NM_001008832 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus1 (RT1-CE1), mRNA. // chr20 // 95 // 88 // 41 // 43 // 0 /// NM_001008835 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE12 (RT1-CE12), mRNA. // chr20 // 78 // 73 // 28 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000061027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6851806:6872656:-1 gene:ENSRNOG00000050183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 77 // 96 // 36 // 47 // 0 /// XM_001072758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I histocompatibility antigen, AA alpha chain-like (LOC686172), partial mRNA. // chr20 // 63 // 71 // 22 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000049310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:7008739:7019717:-1 gene:ENSRNOG00000031607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 64 // 57 // 18 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071840 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:7008109:7019696:-1 gene:ENSRNOG00000031607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 80 // 22 // 39 // 0 /// M24026 // GenBank // Rat MHC class I RT1 (RT44) mRNA (u haplotype), 3 end. // chr20 // 67 // 43 // 14 // 21 // 0 /// NM_001008827 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ia, locus A1 (RT1-A1), mRNA. // chr20 // 25 // 98 // 12 // 48 // 0 /// NM_001008837 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE14 (RT1-CE14), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 33 // 67 // 11 // 33 // 0 /// NM_001008840 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE2 (RT1-CE2), mRNA. // chr20 // 25 // 73 // 9 // 36 // 0 /// NM_001008843 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE5 (RT1-CE5), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 31 // 98 // 15 // 48 // 0 /// NM_001033985 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE14 (RT1-CE14), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 29 // 92 // 13 // 45 // 0 /// NM_001033986 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE5 (RT1-CE5), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 31 // 98 // 15 // 48 // 0 /// NM_001134701 // RefSeq // Rattus norvegicus MHC class I RT1.Aa alpha-chain (Rt1.aa), mRNA. // chr20 // 27 // 98 // 13 // 48 // 0 /// XM_001076061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I histocompatibility antigen, AA alpha chain-like (LOC686860), partial mRNA. // chr20 // 32 // 69 // 11 // 34 // 0 /// XM_002727429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mature alpha chain of MHC class Ib protein-like (LOC100365176), partial mRNA. // chr20 // 36 // 67 // 12 // 33 // 0 /// XM_006256041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE7 (RT1-CE7), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 30 // 76 // 11 // 37 // 0 /// XR_362026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE7 (RT1-CE7), transcript variant X6, misc_RNA. // chr20 // 25 // 73 // 9 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000041590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7474639:7478155:1 gene:ENSRNOG00000038999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 25 // 98 // 12 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000060980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6968850:6973135:-1 gene:ENSRNOG00000000723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 98 // 15 // 48 // 0 /// AJ537440 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for MHC class Ib antigen (rt1-E gene), allele av1. // chr20 // 27 // 90 // 12 // 44 // 0 /// BC083799 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class I, CE14, mRNA (cDNA clone MGC:94828 IMAGE:7108728), complete cds. // chr20 // 29 // 92 // 13 // 45 // 0 /// BC090028 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class I, CE16, mRNA (cDNA clone MGC:109587 IMAGE:7365633), complete cds. // chr20 // 28 // 82 // 11 // 40 // 0 /// BC098841 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class I, CE5, mRNA (cDNA clone MGC:112896 IMAGE:7379095), complete cds. // chr20 // 31 // 98 // 15 // 48 // 0 /// BC166751 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class I RT1.Aa alpha-chain, mRNA (cDNA clone MGC:188489 IMAGE:5621043), complete cds. // chr20 // 27 // 98 // 13 // 48 // 0 /// L40363 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class I RT1.Aw3 protein mRNA, complete cds, haplotype l. // chr20 // 26 // 94 // 12 // 46 // 0 /// M31018 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class I RT1.Aa alpha-chain precursor mRNA, complete cds. // chr20 // 29 // 100 // 14 // 49 // 0 /// U38970 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class I RT1.Ab heavy chain precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 25 // 98 // 12 // 48 // 0 /// X82669 // GenBank // R.norvegicus RT1.Au gene. // chr20 // 33 // 94 // 15 // 46 // 0 /// L40365 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class I RT1.E protein mRNA, complete cds, haplotype u. // chr20 // 23 // 98 // 11 // 48 // 0 /// U50448 // GenBank // Rattus norvegicus clone 12 class I MHC heavy chain RT1.A(n) antigen precursor (RT1.A(n)) mRNA, complete cds. // chr20 // 23 // 98 // 11 // 48 // 0 /// U50449 // GenBank // Rattus norvegicus clone 109 class I MHC heavy chain RT1.A(n) antigen precursor (RT1.A(n)) mRNA, complete cds. // chr20 // 19 // 88 // 8 // 43 // 0 /// NM_001008826 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus T24, gene 4 (RT1-T24-4), mRNA. // chr20 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// NM_001008829 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ia, locus A2 (RT1-A2), mRNA. // chr20 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// NM_012645 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus EC2 (RT1-EC2), mRNA. // chr20 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000038660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7433433:7436985:1 gene:ENSRNOG00000030712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000047439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5287623:5295621:1 gene:ENSRNOG00000042905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000047779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6851806:6855292:-1 gene:ENSRNOG00000050183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000052270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7433433:7436985:1 gene:ENSRNOG00000030712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// BC088465 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class Ia, locus A2, mRNA (cDNA clone MGC:95123 IMAGE:7127909), complete cds. // chr20 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// BC098866 // GenBank // Rattus norvegicus histocompatibility 2, T region locus 24, mRNA (cDNA clone MGC:112931 IMAGE:7380738), complete cds. // chr20 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// M31038 // GenBank // Rat MHC class I non-RT1.A alpha-1-chain mRNA, complete cds. // chr20 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// U38971 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class I RT1.Ac heavy chain precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// U38972 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class I RT1.Au heavy chain precursor, mRNA, complete cds. // chr20 // 33 // 33 // 16 // 49 // 1 /// NM_001008841 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE3 (RT1-CE3), mRNA. // chr20 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// NM_001008842 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE4 (RT1-CE4), mRNA. // chr20 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// NR_002597 // RefSeq // Rattus norvegicus MHC class I RT1.O type 149 processed pseudogene (LOC360231), non-coding RNA. // chr20 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// XM_006223805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I histocompatibility antigen, AA alpha chain-like (LOC100909797), mRNA. // chr20 // 22 // 22 // 11 // 49 // 1 /// XM_006255891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE11-like (LOC100364500), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// XM_006255892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE11-like (LOC100364500), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// XR_349450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I histocompatibility antigen, AA alpha chain-like (LOC102557454), misc_RNA. // chr20 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000041151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6994667:6997483:-1 gene:ENSRNOG00000039744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000050099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7008109:7011516:-1 gene:ENSRNOG00000031607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000064734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6994667:6997474:-1 gene:ENSRNOG00000039744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// BC061817 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus Aw2, mRNA (cDNA clone MGC:72517 IMAGE:5598840), complete cds. // chr20 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// BC158853 // GenBank // Rattus norvegicus histocompatibility 2, T region locus 24, mRNA (cDNA clone MGC:188366 IMAGE:7936214), complete cds. // chr20 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// FQ228760 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YB07 mRNA sequence. // chr20 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// FQ228888 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YM19 mRNA sequence. // chr20 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// FQ230749 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YD09 mRNA sequence. // chr20 // 22 // 22 // 11 // 49 // 1 /// FQ231785 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YD05 mRNA sequence. // chr20 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// U50447 // GenBank // Rattus norvegicus clone 4 class I MHC heavy chain RT1.A(n) antigen precursor (RT1.A(n)) mRNA, complete cds. // chr20 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// GENSCAN00000048366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6862684:6872656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 91 // 90 // 40 // 44 // 0 /// NONRATT033659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 91 // 90 // 40 // 44 // 0 /// GENSCAN00000048311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6831736:6855286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 63 // 9 // 31 // 0 /// NONRATT032844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 98 // 14 // 48 // 0 /// NONRATT032847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 27 // 98 // 13 // 48 // 0 /// NONRATT032848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 27 // 98 // 13 // 48 // 0 /// NONRATT032850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 27 // 92 // 12 // 45 // 0 /// NONRATT032852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 27 // 92 // 12 // 45 // 0 /// NONRATT032853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 82 // 12 // 40 // 0 /// NONRATT032855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 28 // 88 // 12 // 43 // 0 /// NONRATT033651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 96 // 17 // 47 // 0 /// NONRATT033653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 94 // 14 // 46 // 0 /// NONRATT033657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 92 // 14 // 45 // 0 /// NONRATT033673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 98 // 15 // 48 // 0 /// NONRATT033674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 98 // 15 // 48 // 0 /// GENSCAN00000017942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7001449:7019708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 37 // 37 // 18 // 49 // 1 /// NONRATT032626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// NONRATT032628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// NONRATT032839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000044520 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:5857674:5878729:-1 gene:ENSRNOG00000047706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// ENSRNOT00000048076 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:5857674:5878729:-1 gene:ENSRNOG00000047706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// GENSCAN00000017944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6976923:6997474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// GENSCAN00000040564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5857204:5878729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// NONRATT032856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 22 // 22 // 11 // 49 // 1 /// NONRATT033656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// NONRATT033679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1 /// NONRATT033680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1