NM_001108062 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 13B (Ppp1r13b), mRNA. // chr6 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145405635:145444597:-1 gene:ENSRNOG00000012653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145406135:145470311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT048773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XR_347572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 6.8 kDa mitochondrial proteolipid-like (LOC100912557), ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_355163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 6.8 kDa mitochondrial proteolipid-like (LOC100912557), ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:190738267:190738449:-1 gene:ENSRNOG00000032130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142179893:142180455:1 gene:ENSRNOG00000031802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:145534566:145536613:-1 gene:ENSRNOG00000043144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211017 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YO06 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224630 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA5YJ08 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145530783:145569821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001126280 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 179 (Tmem179), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146081901:146092800:-1 gene:ENSRNOG00000013128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146072082:146092689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_033230 // RefSeq // Rattus norvegicus v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 1 (Akt1), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146226687:146243773:-1 gene:ENSRNOG00000028629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D30040 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RAC protein kinase alpha, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146215883:146243735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT048781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_001072924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AHNAK nucleoprotein 2 (Ahnak2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AHNAK nucleoprotein 2 (Ahnak2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039631 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:146342143:146344449:-1 gene:ENSRNOG00000028545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146342143:146386858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT048785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0
XM_001072924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AHNAK nucleoprotein 2 (Ahnak2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AHNAK nucleoprotein 2 (Ahnak2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051326 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:146362358:146366019:-1 gene:ENSRNOG00000037559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146342143:146386858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037214 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle associated 4 (Cdca4), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC107668 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle associated 4, mRNA (cDNA clone MGC:124732 IMAGE:7937865), complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT048787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001170595 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 132 (Gpr132), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 132 (Gpr132), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 132 (Gpr132), transcript variant X2, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 132 (Gpr132), transcript variant X3, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146648352:146660012:-1 gene:ENSRNOG00000013914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146649478:146667228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
ENSRNOT00000046555 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:146688526:146691079:-1 gene:ENSRNOG00000028398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146688445:146689173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000019213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146708461:146729480:-1 gene:ENSRNOG00000013927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U70050 // GenBank // Rattus norvegicus jagged2 precursor, mRNA, partial cds. // chr6 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146708461:146741253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT048791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001106760 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 14 (Nudt14), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146734337:146741325:-1 gene:ENSRNOG00000014362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146708461:146741253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001106761 // RefSeq // Rattus norvegicus BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor 90 subunit (Brf1), mRNA. // chr6 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// XM_006240656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor 90 subunit (Brf1), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:146761304:146804485:-1 gene:ENSRNOG00000014595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// XM_006240659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor 90 subunit (Brf1), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// GENSCAN00000005033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:146761579:146778540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT048795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT048796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT048797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
ENSRNOT00000006912 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:6:147059437:147241846:-1 gene:ENSRNOG00000005328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J00744 // GenBank // rat ig epsilon heavy chain, complete coding region and 3 ut, mrna. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:147047314:147087179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT048803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
J00741 // GenBank // rat ig delta heavy chain constant region and 3 ut, mrna. // chr6 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// FQ219694 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YK03 mRNA sequence. // chr6 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000023324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:147183271:147390338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT048809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT048810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NONRATT048811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000074892 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:149084768:149085300:-1 gene:ENSRNOG00000046574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 83 // 67 // 5 // 6 // 0 /// GENSCAN00000019791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149084752:149094451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// FQ218314 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA5YJ12 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT048829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
ENSRNOT00000071839 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:149229361:149229690:-1 gene:ENSRNOG00000046988 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 53 // 60 // 8 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149229367:149229973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 60 // 8 // 15 // 0
ENSRNOT00000073325 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:149381236:149382492:-1 gene:ENSRNOG00000048745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0
ENSRNOT00000072338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:149541859:149542287:-1 gene:ENSRNOG00000050859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 53 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149541766:149542287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC088254 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain 1a (serum IgG2a), mRNA (cDNA clone IMAGE:7374685). // chr6 // 92 // 76 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT048833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
BC095846 // GenBank // Rattus norvegicus Immunoglobulin heavy chain (gamma polypeptide), mRNA (cDNA clone MGC:112743 IMAGE:7388075), complete cds. // chr6 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000056156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149611727:149612485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 43 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT048834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149619958:149685421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 67 // 57 // 8 // 12 // 0
XM_006225909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691828 (LOC691828), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006240680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691828 (LOC691828), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:149849911:149850207:-1 gene:ENSRNOG00000048425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149849845:149851197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000043144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149906565:150033681:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000070901 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:149898640:149907059:-1 gene:ENSRNOG00000045938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 58 // 100 // 7 // 12 // 0
ENSRNOT00000073446 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:150032752:150033203:-1 gene:ENSRNOG00000048159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000043144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:149906565:150033681:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0
X78894 // GenBank // R.norvegicus mRNA MEC4 for Ig mu-chain. // chr6 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0
BC092582 // GenBank // Rattus norvegicus similar to single chain Fv antibody fragment scFv 7-10A, mRNA (cDNA clone IMAGE:7373926). // chr6 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000042900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:150113474:150113904:-1 gene:ENSRNOG00000030812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT048836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
BC098733 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin G heavy chain, mRNA (cDNA clone IMAGE:7385053). // chr6 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000064361 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:150164148:150165648:-1 gene:ENSRNOG00000033376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000043157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:150165319:150389908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT048837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0
BC092580 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain 6, mRNA (cDNA clone MGC:108850 IMAGE:7368318), complete cds. // chr6 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
BC092592 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain, alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:7375116). // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000008333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:150257521:150257952:-1 gene:ENSRNOG00000006333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT048840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
BC091243 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain, alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365194). // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:150287403:150287874:-1 gene:ENSRNOG00000032671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:150165319:150389908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000043157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:150165319:150389908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000008648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:150431075:150431589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 93 // 70 // 13 // 14 // 0
GENSCAN00000008643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:150445311:150454217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 50 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000047026 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:150535737:150536182:-1 gene:ENSRNOG00000049458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:150535728:150539075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000045320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:151135246:151135677:-1 gene:ENSRNOG00000029121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:150912835:151164210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000051475 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:151208427:151208723:-1 gene:ENSRNOG00000049525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000055699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:151167955:151219727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
NONRATT048846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000008640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:150774798:150791871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
BC091272 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-2a immunoglobulin heavy chain, mRNA (cDNA clone MGC:109134 IMAGE:7382505), complete cds. // chr6 // 69 // 87 // 9 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000048908 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:151592152:151592586:-1 gene:ENSRNOG00000050143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// BC107452 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain 1a (serum IgG2a), mRNA (cDNA clone IMAGE:7380394). // chr6 // 77 // 87 // 10 // 13 // 0 /// NONRATT048850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000021342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:151575202:151592586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
ENSRNOT00000074706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:151749035:151749468:-1 gene:ENSRNOG00000047290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:151749011:151760576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
BC160870 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain, alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:7364733). // chrUn // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:151838651:151839084:-1 gene:ENSRNOG00000050561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT048851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:151797092:151839084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSRNOT00000075707 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:151861849:151862142:-1 gene:ENSRNOG00000050708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000021331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:151861825:151882433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT048852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
ENSRNOT00000044381 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:151951366:151951849:-1 gene:ENSRNOG00000029776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:151929177:151951989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0
ENSRNOT00000056771 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:151995185:151995622:-1 gene:ENSRNOG00000037495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:151981917:151995622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
ENSRNOT00000074930 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:152087320:152087753:-1 gene:ENSRNOG00000048384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
BC092586 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain 6, mRNA (cDNA clone MGC:109030 IMAGE:7366480), complete cds. // chr6 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AY158661 // GenBank // Rattus norvegicus BWK3 mRNA, complete cds. // chr6 // 48 // 100 // 15 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000071409 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:152151164:152152094:-1 gene:ENSRNOG00000050830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 82 // 55 // 14 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074377 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:152151167:152151793:-1 gene:ENSRNOG00000050830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 52 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152151155:152151364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT048856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152532561:152533010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 39 // 100 // 12 // 31 // 0 /// BC098797 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain 1a (serum IgG2a), mRNA (cDNA clone IMAGE:7375856). // chr6 // 44 // 81 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152605375:152617768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:151929177:151951989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
ENSRNOT00000046694 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:152710277:152710585:-1 gene:ENSRNOG00000047011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000002307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152710259:152781399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
BC089851 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin heavy chain, alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377401). // chr6 // 25 // 88 // 9 // 36 // 0 /// BC091257 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-2a immunoglobulin heavy chain, mRNA (cDNA clone MGC:109083 IMAGE:7375893), complete cds. // chr6 // 49 // 95 // 19 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000070923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:152021834:152022285:-1 gene:ENSRNOG00000049315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152021828:152022285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT048853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT048854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000074930 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:152087320:152087753:-1 gene:ENSRNOG00000048384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 38 // 83 // 13 // 34 // 0 /// NONRATT048856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 100 // 12 // 41 // 0 /// GENSCAN00000002308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152481028:152520058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 24 // 83 // 8 // 34 // 0
AY158661 // GenBank // Rattus norvegicus BWK3 mRNA, complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000051410 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:152644243:152644676:-1 gene:ENSRNOG00000046401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000031325 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:152830335:152830645:-1 gene:ENSRNOG00000026992 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:152824573:152830547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001191773 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 60 (Wdr60), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006240691 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 60 (Wdr60), transcript variant X4, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006240692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 60 (Wdr60), transcript variant X5, mRNA. // chr6 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XR_355180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 60 (Wdr60), transcript variant X7, misc_RNA. // chr6 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000006144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:153007323:153061842:-1 gene:ENSRNOG00000004520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000001616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:153023572:153062956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1
NONRATT041953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT041954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
ENSRNOT00000007233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:154698899:154906395:-1 gene:ENSRNOG00000005451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 98 // 63 // 49 // 50 // 0 /// GENSCAN00000032644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:154906120:155012178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 29 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:154698899:154802523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 32 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:154826381:154875630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 18 // 18 // 14 // 79 // 1
NM_012761 // RefSeq // Rattus norvegicus Sp4 transcription factor (Sp4), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:155047728:155108173:-1 gene:ENSRNOG00000005472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U07610 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley zinc finger protein (HF-1b) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:155048722:155110011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000026619 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:155633494:155634535:-1 gene:ENSRNOG00000022489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 81 // 95 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:155633428:155658419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
XM_006225905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 5 (Abcb5), mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 5 (Abcb5), mRNA. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050893 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:155714115:155809554:-1 gene:ENSRNOG00000006398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:155734967:155768787:-1 gene:ENSRNOG00000006398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:155714115:155816746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001108726 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, beta 8 (Itgb8), mRNA. // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000066545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:156003756:156082274:-1 gene:ENSRNOG00000006569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:155954361:156046845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001192017 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family, cytosolic, 6B, member 1 (Sult6b1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1458526:1484401:-1 gene:ENSRNOG00000049335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1421455:1484401:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001004442 // RefSeq // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 6 (Pdia6), mRNA. // chr6 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000074829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:52289504:52306885:1 gene:ENSRNOG00000050197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC082063 // GenBank // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:95222 IMAGE:7132589), complete cds. // chr6 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000021705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:52289522:52306524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_017210 // RefSeq // Rattus norvegicus deiodinase, iodothyronine, type III (Dio3), mRNA. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U24282 // GenBank // Rattus norvegicus type III iodothyronine deiodinase (dioIII) mRNA, complete cds. // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:143683071:143767439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_017359 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB10, member RAS oncogene family (Rab10), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37479074:37531801:-1 gene:ENSRNOG00000047088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085744 // GenBank // Rattus norvegicus RAB10, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:93509 IMAGE:7191921), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070518 // GenBank HTC // Rattus norvegicus RAB10, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:7104085), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr6 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// M83677 // GenBank // Sprague-Dawley (clone LRB3) RAB10 mRNA, complete cds. // chr6 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37481136:37531574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001191874 // RefSeq // Rattus norvegicus GRB2 associated, regulator of MAPK1-like (Gareml), mRNA. // chr6 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:37442035:37453747:-1 gene:ENSRNOG00000048004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:37441321:37453747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0
XR_347551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546650 (LOC102546650), transcript variant X2, ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_355145 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546650 (LOC102546650), transcript variant X2, ncRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013047 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin 1 (Mtm1), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000062057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:28722724:28736837:1 gene:ENSRNOG00000002516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079400 // GenBank // Rattus norvegicus X-linked myotubular myopathy gene 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7112710), partial cds. // chr6 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC091225 // GenBank // Rattus norvegicus X-linked myotubular myopathy gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:108964 IMAGE:7129875), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ224358 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA69YG23 mRNA sequence. // chr6 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:28718147:28931735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// NONRATT046310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001191909 // RefSeq // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 8 (E. coli) (Alkbh8), mRNA. // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000003432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:28777894:28847493:1 gene:ENSRNOG00000024525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:28718147:28931735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT046312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT046313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001135003 // RefSeq // Rattus norvegicus CWF19-like 2, cell cycle control (S. pombe) (Cwf19l2), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000030803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:28868716:28935276:1 gene:ENSRNOG00000024372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:28718147:28931735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT046315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT046316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
XM_006232467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin-like protein 4A-like (LOC102552799), mRNA. // chrU // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// XM_006227179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin-like protein 4A-like (LOC687851), mRNA. // chrU // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// XM_002729019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin-like 4 (LOC100363110), mRNA. // chrU // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// XM_006224085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin-like 4 (LOC100363110), mRNA. // chrU // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// GENSCAN00000036290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:10635869:10636826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// GENSCAN00000045606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:176456960:176457917:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000073320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:175719791:175725648:1 gene:ENSRNOG00000049886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000008717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:40228804:40229769:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000014125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:175724111:175724930:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000014135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:175719888:175720707:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000018563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:110335326:110336499:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// NONRATT010467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001008768 // RefSeq // Rattus norvegicus primase, DNA, polypeptide 1 (Prim1), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000065593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2416149:2430936:1 gene:ENSRNOG00000031993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// BC088272 // GenBank // Rattus norvegicus DNA primase, p49 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:109113 IMAGE:7379940), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT048879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT048881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2413510:2490191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NONRATT048880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// NONRATT048883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// NONRATT048884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_001105939 // RefSeq // Rattus norvegicus nascent polypeptide-associated complex alpha subunit (Naca), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NM_001198562 // RefSeq // Rattus norvegicus nascent polypeptide-associated complex alpha subunit (Naca), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NM_001198580 // RefSeq // Rattus norvegicus nascent polypeptide-associated complex alpha subunit (Naca), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2438021:2450436:1 gene:ENSRNOG00000002632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2438021:2450436:1 gene:ENSRNOG00000002632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC166934 // GenBank // Rattus norvegicus nascent-polypeptide-associated complex alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:188929 IMAGE:6922001), complete cds. // chr7 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// FQ221213 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA39YD20 mRNA sequence. // chr7 // 75 // 55 // 12 // 16 // 0 /// FQ225664 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YE07 mRNA sequence. // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2413510:2490191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_001130989 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin E synthase 3 (cytosolic) (Ptges3), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000003787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2459082:2476400:1 gene:ENSRNOG00000002642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// BC166579 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin E synthase 3 (cytosolic), mRNA (cDNA clone MGC:188278 IMAGE:7379926), complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2413510:2490191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_134364 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, beta polypeptide (Atp5b), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2484095:2490338:1 gene:ENSRNOG00000002840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC099743 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:124522 IMAGE:7937989), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// FQ223600 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA91YP03 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M19044 // GenBank // Rat mitochondrial ATP synthase beta subunit mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2413510:2490191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT048897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NONRATT048895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001107158 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain adjacent to zinc finger domain, 2A (Baz2a), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2507667:2526280:1 gene:ENSRNOG00000028816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2492771:2527534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT048900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001270786 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaminase 2 (liver, mitochondrial) (Gls2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_001270787 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaminase 2 (liver, mitochondrial) (Gls2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_138904 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaminase 2 (liver, mitochondrial) (Gls2), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2584755:2600728:1 gene:ENSRNOG00000031612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// J05499 // GenBank // Rattus norvegicus L-glutamine amidohydrolase mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2584830:2600246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT048904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT048903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT048905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_001105719 // RefSeq // Rattus norvegicus major intrinsic protein of lens fiber (Mip), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000004223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2614664:2620388:1 gene:ENSRNOG00000003132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AB684453 // GenBank // Rattus norvegicus Mip mRNA for major intrinsic protein of lens fiber, complete cds, strain: Kyoto Fancy Rat Stock No.4. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// FQ233861 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YB21 mRNA sequence. // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT048907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2614664:2645690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_031340 // RefSeq // Rattus norvegicus timeless circadian clock (Timeless), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2622164:2646197:1 gene:ENSRNOG00000031916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB019576 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for rTIM, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ232260 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YH08 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2614664:2645690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT048908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001024351 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein F (Apof), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2668375:2669810:1 gene:ENSRNOG00000033619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AY325229 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ba1-666 mRNA, complete cds. // chr7 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// BC088170 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein F, mRNA (cDNA clone MGC:108796 IMAGE:7322324), complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT048915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2668906:2684895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001011905 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 2 (Stat2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000049536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2670243:2685670:1 gene:ENSRNOG00000031081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC083867 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 2, mRNA (cDNA clone MGC:95122 IMAGE:7127907), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000020007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2668906:2684895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT048916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
NM_001008862 // RefSeq // Rattus norvegicus PAN2 poly(A) specific ribonuclease subunit (Pan2), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PAN2 polyA specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae) (Pan2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2697335:2714080:1 gene:ENSRNOG00000032441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2697335:2757855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001077585 // RefSeq // Rattus norvegicus canopy FGF signaling regulator 2 (Cnpy2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2716178:2720781:1 gene:ENSRNOG00000003549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC126101 // GenBank // Rattus norvegicus canopy 2 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:156825 IMAGE:7319422), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT048926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2697335:2757855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT048927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_130755 // RefSeq // Rattus norvegicus citrate synthase (Cs), mRNA. // chr7 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2731053:2757519:1 gene:ENSRNOG00000023520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF461496 // GenBank // Rattus norvegicus citrate synthase precursor mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr7 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// FQ214951 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YG03 mRNA sequence. // chr7 // 81 // 97 // 25 // 31 // 0 /// GENSCAN00000020040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2697335:2757855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT048929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT048930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001191875 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 52 (Ankrd52), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2774352:2788002:1 gene:ENSRNOG00000030597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2774032:2790611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT048932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONRATT048937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012195 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 41 (Rnf41), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 41 (Rnf41), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000029778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2809468:2831145:1 gene:ENSRNOG00000023456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC083614 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 41, mRNA (cDNA clone MGC:94383 IMAGE:7133774), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 41 (Rnf41), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2826025:2830180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT048940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT048938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
XM_002729767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF complex subunit SMARCC2-like (LOC685179), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2852070:2879092:1 gene:ENSRNOG00000031135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2852070:2879092:1 gene:ENSRNOG00000031135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2852070:2879092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
ENSRNOT00000046936 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:3017862:3018216:1 gene:ENSRNOG00000030527 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0
XM_006240779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus premelanosome protein (Pmel), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006240780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus premelanosome protein (Pmel), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000049972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3105334:3116614:1 gene:ENSRNOG00000023085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3106498:3116361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT048959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT048958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001108986 // RefSeq // Rattus norvegicus within bgcn homolog (Drosophila) (Wibg), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000048099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3145368:3165714:1 gene:ENSRNOG00000030821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001107159 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 19 (Mmp19), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 19 (Mmp19), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3187862:3195640:1 gene:ENSRNOG00000006778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// FJ799755 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metalloproteinase 19 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3187951:3195410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT048962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_053690 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 14 (Dnajc14), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000037332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3201890:3213835:1 gene:ENSRNOG00000006844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF351783 // GenBank // Rattus norvegicus dopamine receptor interacting protein (Drip78) mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// BC083549 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:93289 IMAGE:7127738), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3202484:3213117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT048963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001033070 // RefSeq // Rattus norvegicus SAP domain containing ribonucleoprotein (Sarnp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3217790:3271833:1 gene:ENSRNOG00000030520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC100070 // GenBank // Rattus norvegicus cytokine induced protein 29 kDa, mRNA (cDNA clone MGC:112623 IMAGE:7385206), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAP domain containing ribonucleoprotein (Sarnp), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT048973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT048974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3228528:3266827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_017125 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd63 molecule (Cd63), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3304375:3305798:1 gene:ENSRNOG00000007650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC063173 // GenBank // Rattus norvegicus Cd63 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:72893 IMAGE:6921594), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ214468 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YI14 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ220259 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YJ10 mRNA sequence. // chr7 // 76 // 91 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3290968:3305715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT048979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT048980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_030842 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha 7 (Itga7), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006240801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha 7 (Itga7), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3325443:3354361:1 gene:ENSRNOG00000007905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3325443:3354341:1 gene:ENSRNOG00000007905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3325443:3354361:1 gene:ENSRNOG00000007905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC088846 // GenBank // Rattus norvegicus integrin alpha 7, mRNA (cDNA clone MGC:105724 IMAGE:7313230), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3325486:3353922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT048981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0
NM_001000054 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 875 (Olr875), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000045810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3410036:3410974:1 gene:ENSRNOG00000048675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000005807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3410036:3410974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT048985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001000708 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 876 (Olr876), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000061635 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:5893584:5894521:1 gene:ENSRNOG00000014920 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000057 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 901 (Olr901), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:26693084:26694028:-1 gene:ENSRNOG00000045815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5434585:5454794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 74 // 9 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074994 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:5434096:5435175:1 gene:ENSRNOG00000049732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 100 // 11 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:26423307:26698641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1
ENSRNOT00000041403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5560092:5904797:-1 gene:ENSRNOG00000047228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 67 // 6 // 8 // 0
NM_001000706 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 906 (Olr906), mRNA. // chr7 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000034346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5560095:5685689:-1 gene:ENSRNOG00000047228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 61 // 100 // 22 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000040030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5560095:5685689:-1 gene:ENSRNOG00000047228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 100 // 16 // 36 // 0 /// NM_001001355 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 905 (Olr905), mRNA. // chr7 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000041403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5560092:5904797:-1 gene:ENSRNOG00000047228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000072832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:13352007:13352945:1 gene:ENSRNOG00000047193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT050720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// NONRATT030380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 100 // 11 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:13325522:13366125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000041776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259187126:259289414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000000479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5560095:5560688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001000704 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 931 (Olr931), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16571902:16572840:1 gene:ENSRNOG00000047264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16572247:16572840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT049267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000013838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16624358:16690884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 88 // 8 // 15 // 0
NM_001001387 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 937 (Olr937), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8916635:8917570:-1 gene:ENSRNOG00000049098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:8916635:8962721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001370 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 950 (Olr950), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7719276:7720253:-1 gene:ENSRNOG00000032325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:7719276:7720253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000074 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 952 (Olr952), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001001363 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1052 (Olr1052), mRNA. // chr7 // 59 // 96 // 16 // 27 // 0 /// NM_001001386 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 932 (Olr932), mRNA. // chr7 // 59 // 96 // 16 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16596143:16597078:-1 gene:ENSRNOG00000033400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 96 // 16 // 27 // 0 /// NM_001001367 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 936 (Olr936), mRNA. // chr7 // 43 // 100 // 12 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8989148:8990076:-1 gene:ENSRNOG00000030254 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 44 // 96 // 12 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074914 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:6835554:6836485:1 gene:ENSRNOG00000049453 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6834765:6836503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16596143:16596733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 96 // 16 // 27 // 0 /// NONRATT051081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 96 // 16 // 27 // 0 /// NONRATT051082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 96 // 16 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:8989133:9219579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 96 // 12 // 27 // 0
NM_001000077 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1000 (Olr1000), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001000486 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 959 (Olr959), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001000589 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 960 (Olr960), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7076639:7077571:-1 gene:ENSRNOG00000050107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072038 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:5807753:5808672:1 gene:ENSRNOG00000049883 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074121 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:6991971:6992892:-1 gene:ENSRNOG00000047030 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5736386:5808672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6991971:7077571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6810961:6811902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072277 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:4617460:4618398:1 gene:ENSRNOG00000045896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 9 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4617460:4618398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 100 // 9 // 27 // 0
NM_001001073 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 964 (Olr964), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// XM_006240817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 6C3-like (LOC100910607), mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000074329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:6746486:6747430:-1 gene:ENSRNOG00000047993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
NM_001006597 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 990 (Olr990), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_057122 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 4 (Psmc4), mRNA. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86194912:86203260:-1 gene:ENSRNOG00000018994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// BC063145 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 4, mRNA (cDNA clone MGC:72664 IMAGE:6889167), complete cds. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// D50695 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proteasomal ATPase (Tat-binding protein7), complete cds. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// FQ225557 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YK09 mRNA sequence. // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86195008:86203223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 68 // 9 // 17 // 0 /// NONRATT004855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5705373:5721943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:13627435:13659426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT004856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001000938 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 995 (Olr995), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000700 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 996 (Olr996), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000051296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16173446:16174381:-1 gene:ENSRNOG00000028911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001001386 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 932 (Olr932), mRNA. // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16596143:16597078:-1 gene:ENSRNOG00000033400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NM_001001363 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1052 (Olr1052), mRNA. // chr7 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// NM_001001367 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 936 (Olr936), mRNA. // chr7 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8989148:8990076:-1 gene:ENSRNOG00000030254 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074914 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:6835554:6836485:1 gene:ENSRNOG00000049453 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6834765:6836503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16596143:16596733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NONRATT051081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NONRATT051082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:8989133:9219579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_001000071 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1012 (Olr1012), mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000010945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:7138520:7166922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT048998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT048999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000699 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1014 (Olr1014), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NONRATT048999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:7403061:7405572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000035110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7675639:7676582:1 gene:ENSRNOG00000025369 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// NONRATT049000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000034346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5560095:5685689:-1 gene:ENSRNOG00000047228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5560095:5685689:-1 gene:ENSRNOG00000047228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NM_001001355 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 905 (Olr905), mRNA. // chr7 // 43 // 92 // 10 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:13352007:13352945:1 gene:ENSRNOG00000047193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 92 // 10 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5560092:5904797:-1 gene:ENSRNOG00000047228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5560095:5560688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 80 // 10 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010865 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:8005445:8006786:1 gene:ENSRNOG00000048201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 76 // 8 // 19 // 0 /// NONRATT030380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 92 // 10 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:13325522:13366125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259187126:259289414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001000699 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1014 (Olr1014), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8557066:8615015:1 gene:ENSRNOG00000045823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8542017:8673100:1 gene:ENSRNOG00000045823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT049002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000072708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8557066:8672786:1 gene:ENSRNOG00000045823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
ENSRNOT00000072123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8542017:8720625:1 gene:ENSRNOG00000045823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0
NM_001001365 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1049 (Olr1049), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8418720:8542944:1 gene:ENSRNOG00000045823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8418720:8649003:1 gene:ENSRNOG00000045823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8318356:8319250:1 gene:ENSRNOG00000046372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT049001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001001363 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1052 (Olr1052), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001000064 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1063 (Olr1063), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000047647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9438076:9439014:1 gene:ENSRNOG00000046346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9438187:9458919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT049003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001001076 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1064 (Olr1064), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9454709:9455647:1 gene:ENSRNOG00000008499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:14722921:14723859:1 gene:ENSRNOG00000048744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:14594171:14723859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_001000498 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1065 (Olr1065), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000048396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9469798:9470736:1 gene:ENSRNOG00000049157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000072979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:14738010:14738948:1 gene:ENSRNOG00000050926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9469909:9508623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:14738121:14885617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0
ENSRNOT00000044955 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:9513420:9514358:1 gene:ENSRNOG00000045610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9513420:9566246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0
XM_006240827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100910577), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// XR_347625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100910577), transcript variant X3, misc_RNA. // chr7 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000042498 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:10060906:10063355:1 gene:ENSRNOG00000033583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT049005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1
NM_133390 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 347 (Zfp347), mRNA. // chrU // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000044241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:10136669:10138411:-1 gene:ENSRNOG00000031216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// AB047637 // GenBank // Rattus norvegicus GIOT2 alpha mRNA for gonadotropin inducible ovarian transcription factor 2 alpha, complete cds. // chrU // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// AB047638 // GenBank // Rattus norvegicus GIOT2 beta mRNA for gonadotropin inducible ovarian transcription factor 2 beta, complete cds. // chrU // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT050748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 86 // 100 // 18 // 21 // 0
XM_006225927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 91-like (LOC100909569), mRNA. // chrUn // 74 // 100 // 23 // 31 // 0 /// FQ211506 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YE03 mRNA sequence. // chrUn // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
ENSRNOT00000006045 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:10911962:10914733:1 gene:ENSRNOG00000004580 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:10903453:10914733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001031649 // RefSeq // Rattus norvegicus sirtuin 6 (Sirt6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006240897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sirtuin 6 (Sirt6), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11106748:11112173:1 gene:ENSRNOG00000006393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC098923 // GenBank // Rattus norvegicus sirtuin 6 (silent mating type information regulation 2, homolog) 6 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114368 IMAGE:7461534), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11105065:11111572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT049016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_006225930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 6 (E(sp1) homolog, Drosophila) (Tle6), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// XM_006241027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 6 (E(sp1) homolog, Drosophila) (Tle6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006241028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 6 (E(sp1) homolog, Drosophila) (Tle6), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11133941:11155091:1 gene:ENSRNOG00000006350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000075263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11150341:11155091:1 gene:ENSRNOG00000006350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11121253:11155091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_031033 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein, alpha 11 (Gna11), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11200712:11214475:1 gene:ENSRNOG00000005446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF239674 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide-binding protein alpha 11 subunit mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11200324:11214719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_053542 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein, alpha 15 (Gna15), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11221817:11242333:1 gene:ENSRNOG00000005378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB015308 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GTP binding protein alpha 15, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11221967:11241925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108075 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate receptor 4 (S1pr4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11244600:11246876:1 gene:ENSRNOG00000005370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11244994:11246154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT049024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014082 // RefSeq // Rattus norvegicus nicalin (Ncln), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11248842:11258770:1 gene:ENSRNOG00000004793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083785 // GenBank // Rattus norvegicus nicalin homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:94760 IMAGE:7096595), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11248923:11257653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001135603 // RefSeq // Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 5 (Celf5), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000061219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11262657:11287130:1 gene:ENSRNOG00000004695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11258937:11347133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT049032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT049033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT049034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_031567 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor I/C (Nfic), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006240850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor I/C (Nfic), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11319171:11344759:1 gene:ENSRNOG00000004505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB012233 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NF1-C2, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ213370 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YD09 mRNA sequence. // chr7 // 79 // 91 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11258937:11347133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT049038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
BC085939 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100125365, mRNA (cDNA clone MGC:95041 IMAGE:7123253), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108074 // RefSeq // Rattus norvegicus fizzy/cell division cycle 20 related 1 (Drosophila) (Fzr1), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11368581:11380504:1 gene:ENSRNOG00000004169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC162059 // GenBank // Rattus norvegicus fizzy/cell division cycle 20 related 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188054 IMAGE:7115243), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11365126:11383965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001109605 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690617 (LOC690617), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061194 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:11382219:11383981:1 gene:ENSRNOG00000039861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11365126:11383965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108731 // RefSeq // Rattus norvegicus high mobility group 20 B (Hmg20b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006240944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group 20 B (Hmg20b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006240945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group 20 B (Hmg20b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11405510:11410190:1 gene:ENSRNOG00000020601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ220489 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YK22 mRNA sequence. // chr7 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// FQ221321 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA37YM21 mRNA sequence. // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// FQ227368 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YJ13 mRNA sequence. // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000021237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11405506:11409776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT049052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001109282 // RefSeq // Rattus norvegicus GIPC PDZ domain containing family, member 3 (Gipc3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11412757:11417446:1 gene:ENSRNOG00000020593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11412766:11417325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108073 // RefSeq // Rattus norvegicus tight junction protein 3 (Tjp3), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// XM_006240933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tight junction protein 3 (Tjp3), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000027847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11469366:11481943:1 gene:ENSRNOG00000020501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000012906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11463723:11481844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT049058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT049059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
NM_001106770 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L54 (Mrpl54), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000027737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11488465:11490985:1 gene:ENSRNOG00000020464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ224331 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA6YD15 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11488506:11490823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 56 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT049061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001040190 // RefSeq // Rattus norvegicus ataxia, cerebellar, Cayman type (Atcay), mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11523425:11547188:1 gene:ENSRNOG00000020407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// AY611623 // GenBank // Rattus norvegicus caytaxin variant 1 (Atcay) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// BC128695 // GenBank // Rattus norvegicus ataxia, cerebellar, Cayman type, mRNA (cDNA clone MGC:156459 IMAGE:8366437), complete cds. // chr7 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11523431:11546341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0
NM_001100757 // RefSeq // Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 4 (Pias4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11581929:11595424:1 gene:ENSRNOG00000020230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC169045 // GenBank // Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 4, mRNA (cDNA clone MGC:189435 IMAGE:9100787), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000012937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11581984:11594626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_001012115 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 3-like 3 (Creb3l3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000044484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11658216:11666646:1 gene:ENSRNOG00000032202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089877 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 3-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:109013 IMAGE:7325489), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11655348:11666216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_022703 // RefSeq // Rattus norvegicus small glutamine-rich tetratricopeptide repeat (TPR)-containing, alpha (Sgta), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11689394:11705305:1 gene:ENSRNOG00000019891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AF368278 // GenBank // Rattus norvegicus small glutamine rich protein with tetratricopeptide repeats 1 (Sgt1) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// BC087642 // GenBank // Rattus norvegicus small glutamine-rich tetratricopeptide repeat (TPR)-containing, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:105278 IMAGE:7308544), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11696779:11704246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT049076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// NONRATT049078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1
NM_001008356 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 3 (Slc39a3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11712392:11720741:1 gene:ENSRNOG00000045524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086411 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:105842 IMAGE:7111777), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221542 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA34YL07 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11715560:11718282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT049082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108987 // RefSeq // Rattus norvegicus DIRAS family, GTP-binding RAS-like 1 (Diras1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11723556:11728420:1 gene:ENSRNOG00000029738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11726188:11727214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_024138 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 7 (Gng7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11792645:11793928:1 gene:ENSRNOG00000019857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// DQ120497 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY guanine nucleotide binding protein gamma 7 (Gng7) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// DQ120498 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR guanine nucleotide binding protein gamma 7 (Gng7) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// FQ211653 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YH22 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// L23219 // GenBank // Rattus norvegicus G protein gamma subunit (gamma7 subunit) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT049089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000022336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11828422:11844454:1 gene:ENSRNOG00000025742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lamin B2 (Lmnb2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_006241035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lamin B2 (Lmnb2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000075183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11839447:11844454:1 gene:ENSRNOG00000025742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11828527:11842795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ212316 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA59YD04 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145781 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 13 homolog (yeast) (Timm13), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11844860:11845962:1 gene:ENSRNOG00000019682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF144701 // GenBank // Rattus norvegicus small zinc finger-like protein (TIM13) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11844895:11845480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT049094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001108732 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm7), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11892677:11895103:1 gene:ENSRNOG00000019552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM7 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm7), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11892705:11894955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109609 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and Ig domain containing 3 (Lingo3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11905008:11914418:1 gene:ENSRNOG00000032569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11912649:11914418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109591 // RefSeq // Rattus norvegicus junctional sarcoplasmic reticulum protein 1 (Jsrp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus junctional sarcoplasmic reticulum protein 1 (Jsrp1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000044417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11937665:11942088:1 gene:ENSRNOG00000032951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11938286:11942007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT049101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001108072 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family J member 1 (Plekhj1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family J member 1 (Plekhj1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11951787:11954190:1 gene:ENSRNOG00000019247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC088451 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family J member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7126866). // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC168179 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family J member 1, mRNA (cDNA clone MGC:187889 IMAGE:9092463), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// FQ230285 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YJ24 mRNA sequence. // chr7 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11952103:11953901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT049104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001100719 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, delta 1 subunit (Ap3d1), mRNA. // chr7 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12006416:12041236:1 gene:ENSRNOG00000018977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC169097 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, delta 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:189515 IMAGE:7936407), complete cds. // chr7 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12006652:12040329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT049107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108734 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB kinase activator 3A (Mob3a), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006240963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MOB kinase activator 3A (Mob3a), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12046195:12063525:1 gene:ENSRNOG00000018971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC168845 // GenBank // Rattus norvegicus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 2A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:189072 IMAGE:7458111), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ226795 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YG06 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12056933:12084576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// NONRATT049112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001011985 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP kinase-interacting serine/threonine kinase 2 (Mknk2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12075366:12086471:1 gene:ENSRNOG00000029028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085941 // GenBank // Rattus norvegicus MAP kinase-interacting serine/threonine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:95066 IMAGE:7124839), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211808 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA79YI07 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12056933:12084576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT049115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XM_006241037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 2 (Btbd2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025391 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:12097176:12110126:1 gene:ENSRNOG00000018788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12097220:12110126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT049121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001006983 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 17A (Abhd17a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 17A (Abhd17a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12160068:12166498:1 gene:ENSRNOG00000018212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083686 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 108, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:94549 IMAGE:7189228), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12163285:12166317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT049126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001127604 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 16 (Klf16), mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000045421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12174235:12184049:1 gene:ENSRNOG00000033694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC166458 // GenBank // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 16, mRNA (cDNA clone MGC:187751 IMAGE:9026732), complete cds. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12174318:12182296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001012114 // RefSeq // Rattus norvegicus REX1, RNA exonuclease 1 homolog (S. cerevisiae) (Rexo1), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000024080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12189793:12209185:1 gene:ENSRNOG00000017916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC083596 // GenBank // Rattus norvegicus REX1, RNA exonuclease 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:7132816). // chr7 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12189933:12208483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT049133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT049134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
XM_001076355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, aminophospholipid transporter, class I, type 8B, member 3 (Atp8b3), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_234937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, aminophospholipid transporter, class I, type 8B, member 3 (Atp8b3), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039813 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:12211369:12230886:1 gene:ENSRNOG00000024975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC168700 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7454333, with apparent retained intron. // chr7 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12212196:12230919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT049135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_133524 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 3 (Tcf3), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 95 // 93 // 35 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000023473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12316323:12338454:1 gene:ENSRNOG00000016970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 93 // 35 // 37 // 0 /// NM_001035237 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 3 (Tcf3), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 93 // 93 // 37 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000023597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12316323:12338454:1 gene:ENSRNOG00000016970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 93 // 37 // 40 // 1 /// BC078750 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor E2a, mRNA (cDNA clone MGC:93222 IMAGE:7123064), complete cds. // chr7 // 88 // 88 // 35 // 40 // 1 /// GENSCAN00000027462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12273586:12337924:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 85 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT049138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT049140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT049141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NM_001126097 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit XI (Uqcr11), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001287109 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit XI (Uqcr11), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit XI (Uqcr11), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12341264:12345890:1 gene:ENSRNOG00000016952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC157815 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, 6.4kDa subunit, mRNA (cDNA clone MGC:187613 IMAGE:8366041), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ217807 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA17YE15 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12341286:12344477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT049147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NM_001108735 // RefSeq // Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 3 (Mbd3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000049170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12349402:12356298:1 gene:ENSRNOG00000028956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC167041 // GenBank // Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:8363656), partial cds. // chr7 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12349402:12367764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT049148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT049149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT049150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT049151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT049152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
XM_006241041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mex-3 RNA binding family member D (Mex3d), partial mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12361697:12367764:1 gene:ENSRNOG00000030830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000065974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12361697:12367764:1 gene:ENSRNOG00000030830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000027456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12349402:12367764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT049153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001108071 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAMTS-like 5 (Adamtsl5), mRNA. // chr7 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// XM_006240915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 5 (Adamtsl5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12401337:12404316:1 gene:ENSRNOG00000033787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// FQ224249 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA72YF16 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12398572:12405966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT049155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT049157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_133559 // RefSeq // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 4 (Pcsk4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006240844 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 4 (Pcsk4), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12417281:12425514:1 gene:ENSRNOG00000016405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC097288 // GenBank // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, mRNA (cDNA clone MGC:114269 IMAGE:7456182), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC107463 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7454422, containing frame-shift errors. // chr7 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// L14937 // GenBank // Rattus norvegicus proprotein convertase 4 mRNAs, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12417293:12427202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000021939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12426182:12428308:1 gene:ENSRNOG00000016399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079167 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310011J03, mRNA (cDNA clone MGC:94198 IMAGE:7129744), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12417293:12427202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_012793 // RefSeq // Rattus norvegicus guanidinoacetate N-methyltransferase (Gamt), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240848 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanidinoacetate N-methyltransferase (Gamt), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12484550:12487284:1 gene:ENSRNOG00000024577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// J03588 // GenBank // Rat guanidinoacetate methyltransferase mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12473451:12487117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT049163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_001108070 // RefSeq // Rattus norvegicus downstream of Stk11 (Dos), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12605828:12611153:1 gene:ENSRNOG00000024349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC169056 // GenBank // Rattus norvegicus downstream of Stk11, mRNA (cDNA clone MGC:189449 IMAGE:7932746), complete cds. // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000035771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12604952:12610758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT049170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001108068 // RefSeq // Rattus norvegicus strawberry notch homolog 2 (Drosophila) (Sbno2), mRNA. // chr7 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// XM_006240908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus strawberry notch homolog 2 (Drosophila) (Sbno2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// XM_006240909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus strawberry notch homolog 2 (Drosophila) (Sbno2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12641927:12685802:1 gene:ENSRNOG00000013987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12657576:12685386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT049177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0
NM_001100886 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 259 (Tmem259), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006240868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membralin (Mbrl), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000017245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12940961:12947623:-1 gene:ENSRNOG00000012808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC100259 // GenBank // Rattus norvegicus membralin, mRNA (cDNA clone IMAGE:7457466), partial cds. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12941260:12947595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT050968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT050983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT050986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT050985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_001173974 // RefSeq // Rattus norvegicus R3H domain containing 4 (R3hdm4), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12781190:12788308:1 gene:ENSRNOG00000011489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC161971 // GenBank // Rattus norvegicus LOC362840, mRNA (cDNA clone MGC:187780 IMAGE:9028992), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ213685 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YF17 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12781137:12787364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001106768 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 16 (Med16), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006240865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 16 (Med16), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12789464:12801962:1 gene:ENSRNOG00000011315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12789493:12803102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT049192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT049194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_181634 // RefSeq // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphatase-related protein type 3 (Lppr3), mRNA. // chr7 // 84 // 91 // 27 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000031315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12822277:12833539:1 gene:ENSRNOG00000027940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AY147866 // GenBank // Rattus norvegicus plasticity-related protein PRG-2 mRNA, complete cds. // chr7 // 84 // 91 // 27 // 32 // 0 /// AY300027 // GenBank // Rattus norvegicus plasticity-related protein PRG-2 mRNA, complete cds. // chr7 // 84 // 91 // 27 // 32 // 0 /// BC129083 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8365867. // chr7 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC167750 // GenBank // Rattus norvegicus plasticity-related gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:187308 IMAGE:8366697), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12821817:12833462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT049195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_001003956 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 57 (Prss57), mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 57 (Prss57), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12969072:12974487:1 gene:ENSRNOG00000025293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12969072:12975935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT049200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_001033702 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 126 (Rnf126), mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// XM_006240899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 126 (Rnf126), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006240900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 126 (Rnf126), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12991016:12998304:1 gene:ENSRNOG00000009028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC099810 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 126, mRNA (cDNA clone MGC:124770 IMAGE:5621533), complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12989279:12997992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001106766 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) mitochondrial (DNA directed) (Polrmt), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006240860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) mitochondrial (DNA directed) (Polrmt), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000039232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13011142:13021357:1 gene:ENSRNOG00000024879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000052476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13011165:13021150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT049204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT049206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT049205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1
NM_001191777 // RefSeq // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 3-like 2 (Odf3l2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13110710:13115699:1 gene:ENSRNOG00000008199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13110710:13115699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108065 // RefSeq // Rattus norvegicus SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 2 (Shc2), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13117670:13139889:1 gene:ENSRNOG00000008030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13117739:13136838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109285 // RefSeq // Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 4C (C2cd4c), mRNA. // chr7 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// XM_006240985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 4C (C2cd4c), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13142884:13145045:1 gene:ENSRNOG00000008026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13140447:13145045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT049213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001013102 // RefSeq // Rattus norvegicus theg spermatid protein (Theg), mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13177089:13187060:1 gene:ENSRNOG00000007960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000042792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13177089:13184883:1 gene:ENSRNOG00000007960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC083921 // GenBank // Rattus norvegicus testicular haploid expressed gene, mRNA (cDNA clone MGC:95319 IMAGE:7135133), complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testicular haploid expressed gene (Theg), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT049215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13177125:13233000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT049217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001108737 // RefSeq // Rattus norvegicus mesoderm induction early response 1, family member 2 (Mier2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006240976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mesoderm induction early response 1, family member 2 (Mier2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006240977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mesoderm induction early response 1, family member 2 (Mier2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000067771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13203327:13219032:1 gene:ENSRNOG00000000175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13177125:13233000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT049218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT049219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT049220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT049222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_139252 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2c (Ppap2c), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13225606:13233682:1 gene:ENSRNOG00000000177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF503611 // GenBank // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphohydrolase 2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062088 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2c, mRNA (cDNA clone MGC:72294 IMAGE:5621318), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13177125:13233000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENSRNOT00000010203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13338374:13383012:1 gene:ENSRNOG00000007730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_173131 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 53 (Vom2r53), mRNA. // chr7 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// AF016178 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN1) mRNA, complete cds. // chr7 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13264694:13382664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001077082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 84-like (LOC691170), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002726875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 84-like (LOC691170), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034545 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:13517760:13533965:1 gene:ENSRNOG00000022871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13510820:13538050:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT049226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001000998 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1073 (Olr1073), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13574686:13575621:1 gene:ENSRNOG00000031688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13574785:13575621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000709 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1084 (Olr1084), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006241043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1082-like (LOC102547063), mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000048564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13790005:13838883:1 gene:ENSRNOG00000047090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 100 // 9 // 16 // 0 /// NONRATT049230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000420 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1085 (Olr1085), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000048564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13790005:13838883:1 gene:ENSRNOG00000047090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// NONRATT049231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000419 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1086 (Olr1086), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13862639:13863601:1 gene:ENSRNOG00000042262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13862738:13863601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001025774 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 105 (Ccdc105), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14069715:14075206:1 gene:ENSRNOG00000007375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098035 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 105, mRNA (cDNA clone MGC:116191 IMAGE:7456481), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14069783:14075078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT049233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001191776 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 14 (Casp14), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14097121:14099953:1 gene:ENSRNOG00000007352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14097121:14154390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001000418 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1087 (Olr1087), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14153449:14154390:1 gene:ENSRNOG00000007348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14097121:14154390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001191876 // RefSeq // Rattus norvegicus synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 1 (C. elegans) (Syde1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006241068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 1 (C. elegans) (Syde1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14194129:14200115:1 gene:ENSRNOG00000007307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14194129:14200067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
GENSCAN00000006999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14225060:14227513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000031816 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:14226453:14227513:1 gene:ENSRNOG00000028253 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
XM_006225941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39 (Cyp4f39), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// XM_006225942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39 (Cyp4f39), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// XM_006225943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39 (Cyp4f39), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// XM_006241091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39 (Cyp4f39), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_234837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39 (Cyp4f39), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000007548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14639403:14667765:1 gene:ENSRNOG00000029478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ210490 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YM21 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14624862:14697943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT049241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_173124 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 5 (Cyp4f5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC129085 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 4F5, mRNA (cDNA clone MGC:156578 IMAGE:7375658), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// U39207 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 4F5 (CYP4F5) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000007428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14712627:14726344:1 gene:ENSRNOG00000005425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 85 // 11 // 13 // 1 /// GENSCAN00000020770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14703140:14726344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
NM_001109360 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 40 (Cyp4f40), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000066654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15019963:15034106:1 gene:ENSRNOG00000043344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14973938:15060880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_173123 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 4 (Cyp4f4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15045084:15061271:1 gene:ENSRNOG00000032895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U39206 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 4F4 (CYP4F4) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14973938:15060880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_006225952 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC100912582), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_006225953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC100912582), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_006225955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC100912582), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_006241101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC100912582), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_006241102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC100912582), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_006241104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC100912582), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_182823 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 472 (Zfp472), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15406064:15409287:1 gene:ENSRNOG00000004572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// AY195874 // GenBank // Rattus norvegicus KRAB box containing zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006225960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 952 (Zfp952), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// XM_006241108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 952 (Zfp952), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000043826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15437337:15441621:1 gene:ENSRNOG00000029416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// FQ222140 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA28YE09 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_001134561 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 563 (Zfp563), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 563 (Zfp563), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15593481:15601988:1 gene:ENSRNOG00000030273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233442 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YN11 mRNA sequence. // chrU // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT049259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15587505:15628001:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001099494 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 54 (Vom2r54), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:17115313:17124109:1 gene:ENSRNOG00000026094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:17115340:17349316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001099495 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 55 (Vom2r55), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000047281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:17219691:17223646:1 gene:ENSRNOG00000039261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:17115340:17349316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
FQ234631 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YD18 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000045185 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:16943882:16969608:1 gene:ENSRNOG00000050380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046049 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:17800321:17825048:1 gene:ENSRNOG00000009146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16948985:16968639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:17756861:17922259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 46 // 9 // 13 // 0
NM_001008965 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 106 (Vom1r106), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18110948:18111871:1 gene:ENSRNOG00000043367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510363 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re13 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008908 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 107 (Vom1r107), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18240441:18241424:1 gene:ENSRNOG00000042090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510300 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg4 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008957 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 108 (Vom1r108), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000072385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18293045:18379716:1 gene:ENSRNOG00000048787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 80 // 13 // 16 // 0 /// AY510302 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg6 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000068151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18293096:18394733:1 gene:ENSRNOG00000048787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000072312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18293096:18394739:1 gene:ENSRNOG00000048787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 100 // 12 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18293096:18394739:1 gene:ENSRNOG00000048787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONRATT049273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18293300:18340893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
GENSCAN00000052094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18432944:18433378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000050777 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:18432485:18433372:1 gene:ENSRNOG00000032914 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0
XM_001079107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin thioesterase OTUB1-like (RGD1565010), mRNA. // chr7 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// XM_234947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin thioesterase OTUB1-like (RGD1565010), mRNA. // chr7 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000044978 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:18452485:18453294:1 gene:ENSRNOG00000009072 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 80 // 63 // 4 // 5 // 0 /// GENSCAN00000041697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18452485:18453294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 63 // 4 // 5 // 0 /// NONRATT049274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001108077 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-like 9 (Actl9), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18488156:18489514:1 gene:ENSRNOG00000049571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC167767 // GenBank // Rattus norvegicus similar to actin-like 7-alpha-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:187540 IMAGE:7456143), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18488217:18489464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
BC101863 // GenBank // Rattus norvegicus similar to a disintegrin-like and metalloprotease (reprolysin type) with thrombospondin type 1 motif, 10, mRNA (cDNA clone MGC:124747 IMAGE:7939411), complete cds. // chr7 // 94 // 70 // 30 // 32 // 0 /// NM_001271445 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 10 (Adamts10), mRNA. // chr7 // 98 // 98 // 45 // 46 // 1 /// ENSRNOT00000011849 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:18586778:18603292:1 gene:ENSRNOG00000008857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18592151:18693121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT049277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT049276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// NONRATT049278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1
NM_001108076 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IF (Myo1f), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18618342:18669048:1 gene:ENSRNOG00000008409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18592151:18693121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001009664 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 414 (Zfp414), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18675411:18678017:1 gene:ENSRNOG00000008378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087693 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 414, mRNA (cDNA clone MGC:105571 IMAGE:7310348), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ220382 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YB17 mRNA sequence. // chr7 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// FQ227009 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YK02 mRNA sequence. // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT049286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18592151:18693121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT049290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT049287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_006225973 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PML-RARA regulated adaptor molecule 1 (Pram1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PML-RARA regulated adaptor molecule 1 (Pram1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060002 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:18687954:18693103:1 gene:ENSRNOG00000039204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18592151:18693121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 60 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT049291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT049292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001108989 // RefSeq // Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 3 (Kank3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18846292:18859539:1 gene:ENSRNOG00000007230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166847 // GenBank // Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:188740 IMAGE:9030846), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18852604:18873810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT049298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106772 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 7 (Ndufa7), mRNA. // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000009425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18861110:18873924:1 gene:ENSRNOG00000006939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// BC157817 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 7 (B14.5a), mRNA (cDNA clone MGC:188160 IMAGE:7309256), complete cds. // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// FQ209765 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA3YM07 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// FQ224753 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA55YN22 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT049299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// GENSCAN00000041703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18852604:18873810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001014201 // RefSeq // Rattus norvegicus CD320 molecule (Cd320), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003754709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD320 molecule (Cd320), partial mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18878075:18883844:1 gene:ENSRNOG00000006901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088861 // GenBank // Rattus norvegicus CD320 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:105707 IMAGE:7310701), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ234194 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YN09 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18878128:18883519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT049302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT049304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001099484 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 56 (Vom2r56), mRNA. // chr7 // 69 // 100 // 24 // 35 // 0 /// XM_006241136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 57 (Vom2r57), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 67 // 94 // 22 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000049266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:19253644:19268428:-1 gene:ENSRNOG00000039136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 100 // 24 // 35 // 0 /// GENSCAN00000011263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:22952673:23099629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 86 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:19087112:19268419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 100 // 28 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000047547 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:23084443:23099638:-1 gene:ENSRNOG00000026976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 100 // 25 // 35 // 0 /// NONRATT051101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
XM_006241151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC691546), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62002658:62061597:1 gene:ENSRNOG00000010727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// BC167074 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2, mRNA (cDNA clone MGC:189415 IMAGE:9101454), complete cds. // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// XM_006224073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC294831), mRNA. // chr7 // 32 // 100 // 9 // 28 // 0 /// XM_006232081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC294831), mRNA. // chr7 // 32 // 100 // 9 // 28 // 0 /// XR_355305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691764 (LOC691764), ncRNA. // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// XR_355334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547247 (LOC102547247), ncRNA. // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000026040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62002833:62061169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// NONRATT042811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 61 // 100 // 17 // 28 // 0 /// NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21015644:21033084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21329093:21361101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001013952 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4930509O22 (LOC300308), mRNA. // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_006241152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase W-like (RGD1565071), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:23168549:23173903:1 gene:ENSRNOG00000030234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_002727467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase W-like (LOC688362), partial mRNA. // chr7 // 67 // 86 // 16 // 24 // 0 /// XM_006227105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase W-like (LOC102557585), partial mRNA. // chr7 // 67 // 64 // 12 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000046378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:20432424:20644702:1 gene:ENSRNOG00000048230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 100 // 10 // 28 // 0 /// XM_003754694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase W-like (LOC100912652), partial mRNA. // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23168549:23170030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT049316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 78 // 64 // 14 // 18 // 0 /// NONRATT049317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// NONRATT049318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21126333:21165445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_001079135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to high mobility group nucleosomal binding domain 1 (LOC691642), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to high mobility group nucleosomal binding domain 1 (LOC691642), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074095 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:20246953:20247237:1 gene:ENSRNOG00000048170 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:20246953:20247237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001000485 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1096 (Olr1096), mRNA. // chr7 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1901035:1902111:1 gene:ENSRNOG00000014386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:19070330:19070740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT038901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1901479:1913494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001000485 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1096 (Olr1096), mRNA. // chr7 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1901035:1902111:1 gene:ENSRNOG00000014386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:19070330:19070740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1901479:1913494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006241151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC691546), mRNA. // chr7 // 74 // 85 // 17 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62002658:62061597:1 gene:ENSRNOG00000010727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// BC167074 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2, mRNA (cDNA clone MGC:189415 IMAGE:9101454), complete cds. // chr7 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// XM_006224073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC294831), mRNA. // chr7 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// XM_006232081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC294831), mRNA. // chr7 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// XR_355305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691764 (LOC691764), ncRNA. // chr7 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62002833:62061169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// NONRATT042811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21015644:21033084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21329093:21361101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
XM_006241151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC691546), mRNA. // chr5 // 79 // 54 // 15 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000015575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62002658:62061597:1 gene:ENSRNOG00000010727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// BC167074 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2, mRNA (cDNA clone MGC:189415 IMAGE:9101454), complete cds. // chr5 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// XM_006224073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC294831), mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// XM_006232081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2-like (LOC294831), mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// XR_355305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691764 (LOC691764), ncRNA. // chr5 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT042811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 97 // 23 // 34 // 0 /// NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// GENSCAN00000026040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62002833:62061169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000054582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21015644:21033084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_017109 // RefSeq // Rattus norvegicus synapsin III (Syn3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:23553826:23958150:1 gene:ENSRNOG00000026866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF056704 // GenBank // Rattus norvegicus synapsin IIIa mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23933118:23953647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT049323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23553985:23693694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001106773 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family C (Bpifc), mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24004371:24061477:1 gene:ENSRNOG00000022937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24016531:24060846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT049328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0
NM_207614 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA 2,3-cyclic phosphate and 5-OH ligase (Rtcb), mRNA. // chr7 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000006570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24063301:24082716:1 gene:ENSRNOG00000004813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000007332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60070558:60072604:1 gene:ENSRNOG00000005546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 97 // 33 // 37 // 0 /// AY572415 // GenBank // Rattus norvegicus focal adhesion associated protein (Faap) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// BC078924 // GenBank // Rattus norvegicus P55, mRNA (cDNA clone MGC:93713 IMAGE:7106266), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000021834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60070593:60072133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 89 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000030161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24063354:24082358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT049329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT049603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 83 // 32 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT049330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// NONRATT049331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1
NM_133312 // RefSeq // Rattus norvegicus PR domain containing 4 (Prdm4), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24114241:24135565:1 gene:ENSRNOG00000004962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF176023 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT049332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24109668:24135408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
ENSRNOT00000011205 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:24366548:24367946:1 gene:ENSRNOG00000006596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24363545:24367946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT049334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_198750 // RefSeq // Rattus norvegicus cryptochrome circadian clock 1 (Cry1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24683890:24784328:1 gene:ENSRNOG00000006622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF545855 // GenBank // Rattus norvegicus cryptochrome 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// BC107677 // GenBank // Rattus norvegicus cryptochrome 1 (photolyase-like), mRNA (cDNA clone MGC:124541 IMAGE:7939194), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24751473:24798558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT049337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001014265 // RefSeq // Rattus norvegicus MTERF domain containing 3 (Mterfd3), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MTERF domain containing 3 (Mterfd3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24788439:24798713:1 gene:ENSRNOG00000006978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC083741 // GenBank // Rattus norvegicus MTERF domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:94656 IMAGE:7191829), complete cds. // chr7 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC098693 // GenBank // Rattus norvegicus MTERF domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:112659 IMAGE:7386232), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24751473:24798558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT049339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001013172 // RefSeq // Rattus norvegicus four and a half LIM domains 4 (Fhl4), mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:26271782:26272476:-1 gene:ENSRNOG00000006998 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 80 // 38 // 12 // 15 // 0 /// BC078961 // GenBank // Rattus norvegicus four and a half LIM domains 4, mRNA (cDNA clone MGC:93831 IMAGE:7111014), complete cds. // chr7 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// BC099213 // GenBank // Rattus norvegicus four and a half LIM domains 4, mRNA (cDNA clone MGC:116389 IMAGE:7384591), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT051136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000006002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26271634:26311735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
NM_001108740 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoskeleton-associated protein 4 (Ckap4), mRNA. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000010601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:25084905:25093002:1 gene:ENSRNOG00000008016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:25065290:25091939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001106774 // RefSeq // Rattus norvegicus NUAK family, SNF1-like kinase, 1 (Nuak1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:25184054:25253032:1 gene:ENSRNOG00000008061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:25183132:25252307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108741 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor protein, phosphotyrosine interaction, PH domain and leucine zipper containing 2 (Appl2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006241202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor protein, phosphotyrosine interaction, PH domain and leucine zipper containing 2 (Appl2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000010986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:26387152:26436562:1 gene:ENSRNOG00000008174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC168167 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor protein, phosphotyrosine interaction, PH domain and leucine zipper containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:187709 IMAGE:9021772), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000021751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26419368:26435673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 59 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT049355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT049356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// GENSCAN00000005990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26387238:26406733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// GENSCAN00000021733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26408955:26415069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// NONRATT049357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_001191778 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member L2 (Aldh1l2), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chrU // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000059639 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:26506321:26555206:1 gene:ENSRNOG00000008586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000072587 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:26514686:26555206:1 gene:ENSRNOG00000008586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000075809 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:26533738:26554517:1 gene:ENSRNOG00000008586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 44 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26506321:26591402:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 80 // 35 // 36 // 0
NM_001108742 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 41 (magnesium transporter), member 2 (Slc41a2), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:26651682:26734269:1 gene:ENSRNOG00000008713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26651977:26675873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000021737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26686327:26731609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT049365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_031553 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor-Y beta (Nfyb), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241196 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear transcription factor-Y beta (Nfyb), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000066143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:27200204:27216014:1 gene:ENSRNOG00000010309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC089791 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear transcription factor-Y beta, mRNA (cDNA clone MGC:108654 IMAGE:7380395), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// M55045 // GenBank // Rat CCAAT binding transcription factor-B subunit (CBF-A1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// M60617 // GenBank // Rat CCAAT binding transcription factor-B subunit (CBF-A11) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT049372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27200971:27216133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT049373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_001079763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosyltransferase 8 domain containing 2 (Glt8d2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051181 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:27294788:27312237:1 gene:ENSRNOG00000033579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// XM_006225979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosyltransferase 8 domain containing 2 (Glt8d2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000033452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27257238:27312237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001135566 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691921 (LOC691921), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031297 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:27340344:27343437:1 gene:ENSRNOG00000026982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001170605 // RefSeq // Rattus norvegicus first gene upstream of Nt5dc3 (LOC362863), mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031946 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:27360100:27428178:1 gene:ENSRNOG00000026807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059545 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:27366514:27428178:1 gene:ENSRNOG00000026807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC063813 // GenBank // Rattus norvegicus first gene upstream of Nt5dc3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6887594), complete cds. // chr7 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27366514:27403006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT049378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001134887 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-nucleotidase domain containing 3 (Nt5dc3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:27430564:27482415:1 gene:ENSRNOG00000026793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27430669:27483176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006225985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X8, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X15, mRNA. // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006241208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X8, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679534 (RGD1560034), transcript variant X14, mRNA. // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000059532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:27807797:27901214:1 gene:ENSRNOG00000038943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT049385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_012619 // RefSeq // Rattus norvegicus phenylalanine hydroxylase (Pah), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenylalanine hydroxylase (Pah), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000005844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:28180707:28245424:1 gene:ENSRNOG00000004302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078881 // GenBank // Rattus norvegicus phenylalanine hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:93567 IMAGE:7131414), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ218529 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YI24 mRNA sequence. // chr7 // 75 // 92 // 18 // 24 // 0 /// FQ219680 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YK23 mRNA sequence. // chr7 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// M12337 // GenBank // Rat phenylalanine hydroxylase mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT049387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:28180796:28244862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// NONRATT049388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_012625 // RefSeq // Rattus norvegicus pro-melanin-concentrating hormone (Pmch), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:28764993:28766309:1 gene:ENSRNOG00000004632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ214578 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA1YA17 mRNA sequence. // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// M29712 // GenBank // Rat melanin-concentrating hormone (MCH) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:28765050:28765825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT049397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106775 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 37 (Nup37), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:28825302:28853301:1 gene:ENSRNOG00000004727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091253 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7374206. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC161937 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin 37, mRNA (cDNA clone MGC:187721 IMAGE:9022830), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:28827236:28898905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106776 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 53 (Ccdc53), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:28872399:28917928:1 gene:ENSRNOG00000005102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:28827236:28898905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT049403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
XM_343194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase, alpha and beta subunits (Gnptab), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000006946 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:29063508:29128693:1 gene:ENSRNOG00000005228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000006980 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:29095091:29128693:1 gene:ENSRNOG00000005228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 74 // 74 // 35 // 47 // 1 /// GENSCAN00000032152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29090304:29160003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT049408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1 /// NONRATT049405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1 /// NONRATT049406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// NONRATT049407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1
NM_013041 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 3 (Sycp3), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006241222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 3 (Sycp3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29136815:29151274:1 gene:ENSRNOG00000005270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT049411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29090304:29160003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_022385 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 1 (Arl1), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29384709:29396455:1 gene:ENSRNOG00000005763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061553 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:72836 IMAGE:6889396), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U12402 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley rARL1 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29390714:29395066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT049416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191987 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/monocarboxylate cotransporter), member 8 (Slc5a8), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/monocarboxylate cotransporter), member 8 (Slc5a8), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29537674:29578495:1 gene:ENSRNOG00000006367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29510553:29578429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0
XM_006226037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like (LOC100909955), mRNA. // chr7 // 86 // 78 // 6 // 7 // 0 /// XM_006241239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like (LOC100909955), mRNA. // chr7 // 86 // 78 // 6 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000049362 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:30010651:30011145:1 gene:ENSRNOG00000032424 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 86 // 78 // 6 // 7 // 0 /// GENSCAN00000044140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30010137:30011145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 78 // 6 // 7 // 0
NM_001271371 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271371 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30756133:30847744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271371 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271371 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// XM_006241244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006241245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006241246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30756133:30847744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271371 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006241244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006241245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006241246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30756133:30847744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001271371 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30756133:30847744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001271371 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B (Anks1b), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:30922186:31468836:1 gene:ENSRNOG00000024870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30902170:31145418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009430 // RefSeq // Rattus norvegicus IKBKB interacting protein (Ikbip), mRNA. // chr7 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000010914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:31873293:31884637:1 gene:ENSRNOG00000008247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000010929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:31873293:31891984:1 gene:ENSRNOG00000008247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC088210 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700023M03, mRNA (cDNA clone MGC:108928 IMAGE:7382451), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:31891121:31891870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:31873366:31884637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT049434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT049436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
GENSCAN00000001135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:32255900:32274133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054631 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:32549677:32549785:1 gene:ENSRNOG00000050705 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001108082 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 17 (Cdk17), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006241253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 17 (Cdk17), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 17 (Cdk17), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34066669:34144779:1 gene:ENSRNOG00000004148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34024879:34152617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
GENSCAN00000038730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34339351:34380145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0
NM_001030031 // RefSeq // Rattus norvegicus leukotriene A4 hydrolase (Lta4h), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34353506:34385290:1 gene:ENSRNOG00000004494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099819 // GenBank // Rattus norvegicus leukotriene A4 hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:124681 IMAGE:7930840), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT049445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34339351:34380145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT049447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_017159 // RefSeq // Rattus norvegicus histidine ammonia lyase (Hal), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000006971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34391142:34421405:1 gene:ENSRNOG00000004502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// BC089809 // GenBank // Rattus norvegicus histidine ammonia lyase, mRNA (cDNA clone MGC:108720 IMAGE:7325816), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// M58308 // GenBank // Rattus norvegicus histidase mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT049448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000017177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34391150:34419134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1
XM_001080322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 38 (Ccdc38), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// XM_006226005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 38 (Ccdc38), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// XR_347714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 38 (Ccdc38), transcript variant X7, misc_RNA. // chr7 // 89 // 82 // 25 // 28 // 0 /// XR_347715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 38 (Ccdc38), transcript variant X8, misc_RNA. // chr7 // 93 // 82 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030976 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:34514851:34542656:1 gene:ENSRNOG00000021892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 76 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030985 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:34503795:34542656:1 gene:ENSRNOG00000021892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// XM_006226007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 38 (Ccdc38), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// XM_006226008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 38 (Ccdc38), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// GENSCAN00000017206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34506791:34542053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 76 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT049451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001106780 // RefSeq // Rattus norvegicus netrin 4 (Ntn4), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34599083:34705852:1 gene:ENSRNOG00000005573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34599252:34719215:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT049453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001108083 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 44 (Usp44), mRNA. // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34803452:34818325:1 gene:ENSRNOG00000005637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34805044:34818173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001137645 // RefSeq // Rattus norvegicus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 6 (Fgd6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000059068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:35009998:35131012:1 gene:ENSRNOG00000006701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000057015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:35009737:35234016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT049458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_145780 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 2, group C, member 1 (Nr2c1), mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:35137598:35189641:1 gene:ENSRNOG00000006983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC061822 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 2, group C, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72289 IMAGE:5599041), complete cds. // chr7 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// L26398 // GenBank // Rattus norvegicus orphan receptor (TR2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:35009737:35234016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT049461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT049463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001106781 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 12 (Ndufa12), mRNA. // chr7 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000010117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:35193809:35229886:1 gene:ENSRNOG00000007407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000057015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:35009737:35234016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
NM_001108084 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 3 (Tmcc3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 3 (Tmcc3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006241261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 3 (Tmcc3), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006241262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 3 (Tmcc3), transcript variant X8, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:35536671:35608377:1 gene:ENSRNOG00000007713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:35536846:35606742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT049468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001014266 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 83 (Cep83), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:35838379:35911635:1 gene:ENSRNOG00000007859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072047 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:74412255:74414036:-1 gene:ENSRNOG00000046832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC081969 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 41, mRNA (cDNA clone MGC:94102 IMAGE:7125504), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:35881349:35910239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000042225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:35818704:35869064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:74405712:74414036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT049472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT049474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSRNOT00000071221 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:36216915:36217225:1 gene:ENSRNOG00000046659 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 68 // 95 // 13 // 19 // 0
NONRATT049480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT049481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108086 // RefSeq // Rattus norvegicus early endosome antigen 1 (Eea1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:37144349:37233282:1 gene:ENSRNOG00000021681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:37067210:37229863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT049482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017258 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell translocation gene 1, anti-proliferative (Btg1), mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:37858321:37860578:1 gene:ENSRNOG00000004284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// L26268 // GenBank // Rattus norvegicus anti-proliferative factor (BTG1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:37836179:37859632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
ENSRNOT00000045255 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:38170311:38171278:1 gene:ENSRNOG00000029422 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:38144282:38217345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
NM_024129 // RefSeq // Rattus norvegicus decorin (Dcn), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:38783714:38823738:1 gene:ENSRNOG00000004554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083750 // GenBank // Rattus norvegicus decorin, mRNA (cDNA clone MGC:94682 IMAGE:7192499), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ210569 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA26YG17 mRNA sequence. // chr7 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// FQ220209 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YM16 mRNA sequence. // chr7 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// FQ222451 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YD20 mRNA sequence. // chr7 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT049491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:38786986:38864665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_031050 // RefSeq // Rattus norvegicus lumican (Lum), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:38861407:38868210:1 gene:ENSRNOG00000004610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061878 // GenBank // Rattus norvegicus lumican, mRNA (cDNA clone MGC:72416 IMAGE:5599252), complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// FQ221670 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA33YD15 mRNA sequence. // chr7 // 71 // 54 // 10 // 14 // 0 /// FQ230097 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YK13 mRNA sequence. // chr7 // 58 // 92 // 14 // 24 // 0 /// NONRATT049493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108087 // RefSeq // Rattus norvegicus keratocan (Kera), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:38899411:38906864:1 gene:ENSRNOG00000004635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:38901001:38906126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT049494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108088 // RefSeq // Rattus norvegicus epiphycan (Epyc), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XR_355419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epiphycan (Epyc), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:38938395:38975915:1 gene:ENSRNOG00000004717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:38941710:38976102:1 gene:ENSRNOG00000004717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC161903 // GenBank // Rattus norvegicus epiphycan, mRNA (cDNA clone MGC:187623 IMAGE:8367209), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:38937469:38975353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT049495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001025052 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil glutamate-rich protein 1 (Ccer1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil glutamate-rich protein 1 (Ccer1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:38986747:38988479:1 gene:ENSRNOG00000004875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:38987127:38988329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053311 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Ca++ transporting, plasma membrane 1 (Atp2b1), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:41154017:41259749:1 gene:ENSRNOG00000004026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000005491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:41154017:41259749:1 gene:ENSRNOG00000004026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:41154017:41259749:1 gene:ENSRNOG00000004026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:41154017:41256887:1 gene:ENSRNOG00000004026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// J03753 // GenBank // Rat plasma membrane Ca2+ ATPase-isoform 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:41206723:41259602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT049511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_002729781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POC1 centriolar protein B (Poc1b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000031905 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:41330541:41439226:1 gene:ENSRNOG00000024450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000058937 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:41330541:41439226:1 gene:ENSRNOG00000024450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075253 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:41341075:41439226:1 gene:ENSRNOG00000024450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// FQ233318 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YF11 mRNA sequence. // chr7 // 79 // 73 // 19 // 24 // 0 /// NONRATT049522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:41358982:41387914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001025053 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4 (Galnt4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB040675 // GenBank // Rattus norvegicus GalNAc-T4 mRNA for UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-4, complete cds. // chr7 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC105818 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4 (GalNAc-T4), mRNA (cDNA clone MGC:125173 IMAGE:7368805), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:41263642:41345535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT049522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053883 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 6 (Dusp6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:41506397:41510626:1 gene:ENSRNOG00000023896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087003 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 6, mRNA (cDNA clone MGC:93276 IMAGE:7124105), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ217285 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA30YG09 mRNA sequence. // chr7 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// U42627 // GenBank // Rattus norvegicus dual-specificity protein tyrosine phosphatase (rVH6) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:41480655:41509451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_021843 // RefSeq // Rattus norvegicus KIT ligand (Kitlg), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_021844 // RefSeq // Rattus norvegicus KIT ligand (Kitlg), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:42337401:42383921:1 gene:ENSRNOG00000005386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:42337401:42383921:1 gene:ENSRNOG00000005386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AB105879 // GenBank // Rattus norvegicus scf mRNA for stem cell factor KL-2, complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AF071204 // GenBank // Rattus norvegicus stem cell factor KL-1 precursor, mRNA, complete cds. // chr7 // 87 // 70 // 20 // 23 // 0 /// AF071205 // GenBank // Rattus norvegicus stem cell factor KL-2 precursor, mRNA, complete cds. // chr7 // 85 // 61 // 17 // 20 // 0 /// M59966 // GenBank // Rat stem cell factor (SCF) mRNA, 5 end. // chr7 // 94 // 52 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT049528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000024565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:42354283:42371910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
ENSRNOT00000028985 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:42437833:42438832:1 gene:ENSRNOG00000023135 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 56 // 100 // 10 // 18 // 0
NM_001135755 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 290 (Cep290), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000038631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:40256312:40344956:1 gene:ENSRNOG00000006822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// GENSCAN00000023509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:40261097:40344360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 45 // 45 // 0
NM_001024352 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ35821 (LOC500827), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ35821 (LOC500827), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006241292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ35821 (LOC500827), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009695 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:40357119:40389241:1 gene:ENSRNOG00000007344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:40370255:40397515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT049508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT049506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000030321 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:43631646:43632877:1 gene:ENSRNOG00000023762 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:43631622:43632652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001135814 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase, isozyme C (putative) (Mgat4c), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:43829446:44052611:1 gene:ENSRNOG00000004149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:43917867:44071744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT049531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_022959 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family (N-terminal) member 9 (Rassf9), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:44205842:44207104:1 gene:ENSRNOG00000038574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// AF056208 // GenBank // Rattus norvegicus PAM COOH-terminal interactor protein 1 (PCIP1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:44175747:44207104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT049532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_172321 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neutral amino acid transporter), member 15 (Slc6a15), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000029208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:45349000:45402668:1 gene:ENSRNOG00000027468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L22022 // GenBank // Rat orphan transporter v7-3 (NTT73) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:45370672:45401698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000053480 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:47093399:47093517:1 gene:ENSRNOG00000035357 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001108090 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 59 (Ccdc59), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:47942423:47948975:1 gene:ENSRNOG00000004183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ215430 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YE10 mRNA sequence. // chr7 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:47942847:47948583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108745 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, f polypeptide (PTPRF), interacting protein (liprin), alpha 2 (Ppfia2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:48882184:49058116:1 gene:ENSRNOG00000004353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:48868146:49046762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT049539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_053514 // RefSeq // Rattus norvegicus lin-7 homolog a (C. elegans) (Lin7a), mRNA. // chr7 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// XM_006241305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein lin-7 homolog A-like (LOC100911013), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:49443197:49637732:1 gene:ENSRNOG00000004527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:49443158:49666753:1 gene:ENSRNOG00000004527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AF090134 // GenBank // Rattus norvegicus lin-7-Ba mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// AF090135 // GenBank // Rattus norvegicus lin-7-Bb mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// XR_355452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein lin-7 homolog A-like (LOC100911160), ncRNA. // chr7 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// GENSCAN00000001002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:49537148:49637732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT049543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_053890 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 12A (Ppp1r12a), mRNA. // chr7 // 94 // 98 // 46 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000006773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:51419607:51527799:-1 gene:ENSRNOG00000004925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 100 // 49 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000041473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:51419607:51527799:-1 gene:ENSRNOG00000004925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 96 // 47 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000050037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:51419607:51527799:-1 gene:ENSRNOG00000004925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 98 // 48 // 49 // 0 /// FQ225612 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YH01 mRNA sequence. // chr7 // 86 // 28 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:51419887:51540454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 84 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT051334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT051333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 15 // 50 // 1 /// NONRATT051335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 15 // 50 // 1 /// NONRATT051336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 15 // 50 // 1
NM_033485 // RefSeq // Rattus norvegicus PRKC, apoptosis, WT1, regulator (Pawr), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:51286670:51365775:-1 gene:ENSRNOG00000005917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U05989 // GenBank // Rattus norvegicus clone par-4 induced by effectors of apoptosis mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:51266538:51300163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001108092 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F transcription factor 7 (E2f7), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E2F transcription factor 7 (E2f7), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:53286862:53326929:1 gene:ENSRNOG00000026252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:53318583:53326221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT049548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:53290261:53313388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
BC086356 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine and glycine-rich protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:105286 IMAGE:7303714), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_177425 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine and glycine-rich protein 2 (Csrp2), mRNA. // chr7 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// ENSRNOT00000067011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:53641861:53660495:1 gene:ENSRNOG00000003772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// U44948 // GenBank // Rattus norvegicus smooth muscle cell LIM protein (SmLIM) mRNA, complete cds. // chr7 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// NONRATT049552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
XM_003754284 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 8 (Osbpl8), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000058589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:54031596:54036553:1 gene:ENSRNOG00000026962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// BC168899 // GenBank // Rattus norvegicus similar to oxysterol-binding protein-like protein 8 isoform a, mRNA (cDNA clone MGC:189166 IMAGE:7455687), complete cds. // chr7 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// GENSCAN00000009019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54015918:54036485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:53980071:54012144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT049556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// NONRATT049559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
ENSRNOT00000008623 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:54013957:54015239:1 gene:ENSRNOG00000038453 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000009024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54013957:54015239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001109286 // RefSeq // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 10 (Bbs10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:54041088:54044111:1 gene:ENSRNOG00000026913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC160915 // GenBank // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 10 (human), mRNA (cDNA clone MGC:188655 IMAGE:7457522), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54041136:54051724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT049560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053561 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleosome assembly protein 1-like 1 (Nap1l1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000005286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:54238052:54261360:1 gene:ENSRNOG00000003890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ230040 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YN12 mRNA sequence. // chr7 // 90 // 67 // 9 // 10 // 0 /// XM_006241342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleosome assembly protein 1-like 1 (Nap1l1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 1 /// AF062594 // GenBank // Rattus norvegicus nucleosome assembly protein mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 93 // 14 // 15 // 1 /// XM_006241343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleosome assembly protein 1-like 1 (Nap1l1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// NONRATT049562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT049563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT049568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT049566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// GENSCAN00000009029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54248782:54269476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// NONRATT049565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// NONRATT049569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_017180 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family A, member 1 (Phlda1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:54272090:54274294:1 gene:ENSRNOG00000004019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF192802 // GenBank // Rattus norvegicus proline- and glutamine-rich protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54272091:54273311:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT049570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001108094 // RefSeq // Rattus norvegicus KRR1, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (Krr1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000063917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:54780329:54791757:1 gene:ENSRNOG00000004035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC128768 // GenBank // Rattus norvegicus HIV-1 Rev binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:156779 IMAGE:7125536), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54765462:54791385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT049573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006241337 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcyphosine 2 (Caps2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006241338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcyphosine 2 (Caps2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001108990 // RefSeq // Rattus norvegicus calcyphosine 2 (Caps2), mRNA. // chr7 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000039141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:54882267:54939800:1 gene:ENSRNOG00000026600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000002727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54893360:54990098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT049576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSRNOT00000005413 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:54973901:54975068:1 gene:ENSRNOG00000004065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 60 // 10 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54893360:54990098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NONRATT049580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001078700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, C3H1-type containing (Zfc3h1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000005541 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:58375094:58436158:1 gene:ENSRNOG00000004106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000058444 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:58425817:58435426:1 gene:ENSRNOG00000004106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// BC085360 // GenBank // Rattus norvegicus proline/serine-rich coiled-coil 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7303805), partial cds. // chr7 // 100 // 33 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000023260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58422114:58435426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58375094:58415598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// NONRATT049585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_133526 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 8 (Tspan8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:58821747:58854524:1 gene:ENSRNOG00000004411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC061785 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 8, mRNA (cDNA clone MGC:72317 IMAGE:5623788), complete cds. // chr7 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// FQ215234 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YB16 mRNA sequence. // chr7 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// FQ233158 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YP18 mRNA sequence. // chr7 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// FQ229427 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YP07 mRNA sequence. // chr7 // 62 // 41 // 8 // 13 // 0 /// NONRATT049589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58807717:58861379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT049590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001113390 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, R (Ptprr), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_053594 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, R (Ptprr), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:59041711:59335373:1 gene:ENSRNOG00000004483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC089186 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, R, mRNA (cDNA clone MGC:105367 IMAGE:7315399), complete cds. // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// D38292 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein tyrosine phosphatase PCPTP1, complete cds. // chr7 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// D64050 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for tyrosine phosphatase CBPTP, complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U14914 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase PC12-PTP1 (PTP) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT049591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59299438:59351354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000038611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59221546:59292753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NONRATT049591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003750321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, B (Ptprb), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:59359196:59432648:1 gene:ENSRNOG00000004840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59368551:59432899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
GENSCAN00000009433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59628152:59630005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001191783 // RefSeq // Rattus norvegicus bestrophin 3 (Best3), mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bestrophin 3 (Best3), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60016746:60057900:1 gene:ENSRNOG00000005491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// FQ222375 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YE18 mRNA sequence. // chr7 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// GENSCAN00000021832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59975012:60056956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_207614 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA 2,3-cyclic phosphate and 5-OH ligase (Rtcb), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000006570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24063301:24082716:1 gene:ENSRNOG00000004813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000007332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60070558:60072604:1 gene:ENSRNOG00000005546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 100 // 33 // 37 // 0 /// AY572415 // GenBank // Rattus norvegicus focal adhesion associated protein (Faap) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// BC078924 // GenBank // Rattus norvegicus P55, mRNA (cDNA clone MGC:93713 IMAGE:7106266), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000021834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60070593:60072133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24063354:24082358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT049329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// NONRATT049603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT049330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// NONRATT049331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001108096 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat-containing 10 (Lrrc10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60099184:60100581:1 gene:ENSRNOG00000005555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073117 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:60087722:60088543:1 gene:ENSRNOG00000049607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60099252:60100073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60087722:60090794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001128494 // RefSeq // Rattus norvegicus lysozyme C type 2 (Lyc2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC166737 // GenBank // Rattus norvegicus lysozyme C type 2, mRNA (cDNA clone MGC:188464 IMAGE:7937244), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000064594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60318027:60325591:1 gene:ENSRNOG00000034139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60318278:60337003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT049605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 71 // 11 // 12 // 0
NM_001108098 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase M (Cpm), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000044413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60654168:60714583:1 gene:ENSRNOG00000034134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60621045:60714146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000009529 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:60868262:60868700:1 gene:ENSRNOG00000007273 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 86 // 93 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60868262:60923031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NM_001017459 // RefSeq // Rattus norvegicus Mdm1 nuclear protein homolog (mouse) (Mdm1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006241386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mdm1 nuclear protein homolog (mouse) (Mdm1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006241387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mdm1 nuclear protein homolog (mouse) (Mdm1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:61171143:61197122:1 gene:ENSRNOG00000007286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC087101 // GenBank // Rattus norvegicus Mdm1 nuclear protein homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:94684 IMAGE:7192579), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT049614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:61112571:61201355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_001191988 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 22 (Il22), mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:61232296:61236761:1 gene:ENSRNOG00000007365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:61216001:61236761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_138880 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon gamma (Ifng), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:61333602:61337640:1 gene:ENSRNOG00000007468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF010466 // GenBank // Rattus norvegicus interferon gamma (IFN-gamma) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:61333604:61337603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT049641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT049643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_199116 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane BAX inhibitor motif containing 4 (Tmbim4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000005694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:65206720:65221307:1 gene:ENSRNOG00000004312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC060596 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane BAX inhibitor motif containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:73002 IMAGE:6889044), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000028749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:65206786:65227684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT049646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT049647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001134464 // RefSeq // Rattus norvegicus LLP homolog, long-term synaptic facilitation (Aplysia) (Llph), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000005794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:65224652:65227684:1 gene:ENSRNOG00000004316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 69 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:135075500:135076578:1 gene:ENSRNOG00000005718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// BC158738 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1190005P17, mRNA (cDNA clone MGC:187906 IMAGE:9099223), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT049648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT049649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:65206786:65227684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// GENSCAN00000001336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135075512:135126834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1
NM_001271541 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine interacting protein (Styx), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:62894479:62895150:1 gene:ENSRNOG00000004453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000010612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23654558:23681602:1 gene:ENSRNOG00000007956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000014341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:62894479:62895150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000057074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23669683:23681602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_053738 // RefSeq // Rattus norvegicus Wnt inhibitory factor 1 (Wif1), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XR_355525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wnt inhibitory factor 1 (Wif1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000006426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:63077688:63147645:1 gene:ENSRNOG00000004476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AY030278 // GenBank // Rattus norvegicus Wnt inhibitor factor 1 (Wif1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC072473 // GenBank // Rattus norvegicus Wnt inhibitory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:91560 IMAGE:7100360), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT049621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000014352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63119507:63266818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// NONRATT049622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT049623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1
XM_001081056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S10-like (RGD1561871), mRNA. // chr7 // 83 // 75 // 10 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000046453 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:63575936:63576557:1 gene:ENSRNOG00000030441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 75 // 10 // 12 // 0
NM_001011989 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase (Gns), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006226033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetylglucosamine-6-sulfatase-like (LOC100909505), mRNA. // chr7 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000006566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:65824339:65858941:1 gene:ENSRNOG00000046159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:63691030:63722905:1 gene:ENSRNOG00000047350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC087741 // GenBank // Rattus norvegicus glucosamine (N-acetyl)-6-sulfatase, mRNA (cDNA clone MGC:105737 IMAGE:7314130), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63691030:63722905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:65824357:65893767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
XM_006241424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1561648 (RGD1561648), partial mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// XR_355530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555868 (LOC102555868), misc_RNA. // chr7 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:63969915:64084062:1 gene:ENSRNOG00000023824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC166520 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1561648, mRNA (cDNA clone MGC:188103 IMAGE:7133986), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT049636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63969925:64107039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT049637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_001109287 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein LOC270802 (RGD1565498), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_001271273 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein LOC270802 (RGD1565498), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000043581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:64146261:64159524:1 gene:ENSRNOG00000028782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:64151371:64158824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT049638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
XM_002726955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sentrin-specific protease 2-like (RGD1561410), partial mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051577 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:64514648:64515961:1 gene:ENSRNOG00000023774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:64514507:64515961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:65926182:65930020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000031284 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:65926395:65927690:1 gene:ENSRNOG00000038174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
XM_002726955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sentrin-specific protease 2-like (RGD1561410), partial mRNA. // chr7 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051577 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:64514648:64515961:1 gene:ENSRNOG00000023774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000031284 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:65926395:65927690:1 gene:ENSRNOG00000038174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 79 // 100 // 30 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:64514507:64515961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000010533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:65926182:65930020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 87 // 29 // 33 // 0
NM_173147 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 54 homolog (S. cerevisiae) (Vps54), mRNA. // chr7 // 38 // 100 // 8 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000030387 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:64612338:64613159:1 gene:ENSRNOG00000023747 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
NM_053019 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine vasopressin receptor 1A (Avpr1a), mRNA. // chr7 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:67528203:67532266:-1 gene:ENSRNOG00000004400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC088095 // GenBank // Rattus norvegicus arginine vasopressin receptor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:108538 IMAGE:7321427), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:67528438:67532041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001271079 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1H (Ppm1h), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// XM_006241438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1H (Ppm1h), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:67042623:67310367:-1 gene:ENSRNOG00000004314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000066381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:67042623:67105309:-1 gene:ENSRNOG00000004314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// BC088307 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1H (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:109521 IMAGE:7324259), complete cds. // chr7 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 25 // 43 // 1 /// NONRATT051477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 28 // 43 // 1 /// GENSCAN00000018756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:67059027:67100272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// GENSCAN00000018758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:67149300:67224690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
XM_006226043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A2 (Fam19a2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A2 (Fam19a2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A2 (Fam19a2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005537 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:66241454:66373683:-1 gene:ENSRNOG00000004180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000010428 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:68368445:68368950:1 gene:ENSRNOG00000007904 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054632 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:68368863:68368971:1 gene:ENSRNOG00000049158 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:68341473:68368829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000032786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:69404288:69454370:1 gene:ENSRNOG00000007654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// BC100645 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7930869, with apparent retained intron. // chr7 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// BC168689 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:188535 IMAGE:7932903), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000030325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:69372104:69454058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT049667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT049668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 67 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1
NM_053593 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 4 (Cdk4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70527541:70530390:1 gene:ENSRNOG00000025602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC063158 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:6921199), partial cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC070956 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:91543 IMAGE:7104124), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L11007 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 4 (cdk4) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ225857 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YO15 mRNA sequence. // chr7 // 67 // 92 // 22 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70527565:70532514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT049672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_023026 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 2 (Agap2), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000031230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70542515:70555124:1 gene:ENSRNOG00000025584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AF280816 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear GTPase PIKE mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 2 (Agap2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 86 // 86 // 38 // 44 // 1 /// GENSCAN00000005736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70542515:70553801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT049675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
XM_006226046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S26-like (RGD1565117), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S26-like (RGD1565117), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000045687 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:70623007:70623570:1 gene:ENSRNOG00000033161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70617923:70623333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_022860 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 1 (B4galnt1), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 1 (B4galnt1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XR_355572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 1 (B4galnt1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr7 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000046099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70630282:70637196:1 gene:ENSRNOG00000004839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC081799 // GenBank // Rattus norvegicus beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyl transferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93424 IMAGE:7133837), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// D17809 // GenBank // Rattus norvegicus GalNAc-T mRNA for beta-4N-acetylgalactosaminyltransferase, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// FQ232922 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YO10 mRNA sequence. // chr7 // 81 // 47 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70630901:70636702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001004239 // RefSeq // Rattus norvegicus dynactin 2 (p50) (Dctn2), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70730174:70745437:1 gene:ENSRNOG00000025481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC079042 // GenBank // Rattus norvegicus dynactin 2, mRNA (cDNA clone MGC:93976 IMAGE:7114929), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70728375:70745105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT049691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT049689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT049692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001109986 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA-damage inducible transcript 3 (Ddit3), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_024134 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA-damage inducible transcript 3 (Ddit3), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70754398:70759220:1 gene:ENSRNOG00000006789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC100664 // GenBank // Rattus norvegicus DNA-damage inducible transcript 3, mRNA (cDNA clone MGC:124604 IMAGE:7932840), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U30186 // GenBank // Rattus norvegicus growth arrest and DNA-damage-inducible protein GADD153 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U36994 // GenBank // Rattus norvegicus GADD153 mRNA, complete cds. // chr7 // 78 // 93 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70756991:70759032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT049695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001130557 // RefSeq // Rattus norvegicus R3H domain containing 2 (R3hdm2), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006241472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain containing 2 (R3hdm2), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain containing 2 (R3hdm2), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain containing 2 (R3hdm2), transcript variant X17, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70870219:70978626:1 gene:ENSRNOG00000007801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT049708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70926510:70996786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT049711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001130558 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 and cysteine rich domain 3 (Stac3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000010639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70981252:70988655:1 gene:ENSRNOG00000008050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ216646 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YM08 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70926510:70996786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT049716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001271272 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 4-like 2 (Ndufa4l2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70995344:70996777:1 gene:ENSRNOG00000031851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70926510:70996786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT049717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT049718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001044250 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 6, interleukin-4 induced (Stat6), mRNA. // chr7 // 97 // 87 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000039306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71118725:71135848:1 gene:ENSRNOG00000025023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// DQ462201 // GenBank // Rattus norvegicus STAT6 (Stat6) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 87 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000040397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71122776:71136055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT049719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT049720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1
NM_019324 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IA (Myo1a), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000005575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71177105:71191860:1 gene:ENSRNOG00000004177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000040446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71177105:71210343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT049721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// NONRATT049722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_019162 // RefSeq // Rattus norvegicus tachykinin 3 (Tac3), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71196645:71203251:1 gene:ENSRNOG00000004229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ224503 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA63YN10 mRNA sequence. // chr7 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// M16410 // GenBank // Rattus norvegicus neurokinin B precursor, mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71177105:71210343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001130537 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 39 (Zbtb39), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71209250:71216714:1 gene:ENSRNOG00000004306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71210993:71213128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199208 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 16 (all-trans) (Rdh16), mRNA. // chr7 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// XM_006226051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rdh2 protein-like (LOC100365958), mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000037218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71230580:71245092:1 gene:ENSRNOG00000029651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 82 // 69 // 9 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000051075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71237866:71245358:1 gene:ENSRNOG00000029651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// BC062000 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:72262 IMAGE:5599919), complete cds. // chr7 // 91 // 69 // 10 // 11 // 0 /// U33500 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase type II mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT049725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT049726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
XM_006226054 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 9C, member 7 (Sdr9c7), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006226055 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 9C, member 7 (Sdr9c7), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 9C, member 7 (Sdr9c7), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 9C, member 7 (Sdr9c7), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005919 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:71329687:71340908:1 gene:ENSRNOG00000004459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY044435 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase similar protein (Rdhs) mRNA, partial cds. // chr7 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71329687:71340908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001012113 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylserine synthase 1 (Ptdss1), mRNA. // chr7 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71466006:71525416:1 gene:ENSRNOG00000004689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC087129 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylserine synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94919 IMAGE:7112273), complete cds. // chr7 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT049728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71483634:71524700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT049729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_013082 // RefSeq // Rattus norvegicus syndecan 2 (Sdc2), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syndecan 2 (Sdc2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71743813:71857533:1 gene:ENSRNOG00000004936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC070890 // GenBank // Rattus norvegicus syndecan 2, mRNA (cDNA clone MGC:91773 IMAGE:7098631), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ222974 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YN14 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// M81687 // GenBank // Rat core protein (HSPG) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71805338:71855174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT049732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT049733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_031640 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase Q (Cpq), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71880824:72338526:1 gene:ENSRNOG00000005931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF097723 // GenBank // Rattus norvegicus hematopoietic lineage switch 2 related protein (Hls2-rp) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF131077 // GenBank // Rattus norvegicus liver annexin-like protein (LAL) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC070884 // GenBank // Rattus norvegicus plasma glutamate carboxypeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:91627 IMAGE:7098277), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000011657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71974958:72140834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT049736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
XM_001058023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S18-like (RGD1562404), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_234780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S18-like (RGD1562404), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051652 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:72772850:72778493:1 gene:ENSRNOG00000032484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:72772893:72825804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133398 // RefSeq // Rattus norvegicus metadherin (Mtdh), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:72939139:72994607:1 gene:ENSRNOG00000006870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:72939139:72994607:1 gene:ENSRNOG00000006870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:72939139:72994607:1 gene:ENSRNOG00000006870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF100421 // GenBank // Rattus norvegicus LYRIC mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73191671:73233368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:72935839:73088260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT049739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT049740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT049741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT049745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT049746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001013174 // RefSeq // Rattus norvegicus lysosomal protein transmembrane 4 beta (Laptm4b), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:73094975:73138156:1 gene:ENSRNOG00000006766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC086442 // GenBank // Rattus norvegicus lysosomal protein transmembrane 4 beta, mRNA (cDNA clone MGC:105539 IMAGE:7303600), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73124690:73133032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_006226198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrilin 2 (Matn2), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_216941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrilin 2 (Matn2), partial mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000008361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:73174202:73376715:1 gene:ENSRNOG00000006060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73288317:73375032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
XM_006226057 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681820 (LOC681820), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007816 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:73406969:73409289:1 gene:ENSRNOG00000005956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73402195:73409289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001130550 // RefSeq // Rattus norvegicus processing of precursor 1, ribonuclease P/MRP subunit (S. cerevisiae) (Pop1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:73436519:73473073:1 gene:ENSRNOG00000005243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ223904 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA83YH09 mRNA sequence. // chr7 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73435481:73472933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_023966 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, delayed-rectifier, subfamily S, member 2 (Kcns2), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:73763134:73765356:1 gene:ENSRNOG00000011369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73747142:73765344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001012118 // RefSeq // Rattus norvegicus odd-skipped related transciption factor 2 (Osr2), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74213951:74221075:1 gene:ENSRNOG00000011136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC079211 // GenBank // Rattus norvegicus odd-skipped related 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94273 IMAGE:7131819), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT049759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_001134886 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 13 homolog B (yeast) (Vps13b), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 58 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000033021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74283881:74879193:1 gene:ENSRNOG00000010865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000034136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74268546:74401328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 27 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT049760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// GENSCAN00000046801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74754807:74892533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 18 // 60 // 1 /// GENSCAN00000034135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74517646:74603707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 18 // 18 // 11 // 60 // 1
XM_006241528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide K (Polr2k), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000013869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:75138464:75141444:1 gene:ENSRNOG00000010408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT049762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT049763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001012116 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 1 (Spag1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006241534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm associated antigen 1 (Spag1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000013801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:75143696:75202277:1 gene:ENSRNOG00000010078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC085828 // GenBank // Rattus norvegicus sperm associated antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:94310 IMAGE:7132502), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000046793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75147038:75201598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001134527 // RefSeq // Rattus norvegicus grainyhead-like 2 (Drosophila) (Grhl2), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:76188472:76317834:1 gene:ENSRNOG00000007000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC168688 // GenBank // Rattus norvegicus grainyhead-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188533 IMAGE:7932577), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT049771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:76241705:76318643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT049772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_024126 // RefSeq // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 1 (Odf1), mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 1 (Odf1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000008700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:77172773:77180529:1 gene:ENSRNOG00000006578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC078708 // GenBank // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 1, mRNA (cDNA clone MGC:93123 IMAGE:7114007), complete cds. // chr7 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// M58677 // GenBank // Rat RT7 mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// M88759 // GenBank // Rat outer dense fiber protein mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT049781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:77172851:77208639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT049782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001011992 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit C1 (Atp6v1c1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006241602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit C1 (Atp6v1c1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78536556:78573997:-1 gene:ENSRNOG00000004846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC089961 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit C1, mRNA (cDNA clone MGC:109315 IMAGE:7314200), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78532303:78558737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT051647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_144762 // RefSeq // Rattus norvegicus brain and acute leukemia, cytoplasmic (Baalc), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006241600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brain and acute leukemia, cytoplasmic (Baalc), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000006411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78416267:78489775:-1 gene:ENSRNOG00000004697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AB073318 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Dem-A20-4, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AF371321 // GenBank // Rattus norvegicus BAALC isoform 1-6-8 (Baalc) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT051645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130536 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled class receptor 6 (Fzd6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus frizzled family receptor 6 (Fzd6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78317823:78349530:-1 gene:ENSRNOG00000004660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78311561:78325258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT051644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001271300 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen triple helix repeat containing 1 (Cthrc1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NM_172333 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen triple helix repeat containing 1 (Cthrc1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78271770:78282052:-1 gene:ENSRNOG00000004578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY136824 // GenBank // Rattus norvegicus collagen triple helix repeat-containing protein 1 (Cthrc1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78272134:78281938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001173558 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 13 (Dcaf13), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78209281:78244263:-1 gene:ENSRNOG00000004301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78209373:78227876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT051640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
XM_001062083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dendrocyte expressed seven transmembrane protein (Dcstamp), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006226060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dendrocyte expressed seven transmembrane protein (Dcstamp), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_235262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dendrocyte expressed seven transmembrane protein (Dcstamp), mRNA. // chrU // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000006243 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:77597525:77598556:-1 gene:ENSRNOG00000004704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:77561264:77728146:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78735022:78831477:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000023369 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:78684010:78684222:1 gene:ENSRNOG00000049047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 42 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000021403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78684013:78714417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001130501 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein, multitype 2 (Zfpm2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:79657649:79976680:1 gene:ENSRNOG00000004109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:79944164:79977077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NONRATT049796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000010509 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:80890700:80891249:1 gene:ENSRNOG00000007987 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 57 // 74 // 8 // 14 // 0
NM_001113785 // RefSeq // Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 2 (Emc2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:82339014:82385900:1 gene:ENSRNOG00000005123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC158805 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 35, mRNA (cDNA clone MGC:188218 IMAGE:7322060), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ214096 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YO14 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:82332456:82379077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT049809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_013047 // RefSeq // Rattus norvegicus thyrotropin releasing hormone receptor (Trhr), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:83121165:83161214:1 gene:ENSRNOG00000005048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M90308 // GenBank // Rat thyrotropin-releasing hormone receptor (TRH-R) mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// D17469 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for thyrotropin releasing hormone receptor, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT049811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001130580 // RefSeq // Rattus norvegicus enhancer of yellow 2 homolog (Drosophila) (Eny2), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of yellow 2 homolog (Drosophila) (Eny2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:83362801:83371599:1 gene:ENSRNOG00000004681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// FQ223243 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YL04 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT049821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001034931 // RefSeq // Rattus norvegicus polycystic kidney and hepatic disease 1-like 1 (Pkhd1l1), mRNA. // chr7 // 98 // 100 // 78 // 80 // 0 /// ENSRNOT00000005958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:83387187:83521467:1 gene:ENSRNOG00000004398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 81 // 63 // 65 // 0 /// ENSRNOT00000057146 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:83387129:83442468:1 gene:ENSRNOG00000004398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 25 // 19 // 20 // 0 /// BC105757 // GenBank // Rattus norvegicus polycystic kidney and hepatic disease 1-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5623427), complete cds. // chr7 // 90 // 25 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:83364189:83564167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 76 // 59 // 61 // 0 /// NONRATT049822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 99 // 98 // 77 // 78 // 0
NM_001009665 // RefSeq // Rattus norvegicus estrogen receptor binding site associated, antigen, 9 (Ebag9), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_006241613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus estrogen receptor binding site associated, antigen, 9 (Ebag9), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000005705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:83579394:83597339:1 gene:ENSRNOG00000004220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC087093 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen receptor binding site associated, antigen, 9, mRNA (cDNA clone MGC:94627 IMAGE:7191226), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:83584303:83596269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT049823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT049825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
XR_347948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Est1p-like protein B (RGD1309489), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_355638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Est1p-like protein B (RGD1309489), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:83817592:83819264:1 gene:ENSRNOG00000024507 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:83749750:83820513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY325224 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1-283 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001126266 // RefSeq // Rattus norvegicus UTP23, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (Utp23), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:92028550:92033826:1 gene:ENSRNOG00000004387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161887 // GenBank // Rattus norvegicus UTP23, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:187462 IMAGE:7134296), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:92009608:92033662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT049838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_145093 // RefSeq // Rattus norvegicus alanine and arginine rich domain containing protein (Aard), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:92232534:92237373:1 gene:ENSRNOG00000004708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY007690 // GenBank // Rattus norvegicus A5D3 protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:92232374:92236682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001130538 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 8 (Slc30a8), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:92476024:92510336:1 gene:ENSRNOG00000004747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:92476333:92553668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT049841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_001130539 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 30 (Med30), mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:92876548:92898051:1 gene:ENSRNOG00000004844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:92876636:92897782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_002729812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S25-like (LOC100359763), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S25-like (LOC100359763), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017602 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:94020341:94020721:1 gene:ENSRNOG00000013191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:94020188:94020721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000031629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:94159129:94159808:1 gene:ENSRNOG00000026659 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:94143805:94159728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130541 // RefSeq // Rattus norvegicus collectin sub-family member 10 (C-type lectin) (Colec10), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:94613483:94674031:1 gene:ENSRNOG00000008591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:94629412:94670322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_198786 // RefSeq // Rattus norvegicus mal, T-cell differentiation protein 2 (Mal2), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:94768727:94801520:1 gene:ENSRNOG00000008615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074549 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:55939162:55967693:-1 gene:ENSRNOG00000046250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// AY079080 // GenBank // Rattus norvegicus MAL2A (Mal2A) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// AY079081 // GenBank // Rattus norvegicus MAL2B (Mal2B) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC062388 // GenBank // Rattus norvegicus mal, T-cell differentiation protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72628 IMAGE:5620891), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_003748700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein MAL2-like (LOC100911027), mRNA. // chr7 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:55939171:55967693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT049846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:94768885:94929106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_030868 // RefSeq // Rattus norvegicus nephroblastoma overexpressed (Nov), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:95015159:95022176:1 gene:ENSRNOG00000008697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF171936 // GenBank // Rattus norvegicus NOV protein (NOV) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC072548 // GenBank // Rattus norvegicus nephroblastoma overexpressed gene, mRNA (cDNA clone MGC:91659 IMAGE:7105981), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95006721:95021823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT049847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001066889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEP domain containing MTOR-interacting protein (Deptor), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:95432383:95620730:1 gene:ENSRNOG00000004328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:95432383:95589000:1 gene:ENSRNOG00000004328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95552306:95620730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130548 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XIV, alpha 1 (Col14a1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000067649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:95678308:95895351:1 gene:ENSRNOG00000026415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000057950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95697682:95852141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0
NM_001130717 // RefSeq // Rattus norvegicus Mdm2, transformed 3T3 cell double minute 2, p53 binding protein (mouse) binding protein (Mtbp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006241656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mdm2, transformed 3T3 cell double minute 2, p53 binding protein (mouse) binding protein (Mtbp), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// XM_006241658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mdm2, transformed 3T3 cell double minute 2, p53 binding protein (mouse) binding protein (Mtbp), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:95931981:96009703:1 gene:ENSRNOG00000004412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000057949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95932341:96020783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT049856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT049857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000054629 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:97818062:97818161:1 gene:ENSRNOG00000036522 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001271056 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 2 (Zhx2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98300087:98302597:1 gene:ENSRNOG00000005417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98300087:98302597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_001134842 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 31 (Tbc1d31), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98385290:98446226:1 gene:ENSRNOG00000006103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98385373:98441968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001130576 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member A (Fam83a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98462331:98486785:1 gene:ENSRNOG00000006251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98462493:98486785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001025024 // RefSeq // Rattus norvegicus WDYHV motif containing 1 (Wdyhv1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98562311:98582049:-1 gene:ENSRNOG00000006700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98562956:98581909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// NONRATT051748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT051746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_006241684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 91, member A1 (Fam91a1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000011797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98904337:98942732:1 gene:ENSRNOG00000008271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// BC166852 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 91, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:188756 IMAGE:9092514), complete cds. // chr7 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000012599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98904557:98984957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 67 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT049871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0
XM_006226072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fer-1-like 6 (C. elegans) (Fer1l6), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 32 // 32 // 0 /// XM_006241685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fer-1-like 6 (C. elegans) (Fer1l6), mRNA. // chr7 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000038973 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:99030714:99150622:1 gene:ENSRNOG00000025300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000012593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:99024152:99144036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 96 // 42 // 43 // 0
NM_001122976 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 12 homolog (S. cerevisiae) (Trmt12), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:99348971:99350595:1 gene:ENSRNOG00000008978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC079303 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 12 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94441 IMAGE:7134578), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC097456 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 12 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114518 IMAGE:7457119), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:99349049:99350362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT049872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001127545 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 139 (Rnf139), mRNA. // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000011891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:99371053:99381956:1 gene:ENSRNOG00000008987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC161975 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 139, mRNA (cDNA clone MGC:187786 IMAGE:9029542), complete cds. // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:99371240:99381709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001130563 // RefSeq // Rattus norvegicus metastasis suppressor 1 (Mtss1), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:99419337:99557952:-1 gene:ENSRNOG00000009001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:99421493:99452662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NONRATT049881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_017136 // RefSeq // Rattus norvegicus squalene epoxidase (Sqle), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000012883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:100196963:100211948:1 gene:ENSRNOG00000009550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC097330 // GenBank // Rattus norvegicus squalene epoxidase, mRNA (cDNA clone MGC:114336 IMAGE:7460860), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// D37920 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for squalene epoxidase, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// FQ210281 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA31YA04 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT049882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:100190850:100212553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_001024876 // RefSeq // Rattus norvegicus non-SMC element 2, MMS21 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC element 2, MMS21 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006241670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC element 2, MMS21 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce2), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000005376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:100263600:100486902:1 gene:ENSRNOG00000003964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097477 // GenBank // Rattus norvegicus non-SMC element 2, MMS21 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114542 IMAGE:7458086), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC element 2, MMS21 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce2), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// XM_006241669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC element 2, MMS21 homolog (S. cerevisiae) (Nsmce2), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:100459815:100486680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT049883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:100267464:100366169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_023985 // RefSeq // Rattus norvegicus tribbles pseudokinase 1 (Trib1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:100534391:100540925:1 gene:ENSRNOG00000004100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:100518550:100562144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001069698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein-like (RGD1563100), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// XM_235352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein-like (RGD1563100), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000006506 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:101278596:101279651:1 gene:ENSRNOG00000004906 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000024911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:101278596:101279651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000024906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:101218868:101248669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006226204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to alpha 1B-glycoprotein (RGD1564515), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to alpha 1B-glycoprotein (RGD1564515), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056894 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:101637587:101640715:1 gene:ENSRNOG00000037549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:101635457:101641504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT049894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
GENSCAN00000025073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:101715303:101739792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_012603 // RefSeq // Rattus norvegicus myelocytomatosis oncogene (Myc), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:103157452:103162376:1 gene:ENSRNOG00000004500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY679729 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI/SegHsd c-myc mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AY679730 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/SsNHsd c-myc mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091699 // GenBank // Rattus norvegicus myelocytomatosis oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:105490 IMAGE:7303974), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:103159617:103161935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT049895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014084 // RefSeq // Rattus norvegicus gasdermin domain containing protein RGD1359449 (RGD1359449), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gasdermin domain containing protein RGD1359449 (RGD1359449), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:91504359:91514579:1 gene:ENSRNOG00000004999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079239 // GenBank // Rattus norvegicus gasdermin domain containing protein RGD1359449, mRNA (cDNA clone MGC:94321 IMAGE:7132649), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:91494775:91514014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT049834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT049835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001130564 // RefSeq // Rattus norvegicus EFR3 homolog A (S. cerevisiae) (Efr3a), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000045357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:106483576:106564947:1 gene:ENSRNOG00000025528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000017054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:106511717:106561429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1 /// NONRATT049909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// NONRATT049911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
ENSRNOT00000041783 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:107202697:107203744:1 gene:ENSRNOG00000029074 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107182100:107203744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
NM_001271439 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 20-like 1 (Phf20l1), mRNA. // chrU // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000007564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:108561906:108700209:1 gene:ENSRNOG00000046527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 41 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000007587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:107345691:107373740:1 gene:ENSRNOG00000005486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// BC096896 // GenBank // Rattus norvegicus PHD finger protein 20-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7389535), complete cds. // chrU // 100 // 41 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107345646:107373740:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:108634504:108719714:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// NONRATT049913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT049928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT049929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT049930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
NM_001270783 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroglobulin (Tg), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// NM_030988 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroglobulin (Tg), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000009240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:107399165:107585123:1 gene:ENSRNOG00000006104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// AB035201 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for thyroglobulin, complete cds. // chr7 // 96 // 98 // 46 // 48 // 0 /// AB679745 // GenBank // Rattus norvegicus Tg mRNA for thyroglobulin, complete cds, strain: Jcl:SD. // chr7 // 98 // 98 // 47 // 48 // 0 /// AB682738 // GenBank // Rattus norvegicus Tg mRNA for thyroglobulin, complete cds, strain: BrlHan:WIST@Jcl(GALAS), wild-type mRNA. // chr7 // 94 // 98 // 45 // 48 // 0 /// AB682739 // GenBank // Rattus norvegicus Tg mRNA for thyroglobulin, complete cds, strain: BrlHan:WIST@Jcl(GALAS), truncated mRNA. // chr7 // 98 // 96 // 46 // 47 // 0 /// AF221622 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344 thyroglobulin mRNA, complete cds. // chr7 // 98 // 98 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000046913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107399205:107513733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT049919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT049920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1
NM_031716 // RefSeq // Rattus norvegicus WNT1 inducible signaling pathway protein 1 (Wisp1), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:107644976:107673495:1 gene:ENSRNOG00000007078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF228049 // GenBank // Rattus norvegicus ELM1 (Elm1) mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC078787 // GenBank // Rattus norvegicus WNT1 inducible signaling pathway protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93340 IMAGE:7131232), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107653866:107672894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT049922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSRNOT00000010996 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:108397264:108397636:1 gene:ENSRNOG00000008326 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:108397270:108397636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0
XM_001072064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.3-like (RGD1564548), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_576283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.3-like (RGD1564548), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000051728 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:109354000:109354410:1 gene:ENSRNOG00000031680 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000044253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:109354000:109409120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 90 // 8 // 9 // 0
NM_022249 // RefSeq // Rattus norvegicus KH domain containing, RNA binding, signal transduction associated 3 (Khdrbs3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:109965262:110111223:1 gene:ENSRNOG00000009539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF152547 // GenBank // Rattus norvegicus Sam68-like protein SLM-2 (Slm-2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT049933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:109942361:110056938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT049934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT049935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_001134880 // RefSeq // Rattus norvegicus chromatin accessibility complex 1 (Chrac1), mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000012121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:114258512:114261899:1 gene:ENSRNOG00000009103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// FQ209946 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA37YG03 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114256228:114261465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT049936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT049937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_001072997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 3 (Dennd3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006226094 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 3 (Dennd3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 3 (Dennd3), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_235398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 3 (Dennd3), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:114658386:114735074:1 gene:ENSRNOG00000010794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114632400:114705085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000015293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114706434:114735074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001114405 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3 (Ptp4a3), mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// XM_006241729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3 (Ptp4a3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// XM_006241731 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3 (Ptp4a3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// XM_006241733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase type IVA, member 3 (Ptp4a3), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000010224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:114918557:114924152:1 gene:ENSRNOG00000007628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// BC159432 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase 4a3, mRNA (cDNA clone MGC:188757 IMAGE:9092581), complete cds. // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000015288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114915526:114923837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000015278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114876182:114896414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT049941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001170597 // RefSeq // Rattus norvegicus brain-specific angiogenesis inhibitor 1 (Bai1), mRNA. // chr7 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115675214:115733670:1 gene:ENSRNOG00000029450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115675443:115699080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000052315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115711554:115733670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0
NONRATT049949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001172106 // RefSeq // Rattus norvegicus prostate stem cell antigen (Psca), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115995508:116154102:1 gene:ENSRNOG00000005887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115995508:115997215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115857450:115857967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001007658 // RefSeq // Rattus norvegicus thioesterase superfamily member 6 (Them6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115861665:115864841:1 gene:ENSRNOG00000005929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083742 // GenBank // Rattus norvegicus mesenchymal stem cell protein DSCD75, mRNA (cDNA clone MGC:94661 IMAGE:7191975), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115861755:115864014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT049951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001073772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like (Gml), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241752 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like (Gml), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_235422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosylphosphatidylinositol anchored molecule like (Gml), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035496 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:115961379:115968467:-1 gene:ENSRNOG00000025641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115961379:115990865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC097997 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7453004. // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENSRNOT00000072652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116029768:116066759:1 gene:ENSRNOG00000046096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NM_001017467 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus E (Ly6e), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus E (Ly6e), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000009333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116253795:116257488:1 gene:ENSRNOG00000007091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079165 // GenBank // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus E, mRNA (cDNA clone MGC:94196 IMAGE:7129625), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT049956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT049957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116203383:116256872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT049958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT049959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001130547 // RefSeq // Rattus norvegicus glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 1 (Gpihbp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116525703:116528750:1 gene:ENSRNOG00000007475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116525741:116527419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XR_348067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910508 (LOC100910508), transcript variant X3, ncRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_355786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910508 (LOC100910508), transcript variant X3, ncRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009823 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:116548746:116549342:1 gene:ENSRNOG00000007489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116548746:116565360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001029926 // RefSeq // Rattus norvegicus GLI family zinc finger 4 (Gli4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// XM_006241855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLI family zinc finger 4 (Gli4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000029711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116565906:116571116:1 gene:ENSRNOG00000021765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// BC097383 // GenBank // Rattus norvegicus similar to GLI-Kruppel family member GLI4, mRNA (cDNA clone MGC:114422 IMAGE:7446306), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// XM_003752188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein GLI4-like (LOC100911986), mRNA. // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT049967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116567629:116570640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006226126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhophilin, Rho GTPase binding protein 1 (Rhpn1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006226127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhophilin, Rho GTPase binding protein 1 (Rhpn1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006241900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhophilin, Rho GTPase binding protein 1 (Rhpn1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhophilin, Rho GTPase binding protein 1 (Rhpn1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010065 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116631700:116641078:1 gene:ENSRNOG00000007597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116631700:116641150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT049971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
GENSCAN00000037491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116750591:116750980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_001130553 // RefSeq // Rattus norvegicus gasdermin D (Gsdmd), mRNA. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000045475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116782280:116786859:1 gene:ENSRNOG00000007728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116783314:116788416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT049974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001126268 // RefSeq // Rattus norvegicus tigger transposable element derived 5 (Tigd5), mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000056527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116835628:116838147:1 gene:ENSRNOG00000008686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC161993 // GenBank // Rattus norvegicus tigger transposable element derived 5, mRNA (cDNA clone MGC:187824 IMAGE:9033247), complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT049978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT049979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000037529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116834161:116838756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
XM_006226131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 623-like (LOC102547932), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 623-like (LOC102547932), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012321 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116873069:116874568:1 gene:ENSRNOG00000009302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT049980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000064286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117012150:117018916:1 gene:ENSRNOG00000009312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC162017 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 1500031N24Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:187894 IMAGE:9098233), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116873072:117018426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT049984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT049985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 85 // 85 // 11 // 13 // 1
NM_173331 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 15 (Mapk15), mRNA. // chr7 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// XM_006241777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 15 (Mapk15), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// XM_006241778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 15 (Mapk15), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000012461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117041464:117046797:1 gene:ENSRNOG00000009336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// AF078798 // GenBank // Rattus norvegicus extracellular signal-regulated kinase 7 mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// BC078691 // GenBank HTC // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:7112172), with apparent retained intron. // chr7 // 97 // 82 // 30 // 31 // 0 /// BC091172 // GenBank HTC // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134108), with apparent retained intron. // chr7 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// FQ212754 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YJ01 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 63 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117041526:117046610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 71 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT049986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
XM_006226132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative IQ motif and ankyrin repeat domain-containing protein LOC642574-like (RGD1563870), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006226134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative IQ motif and ankyrin repeat domain-containing protein LOC642574-like (RGD1563870), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative IQ motif and ankyrin repeat domain-containing protein LOC642574-like (RGD1563870), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117078593:117091270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153308 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate-associated protein 1 (glutamate binding) (Grina), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate-associated protein 1 (glutamate binding) (Grina), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117290445:117293619:1 gene:ENSRNOG00000029941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC062074 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate-associated protein 1 (glutamate binding), mRNA (cDNA clone MGC:72284 IMAGE:5599428), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117288229:117293079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT049994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001115026 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis and centriole associated 1 (Spatc1), mRNA. // chr7 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000050522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117312037:117335715:1 gene:ENSRNOG00000029590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// BC083658 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7135262. // chr7 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// BC158623 // GenBank // Rattus norvegicus similar to sphingomyelin phosphodiesterase 3, neutral membrane, mRNA (cDNA clone MGC:187526 IMAGE:7454231), complete cds. // chr7 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117312121:117339644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000056421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117337460:117339998:1 gene:ENSRNOG00000037299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166812 // GenBank // Rattus norvegicus similar to sphingomyelin phosphodiesterase 3, neutral membrane, mRNA (cDNA clone IMAGE:7454302), partial cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT049999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT050000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117312121:117339644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT050001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NM_001134860 // RefSeq // Rattus norvegicus exosome component 4 (Exosc4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117377932:117380674:1 gene:ENSRNOG00000012348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117377970:117380344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004240 // RefSeq // Rattus norvegicus glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 (Gpaa1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000048706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117381997:117385579:1 gene:ENSRNOG00000029280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC078984 // GenBank // Rattus norvegicus glycosylphosphatidylinositol anchor attachment protein 1 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:93877 IMAGE:7112302), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ214475 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YI01 mRNA sequence. // chr7 // 85 // 38 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000003122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117382075:117385506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT050005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT050003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_001277194 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c-1 (Cyc1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099171 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7382543. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017067 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:117397227:117399580:1 gene:ENSRNOG00000012457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117397240:117399403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT050009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT050008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT050010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT050011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001014085 // RefSeq // Rattus norvegicus MAF1 homolog (S. cerevisiae) (Maf1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117405317:117408349:1 gene:ENSRNOG00000013514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083712 // GenBank // Rattus norvegicus MAF1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94603 IMAGE:7190634), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117406443:117417017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT050014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT050016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT050018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT050019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
XM_006226139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein KIAA1875-like (RGD1562063), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein KIAA1875-like (RGD1562063), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049198 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:117408528:117417017:1 gene:ENSRNOG00000033520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117406443:117417017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001007707 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 203, member A (Fam203a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117422049:117424835:1 gene:ENSRNOG00000029238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079158 // GenBank // Rattus norvegicus brain protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:94185 IMAGE:7129210), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117422125:117423835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001103364 // RefSeq // Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 1 (Mroh1), mRNA. // chr7 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000051754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117432821:117459811:1 gene:ENSRNOG00000030355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000003123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117451554:117502124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT050028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
GENSCAN00000003123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117451554:117502124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT050031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT050032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001130508 // RefSeq // Rattus norvegicus scleraxis (Scx), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117506706:117508724:1 gene:ENSRNOG00000021812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC169036 // GenBank // Rattus norvegicus scleraxis, mRNA (cDNA clone MGC:189419 IMAGE:7105960), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117506871:117508385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_024393 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock transcription factor 1 (Hsf1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock transcription factor 1 (Hsf1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000050108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117526154:117553109:1 gene:ENSRNOG00000021732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117525965:117552470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0
NM_001109670 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2 (Slc52a2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006241821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2 (Slc52a2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006241822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2 (Slc52a2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000047380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117592708:117598130:1 gene:ENSRNOG00000032561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AB362535 // GenBank // Rattus norvegicus RFT1 mRNA for riboflavin transporter 1, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC133726 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 172B, mRNA (cDNA clone MGC:156736 IMAGE:7104339), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117593149:117594925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT050041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
BC168693 // GenBank // Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:188570 IMAGE:7935927), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NM_001135798 // RefSeq // Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 5 (Adck5), mRNA. // chr7 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000044893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117631880:117649865:1 gene:ENSRNOG00000030334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 91 // 32 // 35 // 1 /// GENSCAN00000048828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117631785:117649730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT050044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT050046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT050045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_198752 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member C2 (Kifc2), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006241805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member C2 (Kifc2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000043778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117711349:117718783:1 gene:ENSRNOG00000031748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AJ250330 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for KIFC2 protein, alternative splice variant. // chr7 // 89 // 92 // 31 // 35 // 0 /// FQ211833 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA78YM17 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117711297:117718027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 82 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT050049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT050050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT050053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// NONRATT050051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT050052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_001130566 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 16A (Ppp1r16a), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117722085:117745228:1 gene:ENSRNOG00000015450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117741159:117744980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT050059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_031039 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamic-pyruvate transaminase (alanine aminotransferase) (Gpt), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006241893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamic-pyruvate transaminase (alanine aminotransferase) (Gpt), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000050556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117747058:117749910:1 gene:ENSRNOG00000033915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC085728 // GenBank // Rattus norvegicus glutamic pyruvic transaminase 1, soluble, mRNA (cDNA clone IMAGE:7192757). // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC097937 // GenBank // Rattus norvegicus glutamic-pyruvate transaminase (alanine aminotransferase), mRNA (cDNA clone MGC:116056 IMAGE:7324977), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000048848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117747175:117749774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT050060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT050061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT050063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001024908 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 3 (Mfsd3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117751879:117753881:1 gene:ENSRNOG00000015685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097424 // GenBank // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:114471 IMAGE:7455079), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117752000:117753752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT050064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001024354 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 14 (Lrrc14), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117761927:117767484:1 gene:ENSRNOG00000016128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC092583 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:108882 IMAGE:7376401), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// FQ213127 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YJ07 mRNA sequence. // chr7 // 79 // 48 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000048849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117765328:117767100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT050068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
XM_003750369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 7-like (LOC100910444), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 7 (Zfp7), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001142757 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 7 (Zfp7), mRNA. // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000064873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:118481160:118486167:1 gene:ENSRNOG00000042386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000060181 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:117935817:117938762:1 gene:ENSRNOG00000048868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118468210:118496482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000048829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117933725:117949077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_139108 // RefSeq // Rattus norvegicus COMM domain containing 5 (Commd5), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:118495338:118496759:1 gene:ENSRNOG00000004484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117948403:117949077:1 gene:ENSRNOG00000050582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// AF290194 // GenBank // Rattus norvegicus hypertension-related calcium-regulated gene mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118468210:118496482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000048829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117933725:117949077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_003750371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681282 (LOC681282), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// XM_003754313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681282 (LOC681282), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// XM_006226142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681282 (LOC681282), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// XM_006241922 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681282 (LOC681282), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041750 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:118007781:118009440:1 gene:ENSRNOG00000034107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT050070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001013175 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein L, 3 (Apol3), transcript variant 2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001277359 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein L, 3 (Apol3), transcript variant 1, mRNA. // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:118682730:118691564:1 gene:ENSRNOG00000042771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086447 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein L, 3, mRNA (cDNA clone MGC:106019 IMAGE:7304352), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225154 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YP09 mRNA sequence. // chrU // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// FQ233422 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YO16 mRNA sequence. // chrU // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118685585:118691266:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001134801 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to apolipoprotein L2; apolipoprotein L-II (RGD1309808), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// XM_006241934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to apolipoprotein L2; apolipoprotein L-II (RGD1309808), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// XM_006241936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to apolipoprotein L2; apolipoprotein L-II (RGD1309808), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// XM_006241951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein L3-like (LOC100911562), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:118709584:118715951:1 gene:ENSRNOG00000046779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:118958573:118964940:1 gene:ENSRNOG00000047782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000022832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118935806:118964940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000022846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:118706895:118715951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000054626 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:119284569:119284654:1 gene:ENSRNOG00000036519 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001127304 // RefSeq // Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 4 (Ncf4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119473859:119490871:1 gene:ENSRNOG00000006940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC167076 // GenBank // Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:189418 IMAGE:7129758), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119477699:119490628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_133555 // RefSeq // Rattus norvegicus colony stimulating factor 2 receptor, beta, low-affinity (granulocyte-macrophage) (Csf2rb), mRNA. // chr7 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119544873:119558539:1 gene:ENSRNOG00000000187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119545024:119558487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_138843 // RefSeq // Rattus norvegicus mercaptopyruvate sulfurtransferase (Mpst), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119614631:119622095:1 gene:ENSRNOG00000000185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086575 // GenBank // Rattus norvegicus mercaptopyruvate sulfurtransferase, mRNA (cDNA clone MGC:105317 IMAGE:7306783), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D50564 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mercaptopyruvate sulfurtransferase, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ227898 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YF12 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ215734 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YO21 mRNA sequence. // chr7 // 44 // 100 // 12 // 27 // 0 /// FQ218521 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YJ15 mRNA sequence. // chr7 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// NONRATT050088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT050089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119617338:119637156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001130577 // RefSeq // Rattus norvegicus cytohesin 4 (Cyth4), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:119809478:119833941:1 gene:ENSRNOG00000007679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:119801391:119861395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001079700 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1 (Cdc42ep1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1 (Cdc42ep1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120058685:120062286:1 gene:ENSRNOG00000008517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128744 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 1, mRNA (cDNA clone MGC:156690 IMAGE:7097485), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120058823:120061320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT050102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011994 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1 (Gga1), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006241973 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1 (Gga1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000063876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120098422:120111258:1 gene:ENSRNOG00000008897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC090031 // GenBank // Rattus norvegicus golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:109601 IMAGE:7366311), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000049178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120095584:120110523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT050104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
NM_001171981 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3-domain binding protein 1 (Sh3bp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000012480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120117015:120129416:1 gene:ENSRNOG00000009360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000049172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120117015:120128232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_001135819 // RefSeq // Rattus norvegicus pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) phosphatase (Pdxp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000040513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120132151:120137599:1 gene:ENSRNOG00000009570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120132151:120137599:1 gene:ENSRNOG00000009570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC166563 // GenBank // Rattus norvegicus pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:188190 IMAGE:7316162), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ213538 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YE11 mRNA sequence. // chr7 // 45 // 83 // 9 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120132183:120136522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT050110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_019904 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 1 (Lgals1), mRNA. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120144848:120147980:1 gene:ENSRNOG00000009884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC058476 // GenBank // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 1, mRNA (cDNA clone MGC:72847 IMAGE:6920799), complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// M19036 // GenBank // Rat lung beta-galactoside-binding lectin mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120146276:120221456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001012747 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar protein 12 (Nol12), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar protein 12 (Nol12), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120152881:120158542:1 gene:ENSRNOG00000010209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY917132 // GenBank // Rattus norvegicus strain W 25 kDa nucleolar protein (Nop25) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC103643 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar protein 12, mRNA (cDNA clone MGC:124902 IMAGE:7301307), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ227943 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YC06 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120146276:120221456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_012578 // RefSeq // Rattus norvegicus H1 histone family, member 0 (H1f0), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120252161:120254014:1 gene:ENSRNOG00000042022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061842 // GenBank // Rattus norvegicus H1 histone family, member 0, mRNA (cDNA clone MGC:72534 IMAGE:5621199), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// X70685 // GenBank // R.norvegicus mRNA for histone H10. // chr7 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120252302:120252886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013220 // RefSeq // Rattus norvegicus TRIO and F-actin binding protein (Triobp), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006242009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRIO and F-actin binding protein (Triobp), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// XM_006242011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRIO and F-actin binding protein (Triobp), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000013839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120197796:120222100:1 gene:ENSRNOG00000010373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000056206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120168221:120222100:1 gene:ENSRNOG00000010373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120168221:120222100:1 gene:ENSRNOG00000010373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC088419 // GenBank // Rattus norvegicus TRIO and F-actin binding protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7123350), partial cds. // chr7 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC169041 // GenBank // Rattus norvegicus TRIO and F-actin binding protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:9030088), partial cds. // chr7 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// EF203433 // GenBank // Rattus norvegicus Trio and actin binding protein isoform 1b (Triobp) mRNA, partial cds. // chr7 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120146276:120221456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT050117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001024277 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine C-acetyltransferase (Gcat), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014173 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:120254440:120260146:1 gene:ENSRNOG00000010596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC092591 // GenBank // Rattus norvegicus glycine C-acetyltransferase (2-amino-3-ketobutyrate-coenzyme A ligase), mRNA (cDNA clone MGC:109060 IMAGE:7372269), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ210112 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA34YH05 mRNA sequence. // chr7 // 62 // 96 // 16 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120254454:120260146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT050119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120287805:120364917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_019173 // RefSeq // Rattus norvegicus galanin receptor 3 (Galr3), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000014349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120264117:120266581:1 gene:ENSRNOG00000027060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AF031522 // GenBank // Rattus norvegicus galanin receptor type 3 (GALR3) mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 92 // 41 // 44 // 0 /// AF073798 // GenBank // Rattus norvegicus galanin receptor GALR3 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AF079844 // GenBank // Rattus norvegicus galanin receptor type 3 (GalR3) mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 92 // 41 // 44 // 0 /// GENSCAN00000049200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120265018:120266556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT050119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT050120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 54 // 26 // 26 // 0
NM_001034134 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit L (Eif3l), mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120314744:120325674:1 gene:ENSRNOG00000011020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// BC100264 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 6 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:116337 IMAGE:7382342), complete cds. // chr7 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// FQ209474 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YH14 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 78 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120287805:120364917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT050123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1
XM_002729832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MICAL-like 1 (Micall1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000036357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120339357:120364917:1 gene:ENSRNOG00000026212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120287805:120364917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_031335 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide F (Polr2f), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120374383:120386016:1 gene:ENSRNOG00000011214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB017711 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RNA polymerase II, complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC083552 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide F, mRNA (cDNA clone MGC:93368 IMAGE:7190444), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120374459:120383818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_053460 // RefSeq // Rattus norvegicus protein interacting with PRKCA 1 (Pick1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120459071:120478332:1 gene:ENSRNOG00000011507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// AF327562 // GenBank // Rattus norvegicus PICK1 protein (Pick1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF373289 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C-binding protein PICK1 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF542094 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C interaction protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ240083 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PICK1 protein. // chr7 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC072689 // GenBank // Rattus norvegicus protein interacting with PRKCA 1, mRNA (cDNA clone MGC:91578 IMAGE:7105747), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120454990:120477990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT050131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT050134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT050135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT050138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001130573 // RefSeq // Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog F (Maff), mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006242029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog F (Maff), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XM_006242030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog F (Maff), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000017181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120573573:120584925:1 gene:ENSRNOG00000012886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000012334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120582657:120583565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001130581 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC300074 (RGD1305939), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120859361:120872765:-1 gene:ENSRNOG00000021795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000056179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120839737:120872765:-1 gene:ENSRNOG00000021795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC097470 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical LOC300074, mRNA (cDNA clone MGC:114535 IMAGE:7457750), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120790216:120881851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT052111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001130567 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA meiotic recombinase 1 (Dmc1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA meiotic recombinase 1 (Dmc1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120789216:120833123:-1 gene:ENSRNOG00000013807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA meiotic recombinase 1 (Dmc1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// XM_006242019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA meiotic recombinase 1 (Dmc1), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT052107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120790216:120881851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT052108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENSRNOT00000018185 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:120758999:120772909:-1 gene:ENSRNOG00000013691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120763340:120786780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT052103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT052105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_145676 // RefSeq // Rattus norvegicus chibby homolog 1 (Drosophila) (Cby1), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006241968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chibby homolog 1 (Drosophila) (Cby1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chibby homolog 1 (Drosophila) (Cby1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120884400:120888649:1 gene:ENSRNOG00000013892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF393211 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich protein mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ213554 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YC16 mRNA sequence. // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120886769:120888060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT050148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_212514 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 22 homolog (yeast) (Tomm22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120892307:120894054:1 gene:ENSRNOG00000014058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB162854 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TOM22, complete cds. // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// BC098639 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 22 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:112569 IMAGE:7324771), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ215387 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YG19 mRNA sequence. // chr7 // 77 // 59 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000012340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120892320:120893469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT050150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001199315 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP binding protein 1 (Gtpbp1), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:120914233:120938682:1 gene:ENSRNOG00000014634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GU256773 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:120914273:120938085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT050152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT050155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT050157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT050153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001033703 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3B (Apobec3b), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121099574:121118683:1 gene:ENSRNOG00000016852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC101878 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3F, mRNA (cDNA clone MGC:124783 IMAGE:7929998), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121090349:121127539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT050161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_019166 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptogyrin 1 (Syngr1), mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121301106:121324532:1 gene:ENSRNOG00000017108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// U39549 // GenBank // Rattus norvegicus synaptogyrin mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// XM_006241971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptogyrin 1 (Syngr1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// GENSCAN00000025523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121301157:121324378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT050164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001109976 // RefSeq // Rattus norvegicus TGF-beta activated kinase 1/MAP3K7 binding protein 1 (Tab1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121340948:121371923:1 gene:ENSRNOG00000017285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211519 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA90YH02 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121351925:121370475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_019239 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (beta-1,4-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (Mgat3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mannosyl (beta-1,4-)-glycoprotein beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase (Mgat3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000023434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121398823:121425021:1 gene:ENSRNOG00000017434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D10852 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for N-acetylglucosaminyltransferase III, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121422392:121424008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT050169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007709 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial elongation factor 1 (Mief1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000023843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121458674:121463161:1 gene:ENSRNOG00000017553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC083593 // GenBank // Rattus norvegicus Smith-Magenis syndrome chromosome region, candidate 7-like (human), mRNA (cDNA clone MGC:94326 IMAGE:7132737), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000025518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121458674:121463161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT050171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
NM_024403 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 4 (Atf4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121468540:121470594:1 gene:ENSRNOG00000017801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF252627 // GenBank // Rattus norvegicus activating transcription factor ATF-4 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC158588 // GenBank // Rattus norvegicus activating transcription factor 4 (tax-responsive enhancer element B67), mRNA (cDNA clone MGC:187368 IMAGE:9098368), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ219043 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YC03 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ232350 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YC06 mRNA sequence. // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000025513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121469353:121470506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_020084 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, T type, alpha 1I subunit (Cacna1i), mRNA. // chr7 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000048790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121545990:121604663:1 gene:ENSRNOG00000029914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// AF086827 // GenBank // Rattus norvegicus low voltage-activated T-type calcium channel alpha-1 subunit (CACNA1I) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 97 // 33 // 36 // 0 /// AF290214 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel alpha-1-I subunit mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000044534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121581575:121609439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121525051:121576029:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_001034944 // RefSeq // Rattus norvegicus GRB2-related adaptor protein 2 (Grap2), mRNA. // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024673 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:121831634:121854018:1 gene:ENSRNOG00000018316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC105895 // GenBank // Rattus norvegicus GRB2-related adaptor protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:125066 IMAGE:7380480), complete cds. // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121793599:121853865:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001130502 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member F (Fam83f), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121880994:121910618:1 gene:ENSRNOG00000018330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:121881041:121902436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_138845 // RefSeq // Rattus norvegicus trinucleotide repeat containing 6B (Tnrc6b), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000033975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121922421:122139717:1 gene:ENSRNOG00000024907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF275151 // GenBank // Rattus norvegicus androgen receptor-related apoptosis-associated protein CBL27 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC061751 // GenBank // Rattus norvegicus trinucleotide repeat containing 6B, mRNA (cDNA clone IMAGE:5600134), complete cds. // chr7 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000025223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122080445:122176209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_138845 // RefSeq // Rattus norvegicus trinucleotide repeat containing 6B (Tnrc6b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:121922421:122139717:1 gene:ENSRNOG00000024907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130503 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylosuccinate lyase (Adsl), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122148984:122176665:1 gene:ENSRNOG00000018655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122080445:122176209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT050192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_198787 // RefSeq // Rattus norvegicus small G protein signaling modulator 3 (Sgsm3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006242098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small G protein signaling modulator 3 (Sgsm3), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// XM_006242099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small G protein signaling modulator 3 (Sgsm3), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000025382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122187869:122217328:1 gene:ENSRNOG00000018745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AB091009 // GenBank // Rattus norvegicus BDIF1 mRNA for brain-derived integrating factor-1, complete cds. // chr7 // 95 // 91 // 38 // 40 // 0 /// BC062060 // GenBank // Rattus norvegicus small G protein signaling modulator 3, mRNA (cDNA clone MGC:72600 IMAGE:5599107), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000025222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122187809:122216894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT050194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT050195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// NONRATT050197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
NM_031758 // RefSeq // Rattus norvegicus melanin-concentrating hormone receptor 1 (Mchr1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122432538:122435016:1 gene:ENSRNOG00000018895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF008650 // GenBank // Rattus norvegicus somatostatin receptor-like protein (SLC1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122432560:122434886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001130582 // RefSeq // Rattus norvegicus X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 3, putative (Xpnpep3), mRNA. // chr7 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122612798:122661425:1 gene:ENSRNOG00000019196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC168759 // GenBank // Rattus norvegicus X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 3, putative, mRNA (cDNA clone MGC:188876 IMAGE:6888763), complete cds. // chr7 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122633511:122660524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001034135 // RefSeq // Rattus norvegicus ring-box 1, E3 ubiquitin protein ligase (Rbx1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122677395:122686075:1 gene:ENSRNOG00000019214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// BC100258 // GenBank // Rattus norvegicus ring-box 1, mRNA (cDNA clone MGC:116275 IMAGE:7444286), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT050202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122677400:122691910:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
GENSCAN00000046199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122793713:122862470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
NM_001033695 // RefSeq // Rattus norvegicus l(3)mbt-like 2 (Drosophila) (L3mbtl2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000034998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122871438:122892514:1 gene:ENSRNOG00000024743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC101865 // GenBank // Rattus norvegicus l(3)mbt-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:124862 IMAGE:7938856), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122871457:122891258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_001130695 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 7B (Zc3h7b), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:122976510:123003695:1 gene:ENSRNOG00000019348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122955806:123031214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_019194 // RefSeq // Rattus norvegicus thyrotrophic embryonic factor (Tef), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thyrotrophic embryonic factor (Tef), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006242069 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thyrotrophic embryonic factor (Tef), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006242070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thyrotrophic embryonic factor (Tef), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123019282:123034383:1 gene:ENSRNOG00000019383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC101895 // GenBank // Rattus norvegicus thyrotrophic embryonic factor, mRNA (cDNA clone MGC:124618 IMAGE:7932583), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:122955806:123031214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT050218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_024398 // RefSeq // Rattus norvegicus aconitase 2, mitochondrial (Aco2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123077888:123120964:1 gene:ENSRNOG00000024128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC061999 // GenBank // Rattus norvegicus aconitase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:72424 IMAGE:5621226), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ216755 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YF10 mRNA sequence. // chr7 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// FQ217197 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA32YK21 mRNA sequence. // chr7 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000036431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123077892:123120082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT050221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT050223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT050224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001170542 // RefSeq // Rattus norvegicus cold shock domain containing C2, RNA binding (Csdc2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123144206:123158716:1 gene:ENSRNOG00000005332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123153271:123157036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
XM_006226169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial-like (RGD1306782), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007357 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:123206851:123207306:1 gene:ENSRNOG00000005572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123206851:123207306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139080 // RefSeq // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 (Xrcc6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000008819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123244581:123265278:1 gene:ENSRNOG00000006392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000066849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123245296:123265175:1 gene:ENSRNOG00000006392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AB066102 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for G22p1, complete cds. // chr7 // 94 // 97 // 32 // 34 // 0 /// BC078718 // GenBank // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6, mRNA (cDNA clone MGC:93146 IMAGE:7115290), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000036420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123242334:123265119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT050230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
XM_002729840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362109 (LOC100362109), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003754321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362109 (LOC100362109), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048614 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:123283868:123285712:1 gene:ENSRNOG00000030150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123272006:123287515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_002729840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362109 (LOC100362109), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003754321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362109 (LOC100362109), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000056056 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:123285915:123286756:1 gene:ENSRNOG00000037147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123272006:123287515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001130555 // RefSeq // Rattus norvegicus meiosis inhibitor 1 (Mei1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123291487:123344883:1 gene:ENSRNOG00000007003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123291546:123344193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001024355 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 134 (Ccdc134), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006242113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 134 (Ccdc134), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123347804:123359647:1 gene:ENSRNOG00000007262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC088206 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 134, mRNA (cDNA clone MGC:108917 IMAGE:7381354), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123345936:123358987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001033694 // RefSeq // Rattus norvegicus sterol regulatory element binding transcription factor 2 (Srebf2), mRNA. // chr7 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// XM_006242079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterol regulatory element binding transcription factor 2 (Srebf2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000056041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123364495:123422294:1 gene:ENSRNOG00000007400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// BC101902 // GenBank // Rattus norvegicus sterol regulatory element binding transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:124823 IMAGE:7934137), complete cds. // chr7 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000036456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123385229:123420826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 87 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT050238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NR_031847 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-33 (Mir33), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053670 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:123415303:123415371:1 gene:ENSRNOG00000035547 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-33 // miRBase Micro RNA Database // MI0000874 Rattus norvegicus miR-33 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019375 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 3 (Sept3), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123498331:123508736:1 gene:ENSRNOG00000007686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123495523:123511261:1 gene:ENSRNOG00000007686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF111179 // GenBank // Rattus norvegicus G-septin alpha mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF111180 // GenBank // Rattus norvegicus G-septin beta mRNA, partial cds. // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123474300:123523374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT050246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
XM_006226170 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WBP2 N-terminal like (Wbp2nl), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006226171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WBP2 N-terminal like (Wbp2nl), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006242136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WBP2 N-terminal like (Wbp2nl), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WBP2 N-terminal like (Wbp2nl), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010606 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:123516424:123531733:1 gene:ENSRNOG00000008038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006226172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WBP2 N-terminal like (Wbp2nl), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// XM_006242138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WBP2 N-terminal like (Wbp2nl), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123474300:123523374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_003754323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus single-pass membrane protein with aspartate-rich tail 1 (Smdt1), mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_235517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus single-pass membrane protein with aspartate-rich tail 1 (Smdt1), mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000011316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:123563597:123565558:1 gene:ENSRNOG00000008461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NM_001130511 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member B (Fam109b), mRNA. // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// XM_006242124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member B (Fam109b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// XM_006242125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member B (Fam109b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000066149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123558649:123563270:1 gene:ENSRNOG00000042522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000036416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123561048:123565558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// NONRATT050250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT050251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT050249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001130579 // RefSeq // Rattus norvegicus serine hydrolase-like 2 (Serhl2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000036586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123946390:123972802:1 gene:ENSRNOG00000022932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123930385:123966009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0
NONRATT036902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191788 // RefSeq // Rattus norvegicus malonyl CoA:ACP acyltransferase (mitochondrial) (Mcat), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124401456:124412526:-1 gene:ENSRNOG00000010539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232982 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YK17 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124402186:124425966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT052243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT052242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT052240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001012200 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 1 (Ttll1), mRNA. // chr7 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// XM_006242102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 1 (Ttll1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 47 // 47 // 0 /// XM_006242105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 1 (Ttll1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000055978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124327306:124356545:-1 gene:ENSRNOG00000010141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// BC087669 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:105511 IMAGE:7316813), complete cds. // chr7 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000006039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124318487:124356232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT052237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 95 // 56 // 56 // 0 /// NONRATT052238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 23 // 59 // 1
NM_012515 // RefSeq // Rattus norvegicus translocator protein (Tspo), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124449359:124459089:1 gene:ENSRNOG00000010549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ228784 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YM23 mRNA sequence. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// J05122 // GenBank // Rat peripheral-type benzodiazepine receptor (PKBS) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124431480:124458851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001130569 // RefSeq // Rattus norvegicus metallophosphoesterase domain containing 1 (Mpped1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006242107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metallophosphoesterase domain containing 1 (Mpped1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:124671298:124740991:1 gene:ENSRNOG00000010834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124671385:124738870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001282324 // RefSeq // Rattus norvegicus patatin-like phospholipase domain containing 3 (Pnpla3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125023373:125043275:1 gene:ENSRNOG00000022268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124991589:125065453:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0
NM_001004241 // RefSeq // Rattus norvegicus SAMM50 sorting and assembly machinery component (Samm50), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125047478:125071017:1 gene:ENSRNOG00000011952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079302 // GenBank // Rattus norvegicus sorting and assembly machinery component 50 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94439 IMAGE:7134547), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:124991589:125065453:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT050269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001134780 // RefSeq // Rattus norvegicus parvin, beta (Parvb), mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus parvin, beta (Parvb), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:63181011:63267688:1 gene:ENSRNOG00000011633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC166826 // GenBank // Rattus norvegicus parvin, beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:8372598), partial cds. // chr7 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT049626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63119507:63266818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT049627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001130583 // RefSeq // Rattus norvegicus parvin, gamma (Parvg), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006241412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus parvin, gamma (Parvg), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:63279792:63298465:1 gene:ENSRNOG00000021907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63281991:63351078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT049630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001012121 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 5 (renal) (Prr5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125317939:125338782:1 gene:ENSRNOG00000012475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC090007 // GenBank // Rattus norvegicus proline rich 5 (renal), mRNA (cDNA clone MGC:109513 IMAGE:7323849), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125318081:125338387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT050271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_001004242 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 8 (Arhgap8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125451431:125510336:-1 gene:ENSRNOG00000033570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079089 // GenBank // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:94058 IMAGE:7123477), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125451554:125505073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000018155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125551331:125564950:1 gene:ENSRNOG00000013423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC097337 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear pore associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:114347 IMAGE:7453939), complete cds. // chr7 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NM_012991 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear pore associated protein (Npap60), mRNA. // chr7 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// U41845 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear pore complex protein Nup50 (Nup50) mRNA, complete cds. // chr7 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125531438:125563680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001130507 // RefSeq // Rattus norvegicus uroplakin 3A (Upk3a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125634480:125639553:1 gene:ENSRNOG00000013593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125634508:125677238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT050284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006242157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 118, member A (Fam118a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_006242158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 118, member A (Fam118a), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125652051:125678576:1 gene:ENSRNOG00000013764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC169018 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 118, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189391 IMAGE:9028156), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125634508:125677238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001013949 // RefSeq // Rattus norvegicus RIB43A domain with coiled-coils 2 (Ribc2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125742589:125757587:1 gene:ENSRNOG00000033502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079434 // GenBank // Rattus norvegicus RIB43A domain with coiled-coils 2, mRNA (cDNA clone MGC:94981 IMAGE:7115185), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125742205:125799216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NONRATT050289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1
BC161973 // GenBank // Rattus norvegicus fibulin 1, mRNA (cDNA clone MGC:187782 IMAGE:9029287), complete cds. // chr7 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NM_001127547 // RefSeq // Rattus norvegicus fibulin 1 (Fbln1), mRNA. // chr7 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000047234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125810696:125890371:1 gene:ENSRNOG00000014137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// GENSCAN00000003789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125810820:125855460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT050294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
NM_133313 // RefSeq // Rattus norvegicus ataxin 10 (Atxn10), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:125942296:126065027:1 gene:ENSRNOG00000014637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AJ301634 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neuronal beta-catenin like protein (ORF1). // chr7 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC062087 // GenBank // Rattus norvegicus ataxin 10, mRNA (cDNA clone MGC:72277 IMAGE:5621521), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:125924891:126001477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT050298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT050299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NONRATT050303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NR_031804 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7c-2 (Mirlet7c-2), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000053584 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:126300921:126301015:1 gene:ENSRNOG00000035461 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// rno-let-7c-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000831 Rattus norvegicus let-7c-2 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NR_031802 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7b (Mirlet7b), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000053759 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:126301336:126301420:1 gene:ENSRNOG00000035636 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// rno-let-7b // miRBase Micro RNA Database // MI0000829 Rattus norvegicus let-7b stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_013196 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisome proliferator activated receptor alpha (Ppara), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006242151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisome proliferator activated receptor alpha (Ppara), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126330833:126392748:1 gene:ENSRNOG00000021463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M88592 // GenBank // Rattus rattus peroxisome proliferator activated receptor (PPAR) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126372588:126392511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001130499 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 38 (Ttc38), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126422523:126446119:1 gene:ENSRNOG00000015916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ210197 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA32YM14 mRNA sequence. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126422437:126463973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT050312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001130500 // RefSeq // Rattus norvegicus G-2 and S-phase expressed 1 (Gtse1), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126447562:126464313:1 gene:ENSRNOG00000016148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// FQ218328 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA5YE20 mRNA sequence. // chr7 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT050314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126422437:126463973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001135876 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase (Trmu), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126467263:126483589:1 gene:ENSRNOG00000016465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126467263:126483589:1 gene:ENSRNOG00000016465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC161991 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:187820 IMAGE:9032691), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126467332:126483346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT050318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT050320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_006226190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 4 (Gramd4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// XM_006226192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 4 (Gramd4), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// XM_235571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 4 (Gramd4), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126681301:126721804:1 gene:ENSRNOG00000016968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000045635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:126681304:126721766:1 gene:ENSRNOG00000016968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 84 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000030617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126649478:126721804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT050322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
XR_348146 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family member 22A-like (LOC678774), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// XR_355886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family member 22A-like (LOC678774), transcript variant X2, misc_RNA. // chr7 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000022945 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:126793081:127154298:1 gene:ENSRNOG00000017057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006226193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 22a (Tbc1d22a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// XM_006242171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 22a (Tbc1d22a), mRNA. // chr7 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT050327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:126886165:127053171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
XM_006226239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical gene supported by NM_053561; AF062594 (RGD1560617), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006242175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical gene supported by NM_053561; AF062594 (RGD1560617), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000038168 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:127662453:127663607:1 gene:ENSRNOG00000004457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000015862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:127662453:127663607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000052473 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:127820225:127820336:1 gene:ENSRNOG00000034350 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191991 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A5 (Fam19a5), mRNA. // chr7 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// XM_006242174 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A5 (Fam19a5), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:128196443:128419725:1 gene:ENSRNOG00000049349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// XM_006242172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A5 (Fam19a5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT050330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001134800 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, BED-type containing 4 (Zbed4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000006050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129438426:129475805:1 gene:ENSRNOG00000004588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129471016:129474529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT050334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001037208 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich with EGF-like domains 2 (Creld2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine-rich with EGF-like domains 2 (Creld2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129501501:129508346:1 gene:ENSRNOG00000004659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098722 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich with EGF-like domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:112714 IMAGE:7371287), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129501548:129510405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_199409 // RefSeq // Rattus norvegicus pannexin 2 (Panx2), mRNA. // chr7 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129728892:129738977:1 gene:ENSRNOG00000033627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC112319 // GenBank HTC // Rattus norvegicus pannexin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7933229), with apparent retained intron. // chr7 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000057495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129659471:129755308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_022602 // RefSeq // Rattus norvegicus pim-3 oncogene (Pim3), mRNA. // chr7 // 92 // 91 // 48 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000043461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129544794:129547908:1 gene:ENSRNOG00000029698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 39 // 39 // 0 /// AF057026 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase KID-1 (Kid1) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 91 // 48 // 52 // 0 /// AF086624 // GenBank // Rattus norvegicus serine threonine kinase (pim-3) mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 98 // 52 // 56 // 0 /// BC097317 // GenBank // Rattus norvegicus pim-3 oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:114318 IMAGE:7446368), complete cds. // chr7 // 96 // 91 // 50 // 52 // 0 /// NONRATT050340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 68 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000040824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129544800:129546941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 28 // 28 // 16 // 57 // 1
XM_006226212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mov10l1, Moloney leukemia virus 10-like 1, homolog (mouse) (Mov10l1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mov10l1, Moloney leukemia virus 10-like 1, homolog (mouse) (Mov10l1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042686 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:129659471:129723289:1 gene:ENSRNOG00000031093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050620 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:129694528:129723289:1 gene:ENSRNOG00000031093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000057495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129659471:129755308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001106788 // RefSeq // Rattus norvegicus TraB domain containing (Trabd), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006242182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TraB domain containing (Trabd), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TraB domain containing (Trabd), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000052087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129744197:129755170:1 gene:ENSRNOG00000029095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129659471:129755308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// NONRATT050350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT050351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_001085485 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein O (Selo), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166588 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein O, mRNA (cDNA clone MGC:188348 IMAGE:7929890), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129757176:129767413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT050354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106789 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 6, regulatory subunit 2 (Ppp6r2), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129912709:129945225:1 gene:ENSRNOG00000026425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ211682 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA83YJ12 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000057494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129872977:129941452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_201426 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenomedullin 2 (Adm2), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129982187:129983942:1 gene:ENSRNOG00000029830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB121036 // GenBank // Rattus norvegicus ADM2 mRNA for adrenomedullin 2, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB181297 // GenBank // Rattus norvegicus adm2 mRNA for adrenomedullin 2, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AY590103 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley intermedin peptide precursor (Imd) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT050363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129982507:129996355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_145771 // RefSeq // Rattus norvegicus myo-inositol oxygenase (Miox), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:129994007:129996495:1 gene:ENSRNOG00000008694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF230096 // GenBank // Rattus norvegicus kidney-specific protein 32 mRNA, complete cds. // chr7 // 75 // 97 // 21 // 28 // 0 /// AY738259 // GenBank // Rattus norvegicus myo-inositol oxygenase (Miox) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC078840 // GenBank // Rattus norvegicus myo-inositol oxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:93474 IMAGE:7110224), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:129982507:129996355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT050366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT050368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001024877 // RefSeq // Rattus norvegicus non-SMC condensin II complex, subunit H2 (Ncaph2), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000055808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130011951:130027604:1 gene:ENSRNOG00000009598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC097379 // GenBank // Rattus norvegicus non-SMC condensin II complex, subunit H2, mRNA (cDNA clone MGC:114417 IMAGE:7445599), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000057500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130012000:130027476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT050369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1 /// NONRATT050371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1
XM_001055129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch domain containing 7B (Klhdc7b), mRNA. // chr7 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// XM_235563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch domain containing 7B (Klhdc7b), mRNA. // chr7 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000040769 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:130042825:130044630:1 gene:ENSRNOG00000032419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130040974:130044630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000073852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:130092729:130093063:1 gene:ENSRNOG00000045580 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSRNOT00000055792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130116132:130123675:1 gene:ENSRNOG00000032828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC105884 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7311921), partial cds. // chr7 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130116132:130122952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT050372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT050374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_021676 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 and multiple ankyrin repeat domains 3 (Shank3), mRNA. // chr7 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// XM_006242241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 and multiple ankyrin repeat domains 3 (Shank3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000045913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130159261:130217900:1 gene:ENSRNOG00000032936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000047960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130159261:130217900:1 gene:ENSRNOG00000032936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// AF133301 // GenBank // Rattus norvegicus Shank postsynaptic density protein 3a mRNA, complete cds. // chr7 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000040339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130159261:130233678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT050376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1
NM_012490 // RefSeq // Rattus norvegicus acrosin (Acr), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acrosin (Acr), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000045647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:130227695:130233848:1 gene:ENSRNOG00000029762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC097345 // GenBank // Rattus norvegicus acrosin, mRNA (cDNA clone MGC:114357 IMAGE:7455117), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X59254 // GenBank // R.norvegicus mRNA for sperm acrosin. // chr7 // 80 // 83 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:130159261:130233678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_139101 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG10, alpha-1,2-glucosyltransferase (Alg10), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131010627:131015654:1 gene:ENSRNOG00000014511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// U78090 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel regulator 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:131010727:131014341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT050381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
ENSRNOT00000051033 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:131617184:131618719:1 gene:ENSRNOG00000028866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:131561697:131618743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
XM_006242269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690142 (LOC690142), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010990 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:132052654:132090364:1 gene:ENSRNOG00000025898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:132052656:132090364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001191789 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat kinase 2 (Lrrk2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000005438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:132531605:132693763:1 gene:ENSRNOG00000004048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000056887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:132547391:132643466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 53 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 14 // 51 // 1
NM_001004449 // RefSeq // Rattus norvegicus submandibular gland protein C (Smgc), mRNA. // chr7 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// AY459347 // GenBank // Rattus norvegicus neonatal submandibular gland protein C precursor, mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000056886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:132724642:132752688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
XM_006242276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 19 (Muc19), mRNA. // chr7 // 100 // 35 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000055708 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:132773781:132845511:1 gene:ENSRNOG00000022913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 92 // 58 // 60 // 0 /// ENSRNOT00000073062 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:132803037:132814496:1 gene:ENSRNOG00000022913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 20 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:135679424:135734276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 20 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:132769741:132844949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 74 // 47 // 48 // 0
NM_057118 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin 1 (Cntn1), mRNA. // chr7 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000006219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:133085052:133270392:1 gene:ENSRNOG00000004438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// D38492 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neural adhesion molecule F3, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 45 // 47 // 0 /// GENSCAN00000030756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:133149751:133256335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT050391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NONRATT050391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000030754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:133330050:133385497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108107 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing RING finger 4 (Pdzrn4), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:133539221:133687546:1 gene:ENSRNOG00000022844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:133659585:133686748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000038855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:133575809:133619005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001108992 // RefSeq // Rattus norvegicus periphilin 1 (Pphln1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006242230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus periphilin 1 (Pphln1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:134270162:134361035:1 gene:ENSRNOG00000022778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:134323472:134369478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001106791 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-associated kinase 4 (Irak4), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-associated kinase 4 (Irak4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:135461296:135487468:1 gene:ENSRNOG00000005965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:135460684:135463765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000054644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:135466704:135496663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001271239 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 117 (Tmem117), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008159 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:135545200:136048699:1 gene:ENSRNOG00000006068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001108108 // RefSeq // Rattus norvegicus anoctamin 6 (Ano6), mRNA. // chr7 // 97 // 85 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000068742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:136781652:136973259:1 gene:ENSRNOG00000006995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 85 // 34 // 35 // 0 /// FQ223400 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA11YM01 mRNA sequence. // chr7 // 89 // 22 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000046005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:136859128:137019777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT050412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// NONRATT050413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1
XM_006226280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AT rich interactive domain 2 (Arid-rfx like) (Arid2), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000006970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:137312722:137427659:1 gene:ENSRNOG00000004831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// FQ231567 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YA09 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:137363910:137437767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT050420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1
ENSRNOT00000054622 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:138303602:138303680:1 gene:ENSRNOG00000036515 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000037874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:138330915:138468397:1 gene:ENSRNOG00000022807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NM_001039454 // RefSeq // Rattus norvegicus PC-esterase domain containing 1B (Pced1b), mRNA. // chr7 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// BC112322 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 113, member B, mRNA (cDNA clone MGC:124719 IMAGE:7936449), complete cds. // chr7 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT050434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138413307:138450939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
GENSCAN00000019191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138474223:138474594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001127456 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 48 (heme transporter), member 1 (Slc48a1), mRNA. // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139463280:139471081:1 gene:ENSRNOG00000008192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC105856 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 48 (heme transporter), member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7455733), complete cds. // chr7 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// BC158869 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 48 (heme transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:188505 IMAGE:7930286), complete cds. // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139463328:139470020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT050460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
NM_001008358 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 106C (Tmem106c), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139636746:139642341:1 gene:ENSRNOG00000008784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC086606 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 106C, mRNA (cDNA clone MGC:105614 IMAGE:7316815), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139636633:139642618:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_031715 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphofructokinase, muscle (Pfkm), mRNA. // chr7 // 84 // 100 // 37 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000013374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:138833721:138857275:1 gene:ENSRNOG00000009628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC094212 // GenBank // Rattus norvegicus phosphofructokinase, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:105392 IMAGE:7314667), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// FQ211719 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA82YI05 mRNA sequence. // chr7 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// U25651 // GenBank // Rattus norvegicus phosphofructokinase muscle isozyme mRNA, complete cds. // chr7 // 84 // 100 // 37 // 44 // 0 /// GENSCAN00000001289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138837780:138856896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT050438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT050440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001024909 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 184 (Ccdc184), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:138898271:138899670:1 gene:ENSRNOG00000021945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097418 // GenBank // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AI836003, mRNA (cDNA clone MGC:114464 IMAGE:7454547), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:138889255:138899327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT050445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_036618 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680590 (LOC680590), non-coding RNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_355993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680590 (LOC680590), transcript variant X6, ncRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XR_355989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680590 (LOC680590), transcript variant X2, ncRNA. // chr7 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XR_355991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680590 (LOC680590), transcript variant X4, ncRNA. // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XR_355997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680590 (LOC680590), transcript variant X10, ncRNA. // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XR_355988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680590 (LOC680590), transcript variant X1, ncRNA. // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT050448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT050450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT050447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT050449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001000424 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1107 (Olr1107), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139175070:139175996:1 gene:ENSRNOG00000010787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139175070:139175996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000993 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1108 (Olr1108), mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000014337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139197537:139198472:1 gene:ENSRNOG00000010804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139192214:139198472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000023177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139222536:139225629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001000425 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1111 (Olr1111), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139250062:139250994:1 gene:ENSRNOG00000031503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139250062:139264487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT050455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134528 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC300207 (RGD1305928), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114753032:114774038:1 gene:ENSRNOG00000011578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012828 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, beta 3 subunit (Cacnb3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006257329 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, beta 3 subunit (Cacnb3), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114818643:114828180:1 gene:ENSRNOG00000012489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M88751 // GenBank // Rat calcium channel beta subunit-III mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114816690:114827203:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT059104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT059103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT059105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001014203 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 65 (Ccdc65), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114893623:114907348:1 gene:ENSRNOG00000031424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083683 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 65, mRNA (cDNA clone MGC:94536 IMAGE:7135919), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ212708 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YM24 mRNA sequence. // chrX // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// XM_006257362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 65 (Ccdc65), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000037061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114878737:114907154:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT059106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT059107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT059111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001105714 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 1 (Wnt1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114975118:114979165:1 gene:ENSRNOG00000014627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:114975118:114978251:1 gene:ENSRNOG00000014627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000037092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:114975451:114978251:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT059114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000037067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115115516:115116149:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 83 // 67 // 5 // 6 // 0 /// NONRATT059119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001011995 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, alpha 1C (Tuba1c), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000020932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218679908:218687509:1 gene:ENSRNOG00000015544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC078829 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, alpha 1C, mRNA (cDNA clone MGC:93445 IMAGE:7112420), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ222005 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YC20 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ225183 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YN15 mRNA sequence. // chr2 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// FQ233008 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YJ06 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 57 // 7 // 8 // 0 /// FQ233272 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YI05 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ222354 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YI20 mRNA sequence. // chr2 // 79 // 79 // 11 // 14 // 1 /// GENSCAN00000026435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218683616:218687408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000013574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115214286:115228554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_012633 // RefSeq // Rattus norvegicus peripherin (Prph), mRNA. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115247359:115251138:1 gene:ENSRNOG00000015643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF031878 // GenBank // Rattus norvegicus peripherin mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC100656 // GenBank // Rattus norvegicus peripherin, mRNA (cDNA clone MGC:124633 IMAGE:7936222), complete cds. // chrX // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115230776:115271228:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT059122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT059123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// NONRATT059124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT059125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001271243 // RefSeq // Rattus norvegicus trophinin associated protein (Troap), mRNA. // chrX // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115263537:115271228:1 gene:ENSRNOG00000031040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT059127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000013566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115230776:115271228:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT059126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001014204 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 22 (Dnajc22), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115286885:115291876:1 gene:ENSRNOG00000015837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086949 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 22, mRNA (cDNA clone MGC:108814 IMAGE:7325189), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115286881:115291723:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT059129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001191614 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated, serine-rich 2 (Spats2), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006257350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated, serine-rich 2 (Spats2), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115333557:115384244:1 gene:ENSRNOG00000032055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115293820:115394264:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT059132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017108 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 3 (Kcnh3), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000045515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115293665:115414776:1 gene:ENSRNOG00000032075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB022697 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BEC1, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115396458:115414480:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT059132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_022181 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 6, kidney specific (Aqp6), mRNA. // chrX // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115763284:115766221:1 gene:ENSRNOG00000000296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF083879 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin-6 (AQP6) mRNA, complete cds. // chrX // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// L28113 // GenBank // Rat mRNA sequence. // chrX // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115763423:115780198:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT059151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012909 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 2 (collecting duct) (Aqp2), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115742312:115747347:1 gene:ENSRNOG00000000297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC128705 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 2 (collecting duct), mRNA (cDNA clone MGC:156502 IMAGE:7109642), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D13906 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ADH water channel, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// L28112 // GenBank // Rattus norvegicus unknown mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115730757:115746850:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT059147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT059148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_012779 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 5 (Aqp5), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115753741:115757278:1 gene:ENSRNOG00000017685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092572 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 5, mRNA (cDNA clone MGC:108763 IMAGE:7122974), complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC110045 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 5, mRNA (cDNA clone MGC:124967 IMAGE:7100092), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U16245 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin-5 (AQP5) mRNA, complete cds. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115753624:115756763:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT059149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_024154 // RefSeq // Rattus norvegicus acid-sensing (proton-gated) ion channel 1 (Asic1), mRNA. // chrX // 99 // 92 // 78 // 79 // 0 /// ENSRNOT00000025476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115830969:115859585:1 gene:ENSRNOG00000018789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 99 // 92 // 78 // 79 // 0 /// ENSRNOT00000047887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115851002:115859585:1 gene:ENSRNOG00000018789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 99 // 81 // 69 // 70 // 0 /// AB049451 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proton-gated cation channel subunit ASIC-beta2, complete cds. // chrX // 97 // 67 // 56 // 58 // 0 /// AJ309926 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ion channel (asic 1b gene). // chrX // 99 // 81 // 69 // 70 // 0 /// NONRATT059153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 86 // 86 // 0 /// U94403 // GenBank // Rattus norvegicus proton gated cation channel ASIC1 mRNA, complete cds. // chrX // 90 // 90 // 77 // 86 // 1 /// GENSCAN00000008761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115851002:115869858:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 63 // 63 // 54 // 86 // 1 /// NONRATT059156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 62 // 62 // 53 // 86 // 1 /// NONRATT059154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 40 // 40 // 34 // 86 // 1 /// GENSCAN00000008773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115805721:115844308:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 17 // 17 // 15 // 86 // 1
NM_001108752 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 1 (Smarcd1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000043163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115860833:115871373:1 gene:ENSRNOG00000034268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115851002:115869858:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT059157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_022215 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 (soluble) (Gpd1), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115875188:115882576:1 gene:ENSRNOG00000019213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB002558 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for glycerol 3-phosphate dehydrogenase, complete cds. // chrX // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// BC088396 // GenBank // Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1 (soluble), mRNA (cDNA clone MGC:93453 IMAGE:7108237), complete cds. // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:115875200:115885143:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT059159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001060794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly protein 14 (Cox14), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002726973 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly protein 14 (Cox14), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:115883242:115885365:1 gene:ENSRNOG00000021373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211707 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA82YN14 mRNA sequence. // chrX // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT059160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus la-related protein 4-like (LOC683071), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 92 // 97 // 33 // 36 // 0 /// XR_006033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus la-related protein 4-like (RGD1305704), misc_RNA. // chrX // 86 // 97 // 31 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071031 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:X:116149230:116180301:1 gene:ENSRNOG00000049091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006257404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus la-related protein 4-like (LOC102549697), transcript variant X2, mRNA. // chrX // 81 // 81 // 30 // 37 // 1 /// XM_006257405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus la-related protein 4-like (LOC102549697), transcript variant X3, mRNA. // chrX // 81 // 81 // 30 // 37 // 1 /// XM_006257407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus la-related protein 4-like (LOC102549697), transcript variant X5, mRNA. // chrX // 81 // 81 // 30 // 37 // 1 /// ENSRNOT00000074256 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:236363026:236363653:-1 gene:ENSRNOG00000050414 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrX // 86 // 97 // 31 // 36 // 0 /// GENSCAN00000009141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236361547:236393741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 86 // 97 // 31 // 36 // 0
XM_006226282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disco-interacting protein 2 homolog B-like (LOC100912851), mRNA. // chrX // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026289 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:116297431:116379696:1 gene:ENSRNOG00000019429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000075522 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:116323959:116379696:1 gene:ENSRNOG00000019429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000042542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:116273169:116379314:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT059166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// FQ217354 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA29YD08 mRNA sequence. // chrX // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001100895 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 1 (Atf1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 1 (Atf1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// XM_006242331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 1 (Atf1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006242333 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 1 (Atf1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000055390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139692651:139735614:1 gene:ENSRNOG00000032162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC168224 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7325357. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 1 (Atf1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000032086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139718206:139734368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT050467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT050468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
XM_003754362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane (C-terminal) protease, serine 12 (Tmprss12), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006226267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane (C-terminal) protease, serine 12 (Tmprss12), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041938 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:139764206:139776724:1 gene:ENSRNOG00000031099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139764053:139776724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001037355 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 7A (Mettl7a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000052075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139783755:139790601:1 gene:ENSRNOG00000001376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC105760 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase like 7A, mRNA (cDNA clone MGC:124657 IMAGE:5623503), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139783787:139795971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001122781 // RefSeq // Rattus norvegicus LETM1 domain containing 1 (Letmd1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:139913936:139923419:1 gene:ENSRNOG00000029855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC159426 // GenBank // Rattus norvegicus LETM1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188743 IMAGE:9034024), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:139913966:139922102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT050476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001270794 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 8 (Slc4a8), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NM_001270795 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 8 (Slc4a8), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NM_199497 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 8 (Slc4a8), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006242344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 8 (Slc4a8), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000040890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140201594:140275775:1 gene:ENSRNOG00000028879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000065379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140201594:140275775:1 gene:ENSRNOG00000028879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AY489024 // GenBank // Rattus norvegicus Na-driven Cl-HCO3 exchanger NDCBE1-A mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 44 // 46 // 0 /// AY489025 // GenBank // Rattus norvegicus Na-driven Cl-HCO3 exchanger NDCBE1-B mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 44 // 46 // 0 /// AY489026 // GenBank // Rattus norvegicus Na-driven Cl-HCO3 exchanger NDCBE1-C mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 92 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000042080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140190973:140318111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT050494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001013107 // RefSeq // Rattus norvegicus DAZ associated protein 2 (Dazap2), mRNA. // chr7 // 96 // 63 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140043812:140048948:1 gene:ENSRNOG00000004628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// BC062052 // GenBank // Rattus norvegicus DAZ associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72595 IMAGE:5598966), complete cds. // chr7 // 96 // 63 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT050481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// NONRATT050482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 24 // 41 // 1 /// NONRATT050483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// NONRATT050484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// NONRATT050486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// GENSCAN00000042081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140043843:140047698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 19 // 41 // 1 /// NONRATT050479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT050485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT050488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1
GENSCAN00000042080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140190973:140318111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_019266 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage gated, type VIII, alpha subunit (Scn8a), mRNA. // chr7 // 83 // 94 // 24 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000008160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140395741:140485138:1 gene:ENSRNOG00000005309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AF049239 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated sodium channel rPN4 mRNA, complete cds. // chr7 // 83 // 94 // 24 // 29 // 0 /// AF049240 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated sodium channel variant rPN4a mRNA, complete cds. // chr7 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// L39018 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel protein 6 (SCP6) mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140397023:140468982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_022441 // RefSeq // Rattus norvegicus activin A receptor type II-like 1 (Acvrl1), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006242306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activin A receptor type II-like 1 (Acvrl1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140571223:140588082:1 gene:ENSRNOG00000028713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC083173 // GenBank // Rattus norvegicus activin A receptor type II-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:91691 IMAGE:7098096), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// FQ223580 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA92YN01 mRNA sequence. // chr7 // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// L36088 // GenBank // Rattus norvegicus (clone RSTK-1) serine-threonine kinase receptor type I mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140577529:140589167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT050508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT050510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_199230 // RefSeq // Rattus norvegicus activin A receptor, type IB (Acvr1b), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006242314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activin A receptor, type IB (Acvr1b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140617642:140659124:1 gene:ENSRNOG00000006934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140644620:140658485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140625196:140640951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_138894 // RefSeq // Rattus norvegicus GRP1 (general receptor for phosphoinositides 1)-associated scaffold protein (Grasp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140670666:140678432:1 gene:ENSRNOG00000007346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF374272 // GenBank // Rattus norvegicus tamalin mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140670726:140678211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_024388 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 1 (Nr4a1), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 1 (Nr4a1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 1 (Nr4a1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 1 (Nr4a1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006242358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 1 (Nr4a1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140713176:140721070:1 gene:ENSRNOG00000007607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC097313 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:114310 IMAGE:7458540), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U17254 // GenBank // Rattus norvegicus immediate early gene transcription factor NGFI-B mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140716459:140720493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001007659 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9430023L20 (RGD1359310), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001271114 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9430023L20 (RGD1359310), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// XM_006242324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9430023L20 (RGD1359310), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140730296:140739408:1 gene:ENSRNOG00000007756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079170 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9430023L20, mRNA (cDNA clone MGC:94201 IMAGE:7129890), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140729757:140739142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT050521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT050523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000055353 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:140741979:140742334:1 gene:ENSRNOG00000036872 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140741979:140744691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_003750407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 7 (Krt7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003754353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 7 (Krt7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140862269:140876993:1 gene:ENSRNOG00000008057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140862269:140876993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT050527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
ENSRNOT00000010881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140897357:140903218:1 gene:ENSRNOG00000008242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// BC079419 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700011A15, mRNA (cDNA clone MGC:94960 IMAGE:7113741), complete cds. // chr7 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140892957:140902971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0
NM_001008810 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 86 (Krt86), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000045495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140922818:140929091:1 gene:ENSRNOG00000008367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000067422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:140922818:140929091:1 gene:ENSRNOG00000008367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AB355641 // GenBank // Rattus norvegicus Kb26 mRNA for type II keratin Kb26, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:140922818:140928995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT050530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XR_348277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L4-like (LOC300249), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XR_356019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L4-like (LOC300249), misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000012738 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:141240894:141242157:1 gene:ENSRNOG00000009614 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141240894:141242165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT050533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001008324 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4B (Eif4b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141476183:141497938:1 gene:ENSRNOG00000010103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC085933 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4B, mRNA (cDNA clone MGC:94923 IMAGE:7112408), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000014998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141476197:141496131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 16 // 19 // 1
XM_003750411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tensin like C1 domain containing phosphatase (tensin 2) (Tenc1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_003754356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tensin like C1 domain containing phosphatase (tensin 2) (Tenc1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:141503820:141517146:1 gene:ENSRNOG00000010588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074212 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:141503820:141517146:1 gene:ENSRNOG00000010588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141509746:141517146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141501387:141508642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT050537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_013104 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 6 (Igfbp6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141546160:141551065:1 gene:ENSRNOG00000010977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099742 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:124535 IMAGE:7937967), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ229949 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YC07 mRNA sequence. // chr7 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// FQ220978 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YA07 mRNA sequence. // chr7 // 64 // 85 // 14 // 22 // 0 /// FQ223125 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YD04 mRNA sequence. // chr7 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0 /// FQ229688 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YB07 mRNA sequence. // chr7 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// M69055 // GenBank // Rat insulin-like growth factor binding protein (rIGFBP-6) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141546237:141565472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_153728 // RefSeq // Rattus norvegicus sterol O-acyltransferase 2 (Soat2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141552394:141565491:1 gene:ENSRNOG00000011163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB075946 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for AcylCoA:Cholesterol Acyltransferase 2, complete cds. // chr7 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// AB101480 // GenBank // Rattus norvegicus ACAT-2 mRNA for acyl-coenzyme A:cholesterol acyltransferase-2, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141546237:141565472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
XM_006226276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 740 (Znf740), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006242457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 740 (Znf740), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016240 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:141611103:141614789:1 gene:ENSRNOG00000012192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000004356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141608352:141614789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT050545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT050544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001126282 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 5 (Mfsd5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141678906:141681186:1 gene:ENSRNOG00000012832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161964 // GenBank // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AW556797, mRNA (cDNA clone MGC:187769 IMAGE:9028283), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141679629:141680981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT050550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001170602 // RefSeq // Rattus norvegicus extra spindle pole bodies homolog 1 (S. cerevisiae) (Espl1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141693056:141719909:1 gene:ENSRNOG00000012835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141693432:141719459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:143141641:143162004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT050554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT050555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT050556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001106794 // RefSeq // Rattus norvegicus prefoldin subunit 5 (Pfdn5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141720703:141725439:1 gene:ENSRNOG00000012985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC169128 // GenBank // Rattus norvegicus prefoldin subunit 5, mRNA (cDNA clone MGC:189580 IMAGE:6921287), complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ232138 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YN23 mRNA sequence. // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT050557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141720746:141732891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001005545 // RefSeq // Rattus norvegicus melanocyte proliferating gene 1 (Myg1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141725674:141732906:1 gene:ENSRNOG00000013343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082112 // GenBank // Rattus norvegicus melanocyte proliferating gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:95325 IMAGE:7135321), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ213994 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YG17 mRNA sequence. // chr7 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// FQ230067 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YM03 mRNA sequence. // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ213315 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YI14 mRNA sequence. // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000004355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141720746:141732891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT050560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT050561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_012655 // RefSeq // Rattus norvegicus Sp1 transcription factor (Sp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141806042:141836498:1 gene:ENSRNOG00000014084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D12768 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Sp1, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141806273:141893907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_012655 // RefSeq // Rattus norvegicus Sp1 transcription factor (Sp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141806042:141836498:1 gene:ENSRNOG00000014084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY305388 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor Sp1 mRNA, partial cds. // chr7 // 46 // 96 // 11 // 24 // 0 /// NONRATT050562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030998 // RefSeq // Rattus norvegicus anti-Mullerian hormone receptor, type II (Amhr2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141844072:141852589:1 gene:ENSRNOG00000014850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// U42427 // GenBank // Rattus norvegicus MIS type II receptor (RATMRII) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141806273:141893907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001008379 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 13 (Prr13), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141857064:141860364:1 gene:ENSRNOG00000042094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC086446 // GenBank // Rattus norvegicus proline rich 13, mRNA (cDNA clone MGC:105664 IMAGE:7303132), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ234745 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YN02 mRNA sequence. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT050567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001013223 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 2 (Pcbp2), mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// XM_006242408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 2 (Pcbp2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000055302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141870629:141894027:1 gene:ENSRNOG00000036852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC078906 // GenBank // Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93663 IMAGE:7112287), complete cds. // chr7 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC078909 // GenBank // Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93668 IMAGE:7127139), complete cds. // chr7 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT050569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001013245 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor A (Tbca), mRNA. // chr7 // 85 // 76 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021543 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:142294230:142294553:1 gene:ENSRNOG00000016100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// BC058155 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor A, mRNA (cDNA clone MGC:72998 IMAGE:6888541), complete cds. // chr7 // 85 // 76 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:43661375:43671792:1 gene:ENSRNOG00000048342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 68 // 19 // 23 // 0 /// NONRATT050580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142241259:142321763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000032153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43635361:43671601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_235695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox C13 (Hoxc13), mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000033300 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:142323171:142329323:1 gene:ENSRNOG00000028679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142323171:142329323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001106796 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box C12 (Hoxc12), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142339296:142340894:1 gene:ENSRNOG00000016116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142339296:142340894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003750413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-C11-like (LOC100911859), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// XM_003754359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein Hox-C11-like (LOC100911859), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000021589 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:142356749:142358937:1 gene:ENSRNOG00000016141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142356749:142365438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000021647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142368935:142373319:1 gene:ENSRNOG00000016149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000008771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142368935:142373319:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT050583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
NR_031913 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-196a (Mir196a), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053737 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:142375592:142375701:1 gene:ENSRNOG00000035614 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-196a // miRBase Micro RNA Database // MI0000940 Rattus norvegicus miR-196a stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100907 // RefSeq // Rattus norvegicus homeobox C9 (Hoxc9), mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000021909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142387317:142389989:1 gene:ENSRNOG00000016199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142387317:142389857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT050585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001177326 // RefSeq // Rattus norvegicus homeobox C8 (Hoxc8), mRNA. // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000031404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142396429:142398996:1 gene:ENSRNOG00000028619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000008772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142396429:142398497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT050587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000022217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142415111:142416543:1 gene:ENSRNOG00000016442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000008765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142403634:142416543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT050588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001108116 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box C5 (Hoxc5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142419477:142422899:1 gene:ENSRNOG00000016598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142419551:142420908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NR_032748 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-615 (Mir615), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054621 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:142420376:142420467:1 gene:ENSRNOG00000036514 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-615 // miRBase Micro RNA Database // MI0012597 Rattus norvegicus miR-615 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109884 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box C4 (Hoxc4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142438944:142441486:1 gene:ENSRNOG00000016613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006242376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box C4 (Hoxc4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// XM_006242377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box C4 (Hoxc4), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// NONRATT050590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142439377:142472300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XR_348286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547478 (LOC102547478), transcript variant X1, ncRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_356028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547478 (LOC102547478), transcript variant X1, ncRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108117 // RefSeq // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit zeta 1 (Copz1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006242400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit zeta 1 (Copz1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142680779:142706987:1 gene:ENSRNOG00000036835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ234671 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YB15 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142680629:142709984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT050602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NR_031782 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-148b (Mir148b), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053648 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:142692726:142692822:1 gene:ENSRNOG00000035525 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-148b // miRBase Micro RNA Database // MI0000616 Rattus norvegicus miR-148b stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108119 // RefSeq // Rattus norvegicus NCK associated protein 1 like (Nckap1l), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142849494:142894585:1 gene:ENSRNOG00000036829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142849532:142893321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_022710 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 1B, calmodulin-dependent (Pde1b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000055272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142898973:142925732:1 gene:ENSRNOG00000036828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF327906 // GenBank // Rattus norvegicus clone GB1B21a phosphodiesterase 1B (Pde1B) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ212460 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA54YB23 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// M94537 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic nucleotide phosphodiesterase (CaM-PDE) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142899188:142924051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006225811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 13-like (LOC685173), mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// XM_006239748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 13-like (LOC685173), mRNA. // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSRNOT00000003371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:28607037:28607816:-1 gene:ENSRNOG00000002495 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr6 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000028596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:28607037:28646367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000018312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:115140401:115150355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 75 // 52 // 9 // 12 // 0
NM_173305 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 6 (Hsd17b6), mRNA. // chr7 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// XM_006240737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 6 (Hsd17b6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// XM_006240738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 6 (Hsd17b6), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// XM_006240739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 6 (Hsd17b6), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000003498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2390324:2409187:-1 gene:ENSRNOG00000002597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// U89280 // GenBank // Rattus norvegicus oxidative 17 beta hydroxysteroid dehydrogenase type 6 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT050619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
ENSRNOT00000051488 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:1378045:1381008:-1 gene:ENSRNOG00000046498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 87 // 8 // 13 // 0
NM_001025403 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 2 (Rbms2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 2 (Rbms2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 2 (Rbms2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006240745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 2 (Rbms2), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XR_355211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 2 (Rbms2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2533526:2567969:-1 gene:ENSRNOG00000003076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097377 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:114412 IMAGE:7445017), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2528262:2575256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001037765 // RefSeq // Rattus norvegicus SPRY domain containing 4 (Spryd4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2600837:2602657:-1 gene:ENSRNOG00000003127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC099138 // GenBank // Rattus norvegicus SPRY domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:116283 IMAGE:7456187), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2601685:2602651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT050628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001191090 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 10 (Zc3h10), mRNA. // chr7 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// XM_006240798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 10 (Zc3h10), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000061995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2942063:2946149:-1 gene:ENSRNOG00000040281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000020022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2942670:2960559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT050655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001009385 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein N (Apon), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2654715:2656130:-1 gene:ENSRNOG00000033466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088168 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein N, mRNA (cDNA clone MGC:108794 IMAGE:7322067), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ209551 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YO22 mRNA sequence. // chr7 // 44 // 96 // 11 // 25 // 0 /// FQ219205 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YO18 mRNA sequence. // chr7 // 42 // 100 // 11 // 26 // 0 /// NONRATT050630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_130410 // RefSeq // Rattus norvegicus Interleukin 23, alpha subunit p19 (Il23a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2689128:2691242:-1 gene:ENSRNOG00000003254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY055379 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 23 mRNA, complete cds. // chr7 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// BC098907 // GenBank // Rattus norvegicus Interleukin 23, alpha subunit p19, mRNA (cDNA clone MGC:114275 IMAGE:7454618), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2689771:2690935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108727 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q10 homolog A (S. cerevisiae) (Coq10a), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coenzyme Q10 homolog A (S. cerevisiae) (Coq10a), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2759394:2765320:-1 gene:ENSRNOG00000029571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2759949:2765503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT050633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001108728 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 5 (Slc39a5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 5 (Slc39a5), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 5 (Slc39a5), transcript variant X8, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2792339:2797763:-1 gene:ENSRNOG00000033361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ220010 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YI10 mRNA sequence. // chr7 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2793192:2797302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001034939 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleic acid binding protein 2 (Nabp2), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001244819 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleic acid binding protein 2 (Nabp2), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006240768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleic acid binding protein 2 (Nabp2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000031362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2798471:2804072:-1 gene:ENSRNOG00000023480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC104710 // GenBank // Rattus norvegicus oligonucleotide/oligosaccharide-binding fold containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:125161 IMAGE:7319804), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2798794:2804194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT050638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001100983 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light polypeptide 6, alkali, smooth muscle and non-muscle-like (Myl6l), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NM_001109484 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light chain 6, alkali, smooth muscle and non-muscle (Myl6), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NM_001109486 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light chain 6B, alkali, smooth muscle and non-muscle (Myl6b), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// BC166586 // GenBank // Rattus norvegicus myosin, light chain 6, alkali, smooth muscle and non-muscle, mRNA (cDNA clone MGC:188345 IMAGE:7934414), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ221709 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YM18 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000048453 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:2883129:2885907:-1 gene:ENSRNOG00000028837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2881031:2914750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_017249 // RefSeq // Rattus norvegicus extended synaptotagmin-like protein 1 (Esyt1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2897632:2914841:-1 gene:ENSRNOG00000003909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF099138 // GenBank // Rattus norvegicus GLUT4 vesicle protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC101857 // GenBank // Rattus norvegicus membrane bound C2 domain containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:124625 IMAGE:7937926), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2881031:2914750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001004206 // RefSeq // Rattus norvegicus proliferation-associated 2G4 (Pa2g4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240749 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proliferation-associated 2G4 (Pa2g4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000006578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2953212:2960679:-1 gene:ENSRNOG00000004904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079095 // GenBank // Rattus norvegicus proliferation-associated 2G4, mRNA (cDNA clone MGC:94070 IMAGE:7124036), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2942670:2960559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1
NM_017218 // RefSeq // Rattus norvegicus v-erb-b2 avian erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 3 (Erbb3), mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2964640:2983936:-1 gene:ENSRNOG00000004964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U29339 // GenBank // Rattus norvegicus ErbB3/Her3 precursor mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2964702:2986005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_003754258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 4 (Ikzf4), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006225914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 4 (Ikzf4), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_006240732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S26 (Rps26), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006240734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S26 (Rps26), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000019738 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:3033150:3047553:-1 gene:ENSRNOG00000005535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3025800:3073483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT050671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_031127 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfite oxidase (Suox), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3070930:3073497:-1 gene:ENSRNOG00000005987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061991 // GenBank // Rattus norvegicus sulfite oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:72410 IMAGE:5599452), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L05084 // GenBank // Rattus norvegicus sulfite oxidase mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3025800:3073483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001079936 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB5B, member RAS oncogene family (Rab5b), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// XM_006240751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB5B, member RAS oncogene family (Rab5b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3077243:3095997:-1 gene:ENSRNOG00000006130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC129101 // GenBank // Rattus norvegicus RAB5B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:156695 IMAGE:7098463), complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// FQ211489 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YN19 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT050674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3079587:3104984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// NONRATT050675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1 /// NONRATT050676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
NM_199501 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin dependent kinase 2 (Cdk2), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3097654:3105134:-1 gene:ENSRNOG00000006469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC061832 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin dependent kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:72609 IMAGE:5599608), complete cds. // chr7 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3079587:3104984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT050679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT050678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_080787 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, alpha (Dgka), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000036373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3116798:3142227:-1 gene:ENSRNOG00000022943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// FQ209812 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA39YM08 mRNA sequence. // chr7 // 94 // 98 // 44 // 47 // 0 /// GENSCAN00000005808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3117322:3137152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT050681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT050682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// NONRATT050685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT050683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// NONRATT050684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001109281 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 198b (Tmem198b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 198b (Tmem198b), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 198b (Tmem198b), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 198b (Tmem198b), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3196403:3200737:-1 gene:ENSRNOG00000006827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3197525:3199642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001105940 // RefSeq // Rattus norvegicus ORMDL sphingolipid biosynthesis regulator 2 (Ormdl2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000044292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3214561:3217641:-1 gene:ENSRNOG00000030120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3214950:3216433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONRATT050691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_017203 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 11 (Gdf11), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3280685:3286883:-1 gene:ENSRNOG00000007610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3280685:3286883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_006240810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 5 (11-cis/9-cis) (Rdh5), mRNA. // chr7 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3306531:3311337:-1 gene:ENSRNOG00000040155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// FQ218828 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YK18 mRNA sequence. // chr7 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3306657:3311337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT050698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001105941 // RefSeq // Rattus norvegicus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 1 (Bloc1s1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3312814:3316434:-1 gene:ENSRNOG00000007784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ217708 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA1YE01 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3312897:3316335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT050700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001024276 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 7B (Mettl7b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3354351:3356994:-1 gene:ENSRNOG00000007927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092587 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase like 7B, mRNA (cDNA clone MGC:109041 IMAGE:7368213), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092590 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase like 7B, mRNA (cDNA clone MGC:109058 IMAGE:7371843), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3354858:3356972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT050702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000707 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 877 (Olr877), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3434760:3435698:-1 gene:ENSRNOG00000043299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3434760:3484367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000497 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 878 (Olr878), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3483478:3484407:-1 gene:ENSRNOG00000043334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3434760:3484367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT050706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000586 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 879 (Olr879), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3689827:3690765:-1 gene:ENSRNOG00000043438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3689827:3690519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000055 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 880 (Olr880), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3734735:3735673:-1 gene:ENSRNOG00000042424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3734735:3735694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000056 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 881 (Olr881), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000065917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:3788799:3789734:-1 gene:ENSRNOG00000043125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:3788799:3789392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT050709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001001382 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 886 (Olr886), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000051699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5924658:5925602:-1 gene:ENSRNOG00000029097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT050721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT050722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 69 // 100 // 11 // 16 // 0
NONRATT050712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_001000061 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 889 (Olr889), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:4172534:4173496:-1 gene:ENSRNOG00000033344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4056515:4173151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001000060 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 892 (Olr892), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000046001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:4225602:4226568:-1 gene:ENSRNOG00000029961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 100 // 33 // 39 // 0 /// GENSCAN00000018621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5096898:5116469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000052005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4225639:4285384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
NM_001000940 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 894 (Olr894), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001001074 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 984 (Olr984), mRNA. // chr7 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000047489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:4284407:4285342:-1 gene:ENSRNOG00000049589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// NONRATT048987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// NONRATT050716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4225639:4285384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 77 // 16 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4705214:4764695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 77 // 16 // 23 // 0
NM_001000059 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 896 (Olr896), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000040141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5184683:5185633:-1 gene:ENSRNOG00000031510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5184683:5185633:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT050717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000058 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 898 (Olr898), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000051724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5233845:5234804:-1 gene:ENSRNOG00000046110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5233845:5234804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001000706 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 906 (Olr906), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001001354 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 917 (Olr917), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:5705373:5706308:1 gene:ENSRNOG00000048775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:13627435:13628370:1 gene:ENSRNOG00000049555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5705373:5721943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 95 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:13627435:13659426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 89 // 15 // 17 // 0
NM_001001356 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 920 (Olr920), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001001385 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 921 (Olr921), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000047899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16199057:16199992:-1 gene:ENSRNOG00000049242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000050212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16199057:16232285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000071350 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:3889136:3890071:1 gene:ENSRNOG00000050939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
NM_001000065 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1061 (Olr1061), mRNA. // chr7 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// NM_001000588 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 927 (Olr927), mRNA. // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9237467:9238429:-1 gene:ENSRNOG00000048023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16467947:16468909:1 gene:ENSRNOG00000048132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16467947:16529455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9237467:9238201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT049264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0
NM_001001386 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 932 (Olr932), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000049493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16596143:16597078:-1 gene:ENSRNOG00000033400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// NM_001001363 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1052 (Olr1052), mRNA. // chr7 // 72 // 90 // 26 // 36 // 0 /// NM_001001367 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 936 (Olr936), mRNA. // chr7 // 56 // 90 // 20 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000041966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8989148:8990076:-1 gene:ENSRNOG00000030254 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 53 // 90 // 19 // 36 // 0 /// GENSCAN00000013837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16596143:16596733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 65 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT051081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT051082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6834765:6836503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 70 // 16 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074914 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:6835554:6836485:1 gene:ENSRNOG00000049453 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 47 // 85 // 16 // 34 // 0 /// GENSCAN00000023745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:8989133:9219579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
NM_001001367 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 936 (Olr936), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001368 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 943 (Olr943), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7935969:8080276:1 gene:ENSRNOG00000050255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010865 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:8005445:8006786:1 gene:ENSRNOG00000048201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 79 // 95 // 15 // 19 // 0
NM_001001369 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 947 (Olr947), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7559421:7560266:1 gene:ENSRNOG00000003404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000075705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7776893:7777843:1 gene:ENSRNOG00000048102 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 68 // 96 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:7559613:7560266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT048999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001000073 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 951 (Olr951), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001001363 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1052 (Olr1052), mRNA. // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// NM_001001386 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 932 (Olr932), mRNA. // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16596143:16597078:-1 gene:ENSRNOG00000033400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// NM_001001367 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 936 (Olr936), mRNA. // chr7 // 43 // 100 // 12 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:8989148:8990076:-1 gene:ENSRNOG00000030254 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 43 // 100 // 12 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074914 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:6835554:6836485:1 gene:ENSRNOG00000049453 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6834765:6836503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16596143:16596733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// NONRATT051081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// NONRATT051082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:8989133:9219579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 100 // 12 // 28 // 0
NM_001000077 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1000 (Olr1000), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NM_001000486 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 959 (Olr959), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001000589 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 960 (Olr960), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7076639:7077571:-1 gene:ENSRNOG00000050107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072038 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:5807753:5808672:1 gene:ENSRNOG00000049883 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074121 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:6991971:6992892:-1 gene:ENSRNOG00000047030 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5736386:5808672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6991971:7077571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6810961:6811902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072277 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:4617460:4618398:1 gene:ENSRNOG00000045896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 100 // 9 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4617460:4618398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 100 // 9 // 28 // 0
NM_001000487 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 962 (Olr962), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000051670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:6765416:6766360:1 gene:ENSRNOG00000047710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000021367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6759007:6766360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT048997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000006284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6049656:6078158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001000702 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 982 (Olr982), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000003174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:4205494:4206429:-1 gene:ENSRNOG00000002333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000004526 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:4916492:5078496:-1 gene:ENSRNOG00000046083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// NONRATT050714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000046001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:4225602:4226568:-1 gene:ENSRNOG00000029961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001001074 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 984 (Olr984), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:4284407:4285342:-1 gene:ENSRNOG00000049589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4225639:4285384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4705214:4764695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT048987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001000590 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 987 (Olr987), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:13547611:13548570:-1 gene:ENSRNOG00000050676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:13539742:13548570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT040867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000038310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:6011177:6011686:1 gene:ENSRNOG00000025697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 89 // 6 // 8 // 0
NM_001000077 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1000 (Olr1000), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NM_001000486 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 959 (Olr959), mRNA. // chr7 // 73 // 100 // 27 // 37 // 0 /// NM_001000589 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 960 (Olr960), mRNA. // chr7 // 73 // 100 // 27 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000050153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7076639:7077571:-1 gene:ENSRNOG00000050107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 100 // 27 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000072038 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:5807753:5808672:1 gene:ENSRNOG00000049883 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 81 // 100 // 30 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000074121 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:6991971:6992892:-1 gene:ENSRNOG00000047030 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 84 // 100 // 31 // 37 // 0 /// GENSCAN00000000482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:5736386:5808672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 79 // 78 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6991971:7077571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 76 // 100 // 28 // 37 // 0 /// NONRATT050724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// GENSCAN00000021362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6810961:6811902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 100 // 27 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000072277 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:4617460:4618398:1 gene:ENSRNOG00000045896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 27 // 100 // 10 // 37 // 0 /// GENSCAN00000052068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:4617460:4618398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 27 // 100 // 10 // 37 // 0
NM_001001371 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1002 (Olr1002), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:6323016:6323954:1 gene:ENSRNOG00000046978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:6154918:6354142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT048994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000075 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1006 (Olr1006), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:6204173:6205123:1 gene:ENSRNOG00000032428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000076 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1007 (Olr1007), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000044587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:6175493:6176437:1 gene:ENSRNOG00000050845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT048992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000070 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1016 (Olr1016), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7285807:7286730:-1 gene:ENSRNOG00000003347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:7285807:7286730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000069 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1020 (Olr1020), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7410099:7411058:-1 gene:ENSRNOG00000049559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:7410099:7411058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001075 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1022 (Olr1022), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7636798:7637736:-1 gene:ENSRNOG00000048637 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:7582152:7637391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT050729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000068 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1024 (Olr1024), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001366 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1029 (Olr1029), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:7856880:7857818:-1 gene:ENSRNOG00000047357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:7856880:7926343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000034404 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:7943265:7944196:-1 gene:ENSRNOG00000025340 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0
NM_001001364 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1051 (Olr1051), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9289350:9290285:-1 gene:ENSRNOG00000046337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9289350:9290030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000067 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1055 (Olr1055), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000051359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16624358:16625302:1 gene:ENSRNOG00000030191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16624358:16690884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT049269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001000072 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1057 (Olr1057), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000066 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1058 (Olr1058), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16561493:16562431:1 gene:ENSRNOG00000050142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:16561493:16562431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001362 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1059 (Olr1059), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000044356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:16526592:16527572:1 gene:ENSRNOG00000032290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT049265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000698 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1060 (Olr1060), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000051063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9218623:9219579:-1 gene:ENSRNOG00000031181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT050735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:8989133:9219579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001000065 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1061 (Olr1061), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9237467:9238429:-1 gene:ENSRNOG00000048023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9237467:9238201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000697 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1067 (Olr1067), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000049954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9565689:9566636:-1 gene:ENSRNOG00000049897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT050738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000697 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1067 (Olr1067), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// NM_001001077 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1068 (Olr1068), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000041565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9599915:9600862:-1 gene:ENSRNOG00000050013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9565689:9566636:-1 gene:ENSRNOG00000049897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// NM_001000522 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1069 (Olr1069), mRNA. // chr7 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000044882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9637939:9638883:-1 gene:ENSRNOG00000033263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000000017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9569705:9660298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT050738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// NONRATT050739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001000522 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1069 (Olr1069), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000044882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9637939:9638883:-1 gene:ENSRNOG00000033263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT050740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000000017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9569705:9660298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_001000591 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1070 (Olr1070), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000011198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9659372:9660331:-1 gene:ENSRNOG00000008476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9569705:9660298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT050741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001000063 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1071 (Olr1071), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000011188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9757296:9758237:-1 gene:ENSRNOG00000008464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001000062 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1072 (Olr1072), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9795002:9795970:-1 gene:ENSRNOG00000008460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9708591:9795970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105942 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal differentiation 4 (Neurod4), mRNA. // chr7 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006240819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal differentiation 4 (Neurod4), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal differentiation 4 (Neurod4), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000011167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:9865743:9877509:-1 gene:ENSRNOG00000008449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9867980:9868963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006225919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 124-like (LOC102549817), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 124-like (LOC102549817), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_355233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 124-like (LOC102549817), transcript variant X3, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_355234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 124-like (LOC102549817), transcript variant X4, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_355236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 124-like (LOC102549817), transcript variant X6, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006225919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 124-like (LOC102549817), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 124-like (LOC102549817), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT051002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 50 // 6 // 6 // 0
NM_031656 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 8 (Stx8), mRNA. // chr7 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// XR_357670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 8 (Stx8), transcript variant X1, misc_RNA. // chr7 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54258230:54498841:1 gene:ENSRNOG00000003849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// AF033109 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 8 mRNA, complete cds. // chr7 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:10800628:10801339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 85 // 18 // 23 // 0 /// NONRATT050748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:10226771:10227148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 52 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT008865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 61 // 85 // 14 // 23 // 0 /// NONRATT008868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000014230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54258182:54320203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT008866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT008867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSRNOT00000011102 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:10228492:10232944:-1 gene:ENSRNOG00000008398 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:10228653:10229195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006240827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100910577), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// XR_347625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100910577), transcript variant X3, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000042498 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:10060906:10063355:1 gene:ENSRNOG00000033583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000040134 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:10260453:10261390:1 gene:ENSRNOG00000046029 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000044932 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:10367926:10368863:-1 gene:ENSRNOG00000047335 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT050748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_031656 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 8 (Stx8), mRNA. // chr7 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// XR_357670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 8 (Stx8), transcript variant X1, misc_RNA. // chr7 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54258230:54498841:1 gene:ENSRNOG00000003849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// AF033109 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 8 mRNA, complete cds. // chr7 // 54 // 100 // 14 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:10800628:10801339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:10226771:10227148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT050748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT008865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 88 // 10 // 23 // 0 /// NONRATT008868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XM_006225924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100912294), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100912294), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042386 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:10940588:10943347:-1 gene:ENSRNOG00000021900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT050755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001139487 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein LOC100125368 (LOC100125368), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein LOC100125368 (LOC100125368), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000031481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11063604:11065932:-1 gene:ENSRNOG00000043289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000049348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:10668731:10670396:-1 gene:ENSRNOG00000049005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC128765 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein LOC100125368, mRNA (cDNA clone MGC:156774 IMAGE:7123097), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001106771 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 24 (Ankrd24), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240898 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 24 (Ankrd24), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11086846:11105541:-1 gene:ENSRNOG00000006759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11087246:11100367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:8931868:8940672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001039013 // RefSeq // Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 2 (Tle2), mRNA. // chr7 // 92 // 83 // 36 // 39 // 0 /// XM_006240890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 2 (E(sp1) homolog, Drosophila) (Tle2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000061279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11155631:11170879:-1 gene:ENSRNOG00000005874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// BC100652 // GenBank // Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 2 (E(sp1) homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:124808 IMAGE:7932424), complete cds. // chr7 // 92 // 83 // 36 // 39 // 0 /// GENSCAN00000021210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11155773:11177607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT050760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT050762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1
NM_019220 // RefSeq // Rattus norvegicus amino-terminal enhancer of split (Aes), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11180239:11187085:-1 gene:ENSRNOG00000029133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC101855 // GenBank // Rattus norvegicus amino-terminal enhancer of split, mRNA (cDNA clone MGC:124620 IMAGE:7933368), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L14462 // GenBank // Rattus norvegicus R-esp1 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11180913:11190612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT050771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000054636 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:11239885:11239980:-1 gene:ENSRNOG00000049325 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025006 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxyhypusine hydroxylase/monooxygenase (Dohh), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11358019:11362757:-1 gene:ENSRNOG00000004259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087658 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyhypusine hydroxylase/monooxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:105594 IMAGE:7314221), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ228684 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YN14 mRNA sequence. // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11358509:11360602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT050774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT050777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001108730 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 12 (Mfsd12), mRNA. // chr7 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11383866:11390540:-1 gene:ENSRNOG00000039858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11385044:11390512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT050780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT050783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_017054 // RefSeq // Rattus norvegicus thromboxane A2 receptor (Tbxa2r), mRNA. // chr7 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11419918:11424715:-1 gene:ENSRNOG00000020585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// D21158 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for rat thromboxane A2 receptor, complete cds. // chr7 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// D32080 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for thromboxane A2 receptor, complete cds. // chr7 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11420402:11422248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 43 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT050787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001081447 // RefSeq // Rattus norvegicus cactin, spliceosome C complex subunit (Cactin), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11427936:11432741:-1 gene:ENSRNOG00000039852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY934505 // GenBank // Rattus norvegicus cactin mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166406 // GenBank // Rattus norvegicus similar to R31449_3, mRNA (cDNA clone MGC:187226 IMAGE:9028620), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11428234:11448987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001009967 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, gamma (Pip5k1c), transcript variant c, mRNA. // chr7 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// NM_001033970 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, gamma (Pip5k1c), transcript variant b, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000061159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11433956:11461658:-1 gene:ENSRNOG00000020577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY850259 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type 1 gamma (Pip5k1c) mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 93 // 33 // 37 // 0 /// BC101909 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type I, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:124518 IMAGE:7933923), complete cds. // chr7 // 94 // 88 // 33 // 35 // 0 /// NONRATT050791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000021207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11428234:11448987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// NONRATT050792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT050793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
NM_031781 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family A, member 3 (Apba3), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// XM_006241019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family A, member 3 (Apba3), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11481877:11486849:-1 gene:ENSRNOG00000020466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF029109 // GenBank // Rattus norvegicus mint 3 (mint 3) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC161842 // GenBank // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:187359 IMAGE:9102177), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11482031:11486224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT050796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT050797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT050798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_021859 // RefSeq // Rattus norvegicus megakaryocyte-associated tyrosine kinase (Matk), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus megakaryocyte-associated tyrosine kinase (Matk), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006240990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus megakaryocyte-associated tyrosine kinase (Matk), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11492662:11497686:-1 gene:ENSRNOG00000020431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC087726 // GenBank // Rattus norvegicus megakaryocyte-associated tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:105436 IMAGE:7320205), complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11492786:11521102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
XM_006225935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein 2 (Zfr2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006225936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein 2 (Zfr2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein 2 (Zfr2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein 2 (Zfr2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061132 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:11503082:11521102:-1 gene:ENSRNOG00000020416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11492786:11521102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006225935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein 2 (Zfr2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein 2 (Zfr2), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein 2 (Zfr2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein 2 (Zfr2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061132 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:11503082:11521102:-1 gene:ENSRNOG00000020416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11492786:11521102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_022546 // RefSeq // Rattus norvegicus death-associated protein kinase 3 (Dapk3), mRNA. // chr7 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006240991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death-associated protein kinase 3 (Dapk3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death-associated protein kinase 3 (Dapk3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11559843:11568211:-1 gene:ENSRNOG00000020383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC062076 // GenBank // Rattus norvegicus death-associated protein kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72441 IMAGE:5599435), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11559897:11574114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT050810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT050811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT050812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT050813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_017245 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 2 (Eef2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000047450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11568907:11574177:-1 gene:ENSRNOG00000020266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF000576 // GenBank // Rattus norvegicus EF-2 mRNA, partial cds. // chr7 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// BC066661 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:72505 IMAGE:5623322), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ233941 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YM09 mRNA sequence. // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11559897:11574114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NONRATT050815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_054002 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 7a (Zbtb7a), mRNA. // chr7 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// XM_006240838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 7a (Zbtb7a), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11599413:11612150:-1 gene:ENSRNOG00000020161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// D88450 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for osteoclast-derived zinc finger (OCZF) protein, complete cds. // chr7 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT050822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11600368:11645668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT050823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_133283 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 2 (Map2k2), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11626352:11645697:-1 gene:ENSRNOG00000020005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC126084 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:156599 IMAGE:8376547), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// D14592 // GenBank // Rattus norvegicus MEK2 mRNA for MAP kinase kinase-related protein, complete cds. // chr7 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// L14936 // GenBank // Rattus norvegicus MAP kinase kinase (MKK2) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// FQ215833 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YG11 mRNA sequence. // chr7 // 65 // 100 // 22 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11600368:11645668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT050826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT050825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// NONRATT050827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT050828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONRATT050830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT050829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_172075 // RefSeq // Rattus norvegicus thimet oligopeptidase 1 (Thop1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11668513:11680853:-1 gene:ENSRNOG00000019924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081706 // GenBank // Rattus norvegicus thimet oligopeptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93105 IMAGE:7111806), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M61142 // GenBank // Rat metalloendopeptidase mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11668709:11680719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT050835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001008321 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest and DNA-damage-inducible, beta (Gadd45b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11813536:11815565:-1 gene:ENSRNOG00000019822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085337 // GenBank // Rattus norvegicus growth arrest and DNA-damage-inducible, beta, mRNA (cDNA clone MGC:105966 IMAGE:7302492), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234526 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YK01 mRNA sequence. // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11814097:11815333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT050837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001047100 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 9 (Tmprss9), mRNA. // chr7 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000049221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11846111:11866956:-1 gene:ENSRNOG00000032429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000066037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11855373:11866968:-1 gene:ENSRNOG00000032429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// AB109392 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Serase-1B, complete cds. // chr7 // 94 // 66 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11846266:11866956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NM_001014200 // RefSeq // Rattus norvegicus signal peptide peptidase-like 2B (Sppl2b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240952 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal peptide peptidase-like 2B (Sppl2b), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006240953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal peptide peptidase-like 2B (Sppl2b), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11879708:11892558:-1 gene:ENSRNOG00000033794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC087132 // GenBank // Rattus norvegicus signal peptide peptidase-like 2B, mRNA (cDNA clone MGC:95005 IMAGE:7121303), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ223857 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA84YN20 mRNA sequence. // chr7 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11873485:11892547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// NONRATT050843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT050847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_139081 // RefSeq // Rattus norvegicus ornithine decarboxylase antizyme 1 (Oaz1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000026341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11919843:11922302:-1 gene:ENSRNOG00000019459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// D10706 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ornithine decarboxylase antizyme, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ213504 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YH09 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ225909 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YL18 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_001297557 // RefSeq // Rattus norvegicus ornithine decarboxylase antizyme 1 (Oaz1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11920127:11922223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT050848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT050849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT050850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT050851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT050852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_012902 // RefSeq // Rattus norvegicus anti-Mullerian hormone (Amh), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11942870:11945218:-1 gene:ENSRNOG00000019377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11942870:11945218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001011986 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 3a, subunit 2 (Sf3a2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006240886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus splicing factor 3a, subunit 2 (Sf3a2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11945541:11951564:-1 gene:ENSRNOG00000019349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079320 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor 3a, subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:94492 IMAGE:7135238), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11946469:11949088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT050857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001108733 // RefSeq // Rattus norvegicus DOT1-like histone H3K79 methyltransferase (Dot1l), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DOT1-like histone H3K79 methyltransferase (Dot1l), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:11953820:11992519:-1 gene:ENSRNOG00000032546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:11958697:11992280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
XM_002726872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IZUMO family member 4 (Izumo4), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_002729764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IZUMO family member 4 (Izumo4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000049766 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:12043098:12045489:-1 gene:ENSRNOG00000031950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XR_347641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IZUMO family member 4 (Izumo4), transcript variant X4, misc_RNA. // chr7 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// XR_355259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IZUMO family member 4 (Izumo4), transcript variant X3, misc_RNA. // chr7 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT050864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12043884:12045471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT050865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT050866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_031725 // RefSeq // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 4 (Scamp4), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12137246:12149666:-1 gene:ENSRNOG00000018271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF285631 // GenBank // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 4 mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC090342 // GenBank // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:105391 IMAGE:7304207), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT050877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12113153:12146374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT050879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT050880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001103361 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, tRNA-specific 3 (Adat3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093394 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine deaminase, tRNA-specific 3, mRNA (cDNA clone MGC:112753 IMAGE:7388692), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12113153:12146374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT050874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003750278 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus one cut homeobox 3 (Onecut3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046427 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:12235749:12253402:-1 gene:ENSRNOG00000033869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12252161:12253255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001170557 // RefSeq // Rattus norvegicus polo-like kinase 5 (Plk5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polo-like kinase 5 (Plk5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XR_355241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polo-like kinase 5 (Plk5), transcript variant X8, misc_RNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12382706:12391125:-1 gene:ENSRNOG00000034102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12382905:12396533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT050884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT050886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001013218 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor accessory protein 6 (Reep6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006240967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus receptor accessory protein 6 (Reep6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12409855:12416524:-1 gene:ENSRNOG00000033262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083830 // GenBank // Rattus norvegicus receptor accessory protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:94922 IMAGE:7112359), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12410199:12416497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001106769 // RefSeq // Rattus norvegicus adenomatosis polyposis coli 2 (Apc2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12428263:12444598:-1 gene:ENSRNOG00000033791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12431011:12453244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017151 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S15 (Rps15), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000029791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12451930:12453368:-1 gene:ENSRNOG00000024603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ230466 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA99YK23 mRNA sequence. // chr7 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// FQ228367 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA9YG03 mRNA sequence. // chr7 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// GENSCAN00000027452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12431011:12453244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT050893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_006240969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DAZ associated protein 1 (Dazap1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC083601 // GenBank // Rattus norvegicus DAZ associated protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7133110). // chr7 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// NM_001025742 // RefSeq // Rattus norvegicus DAZ associated protein 1 (Dazap1), mRNA. // chr7 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// ENSRNOT00000046886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12460102:12480849:-1 gene:ENSRNOG00000031387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// BC098930 // GenBank // Rattus norvegicus DAZ associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:114376 IMAGE:7133199), complete cds. // chr7 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// NONRATT050895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT050896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// NONRATT050897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// GENSCAN00000035741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12460289:12472783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001008525 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 7 (Ndufs7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000039728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12488477:12495748:-1 gene:ENSRNOG00000024568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC086574 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:105684 IMAGE:7306868), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ232492 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YI14 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12488535:12563133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001108736 // RefSeq // Rattus norvegicus melanoma associated antigen (mutated) 1 (Mum1), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006240974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus melanoma associated antigen (mutated) 1 (Mum1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000060708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12501116:12516175:-1 gene:ENSRNOG00000024549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC160828 // GenBank // Rattus norvegicus melanoma associated antigen (mutated) 1, mRNA (cDNA clone MGC:187518 IMAGE:7453186), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12488535:12563133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT050908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001168670 // RefSeq // Rattus norvegicus ephrin A2 (Efna2), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12552532:12563371:-1 gene:ENSRNOG00000016203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12488535:12563133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001109283 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1562114 (RGD1562114), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12568305:12570015:-1 gene:ENSRNOG00000016193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12567318:12569991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT050915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_031147 // RefSeq // Rattus norvegicus cold inducible RNA binding protein (Cirbp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12571310:12575127:-1 gene:ENSRNOG00000015999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB000362 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CIRP, complete cds. // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// BC069219 // GenBank // Rattus norvegicus cold inducible RNA binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:72781 IMAGE:6888887), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12572035:12573189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001191577 // RefSeq // Rattus norvegicus midnolin (Midn), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006240911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus midnolin (Midn), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000060698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12585958:12592656:-1 gene:ENSRNOG00000015434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12586165:12603646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_139106 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, delta subunit (Atp5d), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12596918:12600125:-1 gene:ENSRNOG00000014625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC161836 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:187332 IMAGE:9098303, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ214102 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YN23 mRNA sequence. // chr7 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// FQ220930 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YC16 mRNA sequence. // chr7 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// U00926 // GenBank // Rattus norvegicus delta subunit of F1F0 ATPase gene, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT050926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12586165:12603646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_001108069 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 11 (Stk11), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 11 (Stk11), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12610856:12627616:-1 gene:ENSRNOG00000014287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12612039:12626794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT050930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT050932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001108067 // RefSeq // Rattus norvegicus histocompatibility (minor) HA-1 (Hmha1), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000060648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12711159:12910971:-1 gene:ENSRNOG00000013220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12834842:12932042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
NM_207598 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 7 (Abca7), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000064886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12912237:12930983:-1 gene:ENSRNOG00000012939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// AB097814 // GenBank // Rattus norvegicus ABCA7 mRNA for ATP-binding cassette transporter sub-family A member 7, complete cds. // chr7 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000035748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12834842:12932042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT050967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT050968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT050973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 20 // 47 // 1 /// NONRATT050980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1 /// NONRATT050976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1
NM_133308 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl-D-aspartate 3B (Grin3b), mRNA. // chr7 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12934715:12941031:1 gene:ENSRNOG00000012562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// AF440691 // GenBank // Rattus norvegicus NMDA ligand-gated receptor 3B subunit mRNA, complete cds. // chr7 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12934783:12940945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT049198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0
NM_001039027 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 18 (Wdr18), mRNA. // chr7 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// XM_006240906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 18 (Wdr18), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12731050:12738845:-1 gene:ENSRNOG00000012379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC099828 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 18, mRNA (cDNA clone MGC:124826 IMAGE:7934398), complete cds. // chr7 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// FQ219525 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YK22 mRNA sequence. // chr7 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12731116:12738837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT050943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT050944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001108066 // RefSeq // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 3A (Bright like) (Arid3a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AT rich interactive domain 3A (Bright like) (Arid3a), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AT rich interactive domain 3A (Bright like) (Arid3a), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006240905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AT rich interactive domain 3A (Bright like) (Arid3a), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12746095:12768092:-1 gene:ENSRNOG00000026435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168846 // GenBank // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 3A (Bright like), mRNA (cDNA clone MGC:189073 IMAGE:7114467), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12740147:12767645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT050949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_023992 // RefSeq // Rattus norvegicus KISS1 receptor (Kiss1r), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12776069:12779590:-1 gene:ENSRNOG00000011954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB051066 // GenBank // Rattus norvegicus rot7t175 mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF115516 // GenBank // Rattus norvegicus orphan G protein-coupled receptor GPR54 (GPR54) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ232906 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YP15 mRNA sequence. // chr7 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12776069:12779416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001077642 // RefSeq // Rattus norvegicus complement factor D (adipsin) (Cfd), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12803947:12805661:-1 gene:ENSRNOG00000033564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12803982:12805661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106767 // RefSeq // Rattus norvegicus elastase, neutrophil expressed (Elane), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12808042:12809890:-1 gene:ENSRNOG00000033685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12808120:12809867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT050955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001024264 // RefSeq // Rattus norvegicus proteinase 3 (Prtn3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006240901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteinase 3 (Prtn3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000014687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12813434:12816673:-1 gene:ENSRNOG00000029814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12813434:12816673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT050956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271057 // RefSeq // Rattus norvegicus polypyrimidine tract binding protein 1 (Ptbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_022516 // RefSeq // Rattus norvegicus polypyrimidine tract binding protein 1 (Ptbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// XM_006240854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polypyrimidine tract binding protein 1 (Ptbp1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12833688:12843440:-1 gene:ENSRNOG00000010448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000044865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12833688:12843440:-1 gene:ENSRNOG00000010448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC061858 // GenBank // Rattus norvegicus polypyrimidine tract binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72282 IMAGE:5598495), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12834842:12932042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// NONRATT050961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT050960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001109284 // RefSeq // Rattus norvegicus mitotic spindle positioning (Misp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006240983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitotic spindle positioning (Misp), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000013857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12867465:12877644:-1 gene:ENSRNOG00000010423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12834842:12932042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT050964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_130829 // RefSeq // Rattus norvegicus paralemmin (Palm), mRNA. // chr7 // 91 // 97 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12877762:12963915:-1 gene:ENSRNOG00000009760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB058889 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for paralemmin, complete cds. // chr7 // 91 // 97 // 29 // 32 // 0 /// BC072525 // GenBank // Rattus norvegicus paralemmin, mRNA (cDNA clone MGC:91516 IMAGE:7097177), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT050968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000035748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12834842:12932042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_053629 // RefSeq // Rattus norvegicus follistatin-like 3 (secreted glycoprotein) (Fstl3), mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000012578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12975139:12980781:-1 gene:ENSRNOG00000009311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB021295 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for follistatin-related protein FLRG, complete cds. // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AB071603 // GenBank // Rattus norvegicus flrg mRNA for follistatin-like protein, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12976235:12980760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_130751 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 22 (Fgf22), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:12999989:13001879:-1 gene:ENSRNOG00000008960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB078902 // GenBank // Rattus norvegicus FGF22 mRNA for fibroblast growth factor 22, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:12999989:13001879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT050989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053684 // RefSeq // Rattus norvegicus hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 2 (Hcn2), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13021934:13040277:-1 gene:ENSRNOG00000008831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB164197 // GenBank // Rattus norvegicus HCN2 mRNA for Hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated cation channel 2, complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13021482:13051698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NM_001109882 // RefSeq // Rattus norvegicus basigin (Ok blood group) (Bsg), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13044573:13051789:-1 gene:ENSRNOG00000008414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY120888 // GenBank // Rattus norvegicus basigin 2 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ213626 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YL01 mRNA sequence. // chr7 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// NM_012783 // RefSeq // Rattus norvegicus basigin (Ok blood group) (Bsg), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000044275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13044573:13051789:-1 gene:ENSRNOG00000008414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// BC059145 // GenBank // Rattus norvegicus basigin, mRNA (cDNA clone MGC:72895 IMAGE:6889785), complete cds. // chr7 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// X54640 // GenBank // Rat mRNA for the OX47 antigen. // chr7 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// FQ215940 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YM14 mRNA sequence. // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT050991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT050992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13021482:13051698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
GENSCAN00000052482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13059749:13068001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_057183 // RefSeq // Rattus norvegicus granzyme M (lymphocyte met-ase 1) (Gzmm), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13062468:13068067:-1 gene:ENSRNOG00000030530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ233430 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YO04 mRNA sequence. // chr7 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// L05175 // GenBank // Rattus norvegicus serine protease mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13059749:13068001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT050994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013103 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 34 (Cdc34), mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13068994:13074382:-1 gene:ENSRNOG00000008348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13069331:13074373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT050996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT050997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1
NM_001109621 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin polyglutamylase complex subunit 1 (Tpgs1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13080966:13086888:-1 gene:ENSRNOG00000008296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13081169:13086412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT050999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019317 // RefSeq // Rattus norvegicus mucosal vascular addressin cell adhesion molecule 1 (Madcam1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13087425:13090827:-1 gene:ENSRNOG00000008217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D87840 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for madcam 1, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13087355:13101378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT051000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133563 // RefSeq // Rattus norvegicus gonadotropin inducible ovarian transcription factor 1 (Giot1), mRNA. // chrU // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// AB047636 // GenBank // Rattus norvegicus GIOT1 mRNA for gonadotropin inducible ovarian transcription factor 1, complete cds. // chrU // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT051002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 90 // 59 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT050748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 94 // 8 // 16 // 0
ENSRNOT00000048281 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:13545138:13545800:-1 gene:ENSRNOG00000039451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000056266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13545138:13545800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_001000421 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1075 (Olr1075), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13607716:13608675:-1 gene:ENSRNOG00000039449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13607716:13665092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000712 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1076 (Olr1076), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000060455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13628165:13629121:-1 gene:ENSRNOG00000039448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13607716:13665092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT051005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000941 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1077 (Olr1077), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13607716:13665092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT051006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13664392:13693064:-1 gene:ENSRNOG00000049781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_207597 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1078 (Olr1078), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M64376 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13670346:13671275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT051007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13664392:13693064:-1 gene:ENSRNOG00000049781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 72 // 8 // 18 // 0
NM_001000711 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1079 (Olr1079), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13692132:13692962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000592 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1081 (Olr1081), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003750285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1082-like (LOC100910648), mRNA. // chr7 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_173335 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1082 (Olr1082), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000048054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13743247:13744200:-1 gene:ENSRNOG00000050171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// M64381 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT051009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT051010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT051011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0
NM_032065 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (high affinity aspartate/glutamate transporter), member 6 (Slc1a6), mRNA. // chr7 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:13893842:13915011:-1 gene:ENSRNOG00000007509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AY286330 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 1 member 6 (Slc1a6) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC098912 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (high affinity aspartate/glutamate transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:114297 IMAGE:7315936), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// U89608 // GenBank // Rattus norvegicus high-affinity glutamate transporter EAAT4 mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:13893993:13927078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001108738 // RefSeq // Rattus norvegicus ilvB (bacterial acetolactate synthase)-like (Ilvbl), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14201069:14211122:-1 gene:ENSRNOG00000028512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000007002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14201313:14210753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT051015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
GENSCAN00000007005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14230224:14230694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006225970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1088 (Olr1088), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1088 (Olr1088), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012907 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:14273214:14274170:-1 gene:ENSRNOG00000028146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000007004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14273214:14345687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_020087 // RefSeq // Rattus norvegicus notch 3 (Notch3), mRNA. // chr7 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000037456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14294587:14345774:-1 gene:ENSRNOG00000004346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF164486 // GenBank // Rattus norvegicus Notch 3 protein mRNA, complete cds. // chr7 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000007004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14273214:14345687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_001108988 // RefSeq // Rattus norvegicus epoxide hydrolase 3 (Ephx3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epoxide hydrolase 3 (Ephx3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14368556:14373864:-1 gene:ENSRNOG00000027319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14368891:14373840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001100903 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain containing 4 (Brd4), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000008963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14378187:14457537:-1 gene:ENSRNOG00000006770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// BC091168 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7382926, with apparent retained intron. // chr7 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// BC100641 // GenBank // Rattus norvegicus bromodomain containing 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7930095), partial cds. // chr7 // 100 // 36 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14380865:14445147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 55 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 68 // 68 // 32 // 47 // 1 /// NONRATT051022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1 /// NONRATT051027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1
NM_053855 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 8 (Akap8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14477686:14493949:-1 gene:ENSRNOG00000006559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166580 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:188279 IMAGE:7380301), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14479004:14523909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT051031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001013946 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like (Akap8l), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241055 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like (Akap8l), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14494266:14523993:-1 gene:ENSRNOG00000006355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085785 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 8-like, mRNA (cDNA clone MGC:93758 IMAGE:7108413), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14479004:14523909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT051040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT051038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001108064 // RefSeq // Rattus norvegicus widely-interspaced zinc finger motifs (Wiz), mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006241061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus widely-interspaced zinc finger motifs (Wiz), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus widely-interspaced zinc finger motifs (Wiz), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14528651:14556359:-1 gene:ENSRNOG00000006217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14529623:14597859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001134562 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS protein activator like 3 (Rasal3), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// XM_006241059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS protein activator like 3 (Rasal3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000066722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:14557751:14573109:-1 gene:ENSRNOG00000006167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14529623:14597859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT051046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0
GENSCAN00000020731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14914694:14915567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:14815390:14816263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
XM_006225950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102546572), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006697 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:15181626:15184752:-1 gene:ENSRNOG00000004947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075740 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:15181999:15184752:-1 gene:ENSRNOG00000004947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001009537 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 799 (Zfp799), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15224533:15230625:-1 gene:ENSRNOG00000032552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC061577 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 799, mRNA (cDNA clone MGC:72997 IMAGE:6888485), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT051053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001163062 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 870 (Zfp870), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006241082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 870 (Zfp870), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15317710:15322754:-1 gene:ENSRNOG00000030416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// GENSCAN00000031344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15293632:15328394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_019623 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 1 (Cyp4f1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15338348:15349540:-1 gene:ENSRNOG00000004786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081808 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:93476 IMAGE:7109036), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ218792 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YO18 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// M94548 // GenBank // Rattus norvegicus hepatic tumor cytochrome P450 (CYP4F1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15338734:15385474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_153318 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 6 (Cyp4f6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 6 (Cyp4f6), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000006335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15357407:15384091:-1 gene:ENSRNOG00000034157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078713 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 4F6, mRNA (cDNA clone MGC:93133 IMAGE:7107801), complete cds. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// U39208 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 4F6 (CYP4F6) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15338734:15385474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT051063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT051061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001108063 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 763 (Zfp763), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000037299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15455707:15460067:-1 gene:ENSRNOG00000004557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15455344:15473794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
XM_006225962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560314 (RGD1560314), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560314 (RGD1560314), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U78121 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 10 (AZF10) mRNA, partial cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106765 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to KIAA1111-like protein (RGD1310212), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to KIAA1111-like protein (RGD1310212), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15526034:15528817:-1 gene:ENSRNOG00000026582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15475854:15530294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106764 // RefSeq // Rattus norvegicus microrchidia 2B (Morc2b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15650756:15654836:-1 gene:ENSRNOG00000004501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15650916:15675858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001001379 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1090 (Olr1090), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 67 // 96 // 16 // 24 // 0 /// NONRATT051074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 67 // 96 // 16 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15694928:15735336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001001388 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1093 (Olr1093), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_002727303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Zinc finger protein 81-like (LOC100363943), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000050658 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:15991402:15992292:-1 gene:ENSRNOG00000033056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 77 // 42 // 10 // 13 // 0 /// NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000050206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15990684:16006271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000009270 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:16022123:16036263:-1 gene:ENSRNOG00000007076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000072860 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:16020784:16027309:-1 gene:ENSRNOG00000007076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// FQ211033 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YJ20 mRNA sequence. // chr7 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
NM_001000416 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1095 (Olr1095), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000051928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:15788049:15789005:1 gene:ENSRNOG00000050274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:15788010:15789005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT049260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_001078928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to NACHT, leucine rich repeat and PYD containing 4A (RGD1560291), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_234957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to NACHT, leucine rich repeat and PYD containing 4A (RGD1560291), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029672 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:17659402:17684378:-1 gene:ENSRNOG00000009241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:17463283:17684348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
XM_003754279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing protein 4F-like (LOC100912783), mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000030164 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:18008166:18016796:-1 gene:ENSRNOG00000028214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 71 // 9 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18008166:18016817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 71 // 9 // 15 // 0
ENSRNOT00000012098 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:18181342:18182058:-1 gene:ENSRNOG00000009129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18163531:18181978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001109911 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M (Hnrnpm), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NM_053876 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M (Hnrnpm), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// XM_006241116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M (Hnrnpm), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000011047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18693856:18731848:-1 gene:ENSRNOG00000007921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000036172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18693856:18731848:-1 gene:ENSRNOG00000007921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000059985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18693856:18731848:-1 gene:ENSRNOG00000007921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC088317 // GenBank // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, mRNA (cDNA clone MGC:109545 IMAGE:7325202), complete cds. // chr7 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18694112:18762987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_001034108 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 2, E3 ubiquitin protein ligase (March2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18736909:18754963:-1 gene:ENSRNOG00000007769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB048838 // GenBank // Rattus norvegicus MARCH-II mRNA for membrane associated RING-CH finger protein II, complete cds. // chr7 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// AB048839 // GenBank // Rattus norvegicus MARCH-II mRNA for membrane associated RING-CH finger protein II, transcript variant, complete cds. // chr7 // 89 // 60 // 16 // 18 // 0 /// BC088286 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 2, mRNA (cDNA clone MGC:109165 IMAGE:7383057), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18694112:18762987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT051091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_032617 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB11B, member RAS oncogene family (Rab11b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18776594:18789732:-1 gene:ENSRNOG00000007648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF286534 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein RAB11B (Rab11b) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC062041 // GenBank // Rattus norvegicus RAB11B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:72373 IMAGE:5598168), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D01046 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GTP binding protein, complete cds. // chr7 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// FQ213918 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YM19 mRNA sequence. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT051093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18777390:18811503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT051094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_199115 // RefSeq // Rattus norvegicus angiopoietin-like 4 (Angptl4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:18805416:18811643:-1 gene:ENSRNOG00000007545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY393999 // GenBank // Rattus norvegicus angiopoietin-like protein 4 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC078944 // GenBank // Rattus norvegicus angiopoietin-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:93779 IMAGE:7109431), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:18777390:18811503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT051096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001000485 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1096 (Olr1096), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:1901035:1902111:1 gene:ENSRNOG00000014386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:1901479:1913494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006225975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase W-like (LOC102551633), mRNA. // chr7 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// XM_006241137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase W-like (LOC102551633), mRNA. // chr7 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071008 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:20239594:20241562:-1 gene:ENSRNOG00000050249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:20231376:20241562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001079328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase W-like (RGD1565071), mRNA. // chr7 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:20503027:20512402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_001099484 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 56 (Vom2r56), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006241136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 57 (Vom2r57), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:19253644:19268428:-1 gene:ENSRNOG00000039136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001099484 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 56 (Vom2r56), mRNA. // chr7 // 59 // 100 // 19 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000047547 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:23084443:23099638:-1 gene:ENSRNOG00000026976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:22952673:23099629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000050257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:19087112:19268419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT051101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// BC097465 // GenBank // Rattus norvegicus oxidation resistance 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7457642), complete cds. // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23376901:23412332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000025884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23426509:23427727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21169296:21178631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21126333:21165445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21208759:21253582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1
NONRATT049314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23376901:23412332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000025884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23426509:23427727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000054583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21169296:21178631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000054585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21126333:21165445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000054587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:21208759:21253582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_012886 // RefSeq // Rattus norvegicus TIMP metallopeptidase inhibitor 3 (Timp3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:23694454:23744372:-1 gene:ENSRNOG00000004303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097335 // GenBank // Rattus norvegicus TIMP metallopeptidase inhibitor 3, mRNA (cDNA clone MGC:114345 IMAGE:7443686), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U27201 // GenBank // Rattus norvegicus tissue inhibitor of metalloproteinase 3 (TIMP-3) mRNA, complete cds. // chr7 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23696938:23708339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT051107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT051108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001012222 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 7 (Fbxo7), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 7 (Fbxo7), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 7 (Fbxo7), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:23964802:23993030:-1 gene:ENSRNOG00000004637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079382 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:94890 IMAGE:7111095), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:23964964:23992997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT051112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT051113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
XM_006241170 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus achaete-scute family bHLH transcription factor 4 (Ascl4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044252 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:24097290:24097727:-1 gene:ENSRNOG00000031493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24097290:24097727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001191877 // RefSeq // Rattus norvegicus PWP1 homolog (S. cerevisiae) (Pwp1), mRNA. // chr7 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000007549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24138856:24154854:-1 gene:ENSRNOG00000005350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24139350:24255666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// NONRATT051116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// NONRATT051115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
XM_006226034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 11 (Btbd11), mRNA. // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000008596 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:24194086:24254036:-1 gene:ENSRNOG00000005758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000044331 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:24194086:24465369:-1 gene:ENSRNOG00000005758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072370 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:24194086:24464874:-1 gene:ENSRNOG00000005758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT051117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24139350:24255666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_006241165 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC17943 (RGD1563325), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC166979 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC17943, mRNA (cDNA clone MGC:189068 IMAGE:7315264), complete cds. // chr7 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// FQ218051 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA10YE13 mRNA sequence. // chr7 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NM_001108739 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 263 (Tmem263), mRNA. // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000009154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24797541:24817759:-1 gene:ENSRNOG00000006987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24799824:24810537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT051121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_175598 // RefSeq // Rattus norvegicus RIC8 guanine nucleotide exchange factor B (Ric8b), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:26049680:26142157:1 gene:ENSRNOG00000007323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AY177755 // GenBank // Rattus norvegicus heterotrimeric G protein guanine nucleotide exchange factor-like protein Ric-8B mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26049767:26142047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT049352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
XM_006226035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulatory factor X, 4 (influences HLA class II expression) (Rfx4), mRNA. // chrU // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009728 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:25966147:26002330:1 gene:ENSRNOG00000007360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000059685 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:25940667:26037662:1 gene:ENSRNOG00000007360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059687 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:25966147:26037662:1 gene:ENSRNOG00000007360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulatory factor X, 4 (influences HLA class II expression) (Rfx4), mRNA. // chrU // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// GENSCAN00000005978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:25933694:26032985:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT049348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 60 // 24 // 40 // 1
NM_001191878 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide B (Polr3b), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:24893473:24997174:-1 gene:ENSRNOG00000007432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:24922319:24997174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT051125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001017458 // RefSeq // Rattus norvegicus t-complex 11, testis-specific-like 2 (Tcp11l2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241174 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus t-complex 11, testis-specific-like 2 (Tcp11l2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:25004999:25031722:-1 gene:ENSRNOG00000007587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC092644 // GenBank // Rattus norvegicus t-complex 11 (mouse) like 2, mRNA (cDNA clone MGC:109402 IMAGE:7318345), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:25005642:25031658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENSRNOT00000011326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:26439714:26491588:-1 gene:ENSRNOG00000008331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ222739 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YJ05 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000021769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26439542:26491588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT051138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT051139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONRATT051140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
ENSRNOT00000011337 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:26501727:26502691:-1 gene:ENSRNOG00000008576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26501727:26502505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001271340 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to DNA segment, Chr 10, Wayne State University 102, expressed (RGD1563365), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:26602287:26607557:-1 gene:ENSRNOG00000008696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT051142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT051143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:26602278:26634171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
GENSCAN00000023374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:25699185:25764359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001108079 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 11 (Chst11), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:26770955:26981219:-1 gene:ENSRNOG00000008885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031614 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin reductase 1 (Txnrd1), mRNA. // chr7 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000013613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:27065820:27104095:-1 gene:ENSRNOG00000009088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// AF108213 // GenBank // Rattus norvegicus NADPH-dependent thioredoxin reductase (TRR1) mRNA, complete cds. // chr7 // 82 // 79 // 27 // 33 // 0 /// AF220760 // GenBank // Rattus norvegicus tissue-type liver thioredoxin reductase 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 82 // 79 // 27 // 33 // 0 /// BC085726 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93353 IMAGE:7112649), complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// U63923 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin reductase mRNA, complete cds. // chr7 // 87 // 74 // 27 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27067522:27088871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT051149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1
NM_001044304 // RefSeq // Rattus norvegicus EP300 interacting inhibitor of differentiation 3 (Eid3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC097404 // GenBank // Rattus norvegicus EP300 interacting inhibitor of differentiation 3, mRNA (cDNA clone MGC:114449 IMAGE:7453955), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27095953:27097116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001008357 // RefSeq // Rattus norvegicus host cell factor C2 (Hcfc2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:27226472:27255036:-1 gene:ENSRNOG00000011072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085951 // GenBank // Rattus norvegicus host cell factor C2, mRNA (cDNA clone MGC:95223 IMAGE:7132601), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27226134:27255036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT051153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_053729 // RefSeq // Rattus norvegicus thymine-DNA glycosylase (Tdg), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:27313358:27333042:-1 gene:ENSRNOG00000027124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY026945 // GenBank // Rattus norvegicus T:G mismatch thymine glycosylase mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC129088 // GenBank // Rattus norvegicus thymine-DNA glycosylase, mRNA (cDNA clone MGC:156614 IMAGE:8362408), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27314940:27324213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001012197 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 90, beta, member 1 (Hsp90b1), mRNA. // chr7 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000029435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:27345730:27359757:-1 gene:ENSRNOG00000026963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// BC081917 // GenBank // Rattus norvegicus tumor rejection antigen gp96, mRNA (cDNA clone MGC:93881 IMAGE:7112411), complete cds. // chr7 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000033432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27340312:27362554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT051158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 15 // 42 // 1
NM_001246357 // RefSeq // Rattus norvegicus stabilin 2 (Stab2), mRNA. // chr7 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000059538 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:27488874:27666514:-1 gene:ENSRNOG00000038948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// AY007370 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronan receptor for endocytosis HARE precursor, mRNA, partial cds. // chr7 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GQ477370 // GenBank // Rattus norvegicus stabilin-2/HARE (STAB2) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27488874:27666514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT051163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT051164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001246357 // RefSeq // Rattus norvegicus stabilin 2 (Stab2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000059538 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:27488874:27666514:-1 gene:ENSRNOG00000038948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GQ477370 // GenBank // Rattus norvegicus stabilin-2/HARE (STAB2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27488874:27666514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0
NM_001246357 // RefSeq // Rattus norvegicus stabilin 2 (Stab2), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059538 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:27488874:27666514:-1 gene:ENSRNOG00000038948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GQ477370 // GenBank // Rattus norvegicus stabilin-2/HARE (STAB2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XR_355357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550382 (LOC102550382), ncRNA. // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27488874:27666514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27676320:27682550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000070954 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:27943580:27944094:-1 gene:ENSRNOG00000050911 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:27931711:27944048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_022384 // RefSeq // Rattus norvegicus achaete-scute family bHLH transcription factor 1 (Ascl1), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:28152425:28154267:-1 gene:ENSRNOG00000004294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:28152984:28153685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT051167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000009706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:28754755:28762044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074746 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:28756881:28757497:-1 gene:ENSRNOG00000046885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0
NM_001166676 // RefSeq // Rattus norvegicus PARP1 binding protein (Parpbp), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006241184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARP1 binding protein (Parpbp), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// XM_006241186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARP1 binding protein (Parpbp), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006241189 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARP1 binding protein (Parpbp), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:28764494:28825206:-1 gene:ENSRNOG00000004682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:28764494:28825206:-1 gene:ENSRNOG00000004682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF303035 // GenBank // Rattus norvegicus antisense RNA overlapping MCH protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:28766909:28825326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT051170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
XM_006241184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARP1 binding protein (Parpbp), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:28808278:28808883:-1 gene:ENSRNOG00000047852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:28766909:28825326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT051170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001173427 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA-damage regulated autophagy modulator 1 (Dram1), mRNA. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// XR_355371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA-damage regulated autophagy modulator 1 (Dram1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29007048:29040615:-1 gene:ENSRNOG00000038916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC168648 // GenBank // Rattus norvegicus damage-regulated autophagy modulator, mRNA (cDNA clone MGC:187403 IMAGE:7099292), complete cds. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// FQ211820 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA79YD13 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
NM_001007750 // RefSeq // Rattus norvegicus choline phosphotransferase 1 (Chpt1), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006241228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus choline phosphotransferase 1 (Chpt1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus choline phosphotransferase 1 (Chpt1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus choline phosphotransferase 1 (Chpt1), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XR_355370 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus choline phosphotransferase 1 (Chpt1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29150843:29177859:-1 gene:ENSRNOG00000005487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082074 // GenBank // Rattus norvegicus choline phosphotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:95241 IMAGE:7133149), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT051177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001100758 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin binding protein C, slow type (Mybpc1), mRNA. // chr7 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29197335:29277697:-1 gene:ENSRNOG00000005543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// X90475 // GenBank // R.norvegicus mRNA for muscle C-protein. // chr7 // 83 // 40 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000032165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29192331:29259674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT051181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT051185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT051186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
GENSCAN00000032168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29316178:29316594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 55 // 8 // 12 // 0
GENSCAN00000032140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29331675:29352345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT051189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000054194 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:29357295:29357413:-1 gene:ENSRNOG00000036071 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106777 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to ribosomal protein S12 (RGD1561102), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29383629:29384027:-1 gene:ENSRNOG00000043412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29383629:29385060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191779 // RefSeq // Rattus norvegicus UTP20, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (Utp20), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0 /// ENSRNOT00000008317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29399170:29479994:-1 gene:ENSRNOG00000005823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 61 // 61 // 0 /// FQ225077 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YD16 mRNA sequence. // chr7 // 18 // 18 // 11 // 62 // 1 /// GENSCAN00000047081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:29399513:29479994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 54 // 54 // 0 /// NONRATT051191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 19 // 19 // 12 // 62 // 1
NM_001106778 // RefSeq // Rattus norvegicus anoctamin 4 (Ano4), mRNA. // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:29593754:29804859:-1 gene:ENSRNOG00000006841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
ENSRNOT00000033123 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:30065414:30084852:-1 gene:ENSRNOG00000025198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072863 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:30065374:30084852:-1 gene:ENSRNOG00000025198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_002726881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 like 3 (Gas2l3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// XR_347692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 like 3 (Gas2l3), transcript variant X6, misc_RNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// GENSCAN00000044135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30065414:30197323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT051200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_021745 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4 (Nr1h4), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:30104960:30260754:-1 gene:ENSRNOG00000007197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC083815 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:94878 IMAGE:7110420), complete cds. // chr7 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// U18374 // GenBank // Rattus norvegicus farnesoid X activated receptor mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT051202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT051203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// GENSCAN00000044135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30065414:30197323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// NONRATT051205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT051197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_153725 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 17 (vesicular glutamate transporter), member 8 (Slc17a8), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:30314802:30371888:-1 gene:ENSRNOG00000007581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY117026 // GenBank // Rattus norvegicus vesicular glutamate transporter 3 (Vglut3) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT051206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30244279:30371288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001191780 // RefSeq // Rattus norvegicus SCY1-like 2 (S. cerevisiae) (Scyl2), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000002638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:30387991:30441330:-1 gene:ENSRNOG00000024955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000056143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30402538:30430291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT051208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001108081 // RefSeq // Rattus norvegicus ARP6 actin-related protein 6 homolog (yeast) (Actr6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:30474273:30494826:-1 gene:ENSRNOG00000007875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC166860 // GenBank // Rattus norvegicus ARP6 actin-related protein 6 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:188769 IMAGE:9101114), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ220136 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YB06 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:30474733:30494992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_023979 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptotic peptidase activating factor 1 (Apaf1), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010869 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:31792818:31872984:-1 gene:ENSRNOG00000008022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF218388 // GenBank // Rattus norvegicus apoptotic protease activating factor-1 mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// AF320222 // GenBank // Rattus norvegicus APAF1 (Apaf1) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:31781018:31870706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000054633 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:31838446:31838557:-1 gene:ENSRNOG00000036526 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001270788 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 3 (Slc25a3), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_139100 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 3 (Slc25a3), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:31904034:31911476:-1 gene:ENSRNOG00000008289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC070918 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:91476 IMAGE:7104964), complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// M23984 // GenBank // Rat mitochondrial proton/phosphate symporter mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// FQ221128 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YD13 mRNA sequence. // chr7 // 52 // 86 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:31904208:31930285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT051220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT051221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_012887 // RefSeq // Rattus norvegicus thymopoietin (Tmpo), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000012715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:31934412:31952695:-1 gene:ENSRNOG00000008797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// U18314 // GenBank // Rattus norvegicus lamina associated polypeptide 2 (LAP2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT051224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000001140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:31936304:32003436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT051228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT051226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT051229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT051231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
ENSRNOT00000007245 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:32192590:32193497:-1 gene:ENSRNOG00000005474 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:32192590:32201825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NR_031881 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-135a (Mir135a), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053652 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:32974076:32974175:-1 gene:ENSRNOG00000035529 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-135a // miRBase Micro RNA Database // MI0000908 Rattus norvegicus miR-135a stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106779 // RefSeq // Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1 (Nedd1), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:33615235:33655544:-1 gene:ENSRNOG00000004011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:33603335:33672222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
XM_006241267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein C12orf63-like (RGD1565866), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006226038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554778 (LOC102554778), mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000065354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:33772559:33862925:-1 gene:ENSRNOG00000024494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:33768028:33817463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
XM_006241269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680606 (LOC680606), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005492 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:33927709:33985085:-1 gene:ENSRNOG00000029837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075160 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:33955496:33985085:-1 gene:ENSRNOG00000029837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// XM_006241270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680606 (LOC680606), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000038722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:33894173:33985085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_001108743 // RefSeq // Rattus norvegicus ELK3, member of ETS oncogene family (Elk3), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELK3, member of ETS oncogene family (Elk3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34151383:34186857:-1 gene:ENSRNOG00000004367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34153971:34213720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT051250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001191781 // RefSeq // Rattus norvegicus amidohydrolase domain containing 1 (Amdhd1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34427627:34471274:-1 gene:ENSRNOG00000005266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34427627:34471262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT051252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001126091 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide F (Snrpf), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000007351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34543253:34549956:-1 gene:ENSRNOG00000005556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ214256 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YO03 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34543669:34549700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT051253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NR_031778 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 331 (Mir331), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053666 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:34938750:34938845:-1 gene:ENSRNOG00000035543 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-331 // miRBase Micro RNA Database // MI0000608 Rattus norvegicus miR-331 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001006984 // RefSeq // Rattus norvegicus vezatin, adherens junctions transmembrane protein (Vezt), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:34946146:35009764:-1 gene:ENSRNOG00000006514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083840 // GenBank // Rattus norvegicus vezatin, adherens junctions transmembrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:94969 IMAGE:7114280), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ211922 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YG15 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:34946617:34994662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT051267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_001080393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L31-like 3 (Rpl31l3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000049211 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:35614488:35614865:-1 gene:ENSRNOG00000029926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:35614488:35614865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006241283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plexin C1 (Plxnc1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011178 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:35914416:36063727:-1 gene:ENSRNOG00000007970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:35914416:36003596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001108085 // RefSeq // Rattus norvegicus CASP2 and RIPK1 domain containing adaptor with death domain (Cradd), mRNA. // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000063946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:36457911:36470834:-1 gene:ENSRNOG00000008507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// FQ233083 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YE07 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:36317399:36358532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000053175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:36431089:36469618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_058208 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 2 (Socs2), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:36558017:36560623:-1 gene:ENSRNOG00000008965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF075382 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling-2 (SOCS-2) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT051278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:36511499:36661914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001106782 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L42 (Mrpl42), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006241275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L42 (Mrpl42), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000066322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:36638838:36661936:-1 gene:ENSRNOG00000042740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC168747 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L42, mRNA (cDNA clone MGC:188851 IMAGE:6920919), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT051279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT051280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT051281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_053598 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 4 (Nudt4), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:36695609:36711834:-1 gene:ENSRNOG00000009094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF253473 // GenBank // Rattus norvegicus diphosphoinositol polyphosphate phosphohydolase type II (Nudt4) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ223117 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YE08 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// JN831161 // GenBank // Rattus norvegicus diphosphoinositol polyphosphate phosphohydolase isoform 2b mRNA, partial cds. // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT051284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT051285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT051286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000023794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:37910923:37911826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
ENSRNOT00000058989 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:38027716:38028616:-1 gene:ENSRNOG00000038641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:38027698:38087853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000038275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:40978899:40979629:-1 gene:ENSRNOG00000027864 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:40979029:41027688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
GENSCAN00000040703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:42011789:42013189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001135858 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 3 (Tmtc3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:40209728:40256099:-1 gene:ENSRNOG00000006749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:40212766:40258691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001014083 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C430008C19 (RGD1307947), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C430008C19 (RGD1307947), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:40343617:40354037:-1 gene:ENSRNOG00000006973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079461 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C430008C19, mRNA (cDNA clone MGC:95016 IMAGE:7122037), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:40344871:40356109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT051291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001102381 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotensin (Nts), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:44140236:44150124:-1 gene:ENSRNOG00000004179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214250 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YO14 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:44140855:44157399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT051304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012921 // RefSeq // Rattus norvegicus ALX homeobox 1 (Alx1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:44776479:44796064:-1 gene:ENSRNOG00000004390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158591 // GenBank // Rattus norvegicus ALX homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:187385 IMAGE:9023971), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// L14018 // GenBank // Rat cartilage homeoprotein 1 (Cart-1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:44776789:44828991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_006226012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555532 (LOC102555532), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XR_347763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555532 (LOC102555532), transcript variant X8, misc_RNA. // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XR_347766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555532 (LOC102555532), transcript variant X11, misc_RNA. // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000031320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:45105222:45205625:-1 gene:ENSRNOG00000004564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000071306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:45105228:45205634:-1 gene:ENSRNOG00000004564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:45113799:45288347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
GENSCAN00000033148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:45407252:45537914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001171177 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 2 (Tmtc2), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:47197649:47603261:-1 gene:ENSRNOG00000004585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:47400499:47498325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NONRATT051314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001108089 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 25 (Mettl25), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006241301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 25 (Mettl25), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000038144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:47862494:47942719:-1 gene:ENSRNOG00000027451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC127512 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7098085. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC161980 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG33154-PB, mRNA (cDNA clone MGC:187792 IMAGE:9029986), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:47862677:47864988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000022224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:47876564:47935599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT051316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT051317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT051318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT051319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001108091 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase short-chain family member 3 (Acss3), mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase short-chain family member 3 (Acss3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase short-chain family member 3 (Acss3), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase short-chain family member 3 (Acss3), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:49087351:49265391:-1 gene:ENSRNOG00000004448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:49062434:49323691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
K00783 // GenBank // Rat U5a small nuclear RNA. // chr7 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0
NM_001106783 // RefSeq // Rattus norvegicus myogenic factor 5 (Myf5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:49739441:49742672:-1 gene:ENSRNOG00000004768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:49740499:49761569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013172 // RefSeq // Rattus norvegicus myogenic factor 6 (Myf6), mRNA. // chr7 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:49749554:49751448:-1 gene:ENSRNOG00000004878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// M27151 // GenBank // Rat muscle regulatory factor mRNA MRF4, complete cds. // chr7 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT051324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:49740499:49761569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_022925 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, Q (Ptprq), mRNA. // chr7 // 90 // 100 // 35 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000044023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:49963330:50045368:-1 gene:ENSRNOG00000032479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// AF063249 // GenBank // Rattus norvegicus glomerular mesangial cell receptor protein-tyrosine phosphatase precursor (PTPRQ) mRNA, complete cds. // chr7 // 90 // 100 // 35 // 39 // 0 /// GENSCAN00000051102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:49935923:50046099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1
XM_003750318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus otogelin-like (Otogl), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000043774 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:51821489:51944923:1 gene:ENSRNOG00000030316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 80 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000009566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:51791109:51815980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:51821497:51945051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 32 // 32 // 0
NM_001033680 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin I (Syt1), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:50097034:50650569:-1 gene:ENSRNOG00000006426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AJ617620 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for synaptotagmin 1 (syt1 gene), splice variant 5. // chr7 // 86 // 39 // 12 // 14 // 0 /// DQ181550 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin I (Syt1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000051098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:50220175:50251953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT051326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
GENSCAN00000051084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:50297669:50298544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001191782 // RefSeq // Rattus norvegicus neuron navigator 3 (Nav3), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:52215845:52510816:-1 gene:ENSRNOG00000006682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:52174487:52273214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001191782 // RefSeq // Rattus norvegicus neuron navigator 3 (Nav3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:52215845:52510816:-1 gene:ENSRNOG00000006682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:52300042:52314858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191782 // RefSeq // Rattus norvegicus neuron navigator 3 (Nav3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:52215845:52510816:-1 gene:ENSRNOG00000006682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:52339595:52450731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001191782 // RefSeq // Rattus norvegicus neuron navigator 3 (Nav3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:52215845:52510816:-1 gene:ENSRNOG00000006682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:52494876:52510663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 17 (Zdhhc17), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039340 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 17 (Zdhhc17), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006241322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 17 (Zdhhc17), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:53664302:53726422:-1 gene:ENSRNOG00000003803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AY886533 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC17 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000042957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:53676264:53747748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_001011987 // RefSeq // Rattus norvegicus GLI pathogenesis-related 1 (Glipr1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:54792116:54803129:-1 gene:ENSRNOG00000026644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC089858 // GenBank // Rattus norvegicus GLI pathogenesis-related 1, mRNA (cDNA clone MGC:108941 IMAGE:7384037), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ229810 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YJ18 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54792772:54802951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT051351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000073180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:54819553:54848201:-1 gene:ENSRNOG00000049053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083894 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7132912. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54820413:54848201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_002726897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLI pathogenesis-related 1 like 1 (Glipr1l1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_002729790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLI pathogenesis-related 1 like 1 (Glipr1l1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039475 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:54852928:54878400:-1 gene:ENSRNOG00000026634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:54859965:54882778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001136261 // RefSeq // Rattus norvegicus ataxin 7-like 3B (Atxn7l3b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:55624344:55624637:-1 gene:ENSRNOG00000038420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:55624344:55789270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000052544 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:56897123:56897240:-1 gene:ENSRNOG00000034421 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001108991 // RefSeq // Rattus norvegicus thyrotropin-releasing hormone degrading enzyme (Trhde), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000007461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:57265684:57693174:-1 gene:ENSRNOG00000005278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000019553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:57311170:57367720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT051357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
ENSRNOT00000007651 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:57912673:57913195:-1 gene:ENSRNOG00000005831 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000037009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:57912673:57913153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
NM_173839 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptophan hydroxylase 2 (Tph2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:58053270:58157948:-1 gene:ENSRNOG00000003880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY098915 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal tryptophan hydroxylase (Tph) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT051358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000037007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58092840:58159989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000036998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58054275:58072789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
ENSRNOT00000067907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:58174019:58228638:-1 gene:ENSRNOG00000003889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC099146 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:7326101), partial cds. // chr7 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000037010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58174177:58218246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_001004238 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB21, member RAS oncogene family (Rab21), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:58270894:58295672:-1 gene:ENSRNOG00000003923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079323 // GenBank // Rattus norvegicus RAB21, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:94502 IMAGE:7135453), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58265687:58295452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT051366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_199098 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 19 (Tmem19), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 19-like (LOC100912615), partial mRNA. // chr7 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// XM_006241349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 19 (Tmem19), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:58325486:58352039:-1 gene:ENSRNOG00000003985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061871 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 19, mRNA (cDNA clone MGC:72591 IMAGE:5598899), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58331843:58361063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:57811995:57849802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
XM_001080899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus THAP domain containing, apoptosis associated protein 2 (Thap2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002729786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus THAP domain containing, apoptosis associated protein 2 (Thap2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005443 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:58363484:58374215:-1 gene:ENSRNOG00000003993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENSRNOT00000058469 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:58417520:58418846:-1 gene:ENSRNOG00000038392 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000023271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58417597:58418846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0
NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NM_001106784 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing G protein coupled receptor 5 (Lgr5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006241350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing G protein coupled receptor 5 (Lgr5), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:58459666:58596253:-1 gene:ENSRNOG00000004221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000023268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:58460072:58485878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT051372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENSRNOT00000032374 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:59141777:59142919:-1 gene:ENSRNOG00000022632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59141777:59143586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_023960 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 4 (Kcnmb4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:59472015:59526626:-1 gene:ENSRNOG00000022297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB050637 // GenBank // Rattus norvegicus KCNMB4 mRNA for calcium activated potassium channel beta 4 subunit, complete cds. // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AY028605 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-activated potassium channel beta 4 subunit mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC161829 // GenBank // Rattus norvegicus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 4, mRNA (cDNA clone MGC:187309 IMAGE:9033053), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001011988 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 2 (Cnot2), mRNA. // chr7 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 2 (Cnot2), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000066396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:59542042:59598859:-1 gene:ENSRNOG00000004909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC087653 // GenBank // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:105588 IMAGE:7313082), complete cds. // chr7 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59538617:59607996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT051377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT051378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1 /// NONRATT051379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT051380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT051381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT051376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
ENSRNOT00000007048 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:59647425:59648698:-1 gene:ENSRNOG00000005316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
XM_006226023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myelin regulatory factor-like (Myrfl), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006226024 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myelin regulatory factor-like (Myrfl), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// XM_006241394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myelin regulatory factor-like (Myrfl), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000068774 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:59809200:59828027:-1 gene:ENSRNOG00000021833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000021820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59807419:59921604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// NONRATT051388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_017313 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB3A interacting protein (Rab3ip), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006241358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB3A interacting protein (Rab3ip), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000007258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:59933272:59962078:-1 gene:ENSRNOG00000005362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC127500 // GenBank // Rattus norvegicus RAB3A interacting protein (rabin3), mRNA (cDNA clone MGC:156662 IMAGE:7457420), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// U19181 // GenBank // Rattus norvegicus Rabin3 mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59924843:59962047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT051390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001005905 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing TCP1, subunit 2 (beta) (Cct2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006241371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chaperonin containing TCP1, subunit 2 (beta) (Cct2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60110076:60122818:-1 gene:ENSRNOG00000021317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC083650 // GenBank // Rattus norvegicus chaperonin containing TCP1, subunit 2 (beta), mRNA (cDNA clone MGC:94480 IMAGE:7135109), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60105428:60122763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT051399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001108097 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor substrate 2 (Frs2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60128597:60210278:-1 gene:ENSRNOG00000005642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ233619 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YC11 mRNA sequence. // chr7 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000021826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60133181:60278865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001127527 // RefSeq // Rattus norvegicus YEATS domain containing 4 (Yeats4), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60289460:60296600:-1 gene:ENSRNOG00000005689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166753 // GenBank // Rattus norvegicus YEATS domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:188495 IMAGE:5623659), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60291689:60311785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001108746 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9530003J23 (RGD1306474), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60306988:60311860:-1 gene:ENSRNOG00000005790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60291689:60311785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_012771 // RefSeq // Rattus norvegicus lysozyme 2 (Lyz2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000007747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60337951:60343246:-1 gene:ENSRNOG00000005825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC058490 // GenBank // Rattus norvegicus lysozyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:72912 IMAGE:6919643), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ218731 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YA08 mRNA sequence. // chr7 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// FQ227703 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YD20 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000064784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60340639:60343246:-1 gene:ENSRNOG00000005825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// GENSCAN00000016215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60338664:60343216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT051407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001106785 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 6, 68kDa (Cpsf6), mRNA. // chr7 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// XM_006241377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 6, 68kDa (Cpsf6), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60387688:60418950:-1 gene:ENSRNOG00000005927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60355912:60414933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT051408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT051411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT051410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT051412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001108099 // RefSeq // Rattus norvegicus MDM2 oncogene, E3 ubiquitin protein ligase (Mdm2), mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000066767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60719029:60743291:-1 gene:ENSRNOG00000006304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60720260:60782625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT051415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001134687 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member E3 (Slc35e3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60765042:60778112:-1 gene:ENSRNOG00000027622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166468 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member E3, mRNA (cDNA clone MGC:187840 IMAGE:9035289), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ223116 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YE09 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60720260:60782625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_053830 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 107 (Nup107), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60781692:60825205:-1 gene:ENSRNOG00000006541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L31840 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear pore complex protein NUP107 mRNA, complete cds. // chr7 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60805300:60832160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60790119:60803328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT051417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000009511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:60851045:60860980:-1 gene:ENSRNOG00000007048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// BC081731 // GenBank // Rattus norvegicus RAP1B, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:93206 IMAGE:7192310), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ229455 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YN13 mRNA sequence. // chr7 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0 /// U07795 // GenBank // Rattus norvegicus Rap1B mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// NM_134346 // RefSeq // Rattus norvegicus RAP1B, member of RAS oncogene family (Rap1b), mRNA. // chr7 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// AY607847 // GenBank // Rattus norvegicus RAP1B mRNA, complete cds. // chr7 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// GENSCAN00000009388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60852182:60860953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT051419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT051420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT051421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// NONRATT051422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
XM_001080995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 186-like (RGD1306282), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_235171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 186-like (RGD1306282), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000038294 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:60986153:60986761:-1 gene:ENSRNOG00000025487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:60985698:61065376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001108100 // RefSeq // Rattus norvegicus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 2 (Dyrk2), mRNA. // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000010283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:61776788:61789208:-1 gene:ENSRNOG00000007821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT051424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_054004 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin-associated and neddylation-dissociated 1 (Cand1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:62113404:62151495:-1 gene:ENSRNOG00000007834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D87671 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TIP120, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:62113740:62167433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
XM_002726887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase subunit (LOC100362798), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_002729793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase subunit (LOC100362798), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000034088 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:62305353:62305523:-1 gene:ENSRNOG00000026875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:62305353:62318304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 94 // 28 // 31 // 0
XM_001081027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase (DNA) B (Helb), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006226026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase (DNA) B (Helb), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006241426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase (DNA) B (Helb), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase (DNA) B (Helb), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000038147 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:65079036:65104144:-1 gene:ENSRNOG00000004189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:65064972:65104144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108101 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-associated kinase 3 (Irak3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000005686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:65142553:65201088:-1 gene:ENSRNOG00000004226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC166731 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-1 receptor-associated kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:188449 IMAGE:7934689), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:65126939:65200874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENSRNOT00000062125 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:7:65458685:65458803:-1 gene:ENSRNOG00000040372 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191000 // RefSeq // Rattus norvegicus LEM domain containing 3 (Lemd3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// XM_006241410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LEM domain containing 3 (Lemd3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000039532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:62979066:63028458:-1 gene:ENSRNOG00000024027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000014338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:62968741:63028458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT051433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 51 // 51 // 26 // 51 // 1
NM_001191000 // RefSeq // Rattus norvegicus LEM domain containing 3 (Lemd3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LEM domain containing 3 (Lemd3), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:62979066:63028458:-1 gene:ENSRNOG00000024027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:62968741:63028458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000005897 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:63046701:63047169:-1 gene:ENSRNOG00000004469 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000014342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63046680:63066031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
XM_006241423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 30 (Tbc1d30), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024679 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:63585586:63631131:-1 gene:ENSRNOG00000023951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63585586:63670718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_001108747 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 3 (Rassf3), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:63737800:63801753:-1 gene:ENSRNOG00000005388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63729125:63760451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT051443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106786 // RefSeq // Rattus norvegicus TANK-binding kinase 1 (Tbk1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000009260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:63877567:63910298:-1 gene:ENSRNOG00000005528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000010094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63878265:63947797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT051445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT051444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT051447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XM_006241399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exportin, tRNA (Xpot), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NM_001108102 // RefSeq // Rattus norvegicus exportin, tRNA (Xpot), mRNA. // chr7 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000009645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:63912373:63951227:-1 gene:ENSRNOG00000007088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT051449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:63878265:63947797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT051451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT051450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001191784 // RefSeq // Rattus norvegicus SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 1 (Srgap1), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000006180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:64196669:64472697:-1 gene:ENSRNOG00000004603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:64196669:64272860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000006064 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:64548576:64550004:-1 gene:ENSRNOG00000004593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:64548620:64561949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
NM_001024759 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 5 (Tmem5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 5 (Tmem5), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:64550353:64562127:-1 gene:ENSRNOG00000004421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097355 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:114386 IMAGE:7441970), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:64548620:64561949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT051462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NR_031808 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7i (Mirlet7i), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053765 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:67000237:67000326:1 gene:ENSRNOG00000035642 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// rno-let-7i // miRBase Micro RNA Database // MI0000835 Rattus norvegicus let-7i stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001040176 // RefSeq // Rattus norvegicus MON2 homolog (S. cerevisiae) (Mon2), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:66915094:66990456:1 gene:ENSRNOG00000004185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000045130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:66915094:66990456:1 gene:ENSRNOG00000004185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000070857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:66915094:66947913:1 gene:ENSRNOG00000004185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:66915121:67000597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// NONRATT049661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_145184 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 15 (Usp15), mRNA. // chr7 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000031191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:66793581:66884024:1 gene:ENSRNOG00000023202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF106657 // GenBank // Rattus norvegicus deubiquitinating enzyme Ubp109 (ubp109) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:66842993:66883744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT049654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT049657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
GENSCAN00000010528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:66008218:66216058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XR_005434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRG00131 (LOC500845), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_009634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRG00131 (LOC500845), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:83846655:83862034:-1 gene:ENSRNOG00000029354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY539882 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00131 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017302 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 7 (Slc16a7), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000058036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:68640932:68744670:-1 gene:ENSRNOG00000007839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC081701 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 7 (monocarboxylic acid transporter 2), mRNA (cDNA clone MGC:93092 IMAGE:7130138), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// FQ218176 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YB17 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// U62316 // GenBank // Rattus norvegicus monocarboxylate transporter 2 (MCT2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:68642058:68648351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT051482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001047962 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC500846 (LOC500846), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000049063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:69263478:69297957:-1 gene:ENSRNOG00000031425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT051486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:69263562:69353989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
XM_001059859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 5 (Dppa5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006227666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100360362 (LOC100360362), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_236761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 5 (Dppa5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000000215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85265568:-1 gene:ENSRNOG00000000199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040010 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:70164190:70164543:-1 gene:ENSRNOG00000032335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000047129 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14646133:14646486:-1 gene:ENSRNOG00000031089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049144 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:43466258:43466611:1 gene:ENSRNOG00000029793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14646133:14646483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85273561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43466261:43466611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70164190:70164540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001008378 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 31 (Tspan31), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 31 (Tspan31), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70530384:70533257:-1 gene:ENSRNOG00000025592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086452 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 31, mRNA (cDNA clone MGC:105551 IMAGE:7307024), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ215742 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YN16 mRNA sequence. // chr7 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT051489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001007265 // RefSeq // Rattus norvegicus osteosarcoma amplified 9 (Os9), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006241461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus osteosarcoma amplified 9 (Os9), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000049895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70558019:70584816:-1 gene:ENSRNOG00000025570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC085907 // GenBank // Rattus norvegicus amplified in osteosarcoma, mRNA (cDNA clone MGC:94750 IMAGE:7096059), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70558604:70584787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT051494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT051497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001134595 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26, member 10 (Slc26a10), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000052288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70636384:70645045:-1 gene:ENSRNOG00000029465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// FQ211772 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YJ09 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70637399:70645045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_199395 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 25 (Arhgef25), mRNA. // chr7 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// XM_006241454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 25 (Arhgef25), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1 /// XM_006241456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 25 (Arhgef25), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// XM_006241458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 25 (Arhgef25), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000006800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70646953:70653981:-1 gene:ENSRNOG00000005034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// BC061879 // GenBank // Rattus norvegicus RhoA/RAC/CDC42 exchange factor, mRNA (cDNA clone MGC:72605 IMAGE:5599277), complete cds. // chr7 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// GENSCAN00000005721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70647293:70653957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 70 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT051499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT051500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT051502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001191989 // RefSeq // Rattus norvegicus deltex 3, E3 ubiquitin ligase (Dtx3), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000006815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70654776:70659437:-1 gene:ENSRNOG00000005129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70654977:70676463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_080480 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase, type II, gamma (Pip4k2c), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70661195:70676538:-1 gene:ENSRNOG00000005138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF030558 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase gamma mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70654977:70676463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_212523 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 5A (Kif5a), mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70690905:70727087:-1 gene:ENSRNOG00000005299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY535015 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin family member 5A (Kif5a) mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// FQ212220 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YC10 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70693511:70726850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001170566 // RefSeq // Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 6 (Mbd6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70745585:70751297:-1 gene:ENSRNOG00000006209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT051514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70746428:70752682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001127659 // RefSeq // Rattus norvegicus methionyl-tRNA synthetase (Mars), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000035486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70759159:70776456:-1 gene:ENSRNOG00000025459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000040408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70759223:70776446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT051517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1
NM_001191910 // RefSeq // Rattus norvegicus GLI family zinc finger 1 (Gli1), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70795073:70804243:-1 gene:ENSRNOG00000025120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70795244:70835660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_031815 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibin beta E (Inhbe), mRNA. // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000010106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70814363:70817316:-1 gene:ENSRNOG00000007601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF089825 // GenBank // Rattus norvegicus activin beta E mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF140032 // GenBank // Rattus norvegicus activin beta E mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT051523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70795244:70835660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_022614 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibin beta C (Inhbc), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70822285:70835753:-1 gene:ENSRNOG00000007700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF140031 // GenBank // Rattus norvegicus activin beta C mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC089799 // GenBank // Rattus norvegicus inhibin beta C, mRNA (cDNA clone MGC:108687 IMAGE:7321367), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70795244:70835660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001008322 // RefSeq // Rattus norvegicus serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial) (Shmt2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:70998104:71003174:-1 gene:ENSRNOG00000008106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC085331 // GenBank // Rattus norvegicus serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:105820 IMAGE:7106911), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70998577:71008470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT051528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT051530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT051529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT051527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_021680 // RefSeq // Rattus norvegicus neurexophilin 4 (Nxph4), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71007644:71014940:-1 gene:ENSRNOG00000025059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// AF042714 // GenBank // Rattus norvegicus neurexophilin 4 (Nph4) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC081805 // GenBank // Rattus norvegicus neurexophilin 4, mRNA (cDNA clone MGC:93463 IMAGE:7108207), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70998577:71008470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT051532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001130490 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1 (Lrp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// ENSRNOT00000031005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71018808:71099367:-1 gene:ENSRNOG00000025053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 83 // 83 // 0 /// GENSCAN00000040434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71019539:71099022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 81 // 81 // 0 /// NONRATT051534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 80 // 80 // 0 /// NONRATT051533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 20 // 20 // 17 // 83 // 1 /// NONRATT051538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 11 // 11 // 9 // 83 // 1
NM_001134874 // RefSeq // Rattus norvegicus Ngfi-A binding protein 2 (Nab2), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ngfi-A binding protein 2 (Nab2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71135886:71142278:-1 gene:ENSRNOG00000008415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71137464:71142797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_053302 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 182 (Gpr182), mRNA. // chr7 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71218212:71221052:-1 gene:ENSRNOG00000004311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC087572 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7098685, containing frame-shift errors. // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC129072 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 182, mRNA (cDNA clone MGC:156507 IMAGE:7096756), complete cds. // chr7 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71219192:71220388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT051551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT051552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0
XM_006241510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 7 (Rdh7), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000005875 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:71296921:71311267:-1 gene:ENSRNOG00000004391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// U18762 // GenBank // Rattus norvegicus liver microsomal retinol dehydrogenase type I mRNA, complete cds. // chr7 // 61 // 100 // 14 // 23 // 0 /// NM_133543 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 7 (Rdh7), mRNA. // chr7 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// BC088090 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 7, mRNA (cDNA clone MGC:108523 IMAGE:7368214), complete cds. // chr7 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// BC098650 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 7, mRNA (cDNA clone MGC:112590 IMAGE:7371059), complete cds. // chr7 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// U33501 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase type III mRNA, complete cds. // chr7 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// NONRATT051554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// GENSCAN00000013089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71297471:71327147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
ENSRNOT00000044144 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:71392251:71392893:-1 gene:ENSRNOG00000034186 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71358859:71441846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT051554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_199387 // RefSeq // Rattus norvegicus MTERF domain containing 1 (Mterfd1), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006241509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MTERF domain containing 1 (Mterfd1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:71447418:71465651:-1 gene:ENSRNOG00000004492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC062080 // GenBank // Rattus norvegicus MTERF domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:72611 IMAGE:5599618), complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ232616 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YA18 mRNA sequence. // chr7 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71447476:71459934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT051558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT051560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT051559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT051561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT051562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
XM_003752821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 (Esco2), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000021320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:49075099:49090208:1 gene:ENSRNOG00000015921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041958 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:71568902:71570683:-1 gene:ENSRNOG00000033952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000045917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:60898258:60900042:-1 gene:ENSRNOG00000029520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000001774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49070369:49090208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60889361:60900039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71568902:71570683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT020621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_006226056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSPY-like 5 (Tspyl5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241519 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSPY-like 5 (Tspyl5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008227 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:72497606:72498838:-1 gene:ENSRNOG00000006278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:72497606:72498838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000057629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:72598529:72600674:-1 gene:ENSRNOG00000037917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:72587945:72686883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
FQ220874 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YF23 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031714 // RefSeq // Rattus norvegicus heat-responsive protein 12 (Hrsp12), mRNA. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:73422767:73436388:-1 gene:ENSRNOG00000005437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF015949 // GenBank // Rattus norvegicus perchloric acid soluble protein mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC078779 // GenBank // Rattus norvegicus heat-responsive protein 12, mRNA (cDNA clone MGC:93321 IMAGE:7128728), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D49363 // GenBank // Rattus norvegicus PSP1 mRNA for perchrolic acid soluble protein, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ209529 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YC10 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73414013:73427345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001130559 // RefSeq // Rattus norvegicus NIPA-like domain containing 2 (Nipal2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:73513633:73624863:-1 gene:ENSRNOG00000005190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73514183:73534677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT051573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_031735 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 3 (Stk3), mRNA. // chr7 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000065722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:73793742:74055204:-1 gene:ENSRNOG00000011278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC161844 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 3 (STE20 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone MGC:187362 IMAGE:9027884), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73841810:73935175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:73947738:74046298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
GENSCAN00000034144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74458910:74480005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_001191786 // RefSeq // Rattus norvegicus ATM interactor (Atmin), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000015180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:60273787:60290987:1 gene:ENSRNOG00000011422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000034138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74493254:74504003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000036271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180181125:180183557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 86 // 80 // 31 // 36 // 0 /// GENSCAN00000055631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60273787:60288633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT027645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 69 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT051584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 51 // 51 // 23 // 45 // 1 /// NONRATT027642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1
NM_019360 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIc (Cox6c), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74880039:74892526:-1 gene:ENSRNOG00000010807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC058480 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIc, mRNA (cDNA clone MGC:72859 IMAGE:6922382), complete cds. // chr7 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// FQ222901 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YC03 mRNA sequence. // chr7 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// M27466 // GenBank // Rattus norvegicus liver cytochrome oxidase subunit VIc (COX-VIc) mRNA, complete cds. // chr7 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// M27467 // GenBank // Rattus norvegicus heart cytochrome oxidase subunit VIc (COX-VIc) mRNA, complete cds. // chr7 // 70 // 87 // 14 // 20 // 0 /// NONRATT051585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74940646:74970052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74940646:74970052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74940646:74970052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74940646:74970052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74986536:75058256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74986536:75058256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74986536:75058256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74986536:75058256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74986536:75058256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006241548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 22 (Rgs22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:74941968:75024694:-1 gene:ENSRNOG00000025551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74986536:75058256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001012117 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 43 (Fbxo43), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241536 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 43 (Fbxo43), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:75081330:75094901:-1 gene:ENSRNOG00000010459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082107 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:95305 IMAGE:7134870), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75085705:75093228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001130560 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 19A, RBR E3 ubiquitin protein ligase (Rnf19a), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:75206742:75246247:-1 gene:ENSRNOG00000009658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75208162:75230139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013948 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 46 (Ankrd46), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 46 (Ankrd46), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 46 (Ankrd46), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000036904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:75427580:75436478:-1 gene:ENSRNOG00000025504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AB095364 // GenBank // Rattus norvegicus ank-s mRNA for ankyrin repeat small protein, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105616 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 46, mRNA (cDNA clone MGC:124899 IMAGE:7453107), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75429087:75518331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_003750338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 31 (Snx31), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006226200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 31 (Snx31), mRNA. // chr7 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036852 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:75457388:75512302:-1 gene:ENSRNOG00000025501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75429087:75518331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT051597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_134353 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 1 (Pabpc1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:75557273:75570171:-1 gene:ENSRNOG00000008639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC083176 // GenBank // Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 1, mRNA (cDNA clone MGC:91496 IMAGE:7097075), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75558189:75628430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// NONRATT051598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// NONRATT051599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONRATT051603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_001008877 // RefSeq // Rattus norvegicus Ac1254 (LOC362901), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:75692431:75715911:-1 gene:ENSRNOG00000031383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75692431:75725616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_013011 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta (Ywhaz), mRNA. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:75721286:75743714:-1 gene:ENSRNOG00000008195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC070941 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:91665 IMAGE:7099670), complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC094305 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, zeta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:105417 IMAGE:7313193), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D17615 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 14-3-3 protein zeta-subtype, complete cds. // chr7 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// U37252 // GenBank // Rattus norvegicus 14-3-3 zeta isoform mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000036883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75692431:75725616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001126087 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 706 (Zfp706), mRNA. // chr7 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC083795 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 706, mRNA (cDNA clone IMAGE:7107458), complete cds. // chr7 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT051610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000033281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:75942686:75975730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001024371 // RefSeq // Rattus norvegicus neurocalcin delta (Ncald), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006241555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurocalcin delta (Ncald), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurocalcin delta (Ncald), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000064513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:76320074:76414625:-1 gene:ENSRNOG00000042978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087105 // GenBank // Rattus norvegicus neurocalcin delta, mRNA (cDNA clone MGC:94703 IMAGE:7193019), complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ214436 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YL11 mRNA sequence. // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT051613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001130543 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonucleotide reductase M2 B (TP53 inducible) (Rrm2b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000033704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:76865859:76885636:-1 gene:ENSRNOG00000025454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:76865871:76889460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
XM_006241571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5 (Ubr5), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 64 // 37 // 37 // 0 /// XM_006241573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E3 ubiquitin-protein ligase UBR5-like (LOC102551120), mRNA. // chr7 // 100 // 19 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000009115 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:76906409:76975003:-1 gene:ENSRNOG00000006816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 49 // 49 // 0 /// X64411 // GenBank // R.norvegicus mRNA for 100 kDa protein. // chr7 // 100 // 34 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:76974036:76998986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 14 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000050504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:76897566:76969484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT051622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 20 // 58 // 1 /// NONRATT051625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 14 // 14 // 8 // 58 // 1
NM_031135 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 10 (Klf10), mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:77258950:77265321:-1 gene:ENSRNOG00000006118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097309 // GenBank // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 10, mRNA (cDNA clone MGC:114305 IMAGE:7387595), complete cds. // chr7 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// U78875 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger transcription factor homolog CPG20 (cpg20) mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// U88630 // GenBank // Rattus norvegicus Sp1-like zinc finger protein (TIEG) mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 48 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT051632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:77260307:77411355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_022585 // RefSeq // Rattus norvegicus antizyme inhibitor 1 (Azin1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:77448675:77475344:-1 gene:ENSRNOG00000005333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC061550 // GenBank // Rattus norvegicus antizyme inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:72823 IMAGE:6918922), complete cds. // chr7 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// D50734 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA of antizyme inhibitor, complete cds. // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// D89983 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for antizyme inhibitor, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT051635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:77429876:77461063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001173334 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial folate carrier) , member 32 (Slc25a32), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial folate carrier) , member 32 (Slc25a32), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006241604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial folate carrier) , member 32 (Slc25a32), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78244520:78262013:1 gene:ENSRNOG00000004403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC166530 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 32, mRNA (cDNA clone MGC:188123 IMAGE:7189614), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78244217:78259325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT049788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_031705 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydropyrimidinase (Dpys), mRNA. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78796405:78873621:-1 gene:ENSRNOG00000004298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081768 // GenBank // Rattus norvegicus dihydropyrimidinase, mRNA (cDNA clone MGC:93342 IMAGE:7107549), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D63704 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for dihydropyrimidinase, complete cds. // chr7 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT051652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78833845:78873532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT051650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001134883 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 12 (Lrp12), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78885444:78956523:-1 gene:ENSRNOG00000004152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134883 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 12 (Lrp12), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:78885444:78956523:-1 gene:ENSRNOG00000004152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78886823:78981754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT051653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000021405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:78718920:78722790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0
NONRATT051655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000039430 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:80481851:80482227:-1 gene:ENSRNOG00000028486 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:80481844:80482227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_175844 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-binding Rho activating protein (Abra), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:80816575:80820643:-1 gene:ENSRNOG00000007999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF336113 // GenBank // Rattus norvegicus MS1 mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC158575 // GenBank // Rattus norvegicus actin-binding Rho activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:187315 IMAGE:9033092), complete cds. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ224863 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YM08 mRNA sequence. // chr7 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:80816676:80820590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053546 // RefSeq // Rattus norvegicus angiopoietin 1 (Angpt1), mRNA. // chr7 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:81368937:81618369:-1 gene:ENSRNOG00000005854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB080023 // GenBank // Rattus norvegicus ang-1 mRNA for angiopoietin-1, complete cds. // chr7 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:81369033:81466883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT051661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001130575 // RefSeq // Rattus norvegicus R-spondin 2 (Rspo2), mRNA. // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:81992732:82077521:-1 gene:ENSRNOG00000037687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// AB232173 // GenBank // Rattus norvegicus R-spondin2 mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:81991491:82095918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT051662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_001011990 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit E (Eif3e), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000038340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105112074:105144805:1 gene:ENSRNOG00000027690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC082087 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit E, mRNA (cDNA clone MGC:95265 IMAGE:7133833), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ226476 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YA21 mRNA sequence. // chr13 // 78 // 82 // 14 // 18 // 0 /// FQ215980 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YH17 mRNA sequence. // chr13 // 72 // 82 // 13 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:67444247:67445584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 85 // 91 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:67438242:67439579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 85 // 91 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105112078:105151362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
XM_001063530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 74 (Tmem74), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_576263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 74 (Tmem74), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006791 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:82695682:82696599:-1 gene:ENSRNOG00000005114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:82695682:82696599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001130561 // RefSeq // Rattus norvegicus NudC domain containing 1 (Nudcd1), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:83317601:83362537:-1 gene:ENSRNOG00000024929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC169014 // GenBank // Rattus norvegicus NudC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189385 IMAGE:9091867), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:83317924:83362471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_021697 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily V, member 1 (Kcnv1), mRNA. // chr7 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:84030573:84037747:-1 gene:ENSRNOG00000004117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// FQ211837 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA78YL08 mRNA sequence. // chr7 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT051673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:84032171:84201782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
XM_006226203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV-like protein 1-like (LOC688962), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// XM_006241621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV-like protein 1-like (LOC688962), mRNA. // chr7 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011496 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:85757755:85758783:-1 gene:ENSRNOG00000008657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
XM_001063221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 3 (Csmd3), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000039318 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:86716233:87187949:-1 gene:ENSRNOG00000004937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000057108 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:86716233:87187949:-1 gene:ENSRNOG00000004937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 87 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000017094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:86700308:86842514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 39 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:86882446:87187949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 35 // 35 // 19 // 54 // 1
XM_001063221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 3 (Csmd3), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057108 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:86716233:87187949:-1 gene:ENSRNOG00000004937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001063221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 3 (Csmd3), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057108 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:86716233:87187949:-1 gene:ENSRNOG00000004937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:86882446:87187949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001063221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 3 (Csmd3), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039318 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:86716233:87187949:-1 gene:ENSRNOG00000004937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057108 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:86716233:87187949:-1 gene:ENSRNOG00000004937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:86882446:87187949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001063221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 3 (Csmd3), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 85 // 90 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057105 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:87398222:87640017:-1 gene:ENSRNOG00000037640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000026965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:87349115:87640018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
XM_001063221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 3 (Csmd3), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000057105 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:87398222:87640017:-1 gene:ENSRNOG00000037640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000026965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:87349115:87640018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
XM_006241626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trichorhinophalangeal syndrome I (Trps1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134837 // RefSeq // Rattus norvegicus trichorhinophalangeal syndrome I (Trps1), mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000050774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:90118884:90343325:-1 gene:ENSRNOG00000024998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trichorhinophalangeal syndrome I (Trps1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:90277079:90302531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000035516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:90119423:90154085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_198751 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit H (Eif3h), mRNA. // chr6 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000005786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:20146737:20231688:1 gene:ENSRNOG00000004252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000061786 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:116799061:116809296:-1 gene:ENSRNOG00000040153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000073812 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:116799067:116809296:-1 gene:ENSRNOG00000040153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC060586 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit H, mRNA (cDNA clone MGC:72941 IMAGE:6918037), complete cds. // chr6 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:116799061:116872447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000031727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:20146766:20231533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT046275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001025701 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD21 homolog (S. pombe) (Rad21), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:92155547:92182749:-1 gene:ENSRNOG00000004420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099200 // GenBank // Rattus norvegicus RAD21 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:116373 IMAGE:7384021), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:92156990:92174238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000044493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:92293227:92294023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0
XM_002726911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group nucleosomal binding domain 2 (LOC100363319), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_002729811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group nucleosomal binding domain 2 (LOC100363319), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000041268 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:92399598:92399864:-1 gene:ENSRNOG00000028988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:92316724:92457294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0
NM_001130540 // RefSeq // Rattus norvegicus exostosin glycosyltransferase 1 (Ext1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000037809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:93246664:93521815:-1 gene:ENSRNOG00000024886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:93246664:93297226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001130562 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 12 (Samd12), mRNA. // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000064877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:93636142:93930039:-1 gene:ENSRNOG00000043390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT051703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_012870 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11b (Tnfrsf11b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:94436613:94464618:-1 gene:ENSRNOG00000008336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081830 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11b, mRNA (cDNA clone MGC:93568 IMAGE:7096099), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U94330 // GenBank // Rattus norvegicus osteoprotegerin (OPG) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:94370167:94560655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000041424 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:95033962:95034805:-1 gene:ENSRNOG00000029295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95034263:95043135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0
NM_057104 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2 (Enpp2), mRNA. // chr7 // 96 // 96 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000005561 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:95120407:95180901:-1 gene:ENSRNOG00000004089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051139 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:95120407:95180901:-1 gene:ENSRNOG00000004089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 33 // 33 // 0 /// BC081747 // GenBank // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93258 IMAGE:7115236), complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// D28560 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphodiesterase I. // chr7 // 92 // 98 // 45 // 49 // 0 /// DQ131564 // GenBank // Rattus norvegicus autotaxin mRNA, complete cds. // chr7 // 96 // 96 // 46 // 48 // 0 /// GENSCAN00000041070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95120872:95167331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 36 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT051705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 21 // 50 // 1 /// NONRATT051708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 21 // 50 // 1
NM_133319 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF2 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:95339750:95396754:-1 gene:ENSRNOG00000034022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95240623:95415523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_002726929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA replication and sister chromatid cohesion 1 (Dscc1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA replication and sister chromatid cohesion 1 (Dscc1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_216934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA replication and sister chromatid cohesion 1 (Dscc1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036399 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:95399973:95415357:-1 gene:ENSRNOG00000026502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95240623:95415523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000005711 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:95426156:95426904:-1 gene:ENSRNOG00000004324 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000055713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95426332:95426904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 67 // 9 // 10 // 0
NM_001006985 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L13 (Mrpl13), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:95910454:95932053:-1 gene:ENSRNOG00000004401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC084710 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L13, mRNA (cDNA clone MGC:105961 IMAGE:7302342), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ220388 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YB08 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:95897993:95921375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001130542 // RefSeq // Rattus norvegicus syntrophin, beta 1 (Sntb1), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:96019799:96286153:-1 gene:ENSRNOG00000004821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:96023354:96036977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000057951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:96051025:96143713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_013153 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan synthase 2 (Has2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:97055458:97081461:-1 gene:ENSRNOG00000004854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF008201 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronan synthase 2 (Has2) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:96961770:97071340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001013947 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 22 (Slc22a22), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:97658276:97687749:-1 gene:ENSRNOG00000004958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB559554 // GenBank // Rattus norvegicus oat-pg mRNA for prostaglandin transporter OAT-PG, complete cds. // chr7 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// NONRATT051726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:97673402:97683796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001014202 // RefSeq // Rattus norvegicus derlin 1 (Derl1), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000007484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98344208:98366882:-1 gene:ENSRNOG00000005551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC085877 // GenBank // Rattus norvegicus Der1-like domain family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:94650 IMAGE:7191715), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// FQ220628 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YD13 mRNA sequence. // chr7 // 85 // 68 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT051733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000008382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98498309:98509170:-1 gene:ENSRNOG00000006370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091232 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9130401M01, mRNA (cDNA clone MGC:108982 IMAGE:7322456), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98489209:98509118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT051740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_133620 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 1 (Zhx1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 1 (Zhx1), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 1 (Zhx1), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000008454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98521908:98550754:-1 gene:ENSRNOG00000006412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB072439 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transcription factor ZHX1, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134879 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase family, AAA domain containing 2 (Atad2), mRNA. // chr7 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98589668:98631755:1 gene:ENSRNOG00000025604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98589776:98633749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT049869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT049870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_133521 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 32 (Fbxo32), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98669144:98701551:-1 gene:ENSRNOG00000006738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY059628 // GenBank // Rattus norvegicus muscle atrophy F-box protein mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98670533:98734118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025008 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 38 (Klhl38), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98791426:98800554:-1 gene:ENSRNOG00000007896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091195 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 38 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:108871 IMAGE:7374210), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 38 (Klhl38), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT051752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98792074:98852416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001134910 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A13 (Anxa13), mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:98819726:98871641:-1 gene:ENSRNOG00000007980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:98792074:98852416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT051754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001100995 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 65 (Tmem65), mRNA. // chrU // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000064122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:99270342:99310255:-1 gene:ENSRNOG00000008934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// BC129127 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 4930438D12Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:156815 IMAGE:7190631), complete cds. // chrU // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// FQ224194 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA74YC22 mRNA sequence. // chrU // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT051757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT051758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001127294 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 9 (Ndufb9), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:99411522:99417939:1 gene:ENSRNOG00000009364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC166927 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 9, mRNA (cDNA clone MGC:188916 IMAGE:6919700), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC168767 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 9, mRNA (cDNA clone MGC:188896 IMAGE:6891022), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ224000 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA80YE10 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ227503 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YC02 mRNA sequence. // chr7 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000031455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:99388277:99417853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 90 // 88 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT049874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_002729816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC31278 (RGD1564420), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// XM_006226081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC31278 (RGD1564420), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000013315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:100210512:100254422:-1 gene:ENSRNOG00000009739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000050194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:100210512:100234293:-1 gene:ENSRNOG00000009739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 87 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000019606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:100217390:100254422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT051772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// FQ222281 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA25YK10 mRNA sequence. // chr7 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1
NM_001145141 // RefSeq // Rattus norvegicus LOC500876 (LOC500876), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006510 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:100957066:100958598:-1 gene:ENSRNOG00000004914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:100928435:100958598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT051776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001047963 // RefSeq // Rattus norvegicus Ab1-152 (LOC500877), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ab1-152 (LOC500877), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:101676672:101706856:-1 gene:ENSRNOG00000029292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:101695748:101705880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_235349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 84, member B (Fam84b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000006279 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:101707859:101708791:-1 gene:ENSRNOG00000004744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// XM_235349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 84, member B (Fam84b), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:101707859:101708791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT051780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008878 // RefSeq // Rattus norvegicus Ac2-224 (LOC362921), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:101766569:101782904:-1 gene:ENSRNOG00000033584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:101779707:101782904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 89 // 38 // 8 // 9 // 0
NM_022258 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-1-B glycoprotein (A1bg), mRNA. // chr7 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// XM_006241696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-1-B glycoprotein (A1bg), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000006273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:102865944:102869669:-1 gene:ENSRNOG00000004692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF236054 // GenBank // Rattus norvegicus liver regeneration-related protein 1 mRNA, complete cds. // chr7 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// AJ302031 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for putative alpha 1B-glycoprotein (ORF1). // chr7 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// BC089771 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-1-B glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:108566 IMAGE:7326280), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:102864108:102899101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001166307 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG32662-PA (LOC498592), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001008323 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphomannomutase 1 (Pmm1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:123158887:123169142:-1 gene:ENSRNOG00000005358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086346 // GenBank // Rattus norvegicus phosphomannomutase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105960 IMAGE:7302298), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:123159261:123195745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT052178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT052179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT052181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001134495 // RefSeq // Rattus norvegicus gasdermin C (Gsdmc), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000044197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:91477763:91490055:-1 gene:ENSRNOG00000004982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:91445711:91490055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT051682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000007528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:91517912:91581982:-1 gene:ENSRNOG00000005145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC166469 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 49, member B, mRNA (cDNA clone MGC:187849 IMAGE:9036548), complete cds. // chr7 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// FQ212269 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA62YL03 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000057887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:91524661:91545602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT051685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT051687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT051688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT051689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT051686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001044245 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with SH3 domain, ankyrin repeat and PH domain 1 (Asap1), mRNA. // chr7 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000031906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:91673052:91955738:-1 gene:ENSRNOG00000005739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:91673052:91955738:-1 gene:ENSRNOG00000005739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// DQ238622 // GenBank // Rattus norvegicus ASAP1 splice variant a (Ddef1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// DQ238623 // GenBank // Rattus norvegicus ASAP1 splice variant b (Ddef1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// DQ238624 // GenBank // Rattus norvegicus ASAP1 splice variant c (Ddef1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr7 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT051690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:91697724:91810935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_017142 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 8 (brain) (Adcy8), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000006789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:105301842:105540451:-1 gene:ENSRNOG00000004890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L26986 // GenBank // Rat adenylyl cyclase type VIII mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:105301920:105492080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT051783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
GENSCAN00000032554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:105580150:105580617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000034679 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:106507546:106507915:-1 gene:ENSRNOG00000025549 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:106423072:106507915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001134765 // RefSeq // Rattus norvegicus otoconin 90 (Oc90), mRNA. // chr7 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000042522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:106567468:106601709:-1 gene:ENSRNOG00000025516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000044610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:106389399:106413972:-1 gene:ENSRNOG00000050531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:106567707:106591097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:106192743:106407140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT051784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_031597 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 3 (Kcnq3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000006930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:106665371:106956100:-1 gene:ENSRNOG00000005206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:106665371:106955983:-1 gene:ENSRNOG00000005206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// AF091247 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel (KCNQ3) mRNA, complete cds. // chr7 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:106665371:106723051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// AF087454 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel (KCNQ3) mRNA, complete cds. // chr7 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0
NM_001025659 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 6 (Lrrc6), mRNA. // chr7 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// XM_003750358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 6 (Lrrc6), mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000007250 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:107074070:107166410:-1 gene:ENSRNOG00000005233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 86 // 18 // 19 // 0 /// BC097394 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 6 (testis), mRNA (cDNA clone MGC:114437 IMAGE:7453303), complete cds. // chr7 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT051787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107131449:107170944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_001271215 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 71 (Tmem71), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056793 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:107306267:107324573:-1 gene:ENSRNOG00000025460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107288979:107335068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT051789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_178097 // RefSeq // Rattus norvegicus src-like adaptor (Sla), mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:107518054:107566621:-1 gene:ENSRNOG00000005797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// AY217759 // GenBank // Rattus norvegicus slap-1-like protein mRNA, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT051790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107518100:107552859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT051791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001011991 // RefSeq // Rattus norvegicus N-myc downstream regulated 1 (Ndrg1), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006241708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-myc downstream regulated 1 (Ndrg1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:107683925:107725300:-1 gene:ENSRNOG00000007393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AY500369 // GenBank // Rattus norvegicus N-myc downstream regulated 1 (Ndr1) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC081898 // GenBank // Rattus norvegicus N-myc downstream regulated gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:93814 IMAGE:7110455), complete cds. // chr7 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// FQ212154 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA67YK07 mRNA sequence. // chr7 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107685476:107717576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT051793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT051794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001013219 // RefSeq // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 (St3gal1), mRNA. // chr7 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// XM_006241709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 1 (St3gal1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:107847816:107854483:-1 gene:ENSRNOG00000008209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:107847816:107861902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT051796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT051797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NONRATT051798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134957 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and AT hook domain containing (Zfat), mRNA. // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006241715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and AT hook domain containing (Zfat), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:108980617:109147542:-1 gene:ENSRNOG00000025140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:109055103:109089917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000057453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:108981229:109049224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT051800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NR_031841 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-30b (Mir30b), microRNA. // chrUn // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-30b // miRBase Micro RNA Database // MI0000868 Rattus norvegicus miR-30b stem-loop // chrUn // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_031842 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 30d (Mir30d), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000053734 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:7:109228641:109228722:-1 gene:ENSRNOG00000035611 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:109204714:109289208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// rno-mir-30d // miRBase Micro RNA Database // MI0000869 Rattus norvegicus miR-30d stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_001072719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006226092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006241723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_235409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006966 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:112609758:112768320:-1 gene:ENSRNOG00000005159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:112609758:112732001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_001072719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006226092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X6, mRNA. // chr7 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_235409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 135, member B (Fam135b), transcript variant X7, mRNA. // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006966 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:112609758:112768320:-1 gene:ENSRNOG00000005159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:112609758:112732001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
XM_001072793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XXII, alpha 1 (Col22a1), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 64 // 64 // 0 /// ENSRNOT00000034672 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:112952964:113165457:-1 gene:ENSRNOG00000024824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 62 // 62 // 0 /// GENSCAN00000054809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:112952964:113085619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 45 // 45 // 33 // 73 // 1 /// GENSCAN00000012810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:113111483:113165430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 16 // 16 // 12 // 73 // 1 /// GENSCAN00000054824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:113087651:113105986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 12 // 12 // 9 // 73 // 1 /// NONRATT051807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 19 // 19 // 14 // 73 // 1
NM_053405 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 9 (Kcnk9), mRNA. // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000012408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:113841045:113875376:-1 gene:ENSRNOG00000009265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF192366 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel TASK3 mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF391084 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel TASK-3 (Kcnk9) mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// DQ897665 // GenBank // Rattus norvegicus TASK-3 (Kcnk9) mRNA, 5 and 3 UTR. // chr7 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:113841387:113890887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT051811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001034156 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 9 (Trappc9), mRNA. // chrU // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000067327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:114185580:114244503:-1 gene:ENSRNOG00000027569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 93 // 33 // 13 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000038172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:113923438:114238660:-1 gene:ENSRNOG00000027569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000071246 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:113659666:113676676:-1 gene:ENSRNOG00000050398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114197059:114241343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:113640839:113680567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT051810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT051813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NONRATT026343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT026344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT026345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT051813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 50 // 67 // 8 // 16 // 0 /// NONRATT058679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 96 // 11 // 23 // 0
NM_021597 // RefSeq // Rattus norvegicus argonaute RISC catalytic component 2 (Ago2), mRNA. // chr7 // 89 // 100 // 31 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000011898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:114274582:114312135:-1 gene:ENSRNOG00000008533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF195534 // GenBank // Rattus norvegicus GERp95 mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 100 // 31 // 35 // 0 /// GENSCAN00000000122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114272952:114326166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_013081 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine kinase 2 (Ptk2), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:114371990:114525553:-1 gene:ENSRNOG00000007916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF020777 // GenBank // Rattus norvegicus focal adhesion kinase (FAK) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr7 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114372921:114545064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT051827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NR_031798 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-151 (Mir151), microRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-151 // miRBase Micro RNA Database // MI0000647 Rattus norvegicus miR-151 stem-loop // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001072962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36-like (RGD1564268), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_235399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36-like (RGD1564268), mRNA. // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114623767:114624066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000032620 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:114746106:114771962:-1 gene:ENSRNOG00000007818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114739299:114758733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT051830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_022216 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 20 (Gpr20), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 20 (Gpr20), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 20 (Gpr20), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:114865953:114867015:-1 gene:ENSRNOG00000007795 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114865933:114870011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000040236 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:114953541:114981744:-1 gene:ENSRNOG00000032827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071818 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:114953541:114981744:-1 gene:ENSRNOG00000032827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040236 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:114953541:114981744:-1 gene:ENSRNOG00000032827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006226101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X4, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X9, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006226107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), transcript variant X10, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 5 (Mroh5), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:114926102:114985099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000015275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115066721:115085738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
XM_006226110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 4 (Mroh4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006241742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 4 (Mroh4), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000007671 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:115748779:115773667:-1 gene:ENSRNOG00000005382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000052303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115748779:115789888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// NONRATT051837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT051838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT051843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 27 // 27 // 13 // 48 // 1
NM_019361 // RefSeq // Rattus norvegicus activity-regulated cytoskeleton-associated protein (Arc), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115812499:115815943:-1 gene:ENSRNOG00000043465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U19866 // GenBank // Rattus norvegicus growth factor (Arc) mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT051845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001104612 // RefSeq // Rattus norvegicus jerky homolog (mouse) (Jrk), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115847177:115851860:-1 gene:ENSRNOG00000027238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC152551 // GenBank // Rattus norvegicus jerky homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:156801 IMAGE:7133465), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130544 // RefSeq // Rattus norvegicus secreted Ly6/Plaur domain containing 1 (Slurp1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115867044:115868460:-1 gene:ENSRNOG00000005944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115867280:115868432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT051847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001130545 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 2 (Lypd2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115872656:115874693:-1 gene:ENSRNOG00000006058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115870216:115878642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT051848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001130551 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to secreted Ly6/uPAR related protein 2 (RGD1308195), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000036549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115883243:115887123:-1 gene:ENSRNOG00000031437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 86 // 74 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000052310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115883475:115887101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
NM_001130546 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly6/neurotoxin 1 (Lynx1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115891669:115892310:-1 gene:ENSRNOG00000006086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000052296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115891669:115893478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT051852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001130552 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus D (Ly6d), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:115898693:115900201:-1 gene:ENSRNOG00000026133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115896044:115916342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006241756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus K (Ly6k), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035678 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:115939557:115941721:-1 gene:ENSRNOG00000025725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065987 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:115939305:115941721:-1 gene:ENSRNOG00000025725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116006522:116008686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:115939557:115941721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012537 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp11b1), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// X15431 // GenBank // Rat mRNA for cytochrome P-450 11(beta) (EC 1.14.15.4.). // chr7 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// D11354 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytochrome P-450-11beta, complete cds. // chr7 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// D10107 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytochrome P-450-11beta, complete cds. // chr7 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NONRATT051855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// NONRATT044326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_181824 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 3 (Cyp11b3), mRNA. // chr7 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000038109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116099081:116104570:-1 gene:ENSRNOG00000046367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000068707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116058980:116064497:-1 gene:ENSRNOG00000049205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// U14907 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P-450 11-beta hydroxylase (CYP11B3) mRNA, complete cds. // chr7 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// U17082 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450c11B3 (CYP11B3) mRNA, complete cds. // chr7 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116099090:116104576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116059008:116064503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT051855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_012538 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 11, subfamily b, polypeptide 2 (Cyp11b2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000041774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116151128:116157542:-1 gene:ENSRNOG00000030111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// D00568 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytochrome P-450 11beta, variant precursor, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// D00567 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytochrome P-450 11beta, aldo precursor, complete cds. // chr7 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT051855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT051856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// U14908 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P-450 11-beta hydroxylase/aldosterone synthase (CYP11B2) mRNA, complete cds. // chr7 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116152314:116157542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1
XM_002726938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG60069-like (LOC100361556), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002729821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG60069-like (LOC100361556), mRNA. // chr7 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// XM_003750364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ly-6/neurotoxin-like protein 1-like (LOC100910656), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032170 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116185200:116186956:-1 gene:ENSRNOG00000023543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073179 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116177882:116179937:-1 gene:ENSRNOG00000047072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116185200:116186956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116178183:116179937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0
NM_020103 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly6-C antigen (Ly6c), mRNA. // chr14 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22767472:22771288:-1 gene:ENSRNOG00000023397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000070875 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109985.1:7397:10463:-1 gene:ENSRNOG00000048198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// FQ230335 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YH07 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ232627 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YA04 mRNA sequence. // chr14 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// FQ235068 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YJ14 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045718 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109985.1:7397:10445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22724138:22771399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
XM_001073983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6B-like (LOC300024), mRNA. // chr7 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000071792 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116269085:116271191:-1 gene:ENSRNOG00000048850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// NONRATT051857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT051858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116269034:116272671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_139257 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus I (Ly6i), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006241765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus I (Ly6i), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000009395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116315542:116320534:-1 gene:ENSRNOG00000007137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// M30689 // GenBank // Rat Ly6-B antigen mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT051858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT051859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT051860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
XM_006241770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ly6-C antigen gene (RGD1565410), partial mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116396899:116399933:-1 gene:ENSRNOG00000037375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC158674 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Ly6-C antigen gene, mRNA (cDNA clone MGC:187680 IMAGE:8371673), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116361723:116400392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001128099 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus A-like (Ly6al), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006241769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus A-like (Ly6al), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056556 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116450238:116453537:-1 gene:ENSRNOG00000037374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// XM_006241767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus A-like (Ly6al), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// NONRATT051862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116423991:116453387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001134839 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus H (Ly6h), mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006241781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus H (Ly6h), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006241782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus H (Ly6h), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus H (Ly6h), transcript variant X3, mRNA. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000056554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116499353:116501205:-1 gene:ENSRNOG00000007334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC169114 // GenBank // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus H, mRNA (cDNA clone IMAGE:7314821), partial cds. // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116499716:116500795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT051864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT051865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT051866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENSRNOT00000041702 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116510204:116510679:-1 gene:ENSRNOG00000031770 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116510204:116510590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_001002798 // RefSeq // Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) I, mitochondrial (Top1mt), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006241784 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) I, mitochondrial (Top1mt), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) I, mitochondrial (Top1mt), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116583001:116606332:-1 gene:ENSRNOG00000007500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116596046:116606299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000052182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116580012:116595392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT051867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT051869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT051870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_006241903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene A (Mafa), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010084 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116671892:116672977:-1 gene:ENSRNOG00000007668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116671892:116672977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134865 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 3 (Zc3h3), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000010120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116679040:116765271:-1 gene:ENSRNOG00000007684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT051872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116677379:116742673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT051874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
XM_002729836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 6 (Mroh6), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006226129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 6 (Mroh6), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048363 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:116807857:116812476:-1 gene:ENSRNOG00000032231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116807857:116818319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_207609 // RefSeq // Rattus norvegicus nicotinate phosphoribosyltransferase domain containing 1 (Naprt1), mRNA. // chr7 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116814964:116818403:-1 gene:ENSRNOG00000007939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// AY214330 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinate phosphoribosyltransferase-like protein mRNA, complete cds. // chr7 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116807857:116818319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT051876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT051877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT051879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT051880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001011993 // RefSeq // Rattus norvegicus pyrroline-5-carboxylate reductase-like (Pycrl), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrroline-5-carboxylate reductase-like (Pycrl), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116842455:116847953:-1 gene:ENSRNOG00000008708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087166 // GenBank // Rattus norvegicus pyrroline-5-carboxylate reductase-like, mRNA (cDNA clone MGC:95331 IMAGE:7135468), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220816 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YJ09 mRNA sequence. // chr7 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116843031:116847658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001127455 // RefSeq // Rattus norvegicus tissue specific transplantation antigen P35B (Tsta3), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001270789 // RefSeq // Rattus norvegicus tissue specific transplantation antigen P35B (Tsta3), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001270790 // RefSeq // Rattus norvegicus tissue specific transplantation antigen P35B (Tsta3), transcript variant 3, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:116851238:116856095:-1 gene:ENSRNOG00000009020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC158885 // GenBank // Rattus norvegicus tissue specific transplantation antigen P35B, mRNA (cDNA clone MGC:188615 IMAGE:8363456), complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ210097 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA34YL20 mRNA sequence. // chr7 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:116851491:116855380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT051896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001130509 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 166 (Ccdc166), transcript variant 1, mRNA. // chr7 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NM_001163519 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 166 (Ccdc166), transcript variant 2, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006241886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 166 (Ccdc166), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000073835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117026724:117027308:-1 gene:ENSRNOG00000047521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// XM_006241887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 166 (Ccdc166), transcript variant X2, mRNA. // chr7 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117025829:117027308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT051901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001130565 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member H (Fam83h), mRNA. // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000048446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117048588:117056776:-1 gene:ENSRNOG00000030264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117049332:117052758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117053483:117065707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001191879 // RefSeq // Rattus norvegicus scribbled planar cell polarity protein (Scrib), mRNA. // chr7 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000045280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117091481:117114469:-1 gene:ENSRNOG00000032574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000003087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117095796:117114145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117091712:117093640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT051905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 63 // 63 // 26 // 41 // 1 /// NONRATT051906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 37 // 15 // 41 // 1 /// NONRATT051907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1 /// NONRATT051908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1 /// NONRATT051913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1 /// NONRATT051909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_001191880 // RefSeq // Rattus norvegicus poly-U binding splicing factor 60 (Puf60), mRNA. // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117114908:117125839:-1 gene:ENSRNOG00000009960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000056481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117114908:117125839:-1 gene:ENSRNOG00000009960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117115082:117136901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT051917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT051918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT051919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT051920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT051921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
NM_001135007 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor binding protein 2 (Nrbp2), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006241884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor binding protein 2 (Nrbp2), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000051294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117131632:117137365:-1 gene:ENSRNOG00000029535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ223130 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YC13 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117115082:117136901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT051923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT051927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT051928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
XM_003750373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epiplakin 1 (Eppk1), mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// XM_003754311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epiplakin 1 (Eppk1), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000003115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117149828:117159394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 93 // 93 // 13 // 14 // 0
XM_002729838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC680875 (LOC680875), transcript variant X1, mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_003754312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC680875 (LOC680875), mRNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XR_355793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC680875 (LOC680875), transcript variant X5, misc_RNA. // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014191 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:117166480:117173038:-1 gene:ENSRNOG00000023828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117166474:117184502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT051933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT051934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
ENSRNOT00000006376 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:117277297:117286365:-1 gene:ENSRNOG00000004361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117277580:117286365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// FQ235212 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YA20 mRNA sequence. // chr7 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
XR_348074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549107 (LOC102549107), transcript variant X1, ncRNA. // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XR_355794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549107 (LOC102549107), transcript variant X1, ncRNA. // chr7 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT051942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_053904 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysing) (Oplah), mRNA. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysing) (Oplah), transcript variant X5, mRNA. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117339712:117354917:-1 gene:ENSRNOG00000011781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC072530 // GenBank // Rattus norvegicus 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysing), mRNA (cDNA clone IMAGE:7097016), partial cds. // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC085330 // GenBank // Rattus norvegicus 5-oxoprolinase (ATP-hydrolysing), mRNA (cDNA clone MGC:105359 IMAGE:7096390), complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// U70825 // GenBank // Rattus norvegicus 5-oxo-L-prolinase mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117339743:117353098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_031153 // RefSeq // Rattus norvegicus SHANK-associated RH domain interactor (Sharpin), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117400782:117404993:-1 gene:ENSRNOG00000012812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF203906 // GenBank // Rattus norvegicus sharpin mRNA, complete cds. // chr7 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC083553 // GenBank // Rattus norvegicus SHANK-associated RH domain interactor, mRNA (cDNA clone MGC:93373 IMAGE:7189111), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ213170 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YF12 mRNA sequence. // chr7 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117400787:117405706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT051953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
BC089206 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:105906 IMAGE:7135758), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001014086 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 5 (Tssk5), mRNA. // chr7 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000018528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117424934:117427972:-1 gene:ENSRNOG00000013753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT051955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117425077:117450889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT051956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001024250 // RefSeq // Rattus norvegicus block of proliferation 1 (Bop1), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117502164:117525973:-1 gene:ENSRNOG00000021773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC092594 // GenBank // Rattus norvegicus block of proliferation 1, mRNA (cDNA clone MGC:109114 IMAGE:7380064), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117502440:117505516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT051958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT051959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001130570 // RefSeq // Rattus norvegicus scratch family zinc finger 1 (Scrt1), mRNA. // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000035423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117571084:117574734:-1 gene:ENSRNOG00000025594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000003075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117571476:117574448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT051965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006226207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 249 (Tmem249), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006241923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 249 (Tmem249), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064970 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:117587381:117588813:-1 gene:ENSRNOG00000042362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117587381:117591334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001005563 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 6 (Fbxl6), mRNA. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117589688:117592585:-1 gene:ENSRNOG00000025497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC082108 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:95310 IMAGE:7134999), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT051968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117587381:117591334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT051969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001130571 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 1, 160kDa (Cpsf1), mRNA. // chr7 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000066244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:117649865:117660364:-1 gene:ENSRNOG00000030705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC168713 // GenBank // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:188689 IMAGE:8367087), complete cds. // chr7 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000048847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:117649943:117667891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT051970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0