NONRATT002969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227850740:227852216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NONRATT002972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271032 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 5, beta 1 subunit (Ap5b1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227878862:227881595:1 gene:ENSRNOG00000026114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227876746:227898445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT002975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT002974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_002728856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit C (Rnaseh2c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit C (Rnaseh2c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028097 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:227897736:227898678:1 gene:ENSRNOG00000020700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227876746:227898445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199267 // RefSeq // Rattus norvegicus v-rel avian reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (Rela), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000045233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227928092:227938571:1 gene:ENSRNOG00000030888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AY307375 // GenBank // Rattus norvegicus RELA (RelA) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC079457 // GenBank // Rattus norvegicus v-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A (avian), mRNA (cDNA clone MGC:95012 IMAGE:7121610), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227935249:227937842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000029442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227928153:227933218:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT002979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001013150 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11 (Map3k11), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227978441:227991739:1 gene:ENSRNOG00000020773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC081952 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 11, mRNA (cDNA clone MGC:94039 IMAGE:7122664), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT002981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227978876:227995773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_002728858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 7 (Kcnk7), mRNA. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227993346:227995755:1 gene:ENSRNOG00000020784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227978876:227995773:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT002982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001191561 // RefSeq // Rattus norvegicus latent transforming growth factor beta binding protein 3 (Ltbp3), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228032961:228049059:1 gene:ENSRNOG00000020813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228033140:228048611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT002985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001271179 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 45 (Slc25a45), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228170602:228176797:1 gene:ENSRNOG00000030616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228170602:228176843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT002990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001100739 // RefSeq // Rattus norvegicus synovial apoptosis inhibitor 1, synoviolin (Syvn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228345143:228351660:1 gene:ENSRNOG00000020950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166727 // GenBank // Rattus norvegicus synovial apoptosis inhibitor 1, synoviolin, mRNA (cDNA clone MGC:188443 IMAGE:7933989), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228346049:228350632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT002996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT002999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT003000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT003001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001107574 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, HIT-type containing 2 (Znhit2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228359846:228361096:1 gene:ENSRNOG00000021794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168685 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, HIT type 2, mRNA (cDNA clone MGC:188510 IMAGE:7930608), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228359741:228361051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT003006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031759 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase-like 1 (Naaladl1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 63 // 63 // 0 /// ENSRNOT00000054835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228405386:228418544:1 gene:ENSRNOG00000021000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 63 // 63 // 0 /// AF009921 // GenBank // Rattus norvegicus ileal peptidase I100 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 63 // 63 // 0 /// GENSCAN00000025369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228405402:228418246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT003008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// NONRATT003009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 24 // 67 // 1
XM_006223627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 2 (Batf2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 2 (Batf2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006230954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basic leucine zipper transcription factor, ATF-like 2 (Batf2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228473170:228481089:1 gene:ENSRNOG00000021018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228469259:228534271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001024291 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical gene supported by BC078985 (LOC499306), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228567352:228577558:1 gene:ENSRNOG00000028378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228568054:228577558:1 gene:ENSRNOG00000028378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000073684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228493052:228530619:1 gene:ENSRNOG00000049487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT003012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228469259:228534271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// GENSCAN00000025374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228549931:228580565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_133619 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein hormone alpha 2 (Gpha2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein hormone alpha-2-like (LOC100909513), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein hormone alpha-2-like (LOC100909513), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228533294:228534442:1 gene:ENSRNOG00000021020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF260741 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine knot protein (Zsig51) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073348 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:228579937:228580565:1 gene:ENSRNOG00000050454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000025351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228469259:228534271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000025374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228549931:228580565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001109545 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 2A (Atg2a), mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000028547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228549959:228617368:1 gene:ENSRNOG00000021028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000025403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228595994:228616909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT003013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 44 // 55 // 1
NM_001130013 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC42 binding protein kinase gamma (DMPK-like) (Cdc42bpg), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000038016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228661352:228681280:1 gene:ENSRNOG00000027456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000025388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228632702:228678654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT003018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_019208 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple endocrine neoplasia I (Men1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 86 // 86 // 0 /// ENSRNOT00000028592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228692516:228698421:1 gene:ENSRNOG00000021054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 86 // 86 // 0 /// ENSRNOT00000037583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228692516:228698421:1 gene:ENSRNOG00000021054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 77 // 77 // 0 /// AB023400 // GenBank // Rattus norvegicus MEN1 mRNA for menin, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 86 // 86 // 0 /// AF130369 // GenBank // Rattus norvegicus strain Wistar MEN1 tumor suppressor (Men1) mRNA, alternative splice product, complete cds. // chr1 // 98 // 76 // 64 // 65 // 0 /// AF130370 // GenBank // Rattus norvegicus MEN1 tumor suppressor (Men1) mRNA, alternative splice product, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000009311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228692985:228697678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 58 // 58 // 0 /// NONRATT003021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 14 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT003022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 15 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT003023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 58 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT003020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 54 // 86 // 1
NM_001106329 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase kinase 2 (Map4k2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228699326:228713616:1 gene:ENSRNOG00000021061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ211076 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YA10 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228698782:228735808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001110793 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 1 (Sf1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NM_058210 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 1 (Sf1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228723306:228735808:1 gene:ENSRNOG00000021085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000044866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228723306:228736875:1 gene:ENSRNOG00000021085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC081859 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:93670 IMAGE:7132476), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228698782:228735808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1 /// NONRATT003028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT003030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
NM_012638 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphorylase, glycogen, muscle (Pygm), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006230679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphorylase, glycogen, muscle (Pygm), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228744114:228758930:1 gene:ENSRNOG00000021090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC161897 // GenBank // Rattus norvegicus phosphorylase, glycogen, muscle, mRNA (cDNA clone MGC:187616 IMAGE:8366912), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// FQ216177 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YD04 mRNA sequence. // chr1 // 69 // 34 // 9 // 13 // 0 /// GENSCAN00000009331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228744161:228758666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT003032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001082977 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 2 (calcium and DAG-regulated) (Rasgrp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006230853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 2 (calcium and DAG-regulated) (Rasgrp2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006230854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 2 (calcium and DAG-regulated) (Rasgrp2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006230856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAS guanyl releasing protein 2 (calcium and DAG-regulated) (Rasgrp2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:228761043:228776703:1 gene:ENSRNOG00000021098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:228762289:228776337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 78 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT003037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT003040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT003035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT003036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT003038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSRNOT00000034832 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:228949111:228949546:1 gene:ENSRNOG00000025266 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 80 // 71 // 8 // 10 // 0
XM_001072698 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial-like (LOC689961), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_002725781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial-like (LOC689961), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000028681 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:229132905:229133318:1 gene:ENSRNOG00000021123 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229123027:229133318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_001106330 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 11-2 homolog (S. cerevisiae) (Trmt112), mRNA. // chr1 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000028695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229158449:229159630:1 gene:ENSRNOG00000021132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// BC166890 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610038D11, mRNA (cDNA clone MGC:188836 IMAGE:6918473), complete cds. // chr1 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// BC168731 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610038D11, mRNA (cDNA clone MGC:188816 IMAGE:6918571), complete cds. // chr1 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// BC168762 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610038D11, mRNA (cDNA clone MGC:188881 IMAGE:6889581), complete cds. // chr1 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// BC168764 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610038D11, mRNA (cDNA clone MGC:188883 IMAGE:6889585), complete cds. // chr1 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// FQ213514 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YG13 mRNA sequence. // chr1 // 80 // 88 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229158808:229159463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT003048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_172045 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 14B (Ppp1r14b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006221292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1 regulatory subunit 14B-like (LOC100364403), mRNA. // chr1 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229220688:229222797:1 gene:ENSRNOG00000021151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY122323 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitous PKC-potentiated PP1 inhibitor (Phi1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000030546 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:28509263:28509666:-1 gene:ENSRNOG00000025790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 48 // 8 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000028724 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:17:39327287:39327718:1 gene:ENSRNOG00000039080 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 86 // 76 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:39327287:39327718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000056664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229220696:229222528:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 69 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT003055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT017098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 59 // 11 // 17 // 0 /// GENSCAN00000053024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:28509263:28683252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001106331 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA phosphotransferase 1 (Trpt1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229241774:229246773:1 gene:ENSRNOG00000023023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229242406:229244787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT003056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139337 // RefSeq // Rattus norvegicus MACRO domain containing 1 (Macrod1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229301823:229442054:1 gene:ENSRNOG00000021174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// AF404762 // GenBank // Rattus norvegicus LRP16-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AF419856 // GenBank // Rattus norvegicus LRP16-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// FQ216840 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YA04 mRNA sequence. // chr1 // 87 // 97 // 27 // 31 // 0 /// FQ224895 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YJ22 mRNA sequence. // chr1 // 47 // 100 // 15 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229434052:229441932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 47 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT003058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT003060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// GENSCAN00000056662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229290326:229325884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT003057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NONRATT003060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NM_001013994 // RefSeq // Rattus norvegicus REST corepressor 2 (Rcor2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_001061203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus REST corepressor 2-like 1 (Rcor2l1), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006230969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus REST corepressor 2-like (LOC102552640), mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23568509:23574620:1 gene:ENSRNOG00000021183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC089209 // GenBank // Rattus norvegicus REST corepressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:105529 IMAGE:7302520), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019987 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06111241.1:117:2526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229509352:229513908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23568863:23580232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// NONRATT020193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT020192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001109161 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700081O15 (RGD1560108), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700081O15 (RGD1560108), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229659747:229664618:1 gene:ENSRNOG00000032042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229657201:229665979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109161 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700081O15 (RGD1560108), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006230878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700081O15 (RGD1560108), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229659747:229664618:1 gene:ENSRNOG00000032042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT003064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_001044241 // RefSeq // Rattus norvegicus atlastin GTPase 3 (Atl3), mRNA. // chr1 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229733455:229775603:1 gene:ENSRNOG00000021203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229733495:229775603:1 gene:ENSRNOG00000021203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// DQ450893 // GenBank // Rattus norvegicus atlastin-3-like mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// FQ230464 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA99YN19 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// FQ226220 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YO22 mRNA sequence. // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT003065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229733476:229809969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
ENSRNOT00000028795 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:229809406:229810016:1 gene:ENSRNOG00000021205 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000015155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229733476:229809969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0
NM_017060 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group XVI (Pla2g16), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006230687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group XVI (Pla2g16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000032879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229831424:229864255:1 gene:ENSRNOG00000021206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AB298805 // GenBank // Rattus norvegicus RLP-3 mRNA for rat LRAT-like protein 3, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// FQ224126 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA76YB20 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 97 // 35 // 37 // 0 /// NONRATT003069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// X76453 // GenBank // R.norvegicus (Sprague Dawley) H-rev107 mRNA. // chr1 // 95 // 97 // 35 // 37 // 0 /// GENSCAN00000015157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229842046:229882878:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1
NM_001039007 // RefSeq // Rattus norvegicus HRAS-like suppressor family, member 5 (Hrasls5), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:229894247:229924705:1 gene:ENSRNOG00000023528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB255646 // GenBank // Rattus norvegicus iNAT mRNA for Calcium-independent phosphatidylethanolamine N-acyltransferase, complete cds. // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC099084 // GenBank // Rattus norvegicus HRAS-like suppressor family, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:116140 IMAGE:7452977), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229894722:229924586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
GENSCAN00000015153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229944358:229944678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 79 // 14 // 19 // 0
NM_031332 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 8 (Slc22a8), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006231005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 8 (Slc22a8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000024488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231737019:231756334:1 gene:ENSRNOG00000018086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AB017446 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for organic anion transporter 3, complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC081777 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 8, mRNA (cDNA clone MGC:93369 IMAGE:7109603), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// FQ209755 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA3YP11 mRNA sequence. // chr1 // 85 // 92 // 28 // 33 // 0 /// NONRATT003075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000035686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231737816:231778957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT003077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_017224 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 6 (Slc22a6), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231761613:231770057:1 gene:ENSRNOG00000018215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AB004559 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for multispecific organic anion transporter, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// AF008221 // GenBank // Rattus norvegicus renal organic anion transporter 1 (ROAT1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC104692 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic anion transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:124962 IMAGE:7109188), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231737816:231778957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT003080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT003081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_080773 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, muscarinic 1 (Chrm1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231819886:231821268:1 gene:ENSRNOG00000018385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231819886:231821268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109569 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 74 (Wdr74), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000066823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231871409:231876109:1 gene:ENSRNOG00000042878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// BC158834 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 74, mRNA (cDNA clone MGC:188293 IMAGE:7383724), complete cds. // chr1 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT003089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231871412:231907367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT003088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT003083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NONRATT003083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_343400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912041 (LOC100912041), transcript variant X3, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XR_343400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912041 (LOC100912041), transcript variant X3, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONRATT003083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XR_343400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912041 (LOC100912041), transcript variant X3, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031704 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 5 (Stx5), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000025664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231876955:231893829:1 gene:ENSRNOG00000018847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// BC085724 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 5a, mRNA (cDNA clone IMAGE:7189419). // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// BC127489 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 5, mRNA (cDNA clone MGC:156622 IMAGE:7376571), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// L20822 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 5 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000035704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231871412:231907367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 32 // 41 // 1 /// NONRATT003092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1
NM_021579 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear RNA export factor 1 (Nxf1), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000026033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231895704:231908900:1 gene:ENSRNOG00000019069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AF093139 // GenBank // Rattus norvegicus tip associating protein (TAP) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// GENSCAN00000035704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231871412:231907367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT003094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT003096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT003097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 51 // 51 // 21 // 41 // 1 /// NONRATT003098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
NM_001191104 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 223 (Tmem223), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231908980:231910341:1 gene:ENSRNOG00000019266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231908988:231910201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109162 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 3 (Zbtb3), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// XM_006230993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 3 (Zbtb3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006230994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 3 (Zbtb3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231936345:231938662:1 gene:ENSRNOG00000019461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC160822 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:187488 IMAGE:7380153), complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231936834:231938387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000026416 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:231953988:231965766:1 gene:ENSRNOG00000019507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231953988:231965766:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT003101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT003102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001012171 // RefSeq // Rattus norvegicus Berardinelli-Seip congenital lipodystrophy 2 (seipin) (Bscl2), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006230991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Berardinelli-Seip congenital lipodystrophy 2 (seipin) (Bscl2), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231974121:231983756:1 gene:ENSRNOG00000019636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089942 // GenBank // Rattus norvegicus Bernardinelli-Seip congenital lipodystrophy 2 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:109260 IMAGE:7311394), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ220723 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YO10 mRNA sequence. // chrU // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231972727:231987431:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT003110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT003111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT003112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001109579 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRN4 C-terminal like (Lrrn4cl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRN4 C-terminal like (Lrrn4cl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:231985669:231988583:1 gene:ENSRNOG00000026302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRN4 C-terminal like (Lrrn4cl), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000035695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231972727:231987431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT003113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034829 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 1 (Ubxn1), mRNA. // chr1 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// XM_006230975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UBX domain protein 1 (Ubxn1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232005791:232009563:1 gene:ENSRNOG00000019666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232001568:232009471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0
XM_006223711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552120 (LOC102552120), mRNA. // chr1 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// XM_006231011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552120 (LOC102552120), mRNA. // chr1 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000035673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232014262:232024686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_001107576 // RefSeq // Rattus norvegicus integrator complex subunit 5 (Ints5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232029232:232034010:1 gene:ENSRNOG00000026005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ226934 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA16YA19 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232029242:232053062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT003121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106334 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosidase, alpha; neutral AB (Ganab), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232034218:232053998:1 gene:ENSRNOG00000019724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232029242:232053062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// NONRATT003123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001128184 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-1,3-glucuronyltransferase 3 (glucuronosyltransferase I) (B3gat3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232057681:232064199:1 gene:ENSRNOG00000019804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166510 // GenBank // Rattus norvegicus beta-1,3-glucuronyltransferase 3 (glucuronosyltransferase I), mRNA (cDNA clone MGC:188078 IMAGE:7127430), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC168710 // GenBank // Rattus norvegicus beta-1,3-glucuronyltransferase 3 (glucuronosyltransferase I), mRNA (cDNA clone MGC:188682 IMAGE:8364370), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232057859:232063811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT003125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000026938 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:232066656:232120730:1 gene:ENSRNOG00000019873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// FQ228620 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YA04 mRNA sequence. // chr1 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// NONRATT003127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000035670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232066899:232086605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 32 // 44 // 1 /// NONRATT003129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// NONRATT003130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
NM_001100740 // RefSeq // Rattus norvegicus metastasis associated 1 family, member 2 (Mta2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232078483:232087203:1 gene:ENSRNOG00000019913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099177 // GenBank // Rattus norvegicus metastasis-associated gene family, member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7382751), partial cds. // chr1 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// BC166471 // GenBank // Rattus norvegicus metastasis associated 1 family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187858 IMAGE:9089183), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000035670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232066899:232086605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT003133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001033901 // RefSeq // Rattus norvegicus terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific (Tut1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006230995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific (Tut1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000027187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232089082:232100064:1 gene:ENSRNOG00000020047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC104695 // GenBank // Rattus norvegicus terminal uridylyl transferase 1, U6 snRNA-specific, mRNA (cDNA clone MGC:125034 IMAGE:7111833), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232089094:232115617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT003134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
FQ235034 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YL14 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// NM_001004223 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 gamma (Eef1g), mRNA. // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// ENSRNOT00000027305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232100965:232111615:1 gene:ENSRNOG00000020075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// BC079398 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:94929 IMAGE:7112627), complete cds. // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// BC098895 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation elongation factor 1 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:114210 IMAGE:7367246), complete cds. // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// GENSCAN00000035674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232089094:232115617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT003136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
NM_001191951 // RefSeq // Rattus norvegicus AHNAK nucleoprotein (Ahnak), mRNA. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232122559:232151281:1 gene:ENSRNOG00000050145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232121909:232169561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT003139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_207593 // RefSeq // Rattus norvegicus prostatic steroid-binding protein C2 (Psbpc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232643521:232646396:1 gene:ENSRNOG00000020301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC099748 // GenBank // Rattus norvegicus prostatic steroid-binding protein C2, mRNA (cDNA clone IMAGE:5599320), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// J00776 // GenBank // Rattus norvegicus prostatic steroid-binding protein C2 precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 74 // 90 // 14 // 19 // 0 /// NONRATT003153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232643554:232647250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_080770 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 2A, member 1 (Scgb2a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_203333 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 2A, member 2 (Scgb2a2), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232776636:232781635:-1 gene:ENSRNOG00000020305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232850593:232853956:1 gene:ENSRNOG00000023151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232776636:232781635:-1 gene:ENSRNOG00000020305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC061965 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:5621052, partial cds. // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// BC062401 // GenBank // Rattus norvegicus secretoglobin, family 2A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:72333 IMAGE:5621455), complete cds. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT003158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT007227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080770 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 2A, member 1 (Scgb2a1), mRNA. // chr1 // 79 // 86 // 19 // 24 // 0 /// NM_203333 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 2A, member 2 (Scgb2a2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232776636:232781635:-1 gene:ENSRNOG00000020305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 86 // 19 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232850593:232853956:1 gene:ENSRNOG00000023151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232776636:232781635:-1 gene:ENSRNOG00000020305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC062401 // GenBank // Rattus norvegicus secretoglobin, family 2A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:72333 IMAGE:5621455), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061965 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:5621052, partial cds. // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT003158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
ENSRNOT00000030997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:232957210:232957694:1 gene:ENSRNOG00000022693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:232951652:232957694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 68 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT003160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054815 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:232986593:232987169:1 gene:ENSRNOG00000036633 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_134411 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB3A interacting protein (rabin3)-like 1 (Rab3il1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233022972:233030682:1 gene:ENSRNOG00000020349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AY026049 // GenBank // Rattus norvegicus GRAB mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233011844:233054180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_173137 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid desaturase 3 (Fads3), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233037626:233054184:1 gene:ENSRNOG00000020385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// HQ901598 // GenBank // Rattus norvegicus strain Dark Agouti fatty acid desaturase 3 (Fads3) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233011844:233054180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT003170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_053445 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid desaturase 1 (Fads1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233178776:233193796:1 gene:ENSRNOG00000020480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB052085 // GenBank // Rattus norvegicus D5d mRNA for delta-5 fatty acid desaturase, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF320509 // GenBank // Rattus norvegicus liver delta-5 desaturase mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// HQ909026 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid desaturase 1 (Fads1) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT003173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233176808:233193588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NONRATT003175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000039369 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:233196964:233197419:1 gene:ENSRNOG00000028444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT003176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001014245 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 7 (Cpsf7), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// XM_006231061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 7 (Cpsf7), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233519360:233542386:1 gene:ENSRNOG00000020668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// BC083864 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5730453I16, mRNA (cDNA clone MGC:95116 IMAGE:7127736), complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233522357:233534600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT003187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT003190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT003191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001014164 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b561 family, member A3 (Cyb561a3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231055 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome b561 family, member A3 (Cyb561a3), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233566985:233588172:1 gene:ENSRNOG00000020702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085835 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b, ascorbate dependent 3, mRNA (cDNA clone MGC:94469 IMAGE:7134938), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ234846 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YH07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000007887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233581745:233587522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT003199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT003200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT003195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT003201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_171995 // RefSeq // Rattus norvegicus damage-specific DNA binding protein 1, 127kDa (Ddb1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000028188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233603576:233628839:1 gene:ENSRNOG00000020715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000007867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233600868:233662475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT003202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AJ277077 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for damage-specific DNA binding protein 1 (DDB1 gene). // chr1 // 33 // 97 // 11 // 33 // 0
NM_001271311 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor C and EGF domains (Vwce), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006231084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein-like (LOC102554620), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000028268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233633187:233662475:1 gene:ENSRNOG00000020834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000065724 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:233633187:233655344:1 gene:ENSRNOG00000020834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071531 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:233754504:233782663:1 gene:ENSRNOG00000046221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000074548 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:233754504:233782663:1 gene:ENSRNOG00000046221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233735753:233782663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233600868:233662475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1
NM_001107463 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 37 homolog C (S. cerevisiae) (Vps37c), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 37 homolog C (S. cerevisiae) (Vps37c), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 37 homolog C (S. cerevisiae) (Vps37c), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting-associated protein 37C-like (LOC100910929), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting-associated protein 37C-like (LOC100910929), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233687419:233712492:1 gene:ENSRNOG00000001460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233824905:233831155:1 gene:ENSRNOG00000046439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169040 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 37 homolog C (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189426 IMAGE:9024199), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233695577:233712192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233815627:233832242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XR_343412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553869 (LOC102553869), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_350935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553869 (LOC102553869), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_139341 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 15 (oligopeptide transporter), member 3 (Slc15a3), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000029443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:233963402:233978192:1 gene:ENSRNOG00000021644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB026665 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peptide histidine transporter 1 homolog rPHT2, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:233963479:233978060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_139333 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 19 (Prpf19), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// XM_006231013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 19 (Prpf19), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234012654:234023693:1 gene:ENSRNOG00000020897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// AB020022 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal differentiation-related mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC107669 // GenBank // Rattus norvegicus PRP19/PSO4 pre-mRNA processing factor 19 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124562 IMAGE:7937645), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234012841:234023281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT003206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT003209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT003208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001012070 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin D2 receptor 2 (Ptgdr2), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:234059094:234060390:1 gene:ENSRNOG00000036631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AY228550 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 44 (Gpr44) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234056145:234060342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000028414 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:234184840:234186066:1 gene:ENSRNOG00000020934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234178718:234185984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT003211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012845 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 2 (Ms4a2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235019784:235027733:-1 gene:ENSRNOG00000020993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// M22923 // GenBank // Rat IgE Fc receptor beta-subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// M22924 // GenBank // Rat IgE Fc receptor deleted beta-subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT007307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234978361:235032230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
XM_001075502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 11 (Ms4a11), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_342028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 11 (Ms4a11), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033795 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:234983315:234993520:-1 gene:ENSRNOG00000020991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT007305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NONRATT007304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_017162 // RefSeq // Rattus norvegicus gastric intrinsic factor (Gif), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235185900:235200148:1 gene:ENSRNOG00000021001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// J03577 // GenBank // Rat gastric intrinsic factor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235184549:235215122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001009647 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L16 (Mrpl16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235210618:235215431:1 gene:ENSRNOG00000021005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058154 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L16, mRNA (cDNA clone IMAGE:6888305), partial cds. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC088312 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L16, mRNA (cDNA clone MGC:109535 IMAGE:7324682), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU148065 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L16 mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// FQ215871 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YE01 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT003219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235184549:235215122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT003220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSRNOT00000051614 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:235292044:235294659:1 gene:ENSRNOG00000010220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 92 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000003242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235293881:235294659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_001000506 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 319 (Olr319), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235380204:235381133:1 gene:ENSRNOG00000021050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235337302:235381133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108520 // RefSeq // Rattus norvegicus protein associated with topoisomerase II homolog 1 (yeast) (Patl1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000066247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235401989:235433951:1 gene:ENSRNOG00000021052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC168974 // GenBank // Rattus norvegicus protein associated with topoisomerase II homolog 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:189302 IMAGE:7106310), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// FQ217423 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA26YN02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// FQ224360 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA69YG04 mRNA sequence. // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000003246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235400078:235450957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT003225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
FQ226910 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA17YP10 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// FQ222240 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA26YJ09 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// FQ226144 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA35YK05 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// FQ226164 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA34YB22 mRNA sequence. // chr1 // 78 // 100 // 43 // 55 // 0 /// FQ226888 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA19YO14 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// FQ228271 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA103YC23 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT003223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT003224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT003226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 100 // 32 // 55 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 100 // 32 // 55 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 100 // 32 // 55 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 100 // 32 // 55 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 100 // 32 // 55 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 100 // 32 // 55 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 100 // 32 // 55 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 100 // 32 // 55 // 0
NM_001108927 // RefSeq // Rattus norvegicus oxysterol binding protein (Osbp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235460266:235490067:1 gene:ENSRNOG00000021057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235460158:235491902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT003228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001000251 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 329 (Olr329), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235743770:235744711:1 gene:ENSRNOG00000021083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000761 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 330 (Olr330), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235788665:235789603:1 gene:ENSRNOG00000029943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000759 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 336 (Olr336), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236572187:236573149:1 gene:ENSRNOG00000021078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT003246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236572484:236603422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001000507 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 337 (Olr337), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235842832:235843788:1 gene:ENSRNOG00000021074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022617 // RefSeq // Rattus norvegicus macrophage expressed 1 (Mpeg1), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006231115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage expressed 1 (Mpeg1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000028622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:235887051:235889195:1 gene:ENSRNOG00000021084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AF156540 // GenBank // Rattus norvegicus Mpg-1 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:235887051:235889195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT003235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001109163 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 111, member A (Fam111a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236163691:236179257:1 gene:ENSRNOG00000012067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ226103 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YA02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236173311:236178077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236199619:236214857:1 gene:ENSRNOG00000036622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC160862 // GenBank // Rattus norvegicus similar to glycine-N-acyltransferase isoform a, mRNA (cDNA clone MGC:188221 IMAGE:7323546), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ210014 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YE13 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ218994 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YI24 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236188823:236213906:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT003239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009648 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine-N-acyltransferase (Glyat), mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000016454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236219983:236240513:1 gene:ENSRNOG00000012142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// AB201944 // GenBank // Rattus norvegicus GATF-B mRNA for glycine N-acyltransferase, complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// AY325192 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-132 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC087043 // GenBank // Rattus norvegicus glycine-N-acyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:93750 IMAGE:7108337), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// FQ209473 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YH16 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236226271:236239942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT003242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT003241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT003243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001000252 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 338 (Olr338), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236265691:236266629:1 gene:ENSRNOG00000048005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236255335:236273918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134330 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine-N-acyltransferase-like 2 (Glyatl2), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236673077:236706432:1 gene:ENSRNOG00000012387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB019693 // GenBank // Rattus norvegicus HP33 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078701 // GenBank // Rattus norvegicus kidney expressed gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:93099 IMAGE:7130696), complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236693840:236729391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001009649 // RefSeq // Rattus norvegicus leupaxin (Lpxn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leupaxin (Lpxn), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236795798:236827489:1 gene:ENSRNOG00000012611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC088217 // GenBank // Rattus norvegicus leupaxin, mRNA (cDNA clone MGC:108942 IMAGE:7384057), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236800828:236827021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT003253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT003252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT003255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001000954 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 339 (Olr339), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236873476:236874435:1 gene:ENSRNOG00000012838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236873476:236878455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT003256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000253 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 340 (Olr340), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236904466:236905410:1 gene:ENSRNOG00000031648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236904466:236905410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001043 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 344 (Olr344), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236971590:236972525:1 gene:ENSRNOG00000030326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236971590:236972525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000017200 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:236982548:236983461:1 gene:ENSRNOG00000012898 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 80 // 94 // 12 // 15 // 0
NM_001000255 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 346 (Olr346), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:236997764:236998690:1 gene:ENSRNOG00000046004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236982670:237087031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001000758 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 347 (Olr347), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236982670:237087031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_001000757 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 348 (Olr348), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000256 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 352 (Olr352), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064191 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:237025022:237361047:1 gene:ENSRNOG00000050832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237135554:237156683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001045 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 354 (Olr354), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237175606:237239882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT003264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000257 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 357 (Olr357), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000556 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 361 (Olr361), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000754 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 363 (Olr363), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237360124:237406794:1 gene:ENSRNOG00000048006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237360124:237406801:1 gene:ENSRNOG00000048006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT003267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237360124:237406804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001001046 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 365 (Olr365), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237442856:237443800:1 gene:ENSRNOG00000046596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000073539 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:237486044:237486984:1 gene:ENSRNOG00000048382 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001001047 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 367 (Olr367), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237511153:237512088:1 gene:ENSRNOG00000033369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237486712:237512088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT003269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000258 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 371 (Olr371), mRNA. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237586426:237587367:1 gene:ENSRNOG00000030471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075730 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:237550534:237551476:1 gene:ENSRNOG00000045794 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237586426:237645482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073539 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:237486044:237486984:1 gene:ENSRNOG00000048382 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_001000258 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 371 (Olr371), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237586426:237587367:1 gene:ENSRNOG00000030471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237586426:237645482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001048 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 372 (Olr372), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237660221:237661171:1 gene:ENSRNOG00000047343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237660206:237661171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001275 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 373 (Olr373), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237692222:237693172:1 gene:ENSRNOG00000048446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NM_001001289 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 374 (Olr374), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237714076:237715032:1 gene:ENSRNOG00000030032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237714088:237715032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000032593 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:237715221:237715612:1 gene:ENSRNOG00000023564 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237715221:237715612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_001000259 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 375 (Olr375), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237742164:237743123:1 gene:ENSRNOG00000032600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237742164:237743123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000260 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 376 (Olr376), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237767276:237769126:1 gene:ENSRNOG00000013192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000051410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237766958:237767905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000263 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 384 (Olr384), mRNA. // chr1 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237950400:237951350:1 gene:ENSRNOG00000032117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064835 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:237842089:237843076:1 gene:ENSRNOG00000042397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237950400:237951350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// NONRATT003277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0
NM_001000263 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 384 (Olr384), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:237950400:237951350:1 gene:ENSRNOG00000032117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:237950400:237951350:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031036 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), q polypeptide (Gnaq), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:240497178:240736864:1 gene:ENSRNOG00000014183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF234260 // GenBank // Rattus norvegicus heterotrimeric guanine nucleotide-binding protein alpha q subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:240672087:240699246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:240715601:240736864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001013151 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein, alpha 14 (Gna14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:242484562:242665785:1 gene:ENSRNOG00000014840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC090316 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein, alpha 14, mRNA (cDNA clone MGC:105546 IMAGE:7305112), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:242663018:242664601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT003300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:242651971:242660203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
ENSRNOT00000075720 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:243128293:243128860:1 gene:ENSRNOG00000047562 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:243128374:243139189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006223658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prune homolog 2 (Drosophila) (Prune2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 53 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000054794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:243982264:244061511:-1 gene:ENSRNOG00000015088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 35 // 35 // 0 /// XM_006231153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein prune homolog 2-like (LOC102546963), mRNA. // chr1 // 19 // 19 // 11 // 58 // 1 /// ENSRNOT00000066846 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:244187973:244205248:-1 gene:ENSRNOG00000042788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 17 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000021919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:244073155:244158148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 16 // 9 // 9 // 0 /// BC091368 // GenBank HTC // Rattus norvegicus similar to kIAA0367, mRNA (cDNA clone IMAGE:7319256). // chr1 // 100 // 60 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000021929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:243988906:244040713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 18 // 58 // 1 /// NONRATT007387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 21 // 58 // 1 /// NONRATT007388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 21 // 58 // 1 /// GENSCAN00000047667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:244184429:244221695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 17 // 17 // 10 // 58 // 1 /// NONRATT007389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 12 // 58 // 1
ENSRNOT00000011092 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:243833453:243834007:-1 gene:ENSRNOG00000022308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:243833453:243833992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
NM_001024292 // RefSeq // Rattus norvegicus nicotinamide riboside kinase 1 (Nmrk1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:241821771:241849122:-1 gene:ENSRNOG00000012665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079144 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Nicotinamide riboside kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94159 IMAGE:7128209), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
ENSRNOT00000017405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:241777572:241804669:-1 gene:ENSRNOG00000012872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC091268 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2410127L17, mRNA (cDNA clone MGC:109119 IMAGE:7380414), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ224897 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA52YJ17 mRNA sequence. // chr1 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:241777669:241804612:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001024293 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein D030056L22 (LOC499331), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017133 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:241765683:241769891:-1 gene:ENSRNOG00000025644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:241766759:241770304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT007362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 6 (Trpm6), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_006223668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 6 (Trpm6), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000017892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:241579363:241696522:-1 gene:ENSRNOG00000013053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006223673 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 6 (Trpm6), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 59 // 59 // 23 // 39 // 1 /// GENSCAN00000007868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:241639582:241662081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000007877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:241581545:241623555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000008205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:241665146:241695774:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT007360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
XM_006223718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor BTF3 homolog 4-like (RGD1563931), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006231160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor BTF3 homolog 4-like (RGD1563931), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000042738 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:244875571:244876035:1 gene:ENSRNOG00000031086 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000025454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:244862084:244876035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_022407 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member A1 (Aldh1a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:245521322:245562969:1 gene:ENSRNOG00000017619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF001896 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase (ALDH) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF001897 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase (ALDH) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF001898 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase (ALDH) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061526 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:72648 IMAGE:6921926), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// L42009 // GenBank // Rattus rattus aldehyde dehydrogenase (ALDH) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// U79118 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT003309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:245502116:245589179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT003308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT003307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001106356 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 5 (Zfand5), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:246131910:246141138:1 gene:ENSRNOG00000018107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC168882 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 5, mRNA (cDNA clone MGC:189136 IMAGE:9026652), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:246135454:246139692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XR_338491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// XR_357468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// FQ217911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA14YD18 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT059021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 62 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 26 // 63 // 1
NM_001014028 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 17B (Abhd17b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:246554183:246587553:1 gene:ENSRNOG00000012514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079229 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 108, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:94306 IMAGE:7132456), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ227098 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YC20 mRNA sequence. // chr1 // 86 // 50 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000034191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:246565695:246587116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT003318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT003320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001107596 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 2 (Tmem2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006231165 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 2 (Tmem2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006231167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 2 (Tmem2), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000067384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:246700907:246762954:1 gene:ENSRNOG00000012782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000012348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:246685700:246760596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT003323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT003324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 13 // 46 // 1
NM_001191562 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3 (Trpm3), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:247642339:248041913:1 gene:ENSRNOG00000027770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:247953508:247992964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT003330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NR_031919 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-204 (Mir204), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053595 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:247690190:247690299:1 gene:ENSRNOG00000035472 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-204 // miRBase Micro RNA Database // MI0000946 Rattus norvegicus miR-204 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_219903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S12-like (RGD1561453), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000049732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:248061299:248061697:1 gene:ENSRNOG00000046395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:248061299:248061697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000039805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:247840215:247843058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0
NM_057211 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 9 (Klf9), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:248193534:248218136:1 gene:ENSRNOG00000014215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// D12769 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BTE binding protein, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:248193152:248216873:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSRNOT00000032310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:248564008:248564407:1 gene:ENSRNOG00000023901 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0
NM_001105760 // RefSeq // Rattus norvegicus protein prenyltransferase alpha subunit repeat containing 1 (Ptar1), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:248783205:248838996:1 gene:ENSRNOG00000014891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:248759194:248875645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1
NM_031779 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family A, member 1 (Apba1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family A, member 1 (Apba1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000020123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:248875910:249076645:1 gene:ENSRNOG00000014928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF029105 // GenBank // Rattus norvegicus Mint1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249012584:249075832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT003349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NONRATT003349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001007738 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 252 (Tmem252), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:249846442:249851698:1 gene:ENSRNOG00000025476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:249841946:249850258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001037793 // RefSeq // Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 8 (Dock8), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// XM_006231245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 8 (Dock8), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000015668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:250225062:250417768:1 gene:ENSRNOG00000015894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000003304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250378285:250416342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000003298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250332122:250371917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// GENSCAN00000003308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250160331:250329267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// NONRATT003362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001037197 // RefSeq // Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 1 (Kank1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 1 (Kank1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 1 (Kank1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 1 (Kank1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 1 (Kank1), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000021496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:250540559:250659565:1 gene:ENSRNOG00000016023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC107446 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 15, mRNA (cDNA clone IMAGE:7364891), complete cds. // chr1 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// GENSCAN00000003299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250602761:250649401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000057749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250650800:250727264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT003367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT003369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
NM_053706 // RefSeq // Rattus norvegicus doublesex and mab-3 related transcription factor 1 (Dmrt1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublesex and mab-3 related transcription factor 1 (Dmrt1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:250737582:250841372:1 gene:ENSRNOG00000016075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF379608 // GenBank // Rattus norvegicus doublesex and mab-3 related transcription factor 1 (Dmrt1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250737684:250797014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT003372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106358 // RefSeq // Rattus norvegicus doublesex and mab-3 related transcription factor 3 (Dmrt3), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:250848350:250861669:1 gene:ENSRNOG00000016284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000057752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250832650:250860958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT003373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001107597 // RefSeq // Rattus norvegicus doublesex and mab-3 related transcription factor 2 (Dmrt2), mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000067372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:250921208:250927697:1 gene:ENSRNOG00000016301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:250892272:250927430:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT003374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000015848 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:251632609:251633312:1 gene:ENSRNOG00000011898 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:251632609:251633247:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_001004446 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2 (Smarca2), mRNA. // chr1 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:251867337:252034211:1 gene:ENSRNOG00000011931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AY643746 // GenBank // Rattus norvegicus SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin a2 (Smarca2) mRNA, complete cds. // chr1 // 85 // 100 // 29 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:251798873:252034211:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// NONRATT003380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_013155 // RefSeq // Rattus norvegicus very low density lipoprotein receptor (Vldlr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006231197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus very low density lipoprotein receptor (Vldlr), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000035814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:252487250:252518719:1 gene:ENSRNOG00000027491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// L35767 // GenBank // Rat very low density lipoprotein receptor (VLDLR) mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// GENSCAN00000008318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:252487433:252535279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT003391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001106370 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily V, member 2 (Kcnv2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel, subfamily V, member 2 (Kcnv2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000016757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:252646263:252663285:1 gene:ENSRNOG00000012566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:252646871:252659880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000019859 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:253955803:253956340:1 gene:ENSRNOG00000014782 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:253892456:254006426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_013032 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (neuronal/epithelial high affinity glutamate transporter, system Xag), member 1 (Slc1a1), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254195390:254275293:1 gene:ENSRNOG00000014816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC061743 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (neuronal/epithelial high affinity glutamate transporter, system Xag), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72260 IMAGE:5599027), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// D63772 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neuronal high affinity glutamate transporter, complete cds. // chr1 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// U21104 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal glutamate transporter (rEAAC1/rEAAT3) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// U39555 // GenBank // Rattus norvegicus high affinity glutamate transporter EAAC1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// X94255 // GenBank // R.norvegicus mRNA for glutamate transporter REAAC1. // chr1 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254195569:254274775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT003395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT003396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NONRATT003395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034854 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 2 (Ppapdc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254323970:254326819:1 gene:ENSRNOG00000015268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081970 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:94103 IMAGE:7125531), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011941 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 37-like 1 (Cdc37l1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231201 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle 37-like 1 (Cdc37l1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254349958:254376747:1 gene:ENSRNOG00000010967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC083761 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 37 homolog (S. cerevisiae)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94702 IMAGE:7192975), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254354181:254376242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT003402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001013152 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA terminal phosphate cyclase-like 1 (Rcl1), mRNA. // chr1 // 100 // 51 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA terminal phosphate cyclase-like 1 (Rcl1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 32 // 32 // 0 /// XM_006231208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA terminal phosphate cyclase-like 1 (Rcl1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 59 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254491233:254511640:1 gene:ENSRNOG00000015491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 51 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254471098:254544969:1 gene:ENSRNOG00000015491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 32 // 32 // 0 /// AY310155 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1292 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 65 // 32 // 32 // 0 /// AY325146 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-353 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 61 // 30 // 30 // 0 /// BC091413 // GenBank // Rattus norvegicus RNA terminal phosphate cyclase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:109565 IMAGE:7326310), complete cds. // chr1 // 100 // 51 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254467503:254535352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 84 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT003410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 29 // 49 // 1 /// NONRATT003411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 15 // 49 // 1
NR_031799 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-101b (Mir101b), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053655 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:254503393:254503489:1 gene:ENSRNOG00000035532 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-101b // miRBase Micro RNA Database // MI0000648 Rattus norvegicus miR-101b stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031514 // RefSeq // Rattus norvegicus Janus kinase 2 (Jak2), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254646614:254705434:1 gene:ENSRNOG00000015547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// U13396 // GenBank // Rattus norvegicus protein-tyrosine kinase (JAK2) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254659216:254705258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT003414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001191954 // RefSeq // Rattus norvegicus CD274 molecule (Cd274), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254773784:254785561:1 gene:ENSRNOG00000016112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254773784:254785776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001107582 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 1 ligand 2 (Pdcd1lg2), mRNA. // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// XM_006231209 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus programmed cell death 1 ligand 2 (Pdcd1lg2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000021614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:254810377:254876025:1 gene:ENSRNOG00000016136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// GENSCAN00000050753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254819495:254881305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT003417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
XM_006231255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein RIC1 homolog (RGD1310016), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021783 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:254939281:255032155:1 gene:ENSRNOG00000016172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033590 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:254939281:255009157:1 gene:ENSRNOG00000016172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:254952151:255032155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001106348 // RefSeq // Rattus norvegicus melan-A (Mlana), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000054764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255120234:255134036:1 gene:ENSRNOG00000036608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT003421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001014166 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 33 (Il33), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255386570:255397660:1 gene:ENSRNOG00000016456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// BC081993 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 33, mRNA (cDNA clone MGC:94210 IMAGE:7130307), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ212643 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YC06 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255389266:255396072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT003424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001106349 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein D52-like 3 (Tpd52l3), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// XM_006231260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein D52-like 3 (Tpd52l3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000015016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255895653:255897942:1 gene:ENSRNOG00000011304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000066891 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:255443228:255443923:1 gene:ENSRNOG00000042441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// XM_003749085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein D55-like (LOC100911567), mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// GENSCAN00000011026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255886488:255903208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255407222:255450441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
AY321330 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-067 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000047024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255457574:255461596:1 gene:ENSRNOG00000031628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001107585 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like with PHD and ring finger domains 2, E3 ubiquitin protein ligase (Uhrf2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255476029:255539517:1 gene:ENSRNOG00000011308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255476343:255538660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT003429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT003431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_022704 // RefSeq // Rattus norvegicus mannose-binding lectin (protein C) 2 (Mbl2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000072188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255972162:255979749:1 gene:ENSRNOG00000050305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ210356 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA2YI21 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// M14103 // GenBank // Rat mannose-binding protein C (liver) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// AY325174 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-011 mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// AY325178 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-001 mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// GENSCAN00000011017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255973252:255991504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000050984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:255674113:255708047:1 gene:ENSRNOG00000011637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// GENSCAN00000011023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:255655920:255802848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1 /// NONRATT003436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
NM_001107586 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 2, 64kDa, tau variant (Cstf2t), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:256813774:256817290:1 gene:ENSRNOG00000050289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC169065 // GenBank // Rattus norvegicus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA subunit 2, tau, mRNA (cDNA clone MGC:189465 IMAGE:5599284), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:256813448:256815709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133400 // RefSeq // Rattus norvegicus APOBEC1 complementation factor (A1cf), mRNA. // chr1 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000052256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:257660241:257730453:1 gene:ENSRNOG00000033195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:257660241:257746462:1 gene:ENSRNOG00000033195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// AF290984 // GenBank // Rattus norvegicus APOBEC-1 complementation factor short isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 80 // 31 // 32 // 0 /// AF442133 // GenBank // Rattus norvegicus APOBEC-1 complementation factor 43 kDa variant (ACF) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 93 // 73 // 27 // 29 // 0 /// AF442134 // GenBank // Rattus norvegicus APOBEC-1 complementation factor 45 kDa variant (ACF) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 91 // 58 // 21 // 23 // 0 /// AY028945 // GenBank // Rattus norvegicus APOBEC-1 complementation factor long isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 75 // 29 // 30 // 0 /// XM_006231273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus APOBEC1 complementation factor (A1cf), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 73 // 73 // 29 // 40 // 1 /// GENSCAN00000033306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:257715123:257746462:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0
NONRATT003446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT003447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000024498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:258196576:258300923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001106375 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2 (Papss2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000014979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:258376175:258461336:1 gene:ENSRNOG00000011068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC169061 // GenBank // Rattus norvegicus 3-phosphoadenosine 5-phosphosulfate synthase 2, mRNA (cDNA clone MGC:189455 IMAGE:5621354), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:258424820:258459726:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
ENSRNOT00000054410 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:258389295:258389395:1 gene:ENSRNOG00000036287 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031606 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatase and tensin homolog (Pten), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:258651829:258717009:1 gene:ENSRNOG00000020723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF017185 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase and tensin homolog/mutated in multiple advanced cancers protein (PTEN/MMAC1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF455569 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase and tensin-like protein (Pten) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:258671694:258717009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000073369 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:259113353:259113417:1 gene:ENSRNOG00000049375 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000036161 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:259224017:259225340:1 gene:ENSRNOG00000026057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 91 // 15 // 21 // 0
NM_017341 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase, gastric (Lipf), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:259510954:259525994:1 gene:ENSRNOG00000019448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259510965:259577954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT003458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106374 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase, family member K (Lipk), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:259547048:259578724:1 gene:ENSRNOG00000019409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259510965:259577954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
NM_001191955 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase, family member N (Lipn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:259600620:259616791:1 gene:ENSRNOG00000019395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259600620:259616791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT003460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
XM_001079892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipase, family member M (Lipm), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_220066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipase, family member M (Lipm), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026219 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:259632885:259651652:1 gene:ENSRNOG00000019301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259638804:259649109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0
NM_139194 // RefSeq // Rattus norvegicus Fas cell surface death receptor (Fas), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:259812248:259844583:1 gene:ENSRNOG00000019142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// D26113 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Fas antigen/truncated form, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// D26112 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Fas antigen, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT003461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// GENSCAN00000053269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:259779372:259844583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001024753 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 (Ifit2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260116148:260122209:1 gene:ENSRNOG00000036604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097384 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2, mRNA (cDNA clone MGC:114424 IMAGE:7446350), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260091557:260120408:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT003462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007694 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 (Ifit3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260127719:260132858:1 gene:ENSRNOG00000022839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079079 // GenBank // Rattus norvegicus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, mRNA (cDNA clone MGC:94037 IMAGE:7122607), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260122757:260132209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT003463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_020096 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 (Ifit1), mRNA. // chr1 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260165588:260166976:1 gene:ENSRNOG00000019050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260160478:260166976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT003464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107609 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 20B (Kif20b), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000054753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:260440354:260494019:1 gene:ENSRNOG00000018929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:260423461:260493841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT003467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
ENSRNOT00000025428 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:261833335:261834436:1 gene:ENSRNOG00000018819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:261833434:261836588:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001191083 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 30 subunit (Rpp30), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:262053598:262076260:-1 gene:ENSRNOG00000018718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168653 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7100915, with apparent retained intron. // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:262054221:262076252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT007550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT007551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001129882 // RefSeq // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 5 (Pcgf5), mRNA. // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// XM_006231310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycomb group ring finger 5 (Pcgf5), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:262240468:262351833:1 gene:ENSRNOG00000018532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC167067 // GenBank // Rattus norvegicus polycomb group ring finger 5, mRNA (cDNA clone MGC:189388 IMAGE:7104558), complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// FQ233837 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YD08 mRNA sequence. // chr1 // 81 // 87 // 22 // 27 // 0 /// NONRATT003474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000057661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:262305568:262363668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// NONRATT003477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001107608 // RefSeq // Rattus norvegicus HECT domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (Hectd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000024963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:262443066:262510127:1 gene:ENSRNOG00000018498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000057663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:262442390:262575477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 23 // 41 // 1 /// NONRATT003478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 15 // 41 // 1 /// NONRATT003479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT003480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 18 // 41 // 1 /// NONRATT003481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// NONRATT003482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_001107607 // RefSeq // Rattus norvegicus tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase 2 (Tnks2), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_003749096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tankyrase-2-like (LOC100910717), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003753414 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tankyrase-2-like (LOC100910717), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000039942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:262953201:263006973:1 gene:ENSRNOG00000018392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075210 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:262777122:262827339:1 gene:ENSRNOG00000049249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:262953201:263019520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:262777122:262875489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0
NM_001191917 // RefSeq // Rattus norvegicus BTAF1 RNA polymerase II, B-TFIID transcription factor-associated, 170kDa (Btaf1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000024465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:263055333:263130789:1 gene:ENSRNOG00000017938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000003210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263055606:263127991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
ENSRNOT00000031545 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:263186515:263187274:1 gene:ENSRNOG00000022718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263178416:263187274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSRNOT00000018878 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:263276584:263277062:1 gene:ENSRNOG00000014105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000051535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263276775:263277086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
NM_001106372 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 5 (March5), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:263317720:263338103:1 gene:ENSRNOG00000017396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC158801 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 5, mRNA (cDNA clone MGC:188210 IMAGE:7321043), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263320902:263377379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001169112 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 11 (Kif11), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000022555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:263519768:263570293:1 gene:ENSRNOG00000016715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000051543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263465427:263568925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 27 // 42 // 1 /// NONRATT003494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_024385 // RefSeq // Rattus norvegicus hematopoietically expressed homeobox (Hhex), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000022384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:263583988:263589575:1 gene:ENSRNOG00000016595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC088135 // GenBank // Rattus norvegicus hematopoietically expressed homeobox, mRNA (cDNA clone MGC:108673 IMAGE:7366155), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// D86383 // GenBank // Rattus norvegicus Hex mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT003496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263583999:263597558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 16 // 19 // 1 /// NONRATT003498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
XM_001080210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S12-like (RGD1562542), partial mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_220036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S12-like (RGD1562542), partial mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073324 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:263935011:263935409:1 gene:ENSRNOG00000050136 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:263935044:263935409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025646 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 55 (Cep55), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 55 (Cep55), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022133 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264226027:264241499:1 gene:ENSRNOG00000016377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098013 // GenBank // Rattus norvegicus centrosomal protein 55kDa, mRNA (cDNA clone MGC:116160 IMAGE:7454372), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264185668:264240573:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001047088 // RefSeq // Rattus norvegicus free fatty acid receptor 4 (Ffar4), mRNA. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264266658:264284678:1 gene:ENSRNOG00000021763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AB207868 // GenBank // Rattus norvegicus rGPR120 mRNA for G protein-coupled receptor 120, complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264259468:264284421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT003504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_001108522 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 6C, cGMP specific, cone, alpha prime (Pde6c), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000022317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264302856:264358307:1 gene:ENSRNOG00000016593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000032951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264302856:264363144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0
NM_145769 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich, glioma inactivated 1 (Lgi1), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000020411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264436334:264477681:1 gene:ENSRNOG00000014758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC089222 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich, glioma inactivated 1, mRNA (cDNA clone MGC:105310 IMAGE:7320899), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT003507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001191635 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member G1 (Slc35g1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264556961:264563395:1 gene:ENSRNOG00000029740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264556961:264563395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 63 // 15 // 17 // 0
NM_053758 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, epsilon 1 (Plce1), mRNA. // chr1 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000067149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:264652842:264956663:1 gene:ENSRNOG00000014276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// AF323615 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositide-specific phospholipase C epsilon mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:264882146:264953836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000018668 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:265008850:265089552:1 gene:ENSRNOG00000036598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073502 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:265008850:265089552:1 gene:ENSRNOG00000036598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003749100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family member 12-like (LOC100911865), mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_003749101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family member 12-like (LOC100911914), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_006231339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family member 12-like (LOC100911914), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000072002 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:265335074:265339469:1 gene:ENSRNOG00000046033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000075515 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:265216450:265220845:1 gene:ENSRNOG00000050417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000025589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:265012820:265089552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000050328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:265167800:265339469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_001106371 // RefSeq // Rattus norvegicus helicase, lymphoid specific (Hells), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003749098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte-specific helicase-like (LOC100911660), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte-specific helicase-like (LOC100911660), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase, lymphoid specific (Hells), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helicase, lymphoid specific (Hells), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073015 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:265357155:265399315:1 gene:ENSRNOG00000047104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:265106339:265148860:1 gene:ENSRNOG00000047692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:265357155:265405713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:265129537:265155333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_019184 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, subfamily 2, polypeptide 11 (Cyp2c11), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_003749099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450 2C11-like (LOC100911826), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// XM_006231337 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450 2C11-like (LOC100911826), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000017310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:265418158:265454571:1 gene:ENSRNOG00000012896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC088146 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, subfamily IIC (mephenytoin 4-hydroxylase), mRNA (cDNA clone MGC:108707 IMAGE:7369647), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// J02657 // GenBank // Rat cytochrome P-450(M-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U33173 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P-450 (CYP2C11G) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:265418178:265454238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:265167800:265339469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
XM_006229643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 7-like (LOC100361547), mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// ENSRNOT00000021745 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:154528923:154574017:1 gene:ENSRNOG00000030005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// GENSCAN00000002864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:154467748:154580800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1 /// NONRATT001789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_022587 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 1 (Entpd1), mRNA. // chr1 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000054719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267231613:267259591:1 gene:ENSRNOG00000014574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// U81295 // GenBank // Rattus norvegicus ecto-apyrase mRNA, complete cds. // chr1 // 83 // 88 // 19 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000019751 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:267401507:267425135:1 gene:ENSRNOG00000046546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267370496:267429733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000047095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267196771:267259591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006223755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 2B (Cc2d2b), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006231412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 2B (Cc2d2b), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000040331 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:267460860:267532269:1 gene:ENSRNOG00000025491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267467026:267513975:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267296750:267365884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0
NM_001106369 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin J (Ccnj), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267536881:267553922:1 gene:ENSRNOG00000014551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073537 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:267369734:267384994:1 gene:ENSRNOG00000048973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267536881:267625267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267370496:267429733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_001030038 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 518A (Zfp518a), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267596841:267621543:1 gene:ENSRNOG00000036592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099801 // GenBank // Rattus norvegicus similar to KIAA0335, mRNA (cDNA clone MGC:124846 IMAGE:7936437), complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT003524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012461 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA nucleotidylexotransferase (Dntt), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000051058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:267732290:267763835:1 gene:ENSRNOG00000013615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC089904 // GenBank // Rattus norvegicus deoxynucleotidyltransferase, terminal, mRNA (cDNA clone MGC:109152 IMAGE:7384335), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000011683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:267732307:267763560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT003525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
XM_006223757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor corepressor (Lcor), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268267629:268285359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT003529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006223757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligand dependent nuclear receptor corepressor (Lcor), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033699 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly homolog 15 (yeast) (Cox15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:270939907:270956562:-1 gene:ENSRNOG00000017230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC101929 // GenBank // Rattus norvegicus COX15 homolog, cytochrome c oxidase assembly protein (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:124864 IMAGE:7939237), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT007682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270941613:270963680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000015810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270449719:270459034:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT007683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001109515 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial iron transporter), member 28 (Slc25a28), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231568 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial iron transporter), member 28 (Slc25a28), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:270865549:270876783:-1 gene:ENSRNOG00000016751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166775 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 28, mRNA (cDNA clone IMAGE:7934416), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270865868:270876668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_012571 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 1, soluble (Got1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:270691432:270714931:-1 gene:ENSRNOG00000016356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC061877 // GenBank // Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 1, soluble (aspartate aminotransferase 1), mRNA (cDNA clone MGC:72537 IMAGE:5599273), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D00252 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytosolic aspartate aminotransferase, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// J04171 // GenBank // Rat aspartate aminotransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:270692095:270718724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000018198 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:269675014:269676187:-1 gene:ENSRNOG00000013550 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:269674973:269675826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
NM_040669 // RefSeq // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 1 homolog (human) (Hps1), mRNA. // chr1 // 88 // 91 // 35 // 40 // 0 /// XM_006231379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 1 homolog (human) (Hps1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// AF333325 // GenBank // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome protein (Hps) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 91 // 35 // 40 // 0 /// BC099744 // GenBank // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 1 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:124591 IMAGE:7938691), complete cds. // chr1 // 90 // 91 // 36 // 40 // 0 /// GENSCAN00000008644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:269441803:269466161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 70 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT007661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 33 // 44 // 1 /// NONRATT007665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT007660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
NM_001004261 // RefSeq // Rattus norvegicus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 (Pyroxd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 (Pyroxd2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain 2 (Pyroxd2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:269413550:269438930:-1 gene:ENSRNOG00000015807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079368 // GenBank // Rattus norvegicus Phytn_dehydro and Pyr_redox domain containing protein RGD1303232, mRNA (cDNA clone MGC:94853 IMAGE:7109628), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:269320870:269438927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT007654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001107592 // RefSeq // Rattus norvegicus lysyl oxidase-like 4 (Loxl4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:269286675:269305014:-1 gene:ENSRNOG00000015727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000008652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:269288081:269300999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT007647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_134401 // RefSeq // Rattus norvegicus cartilage acidic protein 1 (Crtac1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268979488:269121995:-1 gene:ENSRNOG00000015220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC089944 // GenBank // Rattus norvegicus cartilage acidic protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7311461), partial cds. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// U78304 // GenBank // Rattus norvegicus W307 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT007640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268966520:269074197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT007642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107591 // RefSeq // Rattus norvegicus secreted frizzled-related protein 5 (Sfrp5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268894580:268899042:-1 gene:ENSRNOG00000014940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268895383:268898801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_134373 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine vasopressin-induced 1 (Avpi1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000019978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268818253:268823980:-1 gene:ENSRNOG00000014828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT007633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001024975 // RefSeq // Rattus norvegicus MORN repeat containing 4 (Morn4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:268775555:268785855:-1 gene:ENSRNOG00000027156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091345 // GenBank // Rattus norvegicus MORN repeat containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:109365 IMAGE:7316315), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF688599 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:268776644:268778427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT007631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT007632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001106352 // RefSeq // Rattus norvegicus polycystic kidney disease 2-like 1 (Pkd2l1), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006231439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease 2-like 1 (Pkd2l1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease 2-like 1 (Pkd2l1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000068007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271367373:271404490:-1 gene:ENSRNOG00000012591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000020684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271369492:271407418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT007710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037349 // RefSeq // Rattus norvegicus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 2 (Bloc1s2), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271358891:271366128:-1 gene:ENSRNOG00000012684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY786315 // GenBank // Rattus norvegicus spinal cord-expressed protein 1 (Sep1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// EF061226 // GenBank // Rattus norvegicus BLOC1S2 isoform (BLOC1S2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT007703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT007708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271332616:271366106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT007705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT007709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001108928 // RefSeq // Rattus norvegicus CWF19-like 1, cell cycle control (S. pombe) (Cwf19l1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271332007:271355243:-1 gene:ENSRNOG00000012763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271332616:271366106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT007701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107588 // RefSeq // Rattus norvegicus conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase (Chuk), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006231479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase (Chuk), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006231480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase (Chuk), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000030782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271293822:271329346:-1 gene:ENSRNOG00000022485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC168905 // GenBank // Rattus norvegicus conserved helix-loop-helix ubiquitous kinase, mRNA (cDNA clone MGC:189182 IMAGE:9088878), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000020698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271297381:271329248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT007698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001106353 // RefSeq // Rattus norvegicus ER lipid raft associated 1 (Erlin1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271255433:271290754:-1 gene:ENSRNOG00000012911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC161938 // GenBank // Rattus norvegicus ER lipid raft associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:187723 IMAGE:9022977), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ209728 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA40YJ22 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271257415:271290373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT007695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_031839 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 23 (Cyp2c23), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271223510:271248144:-1 gene:ENSRNOG00000013291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078707 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily c, polypeptide 23, mRNA (cDNA clone MGC:93122 IMAGE:7110580), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U04733 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley cytochrome P450 arachidonic acid epoxygenase (cyp 2C23) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271223925:271248120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// X55446 // GenBank // Rat mRNA for cytochrome P-450 (CYP2C23). // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT007691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_053526 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase N, polypeptide 1 (Cpn1), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271178733:271207757:-1 gene:ENSRNOG00000013439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AB042599 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for carboxypeptidase N, complete cds. // chr1 // 84 // 93 // 21 // 25 // 0 /// BC088124 // GenBank // Rattus norvegicus carboxypeptidase N, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:108636 IMAGE:7326031), complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271123063:271207556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT007684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
NM_031841 // RefSeq // Rattus norvegicus stearoyl-CoA desaturase (delta-9-desaturase) (Scd), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000075397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271502294:271515353:1 gene:ENSRNOG00000046005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AB032243 // GenBank // Rattus norvegicus Scd2 mRNA for stearoyl-CoA desaturase 2, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// BC061737 // GenBank // Rattus norvegicus stearoyl-CoA desaturase (delta-9-desaturase), mRNA (cDNA clone MGC:72380 IMAGE:5599134), complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT003585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271501173:271511728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
XM_001057317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stearoyl-coenzyme A desaturase 4 (Scd4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006223763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stearoyl-coenzyme A desaturase 4 (Scd4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000017834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271537502:271548263:1 gene:ENSRNOG00000032554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271515791:271581469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 89 // 15 // 16 // 0
ENSRNOT00000053460 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:271618758:271618876:1 gene:ENSRNOG00000047325 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106359 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 8B (Wnt8b), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271703670:271707467:1 gene:ENSRNOG00000013817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271628408:271707000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001113749 // RefSeq // Rattus norvegicus hypoxia-inducible factor 1, alpha subunit inhibitor (Hif1an), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271752379:271762020:1 gene:ENSRNOG00000014234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC158810 // GenBank // Rattus norvegicus hypoxia-inducible factor 1, alpha subunit inhibitor, mRNA (cDNA clone MGC:188245 IMAGE:7368955), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271752390:271761743:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT003588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001106361 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 2 (Pax2), mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000050076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:271947266:272025770:1 gene:ENSRNOG00000014253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// XM_006231444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box 2 (Pax2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1 /// GENSCAN00000019899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272004907:272025717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1 /// GENSCAN00000019896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271816222:271983636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 17 // 39 // 1
ENSRNOT00000053353 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:272091501:272091618:1 gene:ENSRNOG00000048135 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0
NM_001134612 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 178, member A (Fam178a), mRNA. // chr1 // 97 // 85 // 34 // 35 // 0 /// XM_006231553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 178, member A (Fam178a), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 97 // 80 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000034814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272113227:272175693:1 gene:ENSRNOG00000014482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 85 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000048434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272120334:272138353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT003595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NONRATT003593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1
NM_001108526 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 4G (Sema4g), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272184299:272195785:1 gene:ENSRNOG00000014650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272152660:272194338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT003599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001107599 // RefSeq // Rattus norvegicus progressive external ophthalmoplegia 1 (Peo1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272198895:272205288:1 gene:ENSRNOG00000014935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272199607:272210210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT003606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001014247 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine zipper, putative tumor suppressor 2 (Lzts2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper, putative tumor suppressor 2 (Lzts2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006231548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper, putative tumor suppressor 2 (Lzts2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000048843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272213429:272218933:1 gene:ENSRNOG00000014969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY928801 // GenBank // Rattus norvegicus LZTS2 (Lzts2) mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 85 // 25 // 29 // 0 /// BC083580 // GenBank // Rattus norvegicus leucine zipper, putative tumor suppressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:94184 IMAGE:7129196), complete cds. // chr1 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// DQ176638 // GenBank // Rattus norvegicus LAPSER1 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 85 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272213471:272218358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT003609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT003608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_022948 // RefSeq // Rattus norvegicus sideroflexin 3 (Sfxn3), mRNA. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006231562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sideroflexin 3 (Sfxn3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sideroflexin 3 (Sfxn3), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272239201:272247546:1 gene:ENSRNOG00000015442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF276997 // GenBank // Rattus norvegicus tricarboxylate carrier-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// BC062043 // GenBank // Rattus norvegicus sideroflexin 3, mRNA (cDNA clone MGC:72434 IMAGE:5597953), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272240699:272246064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT003612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT003613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001033064 // RefSeq // Rattus norvegicus Kazal-type serine peptidase inhibitor domain 1 (Kazald1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272270128:272273540:1 gene:ENSRNOG00000016058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC103652 // GenBank // Rattus norvegicus Kazal-type serine peptidase inhibitor domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:125157 IMAGE:7317353), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272260151:272290210:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT003617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001109166 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell leukemia, homeobox 1 (Tlx1), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272335530:272341791:1 gene:ENSRNOG00000016120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272335731:272368827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001007148 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase (Btrc), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006231534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase (Btrc), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase (Btrc), transcript variant X11, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272580308:272705419:1 gene:ENSRNOG00000016280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC085125 // GenBank // Rattus norvegicus beta-transducin repeat containing, mRNA (cDNA clone MGC:105884 IMAGE:7131883), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017914 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272632676:272703409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT003622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT003623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001013905 // RefSeq // Rattus norvegicus deleted in primary ciliary dyskinesia (Dpcd), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deleted in primary ciliary dyskinesia (Dpcd), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:272738456:272756533:1 gene:ENSRNOG00000017241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078988 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG13901-PA, mRNA (cDNA clone MGC:93886 IMAGE:7112530), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ226696 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YL18 mRNA sequence. // chr1 // 78 // 88 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:272742954:272755677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT003630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// NONRATT003631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT003632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_181432 // RefSeq // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 6 (Hps6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273191755:273194363:1 gene:ENSRNOG00000018433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086975 // GenBank // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 6, mRNA (cDNA clone MGC:93064 IMAGE:7193621), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273191823:273194252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT003636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106363 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator-related 1 (Pprc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273241077:273257483:1 gene:ENSRNOG00000018561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273241131:273269539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_022869 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 (Nolc1), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000025791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273260272:273270982:1 gene:ENSRNOG00000018704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// M94287 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar phosphoprotein of 140kD, Nopp140 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// M94288 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar phosphoprotein of 140kD, Nopp140 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT003644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000050573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273241131:273269539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// NONRATT003645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_001107602 // RefSeq // Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 3 (Elovl3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273313712:273317540:1 gene:ENSRNOG00000019124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273310719:273316656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT003648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001191634 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi brefeldin A resistant guanine nucleotide exchange factor 1 (Gbf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000036156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273335046:273464048:1 gene:ENSRNOG00000026048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000050539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273346056:273490082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT003655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT003658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1
NM_001008349 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2, p49/p100 (Nfkb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000026235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273483943:273490197:1 gene:ENSRNOG00000019311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC085800 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 2, p49/p100, mRNA (cDNA clone MGC:93816 IMAGE:7110486), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// FQ226161 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA34YE12 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 97 // 34 // 38 // 0 /// GENSCAN00000050539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273346056:273490082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT003667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT003668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT003666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT003669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1
NM_001107603 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 15 (Fbxl15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273506723:273508964:1 gene:ENSRNOG00000019509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ235302 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YL12 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273507014:273508812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_006231504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 180 (Tmem180), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 180 (Tmem180), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 180 (Tmem180), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000043925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273536065:273553299:1 gene:ENSRNOG00000019674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC083852 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930538D17, mRNA (cDNA clone MGC:95047 IMAGE:7123646), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273544832:273552754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT003678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001024899 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of fused homolog (Drosophila) (Sufu), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273574759:273669937:1 gene:ENSRNOG00000019807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC097447 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of fused homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:114507 IMAGE:7456556), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273632206:273700857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT003682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001128083 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 8 (Trim8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273686719:273701616:1 gene:ENSRNOG00000019968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273632206:273700857:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT003686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT003688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001013072 // RefSeq // Rattus norvegicus sideroflexin 2 (Sfxn2), mRNA. // chrU // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// XM_006257696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sideroflexin-2-like (LOC100910912), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027112 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109382.1:24888:27993:1 gene:ENSRNOG00000020011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 37 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000071243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273764160:273776423:1 gene:ENSRNOG00000049308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// BC081888 // GenBank // Rattus norvegicus sideroflexin 2, mRNA (cDNA clone MGC:93782 IMAGE:7109479), complete cds. // chrU // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// XM_006257695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sideroflexin-2-like (LOC100910912), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 59 // 59 // 24 // 41 // 1 /// GENSCAN00000042821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273764622:273783989:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022702 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109382.1:17528:30537:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 46 // 46 // 19 // 41 // 1 /// NONRATT003691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
BC088414 // GenBank HTC // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20154, mRNA (cDNA clone IMAGE:7110256), with apparent retained intron. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NM_001127484 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain binding protein 1-like (Wbp1l), mRNA. // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000027118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273789070:273845332:1 gene:ENSRNOG00000020020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// FQ217301 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA2YM18 mRNA sequence. // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT003693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000042829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273789195:273842731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT003694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001134509 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2010012O05 (RGD1311783), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273881051:273894737:1 gene:ENSRNOG00000020076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221652 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA33YH05 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT003698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT003701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000042817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273881095:273956391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
BC061533 // GenBank // Rattus norvegicus arsenic (+3 oxidation state) methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:72713 IMAGE:6918024), complete cds. // chr1 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NM_080890 // RefSeq // Rattus norvegicus arsenite methyltransferase (As3mt), mRNA. // chr1 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// XM_006231428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arsenic (+3 oxidation state) methyltransferase (As3mt), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000027223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273913120:273945391:1 gene:ENSRNOG00000020081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// AF393243 // GenBank // Rattus norvegicus S-adenosylmethionine:arsenic (III) methyltransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// NONRATT003705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT003706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:273881095:273956391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT003704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT003710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT003707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001011942 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin M2 (Cnnm2), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000054699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:273961301:274079325:1 gene:ENSRNOG00000020113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC085930 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin M2, mRNA (cDNA clone MGC:94883 IMAGE:7110800), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274043774:274078789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT003717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_019128 // RefSeq // Rattus norvegicus internexin neuronal intermediate filament protein, alpha (Ina), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274212015:274224817:1 gene:ENSRNOG00000020248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274213307:274223064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106365 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF5 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274274891:274290376:1 gene:ENSRNOG00000020274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000021377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274274913:274297288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT003721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001107604 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 11 (Pdcd11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000027512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274297342:274338453:1 gene:ENSRNOG00000020304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000021361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274299014:274316089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000021373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274320174:274337415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 49 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001107605 // RefSeq // Rattus norvegicus neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1 (Neurl1), mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// XM_006231510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1 (Neurl1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231511 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1 (Neurl1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000054696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274383497:274451430:1 gene:ENSRNOG00000020339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000021358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274449068:274468115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT003730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT003731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_019349 // RefSeq // Rattus norvegicus STE20-like kinase (Slk), mRNA. // chr1 // 92 // 95 // 36 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000015495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274792996:274845812:1 gene:ENSRNOG00000011339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000052971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274793164:274845796:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// AB003357 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein kinase, complete cds. // chr1 // 92 // 93 // 35 // 38 // 0 /// NONRATT003736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT003739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1
NM_001047856 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI5-dependent recombination repair 1 (Sfr1), mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// XM_006231477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI5-dependent recombination repair 1 (Sfr1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// AY383685 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00030 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:274916100:274942306:1 gene:ENSRNOG00000012641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:274938355:274941787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT003743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001007602 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase omega 1 (Gsto1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:275040049:275050032:1 gene:ENSRNOG00000028746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079363 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase omega 1, mRNA (cDNA clone MGC:94845 IMAGE:7109248), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FJ179405 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase omega 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:275036745:275072164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT003747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT003751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001012071 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase omega 2 (Gsto2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutathione S-transferase omega 2 (Gsto2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:275050894:275072300:1 gene:ENSRNOG00000012801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:278657081:278671287:1 gene:ENSRNOG00000049964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// BC079295 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase omega 2, mRNA (cDNA clone MGC:94431 IMAGE:7134485), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ179406 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase omega 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:278640223:278671287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT003752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:275036745:275072164:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_003749139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 147 (Ccdc147), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006223770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 147-like (LOC102553148), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006231594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 147-like (LOC102553148), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000073772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:278723781:278828027:1 gene:ENSRNOG00000049596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000073978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:275124657:275228017:1 gene:ENSRNOG00000048596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:278723928:278823363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:275124666:275223731:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_001106367 // RefSeq // Rattus norvegicus sortilin-related VPS10 domain containing receptor 3 (Sorcs3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:275416587:276058327:1 gene:ENSRNOG00000028832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:275970806:276058327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT003757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_019129 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin 1 (Ins1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:280213615:280214178:1 gene:ENSRNOG00000012052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ231224 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA77YF17 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:280213791:280214123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT003760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT007874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT007876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013160 // RefSeq // Rattus norvegicus MAX interactor 1 (Mxi1), mRNA. // chrU // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// XM_006231606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAX interactor 1 (Mxi1), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000042822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281463334:281503728:1 gene:ENSRNOG00000034078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// AF003008 // GenBank // Rattus norvegicus Mxi1 protein (rMxi1) mRNA, complete cds. // chrU // 80 // 85 // 33 // 41 // 0 /// AY495712 // GenBank // Rattus norvegicus Max interacting protein 1 short isoform (Mxi1) mRNA, partial cds, alternatively spliced. // chrU // 90 // 21 // 9 // 10 // 0 /// BC081824 // GenBank // Rattus norvegicus MAX interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:93544 IMAGE:7133853), complete cds. // chrU // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// U44728 // GenBank // Rattus norvegicus Mxi1 protein (MXI1) mRNA, partial cds. // chrU // 78 // 48 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281444372:281502185:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 56 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT003775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT003778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 73 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT003776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 34 // 48 // 1 /// NONRATT003777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 34 // 48 // 1 /// NONRATT003773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 33 // 33 // 16 // 48 // 1
NM_013160 // RefSeq // Rattus norvegicus MAX interactor 1 (Mxi1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAX interactor 1 (Mxi1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281463334:281503728:1 gene:ENSRNOG00000034078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF003008 // GenBank // Rattus norvegicus Mxi1 protein (rMxi1) mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC081824 // GenBank // Rattus norvegicus MAX interactor 1, mRNA (cDNA clone MGC:93544 IMAGE:7133853), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U44728 // GenBank // Rattus norvegicus Mxi1 protein (MXI1) mRNA, partial cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT003774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT003777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT003778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281444372:281502185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_133578 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 5 (Dusp5), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281658075:281671441:1 gene:ENSRNOG00000014061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF013144 // GenBank // Rattus norvegicus MAP-kinase phosphatase (cpg21) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281658249:281670396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_031583 // RefSeq // Rattus norvegicus structural maintenance of chromosomes 3 (Smc3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281719796:281762525:1 gene:ENSRNOG00000014173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000054686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281719829:281762530:1 gene:ENSRNOG00000014173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U82626 // GenBank // Rattus norvegicus basement membrane-associated chondroitin proteoglycan Bamacan mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281754586:281762163:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000004993 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281719918:281753127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT003787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT003789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001107611 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 20 (Rbm20), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 20 (Rbm20), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 20 (Rbm20), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231611 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 20 (Rbm20), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231612 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 20 (Rbm20), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000054685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:281801481:282003053:1 gene:ENSRNOG00000014705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// EU562301 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 20 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:281952263:281993344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// NONRATT003791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_022265 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 4 (Pdcd4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006231615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus programmed cell death 4 (Pdcd4), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:282038264:282061732:1 gene:ENSRNOG00000014779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000059153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:282038264:282061732:1 gene:ENSRNOG00000014779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// AF239739 // GenBank // Rattus norvegicus death-upregulated gene (DUG) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC167751 // GenBank // Rattus norvegicus programmed cell death 4, mRNA (cDNA clone MGC:187330 IMAGE:9027822), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:282042186:282060931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT003794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NONRATT003796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001009698 // RefSeq // Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 3 (Lysmd3), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000021818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:9409771:9412384:1 gene:ENSRNOG00000016298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC088262 // GenBank // Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:109090 IMAGE:7376577), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000019793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:9381847:9412310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001013155 // RefSeq // Rattus norvegicus soc-2 suppressor of clear homolog (C. elegans) (Shoc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// ENSRNOT00000020580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:282112968:282163537:1 gene:ENSRNOG00000015339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// BC079032 // GenBank // Rattus norvegicus soc-2 (suppressor of clear) homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:93960 IMAGE:7114263), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// GENSCAN00000012470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:282113179:282163357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0 /// NONRATT003797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 79 // 79 // 0
NM_001106200 // RefSeq // Rattus norvegicus tectorin beta (Tectb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:283358674:283377599:1 gene:ENSRNOG00000015671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:283358803:283373807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT003798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_053607 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase long-chain family member 5 (Acsl5), mRNA. // chr1 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000022126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:283660224:283685366:1 gene:ENSRNOG00000016265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AB012933 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for acyl-CoA synthetase 5, complete cds. // chr1 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// BC072497 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase long-chain family member 5, mRNA (cDNA clone MGC:91566 IMAGE:7096959), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// FQ218149 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YI08 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// FQ226883 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YA10 mRNA sequence. // chr1 // 69 // 40 // 11 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:283660224:283684225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// NONRATT003799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT003800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT003801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT003802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT003803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_001191052 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 7-like 2 (T-cell specific, HMG-box) (Tcf7l2), mRNA. // chrU // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284095287:284118928:1 gene:ENSRNOG00000049232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000045642 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:283399380:283411892:-1 gene:ENSRNOG00000013993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:283395587:283411892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000044166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284104156:284117180:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 32 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT003816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000019605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284014307:284099166:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// NONRATT003812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// NONRATT003815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001001505 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan binding protein 2 (Habp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006231631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hyaluronan binding protein 2 (Habp2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284451958:284486017:1 gene:ENSRNOG00000016659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284451955:284486016:1 gene:ENSRNOG00000016659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB177406 // GenBank // Rattus norvegicus PHBP mRNA for hyaluronan-binding protein, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC129080 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronan binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:156541 IMAGE:8374257), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284451993:284485557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT003821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT003822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_022260 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 7 (Casp7), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caspase 7 (Casp7), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006231651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caspase 7 (Casp7), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284591629:284623731:1 gene:ENSRNOG00000016836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// AF072124 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-7 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// BC070936 // GenBank // Rattus norvegicus caspase 7, mRNA (cDNA clone MGC:91698 IMAGE:7099111), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284608912:284671267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001134613 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family S member 1 (Plekhs1), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284642638:284672327:1 gene:ENSRNOG00000016926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT003825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284608912:284671267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001107444 // RefSeq // Rattus norvegicus NHL repeat containing 2 (Nhlrc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006231645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NHL repeat containing 2 (Nhlrc2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284736412:284796700:1 gene:ENSRNOG00000016948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000044341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284736833:284789246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_012701 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenoceptor beta 1 (Adrb1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:284917872:284919272:1 gene:ENSRNOG00000017002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:284917872:284919272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106202 // RefSeq // Rattus norvegicus tudor domain containing 1 (Tdrd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006231636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 1 (Tdrd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006231639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 1 (Tdrd1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000023024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:285021523:285065106:1 gene:ENSRNOG00000017064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000044333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:285024199:285100522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 85 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT003835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
XM_003749146 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 2 (Vwa2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051834 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:285076089:285108016:1 gene:ENSRNOG00000025581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:285024199:285100522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000023247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:285574327:285597886:1 gene:ENSRNOG00000017225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ234191 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YN13 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// FQ234370 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YD16 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000044926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:285485372:285597555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT003838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001012173 // RefSeq // Rattus norvegicus TruB pseudouridine (psi) synthase family member 1 (Trub1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:285685221:285786577:1 gene:ENSRNOG00000017321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087683 // GenBank // Rattus norvegicus TruB pseudouridine (psi) synthase homolog 1 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:105781 IMAGE:7320660), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:285767198:285785925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT003844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT003843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT003846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
XM_006223804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus attractin like 1 (Atrnl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023363 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:285997036:286113279:1 gene:ENSRNOG00000017406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000023414 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:285926442:286113279:1 gene:ENSRNOG00000017406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067127 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:285926442:286045030:1 gene:ENSRNOG00000017406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:285912398:286080500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001014169 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 172 (Ccdc172), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 172 (Ccdc172), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:286995704:287038478:1 gene:ENSRNOG00000017656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC079324 // GenBank // Rattus norvegicus LOC361776, mRNA (cDNA clone MGC:94503 IMAGE:7135457), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:286996073:287030895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT003849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT003851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_013161 // RefSeq // Rattus norvegicus pancreatic lipase (Pnlip), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pancreatic lipase (Pnlip), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287159727:287172912:1 gene:ENSRNOG00000017725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M58369 // GenBank // Rat pancreatic triglyceride lipase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287159841:287290473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_032081 // RefSeq // Rattus norvegicus pancreatic lipase-related protein 1 (Pnliprp1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287228054:287243683:1 gene:ENSRNOG00000017908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ232772 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YH20 mRNA sequence. // chr1 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287159841:287290473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_057206 // RefSeq // Rattus norvegicus pancreatic lipase-related protein 2 (Pnliprp2), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000068119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287258071:287290473:1 gene:ENSRNOG00000017982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// L09216 // GenBank // Rat glycosylated membrane-associated lipase mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287159841:287290473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001134505 // RefSeq // Rattus norvegicus enolase family member 4 (Eno4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287467133:287490511:1 gene:ENSRNOG00000018310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287467165:287514352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT003861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001003820 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 18 (Kcnk18), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NM_001134912 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 18 (Kcnk18), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287744272:287758268:1 gene:ENSRNOG00000032706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287744272:287758268:1 gene:ENSRNOG00000032706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// AY567970 // GenBank // Rattus norvegicus 2P K ion channel TRESK mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// EU152989 // GenBank // Rattus norvegicus K(2P) channel-a subtype mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287723985:287758191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013031 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 18 (vesicular monoamine transporter), member 2 (Slc18a2), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287783563:287817632:1 gene:ENSRNOG00000008890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// L00603 // GenBank // Rat vesicular monoamine transporter mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// M97381 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic vesicle amine transporter (SVAT) mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287762225:287816372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 71 // 23 // 24 // 0
NM_001109169 // RefSeq // Rattus norvegicus empty spiracles homeobox 2 (Emx2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:287993648:288000656:1 gene:ENSRNOG00000009482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:287966781:288095268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSRNOT00000032596 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:288658619:288659090:1 gene:ENSRNOG00000025242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:288658619:288659044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 77 // 13 // 17 // 0
XM_006223790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nanos homolog 1 (Drosophila) (Nanos1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036203 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:289473532:289474323:1 gene:ENSRNOG00000025060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289473532:289474323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001127681 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 45, member A (Fam45a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:289526637:289550131:1 gene:ENSRNOG00000010230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289526685:289548934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_030829 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 5 (Grk5), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000015687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:289603945:289797677:1 gene:ENSRNOG00000011439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC081792 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 5, mRNA (cDNA clone MGC:93405 IMAGE:7123515), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U34841 // GenBank // Rattus norvegicus G protein coupled receptor kinase 5 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000006471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289603172:289797213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT003873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_001066541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycine cleavage system H protein, mitochondrial-like (RGD1563099), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_217678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycine cleavage system H protein, mitochondrial-like (RGD1563099), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289892982:289910617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
XM_001074128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 2I (Ces2i), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006223795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 2I (Ces2i), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006231693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 2I (Ces2i), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_212849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 2I (Ces2i), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000015997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:289903227:289910829:1 gene:ENSRNOG00000012034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000006468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289892982:289910617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
NM_133586 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2C (Ces2c), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:290014349:290021900:1 gene:ENSRNOG00000036571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073241 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:289976771:289984149:1 gene:ENSRNOG00000047661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AB010635 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for carboxylesterase precursor, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AB191005 // GenBank // Rattus norvegicus rCES2 mRNA for carboxylesterase 2, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NM_001190369 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase-like (LOC100365112), mRNA. // chr1 // 32 // 90 // 9 // 28 // 0 /// NM_001271303 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2 (Ces2), mRNA. // chr1 // 35 // 84 // 9 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:290029537:290037029:1 gene:ENSRNOG00000050702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 90 // 9 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:289964336:289984149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:290009059:290021711:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000043877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:111292170:111322102:1 gene:ENSRNOG00000047388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000070942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:111292170:111322081:1 gene:ENSRNOG00000047388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000071037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:111292170:111355229:1 gene:ENSRNOG00000047388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000072076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:111292170:111593613:1 gene:ENSRNOG00000047388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000074402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:111292170:111355229:1 gene:ENSRNOG00000047388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
NM_001099458 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 4 (Vom2r4), mRNA. // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000048913 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:703156:708575:-1 gene:ENSRNOG00000029249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr10 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:704304:801554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr10 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0
XM_006250513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 66 (Vom2r66), mRNA. // chr1 // 63 // 48 // 17 // 27 // 0 /// NM_173320 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 75 (Vom2r75), mRNA. // chr1 // 36 // 100 // 20 // 56 // 0 /// XM_006221621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 66 (Vom2r66), mRNA. // chr1 // 43 // 96 // 23 // 54 // 0 /// ENSRNOT00000036914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:11866:38002:-1 gene:ENSRNOG00000022955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 100 // 20 // 56 // 0 /// AF016185 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN13C) mRNA, complete cds. // chr1 // 36 // 100 // 20 // 56 // 0 /// GENSCAN00000044063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3269310:3279096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 61 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:12471:13373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 50 // 8 // 28 // 0 /// NONRATT026348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 100 // 20 // 56 // 0 /// GENSCAN00000046011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:1404527:1441601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 18 // 18 // 10 // 56 // 1
GENSCAN00000046468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:12471:13373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 100 // 8 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3269310:3279096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
XM_006222813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-beta-like (LOC100913013), mRNA. // chr1 // 56 // 82 // 15 // 27 // 0 /// XR_349798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547284 (LOC102547284), ncRNA. // chr1 // 67 // 73 // 16 // 24 // 0 /// XM_006227610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon-like (LOC102550031), mRNA. // chr1 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// XM_002727344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-delta-like (LOC679782), mRNA. // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// XM_006227157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon-like (LOC102556724), mRNA. // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:2915950:2993351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 100 // 26 // 33 // 0 /// NONRATT003886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3007113:3072942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 100 // 19 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000062033 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:2988150:2993351:-1 gene:ENSRNOG00000040305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 88 // 11 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000075346 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:3093948:3096149:-1 gene:ENSRNOG00000050129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// NONRATT003887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_006227083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-gamma-like (RGD1559424), partial mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006227600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-gamma-like (RGD1559424), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000062027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:2810613:2825886:-1 gene:ENSRNOG00000040300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:2811610:2825886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006222813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-beta-like (LOC100913013), mRNA. // chr1 // 70 // 82 // 16 // 23 // 0 /// XM_006227609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909823 (LOC100909823), mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// XM_006227610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid early-inducible protein 1-epsilon-like (LOC102550031), mRNA. // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000062033 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:2988150:2993351:-1 gene:ENSRNOG00000040305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3007113:3072942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:2915950:2993351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_013073 // RefSeq // Rattus norvegicus protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase 1 (Pcmt1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3433956:3464919:-1 gene:ENSRNOG00000014330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC088417 // GenBank // Rattus norvegicus protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:95039 IMAGE:7123213), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D11475 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for isoaspartyl protein carboxyl methyltransferase, complete cds. // chr1 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT003889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M26686 // GenBank // Rattus norvegicus carboxyl methyltransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3419998:3464857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT003890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT003891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006222816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein integral membrane 1 (Ginm1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006222817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein integral membrane 1 (Ginm1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein integral membrane 1 (Ginm1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006227627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycoprotein integral membrane 1 (Ginm1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020810 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:3566601:3582540:-1 gene:ENSRNOG00000015239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ228838 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YE07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3567145:3582537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT003893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
XM_001068593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S20-like (RGD1563636), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_218063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S20-like (RGD1563636), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000000032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:3585492:3585851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001012062 // RefSeq // Rattus norvegicus TGF-beta activated kinase 1/MAP3K7 binding protein 2 (Tab2), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006227620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGF-beta activated kinase 1/MAP3K7 binding protein 2 (Tab2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3696211:3770496:-1 gene:ENSRNOG00000016054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:3696211:3770496:-1 gene:ENSRNOG00000016054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC085788 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93764 IMAGE:7108689), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006227617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGF-beta activated kinase 1/MAP3K7 binding protein 2 (Tab2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// XM_006227619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TGF-beta activated kinase 1/MAP3K7 binding protein 2 (Tab2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT003895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_001108458 // RefSeq // Rattus norvegicus uronyl-2-sulfotransferase (Ust), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:4022062:4313796:-1 gene:ENSRNOG00000016381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT003898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:4012487:4143066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENSRNOT00000035749 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:4327980:4329065:-1 gene:ENSRNOG00000023568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:4320471:4340569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_003748645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAM and SH3 domain containing 1 (Sash1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000017688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:4470756:4631378:-1 gene:ENSRNOG00000013160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000048881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:4469308:4491837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:4496189:4543600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
GENSCAN00000022320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:4880888:4893808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108901 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 5 (Samd5), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:5388579:5437905:-1 gene:ENSRNOG00000023549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:5404382:5442843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT003907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
FQ214558 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA1YN06 mRNA sequence. // chr1 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1 /// GENSCAN00000006892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:5522766:5562072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// NONRATT003908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1 /// NONRATT003909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NONRATT003911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT003912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006222819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus androglobin (Adgb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006227630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus androglobin (Adgb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000061954 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:6109841:6231640:-1 gene:ENSRNOG00000042741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000061956 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:6109841:6231640:-1 gene:ENSRNOG00000042741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:6109841:6213654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_001108902 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB32, member RAS oncogene family (Rab32), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:6299755:6314539:-1 gene:ENSRNOG00000014258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ223948 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA82YC06 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:6301002:6412115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001114330 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 1 (Grm1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_017011 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 1 (Grm1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:6413420:6818380:-1 gene:ENSRNOG00000014290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:6436712:6818380:-1 gene:ENSRNOG00000014290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// M61099 // GenBank // Rat metabotropic glutamate receptor (MGLUR1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:6416258:6476970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT003925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT003926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001108659 // RefSeq // Rattus norvegicus dynactin 3 (Dctn3), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62622817:62630771:-1 gene:ENSRNOG00000014208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ222216 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA27YB19 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019345 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:6889413:6889973:-1 gene:ENSRNOG00000014431 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62623189:62639043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:6889413:6889973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT003927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// NONRATT044636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_013070 // RefSeq // Rattus norvegicus utrophin (Utrn), mRNA. // chr1 // 95 // 99 // 71 // 75 // 0 /// XM_006227631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus utrophin (Utrn), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 71 // 71 // 0 /// XM_006227632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus utrophin (Utrn), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 74 // 74 // 0 /// XM_006227636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus utrophin (Utrn), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 71 // 71 // 0 /// ENSRNOT00000016273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:8098753:8608676:-1 gene:ENSRNOG00000011058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 99 // 75 // 75 // 0 /// GENSCAN00000053941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:8314085:8484957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000053942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:8076469:8262897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 19 // 76 // 1 /// NONRATT003928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 16 // 16 // 12 // 76 // 1
NM_001025638 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 11 (Stx11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:8676472:8678091:-1 gene:ENSRNOG00000014902 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC099159 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 11, mRNA (cDNA clone MGC:116325 IMAGE:7381603), complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:8677485:8678348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT003938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001014157 // RefSeq // Rattus norvegicus LTV1 ribosome biogenesis factor (Ltv1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:8958295:8971014:-1 gene:ENSRNOG00000015217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079397 // GenBank // Rattus norvegicus LTV1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94927 IMAGE:7112501), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ214000 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YG04 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// GENSCAN00000025488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:8958576:8971086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT003940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_214458 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatase and actin regulator 2 (Phactr2), mRNA. // chr1 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000048754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:8990542:9111369:-1 gene:ENSRNOG00000015473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AY500158 // GenBank // Rattus norvegicus PHACTR2 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:9018028:9111362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000041985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:8990141:9015032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_031350 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 3 (Pex3), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// XM_006227643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 3 (Pex3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:9313354:9354376:-1 gene:ENSRNOG00000015660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB035306 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Pex3p, complete cds. // chr1 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// BC062046 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 3, mRNA (cDNA clone MGC:72404 IMAGE:5597999), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:9315539:9348769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT003945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT003946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001134425 // RefSeq // Rattus norvegicus androgen-induced 1 (Aig1), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:9445190:9665307:-1 gene:ENSRNOG00000010753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC167098 // GenBank // Rattus norvegicus androgen-induced 1, mRNA (cDNA clone MGC:189539 IMAGE:7319120), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FQ213348 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YF07 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 80 // 21 // 24 // 0 /// FQ228352 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA9YH21 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 53 // 15 // 16 // 0 /// FQ228880 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YN18 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus androgen-induced 1 (Aig1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT003948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000014254 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:9660046:9660578:-1 gene:ENSRNOG00000010742 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000009571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:9639041:9665209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_001071417 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 126 (Gpr126), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_218313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 126 (Gpr126), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030511 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:10203643:10274931:-1 gene:ENSRNOG00000011411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:10172557:10256727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT003950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001025640 // RefSeq // Rattus norvegicus vesicle (multivesicular body) trafficking 1 (Vta1), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:10447776:10495500:-1 gene:ENSRNOG00000011540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC098787 // GenBank // Rattus norvegicus Vps20-associated 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112826 IMAGE:7375248), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:10448126:10477393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT003953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT003954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001197092 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, epsilon 1 (Gje1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:10501325:10503331:-1 gene:ENSRNOG00000012092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001059859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 5 (Dppa5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006227666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100360362 (LOC100360362), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_236761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 5 (Dppa5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000000215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85265568:-1 gene:ENSRNOG00000000199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040010 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:70164190:70164543:-1 gene:ENSRNOG00000032335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000047129 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14646133:14646486:-1 gene:ENSRNOG00000031089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049144 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:43466258:43466611:1 gene:ENSRNOG00000029793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14646133:14646483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85273561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000018960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43466261:43466611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70164190:70164540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107514 // RefSeq // Rattus norvegicus headcase homolog (Drosophila) (Heca), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000036663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:14730556:14744291:-1 gene:ENSRNOG00000012466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14733972:14752837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_001099647 // RefSeq // Rattus norvegicus ABRA C-terminal like (Abracl), mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000016618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:14859231:14869483:-1 gene:ENSRNOG00000040145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC089921 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Protein C6orf115, mRNA (cDNA clone MGC:109201 IMAGE:7306744), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ221434 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA36YF23 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// XM_006227665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ABRA C-terminal like (Abracl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT003967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT003968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037789 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 28A (Ccdc28a), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:15072111:15083325:-1 gene:ENSRNOG00000012885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC100268 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 28A, mRNA (cDNA clone MGC:116395 IMAGE:7385321), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// FQ213153 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YH01 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 28A (Ccdc28a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// XM_006227661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 28A (Ccdc28a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:15077552:15099962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT003969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT003971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT003972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XM_006222826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), transcript variant X6, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227673 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), mRNA. // chrU // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000061754 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:14991251:15030947:-1 gene:ENSRNOG00000040140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000017310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14991251:15072641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:13369243:13411938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_006222826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006222828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_006227673 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000061754 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:14991251:15030947:-1 gene:ENSRNOG00000040140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14991251:15072641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006222826 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227673 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial cell transforming sequence 2 oncogene-like (Ect2l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:13369243:13411938:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107515 // RefSeq // Rattus norvegicus heme binding protein 2 (Hebp2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:15398929:15404431:-1 gene:ENSRNOG00000011409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:15399269:15404126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XM_001072524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3-like (RGD1309903), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015927 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:13988001:14063960:-1 gene:ENSRNOG00000011460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000024115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:13988001:14066267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0
XM_001072561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Z-like (RGD1560303), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_218667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Z-like (RGD1560303), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004344 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:15678308:15679771:-1 gene:ENSRNOG00000025799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:15675964:15683783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107522 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member D3 (Slc35d3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:16846809:16850281:-1 gene:ENSRNOG00000012311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16825472:16849836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001034147 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 7 (Pex7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:16860050:16923047:-1 gene:ENSRNOG00000012322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC100091 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 7, mRNA (cDNA clone MGC:112795 IMAGE:7371990), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ213635 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YK09 mRNA sequence. // chr1 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// NONRATT003978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16888811:16922936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
GENSCAN00000039358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:16938013:16938411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// NONRATT003979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000044583 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:16937970:16938411:-1 gene:ENSRNOG00000029825 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0
NM_080894 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 7B (Pde7b), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:17438266:17650684:-1 gene:ENSRNOG00000013436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AB057409 // GenBank // Rattus norvegicus RNPDE7B mRNA for cyclic nucleotide phosphodiesterase 7B1, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AB057410 // GenBank // Rattus norvegicus RNPDE7B mRNA for cyclic nucleotide phosphodiesterase 7B3, complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AB057411 // GenBank // Rattus norvegicus RNPDE7B mRNA for cyclic nucleotide phosphodiesterase 7B4, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000006648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:17438583:17474230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT003983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0
XM_003753134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcriptional activator Myb-like (RGD1560020_predicted), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006222838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcriptional activator Myb-like (RGD1560020_predicted), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000019299 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:17818418:17848370:-1 gene:ENSRNOG00000014313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019313 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:17818418:17848370:-1 gene:ENSRNOG00000014313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT003986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000021840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:17781776:17888137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT003987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSRNOT00000047446 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:18111938:18112574:-1 gene:ENSRNOG00000030186 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:18087663:18112192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1
XM_006222840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thymocyte selection associated (Themis), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thymocyte selection associated (Themis), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020102 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:18435720:18532096:-1 gene:ENSRNOG00000014979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000056966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:18413471:18454987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000056966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:18413471:18454987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001029902 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, K (Ptprk), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AB297790 // GenBank // Rattus norvegicus Ptprk mRNA for protein tyrosine phosphatase receptor type K, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// AF142480 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-like protein tyrosine phosphatase kappa extracellular region (RPTPK) mRNA, complete cds. // chr1 // 52 // 81 // 11 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:18602550:18714240:-1 gene:ENSRNOG00000047605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000067354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:19260652:19574883:-1 gene:ENSRNOG00000015605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT003992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// GENSCAN00000034094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:18688455:18723219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000047989 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:19695281:19696923:-1 gene:ENSRNOG00000029533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:19695467:19696038:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0
ENSRNOT00000075402 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:20022541:20023212:-1 gene:ENSRNOG00000046438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000045386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:21019070:21020033:-1 gene:ENSRNOG00000030796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000039351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:21019224:21020033:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:20022090:20131147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 100 // 8 // 11 // 0
NM_001170575 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 18 (Arhgap18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006227678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 18 (Arhgap18), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 18 (Arhgap18), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 18 (Arhgap18), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:20730432:20879837:-1 gene:ENSRNOG00000011245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:20756084:20805480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT003997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT003998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001172116 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 3 (Samd3), mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000061389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:21613315:21643309:-1 gene:ENSRNOG00000039955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000042199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:21615231:21680035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_001009470 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin B2 (Ccnb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000017117 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:8:76221576:76233721:1 gene:ENSRNOG00000012678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 66 // 22 // 23 // 0 /// BC088212 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin B2, mRNA (cDNA clone MGC:108931 IMAGE:7383459), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC097952 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin B2, mRNA (cDNA clone MGC:116075 IMAGE:7454811), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:22625442:22651175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000035487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:76177851:76241342:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT053609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_001277054 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 23 (Med23), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000032424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23019613:23067284:-1 gene:ENSRNOG00000013422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// FQ231601 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YO15 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23027421:23083360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0
AB023068 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for connective tissue growth factor, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AY596447 // GenBank // Rattus norvegicus connective tissue growth related protein precursor RNA, complete cds. // chr1 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC072503 // GenBank // Rattus norvegicus connective tissue growth factor, mRNA (cDNA clone MGC:91697 IMAGE:7098774), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_022266 // RefSeq // Rattus norvegicus connective tissue growth factor (Ctgf), mRNA. // chr1 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000020528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23331547:23334660:-1 gene:ENSRNOG00000015036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// AF120275 // GenBank // Rattus norvegicus connective tissue growth factor mRNA, complete cds. // chr1 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// GENSCAN00000037591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23332612:23334436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT004019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT004020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000061234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23604655:23686657:-1 gene:ENSRNOG00000015321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC091331 // GenBank // Rattus norvegicus monooxygenase, DBH-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7314319), partial cds. // chr1 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23603960:23644637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_021869 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 7 (Stx7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_003748675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin-7-like (LOC100910446), partial mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23721818:23761945:-1 gene:ENSRNOG00000015670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000072943 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:25013209:25025643:-1 gene:ENSRNOG00000048248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// AF031430 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC085737 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 7, mRNA (cDNA clone MGC:93455 IMAGE:7193349), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000006155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:25013203:25027331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23723014:23743402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT004023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT004025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_175599 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 8a (Taar8a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006227687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 8a (Taar8a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000043157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23841844:23842968:1 gene:ENSRNOG00000048934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000044098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23879681:23880805:-1 gene:ENSRNOG00000030414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23799510:23842968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000061221 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:23907243:23908309:-1 gene:ENSRNOG00000039872 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 67 // 100 // 6 // 9 // 0
NM_175587 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 7h (Taar7h), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23927981:23929057:-1 gene:ENSRNOG00000048072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23927981:23929057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175588 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 7g (Taar7g), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000044271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23941848:23942924:-1 gene:ENSRNOG00000048265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000036435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23941848:23942924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT004027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_175590 // RefSeq // Rattus norvegicus trace-amine-associated receptor 7e (Taar7e), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23956202:23957278:-1 gene:ENSRNOG00000046903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23956202:23957278:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175591 // RefSeq // Rattus norvegicus trace-amine-associated receptor 7d (Taar7d), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23963811:23964887:-1 gene:ENSRNOG00000045914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23963811:23964887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175586 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 7b (Taar7b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000021559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:23993502:23994578:-1 gene:ENSRNOG00000046302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000023083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:23993502:23994578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT004031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001009650 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 5 (Taar5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24022589:24023602:-1 gene:ENSRNOG00000039869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_175583 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 4 (Taar4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24033714:24034757:-1 gene:ENSRNOG00000029877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24033714:24045230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009532 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 3 (Taar3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24044202:24045230:-1 gene:ENSRNOG00000025982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24033714:24045230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT004034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008512 // RefSeq // Rattus norvegicus trace amine-associated receptor 2 (Taar2), mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24052952:24056922:-1 gene:ENSRNOG00000025951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// AY702316 // GenBank // Rattus norvegicus trace amine associated receptor 2 (Taar2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24048234:24099537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 62 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT004035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0
NM_134328 // RefSeq // Rattus norvegicus trace-amine-associated receptor 1 (Taar1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24070405:24071403:-1 gene:ENSRNOG00000016073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF421352 // GenBank // Rattus norvegicus trace amine receptor 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24048234:24099537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001025623 // RefSeq // Rattus norvegicus vanin 1 (Vnn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24089368:24099667:-1 gene:ENSRNOG00000016219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098934 // GenBank // Rattus norvegicus vanin 1, mRNA (cDNA clone MGC:114385 IMAGE:7441890), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24048234:24099537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT004038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001109136 // RefSeq // Rattus norvegicus vanin 3 (Vnn3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24123625:24135887:-1 gene:ENSRNOG00000039865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24123758:24225488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006222867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 18, subfamily B, member 1 (Slc18b1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 18, subfamily B, member 1 (Slc18b1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:24179175:24220597:-1 gene:ENSRNOG00000016371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:24123758:24225488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001107451 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 12 (Slc2a12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:25467855:25520421:-1 gene:ENSRNOG00000011161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:25500350:25555937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT004047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006222868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG41957-like (LOC100365542), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG41957-like (LOC100365542), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
ENSRNOT00000051656 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:26713646:26714498:-1 gene:ENSRNOG00000029303 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:26712280:26714498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000016803 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:26723013:26724013:-1 gene:ENSRNOG00000012588 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 83 // 86 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:26723013:26724013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
NM_021666 // RefSeq // Rattus norvegicus triadin (Trdn), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:27091814:27265144:-1 gene:ENSRNOG00000012609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000067280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:27091814:27248422:-1 gene:ENSRNOG00000012609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// AF220558 // GenBank // Rattus norvegicus triadin 1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// AF220559 // GenBank // Rattus norvegicus triadin 3 mRNA, partial cds. // chr1 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// FQ216580 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YA19 mRNA sequence. // chr1 // 73 // 38 // 8 // 11 // 0 /// AJ243303 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for triadin 51 kDa (triadin gene). // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT004058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NONRATT004058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// NONRATT004060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENSRNOT00000044643 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:29400514:29401668:-1 gene:ENSRNOG00000031050 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:29400668:29400997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0
NM_001108460 // RefSeq // Rattus norvegicus HD domain containing 2 (Hddc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:30034693:30054904:-1 gene:ENSRNOG00000021442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:30038288:30054866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001007734 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase domain containing 1 (Echdc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase domain containing 1 (Echdc1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006227747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase domain containing 1 (Echdc1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32308393:32350239:-1 gene:ENSRNOG00000011622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079052 // GenBank // Rattus norvegicus enoyl Coenzyme A hydratase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:93992 IMAGE:7115386), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32309216:32350391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT004069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NONRATT004071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_002728644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Temporarily Assigned Gene name family member (tag-241)-like (LOC100363248), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// XM_003753155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Temporarily Assigned Gene name family member (tag-241)-like (LOC100363248), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000016712 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:32496076:32550554:-1 gene:ENSRNOG00000012324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// FQ212489 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YE24 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 39 // 12 // 13 // 0 /// NM_001144859 // RefSeq // Rattus norvegicus uncharacterized LOC292199 (Rgd1310049), mRNA. // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000031083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32469423:32484734:-1 gene:ENSRNOG00000042309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000011345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32497478:32550554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000011358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32459642:32478949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT004077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_198766 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 127 (Ccdc127), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:32965363:32971707:-1 gene:ENSRNOG00000012775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058157 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 127, mRNA (cDNA clone MGC:73017 IMAGE:6890640), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:32965732:32970463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT004080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012654 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE3, cation proton antiporter 3), member 3 (Slc9a3), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33159607:33201753:-1 gene:ENSRNOG00000015159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M85300 // GenBank // Rat sodium-hydrogen exchange protein-isoform 3 (NHE-3) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33161903:33201665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108461 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin polymerization promoting protein (Tppp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin polymerization promoting protein (Tppp), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33295461:33315340:-1 gene:ENSRNOG00000028261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33295744:33335664:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT004084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001039342 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 11 (Zdhhc11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33330626:33360795:-1 gene:ENSRNOG00000039743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY886527 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC11 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33347545:33392512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001107453 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain containing 9 (Brd9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33363870:33392304:-1 gene:ENSRNOG00000015676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33347545:33392512:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT004090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT004091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001013144 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 12 (potassium/chloride transporter), member 7 (Slc12a7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33511432:33564814:-1 gene:ENSRNOG00000016372 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC086339 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 12 (potassium/chloride transporters), member 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301899), complete cds. // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000057631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33513706:33544530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT004094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT004093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT004097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_053423 // RefSeq // Rattus norvegicus telomerase reverse transcriptase (Tert), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000022683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33676582:33697344:-1 gene:ENSRNOG00000025327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000034937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33690382:33697344:-1 gene:ENSRNOG00000025327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// AY539717 // GenBank // Rattus norvegicus telomerase reverse transcriptase catalytic subunit mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AY539718 // GenBank // Rattus norvegicus telomerase reverse transcriptase catalytic subunit splice variant a mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AY539719 // GenBank // Rattus norvegicus telomerase reverse transcriptase catalytic subunit splice variant b mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AY539720 // GenBank // Rattus norvegicus telomerase reverse transcriptase catalytic subunit splice variant c mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000057632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33676582:33697344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT004099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108240 // RefSeq // Rattus norvegicus CLPTM1-like (Clptm1l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000023211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33706075:33722058:-1 gene:ENSRNOG00000016923 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000057638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33706572:33721983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT004102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT004103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT004106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_012694 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 3 (Slc6a3), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000040291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33746494:33787466:-1 gene:ENSRNOG00000017302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// M80233 // GenBank // Rat cocaine-sensitive dopamine transporter mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// M80570 // GenBank // Rat dopamine transporter mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000057624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33725928:33790753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 94 // 94 // 29 // 31 // 1
NM_001100735 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidylcholine acyltransferase 1 (Lpcat1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:33802633:33853118:-1 gene:ENSRNOG00000017930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:33804498:33852981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
XM_006240804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras-related protein Rab-1A-like (LOC680967), mRNA. // chr7 // 52 // 97 // 15 // 29 // 0 /// NM_031090 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB1A, member RAS oncogene family (Rab1a), mRNA. // chr7 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021040 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:104208410:104236221:1 gene:ENSRNOG00000004992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// AY321327 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-048 mRNA, complete cds. // chr7 // 48 // 77 // 11 // 23 // 0 /// BC066662 // GenBank // Rattus norvegicus RAB1, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:72414 IMAGE:5623442), complete cds. // chr7 // 40 // 100 // 12 // 30 // 0 /// FQ213656 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YI16 mRNA sequence. // chr7 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000052370 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:2088703:2093233:-1 gene:ENSRNOG00000048784 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr7 // 60 // 100 // 18 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104186108:104234759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 48 // 77 // 11 // 23 // 0 /// NONRATT018865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr7 // 37 // 100 // 11 // 30 // 0
NONRATT010467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT031509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 54 // 96 // 13 // 24 // 0
ENSRNOT00000031519 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:41057053:41058650:-1 gene:ENSRNOG00000023081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000006517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:41031211:41108853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000029676 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:41829803:41830523:-1 gene:ENSRNOG00000021744 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:41829803:41830523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001107460 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 2 (Zbtb2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:42260208:42267107:-1 gene:ENSRNOG00000019544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42261715:42314695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001040128 // RefSeq // Rattus norvegicus required for meiotic nuclear division 1 homolog (S. cerevisiae) (Rmnd1), mRNA. // chr1 // 93 // 75 // 25 // 27 // 0 /// XM_006227835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus required for meiotic nuclear division 1 homolog (S. cerevisiae) (Rmnd1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus required for meiotic nuclear division 1 homolog (S. cerevisiae) (Rmnd1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus required for meiotic nuclear division 1 homolog (S. cerevisiae) (Rmnd1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:42291016:42314989:-1 gene:ENSRNOG00000019501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// FQ233028 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YH22 mRNA sequence. // chr1 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// NONRATT004170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:42261715:42314695:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT004169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_001106206 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 5 (Fbxo5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:43791187:43797556:-1 gene:ENSRNOG00000024077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158745 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:187924 IMAGE:9100726), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:43776182:43797431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT004182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001025723 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial translational release factor 1-like (Mtrf1l), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:43805702:43815909:-1 gene:ENSRNOG00000018773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097970 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial translational release factor 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:116100 IMAGE:7442024), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:43805749:43815892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT004185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107459 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 17 (Rgs17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 17 (Rgs17), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:43822671:43918302:-1 gene:ENSRNOG00000018690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:43824275:43862915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENSRNOT00000045014 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:44072587:44072928:-1 gene:ENSRNOG00000033265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000057558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:44017058:44088342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000020208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:44504838:44633271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000075608 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:44504829:44505443:1 gene:ENSRNOG00000049756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 95 // 12 // 20 // 0
NM_001170799 // RefSeq // Rattus norvegicus interaction protein for cytohesin exchange factors 1 (Ipcef1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227876 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interaction protein for cytohesin exchange factors 1 (Ipcef1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interaction protein for cytohesin exchange factors 1 (Ipcef1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interaction protein for cytohesin exchange factors 1 (Ipcef1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:44896239:44967362:-1 gene:ENSRNOG00000018163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:44858594:44928297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000056289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:44940459:44966860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001012061 // RefSeq // Rattus norvegicus Cnksr family member 3 (Cnksr3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:45120906:45213960:-1 gene:ENSRNOG00000018052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY328890 // GenBank // Rattus norvegicus maguin-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY333962 // GenBank // Rattus norvegicus parturition-related protein PRP4 (Prp4) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:45122056:45145351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT004194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
ENSRNOT00000058849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:45262968:45264205:-1 gene:ENSRNOG00000004144 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:45263375:45264193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT004198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_181474 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor B1, mitochondrial (Tfb1m), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:45762960:45804760:-1 gene:ENSRNOG00000016549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY198392 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial transcription factor b1 (Tfb1m) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC070907 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor B1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:91415 IMAGE:7102927), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:45763487:45819767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT004201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_001004216 // RefSeq // Rattus norvegicus NADPH oxidase 3 (Nox3), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:45881398:45946253:-1 gene:ENSRNOG00000016490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AY573239 // GenBank // Rattus norvegicus NADPH oxidase 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:45883099:45935274:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT004203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001144860 // RefSeq // Rattus norvegicus chromosome 1 open reading frame, human C6orf35 (C1H6orf35), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromosome 1 open reading frame, human C6orf35 (C1H6orf35), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:47618088:47644800:-1 gene:ENSRNOG00000016973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT004213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_183334 // RefSeq // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A-like 6B (Ldhal6b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY342428 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078970 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase A-like 6B, mRNA (cDNA clone MGC:93850 IMAGE:7111795), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:47623139:47624137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT004209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006227908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine active site containing 1 (Serac1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_574308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine active site containing 1 (Serac1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024205 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:48241866:48275927:-1 gene:ENSRNOG00000017889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060527 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:48241866:48275927:-1 gene:ENSRNOG00000017889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48241866:48281091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_031318 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein light chain Tctex-type 1 (Dynlt1), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48510105:48516959:-1 gene:ENSRNOG00000018207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AB010119 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Tctex-1, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// BC059129 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:6920145, partial cds. // chr1 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// BC166879 // GenBank // Rattus norvegicus dynein light chain Tctex-type 1, mRNA (cDNA clone MGC:188810 IMAGE:6919674), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48510446:48512461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_019357 // RefSeq // Rattus norvegicus ezrin (Ezr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046746 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48590973:48634511:-1 gene:ENSRNOG00000018524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY428869 // GenBank // Rattus norvegicus ezrin mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// BC081958 // GenBank // Rattus norvegicus ezrin, mRNA (cDNA clone MGC:94076 IMAGE:7124292), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48591675:48640736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006222907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus radial spoke 3 homolog (Chlamydomonas) (Rsph3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006222909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus radial spoke 3 homolog (Chlamydomonas) (Rsph3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006227909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus radial spoke 3 homolog (Chlamydomonas) (Rsph3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006227911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus radial spoke 3 homolog (Chlamydomonas) (Rsph3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48743922:48780631:-1 gene:ENSRNOG00000018762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:48743738:48780631:-1 gene:ENSRNOG00000018762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC169129 // GenBank // Rattus norvegicus radial spokehead-like 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:6918472), partial cds. // chr1 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48704502:48780211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
XM_003748695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell activation RhoGTPase activating protein (Tagap), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_003753172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell activation RhoGTPase activating protein (Tagap), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025580 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:48798006:48805313:-1 gene:ENSRNOG00000018915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48798006:48858600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_138549 // RefSeq // Rattus norvegicus trans-2,3-enoyl-CoA reductase (Tecr), mRNA. // chr1 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000037608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35684511:35711343:-1 gene:ENSRNOG00000021808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// BC059115 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein, synaptic 2, mRNA (cDNA clone MGC:72691 IMAGE:6920522), complete cds. // chr1 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// EU000473 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 13 mRNA, complete cds. // chr1 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000025594 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:48887512:48888429:-1 gene:ENSRNOG00000018935 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000026849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:48887512:48888429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT004232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_017051 // RefSeq // Rattus norvegicus superoxide dismutase 2, mitochondrial (Sod2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51827380:51834230:1 gene:ENSRNOG00000019048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC070913 // GenBank // Rattus norvegicus superoxide dismutase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:91729 IMAGE:7104698), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51826988:51844977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT000371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_012670 // RefSeq // Rattus norvegicus t-complex 1 (Tcp1), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000019531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51719055:51726734:1 gene:ENSRNOG00000014160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// D90345 // GenBank // Rattus norvegicus Tcp-1 mRNA for t complex polypeptide 1, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT000363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
NONRATT000365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
FQ225819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA42YN15 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT000363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT041719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001002281 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member H (Mrgprh), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS-related GPR, member H (Mrgprh), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020070 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51682237:51683202:1 gene:ENSRNOG00000014965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51682237:51683202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_342669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557306 (LOC102557306), transcript variant X4, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_031584 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22 (organic cation transporter), member 2 (Slc22a2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51394014:51435104:1 gene:ENSRNOG00000016625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000051927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51394014:51435104:1 gene:ENSRNOG00000016625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// D83044 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for organic cation transporter OCT2, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC107564 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7938336, with apparent retained intron. // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000051815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51394102:51421355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT000354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT000355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_053491 // RefSeq // Rattus norvegicus plasminogen (Plg), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000023368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:51192130:51233899:1 gene:ENSRNOG00000017223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// AY325159 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-346 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// BC091135 // GenBank // Rattus norvegicus plasminogen, mRNA (cDNA clone MGC:108638 IMAGE:7369357), complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// FQ210878 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA20YL13 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 83 // 38 // 40 // 0 /// FQ218353 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YO04 mRNA sequence. // chr1 // 72 // 38 // 13 // 18 // 0 /// GENSCAN00000051810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51192310:51233657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT000352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_133406 // RefSeq // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 (Agpat4), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006227856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 (Agpat4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006227857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 (Agpat4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:50930058:51035498:1 gene:ENSRNOG00000017731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB067572 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for lysophosphatidic acid acyltransferase-delta, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC086992 // GenBank // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 4 (lysophosphatidic acid acyltransferase, delta), mRNA (cDNA clone MGC:93227 IMAGE:7191675), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT000346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:51014622:51034990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT000348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
GENSCAN00000046058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:52459624:52460866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_001044277 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681210 (MGC94891), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:53587610:53611289:-1 gene:ENSRNOG00000011243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:53587845:53815498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_022236 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 10A (Pde10a), mRNA. // chr1 // 94 // 87 // 44 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000043474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:53617430:53800481:-1 gene:ENSRNOG00000011310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000067142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:53617430:53846125:-1 gene:ENSRNOG00000011310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 47 // 47 // 0 /// AB027155 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PDE10A2, complete cds. // chr1 // 94 // 87 // 44 // 47 // 0 /// AB027156 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PDE10A3, complete cds. // chr1 // 91 // 85 // 42 // 46 // 0 /// AY462091 // GenBank // Rattus norvegicus PDE10A11 (Pde10a) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 93 // 85 // 43 // 46 // 0 /// AY462092 // GenBank // Rattus norvegicus PDE10A12 (Pde10a) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 94 // 87 // 44 // 47 // 0 /// AY462093 // GenBank // Rattus norvegicus PDE10A13 (Pde10a) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 93 // 81 // 41 // 44 // 0 /// AY462094 // GenBank // Rattus norvegicus PDE10A14 (Pde10a) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 94 // 67 // 34 // 36 // 0 /// AY462095 // GenBank // Rattus norvegicus PDE10A3 (Pde10a) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 93 // 83 // 42 // 45 // 0 /// FQ212600 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YG20 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 17 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT004280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 87 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000039547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:53587845:53815498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 37 // 54 // 1 /// NONRATT004281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 22 // 54 // 1
NM_001106209 // RefSeq // Rattus norvegicus brachyury (T), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54139554:54147319:-1 gene:ENSRNOG00000012229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54140109:54147211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT004287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001161835 // RefSeq // Rattus norvegicus brachyury 2 (T2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brachyury 2 (T2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54159582:54212462:-1 gene:ENSRNOG00000024172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54159924:54264028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT004288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001108464 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich 18 (Prr18), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54240541:54242506:-1 gene:ENSRNOG00000024149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54159924:54264028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008302 // RefSeq // Rattus norvegicus SFT2 domain containing 1 (Sft2d1), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54248199:54264093:-1 gene:ENSRNOG00000024140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC085346 // GenBank // Rattus norvegicus SFT2 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105508 IMAGE:7304630), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54159924:54264028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_133561 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial pyruvate carrier 1 (Mpc1), mRNA. // chr1 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000017282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54275046:54286667:-1 gene:ENSRNOG00000012415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// AF304429 // GenBank // Rattus norvegicus apoptosis-regulating basic protein mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 85 // 16 // 17 // 0 /// BC097287 // GenBank // Rattus norvegicus brain protein 44-like, mRNA (cDNA clone MGC:114268 IMAGE:7445460), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// FQ219877 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YA13 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT004296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001013145 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 6 (Ccr6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54313127:54335174:-1 gene:ENSRNOG00000012964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091197 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) receptor 6, mRNA (cDNA clone MGC:108876 IMAGE:7374663), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225692 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YC21 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54313231:54342451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// NONRATT004298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001101008 // RefSeq // Rattus norvegicus Fgfr1 oncogene partner (LOC683722), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017590 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:54371830:54403026:-1 gene:ENSRNOG00000013119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// BC098026 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Fgfr1 oncogene partner, mRNA (cDNA clone MGC:116179 IMAGE:7455942), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54371672:54403026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
NM_001169132 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 31 (Gpr31), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54767584:54768543:-1 gene:ENSRNOG00000039255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54767584:54768543:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001169136 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 2 (Ttll2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase-like family, member 2 (Ttll2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:54808855:54810633:-1 gene:ENSRNOG00000033901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:54808855:54810384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009514 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 1 (Vom1r1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176374471:176375367:1 gene:ENSRNOG00000039034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510320 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re5 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000049558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176323459:176366877:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
XM_006222917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 48 // 100 // 19 // 40 // 0 /// XM_006222917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 38 // 100 // 15 // 40 // 0 /// XM_006222918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 38 // 100 // 15 // 40 // 0 /// XM_006222919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 38 // 100 // 15 // 40 // 0 /// XM_001065293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000041610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87993184:1 gene:ENSRNOG00000030145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// GENSCAN00000040361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56945187:56963851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 17 // 40 // 1 /// NONRATT004336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT004337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT004338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// GENSCAN00000000945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87992977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XM_003748704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 98 // 61 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000041610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87993184:1 gene:ENSRNOG00000030145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 61 // 35 // 44 // 0 /// XM_001065293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 51 // 51 // 37 // 72 // 1 /// XM_003753182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 32 // 32 // 23 // 72 // 1 /// XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 15 // 15 // 11 // 72 // 1 /// GENSCAN00000000945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87992977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 53 // 32 // 38 // 0 /// GENSCAN00000002263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56429032:56507062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 49 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000002266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56867158:56915367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 14 // 14 // 10 // 72 // 1 /// GENSCAN00000040361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56945187:56963851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 15 // 15 // 11 // 72 // 1
XM_003748704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// XM_001065293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// XM_003753182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000041610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87993184:1 gene:ENSRNOG00000030145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// XM_006227967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561185), mRNA. // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// GENSCAN00000002263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56429032:56507062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// GENSCAN00000000945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87992977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// GENSCAN00000002266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56867158:56915367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
XM_003748704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 94 // 96 // 47 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000041610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87993184:1 gene:ENSRNOG00000030145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 90 // 38 // 47 // 0 /// XM_006227967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561185), mRNA. // chr1 // 69 // 25 // 9 // 13 // 0 /// XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 23 // 90 // 11 // 47 // 0 /// XM_001065293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 79 // 79 // 41 // 52 // 1 /// XM_003753182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC685793), mRNA. // chr1 // 52 // 52 // 27 // 52 // 1 /// GENSCAN00000000945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87991655:87992977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 75 // 31 // 39 // 0 /// GENSCAN00000002263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56429032:56507062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 75 // 36 // 39 // 0 /// GENSCAN00000002266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56867158:56915367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 23 // 23 // 12 // 52 // 1 /// GENSCAN00000040361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:56945187:56963851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 17 // 17 // 9 // 52 // 1 /// NONRATT000399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 19 // 19 // 10 // 52 // 1
XM_003753181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (RGD1561667), mRNA. // chr1 // 51 // 100 // 19 // 37 // 0 /// XM_006222917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 41 // 100 // 15 // 37 // 0 /// XM_006222918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 41 // 100 // 15 // 37 // 0 /// XM_006222919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase Y-like (LOC365499), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 41 // 100 // 15 // 37 // 0 /// NONRATT004336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT004337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT004338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
XM_006227941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM domain containing 1 (Frmd1), mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 20 // 23 // 1 /// GENSCAN00000053367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:55539811:55592054:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 20 // 23 // 1
NM_001107464 // RefSeq // Rattus norvegicus dapper, antagonist of beta-catenin, homolog 2 (Xenopus laevis) (Dact2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled-binding antagonist of beta-catenin 2 (Dact2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled-binding antagonist of beta-catenin 2 (Dact2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled-binding antagonist of beta-catenin 2 (Dact2), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled-binding antagonist of beta-catenin 2 (Dact2), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006227965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled-binding antagonist of beta-catenin 2 (Dact2), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:57354081:57362996:-1 gene:ENSRNOG00000022921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ215550 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YM17 mRNA sequence. // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:57354477:57362969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001169138 // RefSeq // Rattus norvegicus thrombospondin 2 (Thbs2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000014552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:57842346:57871988:-1 gene:ENSRNOG00000010529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000010101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:57844329:57876957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT004343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// NONRATT004344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
XM_006222924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 27 (Wdr27), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006222925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 27 (Wdr27), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006222931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 27 (Wdr27), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000021141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:58076105:58125719:-1 gene:ENSRNOG00000015609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000011012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:57966311:58118564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 25 // 48 // 1 /// NONRATT004351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1
NM_001024747 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 10 (Phf10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:58134864:58191474:-1 gene:ENSRNOG00000015337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC098049 // GenBank // Rattus norvegicus PHD finger protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:116207 IMAGE:7457308), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:58136296:58165631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT004358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT004357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT004359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001191559 // RefSeq // Rattus norvegicus t-complex-associated testis expressed 3 (Tcte3), mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000047157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:58153802:58165631:-1 gene:ENSRNOG00000015293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000011016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:58136296:58165631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_032063 // RefSeq // Rattus norvegicus delta-like 1 (Drosophila) (Dll1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:242107688:242115797:-1 gene:ENSRNOG00000014667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U78889 // GenBank // Rattus norvegicus Delta1 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:242097414:242122877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT007367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_053590 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 1 (Psmb1), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:58398991:58418276:-1 gene:ENSRNOG00000001488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC058455 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 1, mRNA (cDNA clone MGC:72741 IMAGE:6922317), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// FQ214726 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YF19 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ220680 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YA17 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000011014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:58399296:58418243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_031638 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 2 (Pdcd2), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000002040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:58443078:58448568:-1 gene:ENSRNOG00000001490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:58443130:58452229:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001108903 // RefSeq // Rattus norvegicus PR domain containing 9 (Prdm9), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:58463710:58484066:-1 gene:ENSRNOG00000021493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:58463872:58539055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1
NM_001113403 // RefSeq // Rattus norvegicus leucyl/cystinyl aminopeptidase (Lnpep), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NM_133574 // RefSeq // Rattus norvegicus leucyl/cystinyl aminopeptidase (Lnpep), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:60223764:60310668:-1 gene:ENSRNOG00000047387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// U32990 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-regulated membrane aminopeptidase vp165 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// U76997 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-regulated membrane aminopeptidase IRAP mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059766 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:69216790:69275904:1 gene:ENSRNOG00000013082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000007541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60223812:60274167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:69139407:69275856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT004370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
NM_172323 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan synthase 1 (Has1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:60640270:60652067:-1 gene:ENSRNOG00000010994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB097568 // GenBank // Rattus norvegicus HAS1 mRNA for hyaluronan synthase 1, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60640572:60652467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106216 // RefSeq // Rattus norvegicus formyl peptide receptor 1 (Fpr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:60685361:60686568:1 gene:ENSRNOG00000011174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60685373:60686428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001073753 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formyl peptide receptor, related sequence 6 (Fpr-rs6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_002725486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formyl peptide receptor, related sequence 6 (Fpr-rs6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000044825 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:87467445:87468476:-1 gene:ENSRNOG00000048014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001099470 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 11 (Vom2r11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000042425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:87791634:87811423:-1 gene:ENSRNOG00000033775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:87384674:87811417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_001009526 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 5 (Vom1r5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:87859369:87860274:-1 gene:ENSRNOG00000039036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510322 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re27 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001169140 // RefSeq // Rattus norvegicus formyl peptide receptor, related sequence 3 (Fpr-rs3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:60821230:60822261:-1 gene:ENSRNOG00000045732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:60821230:60822261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001008907 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 7 (Vom1r7), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014908 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:61001964:61110514:-1 gene:ENSRNOG00000011221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// AY510304 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re3 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071327 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:61001928:61683450:-1 gene:ENSRNOG00000011221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT004373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001008958 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 10 (Vom1r10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510358 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re21 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0
NM_001008955 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 11 (Vom1r11), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY510291 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001008962 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 12 (Vom1r12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510364 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re23 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008961 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 14 (Vom1r14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510357 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008960 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 15 (Vom1r15), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:61800598:61801518:-1 gene:ENSRNOG00000047498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510361 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re22 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009522 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 111 (Vom1r111), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NM_001167549 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 16 (Vom1r16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY510366 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf4 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NM_001167572 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 17 (Vom1r17), mRNA. // chr1 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62384298:62385203:1 gene:ENSRNOG00000011565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// NM_001008941 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 23 (Vom1r23), mRNA. // chr1 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63875694:63876641:-1 gene:ENSRNOG00000047128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62012404:62013342:-1 gene:ENSRNOG00000047522 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 45 // 100 // 13 // 29 // 0 /// AY510359 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf5 mRNA, complete cds. // chr1 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// NONRATT000463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059671 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:61993727:61994674:-1 gene:ENSRNOG00000050623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// NONRATT004404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0
GENSCAN00000054518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:62426557:62426943:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000059645 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:62426240:62427264:-1 gene:ENSRNOG00000011505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 100 // 7 // 12 // 0
NM_001008900 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 22 (Vom1r22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000038190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:62698443:62699456:-1 gene:ENSRNOG00000025949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// AY510355 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf2 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000054519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:62656491:62699381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 53 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT004378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001008941 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 23 (Vom1r23), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63875694:63876641:-1 gene:ENSRNOG00000047128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510359 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rf5 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059671 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:61993727:61994674:-1 gene:ENSRNOG00000050623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0
ENSRNOT00000051726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:64004678:64024047:-1 gene:ENSRNOG00000025894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000051602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63953114:64250107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// NONRATT004406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
XM_006222974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 182-like (LOC102555644), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XR_342748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 761-like (LOC682225), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_350103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 761-like (LOC682225), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033187 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:64978551:64980122:-1 gene:ENSRNOG00000028767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XR_342748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 761-like (LOC682225), misc_RNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// XR_350103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 761-like (LOC682225), misc_RNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:64922540:65171143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT004411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000033187 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:64978551:64980122:-1 gene:ENSRNOG00000028767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
XR_342747 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 761-like (LOC102555191), misc_RNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XR_350102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 761-like (LOC102555191), misc_RNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0
XM_006222975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 945 (Zfp945), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006222977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 945 (Zfp945), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006222978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 945 (Zfp945), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 945 (Zfp945), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228101 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 945 (Zfp945), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 945 (Zfp945), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:64922540:65171143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001168642 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 40 (Zfp40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:65342107:65361955:-1 gene:ENSRNOG00000011675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT004425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001099490 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 15 (Vom2r15), mRNA. // chr1 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000042466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:65453663:65469483:-1 gene:ENSRNOG00000029458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 33 // 38 // 1 /// NONRATT004427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000008679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:65463012:65490685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1
NM_001033891 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB kinase activator 1A (Mob1a), mRNA. // chr8 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179612702:179631467:1 gene:ENSRNOG00000042657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// BC101879 // GenBank // Rattus norvegicus MOB1, Mps One Binder kinase activator-like 1B (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:124888 IMAGE:7929996), complete cds. // chr8 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071404 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:4236446:4237096:1 gene:ENSRNOG00000050498 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075124 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:4137595:4138245:1 gene:ENSRNOG00000046528 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179605197:179627855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4236446:4237096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4137595:4138245:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT039911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001013893 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-like 9b (Actl9b), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:4105547:4106883:1 gene:ENSRNOG00000026033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079230 // GenBank // Rattus norvegicus similar to actin-like 7-alpha-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:94308 IMAGE:7132497), complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4105602:4106837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT052671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001099649 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 23 (Vom2r23), mRNA. // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000073415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:4038043:4070469:1 gene:ENSRNOG00000048963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:4038202:4083231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT052670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000016662 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:3706963:3707708:1 gene:ENSRNOG00000012492 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr8 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0
NM_001008936 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 24 (Vom1r24), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:3656085:3657035:1 gene:ENSRNOG00000048916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510362 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re14 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008921 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 25 (Vom1r25), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:3557525:3558439:1 gene:ENSRNOG00000030899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY510371 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rm2 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001009525 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 26 (Vom1r26), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:62411241:62412146:1 gene:ENSRNOG00000032657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510372 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rm1 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT018519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein interacting with K protein 1 homolog (mouse) (Zik1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K-like (LOC100911224), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein interacting with K protein 1 homolog (mouse) (Zik1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072367 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:69050215:69055883:-1 gene:ENSRNOG00000046455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072919 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:69605582:69611250:-1 gene:ENSRNOG00000049885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:69036126:69105967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// GENSCAN00000020978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:69591493:69618906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
GENSCAN00000020976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:69723018:69890484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001099471 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 26 (Vom2r26), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69853199:69890484:-1 gene:ENSRNOG00000025168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:69723018:69890484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:22487453:22534014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001100123 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily C, member 2 (Lilrc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily C, member 2 (Lilrc2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69994293:69998713:-1 gene:ENSRNOG00000030642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY998483 // GenBank // Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor (Lilrc2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:69924901:69998050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT004469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000015234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63078979:63082298:-1 gene:ENSRNOG00000011355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000035413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63010583:63013576:-1 gene:ENSRNOG00000049813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// X66370 // GenBank // R.norvegicus mRNA for ribosomal protein S9. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NM_031108 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S9 (Rps9), mRNA. // chr1 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// BC060560 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S9, mRNA (cDNA clone MGC:72792 IMAGE:6922405), complete cds. // chr1 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000046545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63010653:63024526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000046559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63078979:63092852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_001107471 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 3 (Cnot3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006228030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 3 (Cnot3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63123105:63139348:-1 gene:ENSRNOG00000013156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63123388:63154172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT004379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT004382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001106219 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 31 (Prpf31), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63143068:63154743:-1 gene:ENSRNOG00000013504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63123388:63154172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT004383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_001076462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 3 (Ndufa3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// XM_002725503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 3 (Ndufa3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000019141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63164762:63167369:-1 gene:ENSRNOG00000014224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ223729 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA88YL13 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63164822:63167360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT004384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT004385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT004386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_080694 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 6 (Cacng6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63300009:63312647:-1 gene:ENSRNOG00000014326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63300009:63312647:-1 gene:ENSRNOG00000014326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF361343 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit long isoform (Cacng6) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF361344 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit short isoform (Cacng6) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63292405:63312647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_080696 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 8 (Cacng8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63321710:63341943:-1 gene:ENSRNOG00000014348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF361346 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit (Cacng8) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63321710:63343258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080695 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, gamma subunit 7 (Cacng7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63367661:63393913:-1 gene:ENSRNOG00000014416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF361345 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit (Cacng7) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63367661:63393913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012628 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, gamma (Prkcg), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63399153:63425610:-1 gene:ENSRNOG00000014688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC089226 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C, gamma, mRNA (cDNA clone MGC:105487 IMAGE:7319243), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63399957:63410915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT004391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000054688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63415268:63425857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_183332 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid-associated differentiation marker (Myadm), mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63430413:63438759:-1 gene:ENSRNOG00000016588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// AY344060 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid-associated differentiation marker mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// BC087054 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid-associated differentiation marker, mRNA (cDNA clone MGC:94064 IMAGE:7123822), complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// BC107558 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid-associated differentiation marker, mRNA (cDNA clone MGC:124542 IMAGE:7932126), complete cds. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC128719 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid-associated differentiation marker, mRNA (cDNA clone MGC:156559 IMAGE:7315920), complete cds. // chr1 // 100 // 40 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT004396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63426687:63440333:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT004398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NR_031939 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-292 (Mir292), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053618 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:63524481:63524562:-1 gene:ENSRNOG00000035495 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-292 // miRBase Micro RNA Database // MI0000966 Rattus norvegicus miR-292 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NR_031938 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-291a (Mir291a), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053583 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:63524769:63524850:-1 gene:ENSRNOG00000035460 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-291a // miRBase Micro RNA Database // MI0000965 Rattus norvegicus miR-291a stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031937 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-290 (Mir290), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053668 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:63525067:63525147:-1 gene:ENSRNOG00000035545 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-290 // miRBase Micro RNA Database // MI0000964 Rattus norvegicus miR-290 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63524964:63553649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006227178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nitric oxide synthase-interacting protein-like (LOC100909427), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// XM_006228172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nitric oxide synthase-interacting protein-like (LOC100909427), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071983 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:70544189:70545008:-1 gene:ENSRNOG00000048768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:63554056:63554875:-1 gene:ENSRNOG00000046119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70544183:70568349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63554050:63574166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0
XM_006224082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E2F transcription factor 5 (E2f5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// XM_006224083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E2F transcription factor 5 (E2f5), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// U31668 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor E2F-5 mRNA, partial cds. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000044847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108121173:108136514:-1 gene:ENSRNOG00000010760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_173130 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 27 (Vom2r27), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63659859:63691984:-1 gene:ENSRNOG00000027244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF016182 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN5) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63643402:63728045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT004403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001076792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 4F (Nlrp4f), partial mRNA. // chrU // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000050913 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:13976528:13990480:1 gene:ENSRNOG00000038677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// NM_001106220 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 4A (Nlrp4a), mRNA. // chrU // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000043739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:70729660:70832250:-1 gene:ENSRNOG00000042030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// GENSCAN00000004101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70730611:70899533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000039168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:13976528:13989697:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT004472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001008969 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 31 (Vom1r31), mRNA. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:13886527:13887459:1 gene:ENSRNOG00000050783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510343 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re12 mRNA, complete cds. // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr8 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024886 // RefSeq // Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 3 (Dcun1d3), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:196562335:196600712:-1 gene:ENSRNOG00000014037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC097462 // GenBank // Rattus norvegicus DCN1, defective in cullin neddylation 1, domain containing 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114527 IMAGE:7457575), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:70926444:70927360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000054060 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:196562580:196565234:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT006286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT006294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0
NM_001025677 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 978 (Zfp978), mRNA. // chr1 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000030259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71133884:71140536:-1 gene:ENSRNOG00000015598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// BC097363 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Zinc finger protein OZF (POZF-1), mRNA (cDNA clone MGC:114396 IMAGE:7442984), complete cds. // chr1 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT004473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// NONRATT004474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1 /// NONRATT004479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001106221 // RefSeq // Rattus norvegicus aurora kinase C (Aurkc), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006228182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aurora kinase C (Aurkc), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71352904:71355297:-1 gene:ENSRNOG00000015825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000030809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71341706:71364791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT004477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001108465 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 29 (Usp29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 29 (Usp29), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71382517:71397426:-1 gene:ENSRNOG00000015956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71385922:71388540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AB083820 // GenBank // Rattus norvegicus vp130S mRNA for hypothetical protein, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075745 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:71626810:71627741:-1 gene:ENSRNOG00000048353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000020439 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:71904015:71919387:-1 gene:ENSRNOG00000015238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 33 // 8 // 8 // 0
NM_001000768 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 7 (Olr7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71880789:71881730:-1 gene:ENSRNOG00000015289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000113 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 8 (Olr8), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000050607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:71891245:71892189:-1 gene:ENSRNOG00000030070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:71891245:71892189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT004488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
XM_006223038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 28-like (LOC102548693), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006228207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 28-like (LOC102548693), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000020523 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:72560203:72571773:-1 gene:ENSRNOG00000042777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000035184 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:72576020:72583272:-1 gene:ENSRNOG00000015322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000035217 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:72576020:72583272:-1 gene:ENSRNOG00000015322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// XM_006228204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 28-like (LOC102548693), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000048287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:72489303:72599171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT004494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001008557 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 667 (Zfp667), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 667 (Zfp667), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AY221750 // GenBank // Rattus norvegicus myocardial ischemic preconditioning upregulated protein 1 (Mipu1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002725513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 5B (Zscan5b), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_218239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 5B (Zscan5b), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72728609:72736122:-1 gene:ENSRNOG00000049014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:72727880:72782959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0
NM_022633 // RefSeq // Rattus norvegicus galanin-like peptide (Galp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000034854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72745908:72766916:-1 gene:ENSRNOG00000022129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF188491 // GenBank // Rattus norvegicus galanin-like peptide precursor, mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:72727880:72782959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001169143 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 444 (Zfp444), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006228187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 444 (Zfp444), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000020787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72775799:72793062:-1 gene:ENSRNOG00000015517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:72727880:72782959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001107474 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 5 (Nlrp5), mRNA. // chrU // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000041542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:72846717:72878799:-1 gene:ENSRNOG00000022994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000048282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:72846717:72891726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 90 // 43 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT004505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NM_001172164 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 4 (Nlrp4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73062798:73100694:-1 gene:ENSRNOG00000021996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:73063115:73097094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001172164 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 4 (Nlrp4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000046152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73062798:73100694:-1 gene:ENSRNOG00000021996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000017572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:73063115:73097094:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 73 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT004506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// NONRATT004507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1
NM_001169149 // RefSeq // Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 9 (Nlrp9), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000029591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73246708:73296649:-1 gene:ENSRNOG00000021913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000017577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:73246708:73296649:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001008942 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 33 (Vom1r33), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_001167551 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor Vom1r39 (Vom1r39), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY510340 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd22 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NM_001008947 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 34 (Vom1r34), mRNA. // chr9 // 57 // 97 // 21 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000064246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73342240:73343157:-1 gene:ENSRNOG00000049710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 57 // 97 // 21 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000074328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100877964:100878881:1 gene:ENSRNOG00000048104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 58 // 100 // 22 // 38 // 0 /// AY510347 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd23 mRNA, complete cds. // chr9 // 57 // 97 // 21 // 37 // 0
GENSCAN00000036786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100878186:100881685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 91 // 39 // 10 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000050074 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:100880101:100881685:1 gene:ENSRNOG00000031806 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr9 // 74 // 96 // 20 // 27 // 0
NM_001008942 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 33 (Vom1r33), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NM_001008947 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 34 (Vom1r34), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001167551 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor Vom1r39 (Vom1r39), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:73342240:73343157:-1 gene:ENSRNOG00000049710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:100877964:100878881:1 gene:ENSRNOG00000048104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY510340 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd22 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY510347 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd23 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006223072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oocyte specific homeobox 5 (Obox5), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000045660 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:100852373:100853876:1 gene:ENSRNOG00000029702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:100851751:100853876:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001008919 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 35 (Vom1r35), mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000049179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76407751:76408665:1 gene:ENSRNOG00000033755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AY510332 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd7 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT000666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
NM_001008913 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 36 (Vom1r36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76351969:76352880:1 gene:ENSRNOG00000031899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY510335 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rd26 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_057136 // RefSeq // Rattus norvegicus Epsin 1 (Epn1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76226167:76242237:1 gene:ENSRNOG00000015753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF018261 // GenBank // Rattus norvegicus EH domain binding protein Epsin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000008489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76227751:76242143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT000662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT000663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT000664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
XM_003748763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2 (U2af2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76206354:76223195:1 gene:ENSRNOG00000015914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76206354:76223195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT000656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT000659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT000660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_006223060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 106 (Ccdc106), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 106 (Ccdc106), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 106 (Ccdc106), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006228308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 106 (Ccdc106), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 106 (Ccdc106), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 106 (Ccdc106), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000021613 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:76201662:76204586:1 gene:ENSRNOG00000015997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76195617:76204586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001072400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 580 (Zfp580), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_218196 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 580 (Zfp580), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021772 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:76196682:76197200:1 gene:ENSRNOG00000016274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT000654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000008463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76195617:76204586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSRNOT00000073243 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:76174976:76175320:1 gene:ENSRNOG00000046037 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 86 // 88 // 18 // 21 // 0
XM_006223058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 865-like (LOC100911196), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 865-like (LOC100911196), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_342793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 865-like (LOC100911196), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_350148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 865-like (LOC100911196), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76169622:76172801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001108905 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 524 (Zfp524), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76158681:76159625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT000645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134545 // RefSeq // Rattus norvegicus scavenger receptor cysteine rich domain containing (5 domains) (Ssc5d), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006228257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scavenger receptor cysteine rich domain containing (5 domains) (Ssc5d), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006228258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scavenger receptor cysteine rich domain containing (5 domains) (Ssc5d), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76074530:76092319:1 gene:ENSRNOG00000016687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000008472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76040561:76092258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0
XM_006223051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 628 (Zfp628), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// XM_006228300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 628 (Zfp628), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000029136 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:76067424:76070543:1 gene:ENSRNOG00000038622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NM_001108466 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 14 (Nat14), mRNA. // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// XM_006228270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetyltransferase 14 (Nat14), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// XM_006228273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-acetyltransferase 14 (Nat14), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000068550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76071585:76073672:1 gene:ENSRNOG00000042414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76040561:76092258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSRNOT00000022565 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:76021129:76021587:1 gene:ENSRNOG00000016805 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000008446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76021300:76021587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_022697 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L28 (Rpl28), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC081800 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L28, mRNA (cDNA clone MGC:93429 IMAGE:7131175), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT000635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_001078306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 190 (Tmem190), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002725522 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 190 (Tmem190), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066383 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:75902787:75904295:1 gene:ENSRNOG00000042528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75895850:75904301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001107475 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of variegation 4-20 homolog 2 (Drosophila) (Suv420h2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of variegation 4-20 homolog 2 (Drosophila) (Suv420h2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of variegation 4-20 homolog 2 (Drosophila) (Suv420h2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75861337:75868943:1 gene:ENSRNOG00000017508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY724526 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cpz-p-10-0-UI unknown mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75861312:75868299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT000631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT000632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001127337 // RefSeq // Rattus norvegicus BR serine/threonine kinase 1 (Brsk1), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006228283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BR serine/threonine kinase 1 (Brsk1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75808536:75833928:1 gene:ENSRNOG00000017673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AB365521 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for serine/threonine kinase SAD-B, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000030640 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75808536:75833823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT000627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT000629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001108467 // RefSeq // Rattus norvegicus EPS8-like 1 (Eps8l1), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000032306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75610284:75624428:1 gene:ENSRNOG00000027942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000030660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75610425:75622895:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT000623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
ENSRNOT00000053809 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:1:73299351:73299467:1 gene:ENSRNOG00000035686 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_057199 // RefSeq // Rattus norvegicus natural cytotoxicity triggering receptor 1 (Ncr1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75322402:75366003:1 gene:ENSRNOG00000018458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AF082533 // GenBank // Rattus norvegicus NK receptor KILR-1 (KILR-1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75303291:75365949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT000622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_201992 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgA, receptor for (Fcar), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000029621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75285478:75318514:1 gene:ENSRNOG00000027855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB109766 // GenBank // Rattus norvegicus Fcar mRNA for CD89 or IgA Fc receptor isoform 1, complete cds, clone:4-2. // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB109767 // GenBank // Rattus norvegicus Fcar mRNA for CD89 or IgA Fc receptor isoform 1, complete cds, clone:5-3. // chrU // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT000621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000025102 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:75299418:75301316:1 gene:ENSRNOG00000018600 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT000621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_181479 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell immunoglobulin-like receptor, three domains, long cytoplasmic tail, 1 (Kir3dl1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000039823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75204288:75241674:1 gene:ENSRNOG00000027843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// AF527797 // GenBank // Rattus norvegicus KIR3DL1 (Kir3dl1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000044773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75149307:75301044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT000620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001013894 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B, member 4 (Lilrb4), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006227242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B, member 4 (Lilrb4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 31 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000038898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:75149298:75154600:1 gene:ENSRNOG00000027811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AY359280 // GenBank // Rattus norvegicus GP49B1 (Gp49b) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// AY359281 // GenBank // Rattus norvegicus GP49B2 (Gp49b) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XR_349578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor, subfamily B, member 4 (Lilrb4), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT000616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT000617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:75149307:75301044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT000618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT000619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
XM_006228228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily B member 3-like (RGD1566307), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074352 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:74926637:74935844:1 gene:ENSRNOG00000046683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000044776 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74926747:75123689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NONRATT000609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037790 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 8 (Leng8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 8 (Leng8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 8 (Leng8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:74814349:74826049:1 gene:ENSRNOG00000018642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100101 // GenBank // Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377092), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001037790 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 8 (Leng8), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 8 (Leng8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukocyte receptor cluster (LRC) member 8 (Leng8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025338 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:74814349:74826049:1 gene:ENSRNOG00000018642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74795097:74824382:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT000604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001106225 // RefSeq // Rattus norvegicus tweety family member 1 (Ttyh1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:74795009:74813522:1 gene:ENSRNOG00000032699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC168158 // GenBank // Rattus norvegicus tweety homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:187596 IMAGE:8364284), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ212233 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA64YH04 mRNA sequence. // chr1 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT000596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT000601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74795097:74824382:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT000602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
XM_001070253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 4B (Nlrp4b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003748754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B-like (LOC100912013), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_344856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, pyrin domain containing 4B (Nlrp4b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035435 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:74589209:74620967:1 gene:ENSRNOG00000027705 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041128 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:74372259:74395992:1 gene:ENSRNOG00000015527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000026866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74372259:74395936:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000029067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74523648:74620967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000029068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:74397583:74457357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
GENSCAN00000026860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:73896987:74072021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000046047 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:73841069:73981067:1 gene:ENSRNOG00000038479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000003660 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:73962841:74072105:1 gene:ENSRNOG00000038479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 70 // 8 // 14 // 0
NM_001008904 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 40 (Vom1r40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000046111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:68449135:68450127:1 gene:ENSRNOG00000050887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000052217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:68704483:68705475:1 gene:ENSRNOG00000049274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// AY510277 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001008909 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 41 (Vom1r41), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:68531075:68532058:1 gene:ENSRNOG00000029852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510299 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg5 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GATA zinc finger domain-containing protein 10-like (LOC102550140), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GATA zinc finger domain-containing protein 10-like (LOC102550140), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:67922824:67922997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AY310139 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1071 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325225 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1-289 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
JX096837 // GenBank // Rattus norvegicus importin beta 1 mRNA, 3 UTR. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT011995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231521 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YD03 mRNA sequence. // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001008916 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 47 (Vom1r47), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67806605:67807519:1 gene:ENSRNOG00000034101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510316 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg9 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510317 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg14 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008931 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 48 (Vom1r48), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:67745084:67746001:1 gene:ENSRNOG00000031210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510315 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg13 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008918 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 50 (Vom1r50), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:52067092:52068069:-1 gene:ENSRNOG00000031734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510350 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rg11 mRNA, complete cds. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008963 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 54 (Vom1r54), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY510374 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rm4 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107477 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 329 (Zfp329), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 329 (Zfp329), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66592685:66611630:1 gene:ENSRNOG00000019376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7457760, containing frame-shift errors. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233005 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YJ10 mRNA sequence. // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// FQ233784 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YH06 mRNA sequence. // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT000537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053916 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 28 (Trim28), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66355606:66362276:-1 gene:ENSRNOG00000027487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166843 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 28, mRNA (cDNA clone MGC:188735 IMAGE:9028761), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66355784:66361993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT004430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_006222987 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 446-like (LOC102552463), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006228121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 446-like (LOC102552463), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006228123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 446-like (LOC102552463), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006228124 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 446-like (LOC102552463), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000026540 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:66408771:66412079:-1 gene:ENSRNOG00000019623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000046708 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:66408336:66412079:-1 gene:ENSRNOG00000019623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66408336:66455987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006222986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 324 (Zfp324), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036874 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:66417753:66423048:-1 gene:ENSRNOG00000027436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XR_342753 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 324 (Zfp324), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT004441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT004442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000005252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66408336:66455987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001099497 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 33 (Vom2r33), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000073461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:66745463:66760433:1 gene:ENSRNOG00000047703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT000540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT000541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000005255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66661623:66855552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0
NM_001099483 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 36 (Vom2r36), mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT000540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66927795:66962942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 75 // 8 // 12 // 0 /// NONRATT000543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 75 // 8 // 12 // 0
XM_006228133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 18 (Zscan18), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036880 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:66661623:66668933:1 gene:ENSRNOG00000026861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:66661623:66855552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001008951 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 57 (Vom1r57), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// AY510278 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1rk1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT004454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000074520 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:76520725:76522170:-1 gene:ENSRNOG00000048095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NM_019263 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple inositol-polyphosphate phosphatase 1 (Minpp1), mRNA. // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000015017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:258276252:258301852:1 gene:ENSRNOG00000011287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// AF012714 // GenBank // Rattus norvegicus hepatic multiple inositol polyphosphate phosphatase (MIPP1) mRNA, complete cds. // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76520725:76522170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT004585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000024498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:258196576:258300923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0
XM_001073289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330408A02 gene (RGD1310257), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330408A02 gene (RGD1310257), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330408A02 gene (RGD1310257), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330408A02 gene (RGD1310257), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330408A02 gene (RGD1310257), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330408A02 gene (RGD1310257), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330408A02 gene (RGD1310257), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_218322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330408A02 gene (RGD1310257), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:76703515:76722441:-1 gene:ENSRNOG00000014186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:76703515:76723738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_006228336 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus binder of sperm protein homolog 2 (Bsph2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071105 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:77147222:77155527:-1 gene:ENSRNOG00000046669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AY383691 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00036 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_012695 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family 2A, dehydroepiandrosterone (DHEA)-preferring, member 6 (Sult2a6), mRNA. // chr1 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// ENSRNOT00000052129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:77823865:78012472:-1 gene:ENSRNOG00000046091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// M33329 // GenBank // Rat hydroxysteroid sulfotransferase a (STa) mRNA, complete cds. // chr1 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1 /// FQ219721 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YH13 mRNA sequence. // chr1 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1 /// NONRATT004591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 100 // 10 // 19 // 0
NM_001170601 // RefSeq // Rattus norvegicus signal recognition particle 72 (Srp72), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33237745:33351416:-1 gene:ENSRNOG00000002100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:77940755:77942769:-1 gene:ENSRNOG00000048028 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:33238263:33333716:-1 gene:ENSRNOG00000002100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// BC158784 // GenBank // Rattus norvegicus signal recognition particle 72, mRNA (cDNA clone MGC:188145 IMAGE:7302022), complete cds. // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33239304:33265550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:77940358:77959870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:33326272:33388272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
ENSRNOT00000046600 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:77633448:77641909:-1 gene:ENSRNOG00000031005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000041367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:77849696:77903846:-1 gene:ENSRNOG00000047986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// NM_131903 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family 2A, dehydroepiandrosterone (DHEA)-preferring, member 1 (Sult2a1), mRNA. // chr1 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// D14987 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for hydroxysteroid sulfotransferase subunit, complete cds. // chr1 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0 /// FQ219627 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YA03 mRNA sequence. // chr1 // 67 // 75 // 6 // 9 // 0 /// M31363 // GenBank // Rat hydroxysteroid sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 58 // 100 // 7 // 12 // 0 /// NONRATT004591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// NONRATT004592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0
GENSCAN00000030169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:78874818:78875069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000058263 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:78986020:78986346:-1 gene:ENSRNOG00000038276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 58 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:78986014:78986340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NM_021855 // RefSeq // Rattus norvegicus cone-rod homeobox (Crx), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79009897:79015569:-1 gene:ENSRNOG00000013890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB021129 // GenBank // Rattus norvegicus Crx mRNA for cone-rod homeobox protein, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF135838 // GenBank // Rattus norvegicus homeodomain protein CRX (Crx) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79009897:79043514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024897 // RefSeq // Rattus norvegicus EH-domain containing 2 (Ehd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79112280:79130529:-1 gene:ENSRNOG00000011346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097385 // GenBank // Rattus norvegicus EH-domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:114425 IMAGE:7446444), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79112592:79127779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT004599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013027 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein W, 1 (Sepw1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:78801628:78804176:-1 gene:ENSRNOG00000013548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 64 // 13 // 14 // 0 /// BC087625 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein W, 1, mRNA (cDNA clone MGC:105482 IMAGE:7316562), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ224556 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA62YE08 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// U25264 // GenBank // Rattus norvegicus skeletal muscle selenoprotein W (SelW) mRNA, complete cds. // chr1 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:78801628:78849622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1 /// GENSCAN00000042882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79070487:79075009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1
NM_207591 // RefSeq // Rattus norvegicus glioma tumor suppressor candidate region gene 2 (Gltscr2), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000017555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79100888:79108702:-1 gene:ENSRNOG00000013023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AY535002 // GenBank // Rattus norvegicus preS1 binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC086359 // GenBank // Rattus norvegicus glioma tumor suppressor candidate region gene 2, mRNA (cDNA clone MGC:105253 IMAGE:7304013), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// FQ212888 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YN03 mRNA sequence. // chr1 // 78 // 100 // 29 // 37 // 0 /// FQ214363 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YB20 mRNA sequence. // chr1 // 84 // 100 // 31 // 37 // 0 /// GENSCAN00000042896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79094477:79108671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT004596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT004597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_001106226 // RefSeq // Rattus norvegicus glioma tumor suppressor candidate region gene 1 (Gltscr1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79133679:79158168:-1 gene:ENSRNOG00000011262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79134464:79210993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT004602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001012063 // RefSeq // Rattus norvegicus SUMO1 activating enzyme subunit 1 (Sae1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79530175:79585932:-1 gene:ENSRNOG00000015128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079411 // GenBank // Rattus norvegicus SUMO1 activating enzyme subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:94951 IMAGE:7113315), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79530973:79585892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001107479 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal PAS domain protein 1 (Npas1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79667893:79687979:-1 gene:ENSRNOG00000015376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79668010:79689016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001271132 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 35 (Arhgap35), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 35 (Arhgap35), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021223 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:79753058:79769240:-1 gene:ENSRNOG00000015852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000030906 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:27103740:27104747:1 gene:ENSRNOG00000028664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79750843:79769240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000049507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79706824:79720344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// M94721 // GenBank // Rat GAP-associated protein (p190). // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:27101945:27113097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT004610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
XM_006223307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 15 (Ceacam15), mRNA. // chr1 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// GENSCAN00000049503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79869566:79873248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000052299 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:79855540:79873248:-1 gene:ENSRNOG00000028617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT004616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_001054317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor-like (LOC679748), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// XM_002725535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor-like (LOC679748), mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000047079 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:79933260:79933607:-1 gene:ENSRNOG00000034106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000033645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:79933260:79933607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT004617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_001025678 // RefSeq // Rattus norvegicus fukutin related protein (Fkrp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:79980703:79986302:-1 gene:ENSRNOG00000016055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099170 // GenBank // Rattus norvegicus fukutin related protein, mRNA (cDNA clone MGC:116338 IMAGE:7382397), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012518 // RefSeq // Rattus norvegicus calmodulin 3 (Calm3), mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000022603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80090638:80099277:-1 gene:ENSRNOG00000016770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC063187 // GenBank // Rattus norvegicus calmodulin 3, mRNA (cDNA clone MGC:73021 IMAGE:6890866), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M16659 // GenBank // Rat calmodulin mRNA, complete cds, clone prCM79. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// FQ212716 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YM12 mRNA sequence. // chr1 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT004622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80092217:80099176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT004621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT004623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
GENSCAN00000033641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80130913:80131086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000009447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:80130720:80131086:-1 gene:ENSRNOG00000007148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_031729 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 5, catalytic subunit (Ppp5c), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80191565:80215807:-1 gene:ENSRNOG00000016907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078786 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 5, catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93338 IMAGE:7126555), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80192026:80251041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT004626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_022528 // RefSeq // Rattus norvegicus hypoxia inducible factor 3, alpha subunit (Hif3a), mRNA. // chr1 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80223828:80245130:-1 gene:ENSRNOG00000017198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AJ277827 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for hypoxia inducible factor 3 alpha (Hif-3a gene). // chr1 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80192026:80251041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
ENSRNOT00000047777 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:80290666:80291495:-1 gene:ENSRNOG00000038939 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0
NM_001025641 // RefSeq // Rattus norvegicus pregnancy-specific glycoprotein 29 (Psg29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000043333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80481281:80504643:-1 gene:ENSRNOG00000029485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097354 // GenBank // Rattus norvegicus pregnancy-specific glycoprotein 29, mRNA (cDNA clone MGC:114384 IMAGE:7441714), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80481923:80505125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT004633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_019126 // RefSeq // Rattus norvegicus pregnancy specific glycoprotein 19 (Psg19), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000057988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80937733:80947086:-1 gene:ENSRNOG00000038101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 85 // 15 // 17 // 0 /// U09815 // GenBank // Rattus norvegicus pregnancy-specific glycoprotein (rnCGM3) mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// NM_001270654 // RefSeq // Rattus norvegicus pregnancy specific glycoprotein 19 (Psg19), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// BC097328 // GenBank // Rattus norvegicus pregnancy specific glycoprotein 19, mRNA (cDNA clone MGC:114333 IMAGE:7462517), complete cds. // chr1 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000057986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:80937733:80947086:-1 gene:ENSRNOG00000038101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1 /// NONRATT004636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80937971:80970933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
BC097327 // GenBank // Rattus norvegicus heart and neural crest derivatives expressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:114332 IMAGE:7444552), complete cds. // chrU // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000058000 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:80956304:80965005:-1 gene:ENSRNOG00000017721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000041341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:80937971:80970933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// NONRATT004641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_001106229 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 61 (Ccdc61), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81057905:81077772:-1 gene:ENSRNOG00000013767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC127532 // GenBank // Rattus norvegicus similar to BC282485_1, mRNA (cDNA clone MGC:156795 IMAGE:7132439), complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81058109:81074811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSRNOT00000057960 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81159825:81160289:-1 gene:ENSRNOG00000038087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017077 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box A3 (Foxa3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81181104:81190030:-1 gene:ENSRNOG00000014256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L09648 // GenBank // Rattus norvegicus hepatocyte nuclear factor 3a (HNF-3 gamma) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81181459:81189936:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT004647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106230 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaminyl-peptide cyclotransferase-like (Qpctl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutaminyl-peptide cyclotransferase-like (Qpctl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81314398:81323467:-1 gene:ENSRNOG00000015413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC169076 // GenBank // Rattus norvegicus glutaminyl-peptide cyclotransferase-like, mRNA (cDNA clone MGC:189477 IMAGE:5598782), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81315353:81323408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_012714 // RefSeq // Rattus norvegicus gastric inhibitory polypeptide receptor (Gipr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81329941:81340229:-1 gene:ENSRNOG00000015860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// L19660 // GenBank // Rattus norvegicus gastric inhibitory peptide receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81331247:81339152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108475 // RefSeq // Rattus norvegicus vasodilator-stimulated phosphoprotein (Vasp), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81437102:81452365:-1 gene:ENSRNOG00000016367 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// BC168841 // GenBank // Rattus norvegicus vasodilator-stimulated phosphoprotein, mRNA (cDNA clone MGC:189065 IMAGE:9030574), complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT004656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81437115:81459459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT004657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001106231 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1N (Ppm1n), mRNA. // chr1_AABR06109308_random // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006257694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent, 1N (Ppm1n), partial mRNA. // chr1_AABR06109308_random // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000022227 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109308.1:1:1910:-1 gene:ENSRNOG00000016599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1_AABR06109308_random // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007460 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109308.1:137:1884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1_AABR06109308_random // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000026423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81437115:81459459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1_AABR06109308_random // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001256509 // RefSeq // Rattus norvegicus FBJ osteosarcoma oncogene B (Fosb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FBJ osteosarcoma oncogene B (Fosb), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81481174:81487900:-1 gene:ENSRNOG00000046667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// KC847115 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley FBJ osteosarcoma viral oncogene isoform deltaFosb-2 (Fosb) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81483084:81506020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001109416 // RefSeq // Rattus norvegicus CD3e molecule, epsilon associated protein (Cd3eap), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81533986:81537262:-1 gene:ENSRNOG00000016825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81534602:81537076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT004663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000022577 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81596321:81597898:-1 gene:ENSRNOG00000029745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0
NM_001191071 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4 (Mark4), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4 (Mark4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81601798:81633585:-1 gene:ENSRNOG00000017069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81602723:81633561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT004670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT004672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT004673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
XM_006223118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 3 (Bloc1s3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 3 (Bloc1s3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023457 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:81681707:81682294:-1 gene:ENSRNOG00000017463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81681707:81682294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107482 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 37 (Ppp1r37), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000023867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81705739:81737548:-1 gene:ENSRNOG00000017692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC166755 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 68, mRNA (cDNA clone MGC:188503 IMAGE:7930156), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT004676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000026400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81706110:81731244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_138520 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin light chain 3 (Klc3), mRNA. // chr1 // 90 // 98 // 54 // 60 // 0 /// XM_006228377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin light chain 3 (Klc3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 46 // 46 // 0 /// XM_006228379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin light chain 3 (Klc3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000068092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81572385:81581810:-1 gene:ENSRNOG00000018101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// AF166267 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin light chain KLCt mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 98 // 54 // 60 // 0 /// BC078736 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin light chain 3, mRNA (cDNA clone MGC:93186 IMAGE:7134584), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// BC097284 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin light chain 3, mRNA (cDNA clone MGC:114264 IMAGE:7454436), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// GENSCAN00000026429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81572610:81586421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 57 // 57 // 0 /// NONRATT004665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 61 // 61 // 0 /// NONRATT004664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 14 // 61 // 1
ENSRNOT00000052387 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81796729:81810721:-1 gene:ENSRNOG00000033235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067049 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81796656:81810721:-1 gene:ENSRNOG00000033235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000071090 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81799280:81810721:-1 gene:ENSRNOG00000033235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 48 // 14 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000073352 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81799555:81810721:-1 gene:ENSRNOG00000033235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 36 // 10 // 12 // 0 /// XM_006223312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-rel avian reticuloendotheliosis viral oncogene homolog B (Relb), mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// XM_006228502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-rel avian reticuloendotheliosis viral oncogene homolog B (Relb), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000040060 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81783432:81810721:-1 gene:ENSRNOG00000033235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000057802 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:81783432:81810721:-1 gene:ENSRNOG00000033235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000026403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81783432:81810721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
NM_001106232 // RefSeq // Rattus norvegicus cleft lip and palate associated transmembrane protein 1 (Clptm1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81814947:81846254:-1 gene:ENSRNOG00000018255 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166760 // GenBank // Rattus norvegicus cleft lip and palate associated transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:188512 IMAGE:7930858), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81815393:81846242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001085352 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein C-II (Apoc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein C-II (Apoc2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81854611:81859659:-1 gene:ENSRNOG00000018402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ209611 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YI22 mRNA sequence. // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81854786:81855714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT004682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109419 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein C-IV (Apoc4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81860928:81865042:-1 gene:ENSRNOG00000018405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158813 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7370780. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ218092 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA9YJ02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109996 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein C-I (Apoc1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NM_012824 // RefSeq // Rattus norvegicus apolipoprotein C-I (Apoc1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81872117:81875399:-1 gene:ENSRNOG00000018426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071446 // ENSEMBL // ensembl:novel scaffold:Rnor_5.0:AABR06111264.1:971:2519:1 gene:ENSRNOG00000046637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 85 // 46 // 11 // 13 // 0 /// BC098670 // GenBank // Rattus norvegicus apolipoprotein C-I, mRNA (cDNA clone MGC:112622 IMAGE:7372566), complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_003752245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apolipoprotein C-I-like (LOC100911905), mRNA. // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// GENSCAN00000012246 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06111264.1:971:1519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000026395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81872203:81875231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT004685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_212520 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 40 homolog (yeast) (Tomm40), mRNA. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81883632:81895516:-1 gene:ENSRNOG00000018556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AB162855 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TOM40, complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81883632:81885388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000054931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81889821:81896469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT004692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT004691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
XM_006228421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 2 (Pvrl2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NM_001012064 // RefSeq // Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 2 (Pvrl2), mRNA. // chr1 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000025388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81896928:81931943:-1 gene:ENSRNOG00000018730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// BC090075 // GenBank // Rattus norvegicus poliovirus receptor-related 2, mRNA (cDNA clone MGC:94554 IMAGE:7189358), complete cds. // chr1 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// GENSCAN00000054930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81897769:81903589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000054934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81905374:81931731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT004695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_031752 // RefSeq // Rattus norvegicus basal cell adhesion molecule (Lutheran blood group) (Bcam), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000045574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81939822:81954480:-1 gene:ENSRNOG00000029399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AB035510 // GenBank // Rattus norvegicus LU mRNA for Lutheran antigen, complete cds. // chr1 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC072479 // GenBank // Rattus norvegicus basal cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:91621 IMAGE:7104047), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81939840:81981482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001034920 // RefSeq // Rattus norvegicus Cbl proto-oncogene C, E3 ubiquitin protein ligase (Cblc), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// XM_006228404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Cbl proto-oncogene C, E3 ubiquitin protein ligase (Cblc), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81964681:81981504:-1 gene:ENSRNOG00000018953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC105776 // GenBank // Rattus norvegicus Cas-Br-M (murine) ecotropic retroviral transforming sequence c, mRNA (cDNA clone MGC:124804 IMAGE:7931977), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81939840:81981482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT004700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT004701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT004702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001169579 // RefSeq // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16 (Ceacam16), mRNA. // chr1 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000045306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82039102:82049181:-1 gene:ENSRNOG00000031391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// NM_001109422 // RefSeq // Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 3 (Bcl3), mRNA. // chr1 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// NM_001198970 // RefSeq // Rattus norvegicus carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 19 (Ceacam19), mRNA. // chr1 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// XM_006228473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus B-cell CLL/lymphoma 3 (Bcl3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000025913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81996116:82010351:-1 gene:ENSRNOG00000043416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// ENSRNOT00000045073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82066234:82075018:-1 gene:ENSRNOG00000043088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// GENSCAN00000054929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82067774:82074865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82039426:82053526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 23 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81996519:82010289:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT004703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// NONRATT004706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
NM_017076 // RefSeq // Rattus norvegicus poliovirus receptor (PVR), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82085299:82100950:-1 gene:ENSRNOG00000019202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82085299:82100950:-1 gene:ENSRNOG00000019202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085741 // GenBank // Rattus norvegicus poliovirus receptor, mRNA (cDNA clone MGC:93502 IMAGE:7191422), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// L12025 // GenBank // Rattus norvegicus tumor-associated glycoprotein E4 (Tage4) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82086159:82100885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006223121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 23 (Igsf23), mRNA. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006228504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoglobulin superfamily, member 23 (Igsf23), mRNA. // chr1 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000026006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82121240:82129614:-1 gene:ENSRNOG00000024630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000074412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82117293:82129614:-1 gene:ENSRNOG00000024630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000054935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82106749:82134276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_133323 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 111 (Zfp111), mRNA. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_006228375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 111 (Zfp111), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82300647:82307037:-1 gene:ENSRNOG00000024376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// FQ211918 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YJ06 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// U27186 // GenBank // Rattus norvegicus Cys2/His2 zinc finger protein (rKr2) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82256585:82319830:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT004709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001017512 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 61 (Zfp61), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 61 (Zfp61), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000026252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82386242:82390511:-1 gene:ENSRNOG00000019406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC079015 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 61, mRNA (cDNA clone MGC:93939 IMAGE:7113620), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT004713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001037212 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 94 (Zfp94), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82400963:82415836:-1 gene:ENSRNOG00000019416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC108299 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 94, mRNA (cDNA clone MGC:114501 IMAGE:7456297), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82388167:82424431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001106233 // RefSeq // Rattus norvegicus tescalcin-like (Tescl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tescalcin-like (Tescl), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82456666:82457364:-1 gene:ENSRNOG00000019427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82456666:82457364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014016 // RefSeq // Rattus norvegicus immunity-related GTPase family, cinema (Irgc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunity-related GTPase family, cinema (Irgc), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006228426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunity-related GTPase family, cinema (Irgc), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// XM_006228427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunity-related GTPase family, cinema (Irgc), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000030900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82554281:82557958:-1 gene:ENSRNOG00000024257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82554363:82555754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT004723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT004726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001107488 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2 inhibitor and LY6/PLAUR domain containing (Pinlyp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2 inhibitor and LY6/PLAUR domain containing (Pinlyp), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82666951:82672395:-1 gene:ENSRNOG00000019862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82663874:82672382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107489 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 575 (Zfp575), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 575 (Zfp575), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82707389:82709496:-1 gene:ENSRNOG00000024065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82707447:82708674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_139037 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 101 (Tex101), mRNA. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82787111:82789825:-1 gene:ENSRNOG00000020057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF347056 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein TEC-21 mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071768 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:84112989:84115355:-1 gene:ENSRNOG00000045944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000000844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82787268:82817014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT004732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84087642:84159546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001177686 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to BC049730 protein (RGD1565655), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD177 antigen-like (LOC100911001), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000035648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84089808:84159546:-1 gene:ENSRNOG00000022679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC158626 // GenBank // Rattus norvegicus similar to BC049730 protein, mRNA (cDNA clone MGC:187530 IMAGE:7455240), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006228543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD177 antigen-like (LOC100911001), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000074350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82851129:82854148:-1 gene:ENSRNOG00000049317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000075546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84206728:84210565:-1 gene:ENSRNOG00000047176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// GENSCAN00000000860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82851129:82854148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// GENSCAN00000023288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84203951:84209747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// GENSCAN00000023290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84087642:84159546:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_001191948 // RefSeq // Rattus norvegicus CD177 molecule (Cd177), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XR_350188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD177 molecule (Cd177), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000051619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84222312:84244564:-1 gene:ENSRNOG00000022669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000071704 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:82866548:82884825:-1 gene:ENSRNOG00000048783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82861015:82883324:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 81 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84216614:84244564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0
ENSRNOT00000070926 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:82898788:82899390:-1 gene:ENSRNOG00000049941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072982 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:84259045:84259647:-1 gene:ENSRNOG00000050033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82894686:82899390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84254943:84259647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001110295 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 4 (Lypd4), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 4 (Lypd4), transcript variant X1, mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006228476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ly6/Plaur domain containing 4 (Lypd4), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006244577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ly6/PLAUR domain-containing protein 4-like (LOC100910410), transcript variant X3, mRNA. // chr9 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000027226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:82985823:82990918:-1 gene:ENSRNOG00000020098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074821 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:15730045:15732549:1 gene:ENSRNOG00000045544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:82985593:82988436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:15730045:15745254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT056191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006223130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ETS domain-containing transcription factor ERF-like (RGD1563034), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83054889:83059297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT004733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_031774 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab acceptor 1 (prenylated) (Rabac1), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83095962:83099071:-1 gene:ENSRNOG00000020233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF025506 // GenBank // Rattus norvegicus prenylated rab acceptor 1 (PRA1) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC086387 // GenBank // Rattus norvegicus Rab acceptor 1 (prenylated), mRNA (cDNA clone MGC:105390 IMAGE:7302383), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83096152:83098988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT004734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT004738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT004739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT004735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_012506 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Na+/K+ transporting, alpha 3 polypeptide (Atp1a3), mRNA. // chr1 // 98 // 94 // 45 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000027497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83104725:83133845:-1 gene:ENSRNOG00000020263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// M14513 // GenBank // Rat Na+, K+-ATPase alpha(III) isoform catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 94 // 45 // 46 // 0 /// GENSCAN00000010766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83105099:83132585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT004740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0
NM_031508 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, kainate 5 (Grik5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000027578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83137817:83207039:-1 gene:ENSRNOG00000020310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// U08258 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley glutamate receptor KA2 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000010753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83138330:83203330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT004743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001271204 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 2 homeobox 2 (Pou2f2), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// XM_006228367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POU class 2 homeobox 2 (Pou2f2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83226783:83263163:-1 gene:ENSRNOG00000020381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000046678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83226783:83263163:-1 gene:ENSRNOG00000020381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83226783:83263163:-1 gene:ENSRNOG00000020381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83226968:83253829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 83 // 32 // 33 // 0
NM_017344 // RefSeq // Rattus norvegicus glycogen synthase kinase 3 alpha (Gsk3a), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 57 // 59 // 0 /// ENSRNOT00000027677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83366057:83374707:-1 gene:ENSRNOG00000020417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0 /// GENSCAN00000010747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83366268:83374587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 51 // 51 // 0 /// NONRATT004754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 59 // 59 // 0
NM_001170335 // RefSeq // Rattus norvegicus Ets2 repressor factor (Erf), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000027684 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83378953:83382939:-1 gene:ENSRNOG00000020426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83380844:83382937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 57 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT004757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
BC126079 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase, isoform Ib, gamma subunit, mRNA (cDNA clone IMAGE:8369995), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_053654 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, catalytic subunit 3 (Pafah1b3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// XM_006228365 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 1b, catalytic subunit 3 (Pafah1b3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000027774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83427896:83430421:-1 gene:ENSRNOG00000020481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// AF016047 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase alpha 1 subunit (PAF-AH alpha 1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// NONRATT004759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83427942:83429992:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1
NM_001108909 // RefSeq // Rattus norvegicus cornifelin (Cnfn), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cornifelin (Cnfn), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000027845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83497889:83500036:-1 gene:ENSRNOG00000020530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83498019:83499236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT004762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012859 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase, hormone sensitive (Lipe), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006228393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipase, hormone sensitive (Lipe), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83511519:83530200:-1 gene:ENSRNOG00000020546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC078888 // GenBank // Rattus norvegicus lipase, hormone sensitive, mRNA (cDNA clone IMAGE:7113740), complete cds. // chr1 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// U40001 // GenBank // Rattus norvegicus hormone-sensitive lipase testicular isoform mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006228392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipase, hormone sensitive (Lipe), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// GENSCAN00000028051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83511823:83529962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT004763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT004765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001107491 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X-C motif) ligand 17 (Cxcl17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83530854:83542736:-1 gene:ENSRNOG00000037814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83531149:83538052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001109453 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate-rich 4 (Erich4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031326 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:83669400:83671140:-1 gene:ENSRNOG00000037798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83669850:83671085:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012782 // RefSeq // Rattus norvegicus branched chain ketoacid dehydrogenase E1, alpha polypeptide (Bckdha), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus branched chain ketoacid dehydrogenase E1, alpha polypeptide (Bckdha), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006228390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus branched chain ketoacid dehydrogenase E1, alpha polypeptide (Bckdha), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83684797:83713570:-1 gene:ENSRNOG00000020607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC161819 // GenBank // Rattus norvegicus branched chain ketoacid dehydrogenase E1, alpha polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:187269 IMAGE:9099948), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83685112:83699898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT004780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT004781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001106235 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 97 (Ccdc97), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83764847:83772603:-1 gene:ENSRNOG00000020675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212311 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA59YN23 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ216505 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YH18 mRNA sequence. // chr1 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83766621:83772450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT004788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108477 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like 1 (Hnrnpul1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83774021:83808198:-1 gene:ENSRNOG00000020683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83775098:83808124:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001013147 // RefSeq // Rattus norvegicus Axl receptor tyrosine kinase (Axl), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 86 // 90 // 32 // 37 // 0 /// NM_031794 // RefSeq // Rattus norvegicus Axl receptor tyrosine kinase (Axl), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 87 // 95 // 34 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000028131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83812118:83840542:-1 gene:ENSRNOG00000020716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000028132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83812118:83840542:-1 gene:ENSRNOG00000020716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// FQ226468 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YB07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83812118:83840542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT004795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT004798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1
NM_001107495 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily s, polypeptide 1 (Cyp2s1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83854677:83868967:-1 gene:ENSRNOG00000020743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83855751:83868909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000049588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:83908308:83909928:-1 gene:ENSRNOG00000028852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082047 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily s, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131741), partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:83909211:83917923:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT004803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_173294 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 3 (Cyp2b3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84417665:84491180:1 gene:ENSRNOG00000033164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC105823 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450IIB3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7372728), partial cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC127479 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450IIB3, mRNA (cDNA clone MGC:156573 IMAGE:7372256), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ210362 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA2YH02 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M20406 // GenBank // Rat cytochrome P450IIB3 (P450IIB subfamily) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84417688:84636614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT000920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT000921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_198733 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily b, polypeptide 21 (Cyp2b21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:84644038:84672867:-1 gene:ENSRNOG00000032004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF159245 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 CYP2B21 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84644412:84674193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108581 // RefSeq // Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila) (Epc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila) (Epc2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_574397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila)-like 1 (Epc2l1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:38799078:38897923:1 gene:ENSRNOG00000029447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000072193 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:84689817:84692243:-1 gene:ENSRNOG00000050758 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:38786755:38919407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84689817:84692243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001170586 // RefSeq // Rattus norvegicus serologically defined colon cancer antigen 1 (Sdccag1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_354869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550586 (LOC102550586), ncRNA. // chr1 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000029880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:101068662:101132662:-1 gene:ENSRNOG00000004716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85015833:85033911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// NONRATT048207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// GENSCAN00000004268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101070193:101105455:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// GENSCAN00000004260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:101125908:101132662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001004083 // RefSeq // Rattus norvegicus egl-9 family hypoxia-inducible factor 2 (Egln2), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus egl-9 family hypoxia-inducible factor 2 (Egln2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85180395:85188174:-1 gene:ENSRNOG00000020947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY952204 // GenBank // Rattus norvegicus HIF-1alpha prolyl-4-hydroxylase-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC078907 // GenBank // Rattus norvegicus EGL nine homolog 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:93666 IMAGE:7113703), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC081858 // GenBank // Rattus norvegicus EGL nine homolog 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:93662 IMAGE:7107517), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85180821:85187279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT004808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT004809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_017355 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB4B, member RAS oncogene family (Rab4b), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85190236:85201526:-1 gene:ENSRNOG00000001500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// FQ227674 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YF20 mRNA sequence. // chr1 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONRATT004810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT004811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000029119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85194087:85204196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONRATT004814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// NONRATT004813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_030852 // RefSeq // Rattus norvegicus melanoma inhibitory activity (Mia), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85202541:85204208:-1 gene:ENSRNOG00000001499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U67884 // GenBank // Rattus norvegicus melanoma inhibitory activity/condrocyte-derived retinoic acid sensitive protein homolog (MIA/CD-RAP) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U51438 // GenBank // Rattus norvegicus CDRAP mRNA, partial cds. // chr1 // 69 // 48 // 9 // 13 // 0 /// NONRATT004816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85194087:85204196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001008303 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A (Snrpa), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85210610:85219232:-1 gene:ENSRNOG00000001501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086331 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A, mRNA (cDNA clone MGC:105915 IMAGE:7300752), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85210824:85218711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT004817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_178094 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol-trisphosphate 3-kinase C (Itpkc), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85229798:85251619:-1 gene:ENSRNOG00000013945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY160770 // GenBank // Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase C (Ip3kc) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85230944:85251265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000029109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85313615:85313845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170336 // RefSeq // Rattus norvegicus latent transforming growth factor beta binding protein 4 (Ltbp4), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus latent transforming growth factor beta binding protein 4 (Ltbp4), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85328915:85361198:-1 gene:ENSRNOG00000020871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85329176:85357099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT004823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT004825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001271080 // RefSeq // Rattus norvegicus Sh3kbp1 binding protein 1 (Shkbp1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000028348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85366002:85379188:-1 gene:ENSRNOG00000020882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85366002:85379188:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT004829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001100845 // RefSeq // Rattus norvegicus spectrin, beta, non-erythrocytic 4 (Sptbn4), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85379607:85463656:-1 gene:ENSRNOG00000020914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000053585 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85382906:85467364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_001012167 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase D family, member 3 (Pld3), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase D family, member 3 (Pld3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006228578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase D family, member 3 (Pld3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000057177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85556094:85567834:-1 gene:ENSRNOG00000018390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// BC089987 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase D family, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:109410 IMAGE:7318612), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85556392:85567153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT004839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1 /// NONRATT004840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// NONRATT004841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001191621 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase 10 (Map3k10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:85686570:85704588:-1 gene:ENSRNOG00000023521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85686570:85789896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NONRATT004845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000053591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:85808112:85808378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT004845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036173 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:85808062:85808378:-1 gene:ENSRNOG00000022222 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 74 // 100 // 20 // 27 // 0
XM_006228603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 59-like (LOC102553760), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000025586 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:85951318:85964317:-1 gene:ENSRNOG00000018928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000066529 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:85951631:85965377:-1 gene:ENSRNOG00000018928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT004845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000051665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86096157:86112055:-1 gene:ENSRNOG00000018936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// FQ226580 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA23YL09 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_057122 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 4 (Psmc4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86194912:86203260:-1 gene:ENSRNOG00000018994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC063145 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 4, mRNA (cDNA clone MGC:72664 IMAGE:6889167), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// D50695 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proteasomal ATPase (Tat-binding protein7), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ225557 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YK09 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000013465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86195008:86203223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT004855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001166396 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein V (Selv), mRNA. // chr1 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT001026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 52 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT001027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT001028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// GENSCAN00000016559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86697098:86715250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_053666 // RefSeq // Rattus norvegicus delta-like 3 (Drosophila) (Dll3), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006228611 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus delta-like 3 (Drosophila) (Dll3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86697088:86704825:1 gene:ENSRNOG00000019338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF084576 // GenBank // Rattus norvegicus Delta 3 mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86697098:86715250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001073346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to translocase of inner mitochondrial membrane 50 homolog (LOC687295), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057096 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:86684450:86691548:1 gene:ENSRNOG00000037638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// FQ213435 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YN19 mRNA sequence. // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86684450:86691445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT001021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT001024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001107497 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of Ty 5 homolog (S. cerevisiae) (Supt5h), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000048905 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:86651826:86680238:1 gene:ENSRNOG00000032034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057470 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:86664287:86680238:1 gene:ENSRNOG00000032034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// BC166741 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7937457. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86647245:86680238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT001011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT001015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT001016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT001017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT001018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001134972 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 2 (Plekhg2), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 2 (Plekhg2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000044326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86601601:86614808:1 gene:ENSRNOG00000030266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC169013 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:9035284), complete cds. // chr1 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// GENSCAN00000016563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86583672:86614564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// NONRATT001007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_133290 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 36 (Zfp36), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86595418:86597898:1 gene:ENSRNOG00000019673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC060308 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 36, mRNA (cDNA clone MGC:72649 IMAGE:6922188), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT001005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106237 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 29 (Med29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86583618:86589021:1 gene:ENSRNOG00000019702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86583672:86614564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001107498 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 4B (Samd4b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86553119:86577571:1 gene:ENSRNOG00000019831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC090319 // GenBank // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 4B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7113063). // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86553326:86575544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT001001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_003748808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin-28A-like (LOC100911249), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006223315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon, lambda 3 (Ifnl3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006228638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon, lambda 3 (Ifnl3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000035328 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:86450831:86452363:-1 gene:ENSRNOG00000026584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000063788 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:86468148:86469680:1 gene:ENSRNOG00000043368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86434273:86452471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86468040:86469680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001134506 // RefSeq // Rattus norvegicus non-specific cytotoxic cell receptor protein 1 homolog (zebrafish) (Nccrp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86428102:86431684:1 gene:ENSRNOG00000026244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86428185:86431161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86767688:86785475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001106238 // RefSeq // Rattus norvegicus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 4 (Pak4), mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86408071:86417580:1 gene:ENSRNOG00000019883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC168940 // GenBank // Rattus norvegicus p21 (CDKN1A)-activated kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:189242 IMAGE:8363273), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86391260:86416748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT000998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86208387:86378283:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001106239 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S12 (Mrps12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S12 (Mrps12), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88101812:88104707:-1 gene:ENSRNOG00000019949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88102059:88102391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT004883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_030867 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, beta (Nfkbib), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88122206:88129977:-1 gene:ENSRNOG00000020063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF246634 // GenBank // Rattus norvegicus I-kappa-B-beta mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// BC085729 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells inhibitor, beta, mRNA (cDNA clone MGC:93398 IMAGE:7114624), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88122265:88129718:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT004886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_031675 // RefSeq // Rattus norvegicus actinin alpha 4 (Actn4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000027773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88258638:88327926:-1 gene:ENSRNOG00000020433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC061788 // GenBank // Rattus norvegicus actinin alpha 4, mRNA (cDNA clone MGC:72395 IMAGE:5623735), complete cds. // chr1 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// U19893 // GenBank // Rattus norvegicus alpha actinin mRNA, complete cds. // chr1 // 80 // 94 // 35 // 44 // 0 /// AF190909 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-actinin 4 mRNA, complete cds. // chr1 // 74 // 89 // 31 // 42 // 0 /// GENSCAN00000000951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88259664:88355439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 87 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT004891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NM_001106242 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit K (Eif3k), mRNA. // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// XM_006228715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit K (Eif3k), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89103168:89108197:-1 gene:ENSRNOG00000020495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT004910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89097654:89112963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT004914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// FQ227157 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YM16 mRNA sequence. // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// FQ235066 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YJ16 mRNA sequence. // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT004911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT004912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT004916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000027893 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:89151996:89241192:-1 gene:ENSRNOG00000020557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 99 // 76 // 76 // 77 // 0 /// GENSCAN00000029183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89135738:89241192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 99 // 85 // 85 // 86 // 0 /// NONRATT004918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 11 // 11 // 11 // 101 // 1
NM_001198584 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 98, member C (Fam98c), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NR_037147 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 98, member C (Fam98c), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000056964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89270394:89273938:-1 gene:ENSRNOG00000024036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000029195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89270601:89286095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT004927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT004929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT004926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001173344 // RefSeq // Rattus norvegicus sprouty-related, EVH1 domain containing 3 (Spred3), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006228724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sprouty-related, EVH1 domain containing 3 (Spred3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sprouty-related, EVH1 domain containing 3 (Spred3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006228727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sprouty-related, EVH1 domain containing 3 (Spred3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89279385:89288184:-1 gene:ENSRNOG00000020570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC166515 // GenBank // Rattus norvegicus sprouty-related, EVH1 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:188090 IMAGE:7131550), complete cds. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT004933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89270601:89286095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001100831 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 8 (Psmd8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000027937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89292313:89299144:-1 gene:ENSRNOG00000037580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT004934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89292739:89352036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 89 // 16 // 18 // 1 /// NONRATT004936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1 /// NONRATT004937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 12 // 18 // 1
NM_001170340 // RefSeq // Rattus norvegicus cation channel, sperm-associated, gamma 1 (Catsperg1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XR_350220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel, sperm-associated, gamma 1 (Catsperg1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89307167:89337459:-1 gene:ENSRNOG00000020576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC167101 // GenBank // Rattus norvegicus similar to R27328_1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7457683), partial cds. // chr1 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// XM_006228694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cation channel sperm-associated protein subunit gamma 1-like (LOC102550585), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89292739:89352036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_053806 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 6 (Kcnk6), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000027974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88346900:88355439:-1 gene:ENSRNOG00000020598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000032394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89344804:89352036:-1 gene:ENSRNOG00000049868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// AF281304 // GenBank // Rattus norvegicus 2P domain K+ channel TWIK-2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF281305 // GenBank // Rattus norvegicus 2P domain K+ channel TWIK-2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88259664:88355439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89292739:89352036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_002728724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG54286-like (LOC100361913), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_003753231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG54286-like (LOC100361913), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027998 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:88371326:88372142:-1 gene:ENSRNOG00000020628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// FQ220383 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YB16 mRNA sequence. // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88371398:88372187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001082549 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type, 2 (Spint2), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_199087 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type, 2 (Spint2), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88380000:88402455:-1 gene:ENSRNOG00000020636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000046611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88380000:88402455:-1 gene:ENSRNOG00000020636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC061768 // GenBank // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type, 2, mRNA (cDNA clone MGC:72638 IMAGE:5621353), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// FQ221832 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA31YC20 mRNA sequence. // chr1 // 58 // 89 // 18 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88380298:88402160:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT004900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT004901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT004902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_001013066 // RefSeq // Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000042207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88439887:88477653:-1 gene:ENSRNOG00000020703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC091303 // GenBank // Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3, mRNA (cDNA clone MGC:109241 IMAGE:7309905), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT004904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000011143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88441599:88524218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 87 // 87 // 34 // 39 // 1
XM_006228662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88441599:88524218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
XM_006228662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88441599:88524218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006228662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88441599:88524218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006228662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88441599:88524218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006228662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88441599:88524218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006228662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88441599:88524218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006228662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 3 (Sipa1l3), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88441599:88524218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_006228762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 850-like (LOC100912787), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 850-like (LOC100912787), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89535698:89742110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88905472:89002202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006228765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 27-like (LOC102550277), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211480 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YH09 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037288 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:88952861:88954537:-1 gene:ENSRNOG00000048116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000038642 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:89717943:89719619:-1 gene:ENSRNOG00000047627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000010456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89535698:89742110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88905472:89002202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000029176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88905472:89002202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT004909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000010456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89535698:89742110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 1
NM_001271339 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 74 (Zfp74), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89392420:89401781:-1 gene:ENSRNOG00000048894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000072689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88994762:88997933:-1 gene:ENSRNOG00000046937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89394341:89397512:-1 gene:ENSRNOG00000048894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:88992841:89002202:-1 gene:ENSRNOG00000046937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000010451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89395842:89448851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029176 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:88905472:89002202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001100991 // RefSeq // Rattus norvegicus ZFP14 zinc finger protein (Zfp14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ZFP14 zinc finger protein (Zfp14), transcript variant X11, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006228745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ZFP14 zinc finger protein (Zfp14), transcript variant X13, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006255153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC102546354), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006255164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 14-like (LOC102546354), transcript variant X12, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000033661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89511747:89523098:-1 gene:ENSRNOG00000030932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000075435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:25600969:25612320:1 gene:ENSRNOG00000047379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC128772 // GenBank // Rattus norvegicus mouse zinc finger protein 14-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7131296), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166403 // GenBank // Rattus norvegicus mouse zinc finger protein 14-like, mRNA (cDNA clone MGC:187196 IMAGE:8363623), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XM_006223177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 82-like (LOC102547241), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 82-like (LOC102547241), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 82-like (LOC102547241), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 82-like (LOC102547241), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134726 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 566 (Zfp566), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_003748815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 566-like (LOC100910651), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006228760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 566-like (LOC100910651), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89576860:89600307:-1 gene:ENSRNOG00000031226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC167072 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Zinc finger protein 566, mRNA (cDNA clone MGC:189408 IMAGE:9028223), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074582 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:89569607:89574601:-1 gene:ENSRNOG00000048138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT004943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89535698:89742110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT004944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001177687 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1562079 (RGD1562079), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003748823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus succinate dehydrogenase assembly factor 1, mitochondrial-like (LOC100912030), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89936061:89936417:-1 gene:ENSRNOG00000037541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92086132:92087079:1 gene:ENSRNOG00000047045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC159436 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1562079, mRNA (cDNA clone MGC:188772 IMAGE:9101903), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89936061:89980919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92056197:92086514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107502 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 3 (Lrfn3), mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000028275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89975457:89980935:-1 gene:ENSRNOG00000020839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC158862 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat and fibronectin type III domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:188435 IMAGE:7933283), complete cds. // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT004945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89936061:89980919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NONRATT004945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001005900 // RefSeq // Rattus norvegicus hematopoietic cell signal transducer (Hcst), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hematopoietic cell signal transducer (Hcst), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90035102:90037134:-1 gene:ENSRNOG00000020849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AY247020 // GenBank // Rattus norvegicus DAP10 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001100802 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor-like protein 1 (Aplp1), mRNA. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000028297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90053391:90063141:-1 gene:ENSRNOG00000020851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC161904 // GenBank // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor-like protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187624 IMAGE:8367333), complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// FQ213451 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YL23 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000010842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90053678:90074707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT004949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001271398 // RefSeq // Rattus norvegicus kin of IRRE like 2 (Drosophila) (Kirrel2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90066397:90075012:-1 gene:ENSRNOG00000020864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90053678:90074707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
NM_001106244 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide I (Polr2i), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:89844218:89845655:1 gene:ENSRNOG00000020799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073107 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:92178396:92179412:-1 gene:ENSRNOG00000050560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006228865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide I (Polr2i), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:89844596:89845612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044142 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92178396:92179412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
XM_003753235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 33 (Arhgap33), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000034001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90133412:90145522:-1 gene:ENSRNOG00000024677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90133672:90159761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 17 // 23 // 1 /// NONRATT004957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001127579 // RefSeq // Rattus norvegicus proline and serine rich 3 (Proser3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC59495 (RGD1565712), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC59495 (RGD1565712), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000032363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90149377:90161856:-1 gene:ENSRNOG00000024625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT004958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90133672:90159761:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_001106245 // RefSeq // Rattus norvegicus lin-37 homolog (C. elegans) (Lin37), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90165072:90169004:-1 gene:ENSRNOG00000020929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90165156:90167397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT004960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT004961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001008764 // RefSeq // Rattus norvegicus presenilin enhancer gamma secretase subunit (Psenen), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus presenilin enhancer gamma secretase subunit (Psenen), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90170911:90172105:-1 gene:ENSRNOG00000020941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY539891 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00140 mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// BC100104 // GenBank // Rattus norvegicus presenilin enhancer 2 homolog (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:112872 IMAGE:7377803), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90171028:90171883:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT004962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109517 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 32 (Zbtb32), mRNA. // chr1 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// XM_006228792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 32 (Zbtb32), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// XM_006228817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone-lysine N-methyltransferase 2B-like (LOC102550344), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000046359 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:90178012:90197133:-1 gene:ENSRNOG00000020961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 74 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000063808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90197757:90200062:-1 gene:ENSRNOG00000042465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 20 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90178012:90200025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT004963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 10 // 50 // 1 /// NONRATT004973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 10 // 50 // 1
NM_001108911 // RefSeq // Rattus norvegicus uroplakin 1A (Upk1a), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90215600:90223198:-1 gene:ENSRNOG00000024331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90206841:90249073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_001145273 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to cytochrome c oxidase, subunit VIb polypeptide 1 (LOC688869), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to cytochrome c oxidase, subunit VIb polypeptide 1 (LOC688869), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000032026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90230830:90238903:-1 gene:ENSRNOG00000024309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000045155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230806987:230807459:1 gene:ENSRNOG00000034161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// FQ222745 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YH17 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ224063 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA78YA01 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90206841:90249073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230807066:230807326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// NONRATT004975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT004976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006228815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ets variant 2 (Etv2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90246873:90249351:-1 gene:ENSRNOG00000024288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90206841:90249073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT004978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001014159 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 42 (Rbm42), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000031254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90254914:90264844:-1 gene:ENSRNOG00000024278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079321 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 42, mRNA (cDNA clone MGC:94498 IMAGE:7135399), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ222852 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA19YC08 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90255046:90264749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT004980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT004981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0
XM_002725564 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex, subunit 5 (Haus5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_002728731 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex, subunit 5 (Haus5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000031044 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:90268937:90279586:-1 gene:ENSRNOG00000024266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// GENSCAN00000010788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90268895:90279586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT004985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT004986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
XR_145754 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912333 (LOC100912333), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_146742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912333 (LOC100912333), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070888 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:90287496:90296221:-1 gene:ENSRNOG00000046724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 50 // 10 // 13 // 0 /// NONRATT004987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001038494 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 147 (Tmem147), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90332928:90334759:-1 gene:ENSRNOG00000021006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC111082 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 147, mRNA (cDNA clone MGC:125231 IMAGE:7455198), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234356 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YE10 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90333205:90334637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT004991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006228791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, spermatogenic (Gapdhs), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90334996:90344833:-1 gene:ENSRNOG00000021009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC161847 // GenBank // Rattus norvegicus glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, spermatogenic, mRNA (cDNA clone MGC:187369 IMAGE:7112898), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_023964 // RefSeq // Rattus norvegicus glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, spermatogenic (Gapdhs), mRNA. // chr1 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000028518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90334994:90349297:-1 gene:ENSRNOG00000021009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// GENSCAN00000010819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90335110:90349235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT004994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT004995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT004996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001005877 // RefSeq // Rattus norvegicus free fatty acid receptor 2 (Ffar2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90424464:90425456:-1 gene:ENSRNOG00000021021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB106675 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GPR43, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90424464:90466116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108912 // RefSeq // Rattus norvegicus free fatty acid receptor 3 (Ffar3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90457565:90459494:-1 gene:ENSRNOG00000037467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166522 // GenBank // Rattus norvegicus free fatty acid receptor 3, mRNA (cDNA clone MGC:188106 IMAGE:7134236), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90424464:90466116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT004998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_153304 // RefSeq // Rattus norvegicus free fatty acid receptor 1 (Ffar1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90463925:90464827:-1 gene:ENSRNOG00000024009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB095744 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GPR40, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF539810 // GenBank // Rattus norvegicus GPR40 (Gpr40) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90424464:90466116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT004999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107503 // RefSeq // Rattus norvegicus CD22 molecule (Cd22), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD22 molecule (Cd22), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90470008:90484868:-1 gene:ENSRNOG00000024000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90470655:90525456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017190 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin-associated glycoprotein (Mag), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90500839:90516262:-1 gene:ENSRNOG00000021023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90500839:90516262:-1 gene:ENSRNOG00000021023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ212027 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YD05 mRNA sequence. // chr1 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// M14871 // GenBank // Rat myelin-associated glycoprotein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// M16800 // GenBank // Rat 1B236/myelin-associated glycoprotein (MAG) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// M22357 // GenBank // Rat 1B236/myelin-associated glycoprotein (MAG) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// X05301 // GenBank // Rat mRNA for myelin-associated glycoprotein (L-MAG). // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90470655:90525456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT005004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT005005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_053469 // RefSeq // Rattus norvegicus hepcidin antimicrobial peptide (Hamp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hepcidin antimicrobial peptide (Hamp), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000028545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90523509:90525499:-1 gene:ENSRNOG00000021029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF344185 // GenBank // Rattus norvegicus prohepcidin (Hepc) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222617 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YP17 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90470655:90525456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_031139 // RefSeq // Rattus norvegicus upstream transcription factor 2, c-fos interacting (Usf2), mRNA. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90527311:90538049:-1 gene:ENSRNOG00000021030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90527311:90538049:-1 gene:ENSRNOG00000021030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AB035647 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for USF2, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// AB035648 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for USF2 splicing variant-1, complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AB035649 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for USF2 splicing variant-2, complete cds. // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// AB035650 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for USF2 splicing variant-3, complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AB047556 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transcription factor USF2, complete cds. // chr1 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC128735 // GenBank // Rattus norvegicus upstream transcription factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:156629 IMAGE:7190049), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AB035651 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for USF2 splicing variant-4, complete cds. // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90527926:90537997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001270688 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 5 (Fxyd5), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_001270689 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 5 (Fxyd5), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_021909 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 5 (Fxyd5), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90620339:90629722:-1 gene:ENSRNOG00000021062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC060571 // GenBank // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 5, mRNA (cDNA clone MGC:72838 IMAGE:6891214), complete cds. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ220058 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YF19 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90591575:90642025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_022008 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 7 (Fxyd7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90630083:90639081:-1 gene:ENSRNOG00000021067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90591575:90642025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT005018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_031648 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 1 (Fxyd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006228838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 1 (Fxyd1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90639293:90642454:-1 gene:ENSRNOG00000021079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ211349 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YG23 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ224131 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA75YM07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ224338 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA6YB20 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U72246 // GenBank // Rattus norvegicus phospholemman chloride channel mRNA, complete cds. // chr1 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90591575:90642025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_172317 // RefSeq // Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 3 (Fxyd3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FXYD domain-containing ion transport regulator 3 (Fxyd3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90657652:90664433:-1 gene:ENSRNOG00000021095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90658410:90661028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT005025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_017112 // RefSeq // Rattus norvegicus hepsin (Hpn), mRNA. // chr1 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90688659:90698514:-1 gene:ENSRNOG00000021097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC072688 // GenBank // Rattus norvegicus hepsin, mRNA (cDNA clone MGC:91742 IMAGE:7098661), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FQ219040 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YC09 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT005028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90684700:90714878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT005027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT005029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001271046 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type I, beta subunit (Scn1b), transcript variant 3, mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NM_017288 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type I, beta subunit (Scn1b), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90705285:90715018:-1 gene:ENSRNOG00000021102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AF182949 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-gated sodium channel subunit beta1-A (SCN1B) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// FQ216374 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YE07 mRNA sequence. // chr1 // 85 // 56 // 17 // 20 // 0 /// M91808 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel beta-1 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 81 // 26 // 29 // 0 /// NM_001271045 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type I, beta subunit (Scn1b), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// BC094523 // GenBank // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type I, beta, mRNA (cDNA clone MGC:105455 IMAGE:7316686), complete cds. // chr1 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// NONRATT005030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT005031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000025239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90684700:90714878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
NM_001014160 // RefSeq // Rattus norvegicus GRAM domain containing 1A (Gramd1a), mRNA. // chr1 // 88 // 94 // 30 // 34 // 0 /// XR_350237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRAM domain containing 1A (Gramd1a), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90718529:90740144:-1 gene:ENSRNOG00000021106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY171575 // GenBank // Rattus norvegicus EG1RVC mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 94 // 30 // 34 // 0 /// BC105896 // GenBank // Rattus norvegicus GRAM domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:124896 IMAGE:7380410), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90718904:90736489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XR_342859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histo-blood group ABO system transferase-like (RGD1561430), transcript variant X3, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_350245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histo-blood group ABO system transferase-like (RGD1561430), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_001079451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SET-like (RGD1563307), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_218493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SET-like (RGD1563307), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000030832 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:90799762:90800583:-1 gene:ENSRNOG00000028984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90791483:90800583:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001170400 // RefSeq // Rattus norvegicus lacrimal gland protein (LOC292801), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001170457 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to androgen-binding protein eta (LOC689199), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90936251:90937541:1 gene:ENSRNOG00000030828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001100859 // RefSeq // Rattus norvegicus secretoglobin, family 1B, member 30 (Scgb1b30), mRNA. // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000052376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91099203:91100467:1 gene:ENSRNOG00000029116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90936267:90937621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90854524:90870192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000029807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91099203:91100560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT001145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000029680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:90929577:90930489:-1 gene:ENSRNOG00000023314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GU269242 // GenBank // Rattus norvegicus androgen-binding protein (Abpbg3) mRNA, partial cds. // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:90929756:90930489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
ENSRNOT00000056615 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:91020999:91022298:-1 gene:ENSRNOG00000037415 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
GU269241 // GenBank // Rattus norvegicus androgen-binding protein (Abpbg2) pseudogene mRNA, partial sequence. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000037519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91112725:91137956:-1 gene:ENSRNOG00000023296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC167052 // GenBank // Rattus norvegicus Wilms tumor 1 interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7443636), partial cds. // chrU // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// XM_006223198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wilms tumor 1 interacting protein (Wtip), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000029814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91113209:91143974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT005040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT005041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT005042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001100579 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 2 (Uba2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000028672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91155863:91179053:-1 gene:ENSRNOG00000021113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC161985 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like modifier activating enzyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:187804 IMAGE:9030809), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:98347029:98348948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT005043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT016875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91155863:91204997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1
NM_001109544 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 2-like (Pdcd2l), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000028674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91189390:91201359:-1 gene:ENSRNOG00000021119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000029812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91155863:91204997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT005045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT005046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_207592 // RefSeq // Rattus norvegicus glucose-6-phosphate isomerase (Gpi), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000032613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91207017:91234890:-1 gene:ENSRNOG00000023150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC062005 // GenBank // Rattus norvegicus glucose phosphate isomerase, mRNA (cDNA clone MGC:72563 IMAGE:5599776), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// FQ214989 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YE01 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91207285:91234824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT005048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT005052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NONRATT005048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT005049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001271233 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931406P16 (RGD1308428), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228848 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931406P16 (RGD1308428), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931406P16 (RGD1308428), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91240941:91270158:-1 gene:ENSRNOG00000021129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91243173:91313510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT005055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001127552 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM14A, SCD6 homolog A (S. cerevisiae) (Lsm14a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_350248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM14A, SCD6 homolog A (S. cerevisiae) (Lsm14a), transcript variant X4, misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91343533:91388619:-1 gene:ENSRNOG00000021133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166537 // GenBank // Rattus norvegicus LSM14A, SCD6 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188130 IMAGE:7191211), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91341338:91370180:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT005059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001109141 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 15 (Kctd15), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006228860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 15 (Kctd15), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91645833:91659091:-1 gene:ENSRNOG00000021137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC168920 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel tetramerisation domain containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:189207 IMAGE:9100405), complete cds. // chr1 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91647111:91656397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001107504 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 8 (Chst8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 8 (Chst8), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 8 (Chst8), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 8 (Chst8), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:91681357:91822788:-1 gene:ENSRNOG00000022919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC161905 // GenBank // Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 8, mRNA (cDNA clone MGC:187625 IMAGE:8367390), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:91681751:91713848:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012831 // RefSeq // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), gamma (Cebpg), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92418852:92427591:-1 gene:ENSRNOG00000021144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166589 // GenBank // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), gamma, mRNA (cDNA clone MGC:188349 IMAGE:7934938), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92421572:92450660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053541 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 3 (Lrp3), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XR_350256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 3 (Lrp3), transcript variant X1, misc_RNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92579059:92593301:-1 gene:ENSRNOG00000011451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB009463 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for LRp105, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92580270:92592933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 75 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT005069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
XM_006228899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 88 (Wdr88), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000056583 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:92618354:92656646:-1 gene:ENSRNOG00000037393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92600722:92657429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_001106246 // RefSeq // Rattus norvegicus G patch domain containing 1 (Gpatch1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000015791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92659066:92707992:-1 gene:ENSRNOG00000011584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92659770:92707963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001109335 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C230052I12 (RGD1564719), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92784851:92791055:-1 gene:ENSRNOG00000022393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006223202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 12 (Tdrd12), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006228901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 12 (Tdrd12), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017021 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:92868399:92934351:-1 gene:ENSRNOG00000012719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92876969:92939135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT005076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001004258 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 19 (Nudt19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92948067:92959663:-1 gene:ENSRNOG00000012777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079088 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 19, mRNA (cDNA clone MGC:94056 IMAGE:7123358), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ215228 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YC09 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// XM_003748842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 19, mitochondrial-like (LOC100912426), mRNA. // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// GENSCAN00000017697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92948252:92959572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000039230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:94328060:94333120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AF145794 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley morphine related protein-2 mRNA, partial cds. // chr1 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_001109142 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G protein signaling 9 binding protein (Rgs9bp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92983020:92983733:-1 gene:ENSRNOG00000012877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92983020:92983733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106247 // RefSeq // Rattus norvegicus programmed cell death 5 (Pdcd5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006228884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus programmed cell death 5 (Pdcd5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0 /// XM_006228897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus programmed cell death protein 5-like (LOC100912106), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000017708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:92303910:92309238:-1 gene:ENSRNOG00000013250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074804 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:93093134:93098267:-1 gene:ENSRNOG00000050827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 67 // 13 // 14 // 0 /// BC168931 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7315703. // chr1 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// FQ222074 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YG06 mRNA sequence. // chr1 // 83 // 86 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:92304062:92369643:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_001135835 // RefSeq // Rattus norvegicus dpy-19-like 3 (C. elegans) (Dpy19l3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006228890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 3 (C. elegans) (Dpy19l3), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006228891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 3 (C. elegans) (Dpy19l3), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006228892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 3 (C. elegans) (Dpy19l3), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:93139685:93199944:-1 gene:ENSRNOG00000021573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:93111124:93198254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_001106248 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 507 (Zfp507), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:93220458:93250626:-1 gene:ENSRNOG00000013565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106248 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 507 (Zfp507), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003748841 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 507-like (LOC100912350), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000018153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:93220458:93250626:-1 gene:ENSRNOG00000013565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074817 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:92337787:92341532:-1 gene:ENSRNOG00000048691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:93221573:93250438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
XM_006223205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 536 (Zfp536), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006223206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 536 (Zfp536), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006223211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 536 (Zfp536), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// XM_006228907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 536 (Zfp536), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006228908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 536 (Zfp536), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006228913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 536 (Zfp536), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000018956 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:94959057:95054443:-1 gene:ENSRNOG00000014163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000075711 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:94800255:95052712:-1 gene:ENSRNOG00000014163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95030822:95059311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT005093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT005094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001107507 // RefSeq // Rattus norvegicus URI1, prefoldin-like chaperone (Uri1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:95435846:95493474:-1 gene:ENSRNOG00000014463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95382819:95603487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT005096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001100821 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin E1 (Ccne1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000020014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:95575138:95584286:-1 gene:ENSRNOG00000014786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC162008 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin E1, mRNA (cDNA clone MGC:187868 IMAGE:9090267), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT005099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000024436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95382819:95603487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT005100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_001013148 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 1 (Plekhf1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 1 (Plekhf1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079354 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 1, mRNA (cDNA clone MGC:94811 IMAGE:7108247), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225960 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YI22 mRNA sequence. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT005102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95681502:95702877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
FQ213607 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YM10 mRNA sequence. // chr1 // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// NM_001009642 // RefSeq // Rattus norvegicus processing of precursor 4, ribonuclease P/MRP subunit (S. cerevisiae) (Pop4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000020474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:95761043:95769376:-1 gene:ENSRNOG00000027646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// BC088183 // GenBank // Rattus norvegicus processing of precursor 4, ribonuclease P/MRP subunit (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:108830 IMAGE:7365498), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// NONRATT005104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95759195:95769218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT005105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT005106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT005103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
XM_001073318 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690114 (LOC690114), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002725610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690114 (LOC690114), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028923 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:95858445:95862163:-1 gene:ENSRNOG00000027370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95839802:95865782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSRNOT00000056545 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:95873009:95873867:-1 gene:ENSRNOG00000037367 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95873009:95881789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0
NM_001108913 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to CG15432-PA (LOC365238), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:95881454:95885255:-1 gene:ENSRNOG00000015168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:95873009:95881789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT005107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001047937 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00021 (LOC499136), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000019364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:98865577:98867261:-1 gene:ENSRNOG00000014455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006223223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102555051), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006223224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102555051), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006228936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102555051), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006228937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102555051), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT005110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 78 // 78 // 14 // 18 // 1
ENSRNOT00000056528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:99127801:99128447:-1 gene:ENSRNOG00000037360 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 87 // 79 // 13 // 15 // 0 /// D49848 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ash-psi, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001007741 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon stimulated exonuclease gene 20-like 2 (Isg20l2), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000015471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:206705209:206714693:1 gene:ENSRNOG00000011402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// BC079314 // GenBank // Rattus norvegicus interferon stimulated exonuclease gene 20-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:94465 IMAGE:7134903), complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000046787 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:99720948:99722054:1 gene:ENSRNOG00000037348 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000007237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:93422261:93423334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 95 // 37 // 41 // 0 /// GENSCAN00000032744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99720948:99722054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000046561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:206706340:206714569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0 /// NONRATT029638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 100 // 40 // 43 // 0
XR_342940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 715 (Zfp715), partial misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_350308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 715 (Zfp715), partial misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030370 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99693945:99706636:1 gene:ENSRNOG00000024056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034555 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99702648:99706308:1 gene:ENSRNOG00000024056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000075781 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99693945:99706529:1 gene:ENSRNOG00000024056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075785 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99693945:99708207:1 gene:ENSRNOG00000024056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006223321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IgLON family member 5 (Iglon5), partial mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_218634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IgLON family member 5 (Iglon5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024150 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:99516991:99532725:1 gene:ENSRNOG00000017918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99516991:99531252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
XM_006228950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690483 (LOC690483), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690483 (LOC690483), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690483 (LOC690483), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024170 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99502792:99511734:1 gene:ENSRNOG00000032990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082038 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7131195. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99475533:99509366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT001197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT001198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_006223239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SIGLEC family like 1 (Siglecl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SIGLEC family like 1 (Siglecl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99475533:99509366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XR_350303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD33 molecule (Cd33), misc_RNA. // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047473 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:99475533:99479841:1 gene:ENSRNOG00000037331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:99475533:99509366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT001193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT001195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT001196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XR_342908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 8 (Siglec8), misc_RNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XR_350321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 8 (Siglec8), misc_RNA. // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048947 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:100647307:100655905:-1 gene:ENSRNOG00000022640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100652538:100655896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000049123 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100701189:100701581:-1 gene:ENSRNOG00000030089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001005382 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase C12 (Klk1c12), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// XM_006229168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glandular kallikrein-12, submandibular/renal-like (LOC687880), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000025631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100371040:100375077:-1 gene:ENSRNOG00000047662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000010137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100933072:101045488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100371040:100375077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_006229217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein 5-like (Klk5l), mRNA. // chr1 // 79 // 74 // 23 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000073513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100434333:100445333:1 gene:ENSRNOG00000046267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 87 // 23 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000074179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101112112:101123112:1 gene:ENSRNOG00000045980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 68 // 87 // 23 // 34 // 0 /// XM_006229216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostate-specific antigen-like (LOC102546874), mRNA. // chr1 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1 /// ENSRNOT00000072944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101007191:101011185:-1 gene:ENSRNOG00000050893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 69 // 13 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100387582:100399987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 77 // 77 // 30 // 39 // 1 /// GENSCAN00000010137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100933072:101045488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// GENSCAN00000010144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101201288:101261392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 17 // 39 // 1 /// GENSCAN00000010151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101074628:101155474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// GENSCAN00000040744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100426037:100473155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1
NM_001135173 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase C10 (Klk1c10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000041899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100395968:100399987:-1 gene:ENSRNOG00000046670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000045756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100957314:100961373:-1 gene:ENSRNOG00000046297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000010137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100933072:101045488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// GENSCAN00000040730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100387582:100399987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0
XM_006229217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kallikrein 5-like (Klk5l), mRNA. // chr1 // 63 // 68 // 12 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:100434333:100445333:1 gene:ENSRNOG00000046267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 82 // 12 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101112112:101123112:1 gene:ENSRNOG00000045980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 82 // 12 // 23 // 0 /// XM_006229216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostate-specific antigen-like (LOC102546874), mRNA. // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000072880 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101073355:101086321:1 gene:ENSRNOG00000046992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 35 // 93 // 9 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101007191:101011185:-1 gene:ENSRNOG00000050893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 42 // 68 // 8 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100387582:100399987:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100933072:101045488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101201288:101261392:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000010151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101074628:101155474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// GENSCAN00000040744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100426037:100473155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
L33839 // GenBank // Rattus norvegicus (clone K-32) kallikrein mRNA, 3 end. // chr1 // 100 // 47 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000010137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100933072:101045488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT005141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001003977 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase C6 (Klk1c6), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101014192:101030273:-1 gene:ENSRNOG00000048630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100933072:101045488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 85 // 19 // 23 // 0 /// NONRATT005141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_012677 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein 1-related peptidase C2 (Klk1c2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000025701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101046494:101050871:-1 gene:ENSRNOG00000029237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// M11565 // GenBank // Rat submaxillary gland S2 kallikrein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000010145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101046537:101063486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT005142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006229176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552731 (LOC102552731), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552731 (LOC102552731), mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 26 // 37 // 1 /// XM_006229175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552731 (LOC102552731), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 70 // 70 // 26 // 37 // 1 /// XR_350322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552220 (LOC102552220), ncRNA. // chr1 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// ENSRNOT00000046737 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101269130:101270258:-1 gene:ENSRNOG00000032170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000010147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101269130:101271626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000046254 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100369072:100370232:1 gene:ENSRNOG00000045810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 100 // 22 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000056467 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:100931104:100932264:1 gene:ENSRNOG00000049860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 59 // 100 // 22 // 37 // 0 /// GENSCAN00000010121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100897616:100932264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// GENSCAN00000040724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:100361428:100370232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_001107510 // RefSeq // Rattus norvegicus acid phosphatase, testicular (Acpt), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XR_350314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acid phosphatase, testicular (Acpt), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000032200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101292689:101299618:-1 gene:ENSRNOG00000021659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC168932 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7133517. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101293143:101312937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT005144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT005145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT005146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000010127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101293143:101312937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001012459 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 11, member A (Clec11a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 11, member A (Clec11a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006229037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 11, member A (Clec11a), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006229039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 11, member A (Clec11a), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101355487:101358626:-1 gene:ENSRNOG00000019138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090344 // GenBank // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 11, member a, mRNA (cDNA clone MGC:105670 IMAGE:7304238), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 11, member A (Clec11a), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000010143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101356307:101358235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT005147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106255 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC292874 (RGD1309036), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006228989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC292874 (RGD1309036), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006228993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC292874 (RGD1309036), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006228994 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC292874 (RGD1309036), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101411207:101424622:-1 gene:ENSRNOG00000037298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101410226:101415932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001004221 // RefSeq // Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 10 (Emc10), mRNA. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// XM_006229001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 10 (Emc10), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101560506:101566824:-1 gene:ENSRNOG00000019532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC079041 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2310044H10Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:93975 IMAGE:7114835), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT005153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT005154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// NONRATT005155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000011933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101555209:101566741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT005156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT005157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001106257 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin binding protein C, fast-type (Mybpc2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101572091:101595570:-1 gene:ENSRNOG00000019627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101572220:101595503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001024286 // RefSeq // Rattus norvegicus Spi-B transcription factor (Spi-1/PU.1 related) (Spib), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Spi-B transcription factor (Spi-1/PU.1 related) (Spib), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101596933:101602764:-1 gene:ENSRNOG00000019660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089881 // GenBank // Rattus norvegicus Spi-B transcription factor (Spi-1/PU.1 related), mRNA (cDNA clone MGC:109046 IMAGE:7368473), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101598673:101600677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_021662 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), delta 1, catalytic subunit (Pold1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101603485:101614451:-1 gene:ENSRNOG00000019681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ222691 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for DNA polymerase delta, catalytic subunit. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101603493:101624092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT005165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031626 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 1, group H, member 2 (Nr1h2), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101619967:101625287:-1 gene:ENSRNOG00000019812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// U14533 // GenBank // Rattus norvegicus orphan receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// U20389 // GenBank // Rattus norvegicus orphan nuclear receptor OR-1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101603493:101624092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT005170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT005171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT005172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT005173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT005174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT005175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001100690 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 14, non-muscle (Myh14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000027132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101674362:101737053:-1 gene:ENSRNOG00000020014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000011877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101674761:101731801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT005178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
XM_006223267 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 473 (Zfp473), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 473 (Zfp473), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 473 (Zfp473), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229189 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 473 (Zfp473), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037973 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:101801777:101810515:-1 gene:ENSRNOG00000026572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000011893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101792206:101810515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_172336 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 5 (Atf5), mRNA. // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000027260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101872584:101876673:-1 gene:ENSRNOG00000020060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY123225 // GenBank // Rattus norvegicus strain NEDH activating transcription factor 5 (Atf5) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// BC061786 // GenBank // Rattus norvegicus activating transcription factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:72271 IMAGE:5623784), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101873171:101875268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT005182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001106258 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 17 (Tbc1d17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101901664:101909886:-1 gene:ENSRNOG00000020191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC160880 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:188282 IMAGE:7380632), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101901859:101911461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001008304 // RefSeq // Rattus norvegicus prostate tumor overexpressed 1 (Ptov1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_350313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostate tumor overexpressed 1 (Ptov1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101923970:101930515:-1 gene:ENSRNOG00000020358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC085836 // GenBank // Rattus norvegicus prostate tumor overexpressed 1, mRNA (cDNA clone MGC:94482 IMAGE:7135127), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000001377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101924333:101930407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT005187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// NONRATT005188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_001170426 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 25 (Med25), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006229007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 25 (Med25), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101939597:101952474:-1 gene:ENSRNOG00000020363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101939632:101952555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT005189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT005190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT005193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001107511 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 2, alpha 1 subunit (Ap2a1), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 2, alpha 1 subunit (Ap2a1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:101961565:101990733:-1 gene:ENSRNOG00000026243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:101961565:101990733:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001034925 // RefSeq // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase 1c (Cpt1c), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000035908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102019484:102034000:-1 gene:ENSRNOG00000026163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// BC105882 // GenBank // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase 1c, mRNA (cDNA clone IMAGE:7313473), complete cds. // chr1 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102019610:102033731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT005196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT005197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// NONRATT005198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// NONRATT005199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001108480 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-like 12 (proline rich) (Bcl2l12), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BCL2-like 12 (proline rich) (Bcl2l12), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102048990:102057872:-1 gene:ENSRNOG00000020486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT005206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT005208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT005207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_019384 // RefSeq // Rattus norvegicus SR-related CTD-associated factor 1 (Scaf1), mRNA. // chr1 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// XM_006229128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SR-related CTD-associated factor 1 (Scaf1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000027801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102062545:102073215:-1 gene:ENSRNOG00000020499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// U49056 // GenBank // Rattus norvegicus CTD-binding SR-like protein rA1 mRNA, complete cds. // chr1 // 90 // 91 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102062545:102075707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_341852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline rich 12 (Prr12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000038067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102088242:102110835:-1 gene:ENSRNOG00000025877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102088242:102119159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
NM_001108482 // RefSeq // Rattus norvegicus proline rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 2 (Prrg2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102112490:102119928:-1 gene:ENSRNOG00000020517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102088242:102119159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008694 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulocalbin 3, EF-hand calcium binding domain (Rcn3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102141920:102151199:-1 gene:ENSRNOG00000043007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083719 // GenBank // Rattus norvegicus reticulocalbin 3, EF-hand calcium binding domain, mRNA (cDNA clone MGC:94613 IMAGE:7190838), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102141945:102150641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT005218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033706 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 16 family, member A1 (Aldh16a1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006229099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 16 family, member A1 (Aldh16a1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102203197:102216266:-1 gene:ENSRNOG00000020623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC101860 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 16 family, member A1, mRNA (cDNA clone MGC:124726 IMAGE:7936953), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000001401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102203296:102216209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT005244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_033351 // RefSeq // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG, receptor, transporter, alpha (Fcgrt), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102151857:102161645:-1 gene:ENSRNOG00000020583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC061975 // GenBank // Rattus norvegicus Fc fragment of IgG, receptor, transporter, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:72370 IMAGE:5623787), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// FQ229080 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YM08 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// M35495 // GenBank // Rat MHC class I IgG Fc region receptor large subunit p51 (FcRn) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102152104:102160937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT005221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT005222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT005223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_031110 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S11 (Rps11), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000066328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102182159:102184324:-1 gene:ENSRNOG00000020595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC058465 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S11, mRNA (cDNA clone MGC:72790 IMAGE:6920362), complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// FQ211364 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YD09 mRNA sequence. // chr1 // 85 // 81 // 11 // 13 // 0 /// FQ221188 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA39YI10 mRNA sequence. // chr1 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// FQ221872 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA30YL01 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// K03250 // GenBank // Rat ribosomal protein S11 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// XM_006229162 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S11 (Rps11), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// GENSCAN00000001376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102182205:102196520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT005224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 69 // 81 // 9 // 13 // 0 /// NONRATT005227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 8 // 16 // 1
NONRATT005224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000027981 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:102192472:102196701:-1 gene:ENSRNOG00000042254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000074671 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:102192472:102196701:-1 gene:ENSRNOG00000042254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// XM_006223275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fms-related tyrosine kinase 3 ligand-like (LOC102547607), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1 /// XM_006223278 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fms-related tyrosine kinase 3 ligand-like (LOC102547607), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1 /// XR_342913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fms-related tyrosine kinase 3 ligand-like (LOC102547607), transcript variant X5, misc_RNA. // chr1 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1 /// XR_350330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fms-related tyrosine kinase 3 ligand-like (LOC102547607), transcript variant X7, misc_RNA. // chr1 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// ENSRNOT00000074163 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:102191516:102196921:-1 gene:ENSRNOG00000042254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// GENSCAN00000001376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102182205:102196520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// FQ220948 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YB19 mRNA sequence. // chr1 // 71 // 71 // 12 // 17 // 1 /// FQ226639 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YO22 mRNA sequence. // chr1 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1
NONRATT005229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT005229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NONRATT005229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NONRATT005229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 155 (Ccdc155), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006223281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 155 (Ccdc155), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006229199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 155 (Ccdc155), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006229201 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 155 (Ccdc155), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000037998 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:102245530:102267389:-1 gene:ENSRNOG00000025378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000001387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102245530:102267426:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0
NM_001109145 // RefSeq // Rattus norvegicus dickkopf-like 1 (Dkkl1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102270284:102275533:-1 gene:ENSRNOG00000020686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102270360:102274983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT005247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_017124 // RefSeq // Rattus norvegicus CD37 molecule (Cd37), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006228981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD37 molecule (Cd37), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102295449:102300642:-1 gene:ENSRNOG00000020699 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC059144 // GenBank // Rattus norvegicus CD37 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:72894 IMAGE:6887407), complete cds. // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ232748 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YJ06 mRNA sequence. // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// GENSCAN00000001383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102295706:102300842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT005248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001136229 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 4 (Trpm4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102357043:102386710:-1 gene:ENSRNOG00000020714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB040807 // GenBank // Rattus norvegicus MLS2s mRNA for melastatin like 2, complete cds. // chr1 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000012860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102357573:102386928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001270985 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, f polypeptide (PTPRF), interacting protein (liprin), alpha 3 (Ppfia3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102393147:102420877:-1 gene:ENSRNOG00000020731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102393147:102415631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_021758 // RefSeq // Rattus norvegicus lin-7 homolog B (C. elegans) (Lin7b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102422048:102424623:-1 gene:ENSRNOG00000020746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF090133 // GenBank // Rattus norvegicus lin-7-A mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102422369:102424623:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
XM_006229102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 70 (U1) (Snrnp70), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102431123:102468445:-1 gene:ENSRNOG00000020763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC167051 // GenBank // Rattus norvegicus U1 small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A, mRNA (cDNA clone MGC:189347 IMAGE:9089731), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001108483 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 70 (U1) (Snrnp70), mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000049957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102437190:102468582:-1 gene:ENSRNOG00000020763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102431256:102467711:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT005265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001025405 // RefSeq // Rattus norvegicus RuvB-like AAA ATPase 2 (Ruvbl2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102493177:102506032:-1 gene:ENSRNOG00000020793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082022 // GenBank // Rattus norvegicus RuvB-like 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone IMAGE:7129720). // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098042 // GenBank // Rattus norvegicus RuvB-like 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:116199 IMAGE:7457010), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102493260:102503434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT005271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
AF235993 // GenBank // Rattus norvegicus Bax protein splice variant k mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NM_017059 // RefSeq // Rattus norvegicus Bcl2-associated X protein (Bax), mRNA. // chr1 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// ENSRNOT00000028328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102530748:102536167:-1 gene:ENSRNOG00000020876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// FQ229844 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YH24 mRNA sequence. // chr1 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// NONRATT005281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// NONRATT005284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// NONRATT005285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// GENSCAN00000012873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102530911:102555779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
XM_001076463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydrodiol dehydrogenase (dimeric) (Dhdh), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydrodiol dehydrogenase (dimeric) (Dhdh), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028334 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:102545589:102555779:-1 gene:ENSRNOG00000020883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102530911:102555779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_053463 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleobindin 1 (Nucb1), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102559073:102579561:-1 gene:ENSRNOG00000020889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF336828 // GenBank // Rattus norvegicus nucleobindin mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC062084 // GenBank // Rattus norvegicus nucleobindin 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5599758), complete cds. // chr1 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// BC100643 // GenBank // Rattus norvegicus nucleobindin 1, mRNA (cDNA clone MGC:124586 IMAGE:7930904), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102559993:102579060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT005288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT005293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT005289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT005290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT005294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT005296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
AF020618 // GenBank // Rattus norvegicus progression elevated gene 3 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0 /// NM_133546 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 15A (Ppp1r15a), mRNA. // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000044788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102590679:102593734:-1 gene:ENSRNOG00000020938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC072513 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 15A, mRNA (cDNA clone MGC:91505 IMAGE:7104357), complete cds. // chr1 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// NONRATT005298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 83 // 41 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102590787:102593631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_130752 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 21 (Fgf21), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102674359:102675602:-1 gene:ENSRNOG00000020990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB078901 // GenBank // Rattus norvegicus FGF21 mRNA for fibroblast growth factor 21, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102660242:102675602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031635 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosyltransferase 2 (secretor status included) (Fut2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fucosyltransferase 2 (secretor status included) (Fut2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fucosyltransferase 2 (secretor status included) (Fut2), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fucosyltransferase 2 (secretor status included) (Fut2), transcript variant X11, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102710415:102730500:-1 gene:ENSRNOG00000021011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB006138 // GenBank // Rattus norvegicus FTB mRNA for alpha 1,2-fucosyltransferase, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF264005 // GenBank // Rattus norvegicus alpha 1-2 fucosyltransferase mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000012858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102712121:102713185:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT005306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001135584 // RefSeq // Rattus norvegicus secretory blood group 1 (Sec1), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006229076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretory blood group 1 (Sec1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229077 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretory blood group 1 (Sec1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretory blood group 1 (Sec1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretory blood group 1 (Sec1), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102742369:102743268:-1 gene:ENSRNOG00000021014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000012911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102742369:102745413:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT005310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001012066 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingosine kinase 2 (Sphk2), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229086 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sphingosine kinase 2 (Sphk2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006229088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sphingosine kinase 2 (Sphk2), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000028549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102771805:102776109:-1 gene:ENSRNOG00000021032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC079120 // GenBank // Rattus norvegicus sphingosine kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94123 IMAGE:7126682), complete cds. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// FQ211663 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YD14 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102772240:102775218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT005311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001109623 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm acrosome associated 4 (Spaca4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102786530:102786913:-1 gene:ENSRNOG00000021037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102786530:102852296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039665 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family, cytosolic, 2B, member 1 (Sult2b1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfotransferase family, cytosolic, 2B, member 1 (Sult2b1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfotransferase family, cytosolic, 2B, member 1 (Sult2b1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102791087:102820223:-1 gene:ENSRNOG00000021046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102791087:102853054:-1 gene:ENSRNOG00000021046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AY827147 // GenBank // Rattus norvegicus SULT2B1a mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AY827148 // GenBank // Rattus norvegicus SULT2B1b mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC127438 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455706. // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102786530:102852296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT005318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT005319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NONRATT005318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_053911 // RefSeq // Rattus norvegicus cytohesin 2 (Cyth2), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// U83896 // GenBank // Rattus norvegicus sec7B mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000028588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102875334:102882171:-1 gene:ENSRNOG00000021051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 95 // 35 // 37 // 1 /// FQ229744 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YN14 mRNA sequence. // chr1 // 76 // 76 // 28 // 37 // 1 /// NONRATT005321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT005322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 30 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000031139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102875512:102881988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 84 // 84 // 31 // 37 // 1
NM_170718 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 14 (Kcnj14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102884516:102888529:-1 gene:ENSRNOG00000021056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102885397:102887986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001012067 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate-rich WD repeat containing 1 (Grwd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102892342:102898043:-1 gene:ENSRNOG00000021058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083883 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate-rich WD repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:95187 IMAGE:7131596), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102892868:102931990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT005325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_022797 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 2D (Grin2d), mRNA. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000028615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102899803:102935845:-1 gene:ENSRNOG00000021063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// L31611 // GenBank // Rattus norvegicus NMDA receptor subunit NR2D mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// L31612 // GenBank // Rattus norvegicus NMDA receptor subunit NR2D mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// U08260 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley N-methyl-D-aspartate receptor NMDAR2D subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102892868:102931990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001025644 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptogyrin 4 (Syngr4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptogyrin 4 (Syngr4), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000028635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102951507:102962708:-1 gene:ENSRNOG00000021093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098938 // GenBank // Rattus norvegicus synaptogyrin 4, mRNA (cDNA clone MGC:114469 IMAGE:7455020), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102952176:102954005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_030847 // RefSeq // Rattus norvegicus epithelial membrane protein 3 (Emp3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epithelial membrane protein 3 (Emp3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:102979697:102982874:-1 gene:ENSRNOG00000021104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088131 // GenBank // Rattus norvegicus epithelial membrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:108667 IMAGE:7365466), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:102979735:102981904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031013 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 6 (Abcc6), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103042750:103096453:-1 gene:ENSRNOG00000028781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AB010466 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for multidrug resistance-associated protein (MRP)-like protein-1 (MLP-1), complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// U73038 // GenBank // Rattus norvegicus liver multidrug resistance-associated protein 6 (mrp6) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103043945:103093694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_031358 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly rectifying channel, subfamily J, member 11 (Kcnj11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium inwardly rectifying channel, subfamily J, member 11 (Kcnj11), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// AB043638 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP-sensitive K+ channel subunit Kir6.2, complete cds. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// D61687 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for inwardly rectifying pottasium channel, complete cds. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// U44897 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-sensitive potassium channel mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// D86039 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP-sensitive inwardly rectifying K+ channel, BIR(Kir6.2), complete cds. // chr1 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT005332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013039 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 8 (Abcc8), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000028696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103194473:103275523:-1 gene:ENSRNOG00000021130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000038798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103194473:103275523:-1 gene:ENSRNOG00000021130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AB052294 // GenBank // Rattus norvegicus SUR1 mRNA for sulphonylurea receptor 1, complete cds. // chr1 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// AF039595 // GenBank // Rattus norvegicus sulfonylurea receptor 1B (SUR1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000031155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103240732:103275508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000031162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103194473:103232248:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// L40624 // GenBank // Rattus norvegicus sulfonylurea receptor (SUR) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 37 // 40 // 0
NM_212521 // RefSeq // Rattus norvegicus Usher syndrome 1C (Ush1c), mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Usher syndrome 1C (Ush1c), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103291322:103339681:-1 gene:ENSRNOG00000021149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AY588414 // GenBank // Rattus norvegicus harmonin a1 (Ush1c) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 76 // 70 // 16 // 21 // 0 /// BC098641 // GenBank // Rattus norvegicus Usher syndrome 1C homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:112571 IMAGE:7109129), complete cds. // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103291623:103339563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT005339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_006223296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretion regulating guanine nucleotide exchange factor (Sergef), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006229227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secretion regulating guanine nucleotide exchange factor (Sergef), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000015352 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:103690972:103741937:-1 gene:ENSRNOG00000011488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103715160:103781029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT005343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001100634 // RefSeq // Rattus norvegicus tryptophan hydroxylase 1 (Tph1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tryptophan hydroxylase 1 (Tph1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006229220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tryptophan hydroxylase 1 (Tph1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103746878:103774100:-1 gene:ENSRNOG00000011672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103715160:103781029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
XM_003748859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SAAL1-like (LOC691143), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0 /// XM_003753248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SAAL1-like (LOC691143), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0 /// XM_006223299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SAAL1-like (LOC691143), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0 /// XM_006223300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SAAL1-like (LOC691143), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// XM_006229230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SAAL1-like (LOC691143), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0 /// XM_006229231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SAAL1-like (LOC691143), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103793445:103816239:-1 gene:ENSRNOG00000011895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000011866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103793445:103816239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// AY325259 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Bq135360 mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 86 // 30 // 31 // 0
NM_001009478 // RefSeq // Rattus norvegicus serum amyloid A4, constitutive (Saa4), mRNA. // chr1 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// NM_001135612 // RefSeq // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 5 (Hps5), mRNA. // chr1 // 100 // 40 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103884175:103923493:-1 gene:ENSRNOG00000012232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103851924:103901046:-1 gene:ENSRNOG00000012232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:103850710:103855009:-1 gene:ENSRNOG00000012232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// BC088188 // GenBank // Rattus norvegicus serum amyloid A4, constitutive, mRNA (cDNA clone MGC:108857 IMAGE:7371403), complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103851924:103852553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 15 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000036509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:103860762:103919084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 30 // 16 // 16 // 0 /// AY325132 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-018 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// AY325161 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-028 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 47 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 47 // 47 // 25 // 53 // 1 /// NONRATT005357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 22 // 53 // 1
AY856054 // GenBank // Rattus norvegicus clone 27B1A-RBSC spectrin beta-like polypeptide mRNA, complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT005361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181628 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor susceptibility 101 (Tsg101), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104015888:104044600:-1 gene:ENSRNOG00000013381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AY293306 // GenBank // Rattus norvegicus tumor-susceptibility gene 101 protein (Tsg101) mRNA, complete cds. // chr1 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// BC070951 // GenBank // Rattus norvegicus tumor susceptibility gene 101, mRNA (cDNA clone MGC:91392 IMAGE:7100763), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ231102 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YE24 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000036523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104015048:104046944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_001077088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UEV and lactate/malate dehyrogenase domains (Uevld), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_003753250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UEV and lactate/malate dehyrogenase domains (Uevld), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104054415:104082541:-1 gene:ENSRNOG00000013624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104054415:104111382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT005369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_019253 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5 (Ptpn5), mRNA. // chr1 // 97 // 90 // 35 // 36 // 0 /// XM_006229253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5 (Ptpn5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_006229256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5 (Ptpn5), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000018860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104263143:104320930:-1 gene:ENSRNOG00000013981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// BC092196 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 5, mRNA (cDNA clone MGC:105445 IMAGE:7313460), complete cds. // chr1 // 100 // 68 // 27 // 27 // 0 /// FQ211673 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA83YO02 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 93 // 36 // 37 // 0 /// FQ213308 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YJ07 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 70 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT005374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104244695:104344523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 32 // 40 // 1 /// NONRATT005375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_145787 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member X3 (Mrgprx3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104362405:104387707:-1 gene:ENSRNOG00000014227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ311952 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for G-protein coupled receptor (rc 56.1.3 gene). // chr1 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// BC089774 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor MrgA10 RF-amide G protein-coupled receptor, mRNA (cDNA clone MGC:108580 IMAGE:7321342), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104362640:104435418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT005378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001077174 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mas-related G-protein coupled receptor member X2-like (LOC691194), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_003753282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mas-related G-protein coupled receptor member X2-like (LOC691194), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000051589 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:104962262:104965037:-1 gene:ENSRNOG00000028982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0
NM_001002286 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related G-protein coupled receptor, member C (Mrgprc), mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NM_172158 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member X1 (Mrgprx1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104442543:104443556:-1 gene:ENSRNOG00000014242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104442543:104443514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001002287 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member B4 (Mrgprb4), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000045792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104488718:104489689:-1 gene:ENSRNOG00000033021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104488718:104596363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
GENSCAN00000008583 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104488718:104596363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT005381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001002283 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member B13 (Mrgprb13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104743036:104744022:-1 gene:ENSRNOG00000045635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104691351:104692337:-1 gene:ENSRNOG00000049416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071006 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:104682915:104683901:-1 gene:ENSRNOG00000048550 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104743036:104754952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104691351:104692337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT005383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0
ENSRNOT00000029920 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:104777127:104778638:-1 gene:ENSRNOG00000022680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104777379:104778260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0
NM_001002280 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related GPR, member X2 (Mrgprx2), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104805801:104806685:-1 gene:ENSRNOG00000033665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:104805801:104822197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_001002285 // RefSeq // Rattus norvegicus MAS-related G protein-coupled receptor, member X2-like (Mrgprx2l), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:104872889:104873833:-1 gene:ENSRNOG00000022729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
XM_006223302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mas-related G-protein coupled receptor member B3-like (RGD1560730), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mas-related G-protein coupled receptor member B3-like (RGD1560730), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019103 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:105062091:105063026:-1 gene:ENSRNOG00000014266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001080876 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS-related GPR, member B2 (Mrgprb2), mRNA. // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// XM_577804 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAS-related GPR, member B2 (Mrgprb2), mRNA. // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000056081 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:105085702:105086646:-1 gene:ENSRNOG00000037156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000013944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:105085687:105141630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_057144 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine and glycine-rich protein 3 (cardiac LIM protein) (Csrp3), mRNA. // chr1 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// XM_006229237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteine and glycine-rich protein 3 (cardiac LIM protein) (Csrp3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:105206460:105217109:-1 gene:ENSRNOG00000014327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099073 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7191278. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:105206683:105217080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT005387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENSRNOT00000035512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:105245744:105259620:-1 gene:ENSRNOG00000022537 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// BC099080 // GenBank // Rattus norvegicus E2F transcription factor 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:7443681), partial cds. // chr1 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:105246354:105292882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT005390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001009644 // RefSeq // Rattus norvegicus developing brain homeobox 1 (Dbx1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:106021689:106026119:-1 gene:ENSRNOG00000014706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AB197138 // GenBank // Rattus norvegicus Dbx1 mRNA for developing brain homeobox1, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:106011011:106026119:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000051605 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:108197375:108198737:-1 gene:ENSRNOG00000031542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:108151024:108247515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1
XM_001080926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group F (Fancf), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_574453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group F (Fancf), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:108273110:108274114:-1 gene:ENSRNOG00000023968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:108273095:108274114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271084 // RefSeq // Rattus norvegicus small VCP/p97-interacting protein (Svip), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000056024 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:108412833:108415318:-1 gene:ENSRNOG00000037137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:108413305:108479510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT005400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
GENSCAN00000054099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:109319234:109346635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
XR_350352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552287 (LOC102552287), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// XR_350353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552287 (LOC102552287), transcript variant X2, ncRNA. // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000010272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:109590132:109730053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// GENSCAN00000022172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:110629846:110662005:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
GENSCAN00000035049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:114496414:114498399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000035051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:114504583:114535204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1
ENSRNOT00000032337 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:114950593:114951308:-1 gene:ENSRNOG00000021986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:114950367:114951326:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001107518 // RefSeq // Rattus norvegicus non imprinted in Prader-Willi/Angelman syndrome 2 (Nipa2), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non imprinted in Prader-Willi/Angelman syndrome 2 (Nipa2), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:115354415:115378274:-1 gene:ENSRNOG00000012690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// FQ222971 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YO02 mRNA sequence. // chr1 // 91 // 74 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000057238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115355712:115367599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT005413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001107519 // RefSeq // Rattus norvegicus non imprinted in Prader-Willi/Angelman syndrome 1 (Nipa1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:115392570:115410234:-1 gene:ENSRNOG00000042702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:115393443:115411978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024370 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, gamma 3 (Gabrg3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:113167703:113438056:-1 gene:ENSRNOG00000014862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// M81142 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-alpha receptor gamma-3 subunit mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// X63324 // GenBank // R.norvegicus mRNA for GABA-receptor gamma 3 subunit sequence. // chr1 // 92 // 100 // 33 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071317 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:113753824:113822128:-1 gene:ENSRNOG00000050802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000051846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:113167828:113265104:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000050560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:113728982:113823368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
ENSRNOT00000042228 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:113284815:113285671:-1 gene:ENSRNOG00000032462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:113285182:113310144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_017295 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 5 (Gabra5), mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// XM_006229285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, alpha 5 (Gabra5), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:113844283:113955085:-1 gene:ENSRNOG00000010803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// X51992 // GenBank // R.norvegicus GABA-A receptor alpha-5 subunit mRNA. // chr1 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:113842114:113876569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT005408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:113914713:113962443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
XM_003748870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1-like (LOC365263), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_003753285 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1-like (LOC365263), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000030707 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:114355567:114356288:-1 gene:ENSRNOG00000028324 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000035045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:114355599:114400836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 53 // 100 // 18 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:117836211:117935884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 88 // 17 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:118076125:118147876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 88 // 17 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:122682268:122708156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 88 // 17 // 30 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 71 // 100 // 24 // 34 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 100 // 25 // 34 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 33 // 90 // 9 // 27 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 33 // 90 // 9 // 27 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 33 // 100 // 10 // 30 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 36 // 86 // 9 // 25 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 36 // 97 // 10 // 28 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 36 // 89 // 9 // 25 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 36 // 100 // 10 // 28 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 36 // 89 // 9 // 25 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 36 // 100 // 10 // 28 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 29 // 91 // 9 // 31 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 29 // 100 // 10 // 34 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 97 // 16 // 33 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 97 // 16 // 33 // 0
XR_349456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548411 (LOC102548411), ncRNA. // chr1 // 35 // 90 // 9 // 26 // 0 /// XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 34 // 100 // 10 // 29 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
XR_350070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549777 (LOC102549777), ncRNA. // chr1 // 44 // 100 // 15 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:117836211:117935884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 88 // 17 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:118076125:118147876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 88 // 17 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:122682268:122708156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 88 // 17 // 30 // 0 /// NONRATT004349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 100 // 21 // 34 // 0 /// NONRATT004350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 65 // 100 // 22 // 34 // 0
GENSCAN00000021429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:117836211:117935884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000021433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:118076125:118147876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000047528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:122682268:122708156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556159 (LOC102556159), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XR_350409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556159 (LOC102556159), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 48 // 100 // 12 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
XR_350363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552061 (LOC102552061), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 40 // 100 // 10 // 25 // 0
NM_001270712 // RefSeq // Rattus norvegicus SNRPN upstream reading frame (Snurf), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// NM_031117 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N (Snrpn), mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NM_130738 // RefSeq // Rattus norvegicus SNRPN upstream reading frame (Snurf), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000021763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:202123032:202145397:-1 gene:ENSRNOG00000015976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// BC087671 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide N, mRNA (cDNA clone MGC:105406 IMAGE:7316987), complete cds. // chr1 // 100 // 55 // 11 // 11 // 0 /// M29293 // GenBank // Rat small nuclear ribonucleoparticle-associated protein (snRNP) mRNA, complete cds, clone Sm51. // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000010579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:202110027:202127536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT006331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT006332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT006333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT006334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// NONRATT006339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// NONRATT006340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
GENSCAN00000010584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:202158692:202159123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT006342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001056406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier-like (RGD1561206), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_218743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial thiamine pyrophosphate carrier-like (RGD1561206), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000021855 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:202490047:202490988:-1 gene:ENSRNOG00000016331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:202489796:202490988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XR_342974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555470 (LOC102555470), transcript variant X2, ncRNA. // chr1 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// XR_350394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555470 (LOC102555470), transcript variant X2, ncRNA. // chr1 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// GENSCAN00000013144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:121845603:122071831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_031788 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-344-1 (Mir344-1), microRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NR_037352 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-344a-2 (Mir344a-2), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053681 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:123505479:123505585:-1 gene:ENSRNOG00000049433 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053682 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:123441045:123441151:-1 gene:ENSRNOG00000046685 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-344a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000629 Rattus norvegicus miR-344a-1 stem-loop // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// rno-mir-344a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0015432 Rattus norvegicus miR-344a-2 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031788 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-344-1 (Mir344-1), microRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NR_037352 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-344a-2 (Mir344a-2), microRNA. // chr1 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053681 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:123505479:123505585:-1 gene:ENSRNOG00000049433 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053682 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:1:123441045:123441151:-1 gene:ENSRNOG00000046685 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr1 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// rno-mir-344a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000629 Rattus norvegicus miR-344a-1 stem-loop // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-344a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0015432 Rattus norvegicus miR-344a-2 stem-loop // chr1 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0
XM_218735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus makorin, ring finger protein, 3 (Mkrn3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013551 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:124200481:124202260:-1 gene:ENSRNOG00000010172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:124200481:124206408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001170562 // RefSeq // Rattus norvegicus paternally expressed 12 (Peg12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:124237097:124237921:-1 gene:ENSRNOG00000024429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:124235637:124237921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NR_111961 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich coiled-coil 2C (Prrc2c), non-coding RNA. // chrUn // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004410 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004513 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:234578369:234580234:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:103221144:103223357:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102704547:102743756:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 53 // 68 // 9 // 17 // 0 /// NONRATT017570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrUn // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25841585:25849583:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT017569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrUn // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_012832 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 7 (neuronal) (Chrna7), mRNA. // chrU // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:125028876:125158170:-1 gene:ENSRNOG00000010853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// AY574256 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha7 subunit mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AY671974 // GenBank // Rattus norvegicus nicotinic acetylcholine receptor alpha 7 subunit splice variant 7-2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrU // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// L31619 // GenBank // Rattus rattus nicotinic acetylcholine receptor alpha 7 subunit mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:125029451:125097312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT005425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000022919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:125702408:125703757:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 50 // 11 // 12 // 0
NM_001109147 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 13 (Klf13), mRNA. // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000066380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:125883341:125914101:-1 gene:ENSRNOG00000015822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT005433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT005429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT005430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000035256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:125883452:125926521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001191633 // RefSeq // Rattus norvegicus FANCD2/FANCI-associated nuclease 1 (Fan1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:126292302:126318211:-1 gene:ENSRNOG00000023985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:126292634:126318064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001106340 // RefSeq // Rattus norvegicus M-phase phosphoprotein 10 (U3 small nucleolar ribonucleoprotein) (Mphosph10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000038511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:126321919:126338110:-1 gene:ENSRNOG00000016266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC161909 // GenBank // Rattus norvegicus M-phase phosphoprotein 10 (U3 small nucleolar ribonucleoprotein), mRNA (cDNA clone MGC:187632 IMAGE:8367841), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:126324220:126338066:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
XM_006229356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 189, member A1 (Fam189a1), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000031488 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:126661515:127069249:-1 gene:ENSRNOG00000023496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:126661515:126771854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 68 // 17 // 19 // 0
NM_001173527 // RefSeq // Rattus norvegicus necdin-like 2 (Ndnl2), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT005441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001106266 // RefSeq // Rattus norvegicus tight junction protein 1 (Tjp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tight junction protein 1 (Tjp1), transcript variant X8, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:127243076:127307192:-1 gene:ENSRNOG00000011077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:127194552:127307190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001191624 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat kinase 1 (Lrrk1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016959 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:128248473:128372456:-1 gene:ENSRNOG00000012730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000009045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128211336:128312309:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0
NM_153300 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member A3 (Aldh1a3), mRNA. // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:128382914:128415160:-1 gene:ENSRNOG00000013028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AB369261 // GenBank // Rattus norvegicus Aldh1a3 mRNA for aldehyde dehydrogenase family 1 subfamily A3, complete cds. // chr1 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// AF434845 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 6 mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// BC166415 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member A3, mRNA (cDNA clone MGC:187329 IMAGE:9025597), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128323960:128437305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001108915 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 7 (Asb7), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006229350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 7 (Asb7), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:128632992:128674393:-1 gene:ENSRNOG00000013795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006229351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 7 (Asb7), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:128633206:128664603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001108486 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 28 (Lrrc28), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 28 (Lrrc28), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:129551867:129669841:-1 gene:ENSRNOG00000023274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:129553502:129587790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT005455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT005458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT005459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT005456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NONRATT005457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001134858 // RefSeq // Rattus norvegicus synemin, intermediate filament protein (Synm), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:129760413:129787766:-1 gene:ENSRNOG00000014030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AB091769 // GenBank // Rattus norvegicus DMN mRNA for desmuslin, complete cds. // chr1 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:129760413:129787631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
ENSRNOT00000019418 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:130273424:130277614:-1 gene:ENSRNOG00000014402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000045143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:130275634:130286841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
ENSRNOT00000044428 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:130286368:130286841:-1 gene:ENSRNOG00000032310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:130275634:130286841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
FQ222682 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YE17 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047853 // RefSeq // Rattus norvegicus arrestin domain containing 4 (Arrdc4), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:130820199:130829248:-1 gene:ENSRNOG00000010775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// FQ222682 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YE17 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 81 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:130820199:130898965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT005465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NONRATT005467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_080778 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 2, group F, member 2 (Nr2f2), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:132487763:132493715:-1 gene:ENSRNOG00000010308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF003944 // GenBank // Rattus norvegicus ovalbumin upstream promoter beta nuclear receptor rCOUPb mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 2, group F, member 2 (Nr2f2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:132487905:132494875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0
GENSCAN00000041273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:133229658:133232702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
NM_001191625 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple C2 domains, transmembrane 2 (Mctp2), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000046645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:134366957:134540770:-1 gene:ENSRNOG00000009932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// FQ234783 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YK21 mRNA sequence. // chr1 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1 /// GENSCAN00000009003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:134336650:134540770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0
NM_001191686 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 13 (Spata13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 13 (Spata13), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 13 (Spata13), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:44749846:44875232:1 gene:ENSRNOG00000013707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:134744661:134805957:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44855714:44875232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107523 // RefSeq // Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 2 (Chd2), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_006229369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 2 (Chd2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// XM_006229373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 2 (Chd2), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000055829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:135785356:135895466:-1 gene:ENSRNOG00000012716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000029098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:135810816:135978941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:135785370:135810098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT005478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
ENSRNOT00000016597 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:136065399:136065947:-1 gene:ENSRNOG00000012384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:136065329:136072958:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000016461 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:136247218:136247737:-1 gene:ENSRNOG00000012345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0
NM_177481 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 3a1 (Slco3a1), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 3a1 (Slco3a1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:136802247:137070858:-1 gene:ENSRNOG00000032798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AF239219 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin transporter subtype 2 (Pgt2) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000035783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:136810093:136852214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_057207 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptic vesicle glycoprotein 2b (Sv2b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:137657430:137732099:-1 gene:ENSRNOG00000011160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// L10362 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic vesicle protein 2B (SV2B) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:137659955:137678920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000001160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:137684192:137732099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// AF372834 // GenBank // Rattus norvegicus synaptic vesicle protein 2B (Sv2b) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT005493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
XM_006223351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 1 (Agbl1), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// XM_006229413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 1 (Agbl1), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000031334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:138937365:139454565:1 gene:ENSRNOG00000022610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:138950420:139033650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
XM_006223351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 1 (Agbl1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// XM_006229413 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 1 (Agbl1), mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000043786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:138841100:138895330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_001013068 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L46 (Mrpl46), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141445111:141453185:-1 gene:ENSRNOG00000018547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086407 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L46, mRNA (cDNA clone MGC:105682 IMAGE:7306696), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:141433437:141453158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001037194 // RefSeq // Rattus norvegicus de-etiolated homolog 1 (Arabidopsis) (Det1), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_006229398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus de-etiolated homolog 1 (Arabidopsis) (Det1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141498061:141511032:-1 gene:ENSRNOG00000018515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// BC100253 // GenBank // Rattus norvegicus de-etiolated homolog 1 (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:116189 IMAGE:7456473), complete cds. // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:141495278:141520062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 76 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT005517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT005518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001008559 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan and proteoglycan link protein 3 (Hapln3), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141796056:141803912:-1 gene:ENSRNOG00000022321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB186131 // GenBank // Rattus norvegicus Hapln3 mRNA for hyaluronan proteoglycan link protein 3, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:141796233:141800791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT005524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001040186 // RefSeq // Rattus norvegicus milk fat globule-EGF factor 8 protein (Mfge8), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_012811 // RefSeq // Rattus norvegicus milk fat globule-EGF factor 8 protein (Mfge8), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141814240:141829651:-1 gene:ENSRNOG00000017510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:141814240:141829651:-1 gene:ENSRNOG00000017510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC085754 // GenBank // Rattus norvegicus milk fat globule-EGF factor 8 protein, mRNA (cDNA clone MGC:93577 IMAGE:7193796), complete cds. // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// D84068 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for O-acetyl GD3 ganglioside synthase, complete cds. // chr1 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// DQ455823 // GenBank // Rattus norvegicus MFGE8 long form mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:141811723:141829572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_001106274 // RefSeq // Rattus norvegicus retinaldehyde binding protein 1 (Rlbp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142059883:142073463:-1 gene:ENSRNOG00000016897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142060731:142073374:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT005532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053528 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), gamma (Polg), mRNA. // chr1 // 95 // 98 // 42 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000044567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142134505:142149608:-1 gene:ENSRNOG00000032293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000035218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142134505:142149608:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT005533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT005534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 62 // 62 // 28 // 45 // 1
NM_183053 // RefSeq // Rattus norvegicus Rh family, C glycoprotein (Rhcg), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142286924:142310949:-1 gene:ENSRNOG00000015526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY129073 // GenBank // Rattus norvegicus Rh type C glycoprotein mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142287213:142297580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT005536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_001065361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 7 (Kif7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_218828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 7 (Kif7), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000033491 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:142395563:142412012:-1 gene:ENSRNOG00000026857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142396100:142412012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0
NM_013094 // RefSeq // Rattus norvegicus perilipin 1 (Plin1), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006229395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus perilipin 1 (Plin1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142421898:142431601:-1 gene:ENSRNOG00000015086 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// L26043 // GenBank // Rat perilipin A mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// L26044 // GenBank // Rat perlipin B mRNA, 5end. // chr1 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142420799:142431514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_053487 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 11 alpha (Pex11a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142435410:142442491:-1 gene:ENSRNOG00000015003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ224120 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal membrane protein Pmp26p (Peroxin-11). // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039183 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142436822:142442808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107531 // RefSeq // Rattus norvegicus mesoderm posterior 1 homolog (mouse) (Mesp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142493452:142494970:-1 gene:ENSRNOG00000014951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142493726:142494706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031012 // RefSeq // Rattus norvegicus alanyl (membrane) aminopeptidase (Anpep), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000020002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142522426:142540882:-1 gene:ENSRNOG00000014610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// M25073 // GenBank // Rat kidney Zn-peptidase aminopeptidase N mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// M26710 // GenBank // Rattus norvegicus kidney aminopeptidase M (APM) mRNA, complete cds. // chr1 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000039189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142518009:142556994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT005545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001107530 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC308765 (RGD1311021), mRNA. // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142624852:142632040:-1 gene:ENSRNOG00000014589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142575133:142756767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001014161 // RefSeq // Rattus norvegicus isocitrate dehydrogenase 2 (NADP+), mitochondrial (Idh2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142830044:142849360:-1 gene:ENSRNOG00000013949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC076398 // GenBank // Rattus norvegicus isocitrate dehydrogenase 2 (NADP+), mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:94864 IMAGE:7110062), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000030573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142830324:142849331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT005554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT005555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_031145 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium and integrin binding 1 (calmyrin) (Cib1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:142969357:142974856:-1 gene:ENSRNOG00000033498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF136585 // GenBank // Rattus norvegicus calcium- and integrin-binding protein CIB (Cib) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC091143 // GenBank // Rattus norvegicus calcium and integrin binding 1 (calmyrin), mRNA (cDNA clone MGC:108662 IMAGE:7308828), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:142969563:142974827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001037647 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-45 homolog A (C. elegans) (Unc45a), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000017407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143071176:143086028:-1 gene:ENSRNOG00000012357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// BC107919 // GenBank // Rattus norvegicus unc-45 homolog A (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:125248 IMAGE:7457637), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000030584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143061512:143087214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT005562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT005564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 12 // 45 // 1 /// NONRATT005563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
NM_001107527 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 2A, member 2 (Man2a2), mRNA. // chr1 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143096200:143115693:-1 gene:ENSRNOG00000012055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000030588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143096600:143136552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT005569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001108488 // RefSeq // Rattus norvegicus feline sarcoma oncogene (Fes), mRNA. // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000016032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143127277:143136513:-1 gene:ENSRNOG00000011683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// BC166489 // GenBank // Rattus norvegicus feline sarcoma oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:187993 IMAGE:7104787), complete cds. // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC088336 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7366348. // chr1 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000030588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143096600:143136552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT005574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT005575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT005578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_019331 // RefSeq // Rattus norvegicus furin (paired basic amino acid cleaving enzyme) (Furin), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// XM_006229446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus furin (paired basic amino acid cleaving enzyme) (Furin), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143137723:143150202:-1 gene:ENSRNOG00000011352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143139161:143295002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1
XM_006223359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bloom syndrome, RecQ helicase-like (Blm), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 98 // 88 // 41 // 42 // 0 /// XM_006229458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bloom syndrome, RecQ helicase-like (Blm), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000015065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143198805:143264208:-1 gene:ENSRNOG00000011213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000030560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143139161:143295002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT005582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT005583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1
NM_001108489 // RefSeq // Rattus norvegicus IQ motif containing GTPase activating protein 1 (Iqgap1), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000018021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143476887:143567395:-1 gene:ENSRNOG00000012002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// BC169057 // GenBank // Rattus norvegicus IQ motif containing GTPase activating protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5598271), partial cds. // chr1 // 54 // 54 // 21 // 39 // 1 /// GENSCAN00000046590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143477967:143569135:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT005586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0
XM_006223362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CREB regulated transcription coactivator 3 (Crtc3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CREB regulated transcription coactivator 3 (Crtc3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143353060:143452208:-1 gene:ENSRNOG00000011975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073279 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:143343442:143347347:-1 gene:ENSRNOG00000048380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// XM_003748889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CREB-regulated transcription coactivator 3-like (LOC100909455), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000046586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143357840:143446979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001107525 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 73 (Wdr73), mRNA. // chr1 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// XM_006229430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 73 (Wdr73), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000032294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143664127:143672463:-1 gene:ENSRNOG00000010664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// BC158658 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 73, mRNA (cDNA clone MGC:187643 IMAGE:8369176), complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT005592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143664345:143676113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT005594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT005595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT005591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT005596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT005597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001109149 // RefSeq // Rattus norvegicus neuromedin B (Nmb), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143673434:143676178:-1 gene:ENSRNOG00000011011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143664345:143676113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_031723 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC11 homolog A (S. cerevisiae) (Sec11a), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:143685596:143711945:-1 gene:ENSRNOG00000011029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC060554 // GenBank // Rattus norvegicus SEC11 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72761 IMAGE:6921802), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// FQ220501 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YK09 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// L11319 // GenBank // Rat signal peptidase mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000046581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:143681770:143727302:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// NONRATT005599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0
NM_001106276 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1 (Cpeb1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144114219:144199174:-1 gene:ENSRNOG00000019161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT005605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144109719:144220813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
XM_003748891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, beta 2 subunit (Ap3b2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, beta 2 subunit (Ap3b2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223368 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, beta 2 subunit (Ap3b2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, beta 2 subunit (Ap3b2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144226633:144257516:-1 gene:ENSRNOG00000019249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144226633:144262065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001193275 // RefSeq // Rattus norvegicus cDNA sequence BC048679-like (LOC100360933), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cDNA sequence BC048679-like (LOC100360933), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055614 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:144258212:144262014:-1 gene:ENSRNOG00000036981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144226633:144262065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001191627 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type III and SPRY domain containing 2 (Fsd2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000026089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144308592:144336257:-1 gene:ENSRNOG00000019278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ223649 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA90YC24 mRNA sequence. // chr1 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000042801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144309064:144336257:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT005617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_053309 // RefSeq // Rattus norvegicus homer homolog 2 (Drosophila) (Homer2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144387111:144478036:-1 gene:ENSRNOG00000019297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AB007689 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Vesl-2, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB007690 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Vesl-2(delta 11), complete cds. // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000042816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144387673:144420320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
XM_003750235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100363116 (LOC100363116), mRNA. // chrU // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// XM_003754243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100363116 (LOC100363116), mRNA. // chrU // 94 // 94 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144544564:144551617:-1 gene:ENSRNOG00000019514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC094529 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110040N11, mRNA (cDNA clone MGC:105635 IMAGE:7320095), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006229429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110040N11 (RGD1305713), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000016905 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:6:145482536:145482916:1 gene:ENSRNOG00000012677 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chrU // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT047512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000058133 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:162604569:162604945:1 gene:ENSRNOG00000038186 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 63 // 67 // 15 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:145479598:145482916:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// GENSCAN00000042811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144547033:144596889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT005625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001011932 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 1 (Btbd1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144554178:144591200:-1 gene:ENSRNOG00000019529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085850 // GenBank // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94566 IMAGE:7189751), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144547033:144596889:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT005626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_145785 // RefSeq // Rattus norvegicus hepatoma-derived growth factor, related protein 3 (Hdgfrp3), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144646635:144694902:-1 gene:ENSRNOG00000019740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF389347 // GenBank // Rattus norvegicus HRP3 (Hrp3) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144656246:144694779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001108916 // RefSeq // Rattus norvegicus basonuclin 1 (Bnc1), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006229470 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basonuclin 1 (Bnc1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:144733824:144759477:-1 gene:ENSRNOG00000019770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000026762 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:144810239:144817115:-1 gene:ENSRNOG00000047944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000042809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144735582:144759471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000044073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:144810239:144820497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001106277 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 154, member B (Fam154b), mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000029244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:145515238:145530305:-1 gene:ENSRNOG00000026296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:145516764:145547294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000004915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:146222768:146237046:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 65 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000004920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:146032945:146053912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_001105749 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 16 (Il16), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006229488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 16 (Il16), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:146710947:146799931:-1 gene:ENSRNOG00000011680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000029535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:146711766:146757615:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT005636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT005637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
ENSRNOT00000016433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:146836113:146860740:-1 gene:ENSRNOG00000012301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158775 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700026D08, mRNA (cDNA clone MGC:188096 IMAGE:7132188), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:146836587:146860735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT005641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001013149 // RefSeq // Rattus norvegicus mesoderm development candidate 1 (Mesdc1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:146957080:146958168:-1 gene:ENSRNOG00000012349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC091313 // GenBank // Rattus norvegicus mesoderm development candidate 1, mRNA (cDNA clone MGC:109280 IMAGE:7312243), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:146957080:146958168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT005643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001063314 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to transmembrane protein 2 (RGD1305254), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_218855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to transmembrane protein 2 (RGD1305254), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000036343 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:147000790:147067480:-1 gene:ENSRNOG00000012442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:146990037:147110337:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001100736 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 17C (Abhd17c), mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000017362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:147177238:147218200:-1 gene:ENSRNOG00000012683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC169098 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 108, member C1, mRNA (cDNA clone MGC:189516 IMAGE:7939241), complete cds. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:147178437:147244041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT005647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT005649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT005648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
AY264366 // GenBank // Rattus norvegicus ARNT2 exon 19 insertion variant (Arnt2) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr1 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// DQ223732 // GenBank // Rattus norvegicus aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// U61405 // GenBank // Rattus norvegicus aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 (ARNT2) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// NM_012781 // RefSeq // Rattus norvegicus aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator 2 (Arnt2), mRNA. // chr1 // 90 // 90 // 38 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000017636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:147327952:147484879:-1 gene:ENSRNOG00000013017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 90 // 90 // 38 // 42 // 1 /// NONRATT005652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 95 // 95 // 40 // 42 // 1 /// GENSCAN00000033653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:147330222:147445220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 74 // 74 // 31 // 42 // 1
NM_017181 // RefSeq // Rattus norvegicus fumarylacetoacetate hydrolase (Fah), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:147640320:147662820:-1 gene:ENSRNOG00000013223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC076381 // GenBank // Rattus norvegicus fumarylacetoacetate hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:93536 IMAGE:7108528), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M77694 // GenBank // R.norvegicus fumarylacetoacetate hydrolase (FAH) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// FQ209424 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YM23 mRNA sequence. // chr1 // 42 // 87 // 11 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:147640383:147666338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT005653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT005655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NONRATT005659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 16 // 16 // 1
NM_173317 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 40 (Vom2r40), mRNA. // chrU // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// AF016180 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN3) mRNA, complete cds. // chrU // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000041780 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:155230544:155252798:-1 gene:ENSRNOG00000028804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT005763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT005764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 76 // 76 // 25 // 33 // 1
NM_001099511 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 42 (Vom2r42), mRNA. // chr1 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// NM_001099512 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 43 (Vom2r43), mRNA. // chr1 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:155421793:155464687:-1 gene:ENSRNOG00000043159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000052226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:155795825:155818353:-1 gene:ENSRNOG00000013563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000006373 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:155421793:155472108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:155795825:155867939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1 /// NONRATT005766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NM_001000540 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 12 (Olr12), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:155867358:155868281:-1 gene:ENSRNOG00000033009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:155795825:155867939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001000116 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 13 (Olr13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:155904497:155905423:-1 gene:ENSRNOG00000032371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156088538:156089113:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000055564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:155904497:155905072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001000695 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 14 (Olr14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003748918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 14A2-like (LOC100910049), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:155934239:155935180:-1 gene:ENSRNOG00000050901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000073824 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:155953402:156138431:-1 gene:ENSRNOG00000046392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001000694 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 16 (Olr16), mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000052199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156160685:156161635:-1 gene:ENSRNOG00000031741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0
NM_001000937 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 17 (Olr17), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156079898:156080854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:155984557:155985513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000117 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 19 (Olr19), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043024 // ENSEMBL // ensembl:known scaffold:Rnor_5.0:AABR06109393.1:1516:2475:-1 gene:ENSRNOG00000030774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156215803:156216762:-1 gene:ENSRNOG00000032077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024234 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06109393.1:1516:2475:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156215803:156216762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000693 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 24 (Olr24), mRNA. // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156405509:156406450:-1 gene:ENSRNOG00000050054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000936 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 27 (Olr27), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156480591:156481532:-1 gene:ENSRNOG00000050559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000691 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 29 (Olr29), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000690 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 32 (Olr32), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156569436:156570443:-1 gene:ENSRNOG00000049938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_057185 // RefSeq // Rattus norvegicus folate hydrolase 1 (Folh1), mRNA. // chr1 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000018592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:156631301:156702948:-1 gene:ENSRNOG00000013770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF040256 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate carboxypeptidase II mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 95 // 37 // 40 // 0 /// AF513486 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylated alpha-linked acidic dipeptidase (Naalad) mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 100 // 39 // 42 // 0 /// U75973 // GenBank // Rattus norvegicus NAAG-peptidase mRNA, complete cds. // chr1 // 95 // 95 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000041097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:156631988:156702885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT005772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT005773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1
NM_001107535 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosinase (Tyr), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:157322968:157416594:-1 gene:ENSRNOG00000016421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:157324329:157416530:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT005774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 18 // 18 // 1
NONRATT005774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1
NM_001013896 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 135 (Tmem135), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000022578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:159198116:159407174:-1 gene:ENSRNOG00000016815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC085115 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 135, mRNA (cDNA clone MGC:105816 IMAGE:7106476), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001007691 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 23 (Prss23), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 23 (Prss23), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000023239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:160037254:160045625:-1 gene:ENSRNOG00000017307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079179 // GenBank // Rattus norvegicus protease, serine, 23, mRNA (cDNA clone MGC:94216 IMAGE:7130532), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160037866:160039017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT005805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014021 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 81 (Ccdc81), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000055488 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:160368530:160416901:-1 gene:ENSRNOG00000033733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC083639 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 81, mRNA (cDNA clone MGC:94461 IMAGE:7134846), complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160368530:160380562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0
NM_001013897 // RefSeq // Rattus norvegicus lethal, Chr 7, Rinchik 6 (l7Rn6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:160451593:160474922:-1 gene:ENSRNOG00000017383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC088340 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610007P06, mRNA (cDNA clone MGC:109636 IMAGE:7367791), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212776 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YH08 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// FQ220310 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YG03 mRNA sequence. // chr1 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// FQ214616 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YP11 mRNA sequence. // chr1 // 74 // 85 // 17 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160452973:160475032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT005812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT005814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001106278 // RefSeq // Rattus norvegicus embryonic ectoderm development (Eed), mRNA. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus embryonic ectoderm development (Eed), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:160493754:160520834:-1 gene:ENSRNOG00000017509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC168872 // GenBank // Rattus norvegicus embryonic ectoderm development, mRNA (cDNA clone MGC:189125 IMAGE:9025004), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160494018:160520369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT005816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000033400 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:160551916:160552571:-1 gene:ENSRNOG00000022903 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 85 // 95 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:160552029:160552571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0
XM_006223406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 83-like (LOC100912860), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223407 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 83-like (LOC100912860), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 83-like (LOC100912860), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000029219 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:205304320:205332537:-1 gene:ENSRNOG00000022808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000049531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:162739477:162756013:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:205304320:205324290:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 43 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT001817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT041876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001011557 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 126A (Tmem126a), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000038333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162529250:162537179:1 gene:ENSRNOG00000022748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC089104 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 126A, mRNA (cDNA clone MGC:105688 IMAGE:7307750), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ231598 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YO18 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// FQ220582 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YF22 mRNA sequence. // chr1 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// NONRATT001817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT001822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT001823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// GENSCAN00000049530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:162508352:162540582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1 /// NONRATT001825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001106280 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 126B (Tmem126b), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:162508341:162520322:1 gene:ENSRNOG00000022732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC167111 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 126B, mRNA (cDNA clone MGC:189574 IMAGE:6921139), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ216464 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YK17 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT001820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT001821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:162508352:162540582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NONRATT019396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001135013 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 42 (Ankrd42), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000068402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:163663271:163705736:-1 gene:ENSRNOG00000009664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000048888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163663558:163737959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT005832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
XM_001062815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PCF11 cleavage and polyadenylation factor subunit (Pcf11), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000013552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:163712787:163737959:-1 gene:ENSRNOG00000009891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163663558:163737959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001126294 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA damage-induced apoptosis suppressor (Ddias), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:163919411:163943710:-1 gene:ENSRNOG00000022521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:163919916:163952887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000014369 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:164153042:164164771:-1 gene:ENSRNOG00000010769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_001064027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 35 (Usp35), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_238899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 35 (Usp35), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000031161 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:168491301:168507039:-1 gene:ENSRNOG00000024961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000010475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168491301:168507039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT005849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT005850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_012703 // RefSeq // Rattus norvegicus thyroid hormone responsive (Thrsp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168587726:168592099:-1 gene:ENSRNOG00000012404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089061 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid hormone responsive, mRNA (cDNA clone MGC:105418 IMAGE:7308757), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ219004 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YH05 mRNA sequence. // chr1 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// NONRATT005853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168591591:168598872:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001108493 // RefSeq // Rattus norvegicus adipogenesis associated, Mth938 domain containing (Aamdc), mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// XM_006229767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adipogenesis associated, Mth938 domain containing (Aamdc), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000016783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168726362:168740676:-1 gene:ENSRNOG00000012584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT005858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_173105 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 11 (Aqp11), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:168910173:168920364:-1 gene:ENSRNOG00000013358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB023644 // GenBank // Rattus norvegicus AQP11 mRNA for aquaporin 11, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078694 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 11, mRNA (cDNA clone MGC:93078 IMAGE:7111950), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000023698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:168996979:168997489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000041628 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:168996838:168997489:-1 gene:ENSRNOG00000031193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 73 // 65 // 8 // 11 // 0
NM_153473 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin VIIA (Myo7a), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// XM_006229742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin VIIA (Myo7a), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000019053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:169206712:169276704:-1 gene:ENSRNOG00000013641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// AB091825 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for myosin VIIA, complete cds. // chr1 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000023689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169190190:169260259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT005860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0
NM_134461 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 5 (Capn5), mRNA. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XM_006229729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calpain 5 (Capn5), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:169278330:169336535:-1 gene:ENSRNOG00000014251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF484958 // GenBank // Rattus norvegicus calpain-5 protein mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// FQ223532 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA10YB20 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169277399:169293686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_012616 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory marker protein (Omp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M15644 // GenBank // Rat OMP mRNA encoding the olfactory neuronal specific protein, 3 end. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169302355:169335077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106211 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 6 (core 3 synthase) (B3gnt6), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:169350716:169355747:-1 gene:ENSRNOG00000014471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169350652:169352211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001065019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alkaline ceramidase 3 (Acer3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000019987 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:169371624:169469541:-1 gene:ENSRNOG00000036866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000071808 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:169407694:169469541:-1 gene:ENSRNOG00000036866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// FQ230480 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA98YF09 mRNA sequence. // chr1 // 88 // 81 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169377269:169469497:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 42 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT005868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT005869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001009965 // RefSeq // Rattus norvegicus tsukushi, small leucine rich proteoglycan (Tsku), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tsukushi, small leucine rich proteoglycan (Tsku), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tsukushi, small leucine rich proteoglycan (Tsku), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tsukushi, small leucine rich proteoglycan (Tsku), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000034843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:169524021:169535753:-1 gene:ENSRNOG00000027784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY533242 // GenBank // Rattus norvegicus hepatic protein EIIH (Eiih) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC100644 // GenBank // Rattus norvegicus tsukushin, mRNA (cDNA clone MGC:124516 IMAGE:7930712), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169525390:169526451:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 42 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT005871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006229802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to EMSY protein (RGD1310712), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006229803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to EMSY protein (RGD1310712), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000020882 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:169748678:169814867:-1 gene:ENSRNOG00000015560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000030463 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:169748678:169814867:-1 gene:ENSRNOG00000015560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000043788 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:169748678:169814867:-1 gene:ENSRNOG00000015560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AY724538 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cqb-f-24-0-UI unknown mRNA. // chr1 // 100 // 24 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000010870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169748877:169758443:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000057292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:169768186:169821520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// NONRATT005877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
XM_006229763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UV radiation resistance associated gene (Uvrag), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC169073 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7935098. // chr1 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NM_001107536 // RefSeq // Rattus norvegicus UV radiation resistance associated gene (Uvrag), mRNA. // chr1 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000022176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170067082:170304150:-1 gene:ENSRNOG00000016206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000057289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170048957:170258304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// NONRATT005885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001012345 // RefSeq // Rattus norvegicus diacylglycerol O-acyltransferase 2 (Dgat2), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006229733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol O-acyltransferase 2 (Dgat2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170316041:170346306:-1 gene:ENSRNOG00000016573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// BC089846 // GenBank // Rattus norvegicus diacylglycerol O-acyltransferase homolog 2 (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:108863 IMAGE:7372077), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000034503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170316991:170367158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// NONRATT005891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_001109436 // RefSeq // Rattus norvegicus monoacylglycerol O-acyltransferase 2 (Mogat2), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170384257:170407542:-1 gene:ENSRNOG00000027228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC166995 // GenBank // Rattus norvegicus monoacylglycerol O-acyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:189143 IMAGE:9027036), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT005892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000034507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170384969:170398949:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT005894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_017173 // RefSeq // Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade H (heat shock protein 47), member 1, (collagen binding protein 1) (Serpinh1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170503596:170510775:-1 gene:ENSRNOG00000016831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086529 // GenBank // Rattus norvegicus serine (or cysteine) peptidase inhibitor, clade H, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:105471 IMAGE:7303866), complete cds. // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// M69246 // GenBank // Rat collagen-binding protein (gp46) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT005895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170497782:170507125:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT005896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001009239 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S3 (Rps3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000023935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170637738:170643027:-1 gene:ENSRNOG00000017418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC088450 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S3, mRNA (cDNA clone MGC:95096 IMAGE:7126819), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000034501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170638153:170643015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT005900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT005901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT005902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
NONRATT005900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NONRATT005900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT005903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003748929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trophoblast glycoprotein-like (Tpbgl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trophoblast glycoprotein-like (Tpbgl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024157 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:170793078:170794232:-1 gene:ENSRNOG00000017922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170793078:170794232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080786 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 2b1 (Slco2b1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229721 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 2b1 (Slco2b1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:170827269:170863662:-1 gene:ENSRNOG00000017976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF169409 // GenBank // Rattus norvegicus organic anion transporter moat1 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF169410 // GenBank // Rattus norvegicus organic anion transporter moat1 splice variant mRNA, complete cds. // chr1 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:170803591:170860203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT005907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT005908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_054010 // RefSeq // Rattus norvegicus sialidase 3 (membrane sialidase) (Neu3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171006740:171017255:-1 gene:ENSRNOG00000018106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// AB026841 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sialidase, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100625 // GenBank // Rattus norvegicus sialidase 3 (membrane sialidase), mRNA (cDNA clone MGC:124578 IMAGE:7935525), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191601 // RefSeq // Rattus norvegicus signal peptidase complex subunit 2 homolog (S. cerevisiae) (Spcs2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171032500:171052353:-1 gene:ENSRNOG00000018164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171034770:171037771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000039721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171041281:171052348:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT005912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001061888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 169 (Rnf169), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 169 (Rnf169), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 169 (Rnf169), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 169 (Rnf169), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 169 (Rnf169), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000029629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:171124367:171179920:-1 gene:ENSRNOG00000026408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171124367:171179920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT005916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001024750 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta 3, accessory subunit (Pold3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006229748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta 3, accessory subunit (Pold3), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171284865:171323242:-1 gene:ENSRNOG00000018411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC098010 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA-directed), delta 3, accessory subunit, mRNA (cDNA clone MGC:116157 IMAGE:7454306), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ211238 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA14YK07 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171286226:171323425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT005917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001191838 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase methylesterase 1 (Ppme1), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171538086:171582879:-1 gene:ENSRNOG00000017227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ214358 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YC14 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000012571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171538197:171573833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT005918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001005885 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 13 (Dnajb13), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171716972:171731341:-1 gene:ENSRNOG00000017975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY325765 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ-like protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY380804 // GenBank // Rattus norvegicus testis spermatogenesis apoptosis related protein 1 (Tsarg1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098002 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) related, subfamily B, member 13, mRNA (cDNA clone MGC:116148 IMAGE:7453525), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171718268:171731335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT005919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 97 // 97 // 31 // 32 // 1 /// NONRATT005921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSRNOT00000038663 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:171761001:171761308:-1 gene:ENSRNOG00000025375 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001106282 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L48 (Mrpl48), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171765421:171807819:-1 gene:ENSRNOG00000018042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ212514 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YO09 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171765608:171812599:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONRATT005925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_172033 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family B (evectins) member 1 (Plekhb1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006229788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family B (evectins) member 1 (Plekhb1), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:171867146:171881413:-1 gene:ENSRNOG00000018627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF081582 // GenBank // Rattus norvegicus KPL1 (Kpl1) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF118562 // GenBank // Rattus norvegicus evectin-1 (EVT1) mRNA, complete cds. // chr1 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC078704 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family B (evectins) member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93114 IMAGE:7124581), complete cds. // chr1 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:171868195:171879776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT005927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT005928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT005930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001108495 // RefSeq // Rattus norvegicus RELT tumor necrosis factor receptor (Relt), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RELT tumor necrosis factor receptor (Relt), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229776 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RELT tumor necrosis factor receptor (Relt), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006229777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RELT tumor necrosis factor receptor (Relt), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006229779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RELT tumor necrosis factor receptor (Relt), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172081904:172089124:-1 gene:ENSRNOG00000025075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172083319:172148275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT005932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
XM_003748932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 17 (Arhgef17), mRNA. // chr1 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000026047 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:172109215:172164079:-1 gene:ENSRNOG00000019192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000031423 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:172109215:172130736:-1 gene:ENSRNOG00000019192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000036797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172083319:172148275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1 /// NONRATT005933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// NONRATT005936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1 /// NONRATT005937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
XM_006229711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 6 (P2ry6), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 6 (P2ry6), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006229714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 6 (P2ry6), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006229716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 6 (P2ry6), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 6 (P2ry6), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// D63665 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for novel G protein-coupled P2 receptor, complete cds. // chr1 // 84 // 89 // 26 // 31 // 0 /// NM_057124 // RefSeq // Rattus norvegicus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 6 (P2ry6), mRNA. // chr1 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000050227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172169439:172194750:-1 gene:ENSRNOG00000019270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// BC072520 // GenBank // Rattus norvegicus pyrimidinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 6, mRNA (cDNA clone MGC:91535 IMAGE:7105972), complete cds. // chr1 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// NONRATT005940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT005941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT005942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_017255 // RefSeq // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 2 (P2ry2), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006229757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 2 (P2ry2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006229758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 2 (P2ry2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000026115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172227770:172233748:-1 gene:ENSRNOG00000019283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// BC061754 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled 2, mRNA (cDNA clone MGC:72498 IMAGE:5599916), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// L46865 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled purinoceptor (P2U) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U09402 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor (P2u) mRNA, complete cds. // chr1 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// U56839 // GenBank // Rattus norvegicus P2u receptor protein mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT005944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
AY539907 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00156 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191560 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 16-like 2 (S. cerevisiae) (Atg16l2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006229876 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autophagy related 16-like 2 (S. cerevisiae) (Atg16l2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006229877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus autophagy related 16-like 2 (S. cerevisiae) (Atg16l2), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000026286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172590904:172603337:-1 gene:ENSRNOG00000019413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000018647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172591129:172603382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT005948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// NONRATT005949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// NONRATT005950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_198735 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 2b (Art2b), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 2b (Art2b), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006229855 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 2b (Art2b), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:172857749:172867469:-1 gene:ENSRNOG00000019687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099070 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 2b, mRNA (cDNA clone MGC:116041 IMAGE:7366134), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ230306 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YI22 mRNA sequence. // chr1 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// M85193 // GenBank // R.norvegicus RT6.2 mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// X99122 // GenBank // R.norvegicus mRNA for T cell ecto-ADP-ribosyltransferase, exons 2,3,4,5, & 7, spleen, clone B1. // chr1 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172840084:172861059:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT005955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001270843 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate phosphatase-like 1 (Inppl1), transcript variant 2, mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NM_022944 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate phosphatase-like 1 (Inppl1), transcript variant 1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066915 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:173089239:173101408:-1 gene:ENSRNOG00000019730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB011439 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SHIP-2, complete cds. // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// AB025794 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SH2-containing inositol phosphatase 2 (SHIP2), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173088656:173101177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT005957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106283 // RefSeq // Rattus norvegicus folate receptor 2 (fetal) (Folr2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173104848:173110514:-1 gene:ENSRNOG00000019890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211323 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YO09 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173105010:173129187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_133527 // RefSeq // Rattus norvegicus folate receptor 1 (adult) (Folr1), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006229842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus folate receptor 1 (adult) (Folr1), transcript variant X4, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173124247:173133377:-1 gene:ENSRNOG00000019902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF219904 // GenBank // Rattus norvegicus folate binding protein mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173105010:173129187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT005962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001139494 // RefSeq // Rattus norvegicus O-methyltransferase domain containing (Tomt), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173176767:173178816:-1 gene:ENSRNOG00000023434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EU627093 // GenBank // Rattus norvegicus TOMT isoform A mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172479080:172482533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173176851:173178800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106284 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 51 (Lrrc51), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 51 (Lrrc51), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006229871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 51 (Lrrc51), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000027261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173188730:173207946:-1 gene:ENSRNOG00000020124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU627092 // GenBank // Rattus norvegicus LRRC51 isoform A mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173188814:173196539:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT005965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053374 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 18 binding protein (Il18bp), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173280487:173281966:-1 gene:ENSRNOG00000020150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF154569 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 18 binding protein (Il18bp) mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT005968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT005969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001107540 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 121 (Rnf121), mRNA. // chr1 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// XM_006229879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 121 (Rnf121), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173285052:173347260:-1 gene:ENSRNOG00000020175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000029739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173287230:173308042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// GENSCAN00000029760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173313879:173352502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT005971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NONRATT005971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001013039 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 5 (Art5), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 5 (Art5), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000055243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173381705:173391662:-1 gene:ENSRNOG00000020242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC083915 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 5, mRNA (cDNA clone MGC:95294 IMAGE:7134556), complete cds. // chr1 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173381936:173384402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT005972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT005973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_022639 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 10 (neuronal) (Chrna10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 10 (neuronal) (Chrna10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000027507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173395617:173399814:-1 gene:ENSRNOG00000020293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF196344 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor subunit (Alpha10) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173396380:173399751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT005974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031074 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 98 (Nup98), mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173402761:173497459:-1 gene:ENSRNOG00000020347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173435271:173497459:-1 gene:ENSRNOG00000020347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 59 // 22 // 22 // 0 /// L39991 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin (Nup98) mRNA, complete cds. // chr1 // 96 // 62 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173403725:173506141:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT005980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_001037195 // RefSeq // Rattus norvegicus ras homolog family member G (Rhog), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006229882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras homolog family member G (Rhog), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006229883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ras homolog family member G (Rhog), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000027641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173524755:173536314:-1 gene:ENSRNOG00000020393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// BC107943 // GenBank // Rattus norvegicus ras homolog gene family, member G (rho G), mRNA (cDNA clone MGC:125105 IMAGE:7389075), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ232547 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YF06 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// FQ212590 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YH20 mRNA sequence. // chr1 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0 /// NONRATT005984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000042294 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:173766531:173767543:-1 gene:ENSRNOG00000030134 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173766620:173813162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0
NM_001000128 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 39 (Olr39), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173773514:173774503:-1 gene:ENSRNOG00000030042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173766620:173813162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT005988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000127 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 40 (Olr40), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173791155:173792216:-1 gene:ENSRNOG00000018541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173766620:173813162:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT005989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001082572 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 21 (Trim21), mRNA. // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000024992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173874145:173885518:-1 gene:ENSRNOG00000018517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173874145:173896183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT005991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001000125 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 44 (Olr44), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173917269:173918216:-1 gene:ENSRNOG00000018512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173917269:173918417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000123 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 47 (Olr47), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:173954682:173955641:-1 gene:ENSRNOG00000018501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:173954682:173955641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT005995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001021 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 51 (Olr51), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174181197:174182147:1 gene:ENSRNOG00000015424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:172493429:172494244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000046355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174178991:174182147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000130 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 56 (Olr56), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003748940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 51F2-like (LOC100911601), mRNA. // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174120904:174121683:1 gene:ENSRNOG00000015412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174121141:174121692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT002036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174235420:174247477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001000749 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 57 (Olr57), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174113482:174114426:1 gene:ENSRNOG00000015407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174113482:174114426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000542 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 63 (Olr63), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174053616:174054569:1 gene:ENSRNOG00000018551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY834218 // GenBank // Rattus norvegicus prostate overexpressed G protein coupled receptor mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174037830:174054569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT002034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000016840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174272477:174273295:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_001001280 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 69 (Olr69), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174317078:174318829:-1 gene:ENSRNOG00000015657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174317933:174335360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT006004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001269 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 70 (Olr70), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174334419:174335360:-1 gene:ENSRNOG00000015673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174317933:174335360:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001284 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 72 (Olr72), mRNA. // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174350681:174351688:-1 gene:ENSRNOG00000047528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174342612:174351565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 55 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT006006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
NM_001001270 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 80 (Olr80), mRNA. // chr1 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000021115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174456291:174457306:-1 gene:ENSRNOG00000015769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174447322:174457202:-1 gene:ENSRNOG00000015769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000016842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174456249:174457202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0
NM_001001282 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 82 (Olr82), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174482570:174483514:-1 gene:ENSRNOG00000033200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000140 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 92 (Olr92), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000021169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174628152:174629096:-1 gene:ENSRNOG00000015811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000016818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174628152:174629096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000141 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 93 (Olr93), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174636815:174637759:-1 gene:ENSRNOG00000047377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174636815:174637759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001023 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 94 (Olr94), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174643034:174644005:-1 gene:ENSRNOG00000036811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174643034:174643627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT006011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001024 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 95 (Olr95), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174651340:174652284:-1 gene:ENSRNOG00000045808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174651340:174652284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 97 (Olr97), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 97 (Olr97), mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014730 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:174673148:174674062:-1 gene:ENSRNOG00000011001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174673067:174676887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000145 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 104 (Olr104), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174756123:174757082:-1 gene:ENSRNOG00000015876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174756123:174756854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174725893:174726372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000145 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 104 (Olr104), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174756123:174757082:-1 gene:ENSRNOG00000015876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174756123:174756854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000146 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 105 (Olr105), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174770001:174770948:-1 gene:ENSRNOG00000015885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174770001:174770741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000147 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 106 (Olr106), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174780540:174781511:-1 gene:ENSRNOG00000015893 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174780540:174782886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000952 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 109 (Olr109), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174811711:174812824:-1 gene:ENSRNOG00000015919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT006016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000151 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 113 (Olr113), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174870483:174871424:-1 gene:ENSRNOG00000015940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174870483:174871424:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000951 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 114 (Olr114), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174877833:174878777:-1 gene:ENSRNOG00000048293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174877833:174878747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000152 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 115 (Olr115), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174892394:174893347:-1 gene:ENSRNOG00000046188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174892394:174946794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000015493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174892394:174946794:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001000153 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 119 (Olr119), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174960404:174961357:-1 gene:ENSRNOG00000033350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174960404:174961357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000154 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 120 (Olr120), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174968336:174969280:-1 gene:ENSRNOG00000049485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174968336:174969166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000155 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 121 (Olr121), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:174979303:174980256:-1 gene:ENSRNOG00000048603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:174979303:174980256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000157 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 124 (Olr124), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175012985:175013932:-1 gene:ENSRNOG00000016018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175012985:175013731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000740 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 125 (Olr125), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175028771:175029730:-1 gene:ENSRNOG00000016027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175028771:175029730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000158 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 126 (Olr126), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175042946:175043896:-1 gene:ENSRNOG00000029612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175042946:175043896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001026 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 127 (Olr127), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000045417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175065024:175065971:-1 gene:ENSRNOG00000034039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT006026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000159 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 128 (Olr128), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175087438:175088400:-1 gene:ENSRNOG00000016052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175065024:175100086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT006027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198776 // RefSeq // Rattus norvegicus hemoglobin, beta adult major chain (Hbb-b1), mRNA. // chr1 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// XM_003748954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hemoglobin subunit beta-2-like (LOC100910765), mRNA. // chr1 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000019913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175104276:175111736:-1 gene:ENSRNOG00000047098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000041830 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:176575572:176576023:-1 gene:ENSRNOG00000048992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// BC058502 // GenBank // Rattus norvegicus beta-glo, mRNA (cDNA clone MGC:72973 IMAGE:6887460), complete cds. // chr1 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// XM_006229913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hemoglobin, beta adult major chain (Hbb-b1), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1 /// FQ220984 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YP13 mRNA sequence. // chr1 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1 /// GENSCAN00000015499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175104409:175111686:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176571786:176576023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT006031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT006033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_172093 // RefSeq // Rattus norvegicus hemoglobin, gamma A (Hbg1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175156124:175157676:-1 gene:ENSRNOG00000030879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC157810 // GenBank // Rattus norvegicus hemoglobin, gamma A, mRNA (cDNA clone MGC:187321 IMAGE:9027502), complete cds. // chr1 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// FQ228657 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA5YF12 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175156244:175157622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001024805 // RefSeq // Rattus norvegicus hemoglobin, epsilon 2 (Hbe2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000048484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175163760:175165388:-1 gene:ENSRNOG00000030784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000015486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175163760:175165388:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001008890 // RefSeq // Rattus norvegicus hemoglobin, epsilon 1 (Hbe1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175167415:175168866:-1 gene:ENSRNOG00000029286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC157809 // GenBank // Rattus norvegicus hemoglobin, epsilon 1, mRNA (cDNA clone MGC:187286 IMAGE:9033183), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ222123 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA28YI19 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175167531:175168811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001001027 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 129 (Olr129), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175193580:175194515:-1 gene:ENSRNOG00000025163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175193580:175194515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001001272 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 130 (Olr130), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000046616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175202160:175203083:-1 gene:ENSRNOG00000050164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175202160:175203083:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT006046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001001285 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 131 (Olr131), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175212354:175213277:-1 gene:ENSRNOG00000048465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MLV-related proviral Env polyprotein-like (LOC102557105), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006229926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MLV-related proviral Env polyprotein-like (LOC102555557), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_006234148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551194 (LOC102551194), partial mRNA. // chr1 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT049745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 39 // 8 // 15 // 0 /// NONRATT049746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 53 // 39 // 8 // 15 // 0
NM_001001274 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 141 (Olr141), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175363243:175364193:-1 gene:ENSRNOG00000016946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175363243:175364193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000544 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 142 (Olr142), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175378976:175379920:-1 gene:ENSRNOG00000016954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175378976:175387796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000164 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 144 (Olr144), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175397138:175398082:-1 gene:ENSRNOG00000016979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175397138:175398019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT006054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000545 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 145 (Olr145), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175416894:175417838:-1 gene:ENSRNOG00000048582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175416894:175417838:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000022782 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:175426737:175427685:-1 gene:ENSRNOG00000016986 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175426737:175436492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000055216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175467118:175468650:-1 gene:ENSRNOG00000036807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC127523 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ubiquilin 1 isoform 2, mRNA (cDNA clone MGC:156762 IMAGE:7113805), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175467118:175468650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107543 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquilin 3 (Ubqln3), mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175479396:175481843:-1 gene:ENSRNOG00000023833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC161885 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquilin 3, mRNA (cDNA clone MGC:187460 IMAGE:7133921), complete cds. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175479495:175481531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT006057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013899 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquilin-like (Ubqlnl), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175489504:175491342:-1 gene:ENSRNOG00000017016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC083634 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquilin-like, mRNA (cDNA clone MGC:94446 IMAGE:7134647), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175489504:175491312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT006058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106287 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA E030002O03 (RGD1310717), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175494583:175502416:-1 gene:ENSRNOG00000017039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175494821:175502390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000166 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 149 (Olr149), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175512206:175513156:-1 gene:ENSRNOG00000017138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175506484:175513036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000739 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 150 (Olr150), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175525828:175526760:-1 gene:ENSRNOG00000017143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175525828:175526760:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014023 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 5 (Trim5), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175586845:175603800:-1 gene:ENSRNOG00000017191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078926 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 9230105E10Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:93716 IMAGE:7106563), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225508 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YN12 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// FQ230638 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YK03 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000001844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175587625:175596138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT006062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_006229915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing protein 30A-like (LOC102554102), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175613069:175633950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_006229918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 30 (Trim30), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006229919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 30 (Trim30), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175663549:175674660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
ENSRNOT00000034797 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:175685491:175686819:-1 gene:ENSRNOG00000024179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001006595 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 156 (Olr156), mRNA. // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176535354:176536253:-1 gene:ENSRNOG00000047479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175735386:175736285:-1 gene:ENSRNOG00000050696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071675 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:176590571:176591437:-1 gene:ENSRNOG00000049214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175735386:175736138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176590499:176591296:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000049569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176535354:176536106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001000172 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 165 (Olr165), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175905403:175906371:-1 gene:ENSRNOG00000049329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176782274:176783242:-1 gene:ENSRNOG00000048219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175905403:175906371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176782274:176783242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000173 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 167 (Olr167), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176814407:176815366:-1 gene:ENSRNOG00000049739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175936951:175937910:-1 gene:ENSRNOG00000048532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175936951:175937910:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176785178:176815366:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001000175 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 170 (Olr170), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:175996608:175997573:-1 gene:ENSRNOG00000029375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:175996608:175999231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000177 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 172 (Olr172), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176043062:176044018:-1 gene:ENSRNOG00000048276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176043062:176044018:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001028 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 174 (Olr174), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176061824:176062780:-1 gene:ENSRNOG00000049250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176061824:176062780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001029 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 175 (Olr175), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176087087:176088052:-1 gene:ENSRNOG00000017308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046907 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176087087:176088052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000178 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 176 (Olr176), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176094894:176095850:-1 gene:ENSRNOG00000049186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176094894:176095850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000949 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 179 (Olr179), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176857034:176857972:-1 gene:ENSRNOG00000048628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176857034:176857972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000180 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 180 (Olr180), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176868262:176869212:-1 gene:ENSRNOG00000033813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176868262:176869002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001030 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 181 (Olr181), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176894259:176895197:-1 gene:ENSRNOG00000050959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176894259:176895197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000181 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 183 (Olr183), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001001030 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 181 (Olr181), mRNA. // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176904652:176905593:-1 gene:ENSRNOG00000027423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176894259:176895197:-1 gene:ENSRNOG00000050959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NM_001000949 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 179 (Olr179), mRNA. // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176857034:176857972:-1 gene:ENSRNOG00000048628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176904652:176916447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176894259:176895197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT006076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT006077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176857034:176857972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NONRATT006074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0
NM_001000182 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 184 (Olr184), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:176915704:176916657:-1 gene:ENSRNOG00000017341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176904652:176916447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023315 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:176985887:176987849:-1 gene:ENSRNOG00000017362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:176985881:176998014:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001000549 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 192 (Olr192), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177005303:177006241:-1 gene:ENSRNOG00000017366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177005303:177020062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000186 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 193 (Olr193), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177019244:177020185:-1 gene:ENSRNOG00000030947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177005303:177020062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000187 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 196 (Olr196), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001000948 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 194 (Olr194), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177048519:177049469:-1 gene:ENSRNOG00000046579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177087191:177088141:-1 gene:ENSRNOG00000050768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177087191:177088186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177048519:177059483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000187 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 196 (Olr196), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001000948 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 194 (Olr194), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177048519:177049469:-1 gene:ENSRNOG00000046579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177087191:177088141:-1 gene:ENSRNOG00000050768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177087191:177088186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177048519:177059483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000188 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 197 (Olr197), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177099405:177100358:-1 gene:ENSRNOG00000017379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177099405:177100358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000190 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 201 (Olr201), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 201 (Olr201), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177181896:177182840:-1 gene:ENSRNOG00000017387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177181896:177182840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000550 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 202 (Olr202), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177192985:177193953:-1 gene:ENSRNOG00000025819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177192985:177193953:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005538 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 160, member A2 (Fam160a2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177223332:177245718:-1 gene:ENSRNOG00000017408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC082011 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 160, member A2, mRNA (cDNA clone MGC:94288 IMAGE:7132039), complete cds. // chr1 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// GENSCAN00000054596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177223492:177234900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_134449 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C, delta binding protein (Prkcdbp), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177323467:177325064:-1 gene:ENSRNOG00000017914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC101398 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C, delta binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:124564 IMAGE:7933258), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D85435 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein kinase C delta-bindig protein, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220155 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YA05 mRNA sequence. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ229606 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YF14 mRNA sequence. // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177323683:177332102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT006090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080478 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 (Fe65) (Apbb1), mRNA. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006229939 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 (Fe65) (Apbb1), transcript variant X5, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 (Fe65) (Apbb1), transcript variant X6, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006229941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 1 (Fe65) (Apbb1), transcript variant X7, mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177393536:177409951:-1 gene:ENSRNOG00000018020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF333983 // GenBank // Rattus norvegicus FE65 (Fe65) mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177393937:177436950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_053318 // RefSeq // Rattus norvegicus hemopexin (Hpx), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177429400:177436973:-1 gene:ENSRNOG00000018257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091137 // GenBank // Rattus norvegicus hemopexin, mRNA (cDNA clone MGC:108641 IMAGE:7326169), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ218343 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YP19 mRNA sequence. // chr1 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// FQ219309 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YC23 mRNA sequence. // chr1 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// FQ218724 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YB05 mRNA sequence. // chr1 // 71 // 93 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177393937:177436950:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT006096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT006097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_031786 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 3 (Trim3), mRNA. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000024850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177447514:177470193:-1 gene:ENSRNOG00000018356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF036255 // GenBank // Rattus norvegicus RING finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000004165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177447923:177462496:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT006098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT006099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT006101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT006102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001004222 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor interacting protein 2 (Arfip2), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006229933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor interacting protein 2 (Arfip2), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177472247:177476928:-1 gene:ENSRNOG00000018440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079174 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94205 IMAGE:7130075), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177472857:177475994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT006106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT006107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT006108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT006105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT006109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT006111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001008346 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 8, methyltransferase, homolog (yeast) (Rrp8), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177580524:177584545:-1 gene:ENSRNOG00000018766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085119 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1500003O22, mRNA (cDNA clone MGC:105831 IMAGE:7108537), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177581161:177585121:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT006114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT006115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT006116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT006113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001134735 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF10 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf10), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006229934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TAF10 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf10), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177591012:177592280:-1 gene:ENSRNOG00000019178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168203 // GenBank // Rattus norvegicus TAF10 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:188059 IMAGE:7115651), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177591092:177592265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_031357 // RefSeq // Rattus norvegicus tripeptidyl peptidase I (Tpp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000026280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177593887:177600020:-1 gene:ENSRNOG00000019212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB043870 // GenBank // Rattus norvegicus CLN2 mRNA for tripeptidyl peptidase I, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC081775 // GenBank // Rattus norvegicus tripeptidyl peptidase I, mRNA (cDNA clone MGC:93364 IMAGE:7107183), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000004174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177594242:177600006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT006119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001107544 // RefSeq // Rattus norvegicus dachsous cadherin-related 1 (Dchs1), mRNA. // chr1 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000042865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177600834:177620711:-1 gene:ENSRNOG00000031643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000004204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177601306:177620558:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT006121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NM_133539 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L17 (Mrpl17), mRNA. // chr1 // 78 // 85 // 18 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000050562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177657945:177659630:-1 gene:ENSRNOG00000019497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC058447 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L17, mRNA (cDNA clone MGC:72706 IMAGE:6919782), complete cds. // chr1 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// FQ212468 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YP13 mRNA sequence. // chr1 // 75 // 89 // 18 // 24 // 0 /// U53512 // GenBank // Rattus norvegicus brain Na++/Ca++ exchanger-associated protein mRNA, complete cds. // chr1 // 78 // 85 // 18 // 23 // 0 /// NONRATT006123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT006125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
XM_001075523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GTPase, very large interferon inducible 1 (Gvinp1), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036269 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180244458:180247950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 86 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180337371:180344663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000051508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180248076:180276287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000051508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180248076:180276287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ233259 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YJ01 mRNA sequence. // chr1 // 65 // 100 // 15 // 23 // 0 /// NONRATT002146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_001000192 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 204 (Olr204), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:4837923:4838870:1 gene:ENSRNOG00000048643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:4837923:4838870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001001018 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 205 (Olr205), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:4799032:4799982:1 gene:ENSRNOG00000045596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:4799032:4799982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000193 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 206 (Olr206), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:4779381:4780328:1 gene:ENSRNOG00000049967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000001682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:4779381:4780328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000004170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177698759:177728140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000194 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 208 (Olr208), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000051962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177746851:177747801:-1 gene:ENSRNOG00000045631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000004173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177729032:177747801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT006126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000736 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 209 (Olr209), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177766496:177767446:-1 gene:ENSRNOG00000045692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177766531:177767371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT006127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000196 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 211 (Olr211), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000047852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177804703:177805629:-1 gene:ENSRNOG00000048223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177804703:177845081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT006128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001000735 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 213 (Olr213), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000046171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177844506:177845432:-1 gene:ENSRNOG00000048519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT006129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000037902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177804703:177845081:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001000199 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 217 (Olr217), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177919178:177920128:-1 gene:ENSRNOG00000050569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177919178:177932026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000551 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 218 (Olr218), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000049686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177931076:177932026:-1 gene:ENSRNOG00000048022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177919178:177932026:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 94 // 81 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT006131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000552 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 220 (Olr220), mRNA. // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NM_001001372 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 219 (Olr219), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177967176:177968099:1 gene:ENSRNOG00000025755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177936806:177937729:-1 gene:ENSRNOG00000047623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001000200 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 221 (Olr221), mRNA. // chr1 // 29 // 100 // 8 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177993265:177994188:-1 gene:ENSRNOG00000048930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 100 // 8 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177936806:177937729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177967116:177968125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 88 // 61 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT006132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177993265:178014624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 29 // 100 // 8 // 28 // 0 /// NONRATT006133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 29 // 100 // 8 // 28 // 0
NM_001000200 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 221 (Olr221), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:177993265:177994188:-1 gene:ENSRNOG00000048930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177993265:178014624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000201 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 222 (Olr222), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178013692:178014624:-1 gene:ENSRNOG00000019581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT006134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:177993265:178014624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001000202 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 223 (Olr223), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178032391:178033341:-1 gene:ENSRNOG00000019583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178032391:178032996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT006135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000553 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 224 (Olr224), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178049073:178050017:-1 gene:ENSRNOG00000029766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178049073:178049777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT006136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031710 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 226 (Olr226), mRNA. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:178063981:178064964:-1 gene:ENSRNOG00000029142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M64386 // GenBank // Rat olfactory protein mRNA, complete cds. // chr1 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:155149851:155150834:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:178063981:178064964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0