GENSCAN00000022428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:31880696:31881016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 65 // 12 // 15 // 0
NM_057108 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 5 (Serpinb5), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 48 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000003625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:32053528:32073726:1 gene:ENSRNOG00000002640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000034210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32061568:32072384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 62 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT016223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// U58857 // GenBank // Rattus norvegicus maspin mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 48 // 50 // 0
NM_001135867 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 12 (Serpinb12), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006249636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 12 (Serpinb12), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000003501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:32119950:32147132:1 gene:ENSRNOG00000002602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:31603805:31632463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32131317:32146851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001107168 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 13 (Serpinb13), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:32181102:32211674:1 gene:ENSRNOG00000028194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32179401:32211194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001107167 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 11 (Serpinb11), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 11 (Serpinb11), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 11 (Serpinb11), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 11 (Serpinb11), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:32388015:32406429:1 gene:ENSRNOG00000002583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32388807:32405940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_130404 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 7 (Serpinb7), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006249629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 7 (Serpinb7), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:32461746:32503184:1 gene:ENSRNOG00000002555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF105329 // GenBank // Rattus norvegicus megsin mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ228843 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YD11 mRNA sequence. // chr13 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32427222:32503184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_021696 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 2 (Serpinb2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:32603846:32612854:1 gene:ENSRNOG00000002460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// X64563 // GenBank // R.norvegicus mRNA for plasminogen activator inhibitor 2 type A (PAI2A). // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32603869:32633472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_153733 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10 (Serpinb10), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:32615862:32633549:1 gene:ENSRNOG00000002417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY075037 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor beta repressible serpin (Trespin) mRNA, complete cds. // chr13 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// BC061735 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:72283 IMAGE:5598648), complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32603869:32633472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001105948 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 8 (Serpinb8), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:33035661:33058451:1 gene:ENSRNOG00000002396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32965256:33057387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000044909 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:36061595:36062763:1 gene:ENSRNOG00000033999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 75 // 95 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:36061920:36110779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001012737 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 7, type 2 (Cdh7), mRNA. // chr13 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// XM_006249647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 7, type 2 (Cdh7), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006249649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 7, type 2 (Cdh7), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000041413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:36230292:36366642:1 gene:ENSRNOG00000032490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB121031 // GenBank // Rattus norvegicus Cad7 mRNA for Cadherin7, complete cds. // chr13 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:36206206:36366639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
GENSCAN00000007299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:38446900:38447856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000007307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:38550861:38551817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
XM_006221430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dermatan sulfate epimerase-like (Dsel), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dermatan sulfate epimerase-like (Dsel), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043890 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:1936646:1940272:-1 gene:ENSRNOG00000032307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000045152 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:3973027:3974027:1 gene:ENSRNOG00000031274 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:3973027:3974027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000052651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:4563219:4633865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_001109292 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 6 (Ddx6), mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006242953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 6 (Ddx6), transcript variant X4, mRNA. // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:47543903:47576345:1 gene:ENSRNOG00000012453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// FQ213450 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YM03 mRNA sequence. // chr8 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// FQ227926 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YD12 mRNA sequence. // chr8 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000032655 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:24880677:24882113:-1 gene:ENSRNOG00000026825 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 80 // 97 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:24881024:24882080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 81 // 87 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:5338883:5347999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 94 // 55 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000054847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:47546745:47574145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT053130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4159922:4160254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4259839:4261288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT053129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001047866 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin associated protein-like 5C (Cntnap5c), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000067198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:11957533:12804561:1 gene:ENSRNOG00000043185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:12596934:12804561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT016195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// GENSCAN00000027105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:12253937:12407693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSRNOT00000040557 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:13486009:13487570:1 gene:ENSRNOG00000030425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:13486022:13487081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_001047865 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin associated protein-like 5A (Cntnap5a), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000050329 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:78412:363696:1 gene:ENSRNOG00000031539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000053001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:6036240:6075718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:286209:388782:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000011007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:11828473:11946351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT016191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_139186 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar protein interacting with the FHA domain of MKI67 (Nifk), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:39397765:39407568:1 gene:ENSRNOG00000025701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC086585 // GenBank // Rattus norvegicus Mki67 (FHA domain) interacting nucleolar phosphoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:105693 IMAGE:7308059), complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:39381752:39404890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT016245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENSRNOT00000023785 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:39486149:39486850:1 gene:ENSRNOG00000017697 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 82 // 96 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:39486128:39486850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000061513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:39530430:39713144:1 gene:ENSRNOG00000002376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000061515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:39530430:39713144:1 gene:ENSRNOG00000002376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000061516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:39530430:39713144:1 gene:ENSRNOG00000002376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000014078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:39530430:39867855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 71 // 71 // 29 // 41 // 1 /// NONRATT016246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// NONRATT016248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
NM_001107170 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor CP2-like 1 (Tfcp2l1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:39741256:39797758:1 gene:ENSRNOG00000002414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:39530430:39867855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001191668 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 185B (Tmem185b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:40669220:40672564:1 gene:ENSRNOG00000047257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:40669576:40670628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024997 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 93 (Ccdc93), mRNA. // chr13 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000003435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:42558446:42626672:1 gene:ENSRNOG00000002514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// BC091337 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 93, mRNA (cDNA clone MGC:109336 IMAGE:7314934), complete cds. // chr13 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000029619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:42439947:42626324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT016260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0
ENSRNOT00000049137 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:45417135:45418216:1 gene:ENSRNOG00000039928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:45417135:45455669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0
NM_001177819 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00155-like (LOC100362110), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:46914454:46947910:1 gene:ENSRNOG00000030481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001105950 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member F5 (Slc35f5), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006249671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35, member F5 (Slc35f5), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:46994593:47034006:1 gene:ENSRNOG00000003403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001100943 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 39 (Gpr39), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NM_001114392 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 39 (Gpr39), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:47120131:47328371:1 gene:ENSRNOG00000021586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:47115641:47121027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT016269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT016270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:47325671:47344323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENSRNOT00000004775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:48181070:48181789:1 gene:ENSRNOG00000003591 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:48181070:48264696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000048393 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:48486821:48487327:1 gene:ENSRNOG00000033511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000054487 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:13:48487243:48487351:1 gene:ENSRNOG00000036368 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_023095 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,6-N-acetyl-glucosaminyltransferase (Mgat5), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006249676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase A-like (LOC100909582), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000004995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:48946178:49250496:1 gene:ENSRNOG00000003614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// L14284 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylglucosaminyltransferase V mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000054264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49188397:49250393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49130011:49179882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT016272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
NONRATT016272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1
XM_002724862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 19 (Map3k19), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:49609133:49633399:-1 gene:ENSRNOG00000003952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49609133:49636369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000005289 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:49662343:49734484:1 gene:ENSRNOG00000003953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ226620 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA20YC03 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49677246:49740246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001134867 // RefSeq // Rattus norvegicus R3H domain containing 1 (R3hdm1), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain containing 1 (R3hdm1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain containing 1 (R3hdm1), transcript variant X9, mRNA. // chr13 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000005372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:49897739:50035934:1 gene:ENSRNOG00000004099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC087715 // GenBank // Rattus norvegicus R3H domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7317333), complete cds. // chr13 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49953630:50034960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NR_031873 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-128-1 (Mir128-1), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000053657 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:50001706:50001787:1 gene:ENSRNOG00000035534 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// rno-mir-128-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000900 Rattus norvegicus miR-128-1 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001012025 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 4 (Ubxn4), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:50042178:50074671:1 gene:ENSRNOG00000003625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC088845 // GenBank // Rattus norvegicus UBX domain protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:105559 IMAGE:7307995), complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ220386 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YB11 mRNA sequence. // chr13 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// NONRATT016291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:50042469:50074186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT016297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001191669 // RefSeq // Rattus norvegicus thrombospondin, type I, domain containing 7B (Thsd7b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:51235509:51990395:1 gene:ENSRNOG00000003878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001126085 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm6), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050289 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:52469220:52471360:1 gene:ENSRNOG00000030374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:43672737:43679724:1 gene:ENSRNOG00000049370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43665172:43676203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52469220:52469516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT027362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT027363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NM_001008889 // RefSeq // Rattus norvegicus YOD1 deubiquitinase (Yod1), mRNA. // chr13 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52529467:52531852:1 gene:ENSRNOG00000025704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC107904 // GenBank // Rattus norvegicus YOD1 OTU deubiquinating enzyme 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124915 IMAGE:7454897), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT016299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000023864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52528612:52555369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 81 // 30 // 37 // 1
NM_001100788 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to specifically androgen-regulated protein (LOC498222), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52543255:52556096:1 gene:ENSRNOG00000004341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52528612:52555369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// NONRATT016302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XM_003752659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fc receptor, IgA, IgM, high affinity (Fcamr), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52628434:52640511:1 gene:ENSRNOG00000004393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52630776:52640511:1 gene:ENSRNOG00000004393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52589621:52680559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_012723 // RefSeq // Rattus norvegicus polymeric immunoglobulin receptor (Pigr), mRNA. // chr13 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000005853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52661013:52679368:1 gene:ENSRNOG00000004405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000023854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52589621:52680559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT016305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001014843 // RefSeq // Rattus norvegicus Fas apoptotic inhibitory molecule 3 (Faim3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fas apoptotic inhibitory molecule 3 (Faim3), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52691434:52705666:1 gene:ENSRNOG00000004441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC088197 // GenBank // Rattus norvegicus Fas apoptotic inhibitory molecule 3, mRNA (cDNA clone MGC:108879 IMAGE:7375085), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ232848 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YD12 mRNA sequence. // chr13 // 89 // 56 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52691529:52705530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_012854 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 10 (Il10), mRNA. // chr13 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52824653:52829120:1 gene:ENSRNOG00000004647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L02926 // GenBank // Rat interleukin 10 (IL-10) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// X60675 // GenBank // R.norvegicus mRNA for interleukin 10. // chr13 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006249712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 10 (Il10), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52824695:52828416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001017489 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2D (Eif2d), mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2D (Eif2d), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53011087:53030016:1 gene:ENSRNOG00000004910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC087701 // GenBank // Rattus norvegicus ligatin, mRNA (cDNA clone MGC:105736 IMAGE:7314085), complete cds. // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53011285:53029914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001289800 // RefSeq // Rattus norvegicus vasopressin V1b receptor-like (LOC100909648), mRNA. // chr13 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NM_017205 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine vasopressin receptor 1B (Avpr1b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000074204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53465701:53475916:-1 gene:ENSRNOG00000049261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53443235:53453450:1 gene:ENSRNOG00000048522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// AF064541 // GenBank // Rattus norvegicus vasopressin V1b receptor variant mRNA, complete cds. // chr13 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// D45400 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for vasopressin V1b receptor, complete cds. // chr13 // 92 // 76 // 24 // 26 // 0 /// U27322 // GenBank // Rattus norvegicus arginine-vasopressin V1b receptor mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000015031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53440751:53453365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53465786:53503305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0
NM_012938 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin E (Ctse), mRNA. // chr13 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53499150:53521602:1 gene:ENSRNOG00000006963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53499150:53521602:1 gene:ENSRNOG00000006963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC062002 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin E, mRNA (cDNA clone MGC:72542 IMAGE:5599861), complete cds. // chr13 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// D38104 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cathepsin E, complete cds. // chr13 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT016317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53510564:53546587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT016318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001109328 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab7b, member RAS oncogene family (Rab7b), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rab7b, member RAS oncogene family (Rab7b), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53536348:53553149:1 gene:ENSRNOG00000039754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53510564:53546587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107172 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 9 (Slc26a9), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000009742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53585166:53611625:1 gene:ENSRNOG00000029514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000015033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53582375:53668616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT016321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001109068 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidase M20 domain containing 1 (Pm20d1), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53650959:53670855:1 gene:ENSRNOG00000039745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000015033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53582375:53668616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001135868 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 45, member 3 (Slc45a3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 45, member 3 (Slc45a3), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 45, member 3 (Slc45a3), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 45, member 3 (Slc45a3), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 45, member 3 (Slc45a3), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53816774:53837091:1 gene:ENSRNOG00000007591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53830925:53871119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001107173 // RefSeq // Rattus norvegicus ELK4, ETS-domain protein (SRF accessory protein 1) (Elk4), mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000065094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53860253:53883004:1 gene:ENSRNOG00000007887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC168230 // GenBank // Rattus norvegicus ELK4, member of ETS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:188290 IMAGE:7382659), complete cds. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53830925:53871119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031797 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 135b (Mir135b), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053744 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:54046530:54046626:1 gene:ENSRNOG00000035621 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-135b // miRBase Micro RNA Database // MI0000645 Rattus norvegicus miR-135b stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LEM domain-containing protein 1-like (LOC102556277), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LEM domain-containing protein 1-like (LOC102556277), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006249798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LEM domain-containing protein 1-like (LOC102556277), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LEM domain-containing protein 1-like (LOC102556277), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54060698:54104833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT016335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT016334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001100683 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch domain containing 8A (Klhdc8a), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54143333:54151418:1 gene:ENSRNOG00000000036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54143968:54149907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT016337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001007617 // RefSeq // Rattus norvegicus NUAK family, SNF1-like kinase, 2 (Nuak2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54160995:54177739:1 gene:ENSRNOG00000000034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081899 // GenBank // Rattus norvegicus NUAK family, SNF1-like kinase, 2, mRNA (cDNA clone MGC:93817 IMAGE:7110518), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54161067:54176829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_199463 // RefSeq // Rattus norvegicus dual serine/threonine and tyrosine protein kinase (Dstyk), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54263966:54318716:1 gene:ENSRNOG00000021298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY208851 // GenBank // Rattus norvegicus dusty protein kinase mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY429675 // GenBank // Rattus norvegicus dusty protein kinase mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54264035:54351077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
NM_001107174 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoblastoma binding protein 5 (Rbbp5), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000036110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54325701:54352552:1 gene:ENSRNOG00000021289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54264035:54351077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT016346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001107174 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoblastoma binding protein 5 (Rbbp5), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54325701:54352552:1 gene:ENSRNOG00000021289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001017490 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 81 (Tmem81), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54353122:54355551:1 gene:ENSRNOG00000028752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079284 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 81, mRNA (cDNA clone MGC:94412 IMAGE:7134237), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54354342:54355130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT016347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001177368 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat neuronal 2 (Lrrn2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54735286:54801198:1 gene:ENSRNOG00000009691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54798411:54800663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT016349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105951 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase, catalytic subunit type 2 beta (Pik3c2b), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase, catalytic subunit type 2 beta (Pik3c2b), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase, catalytic subunit type 2 beta (Pik3c2b), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000042125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54919438:54977002:1 gene:ENSRNOG00000029938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54921116:54977002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_001107175 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 15B (Ppp1r15b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55001947:55009303:1 gene:ENSRNOG00000028493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 15B (Ppp1r15b), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55001723:55033406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT016351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A member 6 (Plekha6), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006249805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A member 6 (Plekha6), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55038802:55050287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT016353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006221460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A member 6 (Plekha6), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_341118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family A member 6 (Plekha6), transcript variant X16, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109070 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi transport 1A (Golt1a), mRNA. // chr13 // 100 // 37 // 17 // 17 // 0 /// NM_181692 // RefSeq // Rattus norvegicus KiSS-1 metastasis-suppressor (Kiss1), mRNA. // chr13 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KiSS-1 metastasis-suppressor (Kiss1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgi transport 1A (Golt1a), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 93 // 33 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000003918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55590139:55602878:-1 gene:ENSRNOG00000002936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 37 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000035583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55582460:55584962:-1 gene:ENSRNOG00000047481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// AY196983 // GenBank // Rattus norvegicus metastin precursor (Kiss1) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 54 // 25 // 25 // 0 /// JX139031 // GenBank // Rattus norvegicus Kiss1 variant E1b-E2a-E3 (Kiss1) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// JX139032 // GenBank // Rattus norvegicus Kiss1 variant E1b-E2b-E3 (Kiss1) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// JX139030 // GenBank // Rattus norvegicus Kiss1 variant E1a-E2b-E3 (Kiss1) mRNA, complete cds. // chr13 // 63 // 63 // 29 // 46 // 1 /// GENSCAN00000012134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55572771:55667345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// NONRATT017251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// NONRATT017252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1
NM_012642 // RefSeq // Rattus norvegicus renin (Ren), mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55555587:55566981:-1 gene:ENSRNOG00000002937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC078878 // GenBank // Rattus norvegicus renin, mRNA (cDNA clone MGC:93560 IMAGE:7126969), complete cds. // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// J02941 // GenBank // Rat renin mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT017249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55555777:55564607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT017250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001108343 // RefSeq // Rattus norvegicus ethanolamine kinase 2 (Etnk2), mRNA. // chr13 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000065347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55534037:55551850:-1 gene:ENSRNOG00000028368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55534675:55552131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT017247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
GENSCAN00000012119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55534675:55552131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT017246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55534675:55552131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001047925 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00144 (LOC498231), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55296141:55315101:-1 gene:ENSRNOG00000029418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000043419 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:55242184:55242712:-1 gene:ENSRNOG00000031321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55242184:55242712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 83 // 60 // 10 // 12 // 0
NM_080698 // RefSeq // Rattus norvegicus fibromodulin (Fmod), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55928423:55939039:1 gene:ENSRNOG00000003183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053560 // RefSeq // Rattus norvegicus chitinase 3-like 1 (cartilage glycoprotein-39) (Chi3l1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chitinase 3-like 1 (cartilage glycoprotein-39) (Chi3l1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chitinase 3-like 1 (cartilage glycoprotein-39) (Chi3l1), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56075046:56086477:1 gene:ENSRNOG00000003312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000071475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56079112:56086477:1 gene:ENSRNOG00000003312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC091365 // GenBank // Rattus norvegicus chitinase 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:109420 IMAGE:7319171), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56075412:56086027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT016390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_031813 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin binding protein H (Mybph), mRNA. // chr13 // 82 // 92 // 27 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000004528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56089936:56097582:1 gene:ENSRNOG00000003336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000046854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56089977:56097559:1 gene:ENSRNOG00000003336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// AF077338 // GenBank // Rat norvegicus myosin binding protein H mRNA, complete cds. // chr13 // 82 // 92 // 27 // 33 // 0 /// BC061993 // GenBank // Rattus norvegicus myosin binding protein H, mRNA (cDNA clone MGC:72384 IMAGE:5599482), complete cds. // chr13 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56089375:56097340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_017115 // RefSeq // Rattus norvegicus myogenin (Myog), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56182747:56185336:1 gene:ENSRNOG00000030743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF054894 // GenBank // Rattus norvegicus myogenin mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// M24393 // GenBank // Rat myogenin mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56182705:56184596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT016394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001013872 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to UDP-N-acetylglucosamine:a-1,3-D-mannoside beta-1,4-N-acetylgluco (LOC289035), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to UDP-N-acetylglucosamine:a-1,3-D-mannoside beta-1,4-N-acetylgluco (LOC289035), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000033636 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:56274820:56280186:1 gene:ENSRNOG00000027702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079259 // GenBank // Rattus norvegicus similar to UDP-N-acetylglucosamine:a-1,3-D-mannoside beta-1,4-N-acetylgluco, mRNA (cDNA clone MGC:94362 IMAGE:7133407), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56276892:56280123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001013126 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 1 (Cyb5r1), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_358907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 1 (Cyb5r1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56286702:56293106:1 gene:ENSRNOG00000003973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC089945 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b5 reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:109264 IMAGE:7311492), complete cds. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56286746:56292404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_207587 // RefSeq // Rattus norvegicus adiponectin receptor 1 (Adipor1), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006249852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adiponectin receptor 1 (Adipor1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56297571:56316893:1 gene:ENSRNOG00000004143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC061838 // GenBank // Rattus norvegicus adiponectin receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:72623 IMAGE:5599938), complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// DQ148391 // GenBank // Rattus norvegicus adiponectin receptor 1 (Adipor1) mRNA, complete cds. // chr13 // 81 // 70 // 17 // 21 // 0 /// NONRATT016403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56304227:56353764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT016401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT016402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_153730 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 12 (Klhl12), mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56340908:56370203:1 gene:ENSRNOG00000004193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AJ133126 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for kelch-like protein. // chr13 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC086983 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 12 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:93127 IMAGE:7133597), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ210179 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA33YD07 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT016404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56366415:56384126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// GENSCAN00000051907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56304227:56353764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT016406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001007678 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB interacting factor (Rabif), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56374231:56385517:1 gene:ENSRNOG00000004424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185165820:185177312:1 gene:ENSRNOG00000045814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC161807 // GenBank // Rattus norvegicus RAB interacting factor, mRNA (cDNA clone MGC:187223 IMAGE:9036685), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// X70496 // GenBank // R. norvegicus mRNA for Mss4 protein. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56366415:56384126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000053331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:185127415:185197275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001107177 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 5B (Kdm5b), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249873 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 5B (Kdm5b), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56438963:56509593:1 gene:ENSRNOG00000004433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56439129:56556564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT016408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_012665 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin II (Syt2), mRNA. // chr13 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56621946:56629657:1 gene:ENSRNOG00000004756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// M64488 // GenBank // Rat synaptotagmin II mRNA, complete cds. // chr13 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT016411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56570840:56629269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_001108344 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative) (Ube2t), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56842245:56852747:1 gene:ENSRNOG00000005038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC167012 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2T (putative), mRNA (cDNA clone MGC:189202 IMAGE:9099623), complete cds. // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// FQ233263 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YI19 mRNA sequence. // chr13 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56847235:56862911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT016413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_145683 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 7 (Ptpn7), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 7 (Ptpn7), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57010236:57022149:1 gene:ENSRNOG00000005807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U28356 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic protein tyrosine phosphatase HePTP/LC-PTP mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57011311:57021303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109071 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 8A (Arl8a), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57024684:57033686:1 gene:ENSRNOG00000005988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57024842:57034244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107179 // RefSeq // Rattus norvegicus leiomodin 1 (smooth muscle) (Lmod1), mRNA. // chr13 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57197927:57237507:1 gene:ENSRNOG00000007185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57185543:57238493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000035157 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:57462765:57463247:1 gene:ENSRNOG00000026400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_017148 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine and glycine-rich protein 1 (Csrp1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57601914:57623352:1 gene:ENSRNOG00000008937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062407 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine and glycine-rich protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72506 IMAGE:5623423), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U09567 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich protein mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT016423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57601323:57622295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT016424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001012206 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family A, member 3 (Phlda3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57637217:57640301:1 gene:ENSRNOG00000009068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087038 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:93690 IMAGE:7096388), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000060522 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:57650617:57651115:1 gene:ENSRNOG00000039490 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57637536:57650961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001107942 // RefSeq // Rattus norvegicus ladinin 1 (Lad1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000012801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57693625:57707987:1 gene:ENSRNOG00000009144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57693653:57739859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT016436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001105953 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 9 (Tmem9), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001277263 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 9 (Tmem9), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57910156:57927429:1 gene:ENSRNOG00000010204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC169086 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:189496 IMAGE:5621176), complete cds. // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57901031:57926610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_006221485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus achaete-scute family bHLH transcription factor 5 (Ascl5), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus achaete-scute family bHLH transcription factor 5 (Ascl5), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048033 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:57943558:57944124:1 gene:ENSRNOG00000033391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57940605:58078939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001105990 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 21B (Kif21b), mRNA. // chr13 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:58030724:58076237:1 gene:ENSRNOG00000008471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// BC168904 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8366294, with apparent retained intron. // chr13 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57940605:58078939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 76 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT016451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 98 // 98 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT016450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// NONRATT016452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NONRATT016455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106782 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L42 (Mrpl42), mRNA. // chr13 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// XM_006241275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L42 (Mrpl42), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000066322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:36638838:36661936:-1 gene:ENSRNOG00000042740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// BC168747 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L42, mRNA (cDNA clone MGC:188851 IMAGE:6920919), complete cds. // chr13 // 43 // 100 // 9 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011332 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:58118703:58119128:1 gene:ENSRNOG00000025964 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr13 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58118610:58119128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT016456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0
NM_001012030 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 281 (Zfp281), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:58574471:58577421:1 gene:ENSRNOG00000009099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC083844 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 281, mRNA (cDNA clone MGC:95002 IMAGE:7121097), complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58557980:58596614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT016464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000054485 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:13:58702658:58702753:1 gene:ENSRNOG00000036366 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58695735:58748897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000075749 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:59948300:59948632:1 gene:ENSRNOG00000048051 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT016466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031926 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-181a-1 (Mir181a-1), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT016467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-181a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000953 Rattus norvegicus miR-181a-1 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_031899 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 181b-1 (Mir181b1), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053713 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:59986236:59986345:1 gene:ENSRNOG00000035590 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-181b-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000926 Rattus norvegicus miR-181b-1 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001105991 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit G3 (Atp6v1g3), mRNA. // chr13 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// XM_006249925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit G3 (Atp6v1g3), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000029679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:60307337:60321789:1 gene:ENSRNOG00000022480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// XM_006249924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit G3 (Atp6v1g3), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:60253702:60320455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT016469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
XM_006249932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 1B (Dennd1b), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035129 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:61041188:61227766:1 gene:ENSRNOG00000011063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043907 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:61041188:61258169:1 gene:ENSRNOG00000011063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61089987:61175478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT016471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT016472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006249932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 1B (Dennd1b), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014759 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:61218327:61258169:1 gene:ENSRNOG00000011063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043907 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:61041188:61258169:1 gene:ENSRNOG00000011063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000075072 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:61226331:61258169:1 gene:ENSRNOG00000011063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035129 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:61041188:61227766:1 gene:ENSRNOG00000011063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000033738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61196461:61258169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000032908 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:61283682:61284667:1 gene:ENSRNOG00000022174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001191670 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 41 (Zbtb41), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:61532188:61554983:1 gene:ENSRNOG00000011137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ218188 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA7YN17 mRNA sequence. // chr13 // 64 // 47 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000033082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61531225:61554983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0
NM_001105955 // RefSeq // Rattus norvegicus asp (abnormal spindle) homolog, microcephaly associated (Drosophila) (Aspm), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:61564059:61609831:1 gene:ENSRNOG00000012318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61564189:61643111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT016478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NM_001105956 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor XIII, B polypeptide (F13b), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016944 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:61616995:61641162:1 gene:ENSRNOG00000012613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC160876 // GenBank // Rattus norvegicus coagulation factor XIII, B polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:188246 IMAGE:7369453), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61564189:61643111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT016480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT016482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_198762 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily T, member 2 (Kcnt2), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:62144528:62533203:1 gene:ENSRNOG00000013312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY359443 // GenBank // Rattus norvegicus sodium- and chloride-activated ATP-sensitive potassium channel (Slick) mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
ENSRNOT00000054323 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:13:63456856:63456970:1 gene:ENSRNOG00000036200 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0
NM_001109492 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 2 (B3galt2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:65424610:65433621:1 gene:ENSRNOG00000003251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:65429915:65431144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012149 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L5 (Uchl5), mRNA. // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006249962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L5 (Uchl5), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:65556707:65592648:1 gene:ENSRNOG00000003545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC088841 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L5, mRNA (cDNA clone MGC:105874 IMAGE:7125859), complete cds. // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// FQ220301 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YG13 mRNA sequence. // chr13 // 81 // 75 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:65556790:65695820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT016494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT016495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT016496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT016497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
AY377983 // GenBank // Rattus norvegicus brain Zn-finger protein mRNA, complete cds. // chr13 // 80 // 91 // 8 // 10 // 0 /// NM_001010963 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 15 (Zc3h15), mRNA. // chr13 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000007276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:77550919:77570542:1 gene:ENSRNOG00000005256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// BC088438 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:95079 IMAGE:7126102), complete cds. // chr13 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
ENSRNOT00000032860 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:67647330:67648026:1 gene:ENSRNOG00000025771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:67647330:67647779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 60 // 12 // 15 // 0
NM_173121 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 3 (Brinp3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 3 (Brinp3), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 3 (Brinp3), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 3 (Brinp3), transcript variant X6, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:68507843:68937974:1 gene:ENSRNOG00000002811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB077854 // GenBank // Rattus norvegicus BRINP3 mRNA for BMP/Retinoic acid-inducible neural-specific protein-3, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:68649111:68827417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NONRATT016501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 5 // 5 // 1
NM_001109538 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG4025-PA (LOC689412), mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000035431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:70527604:70528310:1 gene:ENSRNOG00000027254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:70527707:70528075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT016506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000045467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:71337916:71347350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_017232 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (Ptgs2), mRNA. // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000003567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72316370:72323056:1 gene:ENSRNOG00000002525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF233596 // GenBank // Rattus norvegicus cyclooxygenase-2 mRNA, complete cds. // chr13 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// AY157736 // GenBank // Rattus norvegicus cyclooxygenase 2b (Cox2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr13 // 78 // 60 // 14 // 18 // 0 /// L20085 // GenBank // Rat cyclooxygenase-2 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// L25925 // GenBank // Rat cyclooxygenase-2 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// S67722 // GenBank // Rattus norvegicus cyclooxygenase isoform COX-2 (Cox2) mRNA, complete cds. // chr13 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// U03389 // GenBank // Rattus norvegicus cyclooxygenase 2 mRNA, complete cds. // chr13 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// U04300 // GenBank // Rattus norvegicus Wistar mitogen inducible cyclooxygenase (cyclooxygenase-2) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:72306633:72322060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_012872 // RefSeq // Rattus norvegicus phosducin (Pdc), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72510241:72523360:1 gene:ENSRNOG00000002517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M33528 // GenBank // Rat 33-kDa phototransducing protein mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M33530 // GenBank // Rat 33-kDa phototransducing protein mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M60738 // GenBank // Rat pineal gland phosducin mRNA, complete cds. // chr13 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:72495436:72522971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT016510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107185 // RefSeq // Rattus norvegicus translocated promoter region, nuclear basket protein (Tpr), mRNA. // chr13 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000063833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72576529:72637648:1 gene:ENSRNOG00000002394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// BC101883 // GenBank // Rattus norvegicus translocated promoter region, mRNA (cDNA clone IMAGE:7929511), partial cds. // chr13 // 100 // 17 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000052374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:72576300:72636904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT016512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0
NM_001047085 // RefSeq // Rattus norvegicus influenza virus NS1A binding protein (Ivns1abp), mRNA. // chr13 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus influenza virus NS1A binding protein (Ivns1abp), mRNA. // chr13 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// XM_006249988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus influenza virus NS1A binding protein (Ivns1abp), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// XM_006249989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus influenza virus NS1A binding protein (Ivns1abp), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000003558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:73676540:73683832:1 gene:ENSRNOG00000002618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// AY553870 // GenBank // Rattus norvegicus myocardium ischemic preconditioning associated protein (Mip5) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066419 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:73671622:73675647:1 gene:ENSRNOG00000048902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT016521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1 /// GENSCAN00000004467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:73633617:73683802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// NONRATT016520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT016523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_001037192 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 1-like (Trmt1l), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:73748227:73781248:1 gene:ENSRNOG00000002580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC100650 // GenBank // Rattus norvegicus similar to C1orf25, mRNA (cDNA clone MGC:124643 IMAGE:7932888), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:73754568:73781024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT016526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT016527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT016528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
GENSCAN00000028623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:73828064:73942673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT016531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000037652 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:73828064:73828794:1 gene:ENSRNOG00000028446 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 69 // 81 // 9 // 13 // 0
NM_022242 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 129, member A (Fam129a), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:73927637:74076132:1 gene:ENSRNOG00000002403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB046718 // GenBank // Rattus norvegicus Niban mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000028628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:73991332:74019395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000028632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:74034141:74075355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001191671 // RefSeq // Rattus norvegicus ER degradation enhancer, mannosidase alpha-like 3 (Edem3), mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000017858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:74110016:74168822:1 gene:ENSRNOG00000028358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000028626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:74114059:74146193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:74148443:74164828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 36 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT016535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT016534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1
NONRATT016535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001070927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 (Colgalt2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006221500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 (Colgalt2), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000030109 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:74834548:74873161:1 gene:ENSRNOG00000028207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000057956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:74834547:74873161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001017492 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative) (Apobec4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75128609:75136630:1 gene:ENSRNOG00000028089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079272 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 4 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:94391 IMAGE:7134003), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75135445:75146490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT016546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025717 // RefSeq // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 5 (Arpc5), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000064068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75146057:75154961:1 gene:ENSRNOG00000028062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC099238 // GenBank // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 5, mRNA (cDNA clone MGC:116419 IMAGE:7445509), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ223037 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YC11 mRNA sequence. // chr13 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// FQ230401 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YD17 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// FQ232353 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YC01 mRNA sequence. // chr13 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// NONRATT016547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001100984 // RefSeq // Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 2 (Ncf2), mRNA. // chr13 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// XM_006250013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 2 (Ncf2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75197734:75228157:1 gene:ENSRNOG00000028016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// JN864041 // GenBank // Rattus norvegicus strain SS neutrophil cytosolic factor 2 (Ncf2) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// JN864042 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN neutrophil cytosolic factor 2 (Ncf2) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// JN864046 // GenBank // Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 2 mutant isoform 2 (Ncf2) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75148394:75228157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001048042 // RefSeq // Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide adenylyltransferase 2 (Nmnat2), mRNA. // chr13 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75346746:75525374:1 gene:ENSRNOG00000027697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// DQ022370 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase-2 mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// NONRATT016551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75454205:75525189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// NONRATT016554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001105961 // RefSeq // Rattus norvegicus SHC SH2-domain binding protein 1-like (Shcbp1l), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75817697:75847988:1 gene:ENSRNOG00000002691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC160910 // GenBank // Rattus norvegicus similar to GE36, mRNA (cDNA clone MGC:188646 IMAGE:7456157), complete cds. // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ220197 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YN06 mRNA sequence. // chr13 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// GENSCAN00000036724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75821441:75847877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT016558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_019344 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 8 (Rgs8), mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 8 (Rgs8), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// XM_006250016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 8 (Rgs8), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:76072717:76104924:1 gene:ENSRNOG00000002369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AB006013 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RGS8, complete cds. // chr13 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// BC089064 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 8, mRNA (cDNA clone MGC:105444 IMAGE:7317138), complete cds. // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT016560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NONRATT016562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001077589 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 16 (Rgs16), mRNA. // chr13 // 89 // 77 // 24 // 27 // 0 /// XM_006250010 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 16 (Rgs16), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006250011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 16 (Rgs16), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000032236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:76145330:76148774:1 gene:ENSRNOG00000027024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AY651775 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 16 (Rgs16) mRNA, complete cds. // chr13 // 89 // 77 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:76143475:76148774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
NM_182673 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent) (Rnasel), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006249998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent) (Rnasel), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent) (Rnasel), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease L (2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent) (Rnasel), transcript variant X7, mRNA. // chr13 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000032157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:76158771:76166016:1 gene:ENSRNOG00000027017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY262823 // GenBank // Rattus norvegicus 2,5-oligoisoadenylate synthetase-dependent ribonuclease L (Rnasel) mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:76158803:76165784:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003752646 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 648 (LOC100362915), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 648 (LOC100362915), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250024 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 648 (LOC100362915), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050365 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:76606608:76608212:1 gene:ENSRNOG00000031569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:76606608:76608212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
AY539921 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00170 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:77514253:77643240:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_031665 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 6 (Stx6), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:77739763:77785250:1 gene:ENSRNOG00000003402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC081769 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 6, mRNA (cDNA clone MGC:93348 IMAGE:7134641), complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// U56815 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 6 mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:77766123:77783724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006221502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (RGD1561635), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_344159 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (RGD1561635), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000032135 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:78085181:78085681:1 gene:ENSRNOG00000025033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_001011906 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA binding domain containing 6 (Acbd6), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA binding domain containing 6 (Acbd6), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000004772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78130762:78265044:1 gene:ENSRNOG00000003550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC086598 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-Coenzyme A binding domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:105589 IMAGE:7313105), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA binding domain containing 6 (Acbd6), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// XM_006250033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA binding domain containing 6 (Acbd6), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT016579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78117714:78189355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_199100 // RefSeq // Rattus norvegicus torsin A interacting protein 2 (Tor1aip2), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78633864:78660388:1 gene:ENSRNOG00000024849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061831 // GenBank // Rattus norvegicus torsin A interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72610 IMAGE:5599615), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78651620:78657254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT016583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001165896 // RefSeq // Rattus norvegicus torsin A interacting protein 2 (Tor1aip2), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NM_001165897 // RefSeq // Rattus norvegicus torsin A interacting protein 2 (Tor1aip2), transcript variant 3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000071482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78633864:78645478:1 gene:ENSRNOG00000048267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT016582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT016583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT016585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT016586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT016584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
XR_339821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongation factor 1-alpha 1-like (LOC679963), misc_RNA. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XR_359032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongation factor 1-alpha 1-like (LOC679963), misc_RNA. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000005341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78792709:78794553:1 gene:ENSRNOG00000004012 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78792779:78794275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
NM_130828 // RefSeq // Rattus norvegicus nephrosis 2, idiopathic, steroid-resistant (Nphs2), mRNA. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78853117:78865501:1 gene:ENSRNOG00000004030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78853117:78865501:1 gene:ENSRNOG00000004030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AB091379 // GenBank // Rattus norvegicus Nphs2 mRNA for podocin, complete cds. // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AY039651 // GenBank // Rattus norvegicus podocin mRNA, complete cds. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC098649 // GenBank // Rattus norvegicus nephrosis 2 homolog, podocin (human), mRNA (cDNA clone MGC:112589 IMAGE:7127895), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78851961:78865082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT016591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006250046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus c-abl oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase (Abl2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006250048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus c-abl oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase (Abl2), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NM_001107186 // RefSeq // Rattus norvegicus c-abl oncogene 2, non-receptor tyrosine kinase (Abl2), mRNA. // chr13 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000059524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:79075163:79253783:1 gene:ENSRNOG00000004305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT016595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79075163:79163881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT016594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
ENSRNOT00000043420 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:79284059:79284654:1 gene:ENSRNOG00000015564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79234855:79285608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
GENSCAN00000028493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79382318:79395606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT016597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000028494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79661328:79689813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001113775 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810025M15 (RGD1304982), mRNA. // chr13 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:80029428:80059901:1 gene:ENSRNOG00000005177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// BC158771 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810025M15, mRNA (cDNA clone MGC:188074 IMAGE:7124147), complete cds. // chr13 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000025776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:80029436:80044259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT016601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT016602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT016600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_053571 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC16 homolog B (S. cerevisiae) (Sec16b), mRNA. // chr13 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// XM_006250076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC16 homolog B (S. cerevisiae) (Sec16b), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC16 homolog B (S. cerevisiae) (Sec16b), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:80091717:80133075:1 gene:ENSRNOG00000005229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:80091717:80133075:1 gene:ENSRNOG00000005229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB060653 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RGPR-p117, complete cds. // chr13 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:80094488:80175598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001170603 // RefSeq // Rattus norvegicus astrotactin 1 (Astn1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000007660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:80970701:81285187:1 gene:ENSRNOG00000005667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000030903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:81259852:81282187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000030917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:81180773:81221472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:81109174:81164722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONRATT016610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1
NR_032299 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-488 (Mir488), microRNA. // chr13 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000054388 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:81112954:81113032:1 gene:ENSRNOG00000036265 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// rno-mir-488 // miRBase Micro RNA Database // MI0006168 Rattus norvegicus miR-488 stem-loop // chr13 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_013045 // RefSeq // Rattus norvegicus tenascin R (Tnr), mRNA. // chr13 // 94 // 100 // 45 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000003407 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:82511491:82587627:1 gene:ENSRNOG00000002468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000011985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:82511649:82585406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT016618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001162897 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100302372 (LOC100302372), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001162898 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100302372 (LOC100302372), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100302372 (LOC100302372), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100302372 (LOC100302372), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071963 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:82727285:82729132:1 gene:ENSRNOG00000049537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168205 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7123283. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105963 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S14 (Mrps14), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S14 (Mrps14), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:82847625:82853368:1 gene:ENSRNOG00000002569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166895 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S14, mRNA (cDNA clone MGC:188850 IMAGE:6920474), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:82847648:82852524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT016629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
AY539867 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00116 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 69 // 100 // 18 // 26 // 0
ENSRNOT00000003662 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:83373937:83374396:1 gene:ENSRNOG00000002733 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000026815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83374049:83374465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0
XM_002724882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger and CCCH-type domains 1 (Rc3h1), mRNA. // chrU // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000003689 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:83648578:83682162:1 gene:ENSRNOG00000002750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 90 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000026811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83654084:83727844:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 74 // 74 // 29 // 39 // 1
XM_002724882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger and CCCH-type domains 1 (Rc3h1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000046512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:83705813:83727844:1 gene:ENSRNOG00000002783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// AY321346 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-248 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// NM_001012027 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1 (Serpinc1), mRNA. // chr13 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000003748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:83700732:83715023:1 gene:ENSRNOG00000002783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// BC088467 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade C (antithrombin), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:95125 IMAGE:7127992), complete cds. // chr13 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// FQ211013 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YP07 mRNA sequence. // chr13 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// GENSCAN00000026811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83654084:83727844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT016640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// NONRATT016642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
GAS5 // lncRNA Db // rn4 chr13:76,594,781-76,598,102 // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GAS5 // lncRNA Db // rn4 chr13:76,594,781-76,598,102 // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
GAS5 // lncRNA Db // rn4 chr13:76,594,781-76,598,102 // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
FQ233900 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YO19 mRNA sequence. // chr13 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GAS5 // lncRNA Db // rn4 chr13:76,594,781-76,598,102 // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GAS5 // lncRNA Db // rn4 chr13:76,594,781-76,598,102 // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033061 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein L (Cenpl), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001244761 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein L (Cenpl), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006250099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein L (Cenpl), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000059266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:83781165:83795518:1 gene:ENSRNOG00000038789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079467 // GenBank // Rattus norvegicus centromere protein L, mRNA (cDNA clone MGC:95027 IMAGE:7122576), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC103642 // GenBank // Rattus norvegicus centromere protein L, mRNA (cDNA clone MGC:125045 IMAGE:7300924), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83784418:83792625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT016654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_006221516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 45 (Ankrd45), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006221517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 45 (Ankrd45), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// XM_006221519 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 45 (Ankrd45), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 45 (Ankrd45), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006250120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 45 (Ankrd45), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// XM_006250122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 45 (Ankrd45), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:83874383:83886577:1 gene:ENSRNOG00000002890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83868748:83967954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT016659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
XM_006221521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 9, member C2 (putative) (Slc9c2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035113 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:83896843:83963584:1 gene:ENSRNOG00000026797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074468 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:83934759:83963558:1 gene:ENSRNOG00000026797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000006819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83868748:83967954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_053552 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 4 (Tnfsf4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:84166838:84190558:1 gene:ENSRNOG00000002968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF037067 // GenBank // Rattus norvegicus OX40 ligand (Ox40l) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001074323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18 (Tnfsf18), mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_344166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 18 (Tnfsf18), mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039221 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:84273107:84281313:1 gene:ENSRNOG00000026607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:84262160:84278638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
GENSCAN00000019329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:84343629:84388245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001012207 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C (Pigc), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C (Pigc), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C (Pigc), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:84780658:84783012:1 gene:ENSRNOG00000026497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087080 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class C, mRNA (cDNA clone MGC:94541 IMAGE:7189037), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031914 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 199a-2 (Mir199a2), microRNA. // chr13 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000044190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:85019301:85019735:1 gene:ENSRNOG00000029459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054483 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:85019397:85019506:1 gene:ENSRNOG00000036364 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000020509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85019301:85049654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// rno-mir-199a // miRBase Micro RNA Database // MI0000941 Rattus norvegicus miR-199a stem-loop // chr13 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT016669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NR_031927 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-214 (Mir214), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-214 // miRBase Micro RNA Database // MI0000954 Rattus norvegicus miR-214 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108856 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 4 (Vamp4), mRNA. // chr13 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006250184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 4 (Vamp4), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:85352970:85375551:1 gene:ENSRNOG00000003071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85356459:85384383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT016672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_030865 // RefSeq // Rattus norvegicus myocilin, trabecular meshwork inducible glucocorticoid response (Myoc), mRNA. // chr13 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:85409611:85420007:1 gene:ENSRNOG00000003221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB019393 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for myocilin, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF093567 // GenBank // Rattus norvegicus myocilin mRNA, complete cds. // chr13 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85409725:85429578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105964 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin-associated protein 3 (Kifap3), mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000063810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:86953394:87089644:1 gene:ENSRNOG00000002544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:86942973:87009244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT016682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000020243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87014217:87126906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// NONRATT016685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// NONRATT016680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// NONRATT016681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_001191828 // RefSeq // Rattus norvegicus SCY1-like 3 (S. cerevisiae) (Scyl3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SCY1-like 3 (S. cerevisiae) (Scyl3), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87103921:87127294:1 gene:ENSRNOG00000025318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87014217:87126906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001025668 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 18 (Mettl18), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 18 (Mettl18), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87171578:87173701:1 gene:ENSRNOG00000025189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098702 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2810422O20Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:112676 IMAGE:7388665), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87172569:87173657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000003646 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:87195318:87196539:1 gene:ENSRNOG00000002712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_138879 // RefSeq // Rattus norvegicus selectin E (Sele), mRNA. // chr13 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000030677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87235309:87242177:1 gene:ENSRNOG00000002723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// L25527 // GenBank // Rattus norvegicus E-selectin (ELAM-1) mRNA, complete cds. // chr13 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87235356:87243110:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_019177 // RefSeq // Rattus norvegicus selectin L (Sell), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87249243:87267197:1 gene:ENSRNOG00000002776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// D10831 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for LECAM-1, complete cds. // chr13 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87249174:87263763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_013114 // RefSeq // Rattus norvegicus selectin P (Selp), mRNA. // chr13 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87318111:87344163:1 gene:ENSRNOG00000002794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC101919 // GenBank // Rattus norvegicus selectin, platelet, mRNA (cDNA clone MGC:124632 IMAGE:7935390), complete cds. // chr13 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// L23088 // GenBank // Rattus norvegicus P-selectin mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87305827:87343608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001047878 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor V (proaccelerin, labile factor) (F5), mRNA. // chr13 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87355980:87417680:1 gene:ENSRNOG00000002815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87355980:87448675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_001030024 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 2 (Slc19a2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87436626:87450478:1 gene:ENSRNOG00000002839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099811 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 19 (thiamine transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124887 IMAGE:7929969), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87355980:87448675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001014131 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 181 (Ccdc181), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87458873:87472530:1 gene:ENSRNOG00000002860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078972 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930455F23, mRNA (cDNA clone MGC:93852 IMAGE:7111822), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87461113:87472358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT016702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_138532 // RefSeq // Rattus norvegicus NME/NM23 family member 7 (Nme7), mRNA. // chr13 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000058897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87510979:87621629:1 gene:ENSRNOG00000002898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF202049 // GenBank // Rattus norvegicus NM23-R7 (Nm23-R7) mRNA, complete cds. // chr13 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// BC060314 // GenBank // Rattus norvegicus non-metastatic cells 7, protein expressed in (nucleoside-diphosphate kinase), mRNA (cDNA clone MGC:72693 IMAGE:6918381), complete cds. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87510015:87531212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT016704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001105965 // RefSeq // Rattus norvegicus dermatopontin (Dpt), mRNA. // chr13 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000066119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87954464:87982420:1 gene:ENSRNOG00000002947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC167054 // GenBank // Rattus norvegicus dermatopontin, mRNA (cDNA clone MGC:189353 IMAGE:7113939), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87954550:87981906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT016713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_006221526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 161 (Gpr161), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 161 (Gpr161), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 161 (Gpr161), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 161 (Gpr161), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004104 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:88434397:88450766:1 gene:ENSRNOG00000003073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88408581:88450766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001077643 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial pyruvate carrier 2 (Mpc2), mRNA. // chr13 // 89 // 100 // 34 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000004206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88560644:88579857:1 gene:ENSRNOG00000003150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ215073 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA4YF17 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ224252 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA72YB19 mRNA sequence. // chr13 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// FQ222522 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA22YF04 mRNA sequence. // chr13 // 71 // 100 // 27 // 38 // 0 /// NONRATT016717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT016718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000051014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88560780:88624912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_021684 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 10 (soluble) (Adcy10), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000004326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88600755:88667831:1 gene:ENSRNOG00000003153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AF081941 // GenBank // Rattus norvegicus soluble adenylyl cyclase (SAC) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000050993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88631925:88667805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88560780:88624912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0
NM_001105966 // RefSeq // Rattus norvegicus cellular repressor of E1A-stimulated genes 1 (Creg1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88852202:88864665:1 gene:ENSRNOG00000003291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166446 // GenBank // Rattus norvegicus cellular repressor of E1A-stimulated genes 1, mRNA (cDNA clone MGC:187595 IMAGE:8364240), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233661 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YP04 mRNA sequence. // chr13 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88852239:88948816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT016722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001205304 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd247 molecule (Cd247), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NM_170789 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd247 molecule (Cd247), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88876070:88950995:1 gene:ENSRNOG00000003298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000070958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88876070:88950995:1 gene:ENSRNOG00000003298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC097933 // GenBank // Rattus norvegicus Cd247 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:116047 IMAGE:7384006), complete cds. // chr13 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// D13555 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for T cell receptor zeta chain, complete cds. // chr13 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// L08447 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor CD3 zeta subunit mRNA, complete cds. // chr13 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT016724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000031911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88852239:88948816:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NONRATT016725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001191829 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein A33 (transmembrane) (Gpa33), mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:89212323:89245475:1 gene:ENSRNOG00000003740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:89217683:89245475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT016728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001037980 // RefSeq // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 1 (Tada1), mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:89462838:89476792:1 gene:ENSRNOG00000003816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000058689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:89462838:89476792:1 gene:ENSRNOG00000003816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC091380 // GenBank // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 1 (HFI1 homolog, yeast) like, mRNA (cDNA clone MGC:109458 IMAGE:7320760), complete cds. // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC158713 // GenBank // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 1 (HFI1 homolog, yeast) like, mRNA (cDNA clone MGC:187842 IMAGE:9035442), complete cds. // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:89377633:89476477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT016733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT016736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
XM_001075923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 78, member B (Fam78b), partial mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_002728030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 78, member B (Fam78b), mRNA. // chr13 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT016908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001009631 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 1 (Tmco1), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90109017:90131813:1 gene:ENSRNOG00000003928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC088319 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:109554 IMAGE:7325542), complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90109066:90162902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_022273 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 9 family, member A1 (Aldh9a1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase-like (LOC100910278), mRNA. // chr13 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000005611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90223961:90240182:1 gene:ENSRNOG00000004027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF170918 // GenBank // Rattus norvegicus 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase (Tmabadh) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC074019 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 9 family, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:91695 IMAGE:7104823), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90205163:90239410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT016743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90109066:90162902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT016742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
XR_146261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus osteoclast-stimulating factor 1-like (LOC685495), misc_RNA. // chr13 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XR_146262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus osteoclast-stimulating factor 1-like (LOC100910652), misc_RNA. // chr13 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000071204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90267313:90267953:1 gene:ENSRNOG00000047428 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90162262:90162902:1 gene:ENSRNOG00000049231 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000009604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90267313:90267953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90109066:90162902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_031765 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoid X receptor gamma (Rxrg), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoid X receptor gamma (Rxrg), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90460380:90511040:1 gene:ENSRNOG00000004537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091363 // GenBank // Rattus norvegicus retinoid X receptor gamma, mRNA (cDNA clone MGC:109416 IMAGE:7319081), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90467491:90510697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT016745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001105967 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM homeobox transcription factor 1 alpha (Lmx1a), mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90560341:90699341:1 gene:ENSRNOG00000004642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90631898:90697452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT016749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSRNOT00000003656 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:92548308:92548943:1 gene:ENSRNOG00000002726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_019341 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 5 (Rgs5), mRNA. // chr13 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:92595346:92631357:1 gene:ENSRNOG00000002730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// AF241259 // GenBank // Rattus norvegicus RGS5 mRNA, complete cds. // chr13 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// EF568934 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G protein signaling 5 (RGS5) mRNA, complete cds. // chr13 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// FQ229382 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YC01 mRNA sequence. // chr13 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// FQ234716 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YO17 mRNA sequence. // chr13 // 86 // 97 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:92610820:92631357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NONRATT016752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214383 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YP21 mRNA sequence. // chr13 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0
NM_001109073 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to novel protein (RGD1560672), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to novel protein (RGD1560672), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:92891869:92899444:1 gene:ENSRNOG00000025005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:92890952:92917919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001177830 // RefSeq // Rattus norvegicus Da1-10-like (LOC100366054), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:92913183:92937227:1 gene:ENSRNOG00000033515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT016757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001033899 // RefSeq // Rattus norvegicus spermine synthase (Sms), mRNA. // chr13 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000010135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:40674244:40725965:1 gene:ENSRNOG00000007688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// BC101870 // GenBank // Rattus norvegicus spermine synthase, mRNA (cDNA clone MGC:124869 IMAGE:5621864), complete cds. // chr13 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000051667 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:156315380:156316480:-1 gene:ENSRNOG00000031275 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr13 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:156315380:156316480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93182071:93183069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT058779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000055622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:40674514:40725526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1
XM_001065477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain protein 1B2 (Sh2d1b2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain protein 1B2 (Sh2d1b2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058547 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:93183903:93203419:1 gene:ENSRNOG00000038432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001076754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 1B (Sh2d1b), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_577285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 1B (Sh2d1b), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048692 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:93232943:93248518:1 gene:ENSRNOG00000031599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain-containing protein 1B-like (LOC100910879), mRNA. // chr13 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// XM_006221541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 1B (Sh2d1b), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93199540:93257649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:92037105:92133985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001109074 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to novel protein (RGD1565283), mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000003979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93270446:93274071:1 gene:ENSRNOG00000002972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93270423:93273976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT016759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000048823 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:93406831:93407061:1 gene:ENSRNOG00000034300 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93367278:93407061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107195 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactomedin-like 2B (Olfml2b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93609913:93647084:1 gene:ENSRNOG00000003018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93610322:93646612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT016762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_207603 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG, low affinity IIIa, receptor (Fcgr3a), mRNA. // chr13 // 84 // 81 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94025117:94035162:1 gene:ENSRNOG00000024382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AY219230 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane receptor FcgammaRIII-X mRNA, complete cds. // chr13 // 84 // 81 // 21 // 25 // 0 /// BC166877 // GenBank // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG, low affinity IIIa, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:188806 IMAGE:6921627), complete cds. // chr13 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// EF158003 // GenBank // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG intermediate affinity IV receptor (Fcgr4) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94025174:94034770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT016765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_001109075 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700009P17 (RGD1562658), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000050804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94107559:94123450:1 gene:ENSRNOG00000034221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ219903 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YO22 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94119517:94123237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
NM_017027 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin protein zero (Mpz), mRNA. // chr13 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94151844:94157570:1 gene:ENSRNOG00000003171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC078859 // GenBank // Rattus norvegicus myelin protein zero, mRNA (cDNA clone IMAGE:7121950). // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// K03242 // GenBank // Rat Schwann cell peripheral myelin (P-0) mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94153897:94156689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT016768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_013112 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein A-II (Apoa2), mRNA. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006250239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein A-II (Apoa2), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94223782:94225667:1 gene:ENSRNOG00000003500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ210325 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA30YE05 mRNA sequence. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// FQ210542 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA26YO17 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ210885 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA20YI06 mRNA sequence. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94224030:94225563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 87 // 85 // 20 // 23 // 0 /// NONRATT016771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_023959 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 4 (Adamts4), mRNA. // chr13 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94249862:94259351:1 gene:ENSRNOG00000003538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94249907:94276123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001009539 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 3 (B4galt3), mRNA. // chr13 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000004735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94270746:94276732:1 gene:ENSRNOG00000003551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC061812 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:72586 IMAGE:5598658), complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT016775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94249907:94276123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT016777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_031800 // RefSeq // Rattus norvegicus death effector domain-containing (Dedd), mRNA. // chr13 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// XM_006250272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death effector domain-containing (Dedd), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94345399:94348787:1 gene:ENSRNOG00000003779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF053362 // GenBank // Rattus norvegicus death effector domain-containing protein DEFT mRNA, complete cds. // chr13 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94345449:94348665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT016779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT016778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT016782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001109476 // RefSeq // Rattus norvegicus prefoldin subunit 2 (Pfdn2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prefoldin subunit 2 (Pfdn2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000005346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94353202:94371423:1 gene:ENSRNOG00000003983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158649 // GenBank // Rattus norvegicus prefoldin subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:187626 IMAGE:8367459), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94353207:94370226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109076 // RefSeq // Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 4 (Pvrl4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94383718:94401716:1 gene:ENSRNOG00000004029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ228642 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA5YL01 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94383742:94400201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT016789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001109077 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 30 (Arhgap30), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006250257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 30 (Arhgap30), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94402572:94423807:1 gene:ENSRNOG00000004192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ211641 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YN09 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000047695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94402653:94432477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT016790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_031777 // RefSeq // Rattus norvegicus upstream transcription factor 1 (Usf1), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94424975:94433095:1 gene:ENSRNOG00000004255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF026476 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor USF-1 mRNA, complete cds. // chr13 // 89 // 79 // 24 // 27 // 0 /// BC088849 // GenBank // Rattus norvegicus upstream transcription factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:105389 IMAGE:7313699), complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// FQ231045 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YI05 mRNA sequence. // chr13 // 85 // 97 // 28 // 33 // 0 /// NONRATT016791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT016792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// GENSCAN00000047695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94402653:94432477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_053796 // RefSeq // Rattus norvegicus F11 receptor (F11r), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000006141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94453478:94477354:1 gene:ENSRNOG00000004414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// AF276998 // GenBank // Rattus norvegicus junctional adhesion molecule JAM (Jam) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC065309 // GenBank // Rattus norvegicus F11 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:72346 IMAGE:5599898), complete cds. // chr13 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// GENSCAN00000047714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94468279:94476532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
XM_006250258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intelectin 1 (galactofuranose binding) (Itln1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94546196:94556299:1 gene:ENSRNOG00000004678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001034946 // RefSeq // Rattus norvegicus intelectin 1 (galactofuranose binding) (Itln1), mRNA. // chr13 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// BC099766 // GenBank // Rattus norvegicus intelectin 1 (galactofuranose binding), mRNA (cDNA clone MGC:124684 IMAGE:7931002), complete cds. // chr13 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94519763:94556182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006221613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd244 molecule, natural killer cell receptor 2B4 (Cd244), partial mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF209406 // GenBank // Rattus norvegicus NK cell receptor 2B4 mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94597699:94618284:1 gene:ENSRNOG00000004698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 70 // 100 // 16 // 23 // 0 /// NONRATT016799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_022259 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd244 molecule, natural killer cell receptor 2B4 (Cd244), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000000053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94597696:94613022:1 gene:ENSRNOG00000004698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// AF156988 // GenBank // Rattus norvegicus secreted NK cell receptor 2B4 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF156989 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane NK cell receptor 2B4 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94597699:94618284:1 gene:ENSRNOG00000004698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
GENSCAN00000047710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94611447:94621009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_139103 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd48 molecule (Cd48), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_359106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd48 molecule (Cd48), transcript variant X2, misc_RNA. // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94737393:94760905:1 gene:ENSRNOG00000004737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC060542 // GenBank // Rattus norvegicus Cd48 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:72677 IMAGE:6921213), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94732539:94755103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT016801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT016800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT016803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001109078 // RefSeq // Rattus norvegicus signaling lymphocytic activation molecule family member 1 (Slamf1), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000033868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:101446883:101481363:1 gene:ENSRNOG00000004761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:101446966:101526049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001192006 // RefSeq // Rattus norvegicus CD84 molecule (Cd84), mRNA. // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000050547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94797092:94800870:1 gene:ENSRNOG00000022884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001191932 // RefSeq // Rattus norvegicus SLAM family member 6 (Slamf6), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLAM family member 6 (Slamf6), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000029315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94824150:94844891:1 gene:ENSRNOG00000038286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94835836:94888724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT016806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000006326 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:94860929:94861316:1 gene:ENSRNOG00000004765 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94835836:94888724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0
NM_001014231 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 8 (Dcaf8), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 8 (Dcaf8), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000008944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95053335:95099779:1 gene:ENSRNOG00000006785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC085957 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 42A, mRNA (cDNA clone MGC:95309 IMAGE:7134976), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_359113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 8 (Dcaf8), transcript variant X5, misc_RNA. // chr13 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// XM_006250300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 8 (Dcaf8), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000050644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95078171:95098870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT016818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001134540 // RefSeq // Rattus norvegicus coatomer protein complex subunit alpha (Copa), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000008518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94990249:95030030:1 gene:ENSRNOG00000006247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// BC169090 // GenBank // Rattus norvegicus coatomer protein complex subunit alpha, mRNA (cDNA clone MGC:189504 IMAGE:7937992), complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000050637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94989856:95029437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT016809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT016811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NONRATT016812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001014787 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 8 (Igsf8), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 8 (Igsf8), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 8 (Igsf8), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95213847:95221979:1 gene:ENSRNOG00000007604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC092192 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:105805 IMAGE:7312924), complete cds. // chr13 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95214614:95221537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT016822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_031602 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 10 (Kcnj10), mRNA. // chr13 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95245046:95274535:1 gene:ENSRNOG00000007705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U27558 // GenBank // Rattus norvegicus brain-specific inwardly rectifying K+ channel 1 mRNA, complete cds. // chr13 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95274047:95274371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT016825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_024144 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class M (Pigm), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95281187:95284884:1 gene:ENSRNOG00000007735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB028126 // GenBank // Rattus norvegicus PIG-M mRNA for mannosyltransferase, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95281273:95282544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT016828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105971 // RefSeq // Rattus norvegicus SLAM family member 9 (Slamf9), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95381996:95384776:1 gene:ENSRNOG00000008045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ235209 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YB03 mRNA sequence. // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT016831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95382116:95413354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001107197 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 9 (Igsf9), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006250291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 9 (Igsf9), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006250292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 9 (Igsf9), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006250293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 9 (Igsf9), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000010930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95389058:95405643:1 gene:ENSRNOG00000008054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000051271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95382116:95413354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT016832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001013127 // RefSeq // Rattus norvegicus transgelin 2 (Tagln2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250295 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transgelin 2 (Tagln2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95407052:95413998:1 gene:ENSRNOG00000008301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC084703 // GenBank // Rattus norvegicus transgelin 2, mRNA (cDNA clone MGC:105912 IMAGE:7300611), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ223112 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YE22 mRNA sequence. // chr13 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT016834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95382116:95413354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT016835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT016836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT016839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT016840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001024882 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 19 (Ccdc19), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000011450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95428891:95452273:1 gene:ENSRNOG00000008492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC098058 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:116217 IMAGE:7457890), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000051275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95417716:95470351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT016843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT016842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001105972 // RefSeq // Rattus norvegicus V-set and immunoglobulin domain containing 8 (Vsig8), mRNA. // chr13 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95462572:95470761:1 gene:ENSRNOG00000008668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT016844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95417716:95470351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_017096 // RefSeq // Rattus norvegicus C-reactive protein, pentraxin-related (Crp), mRNA. // chrU // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000000058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95599335:95601216:1 gene:ENSRNOG00000000053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// BC091157 // GenBank // Rattus norvegicus C-reactive protein, pentraxin-related, mRNA (cDNA clone MGC:108726 IMAGE:7368286), complete cds. // chrU // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// FQ218887 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YE11 mRNA sequence. // chrU // 92 // 60 // 22 // 24 // 0 /// FQ219029 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YE06 mRNA sequence. // chrU // 88 // 63 // 22 // 25 // 0 /// FQ219098 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YL12 mRNA sequence. // chrU // 76 // 63 // 19 // 25 // 0 /// FQ219118 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YI20 mRNA sequence. // chrU // 92 // 60 // 22 // 24 // 0 /// M83176 // GenBank // R.norvegicus C-reactive protein mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// AY321318 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1-114 mRNA, complete cds. // chrU // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// GENSCAN00000051270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95599418:95622171:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 87 // 58 // 20 // 23 // 0
NM_001000499 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1576 (Olr1576), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95994475:95995404:1 gene:ENSRNOG00000009141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95994475:96058152:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000079 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1582 (Olr1582), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96226413:96227354:1 gene:ENSRNOG00000046512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96224340:96227354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001000080 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1583 (Olr1583), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96239742:96240683:1 gene:ENSRNOG00000045582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96239919:96240683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus absent in melanoma 2 (Aim2), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006221557 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus absent in melanoma 2 (Aim2), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006250334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus absent in melanoma 2 (Aim2), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006250336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus absent in melanoma 2 (Aim2), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000037655 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:96469430:96477880:1 gene:ENSRNOG00000003480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96469430:96477880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT016851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001000081 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1584 (Olr1584), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006250315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1584 (Olr1584), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000004643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96618117:96619061:1 gene:ENSRNOG00000003498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000030450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96618117:96619061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT016852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001001109 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1585 (Olr1585), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 11H6-like (LOC102550614), mRNA. // chr13 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000047706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96631730:96640658:1 gene:ENSRNOG00000050357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96631730:96641895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000913 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1587 (Olr1587), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000049819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96653319:96654257:1 gene:ENSRNOG00000050941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96653319:96665467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT016854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000082 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1588 (Olr1588), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 6N2-like (LOC102550713), partial mRNA. // chr13 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000004659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96663615:96664568:1 gene:ENSRNOG00000003509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96653319:96665467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000083 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1589 (Olr1589), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96685799:96686737:1 gene:ENSRNOG00000022387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96685799:96686737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000995 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1590 (Olr1590), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96695077:96696024:1 gene:ENSRNOG00000030059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96695077:96715979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT016857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000912 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1591 (Olr1591), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96715029:96715974:1 gene:ENSRNOG00000032352 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96695077:96715979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000085 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1593 (Olr1593), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96743127:96744074:1 gene:ENSRNOG00000003521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96743100:96744074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000073365 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:96750824:96751772:1 gene:ENSRNOG00000048228 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96751065:96768880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001000500 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1595 (Olr1595), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96759462:96760409:1 gene:ENSRNOG00000022329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96751065:96768880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000501 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1596 (Olr1596), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96751065:96768880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011908 // RefSeq // Rattus norvegicus spectrin, alpha, erythrocytic 1 (elliptocytosis 2) (Spta1), mRNA. // chr13 // 98 // 100 // 52 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000004716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96764163:96859811:1 gene:ENSRNOG00000003537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000066509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96764163:96859811:1 gene:ENSRNOG00000003537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0 /// AY238342 // GenBank // Rattus norvegicus erythroid spectrin alpha mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000006297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96783767:96859811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT016862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0
NM_001000910 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1598 (Olr1598), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000048222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96878516:96879448:1 gene:ENSRNOG00000046866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96863271:96879448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT016863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001000086 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1600 (Olr1600), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96897148:96898080:1 gene:ENSRNOG00000047062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000087 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1601 (Olr1601), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96932848:96933801:1 gene:ENSRNOG00000003560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96933022:96933801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000909 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1602 (Olr1602), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96971816:96972793:1 gene:ENSRNOG00000022063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96971816:96972793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formin 2-like (LOC100360457), mRNA. // chrU // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000072243 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:97036274:97135362:1 gene:ENSRNOG00000046471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 24 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000006292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:97036274:97144149:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 31 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000006294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:97206170:97250596:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// NONRATT016869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 24 // 24 // 11 // 45 // 1
NM_021593 // RefSeq // Rattus norvegicus kynurenine 3-monooxygenase (kynurenine 3-hydroxylase) (Kmo), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006250325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kynurenine 3-monooxygenase (kynurenine 3-hydroxylase) (Kmo), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006250326 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kynurenine 3-monooxygenase (kynurenine 3-hydroxylase) (Kmo), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:98149430:98180385:1 gene:ENSRNOG00000003709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF056031 // GenBank // Rattus norvegicus kynurenine 3-hydroxylase mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC088142 // GenBank // Rattus norvegicus kynurenine 3-monooxygenase (kynurenine 3-hydroxylase), mRNA (cDNA clone MGC:108700 IMAGE:7322842), complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// FQ210049 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA35YJ18 mRNA sequence. // chr13 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT016872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98149472:98176930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT016873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT016874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005091 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98268462:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038285 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98333663:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98210711:98250240:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038285 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98333663:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98266812:98338600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038285 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98333663:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98266812:98338600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038285 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98333663:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98266812:98338600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038285 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98333663:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98266812:98338600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038285 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98333663:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98266812:98338600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98266812:98338600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
XM_006221570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 64 (Wdr64), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98216253:98337829:1 gene:ENSRNOG00000038083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100579 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 2 (Uba2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91155863:91179053:-1 gene:ENSRNOG00000021113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC161985 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:187804 IMAGE:9030809), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98347029:98348948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91155863:91204997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT016875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107198 // RefSeq // Rattus norvegicus exonuclease 1 (Exo1), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:98403058:98427400:1 gene:ENSRNOG00000003876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98403058:98424993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001059251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Beclin 1 (Coiled-coil myosin-like BCL2-interacting protein) (RGD1563293), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Beclin 1 (Coiled-coil myosin-like BCL2-interacting protein) (RGD1563293), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Beclin 1 (Coiled-coil myosin-like BCL2-interacting protein) (RGD1563293), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_222933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Beclin 1 (Coiled-coil myosin-like BCL2-interacting protein) (RGD1563293), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057933 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:98437276:98438526:1 gene:ENSRNOG00000038076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98437276:98438532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_177929 // RefSeq // Rattus norvegicus serologically defined colon cancer antigen 8 (Sdccag8), mRNA. // chr13 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// XM_006250321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serologically defined colon cancer antigen 8 (Sdccag8), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006250322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serologically defined colon cancer antigen 8 (Sdccag8), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:99341229:99528213:1 gene:ENSRNOG00000004181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AF352814 // GenBank // Rattus norvegicus slinky mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// BC086973 // GenBank // Rattus norvegicus serologically defined colon cancer antigen 8, mRNA (cDNA clone MGC:93052 IMAGE:7191324), complete cds. // chr13 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000022947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:99340067:99475525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT016881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
XM_001059720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L30-like 1 (Rpl30l1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_344178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L30-like 1 (Rpl30l1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:99821774:99896351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_022678 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 238 (Zfp238), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 238 (Zfp238), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100036034:100037602:1 gene:ENSRNOG00000004423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF221838 // GenBank // Rattus norvegicus RP58 (rp58) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:99974554:100037602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109549 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689766 (LOC689766), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689766 (LOC689766), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029081 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:100330261:100350556:1 gene:ENSRNOG00000021411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100335838:100350277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006250352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689786 (LOC689786), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057852 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:100428208:100543933:1 gene:ENSRNOG00000038022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006221584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556688 (LOC102556688), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// XM_006221586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689786 (LOC689786), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// XM_006221588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689786 (LOC689786), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// XR_339925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556688 (LOC102556688), transcript variant X2, misc_RNA. // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XR_339926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689786 (LOC689786), transcript variant X6, misc_RNA. // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100406043:100558399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT016888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001013873 // RefSeq // Rattus norvegicus desumoylating isopeptidase 2 (Desi2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus desumoylating isopeptidase 2 (Desi2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100554069:100597418:1 gene:ENSRNOG00000004524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083584 // GenBank // Rattus norvegicus PPPDE peptidase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94230 IMAGE:7131107), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100581713:100597069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000005986 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:100606798:100607235:1 gene:ENSRNOG00000004543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000003139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100604683:100607235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT016893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000042547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100637270:100638129:1 gene:ENSRNOG00000031864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100637379:100637867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT016894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001105976 // RefSeq // Rattus norvegicus COX20 cytochrome C oxidase assembly factor (Cox20), mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100661214:100666065:1 gene:ENSRNOG00000004553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// FQ215236 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YA19 mRNA sequence. // chr13 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// FQ217742 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA19YA22 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// FQ229252 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YJ04 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 84 // 84 // 16 // 19 // 1 /// NONRATT016898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// NONRATT016899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1
NM_001105977 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 2 (Efcab2), mRNA. // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006250319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 2 (Efcab2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100744214:100849978:1 gene:ENSRNOG00000042201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006250348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2-like (LOC102550369), mRNA. // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT016901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100818635:100848016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT016902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001109079 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 26B (Kif26b), mRNA. // chr13 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000017784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:101800843:102194975:-1 gene:ENSRNOG00000028624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT017863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102003251:102049991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
ENSRNOT00000007380 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:102139153:102140458:-1 gene:ENSRNOG00000005581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102139226:102171885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT017863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109079 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 26B (Kif26b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 26B (Kif26b), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:101800843:102194975:-1 gene:ENSRNOG00000028624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:101907311:101919129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109079 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 26B (Kif26b), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006250358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 26B (Kif26b), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:101800843:102194975:-1 gene:ENSRNOG00000028624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:101799233:101886440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_001109079 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 26B (Kif26b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 26B (Kif26b), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:101800843:102194975:-1 gene:ENSRNOG00000028624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:101799233:101886440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
XM_001060344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus consortin, connexin sorting protein (Cnst), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus consortin, connexin sorting protein (Cnst), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus consortin, connexin sorting protein (Cnst), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006250411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus consortin, connexin sorting protein (Cnst), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus consortin, connexin sorting protein (Cnst), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_573525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus consortin, connexin sorting protein (Cnst), transcript variant X6, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003641 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:102879477:102922898:1 gene:ENSRNOG00000002710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102894363:102922898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// FQ231508 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YD21 mRNA sequence. // chr13 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT016912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT016914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001013985 // RefSeq // Rattus norvegicus saccharopine dehydrogenase (putative) (Sccpdh), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:102950971:102972724:1 gene:ENSRNOG00000037984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:102718106:102739594:1 gene:ENSRNOG00000046051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC061579 // GenBank // Rattus norvegicus saccharopine dehydrogenase (putative), mRNA (cDNA clone IMAGE:6889267). // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC079215 // GenBank // Rattus norvegicus saccharopine dehydrogenase (putative), mRNA (cDNA clone MGC:94278 IMAGE:7131885), complete cds. // chr13 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102717812:102739594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102930653:102972571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_053657 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 binding protein kinase alpha (Cdc42bpa), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000003837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:103238053:103453991:1 gene:ENSRNOG00000002841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF021935 // GenBank // Rattus norvegicus mytonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase (MRCK) mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000003725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103255984:103453408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT016917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_019312 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol-trisphosphate 3-kinase B (Itpkb), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:103624308:103715736:1 gene:ENSRNOG00000002969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AJ242781 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase, isoform B. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103706510:103715736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000003733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103591409:103638488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT016918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_013063 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase 1 (Parp1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000004232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:103859760:103891948:1 gene:ENSRNOG00000003084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC085765 // GenBank // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93658 IMAGE:7107130), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// U94340 // GenBank // Rattus norvegicus poly(ADP-ribose) polymerase mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000034026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103859822:103914130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 98 // 94 // 44 // 45 // 0 /// NONRATT016922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT016926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
XM_006250418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-9 homolog (C. elegans) (Lin9), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034265 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:103927066:103971592:1 gene:ENSRNOG00000023304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074148 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:103927066:103969791:1 gene:ENSRNOG00000023304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// XM_001067807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-9 homolog (C. elegans) (Lin9), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000031524 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:48440068:48441536:-1 gene:ENSRNOG00000026134 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 95 // 55 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:48440068:48441443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103942395:103969791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT016927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// NONRATT016929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_182843 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA binding domain containing 3 (Acbd3), mRNA. // chr13 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104006998:104035795:1 gene:ENSRNOG00000003185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY336075 // GenBank // Rattus norvegicus DMT1-associated protein mRNA, complete cds. // chr13 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC083877 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-Coenzyme A binding domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:95164 IMAGE:7130229), complete cds. // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103994085:104049630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT016930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001024970 // RefSeq // Rattus norvegicus SDE2 telomere maintenance homolog (S. pombe) (Sde2), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104135522:104151782:1 gene:ENSRNOG00000003247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC091401 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC30618, mRNA (cDNA clone MGC:109518 IMAGE:7324146), complete cds. // chr13 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104119097:104150057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT016934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT016935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NM_001007556 // RefSeq // Rattus norvegicus Left-right determination factor 2 (Lefty2), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY758558 // GenBank // Rattus norvegicus EBAF precursor, mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT016936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104172572:104186272:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_001012208 // RefSeq // Rattus norvegicus pyrroline-5-carboxylate reductase family, member 2 (Pycr2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104182940:104186733:1 gene:ENSRNOG00000003267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079222 // GenBank // Rattus norvegicus pyrroline-5-carboxylate reductase family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:94295 IMAGE:7132148), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104172572:104186272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT016939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001109080 // RefSeq // Rattus norvegicus left right determination factor 1 (Lefty1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104212318:104215251:1 gene:ENSRNOG00000003263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104212318:104250217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001134496 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 63a (Tmem63a), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// XM_006250364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 63a (Tmem63a), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000004519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104218357:104250973:1 gene:ENSRNOG00000003310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT016942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000034019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104212318:104250217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 76 // 76 // 35 // 46 // 1 /// NONRATT016941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1
ENSRNOT00000029787 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:104332057:104343580:1 gene:ENSRNOG00000037928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006221616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sphingolipid delta(4)-desaturase DES1-like (LOC498300), partial mRNA. // chr13 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072695 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:104366163:104371070:1 gene:ENSRNOG00000050163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104364847:104371070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_001062653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Mdes protein (RGD1564463), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006221599 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Mdes protein (RGD1564463), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// XM_006250421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Mdes protein (RGD1564463), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// XM_223005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Mdes protein (RGD1564463), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004815 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:104385060:104392200:1 gene:ENSRNOG00000003601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104385060:104392200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001105981 // RefSeq // Rattus norvegicus cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4 (Cnih4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104468780:104484267:1 gene:ENSRNOG00000003717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ213684 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YF18 mRNA sequence. // chr13 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT016943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001166578 // RefSeq // Rattus norvegicus cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3 (Cnih3), mRNA. // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000036705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104655193:104761214:1 gene:ENSRNOG00000022724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// FJ403327 // GenBank // Rattus norvegicus strain W cornichon 3 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// D13896 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytoplasmic dynein heavy chain, complete cds. // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006221600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Dynein heavy chain at 16F CG7092-PA (LOC690288), mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 66 // 66 // 0 /// ENSRNOT00000075792 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:105030248:105050414:1 gene:ENSRNOG00000048741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 11 // 11 // 8 // 73 // 1 /// GENSCAN00000031313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104893210:104961774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 33 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104970326:105066345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 40 // 40 // 29 // 73 // 1
NM_001126095 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle 9 (Srp9), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105486289:105494429:1 gene:ENSRNOG00000003211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105486442:105493515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001063503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 binding protein, 2 (Tp53bp2), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_223012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 binding protein, 2 (Tp53bp2), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105773785:105809219:1 gene:ENSRNOG00000003237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105753283:105809664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT016952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// NONRATT016953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_133309 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 8 (Capn8), mRNA. // chr13 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105915589:105977240:1 gene:ENSRNOG00000003468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// D14479 // GenBank // Rattus norvegicus cls4 mRNA for calpain, complete cds. // chr13 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// D14480 // GenBank // Rattus norvegicus cls4 mRNA for calpain, complete cds. // chr13 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// D14478 // GenBank // Rattus norvegicus cls4 premature mRNA for calpain, complete cds. // chr13 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// XM_006250362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 8 (Capn8), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000004649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105915589:105953291:1 gene:ENSRNOG00000003468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT016957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105935847:105974979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001105982 // RefSeq // Rattus norvegicus sushi domain containing 4 (Susd4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000052407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:106115286:106237584:1 gene:ENSRNOG00000003562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ212123 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA68YK21 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:106182648:106247006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000000544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:106248230:106285870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001145828 // RefSeq // Rattus norvegicus toll-like receptor 5 (Tlr5), mRNA. // chr13 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// XM_006250376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-like receptor 5 (Tlr5), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// XM_006250377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-like receptor 5 (Tlr5), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000004821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:106310984:106315238:1 gene:ENSRNOG00000022067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// FJ750588 // GenBank // Rattus norvegicus toll-like receptor 5 (Tlr5) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:106311951:106314530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
NM_001127600 // RefSeq // Rattus norvegicus axin interactor, dorsalization associated (Aida), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100906568:100933399:1 gene:ENSRNOG00000003730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100906715:100933450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001037204 // RefSeq // Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A (Taf1a), mRNA. // chr13 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000068036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100975811:101010930:1 gene:ENSRNOG00000022008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// BC107466 // GenBank // Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, A, mRNA (cDNA clone MGC:125031 IMAGE:7460374), complete cds. // chr13 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT016905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 90 // 98 // 37 // 41 // 0 /// GENSCAN00000056712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100994898:101051788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 60 // 60 // 25 // 42 // 1 /// NONRATT016906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1
XM_001064362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hedgehog interacting protein-like 2 (Hhipl2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_229754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hedgehog interacting protein-like 2 (Hhipl2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019932 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:101018604:101038614:1 gene:ENSRNOG00000014826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100994898:101051788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001105734 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 10 (Dusp10), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:108932784:108969913:1 gene:ENSRNOG00000004003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001040154 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB3 GTPase activating protein subunit 2 (Rab3gap2), mRNA. // chr13 // 100 // 98 // 53 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000003216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107643922:107901904:1 gene:ENSRNOG00000002353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000034888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107643922:107901904:1 gene:ENSRNOG00000002353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// BC086380 // GenBank // Rattus norvegicus RAB3 GTPase activating protein subunit 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301410), complete cds. // chr13 // 96 // 50 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:107810717:107901790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT016969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 48 // 48 // 26 // 54 // 1 /// NONRATT016966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 20 // 20 // 11 // 54 // 1
NR_031910 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 194-1 (Mir194-1), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000053605 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:107924394:107924476:1 gene:ENSRNOG00000035482 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// rno-mir-194-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000937 Rattus norvegicus miR-194-1 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_032110 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-215 (Mir215), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054364 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:107924668:107924768:1 gene:ENSRNOG00000036241 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT016973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// rno-mir-215 // miRBase Micro RNA Database // MI0003482 Rattus norvegicus miR-215 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_171990 // RefSeq // Rattus norvegicus 3(2), 5-bisphosphate nucleotidase 1 (Bpnt1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000003249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107941117:107965559:1 gene:ENSRNOG00000002378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AJ000347 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 3(2),5-bisphosphate nucleotidase. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC085692 // GenBank // Rattus norvegicus 3(2), 5-bisphosphate nucleotidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93112 IMAGE:7190529), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ214355 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YC23 mRNA sequence. // chr13 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:107946691:107964626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT016976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT016977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_001024238 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamyl-prolyl-tRNA synthetase (Eprs), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107973816:108044104:1 gene:ENSRNOG00000002393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC088324 // GenBank // Rattus norvegicus glutamyl-prolyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7364865), partial cds. // chr13 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000000380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:107973816:108044104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT016980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_001105985 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30, member 10 (Slc30a10), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:108069778:108080242:1 gene:ENSRNOG00000002397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 30, member 10 (Slc30a10), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:108069978:108071461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT016989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:108077064:108120436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000018606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:109990688:110029028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001011909 // RefSeq // Rattus norvegicus G patch domain containing 2 (Gpatch2), mRNA. // chr13 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 2 (Gpatch2), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// XM_006250440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 2 (Gpatch2), transcript variant X6, mRNA. // chr13 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:110334296:110351724:1 gene:ENSRNOG00000002512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// BC079232 // GenBank // Rattus norvegicus G patch domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:94311 IMAGE:7132530), complete cds. // chr13 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// FQ230498 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA96YM14 mRNA sequence. // chr13 // 79 // 67 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:110343408:110367132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT016998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 53 // 53 // 23 // 43 // 1
GENSCAN00000043141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:110582164:110582511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000051695 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:110582037:110582511:1 gene:ENSRNOG00000032111 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 65 // 85 // 11 // 17 // 0 /// NONRATT017004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_203336 // RefSeq // Rattus norvegicus estrogen-related receptor gamma (Esrrg), mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus estrogen-related receptor gamma (Esrrg), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// XM_006250444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus estrogen-related receptor gamma (Esrrg), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006250445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus estrogen-related receptor gamma (Esrrg), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006250446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus estrogen-related receptor gamma (Esrrg), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006250447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus estrogen-related receptor gamma (Esrrg), transcript variant X6, mRNA. // chr13 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000003489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:111109757:111326800:1 gene:ENSRNOG00000002593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB126962 // GenBank // Rattus norvegicus errg-1 mRNA for estrogen receptor-related receptor gamma-1, complete cds. // chr13 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB126963 // GenBank // Rattus norvegicus errg-2 mRNA for estrogen receptor-related receptor gamma-2, complete cds. // chr13 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AY341057 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen receptor-related receptor gamma (Esrrg) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001244757 // RefSeq // Rattus norvegicus Usher syndrome 2A homolog (human) (Ush2a), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 69 // 69 // 0 /// NM_172048 // RefSeq // Rattus norvegicus Usher syndrome 2A (autosomal recessive, mild) (Ush2a), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 89 // 27 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:111395505:111568482:1 gene:ENSRNOG00000003738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 25 // 18 // 18 // 0 /// AY077844 // GenBank // Rattus norvegicus usherin (Ush2a) mRNA, complete cds. // chr13 // 89 // 27 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000056695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:111780330:111904753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 17 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:111913768:112057450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 27 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:111395683:111552064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 14 // 14 // 10 // 71 // 1
NM_001107200 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 (Ptpn14), mRNA. // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006250453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 14 (Ptpn14), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000004632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:113312814:113456734:-1 gene:ENSRNOG00000003407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:113313059:113340989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:113341597:113396984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001047927 // RefSeq // Rattus norvegicus Da2-20 (LOC498308), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:113064717:113080859:-1 gene:ENSRNOG00000032812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001135119 // RefSeq // Rattus norvegicus angel homolog 2 (Drosophila) (Angel2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114107705:114121845:1 gene:ENSRNOG00000003795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114107998:114119870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_021865 // RefSeq // Rattus norvegicus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 3 (Batf3), mRNA. // chr13 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114308705:114320081:1 gene:ENSRNOG00000003716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114308705:114320036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT017028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001007679 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 206 (Tmem206), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114572850:114597636:1 gene:ENSRNOG00000003915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC082061 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 206, mRNA (cDNA clone MGC:95217 IMAGE:7132483), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ228821 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YH14 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114569658:114597202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT017032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001191675 // RefSeq // Rattus norvegicus integrator complex subunit 7 (Ints7), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000005715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114821472:114873815:1 gene:ENSRNOG00000004263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000018314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114821535:114922065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 78 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT017034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
ENSRNOT00000030865 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:114890067:114890512:1 gene:ENSRNOG00000024078 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0
XM_223076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L37-like (RGD1560186), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000049634 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:114935445:114935726:1 gene:ENSRNOG00000031098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000048997 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:37746070:37746363:-1 gene:ENSRNOG00000045968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114935445:114935726:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000047422 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:44036062:44036355:1 gene:ENSRNOG00000045963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:69600143:69600436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000035879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44036062:44036355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 64 // 100 // 9 // 14 // 0
NM_001109376 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1 (Lpgat1), mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000064492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114962169:115028639:1 gene:ENSRNOG00000004402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114958814:115082965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
NM_053691 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA (never in mitosis gene a)-related expressed kinase 2 (Nek2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:115071864:115082965:1 gene:ENSRNOG00000004487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016174 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:16016211:16017544:1 gene:ENSRNOG00000012119 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114958814:115082965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:16016211:16017544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT052764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 86 // 44 // 12 // 14 // 0
NM_022853 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 1 (Slc30a1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:115236547:115240420:1 gene:ENSRNOG00000004749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U17133 // GenBank // Rattus norvegicus zinc transporter ZnT-1 (ZnT-1) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:115231882:115239506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT017043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XM_006221608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinal degeneration 3 (Rd3), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 61 // 100 // 19 // 31 // 0 /// XM_006221609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinal degeneration 3 (Rd3), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 65 // 100 // 20 // 31 // 0 /// XM_006250497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinal degeneration 3 (Rd3), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 61 // 100 // 19 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000075086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:115304234:115306466:1 gene:ENSRNOG00000050766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 61 // 100 // 19 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:115255675:115306466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 61 // 100 // 19 // 31 // 0
NM_031742 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 1 (Kcnh1), mRNA. // chr13 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:115478550:115789683:1 gene:ENSRNOG00000003841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT017045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:115495073:115568463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000001092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:115649295:115718073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001108859 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 6 (Irf6), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:116425025:116444232:1 gene:ENSRNOG00000005082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:116410123:116441741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001103357 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100125367 (LOC100125367), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100125367 (LOC100125367), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007341 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:116445798:116448210:1 gene:ENSRNOG00000005558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:116446544:116447281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT017051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100841 // RefSeq // Rattus norvegicus laminin, beta 3 (Lamb3), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:116587121:116628793:1 gene:ENSRNOG00000006025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:116575788:116628421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001105988 // RefSeq // Rattus norvegicus plexin A2 (Plxna2), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:117922569:118118393:1 gene:ENSRNOG00000007324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000001045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:118027210:118196646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_001107202 // RefSeq // Rattus norvegicus CD34 molecule (Cd34), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:118239587:118258715:1 gene:ENSRNOG00000050078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000057160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:118532088:118551216:1 gene:ENSRNOG00000045558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// EU448292 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley CD34 antigen isoform 1 (Cd34) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// EU448293 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley CD34 antigen isoform 2 (Cd34) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:118247663:118258715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:118540164:118551216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
XR_340038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550527 (LOC102550527), transcript variant X1, ncRNA. // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NR_031835 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 29b-2 (Mir29b2), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000053760 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:118329450:118329533:1 gene:ENSRNOG00000035637 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000071880 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:39612388:39612471:1 gene:ENSRNOG00000049256 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// rno-mir-29b-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000862 Rattus norvegicus miR-29b-2 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NR_031838 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-29c (Mir29c), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-29c // miRBase Micro RNA Database // MI0000865 Rattus norvegicus miR-29c stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006249616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus contactin-associated protein like 5-2-like (LOC304725), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000046060 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:19615958:19934642:-1 gene:ENSRNOG00000029556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:19615958:19683980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000051290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:19718942:19823819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
ENSRNOT00000061920 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:22723849:22725058:-1 gene:ENSRNOG00000030028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0
NM_001191924 // RefSeq // Rattus norvegicus nemo like kinase (Nlk), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000011726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65679688:65803568:1 gene:ENSRNOG00000008704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000051065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65746002:65801074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 30 // 30 // 15 // 50 // 1 /// GENSCAN00000011552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261771314:261813771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 20 // 20 // 10 // 50 // 1 /// NONRATT009259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 18 // 18 // 9 // 50 // 1 /// NONRATT009260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 12 // 50 // 1
GENSCAN00000003321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:25338662:25338882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000018729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:29675277:29675513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_001106305 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 152 (Rnf152), mRNA. // chr13 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006249620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 152 (Rnf152), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006249622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 152 (Rnf152), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000019921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:30348244:30424288:-1 gene:ENSRNOG00000014859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT017104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100584 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class N (Pign), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:30676676:30814931:-1 gene:ENSRNOG00000014866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:30713615:30814931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_016993 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 2 (Bcl2), mRNA. // chr13 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// XR_358842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 2 (Bcl2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr13 // 87 // 54 // 13 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000003768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:31758213:31919850:-1 gene:ENSRNOG00000002791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// L14680 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2 (bcl-2) mRNA, complete cds. // chr13 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// U34964 // GenBank // Rattus norvegicus repressor of programmed cell death BCL-2 mRNA, complete cds. // chr13 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// AF512835 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl2-like protein mRNA, complete cds. // chr13 // 73 // 79 // 16 // 22 // 0 /// XM_006249630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 2 (Bcl2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT017112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:31893926:31919614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000022414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:31732840:31778287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001108342 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-ketodihydrosphingosine reductase (Kdsr), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3-ketodihydrosphingosine reductase (Kdsr), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:31929862:31962747:-1 gene:ENSRNOG00000002781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:31931308:31962673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_001025716 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 4 homolog B (S. cerevisiae) (Vps4b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000003715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:31975737:32000936:-1 gene:ENSRNOG00000002705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC099128 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 4 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116271 IMAGE:7459593), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000034186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:31977036:32016563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006221436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3A (Serpinb3a), mRNA. // chr13 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// XM_006249640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3A (Serpinb3a), mRNA. // chr13 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// ENSRNOT00000003475 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:32303013:32307716:-1 gene:ENSRNOG00000002578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1 /// NONRATT017117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32256090:32307716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 80 // 12 // 15 // 1
NM_001008887 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 3 (Serpinb3), mRNA. // chr13 // 86 // 70 // 12 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000040021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:32336215:32341680:-1 gene:ENSRNOG00000031134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 86 // 70 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32336215:32341680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000045607 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:33225766:33226757:-1 gene:ENSRNOG00000030429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0
NONRATT041441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT041929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 90 // 100 // 27 // 30 // 0
NM_134351 // RefSeq // Rattus norvegicus methionine adenosyltransferase II, alpha (Mat2a), mRNA. // chr13 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:165067990:165073559:-1 gene:ENSRNOG00000013520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000070847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:3174791:3176001:-1 gene:ENSRNOG00000050173 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC062394 // GenBank // Rattus norvegicus methionine adenosyltransferase II, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:72314 IMAGE:5622019), complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000036417 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:35629032:35630218:-1 gene:ENSRNOG00000028513 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:165067076:165074133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000018663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:3140737:3176052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:35620429:35674746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT041525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT041524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT041527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
GENSCAN00000026113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:35620429:35674746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
GENSCAN00000052804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:36889267:36892761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001126299 // RefSeq // Rattus norvegicus establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 (Esco1), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:1823873:1862268:-1 gene:ENSRNOG00000014031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC166441 // GenBank // Rattus norvegicus establishment of cohesion 1 homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187566 IMAGE:7461161), complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006254415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 (Esco1), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010967 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06111748.1:258:729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 75 // 64 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000022233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:36989239:36989853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000036748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1821524:1861801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT026366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT026367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001009448 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 19, type 2 (Cdh19), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006249653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 19, type 2 (Cdh19), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000044628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:37483991:37565246:-1 gene:ENSRNOG00000029841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB121032 // GenBank // Rattus norvegicus Cad19 mRNA for Cadherin19, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000048943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:37483994:37531541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT017123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSRNOT00000061683 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:11990056:11990676:-1 gene:ENSRNOG00000040105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:11989948:12047734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
XM_003751219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36a-like (LOC100910714), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000039948 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:12565142:12565462:-1 gene:ENSRNOG00000031844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:12522438:12565504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000047354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:17685855:17686685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000041504 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:17685658:17686685:-1 gene:ENSRNOG00000029111 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0
NM_021762 // RefSeq // Rattus norvegicus translin (Tsn), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044095 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:39371412:39382208:-1 gene:ENSRNOG00000002319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068524 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:39371412:39381838:-1 gene:ENSRNOG00000002319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AF262356 // GenBank // Rattus norvegicus translin mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY325258 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Da2-35 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:39371574:39379273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
AF502592 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis-related protein (Srp) mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENSRNOT00000016604 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:39496811:39498573:-1 gene:ENSRNOG00000012435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:39496811:39498573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
NM_001107169 // RefSeq // Rattus norvegicus GLI family zinc finger 2 (Gli2), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLI family zinc finger 2 (Gli2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:39955094:40011594:-1 gene:ENSRNOG00000007261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:39956749:40209982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT017130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_080771 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibin beta-B (Inhbb), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:40555699:40561389:-1 gene:ENSRNOG00000047726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000026126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:40557594:40603531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_053821 // RefSeq // Rattus norvegicus v-ral simian leukemia viral oncogene homolog B (Ralb), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:40612012:40621240:-1 gene:ENSRNOG00000002440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC072505 // GenBank // Rattus norvegicus v-ral simian leukemia viral oncogene homolog B (ras related; GTP binding protein), mRNA (cDNA clone MGC:91556 IMAGE:7099019), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L19699 // GenBank // Rat GTP-binding protein (ral B) mRNA, complete cds. // chr13 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:40613396:40627591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT017133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012023 // RefSeq // Rattus norvegicus erythrocyte membrane protein band 4.1 like 5 (Epb4.1l5), mRNA. // chr13 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000003428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:40737284:40787937:-1 gene:ENSRNOG00000002538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:40694351:40787937:-1 gene:ENSRNOG00000002538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// BC090012 // GenBank // Rattus norvegicus erythrocyte protein band 4.1-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:109531 IMAGE:7324591), complete cds. // chr13 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT017135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 76 // 76 // 35 // 46 // 1 /// GENSCAN00000026124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:40737284:40898024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 23 // 46 // 1 /// NONRATT017136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NM_001100479 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4 (Ptpn4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:40797330:40972784:-1 gene:ENSRNOG00000002625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:40737284:40898024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT017140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NONRATT017140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// NONRATT017141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073525 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:40962169:40962826:-1 gene:ENSRNOG00000047156 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 68 // 100 // 15 // 22 // 0
NM_001037776 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 177 (Tmem177), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 177 (Tmem177), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006249665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 177 (Tmem177), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000039074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:41042438:41045862:-1 gene:ENSRNOG00000025484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098688 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 177, mRNA (cDNA clone MGC:112654 IMAGE:7386020), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus primary ciliary dyskinesia protein 1 (Pcdp1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039049 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:41064503:41133036:-1 gene:ENSRNOG00000025479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:41042712:41133036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
XM_006221449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translationally-controlled tumor protein-like (RGD1565260), mRNA. // chr13 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// XM_006249670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translationally-controlled tumor protein-like (RGD1565260), mRNA. // chr13 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000041810 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:42021216:42021741:-1 gene:ENSRNOG00000031807 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:41963597:42021713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 64 // 13 // 14 // 0
NM_178091 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin induced gene 2 (Insig2), mRNA. // chr13 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000003391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:42366079:42388541:-1 gene:ENSRNOG00000002478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY152392 // GenBank // Rattus norvegicus INSIG2 membrane protein mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC085682 // GenBank // Rattus norvegicus insulin induced gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:93054 IMAGE:7189822), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000054044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:42367687:42394469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
GENSCAN00000029628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:42638396:42722702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_024395 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 5B (Htr5b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:42637728:42650516:-1 gene:ENSRNOG00000002549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// L10073 // GenBank // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine receptor (5HT5b) mRNA, 5 end. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:42638396:42722702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001006996 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18 (Ddx18), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000037203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:42680397:42693902:-1 gene:ENSRNOG00000025430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC083919 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:95311 IMAGE:7135005), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:42638396:42722702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_001056467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase B9 subunit (Complex I-B9) (CI-B9) (LOC680288), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_003752631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase B9 subunit (Complex I-B9) (CI-B9) (LOC680288), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000045263 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:42851713:42851967:-1 gene:ENSRNOG00000029868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000029633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:42851713:42851967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000061340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:44292432:44293435:-1 gene:ENSRNOG00000032761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000002252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:44287895:44347516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_001012205 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 10 (Dpp10), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000003527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:44555442:44766710:-1 gene:ENSRNOG00000002595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// AY557199 // GenBank // Rattus norvegicus Kv4 potassium channel auxiliary subunit mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// DQ857324 // GenBank // Rattus norvegicus DPPY splice variant c (Dpp10) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr13 // 98 // 96 // 46 // 47 // 0 /// DQ857325 // GenBank // Rattus norvegicus DPPY splice variant d (Dpp10) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr13 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// FQ211584 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA87YH16 mRNA sequence. // chr13 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// NONRATT017151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 78 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000048515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:44517758:44805512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 37 // 37 // 18 // 49 // 1
NM_031068 // RefSeq // Rattus norvegicus ARP3 actin-related protein 3 homolog (yeast) (Actr3), mRNA. // chr13 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000004520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:46808188:46850658:-1 gene:ENSRNOG00000003206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// AB292042 // GenBank // Rattus norvegicus Arp3 mRNA for actin-related protein 3 homolog, complete cds, strain: BUF/Mna. // chr13 // 90 // 86 // 28 // 31 // 0 /// BC098014 // GenBank // Rattus norvegicus ARP3 actin-related protein 3 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:116163 IMAGE:7454624), complete cds. // chr13 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// FQ212256 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA63YG05 mRNA sequence. // chr13 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// NONRATT017153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:46813861:46881210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT017154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001007727 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 1 (Lypd1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:47327525:47368232:-1 gene:ENSRNOG00000003453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082032 // GenBank // Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:95169 IMAGE:7130639), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213690 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YE20 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:47347722:47368836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_001056226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NCK-associated protein 5 (Nckap5), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_344134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NCK-associated protein 5 (Nckap5), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:47371394:47850408:-1 gene:ENSRNOG00000021553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:47371394:47850408:-1 gene:ENSRNOG00000021553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:47437281:47850408:-1 gene:ENSRNOG00000021553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:47426104:47491241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0
XR_339697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556887 (LOC102556887), ncRNA. // chr13 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000033450 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:48503140:48504488:-1 gene:ENSRNOG00000021438 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:48496439:48504383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
NM_001110763 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 163 (Tmem163), mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:49258672:49433018:-1 gene:ENSRNOG00000003769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49259216:49319623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT017162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001107171 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin T2 (Ccnt2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin T2 (Ccnt2), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000024602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:49560748:49600517:1 gene:ENSRNOG00000017113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49519899:49597068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT016280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_134372 // RefSeq // Rattus norvegicus aminocarboxymuconate semialdehyde decarboxylase (Acmsd), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:49530262:49553512:1 gene:ENSRNOG00000003884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB069781 // GenBank // Rattus norvegicus acmsd mRNA for 2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49519899:49597068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
XM_006221542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, RAN-binding domain containing 3 (Zranb3), mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006249702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, RAN-binding domain containing 3 (Zranb3), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_006249704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, RAN-binding domain containing 3 (Zranb3), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000005355 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:49746797:49846410:-1 gene:ENSRNOG00000003979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 95 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000066136 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:49777981:49846410:-1 gene:ENSRNOG00000003979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 46 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000067965 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:49777328:49846410:-1 gene:ENSRNOG00000003979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 49 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000068466 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:49766894:49846410:-1 gene:ENSRNOG00000003979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49759851:49852159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:49744587:49756966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_053841 // RefSeq // Rattus norvegicus lactase (Lct), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000004908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:50083799:50125203:-1 gene:ENSRNOG00000003681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:50079485:50125202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_017287 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 6 (Mcm6), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000004969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:50127493:50152683:-1 gene:ENSRNOG00000003703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC166822 // GenBank // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 6, mRNA (cDNA clone MGC:188701 IMAGE:8369193), complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// U17565 // GenBank // Rattus norvegicus intestinal DNA replication protein mRNA, partial cds. // chr13 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:50129076:50222870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT017175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_053799 // RefSeq // Rattus norvegicus aspartyl-tRNA synthetase (Dars), mRNA. // chr13 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006249684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartyl-tRNA synthetase (Dars), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000005127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:50158684:50212425:-1 gene:ENSRNOG00000003743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC072534 // GenBank // Rattus norvegicus aspartyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:91557 IMAGE:7098427), complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// J04487 // GenBank // Rat aspartyl-tRNA synthetase alpha 2 protein mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:50129076:50222870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_022205 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) receptor 4 (Cxcr4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:50394711:50395760:-1 gene:ENSRNOG00000003866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF452185 // GenBank // Rattus norvegicus strain Holtzman chemokine receptor CXCR4 (Cxcr4) gene, complete cds. // chr13 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// BC089804 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:108696 IMAGE:7380432), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U54791 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine receptor LCR1 mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// U90610 // GenBank // Rattus norvegicus CXC chemokine receptor (CXCR4) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000017526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:50394711:50397957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT017178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000061215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:50988959:50990056:-1 gene:ENSRNOG00000039870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:50988953:50989366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_001270844 // RefSeq // Rattus norvegicus zona pellucida 3 receptor (Zp3r), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001270845 // RefSeq // Rattus norvegicus zona pellucida 3 receptor (Zp3r), transcript variant 3, mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_182815 // RefSeq // Rattus norvegicus zona pellucida 3 receptor (Zp3r), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zona pellucida sperm-binding protein 3 receptor-like (LOC100911214), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000035577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52375712:52420503:-1 gene:ENSRNOG00000025862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52375712:52420503:-1 gene:ENSRNOG00000025862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY278363 // GenBank // Rattus norvegicus sp56(L) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AY278364 // GenBank // Rattus norvegicus sp56(S) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr13 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC079287 // GenBank // Rattus norvegicus zona pellucida 3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:94417 IMAGE:7134311), complete cds. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52378697:52410402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52315964:52347821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT017186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_012516 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 4 binding protein, alpha (C4bpa), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52430756:52466244:-1 gene:ENSRNOG00000004062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088165 // GenBank // Rattus norvegicus complement component 4 binding protein, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:108761 IMAGE:7324823), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52431003:52459599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_016995 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 4 binding protein, beta (C4bpb), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus complement component 4 binding protein, beta (C4bpb), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52475837:52486554:-1 gene:ENSRNOG00000004125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088152 // GenBank // Rattus norvegicus complement component 4 binding protein, beta, mRNA (cDNA clone MGC:108727 IMAGE:7322205), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ209487 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YG07 mRNA sequence. // chr13 // 67 // 96 // 18 // 27 // 0 /// NONRATT017188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52475886:52522341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_133311 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 24 (Il24), mRNA. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52707116:52712513:-1 gene:ENSRNOG00000004470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF004774 // GenBank // Rattus norvegicus c49a mRNA, complete cds. // chr13 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// AF269251 // GenBank // Rattus norvegicus secreted protein Mob-5 (mob-5) mRNA, complete cds. // chr13 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT017195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52708100:52806880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001143881 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 20 (Il20), mRNA. // chr13 // 78 // 74 // 18 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52734137:52737781:-1 gene:ENSRNOG00000004633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 78 // 74 // 18 // 23 // 0 /// DQ229286 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-20 mRNA, complete cds. // chr13 // 83 // 74 // 19 // 23 // 0
XM_001060482 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 19 (Il19), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_003752660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 19 (Il19), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000035044 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:52751715:52758060:-1 gene:ENSRNOG00000025571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52708100:52806880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_178102 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2 (Mapkapk2), mRNA. // chr13 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000061070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52865897:52870983:-1 gene:ENSRNOG00000004726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AY197741 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase-2 mRNA, complete cds. // chr13 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// BC062048 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:72264 IMAGE:5598069), complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000023860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52867310:52871100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT017197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_001024767 // RefSeq // Rattus norvegicus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 3 (Dyrk3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:52989585:52998242:-1 gene:ENSRNOG00000004870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC097474 // GenBank // Rattus norvegicus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:114539 IMAGE:7457808), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52989813:53008952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT017198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT017199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_019365 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 5 (Rassf5), mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 5 (Rassf5), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53032716:53098045:-1 gene:ENSRNOG00000005342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF002251 // GenBank // Rattus norvegicus Maxp1 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53034770:53129305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT017201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001108854 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase epsilon (Ikbke), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000038151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53107178:53132162:-1 gene:ENSRNOG00000025100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT017202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000015676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53034770:53129305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// NONRATT017204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1
NM_001134958 // RefSeq // Rattus norvegicus SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2 (Srgap2), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006249782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2 (Srgap2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53149845:53362638:-1 gene:ENSRNOG00000006733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC168690 // GenBank // Rattus norvegicus SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:188551 IMAGE:7934193), complete cds. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ212420 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA55YK04 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53144073:53298215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT017208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001109069 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 4 (Mfsd4), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 4 (Mfsd4), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53877464:53918741:-1 gene:ENSRNOG00000024657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53889787:53918569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT017214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001100506 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 18 (Cdk18), mRNA. // chr13 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249752 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 18 (Cdk18), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:53964633:53972998:-1 gene:ENSRNOG00000008137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// BC082045 // GenBank // Rattus norvegicus PCTAIRE protein kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:95190 IMAGE:7131722), complete cds. // chr13 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000054410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:53954837:53974182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1
XM_003751237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 2 (Tmcc2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_003752639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 2 (Tmcc2), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54201418:54238500:-1 gene:ENSRNOG00000000033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// FQ211467 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YO16 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006221458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 2 (Tmcc2), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XM_006221459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 2 (Tmcc2), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XM_006249802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 2 (Tmcc2), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// XM_006249803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domain family 2 (Tmcc2), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54202612:54238303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT017217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_012884 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin 2 (axonal) (Cntn2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000012190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54360710:54389586:-1 gene:ENSRNOG00000009033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// M31725 // GenBank // Rat axonal glycoprotein (TAG-1), mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000054414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54362403:54370493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000030549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54371947:54408616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1
NONRATT017225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1
NM_001160313 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofascin (Nfasc), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// NM_001160314 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofascin (Nfasc), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// NM_001160315 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofascin (Nfasc), transcript variant 4, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_053909 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofascin (Nfasc), transcript variant 3, mRNA. // chr13 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// XM_006249743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurofascin (Nfasc), transcript variant X17, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54410797:54597345:-1 gene:ENSRNOG00000030515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54410797:54597345:-1 gene:ENSRNOG00000030515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54410797:54597345:-1 gene:ENSRNOG00000030515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AY061639 // GenBank // Rattus norvegicus neurofascin 155 kDa isoform mRNA, complete cds. // chr13 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// L11002 // GenBank // Rat ankyrin binding glycoprotein-1 related mRNA sequence. // chr13 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54416573:54490242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_001012026 // RefSeq // Rattus norvegicus MDM4, p53 regulator (Mdm4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000012984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:54863121:54899047:-1 gene:ENSRNOG00000009696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC083647 // GenBank // Rattus norvegicus Mdm4 p53 binding protein homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:94476 IMAGE:7135053), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000036402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54876194:54901142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT017235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT017236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT017237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT017240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT017238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT017239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000030554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:54807428:54869292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001105952 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 13 (Sox13), mRNA. // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 13 (Sox13), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 13 (Sox13), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 13 (Sox13), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55487561:55531977:1 gene:ENSRNOG00000028353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55516348:55530597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001271237 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide E (Snrpe), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:128569282:128569560:-1 gene:ENSRNOG00000031127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000040164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142464895:142465173:-1 gene:ENSRNOG00000034206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 64 // 100 // 18 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:128569282:128569560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT039398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 54 // 100 // 15 // 28 // 0 /// NONRATT039401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 54 // 100 // 15 // 28 // 0 /// NONRATT039402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 54 // 100 // 15 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55306385:55338922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT016375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001047902 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 11A (Zc3h11a), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000004025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55250213:55288525:1 gene:ENSRNOG00000002993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 98 // 93 // 41 // 42 // 0 /// BC111404 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5730454B08, mRNA (cDNA clone IMAGE:7373975), partial cds. // chr13 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210102175:210109735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 29 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55258438:55288525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 78 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000040506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:124318979:124320564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 90 // 44 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000051240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:214981710:214983294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 90 // 47 // 19 // 21 // 0 /// FQ211482 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YD22 mRNA sequence. // chr13 // 92 // 56 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT016362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT016367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1 /// NONRATT016368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// NONRATT016369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// NONRATT016365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// NONRATT016366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1
NM_001017491 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte transmembrane adaptor 1 (Lax1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte transmembrane adaptor 1 (Lax1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55218781:55229330:1 gene:ENSRNOG00000028250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089837 // GenBank // Rattus norvegicus lymphocyte transmembrane adaptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:108827 IMAGE:7365271), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55208129:55228689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT016360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001005871 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Ca++ transporting, plasma membrane 4 (Atp2b4), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000004078 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:55157902:55204057:1 gene:ENSRNOG00000003031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000041084 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:55157902:55204057:1 gene:ENSRNOG00000003031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000046273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55157902:55199816:1 gene:ENSRNOG00000003031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// U15408 // GenBank // Rattus norvegicus plasma membrane Ca2+-ATPase isoform 4 mRNA, complete cds and alternatively spliced variations. // chr13 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000036415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55158069:55204057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0
NM_001107176 // RefSeq // Rattus norvegicus opticin (Optc), mRNA. // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006249871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus opticin (Optc), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006249872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus opticin (Optc), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000064556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55788831:55799588:-1 gene:ENSRNOG00000003059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000012122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55730926:55861182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT017260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053385 // RefSeq // Rattus norvegicus proline/arginine-rich end leucine-rich repeat protein (Prelp), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55804884:55814122:-1 gene:ENSRNOG00000003120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF163569 // GenBank // Rattus norvegicus proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein (Prelp) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC072487 // GenBank // Rattus norvegicus proline arginine-rich end leucine-rich repeat protein, mRNA (cDNA clone MGC:91584 IMAGE:7104853), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55730926:55861182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT017262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017259 // RefSeq // Rattus norvegicus BTG family, member 2 (Btg2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55966299:55970058:-1 gene:ENSRNOG00000003300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC072493 // GenBank // Rattus norvegicus B-cell translocation gene 2, anti-proliferative, mRNA (cDNA clone MGC:91753 IMAGE:7097327), complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ233426 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YO09 mRNA sequence. // chr13 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// M60921 // GenBank // Rattus norvegicus PC3 NGF-inducible anti-proliferative putative secreted protein (PC3) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225094 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YC16 mRNA sequence. // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT017267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55968277:55973779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT017268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_017155 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine A1 receptor (Adora1), mRNA. // chr13 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// XM_006249859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine A1 receptor (Adora1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56097928:56131500:-1 gene:ENSRNOG00000003442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB001089 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for adenosine A1-receptor, complete cds. // chr13 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AF042079 // GenBank // Rattus norvegicus A1 adenosine receptor mRNA, complete cds. // chr13 // 86 // 48 // 12 // 14 // 0 /// M69045 // GenBank // Rat A1-adenosine receptor mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// Y12519 // GenBank // R.norvegicus mRNA for cerebellar A1 receptor 326 AS. // chr13 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56099213:56131084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// M64299 // GenBank // Rat A1 adenosine receptor mRNA, complete cds. // chr13 // 90 // 72 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT017270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_080409 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, f polypeptide (PTPRF), interacting protein (liprin), alpha 4 (Ppfia4), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000039540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56191119:56239610:-1 gene:ENSRNOG00000003494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56193128:56227033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001013871 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 183A (Tmem183a), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56242447:56257679:-1 gene:ENSRNOG00000003594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079375 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 183A, mRNA (cDNA clone MGC:94871 IMAGE:7110239), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ210515 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YF12 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56242923:56257592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT017280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT017279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT017282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT017283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001101011 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 3 (Ndufv3), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_022607 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 3 (Ndufv3), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12455139:12464611:1 gene:ENSRNOG00000001182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000030926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56353959:56354285:-1 gene:ENSRNOG00000027593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB000098 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MIPP65, complete cds. // chr13 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC059134 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:6891049), complete cds. // chr13 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12455226:12464539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56353959:56354285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT033039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// NONRATT033040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// NONRATT033041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
XM_006221475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog (RGD1308112), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog (RGD1308112), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249895 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog (RGD1308112), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase-like protein LOC641515 homolog (RGD1308112), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060656 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:56419528:56425725:-1 gene:ENSRNOG00000039568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56387466:56425862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT017288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 62 // 50 // 8 // 13 // 0
NM_001107178 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 12B (Ppp1r12b), mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 12B (Ppp1r12b), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000006671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56637005:56836014:-1 gene:ENSRNOG00000005032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56749339:56790817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000022577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56629981:56729906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT017295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_001062538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat-containing G protein-coupled receptor 6 (Lgr6), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_573455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat-containing G protein-coupled receptor 6 (Lgr6), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000006969 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:56866583:56982331:-1 gene:ENSRNOG00000005093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56866583:56941448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_033099 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, V (Ptprv), mRNA. // chr13 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000007597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56986605:57006799:-1 gene:ENSRNOG00000005277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// L36884 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase (OST-PTP) mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000017612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56955099:57004705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0
NM_145784 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 37-like 1 (Gpr37l1), mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57037410:57044257:-1 gene:ENSRNOG00000006237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF087947 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor GPCR/CNS2 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168215 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 37-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188175 IMAGE:7313732), complete cds. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57038199:57044214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT017301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001024768 // RefSeq // Rattus norvegicus E74-like factor 3 (Elf3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57135485:57140303:-1 gene:ENSRNOG00000006330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097980 // GenBank // Rattus norvegicus E74-like factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:116113 IMAGE:7443278), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57057018:57162989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NONRATT017305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_031097 // RefSeq // Rattus norvegicus arginyl aminopeptidase (aminopeptidase B) (Rnpep), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000009198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57144705:57163169:-1 gene:ENSRNOG00000006720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC061718 // GenBank // Rattus norvegicus arginyl aminopeptidase (aminopeptidase B), mRNA (cDNA clone MGC:72412 IMAGE:5598331), complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// D87515 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for aminopeptidase-B, complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// U61696 // GenBank // Rattus norvegicus aminopeptidase B mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000017614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57057018:57162989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT017306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT017308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT017310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
ENSRNOT00000009398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57174166:57185658:-1 gene:ENSRNOG00000007040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// BC061982 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 17 homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:72274 IMAGE:5598788), complete cds. // chr13 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT017312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT017313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT017314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
NM_001077826 // RefSeq // Rattus norvegicus shisa family member 4 (Shisa4), mRNA. // chr13 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57243999:57248373:-1 gene:ENSRNOG00000007369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC158557 // GenBank // Rattus norvegicus shisa homolog 4 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:187232 IMAGE:7313337), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// EF044301 // GenBank // Rattus norvegicus proline rich membrane protein (Prmp) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// FQ213723 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YB15 mRNA sequence. // chr13 // 80 // 86 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57244749:57248270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT017316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_001107180 // RefSeq // Rattus norvegicus importin 9 (Ipo9), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57258618:57305942:-1 gene:ENSRNOG00000007418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57258865:57305894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT017322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000011801 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:57316374:57463205:-1 gene:ENSRNOG00000008425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037100 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:57316374:57463205:-1 gene:ENSRNOG00000008425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064758 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:57332017:57387508:-1 gene:ENSRNOG00000008425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57317210:57349326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT017330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001107181 // RefSeq // Rattus norvegicus plakophilin 1 (Pkp1), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57753232:57800892:-1 gene:ENSRNOG00000010076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57755372:57800704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_006221483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin-like and fibronectin type III domain containing 1 (Igfn1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// XM_006249903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin-like and fibronectin type III domain containing 1 (Igfn1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000038874 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:57838419:57871358:-1 gene:ENSRNOG00000026087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000068521 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:57838419:57871358:-1 gene:ENSRNOG00000026087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57839980:57861654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57862800:57884663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
NM_001047926 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00186 (LOC498236), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000036094 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:58084603:58138209:-1 gene:ENSRNOG00000025987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000018801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58122652:58138209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 90 // 48 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58084603:58112085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT017338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT017340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001134502 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ10901 (RGD1311892), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249922 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ10901 (RGD1311892), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:58140417:58160691:-1 gene:ENSRNOG00000025948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58141058:58161114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001064036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 25 (Gpr25), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011368 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:58188054:58189133:-1 gene:ENSRNOG00000008603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58187406:58276396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001134503 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin regulated spectrin-associated protein family, member 2 (Camsap2), mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000060410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:58197543:58276568:-1 gene:ENSRNOG00000008741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58187406:58276396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT017343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001109499 // RefSeq // Rattus norvegicus Williams Beuren syndrome chromosome region 27 (Wbscr27), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosomal region 27 protein-like (RGD1307782), partial mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams Beuren syndrome chromosome region 27 (Wbscr27), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosomal region 27 protein-like (RGD1307782), partial mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26767621:26776161:-1 gene:ENSRNOG00000046700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043688 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:58761728:58763042:-1 gene:ENSRNOG00000029425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26766296:26776161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58758318:58783108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT015714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021742 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 (Nr5a2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 5, group A, member 2 (Nr5a2), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000000812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:58794163:58910799:-1 gene:ENSRNOG00000000653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AB012960 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FTZ-F1 beta1, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB012961 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FTZ-F1 beta2, complete cds. // chr13 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58794321:58840982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000029987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58894771:59002717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
ENSRNOT00000009419 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:58974041:58974615:-1 gene:ENSRNOG00000007190 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58894771:59002717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001271276 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 14 (Fbxl14), mRNA. // chr13 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:219073024:219074225:1 gene:ENSRNOG00000000021 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:79284367:79472300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 71 // 56 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000053132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:219059306:219085523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 71 // 68 // 12 // 17 // 0 /// NONRATT040349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000000816 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:60488188:60489862:-1 gene:ENSRNOG00000000656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT017359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_001108346 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA-related kinase 7 (Nek7), mRNA. // chr13 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006249927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 7 (Nek7), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000000817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:60518085:60586290:-1 gene:ENSRNOG00000000657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT017360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:60542180:60579987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000060277 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:60723812:60724177:-1 gene:ENSRNOG00000039332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:60723785:60789003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_181367 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM homeobox 9 (Lhx9), mRNA. // chr13 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AY273890 // GenBank // Rattus norvegicus LIM-homeodomain type transcription factor Lhx9 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:60885812:60903985:-1 gene:ENSRNOG00000010357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// BC128722 // GenBank // Rattus norvegicus LIM homeobox 9, mRNA (cDNA clone MGC:156570 IMAGE:8362986), complete cds. // chr13 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// XM_006249915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM homeobox 9 (Lhx9), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// XM_006249918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM homeobox 9 (Lhx9), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000014218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:60884286:60903985:-1 gene:ENSRNOG00000010357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT017364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT017365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// GENSCAN00000033727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:60864330:60912421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001108347 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to novel protein (RGD1566099), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:60907257:60912445:-1 gene:ENSRNOG00000043374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166874 // GenBank // Rattus norvegicus similar to novel protein, mRNA (cDNA clone MGC:188801 IMAGE:6890641), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166876 // GenBank // Rattus norvegicus similar to novel protein, mRNA (cDNA clone MGC:188804 IMAGE:6919569), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166924 // GenBank // Rattus norvegicus similar to novel protein, mRNA (cDNA clone MGC:188912 IMAGE:6919449), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:60864330:60912421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSRNOT00000054084 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:13:60921537:60921658:-1 gene:ENSRNOG00000035961 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107182 // RefSeq // Rattus norvegicus crumbs family member 1, photoreceptor morphogenesis associated (Crb1), mRNA. // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000032122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:61292273:61480872:-1 gene:ENSRNOG00000010903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61327615:61347194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000033069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61413232:61480747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_006221491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus complement factor H-related 2 (Cfhr2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029281 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:61660054:61712099:-1 gene:ENSRNOG00000021575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060160 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:61660054:61712350:-1 gene:ENSRNOG00000021575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029294 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:61660054:61676318:-1 gene:ENSRNOG00000021575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61660741:61782554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// FQ211198 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA15YJ22 mRNA sequence. // chr13 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// FQ218751 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA4YI22 mRNA sequence. // chr13 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
XM_006249953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus complement factor H-related protein B (LOC100361907), mRNA. // chr13 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC089845 // GenBank // Rattus norvegicus complement factor H, mRNA (cDNA clone IMAGE:7370585), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ219200 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YP12 mRNA sequence. // chr13 // 87 // 48 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT017374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT017375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000033074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61660741:61782554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT017376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
FQ210516 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YF11 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001044227 // RefSeq // Rattus norvegicus complement factor H-related 1 (Cfhr1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000017195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:61880594:61895848:-1 gene:ENSRNOG00000042901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC088173 // GenBank // Rattus norvegicus complement component factor h-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:108802 IMAGE:7323337), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ219461 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YB11 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001134792 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to complement factor H-related protein (RGD1564614), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to complement factor H-related protein (RGD1564614), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:61907846:61976726:-1 gene:ENSRNOG00000042369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF436847 // GenBank // Rattus norvegicus complement factor H-related protein mRNA, complete cds. // chr13 // 80 // 93 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT017374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61919966:62060906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_130409 // RefSeq // Rattus norvegicus complement factor H (Cfh), mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:61997444:62094826:-1 gene:ENSRNOG00000030715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000060111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:61997444:62094826:-1 gene:ENSRNOG00000030715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// AJ320522 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for complement inhibitory factor H (FH gene). // chr13 // 90 // 95 // 19 // 21 // 0 /// BC083174 // GenBank // Rattus norvegicus complement factor H, mRNA (cDNA clone MGC:91522 IMAGE:7096787), complete cds. // chr13 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT017374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:61919966:62060906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// NONRATT017384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
ENSRNOT00000004332 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:65378194:65378765:-1 gene:ENSRNOG00000003246 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:65378194:65412344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 88 // 13 // 14 // 0
NM_001024769 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 73 (Cdc73), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000004495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:65392579:65485175:-1 gene:ENSRNOG00000003258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC097445 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 73, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114504 IMAGE:7456471), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT017387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:65378194:65412344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000029980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:65431940:65502295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_001107183 // RefSeq // Rattus norvegicus TROVE domain family, member 2 (Trove2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:65535453:65556443:-1 gene:ENSRNOG00000003434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:65537426:65549856:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_053453 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 2 (Rgs2), mRNA. // chr13 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:65830461:65834020:-1 gene:ENSRNOG00000003687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF279918 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling protein 2 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF321837 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 2 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AY043246 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 2 (Rgs2) mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC061969 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 2, mRNA (cDNA clone MGC:72363 IMAGE:5621945), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ224353 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA69YI09 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:65831435:65842397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
XM_001068656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 13 (Rgs13), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_573469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 13 (Rgs13), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005163 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:65957846:65983487:-1 gene:ENSRNOG00000003888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_019336 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 1 (Rgs1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 1 (Rgs1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000005251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:66051576:66055901:-1 gene:ENSRNOG00000003895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098681 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 1, mRNA (cDNA clone MGC:112645 IMAGE:7385088), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:66041404:66054804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001287022 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 21 (Rgs21), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047084 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 18 (Rgs18), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:66552686:66578436:-1 gene:ENSRNOG00000003959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AY651776 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 18 (Rgs18) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 21 (Rgs21), mRNA. // chr13 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000054894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:66497926:66819683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:66352931:66421183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000036412 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:68322368:68322877:-1 gene:ENSRNOG00000050917 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0
ENSRNOT00000003755 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:69594212:69595105:-1 gene:ENSRNOG00000002760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000018760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:69394254:69732468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT017398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_133551 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent) (Pla2g4a), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006249964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent) (Pla2g4a), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000003630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72028204:72172613:-1 gene:ENSRNOG00000002657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC070940 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVA (cytosolic, calcium-dependent), mRNA (cDNA clone MGC:91503 IMAGE:7099813), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U38376 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr13 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// NONRATT017404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:71941800:72104557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT017405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
GENSCAN00000023446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:72865881:73207872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:72381434:72393974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000024661 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:72380909:72381771:-1 gene:ENSRNOG00000026685 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 65 // 80 // 13 // 20 // 0
XM_222746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC003331 (RGD1307830), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72548442:72574290:-1 gene:ENSRNOG00000002473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72548442:72574290:-1 gene:ENSRNOG00000002473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72548442:72574290:-1 gene:ENSRNOG00000002473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:72548442:72574290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001105962 // RefSeq // Rattus norvegicus proteoglycan 4, (megakaryocyte stimulating factor, articular superficial zone protein, camptodactyly, arthropathy, coxa vara, pericarditis syndrome) (Prg4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72637409:72653723:-1 gene:ENSRNOG00000002385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:72637699:72653298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001271292 // RefSeq // Rattus norvegicus hemicentin 1 (Hmcn1), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 106 // 106 // 0 /// ENSRNOT00000030971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:72887378:73321707:-1 gene:ENSRNOG00000028627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 99 // 99 // 0 /// GENSCAN00000023446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:72865881:73207872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 95 // 95 // 0
NM_001105960 // RefSeq // Rattus norvegicus Swt1 RNA endoribonuclease homolog (S. cerevisiae) (Swt1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000044255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:73690645:73748003:-1 gene:ENSRNOG00000032258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// FQ211819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA79YD18 mRNA sequence. // chr13 // 81 // 39 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000004486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:73687472:73751274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 78 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT017415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT017417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// NONRATT017418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 49 // 49 // 20 // 41 // 1
NM_001025667 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 2 (Rnf2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 2 (Rnf2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:73792852:73821013:-1 gene:ENSRNOG00000002454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098941 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:114502 IMAGE:7456372), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:73793802:73820998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001105959 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700025G04 gene (RGD1309104), mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000059807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:74240136:74408344:-1 gene:ENSRNOG00000028236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001105958 // RefSeq // Rattus norvegicus TSEN15 tRNA splicing endonuclease subunit (Tsen15), mRNA. // chr13 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000065521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:74737179:74753103:-1 gene:ENSRNOG00000002352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000046317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:74732404:74753005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001105957 // RefSeq // Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator,-like 1 (Rgl1), mRNA. // chr13 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006249982 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator,-like 1 (Rgl1), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000067135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:74881865:75145652:-1 gene:ENSRNOG00000002347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000057955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:74874409:74956525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1
NM_001191549 // RefSeq // Rattus norvegicus SMG7 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg7), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75229500:75270238:-1 gene:ENSRNOG00000027962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75231769:75320866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT017434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
XR_146256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 40S ribosomal protein S2 (LOC689943), misc_RNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_146579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 40S ribosomal protein S2 (LOC689943), misc_RNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050867 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:75340910:75341661:-1 gene:ENSRNOG00000033314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75340910:75343247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001100640 // RefSeq // Rattus norvegicus laminin, gamma 2 (Lamc2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75532726:75592335:-1 gene:ENSRNOG00000002667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75534003:75591883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053966 // RefSeq // Rattus norvegicus laminin, gamma 1 (Lamc1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus laminin, gamma 1 (Lamc1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75622195:75749168:-1 gene:ENSRNOG00000002680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75624760:75676198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001107184 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 9 (Dhx9), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75851157:75887898:-1 gene:ENSRNOG00000002735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75851454:75887521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT017453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001013984 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylneuraminate pyruvate lyase (Npl), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006249997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetylneuraminate pyruvate lyase (Npl), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:75903278:75946056:-1 gene:ENSRNOG00000002775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC082004 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylneuraminate pyruvate lyase, mRNA (cDNA clone MGC:94250 IMAGE:7131519), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT017455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT017456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT017457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75901885:75986224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// NONRATT017458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
GENSCAN00000036742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:75994553:76004981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_003751254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling like 1 (Rgsl1), mRNA. // chrU // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000029773 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:76187609:76220921:-1 gene:ENSRNOG00000026952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// XM_006221548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling like 1 (Rgsl1), mRNA. // chrU // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// GENSCAN00000036719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:76170042:76237592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// NONRATT017462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
XM_006221548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling like 1 (Rgsl1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling like 1 (Rgsl1), mRNA. // chr13 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:76170042:76237592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_198790 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling like 2 homolog (mouse) (Rgsl2h), mRNA. // chr13 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:76242704:76243486:-1 gene:ENSRNOG00000026940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT017464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:76242704:76263129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_019294 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, R type, alpha 1E subunit (Cacna1e), mRNA. // chr13 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000003869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:76850596:77306352:-1 gene:ENSRNOG00000002863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000003928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:76850596:77306502:-1 gene:ENSRNOG00000002863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// AY029412 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel isoform alpha1E7 (CaV2.3) mRNA, complete cds. // chr13 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// L15453 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-activated calcium channel alpha-1 subunit (rbe-ii) mRNA, complete cds. // chr13 // 98 // 96 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000039599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:76850596:77025172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT017466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0
NM_001025137 // RefSeq // Rattus norvegicus immediate early response 5 (Ier5), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000071937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:77678740:77679666:-1 gene:ENSRNOG00000050671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC091181 // GenBank // Rattus norvegicus immediate early response 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7326120), complete cds. // chr13 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000007634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:77678740:77679666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001100635 // RefSeq // Rattus norvegicus major histocompatibility complex, class I-related (Mr1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus major histocompatibility complex, class I-related (Mr1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000004694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:77707537:77725283:-1 gene:ENSRNOG00000003522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// Y13972 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MHC class I-related protein, Mr1. // chr13 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:77690351:77735955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006221549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 6820428L09 protein (RGD1304622), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 6820428L09 protein (RGD1304622), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004704 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:77796633:77815260:-1 gene:ENSRNOG00000000040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:77793726:77815180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001105992 // RefSeq // Rattus norvegicus xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1 (Xpr1), mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:77853049:77991192:-1 gene:ENSRNOG00000000042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC161992 // GenBank // Rattus norvegicus xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:187823 IMAGE:9033232), complete cds. // chr13 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:77853273:77979987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108348 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM homeobox 4 (Lhx4), mRNA. // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000067253 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:78279842:78300742:-1 gene:ENSRNOG00000003595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78280334:78309825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT017484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT017485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001109898 // RefSeq // Rattus norvegicus quiescin Q6 sulfhydryl oxidase 1 (Qsox1), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_053431 // RefSeq // Rattus norvegicus quiescin Q6 sulfhydryl oxidase 1 (Qsox1), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78351223:78388725:-1 gene:ENSRNOG00000003649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78351223:78388676:-1 gene:ENSRNOG00000003649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AB044285 // GenBank // Rattus norvegicus SOx mRNA for sulfhydryl oxidase, complete cds. // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF217799 // GenBank // Rattus norvegicus FAD-dependent sulfhydryl oxidase mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// AF285078 // GenBank // Rattus norvegicus FAD-dependent sulfhydryl oxidase-2 mRNA, complete cds. // chr13 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// AY623665 // GenBank // Rattus norvegicus quiescin Q6 mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78352214:78388676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000005235 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:78427849:78547242:-1 gene:ENSRNOG00000003882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AF287357 // GenBank // Rattus norvegicus centrosome-associated protein 350 mRNA, partial cds. // chr13 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78427612:78547242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
NM_001109072 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 163, member A (Fam163a), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78666728:78677673:-1 gene:ENSRNOG00000024825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78669694:78713575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001134739 // RefSeq // Rattus norvegicus tudor domain containing 5 (Tdrd5), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NM_001134740 // RefSeq // Rattus norvegicus tudor domain containing 5 (Tdrd5), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78797045:78845281:-1 gene:ENSRNOG00000004018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC168218 // GenBank // Rattus norvegicus tudor domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:188201 IMAGE:7319314), complete cds. // chr13 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78813830:78845279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT017504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006221550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus axonemal dynein light chain domain-containing protein 1-like (RGD1566124), mRNA. // chrU // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006250094 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus axonemal dynein light chain domain-containing protein 1-like (RGD1566124), mRNA. // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78875419:79040784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_031118 // RefSeq // Rattus norvegicus sterol O-acyltransferase 1 (Soat1), mRNA. // chr13 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:78956528:78999029:-1 gene:ENSRNOG00000004111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D86373 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for acyl-coenzyme A:cholesterol acyltransferase, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:78875419:79040784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001009683 // RefSeq // Rattus norvegicus torsin family 3, member A (Tor3a), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:79174048:79198607:-1 gene:ENSRNOG00000004307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087678 // GenBank // Rattus norvegicus torsin family 3, member A, mRNA (cDNA clone MGC:105766 IMAGE:7318816), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79174666:79198604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107187 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 20, member B (Fam20b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:79201816:79251753:-1 gene:ENSRNOG00000004337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79205431:79227454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
GENSCAN00000028490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79312334:79330537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_001100680 // RefSeq // Rattus norvegicus Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2 (Ralgps2), mRNA. // chr13 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:79366283:79434660:-1 gene:ENSRNOG00000004736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// BC105626 // GenBank // Rattus norvegicus Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 2, mRNA (cDNA clone MGC:125168 IMAGE:7326132), complete cds. // chr13 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79340211:79380288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT017513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1 /// GENSCAN00000028497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79405448:79536452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT017514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
XM_001055979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 35 (Tex35), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_003752648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 35 (Tex35), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006221510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 35 (Tex35), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006250092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 35 (Tex35), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XR_339825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 35 (Tex35), transcript variant X4, misc_RNA. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XR_359038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 35 (Tex35), transcript variant X4, misc_RNA. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:79646752:79657855:-1 gene:ENSRNOG00000038921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79636670:79659085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001107188 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS protein activator like 2 (Rasal2), mRNA. // chr13 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:79688897:79840482:-1 gene:ENSRNOG00000004917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS protein activator like 2 (Rasal2), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// XM_006250065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS protein activator like 2 (Rasal2), transcript variant X6, mRNA. // chr13 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// XM_006250066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS protein activator like 2 (Rasal2), transcript variant X7, mRNA. // chr13 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// GENSCAN00000028498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79693256:79716441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000028495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:79720056:79805967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// NONRATT017520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// NONRATT017521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1
NM_173115 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 2 (Brinp2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:80864668:80964493:-1 gene:ENSRNOG00000005592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB077853 // GenBank // Rattus norvegicus BRINP2 mRNA for BMP/Retinoic acid-inducible neurai-specific protein-2, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:80867383:80885702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_003752649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pappalysin-2-like (LOC680415), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000039210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:81307018:81574056:-1 gene:ENSRNOG00000042860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 92 // 92 // 35 // 38 // 1 /// GENSCAN00000017073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:81388926:81524902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_001107189 // RefSeq // Rattus norvegicus tenascin N (Tnn), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000003452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:82737832:82805226:-1 gene:ENSRNOG00000002548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000011986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:82738794:82797944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT017529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NM_001004208 // RefSeq // Rattus norvegicus calcyclin binding protein (Cacybp), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:82855951:82866235:-1 gene:ENSRNOG00000002572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079007 // GenBank // Rattus norvegicus calcyclin binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:93921 IMAGE:7113129), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:82856627:82944689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT017532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT017533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001107190 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB GTPase activating protein 1-like (Rabgap1l), mRNA. // chr13 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// XM_006250106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB GTPase activating protein 1-like (Rabgap1l), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:82918223:83505642:-1 gene:ENSRNOG00000002736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// FQ230855 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA85YL07 mRNA sequence. // chr13 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// XM_006250108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB GTPase activating protein 1-like (Rabgap1l), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT017536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NONRATT017536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1
NONRATT017536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001289935 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 52 (Gpr52), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003659 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:83228271:83229277:-1 gene:ENSRNOG00000002731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT017536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001107191 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 37 (Zbtb37), mRNA. // chr13 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_006250109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 37 (Zbtb37), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000039082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:83731914:83747221:-1 gene:ENSRNOG00000026907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83731914:83748275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT017541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001034143 // RefSeq // Rattus norvegicus aspartyl-tRNA synthetase 2 (mitochondrial) (Dars2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000003828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:83752704:83780466:-1 gene:ENSRNOG00000002813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC105774 // GenBank // Rattus norvegicus aspartyl-tRNA synthetase 2 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:124683 IMAGE:7930977), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83752920:83781557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT017542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001107192 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 20 (Klhl20), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:83806860:83851817:-1 gene:ENSRNOG00000002875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ231175 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YA22 mRNA sequence. // chr13 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000006826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83808803:83829519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006221515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551559 (LOC102551559), mRNA. // chr13 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// XM_006250118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551559 (LOC102551559), mRNA. // chr13 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059261 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:83880249:83882612:-1 gene:ENSRNOG00000038786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158851 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452964. // chr13 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_053576 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxiredoxin 6 (Prdx6), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000034583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:83972034:83983136:-1 gene:ENSRNOG00000002896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF014009 // GenBank // Rattus norvegicus acidic calcium-independent phospholipase A2 (aiPLA2) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ213288 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YL03 mRNA sequence. // chr13 // 89 // 95 // 16 // 18 // 0 /// FQ218168 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YD06 mRNA sequence. // chr13 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// Y17295 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for thiol-specific antioxidant protein (1-Cys peroxiredoxin). // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:83972725:83983090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT017548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000031809 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:84134867:84136313:-1 gene:ENSRNOG00000026715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT017550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:84134481:84162040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSRNOT00000030922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:84169590:84170136:-1 gene:ENSRNOG00000051020 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT017551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_012908 // RefSeq // Rattus norvegicus Fas ligand (TNF superfamily, member 6) (Faslg), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:84591721:84598981:-1 gene:ENSRNOG00000002978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U03470 // GenBank // Rattus norvegicus Fas antigen ligand mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:84596046:84598908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_199403 // RefSeq // Rattus norvegicus SUN domain containing ossification factor (Suco), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006250167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SUN domain containing ossification factor (Suco), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000036483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:84631122:84694399:-1 gene:ENSRNOG00000026542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000019334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:84631287:84682136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT017555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT017554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1
NM_001014130 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1309106), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1309106), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1309106), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:84750188:84793350:-1 gene:ENSRNOG00000026523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1309106), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT017558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:84738487:84780788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NONRATT017561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT017561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001134501 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 13 (Mettl13), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000063902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:85319679:85333384:-1 gene:ENSRNOG00000003042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85320429:85333117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_012792 // RefSeq // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 1 (Fmo1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250145 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 1 (Fmo1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000041908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:85607536:85639986:-1 gene:ENSRNOG00000034191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC061567 // GenBank // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:72920 IMAGE:6887467), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ218919 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YB18 mRNA sequence. // chr13 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// M84719 // GenBank // Rat flavin-containing monooxygenase 1 (FMO-1) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85544915:85619250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85620194:85622130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT017590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_144737 // RefSeq // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 2 (Fmo2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 2 (Fmo2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:85649741:85669947:-1 gene:ENSRNOG00000003510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF458414 // GenBank // Rattus norvegicus flavin-containing monooxygenase 2 (FMO2) mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC070904 // GenBank // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:91466 IMAGE:7100688), complete cds. // chr13 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85653135:85669490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT017594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT017595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
GENSCAN00000014382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85677282:85713617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_053433 // RefSeq // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 3 (Fmo3), mRNA. // chr13 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:85732375:85750452:-1 gene:ENSRNOG00000003620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AF286595 // GenBank // Rattus norvegicus flavin-containing monooxygenase FMO3 mRNA, complete cds. // chr13 // 84 // 91 // 26 // 31 // 0 /// BC087008 // GenBank // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 3, mRNA (cDNA clone MGC:93304 IMAGE:7129948), complete cds. // chr13 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// FQ218452 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YA17 mRNA sequence. // chr13 // 92 // 35 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000014381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85732438:85750199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0
ENSRNOT00000034533 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:85793015:85794010:-1 gene:ENSRNOG00000025797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85793231:85793929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0
XM_002724858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 9 (Mroh9), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_002728027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 9 (Mroh9), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000004931 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:85822779:85871847:-1 gene:ENSRNOG00000003698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000004852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85822734:85870530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0
NM_153821 // RefSeq // Rattus norvegicus paired related homeobox 1 (Prrx1), mRNA. // chr13 // 84 // 86 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:86039713:86107193:-1 gene:ENSRNOG00000003720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AY730764 // GenBank // Rattus norvegicus Prx-1 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:86028214:86064262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001100563 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin, RAB6-interacting (Gorab), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:86562603:86579222:-1 gene:ENSRNOG00000003861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC160825 // GenBank // Rattus norvegicus SCY1-like 1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7443998), partial cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:86563886:86703415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSRNOT00000039581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:86869572:86886651:-1 gene:ENSRNOG00000025415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ213916 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YM22 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:86869958:86877972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:86884811:86886387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001017493 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ10706 (LOC498265), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058968 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:87127496:87171448:-1 gene:ENSRNOG00000002587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87127628:87171358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001017494 // RefSeq // Rattus norvegicus basic leucine zipper nuclear factor 1 (Blzf1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87476065:87491192:-1 gene:ENSRNOG00000002884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079114 // GenBank // Rattus norvegicus basic leucine zipper nuclear factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:94112 IMAGE:7126053), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87476888:87507324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_013113 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide (Atp1b1), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000003932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:87621449:87641967:-1 gene:ENSRNOG00000002934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC078902 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 1 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:93649 IMAGE:7111949), complete cds. // chr13 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// FQ212719 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YM05 mRNA sequence. // chr13 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// J02701 // GenBank // Rat Na+, K+ -ATPase beta subunit protein mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M14137 // GenBank // Rat brain Na- ,K- ATPase beta subunit protein mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT017608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:87607205:87682154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT017610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_134361 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C motif) ligand 1 (Xcl1), mRNA. // chr13 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88079753:88083196:-1 gene:ENSRNOG00000002964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U23377 // GenBank // Rattus norvegicus lymphotactin (LTN) mRNA, complete cds. // chr13 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88008608:88091529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107193 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 19 (Tbx19), mRNA. // chr13 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// XM_006250157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 19 (Tbx19), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 19 (Tbx19), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000063870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88283232:88305361:-1 gene:ENSRNOG00000002979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88291963:88305154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT017615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88282534:88289950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001034011 // RefSeq // Rattus norvegicus SFT2 domain containing 2 (Sft2d2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88322945:88331583:-1 gene:ENSRNOG00000003038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC099092 // GenBank // Rattus norvegicus SFT2 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:116218 IMAGE:7457938), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88322945:88388748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001109667 // RefSeq // Rattus norvegicus TOR signaling pathway regulator (Tiprl), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TIP41, TOR signaling pathway regulator-like (S. cerevisiae) (Tiprl), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006250179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TIP41, TOR signaling pathway regulator-like (S. cerevisiae) (Tiprl), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88358553:88384034:-1 gene:ENSRNOG00000003048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128780 // GenBank // Rattus norvegicus TIP41, TOR signaling pathway regulator-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156824 IMAGE:7315719), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88322945:88388748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT017618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001071288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 6 (Dcaf6), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_213926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 6 (Dcaf6), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000004199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88458601:88559585:-1 gene:ENSRNOG00000003078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000051006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88458601:88537354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT017621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT017622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
NM_001007728 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin protein zero-like 1 (Mpzl1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88685412:88722184:-1 gene:ENSRNOG00000003248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078916 // GenBank // Rattus norvegicus myelin protein zero-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:93692 IMAGE:7096438), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88686768:88774100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001108349 // RefSeq // Rattus norvegicus RCSD domain containing 1 (Rcsd1), mRNA. // chr13 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88734830:88797167:-1 gene:ENSRNOG00000003283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT017625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88686768:88774100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT017626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT017627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT017628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001100639 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 2 homeobox 1 (Pou2f1), mRNA. // chr13 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// XM_006250130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POU class 2 homeobox 1 (Pou2f1), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000047488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:88963389:89095110:-1 gene:ENSRNOG00000003581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:88962004:89026938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT017636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1 /// NONRATT017634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001191929 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 27 (putative) (Dusp27), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000004965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:89180887:89208908:-1 gene:ENSRNOG00000003722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:89181372:89208908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
NM_001108857 // RefSeq // Rattus norvegicus maelstrom spermatogenic transposon silencer (Mael), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:89287037:89326509:-1 gene:ENSRNOG00000003790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT017642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:89289330:89347399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT017643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
NM_001107194 // RefSeq // Rattus norvegicus pogo transposable element with KRAB domain (Pogk), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pogo transposable element with KRAB domain (Pogk), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pogo transposable element with KRAB domain (Pogk), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:89477377:89493293:-1 gene:ENSRNOG00000032058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:89479530:89529062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT017645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
XM_001063445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to flavin containing monooxygenase 5 (LOC685351), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_002724860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to flavin containing monooxygenase 5 (LOC685351), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000058683 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:89619431:89632973:-1 gene:ENSRNOG00000038499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:89619431:89667328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001109466 // RefSeq // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 9 (Fmo9), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:89648149:89668956:-1 gene:ENSRNOG00000025119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:89619431:89667328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000005903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:101397598:101397954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001102408 // RefSeq // Rattus norvegicus uridine-cytidine kinase 2 (Uck2), mRNA. // chrU // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90035481:90087109:-1 gene:ENSRNOG00000003917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// BC167060 // GenBank // Rattus norvegicus uridine-cytidine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:189371 IMAGE:9031892), complete cds. // chrU // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90006752:90056863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT017650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001191594 // RefSeq // Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase 3 (Mgst3), mRNA. // chr13 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// XM_006250209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase 3 (Mgst3), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006250210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase 3 (Mgst3), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000005719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90244300:90265035:-1 gene:ENSRNOG00000004245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 94 // 14 // 15 // 0 /// FQ210409 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA29YC18 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:90244300:90250186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 91 // 69 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT017652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001077434 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 52 (Lrrc52), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:90314834:90337972:-1 gene:ENSRNOG00000004356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// BC126099 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:156754 IMAGE:7112275), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100681 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox 1 (Pbx1), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NM_001134862 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox 1 (Pbx1), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:91062347:91306878:-1 gene:ENSRNOG00000004693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000043004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:91029200:91306878:-1 gene:ENSRNOG00000004693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC161983 // GenBank // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:187800 IMAGE:9030389), complete cds. // chr13 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:91051492:91092025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT017659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000027819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:91839908:91889348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001012028 // RefSeq // Rattus norvegicus NUF2, NDC80 kinetochore complex component (Nuf2), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:92450022:92478789:-1 gene:ENSRNOG00000002711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC078993 // GenBank // Rattus norvegicus NUF2, NDC80 kinetochore complex component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93892 IMAGE:7112621), complete cds. // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:92414390:92479029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_017214 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 4 (Rgs4), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:92682956:92689247:-1 gene:ENSRNOG00000002773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF117211 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 4 (Rgs4) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U27767 // GenBank // Rattus norvegicus RGP4 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:92685147:92694569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_017235 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 7 (Hsd17b7), mRNA. // chr13 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:92917716:92934194:-1 gene:ENSRNOG00000002826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC081818 // GenBank HTC // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:7106149), with apparent retained intron. // chr13 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// U44803 // GenBank // Rattus norvegicus ovarian-specific protein mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 7 (Hsd17b7), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// NONRATT017671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT017672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:92920645:93006227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// NONRATT017670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
XM_006250230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 (Ddr2), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031764 // RefSeq // Rattus norvegicus discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 (Ddr2), mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006250230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 (Ddr2), transcript variant X5, mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000003901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:92942668:92987943:-1 gene:ENSRNOG00000002881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC161961 // GenBank // Rattus norvegicus discoidin domain receptor tyrosine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:187764 IMAGE:9027893), complete cds. // chr13 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000011478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:92920645:93006227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_001191930 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-N-acteylglucosamine pyrophosphorylase 1 (Uap1), mRNA. // chr13 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000058560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93089458:93123827:-1 gene:ENSRNOG00000002926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT017676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT017677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
NM_017293 // RefSeq // Rattus norvegicus U2AF homology motif (UHM) kinase 1 (Uhmk1), mRNA. // chr13 // 88 // 89 // 7 // 8 // 0 /// BC098669 // GenBank // Rattus norvegicus U2AF homology motif (UHM) kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:112620 IMAGE:7096907), complete cds. // chr13 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// U70372 // GenBank // Rattus norvegicus PAM COOH-terminal interactor protein 2 mRNA, complete cds. // chr13 // 88 // 89 // 7 // 8 // 0 /// NONRATT017680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_138922 // RefSeq // Rattus norvegicus nitric oxide synthase 1 (neuronal) adaptor protein (Nos1ap), mRNA. // chr13 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000032218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93279049:93562008:-1 gene:ENSRNOG00000002985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF037071 // GenBank // Rattus norvegicus carboxyl-terminal PDZ ligand of neuronal nitric oxide synthase mRNA, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000048570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93280057:93352366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GU827476 // GenBank // Rattus norvegicus nitric oxide synthase adaptor protein c (NOS1AP) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr13 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_001107196 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 6 (Atf6), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000029202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93670582:93854827:-1 gene:ENSRNOG00000024632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC168890 // GenBank // Rattus norvegicus activating transcription factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:189149 IMAGE:7108280), complete cds. // chr13 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93778079:93854774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT017692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_022248 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 12 (Dusp12), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93870680:93879772:-1 gene:ENSRNOG00000003100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF217233 // GenBank // Rattus norvegicus glucokinase-associated dual specificity phosphatase mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93874253:93879754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191931 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc receptor-like B (Fcrlb), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93898241:93903745:-1 gene:ENSRNOG00000003135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93896696:93918565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001100682 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc receptor-like A (Fcrla), mRNA. // chr13 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000004183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93908889:93918565:-1 gene:ENSRNOG00000003136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC105902 // GenBank // Rattus norvegicus Fc receptor-like A, mRNA (cDNA clone IMAGE:7376173), partial cds. // chr13 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// BC158820 // GenBank // Rattus norvegicus Fc receptor-like A, mRNA (cDNA clone MGC:188261 IMAGE:7375319), complete cds. // chr13 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000034359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93896696:93918565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT017698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONRATT017700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_175756 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG, low affinity IIb, receptor (CD32) (Fcgr2b), mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93968431:93983026:-1 gene:ENSRNOG00000046452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000058497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93968431:93982995:-1 gene:ENSRNOG00000046452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC091113 // GenBank // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG, low affinity IIb, receptor (CD32), mRNA (cDNA clone MGC:108556 IMAGE:7323350), complete cds. // chr13 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// EF424788 // GenBank // Rattus norvegicus low affinity Fc-gamma receptor IIB isoform 1 (Fcgr2b) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr13 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// X73371 // GenBank // R.norvegicus mRNA for Fc gamma receptor. // chr13 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT017702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT017703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000034296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93968878:94004954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1 /// NONRATT017704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// NONRATT017705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1
ENSRNOT00000045829 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:94048398:94049861:-1 gene:ENSRNOG00000031708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 81 // 93 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94048377:94049611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_001005534 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein (Sdhc), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94125549:94146440:-1 gene:ENSRNOG00000003163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC082027 // GenBank // Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex, subunit C, integral membrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:95158 IMAGE:7130052), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ215668 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YE11 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ215990 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YG16 mRNA sequence. // chr13 // 68 // 100 // 13 // 19 // 0 /// NONRATT017707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT017708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94126181:94153714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001126093 // RefSeq // Rattus norvegicus Purkinje cell protein 4-like 1 (Pcp4l1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94169878:94192679:-1 gene:ENSRNOG00000003209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC162039 // GenBank // Rattus norvegicus Purkinje cell protein 4-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:187968 IMAGE:7099690), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001083338 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 40 homolog (yeast)-like (Tomm40l), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94218782:94221471:-1 gene:ENSRNOG00000003398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB274732 // GenBank // Rattus norvegicus tomm40b mRNA for Tom40B, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94218782:94221471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001131001 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma polypeptide (Fcer1g), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94228761:94233191:-1 gene:ENSRNOG00000024159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC160864 // GenBank // Rattus norvegicus Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:188226 IMAGE:7324585), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94229050:94246247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// L04306 // GenBank // Rat high affinity IgE receptor gamma chain (FcERIgamma). // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001011907 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 2 (Ndufs2), mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000058423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94233721:94246253:-1 gene:ENSRNOG00000038372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// BC082067 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:95229 IMAGE:7132777), complete cds. // chr13 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000034341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94229050:94246247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 51 // 51 // 0 /// NONRATT017716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 56 // 56 // 30 // 54 // 1
NM_001105968 // RefSeq // Rattus norvegicus protoporphyrinogen oxidase (Ppox), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94276960:94281095:-1 gene:ENSRNOG00000003567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ226237 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YN18 mRNA sequence. // chr13 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT017720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94277003:94295402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT017723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT017724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001127638 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 21 (Usp21), mRNA. // chr13 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006250264 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 21 (Usp21), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000058390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94281930:94288016:-1 gene:ENSRNOG00000038347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC166443 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 21, mRNA (cDNA clone MGC:187584 IMAGE:8363035), complete cds. // chr13 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94277003:94295402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT017725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT017726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001082580 // RefSeq // Rattus norvegicus nitrilase 1 (Nit1), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_182668 // RefSeq // Rattus norvegicus nitrilase 1 (Nit1), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94349707:94353139:-1 gene:ENSRNOG00000003881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY300752 // GenBank // Rattus norvegicus nitrilase 1 (Nit1) mRNA, complete cds. // chr13 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// BC087146 // GenBank // Rattus norvegicus nitrilase 1, mRNA (cDNA clone MGC:95151 IMAGE:7129801), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ222988 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YK13 mRNA sequence. // chr13 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT017735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT017740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT017741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT017742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001108350 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch domain containing 9 (Klhdc9), mRNA. // chr13 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000005352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94370325:94373418:-1 gene:ENSRNOG00000004022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT017743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94372614:94380058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT017744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000047683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94609032:94609981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191673 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 9 (Ly9), mRNA. // chr13 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94625074:94644171:-1 gene:ENSRNOG00000025069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94626615:94662691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 89 // 63 // 17 // 19 // 0
FQ230857 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA85YK10 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000039633 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:94680739:94682046:-1 gene:ENSRNOG00000023269 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT017751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94680739:94713569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_001191550 // RefSeq // Rattus norvegicus SLAM family member 7 (Slamf7), mRNA. // chr13 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// XM_006250249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLAM family member 7 (Slamf7), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94680029:94696854:-1 gene:ENSRNOG00000023209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94680739:94713569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT017753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001105969 // RefSeq // Rattus norvegicus VANGL planar cell polarity protein 2 (Vangl2), mRNA. // chr13 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006250278 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus VANGL planar cell polarity protein 2 (Vangl2), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000006849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94905108:94928701:-1 gene:ENSRNOG00000004889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000050638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94905765:94960918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT017756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001105970 // RefSeq // Rattus norvegicus nescient helix loop helix 1 (Nhlh1), mRNA. // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94960920:94966121:-1 gene:ENSRNOG00000005166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT017757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_174864 // RefSeq // Rattus norvegicus nicastrin (Ncstn), mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000008150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:94974017:94990220:-1 gene:ENSRNOG00000005355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AY101378 // GenBank // Rattus norvegicus nicastrin (Ncstn) mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 85 // 33 // 34 // 0 /// BC074006 // GenBank // Rattus norvegicus nicastrin, mRNA (cDNA clone IMAGE:7103372). // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF510722 // GenBank // Rattus norvegicus nicastrin isoform (Ncstn) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr13 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// BC167747 // GenBank // Rattus norvegicus nicastrin, mRNA (cDNA clone MGC:187272 IMAGE:8365089), complete cds. // chr13 // 88 // 88 // 35 // 40 // 1 /// GENSCAN00000050652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:94974682:94988795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT017759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT017760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT017761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT017764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1
NM_001013231 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoprotein enriched in astrocytes 15 (Pea15), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95100951:95110571:-1 gene:ENSRNOG00000046996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085766 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoprotein enriched in astrocytes 15A, mRNA (cDNA clone MGC:93673 IMAGE:7190459), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95102774:95108968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001159594 // RefSeq // Rattus norvegicus calsequestrin 1 (fast-twitch, skeletal muscle) (Casq1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000009344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95113786:95123307:-1 gene:ENSRNOG00000006930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ223718 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA89YA08 mRNA sequence. // chr13 // 76 // 88 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000050649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95114246:95123289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT017769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT017768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT017771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001271030 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 4 polypeptide (Atp1a4), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NM_022848 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 4 polypeptide (Atp1a4), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000064601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95126900:95163433:-1 gene:ENSRNOG00000032378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC087015 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 4 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:93426 IMAGE:7113151), complete cds. // chr13 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// U15176 // GenBank // Rattus norvegicus Na,K-ATPase alpha subunit mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000050625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95127167:95144732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 48 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000050640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95147657:95163069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// NONRATT017774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 35 // 35 // 17 // 48 // 1 /// NONRATT017775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1
NM_012505 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 2 polypeptide (Atp1a2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000058143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95173347:95198290:-1 gene:ENSRNOG00000007290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC085764 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 2 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:93650 IMAGE:7190910), complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// M14512 // GenBank // Rat Na+,K+-ATPase alpha(+) isoform catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000050631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95175299:95198177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT017774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT017777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT017778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 41 // 41 // 19 // 46 // 1
NM_053834 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 9 (Kcnj9), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95224238:95231331:-1 gene:ENSRNOG00000007645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L77929 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-activated K+ inward rectifier (RBGIRK3/Kir3.3) mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95225112:95228846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT017785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// FQ211759 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA81YA09 mRNA sequence. // chr13 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001105973 // RefSeq // Rattus norvegicus SLAM family member 8 (Slamf8), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95487465:95496444:-1 gene:ENSRNOG00000008736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95476258:95511451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1
NM_001164726 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc receptor-like 6 (Fcrl6), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95506496:95511808:-1 gene:ENSRNOG00000000055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ228799 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YK23 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95476258:95511451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT017791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001191830 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 23 (Dusp23), mRNA. // chr13 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95537373:95538565:-1 gene:ENSRNOG00000022143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95537373:95538565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT017794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_017170 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid P component, serum (Apcs), mRNA. // chr13 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000012092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:95938000:95939037:-1 gene:ENSRNOG00000009086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M83177 // GenBank // Rat amyloid P component (SAP) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// X55761 // GenBank // R.norvegicus mRNA for serum amyloid P (SAP). // chr13 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// FQ218451 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YA19 mRNA sequence. // chr13 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:95938118:95939745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001000078 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1579 (Olr1579), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96152147:96153079:-1 gene:ENSRNOG00000049212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96152147:96207626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000533 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1581 (Olr1581), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96207045:96207977:-1 gene:ENSRNOG00000046418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96152147:96207626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// NONRATT017798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012724 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgE, high affinity I, receptor for; alpha polypeptide (Fcer1a), mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96245261:96251469:-1 gene:ENSRNOG00000009177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// M17153 // GenBank // Rat receptor with high affinity for immunoglobulin E, alpha subunit (Fc-epsilon-RI(alpha) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// M21622 // GenBank // Rat high-affinity IgE receptor (Fc-epsilon-R-I) mRNA, complete cds, clones R8-2b and R3-3. // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// M21623 // GenBank // Rat high-affinity IgE receptor (Fc-epsilon-R-I) mRNA, complete cds, clones R3-4 and R6-1. // chr13 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000013885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96243845:96252375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
FQ231892 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YM14 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0
NM_001047103 // RefSeq // Rattus norvegicus cell adhesion molecule 3 (Cadm3), mRNA. // chr13 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96356701:96388464:-1 gene:ENSRNOG00000003365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC161811 // GenBank // Rattus norvegicus cell adhesion molecule 3, mRNA (cDNA clone MGC:187244 IMAGE:7317639), complete cds. // chr13 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// DQ272743 // GenBank // Rattus norvegicus nectin-like protein 1 mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96331005:96371532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 85 // 85 // 35 // 41 // 1 /// NONRATT017804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 37 // 37 // 15 // 41 // 1
NM_001012029 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid cell nuclear differentiation antigen (Mnda), mRNA. // chr13 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96588441:96604826:-1 gene:ENSRNOG00000003486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// BC085891 // GenBank // Rattus norvegicus interferon activated gene 204, mRNA (cDNA clone MGC:94687 IMAGE:7192620), complete cds. // chr13 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96588622:96599716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT017808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 68 // 68 // 30 // 44 // 1 /// NONRATT017809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
XM_006221561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrin domain-containing protein 3-like (LOC102556096), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// XM_006221562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrin domain-containing protein 3-like (LOC102556096), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// XM_006221567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrin domain-containing protein 3-like (LOC102556096), transcript variant X7, mRNA. // chr13 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// XM_006250340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrin domain-containing protein 3-like (LOC102556096), mRNA. // chr13 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004637 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:96490074:96496629:-1 gene:ENSRNOG00000042990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96483527:96496626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0
NM_001000084 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1592 (Olr1592), mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96727285:96728208:-1 gene:ENSRNOG00000003518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:96727285:96728208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000911 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1597 (Olr1597), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:96862491:96863432:-1 gene:ENSRNOG00000003555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105974 // RefSeq // Rattus norvegicus gremlin 2 (Grem2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:97359449:97453188:-1 gene:ENSRNOG00000003616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:97362415:97362921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_019343 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 7 (Rgs7), mRNA. // chr13 // 97 // 88 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000065041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:97560710:97772203:-1 gene:ENSRNOG00000021984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AB024398 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for G-protein signaling regulator RGS7, complete cds. // chr13 // 97 // 88 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT017816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000047540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:97551830:97704137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1
NONRATT017822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_017005 // RefSeq // Rattus norvegicus fumarate hydratase (Fh), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:98116501:98142647:-1 gene:ENSRNOG00000003653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087598 // GenBank // Rattus norvegicus fumarate hydratase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105468 IMAGE:7311498), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ223001 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YI06 mRNA sequence. // chr13 // 86 // 97 // 25 // 29 // 0 /// J04473 // GenBank // Rat mitochondrial fumarase mRNA, complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98116537:98142622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001191933 // RefSeq // Rattus norvegicus opsin 3 (Opn3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:98180840:98211263:-1 gene:ENSRNOG00000003778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98181155:98200571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT017825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT017826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001109524 // RefSeq // Rattus norvegicus choroideremia-like (Rab escort protein 2) (Chml), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98205028:98206893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001191674 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase D family, member 5 (Pld5), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:98486317:98812030:-1 gene:ENSRNOG00000003997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98547517:98619306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98446607:98542783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT017830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006249680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein of 170 kDa-like (LOC100909664), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:99285362:99312482:-1 gene:ENSRNOG00000004127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// AB038495 // GenBank // Rattus norvegicus Rhk1 mRNA for KARP-1-binding protein 1, complete cds. // chr13 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000005532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:48912975:48940066:1 gene:ENSRNOG00000048922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:99266200:99312445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:48903169:49031553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT017831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
NR_031794 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-350 (Mir350), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071079 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:48922457:48922555:1 gene:ENSRNOG00000047684 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074854 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:99302871:99302969:-1 gene:ENSRNOG00000048587 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-350 // miRBase Micro RNA Database // MI0000639 Rattus norvegicus miR-350 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031575 // RefSeq // Rattus norvegicus v-akt murine thymoma viral oncogene homolog 3 (Akt3), mRNA. // chr13 // 93 // 95 // 53 // 57 // 0 /// ENSRNOT00000057879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:99533234:99800302:-1 gene:ENSRNOG00000021497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 100 // 57 // 60 // 0 /// D49836 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RAC protein kinase gamma, complete cds. // chr13 // 93 // 95 // 53 // 57 // 0 /// GENSCAN00000022952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:99529862:99660501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 77 // 43 // 46 // 0 /// NONRATT017840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 90 // 54 // 54 // 0
NM_001105975 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylosuccinate synthase (Adss), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100355979:100386314:-1 gene:ENSRNOG00000004481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100357032:100386199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000003133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100622203:100622589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_057139 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (Hnrnpu), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U (Hnrnpu), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100670813:100679599:-1 gene:ENSRNOG00000033790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC072529 // GenBank // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U, mRNA (cDNA clone MGC:91534 IMAGE:7096906), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D14048 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SP120, complete cds. // chr13 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100660916:100679432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001025762 // RefSeq // Rattus norvegicus SET and MYND domain containing 3 (Smyd3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000040829 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:102350017:102588971:-1 gene:ENSRNOG00000028924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// BC097455 // GenBank // Rattus norvegicus SET and MYND domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:114517 IMAGE:7457098), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000034908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102350227:102434160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001008293 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor B2, mitochondrial (Tfb2m), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000003618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:102830291:102848026:-1 gene:ENSRNOG00000002695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085870 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor B2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:94625 IMAGE:7191198), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor B2, mitochondrial (Tfb2m), mRNA. // chr13 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102831074:102847921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT017867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT017869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001271270 // RefSeq // Rattus norvegicus AT hook containing transcription factor 1 (Ahctf1), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006250386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AT hook containing transcription factor 1 (Ahctf1), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000035875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:103034524:103084625:-1 gene:ENSRNOG00000023541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000019046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102978586:103088016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
NM_031087 // RefSeq // Rattus norvegicus presenilin 2 (Psen2), mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus presenilin 2 (Psen2), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000040203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:103521935:103547127:-1 gene:ENSRNOG00000002879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB004454 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for presenilin-2, complete cds. // chr13 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC078805 // GenBank // Rattus norvegicus presenilin 2, mRNA (cDNA clone MGC:93382 IMAGE:7109917), complete cds. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// D83700 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA for presenilin-2, complete cds. // chr13 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// X99267 // GenBank // R.norvegicus mRNA for presenilin-2. // chr13 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT017878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103508918:103565464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT017879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT017880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001013185 // RefSeq // Rattus norvegicus aarF domain containing kinase 3 (Adck3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:103459496:103486271:-1 gene:ENSRNOG00000043201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC091388 // GenBank // Rattus norvegicus chaperone, ABC1 activity of bc1 complex homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:109473 IMAGE:7321446), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103459731:103475453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT017876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001067525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689499 (LOC689499), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689499 (LOC689499), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057735 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:103732725:103737132:-1 gene:ENSRNOG00000037960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000003732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103732725:103744420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103773939:103780566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT017887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001105979 // RefSeq // Rattus norvegicus Mix paired-like homeobox 1 (Mixl1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:102298849:102302890:-1 gene:ENSRNOG00000003176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074370 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:103975097:103977482:-1 gene:ENSRNOG00000048085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103975097:103977482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:102300473:102302868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034090 // RefSeq // Rattus norvegicus epoxide hydrolase 1, microsomal (xenobiotic) (Ephx1), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NM_012844 // RefSeq // Rattus norvegicus epoxide hydrolase 1, microsomal (xenobiotic) (Ephx1), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104268708:104343633:-1 gene:ENSRNOG00000003515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// BC061568 // GenBank // Rattus norvegicus epoxide hydrolase 1, microsomal, mRNA (cDNA clone MGC:72921 IMAGE:6889368), complete cds. // chr13 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// M26125 // GenBank // Rat epoxide hydrolase mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT017896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104268925:104283734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NM_001105980 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear VCP-like (Nvl), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006250367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear VCP-like (Nvl), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006250368 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear VCP-like (Nvl), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// XM_006250372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear VCP-like (Nvl), transcript variant X6, mRNA. // chr13 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000004927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104407045:104464514:-1 gene:ENSRNOG00000003629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000037135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104400534:104464432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT017898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT017899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// NONRATT017901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// NONRATT017902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
NM_001109081 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 26 (Wdr26), mRNA. // chr13 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:104488124:104526797:-1 gene:ENSRNOG00000003723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104473571:104541112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT017907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
XM_001062881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 121 (Ccdc121), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_223007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 121 (Ccdc121), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:104808089:104809060:-1 gene:ENSRNOG00000022717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:104775697:104809060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003751289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 28S ribosomal protein S11, mitochondrial-like (LOC690271), mRNA. // chr13 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000004114 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:104965563:104967179:-1 gene:ENSRNOG00000003080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_134453 // RefSeq // Rattus norvegicus lamin B receptor (Lbr), mRNA. // chr13 // 87 // 100 // 33 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000029841 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:106629770:106648432:-1 gene:ENSRNOG00000003103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// AB002466 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NBP60, complete cds. // chr13 // 87 // 100 // 33 // 38 // 0 /// GENSCAN00000000534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:106629770:106652148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT017943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0
XM_006250394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enabled homolog (Drosophila) (Enah), transcript variant X7, mRNA. // chr13 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_001012150 // RefSeq // Rattus norvegicus enabled homolog (Drosophila) (Enah), mRNA. // chr13 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000039974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105280250:105385633:-1 gene:ENSRNOG00000031934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// BC083927 // GenBank // Rattus norvegicus enabled homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:95334 IMAGE:7135538), complete cds. // chr13 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// GENSCAN00000035023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105273057:105337787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT017913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT017915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0
NM_053323 // RefSeq // Rattus norvegicus delta(4)-desaturase, sphingolipid 1 (Degs1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus delta(4)-desaturase, sphingolipid 1 (Degs1), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105599916:105606572:-1 gene:ENSRNOG00000003223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY036902 // GenBank // Rattus norvegicus degenerative spermatocyte-like protein RDES mRNA, complete cds. // chr13 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// BC083727 // GenBank // Rattus norvegicus degenerative spermatocyte homolog 1, lipid desaturase (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94629 IMAGE:7191263), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105600334:105606525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001107203 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 28 (Fbxo28), mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000000074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105649130:105674598:-1 gene:ENSRNOG00000000066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC167003 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 28, mRNA (cDNA clone MGC:189169 IMAGE:8366732), complete cds. // chr13 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT017926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105649505:105674583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// NONRATT017927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
GENSCAN00000035027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105682141:105718261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_017116 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 2, (m/II) large subunit (Capn2), mRNA. // chr13 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000045326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:105814750:105864911:-1 gene:ENSRNOG00000034015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC065306 // GenBank // Rattus norvegicus calpain 2, mRNA (cDNA clone MGC:72508 IMAGE:5621252), complete cds. // chr13 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// L09120 // GenBank // Rattus norvegicus calpain II 80 kDa subunit mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000048534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:105813249:105864485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 97 // 84 // 36 // 37 // 0 /// NONRATT017931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT017930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT017932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
NM_001170428 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 185 (Ccdc185), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037997 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:106095543:106097408:-1 gene:ENSRNOG00000022104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:106095543:106097408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
NM_001105983 // RefSeq // Rattus norvegicus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dispatched homolog 1 (Drosophila) (Disp1), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:106384791:106527113:-1 gene:ENSRNOG00000003635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:106384811:106407726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT017941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025669 // RefSeq // Rattus norvegicus BRO1 domain and CAAX motif containing (Brox), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRO1 domain and CAAX motif containing (Brox), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:100886374:100906156:-1 gene:ENSRNOG00000003664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097348 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 0610010K06Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:114362 IMAGE:7460070), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:100882185:100904278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000054293 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:13:101072318:101072425:-1 gene:ENSRNOG00000036170 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003752686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912365 (LOC100912365), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005407 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:108931488:108932192:-1 gene:ENSRNOG00000004066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:108931488:108932192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001077674 // RefSeq // Rattus norvegicus H2.0-like homeobox (Hlx), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000003155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107315404:107320809:-1 gene:ENSRNOG00000002309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC127513 // GenBank // Rattus norvegicus H2.0-like homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:156701 IMAGE:7099599), complete cds. // chr13 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT017946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:107305405:107352876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 70 // 70 // 16 // 23 // 1
NM_001100811 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial amidoxime reducing component 1 (Marc1), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107375897:107398500:-1 gene:ENSRNOG00000004101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:107360271:107398500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT017948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT017949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_134410 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial amidoxime reducing component 2 (Marc2), mRNA. // chrU // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000029439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107401555:107432931:-1 gene:ENSRNOG00000037850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AF095741 // GenBank // Rattus norvegicus putative thiol-like protein (CDK7) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC061734 // GenBank // Rattus norvegicus MOCO sulphurase C-terminal domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:72310 IMAGE:5598768), complete cds. // chrU // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:107406021:107432892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT017949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT017950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// NONRATT017952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
NM_001100857 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ14146 (RGD1310587), mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000003177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107456595:107466329:-1 gene:ENSRNOG00000002322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT017953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_053947 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 1 (Mark1), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000003198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:107485344:107589708:-1 gene:ENSRNOG00000002339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000014430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:107485762:107524176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT017956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT017955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1
XM_006221618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Iars2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006250432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isoleucyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Iars2), mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000057395 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:107928811:107937935:-1 gene:ENSRNOG00000002368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// GENSCAN00000000391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:107904908:107937935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 72 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT017959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1 /// NONRATT017962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// NONRATT017960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
ENSRNOT00000074553 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:108048880:108049367:-1 gene:ENSRNOG00000046240 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr13 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001105986 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophospholipase-like 1 (Lyplal1), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:108706787:108738098:-1 gene:ENSRNOG00000023130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166929 // GenBank // Rattus norvegicus lysophospholipase-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6920971), partial cds. // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:108707515:108740033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT017965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT017966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
GENSCAN00000041837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:108787117:108803363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
ENSRNOT00000031419 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:108812680:108813114:-1 gene:ENSRNOG00000023091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:108812662:108857104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_031131 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta 2 (Tgfb2), mRNA. // chr13 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:109681282:109791576:-1 gene:ENSRNOG00000002418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF135598 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor beta 2 precursor, mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AF153012 // GenBank // Rattus norvegicus TGF-beta 2 long form precursor (TGF-beta2) mRNA, complete cds. // chr13 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// AF153013 // GenBank // Rattus norvegicus TGF-beta 2 short form precursor (TGF-beta2) mRNA, complete cds. // chr13 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT017969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000028136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:109685496:109736683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001009702 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 15 homolog (S. cerevisiae) (Rrp15), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:109807390:109830733:-1 gene:ENSRNOG00000002450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087649 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 15 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105708 IMAGE:7310706), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ219085 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YN03 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT017974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:109807714:109839193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
XM_006250449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 17 (Spata17), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000057326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:110203123:110286162:-1 gene:ENSRNOG00000002504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000073142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:110184471:110286162:-1 gene:ENSRNOG00000002504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT017975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:110102263:110213017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT017976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001107199 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 3 (Kctd3), mRNA. // chr13 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000003556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:112063807:112101984:-1 gene:ENSRNOG00000002627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000056699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:112064833:112101774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0
NM_001100827 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein F (Cenpf), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:112758855:112804965:-1 gene:ENSRNOG00000003388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:112759824:112801737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT017989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_206851 // RefSeq // Rattus norvegicus SET and MYND domain containing 2 (Smyd2), mRNA. // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:113261746:113302396:1 gene:ENSRNOG00000003583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:113257683:113290790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000042163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:113293625:113302157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT017018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107201 // RefSeq // Rattus norvegicus prospero homeobox 1 (Prox1), mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006250456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prospero homeobox 1 (Prox1), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006250457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prospero homeobox 1 (Prox1), transcript variant X4, mRNA. // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:113004597:113060843:1 gene:ENSRNOG00000003694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT017016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:113013622:113047611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001105984 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide C1 (Rps6kc1), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XR_359213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 1 (Rps6kc1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr13 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:113940375:114084551:-1 gene:ENSRNOG00000003767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC064438 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5599778). // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT018000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114043255:114095582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT017999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT018003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT018004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001109082 // RefSeq // Rattus norvegicus vasohibin 2 (Vash2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vasohibin 2 (Vash2), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_359216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vasohibin 2 (Vash2), transcript variant X6, misc_RNA. // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114122604:114154107:-1 gene:ENSRNOG00000003832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114125040:114145530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109084 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 71, member A (Fam71a), mRNA. // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000043672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114361911:114363629:-1 gene:ENSRNOG00000029371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114361911:114363551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_012912 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 3 (Atf3), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114411695:114443438:-1 gene:ENSRNOG00000003745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078903 // GenBank // Rattus norvegicus activating transcription factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:93651 IMAGE:7100767), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M63282 // GenBank // Rat leucine zipper protein mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3-like (LOC100911428), mRNA. // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT018011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114412880:114474462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT018012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114367437:114381085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT018013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001002851 // RefSeq // Rattus norvegicus neudesin neurotrophic factor (Nenf), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114555781:114562973:-1 gene:ENSRNOG00000003833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY623793 // GenBank // Rattus norvegicus SCIRP10-related protein (SCIRP10) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114555900:114562954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT018015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107891 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, alpha (Ppp2r5a), mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000000078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114599131:114643527:-1 gene:ENSRNOG00000000068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT018020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000047410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114600089:114643350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
XM_001068900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog (Drosophila) (Dtl), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006221605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog (Drosophila) (Dtl), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog (Drosophila) (Dtl), transcript variant X3, mRNA. // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_223074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus denticleless E3 ubiquitin protein ligase homolog (Drosophila) (Dtl), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005576 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:114785011:114821077:-1 gene:ENSRNOG00000004195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005628 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:114786102:114821077:-1 gene:ENSRNOG00000004195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114779057:114821239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT018024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT018025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
XM_006221620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hedgehog acyltransferase (Hhat), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005223 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:115831861:116027857:-1 gene:ENSRNOG00000003925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072729 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:115793877:116027857:-1 gene:ENSRNOG00000003925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:115939023:115993269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT018029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001108351 // RefSeq // Rattus norvegicus SERTA domain containing 4 (Sertad4), mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:116128415:116133122:-1 gene:ENSRNOG00000003935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT018032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:116123171:116137002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT018033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001013986 // RefSeq // Rattus norvegicus digestive organ expansion factor homolog (zebrafish) (Diexf), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:116383169:116404439:-1 gene:ENSRNOG00000004789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217506 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA24YL24 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:116383426:116404346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT018040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001014132 // RefSeq // Rattus norvegicus TRAF3 interacting protein 3 (Traf3ip3), mRNA. // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRAF3 interacting protein 3 (Traf3ip3), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:116447651:116472948:-1 gene:ENSRNOG00000005565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC089843 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF3 interacting protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:108851 IMAGE:7368358), complete cds. // chr13 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:116447863:116470202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT018043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT018044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001009632 // RefSeq // Rattus norvegicus G0/G1switch 2 (G0s2), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:116559387:116560299:-1 gene:ENSRNOG00000006019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088248 // GenBank // Rattus norvegicus G0/G1switch 2, mRNA (cDNA clone MGC:109048 IMAGE:7369006), complete cds. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:116559708:116565518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_182842 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase IG (Camk1g), mRNA. // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// XM_006250470 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase IG (Camk1g), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:116631306:116654952:-1 gene:ENSRNOG00000006470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:116631306:116654952:-1 gene:ENSRNOG00000006470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB101231 // GenBank // Rattus norvegicus CaMKIg1 mRNA for Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase I gamma 1, complete cds. // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// AB101232 // GenBank // Rattus norvegicus CaMKIg2 mRNA for Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase I gamma 2, complete cds. // chr13 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:116631081:116651585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT018052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NR_031920 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 205 (Mir205), microRNA. // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053643 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:116787618:116787725:-1 gene:ENSRNOG00000035520 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-205 // miRBase Micro RNA Database // MI0000947 Rattus norvegicus miR-205 stem-loop // chr13 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019190 // RefSeq // Rattus norvegicus CD46 molecule, complement regulatory protein (Cd46), mRNA. // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD46 molecule, complement regulatory protein (Cd46), transcript variant X2, mRNA. // chr13 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:118334939:118366003:-1 gene:ENSRNOG00000007917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AB010920 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for membrane cofactor protein, complete cds. // chr13 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT018059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001005265 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component (3b/4b) receptor 1-like (Cr1l), transcript variant 3, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001005330 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component (3b/4b) receptor 1-like (Cr1l), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_019301 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component (3b/4b) receptor 1-like (Cr1l), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:118373053:118420106:-1 gene:ENSRNOG00000008193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC061736 // GenBank // Rattus norvegicus complement component (3b/4b) receptor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:72484 IMAGE:5599318), complete cds. // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D42114 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 5I2 antigen precursor, complete cds. // chr13 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// D42115 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 5I2 antigen, clone 5, complete cds. // chr13 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// L36532 // GenBank // Rat complement regulatory protein (Crry) mRNA, complete cds. // chr13 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT018065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT018064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001105989 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component (3d/Epstein Barr virus) receptor 2 (Cr2), mRNA. // chr13 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006250474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus complement component (3d/Epstein Barr virus) receptor 2 (Cr2), transcript variant X1, mRNA. // chr13 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:118587318:118617951:-1 gene:ENSRNOG00000034164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000008271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:118554210:118617951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT018069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109085 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC498316 (LOC498316), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC498316 (LOC498316), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061146 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:18898934:18899227:-1 gene:ENSRNOG00000039841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114241382:114247156:1 gene:ENSRNOG00000048659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:18898934:18899227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114243709:114295020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001099654 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 65 (Vom2r65), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000002777 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:1371545:1372535:-1 gene:ENSRNOG00000002029 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0
NM_001099477 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 70 (Vom2r70), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:308061:378298:1 gene:ENSRNOG00000049387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:308061:337649:1 gene:ENSRNOG00000049387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:305247:337649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT018072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000050676 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:360900:372386:1 gene:ENSRNOG00000046189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 47 // 100 // 9 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000052336 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:360900:372386:1 gene:ENSRNOG00000046189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 47 // 100 // 9 // 19 // 0 /// NONRATT018073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 42 // 100 // 8 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:363944:447140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
XM_001071744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 11 (Tmed11), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003752699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 11 (Tmed11), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000040 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:1932659:1953305:1 gene:ENSRNOG00000000035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1935285:1953305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
XM_002728061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003751319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003752700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003752701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006221632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006221633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 212 (Rnf212), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ223894 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA83YK13 mRNA sequence. // chr14 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_022287 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 1 (Slc26a1), mRNA. // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000000047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2046024:2051630:1 gene:ENSRNOG00000000041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085735 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (sulfate transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93448 IMAGE:7108820), complete cds. // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// L23413 // GenBank // Rattus norvegicus sulfate anion transporter (sat-1) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2047546:2050398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT018090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001198804 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, theta (Dgkq), mRNA. // chr14 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000032056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2064952:2078913:1 gene:ENSRNOG00000024112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000017910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2065039:2077278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0
NM_031030 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin G associated kinase (Gak), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2095648:2168937:1 gene:ENSRNOG00000000048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D38560 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cyclinG-associated kinase, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2095752:2168506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT018095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_022864 // RefSeq // Rattus norvegicus complexin 1 (Cplx1), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2190908:2220991:1 gene:ENSRNOG00000000060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC093605 // GenBank // Rattus norvegicus complexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:105424 IMAGE:7317504), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// D70817 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for synaphin 2, complete cds. // chr14 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// U35098 // GenBank // Rattus norvegicus complexin I mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2179721:2219403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001107246 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 7 (Mfsd7), mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 7 (Mfsd7), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2309476:2317928:1 gene:ENSRNOG00000023937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2304915:2316991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT018099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_080481 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit E (Atp5i), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2323662:2324790:1 gene:ENSRNOG00000000064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC058449 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit E, mRNA (cDNA clone MGC:72719 IMAGE:6890563), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D13121 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP synthase subunit e, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ224619 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA60YA06 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT018101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000071557 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:1685988:1692113:1 gene:ENSRNOG00000049543 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000073831 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:2532427:2538555:1 gene:ENSRNOG00000049960 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_001007619 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 5 (Tmed5), mRNA. // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000000083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2612362:2623810:1 gene:ENSRNOG00000000073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC079452 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:95001 IMAGE:7121068), complete cds. // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AY539871 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00120 mRNA, complete cds. // chr14 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT018106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2612450:2632994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001170456 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 69, member A (Fam69a), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2789913:2860548:1 gene:ENSRNOG00000023533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166752 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 69, member A, mRNA (cDNA clone MGC:188491 IMAGE:5621368), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ211286 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA13YK23 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2854776:2859648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT018107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001271410 // RefSeq // Rattus norvegicus ecotropic viral integration site 5 (Evi5), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// XM_006250530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ecotropic viral integration site 5 (Evi5), transcript variant X8, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006250531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ecotropic viral integration site 5 (Evi5), transcript variant X9, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// XM_006250534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ecotropic viral integration site 5 (Evi5), transcript variant X12, mRNA. // chr14 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000061630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2892968:2979616:1 gene:ENSRNOG00000002039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// FQ228104 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YH23 mRNA sequence. // chr14 // 95 // 45 // 18 // 19 // 0 /// FQ234355 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YE11 mRNA sequence. // chr14 // 47 // 45 // 9 // 19 // 0 /// GENSCAN00000043384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2941795:2989350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 67 // 27 // 28 // 0
GENSCAN00000043396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2866232:2895333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_012566 // RefSeq // Rattus norvegicus growth factor independent 1 transcription repressor (Gfi1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_359278 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth factor independent 1 transcription repressor (Gfi1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3060444:3069821:1 gene:ENSRNOG00000002042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L06986 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein (Gfi-1) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3062524:3068749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_017256 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta receptor III (Tgfbr3), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000002867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3509601:3683814:1 gene:ENSRNOG00000002093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M77809 // GenBank // Rat betaglycan mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// M80784 // GenBank // R.norvegicus type III TGF-beta receptor mRNA, complete cds. // chr14 // 88 // 94 // 30 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3631227:3674624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001191101 // RefSeq // Rattus norvegicus HFM1, ATP-dependent DNA helicase homolog (S. cerevisiae) (Hfm1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3879476:3958032:1 gene:ENSRNOG00000023299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3861012:3908485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001191101 // RefSeq // Rattus norvegicus HFM1, ATP-dependent DNA helicase homolog (S. cerevisiae) (Hfm1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000033794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3879476:3958032:1 gene:ENSRNOG00000023299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001139484 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 644 (Zfp644), mRNA. // chr14 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// XM_006250549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 644 (Zfp644), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 644 (Zfp644), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 644 (Zfp644), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:4120819:4195995:1 gene:ENSRNOG00000002112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:4165348:4184485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT018134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_022956 // RefSeq // Rattus norvegicus BarH-like homeobox 2 (Barhl2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:4356650:4361538:1 gene:ENSRNOG00000002117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB004056 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BarH-class homeodomain transcription factor, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:4356719:4368345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT018135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000047322 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:4536680:4537132:1 gene:ENSRNOG00000039989 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000021068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:4527456:4537138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
XM_006221650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102548082), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006250602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC102548082), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051668 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:5293357:5293809:1 gene:ENSRNOG00000033936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:5293474:5293809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000018364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:5851003:5873907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001128311 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 3 (Abcg3), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 14 // 14 // 0
NONRATT018139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107205 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 3-like 3 (Abcg3l3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000061267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6037995:6083614:1 gene:ENSRNOG00000039890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT018139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT018141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:6036193:6085974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
XM_006221658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 442-like (LOC100909622), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006250613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 442-like (LOC100909622), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000068215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:6201384:6205555:1 gene:ENSRNOG00000042166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XR_340100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548650 (LOC102548650), ncRNA. // chrU // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NM_001134998 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 951 (Zfp951), mRNA. // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// XM_006250617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102555406), mRNA. // chrU // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// XM_006250618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102555488), mRNA. // chrU // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// XM_006250644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 791-like (LOC102548396), mRNA. // chrU // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000048419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6336742:6350405:-1 gene:ENSRNOG00000037421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// BC169037 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:189422 IMAGE:7368372, complete cds. // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT019077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044065 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:6262167:6264976:-1 gene:ENSRNOG00000043048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT019079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_012946 // RefSeq // Rattus norvegicus SPARC-like 1 (hevin) (Sparcl1), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6985393:7016295:1 gene:ENSRNOG00000015093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC061755 // GenBank // Rattus norvegicus SPARC-like 1 (hevin), mRNA (cDNA clone MGC:72541 IMAGE:5600008), complete cds. // chr14 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// U27562 // GenBank // Rattus norvegicus SC1 protein mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:6999684:7011760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001004209 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 11 (Hsd17b11), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 11 (Hsd17b11), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:7064323:7095461:1 gene:ENSRNOG00000002210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078929 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 11, mRNA (cDNA clone MGC:93725 IMAGE:7107084), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ211398 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA11YG16 mRNA sequence. // chr14 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// FQ219665 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YM02 mRNA sequence. // chr14 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7064394:7094818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT018149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001009684 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13 (Hsd17b13), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:7103692:7118366:1 gene:ENSRNOG00000002212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC088191 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 13, mRNA (cDNA clone MGC:108860 IMAGE:7372031), complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7096918:7118042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT018152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001105995 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 8 (Klhl8), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:7159371:7204942:1 gene:ENSRNOG00000002214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7180217:7212772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001017495 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC26744 (LOC498330), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_359352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546454 (LOC102546454), ncRNA. // chr14 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000072463 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:7621999:7622507:1 gene:ENSRNOG00000050063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT018157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000033116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7592605:7656400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_198049 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter), member 6 (Slc10a6), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:7592605:7656400:1 gene:ENSRNOG00000002057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7592605:7656400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT018158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
XM_001065938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 4-like 1 (Ndufb4l1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_577306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 4-like 1 (Ndufb4l1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044617 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:7922240:7922632:1 gene:ENSRNOG00000034289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7830842:7922632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001270556 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 10 (Mapk10), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// NM_012806 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 10 (Mapk10), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:8053730:8340390:1 gene:ENSRNOG00000002079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// DQ377224 // GenBank // Rattus norvegicus JNK3 protein (JNK3) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// L27128 // GenBank // Rattus norvegicus stress activated protein kinase beta isoform mRNA, complete cds. // chr14 // 87 // 94 // 27 // 31 // 0 /// NONRATT018163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// NONRATT018164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NONRATT018165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170551 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat and FYVE domain containing 3 (Wdfy3), mRNA. // chr14 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000033194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:9200912:9346382:1 gene:ENSRNOG00000002099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 65 // 65 // 0 /// GENSCAN00000024955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:9249983:9342857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000024965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:9188254:9244325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 16 // 11 // 11 // 0
NM_031737 // RefSeq // Rattus norvegicus NK6 homeobox 1 (Nkx6-1), mRNA. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:9516942:9523867:1 gene:ENSRNOG00000002149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF004431 // GenBank // Rattus norvegicus homeodomain protein Nkx6.1 (nkx6.1) mRNA, complete cds. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:9517757:9522549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT018176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001009633 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 175, member A (Fam175a), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10372640:10386976:1 gene:ENSRNOG00000002165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088408 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 98, mRNA (cDNA clone MGC:94265 IMAGE:7131771), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10372689:10465994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001014134 // RefSeq // Rattus norvegicus helicase, POLQ-like (Helq), mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10394947:10439008:1 gene:ENSRNOG00000002181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC086609 // GenBank // Rattus norvegicus DNA helicase HEL308, mRNA (cDNA clone IMAGE:7320927), complete cds. // chr14 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000052781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10372689:10465994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT018179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT018180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_022605 // RefSeq // Rattus norvegicus heparanase (Hpse), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:10483181:10523889:1 gene:ENSRNOG00000002188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF184967 // GenBank // Rattus norvegicus heparanase (Hep) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF359508 // GenBank // Rattus norvegicus heparanase (Hspe) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10517832:10522428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT018182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001044255 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q2 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase (Coq2), mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coenzyme Q2 4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase (Coq2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10528340:10547770:1 gene:ENSRNOG00000002194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC099827 // GenBank // Rattus norvegicus coenzyme Q2 homolog, prenyltransferase (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:124824 IMAGE:7934175), complete cds. // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10528344:10572332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_022186 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor binding factor 2 (Nrbf2), mRNA. // chr14 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24818944:24837210:1 gene:ENSRNOG00000000641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AB024930 // GenBank // Rattus norvegicus NRBF-2 mRNA for nuclear receptor binding factor-2, complete cds. // chr14 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002990 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:10571469:10572332:1 gene:ENSRNOG00000002200 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042769 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215334735:215335598:-1 gene:ENSRNOG00000030494 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24769561:24836434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10528344:10572332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215334735:215472677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT033238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 74 // 100 // 23 // 31 // 0
NM_001108353 // RefSeq // Rattus norvegicus placenta-specific 8 (Plac8), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_146272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910270 (LOC100910270), ncRNA. // chr14 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000003012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10640286:10661811:1 gene:ENSRNOG00000002217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168910 // GenBank // Rattus norvegicus placenta-specific 8, mRNA (cDNA clone MGC:189192 IMAGE:7378144), complete cds. // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ222343 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YL10 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ222760 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YE19 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227172 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YK18 mRNA sequence. // chr14 // 52 // 84 // 11 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10639517:10657194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7483711:7487347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT018186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100564 // RefSeq // Rattus norvegicus lin-54 homolog (C. elegans) (Lin54), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-54 homolog (C. elegans) (Lin54), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-54 homolog (C. elegans) (Lin54), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-54 homolog (C. elegans) (Lin54), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10733789:10775701:1 gene:ENSRNOG00000002203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC082043 // GenBank // Rattus norvegicus lin-54 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:7131638), partial cds. // chr14 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT018188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10752985:10773672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_033021 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC31 homolog A (S. cerevisiae) (Sec31a), mRNA. // chr14 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10801889:10856886:1 gene:ENSRNOG00000002251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000033489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10801889:10856886:1 gene:ENSRNOG00000002251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF034582 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle associated protein (VAP1) mRNA, complete cds. // chr14 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// BC085722 // GenBank // Rattus norvegicus SEC31 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93320 IMAGE:7107486), complete cds. // chr14 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10809592:10961012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT018197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001108354 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 150C (Tmem150c), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 150C (Tmem150c), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:11093499:11110144:1 gene:ENSRNOG00000002258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC169066 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2610318G18, mRNA (cDNA clone MGC:189466 IMAGE:5598025), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ214560 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA1YM16 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:11024779:11104645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT018202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT018203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001033696 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like (Hnrnpdl), mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XR_359349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like (Hnrnpdl), transcript variant X4, misc_RNA. // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000003106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:11143239:11146504:1 gene:ENSRNOG00000002270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC104683 // GenBank // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like, mRNA (cDNA clone MGC:125262 IMAGE:7461444), complete cds. // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ222460 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YC05 mRNA sequence. // chr14 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT018205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:11133846:11162197:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT018207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT018208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
GENSCAN00000012777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:11200663:11233177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000032787 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:11571030:11571717:1 gene:ENSRNOG00000022882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075469 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:11571030:11571717:1 gene:ENSRNOG00000022882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:11525106:11571459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_002728083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RasGEF domain family, member 1B (Rasgef1b), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250691 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RasGEF domain family, member 1B (Rasgef1b), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003207 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:11944914:11968889:1 gene:ENSRNOG00000002345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:11944941:11955932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_013012 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, cGMP-dependent, type II (Prkg2), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000003237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:12160807:12255994:1 gene:ENSRNOG00000002361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:12122329:12252639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1
GENSCAN00000044071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:12756522:12840619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSRNOT00000013655 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:12839620:12840619:1 gene:ENSRNOG00000010293 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
ENSRNOT00000000092 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:13133992:13216815:1 gene:ENSRNOG00000000081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// DQ486884 // GenBank // Rattus norvegicus anthrax toxin receptor 2 (Antxr2) mRNA, partial cds. // chrU // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:13145268:13230821:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001004077 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerol kinase 2 (Gk2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:13695244:13697089:1 gene:ENSRNOG00000029397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079449 // GenBank // Rattus norvegicus glycerol kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94998 IMAGE:7115796), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:13661186:13742266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT018227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024742 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 11, NatA catalytic subunit (Naa11), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000002776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:13771578:13781613:1 gene:ENSRNOG00000002031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC078912 // GenBank // Rattus norvegicus ARD1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:7114829). // chr14 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// BC097350 // GenBank // Rattus norvegicus ARD1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114365 IMAGE:7462336), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0
NM_001012033 // RefSeq // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member III (Paqr3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:14051459:14068707:1 gene:ENSRNOG00000002035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079418 // GenBank // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member III, mRNA (cDNA clone MGC:94959 IMAGE:7113653), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member III (Paqr3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000042420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:14051574:14066219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108355 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 6-like (Cnot6l), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:15000864:15087397:1 gene:ENSRNOG00000002075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:15000889:15144636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006227033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 12-like (LOC100912233), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000051054 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:15637417:15639974:-1 gene:ENSRNOG00000048778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:15636193:15643201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 83 // 14 // 15 // 0
NM_001105998 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin I (Ccni), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16267528:16290318:1 gene:ENSRNOG00000002125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ223715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA89YC15 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16271431:16289264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT018238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
XM_001070624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sosondowah ankyrin repeat domain family member B (Sowahb), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_223228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sosondowah ankyrin repeat domain family member B (Sowahb), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16417565:16419868:1 gene:ENSRNOG00000002202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16417565:16419868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_340175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555766 (LOC102555766), ncRNA. // chr14 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0
XM_006221687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 158 (Ccdc158), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006221688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 158 (Ccdc158), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006250752 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 158 (Ccdc158), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000003009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16838813:16887877:1 gene:ENSRNOG00000002204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000067471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16838813:16852206:1 gene:ENSRNOG00000002204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16836826:16887441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0
NM_054001 // RefSeq // Rattus norvegicus scavenger receptor class B, member 2 (Scarb2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000003052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16980270:17031712:1 gene:ENSRNOG00000002225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC061853 // GenBank // Rattus norvegicus scavenger receptor class B, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:72341 IMAGE:5621697), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M68965 // GenBank // Rat lysosomal membrane protein (LIMPII) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16998297:17057266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_017361 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 54 (Nup54), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17039623:17057923:1 gene:ENSRNOG00000002247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078858 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin 54, mRNA (cDNA clone MGC:93519 IMAGE:7134682), complete cds. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U63840 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin p54 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16998297:17057266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT018252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_182952 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 11 (Cxcl11), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17111519:17114366:1 gene:ENSRNOG00000022298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF537209 // GenBank // Rattus norvegicus SCYB11 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY340181 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-inducible T-cell a chemoattractant I-TAC mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC168725 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 11, mRNA (cDNA clone MGC:188799 IMAGE:6919932), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT018254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17111588:17121335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT018255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_139089 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 10 (Cxcl10), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17126851:17129068:1 gene:ENSRNOG00000022256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058444 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 10, mRNA (cDNA clone MGC:72680 IMAGE:6918440), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225221 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YL10 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233884 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YP22 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ234688 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YA15 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U22520 // GenBank // Rattus norvegicus interferon inducible protein 10 (IP-10) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17126957:17190594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_145672 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 9 (Cxcl9), mRNA. // chr14 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17145006:17150876:1 gene:ENSRNOG00000022242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF462610 // GenBank // Rattus norvegicus monokine-like protein mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AF537208 // GenBank // Rattus norvegicus monokine induced by gamma interferon (Mig) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC087594 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 9, mRNA (cDNA clone MGC:105312 IMAGE:7310193), complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// FQ224849 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YN08 mRNA sequence. // chr14 // 79 // 97 // 22 // 28 // 0 /// NONRATT018257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17126957:17190594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001006958 // RefSeq // Rattus norvegicus SDA1 domain containing 1 (Sdad1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006250722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SDA1 domain containing 1 (Sdad1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000030222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17163928:17190707:1 gene:ENSRNOG00000022229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC083620 // GenBank // Rattus norvegicus SDA1 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94390 IMAGE:7133993), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000027107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17126957:17190594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001010967 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acylethanolamine acid amidase (Naaa), mRNA. // chr14 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000003102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17199739:17218990:1 gene:ENSRNOG00000002273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB162193 // GenBank // Rattus norvegicus NAAA mRNA for N-acylethanolamine-hydrolyzing acid amidase, complete cds. // chr14 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC105771 // GenBank // Rattus norvegicus N-acylethanolamine acid amidase, mRNA (cDNA clone MGC:124515 IMAGE:7930474), complete cds. // chr14 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT018259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17199756:17253569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_001107210 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, EF hand calcium-binding domain 2 (Ppef2), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006250743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase, EF hand calcium-binding domain 2 (Ppef2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006250744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase, EF hand calcium-binding domain 2 (Ppef2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17220015:17254101:1 gene:ENSRNOG00000002282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17199756:17253569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT018260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001013989 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase activating protein (SH3 domain) binding protein 2 (G3bp2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTPase activating protein (SH3 domain) binding protein 2 (G3bp2), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000003346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17409459:17438170:1 gene:ENSRNOG00000002433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079225 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase activating protein (SH3 domain) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94299 IMAGE:7132309), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212261 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA63YA08 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17392358:17438034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NONRATT018264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001012035 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 2 (CDC2-related kinase) (Cdkl2), mRNA. // chr14 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// XM_006250738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 2 (CDC2-related kinase) (Cdkl2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000046771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17448776:17480554:1 gene:ENSRNOG00000002506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000050038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17448776:17471445:1 gene:ENSRNOG00000002506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// AY383681 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00026 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// BC083590 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase-like 2 (CDC2-related kinase), mRNA (cDNA clone MGC:94313 IMAGE:7132550), complete cds. // chr14 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000029609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17451820:17480554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT018267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT018266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 18 // 47 // 1 /// NONRATT018268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 18 // 47 // 1
NM_001007618 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger and CHY zinc finger domain containing 1, E3 ubiquitin protein ligase (Rchy1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000003470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17533357:17548693:1 gene:ENSRNOG00000002546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC083739 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger and CHY zinc finger domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94651 IMAGE:7191744), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC105864 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7461692, containing frame-shift errors. // chr14 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17533749:17548199:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT018269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT018270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 91 // 91 // 21 // 23 // 1
NM_022256 // RefSeq // Rattus norvegicus betacellulin (Btc), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18142884:18181817:1 gene:ENSRNOG00000002728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB028862 // GenBank // Rattus norvegicus BTC mRNA for betacellulin, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18161831:18180244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000034281 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:18696479:18697744:1 gene:ENSRNOG00000028678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0
NM_001025671 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 6 (Rassf6), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 6 (Rassf6), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006250748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 6 (Rassf6), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18902157:18932580:1 gene:ENSRNOG00000002866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC097375 // GenBank // Rattus norvegicus Ras association (RalGDS/AF-6) domain family member 6, mRNA (cDNA clone MGC:114410 IMAGE:7444629), complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18902202:18934177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NM_001105999 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 17 (Ankrd17), mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:19224896:19337844:1 gene:ENSRNOG00000002940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// FQ235158 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YD23 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:19250217:19335770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT018279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// NONRATT018278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_001106000 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly protein 18 (Cox18), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:19341084:19352707:1 gene:ENSRNOG00000003052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:19341149:19352430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001107212 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1, motif 3 (Adamts3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:19773136:19977447:1 gene:ENSRNOG00000027463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:19772698:19817534:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT018287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107212 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1, motif 3 (Adamts3), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000060465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:19773136:19977447:1 gene:ENSRNOG00000027463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000054391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:19943981:19977094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
ENSRNOT00000049368 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:20308979:20309361:1 gene:ENSRNOG00000032425 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000054394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:20278564:20309361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_001100890 // RefSeq // Rattus norvegicus G-rich RNA sequence binding factor 1 (Grsf1), mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G-rich RNA sequence binding factor 1 (Grsf1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G-rich RNA sequence binding factor 1 (Grsf1), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:20949817:20966234:1 gene:ENSRNOG00000003392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:20949835:20965344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT018295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
XM_001073485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase 3-like (RGD1561381), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_573571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase 3-like (RGD1561381), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000004798 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:21073667:21074125:1 gene:ENSRNOG00000003606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT018298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000004866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21087060:21093606:1 gene:ENSRNOG00000003666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC097960 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin joining chain, mRNA (cDNA clone IMAGE:7384980). // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT018300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000040290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21073667:21101442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000054785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21641139:21650618:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NM_017120 // RefSeq // Rattus norvegicus casein beta (Csn2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21887084:21894554:1 gene:ENSRNOG00000039326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21889037:21927592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001007718 // RefSeq // Rattus norvegicus estrogen sulfotransferase (ste2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21986910:22004134:1 gene:ENSRNOG00000001957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088157 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen sulfotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:108739 IMAGE:7323209), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_012883 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family 1E, estrogen-preferring, member 1 (Sult1e1), mRNA. // chr14 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// M86758 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr14 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// U50204 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen sulfotransferase (Ste1) mRNA, complete cds. // chr14 // 67 // 78 // 14 // 21 // 0 /// U50205 // GenBank // Rattus norvegicus estrogen sulfotransferase (Ste2) mRNA, complete cds. // chr14 // 71 // 78 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21988275:22003864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT018307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSRNOT00000002704 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:22107068:22131223:1 gene:ENSRNOG00000001973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000041514 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:22107068:22131223:1 gene:ENSRNOG00000001973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NM_022228 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A1 (Ugt2a1), mRNA. // chr14 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000022289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22125642:22149655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT018310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 88 // 81 // 22 // 25 // 0
NM_021769 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family 1D, member 1 (Sult1d1), mRNA. // chr14 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22022302:22040897:1 gene:ENSRNOG00000001960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22022302:22040897:1 gene:ENSRNOG00000001960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U32372 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine-ester sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr14 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NONRATT018308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22022313:22070281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
NM_022513 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family, cytosolic, 1B, member 1 (Sult1b1), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22057243:22070527:1 gene:ENSRNOG00000001967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// D89375 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ST1B1, complete cds. // chr14 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// FQ209579 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YL20 mRNA sequence. // chr14 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// U38419 // GenBank // Rattus norvegicus dopa/tyrosine sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22022313:22070281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001135869 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide A3 (Ugt2a3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22165755:22351508:1 gene:ENSRNOG00000001975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22165755:22254436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_031533 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP glycosyltransferase 2 family, polypeptide B (Ugt2b), mRNA. // chrU // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000052369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22236291:22344431:1 gene:ENSRNOG00000046540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 88 // 94 // 14 // 16 // 0 /// BC089792 // GenBank // Rattus norvegicus UDP glycosyltransferase 2 family, polypeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:108656 IMAGE:7370057), complete cds. // chrU // 86 // 82 // 12 // 14 // 0 /// DQ351215 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN UDP glycosyltransferase 2 family polypeptide B (Ugt2b) mRNA, complete cds. // chrU // 88 // 94 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT018310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT018312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT018314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22286519:22387989:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
ENSRNOT00000063915 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:22236566:22256033:1 gene:ENSRNOG00000042588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT018310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22165755:22254436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_001007264 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-glucuronosyltransferase 2 family, member 37 (Ugt2b37), mRNA. // chr14 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// ENSRNOT00000047655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22418687:22435535:1 gene:ENSRNOG00000033139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1 /// M33746 // GenBank // Rat UDP glucuronosyltransferase-5 (UDPGTr-5) mRNA, complete cds. // chr14 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_001004271 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B15 (Ugt2b15), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B15 (Ugt2b15), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22455325:22493180:1 gene:ENSRNOG00000001980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078782 // GenBank // Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B36, mRNA (cDNA clone MGC:93327 IMAGE:7107952), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U06273 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley UDP-glucuronosyltransferase (UGT2B12) mRNA, complete cds. // chr14 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// U06274 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley UDP-glucuronosyltransferase (UGT2B12) kidney variant mRNA, complete cds. // chr14 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22455346:22479822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_173323 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B7 (Ugt2b7), mRNA. // chr14 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// U27518 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-glucuronosyltransferase mRNA, complete cds. // chr14 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22499000:22527820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT018320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 80 // 95 // 16 // 20 // 0
NM_173295 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B1 (Ugt2b1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000002724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22625222:22636971:1 gene:ENSRNOG00000001990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// M13506 // GenBank // Rat liver UDP-glucuronosyltransferase, phenobarbital-inducible form mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22625193:22687787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT018322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0
NM_001191676 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (Ugt2b10), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000002728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22705080:22724392:1 gene:ENSRNOG00000029007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006250803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP glucuronosyltransferase 2 family, polypeptide B10 (Ugt2b10), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// GENSCAN00000046498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22705080:22722321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_006250809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-glucuronosyltransferase 2B31-like (RGD1559459), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000065079 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:22834704:22850105:1 gene:ENSRNOG00000042714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000046489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22834704:22850105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006221706 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 11e (Tmprss11e), partial mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 11e (Tmprss11e), partial mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036948 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:22986982:23008535:1 gene:ENSRNOG00000022255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22979658:23008535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0
NM_001004020 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 11b (Tmprss11b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000002743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:23940743:23960116:-1 gene:ENSRNOG00000002002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23940743:23960116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_006250816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 11f (Tmprss11f), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002745 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:23817779:23854617:-1 gene:ENSRNOG00000002005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23811249:23834320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001008554 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 11G (Tmprss11g), mRNA. // chr14 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000042727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:23058672:23097346:1 gene:ENSRNOG00000029964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000060109 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:23058672:23097346:1 gene:ENSRNOG00000029964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23081389:23095969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT018328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001033652 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 11d (Tmprss11d), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// NM_022630 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 11d (Tmprss11d), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 96 // 64 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:23218327:23289172:1 gene:ENSRNOG00000002006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AF198087 // GenBank // Rattus norvegicus adrenal secretory serine protease precursor, mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 64 // 26 // 27 // 0 /// AF453776 // GenBank // Rattus norvegicus airway trypsin-like protease mRNA, complete cds. // chr14 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// NONRATT018329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000037347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23123897:23289009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// NONRATT018330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1
NM_001003979 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 11c (Tmprss11c), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:23301899:23365783:1 gene:ENSRNOG00000033910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23301899:23329768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT018332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23338574:23428950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_031038 // RefSeq // Rattus norvegicus gonadotropin releasing hormone receptor (Gnrhr), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:23384861:23402815:1 gene:ENSRNOG00000002011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L07646 // GenBank // Rattus norvegicus gonadotropin-releasing hormone receptor mRNA, complete cds. // chr14 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// L25053 // GenBank // Rattus norvegicus Gonadotropin releasing hormone receptor (GnRH-R) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U00935 // GenBank // Rattus norvegicus gonadotropin releasing hormone receptor mRNA, complete cds. // chr14 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23338574:23428950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001107213 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 6 (Uba6), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000037509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:23412097:23475036:1 gene:ENSRNOG00000021931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23431338:23471689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT018334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001004098 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein C (Cenpc), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006250815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein C (Cenpc), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:23515343:23571971:1 gene:ENSRNOG00000021776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY693788 // GenBank // Rattus norvegicus clone DRNAAIB08 CENP-C mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000024184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23515356:23582451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108860 // RefSeq // Rattus norvegicus trans-2,3-enoyl-CoA reductase-like (Tecrl), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000002621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:26494055:26567265:1 gene:ENSRNOG00000001912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000053761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:26494251:26596229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT018343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENSRNOT00000054495 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:27898204:27898309:1 gene:ENSRNOG00000036377 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001013048 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 7 (Igfbp7), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:32803851:32863713:1 gene:ENSRNOG00000002050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086582 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:105555 IMAGE:7307584), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:32855624:32863476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT018348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001006959 // RefSeq // Rattus norvegicus nitric oxide associated 1 (Noa1), mRNA. // chr14 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:32901625:32918107:1 gene:ENSRNOG00000002055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC083902 // GenBank // Rattus norvegicus MMR_HSR1 domain containing protein RGD1359460, mRNA (cDNA clone MGC:95260 IMAGE:7133605), complete cds. // chr14 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:32901703:32917922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT018350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
GENSCAN00000011920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:32945230:32951892:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001008870 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 2 (acrosin-trypsin inhibitor) (Spink2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33691457:33697965:1 gene:ENSRNOG00000031710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33038333:33044592:1 gene:ENSRNOG00000047065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33691457:33734767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_057198 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase (Ppat), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006250851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase (Ppat), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33371454:33405832:1 gene:ENSRNOG00000002128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC086999 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoribosyl pyrophosphate amidotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93251 IMAGE:7189259), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// D10853 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for amidophosphoribosyltransferase, complete cds. // chr14 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33390508:33398912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33399181:33403910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT018357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT018358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
XM_006250862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase (Aasdh), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002907 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:33415303:33438093:1 gene:ENSRNOG00000002137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33408089:33439442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000002935 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:34041127:34042683:1 gene:ENSRNOG00000002156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34015389:34042261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_022239 // RefSeq // Rattus norvegicus neuromedin U (Nmu), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34140350:34167675:1 gene:ENSRNOG00000002164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// M94555 // GenBank // Rat neuromedin U mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT018367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34143335:34161490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_001076368 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosducin-like 2 (Pdcl2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_573585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosducin-like 2 (Pdcl2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34176028:34190891:1 gene:ENSRNOG00000002169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34170503:34190891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001289832 // RefSeq // Rattus norvegicus clock circadian regulator (Clock), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 93 // 95 // 38 // 41 // 0 /// NM_021856 // RefSeq // Rattus norvegicus clock circadian regulator (Clock), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000002976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34242961:34282766:1 gene:ENSRNOG00000002175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000002981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34242961:34282766:1 gene:ENSRNOG00000002175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// AB019258 // GenBank // Rattus norvegicus clock mRNA, complete cds. // chr14 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// AB019259 // GenBank // Rattus norvegicus clock mRNA for CLOCK-S, splice variant, complete cds. // chr14 // 93 // 95 // 38 // 41 // 0 /// GENSCAN00000025792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34204131:34285033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000025804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34318573:34330619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0
NM_001289832 // RefSeq // Rattus norvegicus clock circadian regulator (Clock), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_021856 // RefSeq // Rattus norvegicus clock circadian regulator (Clock), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105736 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich hydrophobic domain 2 (Chic2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:35512033:35546381:1 gene:ENSRNOG00000002267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:35495214:35545966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108358 // RefSeq // Rattus norvegicus ligand of numb-protein X 1, E3 ubiquitin protein ligase (Lnx1), mRNA. // chr14 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:35873425:35976075:1 gene:ENSRNOG00000002272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// EU219404 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI ligand of numb-protein X 1 (Lnx1) mRNA, complete cds. // chr14 // 90 // 86 // 27 // 30 // 0 /// EU219405 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN ligand of numb-protein X 1 (Lnx1) mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// EU219406 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI ligand of numb-protein X 1 (Lnx1) mRNA, complete cds. // chr14 // 90 // 86 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:35944276:35976568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT018377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1
NM_001017499 // RefSeq // Rattus norvegicus sec1 family domain containing 2 (Scfd2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000038506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:36042335:36371465:1 gene:ENSRNOG00000026828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC085889 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Sec1 family domain containing protein 2 (Syntaxin binding protein 1-like 1) (Neuronal Sec1), mRNA (cDNA clone MGC:94680 IMAGE:7192440), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36324124:36371252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36042402:36099819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT018379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT018380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT018381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001191596 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 46 (Usp46), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 46 (Usp46), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:36514023:36582331:1 gene:ENSRNOG00000002106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GU455413 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific protease 46 (Usp46) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 46 (Usp46), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000053705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36544232:36602658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT018384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_002728110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin B-like (LOC100363494), mRNA. // chr14 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// XM_003752719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin B-like (LOC100363494), mRNA. // chr14 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36690985:36691218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_001191068 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcoglycan, beta (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgcb), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:36936116:36951529:1 gene:ENSRNOG00000002135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36936116:36948797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001008763 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 66 (Lrrc66), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 66 (Lrrc66), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:36954231:36976506:1 gene:ENSRNOG00000026585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36954231:36976506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001271181 // RefSeq // Rattus norvegicus OCIA domain containing 2 (Ociad2), mRNA. // chr14 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000002991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37254040:37263149:1 gene:ENSRNOG00000002196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT018390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37226598:37311047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT018392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
XM_006250927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FRY-like (Fryl), transcript variant X12, mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 59 // 59 // 0 /// ENSRNOT00000003061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37444220:37566066:1 gene:ENSRNOG00000002248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 59 // 59 // 0 /// ENSRNOT00000036206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37424298:37491044:1 gene:ENSRNOG00000002248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 34 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37399029:37566066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 56 // 56 // 0 /// NONRATT018400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 23 // 23 // 14 // 62 // 1
NM_053432 // RefSeq // Rattus norvegicus tec protein tyrosine kinase (Tec), mRNA. // chr14 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000003125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37729490:37838224:1 gene:ENSRNOG00000002278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF285881 // GenBank // Rattus norvegicus TEC kinase mRNA, partial cds. // chr14 // 83 // 81 // 24 // 29 // 0 /// BC166730 // GenBank // Rattus norvegicus tec protein tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:188447 IMAGE:7934247), complete cds. // chr14 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// NONRATT018404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37799645:37882201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
NM_001024255 // RefSeq // Rattus norvegicus TXK tyrosine kinase (Txk), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TXK tyrosine kinase (Txk), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37840611:37896117:1 gene:ENSRNOG00000025925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC095847 // GenBank // Rattus norvegicus TXK tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:112756 IMAGE:7388955), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37799645:37882201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_053497 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclic nucleotide gated channel alpha 1 (Cnga1), mRNA. // chr14 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37966491:37981839:1 gene:ENSRNOG00000004778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U93851 // GenBank // Rattus norvegicus rod-type cyclic nucleotide-gated cation channel mRNA, complete cds. // chr14 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37956050:37981742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 91 // 91 // 20 // 22 // 1 /// GENSCAN00000012677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37983486:38014692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38016271:38034535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38016271:38034535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38016271:38034535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38016271:38034535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38016271:38034535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38016271:38034535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170438 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding-like 1 (Nfxl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38003888:38044774:1 gene:ENSRNOG00000002296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38040137:38060977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_182473 // RefSeq // Rattus norvegicus corin, serine peptidase (Corin), mRNA. // chr14 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000064128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38058862:38284566:1 gene:ENSRNOG00000002302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AY251285 // GenBank // Rattus norvegicus corin mRNA, complete cds. // chr14 // 95 // 100 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000012649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38239486:38255557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT018414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0
GENSCAN00000003493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38391300:38449578:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001106004 // RefSeq // Rattus norvegicus COMM domain containing 8 (Commd8), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38422179:38432351:1 gene:ENSRNOG00000002320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC159414 // GenBank // Rattus norvegicus COMM domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:188697 IMAGE:8368074), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212906 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YL17 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38391300:38449578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_080587 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 4 (Gabra4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38966016:39040596:1 gene:ENSRNOG00000002336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38970685:39000262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_002724962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIb2 (Cox7b2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002728101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIb2 (Cox7b2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIb2 (Cox7b2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIb2 (Cox7b2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135779 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, subunit alpha 2 (Gabra2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 2 (Gabra2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:39473412:39609387:1 gene:ENSRNOG00000002349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:39473412:39609387:1 gene:ENSRNOG00000002349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:39507746:39609387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_080586 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 1 (Gabrg1), mRNA. // chr14 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:39777522:39858765:1 gene:ENSRNOG00000002360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:39798549:39868384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106005 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosamine-6-phosphate deaminase 2 (Gnpda2), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:62731015:62749014:-1 gene:ENSRNOG00000002177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC168866 // GenBank // Rattus norvegicus glucosamine-6-phosphate deaminase 2, mRNA (cDNA clone MGC:189113 IMAGE:7460205), complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:62731875:62805890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT019518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT019521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT019517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108861 // RefSeq // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 7 (Yipf7), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:62670745:62698718:-1 gene:ENSRNOG00000002224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:62671100:62697266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001100172 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 8 (Kctd8), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:62015922:62261874:-1 gene:ENSRNOG00000026472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF043041 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 8 (Kctd8) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:62260840:62261874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001047903 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Ac1591 (LOC360933), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:41185952:41231346:1 gene:ENSRNOG00000029734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:41190866:41231343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT018428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006221758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, aminophospholipid transporter (APLT), class I, type 8A, member 1 (Atp8a1), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006250978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, aminophospholipid transporter (APLT), class I, type 8A, member 1 (Atp8a1), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000041793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:41805133:42002866:1 gene:ENSRNOG00000034200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000044017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:41805133:42002866:1 gene:ENSRNOG00000034200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000065214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:41805133:42002866:1 gene:ENSRNOG00000034200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:41887433:41987167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT018433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
GENSCAN00000036990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:42073699:42094290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000003053 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:42079628:42080633:1 gene:ENSRNOG00000002243 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
XM_006221735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BEN domain containing 4 (Bend4), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250982 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BEN domain containing 4 (Bend4), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043639 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:42198080:42227219:1 gene:ENSRNOG00000032019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:42197300:42227219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003136 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:42510775:42513503:1 gene:ENSRNOG00000002299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071497 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:42510775:42512178:1 gene:ENSRNOG00000002299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000007723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:42510835:42555311:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006221760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired-like homeobox 2b (Phox2b), mRNA. // chr14 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006221737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 2 (Apbb2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 2 (Apbb2), transcript variant X7, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 2 (Apbb2), transcript variant X8, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 2 (Apbb2), transcript variant X9, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:43166629:43317056:1 gene:ENSRNOG00000025509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:43166629:43317056:1 gene:ENSRNOG00000025509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:43166629:43317056:1 gene:ENSRNOG00000025509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211919 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YH04 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005882 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 47 (Rbm47), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 47 (Rbm47), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 47 (Rbm47), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 47 (Rbm47), transcript variant X7, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006250957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 47 (Rbm47), transcript variant X9, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:43597574:43625113:1 gene:ENSRNOG00000002408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:43565106:43624690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001083624 // RefSeq // Rattus norvegicus PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog A (S. cerevisiae) (Pds5a), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44003226:44099515:1 gene:ENSRNOG00000002541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// EF460313 // GenBank // Rattus norvegicus SCC-112 protein mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44046998:44099612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001037792 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 14 (Smim14), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000003552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44233124:44276792:1 gene:ENSRNOG00000002553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC100271 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110003E01, mRNA (cDNA clone MGC:116420 IMAGE:7445571), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ229716 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YP12 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ229847 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YH20 mRNA sequence. // chr14 // 93 // 74 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT018458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT018459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0
NM_031325 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-glucose 6-dehydrogenase (Ugdh), mRNA. // chr14 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000003691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44299226:44322226:1 gene:ENSRNOG00000002643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB013732 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for UDP-glucose dehydrogeanse, complete cds. // chr14 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000004784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44307835:44321499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
GENSCAN00000011440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44374646:44387809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_053547 // RefSeq // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 1 (Rfc1), mRNA. // chr14 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44397927:44516383:1 gene:ENSRNOG00000002855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF059678 // GenBank // Rattus norvegicus VIP-receptor-gene repressor protein mRNA, complete cds. // chr14 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44441702:44515139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000011468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44604041:44604945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
NM_001025138 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 156 (Tmem156), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 156 (Tmem156), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44702507:44731478:1 gene:ENSRNOG00000026518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC091217 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 156, mRNA (cDNA clone MGC:108944 IMAGE:7384360), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44702536:44732877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT018478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_207604 // RefSeq // Rattus norvegicus toll-like receptor 6 (Tlr6), mRNA. // chr14 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000002933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44848509:44850998:1 gene:ENSRNOG00000002161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC062390 // GenBank // Rattus norvegicus toll-like receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:72634 IMAGE:5621142), complete cds. // chr14 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44819256:44850962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT018480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001146035 // RefSeq // Rattus norvegicus toll-like receptor 10 (Tlr10), mRNA. // chr14 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XM_006251001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-like receptor 10 (Tlr10), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// XM_006251003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus toll-like receptor 10 (Tlr10), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000059124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44888924:44891359:1 gene:ENSRNOG00000038722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// FJ755908 // GenBank // Rattus norvegicus toll-like receptor 10 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44884460:44917051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
XM_223426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat and WD repeat-containing protein KIAA1239-like (RGD1563065), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002978 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:45938969:46347907:-1 gene:ENSRNOG00000002190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:45938969:45961686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
XM_223426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat and WD repeat-containing protein KIAA1239-like (RGD1563065), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002978 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:45938969:46347907:-1 gene:ENSRNOG00000002190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:45938969:45961686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000002982 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:45855972:45858411:-1 gene:ENSRNOG00000002191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC079124 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610040J01, mRNA (cDNA clone MGC:94129 IMAGE:7126862), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:45856749:45857658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT019471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001024765 // RefSeq // Rattus norvegicus neighbor of Brca1 gene 1 (Nbr1), mRNA. // chr14 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// XM_006251010 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus next to BRCA1 gene 1 protein-like (LOC498369), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89257664:89281799:1 gene:ENSRNOG00000020730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC095903 // GenBank // Rattus norvegicus neighbor of Brca1 gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:93700 IMAGE:7096697), complete cds. // chr14 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// FQ211883 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YI03 mRNA sequence. // chr14 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:46460910:46464823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89263293:89280603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// NONRATT009858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT009859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0
ENSRNOT00000031638 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:47893636:47895706:1 gene:ENSRNOG00000026155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001271306 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 82 (Wdr82), mRNA. // chr14 // 53 // 100 // 8 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000002988 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:47906674:47907345:1 gene:ENSRNOG00000002198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000030861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:114230492:114247514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 53 // 100 // 8 // 15 // 0 /// NONRATT018490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
XM_001067807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-9 homolog (C. elegans) (Lin9), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006250418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-9 homolog (C. elegans) (Lin9), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000034265 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:103927066:103971592:1 gene:ENSRNOG00000023304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074148 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:103927066:103969791:1 gene:ENSRNOG00000023304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000031524 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:48440068:48441536:-1 gene:ENSRNOG00000026134 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:103942395:103969791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:48440068:48441443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0
XM_006244402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC501396 (LOC501396), transcript variant X2, mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061476 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:11415876:11555188:1 gene:ENSRNOG00000049194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 77 // 92 // 17 // 22 // 0 /// XM_006227129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC100912852), mRNA. // chr9 // 36 // 92 // 8 // 22 // 0 /// XR_359685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909601 (LOC100909601), transcript variant X3, ncRNA. // chr9 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000022806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:11415887:11422511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT056088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT056080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 61 // 96 // 14 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:7404083:7462103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// BC091362 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7318973. // chr9 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_001107216 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 2 (Arap2), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:48906157:49090667:1 gene:ENSRNOG00000002209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:48864335:49088845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
XM_003751364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin-related protein 2-like (LOC301861), mRNA. // chr14 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// XM_003752732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin-related protein 2-like (LOC301861), mRNA. // chr14 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000020237 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:49676453:49678629:1 gene:ENSRNOG00000015015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000000972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:49676453:49679668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
XM_006221766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sentrin-specific protease 2-like (LOC289647), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_022503 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIIa polypeptide 2 (Cox7a2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000038497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:52813655:52814107:1 gene:ENSRNOG00000027791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000066084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:86753412:86757509:-1 gene:ENSRNOG00000042903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC166880 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIIa 2, mRNA (cDNA clone MGC:188812 IMAGE:6888806), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// FQ228537 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YD11 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// FQ229029 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA4YG22 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// FQ230547 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA90YH12 mRNA sequence. // chr14 // 76 // 100 // 28 // 37 // 0 /// GENSCAN00000017005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:52813694:52813945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT055474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// NONRATT055475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000003022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:218078619:218078867:-1 gene:ENSRNOG00000002223 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 32 // 100 // 12 // 37 // 0 /// GENSCAN00000005306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218060596:218111362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
GENSCAN00000013440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:57091870:57126184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
XM_006221767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L23a-like (RGD1562755), partial mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006251025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L23a-like (RGD1562755), partial mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000051559 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:59010219:59010683:1 gene:ENSRNOG00000028963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:59010219:59016067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000052489 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:59598787:59598891:1 gene:ENSRNOG00000034366 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000052636 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:60116790:60116894:1 gene:ENSRNOG00000034513 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sel-1 suppressor of lin-12-like 3 (C. elegans) (Sel1l3), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006251033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sel-1 suppressor of lin-12-like 3 (C. elegans) (Sel1l3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_341223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sel-1 suppressor of lin-12-like 3 (C. elegans) (Sel1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000006610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:60243671:60348547:1 gene:ENSRNOG00000004932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000050080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:60318802:60353454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000006726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:60243671:60316163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 54 // 54 // 25 // 46 // 1 /// NONRATT018505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1 /// NONRATT018507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001107219 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat LGI family, member 2 (Lgi2), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:60876468:60903945:1 gene:ENSRNOG00000003887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC168885 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeat LGI family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:189141 IMAGE:7121391), complete cds. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:60876495:60903848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006221768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 149 (Ccdc149), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000034411 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:60971605:61064616:1 gene:ENSRNOG00000024454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:61032428:61064616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
XM_006221768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 149 (Ccdc149), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191597 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 15 (Dhx15), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003751372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15-like (LOC100910750), mRNA. // chr14 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// XM_006251031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box helicase 15 (Dhx15), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000005126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:61248771:61286905:1 gene:ENSRNOG00000003844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:61248939:61286454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:61760381:61788026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT018514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT018516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_031347 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator 1 alpha (Ppargc1a), mRNA. // chr14 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// XM_006251043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator 1 alpha (Ppargc1a), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:63195104:63286096:1 gene:ENSRNOG00000004473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AB025784 // GenBank // Rattus norvegicus PGC1 mRNA for PPAR gamma coactivator, complete cds. // chr14 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// AY237127 // GenBank // Rattus norvegicus PPAR gamma coactivator 1 mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:63241039:63296017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
FQ213484 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YI23 mRNA sequence. // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
AY310149 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1233 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:63496725:63558180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
XM_003752737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 125 (Gpr125), mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000005894 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:64778550:64831460:1 gene:ENSRNOG00000004279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000036646 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:64778673:64878260:1 gene:ENSRNOG00000004279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:64809700:64878260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT018532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1
NM_181365 // RefSeq // Rattus norvegicus Kv channel interacting protein 4 (Kcnip4), mRNA. // chr14 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:66629284:66779107:1 gene:ENSRNOG00000032350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AF345444 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel beta subunit KChIP4 mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AF345445 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel beta subunit KChIP4 variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AF453245 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley potassium channel interacting protein 4b long isoform mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr14 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006251048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kv channel interacting protein 4 (Kcnip4), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// XM_006251049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kv channel interacting protein 4 (Kcnip4), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT018534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:66605294:66780820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSRNOT00000005121 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:69895286:69909139:1 gene:ENSRNOG00000003787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000005146 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:69844168:69864638:1 gene:ENSRNOG00000003787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000058853 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:69844168:69903153:1 gene:ENSRNOG00000003787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072746 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:69844168:69906868:1 gene:ENSRNOG00000003787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_001058603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor corepressor-like (Lcorl), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XM_006221776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor corepressor-like (Lcorl), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XM_006251063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor corepressor-like (Lcorl), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XM_573620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor corepressor-like (Lcorl), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:69845795:69909139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000058847 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:69870518:69870926:1 gene:ENSRNOG00000038577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 73 // 54 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000016375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:69845795:69909139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_006221777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 184, member B (Fam184b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006251064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 184, member B (Fam184b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004923 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:70013085:70127477:1 gene:ENSRNOG00000003704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:70081109:70127508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:70056771:70075322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0
NM_022390 // RefSeq // Rattus norvegicus quinoid dihydropteridine reductase (Qdpr), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:70207853:70221468:1 gene:ENSRNOG00000003253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC072536 // GenBank // Rattus norvegicus quinoid dihydropteridine reductase, mRNA (cDNA clone MGC:91693 IMAGE:7103182), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ209462 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YI21 mRNA sequence. // chr14 // 88 // 57 // 14 // 16 // 0 /// FQ213843 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YF05 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// J03481 // GenBank // Rat dihydropteridine reductase mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT018541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:70207916:70278542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001106009 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain binding 2 (Ldb2), mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000058803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:70817550:71145367:1 gene:ENSRNOG00000003205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC168881 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domain binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:189135 IMAGE:8363537), complete cds. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:71074313:71121422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006221836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane anterior posterior transformation 1 (Tapt1), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_223500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane anterior posterior transformation 1 (Tapt1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004274 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:71467973:71492220:1 gene:ENSRNOG00000003174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:71447782:71492220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT018549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT018550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001110137 // RefSeq // Rattus norvegicus prominin 1 (Prom1), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_021751 // RefSeq // Rattus norvegicus prominin 1 (Prom1), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:71563324:71668091:1 gene:ENSRNOG00000003098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF263368 // GenBank // Rattus norvegicus fudenine mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF386758 // GenBank // Rattus norvegicus prominin-1.s1 splice variant mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY262731 // GenBank // Rattus norvegicus prominin-1.s7 splice variant (Prom1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// DQ871262 // GenBank // Rattus norvegicus prominin 1 (Prom1) mRNA, partial cds. // chr14 // 80 // 50 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000045673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:71617394:71664854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT018551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_022603 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor binding protein 1 (Fgfbp1), mRNA. // chr14 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:71679816:71680896:1 gene:ENSRNOG00000003095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF142758 // GenBank // Rattus norvegicus growth factor binding protein-1 (FGF-BP1) mRNA, complete cds. // chr14 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:71679825:71680541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT018555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107222 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 5 (Fbxl5), mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251077 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 5 (Fbxl5), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:71880738:71918708:1 gene:ENSRNOG00000005261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:71880724:71918001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001109278 // RefSeq // Rattus norvegicus iron-sulfur cluster assembly 2 (Isca2), mRNA. // chr14 // 95 // 98 // 41 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000016089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:117058978:117060567:-1 gene:ENSRNOG00000012085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000006734 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:72287869:72288333:1 gene:ENSRNOG00000005077 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000008850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:72287869:72339697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 92 // 89 // 36 // 39 // 0 /// NONRATT048437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 91 // 100 // 40 // 44 // 0 /// NONRATT048436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 23 // 44 // 1
NM_022692 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB5A, member RAS oncogene family (Rab5a), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:72908161:72908809:1 gene:ENSRNOG00000005028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF072935 // GenBank // Rattus norvegicus small GTP-binding protein rab5 (RAB5) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC161848 // GenBank // Rattus norvegicus RAB5A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:187370 IMAGE:9025210), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC072495 // GenBank // Rattus norvegicus RAB5A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:7097094), complete cds. // chr14 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:72908162:72908809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_001060544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S11-like (RGD1565560), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_223504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S11-like (RGD1565560), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006659 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:72916569:72917045:1 gene:ENSRNOG00000005022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:72916569:72917045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_053978 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB28, member RAS oncogene family (Rab28), mRNA. // chr14 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:73894215:73970534:1 gene:ENSRNOG00000017074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC072512 // GenBank // Rattus norvegicus RAB28, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:91546 IMAGE:7104824), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// NONRATT018570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT018571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000008186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:73894357:73981504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_053391 // RefSeq // Rattus norvegicus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 1 (Hs3st1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:75872397:75873335:1 gene:ENSRNOG00000010598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF177430 // GenBank // Rattus norvegicus 3-O-sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:75872397:75873335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytokine-dependent hematopoietic cell linker (Clnk), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytokine-dependent hematopoietic cell linker (Clnk), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:76777572:76818093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000001521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:76737648:76766964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XM_006221792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 518B (Zfp518b), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006251103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 518B (Zfp518b), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000037291 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:76850725:76853958:1 gene:ENSRNOG00000028534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:76850896:76853958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NONRATT018581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001014135 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 1 (Wdr1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:76974171:77007900:1 gene:ENSRNOG00000028498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY986483 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat protein 1 (WDR1) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC085864 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:94596 IMAGE:7190485), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:76912252:77006921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT018583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT018584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001191551 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 9 (Slc2a9), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 9 (Slc2a9), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 9 (Slc2a9), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77061880:77174290:1 gene:ENSRNOG00000005302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77015894:77172544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001107223 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 49 (Zbtb49), mRNA. // chr14 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77303902:77325596:1 gene:ENSRNOG00000005633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77303574:77325248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_024128 // RefSeq // Rattus norvegicus neuron specific gene family member 1 (Nsg1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77362124:77383868:1 gene:ENSRNOG00000005700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC060538 // GenBank // Rattus norvegicus neuron specific gene family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72656 IMAGE:6921928), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77362566:77382891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT018593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031059 // RefSeq // Rattus norvegicus msh homeobox 1 (Msx1), mRNA. // chr14 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77690990:77694787:1 gene:ENSRNOG00000006876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D83036 // GenBank // Rattus norvegicus Msx-1 mRNA for Msx-1 protein, complete cds. // chr14 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT018594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77661479:77694034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001107224 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 32B (Stk32b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 32B (Stk32b), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000052006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77807749:78072471:1 gene:ENSRNOG00000031397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77970845:78071391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001107224 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 32B (Stk32b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 32B (Stk32b), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000052006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77807749:78072471:1 gene:ENSRNOG00000031397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77970845:78071391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001170439 // RefSeq // Rattus norvegicus Ellis van Creveld syndrome (Evc), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000010541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:78187671:78227302:1 gene:ENSRNOG00000007564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000028486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78187752:78228859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT018598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1
NM_031823 // RefSeq // Rattus norvegicus Wolfram syndrome 1 (wolframin) (Wfs1), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:78613738:78630689:1 gene:ENSRNOG00000005108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF136378 // GenBank // Rattus norvegicus WFS1 (Wfs1) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78565925:78630637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100766 // RefSeq // Rattus norvegicus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 4, cappuccino (Bloc1s4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:87207216:87208516:1 gene:ENSRNOG00000006207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091265 // GenBank // Rattus norvegicus cappuccino homolog (mouse), mRNA (cDNA clone IMAGE:7379240), partial cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213984 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YH19 mRNA sequence. // chr14 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:87207240:87207887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT018817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109388 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680039 (LOC680039), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680039 (LOC680039), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029191 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:78899825:78964642:1 gene:ENSRNOG00000027623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78900020:79080215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012152 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 14 (Tbc1d14), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// NM_001034021 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 14 (Tbc1d14), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// NM_001113365 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 14 (Tbc1d14), transcript variant 3, mRNA. // chr14 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000058414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:78978024:79077774:1 gene:ENSRNOG00000006400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// AB108668 // GenBank // Rattus norvegicus UR-NR#2 mRNA for Up-regulated in nephrectomized rat kidney #2, complete cds. // chr14 // 83 // 80 // 30 // 36 // 0 /// BC099760 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 14, mRNA (cDNA clone MGC:124676 IMAGE:7930485), complete cds. // chr14 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT018607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT018608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT018609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000054899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78900020:79080215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 73 // 73 // 33 // 45 // 1
NM_001170455 // RefSeq // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 2B (Tada2b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcriptional adaptor 2B (Tada2b), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000037061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79085067:79096335:1 gene:ENSRNOG00000027326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC169109 // GenBank // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 2 (ADA2 homolog, yeast)-beta, mRNA (cDNA clone MGC:189538 IMAGE:7315785), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79084839:79094037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107225 // RefSeq // Rattus norvegicus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 2 (Sorcs2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79176694:79547823:1 gene:ENSRNOG00000007033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79440111:79545877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107226 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1 (Sh3tc1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006251126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1 (Sh3tc1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000010784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79829771:79857492:1 gene:ENSRNOG00000007993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000041981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79833359:79864071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001271027 // RefSeq // Rattus norvegicus HtrA serine peptidase 3 (Htra3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79875571:79902664:1 gene:ENSRNOG00000008182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79875571:79893236:1 gene:ENSRNOG00000008182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000073624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79875571:79902664:1 gene:ENSRNOG00000008182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79875571:79912991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001130061 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 44 homolog (S. cerevisiae) (Trmt44), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006251144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 44 homolog (S. cerevisiae) (Trmt44), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79987434:80004327:1 gene:ENSRNOG00000008898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ212309 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA60YD16 mRNA sequence. // chr14 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79987414:80024055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_031766 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase Z (Cpz), mRNA. // chr14 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80028903:80052295:1 gene:ENSRNOG00000008947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF017637 // GenBank // Rattus norvegicus, PC12 cells, carboxypeptidase Z mRNA, complete cds. // chr14 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// AF017638 // GenBank // Rattus norvegicus, BRL3A cells, carboxypeptidase Z mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80028966:80077813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006251432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG20085-like (LOC100362142), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81456428:81576351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_001169113 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein associated protein 1 (Lrpap1), mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81600002:81613373:1 gene:ENSRNOG00000009313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// Z11994 // GenBank // R.norvegicus mRNA encoding 45kDa protein which binds to heymann nephritis antigen gp330. // chr14 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81600002:81611271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// Z11995 // GenBank // R.norvegicus mRNA encoding 45kDa protein which binds to heymann nephritis antigen gp330. // chr14 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT018645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
XM_006251401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (LOC102554167), mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000043609 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:81731904:81732362:1 gene:ENSRNOG00000030162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81714085:81732337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001106013 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP14 nucleolar protein (Nop14), mRNA. // chr14 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000066391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82027602:82048732:1 gene:ENSRNOG00000012147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82026765:82053316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT018646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT018647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONRATT018648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT018649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001191680 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 10 (Mfsd10), mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000017386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82050489:82053316:1 gene:ENSRNOG00000012534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT018650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82026765:82053316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT018651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT018652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001024771 // RefSeq // Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 2 (Tnip2), mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 2 (Tnip2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82175496:82192493:1 gene:ENSRNOG00000013805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC097956 // GenBank // Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:116079 IMAGE:7461734), complete cds. // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82175598:82203922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT018656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006251258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 28 (Zfyve28), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// XM_006251259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 28 (Zfyve28), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// NM_001107227 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 28 (Zfyve28), mRNA. // chr14 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000020154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82412194:82497078:1 gene:ENSRNOG00000014874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000052358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82451325:82499364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001108364 // RefSeq // Rattus norvegicus Max dimerization protein 4 (Mxd4), mRNA. // chr14 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82504737:82516133:1 gene:ENSRNOG00000015033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82504529:82515675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT018664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006221810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA polymerase nu-like (LOC102555079), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006251412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA polymerase nu-like (LOC102555079), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000029784 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:82544059:82721987:1 gene:ENSRNOG00000027929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000058067 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:82544065:82721987:1 gene:ENSRNOG00000027929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000058068 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:82544059:82721987:1 gene:ENSRNOG00000027929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 98 // 94 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000052354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82666028:82725982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// NONRATT018670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001109412 // RefSeq // Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex, subunit 3 (Haus3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82523103:82542098:1 gene:ENSRNOG00000015255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC162020 // GenBank // Rattus norvegicus similar to EEA1 (Early Endosome Antigen, Rab effector) homolog family member (eea-1), mRNA (cDNA clone MGC:187898 IMAGE:9098415), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82524160:82573796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001008339 // RefSeq // Rattus norvegicus negative elongation factor complex member A (Nelfa), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82778077:82802146:1 gene:ENSRNOG00000015474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC085948 // GenBank // Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 2 (human), mRNA (cDNA clone MGC:95174 IMAGE:7130899), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82778136:82801613:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT018674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001005884 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (Letm1), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006251260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (Letm1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82917692:82956467:1 gene:ENSRNOG00000016427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083642 // GenBank // Rattus norvegicus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94466 IMAGE:7134917), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82894550:82956327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001126274 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 129 (Tmem129), mRNA. // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000023259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83040119:83045463:1 gene:ENSRNOG00000017329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// BC099194 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7383643. // chr14 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// BC161857 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 129, mRNA (cDNA clone MGC:187389 IMAGE:9023916), complete cds. // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NM_001130988 // RefSeq // Rattus norvegicus stem-loop binding protein (Slbp), mRNA. // chr14 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// XM_006251380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stem-loop binding protein (Slbp), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000040229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83046301:83056019:1 gene:ENSRNOG00000037162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// BC167755 // GenBank // Rattus norvegicus stem-loop binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:187387 IMAGE:8363815), complete cds. // chr14 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000004741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83040196:83044287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83046343:83055233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT018683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_001107228 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member A (Fam53a), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member A (Fam53a), transcript variant X10, mRNA. // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XR_359624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member A (Fam53a), transcript variant X13, misc_RNA. // chr14 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000023904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83064832:83104049:1 gene:ENSRNOG00000017548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168895 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189159 IMAGE:7312953), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member A (Fam53a), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000004740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83085695:83103837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT018690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT018689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT018691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000032067 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:83143866:83144460:1 gene:ENSRNOG00000026827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 77 // 100 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83143899:83196206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// GENSCAN00000004762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83127847:83142722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001008319 // RefSeq // Rattus norvegicus macrophage erythroblast attacher (Maea), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83349565:83383727:-1 gene:ENSRNOG00000005397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC085770 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage erythroblast attacher, mRNA (cDNA clone MGC:93683 IMAGE:7189726), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83308393:83383694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1
NM_001134558 // RefSeq // Rattus norvegicus UV-stimulated scaffold protein A (Uvssa), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912062 (LOC100912062), partial mRNA. // chr14 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// XM_006251326 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UV-stimulated scaffold protein A (Uvssa), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83308371:83344207:-1 gene:ENSRNOG00000005122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83308393:83383694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80206006:80250198:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_002724999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial-like (LOC100361879), mRNA. // chr14 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_002728131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial-like (LOC100361879), mRNA. // chr14 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071297 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:83907107:83907265:1 gene:ENSRNOG00000045749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NM_139099 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, epsilon subunit (Atp5e), mRNA. // chr14 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:178609114:178612055:-1 gene:ENSRNOG00000049912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// AF010323 // GenBank // Rattus norvegicus F1-ATPase epsilon subunit mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr14 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// BC058133 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, epsilon subunit, mRNA (cDNA clone MGC:72679 IMAGE:6887013), complete cds. // chr14 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0 /// FQ214935 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YH02 mRNA sequence. // chr14 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// NONRATT018700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224815 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA53YI10 mRNA sequence. // chr14 // 46 // 96 // 11 // 24 // 0
XM_006221820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072368 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:83923291:83976596:1 gene:ENSRNOG00000048891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83913546:83976596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XM_006221820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006251416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 14-like (Prr14l), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072368 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:83923291:83976596:1 gene:ENSRNOG00000048891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83913546:83976596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
XM_001061408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylserine decarboxylase (Pisd), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_002725000 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylserine decarboxylase (Pisd), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylserine decarboxylase (Pisd), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylserine decarboxylase (Pisd), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83999012:84034630:1 gene:ENSRNOG00000018319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83985730:84033748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT018707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT018708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT018709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT018711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT018706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT018710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001107230 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E nuclear import factor 1 (Eif4enif1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006251290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E nuclear import factor 1 (Eif4enif1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000024993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84100708:84143194:1 gene:ENSRNOG00000018475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// FQ226579 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA23YP18 mRNA sequence. // chr14 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// GENSCAN00000018556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84115922:84142697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 59 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT018713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001107231 // RefSeq // Rattus norvegicus POZ (BTB) and AT hook containing zinc finger 1 (Patz1), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NM_001277214 // RefSeq // Rattus norvegicus POZ (BTB) and AT hook containing zinc finger 1 (Patz1), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NM_001277215 // RefSeq // Rattus norvegicus POZ (BTB) and AT hook containing zinc finger 1 (Patz1), transcript variant 3, mRNA. // chr14 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// NR_102353 // RefSeq // Rattus norvegicus POZ (BTB) and AT hook containing zinc finger 1 (Patz1), transcript variant 4, non-coding RNA. // chr14 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// NR_102354 // RefSeq // Rattus norvegicus POZ (BTB) and AT hook containing zinc finger 1 (Patz1), transcript variant 5, non-coding RNA. // chr14 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000025378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84198496:84229550:1 gene:ENSRNOG00000018709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84198776:84216040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT018716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT018717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT018720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001017453 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase interacting protein 1 (Pik3ip1), mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84248813:84260745:1 gene:ENSRNOG00000018859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC092208 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105603 IMAGE:7314987), complete cds. // chr14 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84248974:84259383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT018723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONRATT018724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
ENSRNOT00000052215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:84296632:84297061:1 gene:ENSRNOG00000033455 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000023072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84296647:84297318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 85 // 87 // 11 // 13 // 0
NM_001106015 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group III (Pla2g3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84412999:84418680:1 gene:ENSRNOG00000025121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84413053:84417729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT018728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001115013 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein M (Selm), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84440389:84442729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT018729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000037020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84508050:84508454:1 gene:ENSRNOG00000025045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// FQ227683 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YF03 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84508035:84508280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_001106016 // RefSeq // Rattus norvegicus MORC family CW-type zinc finger 2 (Morc2), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84582010:84615107:1 gene:ENSRNOG00000019624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84574256:84613791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001013128 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 18 (Dusp18), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84834651:84839036:1 gene:ENSRNOG00000024945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079285 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 18, mRNA (cDNA clone MGC:94414 IMAGE:7134264), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_359626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 18 (Dusp18), transcript variant X2, misc_RNA. // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT018733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001044228 // RefSeq // Rattus norvegicus pescadillo ribosomal biogenesis factor 1 (Pes1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84895325:84911703:1 gene:ENSRNOG00000004515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC105910 // GenBank // Rattus norvegicus similar to PES1 protein, mRNA (cDNA clone MGC:125075 IMAGE:7388101), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84875389:84933120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT018738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001109090 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC14-like 4 (S. cerevisiae) (Sec14l4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84955987:84971855:1 gene:ENSRNOG00000004555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84948750:84970238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_022608 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC14-like 3 (S. cerevisiae) (Sec14l3), mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006251371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC14-like 3 (S. cerevisiae) (Sec14l3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84987877:84998632:1 gene:ENSRNOG00000004594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC162038 // GenBank // Rattus norvegicus SEC14-like 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187966 IMAGE:7099625), complete cds. // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84987917:84998312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_001107234 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 215 (Rnf215), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006251300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 215 (Rnf215), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85050141:85056544:1 gene:ENSRNOG00000004940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85050222:85055273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT018747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107235 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 3a, subunit 1 (Sf3a1), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85074847:85095596:1 gene:ENSRNOG00000005218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85074979:85093085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT018749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_001015022 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 10a (Tbc1d10a), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 10a (Tbc1d10a), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85098922:85127054:1 gene:ENSRNOG00000006394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB210856 // GenBank // Rattus norvegicus rabgap(po) mRNA for potential RabGAP, complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC093603 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 10a, mRNA (cDNA clone MGC:105611 IMAGE:7316341), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85098985:85133538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT018751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001025128 // RefSeq // Rattus norvegicus GATS protein-like 3 (Gatsl3), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85129586:85133998:1 gene:ENSRNOG00000006740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC091274 // GenBank // Rattus norvegicus similar to opposite strand transcription unit to Stag3; Gats protein, mRNA (cDNA clone MGC:109140 IMAGE:7383249), complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85098985:85133538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT018754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT018755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001006961 // RefSeq // Rattus norvegicus oncostatin M (Osm), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oncostatin M (Osm), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006251200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oncostatin M (Osm), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000035591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85147855:85150705:1 gene:ENSRNOG00000024390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB167521 // GenBank // Rattus norvegicus OSM mRNA for oncostatin M, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85145970:85153255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_022196 // RefSeq // Rattus norvegicus leukemia inhibitory factor (Lif), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukemia inhibitory factor (Lif), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85177766:85180540:1 gene:ENSRNOG00000007002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB010275 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for leukemia inhibitory factor, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M32748 // GenBank // Rat cholinergic neuronal differentiation factor mRNA, complete cds. // chr14 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85177766:85180540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109091 // RefSeq // Rattus norvegicus activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 (Ascc2), mRNA. // chr14 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000065188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85555815:85592750:1 gene:ENSRNOG00000007349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000036194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85555815:85579245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85580639:85592444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT018759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT018760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1
XM_001067336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, matrin type 5 (Zmat5), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, matrin type 5 (Zmat5), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// XM_577351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, matrin type 5 (Zmat5), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85614859:85645517:1 gene:ENSRNOG00000007849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// XM_006251428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, matrin type 5 (Zmat5), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// FQ227485 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YC24 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT018762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001100730 // RefSeq // Rattus norvegicus nipsnap homolog 1 (C. elegans) (Nipsnap1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006251337 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nipsnap homolog 1 (C. elegans) (Nipsnap1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85791355:85815289:1 gene:ENSRNOG00000008374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT018763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85791371:85848927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT018766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001012153 // RefSeq // Rattus norvegicus THO complex 5 (Thoc5), mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85820114:85849561:1 gene:ENSRNOG00000008456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC079058 // GenBank // Rattus norvegicus THO complex 5, mRNA (cDNA clone MGC:94002 IMAGE:7115655), complete cds. // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// FQ229924 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YD11 mRNA sequence. // chr14 // 79 // 94 // 27 // 34 // 0 /// GENSCAN00000031169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85791371:85848927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT018769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT018771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_017277 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, beta 1 subunit (Ap1b1), mRNA. // chr14 // 86 // 100 // 38 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000057407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85927663:85959251:1 gene:ENSRNOG00000008786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// M77245 // GenBank // R.norvegicus beta-chain clathrin associated protein complex AP-1 mRNA, complete cds. // chr14 // 86 // 100 // 38 // 44 // 0 /// GENSCAN00000031189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85885202:85958483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT018776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT018775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// NONRATT018777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
NM_001108862 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS-like, family 10, member A (Rasl10a), mRNA. // chr14 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000064933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85989454:85990832:1 gene:ENSRNOG00000008951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// BC169075 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7935258. // chr14 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85988991:85990512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT018780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001013875 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid domain containing 3 (Rhbdd3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid domain containing 3 (Rhbdd3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid domain containing 3 (Rhbdd3), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid domain containing 3 (Rhbdd3), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid domain containing 3 (Rhbdd3), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000031914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86028976:86034641:1 gene:ENSRNOG00000027032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC081912 // GenBank // Rattus norvegicus rhomboid domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:93864 IMAGE:7112018), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86031836:86034500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT018782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT018784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001004210 // RefSeq // Rattus norvegicus X-box binding protein 1 (Xbp1), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001271731 // RefSeq // Rattus norvegicus X-box binding protein 1 (Xbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86423858:86428922:1 gene:ENSRNOG00000010298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079450 // GenBank // Rattus norvegicus X-box binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94999 IMAGE:7115933), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86423863:86428248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT018786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT018787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT018789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006221826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FSHD region gene 2 (Frg2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FSHD region gene 2 (Frg2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041857 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:86460872:86462375:1 gene:ENSRNOG00000034011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86460875:86462396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_006221827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 36 (Ankrd36), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86486398:86548418:1 gene:ENSRNOG00000011940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB095021 // GenBank // Rattus norvegicus spergen-2 mRNA for spergen-2, complete cds. // chr14 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC083629 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 36, mRNA (cDNA clone MGC:94422 IMAGE:7134382), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86486607:86580905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT018792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT018790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT018793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
ENSRNOT00000012194 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:86560037:86581295:1 gene:ENSRNOG00000009121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC167759 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7367251. // chr14 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// XM_006221827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 36 (Ankrd36), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86486607:86580905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT018794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001100970 // RefSeq // Rattus norvegicus AE binding protein 1 (Aebp1), mRNA. // chr14 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000018846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86792973:86802766:1 gene:ENSRNOG00000013720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// BC133065 // GenBank // Rattus norvegicus AE binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:156778 IMAGE:7124847), complete cds. // chr14 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000040297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86793164:86802552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 98 // 39 // 41 // 0 /// NONRATT018803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// NONRATT018804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1
NM_031692 // RefSeq // Rattus norvegicus YKT6 v-SNARE homolog (S. cerevisiae) (Ykt6), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000020693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86880204:86889524:1 gene:ENSRNOG00000014785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY881621 // GenBank // Rattus norvegicus SNARE protein Ykt6 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF033027 // GenBank // Rattus norvegicus prenylated SNARE protein Ykt6p (Ykt6) mRNA, complete cds. // chr14 // 74 // 100 // 23 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86880204:86893265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT018807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT018809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001017461 // RefSeq // Rattus norvegicus oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide) (Ogdh), mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// XM_006251446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide) (Ogdh), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000057199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:87376186:87442861:1 gene:ENSRNOG00000005130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC083811 // GenBank // Rattus norvegicus oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) dehydrogenase (lipoamide), mRNA (cDNA clone MGC:94869 IMAGE:7110182), complete cds. // chr14 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// FQ222842 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA19YE17 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 96 // 44 // 46 // 0 /// GENSCAN00000044818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:87391768:87441897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT018819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT018818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 23 // 23 // 11 // 48 // 1
NM_001100507 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MIZ-type containing 2 (Zmiz2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006251441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MIZ-type containing 2 (Zmiz2), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000052002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:87476042:87492529:1 gene:ENSRNOG00000025923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000044826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:87468206:87491551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// NONRATT018827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_001126275 // RefSeq // Rattus norvegicus cerebral cavernous malformation 2 (Ccm2), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebral cavernous malformation 2 (Ccm2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebral cavernous malformation 2 (Ccm2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebral cavernous malformation 2 (Ccm2), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80446452:80492850:1 gene:ENSRNOG00000007643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC160889 // GenBank // Rattus norvegicus cerebral cavernous malformation 2, mRNA (cDNA clone MGC:188309 IMAGE:7441909), complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80446486:80492466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_020100 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor (G protein-coupled) activity modifying protein 3 (Ramp3), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80555463:80572980:1 gene:ENSRNOG00000008154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB030944 // GenBank // Rattus norvegicus RAMP3 mRNA for receptor activity modifying protein 3, complete cds. // chr14 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// AB042889 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for receptor activity modifying protein 3, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AF181552 // GenBank // Rattus norvegicus receptor activity modifying protein 3 (Ramp3) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ229563 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YH22 mRNA sequence. // chr14 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT018635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80555514:80589639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT018637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT018636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001107239 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 1 (brain) (Adcy1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000011043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80947153:81055801:1 gene:ENSRNOG00000008276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000020623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80946841:81087600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0
NM_013144 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 1 (Igfbp1), mRNA. // chr14 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81083056:81088123:1 gene:ENSRNOG00000008371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC078889 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93595 IMAGE:7129185), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M89791 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor-binding protein-1 (IGFBP-1) mRNA, complete cds. // chr14 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT018642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80946841:81087600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_003751398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36-like (RGD1562776), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:88673231:88673536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221844 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease 1 like 1 (Pkd1l1), mRNA. // chr14 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006498 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:88857512:88971091:-1 gene:ENSRNOG00000004865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:88780287:89006120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001135915 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688553 (LOC688553), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035922 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:89050478:89069657:1 gene:ENSRNOG00000037632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:89050945:89132032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001030025 // RefSeq // Rattus norvegicus uridine phosphorylase 1 (Upp1), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006251484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uridine phosphorylase 1 (Upp1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uridine phosphorylase 1 (Upp1), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uridine phosphorylase 1 (Upp1), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:89113731:89132096:1 gene:ENSRNOG00000004972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099752 // GenBank // Rattus norvegicus uridine phosphorylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:124655 IMAGE:5623209), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:89050945:89132032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT018836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106020 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 13 (Abca13), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// ENSRNOT00000035612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:89181315:89673490:1 gene:ENSRNOG00000025645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// GENSCAN00000040959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:89235035:89486893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 55 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000040961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:89544633:89621948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 16 // 10 // 10 // 0
XM_001057417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 161B (Tmem161b), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006223968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 161B (Tmem161b), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_226652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 161B (Tmem161b), mRNA. // chr14 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000050072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:12379283:12410781:1 gene:ENSRNOG00000032414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:12304465:12458429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 58 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:89235035:89486893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT028724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT028726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
XM_006251478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC289778 (RGD1309870), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038733 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:91345258:91345698:1 gene:ENSRNOG00000027755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:91345120:91405922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001106018 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC289778 (RGD1309870), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC289778 (RGD1309870), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC289778 (RGD1309870), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251481 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC289778 (RGD1309870), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:91374634:91399177:1 gene:ENSRNOG00000037621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107237 // RefSeq // Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 1 (Ikzf1), mRNA. // chr14 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 1 (Ikzf1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 1 (Ikzf1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:91567474:91652247:1 gene:ENSRNOG00000004444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:91627682:91666885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT018840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT018841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
XM_006221846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006897 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:99295236:99319815:-1 gene:ENSRNOG00000005180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000067134 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:99314949:99319812:-1 gene:ENSRNOG00000005180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 57 // 14 // 16 // 0 /// XM_006221847 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// XM_006251523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus V-set and transmembrane domain containing 2A (Vstm2a), mRNA. // chr14 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:99314841:99317592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 50 // 12 // 14 // 0 /// NONRATT019894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT019896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_031507 // RefSeq // Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor (Egfr), mRNA. // chr14 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:100438987:100617315:-1 gene:ENSRNOG00000004332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// HM801041 // GenBank // Rattus norvegicus strain Yuyi Curly Hair epidermal growth factor receptor (Egfr) mRNA, complete cds. // chr14 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// HM801042 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley epidermal growth factor receptor (Egfr) mRNA, complete cds. // chr14 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// M37394 // GenBank // Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor (Egfr) mRNA, complete cds. // chr14 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:100401502:100521566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108863 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 48 (Fbxo48), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:100401055:100402512:-1 gene:ENSRNOG00000023026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:100401502:100521566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001014232 // RefSeq // Rattus norvegicus cannabinoid receptor interacting protein 1 (Cnrip1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:100291061:100320330:-1 gene:ENSRNOG00000005326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY883936 // GenBank // Rattus norvegicus CB1 cannabinoid receptor interacting protein mRNA, complete cds. // chr14 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// BC088754 // GenBank // Rattus norvegicus cannabinoid receptor interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105778 IMAGE:7319918), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:100291314:100323586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001106021 // RefSeq // Rattus norvegicus C1D nuclear receptor co-repressor (C1d), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225863 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear nucleic acid-binding protein C1D-like (LOC100912037), mRNA. // chr14 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// XM_006251514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1D nuclear receptor co-repressor (C1d), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1D nuclear receptor co-repressor (C1d), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006251516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1D nuclear receptor co-repressor (C1d), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:100111604:100123763:-1 gene:ENSRNOG00000005982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168684 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear DNA binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:188504 IMAGE:7930158), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT048624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:135868676:135897371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:100067128:100137893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT019899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
GENSCAN00000042486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:103719305:103766161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_001047094 // RefSeq // Rattus norvegicus sprouty-related, EVH1 domain containing 2 (Spred2), mRNA. // chr14 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:103926069:104024317:1 gene:ENSRNOG00000004888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AB125136 // GenBank // Rattus norvegicus Spred-2 mRNA for Sprouty-related protein with EVH-1 domain 2, complete cds. // chr14 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT018863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 89 // 82 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:103965678:104026486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
AY539917 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00166 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031090 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB1A, member RAS oncogene family (Rab1a), mRNA. // chr14 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000021040 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:104208410:104236221:1 gene:ENSRNOG00000004992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC066662 // GenBank // Rattus norvegicus RAB1, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:72414 IMAGE:5623442), complete cds. // chr14 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// FQ213656 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YI16 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY321327 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-048 mRNA, complete cds. // chr14 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT018865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104186108:104234759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001024903 // RefSeq // Rattus norvegicus SERTA domain containing 2 (Sertad2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SERTA domain containing 2 (Sertad2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000007162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104552934:104616957:1 gene:ENSRNOG00000005393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098047 // GenBank // Rattus norvegicus SERTA domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:116204 IMAGE:7457109), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231928 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YK11 mRNA sequence. // chr14 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT018877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104586726:104645332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001100565 // RefSeq // Rattus norvegicus pellino E3 ubiquitin protein ligase 1 (Peli1), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:106075061:106128271:1 gene:ENSRNOG00000006329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC166745 // GenBank // Rattus norvegicus pellino 1, mRNA (cDNA clone MGC:188476 IMAGE:7939059), complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76948456:76966058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT018903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:106074690:106127424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT018904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT018905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_173147 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 54 homolog (S. cerevisiae) (Vps54), mRNA. // chr14 // 78 // 95 // 28 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:106220349:106274484:1 gene:ENSRNOG00000007125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000057562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:106219042:106273235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1
NM_001127537 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat containing planar cell polarity effector (Wdpcp), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:106464351:106823366:1 gene:ENSRNOG00000008735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT018912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:106560441:106587115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT018913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT018914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NONRATT018912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT018914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_006251560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hornerin-like (LOC102550584), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// XM_006251561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hornerin-like (LOC102550584), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// XM_006251562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hornerin-like (LOC102550584), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// XM_006251563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hornerin-like (LOC102550584), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// ENSRNOT00000032878 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:107127095:107127846:1 gene:ENSRNOG00000027013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT018916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001010961 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 17 (Tmem17), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:107366212:107371630:1 gene:ENSRNOG00000009220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089059 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:105637 IMAGE:7320241), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:107366556:107371069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT018920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L28-like (LOC690096), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006251571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L28-like (LOC690096), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000012255 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:107411935:107412469:1 gene:ENSRNOG00000009240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001017504 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger (CCCH type), RNA binding motif and serine/arginine rich 1 (Zrsr1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:107826181:107827911:1 gene:ENSRNOG00000009639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086322 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger (CCCH type), RNA binding motif and serine/arginine rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:105652 IMAGE:7301896), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:107826210:107827496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_182814 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 4 (delta) (Cct4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000012847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:107843411:107856260:1 gene:ENSRNOG00000009642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY223861 // GenBank // Rattus norvegicus chaperonin delta subunit (Cct4) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC079283 // GenBank // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 4 (delta), mRNA (cDNA clone MGC:94410 IMAGE:7134210), complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:107843545:107880186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT018931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001013876 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 161, member A (Fam161a), mRNA. // chr14 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 161, member A (Fam161a), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:107861019:107874812:1 gene:ENSRNOG00000009881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC079233 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 161, member A, mRNA (cDNA clone MGC:94314 IMAGE:7132584), complete cds. // chr14 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:107843545:107880186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT018934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000028006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:107906778:107907089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT018936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000045296 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:107906778:107907221:1 gene:ENSRNOG00000030555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 55 // 87 // 11 // 20 // 0
ENSRNOT00000058986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:108015700:108017820:1 gene:ENSRNOG00000038638 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 65 // 100 // 11 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:108015789:108122311:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
NM_053490 // RefSeq // Rattus norvegicus exportin 1 (Xpo1), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000014062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:108088677:108124346:1 gene:ENSRNOG00000009935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AB105193 // GenBank // Rattus norvegicus crm1 mRNA for nuclear export factor CRM1, complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AJ238278 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for CRM1 protein. // chr14 // 100 // 50 // 24 // 24 // 0 /// FQ215825 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YH08 mRNA sequence. // chr14 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// GENSCAN00000028018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:108015789:108122311:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT018938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001271196 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 34 (Usp34), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 77 // 77 // 0 /// ENSRNOT00000038258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104962650:105100491:1 gene:ENSRNOG00000026034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 74 // 74 // 0 /// ENSRNOT00000056861 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:104962650:105100491:1 gene:ENSRNOG00000026034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000035041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:105013225:105099940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 38 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104875094:105004771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 21 // 21 // 16 // 77 // 1 /// NONRATT018893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 13 // 13 // 10 // 77 // 1 /// NONRATT018894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 17 // 17 // 13 // 77 // 1 /// NONRATT018895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 10 // 10 // 8 // 77 // 1 /// NONRATT018896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 10 // 10 // 8 // 77 // 1
ENSRNOT00000034363 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:105141952:105142732:1 gene:ENSRNOG00000025903 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:105121968:105142428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_001025278 // RefSeq // Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 10 (Pus10), mRNA. // chrU // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 10 (Pus10), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:105247077:105284030:1 gene:ENSRNOG00000006005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// BC093611 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933435A13, mRNA (cDNA clone MGC:105557 IMAGE:7307810), complete cds. // chrU // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 10 (Pus10), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 69 // 69 // 31 // 45 // 1 /// XM_003751414 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative tRNA pseudouridine synthase Pus10-like (LOC100910638), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// XM_006251595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative tRNA pseudouridine synthase Pus10-like (LOC100910638), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// GENSCAN00000008225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:108173307:108195257:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT018900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 60 // 27 // 45 // 1 /// GENSCAN00000056258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:105246343:105278600:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 16 // 45 // 1 /// NONRATT018940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 27 // 27 // 12 // 45 // 1
NM_001191684 // RefSeq // Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group L (Fancl), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006251597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group L (Fancl), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000029513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:110369260:110433487:1 gene:ENSRNOG00000027249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:110368917:110431106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT018950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1
BC085866 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7190765. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NR_037355 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 216b (Mir216b), microRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054490 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:14:112790786:112790887:1 gene:ENSRNOG00000036371 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-216b // miRBase Micro RNA Database // MI0015435 Rattus norvegicus miR-216b stem-loop // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031928 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 216a (Mir216a), microRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053637 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:14:112802262:112802367:1 gene:ENSRNOG00000035514 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-216a // miRBase Micro RNA Database // MI0000955 Rattus norvegicus miR-216a stem-loop // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031929 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 217 (Mir217), microRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053641 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:14:112809662:112809766:1 gene:ENSRNOG00000035518 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-217 // miRBase Micro RNA Database // MI0000956 Rattus norvegicus miR-217 stem-loop // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012039 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1 (Efemp1), mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000004764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:112892387:112984799:1 gene:ENSRNOG00000003553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC079455 // GenBank // Rattus norvegicus EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95010 IMAGE:7121509), complete cds. // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:112862448:113034676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 81 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT018957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT018959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT018958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT018960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001142371 // RefSeq // Rattus norvegicus polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1 (Pnpt1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113205574:113236749:1 gene:ENSRNOG00000003600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113205547:113291038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT018964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001108367 // RefSeq // Rattus norvegicus SMEK homolog 2, suppressor of mek1 (Dictyostelium) (Smek2), mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113245254:113293242:1 gene:ENSRNOG00000003712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113205547:113291038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT018968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000054489 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:113421734:113421823:1 gene:ENSRNOG00000036370 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000005388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113438294:113598052:1 gene:ENSRNOG00000004057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000005487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113438294:113598052:1 gene:ENSRNOG00000004057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113438294:113598052:1 gene:ENSRNOG00000004057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// FQ230491 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA97YG12 mRNA sequence. // chr14 // 94 // 49 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000041952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113433271:113594931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 63 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT018973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_001004254 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial translational initiation factor 2 (Mtif2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113621601:113631935:1 gene:ENSRNOG00000004161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC079421 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial translational initiation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:94962 IMAGE:7113831), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ224859 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YM15 mRNA sequence. // chr14 // 82 // 65 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000041955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113611947:113650633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001013877 // RefSeq // Rattus norvegicus clathrin heavy chain linker domain containing 1 (Clhc1), mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113634942:113673626:1 gene:ENSRNOG00000004456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113659718:113688491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT018980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000041955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113611947:113650633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT018981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_001013130 // RefSeq // Rattus norvegicus spectrin, beta, non-erythrocytic 1 (Sptbn1), mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000008210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:114188059:114356233:-1 gene:ENSRNOG00000005434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// AY238344 // GenBank // Rattus norvegicus non-erythroid spectrin beta mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC090340 // GenBank // Rattus norvegicus spectrin, beta, non-erythrocytic 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7303580), partial cds. // chr14 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// GENSCAN00000040727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:114188183:114255447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT020004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT020008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT020010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001109095 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ40298 (RGD1562229), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:114495982:114529238:-1 gene:ENSRNOG00000006356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:114496134:114554541:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT020012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001025140 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 4 (Psme4), mRNA. // chr14 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000009500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:114823668:114926542:1 gene:ENSRNOG00000006609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000001392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:114823924:114935019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 61 // 61 // 30 // 49 // 1 /// NONRATT018992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 15 // 49 // 1
NM_001108864 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 3 (Asb3), mRNA. // chr14 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:115009338:115105125:1 gene:ENSRNOG00000032471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:115052228:115138543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT018999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001109096 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 75 (Gpr75), mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000033437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:114933397:114936006:1 gene:ENSRNOG00000022176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT018996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:114823924:114935019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NONRATT018999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_006247972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 100-like (LOC102553388), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_349795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 729-like (LOC102556098), misc_RNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006250513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 66 (Vom2r66), mRNA. // chr14 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
XM_006221622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 844-like (LOC102554605), mRNA. // chr14 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0 /// XM_006250510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 844-like (LOC102554605), mRNA. // chr14 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043131 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:1352183:1352731:1 gene:ENSRNOG00000040213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT018081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001099485 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 67 (Vom2r67), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000061889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:1315284:1320867:1 gene:ENSRNOG00000031928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1313557:1328905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 92 // 60 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT018080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000046018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1240108:1300049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001099468 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 69 (Vom2r69), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:1006116:1019603:1 gene:ENSRNOG00000040210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1002796:1164275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000046014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1002796:1164275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000042710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:939385:981631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000042705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:812046:938887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_001099516 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 71 (Vom2r71), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000029752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72997065:73020962:1 gene:ENSRNOG00000042719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000037286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72997065:73020941:1 gene:ENSRNOG00000042719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000045085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72997065:73020965:1 gene:ENSRNOG00000042719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000049544 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:900797:924018:1 gene:ENSRNOG00000046835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:72997065:73020469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000042705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:812046:938887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT000590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000061856 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:1440025:1441601:1 gene:ENSRNOG00000040190 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000046011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1404527:1441601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_199114 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor-like 1 (Fgfrl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2015651:2027710:-1 gene:ENSRNOG00000024207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC097261 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:114230 IMAGE:7442454), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2016270:2027568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001172084 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-L-iduronidase (Idua), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-L-iduronidase (Idua), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2037952:2052303:-1 gene:ENSRNOG00000000043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC103733 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7365313. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2038522:2044382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT019010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT019011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT019012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT019013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT019016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001013991 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 175 (Tmem175), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2079289:2095394:-1 gene:ENSRNOG00000000044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC079245 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 175, mRNA (cDNA clone MGC:94332 IMAGE:7132812), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2079390:2089325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT019022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT019023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NONRATT019027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107245 // RefSeq // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 3 (Pcgf3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2242209:2295509:-1 gene:ENSRNOG00000000062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC167000 // GenBank // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 3, mRNA (cDNA clone MGC:189162 IMAGE:9031673), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2241342:2287950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// NONRATT019030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
NM_001106024 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 6B, cGMP-specific, rod, beta (Pde6b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000000077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2327104:2370811:-1 gene:ENSRNOG00000000065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000017919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2323429:2370781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT019032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT019033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1
ENSRNOT00000034962 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:1559728:1560721:-1 gene:ENSRNOG00000050167 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 89 // 90 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000041183 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:2406051:2407044:-1 gene:ENSRNOG00000050056 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 89 // 90 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000015693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1501064:1560721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2395491:2407044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_002724924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class G (Pigg), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_002728071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class G (Pigg), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_003751315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GPI ethanolamine phosphate transferase 2-like (LOC100910143), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:2411468:2437420:-1 gene:ENSRNOG00000049895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075415 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:1565145:1591097:-1 gene:ENSRNOG00000050374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1565145:1610216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2411468:2456539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0
NM_001011914 // RefSeq // Rattus norvegicus down-regulator of transcription 1 (Dr1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:1616257:1627609:-1 gene:ENSRNOG00000000070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2464435:2473311:-1 gene:ENSRNOG00000048308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// BC083822 // GenBank // Rattus norvegicus down-regulator of transcription 1, mRNA (cDNA clone MGC:94897 IMAGE:7111461), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1618112:1626988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000017908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2464435:2473311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
XM_006221639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 18 (Ccdc18), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006221641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 18 (Ccdc18), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2509530:2609972:-1 gene:ENSRNOG00000024545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2584580:2609972:-1 gene:ENSRNOG00000024545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000043388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2509534:2555662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_001100898 // RefSeq // Rattus norvegicus metal response element binding transcription factor 2 (Mtf2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006250569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metal response element binding transcription factor 2 (Mtf2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000000086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2657176:2699986:-1 gene:ENSRNOG00000000075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:2657710:2691807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT019041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_031099 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L5 (Rpl5), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000030428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:2861180:2867612:-1 gene:ENSRNOG00000023529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC060561 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L5, mRNA (cDNA clone MGC:72798 IMAGE:6918805), complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// FQ233314 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YF15 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// FQ234171 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YO18 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// M17419 // GenBank // Rat ribosomal protein L5 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT019043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NONRATT019043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_031001 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4 (putative) (Ube2d4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078808 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme, mRNA (cDNA clone MGC:93393 IMAGE:7113229), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U56407 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin conjugating enzyme mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001013987 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 2 (Rpap2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 2 (Rpap2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 2 (Rpap2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 2 (Rpap2), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006250547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 2 (Rpap2), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3126078:3205387:-1 gene:ENSRNOG00000023484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000063778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3126078:3205387:-1 gene:ENSRNOG00000023484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088426 // GenBank // Rattus norvegicus RNA polymerase II associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:95054 IMAGE:7123983), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3170542:3206300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT019046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000045820 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:3238455:3240097:-1 gene:ENSRNOG00000029723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3238281:3285444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT048237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001109563 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689986 (LOC689986), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689986 (LOC689986), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689986 (LOC689986), transcript variant X7, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689986 (LOC689986), transcript variant X9, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002824 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:3252250:3261835:-1 gene:ENSRNOG00000047876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3238281:3285444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006250596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 8-like (LOC100364240), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037931 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:3287525:3303541:-1 gene:ENSRNOG00000023446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3287525:3309681:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001025631 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidylcholine acyltransferase 2b (Lpcat2b), mRNA. // chr14 // 96 // 56 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037931 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:3287525:3303541:-1 gene:ENSRNOG00000023446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000043421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3359378:3362781:-1 gene:ENSRNOG00000048507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 56 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061556 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:3307623:3355037:-1 gene:ENSRNOG00000047302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// BC097476 // GenBank // Rattus norvegicus acyltransferase like 1B, mRNA (cDNA clone MGC:114541 IMAGE:7457927), complete cds. // chr14 // 96 // 56 // 26 // 27 // 0 /// XM_006250596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 8-like (LOC100364240), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 27 // 27 // 13 // 48 // 1 /// XM_002724929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 8-like (LOC100364240), mRNA. // chr14 // 23 // 23 // 11 // 48 // 1 /// XM_003751321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 8-like (LOC100364240), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 23 // 23 // 11 // 48 // 1 /// GENSCAN00000000757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3359475:3360989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 31 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT019053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1
NM_001105994 // RefSeq // Rattus norvegicus epoxide hydrolase 4 (Ephx4), mRNA. // chr14 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000037101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3364193:3393612:-1 gene:ENSRNOG00000023389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// FQ212126 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA68YJ18 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// FQ213206 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YC05 mRNA sequence. // chr14 // 83 // 60 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3364330:3384454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT019056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001012031 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain, testis-specific (Brdt), mRNA. // chr14 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000061538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3441091:3465773:-1 gene:ENSRNOG00000002073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// BC078999 // GenBank // Rattus norvegicus bromodomain, testis-specific, mRNA (cDNA clone IMAGE:7112786), complete cds. // chr14 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// BC158630 // GenBank // Rattus norvegicus bromodomain, testis-specific, mRNA (cDNA clone MGC:187542 IMAGE:7456383), complete cds. // chr14 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3400150:3449802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT019058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1
NM_001108352 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 7 (Cdc7), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000068520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:3823737:3843969:-1 gene:ENSRNOG00000002105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:3809297:3845930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT019062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
XM_006227121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC679711 (LOC679711), mRNA. // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000071778 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:39811877:40122005:-1 gene:ENSRNOG00000047330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT028202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 62 // 96 // 16 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37383660:37519213:1 gene:ENSRNOG00000050916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006255351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552540 (LOC102552540), mRNA. // chr19 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000040473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37383660:37519213:1 gene:ENSRNOG00000050916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37342313:37407900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// FQ214467 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YI15 mRNA sequence. // chr19 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0
NM_001008338 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member D (Lrrc8d), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member D (Lrrc8d), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000002888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:5077924:5093047:-1 gene:ENSRNOG00000002121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085783 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member D, mRNA (cDNA clone MGC:93739 IMAGE:7107805), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037179 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member C (Lrrc8c), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member C (Lrrc8c), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:5278309:5369415:-1 gene:ENSRNOG00000002122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100076 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:112653 IMAGE:7386007), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:5278475:5280745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT019068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NONRATT019069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001107204 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member B (Lrrc8b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:5409635:5471379:-1 gene:ENSRNOG00000002129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212117 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA68YN19 mRNA sequence. // chr14 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:5379496:5436785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT019077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1
GENSCAN00000018354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:5806392:5841454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 89 // 82 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000052308 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:5830062:5841454:-1 gene:ENSRNOG00000002130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// NONRATT019077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
ENSRNOT00000049165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6171817:6180127:-1 gene:ENSRNOG00000047293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000075091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6121183:6129823:-1 gene:ENSRNOG00000049446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// NM_001177909 // RefSeq // Rattus norvegicus rCG37858-like (LOC100366030), mRNA. // chr14 // 90 // 90 // 19 // 21 // 1 /// AY245000 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of four 1 mRNA, complete cds. // chr14 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// NONRATT019077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
XM_006221654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC102548800), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006221657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC102548800), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC102548800), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XR_340100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548650 (LOC102548650), ncRNA. // chrU // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NM_001134998 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 951 (Zfp951), mRNA. // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// XM_006250617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102555406), mRNA. // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XM_006250618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102555488), mRNA. // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XM_006250644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 791-like (LOC102548396), mRNA. // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000048419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6336742:6350405:-1 gene:ENSRNOG00000037421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// BC169037 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:189422 IMAGE:7368372, complete cds. // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT019077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044065 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:6262167:6264976:-1 gene:ENSRNOG00000043048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT019079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001004076 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 3-like 1 (Abcg3l1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006250625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 3-like 1 (Abcg3l1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// XM_006250626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 3-like 1 (Abcg3l1), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000042532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6468120:6520631:-1 gene:ENSRNOG00000030216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY688113 // GenBank // Rattus norvegicus ABC transporter ABCG3 mRNA, complete cds. // chr14 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// BC098896 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:114213 IMAGE:7100556), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:6485258:6518584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_001191934 // RefSeq // Rattus norvegicus polycystic kidney disease 2 (autosomal dominant) (Pkd2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6581342:6624595:-1 gene:ENSRNOG00000002146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:6561520:6657533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
AF530559 // GenBank // Rattus norvegicus osteoregulin-like protein mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 65 // 25 // 26 // 0 /// NM_024142 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix extracellular phosphoglycoprotein (Mepe), mRNA. // chr14 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// XM_006250634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix extracellular phosphoglycoprotein (Mepe), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000002927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6770084:6781630:-1 gene:ENSRNOG00000002154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// AF260922 // GenBank // Rattus norvegicus osteoregulin mRNA, complete cds. // chr14 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// AF530558 // GenBank // Rattus norvegicus osteoregulin mRNA, complete cds. // chr14 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// GENSCAN00000016497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:6768922:6771818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 38 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT019091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_012587 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin-binding sialoprotein (Ibsp), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6789273:6802236:-1 gene:ENSRNOG00000002158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB001383 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sialoprotein, complete cds. // chr14 // 78 // 69 // 14 // 18 // 0 /// BC127506 // GenBank // Rattus norvegicus integrin binding sialoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:156673 IMAGE:8369751), complete cds. // chr14 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// DQ213013 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley bone sialoprotein (Ibsp) mRNA, complete cds. // chr14 // 83 // 69 // 15 // 18 // 0 /// J04215 // GenBank // Rat cell-binding bone sialoprotein mRNA, complete cds. // chr14 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:6790170:6798800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_203493 // RefSeq // Rattus norvegicus dentin matrix acidic phosphoprotein 1 (Dmp1), mRNA. // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000061224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6878109:6885158:-1 gene:ENSRNOG00000002167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC129082 // GenBank // Rattus norvegicus dentin matrix acidic phosphoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:156551 IMAGE:8365946), complete cds. // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// L11354 // GenBank // Rattus norvegicus acidic phosphoprotein mRNA, complete cds. // chr14 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:6879247:6894241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_012790 // RefSeq // Rattus norvegicus dentin sialophosphoprotein (Dspp), mRNA. // chr14 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6914452:6920492:-1 gene:ENSRNOG00000002168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000002946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6915915:6920492:-1 gene:ENSRNOG00000002168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000002947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:6915915:6920492:-1 gene:ENSRNOG00000002168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF247187 // GenBank // Rattus norvegicus DSP-PP mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// AF250373 // GenBank // Rattus norvegicus dentin sialoprotein II mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// AF250374 // GenBank // Rattus norvegicus sialoprotein-phosphophoryn DSP-PP523 mRNA, complete cds. // chr14 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// U02074 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley dentin sialoprotein (RDSP2) mRNA, complete cds. // chr14 // 80 // 37 // 8 // 10 // 0 /// U63111 // GenBank // Rattus norvegicus dentin phosphoprotein precursor mRNA, complete cds. // chr14 // 80 // 37 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000016490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:6915915:6930201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001006991 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 9 (Nudt9), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:7027806:7045536:-1 gene:ENSRNOG00000002186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083722 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 9, mRNA (cDNA clone MGC:94618 IMAGE:7190984), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7028052:7045442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT019097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001107206 // RefSeq // Rattus norvegicus AF4/FMR2 family, member 1 (Aff1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006250633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AF4/FMR2 family, member 1 (Aff1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000066071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:7216503:7314729:-1 gene:ENSRNOG00000002232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000026936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7217135:7249203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001100789 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13 (Ptpn13), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// XM_006250645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13-like (LOC100910240), mRNA. // chr14 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000061162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:7662574:7837443:-1 gene:ENSRNOG00000002061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000033126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:7663147:7807839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT019106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 51 // 51 // 25 // 49 // 1 /// NONRATT019105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 37 // 37 // 18 // 49 // 1 /// NONRATT019104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1
ENSRNOT00000034062 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:8404356:8404724:-1 gene:ENSRNOG00000021722 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:8298137:8410743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000050301 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:8992549:8993276:-1 gene:ENSRNOG00000033876 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:8992584:9010284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0
NM_031242 // RefSeq // Rattus norvegicus CDP-diacylglycerol synthase 1 (Cds1), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:9356230:9418464:-1 gene:ENSRNOG00000002142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB009999 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CDP-diacylglycerol synthase, complete cds. // chr14 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// BC127492 // GenBank // Rattus norvegicus CDP-diacylglycerol synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:156628 IMAGE:8373547), complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// FQ212493 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YC06 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:9354758:9418461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT019128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001025670 // RefSeq // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 9 (Agpat9), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000002936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10293028:10343730:-1 gene:ENSRNOG00000002159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC097362 // GenBank // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 9, mRNA (cDNA clone MGC:114395 IMAGE:7442656), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10271194:10360350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT019132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001105996 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S18C (Mrps18c), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10388657:10394875:-1 gene:ENSRNOG00000002178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ224447 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA65YO08 mRNA sequence. // chr14 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT019134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
BC081964 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical LOC100125386, mRNA (cDNA clone MGC:94093 IMAGE:7125106), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001004275 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 4 (Cops4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:10666123:10696464:-1 gene:ENSRNOG00000023650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079384 // GenBank // Rattus norvegicus COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 4 (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:94896 IMAGE:7111425), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10659057:10696426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT019142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001009391 // RefSeq // Rattus norvegicus enolase-phosphatase 1 (Enoph1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:11116183:11142029:-1 gene:ENSRNOG00000002262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087697 // GenBank // Rattus norvegicus enolase-phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105720 IMAGE:7312419), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:11116989:11131074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NONRATT019150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000036280 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:11234824:11235400:-1 gene:ENSRNOG00000023336 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:11235075:11242828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
ENSRNOT00000045328 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:11358776:11359247:-1 gene:ENSRNOG00000030837 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:11352820:11359183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NONRATT019157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_017105 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 3 (Bmp3), mRNA. // chr14 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000038872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:12306370:12331030:-1 gene:ENSRNOG00000002381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT019158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000033930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:12313609:12349498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
XM_003752705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC685158 (LOC685158), mRNA. // chrU // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC685158 (LOC685158), mRNA. // chrU // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000035479 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:12380790:12864775:-1 gene:ENSRNOG00000022641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT019159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:12842483:12942795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
GENSCAN00000044065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:12663755:12723223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022211 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 5 (Fgf5), mRNA. // chr14 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:12917742:12938405:-1 gene:ENSRNOG00000022631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// D64085 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for fibroblast growth factor FGF-5, complete cds. // chr14 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// D64086 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for truncated FGF-5 (fibroblast growth factor), complete cds. // chr14 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000044055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:12842483:12942795:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
XM_003751330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 8 (Prdm8), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// XM_006221675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 8 (Prdm8), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// XM_006221676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 8 (Prdm8), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// XM_006250702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 8 (Prdm8), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// XM_006250703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 8 (Prdm8), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000002746 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:12997501:13000902:-1 gene:ENSRNOG00000002004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000071706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:12997505:13000902:-1 gene:ENSRNOG00000002004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:12997501:13000992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:13013649:13049995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006221682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S19-like (LOC100361732), mRNA. // chr14 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// XM_006250706 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S19-like (LOC100361732), mRNA. // chr14 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
XM_006221683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BMP-2 inducible kinase (Bmp2k), mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060868 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:14073451:14135927:-1 gene:ENSRNOG00000002040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC098765 // GenBank // Rattus norvegicus BMP-2 inducible kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7371247), partial cds. // chr14 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000002795 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:14095530:14135927:-1 gene:ENSRNOG00000002040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// BC103651 // GenBank // Rattus norvegicus BMP-2 inducible kinase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7316892), partial cds. // chr14 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// GENSCAN00000042429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:14073604:14154273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_001191595 // RefSeq // Rattus norvegicus Fraser syndrome 1 (Fras1), mRNA. // chr14 // 99 // 99 // 69 // 70 // 0 /// ENSRNOT00000002814 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:14413367:14794704:-1 gene:ENSRNOG00000002053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 98 // 80 // 56 // 57 // 0 /// GENSCAN00000040196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:14457553:14491608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 20 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:14511752:14593759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 18 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000042410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:14380804:14449192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 32 // 23 // 23 // 0
NM_001105997 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L1 (Mrpl1), mRNA. // chr14 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:54994572:55084743:1 gene:ENSRNOG00000045785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC168772 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L1, mRNA (cDNA clone MGC:188918 IMAGE:6920150), complete cds. // chr14 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000002834 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:14893494:14949596:-1 gene:ENSRNOG00000002070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT019181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:14875317:14950376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000019290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:54994589:55063783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001017496 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 13 (Cxcl13), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250710 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 13 (Cxcl13), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:15193480:15198511:-1 gene:ENSRNOG00000024899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088260 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 13, mRNA (cDNA clone MGC:109086 IMAGE:7375992), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:15157918:15198489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XM_006221678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 12 (LOC100363333), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 12-like (LOC685667), mRNA. // chr14 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// XM_006250717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 12 (LOC100363333), mRNA. // chr14 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041124 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:15876857:15879515:1 gene:ENSRNOG00000032647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:15363285:15571735:-1 gene:ENSRNOG00000047839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 44 // 100 // 12 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:15876857:15893928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:15396606:15401243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
XM_001070041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 7-like (RGD1559654), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_577321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 7-like (RGD1559654), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:15760043:15807302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_001109329 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to DNA segment, Chr 5, ERATO Doi 577, expressed (RGD1561226), mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000040280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:15653423:15656050:1 gene:ENSRNOG00000048835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT018236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:15653495:15730437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
ENSRNOT00000050518 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:15386870:15616675:1 gene:ENSRNOG00000046931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:15614025:15627469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001105725 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin G2 (Ccng2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16193744:16202239:-1 gene:ENSRNOG00000002089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC169085 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin G2, mRNA (cDNA clone MGC:189495 IMAGE:7938657), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16194997:16267797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
BC167769 // GenBank // Rattus norvegicus septin 11, mRNA (cDNA clone MGC:187546 IMAGE:7456582), complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// EU711414 // GenBank // Rattus norvegicus septin 11 isoform I (Sept11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// EU711417 // GenBank // Rattus norvegicus septin 11 isoform IV (Sept11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// NM_001107208 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 11 (Sept11), mRNA. // chr14 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000067222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16295536:16378882:-1 gene:ENSRNOG00000002182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// EU711415 // GenBank // Rattus norvegicus septin 11 isoform II (Sept11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// EU711416 // GenBank // Rattus norvegicus septin 11 isoform III (Sept11) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT019188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16293159:16378882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT019190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT019191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1
NM_001100889 // RefSeq // Rattus norvegicus shroom family member 3 (Shroom3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000003001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16547964:16816352:-1 gene:ENSRNOG00000002208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16533310:16597182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001013988 // RefSeq // Rattus norvegicus starch binding domain 1 (Stbd1), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:16889875:16893279:-1 gene:ENSRNOG00000002218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC089867 // GenBank // Rattus norvegicus starch binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:108973 IMAGE:7321620), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16890750:16893223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT019203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006221696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 47, member E (Fam47e), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// XM_006250756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 47, member E (Fam47e), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000047214 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:16905176:16933066:-1 gene:ENSRNOG00000031635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// XM_006221695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 47, member E (Fam47e), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// XM_006250755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 47, member E (Fam47e), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000043910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:16905152:16943246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_001012034 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 3 (Art3), mRNA. // chr14 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 3 (Art3), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250731 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 3 (Art3), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000052035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17059132:17087206:-1 gene:ENSRNOG00000002256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC079018 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:93942 IMAGE:7113746), complete cds. // chr14 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// FQ223913 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA83YC24 mRNA sequence. // chr14 // 87 // 79 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17059316:17085976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 53 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT019204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT019205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_019379 // RefSeq // Rattus norvegicus USO1 vesicle transport factor (Uso1), mRNA. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17289140:17354576:-1 gene:ENSRNOG00000002301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U14192 // GenBank // Rattus norvegicus general vesicular transport factor p115 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U15589 // GenBank // Rattus norvegicus transcytosis associated protein TAP mRNA, complete cds. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17290009:17353412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003751342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911949 (LOC100911949), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911949 (LOC100911949), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107209 // RefSeq // Rattus norvegicus THAP domain containing 6 (Thap6), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17523509:17533559:-1 gene:ENSRNOG00000002543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT019211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT019212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT019213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
ENSRNOT00000060618 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:17721608:17723604:-1 gene:ENSRNOG00000039548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000029615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17721236:17729091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
NM_173114 // RefSeq // Rattus norvegicus prostate androgen-regulated mucin-like protein 1 (Parm1), mRNA. // chr14 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000003472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:17888361:17918277:-1 gene:ENSRNOG00000002579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC060539 // GenBank // Rattus norvegicus castration induced prostatic apoptosis-related protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72661 IMAGE:6890269), complete cds. // chr14 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000029618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17849606:17922013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT019215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_017123 // RefSeq // Rattus norvegicus amphiregulin (Areg), mRNA. // chr14 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18431492:18440735:-1 gene:ENSRNOG00000002754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18420905:18440557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_021689 // RefSeq // Rattus norvegicus epiregulin (Ereg), mRNA. // chr14 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18486956:18500731:-1 gene:ENSRNOG00000002771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF074952 // GenBank // Rattus norvegicus epiregulin precursor, mRNA, complete cds. // chr14 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT019217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18480470:18554556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
XM_001072006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial mitogen (Epgn), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_223280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial mitogen (Epgn), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18536111:18542821:-1 gene:ENSRNOG00000002782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18480470:18554556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001107211 // RefSeq // Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2-like (Mthfd2l), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18548222:18629209:-1 gene:ENSRNOG00000021347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18581173:18629112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT019220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_053647 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 2 (Cxcl2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000003745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18640312:18642357:-1 gene:ENSRNOG00000002792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB060092 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for macrophage inflammatory protein-2, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// U45965 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage inflammatory protein-2 precursor, mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000016662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18634846:18642287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_030845 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 1 (Cxcl1), mRNA. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18653039:18654811:-1 gene:ENSRNOG00000002802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D11444 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for gro, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// M86536 // GenBank // Rattus norvegicus KC protein mRNA, complete cds. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT019222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18643155:18654760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_138522 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 3 (Cxcl3), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18729345:18748597:-1 gene:ENSRNOG00000028043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// D21095 // GenBank // Rattus norvegicus CINC-2 beta mRNA for cytokine-induced neutrophil chemoattractant-2 beta, complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// D87927 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CINC-2 alpha, complete cds. // chr14 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000016654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18746838:18748595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT019225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT019224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18713021:18741013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001007729 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet factor 4 (Pf4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18758191:18758900:-1 gene:ENSRNOG00000028015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18755965:18758900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT019226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_153721 // RefSeq // Rattus norvegicus pro-platelet basic protein (chemokine (C-X-C motif) ligand 7) (Ppbp), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18762075:18762879:-1 gene:ENSRNOG00000002829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF349115 // GenBank // Rattus norvegicus CXC chemokine RTCK1 (Rtck1) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18761899:18771910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022214 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 6 (Cxcl6), mRNA. // chr14 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18770998:18771910:-1 gene:ENSRNOG00000002843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U90448 // GenBank // Rattus norvegicus CXC chemokine LIX mRNA, complete cds. // chr14 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18761899:18771910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
BC088176 // GenBank // Rattus norvegicus similar to alpha-fetoprotein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7323727), partial cds. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_003751340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to alpha-fetoprotein (LOC360919), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// XM_003752714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to alpha-fetoprotein (LOC360919), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// XM_006221700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to alpha-fetoprotein (LOC360919), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// XM_006250760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to alpha-fetoprotein (LOC360919), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000060548 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:18938045:18982052:-1 gene:ENSRNOG00000039504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// NONRATT019233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000052040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18944934:19121846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT019229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_172320 // RefSeq // Rattus norvegicus afamin (Afm), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:18987903:19039510:-1 gene:ENSRNOG00000002878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091391 // GenBank // Rattus norvegicus afamin, mRNA (cDNA clone IMAGE:7322187), partial cds. // chr14 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18944934:19121846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_012493 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-fetoprotein (Afp), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:19049096:19067264:-1 gene:ENSRNOG00000002889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC097344 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-fetoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:114356 IMAGE:7459964), complete cds. // chr14 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:18944934:19121846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT019235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT019236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT019237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT019238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT019239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSRNOT00000046734 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:19168957:19169595:-1 gene:ENSRNOG00000033710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:19168957:19178393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_023980 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide FF receptor 2 (Npffr2), mRNA. // chr14 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:20055407:20064042:-1 gene:ENSRNOG00000003067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF268900 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide FF receptor 2 (NPFF2) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:20055407:20064042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001047928 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00190 (LOC498339), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:20362082:20380711:-1 gene:ENSRNOG00000029004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:20362082:20423623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_053424 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 4 (Slc4a4), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 4 (Slc4a4), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:20386111:20723823:-1 gene:ENSRNOG00000003134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:20386111:20723823:-1 gene:ENSRNOG00000003134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF004017 // GenBank // Rattus norvegicus electrogenic Na+ bicarbonate cotransporter (NBC) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF027362 // GenBank // Rattus norvegicus sodium bicarbonate cotransporter (rNBC1) mRNA, complete cds. // chr14 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// AF124441 // GenBank // Rattus norvegicus NBC-like protein (NBC) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF210250 // GenBank // Rattus norvegicus sodium bicarbonate cotransporter mRNA, complete cds. // chr14 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// AF254802 // GenBank // Rattus norvegicus NBC-like protein mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:20362082:20423623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_024158 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxycytidine kinase (Dck), mRNA. // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:20843808:20863311:-1 gene:ENSRNOG00000003296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212366 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YJ12 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L33894 // GenBank // Rattus norvegicus deoxycytidine kinase (Dck) mRNA, complete cds. // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:20827466:20921709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108357 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB kinase activator 1B (Mob1b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MOB kinase activator 1B (Mob1b), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:20870121:20902822:-1 gene:ENSRNOG00000010996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:20827466:20921709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001012036 // RefSeq // Rattus norvegicus UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae) (Utp3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21063887:21065299:-1 gene:ENSRNOG00000003599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC079277 // GenBank // Rattus norvegicus UTP3, small subunit (SSU) processome component, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94402 IMAGE:7134148), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21063887:21065299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106001 // RefSeq // Rattus norvegicus enamelin (Enam), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000049462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21104462:21130928:-1 gene:ENSRNOG00000003672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21104491:21135966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_012900 // RefSeq // Rattus norvegicus ameloblastin (Ambn), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21151296:21164251:-1 gene:ENSRNOG00000003718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// U35097 // GenBank // Rattus norvegicus ameloblastin precursor, mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// Z50083 // GenBank // R.norvegicus mRNA for amelin 1. // chr14 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// Z50084 // GenBank // R.norvegicus mRNA for amelin 2. // chr14 // 90 // 61 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT019263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21151858:21211528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT019264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001044296 // RefSeq // Rattus norvegicus amelotin (Amtn), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065315 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:21199777:21211724:-1 gene:ENSRNOG00000003776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000065778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21199166:21211724:-1 gene:ENSRNOG00000003776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// DQ198381 // GenBank // Rattus norvegicus amelotin mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21151858:21211528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_133513 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich, lacrimal 1 (Prol1), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21252681:21267602:-1 gene:ENSRNOG00000023578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U03407 // GenBank // Rattus norvegicus strain W/Crl apomucin mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT019266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21252681:21268818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NONRATT019267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198729 // RefSeq // Rattus norvegicus variable coding sequence A2 (Vcsa2), mRNA. // chr14 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000002667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21467157:21467453:-1 gene:ENSRNOG00000001945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT019267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000002668 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:21516593:21524162:-1 gene:ENSRNOG00000001948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21516609:21521012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_012684 // RefSeq // Rattus norvegicus variable coding sequence A1 (Vcsa1), mRNA. // chr14 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NM_198729 // RefSeq // Rattus norvegicus variable coding sequence A2 (Vcsa2), mRNA. // chr14 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// X77819 // GenBank // R.norvegicus VCS-alpha1 mRNA for SMR1-alpha1. // chr14 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT019267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT019268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT019269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001017497 // RefSeq // Rattus norvegicus submaxillary gland androgen regulated protein 3A (Smr3a), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000002669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21613121:21616915:-1 gene:ENSRNOG00000001949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21611989:21638064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_022263 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium-binding protein, spermatid-specific 1 (Cabs1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21656185:21658246:-1 gene:ENSRNOG00000001950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF271155 // GenBank // Rattus norvegicus RSD-6 mRNA, complete cds. // chr14 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// BC079062 // GenBank // Rattus norvegicus casein-like phosphoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:94008 IMAGE:7115934), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21657045:21658217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000038520 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:21666335:21668678:-1 gene:ENSRNOG00000023430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21663827:21668678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000038393 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:21680084:21681415:-1 gene:ENSRNOG00000023418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21679439:21687132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_031562 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kappa (Csn3), mRNA. // chr14 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21713823:21720378:-1 gene:ENSRNOG00000001951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// K02598 // GenBank // Rat kappa-casein mRNA, complete cds. // chr14 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21716068:21733809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT019272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001009505 // RefSeq // Rattus norvegicus follicular dendritic cell secreted (LOC494224), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus follicular dendritic cell secreted (LOC494224), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000046005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21729480:21733772:-1 gene:ENSRNOG00000030258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB196306 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for follicular dendritic cell secreted peptide, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21716068:21733809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001044274 // RefSeq // Rattus norvegicus odontogenic, ameloblast asssociated (Odam), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000037003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21753091:21767321:-1 gene:ENSRNOG00000023372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// DQ198380 // GenBank // Rattus norvegicus APIN precursor (Apin) mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT019274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21754252:21787325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NR_003527 // RefSeq // Rattus norvegicus DAZ interacting protein 1, pseudogene 1 (Dzip1-ps1), non-coding RNA. // chr14 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21792007:21794065:-1 gene:ENSRNOG00000046611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY847187 // GenBank // Rattus norvegicus zinc-finger protein DZIP (Dzip) mRNA, complete cds. // chr14 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21792701:21793699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT019275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001064794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC289530 (RGD1310384), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006221703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC289530 (RGD1310384), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC289530 (RGD1310384), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_214018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC289530 (RGD1310384), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000036314 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:21799060:21806402:-1 gene:ENSRNOG00000023342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000048341 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:21799060:21806402:-1 gene:ENSRNOG00000023342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000068032 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:21799195:21806402:-1 gene:ENSRNOG00000023342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000054779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21796408:21858023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_173106 // RefSeq // Rattus norvegicus casein alpha s2-like B (Csn1s2b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000060280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21815030:21831138:-1 gene:ENSRNOG00000039334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY154894 // GenBank // Rattus norvegicus delta casein (Csnd) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000054779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21796408:21858023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001105741 // RefSeq // Rattus norvegicus casein alpha s2-like A (Csn1s2a), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21845520:21859731:-1 gene:ENSRNOG00000039331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21796408:21858023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
AY496457 // GenBank // Rattus norvegicus theobromine induced protein mRNA, complete cds. // chr14 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21871865:21873951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_138874 // RefSeq // Rattus norvegicus casein alpha s1 (Csn1s1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:21908365:21924353:-1 gene:ENSRNOG00000039304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001081708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L30-like (RGD1562394), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21941436:21946852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XR_359436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like (LOC100910436), transcript variant X1, ncRNA. // chr14 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// XR_359437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like (LOC100910436), transcript variant X2, ncRNA. // chr14 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000060207 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:21970940:21971350:-1 gene:ENSRNOG00000039301 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 82 // 96 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:21971034:21971343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0
ENSRNOT00000051535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:22566148:22567005:-1 gene:ENSRNOG00000033211 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_133423 // RefSeq // Rattus norvegicus YTH domain containing 1 (Ythdc1), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22869119:22899609:-1 gene:ENSRNOG00000001996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000002740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:22869119:22899609:-1 gene:ENSRNOG00000001996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF144731 // GenBank // Rattus norvegicus putative splicing factor YT521-B (YT521) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// D78303 // GenBank // Rattus norvegicus YT521 mRNA for RNA splicing-related protein, complete cds. // chr14 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:22869870:22925122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT019286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT019287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT019288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001025115 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducing adaptor family member 1 (Stap1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250814 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal transducing adaptor family member 1 (Stap1), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:23479675:23508138:-1 gene:ENSRNOG00000002014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC091249 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducing adaptor family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:109040 IMAGE:7368126), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal transducing adaptor family member 1 (Stap1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000024176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:23480079:23508105:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1
NONRATT019294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006228962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC100912689), mRNA. // chr14 // 29 // 95 // 12 // 41 // 0 /// XM_006223232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100912683), mRNA. // chr14 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// XM_006228957 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC100912683), mRNA. // chr14 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// FQ228756 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YB13 mRNA sequence. // chr14 // 71 // 98 // 30 // 42 // 0 /// NONRATT001189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 68 // 86 // 25 // 37 // 0
NM_001106002 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide B (Polr2b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:32863627:32901277:-1 gene:ENSRNOG00000024779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:32863747:32898559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031788 // RefSeq // Rattus norvegicus RE1-silencing transcription factor (Rest), mRNA. // chr14 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:32929210:32944266:-1 gene:ENSRNOG00000002074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:32937093:32944266:-1 gene:ENSRNOG00000002074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000064627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:32932198:32944266:-1 gene:ENSRNOG00000002074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// AF037199 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger transcription factor REST protein mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// AF037203 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger transcription factor REST protein mRNA, alternatively spliced product, complete cds. // chr14 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:32929210:32944251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000002860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33180111:33221418:-1 gene:ENSRNOG00000002085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087065 // GenBank // Rattus norvegicus similar to testicular haploid expressed gene product isoform 2, mRNA (cDNA clone MGC:94301 IMAGE:7132384), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006250846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to testicular haploid expressed gene product isoform 2 (LOC498350), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT019312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33181263:33205883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT019313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_212459 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 9 (Arl9), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33227442:33234397:-1 gene:ENSRNOG00000029628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33227553:33236203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT019314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001170601 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle 72 (Srp72), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000002862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33237745:33351416:-1 gene:ENSRNOG00000002100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
XM_006221707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain-containing protein 20-like (LOC102553031), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// XM_006221708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain-containing protein 20-like (LOC102553031), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// XM_006250855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain-containing protein 20-like (LOC102553031), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// XM_006250856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain-containing protein 20-like (LOC102553031), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000002894 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:33387837:33388272:-1 gene:ENSRNOG00000002127 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33326272:33388272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
ENSRNOT00000002908 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:33440563:33469053:-1 gene:ENSRNOG00000002139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074534 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:33440563:33469053:-1 gene:ENSRNOG00000002139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ211842 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA78YJ01 mRNA sequence. // chr14 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33443269:33526515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT019324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
XM_001076228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 135 (Cep135), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000032156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33837370:33892880:-1 gene:ENSRNOG00000002153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000040699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33881351:33892880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000040687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33744588:33875204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 50 // 24 // 48 // 1 /// NONRATT019328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT019329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1
NM_001024770 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 1 (Exoc1), mRNA. // chr14 // 96 // 67 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33923765:33954581:-1 gene:ENSRNOG00000002144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// BC097392 // GenBank // Rattus norvegicus SEC3-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114435 IMAGE:7453203), complete cds. // chr14 // 96 // 67 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT019333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// GENSCAN00000025789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33907513:33933454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// GENSCAN00000025797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33937292:34006516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// NONRATT019332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1 /// NONRATT019335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 15 // 42 // 1 /// NONRATT019331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001024802 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 165 (Tmem165), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34290288:34315304:-1 gene:ENSRNOG00000002199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34336565:34361098:-1 gene:ENSRNOG00000046442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC097478 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 165, mRNA (cDNA clone MGC:114543 IMAGE:7458161), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34336565:34360890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34290979:34315304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001013990 // RefSeq // Rattus norvegicus steroid 5 alpha-reductase 3 (Srd5a3), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34388669:34402835:-1 gene:ENSRNOG00000002216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34388669:34402835:-1 gene:ENSRNOG00000002216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC086584 // GenBank // Rattus norvegicus steroid 5 alpha-reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:105689 IMAGE:7307843), complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34396506:34402835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000025790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34378591:34394249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT019337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_022264 // RefSeq // Rattus norvegicus v-kit Hardy-Zuckerman 4 feline sarcoma viral oncogene homolog (Kit), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000003050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:34903278:34979346:-1 gene:ENSRNOG00000002227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// EU247827 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI Kit oncogene (KIT) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// EU247828 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN Kit oncogene (KIT) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AH010215 // GenBank // Rattus norvegicus c-kit receptor mRNA, partial cds. // chr14 // 41 // 64 // 11 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:34904116:34948297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT019339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_012802 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet derived growth factor receptor, alpha polypeptide (Pdgfra), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006250878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet derived growth factor receptor, alpha polypeptide (Pdgfra), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000003077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:35356435:35409311:-1 gene:ENSRNOG00000002244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000010347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:35359549:35392812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 81 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT019341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 53 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 28 // 28 // 13 // 47 // 1 /// NONRATT019344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
NM_001137563 // RefSeq // Rattus norvegicus GS homeobox 2 (Gsx2), mRNA. // chr14 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000003080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:35479361:35481085:-1 gene:ENSRNOG00000002266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000040111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:35479361:35480954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001008295 // RefSeq // Rattus norvegicus factor interacting with PAPOLA and CPSF1 (Fip1l1), mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000045050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:35976772:36034611:-1 gene:ENSRNOG00000002275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// BC085767 // GenBank // Rattus norvegicus FIP1 like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93674 IMAGE:7192362), complete cds. // chr14 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// EU224276 // GenBank // Rattus norvegicus FIP1-like 1 (Fip1l1) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 75 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:35976928:36034484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT019350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT019351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// NONRATT019352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1 /// NONRATT019353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1
NM_001002830 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS-like family 11 member B (Rasl11b), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:36378166:36382381:-1 gene:ENSRNOG00000002097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083755 // GenBank // Rattus norvegicus RAS-like family 11 member B, mRNA (cDNA clone MGC:94690 IMAGE:7192690), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36379072:36387485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000047334 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:36676446:36677688:-1 gene:ENSRNOG00000029553 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36657431:36687003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_199374 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 18 (Spata18), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:36904437:36931140:-1 gene:ENSRNOG00000002120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB116526 // GenBank // Rattus norvegicus spetex-1 mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC078996 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 18, mRNA (cDNA clone MGC:93900 IMAGE:7112725), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000056045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:36904454:36930940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT019360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT019362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT019363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001108359 // RefSeq // Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 4 (Dcun1d4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 4 (Dcun1d4), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006250908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 4 (Dcun1d4), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37033185:37103735:-1 gene:ENSRNOG00000002152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37036366:37067205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37071399:37187336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT019367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001191677 // RefSeq // Rattus norvegicus cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog (S. cerevisiae) (Cwh43), mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XR_359487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell wall biogenesis 43 C-terminal homolog (S. cerevisiae) (Cwh43), transcript variant X1, misc_RNA. // chr14 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37134059:37180298:-1 gene:ENSRNOG00000002174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000056044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37071399:37187336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT019369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_001013874 // RefSeq // Rattus norvegicus OCIA domain containing 1 (Ociad1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37276461:37293850:-1 gene:ENSRNOG00000002205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083718 // GenBank // Rattus norvegicus OCIA domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94612 IMAGE:7190773), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ213629 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YK19 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT019374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT019375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT019371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT019372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_181385 // RefSeq // Rattus norvegicus zygote arrest 1 (Zar1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37570281:37574217:-1 gene:ENSRNOG00000026150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY283175 // GenBank // Rattus norvegicus zygote arrest 1 (Zar1) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37570448:37574226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008555 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 10, member 4 (Slc10a4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37575344:37580564:-1 gene:ENSRNOG00000026091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY704415 // GenBank // Rattus norvegicus bile acid transporter Slc10a4 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY825923 // GenBank // Rattus norvegicus SLC10A4 (Slc10a4) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37575344:37580564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107214 // RefSeq // Rattus norvegicus SLAIN motif family, member 2 (Slain2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006250900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLAIN motif family, member 2 (Slain2), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37612584:37681311:-1 gene:ENSRNOG00000002271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37614369:37681070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001106003 // RefSeq // Rattus norvegicus NIPA-like domain containing 1 (Nipal1), mRNA. // chr14 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:37917250:37938562:-1 gene:ENSRNOG00000025882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:37917355:37939207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_002724961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A (Leucine-rich acidic nuclear protein) (LOC680377), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000047918 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:38170828:38171544:-1 gene:ENSRNOG00000033977 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38170818:38171544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
XM_006250933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class V, type 10D (Atp10d), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000003146 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:38288165:38385637:-1 gene:ENSRNOG00000002312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000012666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38309802:38335494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// GENSCAN00000012631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38340459:38382802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT019389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1 /// NONRATT019390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1
NM_012956 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, beta 1 (Gabrb1), mRNA. // chr14 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:38453156:38924075:-1 gene:ENSRNOG00000002327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38453584:38474037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT019393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000035056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:39667505:39667807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_001107215 // RefSeq // Rattus norvegicus GUF1 GTPase homolog (S. cerevisiae) (Guf1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000003017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:62712388:62731766:1 gene:ENSRNOG00000002207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:62712529:62725490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT018520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
GENSCAN00000048842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:62252084:62252606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_022229 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 1 (chaperonin) (Hspd1), mRNA. // chr14 // 27 // 100 // 8 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61361746:61372172:-1 gene:ENSRNOG00000014525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 27 // 100 // 8 // 30 // 0 /// BC086507 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 1 (chaperonin), mRNA (cDNA clone MGC:91701 IMAGE:7103955), complete cds. // chr14 // 27 // 100 // 8 // 30 // 0 /// X54793 // GenBank // Rat liver mRNA for heat shock protein (hsp60). // chr14 // 27 // 100 // 8 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:62058544:62059788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 85 // 43 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT018518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000059450 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:62058437:62060138:1 gene:ENSRNOG00000038897 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 53 // 100 // 16 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003034 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:41391394:41393101:1 gene:ENSRNOG00000002233 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 27 // 100 // 8 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61357939:61381696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 29 // 93 // 8 // 28 // 0 /// NONRATT057878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 27 // 100 // 8 // 30 // 0
AY539908 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00157 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191935 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaredoxin, cysteine rich 1 (Grxcr1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:41461372:41583874:-1 gene:ENSRNOG00000038891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:41439235:41520305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT019396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT019397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000012275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:41521351:41583809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001109087 // RefSeq // Rattus norvegicus shisa family member 3 (Shisa3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:42013407:42017978:-1 gene:ENSRNOG00000025670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168960 // GenBank // Rattus norvegicus shisa homolog 3 (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:189276 IMAGE:9023733), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:42014364:42017458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109088 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9 (Slc30a9), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006250965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 9 (Slc30a9), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:42260672:42315461:-1 gene:ENSRNOG00000002246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// FQ222791 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA19YO05 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:42274599:42352331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT019404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT019405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_021671 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 33 (Tmem33), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000003128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:42334624:42355562:-1 gene:ENSRNOG00000002254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB006135 // GenBank // Rattus norvegicus db83 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_001034198 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 33 (Tmem33), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// NONRATT019403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT019407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000036988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:42274599:42352331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001191678 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM and calponin homology domains 1 (Limch1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006250944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM and calponin homology domains 1 (Limch1), transcript variant X10, mRNA. // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000064263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:42560956:42868253:-1 gene:ENSRNOG00000002318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:42561616:42654801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000054494 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:42907551:42907615:-1 gene:ENSRNOG00000036376 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_017237 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L1 (ubiquitin thiolesterase) (Uchl1), mRNA. // chr14 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:42928247:42938965:-1 gene:ENSRNOG00000002343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC060573 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L1 (ubiquitin thiolesterase), mRNA (cDNA clone MGC:72862 IMAGE:6920680), complete cds. // chr14 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// D10699 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase PGP9.5, complete cds. // chr14 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// FQ219907 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YO17 mRNA sequence. // chr14 // 70 // 97 // 21 // 30 // 0 /// XR_359519 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L1 (ubiquitin thiolesterase) (Uchl1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr14 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// XR_359520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L1 (ubiquitin thiolesterase) (Uchl1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr14 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000057310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:42928553:42938916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001017452 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP2/Sun domain family, member 7 (Nsun7), mRNA. // chr14 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// XM_006250947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NOP2/Sun domain family, member 7 (Nsun7), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// XM_006250948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NOP2/Sun domain family, member 7 (Nsun7), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000039835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:43346771:43374401:-1 gene:ENSRNOG00000025494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// BC083653 // GenBank // Rattus norvegicus NOL1/NOP2/Sun domain family, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:94486 IMAGE:7135159), complete cds. // chr14 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:43370510:43373829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 27 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000057311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:43316624:43349319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 49 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 71 // 71 // 29 // 41 // 1
NM_022930 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 9 (neuronal) (Chrna9), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:43670533:43677246:-1 gene:ENSRNOG00000002484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY574257 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha9 subunit mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// U12336 // GenBank // Rattus norvegicus acetylcholine receptor alpha 9 subunit (nAChR) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:43670932:43699554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001013430 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member H (Rhoh), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:43781206:43812028:-1 gene:ENSRNOG00000002540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091269 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member H, mRNA (cDNA clone MGC:109123 IMAGE:7381512), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228192 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YC17 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ232637 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YP16 mRNA sequence. // chr14 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT019431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
XM_006250985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD4 binding protein 2 (N4bp2), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006250987 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD4 binding protein 2 (N4bp2), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000031792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:43850808:43892633:-1 gene:ENSRNOG00000027152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:43868222:43896320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:43799743:43865859:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_001058222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L14-like (LOC680579), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_002724967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L14-like (LOC680579), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049161 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:44044699:44045325:-1 gene:ENSRNOG00000032160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44044699:44045325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001106006 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2K (Ube2k), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006250934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2K (Ube2k), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000030485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44108859:44168631:-1 gene:ENSRNOG00000027088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44113015:44115903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT019437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONRATT019441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONRATT019440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001012037 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoic acid synthetase (Lias), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44326599:44343665:-1 gene:ENSRNOG00000002759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083708 // GenBank // Rattus norvegicus lipoic acid synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:94598 IMAGE:7190554), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44327573:44343602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006250990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus klotho beta (Klb), mRNA. // chrU // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000003811 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:44362636:44427932:-1 gene:ENSRNOG00000002834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 52 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000059243 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:44429432:44430003:-1 gene:ENSRNOG00000038777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44429557:44430661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001191679 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 19 (Wdr19), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000003991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44519192:44580950:-1 gene:ENSRNOG00000002932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44519874:44573975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 78 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT019448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
XM_003751361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial carrier triple repeat protein 1-like (LOC100910864), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006221762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial carrier triple repeat protein 1-like (LOC100910864), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000073146 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:45873681:45874577:-1 gene:ENSRNOG00000047400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000074180 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:44616730:44617626:-1 gene:ENSRNOG00000046678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:45873207:45874577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44605272:44617626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001047093 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 5 (Klhl5), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006250959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 5 (Klhl5), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44618848:44658817:-1 gene:ENSRNOG00000008421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AY641809 // GenBank // Rattus norvegicus myocardial ischemic preconditioning associated protein 6 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44619949:44658651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_001056810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 114, member A1-like 1 (Fam114a1l1), mRNA. // chr14 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// XM_006221763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 114, member A1 (Fam114a1), mRNA. // chr14 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// XM_237514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 114, member A1-like 1 (Fam114a1l1), mRNA. // chr14 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002883 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:44756277:44815155:-1 gene:ENSRNOG00000026504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:119555072:119556772:-1 gene:ENSRNOG00000002110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44756277:44815155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:119555072:119556772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 94 // 25 // 29 // 0 /// NONRATT019457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001105742 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 3 (basic) (Klf3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:44952288:44974726:-1 gene:ENSRNOG00000002163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:44956010:45007839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 (tre-2/USP6, BUB2, cdc16) domain family, member 1 (Tbc1d1), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006251006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 (tre-2/USP6, BUB2, cdc16) domain family, member 1 (Tbc1d1), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000002965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:45405698:45590253:-1 gene:ENSRNOG00000002180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000029209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:45405698:45590253:-1 gene:ENSRNOG00000002180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000018768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:45405698:45528407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT019463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1
NM_001106007 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 2 (Pgm2), mRNA. // chr14 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// XM_006250997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphoglucomutase 2 (Pgm2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:45635119:45669788:-1 gene:ENSRNOG00000002185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC160893 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 2, mRNA (cDNA clone MGC:188332 IMAGE:7445317), complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:45603146:45693146:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001113776 // RefSeq // Rattus norvegicus RELT-like 1 (Rell1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006250998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RELT-like 1 (Rell1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:45787243:45835906:1 gene:ENSRNOG00000002192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158872 // GenBank // Rattus norvegicus RELT-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188531 IMAGE:7932431), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221372 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA37YE04 mRNA sequence. // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// FQ224412 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA67YI02 mRNA sequence. // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:45787317:45832301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_223426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat and WD repeat-containing protein KIAA1239-like (RGD1563065), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002978 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:45938969:46347907:-1 gene:ENSRNOG00000002190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033315 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:46237781:46347907:-1 gene:ENSRNOG00000002190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:46238964:46329409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000007226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:46342335:46350063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
GENSCAN00000015459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:47023948:47044778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000002985 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:47023948:47024961:-1 gene:ENSRNOG00000002195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
XR_340284 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transformer-2 protein homolog beta-like (LOC685935), misc_RNA. // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000029824 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:48780281:48781151:-1 gene:ENSRNOG00000002201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001004087 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin 7 (Pcdh7), mRNA. // chr14 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin 7 (Pcdh7), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// XM_006251022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin 7 (Pcdh7), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 94 // 50 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000049245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:54787857:55216817:-1 gene:ENSRNOG00000012367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// AY690613 // GenBank // Rattus norvegicus protocadherin 7a (Pcdh7) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AY690614 // GenBank // Rattus norvegicus protocadherin 7b (Pcdh7) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// AY690615 // GenBank // Rattus norvegicus protocadherin 7c (Pcdh7) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// AY690616 // GenBank // Rattus norvegicus protocadherin 7c1 (Pcdh7) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:55147843:55216817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0