NM_001014051 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 9 (Ttll9), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006235275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 9 (Ttll9), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 9 (Ttll9), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000064196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154841931:154888352:1 gene:ENSRNOG00000008596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC082105 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:95301 IMAGE:7134735), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154841962:154888023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001012092 // RefSeq // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 7 (Xkr7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154913771:154936396:1 gene:ENSRNOG00000009180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY534261 // GenBank // Rattus norvegicus XK-related protein 7 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154913934:154935584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebral cavernous malformations 2 protein-like (RGD1305202), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012187 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:154944901:154959736:1 gene:ENSRNOG00000009191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154952261:154959921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154944901:154950810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0
NM_013185 // RefSeq // Rattus norvegicus hemopoietic cell kinase (Hck), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154982909:155025526:1 gene:ENSRNOG00000009331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078890 // GenBank // Rattus norvegicus hemopoietic cell kinase, mRNA (cDNA clone MGC:93602 IMAGE:7121407), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M83666 // GenBank // Rattus norvegicus hematopoietic cell tyrosine kinase (hck) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154990454:155025245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001025649 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily protein member 4 (Tm9sf4), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006235284 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily protein member 4 (Tm9sf4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000067261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155408354:155457981:-1 gene:ENSRNOG00000009406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC099133 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily protein member 4, mRNA (cDNA clone MGC:116278 IMAGE:7454474), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000036613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155408459:155495049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT038351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT038354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_001002278 // RefSeq // Rattus norvegicus protein O-fucosyltransferase 1 (Pofut1), mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1 /// XM_006235291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein O-fucosyltransferase 1 (Pofut1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000013730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155352444:155374642:-1 gene:ENSRNOG00000010104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1 /// NONRATT038349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155352444:155374642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1
ENSRNOT00000046786 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:155334453:155336128:-1 gene:ENSRNOG00000010354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155334453:155334845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
NM_001106529 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 3B (Kif3b), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155284616:155324361:-1 gene:ENSRNOG00000010361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155285650:155301661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006224720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus additional sex combs like 1 (Asxl1), mRNA. // chr3 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000045241 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:155204644:155263216:-1 gene:ENSRNOG00000023335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155201371:155266091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
XM_006224720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus additional sex combs like 1 (Asxl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045241 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:155204644:155263216:-1 gene:ENSRNOG00000023335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155201371:155266091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001003959 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta (Dnmt3b), mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// XM_006235342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta (Dnmt3b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// XM_006235343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta (Dnmt3b), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000015482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155524090:155549356:1 gene:ENSRNOG00000010625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// XM_006235341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta (Dnmt3b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// XR_352745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta (Dnmt3b), transcript variant X13, misc_RNA. // chr3 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// NONRATT036074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155520370:155591157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
GENSCAN00000036630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155520370:155591157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000015682 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:155589055:155590341:1 gene:ENSRNOG00000011768 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 57 // 100 // 12 // 21 // 0
NM_138509 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 1 (Mapre1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155599601:155627491:1 gene:ENSRNOG00000011798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081726 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein, RP/EB family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93188 IMAGE:7192469), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U75920 // GenBank // Rattus norvegicus APC binding protein EB1 mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155599533:155626090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT036081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
XM_006224715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 8 (Efcab8), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 8 (Efcab8), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038684 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:155639542:155648471:1 gene:ENSRNOG00000027920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155637455:155712480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_001106531 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 2 (Bpifb2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155736658:155755644:1 gene:ENSRNOG00000012197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155737813:155746317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT036085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155749555:155761202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001107791 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 6 (Bpifb6), mRNA. // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000017876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155769706:155773907:1 gene:ENSRNOG00000013371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000036632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155762348:155773847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001109208 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 3 (Bpifb3), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000055349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155779667:155794283:1 gene:ENSRNOG00000013398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155781107:155909718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001109209 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 4 (Bpifb4), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000044574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155802169:155827127:1 gene:ENSRNOG00000034174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155781107:155909718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_052808 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family A, member 2 (Bpifa2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155871130:155879088:1 gene:ENSRNOG00000013540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M83209 // GenBank // Rattus norvegicus parotid secretory protein precursor (psp) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155781107:155909718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT036090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_080775 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family A, member 2F (Bpifa2f), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000055345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155902142:155910723:1 gene:ENSRNOG00000036870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M83210 // GenBank // Rattus norvegicus neonatal submandibular gland proacinar cell protein precursor (SMGB1/SMGB2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155781107:155909718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 78 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT036091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001109588 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family A, member 3 (Bpifa3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155984516:155994330:1 gene:ENSRNOG00000013778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155984708:156077816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172031 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family A, member 1 (Bpifa1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156002440:156008182:1 gene:ENSRNOG00000013859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF393750 // GenBank // Rattus norvegicus plunc mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155984708:156077816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001107792 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family A, member 5 (Bpifa5), mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156021054:156026971:1 gene:ENSRNOG00000013908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155984708:156077816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 79 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT036095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001077680 // RefSeq // Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 1 (Bpifb1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006235353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 1 (Bpifb1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006235355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 1 (Bpifb1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000055342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156046295:156078740:1 gene:ENSRNOG00000015468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC127515 // GenBank // Rattus norvegicus similar to von Ebner minor salivary gland protein, mRNA (cDNA clone MGC:156708 IMAGE:7100079), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155984708:156077816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
XM_001074561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 5 (Bpifb5), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_002726273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BPI fold containing family B, member 5 (Bpifb5), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034798 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156082418:156100695:1 gene:ENSRNOG00000025238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156082418:156100695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0
XM_006227161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeromodulin-like (LOC102557262), mRNA. // chr3 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// XM_006227215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Vomeromodulin (LOC690507), partial mRNA. // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// XM_006235368 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Vomeromodulin (LOC690507), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000020968 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156174613:156181781:1 gene:ENSRNOG00000015637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000071772 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156174586:156184148:1 gene:ENSRNOG00000015637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156173972:156185711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000070854 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156116302:156116943:1 gene:ENSRNOG00000048471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000075275 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156162821:156163462:1 gene:ENSRNOG00000048094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156162821:156163462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156116302:156116943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001168542 // RefSeq // Rattus norvegicus core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2; translocated to, 2 (Cbfa2t2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156308253:156410892:1 gene:ENSRNOG00000016352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ222452 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YD18 mRNA sequence. // chr3 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156380499:156410196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT036102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_006235356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to chromosome 20 open reading frame 144 (RGD1561517), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156425118:156426305:1 gene:ENSRNOG00000016583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// DQ080432 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl-2-like protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156425176:156426206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT036108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
XM_003749597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin-like 10 (Actl10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin-like 10 (Actl10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055335 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156428384:156429424:1 gene:ENSRNOG00000036864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156427929:156429424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
XM_006224722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 966 (Zfp966), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// XM_006235372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 966 (Zfp966), mRNA. // chr3 // 95 // 87 // 37 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000047286 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:156507626:156525604:1 gene:ENSRNOG00000017086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 62 // 24 // 28 // 0 /// AY539896 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00145 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 62 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156516977:156525604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 42 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156528170:156543578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT036110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 26 // 45 // 1 /// NONRATT036111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1
NM_001276456 // RefSeq // Rattus norvegicus chromatin modifying protein 4B-like 1 (Chmp4bl1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006235373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 4B (Chmp4b), mRNA. // chrU // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000052393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:66867607:66868281:1 gene:ENSRNOG00000034071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156559482:156596179:1 gene:ENSRNOG00000046585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:66867607:66868281:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156559482:156620521:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT036114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT036115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NM_001011958 // RefSeq // Rattus norvegicus RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein (Raly), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000023429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156695466:156756861:1 gene:ENSRNOG00000017405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// BC087074 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding protein, autoantigenic (hnRNP-associated with lethal yellow homolog (mouse)), mRNA (cDNA clone MGC:94432 IMAGE:7134486), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000007497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156711678:156761579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT036117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT036122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 23 // 41 // 1 /// NONRATT036121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 24 // 41 // 1 /// NONRATT036119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
NM_052979 // RefSeq // Rattus norvegicus agouti signaling protein (Asip), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156860395:156949277:1 gene:ENSRNOG00000017701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// AB045587 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for agouti, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156934669:156949099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0
NM_001005887 // RefSeq // Rattus norvegicus itchy E3 ubiquitin protein ligase (Itch), mRNA. // chr3 // 93 // 96 // 43 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000024411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157055848:157117955:1 gene:ENSRNOG00000018099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AY600518 // GenBank // Rattus norvegicus itch E3 ubiquitin ligase mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 96 // 43 // 46 // 0 /// GENSCAN00000003603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157048904:157117955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0
NM_131910 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein light chain roadblock-type 1 (Dynlrb1), mRNA. // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157129655:157150710:1 gene:ENSRNOG00000025715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF073839 // GenBank // Rattus norvegicus bithoraxoid-like protein mRNA, complete cds. // chr3 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// AY026512 // GenBank // Rattus norvegicus dynein-associated protein RKM23 (km23) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC058437 // GenBank // Rattus norvegicus dynein light chain roadblock-type 1, mRNA (cDNA clone MGC:72642 IMAGE:6921076), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157129708:157170752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_199500 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha (Map1lc3a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157169534:157171180:1 gene:ENSRNOG00000025443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY206668 // GenBank // Rattus norvegicus map1a/1b light chain 3a mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC086389 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:105263 IMAGE:7302206), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000003586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157129708:157170752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001270947 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 (Tp53inp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003749598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 (Tp53inp2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006235327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 (Tp53inp2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006235329 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible nuclear protein 2 (Tp53inp2), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000055310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157278565:157283521:1 gene:ENSRNOG00000018225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157278523:157283521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT036134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107793 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase short-chain family member 2 (Acss2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157400421:157443341:1 gene:ENSRNOG00000018755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC161963 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase short-chain family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187768 IMAGE:9028172), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157400485:157442644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT036135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001107794 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 7B, cardiac muscle, beta (Myh7b), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000025859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157494398:157518151:1 gene:ENSRNOG00000018997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// EU241478 // GenBank // Rattus norvegicus myosin heavy chain 7B (Myh7b) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000044367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157485844:157518151:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT036137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0
NR_032141 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-499 (Mir499), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054554 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:157506669:157506733:1 gene:ENSRNOG00000036443 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-499 // miRBase Micro RNA Database // MI0003721 Rattus norvegicus miR-499 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000044380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157567603:157568600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_001025733 // RefSeq // Rattus norvegicus protein C receptor, endothelial (Procr), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157650399:157654720:1 gene:ENSRNOG00000019330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC097380 // GenBank // Rattus norvegicus protein C receptor, endothelial, mRNA (cDNA clone MGC:114418 IMAGE:7445753), complete cds. // chr3 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// BC099115 // GenBank // Rattus norvegicus protein C receptor, endothelial, mRNA (cDNA clone MGC:116255 IMAGE:7462042), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ221148 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YA01 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ229445 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YO04 mRNA sequence. // chr3 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// FQ222113 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA28YM19 mRNA sequence. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157650535:157654185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT036142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006224723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 250 (Cep250), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000026149 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:157872143:157908796:1 gene:ENSRNOG00000019340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000055251 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:157872143:157908796:1 gene:ENSRNOG00000019340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000030085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157863976:157927796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT036146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001106533 // RefSeq // Rattus norvegicus ERGIC and golgi 3 (Ergic3), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157918210:157927936:1 gene:ENSRNOG00000031085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ228199 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YC08 mRNA sequence. // chr3 // 78 // 90 // 21 // 27 // 0 /// FQ232583 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YD04 mRNA sequence. // chr3 // 44 // 90 // 12 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157863976:157927796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT036150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT036152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_031792 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 4 (Spag4), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// XM_006235363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm associated antigen 4 (Spag4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000026578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159542734:159547074:-1 gene:ENSRNOG00000019566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000065052 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:157974324:157978542:1 gene:ENSRNOG00000048056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AF043345 // GenBank // Rattus norvegicus sperm antigen 4 (SPAG4) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000030099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157974324:157978542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 80 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159542752:159546970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0
NM_001195490 // RefSeq // Rattus norvegicus reactive oxygen species modulator 1 (Romo1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158052831:158054431:1 gene:ENSRNOG00000019823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072464 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:159466557:159467814:-1 gene:ENSRNOG00000045555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ211245 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA14YH19 mRNA sequence. // chr3 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0
AY633845 // GenBank // Rattus norvegicus RNA-binding region containing protein 2 (Rnpc2) mRNA, Rnpc2-2 H1 allele, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158056133:158056466:1 gene:ENSRNOG00000032925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073201 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:159464520:159464711:-1 gene:ENSRNOG00000046176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0
NM_001107795 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 20 (Phf20), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006235406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 20 (Phf20), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159312084:159417512:-1 gene:ENSRNOG00000019948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ225423 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YA07 mRNA sequence. // chr3 // 79 // 39 // 11 // 14 // 0 /// FQ232700 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YL18 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000052650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159313611:159375272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT038462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT038463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001177681 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclic nucleotide binding domain containing 2 (Cnbd2), mRNA. // chr3 // 97 // 88 // 36 // 37 // 0 /// XM_006235397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide binding domain containing 2 (Cnbd2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 97 // 83 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000027086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159226090:159288261:-1 gene:ENSRNOG00000019992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 88 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000031707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159226090:159267569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 43 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159276520:159284415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT038460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// NONRATT038461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
ENSRNOT00000027090 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:159212190:159212731:-1 gene:ENSRNOG00000020003 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159160335:159216249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_001106535 // RefSeq // Rattus norvegicus AAR2 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (Aar2), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159044400:159067330:-1 gene:ENSRNOG00000020086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161955 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610011L14 gene, mRNA (cDNA clone MGC:187756 IMAGE:9027129), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AAR2 splicing factor homolog (S. cerevisiae) (Aar2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT038451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159046778:159131853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT038453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_173145 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 4 (Dlgap4), mRNA. // chr3 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000037177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158850471:158944119:-1 gene:ENSRNOG00000020225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// FQ212717 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YM10 mRNA sequence. // chr3 // 88 // 45 // 15 // 17 // 0 /// U67140 // GenBank // Rattus norvegicus PSD-95/SAP90-associated protein-4 mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158850622:158905580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT038445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// NONRATT038446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT038447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
ENSRNOT00000027445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158832629:158838991:-1 gene:ENSRNOG00000020246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC158548 // GenBank // Rattus norvegicus myosin, light chain 9, regulatory, mRNA (cDNA clone MGC:187199 IMAGE:9036351), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// FQ220400 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YA11 mRNA sequence. // chr3 // 78 // 69 // 14 // 18 // 0 /// FQ229855 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YH10 mRNA sequence. // chr3 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// FQ231820 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YB02 mRNA sequence. // chr3 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// NM_001100885 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light chain 9, regulatory (Myl9), mRNA. // chr3 // 69 // 62 // 11 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158833100:158847250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001134983 // RefSeq // Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006235424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006235426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048929 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:47572323:47573036:1 gene:ENSRNOG00000030925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000066341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158772767:158787955:-1 gene:ENSRNOG00000042374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC168719 // GenBank // Rattus norvegicus similar to TGFB-induced factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:188777 IMAGE:8364226), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:47572323:47671328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158782341:158783894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT038439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158753841:158775238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001134983 // RefSeq // Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048929 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:47572323:47573036:1 gene:ENSRNOG00000030925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158772767:158787955:-1 gene:ENSRNOG00000042374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC168719 // GenBank // Rattus norvegicus similar to TGFB-induced factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:188777 IMAGE:8364226), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:47572323:47671328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158782341:158783894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT038439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158753841:158775238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001013922 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110008F13 (RGD1307752), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000027539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158753367:158763385:-1 gene:ENSRNOG00000020317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// BC089919 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110008F13, mRNA (cDNA clone MGC:109198 IMAGE:7306699), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// FQ212871 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YO03 mRNA sequence. // chr3 // 88 // 94 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT038435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT038437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0
XM_003753821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC/LysM-associated domain containing 2 (Tldc2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XM_006224724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC/LysM-associated domain containing 2 (Tldc2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000008386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:158507196:158517368:-1 gene:ENSRNOG00000006395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158505891:158531420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_031698 // RefSeq // Rattus norvegicus ribophorin II (Rpn2), mRNA. // chr3 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158274304:158321446:-1 gene:ENSRNOG00000007492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC060556 // GenBank // Rattus norvegicus ribophorin II, mRNA (cDNA clone MGC:72765 IMAGE:6919638), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158278432:158318251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT038431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT038426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT038433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001173380 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, beta A, lysosomal-like (Manbal), mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000047047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158198825:158228410:-1 gene:ENSRNOG00000031453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC091276 // GenBank // Rattus norvegicus mannosidase, beta A, lysosomal-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7383362), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158125552:158241580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_031977 // RefSeq // Rattus norvegicus v-src avian sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (Src), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000012739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158125180:158138447:-1 gene:ENSRNOG00000009495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF130457 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine protein kinase pp60-c-src mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// AF157016 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal C-SRC tyrosine-specific protein kinase (Src) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000030093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158125552:158241580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT038421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT038423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001270867 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronatin (Nnat), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// NM_053601 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronatin (Nnat), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NR_073089 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronatin (Nnat), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000034166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:161553362:161555777:-1 gene:ENSRNOG00000024923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U08290 // GenBank // Rattus norvegicus neuronatin alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// U09785 // GenBank // Rattus norvegicus neuronatin beta mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NM_181687 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronatin (Nnat), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000072502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:161553362:161555777:-1 gene:ENSRNOG00000024923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1 /// BC127473 // GenBank // Rattus norvegicus neuronatin, mRNA (cDNA clone MGC:156562 IMAGE:8364201), complete cds. // chr3 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000021897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:161554255:161555698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT038504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001024870 // RefSeq // Rattus norvegicus catenin, beta like 1 (Ctnnbl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000066808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:161228794:161389518:-1 gene:ENSRNOG00000012021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// BC097352 // GenBank // Rattus norvegicus catenin, beta like 1, mRNA (cDNA clone MGC:114382 IMAGE:7387542), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 1 /// GENSCAN00000021012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:161228891:161257907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:161276559:161330095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
XM_003753823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein-like (RGD1305725), mRNA. // chr3 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000050810 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:161177532:161206776:-1 gene:ENSRNOG00000034031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT038494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:161177829:161206776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT038495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000019331 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:161163791:161164563:-1 gene:ENSRNOG00000014425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:161164177:161169044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_001098727 // RefSeq // Rattus norvegicus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B (Rprd1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:161050868:161097240:-1 gene:ENSRNOG00000012923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168699 // GenBank // Rattus norvegicus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, mRNA (cDNA clone MGC:188611 IMAGE:8362231), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:161053089:161096871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001004079 // RefSeq // Rattus norvegicus bactericidal/permeability-increasing protein (Bpi), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006235403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bactericidal/permeability-increasing protein (Bpi), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160837672:160864602:-1 gene:ENSRNOG00000034195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079318 // GenBank // Rattus norvegicus bactericidal/permeability-increasing protein, mRNA (cDNA clone MGC:94477 IMAGE:7135061), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160780361:160875064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_017208 // RefSeq // Rattus norvegicus lipopolysaccharide binding protein (Lbp), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160792747:160819996:-1 gene:ENSRNOG00000014532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC101906 // GenBank // Rattus norvegicus lipopolysaccharide binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:124626 IMAGE:7933709), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ229146 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YP03 mRNA sequence. // chr3 // 93 // 44 // 13 // 14 // 0 /// L32132 // GenBank // Rat lipopolysaccharide binding protein mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT038489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160780361:160875064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT038490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT038491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001258011 // RefSeq // Rattus norvegicus small nucleolar RNA host gene 11 (non-protein coding) (Snhg11), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160736978:160743135:-1 gene:ENSRNOG00000036802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC094214 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1563912, mRNA (cDNA clone MGC:105739 IMAGE:7314456), complete cds. // chrU // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XR_352761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nucleolar RNA host gene 11 (non-protein coding) (Snhg11), transcript variant X3, misc_RNA. // chrU // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT038484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160715100:160743345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT038487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT038488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NONRATT038484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271210 // RefSeq // Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, beta subunit (non-catalytic) (Ralgapb), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160627361:160699898:-1 gene:ENSRNOG00000014836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160568989:160712136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT038476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSRNOT00000040516 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:160565204:160610205:-1 gene:ENSRNOG00000015359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// XM_001068716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 40 (Arhgap40), mRNA. // chrU // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// GENSCAN00000019077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160568989:160712136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 24 // 40 // 1
NM_031782 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 32 (GABA vesicular transporter), member 1 (Slc32a1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 32 (GABA vesicular transporter), member 1 (Slc32a1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000020720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160500060:160504727:-1 gene:ENSRNOG00000015393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF030253 // GenBank // Rattus norvegicus vesicular GABA transporter (VGAT) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160500977:160505968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108600 // RefSeq // Rattus norvegicus ARP5 actin-related protein 5 homolog (yeast) (Actr5), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ARP5 actin-related protein 5 homolog (yeast) (Actr5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000032943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160477100:160490585:-1 gene:ENSRNOG00000023989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160442336:160490346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT038471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT038472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001191072 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 16B (Ppp1r16b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160348036:160448839:-1 gene:ENSRNOG00000015614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160348036:160405465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001107796 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 83, member D (Fam83d), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160322831:160342099:-1 gene:ENSRNOG00000015794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160323302:160342075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001108601 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 35 (Dhx35), mRNA. // chr3 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000021435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160256785:160313877:-1 gene:ENSRNOG00000015928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000008692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160251874:160272830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000019084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160275980:160313808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 59 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT038465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_022615 // RefSeq // Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) I (Top1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF140782 // GenBank // Rattus norvegicus DNA topoisomerase I mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// FQ230605 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YM06 mRNA sequence. // chr3 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// GENSCAN00000007531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:162842106:162947076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000029101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:136004303:136023234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 68 // 24 // 28 // 0 /// NONRATT036212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 49 // 49 // 20 // 41 // 1 /// NONRATT036213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1
NM_013187 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, gamma 1 (Plcg1), mRNA. // chr3 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000022276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:162957126:162987842:1 gene:ENSRNOG00000016340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// J03806 // GenBank // Rat phospholipase C mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000007540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:162957195:162986702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT036217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0
NM_001014184 // RefSeq // Rattus norvegicus lipin 3 (Lpin3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006235489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipin 3 (Lpin3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006235490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipin 3 (Lpin3), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000022403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:163113545:163126527:1 gene:ENSRNOG00000016636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC089878 // GenBank // Rattus norvegicus lipin 3, mRNA (cDNA clone MGC:109016 IMAGE:7326188), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000007533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:163113567:163126176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
XR_345358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557588 (LOC102557588), ncRNA. // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000057265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:164837879:164843956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001014185 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 6 (Srsf6), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165502385:165507708:1 gene:ENSRNOG00000006380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC087121 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine-rich 6, mRNA (cDNA clone MGC:94786 IMAGE:7106749), complete cds. // chr3 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// FQ227426 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YG06 mRNA sequence. // chr3 // 81 // 90 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT036234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165500371:165504668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT036235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT036237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
XM_006224732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus l(3)mbt-like 1 (Drosophila) (L3mbtl1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006224735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus l(3)mbt-like 1 (Drosophila) (L3mbtl1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006235620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus l(3)mbt-like 1 (Drosophila) (L3mbtl1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000045677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165517651:165544071:1 gene:ENSRNOG00000007044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000063906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165517669:165536739:1 gene:ENSRNOG00000007044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165514662:165544071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_134463 // RefSeq // Rattus norvegicus serum/glucocorticoid regulated kinase 2 (Sgk2), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165557662:165581916:1 gene:ENSRNOG00000033573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165560821:165608138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0
NM_001177685 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 52 homolog (Chlamydomonas) (Ift52), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000066260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165588271:165605625:1 gene:ENSRNOG00000007692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 81 // 27 // 29 // 0 /// BC162007 // GenBank // Rattus norvegicus intraflagellar transport 52 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:187867 IMAGE:9090205), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000029223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165560821:165608138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT036241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT036242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001106536 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloblastosis oncogene-like 2 (Mybl2), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165617194:165645609:1 gene:ENSRNOG00000007805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165617467:165644208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001107798 // RefSeq // Rattus norvegicus ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1 (Gdap1l1), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166016380:166034837:1 gene:ENSRNOG00000008790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC168159 // GenBank // Rattus norvegicus ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:187603 IMAGE:8364600), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ212886 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YN06 mRNA sequence. // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166016446:166034813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT036251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NONRATT036252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001108962 // RefSeq // Rattus norvegicus R3H domain containing-like (R3hdml), mRNA. // chr3 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// XM_006235600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain containing-like (R3hdml), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166077700:166088469:1 gene:ENSRNOG00000027432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166077870:166093920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT036256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001270931 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatocyte nuclear factor 4, alpha (Hnf4a), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NM_001270933 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatocyte nuclear factor 4, alpha (Hnf4a), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NM_022180 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatocyte nuclear factor 4, alpha (Hnf4a), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166127644:166152838:1 gene:ENSRNOG00000008895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// D10554 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for hepatocyte nuclear factor 4, complete cds. // chr3 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// EF193390 // GenBank // Rattus norvegicus hepatocyte nuclear factor 4 alpha 9 (Hnf4a) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// FJ608818 // GenBank // Rattus norvegicus HNF4alpha12 (Hnf4alpha) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166127687:166152836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_001106537 // RefSeq // Rattus norvegicus tocopherol (alpha) transfer protein-like (Ttpal), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166185907:166204117:1 gene:ENSRNOG00000009076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166191025:166200602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT036259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_153469 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase (cAMP-dependent, catalytic) inhibitor gamma (Pkig), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase inhibitor, gamma (Pkig), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166238136:166305338:1 gene:ENSRNOG00000010235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY150308 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase inhibitor gamma mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC088108 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase inhibitor, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:108574 IMAGE:7368431), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ218619 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YP09 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235519 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase inhibitor, gamma (Pkig), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT036260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT036261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT036262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT036263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000001455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166278095:166302786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000014346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166397532:166408879:1 gene:ENSRNOG00000010666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089187 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7309413. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_031590 // RefSeq // Rattus norvegicus WNT1 inducible signaling pathway protein 2 (Wisp2), mRNA. // chr3 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// AF259981 // GenBank // Rattus norvegicus CCN family protein COP-1 (Cop-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// NONRATT036268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166398006:166426347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_130813 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 15 (Kcnk15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166421477:166427695:1 gene:ENSRNOG00000010816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF467250 // GenBank // Rattus norvegicus tandem pore potassium channel mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166398006:166426347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_019377 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, beta (Ywhab), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166577976:166586801:1 gene:ENSRNOG00000010945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC076502 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:91711 IMAGE:7100393), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D17446 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 14-3-3 protein beta-subtype, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ214109 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YN11 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000001441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166544930:166629586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
XM_230831 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 1-like (Pabpc1l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055172 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:166597627:166629533:1 gene:ENSRNOG00000012750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166544930:166629586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001107800 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 4 (Stk4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000066657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166652145:166731210:1 gene:ENSRNOG00000013529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ226333 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YI19 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166656742:166727498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_012662 // RefSeq // Rattus norvegicus seminal vesicle secretory protein 4 (Svs4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seminal vesicle secretory protein 4-like (LOC100909594), mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000018456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166849398:166851630:-1 gene:ENSRNOG00000013796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165303461:165304256:1 gene:ENSRNOG00000046558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// J00791 // GenBank // rat seminal vesicle secretion protein iv (svs iv) mrna. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// M25590 // GenBank // Rat androgen-dependent protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// X01114 // GenBank // Rat seminal vesicle mRNA for SVS-protein S. // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166850784:166851579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165303461:165456841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001007605 // RefSeq // Rattus norvegicus seminal vesicle secretory protein 3A (Svs3a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000018481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166862837:166865053:1 gene:ENSRNOG00000013819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001102403 // RefSeq // Rattus norvegicus seminal vesicle secretory protein 6 (Svs6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166879444:166881115:1 gene:ENSRNOG00000026346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// D11339 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA, complete cds, clone: p116, expressed in seminal vesicle. // chr3 // 77 // 100 // 17 // 22 // 0 /// NONRATT036277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166862857:166880288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_133516 // RefSeq // Rattus norvegicus seminal vesicle secretory protein 5 (Svs5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166897273:166898877:1 gene:ENSRNOG00000013834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NONRATT036279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001108604 // RefSeq // Rattus norvegicus recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region-like (Rbpjl), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006235598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region-like (Rbpjl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167032450:167044820:1 gene:ENSRNOG00000026295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167032603:167043929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT036281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
XM_001062200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SYS1 Golgi-localized integral membrane protein homolog (S. cerevisiae) (Sys1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SYS1 Golgi-localized integral membrane protein homolog (S. cerevisiae) (Sys1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167089540:167092582:1 gene:ENSRNOG00000014480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030054 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:167089540:167092595:1 gene:ENSRNOG00000014480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167081195:167092595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001047111 // RefSeq // Rattus norvegicus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 2 (Dbndd2), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 2 (Dbndd2), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006235615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 2 (Dbndd2), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167115995:167118753:1 gene:ENSRNOG00000014571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY113696 // GenBank // Rattus norvegicus SCF apoptosis response protein-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC158561 // GenBank // Rattus norvegicus similar to uncharacterized hypothalamus protein HSMNP1, mRNA (cDNA clone MGC:187243 IMAGE:7387488), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// FQ220039 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YG23 mRNA sequence. // chr3 // 95 // 70 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167114001:167118320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT036285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT036283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001106540 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class T (Pigt), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167125865:167135023:1 gene:ENSRNOG00000014690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000045375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167125897:167134657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT036287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_173109 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 2 (Wfdc2), mRNA. // chr3 // 84 // 89 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167197728:167203405:1 gene:ENSRNOG00000014739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167197728:167203405:1 gene:ENSRNOG00000014739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// FQ222047 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YK13 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000045373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167197764:167200904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT036290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT036292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT036293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001008867 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 6B (Wfdc6b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000048654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167249154:167256308:1 gene:ENSRNOG00000031823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001109461 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 10 (Wfdc10), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167298958:167300311:1 gene:ENSRNOG00000026067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167299017:167300277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
XR_345379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 (Spint4), misc_RNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XR_352821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type 4 (Spint4), misc_RNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000019849 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:167338188:167341131:1 gene:ENSRNOG00000014794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167338188:167390456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001008881 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type 5 (Spint5p), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167365260:167366887:1 gene:ENSRNOG00000014807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000019871 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:167379659:167380375:1 gene:ENSRNOG00000032531 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167338188:167390456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0
NM_134400 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 1 (Dnttip1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// XM_006235512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 1 (Dnttip1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// XM_006235513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 1 (Dnttip1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000020280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167398374:167421692:1 gene:ENSRNOG00000014933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// BC100640 // GenBank // Rattus norvegicus deoxynucleotidyltransferase, terminal, interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:124886 IMAGE:7929876), complete cds. // chr3 // 98 // 98 // 48 // 49 // 0 /// AJ002424 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for p65 protein. // chr3 // 70 // 70 // 35 // 50 // 1 /// NONRATT036298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000027291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167398427:167424799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 29 // 50 // 1 /// NONRATT036299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 11 // 50 // 1
NM_001106542 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2C (Ube2c), mRNA. // chr3 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// ENSRNOT00000020323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167422569:167424969:1 gene:ENSRNOG00000015131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// FQ234128 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YB06 mRNA sequence. // chr3 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// NONRATT036300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167398427:167424799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
XM_003753838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin family member 21 (Snx21), mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000020358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167377588:167445774:1 gene:ENSRNOG00000015181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167445038:167445694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC105769 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7930328. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001107801 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 3 (Zswim3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167457690:167472950:1 gene:ENSRNOG00000015525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167457846:167472534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT036304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006224741 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 1 (Zswim1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 1 (Zswim1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021070 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:167475675:167477042:1 gene:ENSRNOG00000015735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000027343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167475675:167478446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT036306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT036307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001011959 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin A (Ctsa), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006235534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cathepsin A (Ctsa), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167484246:167489974:1 gene:ENSRNOG00000015857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC078934 // GenBank // Rattus norvegicus protective protein for beta-galactosidase, mRNA (cDNA clone MGC:93743 IMAGE:7108104), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ212992 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YF05 mRNA sequence. // chr3 // 80 // 74 // 20 // 25 // 0 /// FQ229081 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YM01 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// FQ220109 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YC19 mRNA sequence. // chr3 // 74 // 56 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167484413:167489624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT036312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT036310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT036311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT036313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_001108605 // RefSeq // Rattus norvegicus PDX1 C-terminal inhibiting factor 1 (Pcif1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000023202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167528503:167541435:1 gene:ENSRNOG00000016870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167529650:167541087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT036316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_031055 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 9 (Mmp9), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167597817:167605882:1 gene:ENSRNOG00000017539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U24441 // GenBank // Rattus norvegicus gelatinase B (GelB) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// U36476 // GenBank // Rattus norvegicus 92-kDa type IV collagenase mRNA, complete cds. // chr3 // 81 // 93 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167597817:167605022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_134363 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 12 (potassium-chloride transporter), member 5 (Slc12a5), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167617776:167647352:1 gene:ENSRNOG00000018111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065184 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:167610336:167647352:1 gene:ENSRNOG00000018111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// EF641113 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal-specific K-Cl cotransporter (Slc12a5) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// U55816 // GenBank // Rattus norvegicus furosemide-sensitive K-Cl cotransporter (KCC2) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167617883:167647134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_134360 // RefSeq // Rattus norvegicus CD40 molecule, TNF receptor superfamily member 5 (Cd40), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167704321:167719409:1 gene:ENSRNOG00000018488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097949 // GenBank // Rattus norvegicus CD40 molecule, TNF receptor superfamily member 5, mRNA (cDNA clone MGC:116072 IMAGE:7387440), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ231420 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YJ01 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167704349:167718802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT036328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT036329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001108963 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 10 (Slc2a10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168364925:168377379:1 gene:ENSRNOG00000025384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168361588:168392688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT036332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_130427 // RefSeq // Rattus norvegicus EYA transcriptional coactivator and phosphatase 2 (Eya2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000030119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168537541:168647321:1 gene:ENSRNOG00000019203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY366465 // GenBank // Rattus norvegicus Drosophila-type eyes absent 2-like protein (Eya2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168547243:168629566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000051679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168635458:168652354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSRNOT00000007768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168933287:168958994:1 gene:ENSRNOG00000005616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000044234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168933287:168958994:1 gene:ENSRNOG00000005616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000066122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168933287:168958994:1 gene:ENSRNOG00000005616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF322224 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator AIB1 mRNA, partial cds. // chr3 // 97 // 69 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168933287:168960126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT036339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
GENSCAN00000031194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:169306490:169306762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001108606 // RefSeq // Rattus norvegicus TP53 regulating kinase (Tp53rk), mRNA. // chr3 // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000049082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:169715189:169718619:1 gene:ENSRNOG00000007285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT036345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_181083 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor guanine nucleotide-exchange factor 2 (brefeldin A-inhibited) (Arfgef2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000010054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:169733008:169814500:1 gene:ENSRNOG00000007485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY255526 // GenBank // Rattus norvegicus Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange factor 2 (Big2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000009096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:169762951:169814110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT036346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001108607 // RefSeq // Rattus norvegicus CSE1 chromosome segregation 1-like (yeast) (Cse1l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:169825002:169862567:1 gene:ENSRNOG00000007665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:169833072:169861990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001135801 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 27 (Ddx27), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000010806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:169927524:169946720:1 gene:ENSRNOG00000008081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// BC160885 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 27, mRNA (cDNA clone MGC:188296 IMAGE:7384442), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// BC088338 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 27, mRNA (cDNA clone IMAGE:7366630), partial cds. // chr3 // 31 // 31 // 14 // 45 // 1 /// GENSCAN00000009103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:169927538:169946335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT036350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT036353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1
NR_110672 // RefSeq // Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911177 (LOC100911177), long non-coding RNA. // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// FQ222042 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YK21 mRNA sequence. // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// FQ222426 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YJ19 mRNA sequence. // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT036354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// Zfas1 // lncRNA Db // rn4 chr3:158,214,340-158,216,912 // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001025281 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE8, cation proton antiporter 8), member 8 (Slc9a8), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000012175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170326024:170373076:1 gene:ENSRNOG00000008354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY496958 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-hydrogen exchanger isoform 8 mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// FQ210940 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA1YF11 mRNA sequence. // chr3 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170315676:170376134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT036363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001001517 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 114 (Rnf114), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170399735:170411498:1 gene:ENSRNOG00000009525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY603473 // GenBank // Rattus norvegicus ZFP313 protein (Znf313) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098633 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 114, mRNA (cDNA clone MGC:112560 IMAGE:7369070), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170395069:170410068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT036369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_053805 // RefSeq // Rattus norvegicus snail family zinc finger 1 (Snai1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170425898:170430382:1 gene:ENSRNOG00000009594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079210 // GenBank // Rattus norvegicus snail homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94272 IMAGE:7131806), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170425978:170429663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_024125 // RefSeq // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta (Cebpb), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170577777:170578880:1 gene:ENSRNOG00000049393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// BC129071 // GenBank // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta, mRNA (cDNA clone MGC:156483 IMAGE:7458221), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// M57235 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-6-dependent binding protein (IL-6DBP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170577777:170578880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT036376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012637 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1 (Ptpn1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170816920:170866072:1 gene:ENSRNOG00000010574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081829 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 1, mRNA (cDNA clone MGC:93562 IMAGE:7135855), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M33962 // GenBank // Rattus norvegicus protein-tyrosine-phospatase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170764717:170866711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT036385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_001108609 // RefSeq // Rattus norvegicus par-6 family cell polarity regulator beta (Pard6b), mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000014568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170968975:170990259:1 gene:ENSRNOG00000010883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170910115:170988320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001107804 // RefSeq // Rattus norvegicus molybdenum cofactor synthesis 3 (Mocs3), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:171125683:171127643:1 gene:ENSRNOG00000025067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:171125697:171127073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT036396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001109344 // RefSeq // Rattus norvegicus docking protein 5 (Dok5), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235673 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus docking protein 5 (Dok5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:174447259:174579714:1 gene:ENSRNOG00000013196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC167027 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Docking protein 5 (Downstream of tyrosine kinase 5) (Protein dok-5), mRNA (cDNA clone MGC:189260 IMAGE:7315978), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:174477208:174679458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001025270 // RefSeq // Rattus norvegicus melanocortin 3 receptor (Mc3r), mRNA. // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000005871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176331172:176332269:1 gene:ENSRNOG00000004451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AY671938 // GenBank // Rattus norvegicus melanocortin 3 receptor (Mc3r) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000007181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176331271:176332242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT036425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000005886 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:176373883:176374295:1 gene:ENSRNOG00000004455 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 91 // 96 // 20 // 22 // 0
NM_001106547 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 210, member B (Fam210b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 210, member B (Fam210b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176429999:176438295:1 gene:ENSRNOG00000004466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166836 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2010011I20, mRNA (cDNA clone MGC:188726 IMAGE:9024310), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 210, member B (Fam210b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// FQ218214 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA7YH02 mRNA sequence. // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000007168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176430027:176437156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001013161 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 1, 50kDa (Cstf1), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006235681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 1, 50kDa (Cstf1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176456501:176467942:1 gene:ENSRNOG00000004775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC091381 // GenBank // Rattus norvegicus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:109461 IMAGE:7320917), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176454537:176466155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT036428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT036430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT036431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001191744 // RefSeq // Rattus norvegicus Cas scaffolding protein family member 4 (Cass4), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176475073:176512469:1 gene:ENSRNOG00000021560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176484079:176512469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001033890 // RefSeq // Rattus norvegicus replication termination factor 2 domain containing 1 (Rtfdc1), mRNA. // chr3 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176519321:176548882:1 gene:ENSRNOG00000005083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC101880 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2410001C21Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:124670 IMAGE:7929941), complete cds. // chr3 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176519384:176527937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000007186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176537523:176547750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT036433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106548 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 209, member A (Fam209a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176551257:176552942:1 gene:ENSRNOG00000005235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176551304:176552862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT036434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_201420 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor AP-2 gamma (Tfap2c), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235691 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor AP-2 gamma (Tfap2c), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176625472:176633352:1 gene:ENSRNOG00000005246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY510602 // GenBank // Rattus norvegicus activator protein-2 gamma mRNA, complete cds. // chr3 // 81 // 70 // 17 // 21 // 0 /// BC097260 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor AP-2, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:114227 IMAGE:7443035), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176605801:176633138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT036435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT036438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT036439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001108964 // RefSeq // Rattus norvegicus SPO11 meiotic protein covalently bound to DSB (Spo11), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPO11 meiotic protein covalently bound to DSB (Spo11), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPO11 meiotic protein covalently bound to DSB (Spo11), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPO11 meiotic protein covalently bound to DSB (Spo11), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XR_352938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPO11 meiotic protein covalently bound to DSB (Spo11), transcript variant X8, misc_RNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177062658:177073908:1 gene:ENSRNOG00000006732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPO11 meiotic protein covalently bound to DSB (Spo11), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// XM_006235703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPO11 meiotic protein covalently bound to DSB (Spo11), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177060554:177069372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT036444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001033708 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonucleic acid export 1 (Rae1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177082075:177096826:1 gene:ENSRNOG00000021295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC104721 // GenBank // Rattus norvegicus RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:125198 IMAGE:7383476), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC105758 // GenBank // Rattus norvegicus RAE1 RNA export 1 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:124870 IMAGE:5623260), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177074843:177151957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001108965 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 38 (Rbm38), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177104361:177116960:1 gene:ENSRNOG00000006420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// FQ215279 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YN12 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT036450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177074843:177151957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT036451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT036452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_198780 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 (soluble) (Pck1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000031586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177278783:177284731:1 gene:ENSRNOG00000028616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC081900 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoenolpyruvate carboxykinase 1 (soluble), mRNA (cDNA clone MGC:93820 IMAGE:7110760), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// FQ219336 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YA02 mRNA sequence. // chr3 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177263557:177284109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001109542 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Protein C20orf85 homolog (LOC689618), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029558 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:177658756:177665531:1 gene:ENSRNOG00000028533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177658806:177665380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108966 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB22A, member RAS oncogene family (Rab22a), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177802660:177843968:1 gene:ENSRNOG00000005762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC158650 // GenBank // Rattus norvegicus RAB22A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:187628 IMAGE:8367507), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177802643:177843105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_021847 // RefSeq // Rattus norvegicus VAMP (vesicle-associated membrane protein)-associated protein B and C (Vapb), mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177890671:177927965:1 gene:ENSRNOG00000005331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF086631 // GenBank // Rattus norvegicus VAMP-associated protein B (VAP-B) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC065576 // GenBank // Rattus norvegicus VAMP (vesicle-associated membrane protein)-associated protein B and C, mRNA (cDNA clone MGC:72459 IMAGE:5598396), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT036460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177885473:177926747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NONRATT036461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108610 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 16 (Stx16), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:178207252:178234585:1 gene:ENSRNOG00000005281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC168980 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 16, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131681), partial cds. // chr3 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:178207258:178232817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT036468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT036469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_001107806 // RefSeq // Rattus norvegicus aminopeptidase-like 1 (Npepl1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000034915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:178247574:178259415:1 gene:ENSRNOG00000028384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:178248956:178258962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:178246927:178248292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT036470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// NONRATT036472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT036473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001159653 // RefSeq // Rattus norvegicus GNAS complex locus (Gnas), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001159656 // RefSeq // Rattus norvegicus GNAS complex locus (Gnas), transcript variant 5, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:178426595:178427365:1 gene:ENSRNOG00000025889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AF105254 // GenBank // Rattus norvegicus neuroendocrine secretory protein 55 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AF107844 // GenBank // Rattus norvegicus neuroendocrine-specific Golgi protein p55 and guanine nucleotide-binding protein (XLalphas) alternatively spliced mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF107845 // GenBank // Rattus norvegicus neuroendocrine-specific Golgi protein p55 (XLalphas) alternatively spliced mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:178396854:178427365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT036474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT036475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT036476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006227589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102553249), mRNA. // chrU // 77 // 52 // 10 // 13 // 0 /// XM_006257594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102553249), mRNA. // chrU // 77 // 52 // 10 // 13 // 0 /// XM_006227146 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 669-like (LOC102550609), partial mRNA. // chrU // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// XM_006235716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910819 (LOC100910819), mRNA. // chrU // 40 // 100 // 10 // 25 // 0 /// XM_006235668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 669-like (LOC102550609), mRNA. // chrU // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006235662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 879-like (LOC102549391), mRNA. // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// XM_006253773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102554989), partial mRNA. // chrU // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000073650 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:179413739:179414249:-1 gene:ENSRNOG00000047007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 77 // 52 // 10 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000075012 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:173326708:173332871:-1 gene:ENSRNOG00000045707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 77 // 52 // 10 // 13 // 0
XM_006235670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102551102), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006235836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102555369), partial mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000043032 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:183459430:183460175:-1 gene:ENSRNOG00000031725 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000036185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183459430:183460211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
NM_001171096 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to C20orf174 (RGD1565819), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000033863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:178767065:178849594:1 gene:ENSRNOG00000024693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:178767030:178802394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000025282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:178845338:178862868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000072016 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:178862544:178862991:1 gene:ENSRNOG00000050272 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 61 // 92 // 14 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:178845338:178862868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001077650 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelin 3 (Edn3), mRNA. // chr3 // 80 // 76 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:178903017:178925563:1 gene:ENSRNOG00000007477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_214459 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatase and actin regulator 3 (Phactr3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AY500157 // GenBank // Rattus norvegicus PHACTR3 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000009906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:183262099:183304794:-1 gene:ENSRNOG00000007524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 29 // 48 // 1 /// GENSCAN00000036177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183260364:183312667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 65 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT038871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000040875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183219383:183224965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// NONRATT038870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1
ENSRNOT00000037118 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:183153475:183154415:-1 gene:ENSRNOG00000026887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_001134551 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 217, member B (Fam217b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 217, member B (Fam217b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 217, member B (Fam217b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:183130338:183135513:-1 gene:ENSRNOG00000024702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183127071:183135427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT038868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001191745 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 26 (Cdh26), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:183071632:183121671:-1 gene:ENSRNOG00000004584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183071632:183119631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
XM_006235829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 4 (Cdh4), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032405 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:181834313:181967627:-1 gene:ENSRNOG00000008976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181834313:181857440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
XM_006235827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM14B, SCD6 homolog B (S. cerevisiae) (Lsm14b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181701084:181707064:-1 gene:ENSRNOG00000008877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181701084:181707064:-1 gene:ENSRNOG00000008877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000055058 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:181701084:181710021:-1 gene:ENSRNOG00000008877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181700485:181729856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_138918 // RefSeq // Rattus norvegicus synovial sarcoma translocation gene on chromosome 18-like 1 (Ss18l1), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181673460:181691930:-1 gene:ENSRNOG00000008437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AY034073 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-responsive transcription coactivator mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181672849:181691920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001013924 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosome-associated GTPase 2 (Mtg2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006235818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTP binding protein 5 (Gtpbp5), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTP binding protein 5 (Gtpbp5), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181654577:181661966:-1 gene:ENSRNOG00000008418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC083707 // GenBank // Rattus norvegicus GTP binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:94597 IMAGE:7190542), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT038855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181645749:181663121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT038856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT038857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT038858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NONRATT038853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013079 // RefSeq // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 2 (Osbpl2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181579720:181624984:-1 gene:ENSRNOG00000007691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091208 // GenBank // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:108916 IMAGE:7381353), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181565878:181593198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT038850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_031708 // RefSeq // Rattus norvegicus adhesion regulating molecule 1 (Adrm1), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181565742:181570520:-1 gene:ENSRNOG00000006991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB032742 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cell membrane glycoprotein 110000Mr (surface antigen) homolog, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC061773 // GenBank // Rattus norvegicus adhesion regulating molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:72391 IMAGE:5621873), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ218007 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA11YJ20 mRNA sequence. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181565878:181593198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_133608 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 4a1 (Slco4a1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XR_352985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 4a1 (Slco4a1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181259389:181278378:-1 gene:ENSRNOG00000021870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF239262 // GenBank // Rattus norvegicus organic anion transporter E (oatpE) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// BC097285 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 4a1, mRNA (cDNA clone MGC:114266 IMAGE:7441748), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC097286 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 4a1, mRNA (cDNA clone MGC:114267 IMAGE:7444297), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181260015:181349441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT038840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001108967 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotensin receptor 1 (Ntsr1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179681394:179747034:1 gene:ENSRNOG00000028708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179681858:179742289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT036482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006235824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MRG-binding protein-like (LOC100910098), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// BC099155 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Protein C20orf20, mRNA (cDNA clone IMAGE:7381284), complete cds. // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NM_001173739 // RefSeq // Rattus norvegicus MRG/MORF4L binding protein (Mrgbp), mRNA. // chr3 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000071953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181189456:181192854:-1 gene:ENSRNOG00000048652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000073679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179788389:179791769:1 gene:ENSRNOG00000045955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179788389:179800329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181186100:181211684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_053340 // RefSeq // Rattus norvegicus opioid growth factor receptor (Ogfr), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179794351:179800638:1 gene:ENSRNOG00000009355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC101898 // GenBank // Rattus norvegicus opioid growth factor receptor, mRNA (cDNA clone MGC:124590 IMAGE:7932932), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179788389:179800329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF156878 // GenBank // Rattus norvegicus opioid growth factor receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT036483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT036484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003753842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type IX, alpha 3 (Col9a3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006224774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type IX, alpha 3 (Col9a3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013105 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:179803040:179824998:1 gene:ENSRNOG00000009531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179803040:179824960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT036485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT036486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_198743 // RefSeq // Rattus norvegicus GID complex subunit 8 (Gid8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179916193:179922710:1 gene:ENSRNOG00000010180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY156921 // GenBank // Rattus norvegicus BWK-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179918793:179945260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001108613 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 17 (vesicular nucleotide transporter), member 9 (Slc17a9), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 17 (vesicular nucleotide transporter), member 9 (Slc17a9), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179929443:179946156:1 gene:ENSRNOG00000010275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179918793:179945260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT036497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NR_031865 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 124-3 (Mir124-3), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000053716 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:180116126:180116212:1 gene:ENSRNOG00000035593 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// rno-mir-124-3 // miRBase Micro RNA Database // MI0000892 Rattus norvegicus miR-124-3 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006224769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XX, alpha 1 (Col20a1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XX, alpha 1 (Col20a1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009316 // RefSeq // Rattus norvegicus pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor (Ppdpf), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor (Ppdpf), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pancreatic progenitor cell differentiation and proliferation factor (Ppdpf), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180401475:180402473:1 gene:ENSRNOG00000012722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086948 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700038C09, mRNA (cDNA clone MGC:108808 IMAGE:7323892), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211007 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA19YB23 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180401623:180402253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001134620 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC5356 (RGD1564340), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180431836:180434255:1 gene:ENSRNOG00000013243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180433210:180434923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191857 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of telomere elongation helicase 1 (Rtel1), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006235772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of telomere elongation helicase 1 (Rtel1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006235777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of telomere elongation helicase 1 (Rtel1), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// XM_006235778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of telomere elongation helicase 1 (Rtel1), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000055030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180531778:180566698:1 gene:ENSRNOG00000027513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000034568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180532321:180565658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT036529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 24 // 41 // 1 /// NONRATT036530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 15 // 41 // 1 /// NONRATT036533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// NONRATT036526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_001009656 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCCH-type with G patch domain (Zgpat), mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235749 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCCH-type with G patch domain (Zgpat), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180575440:180591733:1 gene:ENSRNOG00000014235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// BC087720 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, CCCH-type with G patch domain, mRNA (cDNA clone MGC:105627 IMAGE:7318724), complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// BC158665 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8370119. // chr3 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// NM_001108614 // RefSeq // Rattus norvegicus Lck interacting transmembrane adaptor 1 (Lime1), mRNA. // chr3 // 33 // 33 // 15 // 45 // 1 /// ENSRNOT00000019545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180592159:180594482:1 gene:ENSRNOG00000049336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 15 // 45 // 1 /// GENSCAN00000034550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180575575:180596724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT036536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 30 // 45 // 1 /// NONRATT036537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 15 // 45 // 1 /// NONRATT036539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 15 // 45 // 1 /// NONRATT036538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
NM_001014052 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 16B (Abhd16b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180696183:180698079:1 gene:ENSRNOG00000015067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180651747:180723817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT036541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198744 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein D52-like 2 (Tpd52l2), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180699955:180718702:1 gene:ENSRNOG00000015122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC059167 // GenBank // Rattus norvegicus tumor protein D52-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:73020 IMAGE:6890828), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ214735 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YF04 mRNA sequence. // chr3 // 71 // 93 // 20 // 28 // 0 /// NONRATT036542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT036546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180651747:180723817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT036544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_024161 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 (Dnajc5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180723887:180754185:1 gene:ENSRNOG00000015202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF323955 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine string protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ223796 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA86YI21 mRNA sequence. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// U39320 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine string protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180751000:180753970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT036547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
FQ223796 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA86YI21 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001079766 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 6 (Prpf6), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000021722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180807600:180871660:1 gene:ENSRNOG00000015600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// BC128779 // GenBank // Rattus norvegicus PRP6 pre-mRNA splicing factor 6 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156816 IMAGE:7191091), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000019959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180807711:180875458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT036550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT036551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1
NM_057098 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription elongation factor A (SII), 2 (Tcea2), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180896673:180904401:1 gene:ENSRNOG00000016288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ213752 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YO10 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180896673:180904229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT036556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001108615 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin transcription factor 1 (Myt1), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// XM_006235783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myelin transcription factor 1 (Myt1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000031448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181019141:181049952:1 gene:ENSRNOG00000017346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// XM_006235786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myelin transcription factor 1 (Myt1), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 67 // 67 // 31 // 46 // 1 /// GENSCAN00000019938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180977898:181048235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT036562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0
NM_001107810 // RefSeq // Rattus norvegicus protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2 (Pcmtd2), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000023989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181059923:181079779:1 gene:ENSRNOG00000017404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// FQ211587 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA87YB11 mRNA sequence. // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181050976:181077598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001014259 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide K (Polr3k), mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181083089:181087319:1 gene:ENSRNOG00000017843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC089990 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide K, 12.3 kDa, mRNA (cDNA clone MGC:109430 IMAGE:7319381), complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// FQ213830 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YG05 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181083187:181086745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT036565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000074031 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:181117413:181165065:1 gene:ENSRNOG00000047086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 100 // 9 // 18 // 0 /// GENSCAN00000019955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181118286:181165065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
NM_001024308 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRG00137 (LOC499742), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001287614 // RefSeq // Rattus norvegicus stress response protein nst-1-like (LOC102551365), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001134447 // RefSeq // Rattus norvegicus speckle-type POZ protein-like (Spopl), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000033653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:396612:427083:-1 gene:ENSRNOG00000005070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC167106 // GenBank // Rattus norvegicus speckle-type POZ protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:189563 IMAGE:7133920), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:396778:481158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 97 // 32 // 33 // 1
NM_031044 // RefSeq // Rattus norvegicus histamine N-methyltransferase (Hnmt), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:896390:928854:-1 gene:ENSRNOG00000005223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087635 // GenBank // Rattus norvegicus histamine N-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:105411 IMAGE:7319794), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D10693 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for histamine N-methyltransferase, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:860491:928655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT036603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001099361 // RefSeq // Rattus norvegicus TATA box binding protein-like 2 (Tbpl2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1087370:1108164:-1 gene:ENSRNOG00000033682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1102350:1110893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
ENSRNOT00000041682 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:1186728:1188081:-1 gene:ENSRNOG00000027086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1141684:1196469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
ENSRNOT00000010972 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:1198607:1199952:-1 gene:ENSRNOG00000027336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1199562:1221566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1
ENSRNOT00000054562 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:3:1253538:1253648:-1 gene:ENSRNOG00000036451 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT036605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000049850 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:1332131:1332578:-1 gene:ENSRNOG00000033052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1332213:1332578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0
NM_001108570 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 36, beta (Il36b), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006233616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 36, beta (Il36b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 36, beta (Il36b), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1359278:1364124:-1 gene:ENSRNOG00000043323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1359450:1364774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_031141 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 8 (Pax8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1520146:1543634:-1 gene:ENSRNOG00000026203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC081779 // GenBank // Rattus norvegicus paired box 8, mRNA (cDNA clone MGC:93376 IMAGE:7127710), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1519487:1549064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001195199 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, N type, alpha 1B subunit (Cacna1b), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// NM_147141 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, N type, alpha 1B subunit (Cacna1b), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000006162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1727956:1910340:-1 gene:ENSRNOG00000004560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000048945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1727956:1910340:-1 gene:ENSRNOG00000004560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// AF055477 // GenBank // Rattus norvegicus pore-forming calcium channel alpha-1B subunit variant a mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// HQ008360 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley Cav2.2 (CACNA1B) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// M92905 // GenBank // Rat calcium channel alpha-1 subunit (rbB-I) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000020217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1730541:1798943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1803259:1910340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT036610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT036611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT036612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0
NM_001108572 // RefSeq // Rattus norvegicus euchromatic histone-lysine N-methyltransferase 1 (Ehmt1), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1952113:2043561:-1 gene:ENSRNOG00000007242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1952113:1996002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT036613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001100770 // RefSeq // Rattus norvegicus arrestin domain containing 1 (Arrdc1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2112659:2119716:-1 gene:ENSRNOG00000007622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC158871 // GenBank // Rattus norvegicus arrestin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188522 IMAGE:7931820), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2112918:2119702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT036617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001100171 // RefSeq // Rattus norvegicus NADPH oxidase activator 1 (Noxa1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2281049:2290537:-1 gene:ENSRNOG00000009286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2281266:2318954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001107816 // RefSeq // Rattus norvegicus torsin family 4, member A (Tor4a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2389140:2392827:-1 gene:ENSRNOG00000009369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2390605:2391909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107817 // RefSeq // Rattus norvegicus negative elongation factor complex member B (Nelfb), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2395734:2412431:-1 gene:ENSRNOG00000009377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC160853 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8364737. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2404664:2415264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_006224310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical gene supported by AK097565; BC033939 (LOC499746), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006233649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical gene supported by AK097565; BC033939 (LOC499746), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000013278 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:2413973:2419629:-1 gene:ENSRNOG00000010002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100078 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical gene supported by AK097565; BC033939, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132193), partial cds. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC160838 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7457369. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006224311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical gene supported by AK097565; BC033939 (LOC499746), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// XM_006233650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical gene supported by AK097565; BC033939 (LOC499746), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// BC082090 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7134045. // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT036627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2404664:2415264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT036628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_199094 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, beta 4B class IVb (Tubb4b), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2422872:2425633:-1 gene:ENSRNOG00000010170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC060597 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, beta 2c, mRNA (cDNA clone MGC:73008 IMAGE:6889737), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// BC090334 // GenBank HTC // Rattus norvegicus tubulin, beta 2c, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301482), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// FQ225007 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YH02 mRNA sequence. // chr3 // 83 // 96 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2423016:2443184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_139338 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 34 (type II sodium/phosphate contransporter), member 3 (Slc34a3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 34 (type II sodium/phosphate contransporter), member 3 (Slc34a3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 34 (type II sodium/phosphate contransporter), member 3 (Slc34a3), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000014060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2429674:2435216:-1 gene:ENSRNOG00000010451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB077042 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Na+/Pi-cotransporter type IIc, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2423016:2443184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT036630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006224312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 224 (Rnf224), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 224 (Rnf224), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000062001 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:2436854:2437324:-1 gene:ENSRNOG00000040284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2423016:2443184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_001109194 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich tail protein 1 (Cysrt1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2439578:2440668:-1 gene:ENSRNOG00000010600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2423016:2443184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001107818 // RefSeq // Rattus norvegicus NADPH dependent diflavin oxidoreductase 1 (Ndor1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2448121:2456341:-1 gene:ENSRNOG00000010616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2446567:2452537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT036634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT036635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
ENSRNOT00000014993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2471319:2471805:-1 gene:ENSRNOG00000011093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC166994 // GenBank // Rattus norvegicus Sjogren syndrome nuclear autoantigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:189140 IMAGE:7304458), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001107820 // RefSeq // Rattus norvegicus Sjogren syndrome nuclear autoantigen 1 (Ssna1), mRNA. // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2470893:2471788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT036636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_031973 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 7 (Dpp7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2550548:2554800:-1 gene:ENSRNOG00000012640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB038232 // GenBank // Rattus norvegicus DPP2 mRNA for dipeptidyl peptidase II, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB048711 // GenBank // Rattus norvegicus DPP II mRNA for dipeptidyl peptidase II, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078783 // GenBank // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 7, mRNA (cDNA clone MGC:93328 IMAGE:7110490), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2550718:2565862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT036652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT036653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001134516 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-N-acteylglucosamine pyrophosphorylase 1-like 1 (Uap1l1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2560671:2565936:-1 gene:ENSRNOG00000012960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168670 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acteylglucosamine pyrophosphorylase 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188452 IMAGE:7935165), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2550718:2565862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000039796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2569259:2570274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT036655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000058105 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:2614564:2614979:-1 gene:ENSRNOG00000038170 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2614665:2623578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
NM_001106556 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC36831 (RGD1306215), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC36831 (RGD1306215), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2660403:2661945:-1 gene:ENSRNOG00000015294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ212908 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YL15 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U30788 // GenBank // Rattus norvegicus Tclone4 mRNA. // chr3 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NONRATT036656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2660598:2693851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT036658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT036661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_013015 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin D2 synthase (brain) (Ptgds), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2667538:2670472:-1 gene:ENSRNOG00000015550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ214359 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YC13 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// J04488 // GenBank // Rat prostaglandin D synthetase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2660598:2693851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT036662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001128138 // RefSeq // Rattus norvegicus lipocalin 12 (Lcn12), mRNA. // chr3 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2697947:2700926:-1 gene:ENSRNOG00000028730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ537492 // GenBank // Rattus norvegicus lipocalin 12 (Lcn12) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT036668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2699167:2707589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT036671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001106555 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 8, gamma polypeptide (C8g), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2706037:2708861:-1 gene:ENSRNOG00000028701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ212796 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YF09 mRNA sequence. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// FQ214907 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YI22 mRNA sequence. // chr3 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2699167:2707589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001107815 // RefSeq // Rattus norvegicus Tnf receptor-associated factor 2 (Traf2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Tnf receptor-associated factor 2 (Traf2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2727488:2752033:-1 gene:ENSRNOG00000006238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC169064 // GenBank // Rattus norvegicus Tnf receptor-associated factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:189462 IMAGE:5599352), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2728020:2757727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT036681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_145768 // RefSeq // Rattus norvegicus MAM domain containing 4 (Mamdc4), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006233568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAM domain containing 4 (Mamdc4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2767936:2776522:-1 gene:ENSRNOG00000016584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L37380 // GenBank // Rat apical endosomal glycoprotein mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2768135:2776466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001106558 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphohistidine phosphatase 1 (Phpt1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2778458:2779837:-1 gene:ENSRNOG00000016723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228612 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YC06 mRNA sequence. // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2778624:2779837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// NONRATT036683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Gene model 996 (RGD1560470), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Gene model 996 (RGD1560470), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2782063:2784987:-1 gene:ENSRNOG00000033863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2780467:2786856:-1 gene:ENSRNOG00000033863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211897 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YB21 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2782063:2784987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001108573 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB, member RAS oncogene family-like 6 (Rabl6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006233629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB, member RAS oncogene family-like 6 (Rabl6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2788190:2814110:-1 gene:ENSRNOG00000016795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000039797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2788938:2826984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT036692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_001025040 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 183 (Ccdc183), mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// XM_006233635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC499754 (LOC499754), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000061874 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:2814309:2822709:-1 gene:ENSRNOG00000017044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000039797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2788938:2826984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1
NM_001109197 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 141 (Tmem141), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2825048:2827006:-1 gene:ENSRNOG00000028254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ216068 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YO13 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// FQ230264 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YL06 mRNA sequence. // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000039797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2788938:2826984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT036694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031348 // RefSeq // Rattus norvegicus ficolin (collagen/fibrinogen domain containing) 1 (Fcn1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000023022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2831420:2834620:-1 gene:ENSRNOG00000017063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB026057 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ficolin-A, complete cds. // chr3 // 90 // 88 // 27 // 30 // 0 /// BC088128 // GenBank // Rattus norvegicus ficolin (collagen/fibrinogen domain containing) 1, mRNA (cDNA clone MGC:108660 IMAGE:7376326), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ234790 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YK11 mRNA sequence. // chr3 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// GENSCAN00000039765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2831578:2834527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT036700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1
NM_001135809 // RefSeq // Rattus norvegicus lipocalin 11 (Lcn11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2916811:2920076:-1 gene:ENSRNOG00000047732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8599189:8602475:1 gene:ENSRNOG00000049038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// DQ537495 // GenBank // Rattus norvegicus lipocalin 11 (Lcn11) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8596473:8616528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2902520:2920076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipocalin 3 (Lcn3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_578100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipocalin 3 (Lcn3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061847 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:2926593:2928731:-1 gene:ENSRNOG00000040188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2926072:2928716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001106559 // RefSeq // Rattus norvegicus glycosyltransferase 6 domain containing 1 (Glt6d1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8617995:8626183:-1 gene:ENSRNOG00000027900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8618183:8626177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT036704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001191852 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1 (Sohlh1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006233688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 1 (Sohlh1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8653166:8657183:-1 gene:ENSRNOG00000033983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8653166:8657978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001168549 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin regulated spectrin-associated protein 1 (Camsap1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calmodulin regulated spectrin-associated protein 1 (Camsap1), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8736053:8796109:-1 gene:ENSRNOG00000017883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8737283:8750077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000033002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8752761:8931045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT036706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT036709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001007742 // RefSeq // Rattus norvegicus UBA domain containing 1 (Ubac1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8815483:8838290:-1 gene:ENSRNOG00000017983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083603 // GenBank // Rattus norvegicus UBA domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94349 IMAGE:7133164), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8752761:8931045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NONRATT036719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100533 // RefSeq // Rattus norvegicus NACC family member 2, BEN and BTB (POZ) domain containing (Nacc2), mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8870073:8903682:-1 gene:ENSRNOG00000018231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// FQ210633 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA25YF12 mRNA sequence. // chr3 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT036719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8752761:8931045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT036720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENSRNOT00000025047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9016548:9023603:-1 gene:ENSRNOG00000018427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9016548:9021799:-1 gene:ENSRNOG00000018427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9016548:9053713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001109434 // RefSeq // Rattus norvegicus quiescin Q6 sulfhydryl oxidase 2 (Qsox2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000061735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9024117:9053765:-1 gene:ENSRNOG00000018574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9016548:9053713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006224316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin-17-like (LOC102551235), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin-17-like (LOC102551235), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036231 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:9061619:9061993:-1 gene:ENSRNOG00000027393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9061619:9112785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134617 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4932418E24 (RGD1565512), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006233694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4932418E24 (RGD1565512), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9086793:9109576:-1 gene:ENSRNOG00000027392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9061619:9112785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001130990 // RefSeq // Rattus norvegicus DNL-type zinc finger (Dnlz), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NR_024073 // RefSeq // Rattus norvegicus DNL-type zinc finger (Dnlz), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000025386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9157628:9159374:-1 gene:ENSRNOG00000018791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ232660 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YO02 mRNA sequence. // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9157750:9159445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT036732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_022303 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase recruitment domain family, member 9 (Card9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caspase recruitment domain family, member 9 (Card9), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9159494:9167941:-1 gene:ENSRNOG00000018794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF311288 // GenBank // Rattus norvegicus caspase recruitment domain protein 9 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9159622:9185512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_003749426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 4 (Snapc4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000061682 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:9170635:9185512:-1 gene:ENSRNOG00000018845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000068110 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:9170635:9185512:-1 gene:ENSRNOG00000018845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000049768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9159622:9185512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT036739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT036740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 69 // 31 // 31 // 0
NM_053632 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase E (Inpp5e), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000025764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9204538:9216619:-1 gene:ENSRNOG00000019039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9205340:9247798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT036758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT036759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001276417 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC16 homolog A (S. cerevisiae) (Sec16a), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9218903:9248509:-1 gene:ENSRNOG00000019122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9205340:9247798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT036762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT036761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001105721 // RefSeq // Rattus norvegicus notch 1 (Notch1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000026212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9266672:9311575:-1 gene:ENSRNOG00000019322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000049776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9268248:9295070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
NM_001107821 // RefSeq // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2 (Agpat2), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006233687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 2 (Agpat2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9404482:9415283:-1 gene:ENSRNOG00000019466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9404989:9415267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NONRATT036778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT036779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT036780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_053574 // RefSeq // Rattus norvegicus von Ebners gland protein 2 (Vegp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006233711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Ebners gland protein 2 (Vegp2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000041399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9496155:9580034:-1 gene:ENSRNOG00000033020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT036781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT036782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000042191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9547242:9579981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
ENSRNOT00000006466 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:10396372:10397941:-1 gene:ENSRNOG00000004880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10396366:10397965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001013426 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L41 (Mrpl41), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003750552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 39S ribosomal protein L41, mitochondrial-like (RGD1560917), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_003754443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 39S ribosomal protein L41, mitochondrial-like (RGD1560917), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043351 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:91338436:91338840:1 gene:ENSRNOG00000034128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000044802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2162293:2163210:-1 gene:ENSRNOG00000029875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091293 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L41, mRNA (cDNA clone MGC:109209 IMAGE:7307323), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2162423:2162827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:91338436:91338840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// NONRATT036620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_001061529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Vomeronasal secretory protein 2 precursor (Vomeronasal secretory protein II) (VNSP II) (Lipocalin-4) (LOC681385), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_003753688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Vomeronasal secretory protein 2 precursor (Vomeronasal secretory protein II) (VNSP II) (Lipocalin-4) (LOC681385), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067576 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:10629695:10633078:-1 gene:ENSRNOG00000043494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10583673:10650830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
ENSRNOT00000044775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9729919:9749616:-1 gene:ENSRNOG00000046958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// AB081652 // GenBank // Rattus norvegicus ratABO3.47 mRNA for histo-blood group ABO transferase, complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// NM_001160263 // RefSeq // Rattus norvegicus ABO blood group (transferase A, alpha 1-3-N-acetylgalactosaminyltransferase; transferase B, alpha 1-3-galactosyltransferase) (Abo), mRNA. // chr3 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// AY228143 // GenBank // Rattus norvegicus B blood group galactosyltransferase (Abo2) mRNA, complete cds. // chr3 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// NONRATT036783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001015014 // RefSeq // Rattus norvegicus surfeit 6 (Surf6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006233784 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus surfeit 6 (Surf6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000006699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10803319:10814066:-1 gene:ENSRNOG00000005031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC091270 // GenBank // Rattus norvegicus surfeit 6, mRNA (cDNA clone MGC:109125 IMAGE:7381547), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT036788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001077679 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 22 (Med22), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003749430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22-like (LOC100911917), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10216950:10222030:-1 gene:ENSRNOG00000005059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10816125:10820477:-1 gene:ENSRNOG00000049749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC127519 // GenBank // Rattus norvegicus mediator complex subunit 22, mRNA (cDNA clone MGC:156735 IMAGE:7104131), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10804238:10820477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10191137:10221837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_172068 // RefSeq // Rattus norvegicus surfeit 1 (Surf1), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006233725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912008 (LOC100912008), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233863 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus surfeit 1 (Surf1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10823677:10845267:-1 gene:ENSRNOG00000047059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10224992:10238099:-1 gene:ENSRNOG00000005247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF182952 // GenBank // Rattus norvegicus Surfeit 1 (Surf1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10823677:10843053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10225037:10238547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY325150 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-205 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_001033868 // RefSeq // Rattus norvegicus surfeit 4 (Surf4), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10832018:10845267:-1 gene:ENSRNOG00000047585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000071754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10233378:10238099:-1 gene:ENSRNOG00000005247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000006855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10823677:10845267:-1 gene:ENSRNOG00000047059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000061242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10224992:10238099:-1 gene:ENSRNOG00000005247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT036789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10823677:10843053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000018989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10225037:10238547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// AY325150 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-205 mRNA, complete cds. // chr3 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
ENSRNOT00000006855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10823677:10845267:-1 gene:ENSRNOG00000047059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10224992:10238099:-1 gene:ENSRNOG00000005247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10823677:10843053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10225037:10238547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325150 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-205 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000006855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10823677:10845267:-1 gene:ENSRNOG00000047059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000007573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10832018:10845267:-1 gene:ENSRNOG00000047585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AY325150 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-205 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001033884 // RefSeq // Rattus norvegicus REX4, RNA exonuclease 4 homolog (S. cerevisiae) (Rexo4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000042289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10862784:10873113:-1 gene:ENSRNOG00000027867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161820 // GenBank // Rattus norvegicus REX4, RNA exonuclease 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187273 IMAGE:9088929), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10863836:10873036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106562 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 6 (Slc2a6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10930061:10936876:-1 gene:ENSRNOG00000005900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10930585:10979523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT036794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001134517 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 8C (Tmem8c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10970626:10979608:-1 gene:ENSRNOG00000006142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10930585:10979523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109458 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 163, member B (Fam163b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 163, member B (Fam163b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11020099:11054772:-1 gene:ENSRNOG00000006591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11018519:11031352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 48 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT036797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053664 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcosine dehydrogenase (Sardh), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11101704:11162650:-1 gene:ENSRNOG00000006916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AF067650 // GenBank // Rattus norvegicus sarcosine dehydrogenase (SarDH) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// FQ218777 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA4YC03 mRNA sequence. // chr3 // 91 // 89 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11101877:11110827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000005320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11117461:11375054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
NM_001106563 // RefSeq // Rattus norvegicus vav 2 guanine nucleotide exchange factor (Vav2), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11173752:11337325:-1 gene:ENSRNOG00000007422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11117461:11375054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108575 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain containing 3 (Brd3), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11358266:11378548:-1 gene:ENSRNOG00000007681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC168949 // GenBank // Rattus norvegicus bromodomain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:189256 IMAGE:7112751), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11117461:11375054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT036807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT036809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT036810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT036804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_053634 // RefSeq // Rattus norvegicus ficolin B (Fcnb), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000012494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11974639:11983071:-1 gene:ENSRNOG00000009342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB036792 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ficolin-B, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC088123 // GenBank // Rattus norvegicus ficolin B, mRNA (cDNA clone MGC:108632 IMAGE:7376834), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ234176 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YO11 mRNA sequence. // chr3 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000036052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11970233:11983042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT036812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001106564 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC29761 (RGD1306233), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12398276:12402626:-1 gene:ENSRNOG00000010152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12398675:12402558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT036814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_016997 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxyl ester lipase (Cel), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12485038:12492645:-1 gene:ENSRNOG00000010406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M15893 // GenBank // Rat pancreatic lysophospholipase mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// X16054 // GenBank // Rat mRNA for cholesterol esterase (EC 3.1.1.13). // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12485240:12492624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001079941 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 5 (Gtf3c5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12495485:12515790:-1 gene:ENSRNOG00000010981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC129109 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:156738 IMAGE:7105121), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12496870:12515543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT036817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107823 // RefSeq // Rattus norvegicus growth factor independent 1B transcription repressor (Gfi1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth factor independent 1B transcription repressor (Gfi1b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth factor independent 1B transcription repressor (Gfi1b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth factor independent 1B transcription repressor (Gfi1b), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth factor independent 1B transcription repressor (Gfi1b), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12540995:12553692:-1 gene:ENSRNOG00000011353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158685 // GenBank // Rattus norvegicus growth factor independent 1B transcription repressor, mRNA (cDNA clone MGC:187699 IMAGE:8374780), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12541214:12547007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181694 // RefSeq // Rattus norvegicus Rsb-66 protein (Rsb66), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rsb-66 protein (Rsb66), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rsb-66 protein (Rsb66), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rsb-66 protein (Rsb66), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rsb-66 protein (Rsb66), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rsb-66 protein (Rsb66), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12620543:12629448:-1 gene:ENSRNOG00000012697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY121839 // GenBank HTC // Rattus norvegicus RSB-66 mRNA, complete cds. // chr3 // 77 // 76 // 17 // 22 // 0 /// BC097268 // GenBank // Rattus norvegicus Rsb-66 protein, mRNA (cDNA clone MGC:114240 IMAGE:7457912), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12618831:12632046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT036825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001109473 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 4 (Gtf3c4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006233871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 4 (Gtf3c4), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006233872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 4 (Gtf3c4), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12755272:12773005:-1 gene:ENSRNOG00000012784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12712255:12772891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_057109 // RefSeq // Rattus norvegicus BarH-like homeobox 1 (Barhl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12841460:12848781:-1 gene:ENSRNOG00000013209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB043981 // GenBank // Rattus norvegicus mbh2 mRNA for Bar-class homeodomain protein MBH2, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12842108:12865879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT036829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003749443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909960 (LOC100909960), partial mRNA. // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000049889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12858726:12980874:-1 gene:ENSRNOG00000028805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC166521 // GenBank // Rattus norvegicus similar to FLJ46082 protein, mRNA (cDNA clone MGC:188104 IMAGE:7133997), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073625 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:16247818:16276343:-1 gene:ENSRNOG00000047642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT036830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16248146:16342332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12885876:12942967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001107825 // RefSeq // Rattus norvegicus netrin G2 (Ntng2), mRNA. // chr3 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// XM_006233800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus netrin G2 (Ntng2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// XM_006233802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus netrin G2 (Ntng2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000045919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13091083:13144474:-1 gene:ENSRNOG00000013694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// XM_006233803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus netrin G2 (Ntng2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XR_352195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus netrin G2 (Ntng2), transcript variant X6, misc_RNA. // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000013787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13091328:13136205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT036834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NR_031933 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-219-2 (Mir219-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-219a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000960 Rattus norvegicus miR-219a-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005542 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 34 (Wdr34), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13950972:13966415:-1 gene:ENSRNOG00000015636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC082103 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 34, mRNA (cDNA clone MGC:95297 IMAGE:7134619), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13951059:13966459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT036841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT036842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT036844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001013239 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 12 (Zdhhc12), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14008557:14011260:-1 gene:ENSRNOG00000015791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AY886528 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC12 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC076393 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:94803 IMAGE:7107692), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000048582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14008855:14037824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT036847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001100707 // RefSeq // Rattus norvegicus zyg-11 related, cell cycle regulator (Zer1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14014737:14042463:-1 gene:ENSRNOG00000025832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14008855:14037824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT036849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
XM_006233839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to LOC495800 protein (LOC499770), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// XM_006233840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to LOC495800 protein (LOC499770), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000030623 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:14096394:14101124:-1 gene:ENSRNOG00000025711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// BC098818 // GenBank // Rattus norvegicus similar to LOC495800 protein, mRNA (cDNA clone MGC:112863 IMAGE:7377299), complete cds. // chr3 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT036852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14097828:14128795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT036854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT036853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT036856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001013164 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine conjugate-beta lyase, cytoplasmic (Ccbl1), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine conjugate-beta lyase, cytoplasmic (Ccbl1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14104787:14118929:-1 gene:ENSRNOG00000016097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// FQ224906 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YJ03 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 65 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT036857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14097828:14128795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT036860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001107826 // RefSeq // Rattus norvegicus dolichol kinase (Dolk), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14203272:14204882:-1 gene:ENSRNOG00000016989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14203272:14204882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009692 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like endophilin B2 (Sh3glb2), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006233816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like endophilin B2 (Sh3glb2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023527 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:14262005:14276806:-1 gene:ENSRNOG00000017295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC087652 // GenBank // Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like endophilin B2, mRNA (cDNA clone MGC:105723 IMAGE:7312960), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000048605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14262513:14276752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// NONRATT036867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// NONRATT036868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT036863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT036865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT036870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
XM_001066392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L38-like (LOC686066), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_003753692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L38-like (LOC686066), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000040570 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:14308103:14308312:-1 gene:ENSRNOG00000031434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14308103:14308309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001004085 // RefSeq // Rattus norvegicus carnitine O-acetyltransferase (Crat), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carnitine O-acetyltransferase (Crat), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14320765:14334358:-1 gene:ENSRNOG00000018145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083616 // GenBank // Rattus norvegicus carnitine acetyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:94385 IMAGE:7133847), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ230824 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA88YD08 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14321390:14332555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT036875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001025041 // RefSeq // Rattus norvegicus immediate early response 5-like (Ier5l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14389636:14390865:-1 gene:ENSRNOG00000024846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC087095 // GenBank // Rattus norvegicus immediate early response 5-like, mRNA (cDNA clone MGC:94639 IMAGE:7191438), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14389636:14446202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT036879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145783 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit Va (Cox5a), mRNA. // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:62075284:62087001:1 gene:ENSRNOG00000018816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// FQ211124 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA17YB04 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// FQ220977 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YA08 mRNA sequence. // chr3 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033253 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:14460819:14461259:-1 gene:ENSRNOG00000022490 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:62075356:62086235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14460819:14461259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT053361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT053362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 77 // 85 // 17 // 22 // 0
ENSRNOT00000024953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14989206:14995422:-1 gene:ENSRNOG00000018486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC127535 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 1700113K14Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:156805 IMAGE:7133909), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14980493:14995286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT036886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001011963 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 6 (Asb6), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15019073:15023681:-1 gene:ENSRNOG00000024786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC079099 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:94078 IMAGE:7124433), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15019821:15023601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT036890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_021583 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin E synthase (Ptges), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15086726:15098072:-1 gene:ENSRNOG00000006320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB035145 // GenBank // Rattus norvegicus PIG12 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AB041998 // GenBank // Rattus norvegicus PGES mRNA for prostaglandin E synthase, complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AB048730 // GenBank // Rattus norvegicus iPGES mRNA for inducible prostaglandin E synthase, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF280967 // GenBank // Rattus norvegicus PGE synthase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC105858 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin E synthase, mRNA (cDNA clone MGC:124930 IMAGE:7456259), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15087478:15098030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_153303 // RefSeq // Rattus norvegicus torsin family 1, member A (Tor1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15158995:15165990:-1 gene:ENSRNOG00000006894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY054303 // GenBank // Rattus norvegicus torsinA mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC078714 // GenBank // Rattus norvegicus dystonia 1, mRNA (cDNA clone MGC:93134 IMAGE:7134604), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15159330:15164074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000024203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15165121:15165952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT036893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001025003 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC11690 (RGD1305178), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15172593:15180859:-1 gene:ENSRNOG00000007532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15172962:15187246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NONRATT036898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT036902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1
GENSCAN00000054667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15934100:15959466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_198200 // RefSeq // Rattus norvegicus pyroglutamylated RFamide peptide (Qrfp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14763635:14764009:1 gene:ENSRNOG00000050781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15395829:15396203:1 gene:ENSRNOG00000046473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB109627 // GenBank // Rattus norvegicus QRFP mRNA for preproQRFP, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY438327 // GenBank // Rattus norvegicus 26RFa precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15350450:15396747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14718254:14764553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001107829 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrinogen C domain containing 1 (Fibcd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15357857:15391567:1 gene:ENSRNOG00000009735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073999 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:14725848:14756245:1 gene:ENSRNOG00000050844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15350450:15396747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14718254:14764553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
XM_001079857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 78, member A (Fam78a), mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_575110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 78, member A (Fam78a), mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000035580 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:16441002:16454539:-1 gene:ENSRNOG00000023352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT036929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16441002:16459485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001107831 // RefSeq // Rattus norvegicus uridine-cytidine kinase 1 (Uck1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_352226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uridine-cytidine kinase 1 (Uck1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16620744:16626627:-1 gene:ENSRNOG00000011467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168897 // GenBank // Rattus norvegicus uridine-cytidine kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189164 IMAGE:8362491), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16621754:16626538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT036932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT036933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001246661 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI5 recombination repair homolog (yeast) (Swi5), mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// XM_006233989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI5 recombination repair homolog (yeast) (Swi5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000030558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16656851:16665969:-1 gene:ENSRNOG00000022860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// BC082799 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2900010J23, mRNA (cDNA clone MGC:105672 IMAGE:7304460), complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// FQ221000 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YN13 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// XM_006233990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI5 recombination repair homolog (yeast) (Swi5), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// NONRATT036937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT036938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_080689 // RefSeq // Rattus norvegicus dynamin 1 (Dnm1), mRNA. // chr3 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000042762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16686951:16730913:-1 gene:ENSRNOG00000033835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000047921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16690443:16730913:-1 gene:ENSRNOG00000033835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000064039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16686951:16730913:-1 gene:ENSRNOG00000033835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000068349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16686951:16730913:-1 gene:ENSRNOG00000033835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000056477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16688053:16730874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT036939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT036942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT036940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1 /// NONRATT036943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
XM_003753697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF0184 protein C9orf16 homolog (RGD1561113), mRNA. // chr3 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000034930 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:16756950:16759602:-1 gene:ENSRNOG00000022681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC166564 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:188191 IMAGE:7316514. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16757218:16766359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_130741 // RefSeq // Rattus norvegicus lipocalin 2 (Lcn2), mRNA. // chr3 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16763059:16766466:-1 gene:ENSRNOG00000013973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC089053 // GenBank // Rattus norvegicus lipocalin 2, mRNA (cDNA clone MGC:105339 IMAGE:7310185), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT036950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16757218:16766359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT036951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001146125 // RefSeq // Rattus norvegicus folylpolyglutamate synthase (Fpgs), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070916 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:17058730:17068931:-1 gene:ENSRNOG00000050780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007743 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 9 (Cdk9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17081165:17086012:-1 gene:ENSRNOG00000022586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082037 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 9, mRNA (cDNA clone MGC:95175 IMAGE:7130973), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17081676:17086325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT036958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT036957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
XM_003749453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 16 (LOC100362059), mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// XM_003753709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 16 (LOC100362059), mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17136781:17157497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT036959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSRNOT00000020660 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:17150546:17157519:-1 gene:ENSRNOG00000039315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC098043 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG17122-PA, mRNA (cDNA clone IMAGE:7457026), partial cds. // chr3 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17136781:17157497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT036960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT036961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_013038 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin binding protein 1 (Stxbp1), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000021178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17160754:17221831:-1 gene:ENSRNOG00000015420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000021189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17167016:17221831:-1 gene:ENSRNOG00000015420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// BC088850 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105262 IMAGE:7315868), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// L26264 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin-binding protein (n-sec1) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// U06069 // GenBank // Rattus norvegicus Sec1 homolog mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// U21116 // GenBank // Rattus norvegicus rbSec1B mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17162363:17238826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0 /// L26087 // GenBank // Rat Munc18-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT036962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT036964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_001107833 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and sterile alpha motif containing 1 (Lrsam1), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17306364:17344203:-1 gene:ENSRNOG00000022312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17308776:17344203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_053494 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2, (facilitated glucose transporter) member 8 (Slc2a8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17356862:17366510:-1 gene:ENSRNOG00000022274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17357483:17366481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB033418 // GenBank // Rattus norvegicus glut8 mRNA for glucose transporter 8, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT036974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT036978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006224386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTPase activating Rap/RanGAP domain-like 3 (Garnl3), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTPase activating Rap/RanGAP domain-like 3 (Garnl3), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032078 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:17370765:17488893:-1 gene:ENSRNOG00000022237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032897 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:17370765:17488770:-1 gene:ENSRNOG00000022237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17371046:17449978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// FQ211851 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA78YD24 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// FQ211906 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YP05 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT036979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_006224356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1 (Ralgps1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006234015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1 (Ralgps1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006234017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1 (Ralgps1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022755 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:17517035:17713947:-1 gene:ENSRNOG00000016910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000045724 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:17517035:17713947:-1 gene:ENSRNOG00000016910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065544 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:17517035:17713947:-1 gene:ENSRNOG00000016910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066922 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:17640073:17713947:-1 gene:ENSRNOG00000016910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000055843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17513173:17559815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
XM_001069858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 34 (Zbtb34), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_006224362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 34 (Zbtb34), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_006224363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 34 (Zbtb34), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051893 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:17785513:17800154:-1 gene:ENSRNOG00000032700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000055842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17785513:17787015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001012094 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 43 (Zbtb43), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17825499:17834966:-1 gene:ENSRNOG00000017017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC087042 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 43, mRNA (cDNA clone MGC:93727 IMAGE:7107163), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17825499:17875498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT036987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000022953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17940911:17945905:-1 gene:ENSRNOG00000017019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17940911:17949447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:18017103:18024662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001271232 // RefSeq // Rattus norvegicus multivesicular body subunit 12B (Mvb12b), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:18111129:18274624:-1 gene:ENSRNOG00000017172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:18111129:18275223:-1 gene:ENSRNOG00000017172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FQ212046 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YK12 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:18206106:18296663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT036992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001107834 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox 3 (Pbx3), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006233975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox 3 (Pbx3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000029600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:18569629:18763387:-1 gene:ENSRNOG00000022162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:18570597:18616702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT036996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006224367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTPase activating protein and VPS9 domains 1 (Gapvd1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTPase activating protein and VPS9 domains 1 (Gapvd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024599 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:19073588:19123578:-1 gene:ENSRNOG00000017925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066961 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:19073588:19123578:-1 gene:ENSRNOG00000017925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19025242:19148313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT036998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001024871 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab9 effector protein with kelch motifs (Rabepk), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rab9 effector protein with kelch motifs (Rabepk), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006233956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rab9 effector protein with kelch motifs (Rabepk), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006233962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rab9 effector protein with kelch motifs (Rabepk), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19164931:19185412:-1 gene:ENSRNOG00000018591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097415 // GenBank // Rattus norvegicus Rab9 effector protein with kelch motifs, mRNA (cDNA clone MGC:114460 IMAGE:7454340), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19164954:19181463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT037007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT037010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001107835 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 2 (Fbxw2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 2 (Fbxw2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 2 (Fbxw2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19191086:19216407:-1 gene:ENSRNOG00000018687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166990 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:189122 IMAGE:7110795), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19191460:19211394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT037015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001106569 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 5 (Psmd5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19235769:19253052:-1 gene:ENSRNOG00000018809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166850 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 5, mRNA (cDNA clone MGC:188748 IMAGE:9088649), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19236272:19253029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001106570 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 19 (Phf19), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19276705:19297793:-1 gene:ENSRNOG00000018874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19278385:19382331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_003749455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus complement component 5 (C5), mRNA. // chr3 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000025534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19370345:19547584:-1 gene:ENSRNOG00000018899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000047946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19386888:19466649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 49 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT037027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1
XM_006224373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Complement C5 precursor (RGD1308742), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035829 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:19594785:19609836:-1 gene:ENSRNOG00000022033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19523379:19610422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT037034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_053589 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB14, member RAS oncogene family (Rab14), mRNA. // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_006234050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB14, member RAS oncogene family (Rab14), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19693766:19704635:-1 gene:ENSRNOG00000018901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158585 // GenBank // Rattus norvegicus RAB14, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:187348 IMAGE:7446356), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M83680 // GenBank // Sprague-Dawley (clone LRB13) RAB14 mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT037035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19692411:19704040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT037036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001011965 // RefSeq // Rattus norvegicus stomatin (Stom), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19833117:19855740:-1 gene:ENSRNOG00000019147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC083895 // GenBank // Rattus norvegicus stomatin, mRNA (cDNA clone MGC:95236 IMAGE:7132959), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19833991:19874077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
GENSCAN00000015908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19833991:19874077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000015908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19833991:19874077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001037583 // RefSeq // Rattus norvegicus ABO-family member 5 (Ggta1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ABO-family member 5 (Ggta1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ABO-family member 5 (Ggta1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000060013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19873574:19888633:-1 gene:ENSRNOG00000042373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY524048 // GenBank // Rattus norvegicus ABO-family member 5 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT037038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 1
XM_006234042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ABO-family member 6 (LOC502618), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ABO-family member 6 (LOC502618), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060011 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:19905760:19917524:-1 gene:ENSRNOG00000039210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY524049 // GenBank // Rattus norvegicus ABO-family member 6 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19905394:19971446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145674 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1,3 (Ggta1p), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1,3 (Ggta1p), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19925448:19957495:-1 gene:ENSRNOG00000019179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AF488784 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-1,3-galactosyltransferase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// AF520589 // GenBank // Rattus norvegicus alpha1,3 galactosyltransferase (alpha3GalT) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC166599 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:188373 IMAGE:7932138), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// FQ222249 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA26YG04 mRNA sequence. // chr3 // 87 // 83 // 26 // 30 // 0 /// NONRATT037040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT037041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000015909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19905394:19971446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
ENSRNOT00000032204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20395616:20588216:-1 gene:ENSRNOG00000019339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC169049 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:189441 IMAGE:7374372), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20525934:20621494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT037046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
GENSCAN00000043203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20525934:20621494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT037048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 85 // 74 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20525934:20621494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001047862 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 8 (Ndufa8), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20672277:20685979:-1 gene:ENSRNOG00000005668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ226210 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YP14 mRNA sequence. // chr3 // 89 // 64 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20672278:20685774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001107837 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM homeobox 6 (Lhx6), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM homeobox 6 (Lhx6), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000008817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20721151:20742464:-1 gene:ENSRNOG00000005996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20721092:20742843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT037054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107838 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 18 (Rbm18), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20753255:20773093:-1 gene:ENSRNOG00000006763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168896 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 18, mRNA (cDNA clone MGC:189160 IMAGE:7103021), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20755004:20773909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT037058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001000385 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 411 (Olr411), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000010360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26094430:26095371:-1 gene:ENSRNOG00000007911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26094430:26095272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_020106 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 414 (Olr414), mRNA. // chr3 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000052047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26123987:26124928:-1 gene:ENSRNOG00000033799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26123987:26124922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001000387 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 416 (Olr416), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26155331:26156266:-1 gene:ENSRNOG00000029069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26155331:26156266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000825 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 418 (Olr418), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26227291:26228223:-1 gene:ENSRNOG00000029787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001000824 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 421 (Olr421), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000051973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26272600:26273592:-1 gene:ENSRNOG00000032321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26228593:26273526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT037066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001000390 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 422 (Olr422), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26305762:26306715:-1 gene:ENSRNOG00000032102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26305762:26306649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000392 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 424 (Olr424), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26376145:26377137:-1 gene:ENSRNOG00000007977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26376145:26394338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000393 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 425 (Olr425), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26393589:26394542:-1 gene:ENSRNOG00000007986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26376145:26394338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT037069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XR_352252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosducin-like protein-like (LOC690155), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26841046:26849027:-1 gene:ENSRNOG00000008484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// NM_022247 // RefSeq // Rattus norvegicus phosducin-like (Pdcl), mRNA. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// BC097322 // GenBank // Rattus norvegicus phosducin-like, mRNA (cDNA clone MGC:114325 IMAGE:7453703), complete cds. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// FQ223348 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YG05 mRNA sequence. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// L15354 // GenBank // Rattus norvegicus phosducin-like protein (PhLP) mRNA, complete cds. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// L15355 // GenBank // Rattus norvegicus phosducin-like protein (PhLP) mRNA, complete cds. // chr3 // 63 // 73 // 12 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26615205:26681738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26842841:26848875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONRATT037071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONRATT037072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0
NM_022247 // RefSeq // Rattus norvegicus phosducin-like (Pdcl), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000012160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26841046:26849027:-1 gene:ENSRNOG00000008484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC097322 // GenBank // Rattus norvegicus phosducin-like, mRNA (cDNA clone MGC:114325 IMAGE:7453703), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ223348 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YG05 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// L15354 // GenBank // Rattus norvegicus phosducin-like protein (PhLP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// L15355 // GenBank // Rattus norvegicus phosducin-like protein (PhLP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26842841:26848875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001107839 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger and CCCH-type domains 2 (Rc3h2), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006234080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger and CCCH-type domains 2 (Rc3h2), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000012354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26866072:26909177:-1 gene:ENSRNOG00000009196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000002345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26866247:26909102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT037074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT037076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 15 // 41 // 1
NM_001108953 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 6 (Zbtb6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 6 (Zbtb6), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26919902:26923316:-1 gene:ENSRNOG00000009340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26920959:26946161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107840 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 26 (Zbtb26), mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// XM_006234083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 26 (Zbtb26), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000012433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26927108:26937120:-1 gene:ENSRNOG00000009346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT037079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26920959:26946161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NONRATT037079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_053416 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatid perinuclear RNA binding protein (Strbp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006234107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatid perinuclear RNA binding protein (Strbp), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatid perinuclear RNA binding protein (Strbp), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatid perinuclear RNA binding protein (Strbp), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatid perinuclear RNA binding protein (Strbp), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000066377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:27069384:27141888:-1 gene:ENSRNOG00000010150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC078774 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7110641. // chr3 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// AF226864 // GenBank // Rattus norvegicus double-stranded RNA-binding protein p74 mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// NONRATT037082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:27070262:27141720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT037081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT037083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001191747 // RefSeq // Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 1A (Dennd1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000025443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:27296835:27729383:-1 gene:ENSRNOG00000010526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT037086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:27341544:27394805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// NONRATT037088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_053532 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 7 (Psmb7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28115650:28176238:-1 gene:ENSRNOG00000011732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF285103 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome z subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060551 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 7, mRNA (cDNA clone MGC:72743 IMAGE:6922407), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ219830 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YC21 mRNA sequence. // chr3 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0 /// FQ216582 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YA07 mRNA sequence. // chr3 // 62 // 81 // 13 // 21 // 0 /// FQ227379 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YI23 mRNA sequence. // chr3 // 67 // 81 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28115780:28176238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001191099 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 1 (Nr5a1), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 1 (Nr5a1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28224143:28244968:-1 gene:ENSRNOG00000012682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 1 (Nr5a1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28224792:28241524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000018751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28258302:28290763:-1 gene:ENSRNOG00000013232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28258302:28400493:-1 gene:ENSRNOG00000013232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28258302:28400493:-1 gene:ENSRNOG00000013232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000017079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28258302:28290426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT037096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_212511 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L35 (Rpl35), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28516640:28519600:-1 gene:ENSRNOG00000014272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058499 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L35, mRNA (cDNA clone MGC:72958 IMAGE:6919623), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217126 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YM01 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28516675:28523693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038984 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:11298261:11298632:1 gene:ENSRNOG00000050692 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 50 // 69 // 9 // 18 // 0 /// NONRATT026470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 92 // 9 // 24 // 0
NM_001107842 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin A1 (Golga1), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006234097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgin A1 (Golga1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28531144:28575251:-1 gene:ENSRNOG00000014493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28533474:28573398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006224406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of cancer cell invasion (Scai), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of cancer cell invasion (Scai), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039410 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:28584731:28695956:-1 gene:ENSRNOG00000025278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000074848 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:28608318:28695956:-1 gene:ENSRNOG00000025278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28584731:28700839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_133589 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 6, catalytic subunit (Ppp6c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28702128:28732821:-1 gene:ENSRNOG00000015145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078747 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 6, catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93213 IMAGE:7131278), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28702950:28758625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSRNOT00000021237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28983200:28990246:-1 gene:ENSRNOG00000015854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28983200:28990246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040023 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:30416992:30427957:-1 gene:ENSRNOG00000039050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30416992:30456200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000044209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:30668625:31634018:-1 gene:ENSRNOG00000030243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:30668625:31634018:-1 gene:ENSRNOG00000030243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:30470483:30849555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000044209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:30668625:31634018:-1 gene:ENSRNOG00000030243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000048194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:31123183:31230252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:31248310:31427164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
ENSRNOT00000040405 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:31114221:31115246:-1 gene:ENSRNOG00000030929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT037112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000044209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:30668625:31634018:-1 gene:ENSRNOG00000030243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:31493721:31874775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:31493721:31874775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107843 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 1B (Lrp1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068271 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:32197410:32550909:-1 gene:ENSRNOG00000043117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:32197410:32227168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001024274 // RefSeq // Rattus norvegicus glycosyltransferase-like domain containing 1 (Gtdc1), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:34615976:34911411:-1 gene:ENSRNOG00000031038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY281367 // GenBank // Rattus norvegicus glycosyltransferase-like protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
KC773874 // GenBank // Rattus norvegicus Zeb2 mRNA, 3 UTR. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059678 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:35062657:35063057:-1 gene:ENSRNOG00000039025 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033701 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger E-box binding homeobox 2 (Zeb2), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:35063909:35185403:-1 gene:ENSRNOG00000004677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:35063909:35094524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000037001 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:36100847:36101140:-1 gene:ENSRNOG00000021999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:36061430:36101122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
GENSCAN00000039405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:38026993:38135086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199092 // RefSeq // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 4 (Orc4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:38201916:38240567:-1 gene:ENSRNOG00000005021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060516 // GenBank // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 4-like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:72574 IMAGE:5598062), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ213311 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YJ03 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ230805 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YA02 mRNA sequence. // chr3 // 78 // 64 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:38202138:38223833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT037128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT037130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_207607 // RefSeq // Rattus norvegicus NS5A (hepatitis C virus) transactivated protein 4 (Ns5atp4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000031887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:40659571:40660326:-1 gene:ENSRNOG00000027533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AY533136 // GenBank // Rattus norvegicus NS5ATP4 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:40659571:40665824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT037133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006224412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid-binding protein, epidermal-like (LOC102555146), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006234162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid-binding protein, epidermal-like (LOC102555146), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000075631 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:40775538:40775846:-1 gene:ENSRNOG00000048601 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000017143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:40743524:40775846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0
NM_001004280 // RefSeq // Rattus norvegicus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblD type, with homocystinuria (Mmadhc), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:40897290:40915185:-1 gene:ENSRNOG00000004740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078953 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2010311D03, mRNA (cDNA clone MGC:93805 IMAGE:7110154), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ216405 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YC02 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:40897600:40934339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT037138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT037134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT037139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT037140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001007641 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho family GTPase 3 (Rnd3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:41756399:41774581:-1 gene:ENSRNOG00000004624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY461427 // GenBank // Rattus norvegicus RHOE mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168142 // GenBank // Rattus norvegicus Rho family GTPase 3, mRNA (cDNA clone MGC:187290 IMAGE:9100645), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:41728141:41774354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_006234167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 43 (Rbm43), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 94 // 75 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:42539334:42549835:-1 gene:ENSRNOG00000004673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NM_001037649 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 43 (Rbm43), mRNA. // chr3 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0 /// BC107648 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:124672 IMAGE:7930358), complete cds. // chr3 // 67 // 100 // 16 // 24 // 0 /// NONRATT037142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:42512647:42597498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// NONRATT037143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001034148 // RefSeq // Rattus norvegicus N-myc (and STAT) interactor (Nmi), mRNA. // chr3 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000030373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:42562212:42584322:-1 gene:ENSRNOG00000027502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// BC100089 // GenBank // Rattus norvegicus N-myc (and STAT) interactor, mRNA (cDNA clone MGC:112791 IMAGE:7371417), complete cds. // chr3 // 98 // 100 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000026636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:42512647:42597498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT037145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT037146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
ENSRNOT00000059461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:42756012:42835971:-1 gene:ENSRNOG00000006783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 67 // 67 // 0 /// FQ224466 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA65YC18 mRNA sequence. // chr3 // 89 // 6 // 8 // 9 // 0 /// FQ215427 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YE14 mRNA sequence. // chr3 // 5 // 5 // 8 // 152 // 1 /// GENSCAN00000026639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:42756616:42936041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 130 // 130 // 0 /// GENSCAN00000029636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:42939673:42975410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 5 // 5 // 8 // 152 // 1 /// NONRATT037148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 8 // 8 // 12 // 152 // 1 /// NONRATT037149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 5 // 5 // 8 // 152 // 1 /// NONRATT037150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 6 // 6 // 9 // 152 // 1 /// NONRATT037152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 5 // 5 // 8 // 152 // 1 /// NONRATT037155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 9 // 9 // 14 // 152 // 1
ENSRNOT00000008925 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:42975030:42975468:-1 gene:ENSRNOG00000006829 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:42939673:42975410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_053979 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 5A (Arl5a), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43024477:43046967:-1 gene:ENSRNOG00000006839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097294 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 5A, mRNA (cDNA clone MGC:114279 IMAGE:7458249), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// X78604 // GenBank // R.norvegicus (Sprague Dawley) ARL5 mRNA for ARF-like protein 5. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43020972:43039599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001105733 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, beta 4 subunit (Cacnb4), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43054753:43191213:-1 gene:ENSRNOG00000007666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// L02315 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA sequence, complete 5 and 3 UTRs. // chr3 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT037166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43056820:43113345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001012085 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 2 (Stam2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43331361:43378116:-1 gene:ENSRNOG00000027447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083912 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 2, mRNA (cDNA clone MGC:95283 IMAGE:7134287), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43329876:43357829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106480 // RefSeq // Rattus norvegicus PRP40 pre-mRNA processing factor 40 homolog A (S. cerevisiae) (Prpf40a), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43779312:43838952:-1 gene:ENSRNOG00000004864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ210557 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA26YK19 mRNA sequence. // chr3 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// FQ211946 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YK19 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000018965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43780014:43823585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000036265 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:43951227:43951800:-1 gene:ENSRNOG00000027417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 79 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43951386:44042492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000040517 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:44171337:44172314:-1 gene:ENSRNOG00000029898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000025987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:44171471:44418494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001044276 // RefSeq // Rattus norvegicus reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator candidate (Rprm), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:44691990:44692319:-1 gene:ENSRNOG00000005109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC091400 // GenBank // Rattus norvegicus reprimo, TP53 dependent G2 arrest mediator candidate, mRNA (cDNA clone MGC:109515 IMAGE:7323940), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:44691502:44693568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000006859 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:45240567:45241267:-1 gene:ENSRNOG00000005116 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:45240567:45241231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0
ENSRNOT00000007377 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:47453518:47454505:1 gene:ENSRNOG00000005559 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:47453518:47454505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000054229 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:3:46849508:46849626:1 gene:ENSRNOG00000046771 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000070853 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:48294920:48295285:-1 gene:ENSRNOG00000049377 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:48295049:48295285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_001008311 // RefSeq // Rattus norvegicus ermin, ERM-like protein (Ermn), mRNA. // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000034449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:49191499:49198934:-1 gene:ENSRNOG00000021472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC086596 // GenBank // Rattus norvegicus ermin, ERM-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:105579 IMAGE:7311836), complete cds. // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// DQ119821 // GenBank // Rattus norvegicus juxtanodin mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:49194129:49198854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT037180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001012086 // RefSeq // Rattus norvegicus cytohesin 1 interacting protein (Cytip), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytohesin 1 interacting protein (Cytip), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:49270139:49296836:-1 gene:ENSRNOG00000004772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC088207 // GenBank // Rattus norvegicus cytohesin 1 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:108923 IMAGE:7381695), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:49270676:49288400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_139090 // RefSeq // Rattus norvegicus activin A receptor, type IC (Acvr1c), mRNA. // chr3 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000059280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:49392012:49462619:-1 gene:ENSRNOG00000004828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U35025 // GenBank // Rattus norvegicus activin receptor-like kinase 7 (ALK7) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// U69702 // GenBank // Rattus norvegicus activin-like receptor kinase-7 (ALK-7) mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:49347169:49410727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_024486 // RefSeq // Rattus norvegicus activin A receptor, type I (Acvr1), mRNA. // chr3 // 86 // 97 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:49551414:49641517:-1 gene:ENSRNOG00000005033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC167754 // GenBank // Rattus norvegicus activin A receptor, type I, mRNA (cDNA clone MGC:187367 IMAGE:9089038), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// L19341 // GenBank // Rattus norvegicus activin type I receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 86 // 97 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:49552561:49626291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001107732 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 148 (Ccdc148), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006234203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 148 (Ccdc148), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000033090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:50007273:50327062:-1 gene:ENSRNOG00000025776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000070990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:50227317:50285706:-1 gene:ENSRNOG00000025776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// BC167021 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 148, mRNA (cDNA clone IMAGE:7133614), complete cds. // chr3 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// GENSCAN00000033581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:50007534:50271886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT037191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT037192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// NONRATT037193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
NM_001014179 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 (Wdsub1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006234208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 (Wdsub1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1 (Wdsub1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000008168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:51036940:51067275:-1 gene:ENSRNOG00000005990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC089856 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat, sterile alpha motif and U-box domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:108920 IMAGE:7381399), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000015446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51037226:51064532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT037194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001108260 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain adjacent to zinc finger domain, 2B (Baz2b), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000056440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:51081857:51200027:-1 gene:ENSRNOG00000025148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51073093:51128785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51138718:51211027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 27 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT037197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT037196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_001013916 // RefSeq // Rattus norvegicus CD302 molecule (Cd302), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000008987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:51435507:51469216:-1 gene:ENSRNOG00000006623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC089829 // GenBank // Rattus norvegicus CD302 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:108799 IMAGE:7322853), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// FQ218624 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YO21 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 90 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51435794:51468980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006234242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 75 (Ly75), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000010683 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:51479563:51565223:-1 gene:ENSRNOG00000007012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000071468 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:51512186:51565223:-1 gene:ENSRNOG00000007012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51474611:51551094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0
NM_001100837 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2 receptor 1 (Pla2r1), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:51596536:51728234:-1 gene:ENSRNOG00000008129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51597619:51628516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000052983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51650519:51709864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001004263 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, beta 6 (Itgb6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:51762620:51835353:-1 gene:ENSRNOG00000008346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079069 // GenBank // Rattus norvegicus integrin, beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:94023 IMAGE:7121642), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51728753:51859210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT037218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012184 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 1 (Rbms1), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 1 (Rbms1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 1 (Rbms1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:51911276:52132833:-1 gene:ENSRNOG00000008482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC087094 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94632 IMAGE:7191334), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif, single stranded interacting protein 1 (Rbms1), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT037219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51912299:51924043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT037221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT037222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT037223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSRNOT00000059115 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:52168571:52169659:-1 gene:ENSRNOG00000038715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000050033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:52168997:52169659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001191070 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box, brain, 1 (Tbr1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:54349276:54356654:1 gene:ENSRNOG00000005049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:54349276:54356654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 58 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT034874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001025689 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 14 (Psmd14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:54249938:54344885:1 gene:ENSRNOG00000004911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097427 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 14, mRNA (cDNA clone IMAGE:7455230), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158645 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 14, mRNA (cDNA clone MGC:187593 IMAGE:8363877), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ213202 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YC12 mRNA sequence. // chr3 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// FQ228900 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YL07 mRNA sequence. // chr3 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:54321895:54344592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT034873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:54251608:54315605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_012789 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 4 (Dpp4), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000040482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:54961700:55038565:-1 gene:ENSRNOG00000030763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// J02997 // GenBank // Rat bile canaliculus domain-specific membrane glycoprotein mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// J04591 // GenBank // Rat dipeptidyl peptidase IV (DPP) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT037243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:54955363:55014791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT037242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_012707 // RefSeq // Rattus norvegicus glucagon (Gcg), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:55108272:55117287:-1 gene:ENSRNOG00000005498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:55102839:55114274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_138850 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast activation protein, alpha (Fap), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000008148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:55133418:55201837:-1 gene:ENSRNOG00000005679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// AF493782 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast activation protein alpha subunit (Fap) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 48 // 48 // 0 /// BC061713 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast activation protein, alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:5598128), complete cds. // chr3 // 100 // 42 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000003381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:55129920:55184492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 26 // 50 // 1 /// NONRATT037247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 17 // 50 // 1 /// NONRATT037245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 12 // 50 // 1
NM_001109199 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon induced with helicase C domain 1 (Ifih1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon induced with helicase C domain 1 (Ifih1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:55223298:55269581:-1 gene:ENSRNOG00000006227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC168680 // GenBank // Rattus norvegicus interferon induced with helicase C domain 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5621875), partial cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:55221108:55241949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_131912 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 7 (Kcnh7), mRNA. // chr3 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000009920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:55334508:55822719:-1 gene:ENSRNOG00000007528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// AF016191 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel (erg3) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:55328405:55412743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT037251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000055738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:55421810:55588308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001106484 // RefSeq // Rattus norvegicus fidgetin (Fign), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:56637401:56764164:-1 gene:ENSRNOG00000004679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:56637962:56640208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000037724 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:57275302:57275892:-1 gene:ENSRNOG00000027084 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 89 // 70 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:57275407:57277375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_031623 // RefSeq // Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 14 (Grb14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000052395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:57578232:57695025:-1 gene:ENSRNOG00000031396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF076619 // GenBank // Rattus norvegicus molecular adapter rGrb14 (Grb14) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:57574843:57694956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NONRATT037253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000001607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:57773840:57848396:-1 gene:ENSRNOG00000027016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:57773840:57848396:-1 gene:ENSRNOG00000027016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// BC168937 // GenBank // Rattus norvegicus Cobl-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7129426), partial cds. // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:57775545:57835651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
XM_342441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 11 (Slc38a11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58045274:58053241:-1 gene:ENSRNOG00000004966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000034141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58045274:58053241:-1 gene:ENSRNOG00000004966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000058962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58008518:58053241:-1 gene:ENSRNOG00000004966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58008518:58053241:-1 gene:ENSRNOG00000004966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58008518:58053241:-1 gene:ENSRNOG00000004966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000014288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:57949253:58053241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
ENSRNOT00000052876 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:3:58067135:58067256:-1 gene:ENSRNOG00000034753 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_013119 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type III, alpha (Scn3a), mRNA. // chr3 // 95 // 100 // 41 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000006646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58167493:58277870:-1 gene:ENSRNOG00000005007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000014283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58168047:58172400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000014290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58174496:58247127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 26 // 43 // 1
NM_013119 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type III, alpha (Scn3a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58167493:58277870:-1 gene:ENSRNOG00000005007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58174496:58247127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001015032 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 (Galnt3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58806687:58830432:-1 gene:ENSRNOG00000005727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB040674 // GenBank // Rattus norvegicus GalNAc-T3 mRNA for UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-3, complete cds. // chr3 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// BC101886 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 3 (GalNAc-T3), mRNA (cDNA clone MGC:124508 IMAGE:7929522), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58807414:58830168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
GENSCAN00000017231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58842667:58848980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT037262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001191737 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 21B (Ttc21b), mRNA. // chrU // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007832 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:58917760:58990221:-1 gene:ENSRNOG00000005868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58954770:58990221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000051694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58917760:58942127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_030875 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type I, alpha subunit (Scn1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:59009807:59089000:-1 gene:ENSRNOG00000005989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M22253 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel I mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:59018757:59089000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_133289 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type IX, alpha subunit (Scn9a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:59207262:59286961:-1 gene:ENSRNOG00000006639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF000368 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated sodium channel mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:59210608:59286961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031686 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type VII, alpha subunit (Scn7a), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:59396876:59469569:-1 gene:ENSRNOG00000029342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:59416544:59485400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
XM_575143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S3-like (RGD1560831), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000009988 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:59616332:59617063:-1 gene:ENSRNOG00000007605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:59616332:59617063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_019362 // RefSeq // Rattus norvegicus serine threonine kinase 39 (Stk39), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000037133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:60973443:61243989:-1 gene:ENSRNOG00000024808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AF068261 // GenBank // Rattus norvegicus pancreatic serine threonine kinase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// AF099990 // GenBank // Rattus norvegicus Ste-20 related kinase SPAK mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// D88190 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein kinase PASK, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT037276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT037277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 23 // 41 // 1 /// GENSCAN00000034500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:61125336:61170640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1
NM_001009654 // RefSeq // Rattus norvegicus SPC25, NDC80 kinetochore complex component (Spc25), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPC25, NDC80 kinetochore complex component (Spc25), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62050002:62063264:-1 gene:ENSRNOG00000006731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088213 // GenBank // Rattus norvegicus SPC25, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:108932 IMAGE:7383479), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62050506:62062220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_030827 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 2 (Lrp2), mRNA. // chr3 // 98 // 99 // 80 // 82 // 0 /// ENSRNOT00000070816 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:62271279:62359283:-1 gene:ENSRNOG00000047711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 72 // 59 // 60 // 0 /// L34049 // GenBank // Rattus norvegicus megalin mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 99 // 80 // 82 // 0 /// ENSRNOT00000050675 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:62363998:62434837:-1 gene:ENSRNOG00000030487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 12 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62266826:62409218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 99 // 92 // 75 // 76 // 0 /// NONRATT037281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 21 // 83 // 1
NM_001191738 // RefSeq // Rattus norvegicus FAST kinase domains 1 (Fastkd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FAST kinase domains 1 (Fastkd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62537420:62563261:-1 gene:ENSRNOG00000024335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62552007:62563313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT037286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT037287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001127486 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 173 (Ccdc173), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 173 (Ccdc173), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000043462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62608127:62667564:-1 gene:ENSRNOG00000030535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158633 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein, mRNA (cDNA clone MGC:187548 IMAGE:7456638), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62601686:62664798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001114181 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 5 (Mettl5), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62736608:62747462:-1 gene:ENSRNOG00000008469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC158754 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase like 5, mRNA (cDNA clone MGC:187943 IMAGE:9102963), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62739151:62748342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001107734 // RefSeq // Rattus norvegicus tousled-like kinase 1 (Tlk1), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:63799371:63897975:-1 gene:ENSRNOG00000009300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:63800085:63878338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT037296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
XM_001059981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L15-like (RGD1565767), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_230013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L15-like (RGD1565767), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000032528 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:63675310:63675924:-1 gene:ENSRNOG00000023181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:63675310:63675924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_001060093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 8 (Mettl8), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// XM_006224480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 8 (Mettl8), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// XM_006224481 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 8 (Mettl8), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000058524 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:64067594:64103342:-1 gene:ENSRNOG00000009382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// XM_003749487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 8 (Mettl8), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006234348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 8 (Mettl8), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006234349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 8 (Mettl8), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XM_578127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 8 (Mettl8), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// FQ224337 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA6YB21 mRNA sequence. // chr3 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:63740371:63752294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000007610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64067640:64110454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
AB007601 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sproutin, partial sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64237469:64237621:-1 gene:ENSRNOG00000023090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (aspartate/glutamate carrier), member 12 (Slc25a12), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036728 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:64378093:64485534:-1 gene:ENSRNOG00000022922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// XM_006234367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (aspartate/glutamate carrier), member 12 (Slc25a12), mRNA. // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT037300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000007604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64366524:64408410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64414037:64467379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT037301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT037302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
BC092641 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7316947. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191746 // RefSeq // Rattus norvegicus distal-less homeobox 2 (Dlx2), mRNA. // chr3 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000002076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64665449:64667332:-1 gene:ENSRNOG00000001519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000049989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64655801:64667332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT037309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006224491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sp3 transcription factor (Sp3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// XM_006234365 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sp3 transcription factor (Sp3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000026148 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:66119807:66153955:-1 gene:ENSRNOG00000019263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66119807:66166907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT037314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66731292:66800492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001033927 // RefSeq // Rattus norvegicus Obg-like ATPase 1 (Ola1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66275428:66395046:-1 gene:ENSRNOG00000019047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC127457 // GenBank // Rattus norvegicus Obg-like ATPase 1, mRNA (cDNA clone MGC:156509 IMAGE:8363318), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// U21721 // GenBank // Rattus norvegicus clone C101 intestinal epithelium proliferating cell-associated mRNA sequence. // chr3 // 80 // 30 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT037315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66307482:66346909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001007799 // RefSeq // Rattus norvegicus corepressor interacting with RBPJ, 1 (Cir1), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66477815:66507826:-1 gene:ENSRNOG00000018719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085869 // GenBank // Rattus norvegicus CBF1 interacting corepressor, mRNA (cDNA clone MGC:94623 IMAGE:7191148), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107811 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 155 (Gpr155), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 155 (Gpr155), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66535459:66588943:-1 gene:ENSRNOG00000018485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66537424:66579066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_057192 // RefSeq // Rattus norvegicus WAS/WASL interacting protein family, member 1 (Wipf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000024922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66633174:66649130:-1 gene:ENSRNOG00000018406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC072475 // GenBank // Rattus norvegicus WAS/WASL interacting protein family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:91527 IMAGE:7100751), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66617902:66667378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_024485 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 1 (muscle) (Chrna1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66925970:66940958:-1 gene:ENSRNOG00000018286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66924512:66935285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_032083 // RefSeq // Rattus norvegicus chimerin 1 (Chn1), mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006234386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chimerin 1 (Chn1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006234389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chimerin 1 (Chn1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000068745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66992186:67035054:-1 gene:ENSRNOG00000017939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC094519 // GenBank // Rattus norvegicus chimerin (chimaerin) 1, mRNA (cDNA clone MGC:105381 IMAGE:7315609), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT037332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_031018 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 2 (Atf2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:67199878:67274694:-1 gene:ENSRNOG00000001597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:67199878:67274694:-1 gene:ENSRNOG00000001597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// M65148 // GenBank // Rat RATF2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// U38938 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP response element binding protein 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:67199926:67258875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
XM_006224495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit C3 (subunit 9) (Atp5g3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// XM_006234393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit C3 (subunit 9) (Atp5g3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000058234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:67289968:67292590:-1 gene:ENSRNOG00000001596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC079448 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7115709. // chr3 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// FQ228633 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA5YN11 mRNA sequence. // chr3 // 59 // 96 // 13 // 22 // 0 /// BC099786 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:124584 IMAGE:7934752, complete cds. // chr3 // 45 // 96 // 10 // 22 // 0 /// NONRATT037338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:67290112:67352751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONRATT037340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1 /// NONRATT037341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
NM_001077429 // RefSeq // Rattus norvegicus limb and neural patterns (Lnp), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus limb and neural patterns (Lnp), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus limb and neural patterns (Lnp), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus limb and neural patterns (Lnp), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus limb and neural patterns (Lnp), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:67901786:67962502:-1 gene:ENSRNOG00000001593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC126100 // GenBank // Rattus norvegicus limb and neural patterns, mRNA (cDNA clone MGC:156797 IMAGE:7132654), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ218047 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA10YF12 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// XM_006234384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus limb and neural patterns (Lnp), transcript variant X8, mRNA. // chr3 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT037344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:67905249:67987062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_221512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus even-skipped homeobox 2 (Evx2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002156 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:68044676:68048012:-1 gene:ENSRNOG00000001589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006224626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus even-skipped homeobox 2 (Evx2), mRNA. // chr3 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// GENSCAN00000043477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:68032231:68048012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0
NM_031789 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 2 (Nfe2l2), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006234396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 2 (Nfe2l2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 2 (Nfe2l2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006234399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 2 (Nfe2l2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000002114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69041647:69069072:-1 gene:ENSRNOG00000001548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF037350 // GenBank // Rattus norvegicus NF-E2-related factor 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC061724 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid derived 2, like 2, mRNA (cDNA clone MGC:72386 IMAGE:5598313), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ221441 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA36YE05 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:69042091:69057200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001127607 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 30B (Ttc30b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000013565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69306229:69308223:-1 gene:ENSRNOG00000050762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC166739 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 30B, mRNA (cDNA clone MGC:188467 IMAGE:7937387), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:69306229:69308223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001029918 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 30A1 (Ttc30a1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC098051 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 30A1, mRNA (cDNA clone MGC:116209 IMAGE:7457462), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001271494 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 30B (LOC100362431), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_012840 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c, testis (Cyct), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69744115:69781051:-1 gene:ENSRNOG00000024457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M20623 // GenBank // Rat testis-specific cytochrome c mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001127480 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 11A (Pde11a), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000050355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69363100:69784932:-1 gene:ENSRNOG00000024457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// AB059361 // GenBank // Rattus norvegicus RNPDE11A3 mRNA for phosphodiesterase 11A3, complete cds. // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT037356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001127480 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 11A (Pde11a), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69363100:69784932:-1 gene:ENSRNOG00000024457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB059361 // GenBank // Rattus norvegicus RNPDE11A3 mRNA for phosphodiesterase 11A3, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024780 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, interferon inducible double stranded RNA dependent activator (Prkra), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:70062246:70081079:-1 gene:ENSRNOG00000011195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097446 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, interferon inducible double stranded RNA dependent activator, mRNA (cDNA clone MGC:114506 IMAGE:7456528), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT037362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70046742:70083071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT037363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001106485 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 7 (Fkbp7), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:70095653:70107822:-1 gene:ENSRNOG00000011758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70095792:70107749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000032687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70139920:70255398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0
GENSCAN00000032687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70139920:70255398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0
AF525411 // GenBank // Rattus norvegicus cardiac titin N2BA isoform (Ttn) mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 25 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000030978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:70391619:70406879:-1 gene:ENSRNOG00000022637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 7 // 10 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000057977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:70347019:70396364:-1 gene:ENSRNOG00000022637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000008553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70401471:70429964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 5 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000032710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70277908:70388224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 85 // 85 // 0 /// ENSRNOT00000033510 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:70247338:70334172:-1 gene:ENSRNOG00000048351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 49 // 169 // 1 /// GENSCAN00000032687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70139920:70255398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 53 // 169 // 1
ENSRNOT00000037015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:70437253:70594245:-1 gene:ENSRNOG00000012580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70439950:70594245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001134514 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC14 and spectrin domains 1 (Sestd1), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006234402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC14 and spectrin domains 1 (Sestd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:70613829:70664787:-1 gene:ENSRNOG00000012603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC169110 // GenBank // Rattus norvegicus SEC14 and spectrin domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:189541 IMAGE:7445081), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT037395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000008571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70624208:70668569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1
NONRATT037395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 1
NM_001107736 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 385B (Zfp385b), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234414 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 385B (Zfp385b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 385B (Zfp385b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 385B (Zfp385b), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 385B (Zfp385b), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:70838018:71110119:-1 gene:ENSRNOG00000019065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70841195:70886237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENSRNOT00000037684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:71298090:71346652:-1 gene:ENSRNOG00000012651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ231274 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA73YC01 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ231579 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC07 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000020104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:71298326:71352141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000023983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:71707075:71710422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XR_086195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceramide kinase-like (Cerkl), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043238 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:72830501:72866241:-1 gene:ENSRNOG00000030212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000057878 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:72830501:72866241:-1 gene:ENSRNOG00000030212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073412 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:72830501:72866241:-1 gene:ENSRNOG00000030212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:72826754:72840662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0
AF107728 // GenBank // Rattus norvegicus neurogenic differentiation factor (neuroD) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC094526 // GenBank // Rattus norvegicus neurogenic differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:105448 IMAGE:7318277), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// D82945 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NeuroD, complete cds. // chr3 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// NM_019218 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal differentiation 1 (Neurod1), mRNA. // chr3 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000007662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:72974863:72978179:-1 gene:ENSRNOG00000005609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC092367 // GenBank // Rattus norvegicus neurogenic differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:105447 IMAGE:7312547), complete cds. // chr3 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// NONRATT037400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:72975536:73035116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_030871 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 1A, calmodulin-dependent (Pde1a), mRNA. // chr3 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:73364538:73820966:-1 gene:ENSRNOG00000006154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// AF327838 // GenBank // Rattus norvegicus phosphodiesterase 1A mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:73397954:73451393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_031618 // RefSeq // Rattus norvegicus NCK-associated protein 1 (Nckap1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:74284278:74346873:-1 gene:ENSRNOG00000007518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:74293621:74371887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_001100527 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled-related protein (Frzb), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:74196166:74229331:-1 gene:ENSRNOG00000007765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098777 // GenBank // Rattus norvegicus frizzled-related protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7374231), partial cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC166428 // GenBank // Rattus norvegicus frizzled-related protein, mRNA (cDNA clone MGC:187419 IMAGE:7106784), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:74170519:74202541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000002063 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:77473917:77475216:-1 gene:ENSRNOG00000001511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:77474241:77512846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000049111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:77474241:77512846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0
NM_001011960 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 2 (Zswim2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:77799742:77821010:-1 gene:ENSRNOG00000032579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079431 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:94977 IMAGE:7114765), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:77799864:77810755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT037411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012717 // RefSeq // Rattus norvegicus calcitonin receptor-like (Calcrl), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000006462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78271011:78366562:-1 gene:ENSRNOG00000004622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// L27487 // GenBank // Rat calcitonin receptor-like receptor (CRLR) mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// NONRATT037413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78272108:78358719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT037416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001107740 // RefSeq // Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), delta 1 (Ctnnd1), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000064009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78522966:78573636:-1 gene:ENSRNOG00000030790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000052649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78440624:78546608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT037427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
NM_001114939 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Selenoprotein H (RGD1563348), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ220990 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YO17 mRNA sequence. // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT037429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001007643 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin-related transmembrane protein 2 (Tmx2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78594077:78601725:-1 gene:ENSRNOG00000005308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083678 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin-related transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94529 IMAGE:7135830), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78594378:78600914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001039338 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 5 (Zdhhc5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78611962:78634327:-1 gene:ENSRNOG00000006832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY871203 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC5 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78612289:78639244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001009599 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation factor I subunit 1 (Clp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation factor I subunit 1 (Clp1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78645912:78649612:-1 gene:ENSRNOG00000007416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087130 // GenBank // Rattus norvegicus CLP1, cleavage and polyadenylation factor I subunit, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94928 IMAGE:7112583), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231160 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YB14 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78646334:78648728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT037441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT037443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT037444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_031876 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 130a (Mir130a), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053693 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:78661697:78661784:-1 gene:ENSRNOG00000035570 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-130a // miRBase Micro RNA Database // MI0000903 Rattus norvegicus miR-130a stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199093 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade G (C1 inhibitor), member 1 (Serping1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78681826:78691120:-1 gene:ENSRNOG00000007457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061860 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade G, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72585 IMAGE:5598525), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78682048:78691066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT037449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001191739 // RefSeq // Rattus norvegicus smoothelin-like 1 (Smtnl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78561464:78740155:-1 gene:ENSRNOG00000007516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ216695 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YJ06 mRNA sequence. // chr3 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// FQ217513 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA24YJ14 mRNA sequence. // chr3 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78728406:78739744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_181380 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulon 4 receptor-like 2 (Rtn4rl2), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reticulon 4 receptor-like 2 (Rtn4rl2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reticulon 4 receptor-like 2 (Rtn4rl2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000038250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78793337:78809760:-1 gene:ENSRNOG00000021513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF532860 // GenBank // Rattus norvegicus Nogo-66 receptor homolog-1 (Ngrh1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78793360:78809742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
GENSCAN00000052656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78881062:78881879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
NM_001270621 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 3 (P2rx3), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NM_031075 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 3 (P2rx3), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NR_073054 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 3 (P2rx3), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000033427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78914880:78956433:-1 gene:ENSRNOG00000008552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF084975 // GenBank // Rattus norvegicus P2X3b receptor mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// BC081783 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 3, mRNA (cDNA clone MGC:93384 IMAGE:7134300), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// X90651 // GenBank // R.norvegicus mRNA for P2X3 receptor. // chr3 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT037454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78916404:78956832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT037455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT037456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001122975 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 55 (Lrrc55), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 55 (Lrrc55), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000031745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79101424:79114130:-1 gene:ENSRNOG00000028266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099134 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 55, mRNA (cDNA clone MGC:116279 IMAGE:7454777), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79109212:79185927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001000688 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 436 (Olr436), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79251726:79252655:-1 gene:ENSRNOG00000032273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79195983:79252655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000281 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 439 (Olr439), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79281068:79281997:-1 gene:ENSRNOG00000029640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79281068:79283040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT037459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000282 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 440 (Olr440), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79298463:79299410:-1 gene:ENSRNOG00000009376 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79298507:79299410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 71 // 12 // 15 // 0 /// NONRATT037460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_001000283 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 441 (Olr441), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79319566:79320510:-1 gene:ENSRNOG00000034115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79319566:79381040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000284 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 442 (Olr442), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79329981:79330928:-1 gene:ENSRNOG00000033543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79319566:79381040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT037462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002726225 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to fatty acid desaturase 2; linoleoyl-CoA desaturase (delta-6-desaturase)-like 2; delta-6 fatty acid desaturase (RGD1311224), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_002729187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to fatty acid desaturase 2; linoleoyl-CoA desaturase (delta-6-desaturase)-like 2; delta-6 fatty acid desaturase (RGD1311224), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012568 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:79368140:79406752:-1 gene:ENSRNOG00000009399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79388924:79406752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79319566:79381040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT037463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NONRATT043572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001000287 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 448 (Olr448), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79607286:79608242:-1 gene:ENSRNOG00000009526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79607286:79608242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000288 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 450 (Olr450), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79616506:79617444:-1 gene:ENSRNOG00000029578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79616506:79617444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000291 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 455 (Olr455), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79691902:79692837:-1 gene:ENSRNOG00000009586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79691902:79692837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000293 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 459 (Olr459), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79746212:79747141:-1 gene:ENSRNOG00000030662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79746212:79747141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000295 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 462 (Olr462), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79794251:79795183:-1 gene:ENSRNOG00000009624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79794251:79795183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000012787 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:79852262:79853223:-1 gene:ENSRNOG00000009648 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79852262:79852738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001000303 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 476 (Olr476), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79968748:79969713:-1 gene:ENSRNOG00000009693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79968748:79969362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000043221 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:80006531:80007468:-1 gene:ENSRNOG00000032597 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80006510:80044478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
NM_001000305 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 479 (Olr479), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80024852:80025793:-1 gene:ENSRNOG00000049794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80006510:80044478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000685 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 480 (Olr480), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000049630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80043888:80044829:-1 gene:ENSRNOG00000050467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT037473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001000684 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 481 (Olr481), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80052953:80053897:-1 gene:ENSRNOG00000031051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000561 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 482 (Olr482), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80061928:80062842:-1 gene:ENSRNOG00000049721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80061898:80063450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000683 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 483 (Olr483), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80166856:80167815:-1 gene:ENSRNOG00000049332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80078276:80079235:-1 gene:ENSRNOG00000046645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80166856:80167815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80078276:80079235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000306 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 484 (Olr484), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80091316:80092263:-1 gene:ENSRNOG00000050712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80179896:80180843:-1 gene:ENSRNOG00000045807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80179896:80180843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80091316:80152035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001000307 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 485 (Olr485), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80195860:80196810:-1 gene:ENSRNOG00000009747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80195860:80196810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000682 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 486 (Olr486), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000052306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80213828:80214787:-1 gene:ENSRNOG00000029884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000308 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 488 (Olr488), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80233051:80233977:-1 gene:ENSRNOG00000009764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80233051:80288794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000933 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 490 (Olr490), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000012938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81389680:81390621:-1 gene:ENSRNOG00000009770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000073202 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:80275851:80396741:-1 gene:ENSRNOG00000045634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000932 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 491 (Olr491), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000046197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81401261:81402215:-1 gene:ENSRNOG00000033174 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074870 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:80275809:80288794:-1 gene:ENSRNOG00000045634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
XM_002729195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1055 (Olfr1055), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000309 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 493 (Olr493), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045888 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:81418327:81443077:-1 gene:ENSRNOG00000032730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000007804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81418315:81419142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80305294:80306121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_001000310 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 495 (Olr495), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81433725:81434672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80320704:80321651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000681 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 496 (Olr496), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045888 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:81418327:81443077:-1 gene:ENSRNOG00000032730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001000931 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 499 (Olr499), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000045173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81466823:81467764:-1 gene:ENSRNOG00000047474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000047131 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:80369655:80396741:-1 gene:ENSRNOG00000045634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 100 // 9 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80369655:80370449:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_001000680 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 500 (Olr500), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000311 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 502 (Olr502), mRNA. // chr3 // 38 // 100 // 10 // 26 // 0 /// NM_001000679 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 505 (Olr505), mRNA. // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000047131 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:80369655:80396741:-1 gene:ENSRNOG00000045634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT037480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 100 // 10 // 26 // 0 /// NONRATT037481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001000311 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 502 (Olr502), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000679 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 505 (Olr505), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000678 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 507 (Olr507), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80453484:80454425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000677 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 508 (Olr508), mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80505445:80531670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001000312 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 510 (Olr510), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80505445:80531670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000013038 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:80397658:80586214:-1 gene:ENSRNOG00000045634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 65 // 8 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000051169 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:80505445:80586214:-1 gene:ENSRNOG00000045634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001000313 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 513 (Olr513), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013038 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:80397658:80586214:-1 gene:ENSRNOG00000045634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000073787 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:80275804:80586214:-1 gene:ENSRNOG00000045634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80585279:80586214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000314 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 514 (Olr514), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80601658:80602599:-1 gene:ENSRNOG00000046997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80601658:80602599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000316 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 516 (Olr516), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80665059:80665994:-1 gene:ENSRNOG00000049954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80665059:80665994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000930 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 520 (Olr520), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000562 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 522 (Olr522), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80905288:80906235:-1 gene:ENSRNOG00000049234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000675 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 527 (Olr527), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81097478:81098425:-1 gene:ENSRNOG00000050009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81097478:81153252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000319 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 528 (Olr528), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81124701:81125648:-1 gene:ENSRNOG00000048928 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81097478:81153252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_001000674 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 529 (Olr529), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81097478:81153252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 76 // 10 // 13 // 0 /// NONRATT037493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001001051 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 531 (Olr531), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT037494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001000563 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 532 (Olr532), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81216870:81217835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000673 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 533 (Olr533), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81224225:81225160:-1 gene:ENSRNOG00000030825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000672 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 535 (Olr535), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81239668:81240609:-1 gene:ENSRNOG00000050080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81239668:81240609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001000564 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 536 (Olr536), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81246611:81247543:-1 gene:ENSRNOG00000009943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81246611:81247192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT037498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000671 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 537 (Olr537), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81256385:81257323:-1 gene:ENSRNOG00000034047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000320 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 539 (Olr539), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81281209:81282147:-1 gene:ENSRNOG00000009969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81281209:81281796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000565 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 541 (Olr541), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81353395:81354333:-1 gene:ENSRNOG00000049276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81353395:81353982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000566 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 542 (Olr542), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000046167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81736843:81737781:-1 gene:ENSRNOG00000050876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001001052 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 544 (Olr544), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81518429:81519367:-1 gene:ENSRNOG00000031356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81518429:81641609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001001053 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 545 (Olr545), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000071001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81556816:81557781:-1 gene:ENSRNOG00000045694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81816233:81817198:-1 gene:ENSRNOG00000049438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000322 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 550 (Olr550), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000049273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81641022:81641960:-1 gene:ENSRNOG00000050825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000051768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81647950:81648888:-1 gene:ENSRNOG00000048383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000007808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81647950:81648537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001000670 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 551 (Olr551), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81670186:81671123:-1 gene:ENSRNOG00000046960 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NM_001000565 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 541 (Olr541), mRNA. // chr3 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81353395:81354333:-1 gene:ENSRNOG00000049276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81670186:81670884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT037505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT037502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0
NM_001001055 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 552 (Olr552), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81883863:81884801:-1 gene:ENSRNOG00000045627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81883863:81884317:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT037508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001074348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus preferentially expressed antigen in melanoma-like 7 (Pramel7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_578142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus preferentially expressed antigen in melanoma-like 7 (Pramel7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82262219:82265191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT037509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001000326 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 567 (Olr567), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82291952:82292878:-1 gene:ENSRNOG00000047552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82291952:82292878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000013518 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:82354676:82355612:-1 gene:ENSRNOG00000010179 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000001021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82354676:82355287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT037509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000034274 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:82374017:82374723:-1 gene:ENSRNOG00000021884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000001022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82374017:82374532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 58 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT037509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001000328 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 576 (Olr576), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82435635:82436728:-1 gene:ENSRNOG00000047926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82435802:82436728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000567 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 577 (Olr577), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000033519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82449461:82450399:-1 gene:ENSRNOG00000021658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82449461:82450399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NM_001000568 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 578 (Olr578), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82467998:82468930:-1 gene:ENSRNOG00000050566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000661 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 584 (Olr584), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82592998:82593936:-1 gene:ENSRNOG00000005742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000659 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 587 (Olr587), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82636493:82637428:-1 gene:ENSRNOG00000050681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82628933:82661582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
GENSCAN00000046244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82794482:82800485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001000512 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 601 (Olr601), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82799532:82800485:-1 gene:ENSRNOG00000005863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82794482:82800485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000333 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 602 (Olr602), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82816358:82817296:-1 gene:ENSRNOG00000045865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82816358:82817296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000656 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 604 (Olr604), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82847920:82848876:-1 gene:ENSRNOG00000005880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000334 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 607 (Olr607), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82960771:82961721:-1 gene:ENSRNOG00000050737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072741 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:82966060:82967010:-1 gene:ENSRNOG00000047639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// XM_002726230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG27063-like (LOC100365887), mRNA. // chr3 // 54 // 96 // 13 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82960771:82961721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82966060:82967010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT037522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000655 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 608 (Olr608), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82989005:82989985:-1 gene:ENSRNOG00000005950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000335 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 609 (Olr609), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82999321:83000271:-1 gene:ENSRNOG00000050679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82999321:82999914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000336 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 610 (Olr610), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83025339:83026284:-1 gene:ENSRNOG00000047074 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT037525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001000926 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 611 (Olr611), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83203687:83204643:-1 gene:ENSRNOG00000032126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83203687:83225882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83037168:83038121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT037528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000654 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 613 (Olr613), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83056148:83057080:-1 gene:ENSRNOG00000045685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001000337 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 614 (Olr614), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83075944:83076894:-1 gene:ENSRNOG00000049509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83075944:83076537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 5D13-like (LOC688657), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 5D13-like (LOC688657), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83203687:83225882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_006224637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 5D13-like (LOC688691), mRNA. // chr3 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// XM_006234495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 5D13-like (LOC688691), mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001000652 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 621 (Olr621), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83251547:83252395:1 gene:ENSRNOG00000045526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001000630 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 691 (Olr691), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NM_001001058 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 629 (Olr629), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83401429:83402379:-1 gene:ENSRNOG00000047271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84819100:84820050:1 gene:ENSRNOG00000048259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83401429:83424611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT037531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001001059 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 630 (Olr630), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000007890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83413764:83414702:-1 gene:ENSRNOG00000006024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT037532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001000339 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 631 (Olr631), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000050173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83424036:83424956:-1 gene:ENSRNOG00000032712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000643 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 641 (Olr641), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83628908:83629816:-1 gene:ENSRNOG00000030406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001000639 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 650 (Olr650), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000051966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83804280:83805206:-1 gene:ENSRNOG00000050952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000000484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83782269:83805206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001000341 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 651 (Olr651), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83819476:83820402:-1 gene:ENSRNOG00000047268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83810463:83820402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000344 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 658 (Olr658), mRNA. // chr3 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// NM_001000638 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 652 (Olr652), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007996 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:83835832:83836761:-1 gene:ENSRNOG00000049836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84255876:84256805:1 gene:ENSRNOG00000046684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// NM_001000636 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 654 (Olr654), mRNA. // chr3 // 64 // 96 // 16 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83878727:83879656:-1 gene:ENSRNOG00000047650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 96 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83877612:83879423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000000489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83835832:83836650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// NONRATT035196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT035197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT037539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 96 // 16 // 25 // 0
NM_001000636 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 654 (Olr654), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000042667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83878727:83879656:-1 gene:ENSRNOG00000047650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000343 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 657 (Olr657), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84269015:84269947:1 gene:ENSRNOG00000045624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000344 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 658 (Olr658), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007996 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:83835832:83836761:-1 gene:ENSRNOG00000049836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84255876:84256805:1 gene:ENSRNOG00000046684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83835832:83836650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 76 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT035196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT035197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0
NM_001000925 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 661 (Olr661), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84176022:84176948:1 gene:ENSRNOG00000046340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84176022:84176948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001060 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 662 (Olr662), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000047726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84165236:84166168:1 gene:ENSRNOG00000048178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84165236:84167858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000346 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 663 (Olr663), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84133825:84134760:1 gene:ENSRNOG00000047879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84133945:84134760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT035197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT035198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000634 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 665 (Olr665), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000073332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84054860:84055705:1 gene:ENSRNOG00000049548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001000924 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 666 (Olr666), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000044273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84281973:84282908:-1 gene:ENSRNOG00000049947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000348 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 668 (Olr668), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000349 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 669 (Olr669), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT037544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000633 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 670 (Olr670), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84358837:84359772:-1 gene:ENSRNOG00000046773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001061 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 671 (Olr671), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84372723:84373658:-1 gene:ENSRNOG00000028809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84372723:84373538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000350 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 672 (Olr672), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000048442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84389382:84390296:-1 gene:ENSRNOG00000029153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT037547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000351 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 673 (Olr673), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000352 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 674 (Olr674), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071319 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:84454294:84463153:-1 gene:ENSRNOG00000046674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NONRATT037548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000632 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 675 (Olr675), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84491157:84492092:-1 gene:ENSRNOG00000049711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84558558:84559493:-1 gene:ENSRNOG00000046970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84491157:84491972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84558558:84559373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001000352 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 674 (Olr674), mRNA. // chr3 // 50 // 100 // 15 // 30 // 0 /// NM_001000350 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 672 (Olr672), mRNA. // chr3 // 30 // 100 // 9 // 30 // 0 /// NM_001000632 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 675 (Olr675), mRNA. // chr3 // 43 // 100 // 13 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84389382:84390296:-1 gene:ENSRNOG00000029153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 100 // 9 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84491157:84492092:-1 gene:ENSRNOG00000049711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 100 // 13 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84558558:84559493:-1 gene:ENSRNOG00000046970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 100 // 13 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84569619:84580355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84502580:84513316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT037548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 100 // 15 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84491157:84491972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 93 // 13 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84558558:84559373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 93 // 13 // 28 // 0 /// NONRATT037547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 100 // 9 // 30 // 0
NM_001001062 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 677 (Olr677), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84615331:84626495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000353 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 678 (Olr678), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000354 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 679 (Olr679), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84643192:84644127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000631 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 681 (Olr681), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84659859:84660794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000037743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84693623:84694321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 9 // 12 // 0
NM_001000356 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 687 (Olr687), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84748238:84798160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000997 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 689 (Olr689), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000049094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84748250:84777536:-1 gene:ENSRNOG00000050195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// NONRATT037554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000569 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 690 (Olr690), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000073165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84797345:84798280:-1 gene:ENSRNOG00000047252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT037555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84748238:84798160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001000629 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 693 (Olr693), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000008384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84837572:84838489:-1 gene:ENSRNOG00000006408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT037556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000357 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 694 (Olr694), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84844003:84844929:-1 gene:ENSRNOG00000006415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84844003:84867031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001000628 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 695 (Olr695), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85044807:85045742:-1 gene:ENSRNOG00000050826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003749526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 4C15-like (LOC687065), mRNA. // chr3 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85044807:85045742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051501 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:84866327:84867255:-1 gene:ENSRNOG00000049594 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84844003:84867031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001001063 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 696 (Olr696), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84914723:84915643:-1 gene:ENSRNOG00000006433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84914723:84994039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001064 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 697 (Olr697), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000046271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84937577:84938500:-1 gene:ENSRNOG00000029675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000011451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84914723:84994039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_001000513 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 698 (Olr698), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84956977:84957924:-1 gene:ENSRNOG00000006445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000359 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 703 (Olr703), mRNA. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84985136:84994039:-1 gene:ENSRNOG00000050455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT037561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001000627 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 701 (Olr701), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84985136:84994039:-1 gene:ENSRNOG00000050455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 87 // 16 // 20 // 0 /// NONRATT037562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84914723:84994039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
XM_001077079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 702 (Olr702), partial mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_230251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 702 (Olr702), partial mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000042026 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:85000497:85001438:-1 gene:ENSRNOG00000031645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_001077136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 4A16-like (LOC687110), mRNA. // chr3 // 52 // 100 // 11 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85000449:85001330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_001000359 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 703 (Olr703), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000626 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 704 (Olr704), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85124089:85125012:-1 gene:ENSRNOG00000031282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000570 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 705 (Olr705), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85144412:85145332:-1 gene:ENSRNOG00000034169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85061982:85259851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 92 // 17 // 23 // 0
NM_001001065 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 707 (Olr707), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85207877:85208801:-1 gene:ENSRNOG00000049413 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:85223101:85224025:-1 gene:ENSRNOG00000048156 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT037568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85061982:85259851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001001065 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 707 (Olr707), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85207877:85208801:-1 gene:ENSRNOG00000049413 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:85223101:85224025:-1 gene:ENSRNOG00000048156 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85061982:85259851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001001066 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 709 (Olr709), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85239827:85378063:-1 gene:ENSRNOG00000046433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 96 // 13 // 23 // 0 /// NONRATT037569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85061982:85259851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001000571 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 710 (Olr710), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85061982:85259851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT037570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000625 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 711 (Olr711), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85264275:85286323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000624 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 712 (Olr712), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000360 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 713 (Olr713), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85061982:85062926:-1 gene:ENSRNOG00000046126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001000625 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 711 (Olr711), mRNA. // chr3 // 68 // 88 // 15 // 22 // 0 /// NM_001000623 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 715 (Olr715), mRNA. // chr3 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85061982:85259851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT037564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 88 // 15 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85309571:85377955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 88 // 9 // 22 // 0 /// NONRATT037573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85264275:85286323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001000923 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 714 (Olr714), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85083305:85084258:-1 gene:ENSRNOG00000049728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000623 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 715 (Olr715), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000011454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85309571:85377955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000622 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 716 (Olr716), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001000923 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 714 (Olr714), mRNA. // chr3 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000051799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85083305:85084258:-1 gene:ENSRNOG00000049728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85334831:85336023:-1 gene:ENSRNOG00000046907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001000624 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 712 (Olr712), mRNA. // chr3 // 57 // 100 // 17 // 30 // 0 /// NONRATT037565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// NONRATT037574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 57 // 100 // 17 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85309571:85377955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001000621 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 717 (Olr717), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000048787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85354038:85378063:-1 gene:ENSRNOG00000046433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 77 // 12 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000073134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85354056:85378063:-1 gene:ENSRNOG00000046433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 77 // 12 // 17 // 0 /// NONRATT037575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000361 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 718 (Olr718), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85354038:85378063:-1 gene:ENSRNOG00000046433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 96 // 11 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85354056:85378063:-1 gene:ENSRNOG00000046433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 96 // 11 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85309571:85377955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT037576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001067 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 720 (Olr720), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85430906:85431835:-1 gene:ENSRNOG00000006637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000362 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 721 (Olr721), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85439472:85440383:-1 gene:ENSRNOG00000006654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85439472:85440383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000573 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 724 (Olr724), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85506164:85507084:-1 gene:ENSRNOG00000006706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85506164:85507084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000574 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 729 (Olr729), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85600914:85601840:-1 gene:ENSRNOG00000006771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85600914:85609873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000364 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 731 (Olr731), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000004630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85657372:85658211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT037581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000008924 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:85657375:85866707:-1 gene:ENSRNOG00000006819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_001000618 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 733 (Olr733), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000004614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85689448:85690377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT037582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001000617 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 734 (Olr734), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006234543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 734 (Olr734), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000004625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85697629:85724667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT037583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001000922 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 735 (Olr735), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT037584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001001384 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 736 (Olr736), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85732207:85765029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000616 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 737 (Olr737), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000004627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85804368:85805285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000575 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 741 (Olr741), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85835262:85836188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000576 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 742 (Olr742), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85847320:85866707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000577 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 744 (Olr744), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85879343:85880266:-1 gene:ENSRNOG00000028267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85879343:85880266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017269 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, J (Ptprj), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 92 // 92 // 0 /// ENSRNOT00000049832 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:85950332:86099287:-1 gene:ENSRNOG00000034025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 90 // 90 // 0 /// U40790 // GenBank // Rattus norvegicus vascular protein tyrosine phosphatase-1 rDEP-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 96 // 87 // 90 // 0 /// GENSCAN00000029692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85949424:85996191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 79 // 79 // 0 /// NONRATT037591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 10 // 10 // 9 // 94 // 1
NM_001106489 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 3 (Ndufs3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86430806:86437983:-1 gene:ENSRNOG00000009155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86430887:86437803:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001105726 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, mitochondrial 1 (Ptpmt1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86444081:86452749:-1 gene:ENSRNOG00000009723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86444532:86452153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// Z46372 // GenBank // R.norvegicus RNA for DNA topoisomerase II. // chr3 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// NONRATT037599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001039196 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 13 (Slc39a13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86593277:86601182:-1 gene:ENSRNOG00000011981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC112321 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (metal ion transporter), member 13, mRNA (cDNA clone MGC:124816 IMAGE:7933412), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000048328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86594404:86601090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT037602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_053585 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP-kinase activating death domain (Madd), mRNA. // chr3 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000017360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86669054:86711776:-1 gene:ENSRNOG00000012568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// U72995 // GenBank // Rattus norvegicus Rab3 GDP/GTP exchange protein mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000048292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86669311:86721479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT037605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT037604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_031627 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 3 (Nr1h3), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 3 (Nr1h3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 3 (Nr1h3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234536 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 3 (Nr1h3), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86712883:86721503:-1 gene:ENSRNOG00000013172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC072499 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7096798), partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC088750 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:105398 IMAGE:7314121), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// U11685 // GenBank // Rattus norvegicus orphan receptor RLD-1 (rld-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// NONRATT037610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86669311:86721479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT037611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT037612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001271346 // RefSeq // Rattus norvegicus damage specific DNA binding protein 2 (Ddb2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86739191:86761706:-1 gene:ENSRNOG00000014071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86739191:86761706:-1 gene:ENSRNOG00000014071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000048313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86739560:86765509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001013918 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC40841; similar to hypothetical protein MGC4707 (RGD1309540), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86803733:87050021:-1 gene:ENSRNOG00000014798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// FQ212395 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA56YK15 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 87 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86804289:86812382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86954782:87050085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT037616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_022924 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor II (F2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87228705:87242228:-1 gene:ENSRNOG00000016325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// X52835 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prothrombin precursor (F2 gene). // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87228817:87242213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_003749532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 408 (LOC100362202), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003753785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 408 (LOC100362202), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87242708:87254834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000022841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87278370:87313656:-1 gene:ENSRNOG00000016984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87278370:87313656:-1 gene:ENSRNOG00000016984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ217242 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA31YH23 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001271212 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 13 (Atg13), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87278370:87313656:-1 gene:ENSRNOG00000016984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87278370:87313656:-1 gene:ENSRNOG00000016984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ217242 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA31YH23 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87280347:87300510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT037624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENSRNOT00000051642 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:87469580:87470207:-1 gene:ENSRNOG00000037626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_030859 // RefSeq // Rattus norvegicus midkine (Mdk), mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000033978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87539673:87541584:-1 gene:ENSRNOG00000017560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AB025023 // GenBank // Rattus norvegicus Mdk mRNA for midkine, complete cds. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// AF315950 // GenBank // Rattus norvegicus midkine (Mdk) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC157805 // GenBank // Rattus norvegicus midkine, mRNA (cDNA clone MGC:187207 IMAGE:9026085), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT037630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87539940:87555106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT037629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_031143 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol kinase zeta (Dgkz), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006234594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase zeta (Dgkz), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006234595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase zeta (Dgkz), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87542673:87572556:-1 gene:ENSRNOG00000017737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// D78588 // GenBank // Rattus norvegicus DGK-IV mRNA for diacylglycerol kinase, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006234596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase zeta (Dgkz), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// GENSCAN00000044766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87539940:87555106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT037632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT037633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT037634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT037636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_006234595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase zeta (Dgkz), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87564938:87637576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT037637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_001005562 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 3-like 1 (Creb3l1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87591105:87632647:-1 gene:ENSRNOG00000005413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081951 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94038 IMAGE:7122657), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87564938:87637576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_199107 // RefSeq // Rattus norvegicus glycosyltransferase-like 1B (Gyltl1b), mRNA. // chr3 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// XM_006234562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosyltransferase-like 1B (Gyltl1b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006234563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosyltransferase-like 1B (Gyltl1b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006234564 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosyltransferase-like 1B (Gyltl1b), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000051258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87979497:87985625:-1 gene:ENSRNOG00000006353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC061762 // GenBank // Rattus norvegicus glycosyltransferase-like 1B, mRNA (cDNA clone MGC:72631 IMAGE:5621056), complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000045014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87979729:87985451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT037644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT037645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
NM_053777 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 1 (Mapk8ip1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87998492:88007431:-1 gene:ENSRNOG00000006938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87998492:88016197:-1 gene:ENSRNOG00000006938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF092450 // GenBank // Rattus norvegicus JIP-1 related protein (JRP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AF108959 // GenBank // Rattus norvegicus islet-brain 1 (IB1) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AF109772 // GenBank // Rattus norvegicus JIP-1b mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF109773 // GenBank // Rattus norvegicus JIP-1c mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF109774 // GenBank // Rattus norvegicus JIP-2a mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// DQ377223 // GenBank // Rattus norvegicus JIP1 protein (JIP1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87999166:88048157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_133405 // RefSeq // Rattus norvegicus cryptochrome circadian clock 2 (Cry2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:88018205:88048159:-1 gene:ENSRNOG00000007478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY033877 // GenBank // Rattus norvegicus cryptochrome 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// BC166416 // GenBank // Rattus norvegicus cryptochrome 2 (photolyase-like), mRNA (cDNA clone MGC:187339 IMAGE:9033484), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT037653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000045034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87999166:88048157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT037654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT037655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001107748 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35 (GDP-fucose transporter), member C1 (Slc35c1), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35 (GDP-fucose transporter), member C1 (Slc35c1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:88065146:88071681:-1 gene:ENSRNOG00000007732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001271530 // RefSeq // Rattus norvegicus PR domain containing 11 (Prdm11), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066526 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:88574911:88613187:-1 gene:ENSRNOG00000008674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:88572028:88630474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001107750 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 18 (Tspan18), mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234575 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 18 (Tspan18), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:88799485:88939055:-1 gene:ENSRNOG00000008758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:88801948:88808432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_031797 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd82 molecule (Cd82), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd82 molecule (Cd82), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:89026124:89070127:-1 gene:ENSRNOG00000000047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF049882 // GenBank // Rattus norvegicus metastasis suppressor homolog (KAI1) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// BC072498 // GenBank // Rattus norvegicus Cd82 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:91618 IMAGE:7096826), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:88987851:89063763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT037671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT037673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT037669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT037674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT037675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT037676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001107751 // RefSeq // Rattus norvegicus exostosin glycosyltransferase 2 (Ext2), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:89303368:89435102:-1 gene:ENSRNOG00000008944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC166748 // GenBank // Rattus norvegicus exostoses (multiple) 2, mRNA (cDNA clone MGC:188484 IMAGE:5599208), complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT037678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89396630:89481353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000025554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89293550:89369123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT037680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001110055 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to LOC387763 protein (RGD1564664), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:89556578:89557305:-1 gene:ENSRNOG00000021687 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB010079 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ag2 protein, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89541114:89749355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT037686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001014180 // RefSeq // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 3 (E. coli) (Alkbh3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000030784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:89575454:89608081:-1 gene:ENSRNOG00000021678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC083756 // GenBank // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 3 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:94691 IMAGE:7192721), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ229710 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YP22 mRNA sequence. // chr3 // 79 // 100 // 26 // 33 // 0 /// NONRATT037687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT037689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT037691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// GENSCAN00000025181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89541114:89749355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT037688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT037690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_032066 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 12 (Hsd17b12), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000012806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:89626177:89749430:-1 gene:ENSRNOG00000009630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000047571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:89626177:89749430:-1 gene:ENSRNOG00000009630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC061543 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 12, mRNA (cDNA clone MGC:72757 IMAGE:6888949), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// FQ214777 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YB23 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U81186 // GenBank // Rattus norvegicus smooth muscle-specific 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 3 mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// NONRATT037693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89541114:89749355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT037695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NR_031792 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 129-2 (Mir129-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053665 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:89837992:89838088:-1 gene:ENSRNOG00000035542 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-129-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000637 Rattus norvegicus miR-129-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107752 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 17 (Ttc17), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006234582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 17 (Ttc17), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// XR_352446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 17 (Ttc17), transcript variant X4, misc_RNA. // chr3 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000014088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:89898709:90006207:-1 gene:ENSRNOG00000010495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC168714 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 17, mRNA (cDNA clone MGC:188727 IMAGE:9025859), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000034057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89899616:89938264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT037697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT037698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000034067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89956955:90035509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 27 // 47 // 1 /// NONRATT037699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1
NM_001127379 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis inhibitor 5 (Api5), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:90010501:90035577:-1 gene:ENSRNOG00000009689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC162003 // GenBank // Rattus norvegicus apoptosis inhibitor 5, mRNA (cDNA clone MGC:187857 IMAGE:9089120), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89956955:90035509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_003749533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Down syndrome critical region protein 3 homolog (LOC366130), mRNA. // chr3 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// XM_003753786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Down syndrome critical region protein 3 homolog (LOC366130), mRNA. // chr3 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:92414661:92496151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
GENSCAN00000007798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:94600527:94693708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENSRNOT00000036047 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:96221294:96222832:-1 gene:ENSRNOG00000027820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:96221334:96293239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001047953 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00091 (LOC499843), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:97382509:97412619:-1 gene:ENSRNOG00000032177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:97393757:97412619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSRNOT00000056935 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:97747219:97833544:-1 gene:ENSRNOG00000037567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166899 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA B230118H07, mRNA (cDNA clone MGC:188860 IMAGE:6922132), complete cds. // chr3 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// FQ214875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YK15 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:97747296:97834365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_053468 // RefSeq // Rattus norvegicus recombination activating gene 1 (Rag1), mRNA. // chr3 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000006115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:97866048:97877145:-1 gene:ENSRNOG00000004630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:97869367:97912773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001080150 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 5 like (Prr5l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 5 like (Prr5l), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 5 like (Prr5l), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 5 like (Prr5l), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:97950825:98029048:-1 gene:ENSRNOG00000004666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY724495 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cpw-j-05-0-UI unknown mRNA. // chr3 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC129104 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2600010E01, mRNA (cDNA clone MGC:156710 IMAGE:7100178), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:97951672:98007843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_001079308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 (Ldlrad3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006224537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 (Ldlrad3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 (Ldlrad3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_345406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 3 (Ldlrad3), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000006812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:98257873:98497316:-1 gene:ENSRNOG00000005136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:98257809:98497316:-1 gene:ENSRNOG00000005136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:98257809:98294140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000039107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:98188766:98225097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000042475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:98368118:98441544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001013203 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 44 (Trim44), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:98836267:98894480:-1 gene:ENSRNOG00000005191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY551091 // GenBank // Rattus norvegicus DIPB protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:98864399:98894480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001108955 // RefSeq // Rattus norvegicus four jointed box 1 (Drosophila) (Fjx1), mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000007077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:98940094:98941443:-1 gene:ENSRNOG00000005347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000043020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:98940094:98941443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001044242 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase complex, component X (Pdhx), mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:99552950:99576700:-1 gene:ENSRNOG00000006947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// BC091292 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase complex, component X, mRNA (cDNA clone IMAGE:7307052), partial cds. // chr3 // 100 // 57 // 24 // 24 // 0 /// FQ232219 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YJ18 mRNA sequence. // chr3 // 97 // 74 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:99552950:99574446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT037728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT037726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001106493 // RefSeq // Rattus norvegicus ets homologous factor (Ehf), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:99821114:99859284:-1 gene:ENSRNOG00000007484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC166742 // GenBank // Rattus norvegicus ets homologous factor, mRNA (cDNA clone MGC:188471 IMAGE:7937842), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:99822414:99835396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT037730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000022421 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:100050674:100051473:1 gene:ENSRNOG00000016713 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000026637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:100050674:100051473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0
NM_001108956 // RefSeq // Rattus norvegicus E74-like factor 5 (Elf5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000011035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:99994508:100014545:1 gene:ENSRNOG00000008282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:99961218:100014545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001107756 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 10 (GCN5-related) (Nat10), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:100298714:100338718:-1 gene:ENSRNOG00000008663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:100298716:100338733:-1 gene:ENSRNOG00000008663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:100299251:100336035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001109606 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 3 (Fbxo3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 3 (Fbxo3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 3 (Fbxo3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:100608785:100640793:1 gene:ENSRNOG00000009549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000017587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:100607606:100638634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT035352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT035353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
XM_006224539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362814 (LOC100362814), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015073 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:100703018:100819225:-1 gene:ENSRNOG00000011132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:100703018:100849227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NONRATT037752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_031787 // RefSeq // Rattus norvegicus homeodomain interacting protein kinase 3 (Hipk3), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000015775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:100989148:101054811:-1 gene:ENSRNOG00000011358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AF036959 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear serine/threonine protein kinase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC100068 // GenBank // Rattus norvegicus homeodomain interacting protein kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:112610 IMAGE:7111326), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:100989222:101067493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT037753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT037754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT037755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001109202 // RefSeq // Rattus norvegicus t-complex 11, testis-specific-like 1 (Tcp11l1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101247426:101278392:-1 gene:ENSRNOG00000042576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101246439:101278392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001029916 // RefSeq // Rattus norvegicus DEP domain containing 7 (Depdc7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101290429:101311699:-1 gene:ENSRNOG00000012262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097357 // GenBank // Rattus norvegicus DEP domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:114389 IMAGE:7442188), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101290548:101311650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001139493 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamine and serine rich 1 (Qser1), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000056808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101330796:101391977:-1 gene:ENSRNOG00000037514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// GENSCAN00000014203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101360954:101392041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101331140:101349231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 14 // 56 // 1
NM_001139493 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamine and serine rich 1 (Qser1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101330796:101391977:-1 gene:ENSRNOG00000037514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101360954:101392041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109203 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 4 (transmembrane) (Prrg4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 4 (transmembrane) (Prrg4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101408709:101433212:-1 gene:ENSRNOG00000022710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000014201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101414713:101452709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT037770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_001073068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L17-like (RGD1560017), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_342480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L17-like (RGD1560017), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000014207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101457212:101457766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001168523 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit M (Eif3m), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101614557:101632161:-1 gene:ENSRNOG00000012738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ222771 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YC02 mRNA sequence. // chr3 // 90 // 97 // 28 // 31 // 0 /// FQ229546 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YI20 mRNA sequence. // chr3 // 87 // 97 // 27 // 31 // 0 /// FQ220398 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YA16 mRNA sequence. // chr3 // 68 // 97 // 21 // 31 // 0 /// FQ230129 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YI16 mRNA sequence. // chr3 // 42 // 97 // 13 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101616114:101645484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000017932 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:101928410:101929307:-1 gene:ENSRNOG00000013424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001108586 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulocalbin 1, EF-hand calcium binding domain (Rcn1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000018074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:102026257:102040504:-1 gene:ENSRNOG00000013452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:102027900:102040052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT037778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_003749325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongator complex protein 4-like (LOC365839), mRNA. // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// XM_003753615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongator complex protein 4-like (LOC365839), mRNA. // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// BC158667 // GenBank // Rattus norvegicus similar to elongation protein 4 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:187663 IMAGE:8370237), complete cds. // chr3 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000021604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206033597:206034385:1 gene:ENSRNOG00000016146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000006385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:102353885:102575106:-1 gene:ENSRNOG00000004787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:102452818:102575106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT037780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206030903:206034952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT029601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001191853 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 24 (Dnajc24), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006234653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 24 (Dnajc24), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:102647266:102687956:-1 gene:ENSRNOG00000004842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000045648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:102647540:102692842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC099771 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7931886. // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT037784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001014045 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein (Arl14ep), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein (Arl14ep), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein (Arl14ep), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein (Arl14ep), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:104597234:104606970:-1 gene:ENSRNOG00000004891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089920 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700007P21, mRNA (cDNA clone MGC:109199 IMAGE:7306710), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:104576766:104602730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT037787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT037789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT037790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001007597 // RefSeq // Rattus norvegicus follicle stimulating hormone, beta polypeptide (Fshb), mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:104700144:104703951:-1 gene:ENSRNOG00000004898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC168724 // GenBank // Rattus norvegicus follicle stimulating hormone, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:188798 IMAGE:6889701), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// M36804 // GenBank // Rat follicle stimulating hormone beta-subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000028765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:104693660:104703248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 62 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT037793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
GENSCAN00000005177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:106576386:106643537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 61 // 12 // 14 // 0
GENSCAN00000005180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:106685732:106719085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
ENSRNOT00000006670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:106819557:106965873:-1 gene:ENSRNOG00000004926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC091215 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610027B03, mRNA (cDNA clone MGC:108934 IMAGE:7383613), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610027B03 (RGD1304978), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// XM_006234686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610027B03 (RGD1304978), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT037795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:106789564:106824772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
GENSCAN00000021910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:107257417:107289504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000033864 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:107288631:107290829:-1 gene:ENSRNOG00000028399 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 70 // 100 // 16 // 23 // 0
GENSCAN00000029337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:107859635:107860530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_022629 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrobetaine (gamma), 2-oxoglutarate dioxygenase (gamma-butyrobetaine hydroxylase) 1 (Bbox1), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006234692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrobetaine (gamma), 2-oxoglutarate dioxygenase (gamma-butyrobetaine hydroxylase) 1 (Bbox1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrobetaine (gamma), 2-oxoglutarate dioxygenase (gamma-butyrobetaine hydroxylase) 1 (Bbox1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:108023621:108062092:-1 gene:ENSRNOG00000004536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF160958 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-butyrobetaine hydroxylase (BBH) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ210746 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA23YC02 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ211247 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA14YG22 mRNA sequence. // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:108001663:108062092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001025042 // RefSeq // Rattus norvegicus fin bud initiation factor homolog (zebrafish) (Fibin), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:108151336:108151989:-1 gene:ENSRNOG00000004699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC085873 // GenBank // Rattus norvegicus fin bud initiation factor homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:94638 IMAGE:7191397), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:108151336:108151989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT037802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001080134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 3 (Ano3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000006349 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:108441385:108751667:-1 gene:ENSRNOG00000004731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:108441370:108491726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000006507 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:109015248:109029780:-1 gene:ENSRNOG00000004809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// XM_006224546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (LOC102555149), mRNA. // chr3 // 50 // 50 // 24 // 48 // 1 /// XM_006234698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930430A15 (RGD1309783), mRNA. // chr3 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// XM_006234697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (LOC102555149), mRNA. // chr3 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// GENSCAN00000024864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:108972866:109029780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000024855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:108846360:108899617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
NM_001001068 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 747 (Olr747), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109031170:109032108:-1 gene:ENSRNOG00000046816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000366 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 750 (Olr750), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109083435:109084346:-1 gene:ENSRNOG00000004920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109083435:109118984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000044536 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:109184623:109185614:-1 gene:ENSRNOG00000031639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001001069 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 760 (Olr760), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000030909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109267535:109268473:-1 gene:ENSRNOG00000027004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000024851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109267535:109268473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT037807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000996 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 766 (Olr766), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109337216:109338154:-1 gene:ENSRNOG00000050138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000611 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 767 (Olr767), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109368337:109369275:-1 gene:ENSRNOG00000045977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109368337:109397905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000919 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 768 (Olr768), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000050334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109396874:109397812:-1 gene:ENSRNOG00000047849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000371 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 769 (Olr769), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109420915:109421853:-1 gene:ENSRNOG00000050221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109420915:109425280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000918 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 774 (Olr774), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109587029:109587967:-1 gene:ENSRNOG00000046079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000374 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 775 (Olr775), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000052294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109634886:109635824:-1 gene:ENSRNOG00000045988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000608 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 776 (Olr776), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109657494:109658432:-1 gene:ENSRNOG00000047253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001000579 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 777 (Olr777), mRNA. // chr3 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// NM_001000918 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 774 (Olr774), mRNA. // chr3 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109681492:109682430:-1 gene:ENSRNOG00000050428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109587029:109587967:-1 gene:ENSRNOG00000046079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT037814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT037815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0
NM_001000579 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 777 (Olr777), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109681492:109682430:-1 gene:ENSRNOG00000050428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000607 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 778 (Olr778), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109702909:109703835:-1 gene:ENSRNOG00000004993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109702909:109703595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT037816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000606 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 780 (Olr780), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NM_001000917 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 779 (Olr779), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109719345:109720283:-1 gene:ENSRNOG00000050125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000052368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109732070:109733008:-1 gene:ENSRNOG00000048669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT037817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
NM_001000606 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 780 (Olr780), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001000917 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 779 (Olr779), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109719345:109720283:-1 gene:ENSRNOG00000050125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109732070:109733008:-1 gene:ENSRNOG00000048669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000375 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 781 (Olr781), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109743196:109744158:-1 gene:ENSRNOG00000048229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109743196:109768436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000605 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 782 (Olr782), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109763963:109764901:-1 gene:ENSRNOG00000047084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000376 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 783 (Olr783), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000047208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109793908:109794846:-1 gene:ENSRNOG00000047060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000604 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 784 (Olr784), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110052599:110053537:-1 gene:ENSRNOG00000046058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109808137:109809075:-1 gene:ENSRNOG00000050402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109991824:110053537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109808137:109809075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000603 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 785 (Olr785), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000049984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109815209:109816171:-1 gene:ENSRNOG00000045817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109815209:109816192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000073965 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:109855999:109856937:-1 gene:ENSRNOG00000045602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000023744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109855999:109940123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000602 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 788 (Olr788), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109890952:109891890:-1 gene:ENSRNOG00000031865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000377 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 789 (Olr789), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000071479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109934899:109935837:-1 gene:ENSRNOG00000048999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000072524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110077824:110078762:-1 gene:ENSRNOG00000046043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109855999:109940123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000023748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110077824:110128577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001000915 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 790 (Olr790), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109991824:109992762:-1 gene:ENSRNOG00000050791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109991824:110053537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000580 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 791 (Olr791), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110040147:110041085:-1 gene:ENSRNOG00000045900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108957 // RefSeq // Rattus norvegicus NUT midline carcinoma, family member 1 (Nutm1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110329297:110340098:-1 gene:ENSRNOG00000005111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110329518:110342656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106495 // RefSeq // Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 4 (Emc4), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110445980:110450999:-1 gene:ENSRNOG00000005719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ229681 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YB15 mRNA sequence. // chr3 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110446673:110450876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT037827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
NM_017362 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, muscarinic 5 (Chrm5), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110560292:110612656:-1 gene:ENSRNOG00000006397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M22926 // GenBank // Rat muscarinic acetylcholine receptor M5 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110560456:110562051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT037831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000034377 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:110657783:110658585:-1 gene:ENSRNOG00000026363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000031655 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:110629498:110663765:-1 gene:ENSRNOG00000026251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110629582:110632802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000027865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110710790:110851485:-1 gene:ENSRNOG00000006645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 57 // 57 // 0 /// ENSRNOT00000040306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110710790:110851485:-1 gene:ENSRNOG00000006645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 58 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000049582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110710790:110851485:-1 gene:ENSRNOG00000006645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000024058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110711665:110841362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 48 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000035178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110844251:111039976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 36 // 36 // 0
GENSCAN00000035176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:111043309:111090603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000035176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:111043309:111090603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000035188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:111169495:111260638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_002729203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group nucleosomal binding domain 2 (LOC100359546), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_003753756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group nucleosomal binding domain 2 (LOC100359546), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041537 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:111260276:111260536:-1 gene:ENSRNOG00000029847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:111169495:111260638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_019282 // RefSeq // Rattus norvegicus gremlin 1 (Grem1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:111781603:111791645:-1 gene:ENSRNOG00000026053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// Y10019 // GenBank // R.norvegicus mRNA for DRM protein. // chr3 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// NONRATT037839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_013175 // RefSeq // Rattus norvegicus secretogranin V (7B2 protein) (Scg5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:111811719:111856163:-1 gene:ENSRNOG00000007542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061560 // GenBank // Rattus norvegicus secretogranin V, mRNA (cDNA clone MGC:72901 IMAGE:6918342), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213081 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YN09 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M63901 // GenBank // Rat neuroendrocrine protein 7B2 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT037840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:111799877:111833300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001168524 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 11A (Arhgap11a), mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000010994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:111858565:111874846:-1 gene:ENSRNOG00000008115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:111846295:111920399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT037843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_019281 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, delta 2 (Gjd2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:112040926:112043925:-1 gene:ENSRNOG00000008337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// Y16898 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for connexin36. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:112041741:112043810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000056535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:112068131:112068742:-1 gene:ENSRNOG00000037362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:112068194:112068791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_019183 // RefSeq // Rattus norvegicus actin, alpha, cardiac muscle 1 (Actc1), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000011773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:112080853:112086389:-1 gene:ENSRNOG00000008536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC127451 // GenBank // Rattus norvegicus actin, alpha, cardiac muscle 1, mRNA (cDNA clone MGC:156490 IMAGE:7379877), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:112081016:112092073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001100987 // RefSeq // Rattus norvegicus aquarius intron-binding spliceosomal factor (Aqr), mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:112143851:112213881:-1 gene:ENSRNOG00000008912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC133727 // GenBank // Rattus norvegicus aquarius homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:156744 IMAGE:7108638), complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:112144111:112208005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 97 // 36 // 37 // 1
NM_001014181 // RefSeq // Rattus norvegicus diphthamine biosynthesis 6 (Dph6), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000056522 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:112579630:112708153:-1 gene:ENSRNOG00000037356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// BC087148 // GenBank // Rattus norvegicus ATP binding domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:95176 IMAGE:7131040), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT037856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 70 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:112543465:112741372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1
NM_001107758 // RefSeq // Rattus norvegicus Meis homeobox 2 (Meis2), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234753 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Meis homeobox 2 (Meis2), transcript variant X12, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:114124747:114324924:-1 gene:ENSRNOG00000004730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234750 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Meis homeobox 2 (Meis2), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// NONRATT037858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT037860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:114240213:114326158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT037861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000041388 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:115396083:115397352:-1 gene:ENSRNOG00000025066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:115396083:115396745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_019211 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 1 (calcium and DAG-regulated) (Rasgrp1), mRNA. // chr3 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000007687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:115539782:115600270:-1 gene:ENSRNOG00000005404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AF060819 // GenBank // Rattus norvegicus ras guanyl releasing protein (rasGRP) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// AF081196 // GenBank // Rattus norvegicus calcium and DAG-regulated guanine nucleotide exchange factor II mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000034833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:115540878:115576579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001013078 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrous sheath interacting protein 1 (Fsip1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrous sheath interacting protein 1 (Fsip1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:116515966:116567963:-1 gene:ENSRNOG00000005888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC082080 // GenBank // Rattus norvegicus fibrous sheath interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95248 IMAGE:7133293), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:116430448:116568721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT037872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001270986 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 176 (Gpr176), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 176 (Gpr176), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006234720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 176 (Gpr176), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000007882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:116588548:116686280:-1 gene:ENSRNOG00000005971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:116590645:116597919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT037874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001106497 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle 14 (Srp14), mRNA. // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000009866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:116791591:116795282:-1 gene:ENSRNOG00000007512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC166931 // GenBank // Rattus norvegicus signal recognition particle 14, mRNA (cDNA clone MGC:188923 IMAGE:6921277), complete cds. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// FQ210780 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA22YG21 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:116792019:116803218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT037877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT037878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT037879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_139258 // RefSeq // Rattus norvegicus Bcl2 modifying factor (Bmf), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:116851722:116869739:-1 gene:ENSRNOG00000007529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF506761 // GenBank // Rattus norvegicus BMF protein (Bmf) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053478 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, beta 2 (Plcb2), mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000034528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117039031:117058034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0
XR_085782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1565536), misc_RNA. // chr3 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// XR_086202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1565536), misc_RNA. // chr3 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000045362 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:117092046:117097427:-1 gene:ENSRNOG00000028910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117087686:117115460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_001024245 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 32 (Ccdc32), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117353970:117364626:-1 gene:ENSRNOG00000010472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC093612 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 32, mRNA (cDNA clone MGC:105687 IMAGE:7307602), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117336297:117364619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001014046 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of microtubule dynamics 3 (Rmdn3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006234824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of microtubule dynamics protein 3-like (LOC100911313), mRNA. // chr3 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117494482:117515087:-1 gene:ENSRNOG00000011690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000071591 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:119150442:119159183:-1 gene:ENSRNOG00000049007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC082081 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 82, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:95250 IMAGE:7133344), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000054365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117495153:117523271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000022914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119150442:119174919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT037893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001191740 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 17 (Dnajc17), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 17 (Dnajc17), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117530720:117564237:-1 gene:ENSRNOG00000012368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ212288 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA61YN23 mRNA sequence. // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117526740:117564210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_172011 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14D (Ppp1r14d), mRNA. // chr3 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117573558:117587801:-1 gene:ENSRNOG00000012648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY122322 // GenBank // Rattus norvegicus gastrointestinal- and brain-specific PKC-activated PP1 inhibitor (Gbpi) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117573722:117587758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT037896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_138542 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member V (Rhov), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117629288:117637987:-1 gene:ENSRNOG00000013380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF097887 // GenBank // Rattus norvegicus Chp mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC086990 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member V, mRNA (cDNA clone MGC:93183 IMAGE:7135643), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117622401:117631224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001261404 // RefSeq // Rattus norvegicus INO80 complex subunit (Ino80), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000031672 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:117738630:117817221:-1 gene:ENSRNOG00000014483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000068584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117738630:117817221:-1 gene:ENSRNOG00000014483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000054363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117738630:117817221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT037900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001107761 // RefSeq // Rattus norvegicus exonuclease 3-5 domain containing 1 (Exd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exonuclease 3-5 domain containing 1 (Exd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000038365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117874962:117902901:-1 gene:ENSRNOG00000025360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117875909:117893589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XR_085783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Opa interacting protein 5 (Oip5), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_086203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Opa interacting protein 5 (Oip5), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC167069 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9035346. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001106500 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 1 (Ndufaf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 1 (Ndufaf1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 1 (Ndufaf1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234741 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 1 (Ndufaf1), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118007327:118017688:-1 gene:ENSRNOG00000005006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118007546:118012543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033999 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 1 (Rpap1), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118019055:118135613:-1 gene:ENSRNOG00000005483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118102416:118132536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC101894 // GenBank HTC // Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7930932). // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT037910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107763 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte receptor tyrosine kinase (Ltk), mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118102135:118109011:-1 gene:ENSRNOG00000025130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118102416:118132536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT037909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1
XM_006224561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spectrin, beta, non-erythrocytic 5 (Sptbn5), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 76 // 76 // 0 /// ENSRNOT00000056264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118385424:118421768:-1 gene:ENSRNOG00000034298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 91 // 71 // 73 // 0 /// GENSCAN00000006962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118385228:118489587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 67 // 67 // 0
NM_139324 // RefSeq // Rattus norvegicus EH-domain containing 4 (Ehd4), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118425620:118489608:-1 gene:ENSRNOG00000007584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY094093 // GenBank // Rattus norvegicus pincher mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC083175 // GenBank // Rattus norvegicus EH-domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:91469 IMAGE:7105816), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118385228:118489587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_006224562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVE (Pla2g4e), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006224565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVE (Pla2g4e), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006234804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVE (Pla2g4e), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006234807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVE (Pla2g4e), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000030502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118501873:118532419:-1 gene:ENSRNOG00000024904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000006979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118501873:118565983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0
XM_001080051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVD (cytosolic) (Pla2g4d), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_002726160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVD (cytosolic) (Pla2g4d), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000056258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118589300:118609563:-1 gene:ENSRNOG00000037231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000006955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118589300:118633329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT037918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
XM_006224568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVF (Pla2g4f), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006234810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVF (Pla2g4f), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000010959 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118617958:118631265:-1 gene:ENSRNOG00000008135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000006955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118589300:118633329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_001012186 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 39 homolog (S. cerevisiae) (Vps39), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118634996:118673025:-1 gene:ENSRNOG00000008316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC087048 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 39 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93907 IMAGE:7112790), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118636606:118715549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
XM_003749546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 87A (Tmem87a), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006224569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 87A (Tmem87a), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011280 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118677063:118721810:-1 gene:ENSRNOG00000008455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000033788 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118677063:118721810:-1 gene:ENSRNOG00000008455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067836 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118677063:118721810:-1 gene:ENSRNOG00000008455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000074242 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118682945:118721798:-1 gene:ENSRNOG00000008455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT037926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000006941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118636606:118715549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1 /// NONRATT037927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
ENSRNOT00000072405 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:118830516:118868033:-1 gene:ENSRNOG00000048057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118833001:118868033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001012354 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 57 (Lrrc57), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012636 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118930877:118932607:-1 gene:ENSRNOG00000048310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000049756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118912834:118918178:-1 gene:ENSRNOG00000009143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC089966 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 57, mRNA (cDNA clone MGC:109337 IMAGE:7314989), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat-containing protein 57-like (LOC100910478), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// NONRATT037931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118913648:118925392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
XM_003749559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus codanin 1 (Cdan1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014664 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:119207104:119220303:-1 gene:ENSRNOG00000047427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119207309:119220277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_001107766 // RefSeq // Rattus norvegicus tau tubulin kinase 2 (Ttbk2), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tau tubulin kinase 2 (Ttbk2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119227873:119332743:-1 gene:ENSRNOG00000011059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119226755:119304138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001178072 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 (Ubr1), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 45 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000015086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119343521:119453073:-1 gene:ENSRNOG00000037207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// FQ212466 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YP17 mRNA sequence. // chr3 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1 /// GENSCAN00000050877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119332368:119453073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT037941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1
GENSCAN00000050902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119497822:119528074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001108590 // RefSeq // Rattus norvegicus erythrocyte membrane protein band 4.2 (Epb42), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119509976:119528195:-1 gene:ENSRNOG00000011649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC168935 // GenBank // Rattus norvegicus erythrocyte protein band 4.2, mRNA (cDNA clone MGC:189234 IMAGE:9101840), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119497822:119528074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003749563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5-like (LOC691932), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006224647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5-like (LOC691932), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119538403:119565715:-1 gene:ENSRNOG00000011710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119538403:119566382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006224579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein-glutamine gamma-glutamyltransferase Z-like (LOC102552199), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein-glutamine gamma-glutamyltransferase Z-like (LOC102552199), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056190 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119581674:119597688:-1 gene:ENSRNOG00000037203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119581674:119624949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 29 (Zscan29), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000035889 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:119661131:119670600:-1 gene:ENSRNOG00000012419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000046391 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:119666854:119670487:-1 gene:ENSRNOG00000012419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 55 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000050887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119661851:119667520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT037946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT037947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001011956 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine carboxyl methyltransferase 2 (Lcmt2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119629556:119631616:-1 gene:ENSRNOG00000043002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC083783 // GenBank // Rattus norvegicus leucine carboxyl methyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94756 IMAGE:7096502), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119629556:119631616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 binding protein 1 (Tp53bp1), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 binding protein 1 (Tp53bp1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019025 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119700000:119770850:-1 gene:ENSRNOG00000013837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033109 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119700000:119770835:-1 gene:ENSRNOG00000013837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067155 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119695001:119712230:-1 gene:ENSRNOG00000013837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000050890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119700000:119771413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT037948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001080783 // RefSeq // Rattus norvegicus diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 1 (Ppip5k1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006234840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 1 (Ppip5k1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006234841 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diphosphoinositol pentakisphosphate kinase 1 (Ppip5k1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119812648:119851674:-1 gene:ENSRNOG00000014436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000026457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119831872:119851312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_001080205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stereocilin (Strc), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020130 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119864245:119882222:-1 gene:ENSRNOG00000014845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119864488:119882222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0
NM_001012220 // RefSeq // Rattus norvegicus cation channel, sperm associated 2 (Catsper2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006234860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel, sperm associated 2 (Catsper2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000030019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119896998:119916540:-1 gene:ENSRNOG00000023064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079422 // GenBank // Rattus norvegicus cation channel, sperm associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:94963 IMAGE:7114001), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119897097:119913881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001011957 // RefSeq // Rattus norvegicus elongation factor RNA polymerase II-like 3 (Ell3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000036823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119941853:119945947:-1 gene:ENSRNOG00000022868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC084693 // GenBank // Rattus norvegicus elongation factor RNA polymerase II-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:105822 IMAGE:7107022), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119942265:119945895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT037967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001110811 // RefSeq // Rattus norvegicus serine incorporator 4 (Serinc4), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000021008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119957712:119963592:-1 gene:ENSRNOG00000015499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119957712:119963592:-1 gene:ENSRNOG00000015499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// EU220432 // GenBank // Rattus norvegicus truncated serine incorporator 4 (Serinc4) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT037968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119952237:119963268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT037969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001191964 // RefSeq // Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 1A (Mfap1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000021562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119968974:119985554:-1 gene:ENSRNOG00000015984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119969406:119985435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT037970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_001076895 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM domain containing 5 (Frmd5), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_230513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM domain containing 5 (Frmd5), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046659 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:120023641:120294028:-1 gene:ENSRNOG00000016189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064663 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:120024337:120060152:-1 gene:ENSRNOG00000016189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067258 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:120023279:120060152:-1 gene:ENSRNOG00000016189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120024330:120071872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT037973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT037974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001191571 // RefSeq // Rattus norvegicus spastic paraplegia 11 (autosomal recessive) (Spg11), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000022875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120539692:120604601:-1 gene:ENSRNOG00000021954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000013633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120539773:120604547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT037977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// NONRATT037979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1
XR_345144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein associated with topoisomerase II homolog 2 (yeast) (Patl2), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_352553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein associated with topoisomerase II homolog 2 (yeast) (Patl2), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022964 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:120607052:120614450:-1 gene:ENSRNOG00000017061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120607023:120615394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT037980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSRNOT00000073542 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:120723113:120723786:-1 gene:ENSRNOG00000047508 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120721413:120723786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024141 // RefSeq // Rattus norvegicus dual oxidase 2 (Duox2), mRNA. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120757639:120775379:-1 gene:ENSRNOG00000017395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF237962 // GenBank // Rattus norvegicus NADH/NADPH thyroid oxidase THOX2 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// AF547268 // GenBank // Rattus norvegicus FRTL-5 dual oxidase 2 short isoform (Duox2) mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000013611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120758741:120775379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0
NM_001107767 // RefSeq // Rattus norvegicus dual oxidase maturation factor 1 (Duoxa1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual oxidase maturation factor 1 (Duoxa1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual oxidase maturation factor 1 (Duoxa1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120780503:120790938:-1 gene:ENSRNOG00000018005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120780784:120783887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT037984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Src homology 2 domain containing F (Shf), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// XM_006224591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Src homology 2 domain containing F (Shf), transcript variant X7, mRNA. // chrU // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006234879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Src homology 2 domain containing F (Shf), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Src homology 2 domain containing F (Shf), transcript variant X8, mRNA. // chrU // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000064592 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:120827512:120837367:-1 gene:ENSRNOG00000028685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// XM_006224594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Src homology 2 domain containing F (Shf), transcript variant X10, mRNA. // chrU // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000005229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120831635:120862791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT037988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_031664 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 28 (sodium-coupled nucleoside transporter), member 2 (Slc28a2), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:121177530:121185650:1 gene:ENSRNOG00000018204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120897877:120920739:1 gene:ENSRNOG00000028668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY029302 // GenBank // Rattus norvegicus concentrative Na+ nucleoside cotransporter mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EU032627 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// U25055 // GenBank // Rattus norvegicus purine specific Na+ nucleoside cotransporter (SPNT) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// U66723 // GenBank // Rattus norvegicus purine-selective sodium/nucleoside cotransporter (rCNT2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120897893:121239658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031664 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 28 (sodium-coupled nucleoside transporter), member 2 (Slc28a2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AY029302 // GenBank // Rattus norvegicus concentrative Na+ nucleoside cotransporter mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// EU032627 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// U25055 // GenBank // Rattus norvegicus purine specific Na+ nucleoside cotransporter (SPNT) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// U66723 // GenBank // Rattus norvegicus purine-selective sodium/nucleoside cotransporter (rCNT2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0
NM_031031 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine amidinotransferase (L-arginine:glycine amidinotransferase) (Gatm), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:121249708:121266292:-1 gene:ENSRNOG00000000168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC081785 // GenBank // Rattus norvegicus glycine amidinotransferase (L-arginine:glycine amidinotransferase), mRNA (cDNA clone MGC:93388 IMAGE:7132560), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:121250644:121266353:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_172066 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 4 (Slc30a4), mRNA. // chr3 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:121344030:121366262:-1 gene:ENSRNOG00000000170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC086981 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:93108 IMAGE:7112403), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// Y16774 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Dri 27/ZnT4 protein, complete CDS. // chr3 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:121342118:121365996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000045281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:121573756:121574166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001013205 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin expression factor 2 (Myef2), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000007103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:123877348:123913267:-1 gene:ENSRNOG00000005258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC089980 // GenBank // Rattus norvegicus myelin basic protein expression factor 2, repressor, mRNA (cDNA clone IMAGE:7317765). // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000045820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:123878439:123913267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT037994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// NONRATT037992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT037996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_031825 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrillin 1 (Fbn1), mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 58 // 66 // 0 /// ENSRNOT00000056022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124095126:124289500:-1 gene:ENSRNOG00000007302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 66 // 66 // 0 /// AF135059 // GenBank // Rattus norvegicus fibrillin-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 58 // 66 // 0 /// GENSCAN00000045823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124095449:124172265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT037997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 66 // 66 // 0 /// GENSCAN00000045810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124174737:124263735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 17 // 17 // 11 // 66 // 1
XM_006224604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 152 (Cep152), transcript variant X8, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006234945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 152 (Cep152), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_345162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 152 (Cep152), transcript variant X9, misc_RNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031268 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:124350158:124417461:-1 gene:ENSRNOG00000008260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000047830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124379946:124449528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001191065 // RefSeq // Rattus norvegicus SHC (Src homology 2 domain containing) family, member 4 (Shc4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124421964:124514515:-1 gene:ENSRNOG00000037134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000047830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124379946:124449528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001168527 // RefSeq // Rattus norvegicus SECIS binding protein 2-like (Secisbp2l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124532094:124575388:-1 gene:ENSRNOG00000008629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124533095:124563145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT038010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_153297 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 2 (Cops2), mRNA. // chr3 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// XM_006234902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 2 (Cops2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124633196:124661562:-1 gene:ENSRNOG00000008744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB081072 // GenBank // Rattus norvegicus Trip15 mRNA for Thyroid receptor interacting protein 15, complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// BC061864 // GenBank // Rattus norvegicus COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 2 (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:72285 IMAGE:5597874), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// FQ210124 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA34YD04 mRNA sequence. // chr3 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124627816:124661412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT038015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT038016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001013920 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 227, member B (Fam227b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 227, member B (Fam227b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 227, member B (Fam227b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000055995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124793204:124952265:-1 gene:ENSRNOG00000037124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079426 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ32800, mRNA (cDNA clone MGC:94967 IMAGE:7114265), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT038020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT038021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_006224605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 4 (Atp8b4), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125071574:125195820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0
NM_017016 // RefSeq // Rattus norvegicus histidine decarboxylase (Hdc), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000041569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:125585493:125603283:-1 gene:ENSRNOG00000010262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC128724 // GenBank // Rattus norvegicus histidine decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:156577 IMAGE:8375507), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M29591 // GenBank // Rattus norvegicus histidine decarboxylase mRNA, complete cds. // chr3 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// M38759 // GenBank // Rat androgen binding protein (ABP) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125585554:125616901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001039036 // RefSeq // Rattus norvegicus GA binding protein transcription factor, beta subunit 1 (Gabpb1), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// NM_001135015 // RefSeq // Rattus norvegicus GA binding protein transcription factor, beta subunit 1-like (Gabpb1l), mRNA. // chr3 // 97 // 84 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020381 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:53581541:53582571:-1 gene:ENSRNOG00000015190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 65 // 24 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:125617857:125645734:-1 gene:ENSRNOG00000010659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// BC098859 // GenBank // Rattus norvegicus GA repeat binding protein, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:112921 IMAGE:7380252), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// FQ212553 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YL03 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:53581420:53604318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000050654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125619163:125647407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT038026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT038027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 81 // 81 // 35 // 43 // 1 /// NONRATT038029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1 /// NONRATT038030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 20 // 43 // 1
XM_001081082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 50 (Usp50), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 50 (Usp50), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015238 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:125749697:125772124:-1 gene:ENSRNOG00000011401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125749697:125820043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT038033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT038034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT038035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
AF375874 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase C-interacting kinase PLIK mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// NM_053705 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 7 (Trpm7), mRNA. // chr3 // 95 // 95 // 39 // 41 // 1 /// ENSRNOT00000033341 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:125783791:125840900:-1 gene:ENSRNOG00000011596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 33 // 41 // 1 /// GENSCAN00000050659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125749697:125820043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// NONRATT038036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1
NM_001107770 // RefSeq // Rattus norvegicus signal peptide peptidase-like 2A (Sppl2a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:125887346:125929935:-1 gene:ENSRNOG00000011652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ210986 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA19YG17 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125900474:125929935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XR_085785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC condensin I complex, subunit H (Ncaph), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_086214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC condensin I complex, subunit H (Ncaph), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_345166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC condensin I complex, subunit H (Ncaph), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_352574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC condensin I complex, subunit H (Ncaph), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016157 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:126109413:126130107:-1 gene:ENSRNOG00000012051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000052235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126109413:126129997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT038047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT038048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001025043 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein-like 1 (Itpripl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein-like 1 (Itpripl1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 75 // 62 // 12 // 16 // 0 /// XM_006234929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor interacting protein-like 1 (Itpripl1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 75 // 62 // 12 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000016172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126142197:126145117:-1 gene:ENSRNOG00000012151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC082013 // GenBank // Rattus norvegicus inositol 1,4,5-triphosphate receptor interacting protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94290 IMAGE:7132065), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126135948:126158591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT038050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001008766 // RefSeq // Rattus norvegicus cytosolic iron-sulfur assembly component 1 (Ciao1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126196997:126202542:-1 gene:ENSRNOG00000012638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088474 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic iron-sulfur protein assembly 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95143 IMAGE:7129030), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126197331:126208375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XR_352579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547230 (LOC102547230), transcript variant X1, ncRNA. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_001134834 // RefSeq // Rattus norvegicus fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 2A (Fahd2a), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127321224:127329382:1 gene:ENSRNOG00000013974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC166933 // GenBank // Rattus norvegicus fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:188927 IMAGE:6921785), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127323674:127329255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT035715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_032462 // RefSeq // Rattus norvegicus Kv channel interacting protein 3, calsenilin (Kcnip3), mRNA. // chr3 // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// XM_006234990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kv channel interacting protein 3, calsenilin (Kcnip3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000047158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127245518:127307875:1 gene:ENSRNOG00000014152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AB043892 // GenBank // Rattus norvegicus rKChIP3 mRNA for A-type potassium channel modulating protein 3, complete cds. // chr3 // 81 // 86 // 26 // 32 // 0 /// AF297118 // GenBank // Rattus norvegicus DREAM (Dream) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127225977:127307849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT035709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT035710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// NONRATT035711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_138857 // RefSeq // Rattus norvegicus prominin 2 (Prom2), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127225845:127239960:1 gene:ENSRNOG00000014710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF486828 // GenBank // Rattus norvegicus testosterone-regulated prominin-related protein (Trprp) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AF508942 // GenBank // Rattus norvegicus prominin-2.s1 splice variant mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT035706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127225977:127307849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_006234994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 135-like (LOC102556086), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
XM_003753768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 2-like (LOC100909998), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020367 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:127172411:127176402:1 gene:ENSRNOG00000015188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127162322:127178777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_012798 // RefSeq // Rattus norvegicus mal, T-cell differentiation protein (Mal), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127099278:127123286:1 gene:ENSRNOG00000015445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085755 // GenBank // Rattus norvegicus mal, T-cell differentiation protein, mRNA (cDNA clone MGC:93584 IMAGE:7108924), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U31367 // GenBank // Rattus norvegicus myelin protein MVP17 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127099355:127121553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT035705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014182 // RefSeq // Rattus norvegicus mal, T-cell differentiation protein-like (Mall), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127027482:127060350:1 gene:ENSRNOG00000015599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090079 // GenBank // Rattus norvegicus mal, T-cell differentiation protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:95101 IMAGE:7126923), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_352582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mal, T-cell differentiation protein-like (Mall), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127027512:127059067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT035704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106506 // RefSeq // Rattus norvegicus nephronophthisis 1 (juvenile) (Nphp1), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// XM_006234962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nephronophthisis 1 (juvenile) (Nphp1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000067727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126969057:127017983:1 gene:ENSRNOG00000015756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126929422:127017796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 77 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT035698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT035699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT035700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT035701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT035702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// NONRATT035703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001106506 // RefSeq // Rattus norvegicus nephronophthisis 1 (juvenile) (Nphp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212323 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA58YP03 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021328 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:126960510:126961368:1 gene:ENSRNOG00000015847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106507 // RefSeq // Rattus norvegicus BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase (Bub1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126929123:126960429:1 gene:ENSRNOG00000032778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126929422:127017796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000029795 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:126530690:126531149:1 gene:ENSRNOG00000026619 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126530690:126556601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 100 // 16 // 23 // 0
NM_001107771 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 1 (Anapc1), mRNA. // chr3 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000055875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128786183:128864613:1 gene:ENSRNOG00000016965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000032727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128818467:128872591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 49 // 23 // 23 // 0
NM_001012090 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 8 (Zc3h8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128523840:128540532:1 gene:ENSRNOG00000017647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079122 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:94125 IMAGE:7126707), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128523918:128545242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT035731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001057508 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytoskeleton associated protein 2-like (Ckap2l), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039794 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:128193419:128219403:1 gene:ENSRNOG00000026143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128173214:128223545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_017019 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 alpha (Il1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128181237:128190980:1 gene:ENSRNOG00000004575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128181237:128190980:1 gene:ENSRNOG00000004575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// D00403 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-1 alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128173214:128223545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_031512 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 beta (Il1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128133909:128140349:1 gene:ENSRNOG00000004649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091141 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 1 beta, mRNA (cDNA clone MGC:108658 IMAGE:7365029), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M98820 // GenBank // Rat interleukin 1-beta mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT035720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128009624:128139903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001134515 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein F830045P16 (RGD1566226), mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein F830045P16 (RGD1566226), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// XM_006234972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein F830045P16 (RGD1566226), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127958991:128038440:1 gene:ENSRNOG00000026061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128009624:128139903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_019374 // RefSeq // Rattus norvegicus prodynorphin (Pdyn), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127809952:127822294:1 gene:ENSRNOG00000026036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000036778 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:127412198:127412998:1 gene:ENSRNOG00000026004 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127368980:127422778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_134358 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1 (Snrpb), mRNA. // chr3 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129196990:129204596:-1 gene:ENSRNOG00000006961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// BC083694 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7189534), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC158686 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1, mRNA (cDNA clone MGC:187701 IMAGE:8374870), complete cds. // chr3 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// FQ209586 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YL02 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 63 // 17 // 20 // 0 /// M29295 // GenBank // Rat small nuclear ribonucleoparticle-associated protein (snRNP) mRNA, 3 end, clone Sm11. // chr3 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129187374:129204500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT038092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_053581 // RefSeq // Rattus norvegicus isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) beta (Idh3B), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129308614:129313298:-1 gene:ENSRNOG00000007316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC079113 // GenBank // Rattus norvegicus isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) beta, mRNA (cDNA clone MGC:94111 IMAGE:7126029), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// FQ224569 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA61YO24 mRNA sequence. // chr3 // 69 // 84 // 22 // 32 // 0 /// XM_006235047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isocitrate dehydrogenase 3 (NAD+) beta (Idh3B), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// GENSCAN00000032732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129308614:129313285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT038093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT038094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_001106511 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase X (M14 family), member 1 (Cpxm1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129414247:129421045:-1 gene:ENSRNOG00000021220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129414377:129420977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001012348 // RefSeq // Rattus norvegicus PC-esterase domain containing 1A (Pced1a), mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PC-esterase domain containing 1A (Pced1a), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129442747:129446650:-1 gene:ENSRNOG00000021221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC089908 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 113, member A, mRNA (cDNA clone MGC:109176 IMAGE:7304556), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129442071:129449567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT038099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT038098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_016992 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine vasopressin (Avp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129615610:129617588:-1 gene:ENSRNOG00000021229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// M25646 // GenBank // Rat vasopressin mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arginine vasopressin (Avp), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// M64785 // GenBank // Rat vasopressin (VP) mRNA. // chr3 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// GENSCAN00000037233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129615668:129617559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT038100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001033997 // RefSeq // Rattus norvegicus U-box domain containing 5 (Ubox5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U-box domain containing 5 (Ubox5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129628377:129670003:-1 gene:ENSRNOG00000021230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101912 // GenBank // Rattus norvegicus U-box domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:124819 IMAGE:7933511), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT038104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT038102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_003749573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FAST kinase domains 5 (Fastkd5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030308 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:129652794:129655212:-1 gene:ENSRNOG00000025804 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129630115:129658432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_172022 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3 (Lzts3), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006235013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper, putative tumor suppressor family member 3 (Lzts3), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129673988:129677772:-1 gene:ENSRNOG00000021231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129674451:129677772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106512 // RefSeq // Rattus norvegicus DDRGK domain containing 1 (Ddrgk1), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129693708:129704956:-1 gene:ENSRNOG00000021232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129693903:129704526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107775 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium borate transporter, member 11 (Slc4a11), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000028839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129722370:129725935:-1 gene:ENSRNOG00000021234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 23 // 23 // 0 /// FQ225785 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA45YM21 mRNA sequence. // chr3 // 94 // 80 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000037244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129722687:129808078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 30 // 44 // 1 /// NONRATT038110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT038111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001109206 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1565616 (RGD1565616), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129743622:129876576:-1 gene:ENSRNOG00000021237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129817362:129876483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129722687:129808078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT038113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT038116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_023967 // RefSeq // Rattus norvegicus GDNF family receptor alpha 4 (Gfra4), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GDNF family receptor alpha 4 (Gfra4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000047947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130078342:130080863:-1 gene:ENSRNOG00000021241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130078265:130081269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
XM_006224615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 33 (Adam33), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// XM_006235051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 33 (Adam33), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// XR_345201 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 33 (Adam33), transcript variant X6, misc_RNA. // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// XR_352616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 33 (Adam33), transcript variant X6, misc_RNA. // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000028854 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:130094905:130106625:-1 gene:ENSRNOG00000021242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000051404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130094905:130106625:-1 gene:ENSRNOG00000021242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT038125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001107777 // RefSeq // Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin (Siglec1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_006235026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 1, sialoadhesin (Siglec1), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000028855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130111340:130129845:-1 gene:ENSRNOG00000021243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000031211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130112941:130129133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT038129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
XM_006235029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700037H04 (RGD1311739), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// XM_006235030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700037H04 (RGD1311739), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// XM_006235031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700037H04 (RGD1311739), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130187020:130201122:-1 gene:ENSRNOG00000021245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// BC098814 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700037H04, mRNA (cDNA clone MGC:112859 IMAGE:7377135), complete cds. // chr3 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// XM_006235032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700037H04 (RGD1311739), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT038131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT038132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT038133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT038134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000031223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130187584:130201374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001039024 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm flagellar 1 (Spef1), mRNA. // chr3 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm flagellar 1 (Spef1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130212953:130216821:-1 gene:ENSRNOG00000021247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// BC099127 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931426K16 gene, mRNA (cDNA clone MGC:116270 IMAGE:7457521), complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT038135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130209889:130222054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT038136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
XM_001081194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein B (Cenpb), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000002929 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:130219464:130221882:-1 gene:ENSRNOG00000021246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130209889:130222054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT038138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 89 // 45 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT038137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_001108591 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 24 (Rnf24), mRNA. // chr3 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000028869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130344343:130345306:-1 gene:ENSRNOG00000021250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT038141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_001081206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome subunit beta type-3-like (RGD1564425), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_215842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome subunit beta type-3-like (RGD1564425), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000058238 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:130493870:130494487:-1 gene:ENSRNOG00000038259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130493870:130494487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000040382 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:130498450:130499260:-1 gene:ENSRNOG00000033002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130498535:130499260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_024483 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenoceptor alpha 1D (Adra1d), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130621199:130637207:-1 gene:ENSRNOG00000021256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L31771 // GenBank // Rat alpha 1a/d adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// M60654 // GenBank // Rat alpha-1A-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT038142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130621976:130652270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000073088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130953013:130958883:-1 gene:ENSRNOG00000045581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222062 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YI17 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001037096 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 2 (Rassf2), mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// XM_006235066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 2 (Rassf2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131075323:131109910:-1 gene:ENSRNOG00000021261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC107656 // GenBank // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124713 IMAGE:7935449), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// NONRATT038147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000034096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131064555:131180320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_017316 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 23 (ascorbic acid transporter), member 2 (Slc23a2), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006235067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 23 (ascorbic acid transporter), member 2 (Slc23a2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006235069 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 23 (ascorbic acid transporter), member 2 (Slc23a2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131132125:131224768:-1 gene:ENSRNOG00000021262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AF080453 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-coupled ascorbic acid transporter SVCT2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT038149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000034096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131064555:131180320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1
NM_001048043 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 230 (Tmem230), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 230 (Tmem230), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131364937:131374753:-1 gene:ENSRNOG00000021263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105614 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 20 open reading frame 30; HSPC274 protein, mRNA (cDNA clone MGC:125200 IMAGE:7384127), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131365935:131372751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT038151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_022381 // RefSeq // Rattus norvegicus proliferating cell nuclear antigen (Pcna), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131376228:131380189:-1 gene:ENSRNOG00000021264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC060570 // GenBank // Rattus norvegicus proliferating cell nuclear antigen, mRNA (cDNA clone MGC:72837 IMAGE:6891516), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ232129 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YO09 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// FQ234183 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YO01 mRNA sequence. // chr3 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131376547:131380046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT038153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_138978 // RefSeq // Rattus norvegicus prokineticin receptor 2 (Prokr2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131503826:131511943:-1 gene:ENSRNOG00000021266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY089975 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor I5E mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131503826:131531960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_198779 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerophosphocholine phosphodiesterase GDE1 homolog (S. cerevisiae) (Gpcpd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000028890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131661271:131700120:-1 gene:ENSRNOG00000021267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// FQ217938 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA13YI18 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000011642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131662679:131693350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT038158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1
NM_001107779 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 6 homolog (S. cerevisiae) (Trmt6), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131942470:131954191:-1 gene:ENSRNOG00000021270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// FQ209408 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YO22 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131943776:131954070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_001081242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat neuronal 4 (Lrrn4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000040802 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:132007758:132017217:-1 gene:ENSRNOG00000032989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131991808:132017217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001106515 // RefSeq // Rattus norvegicus fermitin family member 1 (Fermt1), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006235076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fermitin family member 1 (Fermt1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:132049771:132090550:-1 gene:ENSRNOG00000021274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:132027631:132130671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107780 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase) 1 (Hao1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006235096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxyacid oxidase (glycolate oxidase) 1 (Hao1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:133933147:133988954:-1 gene:ENSRNOG00000004601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC158804 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxyacid oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:188217 IMAGE:7322008), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:133928001:133988940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001100529 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin-related transmembrane protein 4 (Tmx4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000034567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:134016679:134057338:-1 gene:ENSRNOG00000024852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000048536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:134020478:134057200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001107781 // RefSeq // Rattus norvegicus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 7 (Pak7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:135530902:135841101:-1 gene:ENSRNOG00000005509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:135532212:135576474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT029690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008353 // RefSeq // Rattus norvegicus McKusick-Kaufman syndrome (Mkks), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:136347550:136365793:-1 gene:ENSRNOG00000006705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083863 // GenBank // Rattus norvegicus McKusick-Kaufman syndrome, mRNA (cDNA clone MGC:95109 IMAGE:7127425), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:136338208:136354273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT038172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_019147 // RefSeq // Rattus norvegicus jagged 1 (Jag1), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:136558688:136594097:-1 gene:ENSRNOG00000007443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L38483 // GenBank // Rattus norvegicus jagged protein mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:136560235:136593726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000072407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:138003285:138004567:-1 gene:ENSRNOG00000051005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072776 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14596908:14598190:1 gene:ENSRNOG00000048504 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072845 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:9184976:9186258:1 gene:ENSRNOG00000046314 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54940686:54941968:-1 gene:ENSRNOG00000047509 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59271854:59273136:1 gene:ENSRNOG00000048192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:172047210:172048492:1 gene:ENSRNOG00000050867 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165832069:165833351:-1 gene:ENSRNOG00000050976 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// U15425 // GenBank // Rattus norvegicus membrane- and microfilament-associated protein p58 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_002729237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high-mobility group nucleosomal binding domain 2-like (LOC100361388), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high-mobility group nucleosomal binding domain 2-like (LOC100361388), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042040 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:138747776:138748027:-1 gene:ENSRNOG00000030601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:138747776:138748033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001044243 // RefSeq // Rattus norvegicus taspase, threonine aspartase 1 (Tasp1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taspase, threonine aspartase 1 (Tasp1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:139347887:139579995:-1 gene:ENSRNOG00000004493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC105618 // GenBank // Rattus norvegicus taspase, threonine aspartase 1, mRNA (cDNA clone MGC:125209 IMAGE:7453153), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taspase, threonine aspartase 1 (Tasp1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT038175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:139372412:139579925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001100771 // RefSeq // Rattus norvegicus ESF1, nucleolar pre-rRNA processing protein, homolog (S. cerevisiae) (Esf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:139635099:139688205:-1 gene:ENSRNOG00000004777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:139677703:139688731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:139635849:139673546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001014049 // RefSeq // Rattus norvegicus sel-1 suppressor of lin-12-like 2 (C. elegans) (Sel1l2), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000033562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:140728734:140910936:-1 gene:ENSRNOG00000004852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// BC083893 // GenBank // Rattus norvegicus sel-1 suppressor of lin-12-like 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:95231 IMAGE:7132857), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT038180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000013600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:140725397:140786466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT038181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 21 // 44 // 1
NM_001126291 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin leucine rich transmembrane protein 3 (Flrt3), mRNA. // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000006454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:141134897:141147030:-1 gene:ENSRNOG00000004874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// BC160843 // GenBank // Rattus norvegicus fibronectin leucine rich transmembrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:187569 IMAGE:8361648), complete cds. // chr3 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT038183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107783 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 16B (Kif16b), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 16B (Kif16b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000036273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:143103729:143381497:-1 gene:ENSRNOG00000004951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:143113172:143198507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT038184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:143318658:143392673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT038187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
GENSCAN00000006886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144099725:144100051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_031555 // RefSeq // Rattus norvegicus beaded filament structural protein 1, filensin (Bfsp1), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006235117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beaded filament structural protein 1, filensin (Bfsp1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144374721:144408658:-1 gene:ENSRNOG00000005707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB003104 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for lens fiber cell beaded-filament structureprotein, partial cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144374846:144408646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006224655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosome binding protein 1 (Rrbp1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosome binding protein 1 (Rrbp1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007888 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:144493295:144533705:-1 gene:ENSRNOG00000005958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055602 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:144493295:144533705:-1 gene:ENSRNOG00000005958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ227765 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YP06 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144493795:144605611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001106518 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 5 (Snx5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 5 (Snx5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144812724:144831878:-1 gene:ENSRNOG00000006077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144812724:144818561:-1 gene:ENSRNOG00000006077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// BC160883 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 5, mRNA (cDNA clone MGC:188288 IMAGE:7382263), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144814418:144826726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT038193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// NONRATT038197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
NM_001106519 // RefSeq // Rattus norvegicus ovo-like zinc finger 2 (Ovol2), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ovo-like zinc finger 2 (Ovol2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144867735:144895808:-1 gene:ENSRNOG00000006850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144868173:144896307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_003753800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus double zinc ribbon and ankyrin repeat domains 1 (Dzank1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000029701 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:145054603:145112674:-1 gene:ENSRNOG00000007440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000067869 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:145062264:145112674:-1 gene:ENSRNOG00000007440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145054667:145112674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_019219 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoblastoma binding protein 9 (Rbbp9), mRNA. // chr3 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:145131500:145138290:-1 gene:ENSRNOG00000007972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF025819 // GenBank // Rattus norvegicus Rb binding protein pBOG (rBOG) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// BC101915 // GenBank // Rattus norvegicus retinoblastoma binding protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:124617 IMAGE:7935765), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145132836:145136789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT038203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT038204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
GENSCAN00000029446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146344575:146357226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSRNOT00000036834 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:146367816:146368709:-1 gene:ENSRNOG00000026836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 92 // 8 // 12 // 0
NM_053797 // RefSeq // Rattus norvegicus crooked neck pre-mRNA splicing factor 1 (Crnkl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006224679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crooked neck-like protein 1-like (LOC102548514), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000014632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:146546963:146561830:-1 gene:ENSRNOG00000010587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF245018 // GenBank // Rattus norvegicus crooked neck protein mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// BC085718 // GenBank // Rattus norvegicus crooked neck pre-mRNA splicing factor-like 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:93283 IMAGE:7190212), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000061588 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:28249274:28251346:-1 gene:ENSRNOG00000040045 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 97 // 71 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:28249274:28251346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 71 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146547125:146561754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT038212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// NONRATT038214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ral GTPase activating protein, alpha subunit 2 (catalytic) (Ralgapa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:146887749:147146568:-1 gene:ENSRNOG00000036964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146905090:147109374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_001055558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NK2 homeobox 4 (Nkx2-4), mRNA. // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_345445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NK2 homeobox 4 (Nkx2-4), mRNA. // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016915 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:147721677:147723143:-1 gene:ENSRNOG00000012647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:147721677:147723143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001191904 // RefSeq // Rattus norvegicus NK2 homeobox 2 (Nkx2-2), mRNA. // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XM_006235160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NK2 homeobox 2 (Nkx2-2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000017364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:147827035:147829407:-1 gene:ENSRNOG00000012728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT038223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:147791756:147829111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
GENSCAN00000021996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:148222052:148281371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000066912 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:148263285:148264569:-1 gene:ENSRNOG00000024875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_012743 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box A2 (Foxa2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box A2 (Foxa2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box A2 (Foxa2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:148793487:148797682:1 gene:ENSRNOG00000013133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L09647 // GenBank // Rattus norvegicus hepatocyte nuclear factor 3a (HNF-3 beta) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:148794629:148797035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT035928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_031771 // RefSeq // Rattus norvegicus thrombomodulin (Thbd), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149161661:149163394:-1 gene:ENSRNOG00000004687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// AF022743 // GenBank // Rattus norvegicus thrombomodulin mRNA, complete cds. // chr3 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// BC070903 // GenBank // Rattus norvegicus thrombomodulin, mRNA (cDNA clone MGC:91620 IMAGE:7100705), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149161661:149163394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT038228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053383 // RefSeq // Rattus norvegicus CD93 molecule (Cd93), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149189170:149193959:-1 gene:ENSRNOG00000024799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF136537 // GenBank // Rattus norvegicus C1q/MBL/SPA receptor C1qRp precursor (C1qrp) mRNA, complete cds. // chr3 // 77 // 46 // 10 // 13 // 0 /// AF160978 // GenBank // Rattus norvegicus C1qRp (C1qRp) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
AF077195 // GenBank // Rattus norvegicus Sertoli cell protein (SERT-1) mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_345280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sertoli cell protein 1 (Sert1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT038232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT038235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191966 // RefSeq // Rattus norvegicus N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein, beta (Napb), mRNA. // chr3 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000006329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149431212:149473190:-1 gene:ENSRNOG00000004753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149431212:149443489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 70 // 22 // 23 // 0
NM_139085 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin 11 (Cst11), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149504896:149507620:-1 gene:ENSRNOG00000004808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF501290 // GenBank // Rattus norvegicus cystatin 11 (Cst11) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149493722:149507604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109522 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to cystatin E2 (LOC689081), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to cystatin E2 (LOC689081), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006885 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:149597682:149601429:-1 gene:ENSRNOG00000005178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149597330:149632496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT038238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012837 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin C (Cst3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000007175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149628698:149632565:-1 gene:ENSRNOG00000005195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC087591 // GenBank // Rattus norvegicus cystatin C, mRNA (cDNA clone MGC:105556 IMAGE:7307694), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// FQ212057 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YF06 mRNA sequence. // chr3 // 80 // 83 // 12 // 15 // 0 /// FQ228336 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA9YK10 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149597330:149632496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_012718 // RefSeq // Rattus norvegicus androgen regulated protein (Andpro), mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:150274644:150281008:-1 gene:ENSRNOG00000031840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC065311 // GenBank // Rattus norvegicus androgen regulated 20 kDa protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5621067). // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M27901 // GenBank // Rat 20 kDa ventral prostate-specific protein mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// M58167 // GenBank // Rat prostatic 22-kD glycoprotein mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT038250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:150239436:150280956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// NONRATT038251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
ENSRNOT00000046355 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:150339098:150342115:-1 gene:ENSRNOG00000032769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:150339077:150498571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NONRATT038242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000023331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149804425:150189032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_199266 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin related protein 2 (P22k15), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC100632 // GenBank // Rattus norvegicus cystatin related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:124536 IMAGE:5621817), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// M58169 // GenBank // Rat prostatic 22-kD glycoprotein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000050369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149833817:150050381:-1 gene:ENSRNOG00000030184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 88 // 15 // 22 // 0 /// NONRATT038242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 88 // 15 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149804425:150189032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_003749587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cystatin-S-like (LOC689220), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cystatin-S-like (LOC689220), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049508 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:150690754:150695494:-1 gene:ENSRNOG00000030508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cystatin-S-like (LOC689168), mRNA. // chr3 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// XR_085796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Cystatin S precursor (LM protein) (LOC689212), misc_RNA. // chr3 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// XM_003753802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cystatin-S-like (LOC689168), mRNA. // chr3 // 42 // 96 // 10 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:150627371:150695494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT038257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// NONRATT038258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:150573313:150612280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0
NM_198685 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin S (Cyss), mRNA. // chr3 // 85 // 77 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:150801172:150805733:-1 gene:ENSRNOG00000030857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// J04206 // GenBank // Rat (clone 1a) cystatin S mRNA, 3 end. // chr3 // 88 // 94 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:150802480:150806219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT038259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1
NM_001037350 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Cystatin S precursor (LM protein) (LOC296235), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:150854174:150859379:-1 gene:ENSRNOG00000036952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101872 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Cystatin S precursor (LM protein), mRNA (cDNA clone MGC:124773 IMAGE:5621810), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:150856245:150862885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT038260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_002729212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein S100-A11-like (LOC100362296), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_575255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein S100-A11-like (RGD1565648), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_001106210 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease T2 (Rnaset2), mRNA. // chr3 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54425133:54442302:1 gene:ENSRNOG00000013190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC168957 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease T2, mRNA (cDNA clone MGC:189268 IMAGE:9098746), complete cds. // chr3 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007780 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:152191998:152203006:1 gene:ENSRNOG00000005920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152192001:152192645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54425229:54442206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT000382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// NONRATT035963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0
NONRATT035961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000010951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:151920447:151948322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
GENSCAN00000042291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152395500:152433256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_001034003 // RefSeq // Rattus norvegicus adipocyte plasma membrane associated protein (Apmap), mRNA. // chr3 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// XM_006235217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adipocyte plasma membrane associated protein (Apmap), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152738538:152758056:-1 gene:ENSRNOG00000006795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000040188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152739492:152758056:-1 gene:ENSRNOG00000006795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// AY325201 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-305 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC090021 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310001A20, mRNA (cDNA clone IMAGE:7325717), partial cds. // chr3 // 92 // 38 // 12 // 13 // 0 /// BC105824 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310001A20, mRNA (cDNA clone MGC:125177 IMAGE:7372968), complete cds. // chr3 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152738283:152757982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT038274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT038275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT038276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001106524 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase short-chain family member 1 (Acss1), mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152779621:152829324:-1 gene:ENSRNOG00000007102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// NM_001109546 // RefSeq // Rattus norvegicus visual system homeobox 1 (Vsx1), mRNA. // chr3 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000061469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152843269:152850868:-1 gene:ENSRNOG00000042220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// GENSCAN00000010643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152844496:152850692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152786512:152800994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
NM_001024314 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 12 (Abhd12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152989212:153051233:-1 gene:ENSRNOG00000036934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078918 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 12, mRNA (cDNA clone MGC:93694 IMAGE:7096446), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152989804:153067054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT038283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT038284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSRNOT00000045159 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:153066280:153067092:-1 gene:ENSRNOG00000036933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152989804:153067054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
XM_001060198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ninein-like (Ninl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ninein-like (Ninl), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000038447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:153080769:153124873:-1 gene:ENSRNOG00000027747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064806 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:153080769:153124873:-1 gene:ENSRNOG00000027747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000068689 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:153080769:153124873:-1 gene:ENSRNOG00000027747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153080769:153111541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001009409 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylneuraminic acid phosphatase (Nanp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153160645:153173615:-1 gene:ENSRNOG00000008307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087587 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylneuraminic acid phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:105812 IMAGE:7319178), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153161206:153173598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT038290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001072159 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD21-like 1 (S. pombe) (Rad21l1), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153517258:153542131:-1 gene:ENSRNOG00000022335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153458737:153576005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001106525 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaphilin (Snph), mRNA. // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000012727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153457050:153496985:-1 gene:ENSRNOG00000009588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// BC168917 // GenBank // Rattus norvegicus syntaphilin, mRNA (cDNA clone MGC:189203 IMAGE:7132786), complete cds. // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// XM_006235224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaphilin (Snph), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000027664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153458737:153576005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001101005 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) inhibitor subunit 1 (Psmf1), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000029620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153590719:153615931:-1 gene:ENSRNOG00000009640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC083575 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Proteasome inhibitor PI31 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93913 IMAGE:7112877), complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// FQ209572 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YN03 mRNA sequence. // chr3 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// FQ227680 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YF08 mRNA sequence. // chr3 // 54 // 88 // 15 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153591088:153612934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 66 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT038297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_021764 // RefSeq // Rattus norvegicus RanBP-type and C3HC4-type zinc finger containing 1 (Rbck1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RanBP-type and C3HC4-type zinc finger containing 1 (Rbck1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000045314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154141158:154157799:-1 gene:ENSRNOG00000006695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AB011369 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RBCK2, complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC061723 // GenBank // Rattus norvegicus RanBP-type and C3HC4-type zinc finger containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:72463 IMAGE:5598480), complete cds. // chr3 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// U48248 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C-binding protein Beta15 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154141317:154200644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_144755 // RefSeq // Rattus norvegicus tribbles pseudokinase 3 (Trib3), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154162213:154167791:-1 gene:ENSRNOG00000007319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC091120 // GenBank // Rattus norvegicus tribbles homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:108584 IMAGE:7326024), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT038315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154141317:154200644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001109561 // RefSeq // Rattus norvegicus neurensin 2 (Nrsn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154190944:154199640:-1 gene:ENSRNOG00000023935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC159407 // GenBank // Rattus norvegicus neurensin 2, mRNA (cDNA clone MGC:188674 IMAGE:8362039), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213718 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YB21 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154141317:154200644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001168650 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 12 (Sox12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154212620:154213564:-1 gene:ENSRNOG00000007514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154212620:154213564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_001072887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 3 (Zcchc3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002726251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 3 (Zcchc3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009859 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:154226833:154228035:-1 gene:ENSRNOG00000007520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154226833:154228035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT038320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001037518 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 23 (Defb23), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154275191:154279834:-1 gene:ENSRNOG00000023477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621354 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 23 (Defb23) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154275191:154279834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_134391 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 22 (Defb22), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154307906:154312188:-1 gene:ENSRNOG00000007525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF329091 // GenBank // Rattus norvegicus E-3 epididymal fluid protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AY621353 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 22 (Defb22) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154307968:154311930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT038322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037506 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 26 (Defb26), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154328304:154331697:-1 gene:ENSRNOG00000049996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154391632:154395035:-1 gene:ENSRNOG00000047529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621357 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 26 (Defb26) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037368 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 29 (Defb29), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154353772:154355231:-1 gene:ENSRNOG00000023195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AY621360 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 29 (Defb29) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154353908:154375258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT038323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037508 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 24 (Defb24), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154457908:154464040:-1 gene:ENSRNOG00000036897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY600148 // GenBank // Rattus norvegicus DEFB24 (Defb24) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AY621355 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 24 (Defb24) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154457984:154480341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001037519 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 27 (Defb27), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000055407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154476624:154480244:-1 gene:ENSRNOG00000036896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY600149 // GenBank // Rattus norvegicus DEFB27 (Defb27) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AY621358 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 27 (Defb27) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001037516 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 25 (Defb25), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154508801:154509641:-1 gene:ENSRNOG00000036895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621356 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 25 (Defb25) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001012091 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box S1 (Foxs1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154809751:154810734:-1 gene:ENSRNOG00000008529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC089055 // GenBank // Rattus norvegicus forkhead box S1, mRNA (cDNA clone MGC:105700 IMAGE:7308908), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ229549 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YI17 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154803272:154831533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT038336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108598 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 15 (Dusp15), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NM_001244784 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 15 (Dusp15), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154820985:154831486:-1 gene:ENSRNOG00000008534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154820985:154831486:-1 gene:ENSRNOG00000008534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC168211 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase-like 15, mRNA (cDNA clone MGC:188117 IMAGE:7135378), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154803272:154831533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001014762 // RefSeq // Rattus norvegicus p53 and DNA damage regulated 1 (Pdrg1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154890051:154896217:-1 gene:ENSRNOG00000008845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082021 // GenBank // Rattus norvegicus p53 and DNA damage regulated 1, mRNA (cDNA clone MGC:95148 IMAGE:7129610), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154890808:154900585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001106527 // RefSeq // Rattus norvegicus TSPY-like 3 (Tspyl3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155390626:155392698:1 gene:ENSRNOG00000026770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168711 // GenBank // Rattus norvegicus TSPY-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:188686 IMAGE:8366622), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155390706:155391710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106528 // RefSeq // Rattus norvegicus pleiomorphic adenoma gene-like 2 (Plagl2), mRNA. // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000068592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155374856:155388034:1 gene:ENSRNOG00000010086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155383073:155384299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT036069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000016287 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:155329090:155329570:1 gene:ENSRNOG00000012231 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155329262:155329570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
XM_006224712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 8430427H17 gene (RGD1563510), transcript variant X7, mRNA. // chrU // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// XM_006224713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 8430427H17 gene (RGD1563510), transcript variant X8, mRNA. // chrU // 86 // 78 // 18 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155172218:155195270:1 gene:ENSRNOG00000010417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 80 // 56 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155179837:155195270:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001030029 // RefSeq // Rattus norvegicus COMM domain containing 7 (Commd7), mRNA. // chr3 // 87 // 91 // 27 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155480868:155495101:-1 gene:ENSRNOG00000010538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC099753 // GenBank // Rattus norvegicus COMM domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:124656 IMAGE:5623299), complete cds. // chr3 // 87 // 91 // 27 // 31 // 0 /// FQ225978 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YH20 mRNA sequence. // chr3 // 81 // 91 // 25 // 31 // 0 /// XM_006235309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COMM domain containing 7 (Commd7), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// NONRATT038356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT038358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155408459:155495049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT038357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONRATT038360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001106530 // RefSeq // Rattus norvegicus Sad1 and UNC84 domain containing 5 (Sun5), mRNA. // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000037589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155714461:155733937:-1 gene:ENSRNOG00000027221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:155714500:155733851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT038362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_145721 // RefSeq // Rattus norvegicus CDK5 regulatory subunit associated protein 1 (Cdk5rap1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDK5 regulatory subunit associated protein 1 (Cdk5rap1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:155983803:156241584:-1 gene:ENSRNOG00000015696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF177477 // GenBank // Rattus norvegicus clone C42 CDK5 activator-binding protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC066666 // GenBank // Rattus norvegicus CDK5 regulatory subunit associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72290 IMAGE:5623565), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156198783:156241302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001100901 // RefSeq // Rattus norvegicus syntrophin, alpha 1 (Snta1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156245201:156278466:-1 gene:ENSRNOG00000016062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC169101 // GenBank // Rattus norvegicus syntrophin, acidic 1, mRNA (cDNA clone MGC:189519 IMAGE:5599966), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156245687:156278356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT038370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001033899 // RefSeq // Rattus norvegicus spermine synthase (Sms), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:40674244:40725965:1 gene:ENSRNOG00000007688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC101870 // GenBank // Rattus norvegicus spermine synthase, mRNA (cDNA clone MGC:124869 IMAGE:5621864), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000051667 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156315380:156316480:-1 gene:ENSRNOG00000031275 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156315380:156316480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93182071:93183069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT058779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000055622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:40674514:40725526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001098724 // RefSeq // Rattus norvegicus N-terminal EF-hand calcium binding protein 3 (Necab3), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156420461:156434946:-1 gene:ENSRNOG00000016380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156429876:156434943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156420559:156423897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT038373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT038375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT038376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001100778 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F transcription factor 1 (E2f1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156435530:156446390:-1 gene:ENSRNOG00000016708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156436721:156457846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT038381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT038382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT038383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_172223 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal membrane protein 4 (Pxmp4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156464197:156481427:-1 gene:ENSRNOG00000016975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY151834 // GenBank // Rattus norvegicus 24 kDa intrinsic membrane protein PMP-24 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC081699 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal membrane protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:93086 IMAGE:7193564), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156464853:156511550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
GENSCAN00000007465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156674061:156674249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199380 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 beta (Eif2s2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000023786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156763138:156783857:-1 gene:ENSRNOG00000017447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC062402 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 (beta), mRNA (cDNA clone MGC:72558 IMAGE:5621303), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ209519 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YD08 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ215337 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YJ22 mRNA sequence. // chr3 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// FQ227434 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YF20 mRNA sequence. // chr3 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// NONRATT038386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT038387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_017201 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosylhomocysteinase (Ahcy), mRNA. // chr3 // 89 // 86 // 16 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000024310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:156957240:156972458:-1 gene:ENSRNOG00000017777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156957944:157037042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// NONRATT038393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
GENSCAN00000003601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156957944:157037042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT038394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_181637 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class U (Pigu), mRNA. // chr3 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000034708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157171342:157253270:-1 gene:ENSRNOG00000025181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// AB086841 // GenBank // Rattus norvegicus PIGU mRNA for PIG-U, complete cds. // chr3 // 93 // 83 // 27 // 29 // 0 /// AY383714 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00059 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// BC097269 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455679. // chr3 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157245255:157253318:-1 gene:ENSRNOG00000042074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157171635:157265914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT038398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001276714 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 6 (Ncoa6), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157287951:157320293:-1 gene:ENSRNOG00000018288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000074304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157287951:157328147:-1 gene:ENSRNOG00000018288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157287951:157328147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT038400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_130423 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-glutamyltransferase 7 (Ggt7), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006235302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-glutamyltransferase 7 (Ggt7), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157373962:157397348:-1 gene:ENSRNOG00000018441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF244973 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-glutamyltranspeptidase-like protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157374533:157397336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT038406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_012962 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione synthetase (Gss), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000025657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157443739:157474042:-1 gene:ENSRNOG00000018964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC078700 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:93095 IMAGE:7110971), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L38615 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione synthetase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157444152:157475842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT038408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001100748 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 associated protein (Trpc4ap), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000026091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157518203:157588962:-1 gene:ENSRNOG00000019152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC166758 // GenBank // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 4 associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:188509 IMAGE:7930596), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000044386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157518915:157567267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT038410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT038412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_001004230 // RefSeq // Rattus norvegicus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 2 (Edem2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157597581:157623398:-1 gene:ENSRNOG00000019299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079029 // GenBank // Rattus norvegicus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:93956 IMAGE:7114041), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157597444:157628496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT038413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT038414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT038415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT038416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001106534 // RefSeq // Rattus norvegicus fer-1-like 4 (C. elegans) (Fer1l4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000026451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157929222:157964758:-1 gene:ENSRNOG00000019467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000030095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157929335:157964758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000052628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159556536:159572167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0
NM_001256465 // RefSeq // Rattus norvegicus copine I (Cpne1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006235460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine-1-like (LOC100910990), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157982351:157990066:-1 gene:ENSRNOG00000050864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159531228:159538943:1 gene:ENSRNOG00000046990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157982351:158009302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159502890:159538943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001037657 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 12 (Rbm12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine-1-like (LOC100910990), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000026700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159511588:159514686:1 gene:ENSRNOG00000049913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000047246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158005713:158023035:-1 gene:ENSRNOG00000019723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY226099 // GenBank // Rattus norvegicus swan mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:157982351:158009302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000052640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159502890:159538943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_053462 // RefSeq // Rattus norvegicus NFS1 nitrogen fixation 1 homolog (S. cerevisiae) (Nfs1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159468119:159490458:1 gene:ENSRNOG00000019736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000072945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158031045:158052752:-1 gene:ENSRNOG00000045686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF336041 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine desulfurase (NifS) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC104699 // GenBank // Rattus norvegicus NFS1 nitrogen fixation 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124952 IMAGE:7189705), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158031045:158052728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159468158:159489987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001013207 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 39 (Rbm39), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158056965:158088378:-1 gene:ENSRNOG00000019848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159431614:159464754:1 gene:ENSRNOG00000049814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC078917 // GenBank // Rattus norvegicus RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7096440). // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC091394 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 39, mRNA (cDNA clone MGC:109490 IMAGE:7322533), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000030097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158056965:158082180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159430332:159463921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0
NM_001108599 // RefSeq // Rattus norvegicus SCAN domain-containing 1 (Scand1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:159308252:159309116:1 gene:ENSRNOG00000019987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:159308619:159309047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT036182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001172118 // RefSeq // Rattus norvegicus Src-like-adaptor 2 (Sla2), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158708069:158752778:1 gene:ENSRNOG00000020337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XR_352758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554229 (LOC102554229), ncRNA. // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000055670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158706635:158752494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT036169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT036170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT036172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT036174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT036175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT036177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XR_345319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NDRG3-like (LOC679863), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XR_352760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NDRG3-like (LOC679863), misc_RNA. // chr3 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158614015:158700562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT036169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT036170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_001013923 // RefSeq // Rattus norvegicus NDRG family member 3 (Ndrg3), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC078946 // GenBank // Rattus norvegicus N-myc downstream regulated gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:93790 IMAGE:7109582), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_345319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NDRG3-like (LOC679863), misc_RNA. // chrU // 64 // 100 // 21 // 33 // 0 /// XR_352760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NDRG3-like (LOC679863), misc_RNA. // chrU // 70 // 100 // 23 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158659369:158692285:1 gene:ENSRNOG00000036813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 65 // 52 // 11 // 17 // 0 /// BC091308 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7311366. // chrU // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000055673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158614015:158700562:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 77 // 91 // 23 // 30 // 0 /// NONRATT036169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 77 // 91 // 23 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158706635:158752494:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT036170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT036171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT036172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT036174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT036175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
ENSRNOT00000008267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158525115:158589194:1 gene:ENSRNOG00000006309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158534205:158612194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 84 // 29 // 31 // 0
NM_001025768 // RefSeq // Rattus norvegicus DSN1, MIS12 kinetochore complex component (Dsn1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006235375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DSN1, MIS12 kinetochore complex component (Dsn1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158598784:158611010:1 gene:ENSRNOG00000006236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098027 // GenBank // Rattus norvegicus DSN1, MIND kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116180 IMAGE:7456020), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT036163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158534205:158612194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT036164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001191743 // RefSeq // Rattus norvegicus SAM domain and HD domain, 1 (Samhd1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000008961 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:158468734:158503809:1 gene:ENSRNOG00000006418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067748 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:158468734:158501733:1 gene:ENSRNOG00000006418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158321285:158503809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT036160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001191066 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoblastoma-like 1 (p107) (Rbl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000064824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158398177:158452482:1 gene:ENSRNOG00000006921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000055668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158321285:158503809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// NONRATT036159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
XM_002729244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 8 (Mroh8), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_003753822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 8 (Mroh8), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006224727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 8 (Mroh8), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006235389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 8 (Mroh8), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006235390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 8 (Mroh8), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000055219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158321285:158386288:1 gene:ENSRNOG00000007341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000074703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158330368:158386288:1 gene:ENSRNOG00000007341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000055668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158321285:158503809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 67 // 31 // 46 // 1 /// NONRATT036156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONRATT036155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1
NM_031577 // RefSeq // Rattus norvegicus growth hormone releasing hormone (Ghrh), mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158251824:158269850:1 gene:ENSRNOG00000007782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158251824:158270811:1 gene:ENSRNOG00000007782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// M73486 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone-releasing hormone (GHRH) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// U10156 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley growth hormone-releasing hormone (GHRH) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// U41183 // GenBank // Rattus norvegicus placental pre-progrowth hormone-releasing hormone (GHRH) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// U10155 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone-releasing hormone (GHRH) mRNA, 5 UTR with alternate exon 1. // chr3 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// Z34004 // GenBank // R.norvegicus (Sprague Dawley) mRNA for growth hormone-releasing hormone alternate exon 1. // chr3 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1 /// NONRATT036154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158254862:158268104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_133582 // RefSeq // Rattus norvegicus bladder cancer associated protein (Blcap), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:161557723:161559527:1 gene:ENSRNOG00000024437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AB071598 // GenBank // Rattus norvegicus Blcap mRNA for bladder cancer associated protein, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC087661 // GenBank // Rattus norvegicus bladder cancer associated protein homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:105330 IMAGE:7313852), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT036205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001134619 // RefSeq // Rattus norvegicus TELO2 interacting protein 1 (Tti1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:161113415:161140919:1 gene:ENSRNOG00000012880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:161113457:161140424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT036199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT036200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_019386 // RefSeq // Rattus norvegicus transglutaminase 2 (Tgm2), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160977905:161007258:1 gene:ENSRNOG00000012956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF106325 // GenBank // Rattus norvegicus tissue-type transglutaminase (TgaseII) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC062062 // GenBank // Rattus norvegicus transglutaminase 2, C polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:72474 IMAGE:5599202), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160940753:161005869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006235462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein D630003M21 (RGD1563354), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160898555:160923491:1 gene:ENSRNOG00000014424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:160898555:160933737:1 gene:ENSRNOG00000014424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160898171:160923491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT036191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NONRATT036189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT036190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NONRATT036189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_352771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911534 (LOC100911534), ncRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:160749243:160760628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_019316 // RefSeq // Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog B (Mafb), mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:162573583:162574554:-1 gene:ENSRNOG00000016037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// U56241 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor Maf1 mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:162551316:162574554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT038506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047097 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 3 (Zhx3), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 3 (Zhx3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006235475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 3 (Zhx3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006235476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 3 (Zhx3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006235478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 3 (Zhx3), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006235479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 3 (Zhx3), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000032588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:162994286:163008101:-1 gene:ENSRNOG00000027988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ017884 // GenBank // Rattus norvegicus zinc fingers and homeoboxes 3 (Zhx3) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:162989836:163008101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT038514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109901 // RefSeq // Rattus norvegicus elastin microfibril interfacer 3 (Emilin3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elastin microfibril interfacer 3 (Emilin3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:163128168:163132983:-1 gene:ENSRNOG00000016734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:163127878:163132838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT038521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107797 // RefSeq // Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 6 (Chd6), mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 38 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000022861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:163164938:163324764:-1 gene:ENSRNOG00000016744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 97 // 38 // 39 // 1 /// FQ230879 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA83YJ23 mRNA sequence. // chr3 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// GENSCAN00000007555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:163167203:163267783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001108603 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, T (Ptprt), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:163763405:164548723:-1 gene:ENSRNOG00000032656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
XR_345358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557588 (LOC102557588), ncRNA. // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000057265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:164837879:164843956:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_006224737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gametocyte specific factor 1-like (Gtsf1l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gametocyte specific factor 1-like (Gtsf1l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:165647956:165648358:-1 gene:ENSRNOG00000008136 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165647990:165717727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000010939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165905616:165968629:-1 gene:ENSRNOG00000008170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ223967 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA81YH09 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT038540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001037974 // RefSeq // Rattus norvegicus junctophilin 2 (Jph2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165905616:165968629:-1 gene:ENSRNOG00000008170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ304564 // GenBank // Rattus norvegicus junctophilin-2 (JP-2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ223967 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA81YH09 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165899612:165951640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT038541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165967511:165970385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_201560 // RefSeq // Rattus norvegicus oxidative stress responsive serine-rich 1 (Oser1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:165976713:165995482:-1 gene:ENSRNOG00000008297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ621831 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peroxide-inducible transcript 1 (Perit1 gene), clone TK1. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082096 // GenBank // Rattus norvegicus oxidative stress responsive gene, mRNA (cDNA clone MGC:95286 IMAGE:7134395), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:165977279:166004900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107799 // RefSeq // Rattus norvegicus fat storage-inducing transmembrane protein 2 (Fitm2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166047354:166053866:-1 gene:ENSRNOG00000027434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166050900:166053737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000012002 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:166180378:166180792:-1 gene:ENSRNOG00000009060 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166163659:166182010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001008312 // RefSeq // Rattus norvegicus serine incorporator 3 (Serinc3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166209489:166228921:-1 gene:ENSRNOG00000009552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085853 // GenBank // Rattus norvegicus serine incorporator 3, mRNA (cDNA clone MGC:94574 IMAGE:7190015), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// EU220431 // GenBank // Rattus norvegicus serine incorporator 3 (Serinc3) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166201005:166228828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_130399 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase (Ada), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine deaminase (Ada), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000014151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166306003:166330118:-1 gene:ENSRNOG00000010265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB059655 // GenBank // Rattus norvegicus ADA mRNA for adenosine deaminase, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC088116 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine deaminase, mRNA (cDNA clone MGC:108610 IMAGE:7384286), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// FQ221792 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA31YM19 mRNA sequence. // chr3 // 64 // 96 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166306778:166384274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT038553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_170666 // RefSeq // Rattus norvegicus regulating synaptic membrane exocytosis 4 (Rims4), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166431305:166490895:-1 gene:ENSRNOG00000010868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF548739 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic regulatory protein RIM4 gamma (Rims4) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166430681:166490895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001044244 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 34 (Tomm34), mRNA. // chr3 // 88 // 91 // 28 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166632891:166649736:-1 gene:ENSRNOG00000029799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// BC105768 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 34, mRNA (cDNA clone MGC:124787 IMAGE:7930355), complete cds. // chr3 // 88 // 91 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166633725:166654916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0
NM_053954 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, delayed-rectifier, subfamily S, member 1 (Kcns1), mRNA. // chr3 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, delayed-rectifier, subfamily S, member 1 (Kcns1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000018364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166739099:166746415:-1 gene:ENSRNOG00000013681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166740075:166747113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT038565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106538 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 5 (Wfdc5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166752479:166758652:-1 gene:ENSRNOG00000013760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166750413:166758563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008866 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 12 (Wfdc12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166766123:166766472:-1 gene:ENSRNOG00000032412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008869 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 15A (Wfdc15a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166776186:166776558:-1 gene:ENSRNOG00000026369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001009179 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 15B (Wfdc15b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 15B (Wfdc15b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 15B (Wfdc15b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166791637:166792021:-1 gene:ENSRNOG00000028779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012710 // RefSeq // Rattus norvegicus semenogelin I (Semg1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166811167:166814014:-1 gene:ENSRNOG00000013776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061977 // GenBank // Rattus norvegicus semenogelin I, mRNA (cDNA clone MGC:72513 IMAGE:5623736), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166812521:166814005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT038569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_001008872 // RefSeq // Rattus norvegicus antileukoproteinase-like 2 (Slpil2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000043470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166921184:166922634:-1 gene:ENSRNOG00000029508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166920777:166922634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT038572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001008873 // RefSeq // Rattus norvegicus antileukoproteinase-like 3 (Slpil3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166956773:166958192:-1 gene:ENSRNOG00000049280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:166933911:166983274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_053372 // RefSeq // Rattus norvegicus secretory leukocyte peptidase inhibitor (Slpi), mRNA. // chr3 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000074757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:166981831:166983296:-1 gene:ENSRNOG00000046699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// AF151982 // GenBank // Rattus norvegicus secretory leukocyte protease inhibitor (SLPI) mRNA, complete cds. // chr3 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// AF421377 // GenBank // Rattus norvegicus secretory leukocyte protease inhibitor precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// NONRATT038574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001106539 // RefSeq // Rattus norvegicus matrilin 4 (Matn4), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167018918:167033936:-1 gene:ENSRNOG00000014021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167002422:167031292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_012649 // RefSeq // Rattus norvegicus syndecan 4 (Sdc4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167052789:167071476:-1 gene:ENSRNOG00000014297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M81786 // GenBank // Rattus norvegicus ryudocan mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167054653:167071461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT038576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_003749631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53 target 5 (Tp53tg5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53 target 5 (Tp53tg5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029206 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:167099653:167102352:-1 gene:ENSRNOG00000026215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167099653:167105810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 69 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT038579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XM_002726294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type, 3 (Spint3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type, 3 (Spint3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167204714:167257759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT038580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000055160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167236462:167245493:-1 gene:ENSRNOG00000014771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GQ406385 // GenBank // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain protein 8 (Wfdc8) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000045399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167204714:167257759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_001109457 // RefSeq // Rattus norvegicus epididymal peptidase inhibitor (Eppin), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167222870:167229659:-1 gene:ENSRNOG00000028908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000045399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167204714:167257759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT038584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001253678 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 16 (Wfdc16), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167275816:167278896:-1 gene:ENSRNOG00000036777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GQ406386 // GenBank // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain protein 16 (Wfdc16) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167269100:167292581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001008868 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 9 (Wfdc9), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167290331:167292581:-1 gene:ENSRNOG00000031380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167269100:167292581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_001253677 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 11 (Wfdc11), mRNA. // chr3 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// XM_006235618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 11 (Wfdc11), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167306602:167308869:-1 gene:ENSRNOG00000033980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GQ847861 // GenBank // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain protein 11 (Wfdc11) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167303765:167308869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001106541 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 3 (Wfdc3), mRNA. // chrU // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// XM_006235533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 3 (Wfdc3), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000065751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167381768:167395577:-1 gene:ENSRNOG00000042162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT038587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001037351 // RefSeq // Rattus norvegicus troponin C type 2 (fast) (Tnnc2), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167429205:167431933:-1 gene:ENSRNOG00000015155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// DQ273679 // GenBank // Rattus norvegicus skeletal troponin C (Tnnc2) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ224501 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA63YP05 mRNA sequence. // chr3 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// FQ224755 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA55YK09 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167425492:167431840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT038589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130756 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 8 (Acot8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167446049:167457779:-1 gene:ENSRNOG00000015187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF452100 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal thioesterase 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC078751 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 8, mRNA (cDNA clone MGC:93234 IMAGE:7114090), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167448037:167457387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT038591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT038596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001025769 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 25 (Spata25), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_352805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 25 (Spata25), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167477457:167479409:-1 gene:ENSRNOG00000015744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097436 // GenBank // Rattus norvegicus chromosome 20 open reading frame 165, mRNA (cDNA clone MGC:114486 IMAGE:7455517), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107802 // RefSeq // Rattus norvegicus neuralized E3 ubiquitin protein ligase 2 (Neurl2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167481588:167484308:-1 gene:ENSRNOG00000015797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158617 // GenBank // Rattus norvegicus neuralized-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:187500 IMAGE:7388563), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167481718:167483840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001168543 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipid transfer protein (Pltp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167489818:167507385:-1 gene:ENSRNOG00000016488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167490098:167506537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
ENSRNOT00000023521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167542097:167560575:-1 gene:ENSRNOG00000017290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167549736:167560575:-1 gene:ENSRNOG00000017290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AY079168 // GenBank // Rattus norvegicus co-activator/regulatory zinc-finger protein NIF (Nif) mRNA, partial cds. // chr3 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167542097:167589011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106543 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 5 (Ncoa5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167650206:167683424:-1 gene:ENSRNOG00000017824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167651410:167694765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT038612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT038614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_019161 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 22 (Cdh22), mRNA. // chr3 // 98 // 95 // 56 // 57 // 0 /// ENSRNOT00000025150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168055444:168153121:-1 gene:ENSRNOG00000018557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 43 // 43 // 0 /// D83348 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for long type PB-cadherin, complete cds. // chr3 // 98 // 95 // 56 // 57 // 0 /// XM_006235523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 22 (Cdh22), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 44 // 60 // 1 /// GENSCAN00000034045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168053696:168099534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 38 // 38 // 0 /// D83349 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for short type PB-cadherin, complete cds. // chr3 // 85 // 85 // 51 // 60 // 1 /// GENSCAN00000034044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167764589:167960357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 32 // 60 // 1 /// NONRATT038620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 13 // 60 // 1
NM_001134955 // RefSeq // Rattus norvegicus engulfment and cell motility 2 (Elmo2), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus engulfment and cell motility protein 2-like (LOC102555457), mRNA. // chr3 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000049262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:167997379:168185837:-1 gene:ENSRNOG00000018747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:167999671:168026845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168139838:168177810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT038630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_002729249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 663 (Zfp663), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047890 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:168210633:168217863:-1 gene:ENSRNOG00000031478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168208336:168260141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_006224743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 334 (LOC685574), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 334 (LOC685574), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033873 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:168239929:168243006:-1 gene:ENSRNOG00000019099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168208336:168260141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_001072745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 334 (Zfp334), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_230857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 334 (Zfp334), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168257337:168261700:-1 gene:ENSRNOG00000019110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// FQ233975 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YK10 mRNA sequence. // chr3 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168208336:168260141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_022866 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 3 (Slc13a3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168266579:168329649:-1 gene:ENSRNOG00000019118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF080451 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-dependent dicarboxylate transporter SDCT2 (SDCT2) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AF081825 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-dependent high-affinity dicarboxylate transporter (NADC3) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC129094 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:156643 IMAGE:8365494), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168267933:168331279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_002729250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53-regulating kinase-like (LOC685619), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_003753830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53-regulating kinase-like (LOC685619), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006235633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53-regulating kinase-like (LOC685619), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XR_345384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53-regulating kinase-like (LOC685619), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XR_352828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TP53-regulating kinase-like (LOC685619), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000049468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168347846:168350355:-1 gene:ENSRNOG00000029470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000051673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168347846:168350334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT038638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT038639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_006235539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 8 (Zmynd8), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 8 (Zmynd8), transcript variant X10, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 8 (Zmynd8), transcript variant X11, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 8 (Zmynd8), transcript variant X13, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 8 (Zmynd8), transcript variant X14, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 8 (Zmynd8), transcript variant X37, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034927 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfatase 2 (Sulf2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006235596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfatase 2 (Sulf2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000008478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:168962200:169044078:-1 gene:ENSRNOG00000006052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY742216 // GenBank // Rattus norvegicus sulfatase FP2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC166410 // GenBank // Rattus norvegicus sulfatase 2, mRNA (cDNA clone MGC:187254 IMAGE:9026145), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000002228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:168965647:169022649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT038664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT038666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001135718 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchange factor 1 (Prex1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000009517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:169494331:169575983:-1 gene:ENSRNOG00000006952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000031191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:169467022:169599300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT038669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1 /// NONRATT038670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1
NM_001109907 // RefSeq // Rattus norvegicus staufen double-stranded RNA binding protein 1 (Stau1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NM_053436 // RefSeq // Rattus norvegicus staufen double-stranded RNA binding protein 1 (Stau1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:169863711:169909847:-1 gene:ENSRNOG00000007781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF227200 // GenBank // Rattus norvegicus staufen isoform Stau+I6 (Stau) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// AF290989 // GenBank // Rattus norvegicus staufen isoform Stau-I6 (Stau) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// BC101858 // GenBank // Rattus norvegicus staufen RNA binding protein homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:124588 IMAGE:7937343), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:169864666:169909948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT038678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001047860 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, NFX1-type containing 1 (Znfx1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000055127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:169948332:170007642:-1 gene:ENSRNOG00000008194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:169948332:170004190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_013186 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 1 (Kcnb1), mRNA. // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170010756:170094516:-1 gene:ENSRNOG00000046949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170009266:170016924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 38 // 8 // 10 // 0
NM_031557 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase (Ptgis), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000010891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170109319:170249262:-1 gene:ENSRNOG00000008245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC061814 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin I2 (prostacyclin) synthase, mRNA (cDNA clone MGC:72400 IMAGE:5598666), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// U53855 // GenBank // Rattus norvegicus prostacyclin synthase (ratpgis) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000009100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170099698:170129267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT038686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
GENSCAN00000009097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170188683:170247237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_053675 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 2 (Spata2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:170381599:170389997:-1 gene:ENSRNOG00000009207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF123651 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 2 (Spata2) mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC081752 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:93291 IMAGE:7134513), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170382131:170390648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT038691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001113752 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 189 (Tmem189), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC158660 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 189, mRNA (cDNA clone MGC:187649 IMAGE:8369614), complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT038698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170495922:170549229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1
XM_003753833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 65, member C (Fam65c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000035463 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:170867542:170893688:-1 gene:ENSRNOG00000010791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000030080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:170867986:170896600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0
NM_022681 // RefSeq // Rattus norvegicus activity-dependent neuroprotector homeobox (Adnp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:171077553:171087332:-1 gene:ENSRNOG00000010975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:171079699:171125416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106544 // RefSeq // Rattus norvegicus dolichyl-phosphate mannosyltransferase polypeptide 1, catalytic subunit (Dpm1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:171105899:171125442:-1 gene:ENSRNOG00000010993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT038706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:171079699:171125416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT038707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT038708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT038709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001106545 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 1 (Kcng1), mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000042631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:171047847:171178647:-1 gene:ENSRNOG00000012144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M81784 // GenBank // Rattus norvegicus K+ channel mRNA, sequence. // chr3 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:171160656:171167344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001107805 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2 (Nfatc2), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2 (Nfatc2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000065615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:171384481:171500358:-1 gene:ENSRNOG00000012175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2 (Nfatc2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006235654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 2 (Nfatc2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:171395077:171517566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001012093 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 64 (Zfp64), mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:171846883:171875427:-1 gene:ENSRNOG00000012762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// BC085820 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 64, mRNA (cDNA clone MGC:94114 IMAGE:7126205), complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NM_001106546 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 93 (Zfp93), mRNA. // chr3 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000017008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:171813567:171834301:-1 gene:ENSRNOG00000042101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000029755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:171814099:171834019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:171847161:171875347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT038716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT038719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT038717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001107813 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 217 (Zfp217), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_006235655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 217 (Zfp217), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000034669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:173096854:173107574:-1 gene:ENSRNOG00000021787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:173043926:173118746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_145670 // RefSeq // Rattus norvegicus breast carcinoma amplified sequence 1 (Bcas1), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000055111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:174061542:174136769:-1 gene:ENSRNOG00000012906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// AB029897 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for band83, complete cds. // chr3 // 97 // 72 // 30 // 31 // 0 /// AB180269 // GenBank // Rattus norvegicus Pmes-2b mRNA for PMES-2B, complete cds. // chr3 // 97 // 77 // 32 // 33 // 0 /// AB180270 // GenBank // Rattus norvegicus Pmes-2c mRNA for PMES-2C, complete cds. // chr3 // 96 // 63 // 26 // 27 // 0 /// AB180271 // GenBank // Rattus norvegicus Pmes-2d mRNA for PMES-2D, complete cds. // chr3 // 96 // 53 // 22 // 23 // 0 /// AB180272 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PMES-2deltaED, complete cds. // chr3 // 96 // 65 // 27 // 28 // 0 /// BC094306 // GenBank // Rattus norvegicus breast carcinoma amplified sequence 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7313637), partial cds. // chr3 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:174062165:174136769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT038729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT038730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 /// NONRATT038731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 /// NONRATT038732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 /// NONRATT038734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_201635 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 24, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp24a1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000046011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:174200350:174214785:-1 gene:ENSRNOG00000013062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC100059 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, subfamily 24, mRNA (cDNA clone MGC:112576 IMAGE:7129117), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:174174017:174222580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// NONRATT038736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// NONRATT038737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
ENSRNOT00000013313 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:176104932:176105667:-1 gene:ENSRNOG00000010036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000042672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176104932:176119007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0
NM_001109210 // RefSeq // Rattus norvegicus cerebellin 4 precursor (Cbln4), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176112391:176120178:-1 gene:ENSRNOG00000004372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176104932:176119007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_153296 // RefSeq // Rattus norvegicus aurora kinase A (Aurka), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000055102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176439963:176453986:-1 gene:ENSRNOG00000004479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC104676 // GenBank // Rattus norvegicus aurora kinase A, mRNA (cDNA clone MGC:124935 IMAGE:7453115), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF537333 // GenBank // Rattus norvegicus aurora A mRNA, complete cds. // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT038745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176441116:176453342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT038747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_006224757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7-like (LOC102550196), mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006235707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7-like (LOC102550196), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035071 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:176530918:176534102:-1 gene:ENSRNOG00000021551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072742 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:176530918:176534102:-1 gene:ENSRNOG00000021551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176530918:176534102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191856 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 7 (Bmp7), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:176945362:177020736:-1 gene:ENSRNOG00000007108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:176937634:176994805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT038749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001110165 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L3 (ubiquitin thiolesterase) (Uchl3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012842 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:89919807:89964085:1 gene:ENSRNOG00000009530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177158973:177200824:-1 gene:ENSRNOG00000046120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AB043959 // GenBank // Rattus norvegicus uchl3 mRNA for ubiqutin carboxyl-terminal hydrolase l3, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:89919295:89964085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177159115:177200824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0
XM_002726302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCCTC-binding factor (zinc finger protein)-like (LOC100360757), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// XM_002729255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCCTC-binding factor (zinc finger protein)-like (LOC100360757), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000034131 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:177211753:177232623:-1 gene:ENSRNOG00000028661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177211753:177243021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_133564 // RefSeq // Rattus norvegicus Z-DNA binding protein 1 (Zbp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177340451:177350801:-1 gene:ENSRNOG00000006314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ302054 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for putative tumor stroma and activated macrophage protein DLM-1, (Dlm-1 gene). // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177341753:177350801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT038754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001107807 // RefSeq // Rattus norvegicus prostate transmembrane protein, androgen induced 1 (Pmepa1), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000071853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177360059:177366886:-1 gene:ENSRNOG00000050404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177360059:177407026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
XM_001071433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 60 (Ankrd60), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006224758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 60 (Ankrd60), partial mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 60 (Ankrd60), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177710333:177714413:-1 gene:ENSRNOG00000036755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177698173:177741757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT038758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NONRATT038760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 76 // 10 // 22 // 0
XM_003749637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenomatosis polyposis coli down-regulated 1-like (Apcdd1l), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_003753840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenomatosis polyposis coli down-regulated 1-like (Apcdd1l), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006235711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenomatosis polyposis coli down-regulated 1-like (Apcdd1l), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177936441:178010000:-1 gene:ENSRNOG00000028440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC081904 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ90166, mRNA (cDNA clone MGC:93829 IMAGE:7110948), complete cds. // chrU // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006235710 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenomatosis polyposis coli down-regulated 1-like (Apcdd1l), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT038763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177939391:177953869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NONRATT038763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
NR_031940 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 296 (Mir296), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053742 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:178408788:178408865:-1 gene:ENSRNOG00000035619 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-296 // miRBase Micro RNA Database // MI0000967 Rattus norvegicus miR-296 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_031942 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 298 (Mir298), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053689 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:178409241:178409322:-1 gene:ENSRNOG00000035566 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-298 // miRBase Micro RNA Database // MI0000969 Rattus norvegicus miR-298 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000049457 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:173862306:173866982:-1 gene:ENSRNOG00000048632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0
GENSCAN00000036184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183662764:183663006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
XM_006235669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102551000), mRNA. // chrU // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006224781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102551000), mRNA. // chrU // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000051082 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:173894092:173896644:1 gene:ENSRNOG00000036747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000036173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183453247:183453981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 89 // 6 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000009721 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:183453247:183454048:1 gene:ENSRNOG00000007411 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
XM_006224765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 658B-like (LOC102556591), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006224766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 557-like (LOC100912864), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_006227123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102557433), partial mRNA. // chrU // 93 // 100 // 13 // 14 // 0
XM_003749648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L19-like (LOC100363736), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_130735 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 2 (Sycp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000006038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:183144181:183206569:1 gene:ENSRNOG00000004529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000040891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183157462:183204641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT036596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001109564 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3D (Ppp1r3d), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:183137515:183140586:1 gene:ENSRNOG00000045825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:183137771:183151391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT036595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000052843 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:3:182146485:182146604:1 gene:ENSRNOG00000034720 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001008217 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 7 (Psma7), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181692291:181698641:1 gene:ENSRNOG00000008630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC127466 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 7, mRNA (cDNA clone MGC:156537 IMAGE:7381383), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ212471 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YP03 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 79 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181692361:181698543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT036588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT036592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT036589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT036590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT036591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_001191609 // RefSeq // Rattus norvegicus laminin, alpha 5 (Lama5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 80 // 80 // 0 /// ENSRNOT00000008981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181517512:181565641:1 gene:ENSRNOG00000006479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 80 // 80 // 0 /// GENSCAN00000029603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181517512:181565476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 64 // 64 // 0 /// NONRATT036578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 16 // 16 // 13 // 80 // 1 /// NONRATT036581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 19 // 80 // 1
XM_006224780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cdk5 and Abl enzyme substrate 2 (Cables2), mRNA. // chr3 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181470268:181483108:1 gene:ENSRNOG00000036735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181478647:181483108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT036570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
XM_006224775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RBBP8 N-terminal like (Rbbp8nl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006224776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RBBP8 N-terminal like (Rbbp8nl), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RBBP8 N-terminal like (Rbbp8nl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008144 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:181458779:181465395:1 gene:ENSRNOG00000005511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181453393:181467240:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001024316 // RefSeq // Rattus norvegicus GATA binding protein 5 (Gata5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181406297:181414482:1 gene:ENSRNOG00000036732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085855 // GenBank // Rattus norvegicus GATA binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:94578 IMAGE:7190097), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:181405696:181445337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_006224779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor-like 5 (basic helix-loop-helix) (Tcfl5), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235814 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor-like 5 (basic helix-loop-helix) (Tcfl5), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179826168:179845122:-1 gene:ENSRNOG00000023770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179826046:179845027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_006224770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death inducer-obliterator 1 (Dido1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006224772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death inducer-obliterator 1 (Dido1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death inducer-obliterator 1 (Dido1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179864373:179894768:-1 gene:ENSRNOG00000009936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179887990:179894768:-1 gene:ENSRNOG00000009936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 35 // 10 // 11 // 0 /// XM_006224773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death inducer-obliterator 1 (Dido1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// GENSCAN00000005173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179864373:179894768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT038778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT038782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001109211 // RefSeq // Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member e23 (Bhlhe23), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:179979961:179980632:-1 gene:ENSRNOG00000010312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:179979961:179980632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024756 // RefSeq // Rattus norvegicus YTH domain family, member 1 (Ythdf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180125834:180141343:-1 gene:ENSRNOG00000027015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097360 // GenBank // Rattus norvegicus YTH domain family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:114393 IMAGE:7442371), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180048705:180140812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006235745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Na+/K+ transporting ATPase interacting 4 (Nkain4), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001106550 // RefSeq // Rattus norvegicus Na+/K+ transporting ATPase interacting 4 (Nkain4), mRNA. // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000048807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180154361:180174989:-1 gene:ENSRNOG00000031834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180156670:180166048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT038788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_024354 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 4 (neuronal) (Chrna4), mRNA. // chr3 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180243038:180258028:-1 gene:ENSRNOG00000011202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF007212 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinic acetylcholine receptor alpha4-2 mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// L31620 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinic acetylcholine receptor alpha 4 subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// M15682 // GenBank // Rat nicotinic acetylcholine receptor alpha subunit, 3 end. // chr3 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180246915:180258028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT038790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
ENSRNOT00000045508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180299959:180354983:-1 gene:ENSRNOG00000011624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NM_133322 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 2 (Kcnq2), mRNA. // chr3 // 82 // 82 // 36 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000049961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180299959:180354983:-1 gene:ENSRNOG00000011624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 38 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000051170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180299959:180354983:-1 gene:ENSRNOG00000011624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 82 // 36 // 44 // 1 /// AF087453 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel (KCNQ2) mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 82 // 36 // 44 // 1 /// XR_352966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, KQT-like subfamily, member 2 (Kcnq2), transcript variant X11, misc_RNA. // chr3 // 57 // 57 // 25 // 44 // 1 /// NONRATT038794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000034542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180270145:180392889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 30 // 44 // 1
NM_012660 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2 (Eef1a2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180367139:180376314:-1 gene:ENSRNOG00000012477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC074016 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:91772 IMAGE:7105980), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M62751 // GenBank // Rat statin-related protein mRNA, complete CDS. // chr3 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180270145:180392889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT038796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001108968 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine kinase 6 (Ptk6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006235789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine kinase 6 (Ptk6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180408487:180417078:-1 gene:ENSRNOG00000012987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180408565:180416787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001011961 // RefSeq // Rattus norvegicus src-related kinase lacking C-terminal regulatory tyrosine and N-terminal myristylation sites (Srms), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180419925:180426328:-1 gene:ENSRNOG00000013003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC090006 // GenBank // Rattus norvegicus src-related kinase lacking C-terminal regulatory tyrosine and N-terminal myristylation sites, mRNA (cDNA clone MGC:109505 IMAGE:7323399), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180419976:180426201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_001057758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase with zinc finger 2, transcriptional coactivator (Helz2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_230961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase with zinc finger 2, transcriptional coactivator (Helz2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000017787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180439964:180453229:-1 gene:ENSRNOG00000013267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC091404 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7324433, with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 22 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000034540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180441033:180453229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT038802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT038803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1
NM_031803 // RefSeq // Rattus norvegicus glucocorticoid modulatory element binding protein 2 (Gmeb2), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180464117:180501893:-1 gene:ENSRNOG00000013339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180465943:180501893:-1 gene:ENSRNOG00000013339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180464070:180501893:-1 gene:ENSRNOG00000013339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF059273 // GenBank // Rattus norvegicus glucocorticoid modulatory element binding protein 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF205778 // GenBank // Rattus norvegicus GMEB-2 (GMEB-2) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// AF205779 // GenBank // Rattus norvegicus GMEB-2a (GMEB-2) mRNA, complete cds. // chr3 // 83 // 75 // 20 // 24 // 0 /// AF205780 // GenBank // Rattus norvegicus GMEB-2b (GMEB-2) mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 69 // 18 // 22 // 0 /// FQ211504 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YE20 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180466182:180528475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_024346 // RefSeq // Rattus norvegicus stathmin-like 3 (Stmn3), mRNA. // chr3 // 88 // 83 // 21 // 24 // 0 /// AY004290 // GenBank // Rattus norvegicus scg10-like-protein mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 83 // 21 // 24 // 0 /// FQ214184 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YF22 mRNA sequence. // chr3 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000018697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180518143:180526259:-1 gene:ENSRNOG00000013657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT038808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180466182:180528475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT038811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_053980 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor related protein 1 (Arfrp1), mRNA. // chr3 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// XM_006235719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor related protein 1 (Arfrp1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor related protein 1 (Arfrp1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180569335:180575252:-1 gene:ENSRNOG00000013992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180569517:180574690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT038812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000074319 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:63551108:63551738:1 gene:ENSRNOG00000046012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 78 // 8 // 25 // 0 /// NONRATT038817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_001107808 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 46 (Zbtb46), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180600938:180636854:-1 gene:ENSRNOG00000014592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180601935:180636821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT038819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001109212 // RefSeq // Rattus norvegicus uridine-cytidine kinase 1-like 1 (Uckl1), mRNA. // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// XM_006235793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uridine-cytidine kinase 1-like 1 (Uckl1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// XM_006235796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uridine-cytidine kinase 1-like 1 (Uckl1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180775487:180788073:-1 gene:ENSRNOG00000050277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180759184:180788033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT038825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001107809 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 512B (Zfp512b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000020873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180788171:180798662:-1 gene:ENSRNOG00000015558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000019949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180790913:180805061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001191967 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 10 (Samd10), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000029386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180801648:180805061:-1 gene:ENSRNOG00000036719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT038830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT038831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180790913:180805061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001024781 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 18 (Sox18), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180885770:180887570:-1 gene:ENSRNOG00000016248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097973 // GenBank // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 18, mRNA (cDNA clone MGC:116103 IMAGE:7442067), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180886147:180887464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_021661 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 19 (Rgs19), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180905218:180910056:-1 gene:ENSRNOG00000016547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF068136 // GenBank // Rattus norvegicus G alpha interacting protein (GAIP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC088141 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 19, mRNA (cDNA clone MGC:108699 IMAGE:7377022), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180905565:180914405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT038836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT038837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_001106551 // RefSeq // Rattus norvegicus LKAAEAR motif containing 1 (Lkaaear1), mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC296483 (RGD1306208), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006235763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC296483 (RGD1306208), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006235764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC296483 (RGD1306208), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000034209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:180913365:180914367:-1 gene:ENSRNOG00000024815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180905565:180914405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT038838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000019951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:180942592:180947527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_001076062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha family, gene 5 (Ifna5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha family, gene 5 (Ifna5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046931 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:110928385:111011098:1 gene:ENSRNOG00000031068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110928385:110928954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY325246 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cc2-17 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001047913 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfide quinone reductase-like (yeast) (Sqrdl), mRNA. // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// XM_006234887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfide quinone reductase-like (yeast) (Sqrdl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// XM_006234888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfide quinone reductase-like (yeast) (Sqrdl), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000068129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:121438451:121477299:1 gene:ENSRNOG00000000172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// BC158559 // GenBank // Rattus norvegicus sulfide quinone reductase-like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:187237 IMAGE:7456444), complete cds. // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:121370264:121527426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
XM_003751767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta-13-like (LOC690826), mRNA. // chr18 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// XM_006222549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta-13-like (LOC690826), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 30 // 88 // 9 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060488 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30262285:30264692:1 gene:ENSRNOG00000039472 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30261872:30265976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 94 // 28 // 32 // 0
NM_001106667 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon, alpha 4 (Ifna4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110900533:110901102:-1 gene:ENSRNOG00000033823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003754056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (RGD1564897), mRNA. // chr5 // 41 // 100 // 11 // 27 // 0 /// XM_578466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (RGD1559679), mRNA. // chr5 // 41 // 100 // 11 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110846661:110901102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045433 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:111331216:111331792:1 gene:ENSRNOG00000032524 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 41 // 100 // 11 // 27 // 0
NONRATT040754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000018259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41137857:41163224:1 gene:ENSRNOG00000013521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 91 // 8 // 21 // 0 /// BC158583 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrofolate reductase, mRNA (cDNA clone MGC:187341 IMAGE:9022774), complete cds. // chr4 // 38 // 91 // 8 // 21 // 0
GENSCAN00000020191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:2761600:2766276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001191858 // RefSeq // Rattus norvegicus limb development membrane protein 1 (Lmbr1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000007189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:2172459:2330391:-1 gene:ENSRNOG00000005306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT040750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:2171743:2250584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT040751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NONRATT040750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_017221 // RefSeq // Rattus norvegicus sonic hedgehog (Shh), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:711420:720573:-1 gene:ENSRNOG00000006120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L27340 // GenBank // Rat (vhh-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:711507:761549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT040747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT040746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NONRATT040744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000071713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:475204:477469:-1 gene:ENSRNOG00000028311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000062073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:470884:477469:-1 gene:ENSRNOG00000028311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// AB190508 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA CSG245, partial sequence. // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT040744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:454230:498986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001107844 // RefSeq // Rattus norvegicus PAX interacting (with transcription-activation domain) protein 1 (Paxip1), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000009439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:4000253:4047988:1 gene:ENSRNOG00000007131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000050465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:4000253:4045603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT038918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// NONRATT038919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
ENSRNOT00000009816 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:5822422:5823733:1 gene:ENSRNOG00000007470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000042284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:5811716:5990412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NM_001109215 // RefSeq // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 2 (Xrcc2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:5865957:5884492:1 gene:ENSRNOG00000007493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211933 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YB03 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:5811716:5990412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT038923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000010349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6271095:6313413:1 gene:ENSRNOG00000007997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 28 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000071915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6271095:6313413:1 gene:ENSRNOG00000007997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 18 // 18 // 0 /// XM_006235840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific methyltransferase 2C (Kmt2c), mRNA. // chr4 // 15 // 15 // 8 // 54 // 1 /// GENSCAN00000051375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6157220:6313413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 46 // 46 // 0
GENSCAN00000051378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6348165:6447009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0
NM_184051 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 2 non-catalytic subunit (Prkag2), mRNA. // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 2 non-catalytic subunit (Prkag2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006235953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 2 non-catalytic subunit (Prkag2), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 2 non-catalytic subunit (Prkag2), transcript variant X9, mRNA. // chr4 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6770353:6816799:1 gene:ENSRNOG00000009085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// AY348865 // GenBank // Rattus norvegicus AMP-activated protein kinase gamma 2 non-catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// FQ223364 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YD07 mRNA sequence. // chr4 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// XM_006235955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, gamma 2 non-catalytic subunit (Prkag2), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT038938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT038937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// GENSCAN00000054828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6746410:6815721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_001106573 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma N (Crygn), mRNA. // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000012285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6917315:6923284:1 gene:ENSRNOG00000009226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6915504:6917459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000054836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6920058:6961655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT038941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001110489 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 86 (Wdr86), mRNA. // chr4 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// XM_006235924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 86 (Wdr86), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000040373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:6960244:6962522:1 gene:ENSRNOG00000025735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// BC089892 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1566180, mRNA (cDNA clone IMAGE:7376138), partial cds. // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// XR_353027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 86 (Wdr86), transcript variant X6, misc_RNA. // chr4 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT038945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:6920058:6961655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT038943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT038942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT038944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001011966 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 (Smarcd3), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 (Smarcd3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3 (Smarcd3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7089270:7120843:1 gene:ENSRNOG00000010077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC085349 // GenBank // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:105828 IMAGE:7107899), complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7108321:7120723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT038947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT038948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT038950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001109666 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily F (GCN20), member 2 (Abcf2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000014718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7135433:7148121:1 gene:ENSRNOG00000010609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC129119 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:156772 IMAGE:7115823), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7136135:7179578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:200700776:200702650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT038953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000072364 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:72623689:72625540:-1 gene:ENSRNOG00000046437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 66 // 89 // 21 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:72432362:72860153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT038952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT038954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001024317 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4931409K22 (LOC499971), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000014998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7157192:7168818:1 gene:ENSRNOG00000011092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000018376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7136135:7179578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT038956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// NONRATT038955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001109216 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 10 (Asb10), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000037446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7171488:7180018:1 gene:ENSRNOG00000024885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC168867 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:189115 IMAGE:7191440), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ215594 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YJ17 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7136135:7179578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001271453 // RefSeq // Rattus norvegicus gastrulation brain homeobox 1 (Gbx1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7186865:7211952:1 gene:ENSRNOG00000013369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7187045:7211952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001080153 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 1 (Tmub1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_198781 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 1 (Tmub1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 1 (Tmub1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7269540:7271681:1 gene:ENSRNOG00000013383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY603378 // GenBank // Rattus norvegicus hepatocyte odd protein shuttling protein (Hops) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7269055:7275839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
XM_006235894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fas-activated serine/threonine kinase (Fastk), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006235895 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fas-activated serine/threonine kinase (Fastk), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000064893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7271939:7275953:1 gene:ENSRNOG00000011667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC083715 // GenBank // Rattus norvegicus Fas-activated serine/threonine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:94606 IMAGE:7190690), complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// FQ228972 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YB03 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 97 // 33 // 37 // 0 /// GENSCAN00000018342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7269055:7275839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT038962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT038963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT038969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT038965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT038968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT038964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_080885 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 5 (Cdk5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7294309:7298788:1 gene:ENSRNOG00000008017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L02121 // GenBank // Rattus norvegicus (clone nclk) cdc2-related protein kinase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7294403:7298601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT038971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT038972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT038973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001191968 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 9B (Atg9b), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7325733:7332393:1 gene:ENSRNOG00000023449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7322704:7332643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_053949 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 2 (Kcnh2), mRNA. // chr4 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7366964:7398603:1 gene:ENSRNOG00000009872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AY669863 // GenBank // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel splice variant erg1b (Kcnh2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 92 // 69 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7357905:7398215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001191969 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 126, member A (Fam126a), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7670532:7731263:1 gene:ENSRNOG00000010517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 126, member A (Fam126a), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7705882:7750213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001135174 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 7 homolog (yeast) (Tomm7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7844007:7850847:1 gene:ENSRNOG00000043114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ223270 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YF10 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011847 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:122159152:122159320:-1 gene:ENSRNOG00000008953 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7844058:7858130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT038982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001170589 // RefSeq // Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 7 (Pus7), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7897731:7938568:1 gene:ENSRNOG00000010572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:7901590:7938188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT038986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NONRATT038989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106575 // RefSeq // Rattus norvegicus SRSF protein kinase 2 (Srpk2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000063994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:8073530:8191643:1 gene:ENSRNOG00000010601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC161879 // GenBank // Rattus norvegicus SFRS protein kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:187443 IMAGE:7125533), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:8126174:8190267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT038992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT038991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
GENSCAN00000044297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:8260941:8334387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001014186 // RefSeq // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 5 (Orc5), mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 5 (Orc5), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9162486:9226334:1 gene:ENSRNOG00000011519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC088447 // GenBank // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 5-like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:95091 IMAGE:7126516), complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT039003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000044640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9101383:9271791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT039001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT039004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_080394 // RefSeq // Rattus norvegicus reelin (Reln), mRNA. // chr4 // 97 // 97 // 64 // 66 // 0 /// ENSRNOT00000010521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9349481:9775752:1 gene:ENSRNOG00000021441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 98 // 97 // 65 // 66 // 0 /// ENSRNOT00000061858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9349481:9774854:1 gene:ENSRNOG00000021441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 98 // 94 // 63 // 64 // 0 /// AB049473 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for reelin, complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 64 // 66 // 0 /// AB062680 // GenBank // Rattus norvegicus Reln mRNA for reelin, complete cds. // chr4 // 97 // 97 // 64 // 66 // 0 /// GENSCAN00000011362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9752041:9774854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 13 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9728793:9750262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 13 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT039009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 99 // 99 // 66 // 67 // 0 /// GENSCAN00000011364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9547042:9724686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 47 // 47 // 32 // 68 // 1
NM_001013044 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, zeta (quinone reductase)-like 1 (Cryzl1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crystallin, zeta (quinone reductase)-like 1 (Cryzl1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// XR_345589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus quinone oxidoreductase-like protein 1-like (LOC102555727), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_353058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus quinone oxidoreductase-like protein 1-like (LOC102555727), misc_RNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35456478:35497959:-1 gene:ENSRNOG00000028014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083853 // GenBank // Rattus norvegicus crystallin, zeta (quinone reductase)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:95055 IMAGE:7124012), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000052316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:9810739:9811413:1 gene:ENSRNOG00000029686 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9810739:9811647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT013710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35461272:35479737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT013711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_030840 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 5 (Slc26a5), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9822682:9861708:1 gene:ENSRNOG00000011616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF315652 // GenBank // Rattus norvegicus prestin mRNA, partial cds. // chr4 // 81 // 58 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9815396:9861708:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_053776 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 2 (Dnajc2), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000016909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9884085:9909846:1 gene:ENSRNOG00000012392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AY322161 // GenBank // Rattus norvegicus zuotin related factor 1 (Zrf1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AY322162 // GenBank // Rattus norvegicus zuotin related factor 4 (Zrf4) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AY322163 // GenBank // Rattus norvegicus zuotin related factor 3 (Zrf3) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AY322164 // GenBank // Rattus norvegicus zuotin related factor 2 (Zrf2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// BC088838 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:105894 IMAGE:7132881), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000011357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9893655:9909785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT039015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT039016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
ENSRNOT00000051056 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:9940392:9940933:1 gene:ENSRNOG00000012776 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9932417:9941014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
NM_199381 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acyl phosphatidylethanolamine phospholipase D (Napepld), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006235906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acyl phosphatidylethanolamine phospholipase D (Napepld), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006235909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acyl phosphatidylethanolamine phospholipase D (Napepld), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:9983118:10003406:1 gene:ENSRNOG00000011363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AB112351 // GenBank // Rattus norvegicus NAPE-PLD mRNA for N-acyl-phosphatidylethanolamine-hydrolyzing phospholipase D, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9974006:9992150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9998136:10003406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT039017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_001103355 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 13 (Fbxl13), mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10021508:10177069:1 gene:ENSRNOG00000043035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC087158 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:95282 IMAGE:7134260), complete cds. // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10040598:10104074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT039018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10124764:10210000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001025044 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 146 (Ccdc146), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10360967:10414944:1 gene:ENSRNOG00000012932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10357950:10414637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_057115 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12 (Ptpn12), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006235871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12 (Ptpn12), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000017907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10623859:10695124:1 gene:ENSRNOG00000013135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// D38072 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein tyrosine phosphatase, complete cds. // chr4 // 97 // 71 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10623928:10734365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0
NM_001135872 // RefSeq // Rattus norvegicus round spermatid basic protein 1-like (Rsbn1l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000046142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10741003:10801400:1 gene:ENSRNOG00000013431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10741455:10789954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10795141:10800935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT039024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT039025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001106577 // RefSeq // Rattus norvegicus putative homeodomain transcription factor 2 (Phtf2), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000066739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:10815516:10930367:1 gene:ENSRNOG00000013517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// FQ217223 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA32YB09 mRNA sequence. // chr4 // 90 // 65 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:10840260:10952216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
GENSCAN00000050266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:12188588:12189917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_013145 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting activity polypeptide 1 (Gnai1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006978 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:13388237:13470279:1 gene:ENSRNOG00000005210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ120469 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY guanine nucleotide binding protein alpha inhibiting 1 (Gnai1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// DQ120470 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR guanine nucleotide binding protein alpha inhibiting 1 (Gnai1) mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// M17527 // GenBank // Rat GTP-binding protein (G-alpha-i1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:13440441:13469125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000051361 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:51331056:51331652:-1 gene:ENSRNOG00000033785 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000041469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:51331056:51331652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NONRATT039043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT053125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_001105712 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 3 (Grm3), mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:21395468:21492586:1 gene:ENSRNOG00000005519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:21467740:21483269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT039052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_053693 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin D binding myb-like transcription factor 1 (Dmtf1), mRNA. // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:21793677:21834126:1 gene:ENSRNOG00000005908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000044810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:21793677:21834126:1 gene:ENSRNOG00000005908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC081880 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin D binding myb-like transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:93746 IMAGE:7108159), complete cds. // chr4 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000051028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:21798387:21848889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT039058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NONRATT039058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001037186 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 40 (Slc25a40), mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000030352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22550812:22593670:-1 gene:ENSRNOG00000022837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000061342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22508236:22593670:-1 gene:ENSRNOG00000022837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC100071 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 40, mRNA (cDNA clone MGC:112631 IMAGE:7322585), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT040917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT040919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1 /// GENSCAN00000000271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:22550812:22590026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
NM_133401 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 1A (Abcb1a), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22276392:22360509:-1 gene:ENSRNOG00000008012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF257746 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance protein 1a (Pgy1) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// AF286167 // GenBank // Rattus norvegicus truncated P-glycoprotein (Mdr1a) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// AY582535 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance protein 1a (Mdr1a) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT040915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:22312890:22380801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_012623 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1B (Abcb1b), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000037712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22184034:22244635:-1 gene:ENSRNOG00000022719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000047126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22161935:22244635:-1 gene:ENSRNOG00000022719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AY082609 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein B1b mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// M81855 // GenBank // Rat mdr mRNA sequence. // chr4 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:22071670:22244164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_012690 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 4 (Abcb4), mRNA. // chr4 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// XM_006235997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 4 (Abcb4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 4 (Abcb4), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 4 (Abcb4), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:22071627:22128783:-1 gene:ENSRNOG00000029207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// L15079 // GenBank // Rat p-glycoprotein mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:22071670:22244164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT040913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000037380 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:23468958:23472302:1 gene:ENSRNOG00000022379 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 89 // 68 // 17 // 19 // 0
XM_003749682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 804B (Zfp804b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045346 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:24041694:24155068:1 gene:ENSRNOG00000031306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:24117235:24155068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000036604 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:24764439:24765155:1 gene:ENSRNOG00000022340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 95 // 16 // 19 // 0
GENSCAN00000038699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:24900981:24930689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0
NM_001106629 // RefSeq // Rattus norvegicus six transmembrane epithelial antigen of the prostate 1 (Steap1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:25343969:25354487:1 gene:ENSRNOG00000000017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220437 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YN21 mRNA sequence. // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT039075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:25343851:25432562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001107846 // RefSeq // Rattus norvegicus STEAP family member 2, metalloreductase (Steap2), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus STEAP family member 2, metalloreductase (Steap2), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus STEAP family member 2, metalloreductase (Steap2), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus STEAP family member 2, metalloreductase (Steap2), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:25414631:25434255:1 gene:ENSRNOG00000006076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:25343851:25432562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000008517 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:25445688:25516719:1 gene:ENSRNOG00000006114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009264 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:25445688:25516719:1 gene:ENSRNOG00000006114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068355 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:25484511:25516719:1 gene:ENSRNOG00000006114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC061963 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA A330021E22, mRNA (cDNA clone MGC:72627 IMAGE:5600085), complete cds. // chr4 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// XM_003749688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910867 (LOC100910867), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// XM_003753858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910867 (LOC100910867), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000024735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:25508558:25516719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT039081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT039082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001100815 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP-binding protein 10 (putative) (Gtpbp10), mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:25542933:25560451:1 gene:ENSRNOG00000007098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:25544956:25602360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1
NM_001100813 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 12 (Cldn12), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:25593560:25599715:1 gene:ENSRNOG00000039862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:25544956:25602360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108617 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 14 (Cdk14), mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006236038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 14 (Cdk14), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006236039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 14 (Cdk14), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006236042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 14 (Cdk14), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:25732186:26326121:1 gene:ENSRNOG00000007151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT039093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_021266 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled class receptor 1 (Fzd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:26377857:26382008:1 gene:ENSRNOG00000016242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L02529 // GenBank // Rattus norvegicus Drosophila polarity gene (frizzled) homologue mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT039097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012941 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 51 (Cyp51), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC087033 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, subfamily 51, mRNA (cDNA clone MGC:93630 IMAGE:7130609), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000009985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27078469:27096431:1 gene:ENSRNOG00000007234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// U17697 // GenBank // Rattus norvegicus lanosterol 14-alpha-demethylase mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// NONRATT039098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_053499 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial transcription termination factor (Mterf), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000010425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27268602:27275598:1 gene:ENSRNOG00000007899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT039100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT039099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// NONRATT039101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// NONRATT039102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1
NM_001134781 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and IBR domain containing 1 (Ankib1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006236050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and IBR domain containing 1 (Ankib1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000007940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27376703:27500432:1 gene:ENSRNOG00000005502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000067954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27376703:27441635:1 gene:ENSRNOG00000005502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC158823 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and IBR domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7376150), complete cds. // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000052505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27483117:27497673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 39 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT039104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT039103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// NONRATT039105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NONRATT039104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27452433:27459647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENSRNOT00000011666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27550561:27561759:1 gene:ENSRNOG00000008613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27550561:27558338:1 gene:ENSRNOG00000008613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC088430 // GenBank // Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7124558), partial cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006224820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 1 (Gatad1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// XM_006236076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 1 (Gatad1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT039106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT039107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001024246 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 48 (Rbm48), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:27601633:27611886:1 gene:ENSRNOG00000008980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC093393 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C030048B08, mRNA (cDNA clone MGC:112752 IMAGE:7388615), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:27602324:27611150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NONRATT040997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT040999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001173511 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 132 (Ccdc132), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:28344519:28455450:1 gene:ENSRNOG00000009894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28341627:28454896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT039113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001135777 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 1 (Gngt1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:28880230:28883215:1 gene:ENSRNOG00000010546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28880465:28909071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022396 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 11 (Gng11), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000074048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:31291227:31296663:1 gene:ENSRNOG00000050469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000075326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:28897478:28902917:1 gene:ENSRNOG00000047914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC097320 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 11, mRNA (cDNA clone MGC:114323 IMAGE:7455035), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
GENSCAN00000023963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:29363116:29391212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NM_053356 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type I, alpha 2 (Col1a2), mRNA. // chr4 // 96 // 98 // 48 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000016423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:31405253:31440179:1 gene:ENSRNOG00000011292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// AF121217 // GenBank // Rattus norvegicus pro-alpha-2(I) collagen (col1a2) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 98 // 48 // 50 // 0 /// BC108298 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7098053. // chr4 // 98 // 98 // 49 // 50 // 0 /// GENSCAN00000019708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:31410085:31446906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000023964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:29448010:29479779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 43 // 43 // 0
GENSCAN00000013131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:29820178:29822176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000030657 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:29820178:29822190:1 gene:ENSRNOG00000025795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0
NM_053473 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 9A (Ppp1r9a), mRNA. // chr4 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// XM_006236065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 9A (Ppp1r9a), transcript variant X9, mRNA. // chr4 // 92 // 72 // 24 // 26 // 0 /// XM_006236067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 9A (Ppp1r9a), transcript variant X11, mRNA. // chr4 // 92 // 72 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:29885036:30148874:1 gene:ENSRNOG00000008869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// U72994 // GenBank // Rattus norvegicus neurabin mRNA, complete cds. // chr4 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT039119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:30087768:30154741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NONRATT039119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000017542 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:29956518:29957302:1 gene:ENSRNOG00000013130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NM_001024318 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 4 (Asb4), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:30369571:30407201:1 gene:ENSRNOG00000009197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AY577765 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing protein 4 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:30377427:30414775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT039123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_019234 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein cytoplasmic 1 intermediate chain 1 (Dync1i1), mRNA. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000013184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:30715225:31028000:1 gene:ENSRNOG00000009700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT039126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:30901418:30978760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT039127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT039128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT039129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT039130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NONRATT039140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006224829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus distal-less homeobox 6 (Dlx6), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014468 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:32242555:32244664:1 gene:ENSRNOG00000010822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// Evf2 // lncRNA Db // rn4 chr4:31,722,073-31,770,275 // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:32155796:32244918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001047914 // RefSeq // Rattus norvegicus ACN9 homolog (S. cerevisiae) (Acn9), mRNA. // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000015286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:32359888:32421681:1 gene:ENSRNOG00000011283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000050827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:32404589:32421681:1 gene:ENSRNOG00000011283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:32404589:32421681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
GENSCAN00000035231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:32513727:32530211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT039144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000014971 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:32529845:32530218:1 gene:ENSRNOG00000011265 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NM_022950 // RefSeq // Rattus norvegicus core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1 (C1galt1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase, 1 (C1galt1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:33766334:33796913:1 gene:ENSRNOG00000007804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF157963 // GenBank // Rattus norvegicus core1 UDP-galactose:N-acetylgalactosamine-alpha-R beta 1,3-galactosyltransferase (C1galt1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:33782827:33805628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001173554 // RefSeq // Rattus norvegicus missing oocyte, meiosis regulator, homolog (Drosophila) (Mios), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:34098618:34124193:1 gene:ENSRNOG00000007924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:34104483:34123387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
BC083591 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7132615. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ230459 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YA07 mRNA sequence. // chr4 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT039160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT039156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NM_001177442 // RefSeq // Rattus norvegicus glucocorticoid induced transcript 1 (Glcci1), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:34142803:34470794:1 gene:ENSRNOG00000008524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:34401915:34469984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC166806 // GenBank // Rattus norvegicus similar to testhymin, mRNA (cDNA clone MGC:188609 IMAGE:7939013), complete cds. // chr4 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_012994 // RefSeq // Rattus norvegicus neurexophilin 1 (Nxph1), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:35136613:35138564:1 gene:ENSRNOG00000008939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// BC105770 // GenBank // Rattus norvegicus neurexophilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:124635 IMAGE:7930348), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// L27867 // GenBank // Rattus norvegicus neurexophilin mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT039161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000072150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:35390082:35390868:1 gene:ENSRNOG00000046220 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:35088994:35390537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// NONRATT039164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
XR_345666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548177 (LOC102548177), ncRNA. // chr4 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// XR_353147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548177 (LOC102548177), ncRNA. // chr4 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
NM_001024319 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor type 2 member 7-like (Tas2r7l), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:39580999:39581910:1 gene:ENSRNOG00000024685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047955 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC500035 (LOC500035), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:39988834:39997113:1 gene:ENSRNOG00000031207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000036912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:39975348:40114796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001271104 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box P2 (Foxp2), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_002729285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P2 (Foxp2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P2 (Foxp2), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006236118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P2 (Foxp2), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:41461965:41525487:1 gene:ENSRNOG00000005429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:41461965:41496421:1 gene:ENSRNOG00000005429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 95 // 63 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:41479180:41525487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// GENSCAN00000023363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:41370500:41467831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001271104 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box P2 (Foxp2), mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_002729285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P2 (Foxp2), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_006236117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box P2 (Foxp2), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:41279446:41297869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0
NM_001105668 // RefSeq // Rattus norvegicus MyoD family inhibitor domain containing (Mdfic), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:41790495:41870159:1 gene:ENSRNOG00000031036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006236103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MyoD family inhibitor domain containing (Mdfic), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT039185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT039186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000032198 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:44521931:44522629:1 gene:ENSRNOG00000021489 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000002971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:44521931:44522629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_001039344 // RefSeq // Rattus norvegicus testis derived transcript (Tes), mRNA. // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:44929781:44968303:1 gene:ENSRNOG00000032978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC129069 // GenBank // Rattus norvegicus testis derived transcript, mRNA (cDNA clone MGC:156466 IMAGE:7100907), complete cds. // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// DQ339047 // GenBank // Rattus norvegicus testis derived transcript mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000002975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:44944503:44964693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_131914 // RefSeq // Rattus norvegicus caveolin 2 (Cav2), mRNA. // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45179465:45186995:1 gene:ENSRNOG00000006411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF439780 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin-2 mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 58 // 12 // 15 // 0 /// BC062059 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin 2, mRNA (cDNA clone MGC:72322 IMAGE:5598269), complete cds. // chr4 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// FQ209775 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA3YJ04 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:45179642:45188403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT039199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_031556 // RefSeq // Rattus norvegicus caveolin 1, caveolae protein (Cav1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NM_133651 // RefSeq // Rattus norvegicus caveolin 1, caveolae protein (Cav1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006236130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caveolin 1, caveolae protein (Cav1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006236131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caveolin 1, caveolae protein (Cav1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000009253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45203434:45236460:1 gene:ENSRNOG00000006694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF439779 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin-1 beta mRNA, complete cds. // chr4 // 85 // 72 // 11 // 13 // 0 /// BC161826 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin 1, caveolae protein, mRNA (cDNA clone MGC:187299 IMAGE:9100114), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF439778 // GenBank // Rattus norvegicus caveolin-1 alpha mRNA, complete cds. // chr4 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// NONRATT039201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// NONRATT039202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NM_031517 // RefSeq // Rattus norvegicus met proto-oncogene (Met), mRNA. // chr4 // 98 // 95 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000009662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45382347:45459517:1 gene:ENSRNOG00000007079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// U65007 // GenBank // Rattus norvegicus hepatocyte growth factor receptor mRNA, complete cds. // chr4 // 98 // 95 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000030878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:45415376:45459477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001009180 // RefSeq // Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 2 (Capza2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45541352:45577239:1 gene:ENSRNOG00000028549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC101867 // GenBank // Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:124519 IMAGE:7938377), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214747 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YE12 mRNA sequence. // chr4 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// FQ215656 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YF03 mRNA sequence. // chr4 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000055165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:45541409:45575854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT039206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001004102 // RefSeq // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 7 (ST7), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 7 (ST7), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006236134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 7 (ST7), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45604814:45851998:1 gene:ENSRNOG00000007474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000042575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45604814:45851998:1 gene:ENSRNOG00000007474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:45604814:45851998:1 gene:ENSRNOG00000007474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC078945 // GenBank // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:7109570). // chr4 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC099820 // GenBank // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 7, mRNA (cDNA clone MGC:124523 IMAGE:7930680), complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT039210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:45724854:45849430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// NONRATT039211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_031506 // RefSeq // Rattus norvegicus cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (Cftr), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:42281456:42448568:1 gene:ENSRNOG00000008284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FJ959076 // GenBank // Rattus norvegicus cystic fibrosis transmembrane conductance regulator splice variant (CFTR) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:42316198:42409769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT039187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000011609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:102704851:102757330:-1 gene:ENSRNOG00000008607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:102704851:102757330:-1 gene:ENSRNOG00000008607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:102704851:102759211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:42716098:42722627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// FQ226547 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA26YC13 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT055590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:42721859:42724244:1 gene:ENSRNOG00000039539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT055593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001109459 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to protein disulfide isomerase-associated 6 (LOC685171), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000060602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:43314662:43315880:1 gene:ENSRNOG00000039535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT039194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:43140677:43315198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_031730 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Shal-related subfamily, member 2 (Kcnd2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:48100008:48607643:1 gene:ENSRNOG00000029610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// M59980 // GenBank // Rat voltage-gated K+ channel protein (RK5) mRNA, complete cds. // chr4 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT039216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:48590905:48628203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
GENSCAN00000017538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:48324053:48333022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034107 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 3 (Ing3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006236142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 3 (Ing3), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:48812271:48837948:1 gene:ENSRNOG00000005496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC100082 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:112729 IMAGE:7385392), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:48780951:48837126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT039221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT039220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// NONRATT039222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT039223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
XM_001059531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-like and PC-esterase domain containing 1 (Cped1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// XM_002729287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-like and PC-esterase domain containing 1 (Cped1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000038566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:48851657:48999716:1 gene:ENSRNOG00000021840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// BC100097 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ21986, mRNA (cDNA clone IMAGE:7375263), complete cds. // chr4 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:48977895:49031102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1 /// NONRATT039226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1
NM_001109223 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 16 (Wnt16), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 16 (Wnt16), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000007822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:49160277:49170576:1 gene:ENSRNOG00000005781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:49160558:49178362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001170685 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor-type, Z polypeptide 1 (Ptprz1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NM_013080 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor-type, Z polypeptide 1 (Ptprz1), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:49730552:49927326:1 gene:ENSRNOG00000006030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// U04998 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley phosphacan mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// U09357 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-type protein tyrosine phosphatase zeta/beta mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:49800530:49926528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000008917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51404857:51420450:1 gene:ENSRNOG00000006365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000060494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51377551:51420450:1 gene:ENSRNOG00000006365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// BC097405 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing protein 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:7453988), partial cds. // chrU // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT039240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000051966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51024088:51074901:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000051974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51376376:51408947:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001024320 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 6 (Hyal6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51898520:51911185:1 gene:ENSRNOG00000021695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082016 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 6, mRNA (cDNA clone MGC:94293 IMAGE:7132110), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51899343:51909637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT039241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001100780 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 4 (Hyal4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51916581:51935494:1 gene:ENSRNOG00000007212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51924526:51936116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_053967 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm adhesion molecule 1 (PH-20 hyaluronidase, zona pellucida binding) (Spam1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51969252:51974137:1 gene:ENSRNOG00000007231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC081748 // GenBank // Rattus norvegicus sperm adhesion molecule 1 (PH-20 hyaluronidase, zona pellucida binding), mRNA (cDNA clone MGC:93268 IMAGE:7134081), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// X89999 // GenBank // R.norvegicus mRNA for 2B1 antigen protein. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51969442:51973900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT039242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000060478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:52004870:52045423:1 gene:ENSRNOG00000039466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC079447 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7115646. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001024321 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 5 (Hyal5), mRNA. // chr4 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// BC091219 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 5, mRNA (cDNA clone MGC:108951 IMAGE:7112082), complete cds. // chr4 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// XM_006236167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 5 (Hyal5), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// XM_006236168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hyaluronoglucosaminidase 5 (Hyal5), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000040149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:52016340:52082816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT039244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NONRATT026572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT007288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
ENSRNOT00000010055 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:55281865:55282272:1 gene:ENSRNOG00000007658 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55263923:55310963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_024149 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 5 (Arf5), mRNA. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:55463191:55466117:1 gene:ENSRNOG00000007806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087692 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:105422 IMAGE:7310424), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// L12384 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 5 mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55463285:55464854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT039249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001004232 // RefSeq // Rattus norvegicus fascin actin-bundling protein 3, testicular (Fscn3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000063987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:55467469:55476889:1 gene:ENSRNOG00000007942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC079410 // GenBank // Rattus norvegicus fascin homolog 3, actin-bundling protein, testicular (Strongylocentrotus purpuratus), mRNA (cDNA clone MGC:94950 IMAGE:7113273), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55465373:55474992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_022694 // RefSeq // Rattus norvegicus staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1 (Snd1), mRNA. // chr4 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000047698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:55519818:55919017:1 gene:ENSRNOG00000031173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000048252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:55520078:55918739:1 gene:ENSRNOG00000031173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 98 // 90 // 43 // 44 // 0 /// AY697864 // GenBank // Rattus norvegicus SND p102 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC072471 // GenBank // Rattus norvegicus staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:91679 IMAGE:7100501), complete cds. // chr4 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// U83883 // GenBank // Rattus norvegicus p105 coactivator mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 94 // 41 // 46 // 0 /// GENSCAN00000016095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55899047:55918500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:55531427:55712576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 41 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT039251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// NONRATT039259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT039255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 20 // 49 // 1 /// NONRATT039252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1
NM_145790 // RefSeq // Rattus norvegicus Lipogenin (Lipogenin), mRNA. // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// AY057076 // GenBank // Rattus norvegicus lipogenin mRNA, complete cds. // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT039251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031875 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 129-1 (Mir129-1), microRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000053721 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:4:56049095:56049166:1 gene:ENSRNOG00000035598 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// rno-mir-129-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000902 Rattus norvegicus miR-129-1 stem-loop // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_013076 // RefSeq // Rattus norvegicus leptin (Lep), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56085079:56099209:1 gene:ENSRNOG00000045797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// D49653 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for obese(leptin), complete cds. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56071306:56096471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT039263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
FQ232409 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YN16 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233481 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YK22 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT039264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56314717:56418098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENSRNOT00000060353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56323706:56334507:1 gene:ENSRNOG00000039383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC086566 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member F2, mRNA (cDNA clone MGC:105845 IMAGE:7112589), complete cds. // chr4 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56314717:56418098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001024324 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member F1 (Fam71f1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56365398:56382287:1 gene:ENSRNOG00000006132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079297 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member F1, mRNA (cDNA clone MGC:94434 IMAGE:7134497), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_353185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member F1 (Fam71f1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr4 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT039268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56314717:56418098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001033898 // RefSeq // Rattus norvegicus calumenin (Calu), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NM_022535 // RefSeq // Rattus norvegicus calumenin (Calu), transcript variant 1, mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000008356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56392772:56420272:1 gene:ENSRNOG00000006197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000008972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56392772:56420272:1 gene:ENSRNOG00000006197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// AJ001929 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for of CBP-50 protein. // chr4 // 78 // 84 // 25 // 32 // 0 /// BC101908 // GenBank // Rattus norvegicus calumenin, mRNA (cDNA clone MGC:124555 IMAGE:7933832), complete cds. // chr4 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// FQ232245 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YI05 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT039269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT039270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000031652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56314717:56418098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// NONRATT039271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
XM_006224852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 136 (Ccdc136), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006236242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 136 (Ccdc136), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000060309 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:56444662:56471661:1 gene:ENSRNOG00000007100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071128 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:56444662:56471661:1 gene:ENSRNOG00000007100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// FQ228611 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YC10 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56441994:56463865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT039272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT039274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT039276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001191862 // RefSeq // Rattus norvegicus filamin C, gamma (Flnc), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000027237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56478247:56505940:1 gene:ENSRNOG00000007281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000012030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56464559:56505261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT039282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 30 // 47 // 1 /// NONRATT039283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 47 // 47 // 22 // 47 // 1
NM_053884 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit F (Atp6v1f), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006236177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit F (Atp6v1f), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000009737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56511722:56514817:1 gene:ENSRNOG00000007392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U43175 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar ATPase subunit F (vatf) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56511768:56514580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT039284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001106586 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 5 (Irf5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 5 (Irf5), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 5 (Irf5), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006236185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 5 (Irf5), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:56572293:56583432:1 gene:ENSRNOG00000007437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ230949 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YN15 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000012056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:56572255:56582916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT039285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT039286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1