728870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100361049 (LOC100361049), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_003753365 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100361049 (LOC100361049), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY539919 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00168 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000015169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211312736:211315310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000022273 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:211504796:211505722:1 gene:ENSRNOG00000016624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211504796:211514659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0
NM_001009706 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase (Lhpp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211611521:211702233:1 gene:ENSRNOG00000017097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088448 // GenBank // Rattus norvegicus phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:95092 IMAGE:7126522), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase (Lhpp), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT002599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211611531:211659412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT002600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT002601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001106307 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 175, member B (Fam175b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211854578:211880154:1 gene:ENSRNOG00000017222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ218234 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA7YC05 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211764020:211878486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// NONRATT002606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
XM_006223549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, RAN-binding domain containing 1 protein-like (LOC100360606), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:211953388:211990331:1 gene:ENSRNOG00000017294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:211954069:211990331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT002607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001107557 // RefSeq // Rattus norvegicus erythroid differentiation regulatory factor 1 (Edrf1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:212655637:212692701:1 gene:ENSRNOG00000017728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212651004:212691246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT002616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108505 // RefSeq // Rattus norvegicus BRCA2 and CDKN1A interacting protein (Bccip), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:212726542:212738954:1 gene:ENSRNOG00000018066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ228402 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA8YO21 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212726561:212738690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001008347 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type 3 and ankyrin repeat domains 1 (Fank1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000024751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:212790893:212897407:1 gene:ENSRNOG00000018327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC082095 // GenBank // Rattus norvegicus fibronectin type 3 and ankyrin repeat domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:95281 IMAGE:7134234), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:212814254:212897357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT002620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001143858 // RefSeq // Rattus norvegicus dedicator of cyto-kinesis 1 (Dock1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000054897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:213838803:214349252:1 gene:ENSRNOG00000018683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// XM_003749001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis protein 1-like (LOC100909609), mRNA. // chr1 // 17 // 17 // 9 // 52 // 1 /// GENSCAN00000003896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:213415361:213514467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 17 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:214204817:214284608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 17 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000034747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:213708578:213982879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 23 // 52 // 1 /// GENSCAN00000047969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:214307667:214361523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 13 // 52 // 1 /// NONRATT002623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 17 // 17 // 9 // 52 // 1 /// NONRATT002624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 17 // 17 // 9 // 52 // 1 /// NONRATT002630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 19 // 19 // 10 // 52 // 1
NM_001271113 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide S (Nps), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:214442729:214446510:1 gene:ENSRNOG00000036653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000025569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:214587309:214588960:1 gene:ENSRNOG00000018917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// L13205 // GenBank // Rattus norvegicus HNF-3/fork-head homolog-5 (HFH-5) mRNA, complete cds. // chr1 // 67 // 48 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000047970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:214587387:214588960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_053767 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, E (Ptpre), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000021359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:214879098:214919139:1 gene:ENSRNOG00000015717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000021379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:214887078:214919139:1 gene:ENSRNOG00000015717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// BC166573 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, E, mRNA (cDNA clone MGC:188208 IMAGE:7320594), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// D78610 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein tyrosine phosphatase epsilon C, partial cds. // chr1 // 92 // 86 // 34 // 37 // 0 /// D78613 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein tyrosine phosphatase epsilon M, partial cds. // chr1 // 95 // 47 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:214879106:214921569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT002631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT002632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1
NM_012861 // RefSeq // Rattus norvegicus O-6-methylguanine-DNA methyltransferase (Mgmt), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:216161435:216388310:1 gene:ENSRNOG00000016038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M76704 // GenBank // Rat O-6-methylguanine-DNA methyltransferase (RMGMT) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// X54862 // GenBank // Rat O-6-alkylguanine-DNA-alkyltransferase mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT002640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:216326295:216416690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_032614 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaredoxin 3 (Glrx3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006230497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutaredoxin 3 (Glrx3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:216692884:216724091:1 gene:ENSRNOG00000016227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF118651 // GenBank // Rattus norvegicus PKCq-interacting protein PICOT (PICOT) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC086381 // GenBank // Rattus norvegicus glutaredoxin 3, mRNA (cDNA clone MGC:105380 IMAGE:7301390), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ216152 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YG15 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:216702574:216723468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT002643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_144746 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, delta (Ppp2r2d), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218132463:218166449:1 gene:ENSRNOG00000016940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218153952:218166217:1 gene:ENSRNOG00000016940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// AF180350 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2A B regulatory subunit delta isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081720 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, delta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:93154 IMAGE:7112646), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218104538:218166208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT002645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT002646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_001163277 // RefSeq // Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 3 (Jakmip3), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006230472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 3 (Jakmip3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006230475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 3 (Jakmip3), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// XM_006230481 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 3 (Jakmip3), transcript variant X12, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000030461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218277853:218347771:1 gene:ENSRNOG00000027590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000008997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218289358:218364487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_012933 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydropyrimidinase-like 4 (Dpysl4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000029587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218349771:218365280:1 gene:ENSRNOG00000027582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218289358:218364487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_001143756 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 27 (Lrrc27), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006230492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 27 (Lrrc27), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218470409:218499898:1 gene:ENSRNOG00000017538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000049631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218470409:218486611:1 gene:ENSRNOG00000017538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC158629 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:187538 IMAGE:7456037), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NM_001113789 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 27 (Lrrc27), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// GENSCAN00000008983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218471776:218583467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT002658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// NONRATT002659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT002660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT002662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001108507 // RefSeq // Rattus norvegicus PWWP domain containing 2B (Pwwp2b), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006230468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PWWP domain containing 2B (Pwwp2b), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006230469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PWWP domain containing 2B (Pwwp2b), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000023619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218506152:218524764:1 gene:ENSRNOG00000036649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC162015 // GenBank // Rattus norvegicus PWWP domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:187886 IMAGE:9092167), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000008983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218471776:218583467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001108923 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase A (Inpp5a), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XR_350830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus type I inositol 1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase-like (LOC100910988), ncRNA. // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000054890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:218656329:218844831:1 gene:ENSRNOG00000017635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:218718122:218842631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219329740:219426682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_006230505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 123 (Gpr123), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050400 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:219103136:219133127:1 gene:ENSRNOG00000033646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000054884 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:219095294:219133257:1 gene:ENSRNOG00000033646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219047913:219192681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
XM_006223700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinase non-catalytic C-lobe domain (KIND) containing 1 (Kndc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034426 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:219152239:219196635:1 gene:ENSRNOG00000027240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219047913:219192681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT002676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT002678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006223559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36-like (LOC102554107), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001106309 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 511 (Zfp511), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 511 (Zfp511), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219277464:219281869:1 gene:ENSRNOG00000018272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219277544:219288793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_031669 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich acidic protein 1 (Prap1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219472906:219476700:1 gene:ENSRNOG00000018446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF214733 // GenBank // Rattus norvegicus proline-rich acidic protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106311 // RefSeq // Rattus norvegicus polyamine oxidase (exo-N4-amino) (Paox), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006230524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polyamine oxidase (exo-N4-amino) (Paox), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219493099:219518141:1 gene:ENSRNOG00000018838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219509428:219519059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
ENSRNOT00000025574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219521209:219533905:1 gene:ENSRNOG00000018860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ212842 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YB05 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219521227:219533579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT002690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT002687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT002688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT002691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_173334 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 287 (Olr287), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219566173:219567108:1 gene:ENSRNOG00000018956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M64378 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219563750:219567108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001106312 // RefSeq // Rattus norvegicus CD163 molecule-like 1 (Cd163l1), mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000049269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219609867:219620922:1 gene:ENSRNOG00000018978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000056751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219610165:219630571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
XM_002725728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein LOC619207-like (LOC680907), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_002728818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein LOC619207-like (LOC680907), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025680 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:219628311:219723659:1 gene:ENSRNOG00000036647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000054880 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:219628311:219723659:1 gene:ENSRNOG00000036647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219717505:219723659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000056751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219610165:219630571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001000767 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 289 (Olr289), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000046290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219748607:219749536:1 gene:ENSRNOG00000031903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000027755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219737038:219749536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT002695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000232 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 292 (Olr292), mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000041858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219917108:219918025:-1 gene:ENSRNOG00000030817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000027774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219917108:219917974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000027775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219814320:219814955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT006713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0
NM_001000237 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 300 (Olr300), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219964819:219965742:1 gene:ENSRNOG00000033032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219964849:219965742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000238 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 302 (Olr302), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:219995479:219996411:1 gene:ENSRNOG00000045957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:219995587:219996411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001039 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 304 (Olr304), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220055034:220055966:1 gene:ENSRNOG00000049502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220055034:220055966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000240 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 305 (Olr305), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220091536:220092534:1 gene:ENSRNOG00000047875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220078296:220092534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000766 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 306 (Olr306), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000044878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220116945:220117877:1 gene:ENSRNOG00000047643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000027757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220116945:220117877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001000241 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 307 (Olr307), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176504648:176505580:1 gene:ENSRNOG00000045983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176504648:176505580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000955 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 308 (Olr308), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220181281:220182213:1 gene:ENSRNOG00000050992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220181281:220182213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000242 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 309 (Olr309), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220229219:220230151:1 gene:ENSRNOG00000047518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220229219:220230151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000765 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 310 (Olr310), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220242237:220243169:1 gene:ENSRNOG00000045726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220242237:220243169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000555 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 311 (Olr311), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000041052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220269158:220270090:1 gene:ENSRNOG00000050359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000042781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220269155:220299606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001000764 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 312 (Olr312), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220298671:220299606:1 gene:ENSRNOG00000050629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220269155:220299606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001040 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 313 (Olr313), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220321115:220322050:1 gene:ENSRNOG00000029226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220321058:220322050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000243 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 315 (Olr315), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220345992:220346924:1 gene:ENSRNOG00000045841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000042793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220345989:220346924:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT002707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001134507 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to transthyretin (4L369) (RGD1309350), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220502568:220505787:1 gene:ENSRNOG00000012744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071925 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:220472620:220475780:1 gene:ENSRNOG00000048275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220465722:220475780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000042779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220495493:220505551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000040274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220508795:220512296:1 gene:ENSRNOG00000033991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383675 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00020 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107561 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 1C, member 1 (Scgb1c1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220520589:220521808:1 gene:ENSRNOG00000012847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220520619:220525803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001108924 // RefSeq // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 3 (Odf3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220522827:220526034:1 gene:ENSRNOG00000012858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081921 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7112676. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220520619:220525803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001100520 // RefSeq // Rattus norvegicus RIC8 guanine nucleotide exchange factor A (Ric8a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220531948:220538535:1 gene:ENSRNOG00000013256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC160852 // GenBank // Rattus norvegicus resistance to inhibitors of cholinesterase 8 homolog A (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:187601 IMAGE:8364542), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ223245 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YK16 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220532179:220537818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT002716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001108925 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 13 (Psmd13), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220561620:220574027:1 gene:ENSRNOG00000014109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC158732 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 13, mRNA (cDNA clone MGC:187891 IMAGE:9092746), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ226487 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YA10 mRNA sequence. // chr1 // 73 // 93 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220563953:220573673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT002719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT002720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_134375 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 6 (Nlrp6), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 6 (Nlrp6), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006230585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6-like (LOC100912017), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220611580:220617711:1 gene:ENSRNOG00000014685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050551 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:220602488:220608414:1 gene:ENSRNOG00000045677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// DQ631800 // GenBank // Rattus norvegicus dual angiotensin II/vasopressin receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// M85183 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensin/vasopressin receptor (AII/AVP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000042769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220602517:220663602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0
XM_006223561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATH1, acid trehalase-like 1 (yeast) (Athl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATH1, acid trehalase-like 1 (yeast) (Athl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020004 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:220658976:220663578:1 gene:ENSRNOG00000014783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054876 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:220658976:220663458:1 gene:ENSRNOG00000014783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000042769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220602517:220663602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT002724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT002725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT002726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT002727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001106314 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 1 (Ifitm1), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_006230530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 1 (Ifitm1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000005645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220687945:220689004:1 gene:ENSRNOG00000004273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// FQ221702 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YN21 mRNA sequence. // chr1 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000042778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220683855:220688824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT002729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001107562 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 4 (B4galnt4), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000033944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220789704:220800586:1 gene:ENSRNOG00000024760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000015566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220781881:220800313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT002732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT002734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// NONRATT002733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001106315 // RefSeq // Rattus norvegicus plakophilin 3 (Pkp3), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plakophilin 3 (Pkp3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220806128:220817136:1 gene:ENSRNOG00000015152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220803541:220816778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106316 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylserine synthase 2 (Ptdss2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006230532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylserine synthase 2 (Ptdss2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006230533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylserine synthase 2 (Ptdss2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221040330:221067014:1 gene:ENSRNOG00000015912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC166496 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylserine synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:188029 IMAGE:7111527), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT002739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000015547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221012638:221064640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT002740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001024902 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 56 (Lrrc56), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 56 (Lrrc56), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 56 (Lrrc56), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 56 (Lrrc56), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221100369:221114723:1 gene:ENSRNOG00000016697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097444 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 56, mRNA (cDNA clone MGC:114503 IMAGE:7456428), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221102780:221112286:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001106317 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 7 (Rassf7), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000023219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221121400:221123321:1 gene:ENSRNOG00000017109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC158743 // GenBank // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 7, mRNA (cDNA clone MGC:187922 IMAGE:9100666), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221121412:221166250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT002744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_139093 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD and ring finger domains 1 (Phrf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221147883:221166439:1 gene:ENSRNOG00000017299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221133586:221166439:1 gene:ENSRNOG00000017299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U49057 // GenBank // Rattus norvegicus CTD-binding SR-like protein rA9 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000015534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221121412:221166250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT002752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT002753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_012944 // RefSeq // Rattus norvegicus dopamine receptor D4 (Drd4), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006230521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopamine receptor D4 (Drd4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221195844:221199031:1 gene:ENSRNOG00000017927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M84009 // GenBank // Rat dopamine receptor D4 (RATD4) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221195974:221198909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT002754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_045202 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 80 (Tmem80), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_045203 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 80 (Tmem80), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC083751 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 80, mRNA (cDNA clone MGC:94683 IMAGE:7192578), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221234795:221243404:1 gene:ENSRNOG00000018061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT002756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221239964:221269803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT002757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_001108508 // RefSeq // Rattus norvegicus EPS8-like 2 (Eps8l2), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000024725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221245325:221270579:1 gene:ENSRNOG00000018336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// BC166805 // GenBank // Rattus norvegicus EPS8-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:188608 IMAGE:7939004), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000007368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221239964:221269803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT002760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT002762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT002764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT002761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1 /// NONRATT002763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_031811 // RefSeq // Rattus norvegicus transaldolase 1 (Taldo1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221292657:221303008:1 gene:ENSRNOG00000018367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF069306 // GenBank // Rattus norvegicus transaldolase mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// BC059126 // GenBank // Rattus norvegicus transaldolase 1, mRNA (cDNA clone MGC:72759 IMAGE:6889440), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ213939 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YL09 mRNA sequence. // chr1 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221292683:221302829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001108509 // RefSeq // Rattus norvegicus patatin-like phospholipase domain containing 2 (Pnpla2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221351750:221356832:1 gene:ENSRNOG00000018736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220915080:220919368:1 gene:ENSRNOG00000047551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221345638:221356157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220908849:220919368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_001013070 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 4 (Tspan4), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_003749019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin-4-like (LOC100911766), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006230545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 4 (Tspan4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000049448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221371202:221390853:1 gene:ENSRNOG00000029810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000075588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:220943455:220953637:1 gene:ENSRNOG00000049324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC091174 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 4, mRNA (cDNA clone MGC:108789 IMAGE:7321737), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000007327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221379959:221390426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:220943170:220953637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_031008 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 2, alpha 2 subunit (Ap2a2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000064254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:221451396:221523284:1 gene:ENSRNOG00000019534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC081786 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 2, alpha 2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93391 IMAGE:7126468), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000007360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221474139:221522956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT002769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT002770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT002772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 20 // 45 // 1 /// NONRATT002774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
XM_006230608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 5B, oligomeric mucus/gel-forming (Muc5b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000028967 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:221691900:221724124:1 gene:ENSRNOG00000019846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000073645 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:221694542:221724103:1 gene:ENSRNOG00000019846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000041226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221691900:221724124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0
XM_006223703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BR serine/threonine kinase 2 (Brsk2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006230609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BR serine/threonine kinase 2 (Brsk2), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027134 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:221840644:221860773:1 gene:ENSRNOG00000020021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000054868 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:221840644:221860773:1 gene:ENSRNOG00000020021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AM040976 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for brain serine/threonine kinase 2 (Brsk2 gene). // chr1 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:221827208:221860773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001109474 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685544 (LOC685544), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000027270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222355771:222356463:1 gene:ENSRNOG00000020131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_053325 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin VIII (Syt8), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222500771:222502969:1 gene:ENSRNOG00000020245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF375462 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 8 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AF375467 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 8 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222490196:222506922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT002786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_017185 // RefSeq // Rattus norvegicus troponin I type 2 (skeletal, fast) (Tnni2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222504403:222507025:1 gene:ENSRNOG00000020276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ218058 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA10YC19 mRNA sequence. // chr1 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// FQ224489 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA64YG07 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// M73701 // GenBank // R.norvegicus troponin I mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222490196:222506922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT002788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025420 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein 1 (Lsp1), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006230813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein 1 (Lsp1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein 1 (Lsp1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein 1 (Lsp1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein 1 (Lsp1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000054864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222524162:222557294:1 gene:ENSRNOG00000020300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC097966 // GenBank // Rattus norvegicus lymphocyte-specific protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116094 IMAGE:7388019), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// FQ233085 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YE05 mRNA sequence. // chr1 // 79 // 92 // 26 // 33 // 0 /// FQ233963 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YL03 mRNA sequence. // chr1 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000050574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222515569:222553358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT002791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT002793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_022529 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L23 (Mrpl23), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:222596334:222604103:1 gene:ENSRNOG00000020354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC059936 // GenBank HTC // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L23, mRNA (cDNA clone IMAGE:6921867). // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U62635 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L23-related product homolog (rL23MRP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:222563521:222633504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000036132 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:223053506:223067726:1 gene:ENSRNOG00000026039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047533 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:223053506:223067726:1 gene:ENSRNOG00000026039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000048730 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:223053506:223066998:1 gene:ENSRNOG00000026039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000054863 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:223053445:223066998:1 gene:ENSRNOG00000026039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC158837 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7386583. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC105909 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7388379. // chr1 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT002810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// NONRATT002813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000028388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223037315:223118058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT002814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_013087 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd81 molecule (Cd81), mRNA. // chr1 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223099329:223115089:1 gene:ENSRNOG00000020451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC060583 // GenBank // Rattus norvegicus Cd81 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:72925 IMAGE:6918296), complete cds. // chr1 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// FQ214006 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YF11 mRNA sequence. // chr1 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// FQ218562 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YF10 mRNA sequence. // chr1 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0 /// FQ232886 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YB09 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// U19894 // GenBank // Rattus norvegicus target of the antiproliferative antibody mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// FQ215739 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YO03 mRNA sequence. // chr1 // 63 // 100 // 19 // 30 // 0 /// NONRATT002817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223037315:223118058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT002821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT002818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001013194 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor suppressing subtransferable candidate 4 (Tssc4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor suppressing subtransferable candidate 4 (Tssc4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223116610:223118239:1 gene:ENSRNOG00000032677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083775 // GenBank // Rattus norvegicus tumor suppressing subtransferable candidate 4, mRNA (cDNA clone MGC:94728 IMAGE:7193466), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223037315:223118058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT002823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT002824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_032073 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 1 (Kcnq1), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223154713:223490460:1 gene:ENSRNOG00000020532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000025055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223194059:223327021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000025054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223360408:223489520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT002827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001004260 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22, member 18 (Slc22a18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223537696:223560895:1 gene:ENSRNOG00000020562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079159 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 22, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:94186 IMAGE:7129231), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ228759 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YB09 mRNA sequence. // chr1 // 86 // 91 // 25 // 29 // 0 /// FQ231035 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YI17 mRNA sequence. // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223525032:223560843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT002832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT002834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT002836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_022389 // RefSeq // Rattus norvegicus 7-dehydrocholesterol reductase (Dhcr7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:223874935:223890913:1 gene:ENSRNOG00000020776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB016800 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 7-dehydrocholesterol reductase, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF071500 // GenBank // Rattus norvegicus 7-dehydrocholesterol reductase (DHCR7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF272393 // GenBank // Rattus norvegicus 7-dehydrocholesterol reductase (Dhcr7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081688 // GenBank // Rattus norvegicus 7-dehydrocholesterol reductase, mRNA (cDNA clone MGC:93039 IMAGE:7109221), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223879447:223890039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006223582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin, aortic smooth muscle-like (LOC683498), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin-like (LOC102552318), mRNA. // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:223895528:224014951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001177828 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRG00136-like (LOC100364769), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000042579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224556182:224592483:1 gene:ENSRNOG00000029588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_130817 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 3 (Fgf3), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224872403:224876327:1 gene:ENSRNOG00000020888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AB079262 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FGF3, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224777967:224876327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_053809 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 4 (Fgf4), mRNA. // chr1 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224895196:224896606:1 gene:ENSRNOG00000020890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 96 // 22 // 27 // 0 /// AB079673 // GenBank // Rattus norvegicus FGF4 mRNA for fibroblast growth factor, complete cds. // chr1 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224895196:224920312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT002847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_130753 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 19 (Fgf19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224927791:224931079:1 gene:ENSRNOG00000020899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB078900 // GenBank // Rattus norvegicus FGF15 mRNA for fibroblast growth factor 15, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224927791:224931079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107565 // RefSeq // Rattus norvegicus oral cancer overexpressed 1 (Oraov1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:224945387:224952084:1 gene:ENSRNOG00000020903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:224937814:224952601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_153722 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member F (Mrgprf), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS-related GPR, member F (Mrgprf), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225337863:225344007:1 gene:ENSRNOG00000013426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// M35297 // GenBank // Rat pot. G protein coupled receptor (RTA) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001506 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member D (Mrgprd), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225355623:225356582:1 gene:ENSRNOG00000013448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB154411 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for G protein-coupled receptor TGR7, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225355677:225356582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107567 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L21 (Mrpl21), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L21 (Mrpl21), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225399844:225408322:1 gene:ENSRNOG00000013845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225404018:225412795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_031559 // RefSeq // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase 1a, liver (Cpt1a), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000019652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225437255:225497583:1 gene:ENSRNOG00000014254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC072522 // GenBank // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase 1a, liver, mRNA (cDNA clone MGC:91635 IMAGE:7105825), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// L07736 // GenBank // Rat carnitine palmitoyltransferase I mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// U88294 // GenBank // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase I (CPTI) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT002857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000015894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225450053:225518381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 34 // 41 // 1
NM_001012069 // RefSeq // Rattus norvegicus metallothionein-like 5, testis-specific (tesmin) (Mtl5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225500671:225518960:1 gene:ENSRNOG00000014671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC083920 // GenBank // Rattus norvegicus metallothionein-like 5, testis-specific (tesmin), mRNA (cDNA clone MGC:95317 IMAGE:7135090), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225450053:225518381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1
ENSRNOT00000034240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225819324:225828032:1 gene:ENSRNOG00000025245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098053 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1810055G02, mRNA (cDNA clone MGC:116211 IMAGE:7457583), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT002861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225800241:225827752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001108512 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of variegation 4-20 homolog 1 (Drosophila) (Suv420h1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225874424:225923708:1 gene:ENSRNOG00000016790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225892199:225920960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT002862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_017127 // RefSeq // Rattus norvegicus choline kinase alpha (Chka), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006230709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus choline kinase alpha (Chka), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225950376:225998825:1 gene:ENSRNOG00000016791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:225950376:225998825:1 gene:ENSRNOG00000016791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC081821 // GenBank // Rattus norvegicus choline kinase alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93538 IMAGE:7109261), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// D10262 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for choline kinase R1, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000009952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:225942001:225998019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT002867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1
NM_001108513 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-93 homolog B1 (C. elegans) (Unc93b1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000024018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226043713:226054651:1 gene:ENSRNOG00000017703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC088464 // GenBank // Rattus norvegicus unc-93 homolog B1 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:7127866). // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226043776:226054273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT002869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT002871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// NONRATT002873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT002872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_006230919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase family 3 member B1-like (LOC688778), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000024034 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:226064194:226077304:1 gene:ENSRNOG00000017872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000010001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226067436:226124281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT002877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
XM_006223594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase family 3 member B1-like (LOC688778), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// XM_006230968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 3 family, member B2 (Aldh3b2), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000024064 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:226069627:226088209:1 gene:ENSRNOG00000017872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT002877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000010001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226067436:226124281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001009603 // RefSeq // Rattus norvegicus aspartoacylase (aminocyclase) 3 (Acy3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartoacylase (aminocyclase) 3 (Acy3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226104425:226107749:1 gene:ENSRNOG00000017901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088190 // GenBank // Rattus norvegicus aspartoacylase (aminocyclase) 3, mRNA (cDNA clone MGC:108859 IMAGE:7371632), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226067436:226124281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT002882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
XM_003749030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 10 (Tbx10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003753373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 10 (Tbx10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006223596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 10 (Tbx10), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006230920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 10 (Tbx10), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024129 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:226114098:226116913:1 gene:ENSRNOG00000017944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226067436:226124281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
XM_003753374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 8 (Nudt8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_341975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 8 (Nudt8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226118370:226119800:1 gene:ENSRNOG00000017955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ217198 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA32YI21 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226067436:226124281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001011937 // RefSeq // Rattus norvegicus double C2-like domains, gamma (Doc2g), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226120916:226124439:1 gene:ENSRNOG00000018029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC083779 // GenBank // Rattus norvegicus double C2, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:94744 IMAGE:7193879), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226067436:226124281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT002885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT002886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001109498 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 2 associated protein 2 (Cdk2ap2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 2 associated protein 2 (Cdk2ap2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006230903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 2 associated protein 2 (Cdk2ap2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000025018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226216692:226218360:1 gene:ENSRNOG00000018391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234216 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YM04 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000013195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226200977:226232501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT002891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001008369 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, membrane-associated 1 (Pitpnm1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000025084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226219372:226232745:1 gene:ENSRNOG00000018553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC085945 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, membrane-associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:95131 IMAGE:7128360), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000013195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226200977:226232501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT002892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001078647 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 134 (Tmem134), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NM_001078648 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 134 (Tmem134), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006230836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 134 (Tmem134), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226244711:226250208:1 gene:ENSRNOG00000022153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000030340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226244711:226250208:1 gene:ENSRNOG00000022153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006230835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 134 (Tmem134), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// GENSCAN00000013211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226244753:226249929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// NONRATT002897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
XM_001068698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 152 (Gpr152), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000054852 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:226261372:226262931:1 gene:ENSRNOG00000021912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226261372:226273585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_019222 // RefSeq // Rattus norvegicus coronin, actin-binding protein, 1B (Coro1b), mRNA. // chr1 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// BC061558 // GenBank // Rattus norvegicus coronin, actin-binding protein, 1B, mRNA (cDNA clone MGC:72860 IMAGE:6919414), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ214310 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YH09 mRNA sequence. // chr1 // 80 // 76 // 20 // 25 // 0 /// XM_006230773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coronin, actin-binding protein, 1B (Coro1b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000029829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226268590:226273903:1 gene:ENSRNOG00000021828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// NONRATT002902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT002903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226261372:226273585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1
NM_001024289 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, C-associated protein (Ptprcap), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226274621:226276779:1 gene:ENSRNOG00000021724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088279 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, C-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:109135 IMAGE:7382668), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232242 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YI09 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226274779:226276578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT002905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031527 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isozyme (Ppp1ca), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226310595:226314221:1 gene:ENSRNOG00000018708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC070517 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:91638 IMAGE:7104674), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D00859 // GenBank // Rattus norvegicus PP-1 alpha mRNA for protein phosphatase type 1 alpha catalytic subunit, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D90163 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for catalytic subunit of protein phosphatase 1, complete cds, clone:PP-1 alpha. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ232496 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YI07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ234898 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YE01 mRNA sequence. // chr1 // 70 // 96 // 19 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226310672:226313890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_207615 // RefSeq // Rattus norvegicus cardiotrophin-like cytokine factor 1 (Clcf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226338540:226342117:1 gene:ENSRNOG00000018752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY365006 // GenBank // Rattus norvegicus cardiotrophin-like cytokine mRNA, complete cds. // chr1 // 79 // 54 // 11 // 14 // 0 /// BC098643 // GenBank // Rattus norvegicus cardiotrophin-like cytokine factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:112574 IMAGE:7123848), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226328649:226341187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT002907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT002908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001013195 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta 4, accessory subunit (Pold4), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006230841 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta 4, accessory subunit (Pold4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000025507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226351249:226352915:1 gene:ENSRNOG00000018765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062014 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta 4, mRNA (cDNA clone MGC:72637 IMAGE:5621348), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT002909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226351372:226373764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT002910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
FQ226910 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA17YP10 mRNA sequence. // chr1 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// FQ222240 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA26YJ09 mRNA sequence. // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// FQ226144 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA35YK05 mRNA sequence. // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// FQ226888 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA19YO14 mRNA sequence. // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// FQ228271 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA103YC23 mRNA sequence. // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT003223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT003224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT003226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
NM_012744 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate carboxylase (Pc), mRNA. // chr1 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000026316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226626841:226726328:1 gene:ENSRNOG00000019372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC085680 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate carboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:93035 IMAGE:7109369), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// U32314 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate carboxylase mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// U36585 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate carboxylase mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// GENSCAN00000029711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226684115:226715552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226721943:226725960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT002917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT002919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_019167 // RefSeq // Rattus norvegicus spectrin, beta, non-erythrocytic 2 (Sptbn2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000026573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226828798:226869726:1 gene:ENSRNOG00000019564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB001347 // GenBank // Rattus norvegicus Spnb-3 mRNA for brain beta 3 spectrin, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB008551 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for beta-spectrin III, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AF225960 // GenBank // Rattus norvegicus spectrin-like protein GTRAP41 mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 95 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226836087:226869105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT002920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001007014 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 4B (Rbm4b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006230874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 4B (Rbm4b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000026605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226874271:226884602:1 gene:ENSRNOG00000019650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY303541 // GenBank // Rattus norvegicus zinc responsive protein ZD7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// BC086416 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 4B, mRNA (cDNA clone MGC:105881 IMAGE:7130401), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// NONRATT002929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_001109527 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 87 (Ccdc87), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227027475:227030165:1 gene:ENSRNOG00000025247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:226961925:226964492:1 gene:ENSRNOG00000050596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166526 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 87, mRNA (cDNA clone MGC:188119 IMAGE:7135699), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227027519:227030086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226961925:226964492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034110 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin F (Ctsf), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227045196:227050974:1 gene:ENSRNOG00000019708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC099780 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin F, mRNA (cDNA clone MGC:124702 IMAGE:7933625), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// EU253481 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin F mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227045257:227050531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT002930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001039100 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 24 (Zdhhc24), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227068278:227074385:1 gene:ENSRNOG00000019825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY886540 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC25 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227068298:227073700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT002932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001006973 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L11 (mrpl11), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// XM_006230739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L11 (mrpl11), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227174538:227177359:1 gene:ENSRNOG00000019970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC083740 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L11, mRNA (cDNA clone MGC:94654 IMAGE:7191782), complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// FQ225172 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YO08 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227170080:227177207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT002936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_031738 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 2 (Slc29a2), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// XM_006230900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 2 (Slc29a2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006230933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus equilibrative nucleoside transporter 2-like (LOC100911721), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227331878:227338362:1 gene:ENSRNOG00000020025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000071891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227238417:227244908:1 gene:ENSRNOG00000050201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// AF015305 // GenBank // Rattus norvegicus equilbrative nitrobenzylthioinosine-insensitive nucleoside transporter mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000054536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227201152:227270972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227331544:227364136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001106324 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 1 (B3gnt1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227347041:227349263:1 gene:ENSRNOG00000020110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074972 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:227253963:227255453:1 gene:ENSRNOG00000046904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000054536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227201152:227270972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227331544:227364136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001009605 // RefSeq // Rattus norvegicus breast cancer metastasis-suppressor 1 (Brms1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_003749038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog (LOC100911841), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227256375:227265638:1 gene:ENSRNOG00000020117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227354449:227358802:1 gene:ENSRNOG00000047683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC088469 // GenBank // Rattus norvegicus breast cancer metastasis-suppressor 1, mRNA (cDNA clone MGC:95128 IMAGE:7128111), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227201152:227270972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// GENSCAN00000054542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227331544:227364136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_139038 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras and Rab interactor 1 (Rin1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227359504:227364152:1 gene:ENSRNOG00000020133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072261 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:227266476:227270972:1 gene:ENSRNOG00000050223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U80076 // GenBank // Rattus norvegicus RIN1 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227201152:227270972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227331544:227364136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_001106325 // RefSeq // Rattus norvegicus CD248 molecule, endosialin (Cd248), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227377520:227380084:1 gene:ENSRNOG00000020197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074361 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:227293087:227295381:1 gene:ENSRNOG00000050278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074640 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:227284379:227286673:1 gene:ENSRNOG00000047071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227377568:227379862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227284379:227286673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227293087:227295381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_172017 // RefSeq // Rattus norvegicus Yip1 interacting factor homolog A (S. cerevisiae) (Yif1a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227401143:227405550:1 gene:ENSRNOG00000020201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158578 // GenBank // Rattus norvegicus Yip1 interacting factor homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187324 IMAGE:7387164), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U96490 // GenBank // Rattus norvegicus liver mRNA, complete cds. // chr1 // 77 // 96 // 20 // 26 // 0 /// FQ214813 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YO06 mRNA sequence. // chr1 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227401133:227405128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000054545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227540855:227542456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000027660 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:227541602:227542456:1 gene:ENSRNOG00000020409 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 61 // 95 // 11 // 18 // 0
NM_001024290 // RefSeq // Rattus norvegicus galactose-3-O-sulfotransferase 3 (Gal3st3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000039842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227598280:227608036:1 gene:ENSRNOG00000028743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC094516 // GenBank // Rattus norvegicus galactose-3-O-sulfotransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:105600 IMAGE:7314624), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227602201:227607412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT002942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_001070492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel, sperm associated 1 (Catsper1), mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// XM_002725770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel, sperm associated 1 (Catsper1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000054537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227644904:227652932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0
NM_001008305 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1A domain containing (Eif1ad), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227675718:227680195:1 gene:ENSRNOG00000020463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC085818 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1A domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:94083 IMAGE:7124507), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227677395:227679506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT002944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001024233 // RefSeq // Rattus norvegicus basophilic leukemia expressed protein BLES03 (Bles03), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001243534 // RefSeq // Rattus norvegicus basophilic leukemia expressed protein BLES03 (Bles03), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227735894:227738143:1 gene:ENSRNOG00000020551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC093387 // GenBank // Rattus norvegicus basophilic leukemia expressed protein BLES03, mRNA (cDNA clone MGC:112683 IMAGE:7389419), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227736782:227737537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012953 // RefSeq // Rattus norvegicus fos-like antigen 1 (Fosl1), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227755887:227764393:1 gene:ENSRNOG00000020552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097342 // GenBank // Rattus norvegicus fos-like antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:114353 IMAGE:7459558), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M19651 // GenBank // Rat fos-related antigen (Fra-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC060582 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6917894, partial cds. // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227756111:227763782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT002951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017147 // RefSeq // Rattus norvegicus cofilin 1, non-muscle (Cfl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000015962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227799060:227802655:1 gene:ENSRNOG00000020660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC059143 // GenBank // Rattus norvegicus cofilin 1, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:72892 IMAGE:6889053), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC086533 // GenBank // Rattus norvegicus cofilin 1, non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:105258 IMAGE:7305422), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ214504 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YF02 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// FQ229602 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YF22 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227799203:227802131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT002962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0