NM_001109444 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 13 (Rnf13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 13 (Rnf13), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000068606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:167261840:167446313:1 gene:ENSRNOG00000029209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081881 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ring finger protein 13, mRNA (cDNA clone MGC:93748 IMAGE:7108181), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ224754 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA55YN03 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:167283157:167353098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:167402008:167445327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
GENSCAN00000011783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:167534670:167623063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XR_145838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG49992-like (LOC100361313), misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_146838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG49992-like (LOC100361313), misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000035183 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:168015031:168015454:1 gene:ENSRNOG00000025738 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168015031:168070497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 73 // 14 // 16 // 0
NM_001191960 // RefSeq // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 2 (Tsc22d2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006232387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 2 (Tsc22d2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 72 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000015119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168025537:168072788:1 gene:ENSRNOG00000038044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000027902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168015031:168070497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT029462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1
NM_001191960 // RefSeq // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 2 (Tsc22d2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 2 (Tsc22d2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168025537:168072788:1 gene:ENSRNOG00000038044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168015031:168070497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109339 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2A (Eif2a), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168140000:168173620:1 gene:ENSRNOG00000013393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168139412:168196666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT029464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001014253 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein T (Selt), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168183559:168197314:1 gene:ENSRNOG00000013507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AY995234 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein T (Selt) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC086953 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein T, mRNA (cDNA clone MGC:109481 IMAGE:7321890), complete cds. // chr2 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// FQ211813 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA79YG13 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT029466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168139412:168196666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001169130 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 12-like (Med12l), mRNA. // chr2 // 33 // 33 // 15 // 46 // 1 /// ENSRNOT00000014470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168632572:168735461:1 gene:ENSRNOG00000010680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 15 // 46 // 1 /// ENSRNOT00000074764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168917166:168964460:1 gene:ENSRNOG00000047010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168881724:168930731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168656188:168735401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 28 // 13 // 13 // 0
XM_001062078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 2-like (RGD1311318), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_227185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 2-like (RGD1311318), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000052313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:169433243:169449580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_001062135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 2-like (RGD1560162), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_578020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 2-like (RGD1560162), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000052317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:169485541:169507770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000057820 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:169489435:169507770:1 gene:ENSRNOG00000038008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_001191706 // RefSeq // Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 2 (Aadacl2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:169764505:169785231:1 gene:ENSRNOG00000050494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:169532271:169551722:1 gene:ENSRNOG00000050858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:169764505:169825533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:169532271:169590053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020538 // RefSeq // Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase (Aadac), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:169583697:169590476:1 gene:ENSRNOG00000013950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000074684 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:169573785:169580510:1 gene:ENSRNOG00000048352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// AF182426 // GenBank // Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC088143 // GenBank // Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase (esterase), mRNA (cDNA clone MGC:108701 IMAGE:7323135), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ218395 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YI01 mRNA sequence. // chr2 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// FQ218651 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YK09 mRNA sequence. // chr2 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT029476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:169532271:169590053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001001518 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate receptor 1 (Sucnr1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:169643631:169644582:1 gene:ENSRNOG00000014039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY612851 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein-coupled receptor 91 (Gpr91) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000044208 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:170090631:170091296:1 gene:ENSRNOG00000032875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
NM_001191566 // RefSeq // Rattus norvegicus muscleblind-like splicing regulator 1 (Mbnl1), mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus muscleblind-like splicing regulator 1 (Mbnl1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232414 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus muscleblind-like splicing regulator 1 (Mbnl1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:170175585:170287163:1 gene:ENSRNOG00000014076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus muscleblind-like splicing regulator 1 (Mbnl1), transcript variant X19, mRNA. // chr2 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT029479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT029482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000001407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:170247491:170291074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT029484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENSRNOT00000005695 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:170403114:170404195:1 gene:ENSRNOG00000022072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_012800 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 1 (P2ry1), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:170730012:170735513:1 gene:ENSRNOG00000014232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U22830 // GenBank // Rattus norvegicus P2Y purinoceptor mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ224409 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA67YJ10 mRNA sequence. // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:170730619:170731740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT029486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_023968 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y2 (Npy2r), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:200944755:200945900:-1 gene:ENSRNOG00000049213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY004257 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide Y/peptide YY-Y2 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200944755:200973742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133410 // RefSeq // Rattus norvegicus RAP2B, member of RAS oncogene family (Rap2b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:171097071:171097622:1 gene:ENSRNOG00000014420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF386786 // GenBank // Rattus norvegicus RAP2B mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:171097071:171097622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase-like (LOC690921), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_003753594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphokine-activated killer T-cell-originated protein kinase-like (LOC690921), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031061 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:171908918:171911372:1 gene:ENSRNOG00000021950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:171908015:171910208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
XM_001063458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 26 (Arhgef26), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019553 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:46226750:46352443:1 gene:ENSRNOG00000014549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46336588:46351112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000053775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46226750:46309192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// FQ218213 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA7YH03 mRNA sequence. // chr2 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT028812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_012608 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane metallo-endopeptidase (Mme), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000042576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:173197265:173275026:1 gene:ENSRNOG00000009514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC085753 // GenBank // Rattus norvegicus membrane metallo endopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:93576 IMAGE:7110842), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// M15944 // GenBank // Rat enkephalinase (neutral endopeptidase) mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC091571 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7129830, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1 /// GENSCAN00000005609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173238163:173263873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173197265:173236488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT029489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT029490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// NONRATT029491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
GENSCAN00000005618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173565869:173602624:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001024754 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine monphosphate synthase (Gmps), mRNA. // chr2 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// BC098016 // GenBank // Rattus norvegicus guanine monphosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:116167 IMAGE:7454908), complete cds. // chr2 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173936750:173974520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT029493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT029496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001099498 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor 44 (Vom2r44), mRNA. // chr2 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:173989005:174020953:1 gene:ENSRNOG00000010268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AF053989 // GenBank // Rattus norvegicus tissue-type vomeronasal neurons putative pheromone receptor V2R2 mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000051180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173988906:174020861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_017303 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 1 (Kcnab1), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:175102652:175398300:1 gene:ENSRNOG00000010422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC089219 // GenBank // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, beta member 1, mRNA (cDNA clone MGC:105463 IMAGE:7320941), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U17967 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated potassium channel beta subunit mRNA, partial cds. // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:175381725:175396670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT029502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:175296060:175352583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSRNOT00000015387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:176688181:176710351:1 gene:ENSRNOG00000011238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:176688181:176710351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001115029 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), mRNA. // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// XM_006232472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// XM_006232473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000051494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:176821695:176987915:1 gene:ENSRNOG00000031247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// BC107462 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7454573. // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// BC158627 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Restin, mRNA (cDNA clone MGC:187532 IMAGE:7455378), complete cds. // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:176789121:176808529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:176821420:176856835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT029510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001115029 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine, glutamate and lysine rich 1 (Lekr1), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:176821695:176987915:1 gene:ENSRNOG00000031247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:176869629:177002239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001109536 // RefSeq // Rattus norvegicus pentraxin 3, long (Ptx3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:177457263:177463073:1 gene:ENSRNOG00000012280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:177457423:177462455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001014172 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine/serine-rich coiled-coil 1 (Rsrc1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000051977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:183491965:183881122:1 gene:ENSRNOG00000012639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// BC087665 // GenBank // Rattus norvegicus arginine/serine-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:105761 IMAGE:7317835), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
XR_338491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// XR_357468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// FQ217911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA14YD18 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT059021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 62 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 41 // 41 // 26 // 63 // 1
NM_001107680 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid leukemia factor 1 (Mlf1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:183898817:183932144:1 gene:ENSRNOG00000012827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ215722 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YA13 mRNA sequence. // chr2 // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// FQ216411 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YB13 mRNA sequence. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT029517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT029518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:183898853:183976786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_053625 // RefSeq // Rattus norvegicus G elongation factor, mitochondrial 1 (Gfm1), mRNA. // chr2 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:183950902:183995881:1 gene:ENSRNOG00000012873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000042079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:183950902:183995881:1 gene:ENSRNOG00000012873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC085721 // GenBank // Rattus norvegicus G elongation factor, mitochondrial 1, mRNA (cDNA clone MGC:93294 IMAGE:7192461), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// L14684 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear-encoded mitochondrial elongation factor G mRNA, complete cds. // chr2 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// NONRATT029519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000034692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:183898853:183976786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_001191847 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 1 (Mfsd1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:184095497:184116407:1 gene:ENSRNOG00000013790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ211604 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YA23 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184070782:184106945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001191847 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 1 (Mfsd1), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000018489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:184095497:184116407:1 gene:ENSRNOG00000013790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211604 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YA23 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT029521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100666 // RefSeq // Rattus norvegicus schwannomin interacting protein 1 (Schip1), mRNA. // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000057473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:191602850:192287061:-1 gene:ENSRNOG00000009276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT031561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:192260821:192359123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001100666 // RefSeq // Rattus norvegicus schwannomin interacting protein 1 (Schip1), mRNA. // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000057473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:191602850:192287061:-1 gene:ENSRNOG00000009276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// BC169016 // GenBank // Rattus norvegicus schwannomin interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7189550), complete cds. // chr2 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT031561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:191795753:191828471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:191606501:191622546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT031562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT031563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT031564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENSRNOT00000033720 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:192000195:192001003:-1 gene:ENSRNOG00000028754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT031561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053390 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 12A (Il12a), mRNA. // chr2 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:184430744:184437696:1 gene:ENSRNOG00000009468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF177031 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 12 p35 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184424383:184437585:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT029523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_006224144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362176 (LOC100362176), mRNA. // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// XM_006232486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100362176 (LOC100362176), mRNA. // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184754793:184767062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000053339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184810711:184848426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001037185 // RefSeq // Rattus norvegicus structural maintenance of chromosomes 4 (Smc4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000013931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:184962125:184990525:1 gene:ENSRNOG00000010274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC107944 // GenBank // Rattus norvegicus structural maintenance of chromosomes 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7388735), complete cds. // chr2 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000053328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184959256:184990464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT029526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT029527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1
NR_031816 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-15b (Mir15b), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053606 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:184967041:184967138:1 gene:ENSRNOG00000035483 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-15b // miRBase Micro RNA Database // MI0000843 Rattus norvegicus miR-15b stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031817 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-16 (Mir16), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053627 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:184967190:184967284:1 gene:ENSRNOG00000035504 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-16 // miRBase Micro RNA Database // MI0000844 Rattus norvegicus miR-16 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007678 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB interacting factor (Rabif), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000005845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:56374231:56385517:1 gene:ENSRNOG00000004424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000073716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185165820:185177312:1 gene:ENSRNOG00000045814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC161807 // GenBank // Rattus norvegicus RAB interacting factor, mRNA (cDNA clone MGC:187223 IMAGE:9036685), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000022565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:56366415:56384126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000053331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:185127415:185197275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT016407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 86 // 100 // 30 // 35 // 0 /// X70496 // GenBank // R. norvegicus mRNA for Mss4 protein. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000073257 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:61367757:61367946:1 gene:ENSRNOG00000047342 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 73 // 43 // 11 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075562 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:58603424:58603613:1 gene:ENSRNOG00000050141 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 73 // 43 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61367757:61368112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 71 // 10 // 25 // 0
NM_001107681 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1L (Ppm1l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185498460:185567985:1 gene:ENSRNOG00000046168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:185520486:185567985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_227252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to retinoblastoma binding protein 4 (RGD1563620), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000033132 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:185705225:185707079:1 gene:ENSRNOG00000028052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:185705225:185707079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001107682 // RefSeq // Rattus norvegicus NMD3 ribosome export adaptor (Nmd3), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185759351:185784445:1 gene:ENSRNOG00000009310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185759080:185784441:1 gene:ENSRNOG00000009310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC161998 // GenBank // Rattus norvegicus NMD3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187845 IMAGE:9035992), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT029536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT029537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:185733948:186021024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NONRATT029536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus otolin 1 (Otol1), mRNA. // chr2 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// XM_006232488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus otolin 1 (Otol1), mRNA. // chr2 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000035765 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:186225575:186234986:1 gene:ENSRNOG00000021186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000014840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:186225575:186252539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 35 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000035976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:186189810:186203760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
GENSCAN00000021789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:188645065:188706200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NONRATT029540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000020319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:188871282:189069525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_053779 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade I (neuroserpin), member 1 (Serpini1), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:193348764:193446630:1 gene:ENSRNOG00000010248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF193014 // GenBank // Rattus norvegicus neuroserpin mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// AF193015 // GenBank // Rattus norvegicus neuroserpin mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 91 // 26 // 30 // 0 /// BC061536 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade I, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72736 IMAGE:6920827), complete cds. // chr2 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:193400313:193425193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT029544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001271195 // RefSeq // Rattus norvegicus follistatin-like 5 (Fstl5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014120 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:193937492:194332727:1 gene:ENSRNOG00000010483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:194400119:194576586:1 gene:ENSRNOG00000047002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:194498917:194576586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:194219498:194478875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT029548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000047010 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:194918793:194919767:1 gene:ENSRNOG00000031978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:194919107:194919818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 44 // 11 // 12 // 0
NM_001024301 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ25371 (LOC499643), mRNA. // chrU // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ25371 (LOC499643), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065115 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:197453279:197566926:1 gene:ENSRNOG00000032009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC085354 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ25371, mRNA (cDNA clone MGC:105887 IMAGE:7132360), complete cds. // chrU // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:196560591:196692754:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// GENSCAN00000041803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:197422586:197468105:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001004279 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase D (Ppid), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000037890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:197690280:197702613:1 gene:ENSRNOG00000027408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC076386 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase D (cyclophilin D), mRNA (cDNA clone MGC:93768 IMAGE:7108860), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ214826 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YN08 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT029554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001107685 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1560010 (RGD1560010), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:197725440:197728572:1 gene:ENSRNOG00000010071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC162053 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1560010, mRNA (cDNA clone MGC:188038 IMAGE:7113318), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_199105 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 198, member B (Fam198b), mRNA. // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:198087637:198158770:1 gene:ENSRNOG00000010183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XR_340386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547700 (LOC102547700), transcript variant X1, ncRNA. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT019636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT019638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT034180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80414923:80436854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NM_031317 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet derived growth factor C (Pdgfc), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:199362291:199537365:1 gene:ENSRNOG00000010695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB033830 // GenBank // Rattus norvegicus rScdgf mRNA for spinal cord-derived growth factor, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:199517857:199603037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT029564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000019460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:199412326:199515947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_022227 // RefSeq // Rattus norvegicus acid-sensing (proton-gated) ion channel family member 5 (Asic5), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:200345065:200372742:1 gene:ENSRNOG00000011842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200345149:200379772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000039925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200700015:200711491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_001135716 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 9 (Map9), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:200743299:200775030:1 gene:ENSRNOG00000012982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200732363:200775509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT029568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
GENSCAN00000039939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200984591:200985105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000036146 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:200984591:200985279:1 gene:ENSRNOG00000026433 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 64 // 92 // 7 // 11 // 0
NM_012559 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrinogen gamma chain (Fgg), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:201401833:201409142:1 gene:ENSRNOG00000025074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC078893 // GenBank // Rattus norvegicus fibrinogen gamma chain, mRNA (cDNA clone MGC:93618 IMAGE:7122366), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ219374 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YK24 mRNA sequence. // chr2 // 86 // 88 // 25 // 29 // 0 /// FQ219604 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YD13 mRNA sequence. // chr2 // 87 // 91 // 26 // 30 // 0 /// FQ229132 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YA15 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// FQ209823 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA39YJ04 mRNA sequence. // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// FQ209662 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YD10 mRNA sequence. // chr2 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000008381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:201337851:201428141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT029570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001008724 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrinogen alpha chain (Fga), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_052797 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrinogen alpha chain (Fga), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:201316925:201428141:1 gene:ENSRNOG00000024848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:201420938:201428346:1 gene:ENSRNOG00000024848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC127465 // GenBank // Rattus norvegicus fibrinogen alpha chain, mRNA (cDNA clone MGC:156536 IMAGE:8375711), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// FQ209852 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YP03 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:201337851:201428141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0
NM_021757 // RefSeq // Rattus norvegicus pleiotropic regulator 1 (Plrg1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:201454938:201471292:1 gene:ENSRNOG00000006655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF128241 // GenBank // Rattus norvegicus pleiotropic regulator 1 (PLRG1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC087742 // GenBank // Rattus norvegicus pleiotropic regulator 1, PRL1 homolog (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:105439 IMAGE:7314208), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:201455201:201471169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT029577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
XM_006224153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dachsous cadherin-related 2 (Dchs2), mRNA. // chr2 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032147 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:201528306:201668906:1 gene:ENSRNOG00000023789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 33 // 10 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000072862 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:201705946:201732964:1 gene:ENSRNOG00000049111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:201697726:201744417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:201618738:201692810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 42 // 13 // 14 // 0
NM_001100700 // RefSeq // Rattus norvegicus secreted frizzled-related protein 2 (Sfrp2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:202136233:202143777:1 gene:ENSRNOG00000009465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161900 // GenBank // Rattus norvegicus secreted frizzled-related protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:187620 IMAGE:8367121), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:202139047:202142898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT029578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000043806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:202466892:202481078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
XM_006224159 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tigger transposable element-derived protein 4-like (LOC102550932), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tigger transposable element-derived protein 4-like (LOC102550932), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014409 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:203007313:203008857:1 gene:ENSRNOG00000010741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:203007313:203012328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001108553 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 154 (Tmem154), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000014433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:203082519:203119809:1 gene:ENSRNOG00000010866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:203079709:203127113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT029582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_006224161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 7, E3 ubiquitin protein ligase (Fbxw7), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:203635360:203661643:-1 gene:ENSRNOG00000010889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:203635360:203708054:-1 gene:ENSRNOG00000010889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// XM_006232555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 7, E3 ubiquitin protein ligase (Fbxw7), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:203635424:203648286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT031650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
XM_003749312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PET112-like (yeast) (Pet112l), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:203993423:204069070:1 gene:ENSRNOG00000037655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:203993423:204075947:1 gene:ENSRNOG00000037655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:203993423:204077216:1 gene:ENSRNOG00000037655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing 19 (Sh3d19), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// XM_006224164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing 19 (Sh3d19), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0 /// XM_006232784 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain containing 19 (Sh3d19), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000015802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:204784166:204820405:1 gene:ENSRNOG00000011752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:204791157:204820405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 13 // 47 // 1 /// NONRATT029594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 22 // 47 // 1 /// GENSCAN00000015359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:204758898:204787447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1 /// NONRATT029591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
NM_001108555 // RefSeq // Rattus norvegicus LPS-responsive vesicle trafficking, beach and anchor containing (Lrba), mRNA. // chr2 // 98 // 96 // 53 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000057084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:204990264:205322437:1 gene:ENSRNOG00000023453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000023418 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:205346424:205508257:1 gene:ENSRNOG00000048324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 21 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:205001279:205179437:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:205297025:205508324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 27 // 27 // 15 // 56 // 1 /// NONRATT029598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1
FQ233740 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YK01 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000044715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:205774487:205826123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000046785 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:205803728:205804488:1 gene:ENSRNOG00000029933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 100 // 10 // 16 // 0
XM_003749325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongator complex protein 4-like (LOC365839), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_003753615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongator complex protein 4-like (LOC365839), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC158667 // GenBank // Rattus norvegicus similar to elongation protein 4 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:187663 IMAGE:8370237), complete cds. // chr2 // 63 // 95 // 12 // 19 // 0
NM_001025685 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd5 molecule-like (Cd5l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206092881:206103893:1 gene:ENSRNOG00000023068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098724 // GenBank // Rattus norvegicus Cd5 molecule-like, mRNA (cDNA clone MGC:112716 IMAGE:7378264), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd5 molecule-like (Cd5l), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT029603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206092943:206139651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
XM_006232672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd5 molecule-like (Cd5l), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000052347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206111318:206129916:1 gene:ENSRNOG00000034230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// FQ232638 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YP13 mRNA sequence. // chr2 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206092943:206139651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0
XM_006224179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fc receptor-like 3 (Fcrl3), mRNA. // chr2 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// XM_006232797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fc receptor-like 3 (Fcrl3), mRNA. // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000046778 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:206188165:206203353:1 gene:ENSRNOG00000043414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206188205:206216128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
NM_001100992 // RefSeq // Rattus norvegicus ets variant 3-like (Etv3l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006232729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ets variant 3-like (Etv3l), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006232730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ets variant 3-like (Etv3l), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000057490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206304068:206316647:1 gene:ENSRNOG00000043511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC127525 // GenBank // Rattus norvegicus ets variant 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:156768 IMAGE:7114610), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206310009:206316067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT029613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1
ENSRNOT00000020819 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:206341919:206343163:1 gene:ENSRNOG00000015533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206341925:206343003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_023982 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 11 (Arhgef11), mRNA. // chr2 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000020717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206385941:206506479:1 gene:ENSRNOG00000015026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// AF225961 // GenBank // Rattus norvegicus RhoGEF glutamate transport modulator GTRAP48 mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000028585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206393224:206506479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT029615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_022212 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin receptor-related receptor (Insrr), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000018638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206567015:206585726:1 gene:ENSRNOG00000013344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// D13965 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sIRR-1, complete cds. // chr2 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// D13966 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sIRR-2, complete cds. // chr2 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// M90661 // GenBank // Rattus norvegicus insulin receptor-related receptor-alpha subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 29 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206567413:206629281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT029621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT029622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT029623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1
NM_207605 // RefSeq // Rattus norvegicus SH2 domain containing 2A (Sh2d2a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206622869:206629299:1 gene:ENSRNOG00000013294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF468787 // GenBank // Rattus norvegicus TSAD mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// BC088087 // GenBank // Rattus norvegicus SH2 domain protein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:108514 IMAGE:7379832), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206567413:206629281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_053707 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatoma-derived growth factor (Hdgf), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206679280:206686097:1 gene:ENSRNOG00000012836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AF389348 // GenBank // Rattus norvegicus HDGF (Hdgf) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC070943 // GenBank // Rattus norvegicus hepatoma-derived growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:91563 IMAGE:7103046), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206679280:206686096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001007637 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L24 (mrpl24), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L24 (mrpl24), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206691661:206697673:1 gene:ENSRNOG00000022234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082018 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L24, mRNA (cDNA clone MGC:94307 IMAGE:7132470), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L24 (mrpl24), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000046543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206695485:206696808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT029632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT029635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT029636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT029634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001007741 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon stimulated exonuclease gene 20-like 2 (Isg20l2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// ENSRNOT00000015471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206705209:206714693:1 gene:ENSRNOG00000011402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// BC079314 // GenBank // Rattus norvegicus interferon stimulated exonuclease gene 20-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:94465 IMAGE:7134903), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// ENSRNOT00000046787 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:99720948:99722054:1 gene:ENSRNOG00000037348 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 89 // 80 // 39 // 44 // 0 /// GENSCAN00000007237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:93422261:93423334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 76 // 39 // 42 // 0 /// GENSCAN00000032744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99720948:99722054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 80 // 39 // 44 // 0 /// GENSCAN00000046561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206706340:206714569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT029638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0
NM_017244 // RefSeq // Rattus norvegicus cellular retinoic acid binding protein 2 (Crabp2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000025183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206725433:206729806:1 gene:ENSRNOG00000022101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// U23407 // GenBank // Rattus norvegicus cellular retinoic acid-binding protein II (CRABP II) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072198 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:204274042:204274578:1 gene:ENSRNOG00000048421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000046568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206725535:206762503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT029639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:204237481:204306551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1 /// NONRATT029641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_012987 // RefSeq // Rattus norvegicus nestin (Nes), mRNA. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206747073:206755585:1 gene:ENSRNOG00000018681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206747073:206755585:1 gene:ENSRNOG00000018681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AF538924 // GenBank // Rattus norvegicus nestin mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// M34384 // GenBank // Rat nestin mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000070881 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:204291110:204299418:1 gene:ENSRNOG00000045562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073111 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:204291320:204299418:1 gene:ENSRNOG00000045562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:204237481:204306551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206725535:206762503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001024979 // RefSeq // Rattus norvegicus G patch domain containing 4 (Gpatch4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206818279:206827062:1 gene:ENSRNOG00000018969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093381 // GenBank // Rattus norvegicus G patch domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:112675 IMAGE:7388663), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206809272:206826532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT029643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001191709 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif containing GTPase activating protein 3 (Iqgap3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206850518:206892647:1 gene:ENSRNOG00000027894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206852304:206981204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT029647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_030860 // RefSeq // Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2D (Mef2d), mRNA. // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000051394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206915181:206941043:1 gene:ENSRNOG00000031778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// AJ005425 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MEF2D protein. // chr2 // 93 // 75 // 25 // 27 // 0 /// BC081790 // GenBank // Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2D, mRNA (cDNA clone MGC:93400 IMAGE:7134848), complete cds. // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206852304:206981204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT029652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT029653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT029654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
XR_344464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547113 (LOC102547113), transcript variant X1, ncRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_031811 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-9-1 (Mir9-1), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// rno-mir-9a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000838 Rattus norvegicus miR-9a-1 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_199091 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 3 (gamma) (Cct3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000025824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207072068:207096552:1 gene:ENSRNOG00000019090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC063178 // GenBank // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 3 (gamma), mRNA (cDNA clone MGC:72950 IMAGE:6890550), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207050020:207103731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NONRATT029664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 1
NM_001004226 // RefSeq // Rattus norvegicus kidney predominant protein NCU-G1 (RGD1303130), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207100471:207104060:1 gene:ENSRNOG00000019281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079294 // GenBank // Rattus norvegicus kidney predominant protein NCU-G1, mRNA (cDNA clone MGC:94430 IMAGE:7134483), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207050020:207103731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
XM_006224170 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg5), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// XM_006232790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMG5 nonsense mediated mRNA decay factor (Smg5), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000026514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207111216:207137075:1 gene:ENSRNOG00000019590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// BC169031 // GenBank // Rattus norvegicus Smg-5 homolog, nonsense mediated mRNA decay factor (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:9034114), partial cds. // chr2 // 97 // 80 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207111330:207137075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT029672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
NM_001191077 // RefSeq // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member VI (Paqr6), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member VI (Paqr6), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006232756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member VI (Paqr6), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000036143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207140710:207144108:1 gene:ENSRNOG00000026059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207141169:207144108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT029676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT029677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT029680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT029681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
XM_006232798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mex-3 RNA binding family member A (Mex3a), partial mRNA. // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000052079 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:207296030:207300710:1 gene:ENSRNOG00000029812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207286205:207300710:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001107688 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquilin 4 (Ubqln4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006232642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquilin 4 (Ubqln4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207318101:207333300:1 gene:ENSRNOG00000019933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207318193:207331922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001106442 // RefSeq // Rattus norvegicus signal sequence receptor, beta (Ssr2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207354107:207362738:1 gene:ENSRNOG00000019940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168754 // GenBank // Rattus norvegicus signal sequence receptor, beta, mRNA (cDNA clone MGC:188866 IMAGE:6886830), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207354394:207422650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001012079 // RefSeq // Rattus norvegicus rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Arhgef2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006232651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Arhgef2), transcript variant X9, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006232652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Arhgef2), transcript variant X10, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006232654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Arhgef2), transcript variant X12, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000027182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207396432:207423791:1 gene:ENSRNOG00000020027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC090078 // GenBank // Rattus norvegicus rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2, mRNA (cDNA clone MGC:95068 IMAGE:7125049), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// FQ212011 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YK08 mRNA sequence. // chr2 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000041925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207354394:207422650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 87 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT029689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT029688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// NONRATT029687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
ENSRNOT00000027385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207453978:207481697:1 gene:ENSRNOG00000020139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC103646 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7314291. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207454001:207480637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT029690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT029692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT029693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NONRATT029690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001109185 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras-like without CAAX 1 (Rit1), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000027455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207487476:207498920:1 gene:ENSRNOG00000020232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207487740:207498559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT029696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024797 // RefSeq // Rattus norvegicus gon-4-like (C. elegans) (Gon4l), mRNA. // chr2 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000056789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207538842:207612074:1 gene:ENSRNOG00000020297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AB195689 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for YY1AP-related protein1, complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// AY724781 // GenBank // Rattus norvegicus GON4L isoform A (Gon4l) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// AY724782 // GenBank // Rattus norvegicus GON4L isoform B (Gon4l) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207539589:207611376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NONRATT029698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001107689 // RefSeq // Rattus norvegicus ash1 (absent, small, or homeotic)-like (Drosophila) (Ash1l), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207652622:207799105:1 gene:ENSRNOG00000020386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207698514:207801380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_012624 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate kinase, liver and RBC (Pklr), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207865576:207874393:1 gene:ENSRNOG00000020420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000065791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207866027:207874393:1 gene:ENSRNOG00000020420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC161827 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate kinase, liver and RBC, mRNA (cDNA clone MGC:187302 IMAGE:7127842), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// FQ211172 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA16YD06 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// M11709 // GenBank // Rattus norvegicus L-type pyruvate kinase mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// M17685 // GenBank // Rat L-type pyruvate kinase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000027341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207849430:207873118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT029709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT029711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001014254 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC-like kinase 2 (Clk2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// ENSRNOT00000027793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207895502:207905133:1 gene:ENSRNOG00000020500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// BC083788 // GenBank // Rattus norvegicus CDC-like kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94769 IMAGE:7098251), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// GENSCAN00000027373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207895199:207911153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 62 // 62 // 0 /// NONRATT029716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// NONRATT029717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// NONRATT029714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 51 // 51 // 37 // 72 // 1 /// NONRATT029715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 51 // 51 // 37 // 72 // 1 /// NONRATT029713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 25 // 72 // 1
NM_031724 // RefSeq // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 3 (Scamp3), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000027815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207905687:207911470:1 gene:ENSRNOG00000048405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT029718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT029719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207895199:207911153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
ENSRNOT00000027828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207911887:207917765:1 gene:ENSRNOG00000020518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ221099 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YK17 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207912443:207936609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1 /// NONRATT029721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT029722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT029723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT029724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XM_003749320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thrombospondin 3 (LOC681309), mRNA. // chr2 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// XM_003753605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thrombospondin 3 (LOC681309), mRNA. // chr2 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000027841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207943473:207955131:1 gene:ENSRNOG00000020524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// GENSCAN00000027363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207943473:207955131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// NONRATT029726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 21 // 44 // 1
NM_012602 // RefSeq // Rattus norvegicus mucin 1, cell surface associated (Muc1), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207957655:207962391:1 gene:ENSRNOG00000020539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC166505 // GenBank // Rattus norvegicus mucin 1, cell surface associated, mRNA (cDNA clone MGC:188069 IMAGE:7122817), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207957710:207962112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001106444 // RefSeq // Rattus norvegicus keratinocyte associated protein 2 (Krtcap2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207975076:207979072:1 gene:ENSRNOG00000020542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167108 // GenBank // Rattus norvegicus keratinocyte associated protein 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6918437), partial cds. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001109331 // RefSeq // Rattus norvegicus dolichyl-phosphate mannosyltransferase polypeptide 3 (Dpm3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207997009:207997524:1 gene:ENSRNOG00000029077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207997252:207997464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ223927 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA82YM05 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DC-STAMP domain containing 2 (Dcst2), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_003753619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DC-STAMP domain containing 2 (Dcst2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000065027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208105418:208118758:1 gene:ENSRNOG00000043206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208105472:208114567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001164060 // RefSeq // Rattus norvegicus SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 (Shc1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NM_053517 // RefSeq // Rattus norvegicus SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1 (Shc1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000028038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208162850:208171348:1 gene:ENSRNOG00000020657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000056652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208159786:208171348:1 gene:ENSRNOG00000020657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// BC088298 // GenBank // Rattus norvegicus SHC (Src homology 2 domain containing) transforming protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:109497 IMAGE:7323045), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT029740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000027359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208162850:208174999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
NM_001106447 // RefSeq // Rattus norvegicus pygopus family PHD finger 2 (Pygo2), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pygopus 2 (Pygo2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000028052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208171771:208176564:1 gene:ENSRNOG00000020663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169054 // GenBank // Rattus norvegicus pygopus 2, mRNA (cDNA clone MGC:189447 IMAGE:7930933), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006232616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pygopus 2 (Pygo2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT029743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT029745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208162850:208174999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001106447 // RefSeq // Rattus norvegicus pygopus family PHD finger 2 (Pygo2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pygopus 2 (Pygo2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pygopus 2 (Pygo2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208171771:208176564:1 gene:ENSRNOG00000020663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169054 // GenBank // Rattus norvegicus pygopus 2, mRNA (cDNA clone MGC:189447 IMAGE:7930933), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100976 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox interacting protein 1 (Pbxip1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox interacting protein 1 (Pbxip1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208180635:208190539:1 gene:ENSRNOG00000020673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085776 // GenBank // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia transcription factor interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7097507). // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC129100 // GenBank // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:156694 IMAGE:7098205), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208184789:208207452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT029747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001008352 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphomevalonate kinase (Pmvk), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208198108:208207798:1 gene:ENSRNOG00000020696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086349 // GenBank // Rattus norvegicus phosphomevalonate kinase, mRNA (cDNA clone MGC:105660 IMAGE:7302798), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ226470 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YB05 mRNA sequence. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT029749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208184789:208207452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_019315 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 3 (Kcnn3), mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208267083:208411808:1 gene:ENSRNOG00000020706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF284345 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-activated potassium channel SK3 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF292389 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-activated potassium channel SK3 (Kcnn3) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// U69884 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-activated potassium channel rSK3 (SK) mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT029752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208301556:208411791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT029753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_031006 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, RNA-specific (Adar), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208485313:208508301:1 gene:ENSRNOG00000020744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ212270 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA62YI05 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U18942 // GenBank // Rattus norvegicus double-stranded RNA-specific adenosine deaminase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208471833:208506026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106448 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family member 1 (Ube2q1), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family member 1 (Ube2q1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208528890:208537959:1 gene:ENSRNOG00000020791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC166534 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2Q family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:188127 IMAGE:7190922), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208528444:208560583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT029757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT029759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT029760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT029761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_001062249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Src homology 2 domain containing E (She), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028225 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:208592947:208613786:1 gene:ENSRNOG00000020797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068701 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:208592947:208613786:1 gene:ENSRNOG00000020797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208592947:208613786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001109186 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1564171 (RGD1564171), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208847060:208850038:1 gene:ENSRNOG00000037406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ218036 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA10YJ24 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208833267:208849764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NR_032268 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 190b (Mir190b), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000062998 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:208854175:208854252:1 gene:ENSRNOG00000041245 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// rno-mir-190b // miRBase Micro RNA Database // MI0006135 Rattus norvegicus miR-190b stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001191900 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 210-like (Nup210l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000022990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208887380:209004326:1 gene:ENSRNOG00000017070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000012086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208887380:208914884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000012094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208928741:209018773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0
NM_031092 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB13, member RAS oncogene family (Rab13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209014516:209019148:1 gene:ENSRNOG00000016733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF525280 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein RAB13 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ222701 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YC08 mRNA sequence. // chr2 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// FQ213046 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YA10 mRNA sequence. // chr2 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208928741:209018773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT029792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT029793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT029794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_019213 // RefSeq // Rattus norvegicus jumping translocation breakpoint (Jtb), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209024504:209028715:1 gene:ENSRNOG00000016379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB016489 // GenBank // Rattus norvegicus rJTB mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC062090 // GenBank // Rattus norvegicus jumping translocation breakpoint, mRNA (cDNA clone MGC:72461 IMAGE:5621612), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT029796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209019316:209028432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT029798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001134577 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1 (Slc39a1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209042655:209048221:1 gene:ENSRNOG00000016344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC168649 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:187417 IMAGE:7105124), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209043423:209046862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001033895 // RefSeq // Rattus norvegicus CREB regulated transcription coactivator 2 (Crtc2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209048803:209058907:1 gene:ENSRNOG00000016138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC128708 // GenBank // Rattus norvegicus CREB regulated transcription coactivator 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7129063). // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168242 // GenBank // Rattus norvegicus CREB regulated transcription coactivator 2, mRNA (cDNA clone MGC:188367 IMAGE:7934746), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ185515 // GenBank // Rattus norvegicus transducer of regulated cAMP response element-binding protein 2 (Torc2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209048916:209074840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT029801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENSRNOT00000030622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209062175:209075586:1 gene:ENSRNOG00000022373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209061387:209075586:1 gene:ENSRNOG00000022373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209048916:209074840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001024888 // RefSeq // Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 2B (Gatad2b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 2B (Gatad2b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209087998:209163193:1 gene:ENSRNOG00000015553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC097428 // GenBank // Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:114476 IMAGE:7455294), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209145785:209170649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001047886 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin enhancer binding factor 2 (Ilf2), mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209288460:209308315:1 gene:ENSRNOG00000014154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC167105 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin enhancer binding factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:189560 IMAGE:9102039), complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209289647:209308315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT029813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT029814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT029817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_001191607 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A13 (S100a13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209336486:209342980:1 gene:ENSRNOG00000012393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A14 (S100a14), mRNA. // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT029819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209337422:209347407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT029820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_002725995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A14 (S100a14), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A14 (S100a14), mRNA. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056523 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:209345327:209345896:1 gene:ENSRNOG00000037357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT029820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209337422:209347407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 96 // 12 // 24 // 0
NM_001108557 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A16 (S100a16), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006232717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A16 (S100a16), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000016499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209356215:209361933:1 gene:ENSRNOG00000012053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC158598 // GenBank // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A16, mRNA (cDNA clone MGC:187445 IMAGE:7127572), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// FQ214430 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YL24 mRNA sequence. // chr2 // 84 // 76 // 16 // 19 // 0 /// FQ213610 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YM04 mRNA sequence. // chr2 // 63 // 76 // 12 // 19 // 0 /// FQ213742 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YP15 mRNA sequence. // chr2 // 63 // 76 // 12 // 19 // 0 /// NONRATT029822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_003749328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein S100-A2-like (LOC100910139), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_003753621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein S100-A2-like (LOC100910139), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT029825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209397986:209418619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_012618 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium-binding protein A4 (S100a4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209431370:209433679:1 gene:ENSRNOG00000011821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ229874 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YG09 mRNA sequence. // chr2 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// J03628 // GenBank // Rat S-100 related protein mRNA, complete cds, clone 42A/eX15. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X64022 // GenBank // R.norvegicus p9Ka/42A mRNA. // chr2 // 89 // 60 // 16 // 18 // 0 /// X64023 // GenBank // R.norvegicus p9Ka/42A mRNA. // chr2 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT029830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ222142 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA28YD18 mRNA sequence. // chr2 // 53 // 100 // 16 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209432591:209439839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001106438 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A5 (S100a5), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209437963:209439970:1 gene:ENSRNOG00000011748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209432591:209439839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_053485 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A6 (S100a6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A6 (S100a6), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209441323:209442604:1 gene:ENSRNOG00000011647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF140232 // GenBank // Rattus norvegicus calcium binding protein (S100A6) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166598 // GenBank // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A6, mRNA (cDNA clone MGC:188372 IMAGE:7931905), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ219783 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YF12 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222560 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA21YM14 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ223404 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA11YK23 mRNA sequence. // chr2 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209441951:209442511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT029832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109471 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A7A (S100a7a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209492452:209496893:1 gene:ENSRNOG00000033352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209477719:209496814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053822 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A8 (S100a8), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209508171:209508690:1 gene:ENSRNOG00000011557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L18891 // GenBank // Rattus norvegicus intercellular calcium-binding protein (MRP8) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209508196:209529490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT029836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191708 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidoglycan recognition protein 4 (Pglyrp4), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209561162:209582174:1 gene:ENSRNOG00000021798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidoglycan recognition protein 4-like (LOC100910179), mRNA. // chr2 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000048574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209632897:209637324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209561162:209582174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_001191961 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidoglycan recognition protein 3 (Pglyrp3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidoglycan recognition protein 3 (Pglyrp3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:212602810:212612564:-1 gene:ENSRNOG00000046881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:212951582:212966832:-1 gene:ENSRNOG00000045617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:212602810:212612539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:212951582:212966807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:214300627:214369946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006232846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554691 (LOC102554691), mRNA. // chr2 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000056498 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:212719411:212719680:-1 gene:ENSRNOG00000037341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000044052 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:212433997:212451454:-1 gene:ENSRNOG00000029177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT031852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006224192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2I-like (LOC102550598), mRNA. // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XM_006224205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2D-like (LOC102552542), mRNA. // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// XM_006232815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2D-like (LOC102550512), mRNA. // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XM_006232816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2I-like (LOC102550598), mRNA. // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XM_006232828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2D-like (LOC102552542), mRNA. // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000012067 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:212303210:212304265:-1 gene:ENSRNOG00000009115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 61 // 16 // 17 // 0 /// XM_006232827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2H-like (LOC102552434), mRNA. // chr2 // 59 // 96 // 16 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:212303210:212304265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006224188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2I-like (LOC102550416), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006232814 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2I-like (LOC102550416), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067346 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:212254053:212265147:-1 gene:ENSRNOG00000029760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
XM_006224190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2H-like (LOC102550257), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 2H-like (LOC102550257), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067346 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:212254053:212265147:-1 gene:ENSRNOG00000029760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000064950 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:212254044:212254316:-1 gene:ENSRNOG00000029760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 89 // 14 // 25 // 0
ENSRNOT00000012507 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211916984:211917503:-1 gene:ENSRNOG00000009445 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT031849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_001055530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 91 // 100 // 42 // 46 // 0 /// XM_002726003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_002729072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_002729076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 91 // 100 // 42 // 46 // 0 /// NONRATT029845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// NONRATT031845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT031846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// NONRATT031847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000074852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211575347:211609242:-1 gene:ENSRNOG00000046752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 34 // 46 // 1
XM_001055530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 92 // 78 // 45 // 49 // 0 /// XM_002726003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 90 // 81 // 46 // 51 // 0 /// XM_002729072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 90 // 81 // 46 // 51 // 0 /// XM_002729076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 92 // 78 // 45 // 49 // 0 /// NONRATT031845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 100 // 51 // 63 // 0 /// NONRATT031846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 100 // 62 // 63 // 0 /// NONRATT031847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 100 // 62 // 63 // 0 /// NONRATT029845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 75 // 75 // 47 // 63 // 1 /// ENSRNOT00000074852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211575347:211609242:-1 gene:ENSRNOG00000046752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 35 // 63 // 1
XM_001055530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 94 // 78 // 47 // 50 // 0 /// XM_002726003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 88 // 81 // 46 // 52 // 0 /// XM_002729072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 88 // 81 // 46 // 52 // 0 /// XM_002729076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 94 // 78 // 47 // 50 // 0 /// NONRATT031845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 100 // 52 // 64 // 0 /// NONRATT031846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 64 // 64 // 0 /// NONRATT031847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 64 // 64 // 0 /// NONRATT029845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 77 // 77 // 49 // 64 // 1 /// ENSRNOT00000074852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211575347:211609242:-1 gene:ENSRNOG00000046752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 37 // 64 // 1
XM_001055530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// XM_002726003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_002729072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_002729076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT029845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT031845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT031847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211575347:211609242:-1 gene:ENSRNOG00000046752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1
XM_001055530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 45 // 49 // 0 /// XM_002726003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 46 // 49 // 0 /// XM_002729072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 46 // 49 // 0 /// XM_002729076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 45 // 49 // 0 /// NONRATT029845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// NONRATT031845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT031846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// NONRATT031847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000074852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211575347:211609242:-1 gene:ENSRNOG00000046752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 37 // 49 // 1
XM_001055530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_002729076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_001055236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cornulin (Crnn), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_227367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cornulin (Crnn), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011762 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211438738:211441049:-1 gene:ENSRNOG00000008721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211438738:211441049:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003753631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus filaggrin (Flg), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006232822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus filaggrin (Flg), mRNA. // chrU // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000000449 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211292803:211294588:-1 gene:ENSRNOG00000009602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000037209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211249067:211294588:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
XM_006232821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hornerin-like (RGD1307660), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211228185:211239671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
XM_001054767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus repetin (Rptn), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_227371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus repetin (Rptn), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:211138929:211142986:-1 gene:ENSRNOG00000018679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:211139205:211142986:-1 gene:ENSRNOG00000018679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 91 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211138929:211142986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_006224200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trichohyalin (Tchh), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211057899:211089376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XR_145852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trichohyalin-like 1 (Tchhl1), misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_146847 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trichohyalin-like 1 (Tchhl1), misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038311 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:211057778:211060137:-1 gene:ENSRNOG00000009610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211057899:211089376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001004095 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A11 (S100a11), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000013393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:210998954:211004364:-1 gene:ENSRNOG00000010105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY688465 // GenBank // Rattus norvegicus S100 calcium-binding protein A11 mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// FQ221855 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA30YN12 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210966542:211013509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT031842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_031114 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A10 (S100a10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000035240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:210966310:210975004:-1 gene:ENSRNOG00000023226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC091565 // GenBank // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A10, mRNA (cDNA clone MGC:114307 IMAGE:7441806), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ222734 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YK10 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// J03627 // GenBank // Rat S-100 related protein mRNA, complete cds, clone 42C. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT031840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT031841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
XM_003749330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (RGD1566337), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074001 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:209945041:209946171:1 gene:ENSRNOG00000046388 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209945077:209946171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0
XM_001053809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 3-like (RGD1565369), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_227351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 3-like (RGD1565369), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210260867:210261949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001100985 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to TDPOZ3 (RGD1563667), mRNA. // chr9 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// AY902367 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF domain and POZ/BTB containing protein T2 (Tdpoz-T2) mRNA, complete cds. // chr9 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// FJ004894 // GenBank // Rattus norvegicus clone RIN122 TDPOZ-T2 mRNA, complete cds. // chr9 // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// NM_001100996 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to TDPOZ3 (RGD1559714), mRNA. // chr9 // 24 // 92 // 8 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000048323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:116905089:116940738:-1 gene:ENSRNOG00000037315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 22 // 100 // 8 // 37 // 0 /// AY902366 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF domain and POZ/BTB containing protein T1 variant transcript 1b (Tdpoz-T1) mRNA, complete cds. // chr9 // 22 // 100 // 8 // 37 // 0 /// FJ004892 // GenBank // Rattus norvegicus clone T1E16-A RTDPOZ-T1 mRNA, complete cds. // chr9 // 22 // 100 // 8 // 37 // 0 /// FJ004893 // GenBank // Rattus norvegicus clone T1E16-B RTDPOZ-T1 mRNA, complete cds. // chr9 // 24 // 92 // 8 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:116934376:116935458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 84 // 100 // 31 // 37 // 0 /// GENSCAN00000046705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:214633190:214633954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 81 // 73 // 22 // 27 // 0 /// NONRATT058484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// AY902365 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF domain and POZ/BTB containing protein T1 variant transcript 1a (Tdpoz-T1) mRNA, complete cds. // chr9 // 22 // 100 // 8 // 37 // 0 /// NONRATT031860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 24 // 100 // 9 // 37 // 0
NM_001047902 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 11A (Zc3h11a), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000004025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:55250213:55288525:1 gene:ENSRNOG00000002993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC111404 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5730454B08, mRNA (cDNA clone IMAGE:7373975), partial cds. // chr2 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:55258438:55288525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:124318979:124320564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000051240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:214981710:214983294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT016362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210102175:210109735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// FQ211482 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YD22 mRNA sequence. // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT016366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT016367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT016368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT016369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001025017 // RefSeq // Rattus norvegicus thioesterase superfamily member 4 (Them4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215034646:215055404:1 gene:ENSRNOG00000020829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093385 // GenBank // Rattus norvegicus thioesterase superfamily member 4, mRNA (cDNA clone MGC:112681 IMAGE:7389383), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215034742:215121296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT029870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001108558 // RefSeq // Rattus norvegicus thioesterase superfamily member 5 (Them5), mRNA. // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000066020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215061475:215066694:1 gene:ENSRNOG00000043445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000051247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215034742:215121296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT029871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001109189 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and Ig domain containing 4 (Lingo4), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056455 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215105404:215107929:1 gene:ENSRNOG00000046831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// BC169105 // GenBank // Rattus norvegicus RAR-related orphan receptor C, mRNA (cDNA clone MGC:189525 IMAGE:7383660), complete cds. // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000051247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215034742:215121296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215109109:215116316:1 gene:ENSRNOG00000020836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001109189 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and Ig domain containing 4 (Lingo4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215117129:215121296:1 gene:ENSRNOG00000022863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215034742:215121296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001014038 // RefSeq // Rattus norvegicus tudor and KH domain containing (Tdrkh), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor and KH domain containing (Tdrkh), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215130624:215152162:1 gene:ENSRNOG00000020860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC059161 // GenBank // Rattus norvegicus tudor and KH domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:72982 IMAGE:6887770), complete cds. // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000051249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215144173:215152037:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT029879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001007696 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L9 (mrpl9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215163444:215168154:1 gene:ENSRNOG00000020869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082085 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L9, mRNA (cDNA clone MGC:95263 IMAGE:7133689), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215163461:215167549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT029882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
XM_006232903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 3 (Celf3), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 3 (Celf3), transcript variant X8, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 3 (Celf3), transcript variant X10, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 3 (Celf3), transcript variant X11, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NM_001109190 // RefSeq // Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 3 (Celf3), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// XM_006232909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 3 (Celf3), transcript variant X13, mRNA. // chr2 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000028324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215197408:215211497:1 gene:ENSRNOG00000020875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215198168:215208899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT029886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001030052 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006238827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006238828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:145178506:145195972:-1 gene:ENSRNOG00000026646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215419281:215419757:1 gene:ENSRNOG00000029339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168721 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:188795 IMAGE:6920432), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049342 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:113694684:113712891:-1 gene:ENSRNOG00000030585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:145178612:145221898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT045450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT045451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT045452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001107693 // RefSeq // Rattus norvegicus pogo transposable element with ZNF domain (Pogz), mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215507130:215534824:1 gene:ENSRNOG00000020962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// XM_006232931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pogo transposable element with ZNF domain-like (LOC102546890), mRNA. // chr2 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// GENSCAN00000021036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215493770:215532839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT029894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0
NM_001107694 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression) (Rfx5), mRNA. // chr2 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// XM_006232877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulatory factor X, 5 (influences HLA class II expression) (Rfx5), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000068528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215615266:215622781:1 gene:ENSRNOG00000021012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT029896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215613895:215666061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT029897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT029898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_031083 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 4-kinase, catalytic, beta (Pi4kb), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215634441:215666468:1 gene:ENSRNOG00000021024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// D84667 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol 4-kinase, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215613895:215666061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001107695 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 72 homolog (S. cerevisiae) (Vps72), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215772302:215783863:1 gene:ENSRNOG00000021081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC161999 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 72 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187846 IMAGE:9036078), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215757092:215783685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106449 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomodulin 4 (Tmod4), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001270650 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomodulin 4 (Tmod4), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001270651 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomodulin 4 (Tmod4), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001270652 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomodulin 4 (Tmod4), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001270653 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomodulin 4 (Tmod4), transcript variant 5, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006232856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tropomodulin 4 (Tmod4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215789411:215794215:1 gene:ENSRNOG00000021088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215790467:215793655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT029911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT029910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT029912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001024302 // RefSeq // Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (Lysmd1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215799038:215804338:1 gene:ENSRNOG00000021099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089113 // GenBank // Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105813 IMAGE:7319992), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_351832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 1 (Lysmd1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215802581:215803455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT029913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039044 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 small effector 1 (Cdc42se1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215902738:215904577:1 gene:ENSRNOG00000021112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC091418 // GenBank // Rattus norvegicus CDC42 small effector 1, mRNA (cDNA clone MGC:109578 IMAGE:7365287), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215898708:215907164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT029924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT029926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT029923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000056380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215960035:215967611:1 gene:ENSRNOG00000021131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC091386 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 63, member A, mRNA (cDNA clone MGC:109471 IMAGE:7321358), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ215741 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YN18 mRNA sequence. // chr2 // 92 // 71 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215952647:215967431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT029930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001033700 // RefSeq // Rattus norvegicus ceramide synthase 2 (Cers2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006232887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceramide synthase 2 (Cers2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000028699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215986084:215994332:1 gene:ENSRNOG00000021138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC101876 // GenBank // Rattus norvegicus LAG1 homolog, ceramide synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:124761 IMAGE:5620921), complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// FQ212578 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YI19 mRNA sequence. // chr2 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215990822:215993558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT029931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT029933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT029935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// NONRATT029936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_031560 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin K (Ctsk), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:216154151:216164778:1 gene:ENSRNOG00000021155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF010306 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin K mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC078793 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin K, mRNA (cDNA clone MGC:93359 IMAGE:7134253), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ228691 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YL18 mRNA sequence. // chr2 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:216086637:216164425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_017320 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin S (Ctss), mRNA. // chr2 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028732 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:217144872:217169058:1 gene:ENSRNOG00000021157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// L03201 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin S mRNA, complete cds. // chr2 // 85 // 90 // 23 // 27 // 0 /// FQ231418 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YJ03 mRNA sequence. // chr2 // 67 // 100 // 20 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217144909:217163805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001108949 // RefSeq // Rattus norvegicus HORMA domain containing 1 (Hormad1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006232951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HORMA domain containing 1 (Hormad1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000066821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217171290:217206779:1 gene:ENSRNOG00000021160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT029950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NONRATT029950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001014255 // RefSeq // Rattus norvegicus APH1A gamma secretase subunit (Aph1a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000056289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217496482:217499990:1 gene:ENSRNOG00000023816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC087081 // GenBank // Rattus norvegicus anterior pharynx defective 1 homolog A (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:94545 IMAGE:7189126), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006232977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus APH1A gamma secretase subunit (Aph1a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 91 // 91 // 21 // 23 // 1 /// GENSCAN00000028789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217496674:217499276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT029953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NONRATT029956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028742 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:217520554:217521148:1 gene:ENSRNOG00000021167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 95 // 8 // 19 // 0
NM_001013200 // RefSeq // Rattus norvegicus acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member E (Anp32e), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member E (Anp32e), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217530775:217545154:1 gene:ENSRNOG00000021168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083744 // GenBank // Rattus norvegicus acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member E, mRNA (cDNA clone MGC:94666 IMAGE:7192147), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217531043:217562066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT029959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT029960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001191096 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 11 (Mtmr11), mRNA. // chr2 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// XM_006232984 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 11 (Mtmr11), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000056262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217790151:217798768:1 gene:ENSRNOG00000021176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 19 // 19 // 0 /// NM_001107697 // RefSeq // Rattus norvegicus OTU deubiquitinase 7B (Otud7b), mRNA. // chr2 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// XM_006232985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 11 (Mtmr11), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000046739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217720895:217787184:1 gene:ENSRNOG00000042068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// GENSCAN00000005308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217749716:217798290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT029966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT029968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT029967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001011951 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 3b, subunit 4 (Sf3b4), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217799411:217804163:1 gene:ENSRNOG00000021181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC078997 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor 3b, subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:93901 IMAGE:7112738), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217799515:217804142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 69 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT029970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_057210 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptic vesicle glycoprotein 2a (Sv2a), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217811917:217823542:1 gene:ENSRNOG00000021182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC092132 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic vesicle glycoprotein 2a, mRNA (cDNA clone MGC:105346 IMAGE:7314271), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// L05435 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic vesicle protein (SV2) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217811970:217822294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001111341 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 2, H2ab (Hist2h2ab), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000048582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217845513:217845905:1 gene:ENSRNOG00000048317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217845513:217845905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT029975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_001061909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 2, H2be (Hist2h2be), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_227459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 2, H2be (Hist2h2be), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046129 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:217846757:217904831:1 gene:ENSRNOG00000045753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217846757:217847137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107698 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 2, H3c2 (Hist2h3c2), mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000040906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217866185:217866595:-1 gene:ENSRNOG00000028975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000005291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217866185:217867949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000005303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217874568:217876335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000005305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217903378:217903788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT031950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001107698 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 2, H3c2 (Hist2h3c2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217903378:217903788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT029979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
BC079138 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7127764. // chr2 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XM_006224222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H2B type 2-B-like (LOC100912338), mRNA. // chr2 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// XM_006232995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone H2B type 2-B-like (LOC100912338), mRNA. // chr2 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// GENSCAN00000005304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217904450:217910460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT029981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// NONRATT029980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
FQ225205 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YM12 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_001012080 // RefSeq // Rattus norvegicus hemochromatosis type 2 (juvenile) (Hfe2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218142371:218146252:1 gene:ENSRNOG00000021200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089203 // GenBank // Rattus norvegicus hemochromatosis type 2 (juvenile) (human homolog), mRNA (cDNA clone MGC:105910 IMAGE:7191112), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218143470:218168773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT029985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008767 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin interacting protein (Txnip), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218170012:218173900:1 gene:ENSRNOG00000021201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC088411 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:94673 IMAGE:7192327), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U30789 // GenBank // Rattus norvegicus clone N27 mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218170292:218172535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT029990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT029988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001024980 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 34A (Ankrd34a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218208658:218212088:1 gene:ENSRNOG00000033741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091343 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 34A, mRNA (cDNA clone MGC:109352 IMAGE:7315500), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218204158:218210877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT029991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024303 // RefSeq // Rattus norvegicus Lix1 homolog (mouse)-like (Lix1l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000056237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218213052:218238919:1 gene:ENSRNOG00000021213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC087077 // GenBank // Rattus norvegicus Lix1 homolog (mouse)-like, mRNA (cDNA clone MGC:94485 IMAGE:7135157), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218213127:218226459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT029992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT029994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_001271138 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 8A (Rbm8a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218242220:218244257:1 gene:ENSRNOG00000021215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// FQ212597 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YH03 mRNA sequence. // chr2 // 77 // 100 // 17 // 22 // 0 /// FQ224490 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA64YG02 mRNA sequence. // chr2 // 79 // 86 // 15 // 19 // 0 /// NONRATT029995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 86 // 86 // 19 // 22 // 1 /// GENSCAN00000015074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218242244:218257503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NM_001025684 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 11 beta (Pex11b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 11 beta (Pex11b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000028811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218249072:218257960:1 gene:ENSRNOG00000021216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098865 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 11 beta, mRNA (cDNA clone MGC:112929 IMAGE:7380579), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218242244:218257503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001107699 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha 10 (Itga10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218259871:218279187:1 gene:ENSRNOG00000021217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218259920:218278331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000056225 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:218284432:218303371:1 gene:ENSRNOG00000025108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218282958:218316645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// FQ221348 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA37YH15 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_031784 // RefSeq // Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 3 (Pias3), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006232991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 3 (Pias3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 3 (Pias3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 3 (Pias3), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218310301:218318466:1 gene:ENSRNOG00000021218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF032872 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel regulatory protein KChAP mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT030006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218282958:218316645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT030005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001108560 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 115 (Rnf115), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218339347:218406934:1 gene:ENSRNOG00000000098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218399486:218405806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT030008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_031712 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing 1 (Pdzk1), mRNA. // chr2 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218452670:218484881:1 gene:ENSRNOG00000000096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF013145 // GenBank // Rattus norvegicus Diphor-1 mRNA, complete cds. // chr2 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// AF116896 // GenBank // Rattus norvegicus PDZ domain-containing protein mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC078788 // GenBank // Rattus norvegicus PDZ domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:93341 IMAGE:7109724), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218450786:218484545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_019280 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 5 (Gja5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218648368:218824397:1 gene:ENSRNOG00000017484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AF021806 // GenBank // Rattus norvegicus connexin 40 (GJA5) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070935 // GenBank // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 5, mRNA (cDNA clone MGC:91719 IMAGE:7097997), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M83092 // GenBank // Rat connexin 40 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218666263:218667410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT030016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT030016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_001031645 // RefSeq // Rattus norvegicus acid phosphatase 6, lysophosphatidic (Acp6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000043194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218767629:218789268:1 gene:ENSRNOG00000017494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC099131 // GenBank // Rattus norvegicus acid phosphatase 6, lysophosphatidic, mRNA (cDNA clone MGC:116276 IMAGE:7444695), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218767647:218815494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT030017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_144739 // RefSeq // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 5 (Fmo5), mRNA. // chr2 // 93 // 97 // 56 // 60 // 0 /// ENSRNOT00000024423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219274827:219301535:1 gene:ENSRNOG00000018076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// AF458413 // GenBank // Rattus norvegicus flavin-containing monooxygenase 5 (FMO5) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 97 // 56 // 60 // 0 /// BC070883 // GenBank // Rattus norvegicus flavin containing monooxygenase 5, mRNA (cDNA clone MGC:91467 IMAGE:7096939), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 57 // 57 // 0 /// GENSCAN00000045337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219275288:219301425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT030022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 62 // 62 // 0 /// NONRATT030023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 22 // 62 // 1 /// NONRATT030024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 27 // 62 // 1 /// NONRATT030025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 20 // 62 // 1
NM_022627 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, beta 2 non-catalytic subunit (Prkab2), mRNA. // chr2 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000063783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219310175:219322360:1 gene:ENSRNOG00000018166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF182717 // GenBank // Rattus norvegicus AMP-activated protein kinase beta-2 regulatory subunit (Prkab2) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC078821 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, beta 2 non-catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93432 IMAGE:7135534), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219310182:219321440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001025686 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC22 vesicle trafficking protein homolog B (S. cerevisiae) (Sec22b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219551811:219573833:1 gene:ENSRNOG00000018673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098725 // GenBank // Rattus norvegicus SEC22 vesicle trafficking protein homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112717 IMAGE:7378284), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211503 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YF03 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219551942:219571961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT030032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024358 // RefSeq // Rattus norvegicus notch 2 (Notch2), mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000025718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219662511:219793306:1 gene:ENSRNOG00000018835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// M93661 // GenBank // Rattus norvegicus NOTCH2 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000001232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219672925:219792943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001109600 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 30 (Adam30), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219804507:219807947:1 gene:ENSRNOG00000019044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219804548:219857005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054534 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:2:219814893:219814986:1 gene:ENSRNOG00000036422 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001004096 // RefSeq // Rattus norvegicus regenerating islet-derived family, member 4 (Reg4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219873827:219885388:1 gene:ENSRNOG00000019046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB164049 // GenBank // Rattus norvegicus Reg4 mRNA for regenerating islet-derived family member 4, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT030042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219872953:219885388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_173094 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2 (mitochondrial) (Hmgcs2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219928551:219954859:1 gene:ENSRNOG00000019120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078695 // GenBank // Rattus norvegicus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 2 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:93080 IMAGE:7112644), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083543 // GenBank // Rattus norvegicus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A synthase 2 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:93081 IMAGE:7132009), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M33648 // GenBank // Rat mitochondrial 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219928651:219952814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001271334 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 697 (Zfp697), mRNA. // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// XM_006233006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 697 (Zfp697), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000072189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220076470:220080662:1 gene:ENSRNOG00000049090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000074666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220048024:220052216:1 gene:ENSRNOG00000048181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000001230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220048081:220052216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000001233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220076527:220080662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
XR_344528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551975 (LOC102551975), ncRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_351876 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551975 (LOC102551975), ncRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383684 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00029 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001168641 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptophanyl tRNA synthetase 2 (mitochondrial) (Wars2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006233028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tryptophanyl tRNA synthetase 2 (mitochondrial) (Wars2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220640807:220721461:1 gene:ENSRNOG00000019508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220715203:220736748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001106451 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 15 (Tbx15), mRNA. // chr2 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220812286:220855072:1 gene:ENSRNOG00000019565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220812235:220854252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
XM_006224237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm associated antigen 17 (Spag17), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042263 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:221664088:221894465:1 gene:ENSRNOG00000037196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071938 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:221664088:221894465:1 gene:ENSRNOG00000037196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:221664809:221785290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
XM_006224237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm associated antigen 17 (Spag17), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm associated antigen 17 (Spag17), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// XM_006233035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm associated antigen 17 (Spag17), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000042263 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:221664088:221894465:1 gene:ENSRNOG00000037196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071938 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:221664088:221894465:1 gene:ENSRNOG00000037196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_351884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm associated antigen 17 (Spag17), transcript variant X6, misc_RNA. // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// GENSCAN00000032257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:221813545:221890145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
GENSCAN00000032257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:221813545:221890145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NM_001013201 // RefSeq // Rattus norvegicus ganglioside-induced differentiation-associated-protein 2 (Gdap2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:221921976:221977531:1 gene:ENSRNOG00000019754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082000 // GenBank // Rattus norvegicus ganglioside-induced differentiation-associated-protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94234 IMAGE:7131173), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ211326 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YM11 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ210007 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YF19 mRNA sequence. // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT030065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:221930587:221974587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT030066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001024244 // RefSeq // Rattus norvegicus V-set domain containing T cell activation inhibitor 1 (Vtcn1), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:222647473:222721517:1 gene:ENSRNOG00000015279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC095842 // GenBank // Rattus norvegicus V-set domain containing T cell activation inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:112685 IMAGE:7389454), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:222676377:222729782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001106453 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 45 (Trim45), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 45 (Trim45), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:222749091:222757785:1 gene:ENSRNOG00000015347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:222748924:222762457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000028956 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:223146387:223147118:1 gene:ENSRNOG00000023967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:223146563:223147069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001106455 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 3 (Igsf3), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 3 (Igsf3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:223212465:223299218:1 gene:ENSRNOG00000023851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:223259362:223295848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001106457 // RefSeq // Rattus norvegicus nescient helix loop helix 2 (Nhlh2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:223863475:223863882:1 gene:ENSRNOG00000016237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:223813325:223863882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017131 // RefSeq // Rattus norvegicus calsequestrin 2 (cardiac muscle) (Casq2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000021846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:223945611:224001892:1 gene:ENSRNOG00000016243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC072547 // GenBank // Rattus norvegicus calsequestrin 2 (cardiac muscle), mRNA (cDNA clone MGC:91724 IMAGE:7105911), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U33287 // GenBank // Rattus norvegicus calsequestrin mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// NONRATT030079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:223945763:224008806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 29 // 36 // 1
NM_001277055 // RefSeq // Rattus norvegicus nerve growth factor (beta polypeptide) (Ngf), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nerve growth factor (beta polypeptide) (Ngf), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224316241:224369656:1 gene:ENSRNOG00000016571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ232560 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YE11 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224366233:224369496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT030083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_022589 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 2 (Tspan2), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224590998:224633368:1 gene:ENSRNOG00000023338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085733 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 2, mRNA (cDNA clone MGC:93434 IMAGE:7122828), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_351902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 2 (Tspan2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// XR_351903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 2 (Tspan2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000013060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224591022:224636846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENSRNOT00000023508 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:224903013:224904003:1 gene:ENSRNOG00000017475 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 46 // 100 // 11 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224863145:224903813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001012182 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of IKBKE 1 (Sike1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224918791:224926621:1 gene:ENSRNOG00000017502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089208 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of IKK epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:105932 IMAGE:7301503), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224918882:224982341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT030088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT030089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000037907 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:224934862:224935324:1 gene:ENSRNOG00000028529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000038607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224918882:224982341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0
NM_054006 // RefSeq // Rattus norvegicus cold shock domain containing E1, RNA binding (Csde1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000041529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224955792:224983578:1 gene:ENSRNOG00000030302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000072378 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:39162885:39165281:1 gene:ENSRNOG00000046533 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT030096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39111587:39165281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 89 // 34 // 38 // 1 /// GENSCAN00000038607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224918882:224982341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// NONRATT030092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT030094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
XM_006233059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuroblastoma ras oncogene (Nras), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NM_080766 // RefSeq // Rattus norvegicus neuroblastoma ras oncogene (Nras), mRNA. // chr2 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// ENSRNOT00000039572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224983750:224991378:1 gene:ENSRNOG00000023079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// BC098659 // GenBank // Rattus norvegicus neuroblastoma ras oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:112605 IMAGE:7368145), complete cds. // chr2 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// NONRATT030097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NM_138876 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 1 (Ampd1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224999611:225020451:1 gene:ENSRNOG00000018656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// J02811 // GenBank // Rattus norvegicus myoadenylate deaminase (AMP deaminase) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225003065:225020432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001191569 // RefSeq // Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 2C (Dennd2c), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006233071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 2C (Dennd2c), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225047710:225090476:1 gene:ENSRNOG00000018716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225052105:225088754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001106458 // RefSeq // Rattus norvegicus breast carcinoma amplified sequence 2 (Bcas2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225092498:225100379:1 gene:ENSRNOG00000018783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC169122 // GenBank // Rattus norvegicus breast carcinoma amplified sequence 2, mRNA (cDNA clone MGC:189566 IMAGE:6918597), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225092515:225144659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
ENSRNOT00000044832 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:225126568:225129365:1 gene:ENSRNOG00000037161 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006227488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamic acid-rich protein-like (LOC102551064), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006257309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamic acid-rich protein-like (LOC102551064), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000043861 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:110381821:110382555:1 gene:ENSRNOG00000037611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 100 // 39 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000056084 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:225144132:225144659:1 gene:ENSRNOG00000037159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000013261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:110282825:110427331:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 100 // 39 // 44 // 0 /// GENSCAN00000038602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225092515:225144659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0
ENSRNOT00000025600 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:225244514:225287933:1 gene:ENSRNOG00000018946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 85 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000025633 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:225244514:225287933:1 gene:ENSRNOG00000018946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// FQ227983 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YP06 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000004924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225169685:225313970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT030105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1
NM_022191 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin VI (Syt6), mRNA. // chr2 // 90 // 85 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225492365:225553606:1 gene:ENSRNOG00000019163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC099185 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin VI, mRNA (cDNA clone MGC:116356 IMAGE:7383303), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// U20105 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin VI mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 85 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225492514:225504781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT030108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT030109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// GENSCAN00000004933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225536773:225578243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT030110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT030111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_001107709 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 4, beta 1 subunit (Ap4b1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225717430:225729412:1 gene:ENSRNOG00000019455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225717830:225742949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001106459 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-like 15 (Bcl2l15), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225737923:225743042:1 gene:ENSRNOG00000037149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225717830:225742949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT030117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106460 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22 (lymphoid) (Ptpn22), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006233072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22 (lymphoid) (Ptpn22), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000026556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225765776:225814130:1 gene:ENSRNOG00000019614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000056867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225793764:225812832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT030120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0
NM_001191710 // RefSeq // Rattus norvegicus round spermatid basic protein 1 (Rsbn1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225815982:225875478:1 gene:ENSRNOG00000019671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225826236:225871462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT030122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001191102 // RefSeq // Rattus norvegicus putative homeodomain transcription factor 1 (Phtf1), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative homeodomain transcription factor 1 (Phtf1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225878015:225916843:1 gene:ENSRNOG00000019785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000056870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225891898:225916957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1 /// NONRATT030124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT030126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
XM_001068311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S acidic ribosomal protein P0-like (RGD1564469), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000040909 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:226325556:226326771:1 gene:ENSRNOG00000031358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226325934:226326701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_012716 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16 (monocarboxylate transporter), member 1 (Slc16a1), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000027234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226529274:226550086:1 gene:ENSRNOG00000019996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078877 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 1 (monocarboxylic acid transporter 1), mRNA (cDNA clone MGC:93557 IMAGE:7122399), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// D63834 // GenBank // Rattus norvegicus MCT1 mRNA for monocarboxylate transporter, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226540137:226548485:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT030131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001005540 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1J (Ppm1j), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226682751:226687760:1 gene:ENSRNOG00000012481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC082053 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1J, mRNA (cDNA clone MGC:95205 IMAGE:7132147), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226682755:226696753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106461 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member C (Rhoc), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006233074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras homolog family member C (Rhoc), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226691039:226697174:1 gene:ENSRNOG00000012630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC166849 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:188745 IMAGE:9088252), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ220094 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YD15 mRNA sequence. // chr2 // 58 // 96 // 14 // 24 // 0 /// FQ221526 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA35YA16 mRNA sequence. // chr2 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// NONRATT030138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226682755:226696753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001007639 // RefSeq // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 7-like (St7l), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226767139:226835168:1 gene:ENSRNOG00000014002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC079194 // GenBank // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 7-like, mRNA (cDNA clone MGC:94245 IMAGE:7131380), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// FQ214196 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YE18 mRNA sequence. // chr2 // 60 // 39 // 9 // 15 // 0 /// NONRATT030141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT030142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// NONRATT030143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
ENSRNOT00000019383 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:226896171:226900002:1 gene:ENSRNOG00000014451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 79 // 11 // 15 // 0
NM_001107713 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 212, member B (Fam212b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233089 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 212, member B (Fam212b), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000021001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227591605:227606918:1 gene:ENSRNOG00000015691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227597972:227604610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006233105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein ADORA3, isoform 3-like (LOC100911347), mRNA. // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// XM_006224239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Adora3 protein-like (LOC100363178), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// XM_006233111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Adora3 protein-like (LOC100363178), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// BC097395 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine A3 receptor, mRNA (cDNA clone MGC:114438 IMAGE:7453330), complete cds. // chr2 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000021288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227962577:227978570:1 gene:ENSRNOG00000043375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000075256 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:227743783:227820823:1 gene:ENSRNOG00000048272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227804650:227815087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000028106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227964480:227972452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_012896 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine A3 receptor (Adora3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006233068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine A3 receptor (Adora3), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000021236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227952342:227955984:1 gene:ENSRNOG00000015788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000050538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227793055:227796413:1 gene:ENSRNOG00000050743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// DQ075463 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine A3 receptor (Adora3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// M94152 // GenBank // Rat adenosine receptor (A3) mRNA, 5 end. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001008771 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 77 (Wdr77), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227998604:228008465:1 gene:ENSRNOG00000016394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000073644 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:227841704:227850866:1 gene:ENSRNOG00000046022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC097367 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 77, mRNA (cDNA clone MGC:114400 IMAGE:7443204), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ213175 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YE20 mRNA sequence. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227998604:228007572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227841895:227850866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_207586 // RefSeq // Rattus norvegicus chitinase, acidic (Chia), mRNA. // chr2 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000041562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228174327:228221354:1 gene:ENSRNOG00000033162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// AY486074 // GenBank // Rattus norvegicus chitinase precursor-like mRNA, complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// KC529649 // GenBank // Rattus norvegicus small acid mammalian chitinase mRNA, complete cds. // chr2 // 86 // 90 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228174327:228291792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT030152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENSRNOT00000055966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228318098:228351640:1 gene:ENSRNOG00000037115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// JF781276 // GenBank // Rattus norvegicus strain Wistar chitinase-like protein mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228318115:228376798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
NM_001107714 // RefSeq // Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 2D (Dennd2d), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006233114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 2D (Dennd2d), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228507586:228526624:1 gene:ENSRNOG00000017680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC158880 // GenBank // Rattus norvegicus DENN/MADD domain containing 2D, mRNA (cDNA clone MGC:188574 IMAGE:7936253), complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT030153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228510648:228597198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001025018 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA-damage regulated autophagy modulator 2 (Dram2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228569725:228597446:1 gene:ENSRNOG00000017744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091251 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 77, mRNA (cDNA clone MGC:109061 IMAGE:7372838), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ210299 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA30YL19 mRNA sequence. // chr2 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// FQ225720 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YB04 mRNA sequence. // chr2 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0 /// FQ228782 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YN05 mRNA sequence. // chr2 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// NONRATT030154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT030157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT030158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT030160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228510648:228597198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT030159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001127485 // RefSeq // Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 (Lrif1), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228900177:228915197:1 gene:ENSRNOG00000017784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 (Lrif1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// XM_006233149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1 (Lrif1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// BC092366 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7319656, with apparent retained intron. // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// BC158797 // GenBank // Rattus norvegicus similar to receptor-interacting factor 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7314764), complete cds. // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000009321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228832218:228914429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_019270 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 3 (Kcna3), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000024372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229233084:229234661:1 gene:ENSRNOG00000018116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229180577:229234661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT030165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_012970 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 2 (Kcna2), mRNA. // chr2 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229304210:229308358:1 gene:ENSRNOG00000018285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// J04731 // GenBank // Rat potassium channel protein (BK2) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// M74449 // GenBank // Rat cardiac delayed rectifier potassium channel protein (RAK) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT030166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229269259:229351403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001191713 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 10 (Kcna10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024600 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:229404139:229405674:1 gene:ENSRNOG00000018283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000074358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229384766:229396841:1 gene:ENSRNOG00000050416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229404163:229405674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229395187:229396698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000016694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229448900:229538289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_001106462 // RefSeq // Rattus norvegicus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 5 (Lamtor5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229503095:229508451:1 gene:ENSRNOG00000018186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1
NM_001013913 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 4 (Slc16a4), mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000024455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229514270:229537396:1 gene:ENSRNOG00000018131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// BC085920 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 4 (monocarboxylic acid transporter 5), mRNA (cDNA clone MGC:94829 IMAGE:7108742), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// XM_006233138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 16, member 4 (Slc16a4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 72 // 72 // 34 // 47 // 1 /// NONRATT030172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000016694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229448900:229538289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 33 // 47 // 1 /// NONRATT030173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 22 // 47 // 1
NM_001007012 // RefSeq // Rattus norvegicus ALX homeobox 3 (Alx3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229848434:229853533:1 gene:ENSRNOG00000018290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY488087 // GenBank // Rattus norvegicus aristaless-related ALX3 (Alx3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229784898:229852750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106463 // RefSeq // Rattus norvegicus EPS8-like 3 (Eps8l3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006233125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor kinase substrate 8-like protein 3-like (LOC100912384), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228680032:228693425:1 gene:ENSRNOG00000049290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230137370:230150763:1 gene:ENSRNOG00000048209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228677913:228703298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230097175:230150434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_172038 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, mu 5 (Gstm5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230154305:230157100:1 gene:ENSRNOG00000049743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228696967:228699762:1 gene:ENSRNOG00000047034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U86635 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione s-transferase M5 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228677913:228703298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230154305:230157100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108950 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha transducing activity polypeptide 2 (Gnat2), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230349648:230359129:1 gene:ENSRNOG00000019296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230349837:230358750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT030178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_206881 // RefSeq // Rattus norvegicus adhesion molecule with Ig like domain 1 (Amigo1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230446904:230451545:1 gene:ENSRNOG00000045665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY237729 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein AMIGO (Amigo) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC167749 // GenBank // Rattus norvegicus adhesion molecule with Ig like domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:187296 IMAGE:9021924), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230446948:230448429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017282 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 5 (Psma5), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230519705:230543036:1 gene:ENSRNOG00000019868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC060575 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, alpha type 5, mRNA (cDNA clone MGC:72877 IMAGE:6920479), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000036006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230519808:230624693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 83 // 20 // 24 // 1
NM_031767 // RefSeq // Rattus norvegicus sortilin 1 (Sort1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000049127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230547671:230637210:1 gene:ENSRNOG00000031814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000036006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230519808:230624693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT030190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// NONRATT030186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1 /// NONRATT030189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT030192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001014042 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin binding protein H-like (Mybphl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230629249:230643000:1 gene:ENSRNOG00000037082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087113 // GenBank // Rattus norvegicus myosin binding protein H-like, mRNA (cDNA clone MGC:94735 IMAGE:7193587), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230629368:230650192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001044302 // RefSeq // Rattus norvegicus proline/serine-rich coiled-coil 1 (Psrc1), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline/serine-rich coiled-coil 1 (Psrc1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline/serine-rich coiled-coil 1 (Psrc1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230646557:230650999:1 gene:ENSRNOG00000020013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC105874 // GenBank // Rattus norvegicus proline/serine-rich coiled-coil 1, mRNA (cDNA clone MGC:125042 IMAGE:7131142), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT030196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000035995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230629368:230650192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001134578 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG5435-PA (RGD1309139), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230789966:230802122:1 gene:ENSRNOG00000020307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230783181:230800648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT030198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001145273 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to cytochrome c oxidase, subunit VIb polypeptide 1 (LOC688869), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// XM_006228795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to cytochrome c oxidase, subunit VIb polypeptide 1 (LOC688869), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000032026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90230830:90238903:-1 gene:ENSRNOG00000024309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000045155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230806987:230807459:1 gene:ENSRNOG00000034161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// FQ222745 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YH17 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// FQ224063 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA78YA01 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// GENSCAN00000010843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90206841:90249073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 69 // 27 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230807066:230807326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT004975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 85 // 100 // 41 // 48 // 0 /// NONRATT004976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 85 // 100 // 41 // 48 // 0 /// NONRATT004977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 17 // 48 // 1
NM_001107716 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230830656:230841317:1 gene:ENSRNOG00000020315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC166866 // GenBank // Rattus norvegicus TAF13 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:188782 IMAGE:8369659), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// FQ214817 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YO01 mRNA sequence. // chr2 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0 /// NONRATT030200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
NM_001100702 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 47 (Wdr47), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230852232:230914750:1 gene:ENSRNOG00000020330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT030203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230866879:230950951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT030207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001044303 // RefSeq // Rattus norvegicus AKNA domain containing 1 (Aknad1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NR_073134 // RefSeq // Rattus norvegicus AKNA domain containing 1 (Aknad1), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr2 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000033443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231019511:231048982:1 gene:ENSRNOG00000028025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231023227:231029570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT030211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231034819:231057564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1
NM_001109640 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 54 (Slc25a54), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XR_351945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 54 (Slc25a54), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000038315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231351270:231396651:1 gene:ENSRNOG00000027522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006233185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 54 (Slc25a54), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000046234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231350251:231355615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT030214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231362288:231540096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001127544 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 24 (Slc25a24), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231401404:231438472:1 gene:ENSRNOG00000020470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC162022 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 24, mRNA (cDNA clone MGC:187901 IMAGE:9098607), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ221591 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA34YC01 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231362288:231540096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001127544 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 24 (Slc25a24), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231401404:231438472:1 gene:ENSRNOG00000020470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC162022 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, phosphate carrier), member 24, mRNA (cDNA clone MGC:187901 IMAGE:9098607), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221591 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA34YC01 mRNA sequence. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231362288:231540096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT030215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191714 // RefSeq // Rattus norvegicus vav 3 guanine nucleotide exchange factor (Vav3), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231716228:232053965:1 gene:ENSRNOG00000020485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231860606:231898475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT030216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000046960 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:231903718:231905182:1 gene:ENSRNOG00000030847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000041972 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:233558829:233559273:-1 gene:ENSRNOG00000031690 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:233552810:233559273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
AY539949 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00198 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:234162173:234379650:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000037677 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:245087105:245087960:1 gene:ENSRNOG00000021621 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 77 // 96 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:245087342:245087896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
XM_006224250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation regulator 1-like (LOC691530), mRNA. // chr2 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// XM_006233258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation regulator 1-like (LOC691530), mRNA. // chr2 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023228 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:245833016:245836160:1 gene:ENSRNOG00000017232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 96 // 19 // 25 // 0
NM_013117 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XI, alpha 1 (Col11a1), mRNA. // chr2 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000023693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:234955506:235148332:1 gene:ENSRNOG00000023148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 66 // 66 // 0 /// ENSRNOT00000023794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:234955506:235148332:1 gene:ENSRNOG00000023148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000024138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:234955506:235148332:1 gene:ENSRNOG00000023148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 66 // 66 // 0 /// ENSRNOT00000068413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:234955506:235148332:1 gene:ENSRNOG00000023148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// U20121 // GenBank // Rattus norvegicus type XI collagen alpha-1 chain (COL11A1) mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 21 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000056770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:234914184:235143224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT030218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 13 // 13 // 9 // 68 // 1 /// NONRATT030220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 12 // 12 // 8 // 68 // 1 /// NONRATT030222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 19 // 19 // 13 // 68 // 1
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT019716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 94 // 9 // 31 // 0 /// NONRATT019719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 94 // 9 // 31 // 0 /// NONRATT019720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 94 // 9 // 31 // 0
NM_145777 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactomedin 3 (Olfm3), mRNA. // chr2 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:236054946:236097056:1 gene:ENSRNOG00000017969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF442822 // GenBank // Rattus norvegicus optimedin form B mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr2 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AF442823 // GenBank // Rattus norvegicus optimedin form A mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr2 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:236055039:236094679:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001017449 // RefSeq // Rattus norvegicus diphthamide biosynthesis 5 (Dph5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006233214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diphthamide biosynthesis 5 (Dph5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:236920286:236953013:1 gene:ENSRNOG00000013719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC092598 // GenBank // Rattus norvegicus DPH5 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109155 IMAGE:7321341), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT030228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT030230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:236853940:236952639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_001100704 // RefSeq // Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 2 (Extl2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 2 (Extl2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 2 (Extl2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 2 (Extl2), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237037494:237057929:1 gene:ENSRNOG00000014323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091373 // GenBank // Rattus norvegicus exostoses (multiple)-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7320122), partial cds. // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC162014 // GenBank // Rattus norvegicus exostoses (multiple)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:187885 IMAGE:9091843), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237035878:237134675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_053312 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrolipoamide branched chain transacylase E2 (Dbt), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237625212:237654081:-1 gene:ENSRNOG00000015029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC101904 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrolipoamide branched chain transacylase E2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7934200). // chr2 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC166487 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrolipoamide branched chain transacylase E2, mRNA (cDNA clone MGC:187991 IMAGE:7103882), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237641009:237654063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237626896:237634820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001109637 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 39 (Lrrc39), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237599876:237619700:-1 gene:ENSRNOG00000015117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237603510:237617131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT032207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001107719 // RefSeq // Rattus norvegicus spindle assembly 6 homolog (C. elegans) (Sass6), mRNA. // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237565447:237588679:-1 gene:ENSRNOG00000015211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020757 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:71220027:71232105:-1 gene:ENSRNOG00000046153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237559337:237575059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 56 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71220031:71244392:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 53 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT032202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
XM_006224297 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ferric-chelate reductase 1 (Frrs1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006233233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ferric-chelate reductase 1 (Frrs1), mRNA. // chrU // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021988 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:238494314:238531241:1 gene:ENSRNOG00000016351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// FQ210266 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA31YE08 mRNA sequence. // chrU // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:238423057:238541406:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001107720 // RefSeq // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphatase-related protein type 5 (Lppr5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237965738:238169325:-1 gene:ENSRNOG00000016878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU792473 // GenBank // Rattus norvegicus plasticity-related protein 5 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:238024368:238120978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237976286:237995095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT032211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT032212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NR_031883 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 137 (Mir137), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053614 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:239707763:239707864:1 gene:ENSRNOG00000035491 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-137 // miRBase Micro RNA Database // MI0000910 Rattus norvegicus miR-137 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT030261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_031027 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydropyrimidine dehydrogenase (Dpyd), mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// D85035 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for dihydropyrimidine dehydrogenase, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000055723 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:240215937:240744042:1 gene:ENSRNOG00000017105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072735 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:239910910:240089776:1 gene:ENSRNOG00000049685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000018844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:240041612:240128546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT030265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// GENSCAN00000021245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:240139434:240336091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// NONRATT030262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1 /// NONRATT030264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
XM_006224251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L7a-like (LOC102554310), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L7a-like (LOC102554310), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055716 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:242881170:242881947:1 gene:ENSRNOG00000037019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:242881352:242906431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001014176 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG14, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit (Alg14), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:242894212:242970804:1 gene:ENSRNOG00000011528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079151 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 14 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94171 IMAGE:7128610), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XR_351979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ALG14, UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit (Alg14), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT030267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:242881352:242906431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT030268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_019359 // RefSeq // Rattus norvegicus calponin 3, acidic (Cnn3), mRNA. // chr2 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:243044080:243075190:1 gene:ENSRNOG00000011559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC062020 // GenBank // Rattus norvegicus calponin 3, acidic, mRNA (cDNA clone MGC:72485 IMAGE:5623281), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// FQ228936 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YG08 mRNA sequence. // chr2 // 89 // 53 // 16 // 18 // 0 /// U06755 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley acidic calponin mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243044311:243074483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_013057 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor III (thromboplastin, tissue factor) (F3), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:243348430:243360438:1 gene:ENSRNOG00000011800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081846 // GenBank // Rattus norvegicus coagulation factor III (thromboplastin, tissue factor), mRNA (cDNA clone MGC:93621 IMAGE:7096602), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// U07619 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley tissue factor protein mRNA, complete cds. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243348538:243359905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT030276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001009405 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 29 (Arhgap29), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:243589277:243648767:1 gene:ENSRNOG00000012563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:243589277:243648767:1 gene:ENSRNOG00000012563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087167 // GenBank // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 29, mRNA (cDNA clone MGC:95332 IMAGE:7135494), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243586174:243628652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000054031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243636715:243648738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT030279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107721 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 4 (Abca4), mRNA. // chr2 // 98 // 98 // 48 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000017878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:243682340:243818929:1 gene:ENSRNOG00000012892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 98 // 48 // 49 // 0 /// GENSCAN00000054029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243687541:243821385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT030281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0
NM_017305 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate cysteine ligase, modifier subunit (Gclm), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:243862903:243883273:1 gene:ENSRNOG00000013409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078867 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate cysteine ligase, modifier subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93533 IMAGE:7110139), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L22191 // GenBank // Rat gamma-glutamylcysteine synthetase light subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243863025:243882734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
XM_003749386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxynucleotidyltransferase terminal-interacting protein 2-like (LOC100910753), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// XM_006224298 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxynucleotidyltransferase terminal-interacting protein 2-like (LOC100910753), mRNA. // chr2 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036931 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:243890081:243901563:1 gene:ENSRNOG00000025025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243890081:243901563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_001107722 // RefSeq // Rattus norvegicus breast cancer anti-estrogen resistance 3 (Bcar3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006233270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus breast cancer anti-estrogen resistance 3 (Bcar3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:245929016:246041116:1 gene:ENSRNOG00000013737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000057929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246006893:246046727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_133584 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 5A, cGMP-specific (Pde5a), mRNA. // chr2 // 90 // 95 // 38 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000019638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246262030:246402956:1 gene:ENSRNOG00000014443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// D89093 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cGMP-binding cGMP-specific phosphodiesterase, complete cds. // chr2 // 90 // 95 // 38 // 42 // 0 /// U76032 // GenBank // Rattus norvegicus cGMP-specific phosphodiesterase (PDE5) mRNA, partial cds. // chr2 // 67 // 27 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000008844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246287021:246328462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT030294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT030296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1
NM_013068 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 2, intestinal (Fabp2), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246442292:246445034:1 gene:ENSRNOG00000024947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// M35992 // GenBank // Rat intestinal fatty acid binding protein (FABP) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246442304:246444881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0 /// NONRATT030298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001271116 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691807 (LOC691807), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019647 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:246456867:246458626:1 gene:ENSRNOG00000014654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000064809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246849788:246919956:1 gene:ENSRNOG00000014872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// BC168946 // GenBank // Rattus norvegicus SEC24 family, member D (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189252 IMAGE:8366565), complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246866042:246919279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT030303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT030304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 70 // 70 // 31 // 44 // 1 /// GENSCAN00000031760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246823482:246854736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
ENSRNOT00000043960 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06109522.1:1747:2094:1 gene:ENSRNOG00000029764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000031748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246991437:247013668:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046513 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109522.1:1747:2094:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 39 // 11 // 11 // 0
NM_053504 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 12 neurotrypsin (motopsin) (Prss12), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:247015139:247074636:1 gene:ENSRNOG00000015353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:247015321:247074605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001107724 // RefSeq // Rattus norvegicus translocation associated membrane protein 1-like 1 (Tram1l1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:247895258:247897439:1 gene:ENSRNOG00000009835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:247895383:247896474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000012852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:166368101:166368495:-1 gene:ENSRNOG00000009697 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:166253993:166368495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0
NM_001191849 // RefSeq // Rattus norvegicus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 4 (Ndst4), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:248551066:248852063:1 gene:ENSRNOG00000009577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:248673609:248730157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000032826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:248777472:248842083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NONRATT030310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 50 // 9 // 9 // 0
NM_001047887 // RefSeq // Rattus norvegicus arylsulfatase family, member J (Arsj), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:249516525:250013503:1 gene:ENSRNOG00000000001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
XM_006233293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC310880 (RGD1305834), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:251227779:251289021:1 gene:ENSRNOG00000036980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// FQ230908 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA80YJ17 mRNA sequence. // chr2 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000024853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251227136:251289021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
XM_006233293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC310880 (RGD1305834), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000014695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:251227779:251289021:1 gene:ENSRNOG00000036980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251227136:251289021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0
ENSRNOT00000014570 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:251308041:251308832:1 gene:ENSRNOG00000010972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// XM_001076231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurogenin 2 (Neurog2), mRNA. // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XM_227716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurogenin 2 (Neurog2), mRNA. // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251308041:251308832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
NM_001014044 // RefSeq // Rattus norvegicus TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (Tifa), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (Tifa), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (Tifa), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// XM_006233289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (Tifa), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// XM_006233290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain (Tifa), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:251473156:251481591:1 gene:ENSRNOG00000010941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// BC083765 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain, mRNA (cDNA clone MGC:94710 IMAGE:7193165), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325204 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-389 mRNA, complete cds. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT030325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251465456:251480927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001042505 // RefSeq // Rattus norvegicus paired-like homeodomain 2 (Pitx2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:252943162:252948179:1 gene:ENSRNOG00000010681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// AF039832 // GenBank // Rattus norvegicus homeobox protein (rPtx2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// AJ222971 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for homeodomain protein Ptx2A. // chr2 // 96 // 63 // 24 // 25 // 0 /// AJ222972 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for homeodomain protein Ptx2B. // chr2 // 90 // 73 // 26 // 29 // 0 /// NM_019334 // RefSeq // Rattus norvegicus paired-like homeodomain 2 (Pitx2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000044232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:252929150:252948179:1 gene:ENSRNOG00000010681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// NONRATT030327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT030328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:252904784:252965668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1
ENSRNOT00000075156 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:253425533:253431253:1 gene:ENSRNOG00000047744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 86 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000012774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253430927:253431253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253200352:253200678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253425942:253426268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
NR_033150 // RefSeq // Rattus norvegicus Dcm5 protein (Dcm5), long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:253619349:253620108:1 gene:ENSRNOG00000048400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:253231761:253232520:1 gene:ENSRNOG00000048459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF412817 // GenBank // Rattus norvegicus DCM5 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
GENSCAN00000012780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253278510:253278815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000053957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253803930:253890491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000053958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253669271:253669576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
NM_134383 // RefSeq // Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 6 (Elovl6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:253511329:253616508:-1 gene:ENSRNOG00000010468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000071270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:253695766:253803592:1 gene:ENSRNOG00000048949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB071986 // GenBank // Rattus norvegicus rELO2 mRNA for fatty acid elongase 2, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253771092:253801984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253468314:253542227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_024157 // RefSeq // Rattus norvegicus complement factor I (Cfi), mRNA. // chr2 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// BC089798 // GenBank // Rattus norvegicus complement factor I, mRNA (cDNA clone MGC:108679 IMAGE:7321559), complete cds. // chr2 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// ENSRNOT00000034706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:74628926:74634495:-1 gene:ENSRNOG00000023599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 43 // 76 // 1 /// GENSCAN00000031910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:74629117:74658199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 67 // 67 // 0 /// NONRATT031029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 28 // 76 // 1 /// NONRATT031030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 34 // 76 // 1
NM_001108565 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group XIIA (Pla2g12a), mRNA. // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006232005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group XIIA (Pla2g12a), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000067347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:74606742:74622974:-1 gene:ENSRNOG00000009864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC159417 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A2, group XIIA, mRNA (cDNA clone MGC:188702 IMAGE:8369728), complete cds. // chr2 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// XM_006232004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group XIIA (Pla2g12a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT031025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 82 // 44 // 9 // 11 // 0 /// NONRATT031026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT031027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:74607588:74622898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001271984 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 6 (Casp6), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_031775 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 6 (Casp6), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:249539675:249551881:1 gene:ENSRNOG00000009508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF025670 // GenBank // Rattus norvegicus caspase 6 (Mch2) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC078785 // GenBank // Rattus norvegicus caspase 6, mRNA (cDNA clone MGC:93335 IMAGE:7123179), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:249493896:249551505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT030313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
XM_006224256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XXV, alpha 1 (Col25a1), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006224257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XXV, alpha 1 (Col25a1), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XXV, alpha 1 (Col25a1), mRNA. // chrU // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000071463 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:254151921:254261761:1 gene:ENSRNOG00000050706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000074816 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:254151921:254267154:1 gene:ENSRNOG00000050706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000075728 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:254151921:254261761:1 gene:ENSRNOG00000050706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_130429 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphoid enhancer binding factor 1 (Lef1), mRNA. // chr2 // 88 // 89 // 28 // 32 // 0 /// XM_006233307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphoid enhancer binding factor 1 (Lef1), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// XM_006233309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphoid enhancer binding factor 1 (Lef1), transcript variant X8, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000013694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:254782387:254876426:1 gene:ENSRNOG00000010121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:254782387:254786576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT030332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000055341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:254856821:254903104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT030336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001106471 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 1 (Papss1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:255150454:255224840:1 gene:ENSRNOG00000011311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166793 // GenBank // Rattus norvegicus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:188588 IMAGE:7937610), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT030339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:255150517:255209191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT030340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001106472 // RefSeq // Rattus norvegicus dickkopf WNT signaling pathway inhibitor 2 (Dkk2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:255689579:255781478:1 gene:ENSRNOG00000011360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:255756294:255779914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT030341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001134513 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain containing kinase (Tbck), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:256292173:256497625:1 gene:ENSRNOG00000011454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:256296220:256393018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001007640 // RefSeq // Rattus norvegicus integrator complex subunit 12 (Ints12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 12 (Ints12), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:256790319:256807886:1 gene:ENSRNOG00000011844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079404 // GenBank // Rattus norvegicus integrator complex subunit 12, mRNA (cDNA clone MGC:94937 IMAGE:7112817), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212179 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA66YK02 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:256794404:256806351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001135871 // RefSeq // Rattus norvegicus pyrophosphatase (inorganic) 2 (Ppa2), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:257065673:257142749:1 gene:ENSRNOG00000012091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:257113420:257138867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 38 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT030350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NONRATT030354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000009297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:257403036:257404011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_053342 // RefSeq // Rattus norvegicus CXXC finger protein 4 (Cxxc4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CXXC finger protein 4 (Cxxc4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// XM_006233342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CXXC finger protein 4 (Cxxc4), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000072196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:257941014:257965727:1 gene:ENSRNOG00000045764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF272158 // GenBank // Rattus norvegicus Dvl-binding protein Idax mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:257944147:257987694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT030357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017053 // RefSeq // Rattus norvegicus tachykinin receptor 3 (Tacr3), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:258547661:258644112:1 gene:ENSRNOG00000009372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// J05189 // GenBank // Rat neuromedin K receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT030358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:258576366:258591668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_006224269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein E (Cenpe), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// XM_006233352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein E (Cenpe), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000034565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:258915943:258973999:1 gene:ENSRNOG00000009339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000021151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:258890425:258996752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0
NM_001106473 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxybutyrate dehydrogenase, type 2 (Bdh2), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:258981008:259001648:1 gene:ENSRNOG00000014490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC095848 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7389160. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:258890425:258996752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT030366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001109385 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily B (NHA2, cation proton antiporter 2), member 2 (Slc9b2), mRNA. // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// XM_006233332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily B (NHA2, cation proton antiporter 2), member 2 (Slc9b2), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000031425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259014874:259040106:1 gene:ENSRNOG00000023404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// BC166815 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG10806-PB, isoform B, mRNA (cDNA clone MGC:188667 IMAGE:7460062), complete cds. // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NM_001173973 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily B (NHA1, cation proton antiporter 1), member 1 (Slc9b1), mRNA. // chr2 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// XM_006233330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily B (NHA2, cation proton antiporter 2), member 2 (Slc9b2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000031348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259048088:259097137:1 gene:ENSRNOG00000042985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000021122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259014927:259039823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000021136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259043776:259096957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT030367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT030369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001031655 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, beta A, lysosomal (Manba), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259210951:259317116:1 gene:ENSRNOG00000013476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259284934:259317116:1 gene:ENSRNOG00000013476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// BC099094 // GenBank // Rattus norvegicus mannosidase, beta A, lysosomal, mRNA (cDNA clone MGC:116230 IMAGE:7458970), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC111710 // GenBank // Rattus norvegicus mannosidase, beta A, lysosomal, mRNA (cDNA clone MGC:125196 IMAGE:7383173), complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259293624:259316117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT030380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259187126:259289414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT030381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSRNOT00000052249 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:259549812:259550553:1 gene:ENSRNOG00000030563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 79 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000041770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259491169:259550553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001011952 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 8 (Slc39a8), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259585229:259647901:1 gene:ENSRNOG00000012508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC089844 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (metal ion transporter), member 8, mRNA (cDNA clone MGC:108852 IMAGE:7368889), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259607635:259628587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT030383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_017041 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 3, catalytic subunit, alpha isozyme (Ppp3ca), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000047975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:260462929:260735288:1 gene:ENSRNOG00000009882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// D90035 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for calcineurin A alpha, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ212355 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YN21 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M29275 // GenBank // Rat calcineurin A mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// X57115 // GenBank // Rat mRNA for calcineurin A. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000009928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:260664399:260734734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000012189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:260562104:260601576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000009921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:260765371:260795676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
ENSRNOT00000054533 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:2:261007366:261007461:1 gene:ENSRNOG00000036421 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001004228 // RefSeq // Rattus norvegicus endomucin (Emcn), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261184360:261264293:1 gene:ENSRNOG00000022910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079155 // GenBank // Rattus norvegicus endomucin, mRNA (cDNA clone MGC:94175 IMAGE:7128709), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT030390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261184451:261292932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT030391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_080399 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA-damage-inducible transcript 4-like (Ddit4l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 87 // 87 // 0 /// XM_003753664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA-damage-inducible transcript 4-like protein-like (LOC100363484), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 87 // 87 // 0 /// ENSRNOT00000013661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261430991:261433647:1 gene:ENSRNOG00000010047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 87 // 87 // 0 /// AF327511 // GenBank // Rattus norvegicus SMHS1 (Smhs1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 87 // 87 // 0 /// NONRATT030393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 87 // 87 // 0 /// GENSCAN00000020815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261402805:261433586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 61 // 87 // 1 /// BC059119 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6920122, partial cds. // chr2 // 23 // 23 // 20 // 87 // 1 /// NONRATT030394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 23 // 23 // 20 // 87 // 1
NM_001109193 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 14 (Dnajb14), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006233389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 14 (Dnajb14), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261656714:261699682:1 gene:ENSRNOG00000010487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261656714:261720395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT030402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT030399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT030400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT030401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001008375 // RefSeq // Rattus norvegicus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 3 (Lamtor3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261708666:261721119:1 gene:ENSRNOG00000010552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC086353 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase 1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:106009 IMAGE:7304027), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT030407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT030408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT030409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// NONRATT030410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 90 // 90 // 28 // 31 // 1 /// GENSCAN00000011540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261656714:261720395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
GENSCAN00000011539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261878752:261884354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001044232 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 10 homolog A (S. cerevisiae) (Trmt10a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006233367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 10 homolog A (S. cerevisiae) (Trmt10a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233368 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 10 homolog A (S. cerevisiae) (Trmt10a), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261963880:261977434:1 gene:ENSRNOG00000011025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC099190 // GenBank // Rattus norvegicus RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:116361 IMAGE:7383412), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ232089 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YA21 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261967612:261976947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT030421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT030423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_134329 // RefSeq // Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 7 (class IV), mu or sigma polypeptide (Adh7), mRNA. // chr2 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:262043116:262057569:1 gene:ENSRNOG00000032959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262043029:262063990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_019286 // RefSeq // Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 1 (class I) (Adh1), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:262090879:262102977:1 gene:ENSRNOG00000012464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC062403 // GenBank // Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 1 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:72255 IMAGE:5621394), complete cds. // chr2 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// M15327 // GenBank // Rat alcohol dehydrogenase (ADH) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF508795 // GenBank // Rattus norvegicus ADH-like protein mRNA, complete cds. // chr2 // 74 // 96 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262090216:262101633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001106475 // RefSeq // Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 6A (class V) (Adh6a), mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:262130090:262138056:1 gene:ENSRNOG00000012281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262107180:262144943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001012084 // RefSeq // Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 6 (class V) (Adh6), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 6 (class V) (Adh6), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 6 (class V) (Adh6), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 6 (class V) (Adh6), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XR_352059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 6 (class V) (Adh6), transcript variant X9, misc_RNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:262193376:262224625:1 gene:ENSRNOG00000012436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC083792 // GenBank // Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase 6 (class V), mRNA (cDNA clone MGC:94781 IMAGE:7106499), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262172042:262275698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_001004090 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 5 (Tspan5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:262587481:262753104:1 gene:ENSRNOG00000015913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF540877 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin-5 (Tspan5) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC100135 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 5, mRNA (cDNA clone MGC:114212 IMAGE:7315329), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262713501:262752953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT030446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001100993 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm-tail PG-rich repeat containing 2 (Stpg2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:263050120:263576773:1 gene:ENSRNOG00000023457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:263035902:263091719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000013934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:263137060:263226676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000054532 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:2:263668495:263668602:1 gene:ENSRNOG00000036420 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_199407 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-5 homolog C (C. elegans) (Unc5c), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000050330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:265573556:265919845:1 gene:ENSRNOG00000029071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AB118026 // GenBank // Rattus norvegicus Unc5h3 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT030451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000027005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:265747951:265911461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_001108569 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate binding protein 5 (Gbp5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:266707528:266725950:1 gene:ENSRNOG00000032240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266710950:266801020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000037181 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:266748515:266769711:1 gene:ENSRNOG00000029191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// FQ221477 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA35YM22 mRNA sequence. // chr2 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266710950:266801020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSRNOT00000022648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:266777909:266791110:1 gene:ENSRNOG00000028768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ225190 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YN07 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075336 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:267148402:267154162:1 gene:ENSRNOG00000049916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266710950:266801020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:267148339:267169973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_133624 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate binding protein 2, interferon-inducible (Gbp2), mRNA. // chr2 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000068683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:266805234:266821133:1 gene:ENSRNOG00000031743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC086991 // GenBank // Rattus norvegicus guanylate binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93208 IMAGE:7191761), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// M80367 // GenBank // Rat isoprenylated 67 kDa protein mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266807700:266820685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT030458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1
XM_003753681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon-induced guanylate-binding protein 1-like (LOC685116), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006233427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate-binding protein 6-like (LOC102553780), mRNA. // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XM_006224280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate-binding protein 7-like (LOC687532), mRNA. // chr2 // 35 // 92 // 8 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266976823:267008936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_003753681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon-induced guanylate-binding protein 1-like (LOC685116), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon-induced guanylate-binding protein 1-like (LOC685116), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000040856 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:266999462:267008936:-1 gene:ENSRNOG00000036885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon-induced guanylate-binding protein 1-like (LOC102553974), mRNA. // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266976823:267008936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031041 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIB (Gtf2b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:267245407:267257873:1 gene:ENSRNOG00000011135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC085345 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIB, mRNA (cDNA clone MGC:105412 IMAGE:7303747), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ231337 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YN24 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:267253278:267257607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT030461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_001009708 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain only 4 (Lmo4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain only 4 (Lmo4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XR_352097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547228 (LOC102547228), transcript variant X1, ncRNA. // chr2 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000067502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:268752257:268775408:-1 gene:ENSRNOG00000009205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087700 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domain only 4, mRNA (cDNA clone MGC:105593 IMAGE:7314152), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:268757639:268951804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT032393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_133297 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein 15 (Sep15), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF390544 // GenBank // Rattus norvegicus 15 kDa cytosolic selenoprotein mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC060547 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:72709 IMAGE:6921948), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ221750 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YF11 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT030464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT030468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT030469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000053407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269138259:269161798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT030467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001134708 // RefSeq // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 2-like (Odf2l), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006233440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 2-like (Odf2l), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006233442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 2-like (Odf2l), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:269522749:269560126:1 gene:ENSRNOG00000014059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC166823 // GenBank // Rattus norvegicus outer dense fiber of sperm tails 2-like, mRNA (cDNA clone MGC:188703 IMAGE:8370140), complete cds. // chr2 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269520648:269560475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_006224304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XXIV, alpha 1 (Col24a1), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019210 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:269728156:269962702:1 gene:ENSRNOG00000014143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269728156:269742825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT030481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006224304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XXIV, alpha 1 (Col24a1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019210 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:269728156:269962702:1 gene:ENSRNOG00000014143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT030481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269863786:269925267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_001106203 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, HIT-type containing 6 (Znhit6), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:269981414:270012984:1 gene:ENSRNOG00000030049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC161957 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, HIT type 6, mRNA (cDNA clone MGC:187759 IMAGE:9027306), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269973541:269983595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT030488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT030491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_022297 // RefSeq // Rattus norvegicus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 (Ddah1), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270160834:270289319:1 gene:ENSRNOG00000014613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ220049 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YG08 mRNA sequence. // chr2 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// D86041 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for N-G,N-G-dimethylarginine dimethylaminohydrolase, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270160951:270287599:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT030494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT030495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_031328 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 10 (Bcl10), mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270330540:270340108:1 gene:ENSRNOG00000042389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB016069 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for R-RCD1, complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC061772 // GenBank // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 10, mRNA (cDNA clone MGC:72408 IMAGE:5621919), complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT030498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270308126:270339265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// NONRATT030497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_001134616 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2410004B18 (RGD1560065), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270343010:270349925:1 gene:ENSRNOG00000014857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270343039:270348971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT030499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000036282 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:270386600:270418420:1 gene:ENSRNOG00000026186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270386270:270428075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// FQ218152 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YH23 mRNA sequence. // chr2 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT030503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001012059 // RefSeq // Rattus norvegicus mucolipin 3 (Mcoln3), mRNA. // chr2 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270454072:270529772:1 gene:ENSRNOG00000015024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// BC079200 // GenBank // Rattus norvegicus mucolipin 3, mRNA (cDNA clone MGC:94258 IMAGE:7131704), complete cds. // chr2 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000013564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270507101:270527467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001039005 // RefSeq // Rattus norvegicus mucolipin 2 (Mcoln2), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270540814:270589450:1 gene:ENSRNOG00000015089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099787 // GenBank // Rattus norvegicus mucolipin 2, mRNA (cDNA clone MGC:124828 IMAGE:7934506), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT030506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270540863:270588684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_023969 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidic acid receptor 3 (Lpar3), mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270634753:270679035:1 gene:ENSRNOG00000015260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AB051164 // GenBank // Rattus norvegicus EDG7 mRNA for lysophosphatidic acid G protein-coupled receptor, complete cds. // chr2 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// AF097733 // GenBank // Rattus norvegicus putative G protein-coupled receptor snGPCR32 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT030508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270634753:270712323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1
NM_031023 // RefSeq // Rattus norvegicus chitobiase, di-N-acetyl- (Ctbs), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270832835:270847013:1 gene:ENSRNOG00000015573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC088129 // GenBank // Rattus norvegicus chitobiase, di-N-acetyl-, mRNA (cDNA clone MGC:108665 IMAGE:7323494), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// FQ219359 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YN13 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// M95768 // GenBank // Rattus norvegicus di-N-acetylchitobiase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270832838:270846840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
NM_024377 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5 (Gng5), mRNA. // chr2 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000021358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270886941:270895438:1 gene:ENSRNOG00000015936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// M95780 // GenBank // Rat G protein gamma-5 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT030514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_053768 // RefSeq // Rattus norvegicus urate oxidase (Uox), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270978792:271014748:1 gene:ENSRNOG00000016339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC088112 // GenBank // Rattus norvegicus urate oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:108593 IMAGE:7325917), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ218126 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YP02 mRNA sequence. // chr2 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// FQ219456 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YB24 mRNA sequence. // chr2 // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// J03959 // GenBank // Rat uricase mRNA, 3 end. // chr2 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// M24396 // GenBank // Rat urate oxidase 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ210222 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA32YE13 mRNA sequence. // chr2 // 67 // 94 // 20 // 30 // 0 /// FQ218881 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YE21 mRNA sequence. // chr2 // 72 // 100 // 23 // 32 // 0 /// FQ218978 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YK21 mRNA sequence. // chr2 // 63 // 100 // 20 // 32 // 0 /// FQ219059 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YA17 mRNA sequence. // chr2 // 69 // 100 // 22 // 32 // 0 /// FQ219605 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YD02 mRNA sequence. // chr2 // 66 // 100 // 21 // 32 // 0 /// FQ209850 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YP18 mRNA sequence. // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000027141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270978851:271023070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006224284 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 7 (Ttll7), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000055318 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:271298255:271377377:1 gene:ENSRNOG00000031997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000075452 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:271298255:271377377:1 gene:ENSRNOG00000031997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 95 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000053117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:271298255:271371199:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1
NM_022294 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF, latrophilin and seven transmembrane domain containing 1 (Eltd1), mRNA. // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:275293988:275404570:1 gene:ENSRNOG00000033940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF192401 // GenBank // Rattus norvegicus ETL protein mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// AF192402 // GenBank // Rattus norvegicus ETL protein mRNA, alternatively spliced isoform, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT030534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:275360330:275429799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001013076 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 4 (Dnajb4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 80 // 80 // 0 /// XM_006233488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 4 (Dnajb4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 80 // 80 // 0 /// ENSRNOT00000017381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:276072494:276101989:-1 gene:ENSRNOG00000013011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 80 // 80 // 0 /// BC083638 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:94459 IMAGE:7134832), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 80 // 80 // 0 /// GENSCAN00000054816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:276072560:276074583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 80 // 80 // 0 /// NONRATT032452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 80 // 80 // 0
NM_001191094 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 33 (Usp33), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:276246709:276280815:1 gene:ENSRNOG00000011294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 33 (Usp33), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:276246709:276288955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT030550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001011953 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class K (Pigk), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:276578101:276662884:1 gene:ENSRNOG00000042359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083636 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan, class K, mRNA (cDNA clone MGC:94453 IMAGE:7134753), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:276602673:276608772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT030566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000040029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:277986657:278028683:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 83 // 100 // 10 // 12 // 0
NM_001012183 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, zeta (quinone reductase) (Cryz), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:279546017:279573472:1 gene:ENSRNOG00000028319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078927 // GenBank // Rattus norvegicus crystallin, zeta, mRNA (cDNA clone MGC:93718 IMAGE:7106704), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279552729:279572634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006224289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T06D8.1a (LOC295528), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012638 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:279661644:279694441:1 gene:ENSRNOG00000009533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279640511:279688307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
XM_006224289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T06D8.1a (LOC295528), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279706628:279708916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000029429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279769063:279801679:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
NM_001024307 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and IQ motif containing 3 (Lrriq3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:280074848:280166764:1 gene:ENSRNOG00000009555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078994 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and IQ motif containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:93895 IMAGE:7112662), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_181769 // RefSeq // Rattus norvegicus TNNI3 interacting kinase (Tnni3k), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006233518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNNI3 interacting kinase (Tnni3k), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:279730855:279999097:-1 gene:ENSRNOG00000028225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AY303692 // GenBank // Rattus norvegicus cardiac ankyrin repeat kinase mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT032504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279880822:280074688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_021682 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal growth regulator 1 (Negr1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:281883336:282071757:1 gene:ENSRNOG00000021410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// AB017139 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Kilon, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031616 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, RAN-binding domain containing 2 (Zranb2), mRNA. // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// AF013965 // GenBank // Rattus norvegicus Zis mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// AF013967 // GenBank // Rattus norvegicus Zis mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BC087012 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, RAN-binding domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:93352 IMAGE:7189430), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC107939 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7377730, containing frame-shift errors. // chr2 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// FQ211917 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YJ13 mRNA sequence. // chr2 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000055259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:282777936:282791456:-1 gene:ENSRNOG00000009990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:282782968:282799257:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT032518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT032513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT032514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NR_031904 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-186 (Mir186), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053740 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:282781917:282782002:-1 gene:ENSRNOG00000035617 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-186 // miRBase Micro RNA Database // MI0000931 Rattus norvegicus miR-186 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012704 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin E receptor 3 (subtype EP3) (Ptger3), mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostaglandin E receptor 3 (subtype EP3) (Ptger3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:282683978:282760556:-1 gene:ENSRNOG00000010325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:282680844:282760556:-1 gene:ENSRNOG00000010325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AF302686 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin E2 receptor splice variant mRNA, partial cds. // chr2 // 88 // 74 // 22 // 25 // 0 /// D14869 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prostaglandin Esub2 receptor EPsub3 subtype, complete cds. // chr2 // 90 // 85 // 26 // 29 // 0 /// D16443 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prostaglandin E2 receptor EP3 subtype isoform, complete cds. // chr2 // 81 // 76 // 21 // 26 // 0 /// D29969 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prostaglandin E receptor EP3-beta subtype, complete cds. // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// X83855 // GenBank // R.norvegicus mRNA for hepatocyte EP3alpha receptor. // chr2 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT032508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT032509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT032510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:282618328:282721158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
AY383678 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00023 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191570 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 13C (Ankrd13c), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000015170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283426167:283473209:1 gene:ENSRNOG00000011340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000034614 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:136459509:136461051:1 gene:ENSRNOG00000023004 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 94 // 97 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:136459509:136461051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 79 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039164 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:211475002:211476581:-1 gene:ENSRNOG00000026718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000011741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211475002:211476690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000050970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:283426456:283471202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT030589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT030590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001034926 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 40 (Lrrc40), mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283518779:283533188:1 gene:ENSRNOG00000011555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// BC105888 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 40, mRNA (cDNA clone MGC:125134 IMAGE:7308716), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:283507908:283539813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT030594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
XM_001080406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEP domain containing 1 (Depdc1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_227798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEP domain containing 1 (Depdc1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012667 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:283374022:283406639:1 gene:ENSRNOG00000009503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031544 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:283374022:283406639:1 gene:ENSRNOG00000009503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:283318753:283406639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_053562 // RefSeq // Rattus norvegicus retinal pigment epithelium 65 (Rpe65), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinal pigment epithelium 65 (Rpe65), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:284774182:284804254:1 gene:ENSRNOG00000009582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF035673 // GenBank // Rattus norvegicus retinal pigment epithelium-specific protein (Rpe65) mRNA, complete cds. // chrU // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT030599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001085353 // RefSeq // Rattus norvegicus wntless Wnt ligand secretion mediator (Wls), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 99 // 100 // 67 // 68 // 0 /// BC062391 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 177, mRNA (cDNA clone MGC:72636 IMAGE:5621215), complete cds. // chr2 // 99 // 100 // 67 // 68 // 0 /// NM_199408 // RefSeq // Rattus norvegicus wntless Wnt ligand secretion mediator (Wls), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 65 // 68 // 1 /// ENSRNOT00000055245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:284950842:285064162:1 gene:ENSRNOG00000036816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 65 // 68 // 1 /// GENSCAN00000037465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:284951029:285059239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 84 // 56 // 57 // 0 /// NONRATT030604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 26 // 68 // 1 /// NONRATT030603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 15 // 68 // 1
ENSRNOT00000051340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:2063024:2063575:-1 gene:ENSRNOG00000048631 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2063134:2063575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001107645 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho-related BTB domain containing 3 (Rhobtb3), mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:2626102:2681752:-1 gene:ENSRNOG00000012414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2638157:2702298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001108540 // RefSeq // Rattus norvegicus Rieske (Fe-S) domain containing (Rfesd), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:2767847:2777556:-1 gene:ENSRNOG00000012810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rieske (Fe-S) domain containing (Rfesd), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2768141:2789635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109173 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 150 (Gpr150), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 150 (Gpr150), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000029265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:2811666:2812949:-1 gene:ENSRNOG00000026944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2811666:2812682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT030623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047917 // RefSeq // Rattus norvegicus arylsulfatase family, member K (Arsk), mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006231712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylsulfatase family, member K (Arsk), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:2836108:2891776:-1 gene:ENSRNOG00000026937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2836108:2891776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0
XM_006223945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 81, member B (Fam81b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 81, member B (Fam81b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036547 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:3023608:3096386:-1 gene:ENSRNOG00000026845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000014369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:3023608:3096347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT030626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT030627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT030628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
GENSCAN00000034792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:3652475:3652906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000062000 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:3668205:3669104:-1 gene:ENSRNOG00000040283 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:3668205:3668591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NM_001106400 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 32 (Ankrd32), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:4092109:4193740:-1 gene:ENSRNOG00000040279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:4092567:4190130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106400 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 32 (Ankrd32), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:4092109:4193740:-1 gene:ENSRNOG00000040279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:4092567:4190130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NONRATT030631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_031130 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 2, group F, member 1 (Nr2f1), mRNA. // chr2 // 75 // 97 // 21 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:5553707:5562941:-1 gene:ENSRNOG00000014795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// FQ212534 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YM19 mRNA sequence. // chr2 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// U10995 // GenBank // Rattus norvegicus Wistar orphan receptor COUP-TFI mRNA, complete cds. // chr2 // 75 // 97 // 21 // 28 // 0 /// NONRATT030635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:5553759:5582061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT030636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
GENSCAN00000030905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:8466381:8466546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000047756 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:8544271:8545572:-1 gene:ENSRNOG00000033404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000074476 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:7178614:7179591:-1 gene:ENSRNOG00000050870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:7001469:7363765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
XM_006223954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 98-like (RGD1562101), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 98-like (RGD1562101), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:8807641:8903858:-1 gene:ENSRNOG00000023651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ219861 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YB10 mRNA sequence. // chr2 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT030643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:8807963:8832702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000031233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:8866953:8958711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT030645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NONRATT030645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_199406 // RefSeq // Rattus norvegicus coxsackie virus and adenovirus receptor-like 1 (Cxadrl1), mRNA. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041894 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:106673615:106696431:-1 gene:ENSRNOG00000029567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:106267371:106292926:-1 gene:ENSRNOG00000029029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063181 // GenBank // Rattus norvegicus coxsackie virus and adenovirus receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:72972 IMAGE:6887452), complete cds. // chr8 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106667173:106696431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106263577:106292837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_053481 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, catalytic subunit beta (Pik3cb), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_003750567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform-like (LOC100910021), mRNA. // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:106701471:106771882:-1 gene:ENSRNOG00000016384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000039271 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:106297877:106305377:-1 gene:ENSRNOG00000023622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106701471:106771852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000053089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:106297877:106307817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT055632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT055633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006223954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 98-like (RGD1562101), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006231730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 98-like (RGD1562101), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000021912 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:9258876:9289365:-1 gene:ENSRNOG00000046496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000066186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:9326677:9384140:-1 gene:ENSRNOG00000016306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// D87256 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neurepin, complete cds. // chr2 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000019798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:9166548:9379645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT030646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001109468 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G (Polr3g), mRNA. // chr2 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// ENSRNOT00000021804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:9417665:9458293:-1 gene:ENSRNOG00000016260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// NONRATT030647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000019811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:9419866:9447065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1
ENSRNOT00000048258 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:9944645:9945451:-1 gene:ENSRNOG00000033870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 95 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:9944761:9946700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000072289 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:11747905:11748199:1 gene:ENSRNOG00000050701 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 71 // 56 // 10 // 14 // 0
NR_031813 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-9-2 (Mir9-2), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// rno-mir-9a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000840 Rattus norvegicus miR-9a-2 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006223955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2C (Mef2c), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2C (Mef2c), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2C (Mef2c), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2C (Mef2c), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041296 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:11592404:11680469:1 gene:ENSRNOG00000033134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000041538 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:11592404:11680469:1 gene:ENSRNOG00000033134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:11606845:11680469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
XM_001057417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 161B (Tmem161b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006223968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 161B (Tmem161b), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_226652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 161B (Tmem161b), mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000050072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:12379283:12410781:1 gene:ENSRNOG00000032414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:12304465:12458429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 23 // 43 // 1 /// GENSCAN00000040959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:89235035:89486893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 51 // 51 // 22 // 43 // 1 /// NONRATT028724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 65 // 65 // 28 // 43 // 1 /// NONRATT028725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 24 // 43 // 1 /// NONRATT028723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 19 // 43 // 1 /// NONRATT028726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1 /// NONRATT028727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 19 // 43 // 1
NM_013135 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS p21 protein activator (GTPase activating protein) 1 (Rasa1), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:13470580:13551782:-1 gene:ENSRNOG00000029185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227936 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YC17 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000029724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:13480165:13551779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_344013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555062 (LOC102555062), transcript variant X1, ncRNA. // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// XR_351262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555062 (LOC102555062), transcript variant X1, ncRNA. // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:13567823:13582004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NR_002705 // RefSeq // Rattus norvegicus Z39 small nucleolar RNA (LOC252890), small nuclear RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ219964 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YL03 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134705 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIIc (Cox7c), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000051895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:14553406:14555427:-1 gene:ENSRNOG00000030237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC166894 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIIc, mRNA (cDNA clone MGC:188847 IMAGE:6920183), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ219964 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YL03 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT030660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT030662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT030661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
ENSRNOT00000051938 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:17995429:17996418:-1 gene:ENSRNOG00000033408 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000022269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:17995595:17996418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001170558 // RefSeq // Rattus norvegicus versican (Vcan), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_053663 // RefSeq // Rattus norvegicus versican (Vcan), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000045532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:18363890:18441931:-1 gene:ENSRNOG00000029212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_001170559 // RefSeq // Rattus norvegicus versican (Vcan), transcript variant 4, mRNA. // chr2 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// NM_001170560 // RefSeq // Rattus norvegicus versican (Vcan), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000067456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:18363890:18441931:-1 gene:ENSRNOG00000029212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// AF072892 // GenBank // Rattus norvegicus versican V3 isoform precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000063821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:18363890:18441931:-1 gene:ENSRNOG00000029212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// GENSCAN00000022263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:18374848:18458839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001006999 // RefSeq // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4 (Xrcc4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4 (Xrcc4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:18553028:18803145:-1 gene:ENSRNOG00000029966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083848 // GenBank // Rattus norvegicus X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 4, mRNA (cDNA clone MGC:95022 IMAGE:7122361), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ230968 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YM10 mRNA sequence. // chr2 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT030672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:18534767:18720985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:18756088:18813699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT030674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT030676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001191843 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal accessory protein 1-like (Atp6ap1l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal accessory protein 1-like (Atp6ap1l), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:19657646:19685175:-1 gene:ENSRNOG00000040201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:19657737:19679509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT030677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001109505 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 10 (Atg10), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autophagy related 10 (Atg10), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000021941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:19729784:20026448:-1 gene:ENSRNOG00000016342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autophagy related 10 (Atg10), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT030679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000074243 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:40930186:40942922:-1 gene:ENSRNOG00000046826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT030689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001013156 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 9 (Zcchc9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000020111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:48035517:48044197:1 gene:ENSRNOG00000014927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC083695 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:94562 IMAGE:7189545), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XR_351325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 9 (Zcchc9), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// GENSCAN00000012895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:48035544:48043592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT028829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT028831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_053721 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS protein-specific guanine nucleotide-releasing factor 2 (Rasgrf2), mRNA. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:40664646:40835991:-1 gene:ENSRNOG00000013818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:40775845:40840403:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000000706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:40664646:40710487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT030686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191957 // RefSeq // Rattus norvegicus mutS homolog 3 (Msh3), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:40996035:41137564:-1 gene:ENSRNOG00000013673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:40996497:41135927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT030693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
XM_006231781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 151, member B (Fam151b), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41226510:41262309:-1 gene:ENSRNOG00000024136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC167070 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 151, member B, mRNA (cDNA clone MGC:189401 IMAGE:9032304), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000043595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41226944:41300098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT030697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT030698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001191958 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 16 (Zfyve16), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000017705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41265679:41308896:-1 gene:ENSRNOG00000013055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41226944:41300098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_001024297 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenic leucine zipper 1 (Spz1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41349188:41350390:-1 gene:ENSRNOG00000013050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC079262 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenic leucine zipper 1, mRNA (cDNA clone MGC:94369 IMAGE:7133509), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41349188:41358522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT030705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017133 // RefSeq // Rattus norvegicus thrombospondin 4 (Thbs4), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000065224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41549118:41590922:-1 gene:ENSRNOG00000012471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000007221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41549276:41590927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// X89963 // GenBank // R.norvegicus mRNA TSP-4 protein. // chr2 // 98 // 91 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT030707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 60 // 60 // 27 // 45 // 1 /// NONRATT030706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1
XM_006223980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cardiomyopathy associated 5 (Cmya5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006231789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cardiomyopathy associated 5 (Cmya5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000016611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41845822:41908429:-1 gene:ENSRNOG00000023803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000073710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41845822:41908429:-1 gene:ENSRNOG00000023803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41804453:41910400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT030710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT030711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001008372 // RefSeq // Rattus norvegicus PAP associated domain containing 4 (Papd4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PAP associated domain containing 4 (Papd4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PAP associated domain containing 4 (Papd4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41944123:41995951:-1 gene:ENSRNOG00000012099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085771 // GenBank // Rattus norvegicus PAP associated domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:93684 IMAGE:7191068), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211725 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA82YF01 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ212185 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA66YH13 mRNA sequence. // chr2 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41946593:41998396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT030716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_030850 // RefSeq // Rattus norvegicus betaine-homocysteine S-methyltransferase (Bhmt), mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000015336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:42418000:42437489:-1 gene:ENSRNOG00000011200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF038870 // GenBank // Rattus norvegicus betaine homocysteine methyltransferase (BHMT) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// BC078811 // GenBank // Rattus norvegicus betaine-homocysteine methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93402 IMAGE:7130736), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// U96133 // GenBank // Rattus norvegicus betaine-homocysteine methyltransferase (BHMT) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:42418570:42433807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1
NM_001014256 // RefSeq // Rattus norvegicus betaine-homocysteine S-methyltransferase 2 (Bhmt2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000061708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:42452902:42469840:-1 gene:ENSRNOG00000040120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC079366 // GenBank // Rattus norvegicus betaine-homocysteine methyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94849 IMAGE:7109516), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ211406 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA11YD12 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT030720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 92 // 71 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT030721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0
NM_001100636 // RefSeq // Rattus norvegicus secretory carrier membrane protein 1 (Scamp1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:43029911:43112171:-1 gene:ENSRNOG00000010774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT030724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43025044:43059121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_199268 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 8B (Pde8b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006231809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphodiesterase 8B (Pde8b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// XM_006231812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphodiesterase 8B (Pde8b), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000044087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:43879335:43984030:-1 gene:ENSRNOG00000010280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AB092697 // GenBank // Rattus norvegicus RNPDE8B mRNA for cAMP-specific cyclic nucleotide phosphodiesterase PDE8, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000032150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43879443:43925442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 51 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000014690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43938908:43989838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 16 // 43 // 1
FQ226474 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YA23 mRNA sequence. // chrU // 60 // 95 // 12 // 20 // 0 /// NONRATT025914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 57 // 100 // 12 // 21 // 0 /// NONRATT055450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 95 // 12 // 20 // 0
XM_001060407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiogenic factor with G patch and FHA domains 1 (Aggf1), mRNA. // chr2 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051653 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:44228102:44253809:-1 gene:ENSRNOG00000029304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// BC099754 // GenBank // Rattus norvegicus angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5623942), partial cds. // chr2 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// FQ212444 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA54YK23 mRNA sequence. // chr2 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000014688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:44218337:44289946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT030734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT030731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
ENSRNOT00000035789 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:44289610:44290049:-1 gene:ENSRNOG00000025436 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0
NM_139183 // RefSeq // Rattus norvegicus corticotropin releasing hormone binding protein (Crhbp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:44299507:44311225:-1 gene:ENSRNOG00000017890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:44300056:44311107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053897 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1 (F2rl1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:44378266:44391213:-1 gene:ENSRNOG00000018003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099765 // GenBank // Rattus norvegicus coagulation factor II (thrombin) receptor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:124581 IMAGE:7930573), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U61373 // GenBank // Rattus norvegicus proteinase-activated receptor-2 mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:44379960:44391126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191701 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein Z (S100z), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:44345125:44346838:-1 gene:ENSRNOG00000017998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:44345125:44346838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012950 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor II (thrombin) receptor (F2r), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:45256548:45257759:-1 gene:ENSRNOG00000048043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC085759 // GenBank // Rattus norvegicus coagulation factor II (thrombin) receptor, mRNA (cDNA clone MGC:93622 IMAGE:7106133), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M81642 // GenBank // Rat G-protein coupled thrombin receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:45240010:45279083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT030747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002729002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing GTPase activating protein 2 (Iqgap2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000035017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:45296359:45569036:-1 gene:ENSRNOG00000025406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000049702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:45382171:45430660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:45296359:45363636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// NONRATT030749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// NONRATT030752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1
NM_031593 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptic vesicle glycoprotein 2c (Sv2c), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:45631737:45828663:-1 gene:ENSRNOG00000018094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF060174 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic vesicle protein 2C (SV2C) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:45653491:45779960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000053767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:45998463:46020196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
GENSCAN00000053778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46117979:46119167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1
XM_003753509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and death domain containing 1B (Ankdd1b), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034041 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:46155303:46399373:-1 gene:ENSRNOG00000025377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and death domain containing 1B (Ankdd1b), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46359366:46391699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT030758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_138516 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed) kappa (Polk), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:46418252:46477563:-1 gene:ENSRNOG00000025373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC166778 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed) kappa, mRNA (cDNA clone MGC:188557 IMAGE:7934797), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46431711:46456655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000053774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46403286:46426116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_013134 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase (Hmgcr), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000022055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:46592883:46614276:-1 gene:ENSRNOG00000016122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC064654 // GenBank // Rattus norvegicus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-Coenzyme A reductase, mRNA (cDNA clone MGC:72532 IMAGE:5600023), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000049603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46594474:46623960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT030760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
ENSRNOT00000032906 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:46790981:46791538:-1 gene:ENSRNOG00000025329 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46791116:46791493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 58 // 13 // 14 // 0
NM_134415 // RefSeq // Rattus norvegicus NSA2 ribosome biogenesis homolog (S. cerevisiae) (Nsa2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000022138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:47053384:47060005:-1 gene:ENSRNOG00000016530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF158379 // GenBank // Rattus norvegicus unknown mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// BC098657 // GenBank // Rattus norvegicus CDK105 protein, mRNA (cDNA clone MGC:112601 IMAGE:7378282), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// DQ354588 // GenBank // Rattus norvegicus TGF beta-inducible nuclear protein (Cdk105) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ225571 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YJ13 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ226635 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YP05 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:47053606:47060296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT030763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001011946 // RefSeq // Rattus norvegicus hexosaminidase B (Hexb), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000048554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:47094815:47114918:-1 gene:ENSRNOG00000025274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC079376 // GenBank // Rattus norvegicus hexosaminidase B, mRNA (cDNA clone MGC:94872 IMAGE:7110247), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:47095006:47114918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT030765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT030766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONRATT030767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001108542 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 28 (Arhgef28), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 28 (Arhgef28), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:44892452:45152594:-1 gene:ENSRNOG00000016544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000049699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:44933289:45102860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001107647 // RefSeq // Rattus norvegicus UTP15, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (S. cerevisiae) (Utp15), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000022259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:47453660:47472161:-1 gene:ENSRNOG00000016591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC107908 // GenBank // Rattus norvegicus UTP15, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:7454138), partial cds. // chr2 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// BC131851 // GenBank // Rattus norvegicus UTP15, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156811 IMAGE:7189311), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ211666 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YA24 mRNA sequence. // chr2 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT030768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT030769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT030770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001024298 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 174 (Tmem174), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:47846784:47848314:-1 gene:ENSRNOG00000015472 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079357 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 174, mRNA (cDNA clone MGC:94822 IMAGE:7108570), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013903 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 171 (Tmem171), mRNA. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:47889969:47899300:-1 gene:ENSRNOG00000015449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY185507 // GenBank // Rattus norvegicus PRP2 (Prp2) mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:47875752:47906573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT030778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT030776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001191632 // RefSeq // Rattus norvegicus FCH domain only 2 (Fcho2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000020692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:48110537:48211938:-1 gene:ENSRNOG00000015334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000012877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:48111008:48202336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 67 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT030782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 18 // 46 // 1 /// NONRATT030784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 18 // 46 // 1 /// NONRATT030783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1 /// NONRATT030785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001100692 // RefSeq // Rattus norvegicus transportin 1 (Tnpo1), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:48243521:48302954:-1 gene:ENSRNOG00000014999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:48227779:48324143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT030791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT030790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001107648 // RefSeq // Rattus norvegicus pentatricopeptide repeat domain 2 (Ptcd2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:48732577:48760245:-1 gene:ENSRNOG00000028403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:48733033:48760381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_019217 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1B (Map1b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:48837124:48930483:-1 gene:ENSRNOG00000017428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:48841440:48898251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT030798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017110 // RefSeq // Rattus norvegicus CART prepropeptide (Cartpt), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006231843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CART prepropeptide (Cartpt), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000023869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49285118:49287138:-1 gene:ENSRNOG00000017712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U10071 // GenBank // Rattus norvegicus CART protein mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49281632:49287119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT030801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001012177 // RefSeq // Rattus norvegicus methylcrotonoyl-CoA carboxylase 2 (beta) (Mccc2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000023900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49333902:49404647:-1 gene:ENSRNOG00000017752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC083581 // GenBank // Rattus norvegicus methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 2 (beta), mRNA (cDNA clone MGC:94191 IMAGE:7129446), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49334214:49404758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT030805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
ENSRNOT00000024023 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:49425843:49447799:-1 gene:ENSRNOG00000017864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49425841:49499164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT030807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_031329 // RefSeq // Rattus norvegicus occludin (Ocln), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006231854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus occludin (Ocln), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006231856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus occludin (Ocln), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006231858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus occludin (Ocln), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006231859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus occludin (Ocln), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49686710:49736838:-1 gene:ENSRNOG00000018297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062037 // GenBank // Rattus norvegicus occludin, mRNA (cDNA clone MGC:72407 IMAGE:5623744), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AB016425 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for occludin, complete cds. // chr2 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT030825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49654436:49725691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT030826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001108936 // RefSeq // Rattus norvegicus MARVEL domain containing 2 (Marveld2), mRNA. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49772747:49793880:-1 gene:ENSRNOG00000018340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49767031:49793885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001024778 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD17 homolog (S. pombe) (Rad17), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231848 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD17 homolog (S. pombe) (Rad17), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49793991:49823799:-1 gene:ENSRNOG00000018353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC098057 // GenBank // Rattus norvegicus RAD17 homolog (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:116215 IMAGE:7457767), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000022157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49794482:49823907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_006224026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 7 (Cdk7), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006231867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 7 (Cdk7), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000025026 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:49869831:49893977:-1 gene:ENSRNOG00000018510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071234 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:49875049:49893977:-1 gene:ENSRNOG00000018510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// X83579 // GenBank // R.norvegicus mRNA for Cdk-activating kinase. // chr2 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49864864:49894370:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_001191605 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S36 (Mrps36), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006231846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S36 (Mrps36), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49899205:49906987:-1 gene:ENSRNOG00000048862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023948 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:81834008:81834430:1 gene:ENSRNOG00000017757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// NONRATT030837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 100 // 13 // 33 // 0 /// GENSCAN00000022150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49899689:49906733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
XM_003753512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to centromere autoantigen H (LOC681185), mRNA. // chr2 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025129 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:49924881:49937755:-1 gene:ENSRNOG00000018615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072938 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:49924881:49934809:-1 gene:ENSRNOG00000018615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49924530:49937752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_171991 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin B1 (Ccnb1), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49941586:49948770:-1 gene:ENSRNOG00000018635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC059113 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin B1, mRNA (cDNA clone MGC:72670 IMAGE:6922392), complete cds. // chr2 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// L11995 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin B mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 88 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49941703:49948675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// X64589 // GenBank // R.norvegicus mRNA for cyclin B. // chr2 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// NONRATT030847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// NONRATT030846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NM_001106404 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 5 (Slc30a5), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000025506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49974659:50004756:-1 gene:ENSRNOG00000018746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49983690:50004607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT030848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000029207 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:50047805:50048644:-1 gene:ENSRNOG00000027159 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:50047805:50048632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
NM_013005 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 1 (alpha) (Pik3r1), mRNA. // chr2 // 77 // 84 // 20 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:50895264:50965217:-1 gene:ENSRNOG00000018903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:50895264:50904532:-1 gene:ENSRNOG00000018903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000075057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:50895264:50902427:-1 gene:ENSRNOG00000018903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// D64045 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol 3-kinase p85 alpha subunit, complete cds. // chr2 // 77 // 84 // 20 // 26 // 0 /// D64048 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol 3-kinase p45 subunit, complete cds. // chr2 // 72 // 58 // 13 // 18 // 0 /// D78486 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol 3 kinase, complete cds. // chr2 // 69 // 52 // 11 // 16 // 0 /// U50412 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit p85alpha mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr2 // 71 // 55 // 12 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:50895264:50902406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT030852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT030851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000010415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:50909919:50921557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
XM_006223996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule-associated serine/threonine-protein kinase 4-like (LOC100912235), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule-associated serine/threonine-protein kinase 4-like (LOC100909748), mRNA. // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000061024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:51998511:52583349:-1 gene:ENSRNOG00000027002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:51998697:52583349:-1 gene:ENSRNOG00000027002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT030859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NONRATT030859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
NM_053970 // RefSeq // Rattus norvegicus neurolysin (metallopeptidase M3 family) (Nln), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:53216605:53313982:-1 gene:ENSRNOG00000011561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC072687 // GenBank // Rattus norvegicus neurolysin (metallopeptidase M3 family), mRNA (cDNA clone MGC:91547 IMAGE:7099208), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurolysin (metallopeptidase M3 family) (Nln), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// GENSCAN00000045865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53227853:53266612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 52 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT030876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001013908 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 13 (Trappc13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 13 (Trappc13), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:53350386:53383214:-1 gene:ENSRNOG00000012124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC088172 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2410002O22 gene, mRNA (cDNA clone MGC:108800 IMAGE:7323103), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ217190 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA32YN20 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000045867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53351846:53379604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT030881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT030883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT030884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
GENSCAN00000045867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53351846:53379604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106406 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 (Ppwd1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase domain and WD repeat containing 1 (Ppwd1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:53418985:53442093:-1 gene:ENSRNOG00000012505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC078983 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7112244. // chr2 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53419359:53441955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT030886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001013199 // RefSeq // Rattus norvegicus CWC27 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae) (Cwc27), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CWC27 spliceosome-associated protein homolog (S. cerevisiae) (Cwc27), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000017832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:53846102:54048509:-1 gene:ENSRNOG00000013252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083774 // GenBank // Rattus norvegicus serologically defined colon cancer antigen 10, mRNA (cDNA clone MGC:94726 IMAGE:7193421), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53989359:54052323:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT030891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_001072885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 159, member B (Fam159b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_574844 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 159, member B (Fam159b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017870 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:54072495:54088905:-1 gene:ENSRNOG00000013372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54079750:54089205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT030892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001012347 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 7 binding protein (Rgs7bp), mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:54201509:54742295:-1 gene:ENSRNOG00000013389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT030895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// GENSCAN00000048033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54192070:54241048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
XM_003753514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus importin 11 (Ipo11), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006224009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus importin 11 (Ipo11), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000060904 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:57128218:57205300:-1 gene:ENSRNOG00000039717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000072212 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:57050932:57205300:-1 gene:ENSRNOG00000039717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000074971 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:57050932:57205300:-1 gene:ENSRNOG00000039717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:57095246:57220581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:137050865:137053274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT030900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_053376 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin heavy chain member 2A (Kif2a), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000019189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:57241541:57302938:-1 gene:ENSRNOG00000014000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000019225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:57241541:57302938:-1 gene:ENSRNOG00000014000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF155824 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-like protein KIF2 mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT030903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:57242331:57302938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
XM_006224012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 6 (Zswim6), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 6 (Zswim6), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:58069136:58069479:-1 gene:ENSRNOG00000050795 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT030910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000064292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:58070319:58098435:-1 gene:ENSRNOG00000014528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// AY325185 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-064 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// XM_006224012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 6 (Zswim6), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 29 // 46 // 1 /// XM_006231910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 6 (Zswim6), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 29 // 46 // 1 /// GENSCAN00000027579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:58070324:58138483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT030910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 78 // 78 // 36 // 46 // 1
FQ224641 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA5YD22 mRNA sequence. // chr2 // 76 // 94 // 13 // 17 // 0 /// NONRATT030915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XR_351380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550254 (LOC102550254), ncRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133536 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB3C, member RAS oncogene family (Rab3c), mRNA. // chr2 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:60628055:60843345:-1 gene:ENSRNOG00000011623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D78197 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for rab3C, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U54807 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein (rab 3C) mRNA, complete cds. // chr2 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// XM_006231915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB3C, member RAS oncogene family (Rab3c), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT030921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:60628283:60729969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001109491 // RefSeq // Rattus norvegicus Grb2-binding adaptor protein, transmembrane (Gapt), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:60928713:60931015:-1 gene:ENSRNOG00000026989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:60929712:60944798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT030924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000004964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:61102952:61103769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001106410 // RefSeq // Rattus norvegicus GC-rich promoter binding protein 1 (Gpbp1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:62047278:62114558:-1 gene:ENSRNOG00000013002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161907 // GenBank // Rattus norvegicus GC-rich promoter binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187630 IMAGE:8367604), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// FQ211661 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YE05 mRNA sequence. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// JQ013734 // GenBank // Rattus norvegicus vasculin (Gpbp1) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT030925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000050589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:62048099:62155215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
FQ211661 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YE05 mRNA sequence. // chr2 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// GENSCAN00000050589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:62048099:62155215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT030929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001077647 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 4 (Ddx4), mRNA. // chr2 // 86 // 67 // 36 // 42 // 0 /// NM_001257278 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 31 receptor A (Il31ra), mRNA. // chr2 // 87 // 24 // 13 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000013035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63491191:63544876:-1 gene:ENSRNOG00000026686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000041452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63377712:63445816:-1 gene:ENSRNOG00000042080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 24 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000073469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63377712:63445816:-1 gene:ENSRNOG00000042080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 24 // 14 // 15 // 0 /// GQ243745 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 4 (Ddx4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 87 // 60 // 33 // 38 // 0 /// JQ013736 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 31 receptor A (Il31ra) mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 24 // 13 // 15 // 0 /// JQ013737 // GenBank // Rattus norvegicus putative ATP-dependent RNA helicase DDX4 (Ddx4) mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 63 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000054386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63377925:63400884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 14 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000048489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63418487:63563355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 51 // 51 // 32 // 63 // 1 /// NONRATT030938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 14 // 63 // 1
NM_001034093 // RefSeq // Rattus norvegicus superkiller viralicidic activity 2-like 2 (S. cerevisiae) (Skiv2l2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63766778:63816210:-1 gene:ENSRNOG00000010125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC091305 // GenBank // Rattus norvegicus superkiller viralicidic activity 2-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:7311286), partial cds. // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000048495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63759537:63828918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT030946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001106411 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione peroxidase 8 (Gpx8), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000013979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63940890:63944583:-1 gene:ENSRNOG00000010461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// FQ230090 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YK23 mRNA sequence. // chr2 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0 /// NONRATT030947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT030948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_153468 // RefSeq // Rattus norvegicus granzyme A (Gzma), mRNA. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64004695:64017285:-1 gene:ENSRNOG00000010603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AB082125 // GenBank // Rattus norvegicus GrA mRNA for granzyme A, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64004695:64017285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_017119 // RefSeq // Rattus norvegicus granzyme K (Gzmk), mRNA. // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64101925:64109992:-1 gene:ENSRNOG00000010661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L19694 // GenBank // Rattus norvegicus tryptase 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64102006:64135771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107652 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 18 (Snx18), mRNA. // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000066764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64486855:64512619:-1 gene:ENSRNOG00000010971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000055120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64510690:64512453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT030952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_031750 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein B3 (Hspb3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64549391:64549849:-1 gene:ENSRNOG00000010992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// AF203374 // GenBank // Rattus norvegicus small heat shock protein B3 (Hspb3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64549391:64557441:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT030954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000014735 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:64666007:64666541:-1 gene:ENSRNOG00000011085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64665102:64675324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001025146 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 4 (Ndufs4), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:65403183:65515260:-1 gene:ENSRNOG00000011383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083729 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:94631 IMAGE:7191329), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127458 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:156516 IMAGE:7193742), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212751 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YJ07 mRNA sequence. // chrU // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ214557 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA1YN07 mRNA sequence. // chrU // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT030955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001007634 // RefSeq // Rattus norvegicus pelota homolog (Drosophila) (Pelo), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:71808496:71810350:-1 gene:ENSRNOG00000023127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083637 // GenBank // Rattus norvegicus pelota homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94455 IMAGE:7134766), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ214039 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YD02 mRNA sequence. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71808657:71810104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT031006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0
ENSRNOT00000074861 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:65561959:65562364:-1 gene:ENSRNOG00000048032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075460 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:65988336:65988741:-1 gene:ENSRNOG00000045594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:65988442:66052936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000023930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:65562065:65583544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_012561 // RefSeq // Rattus norvegicus follistatin (Fst), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:65577804:65583544:-1 gene:ENSRNOG00000011631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:65562065:65583544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000015940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:71539705:71609503:-1 gene:ENSRNOG00000011877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB067445 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for alpha 2 integrin, partial cds. // chr2 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000026510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71536517:71591141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000026514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71641030:71700710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_030994 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha 1 (Itga1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:71666606:71823121:-1 gene:ENSRNOG00000012080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// X52140 // GenBank // Rat mRNA for integrin alpha-1. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71701419:71806363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000026514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71641030:71700710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_017339 // RefSeq // Rattus norvegicus ISL LIM homeobox 1 (Isl1), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:66871790:66883936:-1 gene:ENSRNOG00000012556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AY557632 // GenBank // Rattus norvegicus insulin enhancer binding protein mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:66820280:66888986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT030962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT030961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT030963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
ENSRNOT00000038344 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:66962401:66962856:-1 gene:ENSRNOG00000022100 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:66962346:66962702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
XM_006224016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 8 (Parp8), mRNA. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006231955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 8 (Parp8), partial mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:67464107:67546909:-1 gene:ENSRNOG00000010824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:67464107:67505385:-1 gene:ENSRNOG00000010824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT030964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:67485032:67754215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSRNOT00000035746 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:68945488:68950842:-1 gene:ENSRNOG00000021772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0
NM_001106412 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S30 (Mrps30), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:69417353:69424208:-1 gene:ENSRNOG00000012136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:69417444:69424187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT030972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT030973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT030975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_001076433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ferritin light chain 1-like (RGD1561520), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_345159 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ferritin light chain 1-like (RGD1561520), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037130 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:70534802:70535493:-1 gene:ENSRNOG00000022407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70473489:70535691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001013157 // RefSeq // Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide transhydrogenase (Nnt), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000033627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70553345:70644277:-1 gene:ENSRNOG00000026842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC091271 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinamide nucleotide transhydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:109126 IMAGE:7381610), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000024334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70554063:70633933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 83 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT030980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT030982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
XM_006231982 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase NIM1 (Nim1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70812982:70828841:-1 gene:ENSRNOG00000016353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70828402:70828841:-1 gene:ENSRNOG00000016353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70812982:70858192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT030988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
XM_006231982 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine-protein kinase NIM1 (Nim1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001100698 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 131 (Zfp131), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 131 (Zfp131), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70868110:70894880:-1 gene:ENSRNOG00000015925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC161974 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 131, mRNA (cDNA clone MGC:187784 IMAGE:9029363), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FQ227804 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YM12 mRNA sequence. // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70868658:70885066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT030989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70893389:70903721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT030992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT030993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
GENSCAN00000039316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70924068:70933546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSRNOT00000060506 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:71055032:71057142:1 gene:ENSRNOG00000039480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71002362:71002940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000039320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71039577:71057195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001191959 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 152 (Ccdc152), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:72148381:72170595:-1 gene:ENSRNOG00000039473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:72148492:72321200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_017094 // RefSeq // Rattus norvegicus growth hormone receptor (Ghr), mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:72191847:72346118:-1 gene:ENSRNOG00000015654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:72182692:72346118:-1 gene:ENSRNOG00000015654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// BC086591 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:7310431), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// BC103659 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:7325614), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// BC127501 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone receptor, mRNA (cDNA clone IMAGE:8375548), complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// J04811 // GenBank // Rat growth hormone receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// JF412704 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone receptor variant d5-6 (Ghr) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000057338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:72148492:72321200:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT031010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// NONRATT031011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1
NM_001107672 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 4 (Fbxo4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:72830881:72844061:-1 gene:ENSRNOG00000015622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:72831248:72843593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT031013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000020829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:72849783:72859924:-1 gene:ENSRNOG00000015543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// NM_001134548 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AW549877 (RGD1305938), mRNA. // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// FQ211901 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YA11 mRNA sequence. // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:72850238:72884807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT031015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000060343 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:73735309:73802191:-1 gene:ENSRNOG00000012516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000050420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73737430:73820109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT031020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_001106413 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase recruitment domain family, member 6 (Card6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:73837349:73848917:-1 gene:ENSRNOG00000001271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73838287:73840815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT031022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73843797:73882273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_032076 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin E receptor 4 (subtype EP4) (Ptger4), mRNA. // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000017886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:73975576:73986821:-1 gene:ENSRNOG00000013240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D28860 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prostaglandin E receptor EP4 subtype, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U94709 // GenBank // Rattus norvegicus EP4 prostanoid receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT031023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73985219:74028828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT031024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001005384 // RefSeq // Rattus norvegicus oncostatin M receptor (Osmr), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000040847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:75851664:75892056:-1 gene:ENSRNOG00000033192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB167522 // GenBank // Rattus norvegicus OSMR mRNA for oncostatin M specific receptor, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000024694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:75866935:75884177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:75851664:75866135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT031037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001108938 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-like, fibronectin type III and laminin G domains (Egflam), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000016722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:76243792:76418008:-1 gene:ENSRNOG00000012058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// BC168173 // GenBank // Rattus norvegicus EGF-like, fibronectin type III and laminin G domains, mRNA (cDNA clone MGC:187799 IMAGE:9030270), complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000009255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76244256:76369883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT031038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_031048 // RefSeq // Rattus norvegicus leukemia inhibitory factor receptor alpha (Lifr), mRNA. // chr2 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// XM_006232028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukemia inhibitory factor receptor alpha (Lifr), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000016036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:76191377:76227874:1 gene:ENSRNOG00000011696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// D86345 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for leukemia inhibitor factor receptor alpha-chain, complete cds. // chr2 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76191464:76227840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT029036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT031038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000031124 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:76523613:76524101:-1 gene:ENSRNOG00000026824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76493123:76524101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000005459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76569532:76572621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NM_001013909 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 70 (Wdr70), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000060146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:76953968:77203824:-1 gene:ENSRNOG00000013336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC089903 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 70, mRNA (cDNA clone MGC:109151 IMAGE:7384104), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT031039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000028874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77089269:77203812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1 /// NONRATT031040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1 /// NONRATT031041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
ENSRNOT00000048070 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:78984534:78985102:-1 gene:ENSRNOG00000032932 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000044223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:78984628:78987869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000021181 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:78994110:79078582:-1 gene:ENSRNOG00000025680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000044227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:78994110:79164527:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT031051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT031054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
ENSRNOT00000049673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:79209863:79210262:-1 gene:ENSRNOG00000032470 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 50 // 100 // 10 // 20 // 0
XM_002729014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus high-mobility group nucleosomal binding domain 2-like (LOC100362827), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042543 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:79213431:79213694:-1 gene:ENSRNOG00000030748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:79213431:79248851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001289941 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3 (Slc1a3), transcript variant Glast1a, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_001289942 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3 (Slc1a3), transcript variant Glast1b, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_019225 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3 (Slc1a3), transcript variant Glast, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:79348445:79422645:-1 gene:ENSRNOG00000016163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:79348445:79422645:-1 gene:ENSRNOG00000016163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AF265360 // GenBank // Rattus norvegicus GLAST-1a mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NM_001289943 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (glial high affinity glutamate transporter), member 3 (Slc1a3), transcript variant Glast1c, mRNA. // chr2 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000044208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:79350464:79368197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT031059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// X63744 // GenBank // R.norvegicus mRNA for glutamate/aspartate transporter protein. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006232036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC679871 (LOC679871), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000005455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76748697:76757831:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT029039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001106416 // RefSeq // Rattus norvegicus S-phase kinase-associated protein 2, E3 ubiquitin protein ligase (Skp2), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:77593581:77621639:-1 gene:ENSRNOG00000016823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC166459 // GenBank // Rattus norvegicus S-phase kinase-associated protein 2 (p45), mRNA (cDNA clone MGC:187758 IMAGE:9027296), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77595187:77607110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106418 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 7 receptor (Il7r), mRNA. // chr2_JH620298_random // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006257698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 7 receptor (Il7r), transcript variant X1, mRNA. // chr2_JH620298_random // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023422 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:JH620298.1:23896:47908:-1 gene:ENSRNOG00000017413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2_JH620298_random // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048247 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:JH620298.1:25570:57343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2_JH620298_random // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2_JH620298_random // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:79503188:79724315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2_JH620298_random // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_022620 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm flagellar 2 (Spef2), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000023780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:77996983:78179103:-1 gene:ENSRNOG00000017442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000060000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:77996983:78179103:-1 gene:ENSRNOG00000017442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000068456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:77996983:78179103:-1 gene:ENSRNOG00000017442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AF102129 // GenBank // Rattus norvegicus KPL2 (Kpl2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC097318 // GenBank // Rattus norvegicus sperm flagellar 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7454851), complete cds. // chr2 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT031047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77997030:78107152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000057107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:79503188:79724315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT031049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000044842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:78129163:78296171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_138856 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 21 (Dnajc21), mRNA. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000024218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:84235133:84250946:1 gene:ENSRNOG00000017876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// AF492384 // GenBank // Rattus norvegicus putative regulation protein GS3 mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// BC086587 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:7309461), complete cds. // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC158554 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 21, mRNA (cDNA clone MGC:187225 IMAGE:7380100), complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:84228445:84250643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001029915 // RefSeq // Rattus norvegicus BRX1, biogenesis of ribosomes, homolog (S. cerevisiae) (Brix1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:84212803:84223679:1 gene:ENSRNOG00000018021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC098005 // GenBank // Rattus norvegicus brix domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:116151 IMAGE:7453609), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:84212807:84222312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001011947 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid induced 14 (Rai14), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:84073868:84128487:1 gene:ENSRNOG00000028872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:84073868:84128487:1 gene:ENSRNOG00000028872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// BC085775 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid induced 14, mRNA (cDNA clone MGC:93703 IMAGE:7096978), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:84094435:84125467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT029092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
GENSCAN00000041481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:83834931:83835296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000033369 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:83834741:83835296:1 gene:ENSRNOG00000050839 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_001008310 // RefSeq // Rattus norvegicus relaxin/insulin-like family peptide receptor 3 (Rxfp3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:83676999:83678429:1 gene:ENSRNOG00000023126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY633763 // GenBank // Rattus norvegicus relaxin-3/INSL7 receptor 1 (GPCR135) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY633764 // GenBank // Rattus norvegicus relaxin-3/INSL7 receptor 1 long form (GPCR135) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:83676999:83678429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001006976 // RefSeq // Rattus norvegicus threonyl-tRNA synthetase (Tars), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000051910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:83279780:83298533:1 gene:ENSRNOG00000019023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC083914 // GenBank // Rattus norvegicus threonyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:95288 IMAGE:7134406), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000030108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:83264986:83306593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT029086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT029087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1
NM_001047942 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00045 (LOC499541), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82994317:83000530:1 gene:ENSRNOG00000030171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047943 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00178 (LOC499542), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82933699:82942035:1 gene:ENSRNOG00000032427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT029082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_012868 // RefSeq // Rattus norvegicus natriuretic peptide receptor 3 (Npr3), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82741077:82801473:1 gene:ENSRNOG00000019184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// L27339 // GenBank // Rattus norvegicus (NPR-C) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// X78595 // GenBank // R.norvegicus mRNA homolog to natriuretic peptide clearance receptor. // chr2 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT029079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:82780566:82801377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT029080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000003609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:82741093:82754458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT029081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001009618 // RefSeq // Rattus norvegicus SUB1 homolog (S. cerevisiae) (Sub1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82656091:82670880:1 gene:ENSRNOG00000050563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// BC088346 // GenBank // Rattus norvegicus SUB1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109653 IMAGE:7368325), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ211681 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA83YJ15 mRNA sequence. // chr2 // 64 // 78 // 9 // 14 // 0 /// NONRATT029076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:82658280:82684206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_022940 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ domain containing 2 (Pdzd2), mRNA. // chr2 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82185700:82288609:1 gene:ENSRNOG00000013140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AF169411 // GenBank // Rattus norvegicus PAPIN mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:82185686:82288609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0
NM_001107654 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ11193 (RGD1306502), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ11193 (RGD1306502), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ11193 (RGD1306502), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:81805197:81821374:1 gene:ENSRNOG00000022745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:81805302:81843589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012927 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 6, type 2, K-cadherin (Cdh6), mRNA. // chr2 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:81528704:81594434:1 gene:ENSRNOG00000013535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// D25290 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for K-cadherin, complete cds. // chr2 // 94 // 89 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:81547644:81593419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT029069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NONRATT029069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_006224071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog (RGD1564125), mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000012928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:86329690:86336522:-1 gene:ENSRNOG00000009759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000022718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:93558788:93559252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_022300 // RefSeq // Rattus norvegicus brain abundant, membrane attached signal protein 1 (Basp1), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:97311486:97312150:-1 gene:ENSRNOG00000046313 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// D14441 // GenBank // Rattus norvegicus NAP-22 mRNA for acidic membrane protein of rat brain, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:97302061:97312150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT031110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000030328 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:97504433:97505107:-1 gene:ENSRNOG00000025157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000022270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:97504433:97505107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NONRATT031112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000003052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:97997403:97998176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:98100454:98113894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
ENSRNOT00000014549 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:98216493:98217069:-1 gene:ENSRNOG00000010943 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000035999 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:98100228:98100810:-1 gene:ENSRNOG00000022047 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_053925 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 10 (Psmd10), mRNA. // chr2 // 56 // 93 // 14 // 25 // 0 /// AB022014 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for gankyrin homologue, complete cds. // chr2 // 56 // 93 // 14 // 25 // 0 /// BC158584 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 10, mRNA (cDNA clone MGC:187342 IMAGE:8369120), complete cds. // chr2 // 68 // 93 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT031113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
NM_001108545 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 7 (Fbxl7), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 7 (Fbxl7), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000031170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:98744396:98993396:-1 gene:ENSRNOG00000024433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:98744396:98752150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000016111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:99934603:99958197:-1 gene:ENSRNOG00000012017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158613 // GenBank // Rattus norvegicus sertolin, mRNA (cDNA clone MGC:187493 IMAGE:7384798), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006224051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 105, member B (Fam105b), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// XM_006232089 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 105, member B (Fam105b), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000003333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:99929338:99950522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001037648 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 105, member A (Fam105a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000067638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:100047744:100070970:-1 gene:ENSRNOG00000012109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC107649 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 105, member A, mRNA (cDNA clone MGC:124675 IMAGE:7930470), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT031117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000003339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:100043614:100055067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1
XM_003749226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trio Rho guanine nucleotide exchange factor (Trio), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000016784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:100139159:100435855:-1 gene:ENSRNOG00000012148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000049793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:100178088:100435855:-1 gene:ENSRNOG00000012148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:100139159:100195089:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 37 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:100267738:100319728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 14 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT031120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000003332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:100202700:100262640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 22 // 59 // 1 /// NONRATT031121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 17 // 17 // 10 // 59 // 1
NONRATT031120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000014009 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:101940478:101940975:-1 gene:ENSRNOG00000010548 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:101940444:101940914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000059565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:104034185:104110203:-1 gene:ENSRNOG00000010888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ232932 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YN16 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:104034530:104110203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000014938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:104209952:104281884:-1 gene:ENSRNOG00000011066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:104209952:104281884:-1 gene:ENSRNOG00000011066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:104179803:104287827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_001004078 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 5 (epsilon) (Cct5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000015886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:104340316:104351466:-1 gene:ENSRNOG00000011632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC059165 // GenBank // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 5 (epsilon), mRNA (cDNA clone IMAGE:6890776), partial cds. // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// BC079441 // GenBank // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 5 (epsilon), mRNA (cDNA clone MGC:94989 IMAGE:7115414), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ229253 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YJ02 mRNA sequence. // chr2 // 94 // 52 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:104342040:104351464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT031139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT031141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT031142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT031140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
AY539924 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00173 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019291 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 2 (Car2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:107871643:107886834:-1 gene:ENSRNOG00000009629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC065577 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase II, mRNA (cDNA clone MGC:72487 IMAGE:5623601), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ212832 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YC03 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ213417 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YP08 mRNA sequence. // chr2 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ225962 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YI20 mRNA sequence. // chr2 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// FQ233398 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YA21 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// FQ233875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YA18 mRNA sequence. // chr2 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// FQ234291 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YI09 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:107875278:107885715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT031145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT031148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_019292 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 3 (Car3), mRNA. // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:107900583:107909291:-1 gene:ENSRNOG00000010079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AB030829 // GenBank // Rattus norvegicus CA3 mRNA for carbonic anhydrase III, complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AB030830 // GenBank // Rattus norvegicus CA3 mRNA for carbonic anhydrase III, complete cds. // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// AF037072 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase III (CA3) mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 79 // 20 // 23 // 0 /// BC061980 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72261 IMAGE:5597975), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ218670 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YH22 mRNA sequence. // chr2 // 64 // 86 // 16 // 25 // 0 /// M22413 // GenBank // Rat carbonic anhydrase III (CAIII) mRNA, complete cds. // chr2 // 71 // 72 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:107901166:107914584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001134993 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 13 (Car13), mRNA. // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000038546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108055053:108086130:-1 gene:ENSRNOG00000021323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
XM_006224082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E2F transcription factor 5 (E2f5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// XM_006224083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E2F transcription factor 5 (E2f5), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000044847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108121173:108136514:-1 gene:ENSRNOG00000010760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// U31668 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor E2F-5 mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:108121766:108327759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1 /// GENSCAN00000004107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70689076:70714187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001100645 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 (Lrrcc1), mRNA. // chr2 // 71 // 93 // 20 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108155535:108184411:-1 gene:ENSRNOG00000010891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 93 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:108121766:108327759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 86 // 70 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT031153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001011948 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 12 (Slc7a12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000051741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108332502:108432980:-1 gene:ENSRNOG00000033830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC078940 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:93774 IMAGE:7109204), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT031158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000043013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:108366433:108691051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_001100645 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and coiled-coil centrosomal protein 1 (Lrrcc1), mRNA. // chr2 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000014762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108155535:108184411:-1 gene:ENSRNOG00000010891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
ENSRNOT00000042494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108221927:108325908:-1 gene:ENSRNOG00000028985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC079349 // GenBank // Rattus norvegicus similar to solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 12, mRNA (cDNA clone MGC:94806 IMAGE:7107785), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT031157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000013362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:108121766:108327759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
XM_001066729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 7 member 13-like (LOC688389), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_003753571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 7 member 13-like (LOC688389), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059424 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:108517002:108536153:-1 gene:ENSRNOG00000028582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:108366433:108691051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001024978 // RefSeq // Rattus norvegicus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), mRNA. // chrU // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// XM_006232120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant X5, mRNA. // chrU // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RALY RNA binding protein-like (Ralyl), transcript variant X6, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108813893:109080615:-1 gene:ENSRNOG00000011400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT031160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
ENSRNOT00000029830 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:110335674:110336316:1 gene:ENSRNOG00000023999 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:110335326:110336499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001017466 // RefSeq // Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 4C (Chmp4c), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113334160:113397419:-1 gene:ENSRNOG00000010238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC092576 // GenBank // Rattus norvegicus chromatin modifying protein 4C, mRNA (cDNA clone MGC:108776 IMAGE:7122321), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113334942:113397309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_024489 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 10 (Zbtb10), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:114442396:114479723:-1 gene:ENSRNOG00000011319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF091457 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein RIN ZF mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT031174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:114387857:114499084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT031175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
ENSRNOT00000015194 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:114648617:114649223:-1 gene:ENSRNOG00000011429 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 75 // 100 // 12 // 16 // 0
NM_001047947 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00056 (LOC499573), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:114829553:114851456:-1 gene:ENSRNOG00000033449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT031177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT031176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NM_053440 // RefSeq // Rattus norvegicus stathmin 2 (Stmn2), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:115167506:115215213:-1 gene:ENSRNOG00000011705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF306458 // GenBank // Rattus norvegicus SCG10 (Scg10) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC087660 // GenBank // Rattus norvegicus stathmin-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:105372 IMAGE:7313867), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:115166949:115294429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
XM_002729028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome subunit beta type 6-like (LOC100360846), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_003753554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome subunit beta type 6-like (LOC100360846), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000015746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:115773840:115774556:-1 gene:ENSRNOG00000011827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000026507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:56888980:56891231:1 gene:ENSRNOG00000019551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NM_057099 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 6 (Psmb6), mRNA. // chr2 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0 /// BC058451 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 6, mRNA (cDNA clone MGC:72726 IMAGE:6891542), complete cds. // chr2 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0 /// FQ217385 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA28YB21 mRNA sequence. // chr2 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:115773840:115775362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000026989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:56888980:56891231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000015865 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:115888233:115888840:-1 gene:ENSRNOG00000011878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 50 // 9 // 13 // 0
ENSRNOT00000015900 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:116056301:116057107:-1 gene:ENSRNOG00000011948 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001107661 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, C2HC-type containing 1A (Zc2hc1a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000066966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:116224313:116261506:-1 gene:ENSRNOG00000022356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC168976 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 164, member A, mRNA (cDNA clone MGC:189313 IMAGE:9033370), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:116226137:116261472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT031181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_053772 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase (cAMP-dependent, catalytic) inhibitor alpha (Pkia), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase (cAMP-dependent, catalytic) inhibitor alpha (Pkia), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:116338940:116411705:-1 gene:ENSRNOG00000012095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211701 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA83YB03 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// L02615 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP-dependent protein kinase inhibitor (PKI) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:116340304:116351925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT031183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001191702 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger homeobox 4 (Zfhx4), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:118157860:118345227:-1 gene:ENSRNOG00000008765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:118313846:118320739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000034283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:118160584:118197121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSRNOT00000071824 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:118348568:118348904:-1 gene:ENSRNOG00000046362 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
NM_001108939 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatocyte nuclear factor 4, gamma (Hnf4g), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006232165 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hepatocyte nuclear factor 4, gamma (Hnf4g), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:119962231:120107977:-1 gene:ENSRNOG00000008971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:119884777:119985446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
XM_006224113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 3, structural gene Y-linked (Eif2s3y), mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// XM_006232171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 3, structural gene Y-linked (Eif2s3y), mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0
FQ217911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA14YD18 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT059021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000059203 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:122039094:122039481:-1 gene:ENSRNOG00000038752 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_019138 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 7, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp7b1), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:122442002:122610354:-1 gene:ENSRNOG00000009730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:122431843:122474400:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
XM_002729029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L30-like (LOC100361143), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L30-like (LOC100361143), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:122658208:122658549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000008088 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:122782580:122782995:-1 gene:ENSRNOG00000006161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:122782627:122783011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001106425 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 1 (Armc1), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:123653834:123701646:-1 gene:ENSRNOG00000013253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC158721 // GenBank // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187869 IMAGE:9090461), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:123625476:123740768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_031080 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 7A (Pde7a), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:123767824:123856129:-1 gene:ENSRNOG00000013048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// U77880 // GenBank // Rattus norvegicus rolipram-insensitive phosphodiesterase type 7 (RPDE7-1) mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_031019 // RefSeq // Rattus norvegicus corticotropin releasing hormone (Crh), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124182919:124184783:-1 gene:ENSRNOG00000012703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124183377:124242533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001107664 // RefSeq // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 3 homolog (human) (Hps3), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124523995:124551506:-1 gene:ENSRNOG00000031406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124524500:124563352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0
NM_031043 // RefSeq // Rattus norvegicus glycogenin 1 (Gyg1), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124636898:124676137:-1 gene:ENSRNOG00000011146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF021343 // GenBank // Rattus norvegicus glycogenin mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC070944 // GenBank // Rattus norvegicus glycogenin 1, mRNA (cDNA clone MGC:91655 IMAGE:7103004), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000008613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124666103:124777635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_019300 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase A3, mast cell (Cpa3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000014970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124745513:124777636:-1 gene:ENSRNOG00000011181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124666103:124777635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_012533 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase B1 (tissue) (Cpb1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxypeptidase B1 (tissue) (Cpb1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000043381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124787937:124818168:-1 gene:ENSRNOG00000030904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124778290:124808879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT031227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_031009 // RefSeq // Rattus norvegicus angiotensin II receptor, type 1b (Agtr1b), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus angiotensin II receptor, type 1b (Agtr1b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124879262:124954378:-1 gene:ENSRNOG00000010640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// M87003 // GenBank // Rat angiotensin II type-1 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// NONRATT031228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001062720 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_574908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224090 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 2 (Naaladl2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000018392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:129330184:129649581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_053868 // RefSeq // Rattus norvegicus neuroligin 1 (Nlgn1), mRNA. // chr2 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// XM_006232193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuroligin 1 (Nlgn1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuroligin 1 (Nlgn1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000041111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:130772394:131486085:-1 gene:ENSRNOG00000032576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000043276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:130772394:131486085:-1 gene:ENSRNOG00000032576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// U22952 // GenBank // Rattus norvegicus neuroligin I mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 83 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:130772394:130778701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT031234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_001108547 // RefSeq // Rattus norvegicus epithelial cell transforming 2 (Ect2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000018055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:132490052:132546997:-1 gene:ENSRNOG00000024365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000067467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:132490052:132546997:-1 gene:ENSRNOG00000024365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000000450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:132525541:132546997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:132482480:132524259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// NONRATT031236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// NONRATT031237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT031239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001191704 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 3B (Fndc3b), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:132830966:133061245:-1 gene:ENSRNOG00000024089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:132831024:132912754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT031245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001106423 // RefSeq // Rattus norvegicus MDS1 and EVI1 complex locus (Mecom), mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MDS1 and EVI1 complex locus (Mecom), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MDS1 and EVI1 complex locus (Mecom), transcript variant X8, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:137080583:137139270:-1 gene:ENSRNOG00000012645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:137082022:137127063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001164438 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 212 (Tmem212), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001164439 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 212 (Tmem212), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 212 (Tmem212), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:133290901:133321820:-1 gene:ENSRNOG00000012608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:133304080:133321820:-1 gene:ENSRNOG00000012608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT031251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_053457 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 11 (Cldn11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:135520050:135533355:-1 gene:ENSRNOG00000010263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF324043 // GenBank // Rattus norvegicus claudin-11 mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 63 // 15 // 17 // 0 /// BC070927 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 11, mRNA (cDNA clone MGC:91580 IMAGE:7096642), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135521079:135533160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT031258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000013191 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:135562877:135584672:-1 gene:ENSRNOG00000009899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135562877:135584672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT031264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_032059 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, iota (Prkci), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000012924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:135636956:135697732:-1 gene:ENSRNOG00000009652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// EU517502 // GenBank // Rattus norvegicus strain W protein kinase C iota mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135639525:135663661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001025147 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 160 (Gpr160), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 107 // 107 // 0 /// ENSRNOT00000012560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:135800317:135857718:-1 gene:ENSRNOG00000009487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 107 // 107 // 0 /// BC082060 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 160, mRNA (cDNA clone MGC:95215 IMAGE:7132467), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 107 // 107 // 0 /// NONRATT031268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 57 // 59 // 61 // 0
NM_001034129 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC62 homolog (S. cerevisiae) (Sec62), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000012240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:135885423:135914374:-1 gene:ENSRNOG00000009057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT031271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000030289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135885423:135914331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// NONRATT031273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_001191703 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 7 (Samd7), mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000033449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:135937699:135952306:-1 gene:ENSRNOG00000027995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000030271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135930246:135979394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
XM_006224114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and IQ motif containing 4 (Lrriq4), partial mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// XM_006232242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and IQ motif containing 4 (Lrriq4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000011932 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:136041072:136066272:-1 gene:ENSRNOG00000009004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000058919 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:136041072:136071726:-1 gene:ENSRNOG00000009004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:136041106:136066700:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC168195 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7111220. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001012178 // RefSeq // Rattus norvegicus myoneurin (Mynn), mRNA. // chr2 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:136092041:136107672:-1 gene:ENSRNOG00000027923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// BC089853 // GenBank // Rattus norvegicus myoneurin, mRNA (cDNA clone MGC:108895 IMAGE:7379696), complete cds. // chr2 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:136086281:136102778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT031279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_001104560 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M beta member 3 (Kcnmb3), mRNA. // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000058860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138528371:138542202:-1 gene:ENSRNOG00000027836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// AB297662 // GenBank // Rattus norvegicus Kcnmb3 mRNA for potassium large conductance calcium-activated channel subfamily M beta member 3, complete cds. // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT031289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138526799:138552518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001013910 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 4 (Gnb4), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000014871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138634564:138658837:-1 gene:ENSRNOG00000011070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0 /// AY552804 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein beta 4 subunit (Gnb4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0 /// BC097370 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:114405 IMAGE:7444022), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT031294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 70 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT031295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 77 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000016436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138634950:138656641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 39 // 53 // 1 /// NONRATT031293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 17 // 17 // 9 // 53 // 1
NM_001037183 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L47 (Mrpl47), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138779651:138790789:-1 gene:ENSRNOG00000011639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC105820 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L47, mRNA (cDNA clone MGC:125055 IMAGE:7369885), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138780819:138788160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT031298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// NONRATT031300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
ENSRNOT00000058810 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:138791094:138791447:-1 gene:ENSRNOG00000038552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
NM_173152 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 5-like (Pex5l), mRNA. // chr2 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138979958:139185885:-1 gene:ENSRNOG00000011211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF324454 // GenBank // Rattus norvegicus TPR-containing Rab8b-interacting protein mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:139031718:139044310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 28 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138979958:139007288:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT031307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NONRATT031305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001107667 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 39 (Ccdc39), mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000065469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:139933459:139971211:-1 gene:ENSRNOG00000011440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000040062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:139934533:139983967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT031311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0
NM_001134640 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (Dnajc19), mRNA. // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000071944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:140149972:140174575:1 gene:ENSRNOG00000049819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// XM_006232259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 19 (Dnajc19), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// FQ212146 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA68YA07 mRNA sequence. // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT029302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:140124598:140154030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001107668 // RefSeq // Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 1 (Dcun1d1), mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DCN1-like protein 1-like (LOC100912352), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232264 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DCN1-like protein 1-like (LOC100912352), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142111797:142274371:-1 gene:ENSRNOG00000012734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// FQ209587 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YL01 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ234878 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YF05 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142115108:142156735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142186646:142275011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT031324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT031326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT031328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001009653 // RefSeq // Rattus norvegicus methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1 (alpha) (Mccc1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000018942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142186429:142317803:-1 gene:ENSRNOG00000013293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC088473 // GenBank // Rattus norvegicus methylcrotonoyl-Coenzyme A carboxylase 1 (alpha), mRNA (cDNA clone MGC:95141 IMAGE:7128872), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000047165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142301808:142317785:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT031326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000036938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142186646:142275011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 15 // 39 // 1
XM_006224101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 144B (Ccdc144b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// XM_006224102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 144B (Ccdc144b), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// XM_006224104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 144B (Ccdc144b), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// XM_006224105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 144B (Ccdc144b), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// XM_006232291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 144B (Ccdc144b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_198199 // RefSeq // Rattus norvegicus pyroglutamylated RFamide peptide receptor (Qrfpr), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142517181:142568697:-1 gene:ENSRNOG00000014414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB109630 // GenBank // Rattus norvegicus AQ27 mRNA for QRFP receptor, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142517181:142525996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013132 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A5 (Anxa5), mRNA. // chr2 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142777627:142808368:-1 gene:ENSRNOG00000014453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081855 // GenBank // Rattus norvegicus annexin A5, mRNA (cDNA clone MGC:93655 IMAGE:7192977), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ213209 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YB21 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// M21730 // GenBank // Rat lipocortin-V mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142778033:142780673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT031335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT031337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT031338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT031339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142789510:142804465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_053702 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin A2 (Ccna2), mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142891080:142897322:-1 gene:ENSRNOG00000015423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// AY623027 // GenBank // Rattus norvegicus clone E6-A cyclin A2 variant mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AY623028 // GenBank // Rattus norvegicus clone E6-B cyclin A2 variant mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC127462 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin A2, mRNA (cDNA clone MGC:156527 IMAGE:8373429), complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT031343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142891660:143019468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001012180 // RefSeq // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 7 (Bbs7), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000021453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142898506:142938346:-1 gene:ENSRNOG00000015816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// BC081968 // GenBank // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 7, mRNA (cDNA clone MGC:94101 IMAGE:7125501), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT031345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000008977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142891660:143019468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 24 // 46 // 1
NM_021771 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 3 (Trpc3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006232283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 3 (Trpc3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XR_351640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 3 (Trpc3), transcript variant X4, misc_RNA. // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000046700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142945396:143011755:-1 gene:ENSRNOG00000016070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// JN160741 // GenBank // Rattus norvegicus strain Wistar transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 splice variant c (TrpC3c) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142891660:143019468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB022331 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ion channel from heart, complete cds. // chr2 // 84 // 91 // 27 // 32 // 0 /// NONRATT031347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT031349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
ENSRNOT00000017919 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:143043415:143044129:-1 gene:ENSRNOG00000013249 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 50 // 95 // 10 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143020916:143044129:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
XM_006232271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19 (RGD1307100), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19 (RGD1307100), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143191113:143317876:1 gene:ENSRNOG00000038436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143177013:143279309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053836 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 2 (Il2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143460866:143465570:-1 gene:ENSRNOG00000017348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M22899 // GenBank // Rat interleukin 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143461124:143465556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT031350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108943 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 21 (Il21), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143573215:143580530:-1 gene:ENSRNOG00000017376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ387062 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 21 (IL-21) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143575737:143580530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001271151 // RefSeq // Rattus norvegicus centrin 4 (Cetn4), mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143653652:143655150:-1 gene:ENSRNOG00000026162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000058523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143653652:143655150:-1 gene:ENSRNOG00000026162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 68 // 16 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000065384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143653652:143655150:-1 gene:ENSRNOG00000026162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143611185:143656986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT031352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_181363 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 6 (Nudt6), mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006232267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 6 (Nudt6), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143742244:143757825:-1 gene:ENSRNOG00000017420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143742244:143757825:-1 gene:ENSRNOG00000017420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AF188995 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast growth factor isoform 1 (GFG) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// AF188996 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast growth factor putative isoform 2 (GFG) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// U58289 // GenBank // Rattus norvegicus antisense basic fibroblast growth factor GFG mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143742338:143758836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT031354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000026420 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:144075179:144075935:-1 gene:ENSRNOG00000019460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:144062395:144126734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000043647 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:144148817:144149874:-1 gene:ENSRNOG00000029679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT031356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 65 // 13 // 13 // 0
NM_001191606 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 50 (Ankrd50), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:144894601:144925135:-1 gene:ENSRNOG00000010534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ231255 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA74YH08 mRNA sequence. // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:144896720:144943481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000029543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:145789333:145790316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_001047910 // RefSeq // Rattus norvegicus major facilitator superfamily domain containing 8 (Mfsd8), mRNA. // chr2 // 96 // 68 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:147311814:147384522:-1 gene:ENSRNOG00000012729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 68 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147310301:147384384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT031365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1
XR_344340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC684549 (LOC684549), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 75 // 61 // 15 // 20 // 0 /// BC078989 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700034I23, mRNA (cDNA clone MGC:93887 IMAGE:7112531), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AY237129 // GenBank // Rattus norvegicus HCBP6 mRNA, complete cds. // chr2 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// XM_006224110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC684549 (LOC684549), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT031364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT031366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147310301:147384384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001008374 // RefSeq // Rattus norvegicus progesterone receptor membrane component 2 (Pgrmc2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:147587585:147603481:-1 gene:ENSRNOG00000014051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083571 // GenBank // Rattus norvegicus progesterone receptor membrane component 2, mRNA (cDNA clone MGC:93874 IMAGE:7112203), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147588751:147603474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_153740 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel and clathrin linker 1 (Sclt1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006232296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sodium channel and clathrin linker 1 (Sclt1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:148123775:148271208:-1 gene:ENSRNOG00000014139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF421190 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel associated protein 1A mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF421191 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel associated protein 1B mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF427094 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel Nav1.8-binding protein SAP1A mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// AF427095 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel Nav1.8-binding protein SAP1B mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 86 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000053237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:148115585:148272221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT031372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
ENSRNOT00000034698 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:153664916:153666176:-1 gene:ENSRNOG00000023905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
ENSRNOT00000011645 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:155668973:155670295:-1 gene:ENSRNOG00000008655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:155669065:155693281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_001106429 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 4-like (Pabpc4l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 4-like (Pabpc4l), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:150259317:150261307:-1 gene:ENSRNOG00000029749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:150259445:150260557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006232315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC295012 (RGD1563562), mRNA. // chrU // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// XM_006232316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC678817 (LOC678817), mRNA. // chrU // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// ENSRNOT00000058288 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:151850560:151911636:-1 gene:ENSRNOG00000042222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// GENSCAN00000014684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:151849335:151963650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// GENSCAN00000014687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:152103315:152235006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
ENSRNOT00000042248 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:157975075:157975452:1 gene:ENSRNOG00000029493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000057386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:157975075:157975452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001134511 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700018B24 (RGD1307595), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000014928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:157678584:157681890:1 gene:ENSRNOG00000011239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:157678527:157678943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 45 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT029389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000040927 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:157199752:157201661:1 gene:ENSRNOG00000029072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:157199752:157201661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NM_001100524 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin 18 (Pcdh18), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:158301955:158315635:-1 gene:ENSRNOG00000009949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC168716 // GenBank // Rattus norvegicus protocadherin 18, mRNA (cDNA clone MGC:188762 IMAGE:9099515), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:158303013:158315192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107673 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (anionic amino acid transporter light chain, xc- system), member 11 (Slc7a11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 7 (anionic amino acid transporter light chain, xc- system), member 11 (Slc7a11), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:158930294:159004611:-1 gene:ENSRNOG00000010210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:158937549:159045137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012181 // RefSeq // Rattus norvegicus E74-like factor 2 (Elf2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0 /// XM_006232328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E74-like factor 2 (Elf2), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:159783380:159807111:-1 gene:ENSRNOG00000010815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// BC083598 // GenBank // Rattus norvegicus E74-like factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:94337 IMAGE:7132941), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// NM_001033909 // RefSeq // Rattus norvegicus E74-like factor 2 (Elf2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1 /// ENSRNOT00000047635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:159783380:159860729:-1 gene:ENSRNOG00000010815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1 /// BC083585 // GenBank // Rattus norvegicus E74-like factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:94231 IMAGE:7131145), complete cds. // chr2 // 80 // 80 // 36 // 45 // 1 /// GENSCAN00000056034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:159784537:159807111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT031387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT031388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 19 // 45 // 1 /// NONRATT031389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// NONRATT031390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1
NONRATT031387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001109556 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondria-localized glutamic acid-rich protein (Mgarp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondria-localized glutamic acid-rich protein (Mgarp), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006232331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondria-localized glutamic acid-rich protein (Mgarp), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:159919903:159928045:-1 gene:ENSRNOG00000011923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:159895096:159928013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT031391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_344360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, subcomplex unknown, 1 (Ndufc1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_351688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1, subcomplex unknown, 1 (Ndufc1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058190 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:159935705:159939478:-1 gene:ENSRNOG00000038218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// FQ217680 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA20YE21 mRNA sequence. // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT031392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT031393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001109558 // RefSeq // Rattus norvegicus SET domain containing (lysine methyltransferase) 7 (Setd7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:160051126:160093343:-1 gene:ENSRNOG00000013045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:160051906:160101136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001107675 // RefSeq // Rattus norvegicus mastermind like 3 (Drosophila) (Maml3), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044481 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:160209608:160218015:-1 gene:ENSRNOG00000048907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:160208597:160236152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT031400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:160675652:160719731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_001054658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NHL repeat containing 3 (Nhlrc3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_227139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NHL repeat containing 3 (Nhlrc3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014562 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:162358223:162369485:-1 gene:ENSRNOG00000010843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:162330789:162368809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001245978 // RefSeq // Rattus norvegicus Fras1 related extracellular matrix protein 2 (Frem2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000031487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:162430795:162568910:-1 gene:ENSRNOG00000021670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AB612236 // GenBank // Rattus norvegicus Frem2 mRNA for Fras1 related extracellular matrix protein 2, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000028685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:162430880:162488091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0
NM_001004262 // RefSeq // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 6 (Cog6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006232334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 6 (Cog6), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:161883500:161920986:-1 gene:ENSRNOG00000013660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC079442 // GenBank // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 6, mRNA (cDNA clone MGC:94990 IMAGE:7115484), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ225755 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA48YL03 mRNA sequence. // chr2 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:161883674:161920984:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 71 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT031421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT031422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1
ENSRNOT00000039100 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:162653532:162654131:-1 gene:ENSRNOG00000021595 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001126080 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-fold modifier 1 (Ufm1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:162779819:162787960:-1 gene:ENSRNOG00000038176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091395 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-fold modifier 1, mRNA (cDNA clone MGC:109501 IMAGE:7323172), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006232355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-fold modifier 1 (Ufm1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT031431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:162782939:162819693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006224138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Transcription elongation factor B polypeptide 3 binding protein 1 (RGD1564472), mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006232358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Transcription elongation factor B polypeptide 3 binding protein 1 (RGD1564472), mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000049320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:160431566:160433257:1 gene:ENSRNOG00000033337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000025123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:160431566:160433425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000017993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:160331349:160337851:1 gene:ENSRNOG00000013434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// FQ230358 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YF24 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// FQ233209 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YM02 mRNA sequence. // chr2 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// NM_001106432 // RefSeq // Rattus norvegicus exosome component 8 (Exosc8), mRNA. // chr2 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// NONRATT029406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0
NM_001044263 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory factor X-associated protein (Rfxap), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:163630968:163635150:-1 gene:ENSRNOG00000028382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098816 // GenBank // Rattus norvegicus regulatory factor X-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:112861 IMAGE:7377196), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163631820:163657771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001109580 // RefSeq // Rattus norvegicus serine-rich and transmembrane domain containing 1 (Sertm1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine-rich and transmembrane domain containing 1 (Sertm1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:163721932:163741483:-1 gene:ENSRNOG00000014046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163676300:163728497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT031439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011949 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin A1 (Ccna1), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000040002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:163876264:163886211:-1 gene:ENSRNOG00000014052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC079234 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin A1, mRNA (cDNA clone MGC:94315 IMAGE:7132591), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006232360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin A1 (Ccna1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT031442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// GENSCAN00000015736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163876380:163926014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONRATT031440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT031443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT031444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT031445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
XM_006224120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552324 (LOC102552324), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006224121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552324 (LOC102552324), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006224126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552324 (LOC102552324), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552324 (LOC102552324), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552324 (LOC102552324), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:164201820:164223890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_006224127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurobeachin-like (RGD1562629), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000020883 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:164462324:164825633:-1 gene:ENSRNOG00000014747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020916 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:164462324:164825633:-1 gene:ENSRNOG00000014747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074171 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:164425380:164473054:-1 gene:ENSRNOG00000014747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:164414983:164564394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// GENSCAN00000054718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:164757064:164880814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
XM_006224127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurobeachin-like (RGD1562629), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:164757064:164880814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
XM_006224127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurobeachin-like (RGD1562629), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000054717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:164893095:165029012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1 /// NONRATT031455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// GENSCAN00000054718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:164757064:164880814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
XM_006224127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurobeachin-like (RGD1562629), transcript variant X4, mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001106434 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 4 L six family member 1 (Tm4sf1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:166792815:166802011:-1 gene:ENSRNOG00000015812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:166794341:166801672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT031458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001024869 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain containing transcription regulator 1 (Wwtr1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:166985078:167101346:-1 gene:ENSRNOG00000016617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097968 // GenBank // Rattus norvegicus WW domain containing transcription regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:116096 IMAGE:7441820), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:166985267:166990553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT031461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_030873 // RefSeq // Rattus norvegicus profilin 2 (Pfn2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:167359674:167365375:-1 gene:ENSRNOG00000017427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000063986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:167361175:167365375:-1 gene:ENSRNOG00000017427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000064506 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:167453404:167457607:-1 gene:ENSRNOG00000045730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// AF228736 // GenBank // Rattus norvegicus profilin IIa (Pfn2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// AF228737 // GenBank // Rattus norvegicus profilin IIa (Pfn2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY004289 // GenBank // Rattus norvegicus profilin II mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087013 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7131700. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:167360880:167391460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:167453109:167528852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_030835 // RefSeq // Rattus norvegicus stress-associated endoplasmic reticulum protein 1 (Serp1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168137271:168139485:-1 gene:ENSRNOG00000011763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AB018546 // GenBank // Rattus norvegicus SERP1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF100470 // GenBank // Rattus norvegicus ribosome attached membrane protein 4 (RAMP4) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC061854 // GenBank // Rattus norvegicus stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72421 IMAGE:5621665), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000047649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168209278:168225673:-1 gene:ENSRNOG00000031588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY321336 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-141 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001024300 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate-rich 6 (Erich6), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168229962:168256064:-1 gene:ENSRNOG00000013662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168203909:168243482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT031469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_134457 // RefSeq // Rattus norvegicus siah E3 ubiquitin protein ligase 2 (Siah2), mRNA. // chr2 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168292053:168309802:-1 gene:ENSRNOG00000013703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AB067815 // GenBank // Rattus norvegicus Siah2 mRNA for siah2 protein, complete cds. // chr2 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT031470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168303293:168312556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_153299 // RefSeq // Rattus norvegicus clarin 1 (Clrn1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168473047:168511371:-1 gene:ENSRNOG00000042477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF482698 // GenBank // Rattus norvegicus Usher syndrome type III (Ush3) mRNA, complete cds. // chr2 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// NONRATT031473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT031474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000023104 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:168522862:168523782:-1 gene:ENSRNOG00000017199 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000055503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168512842:168583073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001109510 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 171 (Gpr171), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168738979:168744861:-1 gene:ENSRNOG00000025297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168739591:168740280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_133577 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2ry14), mRNA. // chr2 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// XM_006232396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2ry14), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2ry14), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14 (P2ry14), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168751389:168752307:-1 gene:ENSRNOG00000013872 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// BC083545 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 14, mRNA (cDNA clone MGC:93098 IMAGE:7191572), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U76206 // GenBank // Rattus norvegicus VTR 15-20 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168751291:168752307:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT031476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107677 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 87 (Gpr87), mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006232401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 87 (Gpr87), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168817149:168818213:-1 gene:ENSRNOG00000013894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168767662:168821982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT031477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001002853 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 13 (P2ry13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168848655:168849665:-1 gene:ENSRNOG00000029756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY639875 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y13 (P2ry13) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168848655:168849665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022800 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 12 (P2ry12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 12 (P2ry12), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 12 (P2ry12), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168873858:168876803:-1 gene:ENSRNOG00000013902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF313450 // GenBank // Rattus norvegicus P2Y12 platelet ADP receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168873952:168879179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198768 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 10 (Igsf10), mRNA. // chr2 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_006232405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 10 (Igsf10), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000018628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:168967575:168996281:-1 gene:ENSRNOG00000013917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY273816 // GenBank // Rattus norvegicus bone specific CMF608 mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:168967644:169013690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001061908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein C130079G13 (RGD1559622), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_227182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein C130079G13 (RGD1559622), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035057 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:169147767:169157230:-1 gene:ENSRNOG00000025219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057821 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:169147767:169153858:-1 gene:ENSRNOG00000025219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001107678 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36 (Dhx36), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:172178850:172217986:-1 gene:ENSRNOG00000014599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:172181435:172217910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT031485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138891 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 149 (Gpr149), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:172232556:172307498:-1 gene:ENSRNOG00000014793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY030276 // GenBank // Rattus norvegicus orphan seven transmembrane receptor (Ieda) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000033266 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:173146557:173147516:-1 gene:ENSRNOG00000028772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173146582:173193580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT031491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NONRATT031491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
XM_006224142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane emp24 domain-containing protein 2-like (RGD1560703), mRNA. // chr2 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// XM_006232456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane emp24 domain-containing protein 2-like (RGD1560703), mRNA. // chr2 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000053366 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:86819488:86819608:1 gene:ENSRNOG00000035243 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001191707 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, eta 1 (Plch1), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006232442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, eta 1 (Plch1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000057724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:173641410:173802758:-1 gene:ENSRNOG00000009955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// FQ211591 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YN08 mRNA sequence. // chr2 // 91 // 96 // 40 // 44 // 0 /// GENSCAN00000005614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173641410:173715341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0
NM_001127562 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein E130311K13 (RGD1565059), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein E130311K13 (RGD1565059), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:173869856:173892479:-1 gene:ENSRNOG00000021324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein E130311K13 (RGD1565059), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000051188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173870296:173926901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_022252 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1 (Slc33a1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000013392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:173904053:173926434:-1 gene:ENSRNOG00000010023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC078832 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 33 (acetyl-CoA transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93450 IMAGE:7132173), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:173870296:173926901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT031498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT031500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000033591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:174058758:174084595:-1 gene:ENSRNOG00000028443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000057637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:174058304:174081708:-1 gene:ENSRNOG00000028443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:174058304:174084775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001099502 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 46 (Vom2r46), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:174115388:174148481:-1 gene:ENSRNOG00000030104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:174115331:174199629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT031504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001099506 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 47 (Vom2r47), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:174744152:174773776:-1 gene:ENSRNOG00000028345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:174744152:174780322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_031120 // RefSeq // Rattus norvegicus signal sequence receptor, gamma (Ssr3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014912 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:175399773:175410993:-1 gene:ENSRNOG00000011148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC062015 // GenBank // Rattus norvegicus signal sequence receptor, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:72411 IMAGE:5621495), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XR_344409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554278 (LOC102554278), transcript variant X1, ncRNA. // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// XR_351738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554278 (LOC102554278), transcript variant X1, ncRNA. // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001014171 // RefSeq // Rattus norvegicus ventricular zone expressed PH domain-containing 1 (Veph1), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:177231518:177513886:-1 gene:ENSRNOG00000012427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC087055 // GenBank // Rattus norvegicus ventricular zone expressed PH domain homolog 1 (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:94066 IMAGE:7123921), complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT031525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:177262068:177352043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_013028 // RefSeq // Rattus norvegicus short stature homeobox 2 (Shox2), mRNA. // chr2 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:183469829:183478421:-1 gene:ENSRNOG00000012478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:183442866:183478702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_031655 // RefSeq // Rattus norvegicus latexin (Lxn), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:183977969:183983852:-1 gene:ENSRNOG00000013572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081763 // GenBank // Rattus norvegicus latexin, mRNA (cDNA clone MGC:93322 IMAGE:7125782), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ220594 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YF08 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U40260 // GenBank // Rattus norvegicus tissue carboxypeptidase inhibitor (TCI) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:183978200:183983668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001014790 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 1 (Rarres1), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:184000125:184034599:-1 gene:ENSRNOG00000037853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY936478 // GenBank // Rattus norvegicus tazarotene-induced protein 1 (Rarres1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC105631 // GenBank // Rattus norvegicus retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 1, mRNA (cDNA clone MGC:124894 IMAGE:7386690), complete cds. // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT031534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184000562:184021261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184033608:184036757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_001065668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus P2Y purinoceptor 4-like (LOC310487), mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_001077210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus P2Y purinoceptor 4-like (LOC310487), mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000034690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184115786:184203953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000038121 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:184847390:184847963:-1 gene:ENSRNOG00000028561 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013911 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 80 homolog (Chlamydomonas) (Ift80), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000013216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:184867652:184961866:-1 gene:ENSRNOG00000009808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC081931 // GenBank // Rattus norvegicus intraflagellar transport 80 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:93952 IMAGE:7113994), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC081937 // GenBank // Rattus norvegicus intraflagellar transport 80 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:93991 IMAGE:7115382), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000053332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184868063:184947806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001108945 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 59 (Trim59), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 59 (Trim59), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:184991028:185002731:-1 gene:ENSRNOG00000010515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168884 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 59, mRNA (cDNA clone MGC:189139 IMAGE:9035331), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:184992456:184993667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000014384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185044071:185101033:-1 gene:ENSRNOG00000010768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ224515 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA63YI07 mRNA sequence. // chr2 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT031542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT031543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000014384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185044071:185101033:-1 gene:ENSRNOG00000010768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ224515 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA63YI07 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT031542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT031543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001014793 // RefSeq // Rattus norvegicus karyopherin alpha 4 (importin alpha 3) (Kpna4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000014384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185044071:185101033:-1 gene:ENSRNOG00000010768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// AY779028 // GenBank // Rattus norvegicus karyopherin alpha 4 (Kpna4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ224515 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA63YI07 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000053327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:185045950:185087262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 79 // 11 // 14 // 1
NM_001013158 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (globoside blood group) (B3galnt1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185583757:185613045:-1 gene:ENSRNOG00000012019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079206 // GenBank // Rattus norvegicus beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94268 IMAGE:7131789), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108318 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit A (Atp6v1a), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65638470:65691322:1 gene:ENSRNOG00000001992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ211993 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA73YH15 mRNA sequence. // chr2 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012318 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:185674828:185676668:-1 gene:ENSRNOG00000009293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:185674828:185676582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65664940:65689212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT031549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000035482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:185686408:185688558:-1 gene:ENSRNOG00000028120 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:185687428:185695766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 75 // 8 // 9 // 0
NM_001271299 // RefSeq // Rattus norvegicus serine palmitoyltransferase, small subunit B (Sptssb), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001271301 // RefSeq // Rattus norvegicus serine palmitoyltransferase, small subunit B (Sptssb), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine palmitoyltransferase, small subunit B (Sptssb), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000012422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:186020424:186049284:-1 gene:ENSRNOG00000009388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
AY539879 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00128 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000021787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:188576439:188578201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_013061 // RefSeq // Rattus norvegicus sucrase-isomaltase (alpha-glucosidase) (Si), mRNA. // chr2 // 76 // 100 // 38 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000046681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:189563593:189643699:-1 gene:ENSRNOG00000031067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// L25926 // GenBank // Rat sucrase-isomaltase (SI) mRNA, complete cds. // chr2 // 76 // 100 // 38 // 50 // 0 /// GENSCAN00000010912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:189538935:189642037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 31 // 31 // 0
NM_001107683 // RefSeq // Rattus norvegicus SLIT and NTRK-like family, member 3 (Slitrk3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLIT and NTRK-like family, member 3 (Slitrk3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:189795359:189803411:-1 gene:ENSRNOG00000009821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:189795401:189798340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022942 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrylcholinesterase (Bche), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:190443044:190536106:-1 gene:ENSRNOG00000009826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF244349 // GenBank // Rattus norvegicus butyrylcholinesterase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:190443044:190657572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001029922 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, B-box domain containing (Zbbx), mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, B-box domain containing (Zbbx), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// XM_006232495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, B-box domain containing (Zbbx), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000013111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:192810550:192880486:-1 gene:ENSRNOG00000009792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// BC097393 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, B-box domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:114436 IMAGE:7453249), complete cds. // chr2 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:192774929:192933025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT031567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 49 // 49 // 20 // 41 // 1
NM_001134409 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade I, member 2 (Serpini2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:192973630:193002079:-1 gene:ENSRNOG00000009903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// X99773 // GenBank // R.norvegicus mRNA for serpin, ZG-46p. // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:192973698:193001997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_001068667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 49 (Wdr49), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000039524 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:193009604:193134276:-1 gene:ENSRNOG00000024628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:193041680:193093739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0
NM_001009542 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 10 (Pdcd10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:193305005:193348014:-1 gene:ENSRNOG00000010147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC067245 // GenBank // Rattus norvegicus programmed cell death 10, mRNA (cDNA clone MGC:72992 IMAGE:6888212), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:193305309:193353632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT031571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT031572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001191567 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi integral membrane protein 4 (Golim4), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000037115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:193658083:193749106:-1 gene:ENSRNOG00000024213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:193658083:193749106:-1 gene:ENSRNOG00000024213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC091440 // GenBank // Rattus norvegicus golgi integral membrane protein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7368327), partial cds. // chr2 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:193658616:193691168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT031576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT031575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001107684 // RefSeq // Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Rapgef2), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// XM_006232512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Rapgef2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006232513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 2 (Rapgef2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000012792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:197171957:197285983:-1 gene:ENSRNOG00000021581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000029340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:197171957:197260436:-1 gene:ENSRNOG00000021581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000004725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:197173548:197199651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:197203375:197257535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT031582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1
NM_001271167 // RefSeq // Rattus norvegicus folliculin interacting protein 2 (Fnip2), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:197564860:197670260:-1 gene:ENSRNOG00000027833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 76 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:197561623:197629226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0
NM_198742 // RefSeq // Rattus norvegicus electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase (Etfdh), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:197702709:197725069:-1 gene:ENSRNOG00000009538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY365022 // GenBank // Rattus norvegicus electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC081890 // GenBank // Rattus norvegicus electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:93785 IMAGE:7109511), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211230 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA14YN06 mRNA sequence. // chr2 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// FQ218772 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA4YD18 mRNA sequence. // chr2 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:197703199:197725915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_201417 // RefSeq // Rattus norvegicus relaxin/insulin-like family peptide receptor 1 (Rxfp1), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XM_006232509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus relaxin/insulin-like family peptide receptor 1 (Rxfp1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:197738113:197930308:-1 gene:ENSRNOG00000024120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY509976 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 7 (Lgr7) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:197738113:197838186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 67 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT031593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108551 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 144 (Tmem144), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:197996572:198023399:-1 gene:ENSRNOG00000010081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// FQ223804 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA86YG10 mRNA sequence. // chr2 // 90 // 85 // 26 // 29 // 0 /// FQ221228 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA39YB06 mRNA sequence. // chr2 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000007712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:197940282:198034691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT031596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
ENSRNOT00000057272 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:198309866:198310282:-1 gene:ENSRNOG00000029601 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:198309866:198310201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_001083811 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, AMPA 2 (Gria2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NM_017261 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, AMPA 2 (Gria2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000039587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:198991678:199112785:-1 gene:ENSRNOG00000028589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000067113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:198991678:199112785:-1 gene:ENSRNOG00000028589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AF164344 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor subunit GluR2-flip mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// M36419 // GenBank // Rat glutamate receptor (GluR-B) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 77 // 28 // 30 // 0 /// M38061 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor (GluR-B) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 95 // 35 // 37 // 0 /// M85035 // GenBank // Rat glutamate receptor subunit 2 (GLUR2) non-NMDA mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT031597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT031598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000055766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:198839566:199112155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1
NM_053296 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine receptor, beta (Glrb), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:199178597:199251847:-1 gene:ENSRNOG00000010199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212388 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA56YO08 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:199179990:199196612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT031602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003749309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus grancalcin-like (LOC365829), mRNA. // chr2 // 80 // 83 // 20 // 25 // 0 /// XM_003753613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus grancalcin-like (LOC365829), mRNA. // chr2 // 80 // 83 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033467 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:200211103:200211775:-1 gene:ENSRNOG00000024395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200211178:200252651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_022403 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptophan 2,3-dioxygenase (Tdo2), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:200305347:200323296:-1 gene:ENSRNOG00000011612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC089802 // GenBank // Rattus norvegicus tryptophan 2,3-dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:108692 IMAGE:7370033), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M55167 // GenBank // Rat tryptophan-2,3-dioxygenase mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200305776:200323575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_012769 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase 1, soluble, beta 3 (Gucy1b3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:200384722:200433787:-1 gene:ENSRNOG00000012060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB098025 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for soluble guanylyl cyclase beta 1 subunit, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AB098707 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for soluble guanylyl cyclase beta 1 subunit, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AB099520 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for soluble guanylyl cyclase beta 1 subunit, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AB099521 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for soluble guanylyl cyclase beta 1 subunit, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC081840 // GenBank // Rattus norvegicus guanylate cyclase 1, soluble, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:93604 IMAGE:7104600), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M22562 // GenBank // Rat soluble guanylate cyclase 70kd subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200383749:200427981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_017090 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 3 (Gucy1a3), mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:200453505:200514967:-1 gene:ENSRNOG00000012302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB096020 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for guanylyl cyclase alpha 1 subunit, complete cds. // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC085746 // GenBank // Rattus norvegicus guanylate cyclase 1, soluble, alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:93532 IMAGE:7190419), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// M57405 // GenBank // Rat soluble guanylate cyclase 82kDa subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// U60835 // GenBank // Rattus norvegicus soluble guanylyl cyclase alpha 1 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200455741:200481160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000049332 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:200913770:200914263:-1 gene:ENSRNOG00000037705 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000039944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200851880:200914263:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 87 // 87 // 13 // 15 // 1
NM_023968 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y2 (Npy2r), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:200944755:200945900:-1 gene:ENSRNOG00000049213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY004257 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide Y/peptide YY-Y2 receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:200944755:200973742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001135717 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 46 (Rbm46), mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 46 (Rbm46), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XM_006232529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 46 (Rbm46), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000035846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:201245864:201288843:-1 gene:ENSRNOG00000025823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:201245864:201279115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0
NM_022280 // RefSeq // Rattus norvegicus lecithin-retinol acyltransferase (phosphatidylcholine-retinol-O-acyltransferase) (Lrat), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:201315318:201319723:-1 gene:ENSRNOG00000025608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AF255060 // GenBank // Rattus norvegicus lecithin retinol acyltransferase mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT031614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_020071 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrinogen beta chain (Fgb), mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:201442703:201449646:-1 gene:ENSRNOG00000007092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:201441735:201452797:-1 gene:ENSRNOG00000007092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY321323 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1-581 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY325147 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-181 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AY325153 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-216 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC088102 // GenBank // Rattus norvegicus fibrinogen beta chain, mRNA (cDNA clone MGC:108554 IMAGE:7371665), complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// U05675 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley fibrinogen B beta chain mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:201439675:201451742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
ENSRNOT00000071276 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:202208824:202209347:-1 gene:ENSRNOG00000049450 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075009 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:201527918:201528441:-1 gene:ENSRNOG00000047199 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
NM_198769 // RefSeq // Rattus norvegicus toll-like receptor 2 (Tlr2), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:202253257:202258683:-1 gene:ENSRNOG00000009822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY151255 // GenBank // Rattus norvegicus toll-like receptor 2 variant 1 (Tlr2) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AY151256 // GenBank // Rattus norvegicus toll-like receptor 2 variant 2 (Tlr2) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:202253434:202258813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
XM_001054550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D930015E06 (LOC679811), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_002725985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D930015E06 (LOC679811), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006224156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D930015E06 (LOC679811), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006224157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D930015E06 (LOC679811), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006232549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D930015E06 (LOC679811), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006232550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D930015E06 (LOC679811), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013260 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:202310349:202355095:-1 gene:ENSRNOG00000009837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013290 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:202319737:202443572:-1 gene:ENSRNOG00000009837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:202310349:202372523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT031627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
XM_006224158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus meiotic nuclear divisions 1 homolog (S. cerevisiae) (Mnd1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006232551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus meiotic nuclear divisions 1 homolog (S. cerevisiae) (Mnd1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000031179 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:202485557:202541302:-1 gene:ENSRNOG00000024733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:202485557:202533416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_001108552 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 2 (Trim2), mRNA. // chr2 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:202561569:202624484:-1 gene:ENSRNOG00000010124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000043790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:202551192:202624436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT031633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_001106437 // RefSeq // Rattus norvegicus FH2 domain containing 1 (Fhdc1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:202860614:202896104:-1 gene:ENSRNOG00000024594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:202861011:202963635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_021763 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor interacting protein 1 (Arfip1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:202912659:202990882:-1 gene:ENSRNOG00000010533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY004875 // GenBank // Rattus norvegicus arfaptin 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ222383 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YC20 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT031641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT031643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:202861011:202963635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001004448 // RefSeq // Rattus norvegicus dual endothelin 1, angiotensin II receptor (Dear), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:203647926:203648309:1 gene:ENSRNOG00000033147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// AY664492 // GenBank // Rattus norvegicus dual endothelin 1, angiotensin II receptor (Dear) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000074187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:203633992:203634802:1 gene:ENSRNOG00000049530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB020504 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PMF31, complete cds. // chr2 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONRATT029588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000044499 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:203855258:203856196:-1 gene:ENSRNOG00000037656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000006114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:203855258:203876331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT031652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_001134592 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 160, member A1 (Fam160a1), mRNA. // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000071580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:204330567:204386506:-1 gene:ENSRNOG00000048256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000000582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:204307404:204388362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT031653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_006224178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC295168 (LOC295168), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006232796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC295168 (LOC295168), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037507 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:204651888:204653008:-1 gene:ENSRNOG00000024215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074780 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:204652069:204653186:-1 gene:ENSRNOG00000024215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 67 // 16 // 20 // 0 /// NONRATT031654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000000587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:204652121:204689863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
XM_003749316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 48 (Prss48), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003753601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 48 (Prss48), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046286 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:204680788:204689865:-1 gene:ENSRNOG00000024208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:204652121:204689863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_017153 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S3a (Rps3a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000016329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:204831067:204835622:-1 gene:ENSRNOG00000011893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC058483 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S3a, mRNA (cDNA clone MGC:72868 IMAGE:6887884), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ220135 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YB08 mRNA sequence. // chr2 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// FQ226872 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YB06 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ229465 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YM24 mRNA sequence. // chr2 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// FQ230011 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YO21 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// M84716 // GenBank // R.norvegicus putative v-fos transformation effector protein (Fte-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074617 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:81181713:81182507:-1 gene:ENSRNOG00000048109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0 /// FQ220415 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YP08 mRNA sequence. // chr2 // 61 // 100 // 11 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:204831296:204844871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT031658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:81181713:81182507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0
ENSRNOT00000023482 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:205203178:205204366:-1 gene:ENSRNOG00000017461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:205203355:205206958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001109391 // RefSeq // Rattus norvegicus mab-21-like 2 (C. elegans) (Mab21l2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:205250196:205251275:-1 gene:ENSRNOG00000031398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:205250196:205251275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017079 // RefSeq // Rattus norvegicus CD1d1 molecule (Cd1d1), mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:205728725:205732232:-1 gene:ENSRNOG00000016451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D26439 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CD1 antigen precursor, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:205729452:205732135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT031667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_207606 // RefSeq // Rattus norvegicus kin of IRRE like (Drosophila) (Kirrel), mRNA. // chr2 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000031743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:205830116:205884761:-1 gene:ENSRNOG00000016408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY249056 // GenBank // Rattus norvegicus NEPH1 (Neph1) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:205830116:205868084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107702 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc receptor-like 2 (Fcrl2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:205998855:206009505:-1 gene:ENSRNOG00000016164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:205961351:206021405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT031673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001107701 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 71 (Lrrc71), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206506261:206518913:-1 gene:ENSRNOG00000014937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087156 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7133295. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206508486:206516286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001134959 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet endothelial aggregation receptor 1 (Pear1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006232618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet endothelial aggregation receptor 1 (Pear1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006232619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet endothelial aggregation receptor 1 (Pear1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206519129:206539048:-1 gene:ENSRNOG00000014243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC168665 // GenBank // Rattus norvegicus platelet endothelial aggregation receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:188434 IMAGE:7933243), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000028571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206520223:206534368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT031679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_021589 // RefSeq // Rattus norvegicus neurotrophic tyrosine kinase, receptor, type 1 (Ntrk1), mRNA. // chr2 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206548566:206565371:-1 gene:ENSRNOG00000013953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000044046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206548566:206565371:-1 gene:ENSRNOG00000013953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// M85214 // GenBank // Rattus norvegicus trk precursor (trk) mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206548728:206565310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_001107700 // RefSeq // Rattus norvegicus papillary renal cell carcinoma (translocation-associated) (Prcc), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206636545:206661988:-1 gene:ENSRNOG00000012933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166708 // GenBank // Rattus norvegicus papillary renal cell carcinoma (translocation-associated), mRNA (cDNA clone MGC:188404 IMAGE:5621845), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206636918:206661830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001014173 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal RNA adenine dimethylase domain containing 1 (Rrnad1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal RNA adenine dimethylase domain containing 1 (Rrnad1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal RNA adenine dimethylase domain containing 1 (Rrnad1), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000015793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206697126:206705708:-1 gene:ENSRNOG00000011645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079059 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CGI-41 protein, mRNA (cDNA clone MGC:94003 IMAGE:7115706), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206697300:206705228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT031686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT031687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001033665 // RefSeq // Rattus norvegicus brevican (Bcan), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// NM_012916 // RefSeq // Rattus norvegicus brevican (Bcan), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brevican (Bcan), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000025496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206762694:206775669:-1 gene:ENSRNOG00000018798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// U37142 // GenBank // Rattus norvegicus brevican core protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC094307 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7313562. // chr2 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1 /// GENSCAN00000046571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206763364:206773126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT031691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0
NM_022285 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan and proteoglycan link protein 2 (Hapln2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hyaluronan and proteoglycan link protein 2 (Hapln2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206799366:206804796:-1 gene:ENSRNOG00000018870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AB049056 // GenBank // Rattus norvegicus bral1 mRNA for brain link protein-1, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206799538:206801416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT031695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT031698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001106440 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein A-I binding protein (Apoa1bp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206827344:206829392:-1 gene:ENSRNOG00000019201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158876 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein A-I binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:188545 IMAGE:7934057), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206827395:206829374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT031702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
XM_006224168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 24 (Ttc24), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 24 (Ttc24), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050476 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:206833781:206838907:-1 gene:ENSRNOG00000028765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206835970:206839232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_183054 // RefSeq // Rattus norvegicus Rh family, B glycoprotein (Rhbg), mRNA. // chr2 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// XM_006232631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rh family, B glycoprotein (Rhbg), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// XM_006232632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rh family, B glycoprotein (Rhbg), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207013099:207025362:-1 gene:ENSRNOG00000019412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY129072 // GenBank // Rattus norvegicus Rh type B glycoprotein mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// BC079365 // GenBank // Rattus norvegicus Rh family, B glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:94848 IMAGE:7109321), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rh family, B glycoprotein (Rhbg), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// GENSCAN00000046564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206994547:207025332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001108556 // RefSeq // Rattus norvegicus TSSK6 activating co-chaperone (Tsacc), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSSK6 activating co-chaperone (Tsacc), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207062126:207071680:-1 gene:ENSRNOG00000037552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_001033896 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 79 (Tmem79), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 79 (Tmem79), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006232638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 79 (Tmem79), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000026414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207104465:207109243:-1 gene:ENSRNOG00000019414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC101913 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 79, mRNA (cDNA clone MGC:124716 IMAGE:7936201), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207104881:207108434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT031713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013414 // RefSeq // Rattus norvegicus bone gamma-carboxyglutamate (gla) protein (Bglap), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207144714:207145691:-1 gene:ENSRNOG00000019607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M11777 // GenBank // Rat BGP mRNA encoding gamma-carboxyglutamic acid (Gla) protein, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207144852:207145642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT031715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191568 // RefSeq // Rattus norvegicus polyamine-modulated factor 1 (Pmf1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207154781:207174337:-1 gene:ENSRNOG00000019620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233374 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YC10 mRNA sequence. // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207156111:207174337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT031716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108947 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 44 (Slc25a44), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 44 (Slc25a44), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006232721 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 44 (Slc25a44), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000068360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207174512:207189211:-1 gene:ENSRNOG00000025269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207176839:207185296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT031718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012078 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4A (Sema4a), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4A (Sema4a), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207201927:207219874:-1 gene:ENSRNOG00000019737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC081943 // GenBank // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4A, mRNA (cDNA clone MGC:94013 IMAGE:7121310), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207202564:207265702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT031724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001002016 // RefSeq // Rattus norvegicus lamin A/C (Lmna), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207245239:207265869:-1 gene:ENSRNOG00000019638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC062018 // GenBank // Rattus norvegicus lamin A, mRNA (cDNA clone MGC:72422 IMAGE:5621637), complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// X99257 // GenBank // R.norvegicus mRNA for lamin C2. // chr2 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT031726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207202564:207265702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT031729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001107687 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB25, member RAS oncogene family (Rab25), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207305701:207311798:-1 gene:ENSRNOG00000023640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168745 // GenBank // Rattus norvegicus RAB25, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:188848 IMAGE:6920264), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207305914:207317229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT031733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106441 // RefSeq // Rattus norvegicus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 2 (Lamtor2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000026974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207313930:207317305:-1 gene:ENSRNOG00000019908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT031734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT031737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT031738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000041917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207425038:207432093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_031667 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin XI (Syt11), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207513048:207537284:-1 gene:ENSRNOG00000020279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF000423 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin XI mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF375465 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 11 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC094518 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin XI, mRNA (cDNA clone MGC:105395 IMAGE:7315033), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207501452:207537091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT031742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106443 // RefSeq // Rattus norvegicus misato 1, mitochondrial distribution and morphology regulator (Msto1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207611385:207615656:-1 gene:ENSRNOG00000020357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207611650:207615611:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001011950 // RefSeq // Rattus norvegicus death associated protein 3 (Dap3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death associated protein 3 (Dap3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XR_351799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death associated protein 3 (Dap3), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// XR_351800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death associated protein 3 (Dap3), transcript variant X4, misc_RNA. // chr2 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// XR_351803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death associated protein 3 (Dap3), transcript variant X7, misc_RNA. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000027608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207624785:207652339:-1 gene:ENSRNOG00000020373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085878 // GenBank // Rattus norvegicus death associated protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:94652 IMAGE:7191747), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_351801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death associated protein 3 (Dap3), transcript variant X5, misc_RNA. // chr2 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000041924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207625023:207660137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT031747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XM_006224171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN and SH3 domain containing 1-like (LOC100360417), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// XM_006224173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN and SH3 domain containing 1-like (LOC100360417), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN and SH3 domain containing 1-like (LOC100360417), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// BC167763 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7446677, containing frame-shift errors. // chr2 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000033917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:207805217:207825458:-1 gene:ENSRNOG00000043377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// GENSCAN00000027288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207806982:207825458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// AY321335 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-125 mRNA, complete cds. // chr2 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// NONRATT031754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1 /// NONRATT031755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1 /// NONRATT031757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT031758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// NONRATT031761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NONRATT031762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053685 // RefSeq // Rattus norvegicus hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 3 (Hcn3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207875210:207888575:-1 gene:ENSRNOG00000020444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF247452 // GenBank // Rattus norvegicus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated potassium channel 3 (HCN3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207875210:207888575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NR_032298 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 92b (Mir92b), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054535 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:207955680:207955762:-1 gene:ENSRNOG00000036423 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-92b // miRBase Micro RNA Database // MI0006167 Rattus norvegicus miR-92b stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107691 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 46 (Trim46), mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 46 (Trim46), mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038535 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:207963162:207974768:-1 gene:ENSRNOG00000027903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008169 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109505.1:468:3474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000027371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207963841:207974768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// NONRATT034243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_001106445 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 50 (sugar efflux transporter), member 1 (Slc50a1), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207998463:208000843:-1 gene:ENSRNOG00000020554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207998704:208009439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT031772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT031773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_053599 // RefSeq // Rattus norvegicus ephrin A1 (Efna1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ephrin A1 (Efna1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208002159:208009501:-1 gene:ENSRNOG00000020573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC070514 // GenBank // Rattus norvegicus ephrin A1, mRNA (cDNA clone MGC:91567 IMAGE:7100462), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D38056 // GenBank // Rattus norvegicus B61 mRNA, complete cds. // chr2 // 64 // 81 // 14 // 22 // 0 /// NONRATT031774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207998704:208009439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001107692 // RefSeq // Rattus norvegicus ephrin A4 (Efna4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208065969:208070220:-1 gene:ENSRNOG00000020588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208063487:208070159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT031777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_020308 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 15 (Adam15), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 15 (Adam15), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208071876:208082511:-1 gene:ENSRNOG00000020590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208071876:208082511:-1 gene:ENSRNOG00000020590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC061796 // GenBank // Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 15 (metargidin), mRNA (cDNA clone MGC:72471 IMAGE:5597908), complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208072061:208104123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_001074533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DC-STAMP domain containing 1 (Dcst1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006232799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DC-STAMP domain containing 1 (Dcst1), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208082807:208105204:-1 gene:ENSRNOG00000020621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// FQ210715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA23YL23 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208096163:208106097:-1 gene:ENSRNOG00000020621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// GENSCAN00000027296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208072061:208104123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0
NM_001106446 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 7B (Zbtb7b), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208119628:208121619:-1 gene:ENSRNOG00000020640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208119871:208150130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT031783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001110138 // RefSeq // Rattus norvegicus flavin adenine dinucleotide synthetase 1 (Flad1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NM_053614 // RefSeq // Rattus norvegicus lens epithelial protein (Lenep), mRNA. // chr2 // 96 // 57 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208142452:208150771:-1 gene:ENSRNOG00000020642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// BC161933 // GenBank // Rattus norvegicus flavin adenine dinucleotide synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:187714 IMAGE:9022122), complete cds. // chr2 // 100 // 37 // 17 // 17 // 0 /// U15149 // GenBank // Rattus norvegicus putative DNA-binding protein mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 57 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT031784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 39 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT031786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208119871:208150130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1 /// NONRATT031787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1
NM_001135749 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC28 protein kinase regulatory subunit 1B (Cks1b), mRNA. // chr2 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000052379 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:114776113:114776352:-1 gene:ENSRNOG00000032516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208154853:208159427:-1 gene:ENSRNOG00000042561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC167077 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1561797, mRNA (cDNA clone MGC:189430 IMAGE:9023967), complete cds. // chr2 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// BC168780 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1561797, mRNA (cDNA clone MGC:188935 IMAGE:6918892), complete cds. // chr2 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:114776113:114776352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// NONRATT031790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_019297 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, beta 2 (neuronal) (Chrnb2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208511421:208519636:-1 gene:ENSRNOG00000020778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY574258 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor beta2 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// L31622 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinic acetylcholine receptor beta 2 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208511927:208525426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NONRATT031797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_017020 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 6 receptor (Il6r), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208629066:208677779:-1 gene:ENSRNOG00000020811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M58587 // GenBank // Rat liver interleukin 6 receptor ligand binding chain mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// XM_006232585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 6 receptor (Il6r), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// XM_006232588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 6 receptor (Il6r), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// XM_006232589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 6 receptor (Il6r), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000050839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208637220:208677760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT031800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001062555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208729604:-1 gene:ENSRNOG00000020822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208728858:-1 gene:ENSRNOG00000020822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208764731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT031803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_001062555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_003753607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208729604:-1 gene:ENSRNOG00000020822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208728858:-1 gene:ENSRNOG00000020822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208764731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_001062555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208729604:-1 gene:ENSRNOG00000020822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208728858:-1 gene:ENSRNOG00000020822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208764731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001062555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 95 // 98 // 38 // 40 // 0 /// XM_003753607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 95 // 98 // 38 // 40 // 0 /// XM_006232793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 2 (LOC685152), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000028246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208729604:-1 gene:ENSRNOG00000020822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000056606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208728858:-1 gene:ENSRNOG00000020822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 98 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000012081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208710296:208764731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 98 // 38 // 40 // 0
NM_001024798 // RefSeq // Rattus norvegicus Atpase, class I, type 8B, member 2 (Atp8b2), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232691 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Atpase, class I, type 8B, member 2 (Atp8b2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232697 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Atpase, class I, type 8B, member 2 (Atp8b2), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Atpase, class I, type 8B, member 2 (Atp8b2), transcript variant X13, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:208766396:208832721:-1 gene:ENSRNOG00000017990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC097468 // GenBank // Rattus norvegicus Atpase, class I, type 8B, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7457721), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208767715:208820095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
GENSCAN00000012105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:208918352:208919546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000023343 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:208918352:208919458:-1 gene:ENSRNOG00000017139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 100 // 8 // 15 // 0
NM_053597 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S27 (Rps27), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000022897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209004975:209006077:-1 gene:ENSRNOG00000016961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AF184893 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S271 (S27-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC061539 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S27, mRNA (cDNA clone MGC:72740 IMAGE:6918361), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ222348 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YK05 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ223072 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YM04 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT031808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT031809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT031810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_001007093 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 3-like 4 (Creb3l4), mRNA. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209029702:209034693:-1 gene:ENSRNOG00000023493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AY750875 // GenBank // Rattus norvegicus androgen-induced bZIP protein mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// AY750876 // GenBank // Rattus norvegicus androgen-induced bZIP protein mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209029702:209036808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT031814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001106439 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 3 (Slc27a3), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209191620:209196288:-1 gene:ENSRNOG00000015421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209191741:209196139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_001075102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 3 (Ints3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_342288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 3 (Ints3), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209198463:209248534:-1 gene:ENSRNOG00000015153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209199022:209214939:-1 gene:ENSRNOG00000015153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209198463:209267245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_012613 // RefSeq // Rattus norvegicus natriuretic peptide receptor 1 (Npr1), mRNA. // chr2 // 98 // 92 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000020307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209271276:209286963:-1 gene:ENSRNOG00000014684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// BC081831 // GenBank HTC // Rattus norvegicus natriuretic peptide receptor A/guanylate cyclase A (atrionatriuretic peptide receptor A), mRNA (cDNA clone IMAGE:7109702), with apparent retained intron. // chr2 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// BC128742 // GenBank // Rattus norvegicus natriuretic peptide receptor A/guanylate cyclase A (atrionatriuretic peptide receptor A), mRNA (cDNA clone MGC:156671 IMAGE:7458324), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// M74535 // GenBank // Rat membrane guanylate cyclase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000048587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209271800:209286593:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT031821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT031822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// NONRATT031823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1
NM_001025648 // RefSeq // Rattus norvegicus SNAP-associated protein (Snapin), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC098864 // GenBank // Rattus norvegicus SNAP-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:112927 IMAGE:7380523), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// FQ226383 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YG05 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// NM_001170576 // RefSeq // Rattus norvegicus SNAP-associated protein (Snapin), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000018830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209309041:209311590:-1 gene:ENSRNOG00000013356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// NONRATT031824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// GENSCAN00000048599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209310129:209329478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT031826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT031827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001014175 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to DKFZP547E1010 protein (Chtop), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000010455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209318321:209329789:-1 gene:ENSRNOG00000012760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000017561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209318321:209329789:-1 gene:ENSRNOG00000012760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC081985 // GenBank // Rattus norvegicus similar to DKFZP547E1010 protein, mRNA (cDNA clone MGC:94177 IMAGE:7128951), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT031828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001007636 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A1 (S100a1), mRNA. // chr2 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000017000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209331131:209333683:-1 gene:ENSRNOG00000012410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209331131:209333683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT031836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053587 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein A9 (S100a9), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:209531412:209533744:-1 gene:ENSRNOG00000011483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L18948 // GenBank // Rattus norvegicus intracellular calcium-binding protein (MRP14) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209531534:209548491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT031837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000015252 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:209548065:209548653:-1 gene:ENSRNOG00000011472 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209531534:209548491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_176076 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium-binding protein, ventral prostate (S100vp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000023564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:214238665:214241961:-1 gene:ENSRNOG00000028310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY195741 // GenBank // Rattus norvegicus S100 calcium-binding protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:214238795:214241272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT031855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// NONRATT031856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// NONRATT031857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
ENSRNOT00000068076 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:212993926:213119783:1 gene:ENSRNOG00000048515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_001057506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus loricrin (Lor), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus loricrin (Lor), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:212843236:212917959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001271271 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 9 (Prr9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 9 (Prr9), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:212840518:212840868:1 gene:ENSRNOG00000012312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224196 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope-like proline-rich protein 1-like (LOC102553778), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope-like proline-rich protein 1-like (LOC102553058), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope-like proline-rich protein 1-like (LOC102553778), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000005818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:212316031:212446076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0
XM_001065728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 1B (Sprr1b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002726009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small proline-rich protein 1B (Sprr1b), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:212246504:212246941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107686 // RefSeq // Rattus norvegicus small proline-rich protein 3 (Sprr3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:212227761:212228519:1 gene:ENSRNOG00000024046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:212227761:212228519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021864 // RefSeq // Rattus norvegicus small proline-rich protein 1A (Sprr1a), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_022195 // RefSeq // Rattus norvegicus involucrin (Ivl), mRNA. // chr2 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:212106732:212108771:1 gene:ENSRNOG00000009314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:212106732:212108771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT029858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_031536 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein (Smcp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:212089681:212094888:1 gene:ENSRNOG00000009326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC078795 // GenBank // Rattus norvegicus sperm mitochondria-associated cysteine-rich protein, mRNA (cDNA clone MGC:93362 IMAGE:7134574), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// U48702 // GenBank // Rattus norvegicus sperm mitochondria associated cysteine-rich protein SMCP mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002726007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 6A (Lce6a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002729070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 6A (Lce6a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope protein 5A-like (LOC102552326), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012420 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211909984:211910391:1 gene:ENSRNOG00000009383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONRATT029852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109188 // RefSeq // Rattus norvegicus late cornified envelope 1F (Lce1f), mRNA. // chr2 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000056485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:211878085:211879671:1 gene:ENSRNOG00000023892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT029850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NONRATT029849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
GENSCAN00000011049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211751111:211751606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075788 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211751111:211751567:1 gene:ENSRNOG00000049173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 100 // 13 // 24 // 0
NM_001002290 // RefSeq // Rattus norvegicus keratinocyte proline-rich protein (Kprp), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:211735316:211739614:1 gene:ENSRNOG00000028865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF548002 // GenBank // Rattus norvegicus keratinocytes proline-rich protein mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211736842:211738941:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT029848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109493 // RefSeq // Rattus norvegicus late cornified envelope 1L (Lce1l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000065884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:211706100:211707433:1 gene:ENSRNOG00000042105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211685612:211707363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
XM_002729071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to keratinocytes proline-rich protein (LOC686143), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to keratinocytes proline-rich protein (LOC686143), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032698 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:211686894:211687885:1 gene:ENSRNOG00000023511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211685612:211707363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_001055530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 45 // 48 // 0 /// XM_002726003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 45 // 48 // 0 /// XM_002729072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late cornified envelope 3D (Lce3d), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 45 // 48 // 0 /// XM_002729076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564972 (RGD1564972), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 45 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000074852 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:211575347:211609242:-1 gene:ENSRNOG00000046752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 79 // 35 // 38 // 0 /// NONRATT029845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT031845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT031846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT031847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
ENSRNOT00000012684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:211538156:211539891:1 gene:ENSRNOG00000009574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086588 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7309589, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211539394:211586560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001109500 // RefSeq // Rattus norvegicus late cornified envelope 1M (Lce1m), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:211534988:211536190:1 gene:ENSRNOG00000009581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:211466883:211536020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_001054217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (RGD1564513), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_345237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (RGD1564513), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075272 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:210798005:210799135:1 gene:ENSRNOG00000045522 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210798041:210799135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_003749336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (LOC100911679), mRNA. // chr2 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// XM_006224183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (LOC102548071), mRNA. // chr2 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// XM_006232803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (LOC102548071), mRNA. // chr2 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049525 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:210733154:210733789:1 gene:ENSRNOG00000050472 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000070843 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:210084361:210510520:1 gene:ENSRNOG00000047767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000072634 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:209983637:210571359:1 gene:ENSRNOG00000047767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0 /// GENSCAN00000029912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210453462:210454538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000030672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210732746:210733822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0
NM_001100985 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to TDPOZ3 (RGD1563667), mRNA. // chr9 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// AY902367 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF domain and POZ/BTB containing protein T2 (Tdpoz-T2) mRNA, complete cds. // chr9 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// FJ004894 // GenBank // Rattus norvegicus clone RIN122 TDPOZ-T2 mRNA, complete cds. // chr9 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// NM_001100996 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to TDPOZ3 (RGD1559714), mRNA. // chr9 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000048323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:116905089:116940738:-1 gene:ENSRNOG00000037315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0 /// AY902366 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF domain and POZ/BTB containing protein T1 variant transcript 1b (Tdpoz-T1) mRNA, complete cds. // chr9 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0 /// FJ004892 // GenBank // Rattus norvegicus clone T1E16-A RTDPOZ-T1 mRNA, complete cds. // chr9 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0 /// FJ004893 // GenBank // Rattus norvegicus clone T1E16-B RTDPOZ-T1 mRNA, complete cds. // chr9 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0 /// GENSCAN00000036363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:116934376:116935458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:214633190:214633954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT058484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT031860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 27 // 100 // 9 // 33 // 0 /// AY902365 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF domain and POZ/BTB containing protein T1 variant transcript 1a (Tdpoz-T1) mRNA, complete cds. // chr9 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0
XM_003749331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 3-like (RGD1564313), mRNA. // chr2 // 38 // 100 // 13 // 34 // 0 /// XM_006227080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 3-like (RGD1564313), mRNA. // chr2 // 38 // 100 // 13 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209966643:210068742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 79 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073328 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:209879957:209880958:1 gene:ENSRNOG00000046084 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 29 // 91 // 9 // 31 // 0 /// GENSCAN00000020919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209879975:209880973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 91 // 9 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210384977:210386071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 100 // 13 // 34 // 0
XM_002729097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 1-like (RGD1560661), mRNA. // chr2 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// XM_003749330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (RGD1566337), mRNA. // chr2 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209966643:210068742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000074001 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:209945041:209946171:1 gene:ENSRNOG00000046388 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:209945077:209946171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0
ENSRNOT00000068767 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:214632742:215085677:-1 gene:ENSRNOG00000042221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:214758532:215034567:-1 gene:ENSRNOG00000042221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// XM_006232802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (RGD1560510), mRNA. // chr2 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:214757968:214973502:-1 gene:ENSRNOG00000042221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073413 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:214758510:215034566:-1 gene:ENSRNOG00000042221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// XM_003749333 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TD and POZ domain-containing protein 2-like (RGD1563451), mRNA. // chr2 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:214759032:214967386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 85 // 19 // 23 // 0 /// NONRATT031860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:210308081:210309978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0
NM_001101018 // RefSeq // Rattus norvegicus ornithine decarboxylase antizyme 3 (Oaz3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215154623:215157553:-1 gene:ENSRNOG00000020863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// DQ431008 // GenBank // Rattus norvegicus ornithine decarboxylase antizyme 3 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215154739:215157235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT031861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001144957 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory subunit of type II PKA R-subunit (RIIa) domain containing 1 (Riiad1), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215183199:215191155:-1 gene:ENSRNOG00000037310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232847 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulatory subunit of type II PKA R-subunit (RIIa) domain containing 1 (Riiad1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT031863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1
NM_001110151 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin family member 27 (Snx27), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_152847 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin family member 27 (Snx27), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215217244:215275096:-1 gene:ENSRNOG00000020893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215217244:215300226:-1 gene:ENSRNOG00000020893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB010245 // GenBank // Rattus norvegicus mrt1 mRNA for PDZ protein Mrt1a, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB051816 // GenBank // Rattus norvegicus mrt1 mRNA for PDZ protein Mrt1b, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215220907:215300106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_022186 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor binding factor 2 (Nrbf2), mRNA. // chr2 // 84 // 100 // 38 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000000794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24818944:24837210:1 gene:ENSRNOG00000000641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 100 // 41 // 45 // 0 /// AB024930 // GenBank // Rattus norvegicus NRBF-2 mRNA for nuclear receptor binding factor-2, complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 38 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000002990 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:10571469:10572332:1 gene:ENSRNOG00000002200 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000042769 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215334735:215335598:-1 gene:ENSRNOG00000030494 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT033238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 78 // 100 // 35 // 45 // 0 /// GENSCAN00000013054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24769561:24836434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 30 // 45 // 1 /// GENSCAN00000015416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10528344:10572332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 29 // 45 // 1 /// GENSCAN00000021051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215334735:215472677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 33 // 45 // 1
BC168687 // GenBank // Rattus norvegicus tuftelin 1, mRNA (cDNA clone MGC:188530 IMAGE:7932385), complete cds. // chr2 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NM_001108948 // RefSeq // Rattus norvegicus tuftelin 1 (Tuft1), mRNA. // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000056436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215340650:215386078:-1 gene:ENSRNOG00000020923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000021051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215334735:215472677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
XM_006224212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cingulin (Cgn), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006232929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cingulin (Cgn), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000028440 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215389634:215407679:-1 gene:ENSRNOG00000020952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000066035 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215388585:215407679:-1 gene:ENSRNOG00000020952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215334735:215472677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_031629 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 4 (Psmb4), mRNA. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215536872:215539684:-1 gene:ENSRNOG00000020979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225189 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YN09 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// L17127 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome RN3 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// FQ234696 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YA07 mRNA sequence. // chr2 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215536976:215574873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT031875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080892 // RefSeq // Rattus norvegicus selenium binding protein 1 (Selenbp1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000028510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215588507:215598468:1 gene:ENSRNOG00000020992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB036799 // GenBank // Rattus norvegicus rSBP mRNA for selenium-binding protein, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC074008 // GenBank // Rattus norvegicus selenium binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:91524 IMAGE:7100467), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000071603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:214896920:214903905:-1 gene:ENSRNOG00000047158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215583293:215598264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:214759032:214967386:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006224214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 687-like (LOC100363361), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 687-like (LOC100363361), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 687-like (LOC100363361), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215666721:215672448:-1 gene:ENSRNOG00000021026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215667596:215672448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_031331 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 4 (Psmd4), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215692998:215702195:-1 gene:ENSRNOG00000021042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AB017188 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for antisecretory factor, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF175575 // GenBank // Rattus norvegicus 26S proteasome subunit S5a mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC060559 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 4, mRNA (cDNA clone MGC:72776 IMAGE:6891370), complete cds. // chr2 // 89 // 84 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215674113:215741086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001042621 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type 1, alpha (Pip5k1a), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006232892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase, type 1, alpha (Pip5k1a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215722371:215765253:-1 gene:ENSRNOG00000021068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT031884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215674113:215741086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT031885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107696 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel modifier 1 (Scnm1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sodium channel modifier 1 (Scnm1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sodium channel modifier 1 (Scnm1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215794553:215798715:-1 gene:ENSRNOG00000021092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232097 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YA12 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// FQ232474 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YJ22 mRNA sequence. // chr2 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT031886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215793978:215799606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT031887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001014039 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2 (Tnfaip8l2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2 (Tnfaip8l2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000028642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215804336:215820349:-1 gene:ENSRNOG00000021100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079019 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor, alpha-induced protein 8-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:93944 IMAGE:7113794), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215804808:215827735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT031888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001055604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GA binding protein transcription factor, beta subunit 2 (Gabpb2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028661 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215855910:215874322:-1 gene:ENSRNOG00000021105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000056396 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215855910:215874322:-1 gene:ENSRNOG00000021105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215855910:215874322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001013912 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 11 (Mllt11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215889656:215898937:-1 gene:ENSRNOG00000021110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087583 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 11, mRNA (cDNA clone MGC:105613 IMAGE:7316660), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC094215 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 11, mRNA (cDNA clone MGC:105625 IMAGE:7318415), complete cds. // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT031892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001007638 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20519 (RGD1359334), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215908769:215912361:-1 gene:ENSRNOG00000021656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215911236:215912276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT031893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001128187 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like (Bnipl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like (Bnipl), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215912569:215922558:-1 gene:ENSRNOG00000021116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166747 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2/adenovirus E1B 19kD interacting protein like, mRNA (cDNA clone MGC:188483 IMAGE:5598850), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215914177:215939998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT031894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001007697 // RefSeq // Rattus norvegicus prune exopolyphosphatase (Prune), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006232885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prune exopolyphosphatase (Prune), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215925757:215953662:-1 gene:ENSRNOG00000021120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079054 // GenBank // Rattus norvegicus prune homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:93997 IMAGE:7115417), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215914177:215939998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_001072193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A9 (Anxa9), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_002726022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A9 (Anxa9), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006224216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A9 (Anxa9), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A9 (Anxa9), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215968339:215977709:-1 gene:ENSRNOG00000021134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215968339:215986623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001271175 // RefSeq // Rattus norvegicus SET domain, bifurcated 1 (Setdb1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006232913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain, bifurcated 1 (Setdb1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006232914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain, bifurcated 1 (Setdb1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006232917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain, bifurcated 1 (Setdb1), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215994816:216025705:-1 gene:ENSRNOG00000021143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215994816:216053226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT031901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_001134593 // RefSeq // Rattus norvegicus circadian associated repressor of transcription (Ciart), mRNA. // chr2 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// NM_053882 // RefSeq // Rattus norvegicus extracellular matrix protein 1 (Ecm1), mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217345269:217350435:-1 gene:ENSRNOG00000021166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217478839:217482049:-1 gene:ENSRNOG00000042717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// BC085879 // GenBank // Rattus norvegicus extracellular matrix protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94653 IMAGE:7191762), complete cds. // chr2 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217345361:217350328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT031907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// GENSCAN00000028778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217465688:217492109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT031909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1
NM_001014040 // RefSeq // Rattus norvegicus threonyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (Tars2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000044500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217350915:217368084:-1 gene:ENSRNOG00000027726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC079154 // GenBank // Rattus norvegicus threonyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:94174 IMAGE:7128703), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000028796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217351084:217430211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT031911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// NONRATT031912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// NONRATT031914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT031913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
XM_003753636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2-like (LOC100364568), mRNA. // chr2 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// XM_006232994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 2-like (LOC100364568), mRNA. // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000070973 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:217398482:217426719:-1 gene:ENSRNOG00000046507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217351084:217430211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001108559 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 3 (Prpf3), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 3 (Prpf3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 3 (Prpf3), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 3 (Prpf3), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000063866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217438359:217462273:-1 gene:ENSRNOG00000025629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217431367:217459938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT031921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT031925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT031926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT031927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
XM_003753652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690012 (LOC690012), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006233001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690012 (LOC690012), mRNA. // chr2 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// XM_006224220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690012 (LOC690012), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XM_006224221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690012 (LOC690012), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// XR_344499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690012 (LOC690012), transcript variant X4, misc_RNA. // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XR_344500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690012 (LOC690012), transcript variant X5, misc_RNA. // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XR_344501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC690012 (LOC690012), transcript variant X6, misc_RNA. // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217465688:217492109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001109655 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 14 (Car14), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 14 (Car14), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217500706:217507185:-1 gene:ENSRNOG00000023162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// EF187253 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-bound carbonic anhydrase 14 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FQ214663 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YK19 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 87 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217501530:217504938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT031938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT031939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
ENSRNOT00000028745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217576703:217577058:-1 gene:ENSRNOG00000021169 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ229517 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YK08 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217576726:217577058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001025119 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family O member 1 (Plekho1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217601897:217609978:-1 gene:ENSRNOG00000021170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC091420 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family O member 1, mRNA (cDNA clone MGC:109581 IMAGE:7365370), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217601983:217609839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_172072 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 45 homolog (S. cerevisiae) (Vps45), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006232981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 45 homolog (S. cerevisiae) (Vps45), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217613524:217674281:-1 gene:ENSRNOG00000021173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC081705 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 45 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93104 IMAGE:7192410), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// U81160 // GenBank // Rattus norvegicus vesicular transport protein rvps45 mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217626525:217669448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NONRATT031945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1
NM_001071776 // RefSeq // Rattus norvegicus bolA family member 1 (Bola1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217825097:217826113:-1 gene:ENSRNOG00000021185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217825367:217825753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT031949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001061850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 2, H2ac (Hist2h2ac), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_574997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cluster 2, H2ac (Hist2h2ac), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000051917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:217846048:217846437:-1 gene:ENSRNOG00000030736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000005302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217846048:217846437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001107698 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 2, H3c2 (Hist2h3c2), mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000040906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217866185:217866595:-1 gene:ENSRNOG00000028975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000005291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217866185:217867949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000005303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217874568:217876335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000005305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217903378:217903788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT031950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001123469 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cluster 2, H4 (Hist2h4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217897769:217898080:-1 gene:ENSRNOG00000032224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000005298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217897769:217898080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001100836 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG, high affinity Ia, receptor (CD64) (Fcgr1a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217916296:217925213:-1 gene:ENSRNOG00000021199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158809 // GenBank // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG, high affinity Ia, receptor (CD64), mRNA (cDNA clone MGC:188236 IMAGE:7364883), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217915802:217977578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
GENSCAN00000005306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218060596:218111362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000003022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:218078619:218078867:-1 gene:ENSRNOG00000002223 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 86 // 88 // 12 // 14 // 0
FQ225205 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YM12 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0
ENSRNOT00000056241 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:218169445:218169642:-1 gene:ENSRNOG00000037223 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0
NM_001109571 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G-like (Polr3gl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G-like (Polr3gl), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218189916:218206136:-1 gene:ENSRNOG00000021209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168229 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide G (32kD)-like, mRNA (cDNA clone MGC:188269 IMAGE:7377062), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ214367 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YB09 mRNA sequence. // chr2 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218188833:218193322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT031958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT031959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001109340 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 17 (Nudt17), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 17 (Nudt17), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 17 (Nudt17), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218318480:218320972:-1 gene:ENSRNOG00000037217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218318822:218339809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001012081 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide C (Polr3c), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide C (Polr3c), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide C (Polr3c), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218323219:218339095:-1 gene:ENSRNOG00000033560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083667 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide C (62kD), mRNA (cDNA clone MGC:94511 IMAGE:7135563), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218318822:218339809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT031966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NONRATT008654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224225 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD160 molecule (Cd160), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006224227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD160 molecule (Cd160), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD160 molecule (Cd160), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006233000 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD160 molecule (Cd160), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_344510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD160 molecule (Cd160), transcript variant X4, misc_RNA. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XR_351862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD160 molecule (Cd160), transcript variant X4, misc_RNA. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000109 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:218423045:218429666:-1 gene:ENSRNOG00000000097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073913 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:218425907:218429666:-1 gene:ENSRNOG00000000097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218421460:218443708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
NM_001139486 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 89B (Gpr89b), mRNA. // chr2 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// XM_006232976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 89B (Gpr89b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:218485504:218523850:-1 gene:ENSRNOG00000000095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// AY724489 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cpv-o-01-0-UI unknown mRNA. // chr2 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT031968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT031969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218485824:218523752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// NONRATT031970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NR_027366 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 5930416I19Rik protein (MGC94282), transcript variant 1, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NR_027367 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 5930416I19Rik protein (MGC94282), transcript variant 2, long non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:226885736:226891055:-1 gene:ENSRNOG00000028517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079219 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 5930416I19Rik protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131947). // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:226886088:226887721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006233013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 9 (Bcl9), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023548 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:218817615:218828968:-1 gene:ENSRNOG00000017516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:218817615:218834855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT031973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001000558 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 390 (Olr390), mRNA. // chr2 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000023742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219010388:219011350:-1 gene:ENSRNOG00000017664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000026438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219010388:219011350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT031976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
XM_006224228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like (Chd1l), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like (Chd1l), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like (Chd1l), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 1-like (Chd1l), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043937 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:219196513:219249842:-1 gene:ENSRNOG00000017669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219197989:219249935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT031978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT031980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
FQ217306 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA2YK12 mRNA sequence. // chr2 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT031981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022382 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 4D interacting protein (Pde4dip), mRNA. // chr2 // 93 // 88 // 42 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000024900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219345687:219479200:-1 gene:ENSRNOG00000018220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0 /// AF139185 // GenBank // Rattus norvegicus myomegalin mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 88 // 42 // 45 // 0 /// FQ217306 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA2YK12 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 33 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000045347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219324479:219421893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT031983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT031982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 15 // 51 // 1
NM_031620 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglycerate dehydrogenase (Phgdh), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:219959694:219988834:-1 gene:ENSRNOG00000019328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC086327 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglycerate dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:105399 IMAGE:7115765), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:219959786:219988697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
GENSCAN00000001227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220061267:220075173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 10 // 15 // 1
NM_012584 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 5 (Hsd3b5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_003749360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 5-like (LOC100911116), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220060508:220098449:-1 gene:ENSRNOG00000019417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC092571 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 5, mRNA (cDNA clone MGC:108750 IMAGE:7369915), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// M67465 // GenBank // Rat 3-beta-hydroxysteroid dehydrogenase/delta-5-delta-4-ene-isomerase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220089715:220145371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT031996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT031997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT031998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONRATT031999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_017265 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 6 (Hsd3b6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:221794088:221800043:-1 gene:ENSRNOG00000019441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000068511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220179977:220186022:-1 gene:ENSRNOG00000042884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC089937 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 6, mRNA (cDNA clone MGC:109236 IMAGE:7309637), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L17138 // GenBank // Rattus norvegicus 3beta-hydroxysteroid dehydrogenase/delta5-delta4 isomerase (3beta-HSD) mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:221794416:221799961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000050287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220180305:220185928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT031998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007719 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1 (Hsd3b1), mRNA. // chrU // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220148003:220229494:-1 gene:ENSRNOG00000042884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 75 // 69 // 15 // 20 // 0 /// BC086578 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxy-delta-5-steroid dehydrogenase, 3 beta- and steroid delta-isomerase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105549 IMAGE:7306702), complete cds. // chrU // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// M38178 // GenBank // Rat 3-beta-hydroxysteroid dehydrogenase/delta-5-delta-4 isomerase type I (3-beta-HSD) mRNA, complete cds. // chrU // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NM_001042619 // RefSeq // Rattus norvegicus 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase/delta-5-delta-4 isomerase type II (Hsd3b), mRNA. // chrU // 60 // 86 // 15 // 25 // 0 /// M38179 // GenBank // Rat 3-beta-hydroxysteroid dehydrogenase/delta-5-delta-4 isomerase type II (3-beta-HSD) mRNA, complete cds. // chrU // 60 // 86 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT031999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000050289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220224005:220229208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_032082 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxyacid oxidase 2 (long chain) (Hao2), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxyacid oxidase 2 (long chain) (Hao2), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:220254690:220278103:1 gene:ENSRNOG00000019470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC078781 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxyacid oxidase 2 (long chain), mRNA (cDNA clone MGC:93324 IMAGE:7132928), complete cds. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// X67156 // GenBank // R.norvegicus mRNA for (S)-2-hydroxy acid oxidase. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT030049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:220254881:220422759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT030050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT030051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT030052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT030053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001107705 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 3 (Wdr3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_351883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 3 (Wdr3), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:221899195:221921857:-1 gene:ENSRNOG00000019670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:221899694:221920698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006233039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 46, member C (Fam46c), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:222244280:222262430:-1 gene:ENSRNOG00000015222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083570 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 4930431B09Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:93859 IMAGE:7111947), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ235316 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YK14 mRNA sequence. // chr2 // 67 // 58 // 10 // 15 // 0 /// NONRATT032006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106452 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 1A, member 2 (Man1a2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:222338553:222489949:-1 gene:ENSRNOG00000015226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:222336860:222359326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT032009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT032010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001106454 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription termination factor, RNA polymerase II (Ttf2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XR_351888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription termination factor, RNA polymerase II (Ttf2), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000020933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:222765601:222799844:-1 gene:ENSRNOG00000015381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000046085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:222766108:222799844:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT032012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 25 // 47 // 1
NM_001271217 // RefSeq // Rattus norvegicus CD101 molecule (Cd101), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD101 molecule (Cd101), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XR_351889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD101 molecule (Cd101), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056140 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:222826872:222863433:-1 gene:ENSRNOG00000037190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:222827733:222938663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_019243 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin F2 receptor inhibitor (Ptgfrn), mRNA. // chr2 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:222873519:222931395:-1 gene:ENSRNOG00000015655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// U26595 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin F2a receptor regulatory protein precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT032016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:222827733:222938663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_012830 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd2 molecule (Cd2), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:223111198:223124565:-1 gene:ENSRNOG00000015821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088164 // GenBank // Rattus norvegicus Cd2 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:108759 IMAGE:7374969), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:223080709:223124446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT032017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012504 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 1 polypeptide (Atp1a1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 88 // 88 // 0 /// ENSRNOT00000040430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:223440514:223469880:-1 gene:ENSRNOG00000030019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 88 // 88 // 0 /// BC061968 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 1 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:72546 IMAGE:5598014), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 88 // 88 // 0 /// M14511 // GenBank // Rat Na+,K+-ATPase alpha isoform catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 88 // 88 // 0 /// M28647 // GenBank // Rattus norvegicus Na,K-ATPase alpha-1 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 78 // 88 // 0 /// M74494 // GenBank // Rat sodium/potassium ATPase alpha-1 subunit truncated isoform mRNA, 3 end. // chr2 // 31 // 31 // 27 // 88 // 1 /// GENSCAN00000043219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:223373551:223469643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 78 // 78 // 0 /// NONRATT032019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 88 // 88 // 0 /// NONRATT032018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 59 // 59 // 52 // 88 // 1 /// NONRATT032022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 25 // 88 // 1 /// NONRATT032020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 9 // 9 // 8 // 88 // 1 /// NONRATT032021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 11 // 11 // 10 // 88 // 1
NM_001106456 // RefSeq // Rattus norvegicus mab-21-like 3 (C. elegans) (Mab21l3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:223666827:223689474:-1 gene:ENSRNOG00000016044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:223669223:223797678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107707 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22, member 15 (Slc22a15), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:223715478:223775516:-1 gene:ENSRNOG00000033051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:223669223:223797678:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001109584 // RefSeq // Rattus norvegicus VANGL planar cell polarity protein 1 (Vangl1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224011038:224058132:-1 gene:ENSRNOG00000016477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224011843:224151488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013116 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid stimulating hormone, beta (Tshb), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224638397:224643274:-1 gene:ENSRNOG00000016793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058488 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid stimulating hormone, beta, mRNA (cDNA clone MGC:72898 IMAGE:6921292), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// D00578 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TSH beta subunit, partial cds. // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// M10902 // GenBank // Rat thyrotropin-beta-subunit (TSH-Beta) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224638463:224639256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT032035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012810 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptonemal complex protein 1 (Sycp1), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:224707704:224857015:-1 gene:ENSRNOG00000016835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:224708338:224809970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT032036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_003749366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 5 (Nr1h5), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_003753646 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 5 (Nr1h5), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000036229 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:224862584:224881587:-1 gene:ENSRNOG00000023073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0
NONRATT032042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107708 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactomedin-like 3 (Olfml3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225643129:225645958:-1 gene:ENSRNOG00000019211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158838 // GenBank // Rattus norvegicus olfactomedin-like 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7387583), partial cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225643586:225645878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT032043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100986 // RefSeq // Rattus norvegicus homeodomain interacting protein kinase 1 (Hipk1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000056079 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:225647725:225697789:-1 gene:ENSRNOG00000019333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001100986 // RefSeq // Rattus norvegicus homeodomain interacting protein kinase 1 (Hipk1), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000056079 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:225647725:225697789:-1 gene:ENSRNOG00000019333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 87 // 32 // 33 // 0 /// EF460311 // GenBank // Rattus norvegicus homeodomain-interacting protein kinase 1 splice variant 1 (Hipk1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// EF460312 // GenBank // Rattus norvegicus homeodomain-interacting protein kinase 1 splice variant 2 (Hipk1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225669713:225685625:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT032046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT032049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT032048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001025687 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA cross-link repair 1B (Dclre1b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225708799:225717309:-1 gene:ENSRNOG00000019367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098939 // GenBank // Rattus norvegicus DNA cross-link repair 1B, PSO2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114481 IMAGE:7455348), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225710955:225716985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT032050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT032051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT032052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_139084 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 (Magi3), mRNA. // chr2 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// XM_006233058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane associated guanylate kinase, WW and PDZ domain containing 3 (Magi3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000026952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:225923270:226123408:-1 gene:ENSRNOG00000019885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF255614 // GenBank // Rattus norvegicus scaffolding protein SLIPR (Slipr) mRNA, complete cds. // chr2 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000056869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:225924596:226123281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT032054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT032055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1
ENSRNOT00000050049 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:226285065:226285604:-1 gene:ENSRNOG00000029782 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 73 // 92 // 8 // 11 // 0
NM_001107710 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains 2 (Lrig2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226353985:226419472:-1 gene:ENSRNOG00000019957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226353549:226419267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000040772 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:226673357:226675253:-1 gene:ENSRNOG00000030253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006224235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A3 (Fam19a3), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// XM_006233103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 19 (chemokine (C-C motif)-like), member A3 (Fam19a3), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226663114:226677804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001107711 // RefSeq // Rattus norvegicus Moloney leukemia virus 10 (Mov10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006233086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Moloney leukemia virus 10 (Mov10), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000018061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226697325:226717439:-1 gene:ENSRNOG00000012946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000006544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226697875:226722666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT032065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT032067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT032069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001109625 // RefSeq // Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1 (Capza1), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226722919:226767300:-1 gene:ENSRNOG00000013538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC166464 // GenBank // Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:187803 IMAGE:9030793), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ234955 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YA14 mRNA sequence. // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226724399:226767013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001191848 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 2B (Wnt2b), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226855019:226869381:-1 gene:ENSRNOG00000014385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226855608:226869381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001107712 // RefSeq // Rattus norvegicus CTTNBP2 N-terminal like (Cttnbp2nl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:226917956:226964542:-1 gene:ENSRNOG00000014479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:226920688:226964594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT032075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191711 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 20 (Ddx20), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227565095:227573086:-1 gene:ENSRNOG00000015274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227565372:227573086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT032077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001005765 // RefSeq // Rattus norvegicus RAP1A, member of RAS oncogene family (Rap1a), mRNA. // chr2 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000047836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227614907:227691823:-1 gene:ENSRNOG00000032463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// BC083813 // GenBank // Rattus norvegicus RAP1A, member of RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:94873 IMAGE:7110254), complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT032078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT032079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// NONRATT032080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1
ENSRNOT00000074344 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:227776705:227777085:-1 gene:ENSRNOG00000046624 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074779 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:227935625:227936005:-1 gene:ENSRNOG00000049591 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// GENSCAN00000028104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227923426:227936539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// GENSCAN00000028110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227766862:227777620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
XM_003753655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100363228 (LOC100363228), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000055983 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:227819479:227821635:-1 gene:ENSRNOG00000037118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006224238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100363228 (LOC100363228), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000028091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227819479:227841514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000028105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227976845:227998223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_134365 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit B1 (Atp5f1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227830382:227841514:-1 gene:ENSRNOG00000016000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:227987897:227998362:-1 gene:ENSRNOG00000046299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC063808 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit B1, mRNA (cDNA clone MGC:72698 IMAGE:6920021), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ216232 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YO05 mRNA sequence. // chr2 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// FQ218794 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YO11 mRNA sequence. // chr2 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// M35052 // GenBank // Rat F-0-ATPase subunit b mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ216515 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YH04 mRNA sequence. // chr2 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227819479:227841514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227976845:227998223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
XM_001077265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus primary cilia formation (Pifo), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_003749376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus primary cilia formation (Pifo), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_003753656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus primary cilia formation (Pifo), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000022731 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:228037986:228044423:-1 gene:ENSRNOG00000016842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000049155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228037986:228055019:-1 gene:ENSRNOG00000016842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228037986:228071375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_006224294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chitinase 3-like 4 (Chi3l4), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_227566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chitinase 3-like 4 (Chi3l4), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228037986:228071375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_227566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chitinase 3-like 4 (Chi3l4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_006233124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chitinase-3-like protein 3-like (LOC102555481), mRNA. // chr2 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000055966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228318098:228351640:1 gene:ENSRNOG00000037115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// JF781276 // GenBank // Rattus norvegicus strain Wistar chitinase-like protein mRNA, complete cds. // chr2 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228318115:228376798:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 67 // 13 // 18 // 0
NM_001134512 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC58999 (RGD1309110), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228393604:228411979:-1 gene:ENSRNOG00000017574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228392542:228406742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000039222 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:228415540:228417018:-1 gene:ENSRNOG00000023051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042134 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:228415215:228416573:-1 gene:ENSRNOG00000023051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000026607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:228415829:228416607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
XR_344582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912312 (LOC100912312), transcript variant X2, ncRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ231449 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YH07 mRNA sequence. // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// FQ233409 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YP20 mRNA sequence. // chr2 // 42 // 100 // 11 // 26 // 0
NONRATT032084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007699 // RefSeq // Rattus norvegicus choline/ethanolamine phosphotransferase 1 (Cept1), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000036551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228528581:228569428:-1 gene:ENSRNOG00000017723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC079471 // GenBank // Rattus norvegicus choline/ethanolamine phosphotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:95031 IMAGE:7122765), complete cds. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// FQ212036 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YO21 mRNA sequence. // chr2 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT032086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT032087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_012523 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd53 molecule (Cd53), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000024344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:228956411:229004207:-1 gene:ENSRNOG00000017874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC078900 // GenBank // Rattus norvegicus Cd53 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:93640 IMAGE:7130719), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// M57276 // GenBank // Rat leukocyte antigen MRC-OX44 mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT032091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001000914 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 392 (Olr392), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229049044:229049994:-1 gene:ENSRNOG00000018112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020091 // RefSeq // Rattus norvegicus chymosin (Cym), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chymosin (Cym), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229433281:229443486:-1 gene:ENSRNOG00000018236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229433388:229443476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT032093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_138851 // RefSeq // Rattus norvegicus prokineticin 1 (Prok1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prokineticin 1 (Prok1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000024519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229457383:229462641:-1 gene:ENSRNOG00000018201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY089983 // GenBank // Rattus norvegicus prokineticin 1 precursor, mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000025036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229860322:229880245:-1 gene:ENSRNOG00000018293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000033776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229860322:229880245:-1 gene:ENSRNOG00000018293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// FQ225638 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YF17 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229860993:229880410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT032096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0
NM_001108561 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosylhomocysteinase-like 1 (Ahcyl1), mRNA. // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// XM_006233161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosylhomocysteinase-like 1 (Ahcyl1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000066501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229905782:229920833:-1 gene:ENSRNOG00000018569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229881966:230027133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT032097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT032100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT032101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_023981 // RefSeq // Rattus norvegicus colony stimulating factor 1 (macrophage) (Csf1), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:229989435:230017945:-1 gene:ENSRNOG00000018659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF514355 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/SsN macrophage colony stimulating factor (Csf1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF514356 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW/N macrophage colony stimulating factor (Csf1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF514357 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW.tl truncated macrophage colony stimulating factor (Csf1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AF515736 // GenBank // Rattus norvegicus colony stimulating factor-1 (Csf1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC074007 // GenBank // Rattus norvegicus colony stimulating factor 1 (macrophage), mRNA (cDNA clone MGC:91410 IMAGE:7099454), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006233187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus colony stimulating factor 1 (macrophage) (Csf1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT032102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:229881966:230027133:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_001106464 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, mu 6-like (Gstm6l), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000055918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230167122:230172478:-1 gene:ENSRNOG00000029409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 90 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000035987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230167664:230195033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// NONRATT032103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// NONRATT032104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_031154 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, mu 7 (Gstm7), mRNA. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230189594:230195105:-1 gene:ENSRNOG00000018937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC059130 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, mu 7, mRNA (cDNA clone MGC:72778 IMAGE:6921477), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// J02744 // GenBank // Rat Y-b3 glutathione-S-transferase mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT032106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230167664:230195033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT032107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT032109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT032110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001109192 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, mu 6 (Gstm6), mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000025746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230202466:230207250:-1 gene:ENSRNOG00000019017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// BC158681 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, mu 6, mRNA (cDNA clone MGC:187690 IMAGE:8373383), complete cds. // chr2 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000036004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230202837:230308023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT032111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0
NM_020540 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 3 (Gstm3), mRNA. // chr2 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// XM_006233174 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 3 (Gstm3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000025800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230230601:230235373:-1 gene:ENSRNOG00000019058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230202837:230308023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 86 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT032114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
ENSRNOT00000025939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230246914:230251686:-1 gene:ENSRNOG00000019094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ209513 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YD19 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// FQ210478 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA28YA11 mRNA sequence. // chr2 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// FQ229920 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YD17 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// FQ218417 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YE22 mRNA sequence. // chr2 // 56 // 94 // 9 // 16 // 0 /// FQ223823 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA85YL17 mRNA sequence. // chr2 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0 /// NM_177426 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 2 (Gstm2), mRNA. // chr2 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// FJ179402 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// BC158576 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7115150. // chr2 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// NONRATT032116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230202837:230308023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// NONRATT032117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// NONRATT032118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
GENSCAN00000036004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230202837:230308023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_017014 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 1 (Gstm1), mRNA. // chr2 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000047139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230272746:230278303:-1 gene:ENSRNOG00000029726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC063172 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 1, mRNA (cDNA clone MGC:72887 IMAGE:6920688), complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// FJ179401 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// FQ213696 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YE12 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// J02810 // GenBank // Rat prostate glutathione S-transferase mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// M11719 // GenBank // Rat liver glutathione S-transferase Yb-1 subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// M28241 // GenBank // Rat glutathione S-transferase mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// XR_351941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 1 (Gstm1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// NONRATT032120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230202837:230308023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// NONRATT032123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
NM_001024304 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 4 (Gstm4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230302891:230308113:-1 gene:ENSRNOG00000019221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091199 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 4, mRNA (cDNA clone MGC:108896 IMAGE:7379741), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FJ179403 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase mu 3 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT032125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230202837:230308023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT032127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
XM_006233168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 2 (Ampd2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 2 (Ampd2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NM_001101681 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 2 (Ampd2), mRNA. // chr2 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000026051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230330496:230341895:-1 gene:ENSRNOG00000019240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1 /// BC166402 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine monophosphate deaminase 2 (isoform L), mRNA (cDNA clone MGC:187192 IMAGE:9028857), complete cds. // chr2 // 88 // 88 // 37 // 42 // 1 /// GENSCAN00000036008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230331335:230345436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT032128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT032129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 31 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT032131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_013106 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha inhibiting activity polypeptide 3 (Gnai3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230365905:230404045:-1 gene:ENSRNOG00000019465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ222046 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YK15 mRNA sequence. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// J03219 // GenBank // Rat Gi3 protein alpha subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M20713 // GenBank // Rat GTP-binding protein (G-alpha-i3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230368041:230403898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107715 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 61 (Gpr61), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_351942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 61 (Gpr61), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230406537:230412868:-1 gene:ENSRNOG00000019738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001277236 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b561 family, member D1 (Cyb561d1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230456544:230460353:-1 gene:ENSRNOG00000028839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
XM_006224249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 2 (Atxn7l2), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7-like 2 (Atxn7l2), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230462305:230470500:-1 gene:ENSRNOG00000028749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC098000 // GenBank // Rattus norvegicus ataxin 7-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7453150), partial cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230459186:230470605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001108563 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptophysin-like 2 (Sypl2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230472384:230487115:-1 gene:ENSRNOG00000019780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108563 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptophysin-like 2 (Sypl2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230472384:230487115:-1 gene:ENSRNOG00000019780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB158471 // GenBank // Rattus norvegicus Mg29 mRNA for mitsugumin29, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230474810:230486933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191110 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin, EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 (Celsr2), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000027263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230654782:230677391:-1 gene:ENSRNOG00000020058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000019646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230655414:230677391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT032147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT032148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_001007606 // RefSeq // Rattus norvegicus seryl-tRNA synthetase (Sars), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230689716:230705606:-1 gene:ENSRNOG00000020255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC061765 // GenBank // Rattus norvegicus seryl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:72629 IMAGE:5620893), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ233851 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YC11 mRNA sequence. // chr2 // 90 // 36 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000019640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230689976:230705548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000032036 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:230711178:230711604:-1 gene:ENSRNOG00000028298 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230711219:230778324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
ENSRNOT00000027493 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:230716011:230792265:-1 gene:ENSRNOG00000020272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC166728 // GenBank // Rattus norvegicus similar to KIAA1324 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7934022), partial cds. // chr2 // 91 // 73 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230711219:230778324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT032157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT032160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1
NM_001135260 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 167B (Tmem167b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000423 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:28597911:28598135:1 gene:ENSRNOG00000000376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230818557:230822325:-1 gene:ENSRNOG00000042160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230818790:230822139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000033424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:28593250:28598135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001191962 // RefSeq // Rattus norvegicus G-protein signaling modulator 2 (Gpsm2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230965745:230992673:-1 gene:ENSRNOG00000012149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000066178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230953071:230992673:-1 gene:ENSRNOG00000012149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230953550:230992652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT032166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_053637 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin binding protein 3 (Stxbp3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000027666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231068919:231112841:-1 gene:ENSRNOG00000020392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB046544 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for syntaxin binding protein Munc18-3, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC098660 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:112606 IMAGE:7386801), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT032169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000019648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231069407:231146937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 28 // 38 // 1 /// NONRATT032170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001107717 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 7 (Fndc7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231129567:231164848:-1 gene:ENSRNOG00000020421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT032172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231069407:231146937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// GENSCAN00000046236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231150794:231214479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001024305 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 38B (Prpf38b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006233172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 38B (Prpf38b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231180384:231189409:-1 gene:ENSRNOG00000020438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC079264 // GenBank // Rattus norvegicus PRP38 pre-mRNA processing factor 38 (yeast) domain containing B, mRNA (cDNA clone MGC:94372 IMAGE:7133560), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231150794:231214479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT032177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT032178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001163568 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 102, member B (Fam102b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:231243585:231302559:-1 gene:ENSRNOG00000027540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:231237113:231302559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001106465 // RefSeq // Rattus norvegicus netrin G1 (Ntng1), mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006233141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus netrin G1 (Ntng1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:232164771:232320751:-1 gene:ENSRNOG00000031136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT032181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001106466 // RefSeq // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 6 (Prmt6), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:232642305:232647534:-1 gene:ENSRNOG00000017187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075181 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:232888816:232889943:-1 gene:ENSRNOG00000048996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:232888816:232889943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:232646169:232647296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_045198 // RefSeq // Rattus norvegicus heme oxygenase (decycling) 2, pseudogene 1 (Hmox2-ps1), non-coding RNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:244891996:244892868:-1 gene:ENSRNOG00000021627 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AF058787 // GenBank // Rattus norvegicus heme oxygenase-3 (HO-3) mRNA, complete cds. // chr2 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:244891996:244892602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000011956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:245441970:245548563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000023128 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:245441994:245443707:-1 gene:ENSRNOG00000017205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 96 // 17 // 23 // 0
ENSRNOT00000047935 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:245746374:245752215:-1 gene:ENSRNOG00000031336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000022268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:245889222:245897776:-1 gene:ENSRNOG00000030590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 100 // 29 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000065021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:245855271:245864311:-1 gene:ENSRNOG00000016168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_031502 // RefSeq // Rattus norvegicus amylase 2a3 (Amy2a3), mRNA. // chr2 // 71 // 100 // 27 // 38 // 0 /// FQ233367 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YC18 mRNA sequence. // chr2 // 68 // 100 // 26 // 38 // 0 /// J00703 // GenBank // Rattus norvegicus pancreatic amylase mRNA, complete cds. // chr2 // 71 // 100 // 27 // 38 // 0 /// GENSCAN00000057927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:245855303:245864311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT032241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000057933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:245889222:245897760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 89 // 25 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000047935 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:245746374:245752215:-1 gene:ENSRNOG00000031336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 39 // 61 // 9 // 23 // 0 /// GENSCAN00000057924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:245628384:245834216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT032242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// NONRATT032243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_001010970 // RefSeq // Rattus norvegicus amylase, alpha 1A (salivary) (Amy1a), mRNA. // chr2 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000022496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:234523262:234538403:-1 gene:ENSRNOG00000033529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// AB057450 // GenBank // Rattus norvegicus Amy1 mRNA for alpha-amylase, complete cds. // chr2 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// BC088228 // GenBank // Rattus norvegicus amylase, alpha 1A (salivary), mRNA (cDNA clone MGC:108989 IMAGE:7323054), complete cds. // chr2 // 90 // 87 // 18 // 20 // 0 /// FQ219213 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YN18 mRNA sequence. // chr2 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:234523292:234533341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 87 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT032186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_001100810 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 3 (Rnpc3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:234574804:234603133:-1 gene:ENSRNOG00000017310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166571 // GenBank // Rattus norvegicus RNA-binding region (RNP1, RRM) containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:188204 IMAGE:7320328), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:234578261:234603087:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001073271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 39S ribosomal protein L30, mitochondrial-like (RGD1561877), mRNA. // chrU // 87 // 60 // 13 // 15 // 0
NM_017301 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate receptor 1 (S1pr1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:236742193:236746400:-1 gene:ENSRNOG00000013683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097938 // GenBank // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:116057 IMAGE:7460011), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U10303 // GenBank // Rattus norvegicus Edg-1 orphan receptor (edg-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:236743386:236744537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT032191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191715 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7 (Slc30a7), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:236974683:237037073:-1 gene:ENSRNOG00000013912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091417 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365263), partial cds. // chr2 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:236978526:237008329:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000036539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237009072:237027825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_012889 // RefSeq // Rattus norvegicus vascular cell adhesion molecule 1 (Vcam1), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vascular cell adhesion protein 1-like (LOC100912479), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 86 // 48 // 12 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000019377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237158195:237177632:-1 gene:ENSRNOG00000014333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC089812 // GenBank // Rattus norvegicus vascular cell adhesion molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:108734 IMAGE:7364929), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// M84488 // GenBank // Rat vascular cell adhesion molecule-1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237152471:237184308:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_031696 // RefSeq // Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 88 (Gpr88), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237334865:237339419:-1 gene:ENSRNOG00000026953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB042407 // GenBank // Rattus norvegicus strg/Gpr88 mRNA for striatum-specific G protein-coupled receptor GPR88, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT032199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001107718 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 14A (Cdc14a), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NM_001134856 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 14A (Cdc14a), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006233226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle 14A (Cdc14a), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237760156:237895742:1 gene:ENSRNOG00000014515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237760156:237913699:1 gene:ENSRNOG00000014515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC161876 // GenBank // Rattus norvegicus CDC14 cell division cycle 14 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187434 IMAGE:7115002), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006233225 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle 14A (Cdc14a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT030251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 97 // 32 // 33 // 1 /// GENSCAN00000008442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237807914:237899448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001004227 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA terminal phosphate cyclase domain 1 (Rtcd1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237659375:237680650:1 gene:ENSRNOG00000014575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079374 // GenBank // Rattus norvegicus RNA terminal phosphate cyclase domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:94866 IMAGE:7110129), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000008445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237658932:237680412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT030249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_001033902 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 13 homolog (S. cerevisiae) (Trmt13), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237588550:237601699:1 gene:ENSRNOG00000015140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC103656 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 76, mRNA (cDNA clone IMAGE:7319210), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC166503 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 76, mRNA (cDNA clone MGC:188066 IMAGE:7122476), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT030241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT030243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// GENSCAN00000015829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237577336:237601423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT030246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT030244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001106467 // RefSeq // Rattus norvegicus hippocampus abundant gene transcript 1 (Hiat1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006233223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hippocampus abundant transcript 1 (Hiat1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006233224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hippocampus abundant transcript 1 (Hiat1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000020907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237524843:237556087:1 gene:ENSRNOG00000015502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000075340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71185529:71217901:1 gene:ENSRNOG00000050407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC160912 // GenBank // Rattus norvegicus hippocampus abundant gene transcript 1, mRNA (cDNA clone MGC:188651 IMAGE:7456962), complete cds. // chr2 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000015846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237521905:237556087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000030801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71185658:71216781:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0
NM_001012082 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35 (UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) transporter), member A3 (Slc35a3), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237492884:237513169:1 gene:ENSRNOG00000015627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// BC079371 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 35 (UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) transporter), member A3, mRNA (cDNA clone MGC:94859 IMAGE:7109915), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT030240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237446663:237515008:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001108564 // RefSeq // Rattus norvegicus amylo-alpha-1, 6-glucosidase, 4-alpha-glucanotransferase (Agl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000055735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:237376059:237430811:1 gene:ENSRNOG00000016214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:237376678:237428386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001025688 // RefSeq // Rattus norvegicus palmdelphin (Palmd), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:238543610:238596898:-1 gene:ENSRNOG00000016508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC098755 // GenBank // Rattus norvegicus palmdelphin, mRNA (cDNA clone MGC:112777 IMAGE:7370232), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:238545064:238622498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0
ENSRNOT00000050182 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:238864739:238901084:-1 gene:ENSRNOG00000029431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// AY539922 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00171 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:238747955:238913080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001001508 // RefSeq // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphatase-related protein type 4 (Lppr4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:238365252:238405887:1 gene:ENSRNOG00000016872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF541280 // GenBank // Rattus norvegicus plasticity related gene 1 mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// AY266268 // GenBank // Rattus norvegicus strain Wistar plasticity related gene 1 protein mRNA, complete cds. // chr2 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:238374751:238403229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0
NM_001012083 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 7 (Snx7), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 7 (Snx7), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:239065719:239150147:-1 gene:ENSRNOG00000017077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC082033 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 7, mRNA (cDNA clone MGC:95170 IMAGE:7130739), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:239109363:239129228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000039521 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:239621670:239622126:-1 gene:ENSRNOG00000028528 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000030432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:239621670:239622014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_001005555 // RefSeq // Rattus norvegicus polypyrimidine tract binding protein 2 (Ptbp2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:241308282:241367644:-1 gene:ENSRNOG00000010827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082076 // GenBank // Rattus norvegicus polypyrimidine tract binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:95244 IMAGE:7133221), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212405 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA56YF15 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:241321835:241359362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT032220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT032219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT032221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT032222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001128152 // RefSeq // Rattus norvegicus RWD domain containing 3 (Rwdd3), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000040080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:242756616:242769365:-1 gene:ENSRNOG00000029893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:242759102:242771141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000055937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:242784033:242784934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_001135879 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 56 (Tmem56), mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006233245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 56 (Tmem56), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:242813588:242867287:-1 gene:ENSRNOG00000025160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC061828 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:5599715, partial cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:242815983:242845826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_001013914 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 44, member 3 (Slc44a3), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:243077593:243151810:-1 gene:ENSRNOG00000011723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// BC079142 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 44, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:94154 IMAGE:7128044), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243140365:243168630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT032233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// GENSCAN00000055936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243104140:243130882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_012804 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily D (ALD), member 3 (Abcd3), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:243374199:243409607:-1 gene:ENSRNOG00000011929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// D90038 // GenBank // Rattus norvegicus PMP70 mRNA for 70-kDa peroxisomal membrane protein, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:243374383:243403979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT032234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NR_032295 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 760 (Mir760), microRNA. // chr2 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000062138 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:243908753:243908832:-1 gene:ENSRNOG00000040385 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0 /// rno-mir-760 // miRBase Micro RNA Database // MI0006164 Rattus norvegicus miR-760 stem-loop // chr2 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0
NM_001039609 // RefSeq // Rattus norvegicus formin binding protein 1-like (Fnbp1l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246053113:246104570:-1 gene:ENSRNOG00000013798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246053113:246104570:-1 gene:ENSRNOG00000013798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB250295 // GenBank // Rattus norvegicus Toca-1 mRNA for Cdc42 effector, long isoform, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB250296 // GenBank // Rattus norvegicus Toca-1 mRNA for Cdc42 effector, short isoform, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246052110:246103759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106468 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 53 (Usp53), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246460175:246521759:-1 gene:ENSRNOG00000014660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ222386 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YC01 mRNA sequence. // chr2 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246483264:246506565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106469 // RefSeq // Rattus norvegicus myozenin 2 (Myoz2), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006233264 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myozenin 2 (Myoz2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myozenin 2 (Myoz2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000065361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246542267:246568964:-1 gene:ENSRNOG00000014815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ216537 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YF03 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246542445:246561094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT032256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001191963 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptopodin 2 (Synpo2), mRNA. // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006233271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptopodin 2 (Synpo2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000019931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246617297:246771857:-1 gene:ENSRNOG00000014867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246647600:246670106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001106470 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 14 (Mettl14), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246923971:246940051:-1 gene:ENSRNOG00000015250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:246923973:246939750:-1 gene:ENSRNOG00000015250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC166789 // GenBank // Rattus norvegicus similar to KIAA1627 protein, mRNA (cDNA clone MGC:188575 IMAGE:7936402), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:246925094:246940041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT032266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NONRATT032267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001191716 // RefSeq // Rattus norvegicus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 3 (Ndst3), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:247095402:247243643:-1 gene:ENSRNOG00000015781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:247095221:247119904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:247153160:247206725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000073200 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:247826816:247827365:-1 gene:ENSRNOG00000050985 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:247826816:247827177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
XR_344651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T-cell activation Rho GTPase-activating protein isoform b (RGD1306519), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_352004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T-cell activation Rho GTPase-activating protein isoform b (RGD1306519), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034173 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:247998286:248016004:-1 gene:ENSRNOG00000024928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055648 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:247998286:248016041:-1 gene:ENSRNOG00000024928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:247993972:248018801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006232379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC295483 (RGD1306704), mRNA. // chr2 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT029449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:166411131:166543958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
XM_006232379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC295483 (RGD1306704), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT029449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:166411131:166543958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000040758 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:166248485:166249448:1 gene:ENSRNOG00000031758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:166248909:166249487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 63 // 11 // 12 // 0
ENSRNOT00000012840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:248486521:248488445:-1 gene:ENSRNOG00000009679 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000017646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:248486800:248488445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NM_019276 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP glycosyltransferase 8 (Ugt8), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:248998871:249072741:-1 gene:ENSRNOG00000009345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// L21698 // GenBank // Rat ceramide UDP-galactosyltransferase mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:248962146:249053346:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U07683 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-galactose:ceramide galactosyltransferase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000035843 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:251008802:251010033:-1 gene:ENSRNOG00000025827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:250988660:251029874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_001076258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-kinase 1 (Alpk1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:251345862:251401138:-1 gene:ENSRNOG00000022636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251336519:251379020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
XM_001076258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-kinase 1 (Alpk1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:251345862:251401138:-1 gene:ENSRNOG00000022636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001076258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-kinase 1 (Alpk1), mRNA. // chr2 // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000030798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:251345862:251401138:-1 gene:ENSRNOG00000022636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251336519:251379020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251391406:251431414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001191850 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1 associated regulatory protein (Ap1ar), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000055607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:251491339:251523419:-1 gene:ENSRNOG00000024492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:251484603:251562357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT032300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT032301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001109651 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691931 (LOC691931), mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000014510 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:251559192:251589087:-1 gene:ENSRNOG00000010875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000045213 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:252299639:252300089:-1 gene:ENSRNOG00000032485 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000036600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:252299703:252309565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_022251 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamyl aminopeptidase (Enpep), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003749392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamyl aminopeptidase-like (LOC100910501), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074879 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:252991593:253065721:-1 gene:ENSRNOG00000050185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF214568 // GenBank // Rattus norvegicus aminopeptidase A (Enpep) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC066663 // GenBank // Rattus norvegicus glutamyl aminopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:72453 IMAGE:5623429), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF146518 // GenBank // Rattus norvegicus aminopeptidase A short variant mRNA, partial cds. // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253287896:253304565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:253064430:253112435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF146044 // GenBank // Rattus norvegicus aminopeptidase A mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012842 // RefSeq // Rattus norvegicus epidermal growth factor (Egf), mRNA. // chr2 // 83 // 100 // 39 // 47 // 0 /// XM_006232008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epidermal growth factor (Egf), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 38 // 18 // 18 // 0 /// XR_351440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pro-epidermal growth factor-like (LOC100910178), misc_RNA. // chr2 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000046113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:88549746:88627376:1 gene:ENSRNOG00000032707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// BC062030 // GenBank // Rattus norvegicus epidermal growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:72539 IMAGE:5623849), complete cds. // chr2 // 89 // 100 // 42 // 47 // 0 /// JX437943 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley epidermal growth factor (EGF) mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 94 // 42 // 44 // 0 /// U04842 // GenBank // Rattus norvegicus preproepidermal growth factor mRNA, complete cds. // chr2 // 83 // 100 // 39 // 47 // 0 /// XM_006232009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epidermal growth factor (Egf), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1 /// ENSRNOT00000073012 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:74747145:74867985:1 gene:ENSRNOG00000050330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000052145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:88562816:88622827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000031904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:74759818:74871229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 38 // 47 // 1
XM_006232007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 3 (Lrit3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000043105 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:74690741:74711003:1 gene:ENSRNOG00000023715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:74666497:74711003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001107726 // RefSeq // Rattus norvegicus retinal pigment epithelium derived rhodopsin homolog (Rrh), mRNA. // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000013506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:74674146:74686297:1 gene:ENSRNOG00000010159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000031912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:74666497:74711003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001024306 // RefSeq // Rattus norvegicus GAR1 ribonucleoprotein (Gar1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:74665990:74673267:1 gene:ENSRNOG00000009877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079131 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar protein family A, member 1 (H/ACA small nucleolar RNPs), mRNA (cDNA clone MGC:94141 IMAGE:7127379), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GAR1 ribonucleoprotein (Gar1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT029015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031912 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:74666497:74711003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XM_006224254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 109B (Ccdc109b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 109B (Ccdc109b), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 109B (Ccdc109b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 109B (Ccdc109b), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012587 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:249552961:249573851:-1 gene:ENSRNOG00000009433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:249552961:249610486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT032279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001106474 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC24 family member B (Sec24b), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:249637719:249707661:-1 gene:ENSRNOG00000023373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:249629373:249738783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001108566 // RefSeq // Rattus norvegicus oligosaccharyltransferase complex subunit (non-catalytic) (Ostc), mRNA. // chr2 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000037393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:254367954:254383277:-1 gene:ENSRNOG00000023322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC159425 // GenBank // Rattus norvegicus oligosaccharyltransferase complex subunit, mRNA (cDNA clone MGC:188739 IMAGE:9030828), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ218918 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YB22 mRNA sequence. // chr2 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// FQ219812 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YD22 mRNA sequence. // chr2 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// FQ220889 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YF01 mRNA sequence. // chr2 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:254352854:254383233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_057186 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxyacyl-CoA dehydrogenase (Hadh), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:254902140:254944001:-1 gene:ENSRNOG00000010697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF095449 // GenBank // Rattus norvegicus L-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase precursor (HAD) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT032310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:254907587:254943973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001024779 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily u, polypeptide 1 (Cyp2u1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000055570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:254963069:254980063:-1 gene:ENSRNOG00000011053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC097442 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily u, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:114497 IMAGE:7456028), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:254965343:254979987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001014043 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin synthase 2 (Sgms2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006233313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sphingomyelin synthase 2 (Sgms2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:255006746:255028969:-1 gene:ENSRNOG00000011284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085803 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93838 IMAGE:7111151), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// DQ071571 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin synthase 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT032317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:254997348:255072779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT032316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT032318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSRNOT00000038498 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:255675436:255676650:-1 gene:ENSRNOG00000022991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0
NM_053757 // RefSeq // Rattus norvegicus aminoacyl tRNA synthetase complex-interacting multifunctional protein 1 (Aimp1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:256268302:256291846:-1 gene:ENSRNOG00000011384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098675 // GenBank // Rattus norvegicus small inducible cytokine subfamily E, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:112632 IMAGE:7322792), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ213631 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YK14 mRNA sequence. // chr2 // 55 // 74 // 11 // 20 // 0 /// GENSCAN00000040433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:256231996:256285064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_001075423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to nephronectin isoform a (LOC686753), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to nephronectin isoform a (LOC686753), mRNA. // chr2 // 85 // 77 // 17 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000072131 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:256542683:256607414:-1 gene:ENSRNOG00000046293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073037 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:256542683:256607414:-1 gene:ENSRNOG00000046293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075259 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:256542683:256607414:-1 gene:ENSRNOG00000046293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 77 // 17 // 20 // 0
NM_001107725 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, C-terminal domain containing (Gstcd), mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006233325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutathione S-transferase, C-terminal domain containing (Gstcd), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000037154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:256699240:256790462:-1 gene:ENSRNOG00000011669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// FQ211741 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA81YN22 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// XM_006233343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutathione S-transferase C-terminal domain-containing protein-like (LOC102556234), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// XM_006233344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutathione S-transferase C-terminal domain-containing protein-like (LOC102556234), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT032325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:256648526:256792820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT032328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT032329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_006224301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 38 (Arhgef38), mRNA. // chr2 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// XM_006233354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 38 (Arhgef38), mRNA. // chr2 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041583 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:256813220:256839452:-1 gene:ENSRNOG00000023965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:256811963:256898846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0
XM_006224301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 38 (Arhgef38), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233345 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho guanine nucleotide exchange factor 38-like (LOC102556447), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 38 (Arhgef38), mRNA. // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000055537 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:256921541:257004946:-1 gene:ENSRNOG00000036958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:256993765:257027421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000044726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:256923310:256980026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000044731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:256811963:256898846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000046775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:257255362:257279069:-1 gene:ENSRNOG00000023579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000071991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:257255362:257279069:-1 gene:ENSRNOG00000023579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:257255362:257336602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001191608 // RefSeq // Rattus norvegicus CDGSH iron sulfur domain 2 (Cisd2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259106753:259130712:-1 gene:ENSRNOG00000048258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217940 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA13YH22 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259110379:259130679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT032339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001276711 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1 (Nfkb1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000036838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259330384:259421280:-1 gene:ENSRNOG00000023258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000040511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259330384:259421280:-1 gene:ENSRNOG00000023258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000068674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259336820:259421280:-1 gene:ENSRNOG00000023258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000041771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259325612:259385051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT032345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 73 // 73 // 35 // 48 // 1 /// NONRATT032343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// NONRATT032344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1
NM_001047918 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (Bank1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259830428:260099770:-1 gene:ENSRNOG00000032247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ231577 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC16 mRNA sequence. // chr2 // 85 // 93 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259838714:259953787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001047918 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (Bank1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259830428:260099770:-1 gene:ENSRNOG00000032247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231577 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC16 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259838714:259953787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047918 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (Bank1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259830428:260099770:-1 gene:ENSRNOG00000032247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231577 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC16 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259988259:260029804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000051498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259999433:260029804:-1 gene:ENSRNOG00000032247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY387090 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00104 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NM_001047918 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (Bank1), mRNA. // chr2 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000073875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259830428:260099770:-1 gene:ENSRNOG00000032247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// FQ231577 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC16 mRNA sequence. // chr2 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000011090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:259988259:260029804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT032351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001047918 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (Bank1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259830428:260099770:-1 gene:ENSRNOG00000032247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231577 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YC16 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:260030867:260105279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001047918 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell scaffold protein with ankyrin repeats 1 (Bank1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:259830428:260099770:-1 gene:ENSRNOG00000032247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:260030867:260105279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047950 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00095 (LOC499715), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261345991:261377188:-1 gene:ENSRNOG00000033088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT032352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NM_001108568 // RefSeq // Rattus norvegicus dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides (Dapp1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261723411:261772455:-1 gene:ENSRNOG00000010575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261725629:261759554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NONRATT032356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001107727 // RefSeq // Rattus norvegicus microsomal triglyceride transfer protein (Mttp), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000014631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261907825:261948693:-1 gene:ENSRNOG00000010655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000011549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261889330:261948595:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT032360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001134579 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein DKFZp434G072 (RGD1309170), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein DKFZp434G072 (RGD1309170), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:261988211:262008746:-1 gene:ENSRNOG00000024623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000011551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:261982811:262018980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT032361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT032362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001106476 // RefSeq // Rattus norvegicus methionyl aminopeptidase 1 (Metap1), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:262279056:262312345:-1 gene:ENSRNOG00000012947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT032370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000024637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262297641:262349574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
ENSRNOT00000071898 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:262407050:262407855:-1 gene:ENSRNOG00000048781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262407050:262597885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
NM_001107728 // RefSeq // Rattus norvegicus RAP1, GTP-GDP dissociation stimulator 1 (Rap1gds1), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:262787596:262899803:-1 gene:ENSRNOG00000015987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262789314:262827848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
GENSCAN00000010050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:262982085:262982378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0
ENSRNOT00000034183 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:263592384:263592864:-1 gene:ENSRNOG00000031473 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 74 // 79 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000013932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:263577544:263592864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_053994 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2 (Pdha2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000021719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:265263755:265264930:-1 gene:ENSRNOG00000016223 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// BC078757 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase (lipoamide) alpha 2, mRNA (cDNA clone MGC:93262 IMAGE:7113421), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000053065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:265263755:265264921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// U44125 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase E1a alpha subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_001024259 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein receptor, type IB (Bmpr1b), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein receptor, type IB (Bmpr1b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006233400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein receptor, type IB (Bmpr1b), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006233401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein receptor, type IB (Bmpr1b), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000021963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:265932566:265965469:-1 gene:ENSRNOG00000016289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// BC092609 // GenBank // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein receptor, type IB, mRNA (cDNA clone MGC:109250 IMAGE:7310757), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:265927560:266010461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT032377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0
NM_053326 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 5 (Pdlim5), mRNA. // chr2 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:266348751:266518443:-1 gene:ENSRNOG00000016419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// U48247 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C-binding protein Enigma mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// XM_006233420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 5 (Pdlim5), transcript variant X17, mRNA. // chr2 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// FQ215630 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YH02 mRNA sequence. // chr2 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT032379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000042890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266321881:266395898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000042893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266413094:266518826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT032380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT032382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT032384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
XM_006224278 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanylate binding protein 1, interferon-inducible (Gbp1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000045855 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:266924043:266934696:1 gene:ENSRNOG00000023943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 94 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:266924037:266967190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0
NM_001105755 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase N2 (Pkn2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000031748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:267265825:267370861:-1 gene:ENSRNOG00000011317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT032386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000005095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:267267244:267420340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 29 // 45 // 1
NM_001100518 // RefSeq // Rattus norvegicus heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1 (Hs2st1), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:268996211:269129114:-1 gene:ENSRNOG00000012549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:268998977:269047590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_001011929 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like endophilin B1 (Sh3glb1), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:269242689:269271017:-1 gene:ENSRNOG00000012957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC079085 // GenBank // Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like endophilin B1, mRNA (cDNA clone MGC:94050 IMAGE:7123144), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ234013 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YH24 mRNA sequence. // chr2 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT032402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269219431:269273840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT032406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001013202 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel calcium activated 2 (Clca2), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:269282803:269305090:-1 gene:ENSRNOG00000013334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB119249 // GenBank // Rattus norvegicus CLCA mRNA for Ca(2+)-activated chloride channel, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AB212889 // GenBank // Rattus norvegicus rbCLCA mRNA for calcium activated chloride channel, complete cds. // chr2 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// AB306511 // GenBank // Rattus norvegicus CLCA mRNA for Ca(2+)-activated chloride channel splicing variant, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269283376:269390332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001077356 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel calcium activated 4-like (Clca4l), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:269312355:269332154:-1 gene:ENSRNOG00000036877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB256513 // GenBank // Rattus norvegicus rbCLCA2 mRNA for calcium-activated chloride channel, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269283376:269390332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_201419 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel accessory 4 (Clca4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000017943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:269371177:269390431:-1 gene:ENSRNOG00000029889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AY333961 // GenBank // Rattus norvegicus parturition-related protein PRP3 (Prp3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000053404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269283376:269390332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001107449 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel accessory 1 (Clca1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:269425677:269451501:-1 gene:ENSRNOG00000013447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269426538:269451487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107450 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel calcium activated 5 (Clca5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chloride channel calcium activated 5 (Clca5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:269482263:269508776:-1 gene:ENSRNOG00000013771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:269451904:269508583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031327 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich, angiogenic inducer, 61 (Cyr61), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270055954:270058912:-1 gene:ENSRNOG00000014350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB015877 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CYR61, complete cds. // chr2 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AF218568 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich protein 61 (CYR61) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC081689 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich, angiogenic inducer, 61, mRNA (cDNA clone MGC:93040 IMAGE:7122117), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270041086:270058727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT032418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001134736 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 63 (Wdr63), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000020141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270435973:270494382:-1 gene:ENSRNOG00000014893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC168204 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 63, mRNA (cDNA clone MGC:188063 IMAGE:7121248), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000013569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270436133:270505555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001014177 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 1 (Spata1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 1 (Spata1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 1 (Spata1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270841391:270886763:-1 gene:ENSRNOG00000015678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079224 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:94297 IMAGE:7132232), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT032425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001100794 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosome production factor 1 homolog (S. cerevisiae) (Rpf1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270895282:270909803:-1 gene:ENSRNOG00000015969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086515 // GenBank // Rattus norvegicus brix domain containing 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301902), partial cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC166888 // GenBank // Rattus norvegicus brix domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:188831 IMAGE:6891440), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166920 // GenBank // Rattus norvegicus brix domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:188908 IMAGE:6919256), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270901534:270909774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT032427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_021664 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxyribonuclease II beta (Dnase2b), mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006233464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyribonuclease II beta (Dnase2b), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyribonuclease II beta (Dnase2b), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270962867:270978239:-1 gene:ENSRNOG00000016262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF178974 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyribonuclease DLAD mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:270963116:270974749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_020089 // RefSeq // Rattus norvegicus dnaj-like protein (LOC56764), mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dnaj-like protein (LOC56764), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000021984 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:271026746:271032571:-1 gene:ENSRNOG00000016432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// AF154849 // GenBank // Rattus norvegicus dnaj-like protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// BC083558 // GenBank // Rattus norvegicus dnaj-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:93471 IMAGE:7134067), complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:271027753:271032415:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
XM_006233451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, cAMP dependent, catalytic, beta (Prkacb), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT032435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000072487 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:274839167:274840283:-1 gene:ENSRNOG00000048082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:274839770:274840213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0
NM_001107729 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon-induced protein 44 (Ifi44), mRNA. // chr2 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000029990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:275575815:275593538:-1 gene:ENSRNOG00000022218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC088420 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-induced protein 44, mRNA (cDNA clone IMAGE:7123360). // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// BC158758 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-induced protein 44, mRNA (cDNA clone MGC:187965 IMAGE:7099624), complete cds. // chr2 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:275584105:275631440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT032445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT032446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NONRATT032451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000021699 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:275989541:275990043:-1 gene:ENSRNOG00000016209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:275988442:276023708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
XM_006224287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 73, member A (Fam73a), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 73, member A (Fam73a), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016668 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:276170622:276223258:-1 gene:ENSRNOG00000012437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000040920 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:276170622:276223258:-1 gene:ENSRNOG00000012437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:276130382:276225526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT032462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_019123 // RefSeq // Rattus norvegicus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3 (St6galnac3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:278255750:278355379:-1 gene:ENSRNOG00000028683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000065262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:278043623:278046871:-1 gene:ENSRNOG00000042422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// BC072501 // GenBank // Rattus norvegicus ST6 (alpha-N-acetyl-neuraminyl-2,3-beta-galactosyl-1, 3)-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3, mRNA (cDNA clone MGC:91713 IMAGE:7099426), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L29554 // GenBank // Rattus norvegicus alpha 2,6-sialyltransferase mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:278031664:278049609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001106477 // RefSeq // Rattus norvegicus mutS homolog 4 (Msh4), mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000014106 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:278721922:278772964:-1 gene:ENSRNOG00000010431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000032133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:278708127:278765642:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 30 // 48 // 1
NONRATT032482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NONRATT032482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT032482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_016986 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA dehydrogenase, C-4 to C-12 straight chain (Acadm), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000013238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:278788485:278812656:-1 gene:ENSRNOG00000009845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// J02791 // GenBank // Rat acyl coenzyme A dehydrogenase medium chain mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT032492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:278772699:278822845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1
NM_001012219 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM homeobox 8 (Lhx8), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:279235994:279258253:-1 gene:ENSRNOG00000028348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC090011 // GenBank // Rattus norvegicus LIM homeobox 8, mRNA (cDNA clone MGC:109530 IMAGE:7324565), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279202730:279351565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_001080203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae) (Tyw3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_575065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA-yW synthesizing protein 3 homolog (S. cerevisiae) (Tyw3), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032874 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:279523743:279545826:-1 gene:ENSRNOG00000028328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279523743:279545931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_181769 // RefSeq // Rattus norvegicus TNNI3 interacting kinase (Tnni3k), mRNA. // chr2 // 90 // 100 // 36 // 40 // 0 /// XM_006233518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TNNI3 interacting kinase (Tnni3k), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000030341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:279730855:279999097:-1 gene:ENSRNOG00000028225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AY303692 // GenBank // Rattus norvegicus cardiac ankyrin repeat kinase mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 100 // 36 // 40 // 0 /// NONRATT032500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000029423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279880822:280074688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// NONRATT032503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_199494 // RefSeq // Rattus norvegicus fucose-1-phosphate guanylyltransferase (Fpgt), mRNA. // chr2 // 88 // 74 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:280067673:280074692:-1 gene:ENSRNOG00000009548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AJ276066 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for putative GDP-L-fucose pyrophosphorylase. // chr2 // 88 // 74 // 22 // 25 // 0 /// BC088089 // GenBank // Rattus norvegicus fucose-1-phosphate guanylyltransferase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7376038), complete cds. // chr2 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// BC168244 // GenBank // Rattus norvegicus fucose-1-phosphate guanylyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:188371 IMAGE:5600080), complete cds. // chr2 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT032505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT032506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// GENSCAN00000029423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:279880822:280074688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_017074 // RefSeq // Rattus norvegicus cystathionase (cystathionine gamma-lyase) (Cth), mRNA. // chr2 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:282366121:282392112:1 gene:ENSRNOG00000010658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB052882 // GenBank // Rattus norvegicus CSE mRNA for cystathionine gamma-lyase, complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AY032875 // GenBank // Rattus norvegicus cystathionine gamma-lyase mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC078869 // GenBank // Rattus norvegicus cystathionase (cystathionine gamma-lyase), mRNA (cDNA clone MGC:93537 IMAGE:7109746), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D17370 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cystathionine gamma-lyase, complete cds. // chr2 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT030584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:282366131:282457965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT030585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001035255 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 11 (Srsf11), mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 11 (Srsf11), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 11 (Srsf11), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283477397:283496845:-1 gene:ENSRNOG00000029592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC099157 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine-rich 11, mRNA (cDNA clone MGC:116323 IMAGE:7381485), complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ209707 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YA08 mRNA sequence. // chr2 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:283478487:283496742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT032530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT032523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT032525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT032528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT032529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_057142 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 7 (Lrrc7), mRNA. // chr2 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283550319:283934368:-1 gene:ENSRNOG00000011980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283550319:283934368:-1 gene:ENSRNOG00000011980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283550319:283934368:-1 gene:ENSRNOG00000011980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283550319:283934368:-1 gene:ENSRNOG00000011980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283550319:283934368:-1 gene:ENSRNOG00000011980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// EU348642 // GenBank // Rattus norvegicus densin 11-17 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 87 // 52 // 13 // 15 // 0 /// EU348643 // GenBank // Rattus norvegicus densin 11-21 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 94 // 55 // 15 // 16 // 0 /// U66707 // GenBank // Rattus norvegicus densin-180 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:283577195:283697484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT032532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_133387 // RefSeq // Rattus norvegicus trimethyllysine hydroxylase, epsilon (Tmlhe), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:242193:279024:1 gene:ENSRNOG00000000729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:242193:279024:1 gene:ENSRNOG00000000729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF374406 // GenBank // Rattus norvegicus epsilon-trimethyllysine 2-oxoglutarate dioxygenase TMLH (Tmlh) mRNA, complete cds. // chr20 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// BC085923 // GenBank // Rattus norvegicus trimethyllysine hydroxylase, epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:94841 IMAGE:7109209), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:248186:278914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT032538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001009651 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 2 (Clic2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:289420:304438:1 gene:ENSRNOG00000000728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC088182 // GenBank // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 2, mRNA (cDNA clone MGC:108828 IMAGE:7365286), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:289631:304199:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001000895 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1670 (Olr1670), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:372137:373075:1 gene:ENSRNOG00000049000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000270 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1684 (Olr1684), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:556460:557401:1 gene:ENSRNOG00000040183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:556460:613479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT032546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000072445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:612555:613443:1 gene:ENSRNOG00000048772 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:882007:882895:1 gene:ENSRNOG00000046173 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:556460:613479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001000508 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1687 (Olr1687), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:633588:634553:1 gene:ENSRNOG00000046708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:632328:682056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000275 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1688 (Olr1688), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:719116:720120:1 gene:ENSRNOG00000050612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:900113:901117:1 gene:ENSRNOG00000046733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:900137:910346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:719140:729349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001033666 // RefSeq // Rattus norvegicus destrin (Dstn), mRNA. // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144462864:144489654:1 gene:ENSRNOG00000005924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000975 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:829357:829854:1 gene:ENSRNOG00000000748 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144479580:144488587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:829357:829854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT035877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// NONRATT035878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000034790 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:80990003:80990519:1 gene:ENSRNOG00000026891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 61 // 97 // 17 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80978613:81033448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT035879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001001374 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1702 (Olr1702), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:1108083:1109036:1 gene:ENSRNOG00000050738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071389 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:983992:984944:1 gene:ENSRNOG00000047265 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1108083:1122259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT032549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000887 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1705 (Olr1705), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000071933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:1006927:1007865:1 gene:ENSRNOG00000048714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000075252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:1131019:1131957:1 gene:ENSRNOG00000049753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1006951:1007865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000052870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1131043:1131957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
NM_001001115 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1707 (Olr1707), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:1162124:1163062:1 gene:ENSRNOG00000049037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075267 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:1038063:1038977:1 gene:ENSRNOG00000050284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1162148:1181314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1038063:1049063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001000509 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1709 (Olr1709), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:1182710:1183648:1 gene:ENSRNOG00000050354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000279 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1730 (Olr1730), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_213732 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1869 (Olr1869), mRNA. // chr20 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3692456:3693409:1 gene:ENSRNOG00000000759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3692603:3693409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 88 // 16 // 22 // 0 /// NONRATT032553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_001001119 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1734 (Olr1734), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000047035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3780134:3781075:1 gene:ENSRNOG00000028849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT032554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000055662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3780368:3832412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 63 // 80 // 5 // 8 // 0
NM_001001397 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1735 (Olr1735), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3793457:3794383:1 gene:ENSRNOG00000050043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3780368:3832412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT032555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001421 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1736 (Olr1736), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3808599:3809712:1 gene:ENSRNOG00000046270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3780368:3832412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001422 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1737 (Olr1737), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3825496:3826422:1 gene:ENSRNOG00000048048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3780368:3832412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT032557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001006599 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1738 (Olr1738), mRNA. // chr20 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000041883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3831486:3832412:1 gene:ENSRNOG00000029883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000055662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3780368:3832412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT032558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
NM_001001423 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1739 (Olr1739), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3851241:3852170:1 gene:ENSRNOG00000049679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3851241:3852170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000072074 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:3867663:3868559:1 gene:ENSRNOG00000045661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0 /// GENSCAN00000055658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3867663:3880771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_001001424 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1742 (Olr1742), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000041254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3879842:3880771:1 gene:ENSRNOG00000050208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000055658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3867663:3880771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT032560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001001426 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1744 (Olr1744), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3902890:3903828:1 gene:ENSRNOG00000029420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3902890:3903828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000000994 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:3915872:3916910:1 gene:ENSRNOG00000000767 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 72 // 72 // 13 // 18 // 0
NM_001001427 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1746 (Olr1746), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3931254:3932192:1 gene:ENSRNOG00000050443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3931254:3932192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000055665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3946976:3947914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001001428 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1748 (Olr1748), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3946976:3973106:1 gene:ENSRNOG00000048232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3960483:3978667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT032563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001429 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1749 (Olr1749), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3977729:3978667:1 gene:ENSRNOG00000048828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000055647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3960483:3978667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT032564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_212493 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1750 (Olr1750), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3985861:3986793:1 gene:ENSRNOG00000043481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3985861:3986793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022668 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin oligodendrocyte glycoprotein (Mog), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myelin oligodendrocyte glycoprotein (Mog), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4044677:4054910:1 gene:ENSRNOG00000000775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087717 // GenBank // Rattus norvegicus myelin oligodendrocyte glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:105427 IMAGE:7317044), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L21995 // GenBank // Rattus norvegicus myelin/oligodendrocyte glycoprotein (MOG) mRNA, partial cds. // chr20 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// M99485 // GenBank // Rattus norvegicus myelin/oligodendrocyte glycoprotein (MOG) gene, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4044765:4061299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001168343 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus M4 (RT1-M4), mRNA. // chr20 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4084098:4087849:1 gene:ENSRNOG00000022107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4084098:4093032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001008852 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus M6, gene 1 (RT1-M6-1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000040634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4084408:4100398:1 gene:ENSRNOG00000022107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000051480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4098256:4101172:1 gene:ENSRNOG00000022107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// EU106176 // GenBank // Rattus norvegicus haplotype RT1 lv MHC class Ib antigen mRNA, partial cds. // chr20 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000032309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4098256:4102581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT032571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT032572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT032573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0
NM_001008853 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus M6, gene 2 (RT1-M6-2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4113595:4116511:1 gene:ENSRNOG00000040052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// EU093965 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class Ib antigen mRNA, partial cds. // chr20 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4113595:4129088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001166300 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc ribbon domain containing 1 (Znrd1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_213567 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc ribbon domain containing 1 (Znrd1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4125232:4129150:1 gene:ENSRNOG00000000779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4113595:4129088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT032577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_212542 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 11 (Ppp1r11), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006255870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 11 (Ppp1r11), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4131645:4135152:1 gene:ENSRNOG00000000780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC079252 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 11, mRNA (cDNA clone MGC:94346 IMAGE:7133103), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4131846:4134154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT032578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT032580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT032581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001009175 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 40 (Trim40), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4206663:4215227:1 gene:ENSRNOG00000000783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4206663:4215458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001291382 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing protein 15-like (LOC100910806), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001017 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:4231807:4246805:1 gene:ENSRNOG00000031689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000032333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4231705:4238423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
NM_001168332 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, M1, gene 5 (RT1-M1-5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000038725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4386402:4388502:1 gene:ENSRNOG00000028035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4387153:4401229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0
XM_006255889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain-like (LOC102546590), partial mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042866 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:4491215:4493413:1 gene:ENSRNOG00000042370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4241315:4301758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4491215:4523209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039155 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:4299572:4324002:-1 gene:ENSRNOG00000031384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000032347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4321872:4324002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001008851 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus M10, gene 1 (RT1-M10-1), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4514214:4516334:1 gene:ENSRNOG00000033362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4491215:4523209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_213562 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 39 (Trim39), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4530743:4544598:1 gene:ENSRNOG00000000785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4533610:4547484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT032584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001002831 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 21 subunit (Rpp21), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4545572:4547523:1 gene:ENSRNOG00000000786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ209948 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA37YF10 mRNA sequence. // chr20 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// FQ211619 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA85YK02 mRNA sequence. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4533610:4547484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT032585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001044283 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 3 (Snx3), mRNA. // chr20 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000074532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:48923087:48932813:1 gene:ENSRNOG00000046705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC086341 // GenBank // Rattus norvegicus similar to sorting nexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:105945 IMAGE:7301779), complete cds. // chr20 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BC107918 // GenBank // Rattus norvegicus similar to sorting nexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:125029 IMAGE:7458016), complete cds. // chr20 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BC158608 // GenBank // Rattus norvegicus similar to sorting nexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:187477 IMAGE:7301775), complete cds. // chr20 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// NONRATT033547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001002821 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus T18 (RT1-T18), mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5217573:5221833:1 gene:ENSRNOG00000030666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AY144125 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley MHC class Ib antigen (RanoTL) mRNA, RanoTL*1901 allele, partial cds. // chr20 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// BC104719 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7381995. // chr20 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus h-2 class I histocompatibility antigen, TLA(B) alpha chain-like (LOC102552616), mRNA. // chr20 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// GENSCAN00000009263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5211697:5212761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5217582:5230705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// NONRATT032594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
XR_147162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus h-2 class I histocompatibility antigen, D-D alpha chain-like (RGD1562652), misc_RNA. // chrU // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// XR_362008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus h-2 class I histocompatibility antigen, D-D alpha chain-like (RGD1562652), misc_RNA. // chrU // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000036147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5236559:5238631:1 gene:ENSRNOG00000026051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 67 // 75 // 4 // 6 // 0 /// NONRATT032604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_001008854 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus N2 (RT1-N2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NM_012646 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus N1 (RT1-N1), mRNA. // chr20 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// XM_006255938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus N2 (RT1-N2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000050159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5245094:5248485:1 gene:ENSRNOG00000029386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5236559:5248209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// NONRATT032610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// NONRATT032611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1 /// NONRATT032612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
NM_001008857 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus S2 (RT1-S2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000042882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5253818:5255239:1 gene:ENSRNOG00000029001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT032613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001008856 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus O1 (RT1-O1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006255910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus O1 (RT1-O1), transcript variant X1, partial mRNA. // chr20 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000048036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5258701:5261105:1 gene:ENSRNOG00000032664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT032614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT032615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
NM_001008855 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus N3 (RT1-N3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus N3 (RT1-N3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5265245:5269111:1 gene:ENSRNOG00000000795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158567 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class Ib gene, H2-TL-like, grc region (N3), mRNA (cDNA clone MGC:187288 IMAGE:9090368), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L23128 // GenBank // Rattus norvegicus MHC class I mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT032619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5265509:5386644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT032618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
GENSCAN00000009295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5265509:5386644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001008886 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus S3 (RT1-S3), mRNA. // chr20 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5274290:5276827:1 gene:ENSRNOG00000000777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// FQ234242 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YK22 mRNA sequence. // chr20 // 80 // 78 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT032622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5265509:5386644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT032621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT032623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
BC098866 // GenBank // Rattus norvegicus histocompatibility 2, T region locus 24, mRNA (cDNA clone MGC:112931 IMAGE:7380738), complete cds. // chr20 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NM_001008826 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus T24, gene 4 (RT1-T24-4), mRNA. // chr20 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000047439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5287623:5295621:1 gene:ENSRNOG00000042905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// XM_006255992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus T24, gene 4 (RT1-T24-4), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONRATT032626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT032628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1
XM_006223805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I histocompatibility antigen, AA alpha chain-like (LOC100909797), mRNA. // chr20 // 89 // 89 // 16 // 18 // 1 /// XM_006256029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I histocompatibility antigen, AA alpha chain-like (LOC100909797), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 89 // 89 // 16 // 18 // 1 /// GENSCAN00000009295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5265509:5386644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 89 // 16 // 18 // 1
XM_006223805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I histocompatibility antigen, AA alpha chain-like (LOC100909797), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001008858 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus T24, gene 1 (RT1-T24-1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000041502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5367481:5380689:1 gene:ENSRNOG00000032596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT032635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5265509:5386644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 73 // 8 // 11 // 0
NM_212544 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 3 (Prr3), mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006255941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 3 (Prr3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000035838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5398413:5404790:1 gene:ENSRNOG00000025806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC098636 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7387102. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC126073 // GenBank // Rattus norvegicus proline rich 3, mRNA (cDNA clone MGC:156547 IMAGE:7311139), complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT032639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001109883 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily F (GCN20), member 1 (Abcf1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000001049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5407475:5420356:1 gene:ENSRNOG00000000799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000009266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5407421:5419817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT032643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT032644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1
NM_212534 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S18B (Mrps18b), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5442393:5448452:1 gene:ENSRNOG00000000804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC166875 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S18B, mRNA (cDNA clone MGC:188803 IMAGE:6889975), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5442424:5466273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// NONRATT032649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_212498 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha tubulin acetyltransferase 1 (Atat1), mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5448826:5462080:1 gene:ENSRNOG00000000809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha tubulin acetyltransferase 1 (Atat1), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT032650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5442424:5466273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// BC088258 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7375759, with apparent retained intron. // chr20 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT032651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT032653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT032654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT032655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
FQ215898 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YC08 mRNA sequence. // chr20 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// NM_213610 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein MGC:15854 (RGD1302996), mRNA. // chr20 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000001077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5462332:5466442:1 gene:ENSRNOG00000000812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT032656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5442424:5466273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT032658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT032659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_173102 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, beta 5 class I (Tubb5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5519551:5523476:1 gene:ENSRNOG00000000821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AB011679 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for class I beta-tubulin, complete cds. // chr20 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// BC060540 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, beta 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:6890912), complete cds. // chr20 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// FQ213253 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YN19 mRNA sequence. // chr20 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5519747:5522836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT032663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0
NM_001166022 // RefSeq // Rattus norvegicus discoidin domain receptor tyrosine kinase 1 (Ddr1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NM_013137 // RefSeq // Rattus norvegicus discoidin domain receptor tyrosine kinase 1 (Ddr1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000001102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5536686:5671944:1 gene:ENSRNOG00000000830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000040523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5659561:5671944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT032666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT032668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0
NM_212501 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor II H, polypeptide 4 (Gtf2h4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus general transcription factor II H, polypeptide 4 (Gtf2h4), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5679700:5685350:1 gene:ENSRNOG00000000831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083703 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor II H, polypeptide 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7190127). // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC127469 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor II H, polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:156549 IMAGE:7324889), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5680617:5685247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT032675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_213563 // RefSeq // Rattus norvegicus valyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Vars2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5685498:5696344:1 gene:ENSRNOG00000000833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5685442:5699838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
XM_006256039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin-21-like (LOC102555422), partial mRNA. // chr20 // 92 // 81 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT032685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 86 // 88 // 12 // 14 // 0
XM_002728917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metallothionein 1M (Mt1m), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_003753446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metallothionein 1M (Mt1m), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000047663 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:5766751:5766936:1 gene:ENSRNOG00000028841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_001137564 // RefSeq // Rattus norvegicus metallothionein 2A (Mt2A), mRNA. // chr20 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000067391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11283094:11283867:-1 gene:ENSRNOG00000043098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// BC168768 // GenBank // Rattus norvegicus metallothionein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:188897 IMAGE:6891160), complete cds. // chr20 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11273034:11301864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 69 // 76 // 9 // 13 // 0
XM_006256041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE7 (RT1-CE7), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// XR_362024 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE7 (RT1-CE7), transcript variant X4, misc_RNA. // chr20 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1 /// XR_362026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE7 (RT1-CE7), transcript variant X6, misc_RNA. // chr20 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NONRATT032839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001008833 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE10 (RT1-CE10), mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000048858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:155870:158859:-1 gene:ENSRNOG00000050210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// BC083874 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class I, CE10, mRNA (cDNA clone IMAGE:7129682). // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098952 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class I, CE10, mRNA (cDNA clone MGC:114586 IMAGE:7366301), complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:137272:158847:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT033485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_212509 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor-like 1 (Nfkbil1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor-like 1 (Nfkbil1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000001113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6904626:6919601:1 gene:ENSRNOG00000000839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099772 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:124530 IMAGE:7932537), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6913468:6919396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT032790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT032788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT032789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_080769 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphotoxin alpha (Lta), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphotoxin alpha (Lta), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6933071:6935077:1 gene:ENSRNOG00000000838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6932442:6934496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT032793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012675 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (Tnf), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6936229:6938839:1 gene:ENSRNOG00000000837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC107671 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (TNF superfamily, member 2), mRNA (cDNA clone MGC:124630 IMAGE:7938033), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// HQ201305 // GenBank // Rattus norvegicus strain Wistar tumor necrosis factor-alpha mRNA, complete cds. // chr20 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6936373:6938012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022634 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte specific transcript 1 (Lst1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006256080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte specific transcript 1 (Lst1), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7249282:7252477:-1 gene:ENSRNOG00000000855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF208230 // GenBank // Rattus norvegicus B144 (B144) mRNA, complete cds. // chr20 // 79 // 85 // 22 // 28 // 0 /// FQ222284 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA25YJ15 mRNA sequence. // chr20 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT033713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_212462 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich coiled-coil 2A (Prrc2a), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7213149:7226658:-1 gene:ENSRNOG00000000852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7213319:7226658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT033705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT033708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NONRATT033709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_019373 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein M (Apom), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7193732:7196332:-1 gene:ENSRNOG00000000850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF207821 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein M mRNA, complete cds. // chr20 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// BC089807 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein M, mRNA (cDNA clone MGC:108710 IMAGE:7323885), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7193791:7196254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001035238 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 2, beta polypeptide (Csnk2b), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_031021 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 2, beta polypeptide (Csnk2b), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase 2, beta polypeptide (Csnk2b), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7181952:7186247:-1 gene:ENSRNOG00000000847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC078807 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 2, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93390 IMAGE:7133064), complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ224491 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA64YF05 mRNA sequence. // chr20 // 86 // 93 // 24 // 28 // 0 /// HE864434 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 2531 (Csnk2b-Ly6g5b gene). // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7182088:7185503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// L15619 // GenBank // Rat casein kinase II beta subunit (CK2) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT033697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001001934 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus G5B (Ly6g5b), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7180182:7181118:-1 gene:ENSRNOG00000027516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// HE864434 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for chimera Csnk2b-Ly6g5b splicing isoform 2531 (Csnk2b-Ly6g5b gene). // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7180182:7181118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001003691 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6F (Ly6g6f), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7144634:7149502:-1 gene:ENSRNOG00000027225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7144634:7149469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001001970 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6D (Ly6g6d), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7134779:7137362:-1 gene:ENSRNOG00000000844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6D (Ly6g6d), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7134779:7137362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001003976 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif (ITIM) containing platelet receptor (G6b), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7127585:7129404:-1 gene:ENSRNOG00000026936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7127585:7129404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_212536 // RefSeq // Rattus norvegicus mutS homolog 5 (Msh5), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mutS homolog 5 (E. coli) (Msh5), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7093711:7110018:-1 gene:ENSRNOG00000000857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC083904 // GenBank // Rattus norvegicus mutS homolog 5 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:95266 IMAGE:7133915), complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7093832:7109696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT033689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001004069 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor APC domain containing 1 (Sapcd1), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7091299:7093067:-1 gene:ENSRNOG00000000858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor APC domain containing 1 (Sapcd1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT033684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0