XM_001081191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vascular endothelial zinc finger 1 (Vezf1), partial mRNA. // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000055705 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:74727293:74736259:-1 gene:ENSRNOG00000009819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NM_001109552 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 1 (Srsf1), mRNA. // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// XR_357800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 1 (Srsf1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr10 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000073005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74759412:74765463:-1 gene:ENSRNOG00000050323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000043680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74727555:74781587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT011792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT011794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001013971 // RefSeq // Rattus norvegicus CUE domain containing 1 (Cuedc1), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74590109:74610568:-1 gene:ENSRNOG00000010257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC087087 // GenBank // Rattus norvegicus CUE domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94570 IMAGE:7189849), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000043684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74570352:74615396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT011786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001108289 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S23 (Mrps23), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000013771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74570150:74577912:-1 gene:ENSRNOG00000010363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ213501 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YH14 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74570352:74615396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT011784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001277485 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 182 (Ccdc182), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006247075 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 182 (Ccdc182), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013882 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:74487832:74488266:-1 gene:ENSRNOG00000010446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74487832:74493258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_003750899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein, transmembrane 1 (Rnft1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006220765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein, transmembrane 1 (Rnft1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein, transmembrane 1 (Rnft1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005064 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:76280989:76290422:-1 gene:ENSRNOG00000003805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:76285044:76292604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// FQ232570 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YD19 mRNA sequence. // chr10 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001105826 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, delta 1 (Tubd1), mRNA. // chr10 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// XM_006247081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin, delta 1 (Tubd1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// XM_006247083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin, delta 1 (Tubd1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:76212408:76233751:-1 gene:ENSRNOG00000003938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:76212716:76237726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT011842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0
XM_221241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1304870), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000051823 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:73828710:73829048:-1 gene:ENSRNOG00000029479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 60 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000011895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73820291:73829048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_001081217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1564031), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_577119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1564031), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000071720 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:73812434:73812754:-1 gene:ENSRNOG00000047989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73812425:73812754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_017360 // RefSeq // Rattus norvegicus coilin (Coil), mRNA. // chr10 // 92 // 74 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73778176:73791920:-1 gene:ENSRNOG00000000244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// AF399643 // GenBank // Rattus norvegicus p80 coilin mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 74 // 23 // 25 // 0 /// XM_006247072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coilin (Coil), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// GENSCAN00000008658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73762453:73798485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// NONRATT011778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001009536 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 25 (Trim25), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73754576:73769423:-1 gene:ENSRNOG00000002341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC061749 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 25, mRNA (cDNA clone MGC:72607 IMAGE:5599464), complete cds. // chrU // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT011770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73754231:73761031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001017479 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 100 (Tmem100), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:77399483:77405339:1 gene:ENSRNOG00000002434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079110 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7125717. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC092577 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 100, mRNA (cDNA clone MGC:108778 IMAGE:7124708), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220873 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YF24 mRNA sequence. // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT009526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001007673 // RefSeq // Rattus norvegicus monocyte to macrophage differentiation-associated (Mmd), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus monocyte to macrophage differentiation-associated (Mmd), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:77617043:77645125:1 gene:ENSRNOG00000002436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF540876 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage/microglia activation-associated factor (Maf) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// BC081965 // GenBank // Rattus norvegicus monocyte to macrophage differentiation-associated, mRNA (cDNA clone MGC:94095 IMAGE:7125235), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:77616598:77643390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109575 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly homolog 11 (yeast) (Cox11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072294 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:78023828:78028723:1 gene:ENSRNOG00000046318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:77969326:78029697:1 gene:ENSRNOG00000002458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:78023828:78028723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:77964361:77970244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT009537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000042211 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:78264201:78264572:1 gene:ENSRNOG00000032558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:78264186:78275936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054437 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:10:78646951:78647046:1 gene:ENSRNOG00000047340 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000027599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:78550650:78706680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_002727772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 10 (Ca10), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_003752367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 10 (Ca10), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000003553 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:80633889:81131156:1 gene:ENSRNOG00000002626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000075163 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:80633889:81150503:1 gene:ENSRNOG00000002626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006220781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 10 (Ca10), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// XM_006247157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 10 (Ca10), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000003921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81095532:81148126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NONRATT009544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001108290 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 9 (Spag9), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006247148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm associated antigen 9 (Spag9), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81527102:81660894:1 gene:ENSRNOG00000002749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC168954 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9026960, partial cds. // chr10 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// GENSCAN00000012194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81601619:81688475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 60 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT009549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT009553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONRATT009554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NM_133317 // RefSeq // Rattus norvegicus transducer of ErbB-2.1 (Tob1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81746522:81748549:1 gene:ENSRNOG00000002828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF349723 // GenBank // Rattus norvegicus TOB1 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81746666:81747766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT009560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134699 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 40 (Ankrd40), mRNA. // chr10 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81865469:81878114:1 gene:ENSRNOG00000002935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// BC166790 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 40, mRNA (cDNA clone MGC:188577 IMAGE:7936453), complete cds. // chr10 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// NONRATT009561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81865672:81880278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000002188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57601330:57603024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_019164 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroadherin (Chad), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82111981:82115751:1 gene:ENSRNOG00000003304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF004953 // GenBank // Rattus norvegicus chondroadherin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82112031:82114987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT009565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001008280 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 59 (Lrrc59), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82171007:82185664:1 gene:ENSRNOG00000003524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC086530 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:105677 IMAGE:7304726), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82152515:82183995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001105831 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L27 (Mrpl27), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82194180:82199911:1 gene:ENSRNOG00000003724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212021 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YE15 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82194194:82199707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053304 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type I, alpha 1 (Col1a1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000005311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82563434:82580363:1 gene:ENSRNOG00000003897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// BC133728 // GenBank // Rattus norvegicus collagen, type I, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:156780 IMAGE:7125649), complete cds. // chr10 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000022759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82563545:82579011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 94 // 48 // 49 // 0 /// NONRATT009569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0 /// NONRATT009570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 19 // 52 // 1
NM_001109565 // RefSeq // Rattus norvegicus histone linker H1 domain, spermatid-specific 1 (Hils1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82593265:82594061:1 gene:ENSRNOG00000024041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82593486:82593995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053474 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 9B (Ppp1r9b), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000005498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82616848:82632352:1 gene:ENSRNOG00000004052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AF016252 // GenBank // Rattus norvegicus Spinophilin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC160878 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 9B, mRNA (cDNA clone MGC:188268 IMAGE:7376917), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000022751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82616853:82647901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT009576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT009578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1
NM_001024966 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 14 (Samd14), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82639539:82647961:1 gene:ENSRNOG00000004155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC091329 // GenBank // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 14, mRNA (cDNA clone MGC:109312 IMAGE:7313977), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82616853:82647901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT009581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001105832 // RefSeq // Rattus norvegicus distal-less homeobox 3 (Dlx3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82748717:82754094:1 gene:ENSRNOG00000004278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82748902:82752519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001100496 // RefSeq // Rattus norvegicus speckle-type POZ protein (Spop), mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83040649:83121496:1 gene:ENSRNOG00000004686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC166743 // GenBank // Rattus norvegicus speckle-type POZ protein, mRNA (cDNA clone MGC:188472 IMAGE:7938440), complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// FQ217100 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA35YJ06 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83099937:83120377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT009600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT009602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_172328 // RefSeq // Rattus norvegicus tachykinin 4 (hemokinin) (Tac4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82891623:82899774:1 gene:ENSRNOG00000004404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF521561 // GenBank // Rattus norvegicus preprotachykinin C mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY471575 // GenBank // Rattus norvegicus tachykinin 4 precursor (Tac4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82891623:82903558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001109039 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 117, member A (Fam117a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82964187:83008064:1 gene:ENSRNOG00000004417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC168983 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 117, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189322 IMAGE:7387439), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82978130:83041347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT009590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT009591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT009592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_199081 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member B1 (Slc35b1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83010919:83017992:1 gene:ENSRNOG00000004510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY349135 // GenBank // Rattus norvegicus galactose transporter mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085347 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:105266 IMAGE:7305181), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ213149 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YH08 mRNA sequence. // chr10 // 73 // 100 // 22 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82978130:83041347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT009593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT009596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT009597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NONRATT009599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001080207 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 652 (Zfp652), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83360955:83376165:1 gene:ENSRNOG00000017001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC129097 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 652, mRNA (cDNA clone MGC:156681 IMAGE:8365300), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001105833 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatase, orphan 1 (Phospho1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83440620:83447961:1 gene:ENSRNOG00000005569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169002 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatase, orphan 1, mRNA (cDNA clone MGC:189360 IMAGE:7455281), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83365647:83447166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT009610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135767 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 2 (Gngt2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 2 (Gngt2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 2 (Gngt2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 2 (Gngt2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma transducing activity polypeptide 2 (Gngt2), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000008011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83459562:83462703:1 gene:ENSRNOG00000006108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83461999:83478974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT009611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_019630 // RefSeq // Rattus norvegicus gastric inhibitory polypeptide (Gip), mRNA. // chr10 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83645328:83653498:1 gene:ENSRNOG00000006306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// L08831 // GenBank // Rat glucose-dependent insulinotropic peptide (GIP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// M92916 // GenBank // Rat glucose-dependent insulinotropic peptide mRNA exons 1-5, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// X66724 // GenBank // R.norvegicus mRNA for gastric inhibitory peptide (GIP). // chr10 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83646077:83653386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 46 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 87 // 87 // 40 // 46 // 1 /// NONRATT009616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 83 // 83 // 38 // 46 // 1
NM_001007804 // RefSeq // Rattus norvegicus SNF8, ESCRT-II complex subunit (Snf8), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SNF8, ESCRT-II complex subunit (Snf8), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000008964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83661391:83673470:1 gene:ENSRNOG00000006500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC086364 // GenBank // Rattus norvegicus SNF8, ESCRT-II complex subunit, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105799 IMAGE:7304427), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83667184:83673397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT009618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT009620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
XM_006220819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 6 (Ttll6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 6 (Ttll6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006594 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:83767057:83796911:1 gene:ENSRNOG00000004939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83767205:83773935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83778780:83796911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
NM_001107041 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box B13 (Hoxb13), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83834616:83836889:1 gene:ENSRNOG00000007491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83834735:83847538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT009622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NR_032269 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-196c (Mir196c), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053633 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:83916623:83916702:1 gene:ENSRNOG00000035510 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-196c // miRBase Micro RNA Database // MI0006136 Rattus norvegicus miR-196c stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100497 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box B9 (Hoxb9), mRNA. // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000009951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83922929:83926435:1 gene:ENSRNOG00000007573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000033635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83922929:83926251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001191649 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box B8 (Hoxb8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83934227:83935978:1 gene:ENSRNOG00000007585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83934227:83940840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT009628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001017480 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box B7 (Hoxb7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83937956:83941372:1 gene:ENSRNOG00000007611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079340 // GenBank // Rattus norvegicus homeo box B7, mRNA (cDNA clone MGC:94784 IMAGE:7106610), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83934227:83940840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_003752371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box B6 (Hoxb6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box B6 (Hoxb6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010527 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:83950568:83952332:1 gene:ENSRNOG00000007823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT009632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT009635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001191925 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box B5 (Hoxb5), mRNA. // chr10 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000010724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83954884:83957092:1 gene:ENSRNOG00000008010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT009632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031814 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 10a (Mir10a), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053658 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:83968682:83968791:1 gene:ENSRNOG00000035535 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-10a // miRBase Micro RNA Database // MI0000841 Rattus norvegicus miR-10a stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001100787 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box B4 (Hoxb4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83970063:83972639:1 gene:ENSRNOG00000008191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161863 // GenBank // Rattus norvegicus homeo box B4, mRNA (cDNA clone MGC:187401 IMAGE:7098209), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83970279:84005341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001107042 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box B3 (Hoxb3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83984850:83997960:1 gene:ENSRNOG00000008313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC166859 // GenBank // Rattus norvegicus homeo box B3, mRNA (cDNA clone MGC:188766 IMAGE:9100655), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83970279:84005341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_002727806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox B2 (Hoxb2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011213 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:84003533:84005341:1 gene:ENSRNOG00000008365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83970279:84005341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT009643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_001081344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box B1 (Hoxb1), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_220896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box B1 (Hoxb1), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84017011:84018340:1 gene:ENSRNOG00000008506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84016917:84018340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_173311 // RefSeq // Rattus norvegicus src kinase associated phosphoprotein 1 (Skap1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus src kinase associated phosphoprotein 1 (Skap1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84110240:84412121:1 gene:ENSRNOG00000023881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB092812 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SKAP55 adaptor protein, complete cds. // chr10 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC097931 // GenBank // Rattus norvegicus src kinase associated phosphoprotein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116044 IMAGE:7389090), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84357429:84407609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT009646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000011665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84462829:84468656:1 gene:ENSRNOG00000008689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000071236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84462829:84470096:1 gene:ENSRNOG00000008689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// XM_006220821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 1 (Cbx1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// XM_006247233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 1 (Cbx1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// XM_006220822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 1 (Cbx1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// XM_006247234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox homolog 1 (Cbx1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000050918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84462829:84468656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT009650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT009651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001108294 // RefSeq // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit zeta 2 (Copz2), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84511733:84524391:1 gene:ENSRNOG00000009225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ225734 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YA05 mRNA sequence. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84496637:84547027:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NR_031894 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-152 (Mir152), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053662 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:84512232:84512316:1 gene:ENSRNOG00000035539 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-152 // miRBase Micro RNA Database // MI0000921 Rattus norvegicus miR-152 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108833 // RefSeq // Rattus norvegicus Sp6 transcription factor (Sp6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84746349:84750530:1 gene:ENSRNOG00000023551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84741798:84749748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012142 // RefSeq // Rattus norvegicus secernin 2 (Scrn2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secernin 2 (Scrn2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84757537:84761506:1 gene:ENSRNOG00000010214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078939 // GenBank // Rattus norvegicus secernin 2, mRNA (cDNA clone MGC:93754 IMAGE:7108372), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84757966:84761386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001109620 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L10 (Mrpl10), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84766862:84775278:1 gene:ENSRNOG00000009567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84770202:84775278:1 gene:ENSRNOG00000009567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84770202:84773420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT009665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107044 // RefSeq // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 7 (Osbpl7), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000067665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84776869:84794423:1 gene:ENSRNOG00000009473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000031125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84776869:84810133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT009667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT009666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
GENSCAN00000031149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84920108:84922113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0
NM_001105834 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L45 (Mrpl45), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85047890:85059050:1 gene:ENSRNOG00000010540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85033294:85058536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
GENSCAN00000031137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85085490:85233279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006247484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 7 (Socs7), partial mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014943 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:85087048:85118959:1 gene:ENSRNOG00000011204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85085490:85233279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT009673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006247441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 23 (Arhgap23), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// XM_220918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 23 (Arhgap23), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000034305 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:85144259:85233279:1 gene:ENSRNOG00000022771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000031137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85085490:85233279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT009679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 73 // 73 // 36 // 49 // 1
XM_006247441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 23 (Arhgap23), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_220918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 23 (Arhgap23), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034305 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:85144259:85233279:1 gene:ENSRNOG00000022771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85085490:85233279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105835 // RefSeq // Rattus norvegicus CDGSH iron sulfur domain 3 (Cisd3), mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006247269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDGSH iron sulfur domain 3 (Cisd3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85415958:85418989:1 gene:ENSRNOG00000036894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85386218:85418811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT009690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006221022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 6 (Mllt6), partial mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000016924 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:85395401:85411740:1 gene:ENSRNOG00000012135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 93 // 36 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000073560 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:85395401:85411740:1 gene:ENSRNOG00000012135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 93 // 36 // 39 // 0 /// GENSCAN00000011605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85386218:85418811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 76 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT009684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// NONRATT009682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// NONRATT009683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_017285 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 3 (Psmb3), mRNA. // chr10 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85437464:85444560:1 gene:ENSRNOG00000012938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC084723 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 3, mRNA (cDNA clone MGC:105457 IMAGE:7319054), complete cds. // chr10 // 81 // 75 // 17 // 21 // 0 /// FQ232780 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YH07 mRNA sequence. // chr10 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85437666:85444427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 61 // 13 // 17 // 0 /// NONRATT009691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 79 // 86 // 19 // 24 // 0 /// NONRATT009692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_032613 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM and SH3 protein 1 (Lasp1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85533431:85573897:1 gene:ENSRNOG00000004132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF242187 // GenBank // Rattus norvegicus LASP-1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC099791 // GenBank // Rattus norvegicus LIM and SH3 protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:124593 IMAGE:7934892), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85533517:85571375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT009693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NONRATT009694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033867 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 12 (Cdk12), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_138916 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 12 (Cdk12), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85954655:86008029:1 gene:ENSRNOG00000006000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY072294 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase for splicing component (Pksc) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY962568 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 12 isoform (Cdk12) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 12 (Cdk12), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000004547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85954720:86007049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_147142 // RefSeq // Rattus norvegicus hippyragranin (LOC257650), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86020708:86034258:1 gene:ENSRNOG00000028430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF260582 // GenBank // Rattus norvegicus hippyragranin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT009705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT009706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_138521 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1B (Ppp1r1b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1B (Ppp1r1b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000037752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86100811:86109846:1 gene:ENSRNOG00000028404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY601872 // GenBank // Rattus norvegicus dopamine- and cAMP-regulated phosphoprotein DARPP-32 (Ppp1r1b) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078954 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1B, mRNA (cDNA clone MGC:93809 IMAGE:7110316), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86099306:86138369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001014229 // RefSeq // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 3 (Stard3), mRNA. // chr10 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86110514:86133022:1 gene:ENSRNOG00000042044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// BC085872 // GenBank // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:94636 IMAGE:7191363), complete cds. // chr10 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT009710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT009711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT009713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86099306:86138369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT009712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_017003 // RefSeq // Rattus norvegicus v-erb-b2 avian erythroblastic leukemia viral oncogene 2 (Erbb2), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86163531:86187663:1 gene:ENSRNOG00000006450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86163531:86187663:1 gene:ENSRNOG00000006450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY116182 // GenBank // Rattus norvegicus neu protooncoprotein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC061863 // GenBank // Rattus norvegicus v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian), mRNA (cDNA clone MGC:72502 IMAGE:5597835), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071765 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:84628031:84635055:1 gene:ENSRNOG00000049238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000004535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86163636:86186821:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84627302:84635055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_220923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 3C (Lrrc3c), mRNA. // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000039892 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:86361244:86362011:1 gene:ENSRNOG00000031298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000003679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86361244:86362011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_053403 // RefSeq // Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 7 (Grb7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 7 (Grb7), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 7 (Grb7), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 7 (Grb7), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86195776:86204819:1 gene:ENSRNOG00000006990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF190121 // GenBank // Rattus norvegicus growth factor receptor binding protein GRB7 (Grb7) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC081757 // GenBank // Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:93307 IMAGE:7109771), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86192058:86204460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT009717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001007011 // RefSeq // Rattus norvegicus zona pellucida binding protein 2 (Zpbp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zona pellucida binding protein 2 (Zpbp2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zona pellucida binding protein 2 (Zpbp2), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86310808:86319304:1 gene:ENSRNOG00000007255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86310808:86319304:1 gene:ENSRNOG00000007255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY251605 // GenBank // Rattus norvegicus zona pellucida binding protein 2 (Zpbp2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY251606 // GenBank // Rattus norvegicus zona pellucida binding protein 2 (Zpbp2) mRNA, complete cds; alternative transcript. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC082007 // GenBank // Rattus norvegicus zona pellucida binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94255 IMAGE:7131668), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86310912:86338460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001108297 // RefSeq // Rattus norvegicus gasdermin A (Gsdma), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006247347 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gasdermin A (Gsdma), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86378928:86391418:1 gene:ENSRNOG00000007943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC112385 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7934826. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000003681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86380530:86407109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT009724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT009725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT009726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001008281 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 3 (Psmd3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000039836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86395552:86407493:1 gene:ENSRNOG00000028103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC085881 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 3, mRNA (cDNA clone MGC:94658 IMAGE:7191926), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86380530:86407109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT009727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT009728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_017104 // RefSeq // Rattus norvegicus colony stimulating factor 3 (granulocyte) (Csf3), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86413103:86415475:1 gene:ENSRNOG00000008525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U37101 // GenBank // Rattus norvegicus granulocyte colony stimulating factor mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT009730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86412198:86414147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001017960 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor alpha (Thra), transcript variant TRalpha1, mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// M18028 // GenBank // Rat thyroid hormone receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// NM_031134 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone receptor alpha (Thra), transcript variant TRalpha2, mRNA. // chr10 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000012340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86465253:86480926:1 gene:ENSRNOG00000009066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// M31174 // GenBank // Rat c-erbA-alpha-2-related protein mRNA, complete cds. // chr10 // 85 // 85 // 33 // 39 // 1 /// M31177 // GenBank // Rat c-erbA-alpha-2 protein mRNA, complete cds. // chr10 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1 /// GENSCAN00000003678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86468116:86476521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT009732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001107048 // RefSeq // Rattus norvegicus male-specific lethal 1 homolog (Drosophila) (Msl1), mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86507519:86517491:1 gene:ENSRNOG00000009643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// FQ228290 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA101YF12 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86507519:86516643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT009737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT009736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_147144 // RefSeq // Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 3 (Casc3), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86520779:86540730:1 gene:ENSRNOG00000009716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF525467 // GenBank // Rattus norvegicus metastatic lymph node 51 (Mln51) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86520779:86550901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_001081409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF)-like 1 (Rapgefl1), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF)-like 1 (Rapgefl1), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC091361 // GenBank // Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF)-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7318913), complete cds. // chr10 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000030425 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:86545853:86561330:1 gene:ENSRNOG00000027871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86557418:86673844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT009744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
NM_001191825 // RefSeq // Rattus norvegicus WAS/WASL interacting protein family, member 2 (Wipf2), mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAS/WASL interacting protein family, member 2 (Wipf2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006247350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAS/WASL interacting protein family, member 2 (Wipf2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAS/WASL interacting protein family, member 2 (Wipf2), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86591015:86607288:1 gene:ENSRNOG00000027849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86557418:86673844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001108298 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 6 (Cdc6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000038228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86614893:86628265:1 gene:ENSRNOG00000027787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86557418:86673844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_031528 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid receptor, alpha (Rara), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86663849:86681847:1 gene:ENSRNOG00000009972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AJ002940 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for retinoic acid receptor alpha1, partial. // chr10 // 95 // 63 // 21 // 22 // 0 /// BC099830 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid receptor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:124599 IMAGE:7933868), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// U15211 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid receptor alpha 2 isoform (RAR) mRNA, complete cds. // chr10 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86678147:86681585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// GENSCAN00000003675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86557418:86673844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NM_001004274 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 4 (Igfbp4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86747476:86759481:1 gene:ENSRNOG00000010635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY686592 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding 4 (Igfbp4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC098750 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:112770 IMAGE:7368649), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86747717:86758327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000031735 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87446948:87448582:1 gene:ENSRNOG00000027660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000021252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87447926:87448684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
XM_006247454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 4-7-like (LOC100909494), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017313 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87498673:87499272:1 gene:ENSRNOG00000012973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
XM_006221025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 9-1-like (LOC100910814), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006247455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 9-1-like (LOC100910814), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000044342 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87577729:87578283:1 gene:ENSRNOG00000030477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001109406 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680428 (LOC680428), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000065405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87597604:87598555:1 gene:ENSRNOG00000042701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT009762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_002724639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680442 (LOC680442), mRNA. // chr10 // 76 // 85 // 13 // 17 // 0 /// XM_002727813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680442 (LOC680442), mRNA. // chr10 // 76 // 85 // 13 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000064626 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87608349:87609312:1 gene:ENSRNOG00000042736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 60 // 9 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073764 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87608349:87609312:1 gene:ENSRNOG00000042736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 60 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000021248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87608349:87608858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 85 // 13 // 17 // 0
NM_001109409 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin associated protein 31-1 (Krtap31-1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000055286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87622124:87623056:1 gene:ENSRNOG00000036838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_002724639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680442 (LOC680442), mRNA. // chr10 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// XM_002727813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680442 (LOC680442), mRNA. // chr10 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000064626 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87608349:87609312:1 gene:ENSRNOG00000042736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT009763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000021248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87608349:87608858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
BC159406 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:188673 IMAGE:8361778), complete cds. // chr10 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// FQ212688 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YO06 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT009766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT009769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
NM_012849 // RefSeq // Rattus norvegicus gastrin (Gast), mRNA. // chr10 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000019863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88038779:88041731:1 gene:ENSRNOG00000014740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M38653 // GenBank // Rat gastrin mRNA, complete cds. // chr10 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88041220:88041645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 68 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT009770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001014120 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 10 (Fkbp10), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88119584:88131443:1 gene:ENSRNOG00000015941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085854 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:94575 IMAGE:7190051), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88119638:88130687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001001510 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 10 (Klhl10), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88149899:88166176:1 gene:ENSRNOG00000016749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AY495338 // GenBank // Rattus norvegicus KLHL10 (Klhl10) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC085842 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 10 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94527 IMAGE:7135823), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88150006:88166098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107049 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 25 (Ttc25), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88252737:88281484:1 gene:ENSRNOG00000017473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC162060 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 25, mRNA (cDNA clone MGC:188060 IMAGE:7115660), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88267191:88281322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88252852:88262090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT009776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
L16532 // GenBank // Rattus norvegicus 2,3-cyclic nucleotide 3-phosphodiesterase (CnpII) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// M18630 // GenBank // Rattus norvegicus 2,3-cyclic nucleotide 3-phosphodiesterase (CnpI) mRNA, complete cds. // chr10 // 70 // 67 // 14 // 20 // 0 /// NM_012809 // RefSeq // Rattus norvegicus 2,3-cyclic nucleotide 3 phosphodiesterase (Cnp), mRNA. // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000023872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88284045:88290603:1 gene:ENSRNOG00000017496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// BC098066 // GenBank // Rattus norvegicus 2,3-cyclic nucleotide 3 phosphodiesterase, mRNA (cDNA clone MGC:116229 IMAGE:7458826), complete cds. // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000019199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88285374:88289645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT009779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT009782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT009780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001105839 // RefSeq // Rattus norvegicus NFKB inhibitor interacting Ras-like 2 (Nkiras2), mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_006247274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NFKB inhibitor interacting Ras-like 2 (Nkiras2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88331030:88335057:1 gene:ENSRNOG00000018095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC168163 // GenBank // Rattus norvegicus NFKB inhibitor interacting Ras-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:187614 IMAGE:8366401), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000019227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88332046:88333681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT009785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001108835 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein, alpha-crystallin-related, B9 (Hspb9), mRNA. // chr10 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000055248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88414868:88415513:1 gene:ENSRNOG00000036819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88414868:88415479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017064 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 5A (Stat5a), mRNA. // chr10 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000026662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88558936:88583261:1 gene:ENSRNOG00000019496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// U24175 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducer and regulator of transcription 5a1 (STAT5a1) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT009789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88552782:88582081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 95 // 20 // 21 // 1
NM_031604 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit A1 (Atp6v0a1), mRNA. // chr10 // 90 // 98 // 37 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000055238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88712837:88766228:1 gene:ENSRNOG00000036814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// DQ286421 // GenBank // Rattus norvegicus v-H+ATPase subunit a1-I mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 79 // 31 // 33 // 0 /// DQ286422 // GenBank // Rattus norvegicus v-H+ATPase subunit a1-IV mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 79 // 31 // 33 // 0 /// DQ286423 // GenBank // Rattus norvegicus v-H+ATPase subunit a1-II mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 79 // 31 // 33 // 0 /// DQ286424 // GenBank // Rattus norvegicus v-H+ATPase subunit a1-III mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 79 // 31 // 33 // 0 /// M58758 // GenBank // Rat proton pump polypeptide mRNA, complete cds. // chr10 // 87 // 90 // 33 // 38 // 0 /// GENSCAN00000019197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88712867:88758819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT009795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 60 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT009796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 15 // 42 // 1 /// NONRATT009792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
XM_001081442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetylglucosaminidase, alpha (Naglu), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002727815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetylglucosaminidase, alpha (Naglu), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052157 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:88777919:88785165:1 gene:ENSRNOG00000032381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88777919:88785165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT009800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT009797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT009798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_012851 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 1 (Hsd17b1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88786054:88788253:1 gene:ENSRNOG00000019830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086365 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105495 IMAGE:7305002), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88786093:88799092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT009801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001006954 // RefSeq // Rattus norvegicus CoA synthase (Coasy), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88790983:88795172:1 gene:ENSRNOG00000019918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083781 // GenBank // Rattus norvegicus Coenzyme A synthase, mRNA (cDNA clone MGC:94749 IMAGE:7096053), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CoA synthase (Coasy), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000009167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88786093:88799092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_001034112 // RefSeq // Rattus norvegicus MLX, MAX dimerization protein (Mlx), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MLX, MAX dimerization protein (Mlx), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88795895:88800648:1 gene:ENSRNOG00000019983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC128702 // GenBank // Rattus norvegicus MAX-like protein X, mRNA (cDNA clone MGC:156499 IMAGE:7323425), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// DQ350891 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/SsNHsd max-like factor protein (Mlx) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// DQ350892 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI/SegHsd max-like factor protein (Mlx) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// DQ350893 // GenBank // Rattus norvegicus strain COP/CrCrl max-like factor protein (Mlx) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT009806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88786093:88799092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT009808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_145778 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, gamma 1 (Tubg1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88829361:88835951:1 gene:ENSRNOG00000020213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB015946 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for tubulin, complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// BC070957 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, gamma 1, mRNA (cDNA clone MGC:91457 IMAGE:7105643), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88829474:88835762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT009810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT009811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT009812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001191075 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, gamma 2 (Tubg2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006247427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin, gamma 2 (Tubg2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000008576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88867752:88874081:1 gene:ENSRNOG00000006494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88867931:88873897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_032061 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin associated protein 1 (Cntnap1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88888142:88902110:1 gene:ENSRNOG00000020277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF000114 // GenBank // Rattus norvegicus paranodin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U87224 // GenBank // Rattus norvegicus contactin associated protein (Caspr) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88888298:88901359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_031646 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor (G protein-coupled) activity modifying protein 2 (Ramp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88965654:88967459:1 gene:ENSRNOG00000020415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB030943 // GenBank // Rattus norvegicus RAMP2 mRNA for receptor activity modifying protein 2, complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AB042888 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for receptor activity modifying protein 2, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF181551 // GenBank // Rattus norvegicus receptor activity modifying protein 2 (Ramp2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// EF595744 // GenBank // Rattus norvegicus receptor activity modifying protein 2 isoform mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// FQ226087 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YB08 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88953437:88967283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_175579 // RefSeq // Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 4 (Wnk4), mRNA. // chr10 // 95 // 73 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000027770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88979749:88996591:1 gene:ENSRNOG00000020441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000027804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88972339:89007992:1 gene:ENSRNOG00000020441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 46 // 46 // 0 /// AY187039 // GenBank // Rattus norvegicus putative protein kinase WNK4 (Prkwnk4) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 73 // 38 // 40 // 0 /// AY192567 // GenBank // Rattus norvegicus WNK4 Ser/Thr kinase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88973149:89007992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 44 // 44 // 0 /// AY321328 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-059 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT009835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 18 // 10 // 10 // 0
NM_001011894 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 3 (Psme3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000027957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89034248:89042030:1 gene:ENSRNOG00000036806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC089889 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:109065 IMAGE:7374359), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000068275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89034448:89109170:1 gene:ENSRNOG00000036806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// NONRATT009836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89034448:89080983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// AY325211 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-371 mRNA, complete cds. // chr10 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_031582 // RefSeq // Rattus norvegicus amine oxidase, copper containing 3 (Aoc3), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AB195675 // GenBank // Rattus norvegicus SSAO mRNA for semicarbazide-sensitive amine oxidase, complete cds. // chr10 // 91 // 71 // 20 // 22 // 0 /// BC100613 // GenBank // Rattus norvegicus amine oxidase, copper containing 3 (vascular adhesion protein 1), mRNA (cDNA clone MGC:124520 IMAGE:5598211), complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89034448:89109170:1 gene:ENSRNOG00000036806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT009838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89034448:89080983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// AY325211 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-371 mRNA, complete cds. // chr10 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_013098 // RefSeq // Rattus norvegicus glucose-6-phosphatase, catalytic subunit (G6pc), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000028033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89084053:89094261:1 gene:ENSRNOG00000036806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// BC090067 // GenBank // Rattus norvegicus glucose-6-phosphatase, catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93613 IMAGE:7109006), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// D78592 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for glucose-6-phosphatase catalytic subunit, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// L37333 // GenBank // Rattus norvegicus glucose-6-phosphatase (G6Pase) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// U07993 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley glucose-6-phosphatase mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 100 // 52 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000068275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89034448:89109170:1 gene:ENSRNOG00000036806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 47 // 47 // 25 // 53 // 1 /// GENSCAN00000009139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89084130:89109170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 75 // 38 // 40 // 0 /// NONRATT009840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// NONRATT009842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 79 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT009839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 28 // 53 // 1 /// AY325211 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-371 mRNA, complete cds. // chr10 // 47 // 47 // 25 // 53 // 1 /// NONRATT009841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 17 // 53 // 1
XM_006247467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN domain containing 1 (Rundc1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000031208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89137045:89145851:1 gene:ENSRNOG00000023768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89137045:89145851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001009625 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon-induced protein 35 (Ifi35), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89156392:89164642:1 gene:ENSRNOG00000020678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088222 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-induced protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:108976 IMAGE:7321956), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89148647:89164575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001010953 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho family GTPase 2 (Rnd2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89174534:89178109:1 gene:ENSRNOG00000020698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC089058 // GenBank // Rattus norvegicus Rho family GTPase 2, mRNA (cDNA clone MGC:105808 IMAGE:7315480), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// D82867 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RhoN, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000009142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89174693:89177604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001024765 // RefSeq // Rattus norvegicus neighbor of Brca1 gene 1 (Nbr1), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000028149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89257664:89281799:1 gene:ENSRNOG00000020730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC095903 // GenBank // Rattus norvegicus neighbor of Brca1 gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:93700 IMAGE:7096697), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// FQ211883 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YI03 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000046123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89263293:89280603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// NONRATT009854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT009858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 17 // 39 // 1 /// NONRATT009856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// NONRATT009857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NM_001024967 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 106A (Tmem106a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 106A (Tmem106a), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89282482:89291487:1 gene:ENSRNOG00000023628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC091170 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 106A, mRNA (cDNA clone MGC:108779 IMAGE:7131003), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89283670:89290271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001105842 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD52 motif containing 1 (Rdm1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD52 motif 1 (Rdm1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247284 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD52 motif 1 (Rdm1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89337811:89348066:1 gene:ENSRNOG00000020751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89313203:89347824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT009867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001107052 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 4D (Arl4d), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 4D (Arl4d), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89375528:89377684:1 gene:ENSRNOG00000020770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC167047 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 4-like, mRNA (cDNA clone MGC:189329 IMAGE:8367403), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF688597 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89361884:89377088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033685 // RefSeq // Rattus norvegicus Sin3-associated polypeptide 18 (Sap18), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002727811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase complex subunit SAP18-like (RGD1561590), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41910103:41914431:1 gene:ENSRNOG00000010732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89431901:89432419:1 gene:ENSRNOG00000020771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC104706 // GenBank // Rattus norvegicus Sin3-associated polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:125107 IMAGE:7316605), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234134 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YA20 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89431958:89432419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41910171:41914176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT020523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT020525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT020522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001047844 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 8 (Dhx8), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// XM_006247286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 8 (Dhx8), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000048140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89442421:89479672:1 gene:ENSRNOG00000020772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000046127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89442421:89478229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT009873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT009874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 49 // 49 // 23 // 47 // 1 /// NONRATT009872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1 /// NONRATT009875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1 /// NONRATT009876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1
NM_001134601 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1565533 (RGD1565533), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1565533 (RGD1565533), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1565533 (RGD1565533), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1565533 (RGD1565533), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000055192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89710799:89715997:1 gene:ENSRNOG00000036796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003750936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd300 molecule-like family member G (Cd300lg), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003752386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd300 molecule-like family member G (Cd300lg), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028277 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:89768464:89784231:1 gene:ENSRNOG00000020837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073879 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:89768464:89784231:1 gene:ENSRNOG00000020837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89768464:89784231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001107053 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylglutamate synthase (Nags), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89872923:89877057:1 gene:ENSRNOG00000020879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89872997:89876604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_176077 // RefSeq // Rattus norvegicus glucose 6 phosphatase, catalytic, 3 (G6pc3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89921496:89925728:1 gene:ENSRNOG00000020902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY186240 // GenBank // Rattus norvegicus glucose-6-phosphatase catalytic subunit-related protein mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC078689 // GenBank // Rattus norvegicus glucose 6 phosphatase, catalytic, 3, mRNA (cDNA clone MGC:93061 IMAGE:7134166), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89921668:89925470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT009884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT009885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001017988 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F1-inducible gene (LOC303566), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065182 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:89978419:90001064:1 gene:ENSRNOG00000020908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AY623029 // GenBank // Rattus norvegicus clone S26-A hypothetical protein mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89966023:90020447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_001109048 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 16 (Asb16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90004557:90012014:1 gene:ENSRNOG00000036794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89966023:90020447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001031651 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 2 (Tmub2), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90017228:90021390:1 gene:ENSRNOG00000020916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC085794 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:93789 IMAGE:7109581), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC099074 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:116065 IMAGE:7109079), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 2 (Tmub2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// XM_006247332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and ubiquitin-like domain containing 2 (Tmub2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT009888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89966023:90020447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT009889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT009890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_198758 // RefSeq // Rattus norvegicus RUN domain containing 3A (Rundc3a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000028487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90130416:90139535:1 gene:ENSRNOG00000020970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AF288611 // GenBank // Rattus norvegicus guanylate-cyclase regulatory protein (GCRP) mRNA, complete cds. // chr10 // 86 // 65 // 24 // 28 // 0 /// XM_006247341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN domain containing 3A (Rundc3a), transcript variant X9, mRNA. // chr10 // 67 // 67 // 29 // 43 // 1 /// GENSCAN00000030218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90130680:90139087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT009892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT009893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT009894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 19 // 43 // 1 /// NONRATT009895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1 /// NONRATT009896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1
NM_001145842 // RefSeq // Rattus norvegicus granulin (Grn), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NM_017113 // RefSeq // Rattus norvegicus granulin (Grn), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90165634:90171736:1 gene:ENSRNOG00000021031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90165634:90171736:1 gene:ENSRNOG00000021031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC072469 // GenBank // Rattus norvegicus granulin, mRNA (cDNA clone MGC:91745 IMAGE:7098196), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// M97750 // GenBank // Rattus norvegicus granulin mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90168024:90171408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT009897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_172035 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled class receptor 2 (Fzd2), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90343133:90345043:1 gene:ENSRNOG00000021962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// L02530 // GenBank // Rattus norvegicus Drosophila polarity gene (frizzled) homologue mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90343210:90344922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
XM_220997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to nuclear protein with a coiled coil-4 domain of bilaterial origin like (3L720) (RGD1563746), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000032856 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:90413118:90430581:1 gene:ENSRNOG00000021953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90402135:90430581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT009902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001108300 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 11 (Adam11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006247377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 11 (Adam11), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006247378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 11 (Adam11), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 98 // 96 // 44 // 45 // 0 /// XM_006247379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 11 (Adam11), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006247380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 11 (Adam11), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000064429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90521652:90536723:1 gene:ENSRNOG00000002753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000052063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90483870:90558526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT009905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NM_001105844 // RefSeq // Rattus norvegicus HIG1 hypoxia inducible domain family, member 1B (Higd1b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HIG1 hypoxia inducible domain family, member 1B (Higd1b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HIG1 hypoxia inducible domain family, member 1B (Higd1b), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90703634:90705402:1 gene:ENSRNOG00000002814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90704000:90705329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT009907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109049 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 103 (Ccdc103), mRNA. // chr10 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// XM_006247539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 103 (Ccdc103), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90756615:90760015:1 gene:ENSRNOG00000002905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// FQ212882 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YN11 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90758238:90759958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT009911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013861 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 187, member A (FAM187A), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90761120:90762587:1 gene:ENSRNOG00000002918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079299 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933439F11, mRNA (cDNA clone MGC:94436 IMAGE:7134519), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90761315:90762571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT009912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000026177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90804552:90804863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0
NM_148891 // RefSeq // Rattus norvegicus N-myristoyltransferase 1 (Nmt1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90898210:90933049:1 gene:ENSRNOG00000002989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097277 // GenBank // Rattus norvegicus N-myristoyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:114255 IMAGE:7457194), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90898589:90933909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT009915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001025136 // RefSeq // Rattus norvegicus hexamethylene bis-acetamide inducible 1 (Hexim1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90972403:90974513:1 gene:ENSRNOG00000003203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087133 // GenBank // Rattus norvegicus hexamethylene bis-acetamide inducible 1, mRNA (cDNA clone MGC:95020 IMAGE:7122255), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107054 // RefSeq // Rattus norvegicus hexamethylene bis-acetamide inducible 2 (Hexim2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hexamethylene bis-acetamide inducible 2 (Hexim2), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90988728:90994489:1 gene:ENSRNOG00000021287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167046 // GenBank // Rattus norvegicus hexamthylene bis-acetamide inducible 2, mRNA (cDNA clone MGC:189324 IMAGE:7132762), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90990278:91016185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT009932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT009930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT009927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001105846 // RefSeq // Rattus norvegicus formin-like 1 (Fmnl1), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formin-like 1 (Fmnl1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91025570:91052384:1 gene:ENSRNOG00000003207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91025294:91052099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT009935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001109481 // RefSeq // Rattus norvegicus reprimo-like (Rprml), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91476987:91477991:1 gene:ENSRNOG00000028436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220063 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YF14 mRNA sequence. // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91476560:91477537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033244 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:91519426:91519800:1 gene:ENSRNOG00000028427 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91519426:91519800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001105715 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 3 (Wnt3), mRNA. // chr10 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// XM_006247489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 3 (Wnt3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000005176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91597106:91641213:1 gene:ENSRNOG00000003845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91628358:91635970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91579987:91597484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT009941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_024150 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 2 (Arf2), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 2 (Arf2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91783781:91805554:1 gene:ENSRNOG00000004807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC098915 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:114313 IMAGE:7461110), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// L12381 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 81 // 72 // 17 // 21 // 0 /// NONRATT009943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000017560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91770978:91803996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_030999 // RefSeq // Rattus norvegicus corticotropin releasing hormone receptor 1 (Crhr1), mRNA. // chr10 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91953470:91994397:1 gene:ENSRNOG00000004900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91953470:91994397:1 gene:ENSRNOG00000004900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// EU012436 // GenBank // Rattus norvegicus CRF1a receptor isoform desK (Crhr1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// EU012437 // GenBank // Rattus norvegicus CRF1 receptor isoform P (Crhr1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// EU012438 // GenBank // Rattus norvegicus CRF1 receptor isoform Q (Crhr1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// L24096 // GenBank // Rat corticoptropin releasing factor receptor mRNA. // chr10 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// L25438 // GenBank // Rat corticotropin-releasing factor receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT009949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// NONRATT009947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// NONRATT009948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// GENSCAN00000017562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91844810:92011445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_001105847 // RefSeq // Rattus norvegicus signal peptide peptidase like 2C (Sppl2c), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:92007217:92009421:1 gene:ENSRNOG00000005104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC160911 // GenBank // Rattus norvegicus intramembrane protease 5, mRNA (cDNA clone MGC:188649 IMAGE:7456885), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91844810:92011445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108839 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 2B (Mettl2b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93112426:93126251:1 gene:ENSRNOG00000006131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93112499:93125654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001191652 // RefSeq // Rattus norvegicus tousled-like kinase 2 (Tlk2), mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// XM_006247571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tousled-like kinase 2 (Tlk2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000066484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93173881:93265759:1 gene:ENSRNOG00000006285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000024726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93173126:93251084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000042123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93253440:93264850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// NONRATT009966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1
NM_001024687 // RefSeq // Rattus norvegicus mannose receptor, C type 2 (Mrc2), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000055137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93278918:93339315:1 gene:ENSRNOG00000006548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// DQ058624 // GenBank // Rattus norvegicus ENDO180 (Endo180) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93303227:93339315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001191653 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 2 (Tanc2), mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93567079:93880565:1 gene:ENSRNOG00000026364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93751977:93879799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0
NM_012544 // RefSeq // Rattus norvegicus angiotensin I converting enzyme (Ace), mRNA. // chrU // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93922062:93955471:1 gene:ENSRNOG00000007467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// AF201331 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344/N angiotensin-converting enzyme (Ace) mRNA, complete cds. // chrU // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// AF201332 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW/N angiotensin-converting enzyme (Ace) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// AF539425 // GenBank // Rattus norvegicus testicular angiotensin-1 converting enzyme (Ace) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// BC085760 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensin I converting enzyme (peptidyl-dipeptidase A) 1, mRNA (cDNA clone MGC:93629 IMAGE:7097136), complete cds. // chrU // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// U03708 // GenBank // Rattus norvegicus Heidelberg angiotensin converting enzyme (ACE) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// U03734 // GenBank // Rattus norvegicus Wistar-Kyoto (Heidelberg) angiotensin converting enzyme (ACE) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93922085:93955750:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT009982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_053937 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 6 (Kcnh6), mRNA. // chr10 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93958632:93979107:1 gene:ENSRNOG00000008078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF016192 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel (erg2) mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93958664:94000732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107057 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 7 (Dcaf7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000063858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93982501:94005038:1 gene:ENSRNOG00000042245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC167045 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 68, mRNA (cDNA clone MGC:189321 IMAGE:7112910), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93958664:94000732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001108302 // RefSeq // Rattus norvegicus translational activator of mitochondrially encoded cytochrome c oxidase I (Taco1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000063973 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:94011140:94018653:1 gene:ENSRNOG00000008405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166900 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 44, mRNA (cDNA clone MGC:188861 IMAGE:6922142), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94011347:94016710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT009991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001107058 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase 3 (Map3k3), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000011406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94029306:94098038:1 gene:ENSRNOG00000008441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC168979 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:189317 IMAGE:7125270), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94041344:94095598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT009995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001107059 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 42 (Ddx42), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000013046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94158861:94190354:1 gene:ENSRNOG00000009474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000017359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94166093:94189323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT009997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_031149 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 5 (Psmc5), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94197162:94203113:1 gene:ENSRNOG00000010038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB000491 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proteasome p45/SUG, complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC058462 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 5, mRNA (cDNA clone MGC:72780 IMAGE:6891005), complete cds. // chr10 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// D83521 // GenBank // Rattus norvegicus liver mRNA for proteasomal ATPase (SUG1), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// FQ213263 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YN07 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// FQ213820 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YH19 mRNA sequence. // chr10 // 56 // 91 // 18 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94197194:94203061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT010004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT010005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT010003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NONRATT010002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021673 // RefSeq // Rattus norvegicus testicular cell adhesion molecule 1 (Tcam1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testicular cell adhesion molecule 1 (Tcam1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94217914:94229893:1 gene:ENSRNOG00000010929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166495 // GenBank // Rattus norvegicus testicular cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:188025 IMAGE:7111123), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94214517:94228959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001081575 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Protein C17orf72 (RGD1307288), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000055114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94446007:94508324:-1 gene:ENSRNOG00000013659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC083806 // GenBank // Rattus norvegicus testis expressed 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7109270), partial cds. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94447206:94508324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT012411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001013862 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 95kDa (Cep95), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000066525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94734062:94762044:1 gene:ENSRNOG00000014354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC083896 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 45, mRNA (cDNA clone MGC:95238 IMAGE:7133061), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000011391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94748422:94761914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 45 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT010017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
NM_001109050 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein LOC284018 isoform b (RGD1565033), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94983256:94985409:1 gene:ENSRNOG00000043295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158779 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein LOC284018 isoform b, mRNA (cDNA clone MGC:188108 IMAGE:7134339), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein LOC284018 isoform b (RGD1565033), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94981077:94984714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
FQ217715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA1YA02 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222890 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YF20 mRNA sequence. // chr10 // 45 // 80 // 9 // 20 // 0
FQ228297 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA101YA10 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000034773 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:95290869:95291315:1 gene:ENSRNOG00000024858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 100 // 18 // 23 // 0
NM_001047898 // RefSeq // Rattus norvegicus Ribosomal_L22 domain containing protein RGD1359290 (RGD1359290), mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000029782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:95377290:95392627:1 gene:ENSRNOG00000027271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT010027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000004151 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:95437589:95438019:1 gene:ENSRNOG00000003112 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT010030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001005875 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 12 (Psmd12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:95441589:95460233:1 gene:ENSRNOG00000003117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083758 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 12, mRNA (cDNA clone MGC:94696 IMAGE:7192849), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:95441645:95460175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001105848 // RefSeq // Rattus norvegicus helicase with zinc finger (Helz), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000030300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:95504935:95641663:1 gene:ENSRNOG00000003213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000043259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:95529472:95641439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001009626 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein H (beta-2-glycoprotein I) (Apoh), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:96364126:96378117:1 gene:ENSRNOG00000003566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC088180 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein H (beta-2-glycoprotein I), mRNA (cDNA clone MGC:108825 IMAGE:7364928), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ219138 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YG21 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ209433 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YL14 mRNA sequence. // chr10 // 63 // 100 // 20 // 32 // 0 /// FQ218803 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YN08 mRNA sequence. // chr10 // 63 // 100 // 20 // 32 // 0 /// FQ219527 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YK17 mRNA sequence. // chr10 // 70 // 94 // 21 // 30 // 0 /// FQ218065 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA9YO22 mRNA sequence. // chr10 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT010040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:96310650:96367729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000015260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:96371812:96403846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001105849 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 112kDa (Cep112), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 112kDa (Cep112), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:96387919:96868508:1 gene:ENSRNOG00000024557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC166507 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7124740, containing frame-shift errors. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:96371812:96403846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001105849 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 112kDa (Cep112), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006247566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 112kDa (Cep112), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000037067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:96387919:96868508:1 gene:ENSRNOG00000024557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// BC166507 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7124740, containing frame-shift errors. // chr10 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1 /// NONRATT010041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000015256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:96486118:96628248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// NONRATT010042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1
NM_024355 // RefSeq // Rattus norvegicus axin 2 (Axin2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:96933420:96959744:1 gene:ENSRNOG00000003612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF017757 // GenBank // Rattus norvegicus GSK-3beta interacting protein Axil mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:96861887:96959140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT010046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_001127297 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1 (Wipi1), mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:97578115:97614772:-1 gene:ENSRNOG00000003827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC166829 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 1, mRNA (cDNA clone MGC:188712 IMAGE:8373479), complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97581511:97642305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT012475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT012476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
GENSCAN00000006638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97949317:97949782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_053703 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase 6 (Map2k6), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:98413927:98527709:1 gene:ENSRNOG00000004437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF369384 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase 6 (Mkk6) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC087004 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:93287 IMAGE:7190965), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:98487497:98528431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_053314 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 16 (Kcnj16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 16 (Kcnj16), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:99084253:99086021:1 gene:ENSRNOG00000004713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078776 // GenBank // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 16, mRNA (cDNA clone MGC:93314 IMAGE:7107402), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:99084295:99085554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017296 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 2 (Kcnj2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:99130687:99131970:1 gene:ENSRNOG00000004720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF021137 // GenBank // Rattus norvegicus inward rectifier potassium channel (IRK1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// L48490 // GenBank // Rattus norvegicus inwardly rectifying K+ channel protein (RBL-IRK1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:99130687:99131970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000032073 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:100218174:100218704:1 gene:ENSRNOG00000024956 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:100213462:100218609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT010069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000003511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:100965137:100968386:1 gene:ENSRNOG00000002607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:100902869:100968386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_019348 // RefSeq // Rattus norvegicus somatostatin receptor 2 (Sstr2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:101816029:101823322:1 gene:ENSRNOG00000002793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M93273 // GenBank // Rat somatostatin-receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M96817 // GenBank // Rat somatostatin SRIF-1 receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:101821603:101823047:1 gene:ENSRNOG00000002793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:101821603:101822712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT010074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107062 // RefSeq // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 1 (Cog1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 1 (Cog1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:101847319:101860914:1 gene:ENSRNOG00000002795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC169068 // GenBank // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5598060), partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ212043 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YM18 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:101847319:101887857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT010075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT010078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001005532 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC287798 (MGC95210), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC287798 (MGC95210), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XR_357961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC287798 (MGC95210), transcript variant X7, misc_RNA. // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000037371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:101879212:101890139:1 gene:ENSRNOG00000024780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC088445 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical LOC287798, mRNA (cDNA clone MGC:95088 IMAGE:7126436), complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
XM_221081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tweety family member 2 (Ttyh2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004081 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:102865904:102908421:1 gene:ENSRNOG00000024578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055042 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:102865904:102908421:1 gene:ENSRNOG00000024578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:102841427:102907491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001007726 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, intermediate chain 2 (Dnai2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:102925918:102959578:1 gene:ENSRNOG00000024523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081920 // GenBank // Rattus norvegicus dynein, axonemal, intermediate chain 2, mRNA (cDNA clone MGC:93894 IMAGE:7112641), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:102921039:102991701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001271202 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 19 (Kif19), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004141 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:102966408:102991701:1 gene:ENSRNOG00000003105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:102921039:102991701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
XM_006221032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 142 (Gpr142), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 142 (Gpr142), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103001678:103009306:1 gene:ENSRNOG00000024446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103004902:103009306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_001191591 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, class C, group 5, member C (Gprc5c), mRNA. // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// XM_006247679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// XM_006247681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103052022:103073771:1 gene:ENSRNOG00000003144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC168227 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C, mRNA (cDNA clone MGC:188253 IMAGE:7372263), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103064583:103091003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
XM_006247681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C (Gprc5c), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103052022:103073771:1 gene:ENSRNOG00000003144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168227 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, family C, group 5, member C, mRNA (cDNA clone MGC:188253 IMAGE:7372263), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001205348 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd300a molecule (Cd300a), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040436 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:103094716:103107421:1 gene:ENSRNOG00000024399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// EF199812 // GenBank // Rattus norvegicus strain W immune inhibitory receptor CD300A mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103094716:103107165:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_001167664 // RefSeq // Rattus norvegicus CD300 molecule-like family member b (Cd300lb), mRNA. // chr10 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000035639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103127534:103137523:-1 gene:ENSRNOG00000036728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GU054494 // GenBank // Rattus norvegicus strain W immune activating receptor (CD300b) mRNA, complete cds. // chr10 // 77 // 100 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103127560:103152465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 69 // 69 // 9 // 13 // 1
XM_577143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CMRF35-like molecule 6-like (RGD1562667), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000075706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:103352232:103353106:-1 gene:ENSRNOG00000045888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000055040 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:104690028:104690740:-1 gene:ENSRNOG00000036725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104690239:104690900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
XM_006220895 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG35079-like (LOC100364984), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006247775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG35079-like (LOC100364984), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG35079-like (LOC100364984), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004311 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:104593141:104599908:-1 gene:ENSRNOG00000003192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038103 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:104593141:104657878:-1 gene:ENSRNOG00000003192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104573976:104599908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_021594 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE3, cation proton antiporter 3), member 3 regulator 1 (Slc9a3r1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104573316:104590543:-1 gene:ENSRNOG00000003232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF154336 // GenBank // Rattus norvegicus ERM-binding phosphoprotein mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ213792 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YK15 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104573976:104599908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191655 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 104 (Tmem104), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104503014:104566633:-1 gene:ENSRNOG00000025669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104548722:104558435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT012595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001105851 // RefSeq // Rattus norvegicus otopetrin 2 (Otop2), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104412060:104421630:-1 gene:ENSRNOG00000028121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104412374:104421242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001105852 // RefSeq // Rattus norvegicus otopetrin 3 (Otop3), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104393465:104400285:-1 gene:ENSRNOG00000031452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104393953:104400267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
XM_001081680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebellar degeneration-related protein 2-like (Cdr2l), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000035865 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:104332243:104358042:-1 gene:ENSRNOG00000025815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006220899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebellar degeneration-related protein 2-like (Cdr2l), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// XM_006220900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebellar degeneration-related protein 2-like (Cdr2l), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// XM_006247772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebellar degeneration-related protein 2-like (Cdr2l), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000042243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104332243:104358444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001191656 // RefSeq // Rattus norvegicus immature colon carcinoma transcript 1 (Ict1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000045875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104316049:104322545:-1 gene:ENSRNOG00000032780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104316251:104322540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT012584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
XM_006221035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 2 (Kctd2), partial mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 2 (Kctd2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067838 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:104295843:104304213:-1 gene:ENSRNOG00000023764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT012582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104295010:104307021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_001073650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif protein 47-like (Trim47l), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_001081685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif protein 47-like (Trim47l), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006247768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif protein 47-like (Trim47l), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104275379:104286770:-1 gene:ENSRNOG00000028812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC091694 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif protein 47-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134879), partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104275435:104286957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001109568 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 5 (Slc16a5), mRNA. // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// XM_006247735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 5 (Slc16a5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006247736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 5 (Slc16a5), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000032016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104245376:104259551:-1 gene:ENSRNOG00000023476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NM_001127522 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 7 (Armc7), mRNA. // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000004843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104227119:104243604:-1 gene:ENSRNOG00000042691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// BC166454 // GenBank // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:187717 IMAGE:9022599), complete cds. // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104246651:104266796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT012580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT012579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001025401 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 85 (Nup85), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000005035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104144379:104162637:-1 gene:ENSRNOG00000003673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC098031 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin 85kDa, mRNA (cDNA clone MGC:116185 IMAGE:7456325), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000014248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104144459:104162614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT012571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT012574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_001100471 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S7 (Mrps7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104122365:104125390:-1 gene:ENSRNOG00000003797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104122624:104125390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT012570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000005684 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:103942825:103965175:-1 gene:ENSRNOG00000004032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103942825:104004300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_001109576 // RefSeq // Rattus norvegicus TSEN54 tRNA splicing endonuclease subunit (Tsen54), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006247737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSEN54 tRNA splicing endonuclease subunit (Tsen54), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// XR_357996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSEN54 tRNA splicing endonuclease subunit (Tsen54), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103919116:103926625:-1 gene:ENSRNOG00000004598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC166577 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7376806. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103842559:103926622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT012562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT012563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT012564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001127549 // RefSeq // Rattus norvegicus lethal giant larvae homolog 2 (Drosophila) (Llgl2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006247724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lethal giant larvae homolog 2 (Drosophila) (Llgl2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000006519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103882299:103917776:-1 gene:ENSRNOG00000004834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC110052 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7459410. // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC166481 // GenBank // Rattus norvegicus lethal giant larvae homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:187956 IMAGE:7097977), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000014269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103842559:103926622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT012557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT012558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1 /// NONRATT012560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
XR_357998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Myosin-15 (Myosin XV) (Unconventional myosin-15) (LOC690323), transcript variant X1, misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000035001 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:103842329:103847916:-1 gene:ENSRNOG00000042445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// BC162013 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9091829. // chr10 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// GENSCAN00000014269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103842559:103926622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT012551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001163002 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 5 (Smim5), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_001277479 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 5 (Smim5), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103828438:103834217:-1 gene:ENSRNOG00000049642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103828950:103829522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT012549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006220905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small integral membrane protein 6-like (LOC102552551), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small integral membrane protein 6-like (LOC102552551), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small integral membrane protein 6-like (LOC102552551), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108305 // RefSeq // Rattus norvegicus SAP30 binding protein (Sap30bp), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103769674:103802319:-1 gene:ENSRNOG00000005482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC169106 // GenBank // Rattus norvegicus SAP30 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:189528 IMAGE:7458371), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ220147 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YA16 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103771907:103802313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_013180 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, beta 4 (Itgb4), mRNA. // chr10 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000065339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103725177:103761362:-1 gene:ENSRNOG00000005580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// U60096 // GenBank // Rattus norvegicus sciatic nerve integrin beta 4 subunit (RATINTB4R) mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000014238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103725444:103758558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT012541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
XM_003750953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus unkempt family zinc finger (Unk), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009733 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:103673535:103702359:-1 gene:ENSRNOG00000006600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103674247:103702359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108307 // RefSeq // Rattus norvegicus TEN1 CST complex subunit (Ten1), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104741402:104840569:1 gene:ENSRNOG00000028481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC168942 // GenBank // Rattus norvegicus LOC360664, mRNA (cDNA clone MGC:189246 IMAGE:8365819), complete cds. // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104753828:104755335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
U94322 // GenBank // Rattus norvegicus galanin receptor type 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_019172 // RefSeq // Rattus norvegicus galanin receptor 2 (Galr2), mRNA. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000012523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104825372:104827565:1 gene:ENSRNOG00000009407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000075548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104900150:104902315:1 gene:ENSRNOG00000050358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AF008548 // GenBank // Rattus norvegicus galanin receptor type 2 (GALR2) mRNA, complete cds. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AF010318 // GenBank // Rattus norvegicus galanin receptor (GALR2) mRNA, complete cds. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104892991:104905286:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104818231:104830526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
XM_006221036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UBA-like domain containing 2 (Ubald2), mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_213532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UBA-like domain containing 2 (Ubald2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013359 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:105054510:105058301:1 gene:ENSRNOG00000010029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT010197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105049042:105058301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NONRATT010202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000014838 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:105227450:105228077:1 gene:ENSRNOG00000011155 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0
NM_012818 // RefSeq // Rattus norvegicus aralkylamine N-acetyltransferase (Aanat), mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105230818:105235318:1 gene:ENSRNOG00000011182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// DQ075321 // GenBank // Rattus norvegicus arylakylamine N-acetyltransferase (Aanat) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// U29664 // GenBank // Rattus norvegicus pineal arylalkylamine N-acetyltransferase PCR product, partial cds. // chr10 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// U38306 // GenBank // Rattus norvegicus arylalkylamine N-acetyltransferase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U40803 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetyl-transferase (NAT) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105227597:105234740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001008283 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 23 (Mettl23), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 23 (Mettl23), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105446488:105451151:1 gene:ENSRNOG00000000249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086594 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110005A03, mRNA (cDNA clone MGC:105570 IMAGE:7310322), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT010212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001108308 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 11 (Mfsd11), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006247809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 11 (Mfsd11), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105455233:105474239:1 gene:ENSRNOG00000000247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC098019 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455180, containing frame-shift errors. // chr10 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105460246:105472964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT010215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT010216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT010220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT010221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001107068 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,6-N-acetyl-glucosaminyltransferase, isozyme B (Mgat5b), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mannosyl (alpha-1,6-)-glycoprotein beta-1,6-N-acetyl-glucosaminyltransferase, isozyme B (Mgat5b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105520095:105589480:1 gene:ENSRNOG00000024954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105521869:105552956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT010223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000025168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105560920:105661823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NONRATT010225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001108309 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC14-like 1 (S. cerevisiae) (Sec14l1), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC14-like 1 (S. cerevisiae) (Sec14l1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105718075:105765280:1 gene:ENSRNOG00000002722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC092613 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7311611. // chr10 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105742882:105790459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT010228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
ENSRNOT00000040629 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:106337152:106400601:1 gene:ENSRNOG00000022395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000002021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:106305342:106400601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
XM_001081747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylglycerophosphate synthase 1 (Pgs1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_221142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylglycerophosphate synthase 1 (Pgs1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004007 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:106632598:106663922:1 gene:ENSRNOG00000002949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:106632598:106663922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_001007675 // RefSeq // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 1 (C1qtnf1), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 1 (C1qtnf1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006247801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 1 (C1qtnf1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006247802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 1 (C1qtnf1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000004373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107090742:107112156:1 gene:ENSRNOG00000003259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC083720 // GenBank // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94614 IMAGE:7190841), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// FQ209955 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA37YD23 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107106077:107110617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT010248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT010250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001107070 // RefSeq // Rattus norvegicus endo-beta-N-acetylglucosaminidase (Engase), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107137511:107150161:1 gene:ENSRNOG00000027498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212026 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YD06 mRNA sequence. // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107137668:107148540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006247940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 11 (Slc26a11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000054987 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108086788:108110278:1 gene:ENSRNOG00000030537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_001081843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 11 (Slc26a11), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// XM_006220967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 11 (Slc26a11), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000012689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108086788:108110278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108129980:108210611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108211198:108280047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT010263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT010264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XM_006221041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 213 (Rnf213), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108134733:108229040:1 gene:ENSRNOG00000029658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108211198:108280047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000004966 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:108235192:108251018:1 gene:ENSRNOG00000003699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC088247 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA A730011L01 gene, mRNA (cDNA clone IMAGE:7368308), complete cds. // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC158682 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8373568. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108211198:108280047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT010267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001134499 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory associated protein of MTOR, complex 1 (Rptor), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108353697:108658916:1 gene:ENSRNOG00000003821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT010268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000001059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108603765:108703922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT010270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001105856 // RefSeq // Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 6 (Chmp6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000005379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108673903:108679573:1 gene:ENSRNOG00000004014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000052022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:11950005:11950591:1 gene:ENSRNOG00000030674 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000001059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108603765:108703922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000034370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:11949956:12215576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT010272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT010273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT010274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT012808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT010275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT010276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_057196 // RefSeq // Rattus norvegicus BAI1-associated protein 2 (Baiap2), mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// XM_006247870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BAI1-associated protein 2 (Baiap2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000005687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108707318:108785277:1 gene:ENSRNOG00000004049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108707318:108780121:1 gene:ENSRNOG00000004049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// AY037934 // GenBank // Rattus norvegicus insulin receptor tyrosine kinase substrate protein p53 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// BC074009 // GenBank // Rattus norvegicus BAI1-associated protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:91531 IMAGE:7099884), complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108744348:108779953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT010277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT010278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT010280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT010285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
XM_006221043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BAH domain and coiled-coil containing 1 (Bahcc1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000066736 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:109041495:109075317:1 gene:ENSRNOG00000043102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109020029:109075317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_001107072 // RefSeq // Rattus norvegicus fascin actin-bundling protein 2, retinal (Fscn2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109128055:109134594:1 gene:ENSRNOG00000036700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109128223:109134531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_019387 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate (Hgs), mRNA. // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000054966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109232696:109250719:1 gene:ENSRNOG00000036696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AB002811 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GEF-1, complete cds. // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// BC083561 // GenBank // Rattus norvegicus hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate, mRNA (cDNA clone MGC:93483 IMAGE:7133877), complete cds. // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AF036344 // GenBank // Rattus norvegicus Hrs (Hrs) mRNA, complete cds. // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// U87863 // GenBank // Rattus norvegicus SNAP-25 interacting protein hrs-2 mRNA, complete cds. // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000006936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109225595:109255071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT010297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT010298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001029900 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L12 (Mrpl12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109251300:109255333:1 gene:ENSRNOG00000036695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109225595:109255071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_133418 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; dicarboxylate transporter), member 10 (Slc25a10), mRNA. // chr10 // 79 // 100 // 26 // 33 // 0 /// XM_006247873 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; dicarboxylate transporter), member 10 (Slc25a10), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000054963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109258932:109266415:1 gene:ENSRNOG00000036693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC081734 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; dicarboxylate transporter), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:93224 IMAGE:7108552), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109258983:109265389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT010302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT010303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// NONRATT010301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT010305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT010306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_172091 // RefSeq // Rattus norvegicus glucagon receptor (Gcgr), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_172092 // RefSeq // Rattus norvegicus glucagon receptor (Gcgr), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NR_073147 // RefSeq // Rattus norvegicus glucagon receptor (Gcgr), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000054962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109301091:109309258:1 gene:ENSRNOG00000036692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081700 // GenBank // Rattus norvegicus glucagon receptor, mRNA (cDNA clone MGC:93090 IMAGE:7192550), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// L04796 // GenBank // Rattus norvegicus glucagon receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M96674 // GenBank // Rat glucagon receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109305107:109308985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001126082 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 11 (Anapc11), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006247906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 11 (Anapc11), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000054954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109367977:109376450:1 gene:ENSRNOG00000036686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// FQ228975 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YA14 mRNA sequence. // chr10 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109368526:109376185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT010311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_153293 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide B (Npb), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuropeptide B (Npb), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109379275:109379709:1 gene:ENSRNOG00000036685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB085944 // GenBank // Rattus norvegicus NPB mRNA for preproneuropeptide B, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109379275:109379709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT010314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_002724585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alveolar soft part sarcoma chromosome region, candidate 1 (human) (Aspscr1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006220977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alveolar soft part sarcoma chromosome region, candidate 1 (human) (Aspscr1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006220978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alveolar soft part sarcoma chromosome region, candidate 1 (human) (Aspscr1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000054944 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:109444698:109480501:1 gene:ENSRNOG00000036678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// BC162026 // GenBank // Rattus norvegicus alveolar soft part sarcoma chromosome region, candidate 1 (human), mRNA (cDNA clone MGC:187913 IMAGE:9099544), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000006919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109444729:109497867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0
NM_030834 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 3 (Slc16a3), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006247932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 3 (Slc16a3), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109727315:109735890:1 gene:ENSRNOG00000036677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC168146 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 3 (monocarboxylic acid transporter 4), mRNA (cDNA clone MGC:187366 IMAGE:9089640), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// U87627 // GenBank // Rattus norvegicus putative monocarboxylate transporter (MCT3) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109726063:109735277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT010318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT010319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT010317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001017482 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 19.1 (Tex19.1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000054928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109933170:109935369:1 gene:ENSRNOG00000036670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC083916 // GenBank // Rattus norvegicus testis expressed gene 19, mRNA (cDNA clone MGC:95299 IMAGE:7134696), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT010325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_020537 // RefSeq // Rattus norvegicus urotensin 2 receptor (Uts2r), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109951008:109952168:1 gene:ENSRNOG00000036669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB012210 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SENR, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB029611 // GenBank // Rattus norvegicus SENR/GPR14 mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109905017:109952168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001142562 // RefSeq // Rattus norvegicus hexosaminidase (glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain) containing (Hexdc), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hexosaminidase (glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain) containing (Hexdc), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109993108:110011700:1 gene:ENSRNOG00000036667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110000283:110011469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT010330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT010332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT010333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT010334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
ENSRNOT00000054921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:110024802:110025362:1 gene:ENSRNOG00000036665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000006089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110024630:110025362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001039207 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear prelamin A recognition factor (Narf), mRNA. // chr10 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000054920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110032455:110050385:1 gene:ENSRNOG00000036664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// BC110050 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear prelamin A recognition factor, mRNA (cDNA clone MGC:125093 IMAGE:7454395), complete cds. // chr10 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// NM_001107075 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box K2 (Foxk2), mRNA. // chr10 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000054919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110055948:110104742:1 gene:ENSRNOG00000036663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// GENSCAN00000006066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110055675:110101853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000006086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110036985:110048814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT010336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1 /// NONRATT010337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// NONRATT010339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT010340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001107077 // RefSeq // Rattus norvegicus fructosamine-3-kinase-related protein (Fn3krp), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000054916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110200529:110209224:1 gene:ENSRNOG00000036660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC166839 // GenBank // Rattus norvegicus fructosamine-3-kinase-related protein, mRNA (cDNA clone MGC:188730 IMAGE:9027722), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110197363:110204847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT010343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110205863:110282810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001109051 // RefSeq // Rattus norvegicus fructosamine 3 kinase (Fn3k), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000054915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110212812:110227791:1 gene:ENSRNOG00000036659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212712 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YM17 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212922 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YK17 mRNA sequence. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110205863:110282810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001271364 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor D (Tbcd), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110229340:110380958:1 gene:ENSRNOG00000036658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110205863:110282810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
NM_017176 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group X (Pla2g10), mRNA. // chr10 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:406661:417899:-1 gene:ENSRNOG00000003164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF166100 // GenBank // Rattus norvegicus group X secreted phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AY651029 // GenBank // Rattus norvegicus group X phospholipase A2 precursor, mRNA, complete cds. // chr10 // 79 // 63 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:407046:417853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_022281 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 1 (Abcc1), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000041358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:11232233:11354931:-1 gene:ENSRNOG00000032748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// AF487549 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein C1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// AY170916 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance-associated protein 1 (Mrp1) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// AY174892 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley spleen ATP-binding cassette protein C1 variant A (Abcc1) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr10 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// AY174893 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley spleen ATP-binding cassette protein C1 variant B (Abcc1) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr10 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:11232576:11359090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT010467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT010472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_053347 // RefSeq // Rattus norvegicus nudE neurodevelopment protein 1 (Nde1), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006245690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudE neurodevelopment protein 1 (Nde1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000000029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:11540861:11576271:-1 gene:ENSRNOG00000000028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AF240463 // GenBank // Rattus norvegicus LIS1-interacting protein NUDE1 (Nude1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC081759 // GenBank // Rattus norvegicus nudE nuclear distribution gene E homolog 1 (A. nidulans), mRNA (cDNA clone MGC:93309 IMAGE:7190483), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:11540861:11576259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000036212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:954:16246:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
ENSRNOT00000072296 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:808559:840635:1 gene:ENSRNOG00000050955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:840327:862379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006220560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (RGD1565158), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006245697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (RGD1565158), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000061709 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:723365:729479:1 gene:ENSRNOG00000040121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// XM_006220559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (RGD1565158), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XM_006245696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (RGD1565158), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:723365:757117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001134961 // RefSeq // Rattus norvegicus pyridoxal-dependent decarboxylase domain containing 1 (Pdxdc1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245706 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyridoxal-dependent decarboxylase domain containing 1 (Pdxdc1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:2110310:2198387:-1 gene:ENSRNOG00000002407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC169099 // GenBank // Rattus norvegicus pyridoxal-dependent decarboxylase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189517 IMAGE:5623508), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ214570 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA1YI02 mRNA sequence. // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000040132 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:512125:564253:1 gene:ENSRNOG00000050441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:503758:564253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000047705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:2119725:2198888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_001108822 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110001I22 (RGD1305537), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000073995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:361770:368264:1 gene:ENSRNOG00000045696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000036216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:367315:367857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT007962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006220556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein light chain 1, cytoplasmic-like (LOC679822), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein light chain 1, cytoplasmic-like (LOC679822), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:303607:303876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134873 // RefSeq // Rattus norvegicus CTP synthase 1 (Ctps1), mRNA. // chr10 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// XM_006238781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTP synthase 1 (Ctps1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 74 // 100 // 23 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000013899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143259189:143288320:-1 gene:ENSRNOG00000009963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// BC161954 // GenBank // Rattus norvegicus CTP synthase, mRNA (cDNA clone MGC:187755 IMAGE:9027103), complete cds. // chr10 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000072057 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:823988:825668:-1 gene:ENSRNOG00000046218 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000005730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143261980:143285287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 55 // 12 // 17 // 0 /// NONRATT045393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:768642:825668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001109526 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 29 (Snx29), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 29 (Snx29), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:2710405:3115786:-1 gene:ENSRNOG00000002294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 29 (Snx29), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT010368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3000547:3165297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001109526 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 29 (Snx29), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 29 (Snx29), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 29 (Snx29), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:2710405:3115786:-1 gene:ENSRNOG00000002294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3000547:3165297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001105761 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 17 (Tnfrsf17), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006245713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 17 (Tnfrsf17), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000035886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:3118169:3123917:-1 gene:ENSRNOG00000021987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3000547:3165297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT010369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001034083 // RefSeq // Rattus norvegicus stannin (Snn), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100111 // GenBank // Rattus norvegicus stannin, mRNA (cDNA clone MGC:112928 IMAGE:7380565), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001078307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RecQ mediated genome instability 2 (Rmi2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033122 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:3733421:3738516:-1 gene:ENSRNOG00000021902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3725027:3738516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
XM_006245742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 16, member A (Clec16a), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006245747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 16, member A (Clec16a), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000003541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:3829933:3987938:-1 gene:ENSRNOG00000002588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000032901 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:3872501:3987938:-1 gene:ENSRNOG00000002588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000061471 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:3833500:3954108:-1 gene:ENSRNOG00000002588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:3921104:3988520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001270803 // RefSeq // Rattus norvegicus class II, major histocompatibility complex, transactivator (Ciita), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NM_001270804 // RefSeq // Rattus norvegicus class II, major histocompatibility complex, transactivator (Ciita), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// NM_053529 // RefSeq // Rattus norvegicus class II, major histocompatibility complex, transactivator (Ciita), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// XM_006245739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus class II, major histocompatibility complex, transactivator (Ciita), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 62 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4037680:4083966:-1 gene:ENSRNOG00000002659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// AF251305 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class II transactivator type I (CIITA) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 84 // 37 // 38 // 0 /// AF251306 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class II transactivator type III (CIITA) mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 89 // 39 // 40 // 0 /// AF251307 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class II transactivator type IV (CIITA) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 84 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:4037947:4083884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 71 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT010384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
NM_001009619 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleotide binding protein 1 (Nubp1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4155444:4166034:-1 gene:ENSRNOG00000002574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC088221 // GenBank // Rattus norvegicus nucleotide binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:108970 IMAGE:7321552), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ229330 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YE19 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:4156835:4165992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT010388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_001017471 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 7 interacting protein 2 (Atf7ip2), mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// XM_006245733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 7 interacting protein 2 (Atf7ip2), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 33 // 33 // 0 /// XR_357363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 7 interacting protein 2 (Atf7ip2), transcript variant X10, misc_RNA. // chr10 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4297989:4332637:-1 gene:ENSRNOG00000025522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// BC083663 // GenBank // Rattus norvegicus activating transcription factor 7 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94500 IMAGE:7135436), complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// XM_006245729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating transcription factor 7 interacting protein 2 (Atf7ip2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1 /// GENSCAN00000009065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:4307706:4332637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT010390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
NM_001195471 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L39-like (Rpl39l), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000051564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:4350271:4354377:-1 gene:ENSRNOG00000032300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC103490 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930517K11, mRNA (cDNA clone IMAGE:7455539), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000003622 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:4503006:4503667:-1 gene:ENSRNOG00000002699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0
NM_001106972 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG4768-PA (RGD1309748), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006245754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG4768-PA (RGD1309748), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000003439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:5639257:5668196:-1 gene:ENSRNOG00000002545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:5642038:5667834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT010394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// NONRATT010397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
XM_001078704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564086 (RGD1564086), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_579752 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564086 (RGD1564086), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001106973 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphomannomutase 2 (Pmm2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:5857624:5878777:-1 gene:ENSRNOG00000002615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168922 // GenBank // Rattus norvegicus phosphomannomutase 2, mRNA (cDNA clone MGC:189210 IMAGE:7122126), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:5859448:5872917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT010404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_031003 // RefSeq // Rattus norvegicus 4-aminobutyrate aminotransferase (Abat), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:5895469:6002068:-1 gene:ENSRNOG00000002636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC081787 // GenBank // Rattus norvegicus 4-aminobutyrate aminotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93392 IMAGE:7109775), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// D87839 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for beta-alanine oxoglutarate aminotransferase, complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// U29701 // GenBank // Rattus norvegicus GABA transaminase (GABA-T) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:5895590:5944853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_213210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 22 (Mettl22), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:6026812:6043628:-1 gene:ENSRNOG00000002714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:6028507:6040243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
GENSCAN00000011507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:6713304:6842430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 92 // 100 // 11 // 12 // 0
NM_001106974 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 (Rbfox1), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 (Rbfox1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 (Rbfox1), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 (Rbfox1), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 (Rbfox1), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 (Rbfox1), transcript variant X15, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 1 (Rbfox1), transcript variant X16, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:7109396:7450683:-1 gene:ENSRNOG00000002827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:7112069:7223904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT010413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001108264 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG1, chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferase (Alg1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9309794:9320002:-1 gene:ENSRNOG00000002883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9310148:9319996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001135710 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC14-like 5 (S. cerevisiae) (Sec14l5), mRNA. // chr10 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// XM_006245783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC14-like 5 (S. cerevisiae) (Sec14l5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9359289:9397055:-1 gene:ENSRNOG00000002917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9359289:9396328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT010426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001106977 // RefSeq // Rattus norvegicus ubinuclein 1 (Ubn1), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000061236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9457239:9492668:-1 gene:ENSRNOG00000003019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000042351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9479452:9488184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000042935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9459389:9473045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT010427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001014115 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (LOC360479), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006245807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (LOC360479), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// XM_006245808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (LOC360479), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000036954 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:9562157:9575513:-1 gene:ENSRNOG00000028075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9553189:9573958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// NONRATT010436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001100782 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16-like 1 (Nudt16l1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9596797:9598729:-1 gene:ENSRNOG00000003224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC158814 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 16-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188252 IMAGE:7371601), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ213246 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YO07 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ221237 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA38YO22 mRNA sequence. // chr10 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// NONRATT010437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9597411:9639366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT010438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001013964 // RefSeq // Rattus norvegicus mahogunin ring finger 1, E3 ubiquitin protein ligase (Mgrn1), mRNA. // chr10 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000004416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9600449:9648907:-1 gene:ENSRNOG00000003234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC083621 // GenBank // Rattus norvegicus mahogunin, ring finger 1, mRNA (cDNA clone MGC:94393 IMAGE:7134018), complete cds. // chr10 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT010440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000042355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9597411:9639366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT010439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// NONRATT010442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
XM_002727701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CG10869-like (LOC100361104), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006220574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CG10869-like (LOC100361104), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032371 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:9681923:9686454:-1 gene:ENSRNOG00000027315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9668166:9710597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0
NM_024387 // RefSeq // Rattus norvegicus heme oxygenase (decycling) 2 (Hmox2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000005031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9756667:9772409:-1 gene:ENSRNOG00000003773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// J05405 // GenBank // Rat heme oxygenase-2 (HO2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NM_001277073 // RefSeq // Rattus norvegicus heme oxygenase (decycling) 2 (Hmox2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// BC062061 // GenBank // Rattus norvegicus heme oxygenase (decycling) 2, mRNA (cDNA clone MGC:72426 IMAGE:5599345), complete cds. // chr10 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// NONRATT010444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT010445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT010446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT010447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NONRATT010445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001038595 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 3 (Dnaja3), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_001038596 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 3 (Dnaja3), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9826850:9850500:-1 gene:ENSRNOG00000003855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF516338 // GenBank // Rattus norvegicus Tid-1 long isoform mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AY077460 // GenBank // Rattus norvegicus TID1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AY264842 // GenBank // Rattus norvegicus TID-1 short isoform mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9829317:9850500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT010449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_001109382 // RefSeq // Rattus norvegicus vasorin (Vasn), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9886399:9896906:-1 gene:ENSRNOG00000004141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9886961:9888982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106978 // RefSeq // Rattus norvegicus GLIS family zinc finger 2 (Glis2), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:9920016:9940219:-1 gene:ENSRNOG00000004766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:9921670:9971066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_013097 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxyribonuclease I (Dnase1), mRNA. // chr10 // 100 // 60 // 30 // 30 // 0 /// XM_006245829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyribonuclease I (Dnase1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 54 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10512149:10515087:-1 gene:ENSRNOG00000006873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 30 // 30 // 0 /// AF397150 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyribonuclease I variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 60 // 30 // 30 // 0 /// AF397151 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyribonuclease I variant 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 54 // 27 // 27 // 0 /// BC089764 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyribonuclease I, mRNA (cDNA clone MGC:108543 IMAGE:7130586), complete cds. // chr10 // 100 // 60 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10512306:10514691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 46 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT010454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT010455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 34 // 34 // 0
NM_001014225 // RefSeq // Rattus norvegicus clusterin associated protein 1 (Cluap1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006245832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus clusterin associated protein 1 (Cluap1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10602017:10635054:-1 gene:ENSRNOG00000007117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079022 // GenBank // Rattus norvegicus clusterin associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93947 IMAGE:7113868), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT010457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10602252:10655873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT010458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT010459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT010460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
NM_001014226 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 60, NatF catalytic subunit (Naa60), mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10638001:10658027:-1 gene:ENSRNOG00000007280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10639022:10658047:-1 gene:ENSRNOG00000007280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC105304 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 15 (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:124897 IMAGE:7191187), complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// FQ212054 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YG04 mRNA sequence. // chr10 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// AY316589 // GenBank // Rattus norvegicus GNAT acetytransferase mRNA, complete cds. // chr10 // 67 // 83 // 16 // 24 // 0 /// NONRATT010462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10602252:10655873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT010461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT010463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_006220570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 174-like (LOC102551846), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010059 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:10685777:10691026:-1 gene:ENSRNOG00000007655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10685777:10691026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001000493 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1356 (Olr1356), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10698257:10699195:-1 gene:ENSRNOG00000039773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10698257:10699195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105763 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 263 (Zfp263), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:10781419:10788226:-1 gene:ENSRNOG00000007678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10733151:10787957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001006598 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1362 (Olr1362), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12194533:12195474:-1 gene:ENSRNOG00000047553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12194533:12195474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000858 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1364 (Olr1364), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000060994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12210068:12211030:-1 gene:ENSRNOG00000048685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000058010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12206759:12302448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT010478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_214824 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1365 (Olr1365), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12052064:12053005:-1 gene:ENSRNOG00000048615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12258124:12259065:-1 gene:ENSRNOG00000046583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12052064:12074737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12206759:12302448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001000980 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1366 (Olr1366), mRNA. // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000060991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12291943:12293908:-1 gene:ENSRNOG00000039761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// BC097272 // GenBank // Rattus norvegicus olfactory receptor 1366, mRNA (cDNA clone IMAGE:7441750), complete cds. // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000058010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12206759:12302448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT010479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_214825 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1368 (Olr1368), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000071158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12314925:12315866:-1 gene:ENSRNOG00000047259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000058014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12314925:12366836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT010482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000494 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1369 (Olr1369), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000072476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12333242:12334183:-1 gene:ENSRNOG00000050820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT010483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000058014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12314925:12366836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0
NM_001000979 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1370 (Olr1370), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12346086:12347027:-1 gene:ENSRNOG00000046347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000058014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12314925:12366836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT010484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_214826 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1372 (Olr1372), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12394919:12395848:-1 gene:ENSRNOG00000049118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12394919:12395848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000978 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1374 (Olr1374), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12452107:12453048:-1 gene:ENSRNOG00000045802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12452107:12453048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_214829 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1375 (Olr1375), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000041612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12467285:12468226:-1 gene:ENSRNOG00000047727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000005127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12467285:12468226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT010487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_214827 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1376 (Olr1376), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12497244:12498185:-1 gene:ENSRNOG00000049640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12497244:12554299:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT010488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000857 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1380 (Olr1380), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000041708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12598706:12599647:-1 gene:ENSRNOG00000049114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12598706:12671838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT010491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000523 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1381 (Olr1381), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12072739:12073680:-1 gene:ENSRNOG00000047511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12052064:12074737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_214831 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1382 (Olr1382), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000060972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12638493:12639434:-1 gene:ENSRNOG00000050905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000005140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12598706:12671838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT010492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000004583 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:12692337:12693262:-1 gene:ENSRNOG00000003401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 88 // 5 // 7 // 0
XM_006220579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caspase-14-like (LOC680728), mRNA. // chr10 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NM_001105764 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 213 (Zfp213), mRNA. // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// XM_006245863 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 213 (Zfp213), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000030704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12706830:12713743:-1 gene:ENSRNOG00000021872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000005139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12701294:12711197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT010498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001105765 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 13 (Zfp13), mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12729940:12738081:-1 gene:ENSRNOG00000003455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT010502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12730144:12743617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_001055465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 25 (Mmp25), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006220580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 25 (Mmp25), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006245887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 25 (Mmp25), mRNA. // chrU // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000046876 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:12776748:12790164:-1 gene:ENSRNOG00000029621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12776733:12789629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_024384 // RefSeq // Rattus norvegicus THO complex 6 homolog (Drosophila) (Thoc6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12812180:12817540:-1 gene:ENSRNOG00000003497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC079149 // GenBank // Rattus norvegicus THO complex 6 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94166 IMAGE:7128541), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF275266 // GenBank // Rattus norvegicus PDRP mRNA, complete cds. // chr10 // 67 // 41 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12812365:12820946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_181086 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 12a (Tnfrsf12a), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12818949:12820979:-1 gene:ENSRNOG00000003546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY255102 // GenBank // Rattus norvegicus type 1 transmembrane protein FN14 mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 69 // 15 // 18 // 0 /// BC060537 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 12a, mRNA (cDNA clone MGC:72653 IMAGE:6887545), complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT010504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12812365:12820946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001011889 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 9 (Cldn9), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12826470:12827123:-1 gene:ENSRNOG00000003654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC087664 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 9, mRNA (cDNA clone MGC:105509 IMAGE:7315462), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006220581 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus long intergenic non-protein coding RNA 514 (Linc00514), mRNA. // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000033457 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:12866828:12871904:-1 gene:ENSRNOG00000028231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12834657:12874144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_001017377 // RefSeq // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member IV (Paqr4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member IV (Paqr4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000005220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12891716:12895328:-1 gene:ENSRNOG00000003721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC092635 // GenBank // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member IV, mRNA (cDNA clone MGC:109357 IMAGE:7315721), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12892573:12895013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT010508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT010509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001105767 // RefSeq // Rattus norvegicus kringle containing transmembrane protein 2 (Kremen2), mRNA. // chr10 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12896141:12900598:-1 gene:ENSRNOG00000004122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12896531:12940219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT010510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006220588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH-type zinc finger 1 (Flywch1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH-type zinc finger 1 (Flywch1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12910795:12927188:-1 gene:ENSRNOG00000004333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12910768:12927188:-1 gene:ENSRNOG00000004333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC129118 // GenBank // Rattus norvegicus FLYWCH-type zinc finger 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7114597), partial cds. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_003750786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH-type zinc finger-containing protein 1-like (LOC100911062), mRNA. // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000005122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12896531:12940219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT010513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT010514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT010511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT010512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
XM_006220582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH family member 2 (Flywch2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006220583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH family member 2 (Flywch2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006220584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH family member 2 (Flywch2), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH family member 2 (Flywch2), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006245878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH family member 2 (Flywch2), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006245879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH family member 2 (Flywch2), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005899 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:12931766:12934651:-1 gene:ENSRNOG00000004461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0 /// XM_006245881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FLYWCH family member 2 (Flywch2), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12896531:12940219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT010516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT010517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_031129 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 2 (Tceb2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000006892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12983021:12988206:-1 gene:ENSRNOG00000004814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC058463 // GenBank // Rattus norvegicus transcription elongation factor B (SIII), polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:72785 IMAGE:6921630), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// L42855 // GenBank // Rattus norvegicus RNA polymerase II transcription factor SIII p18 subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000019208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12973901:12988162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT010518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001109027 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 33 (Prss33), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 33 (Prss33), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12993514:12995848:-1 gene:ENSRNOG00000029279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12992285:13007428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT010519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135087 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 41 (Prss41), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:12999766:13007446:-1 gene:ENSRNOG00000033690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:12992285:13007428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001108823 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Prostatic spermine-binding protein precursor (SBP) (RGD1562673), mRNA. // chrU // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000068532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13122304:13125182:1 gene:ENSRNOG00000016026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 65 // 9 // 15 // 0 /// BC167085 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Prostatic spermine-binding protein precursor (SBP), mRNA (cDNA clone IMAGE:7930344), complete cds. // chrU // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONRATT008153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT008152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_199371 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 30 (Prss30), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006245922 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 30 (Prss30), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 30 (Prss30), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13164168:13167857:-1 gene:ENSRNOG00000033266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB073023 // GenBank // Rattus norvegicus tmsp-1 mRNA for transmembrane serine protease-1, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13164838:13167821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT010521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106984 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 22 (Prss22), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13186016:13190726:-1 gene:ENSRNOG00000039698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13179104:13199430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105768 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 5 (Kctd5), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13235963:13261942:-1 gene:ENSRNOG00000005607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC168712 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel tetramerisation domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:188688 IMAGE:8366833), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13242287:13261923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_031081 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-phosphoinositide dependent protein kinase-1 (Pdpk1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006246036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3-phosphoinositide dependent protein kinase-1 (Pdpk1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3-phosphoinositide dependent protein kinase-1 (Pdpk1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13267428:13330747:-1 gene:ENSRNOG00000006136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13267569:13298023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT010527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT010526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT010528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT010529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001024990 // RefSeq // Rattus norvegicus amidohydrolase domain containing 2 (Amdhd2), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XR_357448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amidohydrolase domain containing 2 (Amdhd2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 93 // 79 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13344252:13352859:-1 gene:ENSRNOG00000006460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XM_006245946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amidohydrolase domain containing 2 (Amdhd2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// GENSCAN00000019229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13344425:13362297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT010533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT010534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// NONRATT010535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1
NM_130823 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit C (Atp6v0c), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13352992:13358042:-1 gene:ENSRNOG00000006542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC063154 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal 16kDa, V0 subunit c, mRNA (cDNA clone MGC:72710 IMAGE:6918203), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D10874 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for H(+)-transporting ATPase, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// FQ219834 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YC15 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ229188 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YM19 mRNA sequence. // chr10 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT010536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13344425:13362297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT010539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001105769 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 24 (Tbc1d24), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13367060:13392774:-1 gene:ENSRNOG00000006708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13369603:13396314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_053732 // RefSeq // Rattus norvegicus netrin 3 (Ntn3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13393760:13396856:-1 gene:ENSRNOG00000006970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13369603:13396314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT010545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001127606 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100158225 (LOC100158225), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006245888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100158225 (LOC100158225), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047734 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:13402892:13407969:-1 gene:ENSRNOG00000007436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13399742:13407965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001100474 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin F (Ccnf), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13410718:13435965:-1 gene:ENSRNOG00000007483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13411657:13463117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001031637 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 17 (Abca17), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000060818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13446127:13533395:-1 gene:ENSRNOG00000039656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB196699 // GenBank // Rattus norvegicus ABCA17 mRNA for ATP-binding cassette (ABC) transporter 17, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13464414:13542120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001185046 // RefSeq // Rattus norvegicus E4F transcription factor 1 (E4f1), mRNA. // chr10 // 100 // 60 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E4F transcription factor 1 (E4f1), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000012506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13632308:13643815:-1 gene:ENSRNOG00000009224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 28 // 28 // 0 /// BC169042 // GenBank // Rattus norvegicus E4F transcription factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7113420), partial cds. // chr10 // 100 // 57 // 27 // 27 // 0 /// XM_006220592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyribonuclease I-like 2 (Dnase1l2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1 /// XM_006246041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyribonuclease I-like 2 (Dnase1l2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1 /// ENSRNOT00000012203 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:13629322:13631290:-1 gene:ENSRNOG00000042352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1 /// BC092202 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7311660, with apparent retained intron. // chr10 // 38 // 38 // 18 // 47 // 1 /// GENSCAN00000033985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13629693:13643722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT010555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 60 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 21 // 47 // 1 /// NONRATT010556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 13 // 47 // 1 /// NONRATT010551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1
NM_022404 // RefSeq // Rattus norvegicus MTOR associated protein, LST8 homolog (S. cerevisiae) (Mlst8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MTOR associated protein, LST8 homolog (S. cerevisiae) (Mlst8), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13656236:13661987:-1 gene:ENSRNOG00000009667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF051155 // GenBank // Rattus norvegicus G beta-like protein GBL mRNA, complete cds. // chr10 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC097319 // GenBank // Rattus norvegicus G protein beta subunit-like, mRNA (cDNA clone MGC:114322 IMAGE:7455095), complete cds. // chr10 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13658495:13661529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001127548 // RefSeq // Rattus norvegicus TNF receptor-associated factor 7, E3 ubiquitin protein ligase (Traf7), mRNA. // chr10 // 100 // 39 // 19 // 19 // 0 /// NM_133580 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB26, member RAS oncogene family (Rab26), mRNA. // chr10 // 100 // 55 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13691946:13701566:-1 gene:ENSRNOG00000003131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 39 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13711256:13715749:-1 gene:ENSRNOG00000042086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 28 // 28 // 0 /// BC061984 // GenBank // Rattus norvegicus RAB26, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:72316 IMAGE:5599180), complete cds. // chr10 // 100 // 59 // 29 // 29 // 0 /// BC161916 // GenBank // Rattus norvegicus Tnf receptor-associated factor 7, mRNA (cDNA clone MGC:187654 IMAGE:8369808), complete cds. // chr10 // 100 // 39 // 19 // 19 // 0 /// U18771 // GenBank // Rattus norvegicus Rab26 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 55 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13691946:13722840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT010565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 80 // 20 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT010566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 29 // 49 // 1 /// NONRATT010559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 19 // 49 // 1 /// NONRATT010567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 18 // 49 // 1 /// NONRATT010562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1
NM_012680 // RefSeq // Rattus norvegicus tuberous sclerosis 2 (Tsc2), mRNA. // chr10 // 98 // 98 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000016221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13778991:13813550:-1 gene:ENSRNOG00000011375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000030886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13778991:13813550:-1 gene:ENSRNOG00000011375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000052138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13778991:13813550:-1 gene:ENSRNOG00000011375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// D50413 // GenBank // Rattus norvegicus Tsc2 mRNA for tuberin, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// U24150 // GenBank // Rattus norvegicus tuberous sclerosis 2 homolog mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 98 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000033971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13779131:13813021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT010568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT010569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1
NM_053811 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE3, cation proton antiporter 3), member 3 regulator 2 (Slc9a3r2), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13820310:13830824:-1 gene:ENSRNOG00000002997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF294257 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-hydrogen exchanger 3 regulatory factor 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// XM_006245893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE3, cation proton antiporter 3), member 3 regulator 2 (Slc9a3r2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13821331:13830749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_153294 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide W (Npw), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13838167:13839432:-1 gene:ENSRNOG00000012390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB084278 // GenBank // Rattus norvegicus prepro-NPW mRNA for prepro-Neuropeptide W polypeptide, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13838197:13839336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT010575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001106985 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptogyrin 3 (Syngr3), mRNA. // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000017833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13868395:13873149:-1 gene:ENSRNOG00000012620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13869565:13873201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT010577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_013222 // RefSeq // Rattus norvegicus growth factor, augmenter of liver regeneration (Gfer), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13876328:13878685:-1 gene:ENSRNOG00000013370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073702 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06110113.1:19:827:-1 gene:ENSRNOG00000047648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// D30735 // GenBank // Rattus norvegicus ALR mRNA for augmenter of liver regeneration, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// XM_003752199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR-like (LOC100912596), mRNA. // chr10 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// NONRATT010579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13876877:13879042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000041520 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06110113.1:23:1265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001008277 // RefSeq // Rattus norvegicus transducin (beta)-like 3 (Tbl3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000018405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13883208:13888420:-1 gene:ENSRNOG00000013429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC085837 // GenBank // Rattus norvegicus transducin (beta)-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:94510 IMAGE:7135552), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000033948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13883232:13888347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT010580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT010581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 13 // 44 // 1 /// NONRATT010582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
NM_001106987 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 151 (Rnf151), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245952 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 151 (Rnf151), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13899266:13901583:-1 gene:ENSRNOG00000014127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13899647:13900562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT010583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109443 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 10 (Ndufb10), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000019624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:13905856:13908017:-1 gene:ENSRNOG00000014568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ218220 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA7YF07 mRNA sequence. // chr10 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:13905920:13907929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001024991 // RefSeq // Rattus norvegicus fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1 (Fahd1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14031088:14031753:-1 gene:ENSRNOG00000014727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC078950 // GenBank // Rattus norvegicus fumarylacetoacetate hydrolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:93802 IMAGE:7110058), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT010587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011891 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleotide binding protein 2 (Nubp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14060220:14063916:-1 gene:ENSRNOG00000015090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079386 // GenBank // Rattus norvegicus nucleotide binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94899 IMAGE:7111553), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213066 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YO12 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14060766:14064548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT010590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XM_006220597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus essential meiotic structure-specific endonuclease subunit 2 (Eme2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus essential meiotic structure-specific endonuclease subunit 2 (Eme2), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000030458 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:14070214:14072952:-1 gene:ENSRNOG00000024867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// BC158841 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ31364, mRNA (cDNA clone IMAGE:7388708), partial cds. // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14070265:14072946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 65 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT010593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT010592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT010597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_001100673 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 8 interacting protein 3 (Mapk8ip3), mRNA. // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000042066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14076803:14115183:-1 gene:ENSRNOG00000033568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// DQ377222 // GenBank // Rattus norvegicus JIP3 protein (JIP3) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14076803:14115183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT010598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001013182 // RefSeq // Rattus norvegicus hematological and neurological expressed 1-like (Hn1l), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006245995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hematological and neurological expressed 1-like (Hn1l), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000035513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14120135:14139812:-1 gene:ENSRNOG00000024661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091238 // GenBank // Rattus norvegicus hematological and neurological expressed 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:108993 IMAGE:7323726), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006220601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Crm, cramped-like (Drosophila) (Cramp1l), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006220604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Crm, cramped-like (Drosophila) (Cramp1l), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006246049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Crm, cramped-like (Drosophila) (Cramp1l), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006246052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Crm, cramped-like (Drosophila) (Cramp1l), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000022050 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:14143850:14187194:-1 gene:ENSRNOG00000024635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000005223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14122270:14190728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 88 // 36 // 37 // 0 /// NONRATT010609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1
NM_001009620 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 204 (Tmem204), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14233031:14258432:-1 gene:ENSRNOG00000016494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087601 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 204, mRNA (cDNA clone MGC:105601 IMAGE:7314703), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14233567:14262532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT010610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_001059179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus telomere maintenance 2 (Telo2), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_220236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus telomere maintenance 2 (Telo2), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000022670 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:14277469:14291593:-1 gene:ENSRNOG00000016774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000005226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14277469:14291593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT010612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
GENSCAN00000005212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14344732:14348942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 73 // 14 // 19 // 0
NM_001271040 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C (Snrpc), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9611426:9629603:1 gene:ENSRNOG00000000493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// FQ209526 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YC21 mRNA sequence. // chr10 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000023626 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:14348352:14348831:-1 gene:ENSRNOG00000017586 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9612790:9673740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT032957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// NONRATT032958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// NONRATT032959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// NONRATT018912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 100 // 11 // 31 // 0 /// NONRATT014813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001100493 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase, gamma subunit (Gnptg), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000029674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14410651:14415566:-1 gene:ENSRNOG00000024455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC158818 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase, gamma subunit, mRNA (cDNA clone MGC:188258 IMAGE:7374209), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ213320 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YI05 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14410223:14415543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT010616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT010617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT010619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
ENSRNOT00000024072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14418873:14427212:-1 gene:ENSRNOG00000017893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000073112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14418873:14427212:-1 gene:ENSRNOG00000017893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14418873:14453161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT010620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_019322 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptase alpha/beta 1 (Tpsab1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14519181:14521596:-1 gene:ENSRNOG00000024181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061983 // GenBank // Rattus norvegicus tryptase alpha/beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:72481 IMAGE:5598863), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U67910 // GenBank // Rattus norvegicus mast cell protease 7 (RMCP-7) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14519366:14521379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT010631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153814 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, T type, alpha 1H subunit (Cacna1h), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000043626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14547465:14605140:-1 gene:ENSRNOG00000033893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AF290213 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel alpha-1-H subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14548229:14574769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT010632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_012882 // RefSeq // Rattus norvegicus somatostatin receptor 5 (Sstr5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14664005:14670083:-1 gene:ENSRNOG00000018834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L04535 // GenBank // Rattus norvegicus somatostatin receptor (SSTR5) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14664135:14678110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT010635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106989 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 8 (Sox8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14745882:14750870:-1 gene:ENSRNOG00000018841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14747376:14750512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105773 // RefSeq // Rattus norvegicus CTF18, chromosome transmission fidelity factor 18 homolog (S. cerevisiae) (Chtf18), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000026139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14903483:14911519:-1 gene:ENSRNOG00000019174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT010638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000021203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14903601:14911444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 91 // 40 // 44 // 1
NM_031658 // RefSeq // Rattus norvegicus mesothelin (Msln), mRNA. // chr10 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000026395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14932448:14938109:-1 gene:ENSRNOG00000019445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC070934 // GenBank // Rattus norvegicus mesothelin, mRNA (cDNA clone MGC:91602 IMAGE:7098161), complete cds. // chr10 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// D87351 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mesothelin, complete cds. // chr10 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14932579:14946701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT010639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT010640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006246064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxyacylglutathione hydrolase-like (Haghl), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026536 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:14965681:14968346:-1 gene:ENSRNOG00000019612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC076383 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxyacylglutathione hydrolase-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7106791), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC161824 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8368897. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14965851:14967900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT010641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001127447 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 173, member A (Fam173a), mRNA. // chr10 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000026641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14972980:14974838:-1 gene:ENSRNOG00000019684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// BC085808 // GenBank HTC // Rattus norvegicus family with sequence similarity 173, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:7113617), with apparent retained intron. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT010648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000049688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14973041:14979391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001009962 // RefSeq // Rattus norvegicus meteorin, glial cell differentiation regulator (Metrn), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:14977382:14979400:-1 gene:ENSRNOG00000019692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AY800384 // GenBank // Rattus norvegicus HYRAC (Hyrac) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:14973041:14979391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT010651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT010648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT010652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001025625 // RefSeq // Rattus norvegicus STIP1 homology and U-box containing protein 1, E3 ubiquitin protein ligase (Stub1), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15010698:15012978:-1 gene:ENSRNOG00000019798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC099240 // GenBank // Rattus norvegicus STIP1 homology and U-Box containing protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116422 IMAGE:7445727), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15010945:15012875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT010654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT010655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT010656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001191822 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid, veinlet-like 1 (Drosophila) (Rhbdl1), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15014446:15017086:-1 gene:ENSRNOG00000019921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// Y17258 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for rhomboid-related protein. // chr10 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT010660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_181823 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member T2 (Rhot2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000027083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15018888:15024226:-1 gene:ENSRNOG00000019930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// AY303973 // GenBank // Rattus norvegicus MIRO2 precursor, mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT010662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 31 // 42 // 1 /// NONRATT010664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// NONRATT010665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT010666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT010662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT010668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 90-like (LOC102555298), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027121 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15024903:15041178:-1 gene:ENSRNOG00000020006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001109475 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 195, member A (Fam195a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15043744:15048683:-1 gene:ENSRNOG00000020029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15014781:15048618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_001129776 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 1 (Wfikkn1), mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000060156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15056372:15058700:-1 gene:ENSRNOG00000021578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15056372:15078274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_182675 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab40c, member RAS oncogene family (Rab40c), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15060857:15095926:-1 gene:ENSRNOG00000020067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY190240 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein Rab40c mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC128720 // GenBank // Rattus norvegicus Rab40c, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:156560 IMAGE:8374477), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15056372:15078274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007607 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Q (Pigq), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000027353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15102511:15118524:-1 gene:ENSRNOG00000020140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC081875 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Q, mRNA (cDNA clone MGC:93737 IMAGE:7107681), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006245938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Q (Pigq), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// XM_006245939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Q (Pigq), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15103720:15113496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
GENSCAN00000049684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15119044:15124092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003750793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC302999 (LOC302999), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC302999 (LOC302999), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027371 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:15122120:15124092:-1 gene:ENSRNOG00000020212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15119044:15124092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
GENSCAN00000049683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15131307:15131582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000031538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:15131261:15131582:-1 gene:ENSRNOG00000021511 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
NM_001106990 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 15 (Capn15), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15132749:15159349:-1 gene:ENSRNOG00000020239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15133961:15189240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_220262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 3 (class II) (Rab11fip3), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000027439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15162863:15194666:-1 gene:ENSRNOG00000032152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC081997 // GenBank // Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 3 (class II), mRNA (cDNA clone MGC:94219 IMAGE:7130781), complete cds. // chr10 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15133961:15189240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT010687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT010686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT010688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001105775 // RefSeq // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 2 (Pdia2), mRNA. // chr10 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NM_001108269 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) gamma (Arhgdig), mRNA. // chr10 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000027726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15376461:15379535:-1 gene:ENSRNOG00000020445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15379685:15381848:-1 gene:ENSRNOG00000042072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15376658:15381641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT010699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT010700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001009701 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin alpha FG-GAP repeat containing 3 (Itfg3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15392902:15405995:-1 gene:ENSRNOG00000028241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC088404 // GenBank // Rattus norvegicus integrin alpha FG-GAP repeat containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:93756 IMAGE:7108395), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000049679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15393734:15409400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT010701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT010702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT010703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XR_338491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 67 // 91 // 14 // 21 // 0 /// XR_357468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 67 // 91 // 14 // 21 // 0
NM_001013853 // RefSeq // Rattus norvegicus globin, alpha (LOC287167), mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000052292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15472255:15473102:-1 gene:ENSRNOG00000045989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ212394 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA56YK17 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15469907:15473071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
XM_006220618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hemoglobin, theta 1B (Hbq1b), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000035459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15495315:15496002:-1 gene:ENSRNOG00000028114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 97 // 23 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15494921:15496002:-1 gene:ENSRNOG00000028114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15495320:15498711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// FQ234798 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YK03 mRNA sequence. // chr10 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NONRATT010708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15469907:15473071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
XM_006220618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hemoglobin, theta 1B (Hbq1b), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000035459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15495315:15496002:-1 gene:ENSRNOG00000028114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15494921:15496002:-1 gene:ENSRNOG00000028114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000000243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15495320:15498711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// FQ234798 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YK03 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT010708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000000224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15469907:15473071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001172845 // RefSeq // Rattus norvegicus hemoglobin, zeta (Hbz), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15504499:15505978:-1 gene:ENSRNOG00000020536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ221080 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YO15 mRNA sequence. // chr10 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15504599:15505917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_012601 // RefSeq // Rattus norvegicus N-methylpurine-DNA glycosylase (Mpg), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000027940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15556935:15563138:-1 gene:ENSRNOG00000020571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15556948:15568093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT010714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_006220623 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 25 (U11/U12) (Snrnp25), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 25 (U11/U12) (Snrnp25), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15581365:15584287:-1 gene:ENSRNOG00000020626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15581365:15584950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT010716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT010718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000000236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15603333:15610472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000028014 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:15609636:15610539:-1 gene:ENSRNOG00000020641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0
NM_001034152 // RefSeq // Rattus norvegicus neuron specific gene family member 2 (Nsg2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15762454:15822361:-1 gene:ENSRNOG00000020644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105916 // GenBank // Rattus norvegicus neuron specific gene family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:125201 IMAGE:7384671), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15764062:15821359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT010721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001108270 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930524B15 (RGD1311343), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006246018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930524B15 (RGD1311343), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15841445:15854865:-1 gene:ENSRNOG00000027852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT010723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000000227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15840237:15941672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106992 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4 (Cpeb4), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:15882113:15940027:-1 gene:ENSRNOG00000033169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000000227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:15840237:15941672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT010728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_080897 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2/adenovirus E1B interacting protein 1 (Bnip1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000028173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:16565648:16577894:-1 gene:ENSRNOG00000020753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF454391 // GenBank // Rattus norvegicus BNIP1 protein (Bnip1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ218385 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YJ10 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT010731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16535634:16647094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 15 // 17 // 1 /// NONRATT010732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// NONRATT010733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
NM_001277157 // RefSeq // Rattus norvegicus CREB3 regulatory factor (Crebrf), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:16590829:16621974:-1 gene:ENSRNOG00000020769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16535634:16647094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
AB051300 // GenBank // Rattus norvegicus dsr-1 mRNA for Dsr-1A, Dsr-1B, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NM_053578 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal, V0 subunit e1 (Atp6v0e1), mRNA. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000004653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:16661968:16685040:-1 gene:ENSRNOG00000003269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// AB037248 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for vacuolar proton-ATPase subunit M9.2, complete cds. // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// FQ226644 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YO10 mRNA sequence. // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT010738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
XR_146176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910596 (LOC100910596), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XR_146503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910596 (LOC100910596), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XR_338507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910596 (LOC100910596), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XR_357485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910596 (LOC100910596), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT010742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_003752310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment (ERGIC) 1 (Ergic1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006246087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment (ERGIC) 1 (Ergic1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endoplasmic reticulum-golgi intermediate compartment (ERGIC) 1 (Ergic1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005273 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:16719603:16763481:-1 gene:ENSRNOG00000003508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16719603:16835976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
GENSCAN00000028293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16719603:16835976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NONRATT010747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT010748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001142652 // RefSeq // Rattus norvegicus neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1B (Neurl1b), mRNA. // chr10 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000039398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:16945337:16972071:-1 gene:ENSRNOG00000027606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GQ414761 // GenBank // Rattus norvegicus neuralized 2 (Neurl2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:16945337:16948889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
XM_003750796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688443 (LOC688443), mRNA. // chr10 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// XM_003752311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688443 (LOC688443), mRNA. // chr10 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000005396 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:17086916:17087501:-1 gene:ENSRNOG00000004053 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:17079600:17087501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001191091 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 9 (Efcab9), mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000005509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:17303083:17311280:-1 gene:ENSRNOG00000004142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:17291887:17311280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_001108271 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 23 (Smim23), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:17605598:17609232:-1 gene:ENSRNOG00000027196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:17605663:17628203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000064744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:17967960:17975960:-1 gene:ENSRNOG00000004616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// J04943 // GenBank // Rat nucleolar protein B23.2 mRNA, complete cds, clone JH2. // chr10 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// NONRATT010751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT010752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT010753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
ENSRNOT00000052621 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:10:18002408:18002526:-1 gene:ENSRNOG00000034498 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001064411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell leukemia, homeobox 3 (Tlx3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_573065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell leukemia, homeobox 3 (Tlx3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:18013468:18015622:-1 gene:ENSRNOG00000004976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:18011627:18015622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT010754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT010755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001106994 // RefSeq // Rattus norvegicus RAN binding protein 17 (Ranbp17), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 17 (Ranbp17), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:18024416:18328821:-1 gene:ENSRNOG00000005042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ212247 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA63YK17 mRNA sequence. // chr10 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT010758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:18054239:18157818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:18236502:18328659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_031029 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA-A) receptor, pi (Gabrp), mRNA. // chr10 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000043036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:18369151:18391029:-1 gene:ENSRNOG00000032417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// FQ222085 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YE21 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// U95368 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-A receptor pi subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:18343776:18390606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT010762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001261387 // RefSeq // Rattus norvegicus Kv channel-interacting protein 1 (Kcnip1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// NM_001261388 // RefSeq // Rattus norvegicus Kv channel-interacting protein 1 (Kcnip1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// NM_001261389 // RefSeq // Rattus norvegicus Kv channel-interacting protein 1 (Kcnip1), transcript variant 3, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NM_022929 // RefSeq // Rattus norvegicus Kv channel-interacting protein 1 (Kcnip1), transcript variant 4, mRNA. // chr10 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// XM_006246105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kv channel-interacting protein 1 (Kcnip1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:18444651:18663340:-1 gene:ENSRNOG00000005365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000040737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:18444651:18663340:-1 gene:ENSRNOG00000005365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// AY082657 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel auxiliary subunit KChIP1a mRNA, complete cds. // chr10 // 77 // 94 // 24 // 31 // 0 /// AY142709 // GenBank // Rattus norvegicus Kv4 potassium channel-interacting protein KChIP1b mRNA, complete cds. // chr10 // 81 // 94 // 25 // 31 // 0 /// AY082658 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel auxiliary subunit KChIP1b mRNA, complete cds. // chr10 // 72 // 88 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:18456596:18485195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT010763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
NM_001105776 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box I1 (Foxi1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:19039086:19043025:-1 gene:ENSRNOG00000006293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:19040217:19042956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT010765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 2 (Dock2), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000059810 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:19330459:19481125:-1 gene:ENSRNOG00000006932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 18 // 18 // 0 /// BC101877 // GenBank // Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5599905), complete cds. // chr10 // 100 // 42 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:19054404:19199039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 49 // 49 // 22 // 45 // 1 /// NONRATT010766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 17 // 45 // 1 /// GENSCAN00000032804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:19308242:19413533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
NM_001034138 // RefSeq // Rattus norvegicus spindle apparatus coiled-coil protein 1 (Spdl1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000009648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:19504873:19529472:-1 gene:ENSRNOG00000007292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC105812 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 99, mRNA (cDNA clone MGC:124977 IMAGE:7112484), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000023616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:19452214:19545819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001108824 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrillarin-like 1 (Fbll1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:20494823:20495797:-1 gene:ENSRNOG00000015303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:20494823:20495797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105777 // RefSeq // Rattus norvegicus arginyl-tRNA synthetase (Rars), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:20505808:20530334:-1 gene:ENSRNOG00000007739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC161929 // GenBank // Rattus norvegicus arginyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:187703 IMAGE:8375237), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:20505908:20570127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT010776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
ENSRNOT00000011061 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:20535873:20689272:-1 gene:ENSRNOG00000008065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// FQ212171 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA67YD06 mRNA sequence. // chr10 // 94 // 76 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000035708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:20571508:20632049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 39 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:20505908:20570127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1 /// NONRATT010779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONRATT010778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NM_020088 // RefSeq // Rattus norvegicus teneurin transmembrane protein 2 (Tenm2), mRNA. // chr10 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:20716458:21085081:-1 gene:ENSRNOG00000027341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068312 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:20716458:21085081:-1 gene:ENSRNOG00000027341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AF086607 // GenBank // Rattus norvegicus neurestin alpha mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:20716717:20931212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
NM_001044282 // RefSeq // Rattus norvegicus methionine adenosyltransferase II, beta (Mat2b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methionine adenosyltransferase II, beta (Mat2b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:25686298:25699413:-1 gene:ENSRNOG00000003177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC085899 // GenBank // Rattus norvegicus similar to methionine adenosyltransferase II, beta, mRNA (cDNA clone MGC:94725 IMAGE:7193416), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:25687002:25733823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
NM_012964 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan mediated motility receptor (RHAMM) (Hmmr), mRNA. // chr10 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// AF133037 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronan receptor RHAMM (Rhamm) mRNA, complete cds. // chr10 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// AF336825 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronan receptor RHAMM mRNA, complete cds. // chr10 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:25687002:25733823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0 /// U87983 // GenBank // Rattus norvegicus receptor for hyaluronan-mediated motility mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0
NM_012923 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin G1 (Ccng1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:25753833:25760534:-1 gene:ENSRNOG00000003256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081852 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin G1, mRNA (cDNA clone MGC:93642 IMAGE:7105829), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211975 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA74YC21 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ216809 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YC01 mRNA sequence. // chr10 // 52 // 85 // 12 // 23 // 0 /// NONRATT010796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:25746811:25766292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT010798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSRNOT00000004402 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:26667657:26668902:-1 gene:ENSRNOG00000003303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:26664856:26899927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0
NM_183327 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 2 (Gabrg2), mRNA. // chr10 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:26937103:27023929:-1 gene:ENSRNOG00000003241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY574252 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-A gamma2 long isoform mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC092617 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7312477), partial cds. // chr10 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:26937103:26972622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT010800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT010801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000025625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:26983212:27233499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_183326 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 1 (Gabra1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000004725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:27154359:27210126:-1 gene:ENSRNOG00000003512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY574250 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-A receptor alpha1 subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC100061 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:112581 IMAGE:7122007), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ211937 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YP16 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT010802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:26983212:27233499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT010803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_021841 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 6 (Gabra6), mRNA. // chr10 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000004877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:27691631:27706942:-1 gene:ENSRNOG00000003569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:27692441:27706942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT010804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NR_031892 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 146a (Mir146a), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053589 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:28806739:28806833:-1 gene:ENSRNOG00000035466 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-146a // miRBase Micro RNA Database // MI0000919 Rattus norvegicus miR-146a stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022391 // RefSeq // Rattus norvegicus pituitary tumor-transforming 1 (Pttg1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pituitary tumor-transforming 1 (Pttg1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000005070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:28861945:28867675:-1 gene:ENSRNOG00000003802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158551 // GenBank // Rattus norvegicus pituitary tumor-transforming 1, mRNA (cDNA clone MGC:187213 IMAGE:9032805), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U73030 // GenBank // Rattus norvegicus pituitary tumor transforming gene protein (PTTG) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246145 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pituitary tumor-transforming 1 (Pttg1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:28862019:28867395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT010806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_017098 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 6, ileal (Fabp6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000005205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:29030288:29034963:-1 gene:ENSRNOG00000003902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// L22788 // GenBank // Rattus norvegicus 14 kDa bile acid-binding protein (I-BABP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000054476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29030351:29063831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT010809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001005529 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 1 (Ttc1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:29182729:29208110:-1 gene:ENSRNOG00000003980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC082093 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:95276 IMAGE:7134129), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 1 (Ttc1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1 /// GENSCAN00000054489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29183187:29218879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_016991 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenoceptor alpha 1B (Adra1b), mRNA. // chr10 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC070920 // GenBank // Rattus norvegicus adrenergic, alpha-1B-, receptor, mRNA (cDNA clone MGC:91757 IMAGE:7105608), complete cds. // chr10 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// M60655 // GenBank // Rat alpha-1B adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29234519:29246408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001014117 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like domain containing CTD phosphatase 1 (Ublcp1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:29936811:29952077:-1 gene:ENSRNOG00000004477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC089210 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like domain containing CTD phosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105972 IMAGE:7302690), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:29932287:29949280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001173384 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM11, U7 small nuclear RNA associated (Lsm11), mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:30847784:30862999:-1 gene:ENSRNOG00000005450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC158836 // GenBank // Rattus norvegicus LSM11, U7 small nuclear RNA associated, mRNA (cDNA clone MGC:188298 IMAGE:7385359), complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// FQ223124 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YD06 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:30850088:30862956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001013966 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA-histidine guanylyltransferase 1-like (S. cerevisiae) (Thg1l), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:30866224:30873429:-1 gene:ENSRNOG00000005539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087596 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA-histidine guanylyltransferase 1-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105704 IMAGE:7310343), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:30866432:30890780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001106995 // RefSeq // Rattus norvegicus NIPA-like domain containing 4 (Nipal4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000008544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31060605:31077316:-1 gene:ENSRNOG00000006255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31062569:31077236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001106996 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoplasmic FMR1 interacting protein 2 (Cyfip2), mRNA. // chr10 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000059496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31097979:31235818:-1 gene:ENSRNOG00000006557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31145704:31197978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31100468:31134028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0
NM_001108825 // RefSeq // Rattus norvegicus IL2-inducible T-cell kinase (Itk), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31248186:31308803:-1 gene:ENSRNOG00000006860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000056192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31232439:31285936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT010829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0
NM_001105905 // RefSeq // Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 1 (Dppa1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31505874:31525617:-1 gene:ENSRNOG00000043293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000037099 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:6644922:6645278:1 gene:ENSRNOG00000028544 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 79 // 100 // 26 // 33 // 0 /// GENSCAN00000051639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6644922:6645278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 100 // 26 // 33 // 0 /// NONRATT010830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31473043:31516732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000028321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31417966:31465052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_001013855 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 2 (Timd2), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:31565010:31609386:-1 gene:ENSRNOG00000021345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC089832 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:108812 IMAGE:7324518), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246165 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 2 (Timd2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// XM_006246167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 2 (Timd2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// XM_006246168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell immunoglobulin and mucin domain containing 2 (Timd2), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// NONRATT010831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31565240:31593770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001015014 // RefSeq // Rattus norvegicus surfeit 6 (Surf6), mRNA. // chr10 // 87 // 100 // 33 // 38 // 0 /// XM_006233784 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus surfeit 6 (Surf6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 86 // 97 // 32 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000006699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10803319:10814066:-1 gene:ENSRNOG00000005031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 87 // 100 // 33 // 38 // 0 /// BC091270 // GenBank // Rattus norvegicus surfeit 6, mRNA (cDNA clone MGC:109125 IMAGE:7381547), complete cds. // chr10 // 87 // 100 // 33 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000059452 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:31691938:31692995:-1 gene:ENSRNOG00000038898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000000239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10804238:10820477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 97 // 32 // 37 // 0 /// GENSCAN00000028324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31692489:31692995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:31691932:31692216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 45 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 87 // 100 // 33 // 38 // 0 /// NONRATT029319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 87 // 14 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142489208:142510220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_001109029 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcoglycan, delta (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgcd), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NM_001134826 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcoglycan, delta (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgcd), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003224 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:31878904:32255864:-1 gene:ENSRNOG00000002372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075449 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:31879390:32255864:-1 gene:ENSRNOG00000002372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000039342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:32022973:32118780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001134737 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 41 (Trim41), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:33939418:33950502:-1 gene:ENSRNOG00000002388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168206 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 41, mRNA (cDNA clone MGC:188087 IMAGE:7130974), complete cds. // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:33940355:33949791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT010839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001012007 // RefSeq // Rattus norvegicus immunity-related GTPase family, M (Irgm), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunity-related GTPase family, M (Irgm), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000045545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:33997566:34005503:-1 gene:ENSRNOG00000031138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079106 // GenBank // Rattus norvegicus immunity-related GTPase family, M, mRNA (cDNA clone MGC:94096 IMAGE:7125255), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:33998047:33999234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT010841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000046438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34016734:34026889:-1 gene:ENSRNOG00000032396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158643 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8363294, partial cds. // chr10 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000052589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34016734:34026889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT010842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_214832 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1383 (Olr1383), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34081863:34082810:-1 gene:ENSRNOG00000047402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34081863:34082810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000052571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34114412:34119297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001002291 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor gene Olr1384 (Olr1384), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34114412:34115353:-1 gene:ENSRNOG00000047001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_214832 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1383 (Olr1383), mRNA. // chr10 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// NM_214833 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1385 (Olr1385), mRNA. // chr10 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34081863:34082810:-1 gene:ENSRNOG00000047402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34142130:34143077:-1 gene:ENSRNOG00000046800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34114412:34119297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34081863:34082810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34142130:34146227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT010843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// NONRATT010846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_214833 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1385 (Olr1385), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34142130:34143077:-1 gene:ENSRNOG00000046800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34142130:34146227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_006220651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear envelope pore membrane protein POM 121-like (LOC102555091), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear envelope pore membrane protein POM 121-like (LOC102555091), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34820416:34837870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064782 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:34830150:34832249:-1 gene:ENSRNOG00000027334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001013856 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 6 (Cnot6), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// XM_006246233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 6 (Cnot6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34918194:34948524:-1 gene:ENSRNOG00000002803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC079308 // GenBank // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 6, mRNA (cDNA clone MGC:94449 IMAGE:7134677), complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT010848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT010850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_006246233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 6 (Cnot6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073020 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:34918584:34918848:-1 gene:ENSRNOG00000049032 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT010848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukotriene C4 synthase (Ltc4s), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukotriene C4 synthase (Ltc4s), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukotriene C4 synthase (Ltc4s), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000004359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35498266:35500227:-1 gene:ENSRNOG00000003244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_053639 // RefSeq // Rattus norvegicus leukotriene C4 synthase (Ltc4s), mRNA. // chr10 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// AB048790 // GenBank // Rattus norvegicus LTC4 mRNA for leukotriene C4 synthase, complete cds. // chr10 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35498294:35500202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT010871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106997 // RefSeq // Rattus norvegicus mastermind like 1 (Drosophila) (Maml1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35527493:35561786:-1 gene:ENSRNOG00000003268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35529658:35596075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_172008 // RefSeq // Rattus norvegicus calnexin (Canx), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calnexin (Canx), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35562608:35595454:-1 gene:ENSRNOG00000003343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35529658:35596075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT010876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT010878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT010880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT010881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENSRNOT00000062136 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:10:35629522:35629615:-1 gene:ENSRNOG00000040383 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100727 // RefSeq // Rattus norvegicus RUN and FYVE domain containing 1 (Rufy1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006246297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN and FYVE domain containing 1 (Rufy1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000004740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:35653747:35698367:-1 gene:ENSRNOG00000003536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC099227 // GenBank // Rattus norvegicus RUN and FYVE domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7388968), partial cds. // chr10 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:35653949:35698349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// NONRATT010884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_023988 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 354C (Zfp354c), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36082344:36093357:-1 gene:ENSRNOG00000029205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF321874 // GenBank // Rattus norvegicus AJ18 protein mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT010893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36082313:36109193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001134600 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 879 (Zfp879), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36097634:36107629:-1 gene:ENSRNOG00000030517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36082313:36109193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006220660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 454-like (LOC102555919), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039827 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:36136552:36144976:-1 gene:ENSRNOG00000022971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065439 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:36136552:36146954:-1 gene:ENSRNOG00000022971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
NM_001127558 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 2 (Zfp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36160914:36175396:-1 gene:ENSRNOG00000030750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161925 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:187686 IMAGE:8372872), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 354B-like (LOC102556119), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006220655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 354B-like (LOC102556119), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006220656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 354B-like (LOC102556119), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// XM_006246359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 354B-like (LOC102556119), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006246360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 354B-like (LOC102556119), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006246361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 354B-like (LOC102556119), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000004902 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:36185559:36194975:-1 gene:ENSRNOG00000029678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
NM_153627 // RefSeq // Rattus norvegicus PROP paired-like homeobox 1 (Prop1), mRNA. // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36222695:36225156:-1 gene:ENSRNOG00000003671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006246313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4930503F14 (LOC497899), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006246314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4930503F14 (LOC497899), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000038838 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:36480645:36488292:-1 gene:ENSRNOG00000022555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC059166 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6890782, partial cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT010900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031330 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B (Hnrnpab), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000004885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34728062:34733954:-1 gene:ENSRNOG00000003645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000033056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34728062:34733954:-1 gene:ENSRNOG00000003645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000065584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36821959:36827505:-1 gene:ENSRNOG00000046272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// AF216753 // GenBank // Rattus norvegicus CArG-binding factor A (Cbfa) mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 60 // 24 // 27 // 0 /// AJ238854 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for type A/B hnRNP protein p40. // chr10 // 98 // 91 // 40 // 41 // 0 /// BC066664 // GenBank // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B, mRNA (cDNA clone MGC:72406 IMAGE:5621982), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// FQ227737 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YB04 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000001876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34728597:34733672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36822219:36827294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 31 // 31 // 0 /// AB016536 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for AlF-C1, complete cds. // chr10 // 98 // 96 // 42 // 43 // 0 /// AF108653 // GenBank // Rattus norvegicus nucleic acid binding factor pRM10 (pRM10) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 80 // 35 // 36 // 0
NM_001017473 // RefSeq // Rattus norvegicus required for meiotic nuclear division 5 homolog B (S. cerevisiae) (Rmnd5b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000075525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36845890:36856831:-1 gene:ENSRNOG00000047719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000075555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34752524:34763465:-1 gene:ENSRNOG00000047396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC093386 // GenBank // Rattus norvegicus required for meiotic nuclear division 5 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112682 IMAGE:7389386), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34752933:34757982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// GENSCAN00000015857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36846299:36851348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1
NM_001033893 // RefSeq // Rattus norvegicus Nedd4 binding protein 3 (N4bp3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34770368:34773237:-1 gene:ENSRNOG00000021731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36864136:36866601:-1 gene:ENSRNOG00000045965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// DQ176639 // GenBank // Rattus norvegicus Nedd4 binding protein 3 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34770772:34777175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000015879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36864136:36870539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001271111 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex subunit 2-like (LOC100910318), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001271112 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex subunit 2-like (LOC100910318), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein particle complex subunit 2-like (LOC100910318), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_357579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sedlin-like (LOC287274), transcript variant X4, misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36903018:36903440:-1 gene:ENSRNOG00000004419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:34808882:34813072:-1 gene:ENSRNOG00000049062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232274 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YG15 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34809140:34809562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36903018:36903440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105780 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC24 family member A (Sec24a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000006356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:36913611:36988825:-1 gene:ENSRNOG00000004563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000046379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:36914294:36983196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT010902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT010903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1
NM_001106998 // RefSeq // Rattus norvegicus jade family PHD finger 2 (Jade2), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus jade family PHD finger 2 (Jade2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus jade family PHD finger 2 (Jade2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus jade family PHD finger 2 (Jade2), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus jade family PHD finger 2 (Jade2), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000043343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37043431:37084794:-1 gene:ENSRNOG00000004956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC168752 // GenBank // Rattus norvegicus PHD finger protein 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:6921910), partial cds. // chr10 // 93 // 85 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37043562:37086824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT010906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT010907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_031138 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2B (Ube2b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006246343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2B (Ube2b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000016742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37213059:37227635:-1 gene:ENSRNOG00000005064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC070946 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2B, RAD6 homology (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:91645 IMAGE:7103580), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// FQ222428 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YJ13 mRNA sequence. // chr10 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// M62388 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin conjugating enzyme mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000046391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37214593:37227534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 61 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT010909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AF144083 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 83 // 38 // 46 // 1 /// NONRATT010910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 25 // 46 // 1 /// NONRATT010912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 70 // 70 // 32 // 46 // 1 /// NONRATT010911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 15 // 46 // 1 /// NONRATT010913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
XM_006220667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor 7 (T-cell specific, HMG-box) (Tcf7), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// XM_006246363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor 7 (T-cell specific, HMG-box) (Tcf7), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000008022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:37389827:37419231:-1 gene:ENSRNOG00000005872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37390875:37418287:-1 gene:ENSRNOG00000005872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// EF519318 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell specific transcription factor 1 short isoform (Tcf1) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr10 // 91 // 31 // 10 // 11 // 0 /// FQ233211 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YL22 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37418092:37419231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000046382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37389108:37398871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000035572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37570684:37599410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_153629 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 4 (Hspa4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000023628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38383101:38423972:-1 gene:ENSRNOG00000016596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF077354 // GenBank // Rattus norvegicus ischemia responsive 94 kDa protein (irp94) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ222433 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YI23 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38384873:38396620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38398758:38424293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT010921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
FQ210468 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA28YB17 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NM_001126081 // RefSeq // Rattus norvegicus liver-expressed antimicrobial peptide 2 (Leap2), mRNA. // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000049820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38553405:38556793:-1 gene:ENSRNOG00000007218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT010927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT010928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38553405:38556728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001025134 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit VII (Uqcrq), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit VII (Uqcrq), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000073964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38562435:38564716:-1 gene:ENSRNOG00000048174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY323237 // GenBank // Rattus norvegicus low molecular mass ubiquinone-binding protein (Qpc) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211208 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA15YG21 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// FQ217359 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA28YP02 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ224372 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA68YK15 mRNA sequence. // chr10 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000041416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38562538:38564580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT010929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_001073996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sosondowah ankyrin repeat domain family member A (Sowaha), mRNA. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38617551:38619209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_201270 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 4 (Il4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38745706:38751258:-1 gene:ENSRNOG00000007624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY496861 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 4 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38745707:38750819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053828 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 13 (Il13), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38764639:38767196:-1 gene:ENSRNOG00000007652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L26913 // GenBank // Rattus Norvegicus interleukin-13 (IL-13) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38764686:38767196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT010933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022246 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD50 homolog (S. cerevisiae) (Rad50), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000063772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:38783860:38835810:-1 gene:ENSRNOG00000033065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF218576 // GenBank // Rattus norvegicus Rad50 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:38784210:38835656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000041253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39078693:39105980:-1 gene:ENSRNOG00000033865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// DQ119106 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA stabilizer 2b1 splice variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// GENSCAN00000003199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39068404:39154224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_053852 // RefSeq // Rattus norvegicus colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage) (Csf2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39379308:39381289:-1 gene:ENSRNOG00000026805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39379314:39389530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000031762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39397782:39400192:-1 gene:ENSRNOG00000026786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_031513 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 3 (Il3), mRNA. // chr10 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// U81492 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-3 beta mRNA, complete cds. // chr10 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// U81493 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-3 alpha mRNA, complete cds. // chr10 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:39397811:39445566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_338614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L17-like (LOC102551621), misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XR_357600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L17-like (LOC102551621), misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000039203 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:39861990:39862510:-1 gene:ENSRNOG00000021861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT010943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT010944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT010945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT010946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT010947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT010948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001134729 // RefSeq // Rattus norvegicus LYR motif containing 7 (Lyrm7), mRNA. // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000075311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:39955373:39974260:-1 gene:ENSRNOG00000045961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT010949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001108826 // RefSeq // Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 1 (Tnip1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006246303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNFAIP3 interacting protein 1 (Tnip1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40028044:40075239:-1 gene:ENSRNOG00000010370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40028794:40054985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT010950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT010952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_024156 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A6 (Anxa6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// XM_006246338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A6 (Anxa6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// XM_006246342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A6 (Anxa6), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000014464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40092956:40129924:-1 gene:ENSRNOG00000010668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// BC072523 // GenBank // Rattus norvegicus annexin A6, mRNA (cDNA clone MGC:91612 IMAGE:7105847), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000008053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40096781:40261529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT010954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// X86086 // GenBank // R.norvegicus RNA for annexin VI. // chr10 // 96 // 98 // 46 // 48 // 0 /// NONRATT010955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 22 // 49 // 1 /// NONRATT010956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// NONRATT010957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 16 // 49 // 1
NONRATT010954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001109031 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 69 (Ccdc69), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 69 (Ccdc69), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 69 (Ccdc69), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40231947:40257584:-1 gene:ENSRNOG00000021370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 69 (Ccdc69), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT010959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40096781:40261529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001024764 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 36, member 3 (Slc36a3), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000037274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40301378:40328378:-1 gene:ENSRNOG00000021310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC097463 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:114528 IMAGE:7457579), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000008057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40301459:40363538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// NONRATT010963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_139339 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 2 (Slc36a2), mRNA. // chr10 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40335854:40363646:-1 gene:ENSRNOG00000011892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF512430 // GenBank // Rattus norvegicus tramdorin 1 (Tramd1) mRNA, complete cds. // chr10 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// BC166414 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 36 (proton/amino acid symporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187323 IMAGE:9027758), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40301459:40363538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
NM_022954 // RefSeq // Rattus norvegicus FAT atypical cadherin 2 (Fat2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000058665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40421638:40489120:-1 gene:ENSRNOG00000012575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AB011527 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MEGF1, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000009776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40423016:40491196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0
NM_053359 // RefSeq // Rattus norvegicus antioxidant 1 copper chaperone (Atox1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40622328:40637386:-1 gene:ENSRNOG00000013118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF127137 // GenBank // Rattus norvegicus metal transport protein ATX1 mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// AF177671 // GenBank // Rattus norvegicus ATX1 homolog protein Rah1p (rah1) mRNA, complete cds. // chr10 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC058458 // GenBank // Rattus norvegicus ATX1 antioxidant protein 1 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:72749 IMAGE:6919265), complete cds. // chr10 // 76 // 100 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40625585:40637264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT010972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_013133 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine receptor, alpha 1 (Glra1), mRNA. // chr10 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000063889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:40687417:40720140:-1 gene:ENSRNOG00000013588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AY827463 // GenBank // Rattus norvegicus glycine receptor alpha 1 variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 85 // 75 // 23 // 27 // 0 /// D00833 // GenBank // Rattus norvegicus GlyRalpha1 mRNA for glycine receptor alpha 1, complete cds. // chr10 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// GENSCAN00000009785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:40688008:40765364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_022275 // RefSeq // Rattus norvegicus neuromedin U receptor 2 (Nmur2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:41221604:41235468:-1 gene:ENSRNOG00000014081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB041229 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for G protein-coupled receptor TGR-1, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF242875 // GenBank // Rattus norvegicus neuromedin U receptor 2 (NMU2R) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:41198195:41260123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552619 (LOC102552619), mRNA. // chr10 // 88 // 94 // 30 // 34 // 0 /// XM_001074900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (RGD1563169), mRNA. // chr10 // 52 // 92 // 17 // 33 // 0 /// XR_338617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (RGD1561017), misc_RNA. // chr10 // 44 // 94 // 15 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000058627 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:41367049:41368576:-1 gene:ENSRNOG00000038474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 94 // 14 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000035759 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:41315795:41317296:-1 gene:ENSRNOG00000027803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 97 // 30 // 35 // 0 /// GENSCAN00000039984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:41315774:41317430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 84 // 69 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:41366944:41385989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
XM_001074900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (RGD1563169), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000058627 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:41367049:41368576:-1 gene:ENSRNOG00000038474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:41366944:41385989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 72 // 11 // 13 // 0
GENSCAN00000027495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:42269378:42320270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
XR_357628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 114, member A2 (Fam114a2), misc_RNA. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XR_339008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 114, member A2 (Fam114a2), misc_RNA. // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000058619 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:42702545:42733587:-1 gene:ENSRNOG00000002423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT010978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:42652280:42742320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT010979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT010980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT010981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_021592 // RefSeq // Rattus norvegicus heart and neural crest derivatives expressed 1 (Hand1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43050084:43052635:-1 gene:ENSRNOG00000002582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097324 // GenBank // Rattus norvegicus heart and neural crest derivatives expressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:114327 IMAGE:7460879), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43050280:43068667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000038326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43138101:43220311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
XM_001077260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid hydroxylase domain containing 2 (Faxdc2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002724607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid hydroxylase domain containing 2 (Faxdc2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43298906:43308262:-1 gene:ENSRNOG00000027259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43298870:43308238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001172089 // RefSeq // Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 5 (Gemin5), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XR_357601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 5 (Gemin5), transcript variant X7, misc_RNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43347904:43392988:-1 gene:ENSRNOG00000002645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43348339:43382627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT011001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
GENSCAN00000012640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43465343:43468026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001007669 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 672 (Zfp672), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 672 (Zfp672), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000003639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43545159:43553389:-1 gene:ENSRNOG00000002713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081919 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 672, mRNA (cDNA clone MGC:93893 IMAGE:7112624), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43546164:43547570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT011003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT011005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001109634 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930504O13 (LOC691286), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930504O13 (LOC691286), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930504O13 (LOC691286), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930504O13 (LOC691286), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930504O13 (LOC691286), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003801 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:43676763:43684898:-1 gene:ENSRNOG00000002845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_214821 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1413 (Olr1413), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43686723:43687670:-1 gene:ENSRNOG00000026801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43664160:43705194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000782 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1414 (Olr1414), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43704241:43705194:-1 gene:ENSRNOG00000026714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43664160:43705194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT011010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000781 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1415 (Olr1415), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43722381:43723388:-1 gene:ENSRNOG00000026695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43722381:43723388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001002 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1417 (Olr1417), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43802203:43803132:-1 gene:ENSRNOG00000047803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43802203:43827863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000008 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1418 (Olr1418), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000050448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43833914:43848538:-1 gene:ENSRNOG00000050555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43833914:43834624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000012634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43802203:43827863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT011014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_001000780 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1421 (Olr1421), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000051126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43888786:43889748:-1 gene:ENSRNOG00000050694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43888786:43889748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT011015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001000006 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1423 (Olr1423), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43927859:43928821:-1 gene:ENSRNOG00000049845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43927859:43928821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000779 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1424 (Olr1424), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000041113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:43954424:43955353:-1 gene:ENSRNOG00000047232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43954415:43955371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT011018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000010 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1425 (Olr1425), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT011019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:43964701:43991806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
NM_001109638 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Robo-1 (LOC691352), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058517 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:44043539:44048587:-1 gene:ENSRNOG00000038422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44034135:44047973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001000012 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1432 (Olr1432), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44061159:44062130:-1 gene:ENSRNOG00000002858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44061159:44062130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001000777 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1435 (Olr1435), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44153946:44154863:-1 gene:ENSRNOG00000029289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44153946:44154863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000014 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1436 (Olr1436), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44179193:44180113:-1 gene:ENSRNOG00000050235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44635677:44636597:-1 gene:ENSRNOG00000046642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44179193:44180113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44635677:44636597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000017 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1440 (Olr1440), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44729136:44730056:-1 gene:ENSRNOG00000048241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44729136:44730056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44234154:44235027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_006220994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-enolase-like (RGD1559534), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006246416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-enolase-like (RGD1559534), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000002064 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:44417849:44418922:-1 gene:ENSRNOG00000001512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44417849:44437617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_213312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 183, member B (Fam183b), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44496938:44506773:-1 gene:ENSRNOG00000002873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000058484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44496938:44506773:-1 gene:ENSRNOG00000002873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// XM_006220684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 183, member B (Fam183b), mRNA. // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000045840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44496938:44506767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001000526 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1457 (Olr1457), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000042919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44509843:44510769:-1 gene:ENSRNOG00000050914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000045825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44509843:44510769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT011026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001107004 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 39 (Zfp39), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44977898:45001199:-1 gene:ENSRNOG00000014712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44979705:45001147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1
NM_001164264 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 187 (Rnf187), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45030946:45036845:-1 gene:ENSRNOG00000049219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45027198:45037137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109641 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 3, H2bb (Hist3h2bb), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// FQ224413 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA67YH15 mRNA sequence. // chr10 // 91 // 50 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT011034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT011036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY167411 // GenBank // Rattus norvegicus obscurin (Obscurin) mRNA, Obscurin-S allele, partial cds. // chr10 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000058419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45109599:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 54 // 54 // 29 // 54 // 1 /// ENSRNOT00000033222 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:45094429:45171867:-1 gene:ENSRNOG00000022790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 25 // 54 // 1 /// GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 100 // 53 // 54 // 0
GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000043573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45091890:45237489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108827 // RefSeq // Rattus norvegicus IBA57, iron-sulfur cluster assembly homolog (S. cerevisiae) (Iba57), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000036940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45262185:45270970:-1 gene:ENSRNOG00000022725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000043579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45250540:45270922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT011044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NONRATT011044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001100784 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, gamma 2 (Gjc2), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006246513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gap junction protein, gamma 2 (Gjc2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gap junction protein, gamma 2 (Gjc2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000058362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45282830:45290655:-1 gene:ENSRNOG00000038328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45283507:45294738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT011046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001013115 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate kinase 1 (Guk1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006246478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate kinase 1 (Guk1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006246479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate kinase 1 (Guk1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006246483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate kinase 1 (Guk1), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000003926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45291712:45299982:-1 gene:ENSRNOG00000002928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF354443 // GenBank // Rattus norvegicus guanylate kinase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006246484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate kinase 1 (Guk1), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// GENSCAN00000043585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45283507:45294738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT011047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT011048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT011049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
XM_006246524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 1 (Arf1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000074900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45318171:45334628:-1 gene:ENSRNOG00000030591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC061552 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:72830 IMAGE:6889332), complete cds. // chr10 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// FQ217649 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA21YA02 mRNA sequence. // chr10 // 87 // 75 // 13 // 15 // 0 /// NM_022518 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 1 (Arf1), mRNA. // chr10 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// L12380 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// NONRATT011051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45319296:45334901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONRATT011053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// NONRATT011054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONRATT011055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_001107005 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 3A (Wnt3a), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 3A (Wnt3a), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000064505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45355934:45398618:-1 gene:ENSRNOG00000003039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45355934:45367347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT011057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
XM_006220688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 38 (Prss38), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006246538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 38 (Prss38), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000050370 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:45479593:45482206:-1 gene:ENSRNOG00000022548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000014811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45459092:45499098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_199389 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein, 47 (Snap47), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45512878:45554396:-1 gene:ENSRNOG00000022472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062056 // GenBank // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein, 47, mRNA (cDNA clone MGC:72593 IMAGE:5598911), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45513258:45542927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT011059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109677 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 867 (Zfp867), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000038951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45566087:45568322:-1 gene:ENSRNOG00000022431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// BC129129 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein LOC100125361, mRNA (cDNA clone MGC:156833 IMAGE:7366308), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001271396 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 496 (Zfp496), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45590717:45608593:-1 gene:ENSRNOG00000003129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ223523 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA10YC23 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45590717:45610547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001001097 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1462 (Olr1462), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246511 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1462 (Olr1462), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45679820:45680776:-1 gene:ENSRNOG00000022244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45679820:45697530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000023 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1463 (Olr1463), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45696571:45697530:-1 gene:ENSRNOG00000003210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45679820:45697530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000072381 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:45739346:45739906:-1 gene:ENSRNOG00000050199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 84 // 9 // 16 // 0
XM_001077240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase D family, member 6 (Pld6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006220690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase D family, member 6 (Pld6), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// XM_006246540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase D family, member 6 (Pld6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// XM_220517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase D family, member 6 (Pld6), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000033483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45899487:45902028:-1 gene:ENSRNOG00000021657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45899487:45902028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 90 // 45 // 9 // 10 // 0
NM_199390 // RefSeq // Rattus norvegicus folliculin (Flcn), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006246491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus folliculin (Flcn), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45909612:45928697:-1 gene:ENSRNOG00000003302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB096213 // GenBank // Rattus norvegicus Bhd mRNA for folliculin, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC085848 // GenBank // Rattus norvegicus folliculin, mRNA (cDNA clone MGC:94558 IMAGE:7189414), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ212214 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YF10 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45910417:45961927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT011068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT011070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT011071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001004200 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 3 (Cops3), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000004438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:45938611:45962012:-1 gene:ENSRNOG00000003315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079143 // GenBank // Rattus norvegicus COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 3 (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:94156 IMAGE:7128107), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// FQ216141 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YH19 mRNA sequence. // chr10 // 82 // 94 // 28 // 34 // 0 /// FQ228882 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YN16 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:45910417:45961927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT011075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT011076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT011077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001270954 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS, dexamethasone-induced 1 (Rasd1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46087072:46088803:-1 gene:ENSRNOG00000003348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF239157 // GenBank // Rattus norvegicus DEXRAS1 (Dexras1) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC099136 // GenBank // Rattus norvegicus RAS, dexamethasone-induced 1, mRNA (cDNA clone MGC:116281 IMAGE:7455971), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46087707:46113910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001108277 // RefSeq // Rattus norvegicus target of myb1-like 2 (chicken) (Tom1l2), mRNA. // chr10 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// XR_357637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus target of myb1-like 2 (chicken) (Tom1l2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46367588:46475907:-1 gene:ENSRNOG00000003590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT011084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46385322:46407980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000027011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46326907:46376066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT011085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001107006 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 (Atpaf2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46523866:46539216:-1 gene:ENSRNOG00000003719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46524297:46531708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT011089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
GENSCAN00000009906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46609977:46610755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001008279 // RefSeq // Rattus norvegicus flightless I homolog (Drosophila) (Flii), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46728481:46742400:-1 gene:ENSRNOG00000004159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC085829 // GenBank // Rattus norvegicus flightless I homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94344 IMAGE:7133081), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46728644:46742378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006246551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) III alpha (Top3a), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000068351 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:46754952:46790713:-1 gene:ENSRNOG00000005099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46756813:46790713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 29 // 41 // 1
NM_001047842 // RefSeq // Rattus norvegicus serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble) (Shmt1), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble) (Shmt1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46803226:46831051:-1 gene:ENSRNOG00000005275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC099219 // GenBank // Rattus norvegicus serine hydroxymethyltransferase 1 (soluble), mRNA (cDNA clone IMAGE:7385410), partial cds. // chr10 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46803226:46819088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT011101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT011102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001164543 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 11 (Tmem11), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001166165 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 11 (Tmem11), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:46890611:46905318:-1 gene:ENSRNOG00000005377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC158725 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:187876 IMAGE:9090994), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001170541 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyltransferase domain containing 1 (Natd1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_357633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein GTLF3B-like (LOC100911674), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000007490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:44821706:44829374:-1 gene:ENSRNOG00000005408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075751 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:46930957:46938072:-1 gene:ENSRNOG00000050567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000045851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:44822191:44829306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:46930957:46938072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001191644 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 22 (Usp22), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47203849:47227946:-1 gene:ENSRNOG00000032492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47203849:47227946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001013434 // RefSeq // Rattus norvegicus related RAS viral (r-ras) oncogene homolog 2 (Rras2), mRNA. // chr10 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:185908264:185978450:-1 gene:ENSRNOG00000012258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC091333 // GenBank // Rattus norvegicus related RAS viral (r-ras) oncogene homolog 2, mRNA (cDNA clone MGC:109327 IMAGE:7314509), complete cds. // chr10 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// NONRATT006221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47289286:47320760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000007974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:185909642:185924176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_031731 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 3 family, member A2 (Aldh3a2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47300331:47320877:-1 gene:ENSRNOG00000002342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ210485 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YO03 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M73714 // GenBank // Rat microsomal aldehyde dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT011108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47289286:47320760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001191920 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 47, member 2 (Slc47a2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000057907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47363337:47404085:-1 gene:ENSRNOG00000038055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47375746:47404085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT011110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001014118 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 47 (multidrug and toxin extrusion), member 1 (Slc47a1), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000057896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47383154:47440136:-1 gene:ENSRNOG00000002355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AB248823 // GenBank // Rattus norvegicus MATE1 mRNA for H+/organic cation antiporter variant 1, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// AB248824 // GenBank // Rattus norvegicus MATE1 mRNA for H+/organic cation antiporter variant 2, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// BC088413 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 47, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:94857 IMAGE:7109897), complete cds. // chr10 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// FQ217802 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA17YG10 mRNA sequence. // chr10 // 89 // 93 // 34 // 38 // 0 /// GENSCAN00000047322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47406995:47450422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_138613 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 112 (Rnf112), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006246441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 112 (Rnf112), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47491745:47497296:-1 gene:ENSRNOG00000002364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AF054586 // GenBank // Rattus norvegicus brain finger protein (BFP) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// FQ212014 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YJ09 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// FQ212211 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YJ15 mRNA sequence. // chr10 // 86 // 64 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47492690:47509840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001033914 // RefSeq // Rattus norvegicus epsin 2 (Epn2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NM_021852 // RefSeq // Rattus norvegicus epsin 2 (Epn2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000003493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47567991:47646897:-1 gene:ENSRNOG00000002523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000043052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47567991:47646897:-1 gene:ENSRNOG00000002523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AF096269 // GenBank // Rattus norvegicus EH domain binding protein epsin 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 63 // 21 // 24 // 0 /// BC094524 // GenBank // Rattus norvegicus epsin 2, mRNA (cDNA clone MGC:105438 IMAGE:7318094), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// FQ211939 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YO05 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000047342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47566019:47597548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 63 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT011114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT011115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT011116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1
NM_001107007 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/sugar cotransporter), member 10 (Slc5a10), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006246496 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/sugar cotransporter), member 10 (Slc5a10), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000032092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47742920:47789792:-1 gene:ENSRNOG00000002616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161867 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:187422 IMAGE:7107733), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47743143:47749917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000047330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47778146:47797928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT011118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT011122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001191645 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-51 like autophagy activating kinase 2 (Ulk2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47845649:47922223:-1 gene:ENSRNOG00000002763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47802134:47868382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT011131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
BC081953 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:94043 IMAGE:7122794), complete cds. // chr10 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NM_001114606 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 10 (Akap10), mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// XM_006246509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 10 (Akap10), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000003871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:47943748:48001356:-1 gene:ENSRNOG00000002899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// GENSCAN00000042000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:47936018:48020018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0
NONRATT011135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001163492 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 7 (Zswim7), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48375624:48387713:-1 gene:ENSRNOG00000002970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001271103 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor co-repressor 1 (Ncor1), mRNA. // chr10 // 98 // 92 // 45 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000003120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48507097:48559314:-1 gene:ENSRNOG00000002277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000003133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48417491:48453412:-1 gene:ENSRNOG00000002277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000057680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48440377:48559314:-1 gene:ENSRNOG00000002277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 66 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000057681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48467042:48559314:-1 gene:ENSRNOG00000002277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 40 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000057682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48440377:48559314:-1 gene:ENSRNOG00000002277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 66 // 32 // 33 // 0 /// XM_006246520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor co-repressor 1 (Ncor1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 18 // 18 // 9 // 50 // 1 /// GENSCAN00000007015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48418323:48539920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 68 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT011140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 9 // 50 // 1 /// NONRATT011144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 16 // 16 // 8 // 50 // 1 /// NONRATT011149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 9 // 50 // 1
XM_002724504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein V (Cenpv), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000004127 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:48632950:48645825:-1 gene:ENSRNOG00000003086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48632950:48645825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT011154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT011155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_006220999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 211, member A (Fam211a), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 211, member A (Fam211a), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000030379 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:48713373:48727258:-1 gene:ENSRNOG00000027286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48709916:48752239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001107008 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 287 (Zfp287), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 287 (Zfp287), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48913568:48930648:-1 gene:ENSRNOG00000003215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:48913845:48977187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT011162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001191921 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 286A (Zfp286a), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:48966916:48977608:-1 gene:ENSRNOG00000003218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001191646 // RefSeq // Rattus norvegicus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 3B1 (Hs3st3b1), mRNA. // chr10 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000004546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:50138478:50170551:-1 gene:ENSRNOG00000003384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0
XM_003752336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to COX10 homolog, cytochrome c oxidase assembly protein, heme A: farnesyltransferase (LOC691853), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:50208977:50341923:-1 gene:ENSRNOG00000024972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:50168826:50229577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
XM_006246837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 44 (Arhgap44), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000004829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:51259534:51425613:-1 gene:ENSRNOG00000003603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000057583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:51259534:51425613:-1 gene:ENSRNOG00000003603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000071595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:51263165:51425613:-1 gene:ENSRNOG00000003603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000001677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:51260880:51358561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// NONRATT011175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1
GENSCAN00000008594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:51411092:51425613:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT011176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT011177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_182667 // RefSeq // Rattus norvegicus myocardin (Myocd), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:51439733:51534448:-1 gene:ENSRNOG00000003669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF464910 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor myocardin mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000008605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:51441620:51490415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001030023 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 4 (Map2k4), mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000005293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:51951707:52022942:-1 gene:ENSRNOG00000003834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// AY880882 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 (Map2k4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// KC795688 // GenBank // Rattus norvegicus MAP2K4delta (Map2k4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000055979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:51946596:52008196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT011185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0
ENSRNOT00000005583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52103139:52465432:-1 gene:ENSRNOG00000004171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D26500 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for dynein-like protein 9A, partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52179454:52337597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000005583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52103139:52465432:-1 gene:ENSRNOG00000004171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52342457:52359164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000005583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52103139:52465432:-1 gene:ENSRNOG00000004171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 1 /// GENSCAN00000041609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52378341:52465432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000055977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52342457:52359164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001012008 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 18 (Zfp18), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52085992:52100911:1 gene:ENSRNOG00000003981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC081874 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 18, mRNA (cDNA clone MGC:93734 IMAGE:7107522), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT008827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52042236:52100768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT008828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
ENSRNOT00000005583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52103139:52465432:-1 gene:ENSRNOG00000004171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52342457:52359164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000005583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52103139:52465432:-1 gene:ENSRNOG00000004171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52378341:52465432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
ENSRNOT00000005583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52103139:52465432:-1 gene:ENSRNOG00000004171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52378341:52465432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191922 // RefSeq // Rattus norvegicus shisa family member 6 (Shisa6), mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000057509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:52504105:52791629:-1 gene:ENSRNOG00000029012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52766524:52791629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:52504105:52592132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001009246 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribose/CDP-alcohol diphosphatase, manganese-dependent (Adprm), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000004560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:53334313:53346792:-1 gene:ENSRNOG00000003397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC088174 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310004I24 gene, mRNA (cDNA clone MGC:108803 IMAGE:7323419), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// EU037900 // GenBank // Rattus norvegicus liver manganese (II)-dependent ADP-ribose/CDP-alcohol pyrophosphatase (RGD1309906) mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 67 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000057231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:53334407:53338350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT011193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_021848 // RefSeq // Rattus norvegicus glucagon-like peptide 2 receptor (Glp2r), mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54006866:54070157:-1 gene:ENSRNOG00000003683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF105368 // GenBank // Rattus norvegicus glucagon-like peptide-2 receptor precursor (GLP2R) mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54006866:54054458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001126303 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 43 (Usp43), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54152906:54213665:-1 gene:ENSRNOG00000003785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54153291:54257355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001100968 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 16 (Wdr16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54216435:54257416:-1 gene:ENSRNOG00000037718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC161799 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 43, mRNA (cDNA clone MGC:187197 IMAGE:7100780), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ445463 // GenBank // Rattus norvegicus WDR16-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54153291:54257355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053731 // RefSeq // Rattus norvegicus netrin 1 (Ntn1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus netrin 1 (Ntn1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:54507536:54711662:-1 gene:ENSRNOG00000003947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY028417 // GenBank // Rattus norvegicus netrin-1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54507536:54595536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
XM_001079061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 1-like (RGD1564148), mRNA. // chr10 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// XM_220587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 1-like (RGD1564148), mRNA. // chr10 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000005433 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:54965069:54967509:-1 gene:ENSRNOG00000004092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000009955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:54966073:54967389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_133320 // RefSeq // Rattus norvegicus nudE neurodevelopment protein 1-like 1 (Ndel1), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55153459:55186775:-1 gene:ENSRNOG00000004139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55153459:55186775:-1 gene:ENSRNOG00000004139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY008298 // GenBank // Rattus norvegicus LIS1-interacting protein NUDE2 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC070909 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear distribution gene E-like homolog 1 (A. nidulans), mRNA (cDNA clone MGC:91511 IMAGE:7103650), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006246573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudE neurodevelopment protein 1-like 1 (Ndel1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// XM_006246577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudE neurodevelopment protein 1-like 1 (Ndel1), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT011207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55154366:55223327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT011206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT011209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001007670 // RefSeq // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 4 (Odf4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55252753:55258298:-1 gene:ENSRNOG00000004225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079319 // GenBank // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 4, mRNA (cDNA clone MGC:94483 IMAGE:7135137), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55253234:55257993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT011213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT011212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001105789 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 15 (Arhgef15), mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006246609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 15 (Arhgef15), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55274616:55287136:-1 gene:ENSRNOG00000004566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55276147:55286189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001105790 // RefSeq // Rattus norvegicus RAN guanine nucleotide release factor (Rangrf), mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000006883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55301089:55302460:-1 gene:ENSRNOG00000004980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// FQ228156 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YE19 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 76 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55301548:55302218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT011217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_001105791 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoribosylformylglycinamidine synthase (Pfas), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55316450:55328118:-1 gene:ENSRNOG00000005193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55316842:55328805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000057157 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:55385304:55385792:-1 gene:ENSRNOG00000037672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000075523 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:10:55484138:55484233:-1 gene:ENSRNOG00000047266 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_153301 // RefSeq // Rattus norvegicus arachidonate 15-lipoxygenase, type B (Alox15b), mRNA. // chr10 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// XM_006246601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arachidonate 15-lipoxygenase, type B (Alox15b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55517214:55526545:-1 gene:ENSRNOG00000007778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// AF415240 // GenBank // Rattus norvegicus 15-lipoxygenase-2 (Alox15b) mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55517229:55526517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_024380 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase 2E (Gucy2e), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000010790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55578751:55594291:-1 gene:ENSRNOG00000007931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// L36029 // GenBank // Rattus norvegicus guanylyl cyclase (GC-E), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000056200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55539515:55598758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
XM_006221002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 3 (Chd3), partial mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000057058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55686400:55712312:-1 gene:ENSRNOG00000009722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// AY903249 // GenBank // Rattus norvegicus strain WHD chromodomain helicase DNA-binding protein 3 long isoform (Chd3) mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AY903250 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/OlaIpcv chromodomain helicase DNA-binding protein 3 long isoform (Chd3) mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AY903252 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY chromodomain helicase DNA-binding protein 3 long isoform (Chd3) mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000056208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55686606:55716144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT011231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// NONRATT011232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// NONRATT011235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
NM_001191890 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b5 domain containing 1 (Cyb5d1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55735829:55739764:-1 gene:ENSRNOG00000045742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ223142 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YA16 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55737898:55849216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001128155 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 88 (Tmem88), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55740605:55742300:-1 gene:ENSRNOG00000009870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108829 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 6B (Kdm6b), mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000067677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55743758:55750732:-1 gene:ENSRNOG00000037613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// EF532386 // GenBank // Rattus norvegicus strain WHD jumonji domain-containing 3 (Jmjd3) mRNA, 5 UTR and partial cds. // chr10 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55737898:55849216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0
ENSRNOT00000045220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55768511:55892139:-1 gene:ENSRNOG00000021356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 84 // 84 // 0 /// AY903242 // GenBank // Rattus norvegicus strain WHD dynein axonemal heavy chain-like protein mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 86 // 78 // 78 // 0 /// AY903243 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/OlaIpcv dynein axonemal heavy chain-like protein mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 86 // 78 // 78 // 0 /// AY903244 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/Cub dynein axonemal heavy chain-like protein mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 86 // 78 // 78 // 0 /// GENSCAN00000056199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55737898:55849216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 75 // 75 // 0 /// GENSCAN00000046765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55856920:55931298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 12 // 12 // 11 // 91 // 1
NM_001100980 // RefSeq // Rattus norvegicus ephrin B3 (Efnb3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55906787:55912782:-1 gene:ENSRNOG00000010320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF566467 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley ephrin B3 (Efnb3) mRNA, complete cds. // chr10 // 69 // 62 // 11 // 16 // 0 /// GENSCAN00000046765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55856920:55931298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001007610 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat containing, antisense to TP53 (Wrap53), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55914381:55931438:-1 gene:ENSRNOG00000010520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083696 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 79, mRNA (cDNA clone MGC:94565 IMAGE:7189640), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55856920:55931298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_012507 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide (Atp1b2), mRNA. // chr10 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55951263:55957495:-1 gene:ENSRNOG00000011227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC087034 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, beta 2 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:93648 IMAGE:7124310), complete cds. // chr10 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// J04629 // GenBank // Rat (Na+, K+)-ATPase-beta-2 subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// U45946 // GenBank // Rattus norvegicus Na,K-ATPase beta 2 subunit (ATP1B2) mRNA, complete cds. // chr10 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// NONRATT011249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55952793:55968650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_012650 // RefSeq // Rattus norvegicus sex hormone binding globulin (Shbg), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006246591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sex hormone binding globulin (Shbg), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sex hormone binding globulin (Shbg), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55965504:55968684:-1 gene:ENSRNOG00000011357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:55965504:55982854:-1 gene:ENSRNOG00000011357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC097336 // GenBank // Rattus norvegicus sex hormone binding globulin, mRNA (cDNA clone MGC:114346 IMAGE:7453185), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// M38759 // GenBank // Rat androgen binding protein (ABP) mRNA, complete cds. // chr10 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT011251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:55952793:55968650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT011253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT011254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001107011 // RefSeq // Rattus norvegicus mannose-P-dolichol utilization defect 1 (Mpdu1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56007275:56012851:-1 gene:ENSRNOG00000012162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC087071 // GenBank // Rattus norvegicus mannose-P-dolichol utilization defect 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134167). // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107940 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7377012. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56007769:56012812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT011258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT011256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001031638 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd68 molecule (Cd68), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56014365:56016243:-1 gene:ENSRNOG00000037563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098931 // GenBank // Rattus norvegicus Cd68 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:114377 IMAGE:7368498), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56014523:56016077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT011259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_199372 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4A1 (Eif4a1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000049048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56016895:56022402:-1 gene:ENSRNOG00000030628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC063812 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4A1, mRNA (cDNA clone MGC:72964 IMAGE:6921521), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ232549 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YF03 mRNA sequence. // chr10 // 81 // 81 // 13 // 16 // 1 /// FQ225866 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YO04 mRNA sequence. // chr10 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1 /// FQ228907 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YK19 mRNA sequence. // chr10 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// NONRATT011261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT011262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56017430:56045422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
NONRATT011261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_006246703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sumo1/sentrin/SMT3 specific peptidase 3 (Senp3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// BC090032 // GenBank // Rattus norvegicus SUMO1/sentrin/SMT3 specific peptidase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7366528), complete cds. // chr10 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NM_001013116 // RefSeq // Rattus norvegicus Sumo1/sentrin/SMT3 specific peptidase 3 (Senp3), mRNA. // chr10 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000018670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56023253:56032029:-1 gene:ENSRNOG00000013746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT011268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56017430:56045422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT011269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT011267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001009623 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 13 (Tnfsf13), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56032611:56035590:-1 gene:ENSRNOG00000014171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087135 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:95053 IMAGE:7123934), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT011274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001001513 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor ligand superfamily member 12 (Tnfsf12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56036418:56045715:-1 gene:ENSRNOG00000045670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY607588 // GenBank // Rattus norvegicus TNF-related weak inducer of apoptosis (Tnfsf12) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC079107 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mRNA (cDNA clone MGC:94097 IMAGE:7125293), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56017430:56045422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
XM_001079162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A (Polr2a), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_343922 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide A (Polr2a), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000048518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56085087:56110288:-1 gene:ENSRNOG00000028834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56085087:56110288:-1 gene:ENSRNOG00000028834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56081919:56110288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT011282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001127658 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member G3 (Slc35g3), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000019674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56112009:56113760:-1 gene:ENSRNOG00000014519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC159402 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-malonyl condensing enzyme, mRNA (cDNA clone MGC:188652 IMAGE:7457005), complete cds. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56112245:56113781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_012528 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, beta 1 (muscle) (Chrnb1), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56135720:56148237:-1 gene:ENSRNOG00000014698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56136420:56153978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// NONRATT011287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_130816 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 11 (Fgf11), mRNA. // chr10 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56150464:56153978:-1 gene:ENSRNOG00000014882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB079263 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FGF11, complete cds. // chr10 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56136420:56153978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_573124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 102 (Tmem102), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56155967:56157546:-1 gene:ENSRNOG00000015057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56155967:56158679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000065675 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:56169253:56171081:-1 gene:ENSRNOG00000015358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079298 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933402P03, mRNA (cDNA clone MGC:94435 IMAGE:7134515), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56164178:56187006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109653 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatid maturation 1 (Spem1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56173581:56174867:-1 gene:ENSRNOG00000015419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56164178:56187006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053992 // RefSeq // Rattus norvegicus neuroligin 2 (Nlgn2), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000056871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56177613:56189966:-1 gene:ENSRNOG00000015430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000056872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56177613:56189966:-1 gene:ENSRNOG00000015430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// U41662 // GenBank // Rattus norvegicus neuroligin 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56164178:56187006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001107012 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine kinase, non-receptor, 1 (Tnk1), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosine kinase, non-receptor, 1 (Tnk1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000056860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56204227:56210512:-1 gene:ENSRNOG00000015578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56204227:56213205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 79 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT011299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
NM_001134799 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 95 (Tmem95), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006246813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 95 (Tmem95), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56231898:56233842:-1 gene:ENSRNOG00000043507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC168958 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7113159. // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT011300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001108831 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 11 (Kctd11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56235372:56236070:-1 gene:ENSRNOG00000015669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56235372:56256572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105796 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 1 (Acap1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000021357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56237419:56251565:-1 gene:ENSRNOG00000015674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// FQ231017 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YJ15 mRNA sequence. // chr10 // 75 // 28 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56235372:56256572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 24 // 43 // 1 /// NONRATT011306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 27 // 43 // 1 /// NONRATT011305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT011307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// NONRATT011308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1 /// NONRATT011303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001017476 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810408A11 (LOC497940), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021402 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:56252672:56256702:-1 gene:ENSRNOG00000015975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC079326 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810408A11, mRNA (cDNA clone MGC:94506 IMAGE:7135484), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56235372:56256572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT011310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001033681 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5A (Eif5a), mRNA. // chr10 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000022343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56272204:56276711:-1 gene:ENSRNOG00000016478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC101891 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5A, mRNA (cDNA clone MGC:124873 IMAGE:7930704), complete cds. // chr10 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0 /// FQ212627 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YE07 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 62 // 7 // 8 // 0 /// NONRATT011311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT011312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT011313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 77 // 77 // 10 // 13 // 1 /// NONRATT011315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// NONRATT011317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// NONRATT011318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_012751 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 4 (Slc2a4), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56298110:56303651:-1 gene:ENSRNOG00000017226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC085757 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:93607 IMAGE:7192278), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// FQ232657 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YO06 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 68 // 24 // 25 // 0 /// J04524 // GenBank // Rat insulin-responsive glucose transporter (GT) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// M25482 // GenBank // Rat insulin-responsive glucose transporter (skeletal muscle specific SM1-1) mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56298938:56303466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT011320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
NM_001001718 // RefSeq // Rattus norvegicus elongator acetyltransferase complex subunit 5 (Elp5), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006246639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongator acetyltransferase complex subunit 5 (Elp5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000032481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56324104:56335657:-1 gene:ENSRNOG00000027628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AY623900 // GenBank // Rattus norvegicus DERP6 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC158569 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid induced 12, mRNA (cDNA clone MGC:187294 IMAGE:9101477), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT011325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT011323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT011327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_012891 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA dehydrogenase, very long chain (Acadvl), mRNA. // chr10 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000024973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56364442:56369608:-1 gene:ENSRNOG00000018114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC087036 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, very long chain, mRNA (cDNA clone MGC:93660 IMAGE:7193535), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// D30647 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for very-long-chain Acyl-CoA dehydrogenase, complete cds. // chr10 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// FQ210754 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA22YP18 mRNA sequence. // chr10 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// FQ219329 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YA15 mRNA sequence. // chr10 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000057398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56364555:56369568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT011331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT011333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT011334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// NONRATT011329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT011330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// NONRATT011332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_001005530 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 13 (Slc16a13), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 13 (Slc16a13), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56571908:56575557:-1 gene:ENSRNOG00000018785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081902 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 13 (monocarboxylic acid transporter 13), mRNA (cDNA clone MGC:93826 IMAGE:7110851), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56571926:56575230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT011337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT011338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108279 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 6, member B (Bcl6b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56580143:56583586:-1 gene:ENSRNOG00000018811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ223808 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA86YE04 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56580440:56594157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
ENSRNOT00000025491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56589622:56592266:-1 gene:ENSRNOG00000018829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC158879 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110020A23, mRNA (cDNA clone MGC:188571 IMAGE:7936013), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110020A23 (RGD1308134), transcript variant X7, mRNA. // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// FQ228078 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YJ11 mRNA sequence. // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000057399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56580440:56594157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT011346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT011348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT011349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001137561 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase K (Rnasek), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56592533:56594249:-1 gene:ENSRNOG00000018881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169131 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase K, mRNA (cDNA clone MGC:189585 IMAGE:6922284), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56580440:56594157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001105798 // RefSeq // Rattus norvegicus arachidonate 12-lipoxygenase (Alox12), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56595898:56608169:-1 gene:ENSRNOG00000027037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC168184 // GenBank // Rattus norvegicus arachidonate 12-lipoxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:187960 IMAGE:7098799), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000057405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56596697:56619193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001107014 // RefSeq // Rattus norvegicus arachidonate 12-lipoxygenase, epidermal (Alox12e), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56678125:56685590:-1 gene:ENSRNOG00000019074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56678515:56685513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031010 // RefSeq // Rattus norvegicus arachidonate 15-lipoxygenase (Alox15), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56704495:56713186:-1 gene:ENSRNOG00000019183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// L06040 // GenBank // Rattus norvegicus 12-lipoxygenase mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56704685:56713180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT011355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001024270 // RefSeq // Rattus norvegicus proline, glutamate and leucine rich protein 1 (Pelp1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56739145:56756177:-1 gene:ENSRNOG00000019268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY970831 // GenBank // Rattus norvegicus PELP1 mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// BC101890 // GenBank // Rattus norvegicus proline, glutamic acid and leucine rich protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:124791 IMAGE:7930679), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56739193:56760192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001017478 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 16 (Cxcl16), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56817244:56821837:-1 gene:ENSRNOG00000026647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC079312 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 16, mRNA (cDNA clone MGC:94457 IMAGE:7134808), complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// DQ025528 // GenBank // Rattus norvegicus CXCL16 (Cxcl16) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191823 // RefSeq // Rattus norvegicus vitelline membrane outer layer 1 homolog (chicken) (Vmo1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56878079:56879164:-1 gene:ENSRNOG00000026508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246749 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vitelline membrane outer layer 1 homolog (chicken) (Vmo1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56878135:56879164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
NM_017194 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, epsilon (muscle) (Chrne), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XM_006246677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, epsilon (muscle) (Chrne), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56984504:56988822:-1 gene:ENSRNOG00000003777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56984593:56988775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT011364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
ENSRNOT00000005144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57010935:57013640:-1 gene:ENSRNOG00000003815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ216657 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YL19 mRNA sequence. // chr10 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// NM_022398 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; oxoglutarate carrier), member 11 (Slc25a11), mRNA. // chr10 // 69 // 100 // 22 // 32 // 0 /// U84727 // GenBank // Rattus norvegicus 2-oxoglutarate carrier mRNA, complete cds. // chr10 // 69 // 100 // 22 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57011497:57013612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_022511 // RefSeq // Rattus norvegicus profilin 1 (Pfn1), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000005370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57018596:57021336:-1 gene:ENSRNOG00000003975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC062405 // GenBank // Rattus norvegicus profilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:72445 IMAGE:5623232), complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// FQ220951 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YB15 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// FQ221987 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YF11 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// FQ229989 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YP24 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// FQ232161 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YM16 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// FQ233326 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YF02 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// FQ226089 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YB03 mRNA sequence. // chr10 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// FQ228676 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA5YA15 mRNA sequence. // chr10 // 50 // 100 // 7 // 14 // 0 /// FQ231145 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YC10 mRNA sequence. // chr10 // 62 // 93 // 8 // 13 // 0 /// FQ221728 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YI18 mRNA sequence. // chr10 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// GENSCAN00000026977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57018875:57021185:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT011368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT011369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT011367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001107016 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 7 (Spag7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57030583:57036740:-1 gene:ENSRNOG00000004246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57030986:57054880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001105801 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin binding transcription activator 2 (Camta2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57036786:57054892:-1 gene:ENSRNOG00000004283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57030986:57054880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT011376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108280 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of CDK, cyclin A1 interacting protein 1 (Inca1), mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inhibitor of CDK, cyclin A1 interacting protein 1 (Inca1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006246754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inhibitor of CDK, cyclin A1 interacting protein 1 (Inca1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57055316:57063418:-1 gene:ENSRNOG00000037418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT011379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NONRATT011380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT011379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 1
XM_003752341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLP adaptor and CSK interacting membrane protein (Scimp), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57162135:57170928:-1 gene:ENSRNOG00000037409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57162135:57185225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053616 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 88 (Nup88), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57326777:57351383:-1 gene:ENSRNOG00000006126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC072524 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin 88kDa, mRNA (cDNA clone MGC:91539 IMAGE:7097375), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U93692 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin Nup84 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57326943:57342979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NM_019259 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent binding protein (C1qbp), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57359094:57363789:-1 gene:ENSRNOG00000006949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ001102 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for gC1qBP gene. // chr10 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC070510 // GenBank // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:91723 IMAGE:7100505), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ214537 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YB16 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ214480 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YH13 mRNA sequence. // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000002183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57359336:57363738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_001105802 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 33 (Dhx33), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57367234:57383697:-1 gene:ENSRNOG00000007054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57367798:57398527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006246876 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus derlin-2-like (LOC100910823), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009585 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:57386773:57398527:-1 gene:ENSRNOG00000007244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067381 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:57389810:57396025:-1 gene:ENSRNOG00000007244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT011395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT011397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000002189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:57367798:57398527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001103353 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691995 (LOC691995), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:57414744:57416295:-1 gene:ENSRNOG00000007731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ213240 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YO24 mRNA sequence. // chr10 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONRATT011398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_021590 // RefSeq // Rattus norvegicus aryl hydrocarbon receptor-interacting protein-like 1 (Aipl1), mRNA. // chr10 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58340804:58349923:-1 gene:ENSRNOG00000007889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF180340 // GenBank // Rattus norvegicus aryl-hydrocarbon interacting protein-like 1 (Aipl1) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58341200:58343605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000023604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58349051:58349892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT011409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006246878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PITPNM family member 3 (Pitpnm3), mRNA. // chr10 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000011057 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:58363189:58433910:-1 gene:ENSRNOG00000008323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000041067 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:58371101:58434010:-1 gene:ENSRNOG00000008323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 48 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071764 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:58363189:58433910:-1 gene:ENSRNOG00000008323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000023607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58363189:58390768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0
XM_001080113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC360560 (RGD1304728), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006220713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC360560 (RGD1304728), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006220714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC360560 (RGD1304728), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006220715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC360560 (RGD1304728), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246847 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC360560 (RGD1304728), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246848 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC360560 (RGD1304728), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006246849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC360560 (RGD1304728), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_340837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC360560 (RGD1304728), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000018808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58469915:58512207:-1 gene:ENSRNOG00000014027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000023617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58400428:58516506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
ENSRNOT00000019919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58521398:58524780:-1 gene:ENSRNOG00000014618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211088 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA17YM15 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58521573:58525486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_170668 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 13 (sodium-dependent citrate transporter), member 5 (Slc13a5), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58550465:58574301:-1 gene:ENSRNOG00000014870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF522186 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-coupled citrate transporter mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58551913:58574278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_053508 // RefSeq // Rattus norvegicus tektin 1 (Tekt1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000066740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58636236:58663145:-1 gene:ENSRNOG00000014973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC078773 // GenBank // Rattus norvegicus tektin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93302 IMAGE:7133616), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58636272:58662870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT011424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001190998 // RefSeq // Rattus norvegicus smoothelin-like 2 (Smtnl2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58690457:58711606:-1 gene:ENSRNOG00000015157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58691461:58711543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001144991 // RefSeq // Rattus norvegicus spinster homolog 2 (Spns2), mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58749467:58788522:-1 gene:ENSRNOG00000015801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58751821:58788453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT011428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT011429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001109035 // RefSeq // Rattus norvegicus spinster homolog 3 (Drosophila) (Spns3), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:58796829:58851089:-1 gene:ENSRNOG00000015873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:58797087:58838668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001007671 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b5 domain containing 2 (Cyb5d2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59082549:59098781:-1 gene:ENSRNOG00000024553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079177 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b5 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:94212 IMAGE:7130324), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome b5 domain containing 2 (Cyb5d2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59083005:59098576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105806 // RefSeq // Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 6 (Emc6), mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006246669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 6 (Emc6), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59481630:59481962:-1 gene:ENSRNOG00000019352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000038259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59481630:59481962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT011439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT011440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191647 // RefSeq // Rattus norvegicus cystinosin, lysosomal cystine transporter (Ctns), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000030343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59488895:59503993:-1 gene:ENSRNOG00000028688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT011443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59489718:59500034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
NM_024399 // RefSeq // Rattus norvegicus aspartoacylase (Aspa), mRNA. // chr10 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000049311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59607015:59627427:-1 gene:ENSRNOG00000019659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AB023432 // GenBank // Rattus norvegicus Aspa mRNA for aspartoacylase, complete cds. // chr10 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// BC078813 // GenBank // Rattus norvegicus aspartoacylase, mRNA (cDNA clone MGC:93407 IMAGE:7129010), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC078814 // GenBank // Rattus norvegicus aspartoacylase, mRNA (cDNA clone MGC:93408 IMAGE:7133944), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// FQ232103 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YP22 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// XM_006246817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartoacylase (Aspa), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// GENSCAN00000038240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59607472:59630670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_001000724 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1468 (Olr1468), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59696159:59697103:-1 gene:ENSRNOG00000046461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M64392 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59743806:59744753:-1 gene:ENSRNOG00000049457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 96 // 17 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59696159:59698331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59743806:59744753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 96 // 17 // 23 // 0
NM_212527 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor Olr1469 (Olr1469), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000071349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59968169:59969113:1 gene:ENSRNOG00000049973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62076607:62077551:-1 gene:ENSRNOG00000047958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000074648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59711564:59712508:-1 gene:ENSRNOG00000050103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59968169:59969113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000014755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62076607:62077551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000038233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59711564:59712508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000723 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1470 (Olr1470), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59722748:59723692:-1 gene:ENSRNOG00000047556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59956993:59957937:1 gene:ENSRNOG00000049146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M64388 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59956993:59957937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:59722748:59723692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000722 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1471 (Olr1471), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001000943 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1474 (Olr1474), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000045673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62080694:62081632:-1 gene:ENSRNOG00000050809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001000027 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1475 (Olr1475), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000072790 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:JH620370.1:1512:2450:-1 gene:ENSRNOG00000050112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000000074 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:JH620370.1:1512:2444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000721 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1479 (Olr1479), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000028 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1485 (Olr1485), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1485 (Olr1485), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:59814300:60090216:-1 gene:ENSRNOG00000047634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 54 // 96 // 13 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60011975:60143331:-1 gene:ENSRNOG00000047634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 88 // 15 // 22 // 0 /// NONRATT011451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000720 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1486 (Olr1486), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000065541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60011975:60143331:-1 gene:ENSRNOG00000047634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 95 // 8 // 19 // 0
NM_001000717 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1491 (Olr1491), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60003939:60166618:-1 gene:ENSRNOG00000047634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 96 // 11 // 24 // 0 /// NONRATT011453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000029 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1492 (Olr1492), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT011454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000716 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1496 (Olr1496), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60241754:60242689:-1 gene:ENSRNOG00000033475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62106541:62107473:-1 gene:ENSRNOG00000048257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M64385 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60241754:60242461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001000030 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1498 (Olr1498), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60279694:60311884:-1 gene:ENSRNOG00000048401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 8 // 16 // 0 /// NONRATT011455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60274471:60280629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 94 // 15 // 16 // 1
NM_001000031 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1499 (Olr1499), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60310944:60488720:-1 gene:ENSRNOG00000045986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60279692:60311884:-1 gene:ENSRNOG00000048401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60279694:60311884:-1 gene:ENSRNOG00000048401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60310943:60311878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000942 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1500 (Olr1500), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60421865:60422804:-1 gene:ENSRNOG00000031597 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M64391 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60376818:60422804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001000495 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1504 (Olr1504), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60508410:60509348:-1 gene:ENSRNOG00000045754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60508410:60509327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000033 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1507 (Olr1507), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60601363:60602307:-1 gene:ENSRNOG00000019898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60601363:60676242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000528 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1509 (Olr1509), mRNA. // chr10 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60675307:60676242:-1 gene:ENSRNOG00000027806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60601363:60676242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1
NM_001000035 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1513 (Olr1513), mRNA. // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NM_001000036 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1514 (Olr1514), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60765095:60766033:1 gene:ENSRNOG00000034227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60776393:60777337:-1 gene:ENSRNOG00000033267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60765095:60766033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60776393:60777337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT011461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001351 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1517 (Olr1517), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:60818115:60819062:-1 gene:ENSRNOG00000048801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60818115:60819062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000051873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60849837:60850416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
XM_006221007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (RGD1563134), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006246880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (RGD1563134), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000048403 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:60872973:60873440:-1 gene:ENSRNOG00000031525 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:60856108:60873314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_031763 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, regulatory subunit 1 (Pafah1b1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000003696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61186184:61299247:-1 gene:ENSRNOG00000002755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC072510 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, alpha subunit 45kDa, mRNA (cDNA clone MGC:91446 IMAGE:7104733), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF016049 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase beta subunit (PAF-AH beta) mRNA, complete cds. // chr10 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000051890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61188817:61222918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT011469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001107020 // RefSeq // Rattus norvegicus small G protein signaling modulator 2 (Sgsm2), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61425575:61466833:-1 gene:ENSRNOG00000027194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61427080:61454468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198757 // RefSeq // Rattus norvegicus serine racemase (Srr), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61477875:61493655:-1 gene:ENSRNOG00000002991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB106282 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for serine racemase, complete cds. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC082014 // GenBank // Rattus norvegicus serine racemase, mRNA (cDNA clone MGC:94291 IMAGE:7132082), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61478891:61483120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001107021 // RefSeq // Rattus norvegicus hypermethylated in cancer 1 (Hic1), mRNA. // chrU // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006246883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypermethylated in cancer 1 protein-like (LOC100912068), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006246884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypermethylated in cancer 1 protein-like (LOC100912068), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000066972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62192077:62194572:-1 gene:ENSRNOG00000003096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000004143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61721540:61723972:-1 gene:ENSRNOG00000046405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62192077:62219253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61722365:61724505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001105809 // RefSeq // Rattus norvegicus diphthamide biosynthesis 1 (Dph1), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NM_001109036 // RefSeq // Rattus norvegicus ovarian tumor suppressor candidate 2 (Ovca2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61733771:61734889:-1 gene:ENSRNOG00000003111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC087109 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7193285. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166808 // GenBank // Rattus norvegicus DPH1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188614 IMAGE:7124384), complete cds. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61733978:61745330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT011479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001105809 // RefSeq // Rattus norvegicus diphthamide biosynthesis 1 (Dph1), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61735049:61745330:-1 gene:ENSRNOG00000003116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC087109 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7193285. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC166808 // GenBank // Rattus norvegicus DPH1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188614 IMAGE:7124384), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61733978:61745330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT011483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT011482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001047843 // RefSeq // Rattus norvegicus replication protein A1 (Rpa1), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000004229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61855482:61897974:-1 gene:ENSRNOG00000003123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// FQ222430 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YJ06 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61855482:61897974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
GENSCAN00000014764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61913692:61914000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000041305 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:61913711:61914000:-1 gene:ENSRNOG00000033278 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_177927 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade F (alpha-2 antiplasmin, pigment epithelium derived factor), member 1 (Serpinf1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61954921:61969094:-1 gene:ENSRNOG00000003172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY216659 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-2 antiplasmin (Dmrs91) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078686 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade F, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93051 IMAGE:7110230), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ218382 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YJ18 mRNA sequence. // chr10 // 72 // 93 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61955030:61960195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001011892 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade F (alpha-2 antiplasmin, pigment epithelium derived factor), member 2 (Serpinf2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61978965:61987049:-1 gene:ENSRNOG00000003233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC079362 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade F, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:94844 IMAGE:7109243), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61979612:61985879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT011493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001134360 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 81 (Wdr81), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000004365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:61988536:62001860:-1 gene:ENSRNOG00000003243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:61989354:62004787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_031142 // RefSeq // Rattus norvegicus double C2-like domains, beta (Doc2b), mRNA. // chr10 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000008429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64054072:64078438:1 gene:ENSRNOG00000005978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// U70778 // GenBank // Rattus norvegicus Doc2B mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64042297:64078438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NONRATT009231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 1
NM_133591 // RefSeq // Rattus norvegicus rabphilin 3A-like (without C2 domains) (Rph3al), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000008697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63905252:64016749:1 gene:ENSRNOG00000006454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AF022774 // GenBank // Rattus norvegicus rabphilin-3a related protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC091126 // GenBank // Rattus norvegicus rabphilin 3A-like (without C2 domains), mRNA (cDNA clone MGC:108605 IMAGE:7380477), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63931780:64029370:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001007611 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 101, member B (Fam101b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63810534:63816787:1 gene:ENSRNOG00000006674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079330 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 101, member B, mRNA (cDNA clone MGC:94755 IMAGE:7096482), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63672867:63816198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// NONRATT009227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001105813 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 53 homolog (S. cerevisiae) (Vps53), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006246899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 53 homolog (S. cerevisiae) (Vps53), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000010010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63672733:63790222:1 gene:ENSRNOG00000006895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC168148 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 53 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187507 IMAGE:7443082), complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000051398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63672867:63816198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT009220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT009221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT009222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT009224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001109037 // RefSeq // Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 4 (Gemin4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63637708:63645490:1 gene:ENSRNOG00000007751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63637733:63645305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001014227 // RefSeq // Rattus norvegicus glyoxalase domain containing 4 (Glod4), mRNA. // chr10 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000010386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63616109:63633601:1 gene:ENSRNOG00000007788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1 /// BC088458 // GenBank // Rattus norvegicus glyoxalase domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:95108 IMAGE:7127323), complete cds. // chr10 // 82 // 82 // 31 // 38 // 1 /// GENSCAN00000051390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63619081:63633109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// NONRATT009214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1 /// NONRATT009215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT009216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_013056 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, beta A1 (Cryba1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66458194:66464417:-1 gene:ENSRNOG00000008700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66454395:66523309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT011658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001012009 // RefSeq // Rattus norvegicus pipecolic acid oxidase (Pipox), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// XM_006246959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pipecolic acid oxidase (Pipox), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66660854:66673403:-1 gene:ENSRNOG00000008798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC088249 // GenBank // Rattus norvegicus pipecolic acid oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:109052 IMAGE:7370364), complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66661366:66678475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_001013229 // RefSeq // Rattus norvegicus Era-like 12S mitochondrial rRNA chaperone 1 (Eral1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66341064:66356725:-1 gene:ENSRNOG00000010673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC089885 // GenBank // Rattus norvegicus Era (G-protein)-like 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:109051 IMAGE:7370040), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66341797:66356725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_017188 // RefSeq // Rattus norvegicus UNC-119 homolog (C. elegans) (Unc119), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66026834:66032267:-1 gene:ENSRNOG00000011060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC062057 // GenBank // Rattus norvegicus UNC-119 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:72491 IMAGE:5598983), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U40999 // GenBank // Rattus norvegicus retinal protein (RRG4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT011620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000053131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66027336:66129585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001006602 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class S (Pigs), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66032984:66047520:-1 gene:ENSRNOG00000011366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083862 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class S, mRNA (cDNA clone MGC:95099 IMAGE:7126912), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66027336:66129585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT011625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_012497 // RefSeq // Rattus norvegicus aldolase C, fructose-bisphosphate (Aldoc), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66049072:66052680:-1 gene:ENSRNOG00000011452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099749 // GenBank // Rattus norvegicus aldolase C, fructose-bisphosphate, mRNA (cDNA clone MGC:124642 IMAGE:5599032), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212664 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YA13 mRNA sequence. // chr10 // 82 // 41 // 9 // 11 // 0 /// FQ213639 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YK04 mRNA sequence. // chr10 // 83 // 89 // 20 // 24 // 0 /// FQ214420 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YM18 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ213244 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YO10 mRNA sequence. // chr10 // 59 // 100 // 16 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66049072:66052680:-1 gene:ENSRNOG00000011452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// BC059154 // GenBank // Rattus norvegicus aldolase C, fructose-bisphosphate, mRNA (cDNA clone IMAGE:6920375), complete cds. // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT011626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66027336:66129585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001044224 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 5 (Spag5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66053386:66071009:-1 gene:ENSRNOG00000011777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB231661 // GenBank // Rattus norvegicus Spag5 mRNA for sperm associated antigen 5, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF111111 // GenBank // Rattus norvegicus sperm tail protein Spag5 mRNA, partial cds. // chr10 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC166408 // GenBank // Rattus norvegicus sperm associated antigen 5, mRNA (cDNA clone MGC:187251 IMAGE:9030944), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66027336:66129585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000074979 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:10:66074717:66074812:-1 gene:ENSRNOG00000050036 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66027336:66129585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_006246951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized serine/threonine-protein kinase SgK494 (Sgk494), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000056217 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:66081541:66084340:-1 gene:ENSRNOG00000037214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000053131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66027336:66129585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSRNOT00000016084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66084632:66113961:-1 gene:ENSRNOG00000011887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC091287 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG14967-PA, mRNA (cDNA clone IMAGE:7304954), partial cds. // chr10 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66027336:66129585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1
NM_001105803 // RefSeq // Rattus norvegicus stromal cell derived factor 2 (Sdf2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66119399:66129873:-1 gene:ENSRNOG00000012121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66027336:66129585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001025758 // RefSeq // Rattus norvegicus protein interacting with cyclin A1 (Proca1), mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein interacting with cyclin A1 (Proca1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000037048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66167747:66180504:-1 gene:ENSRNOG00000023381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC098036 // GenBank // Rattus norvegicus similar to novel protein, mRNA (cDNA clone MGC:116192 IMAGE:7456533), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000053139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66168088:66187053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001012140 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB34, member RAS oncogene family (Rab34), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000037016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66182985:66185961:-1 gene:ENSRNOG00000023375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC086400 // GenBank // Rattus norvegicus RAB34, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:106012 IMAGE:7304190), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FQ212591 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YH17 mRNA sequence. // chr10 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// NONRATT011651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT011649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT011652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000053139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66168088:66187053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT011650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001013858 // RefSeq // Rattus norvegicus TLC domain containing 1 (Tlcd1), mRNA. // chr10 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66193481:66195513:-1 gene:ENSRNOG00000012579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC085876 // GenBank // Rattus norvegicus TLC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94646 IMAGE:7191659), complete cds. // chr10 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66193927:66195382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT011653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT011654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NM_001109038 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 222, member B (Fam222b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 222, member B (Fam222b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66217748:66283043:-1 gene:ENSRNOG00000029570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66219981:66235454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031746 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2 (Slc13a2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 13 (sodium-dependent dicarboxylate transporter), member 2 (Slc13a2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65951597:65978953:1 gene:ENSRNOG00000010337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB001321 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sodium-dependent dicarboxylate transporter, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF058714 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-dicarboxylate cotransporter SDCT1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U51153 // GenBank // Rattus norvegicus intestinal sodium/dicarboxylate cotransporter mRNA, complete cds. // chr10 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65912222:65978353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105817 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha and TIR motif containing 1 (Sarm1), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65877570:65901277:1 gene:ENSRNOG00000010244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65877697:65899540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001024992 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 199 (Tmem199), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65863303:65867897:1 gene:ENSRNOG00000009896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091246 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 199, mRNA (cDNA clone MGC:109028 IMAGE:7366299), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ216010 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YE24 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65863327:65867244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT009265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_182950 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 1 (endothelial) (Tnfaip1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000012245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65837927:65852617:1 gene:ENSRNOG00000009069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY336949 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor alpha-induced protein 1 (Tnfaip1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC128704 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 1 (endothelial), mRNA (cDNA clone MGC:156501 IMAGE:7459404), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000053142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65843395:65849994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001008334 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 97 (Tmem97), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65823082:65832164:1 gene:ENSRNOG00000022657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085344 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 97, mRNA (cDNA clone MGC:105541 IMAGE:7303878), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ214423 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YM12 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65830054:65831470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001191924 // RefSeq // Rattus norvegicus nemo like kinase (Nlk), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000011726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65679688:65803568:1 gene:ENSRNOG00000008704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000051065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65746002:65801074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 18 // 58 // 1 /// GENSCAN00000011552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261771314:261813771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 22 // 22 // 13 // 58 // 1 /// NONRATT009259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 12 // 58 // 1 /// NONRATT009260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 12 // 58 // 1
NM_001025412 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 58, member B (Fam58b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65623147:65624309:1 gene:ENSRNOG00000022582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097941 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 58, member B, mRNA (cDNA clone MGC:116062 IMAGE:7376750), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ229360 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YD06 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65623158:65623910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT009255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000016897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65415911:65419244:1 gene:ENSRNOG00000012557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ234845 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YH08 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_012976 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactose binding, soluble 5 (Lgals5), mRNA. // chr10 // 53 // 100 // 10 // 19 // 0 /// XR_349480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556770 (LOC102556770), ncRNA. // chr10 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// NONRATT009254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65404153:65418834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_012977 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 9 (Lgals9), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66863439:66886611:-1 gene:ENSRNOG00000012681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66863439:66886611:-1 gene:ENSRNOG00000012681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC061566 // GenBank // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 9, mRNA (cDNA clone MGC:72913 IMAGE:6921383), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U59462 // GenBank // Rattus norvegicus 36 kDa beta-galactoside binding lectin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U67958 // GenBank // Rattus norvegicus urate transporter/channel mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// U72741 // GenBank // Rattus norvegicus 36 Kd beta-galactoside binding lectin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT011665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66860041:66881446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT011663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108284 // RefSeq // Rattus norvegicus kinase suppressor of ras 1 (Ksr1), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006246928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinase suppressor of ras 1 (Ksr1), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006246929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinase suppressor of ras 1 (Ksr1), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65166925:65300246:1 gene:ENSRNOG00000012818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000014746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:65187941:65321719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_001025664 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 1 (Wsb1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// NM_001042561 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 1 (Wsb1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// XM_006246922 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 1 (Wsb1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:65046088:65062151:1 gene:ENSRNOG00000012929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// BC098720 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7370302), complete cds. // chr10 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// BC167746 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187257 IMAGE:8364583), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// XM_006246921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 1 (Wsb1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 51 // 51 // 22 // 43 // 1 /// XM_006246923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 1 (Wsb1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 51 // 51 // 22 // 43 // 1 /// NONRATT009248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT009249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT009250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1 /// NONRATT009251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
NM_001005898 // RefSeq // Rattus norvegicus oligodendrocyte-myelin glycoprotein (Omg), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64800318:64803052:1 gene:ENSRNOG00000014107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY250703 // GenBank // Rattus norvegicus oligodendrocyte-myelin glycoprotein (Omg) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 59 // 16 // 17 // 0 /// AY316298 // GenBank // Rattus norvegicus oligodendrocyte myelin glycoprotein (Omg) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// BC087723 // GenBank // Rattus norvegicus oligodendrocyte-myelin glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:105782 IMAGE:7320740), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001271482 // RefSeq // Rattus norvegicus ecotropic viral integration site 2B (Evi2b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64790037:64791299:1 gene:ENSRNOG00000014125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64790061:64791299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001044287 // RefSeq // Rattus norvegicus ecotropic viral integration site 2A (Evi2a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:64774589:64778582:1 gene:ENSRNOG00000022764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088856 // GenBank // Rattus norvegicus ecotropic viral integration site 2A, mRNA (cDNA clone MGC:105624 IMAGE:7318412), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211650 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YJ01 mRNA sequence. // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64777349:64778017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT009239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000036962 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:64376933:64379174:1 gene:ENSRNOG00000022699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000041473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:64378110:64379174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT009236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
XM_006246964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UTP6, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast) (Utp6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66914440:66944884:-1 gene:ENSRNOG00000014209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ210246 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA31YK20 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66883685:66944884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT011669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006220730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 5 (Efcab5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 5 (Efcab5), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006246917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 5 (Efcab5), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000030805 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:62678113:62783653:1 gene:ENSRNOG00000022536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031618 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:62678455:62783659:1 gene:ENSRNOG00000022536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000013449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62702070:62829433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001107025 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 15 (Abhd15), mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000034282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62340336:62345727:-1 gene:ENSRNOG00000015002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62334876:62345648:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_031814 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase interacting ArfGAP 1 (Git1), mRNA. // chr10 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000056112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62352883:62362209:-1 gene:ENSRNOG00000014883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// AF085693 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase-associated ADP ribosylation factor GTPase-activating protein (GIT1) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// NONRATT011499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000013455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62353754:62379432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// NONRATT011501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1 /// NONRATT011502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_139115 // RefSeq // Rattus norvegicus coronin 6 (Coro6), mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62389414:62397409:-1 gene:ENSRNOG00000014496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF140359 // GenBank // Rattus norvegicus coronin relative protein mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// BC080241 // GenBank // Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:7099881). // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC098656 // GenBank // Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:112600 IMAGE:7192854), complete cds. // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62390380:62467475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001107024 // RefSeq // Rattus norvegicus slingshot protein phosphatase 2 (Ssh2), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006246905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus slingshot protein phosphatase 2 (Ssh2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62402504:62512012:-1 gene:ENSRNOG00000014285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62390380:62467475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_013034 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 4 (Slc6a4), mRNA. // chrU // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62851326:62872481:-1 gene:ENSRNOG00000003476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// M79450 // GenBank // Rat serotonin transporter mRNA, complete cds. // chrU // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// X63995 // GenBank // R.norvegicus NTT mRNA. // chrU // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62851967:62872374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_001034163 // RefSeq // Rattus norvegicus bleomycin hydrolase (Blmh), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000005125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62896489:62939897:-1 gene:ENSRNOG00000003563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC128701 // GenBank // Rattus norvegicus bleomycin hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:156497 IMAGE:7379958), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_003748663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bleomycin hydrolase-like (LOC100911400), partial mRNA. // chr10 // 44 // 72 // 8 // 18 // 0 /// NONRATT011508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072813 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:18721969:18723219:-1 gene:ENSRNOG00000049777 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 44 // 72 // 8 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62897237:62973354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT003992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001135029 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 (Tmigd1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006246908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and immunoglobulin domain containing 1 (Tmigd1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:62961333:62973377:-1 gene:ENSRNOG00000003865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:62897237:62973354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT011512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001039163 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor suppressor candidate 5 (Tusc5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000063941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63170006:63190291:-1 gene:ENSRNOG00000022239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006220729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member a9 (Bhlha9), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member a9 (Bhlha9), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032934 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:63197276:63197968:-1 gene:ENSRNOG00000022232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63195890:63197782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
NM_032618 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 22 homolog (yeast) (Timm22), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:63451314:63458296:-1 gene:ENSRNOG00000007988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF223951 // GenBank // Rattus norvegicus TIM22 preprotein translocase (Tim22) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:63451760:63458296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT011518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001168612 // RefSeq // Rattus norvegicus cytokine receptor-like factor 3 (Crlf3), mRNA. // chrUn // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_001025626 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription elongation factor, mitochondrial (Tefm), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67134520:67137359:-1 gene:ENSRNOG00000004000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67134677:67137298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT011670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001139506 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Protein Njmu-R1 (RGD1310429), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67394162:67406916:-1 gene:ENSRNOG00000000237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67395131:67406869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT011673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_012983 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin ID (Myo1d), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000004609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67520650:67811744:-1 gene:ENSRNOG00000003276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// BC087027 // GenBank // Rattus norvegicus myosin ID, mRNA (cDNA clone MGC:93573 IMAGE:7106587), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000039586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67685016:67737824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 14 // 45 // 1 /// NONRATT011681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// NONRATT011682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// GENSCAN00000039581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67522751:67638351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
NM_012892 // RefSeq // Rattus norvegicus acid-sensing (proton-gated) ion channel 2 (Asic2), transcript variant MDEG2, mRNA. // chr10 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000009348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:67916010:68180348:-1 gene:ENSRNOG00000007019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// NM_001034014 // RefSeq // Rattus norvegicus acid-sensing (proton-gated) ion channel 2 (Asic2), transcript variant MDEG1, mRNA. // chr10 // 88 // 88 // 36 // 41 // 1 /// U53211 // GenBank // Rattus norvegicus degenerin channel MDEG mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 88 // 36 // 41 // 1 /// GENSCAN00000026340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:67916251:67929840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 49 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT011685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 35 // 41 // 1
ENSRNOT00000015606 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:68219427:68219967:-1 gene:ENSRNOG00000011730 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:68219647:68219967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT011684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000008661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:68588673:68589518:-1 gene:ENSRNOG00000006625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:68556552:68589518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT011684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT011686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001191092 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 1 (Ccl1), mRNA. // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000031360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69169282:69172142:-1 gene:ENSRNOG00000021851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69140895:69172142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT011689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001004068 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger and FYVE-like domain containing E3 ubiquitin protein ligase (Rffl), mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger and FYVE-like domain containing E3 ubiquitin protein ligase (Rffl), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69788337:69851152:-1 gene:ENSRNOG00000007596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69788337:69851152:-1 gene:ENSRNOG00000007596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// BC079216 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger and FYVE like domain containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:94279 IMAGE:7131890), complete cds. // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// FQ210900 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA20YD01 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69790513:69803783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001107029 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD51 paralog D (Rad51d), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006246997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD51 paralog D (Rad51d), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69858340:69872417:-1 gene:ENSRNOG00000021780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC169062 // GenBank // Rattus norvegicus RAD51-like 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189456 IMAGE:7934256), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69813857:69872296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1
NM_001127534 // RefSeq // Rattus norvegicus notchless homolog 1 (Drosophila) (Nle1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69882124:69890695:-1 gene:ENSRNOG00000008287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC166567 // GenBank // Rattus norvegicus notchless homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188197 IMAGE:7317666), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69882897:69892101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001013970 // RefSeq // Rattus norvegicus schlafen family member 13 (Slfn13), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006246999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen family member 13 (Slfn13), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247000 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen family member 13 (Slfn13), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69956876:69968233:-1 gene:ENSRNOG00000021412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085777 // GenBank // Rattus norvegicus schlafen 8, mRNA (cDNA clone MGC:93709 IMAGE:7106041), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69963321:69967786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT011699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001270386 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Glutathione S-transferase alpha-4 (Glutathione S-transferase Yk) (GST Yk) (GST 8-8) (GST K) (GST A4-4) (LOC688925), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000043306 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:70058390:70059057:-1 gene:ENSRNOG00000032135 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70058390:70059012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_003750873 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen family member 14-like (LOC100912082), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000071398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71009921:71022163:-1 gene:ENSRNOG00000046406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// AY539914 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00163 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70117961:70140790:-1 gene:ENSRNOG00000009709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70131526:70140790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71012899:71022163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0
NM_053921 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 12 (Pex12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70146618:70150248:-1 gene:ENSRNOG00000009718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71028937:71031136:-1 gene:ENSRNOG00000050704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AB002111 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peroxisome assembly factor-3 (PAF-3), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC072481 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 12, mRNA (cDNA clone MGC:91550 IMAGE:7104469), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70147564:70149763:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000026308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71028937:71031136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001105823 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 like 2 (Gas2l2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034322 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:71101984:71108426:-1 gene:ENSRNOG00000028673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000071218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70273258:70280231:-1 gene:ENSRNOG00000047546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70273789:70280231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71101984:71108426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031116 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 5 (Ccl5), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70373401:70377904:-1 gene:ENSRNOG00000010906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058138 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 5, mRNA (cDNA clone MGC:72786 IMAGE:6921268), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF121972 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW chemokine ligand 5 mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// U06436 // GenBank // Rattus norvegicus Long Evans RANTES mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// EF122007 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS chemokine ligand 5 mRNA, complete cds. // chr10 // 73 // 60 // 11 // 15 // 0 /// NONRATT011702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70359745:70428609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001079888 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 28 (Mmp28), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70293730:70314711:-1 gene:ENSRNOG00000047940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71122715:71143696:-1 gene:ENSRNOG00000048414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// EF121988 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS matrix metalloproteinase 28 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70293730:70306313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71122715:71143696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
XM_006247018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC497970 (RGD1559875), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055932 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:70359554:70369265:-1 gene:ENSRNOG00000037100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70359745:70428609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001012357 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 9 (Ccl9), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70416903:70421785:-1 gene:ENSRNOG00000028548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY863011 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine CCL9 (Ccl9) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC089865 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 9, mRNA (cDNA clone MGC:108969 IMAGE:7321336), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// EF121990 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS Ccl9-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// EF121991 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW Ccl9-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT011703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70359745:70428609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001004202 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 6 (Ccl6), mRNA. // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000045867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70430603:70436258:-1 gene:ENSRNOG00000030021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY620903 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine ligand 6 (ccl6) mRNA, ccl6-C10 allele, complete cds. // chr10 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// BC079460 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 6, mRNA (cDNA clone MGC:95015 IMAGE:7121977), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// EF121992 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS chemokine ligand 6 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// EF121993 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW chemokine ligand 6 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_013025 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 3 (Ccl3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70501119:70502669:-1 gene:ENSRNOG00000011205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EF121994 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS chemokine ligand 3 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// EF121995 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW chemokine ligand 3 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// U06435 // GenBank // Rattus norvegicus Long Evans macrophage inflammatory protein-1 alpha (MIP-1 alpha) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// U22414 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage inflammatory protein-1alpha mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:70501525:70512076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT011706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014228 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 6B (zeta 2) (Cct6b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// ENSRNOT00000009944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:69700677:69748902:-1 gene:ENSRNOG00000007523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// BC079020 // GenBank // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 6B (zeta 2), mRNA (cDNA clone MGC:93945 IMAGE:7113829), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000012477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69700774:69723318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 57 // 33 // 35 // 0 /// NONRATT011690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000012489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:69737105:69746621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 20 // 20 // 12 // 61 // 1
NM_001287624 // RefSeq // Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552783 (Ac1576), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001012141 // RefSeq // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 2A (Tada2a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000003699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71307415:71354773:-1 gene:ENSRNOG00000002757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC079084 // GenBank // Rattus norvegicus transcriptional adaptor 2 (ADA2 homolog, yeast)-like, mRNA (cDNA clone MGC:94047 IMAGE:7123007), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// EF121983 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS transcriptional adapter 2-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// EF121984 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW transcriptional adapter 2-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// EF121985 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW truncated transcriptional adapter 2-like protein variant 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71310362:71340046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONRATT011715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
XM_006220756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552988 (LOC102552988), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_338761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552988 (LOC102552988), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XR_357787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552988 (LOC102552988), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000038955 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:71378171:71404070:-1 gene:ENSRNOG00000028116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065129 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:71378171:71404070:-1 gene:ENSRNOG00000028116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000043045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71374636:71415629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_053720 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis antagonizing transcription factor (Aatf), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71654755:71747166:-1 gene:ENSRNOG00000002778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078769 // GenBank // Rattus norvegicus apoptosis antagonizing transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:93285 IMAGE:7110171), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71701160:71757619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_145880 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM homeobox 1 (Lhx1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:71752917:71758219:-1 gene:ENSRNOG00000002812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ213041 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YA22 mRNA sequence. // chr10 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT011720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71701160:71757619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NM_001108832 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial rRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae) (Mrm1), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72043105:72049392:-1 gene:ENSRNOG00000027901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT011725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71960888:72060107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT011724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001014119 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11 (Dhrs11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11 (Dhrs11), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11 (Dhrs11), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006247045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 11 (Dhrs11), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72050901:72060234:-1 gene:ENSRNOG00000027891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:71960888:72060107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT011726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT011728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001004273 // RefSeq // Rattus norvegicus gametogenetin binding protein 2 (Ggnbp2), mRNA. // chr10 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000042506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72063589:72095167:-1 gene:ENSRNOG00000027860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY633742 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/SsNHsdMCW gametogenetin binding protein 2 mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// FQ227019 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YJ07 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// FQ234201 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YM24 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72064021:72104857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_194461 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class W (Pigw), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72101788:72103296:-1 gene:ENSRNOG00000027857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_338764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, HIT-type containing 3 (Znhit3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XR_357790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, HIT-type containing 3 (Znhit3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72134570:72142765:-1 gene:ENSRNOG00000027818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72135081:72142747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// FQ231514 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YD13 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001107032 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 32 (Usp32), mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000036814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72206629:72323744:-1 gene:ENSRNOG00000027711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000030321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72208653:72303736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0
NM_001100969 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta precursor protein (cytoplasmic tail) binding protein 2 (Appbp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:72408561:72450355:-1 gene:ENSRNOG00000027654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC169030 // GenBank // Rattus norvegicus amyloid beta precursor protein (cytoplasmic tail) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:189407 IMAGE:7446141), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// EF535262 // GenBank // Rattus norvegicus protein interacting with APP tail 1 (Appbp2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:72412914:72450082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006247063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1 (Brip1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000008664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73408629:73437334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73444965:73688462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// NONRATT011753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1
NM_001100630 // RefSeq // Rattus norvegicus integrator complex subunit 2 (Ints2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73559143:73589442:-1 gene:ENSRNOG00000003576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC128757 // GenBank // Rattus norvegicus integrator complex subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:156742 IMAGE:7107619), complete cds. // chr10 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73444965:73688462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001107035 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 13 (Med13), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000035280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73600909:73685836:-1 gene:ENSRNOG00000003679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73444965:73688462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NR_031823 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 21 (Mir21), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053603 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:76197081:76197172:1 gene:ENSRNOG00000035480 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-21 // miRBase Micro RNA Database // MI0000850 Rattus norvegicus miR-21 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138839 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuole membrane protein 1 (Vmp1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000005658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:76098589:76196545:1 gene:ENSRNOG00000003967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AF411216 // GenBank // Rattus norvegicus vacuole membrane protein 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC061721 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 49, mRNA (cDNA clone MGC:72304 IMAGE:5598561), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_019299 // RefSeq // Rattus norvegicus clathrin, heavy chain (Hc) (Cltc), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:76030220:76085922:1 gene:ENSRNOG00000004291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// J03583 // GenBank // Rat clathrin heavy chain mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000036643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75940068:76084979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT009510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001005873 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 40 (Dhx40), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000006926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75981100:76019044:1 gene:ENSRNOG00000004549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC083821 // GenBank // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 40, mRNA (cDNA clone MGC:94894 IMAGE:7111216), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000036643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75940068:76084979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT009509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
NM_001108286 // RefSeq // Rattus norvegicus yippee-like 2 (Drosophila) (Ypel2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75804187:75858297:1 gene:ENSRNOG00000005447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001044238 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1 (Gdpd1), mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000042199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75724331:75767811:1 gene:ENSRNOG00000005596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// BC105620 // GenBank // Rattus norvegicus glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:125217 IMAGE:7453591), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT009501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT009502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// GENSCAN00000042456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75712430:75779892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT009503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
XM_213430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMG8 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008107 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:75712430:75721227:1 gene:ENSRNOG00000005769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75712430:75779892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT009499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_001108287 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 11 (Prr11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 11 (Prr11), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_357799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 11 (Prr11), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75687241:75706849:1 gene:ENSRNOG00000006198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75689900:75706547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_198773 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1E (Ppm1e), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75421043:75552393:1 gene:ENSRNOG00000024730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB081729 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for calmodulin-dependent protein kinase phosphatase N, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75545099:75553755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT009495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75531696:75539660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONRATT009495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1
NM_001129777 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD51 paralog C (Rad51c), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006247106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD51 paralog C (Rad51c), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:75376954:75403188:1 gene:ENSRNOG00000006661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:75376876:75402392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000008889 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:75331264:75332142:1 gene:ENSRNOG00000006796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001105829 // RefSeq // Rattus norvegicus lactoperoxidase (Lpo), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74982141:75002003:1 gene:ENSRNOG00000008422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74985782:75001563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT009488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001107037 // RefSeq // Rattus norvegicus eosinophil peroxidase (Epx), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74930864:74941948:1 gene:ENSRNOG00000008707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74930984:74941233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT009487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001000039 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1521 (Olr1521), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74915498:74916433:1 gene:ENSRNOG00000030521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74915498:74916433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 86 // 95 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT009486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000040 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1522 (Olr1522), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000050349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74900975:74912352:1 gene:ENSRNOG00000030148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 57 // 100 // 12 // 21 // 0 /// GENSCAN00000021503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74811523:74912332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT009485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000713 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1523 (Olr1523), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74900975:74912352:1 gene:ENSRNOG00000030148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT009484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74811523:74912332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_080697 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein light chain LC8-type 2 (Dynll2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:74829855:74837879:1 gene:ENSRNOG00000008921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY034383 // GenBank // Rattus norvegicus dynein light chain-2 (Dlc2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// BC061874 // GenBank // Rattus norvegicus dynein light chain LC8-type 2, mRNA (cDNA clone MGC:72334 IMAGE:5598327), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74811523:74912332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT009482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
GENSCAN00000043699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:74647041:74647355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_031985 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 1 (Rps6kb1), mRNA. // chr10 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// XM_006247110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 1 (Rps6kb1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000005226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:76234215:76275377:1 gene:ENSRNOG00000003919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC089789 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 kinase, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365967). // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// M58340 // GenBank // Rat S6 protein kinase mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:76242518:76274695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// M57428 // GenBank // Rat S6 kinase mRNA, compelete cds. // chr10 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT009520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT009519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT009521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT009522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XM_006247074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus musashi RNA-binding protein 2 (Msi2), mRNA. // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000003164 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:74071857:74427908:1 gene:ENSRNOG00000025338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT009474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT009475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000071623 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:74071857:74101850:1 gene:ENSRNOG00000025338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// XM_006247074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus musashi RNA-binding protein 2 (Msi2), mRNA. // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000003164 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:74071857:74427908:1 gene:ENSRNOG00000025338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000034921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:74071857:74305974:1 gene:ENSRNOG00000025338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_053665 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 1 (Akap1), mRNA. // chr10 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0 /// XM_006247068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 1 (Akap1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000055683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73940526:73959662:1 gene:ENSRNOG00000002373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AF068202 // GenBank // Rattus norvegicus A-kinase anchor protein121 mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0 /// BC081753 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7114881). // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC097298 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7456073. // chr10 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000011891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73945259:74004711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000030873 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:73894601:73895033:1 gene:ENSRNOG00000022574 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 93 // 93 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73846413:73928368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_133383 // RefSeq // Rattus norvegicus serine carboxypeptidase 1 (Scpep1), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73846394:73880404:1 gene:ENSRNOG00000002358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF330051 // GenBank // Rattus norvegicus retinoid-inducible serine carboxypeptidase precursor (Risc) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// FQ235041 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YL06 mRNA sequence. // chr10 // 91 // 41 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000011910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73846413:73928368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT009459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT009460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT009461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_001081212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1561118), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_220759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor B polypeptide 2-like (RGD1561118), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000040561 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:73835234:73835530:1 gene:ENSRNOG00000034060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73835258:73835590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_006247073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription initiation factor TFIID subunit 11-like (RGD1562272), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000000260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73799139:73799762:1 gene:ENSRNOG00000027511 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73799139:73799762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT009458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001039341 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, epsilon 64kDa (Dgke), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:73703727:73725817:1 gene:ENSRNOG00000002338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC110049 // GenBank // Rattus norvegicus similar to diacylglycerol kinase epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:124991 IMAGE:7316890), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:73703896:73724683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT009454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT009455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_012990 // RefSeq // Rattus norvegicus noggin (Nog), mRNA. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// U31203 // GenBank // Rattus norvegicus noggin (NOGGIN) mRNA, partial cds. // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:76647649:76694560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT011847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XM_006220779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64351-like (LOC100364574), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64351-like (LOC100364574), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032109 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:76768471:76795777:-1 gene:ENSRNOG00000023532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:76768471:76789195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000003281 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:76797910:76834936:-1 gene:ENSRNOG00000002415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// XM_006220779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64351-like (LOC100364574), mRNA. // chr10 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// XM_006221016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 1-like (LOC102551403), mRNA. // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// XM_006247134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64351-like (LOC100364574), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// XM_006247138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 1-like (LOC102551403), mRNA. // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:76797910:76832993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:76882175:76908127:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_017225 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylcholine transfer protein (Pctp), mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006247124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylcholine transfer protein (Pctp), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000003295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:77353604:77374000:-1 gene:ENSRNOG00000002425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC078854 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylcholine transfer protein, mRNA (cDNA clone MGC:93515 IMAGE:7113616), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT011850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:77342714:77373995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
XM_006220780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hepatic leukemia factor-like (LOC690286), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000055664 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:77701829:77777898:-1 gene:ENSRNOG00000002456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:77660460:77721621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
XM_006247131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin binding protein 4 (Stxbp4), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_001107038 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin binding protein 4 (Stxbp4), mRNA. // chr10 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000041119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:77871153:78023722:-1 gene:ENSRNOG00000032768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// GENSCAN00000017040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:77981273:78011037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001253859 // RefSeq // Rattus norvegicus target of myb1 (chicken)-like 1 (Tom1l1), mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:78029169:78072505:-1 gene:ENSRNOG00000002474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT011862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:78042223:78060041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// GENSCAN00000017043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:78071854:78078608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
BC100150 // GenBank // Rattus norvegicus similar to glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:114475 IMAGE:7455257), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000048122 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:78536971:78537978:-1 gene:ENSRNOG00000031310 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000027598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:78536971:78537978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT011866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001005874 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 2B (Kif2b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:78940905:78942899:-1 gene:ENSRNOG00000002535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC083841 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin family member 2B, mRNA (cDNA clone MGC:94970 IMAGE:7114321), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:78940905:78943043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT011867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000003919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81200229:81237637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000035499 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:81201080:81201396:-1 gene:ENSRNOG00000027689 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
NM_001135039 // RefSeq // Rattus norvegicus UTP18 small subunit (SSU) processome component homolog (yeast) (Utp18), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81390897:81417858:-1 gene:ENSRNOG00000002644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81350576:81417871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT011869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_031833 // RefSeq // Rattus norvegicus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 2 (Nme2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000003611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81478178:81483679:-1 gene:ENSRNOG00000002671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC086599 // GenBank // Rattus norvegicus non-metastatic cells 2, protein (NM23B) expressed in, mRNA (cDNA clone MGC:105386 IMAGE:7312852), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ217120 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YO06 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ218179 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YA05 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// M55331 // GenBank // Rat nucleoside diphosphate kinase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// M91597 // GenBank // Sprague-Dawley (p18-12d) RBL-NDP kinase 18kDa subunit (p18) mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000012179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81478294:81496646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT011871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT011873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT011874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
NM_138548 // RefSeq // Rattus norvegicus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 1 (Nme1), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// XM_006247139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 1 (Nme1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000003658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81487115:81496485:-1 gene:ENSRNOG00000002693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// D13374 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for nucleoside diphosphate kinase beta isoform, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT011875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81478294:81496646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NONRATT011882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006247173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAP, follistatin/kazal, immunoglobulin, kunitz and netrin domain containing 2 (Wfikkn2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000003784 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:81770067:81775078:-1 gene:ENSRNOG00000002831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81770635:81780854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// FQ220270 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YI14 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT011882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108291 // RefSeq // Rattus norvegicus LUC7-like 3 (S. cerevisiae) (Luc7l3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000003914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81823960:81859932:-1 gene:ENSRNOG00000002835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ212347 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA58YC01 mRNA sequence. // chr10 // 87 // 83 // 13 // 15 // 0 /// FQ233412 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YP11 mRNA sequence. // chr10 // 67 // 67 // 8 // 12 // 0 /// FQ231407 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YJ16 mRNA sequence. // chr10 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// NONRATT011886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 50 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT011887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81825930:81859765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_080581 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 3 (Abcc3), mRNA. // chr10 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000003977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81880042:81938202:-1 gene:ENSRNOG00000002948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000051497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81880042:81938202:-1 gene:ENSRNOG00000002948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AB010467 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for multidrug resistance-associated protein (MRP)-like protein-2 (MLP-2), complete cds. // chr10 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// AF072816 // GenBank // Rattus norvegicus ABC-type transporter MRP3 (mrp3) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000020454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81884992:81920193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_031601 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, T type, alpha 1G subunit (Cacna1g), mRNA. // chr10 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000055597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81951133:82017400:-1 gene:ENSRNOG00000002981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000067416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:81951133:82017400:-1 gene:ENSRNOG00000002981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// AF027984 // GenBank // Rattus norvegicus low voltage-activated, T-type calcium channel alpha subunit (CACNA1G) mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 90 // 36 // 38 // 0 /// AF125161 // GenBank // Rattus norvegicus T-type calcium channel isoform mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// AF290212 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel alpha-1-G subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 83 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000020426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81951326:81987917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:81998240:82011533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT011896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0
NM_199402 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 20 (Spata20), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006247200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 20 (Spata20), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82022659:82029499:-1 gene:ENSRNOG00000003273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY438568 // GenBank // Rattus norvegicus sperm protein SSP411 mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82022807:82047366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001024791 // RefSeq // Rattus norvegicus epsin 3 (Epn3), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006247201 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epsin 3 (Epn3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000004400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82040631:82049009:-1 gene:ENSRNOG00000003284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC097500 // GenBank // Rattus norvegicus epsin 3, mRNA (cDNA clone MGC:114575 IMAGE:7462750), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT011906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000020465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82022807:82047366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001034951 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase family member 2 (Acsf2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82104326:82146073:-1 gene:ENSRNOG00000003330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099826 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124705 IMAGE:7934093), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82115930:82145943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT011911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82052049:82110734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT011912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001105830 // RefSeq // Rattus norvegicus essential meiotic structure-specific endonuclease 1 (Eme1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000032693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82185900:82191905:-1 gene:ENSRNOG00000024420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82185900:82191905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_022296 // RefSeq // Rattus norvegicus xylosyltransferase II (Xylt2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82204622:82218102:-1 gene:ENSRNOG00000003728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC105767 // GenBank // Rattus norvegicus xylosyltransferase II, mRNA (cDNA clone MGC:124608 IMAGE:7930580), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82204657:82218098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006247240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 92-like (LOC102551823), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82285075:82341491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1
XM_003752436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG13644-like (LOC100363099), mRNA. // chr10 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// XM_006247241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 92-like (LOC100910998), mRNA. // chr10 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000022734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82344324:82388125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82458211:82556004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000022773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82411887:82434445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
XM_003752436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG13644-like (LOC100363099), mRNA. // chr10 // 82 // 69 // 18 // 22 // 0 /// XM_006221019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911112 (LOC100911112), mRNA. // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// XM_006227163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556344 (LOC102556344), mRNA. // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// XM_006247241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 92-like (LOC100910998), mRNA. // chr10 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000022734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82344324:82388125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 69 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82458211:82556004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000022773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82411887:82434445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
XM_003752436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG13644-like (LOC100363099), mRNA. // chr10 // 78 // 82 // 21 // 27 // 0 /// XM_006247241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 92-like (LOC100910998), mRNA. // chr10 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000022734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82344324:82388125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 82 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82458211:82556004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000022773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82411887:82434445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001107039 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcoglycan, alpha (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgca), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82588479:82602338:-1 gene:ENSRNOG00000003998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82594669:82597893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT011926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_030872 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 2 (Pdk2), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005641 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:82650223:82663773:-1 gene:ENSRNOG00000004172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// AF237719 // GenBank // Rattus norvegicus PDK2.1 pyruvate dehydrogenase kinase 2 subunit variant p45 mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// BC061823 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:72420 IMAGE:5599188), complete cds. // chr10 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// U10357 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase kinase 2 subunit p45 (PDK2) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82650168:82663675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT011929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT011931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT011932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000005644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82668830:82697897:-1 gene:ENSRNOG00000004276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82667994:82697897:-1 gene:ENSRNOG00000004276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82668830:82690583:-1 gene:ENSRNOG00000004276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AB727941 // GenBank // Rattus norvegicus ITGA3 mRNA for integrin alpha 3 variant A, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AB727942 // GenBank // Rattus norvegicus ITGA3B mRNA for integrin alpha 3 variant B, complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82667994:82697897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT011935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107040 // RefSeq // Rattus norvegicus distal-less homeobox 4 (Dlx4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:82769562:82774553:-1 gene:ENSRNOG00000004399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// HQ616894 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley homeodomain transcription factor (Dlx4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82756967:82774384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_181081 // RefSeq // Rattus norvegicus K (lysine) acetyltransferase 7 (Kat7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000031252 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:82905361:82935808:-1 gene:ENSRNOG00000022664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AY236854 // GenBank // Rattus norvegicus histone acetyltransferase-like protein mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY241457 // GenBank // Rattus norvegicus histone acetyltransferase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82906902:82914409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT011939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// GENSCAN00000022443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82923091:82949751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
XM_001081318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stathmin-like (RGD1565395), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_220874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stathmin-like (RGD1565395), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000034515 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:82956820:82957275:-1 gene:ENSRNOG00000022375 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:82956820:82957275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT011942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
NM_021679 // RefSeq // Rattus norvegicus neurexophilin 3 (Nxph3), mRNA. // chr10 // 88 // 71 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83138261:83142939:-1 gene:ENSRNOG00000005185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AF042713 // GenBank // Rattus norvegicus neurexophilin 3 (Nph3) mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 71 // 22 // 25 // 0 /// BC166603 // GenBank // Rattus norvegicus neurexophilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:188381 IMAGE:7936112), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000022435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83121659:83142579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT011947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_012610 // RefSeq // Rattus norvegicus nerve growth factor receptor (Ngfr), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83198415:83216629:-1 gene:ENSRNOG00000005392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83200278:83216486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT011948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013118 // RefSeq // Rattus norvegicus ABI family, member 3 (Abi3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83448188:83459284:-1 gene:ENSRNOG00000005575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079102 // GenBank // Rattus norvegicus ABI family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:94089 IMAGE:7124908), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ221022 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YJ06 mRNA sequence. // chr10 // 72 // 91 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83448483:83459000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT011952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT011953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_175594 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1 (Igf2bp1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83584829:83628466:-1 gene:ENSRNOG00000006122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF541940 // GenBank // Rattus norvegicus b-actin zipcode binding protein 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161831 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187312 IMAGE:9023972), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83585202:83628212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000024791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83665732:83666115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000040376 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:83664738:83666266:-1 gene:ENSRNOG00000036939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0
NM_001037643 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2Z (Ube2z), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:83674573:83693693:-1 gene:ENSRNOG00000006868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107663 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2Z, mRNA (cDNA clone MGC:124852 IMAGE:7936709), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83676317:83745099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
XM_006247243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium binding and coiled-coil domain 2 (Calcoco2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073801 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:83735503:83745087:-1 gene:ENSRNOG00000031074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
NM_001012012 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 11 (Snx11), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001199169 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 11 (Snx11), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247196 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 11 (Snx11), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 11 (Snx11), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84421495:84432020:-1 gene:ENSRNOG00000008642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC086543 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 11, mRNA (cDNA clone MGC:105892 IMAGE:7132863), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ212083 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA69YP20 mRNA sequence. // chr10 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84417035:84450054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT011973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT011974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT011975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
XM_006220824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 1 (Nfe2l1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006220826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 1 (Nfe2l1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006247236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 1 (Nfe2l1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, erythroid 2-like 1 (Nfe2l1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000067542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84475360:84489905:-1 gene:ENSRNOG00000008830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC169095 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7938135. // chr10 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000050903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84481426:84489900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT011979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT011982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001107045 // RefSeq // Rattus norvegicus Sp2 transcription factor (Sp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sp2 transcription factor (Sp2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84682783:84711848:-1 gene:ENSRNOG00000010492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC168669 // GenBank // Rattus norvegicus Sp2 transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:188450 IMAGE:7934743), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84683036:84710284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001004201 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 46 (Lrrc46), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000013542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84762161:84766655:-1 gene:ENSRNOG00000009902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC079258 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 46, mRNA (cDNA clone MGC:94361 IMAGE:7133394), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000050916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84762226:84766435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT011990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_001107043 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 21 (Tbx21), mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000012538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84822665:84839295:-1 gene:ENSRNOG00000009427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84823362:84856169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT011991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_172021 // RefSeq // Rattus norvegicus TBK1 binding protein 1 (Tbkbp1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBK1 binding protein 1 (Tbkbp1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000012462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84861028:84874814:-1 gene:ENSRNOG00000009370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC076503 // GenBank // Rattus norvegicus TBK1 binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:91442 IMAGE:7100584), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ278800 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ProSAPiP2 protein. // chr10 // 73 // 85 // 16 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84862372:84874282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT011992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
JX096837 // GenBank // Rattus norvegicus importin beta 1 mRNA, 3 UTR. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231521 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YD03 mRNA sequence. // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_017063 // RefSeq // Rattus norvegicus karyopherin (importin) beta 1 (Kpnb1), mRNA. // chr10 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// XM_006247256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus karyopherin (importin) beta 1 (Kpnb1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000012376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84886482:84914608:-1 gene:ENSRNOG00000009275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// L38644 // GenBank // Rattus norvegicus karyopherin beta mRNA, complete cds. // chr10 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000031142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84886637:84914509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT011995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT011997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT011994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT011998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
NM_080395 // RefSeq // Rattus norvegicus aminopeptidase puromycin sensitive (Npepps), mRNA. // chr10 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// XM_006247408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aminopeptidase puromycin sensitive (Npepps), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000031045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:84930337:85012828:-1 gene:ENSRNOG00000023095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000031130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:84931574:85013191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 87 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT011999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0
XM_006221020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 179 (Gpr179), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006247483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 179 (Gpr179), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055427 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:85064024:85079744:-1 gene:ENSRNOG00000029245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85064024:85079594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_019378 // RefSeq // Rattus norvegicus SRC kinase signaling inhibitor 1 (Srcin1), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85248782:85306184:-1 gene:ENSRNOG00000011475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AF156981 // GenBank // Rattus norvegicus SNIP-a mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// AF156982 // GenBank // Rattus norvegicus SNIP-b mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85239173:85268820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0
NM_001109627 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691153 (LOC691153), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072274 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:85361304:85362419:-1 gene:ENSRNOG00000048187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85361304:85364215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105836 // RefSeq // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 2 (Pcgf2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycomb group ring finger 2 (Pcgf2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycomb group ring finger 2 (Pcgf2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85420166:85424249:-1 gene:ENSRNOG00000012705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC167059 // GenBank // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:189369 IMAGE:7445511), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85420368:85424120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053550 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase, type II, beta (Pip4k2b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase, type II, beta (Pip4k2b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85449155:85475137:-1 gene:ENSRNOG00000013030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF033355 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase beta mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85449774:85475024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108295 // RefSeq // Rattus norvegicus CWC25 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae) (Cwc25), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85475897:85499557:-1 gene:ENSRNOG00000004091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85477735:85514849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
XM_002727808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691189 (LOC691189), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691189 (LOC691189), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005445 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:85503770:85507189:-1 gene:ENSRNOG00000036888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NONRATT012022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001007599 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L23 (Rpl23), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000005471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85510910:85514900:-1 gene:ENSRNOG00000004107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC058500 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L23, mRNA (cDNA clone MGC:72962 IMAGE:6921061), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ221690 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA33YA02 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ221693 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YP06 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT012019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000011598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85477735:85514849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1
NONRATT012019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 1
XM_006221023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 47 (Fbxo47), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055379 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:85587972:85613034:-1 gene:ENSRNOG00000036882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85587972:85611254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_001107046 // RefSeq // Rattus norvegicus plexin domain containing 1 (Plxdc1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000043561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85657448:85726578:-1 gene:ENSRNOG00000021536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85658693:85726452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001109046 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 5C (Arl5c), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 5C (Arl5c), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85729670:85736431:-1 gene:ENSRNOG00000036880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85731592:85736377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT012025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_017346 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, beta 1 subunit (Cacnb1), mRNA. // chr10 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// XM_006247411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, beta 1 subunit (Cacnb1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85742631:85763137:-1 gene:ENSRNOG00000004518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85744038:85763300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108834 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 and cysteine rich domain 2 (Stac2), mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85782664:85799680:-1 gene:ENSRNOG00000004805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85784025:85799199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006247421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 20 (Fbxl20), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 20 (Fbxl20), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099108 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7461178. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022272 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 20 (Fbxl20), mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// XM_006247421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 20 (Fbxl20), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_006247426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 20 (Fbxl20), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000067317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85847965:85896206:-1 gene:ENSRNOG00000005081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// AF182443 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein FBL2 (FBL2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85841037:85897010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT012037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// NONRATT012038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 30 // 40 // 1
NM_001134361 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 1 (Med1), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:85901212:85941797:-1 gene:ENSRNOG00000005606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:85902204:85928704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT012041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT012042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1
NM_019326 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal differentiation 2 (Neurod2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86078900:86080048:-1 gene:ENSRNOG00000028417 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// D82868 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for bHLH protein, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86078900:86080048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT012044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108296 // RefSeq // Rattus norvegicus migration and invasion enhancer 1 (Mien1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006247244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus migration and invasion enhancer 1-like (LOC102552549), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000009485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86187295:86189073:-1 gene:ENSRNOG00000007227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ214212 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YD05 mRNA sequence. // chr10 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// NONRATT011983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001107047 // RefSeq // Rattus norvegicus IKAROS family zinc finger 3 (Ikzf3), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86217517:86305385:-1 gene:ENSRNOG00000007200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ226043 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YD18 mRNA sequence. // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000004561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86237293:86244037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT012047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT012047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 5 // 5 // 1
NM_001047897 // RefSeq // Rattus norvegicus ORMDL sphingolipid biosynthesis regulator 3 (Ormdl3), mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247345 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ORM1-like 3 (S. cerevisiae) (Ormdl3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86343415:86350554:-1 gene:ENSRNOG00000030445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86343415:86346447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 57 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 86 // 86 // 32 // 37 // 1 /// NONRATT012051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1
NM_001034079 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 24 (Med24), mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000011947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86416484:86441676:-1 gene:ENSRNOG00000008711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// BC097461 // GenBank // Rattus norvegicus mediator complex subunit 24, mRNA (cDNA clone MGC:114525 IMAGE:7457533), complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 27 // 28 // 1 /// GENSCAN00000003663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86416784:86461931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001113422 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1 (Nr1d1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NM_145775 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1 (Nr1d1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86479868:86486598:-1 gene:ENSRNOG00000009329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86479868:86484723:-1 gene:ENSRNOG00000009329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC062047 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72288 IMAGE:5598020), complete cds. // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// M25804 // GenBank // Rat Rev-ErbA-alpha protein mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86480151:86486598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000034409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86687233:86688069:-1 gene:ENSRNOG00000027688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86687233:86688069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT012060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_022183 // RefSeq // Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) II alpha (Top2a), mRNA. // chr10 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000050725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86699277:86735462:-1 gene:ENSRNOG00000032404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86699683:86736964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// Z46372 // GenBank // R.norvegicus RNA for DNA topoisomerase II. // chr10 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// NONRATT012061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// NONRATT012062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001024881 // RefSeq // Rattus norvegicus tensin 4 (Tns4), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000030720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86774542:86796984:-1 gene:ENSRNOG00000027350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC097378 // GenBank // Rattus norvegicus tensin 4, mRNA (cDNA clone MGC:114413 IMAGE:7445075), complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// XM_006247305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tensin 4 (Tns4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 1 /// GENSCAN00000007034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86774468:86817428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT012067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_199489 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 7 (Ccr7), mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 7 (Ccr7), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86853269:86863401:-1 gene:ENSRNOG00000010665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// AF121670 // GenBank // Rattus norvegicus putative G-protein coupled receptor-like (AMG1) mRNA sequence. // chr10 // 80 // 36 // 8 // 10 // 0 /// AY379972 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine receptor 7-like protein (Ccr7) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC089762 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 7, mRNA (cDNA clone MGC:108519 IMAGE:7381637), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86853269:86883838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT012070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_001024993 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1 (Smarce1), mRNA. // chr10 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000014230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86913923:86933996:-1 gene:ENSRNOG00000010676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// BC091314 // GenBank // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:109283 IMAGE:7312354), complete cds. // chr10 // 88 // 80 // 14 // 16 // 0 /// BC092210 // GenBank // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:105577 IMAGE:7311688), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// FQ213000 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YE14 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000007045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86916409:86990690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT012072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 89 // 90 // 16 // 18 // 0 /// NONRATT012077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
XM_001081416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 222 (Krt222), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_003750923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 222 (Krt222), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006220829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 222 (Krt222), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006247443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 222 (Krt222), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014414 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:86940348:86949914:-1 gene:ENSRNOG00000010839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86916409:86990690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001004131 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 24 (Krt24), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000014851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:86986162:86991053:-1 gene:ENSRNOG00000010970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT012081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000007045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86916409:86990690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 33 // 43 // 1
NM_001008822 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 25 (Krt25), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87020968:87028244:-1 gene:ENSRNOG00000011196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86993934:87044093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001008823 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 26 (Krt26), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87035441:87044093:-1 gene:ENSRNOG00000033617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:86993934:87044093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT012087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001008824 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 27 (Krt27), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006247393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 27 (Krt27), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000015740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87051955:87057238:-1 gene:ENSRNOG00000011628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87051955:87057238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001008760 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 28 (Krt28), mRNA. // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87071826:87081926:-1 gene:ENSRNOG00000011846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87071826:87081926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001008804 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 10 (Krt10), mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 10 (Krt10), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000036023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87092253:87096248:-1 gene:ENSRNOG00000030170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87085302:87096248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT012091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT012090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1
NM_001008761 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 12 (Krt12), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87124674:87131666:-1 gene:ENSRNOG00000011986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87106613:87131312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT012094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_173128 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 20 (Krt20), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034889 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:87138402:87147194:-1 gene:ENSRNOG00000027139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M63665 // GenBank // Rat cytokeratin 21 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87138576:87147098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001008753 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 23 (histone deacetylase inducible) (Krt23), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87187796:87203807:-1 gene:ENSRNOG00000011907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87187796:87203582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001004130 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 39 (Krt39), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87227067:87233672:-1 gene:ENSRNOG00000031422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87211737:87266717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001008821 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 40 (Krt40), mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87249905:87255869:-1 gene:ENSRNOG00000013896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87211737:87266717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_002724543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-3 (Krtap3-3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006220830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-3-like 1 (Krtap3-3l1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-3-like 1 (Krtap3-3l1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_343966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-3 (Krtap3-3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039983 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87264855:87265154:-1 gene:ENSRNOG00000045678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045189 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87271563:87271862:-1 gene:ENSRNOG00000049383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87270170:87271862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87211737:87266717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_002724543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-3 (Krtap3-3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006220830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-3-like 1 (Krtap3-3l1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-3-like 1 (Krtap3-3l1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_343966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-3 (Krtap3-3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039983 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87264855:87265154:-1 gene:ENSRNOG00000045678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045189 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87271563:87271862:-1 gene:ENSRNOG00000049383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87270170:87271862:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87211737:87266717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_001055567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-1 (Krtap3-1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002724545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 3-1 (Krtap3-1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016752 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87280919:87281215:-1 gene:ENSRNOG00000012544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87276736:87281215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001025135 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin associated protein 1-5 (Krtap1-5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000047459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87296191:87296559:-1 gene:ENSRNOG00000032637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000021297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87281547:87296559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT012101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_002724546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 1-1 (Krtap1-1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_002727816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 1-1 (Krtap1-1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000037980 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87298668:87299234:-1 gene:ENSRNOG00000012955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87298668:87299234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_001055744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 1-3 (Krtap1-3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041345 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87305774:87306400:-1 gene:ENSRNOG00000031066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_002724547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 1-3-like (LOC100365588), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_003750925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 1-3-like (LOC100365588), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000050087 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87312553:87312918:-1 gene:ENSRNOG00000030760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87312523:87312918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT012102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000065619 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87350892:87372106:-1 gene:ENSRNOG00000012657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
XM_006220833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362031 (LOC100362031), mRNA. // chr10 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0
ENSRNOT00000065671 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:87485211:87505675:-1 gene:ENSRNOG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// XM_003752379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 4-3-like (LOC100912586), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 1
XM_003752379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 4-3-like (LOC100912586), mRNA. // chr10 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000017292 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:87493058:87493780:-1 gene:ENSRNOG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000065155 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:87493058:87505675:-1 gene:ENSRNOG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000065671 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:87485211:87505675:-1 gene:ENSRNOG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000066758 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:87493058:87511634:-1 gene:ENSRNOG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000067234 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:87493058:87511634:-1 gene:ENSRNOG00000034110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
XM_001081433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 4-3 (Krtap4-3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_577126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 4-3 (Krtap4-3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000047104 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87542349:87542888:-1 gene:ENSRNOG00000029523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064152 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87542349:87542888:-1 gene:ENSRNOG00000029523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 77 // 9 // 17 // 0 /// GENSCAN00000021269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87542285:87546376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000036420 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87581591:87582213:-1 gene:ENSRNOG00000026794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 76 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000021278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87581591:87598168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
XM_006220838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 17-1-like (LOC102554371), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 17-1-like (LOC102554371), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064120 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:87714193:87714513:-1 gene:ENSRNOG00000042473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008757 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 33A (Krt33a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87732925:87749163:-1 gene:ENSRNOG00000030344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87745725:87749163:-1 gene:ENSRNOG00000030344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 78 // 87 // 21 // 27 // 0 /// NM_001008758 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 34 (Krt34), mRNA. // chr10 // 59 // 87 // 16 // 27 // 0 /// NM_001008817 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 31 (Krt31), mRNA. // chr10 // 70 // 87 // 19 // 27 // 0 /// NM_001008819 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 33B (Krt33b), mRNA. // chr10 // 61 // 100 // 19 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87736681:87749163:-1 gene:ENSRNOG00000030344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 90 // 19 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87722824:87762838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 87 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT012104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// NONRATT012107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 84 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT012108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 81 // 84 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT012106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 77 // 16 // 24 // 0
NM_001008819 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 33B (Krt33b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001008758 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 34 (Krt34), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000018048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87736681:87749163:-1 gene:ENSRNOG00000030344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 84 // 83 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87722824:87762838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 74 // 13 // 17 // 0 /// NONRATT012104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT012106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0
NM_001008817 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 31 (Krt31), mRNA. // chr10 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000018176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87745725:87749163:-1 gene:ENSRNOG00000030344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// NONRATT012104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT012107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001008818 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 32 (Krt32), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin 32 (Krt32), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000046751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87787319:87792744:-1 gene:ENSRNOG00000013611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87775586:87812643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1
NM_001008820 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 35 (Krt35), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87798389:87801786:-1 gene:ENSRNOG00000013754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87775586:87812643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001008759 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 36 (Krt36), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87809278:87812643:-1 gene:ENSRNOG00000031805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87775586:87812643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001004021 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 13 (Krt13), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87824805:87828715:-1 gene:ENSRNOG00000014070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87823101:87828715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT012112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001004022 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 15 (Krt15), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87839485:87843297:-1 gene:ENSRNOG00000014099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101868 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 15, mRNA (cDNA clone MGC:124524 IMAGE:7938504), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87839723:87843040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_199498 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 19 (Krt19), mRNA. // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87848518:87853235:-1 gene:ENSRNOG00000014233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY464140 // GenBank // Rattus norvegicus cytokeratin 19 mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC088424 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 19, mRNA (cDNA clone IMAGE:7123832), partial cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC126075 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 19, mRNA (cDNA clone MGC:156553 IMAGE:7442082), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87848630:87853179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_153476 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 9 (Krt9), mRNA. // chrU // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87895194:87899956:-1 gene:ENSRNOG00000014370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY128946 // GenBank // Rattus norvegicus spermatid perinuclear ring manchette protein K9 mRNA, complete cds. // chrU // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87866692:87899917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001008751 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 14 (Krt14), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87910658:87914716:-1 gene:ENSRNOG00000003899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87910658:87945393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001008750 // RefSeq // Rattus norvegicus type I keratin KA11 (Ka11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000068691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87934150:87937029:-1 gene:ENSRNOG00000042875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000055802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87910658:87945393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT012120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001008752 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 16 (Krt16), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000019477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87942674:87945393:-1 gene:ENSRNOG00000014441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000055802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87910658:87945393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT012121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_212545 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 17 (Krt17), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87952324:87957041:-1 gene:ENSRNOG00000026371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100058 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 17, mRNA (cDNA clone MGC:112565 IMAGE:7383488), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87952474:87956988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008816 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 42 (Krt42), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:87958996:87966157:-1 gene:ENSRNOG00000034087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:87958996:87966157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_024133 // RefSeq // Rattus norvegicus huntingtin-associated protein 1 (Hap1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NM_177982 // RefSeq // Rattus norvegicus huntingtin-associated protein 1 (Hap1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88051271:88059466:-1 gene:ENSRNOG00000014819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// U38370 // GenBank // Rattus norvegicus huntingtin associated protein (rHAP1-B) mRNA, complete cds, alternatively spliced form. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// U38373 // GenBank // Rattus norvegicus huntingtin associated protein (rHAP1-A) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88052541:88072782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_031047 // RefSeq // Rattus norvegicus junction plakoglobin (Jup), mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000040845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88073766:88100379:-1 gene:ENSRNOG00000015380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC065580 // GenBank // Rattus norvegicus junction plakoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:72417 IMAGE:5599724), complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ223166 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA14YL11 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// U58858 // GenBank // Rattus norvegicus plakoglobin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88075331:88093606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_021581 // RefSeq // Rattus norvegicus leprecan-like 4 (Leprel4), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88112407:88118469:-1 gene:ENSRNOG00000015787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC107672 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7938082, containing frame-shift errors. // chr10 // 92 // 100 // 34 // 37 // 0 /// FQ227296 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YN17 mRNA sequence. // chr10 // 82 // 92 // 28 // 34 // 0 /// GENSCAN00000055807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88105346:88118547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT012132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1
NM_001007723 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IIIB (Nt5c3b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88135607:88149785:-1 gene:ENSRNOG00000016475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078963 // GenBank // Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic III-like, mRNA (cDNA clone MGC:93839 IMAGE:7111222), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IIIB (Nt5c3b), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000055801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88136045:88148960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT012136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT012137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT012135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT012139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT012141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001105838 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 11 (Klhl11), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88171942:88182499:-1 gene:ENSRNOG00000016921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88172197:88182443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001111095 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP citrate lyase (Acly), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NM_016987 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP citrate lyase (Acly), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88185495:88236092:-1 gene:ENSRNOG00000016924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000043172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88185495:88236092:-1 gene:ENSRNOG00000016924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC100618 // GenBank // Rattus norvegicus ATP citrate lyase, mRNA (cDNA clone MGC:124629 IMAGE:7934668), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// J05210 // GenBank // Rat ATP citrate-lyase mRNA, complete cds. // chr10 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88186395:88236147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_213625 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 7 (Dnajc7), mRNA. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// XM_006247312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 7 (Dnajc7), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88291502:88327520:-1 gene:ENSRNOG00000017781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB178470 // GenBank // Rattus norvegicus CCRP mRNA for cytoplasmic CAR retention protein, complete cds. // chr10 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// BC093600 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:105609 IMAGE:7316009), complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ212948 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YJ03 mRNA sequence. // chr10 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88291789:88293858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88298302:88327490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT012149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001098788 // RefSeq // Rattus norvegicus DEXH (Asp-Glu-X-His) box polypeptide 58 (Dhx58), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000024718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88393941:88405108:-1 gene:ENSRNOG00000018247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88394276:88405107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT012154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001107050 // RefSeq // Rattus norvegicus K(lysine) acetyltransferase 2A (Kat2a), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000055250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88405799:88413750:-1 gene:ENSRNOG00000018364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ213257 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YN15 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88406305:88413696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT012156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001105840 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB5C, member RAS oncogene family (Rab5c), mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000030344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88416138:88439534:-1 gene:ENSRNOG00000018568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC158856 // GenBank // Rattus norvegicus RAB5C, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:188396 IMAGE:5599461), complete cds. // chr10 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT012158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_053630 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 4 (Kcnh4), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// XM_006247247 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily H (eag-related), member 4 (Kcnh4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88441734:88461552:-1 gene:ENSRNOG00000018790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB022699 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BEC2, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000019203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88441915:88461417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_013179 // RefSeq // Rattus norvegicus hypocretin (Hcrt), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88463378:88464604:-1 gene:ENSRNOG00000018892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF019565 // GenBank // Rattus norvegicus preprohypocretin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF041241 // GenBank // Rattus norvegicus prepro-orexin mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT012160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88463463:88470810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001191651 // RefSeq // Rattus norvegicus GH3 domain containing (Ghdc), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88467004:88471225:-1 gene:ENSRNOG00000018906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88463463:88470810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT012163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT012164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_022380 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 5B (Stat5b), mRNA. // chr10 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88480377:88506891:-1 gene:ENSRNOG00000019075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// X91988 // GenBank // R.norvegicus mRNA for Stat5b protein. // chr10 // 68 // 100 // 15 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88478825:88506876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT012166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_012747 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 3 (acute-phase response factor) (Stat3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000026760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88584612:88638724:-1 gene:ENSRNOG00000019742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC087025 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducer and activator of transcription 3, mRNA (cDNA clone MGC:93551 IMAGE:7110655), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000019202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88586521:88612002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT012169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001105841 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase I and transcript release factor (Ptrf), mRNA. // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000026783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88659595:88671569:-1 gene:ENSRNOG00000019778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000019219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88659703:88671463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT012174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001034109 // RefSeq // Rattus norvegicus alanyl-tRNA synthetase domain containing 1 (Aarsd1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006247420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alanyl-tRNA synthetase domain containing 1 (Aarsd1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89115999:89129102:-1 gene:ENSRNOG00000020658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC083790 // GenBank // Rattus norvegicus alanyl-tRNA synthetase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94778 IMAGE:7106366), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT012197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000009145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89113661:89136557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT012198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_006247420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alanyl-tRNA synthetase domain containing 1 (Aarsd1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028053 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:89133680:89136217:-1 gene:ENSRNOG00000050347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073923 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:89133686:89136557:-1 gene:ENSRNOG00000050347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89113661:89136557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_134458 // RefSeq // Rattus norvegicus PSMC3 interacting protein (Psmc3ip), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88800612:88803709:-1 gene:ENSRNOG00000020022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF352812 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator GT198 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88800848:88803687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT012177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
ENSRNOT00000027217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88805098:88829208:-1 gene:ENSRNOG00000020056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166581 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 134, member C, mRNA (cDNA clone MGC:188283 IMAGE:7380672), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ212358 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YN12 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88806738:88829060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001037202 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 3 (Plekhh3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 3 (Plekhh3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88874968:88883381:-1 gene:ENSRNOG00000020238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107561 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family H (with MyTH4 domain) member 3, mRNA (cDNA clone MGC:124855 IMAGE:7937018), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88875163:88882966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108836 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 10 (Ccr10), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247388 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 10 (Ccr10), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88885052:88887489:-1 gene:ENSRNOG00000020275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88885682:88887466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT012186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107051 // RefSeq // Rattus norvegicus enhancer of zeste 1 polycomb repressive complex 2 subunit (Ezh1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000027640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88902523:88928835:-1 gene:ENSRNOG00000020336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:88904451:88927396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0
NM_133544 // RefSeq // Rattus norvegicus up-regulated during skeletal muscle growth 5 homolog (mouse) (Usmg5), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274290376:274297223:-1 gene:ENSRNOG00000020296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000064931 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:43262511:43262819:-1 gene:ENSRNOG00000042869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// FQ217509 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA24YL02 mRNA sequence. // chr10 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000072203 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:70214461:70214766:1 gene:ENSRNOG00000046781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 68 // 100 // 23 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027754 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:88985767:88985943:-1 gene:ENSRNOG00000020473 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr10 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT007827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT007828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// NONRATT012188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT007829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_001109047 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome C oxidase assembly factor 3 (Coa3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000027782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:88997136:88998122:-1 gene:ENSRNOG00000020487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ221438 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA36YF06 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT012189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001034117 // RefSeq // Rattus norvegicus beclin 1, autophagy related (Becn1), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NM_053739 // RefSeq // Rattus norvegicus beclin 1, autophagy related (Becn1), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89008976:89024328:-1 gene:ENSRNOG00000020513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY033824 // GenBank // Rattus norvegicus Bcl-2-interacting coiled-coil protein beclin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC074011 // GenBank // Rattus norvegicus beclin 1, autophagy related, mRNA (cDNA clone MGC:91559 IMAGE:7100185), complete cds. // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// FQ230174 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YG01 mRNA sequence. // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000009175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89010421:89023860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT012191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT012193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT012194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT012195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT012196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_001033683 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle amine transport 1 (Vat1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89164915:89172532:-1 gene:ENSRNOG00000020684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC101882 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle amine transport protein 1 homolog (T californica), mRNA (cDNA clone MGC:124668 IMAGE:7929680), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89166291:89172512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT012205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012514 // RefSeq // Rattus norvegicus breast cancer 1, early onset (Brca1), mRNA. // chr10 // 96 // 96 // 43 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000028109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89193680:89252502:-1 gene:ENSRNOG00000020701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// AF036760 // GenBank // Rattus norvegicus BRCA1 mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 96 // 43 // 45 // 0 /// GENSCAN00000009157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89193716:89240030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NM_001108299 // RefSeq // Rattus norvegicus ets variant 4 (Etv4), mRNA. // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89481284:89496509:-1 gene:ENSRNOG00000020792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC168950 // GenBank // Rattus norvegicus ets variant 4, mRNA (cDNA clone MGC:189257 IMAGE:9022277), complete cds. // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89481884:89669410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001108837 // RefSeq // Rattus norvegicus mesenchyme homeobox 1 (Meox1), mRNA. // chrU // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000028220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89590582:89609632:-1 gene:ENSRNOG00000020803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// GENSCAN00000046126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89481884:89669410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONRATT012220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_030584 // RefSeq // Rattus norvegicus sclerostin (Sost), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89689512:89692559:-1 gene:ENSRNOG00000020805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF326741 // GenBank // Rattus norvegicus sclerostin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89689512:89750839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001173376 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 3 (Dusp3), mRNA. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000055194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89697010:89708826:-1 gene:ENSRNOG00000036798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC169043 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 3, mRNA (cDNA clone MGC:189429 IMAGE:9099479), complete cds. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT012222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89689512:89750839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_053668 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 3 (MAGUK p55 subfamily member 3) (Mpp3), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000028264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89722766:89751677:-1 gene:ENSRNOG00000033653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// FQ211573 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YB08 mRNA sequence. // chr10 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89689512:89750839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT012227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT012224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_053513 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 2 (MAGUK p55 subfamily member 2) (Mpp2), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247435 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 2 (MAGUK p55 subfamily member 2) (Mpp2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000055190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89789505:89819927:-1 gene:ENSRNOG00000020850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF087696 // GenBank // Rattus norvegicus dlg 2 mRNA, partial cds. // chr10 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// FQ211962 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YA19 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89788089:89813631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_012626 // RefSeq // Rattus norvegicus pancreatic polypeptide (Ppy), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89831063:89832358:-1 gene:ENSRNOG00000020874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M13588 // GenBank // Rat prepropancreatic polypeptide mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89831167:89831769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT012235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034080 // RefSeq // Rattus norvegicus peptide YY (mapped) (Pyy), mRNA. // chr10 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// XM_006247287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptide YY (mapped) (Pyy), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89837474:89838593:-1 gene:ENSRNOG00000020877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AB238226 // GenBank // Rattus norvegicus Pyy mRNA for peptide YY, complete cds. // chr10 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89837626:89838100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT012236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191650 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 101 (Tmem101), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89879760:89883460:-1 gene:ENSRNOG00000020887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89880584:89883416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001105843 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM12 homolog (S. cerevisiae) (Lsm12), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89892925:89914903:-1 gene:ENSRNOG00000020894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89895612:89914851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
NM_053450 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 5 (Hdac5), mRNA. // chr10 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000055187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89927486:89938344:-1 gene:ENSRNOG00000020905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000030196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89927573:89954052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT012241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT012242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1
FQ214626 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YO08 mRNA sequence. // chr10 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0
XM_006247470 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 3 (Atxn7l3), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_213493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 3 (Atxn7l3), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:90023643:90026969:-1 gene:ENSRNOG00000020930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90023643:90028463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001105723 // RefSeq // Rattus norvegicus upstream binding transcription factor, RNA polymerase I (Ubtf), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NM_001127690 // RefSeq // Rattus norvegicus upstream binding transcription factor, RNA polymerase I (Ubtf), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000048418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90038146:90051350:-1 gene:ENSRNOG00000020937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000064283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90038146:90051350:-1 gene:ENSRNOG00000020937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// FQ224307 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA6YN07 mRNA sequence. // chr10 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// M61726 // GenBank // Rat transcription factor UBF1 mRNA. // chr10 // 95 // 91 // 40 // 42 // 0 /// NONRATT012246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT012247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT012248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000030224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90038839:90097287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 83 // 83 // 38 // 46 // 1 /// NONRATT012250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONRATT012251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
AY030082 // GenBank // Rattus norvegicus band 3 anion exchange protein mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 79 // 30 // 34 // 0 /// BC085748 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93554 IMAGE:7126960), complete cds. // chr10 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// NM_012651 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4 (anion exchanger), member 1 (Slc4a1), mRNA. // chr10 // 95 // 95 // 41 // 43 // 1 /// ENSRNOT00000028445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90084741:90101181:-1 gene:ENSRNOG00000020951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 95 // 41 // 43 // 1 /// NONRATT012255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT012257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000030224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90038839:90097287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1
XM_002727821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A2 (Fam171a2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A2 (Fam171a2), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028563 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:90172344:90181848:-1 gene:ENSRNOG00000021041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90172344:90181848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT012269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT012270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT012274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_001063315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha 2B (Itga2b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000036112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90190068:90199099:-1 gene:ENSRNOG00000022071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000055179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90186663:90203600:-1 gene:ENSRNOG00000022071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90186663:90244581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_006220851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006220852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006220853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006220852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006220853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006247477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain containing 8 (Gpatch8), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000050474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90212055:90225094:-1 gene:ENSRNOG00000021044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000030225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90186663:90244581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001100728 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 43 (Ccdc43), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90434924:90447114:-1 gene:ENSRNOG00000002748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90436512:90447090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT012286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
ENSRNOT00000055176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90705843:90752820:-1 gene:ENSRNOG00000002818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC089941 // GenBank // Rattus norvegicus elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7311384), partial cds. // chr10 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000052062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90706139:90757085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_017009 // RefSeq // Rattus norvegicus glial fibrillary acidic protein (Gfap), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90766345:90771847:-1 gene:ENSRNOG00000002919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90763149:90771847:-1 gene:ENSRNOG00000002919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC088851 // GenBank // Rattus norvegicus glial fibrillary acidic protein, mRNA (cDNA clone MGC:105466 IMAGE:7315338), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// EF094476 // GenBank // Rattus norvegicus glial fibrillary acidic protein beta (Gfap) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// U03700 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley glial fibrillary acidic protein mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// EF094477 // GenBank // Rattus norvegicus glial fibrillary acidic protein epsilon (Gfap) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT012295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90764544:90791909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT012298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT012297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001039019 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 18B (Kif18b), mRNA. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006247505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 18B (Kif18b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000032339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90780845:90800011:-1 gene:ENSRNOG00000021713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099126 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin family member 18B, mRNA (cDNA clone MGC:116269 IMAGE:7455959), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90764544:90791909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001108838 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent-like 1 (C1ql1), mRNA. // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000003986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90812551:90819723:-1 gene:ENSRNOG00000002963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90813010:90873192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007724 // RefSeq // Rattus norvegicus dephospho-CoA kinase domain containing (Dcakd), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dephospho-CoA kinase domain containing (Dcakd), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90867138:90889424:-1 gene:ENSRNOG00000021682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079186 // GenBank // Rattus norvegicus dephospho-CoA kinase domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:94233 IMAGE:7131172), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90813010:90873192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT012305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT012306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001105845 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, delta 3 (Plcd3), mRNA. // chr10 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// XM_006247495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, delta 3 (Plcd3), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// XM_006247497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, delta 3 (Plcd3), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:90937143:90957990:-1 gene:ENSRNOG00000003033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:90937625:90957906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
XM_002724570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG33642-like (LOC100361655), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_002727823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG33642-like (LOC100361655), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006220860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG33642-like (LOC100361655), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG33642-like (LOC100361655), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG33642-like (LOC100361655), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004356 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:91052450:91056568:-1 gene:ENSRNOG00000003266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91052466:91066790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT012310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT012311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001005531 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 32 (Spata32), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91062288:91073123:-1 gene:ENSRNOG00000003275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF473841 // GenBank // Rattus norvegicus vitamin A-deficient testicular protein 1-like mRNA, partial sequence. // chr10 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91052466:91066790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT012312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001108301 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 14 (Map3k14), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91074396:91121436:-1 gene:ENSRNOG00000003278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91075688:91098372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT012313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1
NM_198759 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 27 (Arhgap27), mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 27 (Arhgap27), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006247525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 27 (Arhgap27), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91186347:91214912:-1 gene:ENSRNOG00000028569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AY394725 // GenBank // Rattus norvegicus CIN85-associated multi-domain containing RhoGAP 1 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91186347:91198591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001009677 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 1 (Plekhm1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000037147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91219140:91267042:-1 gene:ENSRNOG00000028521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC087058 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family M (with RUN domain) member 1, mRNA (cDNA clone MGC:94075 IMAGE:7124252), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91212672:91252864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_006220861 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 37A (Lrrc37a), mRNA. // chr10 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// XM_006247549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat-containing protein 37A2-like (LOC102552016), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066453 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:91311630:91348035:-1 gene:ENSRNOG00000042025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91304801:91348017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0
ENSRNOT00000043156 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:91377230:91433099:-1 gene:ENSRNOG00000042833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// BC101875 // GenBank // Rattus norvegicus proline-rich protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:5620885), partial cds. // chrU // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// M86514 // GenBank // Rat proline-rich protein mRNA, 3 end. // chrU // 95 // 59 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91377331:91467123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 73 // 73 // 27 // 37 // 1 /// NONRATT012326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_001135833 // RefSeq // Rattus norvegicus lysozyme-like 6 (Lyzl6), mRNA. // chr10 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000004650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91461088:91465885:-1 gene:ENSRNOG00000003501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91377331:91467123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_031685 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi SNAP receptor complex member 2 (Gosr2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91503272:91522573:-1 gene:ENSRNOG00000003506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF007549 // GenBank // Rattus norvegicus golgi SNARE (GS27) mRNA, complete cds. // chr10 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// BC061994 // GenBank // Rattus norvegicus golgi SNAP receptor complex member 2, mRNA (cDNA clone MGC:72394 IMAGE:5599557), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U91539 // GenBank // Rattus norvegicus membrin mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91504694:91515947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001107055 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 9B (Wnt9b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 9B (Wnt9b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000005074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91552385:91574275:-1 gene:ENSRNOG00000003807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91555914:91566900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_021748 // RefSeq // Rattus norvegicus N-ethylmaleimide-sensitive factor (Nsf), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000006361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:91645027:91751625:-1 gene:ENSRNOG00000003905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// AF142097 // GenBank // Rattus norvegicus N-ethylmaleimide sensitive factor (ERG1) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AF189019 // GenBank // Rattus norvegicus N-ethylmaleimide sensitive factor (NSF) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// FQ211783 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YC15 mRNA sequence. // chr10 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000005604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91727443:91751551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT012340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000005598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:91642067:91710639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 59 // 59 // 24 // 41 // 1
XM_003752389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 (Kansl1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006220864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 (Kansl1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006220866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 (Kansl1), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006220869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 (Kansl1), transcript variant X8, mRNA. // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006247551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KAT8 regulatory NSL complex subunit 1 (Kansl1), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007324 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:92150853:92236188:-1 gene:ENSRNOG00000005544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000049908 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:92172794:92236188:-1 gene:ENSRNOG00000005544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000064941 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:92172794:92236188:-1 gene:ENSRNOG00000005544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:92150853:92201521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT012348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001024793 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 27 (Cdc27), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000007963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:92316648:92364397:-1 gene:ENSRNOG00000005904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC097475 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 27 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114540 IMAGE:7457819), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000056533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:92281090:92355109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT012353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1 /// NONRATT012354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
ENSRNOT00000043327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:92539147:92543009:-1 gene:ENSRNOG00000029597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:92539149:92545777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY310152 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1261 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000029418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93159138:93160489:-1 gene:ENSRNOG00000027615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93130846:93160976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
NM_001013973 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 10, E3 ubiquitin protein ligase (March10), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 10, E3 ubiquitin protein ligase (March10), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93350039:93438439:-1 gene:ENSRNOG00000007084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB552845 // GenBank // Rattus norvegicus March10 mRNA for microtubule-associated E3 ubiquitin ligase isoform 1, complete cds. // chr10 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// AB552846 // GenBank // Rattus norvegicus March10 mRNA for microtubule-associated E3 ubiquitin ligase isoform 2, complete cds. // chr10 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// BC083567 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 190, mRNA (cDNA clone MGC:93665 IMAGE:7112851), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93351071:93398821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT012364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT012366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_001107056 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b-561 (Cyb561), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:93889863:93896347:-1 gene:ENSRNOG00000007433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169069 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b-561, mRNA (cDNA clone MGC:189469 IMAGE:5623837), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT012370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:93891549:93915370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001025715 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain containing 2 (Limd2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain containing 2 (Limd2), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94099477:94101550:-1 gene:ENSRNOG00000025448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098855 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:112915 IMAGE:7379878), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ226340 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YI11 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ231491 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YE18 mRNA sequence. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT012373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94100112:94155237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_182820 // RefSeq // Rattus norvegicus STE20-related kinase adaptor alpha (Strada), mRNA. // chr10 // 94 // 85 // 33 // 35 // 0 /// XM_006247589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus STE20-related kinase adaptor alpha (Strada), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 97 // 80 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94104054:94113609:-1 gene:ENSRNOG00000008637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 76 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000055125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94104054:94133270:-1 gene:ENSRNOG00000008637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 85 // 34 // 35 // 0 /// AY327409 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase LYK5 (Lyk5) mRNA, complete cds. // chr10 // 94 // 85 // 33 // 35 // 0 /// BC081911 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase LYK5, mRNA (cDNA clone MGC:93856 IMAGE:7111907), complete cds. // chr10 // 95 // 93 // 36 // 38 // 0 /// NONRATT012376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT012377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT012378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 93 // 93 // 38 // 41 // 1 /// GENSCAN00000017373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94100112:94155237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// NONRATT012379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 29 // 41 // 1 /// NONRATT012380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1
NM_001013974 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 47 (Ccdc47), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000012533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94139732:94158251:-1 gene:ENSRNOG00000009006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC085824 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 47, mRNA (cDNA clone MGC:94138 IMAGE:7127239), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000017373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94100112:94155237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_001012014 // RefSeq // Rattus norvegicus FtsJ homolog 3 (E. coli) (Ftsj3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94190363:94196805:-1 gene:ENSRNOG00000009857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC086512 // GenBank // Rattus norvegicus FtsJ homolog 3 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:105896 IMAGE:7133710), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94190679:94196658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_031983 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 2 (Smarcd2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94203168:94212034:-1 gene:ENSRNOG00000010557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062063 // GenBank // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily d, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:72377 IMAGE:5599204), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94204062:94211949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT012390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001034848 // RefSeq // Rattus norvegicus growth hormone 1 (Gh1), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94237415:94239390:-1 gene:ENSRNOG00000011207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166872 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone 1, mRNA (cDNA clone MGC:188794 IMAGE:6922077), complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC168778 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6922196. // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// U62779 // GenBank // Rattus norvegicus presomatotropin mRNA, complete cds. // chr10 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94237513:94239330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT012396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_133533 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd79b molecule, immunoglobulin-associated beta (Cd79b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94248658:94251801:-1 gene:ENSRNOG00000011917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088115 // GenBank // Rattus norvegicus Cd79b molecule, immunoglobulin-associated beta, mRNA (cDNA clone MGC:108607 IMAGE:7325406), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ232790 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YG17 mRNA sequence. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94249160:94251743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_013178 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type IV, alpha subunit (Scn4a), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94256236:94305849:-1 gene:ENSRNOG00000012134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M26643 // GenBank // Rat skeletal muscle voltage-sensitive sodium channel alpha subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94257223:94289664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007725 // RefSeq // Rattus norvegicus intercellular adhesion molecule 2 (Icam2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247623 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intercellular adhesion molecule 2 (Icam2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000035474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94317975:94324597:-1 gene:ENSRNOG00000025143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079465 // GenBank // Rattus norvegicus intercellular adhesion molecule 2, mRNA (cDNA clone MGC:95023 IMAGE:7122370), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ231566 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YA10 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT012403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT012404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000033001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94292742:94322395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001191926 // RefSeq // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum to nucleus signaling 1 (Ern1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000017371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94340405:94400743:-1 gene:ENSRNOG00000012864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000033006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94340461:94429757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0
NM_001107060 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), gamma 2, accessory subunit (Polg2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94714852:94724570:-1 gene:ENSRNOG00000013728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94714955:94724570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT012416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001007613 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 5 (Ddx5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94726628:94734161:-1 gene:ENSRNOG00000030680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079036 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 5, mRNA (cDNA clone MGC:93965 IMAGE:7114313), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94726930:94746141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT012421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107061 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 (Smurf2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94763750:94819535:-1 gene:ENSRNOG00000014623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107061 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 2 (Smurf2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:94763750:94819535:-1 gene:ENSRNOG00000014623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000011388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94766372:94835650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
ENSRNOT00000073484 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:95128388:95146244:-1 gene:ENSRNOG00000050504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 28 // 12 // 12 // 0 /// XM_003752392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar protein 11 (Nol11), mRNA. // chr10 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// ENSRNOT00000071743 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:95128388:95146244:-1 gene:ENSRNOG00000050504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// GENSCAN00000011386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:94990821:95110732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:95128388:95146244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT012436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// NONRATT012444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1
XM_002724573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, cytoplasmic 1 (Pitpnc1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006220881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, cytoplasmic 1 (Pitpnc1), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021493 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:95213010:95298724:-1 gene:ENSRNOG00000015683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000021498 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:95176728:95298724:-1 gene:ENSRNOG00000015683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// XM_002724573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, cytoplasmic 1 (Pitpnc1), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:95171418:95239499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_019255 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 1 (Cacng1), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:95655314:95668486:-1 gene:ENSRNOG00000003245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ224130 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA75YN01 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:95655764:95668305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080692 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 4 (Cacng4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:95688305:95746619:-1 gene:ENSRNOG00000003262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF361341 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit (Cacng4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:95688305:95728840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT012452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080693 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 5 (Cacng5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:95855859:95862665:-1 gene:ENSRNOG00000003288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF361342 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit (Cacng5) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:95838172:95899324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001105713 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, alpha (Prkca), mRNA. // chr10 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000004699 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:95919265:96311060:-1 gene:ENSRNOG00000003491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:95919265:96311060:-1 gene:ENSRNOG00000003491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// BC169007 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:189368 IMAGE:7387040), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000024271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:95920536:95967363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT012455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000005036 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:97203491:97204143:-1 gene:ENSRNOG00000003791 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr10 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000043082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97203491:97204143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0
XM_006247653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor-like (RGD1565459), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000042056 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:97220705:97221073:-1 gene:ENSRNOG00000033613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97220705:97221073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_019224 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 9 (Rgs9), mRNA. // chr10 // 100 // 98 // 86 // 86 // 0 /// ENSRNOT00000005076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:97225541:97298645:-1 gene:ENSRNOG00000003800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 86 // 86 // 0 /// AB019145 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for regulator of G-protein signaling 9 (RGS9), complete cds. // chr10 // 100 // 98 // 86 // 86 // 0 /// AF038006 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signalling 9 (rgs9) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 76 // 76 // 0 /// AF071475 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 9L (RGS9) mRNA, alternatively spliced long form, complete cds. // chr10 // 100 // 98 // 86 // 86 // 0 /// GENSCAN00000043063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97225807:97236073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 33 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 88 // 88 // 0 /// NONRATT012462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 48 // 88 // 1 /// GENSCAN00000006212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97240816:97340973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 49 // 49 // 43 // 88 // 1 /// NONRATT012463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 16 // 16 // 14 // 88 // 1 /// NONRATT012464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 10 // 10 // 9 // 88 // 1 /// NONRATT012465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 18 // 18 // 16 // 88 // 1 /// NONRATT012467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 11 // 11 // 10 // 88 // 1
NM_001047877 // RefSeq // Rattus norvegicus arylsulfatase G (Arsg), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006247599 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylsulfatase G (Arsg), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006247607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylsulfatase G (Arsg), transcript variant X9, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:97497927:97577194:1 gene:ENSRNOG00000003931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97517186:97539582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT010057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97555467:97577194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT010058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001014121 // RefSeq // Rattus norvegicus archaelysin family metallopeptidase 2 (Amz2), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006247629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus archaelysin family metallopeptidase 2 (Amz2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:97435124:97445659:1 gene:ENSRNOG00000000246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC085886 // GenBank // Rattus norvegicus archaelysin family metallopeptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94672 IMAGE:7192275), complete cds. // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT010051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97435329:97458845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT010052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT010053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001013119 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 13 (Gna13), mRNA. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:97371692:97404295:1 gene:ENSRNOG00000036745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// AY553631 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY Galpha13 mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AY553632 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR Galpha13 mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// DQ120481 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY guanine nucleotide binding protein alpha 13 (Gna13) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// DQ120482 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR guanine nucleotide binding protein alpha 13 (Gna13) mRNA, complete cds. // chr10 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97353616:97404295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001012237 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 20, member A (Fam20a), mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000005367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:97677360:97731346:-1 gene:ENSRNOG00000003969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006247610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 20, member A (Fam20a), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97677360:97731346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT012480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001134497 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1559578 (RGD1559578), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:97804613:97838277:-1 gene:ENSRNOG00000024233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97792754:97809389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97811307:97865214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006221030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 8 (Abca8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006247661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 8 (Abca8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005489 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:97950653:98008559:-1 gene:ENSRNOG00000004040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000064334 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:97950653:98008559:-1 gene:ENSRNOG00000004040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:97950653:98020737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT012484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001281824 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 8a (Abca8a), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:98033537:98098568:-1 gene:ENSRNOG00000004147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000065947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:98033537:98099024:-1 gene:ENSRNOG00000004147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000006647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:98034153:98067496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:98075735:98172514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT012486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1
NM_173307 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 5 (Abca5), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000005848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:98282739:98351500:-1 gene:ENSRNOG00000004378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000075561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:98311348:98351500:-1 gene:ENSRNOG00000004378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:98238638:98341684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
ENSRNOT00000054374 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:10:101370357:101370422:-1 gene:ENSRNOG00000036251 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT012504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// rno-mir-297 // miRBase Micro RNA Database // MI0000968 Rattus norvegicus miR-297 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_001034958 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 104, member A (Fam104a), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 104, member A (Fam104a), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:101859027:101879775:-1 gene:ENSRNOG00000002851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC087161 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC619573, mRNA (cDNA clone IMAGE:7135056). // chr10 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC105876 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 104, member A, mRNA (cDNA clone MGC:125039 IMAGE:7129874), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006220890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 4-like (Cpsf4l), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000052406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:101895097:101902722:-1 gene:ENSRNOG00000024772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:101896928:101906618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001107063 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:101923477:101947679:-1 gene:ENSRNOG00000028946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161986 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4, mRNA (cDNA clone MGC:187805 IMAGE:9030824), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:101925055:101926107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001107063 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// XM_006247688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// XM_006247690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4 (Cdc42ep4), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000048264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:101923477:101947679:-1 gene:ENSRNOG00000028946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC161986 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42 effector protein (Rho GTPase binding) 4, mRNA (cDNA clone MGC:187805 IMAGE:9030824), complete cds. // chr10 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT012515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001108303 // RefSeq // Rattus norvegicus sidekick cell adhesion molecule 2 (Sdk2), mRNA. // chr10 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000065145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:101978490:102096741:-1 gene:ENSRNOG00000024711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000029683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:101971393:102170214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0
NM_001134534 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 17 (Btbd17), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 17 (Btbd17), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:102991771:102998271:-1 gene:ENSRNOG00000003109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:102992899:102998544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001168284 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to dendritic cell-derived immunoglobulin(Ig)-like receptor 1, DIgR1 - mouse (RGD1561778), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GU138868 // GenBank // Rattus norvegicus immune activating receptor CD300d2 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000074003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103233780:103288517:-1 gene:ENSRNOG00000046216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// NONRATT012531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 82 // 82 // 9 // 11 // 1
NM_001202463 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd300 molecule-like family member E (Cd300le), mRNA. // chr10 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104711559:104720782:1 gene:ENSRNOG00000042825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// HQ263411 // GenBank // Rattus norvegicus immune CD300 receptor (Clm3) mRNA, complete cds. // chr10 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104698651:104718936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT010194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001166577 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd300e molecule (Cd300e), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104693265:104701139:1 gene:ENSRNOG00000036726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GU057983 // GenBank // Rattus norvegicus strain W CD300e (Cd300e) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104698651:104718936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0
NM_001025111 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd300 molecule-like family member F (Cd300lf), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000039284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104617431:104633280:1 gene:ENSRNOG00000021424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC093593 // GenBank // Rattus norvegicus CD300 molecule-like family member f, mRNA (cDNA clone MGC:105599 IMAGE:7314621), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GU057984 // GenBank // Rattus norvegicus strain W CD300f (Cd300f) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GU062903 // GenBank // Rattus norvegicus strain W CD300f splice variant 1 (Cd300f) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 95 // 61 // 18 // 19 // 0 /// HQ263412 // GenBank // Rattus norvegicus CD300f splice variant 2 (Cd300lf) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr10 // 84 // 61 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000042203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104617484:104648860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT010191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_001134835 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 9 (GCN5-related, putative) (Nat9), mRNA. // chr10 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// XM_006247713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetyltransferase 9 (GCN5-related, putative) (Nat9), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetyltransferase 9 (GCN5-related, putative) (Nat9), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104566822:104571582:1 gene:ENSRNOG00000003264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC158710 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 9 (GCN5-related, putative), mRNA (cDNA clone MGC:187835 IMAGE:9035021), complete cds. // chr10 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// FQ213596 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YN12 mRNA sequence. // chr10 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104566644:104573113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
M91563 // GenBank // Rattus norvegicus NMDA receptor subtype 2C mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// U08259 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR2C subunit mRNA, complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NM_012575 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 2C (Grin2c), mRNA. // chr10 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000004477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104480212:104497817:1 gene:ENSRNOG00000003280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// GENSCAN00000042234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104485767:104497544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_024153 // RefSeq // Rattus norvegicus ferredoxin reductase (Fdxr), mRNA. // chr10 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000004592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104468583:104477286:1 gene:ENSRNOG00000003387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC088844 // GenBank // Rattus norvegicus ferredoxin reductase, mRNA (cDNA clone MGC:105420 IMAGE:7308634), complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// D63761 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for adrenodoxin reductase, complete cds. // chr10 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000042239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104443255:104477000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 94 // 29 // 34 // 0 /// NONRATT010184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0
NM_001107064 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid desaturase 6 (Fads6), mRNA. // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000029001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104447218:104462044:1 gene:ENSRNOG00000021380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT010180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104443255:104477000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001105850 // RefSeq // Rattus norvegicus Usher syndrome 1G (Ush1g), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104422767:104426636:1 gene:ENSRNOG00000028456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104422770:104426632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006247774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HID1 domain containing (Hid1), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000004718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104372280:104391897:1 gene:ENSRNOG00000003464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000042246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104372280:104391897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_019383 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit d (Atp5h), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC059139 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit d, mRNA (cDNA clone MGC:72861 IMAGE:6921557), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC078846 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit d, mRNA (cDNA clone MGC:93491 IMAGE:7133871), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// D10021 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for subunit d of mitochondrial H-ATP synthase, complete cds. // chr10 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// D13120 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP synthase subunit d, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104308188:104314450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000004836 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:104308188:104311283:1 gene:ENSRNOG00000003626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0 /// NONRATT010170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0 /// NONRATT010172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0
NM_001271189 // RefSeq // Rattus norvegicus 5, 3-nucleotidase, cytosolic (Nt5c), mRNA. // chrU // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// FQ227491 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YC16 mRNA sequence. // chrU // 79 // 76 // 15 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104226190:104227156:1 gene:ENSRNOG00000003650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT010167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT010168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001005876 // RefSeq // Rattus norvegicus hematological and neurological expressed 1 (Hn1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000004862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104204896:104222931:1 gene:ENSRNOG00000003661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC079311 // GenBank // Rattus norvegicus hematological and neurological expressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:94456 IMAGE:7134794), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT010166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NONRATT056152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT056153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000053092 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:54235952:54236020:1 gene:ENSRNOG00000045722 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr10 // 53 // 56 // 10 // 19 // 0 /// NONRATT027584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 74 // 100 // 25 // 34 // 0 /// FQ227960 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YB07 mRNA sequence. // chr10 // 36 // 97 // 12 // 33 // 0 /// NONRATT007950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 100 // 13 // 34 // 0 /// NONRATT048207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 36 // 97 // 12 // 33 // 0
NM_133594 // RefSeq // Rattus norvegicus small ubiquitin-like modifier 2 (Sumo2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058446 // GenBank // Rattus norvegicus SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72702 IMAGE:6921523), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078746 // GenBank // Rattus norvegicus SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93211 IMAGE:7125132), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L79949 // GenBank // Rattus norvegicus MIF2 suppressor (SMT3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19767450:19768442:1 gene:ENSRNOG00000032840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004867 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:104184695:104194896:1 gene:ENSRNOG00000003670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104165538:104194896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19755077:19767845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// NONRATT042579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0
NM_001108304 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3 (Gga3), mRNA. // chr10 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// XM_006247719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3 (Gga3), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006247720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3 (Gga3), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104124628:104143981:1 gene:ENSRNOG00000027057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104129608:104142449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT010158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT010160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_001014122 // RefSeq // Rattus norvegicus MIF4G domain containing (Mif4gd), mRNA. // chr10 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104117570:104122031:1 gene:ENSRNOG00000003837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// BC079310 // GenBank // Rattus norvegicus MIF4G domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:94454 IMAGE:7134761), complete cds. // chr10 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// FQ227422 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YG11 mRNA sequence. // chr10 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT010156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT010153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// GENSCAN00000014258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104105781:104121544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT010154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT010155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT010157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001007674 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier), member 19 (Slc25a19), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000005292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104101681:104114606:1 gene:ENSRNOG00000003918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC079002 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier), member 19, mRNA (cDNA clone MGC:93911 IMAGE:7112815), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000014258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104105781:104121544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// NONRATT010151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
D49846 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ash-m, complete cds. // chr10 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// D49847 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ash-s, complete cds. // chr10 // 80 // 36 // 8 // 10 // 0 /// FQ220840 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YI04 mRNA sequence. // chr10 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// NM_030846 // RefSeq // Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 2 (Grb2), mRNA. // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000005347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104019958:104087249:1 gene:ENSRNOG00000003990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// BC091144 // GenBank // Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:108668 IMAGE:7382476), complete cds. // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// FQ229940 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YC18 mRNA sequence. // chr10 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT010146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT010148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104053020:104085511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT010149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001107065 // RefSeq // Rattus norvegicus cask-interacting protein 2 (Caskin2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103927770:103941924:1 gene:ENSRNOG00000004310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103929424:103941181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT010143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT010144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001105853 // RefSeq // Rattus norvegicus RecQ protein-like 5 (Recql5), mRNA. // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000007246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103802523:103841703:1 gene:ENSRNOG00000005107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000014236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103836989:103841268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 54 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103803071:103821675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT010141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT010142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
NM_001008282 // RefSeq // Rattus norvegicus galactokinase 1 (Galk1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103720846:103725036:1 gene:ENSRNOG00000006359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085919 // GenBank // Rattus norvegicus galactokinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94825 IMAGE:7108618), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ227887 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YG10 mRNA sequence. // chr10 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103723207:103724919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT010138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT010140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000028186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103716334:103723015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_053985 // RefSeq // Rattus norvegicus H3 histone, family 3B (H3f3b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000050223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103709482:103711708:1 gene:ENSRNOG00000006532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC063159 // GenBank // Rattus norvegicus H3 histone, family 3B, mRNA (cDNA clone MGC:72729 IMAGE:6921452), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC078759 // GenBank // Rattus norvegicus H3 histone, family 3B, mRNA (cDNA clone MGC:93264 IMAGE:7112262), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT010136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT010137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_138844 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-13 homolog D (C. elegans) (Unc13d), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006247702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus unc-13 homolog D (C. elegans) (Unc13d), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000010466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103656707:103671443:1 gene:ENSRNOG00000007439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF159356 // GenBank // Rattus norvegicus Munc13-4 protein (Munc13-4) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103644186:103670878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT010133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_138975 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain binding protein 2 (Wbp2), mRNA. // chr10 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103647548:103654798:1 gene:ENSRNOG00000007971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF499026 // GenBank // Rattus norvegicus WW-domain binding protein 2 (Wbp2) mRNA, complete cds. // chr10 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103644186:103670878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT010129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT010130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT010131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT010132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001109585 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 47 (Trim47), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103626183:103630654:1 gene:ENSRNOG00000008215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103626201:103630403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0
NM_001135714 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 65 (Trim65), mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103604566:103610661:1 gene:ENSRNOG00000024145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// FQ223610 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA91YK03 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103604439:103609671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT010124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT010123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT010125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001009369 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L38 (Mrpl38), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103596443:103603247:1 gene:ENSRNOG00000008256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087096 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L38, mRNA (cDNA clone MGC:94655 IMAGE:7191805), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234232 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YL10 mRNA sequence. // chr10 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103596457:103603099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT010119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT010121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000011560 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:103567053:103592829:1 gene:ENSRNOG00000008577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057781 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:103587766:103592829:1 gene:ENSRNOG00000008577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// FQ210392 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA29YK20 mRNA sequence. // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103545015:103592695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT010116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_017340 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA oxidase 1, palmitoyl (Acox1), mRNA. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103537778:103562620:1 gene:ENSRNOG00000008755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:103537778:103562620:1 gene:ENSRNOG00000008755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC085743 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-Coenzyme A oxidase 1, palmitoyl, mRNA (cDNA clone MGC:93508 IMAGE:7109722), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// J02752 // GenBank // Rat acyl-coA oxidase mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT010113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:103545015:103592695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001107066 // RefSeq // Rattus norvegicus envoplakin (Evpl), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000012373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104768346:104784686:-1 gene:ENSRNOG00000009343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000053566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104757706:104784610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT012600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001108840 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle 68 (Srp68), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104791135:104818559:-1 gene:ENSRNOG00000009351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC166787 // GenBank // Rattus norvegicus signal recognition particle 68, mRNA (cDNA clone MGC:188569 IMAGE:7935892), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028875 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:104880915:104893428:-1 gene:ENSRNOG00000047119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000053555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104791665:104809830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104880126:104884590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT012602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_022691 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 7 (Exoc7), mRNA. // chr10 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000013281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104907102:104924686:-1 gene:ENSRNOG00000009617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000068050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104831561:104851422:-1 gene:ENSRNOG00000046594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// AF032667 // GenBank // Rattus norvegicus rexo70 mRNA, complete cds. // chr10 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0 /// FQ231273 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA73YD10 mRNA sequence. // chr10 // 98 // 89 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000053557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104832342:104851542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000053559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104907102:104924742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0
XM_006220926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamine rich 2 (Qrich2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000034817 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:105061252:105074065:-1 gene:ENSRNOG00000025254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072644 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:105061252:105074065:-1 gene:ENSRNOG00000025254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105062041:105088426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT012607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_022545 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase-associated protein 1 (Prpsap1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000013573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105092064:105113772:-1 gene:ENSRNOG00000010083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC078822 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoribosyl pyrophosphate synthetase-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93436 IMAGE:7128451), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// D26073 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphoribosylpyrophosphate synthetase-associated protein (39 kDa), complete cds. // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105092439:105147556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT012610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT012613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
XM_221132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2O (Ube2o), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000014699 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:105170740:105216698:-1 gene:ENSRNOG00000011007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000053547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105170740:105216710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT012619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_001107067 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid 5 homolog 2 (Drosophila) (Rhbdf2), transcript variant 1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_001270834 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid 5 homolog 2 (Drosophila) (Rhbdf2), transcript variant 2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_358005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhomboid 5 homolog 2 (Drosophila) (Rhbdf2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// FQ230904 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA81YA07 mRNA sequence. // chr10 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000068026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105236676:105243042:-1 gene:ENSRNOG00000011459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000025147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105237011:105290479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT012622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT012623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_130744 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoglobin (Cygb), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105280905:105290670:-1 gene:ENSRNOG00000011541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088455 // GenBank // Rattus norvegicus cytoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:95105 IMAGE:7127197), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105237011:105290479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT012624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001031652 // RefSeq // Rattus norvegicus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 2 (St6galnac2), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105313763:105331475:-1 gene:ENSRNOG00000012083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099812 // GenBank // Rattus norvegicus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:124782 IMAGE:7929942), complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT012626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105314606:105334949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT012630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001105859 // RefSeq // Rattus norvegicus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 1 (St6galnac1), mRNA. // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105374445:105384844:-1 gene:ENSRNOG00000000251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105375216:105388412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_001012143 // RefSeq // Rattus norvegicus jumonji domain containing 6 (Jmjd6), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_358006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus jumonji domain containing 6 (Jmjd6), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105440306:105446356:-1 gene:ENSRNOG00000000250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079012 // GenBank // Rattus norvegicus jumonji domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:93932 IMAGE:7113380), complete cds. // chr10 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105440506:105454348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT012640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT012636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT012638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT012639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001009720 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 2 (Srsf2), mRNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XR_358009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 2 (Srsf2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XR_358010 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 2 (Srsf2), transcript variant X3, misc_RNA. // chr10 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:105451332:105454511:-1 gene:ENSRNOG00000000248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC058508 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine-rich 2, mRNA (cDNA clone MGC:73009 IMAGE:6889746), complete cds. // chr10 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105440506:105454348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT012645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT012646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
GENSCAN00000010605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:105736528:105740685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_053565 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 3 (Socs3), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:106612942:106613619:-1 gene:ENSRNOG00000002946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AF075383 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling-3 (SOCS-3) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:106612942:106624092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT012653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003752463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein, axonemal, heavy chain 17 (Dnah17), mRNA. // chr10 // 99 // 100 // 78 // 79 // 0 /// ENSRNOT00000004035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:106667437:106770733:-1 gene:ENSRNOG00000003028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 63 // 63 // 0 /// ENSRNOT00000004047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:106667437:106770733:-1 gene:ENSRNOG00000003028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 63 // 63 // 0 /// GENSCAN00000001995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:106667437:106715085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 41 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:106716062:106794614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 58 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT012654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 81 // 64 // 64 // 0
NM_021989 // RefSeq // Rattus norvegicus TIMP metallopeptidase inhibitor 2 (Timp2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:106973463:107021070:-1 gene:ENSRNOG00000003148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC084714 // GenBank // Rattus norvegicus TIMP metallopeptidase inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:105282 IMAGE:7303706), complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// L31884 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metalloproteinase inhibitor (TIMP-2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// U14526 // GenBank // Rattus norvegicus tissue inhibitor of metalloproteinases-2 mRNA (TIMP-2) mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:106974334:107020943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001017481 // RefSeq // Rattus norvegicus differential display clone 8 (Ddc8), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247814 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus differential display clone 8 (Ddc8), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus differential display clone 8 (Ddc8), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus differential display clone 8 (Ddc8), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006247817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus differential display clone 8 (Ddc8), transcript variant X4, mRNA. // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000046213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:106998509:107011643:-1 gene:ENSRNOG00000033143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079213 // GenBank // Rattus norvegicus differential display clone 8, mRNA (cDNA clone MGC:94275 IMAGE:7131836), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:106974334:107020943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT012661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139096 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 3 binding protein (Lgals3bp), mRNA. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107050332:107059670:-1 gene:ENSRNOG00000003217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF065438 // GenBank // Rattus norvegicus mama mRNA, complete cds. // chr10 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AY552591 // GenBank // Rattus norvegicus 90K protein precursor mRNA, complete cds. // chr10 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// BC081724 // GenBank // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 3 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:93166 IMAGE:7123606), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107050603:107059660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT012673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_144754 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium activated nucleotidase 1 (Cant1), mRNA. // chr10 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// XM_006247791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium activated nucleotidase 1 (Cant1), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107067504:107080520:-1 gene:ENSRNOG00000003239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC097279 // GenBank // Rattus norvegicus calcium activated nucleotidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:114258 IMAGE:7443057), complete cds. // chr10 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107068887:107082477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT012674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT012675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0
NM_001134498 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding protein, fox-1 homolog (C. elegans) 3 (Rbfox3), mRNA. // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:107153676:107174397:-1 gene:ENSRNOG00000003386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:107151496:107185438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// NONRATT012680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_153735 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal pentraxin I (Nptx1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108290473:108295779:-1 gene:ENSRNOG00000003741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108290473:108295779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// U18772 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal pentraxin precursor mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
GENSCAN00000001056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108330188:108354243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT012690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_001168703 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis-associated tyrosine kinase (Aatk), mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006247927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apoptosis-associated tyrosine kinase (Aatk), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006247928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apoptosis-associated tyrosine kinase (Aatk), transcript variant X3, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108786271:108822529:-1 gene:ENSRNOG00000004392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108782270:108814162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NR_031783 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-338 (Mir338), microRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-338 // miRBase Micro RNA Database // MI0000618 Rattus norvegicus miR-338 stem-loop // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108310 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 131 (Cep131), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108841399:108865764:-1 gene:ENSRNOG00000004430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108841611:108877549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100729 // RefSeq // Rattus norvegicus ENTH domain containing 2 (Enthd2), mRNA. // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108869255:108876525:-1 gene:ENSRNOG00000028161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108841611:108877549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
ENSRNOT00000006225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108883444:108931638:-1 gene:ENSRNOG00000004604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:108897538:108931638:-1 gene:ENSRNOG00000004604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000068516 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:108903940:108931638:-1 gene:ENSRNOG00000004604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:108883444:109014321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT012704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
XM_001081787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ22175 (RGD1306926), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006220975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ22175 (RGD1306926), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ22175 (RGD1306926), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000054974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109136955:109145928:-1 gene:ENSRNOG00000036699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109134834:109208252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_080577 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear protein localization 4 homolog (S. cerevisiae) (Nploc4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000054973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109148086:109198455:-1 gene:ENSRNOG00000036698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF234600 // GenBank // Rattus norvegicus NPL4 mRNA, complete cds. // chr10 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC101887 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear protein localization 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124575 IMAGE:7930738), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT012722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000031497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109134834:109208252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_022386 // RefSeq // Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (Mafg), mRNA. // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (Mafg), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000054970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109399211:109404375:-1 gene:ENSRNOG00000036697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AB026487 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MafG, complete cds. // chr10 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// AB050011 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MafG-2, complete cds. // chr10 // 82 // 57 // 14 // 17 // 0 /// BC078828 // GenBank // Rattus norvegicus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (avian), mRNA (cDNA clone MGC:93443 IMAGE:7127046), complete cds. // chr10 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000006928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109400132:109414759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT012754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000054960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109313274:109315325:-1 gene:ENSRNOG00000036691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC098826 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7378071. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC158709 // GenBank // Rattus norvegicus similar to BC003940 protein, mRNA (cDNA clone MGC:187832 IMAGE:9034656), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109314080:109320854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 93 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT012725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001105858 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 27 (Ppp1r27), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109320979:109322148:-1 gene:ENSRNOG00000036690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109321207:109322052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT012726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012998 // RefSeq // Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, beta polypeptide (P4hb), mRNA. // chr10 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000054958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109329599:109341105:-1 gene:ENSRNOG00000036689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC061857 // GenBank // Rattus norvegicus prolyl 4-hydroxylase, beta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:72525 IMAGE:5623688), complete cds. // chr10 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000006942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109330480:109341050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT012728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT012729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001007005 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) alpha (Arhgdia), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006247897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) alpha (Arhgdia), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109347156:109350645:-1 gene:ENSRNOG00000036688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083817 // GenBank // Rattus norvegicus Rho GDP dissociation inhibitor (GDI) alpha, mRNA (cDNA clone MGC:94886 IMAGE:7110945), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109348288:109367665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT012732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT012733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001109602 // RefSeq // Rattus norvegicus Aly/REF export factor (Alyref), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000054955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109363929:109367692:-1 gene:ENSRNOG00000036687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109348288:109367665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107073 // RefSeq // Rattus norvegicus sirtuin 7 (Sirt7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006247889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sirtuin 7 (Sirt7), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000054951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109389098:109395794:-1 gene:ENSRNOG00000036683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC167031 // GenBank // Rattus norvegicus sirtuin 7 (silent mating type information regulation 2, homolog) 7 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189272 IMAGE:7099085), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109382037:109395774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006247917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog G (Mafg), transcript variant X6, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT012751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001105857 // RefSeq // Rattus norvegicus pyrroline-5-carboxylate reductase 1 (Pycr1), mRNA. // chr10 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000054949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109411300:109414672:-1 gene:ENSRNOG00000036682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109400132:109414759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT012756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC166873 // GenBank // Rattus norvegicus pyrroline-5-carboxylate reductase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6891529), partial cds. // chr10 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT012757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001128185 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid-associated differentiation marker-like 2 (Myadml2), mRNA. // chr10 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000054948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109419128:109420051:-1 gene:ENSRNOG00000036681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109419128:109420039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT012758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// FQ223679 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA8YB22 mRNA sequence. // chr10 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
BC090016 // GenBank HTC // Rattus norvegicus hypothetical LOC303743, mRNA (cDNA clone IMAGE:7325212). // chr10 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// BC158802 // GenBank HTC // Rattus norvegicus hypothetical LOC303743, mRNA (cDNA clone IMAGE:7321508), with apparent retained intron. // chr10 // 100 // 49 // 19 // 19 // 0 /// NM_001013975 // RefSeq // Rattus norvegicus notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila) (Notum), mRNA. // chr10 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000054947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109425673:109432739:-1 gene:ENSRNOG00000036680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// XM_006247888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus notum pectinacetylesterase homolog (Drosophila) (Notum), transcript variant X2, mRNA. // chr10 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// NONRATT012759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000006916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109421441:109438980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 59 // 59 // 23 // 39 // 1 /// NONRATT012761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1 /// NONRATT012760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 15 // 39 // 1
NM_139060 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 1, delta (Csnk1d), mRNA. // chr10 // 94 // 82 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109736328:109769940:-1 gene:ENSRNOG00000036676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 93 // 71 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000054936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109738952:109769940:-1 gene:ENSRNOG00000036676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 82 // 29 // 31 // 0 /// AB063114 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for casein kinase 1 delta, complete cds. // chr10 // 90 // 82 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109736328:109763498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 90 // 55 // 19 // 21 // 0 /// L07578 // GenBank // Rat casein kinase I delta mRNA, complete cds. // chr10 // 89 // 71 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT012763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// NONRATT012764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 94 // 84 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT012765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_001107074 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd7 molecule (Cd7), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109817153:109820066:-1 gene:ENSRNOG00000036674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167030 // GenBank // Rattus norvegicus Cd7 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:189271 IMAGE:7378211), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233656 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YP20 mRNA sequence. // chr10 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT012767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199082 // RefSeq // Rattus norvegicus secreted and transmembrane 1B (Sectm1b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secreted and transmembrane 1B (Sectm1b), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secreted and transmembrane 1B (Sectm1b), transcript variant X5, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109678029:109846748:-1 gene:ENSRNOG00000036673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC061794 // GenBank // Rattus norvegicus secreted and transmembrane 1B, mRNA (cDNA clone MGC:72571 IMAGE:5597864), complete cds. // chr10 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109838521:109839964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT012768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT012770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001013043 // RefSeq // Rattus norvegicus secreted and transmembrane 1 (Sectm1), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109850608:109861593:-1 gene:ENSRNOG00000036672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078937 // GenBank // Rattus norvegicus secreted and transmembrane 1A, mRNA (cDNA clone MGC:93752 IMAGE:7108345), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109851477:109854375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT012771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109622 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed gene 19.2 (Tex19.2), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006247930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed gene 19.2 (Tex19.2), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000054927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109892726:109895312:-1 gene:ENSRNOG00000036671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109876642:109895177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT012772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001013976 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain containing 3 (Ogfod3), mRNA. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000054925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:109965251:109993035:-1 gene:ENSRNOG00000036668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC088238 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110031I02, mRNA (cDNA clone MGC:109015 IMAGE:7326036), complete cds. // chr10 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:109965484:109996192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT012774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001034959 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC619574 (LOC619574), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006247911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC619574 (LOC619574), transcript variant X1, mRNA. // chr10 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000054922 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:110011632:110018450:-1 gene:ENSRNOG00000036666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110013183:110023491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT012779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT012780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001039587 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 45B (Wdr45b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000054918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110111643:110141197:-1 gene:ENSRNOG00000036662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110112698:110141197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT012784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001107076 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab40b, member RAS oncogene family (Rab40b), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:110143366:110171085:-1 gene:ENSRNOG00000036661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168956 // GenBank // Rattus norvegicus Rab40b, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:189266 IMAGE:7123800), complete cds. // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:110144277:110170975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENSRNOT00000024520 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:1753701:1754069:1 gene:ENSRNOG00000018224 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0
NM_001105900 // RefSeq // Rattus norvegicus CGG triplet repeat binding protein 1 (Cggbp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:1876785:1893694:1 gene:ENSRNOG00000000718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:1889779:1890282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT012799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_013008 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 1 homeobox 1 (Pou1f1), mRNA. // chr11 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// AB622208 // GenBank // Rattus norvegicus Pit-1 mRNA for pituitary-specific positive transcription factor 1 variant w, complete cds. // chr11 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// BC061563 // GenBank // Rattus norvegicus POU class 1 homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:72907 IMAGE:6918965), complete cds. // chr11 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// L01506 // GenBank // Rattus norvegicus PIT-1-alpha (PIT-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// L01507 // GenBank // Rattus norvegicus PIT-1-beta (PIT-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// M23253 // GenBank // Rat pituitary-specific positive transcription factor (Pit-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// X12658 // GenBank // Rat growth-hormone factor 1 (rGHF-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 74 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000000905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:2630254:2647082:1 gene:ENSRNOG00000000715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000020715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:2633114:2650362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT012801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
XM_006221050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vestigial like 3 (Drosophila) (Vgll3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006247980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vestigial like 3 (Drosophila) (Vgll3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:3097621:3142253:1 gene:ENSRNOG00000028774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:3097403:3142360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000032550 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:16387310:16387963:1 gene:ENSRNOG00000028740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:16276902:16410191:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENSRNOT00000050840 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:16992377:16993034:1 gene:ENSRNOG00000031600 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
GENSCAN00000002707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:8988745:8990119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000045308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:10506864:10547228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
ENSRNOT00000061942 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:10873611:10874155:1 gene:ENSRNOG00000040247 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:10873835:10876927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_001100502 // RefSeq // Rattus norvegicus glucan (1,4-alpha-), branching enzyme 1 (Gbe1), mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:10959895:11147574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT012806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT012807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
GENSCAN00000034370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:11949956:12215576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT012808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000052022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:11950005:11950591:1 gene:ENSRNOG00000030674 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0
NM_022188 // RefSeq // Rattus norvegicus roundabout, axon guidance receptor, homolog 1 (Drosophila) (Robo1), mRNA. // chr11 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000042384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:13298875:13807531:1 gene:ENSRNOG00000029614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF041082 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane receptor Robo1 mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:13720003:13815367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
GENSCAN00000007990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:15251159:15345170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENSRNOT00000010487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155354242:155361518:1 gene:ENSRNOG00000007888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// BC158863 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 46, member B, mRNA (cDNA clone MGC:188454 IMAGE:7935820), complete cds. // chr11 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043227 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:15937518:15939702:1 gene:ENSRNOG00000029763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:15937675:15971432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155354399:155365497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT043775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
XM_006247994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 11 (Rbm11), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001105898 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 11 (Rbm11), mRNA. // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000047240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:17664410:17674391:1 gene:ENSRNOG00000029147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT012815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:17661853:17672727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
GENSCAN00000016780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:18835708:18837880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT012816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000037899 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:18837200:18837965:1 gene:ENSRNOG00000028223 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0
NM_001107114 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 25 (Usp25), mRNA. // chr11 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000002150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:19095389:19215605:1 gene:ENSRNOG00000001573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// XM_006247997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 25 (Usp25), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000016305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:19114419:19214411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:18631486:18743973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT012816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1