NONRATT012820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031856 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 99a (Mir99a), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053647 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:11:19707423:19707503:1 gene:ENSRNOG00000035524 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-99a // miRBase Micro RNA Database // MI0000883 Rattus norvegicus miR-99a stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_031803 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA let-7c-1 (Mirlet7c-1), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053623 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:11:19708138:19708245:1 gene:ENSRNOG00000035500 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-let-7c-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000830 Rattus norvegicus let-7c-1 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031870 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-125b-2 (Mir125b-2), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-125b-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000897 Rattus norvegicus miR-125b-2 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000023945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:19897681:19898064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0
NM_053570 // RefSeq // Rattus norvegicus coxsackie virus and adenovirus receptor (Cxadr), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:20481046:20528209:1 gene:ENSRNOG00000001557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF109644 // GenBank // Rattus norvegicus coxsackie-adenovirus-receptor homolog (CAR1) mRNA, partial cds. // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC088313 // GenBank // Rattus norvegicus coxsackie virus and adenovirus receptor, mRNA (cDNA clone MGC:109536 IMAGE:7324723), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:20480514:20521293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001105894 // RefSeq // Rattus norvegicus chondrolectin (Chodl), mRNA. // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000031889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:21183908:21206141:1 gene:ENSRNOG00000001915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT012827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:21184343:21207163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT012828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_203409 // RefSeq // Rattus norvegicus neural cell adhesion molecule 2 (Ncam2), mRNA. // chr11 // 94 // 92 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000002895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:24122738:24352502:1 gene:ENSRNOG00000002126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// AY495695 // GenBank // Rattus norvegicus fasciclin II transmembrane protein isoform mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 92 // 34 // 36 // 0 /// AY495696 // GenBank // Rattus norvegicus fasciclin II GPI-linked protein isoform mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 85 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:24121490:24351531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NONRATT012829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001126100 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP10 ribonucleoprotein (Nop10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110342516:110343601:1 gene:ENSRNOG00000005184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ210519 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YE07 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0
NM_001108841 // RefSeq // Rattus norvegicus GA binding protein transcription factor, alpha subunit (Gabpa), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:27889614:27949403:1 gene:ENSRNOG00000001549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:27924848:27946673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT012837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000028906 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:30285474:30286386:1 gene:ENSRNOG00000027858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:30285660:30286343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
NM_001191592 // RefSeq // Rattus norvegicus N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 (putative) (N6amt1), mRNA. // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:30629574:30641919:1 gene:ENSRNOG00000001603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT012841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:30629588:30638612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT012842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001100501 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 16 (Usp16), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000002173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:30726675:30755789:1 gene:ENSRNOG00000001598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ221582 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA34YE13 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:30730047:30750176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT012843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1
NM_001013979 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP3K7 C-terminal like (Map3k7cl), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002158 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:30834012:30877227:1 gene:ENSRNOG00000001584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC076389 // GenBank // Rattus norvegicus similar to C21ORF7, mRNA (cDNA clone MGC:93801 IMAGE:7110014), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:30851197:30876285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107113 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB and CNC homology 1, basic leucine zipper transcription factor 1 (Bach1), mRNA. // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XR_358122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription regulator protein BACH1-like (LOC100911490), transcript variant X6, misc_RNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:30989417:31023028:1 gene:ENSRNOG00000001582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:31006669:31022163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:31150108:31150410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT012848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:31193093:31227856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053411 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 1 (Snx1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006243317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 1 (Snx1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:71414978:71453464:-1 gene:ENSRNOG00000017029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF218916 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 1 (Snx1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC092201 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 1, mRNA (cDNA clone MGC:105373 IMAGE:7309531), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:31671068:31672312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:71394906:71453387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT055286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT055287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT055285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT055288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT055289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001105896 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin associated protein 15-1 (Krtap15-1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072546 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:32391271:32400093:1 gene:ENSRNOG00000049399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000034959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32399656:32400108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000034936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32564396:32564671:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 61 // 100 // 11 // 18 // 0 /// NONRATT012853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 61 // 100 // 11 // 18 // 0
GENSCAN00000034955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32579593:32579820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006221057 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 20-2-like (LOC102550816), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006248091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 20-2-like (LOC102550816), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000061599 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:32626754:32626912:1 gene:ENSRNOG00000040058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32626754:32632222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0
XM_006221064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 20-2-like (LOC102551406), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006248097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 20-2-like (LOC102551406), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000039927 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:32980681:32981678:1 gene:ENSRNOG00000033732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000014742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32931137:32981678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_001037347 // RefSeq // Rattus norvegicus SR-related CTD-associated factor 4 (Scaf4), mRNA. // chr11 // 81 // 77 // 30 // 37 // 0 /// XM_006248027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SR-related CTD-associated factor 4 (Scaf4), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 95 // 77 // 35 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000047741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:33991195:34047555:-1 gene:ENSRNOG00000002104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 77 // 35 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000002881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34000908:34034300:-1 gene:ENSRNOG00000002104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// AY387086 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00100 mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 92 // 44 // 48 // 1 /// GENSCAN00000032712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:33991539:34111354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT013654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001100558 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell lymphoma invasion and metastasis 1 (Tiam1), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046486 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:33551577:33671896:-1 gene:ENSRNOG00000021569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:33553657:33686592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001135834 // RefSeq // Rattus norvegicus melanocortin 2 receptor accessory protein (Mrap), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000036027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34516208:34526700:1 gene:ENSRNOG00000021524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34513653:34526326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT012869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_001073261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eva-1 homolog C (Eva1c), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_340966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eva-1 homolog C (Eva1c), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34614323:34687047:1 gene:ENSRNOG00000002072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34614323:34687047:1 gene:ENSRNOG00000002072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34614323:34687047:1 gene:ENSRNOG00000002072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000031600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34604892:34687047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001100557 // RefSeq // Rattus norvegicus oligodendrocyte lineage transcription factor 2 (Olig2), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34998542:35001918:1 gene:ENSRNOG00000028658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34999571:35000542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_021770 // RefSeq // Rattus norvegicus oligodendrocyte transcription factor 1 (Olig1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35037423:35039563:1 gene:ENSRNOG00000028648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF151367 // GenBank // Rattus norvegicus Olg-1 bHLH protein (olg1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35023671:35167632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001107111 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 10 receptor, beta (Il10rb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 10 receptor, beta (Il10rb), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35169509:35190491:1 gene:ENSRNOG00000028638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35169547:35189780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001105893 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon (alpha, beta and omega) receptor 1 (Ifnar1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_001271316 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon (alpha, beta and omega) receptor 1 (Ifnar1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35248575:35272229:1 gene:ENSRNOG00000028594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35248850:35281374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT012883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0
NM_001108313 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon gamma receptor 2 (Ifngr2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35302873:35321145:1 gene:ENSRNOG00000002032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35302984:35317121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT012885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001170327 // RefSeq // Rattus norvegicus Son DNA binding protein (Son), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// NM_001170328 // RefSeq // Rattus norvegicus Son DNA binding protein (Son), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// XM_006248065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Son DNA binding protein (Son), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000002769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35415351:35446496:1 gene:ENSRNOG00000002021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000043410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35415351:35431945:1 gene:ENSRNOG00000002021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000023600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35415404:35445602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT012893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_001136096 // RefSeq // Rattus norvegicus intersectin 1 (SH3 domain protein) (Itsn1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0 /// NM_019227 // RefSeq // Rattus norvegicus intersectin 1 (SH3 domain protein) (Itsn1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 97 // 70 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000042750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35547331:35635193:1 gene:ENSRNOG00000002001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35547331:35635193:1 gene:ENSRNOG00000002001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 31 // 31 // 0 /// AF127798 // GenBank // Rattus norvegicus EH- and SH3-domain containing protein EHSH1 mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 70 // 31 // 32 // 0 /// AF132672 // GenBank // Rattus norvegicus EH-domain/SH3-domain containing protein mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 65 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35494951:35618898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 22 // 46 // 1 /// NONRATT012904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1 /// NONRATT012905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// NONRATT012906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
XM_006221083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S6-like (LOC100360017), partial mRNA. // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// XM_006248122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S6-like (LOC100360017), partial mRNA. // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002752 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:35816151:35868614:1 gene:ENSRNOG00000002010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT012912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35857838:35907787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_053715 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/myo-inositol cotransporter), member 3 (Slc5a3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY231162 // GenBank // Rattus norvegicus sodium myo-inositol transporter 1 (Slc5a3) mRNA, complete cds. // chr11 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35834338:35836494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT012912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133603 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 2 (Kcne2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:36049570:36050026:1 gene:ENSRNOG00000029811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AF071003 // GenBank // Rattus norvegicus minK-related peptide 1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC089778 // GenBank // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related subfamily, gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:108602 IMAGE:7301610), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:36017706:36062700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001131000 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 11 (Smim11), mRNA. // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006248022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small integral membrane protein 11 (Smim11), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000061235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:36054414:36064298:1 gene:ENSRNOG00000039877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// FQ212222 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YB05 mRNA sequence. // chr11 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:36017706:36062700:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT012920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT012921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT012923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT012924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_176078 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 6 (Clic6), mRNA. // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000034383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:36259974:36302131:1 gene:ENSRNOG00000026870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY191249 // GenBank // Rattus norvegicus intracellular chloride channel 6b mRNA, complete cds. // chr11 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:36260254:36311479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT012926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NR_032753 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 802 (Mir802), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000062129 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:11:37163115:37163210:1 gene:ENSRNOG00000040376 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-802 // miRBase Micro RNA Database // MI0012602 Rattus norvegicus miR-802 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000010216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37449074:37450813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT012932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT012934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37432105:37432671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// GENSCAN00000010211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37419313:37419879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_019170 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonyl reductase 1 (Cbr1), mRNA. // chr11 // 86 // 90 // 24 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37437038:37439367:1 gene:ENSRNOG00000049693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37405367:37407687:1 gene:ENSRNOG00000047848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37455173:37457389:1 gene:ENSRNOG00000049911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 77 // 19 // 24 // 0 /// BC105893 // GenBank // Rattus norvegicus carbonyl reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:124927 IMAGE:7366019), complete cds. // chr11 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// D89069 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for inducible carbonyl reductase, complete cds. // chr11 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// XM_006227210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonyl reductase [NADPH] 1-like (LOC102548733), mRNA. // chr11 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000010233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37436882:37439259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37455017:37484677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 82 // 90 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37405309:37407687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT012932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 69 // 42 // 9 // 13 // 0
XM_006221089 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonyl reductase 2-like (LOC100360601), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006248110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonyl reductase 2-like (LOC100360601), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000075105 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:37478384:37484677:1 gene:ENSRNOG00000049380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37455017:37484677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT012936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1
NM_001107110 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonyl reductase 3 (Cbr3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37500661:37508918:1 gene:ENSRNOG00000001701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166553 // GenBank // Rattus norvegicus carbonyl reductase 3, mRNA (cDNA clone MGC:188162 IMAGE:7310545), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37496271:37508688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191660 // RefSeq // Rattus norvegicus dopey family member 2 (Dopey2), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37541663:37616846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT012941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1
XM_001054983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 7 (Ifitm7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_221637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon induced transmembrane protein 7 (Ifitm7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000039434 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:37626664:37627273:1 gene:ENSRNOG00000021674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37626720:37630918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 86 // 14 // 19 // 0
NM_001107109 // RefSeq // Rattus norvegicus MORC family CW-type zinc finger 3 (Morc3), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XR_358128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MORC family CW-type zinc finger 3 (Morc3), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37641727:37683916:1 gene:ENSRNOG00000026236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000010209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37655151:37682765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT012942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT012945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001024741 // RefSeq // Rattus norvegicus chromatin assembly factor 1, subunit B (p60) (Chaf1b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromatin assembly factor 1, subunit B (p60) (Chaf1b), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37690511:37710590:1 gene:ENSRNOG00000001692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097460 // GenBank // Rattus norvegicus chromatin assembly factor 1, subunit B (p60), mRNA (cDNA clone MGC:114524 IMAGE:7457454), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37691065:37710492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001107108 // RefSeq // Rattus norvegicus single-minded family bHLH transcription factor 2 (Sim2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000002294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37902514:37942468:1 gene:ENSRNOG00000001688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000008526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37903639:37941316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT012951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
GENSCAN00000008518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37997850:38022248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
NM_001105892 // RefSeq // Rattus norvegicus ripply transcriptional repressor 3 (Ripply3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:38145428:38153525:1 gene:ENSRNOG00000001684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT012952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:38145506:38164161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001108315 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 3 (Ttc3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:38186073:38330440:1 gene:ENSRNOG00000001682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:38199069:38288894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT012955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT012956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT012957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_012791 // RefSeq // Rattus norvegicus dual-specificity tyrosine-(Y)-phosphorylation regulated kinase 1A (Dyrk1a), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:38457362:38548315:1 gene:ENSRNOG00000001662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// X79769 // GenBank // R.norvegicus mRNA for Dual Specificity Yak1-related Kinase (Dyrk). // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:38501695:38547896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT012960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_133321 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 15 (Kcnj15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 15 (Kcnj15), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006248134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 15 (Kcnj15), transcript variant X7, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000002259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:39154504:39171712:1 gene:ENSRNOG00000001656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY028455 // GenBank // Rattus norvegicus inwardly rectifying potassium channel Kir4.2a (Kcnj15) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:39170436:39171563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT012964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT012965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107107 // RefSeq // Rattus norvegicus v-ets avian erythroblastosis virus E26 oncogene homolog 2 (Ets2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:39606999:39623785:1 gene:ENSRNOG00000001647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:39455440:39621809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT012969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000029007 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:39896792:39897576:1 gene:ENSRNOG00000028459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0
NM_199373 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptophan rich basic protein (Wrb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40028142:40042073:1 gene:ENSRNOG00000001629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062049 // GenBank // Rattus norvegicus tryptophan rich basic protein, mRNA (cDNA clone MGC:72575 IMAGE:5598163), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40030331:40040262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT012973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// NONRATT012975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001127682 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3 domain binding glutamate-rich protein (Sh3bgr), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein-like (LOC102553613), mRNA. // chr11 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000047347 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:42645656:42657878:-1 gene:ENSRNOG00000046133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000064981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40086028:40106740:1 gene:ENSRNOG00000028238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 79 // 21 // 23 // 0 /// FQ216161 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YF05 mRNA sequence. // chr11 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NONRATT012976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT012978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:42452042:42684752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000028367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40086190:40124504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001105887 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 5 (B3galt5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 5 (B3galt5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40163670:40211572:1 gene:ENSRNOG00000030983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40206907:40207824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT012979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001006990 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 5 (Igsf5), mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 5 (Igsf5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40265272:40305319:1 gene:ENSRNOG00000028216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AY325233 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cb1-725 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// AY439284 // GenBank // Rattus norvegicus cell adhesion molecule JCAM mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC097947 // GenBank // Rattus norvegicus cell adhesion molecule JCAM, mRNA (cDNA clone MGC:116070 IMAGE:7373302), complete cds. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40272151:40290312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT012983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT012981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT012982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001270538 // RefSeq // Rattus norvegicus Purkinje cell protein 4 (Pcp4), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_013002 // RefSeq // Rattus norvegicus Purkinje cell protein 4 (Pcp4), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40377166:40438049:1 gene:ENSRNOG00000001628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40377162:40438069:1 gene:ENSRNOG00000001628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC059147 // GenBank // Rattus norvegicus Purkinje cell protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:72910 IMAGE:6888437), complete cds. // chr11 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// M24852 // GenBank // Rat neuron-specific protein PEP-19 mRNA, complete cds. // chr11 // 74 // 87 // 20 // 27 // 0 /// NONRATT012984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001002802 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-site APP-cleaving enzyme 2 (Bace2), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-site APP-cleaving enzyme 2 (Bace2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41305970:41388420:1 gene:ENSRNOG00000001953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166597 // GenBank // Rattus norvegicus beta-site APP-cleaving enzyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:188369 IMAGE:7936295), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41305984:41388211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT012986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_134350 // RefSeq // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 2 (Mx2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000002695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41546197:41570078:1 gene:ENSRNOG00000001963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC099808 // GenBank // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 2, mRNA (cDNA clone MGC:124566 IMAGE:7938638), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// X52712 // GenBank // Rat mRNA for Mx2 protein. // chr11 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// JX254907 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley Mx2 mRNA, complete cds. // chr11 // 57 // 100 // 13 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41509090:41569616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT012989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000060963 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:64407247:64407916:1 gene:ENSRNOG00000039739 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:64407253:64407746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000037385 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:64371093:64414208:-1 gene:ENSRNOG00000027762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 58 // 6 // 7 // 0 /// XM_002727884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NOP2/Sun domain family, member 3 (Nsun3), mRNA. // chr1 // 55 // 92 // 6 // 11 // 0
ENSRNOT00000054454 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:44148651:44148759:1 gene:ENSRNOG00000036332 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000052536 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:44339573:44339690:1 gene:ENSRNOG00000034413 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Eph receptor A6 (Epha6), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_221595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Eph receptor A6 (Epha6), mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000047310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:45455271:45755803:1 gene:ENSRNOG00000029184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000002300 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:45701160:45702169:1 gene:ENSRNOG00000001694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000047621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:45701100:45755993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001108842 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 6 (Arl6), mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006248192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 6 (Arl6), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000002293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46049116:46069551:1 gene:ENSRNOG00000001689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC162029 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 6, mRNA (cDNA clone MGC:187918 IMAGE:9100375), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT012999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46000615:46194897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT013000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT013001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_001057435 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-gamma crystallin domain containing 3 (Crybg3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_213639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-gamma crystallin domain containing 3 (Crybg3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000002292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46134583:46196066:1 gene:ENSRNOG00000001687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000074653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46086259:46133478:1 gene:ENSRNOG00000045728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 18 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000021558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46000615:46194897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT013003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 48 // 48 // 21 // 44 // 1
GENSCAN00000021565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46234339:46236074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NM_001001099 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1528 (Olr1528), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000041445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46333875:46334795:1 gene:ENSRNOG00000039716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001001100 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1529 (Olr1529), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46343131:46344051:1 gene:ENSRNOG00000039714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001101 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1530 (Olr1530), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46351500:46352417:1 gene:ENSRNOG00000050245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT013008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001001103 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1532 (Olr1532), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000075303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46385566:46386483:1 gene:ENSRNOG00000045748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT013010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000002277 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:48836880:48837795:1 gene:ENSRNOG00000001675 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0
NM_001000530 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1538 (Olr1538), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46471351:46472274:1 gene:ENSRNOG00000039704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46471351:46517098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 96 // 16 // 24 // 0
NM_001000729 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1539 (Olr1539), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001001352 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1537 (Olr1537), mRNA. // chr11 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000040089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46496674:46497594:1 gene:ENSRNOG00000047514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48804993:48884404:-1 gene:ENSRNOG00000050062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46471351:46517098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT013012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001001353 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1536 (Olr1536), mRNA. // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NM_001001383 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1540 (Olr1540), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46516169:46517098:1 gene:ENSRNOG00000049405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46471351:46517098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48836928:48926789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001000728 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1541 (Olr1541), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000043299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46526974:46527903:1 gene:ENSRNOG00000029104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001001104 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1543 (Olr1543), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46581087:46582007:1 gene:ENSRNOG00000050294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46581087:46692451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001105 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1545 (Olr1545), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000039936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46601569:46619073:1 gene:ENSRNOG00000039700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// NONRATT013016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0
NM_001001106 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1546 (Olr1546), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000030629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46581087:46692451:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001001108 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1548 (Olr1548), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46663107:46664030:1 gene:ENSRNOG00000048626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000052 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1549 (Olr1549), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46673692:46674609:1 gene:ENSRNOG00000048047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000050796 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:46690173:46691103:1 gene:ENSRNOG00000039689 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0
NM_001000727 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1551 (Olr1551), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1551 (Olr1551), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46707836:46708765:1 gene:ENSRNOG00000046134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000725 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1558 (Olr1558), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000048343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46872266:46873213:1 gene:ENSRNOG00000047976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 82 // 92 // 9 // 11 // 0 /// NONRATT013021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 82 // 92 // 9 // 11 // 0
NM_001000049 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1559 (Olr1559), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000070849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46884179:46885132:1 gene:ENSRNOG00000050423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001001009 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1560 (Olr1560), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000060869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46918787:46919740:1 gene:ENSRNOG00000045930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000075812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46895864:46896817:1 gene:ENSRNOG00000050365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000048 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1561 (Olr1561), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000044807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:47054503:47055432:1 gene:ENSRNOG00000050715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000012099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47054503:47055432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT013026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT013025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_001000047 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1562 (Olr1562), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000060872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:47022564:47023493:1 gene:ENSRNOG00000048827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT013024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000046 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1563 (Olr1563), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105890 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 15 (Gpr15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:47191271:47193356:1 gene:ENSRNOG00000039680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47191271:47192353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001057542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG4349-PA (LOC680520), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003752507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG4349-PA (LOC680520), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033716 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:47261959:47265417:1 gene:ENSRNOG00000027997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47262483:47282814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000060861 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:47279713:47282793:1 gene:ENSRNOG00000039678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47262483:47282814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_207602 // RefSeq // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 (St3gal6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 (St3gal6), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6 (St3gal6), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:47382433:47426593:1 gene:ENSRNOG00000001653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC092560 // GenBank // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 6, mRNA (cDNA clone MGC:108513 IMAGE:7308841), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47396592:47424887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT013031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107100 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type VIII, alpha 1 (Col8a1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type VIII, alpha 1 (Col8a1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48073158:48201270:1 gene:ENSRNOG00000039668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48195737:48235786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT013031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013866 // RefSeq // Rattus norvegicus cms1 ribosomal small subunit homolog (yeast) (Cmss1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006248199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cms1 ribosomal small subunit homolog (yeast) (Cmss1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006248200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cms1 ribosomal small subunit homolog (yeast) (Cmss1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000031464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48227871:48525826:1 gene:ENSRNOG00000027888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC089826 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2610528E23, mRNA (cDNA clone MGC:108788 IMAGE:7321402), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ214930 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YH09 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48453848:48524690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001105889 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 30C (Tmem30c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48534906:48552064:1 gene:ENSRNOG00000001644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48534931:48552538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
GENSCAN00000033238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48570984:48571448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
XM_006221097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 23 (Tbc1d23), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006248214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 23 (Tbc1d23), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000002240 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:48594603:48651071:1 gene:ENSRNOG00000001642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48594603:48645039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT013038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_001034126 // RefSeq // Rattus norvegicus nitrilase family, member 2 (Nit2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000029420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48655096:48665855:1 gene:ENSRNOG00000027797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC082034 // GenBank // Rattus norvegicus nitrilase family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7130857). // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC100637 // GenBank // Rattus norvegicus nitrilase family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124762 IMAGE:5621093), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ219054 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YB06 mRNA sequence. // chr11 // 96 // 75 // 23 // 24 // 0 /// FQ219183 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YB03 mRNA sequence. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48648342:48665701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
FQ229246 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YJ14 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT013044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006221099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukemia NUP98 fusion partner 1 (Lnp1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukemia NUP98 fusion partner 1 (Lnp1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060802 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:49073625:49090592:1 gene:ENSRNOG00000039649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066008 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:49073625:49090592:1 gene:ENSRNOG00000039649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071932 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:49073625:49090592:1 gene:ENSRNOG00000039649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:49029674:49090592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT013047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT013046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001107098 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 128 (Gpr128), mRNA. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000002232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:49975766:50038280:1 gene:ENSRNOG00000001634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000073467 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:49294171:49356630:1 gene:ENSRNOG00000048134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:49919857:50062727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:49264424:49391981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001012144 // RefSeq // Rattus norvegicus Trk-fused gene (Tfg), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000048417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:49365948:49392422:1 gene:ENSRNOG00000001633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB218900 // GenBank // Rattus norvegicus TFG mRNA for TRK-fused gene protein, complete cds. // chr11 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// BC078947 // GenBank // Rattus norvegicus Trk-fused gene, mRNA (cDNA clone MGC:93792 IMAGE:7109719), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:49264424:49391981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT013050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000035997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:49919857:50062727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT013051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001008337 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 10 homolog C (S. cerevisiae) (Trmt10c), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50229232:50234308:1 gene:ENSRNOG00000039567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085895 // GenBank // Rattus norvegicus RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94708 IMAGE:7193162), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50231756:50233000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT013057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT013057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001047846 // RefSeq // Rattus norvegicus PEST proteolytic signal containing nuclear protein (Pcnp), mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006248240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PEST proteolytic signal containing nuclear protein (Pcnp), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PEST proteolytic signal containing nuclear protein (Pcnp), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50243284:50250544:1 gene:ENSRNOG00000028411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50243477:50250544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT013058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT013061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT013062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT013063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT013064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT013065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT013066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_024377 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5 (Gng5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:270886941:270895438:1 gene:ENSRNOG00000015936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79793253:79793459:1 gene:ENSRNOG00000038205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058469 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 5, mRNA (cDNA clone MGC:72806 IMAGE:6918279), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M95780 // GenBank // Rat G protein gamma-5 subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50272135:50272338:1 gene:ENSRNOG00000039562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT030514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001107096 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 97 (Cep97), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_358241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 97 (Cep97), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50327805:50355273:1 gene:ENSRNOG00000001609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000025607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50334786:50366895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT013069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001109435 // RefSeq // Rattus norvegicus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 3 (Nxpe3), mRNA. // chr11 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 3 (Nxpe3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50366320:50415914:1 gene:ENSRNOG00000001608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50382701:50414942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT013071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
AB438101 // GenBank // Rattus norvegicus Mail mRNA for molecule possessing ankyrin-repeats induced by lipopolysaccharide, complete cds. // chr11 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// NM_001107095 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, zeta (Nfkbiz), mRNA. // chr11 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// XM_006248249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, zeta (Nfkbiz), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000041116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50420563:50447282:1 gene:ENSRNOG00000031163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000025595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50420274:50444615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT013073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000002177 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:50973836:50974132:1 gene:ENSRNOG00000001601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50973836:50995408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 63 // 11 // 15 // 0
XM_006221171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zona pellucida-like domain containing 1 (Zpld1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zona pellucida-like domain containing 1 (Zpld1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060577 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:51105062:51135794:1 gene:ENSRNOG00000039517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:51091177:51151935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_031753 // RefSeq // Rattus norvegicus activated leukocyte cell adhesion molecule (Alcam), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activated leukocyte cell adhesion molecule (Alcam), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:53964952:54165636:1 gene:ENSRNOG00000001989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB008538 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for HB2, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC061970 // GenBank // Rattus norvegicus activated leukocyte cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:72388 IMAGE:5621856), complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT013083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000051131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:54080121:54154511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT013086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT013085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
XM_001063933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 54 (Ccdc54), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_573274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 54 (Ccdc54), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:55997851:55998843:1 gene:ENSRNOG00000028005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000032394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:55997851:55998843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001079938 // RefSeq // Rattus norvegicus bobby sox homolog (Drosophila) (Bbx), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bobby sox homolog (Drosophila) (Bbx), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bobby sox homolog (Drosophila) (Bbx), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bobby sox homolog (Drosophila) (Bbx), transcript variant X7, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:56250760:56397254:1 gene:ENSRNOG00000001971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC129113 // GenBank // Rattus norvegicus bobby sox homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:156752 IMAGE:7112122), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:56332824:56397216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
XM_006221122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DAZ interacting zinc finger protein 3 (Dzip3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006221124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DAZ interacting zinc finger protein 3 (Dzip3), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006248288 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DAZ interacting zinc finger protein 3 (Dzip3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006248290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DAZ interacting zinc finger protein 3 (Dzip3), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002678 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:57580223:57635241:1 gene:ENSRNOG00000001956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:57580223:57635241:1 gene:ENSRNOG00000001956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:57564176:57635241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT013101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001037981 // RefSeq // Rattus norvegicus T cell receptor associated transmembrane adaptor 1 (Trat1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:57780653:57820982:1 gene:ENSRNOG00000029564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC111081 // GenBank // Rattus norvegicus T cell receptor associated transmembrane adaptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:125004 IMAGE:7384735), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:57808594:57819920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000013668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:57985511:57988719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000052477 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:58235271:58235389:1 gene:ENSRNOG00000034354 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000027064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:58295234:58302239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0
NM_001105883 // RefSeq // Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 3 (Pvrl3), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 3 (Pvrl3), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// XR_358269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 3 (Pvrl3), transcript variant X5, misc_RNA. // chr11 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// XR_358270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 3 (Pvrl3), transcript variant X6, misc_RNA. // chr11 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// XR_358271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 3 (Pvrl3), transcript variant X7, misc_RNA. // chr11 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000002957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:62049050:62144719:-1 gene:ENSRNOG00000002176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC090071 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7111992, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000007370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:62100732:62144729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 95 // 73 // 21 // 22 // 0
GENSCAN00000000115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60207657:60262403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0
NM_001025032 // RefSeq // Rattus norvegicus CD96 molecule (Cd96), mRNA. // chr11 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:60273387:60347695:1 gene:ENSRNOG00000023030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// BC091206 // GenBank // Rattus norvegicus CD96 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:108908 IMAGE:7380788), complete cds. // chr11 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT013114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// GENSCAN00000000110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60273419:60353805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 45 // 45 // 18 // 40 // 1 /// NONRATT013115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// NONRATT013116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XM_006221175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family B, member 2 (Phldb2), mRNA. // chr11 // 88 // 59 // 15 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000034097 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:60566708:60644335:1 gene:ENSRNOG00000002171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042754 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:60566708:60644335:1 gene:ENSRNOG00000002171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 62 // 17 // 18 // 0 /// XM_006248299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology-like domain, family B, member 2 (Phldb2), mRNA. // chr11 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000000108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60585016:60661336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001035236 // RefSeq // Rattus norvegicus transgelin 3 (Tagln3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_031676 // RefSeq // Rattus norvegicus transgelin 3 (Tagln3), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:60668378:60681692:1 gene:ENSRNOG00000002151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF459788 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal protein 22 (Np22) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// FQ212703 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YN07 mRNA sequence. // chr11 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// M84725 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal protein (NP25) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// FQ212759 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YI14 mRNA sequence. // chr11 // 44 // 89 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60679786:60682654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60668546:60671990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT013127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001105882 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 7 (Tmprss7), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:64202921:64238347:1 gene:ENSRNOG00000002145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64203446:64265799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
XM_006248350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TPA-induced transmembrane protein homolog (LOC685680), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033595 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:64240489:64263852:1 gene:ENSRNOG00000022136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64203446:64265799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001064969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OX-2 membrane glycoprotein-like (LOC685716), mRNA. // chr11 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// XM_003752513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OX-2 membrane glycoprotein-like (LOC685716), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// XM_006221130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OX-2 membrane glycoprotein-like (LOC685716), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// GENSCAN00000010539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64351294:64492934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT013141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
XM_003752489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OX-2 membrane glycoprotein-like (LOC685767), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
NM_031518 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd200 molecule (Cd200), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd200 molecule (Cd200), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:64474114:64501029:1 gene:ENSRNOG00000002141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC089793 // GenBank // Rattus norvegicus Cd200 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:108657 IMAGE:7380792), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64351294:64492934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT013146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT013148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001191927 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member A5 (Slc35a5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35, member A5 (Slc35a5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35, member A5 (Slc35a5), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000002853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:64716028:64736221:1 gene:ENSRNOG00000002069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64721883:64735662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000035974 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:64971238:64971700:1 gene:ENSRNOG00000028437 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 41 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64971238:64978931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 59 // 12 // 13 // 0
NM_001025015 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP-binding protein 8 (putative) (Gtpbp8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTP-binding protein 8 (putative) (Gtpbp8), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000002797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65019537:65029484:1 gene:ENSRNOG00000002044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091236 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein 8 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:108988 IMAGE:7322967), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65019549:65030969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT013153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
XM_006221137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BOC cell adhesion associated, oncogene regulated (Boc), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000002790 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:65191760:65266747:1 gene:ENSRNOG00000002041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC168188 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7105552, containing frame-shift errors. // chr11 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000025367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65211499:65266172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT013157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT013156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001100653 // RefSeq // Rattus norvegicus SID1 transmembrane family, member 1 (Sidt1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000002759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65429664:65524944:1 gene:ENSRNOG00000002013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000025358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65455585:65526148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT013158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1
NM_001108318 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit A (Atp6v1a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000002727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65638470:65691322:1 gene:ENSRNOG00000001992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ211993 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA73YH15 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001191826 // RefSeq // Rattus norvegicus GRAM domain containing 1C (Gramd1c), mRNA. // chrU // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000002722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:60714570:60776082:1 gene:ENSRNOG00000001974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 62 // 26 // 26 // 0 /// XM_003751048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain-containing protein 1C-like (LOC100911172), mRNA. // chrU // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000071065 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:65711729:65765390:1 gene:ENSRNOG00000047327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 43 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60695841:60802893:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 57 // 57 // 24 // 42 // 1 /// GENSCAN00000052330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65732670:65920654:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// NONRATT013128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// NONRATT013162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 38 // 38 // 16 // 42 // 1
NM_213627 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 23 (Zdhhc23), mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006248324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911213 (LOC100911213), partial mRNA. // chr11 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000034122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:60791711:60807079:1 gene:ENSRNOG00000027179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB098078 // GenBank // Rattus norvegicus nidd mRNA for nNOS-intereacting DHHC-containing Dem protein-L, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY886538 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC23 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60695841:60802893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_001067760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus queuine tRNA-ribosyltransferase domain containing 1 (Qtrtd1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006221143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus queuine tRNA-ribosyltransferase domain containing 1 (Qtrtd1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006248320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus queuine tRNA-ribosyltransferase domain containing 1 (Qtrtd1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_221768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus queuine tRNA-ribosyltransferase domain containing 1 (Qtrtd1), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000000317 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:60895383:60911712:1 gene:ENSRNOG00000026814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000075723 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:60895386:60911712:1 gene:ENSRNOG00000026814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000049754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60893439:60908471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
XM_003751051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (Tigit), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000059622 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:61104106:61120790:1 gene:ENSRNOG00000038998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_006248323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T cell immunoreceptor with Ig and ITIM domains (Tigit), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:61077583:61150582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000033540 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:62298163:62299242:1 gene:ENSRNOG00000026479 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 79 // 54 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000014861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:62235125:62300666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000029144 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:62476452:62476795:1 gene:ENSRNOG00000026281 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000014864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:62476446:62476841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_017195 // RefSeq // Rattus norvegicus growth associated protein 43 (Gap43), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:62777623:62870996:1 gene:ENSRNOG00000001528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC127502 // GenBank // Rattus norvegicus growth associated protein 43, mRNA (cDNA clone MGC:156666 IMAGE:8364847), complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// M16228 // GenBank // Rat neuronal growth protein 43 (GAP-43) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// M16736 // GenBank // Rat protein associated with nerve growth and regeneration (GAP-43) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:62825452:62870412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001047922 // RefSeq // Rattus norvegicus Ab2-093 (LOC498084), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ab2-093 (LOC498084), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:66297227:66351613:1 gene:ENSRNOG00000038987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:66297881:66313760:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:66326859:66351613:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_001069148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L27-like (RGD1563835), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000042756 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:67637783:67638227:-1 gene:ENSRNOG00000033603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000010049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67637805:67638212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001024253 // RefSeq // Rattus norvegicus uroplakin 1B (Upk1b), mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67555643:67586433:-1 gene:ENSRNOG00000027380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// BC093613 // GenBank // Rattus norvegicus uroplakin 1B, mRNA (cDNA clone MGC:105566 IMAGE:7309649), complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ32859 (RGD1306995), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1 /// GENSCAN00000010027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67552020:67622500:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT013953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1
NM_001105879 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 31 (Arhgap31), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000004138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67395537:67508274:-1 gene:ENSRNOG00000003088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000010057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67395597:67484739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT013952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001100652 // RefSeq // Rattus norvegicus protein O-glucosyltransferase 1 (Poglut1), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67321442:67348158:-1 gene:ENSRNOG00000003014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67323081:67348059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001007676 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 (Timmdc1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XR_358279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 (Timmdc1), transcript variant X1, misc_RNA. // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000004023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67294276:67318850:-1 gene:ENSRNOG00000002999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ215140 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YJ16 mRNA sequence. // chr11 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000010009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67294650:67318754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_183325 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylarginine hydrolase (Adprh), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67241832:67248168:-1 gene:ENSRNOG00000027260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082065 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylarginine hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:95225 IMAGE:7132643), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M86341 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylarginine hydrolase mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67223460:67248671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT013943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT013945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_138882 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A1 member A (Pla1a), mRNA. // chr11 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000038400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67166385:67203665:-1 gene:ENSRNOG00000027252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC078727 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A1 member A, mRNA (cDNA clone MGC:93173 IMAGE:7124402), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// D88666 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PS-PLA1, complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000010019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67166720:67176387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT013942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_001069633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MYCBP-associated, testis expressed 1 (Maats1), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_221434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MYCBP-associated, testis expressed 1 (Maats1), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000040773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67063853:67106609:-1 gene:ENSRNOG00000002976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67063853:67106609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT013940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1 /// NONRATT013941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1
NM_052980 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2 (Nr1i2), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000003934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67024186:67060494:-1 gene:ENSRNOG00000002906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AF151377 // GenBank // Rattus norvegicus pregnane X receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// BC091138 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group I, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7325102). // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67024981:67039017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 68 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT013939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_006221147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin-like protein 10-like (LOC102552404), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006248403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin-like protein 10-like (LOC102552404), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000059509 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:68860950:68866796:1 gene:ENSRNOG00000038931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:68862927:68876833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
BC091106 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 8, mRNA (cDNA clone MGC:108522 IMAGE:7381703), complete cds. // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC097497 // GenBank // Rattus norvegicus keratin 8, mRNA (cDNA clone MGC:114571 IMAGE:7462062), complete cds. // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NM_199370 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin 8 (Krt8), mRNA. // chr11 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// AY464139 // GenBank // Rattus norvegicus cytokeratin 8 mRNA, complete cds. // chr11 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69062083:69063543:1 gene:ENSRNOG00000027116 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000038480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:141393012:141400521:-1 gene:ENSRNOG00000009779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// M63482 // GenBank // Rat cytokeratin 8 polypeptide mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:141326318:141403991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69052386:69063543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT052574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT052575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 63 // 64 // 10 // 16 // 0
NM_001100556 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIE, polypeptide 1 (alpha subunit) (Gtf2e1), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69170988:69203018:1 gene:ENSRNOG00000026008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC099237 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIE, polypeptide 1, alpha, mRNA (cDNA clone IMAGE:7445459), partial cds. // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69188152:69201577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT013193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001271250 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin binding protein 5-like (Stxbp5l), mRNA. // chr11 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69337665:69661178:1 gene:ENSRNOG00000002496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 83 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69337665:69661178:1 gene:ENSRNOG00000002496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69337665:69661178:1 gene:ENSRNOG00000002496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69337665:69641441:1 gene:ENSRNOG00000002496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000072159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69337665:69551359:1 gene:ENSRNOG00000002496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 40 // 11 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69337665:69641441:1 gene:ENSRNOG00000002496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 77 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69337665:69655533:1 gene:ENSRNOG00000002496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69395894:69635936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0
XM_006221148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 40 (Fbxo40), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69805391:69822494:1 gene:ENSRNOG00000002459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217730 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA19YJ19 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ223618 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA91YC22 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69817279:69822143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_172047 // RefSeq // Rattus norvegicus ELL associated factor 2 (Eaf2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000003208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69969912:70013412:1 gene:ENSRNOG00000002350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY049022 // GenBank // Rattus norvegicus testosterone regulated apoptosis inducer and tumor suppressor (Traits) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69956412:70018639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
D63149 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proton-coupled peptide transporter PEPT2, complete cds. // chr11 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NM_031672 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 15 (oligopeptide transporter), member 2 (Slc15a2), mRNA. // chr11 // 98 // 98 // 43 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000003189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70022984:70052072:1 gene:ENSRNOG00000002305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 98 // 43 // 44 // 1 /// BC085327 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 15 (H+/peptide transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:91625 IMAGE:7098404), complete cds. // chr11 // 98 // 98 // 43 // 44 // 1 /// GENSCAN00000002573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70023156:70068380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 73 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT013198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
XM_006248415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stefin A2-like 3 (Stfa2l3), mRNA. // chr11 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000042777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70540499:70542759:1 gene:ENSRNOG00000050586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// NONRATT013203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// NONRATT013204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0
XM_006221153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stefin A2 (Stfa2), mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006221154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stefin-3-like (LOC100911790), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stefin-3-like (LOC100911790), mRNA. // chr11 // 86 // 88 // 24 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042374 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:70554155:70558905:1 gene:ENSRNOG00000050110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045101 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:70614782:70616360:1 gene:ENSRNOG00000047181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000020510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70540478:70616360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001105876 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin A (stefin A) (Csta), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70643269:70654457:1 gene:ENSRNOG00000023953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70643304:70665951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
GENSCAN00000047490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70643304:70665951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
XM_573294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ran-specific GTPase-activating protein-like (RGD1565297), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001108324 // RefSeq // Rattus norvegicus RAN binding protein 1 (Ranbp1), mRNA. // chr11 // 50 // 100 // 15 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89984523:89992756:1 gene:ENSRNOG00000001884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 100 // 15 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038162 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:70671912:70672523:1 gene:ENSRNOG00000023917 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70671912:70672523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000032214 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:5642468:5643077:-1 gene:ENSRNOG00000028352 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 53 // 100 // 16 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89984664:89992457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 100 // 15 // 30 // 0 /// NONRATT015331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 64 // 47 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000031407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:5642468:5680900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 45 // 73 // 10 // 22 // 0 /// NONRATT013447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 30 // 100 // 9 // 30 // 0 /// NONRATT013449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 30 // 100 // 9 // 30 // 0
NM_001029903 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 162, member A (Fam162a), mRNA. // chr11 // 93 // 75 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000041844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70706159:70733730:1 gene:ENSRNOG00000002255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 80 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000043230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70706159:70732219:1 gene:ENSRNOG00000002255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC097971 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 162, member A, mRNA (cDNA clone MGC:116101 IMAGE:7442058), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// FQ222091 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YC15 mRNA sequence. // chr11 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// M17412 // GenBank // Rat growth and transformation-dependent mRNA, 3 end. // chr11 // 47 // 85 // 8 // 17 // 0 /// NONRATT013207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70706217:70732075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_001109053 // RefSeq // Rattus norvegicus deltex 3 like, E3 ubiquitin ligase (Dtx3l), mRNA. // chr11 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70846234:70853376:1 gene:ENSRNOG00000023400 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70846348:71128792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001191659 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 14 (Parp14), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000046888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:71194913:71226980:1 gene:ENSRNOG00000023334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000044705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:71194913:71225257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001012017 // RefSeq // Rattus norvegicus disrupted in renal carcinoma 2 (Dirc2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:71288001:71359970:1 gene:ENSRNOG00000002240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081960 // GenBank // Rattus norvegicus disrupted in renal carcinoma 2 (human), mRNA (cDNA clone MGC:94084 IMAGE:7124589), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:71288259:71350070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001014125 // RefSeq // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 5 (Pdia5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:71580311:71666271:1 gene:ENSRNOG00000032327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088305 // GenBank // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:109516 IMAGE:7323988), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein disulfide-isomerase A5-like (LOC100911928), mRNA. // chr11 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000048283 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:71021165:71097763:1 gene:ENSRNOG00000046127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT013218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:71634353:71785504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000044700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:71519091:71624376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70846348:71128792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NONRATT013219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000037123 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:72435927:72436680:1 gene:ENSRNOG00000028737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 88 // 10 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:72430578:72492643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001025402 // RefSeq // Rattus norvegicus uridine monophosphate synthetase (Umps), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73123827:73134236:1 gene:ENSRNOG00000001797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098033 // GenBank // Rattus norvegicus uridine monophosphate synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:116188 IMAGE:7456468), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73123829:73134078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000002447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:73146270:73156737:1 gene:ENSRNOG00000046836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF336872 // GenBank // Rattus norvegicus V1-type AVP membrane receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001014230 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif containing G (Iqcg), mRNA. // chr11 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// XM_006248456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing G (Iqcg), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000032518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74052400:74092525:1 gene:ENSRNOG00000026420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// BC087078 // GenBank // Rattus norvegicus IQ motif containing G, mRNA (cDNA clone MGC:94499 IMAGE:7135432), complete cds. // chr11 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000053077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74054257:74092250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 81 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT013242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT013241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
XM_006221165 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA0226 protein (RGD1305422), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006248468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA0226 protein (RGD1305422), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006248469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA0226 protein (RGD1305422), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000039814 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:74236038:74282108:1 gene:ENSRNOG00000025885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000046530 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:74236038:74282108:1 gene:ENSRNOG00000025885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000072187 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:74236038:74282108:1 gene:ENSRNOG00000025885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 85 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000041691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74234448:74282108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT013244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
NM_001107089 // RefSeq // Rattus norvegicus mucin 20, cell surface associated (Muc20), mRNA. // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000002418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74307694:74321026:1 gene:ENSRNOG00000001776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// BC167011 // GenBank // Rattus norvegicus mucin 20, cell surface associated, mRNA (cDNA clone MGC:189200 IMAGE:7128599), complete cds. // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74296841:74321491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT013249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107087 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 51, alpha subunit (Slc51a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74617803:74632201:1 gene:ENSRNOG00000001765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74619123:74631973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000002391 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:74880642:74892625:1 gene:ENSRNOG00000001753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 80 // 14 // 20 // 0 /// XM_006221179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 45 (Fbxo45), mRNA. // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74886028:74892625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT013254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 77 // 88 // 17 // 22 // 0
NM_001024995 // RefSeq // Rattus norvegicus negative regulator of reactive oxygen species (Nrros), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus negative regulator of reactive oxygen species (Nrros), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74956756:74973813:1 gene:ENSRNOG00000001752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC091190 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 33, mRNA (cDNA clone MGC:108848 IMAGE:7367889), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74964481:74985666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT013256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT013259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001100651 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class X (Pigx), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75013594:75031091:1 gene:ENSRNOG00000033623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// FQ211517 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA90YH17 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75013597:75034908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_053306 // RefSeq // Rattus norvegicus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 2 (Pak2), mRNA. // chr11 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75034488:75092727:1 gene:ENSRNOG00000001747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75902720:75938995:1 gene:ENSRNOG00000048597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// U19967 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine protein kinase PAK2 mRNA, complete cds. // chr11 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// U35345 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase (gamma-PAK) mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75902720:75988521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75056339:75073324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT013264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75073838:75094728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSRNOT00000034757 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:75119356:75142410:1 gene:ENSRNOG00000024794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000075655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75965739:75989510:1 gene:ENSRNOG00000048136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// FQ233817 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YE13 mRNA sequence. // chr11 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000050814 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:231865222:231867474:1 gene:ENSRNOG00000029315 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000002466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75902720:75988521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000032010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:117434871:117437090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 89 // 35 // 39 // 0 /// GENSCAN00000035671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231865222:231867474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000047215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75119356:75142410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// FQ231313 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YP15 mRNA sequence. // chr11 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
GENSCAN00000002477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75999192:76002789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75152991:75156678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_138823 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2 (Ppp1r2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75823345:76106552:1 gene:ENSRNOG00000001733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// BC092194 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:105260 IMAGE:7313160), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76098948:76106552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT013269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENSRNOT00000002360 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:76094251:76094690:1 gene:ENSRNOG00000001732 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76094251:76094690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 16 // 19 // 1
NM_001034006 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2 (Acap2), mRNA. // chr11 // 98 // 98 // 47 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000029549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:76151876:76262551:1 gene:ENSRNOG00000001730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 98 // 47 // 48 // 0 /// BC090073 // GenBank // Rattus norvegicus ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 2, mRNA (cDNA clone MGC:93962 IMAGE:7114273), complete cds. // chr11 // 98 // 98 // 47 // 48 // 0 /// NONRATT013271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// GENSCAN00000011151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76120003:76261573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 37 // 49 // 1 /// NONRATT013272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1
XM_344027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xyloside xylosyltransferase 1 (Xxylt1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002356 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:76271214:76402197:1 gene:ENSRNOG00000001729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76271067:76306422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT013274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001013421 // RefSeq // Rattus norvegicus large 60S subunit nuclear export GTPase 1 (Lsg1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:76764254:76793848:1 gene:ENSRNOG00000001727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC091338 // GenBank // Rattus norvegicus large subunit GTPase 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109338 IMAGE:7315079), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF452725 // GenBank // Rattus norvegicus synaptogenesis-related mRNA sequence 5. // chr11 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// AF452729 // GenBank // Rattus norvegicus synaptogenesis-related mRNA sequence 3. // chr11 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000011328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76760721:76806083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_006221048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 44 (Tmem44), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:76805943:76840991:1 gene:ENSRNOG00000001726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:76810397:76818545:1 gene:ENSRNOG00000001726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000074716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:76816118:76840991:1 gene:ENSRNOG00000001726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:76814598:76839675:1 gene:ENSRNOG00000001726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000011330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76807736:76857946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT013282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
GENSCAN00000011325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:77007409:77071345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NONRATT013288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012795 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein V (platelet) (Gp5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein V (platelet) (Gp5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000040884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:77076191:77079283:1 gene:ENSRNOG00000038540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76088695:76090398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:77077100:77078803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145083 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 15 (Lrrc15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:77111044:77112780:1 gene:ENSRNOG00000038539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB071036 // GenBank // Rattus norvegicus rLib mRNA for Lib, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:77111044:77112780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107085 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase N, polypeptide 2 (Cpn2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:77118261:77128681:1 gene:ENSRNOG00000024384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC160859 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7321680, partial cds. // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:77126160:77127788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000054450 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:77281926:77282020:1 gene:ENSRNOG00000036328 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 57 // 100 // 13 // 23 // 0
NM_001191658 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase type 13A4 (Atp13a4), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006248512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase type 13A4 (Atp13a4), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:77880133:78013596:1 gene:ENSRNOG00000001714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000007930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:77942262:78013277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_001191657 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase type 13A5 (Atp13a5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XR_358345 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase type 13A5 (Atp13a5), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:78030028:78168702:1 gene:ENSRNOG00000024127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000030129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:78125967:78169129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0
NM_001109056 // RefSeq // Rattus norvegicus Mab-21 domain containing 2 (Mb21d2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Mab-21 domain containing 2 (Mb21d2), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000032569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:78476278:78575233:1 gene:ENSRNOG00000024040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:78557409:78573673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT013300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:78476319:78479556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_130814 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 12 (Fgf12), mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006248495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor 12 (Fgf12), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000002650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:78947043:79210052:1 gene:ENSRNOG00000001931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071586 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:78995012:79210052:1 gene:ENSRNOG00000001931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AB079374 // GenBank // Rattus norvegicus FGF12 mRNA for fibroblast growth factor12, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AF348446 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast growth factor homologous factor 1B (Fhf1B) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:78947043:78996768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENSRNOT00000054449 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:78798131:78798240:1 gene:ENSRNOG00000036327 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_198133 // RefSeq // Rattus norvegicus urotensin 2B (Uts2b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248522 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus urotensin 2B (Uts2b), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:83876035:83890793:-1 gene:ENSRNOG00000038512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY321314 // GenBank // Rattus norvegicus urotensin IIB precursor, mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB116019 // GenBank // Rattus norvegicus URP mRNA for urotensin II-related peptide, complete cds. // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:83881045:83890731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_006221180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus geminin coiled-coil domain containing (Gmnc), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus geminin coiled-coil domain containing (Gmnc), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058701 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:83472991:83478520:-1 gene:ENSRNOG00000038505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:83472991:83568145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006248529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 207 (Tmem207), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 207 (Tmem207), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074688 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:83053274:83072349:-1 gene:ENSRNOG00000048672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031699 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 1 (Cldn1), mRNA. // chr11 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:82888894:82904046:-1 gene:ENSRNOG00000001926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF195500 // GenBank // Rattus norvegicus claudin-1 mRNA, complete cds. // chr11 // 80 // 77 // 16 // 20 // 0 /// BC061992 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 1, mRNA (cDNA clone MGC:72393 IMAGE:5599462), complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT014165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:82891298:82903867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001025627 // RefSeq // Rattus norvegicus leprecan-like 1 (Leprel1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:82549652:82690068:-1 gene:ENSRNOG00000001925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC099107 // GenBank // Rattus norvegicus leprecan-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:116247 IMAGE:7460856), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:82483817:82574181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
ENSRNOT00000029150 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:82644801:82645698:-1 gene:ENSRNOG00000022687 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:82576598:82678532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000038922 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:81111255:81116260:-1 gene:ENSRNOG00000022215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:81107663:81126869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:81214607:81236347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000037631 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:80880824:80881263:-1 gene:ENSRNOG00000022192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000037362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:80880958:80928646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001107084 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 6 (Bcl6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:80454014:80477192:-1 gene:ENSRNOG00000001843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166425 // GenBank // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 6, mRNA (cDNA clone MGC:187400 IMAGE:7097735), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:80455088:80466426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107083 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor (chemosensory) transporter protein 2 (Rtp2), mRNA. // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// XM_006248514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus receptor (chemosensory) transporter protein 2 (Rtp2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000036777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:80401873:80413912:-1 gene:ENSRNOG00000022160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000018065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:80401882:80405086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT014159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_012659 // RefSeq // Rattus norvegicus somatostatin (Sst), mRNA. // chr11 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:80374262:80375447:-1 gene:ENSRNOG00000001837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M25890 // GenBank // Rat somatostatin mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:80374416:80375387:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT014158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022257 // RefSeq // Rattus norvegicus mannan-binding lectin serine peptidase 1 (Masp1), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:79916067:79998571:-1 gene:ENSRNOG00000001827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000047678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:79959899:79998571:-1 gene:ENSRNOG00000001827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0 /// BC085685 // GenBank // Rattus norvegicus mannan-binding lectin serine peptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93068 IMAGE:7191018), complete cds. // chr11 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000002512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:79949379:79998571:-1 gene:ENSRNOG00000001827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1 /// AJ487622 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for MASP-3 protein (masp1-3 gene), partially processed. // chr11 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1 /// GENSCAN00000013927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:79929778:79946390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000013931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:79949379:80000306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
ENSRNOT00000032224 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:79856027:79856487:-1 gene:ENSRNOG00000021974 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:79856027:79856326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
XR_339279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549362 (LOC102549362), ncRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105869 // RefSeq // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 4 (Rfc4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84396735:84411361:1 gene:ENSRNOG00000001816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC168166 // GenBank // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 4, mRNA (cDNA clone MGC:187697 IMAGE:8374426), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84383752:84411310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// NONRATT013358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NONRATT013375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_012696 // RefSeq // Rattus norvegicus kininogen 1 (Kng1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC087028 // GenBank // Rattus norvegicus kininogen 1, mRNA (cDNA clone MGC:93589 IMAGE:7130388), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT014179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_001012016 // RefSeq // Rattus norvegicus TBCC domain containing 1 (Tbccd1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006248546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBCC domain containing 1 (Tbccd1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006248548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBCC domain containing 1 (Tbccd1), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000038826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84857007:84882195:1 gene:ENSRNOG00000026458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC079273 // GenBank // Rattus norvegicus TBCC domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134009), partial cds. // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC089823 // GenBank // Rattus norvegicus TBCC domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:108782 IMAGE:7133137), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84857361:84882044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001109553 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, gamma S (Crygs), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84884805:84889998:1 gene:ENSRNOG00000038355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84884856:84889890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013126 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, gamma (Dgkg), mRNA. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006248538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, gamma (Dgkg), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:85059234:85251061:1 gene:ENSRNOG00000001796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D38448 // GenBank // Rattus norvegicus 88K-DGK mRNA for 88kDa-diacylglycerol kinase, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ231209 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA78YG22 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, gamma (Dgkg), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// XM_006248540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, gamma (Dgkg), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT013368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85099623:85337583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT013369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT013370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001107082 // RefSeq // Rattus norvegicus ets variant 5 (Etv5), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:85282553:85339809:1 gene:ENSRNOG00000001785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85099623:85337583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000030565 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:85446749:85447504:1 gene:ENSRNOG00000026142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85405762:85447504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_057119 // RefSeq // Rattus norvegicus transformer 2 beta homolog (Drosophila) (Tra2b), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:85462041:85480254:1 gene:ENSRNOG00000001783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC070948 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine-rich 10 (transformer 2 homolog, Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:91536 IMAGE:7097246), complete cds. // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// D49708 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RNA binding protein (transformer-2-like), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// FQ212414 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA55YO11 mRNA sequence. // chr11 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// XR_146882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transformer-2 protein homolog beta-like (LOC688064), misc_RNA. // chr11 // 53 // 68 // 10 // 19 // 0 /// NONRATT013376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000053639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85462176:85508061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT013379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
GENSCAN00000053639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85462176:85508061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001270598 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 2 (Igf2bp2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NM_001270599 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 2 (Igf2bp2), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulin-like growth factor 2 mRNA binding protein 2 (Igf2bp2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:85681571:85711438:1 gene:ENSRNOG00000025946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85574845:85709997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_133606 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl-CoA, hydratase/3-hydroxyacyl CoA dehydrogenase (Ehhadh), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86024803:86057811:1 gene:ENSRNOG00000001770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089777 // GenBank // Rattus norvegicus enoyl-Coenzyme A, hydratase/3-hydroxyacyl Coenzyme A dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:108601 IMAGE:7321434), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// K03249 // GenBank // Rat peroxisomal enoyl-CoA: hydrotase-3-hydroxyacyl-CoA bifunctional enzyme mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:86024824:86056454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001058431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1562339 (RGD1562339), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// XM_579785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1562339 (RGD1562339), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000002408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86128083:86173597:1 gene:ENSRNOG00000001767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000053366 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:86819488:86819608:1 gene:ENSRNOG00000035243 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_031133 // RefSeq // Rattus norvegicus thrombopoietin (Thpo), mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86940573:86945828:1 gene:ENSRNOG00000046850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:85926517:85931772:1 gene:ENSRNOG00000050172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC078802 // GenBank HTC // Rattus norvegicus thrombopoietin, mRNA (cDNA clone IMAGE:7126144), with apparent retained intron. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// D32207 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for thrombopoietin, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:86944647:86945574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000027947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85916216:85931518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0
NM_021678 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 2 (Camk2n2), mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000058131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87047758:87048885:1 gene:ENSRNOG00000038184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// AF041854 // GenBank // Rattus norvegicus CaM-KII inhibitory protein mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000021515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87047843:87049301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT013389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0
NM_001142363 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG3, alpha-1,3- mannosyltransferase (Alg3), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NR_024535 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG3, alpha-1,3- mannosyltransferase (Alg3), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87058552:87064028:1 gene:ENSRNOG00000001712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000073703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87058569:87064028:1 gene:ENSRNOG00000001712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC088475 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 3, alpha-1,3- mannosyltransferase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95144 IMAGE:7129249), complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87058570:87063942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_053924 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 5 (Abcc5), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87460863:87554517:1 gene:ENSRNOG00000029178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AB020209 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for multidrug resistance protein (MRP5), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87464247:87545324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0
NM_001108844 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP6 domain containing 1 (Map6d1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87385908:87392137:1 gene:ENSRNOG00000001911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87385916:87393275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105867 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 6 (Klhl6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87808385:87847157:1 gene:ENSRNOG00000001908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ231247 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA75YB09 mRNA sequence. // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT013407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87831621:87846632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT013408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
GENSCAN00000047730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87831621:87846632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XR_339309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910903 (LOC100910903), transcript variant X4, ncRNA. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XR_358428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910903 (LOC100910903), transcript variant X4, ncRNA. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000058006 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:87889489:87895713:1 gene:ENSRNOG00000038119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT013412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87875683:87938444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001012015 // RefSeq // Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein 3 (Lamp3), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein 3 (Lamp3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein 3 (Lamp3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88030960:88058591:1 gene:ENSRNOG00000022792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC083787 // GenBank // Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:94767 IMAGE:7097568), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88020347:88038022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001000908 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1565 (Olr1565), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88212444:88213388:1 gene:ENSRNOG00000048434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001000044 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1566 (Olr1566), mRNA. // chr11 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88243230:88244176:1 gene:ENSRNOG00000049950 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88207673:88213388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0
NM_001000044 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1566 (Olr1566), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000046865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88243230:88244176:1 gene:ENSRNOG00000049950 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88243362:88243790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000043 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1567 (Olr1567), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88323383:88324321:1 gene:ENSRNOG00000048423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88071323:88072261:1 gene:ENSRNOG00000046736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88323512:88324321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000016596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88071452:88072261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
NM_001000532 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1568 (Olr1568), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88346276:88347214:1 gene:ENSRNOG00000050021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88084800:88085738:1 gene:ENSRNOG00000046589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88085037:88085738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88346513:88347214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001000041 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1570 (Olr1570), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88456472:88457413:1 gene:ENSRNOG00000030513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88456466:88457413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000005047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88565991:88636120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000005052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88670590:88704988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0
GENSCAN00000005055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88802798:88849024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89047508:89093323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_006221209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin lambda-like polypeptide 5-like (LOC680329), transcript variant X10, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000008064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89137362:89137823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006221214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lambda-chain C1-region-like (LOC100361706), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lambda-chain C1-region-like (LOC100361706), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000057971 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:89197916:89198230:1 gene:ENSRNOG00000050000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT013426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89194337:89253800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_017039 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, catalytic subunit, alpha isozyme (Ppp2ca), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:37324233:37343983:1 gene:ENSRNOG00000005389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC070914 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:91735 IMAGE:7104697), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC072531 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), catalytic subunit, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:91734 IMAGE:7096821), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M33114 // GenBank // Rat type-2A protein phosphatase catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002599 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:89521819:89522884:1 gene:ENSRNOG00000001893 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89521958:89522887:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:37304470:37343222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT008530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT008531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_053930 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein Ib (platelet), beta polypeptide (Gp1bb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_053931 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 5 (Sept5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89621049:89622160:1 gene:ENSRNOG00000046981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB027143 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CDCrel-1A, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB027146 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for platelet glycoprotein Ib beta, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB027144 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CDCrel-1AI, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89621256:89660592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_053930 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein Ib (platelet), beta polypeptide (Gp1bb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_053931 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 5 (Sept5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89621049:89622160:1 gene:ENSRNOG00000046981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB027143 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CDCrel-1A, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB027146 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for platelet glycoprotein Ib beta, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB027144 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CDCrel-1AI, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89621256:89660592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001108322 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 1 (Tbx1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89651955:89660875:1 gene:ENSRNOG00000001892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89621256:89660592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012531 // RefSeq // Rattus norvegicus catechol-O-methyltransferase (Comt), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus catechol-O-methyltransferase (Comt), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89824622:89829518:1 gene:ENSRNOG00000001889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081850 // GenBank // Rattus norvegicus catechol-O-methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93639 IMAGE:7191956), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M60753 // GenBank // R.norvegicus catechol-O-methyltransferase mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89824622:89828886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NR_031903 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 185 (Mir185), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053708 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:11:89906640:89906719:1 gene:ENSRNOG00000035585 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-185 // miRBase Micro RNA Database // MI0000930 Rattus norvegicus miR-185 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105865 // RefSeq // Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 8 (Dgcr8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89946649:89979162:1 gene:ENSRNOG00000001886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89951528:89962621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000057095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89971663:89977572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT013446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108324 // RefSeq // Rattus norvegicus RAN binding protein 1 (Ranbp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000002579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89984523:89992756:1 gene:ENSRNOG00000001884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT013447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001039021 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 8 (Zdhhc8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89997060:90009653:1 gene:ENSRNOG00000021891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY871204 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC8 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 8 (Zdhhc8), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000057085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89997189:90010508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001135778 // RefSeq // Rattus norvegicus proline dehydrogenase (oxidase) 1 (Prodh), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline dehydrogenase (oxidase) 1 (Prodh), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline dehydrogenase (oxidase) 1 (Prodh), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000002576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90150469:90167638:1 gene:ENSRNOG00000000281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168225 // GenBank // Rattus norvegicus proline dehydrogenase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7370751), partial cds. // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90150493:90167280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017307 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, citrate transporter), member 1 (Slc25a1), mRNA. // chr11 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90295813:90298828:1 gene:ENSRNOG00000038001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// BC100077 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, citrate transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:112694 IMAGE:7126394), complete cds. // chr11 // 96 // 74 // 25 // 26 // 0 /// FQ214871 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YK19 mRNA sequence. // chr11 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// L12016 // GenBank // Rat tricarboxylate transport protein mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90295927:90298236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 63 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT013457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT013458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT013459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// NONRATT013461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT013460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
NM_001108846 // RefSeq // Rattus norvegicus goosecoid homeobox 2 (Gsc2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90312181:90314169:1 gene:ENSRNOG00000000282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90312220:90313687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001012472 // RefSeq // Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 14 (Dgcr14), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 14 (Dgcr14), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90315984:90324889:1 gene:ENSRNOG00000000283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089898 // GenBank // Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 14, mRNA (cDNA clone MGC:109131 IMAGE:7382217), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90315987:90324609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000043210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:147343891:147394304:-1 gene:ENSRNOG00000049965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// FQ211720 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA82YH19 mRNA sequence. // chr6 // 92 // 92 // 11 // 12 // 0 /// NM_001012146 // RefSeq // Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 2 (Dgcr2), mRNA. // chr6 // 85 // 85 // 11 // 13 // 1 /// BC081905 // GenBank // Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:93833 IMAGE:7111034), complete cds. // chr6 // 85 // 85 // 11 // 13 // 1
NM_001105901 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 15 (Car15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006248689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 15 (Car15), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 15 (Car15), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90811893:90814786:-1 gene:ENSRNOG00000037983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90811945:90918549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001108325 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 15 (Med15), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006248702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 15 (Med15), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 15 (Med15), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248706 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 15 (Med15), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000002568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90606490:90681124:-1 gene:ENSRNOG00000001877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC167016 // GenBank // Rattus norvegicus mediator complex subunit 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:9026929), complete cds. // chr11 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// GENSCAN00000055113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90607360:90610974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90625772:90657026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT014312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT014314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT014316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT014318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001107078 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7, member 4 (Slc7a4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90497556:90501226:-1 gene:ENSRNOG00000001874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169079 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:189481 IMAGE:7937326), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214252 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YO10 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90497870:90500313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
XM_003751096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleotide-binding oligomerization domain containing 2-like (LOC100361946), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002557 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:90469499:90485776:-1 gene:ENSRNOG00000001872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000068286 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:90475252:90485776:-1 gene:ENSRNOG00000001872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074346 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:90469499:90485776:-1 gene:ENSRNOG00000001872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90450971:90486034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001105863 // RefSeq // Rattus norvegicus THAP domain containing 7 (Thap7), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90450728:90453825:-1 gene:ENSRNOG00000037967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC083814 // GenBank // Rattus norvegicus THAP domain containing 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:7110405). // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168998 // GenBank // Rattus norvegicus THAP domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:189352 IMAGE:7387094), complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90450971:90486034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT014302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT014305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_022301 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 4-kinase, catalytic, alpha (Pi4ka), mRNA. // chr11 // 95 // 100 // 53 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000065378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90914592:91028242:1 gene:ENSRNOG00000001866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// D83538 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 230kDa phosphatidylinositol 4-kinase, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 54 // 56 // 0 /// GENSCAN00000055119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90921339:90962699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 29 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90985570:91027902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT013494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0
GENSCAN00000037575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91079718:91079954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_001108847 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 (Ube2l3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006248708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2L 3 (Ube2l3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NONRATT013497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
NM_001024740 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 116 (Ccdc116), mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 116 (Ccdc116), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91147684:91150766:1 gene:ENSRNOG00000001860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// BC097459 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 116, mRNA (cDNA clone MGC:114521 IMAGE:7457223), complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91147975:91152549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
NM_001109433 // RefSeq // Rattus norvegicus stromal cell-derived factor 2-like 1 (Sdf2l1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91174846:91177088:1 gene:ENSRNOG00000001859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ230956 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YN06 mRNA sequence. // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91174900:91176741:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001077666 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC287935 (RGD1308065), mRNA. // chr11 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91184507:91198146:1 gene:ENSRNOG00000026918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91184293:91197574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
NM_001017383 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 2 (Ppil2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000034506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91200042:91222633:1 gene:ENSRNOG00000026900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC085890 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:94681 IMAGE:7192457), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91200086:91222467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// NONRATT013507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_001190341 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin lambda-like polypeptide 1 (Igll1), mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// XM_006248656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin lambda-like polypeptide 1 (Igll1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 91 // 69 // 10 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000029851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91443556:91446548:1 gene:ENSRNOG00000025990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91431464:91498548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_001034960 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 6 (Spag6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91480026:91563635:1 gene:ENSRNOG00000025787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC104678 // GenBank // Rattus norvegicus sperm associated antigen 6, mRNA (cDNA clone MGC:125222 IMAGE:7454069), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91533873:91574584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000034210 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:91625602:91626532:1 gene:ENSRNOG00000037898 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_001100499 // RefSeq // Rattus norvegicus plakophilin 2 (Pkp2), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91966047:92013360:-1 gene:ENSRNOG00000001825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91965513:91983864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NONRATT014351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NONRATT014350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0
NM_001009627 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosyl-tRNA synthetase 2 (mitochondrial) (Yars2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91936943:91942704:-1 gene:ENSRNOG00000025252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088224 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosyl-tRNA synthetase 2 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:108978 IMAGE:7322099), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91937084:91963193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT014348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001105860 // RefSeq // Rattus norvegicus mitotic spindle organizing protein 2B (Mzt2b), mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006248728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitotic spindle organizing protein 2B (Mzt2b), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitotic spindle organizing protein 2B (Mzt2b), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:92330667:92336557:1 gene:ENSRNOG00000001834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:92328746:92336290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_033651 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 4 (Mcm4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_358444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 4 (Mcm4), transcript variant X2, misc_RNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:92565514:92579215:1 gene:ENSRNOG00000001833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:92559569:92578658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000024598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:166886418:166889000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 88 // 27 // 30 // 0 /// NONRATT013530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_183052 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 (Ube2v2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006248726 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 (Ube2v2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// XM_006248727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 (Ube2v2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000031401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:92611596:92645498:1 gene:ENSRNOG00000001829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC087593 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2, mRNA (cDNA clone MGC:105268 IMAGE:7310168), complete cds. // chr11 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// FQ209608 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YJ06 mRNA sequence. // chr11 // 89 // 69 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT013533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_031564 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor A3 (Epha3), mRNA. // chr11 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// XM_006247977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Eph receptor A3 (Epha3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:423018:782262:-1 gene:ENSRNOG00000030285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U69278 // GenBank // Rattus norvegicus eph-related receptor tyrosine kinase homolog (Rek4) mRNA, complete cds. // chr11 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000003450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:423107:488287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT013536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_003750999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase 2, alpha prime interacting protein (Csnka2ip), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase 2, alpha prime interacting protein (Csnka2ip), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037345 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:1425629:1426456:-1 gene:ENSRNOG00000021791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:1425629:1427812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001063334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 654 (Zfp654), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_237855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 654 (Zfp654), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000050533 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:1815761:1817473:-1 gene:ENSRNOG00000029956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:1807882:1876827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_021857 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1F, G protein-coupled (Htr1f), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:1960467:1961567:-1 gene:ENSRNOG00000000716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:1960467:1987467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000000904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:2650917:2676654:-1 gene:ENSRNOG00000040257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// FQ212834 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YB20 mRNA sequence. // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT013548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000020722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:2651291:2668123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000000903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:2766902:2768191:-1 gene:ENSRNOG00000000713 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006247979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox protein homolog 2-like (LOC100911342), partial mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070850 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:3018886:3019281:-1 gene:ENSRNOG00000050850 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072520 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:3546651:3547046:-1 gene:ENSRNOG00000047020 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:3018638:3065908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:3546403:3624791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_006247979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromobox protein homolog 2-like (LOC100911342), partial mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001047102 // RefSeq // Rattus norvegicus cell adhesion molecule 2 (Cadm2), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000046370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:7871257:8090083:-1 gene:ENSRNOG00000030840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// DQ272744 // GenBank // Rattus norvegicus nectin-like protein 3 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000006476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:7993824:8028919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000044287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:7871257:7958082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_032106 // RefSeq // Rattus norvegicus roundabout homolog 2 (Drosophila) (Robo2), mRNA. // chr11 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006247986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus roundabout, axon guidance receptor, homolog 2 (Drosophila) (Robo2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:14733231:14884133:-1 gene:ENSRNOG00000029598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:14788764:14842513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000055790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:14669824:14779545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT013567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NONRATT013567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000054456 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:15172810:15172889:-1 gene:ENSRNOG00000036334 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105899 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase, member I (Lipi), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:17618917:17658537:-1 gene:ENSRNOG00000033441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:17619444:17649330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT013575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_019271 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 70 family, member 13 (Hspa13), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:17802532:17816830:-1 gene:ENSRNOG00000032834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF006617 // GenBank // Rattus norvegicus microsomal stress 70 protein ATPase core (Stch) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// BC070954 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 70kDa family, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:91712 IMAGE:7103134), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:17802840:17830554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_130821 // RefSeq // Rattus norvegicus SAM domain, SH3 domain and nuclear localization signals, 1 (Samsn1), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:17910040:17960596:-1 gene:ENSRNOG00000030930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB067679 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NASH, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:17910040:17960596:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0
NM_001100560 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor interacting protein 1 (Nrip1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:18314226:18397564:-1 gene:ENSRNOG00000001585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:18317941:18321429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019290 // RefSeq // Rattus norvegicus BTG family, member 3 (Btg3), mRNA. // chr11 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:20528293:20544036:-1 gene:ENSRNOG00000001555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF087037 // GenBank // Rattus norvegicus BTG3 mRNA, complete cds. // chr11 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// BC127498 // GenBank // Rattus norvegicus B-cell translocation gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:156659 IMAGE:8371953), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT013589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000004049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:20528719:20600005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
ENSRNOT00000002119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:20731051:20783321:-1 gene:ENSRNOG00000001554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234045 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YG01 mRNA sequence. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:20732095:20747079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105895 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 15 (Tmprss15), mRNA. // chr11 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// XM_006248005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 15 (Tmprss15), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:21207441:21331294:-1 gene:ENSRNOG00000001916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:21244177:21351614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT013596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000002629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:26153569:26153917:-1 gene:ENSRNOG00000001918 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 87 // 94 // 13 // 15 // 0
ENSRNOT00000047250 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:26453609:26454499:-1 gene:ENSRNOG00000031122 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000003270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:26423307:26698641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_053602 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit F6 (Atp5j), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC059121 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit F6, mRNA (cDNA clone MGC:72739 IMAGE:6919556), complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// X54510 // GenBank // R.norvegicus mRNA for coupling factor 6 of mitochondrial ATP synthase complex. // chr11 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000002116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:27914800:27918237:-1 gene:ENSRNOG00000001551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// NONRATT013602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// NONRATT013603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// NONRATT013604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_019288 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein (App), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000044081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:28049096:28265240:-1 gene:ENSRNOG00000006997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000048854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:28049096:28265240:-1 gene:ENSRNOG00000006997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF513015 // GenBank // Rattus norvegicus APP770 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC062082 // GenBank // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein, mRNA (cDNA clone MGC:72270 IMAGE:5599880), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// FQ221425 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA36YH02 mRNA sequence. // chr11 // 94 // 95 // 34 // 36 // 0 /// FQ214246 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YP06 mRNA sequence. // chr11 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// GENSCAN00000044332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:28049789:28182161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT013608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT013610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001013980 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine/tyrosine-rich 1 (Cyyr1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:28596076:28702011:-1 gene:ENSRNOG00000001544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC087052 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine/tyrosine-rich 1, mRNA (cDNA clone MGC:94044 IMAGE:7122930), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:28695553:28770630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_024400 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 1 (Adamts1), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:28965542:28974878:-1 gene:ENSRNOG00000001607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF149118 // GenBank // Rattus norvegicus a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 1 (ADAMTS-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AF304446 // GenBank // Rattus norvegicus ADAMTS-1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC080237 // GenBank // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 1, mRNA (cDNA clone MGC:91667 IMAGE:7100443), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:28946871:28974389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_198761 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 5 (Adamts5), mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:29034437:29081047:-1 gene:ENSRNOG00000001606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY382879 // GenBank // Rattus norvegicus ADAMTS5 mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ228283 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA101YN20 mRNA sequence. // chr11 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC083615 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7133780, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr11 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000032845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:29035108:29080570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000046693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:29297710:29298180:-1 gene:ENSRNOG00000032213 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000032842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:29297710:29298180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
NM_001024235 // RefSeq // Rattus norvegicus listerin E3 ubiquitin protein ligase 1 (Ltn1), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:30648567:30706023:-1 gene:ENSRNOG00000001602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:30643658:30701247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001100559 // RefSeq // Rattus norvegicus RWD domain containing 2B (Rwdd2b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000050902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:30711159:30719812:-1 gene:ENSRNOG00000001599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC161911 // GenBank // Rattus norvegicus RWD domain containing 2B, mRNA (cDNA clone MGC:187639 IMAGE:8368806), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:30706046:30714742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT013624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001105897 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 8 (theta) (Cct8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:30755620:30767329:-1 gene:ENSRNOG00000001592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ219784 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YF11 mRNA sequence. // chr11 // 82 // 37 // 9 // 11 // 0 /// FQ225223 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YL06 mRNA sequence. // chr11 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// FQ226011 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YF15 mRNA sequence. // chr11 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:30756367:30773158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 50 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT013625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// NONRATT013627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001107112 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 17 (Cldn17), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:32097227:32097901:-1 gene:ENSRNOG00000027691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32049281:32097901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT013635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037774 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 8 (Cldn8), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099804 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 8, mRNA (cDNA clone MGC:124857 IMAGE:7937572), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002727850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100363136 (LOC100363136), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003752470 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100363136 (LOC100363136), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002137 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:32292510:32293037:-1 gene:ENSRNOG00000001570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109326 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin associated protein 14 (Krtap14), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002132 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:32396247:32396462:-1 gene:ENSRNOG00000001567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000034973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32396318:32396827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT013639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000034961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32440889:32441269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006221080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 19-4-like (LOC102550973), mRNA. // chr11 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// XM_006248118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 19-4-like (LOC102550973), mRNA. // chr11 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32452537:32452794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 81 // 84 // 17 // 21 // 0
NM_001195612 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin associated protein 19-5 (Krtap19-5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:32461227:32461427:-1 gene:ENSRNOG00000040068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32461227:32461427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000002131 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:32489128:32489295:-1 gene:ENSRNOG00000001566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XM_006221056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 19-3-like (LOC102550708), mRNA. // chr11 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// XM_006248090 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 19-3-like (LOC102550708), mRNA. // chr11 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000061606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:32519180:32519467:-1 gene:ENSRNOG00000040064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NM_001109424 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin associated protein 16-5 (Krtap16-5), mRNA. // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000034940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32519180:32519467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32532545:32532790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT013640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
XM_006221081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 6-3-like (LOC102551069), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 6-3-like (LOC102551069), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000061605 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:32559217:32559462:-1 gene:ENSRNOG00000040063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32559217:32559594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000061600 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:32591946:32597656:-1 gene:ENSRNOG00000040060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32597399:32597656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32591919:32592158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32564396:32564671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 100 // 23 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32607729:32608079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 100 // 21 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32579593:32579820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 100 // 21 // 31 // 0 /// NONRATT012853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 74 // 100 // 23 // 31 // 0 /// NONRATT013641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 68 // 100 // 21 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061601 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:32591919:32607963:-1 gene:ENSRNOG00000040060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1
GENSCAN00000034950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32597399:32597656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
GENSCAN00000034938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32607729:32608079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT013641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_006221059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 20-2-like (LOC102551003), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin-associated protein 20-2-like (LOC102551003), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061598 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:32645185:32651477:-1 gene:ENSRNOG00000040057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000034947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32644980:32651413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
GENSCAN00000014736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32907436:32907888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000014739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:32921170:32921544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
ENSRNOT00000064103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:33262940:33263203:-1 gene:ENSRNOG00000043017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NM_001145002 // RefSeq // Rattus norvegicus keratin associated protein 7-1 (Krtap7-1), mRNA. // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:33255052:33263079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT013643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_003751014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 11-1 (Krtap11-1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_003752472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 11-1 (Krtap11-1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000029345 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:33331991:33332542:-1 gene:ENSRNOG00000027478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001191662 // RefSeq // Rattus norvegicus hormonally upregulated Neu-associated kinase (Hunk), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34169334:34282445:1 gene:ENSRNOG00000002092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34233576:34282445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_017050 // RefSeq // Rattus norvegicus superoxide dismutase 1, soluble (Sod1), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:33982764:33988340:1 gene:ENSRNOG00000002115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC082800 // GenBank // Rattus norvegicus superoxide dismutase 1, soluble, mRNA (cDNA clone MGC:105454 IMAGE:7304983), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FQ220715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YO21 mRNA sequence. // chr11 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// M21060 // GenBank // Rat copper-zinc containing superoxide dismutase mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 75 // 21 // 24 // 0 /// M25157 // GenBank // Rat Cu, Zn superoxide dismutase mRNA, complete cds. // chr11 // 84 // 78 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:33982857:33988248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT012861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001127523 // RefSeq // Rattus norvegicus MIS18 kinetochore protein A (Mis18a), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34491738:34504737:-1 gene:ENSRNOG00000021555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC167102 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Putative protein C21orf45, mRNA (cDNA clone MGC:189555 IMAGE:8373935), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34492676:34504714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001191661 // RefSeq // Rattus norvegicus URB1 ribosome biogenesis 1 homolog (S. cerevisiae) (Urb1), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000002851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34528215:34588898:-1 gene:ENSRNOG00000002080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000031602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34528670:34588898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0
ENSRNOT00000030279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34705595:34714961:-1 gene:ENSRNOG00000021399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085340 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110004E09, mRNA (cDNA clone MGC:105532 IMAGE:7302628), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34689300:34780886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT013667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT013668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT013669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_053476 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptojanin 1 (Synj1), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34717258:34791435:-1 gene:ENSRNOG00000002051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000052033 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:34717258:34791435:-1 gene:ENSRNOG00000002051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:34718342:34791435:-1 gene:ENSRNOG00000002051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AJ006855 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for synaptojanin. // chr11 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// U45479 // GenBank // Rattus norvegicus 145 kDa synaptojanin isoform mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34689300:34780886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT013671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// NONRATT013672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
XM_001057305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PAX3 and PAX7 binding protein 1 (Paxbp1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_002724693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PAX3 and PAX7 binding protein 1 (Paxbp1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000002800 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:34796266:34824580:-1 gene:ENSRNOG00000002036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000031601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34791263:34818053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// NONRATT013683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// NONRATT013684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NM_001109052 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Putative protein C21orf62 homolog (RGD1562726), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Putative protein C21orf62 homolog (RGD1562726), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Putative protein C21orf62 homolog (RGD1562726), transcript variant X10, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Putative protein C21orf62 homolog (RGD1562726), transcript variant X12, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:34833565:34848516:-1 gene:ENSRNOG00000028670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:34835214:34835849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_001025014 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 50B (Tmem50b), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006248067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 50B (Tmem50b), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006248069 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 50B (Tmem50b), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006248070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 50B (Tmem50b), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35327977:35360982:-1 gene:ENSRNOG00000002028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091349 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 50B, mRNA (cDNA clone MGC:109374 IMAGE:7316764), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT013693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35322240:35372406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT013695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001014124 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 28 (Dnajc28), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35378904:35381723:-1 gene:ENSRNOG00000002026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079055 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 28, mRNA (cDNA clone MGC:93998 IMAGE:7115421), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35378918:35380045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT013699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
BC087644 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoribosylglycinamide formyltransferase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7311687), complete cds. // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC168661 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoribosylglycinamide formyltransferase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7929954), complete cds. // chr11 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// NM_001011899 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoribosylglycinamide formyltransferase (Gart), mRNA. // chr11 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000032162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35389226:35414461:-1 gene:ENSRNOG00000028292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35389479:35411122:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT013701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001008287 // RefSeq // Rattus norvegicus downstream neighbor of SON (Donson), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006248048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus downstream neighbor of SON (Donson), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006248049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus downstream neighbor of SON (Donson), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000061304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35446572:35456223:-1 gene:ENSRNOG00000002012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC085847 // GenBank // Rattus norvegicus downstream neighbor of SON, mRNA (cDNA clone MGC:94546 IMAGE:7189203), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000023580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35447208:35456114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT013706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT013707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001013044 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, zeta (quinone reductase)-like 1 (Cryzl1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006248045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crystallin, zeta (quinone reductase)-like 1 (Cryzl1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// XR_345589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus quinone oxidoreductase-like protein 1-like (LOC102555727), misc_RNA. // chr11 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XR_353058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus quinone oxidoreductase-like protein 1-like (LOC102555727), misc_RNA. // chr11 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000033745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35456478:35497959:-1 gene:ENSRNOG00000028014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC083853 // GenBank // Rattus norvegicus crystallin, zeta (quinone reductase)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:95055 IMAGE:7124012), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000052316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:9810739:9811413:1 gene:ENSRNOG00000029686 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:9810739:9811647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT013708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT013710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 93 // 93 // 37 // 40 // 1 /// GENSCAN00000023572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35461272:35479737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// NONRATT013711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_138883 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, O subunit (Atp5o), mRNA. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35685318:35691665:-1 gene:ENSRNOG00000001991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC060544 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, O subunit, mRNA (cDNA clone MGC:72688 IMAGE:6918775), complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// D13127 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for oligomycin sensitivity conferring protein, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ223905 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA83YH03 mRNA sequence. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35685377:35691624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000002718 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:36073085:36073840:-1 gene:ENSRNOG00000001986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC083887 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930563D23, mRNA (cDNA clone MGC:95204 IMAGE:7132136), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012973 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 1 (Kcne1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 1 (Kcne1), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 1 (Kcne1), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 1 (Kcne1), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, Isk-related family, member 1 (Kcne1), transcript variant X8, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:36101919:36112078:-1 gene:ENSRNOG00000001984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M22412 // GenBank // Rat potassium channel protein (put.) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M36461 // GenBank // Rat delayed-rectifier-type K+ channel mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:36102048:36144438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_153724 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of calcineurin 1 (Rcan1), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:36145270:36155595:-1 gene:ENSRNOG00000001979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB075973 // GenBank // Rattus norvegicus mcip 1 mRNA for myocyte-enriched calcineurin-interacting protein 1, complete cds. // chr11 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC072478 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of calcineurin 1, mRNA (cDNA clone MGC:91448 IMAGE:7103498), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ211197 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA15YL17 mRNA sequence. // chr11 // 92 // 43 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000002056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:36146741:36155533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT013732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_017325 // RefSeq // Rattus norvegicus runt-related transcription factor 1 (Runx1), mRNA. // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006248086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus runt-related transcription factor 1 (Runx1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:36371333:36460969:-1 gene:ENSRNOG00000001704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// L35271 // GenBank // Rattus norvegicus AML1 mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT013734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:36371586:36410719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001113747 // RefSeq // Rattus norvegicus SET domain containing 4 (Setd4), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain containing 4 (Setd4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XR_358127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain containing 4 (Setd4), transcript variant X4, misc_RNA. // chr11 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37374248:37394377:-1 gene:ENSRNOG00000001699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC079469 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical protein RDA279, mRNA (cDNA clone IMAGE:7122760). // chr11 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// BC158669 // GenBank // Rattus norvegicus SET domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:187669 IMAGE:8370827), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC089907 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7304464, with apparent retained intron. // chr11 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000010234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37374333:37386269:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 41 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT013737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT013741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT013743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT013738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT013740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT013739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001013429 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 14 (Cldn14), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248057 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claudin 14 (Cldn14), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000002297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:37721801:37731973:-1 gene:ENSRNOG00000001691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091387 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 14, mRNA (cDNA clone MGC:109472 IMAGE:7321417), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37722017:37722736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT013745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus holocarboxylase synthetase (biotin-(proprionyl-CoA-carboxylase (ATP-hydrolysing)) ligase) (Hlcs), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus holocarboxylase synthetase (biotin-(proprionyl-CoA-carboxylase (ATP-hydrolysing)) ligase) (Hlcs), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_221630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus holocarboxylase synthetase (biotin-(proprionyl-CoA-carboxylase (ATP-hydrolysing)) ligase) (Hlcs), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002291 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:37947328:38086632:-1 gene:ENSRNOG00000001686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37947328:37961851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000008523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:38078901:38099744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001099758 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class P (Pigp), mRNA. // chr11 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// XM_006248042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class P (Pigp), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000068743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:38179879:38185851:-1 gene:ENSRNOG00000039850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC166404 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class P, mRNA (cDNA clone MGC:187201 IMAGE:9099247), complete cds. // chr11 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NONRATT013750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT013751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT013749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:38179909:38186526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006248072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Down syndrome critical region gene 3 (Dscr3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006248073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Down syndrome critical region gene 3 (Dscr3), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_001108316 // RefSeq // Rattus norvegicus Down syndrome critical region gene 3 (Dscr3), mRNA. // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000002284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:38355950:38383907:-1 gene:ENSRNOG00000001681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// BC160826 // GenBank // Rattus norvegicus Down syndrome critical region gene 3, mRNA (cDNA clone MGC:187512 IMAGE:7444837), complete cds. // chr11 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT013752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:38357134:38384672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT013754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_013192 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 6 (Kcnj6), mRNA. // chr11 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// AB073753 // GenBank // Rattus norvegicus GIRK2A-3 mRNA for GIRK2A, complete cds. // chr11 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// AB073754 // GenBank // Rattus norvegicus GIRK2-2 mRNA for GIRK2, complete cds. // chr11 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// AB073756 // GenBank // Rattus norvegicus GIRK2B-2 mRNA for GIRK2B, complete cds. // chr11 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// AY095171 // GenBank // Rattus norvegicus G protein coupled inward rectifier potassium channel Kir3.2B mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// U21087 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel-like protein KATP-2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000066940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:38617934:38693513:-1 gene:ENSRNOG00000001658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// AB073755 // GenBank // Rattus norvegicus GIRK2-3 mRNA for GIRK2, complete cds. // chr11 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT013759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0
NM_133397 // RefSeq // Rattus norvegicus v-ets avian erythroblastosis virus E26 oncogene (Erg), mRNA. // chr11 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// XM_006248144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-ets avian erythroblastosis virus E26 oncogene (Erg), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000039999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:39232849:39336456:-1 gene:ENSRNOG00000001652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AB031088 // GenBank // Rattus norvegicus VESP14 mRNA for vascular endothelial cell specific protein 14, complete cds. // chr11 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// BC072519 // GenBank // Rattus norvegicus avian erythroblastosis virus E-26 (v-ets) oncogene related, mRNA (cDNA clone MGC:91507 IMAGE:7105647), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FQ217228 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA31YO05 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:39232849:39281544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT013763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_001105891 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 1 (Psmg1), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006248154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 1 (Psmg1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:39858073:39866253:-1 gene:ENSRNOG00000001643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:39841859:39867506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT013765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
XM_003751022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain and WD repeat domain containing 1 (Brwd1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// XM_006221090 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain and WD repeat domain containing 1 (Brwd1), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000002231 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:39870304:39961008:-1 gene:ENSRNOG00000001632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000028387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:39906288:39961008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000028373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:39878385:39895222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 26 // 26 // 11 // 43 // 1
ENSRNOT00000054455 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:39996366:39996462:-1 gene:ENSRNOG00000046913 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000054580 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:42706056:42706152:1 gene:ENSRNOG00000049518 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000041990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:39996397:39996607:-1 gene:ENSRNOG00000028760 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 48 // 86 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:39996395:39996607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 93 // 13 // 27 // 0
NM_001013184 // RefSeq // Rattus norvegicus high mobility group nucleosome binding domain 1 (Hmgn1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:42691942:42697860:1 gene:ENSRNOG00000048226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40004658:40010576:-1 gene:ENSRNOG00000050978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC086423 // GenBank // Rattus norvegicus high-mobility group nucleosome binding domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:105952 IMAGE:7302011), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ220876 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YF20 mRNA sequence. // chr11 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40005469:40028287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
NM_001017484 // RefSeq // Rattus norvegicus Leber congenital amaurosis 5-like (Lca5l), mRNA. // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Leber congenital amaurosis 5-like (Lca5l), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000033486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40043603:40077367:-1 gene:ENSRNOG00000028248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC082082 // GenBank // Rattus norvegicus Leber congenital amaurosis 5-like, mRNA (cDNA clone MGC:95255 IMAGE:7133412), complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40043603:40077151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT013772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
ENSRNOT00000032340 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:40320315:40334704:-1 gene:ENSRNOG00000028203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40311357:40331876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_133587 // RefSeq // Rattus norvegicus Down syndrome cell adhesion molecule (Dscam), mRNA. // chr11 // 100 // 99 // 136 // 136 // 0 /// ENSRNOT00000002215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40530632:40775978:-1 gene:ENSRNOG00000027992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 134 // 134 // 0 /// AF334385 // GenBank // Rattus norvegicus Down syndrome cell adhesion molecule DSCAM (Dscam) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 99 // 136 // 136 // 0 /// GENSCAN00000005097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40530746:40775962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 131 // 131 // 0 /// NONRATT013776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 17 // 17 // 23 // 137 // 1 /// NONRATT013777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 8 // 8 // 11 // 137 // 1 /// NONRATT013778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 10 // 10 // 14 // 137 // 1 /// NONRATT013779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 6 // 6 // 8 // 137 // 1
NM_133587 // RefSeq // Rattus norvegicus Down syndrome cell adhesion molecule (Dscam), mRNA. // chr11 // 70 // 70 // 35 // 50 // 1 /// ENSRNOT00000002215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:40530632:40775978:-1 gene:ENSRNOG00000027992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 70 // 35 // 50 // 1 /// AF334385 // GenBank // Rattus norvegicus Down syndrome cell adhesion molecule DSCAM (Dscam) mRNA, complete cds. // chr11 // 70 // 70 // 35 // 50 // 1 /// GENSCAN00000005097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:40530746:40775962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 66 // 66 // 33 // 50 // 1
NM_001271058 // RefSeq // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 1 (Mx1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001271059 // RefSeq // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 1 (Mx1), transcript variant 3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001271060 // RefSeq // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 1 (Mx1), transcript variant 4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001271061 // RefSeq // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 1 (Mx1), transcript variant 5, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_001271062 // RefSeq // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 1 (Mx1), transcript variant 6, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NM_173096 // RefSeq // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 1 (Mx1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000039876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41398738:41420543:-1 gene:ENSRNOG00000001959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC099784 // GenBank // Rattus norvegicus myxovirus (influenza virus) resistance 1, mRNA (cDNA clone MGC:124551 IMAGE:7933587), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ231581 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA69YB06 mRNA sequence. // chr11 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41399779:41420437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001107102 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 3, member B (Fam3b), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41430624:41503454:-1 gene:ENSRNOG00000001962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41435033:41498991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_130424 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 2 (Tmprss2), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41577095:41599254:-1 gene:ENSRNOG00000001976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41574416:41613792:-1 gene:ENSRNOG00000001976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB073550 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TMPRSS2, complete cds. // chr11 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// BC061712 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 2, mRNA (cDNA clone MGC:72325 IMAGE:5598010), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006248127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 2 (Tmprss2), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41574086:41602829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NONRATT013789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000044101 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:41724439:41725087:-1 gene:ENSRNOG00000033892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000005868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41697811:41736587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_001107103 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor-interacting serine-threonine kinase 4 (Ripk4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus receptor-interacting serine-threonine kinase 4 (Ripk4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41762131:41784398:-1 gene:ENSRNOG00000001618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41763310:41784352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006221091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 15 (Prdm15), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006248187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 15 (Prdm15), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046318 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:41806852:41860803:-1 gene:ENSRNOG00000001620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41806852:41864861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_199391 // RefSeq // Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 2 (C2cd2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 2 (C2cd2), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 2 (C2cd2), transcript variant X6, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41867287:41929895:-1 gene:ENSRNOG00000001621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC062389 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5830404H04, mRNA (cDNA clone MGC:72630 IMAGE:5620907), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248159 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 2 (C2cd2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// XM_006248163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 2 (C2cd2), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// XM_006248165 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 2 (C2cd2), transcript variant X7, mRNA. // chr11 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000040830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41868716:41929661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006248167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 295 (Zfp295), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006248170 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 295 (Zfp295), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NM_001107105 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 295 (Zfp295), mRNA. // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000041177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:41954466:41967238:-1 gene:ENSRNOG00000001623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// XM_006248175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 295 (Zfp295), transcript variant X10, mRNA. // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:41954930:41988524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000051606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:64407253:64407746:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 83 // 48 // 10 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000060963 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:64407247:64407916:1 gene:ENSRNOG00000039739 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrUn // 71 // 96 // 17 // 24 // 0
ENSRNOT00000038656 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:43326979:43328227:-1 gene:ENSRNOG00000023115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:43326979:43392838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000015095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:43698385:43699115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_153309 // RefSeq // Rattus norvegicus myc induced nuclear antigen (Mina), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// AB083195 // GenBank // Rattus norvegicus r-mina53 mRNA for Mina53, complete cds. // chr11 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// BC087650 // GenBank // Rattus norvegicus myc induced nuclear antigen, mRNA (cDNA clone MGC:105305 IMAGE:7310399), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT013801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000002285 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:46196256:46212064:-1 gene:ENSRNOG00000001680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_138897 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 3 (Gabrr3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46236525:46289103:-1 gene:ENSRNOG00000001679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D50671 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GABA receptor rho-3 subunit, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46262603:46308262:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001000496 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1533 (Olr1533), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48804993:48884404:-1 gene:ENSRNOG00000050062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 80 // 12 // 20 // 0 /// NONRATT013830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001353 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1536 (Olr1536), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48836928:48926789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001000729 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1539 (Olr1539), mRNA. // chr11 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// NM_001001352 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1537 (Olr1537), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000040089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46496674:46497594:1 gene:ENSRNOG00000047514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48804993:48884404:-1 gene:ENSRNOG00000050062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000030630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46471351:46517098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 79 // 97 // 23 // 29 // 0 /// NONRATT013012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// NONRATT013013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0
NM_001000531 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1542 (Olr1542), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46543818:46544744:-1 gene:ENSRNOG00000046780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46527138:46544744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT013804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000051 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1553 (Olr1553), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000060877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46745936:46746865:-1 gene:ENSRNOG00000046886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46745936:46746865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000726 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1555 (Olr1555), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46779005:46779932:-1 gene:ENSRNOG00000045866 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46779005:46779934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000050 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1557 (Olr1557), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000060874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:46801980:46802909:-1 gene:ENSRNOG00000046622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000012090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:46801980:46802909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT013807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001006955 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin domain containing 1 (Cldnd1), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:47176078:47182290:-1 gene:ENSRNOG00000001657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC083649 // GenBank // Rattus norvegicus claudin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94479 IMAGE:7135100), complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47177217:47180828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT013811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT013813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT013814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT013815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT013816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT013818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001037095 // RefSeq // Rattus norvegicus coproporphyrinogen oxidase (Cpox), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:47229585:47239564:-1 gene:ENSRNOG00000001654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107664 // GenBank // Rattus norvegicus coproporphyrinogen oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:124847 IMAGE:7936479), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47220502:47250309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
NM_130419 // RefSeq // Rattus norvegicus discoidin, CUB and LCCL domain containing 2 (Dcbld2), mRNA. // chr11 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:47430604:47483838:-1 gene:ENSRNOG00000001651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF387549 // GenBank // Rattus norvegicus endothelial and smooth muscle cell-derived neuropilin-like protein (Esdn) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000028961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47430622:47520475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT013823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_001057887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S28-like (LOC680585), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_002724707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S28-like (LOC680585), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048199 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:47556928:47557137:-1 gene:ENSRNOG00000031634 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47556928:47562564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000028948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:47641347:47675219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0
XM_001056823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus filamin A interacting protein 1-like (Filip1l), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// XM_221535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus filamin A interacting protein 1-like (Filip1l), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000046383 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:48253095:48319928:-1 gene:ENSRNOG00000001645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48253116:48319928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_212519 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae) (Tomm70a), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:48672524:48706365:-1 gene:ENSRNOG00000001640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:62442691:62444516:-1 gene:ENSRNOG00000011040 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr6 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// AB162856 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TOM70, complete cds. // chr6 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC098640 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 70 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112570 IMAGE:7099109), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ228582 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YI05 mRNA sequence. // chr6 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:48667975:48706228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:62442691:62445023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT013829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT048035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0
NM_139088 // RefSeq // Rattus norvegicus interphotoreceptor matrix proteoglycan 2 (Impg2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000044900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:49797496:49875529:-1 gene:ENSRNOG00000001622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// U76717 // GenBank // Rattus norvegicus PG10.2 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000035986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:49799128:49909179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT013841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001105888 // RefSeq // Rattus norvegicus SUMO1/sentrin specific peptidase 7 (Senp7), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50062235:50209557:-1 gene:ENSRNOG00000001616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50063862:50148110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT013842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107097 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 11 (Zbtb11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 11 (Zbtb11), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50261124:50295883:-1 gene:ENSRNOG00000001613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50262685:50296584:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_022515 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L24 (Rpl24), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000002194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:50298776:50304145:-1 gene:ENSRNOG00000001611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC058473 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L24, mRNA (cDNA clone MGC:72831 IMAGE:6918141), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000025600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:50298814:50328433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT013848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT013849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT013850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000034628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:53507035:53634890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 92 // 55 // 11 // 12 // 0
NM_133601 // RefSeq // Rattus norvegicus Cbl proto-oncogene B, E3 ubiquitin protein ligase (Cblb), mRNA. // chr11 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000002719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:54221084:54383336:-1 gene:ENSRNOG00000001982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AB071283 // GenBank // Rattus norvegicus Cblb mRNA for Cbl-b, complete cds. // chr11 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT013856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000046986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:54221697:54297717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1
NM_019195 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd47 molecule (Cd47), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248268 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd47 molecule (Cd47), transcript variant X7, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:56693298:56738925:-1 gene:ENSRNOG00000001964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC085740 // GenBank // Rattus norvegicus Cd47 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:93490 IMAGE:7189894), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// D87659 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for integrin-associated protein, complete cds. // chr11 // 85 // 82 // 23 // 27 // 0 /// AF017437 // GenBank // Rattus norvegicus integrin-associated protein form 4 (IAP) mRNA, complete cds. // chr11 // 63 // 82 // 17 // 27 // 0 /// FQ219882 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YA07 mRNA sequence. // chr11 // 47 // 58 // 9 // 19 // 0 /// NONRATT013860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT013865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// NONRATT013861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT013863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT013864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_001107093 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 57 homolog (Chlamydomonas) (Ift57), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:56827640:56895355:-1 gene:ENSRNOG00000001958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:56828854:56895311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
GENSCAN00000007321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:57064335:57100924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
XM_006221173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, heavy chain 15 (Myh15), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:57361236:57551332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
XM_340982 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C330027C09 (RGD1310335), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000033837 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:57538666:57565904:-1 gene:ENSRNOG00000039183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000037716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:57361236:57551332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// NONRATT013871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_181625 // RefSeq // Rattus norvegicus resistin-like gamma (Retnlg), mRNA. // chr11 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000002673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:57674751:57676090:-1 gene:ENSRNOG00000001943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_053333 // RefSeq // Rattus norvegicus resistin like alpha (Retnla), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus resistin like alpha (Retnla), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:57705933:57707432:-1 gene:ENSRNOG00000001955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF323085 // GenBank // Rattus norvegicus resistin-like molecule alpha mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:57706080:57729398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001024281 // RefSeq // Rattus norvegicus resistin like beta (Retnlb), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:57727747:57729632:-1 gene:ENSRNOG00000032187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// AY641429 // GenBank // Rattus norvegicus resistin-like beta (Retnlb) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:57706080:57729398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001172090 // RefSeq // Rattus norvegicus MORC family CW-type zinc finger 1 (Morc1), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:57921428:58208671:-1 gene:ENSRNOG00000032101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0
XM_006248296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 2-like (LOC683282), mRNA. // chrU // 100 // 78 // 18 // 18 // 0 /// XM_006221174 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 2-like (LOC683282), mRNA. // chrU // 78 // 78 // 18 // 23 // 1
XM_001063552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 4-like (LOC685378), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// XM_003752488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 4-like (LOC685378), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000064614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:58397940:58403636:-1 gene:ENSRNOG00000025404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000074158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13797182:13798066:1 gene:ENSRNOG00000048886 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 90 // 98 // 37 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000074977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13175751:13176635:1 gene:ENSRNOG00000049184 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 90 // 98 // 37 // 41 // 0 /// GENSCAN00000029390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13175751:13214087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000043373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13797182:13825249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000047238 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:63092231:63092974:-1 gene:ENSRNOG00000028973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 20 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:58375318:58447556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// GENSCAN00000054650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:63092263:63177466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
XM_001064866 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus germinal center-associated, signaling and motility (Gcsam), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus germinal center-associated, signaling and motility (Gcsam), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043020 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:64272624:64280628:-1 gene:ENSRNOG00000022110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64272624:64311254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001008762 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, member 10 (Slc9a10), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000040908 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:64291377:64350871:-1 gene:ENSRNOG00000022007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000010540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64272624:64311254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 16 // 49 // 1
NM_213630 // RefSeq // Rattus norvegicus B and T lymphocyte associated (Btla), mRNA. // chr11 // 85 // 79 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:64627209:64649491:-1 gene:ENSRNOG00000030246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AY590499 // GenBank // Rattus norvegicus B and T lymphocyte attenuator (Btla) mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 79 // 23 // 27 // 0 /// BC092588 // GenBank // Rattus norvegicus B and T lymphocyte associated, mRNA (cDNA clone MGC:109042 IMAGE:7368263), complete cds. // chr11 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// DQ198369 // GenBank // Rattus norvegicus B and T lymphocyte attenuator variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr11 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1
NM_134394 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 3 (Atg3), mRNA. // chr11 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:64687322:64715848:-1 gene:ENSRNOG00000002094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF175224 // GenBank // Rattus norvegicus preconditioning-inducible gene 1 protein mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// BC078743 // GenBank // Rattus norvegicus ATG3 autophagy related 3 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93202 IMAGE:7112937), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT013909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT013911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT013910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000047119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64692186:64717493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_022543 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 80 (Ccdc80), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:64747816:64781404:-1 gene:ENSRNOG00000002052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF223677 // GenBank // Rattus norvegicus steroid sensitive gene-1 protein (SSG-1) mRNA, complete cds. // chr11 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// AY548105 // GenBank // Rattus norvegicus DRO1 (Dro1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64748674:64799747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
XM_006221131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD200 receptor 1-like (Cd200r1l), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006221134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD200 receptor 1-like (Cd200r1l), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:64918042:64932901:-1 gene:ENSRNOG00000002046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000043917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:64918042:64932901:-1 gene:ENSRNOG00000002046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64912318:64967446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0
NM_023953 // RefSeq // Rattus norvegicus CD200 receptor 1 (Cd200r1), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:64963191:64994675:-1 gene:ENSRNOG00000039048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AY583211 // GenBank // Rattus norvegicus OX2 receptor precursor variant 1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT013916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:64912318:64967446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001009678 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC027231; hypothetical protein MGC27931 (RGD1311458), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65032121:65044284:-1 gene:ENSRNOG00000013721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65032292:65050805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006221176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 52 (Wdr52), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000059680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65270160:65342227:-1 gene:ENSRNOG00000028077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000025384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65270160:65419670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT013921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1
NM_001008285 // RefSeq // Rattus norvegicus spindle and centriole associated protein 1 (Spice1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006248332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spindle and centriole associated protein 1 (Spice1), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65358818:65400932:-1 gene:ENSRNOG00000039024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC085954 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 52, mRNA (cDNA clone MGC:95293 IMAGE:7134530), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ210155 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA33YJ10 mRNA sequence. // chr11 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65270160:65419670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT013923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT013924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_001067438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein KIAA2018 (RGD1560175), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_221454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein KIAA2018 (RGD1560175), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65542190:65581149:-1 gene:ENSRNOG00000027756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000025347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65531785:65606345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0
NM_001105881 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 50, NatE catalytic subunit (Naa50), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-alpha-acetyltransferase 50-like (LOC102553099), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65617896:65637722:-1 gene:ENSRNOG00000039017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65569908:65637729:-1 gene:ENSRNOG00000039017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC169000 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 13, mRNA (cDNA clone MGC:189357 IMAGE:8362219), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ216855 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA40YK13 mRNA sequence. // chr11 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055675 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:53144562:53147870:1 gene:ENSRNOG00000043100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000073436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:65573816:65576960:-1 gene:ENSRNOG00000049740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:65531785:65606345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_001067695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein KIAA1407 homolog (RGD1566314), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006248318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein KIAA1407 homolog (RGD1566314), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000027087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:60808834:60882302:-1 gene:ENSRNOG00000043435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XR_339192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein KIAA1407 homolog (RGD1566314), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// XR_358267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein KIAA1407 homolog (RGD1566314), transcript variant X3, misc_RNA. // chr11 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// GENSCAN00000049751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60808834:60882344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT013879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// NONRATT013881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_017140 // RefSeq // Rattus norvegicus dopamine receptor D3 (Drd3), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006248313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopamine receptor D3 (Drd3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:60955973:61007398:-1 gene:ENSRNOG00000026772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:60956032:61017192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_032745 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-568 (Mir568), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), transcript variant X9, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054451 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:11:61129098:61129193:-1 gene:ENSRNOG00000036329 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-568 // miRBase Micro RNA Database // MI0012594 Rattus norvegicus miR-568 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105880 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 20 (Zbtb20), transcript variant X9, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:61147996:61583999:-1 gene:ENSRNOG00000001966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:61151171:61160876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_017242 // RefSeq // Rattus norvegicus limbic system-associated membrane protein (Lsamp), mRNA. // chr11 // 97 // 79 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:62956510:63592532:-1 gene:ENSRNOG00000031852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:62956510:63592532:-1 gene:ENSRNOG00000031852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// AY326256 // GenBank // Rattus norvegicus limbic system-associated membrane protein 6c-isoform (Lsamp) mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 92 // 35 // 36 // 0 /// BC087607 // GenBank // Rattus norvegicus limbic system-associated membrane protein, mRNA (cDNA clone MGC:105298 IMAGE:7314244), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// FQ213251 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YN22 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// U31554 // GenBank // Rattus norvegicus limbic system-associated membrane protein mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 79 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT013902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT013901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 69 // 69 // 27 // 39 // 1 /// GENSCAN00000022664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:62981874:63068580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
ENSRNOT00000065766 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:68754495:68755245:1 gene:ENSRNOG00000027656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000036865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:68754650:68762970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001013120 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 11 (Igsf11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 11 (Igsf11), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67684930:67819746:1 gene:ENSRNOG00000001525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085929 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:94879 IMAGE:7110445), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67788305:67817608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT013187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSRNOT00000040976 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:67630680:67631316:1 gene:ENSRNOG00000029720 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67630169:67631003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT013185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012018 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 4 (B4galt4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 4 (B4galt4), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67525273:67550867:1 gene:ENSRNOG00000003114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081866 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:93698 IMAGE:7096554), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000010045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67525173:67550062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001013865 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 39a (Tmem39a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67357137:67386470:1 gene:ENSRNOG00000003075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC085845 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 39a, mRNA (cDNA clone MGC:94539 IMAGE:7188963), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000010042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67358515:67386266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT013179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_012926 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd80 molecule (Cd80), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006248361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cd80 molecule (Cd80), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000002089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67256686:67281236:1 gene:ENSRNOG00000001527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// AF010465 // GenBank // Rattus norvegicus B7.1 (B7.1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// U05593 // GenBank // Rattus norvegicus B7-1 mRNA, complete cds. // chr11 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// U10925 // GenBank // Rattus norvegicus NEDH B7-1 (B7-1) mRNA, partial cds. // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// U88622 // GenBank // Rattus norvegicus CD80 mRNA, complete cds. // chr11 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// GENSCAN00000010033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67256704:67291396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT013177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_199113 // RefSeq // Rattus norvegicus popeye domain containing 2 (Popdc2), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus popeye domain containing 2 (Popdc2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000003999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67129358:67149796:1 gene:ENSRNOG00000002994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AY490241 // GenBank // Rattus norvegicus popeye domain containing 2 (Popdc2) mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// BC061876 // GenBank // Rattus norvegicus popeye domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:72601 IMAGE:5599130), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus popeye domain containing 2 (Popdc2), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT013174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67113701:67145747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT013172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT013175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT013176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_053540 // RefSeq // Rattus norvegicus COX17 cytochrome c oxidase copper chaperone (Cox17), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:67113608:67119379:1 gene:ENSRNOG00000038951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB032178 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytochrome C oxidase assembly protein COX17, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:67113701:67145747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_032080 // RefSeq // Rattus norvegicus glycogen synthase kinase 3 beta (Gsk3b), mRNA. // chr11 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// XM_006248374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycogen synthase kinase 3 beta (Gsk3b), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycogen synthase kinase 3 beta (Gsk3b), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycogen synthase kinase 3 beta (Gsk3b), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000003867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:66873996:67016493:1 gene:ENSRNOG00000002833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT013165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT013166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000046420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:66898381:67001041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT013167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_153295 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 156 (Gpr156), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:66732875:66797798:1 gene:ENSRNOG00000002797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF488741 // GenBank // Rattus norvegicus GABAB-related G-protein coupled receptor (GABABL) mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT013164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:66766226:66781176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001195558 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 58 (Lrrc58), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:68841297:68853498:-1 gene:ENSRNOG00000027151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:68835522:68853444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0
ENSRNOT00000003721 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:68876239:68907277:-1 gene:ENSRNOG00000002746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// AY325203 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-379 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// U06864 // GenBank // Rattus norvegicus follistatin-related protein precursor mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// NM_024369 // RefSeq // Rattus norvegicus follistatin-like 1 (Fstl1), mRNA. // chr11 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// BC087014 // GenBank // Rattus norvegicus follistatin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:93410 IMAGE:7189359), complete cds. // chr11 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// NONRATT013961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000036854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:68879093:68900428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 55 // 55 // 23 // 42 // 1
NM_001012145 // RefSeq // Rattus norvegicus homogentisate 1, 2-dioxygenase (Hgd), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000003645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69075118:69126725:-1 gene:ENSRNOG00000002701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC078948 // GenBank // Rattus norvegicus homogentisate 1, 2-dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:93793 IMAGE:7109741), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69070520:69124983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT013966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT013967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT013968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001108319 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB, member of RAS oncogene family-like 3 (Rabl3), mRNA. // chr11 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69141805:69170839:-1 gene:ENSRNOG00000026085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69146952:69170823:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001105878 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), theta (Polq), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), theta (Polq), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006248391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), theta (Polq), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000063995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69681013:69786646:-1 gene:ENSRNOG00000002471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69681783:69721798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000002577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69725172:69786533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 37 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT013971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_001011898 // RefSeq // Rattus norvegicus hematopoietic cell specific Lyn substrate 1 (Hcls1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69828261:69850286:-1 gene:ENSRNOG00000038881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079081 // GenBank // Rattus norvegicus hematopoietic cell specific Lyn substrate 1, mRNA (cDNA clone MGC:94041 IMAGE:7122756), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69828749:69900334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT013974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_138885 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin B1 (Golgb1), mRNA. // chr11 // 98 // 98 // 45 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000003255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69853333:69909684:-1 gene:ENSRNOG00000030314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// D25543 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for novel golgi-associated protein GCP360, complete cds. // chr11 // 98 // 98 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000002547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69828749:69900334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT013976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT013978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
NM_001107092 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif containing B1 (Iqcb1), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing B1 (Iqcb1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:69914670:69969805:-1 gene:ENSRNOG00000038868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:69914993:69953434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT013982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT013983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT013984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001127536 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin-like domain containing receptor 1 (Ildr1), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin-like domain containing receptor 1 (Ildr1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin-like domain containing receptor 1 (Ildr1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70094409:70127482:-1 gene:ENSRNOG00000002289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC166709 // GenBank // Rattus norvegicus immunoglobulin-like domain containing receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:188405 IMAGE:7929589), complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70071947:70134542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT013987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_001070063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stefin-1-like (LOC689230), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_003752493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stefin-1-like (LOC689230), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000040211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70419286:70426584:1 gene:ENSRNOG00000032728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000020508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70419286:70426584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001105877 // RefSeq // Rattus norvegicus stefin A3 (Stfa3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70398922:70403785:1 gene:ENSRNOG00000033933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70398937:70403709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_016996 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium-sensing receptor (Casr), mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium-sensing receptor (Casr), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AY214122 // GenBank // Rattus norvegicus calcium sensing receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// U10354 // GenBank // Rattus norvegicus kidney extracellular calcium-sensing receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U20289 // GenBank // Rattus norvegicus calcium sensing receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70279170:70348597:1 gene:ENSRNOG00000002265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70301027:70382754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_020081 // RefSeq // Rattus norvegicus CD86 molecule (Cd86), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD86 molecule (Cd86), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70172560:70208488:1 gene:ENSRNOG00000038835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D50558 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for membrane glycoprotein, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70188693:70267518:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT013199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001004129 // RefSeq // Rattus norvegicus stefin A2-like 1 (Stfa2l1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000045639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70484706:70489106:-1 gene:ENSRNOG00000033929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT013988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_002727892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64393-like (LOC100362978), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_003752494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64393-like (LOC100362978), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039860 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:70524199:70566841:-1 gene:ENSRNOG00000045804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 67 // 91 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70524199:70528255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_001009177 // RefSeq // Rattus norvegicus stefin A3-like 1 (Stfa3l1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000049463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70631055:70638688:-1 gene:ENSRNOG00000030984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT013989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001105875 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 58 (Ccdc58), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_006248408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 58 (Ccdc58), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000042208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70685896:70706181:-1 gene:ENSRNOG00000031653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT013992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
NM_001024766 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 5B (Wdr5b), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097449 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 5B, mRNA (cDNA clone MGC:114509 IMAGE:7456711), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198726 // RefSeq // Rattus norvegicus karyopherin alpha 1 (Kpna1), mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70740054:70791248:-1 gene:ENSRNOG00000000399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY351984 // GenBank // Rattus norvegicus karyopherin alpha 1/importin alpha 5 (Kpna1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY779025 // GenBank // Rattus norvegicus karyopherin alpha 1 (Kpna1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 97 // 97 // 28 // 29 // 1 /// GENSCAN00000047491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70743313:70841322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001103351 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 9 (Parp9), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000030975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70812299:70845022:-1 gene:ENSRNOG00000023463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC128756 // GenBank // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:156739 IMAGE:7105391), complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase family, member 9 (Parp9), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT013997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000047491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70743313:70841322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1
NM_134419 // RefSeq // Rattus norvegicus Hspb associated protein 1 (Hspbap1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000003060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:71232155:71287075:-1 gene:ENSRNOG00000002241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF168362 // GenBank // Rattus norvegicus protein associating with small stress protein PASS1 (Pass1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091125 // GenBank // Rattus norvegicus Hspb associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:108597 IMAGE:7366096), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:71232221:71287275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
FQ230383 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YE15 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000044704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:71358701:71376427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_001107091 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, seven thrombospondin repeats (type 1 and type 1-like), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 5B (Sema5b), mRNA. // chr11 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:71394318:71405876:-1 gene:ENSRNOG00000002238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:71390653:71422754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NONRATT014004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022600 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 5 (Adcy5), mRNA. // chr11 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// XM_006248436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate cyclase 5 (Adcy5), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate cyclase 5 (Adcy5), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000049180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:71787104:71933840:-1 gene:ENSRNOG00000002229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// M96159 // GenBank // Rattus norvegicus adenylyl cyclase type V mRNA, complete cds. // chr11 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000054621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:71787732:71850765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT014004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
XM_006248439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-[acyl-carrier protein] dehydratase 2-like (LOC102551408), mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000003013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:71985569:72080891:-1 gene:ENSRNOG00000038761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// XM_006221178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase-like (proline instead of catalytic arginine), member b (Ptplb), mRNA. // chr11 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1 /// GENSCAN00000054624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:72073133:72099860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
NM_001105874 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin light chain kinase (Mylk), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000067060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:72103710:72313911:-1 gene:ENSRNOG00000002215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:72155023:72242245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT014010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_002724722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 14 (Ccdc14), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002727893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 14 (Ccdc14), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 14 (Ccdc14), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006221158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 14 (Ccdc14), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006248441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 14 (Ccdc14), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006248442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 14 (Ccdc14), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000033420 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:72374164:72407312:-1 gene:ENSRNOG00000021469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:72374164:72428817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001025628 // RefSeq // Rattus norvegicus rhophilin associated tail protein 1 (Ropn1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhophilin associated tail protein 1 (Ropn1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:72417281:72446282:-1 gene:ENSRNOG00000002187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099132 // GenBank // Rattus norvegicus ropporin, rhophilin associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116277 IMAGE:7453834), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:72374164:72428817:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_147139 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, beta 5 (Itgb5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73146148:73261215:-1 gene:ENSRNOG00000001795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73147379:73163913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT014023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73174423:73235960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
XM_003752495 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 13, cell surface associated (Muc13), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000002444 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:73275007:73296286:-1 gene:ENSRNOG00000001794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// U89744 // GenBank // Rattus norvegicus putative cell surface antigen mRNA, complete cds. // chr11 // 68 // 100 // 15 // 22 // 0 /// NONRATT014030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73278195:73410395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
XM_006221159 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heart development protein with EGF-like domains 1 (Heg1), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006248443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heart development protein with EGF-like domains 1 (Heg1), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73327373:73410395:-1 gene:ENSRNOG00000001793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000064403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73327373:73410395:-1 gene:ENSRNOG00000001793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73327373:73410395:-1 gene:ENSRNOG00000001793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73278195:73410395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0
NM_153625 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 12, member 8 (Slc12a8), mRNA. // chr11 // 88 // 97 // 29 // 33 // 0 /// XM_006248422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 12, member 8 (Slc12a8), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 12, member 8 (Slc12a8), transcript variant X9, mRNA. // chr11 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73432331:73585559:-1 gene:ENSRNOG00000001792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000040167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73432331:73585559:-1 gene:ENSRNOG00000001792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// AB024430 // GenBank // Rattus norvegicus ccc9a mRNA for cation-chloride cotransporter 9 homolog, complete cds. // chr11 // 88 // 97 // 29 // 33 // 0 /// AB024431 // GenBank // Rattus norvegicus ccc9b mRNA for cation-chloride cotransporter 9 homolog, complete cds. // chr11 // 85 // 79 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT014036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT014037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_031615 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 148 (Zfp148), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248435 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 148 (Zfp148), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000002435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73602071:73704363:-1 gene:ENSRNOG00000001789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// U30381 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger binding protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73602071:73604053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NONRATT041826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// NONRATT041828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// NONRATT006565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// NONRATT006566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 30 // 100 // 8 // 27 // 0 /// NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 44 // 100 // 12 // 27 // 0
NM_001127550 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 4 (Snx4), mRNA. // chr11 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73779997:73836594:-1 gene:ENSRNOG00000001786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC166791 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 4, mRNA (cDNA clone MGC:188581 IMAGE:7937077), complete cds. // chr11 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT014046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73778184:73817533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT014048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT014045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001107090 // RefSeq // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 11 (Osbpl11), mRNA. // chr11 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// XM_006248450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 11 (Osbpl11), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 11 (Osbpl11), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73855648:73918639:-1 gene:ENSRNOG00000001782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC168952 // GenBank // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 11, mRNA (cDNA clone MGC:189259 IMAGE:7453666), complete cds. // chr11 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73862946:73953761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
NM_001108843 // RefSeq // Rattus norvegicus leishmanolysin-like (metallopeptidase M8 family) (Lmln), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leishmanolysin-like (metallopeptidase M8 family) (Lmln), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:73982199:74046319:-1 gene:ENSRNOG00000001781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:73984304:74046214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_003752499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 3 (Lrch3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006221160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 3 (Lrch3), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000051989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74096967:74193090:-1 gene:ENSRNOG00000001774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000063883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74096967:74193090:-1 gene:ENSRNOG00000001774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000073865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74096967:74193090:-1 gene:ENSRNOG00000001774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000041678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74122623:74193090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 62 // 62 // 26 // 42 // 1 /// GENSCAN00000053072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74094931:74114954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1
NM_001047899 // RefSeq // Rattus norvegicus forty-two-three domain containing 1 (Fyttd1), mRNA. // chr11 // 100 // 69 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000042240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74198837:74221579:-1 gene:ENSRNOG00000034233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000050535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74198837:74220399:-1 gene:ENSRNOG00000034233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 41 // 41 // 0 /// AY310146 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1176 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 57 // 28 // 28 // 0 /// AY724512 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cpx-o-22-0-UI unknown mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000041674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74201487:74217935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 84 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT014067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 82 // 82 // 40 // 49 // 1 /// NONRATT014069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 27 // 27 // 13 // 49 // 1 /// NONRATT014070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1
ENSRNOT00000002421 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:74327777:74369743:-1 gene:ENSRNOG00000001777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// U06752 // GenBank // Rattus norvegicus Fisher 344 pre-sialomucin complex (pSMC) mRNA, repeat sequences 10-14, partial cds. // chr11 // 85 // 87 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74328138:74354542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0
NM_001008336 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine kinase, non-receptor, 2 (Tnk2), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74431231:74470437:-1 gene:ENSRNOG00000001769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC085825 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine kinase, non-receptor, 2, mRNA (cDNA clone MGC:94214 IMAGE:7130376), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000041687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74363318:74496348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// NONRATT014075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_022712 // RefSeq // Rattus norvegicus transferrin receptor (Tfrc), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000002407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74479841:74502561:-1 gene:ENSRNOG00000001766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// M58040 // GenBank // Rat transferrin receptor mRNA, 3 end. // chr11 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT014081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74363318:74496348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT014080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NM_001039259 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 19 (Zdhhc19), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74596366:74607670:-1 gene:ENSRNOG00000025055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY886535 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC19 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC127441 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:156468 IMAGE:7111596), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74596027:74606687:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_078622 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphate cytidylyltransferase 1, choline, alpha (Pcyt1a), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74632947:74676225:-1 gene:ENSRNOG00000001762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085713 // GenBank // Rattus norvegicus phosphate cytidylyltransferase 1, choline, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93248 IMAGE:7127059), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M36071 // GenBank // Rat CTP:phosphochlone cytidylyltransferase mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74636042:74657301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT014089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001109054 // RefSeq // Rattus norvegicus Tctex1 domain containing 2 (Tctex1d2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74678025:74686385:-1 gene:ENSRNOG00000001758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74676184:74834946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT014091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001105873 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 4 L six family member 19 (Tm4sf19), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74692458:74703220:-1 gene:ENSRNOG00000001757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74676184:74834946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT014093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_003751074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UBX domain-containing protein 7-like (LOC100911374), mRNA. // chr11 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000029842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75862557:75890080:-1 gene:ENSRNOG00000001756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// NM_001127597 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 168, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf168), mRNA. // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000002395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74805908:74827533:-1 gene:ENSRNOG00000043345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// BC166869 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 168, mRNA (cDNA clone MGC:188789 IMAGE:9030307), complete cds. // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75841812:75886898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000023830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74676184:74834946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT014100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
ENSRNOT00000029572 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:74839333:74841782:-1 gene:ENSRNOG00000024960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74828406:74834257:-1 gene:ENSRNOG00000048188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ217149 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YA13 mRNA sequence. // chr11 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74839333:74857222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000023830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74676184:74834946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001109055 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 53 (Wdr53), mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006248459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 53 (Wdr53), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 53 (Wdr53), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:74871569:74879908:-1 gene:ENSRNOG00000001754 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:74871594:74876364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_138865 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 19 (Cep19), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75004786:75013404:-1 gene:ENSRNOG00000024924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF146738 // GenBank // Rattus norvegicus testis specific protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ211926 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YC24 mRNA sequence. // chr11 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75005459:75008477:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// NONRATT014104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// NONRATT014106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// NONRATT014105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001109525 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (Pigz), mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (Pigz), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006248467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (Pigz), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75147391:75156228:-1 gene:ENSRNOG00000001746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75994573:76002294:-1 gene:ENSRNOG00000048589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC161994 // GenBank // Rattus norvegicus similar to nuclear cap binding protein subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:187828 IMAGE:9034150), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006248481 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan, class Z-like 1 (Pigzl1), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072173 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:75158477:75162003:-1 gene:ENSRNOG00000047384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075353 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:76004588:76008114:-1 gene:ENSRNOG00000047082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (Pigz), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// XM_006248467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class Z (Pigz), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76004588:76005988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000047229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75158477:75161997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001105872 // RefSeq // Rattus norvegicus antigen p97 (melanoma associated) identified by monoclonal antibodies 133.2 and 96.5 (Mfi2), mRNA. // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75210907:75232739:-1 gene:ENSRNOG00000001739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75206134:75236830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT014103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_012788 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large homolog 1 (Drosophila) (Dlg1), mRNA. // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75239783:75454358:-1 gene:ENSRNOG00000038597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U14950 // GenBank // Rattus norvegicus synapse-associated protein 97 mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// FQ211533 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA89YH10 mRNA sequence. // chr11 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75239852:75315659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75318486:75475429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000054167 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:11:75650022:75650149:-1 gene:ENSRNOG00000036044 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_053995 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxybutyrate dehydrogenase, type 1 (Bdh1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3-hydroxybutyrate dehydrogenase, type 1 (Bdh1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75653264:75688263:-1 gene:ENSRNOG00000001736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085916 // GenBank // Rattus norvegicus 3-hydroxybutyrate dehydrogenase, type 1, mRNA (cDNA clone MGC:94818 IMAGE:7108483), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ211457 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA10YC21 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000002458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75653643:75673271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// M89902 // GenBank // Sprague-Dawley D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT014126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT014130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001039002 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 43, member A (Fam43a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:76749153:76750445:-1 gene:ENSRNOG00000001728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071289 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06110207.1:59:1351:-1 gene:ENSRNOG00000048279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC099231 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 43, member A, mRNA (cDNA clone MGC:116410 IMAGE:7442928), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:76749153:76750445:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000038034 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06110207.1:59:1351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_024360 // RefSeq // Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 1 (Hes1), mRNA. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000002346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:77360110:77362537:-1 gene:ENSRNOG00000001720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC061730 // GenBank // Rattus norvegicus hairy and enhancer of split 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:72257 IMAGE:5598665), complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// D13417 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for HES-1 factor, complete cds. // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// L04527 // GenBank // Rattus norvegicus (clone pCDM8/rathairy 1) Drosophila hairy gene homologue, complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:77360478:77362322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT014145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT014146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_133585 // RefSeq // Rattus norvegicus optic atrophy 1 (Opa1), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000002338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:77764210:77840586:-1 gene:ENSRNOG00000001717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000002343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:77764210:77840586:-1 gene:ENSRNOG00000001717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000063999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:77764210:77840586:-1 gene:ENSRNOG00000001717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AY333988 // GenBank // Rattus norvegicus optic atrophy 1-like protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY510274 // GenBank // Rattus norvegicus optic atrophy 1-like protein (Opa1) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC111071 // GenBank // Rattus norvegicus optic atrophy 1 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:124921 IMAGE:7324017), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// U93197 // GenBank // Rattus norvegicus RN protein mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:77706141:77840519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_145789 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 13 receptor, alpha 1 (Il13ra1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000017746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:122873725:122933122:1 gene:ENSRNOG00000013170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// AY044251 // GenBank // Rattus norvegicus IL-13 receptor alpha 1 mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 73 // 34 // 37 // 0 /// BC093615 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 13 receptor, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:105309 IMAGE:7310384), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000002330 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:77910919:77912199:-1 gene:ENSRNOG00000001713 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr11 // 100 // 73 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000007938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:77910919:77919550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 73 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000018039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:122873773:122930802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 63 // 28 // 32 // 0 /// NONRATT059193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 90 // 100 // 46 // 51 // 0 /// NONRATT059194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 29 // 29 // 15 // 51 // 1
NM_001105871 // RefSeq // Rattus norvegicus HRAS-like suppressor (Hrasls), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HRAS-like suppressor (Hrasls), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:78170405:78188507:-1 gene:ENSRNOG00000001711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB510983 // GenBank // Rattus norvegicus A-C1 mRNA for phospholipase A, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:78172727:78299931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_182736 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 50 (Ccdc50), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006248509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 50 (Ccdc50), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000002649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:83920150:83976562:1 gene:ENSRNOG00000001930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:83920150:84026263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT013351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_207612 // RefSeq // Rattus norvegicus osteocrin (Ostn), mRNA. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006248517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus osteocrin (Ostn), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:83846851:83872970:1 gene:ENSRNOG00000030462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY398682 // GenBank // Rattus norvegicus osteocrin protein precursor, mRNA, complete cds. // chr11 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AY573934 // GenBank // Rattus norvegicus musclin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:83846853:83868999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT013349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_131905 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 16 (Cldn16), mRNA. // chr11 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:83013684:83033156:1 gene:ENSRNOG00000033878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF333099 // GenBank // Rattus norvegicus paracellin-1 mRNA, complete cds. // chr11 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:83024303:83032674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT013341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001108320 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein p63 regulated 1 (Tprg1), mRNA. // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000002634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:81863279:81991056:1 gene:ENSRNOG00000001923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:81857187:81903084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000034789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:81908843:82006930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000058616 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:81550395:81551554:1 gene:ENSRNOG00000038467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 83 // 90 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT013333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:81550389:81578711:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NONRATT013331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013864 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma (Lpp), mRNA. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:81026494:81519788:1 gene:ENSRNOG00000031669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC083627 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma, mRNA (cDNA clone MGC:94415 IMAGE:7134282), complete cds. // chr11 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC083890 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma, mRNA (cDNA clone MGC:95216 IMAGE:7132481), complete cds. // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT013323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NR_031834 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-28 (Mir28), microRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053659 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:11:81345175:81345260:1 gene:ENSRNOG00000035536 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-28 // miRBase Micro RNA Database // MI0000861 Rattus norvegicus miR-28 stem-loop // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108321 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor (chemosensory) transporter protein 4 (Rtp4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006248520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus receptor (chemosensory) transporter protein 4 (Rtp4), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006248521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus receptor (chemosensory) transporter protein 4 (Rtp4), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:80084427:80096284:1 gene:ENSRNOG00000028895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:80091365:80095227:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 90 // 42 // 9 // 10 // 0
NM_001105870 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor (chemosensory) transporter protein 1 (Rtp1), mRNA. // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:79908402:79910918:1 gene:ENSRNOG00000021992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:79893391:79910903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT013316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001113344 // RefSeq // Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 1 (St6gal1), transcript variant 1, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_147205 // RefSeq // Rattus norvegicus ST6 beta-galactosamide alpha-2,6-sialyltranferase 1 (St6gal1), transcript variant 2, mRNA. // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:79799205:79808019:1 gene:ENSRNOG00000001823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000002499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:79754197:79808019:1 gene:ENSRNOG00000001823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:79799205:79808019:1 gene:ENSRNOG00000001823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// FQ222565 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA21YL19 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// M83143 // GenBank // Rat beta-galactoside-alpha 2,6-sialyltransferase mRNA. // chr11 // 64 // 76 // 16 // 25 // 0 /// M18769 // GenBank // Rat liver beta-galactoside alpha 2,6-sialyltransferase mRNA, complete cds. // chr11 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT013309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT013311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:79756267:79805538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT013312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_144744 // RefSeq // Rattus norvegicus adiponectin, C1Q and collagen domain containing (Adipoq), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000002492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84363940:84382663:-1 gene:ENSRNOG00000001821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY033885 // GenBank // Rattus norvegicus 30 kDa adipocyte complement-related protein mRNA, complete cds. // chr11 // 86 // 65 // 19 // 22 // 0 /// BC092565 // GenBank // Rattus norvegicus adiponectin, C1Q and collagen domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:108583 IMAGE:7308618), complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84364607:84367205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001008335 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4A2 (Eif4a2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84411366:84417958:-1 gene:ENSRNOG00000001815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085859 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4A2, mRNA (cDNA clone MGC:94588 IMAGE:7190333), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ220942 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YC02 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000020683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84412000:84417174:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// NONRATT014175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT014173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT014178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NONRATT014170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NONRATT014170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NONRATT014170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT014171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT014172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT014173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT014175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000036130 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:84446330:84446682:-1 gene:ENSRNOG00000026765 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 58 // 95 // 11 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84446330:84449195:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 70 // 100 // 14 // 20 // 0
ENSRNOT00000072491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84461453:84489268:-1 gene:ENSRNOG00000031231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 80 // 63 // 4 // 5 // 0 /// GENSCAN00000020690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84459392:84541931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// NONRATT014179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT014180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_133428 // RefSeq // Rattus norvegicus histidine-rich glycoprotein (Hrg), mRNA. // chrU // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000047595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84718230:84736638:-1 gene:ENSRNOG00000001809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// AB055895 // GenBank // Rattus norvegicus RNHRG1 mRNA for histidine-rich glycoprotein 1, complete cds. // chrU // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// BC089779 // GenBank // Rattus norvegicus histidine-rich glycoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:108609 IMAGE:7371893), complete cds. // chrU // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// AB055896 // GenBank // Rattus norvegicus RNHRG2 mRNA for histidine-rich glycoprotein 2, complete cds. // chrU // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// NONRATT014186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// NONRATT014187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// GENSCAN00000054104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84728629:84736587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_053348 // RefSeq // Rattus norvegicus fetuin B (Fetub), mRNA. // chr11 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// XM_006248549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fetuin B (Fetub), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84745603:84754149:-1 gene:ENSRNOG00000001806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84745622:84756917:-1 gene:ENSRNOG00000001806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC070508 // GenBank // Rattus norvegicus fetuin B, mRNA (cDNA clone MGC:91528 IMAGE:7099154), complete cds. // chr11 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// FQ219513 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YM04 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84745749:84756914:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT014193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT014196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT014195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001015021 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 11 (Dnajb11), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:84829172:84845635:-1 gene:ENSRNOG00000001803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC093384 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:112680 IMAGE:7389370), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:84829789:84845455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT014204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_023989 // RefSeq // Rattus norvegicus Sumo1/sentrin/SMT3 specific peptidase 2 (Senp2), mRNA. // chr11 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000002425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:85718646:85755312:-1 gene:ENSRNOG00000001773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AF260129 // GenBank // Rattus norvegicus Axin-associating molecule mRNA, complete cds. // chr11 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// FQ212134 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA68YF03 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
NM_001013978 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13 (Map3k13), mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000035945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:85830850:86018056:-1 gene:ENSRNOG00000025423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC081976 // GenBank // Rattus norvegicus similar to mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13; leucine zipper-bearing kinase, mRNA (cDNA clone MGC:94134 IMAGE:7127060), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85831115:85865022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_006221187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 8 homolog (S. cerevisiae) (Vps8), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// XM_006248576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 8 homolog (S. cerevisiae) (Vps8), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000029255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86184488:86390249:-1 gene:ENSRNOG00000001764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000058274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86184488:86390249:-1 gene:ENSRNOG00000001764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 94 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000058276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86184488:86390249:-1 gene:ENSRNOG00000001764 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 92 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000014413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:86222719:86390249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT014214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 26 // 26 // 13 // 50 // 1 /// NONRATT014216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 28 // 28 // 14 // 50 // 1
NM_001105868 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor B3 (Ephb3), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Eph receptor B3 (Ephb3), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000044896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86602390:86621102:-1 gene:ENSRNOG00000031801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:86603170:86620690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
ENSRNOT00000040029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86980027:86998442:-1 gene:ENSRNOG00000001738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86980027:86998442:-1 gene:ENSRNOG00000001738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042983 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:125584249:125586328:-1 gene:ENSRNOG00000030704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014986 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:124725185:124729965:-1 gene:ENSRNOG00000011281 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124666103:124777635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:86980027:86999650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:125568301:125586151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
XM_001058776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane epididymal protein 1-like (RGD1560559), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_221310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane epididymal protein 1-like (RGD1560559), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86749886:86750770:-1 gene:ENSRNOG00000025031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:86725347:86777147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_057134 // RefSeq // Rattus norvegicus chordin (Chrd), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000002394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:86930422:86939118:-1 gene:ENSRNOG00000001750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// FQ223218 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YP11 mRNA sequence. // chr11 // 89 // 98 // 40 // 45 // 0 /// GENSCAN00000021540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:86930820:86939100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0
XM_002727913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 131, member A (Fam131a), mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_003751082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM131A-like (LOC100912498), mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_003752528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 131, member A (Fam131a), mRNA. // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073526 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:85956346:85963432:-1 gene:ENSRNOG00000045653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000075606 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:86970402:86977488:-1 gene:ENSRNOG00000046177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:86970402:86977488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027952 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:85956346:85963432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT014210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001031639 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 2 (Psmd2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000002358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87006148:87016773:-1 gene:ENSRNOG00000001719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC099135 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 2, mRNA (cDNA clone MGC:116280 IMAGE:7455692), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// FQ216575 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YB09 mRNA sequence. // chr11 // 86 // 33 // 12 // 14 // 0 /// FQ225675 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YD19 mRNA sequence. // chr11 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// GENSCAN00000021532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87006311:87016768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT014232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT014233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001002815 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelin-converting enzyme 2 (Ece2), mRNA. // chr11 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// XM_006248588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endothelin-converting enzyme 2-like (LOC102551435), mRNA. // chr11 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000042833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87020944:87036302:-1 gene:ENSRNOG00000001715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000044482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87020944:87036302:-1 gene:ENSRNOG00000001715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000002334 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:87050350:87057691:-1 gene:ENSRNOG00000029529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000021522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87021140:87036302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT014235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// NONRATT014236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1
NM_001134535 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5B2 (Vwa5b2), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006248568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5B2 (Vwa5b2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000037612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87064398:87081268:-1 gene:ENSRNOG00000001707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT014239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87064401:87079356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// NONRATT014240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001134535 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5B2 (Vwa5b2), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006248568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 5B2 (Vwa5b2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000037612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87064398:87081268:-1 gene:ENSRNOG00000001707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87064401:87079356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001011896 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily F (GCN20), member 3 (Abcf3), mRNA. // chr11 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000002327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87098519:87110250:-1 gene:ENSRNOG00000001710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC082042 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, sub-family F (GCN20), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:95186 IMAGE:7131554), complete cds. // chr11 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000016059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87098823:87119809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT014242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT014243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// NONRATT014244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_053837 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 2, mu 1 subunit (Ap2m1), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87113489:87122152:-1 gene:ENSRNOG00000001709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC087724 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 2, mu 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:105352 IMAGE:7320615), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ213990 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YH03 mRNA sequence. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// M23674 // GenBank // Rat assembly protein (AP50) associated with clathrin-coated vesicles mRNA, complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87098823:87119809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT014245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107081 // RefSeq // Rattus norvegicus dishevelled segment polarity protein 3 (Dvl3), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87125789:87139453:-1 gene:ENSRNOG00000001708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87125789:87139597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT014253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0
NM_138866 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 5 epsilon (Eif2b5), mRNA. // chr11 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000002321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87151639:87161625:-1 gene:ENSRNOG00000038160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// BC085698 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 5 epsilon, mRNA (cDNA clone MGC:93170 IMAGE:7193458), complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// U19516 // GenBank // Rattus norvegicus initiation factor eIF-2Be mRNA, complete cds. // chr11 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87152566:87161589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT014255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000005520 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:87191646:87192256:-1 gene:ENSRNOG00000004017 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87191768:87192256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NONRATT014256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001109057 // RefSeq // Rattus norvegicus YEATS domain containing 2 (Yeats2), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87394894:87645690:-1 gene:ENSRNOG00000023107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87397366:87460857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
NM_181473 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 24 (Klhl24), mRNA. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000052120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87677908:87705842:-1 gene:ENSRNOG00000033372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// AB101615 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DRE1, complete cds. // chr11 // 91 // 65 // 20 // 22 // 0 /// BC092204 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 24 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:105289 IMAGE:7312023), complete cds. // chr11 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// FQ219171 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YC12 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87674606:87695652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// NONRATT014263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_053932 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 5 (B3gnt5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:87978737:87990865:-1 gene:ENSRNOG00000046258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:87948440:87993712:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001000042 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1569 (Olr1569), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000057990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:88370583:88371521:-1 gene:ENSRNOG00000050293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000016598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88370583:88371206:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT014270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_022584 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin reductase 2 (Txnrd2), mRNA. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000002593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89762307:89809957:-1 gene:ENSRNOG00000001890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AF072865 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin reductase (TrxR2) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr11 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// BC085734 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin reductase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93435 IMAGE:7191992), complete cds. // chr11 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000057090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89757122:89810336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// NONRATT014278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// NONRATT014279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001131013 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat gene deleted in velo-cardio-facial syndrome (Arvcf), mRNA. // chr11 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// XM_006248614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat gene deleted in velo-cardio-facial syndrome (Arvcf), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 97 // 83 // 32 // 33 // 0 /// XM_006248616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat gene deleted in velo-cardio-facial syndrome (Arvcf), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat gene deleted in velo-cardio-facial syndrome (Arvcf), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 97 // 78 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000044635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89830069:89887729:-1 gene:ENSRNOG00000001888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// BC168253 // GenBank // Rattus norvegicus armadillo repeat gene deleted in velo-cardio-facial syndrome, mRNA (cDNA clone MGC:188400 IMAGE:5621230), complete cds. // chr11 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000057096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89831699:89850639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT014282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT014283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NONRATT014281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001011895 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 2 homolog A (S. cerevisiae) (Trmt2a), mRNA. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89979612:89984220:-1 gene:ENSRNOG00000001885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC083619 // GenBank // Rattus norvegicus TRM2 tRNA methyltransferase 2 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94388 IMAGE:7133938), complete cds. // chr11 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89980068:89983699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT014285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT014286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT014288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000051037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90085449:90086849:-1 gene:ENSRNOG00000030920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF462390 // GenBank // Rattus norvegicus NOGO-66 receptor (NgR) mRNA, complete cds. // chr11 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NM_053613 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulon 4 receptor (Rtn4r), mRNA. // chr11 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// AY028438 // GenBank // Rattus norvegicus nogo receptor mRNA, complete cds. // chr11 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90083785:90090422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT014294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107080 // RefSeq // Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 6 (Dgcr6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 6 (Dgcr6), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90168058:90173103:-1 gene:ENSRNOG00000001880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158828 // GenBank // Rattus norvegicus DiGeorge syndrome critical region gene 6, mRNA (cDNA clone MGC:188273 IMAGE:7378165), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214135 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YK18 mRNA sequence. // chr11 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90168433:90173090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT014295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT014296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001108845 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B lymphocyte 1 (Vpreb1), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_001134788 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B lymphocyte gene 2 (Vpreb2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90249249:90249959:-1 gene:ENSRNOG00000001839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91363848:91608515:1 gene:ENSRNOG00000043140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006248714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin omega chain-like (LOC100911573), mRNA. // chr11 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91363972:91364469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT013510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90228728:90251604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91431464:91498548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001012019 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 2 (Tssk2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90326832:90327908:-1 gene:ENSRNOG00000037997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC079037 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93966 IMAGE:7114351), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90326832:90327908:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// AY345587 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 22B gene, complete cds. // chr11 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT014299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001011900 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 1B (Tssk1b), mRNA. // chr11 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000052200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90331183:90332280:-1 gene:ENSRNOG00000032856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// AY346103 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 22A (Stk22a) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// BC083661 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94496 IMAGE:7135375), complete cds. // chr11 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90331183:90332280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0
NM_001105864 // RefSeq // Rattus norvegicus scavenger receptor class F, member 2 (Scarf2), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90774764:90786143:1 gene:ENSRNOG00000000288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90774859:90785432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT013491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT013492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
NM_001107079 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 22 (Klhl22), mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 22 (Klhl22), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90730411:90771250:1 gene:ENSRNOG00000001878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90730781:90770660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT013487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT013489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_003752531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 74A (Ccdc74a), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90601613:90605826:1 gene:ENSRNOG00000001876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90601613:90605826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001167806 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase 4, neutral membrane (Smpd4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000043545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90575599:90599309:1 gene:ENSRNOG00000001875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ211899 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YB12 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000055105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90539113:90598448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// BC085900 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7193517), complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT013480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT013482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT013481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_012721 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 6 (P2rx6), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006248662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 6 (P2rx6), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 6 (P2rx6), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000002558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90486479:90496513:1 gene:ENSRNOG00000001873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90486611:90495499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT013478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT013477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_001108326 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-zipper-like transcription regulator 1 (Lztr1), mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_006248707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-zipper-like transcription regulator 1 (Lztr1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000002554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90433248:90448806:1 gene:ENSRNOG00000001870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC169071 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-zipper-like transcription regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:189471 IMAGE:7938530), complete cds. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// FQ211947 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YK09 mRNA sequence. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000018375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90417588:90448594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT013471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT013474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 52 // 52 // 23 // 44 // 1 /// NONRATT013473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// NONRATT013475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1
NM_001013977 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis-inducing factor, mitochondrion-associated 3 (Aifm3), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000040978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90417093:90431999:1 gene:ENSRNOG00000037957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC089949 // GenBank // Rattus norvegicus apoptosis-inducing factor, mitochondrion-associated 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7312074), complete cds. // chr11 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90417588:90448594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT013467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 68 // 68 // 30 // 44 // 1 /// NONRATT013469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// NONRATT013470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001008284 // RefSeq // Rattus norvegicus v-crk avian sarcoma virus CT10 oncogene homolog-like (Crkl), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90833008:90867428:-1 gene:ENSRNOG00000001868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085865 // GenBank // Rattus norvegicus v-crk sarcoma virus CT10 oncogene homolog (avian)-like, mRNA (cDNA clone MGC:94609 IMAGE:7190712), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90811945:90918549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_053810 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein 29 (Snap29), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90883358:90914051:-1 gene:ENSRNOG00000001867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF035822 // GenBank // Rattus norvegicus GS32 (GS32) mRNA, complete cds. // chr11 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// AF260577 // GenBank // Rattus norvegicus SNAP-29 protein (SNAP-29) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC091693 // GenBank // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein 29, mRNA (cDNA clone MGC:105273 IMAGE:7134635), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90811945:90918549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_024382 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade D (heparin cofactor), member 1 (Serpind1), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006248709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade D (heparin cofactor), member 1 (Serpind1), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000031819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:90969518:90980515:-1 gene:ENSRNOG00000001865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091145 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade D, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:108674 IMAGE:7372906), complete cds. // chr11 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000055110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:90970037:90976229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT014324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006221221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 191C (Tmem191c), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002546 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:91030347:91032188:-1 gene:ENSRNOG00000001864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91030347:91030673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
XM_006221221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 191C (Tmem191c), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000002546 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:91030347:91032188:-1 gene:ENSRNOG00000001864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000037562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91031123:91032188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001105862 // RefSeq // Rattus norvegicus hypermethylated in cancer 2 (Hic2), mRNA. // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006248684 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypermethylated in cancer 2 (Hic2), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000002545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91042179:91071088:-1 gene:ENSRNOG00000001863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91044604:91046418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
XM_001064091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RIMS binding protein 3 (Rimbp3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_221302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RIMS binding protein 3 (Rimbp3), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051991 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:91087427:91092265:-1 gene:ENSRNOG00000030452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91087427:91100321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001013863 // RefSeq // Rattus norvegicus YdjC homolog (bacterial) (Ydjc), mRNA. // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006248681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YdjC homolog (bacterial) (Ydjc), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000002542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91143087:91144893:-1 gene:ENSRNOG00000001861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC086565 // GenBank // Rattus norvegicus YdjC homolog (bacterial), mRNA (cDNA clone MGC:105851 IMAGE:7113479), complete cds. // chr11 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YdjC homolog (bacterial) (Ydjc), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// XM_006248680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YdjC homolog (bacterial) (Ydjc), transcript variant X4, mRNA. // chr11 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// XR_358440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YdjC homolog (bacterial) (Ydjc), transcript variant X7, misc_RNA. // chr11 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91141763:91144893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
XM_002727914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus yippee-like 1 (Drosophila) (Ypel1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003752533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus yippee-like 1 (Drosophila) (Ypel1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91226555:91233207:-1 gene:ENSRNOG00000001858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91226555:91238512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_053842 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 1 (Mapk1), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 1 (Mapk1), transcript variant X2, mRNA. // chr11 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91262522:91325572:-1 gene:ENSRNOG00000001849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211642 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YM12 mRNA sequence. // chr11 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// M64300 // GenBank // Rat extracellular signal-related kinase (ERK2) mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91268334:91325361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT014334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_175755 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1F (Ppm1f), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91371435:91398731:-1 gene:ENSRNOG00000037909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB023634 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ca/calmodulin-dependent protein kinase phosphatase, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166854 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1F (PP2C domain containing), mRNA (cDNA clone MGC:188760 IMAGE:9098491), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91368491:91392237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT014341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001105861 // RefSeq // Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) III beta (Top3b), mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) III beta (Top3b), transcript variant X3, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus topoisomerase (DNA) III beta (Top3b), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000002524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91401397:91429763:-1 gene:ENSRNOG00000001845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// FQ211004 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA19YC11 mRNA sequence. // chr11 // 89 // 97 // 31 // 35 // 0 /// FQ212059 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YE09 mRNA sequence. // chr11 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000037561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91401499:91420362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT014343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT014344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT014346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_006221223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546862 (LOC102546862), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546862 (LOC102546862), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91598421:91626453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_139263 // RefSeq // Rattus norvegicus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4 (Fgd4), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 66 // 66 // 0 /// ENSRNOT00000002491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:91755139:91850043:1 gene:ENSRNOG00000001818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 66 // 66 // 0 /// AF038388 // GenBank // Rattus norvegicus actin-filament binding protein Frabin mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 66 // 66 // 0 /// BC097280 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7453959, containing frame-shift errors. // chr11 // 93 // 82 // 50 // 54 // 0 /// GENSCAN00000005196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91808990:91934327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 68 // 68 // 45 // 66 // 1 /// NONRATT013514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 59 // 59 // 39 // 66 // 1 /// NONRATT013513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 39 // 39 // 26 // 66 // 1 /// GENSCAN00000005185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:91705621:91800927:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 24 // 24 // 16 // 66 // 1
NM_001100988 // RefSeq // Rattus norvegicus scaffolding protein involved in DNA repair (Spidr), mRNA. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:92071681:92313960:-1 gene:ENSRNOG00000037851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC129120 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310008H04, mRNA (cDNA clone MGC:156776 IMAGE:7123928), complete cds. // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:92072127:92319632:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
XM_003751100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, DNA activated, catalytic polypeptide (Prkdc), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 99 // 100 // 84 // 85 // 0 /// XM_003752534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase, DNA activated, catalytic polypeptide (Prkdc), transcript variant X1, mRNA. // chr11 // 99 // 100 // 84 // 85 // 0 /// ENSRNOT00000035247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:92347523:92533409:-1 gene:ENSRNOG00000025028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 99 // 84 // 70 // 71 // 0 /// ENSRNOT00000065799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:92517958:92565000:-1 gene:ENSRNOG00000025028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 26 // 22 // 22 // 0 /// BC168859 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8370124, with apparent retained intron. // chr11 // 13 // 13 // 11 // 85 // 1 /// GENSCAN00000045244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:92347523:92518097:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 98 // 66 // 55 // 56 // 0 /// NONRATT014353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 99 // 100 // 84 // 85 // 0 /// GENSCAN00000007648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:92525728:92539872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 9 // 9 // 8 // 85 // 1 /// NONRATT014357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 13 // 13 // 11 // 85 // 1
GENSCAN00000007642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:92741280:92910927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
GENSCAN00000010186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37432105:37432671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000010211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37419313:37419879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT012932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONRATT012934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr11 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:37449074:37450813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001024865 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L40 (Mrpl40), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000071159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89378582:89384417:1 gene:ENSRNOG00000049686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC097472 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L40, mRNA (cDNA clone MGC:114537 IMAGE:7457772), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000008063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89377746:89386123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// GENSCAN00000040177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:58652511:58707144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1
NM_001105866 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 45 (Cdc45), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000072027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89431161:89456061:1 gene:ENSRNOG00000050071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC161946 // GenBank // Rattus norvegicus CDC45 cell division cycle 45-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187739 IMAGE:9025372), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ232109 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YP16 mRNA sequence. // chr11 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// GENSCAN00000008071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89431176:89454716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0
NM_001135760 // RefSeq // Rattus norvegicus histone cell cycle regulator (Hira), mRNA. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006248641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone cell cycle regulator (Hira), transcript variant X5, mRNA. // chr11 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000071462 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:88903620:88994970:-1 gene:ENSRNOG00000049255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89270162:89378396:-1 gene:ENSRNOG00000045770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:88903620:88997072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89270915:89309809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89311113:89358983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001109058 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG15908-PA (LOC498122), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071453 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:11:89401176:89405419:-1 gene:ENSRNOG00000048861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ216047 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YB15 mRNA sequence. // chr11 // 77 // 100 // 20 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89402171:89430311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_053418 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin fusion degradation 1 like (yeast) (Ufd1l), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89406803:89430406:-1 gene:ENSRNOG00000047394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF234601 // GenBank // Rattus norvegicus UFD1 mRNA, complete cds. // chr11 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC161818 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin fusion degradation 1 like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:187268 IMAGE:9101868), complete cds. // chr11 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89402171:89430311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr11 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_031701 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 5 (Cldn5), mRNA. // chr11 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082073 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 5, mRNA (cDNA clone MGC:95240 IMAGE:7133096), complete cds. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ234774 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YL09 mRNA sequence. // chr11 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ212855 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YA02 mRNA sequence. // chr11 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0
GENSCAN00000051632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6795599:6796623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
NM_001099480 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 60 (Vom2r60), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:6440068:6564837:1 gene:ENSRNOG00000040198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6496582:6509436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT014428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000037099 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:6644922:6645278:1 gene:ENSRNOG00000028544 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000051639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6644922:6645278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001106102 // RefSeq // Rattus norvegicus HIG1 hypoxia inducible domain family, member 2A (Higd2a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_001067593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HIG1 hypoxia inducible domain family, member 2A-like 1 (Higd2al1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002724772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HIG1 hypoxia inducible domain family, member 2A-like 1 (Higd2al1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001416 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:6674350:6674670:1 gene:ENSRNOG00000001071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:12684712:12685636:-1 gene:ENSRNOG00000017372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166544 // GenBank // Rattus norvegicus HIG1 domain family, member 2A, mRNA (cDNA clone MGC:188144 IMAGE:7301761), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6674350:6694272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:12684972:12685600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT024819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT024821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001108848 // RefSeq // Rattus norvegicus ELAV like RNA binding protein 1 (Elavl1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4614833:4655379:1 gene:ENSRNOG00000001069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB212679 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for HuR, complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC168972 // GenBank // Rattus norvegicus ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 1 (Hu antigen R), mRNA (cDNA clone MGC:189299 IMAGE:9034405), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4615585:4654073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT014413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NONRATT014413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_017267 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 44 homolog (yeast) (Timm44), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4669953:4686653:1 gene:ENSRNOG00000001058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB006452 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Tim44, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4669974:4686253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109935 // RefSeq // Rattus norvegicus cortexin 1 (Ctxn1), mRNA. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4687159:4688769:1 gene:ENSRNOG00000001057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006248786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein FLJ22184-like (RGD1566084), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:4732781:4738127:1 gene:ENSRNOG00000028892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068586 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:4732781:4738127:1 gene:ENSRNOG00000028892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4732566:4738127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT014420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_002724769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG58956-like (LOC100363064), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000042857 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:4869120:4872081:1 gene:ENSRNOG00000001027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 92 // 75 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4869057:4872102:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
XR_085582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit-like (LOC688812), misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_001064643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD209 antigen-like protein A-like (RGD1559710), mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
NM_001170397 // RefSeq // Rattus norvegicus CD209b antigen (Cd209b), mRNA. // chr12 // 90 // 59 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000061749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4967146:4975729:-1 gene:ENSRNOG00000029881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 59 // 18 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000061750 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:4987624:4993268:-1 gene:ENSRNOG00000042807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// XM_006221228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD209c molecule (Cd209c), mRNA. // chr12 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// XM_006248792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD209c molecule (Cd209c), mRNA. // chr12 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// GENSCAN00000035192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4967336:4975553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 87 // 44 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT015329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_001108849 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member M (Clec4m), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4560987:4567014:-1 gene:ENSRNOG00000001017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4497218:4595067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001192005 // RefSeq // Rattus norvegicus CD209e molecule (Cd209e), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD209e molecule (Cd209e), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4535834:4541289:-1 gene:ENSRNOG00000028803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4497218:4595067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001105904 // RefSeq // Rattus norvegicus CD209a molecule (Cd209a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4495061:4500644:-1 gene:ENSRNOG00000040128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4497218:4595067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
XM_002724768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member G (Clec4g), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 4, member G (Clec4g), mRNA. // chr12 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000061719 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:4434753:4438637:-1 gene:ENSRNOG00000040126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4396708:4438637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001033924 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgE, low affinity II, receptor for (CD23) (Fcer2), transcript variant 1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_133550 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgE, low affinity II, receptor for (CD23) (Fcer2), transcript variant 2, mRNA. // chrU // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000001332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4395823:4407330:-1 gene:ENSRNOG00000001005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4395823:4407330:-1 gene:ENSRNOG00000001005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// AF381978 // GenBank // Rattus norvegicus CD23 mRNA, complete cds. // chrU // 86 // 82 // 24 // 28 // 0 /// BC078749 // GenBank // Rattus norvegicus Fc fragment of IgE, low affinity II, receptor for (CD23), mRNA (cDNA clone MGC:93219 IMAGE:7124300), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4396708:4438637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001107116 // RefSeq // Rattus norvegicus Purkinje cell protein 2 (Pcp2), mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006248762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Purkinje cell protein 2 (Pcp2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000001313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4334710:4336463:-1 gene:ENSRNOG00000000993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4334775:4336950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT015294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_139109 // RefSeq // Rattus norvegicus XPA binding protein 2 (Xab2), mRNA. // chr12 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000001309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4320723:4332729:-1 gene:ENSRNOG00000000988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF277899 // GenBank // Rattus norvegicus adapter protein ATH-55 mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// BC081723 // GenBank // Rattus norvegicus XPA binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93162 IMAGE:7108549), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000038146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4320792:4332683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT015293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
NM_001105902 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 11 gamma (Pex11g), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000037564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4163473:4170562:-1 gene:ENSRNOG00000028100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4164415:4170513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 57 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT015290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENSRNOT00000036279 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:4071218:4073870:-1 gene:ENSRNOG00000028071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 87 // 65 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000038137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4068247:4101563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_017071 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin receptor (Insr), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000041155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:3852577:3989125:-1 gene:ENSRNOG00000029986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000067448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:3852577:3989125:-1 gene:ENSRNOG00000029986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// KF112847 // GenBank // Rattus norvegicus strain Fischer 344 insulin receptor preproprotein (Insr) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// KF112848 // GenBank // Rattus norvegicus strain Copenhagen insulin receptor preproprotein (Insr) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// M29014 // GenBank // Rat insulin receptor mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// GENSCAN00000050901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:3853473:3989141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT015289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NONRATT015289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000073815 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:12:1491075:1491191:-1 gene:ENSRNOG00000050589 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 71 // 70 // 5 // 7 // 0
ENSRNOT00000073815 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:12:1491075:1491191:-1 gene:ENSRNOG00000050589 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT057282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0
GENSCAN00000039065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:466286:466600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 77 // 63 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:53340153:53577842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 29 // 29 // 14 // 49 // 1 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 45 // 45 // 22 // 49 // 1 /// GENSCAN00000029871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:52100696:52104814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1
GENSCAN00000039065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:466286:466600:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 63 // 67 // 20 // 32 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 46 // 46 // 22 // 48 // 1 /// GENSCAN00000029871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:52100696:52104814:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 19 // 19 // 9 // 48 // 1 /// GENSCAN00000046874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:53340153:53577842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 23 // 23 // 11 // 48 // 1
ENSRNOT00000074819 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:12:1482985:1483102:-1 gene:ENSRNOG00000047794 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109060 // RefSeq // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 13 (Stard13), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 13 (Stard13), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 13 (Stard13), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 13 (Stard13), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 13 (Stard13), transcript variant X6, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248749 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 13 (Stard13), transcript variant X7, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:1007827:1174378:-1 gene:ENSRNOG00000001090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// KF112845 // GenBank // Rattus norvegicus strain Fischer 344 StAR-related lipid transfer domain containing 13 (Stard13) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// KF112846 // GenBank // Rattus norvegicus strain Copenhagen StAR-related lipid transfer domain containing 13 (Stard13) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:1009912:1138514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006221226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bolA-like protein 2-like (RGD1562977), mRNA. // chr12 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// XM_344070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bolA-like protein 2-like (RGD1562977), mRNA. // chr12 // 100 // 45 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:872108:872815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001005533 // RefSeq // Rattus norvegicus NEDD4 binding protein 2-like 2 (N4bp2l2), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD4 binding protein 2-like 2 (N4bp2l2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006248736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEDD4 binding protein 2-like 2 (N4bp2l2), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000001468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:613303:634435:-1 gene:ENSRNOG00000001108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC081998 // GenBank // Rattus norvegicus NEDD4 binding protein 2-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:94223 IMAGE:7131024), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:616968:637320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT015280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
GENSCAN00000008027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:535115:607496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001035222 // RefSeq // Rattus norvegicus NEDD4 binding protein 2-like 1 (N4bp2l1), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:533776:563436:-1 gene:ENSRNOG00000001110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC168658 // GenBank // Rattus norvegicus NEDD4 binding protein 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188181 IMAGE:7314496), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ231381 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YL07 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// FQ235206 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YB06 mRNA sequence. // chr12 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT015276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:535115:607496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_002724765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zygote arrest 1-like (Zar1l), mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000001187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:176396082:176435667:-1 gene:ENSRNOG00000000889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166500 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RalA binding protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7115612), partial cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003751539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ralA-binding protein 1-like (LOC685294), partial mRNA. // chr2 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// XR_146327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ralA-binding protein 1-like (LOC501456), misc_RNA. // chr2 // 56 // 100 // 14 // 25 // 0 /// XM_006227093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ralA-binding protein 1-like (LOC685294), mRNA. // chr2 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:514051:522126:-1 gene:ENSRNOG00000050746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 100 // 8 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:514051:522163:-1 gene:ENSRNOG00000050746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:176377284:176445106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:515541:551564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:22821990:22854660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:11081150:11090998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001011901 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock 105/110 protein 1 (Hsph1), mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000001201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:8423548:8442481:-1 gene:ENSRNOG00000000902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC081945 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock 105kDa/110kDa protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94016 IMAGE:7121434), complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8424200:8442287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
GENSCAN00000000615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8853327:8880405:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0
AY321325 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-008 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000047163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:9168919:9180693:1 gene:ENSRNOG00000029813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000014579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:9155066:9180693:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000052581 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:12:9754577:9754685:1 gene:ENSRNOG00000034458 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001015030 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like 3 (Ubl3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:9953322:9997647:1 gene:ENSRNOG00000000921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091342 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:109350 IMAGE:7315459), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:9992986:9996094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013111 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (cationic amino acid transporter, y+ system), member 1 (Slc7a1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:10169916:10192908:1 gene:ENSRNOG00000000924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB066224 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ecotropic retrovirus receptor, complete cds. // chr12 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF245000 // GenBank // Rattus norvegicus cationinc amino acid transporter 1 (Cat1) mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// D67087 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ecotropic retrovirus receptor, complete cds. // chr12 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// U70476 // GenBank // Rattus norvegicus cationic amino acid transporter-1 (CAT-1) mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:10164702:10188341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001024968 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 46, member 3 (Slc46a3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:10842213:10858620:1 gene:ENSRNOG00000000937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091179 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 46, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:108818 IMAGE:7325773), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:10816942:10863771:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT014456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019306 // RefSeq // Rattus norvegicus FMS-related tyrosine kinase 1 (Flt1), mRNA. // chr12 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000001248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:11155072:11322925:1 gene:ENSRNOG00000000940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF157595 // GenBank // Rattus norvegicus soluble FLT-1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// D28498 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Fit-1 tyrosine kinase receptor, complete cds. // chr12 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000053023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11182823:11322438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NONRATT014458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 1 /// GENSCAN00000053023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11182823:11322438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001100822 // RefSeq // Rattus norvegicus fms-related tyrosine kinase 3 (Flt3), mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:11493007:11552299:1 gene:ENSRNOG00000000949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11528280:11552299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11494608:11520307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT014467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_023963 // RefSeq // Rattus norvegicus caudal type homeo box 2 (Cdx2), mRNA. // chrU // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000048188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:11578895:11585434:1 gene:ENSRNOG00000032759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11579004:11586559:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT014471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_001037787 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA polymerase 1-3 (Rpo1-3), mRNA. // chr12 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000001261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:11806333:11839715:-1 gene:ENSRNOG00000000954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// BC098735 // GenBank // Rattus norvegicus RNA polymerase 1-3, mRNA (cDNA clone MGC:112727 IMAGE:7385125), complete cds. // chr12 // 69 // 69 // 25 // 36 // 1 /// FQ223055 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YP08 mRNA sequence. // chr12 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// FQ222546 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA21YP23 mRNA sequence. // chr12 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// GENSCAN00000023673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11838441:11838791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT015388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT015392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001191663 // RefSeq // Rattus norvegicus GS homeobox 1 (Gsx1), mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:11718789:11720084:-1 gene:ENSRNOG00000000952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11685239:11728884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1
NM_001037295 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 12 (Gpr12), transcript variant 1, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NM_030831 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 12 (Gpr12), transcript variant 2, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 12 (Gpr12), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000061129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:12359656:12361832:1 gene:ENSRNOG00000039832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC127447 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 12, mRNA (cDNA clone MGC:156481 IMAGE:8363428), complete cds. // chrU // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// U12184 // GenBank // Rattus norvegicus putative G protein-coupled receptor mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// X61496 // GenBank // Rat mRNA for candidate G-protein coupled receptor. // chrU // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:12360501:12361505:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT014481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 81 // 34 // 34 // 0
NM_001109061 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 8 (Cdk8), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:12597402:12663828:-1 gene:ENSRNOG00000039819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:12625607:12663828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001063552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 4-like (LOC685378), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// XM_003752488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 4-like (LOC685378), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000064614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:58397940:58403636:-1 gene:ENSRNOG00000025404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000074158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13797182:13798066:1 gene:ENSRNOG00000048886 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000074977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13175751:13176635:1 gene:ENSRNOG00000049184 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// GENSCAN00000027071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:58375318:58447556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000029390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13175751:13214087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000043373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13797182:13825249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000047238 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:63092231:63092974:-1 gene:ENSRNOG00000028973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 71 // 19 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:63092263:63177466:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 71 // 19 // 30 // 0
NM_145724 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 394 (Zfp394), mRNA. // chr12 // 81 // 87 // 22 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13248537:13256461:1 gene:ENSRNOG00000000983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// AF052042 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein Y1 (RLZF-Y) mRNA, complete cds. // chr12 // 81 // 87 // 22 // 27 // 0 /// BC100140 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 394, mRNA (cDNA clone MGC:114256 IMAGE:7442414), complete cds. // chr12 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13248707:13267345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 52 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT014487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0
NM_001271117 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit F2 (Atp5j2), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000033537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13260912:13267470:1 gene:ENSRNOG00000027049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// FQ224807 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA53YL08 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// XM_001070212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit f, mitochondrial-like (LOC689271), mRNA. // chr12 // 67 // 98 // 26 // 39 // 0 /// XM_003752586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit f, mitochondrial-like (LOC689271), mRNA. // chr12 // 67 // 98 // 26 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000001251 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:33185002:33185268:1 gene:ENSRNOG00000000943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 67 // 98 // 26 // 39 // 0 /// GENSCAN00000029392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13248707:13267345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT014488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000006786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:33185002:33208182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 67 // 98 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT014848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 98 // 26 // 39 // 0 /// NONRATT036489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 26 // 98 // 10 // 39 // 0 /// NONRATT014489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001109665 // RefSeq // Rattus norvegicus pentatricopeptide repeat domain 1 (Ptcd1), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pentatricopeptide repeat domain 1 (Ptcd1), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13284989:13302661:1 gene:ENSRNOG00000000987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC129116 // GenBank // Rattus norvegicus pentatricopeptide repeat domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:156763 IMAGE:7113830), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13284951:13301818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_022595 // RefSeq // Rattus norvegicus PDGFA associated protein 1 (Pdap1), mRNA. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13309878:13320105:1 gene:ENSRNOG00000000990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088140 // GenBank // Rattus norvegicus PDGFA associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:108688 IMAGE:7382664), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U26541 // GenBank // Rattus norvegicus kinase substrate HASPP28 mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// U41744 // GenBank // Rattus norvegicus PDGF associated protein mRNA, complete cds. // chr12 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT014493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13312250:13319457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
XM_001074637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus karyopherin alpha 7 (Kpna7), mRNA. // chr12 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// XM_006221289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus karyopherin alpha 7 (Kpna7), mRNA. // chr12 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000038175 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:13415221:13444348:1 gene:ENSRNOG00000042296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 34 // 9 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000073712 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:13415221:13444434:1 gene:ENSRNOG00000042296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NM_001109598 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1 (Smurf1), mRNA. // chr12 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000031901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13499018:13591105:1 gene:ENSRNOG00000000999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000029375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13415221:13474315:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000043360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13499040:13588213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_001170399 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 130 (Tmem130), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13876610:13900956:1 gene:ENSRNOG00000025235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13876723:13899587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000054460 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:12:13985683:13985753:1 gene:ENSRNOG00000036339 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_001012351 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 4 (Cpsf4), mRNA. // chr12 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000038958 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:14246609:14248395:1 gene:ENSRNOG00000025217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000042474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13269002:13284752:-1 gene:ENSRNOG00000000985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// BC089824 // GenBank // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:108785 IMAGE:7309116), complete cds. // chr12 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// Y17326 // GenBank // Rattus norvegicus CDK106 mRNA. // chr12 // 76 // 60 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14246681:14247553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000029618 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:17496972:17498409:1 gene:ENSRNOG00000027744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 37 // 64 // 10 // 27 // 0 /// NONRATT015416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 79 // 79 // 33 // 42 // 1 /// GENSCAN00000029372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13269803:13284672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1 /// NONRATT015417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// NONRATT015418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT015414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1
ENSRNOT00000038919 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:14262077:14262990:1 gene:ENSRNOG00000025212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NONRATT047593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001034140 // RefSeq // Rattus norvegicus BAI1-associated protein 2-like 1 (Baiap2l1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14285463:14373559:1 gene:ENSRNOG00000001007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC105815 // GenBank // Rattus norvegicus BAI1-associated protein 2-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:124996 IMAGE:7367101), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14285689:14373065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT014499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001037191 // RefSeq // Rattus norvegicus tectonin beta-propeller repeat containing 1 (Tecpr1), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000001347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14426445:14454186:1 gene:ENSRNOG00000001010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC103478 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2210010N04 gene, mRNA (cDNA clone MGC:124730 IMAGE:7937275), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// GENSCAN00000021376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14418049:14453498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 79 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT014505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 65 // 65 // 31 // 48 // 1 /// NONRATT014507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 21 // 48 // 1 /// NONRATT014503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
ENSRNOT00000004242 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:14582124:14583091:1 gene:ENSRNOG00000003182 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_012995 // RefSeq // Rattus norvegicus oncomodulin 2 (Ocm2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oncomodulin 2 (Ocm2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006248853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oncomodulin 2 (Ocm2), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006248857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oncomodulin 2 (Ocm2), transcript variant X6, mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000043439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14673089:14678847:1 gene:ENSRNOG00000001031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// J02705 // GenBank // Rat oncomodulin mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14663893:14678507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001014126 // RefSeq // Rattus norvegicus CCZ1 vacuolar protein trafficking and biogenesis associated homolog (S. cerevisiae) (Ccz1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XR_358533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCZ1 vacuolar protein trafficking and biogenesis associated homolog (S. cerevisiae) (Ccz1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14682886:14706374:1 gene:ENSRNOG00000001032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079086 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG14980-PB, mRNA (cDNA clone MGC:94051 IMAGE:7123188), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14682963:14706101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT014512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT014513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001037348 // RefSeq // Rattus norvegicus aminoacyl tRNA synthetase complex-interacting multifunctional protein 2 (Aimp2), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14782144:14791697:1 gene:ENSRNOG00000001044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107947 // GenBank // Rattus norvegicus JTV1 gene, mRNA (cDNA clone MGC:125271 IMAGE:7386574), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14782245:14803890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001044297 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 61 (Ankrd61), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14799684:14804040:1 gene:ENSRNOG00000001048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC082099 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Ankyrin CG1651-PC, isoform C, mRNA (cDNA clone MGC:95291 IMAGE:7134466), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14782245:14803890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001105909 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 42 (Usp42), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 42 (Usp42), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14904019:14922553:1 gene:ENSRNOG00000001059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14904019:14920164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_134366 // RefSeq // Rattus norvegicus ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 (Rac1), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15133521:15153741:1 gene:ENSRNOG00000001068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY491395 // GenBank // Rattus norvegicus ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15142913:15153528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT014527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001013123 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 4 (Zdhhc4), mRNA. // chr12 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15324906:15339325:1 gene:ENSRNOG00000001089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY886523 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC4 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// BC089831 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:108810 IMAGE:7323958), complete cds. // chr12 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// FQ214800 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YP07 mRNA sequence. // chr12 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT014534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000014267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15324898:15369132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT014533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
XM_003751128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Protein C7orf26 homolog (LOC683674), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039191 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:15340705:15353986:1 gene:ENSRNOG00000024567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15324898:15369132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT014536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT014537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT014539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006221258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 853-like (LOC102555274), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 853-like (LOC102555274), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049786 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:15368475:15369102:1 gene:ENSRNOG00000030579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074138 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:15364519:15369084:1 gene:ENSRNOG00000030579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15324898:15369132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107121 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 316 (Zfp316), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000052327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15394499:15406460:1 gene:ENSRNOG00000001094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15394502:15405088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001034153 // RefSeq // Rattus norvegicus speedy/RINGO cell cycle regulator family member E4 (Spdye4), mRNA. // chrU // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC105855 // GenBank // Rattus norvegicus similar to speedy B isoform, mRNA (cDNA clone MGC:125213 IMAGE:7453404), complete cds. // chrU // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT014543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 91 // 61 // 10 // 11 // 0
NM_001191664 // RefSeq // Rattus norvegicus RB-associated KRAB zinc finger (Rbak), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15470256:15482463:1 gene:ENSRNOG00000001099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15468844:15481168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT014544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
XR_339419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555525 (LOC102555525), transcript variant X2, ncRNA. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XR_358547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555525 (LOC102555525), transcript variant X2, ncRNA. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT014546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000037311 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:15518210:15519151:1 gene:ENSRNOG00000024527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0
NM_001107122 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 216 (Rnf216), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15547724:15668304:1 gene:ENSRNOG00000001101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15529929:15669102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_031144 // RefSeq // Rattus norvegicus actin, beta (Actb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15745854:15748827:1 gene:ENSRNOG00000034254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063166 // GenBank // Rattus norvegicus actin, beta, mRNA (cDNA clone MGC:72783 IMAGE:6920838), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ228068 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YJ24 mRNA sequence. // chr12 // 53 // 63 // 9 // 17 // 0 /// XM_006248886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin, beta (Actb), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// FQ228822 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YH13 mRNA sequence. // chr12 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// FQ225285 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YH20 mRNA sequence. // chr12 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000029476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15742203:15748768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT014549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT014554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_006248906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 18 (Fbxl18), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// XM_006248905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 18 (Fbxl18), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// XM_006248907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 18 (Fbxl18), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000001479 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:15764431:15781260:1 gene:ENSRNOG00000001117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// XM_003749966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box/LRR-repeat protein 18-like (LOC100909844), partial mRNA. // chr12 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// GENSCAN00000027162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102614270:102618342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000029485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15750205:15785888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102584179:102591896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001107123 // RefSeq // Rattus norvegicus trinucleotide repeat containing 18 (Tnrc18), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15837335:15939011:1 gene:ENSRNOG00000024482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15865816:15939011:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001037217 // RefSeq // Rattus norvegicus monocyte to macrophage differentiation-associated 2 (Mmd2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000060608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:16049294:16105827:1 gene:ENSRNOG00000001113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC161816 // GenBank // Rattus norvegicus monocyte to macrophage differentiation-associated 2, mRNA (cDNA clone MGC:187264 IMAGE:7320318), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:16078973:16185000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_001037218 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras association and DIL domains (Radil), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000033998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:16120532:16185309:1 gene:ENSRNOG00000024456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:16078973:16185000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001012020 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (A) polymerase beta (testis specific) (Papolb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079046 // GenBank // Rattus norvegicus poly (A) polymerase beta (testis specific), mRNA (cDNA clone MGC:93982 IMAGE:7115077), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000031085 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:16757980:16758519:1 gene:ENSRNOG00000024366 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:16757980:16758424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0
XM_006248983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caspase recruitment domain family, member 11 (LOC100363332), mRNA. // chr12 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000051382 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:17801957:17843409:1 gene:ENSRNOG00000024277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000065894 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:17801957:17843409:1 gene:ENSRNOG00000024277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 93 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000047724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:17721289:17890636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 83 // 34 // 35 // 0 /// FQ233752 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YJ09 mRNA sequence. // chr12 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// FQ235080 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YI19 mRNA sequence. // chr12 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_031034 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein) alpha 12 (Gna12), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:17890088:17970852:1 gene:ENSRNOG00000001235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D85760 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for G alpha 12, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ120479 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY guanine nucleotide binding protein alpha 12 (Gna12) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// DQ120480 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR guanine nucleotide binding protein alpha 12 (Gna12) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:17932289:17968680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:17721289:17890636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT014568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT014570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_006221261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing E (Iqce), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006221266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing E (Iqce), transcript variant X7, mRNA. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006221267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing E (Iqce), transcript variant X8, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006248961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing E (Iqce), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing E (Iqce), transcript variant X8, mRNA. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006248967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing E (Iqce), transcript variant X9, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18028345:18065162:1 gene:ENSRNOG00000001241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000051565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18028345:18065162:1 gene:ENSRNOG00000001241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18027547:18065162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001107124 // RefSeq // Rattus norvegicus tweety family member 3 (Ttyh3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006248928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tweety family member 3 (Ttyh3), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18080074:18108489:1 gene:ENSRNOG00000024244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18080091:18103970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_057187 // RefSeq // Rattus norvegicus galectin-related inter-fiber protein (Grifin), mRNA. // chr12 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18164011:18165993:1 gene:ENSRNOG00000001251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF082160 // GenBank // Rattus norvegicus GRIFIN mRNA, complete cds. // chr12 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18160249:18193135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT014581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001105912 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 8 (Snx8), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006248921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 8 (Snx8), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 8 (Snx8), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18334035:18382248:1 gene:ENSRNOG00000001258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18355293:18381051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001109387 // RefSeq // Rattus norvegicus MAD1 mitotic arrest deficient-like 1 (yeast) (Mad1l1), mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18402692:18711591:1 gene:ENSRNOG00000001265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18402806:18433236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 40 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000044624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18575013:18618980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
XM_003751134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 3 (Psmg3), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 3 (Psmg3), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18890327:18893168:1 gene:ENSRNOG00000001273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ209570 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YN07 mRNA sequence. // chr12 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18890825:18892864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT014589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT014590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001025413 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 184A (Tmem184a), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 184A (Tmem184a), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18904350:18912233:1 gene:ENSRNOG00000001275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC098056 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 184A, mRNA (cDNA clone MGC:116214 IMAGE:7457725), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18904440:18911691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
XM_006221274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 1 (Ints1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 98 // 94 // 50 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000060370 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:18941636:18965326:1 gene:ENSRNOG00000022599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 91 // 48 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000001727 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:20063825:20071699:1 gene:ENSRNOG00000047880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000044596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18941717:18965326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 87 // 46 // 47 // 0 /// GENSCAN00000007854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20011148:20153918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 17 // 54 // 1 /// NONRATT014597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 41 // 41 // 22 // 54 // 1 /// NONRATT014596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 24 // 24 // 13 // 54 // 1
ENSRNOT00000036744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18978841:19007460:1 gene:ENSRNOG00000022533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ232177 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YL19 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18992806:19007316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_001047923 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC498152 (LOC498152), mRNA. // chrU // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19198738:19219239:1 gene:ENSRNOG00000030354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001008363 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 2A (Zfand2a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19239057:19250441:1 gene:ENSRNOG00000032917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085928 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 2A, mRNA (cDNA clone MGC:94876 IMAGE:7110398), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19234565:19294823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT014607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001025033 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC498154 (LOC498154), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC498154 (LOC498154), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000001734 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:19264599:19367357:1 gene:ENSRNOG00000001289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000030822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19357092:19368240:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT014610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NONRATT014608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031784 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-339 (Mir339), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053602 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:12:19355865:19355960:1 gene:ENSRNOG00000035479 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-339 // miRBase Micro RNA Database // MI0000620 Rattus norvegicus miR-339 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107126 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly homolog 19 (S. cerevisiae) (Cox19), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19381857:19391336:1 gene:ENSRNOG00000050052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_133567 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with dual PH domains 1 (Adap1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with dual PH domains 1 (Adap1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19402559:19454794:1 gene:ENSRNOG00000001291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF123047 // GenBank // Rattus norvegicus centaurin/PIP3-binding protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC099775 // GenBank // Rattus norvegicus ArfGAP with dual PH domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:124568 IMAGE:7933317), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U51013 // GenBank // Rattus norvegicus centaurin alpha mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19402642:19454704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001033679 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type I, beta (Prkar1b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19611758:19708677:1 gene:ENSRNOG00000028733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC104679 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, cAMP dependent regulatory, type I, beta, mRNA (cDNA clone MGC:125243 IMAGE:7456971), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212815 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YD11 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19631387:19707499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT014622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT014623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_012801 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet-derived growth factor alpha polypeptide (Pdgfa), mRNA. // chr12 // 83 // 86 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19727664:19746379:1 gene:ENSRNOG00000001312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19727664:19748066:1 gene:ENSRNOG00000001312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// L06238 // GenBank // Rat platelet-derived growth factor A chain mRNA, complete cds. // chr12 // 83 // 86 // 25 // 30 // 0 /// L06894 // GenBank // Rattus norvegicus (clones PTZ 18r 5.3 and PTZ 18r 4.1) platelet-derived growth factor A-chain (PDGF A) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// Z14120 // GenBank // R.norvegicus mRNA for platelet-derived growth factor A chain (partial). // chr12 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// BC061731 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-derived growth factor alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:72268 IMAGE:5598667), complete cds. // chr12 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// GENSCAN00000055202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19729578:19754966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT014626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// NONRATT014627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// NONRATT014628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1
NM_001107128 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 68 (Zfp68), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001142945 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 68 (Zfp68), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20141441:20156299:1 gene:ENSRNOG00000001317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000007854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20011148:20153918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_006248993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) X-linked (Dhrsx), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006248997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) X-linked (Dhrsx), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000029485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20501893:20506182:1 gene:ENSRNOG00000028323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC167053 // GenBank // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) X-linked, mRNA (cDNA clone MGC:189350 IMAGE:7110020), complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NM_001105914 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) X-linked (Dhrsx), mRNA. // chr12 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000035562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20501866:20506163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT014635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT014637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT014638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT014634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT014639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001105915 // RefSeq // Rattus norvegicus acetylserotonin O-methyltransferase-like (Asmtl), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acetylserotonin O-methyltransferase-like (Asmtl), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20517050:20519715:1 gene:ENSRNOG00000028166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC160824 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7387044. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20517140:20519592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT014640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT014642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
GENSCAN00000038108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21130124:21194490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_147206 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 9 (Cyp3a9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC086985 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 9, mRNA (cDNA clone MGC:93139 IMAGE:7125835), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U60085 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450olf3 (CYP3A9) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U46118 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 3A9 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21130124:21194490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
ENSRNOT00000037641 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:20889049:20890048:-1 gene:ENSRNOG00000027256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071536 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:20889084:20890048:-1 gene:ENSRNOG00000027256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0
NM_012826 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-2-glycoprotein 1, zinc-binding (Azgp1), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006249003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-2-glycoprotein 1, zinc-binding (Azgp1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21255662:21263727:1 gene:ENSRNOG00000001333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091166 // GenBank HTC // Rattus norvegicus alpha-2-glycoprotein 1, zinc-binding, mRNA (cDNA clone IMAGE:7372197), with apparent retained intron. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105822 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-2-glycoprotein 1, zinc-binding, mRNA (cDNA clone MGC:124966 IMAGE:7371444), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// D21058 // GenBank // Rattus norvegicus Znalpha2gp mRNA for Zn-alpha2-glycoprotein, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// FQ210978 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA19YJ01 mRNA sequence. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ219362 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YN07 mRNA sequence. // chr12 // 82 // 88 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21255699:21261380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001025760 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 1 (Zkscan1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21289593:21305888:1 gene:ENSRNOG00000001335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099191 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:116363 IMAGE:7383463), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 1 (Zkscan1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000038116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21296728:21308726:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT014655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006249015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger with KRAB and SCAN domains 1 (Zkscan1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012021 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 21 (Zscan21), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21321340:21335678:1 gene:ENSRNOG00000039234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079435 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 21, mRNA (cDNA clone MGC:94983 IMAGE:7115285), complete cds. // chrU // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21325878:21355683:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT014661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107129 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 6 (Cops6), mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21361017:21363856:1 gene:ENSRNOG00000001346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000038118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21361019:21363720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT014663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001037977 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 4, mu 1 subunit (Ap4m1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21371823:21377987:1 gene:ENSRNOG00000001353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC161814 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9030004. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ298439 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor protein complex 4, mu 4 subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21371881:21377740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT014666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108852 // RefSeq // Rattus norvegicus canopy FGF signaling regulator 4 (Cnpy4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21386612:21392755:1 gene:ENSRNOG00000027175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC162041 // GenBank // Rattus norvegicus canopy 4 homolog (zebrafish), mRNA (cDNA clone MGC:187975 IMAGE:7100495), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ229096 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YJ02 mRNA sequence. // chr12 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21386666:21392059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001024996 // RefSeq // Rattus norvegicus metallo-beta-lactamase domain containing 1 (Mblac1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21393471:21394732:1 gene:ENSRNOG00000001357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079097 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG9117-PA, mRNA (cDNA clone MGC:94073 IMAGE:7124205), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221295 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 5 (Nxpe5), mRNA. // chr12 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// XM_221996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurexophilin and PC-esterase domain family, member 5 (Nxpe5), mRNA. // chr12 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000030161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21570839:21587357:1 gene:ENSRNOG00000027061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// ENSRNOT00000060024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21570330:21587357:1 gene:ENSRNOG00000027061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
NM_001108330 // RefSeq // Rattus norvegicus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4 (Lamtor4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4 (Lamtor4), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21630758:21634473:1 gene:ENSRNOG00000027028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ221990 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YF03 mRNA sequence. // chr12 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21630827:21634237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT014675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_053730 // RefSeq // Rattus norvegicus stromal antigen 3 (Stag3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000042006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21656555:21686862:1 gene:ENSRNOG00000001360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY027880 // GenBank // Rattus norvegicus stromal antigen 3 (Stag3) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000004534 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06110231.1:261:5623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000030360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21658143:21686521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT014678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
XM_006221296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein PVRIG-like (LOC680923), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein PVRIG-like (LOC680923), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21736493:21738804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT014680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0
NM_001099499 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 63 (Vom2r63), mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
XM_006221308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired immunoglobulin-like type 2 receptor beta-like (RGD1561730), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// XR_358601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired immunoglobulin-like type 2 receptor beta-2-like (LOC102546903), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// XR_358602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired immunoglobulin-like type 2 receptor beta-2-like (LOC102546903), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// XR_358608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired immunoglobulin-like type 2 receptor beta-2-like (LOC102549839), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT015604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:22347586:22395836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT014681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XM_006227054 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal type-2 receptor 26-like (LOC684946), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000042677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:22984152:23164438:-1 gene:ENSRNOG00000047568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// GENSCAN00000013151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:22984152:23112993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 100 // 8 // 13 // 0 /// NONRATT015608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0
NM_001107133 // RefSeq // Rattus norvegicus GRB10 interacting GYF protein 1 (Gigyf1), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// XM_006249150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRB10 interacting GYF protein 1 (Gigyf1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000001912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24252933:24261868:-1 gene:ENSRNOG00000001410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000033913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24253292:24267850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT015634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001105917 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-like 6B (Actl6b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24211506:24227904:-1 gene:ENSRNOG00000001408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24194663:24227824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001105916 // RefSeq // Rattus norvegicus transferrin receptor 2 (Tfr2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006249119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transferrin receptor 2 (Tfr2), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24194288:24211206:-1 gene:ENSRNOG00000001407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC166451 // GenBank // Rattus norvegicus transferrin receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:187679 IMAGE:8371649), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24194663:24227824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT015626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_001127551 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 4 (Lrch4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006249176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 4 (Lrch4), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006249178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 4 (Lrch4), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24144769:24155758:-1 gene:ENSRNOG00000001402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC166781 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:188561 IMAGE:7934984), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24145734:24156542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT015620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001044284 // RefSeq // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 4 (Tsc22d4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24026729:24037917:-1 gene:ENSRNOG00000050805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000059592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:23769501:23781160:-1 gene:ENSRNOG00000024616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC105911 // GenBank // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:125073 IMAGE:7387593), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ214513 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YD19 mRNA sequence. // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000033915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24026729:24037917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23769957:23781145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001271236 // RefSeq // Rattus norvegicus Uncharacterized protein C7orf61 homolog (LOC100362783), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:23760929:23767105:-1 gene:ENSRNOG00000048645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24017853:24023581:-1 gene:ENSRNOG00000046006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// BC079190 // GenBank // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131268), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24005121:24026002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000038419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23748432:23769230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001109451 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 35 (Ppp1r35), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:23748353:23749546:-1 gene:ENSRNOG00000024505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074735 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:24005121:24006157:-1 gene:ENSRNOG00000050881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24005121:24026002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23748432:23769230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011902 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 22 homolog (Chlamydomonas) (Ift22), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24813507:24820156:-1 gene:ENSRNOG00000031346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089940 // GenBank // Rattus norvegicus RAB, member RAS oncogene family-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:109244 IMAGE:7310111), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24802620:24820048:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001105919 // RefSeq // Rattus norvegicus fission 1 (mitochondrial outer membrane) homolog (S. cerevisiae) (Fis1), mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000001924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24760056:24764149:-1 gene:ENSRNOG00000001420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC167057 // GenBank // Rattus norvegicus fission 1 (mitochondrial outer membrane) homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189358 IMAGE:9098277), complete cds. // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// FQ213833 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YF19 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fission 1 (mitochondrial outer membrane) homolog (S. cerevisiae) (Fis1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000063901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24760403:24774734:-1 gene:ENSRNOG00000001420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000015551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24760274:24764057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT015645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107135 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 15 (Cldn15), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24751108:24758228:-1 gene:ENSRNOG00000001419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24751108:24758228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_178101 // RefSeq // Rattus norvegicus procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3 (Plod3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000001921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24728207:24738766:-1 gene:ENSRNOG00000001417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC085683 // GenBank // Rattus norvegicus procollagen-lysine, 2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mRNA (cDNA clone MGC:93055 IMAGE:7110561), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000015545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24728446:24738481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT015640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT015642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT015641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XM_001064308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 2-acylglycerol O-acyltransferase 2-B-like (LOC685560), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000050456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24720989:24722955:-1 gene:ENSRNOG00000029211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24720989:24726158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0
NM_030997 // RefSeq // Rattus norvegicus VGF nerve growth factor inducible (Vgf), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006257726 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurosecretory protein VGF-like (LOC100909521), partial mRNA. // chr12 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24689888:24692911:-1 gene:ENSRNOG00000001416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072825 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06110239.1:772:2439:1 gene:ENSRNOG00000049861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// M60525 // GenBank // Rat nerve growth factor inducible protein (VGF) mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// M74223 // GenBank // Rat VGF mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24690355:24696728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046094 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06110239.1:752:2385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001271268 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XXVI, alpha 1 (Col26a1), mRNA. // chrU // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24844139:24982182:1 gene:ENSRNOG00000001422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000015537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24844139:24976581:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT014724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// GENSCAN00000020480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24977800:25004507:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT014723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_053669 // RefSeq // Rattus norvegicus SH2B adaptor protein 2 (Sh2b2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2B adaptor protein 2 (Sh2b2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249094 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2B adaptor protein 2 (Sh2b2), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25473620:25501386:1 gene:ENSRNOG00000001425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF095576 // GenBank // Rattus norvegicus APS protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25480400:25500709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001098793 // RefSeq // Rattus norvegicus Prkr interacting protein 1 (IL11 inducible) (Prkrip1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25515337:25533620:1 gene:ENSRNOG00000001426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158549 // GenBank // Rattus norvegicus Prkr interacting protein 1 (IL11 inducible), mRNA (cDNA clone MGC:187205 IMAGE:8361725), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25515371:25532842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT014733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001170403 // RefSeq // Rattus norvegicus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2 (Orai2), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000001938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25544833:25562556:1 gene:ENSRNOG00000001427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// BC158835 // GenBank // Rattus norvegicus ORAI calcium release-activated calcium modulator 2, mRNA (cDNA clone MGC:188295 IMAGE:7384003), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// EU644750 // GenBank // Rattus norvegicus calcium release-activated calcium modulator 2 protein (ORAI2) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000052431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25544833:25561847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001013981 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein DKFZp434K1815 (LOC304396), mRNA. // chr12 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// XM_006249156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein DKFZp434K1815 (LOC304396), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000001940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25574639:25587606:1 gene:ENSRNOG00000001429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25574690:25587507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT014741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
XM_006221334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scavenger receptor cysteine rich domain containing, group B (4 domains) (Srcrb4d), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006221336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scavenger receptor cysteine rich domain containing, group B (4 domains) (Srcrb4d), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scavenger receptor cysteine rich domain containing, group B (4 domains) (Srcrb4d), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scavenger receptor cysteine rich domain containing, group B (4 domains) (Srcrb4d), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001953 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:25751492:25761525:1 gene:ENSRNOG00000001435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25753358:25761525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NONRATT014745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
D17447 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 14-3-3 protein gamma-subtype, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NM_019376 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, gamma (Ywhag), mRNA. // chr12 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000001954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25788286:25816531:1 gene:ENSRNOG00000001436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// BC127496 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, gamma polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:156653 IMAGE:8372306), complete cds. // chr12 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// GENSCAN00000052433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25776314:25813955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT014748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_001037788 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine interacting-like 1 (Styxl1), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000046343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25952012:25984353:1 gene:ENSRNOG00000023366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098678 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine interacting-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:112640 IMAGE:7382696), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25960200:25975717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT014752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001010945 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 120A (Tmem120a), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000001960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25986848:25995509:1 gene:ENSRNOG00000001441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC089063 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 120A, mRNA (cDNA clone MGC:105569 IMAGE:7310299), complete cds. // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000004531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25977569:25995302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT014757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
NONRATT014759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001013045 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 24 (Ccl24), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 24 (Ccl24), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 24 (Ccl24), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000045157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26145932:26149923:1 gene:ENSRNOG00000031162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087576 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 24, mRNA (cDNA clone MGC:105554 IMAGE:7307568), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26145982:26156411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001109488 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 26 (Ccl26), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26156069:26159172:1 gene:ENSRNOG00000001444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26145982:26156411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
GENSCAN00000004529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26170143:26308457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_001100475 // RefSeq // Rattus norvegicus huntingtin interacting protein 1 (Hip1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006249096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus huntingtin interacting protein 1 (Hip1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus huntingtin interacting protein 1 (Hip1), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus huntingtin interacting protein 1 (Hip1), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000030497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26178240:26312676:1 gene:ENSRNOG00000001448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26170143:26308457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_053622 // RefSeq // Rattus norvegicus POM121 transmembrane nucleoporin (Pom121), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26321893:26339241:1 gene:ENSRNOG00000001449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26321898:26337340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001105922 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 6 (Fkbp6), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006249131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 6 (Fkbp6), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 6 (Fkbp6), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26364514:26435296:1 gene:ENSRNOG00000001451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26364664:26447862:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153305 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled class receptor 9 (Fzd9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26471284:26473598:1 gene:ENSRNOG00000001452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF455054 // GenBank // Rattus norvegicus frizzled-9 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ211688 // GenBank // Rattus norvegicus strain Hannover Frizzled-like protein 9 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// DQ211689 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA Frizzled-like protein 9 mRNA, complete cds. // chr12 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000004532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26471522:26473300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000053237 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:12:26520358:26520460:1 gene:ENSRNOG00000035114 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001135743 // RefSeq // Rattus norvegicus Williams Beuren syndrome chromosome region 22 (Wbscr22), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000044449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26669896:26681097:1 gene:ENSRNOG00000033700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC160891 // GenBank // Rattus norvegicus Williams Beuren syndrome chromosome region 22, mRNA (cDNA clone MGC:188319 IMAGE:7442902), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26669918:26680698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001012022 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 4 (Cldn4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26761480:26763275:1 gene:ENSRNOG00000001476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083582 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 4, mRNA (cDNA clone MGC:94208 IMAGE:7130270), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26761671:26762303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT014779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001077705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (Wbscr28), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006221338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (Wbscr28), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006221339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (Wbscr28), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006221340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (Wbscr28), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006249213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (Wbscr28), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006249214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (Wbscr28), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006249215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (Wbscr28), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_213758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 28 (Wbscr28), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000033499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26803998:26808539:1 gene:ENSRNOG00000001474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
GENSCAN00000021135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26907576:26908733:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 63 // 100 // 12 // 19 // 0
NM_012722 // RefSeq // Rattus norvegicus elastin (Eln), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000001995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26978753:27022484:1 gene:ENSRNOG00000001469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000032780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26978753:27022484:1 gene:ENSRNOG00000001469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000040069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26978753:27022484:1 gene:ENSRNOG00000001469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC085910 // GenBank // Rattus norvegicus elastin, mRNA (cDNA clone MGC:94768 IMAGE:7097661), complete cds. // chr12 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT014781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000028829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26977021:27069776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 73 // 73 // 30 // 41 // 1
NM_031727 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain kinase 1 (Limk1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006249185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain kinase 1 (Limk1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27037225:27070940:1 gene:ENSRNOG00000001470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// D31873 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for LIMK-1, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26977021:27069776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT014782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT014783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001006957 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4H (Eif4h), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4H (Eif4h), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27093554:27110196:1 gene:ENSRNOG00000001454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083818 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4H, mRNA (cDNA clone MGC:94887 IMAGE:7110979), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27093323:27108567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// NONRATT014786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENSRNOT00000034629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27119773:27126127:1 gene:ENSRNOG00000021856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_173840 // RefSeq // Rattus norvegicus linker for activation of T cells family, member 2 (Lat2), mRNA. // chr12 // 69 // 91 // 20 // 29 // 0 /// AY170849 // GenBank // Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome protein Wbscr5 mRNA, complete cds. // chr12 // 69 // 91 // 20 // 29 // 0 /// FQ226685 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YM07 mRNA sequence. // chr12 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// FQ231408 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YJ15 mRNA sequence. // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// FQ235223 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YA03 mRNA sequence. // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// FQ234957 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YA07 mRNA sequence. // chr12 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000028846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27119773:27126127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001014771 // RefSeq // Rattus norvegicus syncytin a (Syna), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27161524:27168576:1 gene:ENSRNOG00000050672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27165691:27237076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_021997 // RefSeq // Rattus norvegicus CAP-GLY domain containing linker protein 2 (Clip2), mRNA. // chr12 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000033200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27173529:27237324:1 gene:ENSRNOG00000021611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27165691:27237076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_053734 // RefSeq // Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 1 (Ncf1), mRNA. // chr12 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// XM_006249228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neutrophil cytosol factor 1-like (LOC100912379), mRNA. // chr12 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000002028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27505793:27514988:1 gene:ENSRNOG00000001480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// AF547392 // GenBank // Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 1 (Ncf1) mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// AF547393 // GenBank // Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 1 (Ncf1) mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// AY029167 // GenBank // Rattus norvegicus p47 phox mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 89 // 31 // 33 // 0 /// BC061810 // GenBank // Rattus norvegicus neutrophil cytosolic factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:72350 IMAGE:5598653), complete cds. // chr12 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// NONRATT014807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000003014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27475619:27513415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 81 // 81 // 30 // 37 // 1 /// GENSCAN00000056511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:30927153:30939646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001108332 // RefSeq // Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 16 (Wbscr16), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006249183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 16 (Wbscr16), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000002032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27569603:27599906:1 gene:ENSRNOG00000001483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000003007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27569656:27599083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT014809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
XM_003752582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autism susceptibility candidate 2-like (LOC100362819), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001182 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:30173028:30212512:1 gene:ENSRNOG00000000885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:30161434:30212512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
NM_001025112 // RefSeq // Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosome region 17 (Wbscr17), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:30671599:30922308:1 gene:ENSRNOG00000024435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AB040671 // GenBank // Rattus norvegicus pt-GalNAc-T mRNA for putative UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073145 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:31188210:31212714:1 gene:ENSRNOG00000046870 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000036397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:31188125:31212714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0
NM_001008289 // RefSeq // Rattus norvegicus Shwachman-Bodian-Diamond syndrome (Sbds), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:31858315:31867472:1 gene:ENSRNOG00000000888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC086335 // GenBank // Rattus norvegicus Shwachman-Bodian-Diamond syndrome homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:105922 IMAGE:7301062), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:31858342:31866858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1 /// NONRATT014828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_021577 // RefSeq // Rattus norvegicus argininosuccinate lyase (Asl), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 92 // 92 // 0 /// ENSRNOT00000001211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32102491:32115103:1 gene:ENSRNOG00000000903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 99 // 94 // 87 // 88 // 0 /// BC078682 // GenBank // Rattus norvegicus argininosuccinate lyase, mRNA (cDNA clone MGC:93044 IMAGE:7109106), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 87 // 87 // 0 /// BC097270 // GenBank // Rattus norvegicus argininosuccinate lyase, mRNA (cDNA clone MGC:114244 IMAGE:7455735), complete cds. // chr12 // 100 // 98 // 92 // 92 // 0 /// D28501 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for argininosuccinate lyase, complete cds. // chr12 // 93 // 89 // 78 // 84 // 0 /// GENSCAN00000054745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32102794:32131868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 64 // 64 // 0 /// NONRATT014833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 94 // 94 // 0 /// AB016536 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for AlF-C1, complete cds. // chr12 // 80 // 80 // 75 // 94 // 1 /// NONRATT014831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 45 // 94 // 1 /// NONRATT014830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 10 // 10 // 9 // 94 // 1 /// NONRATT014832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 11 // 11 // 10 // 94 // 1 /// NONRATT014834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 21 // 21 // 20 // 94 // 1 /// NONRATT014836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 17 // 17 // 16 // 94 // 1
NM_017015 // RefSeq // Rattus norvegicus glucuronidase, beta (Gusb), mRNA. // chr12 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32139367:32152881:1 gene:ENSRNOG00000000913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32136118:32164707:1 gene:ENSRNOG00000000913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// AY321342 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-223 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// M13962 // GenBank // Rat beta-glucuronidase mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 67 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32136123:32216645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// NONRATT014839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT014838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NM_001105923 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S17 (Mrps17), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32511014:32514191:-1 gene:ENSRNOG00000000926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ223326 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YK16 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32511565:32514271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 89 // 41 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT015766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 95 // 95 // 20 // 21 // 0
NM_001017486 // RefSeq // Rattus norvegicus glioblastoma amplified sequence (Gbas), mRNA. // chr12 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006249282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glioblastoma amplified sequence (Gbas), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32476020:32506643:-1 gene:ENSRNOG00000023919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC086385 // GenBank // Rattus norvegicus glioblastoma amplified sequence, mRNA (cDNA clone MGC:105528 IMAGE:7302515), complete cds. // chr12 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006249281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glioblastoma amplified sequence (Gbas), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XR_358632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glioblastoma amplified sequence (Gbas), transcript variant X4, misc_RNA. // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// XR_358633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glioblastoma amplified sequence (Gbas), transcript variant X5, misc_RNA. // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT015765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32484815:32506641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001033684 // RefSeq // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 6A (zeta 1) (Cct6a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32433338:32443781:-1 gene:ENSRNOG00000000923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC104703 // GenBank // Rattus norvegicus chaperonin containing Tcp1, subunit 6A (zeta 1), mRNA (cDNA clone MGC:125121 IMAGE:7300674), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ218432 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YD09 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32433876:32443716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NONRATT015762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NONRATT015763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT015762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1
NM_001025125 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfatase modifying factor 2 (Sumf2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32407454:32432604:-1 gene:ENSRNOG00000000922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC091176 // GenBank // Rattus norvegicus sulfatase modifying factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:108793 IMAGE:7322044), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32407984:32432565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT015760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006221341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 11 (LOC100363065), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32590619:32607430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT014846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
XM_001070212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit f, mitochondrial-like (LOC689271), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit f, mitochondrial-like (LOC689271), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001251 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:33185002:33185268:1 gene:ENSRNOG00000000943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:33185002:33208182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0
NM_012748 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 2 (Stx2), mRNA. // chr12 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// XM_006249251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 2 (Stx2), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:33261860:33283619:1 gene:ENSRNOG00000000936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:33261860:33285512:1 gene:ENSRNOG00000000936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000037306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:33261860:33285150:1 gene:ENSRNOG00000000936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// AY302700 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 2D mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// L20823 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 2 mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// L20888 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// L20889 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:33261860:33304579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT014850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT014853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001100488 // RefSeq // Rattus norvegicus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006249255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006249257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006249258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006249259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006249260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RIMS binding protein 2 (Rimbp2), transcript variant X6, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000033379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:33319996:33529398:1 gene:ENSRNOG00000022893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000067867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:33319996:33529398:1 gene:ENSRNOG00000022893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000004433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:33471481:33531998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT014860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT014861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_198727 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 132D (Tmem132d), mRNA. // chr12 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// XM_006249266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 132D (Tmem132d), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 132D (Tmem132d), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:33851101:34515311:1 gene:ENSRNOG00000008447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:34487042:34515222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_144758 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 15 (oligopeptide transporter), member 4 (Slc15a4), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:34660965:34680418:1 gene:ENSRNOG00000000962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB000280 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peptide/histidine transporter, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC087709 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 15, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:105315 IMAGE:7315369), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:34660988:34679430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001105926 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 37 (Dhx37), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000030823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:38472183:38492290:1 gene:ENSRNOG00000022171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:38472265:38491648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000045162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:38515328:38520061:1 gene:ENSRNOG00000028756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// BC103477 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin C, mRNA (cDNA clone MGC:124622 IMAGE:7929586), complete cds. // chr12 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// FQ217540 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA23YP15 mRNA sequence. // chr12 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// FQ222335 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YO20 mRNA sequence. // chr12 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// NM_017314 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin C (Ubc), mRNA. // chr12 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// D17296 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for polyubiquitin, complete cds, ten completely repetitive ubiquitins in tandem and one ubiguitin-like protein. // chr12 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// FQ217260 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA30YP22 mRNA sequence. // chr12 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// FQ226186 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA32YF01 mRNA sequence. // chr12 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1 /// GENSCAN00000003504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:38517094:38519982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
NM_001108334 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor co-repressor 2 (Ncor2), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000001334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:38748528:38909933:1 gene:ENSRNOG00000001004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000003530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:38793002:38908939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT014891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT014896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1 /// NONRATT014897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 18 // 18 // 9 // 49 // 1
GENSCAN00000013797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39068594:39110967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001083898 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 92 (Ccdc92), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 92 (Ccdc92), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000032739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39085289:39112093:1 gene:ENSRNOG00000021691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39068594:39110967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
NM_001004205 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab interacting lysosomal protein-like 2 (Rilpl2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001403 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39415025:39426666:1 gene:ENSRNOG00000001061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079132 // GenBank // Rattus norvegicus Rab interacting lysosomal protein-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:94142 IMAGE:7127390), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39415297:39422884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT014909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_172029 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 1 alpha (Eif2b1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39315127:39323400:1 gene:ENSRNOG00000001039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081709 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 1 alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93113 IMAGE:7135576), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ217438 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA26YH10 mRNA sequence. // chr12 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// U05821 // GenBank // Rattus norvegicus translation initiation factor eIF-2B alpha-subunit (eIF-2a) mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ213561 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YB18 mRNA sequence. // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000013798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39316023:39322888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001191665 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab interacting lysosomal protein-like 1 (Rilpl1), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39361410:39398925:1 gene:ENSRNOG00000001055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39361125:39398321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001107138 // RefSeq // Rattus norvegicus strawberry notch homolog 1 (Drosophila) (Sbno1), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000057902 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:39464772:39520024:1 gene:ENSRNOG00000001064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ228291 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA101YE07 mRNA sequence. // chr12 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000051997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39474974:39518761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001113751 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 2 associated protein 1 (Cdk2ap1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39538931:39549784:1 gene:ENSRNOG00000001070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158683 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187692 IMAGE:8373627), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39539161:39549133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001170554 // RefSeq // Rattus norvegicus M-phase phosphoprotein 9 (Mphosph9), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000049985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39583052:39639208:1 gene:ENSRNOG00000001074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000052000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39587275:39638719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_001107139 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, membrane-associated 2 (Pitpnm2), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000048528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39751082:39776218:1 gene:ENSRNOG00000029260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// BC168908 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, membrane-associated 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7455873), complete cds. // chr12 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1 /// GENSCAN00000052004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39725658:39773667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT014921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 14 // 47 // 1 /// NONRATT014923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
NM_022238 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 9 (Abcb9), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39796337:39829020:1 gene:ENSRNOG00000001082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000063961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39796337:39821536:1 gene:ENSRNOG00000001082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39796337:39819969:1 gene:ENSRNOG00000001082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AB027520 // GenBank // Rattus norvegicus TAPL mRNA for TAP-like ABC transporter, complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB116264 // GenBank // Rattus norvegicus TAPL mRNA for TAP-Like isoform C3, complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AB116265 // GenBank // Rattus norvegicus TAPL mRNA for TAP-Like isoform C4, complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39802094:39828244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 66 // 20 // 21 // 0
NM_001105928 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 37 homolog B (S. cerevisiae) (Vps37b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 37 homolog B (S. cerevisiae) (Vps37b), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39857153:39894365:1 gene:ENSRNOG00000001086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39857194:39892744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT014931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001145334 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 81 (Gpr81), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40014637:40015692:1 gene:ENSRNOG00000026661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU809461 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 81 long form (Gpr81) mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// EU809462 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein coupled receptor 81 short form (Gpr81) mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40014637:40015692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_181476 // RefSeq // Rattus norvegicus niacin receptor 1 (Niacr1), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40029980:40031062:1 gene:ENSRNOG00000026653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB103062 // GenBank // Rattus norvegicus HM74b mRNA for nicotinic acid receptor, complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40029980:40062697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001014128 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine/serine-rich coiled-coil 2 (Rsrc2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arginine/serine-rich coiled-coil 2 (Rsrc2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000057788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40146860:40167591:1 gene:ENSRNOG00000001238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087067 // GenBank // Rattus norvegicus LOC360807, mRNA (cDNA clone MGC:94341 IMAGE:7133034), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40162566:40167122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001105929 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 8 (Zcchc8), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249333 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 8 (Zcchc8), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40191351:40200212:1 gene:ENSRNOG00000001243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40178099:40199687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT014947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031745 // RefSeq // Rattus norvegicus CAP-GLY domain containing linker protein 1 (Clip1), mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40226383:40332760:1 gene:ENSRNOG00000001247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT014952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40256512:40306737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT014955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_022961 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 33 homolog A (S. cerevisiae) (Vps33a), mRNA. // chr12 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40348553:40366395:1 gene:ENSRNOG00000008562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC105752 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 33 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124527 IMAGE:5599123), complete cds. // chr12 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// U35244 // GenBank // Rat vacuolar protein sorting homolog r-vps33a mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40340931:40384654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
NM_001008292 // RefSeq // Rattus norvegicus diablo, IAP-binding mitochondrial protein (Diablo), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011308 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:151327329:151328075:1 gene:ENSRNOG00000008548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC086366 // GenBank // Rattus norvegicus diablo homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:105680 IMAGE:7305418), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000047861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40372113:40385230:1 gene:ENSRNOG00000029197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 97 // 30 // 31 // 1 /// GENSCAN00000026581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151327329:151328075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40340931:40384654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT014965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT014966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENSRNOT00000030573 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:40415580:40417587:1 gene:ENSRNOG00000026192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// XM_002727966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 31 (Il31), mRNA. // chr12 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40415580:40417587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_130430 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 9 (Psmd9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000057716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40668828:40698959:-1 gene:ENSRNOG00000001339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// AF067728 // GenBank // Rattus norvegicus transactivating protein BRIDGE mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ229304 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YG08 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// FQ218932 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YP22 mRNA sequence. // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT015880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40509643:40698899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT015878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT015879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT015882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_017233 // RefSeq // Rattus norvegicus 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (Hpd), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40729052:40740668:1 gene:ENSRNOG00000001338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// AF082834 // GenBank // Rattus norvegicus 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (HPPD) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC081819 // GenBank // Rattus norvegicus 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mRNA (cDNA clone MGC:93530 IMAGE:7107086), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// FQ209393 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YA17 mRNA sequence. // chr12 // 82 // 97 // 28 // 34 // 0 /// GENSCAN00000026904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40715609:40740526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT014973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT014974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// NONRATT014975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// NONRATT014972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001100679 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 2B (Kdm2b), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000044071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40918245:41054955:1 gene:ENSRNOG00000025702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000022191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41024071:41053879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 43 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40973142:41013089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 21 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000026908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40918661:40952504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// NONRATT014984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1 /// NONRATT014985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1
NM_001080147 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase-promoting complex subunit 5 (Anapc5), mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41102284:41134467:1 gene:ENSRNOG00000001316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC129106 // GenBank // Rattus norvegicus anaphase-promoting complex subunit 5, mRNA (cDNA clone MGC:156717 IMAGE:7100647), complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000022210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41102399:41134400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT014986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// NONRATT014990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1
NM_031338 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, beta (Camkk2), mRNA. // chr12 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41155843:41191356:1 gene:ENSRNOG00000001309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AB018081 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ca+/Calmodulin-dependent protein kinase kinase beta (CaM-kinase kinase beta), complete cds. // chr12 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41149117:41187785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_199120 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 81 homolog (Chlamydomonas) (Ift81), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000066952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41307847:41387638:1 gene:ENSRNOG00000001294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AY345164 // GenBank // Rattus norvegicus CDV1 protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FQ225832 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA40YF20 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000022207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41310926:41320252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT014997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT015001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// GENSCAN00000022211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41324761:41372807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
ENSRNOT00000050398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41560318:41569453:1 gene:ENSRNOG00000031731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC086384 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1500011H22, mRNA (cDNA clone MGC:105520 IMAGE:7301624), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001030042 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD9 homolog B (S. pombe) (Rad9b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006249366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD9 homolog B (S. pombe) (Rad9b), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41579810:41610543:1 gene:ENSRNOG00000021480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC099750 // GenBank // Rattus norvegicus RAD9 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124758 IMAGE:5599441), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41583159:41610165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 52 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT015018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT015019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001177613 // RefSeq // Rattus norvegicus tectonic family member 1 (Tctn1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41671666:41704377:1 gene:ENSRNOG00000028523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ222752 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YG09 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41667193:41702188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001025665 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 63 (Ccdc63), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 44 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000046604 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:41793657:41828134:1 gene:ENSRNOG00000034266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// BC097409 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 63, mRNA (cDNA clone MGC:114454 IMAGE:7454160), complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 44 // 46 // 0 /// GENSCAN00000028706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41813937:41828083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 57 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41774752:41802002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 33 // 33 // 15 // 46 // 1 /// NONRATT015029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// NONRATT015030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// NONRATT015031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// NONRATT015032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1 /// NONRATT015033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// NONRATT015034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 20 // 20 // 9 // 46 // 1
NM_001271380 // RefSeq // Rattus norvegicus cut-like homeobox 2 (Cux2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_003751189 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cut-like homeobox 2 (Cux2), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000001697 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:42062599:42089880:1 gene:ENSRNOG00000001259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000022239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42039346:42089880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT015035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0
NM_031621 // RefSeq // Rattus norvegicus SH2B adaptor protein 3 (Sh2b3), mRNA. // chr12 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000030583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42132947:42136714:1 gene:ENSRNOG00000028198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 91 // 63 // 20 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42132947:42136714:1 gene:ENSRNOG00000028198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000075776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42132947:42136714:1 gene:ENSRNOG00000028198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 69 // 23 // 24 // 0 /// JX215366 // GenBank // Rattus norvegicus strain SS/JrHsd/Mcwi SH2B adaptor protein 3 mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 71 // 23 // 25 // 0 /// U24652 // GenBank // Rattus norvegicus Lnk1 mRNA, complete cds. // chr12 // 84 // 54 // 16 // 19 // 0 /// U24653 // GenBank // Rattus norvegicus Lnk2 mRNA, complete cds. // chr12 // 82 // 63 // 18 // 22 // 0 /// U24654 // GenBank // Rattus norvegicus Lnk3 mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 69 // 21 // 24 // 0 /// U24655 // GenBank // Rattus norvegicus Lnk4 mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42113170:42134372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT015037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT015038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000057435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42290623:42328188:1 gene:ENSRNOG00000037815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// BC168650 // GenBank // Rattus norvegicus similar to acetyl-coA dehydrogenase -related (111.6 kD) (5G231), mRNA (cDNA clone MGC:187436 IMAGE:7121002), complete cds. // chr12 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NONRATT015039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42291624:42327702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_032416 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 2 family (mitochondrial) (Aldh2), mRNA. // chr12 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42334147:42365988:1 gene:ENSRNOG00000001344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC062081 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 2 family (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:72375 IMAGE:5621229), complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42334147:42396481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT015041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT015043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001025761 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 5 (Mapkapk5), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NM_001164043 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 5 (Mapkapk5), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42377614:42396574:1 gene:ENSRNOG00000001345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42384893:42396574:1 gene:ENSRNOG00000001345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC099161 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:116327 IMAGE:7381631), complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42334147:42396481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT015047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_020078 // RefSeq // Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 1a (Adam1a), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42400868:42403856:1 gene:ENSRNOG00000001347 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081807 // GenBank // Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 1a, mRNA (cDNA clone MGC:93473 IMAGE:7132493), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42401206:42403609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
XM_003751190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG21419-like (LOC100360238), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057396 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:42420977:42423416:1 gene:ENSRNOG00000037801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42420977:42423431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_053961 // RefSeq // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum protein 29 (Erp29), mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42486494:42492998:1 gene:ENSRNOG00000001348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC091129 // GenBank // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum protein 29, mRNA (cDNA clone MGC:108622 IMAGE:7308437), complete cds. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// FQ211664 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YB20 mRNA sequence. // chr12 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// U36482 // GenBank // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum protein ERp29 precursor, mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42486507:42492705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT015054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT015055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT015056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT015057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT015058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_053760 // RefSeq // Rattus norvegicus TRAF type zinc finger domain containing 1 (Trafd1), mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000033984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42562635:42576553:1 gene:ENSRNOG00000001351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC088344 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF type zinc finger domain containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7368105), complete cds. // chr12 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000041441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42564254:42575932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT015060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT015063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
GENSCAN00000041444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42703758:42742046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_001177593 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 (Ptpn11), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_013088 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 (Ptpn11), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000046323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42762630:42822760:1 gene:ENSRNOG00000030124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U05963 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley protein tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// U09307 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley protein-tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42780273:42818605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001177593 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 (Ptpn11), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_013088 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 (Ptpn11), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42762630:42822760:1 gene:ENSRNOG00000030124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133518 // RefSeq // Rattus norvegicus rabphilin 3A (Rph3a), mRNA. // chr12 // 93 // 96 // 41 // 44 // 0 /// XM_006249379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rabphilin 3A (Rph3a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000001844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42939357:43014054:1 gene:ENSRNOG00000001368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// U12571 // GenBank // Rattus norvegicus rabphilin-3A mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 96 // 41 // 44 // 0 /// GENSCAN00000049319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42966294:43013732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT015069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT015070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1
NM_001009680 // RefSeq // Rattus norvegicus 2  -5  oligoadenylate synthetase 1I (Oas1i), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43019585:43031098:1 gene:ENSRNOG00000047076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000043279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:44192563:44204571:1 gene:ENSRNOG00000037744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY196697 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1I mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC160819 // GenBank // Rattus norvegicus 2  -5  oligoadenylate synthetase 1I, mRNA (cDNA clone MGC:187283 IMAGE:7382468), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:44192594:44204563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000049317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43019585:43031554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 14 // 14 // 0
NM_138913 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1A (Oas1a), mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000038426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43064703:43075398:1 gene:ENSRNOG00000001369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000048450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43064703:43075398:1 gene:ENSRNOG00000001369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000057279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43064703:43106931:1 gene:ENSRNOG00000001369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000067176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43064584:43075398:1 gene:ENSRNOG00000001369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// AY221507 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1G (Oas1g) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC086979 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1A, mRNA (cDNA clone MGC:93097 IMAGE:7191865), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ232784 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YH01 mRNA sequence. // chr12 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43064783:43075120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001009492 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1E (Oas1e), mRNA. // chr12 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43140730:43149668:1 gene:ENSRNOG00000031726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43140730:43177213:1 gene:ENSRNOG00000031726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000057267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43140730:43149668:1 gene:ENSRNOG00000031726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// AY196698 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1C mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43130160:43149094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_001079849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 42B (Ccdc42b), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_222198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 42B (Ccdc42b), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43322023:43328003:1 gene:ENSRNOG00000023888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43322023:43328003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001044226 // RefSeq // Rattus norvegicus RBPJ interacting and tubulin associated 1 (Rita1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43344177:43346986:1 gene:ENSRNOG00000037720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC112384 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110008J03, mRNA (cDNA clone MGC:124697 IMAGE:7932995), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_139332 // RefSeq // Rattus norvegicus two pore segment channel 1 (Tpcn1), mRNA. // chr12 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000001866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43398893:43421373:1 gene:ENSRNOG00000001380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AB018253 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for voltage-gated ca channel, complete cds. // chr12 // 88 // 100 // 37 // 42 // 0 /// BC062072 // GenBank // Rattus norvegicus two pore segment channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:72293 IMAGE:5599545), complete cds. // chr12 // 86 // 100 // 36 // 42 // 0 /// GENSCAN00000049318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43399843:43419345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0
NM_139255 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase B domain containing 2 (Plbd2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000001872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43452899:43472080:1 gene:ENSRNOG00000001385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// AY095481 // GenBank // Rattus norvegicus RDCR-0918-3 protein mRNA, complete cds. // chr12 // 86 // 61 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43463065:43471659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT015084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT015085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1
NM_001108336 // RefSeq // Rattus norvegicus serine dehydratase-like (Sdsl), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine dehydratase-like (Sdsl), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001882 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:43487966:43497281:1 gene:ENSRNOG00000001391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43488954:43497154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT015087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107144 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein, transmembrane 2 (Rnft2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:45773943:45839516:1 gene:ENSRNOG00000001124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:45776856:45868266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT015104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001107145 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 8 (Fbxw8), mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:45933952:45966317:1 gene:ENSRNOG00000001126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:45877882:45919249:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:45930952:45957732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT015105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT015106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001107146 // RefSeq // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 5 (Rfc5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46752012:46761552:1 gene:ENSRNOG00000001134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168902 // GenBank // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 5, mRNA (cDNA clone MGC:189178 IMAGE:7388155), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:46732385:46761070:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_017236 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylethanolamine binding protein 1 (Pebp1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46846901:46851098:1 gene:ENSRNOG00000001136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC063171 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylethanolamine binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72882 IMAGE:6888051), complete cds. // chr12 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:46846954:46850681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT015114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_006221377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae) (Suds3), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae) (Suds3), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001504 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:47018975:47039740:1 gene:ENSRNOG00000001139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075646 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:47018975:47040897:1 gene:ENSRNOG00000001139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC086340 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7301952, with apparent retained intron. // chr12 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:47018975:47041965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT015118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT015119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT015120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
GENSCAN00000020013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:47055906:47185535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
XR_085996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/arginine repetitive matrix 4 (Srrm4), misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001507 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:47542290:47695044:1 gene:ENSRNOG00000001141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:47516474:47695044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT015124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_053612 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein B8 (Hspb8), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000039275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:47717762:47731882:1 gene:ENSRNOG00000022392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AF314540 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 22 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0 /// BC061748 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:72354 IMAGE:5599613), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:47718122:47731060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT015127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001034945 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 60 (Ccdc60), mRNA. // chr12 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000046882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:47854185:48016620:1 gene:ENSRNOG00000032684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// BC103639 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 60, mRNA (cDNA clone MGC:124983 IMAGE:7133734), complete cds. // chr12 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:47957064:48016441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1
NM_031976 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, beta 1 non-catalytic subunit (Prkab1), mRNA. // chr12 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48117572:48127947:1 gene:ENSRNOG00000001142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC062008 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, beta 1 non-catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:72378 IMAGE:5599996), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U42411 // GenBank // Rattus norvegicus 5-AMP-activated protein kinase, beta subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// X95577 // GenBank // R.norvegicus mRNA for beta subunit of AMP-activated protein kinase. // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48114473:48126911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT015138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT015133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT015134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT015137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001191667 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 64 (Ccdc64), mRNA. // chr12 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001515 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48413869:48501896:1 gene:ENSRNOG00000001145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48458581:48500612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48345720:48445406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT015141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NONRATT015143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0
NM_001107147 // RefSeq // Rattus norvegicus sirtuin 4 (Sirt4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48665591:48673711:1 gene:ENSRNOG00000001151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167005 // GenBank // Rattus norvegicus sirtuin (silent mating type information regulation 2 homolog) 4 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189175 IMAGE:7099421), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48614854:48670591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000074227 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:48711632:48712095:1 gene:ENSRNOG00000046927 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 55 // 88 // 12 // 22 // 0
NM_012814 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase, subunit VIa, polypeptide 1 (Cox6a1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000001545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48817758:48820811:1 gene:ENSRNOG00000001170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ221968 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YI07 mRNA sequence. // chr12 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48817780:48820620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 70 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT015149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001108339 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, subunit C (Gatc), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48824911:48832872:1 gene:ENSRNOG00000001161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070868 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:48783661:48788995:1 gene:ENSRNOG00000045621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XM_003751199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial-like (LOC100909836), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006249489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial-like (LOC100909836), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48824911:48831382:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT015150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48783670:48806673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053319 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein light chain LC8-type 1 (Dynll1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000014910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48867516:48869888:1 gene:ENSRNOG00000011222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC063183 // GenBank // Rattus norvegicus dynein light chain LC8-type 1, mRNA (cDNA clone MGC:72986 IMAGE:6887897), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// U66461 // GenBank // Rattus norvegicus protein inhibitor of neuronal nitric oxide synthase (PIN) mRNA, complete cds. // chr12 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48867791:48869615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT015152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT015153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001011904 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 10 (Rnf10), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000064910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48897002:48930784:1 gene:ENSRNOG00000001172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC083831 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:94926 IMAGE:7112480), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000019052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48901507:48930576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT015154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT015155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT015157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_001033675 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding protein 1 (Cabp1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NM_001033676 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding protein 1 (Cabp1), transcript variant 3, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NM_133529 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding protein 1 (Cabp1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48980781:49004881:1 gene:ENSRNOG00000001173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48989189:49004881:1 gene:ENSRNOG00000001173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000039281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48989189:49004881:1 gene:ENSRNOG00000001173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// GENSCAN00000049849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48994247:49003094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 68 // 68 // 23 // 34 // 1 /// NONRATT015163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001013983 // RefSeq // Rattus norvegicus malectin (Mlec), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49014186:49024661:1 gene:ENSRNOG00000021725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49014320:49023917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT015164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001105934 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-119 homolog B (C. elegans) (Unc119b), mRNA. // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49034761:49047383:1 gene:ENSRNOG00000001175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49034826:49046747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT015165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_022512 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA dehydrogenase, C-2 to C-3 short chain (Acads), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49049580:49059163:1 gene:ENSRNOG00000001177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC072545 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-Coenzyme A dehydrogenase, C-2 to C-3 short chain, mRNA (cDNA clone MGC:91690 IMAGE:7105799), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// J05030 // GenBank // Rat short chain acyl-coenzyme A dehydrogenase (SCAD) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49049625:49058686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_012669 // RefSeq // Rattus norvegicus HNF1 homeobox A (Hnf1a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49201979:49226746:1 gene:ENSRNOG00000001183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// J03170 // GenBank // Rat liver specific transcription factor (LF-B1) gene, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X53297 // GenBank // R.norvegicus HNF-1, a transcriptional factor involved in expression of genes in the liver. // chr12 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49202129:49225245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001080358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560398 (RGD1560398), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// XM_579793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560398 (RGD1560398), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0 /// XR_339609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560398 (RGD1560398), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// XR_358763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560398 (RGD1560398), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0 /// XR_339608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560398 (RGD1560398), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// XR_358762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560398 (RGD1560398), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// GENSCAN00000049862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49305314:49316175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// BC089955 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7312659. // chr12 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// NONRATT015170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001005553 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase interacting ArfGAP 2 (Git2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000045946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49383689:49424283:1 gene:ENSRNOG00000001190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC081967 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase interacting ArfGAP 2, mRNA (cDNA clone MGC:94099 IMAGE:7125406), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// FQ235304 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YL09 mRNA sequence. // chr12 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// GENSCAN00000049852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49383779:49423669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT015178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 58 // 58 // 25 // 43 // 1 /// NONRATT015180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 60 // 60 // 26 // 43 // 1 /// NONRATT015173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 19 // 43 // 1 /// NONRATT015179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 49 // 49 // 21 // 43 // 1 /// NONRATT015181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// NONRATT015182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001134413 // RefSeq // Rattus norvegicus glycolipid transfer protein (Gltp), mRNA. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000001581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49460373:49480640:1 gene:ENSRNOG00000001192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC158884 // GenBank // Rattus norvegicus glycolipid transfer protein, mRNA (cDNA clone MGC:188604 IMAGE:7938728), complete cds. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49458159:49479685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_023970 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily V, member 4 (Trpv4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49492070:49529956:1 gene:ENSRNOG00000001195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF263521 // GenBank // Rattus norvegicus vanilloid receptor-related osmotically activated channel (Vroac) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49493417:49529454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001105935 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box N4 (Foxn4), mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49887751:49907292:1 gene:ENSRNOG00000000691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49873289:49905952:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001126273 // RefSeq // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 2 (E. coli) (Alkbh2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 2 (E. coli) (Alkbh2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50039937:50044571:1 gene:ENSRNOG00000028584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166547 // GenBank // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:188151 IMAGE:7304677), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50040407:50044551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134404 // RefSeq // Rattus norvegicus SV2 related protein (Svop), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000874 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:50074360:50132727:1 gene:ENSRNOG00000000693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF060173 // GenBank // Rattus norvegicus SV2 related protein (SVOP) mRNA, complete cds. // chr12 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50097418:50132253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
XM_006221384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus slingshot protein phosphatase 1 (Ssh1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006249511 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus slingshot protein phosphatase 1 (Ssh1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006249512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus slingshot protein phosphatase 1 (Ssh1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50192169:50229287:1 gene:ENSRNOG00000000695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50192169:50229287:1 gene:ENSRNOG00000000695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50165343:50270455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001109327 // RefSeq // Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 1C (Coro1c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 1C (Coro1c), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50264710:50337012:1 gene:ENSRNOG00000000697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166764 // GenBank // Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 1C, mRNA (cDNA clone MGC:188526 IMAGE:7932115), complete cds. // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50284932:50335142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
ENSRNOT00000000888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50359789:50361080:1 gene:ENSRNOG00000000699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001013230 // RefSeq // Rattus norvegicus selectin P ligand (Selplg), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000023567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50341910:50361080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001107155 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 119 (Tmem119), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50380531:50387588:1 gene:ENSRNOG00000000700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166820 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 119, mRNA (cDNA clone MGC:188696 IMAGE:8367783), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50385555:50386406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107156 // RefSeq // Rattus norvegicus squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 (Sart3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006249502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 (Sart3), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50410338:50438125:1 gene:ENSRNOG00000000702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50410352:50439675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_022218 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249508 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chemokine-like receptor 1 (Cmklr1), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50577124:50581377:1 gene:ENSRNOG00000000704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50495990:50580056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001105937 // RefSeq // Rattus norvegicus small G protein signaling modulator 1 (Sgsm1), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:51103675:51169362:1 gene:ENSRNOG00000000708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:51078798:51176428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT015213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108340 // RefSeq // Rattus norvegicus HscB mitochondrial iron-sulfur cluster co-chaperone (Hscb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53616659:53626996:1 gene:ENSRNOG00000037508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53616687:53626946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108341 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-51 like autophagy activating kinase 1 (Ulk1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53646799:53673053:1 gene:ENSRNOG00000037505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53643902:53671359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001025563 // RefSeq // Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 1 (Pus1), mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 1 (Pus1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53675526:53684279:1 gene:ENSRNOG00000037500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC161821 // GenBank // Rattus norvegicus pseudouridylate synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:187275 IMAGE:9027947), complete cds. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53675782:53684023:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT015243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT015244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001107149 // RefSeq // Rattus norvegicus E1A binding protein p400 (Ep400), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000056735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53687001:53793498:1 gene:ENSRNOG00000037483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000010894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53687014:53724316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 15 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000010903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53729860:53792137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT015246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 54 // 54 // 0
NM_001014129 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar complex associated 4 homolog (S. cerevisiae) (Noc4l), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000056725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53810417:53814955:1 gene:ENSRNOG00000037478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC088275 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar complex associated 4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109121 IMAGE:7380687), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000010883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53810447:53814793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT015254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT015255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT015256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENSRNOT00000050252 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:54025375:54112849:1 gene:ENSRNOG00000030721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000065893 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:54094684:54112849:1 gene:ENSRNOG00000030721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000071857 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:54094684:54112849:1 gene:ENSRNOG00000030721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// XM_222254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrosin-like 1 (Fbrsl1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000028140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54025375:54116449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT015261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT015262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_031587 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal membrane protein 2 (Pxmp2), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54187729:54198030:1 gene:ENSRNOG00000037446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY327502 // GenBank HTC // Rattus norvegicus liver regeneration-related protein LRRG01 mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54187736:54197794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001025272 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglycerate mutase family member 5 (Pgam5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54202825:54210153:1 gene:ENSRNOG00000037443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC092607 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglycerate mutase family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:109239 IMAGE:7309810), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54202858:54209061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT015272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001135840 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP binding protein 6 (putative) (Gtpbp6), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000056632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54406908:54410777:1 gene:ENSRNOG00000037426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000063905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54373862:54377736:1 gene:ENSRNOG00000048168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ214891 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YJ19 mRNA sequence. // chr12 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54373897:54377736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54406908:54410747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006221429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 791-like (LOC100912845), partial mRNA. // chrU // 73 // 100 // 22 // 30 // 0 /// XM_006249604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 99-like (LOC102556459), partial mRNA. // chrU // 73 // 100 // 22 // 30 // 0 /// XM_006249595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 791-like (LOC100912845), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// XR_358808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 791-like (LOC100912845), transcript variant X2, misc_RNA. // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// XR_358810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 791-like (LOC100912845), transcript variant X4, misc_RNA. // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006249604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 99-like (LOC102556459), partial mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006221429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 791-like (LOC100912845), partial mRNA. // chr12 // 27 // 100 // 8 // 30 // 0
GENSCAN00000039065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:466286:466600:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 65 // 62 // 17 // 26 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// GENSCAN00000046874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:53340153:53577842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// GENSCAN00000029871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:52100696:52104814:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
GENSCAN00000039065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:466286:466600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 100 // 20 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:53340153:53577842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 94 // 14 // 30 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 26 // 97 // 8 // 31 // 0
NM_001142758 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 958 (Zfp958), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000050885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:7595233:7600265:-1 gene:ENSRNOG00000030410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// DQ490055 // GenBank // Rattus norvegicus Arg3.1/Arc mRNA-binding zinc finger protein (Zinki) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006221242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102548303), mRNA. // chr12 // 71 // 68 // 15 // 21 // 0 /// XR_358475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102548389), misc_RNA. // chr12 // 74 // 100 // 23 // 31 // 0 /// NONRATT015339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000035992 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:6863267:6867447:1 gene:ENSRNOG00000000891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// NONRATT014433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 73 // 97 // 22 // 30 // 0 /// NONRATT015340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NONRATT014432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000001186 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:6758233:6758976:1 gene:ENSRNOG00000000887 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
GENSCAN00000017254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6329901:6436440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT014428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001099479 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 58 (Vom2r58), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000041532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:7176562:7316372:1 gene:ENSRNOG00000048482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000061907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:7176562:7316372:1 gene:ENSRNOG00000048482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:7212040:7316372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT014437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
GENSCAN00000039173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:7011443:7053529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 47 // 8 // 8 // 0
NM_001100538 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 4 (Pabpc4), mRNA. // chr12 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000056592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144769098:144784395:1 gene:ENSRNOG00000015642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// BC166452 // GenBank // Rattus norvegicus poly A binding protein, cytoplasmic 4, mRNA (cDNA clone MGC:187687 IMAGE:8372968), complete cds. // chr12 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// GENSCAN00000017259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6052933:6055456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000067752 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:6052650:6055814:-1 gene:ENSRNOG00000028592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// GENSCAN00000048656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144769466:144783593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001107117 // RefSeq // Rattus norvegicus ceramide synthase 4 (Cers4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceramide synthase 4 (Cers4), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceramide synthase 4 (Cers4), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:6568235:6602867:-1 gene:ENSRNOG00000001072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6564070:6578621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001037203 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 25 (Ccl25), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4583199:4592154:-1 gene:ENSRNOG00000028531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC107945 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 25, mRNA (cDNA clone MGC:125074 IMAGE:7388091), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4497218:4595067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT015305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001013121 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 2 (Snapc2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4690243:4693261:-1 gene:ENSRNOG00000001056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079077 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:94033 IMAGE:7122319), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ214278 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YK16 mRNA sequence. // chr12 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4691083:4707936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT015309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT015308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001025425 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 7 (Map2k7), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4700990:4707936:-1 gene:ENSRNOG00000001047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// AY879265 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase 7 (Map2k7) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GU264001 // GenBank // Rattus norvegicus strain NEDH MKK7gamma1 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4691083:4707936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT015315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001034139 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member E (Lrrc8e), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000035142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4710047:4721276:-1 gene:ENSRNOG00000028460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC105779 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member E, mRNA (cDNA clone MGC:124693 IMAGE:7932319), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4710584:4728184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT015317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006248796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ecotropic viral integration site 5-like (Evi5l), mRNA. // chr12 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000034124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4753939:4763811:-1 gene:ENSRNOG00000045588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// GENSCAN00000035194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4742208:4763796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// FQ211110 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA17YG18 mRNA sequence. // chr12 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT015320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4740789:4756602:-1 gene:ENSRNOG00000001034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT015321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
ENSRNOT00000017679 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:4787319:4787684:-1 gene:ENSRNOG00000013193 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4787319:4814511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
XM_001068161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD209f antigen (Cd209f), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// XM_002724770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD209f antigen (Cd209f), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000064859 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:4811689:4814469:-1 gene:ENSRNOG00000042317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000033542 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:4899971:4900751:-1 gene:ENSRNOG00000028397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
XM_003752548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD209 antigen-like protein A-like (LOC100912723), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000032214 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:5642468:5643077:-1 gene:ENSRNOG00000028352 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
GENSCAN00000031405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:5628666:5630285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0
NM_001108850 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 5 (Trappc5), mRNA. // chr12 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// XM_006248770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 5 (Trappc5), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4390645:4394259:1 gene:ENSRNOG00000001003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC158788 // GenBank // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 5, mRNA (cDNA clone MGC:188153 IMAGE:7305395), complete cds. // chr12 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// FQ233193 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YN04 mRNA sequence. // chr12 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT014411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4364248:4393697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001134602 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell-expressed membrane protein 1 (Mcemp1), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein LOC199675 (RGD1565374), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4375803:4379100:1 gene:ENSRNOG00000028259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4364248:4393697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_144741 // RefSeq // Rattus norvegicus resistin (Retn), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4364007:4365746:1 gene:ENSRNOG00000001001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF378366 // GenBank // Rattus norvegicus resistin mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AJ555618 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for resistin (retn gene). // chr12 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4364248:4393697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT014406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_031126 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin binding protein 2 (Stxbp2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006248784 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin binding protein 2 (Stxbp2), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 94 // 89 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4342248:4353273:1 gene:ENSRNOG00000000994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC097310 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455067. // chr12 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// U20283 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin binding protein Munc18-2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000038117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4342254:4352946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT014402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// NONRATT014400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT014401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT014404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_001195245 // RefSeq // Rattus norvegicus PET100 homolog (S. cerevisiae) (Pet100), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000071928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4332962:4335583:1 gene:ENSRNOG00000050169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NM_001144840 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin regulated spectrin-associated protein family, member 3 (Camsap3), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000001305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4296404:4319735:1 gene:ENSRNOG00000000986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000038150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4296517:4319517:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT014393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1 /// NONRATT014394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
XM_006221227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patatin-like phospholipase domain containing 6 (Pnpla6), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// XM_341025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patatin-like phospholipase domain containing 6 (Pnpla6), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4232147:4260092:1 gene:ENSRNOG00000000977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000072952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4232553:4260092:1 gene:ENSRNOG00000000977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4216995:4277259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT014386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001105903 // RefSeq // Rattus norvegicus mucolipin 1 (Mcoln1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006248754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucolipin 1 (Mcoln1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4216868:4230870:1 gene:ENSRNOG00000000975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4216995:4277259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT014383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT014384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001108328 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 358 (Zfp358), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4209518:4213611:1 gene:ENSRNOG00000000974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4209518:4213539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT014381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001109059 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to FLJ35784 protein (RGD1563425), mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4185567:4196186:1 gene:ENSRNOG00000000973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4185567:4196161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107115 // RefSeq // Rattus norvegicus rho/rac guanine nucleotide exchange factor (GEF) 18 (Arhgef18), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000066281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:4056174:4161173:1 gene:ENSRNOG00000028090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000038144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:4133052:4159373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT014374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT014376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0
NM_001009629 // RefSeq // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 3 (Rfc3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:1439597:1450351:1 gene:ENSRNOG00000001088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088281 // GenBank // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 3, mRNA (cDNA clone MGC:109141 IMAGE:7383278), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:1439660:1450252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031336 // RefSeq // Rattus norvegicus Klotho (Kl), mRNA. // chr12 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:929158:972144:1 gene:ENSRNOG00000001092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// AB017820 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Klotho, complete cds. // chr12 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:962089:971677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT014369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001101805 // RefSeq // Rattus norvegicus PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog B (S. cerevisiae) (Pds5b), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_001102383 // RefSeq // Rattus norvegicus PDS5, regulator of cohesion maintenance, homolog B (S. cerevisiae) (Pds5b), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000001464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:687516:777801:1 gene:ENSRNOG00000001098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000040830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:687516:777801:1 gene:ENSRNOG00000001098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000050733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:687516:777801:1 gene:ENSRNOG00000001098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000064951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:687516:777801:1 gene:ENSRNOG00000001098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000074682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:687516:777801:1 gene:ENSRNOG00000001098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000008012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:687525:774981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT014365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_031542 // RefSeq // Rattus norvegicus breast cancer 2, early onset (Brca2), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:491025:531772:1 gene:ENSRNOG00000001111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U89653 // GenBank // Rattus norvegicus breast cancer susceptibility (BRCA2) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:500704:531632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT014359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 58 // 76 // 11 // 19 // 0
GENSCAN00000039065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:466286:466600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 67 // 84 // 24 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:53340153:53577842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 39 // 84 // 14 // 36 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 93 // 15 // 40 // 0
NM_001142758 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 958 (Zfp958), mRNA. // chrU // 82 // 100 // 32 // 39 // 0 /// XR_358475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102548389), misc_RNA. // chrU // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// DQ490055 // GenBank // Rattus norvegicus Arg3.1/Arc mRNA-binding zinc finger protein (Zinki) mRNA, complete cds. // chrU // 82 // 100 // 32 // 39 // 0 /// XM_006221242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102548303), mRNA. // chrU // 71 // 54 // 15 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000050885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:7595233:7600265:-1 gene:ENSRNOG00000030410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 74 // 69 // 20 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035992 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:6863267:6867447:1 gene:ENSRNOG00000000891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT014433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT015339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 82 // 100 // 32 // 39 // 0 /// NONRATT015340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
NM_001170398 // RefSeq // Rattus norvegicus furry homolog (Drosophila) (Fry), mRNA. // chr12 // 95 // 87 // 58 // 61 // 0 /// ENSRNOT00000041365 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:7565891:7876576:-1 gene:ENSRNOG00000000894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 59 // 59 // 0 /// EU563850 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344 furry-like protein (Fry) mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 87 // 58 // 61 // 0 /// EU563851 // GenBank // Rattus norvegicus strain Copenhagen furry-like protein (Fry) mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 87 // 59 // 61 // 0 /// GENSCAN00000009455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:7709909:7924959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 56 // 56 // 0
NM_001012475 // RefSeq // Rattus norvegicus relaxin/insulin-like family peptide receptor 2 (Rxfp2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006248807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus relaxin/insulin-like family peptide receptor 2 (Rxfp2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:8119972:8181214:-1 gene:ENSRNOG00000000897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY906861 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeat-containing G protein-coupled receptor 8 (Lgr8) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8081623:8312617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
XM_006221285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta 1,3-galactosyltransferase-like (B3galtl), mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_006248809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta 1,3-galactosyltransferase-like (B3galtl), mRNA. // chr12 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001199 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:8503727:8573900:1 gene:ENSRNOG00000000899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8515995:8575686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
XM_006221286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD40 repeat domain 95 (Wdr95), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// XM_006248808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD40 repeat domain 95 (Wdr95), mRNA. // chr12 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001203 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:8384646:8404614:1 gene:ENSRNOG00000000904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 51 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000061252 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:8367747:8417809:1 gene:ENSRNOG00000000904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8367645:8421766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0
NM_001134603 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 26 (Tex26), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 26 (Tex26), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000061246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:8769516:8800588:-1 gene:ENSRNOG00000000905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8773609:8800579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001059692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mesenteric estrogen-dependent adipogenesis (Medag), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001205 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:8809780:8827873:-1 gene:ENSRNOG00000000906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_003752551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mesenteric estrogen-dependent adipogenesis (Medag), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT015363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8809229:8835911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT015362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_017260 // RefSeq // Rattus norvegicus arachidonate 5-lipoxygenase activating protein (Alox5ap), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:8950728:8974708:-1 gene:ENSRNOG00000000907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086593 // GenBank // Rattus norvegicus arachidonate 5-lipoxygenase activating protein, mRNA (cDNA clone MGC:105473 IMAGE:7310271), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8951130:8974660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000000625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:8980067:8989709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 64 // 9 // 16 // 0
NM_001198555 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase like 1 (Uspl1), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase like 1 (Uspl1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:9026185:9052902:-1 gene:ENSRNOG00000000909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001105906 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase like 1 (Uspl1), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000001210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:9026185:9052902:-1 gene:ENSRNOG00000000909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:9026374:9107064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT015373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000038446 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:10046445:10046923:-1 gene:ENSRNOG00000039873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
XM_006248826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule associated tumor suppressor candidate 2 (Mtus2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006248827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule associated tumor suppressor candidate 2 (Mtus2), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:10197626:10240087:-1 gene:ENSRNOG00000032410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// BC127538 // GenBank // Rattus norvegicus similar to mKIAA0774 protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7190596), complete cds. // chr12 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:10191022:10228646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 52 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT015374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT015375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001100942 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome maturation protein (Pomp), mRNA. // chr12 // 82 // 92 // 9 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000071796 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:11094518:11107003:1 gene:ENSRNOG00000049229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:10863653:10876138:-1 gene:ENSRNOG00000048470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// BC161800 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome maturation protein, mRNA (cDNA clone MGC:187198 IMAGE:9026464), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// EF535528 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated potassium channel beta subunit 4.1 mRNA, complete cds. // chr12 // 82 // 92 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000023515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:10865528:10876120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000053018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11056734:11107002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
XM_006221251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PAN3 polyA specific ribonuclease subunit homolog (S. cerevisiae) (Pan3), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001250 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:11316059:11356268:-1 gene:ENSRNOG00000000942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044134 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:11328849:11449762:-1 gene:ENSRNOG00000000942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071838 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:11375710:11449762:-1 gene:ENSRNOG00000000942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000053020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11327098:11478743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 58 // 58 // 23 // 40 // 1 /// NONRATT015385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT015382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// NONRATT015384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
BC091375 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7320309. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000001255 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:11470821:11471333:-1 gene:ENSRNOG00000000947 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 61 // 96 // 14 // 23 // 0
NM_001108329 // RefSeq // Rattus norvegicus ligand of numb-protein X 2 (Lnx2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000001263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:11840785:11904808:1 gene:ENSRNOG00000000955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000023688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:11876431:11904665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT014472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000054286 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:12:11764548:11764667:1 gene:ENSRNOG00000036163 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001002829 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS-like family 11 member A (Rasl11a), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006248834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS-like family 11 member A (Rasl11a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:12093851:12098070:-1 gene:ENSRNOG00000000956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// FQ231324 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YO18 mRNA sequence. // chr12 // 86 // 71 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:12094023:12145518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT015396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_145782 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 18 (Cyp3a18), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:12738271:12787786:1 gene:ENSRNOG00000000969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D38381 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for P450 6beta-2, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:12701495:12787352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT014486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107118 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein (C3H2C3 type) 6 (Rnf6), mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:12679023:12685173:1 gene:ENSRNOG00000000968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000021487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:12678649:12684185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT014482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_153312 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 2 (Cyp3a2), mRNA. // chr12 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// BC089765 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:108545 IMAGE:7372112), complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// M13646 // GenBank // Rat pregnenolone 16-alpha-carbonitrile-inducible cytochrome P450, complete cds. // chr12 // 95 // 92 // 21 // 22 // 0 /// U09742 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley testosterone 6-beta-hydroxylase, cytochrome P450/6-beta-A, (CYP3A2) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001291 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:13727979:13740677:-1 gene:ENSRNOG00000000978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000043375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13720361:13740677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT015439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_013105 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 23/polypeptide 1 (Cyp3a23/3a1), mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13766523:13796024:-1 gene:ENSRNOG00000032560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13144058:13174606:-1 gene:ENSRNOG00000047745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC088163 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 23/polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:108757 IMAGE:7370410), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// D13912 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytochrome P-450, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// D29967 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytochrome P450 3A, complete cds. // chr12 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// FQ211106 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA17YI01 mRNA sequence. // chr12 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// FQ218135 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YM24 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// L24207 // GenBank // Rattus norvegicus testosterone 6-beta-hydroxylase (CYP3A1) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// M10161 // GenBank // Rat cytochrome P-450PCN (PNCN inducible) mRNA, complete cds. // chr12 // 65 // 100 // 15 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13102982:13166670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000043377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13766982:13787865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 65 // 14 // 15 // 0
NM_001012351 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 4 (Cpsf4), mRNA. // chr12 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038958 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:14246609:14248395:1 gene:ENSRNOG00000025217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13269002:13284752:-1 gene:ENSRNOG00000000985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// BC089824 // GenBank // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:108785 IMAGE:7309116), complete cds. // chr12 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// Y17326 // GenBank // Rattus norvegicus CDK106 mRNA. // chr12 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// GENSCAN00000021378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14246681:14247553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13269803:13284672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT015416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT015417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT015418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000029618 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:17496972:17498409:1 gene:ENSRNOG00000027744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 38 // 68 // 10 // 26 // 0
NONRATT015415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_053556 // RefSeq // Rattus norvegicus BUD31 homolog (S. cerevisiae) (Bud31), mRNA. // chr12 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// XM_006248888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BUD31 homolog (S. cerevisiae) (Bud31), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BUD31 homolog (S. cerevisiae) (Bud31), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13302069:13309503:-1 gene:ENSRNOG00000000989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF058791 // GenBank // Rattus norvegicus G10 protein homolog (edg2) mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// BC058456 // GenBank // Rattus norvegicus BUD31 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:72742 IMAGE:6887068), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211534 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA89YH04 mRNA sequence. // chr12 // 59 // 63 // 10 // 17 // 0 /// GENSCAN00000029377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13302258:13307290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT015419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_019289 // RefSeq // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 1B (Arpc1b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000001315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13321403:13334951:-1 gene:ENSRNOG00000000991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF083269 // GenBank // Rattus norvegicus p41-Arc mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC062027 // GenBank // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 1B, mRNA (cDNA clone MGC:72489 IMAGE:5622004), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13321693:13358232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT015425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_031146 // RefSeq // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 1A (Arpc1a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000001319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13346433:13363473:-1 gene:ENSRNOG00000000996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000066198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13349592:13363473:-1 gene:ENSRNOG00000000996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF315378 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of profilin/p41 of actin-related complex 2/3 mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC059131 // GenBank // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 1A, mRNA (cDNA clone MGC:72782 IMAGE:6921520), complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13321693:13358232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT015429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001105907 // RefSeq // Rattus norvegicus transformation/transcription domain-associated protein (Trrap), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13602590:13692085:-1 gene:ENSRNOG00000025244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105907 // RefSeq // Rattus norvegicus transformation/transcription domain-associated protein (Trrap), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 73 // 73 // 0 /// ENSRNOT00000030545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:13602590:13692085:-1 gene:ENSRNOG00000025244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 74 // 74 // 0 /// GENSCAN00000043353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13603405:13688981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 72 // 72 // 0
NM_001034199 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal pentraxin II (Nptx2), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14073308:14084217:-1 gene:ENSRNOG00000001006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:13998634:14142572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT015444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001009604 // RefSeq // Rattus norvegicus brain protein I3 (Bri3), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14374635:14383317:-1 gene:ENSRNOG00000001009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC087646 // GenBank // Rattus norvegicus brain protein I3, mRNA (cDNA clone MGC:105711 IMAGE:7311234), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14374899:14401617:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT015449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_012863 // RefSeq // Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member a15 (Bhlha15), mRNA. // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14455040:14459216:-1 gene:ENSRNOG00000025164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061868 // GenBank // Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member a15, mRNA (cDNA clone MGC:72528 IMAGE:5598799), complete cds. // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// U58279 // GenBank // Rattus norvegicus Mist1 bHLH protein mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT015450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14457845:14482863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001137641 // RefSeq // Rattus norvegicus lemur tyrosine kinase 2 (Lmtk2), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14461531:14592856:-1 gene:ENSRNOG00000025155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14457845:14482863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000021090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14489525:14573598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001013867 // RefSeq // Rattus norvegicus radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas) (Rsph10b), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000034483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14709091:14756095:-1 gene:ENSRNOG00000001036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// FQ212099 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA69YG21 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14709177:14751806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0
NM_001105908 // RefSeq // Rattus norvegicus postmeiotic segregation increased 2 (S. cerevisiae) (Pms2), mRNA. // chr12 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14757747:14781994:-1 gene:ENSRNOG00000001040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC160858 // GenBank // Rattus norvegicus PMS2 postmeiotic segregation increased 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187611 IMAGE:8365723), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14758021:14780394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_013223 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1 (Eif2ak1), mRNA. // chr12 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14792378:14825317:-1 gene:ENSRNOG00000001050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC081838 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93597 IMAGE:7132671), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// L27707 // GenBank // Rat eukaryotic hemin-sensitive initiation factor 2a kinase (eIF-2a) mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14805033:14825272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
ENSRNOT00000026942 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:14858780:14859640:-1 gene:ENSRNOG00000019888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 82 // 81 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000021105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14858887:14859357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
NM_053912 // RefSeq // Rattus norvegicus cytohesin 3 (Cyth3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:14921915:14953446:-1 gene:ENSRNOG00000001065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC101884 // GenBank // Rattus norvegicus cytohesin 3, mRNA (cDNA clone MGC:124579 IMAGE:7929513), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U83897 // GenBank // Rattus norvegicus sec7C mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:14922227:14958338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001017485 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 220, member A (Fam220a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15088874:15089653:-1 gene:ENSRNOG00000024605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// BC076392 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810453I06, mRNA (cDNA clone MGC:94793 IMAGE:7107018), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15081851:15089653:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT015473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013122 // RefSeq // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 2 (Kdelr2), mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000001438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15232539:15250771:-1 gene:ENSRNOG00000001083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC085786 // GenBank // Rattus norvegicus KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) endoplasmic reticulum protein retention receptor 2, mRNA (cDNA clone MGC:93761 IMAGE:7108608), complete cds. // chr12 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000014259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15232792:15258772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT015477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT015478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1
NM_001107120 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol lipase, beta (Daglb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15156222:15197954:-1 gene:ENSRNOG00000001079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15156222:15197954:-1 gene:ENSRNOG00000001079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15157152:15197954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001105910 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, delta 2 (Grid2) interacting protein (Grid2ip), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// XM_006248865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, delta 2 (Grid2) interacting protein (Grid2ip), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000044378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15261534:15291234:-1 gene:ENSRNOG00000030927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000014270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15261855:15301160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT015479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0
XM_001072483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 12 (Zfp12), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_221917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 12 (Zfp12), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000038577 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:15413267:15423624:-1 gene:ENSRNOG00000006958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 71 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000038584 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:15413267:15423624:-1 gene:ENSRNOG00000006958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15408875:15462852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_001034153 // RefSeq // Rattus norvegicus speedy/RINGO cell cycle regulator family member E4 (Spdye4), mRNA. // chrU // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// XM_006221290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus speedy protein B-like (LOC102546559), mRNA. // chrU // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006248909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus speedy protein B-like (LOC102546559), mRNA. // chrU // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000066744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15453711:15459125:-1 gene:ENSRNOG00000043425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC105855 // GenBank // Rattus norvegicus similar to speedy B isoform, mRNA (cDNA clone MGC:125213 IMAGE:7453404), complete cds. // chrU // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15408875:15462852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001105911 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 4 (Slc29a4), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15942167:15952584:-1 gene:ENSRNOG00000001115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15943140:15955059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001007615 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2 (Wipi2), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000001476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:15997276:16025704:-1 gene:ENSRNOG00000001114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC079184 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain, phosphoinositide interacting 2, mRNA (cDNA clone MGC:94226 IMAGE:7131054), complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000034268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15997456:16025512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 83 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT015487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001037220 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 5, zeta 1 subunit (Ap5z1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000001469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:16198608:16204550:-1 gene:ENSRNOG00000001107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:16191818:16270042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT015491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT015489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001037219 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box K1 (Foxk1), mRNA. // chr12 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:16212041:16270069:-1 gene:ENSRNOG00000001104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:16191818:16270042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT015496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
ENSRNOT00000032824 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:16394404:16395354:-1 gene:ENSRNOG00000024418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
XM_006221259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sidekick cell adhesion molecule 1 (Sdk1), mRNA. // chr12 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// XM_006248908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sidekick cell adhesion molecule 1 (Sdk1), mRNA. // chr12 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000031149 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:16473809:16728950:-1 gene:ENSRNOG00000001103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 83 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000039241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:16488146:16602563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 53 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:16673265:16752504:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT015499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
XM_006221259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sidekick cell adhesion molecule 1 (Sdk1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein sidekick-1-like (LOC102546902), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:16887313:16938045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sidekick cell adhesion molecule 1 (Sdk1), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006248910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein sidekick-1-like (LOC102546902), mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060520 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:17092501:17116350:-1 gene:ENSRNOG00000039488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:17078694:17141347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000051799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:17359665:17360667:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000030304 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:17359665:17360667:-1 gene:ENSRNOG00000024342 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
GENSCAN00000047728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:17485430:17681116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001047092 // RefSeq // Rattus norvegicus archaelysin family metallopeptidase 1 (Amz1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus archaelysin family metallopeptidase 1 (Amz1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus archaelysin family metallopeptidase 1 (Amz1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus archaelysin family metallopeptidase 1 (Amz1), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:17975719:17994561:-1 gene:ENSRNOG00000024264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC160815 // GenBank // Rattus norvegicus archaelysin family metallopeptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:187245 IMAGE:7365526), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:17976527:17980965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT015509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006221268 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRCA1-associated ATM activator 1 (Brat1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRCA1-associated ATM activator 1 (Brat1), transcript variant X6, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRCA1-associated ATM activator 1 (Brat1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRCA1-associated ATM activator 1 (Brat1), transcript variant X6, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001661 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:18014033:18025424:-1 gene:ENSRNOG00000001236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064726 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:18014395:18025424:-1 gene:ENSRNOG00000001236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18014395:18026880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT015511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_133393 // RefSeq // Rattus norvegicus LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase (Lfng), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18113995:18122013:-1 gene:ENSRNOG00000001250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB054539 // GenBank // Rattus norvegicus Lfng mRNA for lunatic fringe, complete cds. // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC070933 // GenBank // Rattus norvegicus LFNG O-fucosylpeptide 3-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:91508 IMAGE:7097855), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18114635:18121954:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001037775 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 12 (Chst12), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 12 (Chst12), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (chondroitin 4) sulfotransferase 12 (Chst12), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18193614:18194873:-1 gene:ENSRNOG00000001252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC100096 // GenBank // Rattus norvegicus carbohydrate sulfotransferase 12, mRNA (cDNA clone MGC:112823 IMAGE:7375118), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18193614:18194873:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT015516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin-like protein KIF19-like (LOC679924), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248973 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin-like protein KIF19-like (LOC679924), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000060463 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:18247425:18276028:-1 gene:ENSRNOG00000024218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18227416:18303266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001031640 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit B (Eif3b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000060444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18278837:18303294:-1 gene:ENSRNOG00000001253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC098728 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit 9 (eta), mRNA (cDNA clone MGC:112720 IMAGE:7381504), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18227416:18303266:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT015519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_057120 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 1 (Nudt1), mRNA. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006248911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 1 (Nudt1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18384509:18387638:-1 gene:ENSRNOG00000001260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// D49977 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 8-oxo-dGTPase, complete cds. // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18384706:18387624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0
NM_001105913 // RefSeq // Rattus norvegicus extracellular leucine-rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Elfn1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus extracellular leucine-rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Elfn1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus extracellular leucine-rich repeat and fibronectin type III domain containing 1 (Elfn1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18741107:18805200:-1 gene:ENSRNOG00000022767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18742174:18744663:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_145673 // RefSeq // Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog K (Mafk), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006248915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog K (Mafk), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:18914797:18925513:-1 gene:ENSRNOG00000001277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AF461686 // GenBank // Rattus norvegicus strain NEDH MAFK mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// BC070906 // GenBank // Rattus norvegicus v-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog K (avian), mRNA (cDNA clone MGC:91461 IMAGE:7103075), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:18916779:18919210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT015525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_017179 // RefSeq // Rattus norvegicus UNC homeobox (Uncx), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19169972:19174488:-1 gene:ENSRNOG00000001284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D87748 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for paired-type homeodomain transcription factor, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19170263:19173989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133573 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled estrogen receptor 1 (Gper1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19296904:19298031:-1 gene:ENSRNOG00000001287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// U92802 // GenBank // Rattus norvegicus orphan G-protein coupled receptor (GPR41) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19296904:19298031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
XM_006248979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546864 (LOC102546864), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033038 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:19308580:19319788:-1 gene:ENSRNOG00000022426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19308580:19322727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT015529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001109062 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 146 (Gpr146), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006248955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 146 (Gpr146), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19332474:19345579:-1 gene:ENSRNOG00000001288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19326828:19334316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT015531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006248980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily w, polypeptide 1 (Cyp2w1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19370022:19374741:-1 gene:ENSRNOG00000022355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19370022:19374741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001163320 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi to ER traffic protein 4 homolog (S. cerevisiae) (Get4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19455694:19472738:-1 gene:ENSRNOG00000001293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19456685:19472631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT015533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001134857 // RefSeq // Rattus norvegicus HEAT repeat containing 2 (Heatr2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19532497:19570964:-1 gene:ENSRNOG00000021312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC105840 // GenBank // Rattus norvegicus HEAT repeat containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7453430), complete cds. // chr12 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19532703:19604709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT015550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001047924 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00167 (LOC498155), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19816590:19868363:-1 gene:ENSRNOG00000032693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19816590:19911523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003752561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box protein I2-like (LOC680273), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060192 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:19894377:19896110:-1 gene:ENSRNOG00000039296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19816590:19911523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012238 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 20, member C (Fam20c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:19906233:19965797:-1 gene:ENSRNOG00000001314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC161825 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 20, member C, mRNA (cDNA clone MGC:187280 IMAGE:8373563), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19919341:19965274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT015554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000055186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:19816590:19911523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT015556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001107127 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein A430033K04 (RGD1566386), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20094026:20128202:-1 gene:ENSRNOG00000028651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
GENSCAN00000007857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20163228:20163566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT015559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
BC081909 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Leukosialin precursor (Leucocyte sialoglycoprotein) (Sialophorin) (CD43) (W3/13 antigen), mRNA (cDNA clone IMAGE:7111397). // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC098706 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Leukosialin precursor (Leucocyte sialoglycoprotein) (Sialophorin) (CD43) (W3/13 antigen), mRNA (cDNA clone MGC:112692 IMAGE:7114401), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT015560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0
ENSRNOT00000032844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20280052:20291189:-1 gene:ENSRNOG00000028414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC079301 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Leukosialin precursor (Leucocyte sialoglycoprotein) (Sialophorin) (CD43) (W3/13 antigen), mRNA (cDNA clone MGC:94438 IMAGE:7134538), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT015562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000007866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20209598:20281171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_001170404 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 157 (Zfp157), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_358570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 157 (Zfp157), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_358573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 157 (Zfp157), transcript variant X6, misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20449367:20471764:-1 gene:ENSRNOG00000001323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20403876:20461094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_144759 // RefSeq // Rattus norvegicus acetylserotonin O-methyltransferase (Asmt), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20506355:20511204:-1 gene:ENSRNOG00000001324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// EU741665 // GenBank // Rattus norvegicus acetylserotonin O-methyltransferase (Asmt) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20506584:20511184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// L78306 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxyindole-O-methyltransferase mRNA, complete cds. // chr12 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// NONRATT015566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001127246 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 17A (Akap17a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20512073:20516115:-1 gene:ENSRNOG00000028211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166722 // GenBank // Rattus norvegicus similar to DNA segment on chromosome X and Y (unique) 155 expressed sequence isoform 1, mRNA (cDNA clone MGC:188437 IMAGE:7933458), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20512277:20516490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_139260 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 3 receptor, alpha (Il3ra), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006248989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 3 receptor, alpha (Il3ra), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20519721:20525025:-1 gene:ENSRNOG00000001325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// AF030243 // GenBank // Rattus norvegicus cytokine receptor-like protein CYRL mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ214452 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YJ22 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT015570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT015571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20519975:20631488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_053531 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 7 (Vamp7), mRNA. // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20886479:21089729:1 gene:ENSRNOG00000008372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF281632 // GenBank // Rattus norvegicus vesicle-associated membrane protein 7 (Vamp7) mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// FQ228923 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YI09 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20988674:21088820:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001109063 // RefSeq // Rattus norvegicus sprouty homolog 3 (Drosophila) (Spry3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000049851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:20930800:20931768:1 gene:ENSRNOG00000031019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC168971 // GenBank // Rattus norvegicus sprouty homolog 3 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:189298 IMAGE:7316797), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:20930800:20932642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000038108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21130124:21194490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_006249017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gap junction protein, gamma 3 (Gjc3), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_221997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gap junction protein, gamma 3 (Gjc3), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000001797 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:21225451:21226227:-1 gene:ENSRNOG00000001329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21225451:21226224:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000038131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21312690:21313028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT015578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
XM_003751138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 3 (Zfp113), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 3 (Zfp113), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 3 (Zfp113), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006249018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 3 (Zfp113), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001815 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:21336802:21352518:-1 gene:ENSRNOG00000001341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001004203 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 7 (Mcm7), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 7 (Mcm7), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 7 (Mcm7), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21364250:21372100:-1 gene:ENSRNOG00000001349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC078973 // GenBank // Rattus norvegicus minichromosome maintenance deficient 7 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93853 IMAGE:7111847), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// DQ278199 // GenBank // Rattus norvegicus minichromosome maintenance protein 7 transcript variant 1 (Mcm7) mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// DQ278200 // GenBank // Rattus norvegicus minichromosome maintenance protein 7 transcript variant 2 (Mcm7) mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21364363:21370977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_031829 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-25 (Mir25), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053654 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:12:21364970:21365053:-1 gene:ENSRNOG00000035531 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-25 // miRBase Micro RNA Database // MI0000856 Rattus norvegicus miR-25 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031853 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-93 (Mir93), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053608 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:12:21365173:21365259:-1 gene:ENSRNOG00000035485 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-93 // miRBase Micro RNA Database // MI0000880 Rattus norvegicus miR-93 stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031862 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-106b (Mir106b), microRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053663 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:12:21365382:21365463:-1 gene:ENSRNOG00000035540 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-106b // miRBase Micro RNA Database // MI0000889 Rattus norvegicus miR-106b stem-loop // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001044225 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF6 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf6), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC100108 // GenBank // Rattus norvegicus TAF6 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:112914 IMAGE:7379862), complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21378048:21386267:-1 gene:ENSRNOG00000001355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21378048:21383612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT015592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001024969 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ10925 (RGD1305455), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21634746:21639034:-1 gene:ENSRNOG00000039214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ211718 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA82YJ01 mRNA sequence. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21635328:21647270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001109064 // RefSeq // Rattus norvegicus galactose-3-O-sulfotransferase 4 (Gal3st4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus galactose-3-O-sulfotransferase 4 (Gal3st4), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21639959:21648595:-1 gene:ENSRNOG00000001375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21635328:21647270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_138511 // RefSeq // Rattus norvegicus glypican 2 (Gpc2), mRNA. // chr12 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21649636:21655969:-1 gene:ENSRNOG00000001367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// L20468 // GenBank // Rattus norvegicus cerebroglycan mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21650292:21655734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001099508 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 61 (Vom2r61), mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21983773:22047105:-1 gene:ENSRNOG00000050572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 75 // 84 // 12 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000048430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:21983773:22047099:-1 gene:ENSRNOG00000050572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000037646 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:21809298:21817270:-1 gene:ENSRNOG00000046584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21809298:21925851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT015602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000031369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:21983773:21992784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
XM_006221415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zonadhesin (Zan), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24284537:24403421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_017001 // RefSeq // Rattus norvegicus erythropoietin (Epo), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24291481:24294919:1 gene:ENSRNOG00000001412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D10763 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for erythropoietin precursor, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L10608 // GenBank // Rat erythropoietin mRNA, 3 end. // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT014712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24284537:24403421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001105918 // RefSeq // Rattus norvegicus processing of precursor 7, ribonuclease P/MRP subunit (S. cerevisiae) (Pop7), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24276481:24277522:1 gene:ENSRNOG00000025310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24276883:24277305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031037 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2 (Gnb2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24245847:24250864:1 gene:ENSRNOG00000001409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF277892 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein beta-2 subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC065579 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), beta polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:72266 IMAGE:5598923), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U34959 // GenBank // Rat G protein beta 2 subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24231341:24250491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT014705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT014706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// NONRATT014707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001025629 // RefSeq // Rattus norvegicus motile sperm domain containing 3 (Mospd3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus motile sperm domain containing 3 (Mospd3), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24182698:24186561:1 gene:ENSRNOG00000001396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099230 // GenBank // Rattus norvegicus motile sperm domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:116409 IMAGE:7442803), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ226629 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YP14 mRNA sequence. // chr12 // 68 // 100 // 19 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24182923:24186383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT014700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT014702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_019237 // RefSeq // Rattus norvegicus procollagen C-endopeptidase enhancer (Pcolce), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24171335:24177682:1 gene:ENSRNOG00000025001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB008534 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for type 1 procollagen C-proteinase enhancer protein, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF016503 // GenBank // Rattus norvegicus procollagen C-proteinase enhancer protein (PCPE) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC086572 // GenBank // Rattus norvegicus procollagen C-endopeptidase enhancer, mRNA (cDNA clone MGC:105446 IMAGE:7304047), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ209381 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YB13 mRNA sequence. // chr12 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// U94710 // GenBank // Rattus norvegicus type I procollagen C-proteinase enhancer protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24171432:24177625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT014697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001107130 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 24 (Fbxo24), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_006249139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 24 (Fbxo24), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000038397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24159896:24170247:1 gene:ENSRNOG00000024922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24157278:24170002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT014696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_032074 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin receptor substrate 3 (Irs3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000001874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24140329:24142467:1 gene:ENSRNOG00000001389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// BC161840 // GenBank // Rattus norvegicus insulin receptor substrate 3, mRNA (cDNA clone MGC:187353 IMAGE:9027966), complete cds. // chr12 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// U93880 // GenBank // Rattus norvegicus insulin receptor substrate-3 (IRS-3) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000033880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24099483:24142171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT014692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001107131 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with FG repeats 2 (Agfg2), mRNA. // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with FG repeats 2 (Agfg2), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24099333:24135596:1 gene:ENSRNOG00000001404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24099483:24142171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT014689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT014690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001106675 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase domain containing 2 (Echdc2), mRNA. // chr12 // 29 // 88 // 8 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131619158:131638155:1 gene:ENSRNOG00000029333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 29 // 88 // 8 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014681 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:24078317:24078990:1 gene:ENSRNOG00000010937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24062612:24078990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001107132 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 1 (Nyap1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003751152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adapter 1-like (LOC100910838), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006249084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adapter 1-like (LOC100910838), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006249143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal tyrosine-phosphorylated phosphoinositide-3-kinase adaptor 1 (Nyap1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24043357:24054629:1 gene:ENSRNOG00000024641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059602 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:23788474:23794961:1 gene:ENSRNOG00000050511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24045245:24053915:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23788474:23800775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:55297173:55308980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT014688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100678 // RefSeq // Rattus norvegicus methylphosphate capping enzyme (Mepce), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:23998803:24003521:1 gene:ENSRNOG00000001387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:23742705:23746303:1 gene:ENSRNOG00000045911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000033881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23999403:24002992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000038429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23742714:23746303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
XM_003751149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha-like (LOC100910669), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha-like (LOC100910669), mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:23699512:23710386:1 gene:ENSRNOG00000033017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_001061953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha-like (LOC685020), mRNA. // chr12 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000072653 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:23948674:23950049:1 gene:ENSRNOG00000050059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23943777:23967239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23694833:23710287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// FQ234400 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YC01 mRNA sequence. // chr12 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT014682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:23410314:23441601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001271350 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, HIT-type containing 1 (Znhit1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, HIT-type containing 1 (Znhit1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24732249:24744501:1 gene:ENSRNOG00000001418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24739161:24744501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT014719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT014722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001108331 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, sigma 1 subunit (Ap1s1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, sigma 1 subunit (Ap1s1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24677439:24688360:1 gene:ENSRNOG00000001415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC169070 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, sigma 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:189470 IMAGE:5598714), complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// FQ212946 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YJ06 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24514955:24685992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT014716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_012620 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade E (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 1 (Serpine1), mRNA. // chr12 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:24653385:24663763:1 gene:ENSRNOG00000001414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M24067 // GenBank // Rattus norvegicus plasminogen activator inhibitor 1 (PAI-1) mRNA, complete cds. // chr12 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT014713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:24514955:24685992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT014714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006221327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, light chain 10, regulatory (Myl10), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041654 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:25014785:25023421:-1 gene:ENSRNOG00000028981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_003752578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, light chain 10, regulatory (Myl10), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// XM_006249201 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, light chain 10, regulatory (Myl10), mRNA. // chr12 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000020478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25014785:25090995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001105920 // RefSeq // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 4 (E. coli) (Alkbh4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25568554:25574483:-1 gene:ENSRNOG00000001428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166568 // GenBank // Rattus norvegicus alkB, alkylation repair homolog 4 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:188199 IMAGE:7318881), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25569429:25571034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105921 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide J (Polr2j), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25587572:25593124:-1 gene:ENSRNOG00000001430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25587894:25593072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002724809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS p21 protein activator 4 (Rasa4), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_002727953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS p21 protein activator 4 (Rasa4), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000001943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25597617:25624562:-1 gene:ENSRNOG00000001431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000064405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25597617:25624562:-1 gene:ENSRNOG00000001431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000052426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25597617:25624562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT015659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT015658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT015660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1
NM_001109020 // RefSeq // Rattus norvegicus uroplakin 3B-like (Upk3bl), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25655346:25661359:-1 gene:ENSRNOG00000038896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25631254:25661286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006221418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uroplakin 3B (Upk3b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_341056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uroplakin 3B (Upk3b), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000037639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25674993:25680861:-1 gene:ENSRNOG00000023686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25673785:25680861:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT015665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001107157 // RefSeq // Rattus norvegicus deltex 2, E3 ubiquitin ligase (Dtx2), mRNA. // chr12 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000001950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25686614:25726212:-1 gene:ENSRNOG00000001432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// BC166738 // GenBank // Rattus norvegicus deltex 2 homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188465 IMAGE:7937292), complete cds. // chr12 // 94 // 84 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT015666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000052445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25686968:25740809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// NONRATT015668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NONRATT015666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053762 // RefSeq // Rattus norvegicus zona pellucida glycoprotein 3 (sperm receptor) (Zp3), mRNA. // chr12 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000001952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25733871:25740838:-1 gene:ENSRNOG00000001434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC127488 // GenBank // Rattus norvegicus zona pellucida glycoprotein 3 (sperm receptor), mRNA (cDNA clone MGC:156611 IMAGE:7308805), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// D78482 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for zona pellucida 3 glycoprotein, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25686968:25740809:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_031970 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein B1 (Hspb1), mRNA. // chr12 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000031555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25837084:25838661:-1 gene:ENSRNOG00000023546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ222462 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YB19 mRNA sequence. // chr12 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// M86389 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 27 (Hsp27) mRNA, complete cds. // chr12 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// FQ215417 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YF01 mRNA sequence. // chr12 // 70 // 97 // 21 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25837207:25838599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT015671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT015672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_001277394 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine repetitive matrix 3 (Srrm3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25854467:25891680:-1 gene:ENSRNOG00000001439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25854483:25951556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_031151 // RefSeq // Rattus norvegicus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial) (Mdh2), mRNA. // chr12 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25938703:25951658:-1 gene:ENSRNOG00000001440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC063165 // GenBank // Rattus norvegicus malate dehydrogenase 2, NAD (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:72779 IMAGE:6918633), complete cds. // chr12 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// FQ221476 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA35YN03 mRNA sequence. // chr12 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// FQ213887 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YA07 mRNA sequence. // chr12 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25854483:25951556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT015680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_031576 // RefSeq // Rattus norvegicus P450 (cytochrome) oxidoreductase (Por), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000001961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:25995663:26044117:-1 gene:ENSRNOG00000001442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// M10068 // GenBank // Rat NADPH-cytochrome P-450 oxidoreductase mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// M12516 // GenBank // Rat NADPH-cytochrome P-450 reductase mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25996024:26099431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT015683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001191827 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid domain containing 2 (Rhbdd2), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26089458:26099384:-1 gene:ENSRNOG00000001443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:25996024:26099431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001191593 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP2/Sun domain family, member 5 (Nsun5), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26339243:26344203:-1 gene:ENSRNOG00000001450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26338917:26344203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_181080 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 50 (Trim50), mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26345730:26362611:-1 gene:ENSRNOG00000022483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY081950 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif protein 50 (Trim50) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC085684 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 50, mRNA (cDNA clone MGC:93065 IMAGE:7189609), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26346057:26361030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT015694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001191916 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain adjacent to zinc finger domain, 1B (Baz1b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26476185:26534154:-1 gene:ENSRNOG00000001453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26477268:26533867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001109021 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 7B (Bcl7b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26541958:26554167:-1 gene:ENSRNOG00000032705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC160857 // GenBank // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 7B, mRNA (cDNA clone MGC:187610 IMAGE:8365281), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26541958:26554167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001109024 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 30 (Dnajc30), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000043393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26669070:26669729:-1 gene:ENSRNOG00000031721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC166911 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 30, mRNA (cDNA clone MGC:188889 IMAGE:6890506), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ214485 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YG23 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000021110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26669070:26669729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT015704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_053788 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 1A (brain) (Stx1a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26682320:26710272:-1 gene:ENSRNOG00000029165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF217191 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 1A mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26683553:26710383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001271180 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 11 (Abhd11), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26722553:26725258:-1 gene:ENSRNOG00000018910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088239 // GenBank // Rattus norvegicus Williams Beuren syndrome chromosome region 21, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365809). // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26722739:26745305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001109499 // RefSeq // Rattus norvegicus Williams Beuren syndrome chromosome region 27 (Wbscr27), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006221545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosomal region 27 protein-like (RGD1307782), partial mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// XM_006249191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams Beuren syndrome chromosome region 27 (Wbscr27), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Williams-Beuren syndrome chromosomal region 27 protein-like (RGD1307782), partial mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26767621:26776161:-1 gene:ENSRNOG00000046700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000043688 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:58761728:58763042:-1 gene:ENSRNOG00000029425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26766296:26776161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT015714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT015715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:58758318:58783108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_053786 // RefSeq // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 2 (Rfc2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000001989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27130771:27143874:-1 gene:ENSRNOG00000001457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC082110 // GenBank // Rattus norvegicus replication factor C (activator 1) 2, mRNA (cDNA clone MGC:95315 IMAGE:7135071), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27131210:27150265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT015720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
ENSRNOT00000038779 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:27157146:27157842:-1 gene:ENSRNOG00000021728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_001271485 // RefSeq // Rattus norvegicus GTF2I repeat domain containing 2 (Gtf2ird2), mRNA. // chrU // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002030 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:27518168:27553774:-1 gene:ENSRNOG00000001482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27521701:27561842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NONRATT015723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001100561 // RefSeq // Rattus norvegicus GATS protein-like 2 (Gatsl2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:27605972:27646215:-1 gene:ENSRNOG00000001484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:27604306:27646164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
XM_003752582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autism susceptibility candidate 2-like (LOC100362819), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046296 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:29411909:29616480:1 gene:ENSRNOG00000030031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:29406044:29412540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003752582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autism susceptibility candidate 2-like (LOC100362819), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044800 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:29129143:29129451:1 gene:ENSRNOG00000034287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:29129143:29288345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001077201 // RefSeq // Rattus norvegicus calneuron 1 (Caln1), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calneuron 1 (Caln1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:31252691:31680890:-1 gene:ENSRNOG00000000886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// DQ914829 // GenBank // Rattus norvegicus calneuron I short isoform mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// DQ914830 // GenBank // Rattus norvegicus calneuron I long isoform mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:31252691:31277774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT015735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NONRATT015735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006249229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae) (Tyw1), partial mRNA. // chr12 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NM_001107137 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae) (Tyw1), mRNA. // chr12 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000038092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:31761916:31856112:-1 gene:ENSRNOG00000024352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// BC168924 // GenBank // Rattus norvegicus tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189212 IMAGE:9029270), complete cds. // chr12 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// GENSCAN00000038358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:31833680:31850970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 38 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT015736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000038354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:31762225:31817697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000036395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:31095740:31182091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001004204 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 248 (Tmem248), mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000058725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:31870778:31895659:-1 gene:ENSRNOG00000000893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC079161 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 0610007L01Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:94190 IMAGE:7129411), complete cds. // chr12 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC090318 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 0610007L01Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:105849 IMAGE:7113430), complete cds. // chr12 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 248 (Tmem248), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT015739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:31870949:31926334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT015740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT015741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001108333 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1 (Rabgef1), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006249236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1 (Rabgef1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1 (Rabgef1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:31898729:31926568:-1 gene:ENSRNOG00000000895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC168697 // GenBank // Rattus norvegicus RAB guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7938618), partial cds. // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:31870949:31926334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// NONRATT015743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
ENSRNOT00000033004 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:32052322:32053124:-1 gene:ENSRNOG00000024193 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32052280:32056173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053670 // RefSeq // Rattus norvegicus CGRP receptor component (Crcp), mRNA. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32061700:32088178:-1 gene:ENSRNOG00000000901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF440799 // GenBank // Rattus norvegicus CGRP-receptor component protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC059117 // GenBank // Rattus norvegicus calcitonin gene-related peptide-receptor component protein, mRNA (cDNA clone MGC:72700 IMAGE:6891094), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32062700:32088528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT015750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT015751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_203338 // RefSeq // Rattus norvegicus vitamin K epoxide reductase complex, subunit 1-like 1 (Vkorc1l1), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vitamin K epoxide reductase complex subunit 1-like protein 1-like (LOC100909758), partial mRNA. // chr8 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:16361561:16407860:1 gene:ENSRNOG00000018291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY423048 // GenBank // Rattus norvegicus VKORC1-like protein 1 (Vkorc1l1) mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:16361611:16407410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001134570 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear protein, transcriptional regulator, 1-like (Nupr1l), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32248567:32248878:-1 gene:ENSRNOG00000000917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32248567:32257752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT015753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001105924 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, BED-type containing 5 (Zbed5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006249235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, BED-type containing 5 (Zbed5), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 77 // 93 // 10 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000001220 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32253311:32259362:-1 gene:ENSRNOG00000000918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// NONRATT015754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0
NM_001137670 // RefSeq // Rattus norvegicus septin 14 (Sept14), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus septin 14 (Sept14), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32540466:32560172:1 gene:ENSRNOG00000038495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32522488:32565582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0
NM_001009679 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoserine phosphatase (Psph), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32455767:32468317:1 gene:ENSRNOG00000000925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088310 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoserine phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:109524 IMAGE:7324292), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32449680:32468090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT014845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT014843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_031573 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphorylase kinase, gamma 1 (Phkg1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32392860:32406743:1 gene:ENSRNOG00000000920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32323657:32406605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT014842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001034924 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor, suppressor of white-apricot family (Sfswap), mRNA. // chr12 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// XM_006249269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus splicing factor, suppressor of white-apricot homolog (Drosophila) (Sfswap), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// BC105868 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine-rich 8, mRNA (cDNA clone MGC:125102 IMAGE:7462407), complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000001235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32675288:32745272:-1 gene:ENSRNOG00000000931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT015769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000029983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32683582:32878569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 73 // 73 // 33 // 45 // 1 /// NONRATT015771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 14 // 45 // 1 /// NONRATT015773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// NONRATT015774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
NM_001105925 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 17 (Mmp17), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 17 (Mmp17), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:32636907:32663678:-1 gene:ENSRNOG00000023643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:32616060:32681151:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001070157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 133 (Gpr133), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000058586 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:33063956:33175985:-1 gene:ENSRNOG00000023536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000073105 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:33063956:33175985:-1 gene:ENSRNOG00000023536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000006779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:33114514:33175985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:33019259:33108235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001108853 // RefSeq // Rattus norvegicus piwi-like RNA-mediated gene silencing 1 (Piwil1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006249279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus piwi-like RNA-mediated gene silencing 1 (Piwil1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000001238 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:33532887:33553715:-1 gene:ENSRNOG00000000934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000004428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:33534152:33577112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001271192 // RefSeq // Rattus norvegicus frizzled class receptor 10 (Fzd10), mRNA. // chr12 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:33681223:33683082:-1 gene:ENSRNOG00000022784 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:33681223:33682973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_001073476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosyltransferase 1 domain containing 1 (Glt1d1), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_222147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycosyltransferase 1 domain containing 1 (Glt1d1), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001275 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:34618168:34647621:-1 gene:ENSRNOG00000000961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000064526 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:34575934:34647621:-1 gene:ENSRNOG00000000961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:34575934:34647621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0
XM_002724836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 132C (Tmem132c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002727968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 132C (Tmem132c), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:34713829:35029422:-1 gene:ENSRNOG00000000963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:34713829:34744293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT015790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_006240796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, light chain 6, alkali, smooth muscle and non-muscle (Myl6), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006240797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, light chain 6, alkali, smooth muscle and non-muscle (Myl6), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000011278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:35081272:35081883:-1 gene:ENSRNOG00000008521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:2880878:2882604:-1 gene:ENSRNOG00000045928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:35081417:35081872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:2881031:2914750:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT050646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT050647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 75 // 10 // 15 // 0
NM_001290133 // RefSeq // Rattus norvegicus FSHD region gene 1 (Frg1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:35899612:35900388:-1 gene:ENSRNOG00000000964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:53671702:53692373:1 gene:ENSRNOG00000009846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:35899612:35932135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:53637977:53692373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT022519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_001134536 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 132B (Tmem132b), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:38141550:38271429:-1 gene:ENSRNOG00000038406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:38157983:38275777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT015799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_023104 // RefSeq // Rattus norvegicus acetoacetyl-CoA synthetase (Aacs), mRNA. // chr12 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000001292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:38381589:38425067:-1 gene:ENSRNOG00000000967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB026291 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for acetoacetyl-CoA synthetase, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC061803 // GenBank // Rattus norvegicus acetoacetyl-CoA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:72432 IMAGE:5598532), complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:38382649:38424918:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT015800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001017487 // RefSeq // Rattus norvegicus Bri3 binding protein (Bri3bp), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:38445352:38457171:-1 gene:ENSRNOG00000000979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085334 // GenBank // Rattus norvegicus Bri3 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:105518 IMAGE:7301029), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:38445696:38457153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004592 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06110250.1:2114:2510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001109547 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 101, member A (Fam101a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:38914965:38923860:-1 gene:ENSRNOG00000001011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ235329 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YJ23 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000003502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:38915835:38926540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XR_339520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556092 (LOC102556092), transcript variant X1, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_339521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556092 (LOC102556092), transcript variant X2, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_339523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556092 (LOC102556092), transcript variant X4, ncRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001338 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:39058751:39059536:-1 gene:ENSRNOG00000021705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000013803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39112490:39291745:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 99 // 95 // 78 // 79 // 0
NM_001024236 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIH, polypeptide 3 (Gtf2h3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39298571:39315037:-1 gene:ENSRNOG00000001035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC093380 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIH, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:112674 IMAGE:7388486), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000013793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39294547:39315484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001271326 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 55 (Ddx55), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39324516:39339745:-1 gene:ENSRNOG00000001043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39324993:39339745:-1 gene:ENSRNOG00000001043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ227273 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YP03 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39324516:39351072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT015822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT015824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_031722 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24 domain trafficking protein 2 (Tmed2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39342088:39351124:-1 gene:ENSRNOG00000001053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC062036 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane emp24 domain trafficking protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:72390 IMAGE:5623841), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT015827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// GENSCAN00000013802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39324516:39351072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001014127 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 35 (U11/U12) (Snrnp35), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 35 (U11/U12) (Snrnp35), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000001402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39401204:39408530:-1 gene:ENSRNOG00000001060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086435 // GenBank // Rattus norvegicus U11/U12 snRNP 35K, mRNA (cDNA clone MGC:105957 IMAGE:7302221), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213293 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YK13 mRNA sequence. // chr12 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39401483:39402217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT015830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_001109065 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ38663 (RGD1563482), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000001421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39552271:39555685:-1 gene:ENSRNOG00000001073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000030251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39559199:39572337:-1 gene:ENSRNOG00000050518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// FQ211547 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YM11 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT015835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
NM_001025630 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 4 (Arl6ip4), mRNA. // chr12 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39776742:39778884:-1 gene:ENSRNOG00000001080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// BC097374 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation-like factor 6 interacting protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:114409 IMAGE:7444619), complete cds. // chr12 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39776900:39800217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1 /// NONRATT015842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT015843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1
NM_001105927 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain containing 2 (Ogfod2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006249331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain containing 2 (Ogfod2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39779493:39782802:-1 gene:ENSRNOG00000001081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC167103 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:189556 IMAGE:9089723. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39776900:39800217:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT015843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001134763 // RefSeq // Rattus norvegicus huntingtin interacting protein 1 related (Hip1r), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// NM_031234 // RefSeq // Rattus norvegicus huntingtin interacting protein 1 related (Hip1r), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000034264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39895516:39924082:-1 gene:ENSRNOG00000001091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// BC169096 // GenBank // Rattus norvegicus huntingtin interacting protein 1 related, mRNA (cDNA clone MGC:189514 IMAGE:7936362), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 1 /// GENSCAN00000051999 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39896610:39924046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT015849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT015850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001134766 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 62 (Ccdc62), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000057814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:39928538:39964256:-1 gene:ENSRNOG00000038002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39934774:39943547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000052012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39951074:39960765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT015851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT015854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
ENSRNOT00000001467 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:39966924:39987019:-1 gene:ENSRNOG00000001106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC158753 // GenBank // Rattus norvegicus similar to density-regulated protein, mRNA (cDNA clone MGC:187941 IMAGE:9102903), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ210696 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA24YA20 mRNA sequence. // chr12 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// FQ220357 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YD03 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ232794 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YG11 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:39967237:39981027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1 /// NONRATT015856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001107140 // RefSeq // Rattus norvegicus kinetochore associated 1 (Kntc1), mRNA. // chr12 // 98 // 90 // 55 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000063990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40072618:40146547:-1 gene:ENSRNOG00000033658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000038728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40073389:40144057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 77 // 47 // 48 // 0
XM_002724839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein S100-A11-like (LOC100359550), mRNA. // chr12 // 90 // 33 // 9 // 10 // 0 /// XM_002727971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein S100-A11-like (LOC100359550), mRNA. // chr12 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000038733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40221372:40221875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001105938 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 (B3gnt4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 (B3gnt4), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4 (B3gnt4), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40385499:40386548:-1 gene:ENSRNOG00000008544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40385499:40386548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170396 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 43 (Lrrc43), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40388951:40405446:-1 gene:ENSRNOG00000008470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40388989:40405446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT015867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_001079320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MLX interacting protein (Mlxip), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40444472:40510059:-1 gene:ENSRNOG00000001255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40451162:40510059:-1 gene:ENSRNOG00000001255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 47 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000038711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40444472:40460989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NONRATT015874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006249372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 7 protein family member A-like (LOC690085), mRNA. // chr12 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000001814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40532067:40567658:-1 gene:ENSRNOG00000001343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// AY724520 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cpy-l-05-0-UI unknown mRNA. // chr12 // 76 // 96 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT015874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40509643:40698899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
XM_006249373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 66 (Wdr66), mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001813 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:40627061:40648587:-1 gene:ENSRNOG00000001342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000038727 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:40623684:40648462:-1 gene:ENSRNOG00000001342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000064157 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:40586228:40623721:-1 gene:ENSRNOG00000001342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40509643:40698899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
XM_006221421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG21620-like (LOC100359816), mRNA. // chr12 // 92 // 91 // 36 // 39 // 0 /// XM_006249374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG21620-like (LOC100359816), mRNA. // chr12 // 93 // 95 // 38 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000001807 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:40746333:40767105:-1 gene:ENSRNOG00000001337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 91 // 36 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000047609 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:40746333:40767105:-1 gene:ENSRNOG00000001337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 84 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000026907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40746333:40773053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 92 // 91 // 36 // 39 // 0
NM_001013982 // RefSeq // Rattus norvegicus ORAI calcium release-activated calcium modulator 1 (Orai1), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 99 // 99 // 0 /// ENSRNOT00000001806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40878320:40879082:-1 gene:ENSRNOG00000001336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 81 // 80 // 80 // 0 /// BC088225 // GenBank // Rattus norvegicus ORAI calcium release-activated calcium modulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:108979 IMAGE:7322176), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 99 // 99 // 0 /// EU644749 // GenBank // Rattus norvegicus calcium release-activated calcium modulator 1 (ORAI1) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 99 // 99 // 0 /// GENSCAN00000026909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40878456:40916735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 81 // 80 // 80 // 0 /// NONRATT015891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 81 // 80 // 80 // 0
NM_001004075 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 34, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf34), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41057289:41078167:-1 gene:ENSRNOG00000001331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY157968 // GenBank // Rattus norvegicus RING finger protein MOMO mRNA, partial cds. // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC079044 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 34, mRNA (cDNA clone MGC:93980 IMAGE:7115027), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41058008:41077957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_031594 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel 4 (P2rx4), mRNA. // chr12 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41196780:41214369:-1 gene:ENSRNOG00000001300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC078792 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel 4, mRNA (cDNA clone MGC:93356 IMAGE:7123247), complete cds. // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// U32497 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal P2X4 ATP-gated channel subunit mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// U47031 // GenBank // Rattus norvegicus P2x4 ATP receptor mRNA, complete cds. // chr12 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// X93565 // GenBank // R.norvegicus mRNA for P2X4 protein. // chr12 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41190889:41214328:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT015902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_019256 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 7 (P2rx7), mRNA. // chr12 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// XM_006249364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2X, ligand-gated ion channel, 7 (P2rx7), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000001746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41242368:41284797:-1 gene:ENSRNOG00000001296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FJ436445 // GenBank // Rattus norvegicus P2X7 purinoceptor isoform k mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr12 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41244009:41284677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT015903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107142 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 7 (Anapc7), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006249365 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 7 (Anapc7), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000001729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41494331:41520882:-1 gene:ENSRNOG00000001283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41490863:41579659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT015908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT015909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001105933 // RefSeq // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 3 (Arpc3), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41533346:41548335:-1 gene:ENSRNOG00000008673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC166554 // GenBank // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:188163 IMAGE:7311069), complete cds. // chr12 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ221109 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YJ08 mRNA sequence. // chr12 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// FQ232132 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YO06 mRNA sequence. // chr12 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT015910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41490863:41579659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
NONRATT015910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_201991 // RefSeq // Rattus norvegicus GPN-loop GTPase 3 (Gpn3), mRNA. // chr12 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41551262:41559994:-1 gene:ENSRNOG00000001278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY513752 // GenBank // Rattus norvegicus PRYA1876 mRNA, complete cds. // chr12 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41490863:41579659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT015912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT015913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001105932 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae) (Vps29), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41570698:41579742:-1 gene:ENSRNOG00000001274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB578912 // GenBank // Rattus norvegicus vps29 mRNA for vacuolar protein sorting 29, clone: R3_2_52_vps29. // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC167055 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 29 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189354 IMAGE:7302374), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ213481 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YJ06 mRNA sequence. // chr12 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT015914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41490863:41579659:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT015915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001107141 // RefSeq // Rattus norvegicus PTC7 protein phosphatase homolog (S. cerevisiae) (Pptc7), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41612148:41650388:-1 gene:ENSRNOG00000021440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41615159:41650103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006221351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006221352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249370 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006249371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydrogen voltage-gated channel 1 (Hvcn1), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001712 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:41703158:41710333:-1 gene:ENSRNOG00000001270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41703149:41722069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001270983 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, catalytic subunit, gamma isozyme (Ppp1cc), transcript variant 2, mRNA. // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NM_022498 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, catalytic subunit, gamma isozyme (Ppp1cc), transcript variant 1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41744539:41761986:-1 gene:ENSRNOG00000001269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC078825 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, catalytic subunit, gamma isoform, mRNA (cDNA clone MGC:93440 IMAGE:7112668), complete cds. // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// D90165 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for catalytic subunit of protein phosphatase 1, complete cds, clone:PP-1 gamma 1. // chr12 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// D90166 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for catalytic subunit of protein phosphatase 1, complete cds, clone:PP-1 gamma 2. // chr12 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41741872:41761806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT015926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT015925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT015927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001035252 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light chain 2, regulatory, cardiac, slow (Myl2), mRNA. // chrU // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// BC126064 // GenBank // Rattus norvegicus myosin, light polypeptide 2, regulatory, cardiac, slow, mRNA (cDNA clone MGC:156486 IMAGE:7190683), complete cds. // chrU // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// FQ224236 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA72YO06 mRNA sequence. // chrU // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// M11851 // GenBank // Rat heart myosin light chain 2 (MLC2) mRNA, 3 end. // chrU // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000050368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:41777254:41835824:-1 gene:ENSRNOG00000030848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000028716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:41831169:41835777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT015928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
XM_002724821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member A (Fam109a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002727967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member A (Fam109a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member A (Fam109a), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member A (Fam109a), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member A (Fam109a), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 109, member A (Fam109a), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42097550:42098254:-1 gene:ENSRNOG00000028206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42097550:42098254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000001691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42137231:42203348:-1 gene:ENSRNOG00000001256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000040587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42137231:42203348:-1 gene:ENSRNOG00000001256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000045666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42137231:42203348:-1 gene:ENSRNOG00000001256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// BC168999 // GenBank // Rattus norvegicus ataxin 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:8367218), partial cds. // chr12 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// XR_339544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 2 (Atxn2), transcript variant X10, misc_RNA. // chr12 // 79 // 79 // 34 // 43 // 1 /// NONRATT015932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT015933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000022232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42137739:42285790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 26 // 43 // 1 /// NONRATT015934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 53 // 53 // 23 // 43 // 1 /// NONRATT015935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 47 // 47 // 20 // 43 // 1 /// NONRATT015937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1
NM_001159625 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 116 (Tmem116), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 116 (Tmem116), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42424913:42457597:-1 gene:ENSRNOG00000027480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 116 (Tmem116), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42425184:42456222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001047900 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 25, NatB auxiliary subunit (Naa25), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000048984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42495120:42547489:-1 gene:ENSRNOG00000001350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// FQ231707 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YH21 mRNA sequence. // chr12 // 75 // 26 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42495120:42553322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT015946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
XM_006221365 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4-like (RGD1309762), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 99 // 73 // 73 // 0 /// ENSRNOT00000001826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:42581155:42685050:-1 gene:ENSRNOG00000001352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 68 // 68 // 0 /// GENSCAN00000041438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42599375:42675094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 66 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000041445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:42579575:42597367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 20 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT015950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 12 // 12 // 9 // 74 // 1
NONRATT015959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001009379 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1D (Oas1d), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000034036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43043848:43053167:-1 gene:ENSRNOG00000024462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// AY196699 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1D mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000057258 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:44216975:44225866:-1 gene:ENSRNOG00000048485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// GENSCAN00000032020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:44216744:44240452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// GENSCAN00000049327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43035197:43052982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
NM_001009491 // RefSeq // Rattus norvegicus 2  -5  oligoadenylate synthetase 1H (Oas1h), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43076602:43086182:-1 gene:ENSRNOG00000001370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43068941:43086182:-1 gene:ENSRNOG00000001370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 94 // 77 // 16 // 17 // 0 /// AY196701 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1H mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43077578:43086154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT015962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001009490 // RefSeq // Rattus norvegicus 2  -5  oligoadenylate synthetase 1F (Oas1f), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43089838:43099201:-1 gene:ENSRNOG00000030808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY196700 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1F mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43090345:43103296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_144752 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1B (Oas1b), mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43116714:43127900:-1 gene:ENSRNOG00000001372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF068268 // GenBank // Rattus norvegicus 25 oligoadenylate synthetase-2 mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// BC091121 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1B, mRNA (cDNA clone MGC:108585 IMAGE:7383389), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43118044:43127860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT015965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_001009489 // RefSeq // Rattus norvegicus 2  -5  oligoadenylate synthetase 1K (Oas1k), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000048782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43152977:43165724:-1 gene:ENSRNOG00000033220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000057259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43152977:43165724:-1 gene:ENSRNOG00000033220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000075234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43157504:43165724:-1 gene:ENSRNOG00000033220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000075317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43153443:43165724:-1 gene:ENSRNOG00000033220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AY196696 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 1K mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC088437 // GenBank // Rattus norvegicus 2  -5  oligoadenylate synthetase 1K, mRNA (cDNA clone MGC:95074 IMAGE:7125462), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43153254:43165657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT015966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001108335 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS protein activator like 1 (GAP1 like) (Rasal1), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000001856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43274639:43307089:-1 gene:ENSRNOG00000001374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43287866:43306433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001191548 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 54 (Ddx54), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000001859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43328542:43342983:-1 gene:ENSRNOG00000001377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT015972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000049336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43329001:43376835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 90 // 36 // 40 // 1 /// NONRATT015973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT015974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1
XR_085592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing D (Iqcd), transcript variant X1, misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_085994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing D (Iqcd), transcript variant X1, misc_RNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_339546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing D (Iqcd), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000001860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43348902:43360033:-1 gene:ENSRNOG00000001378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000048397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43352201:43360033:-1 gene:ENSRNOG00000001378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC083607 // GenBank // Rattus norvegicus IQ motif containing D, mRNA (cDNA clone MGC:94359 IMAGE:7133364), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43329001:43376835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT015976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001017488 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 24 (sodium/lithium/calcium exchanger), member 6 (Slc24a6), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000038736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43421507:43444143:-1 gene:ENSRNOG00000001383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC079350 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:94807 IMAGE:7107820), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000049320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43422282:43442389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT015978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT015980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
NM_053962 // RefSeq // Rattus norvegicus serine dehydratase (Sds), mRNA. // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43473326:43478300:-1 gene:ENSRNOG00000001388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43473326:43478300:-1 gene:ENSRNOG00000001388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC088110 // GenBank // Rattus norvegicus serine dehydratase, mRNA (cDNA clone MGC:108581 IMAGE:7323391), complete cds. // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// J03863 // GenBank // Rat serine dehydratase (SDH2) mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43473482:43482551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT015981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT015982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_139036 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM homeobox 5 (Lhx5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43513076:43521513:-1 gene:ENSRNOG00000001392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L35572 // GenBank // Rattus norvegicus (clone 1.9kB) lim-2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43505869:43521173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT015983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003751194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 19 (Rbm19), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// XM_003754699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 19 (Rbm19), partial mRNA. // chr12 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000001891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43816223:43843543:-1 gene:ENSRNOG00000001397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000053663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43752299:43930021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT015985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT015986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1
NM_001009964 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 5 (Tbx5), mRNA. // chr12 // 88 // 97 // 28 // 32 // 0 /// XM_006249390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 5 (Tbx5), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 5 (Tbx5), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 5 (Tbx5), transcript variant X6, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 5 (Tbx5), transcript variant X7, mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43949166:43996736:1 gene:ENSRNOG00000001399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AY859491 // GenBank // Rattus norvegicus T-box 5 mRNA, complete cds. // chr12 // 88 // 97 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43964877:43996717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000053655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43949186:43957501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT015089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_181638 // RefSeq // Rattus norvegicus T-box 3 (Tbx3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-box 3 (Tbx3), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:44328562:44340709:-1 gene:ENSRNOG00000008706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY289619 // GenBank // Rattus norvegicus Tbx3 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ221880 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA30YJ12 mRNA sequence. // chr12 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:44320827:44339696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT015990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT015991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT015989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000042331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:45260303:45412655:-1 gene:ENSRNOG00000001120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GU566026 // GenBank // Rattus norvegicus strain W thyroid hormone receptor-associated 240-like protein mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:45260303:45359991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT015998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT015999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001109066 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ21415 (RGD1562310), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ21415 (RGD1562310), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000001485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:45753578:45773812:-1 gene:ENSRNOG00000001123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:45652988:45773714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_057130 // RefSeq // Rattus norvegicus harakiri, BCL2 interacting protein (Hrk), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// D83697 // GenBank // Rattus norvegicus DP5 mRNA for neuronal death protein, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_006221424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tescalcin (Tesc), mRNA. // chr12 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:45973046:46006207:-1 gene:ENSRNOG00000001128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// XM_006249425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tescalcin (Tesc), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT016010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000020580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:45973046:45981315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT016011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001108338 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 21 (Fbxo21), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46075020:46106396:-1 gene:ENSRNOG00000001129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC158866 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 21, mRNA (cDNA clone MGC:188488 IMAGE:5620924), complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:46077071:46225508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT016012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_052799 // RefSeq // Rattus norvegicus nitric oxide synthase 1, neuronal (Nos1), mRNA. // chr12 // 96 // 100 // 78 // 81 // 0 /// ENSRNOT00000001493 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46049288:46209569:-1 gene:ENSRNOG00000001130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 100 // 79 // 81 // 0 /// ENSRNOT00000066810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46049288:46209569:-1 gene:ENSRNOG00000001130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 100 // 79 // 81 // 0 /// U67309 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nitric oxide synthase mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 100 // 78 // 81 // 0 /// ENSRNOT00000046205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46049288:46209569:-1 gene:ENSRNOG00000001130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 88 // 88 // 71 // 81 // 1 /// GENSCAN00000020585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:46077071:46225508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 94 // 74 // 76 // 0 /// NONRATT016015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 98 // 100 // 79 // 81 // 0 /// NONRATT016014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 11 // 11 // 9 // 81 // 1
XM_006221375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinase suppressor of ras 2 (Ksr2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000046190 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:46362374:46511934:-1 gene:ENSRNOG00000028630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071074 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:46583539:46731810:-1 gene:ENSRNOG00000050710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000020576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:46348605:46457606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1
NM_001007616 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 2 (Wsb2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46762964:46783174:-1 gene:ENSRNOG00000001135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC081901 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat and SOCS box-containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:93822 IMAGE:7110808), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:46763214:46770233:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT016020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001271336 // RefSeq // Rattus norvegicus V-set and immunoglobulin domain containing 10 (Vsig10), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006249437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus V-set and immunoglobulin domain containing 10 (Vsig10), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46787917:46819404:-1 gene:ENSRNOG00000022698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:46787917:46819404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001024254 // RefSeq // Rattus norvegicus TAO kinase 3 (Taok3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000001503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:46849166:47002369:-1 gene:ENSRNOG00000001138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB195232 // GenBank // Rattus norvegicus JIK mRNA for JNK/SAPK-inhibitory kinase, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ232267 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YG24 mRNA sequence. // chr12 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// GENSCAN00000055580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:46857195:46936295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1
ENSRNOT00000054458 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:12:48113402:48113513:-1 gene:ENSRNOG00000036337 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001029911 // RefSeq // Rattus norvegicus citron rho-interacting serine/threonine kinase (Cit), mRNA. // chr12 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// XM_006249475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus citron (rho-interacting, serine/threonine kinase 21) (Cit), transcript variant X7, mRNA. // chr12 // 100 // 79 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000041281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48135859:48215605:-1 gene:ENSRNOG00000001143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000057036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48136331:48294184:-1 gene:ENSRNOG00000001143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// AF039218 // GenBank // Rattus norvegicus postsynaptic density protein (citron) mRNA, complete cds. // chr12 // 95 // 77 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000019833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48137245:48232577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 77 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT016034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT016033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 22 // 52 // 1 /// GENSCAN00000019825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48244937:48309935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 15 // 15 // 8 // 52 // 1
NONRATT016037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000019825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48244937:48309935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0
NM_001013046 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB35, member RAS oncogene family (Rab35), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030031 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48502884:48516964:-1 gene:ENSRNOG00000022014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085769 // GenBank // Rattus norvegicus RAB35, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:93682 IMAGE:7135343), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48504262:48587142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT016040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001168664 // RefSeq // Rattus norvegicus GCN1 general control of amino-acid synthesis 1-like 1 (yeast) (Gcn1l1), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000001517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48527293:48587142:-1 gene:ENSRNOG00000021871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000019049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48504262:48587142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 95 // 53 // 54 // 0 /// NONRATT016041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 25 // 57 // 1
XM_006249456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paxillin (Pxn), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NM_001012147 // RefSeq // Rattus norvegicus paxillin (Pxn), mRNA. // chr12 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000047466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48595405:48642172:-1 gene:ENSRNOG00000001149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000064115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48595400:48642173:-1 gene:ENSRNOG00000001149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AY641810 // GenBank // Rattus norvegicus myocardial ischemic preconditioning associated protein 7 mRNA, complete cds. // chr12 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// BC081984 // GenBank // Rattus norvegicus paxillin, mRNA (cDNA clone MGC:94176 IMAGE:7128801), complete cds. // chr12 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// FQ226157 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA34YJ09 mRNA sequence. // chr12 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// GENSCAN00000019070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48597208:48611737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006249456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paxillin (Pxn), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT016050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031585 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IB, pancreas (Pla2g1b), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48676472:48685929:-1 gene:ENSRNOG00000001153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D00036 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for pancreatic phospholipase A-2, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48673994:48733635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT016057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_148890 // RefSeq // Rattus norvegicus musashi RNA-binding protein 1 (Msi1), mRNA. // chr12 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000001532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48696700:48717413:-1 gene:ENSRNOG00000001156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY043393 // GenBank // Rattus norvegicus RNA-binding protein Musashi-1 mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000019057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48673994:48733635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT016058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001126099 // RefSeq // Rattus norvegicus TP53 regulated inhibitor of apoptosis 1 (Triap1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48781114:48783573:-1 gene:ENSRNOG00000001160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:48823177:48824848:-1 gene:ENSRNOG00000047812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ214309 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YH11 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ230723 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YE23 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48781936:48783573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48823177:48824814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001009255 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 9 (Srsf9), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48833032:48839338:-1 gene:ENSRNOG00000001163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087684 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine rich 9, mRNA (cDNA clone MGC:105562 IMAGE:7309111), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48833204:48839275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT016060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT016062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001039022 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q5 homolog, methyltransferase (S. cerevisiae) (Coq5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48872069:48888982:-1 gene:ENSRNOG00000001171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098719 // GenBank // Rattus norvegicus coenzyme Q5 homolog, methyltransferase (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112711 IMAGE:7370143), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48872641:48889055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001105752 // RefSeq // Rattus norvegicus processing of precursor 5, ribonuclease P/MRP subunit (S. cerevisiae) (Pop5), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus processing of precursor 5, ribonuclease P/MRP subunit (S. cerevisiae) (Pop5), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus processing of precursor 5, ribonuclease P/MRP subunit (S. cerevisiae) (Pop5), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:48932062:48936411:-1 gene:ENSRNOG00000001199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212758 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YI15 mRNA sequence. // chr12 // 35 // 100 // 9 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:48932285:48950061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003751200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal peptide peptidase like 3 (Sppl3), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001562 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:49073449:49107696:-1 gene:ENSRNOG00000001178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT016071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT016073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49073449:49104662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT016072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
ENSRNOT00000050782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49226757:49232350:-1 gene:ENSRNOG00000001185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC088751 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2210016L21 gene, mRNA (cDNA clone MGC:105760 IMAGE:7317722), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ212654 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YB09 mRNA sequence. // chr12 // 78 // 100 // 14 // 18 // 0 /// FQ213037 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YB06 mRNA sequence. // chr12 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT016076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT016077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49227337:49232330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// NONRATT016079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001009681 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-5-oligoadenylate synthetase-like (Oasl), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49237542:49249899:-1 gene:ENSRNOG00000001187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY227756 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase-like 1 protein (Oasl1) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49237975:49249891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT016081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001009682 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase-like 2 (Oasl2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49263773:49276267:-1 gene:ENSRNOG00000028814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY237116 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 2-like protein (Oasl2) mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ234292 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YI07 mRNA sequence. // chr12 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// FQ230792 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YA20 mRNA sequence. // chr12 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49263912:49276201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT016085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006221378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691311 (LOC691311), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691311 (LOC691311), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034129 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:49287267:49303632:-1 gene:ENSRNOG00000021364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066171 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:49287861:49300169:-1 gene:ENSRNOG00000021364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49287267:49300294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001012148 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 13a (Ankrd13a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49352116:49381860:-1 gene:ENSRNOG00000001204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC085774 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 13a, mRNA (cDNA clone MGC:93696 IMAGE:7096477), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49353865:49381740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// NONRATT016089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001191666 // RefSeq // Rattus norvegicus trichoplein, keratin filament binding (Tchp), mRNA. // chr12 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49431572:49445524:-1 gene:ENSRNOG00000001191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049865 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49427260:49450716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT016091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT016092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1 /// NONRATT016093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT016090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001109067 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 222, member A (Fam222a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 222, member A (Fam222a), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49539795:49585147:-1 gene:ENSRNOG00000001198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49539795:49543103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053922 // RefSeq // Rattus norvegicus acetyl-CoA carboxylase beta (Acacb), mRNA. // chr12 // 83 // 95 // 43 // 52 // 0 /// ENSRNOT00000000821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49914427:50000977:-1 gene:ENSRNOG00000000658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 98 // 85 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000067975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:49914427:50000977:-1 gene:ENSRNOG00000000658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 47 // 47 // 0 /// AB004329 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for acetyl-CoA carboxylase, complete cds. // chr12 // 83 // 95 // 43 // 52 // 0 /// DQ493871 // GenBank // Rattus norvegicus acetyl-Coenzyme A carboxylase 2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 84 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000023563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49955535:50000882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 36 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:49914427:49954743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 55 // 30 // 30 // 0
NM_001013124 // RefSeq // Rattus norvegicus uracil-DNA glycosylase (Ung), mRNA. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50028792:50037073:-1 gene:ENSRNOG00000000692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC091211 // GenBank // Rattus norvegicus uracil-DNA glycosylase, mRNA (cDNA clone MGC:108922 IMAGE:7381643), complete cds. // chr12 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50007846:50037780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT016100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT016101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT016102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001107153 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 30 (Usp30), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50044991:50068680:-1 gene:ENSRNOG00000028556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50046675:50083684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT016107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_053626 // RefSeq // Rattus norvegicus D-amino-acid oxidase (Dao), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50135334:50157417:-1 gene:ENSRNOG00000000694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB003400 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for D-amino-acid oxidase, complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088395 // GenBank // Rattus norvegicus D-amino-acid oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:93293 IMAGE:7110523), complete cds. // chr12 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000023565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50135901:50156680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT016109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001105936 // RefSeq // Rattus norvegicus iron-sulfur cluster assembly enzyme (Iscu), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50403338:50409181:-1 gene:ENSRNOG00000000701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167056 // GenBank // Rattus norvegicus iron-sulfur cluster scaffold homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:189356 IMAGE:7369214), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232916 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YO20 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// FQ234644 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YD02 mRNA sequence. // chr12 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT016111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50400235:50409140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001010946 // RefSeq // Rattus norvegicus FIC domain containing (Ficd), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50441769:50444594:-1 gene:ENSRNOG00000000703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC079197 // GenBank // Rattus norvegicus FIC domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:94249 IMAGE:7131463), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50441769:50444098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT016114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271178 // RefSeq // Rattus norvegicus WSC domain containing 2 (Wscd2), mRNA. // chr12 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000000895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:50604426:50644721:-1 gene:ENSRNOG00000000705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT016117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:50613453:50662338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT016118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_001054448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 211 (Tmem211), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002724826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 211 (Tmem211), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XR_358790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552958 (LOC102552958), transcript variant X2, misc_RNA. // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XR_358791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552958 (LOC102552958), transcript variant X3, misc_RNA. // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XR_358792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552958 (LOC102552958), transcript variant X4, misc_RNA. // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// BC091332 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7314381. // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT016134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001191928 // RefSeq // Rattus norvegicus meningioma 1 (Mn1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:52955948:52991986:-1 gene:ENSRNOG00000027489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:52978310:53022205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_053742 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, beta (Pitpnb), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000052202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53020772:53079031:-1 gene:ENSRNOG00000000665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53020772:53079031:-1 gene:ENSRNOG00000000665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC061538 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, beta, mRNA (cDNA clone MGC:72738 IMAGE:6888321), complete cds. // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// D21132 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol transfer protein (beta isoform), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006249523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol transfer protein, beta (Pitpnb), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT016137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT016138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53024388:53114499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT016139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT016140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
XM_006249584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006249584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006249584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// XM_006249585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 28 (Ttc28), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000046920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53130431:53332482:-1 gene:ENSRNOG00000032590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53130431:53153842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000023908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53181734:53261734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_053677 // RefSeq // Rattus norvegicus checkpoint kinase 2 (Chek2), mRNA. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000056800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53584455:53615983:-1 gene:ENSRNOG00000037509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF134054 // GenBank // Rattus norvegicus checkpoint kinase Chk2 mRNA, complete cds. // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000010899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53555936:53609634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT016153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT016154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001106584 // RefSeq // Rattus norvegicus replication protein A3 (Rpa3), mRNA. // chr12 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// XM_002727980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus replication protein A3-like (LOC100362927), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003752595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus replication protein A3-like (LOC100362927), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:34139498:34142529:-1 gene:ENSRNOG00000008309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056733 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:53703765:53704130:-1 gene:ENSRNOG00000037481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168164 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8367557. // chr12 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:34129060:34142498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 63 // 68 // 12 // 19 // 0 /// NONRATT041017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 64 // 100 // 18 // 28 // 0 /// NONRATT041018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001107150 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 51 (Ddx51), mRNA. // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 51 (Ddx51), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53805410:53810335:-1 gene:ENSRNOG00000037480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53806197:53810309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT016157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107151 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9 (Galnt9), transcript variant B, mRNA. // chr12 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NM_001122644 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9 (Galnt9), transcript variant A, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:53844763:53922179:-1 gene:ENSRNOG00000037476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:53816117:53916704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT016161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001270418 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich colipase-like 1 (Lrcol1), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54119566:54131440:-1 gene:ENSRNOG00000037466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// JQ258942 // GenBank // Rattus norvegicus colipase-like protein 3 variant 1 (Clpsl3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54119924:54122832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT016164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001107152 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), epsilon, catalytic subunit (Pole), mRNA. // chr12 // 100 // 98 // 50 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000067453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54138907:54187417:-1 gene:ENSRNOG00000037449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 98 // 50 // 50 // 0 /// GENSCAN00000028133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54139113:54184827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT016165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0
NM_001047901 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and LEM domain containing 2 (Ankle2), mRNA. // chr12 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54212226:54240448:-1 gene:ENSRNOG00000037441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54212229:54240439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT016170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001107847 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin A3 (Golga3), mRNA. // chr12 // 100 // 96 // 55 // 55 // 0 /// ENSRNOT00000056656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54248805:54295058:-1 gene:ENSRNOG00000037437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 96 // 55 // 55 // 0 /// GENSCAN00000028163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54249658:54290117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 79 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000053429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:28122691:28127154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 82 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT016174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 96 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT016177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 61 // 61 // 35 // 57 // 1 /// NONRATT016183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 25 // 25 // 14 // 57 // 1 /// NONRATT016175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 16 // 16 // 9 // 57 // 1 /// NONRATT016181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 16 // 16 // 9 // 57 // 1
NM_001009258 // RefSeq // Rattus norvegicus checkpoint with forkhead and ring finger domains, E3 ubiquitin protein ligase (Chfr), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000056639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:54299049:54332973:-1 gene:ENSRNOG00000037430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC087162 // GenBank // Rattus norvegicus checkpoint with forkhead and ring finger domains, mRNA (cDNA clone MGC:95316 IMAGE:7135077), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT016184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:54302035:54361573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1
XM_006221400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG142312-like (LOC100365779), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG142312-like (LOC100365779), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006221404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG142312-like (LOC100365779), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG142312-like (LOC100365779), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006249600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG142312-like (LOC100365779), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041981 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:54344422:54385822:-1 gene:ENSRNOG00000037428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT016188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009715 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 2 (Oas2), mRNA. // chr12 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000072024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:43198845:43220589:1 gene:ENSRNOG00000049282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AY230746 // GenBank // Rattus norvegicus 2-5 oligoadenylate synthetase 2 (Oas2) mRNA, complete cds. // chr12 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:43173953:43263565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0
XM_001070575 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 3, subfamily a, polypeptide 73 (Cyp3a73), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000073099 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:12820328:12840004:-1 gene:ENSRNOG00000046643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NM_053788 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 1A (brain) (Stx1a), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:26682320:26710272:-1 gene:ENSRNOG00000029165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF217191 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 1A mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:26683553:26710383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_031700 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 3 (Cldn3), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062411 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 3, mRNA (cDNA clone MGC:72392 IMAGE:5623891), complete cds. // chr12 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// M74067 // GenBank // Rat ORF, complete cds. // chr12 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
ENSRNOT00000030070 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:21531401:21532266:1 gene:ENSRNOG00000028603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:21531636:21570860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
ENSRNOT00000050013 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:26221637:26224430:1 gene:ENSRNOG00000030239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:26221637:26248442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
GENSCAN00000027268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:26551500:26674066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001047873 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin associated protein-like 5B (Cntnap5b), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000047108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:26870922:27774438:1 gene:ENSRNOG00000032206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000012463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:27467856:27699248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 92 // 30 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:27742584:27774438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT016207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000052547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:27146229:27343061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001012748 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 20 (Cdh20), mRNA. // chr13 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:30018338:30085298:1 gene:ENSRNOG00000014556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB121033 // GenBank // Rattus norvegicus Cad20 mRNA for Cadherin20, complete cds. // chr13 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:29991534:30085254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT016208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001134546 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310035C23 (RGD1307235), mRNA. // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:30820433:30915037:1 gene:ENSRNOG00000015508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ230810 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA89YJ20 mRNA sequence. // chr13 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000006008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:30820672:30913475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT016211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001271235 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11a, NFKB activator (Tnfrsf11a), mRNA. // chr13 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:30966261:30996894:1 gene:ENSRNOG00000015615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:30940569:31014346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000021269 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:31004973:31006125:1 gene:ENSRNOG00000015856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 44 // 100 // 8 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:30940569:31014346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001271042 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 2 (Zcchc2), transcript variant 2, mRNA. // chr13 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000061814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:31126927:31159194:1 gene:ENSRNOG00000002882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// BC100090 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7371871), complete cds. // chr13 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// NM_001122677 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 2 (Zcchc2), transcript variant 1, mRNA. // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// XR_358828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 2 (Zcchc2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// XR_358829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 2 (Zcchc2), transcript variant X6, misc_RNA. // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000003870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:31126927:31175425:1 gene:ENSRNOG00000002882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// GENSCAN00000043890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:31116300:31222496:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT016217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_021657 // RefSeq // Rattus norvegicus PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 1 (Phlpp1), mRNA. // chr13 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000003840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:31327712:31550366:1 gene:ENSRNOG00000002821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB023624 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SCOP, complete cds. // chr13 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:31477175:31549460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr13 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0