NM_001107328 // RefSeq // Rattus norvegicus ephrin B2 (Efnb2), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:86044304:86085652:1 gene:ENSRNOG00000014648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ011669 // GenBank // Rattus norvegicus ephrin B2 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:86082877:86128743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_003751633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi domain-containing protein 3-like (LOC690030), mRNA. // chr16 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// XM_003752939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi domain-containing protein 3-like (LOC690030), mRNA. // chr16 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0
ENSRNOT00000035711 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:87986696:87987342:1 gene:ENSRNOG00000024116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 95 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000037408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:87986696:87987342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 84 // 90 // 16 // 19 // 0
ENSRNOT00000019843 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:88321552:88322340:1 gene:ENSRNOG00000014772 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:88206173:88321958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_017222 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 10 (sodium/bile acid cotransporter), member 2 (Slc10a2), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000057310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:89709569:89726000:1 gene:ENSRNOG00000037753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 60 // 29 // 29 // 0 /// U07183 // GenBank // Rattus norvegicus ileal sodium-dependent bile acid transporter mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006227219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ileal sodium/bile acid cotransporter-like (LOC102557217), mRNA. // chrU // 23 // 23 // 11 // 48 // 1 /// GENSCAN00000008117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:89709569:89726012:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 60 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 65 // 65 // 31 // 48 // 1
ENSRNOT00000013501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:712736:750758:-1 gene:ENSRNOG00000010008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:713119:750758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001108394 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 24 (Zcchc24), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:1973079:2024105:-1 gene:ENSRNOG00000040205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:1976761:1987873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:1995596:2024090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000027512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:3863516:3900725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT021982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108395 // RefSeq // Rattus norvegicus placenta-specific 9 (Plac9), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus placenta-specific 9 (Plac9), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:3817394:3831461:1 gene:ENSRNOG00000011263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001008297 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 213, member A (Fam213a), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 213, member A (Fam213a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000015011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:3783384:3787309:1 gene:ENSRNOG00000011276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC086323 // GenBank // Rattus norvegicus similar to DNA segment, Chr 14, ERATO Doi 449, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:105674 IMAGE:7304524), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:3783596:3786713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT021982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001106060 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcolemma associated protein (Slmap), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006252541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sarcolemma associated protein (Slmap), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006252542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sarcolemma associated protein (Slmap), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2089451:2201800:-1 gene:ENSRNOG00000011307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC168941 // GenBank // Rattus norvegicus sarcolemma associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:189243 IMAGE:7104670), complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006252554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sarcolemma associated protein (Slmap), transcript variant X14, mRNA. // chr16 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// FQ217977 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA12YK02 mRNA sequence. // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000030856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2076780:2142771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT022844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013998 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 12 (Pde12), mRNA. // chr16 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2338087:2343389:-1 gene:ENSRNOG00000013264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2332374:2343205:-1 gene:ENSRNOG00000013264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// BC079396 // GenBank // Rattus norvegicus phosphodiesterase 12, mRNA (cDNA clone MGC:94924 IMAGE:7112419), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2338596:2343205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT022849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT022850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
XM_006222093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor protein, phosphotyrosine interaction, PH domain and leucine zipper containing 1 (Appl1), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// XM_006252730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor protein, phosphotyrosine interaction, PH domain and leucine zipper containing 1 (Appl1), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000018413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2537603:2576791:-1 gene:ENSRNOG00000013574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000031471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2538467:2607276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// FQ226179 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA32YN13 mRNA sequence. // chr16 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT022852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 49 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1
XM_006222086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 66 (Ccdc66), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006222088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 66 (Ccdc66), transcript variant X7, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000039311 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:3075032:3105389:-1 gene:ENSRNOG00000028380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000072414 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:3075032:3105389:-1 gene:ENSRNOG00000028380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074368 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:3075032:3098343:-1 gene:ENSRNOG00000028380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000042914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:3075417:3098343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT022858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT022861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_175595 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, alpha2/delta subunit 3 (Cacna2d3), mRNA. // chr16 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000048043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:4812761:5730476:-1 gene:ENSRNOG00000031287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF486278 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel alpha-2 delta-3 subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// NONRATT022878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000037058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:5035840:5073758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_001107290 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17 receptor B (Il17rb), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000020823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:5996456:6009258:-1 gene:ENSRNOG00000015498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000072778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:5995418:6003870:-1 gene:ENSRNOG00000015498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC168886 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 17 receptor B, mRNA (cDNA clone MGC:189142 IMAGE:7369142), complete cds. // chr16 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:5996087:6032880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1
NM_133307 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, delta (Prkcd), mRNA. // chr16 // 92 // 93 // 34 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000025858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6588979:6608725:-1 gene:ENSRNOG00000016346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000067639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6595658:6608725:-1 gene:ENSRNOG00000016346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// BC076505 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C, delta, mRNA (cDNA clone MGC:91512 IMAGE:7099952), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6589518:6604691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT022890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT022892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
NM_017351 // RefSeq // Rattus norvegicus inter-alpha trypsin inhibitor, heavy chain 3 (Itih3), mRNA. // chr16 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// XM_006252653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inter-alpha trypsin inhibitor, heavy chain 3 (Itih3), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 93 // 64 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6918684:6933186:-1 gene:ENSRNOG00000017689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000041216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6924702:6933186:-1 gene:ENSRNOG00000017689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 59 // 25 // 26 // 0 /// FQ209777 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA3YI05 mRNA sequence. // chr16 // 86 // 48 // 18 // 21 // 0 /// FQ219000 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YH20 mRNA sequence. // chr16 // 61 // 41 // 11 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6918777:6933179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT022897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 57 // 57 // 25 // 44 // 1 /// NONRATT022895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT022896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
NM_001107291 // RefSeq // Rattus norvegicus inter-alpha trypsin inhibitor, heavy chain 1 (Itih1), mRNA. // chr16 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000051751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6938510:6952625:-1 gene:ENSRNOG00000033386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC166831 // GenBank // Rattus norvegicus inter-alpha trypsin inhibitor, heavy chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:188715 IMAGE:8374222), complete cds. // chr16 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000040545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6938657:6952614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT022900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT022901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001131006 // RefSeq // Rattus norvegicus signal peptidase complex subunit 1 homolog (S. cerevisiae) (Spcs1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7008973:7010540:-1 gene:ENSRNOG00000018075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166925 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6919507, containing frame-shift errors. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_175580 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein-like 3 (nucleolar) (Gnl3), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000033677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7026191:7032102:-1 gene:ENSRNOG00000028461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// AY181024 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley nucleostemin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// BC072500 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein-like 3 (nucleolar), mRNA (cDNA clone IMAGE:7099304). // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC093602 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein-like 3 (nucleolar), mRNA (cDNA clone MGC:105287 IMAGE:7316170), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7026288:7036161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
XM_001062546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small integral membrane protein 4 (Smim4), mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_341397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small integral membrane protein 4 (Smim4), mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000061204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7135209:7138892:-1 gene:ENSRNOG00000028178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7138625:7138892:-1 gene:ENSRNOG00000028178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT022910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XM_006222122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stabilin 1 (Stab1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 69 // 69 // 0 /// ENSRNOT00000025394 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:7149123:7179494:-1 gene:ENSRNOG00000018434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 69 // 69 // 0 /// GENSCAN00000012813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7149123:7185868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 58 // 58 // 0 /// NONRATT022911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 19 // 72 // 1
ENSRNOT00000036910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7182945:7219131:-1 gene:ENSRNOG00000018823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000012768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7188343:7219131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000012813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7149123:7185868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// NONRATT022920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1 /// NONRATT022922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// NONRATT022924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001012211 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 7 (Phf7), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 7 (Phf7), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 7 (Phf7), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000044991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7251919:7264620:-1 gene:ENSRNOG00000018996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC079288 // GenBank // Rattus norvegicus PHD finger protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:94419 IMAGE:7134345), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7252169:7265251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001033655 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, heavy chain 1 (Dnah1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 78 // 78 // 0 /// ENSRNOT00000035009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7274368:7337315:-1 gene:ENSRNOG00000026914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 78 // 78 // 0 /// ENSRNOT00000066508 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:7274368:7337315:-1 gene:ENSRNOG00000026914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 78 // 78 // 0 /// GENSCAN00000012802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7274419:7337457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 78 // 78 // 0 /// NONRATT022931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 81 // 81 // 0
XM_224616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S24-like (RGD1564325), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000047252 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:7340799:7341200:-1 gene:ENSRNOG00000046517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000067494 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:7347792:7348193:-1 gene:ENSRNOG00000050238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000012791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7340799:7346102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000012804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7347792:7348193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_054011 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3-domain binding protein 5 (BTK-associated) (Sh3bp5), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7408999:7472907:-1 gene:ENSRNOG00000019475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB027562 // GenBank // Rattus norvegicus VESP18 mRNA for vascular endothelial cell specific protein 18, complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// FQ210473 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA28YB09 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000012795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7410173:7427545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT022932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7470782:7517910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001007623 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 6 (Mettl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 6 (Mettl6), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7507483:7523713:-1 gene:ENSRNOG00000019520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079309 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase like 6, mRNA (cDNA clone MGC:94452 IMAGE:7134747), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ211422 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA10YO04 mRNA sequence. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT022935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000044152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7470782:7517910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_019274 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen-like tail subunit (single strand of homotrimer) of asymmetric acetylcholinesterase (Colq), mRNA. // chr16 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7554358:7608291:-1 gene:ENSRNOG00000019615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// AF007583 // GenBank // Rattus norvegicus acetylcholinesterase-associated collagen (COLQ) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7554358:7608291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT022939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_053493 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1 (Hacl1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006252670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1 (Hacl1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7646580:7682624:-1 gene:ENSRNOG00000019630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC078697 // GenBank // Rattus norvegicus 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93083 IMAGE:7110355), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7642680:7682526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT022940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT022941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT022942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT022943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
XM_006222119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 28 (Ankrd28), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 28 (Ankrd28), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 28 (Ankrd28), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7740393:7820041:-1 gene:ENSRNOG00000019697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7740393:7949522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT022945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000044150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7740393:7949522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT022945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT022947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001134850 // RefSeq // Rattus norvegicus diphthamide biosynthesis 3 (Dph3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8121974:8124449:-1 gene:ENSRNOG00000019727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168674 // GenBank // Rattus norvegicus DPH3, KTI11 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188477 IMAGE:7939231), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8120659:8124397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_019352 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast) (Timm23), mRNA. // chr16 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000026932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8241068:8267099:-1 gene:ENSRNOG00000019811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB006451 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Tim23, complete cds. // chr16 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// BC083559 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:93478 IMAGE:7135081), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000048004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:84786045:84787147:-1 gene:ENSRNOG00000031285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 74 // 100 // 26 // 35 // 0 /// FQ216447 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YM11 mRNA sequence. // chr16 // 71 // 100 // 25 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000051579 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:89672367:89672996:1 gene:ENSRNOG00000032900 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 82 // 80 // 23 // 28 // 0 /// NONRATT022958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT022959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8241437:8267756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT022960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001109431 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680885 (LOC680885), mRNA. // chr16 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000060975 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:8469877:8480546:-1 gene:ENSRNOG00000039749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT022961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000050799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8467310:8480507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001170593 // RefSeq // Rattus norvegicus choline O-acetyltransferase (Chat), mRNA. // chrU // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:10603341:10652313:-1 gene:ENSRNOG00000025012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:10551743:10647570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT022994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_031663 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 18 (vesicular acetylcholine transporter), member 3 (Slc18a3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U09211 // GenBank // Rattus norvegicus vesicular acetylcholine transporter mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U09838 // GenBank // Rattus norvegicus vesicular acetylcholine transporter (rVAChT) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT022996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT022997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000033610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:10675011:10675618:-1 gene:ENSRNOG00000025002 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
GENSCAN00000008833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:10771079:10788309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006222116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556889 (LOC102556889), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT023000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_006222116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556889 (LOC102556889), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:10847408:10851676:-1 gene:ENSRNOG00000049942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:10823119:10932015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0
XM_006222116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556889 (LOC102556889), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000073370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:10847408:10851676:-1 gene:ENSRNOG00000049942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 98 // 42 // 45 // 0 /// GENSCAN00000008829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:10823119:10932015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0
XM_006222116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556889 (LOC102556889), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:10847408:10851676:-1 gene:ENSRNOG00000049942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:10823119:10932015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
XM_006252760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WDFY family member 4 (Wdfy4), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000043811 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:11157745:11368418:-1 gene:ENSRNOG00000029662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000043497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11270501:11428954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// GENSCAN00000043498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11142937:11194971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
XM_006252760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WDFY family member 4 (Wdfy4), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000043811 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:11157745:11368418:-1 gene:ENSRNOG00000029662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11270501:11428954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_053829 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 8 (Mapk8), mRNA. // chr16 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065216 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:11583877:11662858:-1 gene:ENSRNOG00000020155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11583826:11635177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_006222104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 488 (Zfp488), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 488 (Zfp488), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031496 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:8615771:8616787:-1 gene:ENSRNOG00000024597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8615771:8662390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
XM_006222098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910026 (LOC100910026), mRNA. // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000050801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8615771:8662390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT022965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_031581 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y4 (Npy4r), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8808751:8809878:-1 gene:ENSRNOG00000020282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// U42388 // GenBank // Rattus norvegicus panceatic polypeptide receptor mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8808751:8823916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001059778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 (Gprin2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_224702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein regulated inducer of neurite outgrowth 2 (Gprin2), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000027470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8846316:8847683:-1 gene:ENSRNOG00000020285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000050815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8846316:8853651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001025028 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 35, member A (Fam35a), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// XM_006252634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 35, member A (Fam35a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 88 // 56 // 21 // 24 // 0 /// XM_006252635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 35, member A (Fam35a), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 86 // 49 // 18 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8888936:8979969:-1 gene:ENSRNOG00000020291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000060848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8910686:8979969:-1 gene:ENSRNOG00000020291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 65 // 25 // 28 // 0 /// BC089872 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 35, member A, mRNA (cDNA clone MGC:109007 IMAGE:7325236), complete cds. // chr16 // 89 // 65 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8889227:8929236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT022971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
ENSRNOT00000027484 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:8927977:8929320:-1 gene:ENSRNOG00000020292 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT022972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000050812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8889227:8929236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NONRATT022972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001134849 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 25, member A (Fam25a), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013838 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:9020774:9033706:-1 gene:ENSRNOG00000010401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000065516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:9049951:9054488:-1 gene:ENSRNOG00000010437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// AY518351 // GenBank // Rattus norvegicus gamma synuclein (Sncg) mRNA, complete cds. // chr16 // 80 // 74 // 16 // 20 // 0 /// NM_031688 // RefSeq // Rattus norvegicus synuclein, gamma (Sncg), mRNA. // chr16 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9049998:9054439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT022976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_030849 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein receptor, type IA (Bmpr1a), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000015047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:9084570:9114523:-1 gene:ENSRNOG00000010814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// D38082 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for bone morphogenetic protein type IA receptor, complete cds. // chr16 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// D17667 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for bone merphogenetic protein 4 receptor, complete cds. // chr16 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// NONRATT022980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000005748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9085892:9196660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_001110490 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain binding 3 (Ldb3), transcript variant 5, mRNA. // chr16 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NM_001277158 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain binding 3 (Ldb3), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NM_001277159 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain binding 3 (Ldb3), transcript variant 4, mRNA. // chr16 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NM_001277165 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain binding 3 (Ldb3), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// XM_006252645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain binding 3 (Ldb3), transcript variant X9, mRNA. // chr16 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000032730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:9240392:9266240:-1 gene:ENSRNOG00000011343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// BC083721 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domain binding 3, mRNA (cDNA clone MGC:94616 IMAGE:7190925), complete cds. // chr16 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// NM_001277166 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain binding 3 (Ldb3), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// GENSCAN00000005750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9206136:9322440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// NONRATT022986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT022987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT022983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT022989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_138860 // RefSeq // Rattus norvegicus opsin 4 (Opn4), mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:9268372:9277528:-1 gene:ENSRNOG00000011600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY072689 // GenBank // Rattus norvegicus melanopsin mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9206136:9322440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// NONRATT022990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
ENSRNOT00000028041 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:9469573:9470023:-1 gene:ENSRNOG00000045787 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 76 // 77 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9453043:9477242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0
ENSRNOT00000029573 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:12631332:12632771:-1 gene:ENSRNOG00000022798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// XM_001063889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (LOC685463), mRNA. // chr16 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// XM_003751563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (LOC100911649), mRNA. // chr16 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// XM_003752886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (LOC685463), mRNA. // chr16 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1 /// GENSCAN00000016966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:12619550:12636180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 100 // 11 // 17 // 0
XM_006222157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil serine-rich protein 2 (Ccser2), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006252789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil serine-rich protein 2 (Ccser2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016494 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:13981317:14070911:-1 gene:ENSRNOG00000022781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:13981422:14155134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// FQ213092 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YM06 mRNA sequence. // chr16 // 83 // 38 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT023017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT023016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT023019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001107299 // RefSeq // Rattus norvegicus retinal G protein coupled receptor (Rgr), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:14188718:14203346:-1 gene:ENSRNOG00000012396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:14189459:14203307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT023020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053572 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin-related family member 1 (Cdhr1), mRNA. // chr16 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:14230688:14250567:-1 gene:ENSRNOG00000013330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB053449 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for KIAA1775 protein (MT-protocadherin), complete cds. // chr16 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT023022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:14232177:14361448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1
NM_001106063 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical gene supported by AF152002 (LOC290595), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065460 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:14255516:14263116:-1 gene:ENSRNOG00000043342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005908 // RefSeq // Rattus norvegicus growth hormone inducible transmembrane protein (Ghitm), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:14273917:14285152:-1 gene:ENSRNOG00000013961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083778 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone inducible transmembrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:94737 IMAGE:7193683), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212260 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA63YB18 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:14232177:14361448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT023026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_002725161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromosome 14 open reading frame 119-like (LOC100363043), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_002728366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromosome 14 open reading frame 119-like (LOC100363043), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:14232177:14361448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0
GENSCAN00000020896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:14232177:14361448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000073995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:361770:368264:1 gene:ENSRNOG00000045696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// GENSCAN00000036216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:367315:367857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000006825 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:14496714:14497592:-1 gene:ENSRNOG00000039602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// NONRATT007962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 55 // 100 // 6 // 11 // 0
ENSRNOT00000060703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:15004318:15010064:-1 gene:ENSRNOG00000039601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// BC158599 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RNA polymerase II transcription factor SIII subunit A2 (Elongin A2) (EloA2) (Transcription elongation factor B polypeptide 3B), mRNA (cDNA clone MGC:187449 IMAGE:7129113), complete cds. // chr16 // 75 // 80 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000003315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:15004565:15009924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0
XM_006252793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuregulin 3 (Nrg3), partial mRNA. // chrU // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046842 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:15663031:15697361:-1 gene:ENSRNOG00000033894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000065946 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:15663031:15697361:-1 gene:ENSRNOG00000033894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT023029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:15663031:15702935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001169127 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 14 (Tspan14), mRNA. // chr16 // 94 // 45 // 17 // 18 // 0 /// NM_001170349 // RefSeq // Rattus norvegicus SH2 domain containing 4B (Sh2d4b), mRNA. // chr16 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000014772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:17421546:17478815:1 gene:ENSRNOG00000010813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 45 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000032309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:17493970:17588425:1 gene:ENSRNOG00000042623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// GENSCAN00000053105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:17465679:17502041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT022160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_001014140 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5730469M10 (RGD1309676), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5730469M10 (RGD1309676), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:17376841:17396620:1 gene:ENSRNOG00000011140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079275 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5730469M10, mRNA (cDNA clone MGC:94395 IMAGE:7134042), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:17387219:17395949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT022158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001134797 // RefSeq // Rattus norvegicus DPY30 domain containing 2 (Dydc2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DPY30 domain containing 2 (Dydc2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252814 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DPY30 domain containing 2 (Dydc2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DPY30 domain containing 2 (Dydc2), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18506996:18514860:-1 gene:ENSRNOG00000039591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18507140:18512419:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001100175 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 38a (Tmem38a), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18822745:18837486:-1 gene:ENSRNOG00000011912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC161801 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 38a, mRNA (cDNA clone MGC:187200 IMAGE:7128088), complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// EF690436 // GenBank // Rattus norvegicus 27 kDa sarcoplasmic reticulum protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18823063:18837253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT023034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
XM_006252819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NACHT and WD repeat domain containing 1-like (LOC100364350), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074855 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:18741609:18783744:-1 gene:ENSRNOG00000050639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006222197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NACHT and WD repeat domain containing 1-like (LOC100364350), mRNA. // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006252799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 1700030K09Rik protein (RGD1311847), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18944084:18960080:-1 gene:ENSRNOG00000023700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC079430 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 1700030K09Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:94976 IMAGE:7114707), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18944451:18956735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT023044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1
NM_001007684 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 2 (Klf2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19084196:19086146:-1 gene:ENSRNOG00000014205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19084196:19086146:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001044239 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, mu 1 subunit (Ap1m1), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000019350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19148666:19164135:-1 gene:ENSRNOG00000014454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC107903 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, mu 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:125095 IMAGE:7455976), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC088288 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex AP-1, mu subunit 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7321762). // chr16 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONRATT023048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19131129:19169298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1
ENSRNOT00000019556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19164840:19169329:-1 gene:ENSRNOG00000039528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC166765 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 32, member A, mRNA (cDNA clone MGC:188529 IMAGE:7932317), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ219928 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YN15 mRNA sequence. // chr16 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// FQ219981 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YK04 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT023049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19131129:19169298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001271328 // RefSeq // Rattus norvegicus hematopoietic SH2 domain containing (Hsh2d), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19195841:19203469:-1 gene:ENSRNOG00000023614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19195841:19258159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT023052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053998 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB8A, member RAS oncogene family (Rab8a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000020748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19213379:19235107:-1 gene:ENSRNOG00000014621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC071176 // GenBank // Rattus norvegicus RAB8A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:7098881), partial cds. // chr16 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC105863 // GenBank // Rattus norvegicus RAB8A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:124948 IMAGE:7457017), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// JN019799 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley RAB8 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// M83675 // GenBank // Sprague-Dawley (clone LRB11) RAB8 mRNA, complete cds. // chr16 // 76 // 68 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT023053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000036855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19195841:19258159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// NONRATT023054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1
NM_012678 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomyosin 4 (Tpm4), mRNA. // chr16 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000021073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19244266:19258182:-1 gene:ENSRNOG00000015496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// FQ225054 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YE19 mRNA sequence. // chr16 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// FQ225082 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YD07 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// J02780 // GenBank // Rat tropmyosin (TM-4) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT023055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19195841:19258159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT023057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT023056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
XM_006222163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 617 (Zfp617), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 617 (Zfp617), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000074514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19398387:19417115:-1 gene:ENSRNOG00000049856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ211453 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA10YD17 mRNA sequence. // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006222164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 844-like (LOC102548917), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006252956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 844-like (LOC102548917), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XR_341034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 844-like (LOC102548917), transcript variant X3, misc_RNA. // chr16 // 89 // 39 // 8 // 9 // 0 /// XR_360386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 844-like (LOC102548917), transcript variant X3, misc_RNA. // chr16 // 89 // 39 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT023062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1
NM_153731 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 709 (Zfp709), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709 (Zfp709), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006252843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709 (Zfp709), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19491753:19500855:-1 gene:ENSRNOG00000016186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF277903 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein HIT-40 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001024971 // RefSeq // Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex, subunit 8 (Haus8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006252852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex, subunit 8 (Haus8), transcript variant X8, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19512405:19529269:-1 gene:ENSRNOG00000023534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC091198 // GenBank // Rattus norvegicus sarcoma antigen NY-SAR-48, mRNA (cDNA clone MGC:108884 IMAGE:7376974), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006222162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100364316 (LOC100364316), mRNA. // chr16 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19512517:19529093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT023065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT023066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT023072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT023067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// NONRATT023068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_139113 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 2, group F, member 6 (Nr2f6), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19630090:19637536:-1 gene:ENSRNOG00000016892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF003926 // GenBank // Rattus norvegicus ovalbumin upstream promoter gamma nuclear receptor rCOUPg mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC062065 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:5599300, partial cds. // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000040704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19630457:19637324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001033687 // RefSeq // Rattus norvegicus Usher syndrome 1C binding protein 1 (Ushbp1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19641400:19651953:-1 gene:ENSRNOG00000023485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101905 // GenBank // Rattus norvegicus Usher syndrome 1C binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:124707 IMAGE:7934347), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19641662:19651545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT023077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107301 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 8 (Abhd8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19727394:19734131:-1 gene:ENSRNOG00000000054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168736 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:188830 IMAGE:6891332), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168761 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:188879 IMAGE:6889450), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168765 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:188886 IMAGE:6889859), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19727861:19732428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006252965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anoctamin 8 (Ano8), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000038524 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:19747154:19755987:-1 gene:ENSRNOG00000017567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000040637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19747154:19755987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT023086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1
NM_020086 // RefSeq // Rattus norvegicus plasmalemma vesicle associated protein (Plvap), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19767919:19780232:-1 gene:ENSRNOG00000017676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF154831 // GenBank // Rattus norvegicus PV-1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070900 // GenBank // Rattus norvegicus plasmalemma vesicle associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:91710 IMAGE:7100403), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19767000:19792134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_198134 // RefSeq // Rattus norvegicus bone marrow stromal cell antigen 2 (Bst2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19800348:19803919:-1 gene:ENSRNOG00000023370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ538349 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DAMP-1 protein. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19800800:19803909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT023090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENSRNOT00000024424 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:19844606:19848443:-1 gene:ENSRNOG00000018167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_006252969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 221 (Tmem221), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000040672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19845035:19848443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_022861 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-13 homolog A (C. elegans) (Unc13a), mRNA. // chr16 // 99 // 97 // 153 // 155 // 0 /// ENSRNOT00000011863 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:19917585:19958035:-1 gene:ENSRNOG00000018452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 99 // 96 // 152 // 153 // 0 /// ENSRNOT00000025162 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:19917585:19958035:-1 gene:ENSRNOG00000018452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 156 // 156 // 0 /// U24070 // GenBank // Rattus norvegicus Munc13-1 mRNA, complete cds. // chr16 // 99 // 97 // 153 // 155 // 0 /// GENSCAN00000027413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19917952:19959232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 150 // 150 // 0 /// NONRATT023098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 13 // 13 // 20 // 160 // 1 /// NONRATT023099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 6 // 6 // 10 // 160 // 1 /// NONRATT023100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 5 // 5 // 8 // 160 // 1 /// NONRATT023101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 8 // 8 // 13 // 160 // 1 /// NONRATT023102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 9 // 9 // 14 // 160 // 1 /// NONRATT023103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 7 // 7 // 11 // 160 // 1
NM_001106068 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 3 (B3gnt3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19984402:19993283:-1 gene:ENSRNOG00000018764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19985333:19986616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106069 // RefSeq // Rattus norvegicus FCH domain only 1 (Fcho1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006252865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FCH domain only 1 (Fcho1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000040464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19995969:20008828:-1 gene:ENSRNOG00000033912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000027431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19996447:20013335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 81 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT023105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT023106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// NONRATT023108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT023107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001106070 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1S (Map1s), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20126207:20136394:-1 gene:ENSRNOG00000018781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC169058 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1S, mRNA (cDNA clone MGC:189451 IMAGE:7932017), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20126443:20136360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT023110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001170604 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 12 receptor, beta 1 (Il12rb1), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20228436:20240435:-1 gene:ENSRNOG00000019216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20228436:20245700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT023114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_013018 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB3A, member RAS oncogene family (Rab3a), mRNA. // chr16 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20292237:20296302:-1 gene:ENSRNOG00000019433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC087580 // GenBank // Rattus norvegicus RAB3A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:105485 IMAGE:7314616), complete cds. // chr16 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// FQ214110 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YN09 mRNA sequence. // chr16 // 88 // 93 // 23 // 26 // 0 /// FQ214465 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YI18 mRNA sequence. // chr16 // 81 // 93 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT023117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20292774:20306698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001276765 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 4C, cAMP-specific (Pde4c), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphodiesterase 4C, cAMP-specific (Pde4c), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20299675:20318027:-1 gene:ENSRNOG00000019518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20292774:20306698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
XM_006222176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin-17-like (LOC102547294), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin-17-like (LOC102547294), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// XM_006252976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin-17-like (LOC102547294), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000033073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20324576:20334084:-1 gene:ENSRNOG00000022611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20324576:20333238:-1 gene:ENSRNOG00000022611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000027401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20324576:20338585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001286966 // RefSeq // Rattus norvegicus jun D proto-oncogene (Jund), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_138875 // RefSeq // Rattus norvegicus jun D proto-oncogene (Jund), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20342643:20343668:-1 gene:ENSRNOG00000019568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC062053 // GenBank // Rattus norvegicus Jun D proto-oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:72300 IMAGE:5598945), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20342643:20343668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT023123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106073 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20363467:20368886:-1 gene:ENSRNOG00000019572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20359742:20365572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_134399 // RefSeq // Rattus norvegicus Mk1 protein (Mk1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20388727:20389104:-1 gene:ENSRNOG00000019657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000027432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20388727:20389170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF456232 // GenBank // Rattus norvegicus MK1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000031692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20415408:20418157:-1 gene:ENSRNOG00000022565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// FQ228377 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA9YE12 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006222181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 25 (Lrrc25), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20415408:20418166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT023129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001013880 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol-3-phosphate synthase 1 (Isyna1), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20445208:20448042:-1 gene:ENSRNOG00000019741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ229915 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YD24 mRNA sequence. // chr16 // 89 // 55 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20445295:20447864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT023131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT023132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT023133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_001107304 // RefSeq // Rattus norvegicus elongation factor RNA polymerase II (Ell), mRNA. // chr16 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// XM_003751576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA polymerase II elongation factor ELL-like (LOC100911828), mRNA. // chr16 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000026846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20449840:20497154:-1 gene:ENSRNOG00000019824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20451088:20497150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT023134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001037180 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 8 (Fkbp8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20501666:20508369:-1 gene:ENSRNOG00000019944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC107454 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 8, 38kDa, mRNA (cDNA clone MGC:125185 IMAGE:7378812), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20502042:20506815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT023138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT023139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT023140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT023136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001106074 // RefSeq // Rattus norvegicus cytokine receptor-like factor 1 (Crlf1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytokine receptor-like factor 1 (Crlf1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20530521:20541796:-1 gene:ENSRNOG00000020030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20530783:20541675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT023141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001044230 // RefSeq // Rattus norvegicus ceramide synthase 1 (Cers1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NM_001044240 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 1 (Gdf1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000027275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20698224:20699716:-1 gene:ENSRNOG00000020142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 32 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000027306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20700117:20712536:-1 gene:ENSRNOG00000020147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 49 // 20 // 20 // 0 /// DQ479969 // GenBank // Rattus norvegicus longevity assurance-like protein 1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// DQ481538 // GenBank // Rattus norvegicus growth differentiation factor 1 protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000038136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20698224:20725076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 83 // 34 // 41 // 1
ENSRNOT00000027381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20714916:20725117:-1 gene:ENSRNOG00000020178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161928 // GenBank // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:187698 IMAGE:8374450), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ215041 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YA18 mRNA sequence. // chr16 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// FQ232202 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YK15 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001106076 // RefSeq // Rattus norvegicus coatomer protein complex, subunit epsilon (Cope), mRNA. // chr16 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000038136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20698224:20725076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT023149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT023154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_053310 // RefSeq // Rattus norvegicus homer homolog 3 (Drosophila) (Homer3), mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20733291:20740680:-1 gene:ENSRNOG00000020229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AB020879 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Vesl-3, complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC070922 // GenBank // Rattus norvegicus homer homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7096066), complete cds. // chr16 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// BC090328 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7123840, with apparent retained intron. // chr16 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// GENSCAN00000038171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20733365:20742717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT023158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT023160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT023163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT023164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001108397 // RefSeq // Rattus norvegicus SURP and G patch domain containing 2 (Sugp2), mRNA. // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// XM_006252905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SURP and G patch domain containing 2 (Sugp2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20760491:20789858:-1 gene:ENSRNOG00000020269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20763397:20782466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT023166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT023169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001108874 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 161A (Tmem161a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20836631:20846231:-1 gene:ENSRNOG00000020390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC090553 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7130853, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC161989 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 161A, mRNA (cDNA clone MGC:187817 IMAGE:9032206), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20837307:20876980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001017507 // RefSeq // Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2B (Mef2b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20851150:20867107:-1 gene:ENSRNOG00000020400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079361 // GenBank // Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2B, mRNA (cDNA clone MGC:94839 IMAGE:7109152), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20837307:20876980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001145726 // RefSeq // Rattus norvegicus MEF2B neighbor (Mef2bnb), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20872444:20879027:-1 gene:ENSRNOG00000020427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20837307:20876980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001047104 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor 2C2-associated protein (Nr2c2ap), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20886520:20888715:-1 gene:ENSRNOG00000022247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098704 // GenBank // Rattus norvegicus similar to TR4 orphan receptor associated protein TRA16, mRNA (cDNA clone MGC:112689 IMAGE:7389633), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor 2C2-associated protein (Nr2c2ap), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT023178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000038156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20887702:20895904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001108398 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan and proteoglycan link protein 4 (Hapln4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20931165:20939015:-1 gene:ENSRNOG00000049949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20994299:21005078:-1 gene:ENSRNOG00000050507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20931895:20963335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20995029:21041492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001011920 // RefSeq // Rattus norvegicus SURP and G patch domain containing 1 (Sugp1), mRNA. // chr16 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// NM_001127654 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 6 superfamily member 2 (Tm6sf2), mRNA. // chr16 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000027800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20941992:20949189:-1 gene:ENSRNOG00000042237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000027826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21016442:21047083:-1 gene:ENSRNOG00000020510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21008290:21015082:-1 gene:ENSRNOG00000048058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// BC079341 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:94785 IMAGE:7106652), complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// BC158807 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane 6 superfamily member 2, mRNA (cDNA clone MGC:188225 IMAGE:7324580), complete cds. // chr16 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20995029:21041492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000037331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20931895:20963335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1 /// NONRATT023183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// NONRATT023184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1 /// NONRATT023186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
NM_001106078 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 6 (Tssk6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21189471:21190772:-1 gene:ENSRNOG00000020599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21189858:21190679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT023188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108399 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox 4 (Pbx4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox 4 (Pbx4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21219921:21253490:-1 gene:ENSRNOG00000010736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21220129:21276835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001109109 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidic acid receptor 2 (Lpar2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21259278:21262902:-1 gene:ENSRNOG00000010758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 54 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000037377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21220129:21276835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT023194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001107308 // RefSeq // Rattus norvegicus Gem-interacting protein (Gmip), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006252903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Gem-interacting protein (Gmip), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000039607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21263641:21276944:-1 gene:ENSRNOG00000027257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000037377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21220129:21276835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT023195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001106079 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase type 13A1 (Atp13a1), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21278077:21294131:-1 gene:ENSRNOG00000010776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21278289:21306770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000037792 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:21466443:21468323:-1 gene:ENSRNOG00000027208 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21424838:21477018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001134416 // RefSeq // Rattus norvegicus integrator complex subunit 10 (Ints10), mRNA. // chr16 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:22511881:22542494:-1 gene:ENSRNOG00000012429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000041877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:22512102:22542627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT023213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// NONRATT023215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XM_001072009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 7-like (RGD1564941), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006222200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 7-like (RGD1564941), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 80 // 12 // 12 // 0
NM_057213 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit B2 (Atp6v1b2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:22221014:22244664:-1 gene:ENSRNOG00000011891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085714 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit B2, mRNA (cDNA clone MGC:93249 IMAGE:7109340), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ232688 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YM11 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:22222157:22244651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT023206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
XM_001072296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S10-like (RGD1559708), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// XM_224779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S10-like (RGD1559708), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000016204 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:22305258:22305749:-1 gene:ENSRNOG00000012174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:22305258:22305797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_012598 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoprotein lipase (Lpl), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipoprotein lipase (Lpl), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:22431494:22455871:-1 gene:ENSRNOG00000012181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC081836 // GenBank // Rattus norvegicus lipoprotein lipase, mRNA (cDNA clone MGC:93586 IMAGE:7106121), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// L03294 // GenBank // Rattus norvegicus lipoprotein lipase mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:22433441:22463567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001012048 // RefSeq // Rattus norvegicus SH2 domain containing 4A (Sh2d4a), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:22972716:23044750:-1 gene:ENSRNOG00000013541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC079100 // GenBank // Rattus norvegicus SH2 domain containing 4A, mRNA (cDNA clone MGC:94080 IMAGE:7124466), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:22973647:23039576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT023218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
GENSCAN00000049844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:23199208:23200440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_001013052 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 3 (Nat3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetyltransferase 3 (Nat3), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetyltransferase 3 (Nat3), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:23786862:23787734:-1 gene:ENSRNOG00000029977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:23786862:23787734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000034734 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:24209307:24210252:-1 gene:ENSRNOG00000026410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:24209767:24254620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0
NM_001024772 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear assembly factor 1 ribonucleoprotein (Naf1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:24466738:24496546:-1 gene:ENSRNOG00000026403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094302 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear assembly factor 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105580 IMAGE:7311858), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:24423597:24496468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001113357 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y1 (Npy1r), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:24663045:24671859:-1 gene:ENSRNOG00000014149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC089981 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y1, mRNA (cDNA clone MGC:109393 IMAGE:7317839), complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:24664342:24673405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT023228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT023229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0
NM_001106080 // RefSeq // Rattus norvegicus transketolase-like 2 (Tktl2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transketolase-like 2 (Tktl2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:24833389:24835272:-1 gene:ENSRNOG00000014185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:24833389:24835272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135838 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 1, E3 ubiquitin protein ligase (March1), mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006253034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 1, E3 ubiquitin protein ligase (March1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000032289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:24885332:25407999:-1 gene:ENSRNOG00000026310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006253033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 1, E3 ubiquitin protein ligase (March1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// FQ230739 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YD23 mRNA sequence. // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// XM_006253055 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E3 ubiquitin-protein ligase MARCH1-like (LOC100910061), mRNA. // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT023233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:24884201:24934423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:25963487:25985010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000072000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:26412201:26412715:-1 gene:ENSRNOG00000049344 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:26208066:26208580:-1 gene:ENSRNOG00000047432 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000037852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:26412248:26424475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000046882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:26208113:26220661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001014141 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 192 (Tmem192), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:26503238:26515689:-1 gene:ENSRNOG00000030199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086402 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 192, mRNA (cDNA clone MGC:105668 IMAGE:7304126), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:26503445:26551068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000045564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:27342542:27343054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT023238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000046984 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:27342418:27343054:-1 gene:ENSRNOG00000032550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 69 // 76 // 9 // 13 // 0
XR_146649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ab1-351 (LOC364556), misc_RNA. // chrU // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// AY325145 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-351 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049187 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:27956488:28064210:-1 gene:ENSRNOG00000032995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 84 // 70 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:27993574:28194767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_001107310 // RefSeq // Rattus norvegicus sparc/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan (testican) 3 (Spock3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:28243878:28585574:-1 gene:ENSRNOG00000029903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:28245575:28254166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006227050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 (Ddx60), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 85 // 98 // 40 // 47 // 0 /// XM_006227152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like (LOC102547355), partial mRNA. // chr16 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// XM_006253060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 (Ddx60), mRNA. // chr16 // 98 // 90 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000019667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:29667540:29799350:-1 gene:ENSRNOG00000014541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// XM_006253066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like (LOC100911190), mRNA. // chr16 // 50 // 50 // 24 // 48 // 1 /// XR_349503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556583 (LOC102556583), ncRNA. // chr16 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// GENSCAN00000002428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:29667540:29847369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000006840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:30997433:31168573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 17 // 48 // 1
XM_006227050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 (Ddx60), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 (Ddx60), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:29667540:29799350:-1 gene:ENSRNOG00000014541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// XM_006253066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like (LOC100911190), mRNA. // chr16 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// XR_349503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556583 (LOC102556583), ncRNA. // chr16 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:29667540:29847369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_182672 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonyl reductase 4 (Cbr4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000032199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31794875:31810284:-1 gene:ENSRNOG00000024411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AY305858 // GenBank // Rattus norvegicus carbonyl reductase 4 (Cbr4) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC086378 // GenBank // Rattus norvegicus carbonyl reductase 4, mRNA (cDNA clone MGC:105271 IMAGE:7302014), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000045824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:31797891:31810159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT023248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1 /// NONRATT023249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT023247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_198764 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 1 (Sh3rf1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000013816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31900567:32060681:-1 gene:ENSRNOG00000010358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF515735 // GenBank // Rattus norvegicus putative scaffolding protein POSH mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000000325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:31907582:31967893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NONRATT023254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001106082 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA (never in mitosis gene a)-related kinase 1 (Nek1), mRNA. // chr16 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000043100 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:32155914:32274325:-1 gene:ENSRNOG00000010418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:32133969:32268068:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT023257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT023258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NONRATT023260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001169105 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 2700029M09Rik protein (RGD1311747), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:32358969:32375073:-1 gene:ENSRNOG00000011293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:32352835:32388079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT023262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_006222227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1-like (LOC364561), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006253081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1-like (LOC364561), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000015154 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:32491156:32491627:-1 gene:ENSRNOG00000011395 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0
ENSRNOT00000015759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:32571991:32587004:-1 gene:ENSRNOG00000011775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001012049 // RefSeq // Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 3-like (Mfap3l), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// BC078969 // GenBank // Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:93849 IMAGE:7111774), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000004503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:32572405:32624594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT023269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017193 // RefSeq // Rattus norvegicus aminoadipate aminotransferase (Aadat), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aminoadipate aminotransferase (Aadat), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aminoadipate aminotransferase (Aadat), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:32665787:32702406:-1 gene:ENSRNOG00000011861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078864 // GenBank // Rattus norvegicus aminoadipate aminotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93526 IMAGE:7109210), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:32664349:32701979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NONRATT023278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT023279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_033499 // RefSeq // Rattus norvegicus stimulator of chondrogenesis 1 (Scrg1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:35936797:35967145:-1 gene:ENSRNOG00000013228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:35936903:36004061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_022696 // RefSeq // Rattus norvegicus heart and neural crest derivatives expressed 2 (Hand2), mRNA. // chr16 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000030765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:36107394:36174764:-1 gene:ENSRNOG00000022069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000013850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:36096315:36184150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1
GENSCAN00000013847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:36253257:36253595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000017930 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:36253172:36253595:-1 gene:ENSRNOG00000013425 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
ENSRNOT00000034481 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:36471879:36472427:-1 gene:ENSRNOG00000021849 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:36471877:36472427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_001012050 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 8 (Fbxo8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:36936326:36981671:-1 gene:ENSRNOG00000010502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088452 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:95100 IMAGE:7126921), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ232328 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YD08 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:36936987:36982204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT023295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_024390 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15 (NAD) (Hpgd), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:37259045:37296863:-1 gene:ENSRNOG00000010610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC062399 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxyprostaglandin dehydrogenase 15 (NAD), mRNA (cDNA clone MGC:72425 IMAGE:5599288), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U44750 // GenBank // Rattus norvegicus NAD-dependent 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:37259903:37297821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000042767 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:23196964:23197586:1 gene:ENSRNOG00000031906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000000202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:33039:124467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000043100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:23078951:23197586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_012583 // RefSeq // Rattus norvegicus hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1 (Hprt1), mRNA. // chr16 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000045153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:153249883:153281841:-1 gene:ENSRNOG00000031367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// BC098629 // GenBank // Rattus norvegicus hypoxanthine phosphoribosyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:112554 IMAGE:7386548), complete cds. // chr16 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// M63983 // GenBank // Rat hypoxanthine phosphoribosyltransferase mRNA, complete cds. // chr16 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// M86443 // GenBank // Rat hypoxanthine-guanine phosporibosyltransferase mRNA, complete cds. // chr16 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000065935 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:152822456:152854056:-1 gene:ENSRNOG00000048561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NM_178105 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein m6a (Gpm6a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein m6a (Gpm6a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:39144855:39253973:-1 gene:ENSRNOG00000010731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB089242 // GenBank // Rattus norvegicus m6a mRNA for glycoprotein m6a, complete cds. // chr16 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC088862 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein m6a, mRNA (cDNA clone MGC:105292 IMAGE:7313006), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ211804 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA79YL09 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:39146791:39242924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONRATT023298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_053653 // RefSeq // Rattus norvegicus vascular endothelial growth factor C (Vegfc), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:40216307:40331753:-1 gene:ENSRNOG00000011416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY032729 // GenBank // Rattus norvegicus VEGF-C mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:40163572:40292263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
GENSCAN00000012580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:40978661:41003935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001031641 // RefSeq // Rattus norvegicus aspartylglucosaminidase (Aga), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:40992085:41003942:-1 gene:ENSRNOG00000000108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098718 // GenBank // Rattus norvegicus aspartylglucosaminidase, mRNA (cDNA clone MGC:112709 IMAGE:7366394), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:40978661:41003935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT023310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
GENSCAN00000029355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:41375984:41377045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000045541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:41378715:41380205:-1 gene:ENSRNOG00000034147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:41379516:41694381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001013882 // RefSeq // Rattus norvegicus dCMP deaminase (Dctd), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NM_001161512 // RefSeq // Rattus norvegicus dCMP deaminase (Dctd), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000017670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:46903570:46933233:-1 gene:ENSRNOG00000013215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:46903570:46933233:-1 gene:ENSRNOG00000013215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC087138 // GenBank // Rattus norvegicus dCMP deaminase, mRNA (cDNA clone MGC:95078 IMAGE:7125992), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:46890845:46933208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001110143 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 22 (Cldn22), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000040731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47255303:47255965:-1 gene:ENSRNOG00000030889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47255303:47255965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001110144 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 24 (Cldn24), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000050279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47257468:47258130:-1 gene:ENSRNOG00000031521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47257468:47258130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001008318 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 7 (Ndufaf7), mRNA. // chr16 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// XM_006239627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 7 (Ndufaf7), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 77 // 96 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:1524703:1535937:1 gene:ENSRNOG00000005279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47476062:47477387:-1 gene:ENSRNOG00000033638 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083810 // GenBank // Rattus norvegicus similar to PRO1853 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:94867 IMAGE:7110144), complete cds. // chr16 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47476013:47477525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT046195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// NONRATT046194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT046196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:1527436:1534896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001034994 // RefSeq // Rattus norvegicus RWD domain containing 4A (Rwdd4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47578235:47594453:-1 gene:ENSRNOG00000022500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC092581 // GenBank // Rattus norvegicus RWD domain containing 4A, mRNA (cDNA clone MGC:108853 IMAGE:7369199), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ229862 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YG23 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RWD domain containing 4A (Rwdd4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT023325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47516523:47594244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001107311 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6 (Enpp6), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48028067:48150720:-1 gene:ENSRNOG00000009660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000059401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48032053:48150740:-1 gene:ENSRNOG00000009660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC158772 // GenBank // Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase 6, mRNA (cDNA clone MGC:188080 IMAGE:7128690), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006245841 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6-like (LOC100911549), mRNA. // chr16 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000001479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:10884770:10891101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48051459:48150674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT023329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT010467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001047086 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2 (Irf2), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006253136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2 (Irf2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2 (Irf2), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2 (Irf2), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2 (Irf2), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000013118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48295630:48404755:-1 gene:ENSRNOG00000009824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC166593 // GenBank // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:188358 IMAGE:7934031), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// DQ674266 // GenBank // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 2 (Irf2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48294965:48347201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT023331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000017447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48779671:48779883:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AY325228 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ba1-665 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_012922 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 3 (Casp3), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48560091:48578283:-1 gene:ENSRNOG00000010475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// BC081854 // GenBank // Rattus norvegicus caspase 3, apoptosis related cysteine protease, mRNA (cDNA clone MGC:93645 IMAGE:7104685), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// U49930 // GenBank // Rattus norvegicus ICE-like cysteine protease (Lice) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// U84410 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-1beta-converting enzyme-related protease CPP32 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48561661:48581478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT023333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
NM_001025673 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein U (Cenpu), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000041596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48613434:48636501:-1 gene:ENSRNOG00000022261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC097399 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid leukemia factor 1 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:114444 IMAGE:7453610), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000007929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48613578:48702195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT023338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_012820 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase long-chain family member 1 (Acsl1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006253123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase long-chain family member 1 (Acsl1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000014235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48653023:48697521:-1 gene:ENSRNOG00000010633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// D90109 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for long-chain acyl-CoA synthetase, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FQ217275 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA30YJ19 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT023339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000007929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48613578:48702195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// NONRATT023340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
GENSCAN00000007924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48718529:48719390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000044514 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:48845838:48846669:-1 gene:ENSRNOG00000031350 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000017459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48823378:48873782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006253157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933411K20 (RGD1307325), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000045721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48994780:49032961:-1 gene:ENSRNOG00000032192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082052 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933411K20, mRNA (cDNA clone MGC:95202 IMAGE:7132121), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48995098:49025347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT023343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001017443 // RefSeq // Rattus norvegicus Lrp2 binding protein (Lrp2bp), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006253142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Lrp2 binding protein (Lrp2bp), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Lrp2 binding protein (Lrp2bp), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49164361:49179961:-1 gene:ENSRNOG00000011178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC092575 // GenBank // Rattus norvegicus Lrp2 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:108774 IMAGE:7114719), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49164640:49179671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001014142 // RefSeq // Rattus norvegicus UFM1-specific peptidase 2 (Ufsp2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006253158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UFM1-specific peptidase 2 (Ufsp2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49192532:49211670:-1 gene:ENSRNOG00000012087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC083771 // GenBank // Rattus norvegicus UFM1-specific peptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94722 IMAGE:7193395), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000017449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49192536:49207766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT023349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT023351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT023352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT023348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT023353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT023354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
ENSRNOT00000059311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49236440:49256905:-1 gene:ENSRNOG00000021568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:46879393:46890897:-1 gene:ENSRNOG00000045697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// BC166517 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 110, mRNA (cDNA clone MGC:188094 IMAGE:7132003), complete cds. // chr16 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49243381:49245573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:46886029:46888221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49247577:49248647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// GENSCAN00000031769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:46890845:46933208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_053650 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 3 (Pdlim3), mRNA. // chr16 // 77 // 89 // 24 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49271217:49303147:-1 gene:ENSRNOG00000012658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49271217:49303147:-1 gene:ENSRNOG00000012658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AF002281 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-actinin-2 associated LIM protein mRNA, complete cds. // chr16 // 77 // 89 // 24 // 31 // 0 /// BC081703 // GenBank // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:93100 IMAGE:7193873), complete cds. // chr16 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// FQ215471 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YB23 mRNA sequence. // chr16 // 77 // 89 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000051944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49271614:49296685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT023356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT023357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// NONRATT023358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1
NM_053770 // RefSeq // Rattus norvegicus sorbin and SH3 domain containing 2 (Sorbs2), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49355585:49545433:-1 gene:ENSRNOG00000013391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF026505 // GenBank // Rattus norvegicus SH3-containing protein p4015 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000051947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49373375:49503453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT023364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NONRATT023362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_053676 // RefSeq // Rattus norvegicus melatonin receptor 1A (Mtnr1a), mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000039331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:50060173:50079905:-1 gene:ENSRNOG00000028744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AB377274 // GenBank // Rattus norvegicus Mtnr1a mRNA for melatonin receptor 1a, complete cds. // chr16 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:50060680:50065568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_031819 // RefSeq // Rattus norvegicus FAT atypical cadherin 1 (Fat1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:50093094:50220784:-1 gene:ENSRNOG00000030954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF100960 // GenBank // Rattus norvegicus protocadherin (Fat) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:50093875:50148171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT023368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000029141 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:50407805:50408903:-1 gene:ENSRNOG00000028542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:50407904:50438265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000050593 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:50730912:50731392:-1 gene:ENSRNOG00000029382 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000057789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:50730912:50731262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSRNOT00000039250 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:51020851:51021308:-1 gene:ENSRNOG00000025853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_001169119 // RefSeq // Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 26A (Adam26a), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSRNOT00000073801 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:83735503:83745087:-1 gene:ENSRNOG00000031074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0 /// XM_006247243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium binding and coiled-coil domain 2 (Calcoco2), mRNA. // chr16 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055492 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:10:83739037:83745297:-1 gene:ENSRNOG00000031074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:51472177:51511641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:83676317:83745099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 92 // 16 // 24 // 0
NM_001135090 // RefSeq // Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 34 (Adam34), mRNA. // chr16 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:51472177:51511641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001191690 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif family-like 2 (Triml2), mRNA. // chr16 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000033652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:51843224:51853840:-1 gene:ENSRNOG00000028299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000039929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:53379378:53436913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_031076 // RefSeq // Rattus norvegicus pericentriolar material 1 (Pcm1), mRNA. // chr16 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000014202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:53754432:53851213:-1 gene:ENSRNOG00000010155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000049002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:53755807:53833186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT023380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// NONRATT023382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NM_001011921 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet-derived growth factor receptor-like (Pdgfrl), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54098438:54161461:-1 gene:ENSRNOG00000010832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086555 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-derived growth factor receptor-like, mRNA (cDNA clone MGC:105544 IMAGE:7305039), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54098699:54122853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT023392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_003751603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 25-like (LOC100910977), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 25-like (LOC100910977), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54242475:54244742:-1 gene:ENSRNOG00000011397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54242463:54244688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001064767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 24 (Adam24), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_224892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 24 (Adam24), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042587 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:54333297:54335519:-1 gene:ENSRNOG00000038671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54333297:54335519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024867 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 37 homolog A (S. cerevisiae) (Vps37a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54564705:54602075:-1 gene:ENSRNOG00000012001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098069 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 37 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116266 IMAGE:7444656), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232149 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YN06 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54572069:54579166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT023403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145096 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 2 (Zdhhc2), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253189 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 2 (Zdhhc2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000036092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54635195:54704713:-1 gene:ENSRNOG00000022686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB217870 // GenBank // Rattus norvegicus dhhc2 mRNA for DHHC2, complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF228917 // GenBank // Rattus norvegicus small rec (srec) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AY886521 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC2 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// GENSCAN00000048705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54635429:54704693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT023405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001191892 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial calcium uptake family, member 3 (Micu3), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54746920:54835505:-1 gene:ENSRNOG00000012767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC091318 // GenBank // Rattus norvegicus EF hand domain family, member A2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7312992), partial cds. // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT023409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54752693:54835505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001004212 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor suppressor candidate 3 (Tusc3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor suppressor candidate 3 (Tusc3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:55949792:56097480:1 gene:ENSRNOG00000013061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079193 // GenBank // Rattus norvegicus tumor suppressor candidate 3, mRNA (cDNA clone MGC:94243 IMAGE:7131345), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ213307 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YJ08 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:55980289:56030054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT022541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000013255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:57565089:57565816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000038763 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:57565089:57566018:-1 gene:ENSRNOG00000022401 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 55 // 92 // 6 // 11 // 0
NM_001109512 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688765 (LOC688765), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042908 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:58418185:58419063:-1 gene:ENSRNOG00000032376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:58418185:58419063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT023414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107314 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 6430573F11Rik protein (RGD1304810), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 6430573F11Rik protein (RGD1304810), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 6430573F11Rik protein (RGD1304810), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:58998370:59047495:-1 gene:ENSRNOG00000011253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:58989638:59144418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT023418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000072137 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:59160368:59160896:-1 gene:ENSRNOG00000047834 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59160462:59160908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0
NM_001107315 // RefSeq // Rattus norvegicus pragma of Rnd2 (Pragmin), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:59345052:59397741:-1 gene:ENSRNOG00000011407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59345442:59481515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT023423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1-like (LOC100910088), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1-like (LOC100910088), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072307 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:59704269:59717933:-1 gene:ENSRNOG00000050320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000056302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59705538:59721142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000034715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59671357:59702120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001107316 // RefSeq // Rattus norvegicus malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 (Mfhas1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus malignant fibrous histiocytoma amplified sequence 1 (Mfhas1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000015203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:59803007:59882577:-1 gene:ENSRNOG00000011431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59873468:59882577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT023428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59767314:59835759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT023429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_138912 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3B (Ppp1r3b), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:60089267:60101512:-1 gene:ENSRNOG00000011474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC072514 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 3B, mRNA (cDNA clone MGC:91481 IMAGE:7104413), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// Y18208 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein phosphatase 1 (GL-subunit). // chr16 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT023432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:60057430:60093371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_022199 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 4 (Dusp4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:60750785:60760965:-1 gene:ENSRNOG00000011921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U23438 // GenBank // Rattus norvegicus MAP kinase phosphatase (MKP-2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:60750785:60760965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001004213 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 66 (Tmem66), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61400998:61419223:-1 gene:ENSRNOG00000012329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078979 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 66, mRNA (cDNA clone MGC:93866 IMAGE:7112025), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61383514:61419125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT023436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107317 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane bound O-acyltransferase domain containing 4 (Mboat4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61448506:61456800:-1 gene:ENSRNOG00000030102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU518497 // GenBank // Rattus norvegicus ghrelin O-acyltransferase (Mboat4) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61448506:61462220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT023437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000017777 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:61516509:61516924:-1 gene:ENSRNOG00000013310 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61516745:61522745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001107318 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIE, polypeptide 2, beta (Gtf2e2), mRNA. // chr16 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000058872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61778124:61826935:-1 gene:ENSRNOG00000014422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ225698 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YC11 mRNA sequence. // chr16 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// XM_006253231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus general transcription factor IIE, polypeptide 2, beta (Gtf2e2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT023441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61778711:61834599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT023443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_053906 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione reductase (Gsr), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000020252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61859601:61901971:-1 gene:ENSRNOG00000014915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// U73174 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione reductase mRNA, complete cds. // chr16 // 79 // 95 // 30 // 38 // 0 /// GENSCAN00000025874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61860162:61889668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT023445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT023446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
NM_017040 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, catalytic subunit, beta isozyme (Ppp2cb), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61933984:61955477:-1 gene:ENSRNOG00000015182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC085926 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, beta isoform, mRNA (cDNA clone MGC:94855 IMAGE:7109733), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M23591 // GenBank // Rat protein phosphatase 2A-beta catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61934589:61955427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001106087 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 15 (Tex15), mRNA. // chr16 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000034325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61973992:61988059:-1 gene:ENSRNOG00000007748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61976758:62011343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
XR_360515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purine-rich element binding protein G (Purg), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001191554 // RefSeq // Rattus norvegicus purine-rich element binding protein G (Purg), mRNA. // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006253235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purine-rich element binding protein G (Purg), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XR_360515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purine-rich element binding protein G (Purg), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XR_360517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purine-rich element binding protein G (Purg), transcript variant X6, misc_RNA. // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000020683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:62146553:62148455:-1 gene:ENSRNOG00000015426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006253234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purine-rich element binding protein G (Purg), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:62146696:62147751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT023450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001013883 // RefSeq // Rattus norvegicus TELO2 interacting protein 2 (Tti2), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000032467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:64394792:64402657:-1 gene:ENSRNOG00000023494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:64394890:64415453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSRNOT00000031701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:64425173:64429157:-1 gene:ENSRNOG00000023473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// XM_006222259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 122 (Rnf122), partial mRNA. // chr16 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// XM_006253258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 122 (Rnf122), partial mRNA. // chr16 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT023455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001012352 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 26 (putative) (Dusp26), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 26 (putative) (Dusp26), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000015725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:64455739:64463016:-1 gene:ENSRNOG00000011518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089954 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 26 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:109288 IMAGE:7312637), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT023461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:64456369:64484882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000058695 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:67526137:67527058:-1 gene:ENSRNOG00000038503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:67525996:67545610:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
XM_006242424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 2 (Pcbp2), transcript variant X17, mRNA. // chr16 // 53 // 90 // 10 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000055302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141870629:141894027:1 gene:ENSRNOG00000036852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 40 // 95 // 8 // 20 // 0 /// BC097410 // GenBank // Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:114455 IMAGE:7454176), complete cds. // chr16 // 42 // 90 // 8 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141806273:141893907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 90 // 10 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000016081 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:68016007:68017062:-1 gene:ENSRNOG00000012044 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 42 // 90 // 8 // 19 // 0
XM_006222260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911264 (LOC100911264), mRNA. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006253288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911264 (LOC100911264), mRNA. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058668 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:68298813:68300562:-1 gene:ENSRNOG00000038490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68294444:68325309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001014238 // RefSeq // Rattus norvegicus POTE ankyrin domain family, member G (Poteg), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POTE ankyrin domain family, member G (Poteg), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68441440:68459317:-1 gene:ENSRNOG00000012218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC079270 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921537P18, mRNA (cDNA clone MGC:94381 IMAGE:7133714), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68451045:68459183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT023465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_133597 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, beta 3 (neuronal) (Chrnb3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68502911:68539031:-1 gene:ENSRNOG00000012448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY574259 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta3 subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// J04636 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinic acetylcholine receptor beta-3 subunit precursor, mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68504647:68529514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000058643 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:68561143:68562272:-1 gene:ENSRNOG00000038481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002728426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed gene 24-like (LOC100363124), mRNA. // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_003752934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed gene 24-like (LOC100363124), mRNA. // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68561469:68565040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_053857 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 1 (Eif4ebp1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68580280:68593651:-1 gene:ENSRNOG00000012582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U05014 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague/Dawley PHAS-I mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68581577:68582558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT023470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT023471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_003751617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 124 (LOC100363275), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000017776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68769891:68805960:-1 gene:ENSRNOG00000012991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68769891:68805939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT023473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT023476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT023474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001107320 // RefSeq // Rattus norvegicus proline synthetase co-transcribed homolog (bacterial) (Prosc), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68838027:68849618:-1 gene:ENSRNOG00000013751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68838133:68849355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT023479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001106088 // RefSeq // Rattus norvegicus ER lipid raft associated 2 (Erlin2), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68853256:68868395:-1 gene:ENSRNOG00000013763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC168668 // GenBank // Rattus norvegicus ER lipid raft associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:188446 IMAGE:7934033), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68855366:68903678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT023481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_001109425 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 703 (Zfp703), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68911230:68915401:-1 gene:ENSRNOG00000014199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68912627:68931122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001070930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36-like (RGD1564690), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_344533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36-like (RGD1564690), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68935485:68935793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_001008340 // RefSeq // Rattus norvegicus THAP domain containing, apoptosis associated protein 1 (Thap1), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70327540:70332022:-1 gene:ENSRNOG00000014213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC086347 // GenBank // Rattus norvegicus THAP domain containing, apoptosis associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105527 IMAGE:7302510), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// JF423321 // GenBank // Rattus norvegicus THAP domain-containing apoptosis-associated protein 1 transcript variant 2 (Thap1) mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70327638:70414099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XM_006222270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel, subfamily U, member 1 (Kcnu1), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006253336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel, subfamily U, member 1 (Kcnu1), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019935 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:70577723:70663214:-1 gene:ENSRNOG00000014741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70581846:70647150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_031558 // RefSeq // Rattus norvegicus steroidogenic acute regulatory protein (Star), mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70698593:70705478:-1 gene:ENSRNOG00000015052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB001349 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for steroidogenic acute regulatory protein, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB006007 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for steroidogenic acute regulatory protein, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF044081 // GenBank // Rattus norvegicus steroidogenic acute regulatory protein (StAR) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AY736357 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley steroidogenic acute regulatory protein mRNA, complete cds. // chr16 // 90 // 70 // 19 // 21 // 0 /// BC088859 // GenBank // Rattus norvegicus steroidogenic acute regulatory protein, mRNA (cDNA clone MGC:105401 IMAGE:7311249), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70701060:70705404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U76419 // GenBank // Rattus norvegicus steroidogenic acute regulatory protein (StAR) mRNA, complete cds. // chr16 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_001108876 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM1, U6 small nuclear RNA associated (Lsm1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70711151:70722559:-1 gene:ENSRNOG00000015375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ220497 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YK14 mRNA sequence. // chr16 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70711612:70716562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001109411 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 1B (Ppapdc1b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70782080:70786221:-1 gene:ENSRNOG00000015568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70782739:70786181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT023496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT023492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001106090 // RefSeq // Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1-like 1 (Whsc1l1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006253306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1-like 1 (Whsc1l1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000066974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70791573:70897651:-1 gene:ENSRNOG00000015621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC100146 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7444458, with apparent retained intron. // chr16 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// GENSCAN00000019006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70791851:70864067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT023499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT023500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_024146 // RefSeq // Rattus norvegicus Fibroblast growth factor receptor 1 (Fgfr1), mRNA. // chr16 // 81 // 82 // 25 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000029284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70925604:70965251:-1 gene:ENSRNOG00000016050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000050980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70925574:70978004:-1 gene:ENSRNOG00000016050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// D12498 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FGF receptor-1, complete cds. // chr16 // 81 // 82 // 25 // 31 // 0 /// S54008 // GenBank // fibroblast growth factor receptor 1 beta-isoform [Rattus norvegicus=Norway rat, Sprague-Dawley, kidneys, mRNA, 2520 nt]. // chr16 // 94 // 82 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70925604:70949387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT023507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1 /// NONRATT023510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_001017444 // RefSeq // Rattus norvegicus TM2 domain containing 2 (Tm2d2), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71453136:71458658:-1 gene:ENSRNOG00000016559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC093382 // GenBank // Rattus norvegicus TM2 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:112677 IMAGE:7389050), complete cds. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71453656:71457976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT023516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001134747 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, matrin type 4 (Zmat4), mRNA. // chr16 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// BC168220 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, matrin type 4, mRNA (cDNA clone MGC:188207 IMAGE:7320571), complete cds. // chr16 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT023519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001276712 // RefSeq // Rattus norvegicus secreted frizzled-related protein 1 (Sfrp1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73009689:73045509:-1 gene:ENSRNOG00000017783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73036431:73045509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT023521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109455 // RefSeq // Rattus norvegicus NK6 homeobox 3 (Nkx6-3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73297719:73302932:-1 gene:ENSRNOG00000018147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73298500:73333503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107322 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin 1, erythrocytic (Ank1), mRNA. // chr16 // 97 // 83 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000064070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73314002:73459822:-1 gene:ENSRNOG00000018241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 83 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000046808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73397194:73453223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT023523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000046800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73298500:73333503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
NM_001100570 // RefSeq // Rattus norvegicus K(lysine) acetyltransferase 6A (Kat6a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000037389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73577853:73655378:-1 gene:ENSRNOG00000025174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73577853:73623877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT023537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XR_341207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556951 (LOC102556951), ncRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013151 // RefSeq // Rattus norvegicus plasminogen activator, tissue (Plat), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_003751623 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tissue-type plasminogen activator-like (LOC100910418), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006253344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tissue-type plasminogen activator-like (LOC100910418), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// XM_006253345 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tissue-type plasminogen activator-like (LOC100910418), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// XM_006253347 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plasminogen activator, tissue (Plat), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73730256:73754851:-1 gene:ENSRNOG00000019018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061565 // GenBank // Rattus norvegicus plasminogen activator, tissue, mRNA (cDNA clone MGC:72909 IMAGE:6920438), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// M23697 // GenBank // Rat tissue-type plasminogen activator (t-PA) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73730993:73753533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73379082:73395584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001109332 // RefSeq // Rattus norvegicus dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 4 (Dkk4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73893385:73896976:-1 gene:ENSRNOG00000019267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73894286:73896836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT023544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017223 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 20 (phosphate transporter), member 2 (Slc20a2), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000026418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73949887:74042911:-1 gene:ENSRNOG00000019490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// AY325148 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-188 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// BC070908 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 20 (phosphate transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:91730 IMAGE:7103640), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// L19931 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-dependent phosphate transporter 2 (Slc20a2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000016981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73949490:73972450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT023545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT023546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1
NM_001106091 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S31 (Mrps31), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74102247:74133103:-1 gene:ENSRNOG00000011839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158691 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S31, mRNA (cDNA clone MGC:187712 IMAGE:9021908), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74075400:74126726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT023547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108877 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane phosphoinositide 3-phosphatase and tensin homolog 2 (Tpte2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74195701:74298014:-1 gene:ENSRNOG00000024837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74228259:74356762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001108878 // RefSeq // Rattus norvegicus thrombospondin, type I, domain containing 1 (Thsd1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74316449:74346243:-1 gene:ENSRNOG00000012108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC162035 // GenBank // Rattus norvegicus thrombospondin, type I, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187951 IMAGE:7097232), complete cds. // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74228259:74356762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106092 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 36 homolog (S. cerevisiae) (Vps36), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74355188:74378996:-1 gene:ENSRNOG00000012654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC160860 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 36 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188216 IMAGE:7321877), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ217181 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA33YC21 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT023554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74358468:74378962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT023555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT023556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001108401 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG11, alpha-1,2-mannosyltransferase (Alg11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000017164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74487293:74494498:-1 gene:ENSRNOG00000012841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC158702 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9029294, containing frame-shift errors. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74487422:74523785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT023560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
ENSRNOT00000018362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74588763:74592918:-1 gene:ENSRNOG00000013740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169046 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700112P19, mRNA (cDNA clone MGC:189436 IMAGE:7454965), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74589741:74627509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037503 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 13 (Defb13), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74651452:74653298:-1 gene:ENSRNOG00000038157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY621345 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 13 (Defb13) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037514 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 12 (Defb12), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74737487:74739902:-1 gene:ENSRNOG00000038155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621344 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 12 (Defb12) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74727424:74739902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001037505 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 11 (Defb11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000058063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74767480:74774364:-1 gene:ENSRNOG00000038151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY621343 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 11 (Defb11) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT023570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT023571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001037509 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 9 (Defb9), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000058061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74794775:74797558:-1 gene:ENSRNOG00000038149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY621341 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 9 (Defb9) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006253374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus defensin beta 9 (Defb9), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// NONRATT023572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001037510 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 10 (Defb10), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000058059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74815823:74825537:-1 gene:ENSRNOG00000038148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY621342 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 10 (Defb10) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT023573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74790200:74884779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001037507 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 2 (Defb2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000058056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74844019:74857854:-1 gene:ENSRNOG00000038147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY621338 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 2 (Defb2) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74790200:74884779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_001037513 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 50 (Defb50), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74866171:74877668:-1 gene:ENSRNOG00000033972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168240 // GenBank // Rattus norvegicus defensin beta 50, mRNA (cDNA clone MGC:188363 IMAGE:7939010), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ012090 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 50 (Defb50) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74790200:74884779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT023575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031810 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 1 (Defb1), mRNA. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74908902:74923643:-1 gene:ENSRNOG00000013768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF068860 // GenBank // Rattus norvegicus beta defensin-1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AF093536 // GenBank // Rattus norvegicus beta defensin-1 (BD-1) mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// X89820 // GenBank // R.norvegicus mRNA for 3UTR of CDK4 (unknown) protein. // chr16 // 69 // 64 // 11 // 16 // 0 /// NONRATT023576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74909022:74930015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_173329 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin, alpha 5, Paneth cell-specific (Defa5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74952573:74954873:-1 gene:ENSRNOG00000030093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U16685 // GenBank // Rattus norvegicus defensin RatNP-2 precursor mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// U16686 // GenBank // Rattus norvegicus defensin RatNP-1 precursor mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT023577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74952653:74960592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001013053 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin alpha 24 (Defa24), mRNA. // chr16 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74959602:74960638:-1 gene:ENSRNOG00000030524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF115768 // GenBank // Rattus norvegicus defensin-5 precursor mRNA, partial cds. // chr16 // 64 // 85 // 14 // 22 // 0 /// NONRATT023579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74952653:74960592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001033075 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin alpha 7 (Defa7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000029297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75029574:75030343:-1 gene:ENSRNOG00000038141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY623751 // GenBank // Rattus norvegicus defensin alpha 7 (Defa7) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT023580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75025989:75037036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
XM_003751624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100359819 (LOC100359819), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 57 // 88 // 13 // 23 // 0 /// AY746423 // GenBank // Rattus norvegicus defensin alpha 13 (Defa13-ps) pseudogene mRNA, complete sequence. // chr16 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
NM_001079898 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin RatNP-3 precursor (RatNP-3b), mRNA. // chr16 // 100 // 42 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74952566:75131342:-1 gene:ENSRNOG00000038135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 42 // 19 // 22 // 0 /// U16683 // GenBank // Rattus norvegicus defensin RatNP-3 precursor mRNA, complete cds. // chr16 // 91 // 42 // 20 // 22 // 0 /// NM_173299 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin NP-4 precursor (Np4), mRNA. // chr16 // 49 // 49 // 26 // 53 // 1 /// ENSRNOT00000035128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75079896:75082453:-1 gene:ENSRNOG00000028707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 49 // 49 // 26 // 53 // 1 /// U16684 // GenBank // Rattus norvegicus defensin RatNP-4 precursor mRNA, complete cds. // chr16 // 49 // 49 // 26 // 53 // 1 /// GENSCAN00000016402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75079970:75080834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 80 // 28 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75129270:75130161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 21 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT023581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 51 // 51 // 27 // 53 // 1 /// NONRATT023582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 21 // 53 // 1
NM_001033074 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin alpha 10 (Defa10), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// AY623754 // GenBank // Rattus norvegicus defensin alpha 10 (Defa10) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000058039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75080037:75099661:-1 gene:ENSRNOG00000028707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 100 // 10 // 23 // 0 /// NONRATT023581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 55 // 87 // 11 // 20 // 0 /// NONRATT023582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 55 // 87 // 11 // 20 // 0 /// GENSCAN00000016399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75095767:75118985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001033078 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin alpha 11 (Defa11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000058037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75118154:75118985:-1 gene:ENSRNOG00000038133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY623755 // GenBank // Rattus norvegicus defensin alpha 11 (Defa11) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT023583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75095767:75118985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_001037523 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 33 (Defb33), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus defensin beta 33 (Defb33), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75179855:75182474:-1 gene:ENSRNOG00000038128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621362 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 33 (Defb33) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037548 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-defensin 3 (Defb3), mRNA. // chr16 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NM_001037549 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 5 (Defb5), mRNA. // chr16 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75198021:75200181:-1 gene:ENSRNOG00000038126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000058030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75190228:75200181:-1 gene:ENSRNOG00000038126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AY621339 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 3 (Defb3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AY621340 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 5 (Defb5) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// AF068861 // GenBank // Rattus norvegicus beta defensin-2 mRNA, complete cds. // chr16 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000025699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75190228:75200181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_022544 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 4 (Defb4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000058029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75234830:75238021:-1 gene:ENSRNOG00000013939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY621374 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 4 (Defb4) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF068861 // GenBank // Rattus norvegicus beta defensin-2 mRNA, complete cds. // chr16 // 67 // 71 // 10 // 15 // 0 /// NONRATT023588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001037504 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 14 (Defb14), mRNA. // chr16 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// XM_006253373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus defensin beta 14 (Defb14), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75247912:75248770:-1 gene:ENSRNOG00000032304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// AY621346 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 14 (Defb14) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT023589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75247912:75279086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_145087 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 11B (Spag11b), mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75266144:75267887:-1 gene:ENSRNOG00000013957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF217088 // GenBank // Rattus norvegicus anti-microbial-like protein BIN-1B (Bin-1b) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT023590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001037850 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 11C (Spag11c), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NM_001037852 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 11C (Spag11c), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000046821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74763444:74765458:1 gene:ENSRNOG00000031111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74763464:74765458:1 gene:ENSRNOG00000031111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 94 // 28 // 31 // 0 /// AY600145 // GenBank // Rattus norvegicus SPAG11C (Spag11) mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 79 // 23 // 26 // 0 /// DQ012092 // GenBank // Rattus norvegicus sperm-associated antigen 11 variant C (Spag11) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// DQ012093 // GenBank // Rattus norvegicus sperm-associated antigen 11 variant C isoform 1 (Spag11) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AY600144 // GenBank // Rattus norvegicus SPAG11T (Spag11) mRNA, complete cds. // chr16 // 81 // 48 // 13 // 16 // 0 /// NONRATT022734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// NONRATT022735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0
NM_001037520 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 15 (Defb15), mRNA. // chr16 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74742481:74745112:1 gene:ENSRNOG00000045897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000058066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74663812:74666453:1 gene:ENSRNOG00000048359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// AY621347 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 15 (Defb15) mRNA, complete cds. // chr16 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// NONRATT022733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74660632:74667976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001134744 // RefSeq // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 5 (Agpat5), mRNA. // chr16 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000031291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75417609:75460357:-1 gene:ENSRNOG00000028623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// BC168222 // GenBank // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 5 (lysophosphatidic acid acyltransferase, epsilon), mRNA (cDNA clone MGC:188222 IMAGE:7323695), complete cds. // chr16 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75418947:75469195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_022867 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta (Map1lc3b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000067141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64373068:64381399:1 gene:ENSRNOG00000017905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY206669 // GenBank // Rattus norvegicus map1a/1b light chain 3b mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY392036 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 (Map1lc3) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC058144 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta, mRNA (cDNA clone MGC:72811 IMAGE:6889616), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC083556 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta, mRNA (cDNA clone MGC:93422 IMAGE:7189855), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ221245 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA38YL15 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ228912 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YJ17 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// U05784 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated proteins 1A and 1B light chain 3 subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// ENSRNOT00000019033 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:75478724:75479098:-1 gene:ENSRNOG00000038106 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75478724:75517035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
XM_006222285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microcephalin 1 (Mcph1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microcephalin 1 (Mcph1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microcephalin 1 (Mcph1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microcephalin 1 (Mcph1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microcephalin 1 (Mcph1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_225006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microcephalin 1 (Mcph1), transcript variant X7, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75509829:75715383:-1 gene:ENSRNOG00000028586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75683933:75815051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
NM_001169141 // RefSeq // Rattus norvegicus myomesin 2 (Myom2), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:79165318:79248430:-1 gene:ENSRNOG00000011754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000043290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:79165318:79201354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT023603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// GENSCAN00000043304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:79208400:79276980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_001107326 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 11 (Kbtbd11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:79275079:79276980:-1 gene:ENSRNOG00000012333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:79208400:79276980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10 (Arhgef10), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10 (Arhgef10), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 10 (Arhgef10), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:79303507:79377402:-1 gene:ENSRNOG00000012561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:79303507:79377402:-1 gene:ENSRNOG00000012561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:79303507:79377756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001007686 // RefSeq // Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 8 (epilepsy, progressive with mental retardation) (Cln8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:79403688:79413576:-1 gene:ENSRNOG00000012565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078982 // GenBank // Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 8, mRNA (cDNA clone MGC:93871 IMAGE:7112147), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:79404882:79437004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT023610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053901 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 2 (Dlgap2), mRNA. // chr16 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000057845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:79447602:79750039:-1 gene:ENSRNOG00000012573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// U67138 // GenBank // Rattus norvegicus PSD-95/SAP90-associated protein-2 mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:79447878:79549030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
NONRATT023612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001107329 // RefSeq // Rattus norvegicus chromosome alignment maintaining phosphoprotein 1 (Champ1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80403595:80414561:-1 gene:ENSRNOG00000000112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168662 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 828, mRNA (cDNA clone MGC:188407 IMAGE:7930141), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80405032:80407437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012159 // RefSeq // Rattus norvegicus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast) (Upf3a), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81009176:81020604:1 gene:ENSRNOG00000017397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC088463 // GenBank // Rattus norvegicus UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog A (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:95118 IMAGE:7127783), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81009204:81020348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001024744 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 16 (Cdc16), mRNA. // chr16 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80981550:81004585:1 gene:ENSRNOG00000017536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC097498 // GenBank // Rattus norvegicus CDC16 cell division cycle 16 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114573 IMAGE:7462333), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000041188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80981574:81004338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT022770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT022771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSRNOT00000052913 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:16:80959219:80959336:1 gene:ENSRNOG00000034790 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106094 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 255B (Tmem255b), mRNA. // chr16 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// XM_006253434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 255B (Tmem255b), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 255B (Tmem255b), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000042465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80692961:80697619:1 gene:ENSRNOG00000026336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC169123 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 70, member B, mRNA (cDNA clone MGC:189567 IMAGE:6887046), complete cds. // chr16 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000041195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80663520:80699734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT022767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_031096 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 1 (Grk1), mRNA. // chr16 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80642049:80653999:1 gene:ENSRNOG00000018430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U63971 // GenBank // Rattus norvegicus rhodopsin kinase mRNA, complete cds. // chr16 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80642233:80653769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT022764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006253451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to transcription factor (MGC112830), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006253452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to transcription factor (MGC112830), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80578524:80615798:1 gene:ENSRNOG00000019222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC098789 // GenBank // Rattus norvegicus similar to transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:112830 IMAGE:7375514), complete cds. // chr16 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80602497:80614658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT022759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT022762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001135857 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 3 (Tmco3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006253449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 3 (Tmco3), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81037226:81075420:-1 gene:ENSRNOG00000019346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006253406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 3 (Tmco3), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// XM_006253407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 3 (Tmco3), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000057761 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:80471613:80477237:1 gene:ENSRNOG00000046973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81038051:81075556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80439971:80481020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT023636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_012857 // RefSeq // Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein 1 (Lamp1), mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81175815:81192800:-1 gene:ENSRNOG00000019629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// FQ220627 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YD14 mRNA sequence. // chr16 // 89 // 25 // 8 // 9 // 0 /// M34959 // GenBank // Rattus 120 Kd lysosomal membrane glycoprotein mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81176493:81192697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT023642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT023643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT023644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001127301 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin 4A (Cul4a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000026653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81204992:81242020:-1 gene:ENSRNOG00000019649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC166799 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cullin 4A, mRNA (cDNA clone MGC:188598 IMAGE:7938235), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// FQ210009 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YF15 mRNA sequence. // chr16 // 90 // 100 // 37 // 41 // 0 /// GENSCAN00000043438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81205537:81228010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT023647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// NONRATT023649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// NONRATT023645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
ENSRNOT00000026666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81271366:81283180:-1 gene:ENSRNOG00000019700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81271366:81279598:-1 gene:ENSRNOG00000019700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// FQ209855 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YO02 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81272042:81283166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_017143 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor X (F10), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81288538:81307842:-1 gene:ENSRNOG00000033444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC088151 // GenBank // Rattus norvegicus coagulation factor X, mRNA (cDNA clone MGC:108722 IMAGE:7383301), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211285 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA13YL10 mRNA sequence. // chr16 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// FQ219425 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YF09 mRNA sequence. // chr16 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000043378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81288554:81307739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT023653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_152846 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor VII (serum prothrombin conversion accelerator) (F7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coagulation factor VII (serum prothrombin conversion accelerator) (F7), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000037806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81309976:81320833:-1 gene:ENSRNOG00000032737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF532184 // GenBank // Rattus norvegicus coagulation factor VII mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81309976:81325733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053951 // RefSeq // Rattus norvegicus MCF.2 cell line derived transforming sequence-like (Mcf2l), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// XM_006253423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MCF.2 cell line derived transforming sequence-like (Mcf2l), transcript variant X8, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// XM_006253424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MCF.2 cell line derived transforming sequence-like (Mcf2l), transcript variant X9, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// XM_006253425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MCF.2 cell line derived transforming sequence-like (Mcf2l), transcript variant X10, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// XM_006253427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MCF.2 cell line derived transforming sequence-like (Mcf2l), transcript variant X12, mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000023352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81326363:81430900:-1 gene:ENSRNOG00000028426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000043170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81326363:81465756:-1 gene:ENSRNOG00000028426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// Z35654 // GenBank // R.norvegicus mRNA for Ost oncogene. // chr16 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT023655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81327200:81398315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_001107324 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, class VI, type 11A (Atp11a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81476069:81586090:-1 gene:ENSRNOG00000017154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY064511 // GenBank // Rattus norvegicus putative UA20 protein (Ua20) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222294 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA25YI02 mRNA sequence. // chr16 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071773 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:81476070:81477425:-1 gene:ENSRNOG00000045729 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107324 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, class VI, type 11A (Atp11a), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class VI, type 11A (Atp11a), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81476069:81586090:-1 gene:ENSRNOG00000017154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81439340:81533024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
XM_006222297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm acrosome associated 7 (Spaca7), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm acrosome associated 7 (Spaca7), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81746026:81793775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
XR_360640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553495 (LOC102553495), transcript variant X2, ncRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040315 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:81923060:81923819:-1 gene:ENSRNOG00000031681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81860173:81924773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT023668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001017508 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 29 (Tex29), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:82458380:82472372:-1 gene:ENSRNOG00000033585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82426604:82477773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001038591 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 1 (Ing1), mRNA. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:82745456:82746160:-1 gene:ENSRNOG00000014520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// AY624101 // GenBank // Rattus norvegicus p33ING1b mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// AY624102 // GenBank // Rattus norvegicus p33ING1b mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// AY624103 // GenBank // Rattus norvegicus p24ING1c variant 1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AY624104 // GenBank // Rattus norvegicus p24ING1c variant 1 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AY624105 // GenBank // Rattus norvegicus p24ING1c variant 2 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// BC166594 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:188361 IMAGE:7937717), complete cds. // chr16 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// FQ232764 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YI08 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// FQ232985 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YK13 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000013597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82732407:82751125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001108402 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate kinase domain containing (Carkd), mRNA. // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:82791870:82809822:-1 gene:ENSRNOG00000015021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC101881 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7929602. // chr16 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// FQ225763 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA47YJ19 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82793675:82809756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT023682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT023684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT023683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
XM_001076134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type IV, alpha 2 (Col4a2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000057461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:82853206:82987193:-1 gene:ENSRNOG00000023972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000013586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82848497:82964395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT023687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
XM_001076134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type IV, alpha 2 (Col4a2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:82853206:82987193:-1 gene:ENSRNOG00000023972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82848497:82964395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001076134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type IV, alpha 2 (Col4a2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:82853206:82987193:-1 gene:ENSRNOG00000023972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_138893 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin XVI (Myo16), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000022742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:84026826:84387681:-1 gene:ENSRNOG00000016483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AF209114 // GenBank // Rattus norvegicus myosin heavy chain Myr 8 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AY004215 // GenBank // Rattus norvegicus myosin heavy chain Myr 8b mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:84267291:84306915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT023692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000026270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:84106166:84257507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
XM_006253480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 13b (Tnfsf13b), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001109112 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 13b (Tnfsf13b), mRNA. // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000067511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:84726871:84745131:-1 gene:ENSRNOG00000014464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000043541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:84715485:84744825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001271072 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 13 (Abhd13), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:84756698:84769135:-1 gene:ENSRNOG00000014598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ221944 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YL22 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT023698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:84758283:84773644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000037018 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:84902421:84903119:-1 gene:ENSRNOG00000024169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:84893653:84921121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0
XM_001076564 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein Pegasus-like (RGD1564807), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_225049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein Pegasus-like (RGD1564807), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057349 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:85995314:85996507:-1 gene:ENSRNOG00000031728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:85995314:85996507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001004072 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 1 (Pdha1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019797 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:87742772:87744028:-1 gene:ENSRNOG00000014745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000038352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:37640725:37654356:1 gene:ENSRNOG00000025383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC098897 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:114215 IMAGE:7103543), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:37640763:37652753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:87712553:87753076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT058761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT058763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT058762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT058764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_001076846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L23a-like (RGD1565806), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_225053 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L23a-like (RGD1565806), mRNA. // chrU // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:87972363:87972785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000019908 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:88573570:88575612:-1 gene:ENSRNOG00000014803 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:88573537:88604861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XR_085646 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690203 (LOC690203), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_086052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690203 (LOC690203), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:89794035:89913716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001106096 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 2 (Gdf2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8588086:8593750:1 gene:ENSRNOG00000050928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8588203:8592569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001002852 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 4 (Spata4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:39736340:39745690:-1 gene:ENSRNOG00000048035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY653229 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis-associated 4 (Spata4) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:39736426:39800875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001014004 // RefSeq // Rattus norvegicus aminomethyltransferase (Amt), mRNA. // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116421431:116427436:1 gene:ENSRNOG00000050214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC083803 // GenBank // Rattus norvegicus aminomethyltransferase (glycine cleavage system protein T), mRNA (cDNA clone MGC:94838 IMAGE:7109120), complete cds. // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116369317:116426717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_057132 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member A (Rhoa), mRNA. // chr8 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116431339:116464929:1 gene:ENSRNOG00000050519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY026068 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY RhoA small GTPase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// AY026069 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR RhoA small GTPase mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// BC061732 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member A, mRNA (cDNA clone MGC:72339 IMAGE:5598621), complete cds. // chr8 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// FQ214994 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YD20 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0
NM_001106093 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 4 (proto-oncogene) (Usp4), transcript variant 2, mRNA. // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NM_001135012 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 4 (proto-oncogene) (Usp4), transcript variant 1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000071561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116474847:116518209:1 gene:ENSRNOG00000046486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000073725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116474847:116518209:1 gene:ENSRNOG00000046486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC166460 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 4 (proto-oncogene), mRNA (cDNA clone MGC:187765 IMAGE:9027936), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000056597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116474871:116517696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 97 // 89 // 38 // 39 // 0
NM_001109113 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC498675 (LOC498675), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075271 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:116518983:116523598:1 gene:ENSRNOG00000046155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116521314:116527705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001109389 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680045 (LOC680045), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073445 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:116565953:116575596:1 gene:ENSRNOG00000047468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116559556:116575596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024904 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 71 (Ccdc71), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116590946:116594850:1 gene:ENSRNOG00000048718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098020 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 71, mRNA (cDNA clone MGC:116171 IMAGE:7455232), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116593315:116594619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_012974 // RefSeq // Rattus norvegicus laminin, beta 2 (Lamb2), mRNA. // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000072098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116613077:116625217:1 gene:ENSRNOG00000047768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC088400 // GenBank // Rattus norvegicus laminin, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:93588 IMAGE:7107264), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000056609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116600064:116636054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001001516 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 19 (Usp19), mRNA. // chr8 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_006243797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 19 (Usp19), transcript variant X5, mRNA. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116625536:116635791:1 gene:ENSRNOG00000049531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY605065 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific protease 19 (Usp19) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// BC168243 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7934570. // chr8 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116600064:116636054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1
NM_001007624 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaminyl-tRNA synthetase (Qars), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116642373:116650404:1 gene:ENSRNOG00000043447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC082002 // GenBank // Rattus norvegicus glutaminyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:94241 IMAGE:7131336), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116642725:116650315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001014005 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell leukemia translocation altered (Tcta), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116427899:116430966:-1 gene:ENSRNOG00000048237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083731 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell leukemia translocation altered gene, mRNA (cDNA clone MGC:94634 IMAGE:7191343), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ229045 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA4YD18 mRNA sequence. // chr8 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116430218:116431448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_001055346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 36 (Ccdc36), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 36 (Ccdc36), transcript variant X1, mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071189 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:116531706:116555466:-1 gene:ENSRNOG00000048919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007685 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch domain containing 8B (Klhdc8b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:116576640:116581366:-1 gene:ENSRNOG00000047867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083777 // GenBank // Rattus norvegicus kelch domain containing 8B, mRNA (cDNA clone MGC:94736 IMAGE:7193594), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:116577154:116591095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000017050 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:35227893:35228466:1 gene:ENSRNOG00000012773 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:35214186:35228172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001107331 // RefSeq // Rattus norvegicus iroquois homeobox 1 (Irx1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:35319895:35325724:1 gene:ENSRNOG00000033609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:35318978:35366490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT000246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
XM_003748684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 16 (Adamts16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// XM_003753157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 16 (Adamts16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022707 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:36469171:36563053:1 gene:ENSRNOG00000016812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000022790 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:36469171:36573515:1 gene:ENSRNOG00000016812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 55 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:36498564:36549304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT000248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
XM_001062297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to KIAA0947 protein (RGD1309747), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// XM_225143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to KIAA0947 protein (RGD1309747), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000061873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:36680380:36718654:1 gene:ENSRNOG00000023053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:36663462:36718654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT000252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT000249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_031025 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrolipoamide S-acetyltransferase (Dlat), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000023010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:37265515:37268822:1 gene:ENSRNOG00000017095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000032152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:53659922:53685238:-1 gene:ENSRNOG00000009994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC107440 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrolipoamide S-acetyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:125038 IMAGE:7115402), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000014791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:53660613:53768837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:37220672:37316506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 61 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT054989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001145163 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family-like 1 (Ube2ql1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:37582312:37622672:1 gene:ENSRNOG00000034075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:37557502:37587340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT000257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_017070 // RefSeq // Rattus norvegicus steroid-5-alpha-reductase, alpha polypeptide 1 (3-oxo-5 alpha-steroid delta 4-dehydrogenase alpha 1) (Srd5a1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:37717525:37751715:1 gene:ENSRNOG00000017601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC127454 // GenBank // Rattus norvegicus steroid-5-alpha-reductase, alpha polypeptide 1 (3-oxo-5 alpha-steroid delta 4-dehydrogenase alpha 1), mRNA (cDNA clone MGC:156498 IMAGE:7313862), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// J05035 // GenBank // Rat steroid 5 alpha-reductase mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT000258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:37717682:37828490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001107333 // RefSeq // Rattus norvegicus PAP associated domain containing 7 (Papd7), mRNA. // chr1 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:37797465:37830260:1 gene:ENSRNOG00000017613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:37717682:37828490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NM_031007 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 2 (brain) (Adcy2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:38887240:39080014:1 gene:ENSRNOG00000032150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// M80550 // GenBank // Rat adenylyl cyclase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:38800499:38918430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000036160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:38957925:39079356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_017257 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 2 (Psme2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000026279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38155752:38160046:-1 gene:ENSRNOG00000019246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// BC058486 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:72873 IMAGE:6918985), complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// BC097331 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:114338 IMAGE:7389180), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// D45250 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proteasome activator rPA28 subunit beta, complete cds. // chr1 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// FQ227049 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YH03 mRNA sequence. // chr1 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:38939274:38939990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT000262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT000263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT000264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT021312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0 /// NONRATT021314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 100 // 9 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38149179:38160044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NONRATT000262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006227814 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase (Mtrr), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:39124771:39155639:1 gene:ENSRNOG00000017826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_001039003 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase (Mtrr), mRNA. // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000061790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:39124771:39155639:1 gene:ENSRNOG00000017826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// BC100107 // GenBank // Rattus norvegicus 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase, mRNA (cDNA clone MGC:112912 IMAGE:7379770), complete cds. // chr1 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000036176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:39125756:39154874:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT000267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT000268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT000269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001001122 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1652 (Olr1652), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:4938057:4938983:-1 gene:ENSRNOG00000018492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000031981 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:4912995:4914270:-1 gene:ENSRNOG00000027390 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:4912995:4914357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001107334 // RefSeq // Rattus norvegicus hippocampus abundant transcript-like 1 (Hiatl1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:4842401:4894767:-1 gene:ENSRNOG00000018227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC166784 // GenBank // Rattus norvegicus hippocampus abundant transcript-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188565 IMAGE:7935371), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ230882 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA83YC10 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:4843706:4867393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT024672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006222308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 47 (Prss47), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006253500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 47 (Prss47), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000047872 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:5046469:5059824:-1 gene:ENSRNOG00000031461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:5043149:5114249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0
XR_146664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY387076 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00090 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:2424049:2424611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XR_146664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_360682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY387076 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00090 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046779 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:2355535:2370960:-1 gene:ENSRNOG00000048076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:2358544:2374538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_146664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_360682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XR_146664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), transcript variant X1, misc_RNA. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_360682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), misc_RNA. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046525 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:2188225:2271053:-1 gene:ENSRNOG00000027309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:2188198:2296390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XR_146664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_360682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046525 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:2188225:2271053:-1 gene:ENSRNOG00000027309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:2188198:2296390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_146664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), transcript variant X1, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_360682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Contactin associated protein-like 3 precursor (Cell recognition molecule Caspr3) (RGD1563615), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046525 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:2188225:2271053:-1 gene:ENSRNOG00000027309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:2188198:2296390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001047907 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 3 (Srsf3), mRNA. // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000000627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8534915:8544847:1 gene:ENSRNOG00000000520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000025031 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:1897839:1898180:-1 gene:ENSRNOG00000018554 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000009524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8536730:8560438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// NONRATT032905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// NONRATT032906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// NONRATT032907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// NONRATT037317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 21 // 100 // 9 // 43 // 0 /// NONRATT037318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 21 // 100 // 9 // 43 // 0
NM_013156 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin L (Ctsl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1861404:1867575:-1 gene:ENSRNOG00000018566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB630323 // GenBank // Rattus norvegicus CatL mRNA for cathepsin L, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC063175 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin L1, mRNA (cDNA clone MGC:72924 IMAGE:6918389), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ219181 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YB10 mRNA sequence. // chr17 // 77 // 100 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1861698:1865863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006253495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AhpC/TSA antioxidant enzyme domain containing 1 (Aaed1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001109114 // RefSeq // Rattus norvegicus AhpC/TSA antioxidant enzyme domain containing 1 (Aaed1), mRNA. // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000066230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1787661:1819338:-1 gene:ENSRNOG00000018886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000008388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1799472:1819288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001108404 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 14B (Cdc14b), mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1699259:1786825:-1 gene:ENSRNOG00000018999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1701643:1760843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT024657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT024660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NONRATT024657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012051 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 367 (Zfp367), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1642451:1661577:-1 gene:ENSRNOG00000027234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC085804 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 367, mRNA (cDNA clone MGC:93863 IMAGE:7111996), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1644731:1661388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT024655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001106098 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35 (UDP-GlcNAc/UDP-glucose transporter), member D2 (Slc35d2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35 (UDP-GlcNAc/UDP-glucose transporter), member D2 (Slc35d2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35 (UDP-GlcNAc/UDP-glucose transporter), member D2 (Slc35d2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000036212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1608197:1638555:-1 gene:ENSRNOG00000027229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1608728:1638507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT024652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_054007 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 3 (Hsd17b3), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006253487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 3 (Hsd17b3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1570077:1600301:-1 gene:ENSRNOG00000019096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF035156 // GenBank // Rattus norvegicus testicular 17-beta-hydroxysteroid dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1560244:1600280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_053566 // RefSeq // Rattus norvegicus patched 1 (Ptch1), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000026287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1025796:1079561:-1 gene:ENSRNOG00000019354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AF079162 // GenBank // Rattus norvegicus patched (ptc) mRNA, partial cds. // chr17 // 86 // 58 // 24 // 28 // 0 /// AY357891 // GenBank // Rattus norvegicus patched mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000034481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1025796:1072867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT024648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT024649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
NM_012557 // RefSeq // Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group C (Fancc), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group C (Fancc), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:826322:913387:-1 gene:ENSRNOG00000016889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC168147 // GenBank // Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group C, mRNA (cDNA clone MGC:187384 IMAGE:9024689), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U73586 // GenBank // Rattus norvegicus Fanconi anemia group C mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:821356:948820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_012558 // RefSeq // Rattus norvegicus fructose-1,6-bisphosphatase 1 (Fbp1), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023685 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:391470:412426:-1 gene:ENSRNOG00000017597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC078894 // GenBank // Rattus norvegicus fructose-1,6- biphosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93619 IMAGE:7114766), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC078895 // GenBank // Rattus norvegicus fructose-1,6- biphosphatase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93620 IMAGE:7134943), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// J04112 // GenBank // Rattus norvegicu liver fructose-1,6-bisphosphatase (Fru-1,6-P2-ase) mRNA. complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// M86240 // GenBank // Rattus norvegicus fructose-1,6-bisphosphatase mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// FQ210526 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YC17 mRNA sequence. // chr17 // 43 // 81 // 9 // 21 // 0 /// NONRATT024638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:352248:493227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT024636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT024639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT024637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_053716 // RefSeq // Rattus norvegicus fructose-1,6-bisphosphatase 2 (Fbp2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:367706:385066:-1 gene:ENSRNOG00000017637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:352248:493227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT024634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_006222313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 3-like (RGD1559950), mRNA. // chr17 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// XM_006253501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 3-like (RGD1559950), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000047795 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:5142910:5143383:1 gene:ENSRNOG00000031349 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:5142910:5143383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_181378 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin M (Ctsm), mRNA. // chr17 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6041844:6047253:1 gene:ENSRNOG00000030276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF456462 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin M (CtsM) mRNA, complete cds. // chr17 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// NONRATT023744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:5993975:6046232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_175581 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin R (Ctsr), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6105023:6114053:1 gene:ENSRNOG00000017888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097484 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin R, mRNA (cDNA clone MGC:114553 IMAGE:7459242), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF456459 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin R (CtsR) mRNA, complete cds. // chr17 // 61 // 69 // 11 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6104105:6197846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001106099 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin 7 (Cts7), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000043686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:5492909:5498049:1 gene:ENSRNOG00000033540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:5491001:5520068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_001128216 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin 8 (Cts8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:5600012:5611782:1 gene:ENSRNOG00000040000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:5600012:5907263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000061470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6143417:6148915:1 gene:ENSRNOG00000039990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC091563 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cathepsin R, mRNA (cDNA clone MGC:114246 IMAGE:7461240), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF456459 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin R (CtsR) mRNA, complete cds. // chr17 // 52 // 86 // 13 // 25 // 0 /// NONRATT023748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6104105:6197846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_139262 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin Q (Ctsq), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6208222:6213781:1 gene:ENSRNOG00000017946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF187323 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin Q (CatQ) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6211165:6337614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001002813 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin Q-like 2 (Ctsql2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6292659:6297332:1 gene:ENSRNOG00000026013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097257 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin Q-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:114219 IMAGE:7460188), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6211165:6337614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT023752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_172073 // RefSeq // Rattus norvegicus trophoblast specific protein alpha (Tpbpa), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6393064:6395434:1 gene:ENSRNOG00000039975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB009890 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for spongiotrophoblast specific protein, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6394113:6433268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001109115 // RefSeq // Rattus norvegicus cytotoxic T lymphocyte-associated protein 2 alpha (Ctla2a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6397861:6399746:1 gene:ENSRNOG00000039971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ220025 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YH15 mRNA sequence. // chr17 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ220143 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YA22 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytotoxic T lymphocyte-associated protein 2 alpha (Ctla2a), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT023756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT023758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000001430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6394113:6433268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_173132 // RefSeq // Rattus norvegicus testin gene (Testin), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testin gene (Testin), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6440913:6453399:1 gene:ENSRNOG00000018028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U16858 // GenBank // Rattus norvegicus testin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6443713:6455053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006222319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cathepsin L-like 3 (Ctsll3), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// XM_006253530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cathepsin L-like 3 (Ctsll3), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000061398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6484334:6487404:1 gene:ENSRNOG00000039959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// NONRATT023760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6473877:6491503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
XM_001065885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Cathepsin L precursor (Major excreted protein) (MEP) (RGD1308751), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_225137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Cathepsin L precursor (Major excreted protein) (MEP) (RGD1308751), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000061391 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:6498212:6501196:1 gene:ENSRNOG00000039954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000025700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6498230:6501196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000024688 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:7388570:7389009:1 gene:ENSRNOG00000018341 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:7388549:7393699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
XM_006222320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 6 (Zcchc6), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 6 (Zcchc6), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 6 (Zcchc6), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 6 (Zcchc6), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:7452315:7504093:1 gene:ENSRNOG00000016629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:7464283:7551863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT023767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_181626 // RefSeq // Rattus norvegicus iron-sulfur cluster assembly 1 (Isca1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000024781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:7507059:7519770:1 gene:ENSRNOG00000018343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF508158 // GenBank // Rattus norvegicus HesB protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// BC070929 // GenBank // Rattus norvegicus iron-sulfur cluster assembly 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:91391 IMAGE:7096424), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC078677 // GenBank // Rattus norvegicus iron-sulfur cluster assembly 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93032 IMAGE:7133788), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:7464283:7551863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONRATT023772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONRATT023773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001134606 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 31 subfamily D, member 1D (Spata31d1d), mRNA. // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000039803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:7546021:7551907:1 gene:ENSRNOG00000027014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006253539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31D1-like (LOC102547665), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:7464283:7551863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT023775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XR_360703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPATA31 subfamily D, member 3 (Spata31d3), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000037597 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:7606702:7633706:1 gene:ENSRNOG00000018400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 37 // 15 // 16 // 0 /// XM_001056825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgi membrane protein 1 (Golm1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 44 // 44 // 19 // 43 // 1 /// XM_006222331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgi membrane protein 1 (Golm1), mRNA. // chr17 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// XM_006253548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgi membrane protein 1 (Golm1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1 /// XM_003751638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912252 (LOC100912252), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// XM_003752944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912252 (LOC100912252), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// GENSCAN00000014648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:7615152:7633108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// GENSCAN00000014683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:7582182:7607993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// NONRATT023776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 37 // 37 // 16 // 43 // 1 /// NONRATT023780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1
NM_001106100 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein 1 (Agtpbp1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_006253516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein 1 (Agtpbp1), transcript variant X7, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000025381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:7735244:7837762:1 gene:ENSRNOG00000018651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000014657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:7739409:7860390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT023786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT023787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// NONRATT023788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1 /// NONRATT023789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
ENSRNOT00000054516 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:7992675:7992782:1 gene:ENSRNOG00000036402 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_080908 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 28 (concentrative nucleoside transporter), member 3 (Slc28a3), mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000025745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:8665223:8715361:1 gene:ENSRNOG00000018853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY059414 // GenBank // Rattus norvegicus concentrative Na+-nucleoside cotransporter protein (Cnt3) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:8648705:8715361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NR_031795 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-7a-1 (Mir7a-1), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053736 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:17:8879389:8879485:1 gene:ENSRNOG00000035613 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-7a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000641 Rattus norvegicus miR-7a-1 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001173436 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG9752-PA (RGD1311345), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:8887525:8895096:1 gene:ENSRNOG00000019232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098862 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG9752-PA, mRNA (cDNA clone IMAGE:7380496), complete cds. // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// FQ213376 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YD01 mRNA sequence. // chr17 // 61 // 72 // 11 // 18 // 0 /// NONRATT023807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000008812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:8874554:8893602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT023809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_198050 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 27 (Kif27), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000026054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:8905688:8975053:1 gene:ENSRNOG00000019257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC079385 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7111477. // chr17 // 94 // 42 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000008796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:8910565:8950982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:8958020:8974912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT023810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_053747 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquilin 1 (Ubqln1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000061233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:9044249:9080134:1 gene:ENSRNOG00000019282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC072477 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:91558 IMAGE:7103662), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// D87950 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DA41, complete cds. // chr17 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// FQ222353 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YI21 mRNA sequence. // chr17 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000017084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:9044415:9079776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT023823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT023824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_003751640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681410 (LOC681410), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061231 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:9112369:9113277:1 gene:ENSRNOG00000039876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:9112369:9113292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006222345 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 3 (Klhl3), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 3 (Klhl3), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000034877 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:9127611:9226414:1 gene:ENSRNOG00000019533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// XM_006253592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like protein 3-like (LOC102549506), mRNA. // chrU // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000017076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:9141545:9228738:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000014675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:9781428:9817598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT024725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001271297 // RefSeq // Rattus norvegicus sparc/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan (testican) 1 (Spock1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:9966212:9981063:1 gene:ENSRNOG00000012747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC092615 // GenBank // Rattus norvegicus sparc/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan (testican) 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7312156), partial cds. // chrU // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT023830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000003147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:9965965:10032529:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001191691 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 7 (Trpc7), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:10316807:10456371:1 gene:ENSRNOG00000012727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:10389579:10436538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001108405 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte cell-derived chemotaxin 2 (Lect2), mRNA. // chr17 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:10665529:10671751:1 gene:ENSRNOG00000012189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:10665678:10671536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT023840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001105747 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 9 (Il9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:10733181:10736304:1 gene:ENSRNOG00000012131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L36460 // GenBank // Rattus norvegicus IL-9 mRNA fragment. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001013137 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 14 (Cxcl14), mRNA. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11271210:11279229:1 gene:ENSRNOG00000011984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC101896 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 14, mRNA (cDNA clone MGC:124510 IMAGE:7932648), complete cds. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT023848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000034133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11271410:11277525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT023850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_019207 // RefSeq // Rattus norvegicus neurogenin 1 (Neurog1), mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11315715:11317234:1 gene:ENSRNOG00000022405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U67777 // GenBank // Rattus norvegicus neurogenin mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT023854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11304744:11316692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001025029 // RefSeq // Rattus norvegicus TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain, family member B (Tifab), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11395058:11398074:1 gene:ENSRNOG00000011947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091188 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain, family member B, mRNA (cDNA clone MGC:108845 IMAGE:7367314), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017182 // RefSeq // Rattus norvegicus H2A histone family, member Y (H2afy), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000015632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11440883:11502763:1 gene:ENSRNOG00000011523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11440883:11502763:1 gene:ENSRNOG00000011523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC089093 // GenBank // Rattus norvegicus H2A histone family, member Y, mRNA (cDNA clone MGC:105515 IMAGE:7126329), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// M99065 // GenBank // Rattus norvegicus histone H2A.1 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// U79139 // GenBank // Rattus norvegicus histone macroH2A1.2 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT023857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT023858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT023860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11447431:11502218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONRATT023859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT023861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_053624 // RefSeq // Rattus norvegicus paired-like homeodomain 1 (Pitx1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired-like homeodomain 1 (Pitx1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000015307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11043913:11050066:1 gene:ENSRNOG00000011423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB047298 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ptx1 homeodomain protein, complete cds. // chr17 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// BC061966 // GenBank // Rattus norvegicus paired-like homeodomain 1, mRNA (cDNA clone MGC:72352 IMAGE:5621094), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11035640:11049054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001170408 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 193, member B (Fam193b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 193, member B (Fam193b), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 193, member B (Fam193b), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 193, member B (Fam193b), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11705724:11737149:1 gene:ENSRNOG00000039807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166819 // GenBank // Rattus norvegicus similar to mKIAA1931 protein, mRNA (cDNA clone MGC:188694 IMAGE:8367512), complete cds. // chr17 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// FQ211528 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA89YK03 mRNA sequence. // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11704571:11752658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT023866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT023868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001108046 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 41 (Ddx41), mRNA. // chr17 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// ENSRNOT00000018114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11740661:11746052:1 gene:ENSRNOG00000012771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// BC166825 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 41, mRNA (cDNA clone MGC:188708 IMAGE:8370850), complete cds. // chr17 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// GENSCAN00000047149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11704571:11752658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT023872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001107336 // RefSeq // Rattus norvegicus docking protein 3 (Dok3), mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000018232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11748066:11752826:1 gene:ENSRNOG00000013564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC166772 // GenBank // Rattus norvegicus docking protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:188547 IMAGE:7934143), complete cds. // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// FQ235097 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YH20 mRNA sequence. // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11704571:11752658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_173125 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 7 (Pdlim7), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253611 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 7 (Pdlim7), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000018899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11762295:11777443:1 gene:ENSRNOG00000013653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF095585 // GenBank // Rattus norvegicus LIM-domain protein LMP-1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC078693 // GenBank // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 7, mRNA (cDNA clone MGC:93077 IMAGE:7121395), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11762257:11777193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT023881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT023884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT023883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT023885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_031024 // RefSeq // Rattus norvegicus drebrin 1 (Dbn1), mRNA. // chr17 // 94 // 97 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11788597:11802569:1 gene:ENSRNOG00000014170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11788597:11802569:1 gene:ENSRNOG00000014170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AB514558 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for drebrin E, complete cds. // chr17 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// BC139847 // GenBank // Rattus norvegicus drebrin 1, mRNA (cDNA clone MGC:156631 IMAGE:8368018), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// FQ217148 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YC04 mRNA sequence. // chr17 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11781685:11802067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT023892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT023890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT023888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT023891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT023893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_001014006 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor XII (Hageman factor) (F12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000066586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11845561:11853600:1 gene:ENSRNOG00000015139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC088187 // GenBank // Rattus norvegicus coagulation factor XII (Hageman factor), mRNA (cDNA clone MGC:108855 IMAGE:7370526), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11845770:11850141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT023894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001109487 // RefSeq // Rattus norvegicus profilin 3 (Pfn3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11855665:11856192:1 gene:ENSRNOG00000047752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11855715:11856128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001115024 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, mannose-binding 2 (Lman2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11907302:11925365:1 gene:ENSRNOG00000016161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC158808 // GenBank // Rattus norvegicus lectin, mannose-binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:188228 IMAGE:7324877), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ215124 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YL08 mRNA sequence. // chr17 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// FQ231518 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YD06 mRNA sequence. // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11907493:11925231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT023899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_145773 // RefSeq // Rattus norvegicus Max dimerization protein 3 (Mxd3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11940006:11943732:1 gene:ENSRNOG00000016188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ234290 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YI10 mRNA sequence. // chr17 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// U45986 // GenBank // Rattus norvegicus Myx mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11940079:11943435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT023902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001015023 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB24, member RAS oncogene family (Rab24), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11946939:11949132:1 gene:ENSRNOG00000016539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091184 // GenBank // Rattus norvegicus RAB24, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:108835 IMAGE:7366064), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11947362:11948862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT023907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001047934 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC498705 (LOC498705), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12082599:12092482:1 gene:ENSRNOG00000033993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013884 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin interaction motif containing 1 (Uimc1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin interaction motif containing 1 (Uimc1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin interaction motif containing 1 (Uimc1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12173068:12239748:1 gene:ENSRNOG00000016891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC087149 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin interaction motif containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:95177 IMAGE:7131093), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12181313:12261463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT023911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT023913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT023914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_022179 // RefSeq // Rattus norvegicus hexokinase 3 (white cell) (Hk3), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// XM_006253602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hexokinase 3 (white cell) (Hk3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12246816:12261635:1 gene:ENSRNOG00000026235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC100648 // GenBank // Rattus norvegicus hexokinase 3 (white cell), mRNA (cDNA clone MGC:124544 IMAGE:7932574), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000034220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12181313:12261463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT023916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// U73859 // GenBank // Rattus norvegicus hexokinase type III mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0
NM_080777 // RefSeq // Rattus norvegicus synuclein, beta (Sncb), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006253594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synuclein, beta (Sncb), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12510521:12518727:1 gene:ENSRNOG00000018039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC087579 // GenBank // Rattus norvegicus synuclein, beta, mRNA (cDNA clone MGC:105340 IMAGE:7314241), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12510810:12518128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT023918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT023920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_344571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 (Gprin1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024258 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:12537225:12539968:1 gene:ENSRNOG00000017974 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12527574:12539987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001024795 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 44 (Rnf44), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006253633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 44 (Rnf44), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006253637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 44 (Rnf44), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006253638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 44 (Rnf44), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000060822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12589090:12596028:1 gene:ENSRNOG00000017641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC098030 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 44, mRNA (cDNA clone MGC:116184 IMAGE:7456296), complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AY724486 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cpv-f-06-0-UI unknown mRNA. // chr17 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT023926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT023927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12583770:12602490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT023924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT023925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT023930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_053835 // RefSeq // Rattus norvegicus clathrin, light chain B (Cltb), mRNA. // chr17 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// XM_006253595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus clathrin, light chain B (Cltb), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12665098:12682747:1 gene:ENSRNOG00000017506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000032402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12665098:12682747:1 gene:ENSRNOG00000017506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// FQ213176 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YE13 mRNA sequence. // chr17 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// FQ213983 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YH20 mRNA sequence. // chr17 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// M15883 // GenBank // Rat clathrin light chain (LCB2) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// M19262 // GenBank // Rat clathrin light chain (LCB3) mRNA, complete cds. // chr17 // 86 // 90 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12665216:12682483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_001047095 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP16 nucleolar protein (Nop16), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000023320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12685785:12690719:1 gene:ENSRNOG00000017284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AB256043 // GenBank // Rattus norvegicus ZH1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC158562 // GenBank // Rattus norvegicus NOP16 nucleolar protein homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:187246 IMAGE:9088902), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ229428 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YP06 mRNA sequence. // chr17 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// NONRATT023933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12685877:12690265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_001014007 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC306766 (LOC306766), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12708595:12724572:1 gene:ENSRNOG00000017133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// AY325163 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-141 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000052825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12716109:12723409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT023939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XR_341395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551420 (LOC102551420), transcript variant X1, ncRNA. // chr17 // 78 // 100 // 18 // 23 // 0 /// XR_341396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551420 (LOC102551420), transcript variant X2, ncRNA. // chr17 // 78 // 100 // 18 // 23 // 0
NM_001106059 // RefSeq // Rattus norvegicus THO complex 3 (Thoc3), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000000116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12803773:12812964:1 gene:ENSRNOG00000000104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC168852 // GenBank // Rattus norvegicus THO complex 3, mRNA (cDNA clone MGC:189083 IMAGE:7443262), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12803810:12811942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT023942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_012546 // RefSeq // Rattus norvegicus dopamine receptor D1 (Drd1), mRNA. // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// XM_006253600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopamine receptor D1 (Drd1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000030893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:13212535:13214770:1 gene:ENSRNOG00000023688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// M35077 // GenBank // Rattus norvegicus D1 dopamine receptor mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000055321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:13212594:13213934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT023944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT023945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT023946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_012982 // RefSeq // Rattus norvegicus msh homeobox 2 (Msx2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:13785024:13790689:1 gene:ENSRNOG00000018355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:13763685:13792312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// U12514 // GenBank // Rattus norvegicus transcriptional regulator MSX-2 (MSX-2) partially processed mRNA, complete cds. // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006257130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31C2-like (LOC102547119), mRNA. // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:73858712:73911238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:13888918:13893429:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT059802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT023948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108406 // RefSeq // Rattus norvegicus serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 1 (Sptlc1), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:13956140:13995224:1 gene:ENSRNOG00000010882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ218135 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YM24 mRNA sequence. // chr17 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000008508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:13956151:13993623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_053727 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor, interleukin 3 regulated (Nfil3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, interleukin 3 regulated (Nfil3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006253668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, interleukin 3 regulated (Nfil3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006253669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor, interleukin 3 regulated (Nfil3), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:14372306:14374095:1 gene:ENSRNOG00000011668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY004663 // GenBank // Rattus norvegicus NFIL3/E4BP4 transcription factor (NFIL3/E4BP4) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC072527 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor, interleukin 3 regulated, mRNA (cDNA clone MGC:91562 IMAGE:7097417), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:14372447:14386890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT023952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001108407 // RefSeq // Rattus norvegicus AU RNA binding protein/enoyl-CoA hydratase (Auh), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:14407791:14501277:1 gene:ENSRNOG00000011684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091414 // GenBank HTC // Rattus norvegicus AU RNA binding protein/enoyl-coenzyme A hydratase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365077), with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// FQ218844 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YI19 mRNA sequence. // chr17 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// NONRATT023955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT023956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT023958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:14423457:14500926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001169578 // RefSeq // Rattus norvegicus DIRAS family, GTP-binding RAS-like 2 (Diras2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:14854091:14855291:1 gene:ENSRNOG00000032328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:14854123:14854722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0
NM_001170563 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4D (Sema4d), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:15591157:15613214:1 gene:ENSRNOG00000013679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ211736 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA82YB07 mRNA sequence. // chr17 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// FQ212166 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA67YG24 mRNA sequence. // chr17 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:15577576:15611815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT023966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT023965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
FQ211736 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA82YB07 mRNA sequence. // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// FQ212166 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA67YG24 mRNA sequence. // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:15612868:15628049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001105743 // RefSeq // Rattus norvegicus SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 3 (Shc3), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:15743125:15862911:1 gene:ENSRNOG00000014366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT023970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000006213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:15769815:15869112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT023971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001082409 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and WD-40 domain protein 17 (Fbxw17), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000044073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17134537:17152331:-1 gene:ENSRNOG00000030027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC167744 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and WD-40 domain protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:187221 IMAGE:7099140), complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT024863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17080704:17152310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT024864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_001054929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NUT family member 2F (Nutm2f), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_225188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NUT family member 2F (Nutm2f), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044543 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:17080704:17088120:-1 gene:ENSRNOG00000027311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17080704:17152310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
XM_006222388 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546342 (LOC102546342), mRNA. // chr17 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// XM_006222353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689437 (LOC689437), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0
XM_006222352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689458 (LOC689458), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000060670 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:16531452:16536976:1 gene:ENSRNOG00000039581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16497185:16537958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
XM_002725258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689526 (LOC689526), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006222349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31E1-like (LOC689303), mRNA. // chr17 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// XM_006253749 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689526 (LOC689526), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006222352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC689458 (LOC689458), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000073070 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:17252712:17260924:1 gene:ENSRNOG00000048350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060670 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:16531452:16536976:1 gene:ENSRNOG00000039581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 100 // 21 // 30 // 0 /// NONRATT023985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_006222354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31A6-like (LOC689569), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000060660 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:16577624:16583115:1 gene:ENSRNOG00000039574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071469 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:16577645:16583121:1 gene:ENSRNOG00000039574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000070951 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:17344059:17373270:1 gene:ENSRNOG00000050627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000074654 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:17344059:17348184:1 gene:ENSRNOG00000050627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000038979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16577684:16586498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
XM_003752970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31E1-like (LOC689587), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31E1-like (LOC689587), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17344716:17373826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000020914 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:16641831:16656993:1 gene:ENSRNOG00000015545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000073450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17488158:17661428:1 gene:ENSRNOG00000050097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ232545 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YF08 mRNA sequence. // chr17 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// XM_002728459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein P (Cenpp), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// XM_006253697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein P (Cenpp), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// XM_006253698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein P (Cenpp), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT023987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT023988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001108409 // RefSeq // Rattus norvegicus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 3 (Fgd3), mRNA. // chr17 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17820436:17855077:1 gene:ENSRNOG00000016225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17820628:17894602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT023990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001107341 // RefSeq // Rattus norvegicus sushi domain containing 3 (Susd3), mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000032997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17878841:17895037:1 gene:ENSRNOG00000016525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// FQ227785 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YO01 mRNA sequence. // chr17 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// NONRATT023993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17820628:17894602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001134572 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110007C09 (RGD1306058), mRNA. // chr17 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// XM_006253730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110007C09 (RGD1306058), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000022203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17916365:17922567:1 gene:ENSRNOG00000016560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000002858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17906627:17922393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT023997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_001191556 // RefSeq // Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 2 (Wnk2), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006253711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 2 (Wnk2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WNK lysine deficient protein kinase 2 (Wnk2), transcript variant X19, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17987437:18095251:1 gene:ENSRNOG00000016684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:18008965:18095073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001191816 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 120A (Fam120a), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:18167847:18257857:1 gene:ENSRNOG00000016779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:18168344:18256168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001107342 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 2 (Phf2), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000022669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:18301177:18332952:1 gene:ENSRNOG00000016816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000002845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:18295113:18332456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT024015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001106104 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase domain containing 1 (Ptpdc1), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase domain containing 1 (Ptpdc1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase domain containing 1 (Ptpdc1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:18389453:18436686:1 gene:ENSRNOG00000026564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:18422360:18436934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT024018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT024022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NR_031800 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7a-1 (Mirlet7a1), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000053755 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:17:18473968:18474067:1 gene:ENSRNOG00000035632 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// rno-let-7a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000827 Rattus norvegicus let-7a-1 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NR_031806 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7f-1 (Mirlet7f-1), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// rno-let-7f-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000833 Rattus norvegicus let-7f-1 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NR_031774 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7d (Mirlet7d), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053717 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:17:18476093:18476190:1 gene:ENSRNOG00000035594 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-let-7d // miRBase Micro RNA Database // MI0000601 Rattus norvegicus let-7d stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 169 (Zfp169), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 169 (Zfp169), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022932 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:18503758:18526760:1 gene:ENSRNOG00000017092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:18465069:18561514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001004255 // RefSeq // Rattus norvegicus DEK oncogene (Dek), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEK oncogene (Dek), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:19948514:19970468:-1 gene:ENSRNOG00000016152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079344 // GenBank // Rattus norvegicus DEK oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:94795 IMAGE:7107191), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19949823:19996708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT024904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT024905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001079531 // RefSeq // Rattus norvegicus thiopurine S-methyltransferase (Tpmt), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:19889511:19907982:-1 gene:ENSRNOG00000016468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF120100 // GenBank // Rattus norvegicus thiopurine S-methyltransferase (tpmt) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// BC158556 // GenBank // Rattus norvegicus thiopurine S-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:187229 IMAGE:9030831), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19893902:19905498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT024902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_199236 // RefSeq // Rattus norvegicus NHL repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (Nhlrc1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:19876653:19877843:-1 gene:ENSRNOG00000026286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19834758:19877843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107462 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 13A (Kif13a), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000066447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:19600217:19782859:-1 gene:ENSRNOG00000001455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19635259:19709080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19586402:19630545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT024891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_001100470 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 153 (Nup153), mRNA. // chr17 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000001979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:19523818:19575973:-1 gene:ENSRNOG00000001456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000029216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19521365:19571665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0
NM_012726 // RefSeq // Rattus norvegicus ataxin 1 (Atxn1), mRNA. // chr17 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:21272818:21559271:1 gene:ENSRNOG00000016998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// X91619 // GenBank // R.norvegicus mRNA for sca1 protein. // chr17 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
NONRATT024048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_214448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial calcium uniporter regulator 1 (Mcur1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024206 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:26114737:26131882:-1 gene:ENSRNOG00000017988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25979380:26131882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
ENSRNOT00000024174 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:25970453:26062435:-1 gene:ENSRNOG00000017951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000075807 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:25970453:26048148:-1 gene:ENSRNOG00000017951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25979380:26131882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT024957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT024958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001170334 // RefSeq // Rattus norvegicus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 1 (Gfod1), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:25775676:25873301:-1 gene:ENSRNOG00000014007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25867595:25873301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25760292:25815395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001108411 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 7 (Tbc1d7), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006253832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 7 (Tbc1d7), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:25727575:25744428:-1 gene:ENSRNOG00000014019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25727575:25742938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25667758:25684580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
GENSCAN00000050757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25422113:25423202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000039591 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:23919623:23920077:1 gene:ENSRNOG00000023869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:23890497:23935470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001014144 // RefSeq // Rattus norvegicus androgen-dependent TFPI-regulating protein (Adtrp), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000019478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:24598244:24617616:1 gene:ENSRNOG00000014481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000060403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:24598244:24662657:1 gene:ENSRNOG00000014481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AY325171 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-020 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// BC088287 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 9530008L14Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:109474 IMAGE:7321485), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001011922 // RefSeq // Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 (Nedd9), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9 (Nedd9), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:25084201:25143750:1 gene:ENSRNOG00000014548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC085812 // GenBank // Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 9, mRNA (cDNA clone MGC:94019 IMAGE:7121465), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25093684:25141985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001109118 // RefSeq // Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 2 (Elovl2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 2 (Elovl2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:23366147:23405731:1 gene:ENSRNOG00000014702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:23377266:23410310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106105 // RefSeq // Rattus norvegicus glial cells missing homolog 2 (Drosophila) (Gcm2), mRNA. // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000020244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:23472659:23481773:1 gene:ENSRNOG00000015008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000044740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:23469840:23480103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT024052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
NM_013136 // RefSeq // Rattus norvegicus male germ cell-associated kinase (Mak), mRNA. // chr17 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:23514574:23550277:1 gene:ENSRNOG00000015101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000040707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:23514574:23550277:1 gene:ENSRNOG00000015101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC078887 // GenBank // Rattus norvegicus male germ cell-associated kinase, mRNA (cDNA clone MGC:93585 IMAGE:7111717), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// M35862 // GenBank // Rat male germ cell-associated kinase (mak) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:23514802:23550010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001145021 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to chromosome 6 open reading frame 52 (RGD1562963), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:23581994:23595492:1 gene:ENSRNOG00000039379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:23581812:23591908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT024054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENSRNOT00000020764 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:26547466:26547917:1 gene:ENSRNOG00000015490 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 75 // 92 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:26496414:26547781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_001107345 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor AP-2 alpha (Tfap2a), mRNA. // chr17 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000041960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:26596839:26611553:1 gene:ENSRNOG00000015522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000049062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:26595869:26610673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
ENSRNOT00000037041 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:27019957:27020767:1 gene:ENSRNOG00000024499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000072904 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:27019957:27370763:1 gene:ENSRNOG00000024499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000013869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:26988663:27020581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_003751667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein regulator of cytokinesis 1-like (LOC100360173), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_003752973 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein regulator of cytokinesis 1-like (LOC100360173), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049524 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:28384175:28384793:1 gene:ENSRNOG00000033447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:28382827:28384638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001106106 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon 1 (Eef1e1), mRNA. // chr17 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:28701069:28713201:1 gene:ENSRNOG00000016390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC166841 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon 1, mRNA (cDNA clone MGC:188732 IMAGE:9027959), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ225943 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YJ22 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000071334 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:24222855:24223378:1 gene:ENSRNOG00000047411 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000071377 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:24520121:24520644:1 gene:ENSRNOG00000046387 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000031582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:28701075:28708483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24520121:24520672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000057029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24222855:24223406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107347 // RefSeq // Rattus norvegicus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 5, muted (Bloc1s5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:28724370:28749287:1 gene:ENSRNOG00000016497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166529 // GenBank // Rattus norvegicus muted homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:188122 IMAGE:7189489), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:28724446:28748145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NM_001271330 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 5 (endoplasmic reticulum) (Txndc5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:28841101:28867877:1 gene:ENSRNOG00000013469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:28845580:28867877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT024099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001012052 // RefSeq // Rattus norvegicus cancer antigen 1 (Cage1), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:29366867:29405080:1 gene:ENSRNOG00000024111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC081934 // GenBank // Rattus norvegicus cancer antigen 1, mRNA (cDNA clone MGC:93971 IMAGE:7114574), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ211932 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YB04 mRNA sequence. // chr17 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:29371126:29400044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT024101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001008891 // RefSeq // Rattus norvegicus signal sequence receptor, alpha (Ssr1), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:29410635:29426436:1 gene:ENSRNOG00000014165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY321345 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-238 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC098008 // GenBank // Rattus norvegicus signal sequence receptor, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:116155 IMAGE:7454159), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:29410701:29432556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NONRATT024102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_021698 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor XIII, A1 polypeptide (F13a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:30406396:30581429:1 gene:ENSRNOG00000015957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:30453024:30574743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000045500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:30896326:30936460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
XM_006222377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LYR motif-containing protein 4-like (LOC102550385), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006253859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LYR motif-containing protein 4-like (LOC102550385), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:31335896:31449161:1 gene:ENSRNOG00000047970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:31335896:31423691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT024108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001013055 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 40 subunit (Rpp40), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:31534963:31543590:1 gene:ENSRNOG00000016226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:31534575:31543590:1 gene:ENSRNOG00000016226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC091191 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease P 40 subunit (human), mRNA (cDNA clone MGC:108849 IMAGE:7368273), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// FQ220078 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YE14 mRNA sequence. // chr17 // 78 // 87 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:31534575:31543570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT024109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT024111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT024112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
AY539881 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00130 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001006966 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl-CoA delta isomerase 2 (Eci2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:32456608:32473003:1 gene:ENSRNOG00000016369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083764 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal D3,D2-enoyl-CoA isomerase, mRNA (cDNA clone MGC:94706 IMAGE:7193133), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:32453498:32472641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT024114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT024116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT024118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT024119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001009275 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl-Coenzyme A delta isomerase 3 (Eci3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006253791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enoyl-Coenzyme A delta isomerase 3 (Eci3), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000048923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:32517375:32539054:1 gene:ENSRNOG00000029549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC088178 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1810022C23, mRNA (cDNA clone MGC:108813 IMAGE:7324966), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 78 // 78 // 18 // 23 // 1 /// GENSCAN00000054967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:32520758:32545933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1
NM_001271083 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 217, member A (Fam217a), mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000022369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:32566115:32576558:1 gene:ENSRNOG00000016672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC083911 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC43581, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134233), partial cds. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:32561741:32575849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT024126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NR_024023 // RefSeq // Rattus norvegicus high mobility group box 1, pseudogene 2 (Hmgb1-ps2), non-coding RNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT024128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:32635639:32636305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 15 // 18 // 1
NM_001025719 // RefSeq // Rattus norvegicus PX domain containing 1 (Pxdc1), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PX domain containing 1 (Pxdc1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:32865487:32893955:1 gene:ENSRNOG00000017093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC099145 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 1300014I06Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:116297 IMAGE:7325668), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC086419 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7125959. // chr17 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT024129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:32865645:32893022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT024130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT024131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_022624 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22, member 23 (Slc22a23), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:33132227:33298110:1 gene:ENSRNOG00000017210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33252801:33294278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT024133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33104925:33210172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001013886 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, beta 2B class IIb (Tubb2b), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:33336065:33339110:1 gene:ENSRNOG00000017445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105754 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, beta 2b, mRNA (cDNA clone MGC:124866 IMAGE:5599369), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33336164:33338863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT024136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000011122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33362177:33391649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT024139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_199085 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 6 (Serpinb6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 6 (Serpinb6), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006253871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 6 (Serpinb6), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:34084123:34102912:1 gene:ENSRNOG00000017962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC060594 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6a, mRNA (cDNA clone MGC:72983 IMAGE:6887824), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ214268 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YL16 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000017112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34064122:34314217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT024145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
XM_006253873 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin B6-like (RGD1564786), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin B6-like (RGD1564786), mRNA. // chr17 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// XM_003754666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin B6-like (RGD1564786), mRNA. // chr17 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000017112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34064122:34314217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
XM_001066281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6e (Serpinb6e), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6e (Serpinb6e), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033370 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:34304958:34314211:1 gene:ENSRNOG00000022157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34064122:34314217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001107351 // RefSeq // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 9d (Serpinb9d), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000032707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:34408885:34416542:1 gene:ENSRNOG00000022139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000012151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34379000:34416542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001031642 // RefSeq // Rattus norvegicus serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B, member 1a (Serpinb1a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000059854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:34796325:34803701:1 gene:ENSRNOG00000016581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC098686 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B, member 1a, mRNA (cDNA clone MGC:112650 IMAGE:7385870), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34746263:34812810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
ENSRNOT00000059839 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:34845053:34845443:1 gene:ENSRNOG00000039120 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
XM_006222381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin light chain kinase family, member 4 (Mylk4), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006253874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin light chain kinase family, member 4 (Mylk4), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000072764 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:34920505:34942423:1 gene:ENSRNOG00000050349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000074775 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:33976762:33998512:1 gene:ENSRNOG00000049124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000010694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34908224:34952695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000017104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33977146:34008717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_001039606 // RefSeq // Rattus norvegicus GDP-mannose 4, 6-dehydratase (Gmds), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:35298853:35824291:1 gene:ENSRNOG00000017605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC104708 // GenBank // Rattus norvegicus GDP-mannose 4, 6-dehydratase, mRNA (cDNA clone MGC:125154 IMAGE:7317156), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT024156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000019161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:35377654:35462625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// GENSCAN00000019169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:35503384:35570068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT024157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_134414 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 2 (Exoc2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253876 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 2 (Exoc2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// XM_006253880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 2 (Exoc2), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// XM_006253898 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 2 (Exoc2), transcript variant X14, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:38560758:38697270:-1 gene:ENSRNOG00000033643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AF032666 // GenBank // Rattus norvegicus rsec5 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// XM_006253897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 2 (Exoc2), transcript variant X13, mRNA. // chr17 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000012952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:36750119:36796404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000037870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:38562084:38637018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000037876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:38651062:38697222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT025054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001134846 // RefSeq // Rattus norvegicus HUS1 checkpoint homolog b (S. pombe) (Hus1b), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072505 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:38707452:38708282:-1 gene:ENSRNOG00000047420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:36739058:36739888:1 gene:ENSRNOG00000049323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:36739058:36739888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:38707452:38708282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008888 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1 (Uqcrfs1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:36991598:36996097:1 gene:ENSRNOG00000018281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC085339 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, Rieske iron-sulfur polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:105530 IMAGE:7302533), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ216362 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YF08 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ215328 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YK13 mRNA sequence. // chr17 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// FQ215868 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YE05 mRNA sequence. // chr17 // 65 // 92 // 15 // 23 // 0 /// FQ216444 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YM24 mRNA sequence. // chr17 // 68 // 76 // 13 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:36991643:36995658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT024163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000049560 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:37635026:37635507:1 gene:ENSRNOG00000030989 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001137626 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F transcription factor 3 (E2f3), mRNA. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:37642240:37716592:1 gene:ENSRNOG00000029273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:37642256:37716112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT024166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDK5 regulatory subunit associated protein 1-like 1 (Cdkal1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:38824446:38993624:1 gene:ENSRNOG00000018381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000071408 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:37843673:37934819:1 gene:ENSRNOG00000049391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// XM_006253901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDK5 regulatory subunit associated protein 1-like 1 (Cdkal1), mRNA. // chr17 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// XM_006253883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDK5 regulatory subunit associated protein 1-like 1 (Cdkal1), mRNA. // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// JQ935002 // GenBank // Rattus norvegicus CDK5 regulatory subunit associated protein 1-like 1 (CDKAL1) mRNA, complete cds. // chr17 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NONRATT024171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
GENSCAN00000001794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:39327287:39327718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000028724 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:39327287:39327718:1 gene:ENSRNOG00000039080 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 67 // 75 // 4 // 6 // 0
NM_001271205 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 4 (Sox4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:39477612:39479792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT024186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.3-like (LOC100910095), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006253903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.3-like (LOC100910095), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_002728475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolactin family 5, subfamily a, member 2-like (LOC100361579), mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:40141529:40262069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_053364 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 7, subfamily d, member 1 (Prl7d1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40852387:40859244:1 gene:ENSRNOG00000016510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF139809 // GenBank // Rattus norvegicus proliferin-related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF226609 // GenBank // Rattus norvegicus proliferin-related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ219949 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YM06 mRNA sequence. // chr17 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT024195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_022530 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 7, subfamily a, member 3 (Prl7a3), mRNA. // chr17 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40891610:40904560:1 gene:ENSRNOG00000016616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF139808 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein F mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// FQ221033 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YH06 mRNA sequence. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ229694 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YA22 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ230112 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YJ17 mRNA sequence. // chr17 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:40900053:40904292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT024197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001008341 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 7, subfamily a, member 4 (Prl7a4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40954515:40963574:1 gene:ENSRNOG00000029126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY741310 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein-F beta mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:40955681:40965344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
XM_006222393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolactin-7A1-like (LOC102556049), mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006253911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolactin-7A1-like (LOC102556049), mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059683 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:40978327:40988804:1 gene:ENSRNOG00000039029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071084 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:40978327:40990531:1 gene:ENSRNOG00000039029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
XM_006222393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolactin-7A1-like (LOC102556049), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolactin-7A1-like (LOC102556049), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071084 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:40978327:40990531:1 gene:ENSRNOG00000039029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153738 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 7, subfamily b, member 1 (Prl7b1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:41012521:41020697:1 gene:ENSRNOG00000016742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF525159 // GenBank // Rattus norvegicus placental prolactin-like protein-N mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:40998150:41074473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_021580 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 4 (Prl8a4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:41512558:41518458:1 gene:ENSRNOG00000016803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AB009889 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prolactin-like protein H, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT024206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT024212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:41297223:41302495:1 gene:ENSRNOG00000048069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000075315 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:41297094:41302495:1 gene:ENSRNOG00000048069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:41423279:41519692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_173110 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 5 (Prl8a5), mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000022659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:41330410:41336573:1 gene:ENSRNOG00000016871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:41331750:41336573:1 gene:ENSRNOG00000016871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC097274 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:114250 IMAGE:7441946), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC158577 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:187319 IMAGE:7461869), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// M76537 // GenBank // Rat prolactin-like protein-C mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// U09099 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein C-related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:41297503:41381586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_020079 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 3 (Prl8a3), mRNA. // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// U93351 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein-C variant mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000068163 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:41374529:41380583:1 gene:ENSRNOG00000043237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT024206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:41297503:41381586:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_022537 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 7 (Prl8a7), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:41426985:41432786:1 gene:ENSRNOG00000016933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB000107 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prolactin-like protein D, complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC098917 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:114320 IMAGE:7445772), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT024208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:41423279:41519692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_138861 // RefSeq // Rattus norvegicus Prolactin family 2, subfamily b, member 1 (Prl2b1), mRNA. // chr17 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:41459565:41466551:1 gene:ENSRNOG00000017007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AB022882 // GenBank // Rattus norvegicus PLP-K mRNA for prolactin-like-peptide, complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AF234635 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein K mRNA, complete cds. // chr17 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:41423279:41519692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT024211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133549 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatoma derived growth factor-like 1 (Hdgfl1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY061636 // GenBank // Rattus norvegicus hepatoma-derived apoptotic-related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC085707 // GenBank // Rattus norvegicus hepatoma derived growth factor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:93218 IMAGE:7132556), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106109 // RefSeq // Rattus norvegicus neurensin 1 (Nrsn1), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006253915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurensin 1 (Nrsn1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000023519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:43671713:43689288:1 gene:ENSRNOG00000017444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166881 // GenBank // Rattus norvegicus neurensin 1, mRNA (cDNA clone MGC:188815 IMAGE:6891333), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC166919 // GenBank // Rattus norvegicus neurensin 1, mRNA (cDNA clone MGC:188907 IMAGE:6919003), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:43667710:43688709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_024001 // RefSeq // Rattus norvegicus MRS2 magnesium transporter (Mrs2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:43932173:43950097:1 gene:ENSRNOG00000017545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF288289 // GenBank // Rattus norvegicus RPT protein (RPT) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF288290 // GenBank // Rattus norvegicus RPT protein (RPT) mRNA, partial cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// BC083554 // GenBank // Rattus norvegicus MRS2 magnesium homeostasis factor homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:7134819), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:43932247:43949527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT024218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT024219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_022851 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 5 family, member A1 (Aldh5a1), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000031384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44000891:44023629:1 gene:ENSRNOG00000023538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000050919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44000891:44023629:1 gene:ENSRNOG00000023538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44000891:44030239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0
NM_001106111 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 13 (Acot13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44108940:44121410:1 gene:ENSRNOG00000018415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ217526 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA24YG04 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44116906:44121322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT024226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106112 // RefSeq // Rattus norvegicus geminin (Gmnn), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44170134:44178377:1 gene:ENSRNOG00000018782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ219913 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YO10 mRNA sequence. // chr17 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44171599:44178171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT024227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001191692 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 16A (Lrrc16a), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000059510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44916816:45196987:1 gene:ENSRNOG00000016576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000029516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45075077:45127424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1 /// GENSCAN00000029524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45170443:45205030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// NONRATT024233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
NM_201561 // RefSeq // Rattus norvegicus secretagogin, EF-hand calcium binding protein (Scgn), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006253965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretagogin, EF-hand calcium binding protein (Scgn), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45214779:45256404:1 gene:ENSRNOG00000016628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY513659 // GenBank // Rattus norvegicus secretagogin (Scgn) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45214779:45256404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_022643 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ba (Hist1h2ba), mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45279949:45280418:1 gene:ENSRNOG00000016865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M18045 // GenBank // Rat testis-specific histone TH2B mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// M18046 // GenBank // Rat testis-specific histone H2B mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45279990:45287493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT024239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271214 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 17, member 4 (Slc17a4), mRNA. // chr17 // 91 // 97 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000059494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45316866:45323260:1 gene:ENSRNOG00000022505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45314672:45325166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT024240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001107352 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H2bh (Hist1h2bh), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45534129:45542936:-1 gene:ENSRNOG00000021198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ219493 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YO06 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45542469:45553389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_012579 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H1t (Hist1h1t), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H1t (Hist1h1t), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H1t (Hist1h1t), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45529443:45530069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000015956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45493721:45494846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ215278 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YN13 mRNA sequence. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// FQ218623 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YP01 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024282 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H2af (Hist1h2af), mRNA. // chr17 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000022965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45481622:45482014:-1 gene:ENSRNOG00000022146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45481622:45482014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_006222398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.2-like (LOC102549173), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006253979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.2-like (LOC102549173), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000074292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45480513:45480923:-1 gene:ENSRNOG00000050478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0 /// NONRATT025125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45480513:45480923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 100 // 8 // 20 // 0
ENSRNOT00000075018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45475734:45475986:-1 gene:ENSRNOG00000046746 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 84 // 58 // 16 // 19 // 0 /// AY936210 // GenBank // Rattus norvegicus pro-histogranin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001106113 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H1a (Hist1h1a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45468539:45469183:-1 gene:ENSRNOG00000017175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45468539:45469183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT025122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107353 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 17, member 2 (Slc17a2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 17, member 2 (Slc17a2), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45421914:45438537:-1 gene:ENSRNOG00000017180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45422888:45438364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT025121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_022647 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H2bl (Hist1h2bl), mRNA. // chr17 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000072195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45665689:45666069:1 gene:ENSRNOG00000050098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45665689:45666069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0 /// NONRATT024247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 47 // 100 // 8 // 17 // 0
XM_006222407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin, subfamily 2, member A2 (Btn2a2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin, subfamily 2, member A2 (Btn2a2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000059403 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:45724256:45734369:1 gene:ENSRNOG00000038877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000074248 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:45724256:45734369:1 gene:ENSRNOG00000038877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075098 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:45724256:45734369:1 gene:ENSRNOG00000038877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45700981:45734399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT024249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001170337 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrophilin, subfamily 1, member A1 (Btn1a1), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000023622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45756702:45764460:1 gene:ENSRNOG00000017514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45756706:45764460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001025674 // RefSeq // Rattus norvegicus activator of basal transcription 1 (Abt1), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000023649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45800802:45802895:1 gene:ENSRNOG00000017585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC099109 // GenBank // Rattus norvegicus activator of basal transcription 1, mRNA (cDNA clone MGC:116249 IMAGE:7461222), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45793460:45802462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT024250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_001135084 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 322a (Zfp322a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000023268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45878662:45892679:1 gene:ENSRNOG00000017318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_001062714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ac (Hist1h2ac), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_003751712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ac (Hist1h2ac), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000047696 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58949629:58950021:-1 gene:ENSRNOG00000048624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000022891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58949629:58950021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT025253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NM_022686 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H4b (Hist1h4b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58943975:58948418:-1 gene:ENSRNOG00000030142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY936209 // GenBank // Rattus norvegicus histone H4 variant H4-v.1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100619 // GenBank // Rattus norvegicus histone cluster 1, H4b, mRNA (cDNA clone MGC:124607 IMAGE:7938313), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58948084:58948395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT025252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033710 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 16 (thymus) (Prss16), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000024043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58906733:58914519:-1 gene:ENSRNOG00000017713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC089895 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7380278, with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC104722 // GenBank // Rattus norvegicus protease, serine, 16 (thymus), mRNA (cDNA clone MGC:125068 IMAGE:7383387), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58893381:58914493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT025248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000072293 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58718145:58718525:-1 gene:ENSRNOG00000049601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// XM_001061682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2bf (Hist1h2bf), mRNA. // chr17 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58717953:58718525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT025243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 83 // 60 // 5 // 6 // 0
XM_002728479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ae-like (LOC100360754), mRNA. // chr17 // 89 // 50 // 8 // 9 // 0 /// XM_003752994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ae-like (LOC100360754), mRNA. // chr17 // 89 // 50 // 8 // 9 // 0
XM_001057443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG31613-PA (LOC680498), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58702711:58703121:-1 gene:ENSRNOG00000049506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58699738:58703121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0
NM_001109417 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H1b (Hist1h1b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58699738:58700406:-1 gene:ENSRNOG00000018073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58699738:58703121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001061350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ai (Hist1h2ai), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_577577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ai (Hist1h2ai), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000074307 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58672059:58672451:-1 gene:ENSRNOG00000049582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58668360:58672451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT025240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_021860 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1654 (Olr1654), mRNA. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58612831:58613772:1 gene:ENSRNOG00000018180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072839 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58576540:58577450:-1 gene:ENSRNOG00000050718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58612831:58616229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58576809:58577450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT024347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_001000105 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1658 (Olr1658), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58467099:58468019:-1 gene:ENSRNOG00000030274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58398237:58468019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT025238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000024480 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:58398124:58407085:-1 gene:ENSRNOG00000018195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58398237:58468019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001100574 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 192 (Zfp192), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58372076:58390621:-1 gene:ENSRNOG00000045789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58318104:58386365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT025237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
FQ212013 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YJ24 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001029913 // RefSeq // Rattus norvegicus NFKB activating protein-like (Nkapl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58291613:58292800:-1 gene:ENSRNOG00000032534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC097473 // GenBank // Rattus norvegicus NFKB activating protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:114538 IMAGE:7457806), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58291613:58292800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT025234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001060246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 187 (Zfp187), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 187 (Zfp187), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006222420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 187 (Zfp187), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 187 (Zfp187), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006254105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 187 (Zfp187), transcript variant X5, mRNA. // chrU // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_577579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 187 (Zfp187), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58263506:58268024:-1 gene:ENSRNOG00000033114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000064019 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58263506:58268024:-1 gene:ENSRNOG00000033114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000028584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58235247:58282675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT025231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT025232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XR_341648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus piggyBac transposable element-derived protein 1-like (LOC102553146), misc_RNA. // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58235247:58282675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001012053 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 3 (Zkscan3), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 3 (Zkscan3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58204679:58220497:-1 gene:ENSRNOG00000031679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC089847 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:108865 IMAGE:7373658), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58206288:58214262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT025226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000025108 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:57952807:57962094:-1 gene:ENSRNOG00000018596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NM_001105738 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione peroxidase 5 (Gpx5), mRNA. // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000052098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57953756:57962142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001000106 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1660 (Olr1660), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:57801110:57802048:-1 gene:ENSRNOG00000018661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57801110:57802048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001007 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1664 (Olr1664), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:57676503:57677453:-1 gene:ENSRNOG00000033684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57676503:57677381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000014115 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:57401692:57402690:-1 gene:ENSRNOG00000010441 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57401692:57434183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
XM_006222417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable G-protein coupled receptor 141-like (LOC102546579), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254090 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable G-protein coupled receptor 141-like (LOC102546579), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034855 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:56219772:56220672:-1 gene:ENSRNOG00000027612 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198792 // RefSeq // Rattus norvegicus NME/NM23 family member 8 (Nme8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000059201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:56120347:56185412:-1 gene:ENSRNOG00000027604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000059202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:56120347:56185412:-1 gene:ENSRNOG00000027604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000066673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:56120347:56185412:-1 gene:ENSRNOG00000027604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF548544 // GenBank // Rattus norvegicus spermatid-specific thioredoxin-2 protein (Sptrx2) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// BC097265 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 3 (spermatozoa), mRNA (cDNA clone IMAGE:7455991), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:56124681:56181297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT025215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// NONRATT025214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_001007625 // RefSeq // Rattus norvegicus ependymin related 1 (Epdr1), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:56066897:56091673:-1 gene:ENSRNOG00000018989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC083701 // GenBank // Rattus norvegicus ependymin related protein 1 (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:94579 IMAGE:7190104), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:56068208:56091900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000046612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:55901371:56025223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000033203 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:55944776:55945359:-1 gene:ENSRNOG00000027581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 73 // 92 // 8 // 11 // 0
NM_001008298 // RefSeq // Rattus norvegicus STARD3 N-terminal like (Stard3nl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000041099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:55791552:55825490:-1 gene:ENSRNOG00000012126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC086352 // GenBank // Rattus norvegicus STARD3 N-terminal like, mRNA (cDNA clone MGC:105513 IMAGE:7303026), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ220233 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YL06 mRNA sequence. // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT025209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:55786184:55841205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT025210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENSRNOT00000035939 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:108934526:108969204:-1 gene:ENSRNOG00000024854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ230383 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YE15 mRNA sequence. // chr17 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// FQ230907 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA80YL13 mRNA sequence. // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000071035 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:55776597:55778169:1 gene:ENSRNOG00000046627 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071192 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:46463192:46464764:1 gene:ENSRNOG00000046028 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:108934031:108969204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:55772076:55778169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:46458671:46481253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT045032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT045033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000059158 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:46575692:46576348:1 gene:ENSRNOG00000038737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:46328533:46329288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:46575695:46576450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001101002 // RefSeq // Rattus norvegicus POU domain, class 6, transcription factor 2 (Pou6f2), mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000017713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:47109121:47563701:1 gene:ENSRNOG00000013237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC128774 // GenBank // Rattus norvegicus similar to POU domain, class 6, transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:156799 IMAGE:7132745), complete cds. // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:47360809:47525081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001134983 // RefSeq // Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGFB-induced factor homeobox 2 (Tgif2), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048929 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:47572323:47573036:1 gene:ENSRNOG00000030925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:158772767:158787955:-1 gene:ENSRNOG00000042374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC168719 // GenBank // Rattus norvegicus similar to TGFB-induced factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:188777 IMAGE:8364226), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:47572323:47671328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158782341:158783894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT038439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:158753841:158775238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001107356 // RefSeq // Rattus norvegicus Yae1 domain containing 1 (Yae1d1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:35745595:35746269:-1 gene:ENSRNOG00000008962 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:47667539:47674056:1 gene:ENSRNOG00000013438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ211942 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YM20 mRNA sequence. // chr17 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:47572323:47671328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:35745595:35746269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT024261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0
NM_031093 // RefSeq // Rattus norvegicus v-ral simian leukemia viral oncogene homolog A (ras related) (Rala), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:47770966:47784077:1 gene:ENSRNOG00000013454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:47770969:47869488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// L19698 // GenBank // Rat GTP-binding protein (ral A) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001271295 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 13 (Cdk13), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NM_001271296 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 13 (Cdk13), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:47890049:47978811:1 gene:ENSRNOG00000013620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:47914310:47978245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001014146 // RefSeq // Rattus norvegicus succinylCoA:glutarate-CoA transferase (Sugct), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:48264236:48714043:1 gene:ENSRNOG00000014028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 71 // 16 // 17 // 0 /// BC079348 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence AF397014, mRNA (cDNA clone MGC:94802 IMAGE:7107655), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000019426 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:111841677:111842207:-1 gene:ENSRNOG00000014487 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 81 // 88 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:111841453:111875908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENSRNOT00000044024 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:53764349:53765104:-1 gene:ENSRNOG00000014510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:53764349:54102748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT025181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001039036 // RefSeq // Rattus norvegicus GA binding protein transcription factor, beta subunit 1 (Gabpb1), mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NM_001135015 // RefSeq // Rattus norvegicus GA binding protein transcription factor, beta subunit 1-like (Gabpb1l), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020381 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:53581541:53582571:-1 gene:ENSRNOG00000015190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000045443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:125617857:125645734:-1 gene:ENSRNOG00000010659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC098859 // GenBank // Rattus norvegicus GA repeat binding protein, beta 1, mRNA (cDNA clone MGC:112921 IMAGE:7380252), complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// FQ212553 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YL03 mRNA sequence. // chr17 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:53581420:53604318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125619163:125647407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT038029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_181627 // RefSeq // Rattus norvegicus HCLS1 associated protein X-1 (Hax1), mRNA. // chr17 // 36 // 89 // 9 // 25 // 0 /// AY291062 // GenBank // Rattus norvegicus HS1 binding protein (Hax1) mRNA, complete cds. // chr17 // 36 // 89 // 9 // 25 // 0 /// FQ214498 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YF13 mRNA sequence. // chr17 // 36 // 89 // 9 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020387 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:53566763:53567862:-1 gene:ENSRNOG00000015207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:53566935:53567689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106116 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L32 (Mrpl32), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:50802293:50805159:1 gene:ENSRNOG00000015989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:50802330:50804992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT024278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001106117 // RefSeq // Rattus norvegicus HECT, C2 and WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (Hecw1), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:50929146:51469507:1 gene:ENSRNOG00000016046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:51096674:51199296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT024279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NONRATT024279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000071073 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:51411214:51411333:1 gene:ENSRNOG00000050622 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074592 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:51609970:51610089:1 gene:ENSRNOG00000048387 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007626 // RefSeq // Rattus norvegicus geranylgeranyl diphosphate synthase 1 (Ggps1), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:51649823:51662765:1 gene:ENSRNOG00000016767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB118238 // GenBank // Rattus norvegicus rGGPS1a1 mRNA for geranylgeranyl diphosphate synthase1, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB118239 // GenBank // Rattus norvegicus rGGPS1a2 mRNA for geranylgeranyl diphosphate synthase1, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB118240 // GenBank // Rattus norvegicus rGGPS1a3 mRNA for geranylgeranyl diphosphate synthase1, complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB118242 // GenBank // Rattus norvegicus rGGPS1b2 pseudogene mRNA. // chr17 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC090327 // GenBank // Rattus norvegicus geranylgeranyl diphosphate synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105870 IMAGE:7125199), complete cds. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:51656814:51720929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001012161 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor E (Tbce), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006254015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin folding cofactor E (Tbce), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:51676788:51723129:1 gene:ENSRNOG00000029667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC089833 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin folding cofactor E, mRNA (cDNA clone MGC:108815 IMAGE:7325371), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:51656814:51720929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT024289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT024287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT024288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT024290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_057202 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 5B (Kif5b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:51876234:51906466:1 gene:ENSRNOG00000017466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ309275 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-1 heavy chain (Kif5b) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:51857518:51906466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001107357 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 12 (Arhgap12), mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000024022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:51975229:52089012:1 gene:ENSRNOG00000017791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000029891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:51995148:52086892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT024299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XR_341626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557135 (LOC102557135), transcript variant X2, ncRNA. // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001107358 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 438 (Zfp438), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254021 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 438 (Zfp438), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254024 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 438 (Zfp438), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 438 (Zfp438), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 438 (Zfp438), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:52693425:52814680:1 gene:ENSRNOG00000028329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:52753332:52857977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT024303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_053847 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 (Map3k8), mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006254048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 8 (Map3k8), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:54146364:54166886:1 gene:ENSRNOG00000016378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ217924 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA13YN15 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// M94454 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine protein kinase (Tpl-2) mRNA, exons 1-7 and complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:54146440:54165886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_001057382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (RGD1564129), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000058966 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:54969409:54971489:1 gene:ENSRNOG00000042120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT024309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000043855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:54963349:54974489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1
NM_001170421 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to ankyrin repeat domain 26 (RGD1560860), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:61491661:61536163:1 gene:ENSRNOG00000026376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC158594 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ankyrin repeat domain 26, mRNA (cDNA clone MGC:187426 IMAGE:7111099), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ225186 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YN12 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072723 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:55530466:55549926:-1 gene:ENSRNOG00000050332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:61501567:61536021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT024376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:55530608:55633972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENSRNOT00000054508 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:55523887:55523993:-1 gene:ENSRNOG00000049001 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054509 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:61542633:61542739:1 gene:ENSRNOG00000045630 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054508 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:55523887:55523993:-1 gene:ENSRNOG00000049001 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054509 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:61542633:61542739:1 gene:ENSRNOG00000045630 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012468 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB18, member RAS oncogene family (Rab18), mRNA. // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000025828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:61632853:61664236:1 gene:ENSRNOG00000018972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC089957 // GenBank // Rattus norvegicus RAB18, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:109292 IMAGE:7312864), complete cds. // chr17 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT024377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT024378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001270417 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to WAC (RGD1562407), mRNA. // chr17 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// XM_006225665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing adapter protein with coiled-coil-like (LOC100909597), mRNA. // chr17 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0 /// AB574169 // GenBank // Rattus norvegicus WAC mRNA for WW domain-containing adaptor with coiled-coil, complete cds. // chr17 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000058852 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:62664132:62722879:-1 gene:ENSRNOG00000018698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:62666350:62698797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSRNOT00000028942 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:63783696:63784804:1 gene:ENSRNOG00000022378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:63783696:63784831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001044251 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled class receptor 8 (Fzd8), mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:64035884:64038868:1 gene:ENSRNOG00000038571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:64771898:64773952:1 gene:ENSRNOG00000048236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0 /// BC100088 // GenBank // Rattus norvegicus frizzled homolog 8 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:112790 IMAGE:7371338), complete cds. // chr17 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:64724255:64773952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:64036124:64038178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 47 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000036884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:64176536:64177111:1 gene:ENSRNOG00000022250 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001105978 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 137B (Gpr137b), mRNA. // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006254373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 137B (Gpr137b), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:92351953:92362368:1 gene:ENSRNOG00000002480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:92331779:92362335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT024614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
XM_001054456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EDAR-associated death domain (Edaradd), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_574055 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EDAR-associated death domain (Edaradd), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:92462791:92502338:1 gene:ENSRNOG00000002624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:92433103:92502280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 38 // 43 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 38 // 43 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 38 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 58 // 24 // 25 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 65 // 100 // 28 // 43 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 84 // 100 // 36 // 43 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 73 // 60 // 19 // 26 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 52 // 21 // 22 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 66 // 83 // 23 // 35 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 50 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 44 // 48 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 44 // 48 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 44 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 54 // 25 // 26 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 71 // 85 // 29 // 41 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 92 // 100 // 44 // 48 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 83 // 48 // 19 // 23 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 20 // 48 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 30 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 28 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 24 // 19 // 19 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 70 // 25 // 14 // 20 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 80 // 80 // 63 // 79 // 1 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 78 // 78 // 62 // 79 // 1 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 28 // 28 // 22 // 79 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 82 // 62 // 65 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 86 // 28 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 30 // 30 // 24 // 79 // 1 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 20 // 79 // 1
XM_001079298 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 7-like (LOC691693), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006222443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 7-like (LOC691693), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006222444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 7-like (LOC691693), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 7-like (LOC691693), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:68400784:68410882:-1 gene:ENSRNOG00000038520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_053862 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 8 (Lgals8), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000044662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:68233213:68257626:-1 gene:ENSRNOG00000018046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// BC072488 // GenBank // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding, soluble, 8, mRNA (cDNA clone MGC:91554 IMAGE:7104910), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// U09824 // GenBank // Rattus norvegicus 30 kDa S-type lectin (RL-30) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT025310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT025311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:68234623:68287043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001170325 // RefSeq // Rattus norvegicus actinin alpha 2 (Actn2), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000024098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:68050946:68143522:-1 gene:ENSRNOG00000017833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000018811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:68051015:68107460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT025307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT025308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_030864 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase (Mtr), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:67958262:68041430:-1 gene:ENSRNOG00000017593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF034214 // GenBank // Rattus norvegicus methionine synthase (MS) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:67956652:67983319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000018800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:67990460:68034618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000023629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:67941296:67941791:-1 gene:ENSRNOG00000017584 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:67919537:67947441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001191043 // RefSeq // Rattus norvegicus ryanodine receptor 2, cardiac (Ryr2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 96 // 99 // 96 // 100 // 0 /// NM_032078 // RefSeq // Rattus norvegicus ryanodine receptor 2, cardiac (Ryr2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 91 // 99 // 91 // 100 // 0 /// ENSRNOT00000023601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:67286594:67704766:-1 gene:ENSRNOG00000017060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 99 // 98 // 98 // 99 // 0 /// ENSRNOT00000067949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:67286594:67704766:-1 gene:ENSRNOG00000017060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 99 // 98 // 98 // 99 // 0 /// AB204523 // GenBank // Rattus norvegicus RyR mRNA for islet-type ryanodine receptor, complete cds. // chr17 // 96 // 99 // 96 // 100 // 0 /// BC167757 // GenBank // Rattus norvegicus ryanodine receptor 2, cardiac, mRNA (cDNA clone IMAGE:7104355), partial cds. // chr17 // 100 // 20 // 20 // 20 // 0 /// EU346200 // GenBank // Rattus norvegicus ryanodine receptor 2 (Ryr2) mRNA, complete cds. // chr17 // 91 // 99 // 91 // 100 // 0 /// GENSCAN00000019854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:67265826:67582443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 99 // 83 // 83 // 84 // 0 /// NONRATT025300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 15 // 15 // 15 // 101 // 1
NM_012527 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, muscarinic 3 (Chrm3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000075651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:65755434:65757203:-1 gene:ENSRNOG00000049410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AB017656 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for muscarinic receptor m3, complete cds. // chr17 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// M18088 // GenBank // Rat muscarinic acetylcholine receptor (mAChR) subtype M4 mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 74 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:65755434:65757203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT025293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000039221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:65294721:65294975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0
XM_001072335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (RGD1564999), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (RGD1564999), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (LOC102550988), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_344622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (RGD1564347), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043837 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:59741549:59759700:-1 gene:ENSRNOG00000046034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000044132 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:59566862:59574998:-1 gene:ENSRNOG00000046403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000072747 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:59489858:59500683:1 gene:ENSRNOG00000048661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59741549:59789069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59489903:59500683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59522999:59574998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001107362 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 37 (Wdr37), mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000022688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:59811420:59855683:1 gene:ENSRNOG00000016834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000014177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59814093:59835069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT024369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT024372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENSRNOT00000046253 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:60364064:60364427:1 gene:ENSRNOG00000030685 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:60248509:60364372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0
NM_206847 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphofructokinase, platelet (Pfkp), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000023252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:70227568:70290412:-1 gene:ENSRNOG00000017163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC088847 // GenBank // Rattus norvegicus phosphofructokinase, platelet, mRNA (cDNA clone MGC:105718 IMAGE:7312293), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000035628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:70243233:70290364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0
NM_001164396 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 20-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (RGD1564865), mRNA. // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// XM_006254190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C12 (Akr1c12), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT024419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001164396 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 20-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (RGD1564865), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71182340:71211047:1 gene:ENSRNOG00000038361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71180730:71314475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_001008342 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member E2 (Akr1e2), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71079204:71093695:1 gene:ENSRNOG00000017165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC086397 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:105536 IMAGE:7302893), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// FQ212583 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YI11 mRNA sequence. // chr17 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71079284:71093528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT024413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONRATT024414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT024415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
ENSRNOT00000073029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71327496:71327894:1 gene:ENSRNOG00000050653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY383670 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00015 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001170342 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C12 (Akr1c12), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006254190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C12 (Akr1c12), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000029049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71344596:71357471:1 gene:ENSRNOG00000050040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT024419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71344635:71355301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// NONRATT024420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_001100576 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C19 (Akr1c19), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254189 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C19 (Akr1c19), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71363870:71384879:1 gene:ENSRNOG00000038319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71368822:71384863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_138510 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C3 (Akr1c3), mRNA. // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71465935:71482843:1 gene:ENSRNOG00000017531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086579 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C18, mRNA (cDNA clone IMAGE:7307445), partial cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC100248 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C18, mRNA (cDNA clone MGC:116049 IMAGE:7307214), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D14424 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 20-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (20-alpha-HSD), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// L32601 // GenBank // Rat 20 alpha-hydroxysteroid dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71466000:71507351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT024423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001080208 // RefSeq // Rattus norvegicus urocortin 3 (Ucn3), mRNA. // chr17 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71669175:71669669:1 gene:ENSRNOG00000017759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// EF078967 // GenBank // Rattus norvegicus urocortin 3 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71669175:71669669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT024426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0
NM_001039023 // RefSeq // Rattus norvegicus neuroepithelial cell transforming 1 (Net1), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006254206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuroepithelial cell transforming 1 (Net1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71714423:71724531:1 gene:ENSRNOG00000017765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// BC100154 // GenBank // Rattus norvegicus neuroepithelial cell transforming 1, mRNA (cDNA clone MGC:114559 IMAGE:7460511), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000049832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71714504:71723091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT024427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1
NM_001012054 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin-like 3 (Calml3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calmodulin-like 3 (Calml3), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71775714:71777088:1 gene:ENSRNOG00000031955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086350 // GenBank // Rattus norvegicus calmodulin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:105977 IMAGE:7302843), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000024075 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:71879528:71880069:1 gene:ENSRNOG00000017898 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 90 // 95 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71879528:71879869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT024430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006222452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 208, member B (Fam208b), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006254220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 208, member B (Fam208b), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71949094:72002002:1 gene:ENSRNOG00000018011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71949094:71990801:1 gene:ENSRNOG00000018011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 53 // 15 // 17 // 0 /// BC168208 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 10 open reading frame 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131179), partial cds. // chr17 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000049826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71967775:72002002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT024434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001106119 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein, helicase, 18 (Fbxo18), mRNA. // chr17 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// XM_006254201 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein, helicase, 18 (Fbxo18), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// XM_006254203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein, helicase, 18 (Fbxo18), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 97 // 70 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:72103236:72141153:1 gene:ENSRNOG00000018549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 88 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000040046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:72116645:72140884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 77 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT024438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// NONRATT024439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
NM_001013058 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 17 (Rbm17), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000025550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:72289005:72305891:1 gene:ENSRNOG00000018767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079248 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 17, mRNA (cDNA clone MGC:94338 IMAGE:7132972), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:72291123:72413509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NONRATT024449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000038817 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:73846179:73882795:1 gene:ENSRNOG00000001066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// BC100087 // GenBank // Rattus norvegicus similar to inter-alpha-inhibitor H2 chain, mRNA (cDNA clone IMAGE:7370417), partial cds. // chr17 // 100 // 41 // 18 // 18 // 0 /// FQ219080 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YN15 mRNA sequence. // chr17 // 64 // 32 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:73806947:73882872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 75 // 33 // 33 // 0
NM_133293 // RefSeq // Rattus norvegicus GATA binding protein 3 (Gata3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:74115946:74135216:1 gene:ENSRNOG00000019336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY024364 // GenBank // Rattus norvegicus GATA-3 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:74106205:74128155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT024469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001025720 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1 (Dhtkd1), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065978 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:77943929:78014754:1 gene:ENSRNOG00000023587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// BC099075 // GenBank // Rattus norvegicus dehydrogenase E1 and transketolase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:116097 IMAGE:7441857), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:77943929:78011512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_001170343 // RefSeq // Rattus norvegicus Sec61 alpha 2 subunit (S. cerevisiae) (Sec61a2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006254257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sec61 alpha 2 subunit (S. cerevisiae) (Sec61a2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78015736:78041913:1 gene:ENSRNOG00000023278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78027435:78041395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT024486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT024487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_053877 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 123 (Cdc123), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78066968:78109667:1 gene:ENSRNOG00000017770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC061527 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 123 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72665 IMAGE:6920755), complete cds. // chrU // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U34843 // GenBank // Rattus norvegicus cell cycle progression related D123 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78083884:78109095:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT024490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001107365 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase ID (Camk1d), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78187614:78591805:1 gene:ENSRNOG00000017882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000041963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78424818:78574043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENSRNOT00000042991 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:78386693:78388203:1 gene:ENSRNOG00000031981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 63 // 15 // 15 // 0
NM_001107365 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase ID (Camk1d), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78187614:78591805:1 gene:ENSRNOG00000017882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145081 // RefSeq // Rattus norvegicus optineurin (Optn), mRNA. // chr17 // 75 // 80 // 24 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78833450:78884466:1 gene:ENSRNOG00000017941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000042881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78833450:78884466:1 gene:ENSRNOG00000017941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000074087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78861334:78884466:1 gene:ENSRNOG00000017941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 60 // 23 // 24 // 0 /// AB050777 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for injury-inducible-protein I-55, complete cds. // chr17 // 88 // 65 // 23 // 26 // 0 /// AB069907 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FIP-2 like protein, complete cds. // chr17 // 75 // 80 // 24 // 32 // 0 /// BC086976 // GenBank // Rattus norvegicus optineurin, mRNA (cDNA clone MGC:93070 IMAGE:7111026), complete cds. // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// FQ223875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA84YG05 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT024498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000040480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78842465:78882335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// NONRATT024499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1
NM_001107366 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 10 (Mcm10), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000024178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78890310:78911578:1 gene:ENSRNOG00000017981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78889879:78909268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT024502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_138523 // RefSeq // Rattus norvegicus PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae) (Prpf18), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:79256708:79287301:1 gene:ENSRNOG00000018396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF244920 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel regulatory factor mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:79256812:79283007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT024508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_138523 // RefSeq // Rattus norvegicus PRP18 pre-mRNA processing factor 18 homolog (S. cerevisiae) (Prpf18), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:79256708:79287301:1 gene:ENSRNOG00000018396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000037417 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:79715182:79716690:1 gene:ENSRNOG00000026535 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
NM_001004257 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 14 (Hspa14), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80379450:80400359:1 gene:ENSRNOG00000015212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079118 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:94119 IMAGE:7126497), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80383209:80437380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT024515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_006222461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547897 (LOC102547897), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547897 (LOC102547897), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020384 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:80383209:80384852:1 gene:ENSRNOG00000015196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80383209:80437380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT024513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108883 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of variegation 3-9 homolog 2 (Drosophila) (Suv39h2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of variegation 3-9 homolog 2 (Drosophila) (Suv39h2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000020924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80406940:80425965:1 gene:ENSRNOG00000015585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000012245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80383209:80437380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_001134882 // RefSeq // Rattus norvegicus meiosis/spermiogenesis associated 1 (Meig1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus meiosis/spermiogenesis associated 1 (Meig1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254278 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus meiosis/spermiogenesis associated 1 (Meig1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80461316:80474218:1 gene:ENSRNOG00000016283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80471448:80474069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022705 // RefSeq // Rattus norvegicus oleoyl-ACP hydrolase (Olah), mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006254275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oleoyl-ACP hydrolase (Olah), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000022043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80520857:80545393:1 gene:ENSRNOG00000016403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M16200 // GenBank // Rat medium-chain S-acyl fatty acid synthetase thio ester hydrolase (MCH), complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// Y00311 // GenBank // Rat mRNA for thioesterase II (medium-chain S-acyl fatty acid synthetase thioester hydrolase). // chr17 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80522099:80545113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT024524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033063 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 38 subunit (Rpp38), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 38 subunit (Rpp38), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80556409:80559948:1 gene:ENSRNOG00000038025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100623 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 38 subunit (human), mRNA (cDNA clone MGC:124666 IMAGE:7929545), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80559044:80559862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT024525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT024526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022224 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphotriesterase related (Pter), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphotriesterase related (Pter), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:81874644:81936881:1 gene:ENSRNOG00000017328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078833 // GenBank // Rattus norvegicus phosphotriesterase related, mRNA (cDNA clone MGC:93452 IMAGE:7110694), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ225601 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YH18 mRNA sequence. // chr17 // 73 // 81 // 16 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:81907136:81935914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT024530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_031140 // RefSeq // Rattus norvegicus vimentin (Vim), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:82500858:82509377:1 gene:ENSRNOG00000018087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061847 // GenBank // Rattus norvegicus vimentin, mRNA (cDNA clone MGC:72372 IMAGE:5621065), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:82496848:82554236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT024535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT024533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001109121 // RefSeq // Rattus norvegicus signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 1 (Stam), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006254287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 1 (Stam), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000035634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:82954327:83002354:1 gene:ENSRNOG00000026026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC168933 // GenBank // Rattus norvegicus signal transducing adaptor molecule (SH3 domain and ITAM motif) 1, mRNA (cDNA clone MGC:189232 IMAGE:7106331), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ221736 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YH16 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:82930876:83004284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT024537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT024538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
XM_001057551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 236 (Tmem236), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_003753012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 236 (Tmem236), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057785 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:83026672:83088858:1 gene:ENSRNOG00000037982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001106123 // RefSeq // Rattus norvegicus mannose receptor, C type 1 (Mrc1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:83099574:83180475:1 gene:ENSRNOG00000018251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:83153327:83179860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT024540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:83072540:83150203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001106124 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 12 (Slc39a12), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000044313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:83212254:83288595:1 gene:ENSRNOG00000025639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000002641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:83189426:83263021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_053851 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, beta 2 subunit (Cacnb2), mRNA. // chr17 // 93 // 70 // 26 // 28 // 0 /// XM_006254297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, beta 2 subunit (Cacnb2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:83664610:83761206:1 gene:ENSRNOG00000018378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:83540713:83761206:1 gene:ENSRNOG00000018378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// AF394941 // GenBank // Rattus norvegicus L-type calcium channel beta-2c subunit mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 90 // 75 // 27 // 30 // 0 /// AF423193 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel beta 2b subunit (CACNB2) mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 65 // 24 // 26 // 0 /// AY190119 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel beta 2c subunit (Cacnb2) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 70 // 26 // 28 // 0 /// AY190120 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel beta 2e subunit (Cacnb2) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 65 // 23 // 26 // 0 /// M80545 // GenBank // Rattus norvegicus calcium channel L-type beta 2 subunit mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 70 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:83721551:83759471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001015031 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 5B (Arl5b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:83807999:83830811:1 gene:ENSRNOG00000018714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC091260 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 5B, mRNA (cDNA clone MGC:109092 IMAGE:7376855), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:83819582:83832724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
KC843479 // GenBank // Rattus norvegicus Diet1 (Diet1) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:84229386:84533323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
KC843479 // GenBank // Rattus norvegicus Diet1 (Diet1) mRNA, complete cds. // chr17 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:84653688:84832922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001108422 // RefSeq // Rattus norvegicus plexin domain containing 2 (Plxdc2), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:84957327:85343868:1 gene:ENSRNOG00000000142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC168868 // GenBank // Rattus norvegicus plexin domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:189116 IMAGE:9088739), complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT024555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:85234013:85284891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT024557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001012162 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 10 (Mllt10), mRNA. // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000034157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:86605397:86705156:1 gene:ENSRNOG00000022249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// BC087128 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 10, mRNA (cDNA clone MGC:94916 IMAGE:7112191), complete cds. // chr17 // 98 // 100 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000025447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:86574639:86704474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 77 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT024571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// NONRATT024570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT024572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_198732 // RefSeq // Rattus norvegicus COMM domain containing 3 (Commd3), mRNA. // chr17 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:87079392:87083183:1 gene:ENSRNOG00000016383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC060591 // GenBank // Rattus norvegicus COMM domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:72959 IMAGE:6920278), complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// NONRATT024575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT024577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT024579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT024578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001107368 // RefSeq // Rattus norvegicus Bmi1 polycomb ring finger oncogene (Bmi1), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:87087687:87091415:1 gene:ENSRNOG00000016585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC168209 // GenBank // Rattus norvegicus Bmi1 polycomb ring finger oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:188100 IMAGE:7133190), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87047271:87091348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT024581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001106125 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 6-like (Spag6l), mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:87105510:87165997:1 gene:ENSRNOG00000022021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87105518:87135802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87144414:87210517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001287020 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 3 (Armc3), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006222471 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 3 (Armc3), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006254321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 3 (Armc3), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:87632223:87712693:1 gene:ENSRNOG00000016716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:87632223:87725943:1 gene:ENSRNOG00000016716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000075188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:87632223:87725943:1 gene:ENSRNOG00000016716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87622973:87657686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87675345:87725943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT024584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001031660 // RefSeq // Rattus norvegicus methionine sulfoxide reductase B2 (Msrb2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:87781867:87860120:1 gene:ENSRNOG00000016873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098953 // GenBank // Rattus norvegicus methionine sulfoxide reductase B2, mRNA (cDNA clone MGC:114588 IMAGE:7374871), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87781885:87858783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_053964 // RefSeq // Rattus norvegicus pancreas specific transcription factor, 1a (Ptf1a), mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:87911175:87913029:1 gene:ENSRNOG00000016902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87896538:87912712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT024589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_574086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OTU domain containing 1 (Otud1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006222477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer trap locus 4 (Etl4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer trap locus 4 (Etl4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89090162:89370265:1 gene:ENSRNOG00000008666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89090162:89370265:1 gene:ENSRNOG00000008666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89090162:89370265:1 gene:ENSRNOG00000008666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:88907370:89370265:1 gene:ENSRNOG00000008666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89090162:89370265:1 gene:ENSRNOG00000008666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89090162:89370265:1 gene:ENSRNOG00000008666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000053468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:89724870:89737848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001025035 // RefSeq // Rattus norvegicus threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae) (Thnsl1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89783177:89789609:1 gene:ENSRNOG00000033076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091213 // GenBank // Rattus norvegicus threonine synthase-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:108927 IMAGE:7382276), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:89787301:89789538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT024597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170326 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 158 (Gpr158), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000034098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89902429:90335831:1 gene:ENSRNOG00000024832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:90221765:90332955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:90099065:90204918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT024598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT024600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
XM_001053631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin IIIA (Myo3a), mRNA. // chr17 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025053 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:90644638:90847767:1 gene:ENSRNOG00000018478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:90710056:90820549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0
NM_012563 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate decarboxylase 2 (Gad2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:90851697:90914893:1 gene:ENSRNOG00000018200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M72422 // GenBank // Rat glutamic acid decarboxylase (GAD65) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:90847117:90914759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000071601 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:91818487:91818946:-1 gene:ENSRNOG00000046464 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91762557:91818696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
NM_001100577 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 interacting protein (Apbb1ip), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91762064:91812342:-1 gene:ENSRNOG00000017803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91762557:91818696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_053682 // RefSeq // Rattus norvegicus YME1-like 1 ATPase (Yme1l1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006254339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YME1-like 1 ATPase (Yme1l1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006254369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1-like (LOC100910779), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000023395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91368188:91406073:-1 gene:ENSRNOG00000017100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000071812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91466352:91503738:-1 gene:ENSRNOG00000048225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// AF151784 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-dependent metalloprotease FtsH1 homolog (meg-4) mRNA, complete cds. // chr17 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// BC081751 // GenBank // Rattus norvegicus YME1-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93290 IMAGE:7108995), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000028872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91472160:91504854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91374661:91445269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0
XM_006222494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921537P18 (RGD1308454), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006254366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921537P18 (RGD1308454), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000052342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91249873:91445730:-1 gene:ENSRNOG00000016992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC079322 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921537P18, mRNA (cDNA clone MGC:94501 IMAGE:7135443), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT025492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108879 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L36 (Mrpl36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32688645:32689707:-1 gene:ENSRNOG00000023407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33993648:33993941:-1 gene:ENSRNOG00000047971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// BC167015 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L36, mRNA (cDNA clone MGC:189215 IMAGE:9099683), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33993648:33993941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001107330 // RefSeq // Rattus norvegicus iroquois homeobox 4 (Irx4), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus iroquois homeobox 4 (Irx4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus iroquois homeobox 4 (Irx4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus iroquois homeobox 4 (Irx4), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:34059614:34068683:-1 gene:ENSRNOG00000012720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:34060186:34064260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001039505 // RefSeq // Rattus norvegicus iroquois homeobox 2 (Irx2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:34682802:34688217:-1 gene:ENSRNOG00000012742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:34668193:34730119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT004117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001106097 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 10 (Med10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:37504218:37509877:-1 gene:ENSRNOG00000017150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:37504609:37545854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001108403 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP2/Sun RNA methyltransferase family, member 2 (Nsun2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000023641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:37692672:37716918:-1 gene:ENSRNOG00000017254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000050310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:37694985:37716841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT004127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
ENSRNOT00000013363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:70154033:70255794:1 gene:ENSRNOG00000009988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000023779 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:38348364:38351171:-1 gene:ENSRNOG00000017678 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
XM_001063171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LOC361192 (RGD1308544), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_341475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LOC361192 (RGD1308544), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:39083932:39107584:-1 gene:ENSRNOG00000047406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT004132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:39083186:39123314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001082574 // RefSeq // Rattus norvegicus FAST kinase domains 3 (Fastkd3), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FAST kinase domains 3 (Fastkd3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000034410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:39116027:39123314:-1 gene:ENSRNOG00000027422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC161806 // GenBank // Rattus norvegicus FAST kinase domains 3, mRNA (cDNA clone MGC:187220 IMAGE:7111194), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:39083186:39123314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT004134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT004133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT004136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XR_342586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to regulator of sex-limitation candidate 16 (RGD1566325), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XR_342587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to regulator of sex-limitation candidate 16 (RGD1566325), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XR_342588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to regulator of sex-limitation candidate 16 (RGD1566325), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XR_349946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to regulator of sex-limitation candidate 16 (RGD1566325), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XR_349947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to regulator of sex-limitation candidate 16 (RGD1566325), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XR_349948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to regulator of sex-limitation candidate 16 (RGD1566325), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:39260120:39268029:-1 gene:ENSRNOG00000017963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:39260120:39281445:-1 gene:ENSRNOG00000017963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 100 // 15 // 23 // 0 /// NONRATT004145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT004146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 83 // 19 // 23 // 1
XR_342585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 728-like (LOC102547287), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XR_349945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 728-like (LOC102547287), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:39309508:39319406:-1 gene:ENSRNOG00000016462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT004149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ225927 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YK19 mRNA sequence. // chr1 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
ENSRNOT00000071889 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:39329955:39347172:-1 gene:ENSRNOG00000049259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ211879 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YJ08 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NONRATT004153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// NONRATT004154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
XM_006222885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 728-like (LOC102551340), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT004159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_001000104 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1653 (Olr1653), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:4923922:4924869:1 gene:ENSRNOG00000018489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:4923922:4938323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NONRATT023736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000056119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:4907710:4911449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
XR_085649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to FLJ46321 protein (LOC502109), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_086056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to FLJ46321 protein (LOC502109), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061701 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:5036234:5040298:1 gene:ENSRNOG00000040116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC105873 // GenBank // Rattus norvegicus similar to FLJ46321 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131903), partial cds. // chr17 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:5017766:5039767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_001008359 // RefSeq // Rattus norvegicus SPATA31 subfamily A, member 5 (Spata31a5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:2400214:2405996:-1 gene:ENSRNOG00000018202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF511042 // GenBank // Rattus norvegicus acrosome-specific protein VAD1.3 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC085936 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 75, member A4, mRNA (cDNA clone MGC:94993 IMAGE:7115545), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:2400309:2403101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT024671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000047043 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:2152356:2152658:1 gene:ENSRNOG00000040101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000016743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:2141582:2152658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT023735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
BC098838 // GenBank // Rattus norvegicus cell cycle related kinase, mRNA (cDNA clone MGC:112893 IMAGE:7378980), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001025752 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 20 (Cdk20), mRNA. // chr17 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000024466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1924304:1931006:1 gene:ENSRNOG00000017991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// NONRATT023732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT023733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000008374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1892407:1972799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001079940 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan binding protein 4 (Habp4), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hyaluronan binding protein 4 (Habp4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1669173:1691084:1 gene:ENSRNOG00000019027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC129111 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronan binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:156749 IMAGE:7111244), complete cds. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1669255:1690981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENSRNOT00000025965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1318565:1414152:1 gene:ENSRNOG00000019175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211532 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA89YI06 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000034477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1204140:1413325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_006222307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6-like 2 (Ercc6l2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// XM_006253499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6-like 2 (Ercc6l2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000025965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1318565:1414152:1 gene:ENSRNOG00000019175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ211532 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA89YI06 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:1318565:1354698:1 gene:ENSRNOG00000019175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000034477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:1204140:1413325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT023722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NR_031827 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-24-1 (Mir24-1), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT023720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// rno-mir-24-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000854 Rattus norvegicus miR-24-1 stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NR_031832 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 27b (Mir27b), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053699 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:17:816274:816370:1 gene:ENSRNOG00000035576 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-27b // miRBase Micro RNA Database // MI0000859 Rattus norvegicus miR-27b stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031826 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-23b (Mir23b), microRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053590 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:17:816035:816131:1 gene:ENSRNOG00000035467 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT023719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-23b // miRBase Micro RNA Database // MI0000853 Rattus norvegicus miR-23b stem-loop // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012346 // RefSeq // Rattus norvegicus aminopeptidase O (Npepo), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:550168:814393:1 gene:ENSRNOG00000017505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT023712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
ENSRNOT00000043659 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:352319:352416:1 gene:ENSRNOG00000036404 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
DQ100479 // GenBank // Rattus norvegicus LINE-1 retrotransposon nucleic acid binding protein mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001107335 // RefSeq // Rattus norvegicus death associated protein kinase 1 (Dapk1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:6525247:6683920:-1 gene:ENSRNOG00000018198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:6507095:6653376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_133324 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 35, NatC auxiliary subunit (Naa35), mRNA. // chr17 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000025096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:7636176:7688566:-1 gene:ENSRNOG00000018417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AF272892 // GenBank // Rattus norvegicus corneal wound healing related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// BC074005 // GenBank // Rattus norvegicus MAK10 homolog, amino-acid N-acetyltransferase subunit, (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:91510 IMAGE:7099269), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000014652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:7636472:7687826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT024695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT024697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 28 // 28 // 13 // 46 // 1 /// NONRATT024699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1 /// NONRATT024700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 15 // 46 // 1 /// NONRATT024696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// NONRATT024701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
AY265419 // GenBank // Rattus norvegicus truncated trkB receptor (TrkB) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 62 // 28 // 29 // 0 /// M55291 // GenBank // Rat neural receptor protein-tyrosine kinase (trkB) mRNA, complete cds. // chr17 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// M55292 // GenBank // Rat neural receptor protein-tyrosine kinase (trkB) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 57 // 26 // 27 // 0 /// M55293 // GenBank // Rat neural receptor protein-tyrosine kinase (trkB) mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 51 // 23 // 24 // 0 /// NM_012731 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophic tyrosine kinase, receptor, type 2 (Ntrk2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 91 // 91 // 43 // 47 // 1 /// ENSRNOT00000042145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:8156432:8464507:-1 gene:ENSRNOG00000018839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 91 // 43 // 47 // 1 /// NM_001163168 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophic tyrosine kinase, receptor, type 2 (Ntrk2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 66 // 66 // 31 // 47 // 1 /// NONRATT024709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000003471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:8341506:8447237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 38 // 38 // 18 // 47 // 1 /// GENSCAN00000003484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:8213013:8292383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// NONRATT024711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1
XM_001067170 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RecQ mediated genome instability 1 (Rmi1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RecQ mediated genome instability 1 (Rmi1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006222333 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RecQ mediated genome instability 1 (Rmi1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006253565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RecQ mediated genome instability 1 (Rmi1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_225150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RecQ mediated genome instability 1 (Rmi1), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:8862959:8864812:-1 gene:ENSRNOG00000019108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT024715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:8833280:8872231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001037362 // RefSeq // Rattus norvegicus idnK, gluconokinase homolog (E. coli) (Idnk), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus idnK, gluconokinase homolog (E. coli) (Idnk), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000026407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:9088387:9095099:-1 gene:ENSRNOG00000019519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC087713 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7317196. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC107923 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5133401N09, mRNA (cDNA clone MGC:125086 IMAGE:7444531), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:9088905:9092594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 37 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT024718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_021692 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 5 (Smad5), mRNA. // chr17 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// XM_006253585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMAD family member 5 (Smad5), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:10488652:10507888:-1 gene:ENSRNOG00000022870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AB010955 // GenBank // Rattus norvegicus Smad5 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// BC070905 // GenBank // Rattus norvegicus SMAD family member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7103141), partial cds. // chr17 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// BC161849 // GenBank // Rattus norvegicus SMAD family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:187371 IMAGE:9099068), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:10489295:10513126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_053802 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta induced (Tgfbi), mRNA. // chr17 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:10576349:10605606:-1 gene:ENSRNOG00000012216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:10576956:10605580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT024730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001291408 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 3, pseudogene 1 (Fbxl3-ps1), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000035839 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:10683643:10692612:-1 gene:ENSRNOG00000012168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:10673642:10798513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
XM_006253590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 48 (Slc25a48), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016138 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:10744823:10781826:-1 gene:ENSRNOG00000012040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:10673642:10798513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT024742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001106101 // RefSeq // Rattus norvegicus cation channel, sperm associated 3 (Catsper3), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11065031:11090130:-1 gene:ENSRNOG00000011374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11065104:11113975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001024998 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 15 (Txndc15), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11147557:11548829:-1 gene:ENSRNOG00000000133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC091340 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:109343 IMAGE:7315216), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11545236:11548966:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT024746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007048 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:59647425:59648698:-1 gene:ENSRNOG00000005316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 66 // 14 // 19 // 0 /// NONRATT024747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000009406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:59647908:59671531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT024750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
XM_006222335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA B230219D22 (RGD1566359), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11561581:11571465:-1 gene:ENSRNOG00000047934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ228424 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA8YJ20 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11565172:11641986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_139098 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 46 (Ddx46), mRNA. // chr17 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// XM_006253601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 46 (Ddx46), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000029885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11582992:11626966:-1 gene:ENSRNOG00000021637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// BC107590 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 46, mRNA (cDNA clone MGC:124939 IMAGE:7461248), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// U25746 // GenBank // Rattus norvegicus RNA helicase with arginine-serine-rich domain mRNA, complete cds. // chr17 // 98 // 98 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000047112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11565172:11641986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT024755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// NONRATT024754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 46 // 46 // 21 // 46 // 1
NM_053334 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium modulating ligand (Camlg), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium modulating ligand (Camlg), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000037088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11631232:11642058:-1 gene:ENSRNOG00000021911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF302085 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-modulating cyclophilin ligand mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC076377 // GenBank // Rattus norvegicus calcium modulating ligand, mRNA (cDNA clone MGC:93311 IMAGE:7110159), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT024758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11565172:11641986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001031661 // RefSeq // Rattus norvegicus xylosylprotein beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 7 (B4galt7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11657452:11666049:-1 gene:ENSRNOG00000021886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099103 // GenBank // Rattus norvegicus xylosylprotein beta1,4-galactosyltransferase, polypeptide 7 (galactosyltransferase I), mRNA (cDNA clone MGC:116242 IMAGE:7460148), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11657981:11672670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT024762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001009703 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 9 (Tmed9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11668171:11672682:-1 gene:ENSRNOG00000021882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088422 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:95048 IMAGE:7123664), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT024764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11657981:11672670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001109116 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 7 (synaptic) (Prr7), mRNA. // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000036162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11803152:11804276:-1 gene:ENSRNOG00000021447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11803312:11830518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT024766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001112712 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 6 (Grk6), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NM_001112713 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 6 (Grk6), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NM_031657 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 6 (Grk6), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000047958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11815973:11830526:-1 gene:ENSRNOG00000014615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// AF040750 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 6, splice variant C (GRK6) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// FQ222081 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YF06 mRNA sequence. // chr17 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// NONRATT024767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000047088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11803312:11830518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 84 // 31 // 37 // 1 /// NONRATT024769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 84 // 84 // 31 // 37 // 1 /// NONRATT024768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1
NM_013030 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 34 (type II sodium/phosphate contransporter), member 1 (Slc34a1), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000033749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11856946:11872100:-1 gene:ENSRNOG00000015262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// AB013453 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NaPi-2 alpha, complete cds. // chr17 // 100 // 55 // 23 // 23 // 0 /// AB013455 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NaPi-2 gamma, complete cds. // chr17 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// BC078876 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 34 (sodium phosphate), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93556 IMAGE:7109613), complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// L13257 // GenBank // Rattus norvegicus, renal Na/Pi-cotransport mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT024770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000047140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11857417:11900897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// NONRATT024772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// AB013454 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NaPi-2 beta, complete cds. // chr17 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT024771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT024775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1
NM_053764 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 14 (Rgs14), mRNA. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11887270:11901352:-1 gene:ENSRNOG00000015616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC091132 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 14, mRNA (cDNA clone MGC:108631 IMAGE:7376916), complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// U92279 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signalling 14 (RGS14) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000047140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11857417:11900897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT024777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_001009636 // RefSeq // Rattus norvegicus PRELI domain containing 1 (Prelid1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000022134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11943926:11946985:-1 gene:ENSRNOG00000016410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC088284 // GenBank // Rattus norvegicus PRELI domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:109157 IMAGE:7323653), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ230147 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YH17 mRNA sequence. // chr17 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// FQ213335 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YG18 mRNA sequence. // chr17 // 67 // 90 // 12 // 18 // 0 /// GENSCAN00000034215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11944220:11946824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT024782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_001107337 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor binding SET domain protein 1 (Nsd1), mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// XM_006253627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor binding SET domain protein 1 (Nsd1), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000060928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:11953813:12062583:-1 gene:ENSRNOG00000016680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000034231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:11955004:12065788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT024785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001109904 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor 4 (Fgfr4), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000042394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12099389:12113632:-1 gene:ENSRNOG00000016763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC100260 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor 4, mRNA (cDNA clone MGC:116290 IMAGE:7100540), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT024788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000034244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12092378:12173755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// NONRATT024790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001107338 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 346 (Zfp346), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12131051:12168912:-1 gene:ENSRNOG00000016867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12092378:12173755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT024791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_022206 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-5 homolog A (C. elegans) (Unc5a), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000034731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12262674:12317433:-1 gene:ENSRNOG00000025920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U87305 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane receptor Unc5H1 mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12262674:12281210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001013138 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 17 (Tspan17), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 17 (Tspan17), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12482948:12490502:-1 gene:ENSRNOG00000018122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC097431 // GenBank // Rattus norvegicus F-box only protein 23, mRNA (cDNA clone MGC:114479 IMAGE:7455325), complete cds. // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AY485933 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-hydroxybutyrate receptor mRNA, complete cds. // chr17 // 58 // 83 // 14 // 24 // 0 /// NONRATT024799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12471580:12490382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// NONRATT024802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT024800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT024801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT024803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_006222336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E family member 1B (Eif4e1b), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E family member 1B (Eif4e1b), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000037527 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:12495950:12498474:-1 gene:ENSRNOG00000025480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075579 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:12495950:12498546:-1 gene:ENSRNOG00000025480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12495950:12507890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_001070261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin-related family member 2 (Cdhr2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000024151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12541003:12565478:-1 gene:ENSRNOG00000017917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12543958:12565478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// FQ211788 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA79YP23 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT024809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001017445 // RefSeq // Rattus norvegicus Fas associated factor family member 2 (Faf2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12613754:12653474:-1 gene:ENSRNOG00000017607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC091224 // GenBank // Rattus norvegicus Fas associated factor family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:108962 IMAGE:7128668), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12612762:12653462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT024813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT024815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT024816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT024817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT024818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT024819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001106102 // RefSeq // Rattus norvegicus HIG1 hypoxia inducible domain family, member 2A (Higd2a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000023515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12684712:12685636:-1 gene:ENSRNOG00000017372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC166544 // GenBank // Rattus norvegicus HIG1 domain family, member 2A, mRNA (cDNA clone MGC:188144 IMAGE:7301761), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT024819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT024821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_207165 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 10 (Arl10), mRNA. // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12693071:12701000:-1 gene:ENSRNOG00000045948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// FQ210279 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA31YA09 mRNA sequence. // chr17 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000052830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12694957:12701434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0
XM_006253664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SUMO-interacting motifs containing 1 (Simc1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022980 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:12725166:12747399:-1 gene:ENSRNOG00000016932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 90 // 66 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000044559 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:12725166:12747562:-1 gene:ENSRNOG00000016932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064274 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:12725166:12749263:-1 gene:ENSRNOG00000016932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12725166:12767848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
XM_001070540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM195B-like (RGD1566033), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_577557 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM195B-like (RGD1566033), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000039245 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:12782625:12782915:-1 gene:ENSRNOG00000023936 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000052831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12782586:12782915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT024826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_053878 // RefSeq // Rattus norvegicus complexin 2 (Cplx2), mRNA. // chr17 // 92 // 79 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12883635:12892106:-1 gene:ENSRNOG00000000105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// D70816 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for synaphin 1, complete cds. // chr17 // 92 // 79 // 24 // 26 // 0 /// U35099 // GenBank // Rattus norvegicus complexin II mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12841226:12884894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT024829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_012965 // RefSeq // Rattus norvegicus histamine receptor H 2 (Hrh2), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:13041793:13042869:-1 gene:ENSRNOG00000018260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:13019951:13042869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001012213 // RefSeq // Rattus norvegicus sideroflexin 1 (Sfxn1), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// XM_006253645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sideroflexin 1 (Sfxn1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:13157817:13193253:-1 gene:ENSRNOG00000018279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC078935 // GenBank // Rattus norvegicus sideroflexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93747 IMAGE:7108166), complete cds. // chr17 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// FQ209748 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA40YB17 mRNA sequence. // chr17 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000055323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:13148635:13201035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// NONRATT024833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1 /// NONRATT024832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
NM_001107339 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 2 (Ror2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:14050995:14228982:1 gene:ENSRNOG00000010974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:14189604:14228073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT023951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012758 // RefSeq // Rattus norvegicus spleen tyrosine kinase (Syk), mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:14705881:14759165:-1 gene:ENSRNOG00000012160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:14705881:14759165:-1 gene:ENSRNOG00000012160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// U21683 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine kinase p72 (syk) mRNA, alternative splice sykA, complete cds. // chr17 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// U21684 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine kinase p72 (syk) mRNA, alternative splice sykB, complete cds. // chr17 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:14707016:14745089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT024838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001077640 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma (Gadd45g), mRNA. // chr17 // 92 // 60 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:15469301:15471060:-1 gene:ENSRNOG00000013090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// BC168643 // GenBank // Rattus norvegicus growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:187235 IMAGE:9092341), complete cds. // chr17 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:15469788:15482915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 50 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT024845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1
NM_024002 // RefSeq // Rattus norvegicus SECIS binding protein 2 (Secisbp2), mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:15630050:15661255:-1 gene:ENSRNOG00000013773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ234993 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YN24 mRNA sequence. // chr17 // 93 // 44 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:15630706:15713945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT024850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
GENSCAN00000006234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:15630706:15713945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_001271143 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate receptor 3 (S1pr3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate receptor 3 (S1pr3), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:15873396:15874535:-1 gene:ENSRNOG00000014524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:15873396:15874535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_001170429 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoredoxin-like 2 (Nxnl2), mRNA. // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000019489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:16120216:16124962:-1 gene:ENSRNOG00000014538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000019622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16108730:16125328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006222348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910585 (LOC100910585), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006222349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis-associated protein 31E1-like (LOC689303), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT023985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
XM_006222355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase MARK2-like (RGD1560527), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase MARK2-like (RGD1560527), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_341451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase MARK2-like (RGD1560527), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_341452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase MARK2-like (RGD1560527), transcript variant X5, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_360862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase MARK2-like (RGD1560527), transcript variant X4, misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17315779:17331529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_006222389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1565598), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1565598), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_341453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group protein B1-like (LOC102549716), misc_RNA. // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// XR_360863 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high mobility group protein B1-like (LOC102549716), misc_RNA. // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17379178:17396661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001100572 // RefSeq // Rattus norvegicus isoleucyl-tRNA synthetase (Iars), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17414466:17461081:-1 gene:ENSRNOG00000014616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17414961:17480629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
NM_001108408 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar protein 8 (Nol8), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253686 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar protein 8 (Nol8), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar protein 8 (Nol8), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000073035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:16618115:16641475:-1 gene:ENSRNOG00000046968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000074667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17464281:17487878:-1 gene:ENSRNOG00000045569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16604190:16634463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17414961:17480629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001106103 // RefSeq // Rattus norvegicus osteoglycin (Ogn), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus osteoglycin (Ogn), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17506166:17526899:-1 gene:ENSRNOG00000029792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:16659766:16679168:-1 gene:ENSRNOG00000047786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16661348:16679088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000047638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17507751:17525729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_031817 // RefSeq // Rattus norvegicus osteomodulin (Omd), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17534553:17542498:-1 gene:ENSRNOG00000039560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074323 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:16688136:16690150:-1 gene:ENSRNOG00000046658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AF104362 // GenBank // Rattus norvegicus osteoadherin mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16688136:16715975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17534774:17570402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001014008 // RefSeq // Rattus norvegicus asporin (Aspn), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus asporin (Aspn), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus asporin (Aspn), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:16708333:16731733:-1 gene:ENSRNOG00000015410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17555163:17570402:-1 gene:ENSRNOG00000050431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC083711 // GenBank // Rattus norvegicus asporin, mRNA (cDNA clone MGC:94601 IMAGE:7190620), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17534774:17570402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000038962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16688136:16715975:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
XM_006222357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus extracellular matrix protein 2-like (LOC100361383), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus extracellular matrix protein 2-like (LOC100910978), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ215770 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YL11 mRNA sequence. // chr17 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000043852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:17593225:17614338:-1 gene:ENSRNOG00000031716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000071131 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:16747888:16769745:-1 gene:ENSRNOG00000045684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// GENSCAN00000038968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16738878:16766294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000047637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17584792:17610887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001008556 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol 1,3,4,5,6-pentakisphosphate 2-kinase (Ippk), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17663712:17701633:-1 gene:ENSRNOG00000015631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY823319 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate kinase 1 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17644250:17707345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033674 // RefSeq // Rattus norvegicus bicaudal D homolog 2 (Drosophila) (Bicd2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_198765 // RefSeq // Rattus norvegicus bicaudal D homolog 2 (Drosophila) (Bicd2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17731019:17775591:-1 gene:ENSRNOG00000016031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC100660 // GenBank // Rattus norvegicus bicaudal D homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:124540 IMAGE:7935996), complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000047640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17722983:17775521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT024877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_012867 // RefSeq // Rattus norvegicus ninjurin 1 (Ninj1), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:17930044:17945158:-1 gene:ENSRNOG00000016587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U72660 // GenBank // Rattus norvegicus ninjurin1 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ220561 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YH01 mRNA sequence. // chr17 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:17930412:17945124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT024879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108880 // RefSeq // Rattus norvegicus BARX homeobox 1 (Barx1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:16875794:16879269:-1 gene:ENSRNOG00000016915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:16876318:16879186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT024859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175582 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of DNA binding 4 (Id4), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:18744511:18747080:-1 gene:ENSRNOG00000016099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:18746250:18757412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001108881 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 144B (Rnf144b), mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 144B (Rnf144b), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 144B (Rnf144b), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 144B (Rnf144b), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:19987412:20121060:1 gene:ENSRNOG00000016123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:20002119:20121865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001107343 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 1B (Kdm1b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000022244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:19908417:19948376:1 gene:ENSRNOG00000016519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000051650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19913064:19946764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT024041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
XM_001058608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 8, member A1 (Fam8a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_214446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 8, member A1 (Fam8a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036560 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:19513325:19519557:1 gene:ENSRNOG00000026120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060500 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:19513325:19519557:1 gene:ENSRNOG00000026120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19493678:19519557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001191100 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 24 (Rbm24), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:19261277:19269603:1 gene:ENSRNOG00000046547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT024031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:19251540:19267788:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT024030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_006253771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stathmin domain-containing protein 1-like (LOC102554838), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:19120176:19152208:1 gene:ENSRNOG00000031595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000031025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:18947861:19152208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_057188 // RefSeq // Rattus norvegicus guanosine monophosphate reductase (Gmpr), mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:21568732:21606386:-1 gene:ENSRNOG00000017250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF090867 // GenBank // Rattus norvegicus guanosine monophosphate reductase mRNA, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:21569049:21606309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001107344 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin regulatory light chain interacting protein (Mylip), mRNA. // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000024021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:21703597:21725205:-1 gene:ENSRNOG00000017579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:21694062:21714641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT024914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001108410 // RefSeq // Rattus norvegicus CD83 molecule (Cd83), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:26364944:26384002:1 gene:ENSRNOG00000018092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166582 // GenBank // Rattus norvegicus CD83 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:188297 IMAGE:7385133), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:26365176:26382919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT024078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109117 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 182 (Rnf182), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 182 (Rnf182), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:26191715:26240098:1 gene:ENSRNOG00000018070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253844 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 182 (Rnf182), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000030961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:26239178:26245132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT024077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000009844 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:25976239:25977011:1 gene:ENSRNOG00000007488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_003752959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar protein 7 (Nol7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024122 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:25966535:25969643:1 gene:ENSRNOG00000017904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ223635 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA90YJ16 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25942146:25977011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT024071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT024072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001004256 // RefSeq // Rattus norvegicus sirtuin 5 (Sirt5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:25942005:25963431:1 gene:ENSRNOG00000017866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC078958 // GenBank // Rattus norvegicus sirtuin (silent mating type information regulation 2 homolog) 5 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93823 IMAGE:7110841), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000030962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25942146:25977011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT024066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT024067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT024068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT024070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_214457 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatase and actin regulator 1 (Phactr1), mRNA. // chr17 // 93 // 75 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:25210472:25713154:1 gene:ENSRNOG00000014264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// AY494977 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatase and actin regulator 1 (Phactr1) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 75 // 28 // 30 // 0 /// BC098634 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatase and actin regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:112561 IMAGE:7317963), complete cds. // chr17 // 93 // 75 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25613137:25658622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT024059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000050766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:25694763:25716363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT024061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_012548 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelin 1 (Edn1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:24118009:24124009:-1 gene:ENSRNOG00000014361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M64711 // GenBank // Rat endothelin-1 mRNA , complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:24118601:24123820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT024935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001105751 // RefSeq // Rattus norvegicus human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1 (Hivep1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019389 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:24256199:24289488:-1 gene:ENSRNOG00000014460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:24273296:24342242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:24256894:24267413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT024936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001177820 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00112-like (LOC100362172), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:24633513:24652615:-1 gene:ENSRNOG00000031845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:24633513:24648634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
AY310151 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1258 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001008774 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 170B (Tmem170b), mRNA. // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000046157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:24806010:24837335:-1 gene:ENSRNOG00000031495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT024945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006222392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 2-like (Sycp2l), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006253783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 2-like (Sycp2l), mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000038180 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:23413658:23466965:-1 gene:ENSRNOG00000023831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000044736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:23417383:23461573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 49 // 23 // 23 // 0
NM_001037356 // RefSeq // Rattus norvegicus PAK1 interacting protein 1 (Pak1ip1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:23562529:23573599:-1 gene:ENSRNOG00000023799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC107922 // GenBank // Rattus norvegicus PAK1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:125015 IMAGE:7444847), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:23562821:23573540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001001511 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2, I-branching enzyme (Gcnt2), mRNA. // chr17 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000035448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:23615673:23657985:-1 gene:ENSRNOG00000023778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AY435151 // GenBank // Rattus norvegicus I-branching beta-1,6-acetylglucosaminyltransferase family polypeptide 1 (Ignt1) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// AY435152 // GenBank // Rattus norvegicus I-branching beta-1,6-acetylglucosaminyltransferase family polypeptide 2 (Ignt2) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AY435153 // GenBank // Rattus norvegicus I-branching beta-1,6-acetylglucosaminyltransferase family polypeptide 3 (Ignt3) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// BC099796 // GenBank // Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 2, I-branching enzyme, mRNA (cDNA clone MGC:124528 IMAGE:7936188), complete cds. // chr17 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:23618078:23621043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONRATT024932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_013107 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 6 (Bmp6), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:28869728:29029564:-1 gene:ENSRNOG00000013717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY184240 // GenBank // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 6 (Bmp6) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// X58830 // GenBank // Rat vgr mRNA. // chr17 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// FQ228856 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YB11 mRNA sequence. // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000013538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:28870345:28913232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT024967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001106107 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 48 (U11/U12) (Snrnp48), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 48 (U11/U12) (Snrnp48), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:29159013:29194311:-1 gene:ENSRNOG00000013756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:29146215:29194281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT024971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT024975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSRNOT00000018649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:29202519:29249169:-1 gene:ENSRNOG00000013928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:29202519:29249169:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001100511 // RefSeq // Rattus norvegicus RIO kinase 1 (Riok1), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000018936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:29343651:29366597:-1 gene:ENSRNOG00000014049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ209749 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA40YB15 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000000608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:29344363:29366341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT024984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001107348 // RefSeq // Rattus norvegicus ras responsive element binding protein 1 (Rreb1), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras responsive element binding protein 1 (Rreb1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras responsive element binding protein 1 (Rreb1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras responsive element binding protein 1 (Rreb1), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:29453342:29579484:-1 gene:ENSRNOG00000015701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:29456178:29512197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000054514 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:29774091:29774199:-1 gene:ENSRNOG00000036399 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
NM_001106128 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 86 (Ly86), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:30007745:30080876:-1 gene:ENSRNOG00000000137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:30008093:30049210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:30080503:30080777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENSRNOT00000034755 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:30086466:30088002:-1 gene:ENSRNOG00000025289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:30086494:30088002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001013139 // RefSeq // Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Fars2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006253819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Fars2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006253820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Fars2), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// XM_006253821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Fars2), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// XM_006253823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Fars2), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XM_006253824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Fars2), transcript variant X7, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006253826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Fars2), transcript variant X9, mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000021660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:30910292:31335168:-1 gene:ENSRNOG00000016135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC078956 // GenBank // Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:93815 IMAGE:7110464), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ232145 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YN10 mRNA sequence. // chr17 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT024998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT024999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_006222378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3G (Ppp1r3g), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3G (Ppp1r3g), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021704 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:31464150:31465193:-1 gene:ENSRNOG00000016222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:31464150:31465193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014145 // RefSeq // Rattus norvegicus chromodomain protein, Y-like (Cdyl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006253837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain protein, Y-like (Cdyl), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:31569734:31795070:-1 gene:ENSRNOG00000032215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079003 // GenBank // Rattus norvegicus chromodomain protein, Y chromosome-like, mRNA (cDNA clone MGC:93912 IMAGE:7112869), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:31569881:31589668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT025002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSRNOT00000021900 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:32210724:32211510:-1 gene:ENSRNOG00000016355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:32194662:32305528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000048146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:32523519:32561683:-1 gene:ENSRNOG00000033763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// BC079269 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933417A18, mRNA (cDNA clone MGC:94380 IMAGE:7133712), complete cds. // chrU // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_001011923 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 4B (Prpf4b), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 4B (Prpf4b), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006253797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 4B (Prpf4b), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006253799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 4B (Prpf4b), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000022902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:32583633:32614446:-1 gene:ENSRNOG00000016705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// BC085927 // GenBank // Rattus norvegicus PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:94868 IMAGE:7110150), complete cds. // chr17 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000054969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:32584918:32606878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_001107349 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 50, member B (Fam50b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 50, member B (Fam50b), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:32764500:32765507:-1 gene:ENSRNOG00000017083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:32764500:32765507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001129879 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 4 (Psmg4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000060132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:33299002:33306344:-1 gene:ENSRNOG00000039265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC167096 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 4, mRNA (cDNA clone MGC:189533 IMAGE:8362489), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000049188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33299073:33306242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC085704 // GenBank // Rattus norvegicus phosphodiesterase 4B, cAMP specific, mRNA (cDNA clone MGC:93193 IMAGE:7189628), complete cds. // chr17 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT025015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001037206 // RefSeq // Rattus norvegicus biphenyl hydrolase-like (serine hydrolase) (Bphl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:33392069:33428242:-1 gene:ENSRNOG00000017577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105908 // GenBank // Rattus norvegicus biphenyl hydrolase-like (serine hydrolase), mRNA (cDNA clone MGC:125077 IMAGE:7388526), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ218691 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YF13 mRNA sequence. // chr17 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT025018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT025019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33394774:33457396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT025020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT025021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT025023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107350 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor (TNFRSF)-interacting serine-threonine kinase 1 (Ripk1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus receptor (TNFRSF)-interacting serine-threonine kinase 1 (Ripk1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:33430661:33462906:-1 gene:ENSRNOG00000017787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33394774:33457396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001004214 // RefSeq // Rattus norvegicus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 2 (Nqo2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 2 (Nqo2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 2 (Nqo2), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:34023306:34051486:-1 gene:ENSRNOG00000017820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079157 // GenBank // Rattus norvegicus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 2, mRNA (cDNA clone MGC:94180 IMAGE:7128990), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34019448:34047955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
XM_001066387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 1b (Serpinb1b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_225268 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 1b (Serpinb1b), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000022681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:34442903:34450396:-1 gene:ENSRNOG00000034229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000070876 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:33903628:33908890:-1 gene:ENSRNOG00000048358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34443007:34450386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000017111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33903628:33944094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_003751674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte elastase inhibitor A-like (LOC100911107), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_003752962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte elastase inhibitor A-like (LOC100911107), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XR_360978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B, member 9 (RGD1562844), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074842 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:33960032:33969988:-1 gene:ENSRNOG00000048576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000012154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34501208:34512325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:33960119:33970982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT025035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
NM_001007732 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 9 (Serpinb9), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:34542627:34554071:-1 gene:ENSRNOG00000033772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079063 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:94010 IMAGE:7121006), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ226618 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA20YE22 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34543139:34715969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001012214 // RefSeq // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6b (Serpinb6b), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000059921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:34662699:34680041:-1 gene:ENSRNOG00000016420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// BC079108 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade B, member 6b, mRNA (cDNA clone MGC:94100 IMAGE:7125468), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000012155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34543139:34715969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONRATT025038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1 /// NONRATT025039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_172332 // RefSeq // Rattus norvegicus Werner helicase interacting protein 1 (Wrnip1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:34825602:34845847:-1 gene:ENSRNOG00000017040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY136827 // GenBank // Rattus norvegicus Werner syndrome-interacting protein-like protein (Wrnip) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC098652 // GenBank // Rattus norvegicus Werner helicase interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:112594 IMAGE:7306780), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34826047:34855138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_134338 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box C1 (Foxc1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:35835470:35837131:-1 gene:ENSRNOG00000017800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:35835470:35837131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000010687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:34877064:34885167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 41 // 12 // 12 // 0
NM_022858 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box Q1 (Foxq1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:36109377:36110699:-1 gene:ENSRNOG00000021752 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// L13201 // GenBank // Rattus norvegicus HNF-3/forkhead homolog-1 (HFH-1) mRNA, complete cds. // chr17 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:36109542:36186230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT025047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106108 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 4 (Irf4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 4 (Irf4), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000024494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:38499153:38517524:1 gene:ENSRNOG00000018108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:38481784:38528087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT024178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001108412 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 22 (Dusp22), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:38367181:38417679:1 gene:ENSRNOG00000018218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT024171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:38413940:38437407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT024175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_030985 // RefSeq // Rattus norvegicus angiotensin II receptor, type 1a (Agtr1a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// XM_006253882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiotensin II receptor, type 1a (Agtr1a), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 54 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000038532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:37218834:37270540:-1 gene:ENSRNOG00000018346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// AY585654 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensin II receptor type 1A (Agtr1a) mRNA, 5 UTR and partial cds; alternatively spliced. // chr17 // 92 // 22 // 12 // 13 // 0 /// BC078810 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensin II receptor, type 1, mRNA (cDNA clone MGC:93396 IMAGE:7126918), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// M74054 // GenBank // Rat angiotensin II receptor mRNA, complete cds. // chr17 // 86 // 72 // 36 // 42 // 0 /// GENSCAN00000034704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:37219673:37242948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 52 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT025050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0
NM_001109120 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane bound O-acyltransferase domain containing 1 (Mboat1), mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:37374238:37486374:-1 gene:ENSRNOG00000027125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ225431 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA53YL16 mRNA sequence. // chr17 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000057858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:37321398:37441727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001137626 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F transcription factor 3 (E2f3), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000050261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:37642240:37716592:1 gene:ENSRNOG00000029273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:37642256:37716112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001044702 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 5, subfamily a, member 2 (Prl5a2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000059757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40318162:40324498:1 gene:ENSRNOG00000039075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// DQ329280 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein P (Prlpp) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:40320007:40324341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT024194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_138527 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 5, subfamily a, member 1 (Prl5a1), mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40184558:40191996:1 gene:ENSRNOG00000016307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40184558:40191996:1 gene:ENSRNOG00000016307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB022883 // GenBank // Rattus norvegicus PLP-L mRNA for prolactin-like-peptide, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// AF226607 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein L mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ230176 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YF22 mRNA sequence. // chr17 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT024192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:40141529:40262069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_017036 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 4, subfamily a, member 1 (Prl4a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40569969:40577892:-1 gene:ENSRNOG00000016436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097332 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin family 4, subfamily a, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:114339 IMAGE:7443660), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228460 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA8YB23 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M13750 // GenBank // Rat prolactin-like protein A (rPLP-A) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:40534469:40712223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001044271 // RefSeq // Rattus norvegicus Prolactin family 2, subfamily c, member 1 (Prl2c1), mRNA. // chr17 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40711015:40719474:-1 gene:ENSRNOG00000039058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// DQ329281 // GenBank // Rattus norvegicus proliferin (Plf) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT025063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0
NM_053791 // RefSeq // Rattus norvegicus Prolactin family 2, subfamily a, member 1 (Prl2a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:40761345:40767436:-1 gene:ENSRNOG00000016463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF226608 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein M mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC097296 // GenBank // Rattus norvegicus Prolactin family 2, subfamily a, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:114285 IMAGE:7445776), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ329279 // GenBank // Rattus norvegicus truncated prolactin-like protein M (Prlpm) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:40761546:40765332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT025064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_033233 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 3, subfamily d, member 4 (Prl3d4), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44786251:44793065:-1 gene:ENSRNOG00000016792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC097302 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin family 3, subfamily d, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:114295 IMAGE:7444366), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U32679 // GenBank // Rattus norvegicus placental lactogen-I variant mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44786372:44798066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT025107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT025109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_022846 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 2 (Prl8a2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:41481076:41490310:-1 gene:ENSRNOG00000017048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097316 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin family 8, subfamily a, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:114317 IMAGE:7442457), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ220685 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YA11 mRNA sequence. // chr17 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ228468 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA8YA22 mRNA sequence. // chr17 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// L06441 // GenBank // Rattus norvegicus decidual prolactin-related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022176 // RefSeq // Rattus norvegicus prolactin family 6, subfamily a, member 1 (Prl6a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44570611:44575451:-1 gene:ENSRNOG00000017089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158563 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin family 6, subfamily a, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:187255 IMAGE:7443132), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ219971 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YK18 mRNA sequence. // chr17 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// M31155 // GenBank // Rat prolactin-like protein B mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220349 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YD14 mRNA sequence. // chr17 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44570758:44573846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT025100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153736 // RefSeq // Rattus norvegicus Prolactin family 3, subfamily a, member 1 (Prl3a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44588559:44604898:-1 gene:ENSRNOG00000017103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB019791 // GenBank // Rattus norvegicus PLP-H mRNA for prolactin-like protein H, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AF526270 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein-I mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44588689:44613922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012535 // RefSeq // Rattus norvegicus Prolactin family 3, subfamily b, member 1 (Prl3b1), mRNA. // chr17 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000023086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44635983:44641617:-1 gene:ENSRNOG00000017185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097255 // GenBank // Rattus norvegicus Prolactin family 3, subfamily b, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:114216 IMAGE:7444166), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44636124:44681464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_031316 // RefSeq // Rattus norvegicus Prolactin family 3, subfamily c, member 1 (Prl3c1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44676965:44682715:-1 gene:ENSRNOG00000017203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AB019119 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for decidualin, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AB019945 // GenBank // Rattus norvegicus plp-j mRNA for prolactin-like-protein J, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF150741 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein J mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF234638 // GenBank // Rattus norvegicus prolactin-like protein J mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44636124:44681464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000010703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:42001428:42003367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106110 // RefSeq // Rattus norvegicus doublecortin domain containing 2 (Dcdc2), mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006253916 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin domain containing 2 (Dcdc2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:43711172:43899062:-1 gene:ENSRNOG00000017511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:43716492:43752772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000035882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:43831797:43849093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001100512 // RefSeq // Rattus norvegicus glycosylphosphatidylinositol specific phospholipase D1 (Gpld1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosylphosphatidylinositol specific phospholipase D1 (Gpld1), transcript variant X7, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:43952825:43995477:-1 gene:ENSRNOG00000017702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:43953469:43973689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT025082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001197023 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to mKIAA0319 protein (RGD1307443), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000024536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44033616:44094176:-1 gene:ENSRNOG00000018141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000035891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44038519:44083486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT025086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT025087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001034947 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosyl-DNA phosphodiesterase 2 (Tdp2), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44097468:44108824:-1 gene:ENSRNOG00000018246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC101920 // GenBank // Rattus norvegicus Traf and Tnf receptor associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:124734 IMAGE:7937874), complete cds. // chr17 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44089699:44108755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
ENSRNOT00000059564 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:44124794:44134878:-1 gene:ENSRNOG00000018456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// BC089212 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC005537, mRNA (cDNA clone MGC:105535 IMAGE:7302835), complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT025091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0
NM_001014009 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 65, member B (Fam65b), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006253934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 65, member B (Fam65b), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000048298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44192188:44289647:-1 gene:ENSRNOG00000018804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC089211 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7302784, with apparent retained intron. // chr17 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// XM_006253932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 65, member B (Fam65b), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// FQ226921 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA17YC05 mRNA sequence. // chr17 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000035897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44207016:44254423:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT025093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT025095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001024273 // RefSeq // Rattus norvegicus cytidine monophospho-N-acetylneuraminic acid hydroxylase (Cmah), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// ENSRNOT00000018699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:44449940:44506535:-1 gene:ENSRNOG00000003094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// BC095843 // GenBank // Rattus norvegicus cytidine monophosphate-N-acetylneuraminic acid hydroxylase (CMP-N-acetylneuraminate monooxygenase) pseudogene, mRNA (cDNA clone MGC:112687 IMAGE:7389569), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// GENSCAN00000017707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:44432410:44524550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 62 // 62 // 0 /// NONRATT025098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// NONRATT025097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 51 // 51 // 33 // 65 // 1 /// NONRATT025099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 31 // 65 // 1
GENSCAN00000015949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45273785:45274801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_021839 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H2aa (Hist1h2aa), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45279292:45279684:-1 gene:ENSRNOG00000048122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45279292:45279684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H4-like (LOC102548682), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006253976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H4-like (LOC102548682), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000074109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45527498:45527809:1 gene:ENSRNOG00000046636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000015950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45527498:45527809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001173434 // RefSeq // Rattus norvegicus hemochromatosis (Hfe), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 114 // 114 // 0 /// NM_053301 // RefSeq // Rattus norvegicus hemochromatosis (Hfe), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 136 // 136 // 0 /// ENSRNOT00000022809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45515737:45523531:1 gene:ENSRNOG00000016967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 114 // 114 // 0 /// ENSRNOT00000022881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45515737:45523531:1 gene:ENSRNOG00000016967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 136 // 136 // 0 /// AF176534 // GenBank // Rattus norvegicus hemochromatosis gene product HFE splice variant delE2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 49 // 68 // 68 // 0 /// AJ001517 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for hereditary haemochromatosis-like protein. // chr17 // 95 // 97 // 129 // 136 // 0 /// NM_001173435 // RefSeq // Rattus norvegicus hemochromatosis (Hfe), transcript variant 3, mRNA. // chr17 // 64 // 64 // 90 // 140 // 1 /// ENSRNOT00000022810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45515737:45523531:1 gene:ENSRNOG00000016967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 64 // 64 // 90 // 140 // 1 /// AF176535 // GenBank // Rattus norvegicus hemochromatosis gene product HFE splice variant delE2(14E4) mRNA, complete cds. // chr17 // 31 // 31 // 44 // 140 // 1 /// GENSCAN00000015945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45515817:45524107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 61 // 85 // 85 // 0 /// NONRATT024245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 99 // 139 // 139 // 0
XM_006253977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ah (Hist1h2ah), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45486782:45487174:1 gene:ENSRNOG00000049649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45486782:45488470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT024243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
XM_006253978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H2B type 1-N-like (LOC102549061), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000049785 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:45482315:45482695:1 gene:ENSRNOG00000047776 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000015969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45482315:45482695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
XM_006253992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H3a (Hist1h3a), mRNA. // chr17 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000072019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45470632:45471042:1 gene:ENSRNOG00000046144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006222399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H4a (Hist1h4a), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// XM_006253980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H4a (Hist1h4a), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// GENSCAN00000015936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45470632:45471943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 89 // 53 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT024241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_001055696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H4-like (LOC680097), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_003752983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H4-like (LOC680097), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45677621:45677932:-1 gene:ENSRNOG00000050933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:45677621:45680247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT025130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XR_338491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr17 // 23 // 23 // 12 // 53 // 1 /// XR_357468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr17 // 23 // 23 // 12 // 53 // 1 /// FQ217911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA14YD18 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0 /// NONRATT059021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 55 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 17 // 53 // 1
NM_017293 // RefSeq // Rattus norvegicus U2AF homology motif (UHM) kinase 1 (Uhmk1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:93147551:93162493:-1 gene:ENSRNOG00000002941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// U70372 // GenBank // Rattus norvegicus PAM COOH-terminal interactor protein 2 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC098669 // GenBank // Rattus norvegicus U2AF homology motif (UHM) kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:112620 IMAGE:7096907), complete cds. // chr17 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000023660 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:59052938:59054562:1 gene:ENSRNOG00000017603 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:93149376:93178117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59052968:59054227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT017680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT017682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
XM_003753000 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2bc-like (LOC100359692), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006222433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2bc-like (LOC100359692), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000048465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58950318:58950698:1 gene:ENSRNOG00000045750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000022875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58950318:58983040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001109400 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H2bk (Hist1h2bk), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000041423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58942757:58943137:1 gene:ENSRNOG00000047183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000022881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58942757:58943137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT024361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001162930 // RefSeq // Rattus norvegicus POM121 transmembrane nucleoporin-like 2 (Pom121l2), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001162931 // RefSeq // Rattus norvegicus POM121 transmembrane nucleoporin-like 2 (Pom121l2), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000068720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58875459:58882513:1 gene:ENSRNOG00000038850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000022882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58875561:58878314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 184 (Zfp184), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006222427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 184 (Zfp184), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006254113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 184 (Zfp184), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006254114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 184 (Zfp184), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006254115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 184 (Zfp184), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC128784 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 184, mRNA (cDNA clone MGC:156842 IMAGE:7381364), complete cds. // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000021042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58827366:58862470:1 gene:ENSRNOG00000017947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT024355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000054510 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58761585:58761695:1 gene:ENSRNOG00000036395 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001061734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ao (Hist1h2ao), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// XM_344599 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ao (Hist1h2ao), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000045512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58718819:58719211:1 gene:ENSRNOG00000050266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58718819:58721226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 79 // 83 // 15 // 19 // 0
XM_001061048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.1-like (LOC682330), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003751708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H3.1-like (LOC682330), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58626130:58626540:1 gene:ENSRNOG00000050821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58624879:58626540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109423 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 1, H2ak (Hist1h2ak), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58624879:58625271:1 gene:ENSRNOG00000046114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58624879:58626540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT024348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_021860 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1654 (Olr1654), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000024463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58612831:58613772:1 gene:ENSRNOG00000018180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58612831:58616229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT024347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001000536 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1657 (Olr1657), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58555249:58556187:-1 gene:ENSRNOG00000027810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58555249:58561002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 4 (Zkscan4), mRNA. // chrU // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000024797 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58313742:58319451:1 gene:ENSRNOG00000038818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT024346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000068397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58187516:58188211:1 gene:ENSRNOG00000018429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 16 // 16 // 0 /// BC161917 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8369939. // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000052103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58183429:58187446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY129561 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein ZFP96 mRNA, complete cds. // chr17 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1
ENSRNOT00000041927 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:58180751:58181545:1 gene:ENSRNOG00000032965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000052101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58180757:58181545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_147165 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione peroxidase 6 (Gpx6), mRNA. // chr17 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000058270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:58020331:58027779:1 gene:ENSRNOG00000018473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// M76733 // GenBank // Rat odorant-metabolizing protein (RY2D1) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 86 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT024340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000052110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:58021996:58030301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001134974 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 27 (Trim27), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC169072 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 27, mRNA (cDNA clone MGC:189472 IMAGE:5599836), complete cds. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041671 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:57844089:57856502:1 gene:ENSRNOG00000018622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57837732:57865723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT024335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001000107 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1662 (Olr1662), mRNA. // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:57783016:57783969:1 gene:ENSRNOG00000038792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57783016:57783969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT024334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_001000107 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1662 (Olr1662), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000059275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:57783016:57783969:1 gene:ENSRNOG00000038792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57783016:57783969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT024334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000020944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:57716505:57717324:1 gene:ENSRNOG00000038790 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57692908:57730226:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_001191940 // RefSeq // Rattus norvegicus acyloxyacyl hydrolase (neutrophil) (Aoah), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000036418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:57368445:57604881:1 gene:ENSRNOG00000027672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000017851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57454372:57501889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// GENSCAN00000017864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:57564851:57604881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT024333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001108415 // RefSeq // Rattus norvegicus engulfment and cell motility 1 (Elmo1), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// XM_006254084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus engulfment and cell motility 1 (Elmo1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// XM_006254087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus engulfment and cell motility 1 (Elmo1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000025516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:56598697:57133815:1 gene:ENSRNOG00000018726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000074910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:56692515:57132588:1 gene:ENSRNOG00000018726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// HQ438489 // GenBank // Rattus norvegicus strain Wistar engulfment and cell motility 1 splice 1 variant (Elmo1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr17 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000026385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:56696364:56828135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 49 // 49 // 22 // 45 // 1 /// GENSCAN00000026387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:56981307:57132588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1 /// NONRATT024331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 19 // 45 // 1 /// NONRATT024328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1 /// NONRATT024329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1
ENSRNOT00000034910 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:56431720:56432862:1 gene:ENSRNOG00000027620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:56401990:56502671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_053544 // RefSeq // Rattus norvegicus secreted frizzled-related protein 4 (Sfrp4), mRNA. // chr17 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:56095160:56105248:1 gene:ENSRNOG00000018893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AF012891 // GenBank // Rattus norvegicus frizzled related protein frpAP mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// AF140346 // GenBank // Rattus norvegicus frizzled related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// AF220608 // GenBank // Rattus norvegicus frizzled related protein (Frp) mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:56094979:56104485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 65 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT024325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1
XR_005438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRGT00094 (LOC498759), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XR_009616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRGT00094 (LOC498759), misc_RNA. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000040660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:55834031:55847316:1 gene:ENSRNOG00000030323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY387080 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00094 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
S75437 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor gamma chain (TCRg; C4L) mRNA, complete cds. // chrU // 80 // 79 // 12 // 15 // 0
ENSRNOT00000046953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:55609862:55617141:-1 gene:ENSRNOG00000027571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000059170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:55609862:55612302:-1 gene:ENSRNOG00000027571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000047361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:55640564:55641080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// FQ231824 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YA19 mRNA sequence. // chr17 // 83 // 64 // 15 // 18 // 0 /// FQ232605 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YB18 mRNA sequence. // chr17 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT025207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT025206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
GENSCAN00000047366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:55646268:55646751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022217 // RefSeq // Rattus norvegicus amphiphysin (Amph), mRNA. // chr17 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// XM_006254082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amphiphysin-like (LOC100910792), mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000017102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:46357604:46621763:-1 gene:ENSRNOG00000012490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006257729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amphiphysin-like (LOC100909679), mRNA. // chr17 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000073497 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:55671837:55699822:-1 gene:ENSRNOG00000048110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:46344446:46455770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:55703366:55769175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// GENSCAN00000052953 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06110520.1:2802:30017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_001107355 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 41 homolog (S. cerevisiae) (Vps41), mRNA. // chr17 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:46706104:46866332:-1 gene:ENSRNOG00000012940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// FQ223450 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA11YD02 mRNA sequence. // chr17 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT025133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:46702905:46742922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT025135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001109452 // RefSeq // Rattus norvegicus M-phase specific PLK1 interacting protein (Mplkip), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:48011755:48046661:-1 gene:ENSRNOG00000013806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017128 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibin beta-A (Inhba), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inhibin beta-A (Inhba), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:49965505:49978776:-1 gene:ENSRNOG00000014320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M37482 // GenBank // Rat inhibin beta-A-subunit mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT025144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:49965606:50026601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_080405 // RefSeq // Rattus norvegicus GLI family zinc finger 3 (Gli3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:50360049:50629477:-1 gene:ENSRNOG00000014395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:50360111:50374563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000034999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:50429446:50504455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_006254003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to expressed sequence AW209491 (RGD1308147), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:50780397:50787033:-1 gene:ENSRNOG00000015523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC088171 // GenBank // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AW209491, mRNA (cDNA clone MGC:108798 IMAGE:7322765), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC090337 // GenBank // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AW209491, mRNA (cDNA clone MGC:105979 IMAGE:7302860), complete cds. // chr17 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT025149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT025151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000052359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:50780755:50800258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT025150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT025152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_017279 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 2 (Psma2), mRNA. // chr17 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:50789084:50802098:-1 gene:ENSRNOG00000049920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC060576 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 2, mRNA (cDNA clone MGC:72879 IMAGE:6919255), complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// FQ214776 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YB24 mRNA sequence. // chr17 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// FQ223872 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA84YI10 mRNA sequence. // chr17 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// J02897 // GenBank // Rat proteasome component C3 mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// FQ226013 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YF12 mRNA sequence. // chr17 // 65 // 92 // 15 // 23 // 0 /// NONRATT025153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:50780755:50800258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT025154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_053421 // RefSeq // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 4B (Rbp1 like) (Arid4b), mRNA. // chr17 // 98 // 96 // 46 // 47 // 0 /// XM_006254020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AT rich interactive domain 4B (Rbp1 like) (Arid4b), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000010836 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:51526629:51608638:-1 gene:ENSRNOG00000049751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000022445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:51326388:51409882:-1 gene:ENSRNOG00000016391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// AF245512 // GenBank // Rattus norvegicus retinoblastoma-binding protein 1-related protein mRNA, complete cds. // chr17 // 98 // 96 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000024417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:51327631:51433950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000024433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:51519941:51650304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0
NM_001144851 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (B3galnt2), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XR_361036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (B3galnt2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr17 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:51721961:51764786:-1 gene:ENSRNOG00000016855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (B3galnt2), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000029873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:51724045:51747221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_013164 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger E-box binding homeobox 1 (Zeb1), mRNA. // chrU // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:52352978:52409521:-1 gene:ENSRNOG00000017863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000046013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:52352978:52373311:-1 gene:ENSRNOG00000017863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// U51584 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger homeodomain enhancer-binding protein-2 Zfhep-2) mRNA, partial cds. // chrU // 100 // 63 // 26 // 26 // 0 /// U51583 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger homeodomain enhancer-binding protein-1 (Zfhep-1) mRNA, partial cds. // chrU // 78 // 78 // 32 // 41 // 1 /// NONRATT025164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000052268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:52353064:52436141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// NONRATT025165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 29 // 41 // 1
NM_001108416 // RefSeq // Rattus norvegicus supervillin (Svil), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006254030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus supervillin (Svil), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000025037 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:52916420:52984969:-1 gene:ENSRNOG00000018110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064331 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:52916420:52984969:-1 gene:ENSRNOG00000018110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:52867048:53009039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0
XM_001056659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to OTTHUMP00000046255 (RGD1562037), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006222410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to OTTHUMP00000046255 (RGD1562037), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to OTTHUMP00000046255 (RGD1562037), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_574050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to OTTHUMP00000046255 (RGD1562037), transcript variant X6, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033359 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:53353516:53378127:-1 gene:ENSRNOG00000027938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:53325466:53362436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT025176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001107359 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial poly(A) polymerase (Mtpap), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:54083470:54105086:-1 gene:ENSRNOG00000016578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:53764349:54102748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT025182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT025186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT025187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT025188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
GENSCAN00000002273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:54227402:54266418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 62 // 76 // 8 // 13 // 0
NM_001108882 // RefSeq // Rattus norvegicus lysozyme-like 1 (Lyzl1), mRNA. // chr17 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:54292574:54306206:-1 gene:ENSRNOG00000016295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:54284902:54464368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_139082 // RefSeq // Rattus norvegicus BMP and activin membrane-bound inhibitor (Bambi), mRNA. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006254076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BMP and activin membrane-bound inhibitor (Bambi), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000021801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:54939072:54943877:-1 gene:ENSRNOG00000016066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF387513 // GenBank // Rattus norvegicus kinase-deficient TGFbeta superfamily receptor subunit mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC070516 // GenBank // Rattus norvegicus BMP and activin membrane-bound inhibitor, homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:91477 IMAGE:7100920), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:54939425:54941743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT025191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108417 // RefSeq // Rattus norvegicus cullin 2 (Cul2), mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006254073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cullin 2 (Cul2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000066805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:54986452:55026463:-1 gene:ENSRNOG00000015292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000043845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:54987841:55041645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT025193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0
XM_002725273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila) (Epc1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_002728490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila) (Epc1), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 1 (Drosophila) (Epc1), transcript variant 2, mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019968 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:55333276:55360933:-1 gene:ENSRNOG00000014834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:55323619:55374040:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT025201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NONRATT025260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
GENSCAN00000048654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:61593277:61593507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000025854 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:61593234:61593713:-1 gene:ENSRNOG00000019131 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 60 // 91 // 6 // 10 // 0
XM_006222440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mohawk homeobox (Mkx), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mohawk homeobox (Mkx), partial mRNA. // chrU // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000025623 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:62322717:62332383:1 gene:ENSRNOG00000018938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:62321118:62353114:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:61761953:61780647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT025263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000036082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:62168256:62178633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 93 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT024386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006254140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 4 (Armc4), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_225474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 4 (Armc4), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025585 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:62070675:62256890:1 gene:ENSRNOG00000018905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:61999890:62151072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NONRATT024383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100575 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 7 (MAGUK p55 subfamily member 7) (Mpp7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:61845053:62033794:1 gene:ENSRNOG00000018760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC085813 // GenBank // Rattus norvegicus membrane protein, palmitoylated 7 (MAGUK p55 subfamily member 7), mRNA (cDNA clone IMAGE:7122468), partial cds. // chr17 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:61999890:62151072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000029774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:61931339:61996034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT024379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT024380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
ENSRNOT00000025224 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:63104696:63105542:-1 gene:ENSRNOG00000018685 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000030551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:63104820:63105542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT025270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NM_001100487 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, delta 4 (Gjd4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:64070841:64073410:-1 gene:ENSRNOG00000018407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:64070841:64071860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001191833 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin Y (Ccny), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000024545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:64106292:64238150:-1 gene:ENSRNOG00000018123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT025277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000029836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:64076088:64149605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT025278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_053518 // RefSeq // Rattus norvegicus lysosomal trafficking regulator (Lyst), mRNA. // chr17 // 92 // 100 // 48 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000017270 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:91981718:92183054:-1 gene:ENSRNOG00000012662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000058790 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:92113409:92183054:-1 gene:ENSRNOG00000012662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 21 // 11 // 11 // 0 /// AB020019 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BEIGE, complete cds. // chr17 // 92 // 100 // 48 // 52 // 0 /// FQ223510 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA10YG09 mRNA sequence. // chr17 // 48 // 48 // 25 // 52 // 1 /// GENSCAN00000029650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:92006363:92213108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91983426:92005270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 15 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT025500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 17 // 52 // 1
ENSRNOT00000003349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:92216094:92287843:-1 gene:ENSRNOG00000002461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000029644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:92216094:92287813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT025504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT025505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001191893 // RefSeq // Rattus norvegicus ERO1-like beta (S. cerevisiae) (Ero1lb), mRNA. // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ERO1-like beta (S. cerevisiae) (Ero1lb), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ERO1-like beta (S. cerevisiae) (Ero1lb), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:92372954:92415877:-1 gene:ENSRNOG00000002609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:92366149:92415877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT025514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 92 // 95 // 36 // 39 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chrU // 83 // 73 // 25 // 30 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 92 // 95 // 36 // 39 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 92 // 95 // 36 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 59 // 23 // 24 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chrU // 41 // 41 // 17 // 41 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chrU // 90 // 95 // 35 // 39 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 77 // 32 // 10 // 13 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 44 // 44 // 18 // 41 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 48 // 51 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 48 // 51 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 94 // 100 // 48 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 94 // 96 // 46 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 55 // 27 // 28 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 67 // 90 // 31 // 46 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 39 // 39 // 20 // 51 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 47 // 47 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 88 // 96 // 43 // 49 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 85 // 51 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 49 // 49 // 25 // 51 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 92 // 100 // 58 // 63 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 92 // 100 // 58 // 63 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 92 // 100 // 58 // 63 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 90 // 100 // 57 // 63 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 43 // 26 // 27 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chrU // 69 // 67 // 29 // 42 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chrU // 32 // 32 // 20 // 63 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 98 // 86 // 53 // 54 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chrU // 83 // 100 // 52 // 63 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 76 // 33 // 16 // 21 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 38 // 38 // 24 // 63 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 59 // 25 // 26 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 65 // 84 // 24 // 37 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 89 // 100 // 39 // 44 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 43 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 95 // 93 // 37 // 39 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 95 // 93 // 37 // 39 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 95 // 93 // 37 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 55 // 22 // 23 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 61 // 74 // 19 // 31 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 82 // 93 // 32 // 39 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 94 // 38 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1
XM_006222448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anillin, actin binding protein-like 1 (Anlnl1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006242714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anillin, actin binding protein (Anln), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000024361 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:68294574:68297703:1 gene:ENSRNOG00000018113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000019601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23389798:23442950:-1 gene:ENSRNOG00000014343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000071846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:23389798:23442950:-1 gene:ENSRNOG00000014343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000052578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:68294634:68297703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000054251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23375151:23442167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 26 // 43 // 1 /// GENSCAN00000029754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:226779690:226783929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT054638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1
NM_001108418 // RefSeq // Rattus norvegicus HEAT repeat containing 1 (Heatr1), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000070825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:68192325:68234059:1 gene:ENSRNOG00000047594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000071829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:68322348:68364082:1 gene:ENSRNOG00000047775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000052560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:68322348:68362279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000052565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:68192325:68232256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0
NM_001107419 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 (Smarca5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:41841149:41873900:1 gene:ENSRNOG00000018149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031851 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:67986575:67989068:1 gene:ENSRNOG00000021584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:67986602:67989068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41841026:41872765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_172330 // RefSeq // Rattus norvegicus zona pellucida glycoprotein 4 (Zp4), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:67248685:67255238:1 gene:ENSRNOG00000027506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF456325 // GenBank // Rattus norvegicus zona pellucida B glycoprotein mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:67194408:67255193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT024403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT024401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107360 // RefSeq // Rattus norvegicus DIP2 disco-interacting protein 2 homolog C (Drosophila) (Dip2c), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:65192742:65571872:1 gene:ENSRNOG00000015288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT024401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:65488935:65560403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001107360 // RefSeq // Rattus norvegicus DIP2 disco-interacting protein 2 homolog C (Drosophila) (Dip2c), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:65192742:65571872:1 gene:ENSRNOG00000015288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:65378615:65486758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107360 // RefSeq // Rattus norvegicus DIP2 disco-interacting protein 2 homolog C (Drosophila) (Dip2c), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:65192742:65571872:1 gene:ENSRNOG00000015288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:65378615:65486758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT024400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT024399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001107360 // RefSeq // Rattus norvegicus DIP2 disco-interacting protein 2 homolog C (Drosophila) (Dip2c), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:65192742:65571872:1 gene:ENSRNOG00000015288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:65192475:65193626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT024401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107361 // RefSeq // Rattus norvegicus La ribonucleoprotein domain family, member 4B (Larp4b), mRNA. // chr17 // 88 // 88 // 38 // 43 // 1 /// ENSRNOT00000058548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:65036457:65085258:1 gene:ENSRNOG00000015888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 86 // 86 // 37 // 43 // 1 /// NONRATT024397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000014315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:65041062:65081824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 65 // 65 // 28 // 43 // 1
NM_001192008 // RefSeq // Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta isomerase 2 (Idi2), mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051570 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:59623815:59625532:-1 gene:ENSRNOG00000045919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000035986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:59667028:59713365:1 gene:ENSRNOG00000048583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 88 // 21 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000045035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:59515165:59517597:-1 gene:ENSRNOG00000046404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 88 // 21 // 29 // 0 /// XM_006222436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (LOC291276), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// XR_341654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (LOC291276), transcript variant X2, misc_RNA. // chr17 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000017779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59623815:59628248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59515165:59519091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 74 // 94 // 23 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59641590:59672506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 88 // 20 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59708053:59713365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 76 // 11 // 25 // 0
XM_001072335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (RGD1564999), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006222437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (RGD1564999), mRNA. // chr17 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006254124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (LOC102550988), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_344622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta-isomerase 2-like (RGD1564347), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043837 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:59741549:59759700:-1 gene:ENSRNOG00000046034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000044132 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:59566862:59574998:-1 gene:ENSRNOG00000046403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000072747 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:59489858:59500683:1 gene:ENSRNOG00000048661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59741549:59789069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59489903:59500683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59522999:59574998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_053539 // RefSeq // Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1 (Idi1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:59783326:59789305:-1 gene:ENSRNOG00000016690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF003835 // GenBank // Rattus norvegicus isopentenyl diphosphate:dimethylallyl diphosphate isomerase mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// BC089786 // GenBank // Rattus norvegicus isopentenyl-diphosphate delta isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:108635 IMAGE:7322086), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59741549:59789069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_133302 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, RNA-specific, B2 (Adarb2), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XM_006254131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine deaminase, RNA-specific, B2 (Adarb2), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000047512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:59905474:60096380:-1 gene:ENSRNOG00000030775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// U74586 // GenBank // Rattus norvegicus double-stranded RNA specific adenosine deaminase (RED2) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT025259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:59944806:60008006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001107363 // RefSeq // Rattus norvegicus pitrilysin metallopeptidase 1 (Pitrm1), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:70194249:70225893:1 gene:ENSRNOG00000016511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:70194256:70225607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT024407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006254182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 6 (Klf6), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 67 // 34 // 34 // 0 /// AF001417 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 55 // 27 // 28 // 0 /// AY318957 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa1017 mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 67 // 34 // 34 // 0 /// BC097306 // GenBank // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:114301 IMAGE:7444817), complete cds. // chr17 // 100 // 61 // 31 // 31 // 0 /// NM_031642 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 6 (Klf6), mRNA. // chr17 // 61 // 61 // 31 // 51 // 1 /// ENSRNOT00000023033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:69616967:69674030:-1 gene:ENSRNOG00000016885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 67 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:69627765:69654259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 43 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 69 // 69 // 35 // 51 // 1
ENSRNOT00000043733 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:71315672:71316811:-1 gene:ENSRNOG00000029794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71315765:71316154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_001013057 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C2 (Akr1c2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C2 (Akr1c2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71102104:71118080:-1 gene:ENSRNOG00000029844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC078957 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C21, mRNA (cDNA clone MGC:93821 IMAGE:7110806), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71099096:71117942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT025316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001033697 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C1 (Akr1c1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C1 (Akr1c1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C1 (Akr1c1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000058367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71155011:71174044:-1 gene:ENSRNOG00000038331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB300410 // GenBank // Rattus norvegicus Hsd17b5 mRNA for type 5 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase, complete cds. // chr17 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC104716 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C1 (dihydrodiol dehydrogenase 1; 20-alpha (3-alpha)-hydroxysteroid dehydrogenase), mRNA (cDNA clone MGC:125057 IMAGE:7373256), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71144177:71174035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001014240 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C13 (Akr1c13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000041925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71405301:71421049:-1 gene:ENSRNOG00000033010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB221346 // GenBank // Rattus norvegicus TBER1-S mRNA for Truncated form of 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase, complete cds. // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC088169 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C13, mRNA (cDNA clone MGC:108795 IMAGE:7322153), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB221345 // GenBank // Rattus norvegicus TBER1 mRNA for 17beta-hydroxysteroid dehydrogenase, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT025326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71393261:71421001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT025327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_138547 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C14 (Akr1c14), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71510874:71530255:-1 gene:ENSRNOG00000017672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091123 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C14, mRNA (cDNA clone MGC:108595 IMAGE:7372929), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D17310 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for steroid 3-alpha-dehydrogenase, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// M64393 // GenBank // Rat 3-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase (3-alpha-HSD) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// M61937 // GenBank // R.norvegicus dihydrodiol dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr17 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT025328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71513653:71572629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT025330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001109900 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member C-like (Akr1cl), mRNA. // chr17 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71538483:71565238:-1 gene:ENSRNOG00000021735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71513653:71572629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// NONRATT025333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT025332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT025334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001106118 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, alpha-like 3 (Tubal3), mRNA. // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000036821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71677830:71686515:-1 gene:ENSRNOG00000028750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71677830:71696581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT025335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001062982 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calmodulin-like 5 (Calml5), transcript variant 1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_344627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calmodulin-like 5 (Calml5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71748847:71749290:-1 gene:ENSRNOG00000028576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71748847:71749290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001108420 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 13 (Asb13), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:71918385:71937087:-1 gene:ENSRNOG00000017967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:71919345:71949782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT025338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT025340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_017276 // RefSeq // Rattus norvegicus GDP dissociation inhibitor 2 (Gdi2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:72003434:72030115:-1 gene:ENSRNOG00000018091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061767 // GenBank // Rattus norvegicus GDP dissociation inhibitor 2, mRNA (cDNA clone MGC:72501 IMAGE:5621162), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:72004174:72032927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033698 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 16 (Ankrd16), mRNA. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:72090953:72102223:-1 gene:ENSRNOG00000028168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// BC099837 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 16, mRNA (cDNA clone MGC:124844 IMAGE:7936269), complete cds. // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:72091033:72102170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT025344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSRNOT00000025252 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:72156606:72185115:-1 gene:ENSRNOG00000018706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050998 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:72156606:72185115:-1 gene:ENSRNOG00000018706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000058221 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:72156606:72185115:-1 gene:ENSRNOG00000018706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073691 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:72156606:72185115:-1 gene:ENSRNOG00000018706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// DQ157696 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344 x BN interleukin-15 receptor alpha chain mRNA, partial cds. // chrU // 89 // 29 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000040051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:72156567:72185115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_013163 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 2 receptor, alpha (Il2ra), mRNA. // chr17 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:72202947:72250588:-1 gene:ENSRNOG00000047647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// FQ228242 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA106YN01 mRNA sequence. // chr17 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// M55049 // GenBank // Rattus norwegicus interleukin-2 receptor alpha chain (CD25) mRNA, complete cds. // chr17 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:72190385:72255294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT025346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001276721 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, theta (Prkcq), mRNA. // chr17 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:72670750:72747139:-1 gene:ENSRNOG00000019057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT025347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:72666770:72763814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT025348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
GENSCAN00000040467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:72866506:72867228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 92 // 60 // 11 // 12 // 0
ENSRNOT00000058142 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:73091430:73092322:-1 gene:ENSRNOG00000038191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:73083821:73092269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001107364 // RefSeq // Rattus norvegicus Scm-like with four mbt domains 2 (Sfmbt2), mRNA. // chr17 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// XM_006254211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Scm-like with four mbt domains 2 (Sfmbt2), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006254217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Scm-like with four mbt domains 2 (Sfmbt2), transcript variant X8, mRNA. // chr17 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000065942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:73413305:73589644:-1 gene:ENSRNOG00000029235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000053202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:73403896:73540089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 97 // 76 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT025351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_001109529 // RefSeq // Rattus norvegicus antigenic determinant of rec-A protein homolog (mouse) (Kin), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus antigenic determinant of rec-A protein homolog (mouse) (Kin), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000039689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:73884594:73894936:-1 gene:ENSRNOG00000026690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:73884764:73896899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT025354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY539894 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00143 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:76374479:76409087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001106120 // RefSeq // Rattus norvegicus USP6 N-terminal like (Usp6nl), mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus USP6 N-terminal like (Usp6nl), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:77417426:77541567:-1 gene:ENSRNOG00000017644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:77419995:77478043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT025364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108421 // RefSeq // Rattus norvegicus UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast) (Upf2), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000058070 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:77825279:77919654:-1 gene:ENSRNOG00000023593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:77815368:77930598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT025365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001007733 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 5 (Nudt5), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 5 (Nudt5), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78043454:78066592:-1 gene:ENSRNOG00000017741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079176 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 5, mRNA (cDNA clone MGC:94209 IMAGE:7130276), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78043985:78076723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
XM_574081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 3 (Ccdc3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024110 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:78647892:78747487:-1 gene:ENSRNOG00000017933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78647892:78747487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001106121 // RefSeq // Rattus norvegicus upper zone of growth plate and cartilage matrix associated (Ucma), mRNA. // chr17 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000066850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78918189:78927820:-1 gene:ENSRNOG00000017987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// EU022754 // GenBank // Rattus norvegicus Gla-rich protein (GRP) mRNA, complete cds. // chr17 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78918537:78944212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT025375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT025374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT025373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_053674 // RefSeq // Rattus norvegicus phytanoyl-CoA 2-hydroxylase (Phyh), mRNA. // chr17 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000024362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78953406:78970294:-1 gene:ENSRNOG00000018044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF121345 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal phytanoyl-CoA hydroxylase (PHYH) mRNA, complete cds. // chr17 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// BC086573 // GenBank // Rattus norvegicus phytanoyl-CoA 2-hydroxylase, mRNA (cDNA clone MGC:105364 IMAGE:7306754), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78953988:78970289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT025376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT025379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT025380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001104630 // RefSeq // Rattus norvegicus selenophosphate synthetase 1 (Sephs1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selenophosphate synthetase 1 (Sephs1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:78978379:79006698:-1 gene:ENSRNOG00000018125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:78982081:79003827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT025384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT025382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001191834 // RefSeq // Rattus norvegicus BEN domain containing 7 (Bend7), mRNA. // chr17 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000032173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:79104805:79183747:-1 gene:ENSRNOG00000022712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT025387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:79104848:79171168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT025389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_001191821 // RefSeq // Rattus norvegicus FERM domain containing 4A (Frmd4a), mRNA. // chr17 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000045765 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:79297096:79342250:-1 gene:ENSRNOG00000018500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 47 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:79284367:79472300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 95 // 89 // 40 // 42 // 0 /// NONRATT025391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
NM_001025034 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 107, member B (Fam107b), mRNA. // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80136084:80208479:-1 gene:ENSRNOG00000014886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC085116 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 107, member B, mRNA (cDNA clone MGC:105826 IMAGE:7107468), complete cds. // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 107, member B (Fam107b), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000012238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80138560:80172207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT025396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT025399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT025400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001037543 // RefSeq // Rattus norvegicus cerebral dopamine neurotrophic factor (Cdnf), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80366184:80379144:-1 gene:ENSRNOG00000026493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80366184:80379084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_147145 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA cross-link repair 1C (Dclre1c), mRNA. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80427568:80455878:-1 gene:ENSRNOG00000015980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// AF395746 // GenBank // Rattus norvegicus SNM1-like protein mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// BC083546 // GenBank // Rattus norvegicus DNA cross-link repair 1C, PSO2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93142 IMAGE:7134940), complete cds. // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000012217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80439118:80455802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT025403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT025408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// NONRATT025409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001126079 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA binding domain containing 7 (Acbd7), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80546951:80552017:-1 gene:ENSRNOG00000016480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80547172:80556572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_207590 // RefSeq // Rattus norvegicus N-myristoyltransferase 2 (Nmt2), mRNA. // chr17 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80562797:80583124:-1 gene:ENSRNOG00000026248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80569138:80603365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT025411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006222462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// XM_006222463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// XM_006222465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// XM_006222466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// XM_006254280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), mRNA. // chr17 // 100 // 86 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000057851 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:80669766:80784669:-1 gene:ENSRNOG00000016534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000012482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80669766:80730744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT025413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 28 // 50 // 1 /// NONRATT025414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 22 // 22 // 11 // 50 // 1
XM_006222462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), transcript variant X5, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member A1 (Fam171a1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057851 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:80669766:80784669:-1 gene:ENSRNOG00000016534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:80669766:80730744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001173972 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha 8 (Itga8), mRNA. // chr17 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:80956113:81304978:-1 gene:ENSRNOG00000016538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC168655 // GenBank // Rattus norvegicus similar to integrin alpha 8, mRNA (cDNA clone MGC:188067 IMAGE:7122577), complete cds. // chr17 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:81177820:81245630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT025418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001106122 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 188, member A (Fam188a), mRNA. // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:81348948:81426318:-1 gene:ENSRNOG00000016955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// FQ230167 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YG11 mRNA sequence. // chr17 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT025419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:81349747:81468631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT025420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT025422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT025423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT025424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT025425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT025426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001109403 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 1, q subcomponent-like 3 (C1ql3), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:81939086:81945581:-1 gene:ENSRNOG00000017459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:81939086:81945581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT025428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001109404 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras suppressor protein 1 (Rsu1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000057827 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:82010120:82197615:-1 gene:ENSRNOG00000017595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT025429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_053332 // RefSeq // Rattus norvegicus cubilin (intrinsic factor-cobalamin receptor) (Cubn), mRNA. // chr17 // 97 // 94 // 60 // 62 // 0 /// ENSRNOT00000040052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:82205509:82425565:-1 gene:ENSRNOG00000029047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 62 // 62 // 0 /// AF022247 // GenBank // Rattus norvegicus intrinsic factor-B12 receptor precursor (CUBILIN) mRNA, complete cds. // chr17 // 97 // 94 // 60 // 62 // 0 /// GENSCAN00000022036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:82309130:82425565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 41 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:82205888:82304968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 42 // 28 // 28 // 0
NM_001031643 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA aspartic acid methyltransferase 1 (Trdmt1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006254282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA aspartic acid methyltransferase 1 (Trdmt1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:82445133:82477970:-1 gene:ENSRNOG00000026132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC098700 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA aspartic acid methyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:112666 IMAGE:7387075), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000022021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:82445429:82477936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT025437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT025436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_213624 // RefSeq // Rattus norvegicus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 6 (St8sia6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:82588914:82726110:-1 gene:ENSRNOG00000018171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:82588914:82599049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000048715 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:83304745:83305421:-1 gene:ENSRNOG00000031519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:83305077:83342809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001107367 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP2/Sun domain family, member 6 (Nsun6), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:83764477:83802110:-1 gene:ENSRNOG00000018520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC162024 // GenBank // Rattus norvegicus NOL1/NOP2/Sun domain family, member 6, mRNA (cDNA clone MGC:187910 IMAGE:9099401), complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000037295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:83762675:83791506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT025445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_001191694 // RefSeq // Rattus norvegicus nebulette (Nebl), mRNA. // chr17 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068553 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:85915693:85979867:-1 gene:ENSRNOG00000000146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000048450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:85874473:85979867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT025448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NONRATT025451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000050803 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:86435001:86435483:-1 gene:ENSRNOG00000045917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:86435001:86435393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
XM_006222491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SKI/DACH domain containing 1 (Skida1), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040697 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:86556268:86557647:-1 gene:ENSRNOG00000033330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:86556268:86559445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT025453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_002728514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 1-like (LOC100360412), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_003753013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 1-like (LOC100360412), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000162 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:86711161:86865487:-1 gene:ENSRNOG00000000150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT025460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:86760886:86897752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// FQ231772 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YD20 mRNA sequence. // chr17 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// FQ233886 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YP19 mRNA sequence. // chr17 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000025449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:86705143:86745471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_053926 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase, type II, alpha (Pip4k2a), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022375 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:87260014:87463891:-1 gene:ENSRNOG00000016670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB032899 // GenBank // Rattus norvegicus PIPK2 alpha mRNA for phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase alpha, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87249230:87343916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000022385 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:87662234:87662923:-1 gene:ENSRNOG00000016710 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87662234:87662902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_006222474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681241 (LOC681241), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006222475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681241 (LOC681241), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006222476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681241 (LOC681241), transcript variant X3, mRNA. // chr17 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681241 (LOC681241), mRNA. // chr17 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000034474 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:17:87990379:88032635:-1 gene:ENSRNOG00000021898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000014187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:87966942:88021083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
XM_006222485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin alpha-3 chain-like (LOC680225), mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006254326 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin alpha-3 chain-like (LOC680225), mRNA. // chr17 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:88516838:88518173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001191693 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 21 (Arhgap21), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89415087:89486545:-1 gene:ENSRNOG00000008659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:89415868:89491640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT025477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106127 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoribosyl transferase domain containing 1 (Prtfdc1), mRNA. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89615538:89724742:-1 gene:ENSRNOG00000024874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC166887 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoribosyl transferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188828 IMAGE:6890546), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC166923 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoribosyl transferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188911 IMAGE:6919422), complete cds. // chr17 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// NONRATT025486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000053455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:89690923:89718402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT025488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106126 // RefSeq // Rattus norvegicus enkurin, TRPC channel interacting protein (Enkur), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:89759584:89782791:-1 gene:ENSRNOG00000018631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:89759531:89775003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
GENSCAN00000053464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:89759531:89775003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT025489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000057606 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:89774538:89775003:-1 gene:ENSRNOG00000037902 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 62 // 100 // 18 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071601 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:91818487:91818946:-1 gene:ENSRNOG00000046464 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 38 // 100 // 11 // 29 // 0
NM_024397 // RefSeq // Rattus norvegicus abl-interactor 1 (Abi1), mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// XM_006254353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus abl-interactor 1 (Abi1), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000057572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91617157:91698733:1 gene:ENSRNOG00000031325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// AF176784 // GenBank // Rattus norvegicus eps8 binding protein (e3B1) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC129092 // GenBank // Rattus norvegicus abl-interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:156634 IMAGE:7192971), complete cds. // chr17 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000035725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91631046:91688212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT024608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT024610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1
NM_001107369 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated serine/threonine kinase-like (Mastl), mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91504460:91539143:1 gene:ENSRNOG00000017569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// FQ224658 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA59YE19 mRNA sequence. // chr17 // 91 // 97 // 32 // 35 // 0 /// XM_006254368 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase greatwall-like (LOC102553656), mRNA. // chr17 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000035715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91509156:91538814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT024606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT024607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 91 // 65 // 43 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 91 // 74 // 48 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 38 // 26 // 27 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chrU // 71 // 53 // 27 // 38 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 83 // 83 // 60 // 72 // 1 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 83 // 83 // 60 // 72 // 1 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chrU // 26 // 26 // 19 // 72 // 1 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chrU // 81 // 74 // 43 // 53 // 0 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 79 // 26 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 90 // 90 // 65 // 72 // 1 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 33 // 33 // 24 // 72 // 1
XM_001063340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X1, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC689258), mRNA. // chr17 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// XM_006254336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X2, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC498781), transcript variant X4, mRNA. // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91069715:91127097:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91121080:91122304:1 gene:ENSRNOG00000028913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_002727480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (RGD1561497_predicted), partial mRNA. // chr17 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91074096:91126706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr17 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC160827 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7452957. // chr17 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// NONRATT024604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT024605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
ENSRNOT00000033663 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:456454:457099:-1 gene:ENSRNOG00000024071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// XM_001070795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mature T-cell proliferation 1 (Mtcp1), mRNA. // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT026357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:453383:460250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT026358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006222499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cx9C motif-containing protein 4-like (LOC102546764), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cx9C motif-containing protein 4-like (LOC102546764), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cx9C motif-containing protein 4-like (LOC102546764), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:453383:460250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT026357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_183331 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor VIII, procoagulant component (F8), mRNA. // chr18 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:413495:444411:-1 gene:ENSRNOG00000031197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AY362193 // GenBank // Rattus norvegicus factor VIII mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GU320196 // GenBank // Rattus norvegicus strain WAGRijYcb factor VIII mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GU320197 // GenBank // Rattus norvegicus strain WAGRijCmcr factor VIII mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:414923:444411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191725 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 1 (Mtmr1), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006254378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 1 (Mtmr1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006254382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 1 (Mtmr1), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:337401:370993:-1 gene:ENSRNOG00000002697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:340958:362990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
XM_006222501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to zinc finger protein 124 (RGD1565635), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to zinc finger protein 124 (RGD1565635), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021981 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:794768:796608:1 gene:ENSRNOG00000016417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001025721 // RefSeq // Rattus norvegicus collectin sub-family member 12 (Colec12), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:910945:1096503:1 gene:ENSRNOG00000016366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC097495 // GenBank // Rattus norvegicus collectin sub-family member 12, mRNA (cDNA clone MGC:114569 IMAGE:7461783), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1027529:1132796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001047850 // RefSeq // Rattus norvegicus THO complex 1 (Thoc1), mRNA. // chr18 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:1185635:1219998:1 gene:ENSRNOG00000015332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0 /// FQ229414 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YA02 mRNA sequence. // chr18 // 93 // 44 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000023757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1185635:1219894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT025534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// NONRATT025535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
XM_003753022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033468 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:1710684:1818209:1 gene:ENSRNOG00000023492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1691825:1819697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003753022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth regulation by estrogen in breast cancer-like (Greb1l), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000033468 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:1710684:1818209:1 gene:ENSRNOG00000023492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1691825:1819697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001106163 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D1 (Snrpd1), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// XM_006254411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D1 (Snrpd1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000018646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:1898841:1909374:1 gene:ENSRNOG00000013714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// BC167095 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein D1, mRNA (cDNA clone MGC:189532 IMAGE:9091450), complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000036728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1889262:1909019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT025542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001107405 // RefSeq // Rattus norvegicus mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 (Mib1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000018025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:2003879:2127899:1 gene:ENSRNOG00000013281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000011200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:2003693:2124476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT025543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0
NONRATT025543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_019185 // RefSeq // Rattus norvegicus GATA binding protein 6 (Gata6), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:2436181:2465966:1 gene:ENSRNOG00000023433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// L22760 // GenBank // Rat DNA binding protein (GATA-GT1) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006254419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor GATA-6-like (LOC102554525), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:2370408:2465569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT025547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001134417 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoblastoma binding protein 8 (Rbbp8), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoblastoma binding protein 8 (Rbbp8), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoblastoma binding protein 8 (Rbbp8), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:3175473:3239957:1 gene:ENSRNOG00000012899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC162012 // GenBank // Rattus norvegicus retinoblastoma binding protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:187882 IMAGE:9091712), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ209715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA40YN22 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ230337 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YH05 mRNA sequence. // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT025550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:3165750:3265886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001107404 // RefSeq // Rattus norvegicus Cdk5 and Abl enzyme substrate 1 (Cables1), mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:3328555:3432388:1 gene:ENSRNOG00000012795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:3406844:3431348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:3328561:3400212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001108423 // RefSeq // Rattus norvegicus RIO kinase 3 (Riok3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:3574641:3600214:1 gene:ENSRNOG00000023376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:3582504:3626222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT025561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NONRATT025556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// NONRATT025560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
ENSRNOT00000017045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:3606715:3626293:1 gene:ENSRNOG00000012597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC087672 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2400010D15, mRNA (cDNA clone MGC:105615 IMAGE:7317049), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000021325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:3582504:3626222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT025564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
XM_003753026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus laminin, alpha 3 (Lama3), mRNA. // chr18 // 99 // 97 // 73 // 74 // 0 /// ENSRNOT00000015363 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:3867377:3939230:1 gene:ENSRNOG00000011300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 47 // 36 // 36 // 0 /// U61261 // GenBank // Rattus norvegicus laminin-5 alpha 3 chain mRNA, complete cds. // chr18 // 89 // 50 // 34 // 38 // 0 /// GENSCAN00000021330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:3755985:3933221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 64 // 64 // 0 /// NONRATT025566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 49 // 49 // 37 // 76 // 1
NM_131909 // RefSeq // Rattus norvegicus histamine receptor H4 (Hrh4), mRNA. // chr18 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:4353104:4368943:1 gene:ENSRNOG00000016887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF358860 // GenBank // Rattus norvegicus histamine H4 receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:4361068:4368584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT025571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108884 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type, 8 (Psma8), mRNA. // chr18 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:6079006:6144199:1 gene:ENSRNOG00000030363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:6079105:6143213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 85 // 96 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT025574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
XM_006222506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription initiation factor TFIID subunit 4B-like (RGD1562997), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:6169030:6241364:1 gene:ENSRNOG00000026023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT025577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:6169030:6241412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENSRNOT00000021215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:7189874:7190757:1 gene:ENSRNOG00000015823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 58 // 100 // 14 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:7174620:7191547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
GENSCAN00000041281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:17691186:17702172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000022665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:11807609:11835632:1 gene:ENSRNOG00000016853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000038635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:11807609:11835920:1 gene:ENSRNOG00000016853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000061344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:11807609:11835920:1 gene:ENSRNOG00000016853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_214616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus desmoglein 1 (Dsg1), mRNA. // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000016676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:11791586:11835920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_199490 // RefSeq // Rattus norvegicus desmoglein 4 (Dsg4), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:11853980:11888828:1 gene:ENSRNOG00000022364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AY314982 // GenBank // Rattus norvegicus desmoglein 4 (Dsg4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:11860045:11888828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
GENSCAN00000015774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15468499:15481470:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
NM_001191079 // RefSeq // Rattus norvegicus desmoglein 3 (Dsg3), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:15427642:15458557:-1 gene:ENSRNOG00000016632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15427642:15441565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15442471:15449020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
XM_006222509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus desmoglein 2 (Dsg2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006254474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus desmoglein 2 (Dsg2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022270 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:15355369:15389421:-1 gene:ENSRNOG00000016526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15355369:15411530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
AY539916 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00165 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046326 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:15051501:15063090:-1 gene:ENSRNOG00000031060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108424 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 125 (Rnf125), mRNA. // chr18 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000021136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:14972266:15004357:-1 gene:ENSRNOG00000015740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC162061 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 125, mRNA (cDNA clone MGC:188062 IMAGE:7115974), complete cds. // chr18 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// FQ209520 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YD06 mRNA sequence. // chr18 // 90 // 74 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT026425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:14956897:15018571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_053588 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 138, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf138), mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:14930045:14956940:-1 gene:ENSRNOG00000015645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// AF315468 // GenBank // Rattus norvegicus RSD-4 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC061821 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 138, mRNA (cDNA clone MGC:72355 IMAGE:5599087), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// FQ220857 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YH04 mRNA sequence. // chr18 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT026421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT026422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XR_361242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555023 (LOC102555023), misc_RNA. // chr18 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000030993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:12425734:12428377:1 gene:ENSRNOG00000022163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// BC084694 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7106782. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088278 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7382204. // chr18 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT025586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT025587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
XR_361247 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus additional sex combs like 3 (Drosophila) (Asxl3), transcript variant X2, misc_RNA. // chr18 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020661 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:13136947:13274883:1 gene:ENSRNOG00000015383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:13258944:13370837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000053743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:13150925:13196334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
GENSCAN00000052272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:13686848:13687189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000051543 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:14526050:14526694:1 gene:ENSRNOG00000029958 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:14526050:14526694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT025599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001013141 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 35 (Zfp35), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089850 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 35, mRNA (cDNA clone MGC:108880 IMAGE:7375328), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_024373 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (Galnt1), mRNA. // chr18 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:15906881:15947004:1 gene:ENSRNOG00000016207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// U35890 // GenBank // Rattus norvegicus polypeptide GalNAc transferase T1 mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000015788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15906888:15945638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
XM_006222526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (RGD1559877), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_344657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (RGD1559877), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000049689 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:16090181:16090624:1 gene:ENSRNOG00000030439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:16090181:16090624:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006254483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NYNRIN-like (LOC102553405), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000020856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:16197063:16204477:1 gene:ENSRNOG00000015546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097984 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700062C07, mRNA (cDNA clone MGC:116121 IMAGE:7444421), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001034145 // RefSeq // Rattus norvegicus elongator acetyltransferase complex subunit 2 (Elp2), mRNA. // chr18 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000020601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:16303487:16340055:1 gene:ENSRNOG00000015301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// BC100661 // GenBank // Rattus norvegicus elongation protein 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124711 IMAGE:7935317), complete cds. // chr18 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000049476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:16303513:16314994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT025618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000049489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:16321179:16417549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1
NM_001108425 // RefSeq // Rattus norvegicus molybdenum cofactor sulfurase (Mocos), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus molybdenum cofactor sulfurase (Mocos), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:16349169:16395056:1 gene:ENSRNOG00000015113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:16321179:16417549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT025619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT025622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001271332 // RefSeq // Rattus norvegicus formin homology 2 domain containing 3 (Fhod3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:16916474:17086632:1 gene:ENSRNOG00000027230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000041961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:16916474:17086632:1 gene:ENSRNOG00000027230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:17037753:17086632:1 gene:ENSRNOG00000027230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000068139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:16916474:17086632:1 gene:ENSRNOG00000027230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001134607 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to KIAA1328 protein (RGD1562608), mRNA. // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_003751756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to KIAA1328 protein (RGD1562608), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:17157409:17429811:1 gene:ENSRNOG00000029466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// BC166863 // GenBank // Rattus norvegicus similar to AW554918 protein, mRNA (cDNA clone MGC:188779 IMAGE:8367005), complete cds. // chr18 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:17301813:17373234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
ENSRNOT00000031394 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:22590921:22591733:1 gene:ENSRNOG00000022738 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:22590921:22638464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_022958 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 3-kinase, catalytic subunit type 3 (Pik3c3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:22694942:22778627:1 gene:ENSRNOG00000017840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061981 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, class 3, mRNA (cDNA clone MGC:72433 IMAGE:5597998), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:22688525:22827108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sin3A associated protein (Sap130), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// XM_006222530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sin3A associated protein (Sap130), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// XM_006254605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sin3A associated protein (Sap130), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// XM_006254607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sin3A associated protein (Sap130), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000022761 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:24138859:24166083:1 gene:ENSRNOG00000016773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000013386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24129717:24214785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT025642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 51 // 51 // 24 // 47 // 1 /// NONRATT025644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1 /// NONRATT025643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1
NM_001107399 // RefSeq // Rattus norvegicus AMME chromosomal region gene 1-like (Ammecr1l), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AMME chromosomal region gene 1-like (Ammecr1l), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_361286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AMME chromosomal region gene 1-like (Ammecr1l), transcript variant X8, misc_RNA. // chr18 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000061074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24257857:24280774:1 gene:ENSRNOG00000016250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ223764 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA87YI23 mRNA sequence. // chr18 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// BC168199 // GenBank // Rattus norvegicus AMME chromosomal region gene 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:188040 IMAGE:7113894), complete cds. // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000013400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24257125:24277703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT025649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001108886 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide D (Polr2d), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24287960:24295092:1 gene:ENSRNOG00000016231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221276 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA38YH11 mRNA sequence. // chr18 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// FQ224930 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YG16 mRNA sequence. // chr18 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT025651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24284638:24294461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT025652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001107398 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 33 (Wdr33), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000017075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24302098:24403929:1 gene:ENSRNOG00000011382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000013381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24328954:24351036:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24376072:24402134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT025653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 28 // 28 // 13 // 46 // 1 /// NONRATT025656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 28 // 28 // 13 // 46 // 1 /// NONRATT025657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 28 // 28 // 13 // 46 // 1
NM_001012163 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen like domains 2 (Lims2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006254596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen like domains 2 (Lims2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen like domains 2 (Lims2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000061054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24422408:24460482:1 gene:ENSRNOG00000016021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC087108 // GenBank // Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen like domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:94717 IMAGE:7193274), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000035870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24454565:24459872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT025660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24432030:24446328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001034918 // RefSeq // Rattus norvegicus IWS1 homolog (S. cerevisiae) (Iws1), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IWS1 homolog (S. cerevisiae) (Iws1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IWS1 homolog (S. cerevisiae) (Iws1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006254574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IWS1 homolog (S. cerevisiae) (Iws1), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24564414:24595079:1 gene:ENSRNOG00000014630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC104700 // GenBank // Rattus norvegicus IWS1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124986 IMAGE:7190021), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// FQ227776 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YO15 mRNA sequence. // chr18 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000035875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24564661:24589661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT025663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT025667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_138503 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase 2 (Map3k2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24676280:24740723:1 gene:ENSRNOG00000014089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24692303:24740567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NONRATT025672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001031644 // RefSeq // Rattus norvegicus excision repair cross-complementation group 3 (Ercc3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24752960:24783859:1 gene:ENSRNOG00000013180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC098856 // GenBank // Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3, mRNA (cDNA clone MGC:112916 IMAGE:7379944), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24743355:24783632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT025675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XM_006222563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to WD repeat domain 36 (LOC688637), partial mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031530 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:25352752:25380806:1 gene:ENSRNOG00000027355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075283 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:25352752:25380619:1 gene:ENSRNOG00000027355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:25326396:25409116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_012727 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase IV (Camk4), mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:25464155:25680622:1 gene:ENSRNOG00000020478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC128706 // GenBank // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase IV, mRNA (cDNA clone MGC:156504 IMAGE:7455982), complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// M63334 // GenBank // R.norvegicus calmodulin-dependent protein kinase(CaM kinase-GR) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// M64757 // GenBank // Rat Ca++/calmodulin protein kinase and calmodulin-binding protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:25617663:25680515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT025696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NONRATT025701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 1
NONRATT025704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000011428 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:26540690:26541169:1 gene:ENSRNOG00000008633 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:26540693:26541043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_012499 // RefSeq // Rattus norvegicus adenomatous polyposis coli (Apc), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenomatous polyposis coli (Apc), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenomatous polyposis coli (Apc), transcript variant X13, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:26761212:26818872:1 gene:ENSRNOG00000020423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D38629 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for APC protein, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:26761265:26818872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001106157 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle 19 (Srp19), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000027418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:26828311:26834643:1 gene:ENSRNOG00000020204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC167043 // GenBank // Rattus norvegicus signal recognition particle 19, mRNA (cDNA clone MGC:189310 IMAGE:7319792), complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// FQ233350 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YD18 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT025713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_001106156 // RefSeq // Rattus norvegicus polycystic kidney disease 2-like 2 (Pkd2l2), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease 2-like 2 (Pkd2l2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease 2-like 2 (Pkd2l2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:26904427:26938848:1 gene:ENSRNOG00000025489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:26885856:26911490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000043395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:26921664:26935278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT025715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001106155 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 8A (Wnt8a), mRNA. // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27044608:27050201:1 gene:ENSRNOG00000020157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027294 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:27027640:27030058:1 gene:ENSRNOG00000046014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000043441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27044649:27049630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27001430:27042420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001108426 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 20A (Kif20a), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000033784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27137685:27146171:1 gene:ENSRNOG00000024428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC161953 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin family member 20A, mRNA (cDNA clone MGC:187752 IMAGE:9026823), complete cds. // chr18 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000043436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27138185:27145995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
XM_001062862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member C (Fam53c), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002725325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member C (Fam53c), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member C (Fam53c), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 53, member C (Fam53c), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027499 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:27275541:27283115:1 gene:ENSRNOG00000020261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27263389:27283115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT025719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_012551 // RefSeq // Rattus norvegicus early growth response 1 (Egr1), mRNA. // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000026303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27369166:27372951:1 gene:ENSRNOG00000019422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AH004881 // GenBank // Rattus norvegicus Krox-24 (Krox-24) mRNA, partial cds. // chr18 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// AY551092 // GenBank // Rattus norvegicus EGR1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// M18416 // GenBank // Rat nerve growth factor-induced (NGFI-A) gene, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27289264:27371716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_001007145 // RefSeq // Rattus norvegicus catenin (cadherin-associated protein), alpha 1, 102kDa (Ctnna1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27633009:27766063:1 gene:ENSRNOG00000005796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC085789 // GenBank // Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:93767 IMAGE:7108824), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27619882:27719863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000051884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27733958:27765245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001014148 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 2 (Paip2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000026989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28123065:28129020:1 gene:ENSRNOG00000019934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// BC079261 // GenBank // Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94367 IMAGE:7133501), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// NONRATT025744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// NONRATT025745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// NONRATT025746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
ENSRNOT00000060688 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:28236808:28237191:1 gene:ENSRNOG00000039592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28235462:28237191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007628 // RefSeq // Rattus norvegicus CXXC finger protein 5 (Cxxc5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CXXC finger protein 5 (Cxxc5), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CXXC finger protein 5 (Cxxc5), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28365065:28368322:1 gene:ENSRNOG00000032878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083622 // GenBank // Rattus norvegicus CXXC finger 5, mRNA (cDNA clone MGC:94398 IMAGE:7134100), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ232612 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YB02 mRNA sequence. // chr18 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT025757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28352752:28407410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT025760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107395 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 2 (Psd2), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28490974:28541901:1 gene:ENSRNOG00000019177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28472004:28540005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000025756 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:28817976:28818941:1 gene:ENSRNOG00000019062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28777458:28859896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000068085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28878687:28928019:1 gene:ENSRNOG00000018775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 77 // 50 // 10 // 13 // 0 /// XM_006222544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine-rich transmembrane module containing 1 (Cystm1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// XM_006254622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine-rich transmembrane module containing 1 (Cystm1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000025495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28878687:28939398:1 gene:ENSRNOG00000018775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// FQ222514 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA22YG05 mRNA sequence. // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// FQ224367 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA69YA13 mRNA sequence. // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT025768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_152938 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 9 (Slc4a9), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 4, sodium bicarbonate cotransporter, member 9 (Slc4a9), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29059313:29072105:1 gene:ENSRNOG00000018525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AB024339 // GenBank // Rattus norvegicus AE4 mRNA for anion exchanger 4, complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29059347:29197502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001204053 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and KH domain containing 1 (Ankhd1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000024825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29093401:29190681:1 gene:ENSRNOG00000030247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000032635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29059347:29197502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT025775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// NONRATT025776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001202552 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 3 (Eif4ebp3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29196055:29197801:1 gene:ENSRNOG00000028625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29059347:29197502:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// FQ226784 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YG21 mRNA sequence. // chr18 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_147140 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member A4 (Slc35a4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29211202:29214370:1 gene:ENSRNOG00000002908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF406814 // GenBank // Rattus norvegicus clone PLRR-4 polymorphic leucine-rich repeat protein mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC085695 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member A4, mRNA (cDNA clone MGC:93140 IMAGE:7191954), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086986 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member A4, mRNA (cDNA clone MGC:93141 IMAGE:7192444), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT025782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29210359:29213606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT025781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000032617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29243962:29244639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_001106154 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 6 (Tmco6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000038066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29282952:29289547:1 gene:ENSRNOG00000017718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29283088:29289326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT025786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001005537 // RefSeq // Rattus norvegicus IK cytokine (Ik), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC081870 // GenBank // Rattus norvegicus IK cytokine, mRNA (cDNA clone MGC:93710 IMAGE:7106138), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000043271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29295418:29312145:1 gene:ENSRNOG00000017251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT025788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29295418:29312145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// AY539884 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00133 mRNA, complete cds. // chr18 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT025790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT025791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT025792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001017932 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 55 (Wdr55), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29295418:29312145:1 gene:ENSRNOG00000017251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC127460 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 55, mRNA (cDNA clone MGC:156524 IMAGE:8367400), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29295418:29312145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY539884 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00133 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT025796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001014012 // RefSeq // Rattus norvegicus histidyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Hars2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000021797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29332602:29341926:1 gene:ENSRNOG00000016087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC089973 // GenBank // Rattus norvegicus histidyl-tRNA synthetase 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:109366 IMAGE:7316402), complete cds. // chr18 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000032611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29335699:29346883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_001135582 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, matrin type 2 (Zmat2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29343457:29347545:1 gene:ENSRNOG00000016016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29335699:29346883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT025802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001054930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 1 (Pcdhb1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_001064318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 1 (Pcdhb1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 1 (Pcdhb1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006254630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 1 (Pcdhb1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027229 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:29992749:29995205:1 gene:ENSRNOG00000020103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29992749:29995205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109123 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 2 (Pcdhb2), mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000060497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30083426:30085822:1 gene:ENSRNOG00000039476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000036130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30083441:30091365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 88 // 76 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT025819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001014783 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 3 (Pcdhb3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30088851:30091405:1 gene:ENSRNOG00000020095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30083441:30091365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001114601 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 4 (Pcdhb4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000027210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30095466:30098005:1 gene:ENSRNOG00000027469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30095647:30097986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001114602 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 5 (Pcdhb5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000027206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30105642:30108224:1 gene:ENSRNOG00000020084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30105831:30108224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001014780 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 6 (Pcdhb6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30123238:30125556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000036114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30132101:30134497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001014779 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 8 (Pcdhb8), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30142319:30144658:1 gene:ENSRNOG00000020073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30142319:30144658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT025824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001109390 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 9 (Pcdhb9), mRNA. // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NM_001114603 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 10 (Pcdhb10), mRNA. // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000027188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30182142:30185312:1 gene:ENSRNOG00000020072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000040125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30194692:30197239:1 gene:ENSRNOG00000029244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006254628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 10 (Pcdhb10), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006254629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 10 (Pcdhb10), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30194858:30197239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30182333:30184729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT025827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT025828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
XM_001064927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 11 (Pcdhb11), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027179 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30203513:30205831:1 gene:ENSRNOG00000020066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30203513:30205906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173099 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 12 (Pcdhb12), mRNA. // chr18 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30216588:30219606:1 gene:ENSRNOG00000033719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L43592 // GenBank // Rattus norvegicus protocadherin-3 (pcdh3) mRNA, complete cds. // chr18 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30216827:30219118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT025830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006254627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 12 (Pcdhb12), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000027172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30223157:30225547:1 gene:ENSRNOG00000020062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000036134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30223256:30225547:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
XM_001055753 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 14 (Pcdhb14), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_001065084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 14 (Pcdhb14), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027168 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30234900:30237293:1 gene:ENSRNOG00000020059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30234900:30237293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
XM_001055818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 15 (Pcdhb15), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_001065137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 15 (Pcdhb15), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027164 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30258072:30260432:1 gene:ENSRNOG00000020054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30258072:30260432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
XM_003751767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta-13-like (LOC690826), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006222549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta-13-like (LOC690826), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 37 // 87 // 10 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060488 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30262285:30264692:1 gene:ENSRNOG00000039472 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30261872:30265976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
XM_006222548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta-13-like (LOC690826), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 17 (Pcdhb17), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040998 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30269373:30271772:1 gene:ENSRNOG00000039471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta-13-like (LOC690826), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30269373:30271772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 17 (Pcdhb17), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 17 (Pcdhb17), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000060486 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30273856:30275746:1 gene:ENSRNOG00000039470 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 92 // 57 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30273856:30276234:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_001056051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 19 (Pcdhb19), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_001065373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin beta 19 (Pcdhb19), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30281822:30284230:1 gene:ENSRNOG00000039469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30281822:30284230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109395 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 20 (Pcdhb20), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30288725:30292100:1 gene:ENSRNOG00000033123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30288859:30291258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT025835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001114604 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin beta 21 (Pcdhb21), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30295067:30297984:1 gene:ENSRNOG00000033479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30295235:30297508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000027133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30299989:30302376:1 gene:ENSRNOG00000020028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30300088:30302376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
ENSRNOT00000017963 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30464847:30465259:1 gene:ENSRNOG00000013427 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30464847:30465268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0
XR_361321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin gamma subfamily B, 2 (Pcdhgb2), misc_RNA. // chr18 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000067185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30525592:30528009:1 gene:ENSRNOG00000042322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
XM_006254645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin gamma-A6-like (LOC102552796), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027019 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30551074:30553488:1 gene:ENSRNOG00000027296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30551074:30577478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006254644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin gamma-B4-like (LOC102552705), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000060470 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30563855:30566233:1 gene:ENSRNOG00000039459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30551074:30577478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006254643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin gamma subfamily B, 5 (Pcdhgb5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000060468 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30574247:30576643:1 gene:ENSRNOG00000039457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30551074:30577478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_006254642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin gamma-B6-like (LOC102552497), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000060466 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:30585096:30587513:1 gene:ENSRNOG00000039455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30580016:30587566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001014149 // RefSeq // Rattus norvegicus RELT-like 2 (Rell2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30783005:30786576:1 gene:ENSRNOG00000019575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089946 // GenBank // Rattus norvegicus RELT-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:109265 IMAGE:7311493), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30783235:30786307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_199493 // RefSeq // Rattus norvegicus SEL1 domain containing protein RGD735029 (RGD735029), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:31076952:31090582:1 gene:ENSRNOG00000019276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC064660 // GenBank // Rattus norvegicus SEL1 domain containing protein RGD735029, mRNA (cDNA clone MGC:72566 IMAGE:5623815), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ211991 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA73YI24 mRNA sequence. // chr18 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:31040951:31090854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001034995 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 14 (Rnf14), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006254639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 14 (Rnf14), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:31124493:31147232:1 gene:ENSRNOG00000045637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC103648 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:125150 IMAGE:7315158), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:31121491:31145976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT025875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT025876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT025874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001013059 // RefSeq // Rattus norvegicus Nedd4 family interacting protein 1 (Ndfip1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:31252998:31303451:1 gene:ENSRNOG00000013562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085887 // GenBank // Rattus norvegicus Nedd4 family interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94675 IMAGE:7192378), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:31235371:31318673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT025877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT025881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONRATT026618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:31944484:31972093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NONRATT026618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// NONRATT026620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001107389 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 26 (Arhgap26), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006254660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 26 (Arhgap26), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:31493583:31887220:-1 gene:ENSRNOG00000013920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT026618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:31655859:31782404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001106151 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 2 (Pabpc2), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:32641704:32643843:1 gene:ENSRNOG00000014527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:32641871:32643763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001172155 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 16 (Kctd16), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:33119771:33404042:1 gene:ENSRNOG00000021008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212362 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YL20 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:33403591:33404042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT025892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001034187 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 2 (Sh3rf2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:36038469:36138307:1 gene:ENSRNOG00000018780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC100155 // GenBank // Rattus norvegicus SH3 domain containing ring finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:114566 IMAGE:7461488), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:36061094:36145037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT025896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSRNOT00000036613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:36273350:36320859:1 gene:ENSRNOG00000027250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000060199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:36273350:36320859:1 gene:ENSRNOG00000027250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000037599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:36273350:36320859:1 gene:ENSRNOG00000027250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000050103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:36272874:36320859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT025898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001108889 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 4 homeobox 3 (Pou4f3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:36378513:36381105:1 gene:ENSRNOG00000018842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:36368427:36385655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT025899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001107390 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription elongation regulator 1 (Tcerg1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XR_361332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation regulator 1 (Tcerg1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr18 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000025467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:36491823:36552727:1 gene:ENSRNOG00000018849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC168862 // GenBank // Rattus norvegicus transcription elongation regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:189100 IMAGE:7444403), complete cds. // chr18 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// FQ216952 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA38YM23 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:36501693:36551647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT025901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT025902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT025904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// NONRATT025906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 19 // 44 // 1 /// NONRATT025907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NONRATT026639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001191894 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 32A (Stk32a), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 32A (Stk32a), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000031370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:37253265:37362844:1 gene:ENSRNOG00000027066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:37257395:37372261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT025909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001024283 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 3A, member 2 (Scgb3a2), mRNA. // chr18 // 79 // 83 // 23 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000037796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:37950632:37953554:1 gene:ENSRNOG00000026912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AF439547 // GenBank // Rattus norvegicus pneumo secretory protein 1 (Pnsp1) mRNA, complete cds. // chr18 // 79 // 83 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:37950679:37953510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001008875 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 14 (Spink14), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:34862160:34865081:1 gene:ENSRNOG00000028902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:55126832:55129753:1 gene:ENSRNOG00000045824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075498 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:236506634:236508672:1 gene:ENSRNOG00000046686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001008874 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 6 (Spink6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:34914760:34926669:1 gene:ENSRNOG00000013073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:43337855:43349921:-1 gene:ENSRNOG00000046265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:55179917:55191826:1 gene:ENSRNOG00000048570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001061351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 12-like 1 (Spink12l1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002727266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 12-like 1 (Spink12l1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003749196 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease inhibitor Kazal-type 12-like (LOC100911241), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003751773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease inhibitor Kazal-type 12 (Spink12), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060114 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:34957308:34960590:1 gene:ENSRNOG00000039251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074521 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:55209088:55212370:1 gene:ENSRNOG00000051016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075045 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:43317403:43320685:-1 gene:ENSRNOG00000045937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:34957362:35122288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:55209142:55276531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:43292480:43320631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000017311 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:35047524:35048531:1 gene:ENSRNOG00000012408 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047574 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:43231649:43232656:-1 gene:ENSRNOG00000048364 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000049223 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:43052415:43053422:-1 gene:ENSRNOG00000049366 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:34957362:35122288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// GENSCAN00000044281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:42954744:43232656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
XM_003748653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2-like (LOC100909599), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003748976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YTH domain containing 2 (Ythdc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060098 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:189058204:189111184:-1 gene:ENSRNOG00000039241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:13571561:13584279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:188907038:189130994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
GENSCAN00000039482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:38401738:38409729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
NM_001109506 // RefSeq // Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 2 (Elmod2), mRNA. // chr18 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// XM_006255302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 2 (Elmod2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// XM_006255303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 2 (Elmod2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014916 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:38501033:38506809:1 gene:ENSRNOG00000011225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000031614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35445968:35465400:-1 gene:ENSRNOG00000028176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:38501033:38501767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000028909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35443476:35456707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_019314 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 2 (Kcnn2), mRNA. // chr18 // 84 // 89 // 27 // 32 // 0 /// XM_006254683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small conductance calcium-activated potassium channel protein 2-like (LOC100910229), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000022530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:38985930:39129190:1 gene:ENSRNOG00000016675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000067262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:38985930:39129190:1 gene:ENSRNOG00000016675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// JN857942 // GenBank // Rattus norvegicus small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 2 (Kcnn2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr18 // 88 // 89 // 28 // 32 // 0 /// U69882 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-activated potassium channel rSK2 (SK) mRNA, complete cds. // chr18 // 84 // 89 // 27 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002167 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:38822146:38859793:1 gene:ENSRNOG00000050774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000003882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:39094044:39129190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 47 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT025912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1
GENSCAN00000028344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:39706264:39706608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000041763 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:39742594:39742971:1 gene:ENSRNOG00000050666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000028334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:39742594:39742971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
FQ226474 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YA23 mRNA sequence. // chr18 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// NONRATT025914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0
GENSCAN00000039763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40224529:40225288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001008773 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1A (Eif1a), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1A (Eif1a), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1A (Eif1a), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40240997:40252362:1 gene:ENSRNOG00000031421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC093607 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1A, mRNA (cDNA clone MGC:105626 IMAGE:7318425), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001106933 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, sigma 1 subunit (Ap3s1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006254695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, sigma 1 subunit (Ap3s1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000064116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40378507:40443852:1 gene:ENSRNOG00000003829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC167039 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, sigma 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:189303 IMAGE:8368273), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// XM_006254696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, sigma 1 subunit (Ap3s1), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 79 // 79 // 11 // 14 // 1 /// NONRATT025917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT025918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT025919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 93 // 93 // 13 // 14 // 1 /// NONRATT025920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
NM_001047892 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Set alpha isoform (LOC317165), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051002 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:40500379:40517959:1 gene:ENSRNOG00000032100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT025921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40500379:40579934:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_577617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus laeverin (Aqpep), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000039733 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:40527841:40601218:1 gene:ENSRNOG00000003950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000034367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40500379:40579934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 18 // 43 // 1
XM_006222569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein-like (Arl14epl), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006222570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein-like (Arl14epl), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006254700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein-like (Arl14epl), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006254701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 14 effector protein-like (Arl14epl), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000035656 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:40627705:40634001:1 gene:ENSRNOG00000025590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40627705:40660758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 87 // 19 // 20 // 0
NM_001004276 // RefSeq // Rattus norvegicus COMM domain containing 10 (Commd10), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COMM domain containing 10 (Commd10), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40666687:40798787:1 gene:ENSRNOG00000003958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079373 // GenBank // Rattus norvegicus COMM domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:94865 IMAGE:7110105), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT025924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40668259:40759085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
GENSCAN00000019585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:42418290:42443326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000022171 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:43065468:43066590:1 gene:ENSRNOG00000024836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:43059092:43090917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0
GENSCAN00000007223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:46094730:46102771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT018486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000032083 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:46100513:46101619:1 gene:ENSRNOG00000024704 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 69 // 100 // 11 // 16 // 0
XM_006222574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Dmx-like 1 (Dmxl1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006254710 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Dmx-like 1 (Dmxl1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000031812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:43689414:43865045:1 gene:ENSRNOG00000024671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000053571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:43689414:43860495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT025937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_001107387 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8 (Tnfaip8), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8 (Tnfaip8), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006254708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8 (Tnfaip8), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000021972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:43960149:44002489:1 gene:ENSRNOG00000026136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231450 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YH06 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000020662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:43972261:44001384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT025940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:43961925:43967801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_024392 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4 (Hsd17b4), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000021646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:44032347:44119545:1 gene:ENSRNOG00000015840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC072472 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 4, mRNA (cDNA clone MGC:91668 IMAGE:7100430), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// U37486 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal multifunctional enzyme type II mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 96 // 41 // 44 // 0 /// GENSCAN00000020670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:44032396:44135609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 80 // 35 // 37 // 0 /// NONRATT025941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT025942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1
ENSRNOT00000039379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:44243884:44248595:1 gene:ENSRNOG00000015834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC160906 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 170, member A, mRNA (cDNA clone MGC:188638 IMAGE:7455403), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:44244092:44248567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108432 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 16 (Prr16), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:45166704:45370225:1 gene:ENSRNOG00000019744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:45369467:45370225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT025945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT025945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NM_001106136 // RefSeq // Rattus norvegicus ferritin mitochondrial (Ftmt), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:46510407:46511656:1 gene:ENSRNOG00000014988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:46372767:46511199:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT025947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000020091 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:46630330:46631214:1 gene:ENSRNOG00000014942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000025977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:46630544:46670891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001005536 // RefSeq // Rattus norvegicus serum response factor binding protein 1 (Srfbp1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:46669390:46690468:1 gene:ENSRNOG00000014808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC082077 // GenBank // Rattus norvegicus serum response factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95245 IMAGE:7133229), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:46674307:46690364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT025949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NR_032142 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-664-1 (Mir664-1), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NR_032143 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-664-2 (Mir664-2), microRNA. // chr18 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000069087 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:18:46701241:46701299:1 gene:ENSRNOG00000043820 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071851 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:13:107866605:107866663:1 gene:ENSRNOG00000046719 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// NONRATT016965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// NONRATT025950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// rno-mir-664-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0003722 Rattus norvegicus miR-664-1 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// rno-mir-664-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0003723 Rattus norvegicus miR-664-2 stem-loop // chr18 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0
NM_001107380 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 474 (Zfp474), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 474 (Zfp474), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:46791114:46821060:1 gene:ENSRNOG00000018724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:46819472:46820512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001109125 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to FLJ32921 protein (RGD1564428), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to FLJ32921 protein (RGD1564428), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:46827402:46847659:1 gene:ENSRNOG00000018721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT025953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:46826503:46847647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_134341 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerol kinase-like 1 (Gykl1), mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000051142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:46872633:46874534:1 gene:ENSRNOG00000029096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:46872676:46950842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT025954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001107379 // RefSeq // Rattus norvegicus synuclein, alpha interacting protein (Sncaip), mRNA. // chr18 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// XM_006254719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synuclein, alpha interacting protein (Sncaip), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:46954706:47092054:1 gene:ENSRNOG00000018254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:47052667:47086222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT025955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106135 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 2 (Snx2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000050631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:47347481:47389036:1 gene:ENSRNOG00000017832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC166853 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 2, mRNA (cDNA clone MGC:188758 IMAGE:9092757), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:47358033:47400943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT025958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT025960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONRATT025962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT025963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001008364 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 24 (Snx24), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 24 (Snx24), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000023507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:47416795:47569094:1 gene:ENSRNOG00000017488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC085883 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 24, mRNA (cDNA clone MGC:94664 IMAGE:7192093), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 24 (Snx24), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// XM_006254729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 24 (Snx24), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT025964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001058066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 6 (Prdm6), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006222577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 6 (Prdm6), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// XM_225764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 6 (Prdm6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:47648388:47749754:1 gene:ENSRNOG00000030486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:47648388:47749754:1 gene:ENSRNOG00000030486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:47702428:47757138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_022855 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 1, gamma 3 (Csnk1g3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:48065995:48126390:1 gene:ENSRNOG00000016677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT025969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// U22321 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 1 gamma 3 isoform mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT025970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT025971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT025972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000032792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:48100392:48121727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
GENSCAN00000032755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:48241497:48248259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
GENSCAN00000055211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:50372243:50376193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
XM_006254748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 3 (Gramd3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001014011 // RefSeq // Rattus norvegicus GRAM domain containing 3 (Gramd3), mRNA. // chr18 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000020570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:50688264:50786064:1 gene:ENSRNOG00000015225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// BC090001 // GenBank // Rattus norvegicus GRAM domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:109479 IMAGE:7321780), complete cds. // chr18 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// NONRATT025976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000055208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:50753213:50786284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT025978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT025977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_173133 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphorylated adaptor for RNA export (Phax), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:50857303:50873989:1 gene:ENSRNOG00000014459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097932 // GenBank // Rattus norvegicus phosphorylated adaptor for RNA export, mRNA (cDNA clone MGC:116045 IMAGE:7386998), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:50857331:50877982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT025980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109126 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 43 (Tex43), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:50874777:50878111:1 gene:ENSRNOG00000023034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053905 // RefSeq // Rattus norvegicus lamin B1 (Lmnb1), mRNA. // chr18 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:50979875:51017524:1 gene:ENSRNOG00000013774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// U72353 // GenBank // Rattus norvegicus lamin B1 mRNA, complete cds. // chr18 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// XM_006254745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lamin B1 (Lmnb1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// NONRATT025983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:50997941:51027409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001100657 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple EGF-like domains 10 (Megf10), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:51448631:51551513:1 gene:ENSRNOG00000013674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:51518227:51550914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001033887 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich coiled-coil 1 (Prrc1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006254746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich coiled-coil 1 (Prrc1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:51612007:51645426:1 gene:ENSRNOG00000016433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC101903 // GenBank // Rattus norvegicus proline-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:124825 IMAGE:7934311), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ214150 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YJ04 mRNA sequence. // chr18 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:51623852:51645263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT025990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_003751786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910150 (LOC100910150), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910150 (LOC100910150), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:51646959:51675579:1 gene:ENSRNOG00000033015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY321326 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-032 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:51646959:51675579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001134696 // RefSeq // Rattus norvegicus cortexin 3 (Ctxn3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cortexin 3 (Ctxn3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cortexin 3 (Ctxn3), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:51730154:51739529:1 gene:ENSRNOG00000022957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166550 // GenBank // Rattus norvegicus cortexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:188156 IMAGE:7307107), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212564 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YJ22 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_341932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sporulation-specific protein 15-like (LOC102547870), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021974 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:51790845:51956754:1 gene:ENSRNOG00000016402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0
ENSRNOT00000059732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:51966075:51966829:1 gene:ENSRNOG00000039055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 88 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:51966269:51972235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_031798 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 12 (sodium/potassium/chloride transporter), member 2 (Slc12a2), mRNA. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:52104434:52172618:1 gene:ENSRNOG00000015971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF051561 // GenBank // Rattus norvegicus Na-K-Cl cotransporter (Nkcc1) mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:52116003:52167754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT025997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT025998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001106145 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 6 (Slc27a6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000045244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:52825799:52891779:1 gene:ENSRNOG00000019733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53034123:53117463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT026004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:52840885:52987569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001014242 // RefSeq // Rattus norvegicus isochorismatase domain containing 1 (Isoc1), mRNA. // chr18 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:53008862:53028768:-1 gene:ENSRNOG00000019711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AB108669 // GenBank // Rattus norvegicus DR-NR#1 mRNA for Down-regulated in nephrectomized rat kidney #1, complete cds. // chr18 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT026718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53010771:53026433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001108433 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 19 (Adamts19), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000026543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:53154607:53337093:1 gene:ENSRNOG00000019577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000019965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53155131:53333255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT026005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT026006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
NONRATT026005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227645611:227646093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// FQ232462 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YK12 mRNA sequence. // chr18 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:52840885:52987569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53155131:53333255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001106144 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to DD1 (RGD1312005), mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000029239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:53346501:53361030:1 gene:ENSRNOG00000022429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC166445 // GenBank // Rattus norvegicus similar to DD1, mRNA (cDNA clone MGC:187590 IMAGE:8363471), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53351069:53359748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT026007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT026008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT026011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONRATT026012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
XM_003753051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroitin sulfate synthase 3-like (LOC100910780), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_225912 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroitin sulfate synthase 3 (Chsy3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073295 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:53441962:53442834:1 gene:ENSRNOG00000047935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000075483 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:53479221:53483110:1 gene:ENSRNOG00000050152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000006672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53441962:53445869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000006679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53723207:53730765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000006685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53479221:53510867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_003751792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon-inducible GTPase 1-like (LOC100910934), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000043736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:54739047:54741758:1 gene:ENSRNOG00000038960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC098065 // GenBank // Rattus norvegicus similar to interferon-inducible GTPase, mRNA (cDNA clone MGC:116227 IMAGE:7458735), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ227882 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YG21 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT026023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001012353 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to interferon-inducible GTPase (MGC108823), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006222578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon-inducible GTPase 1-like (LOC102549198), mRNA. // chr18 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000050063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:54811546:54820264:1 gene:ENSRNOG00000019542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC089836 // GenBank // Rattus norvegicus similar to interferon-inducible GTPase, mRNA (cDNA clone MGC:108823 IMAGE:7326302), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT026025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006222579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CDNA sequence BC023105 (RGD1305184), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_225905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CDNA sequence BC023105 (RGD1305184), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:54901571:54903044:1 gene:ENSRNOG00000038957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:54901571:54902997:1 gene:ENSRNOG00000038957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:54901571:54975461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000040116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:54920890:54939122:1 gene:ENSRNOG00000038955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093614 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC023105, mRNA (cDNA clone MGC:105567 IMAGE:7309663), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:54901571:54975461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000026334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55030628:55056365:1 gene:ENSRNOG00000019298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000026394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55030628:55056365:1 gene:ENSRNOG00000019298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AF190798 // GenBank // Rattus norvegicus dynactin subunit p62 mRNA, complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// BC100143 // GenBank // Rattus norvegicus dynactin 4, mRNA (cDNA clone MGC:114292 IMAGE:7133708), complete cds. // chr18 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// NM_053404 // RefSeq // Rattus norvegicus dynactin 4 (p62) (Dctn4), mRNA. // chr18 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// AF192493 // GenBank // Rattus norvegicus p62 dynactin subunit mRNA, complete cds. // chr18 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// AF192494 // GenBank // Rattus norvegicus p62 dynactin subunit isoform 2 mRNA, complete cds. // chr18 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// NONRATT026029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55030684:55073918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// NONRATT026030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
NM_001025676 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 22 (Rbm22), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55061638:55072446:1 gene:ENSRNOG00000019235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC097991 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 22, mRNA (cDNA clone MGC:116134 IMAGE:7446014), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55030684:55073918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1
NM_001047881 // RefSeq // Rattus norvegicus arylsulfatase family, member I (Arsi), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylsulfatase family, member I (Arsi), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000030966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55414598:55420577:1 gene:ENSRNOG00000026060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55352889:55420577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012920 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II alpha (Camk2a), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 59 // 59 // 0 /// J02942 // GenBank // Rat calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II alpha-subunit mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 59 // 59 // 0 /// ENSRNOT00000041533 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:55428528:55529045:1 gene:ENSRNOG00000018712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000026495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55428528:55528770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 60 // 60 // 0 /// NONRATT026049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 30 // 30 // 19 // 64 // 1 /// NONRATT026054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 19 // 19 // 12 // 64 // 1
NM_031525 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet derived growth factor receptor, beta polypeptide (Pdgfrb), mRNA. // chr18 // 96 // 96 // 44 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000068535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55596758:55637692:1 gene:ENSRNOG00000018461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AY090783 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-derived growth factor receptor beta (Pdgfrb) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 96 // 44 // 46 // 0 /// DQ979389 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-derived growth factor receptor beta variant 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 75 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55611971:55635982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT026056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT026055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 27 // 27 // 13 // 48 // 1
NM_001029901 // RefSeq // Rattus norvegicus colony stimulating factor 1 receptor (Csf1r), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// XM_006254813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus colony stimulating factor 1 receptor (Csf1r), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000049357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55662900:55689297:1 gene:ENSRNOG00000018414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// BC107475 // GenBank // Rattus norvegicus colony stimulating factor 1 receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:7444694), complete cds. // chr18 // 38 // 38 // 18 // 47 // 1 /// GENSCAN00000026496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55662900:55688668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT026060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0
NM_001107386 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 6A, cGMP-specific, rod, alpha (Pde6a), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000024171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55775712:55848018:1 gene:ENSRNOG00000017816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000016448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55839644:55847412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55775819:55823667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_053615 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 1, alpha 1 (Csnk1a1), mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56116409:56147273:1 gene:ENSRNOG00000017106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000066133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56116409:56147273:1 gene:ENSRNOG00000017106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC127486 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 1, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:156603 IMAGE:8364080), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// U77582 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 1 alpha (CKIa) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56116635:56188838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_053789 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17B (Il17b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56240488:56244922:1 gene:ENSRNOG00000019695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56234718:56244818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2 (Sh3tc2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006254817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2 (Sh3tc2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56514260:56575124:1 gene:ENSRNOG00000019305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000071911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56514260:56572911:1 gene:ENSRNOG00000019305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56514260:56629696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT026078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_012853 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 4, G protein-coupled (Htr4), mRNA. // chr18 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// XM_006254792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 4, G protein-coupled (Htr4), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56880237:57045771:1 gene:ENSRNOG00000019134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56880237:57004861:1 gene:ENSRNOG00000019134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56880237:57004861:1 gene:ENSRNOG00000019134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AJ011370 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for serotonin 4 receptor, splice variant r5-HT4(e). // chr18 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// U20906 // GenBank // Rattus norvegicus 5-HT4S receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// U20907 // GenBank // Rattus norvegicus 5-HT4L receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56925781:57012472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
NM_001107384 // RefSeq // Rattus norvegicus N-ethylmaleimide-sensitive factor attachment protein, gamma (Napg), mRNA. // chr18 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000065802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:57548236:57566987:1 gene:ENSRNOG00000018914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// AY724541 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cqb-k-04-0-UI unknown mRNA. // chr18 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:57525197:57564529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT026083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT026084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_001071384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenomatosis polyposis coli down-regulated 1 (Apcdd1), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023975 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 7 (Wdr7), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025325 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:58326473:58612197:1 gene:ENSRNOG00000018387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF305813 // GenBank // Rattus norvegicus TGF-beta resistance-associated protein (TRAG) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:58321682:58453526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT026087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000025134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:58679176:58698412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT026089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_013029 // RefSeq // Rattus norvegicus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 3 (St8sia3), mRNA. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:58962843:58969336:1 gene:ENSRNOG00000018305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U55938 // GenBank // Rattus norvegicus GD3 alpha 2,8-sialyltransferase mRNA complete cds. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:58962910:58969107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT026091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_002725360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus one cut homeobox 2 (Onecut2), partial mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:59039619:59086702:1 gene:ENSRNOG00000018299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:59039685:59086702:1 gene:ENSRNOG00000018299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:59042246:59086702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001008300 // RefSeq // Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase (Nedd4l), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:59776172:59921504:1 gene:ENSRNOG00000017610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC086371 // GenBank // Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7126721), complete cds. // chr18 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// GQ160815 // GenBank // Rattus norvegicus strain DSS Nedd4l mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GQ160816 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW Nedd4l mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:59841305:59968806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT026098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001025057 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC502176 (LOC502176), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:59946819:59968806:1 gene:ENSRNOG00000030321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:59841305:59968806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NR_031864 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-122 (Mir122), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-122 // miRBase Micro RNA Database // MI0000891 Rattus norvegicus miR-122 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60305268:60356704:1 gene:ENSRNOG00000017181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000068418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60305268:60356704:1 gene:ENSRNOG00000017181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// FQ225105 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YC01 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60317759:60382322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// NONRATT026111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_001107382 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 532 (Zfp532), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 532 (Zfp532), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 532 (Zfp532), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 532 (Zfp532), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 532 (Zfp532), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 532 (Zfp532), transcript variant X10, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60458275:60565220:1 gene:ENSRNOG00000017116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000056988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60520567:60563288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT026115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// NONRATT026113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001106139 // RefSeq // Rattus norvegicus O-acyltransferase like (Oacyl), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60573908:60629730:1 gene:ENSRNOG00000024640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60573934:60731711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_153628 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC11 homolog C (S. cerevisiae) (Sec11c), mRNA. // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60686314:60702656:1 gene:ENSRNOG00000017036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB022714 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for signal peptidase 21kDa subunit, complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// FQ214257 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YO02 mRNA sequence. // chr18 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000056987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60573934:60731711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT026121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT026123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_133570 // RefSeq // Rattus norvegicus gastrin releasing peptide (Grp), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60759080:60772845:1 gene:ENSRNOG00000016999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M31176 // GenBank // Rat gastrin-releasing peptide mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60759593:60798640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT026124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
ENSRNOT00000054519 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:18:61125137:61125202:-1 gene:ENSRNOG00000036406 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001065428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen and calcium binding EGF domains 1 (Ccbe1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_341624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen and calcium binding EGF domains 1 (Ccbe1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60953849:60983423:-1 gene:ENSRNOG00000024536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000034075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60956663:60983419:-1 gene:ENSRNOG00000024536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60953849:60984812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT026811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_053886 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, mannose-binding, 1 (Lman1), mRNA. // chr18 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60880943:60901867:-1 gene:ENSRNOG00000024470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U44129 // GenBank // Rattus norvegicus p58 mRNA, complete cds. // chr18 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60835143:60901867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT026806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001191835 // RefSeq // Rattus norvegicus complexin 4 (Cplx4), mRNA. // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60853137:60867940:-1 gene:ENSRNOG00000016928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006254878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus complexin 4 (Cplx4), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60835143:60901867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT026799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_053678 // RefSeq // Rattus norvegicus retina and anterior neural fold homeobox (Rax), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:60835143:60838820:-1 gene:ENSRNOG00000016944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF135839 // GenBank // Rattus norvegicus homeodomain protein RX (Rx) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60835143:60901867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT026797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000051208 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:61315868:61316427:1 gene:ENSRNOG00000030242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:61312243:61327337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000072461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:61342105:61342722:1 gene:ENSRNOG00000046399 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:61342120:61369043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT026127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001008385 // RefSeq // Rattus norvegicus phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 (Pmaip1), mRNA. // chr18 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:61365056:61369043:1 gene:ENSRNOG00000018770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY788892 // GenBank // Rattus norvegicus phorbol-12-myristate-13-acetate-induced protein 1 mRNA, complete cds. // chr18 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:61342120:61369043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT026130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000028545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:61657229:61658426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000036887 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:61657334:61658426:1 gene:ENSRNOG00000024232 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 68 // 100 // 15 // 22 // 0
ENSRNOT00000035566 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:60036383:60037392:1 gene:ENSRNOG00000023260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 69 // 100 // 11 // 16 // 0
ENSRNOT00000025172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62036103:62131420:1 gene:ENSRNOG00000010440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// S80376 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein Golf alpha subunit (G-alpha-olf) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chr18 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NM_001191836 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein, alpha stimulating, olfactory type (Gnal), mRNA. // chr18 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT026132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001109533 // RefSeq // Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 1B (Chmp1b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168175 // GenBank // Rattus norvegicus chromatin modifying protein 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:9034182), partial cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62067449:62111141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172224 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 2 (Impa2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006254856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 2 (Impa2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62201776:62232717:1 gene:ENSRNOG00000018516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY160191 // GenBank // Rattus norvegicus myo-inositol monophosphatase 2 (Impa2) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083544 // GenBank // Rattus norvegicus inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93085 IMAGE:7191219), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62200876:62306308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT026136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT026137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001170467 // RefSeq // Rattus norvegicus cell death-inducing DFFA-like effector a (Cidea), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62268025:62292643:1 gene:ENSRNOG00000018505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT026139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62200876:62306308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001025675 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, beta 6 class V (Tubb6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62314821:62324460:1 gene:ENSRNOG00000018371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097977 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:116110 IMAGE:7442728), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62314852:62324084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT026140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109570 // RefSeq // Rattus norvegicus slowmo homolog 1 (Drosophila) (Slmo1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus slowmo homolog 1 (Drosophila) (Slmo1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus slowmo homolog 1 (Drosophila) (Slmo1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62388335:62401682:1 gene:ENSRNOG00000017954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62396070:62400189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0