ENSRNOT00000030858 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:55020983:55021510:-1 gene:ENSRNOG00000025813 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:55020971:55021510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000013441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:57211623:57292652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0
NM_001105750 // RefSeq // Rattus norvegicus stromal interaction molecule 2 (Stim2), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:59324133:59450997:-1 gene:ENSRNOG00000002956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ235297 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YL20 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:59326555:59348858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT019489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NONRATT019489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106008 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 19 (Tbc1d19), mRNA. // chr14 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000004030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:59531483:59644982:-1 gene:ENSRNOG00000003003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// BC166575 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 19, mRNA (cDNA clone MGC:188211 IMAGE:7321142), complete cds. // chr14 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT019491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000001507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:59552191:59644911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_001134639 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 20 (Smim20), mRNA. // chr14 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// FQ219849 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YB22 mRNA sequence. // chr14 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// FQ231014 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YJ18 mRNA sequence. // chr14 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075821 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:60072827:60190437:-1 gene:ENSRNOG00000046603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT019498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT019497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000006710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:60117762:60190437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_053380 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 34 (type II sodium/phosphate contransporter), member 2 (Slc34a2), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:60376434:60395739:-1 gene:ENSRNOG00000004626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF157026 // GenBank // Rattus norvegicus type IIb sodium-phosphate transporter mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// BC070898 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 34 (sodium phosphate), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:91585 IMAGE:7099656), complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:60377807:60421502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001107220 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 4 (Anapc4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:60589356:60621597:-1 gene:ENSRNOG00000004130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC086546 // GenBank // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134721). // chr14 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT019502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:60573265:60712532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT019507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108360 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 4 (Zcchc4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000042757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:60629291:60670784:-1 gene:ENSRNOG00000029064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT019508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000050085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:60573265:60712532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001005883 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta (Pi4k2b), mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000005349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:60685764:60712615:-1 gene:ENSRNOG00000003924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC083668 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidylinositol 4-kinase type 2 beta, mRNA (cDNA clone MGC:94512 IMAGE:7135573), complete cds. // chr14 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT019509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000050085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:60573265:60712532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 65 // 65 // 24 // 37 // 1
NM_012880 // RefSeq // Rattus norvegicus superoxide dismutase 3, extracellular (Sod3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus superoxide dismutase 3, extracellular (Sod3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000005155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:61071313:61077045:-1 gene:ENSRNOG00000003869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061861 // GenBank // Rattus norvegicus superoxide dismutase 3, extracellular, mRNA (cDNA clone MGC:72515 IMAGE:5598594), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// Z24721 // GenBank // R.norvegicus SOD gene, complete CDS. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106010 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosidase, beta, acid 3 (Gba3), mRNA. // chr14 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// XM_006251045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosidase, beta, acid 3 (Gba3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosidase, beta, acid 3 (Gba3), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:64480977:64567844:-1 gene:ENSRNOG00000024634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// BC168903 // GenBank // Rattus norvegicus glucosidase, beta, acid 3 (cytosolic), mRNA (cDNA clone IMAGE:7130860), partial cds. // chr14 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:64565691:64602813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000071542 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:65237053:65237658:-1 gene:ENSRNOG00000048944 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:65237185:65240313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054493 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:66567782:66567894:-1 gene:ENSRNOG00000036375 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006221771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006221772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006221773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251057 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006251059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PARK2 co-regulated-like (Pacrgl), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005587 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:66781647:66802061:-1 gene:ENSRNOG00000004140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT019531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_022632 // RefSeq // Rattus norvegicus slit homolog 2 (Drosophila) (Slit2), mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000005477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:66864065:67201603:-1 gene:ENSRNOG00000003840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:66831496:66998669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// AF141386 // GenBank // Rattus norvegicus SLIT-2 mRNA, complete cds. // chr14 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT019533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NR_031931 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-218-1 (Mir218-1), microRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-218a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000958 Rattus norvegicus miR-218a-1 stem-loop // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_223468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-SMC condensin I complex, subunit G (Ncapg), mRNA. // chr14 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// FQ222654 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YJ19 mRNA sequence. // chr14 // 90 // 100 // 38 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000058838 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:69941735:69962624:-1 gene:ENSRNOG00000038572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// GENSCAN00000016380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:69933911:69970480:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1
NM_001107217 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 28 (Med28), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:70131688:70140484:-1 gene:ENSRNOG00000003592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221610 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA33YO11 mRNA sequence. // chr14 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:70133198:70140442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT019545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011910 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine aminopeptidase 3 (Lap3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:70145277:70164260:-1 gene:ENSRNOG00000003289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:70145277:70162786:-1 gene:ENSRNOG00000003289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC079381 // GenBank // Rattus norvegicus leucine aminopeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:94889 IMAGE:7111053), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:70145862:70199173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001191097 // RefSeq // Rattus norvegicus clarin 2 (Clrn2), mRNA. // chr14 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:70194126:70203808:-1 gene:ENSRNOG00000027195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:70201222:70203808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001277396 // RefSeq // Rattus norvegicus APEX nuclease (apurinic/apyrimidinic endonuclease) 2-like 1 (Apex2l1), mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000038157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:71740222:71741772:-1 gene:ENSRNOG00000026046 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:71740222:71741772:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 43 // 9 // 9 // 0
NM_013127 // RefSeq // Rattus norvegicus CD38 molecule (Cd38), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD38 molecule (Cd38), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:71745755:71785718:-1 gene:ENSRNOG00000003069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D29646 // GenBank // Rattus norvegicus CD38 mRNA for ADP-ribosyl cyclase, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D30795 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CD38-homologous protein, complete cds. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ212353 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YP13 mRNA sequence. // chr14 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT019553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_030848 // RefSeq // Rattus norvegicus bone marrow stromal cell antigen 1 (Bst1), mRNA. // chr14 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000004094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:71827040:71843323:-1 gene:ENSRNOG00000003064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// D49955 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for bone marrow stromal cell antigen 1 (BST-1), complete cds. // chr14 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// NONRATT019555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// NONRATT019556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 77 // 76 // 17 // 22 // 0
XM_003752739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 2A (Cc2d2a), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006221788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 2A (Cc2d2a), transcript variant X7, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006251081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 2A (Cc2d2a), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006968 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:71922811:71997340:-1 gene:ENSRNOG00000005106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:71922440:72028959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT019560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001107221 // RefSeq // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 7 (C1qtnf7), mRNA. // chr14 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006251074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 7 (C1qtnf7), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// XM_006251075 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 7 (C1qtnf7), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000064495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:72037997:72148187:-1 gene:ENSRNOG00000005094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// BC166720 // GenBank // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:188432 IMAGE:7932439), complete cds. // chr14 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT019563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NONRATT019563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000006727 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:72360166:72408363:-1 gene:ENSRNOG00000005043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// JF973322 // GenBank // Rattus norvegicus cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 isoform a (Cpeb2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// JF973323 // GenBank // Rattus norvegicus cytoplasmic polyadenylation element binding protein 2 isoform b (Cpeb2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:72360166:72408719:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// NONRATT019567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT019568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// NONRATT019569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
GENSCAN00000008195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:74040676:74065490:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
XM_001054394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 3-like (LOC679766), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// XM_003752742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency-associated protein 3-like (LOC679766), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000049313 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:74099974:74100450:-1 gene:ENSRNOG00000033640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000008182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:74099974:74100450:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_012768 // RefSeq // Rattus norvegicus dopamine receptor D5 (Drd5), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77202167:77203594:-1 gene:ENSRNOG00000005338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77202167:77206373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181433 // RefSeq // Rattus norvegicus otopetrin 1 (Otop1), mRNA. // chr14 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77217741:77245192:-1 gene:ENSRNOG00000028423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77217741:77261252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NM_001108362 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 128 (Tmem128), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006251099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 128 (Tmem128), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77252258:77261289:-1 gene:ENSRNOG00000005346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC167007 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 128, mRNA (cDNA clone MGC:189185 IMAGE:7310387), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ211361 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YE10 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77217741:77261252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT019582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001011911 // RefSeq // Rattus norvegicus Ly1 antibody reactive (Lyar), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ly1 antibody reactive (Lyar), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000007154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77290080:77303645:-1 gene:ENSRNOG00000005374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079008 // GenBank // Rattus norvegicus Ly1 antibody reactive homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:93922 IMAGE:7113133), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77290246:77299377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 83 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT019584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_001012151 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 18 (Stx18), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000008410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77384817:77475005:-1 gene:ENSRNOG00000006139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC079183 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 18, mRNA (cDNA clone MGC:94222 IMAGE:7130966), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT019588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77408639:77539749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000027424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77385288:77392829:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT019590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001134604 // RefSeq // Rattus norvegicus cytokine like 1 (Cytl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:77783866:77788875:-1 gene:ENSRNOG00000028108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169053 // GenBank // Rattus norvegicus cytokine like 1, mRNA (cDNA clone MGC:189445 IMAGE:7096107), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:77767299:77788869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001106012 // RefSeq // Rattus norvegicus Ellis van Creveld syndrome 2 (Evc2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006251088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ellis van Creveld syndrome 2 (Evc2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000009914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:78103484:78185967:-1 gene:ENSRNOG00000007025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000028474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78103839:78181245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT019595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_012932 // RefSeq // Rattus norvegicus collapsin response mediator protein 1 (Crmp1), mRNA. // chr14 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// XM_006251084 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collapsin response mediator protein 1 (Crmp1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:78240967:78282969:-1 gene:ENSRNOG00000004781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// U52095 // GenBank // Rattus norvegicus collapsin response mediator protein mRNA, complete cds. // chr14 // 94 // 84 // 29 // 31 // 0 /// U52102 // GenBank // Rattus norvegicus rCRMP-1 mRNA, complete cds. // chr14 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78241883:78263338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT019598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
ENSRNOT00000058528 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:78335088:78339912:-1 gene:ENSRNOG00000038427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// XM_006221797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553825 (LOC102553825), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006221799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553825 (LOC102553825), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006221802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553825 (LOC102553825), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006251116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553825 (LOC102553825), transcript variant X6, mRNA. // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XR_340352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553825 (LOC102553825), transcript variant X12, misc_RNA. // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000068104 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:78331241:78344307:-1 gene:ENSRNOG00000038427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// XM_006221806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553825 (LOC102553825), transcript variant X10, mRNA. // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// XM_006251120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553825 (LOC102553825), transcript variant X10, mRNA. // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78298356:78371917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
XM_006251097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 1 (Jakmip1), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000042078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78380423:78527986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001033894 // RefSeq // Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 1 (Jakmip1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006251097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 1 (Jakmip1), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:78398572:78443092:-1 gene:ENSRNOG00000004998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC104677 // GenBank // Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:125215 IMAGE:7453460), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC104718 // GenBank // Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:125191 IMAGE:7381652), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000042078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78380423:78527986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_057116 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, gamma (Ppp2r2c), mRNA. // chr14 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:78644679:78672624:-1 gene:ENSRNOG00000005452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// D38261 // GenBank // Rattus norvegicus BRgamma mRNA for B-regulatory subunit of protein phosphatase 2A, complete cds. // chr14 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:78644679:78727963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0
XM_001063560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 96 (Ccdc96), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_223518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 96 (Ccdc96), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008601 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:79082553:79084481:-1 gene:ENSRNOG00000006575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79082553:79084481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_024487 // RefSeq // Rattus norvegicus GrpE-like 1, mitochondrial (Grpel1), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79097609:79103770:-1 gene:ENSRNOG00000006593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097312 // GenBank // Rattus norvegicus GrpE-like 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:114309 IMAGE:7387647), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ219742 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YF03 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ219886 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YA01 mRNA sequence. // chr14 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// FQ220899 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YE12 mRNA sequence. // chr14 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// U62940 // GenBank // Rattus norvegicus stress-inducible chaperone mt-GrpE#1 mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79098258:79103759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT019609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001144850 // RefSeq // Rattus norvegicus prosaposin-like 1 (Psapl1), mRNA. // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79348847:79350430:-1 gene:ENSRNOG00000006845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79348847:79350430:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:77732276:77784323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_080900 // RefSeq // Rattus norvegicus actin filament associated protein 1 (Afap1), mRNA. // chr14 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000010346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79558760:79622351:-1 gene:ENSRNOG00000007599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AY063759 // GenBank // Rattus norvegicus actin filament associated protein (Afap) mRNA, complete cds. // chr14 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000000468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79548821:79640008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_001001514 // RefSeq // Rattus norvegicus actin binding LIM protein family, member 2 (Ablim2), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// NM_001177695 // RefSeq // Rattus norvegicus actin binding LIM protein family, member 2 (Ablim2), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// XM_006251135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin binding LIM protein family, member 2 (Ablim2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000010482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79676533:79799069:-1 gene:ENSRNOG00000007882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000058315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79676533:79799069:-1 gene:ENSRNOG00000007882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT019615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000000469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79677221:79755710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 74 // 74 // 34 // 46 // 1
NM_053339 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA oxidase 3, pristanoyl (Acox3), mRNA. // chr14 // 91 // 95 // 32 // 35 // 0 /// XM_006251148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA oxidase 3, pristanoyl (Acox3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000049798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:79942668:79981341:-1 gene:ENSRNOG00000008474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000041978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:79943124:79985038:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT019618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT019617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_001108363 // RefSeq // Rattus norvegicus H6 family homeobox 1 (Hmx1), mRNA. // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80166246:80170013:-1 gene:ENSRNOG00000009154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80166745:80167335:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_138506 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenoceptor alpha 2C (Adra2c), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81422367:81423743:-1 gene:ENSRNOG00000009299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// M58316 // GenBank // Rat alpha-2B-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81422367:81430489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT019654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001130062 // RefSeq // Rattus norvegicus docking protein 7 (Dok7), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus docking protein 7 (Dok7), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000035385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81615342:81647361:-1 gene:ENSRNOG00000022419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ223777 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA87YB24 mRNA sequence. // chr14 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81615993:81647508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_053320 // RefSeq // Rattus norvegicus HGF activator (Hgfac), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81655786:81662339:-1 gene:ENSRNOG00000009572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089871 // GenBank // Rattus norvegicus hepatocyte growth factor activator, mRNA (cDNA clone MGC:109000 IMAGE:7324508), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81655854:81696554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT019659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_019339 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 12 (Rgs12), mRNA. // chr14 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// XM_006251353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 12 (Rgs12), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// XM_006251354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 12 (Rgs12), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000040215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81671045:81742380:-1 gene:ENSRNOG00000030568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000045068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81671045:81742380:-1 gene:ENSRNOG00000030568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AF035151 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signalling 12 PDZ-less variant (RGS12) mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// FQ230909 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA80YI03 mRNA sequence. // chr14 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// U92280 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signalling 12 (RGS12) mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT019661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81655854:81696554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// NONRATT019662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1 /// NONRATT019663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001109089 // RefSeq // Rattus norvegicus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 1 (Msantd1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81783158:81789350:-1 gene:ENSRNOG00000010867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81778013:81830941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_024357 // RefSeq // Rattus norvegicus huntingtin (Htt), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000058166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81796508:81942093:-1 gene:ENSRNOG00000011073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// U18650 // GenBank // Rattus norvegicus Huntington gene product mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 99 // 64 // 66 // 0 /// GENSCAN00000040761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81834961:82026050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 49 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT019666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000040753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81778013:81830941:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 34 // 34 // 23 // 67 // 1
NM_022928 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 4 (Grk4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006251359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 4 (Grk4), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006251360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 4 (Grk4), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006251362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor kinase 4 (Grk4), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000015894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81953240:82026972:-1 gene:ENSRNOG00000011847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81953240:82026972:-1 gene:ENSRNOG00000011847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT019671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81834961:82026050:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT019669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT019670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT019672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT019673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_016990 // RefSeq // Rattus norvegicus adducin 1 (alpha) (Add1), mRNA. // chr14 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82054924:82113952:-1 gene:ENSRNOG00000013039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82058059:82113952:-1 gene:ENSRNOG00000013039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC107657 // GenBank // Rattus norvegicus adducin 1 (alpha), mRNA (cDNA clone MGC:124621 IMAGE:7935564), complete cds. // chr14 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adducin 1 (alpha) (Add1), transcript variant X8, mRNA. // chr14 // 89 // 89 // 32 // 36 // 1 /// NONRATT019676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82056455:82133758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// NONRATT019677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001100684 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3-domain binding protein 2 (Sh3bp2), mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251247 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3-domain binding protein 2 (Sh3bp2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3-domain binding protein 2 (Sh3bp2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3-domain binding protein 2 (Sh3bp2), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH3-domain binding protein 2 (Sh3bp2), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82122933:82160436:-1 gene:ENSRNOG00000013747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// FQ210321 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA30YF01 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82056455:82133758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NONRATT019682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 193, member A (Fam193a), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006251402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 193, member A (Fam193a), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006251409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 193, member A (Fam193a), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// XM_006251410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 193, member A (Fam193a), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000018616 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:82204090:82286026:-1 gene:ENSRNOG00000013832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ225369 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YD08 mRNA sequence. // chr14 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000052343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82584622:82647536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT019684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000040756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82213648:82251216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// GENSCAN00000052346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82251380:82285882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_019182 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 4 (Rnf4), mRNA. // chr14 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82345320:82374810:-1 gene:ENSRNOG00000013930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// AF022081 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear RING finger protein mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AY050655 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear RING finger protein (Rnf4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr14 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// BC062024 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:72476 IMAGE:5623495), complete cds. // chr14 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// FQ223606 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA91YM03 mRNA sequence. // chr14 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT019688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT019690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 89 // 89 // 31 // 35 // 1 /// NONRATT019691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// NONRATT019692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1 /// NONRATT019693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 63 // 63 // 22 // 35 // 1 /// NONRATT019689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001191681 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 8-like (Nat8l), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82725856:82732491:-1 gene:ENSRNOG00000049351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82728235:82739186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001106014 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1560394 (RGD1560394), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82737925:82739530:-1 gene:ENSRNOG00000038150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT019700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT019701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82728235:82739186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001191552 // RefSeq // Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (Whsc1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006251375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (Whsc1), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82803450:82855797:-1 gene:ENSRNOG00000038140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000004742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82805107:82855857:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT019704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT019703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001191552 // RefSeq // Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (Whsc1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006251375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (Whsc1), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006251379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 1 (Whsc1), transcript variant X8, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000021952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82803450:82855797:-1 gene:ENSRNOG00000038140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006251390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor 3 (Fgfr3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0 /// NM_053429 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor 3 (Fgfr3), mRNA. // chr14 // 85 // 85 // 35 // 41 // 1 /// ENSRNOT00000023144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:82962626:82976486:-1 gene:ENSRNOG00000016818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 88 // 36 // 41 // 1 /// AF277717 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast growth factor receptor 3 (Fgfr3) mRNA, complete cds. // chr14 // 85 // 85 // 35 // 41 // 1 /// GENSCAN00000004778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:82963410:82976486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT019714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT019713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1
NM_001004424 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming, acidic coiled-coil containing protein 3 (Tacc3), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006251330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transforming, acidic coiled-coil containing protein 3 (Tacc3), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000032972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83025668:83039430:-1 gene:ENSRNOG00000017259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83025817:83037063:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT019720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NONRATT019719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT019720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT019716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 35 // 35 // 1
NM_138533 // RefSeq // Rattus norvegicus spondin 2, extracellular matrix protein (Spon2), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006251156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spondin 2, extracellular matrix protein (Spon2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006251434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spondin-2-like (LOC100910790), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000008262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83504276:83510364:1 gene:ENSRNOG00000006033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC078734 // GenBank // Rattus norvegicus spondin 2, extracellular matrix protein, mRNA (cDNA clone MGC:93184 IMAGE:7121065), complete cds. // chr14 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000075130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83552734:83554580:1 gene:ENSRNOG00000046246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83552788:83574572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// AF155196 // GenBank // Rattus norvegicus mindin precursor, mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000000247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83387164:83535148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1
NM_019201 // RefSeq // Rattus norvegicus C-terminal binding protein 1 (Ctbp1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83447906:83474617:1 gene:ENSRNOG00000005428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000065393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83447913:83475121:1 gene:ENSRNOG00000005428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF067795 // GenBank // Rattus norvegicus BFA-dependent ADP-ribosylation substrate BARS50 (Bars) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078778 // GenBank // Rattus norvegicus C-terminal binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93318 IMAGE:7108845), complete cds. // chr14 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT018694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83387164:83535148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT018696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT018697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_001065657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_234082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NK1 homeobox 1 (Nkx1-1), mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000057911 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:83290200:83290994:1 gene:ENSRNOG00000005113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000073177 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:83287754:83290994:1 gene:ENSRNOG00000005113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83287634:83290994:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013033 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 1 (Slc5a1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000024165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83595065:83660489:-1 gene:ENSRNOG00000017775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// AB000729 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Na/glucose cotransporter, complete cds. // chr14 // 93 // 100 // 62 // 67 // 0 /// BC081827 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/glucose cotransporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93553 IMAGE:7129017), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// U03120 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley sodium-glucose cotransporter 1 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000000241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83595567:83660362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 94 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT019730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0
NM_013052 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta (Ywhah), mRNA. // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83739010:83748417:-1 gene:ENSRNOG00000026119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC081825 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, eta polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:93547 IMAGE:7192904), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D17445 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 14-3-3 protein eta-subtype, complete cds. // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT019731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001107229 // RefSeq // Rattus norvegicus DEP domain containing 5 (Depdc5), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// XM_006251272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEP domain containing 5 (Depdc5), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000067694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:83775510:83906306:-1 gene:ENSRNOG00000018144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000018555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:83778738:83907357:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 98 // 96 // 42 // 43 // 0 /// NONRATT019733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0
NM_001191682 // RefSeq // Rattus norvegicus Sfi1 homolog, spindle assembly associated (yeast) (Sfi1), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006251289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sfi1 homolog, spindle assembly associated (yeast) (Sfi1), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000036848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84034648:84092093:-1 gene:ENSRNOG00000018412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000018554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84034758:84086363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
NM_001009685 // RefSeq // Rattus norvegicus developmentally regulated GTP binding protein 1 (Drg1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84148278:84164306:-1 gene:ENSRNOG00000018590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088410 // GenBank // Rattus norvegicus developmentally regulated GTP binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94569 IMAGE:7189810), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84148732:84164257:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001024271 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 185 (Rnf185), mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 185 (Rnf185), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000026134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84336669:84373469:-1 gene:ENSRNOG00000019325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC092655 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 185, mRNA (cDNA clone MGC:109455 IMAGE:7320514), complete cds. // chr14 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_133562 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase J (Inpp5j), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84418928:84430035:-1 gene:ENSRNOG00000019361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB032551 // GenBank // Rattus norvegicus PIPP mRNA for proline-rich inositol polyphosphate 5-phosphatase, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84419203:84430377:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001013049 // RefSeq // Rattus norvegicus smoothelin (Smtn), mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84443089:84464810:-1 gene:ENSRNOG00000019451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000023055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84443242:84485067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT019756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
XR_146292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100125371 (LOC100125371), misc_RNA. // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC089106 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical LOC100125371, mRNA (cDNA clone MGC:105701 IMAGE:7309421), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT019761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001107232 // RefSeq // Rattus norvegicus oxysterol binding protein 2 (Osbp2), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84628870:84790722:-1 gene:ENSRNOG00000019645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251295 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein 2 (Osbp2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// XM_006251298 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein 2 (Osbp2), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// GENSCAN00000023070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84630237:84671688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107233 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921536K21 (RGD1308775), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84825689:84834332:-1 gene:ENSRNOG00000004112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84801795:84834321:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_153316 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member E4 (Slc35e4), mRNA. // chr14 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84847697:84854560:-1 gene:ENSRNOG00000004168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF182714 // GenBank // Rattus norvegicus putative phosphate/phosphoenolpyruvate translocator mRNA, complete cds. // chr14 // 83 // 80 // 20 // 24 // 0 /// BC085693 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member E4, mRNA (cDNA clone MGC:93128 IMAGE:7191218), complete cds. // chr14 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84848195:84872410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_022534 // RefSeq // Rattus norvegicus transcobalamin 2 (Tcn2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000005934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:84857866:84872462:-1 gene:ENSRNOG00000004280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF054810 // GenBank // Rattus norvegicus transcobalamin II precursor (TCII) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:84848195:84872410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT019775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT019776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT019777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001006960 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial fission process 1 (Mtfp1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85011888:85015728:-1 gene:ENSRNOG00000004640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083713 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial protein 18 kDa, mRNA (cDNA clone MGC:94604 IMAGE:7190675), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85012616:85015603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_053801 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC14-like 2 (S. cerevisiae) (Sec14l2), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC14-like 2 (S. cerevisiae) (Sec14l2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85017262:85037193:-1 gene:ENSRNOG00000004672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF309558 // GenBank // Rattus norvegicus supernatant protein factor (Spf) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC089785 // GenBank // Rattus norvegicus SEC14-like 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:108628 IMAGE:7322689), complete cds. // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000044009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85018591:85037145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
XM_001062582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 157 (Ccdc157), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_002724989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 157 (Ccdc157), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006911 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:85058453:85066554:-1 gene:ENSRNOG00000005147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85059184:85066554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001017501 // RefSeq // Rattus norvegicus HORMA domain containing 2 (Hormad2), mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000057529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85258458:85343038:-1 gene:ENSRNOG00000037865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC079253 // GenBank // Rattus norvegicus similar to HORMA domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:94350 IMAGE:7133170), complete cds. // chr14 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT019786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 46 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036195 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85283629:85375645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NONRATT019785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT019786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT019787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001012038 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 3 (Mtmr3), mRNA. // chr14 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// XM_006251306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 3 (Mtmr3), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 97 // 88 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000057501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85381833:85500445:-1 gene:ENSRNOG00000007120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// BC087045 // GenBank // Rattus norvegicus myotubularin related protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:93777 IMAGE:7109341), complete cds. // chr14 // 98 // 98 // 40 // 41 // 0 /// GENSCAN00000036198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85383736:85429473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT019788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT019789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1
NM_001170465 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase, complex III subunit X (Uqcr10), mRNA. // chr14 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// BC166935 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ubiquinol-cytochrome c reductase complex 7.2kDa protein isoform b, mRNA (cDNA clone MGC:188932 IMAGE:6922239), complete cds. // chr14 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// FQ217035 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA37YA20 mRNA sequence. // chr14 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85597352:85654713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0
NM_001007730 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding protein 7 (Cabp7), mRNA. // chr14 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85644750:85655064:-1 gene:ENSRNOG00000007871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY841152 // GenBank // Rattus norvegicus calcium binding protein 7 (Cabp7) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC081959 // GenBank // Rattus norvegicus calcium binding protein 7, mRNA (cDNA clone MGC:94082 IMAGE:7124492), complete cds. // chr14 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT019795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85597352:85654713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_013193 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofibromin 2 (merlin) (Nf2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006251190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurofibromin 2 (merlin) (Nf2), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurofibromin 2 (merlin) (Nf2), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85673149:85766300:-1 gene:ENSRNOG00000007948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000036200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85686799:85739737:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_012607 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofilament, heavy polypeptide (Nefh), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85859193:85869178:-1 gene:ENSRNOG00000008716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF031879 // GenBank // Rattus norvegicus high molecular-weight neurofilament (NF-H) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85859273:85869126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT019801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006251340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 like 1 (Gas2l1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 like 1 (Gas2l1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_001108365 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest-specific 2 like 1 (Gas2l1), mRNA. // chr14 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000065135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85986064:85995815:-1 gene:ENSRNOG00000009040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000031172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:85991248:85994982:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT019802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT019807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001025632 // RefSeq // Rattus norvegicus EWS RNA-binding protein 1 (Ewsr1), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000057382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:24535689:24564164:1 gene:ENSRNOG00000046950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC098822 // GenBank // Rattus norvegicus Ewing sarcoma breakpoint region 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377836), complete cds. // chr14 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// BC162004 // GenBank // Rattus norvegicus Ewing sarcoma breakpoint region 1, mRNA (cDNA clone MGC:187859 IMAGE:9089248), complete cds. // chr14 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ221459 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA36YB01 mRNA sequence. // chr14 // 87 // 47 // 13 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000012634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:85999931:86028404:-1 gene:ENSRNOG00000009437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86000316:86026067:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 53 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:24535687:24563998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001109467 // RefSeq // Rattus norvegicus EMI domain containing 1 (Emid1), mRNA. // chrU // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// XM_006251384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EMI domain containing 1 (Emid1), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// XM_006251385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EMI domain containing 1 (Emid1), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// XM_006251386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EMI domain containing 1 (Emid1), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000057361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86034840:86073361:-1 gene:ENSRNOG00000033575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT019809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86035456:86223405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT019811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_053649 // RefSeq // Rattus norvegicus kringle containing transmembrane protein 1 (Kremen1), mRNA. // chr14 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86114543:86175895:-1 gene:ENSRNOG00000009947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// AB065090 // GenBank // Rattus norvegicus kremen mRNA for kringle-containing transmembrane protein, complete cds. // chr14 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT019813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86035456:86223405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONRATT019812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
XM_006221825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc and ring finger 3 (Znrf3), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006251435 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc and ring finger 3 (Znrf3), partial mRNA. // chrU // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000013651 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:86199006:86256716:-1 gene:ENSRNOG00000010290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000071340 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:86200955:86256716:-1 gene:ENSRNOG00000010290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86035456:86223405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006221825 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc and ring finger 3 (Znrf3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251435 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc and ring finger 3 (Znrf3), partial mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013651 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:86199006:86256716:-1 gene:ENSRNOG00000010290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000071340 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:86200955:86256716:-1 gene:ENSRNOG00000010290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT019817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86035456:86223405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000016079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86247034:86329363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001017502 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 117 (Ccdc117), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86433500:86442865:-1 gene:ENSRNOG00000010706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087119 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 117, mRNA (cDNA clone MGC:94764 IMAGE:7097247), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86434840:86442840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT019819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000016091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86585240:86620871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000035954 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:86620412:86620871:-1 gene:ENSRNOG00000026847 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000016091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86585240:86620871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT019823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001077659 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S24 (Mrps24), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86640006:86644150:-1 gene:ENSRNOG00000011979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC157807 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S24, mRNA (cDNA clone MGC:187230 IMAGE:8375708), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227686 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YE22 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234389 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YC12 mRNA sequence. // chr14 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT019824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86640283:86674917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001077660 // RefSeq // Rattus norvegicus upregulator of cell proliferation (Urgcp), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus upregulator of cell proliferation (Urgcp), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86649972:86660719:-1 gene:ENSRNOG00000012184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ209875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YJ21 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000016088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86640283:86674917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT019828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT019829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_017328 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglycerate mutase 2 (muscle) (Pgam2), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86736789:86738938:-1 gene:ENSRNOG00000013532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ217291 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA30YD11 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M31835 // GenBank // Rat phosphoglycerate mutase (PGAM-M) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ215867 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YE06 mRNA sequence. // chr14 // 70 // 100 // 19 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86736825:86736991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000040282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86738220:86738909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001011912 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), mu (Polm), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006251211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), mu (Polm), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000018319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86761193:86770768:-1 gene:ENSRNOG00000013647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC081868 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), mu, mRNA (cDNA clone MGC:93702 IMAGE:7096894), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT019832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000040277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86762319:86791319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
NM_001013050 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), delta 2, accessory subunit (Pold2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86802862:86809022:-1 gene:ENSRNOG00000014098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079267 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), delta 2, regulatory subunit, mRNA (cDNA clone MGC:94378 IMAGE:7133662), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86802936:86807742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT019837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001106017 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, light chain 7, regulatory (Myl7), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, light chain 7, regulatory (Myl7), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin, light chain 7, regulatory (Myl7), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86827680:86830562:-1 gene:ENSRNOG00000014409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC161995 // GenBank // Rattus norvegicus myosin, light chain 7, regulatory, mRNA (cDNA clone MGC:187830 IMAGE:9034230), complete cds. // chr14 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86828633:86830789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001270849 // RefSeq // Rattus norvegicus glucokinase (Gck), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// NM_001270850 // RefSeq // Rattus norvegicus glucokinase (Gck), transcript variant 3, mRNA. // chr14 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NM_012565 // RefSeq // Rattus norvegicus glucokinase (Gck), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000019625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86832964:86848727:-1 gene:ENSRNOG00000014447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// J04218 // GenBank // Rat glucokinase mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// KJ026953 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley glucokinase variant 3 (Gck) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// M25807 // GenBank // Rat glucokinase mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86833801:86860771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT019843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
ENSRNOT00000005441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86893087:86982260:-1 gene:ENSRNOG00000004005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000045935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:86893087:86982260:-1 gene:ENSRNOG00000004005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0 /// M16112 // GenBank // Rat brain type II Ca2+/calmodulin-dependent protein kinase beta subunit mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 69 // 35 // 35 // 0 /// NM_001042354 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II beta (Camk2b), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 90 // 90 // 46 // 51 // 1 /// NM_001042356 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II beta (Camk2b), transcript variant 3, mRNA. // chr14 // 82 // 82 // 42 // 51 // 1 /// NM_021739 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II beta (Camk2b), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 90 // 90 // 46 // 51 // 1 /// NONRATT019845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// NONRATT019846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// NONRATT019847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000040300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86895498:86922041:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 63 // 63 // 32 // 51 // 1 /// GENSCAN00000040270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:86932848:87005955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 16 // 16 // 8 // 51 // 1 /// NONRATT019848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 16 // 16 // 8 // 51 // 1
NM_001004211 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 56 (Ddx56), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:87340632:87348794:-1 gene:ENSRNOG00000004670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC078919 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 56, mRNA (cDNA clone MGC:93697 IMAGE:7096512), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ212430 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA55YE03 mRNA sequence. // chr14 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:87307845:87348771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001107238 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 4 (Tmed4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006251445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 4 (Tmed4), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000006802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:87351932:87356305:-1 gene:ENSRNOG00000005016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// BC168726 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:188805 IMAGE:6889842), complete cds. // chr14 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// BC168735 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:188829 IMAGE:6891034), complete cds. // chr14 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// BC168766 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:188895 IMAGE:6890852), complete cds. // chr14 // 91 // 73 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT019852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT019854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000044827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:87352814:87356281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001017503 // RefSeq // Rattus norvegicus purine rich element binding protein B (Purb), mRNA. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80372896:80373849:-1 gene:ENSRNOG00000007042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// AB182574 // GenBank // Rattus norvegicus pur-beta mRNA for transcription factor Pur-beta, complete cds. // chr14 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ222305 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA25YG03 mRNA sequence. // chr14 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000021609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80372896:80373849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT019631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001134843 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IG (Myo1g), mRNA. // chr14 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80414799:80429940:-1 gene:ENSRNOG00000007113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC088329 // GenBank // Rattus norvegicus myosin IG, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365597), complete cds. // chr14 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000021601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80414923:80436854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0
XR_340386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547700 (LOC102547700), transcript variant X1, ncRNA. // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT019636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT019638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001100655 // RefSeq // Rattus norvegicus NAC alpha domain containing (Nacad), mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000044768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80494052:80502042:-1 gene:ENSRNOG00000007674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80492880:80533484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT019640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001012154 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor beta regulator 4 (Tbrg4), mRNA. // chr14 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000057144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80510245:80519011:-1 gene:ENSRNOG00000037664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC087073 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor beta regulator 4, mRNA (cDNA clone MGC:94428 IMAGE:7134456), complete cds. // chr14 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// FQ217643 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA21YB15 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// FQ217828 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA16YI02 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000021608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80492880:80533484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT019645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// NONRATT019646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// NONRATT019647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NONRATT019644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NONRATT019644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 13 // 13 // 1
ENSRNOT00000010744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:80531390:80533486:-1 gene:ENSRNOG00000008097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_053751 // RefSeq // Rattus norvegicus whey acidic protein (Wap), mRNA. // chr14 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// J00801 // GenBank // rat whey acidic protein mrna. // chr14 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80492880:80533484:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
FQ225532 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YL19 mRNA sequence. // chr14 // 56 // 53 // 9 // 16 // 0 /// NM_001037352 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 6 (Eif6), mRNA. // chr14 // 37 // 100 // 11 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:157722079:157728326:-1 gene:ENSRNOG00000049497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 37 // 100 // 11 // 30 // 0 /// BC105764 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:124669 IMAGE:7929717), complete cds. // chr14 // 37 // 100 // 11 // 30 // 0 /// FQ226630 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YP12 mRNA sequence. // chr14 // 31 // 97 // 9 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010911 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:80612092:80612829:-1 gene:ENSRNOG00000008241 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr14 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000021605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80612092:80619582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ230771 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YC05 mRNA sequence. // chr14 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
BC128764 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:156773 IMAGE:7121538), complete cds. // chr14 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// M31837 // GenBank // Rat insulin-like growth factor-binding protein (IGF-BP3) mRNA, complete cds. // chr14 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// M33300 // GenBank // Rat insulin-like growth factor binding protein 3 (IGFBP-3) mRNA, complete cds. // chr14 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// NM_012588 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein 3 (Igfbp3), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000011678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81091987:81099928:-1 gene:ENSRNOG00000008645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT019651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:81094334:81131013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001014107 // RefSeq // Rattus norvegicus motile sperm domain containing 1 (Mospd1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000003192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:152382193:152397168:1 gene:ENSRNOG00000002332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:81329787:81332177:-1 gene:ENSRNOG00000008840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC086521 // GenBank // Rattus norvegicus motile sperm domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:105971 IMAGE:7302680), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006257632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus motile sperm domain containing 1 (Mospd1), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// XM_006257630 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus motile sperm domain containing 1 (Mospd1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000011967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:152382295:152395779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT059320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT059321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT059318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT059319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001170459 // RefSeq // Rattus norvegicus tensin 3 (Tns3), mRNA. // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tensin 3 (Tns3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006251461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tensin 3 (Tns3), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XM_006251462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tensin 3 (Tns3), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000012661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:88471109:88645807:-1 gene:ENSRNOG00000025695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB510354 // GenBank // Rattus norvegicus TSN3 mRNA for tensin3, complete cds. // chr14 // 93 // 88 // 27 // 29 // 0 /// BC160892 // GenBank // Rattus norvegicus similar to novel protein similar to Tensin Tns, mRNA (cDNA clone MGC:188320 IMAGE:7443268), complete cds. // chr14 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// GENSCAN00000020849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:88473787:88598689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT019855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
ENSRNOT00000054268 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:88808097:88808208:1 gene:ENSRNOG00000036145 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr14 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0
NM_001109092 // RefSeq // Rattus norvegicus HUS1 checkpoint homolog (S. pombe) (Hus1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HUS1 checkpoint homolog (S. pombe) (Hus1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:88991468:89006201:-1 gene:ENSRNOG00000005141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:88780287:89006120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT019865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_006221842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006221843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251471 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sad1 and UNC84 domain containing 3 (Sun3), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006818 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:89013079:89035470:-1 gene:ENSRNOG00000005105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:89013079:89021846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0
AY539948 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00197 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:90613286:90655074:-1 gene:ENSRNOG00000030665 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:90588974:90723979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001025139 // RefSeq // Rattus norvegicus zona pellucida binding protein (Zpbp), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006251503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zona pellucida binding protein (Zpbp), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000039182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:91152515:91343430:-1 gene:ENSRNOG00000027801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC079315 // GenBank // Rattus norvegicus zona pellucida binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:94468 IMAGE:7134936), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT019870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000023523 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:91340792:91343181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_001011913 // RefSeq // Rattus norvegicus fidgetin-like 1 (Fignl1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fidgetin-like 1 (Fignl1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:91679884:91688408:-1 gene:ENSRNOG00000004440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY623031 // GenBank // Rattus norvegicus clone S30-A fidgetin-like 1 (Fignl1) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY623032 // GenBank // Rattus norvegicus clone S30-B fidgetin-like 1 (Fignl1) mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT019871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109093 // RefSeq // Rattus norvegicus growth factor receptor bound protein 10 (Grb10), mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000044726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:91818383:91914861:-1 gene:ENSRNOG00000004290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ230846 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA86YC20 mRNA sequence. // chr14 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000051466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:91821331:91842032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001107236 // RefSeq // Rattus norvegicus cordon-bleu WH2 repeat protein (Cobl), mRNA. // chr14 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000064483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:92142188:92292689:-1 gene:ENSRNOG00000004281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:91983810:92219454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:92235171:92308115:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT019886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT019887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
ENSRNOT00000053435 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:92838073:92838192:-1 gene:ENSRNOG00000035312 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000045434 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:99238881:99239265:1 gene:ENSRNOG00000030181 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 84 // 93 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:99238957:99239265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001025750 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin (Plek), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:100353685:100386527:1 gene:ENSRNOG00000005214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098846 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin, mRNA (cDNA clone MGC:112902 IMAGE:7379453), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT018855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:100353894:100398760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_199083 // RefSeq // Rattus norvegicus partner of NOB1 homolog (S. cerevisiae) (Pno1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000007824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:100166648:100175214:1 gene:ENSRNOG00000005524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY344057 // GenBank // Rattus norvegicus partner of Nob1 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC088091 // GenBank // Rattus norvegicus partner of NOB1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:108528 IMAGE:7325613), complete cds. // chr14 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT018853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001109094 // RefSeq // Rattus norvegicus Ewing tumor-associated antigen 1 (Etaa1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ewings tumor-associated antigen 1 homolog (LOC316820), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 91 // 82 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:102045074:102047692:-1 gene:ENSRNOG00000006185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:102045074:102047692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 86 // 79 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT019909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT019910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001134702 // RefSeq // Rattus norvegicus Meis homeobox 1 (Meis1), mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Meis homeobox 1 (Meis1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Meis homeobox 1 (Meis1), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:102927228:103063968:-1 gene:ENSRNOG00000004606 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC161984 // GenBank // Rattus norvegicus Meis homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:187802 IMAGE:9030600), complete cds. // chr14 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT019912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000054492 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:14:103101082:103101177:-1 gene:ENSRNOG00000036373 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001009268 // RefSeq // Rattus norvegicus ARP2 actin-related protein 2 homolog (yeast) (Actr2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000006607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104074912:104109758:-1 gene:ENSRNOG00000004959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC088442 // GenBank // Rattus norvegicus ARP2 actin-related protein 2 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:95085 IMAGE:7126325), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000042485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104073663:104109694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 95 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT019913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_001059836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 68 (Cep68), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_214106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 68 (Cep68), mRNA. // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000039523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104240524:104251658:-1 gene:ENSRNOG00000027282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104240524:104307778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT019922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT019923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_198763 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (glutamate/neutral amino acid transporter), member 4 (Slc1a4), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104316565:104346057:-1 gene:ENSRNOG00000005248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB103401 // GenBank // Rattus norvegicus ASCT1 mRNA for neutral amino acid transporter ASCT1, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ210448 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA28YI10 mRNA sequence. // chr14 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104318193:104367767:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT019925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
ENSRNOT00000007215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104652712:104691189:-1 gene:ENSRNOG00000005411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056944 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104652712:104691189:-1 gene:ENSRNOG00000005411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104672161:104691189:-1 gene:ENSRNOG00000005411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000013775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104653688:104677260:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// FQ230354 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YG06 mRNA sequence. // chr14 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT019929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT019932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001134730 // RefSeq // Rattus norvegicus lectin, galactoside-binding-like (Lgalsl), mRNA. // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:104777094:104784596:-1 gene:ENSRNOG00000005464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC168193 // GenBank // Rattus norvegicus galectin-related protein, mRNA (cDNA clone MGC:188016 IMAGE:7109522), complete cds. // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT019933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:104779900:104784414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT019935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001024743 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-glucose pyrophosphorylase 2 (Ugp2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006251538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-glucose pyrophosphorylase 2 (Ugp2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:106274950:106315312:-1 gene:ENSRNOG00000008079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC097369 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-glucose pyrophosphorylase 2, mRNA (cDNA clone MGC:114404 IMAGE:7443949), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT019950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000057565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:106275288:106441156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT019951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT019952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_033235 // RefSeq // Rattus norvegicus malate dehydrogenase 1, NAD (soluble) (Mdh1), mRNA. // chr14 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:106449340:106463995:-1 gene:ENSRNOG00000008103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AF093773 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic malate dehydrogenase (Mdh) mRNA, complete cds. // chr14 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// BC059124 // GenBank // Rattus norvegicus malate dehydrogenase 1, NAD (soluble), mRNA (cDNA clone MGC:72755 IMAGE:6921518), complete cds. // chr14 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// FQ217819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA16YP13 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ224699 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA57YN01 mRNA sequence. // chr14 // 79 // 97 // 23 // 29 // 0 /// FQ212736 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YK11 mRNA sequence. // chr14 // 63 // 100 // 19 // 30 // 0 /// FQ215010 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YC16 mRNA sequence. // chr14 // 31 // 97 // 9 // 29 // 0 /// GENSCAN00000057568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:106449537:106557887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT019955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001105875 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 58 (Ccdc58), mRNA. // chr14 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// XM_006248408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 58 (Ccdc58), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:70685896:70706181:-1 gene:ENSRNOG00000031653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000075642 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:80344665:80345026:1 gene:ENSRNOG00000048815 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:70686136:70695320:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// NONRATT013990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 100 // 16 // 31 // 0 /// NONRATT013991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 100 // 16 // 31 // 0 /// NONRATT013992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 100 // 16 // 31 // 0
NM_013109 // RefSeq // Rattus norvegicus orthodenticle homeobox 1 (Otx1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011668 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:106926625:106929875:-1 gene:ENSRNOG00000008756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ212299 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA61YE10 mRNA sequence. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L32602 // GenBank // Rattus norvegicus OTX1 mRNA, complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:106905330:106952874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006221860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EH domain binding protein 1 (Ehbp1), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006221865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EH domain binding protein 1 (Ehbp1), transcript variant X8, mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// XM_006251565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EH domain binding protein 1 (Ehbp1), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// XM_006251569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EH domain binding protein 1 (Ehbp1), transcript variant X7, mRNA. // chr14 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// XM_006251570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EH domain binding protein 1 (Ehbp1), transcript variant X8, mRNA. // chr14 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000012131 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:106937303:107187814:-1 gene:ENSRNOG00000008917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000020965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:107058128:107101609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 29 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:107016385:107031605:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT019958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 58 // 58 // 28 // 48 // 1 /// NONRATT019959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// GENSCAN00000020973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:106970131:106993045:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_001107240 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (B3gnt2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (B3gnt2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006251556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 2 (B3gnt2), transcript variant X3, mRNA. // chr14 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:107652782:107677809:-1 gene:ENSRNOG00000009267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:107567775:107655306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001115022 // RefSeq // Rattus norvegicus copper metabolism (Murr1) domain containing 1 (Commd1), mRNA. // chr14 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000012750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:107724470:107835993:-1 gene:ENSRNOG00000009281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// BC158752 // GenBank // Rattus norvegicus copper metabolism (Murr1) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187940 IMAGE:9102854), complete cds. // chr14 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// FQ212542 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YM03 mRNA sequence. // chr14 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT019966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT019967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000028011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:108145162:108145534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001107241 // RefSeq // Rattus norvegicus AHA1, activator of heat shock protein ATPase 2 (Ahsa2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006251539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AHA1, activator of heat shock protein ATPase 2 (Ahsa2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000056855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:105098652:105109823:-1 gene:ENSRNOG00000005318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC099114 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7461967. // chr14 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:105101460:105109731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT019936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT019938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001109582 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690352 (LOC690352), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690352 (LOC690352), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056854 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:14:105117844:105120865:-1 gene:ENSRNOG00000037532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:105118035:105120189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT019940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000007385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:105141275:105211491:-1 gene:ENSRNOG00000005548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC128776 // GenBank // Rattus norvegicus similar to KIAA1841 protein, mRNA (cDNA clone MGC:156804 IMAGE:7133856), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// FQ212361 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YM08 mRNA sequence. // chr14 // 63 // 63 // 26 // 41 // 1 /// FQ212938 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YJ20 mRNA sequence. // chr14 // 32 // 32 // 13 // 41 // 1 /// GENSCAN00000035028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:105158752:105178347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:105182814:105207008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 68 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT019941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_001107242 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 13 (Pex13), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:105229694:105246870:-1 gene:ENSRNOG00000005601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:105229694:105240542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT019946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-rel avian reticuloendotheliosis viral oncogene homolog (Rel), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-rel avian reticuloendotheliosis viral oncogene homolog (Rel), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:108212989:108231038:-1 gene:ENSRNOG00000006205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:108213152:108290152:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001107244 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) polymerase gamma (Papolg), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000008919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:108346030:108380042:-1 gene:ENSRNOG00000006261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000008241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:108347302:108399332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 97 // 70 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT019975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
XR_340482 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909672 (LOC100909672), transcript variant X2, ncRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_340483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909672 (LOC100909672), transcript variant X3, ncRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_340487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909672 (LOC100909672), transcript variant X7, ncRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_359736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909672 (LOC100909672), transcript variant X2, ncRNA. // chrU // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// XR_359737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909672 (LOC100909672), transcript variant X3, ncRNA. // chrU // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// XR_359738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909672 (LOC100909672), transcript variant X4, ncRNA. // chrU // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT019947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT019948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001108366 // RefSeq // Rattus norvegicus vaccinia related kinase 2 (Vrk2), mRNA. // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000068190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:110444503:110576584:-1 gene:ENSRNOG00000007864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT019980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT019982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000011074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:110432029:110482088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001191553 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 85A (Ccdc85a), mRNA. // chr14 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_003751420 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 85A-like (LOC100911414), mRNA. // chr14 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000056813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:112409633:112636341:-1 gene:ENSRNOG00000003374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006221874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 85A-like (LOC100911414), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// XM_006221876 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 85A-like (LOC100911414), transcript variant X7, mRNA. // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:112629257:112640117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT019985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:112372683:112430827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NONRATT019985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000004753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113114580:113114960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 55 // 55 // 11 // 20 // 1
NM_001024866 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 104 (Ccdc104), mRNA. // chr14 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// XM_006251598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 104 (Ccdc104), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113294068:113319546:-1 gene:ENSRNOG00000003901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC097425 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 104, mRNA (cDNA clone MGC:114472 IMAGE:7455112), complete cds. // chr14 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// FQ213878 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YB10 mRNA sequence. // chr14 // 92 // 76 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT019990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT019991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113294357:113319431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT019993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001106022 // RefSeq // Rattus norvegicus prolyl-tRNA synthetase associated domain containing 1 (Prorsd1), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000005504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113345111:113606671:-1 gene:ENSRNOG00000004145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0 /// BC167083 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2010316F05, mRNA (cDNA clone MGC:189459 IMAGE:5620957), complete cds. // chr14 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113604916:113606665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT019994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001030052 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006238827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006238828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5 (Ndufs5), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:145178506:145195972:-1 gene:ENSRNOG00000026646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:215419281:215419757:1 gene:ENSRNOG00000029339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168721 // GenBank // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) Fe-S protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:188795 IMAGE:6920432), complete cds. // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000049342 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:113694684:113712891:-1 gene:ENSRNOG00000030585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:145178612:145221898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT045450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT045451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT045452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XM_006221880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule-associated protein-like 6-like (RGD1561672), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006221883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule-associated protein-like 6-like (RGD1561672), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule-associated protein-like 6-like (RGD1561672), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule-associated protein-like 6-like (RGD1561672), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113836821:114054235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006221880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule-associated protein-like 6-like (RGD1561672), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006251610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule-associated protein-like 6-like (RGD1561672), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006221883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule-associated protein-like 6-like (RGD1561672), transcript variant X5, mRNA. // chr14 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// XM_006251613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus echinoderm microtubule-associated protein-like 6-like (RGD1561672), transcript variant X4, mRNA. // chr14 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000056706 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:113857590:114150219:-1 gene:ENSRNOG00000037462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:113836821:114054235:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1
ENSRNOT00000037897 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:114773363:114773692:-1 gene:ENSRNOG00000028222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:114667961:114773692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000052276 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:114820242:114820681:-1 gene:ENSRNOG00000022441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:114820242:114820538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0
NM_001106023 // RefSeq // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum lectin 1 (Erlec1), mRNA. // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endoplasmic reticulum lectin 1 (Erlec1), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000050321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:114972393:115009184:-1 gene:ENSRNOG00000007283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC166988 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein CL25084, mRNA (cDNA clone IMAGE:7303938), partial cds. // chr14 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000001395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:114960052:115009117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001025016 // RefSeq // Rattus norvegicus ChaC, cation transport regulator homolog 2 (E. coli) (Chac2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000002094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:115040363:115047436:-1 gene:ENSRNOG00000001531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC082031 // GenBank // Rattus norvegicus ChaC, cation transport regulator homolog 2 (E. coli), mRNA (cDNA clone MGC:95163 IMAGE:7130142), complete cds. // chr14 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000001396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:115040363:115047436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// FQ230197 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YO21 mRNA sequence. // chr14 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0 /// NONRATT020022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 82 // 82 // 14 // 17 // 1
XM_002724961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A (Leucine-rich acidic nuclear protein) (LOC680377), mRNA. // chr14 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047918 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:38170828:38171544:-1 gene:ENSRNOG00000033977 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr14 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:38170818:38171544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
XM_003752781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus discs, large homolog 5 (Drosophila) (Dlg5), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007828 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:115167:223675:1 gene:ENSRNOG00000005783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068181 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:115167:223675:1 gene:ENSRNOG00000005783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:144110:245728:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT020026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_031828 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, alpha member 1 (Kcnma1), mRNA. // chr15 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:339099:1012524:1 gene:ENSRNOG00000005985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:339099:1012524:1 gene:ENSRNOG00000005985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// AF135265 // GenBank // Rattus norvegicus large-conductance calcium-activated potassium channel (slo) mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 84 // 30 // 31 // 0 /// AY344965 // GenBank // Rattus norvegicus large-conductance calcium-activated potassium ion channel truncated isoform S0-S6 (Kcnma1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// U40603 // GenBank // Rattus norvegicus rat-slowpoke-alpha mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// U55995 // GenBank // Rattus norvegicus calcium activated potassium channel mRNA, complete cds. // chr15 // 90 // 81 // 27 // 30 // 0 /// NONRATT020033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 81 // 81 // 30 // 37 // 1 /// GENSCAN00000042904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:771586:908377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
ENSRNOT00000008154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:1043193:1043501:1 gene:ENSRNOG00000006051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107250 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 503 (Zfp503), mRNA. // chr15 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000019644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:2357098:2360886:1 gene:ENSRNOG00000014237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000042219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2346063:2360175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT020040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_001107249 // RefSeq // Rattus norvegicus catechol-O-methyltransferase domain containing 1 (Comtd1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000018897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:2612542:2615653:1 gene:ENSRNOG00000013968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2612608:2614200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT020041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT020042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0
NM_001162408 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 13 (Dusp13), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074545 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:2714172:2716788:1 gene:ENSRNOG00000048428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC166532 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 13, mRNA (cDNA clone MGC:188125 IMAGE:7190084), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XR_359784 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual specificity protein phosphatase isoform MDSP-like (LOC100909538), misc_RNA. // chr15 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000048713 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:2508147:2510764:1 gene:ENSRNOG00000033011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2714172:2784236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2508147:2530972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001007006 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 13 (Dusp13), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:2721842:2729508:1 gene:ENSRNOG00000013112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:2516997:2523238:1 gene:ENSRNOG00000050202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// BC083646 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 13, mRNA (cDNA clone MGC:94474 IMAGE:7135038), complete cds. // chr15 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NM_001162408 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 13 (Dusp13), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// XM_006251621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual specificity protein phosphatase 13-like (LOC100909469), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000017663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:2720216:2729508:1 gene:ENSRNOG00000013112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// BC166532 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 13, mRNA (cDNA clone MGC:188125 IMAGE:7190084), complete cds. // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000036564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2714172:2784236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// GENSCAN00000036565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2508147:2530972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001108368 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 (Dupd1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 (Dupd1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006251649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dual specificity phosphatase and pro isomerase domain containing 1 (Dupd1), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:2747987:2787603:1 gene:ENSRNOG00000013034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2714172:2784236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_133593 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, mu 1 subunit (Ap3m1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:3414671:3432589:1 gene:ENSRNOG00000011461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC070925 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, mu 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:91500 IMAGE:7096586), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L07073 // GenBank // Rat clathrin-associated adaptor protein homolog (p47A) mRNA, complete cds. // chr15 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// FQ217389 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA27YP24 mRNA sequence. // chr15 // 71 // 89 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:3418961:3430718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001105740 // RefSeq // Rattus norvegicus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 2 (Ndst2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 2 (Ndst2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:3726914:3737357:1 gene:ENSRNOG00000027171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:3665618:3736699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XM_223791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptopodin 2-like (Synpo2l), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011956 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:8165924:8173853:1 gene:ENSRNOG00000008949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8158093:8185254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109097 // RefSeq // Rattus norvegicus myozenin 1 (Myoz1), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8178309:8185523:1 gene:ENSRNOG00000040122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ215657 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YF01 mRNA sequence. // chr15 // 79 // 89 // 19 // 24 // 0 /// FQ216019 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YE11 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ217380 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA28YF19 mRNA sequence. // chr15 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT020061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8158093:8185254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001008863 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 54 (Usp54), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 54 (Usp54), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8226916:8291196:1 gene:ENSRNOG00000027012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8232279:8337504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
FJ817497 // GenBank // Rattus norvegicus strain W nucleolin-like protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_012749 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolin (Ncl), mRNA. // chr15 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000024712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:93097881:93106405:-1 gene:ENSRNOG00000018273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// BC085751 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolin, mRNA (cDNA clone MGC:93572 IMAGE:7109097), complete cds. // chr15 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000011480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8232279:8234013:1 gene:ENSRNOG00000008664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073823 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:8232345:8234013:1 gene:ENSRNOG00000008664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000042806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8232279:8337504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT020062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000053223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:93098005:93106279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0
NM_001008863 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 54 (Usp54), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 54 (Usp54), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8226916:8291196:1 gene:ENSRNOG00000027012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8232279:8337504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT020066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT020067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_017042 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 3, catalytic subunit, beta isozyme (Ppp3cb), mRNA. // chr15 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000010476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8293592:8338152:1 gene:ENSRNOG00000007757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// D90036 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for calcineurin A beta, complete cds. // chr15 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// M31809 // GenBank // Rat calcineurin A-beta mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT020068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_001106025 // RefSeq // Rattus norvegicus MSS51 mitochondrial translational activator (Mss51), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8341460:8353329:1 gene:ENSRNOG00000007632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ215224 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YC15 mRNA sequence. // chr15 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// FQ215395 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YG07 mRNA sequence. // chr15 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// FQ215873 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YD21 mRNA sequence. // chr15 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8349348:8353214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT020078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT020079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_130416 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A7 (Anxa7), mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006251626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A7 (Anxa7), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000061686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8355756:8382542:1 gene:ENSRNOG00000007136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF280423 // GenBank // Rattus norvegicus annexin VII mRNA, complete cds. // chr15 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// BC070896 // GenBank // Rattus norvegicus annexin A7, mRNA (cDNA clone MGC:91520 IMAGE:7099644), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000042818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8362664:8382244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT020081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT020082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT020083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_003752779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 18 (Ttc18), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006221888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 18 (Ttc18), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8389847:8452066:1 gene:ENSRNOG00000007046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8389847:8452066:1 gene:ENSRNOG00000007046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8389847:8452066:1 gene:ENSRNOG00000007046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8387228:8468512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001109518 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S16 (Mrps16), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8452790:8455192:1 gene:ENSRNOG00000006898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228795 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YL09 mRNA sequence. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT020088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8387228:8468512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001108865 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 9 (Dnajc9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8457759:8462062:1 gene:ENSRNOG00000006619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB002591 // GenBank // Rattus norvegicus JDD1 mRNA for DnaJ-like factor, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8387228:8468512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT020091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001039516 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 5 (Kcnk5), mRNA. // chr15 // 92 // 46 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8654578:8696346:1 gene:ENSRNOG00000047005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 46 // 24 // 26 // 0 /// BC129068 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 5, mRNA (cDNA clone MGC:156464 IMAGE:7387039), complete cds. // chr15 // 92 // 46 // 24 // 26 // 0 /// NM_001109520 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 16 (Kcnk16), mRNA. // chr15 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1 /// XM_006251675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ecdysoneless homolog (Drosophila) (Ecd), mRNA. // chr15 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1 /// ENSRNOT00000008461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8575512:8582655:1 gene:ENSRNOG00000006422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1 /// ENSRNOT00000008553 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:8502035:8531649:1 gene:ENSRNOG00000042253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1 /// GENSCAN00000008925 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8596750:8694739:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 30 // 30 // 17 // 56 // 1 /// GENSCAN00000008931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8546600:8581231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 25 // 25 // 14 // 56 // 1 /// GENSCAN00000008929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8502035:8531664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1 /// NONRATT020094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 18 // 18 // 10 // 56 // 1 /// NONRATT020095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 21 // 21 // 12 // 56 // 1
XR_146612 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAYSVFN motif domain containing 1 (Saysd1), misc_RNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8706597:8761676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001047874 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein CGI-99 (RGD1304704), mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8973717:8984672:1 gene:ENSRNOG00000000340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// FQ229372 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YC15 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8973822:8984510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT020100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT020102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT020104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
GENSCAN00000048408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9064617:9125422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_134459 // RefSeq // Rattus norvegicus CD99 molecule-like 2 (Cd99l2), mRNA. // chr15 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// XM_006227062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 molecule-like 2 (Cd99l2), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 antigen-like protein 2-like (LOC100911604), partial mRNA. // chr15 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000024427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:9794007:9962274:-1 gene:ENSRNOG00000018148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:9351971:9394392:1 gene:ENSRNOG00000023841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// AB031014 // GenBank // Rattus norvegicus vms-tm2 mRNA for single-pass transmembrane protein, complete cds. // chr15 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// AF481858 // GenBank // Rattus norvegicus MIC2L1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006227060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 molecule-like 2 (Cd99l2), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// XM_006251676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 molecule-like 2 (Cd99l2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// XM_006251694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 molecule-like 2 (Cd99l2), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// GENSCAN00000048401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9351971:9412934:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000049648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9926631:9962264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001011702 // RefSeq // Rattus norvegicus Spetex-2E protein (Spetex-2E), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// AB180080 // GenBank // Rattus norvegicus Spetex-2E mRNA for Spetex-2E, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT020987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT020988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT020991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT020992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
GENSCAN00000025953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:10694781:10945621:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001108371 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2E 2 (Ube2e2), mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000046879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:11938853:11995295:1 gene:ENSRNOG00000032690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// NONRATT020115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:11963903:11994949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
BC079134 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2E 2 (UBC4/5 homolog, yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:7127579), partial cds. // chr15 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000011653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:12188506:12240285:1 gene:ENSRNOG00000008794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT020119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_139114 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L15 (Rpl15), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC078724 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L15, mRNA (cDNA clone MGC:93161 IMAGE:7125608), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000034550 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:12891582:12892872:1 gene:ENSRNOG00000026320 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 77 // 100 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:12892312:12892872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 45 // 10 // 10 // 0
NM_001100508 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-oxoacyl-ACP synthase, mitochondrial (Oxsm), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:14508023:14511770:1 gene:ENSRNOG00000005993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:14506634:14510651:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT020138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_006251713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S7-like (RGD1559461), mRNA. // chr15 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073968 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:14675501:14676132:1 gene:ENSRNOG00000050674 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:14675520:14676083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0
XM_002725036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 3B (Lrrc3b), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_002728176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 3B (Lrrc3b), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_003751442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 3B (Lrrc3b), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_003752783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 3B (Lrrc3b), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006221893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 3B (Lrrc3b), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006251719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 3B (Lrrc3b), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000007672 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:15338715:15339494:1 gene:ENSRNOG00000005857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000006530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:15338715:15339494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT020140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001000534 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1607 (Olr1607), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:16394649:16395596:1 gene:ENSRNOG00000006746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16389434:16445368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT020143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198730 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 6 (Psmd6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006251723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 6 (Psmd6), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:16438805:16447424:1 gene:ENSRNOG00000006751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC059159 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 6, mRNA (cDNA clone MGC:72968 IMAGE:6887177), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ213157 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YG19 mRNA sequence. // chr15 // 87 // 97 // 27 // 31 // 0 /// FQ213627 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YK22 mRNA sequence. // chr15 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// FQ213655 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YI17 mRNA sequence. // chr15 // 50 // 100 // 16 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16389434:16445368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001271293 // RefSeq // Rattus norvegicus THO complex 7 homolog (Drosophila) (Thoc7), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001271294 // RefSeq // Rattus norvegicus THO complex 7 homolog (Drosophila) (Thoc7), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus THO complex 7 homolog (Drosophila) (Thoc7), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus THO complex 7 homolog (Drosophila) (Thoc7), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:16606452:16611280:1 gene:ENSRNOG00000007701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16590380:16611280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT020147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_340592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ23834 (RGD1565725), misc_RNA. // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XR_359833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ23834 (RGD1565725), misc_RNA. // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16686443:16724336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_013219 // RefSeq // Rattus norvegicus Ca++-dependent secretion activator (Cadps), mRNA. // chrU // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:19278581:19669176:1 gene:ENSRNOG00000008570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 77 // 22 // 23 // 0 /// U16802 // GenBank // Rattus norvegicus Ca2+-dependent activator protein (CAPS) mRNA, complete cds. // chrU // 96 // 93 // 27 // 28 // 0
NM_001107251 // RefSeq // Rattus norvegicus Fez family zinc finger 2 (Fezf2), mRNA. // chr15 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000012452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:16854926:16858715:1 gene:ENSRNOG00000009206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// BC168214 // GenBank // Rattus norvegicus Fez family zinc finger 2, mRNA (cDNA clone MGC:188173 IMAGE:7313369), complete cds. // chr15 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16855571:16858307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_021774 // RefSeq // Rattus norvegicus fragile histidine triad (Fhit), mRNA. // chr15 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:20143551:20818336:1 gene:ENSRNOG00000007167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// AF170064 // GenBank // Rattus norvegicus fragile histidine triad protein (FHIT) mRNA, complete cds. // chr15 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000042654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:20537684:20550780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT020163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000061169 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:21650963:21865186:1 gene:ENSRNOG00000007206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// BC086559 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933406L09, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301570), complete cds. // chr15 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// BC098040 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933406L09, mRNA (cDNA clone MGC:116196 IMAGE:7456960), complete cds. // chr15 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:21763554:21831473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT020166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// NONRATT020168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1 /// NONRATT020165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// NONRATT020167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001106027 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 3, member D (Fam3d), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251752 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 3, member D (Fam3d), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251753 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 3, member D (Fam3d), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22298428:22331398:1 gene:ENSRNOG00000007320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22316598:22385616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT020173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001025129 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 107, member A (Fam107a), mRNA. // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22284696:22387948:1 gene:ENSRNOG00000033261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22370132:22387948:1 gene:ENSRNOG00000033261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC093601 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 107, member A, mRNA (cDNA clone MGC:105610 IMAGE:7316049), complete cds. // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22316598:22385616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_145770 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA oxidase 2, branched chain (Acox2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA oxidase 2, branched chain (Acox2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA oxidase 2, branched chain (Acox2), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22419914:22449498:1 gene:ENSRNOG00000007378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// X95189 // GenBank // R.norvegicus mRNA for Trihydroxycoprostanoyl-CoA Oxidase. // chr15 // 93 // 97 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000033711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22428454:22444812:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT020177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22396109:22426737:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001007620 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase (lipoamide) beta (Pdhb), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22507948:22513889:1 gene:ENSRNOG00000007895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079137 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase (lipoamide) beta, mRNA (cDNA clone MGC:94149 IMAGE:7127701), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ234205 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YM19 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22505570:22513510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_053907 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxyribonuclease 1-like 3 (Dnase1l3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deoxyribonuclease 1-like 3 (Dnase1l3), partial mRNA. // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000012532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22676702:22702927:1 gene:ENSRNOG00000009291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF039852 // GenBank // Rattus norvegicus DNAseY mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC088122 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyribonuclease 1-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:108624 IMAGE:7325326), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U75689 // GenBank // Rattus norvegicus DNase gamma mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ227164 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YL16 mRNA sequence. // chr15 // 55 // 88 // 12 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22676904:22702660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT020184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221898 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG11429-like (LOC100363368), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG11429-like (LOC100363368), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036754 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:22885632:22891966:1 gene:ENSRNOG00000024504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22886732:22905598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
XM_006221898 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG11429-like (LOC100363368), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG11429-like (LOC100363368), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000073284 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:23093469:23094279:1 gene:ENSRNOG00000046818 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23034759:23184470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001135164 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin D2 receptor-like (Ptgdr), mRNA. // chr15 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// NM_022241 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin D2 receptor (Ptgdrl), mRNA. // chr15 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000042545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22064758:22073554:-1 gene:ENSRNOG00000031535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// AF120101 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin D2 receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// FQ222068 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YH07 mRNA sequence. // chr15 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// U92289 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin D2 receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000041790 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:23162070:23164381:1 gene:ENSRNOG00000031307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000057894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22066550:22208586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 73 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT021051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23034759:23184470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
XM_006227114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC102549564), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0 /// XM_006227115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC102549564), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000039197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:9203711:9205028:1 gene:ENSRNOG00000026456 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 81 // 79 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9179473:9181593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 81 // 62 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9202429:9204549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 81 // 62 // 17 // 21 // 0 /// NONRATT020105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 74 // 100 // 25 // 34 // 0
ENSRNOT00000039197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:9203711:9205028:1 gene:ENSRNOG00000026456 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 90 // 97 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9179473:9181593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9202429:9204549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 68 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT020105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_031088 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin E receptor 2 (subtype EP2) (Ptger2), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23303778:23315207:1 gene:ENSRNOG00000050968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U48858 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin E receptor EP2 subtype mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U94708 // GenBank // Rattus norvegicus EP2 prostanoid receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostaglandin E receptor 2 (subtype EP2) (Ptger2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000052694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23303820:23314970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT020188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_031088 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin E receptor 2 (subtype EP2) (Ptger2), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23303778:23315207:1 gene:ENSRNOG00000050968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U48858 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin E receptor EP2 subtype mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// U94708 // GenBank // Rattus norvegicus EP2 prostanoid receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostaglandin E receptor 2 (subtype EP2) (Ptger2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000052694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23303820:23314970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT020188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001134541 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 137C (Gpr137c), mRNA. // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT020190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001013994 // RefSeq // Rattus norvegicus REST corepressor 2 (Rcor2), mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XM_001061203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus REST corepressor 2-like 1 (Rcor2l1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006230969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus REST corepressor 2-like (LOC102552640), mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23568509:23574620:1 gene:ENSRNOG00000021183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC089209 // GenBank // Rattus norvegicus REST corepressor 2, mRNA (cDNA clone MGC:105529 IMAGE:7302520), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019987 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06111241.1:117:2526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:229509352:229513908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23568863:23580232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// NONRATT020193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT020192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001134541 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 137C (Gpr137c), mRNA. // chr15 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000036235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23512965:23580026:1 gene:ENSRNOG00000026328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// GENSCAN00000057064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23568863:23580232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT020190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1
NM_001100509 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase, 6 (Psmc6), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23631640:23653070:1 gene:ENSRNOG00000007203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000057079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23631653:23651916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT020195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
NM_001271541 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine interacting protein (Styx), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:62894479:62895150:1 gene:ENSRNOG00000004453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23654558:23681602:1 gene:ENSRNOG00000007956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:62894479:62895150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23669683:23681602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
ENSRNOT00000010449 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:23669683:23670691:1 gene:ENSRNOG00000007915 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 96 // 14 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23669683:23681602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0
XM_006251791 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 3 (Cdkn3), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC167026 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 3, mRNA (cDNA clone MGC:189250 IMAGE:8375927), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001106028 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 3 (Cdkn3), mRNA. // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000012985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:27496741:27508022:1 gene:ENSRNOG00000009785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_053899 // RefSeq // Rattus norvegicus cell growth regulator with ring finger domain 1 (Cgrrf1), mRNA. // chr15 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:27562651:27583110:1 gene:ENSRNOG00000010178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC078763 // GenBank // Rattus norvegicus cell growth regulator with ring finger domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:93274 IMAGE:7107668), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U66471 // GenBank // Rattus norvegicus cell growth regulator rCGR19 mRNA, complete cds. // chr15 // 89 // 88 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT020211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000027633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:27553675:27598617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT020212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001107254 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 4A (Samd4a), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:27721129:27815275:1 gene:ENSRNOG00000010489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC168894 // GenBank // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 4A, mRNA (cDNA clone MGC:189158 IMAGE:7453870), complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:27736561:27822839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107256 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 4 (Socs4), mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000015120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:27997125:28011599:1 gene:ENSRNOG00000011377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC168879 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 4, mRNA (cDNA clone MGC:189133 IMAGE:9035196), complete cds. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000039509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:28009767:28011077:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT020222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001108373 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1-like (Mapk1ip1l), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006251812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1-like (Mapk1ip1l), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000015511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:28019022:28041288:1 gene:ENSRNOG00000011611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000063807 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:28019024:28042563:1 gene:ENSRNOG00000011611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC167004 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 1 interacting protein 1-like, mRNA (cDNA clone MGC:189170 IMAGE:9090872), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ212003 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YP17 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT020225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT020226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001107257 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 34 (Fbxo34), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 34 (Fbxo34), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006251799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 34 (Fbxo34), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 34 (Fbxo34), transcript variant X8, mRNA. // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000015778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:28202792:28270018:1 gene:ENSRNOG00000011704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168877 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 34, mRNA (cDNA clone MGC:189131 IMAGE:7134856), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:28238006:28273281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT020233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:28180229:28218209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NONRATT020233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT020248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0
NM_001107259 // RefSeq // Rattus norvegicus pellino E3 ubiquitin protein ligase family member 2 (Peli2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:28874964:29015649:1 gene:ENSRNOG00000012363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:28994656:29013914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT020249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170475 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Protein C14orf101 homolog (RGD1562018), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:29220349:29287363:1 gene:ENSRNOG00000013353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC168696 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Protein C14orf101 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:188600 IMAGE:7938311), complete cds. // chr15 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// FQ211595 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YH06 mRNA sequence. // chr15 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000024781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:29246503:29284416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT020252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT020253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT020254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001030036 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 5, mu 1 subunit (Ap5m1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 5, mu 1 subunit (Ap5m1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:29856055:29878317:1 gene:ENSRNOG00000014148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099829 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4932432K03, mRNA (cDNA clone MGC:124703 IMAGE:7933740), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:29860457:29887159:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109099 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 30, NatC catalytic subunit (Naa30), mRNA. // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000020074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:29962873:29982034:1 gene:ENSRNOG00000014192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000034807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:29952561:29978615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
XM_001074371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1611 (Olr1611), mRNA. // chr15 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// XM_003751458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1610 (Olr1610), mRNA. // chr15 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000016721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31002767:31003693:-1 gene:ENSRNOG00000047419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31002767:31003693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// NONRATT021128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_001144779 // RefSeq // Rattus norvegicus toll-like receptor 11 (Tlr11), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31116041:31118920:1 gene:ENSRNOG00000032368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FJ539013 // GenBank // Rattus norvegicus toll-like receptor 11 (Tlr11) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ230537 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA91YF20 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31116638:31118872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001000841 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1614 (Olr1614), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31144626:31145564:1 gene:ENSRNOG00000008739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31144758:31145564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001003 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1615 (Olr1615), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31180318:31181253:1 gene:ENSRNOG00000049936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000840 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1616 (Olr1616), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31203612:31204860:1 gene:ENSRNOG00000045601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000839 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1617 (Olr1617), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31217300:31218235:1 gene:ENSRNOG00000046129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000521 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1619 (Olr1619), mRNA. // chr15 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31282507:31283442:1 gene:ENSRNOG00000048856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NM_001000839 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1617 (Olr1617), mRNA. // chr15 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31217300:31218235:1 gene:ENSRNOG00000046129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// NM_001000097 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1620 (Olr1620), mRNA. // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NM_001001003 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1615 (Olr1615), mRNA. // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000046583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31180318:31181253:1 gene:ENSRNOG00000049936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000047008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31338431:31339405:1 gene:ENSRNOG00000030687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT020273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT020272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 100 // 11 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31338431:31341397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT020270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT020274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001000521 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1619 (Olr1619), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31282507:31283442:1 gene:ENSRNOG00000048856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000097 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1620 (Olr1620), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31338431:31339405:1 gene:ENSRNOG00000030687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31338431:31341397:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT020274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001074716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1621 (Olr1621), partial mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_223986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1621 (Olr1621), partial mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011632 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:31359897:31360883:1 gene:ENSRNOG00000008800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31360296:31360883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001000838 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1622 (Olr1622), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000011636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31374818:31375756:1 gene:ENSRNOG00000008804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31372653:31375756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT020275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000091 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1627 (Olr1627), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000016674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30813946:30814920:1 gene:ENSRNOG00000012510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:30814186:30814920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT020265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000049471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31393081:31393782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001106030 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase 2 (Parp2), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase 2 (Parp2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31571841:31582073:1 gene:ENSRNOG00000008892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC161972 // GenBank // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) polymerase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:9029055), complete cds. // chr15 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// GENSCAN00000026493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31571875:31581967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT020277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1 /// NONRATT020276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT020279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_024148 // RefSeq // Rattus norvegicus APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1 (Apex1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1 (Apex1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000013176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31682396:31684507:1 gene:ENSRNOG00000009663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF309114 // GenBank // Rattus norvegicus nuclease APEX mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// BC078816 // GenBank // Rattus norvegicus APEX nuclease (multifunctional DNA repair enzyme) 1, mRNA (cDNA clone MGC:93413 IMAGE:7127205), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D44495 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for APEX nuclease, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// L27076 // GenBank // Rattus norvegicus apurinic/apyrimidinic endonuclease mRNA, complete cds. // chr15 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31682692:31684352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_001106031 // RefSeq // Rattus norvegicus purine nucleoside phosphorylase (Pnp), mRNA. // chr15 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31712198:31716288:1 gene:ENSRNOG00000009982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31708700:31748028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NM_001012467 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 10 (non-active) (Rnase10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31765980:31766618:1 gene:ENSRNOG00000010261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31765980:31796179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT020291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000013637 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:31795370:31796065:1 gene:ENSRNOG00000010272 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31765980:31796179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001006992 // RefSeq // Rattus norvegicus angiogenin, ribonuclease, RNase A family, 5 (Ang), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_001012359 // RefSeq // Rattus norvegicus angiogenin, ribonuclease A family, member 2 (Ang2), mRNA. // chr15 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31932544:31933047:-1 gene:ENSRNOG00000025562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31854894:31859799:1 gene:ENSRNOG00000043032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY395869 // GenBank // Rattus norvegicus angiogenin precursor (Ang1) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31859205:31860186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ209834 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA39YE24 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ218250 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA6YO10 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31932065:31933047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 59 // 68 // 10 // 17 // 0
NM_178103 // RefSeq // Rattus norvegicus epididymal protein 3B (Eddm3b), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31880764:31881956:1 gene:ENSRNOG00000033532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_206815 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 6 (Rnase6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 6 (Rnase6), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251873 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 6 (Rnase6), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31889678:31892267:1 gene:ENSRNOG00000025597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ231647 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YL12 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31891330:31891791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000028949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31911759:31912064:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0
NM_001025116 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 1-like 2 (pancreatic) (Rnase1l2), mRNA. // chr15 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000046615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31957448:31959061:1 gene:ENSRNOG00000030694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ222493 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA22YM03 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31958343:31958801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT020299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_002728193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eosinophil-associated, ribonuclease A family, member 1 (Ear1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000021645 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:32073262:32073717:1 gene:ENSRNOG00000025515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_223974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyltransferase like 17 (Mettl17), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064907 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:32100248:32106730:1 gene:ENSRNOG00000025512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32100248:32106730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT020300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT020303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT020302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001107260 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 2 (Slc39a2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32108556:32110668:1 gene:ENSRNOG00000010375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32108680:32110393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109100 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin polymerization-promoting protein family member 2 (Tppp2), mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000048723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32132155:32134449:1 gene:ENSRNOG00000025473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000028963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32132155:32134354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001271313 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 40 (Arhgef40), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// XR_359901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 40 (Arhgef40), transcript variant X5, misc_RNA. // chr15 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// XR_359903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 40 (Arhgef40), transcript variant X7, misc_RNA. // chr15 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000015331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32193215:32213812:1 gene:ENSRNOG00000011129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000028919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32193215:32213812:1 gene:ENSRNOG00000011129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000028986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32191519:32212452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT020309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// NONRATT020308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT020311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
XM_006221925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 253 (Tmem253), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006221928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 253 (Tmem253), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006251915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 253 (Tmem253), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006251918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 253 (Tmem253), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000060521 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:32223925:32226021:1 gene:ENSRNOG00000039489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32225288:32240440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
XM_006221930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L31-like (LOC690384), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006251920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L31-like (LOC690384), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000060519 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:32249998:32250375:1 gene:ENSRNOG00000039487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028953 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32249998:32250375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_006251921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinitis pigmentosa GTPase regulator interacting protein 1 (Rpgrip1), mRNA. // chr15 // 98 // 82 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000060495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32355471:32363349:1 gene:ENSRNOG00000011809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 27 // 27 // 0 /// BC097397 // GenBank // Rattus norvegicus retinitis pigmentosa GTPase regulator interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7453600), complete cds. // chr15 // 100 // 54 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32333018:32384859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 82 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT020320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 28 // 50 // 1 /// NONRATT020321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 48 // 48 // 24 // 50 // 1 /// NONRATT020322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 19 // 50 // 1 /// BC092191 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7111416, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr15 // 16 // 16 // 8 // 50 // 1
NM_173324 // RefSeq // Rattus norvegicus TOX high mobility group box family member 4 (Tox4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000017476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32506570:32520158:1 gene:ENSRNOG00000012844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF267197 // GenBank // Rattus norvegicus epidermal Langerhans cell protein LCP1 mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// BC081696 // GenBank // Rattus norvegicus TOX high mobility group box family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:93073 IMAGE:7112549), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ212245 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA63YM16 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32510209:32519131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT020325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000007110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32688257:32701687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000007110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32688257:32701687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001000535 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1643 (Olr1643), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32725888:32726814:1 gene:ENSRNOG00000013338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32725888:32726814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
L11031 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32805269:32875604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000060424 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:32858009:32858549:1 gene:ENSRNOG00000039432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000065142 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:32856856:32858597:1 gene:ENSRNOG00000039432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32805269:32875604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000060420 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:34627204:34627722:1 gene:ENSRNOG00000046840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34616927:34642378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000012319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33955820:33976801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35106181:35128082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33656985:33657537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35895906:35921106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35717415:35717968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33143864:33145811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0
GENSCAN00000023133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35895906:35921106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34160325:34202683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33639758:33640261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33115872:33124491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34490438:34564325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 100 // 12 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35106181:35128082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35725596:35760166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
GENSCAN00000023133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35895906:35921106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35106181:35128082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// L11036 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33115872:33124491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 71 // 14 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000060386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:33634468:33634932:-1 gene:ENSRNOG00000039404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 97 // 14 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34338256:34338765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33588945:33634932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 45 // 100 // 14 // 31 // 0
XM_006252036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG140239-like (LOC100362949), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006227156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG140239-like (LOC100361213), mRNA. // chr15 // 64 // 100 // 21 // 33 // 0 /// XM_006252037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554516 (LOC102554516), mRNA. // chr15 // 55 // 100 // 18 // 33 // 0 /// DQ340291 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha chain mRNA, complete cds. // chr15 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// JQ074230 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344 nonfunctional T-cell receptor alpha chain AV14S5 mRNA, complete sequence. // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// GENSCAN00000047792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35170939:35174834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35167986:35168503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 88 // 22 // 29 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 88 // 22 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34347420:34370569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 65 // 79 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35948387:36056481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 76 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35182255:35212673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSRNOT00000060310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:35887930:35888482:1 gene:ENSRNOG00000045525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 100 // 17 // 34 // 0 /// XM_002725076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T cell receptor alpha chain (RGD1564212), mRNA. // chr15 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35678977:35716355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35076704:35105005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34982285:35059044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 62 // 100 // 21 // 34 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 17 // 34 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 17 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000060399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:33966148:33966803:-1 gene:ENSRNOG00000047855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 38 // 100 // 13 // 34 // 0 /// L37966 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 38 // 100 // 13 // 34 // 0
ENSRNOT00000072888 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:35971976:35980921:1 gene:ENSRNOG00000049867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35948387:36056481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34490438:34564325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
ENSRNOT00000060399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:33966148:33966803:-1 gene:ENSRNOG00000047855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 86 // 29 // 31 // 0 /// L37966 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33151269:33166032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 39 // 100 // 14 // 36 // 0 /// GENSCAN00000047802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34982285:35059044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 31 // 81 // 9 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35076704:35105005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 53 // 9 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35678977:35716355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
GENSCAN00000023133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35895906:35921106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35106181:35128082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34160325:34202683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33639758:33640261:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33115872:33124491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 100 // 17 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34490438:34564325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 100 // 12 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35725596:35760166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006227156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG140239-like (LOC100361213), mRNA. // chr15 // 77 // 85 // 17 // 22 // 0 /// XM_006252036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG140239-like (LOC100362949), mRNA. // chr15 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// XM_006252037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554516 (LOC102554516), mRNA. // chr15 // 50 // 85 // 11 // 22 // 0 /// DQ340291 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha chain mRNA, complete cds. // chr15 // 48 // 96 // 12 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35948387:36056481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34347420:34370569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 85 // 14 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35170939:35174834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0
ENSRNOT00000072888 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:35971976:35980921:1 gene:ENSRNOG00000049867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35948387:36056481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 78 // 79 // 18 // 23 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34490438:34564325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
ENSRNOT00000060310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:35887930:35888482:1 gene:ENSRNOG00000045525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 100 // 16 // 32 // 0 /// XM_002725076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T cell receptor alpha chain (RGD1564212), mRNA. // chr15 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000032466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33151269:33166032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 59 // 100 // 19 // 32 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 16 // 32 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 16 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000060399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:33966148:33966803:-1 gene:ENSRNOG00000047855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 100 // 14 // 32 // 0 /// L37966 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 44 // 100 // 14 // 32 // 0
ENSRNOT00000060392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:35539362:35539868:1 gene:ENSRNOG00000039408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000040973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35762728:35764054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 53 // 100 // 18 // 34 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 17 // 34 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 17 // 34 // 0
ENSRNOT00000060310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:35887930:35888482:1 gene:ENSRNOG00000045525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 100 // 17 // 34 // 0 /// XM_002725076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T cell receptor alpha chain (RGD1564212), mRNA. // chr15 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1 /// GENSCAN00000040972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35678977:35716355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35076704:35105005:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34982285:35059044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 62 // 100 // 21 // 34 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 17 // 34 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 100 // 17 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000060399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:33966148:33966803:-1 gene:ENSRNOG00000047855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 38 // 100 // 13 // 34 // 0 /// L37966 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 38 // 100 // 13 // 34 // 0
GENSCAN00000023133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35895906:35921106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35106181:35128082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// L11036 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 92 // 81 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33115872:33124491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 71 // 14 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000060386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:33634468:33634932:-1 gene:ENSRNOG00000039404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 97 // 14 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34338256:34338765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 42 // 100 // 13 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33588945:33634932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 45 // 100 // 14 // 31 // 0
GENSCAN00000040973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35762728:35764054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 100 // 38 // 41 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000060392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:35539362:35539868:1 gene:ENSRNOG00000039408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 90 // 16 // 37 // 0 /// L11025 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 34 // 100 // 14 // 41 // 0 /// L37973 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 39 // 80 // 13 // 33 // 0
GENSCAN00000040973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35762728:35764054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 100 // 39 // 44 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000060392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:35539362:35539868:1 gene:ENSRNOG00000039408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 91 // 20 // 40 // 0 /// L11025 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 30 // 100 // 13 // 44 // 0 /// L37973 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 36 // 82 // 13 // 36 // 0
GENSCAN00000040973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35762728:35764054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 82 // 100 // 32 // 39 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 87 // 100 // 34 // 39 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 87 // 100 // 34 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000060392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:35539362:35539868:1 gene:ENSRNOG00000039408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 90 // 21 // 35 // 0 /// L11025 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 38 // 100 // 15 // 39 // 0 /// L37973 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 48 // 79 // 15 // 31 // 0
XM_006221951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell receptor alpha chain V region 2B4-like (LOC102556949), mRNA. // chr15 // 81 // 70 // 13 // 16 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000023155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36229986:36235759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000023139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36316834:36317720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000011998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36574340:36588553:1 gene:ENSRNOG00000039306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 45 // 20 // 20 // 0 /// BC099216 // GenBank // Rattus norvegicus similar to T cell receptor V delta 6, mRNA (cDNA clone MGC:116392 IMAGE:7384680), complete cds. // chr15 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36575247:36586869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT020338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT020339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT020343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1
ENSRNOT00000047018 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:36388013:36388624:1 gene:ENSRNOG00000009016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36382468:36388630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT020338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT020339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// Y09171 // GenBank // R.norvegicus TCR alpha joining region, clone-library VA8s2A41. // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
L11030 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001108866 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 4 (Abhd4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 4 (Abhd4), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 4 (Abhd4), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36705478:36717401:1 gene:ENSRNOG00000009244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36705508:36716100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT020354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT020356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001168583 // RefSeq // Rattus norvegicus oxidase (cytochrome c) assembly 1-like (Oxa1l), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36884734:36893489:1 gene:ENSRNOG00000009713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ218860 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YH08 mRNA sequence. // chr15 // 53 // 91 // 16 // 30 // 0 /// FQ228721 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YH12 mRNA sequence. // chr15 // 70 // 91 // 21 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36884684:36893277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT020360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT020362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001108375 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L52 (Mrpl52), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36955394:36958618:1 gene:ENSRNOG00000039297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083892 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7132742. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166922 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L52, mRNA (cDNA clone MGC:188910 IMAGE:6919316), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_031056 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 14 (membrane-inserted) (Mmp14), mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000042938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36960273:36969496:1 gene:ENSRNOG00000010947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000075610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36960282:36969507:1 gene:ENSRNOG00000010947 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC072509 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 14 (membrane-inserted), mRNA (cDNA clone MGC:91652 IMAGE:7103279), complete cds. // chr15 // 94 // 97 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000052245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36960445:36968971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT020371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0
NM_001037777 // RefSeq // Rattus norvegicus low-density lipoprotein receptor-related protein 10 (Lrp10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36993827:36999985:1 gene:ENSRNOG00000011592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC100651 // GenBank // Rattus norvegicus low-density lipoprotein receptor-related protein 10, mRNA (cDNA clone MGC:124814 IMAGE:7932904), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36994224:36999607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT020375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_022685 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS (RAD and GEM) like GTP binding 2 (Rem2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37006429:37010908:1 gene:ENSRNOG00000011646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF084464 // GenBank // Rattus norvegicus GTP-binding protein REM2 (Rem2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AY916790 // GenBank // Rattus norvegicus REM2 (Rem2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// BC127495 // GenBank // Rattus norvegicus RAS (RAD and GEM) like GTP binding 2, mRNA (cDNA clone MGC:156645 IMAGE:8371030), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052256 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37006513:37027944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT020377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001106032 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type, 11 (Psmb11), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37155798:37157346:1 gene:ENSRNOG00000047091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37155807:37156712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006251977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 1700123O20Rik protein (RGD1308430), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000049927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37218216:37222470:1 gene:ENSRNOG00000029146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC158656 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 1700123O20Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:187641 IMAGE:8369089), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001192007 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 25 (Il25), mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37483323:37486157:1 gene:ENSRNOG00000016804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37483323:37489688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001106034 // RefSeq // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 5 (Cmtm5), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37486998:37489784:1 gene:ENSRNOG00000016828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37483323:37489688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001107263 // RefSeq // Rattus norvegicus neuroguidin, EIF4E binding protein (Ngdn), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuroguidin, EIF4E binding protein (Ngdn), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37564770:37571979:1 gene:ENSRNOG00000018069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37564821:37591815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001007682 // RefSeq // Rattus norvegicus thiamine triphosphatase (Thtpa), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37642563:37646200:1 gene:ENSRNOG00000018105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081978 // GenBank // Rattus norvegicus thiamine triphosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:94155 IMAGE:7128058), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001078405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 2 (Dhrs2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_002725093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 2 (Dhrs2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024483 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:37769461:37775515:1 gene:ENSRNOG00000018177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37730321:37775515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_153315 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 4 (Dhrs4), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XR_359914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 4 (Dhrs4), transcript variant X1, misc_RNA. // chr15 // 96 // 78 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024782 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38045928:38057498:1 gene:ENSRNOG00000018239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AB062758 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for carbonyl reductase/NADP-retinol dehydrogenase, complete cds. // chr15 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC070961 // GenBank // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 4, mRNA (cDNA clone MGC:91451 IMAGE:7099044), complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT020415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38046112:38084638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT020417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT020418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT020416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT020419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT020421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001014138 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 16B (Lrrc16b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000032252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38058379:38075410:1 gene:ENSRNOG00000025518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000023010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38046112:38084638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT020422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT020423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1
NM_001191113 // RefSeq // Rattus norvegicus copine VI (neuronal) (Cpne6), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38077840:38084718:1 gene:ENSRNOG00000018399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// XM_006252019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine VI (neuronal) (Cpne6), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000023010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38046112:38084638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 81 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT020428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT020427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT020429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001108377 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoenolpyruvate carboxykinase 2 (mitochondrial) (Pck2), mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025260 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:38106930:38114388:1 gene:ENSRNOG00000018536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// FQ226789 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YG14 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38096725:38111324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001106037 // RefSeq // Rattus norvegicus fat storage-inducing transmembrane protein 1 (Fitm1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38142000:38143269:1 gene:ENSRNOG00000019019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38142015:38149000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_017264 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 1 (Psme1), mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000025887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38146266:38149140:1 gene:ENSRNOG00000019041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC060574 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:72874 IMAGE:6890794), complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// D45249 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proteasome activator rPA28 subunit alpha, complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// FQ215166 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YH15 mRNA sequence. // chr15 // 87 // 88 // 20 // 23 // 0 /// FQ228562 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YN17 mRNA sequence. // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38142015:38149000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001108868 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 31 (Rnf31), mRNA. // chr15 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000026333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38160918:38172580:1 gene:ENSRNOG00000019438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// BC169074 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 31, mRNA (cDNA clone IMAGE:7935699), partial cds. // chr15 // 96 // 55 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38161036:38177954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT020446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT020448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT020449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1
NM_001012041 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 9 (Irf9), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 9 (Irf9), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006251975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon regulatory factor 9 (Irf9), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38173131:38178333:1 gene:ENSRNOG00000019478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC079454 // GenBank // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 9, mRNA (cDNA clone MGC:95006 IMAGE:7121327), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38161036:38177954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000026371 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:38180473:38181505:1 gene:ENSRNOG00000019498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38181150:38181446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 57 // 11 // 12 // 0
NM_001011916 // RefSeq // Rattus norvegicus REC8 meiotic recombination protein (Rec8), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000026430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38187118:38194581:1 gene:ENSRNOG00000019503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// AY529701 // GenBank // Rattus norvegicus meiosis specific sister chromatid cohesion protein (Rec8) mRNA, complete cds. // chr15 // 98 // 98 // 39 // 40 // 0 /// BC079023 // GenBank // Rattus norvegicus REC8 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:93948 IMAGE:7113870), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000023025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38187539:38194553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 73 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT020454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_001271325 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 4 (Tssk4), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NR_073162 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 4 (Tssk4), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006251938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 4 (Tssk4), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000026819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38219023:38221383:1 gene:ENSRNOG00000019789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// BC079202 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific serine kinase 4, mRNA (cDNA clone MGC:94261 IMAGE:7131733), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38219167:38221293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
XM_006251926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanosine monophosphate reductase 2 (Gmpr2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// FQ211507 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YD13 mRNA sequence. // chr15 // 90 // 91 // 27 // 30 // 0 /// NM_001013036 // RefSeq // Rattus norvegicus guanosine monophosphate reductase 2 (Gmpr2), mRNA. // chr15 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000067150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38242891:38252027:1 gene:ENSRNOG00000020216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// BC089848 // GenBank // Rattus norvegicus guanosine monophosphate reductase 2, mRNA (cDNA clone MGC:108877 IMAGE:7374684), complete cds. // chr15 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// GENSCAN00000023001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38229880:38250196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT020459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT020460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT020461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT020462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001106040 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP9 nucleolar protein (Nop9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38320522:38328222:1 gene:ENSRNOG00000020321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38320593:38327967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_053640 // RefSeq // Rattus norvegicus leukotriene B4 receptor 2 (Ltb4r2), mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38335390:38336466:1 gene:ENSRNOG00000020382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB052660 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for second LTB4 receptor JULF2, complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38335390:38341683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT020465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_021656 // RefSeq // Rattus norvegicus leukotriene B4 receptor (Ltb4r), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38340628:38341683:1 gene:ENSRNOG00000020399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38335390:38341683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107264 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 4 (Nfatc4), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38381669:38390744:1 gene:ENSRNOG00000020482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38381806:38433059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
XM_006252031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NYNRIN-like (LOC100912447), mRNA. // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000074659 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:38408648:38428231:1 gene:ENSRNOG00000048431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000041072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38381806:38433059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
XM_006252031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NYNRIN-like (LOC100912447), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074659 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:38408648:38428231:1 gene:ENSRNOG00000048431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38381806:38433059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_006252031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NYNRIN-like (LOC100912447), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003751468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH and NYN domain containing (Khnyn), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_003752800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH and NYN domain containing (Khnyn), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006221938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH and NYN domain containing (Khnyn), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KH and NYN domain containing (Khnyn), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027802 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:38440708:38450025:1 gene:ENSRNOG00000020506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000041079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38440708:38450025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT020474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000048255 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:38473655:38474128:1 gene:ENSRNOG00000039060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 95 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38473655:38474128:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 95 // 19 // 21 // 0
XM_006221953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mast cell protease 4-like 1 (Mcpt4l1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006252039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mast cell protease 4-like 1 (Mcpt4l1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_019321 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell protease 4 (Mcpt4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38644897:38647754:1 gene:ENSRNOG00000024785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// U67907 // GenBank // Rattus norvegicus mast cell protease 4 precursor (RMCP-4) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT020476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000041086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38644910:38648207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
NM_001170466 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell peptidase 3 (Mcpt3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000041631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38686161:38689249:1 gene:ENSRNOG00000029240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// FQ219924 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YN20 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_017145 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell protease 1 (Mcpt1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000027931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38754292:38756878:1 gene:ENSRNOG00000020582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF063851 // GenBank // Rattus norvegicus vascular chymase (VCH) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ220808 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YJ18 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38754356:38775539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NM_021598 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell protease 8 (Mcpt8), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000027950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38581441:38584314:-1 gene:ENSRNOG00000047190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000072426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38534582:38537526:-1 gene:ENSRNOG00000049991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// FQ229669 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YC11 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// U67911 // GenBank // Rattus norvegicus mast cell protease 8 precursor (RMCP-8) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000041064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38499484:38584304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT021373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_017146 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell protease 10 (Mcpt10), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000050844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:6578816:6581777:-1 gene:ENSRNOG00000048767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000015468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:6489691:6669438:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT059396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT059397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_019323 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell protease 9 (Mcpt9), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// U72143 // GenBank // Rattus norvegicus Granzyme J (RNKP-5) mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_172044 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell protease 2 (Mcpt2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000027988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38920069:38922403:1 gene:ENSRNOG00000020625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38920069:38923079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT020478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_133517 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+/K+ transporting, nongastric, alpha polypeptide (Atp12a), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40419506:40444086:1 gene:ENSRNOG00000020685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// M90398 // GenBank // Rat H+,K+-ATPase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U94912 // GenBank // Rattus norvegicus H-K-ATPase alpha 2a subunit (HKalpha2a) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// U94913 // GenBank // Rattus norvegicus H-K-ATPase alpha 2b subunit (HKalpha2b) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40379445:40598221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191685 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 17 (Rnf17), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40463263:40598811:1 gene:ENSRNOG00000008059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40379445:40598221:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000049420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40732115:40799437:1 gene:ENSRNOG00000032888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// GENSCAN00000028112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40681636:40824167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// AY325180 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-008 mRNA, complete cds. // chr15 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT020494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1
ENSRNOT00000049420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40732115:40799437:1 gene:ENSRNOG00000032888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325180 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-008 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000049420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40732115:40799437:1 gene:ENSRNOG00000032888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40681636:40824167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AY325180 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-008 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000049420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40732115:40799437:1 gene:ENSRNOG00000032888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40681636:40824167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325180 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-008 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000049420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40732115:40799437:1 gene:ENSRNOG00000032888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40681636:40824167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325180 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-008 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001017375 // RefSeq // Rattus norvegicus M-phase phosphoprotein 8 (Mphosph8), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40771235:40798798:1 gene:ENSRNOG00000032888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40732115:40799437:1 gene:ENSRNOG00000032888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC099116 // GenBank // Rattus norvegicus M-phase phosphoprotein 8, mRNA (cDNA clone MGC:116256 IMAGE:7462184), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40681636:40824167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AY325180 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-008 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000049420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40732115:40799437:1 gene:ENSRNOG00000032888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325180 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-008 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000038403 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:39925810:39926242:1 gene:ENSRNOG00000022328 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0
XM_001060431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 2 (Zmym2), mRNA. // chr15 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// XM_006252087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 2 (Zmym2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000011684 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:41020722:41075984:1 gene:ENSRNOG00000008734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC091383 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7321020, with apparent retained intron. // chr15 // 100 // 55 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40911728:41075329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT020508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT020509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// NONRATT020511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT020510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT020512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
GENSCAN00000051095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41102982:41148508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
XM_001060945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L23a-like (RGD1565170), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_573792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L23a-like (RGD1565170), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000043836 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:41266075:41266542:1 gene:ENSRNOG00000032148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001107266 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 88 homolog (Chlamydomonas) (Ift88), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 88 homolog (Chlamydomonas) (Ift88), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 88 homolog (Chlamydomonas) (Ift88), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41537251:41630808:1 gene:ENSRNOG00000009278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41543616:41594508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006221958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 17D (Il17d), mRNA. // chr15 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// XM_006252088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 17D (Il17d), mRNA. // chr15 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000054210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41595283:41652578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
ENSRNOT00000074760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41869599:41871108:1 gene:ENSRNOG00000050940 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41869702:41870819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT020520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0
ENSRNOT00000054499 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:15:41895837:41895941:1 gene:ENSRNOG00000036382 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001033685 // RefSeq // Rattus norvegicus Sin3-associated polypeptide 18 (Sap18), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002727811 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone deacetylase complex subunit SAP18-like (RGD1561590), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41910103:41914431:1 gene:ENSRNOG00000010732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:89431901:89432419:1 gene:ENSRNOG00000020771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC104706 // GenBank // Rattus norvegicus Sin3-associated polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:125107 IMAGE:7316605), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ234134 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YA20 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:89431958:89432419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41910171:41914176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT020522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
AY325260 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Bm403207 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC167109 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein 63, mRNA (cDNA clone MGC:189572 IMAGE:6919188), complete cds. // chr15 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000064635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41937753:41938638:1 gene:ENSRNOG00000010855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// FQ226652 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YN23 mRNA sequence. // chr15 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// FQ232036 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YE02 mRNA sequence. // chr15 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NM_001109649 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein 63 (Mrp63), mRNA. // chr15 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT020528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT020529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_012952 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 9 (Fgf9), mRNA. // chr15 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:42176762:42217711:1 gene:ENSRNOG00000011471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC078699 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7124006). // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// D14839 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for the ninth member of the fibroblast growth factor, complete cds. // chr15 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT020533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// GENSCAN00000056494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:42149488:42240769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT020531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001108380 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of chromosome condensation (RCC1) and BTB (POZ) domain containing protein 1 (Rcbtb1), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:43439885:43481994:1 gene:ENSRNOG00000021712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43456602:43474805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT020536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001011917 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium binding protein 39-like (Cab39l), mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:43580647:43669195:1 gene:ENSRNOG00000011603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// BC083684 // GenBank // Rattus norvegicus calcium binding protein 39-like, mRNA (cDNA clone MGC:94538 IMAGE:7188949), complete cds. // chr15 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT020540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT020544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000005461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43580714:43669051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// NONRATT020541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// NONRATT020542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 59 // 59 // 24 // 41 // 1 /// NONRATT020543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// NONRATT020539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
NM_001191936 // RefSeq // Rattus norvegicus shisa family member 2 (Shisa2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:43763011:43767309:1 gene:ENSRNOG00000012521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43763011:43767238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107268 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 6 (Mtmr6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:44371075:44409232:1 gene:ENSRNOG00000012918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44357544:44416432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
XM_006222003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus APC membrane recruitment protein 2 (Amer2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44476884:44478899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018300 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:44476884:44478899:1 gene:ENSRNOG00000013623 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT020553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001191686 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 13 (Spata13), mRNA. // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:44749846:44875232:1 gene:ENSRNOG00000013707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44804236:44838789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001191686 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 13 (Spata13), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 13 (Spata13), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 13 (Spata13), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000018407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:44749846:44875232:1 gene:ENSRNOG00000013707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44855714:44875232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 63 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT020558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001191891 // RefSeq // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 9 (C1qtnf9), mRNA. // chr15 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:44886443:44893075:1 gene:ENSRNOG00000013793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44886546:44892880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_031052 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial intermediate peptidase (Mipep), mRNA. // chr15 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000018845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:44896328:45002041:1 gene:ENSRNOG00000013876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// M96633 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial intermediate peptidase (MIP) mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44896416:44965365:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT020561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
XM_006221973 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (sacsin) (Sacs), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006221974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (sacsin) (Sacs), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (sacsin) (Sacs), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spastic ataxia of Charlevoix-Saguenay (sacsin) (Sacs), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45295350:45336899:1 gene:ENSRNOG00000014509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45295436:45321249:1 gene:ENSRNOG00000014509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075479 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:45295436:45374159:1 gene:ENSRNOG00000014509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000028535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:45274941:45314421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0
NM_001013433 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 11 (Arl11), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45448923:45451069:1 gene:ENSRNOG00000014653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091183 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 11, mRNA (cDNA clone MGC:108833 IMAGE:7365828), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000032631 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:45604125:45604519:1 gene:ENSRNOG00000021843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000047431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:45588574:45604508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001012210 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 13 (Trim13), mRNA. // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 13 (Trim13), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45727569:45735914:1 gene:ENSRNOG00000009075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC088425 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 13, mRNA (cDNA clone MGC:95051 IMAGE:7123847), complete cds. // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 13 (Trim13), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000047430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:45713826:45735902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001191687 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel regulator (Kcnrg), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45738076:45742807:1 gene:ENSRNOG00000021831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222096 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YC05 mRNA sequence. // chr15 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT020573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:45738175:45807467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XR_340676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547503 (LOC102547503), transcript variant X2, ncRNA. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XR_359975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547503 (LOC102547503), transcript variant X2, ncRNA. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:45738175:45807467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT020575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001007007 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit B (Rnaseh2b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit B (Rnaseh2b), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49197430:49240305:1 gene:ENSRNOG00000009192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC083791 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit B, mRNA (cDNA clone MGC:94780 IMAGE:7106440), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit B (Rnaseh2b), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// FQ220108 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YC22 mRNA sequence. // chr15 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// NONRATT020622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT020625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49197440:49247960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
BC079432 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 124A, mRNA (cDNA clone MGC:94979 IMAGE:7114870), complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_001080220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 124A (Fam124a), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XM_002725111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 124A (Fam124a), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000045833 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:49481137:49546175:1 gene:ENSRNOG00000009802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT020627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006222005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serpin peptidase inhibitor, clade E (nexin, plasminogen activator inhibitor type 1), member 3 (Serpine3), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051307 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:49600600:49624633:1 gene:ENSRNOG00000009814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49600600:49607205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001170471 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 13 (Zc3h13), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61051549:61116257:1 gene:ENSRNOG00000011237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61024936:61115548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000057826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49719668:49729406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT020745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001107269 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat and FYVE domain containing 2 (Wdfy2), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat and FYVE domain containing 2 (Wdfy2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000066864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49774557:49900008:1 gene:ENSRNOG00000010042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49861200:49901136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_001037526 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 41 (Defb41), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49945731:49948252:1 gene:ENSRNOG00000038760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY621368 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 41 (Defb41) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037528 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 43 (Defb43), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49962715:49967215:1 gene:ENSRNOG00000038759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621370 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 43 (Defb43) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037529 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 44 (Defb44), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50002354:50003416:1 gene:ENSRNOG00000038757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621371 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 44 (Defb44) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49986449:50012808:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_022597 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin B (Ctsb), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50081535:50102406:1 gene:ENSRNOG00000010331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC072490 // GenBank // Rattus norvegicus cathepsin B, mRNA (cDNA clone MGC:91684 IMAGE:7097817), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT020634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50081916:50102031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT020635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001109102 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 167, member A (Fam167a), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50391387:50405856:1 gene:ENSRNOG00000011316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50391395:50414950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT020642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001012042 // RefSeq // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 6 (Xkr6), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50706269:50932560:1 gene:ENSRNOG00000011634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AY534260 // GenBank // Rattus norvegicus XK-related protein 6 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008488 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06110412.1:46:438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT020643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50836402:50931699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// GENSCAN00000046493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50704485:50706747:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NR_032286 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-598 (Mir598), microRNA. // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073058 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:50816188:50816267:1 gene:ENSRNOG00000046841 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074686 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:50653535:50653614:1 gene:ENSRNOG00000046413 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-598 // miRBase Micro RNA Database // MI0006155 Rattus norvegicus miR-598 stem-loop // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_001083337 // RefSeq // Rattus norvegicus PIN2/TERF1 interacting, telomerase inhibitor 1 (Pinx1), mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50970604:51029711:1 gene:ENSRNOG00000012012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158553 // GenBank // Rattus norvegicus PIN2-interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187218 IMAGE:9088212), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF446165 // GenBank // Rattus norvegicus Pin2-interacting protein X1 (PinX1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// FQ232228 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YJ04 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50934552:51009515:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001106045 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 7 (Sox7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:51053093:51059854:1 gene:ENSRNOG00000012049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:51053174:51069406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031866 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 124-1 (Mir124-1), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000053594 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:51712751:51712835:1 gene:ENSRNOG00000035471 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// RNCR3 // lncRNA Db // rn4 chr15:43,941,969-43,947,942 // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// rno-mir-124-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000893 Rattus norvegicus miR-124-1 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_213626 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 13B (Kif13b), mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000029757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:51779297:51936975:1 gene:ENSRNOG00000013089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000056626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:51840739:51936975:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT020652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
XM_006221981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 9-like (LOC102549712), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XR_360023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 9 (Ints9), misc_RNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:52098924:52157914:1 gene:ENSRNOG00000013459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000056624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52241649:52288113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000056630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52125662:52159751:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001013132 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 16 (Fbxo16), mRNA. // chr15 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// XM_006252201 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 16 (Fbxo16), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:52415892:52465127:1 gene:ENSRNOG00000014003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC062801 // GenBank // Rattus norvegicus F-box protein 16, mRNA (cDNA clone MGC:73012 IMAGE:6889991), complete cds. // chr15 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// FQ214106 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YN16 mRNA sequence. // chr15 // 71 // 100 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52420019:52505454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT020657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT020656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT020658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001107271 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 395 (Zfp395), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:52531127:52542971:1 gene:ENSRNOG00000014191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52530225:52542568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT020663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006221993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear GTPase, germinal center associated (Nuggc), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear GTPase, germinal center associated (Nuggc), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:52756262:52793888:1 gene:ENSRNOG00000018238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000026830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52748072:52793888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001135855 // RefSeq // Rattus norvegicus scavenger receptor class A, member 5 (putative) (Scara5), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:52819510:52910547:1 gene:ENSRNOG00000014398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52829042:52891099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT020663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001079937 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ binding kinase (Pbk), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ binding kinase (Pbk), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006252103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ binding kinase (Pbk), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006252104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ binding kinase (Pbk), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006252105 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ binding kinase (Pbk), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49092280:49103281:-1 gene:ENSRNOG00000015308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC129099 // GenBank // Rattus norvegicus PDZ binding kinase, mRNA (cDNA clone MGC:156686 IMAGE:8375047), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49092830:49102988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT021534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108382 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 25 (Ccdc25), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 25 (Ccdc25), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000021621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49038971:49070547:-1 gene:ENSRNOG00000015939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49040383:49047855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT021533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133420 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 2 (neuronal) (Chrna2), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006252092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 2 (neuronal) (Chrna2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000023475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48768910:48785192:-1 gene:ENSRNOG00000017424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AY574253 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha2 subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// L10077 // GenBank // Rat neuronal nicotinic acetylcholine receptor alpha 2 subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48769001:48777825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT021521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001025142 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 35 (Trim35), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48617501:48633962:-1 gene:ENSRNOG00000009449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085942 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 35, mRNA (cDNA clone MGC:95090 IMAGE:7126503), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48619620:48705327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_017191 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenoceptor alpha 1A (Adra1a), mRNA. // chr15 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006252108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adrenoceptor alpha 1A (Adra1a), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012736 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48203098:48295045:-1 gene:ENSRNOG00000009522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// U07126 // GenBank // Rattus norvegicus alpha1c adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// U13368 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley alpha1C-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT021512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT021511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENSRNOT00000058944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:48052216:48052745:-1 gene:ENSRNOG00000038619 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48052348:48052640:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0
NM_001107272 // RefSeq // Rattus norvegicus paraneoplastic Ma antigen 2 (Pnma2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paraneoplastic Ma antigen 2 (Pnma2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48006292:48013952:-1 gene:ENSRNOG00000009815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033766 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:47729816:47730703:-1 gene:ENSRNOG00000025642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:47729936:47745961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0
NM_001108383 // RefSeq // Rattus norvegicus early B-cell factor 2 (Ebf2), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus early B-cell factor 2 (Ebf2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:47492258:47690729:-1 gene:ENSRNOG00000011548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000055487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:47475193:47568676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// GENSCAN00000055491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:47623056:47709239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NONRATT021506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000026790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:47249124:47267227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001108871 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 9 (Kctd9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:47158099:47185440:-1 gene:ENSRNOG00000012951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ221845 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA30YP14 mRNA sequence. // chr15 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:47159820:47176866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT021503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_012767 // RefSeq // Rattus norvegicus gonadotropin-releasing hormone 1 (luteinizing-releasing hormone) (Gnrh1), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gonadotropin-releasing hormone 1 (luteinizing-releasing hormone) (Gnrh1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:47151131:47155339:-1 gene:ENSRNOG00000013441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M12579 // GenBank // Rat hypothalamic gonadotropin-releasing hormone and prolactin release-inhibiting factor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_031783 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofilament, light polypeptide (Nefl), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:46793526:46797403:-1 gene:ENSRNOG00000013658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF031880 // GenBank // Rattus norvegicus light molecular-weight neurofilament (NF-L) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:46793858:46797334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT021498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
GENSCAN00000006772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:54371750:54400012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 57 // 10 // 12 // 0
NM_031123 // RefSeq // Rattus norvegicus stanniocalcin 1 (Stc1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:54622230:54632873:1 gene:ENSRNOG00000015075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC078803 // GenBank // Rattus norvegicus stanniocalcin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93378 IMAGE:7123665), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U62667 // GenBank // Rattus norvegicus stanniocalcin (rSTC) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:54614751:54633459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001127653 // RefSeq // Rattus norvegicus NK2 homeobox 6 (Nkx2-6), mRNA. // chr15 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000032826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:54764663:54768747:1 gene:ENSRNOG00000021910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// BC160896 // GenBank // Rattus norvegicus NK2 transcription factor related, locus 6 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188338 IMAGE:7453070), complete cds. // chr15 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// GENSCAN00000006773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:54764252:54797633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_001034144 // RefSeq // Rattus norvegicus NK3 homeobox 1 (Nkx3-1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:54796102:54798694:1 gene:ENSRNOG00000015477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100628 // GenBank // Rattus norvegicus NK3 homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:124859 IMAGE:7938032), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY539899 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00148 mRNA, complete cds. // chrX // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006252276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 (Entpd4), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001108384 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 4 (Entpd4), mRNA. // chr15 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000064428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:54952393:54980226:1 gene:ENSRNOG00000016321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000022679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:54924908:54979178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT020674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001106047 // RefSeq // Rattus norvegicus lysyl oxidase-like 2 (Loxl2), mRNA. // chr15 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55059673:55092976:1 gene:ENSRNOG00000016758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC168900 // GenBank // Rattus norvegicus lysyl oxidase-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:189171 IMAGE:9032601), complete cds. // chr15 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55045387:55092869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT020678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0
NM_001108873 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 10b (Tnfrsf10b), mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000066128 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:55161838:55192095:1 gene:ENSRNOG00000038483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// FJ515907 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily member 10b (Tnfrsf10b) mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT020683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000022671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55129451:55191038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
XM_006222065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylethanolamine binding protein 4 (Pebp4), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000039454 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:55261965:55265037:1 gene:ENSRNOG00000026247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000022685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55261971:55268333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000054704 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55338015:55466010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_017086 // RefSeq // Rattus norvegicus early growth response 3 (Egr3), mRNA. // chr15 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus early growth response 3 (Egr3), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000024067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55482581:55485279:1 gene:ENSRNOG00000017828 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC097334 // GenBank // Rattus norvegicus early growth response 3, mRNA (cDNA clone MGC:114342 IMAGE:7456458), complete cds. // chr15 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// U12428 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley zinc-finger transcription factor Egr3/Pilot mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55469548:55485279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT020685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
NM_001013186 // RefSeq // Rattus norvegicus bridging integrator 3 (Bin3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55524836:55544843:1 gene:ENSRNOG00000018023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079146 // GenBank // Rattus norvegicus bridging integrator 3, mRNA (cDNA clone MGC:94161 IMAGE:7128352), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55511103:55544146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT020689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT020690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NR_031945 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 320a (Mir320a), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053752 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:55857793:55857874:1 gene:ENSRNOG00000035629 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-320 // miRBase Micro RNA Database // MI0000972 Rattus norvegicus miR-320 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001017376 // RefSeq // Rattus norvegicus phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein (Phyhip), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein (Phyhip), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006252293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like (LOC102551958), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:56490752:56501997:1 gene:ENSRNOG00000010555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55876356:55882313:1 gene:ENSRNOG00000049071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC092627 // GenBank // Rattus norvegicus phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:109318 IMAGE:7314255), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55876356:55882313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000054926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56439838:56500514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001107277 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat LGI family, member 3 (Lgi3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006252273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat LGI family, member 3 (Lgi3), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55944095:55951223:1 gene:ENSRNOG00000011323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC158671 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeat LGI family, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:8371466), complete cds. // chr15 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// GENSCAN00000001706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55944474:55949930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT020694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT020695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_001025279 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor accessory protein 4 (Reep4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55958424:55962009:1 gene:ENSRNOG00000011373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097957 // GenBank // Rattus norvegicus receptor accessory protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:116080 IMAGE:7462731), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ234004 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YI13 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55959073:55991259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_024364 // RefSeq // Rattus norvegicus hair growth associated (Hr), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000015716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55968992:55984793:1 gene:ENSRNOG00000011427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// U71293 // GenBank // Rattus norvegicus hairless protein mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// NONRATT020699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000001659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55959073:55991259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 76 // 29 // 38 // 1
NM_001100732 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 18 (Nudt18), mRNA. // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000015969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55989072:55991602:1 gene:ENSRNOG00000011831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC082050 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132056), partial cds. // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC158874 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 18, mRNA (cDNA clone MGC:188538 IMAGE:7933460), complete cds. // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000001659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55959073:55991259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT020705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001106048 // RefSeq // Rattus norvegicus docking protein 2 (Dok2), mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006252262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus docking protein 2 (Dok2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006252263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus docking protein 2 (Dok2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000018725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:56176051:56179111:1 gene:ENSRNOG00000013922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56175015:56182032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_012750 // RefSeq // Rattus norvegicus GDNF family receptor alpha 2 (Gfra2), mRNA. // chr15 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:56280942:56372307:1 gene:ENSRNOG00000014010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// AF003825 // GenBank // Rattus norvegicus GDNF receptor-beta mRNA, partial cds. // chr15 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// AF005226 // GenBank // Rattus norvegicus glial cell line-derived neurotrophic factor receptor-beta (GDNFR-beta) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 71 // 24 // 25 // 0 /// U97143 // GenBank // Rattus norvegicus RET ligand 2 (RETL2) mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000001696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56285272:56315422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56359044:56380238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001024865 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L40 (Mrpl40), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:89378582:89384417:1 gene:ENSRNOG00000049686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC097472 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L40, mRNA (cDNA clone MGC:114537 IMAGE:7457772), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000008063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:89377746:89386123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000040177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:58652511:58707144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001045843 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidic acid receptor 6 (Lpar6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:58850070:58851878:1 gene:ENSRNOG00000015577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098703 // GenBank // Rattus norvegicus purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 5, mRNA (cDNA clone MGC:112684 IMAGE:7389453), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:58850679:58851713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 60 // 13 // 15 // 0 /// NONRATT020723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024256 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 4 (Med4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:59128754:59139026:1 gene:ENSRNOG00000017170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC093402 // GenBank // Rattus norvegicus mediator complex subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:112765 IMAGE:7389622), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048910 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:59123316:59138529:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108387 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate-CoA ligase, ADP-forming, beta subunit (Sucla2), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:59183906:59238106:1 gene:ENSRNOG00000017481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000048923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:59183906:59282914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT020727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_017254 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 2A, G protein-coupled (Htr2a), mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:60388152:60456545:1 gene:ENSRNOG00000010063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// M30705 // GenBank // Rat serotonin 5HT2 receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// M64867 // GenBank // Rat serotonin receptor mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// X13971 // GenBank // R.norvegicus mRNA for serotonin receptor 5HT-2. // chr15 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60336826:60454783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 47 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1
NM_001106051 // RefSeq // Rattus norvegicus esterase D (Esd), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NM_001270865 // RefSeq // Rattus norvegicus esterase D (Esd), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NM_001270866 // RefSeq // Rattus norvegicus esterase D (Esd), transcript variant 3, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000013324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:60479262:60498753:1 gene:ENSRNOG00000009512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// BC158790 // GenBank // Rattus norvegicus esterase D/formylglutathione hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:188158 IMAGE:7308742), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// FQ219749 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YE11 mRNA sequence. // chr15 // 94 // 86 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT020731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60469397:60524335:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
XM_001071603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to chromosome 13 open reading frame 18 (RGD1304929), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_224403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to chromosome 13 open reading frame 18 (RGD1304929), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039518 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:60796204:60814555:1 gene:ENSRNOG00000022760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60804264:60816498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT020734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001012044 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte cytosolic protein 1 (Lcp1), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014502 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:60932334:60988849:1 gene:ENSRNOG00000010319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC083855 // GenBank // Rattus norvegicus lymphocyte cytosolic protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95070 IMAGE:7125327), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60951950:60987971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_053617 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase B2 (plasma) (Cpb2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000014909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61001884:61050725:1 gene:ENSRNOG00000010935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC107447 // GenBank // Rattus norvegicus carboxypeptidase B2 (plasma), mRNA (cDNA clone MGC:124950 IMAGE:7323668), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ219645 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YN21 mRNA sequence. // chr15 // 83 // 91 // 25 // 30 // 0 /// AB042598 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for pre-procarboxypeptidase R, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT020737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61024936:61115548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT020738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NONRATT020738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT020737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 1
NM_001170471 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 13 (Zc3h13), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61051549:61116257:1 gene:ENSRNOG00000011237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61024936:61115548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001191118 // RefSeq // Rattus norvegicus siah E3 ubiquitin protein ligase family member 3 (Siah3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61215305:61278376:1 gene:ENSRNOG00000043061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61242318:61278376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
XM_006222021 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911795 (LOC100911795), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006222024 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911795 (LOC100911795), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006222025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911795 (LOC100911795), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006252334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911795 (LOC100911795), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006252337 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911795 (LOC100911795), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006252338 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100911795 (LOC100911795), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030579 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:61417434:61426006:1 gene:ENSRNOG00000022462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61417437:61428196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT020747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NONRATT020748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0
NONRATT020751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
ENSRNOT00000051764 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:61640466:61640778:1 gene:ENSRNOG00000032277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109650 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 4 (Kctd4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61719150:61722354:1 gene:ENSRNOG00000050996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61719335:61720114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007758 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 1 (Nufip1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61872647:61903369:1 gene:ENSRNOG00000001033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC082111 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95323 IMAGE:7135272), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61878565:61905003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT020755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT020756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSRNOT00000032582 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:61904732:61905003:1 gene:ENSRNOG00000022132 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61878565:61905003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_013043 // RefSeq // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 1 (Tsc22d1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000001360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:62345358:62348598:1 gene:ENSRNOG00000001030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// BC059146 // GenBank // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6918096), complete cds. // chr15 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// BC127547 // GenBank // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7325048), complete cds. // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// FQ214015 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YE20 mRNA sequence. // chr15 // 83 // 43 // 10 // 12 // 0 /// L25785 // GenBank // Rattus norvegicus (TSC-22) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NM_001109912 // RefSeq // Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 1 (Tsc22d1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000058206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:62249980:62348598:1 gene:ENSRNOG00000001030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// XM_006252340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TSC22 domain family, member 1 (Tsc22d1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000025206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:62194798:62274537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT020759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT020762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
XM_006222032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 (Enox1), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// XM_006252360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ecto-NOX disulfide-thiol exchanger 1 (Enox1), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000030097 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:62915601:62960799:1 gene:ENSRNOG00000042404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:63013560:63564417:1 gene:ENSRNOG00000047817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000074868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:63013560:63564417:1 gene:ENSRNOG00000047817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// FQ222793 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA19YN23 mRNA sequence. // chr15 // 97 // 71 // 28 // 29 // 0 /// XM_002728275 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 122 (Ccdc122), mRNA. // chr15 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// XM_003752829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 122 (Ccdc122), mRNA. // chr15 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1 /// GENSCAN00000039017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:63412813:63492046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// GENSCAN00000039009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:63504852:63563591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// NONRATT020773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
NM_001044257 // RefSeq // Rattus norvegicus epithelial stromal interaction 1 (breast) (Epsti1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:63762909:63865563:1 gene:ENSRNOG00000009471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091212 // GenBank // Rattus norvegicus epithelial stromal interaction 1 (breast), mRNA (cDNA clone MGC:108925 IMAGE:7381964), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000024970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:64097213:64118852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000024977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:64121437:64125175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 91 // 10 // 11 // 1
GENSCAN00000030238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:64357011:64363313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
XM_006252373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 8 (Vwa8), mRNA. // chr15 // 100 // 27 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000013780 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:64930197:65131503:1 gene:ENSRNOG00000010216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000070840 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:64847113:64892554:1 gene:ENSRNOG00000010216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 22 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000074956 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:64847113:64956902:1 gene:ENSRNOG00000010216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 18 // 18 // 0 /// BC083871 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7128439. // chr15 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1 /// GENSCAN00000045302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:64796593:64965764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 38 // 38 // 17 // 45 // 1 /// GENSCAN00000045329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65019443:65057983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1 /// NONRATT020776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1 /// NONRATT020779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 24 // 24 // 11 // 45 // 1
ENSRNOT00000072629 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:64964452:64965764:1 gene:ENSRNOG00000049690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000045302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:64796593:64965764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT020776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 85 // 57 // 11 // 13 // 0
ENSRNOT00000058069 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:65475875:65478434:1 gene:ENSRNOG00000038156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65477775:65530660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NM_053520 // RefSeq // Rattus norvegicus E74-like factor 1 (Elf1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E74-like factor 1 (Elf1), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65490135:65531085:1 gene:ENSRNOG00000011762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AB030216 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transcription factor Elf-1, complete cds. // chr15 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// AB030217 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transcription factor Elf-1, complete cds. // chr15 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// AB046531 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Ets-family transcription factor ELF1, complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// FQ221456 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA36YB18 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65477775:65530660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AB030215 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transcription factor Elf-1, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT020781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001013051 // RefSeq // Rattus norvegicus SGT1, suppressor of G2 allele of SKP1 (S. cerevisiae) (Sugt1), mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65536894:65577747:1 gene:ENSRNOG00000012594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC158724 // GenBank // Rattus norvegicus SGT1, suppressor of G2 allele of SKP1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187875 IMAGE:9090831), complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// FQ232174 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YL23 mRNA sequence. // chr15 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65542920:65577635:1 gene:ENSRNOG00000012594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// AY318960 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa1114 mRNA, complete cds. // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT020784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NR_032768 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-759 (Mir759), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000062134 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:65686082:65686178:1 gene:ENSRNOG00000040381 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-759 // miRBase Micro RNA Database // MI0012618 Rattus norvegicus miR-759 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_340788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552858 (LOC102552858), ncRNA. // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// XR_360103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552858 (LOC102552858), ncRNA. // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001106052 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactomedin 4 (Olfm4), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:66064452:66086655:1 gene:ENSRNOG00000013280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:66025023:66085488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001047879 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3100001N19 (LOC306079), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000040851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:66175916:66187138:1 gene:ENSRNOG00000031061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000014870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:66113190:66187138:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT020789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001012045 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 6 (Kbtbd6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015517 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65356638:65358107:1 gene:ENSRNOG00000011657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65395106:65396863:1 gene:ENSRNOG00000047604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC086326 // GenBank // Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:105795 IMAGE:7114652), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65356638:65358596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65395357:65396826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000058010 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:69802435:69802758:1 gene:ENSRNOG00000038122 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:69802435:69802758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107279 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin 17 (Pcdh17), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin 17 (Pcdh17), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:71182073:71271037:1 gene:ENSRNOG00000008970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:71269199:71270204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000054593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:71179665:71206174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT020792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001012043 // RefSeq // Rattus norvegicus tudor domain containing 3 (Tdrd3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:74335410:74462431:1 gene:ENSRNOG00000009034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC081929 // GenBank // Rattus norvegicus tudor domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:93931 IMAGE:7113366), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:74371089:74441818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT020794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
GENSCAN00000028358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:74858246:74926454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
GENSCAN00000028363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:75222738:75246531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001106053 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921530L21 (RGD1306441), mRNA. // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// XM_006252385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921530L21 (RGD1306441), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// XM_006252386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921530L21 (RGD1306441), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:83580722:83581798:1 gene:ENSRNOG00000031449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// BC079439 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921530L21 (predicted), mRNA (cDNA clone IMAGE:7115401). // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:83580835:83581659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT020806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT020805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
ENSRNOT00000039721 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:84302238:84302934:1 gene:ENSRNOG00000023707 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:84302256:84302894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_019149 // RefSeq // Rattus norvegicus matrin 3 (Matr3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28074392:28103826:1 gene:ENSRNOG00000019875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB205483 // GenBank // Rattus norvegicus P130/MAT3 mRNA for nuclear scaffold protein P130/MAT3, complete cds. // chr15 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// M63485 // GenBank // Rattus norvegicus matrin 3 mRNA, complete cds. // chr15 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27958992:28102824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:84983039:84985714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:126982100:126985688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT025733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT025729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT025734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT025735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT025740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
GENSCAN00000020361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:85268661:85269441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000047228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:85727949:85728233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001013997 // RefSeq // Rattus norvegicus bora, aurora kinase A activator (Bora), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:86953494:86975023:1 gene:ENSRNOG00000024798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:86946444:86973966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT020811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
ENSRNOT00000012239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:87005567:87018252:1 gene:ENSRNOG00000009208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 26 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000036350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:87005567:87327709:1 gene:ENSRNOG00000009208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:87006678:87171814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// FQ210517 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YF05 mRNA sequence. // chr15 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// FQ233410 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YP19 mRNA sequence. // chr15 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1 /// NONRATT020814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1 /// NONRATT020816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT020813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_053394 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 5 (Klf5), mRNA. // chr15 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// XM_006252403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 5 (Klf5), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000057843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:87216663:87231849:1 gene:ENSRNOG00000008785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// BC081758 // GenBank // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 5, mRNA (cDNA clone MGC:93308 IMAGE:7132572), complete cds. // chr15 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT020819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT020818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
ENSRNOT00000033709 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:87443841:87444636:1 gene:ENSRNOG00000024599 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT020821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0
NM_001110165 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal esterase L3 (ubiquitin thiolesterase) (Uchl3), mRNA. // chr15 // 91 // 92 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000012842 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:89919807:89964085:1 gene:ENSRNOG00000009530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 78 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000028960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:177158973:177200824:-1 gene:ENSRNOG00000046120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AB043959 // GenBank // Rattus norvegicus uchl3 mRNA for ubiqutin carboxyl-terminal hydrolase l3, complete cds. // chr15 // 84 // 89 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:89919295:89964085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:177159115:177200824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001001515 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain 7 (Lmo7), mRNA. // chr15 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// XM_006252394 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain 7 (Lmo7), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000032917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:87780478:87996342:1 gene:ENSRNOG00000009702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AY533473 // GenBank // Rattus norvegicus LMO7a mRNA, complete cds. // chr15 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// AY533474 // GenBank // Rattus norvegicus LMO7b mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 85 // 21 // 23 // 0 /// AY609384 // GenBank // Rattus norvegicus P100 LMO7 variant protein mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr15 // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000000084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:87923784:87996412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT020822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107282 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoresponsive gene 1 (Irg1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus immunoresponsive gene 1 (Irg1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000013182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:97100761:97109707:1 gene:ENSRNOG00000009919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:97062789:97109146:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT020852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191689 // RefSeq // Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis, neuronal 5 (Cln5), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006224071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog (RGD1564125), mRNA. // chr2 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// XM_006232077 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog (RGD1564125), partial mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:86329690:86336522:-1 gene:ENSRNOG00000009759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000021749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:86329826:86336574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000056831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:97122608:97128000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT020853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001108388 // RefSeq // Rattus norvegicus sciellin (Scel), mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:91201297:91315614:1 gene:ENSRNOG00000024237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT020835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:91262474:91314903:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT020834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001014139 // RefSeq // Rattus norvegicus SLAIN motif family, member 1 (Slain1), mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:91364574:91401697:1 gene:ENSRNOG00000024125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC088867 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 9630044O09Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:105641 IMAGE:7320965), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:91378427:91414389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// NONRATT020836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT020837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT020838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT020839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
ENSRNOT00000013021 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:92606567:92608432:1 gene:ENSRNOG00000009732 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:92606771:92621187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_001108390 // RefSeq // Rattus norvegicus Nedd4 family interacting protein 2 (Ndfip2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252429 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Nedd4 family interacting protein 2 (Ndfip2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000039423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:92899714:92951232:1 gene:ENSRNOG00000024022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:92899814:92950314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
ENSRNOT00000013326 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:93152951:93159162:1 gene:ENSRNOG00000010044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:93152693:93159125:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_001106056 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 52 (Trim52), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_360172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 52 (Trim52), transcript variant X4, misc_RNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:93853538:93855217:1 gene:ENSRNOG00000024509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:93750982:93855141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT041930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
NONRATT041441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 75 // 80 // 15 // 20 // 0 /// NONRATT041929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000012211 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:97004985:97005480:1 gene:ENSRNOG00000009215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:97005192:97005479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107284 // RefSeq // Rattus norvegicus SLIT and NTRK-like family, member 5 (Slitrk5), mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006252447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SLIT and NTRK-like family, member 5 (Slitrk5), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000012785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:100299987:100304808:1 gene:ENSRNOG00000009649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:100295748:100302880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT020856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NR_031818 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-17-1 (Mir17-1), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000053780 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:103640902:103640985:1 gene:ENSRNOG00000035657 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// rno-mir-17-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000845 Rattus norvegicus miR-17-1 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NR_031819 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 18a (Mir18a), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053768 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:103641038:103641133:1 gene:ENSRNOG00000035645 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-18a // miRBase Micro RNA Database // MI0000846 Rattus norvegicus miR-18a stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031822 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 19a (Mir19a), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053701 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:103641185:103641266:1 gene:ENSRNOG00000035578 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-19a // miRBase Micro RNA Database // MI0000849 Rattus norvegicus miR-19a stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_031793 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 20a (Mir20a), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053728 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:103641357:103641441:1 gene:ENSRNOG00000035605 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-20a // miRBase Micro RNA Database // MI0000638 Rattus norvegicus miR-20a stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031820 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 19b-1 (Mir19b1), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053585 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:15:103641487:103641573:1 gene:ENSRNOG00000035462 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-19b-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000847 Rattus norvegicus miR-19b-1 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107285 // RefSeq // Rattus norvegicus glypican 5 (Gpc5), mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000057664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:104018023:104084185:1 gene:ENSRNOG00000008631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT020862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0
XM_002725130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Glypican-6 precursor (LOC691984), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003751533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Glypican-6 precursor (LOC691984), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:106077528:106254924:1 gene:ENSRNOG00000031435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072531 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:106497423:106607464:1 gene:ENSRNOG00000046660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000074982 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:106497423:106607464:1 gene:ENSRNOG00000046660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT020867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT020870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001006994 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 180 (Gpr180), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:106783002:106806560:1 gene:ENSRNOG00000009766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC083689 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 180, mRNA (cDNA clone MGC:94555 IMAGE:7189368), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:106783036:106872048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT020872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001106058 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 10 (Cldn10), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claudin 10 (Cldn10), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claudin 10 (Cldn10), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107450003:107539150:1 gene:ENSRNOG00000010085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC158829 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 10, mRNA (cDNA clone IMAGE:7378907), partial cds. // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000012500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107518598:107531116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000012508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107536536:107538929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT020875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_022232 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 3 (Dnajc3), mRNA. // chr15 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000014182 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107610234:107649355:1 gene:ENSRNOG00000010352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB017702 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for protein kinase inhibitor p58, complete cds. // chr15 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC061764 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:5621087), partial cds. // chr15 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107610329:107649257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT020877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001271404 // RefSeq // Rattus norvegicus heparan sulfate 6-O-sulfotransferase 3 (Hs6st3), mRNA. // chr15 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000057567 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:107871179:107872025:1 gene:ENSRNOG00000037886 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107869774:107888967:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0
NM_001111064 // RefSeq // Rattus norvegicus muscleblind-like splicing regulator 2 (Mbnl2), mRNA. // chr15 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:109043305:109175502:1 gene:ENSRNOG00000010737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT020881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT020885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT020886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_053741 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS related protein 2a (Rap2a), mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:109253818:109254308:1 gene:ENSRNOG00000023687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AY037826 // GenBank // Rattus norvegicus rap2A-like protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:109253823:109254367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT020890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT020891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000014590 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:109385404:109386209:1 gene:ENSRNOG00000010979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:109385404:109473912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
XM_006222061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus importin 5 (Ipo5), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus importin 5 (Ipo5), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:109653549:109688633:1 gene:ENSRNOG00000010989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:109653549:109688633:1 gene:ENSRNOG00000010989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT020895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:109653549:109680735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001107287 // RefSeq // Rattus norvegicus FERM, RhoGEF (Arhgef) and pleckstrin domain protein 1 (chondrocyte-derived) (Farp1), mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:109829728:110020013:1 gene:ENSRNOG00000011203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:109985528:110019901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000021807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:109945156:109980793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT020897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001034937 // RefSeq // Rattus norvegicus UBA domain containing 2 (Ubac2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000016986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111674945:111821085:1 gene:ENSRNOG00000012710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000057469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111706220:111821085:1 gene:ENSRNOG00000012710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// BC105842 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglycerate dehydrogenase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:125241 IMAGE:7455960), complete cds. // chr15 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 82 // 82 // 32 // 39 // 1 /// NONRATT020908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1
NM_001109429 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 8A2 (Timm8a2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111840703:111844364:1 gene:ENSRNOG00000013835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:111840704:111840997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005554 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily member 2 (Tm9sf2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000017211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111913765:111967206:1 gene:ENSRNOG00000012751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC081873 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily member 2, mRNA (cDNA clone MGC:93724 IMAGE:7107003), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:111913930:111966590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001100685 // RefSeq // Rattus norvegicus citrate lyase beta like (Clybl), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111996346:112224034:1 gene:ENSRNOG00000014075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111996346:112224034:1 gene:ENSRNOG00000014075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:112171582:112231712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT020917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001108392 // RefSeq // Rattus norvegicus Zic family member 2 (Zic2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252510 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Zic family member 2 (Zic2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000066195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:112296546:112301371:1 gene:ENSRNOG00000014397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:112296787:112303352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT020920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_019330 // RefSeq // Rattus norvegicus propionyl CoA carboxylase, alpha polypeptide (Pcca), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019144 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:112346187:112687786:1 gene:ENSRNOG00000014146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000057429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:112346187:112687786:1 gene:ENSRNOG00000014146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// M22631 // GenBank // Rat alpha-propionyl-CoA carboxylase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT020926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000042305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:112390726:112622654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_153630 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium leak channel, non-selective (Nalcn), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:113117194:113455059:-1 gene:ENSRNOG00000004752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000057404 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:113117194:113455059:-1 gene:ENSRNOG00000004752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF078779 // GenBank // Rattus norvegicus putative four repeat ion channel mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY555273 // GenBank // Rattus norvegicus four domain-type voltage-gated ion channel alpha-1 subunit (Nca) mRNA, complete cds. // chr15 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// EF427668 // GenBank // Rattus norvegicus brain voltage-gated cation channel mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// EF492985 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley brain voltage-gated cation channel mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:113215562:113432552:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NM_001017505 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, beta-like 1 (Itgbl1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:113495871:113759207:1 gene:ENSRNOG00000004516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC087076 // GenBank // Rattus norvegicus integrin, beta-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94470 IMAGE:7134947), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:113588312:113629230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT020930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000028659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:113636642:113758542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001109441 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Protein C10orf11 homolog (LOC681383), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Protein C10orf11 homolog (LOC681383), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006251619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Protein C10orf11 homolog (LOC681383), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XR_359781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Protein C10orf11 homolog (LOC681383), transcript variant X4, misc_RNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XR_359782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Protein C10orf11 homolog (LOC681383), transcript variant X5, misc_RNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000065603 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:1718966:1737760:-1 gene:ENSRNOG00000040171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// XM_006251618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Protein C10orf11 homolog (LOC681383), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT020933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_031354 // RefSeq // Rattus norvegicus voltage-dependent anion channel 2 (Vdac2), mRNA. // chr15 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:2615637:2629307:-1 gene:ENSRNOG00000013505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// AB039663 // GenBank // Rattus norvegicus VDAC2 mRNA for mitochondrial voltage dependent anion channel, complete cds. // chr15 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// XM_006251661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus voltage-dependent anion channel 2 (Vdac2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// AF268468 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent anion channel 2 (VDAC2) mRNA, complete cds. // chr15 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// BC063164 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent anion channel 2, mRNA (cDNA clone MGC:72774 IMAGE:6921675), complete cds. // chr15 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// FQ214165 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YH21 mRNA sequence. // chr15 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONRATT020937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT020939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT020940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// GENSCAN00000036593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2616278:2659069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001012040 // RefSeq // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 8 (Samd8), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:2670863:2712120:-1 gene:ENSRNOG00000013236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC082100 // GenBank // Rattus norvegicus sterile alpha motif domain containing 8, mRNA (cDNA clone MGC:95292 IMAGE:7134467), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// FQ219794 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YE20 mRNA sequence. // chr15 // 85 // 93 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:2671136:2712079:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT020944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006221891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone acetyltransferase KAT6B-like (RGD1566399), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000070893 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:2794421:2945373:-1 gene:ENSRNOG00000012850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT020945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_012895 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine kinase (Adk), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000016709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:3011936:3414198:-1 gene:ENSRNOG00000012325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC081712 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:93119 IMAGE:7193044), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// FQ218123 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YP18 mRNA sequence. // chr15 // 86 // 60 // 18 // 21 // 0 /// FQ225093 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YC17 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// U57042 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine kinase mRNA, complete cds. // chr15 // 79 // 80 // 22 // 28 // 0 /// U90340 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine kinase mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT020946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT020947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 60 // 60 // 21 // 35 // 1
NM_001107248 // RefSeq // Rattus norvegicus vinculin (Vcl), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000015179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:3433521:3522277:-1 gene:ENSRNOG00000010765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 91 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000050729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:3433627:3482327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT020950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0
NM_013085 // RefSeq // Rattus norvegicus plasminogen activator, urokinase (Plau), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000014273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:3621553:3627467:-1 gene:ENSRNOG00000010516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC105859 // GenBank // Rattus norvegicus plasminogen activator, urokinase, mRNA (cDNA clone MGC:124931 IMAGE:7456771), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// X63434 // GenBank // R.norvegicus mRNA for urokinase-type plasminogen activator. // chr15 // 86 // 100 // 30 // 35 // 0 /// GENSCAN00000026348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:3621931:3627090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// NONRATT020954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_001271275 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 8 (Zswim8), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:3737671:3749885:-1 gene:ENSRNOG00000009596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000063831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:3737671:3749885:-1 gene:ENSRNOG00000009596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:3738315:3744411:-1 gene:ENSRNOG00000009596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000026358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:3737671:3749884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT020955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT020957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001108369 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 (Chchd1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8126681:8127855:-1 gene:ENSRNOG00000009297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168773 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188920 IMAGE:6920789), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8122771:8127832:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_173308 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosyltransferase 11 (alpha (1,3) fucosyltransferase) (Fut11), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8132712:8136310:-1 gene:ENSRNOG00000009274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ535753 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for putative alpha3-fucosyltransferase (fut11 gene). // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC079316 // GenBank // Rattus norvegicus fucosyltransferase 11 (alpha (1,3) fucosyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:94472 IMAGE:7135022), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000042786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8132727:8136265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001109456 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC24 family member C (Sec24c), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// XM_006251658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEC24 family member C (Sec24c), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8136414:8158375:-1 gene:ENSRNOG00000009042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// BC168663 // GenBank // Rattus norvegicus similar to SEC24 related gene family, member C, mRNA (cDNA clone MGC:188425 IMAGE:7931717), complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000042812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8137503:8156731:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT020965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001013878 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 149, member B1 (Fam149b1), mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8463360:8500617:-1 gene:ENSRNOG00000006554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC087126 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 149, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:94893 IMAGE:7111155), complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008932 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8472532:8501189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT020970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT020972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001012005 // RefSeq // Rattus norvegicus nidogen 2 (osteonidogen) (Nid2), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000000383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:8984788:9041180:-1 gene:ENSRNOG00000000341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// BC088325 // GenBank // Rattus norvegicus nidogen 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7364935), complete cds. // chr15 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// BC169012 // GenBank // Rattus norvegicus nidogen 2, mRNA (cDNA clone MGC:189380 IMAGE:9022732), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000048404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:8985200:9041157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT020977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT020978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT020979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1 /// NONRATT020981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT020980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_001013992 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 385D (Zfp385d), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006251688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 385D (Zfp385d), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006251691 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 385D (Zfp385d), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:10266313:10653490:-1 gene:ENSRNOG00000014661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT020993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000023248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:11958481:11960281:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001107252 // RefSeq // Rattus norvegicus NFKB inhibitor interacting Ras-like 1 (Nkiras1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:12240425:12245726:-1 gene:ENSRNOG00000008565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC169080 // GenBank // Rattus norvegicus NFKB inhibitor interacting Ras-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:189482 IMAGE:5623298), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211880 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YI18 mRNA sequence. // chr15 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:12242802:12246878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT020999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031529 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid receptor, beta (Rarb), mRNA. // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// XM_006251701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid receptor, beta (Rarb), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000033048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:14166625:14306790:1 gene:ENSRNOG00000024061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000036872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:13963828:14306790:1 gene:ENSRNOG00000024061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000065435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:13963828:14306790:1 gene:ENSRNOG00000024061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT020133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:14166822:14231510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_031529 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid receptor, beta (Rarb), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:14166625:14306790:1 gene:ENSRNOG00000024061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:14166822:14231510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014136 // RefSeq // Rattus norvegicus N-glycanase 1 (Ngly1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:14450836:14501356:-1 gene:ENSRNOG00000006143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083837 // GenBank // Rattus norvegicus N-glycanase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94949 IMAGE:7113173), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:14456640:14501301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT021002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT021004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT021006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000039924 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:14591555:14592768:-1 gene:ENSRNOG00000033834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:14591540:14639962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
XM_006251721 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 10 (Nek10), mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:15674645:15804446:-1 gene:ENSRNOG00000005883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:15671472:15851264:-1 gene:ENSRNOG00000005883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:15709988:15851264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
XM_006251721 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 10 (Nek10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:15674645:15804446:-1 gene:ENSRNOG00000005883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:15671472:15851264:-1 gene:ENSRNOG00000005883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006251721 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 10 (Nek10), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000030991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:15671472:15851264:-1 gene:ENSRNOG00000005883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000016750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:15709988:15851264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT021012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1
NM_001000088 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1605 (Olr1605), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:16165180:16166148:-1 gene:ENSRNOG00000021557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:15949897:16168858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT021017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000502 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1606 (Olr1606), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:16294146:16295099:-1 gene:ENSRNOG00000006734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16294146:16295099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006251726 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7 (Atxn7), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006251728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ataxin 7 (Atxn7), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000010103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:16456718:16543614:-1 gene:ENSRNOG00000007246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16452469:16474961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT021020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
XR_340558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550375 (LOC102550375), ncRNA. // chr15 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// XR_359832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550375 (LOC102550375), ncRNA. // chr15 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000029140 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:16612214:16630483:-1 gene:ENSRNOG00000027633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16612178:16630483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001063506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein-like (LOC685367), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_003751444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein-like (LOC100910341), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_003752785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein-like (LOC685367), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000072561 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:16751039:16751473:-1 gene:ENSRNOG00000050299 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000073371 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:16739725:16740159:-1 gene:ENSRNOG00000045812 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16751039:16751473:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000020130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16739725:16740159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001109098 // RefSeq // Rattus norvegicus sentan, cilia apical structure protein (Sntn), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000039347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:18501194:18514256:-1 gene:ENSRNOG00000027383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_023974 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptoporin (Synpr), mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:18562899:18741366:-1 gene:ENSRNOG00000008203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF306459 // GenBank // Rattus norvegicus synaptorin mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptoporin (Synpr), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// NONRATT021044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT021045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT021047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
ENSRNOT00000041291 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:19626766:19627742:-1 gene:ENSRNOG00000031694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000055608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:19626766:19633511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000033248 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:16939456:16939836:-1 gene:ENSRNOG00000027237 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 79 // 95 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000020092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16932110:16939836:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 95 // 17 // 19 // 0
NM_134356 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, G (Ptprg), mRNA. // chr15 // 94 // 84 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:16953386:17647514:-1 gene:ENSRNOG00000009419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// AY177703 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-like protein tyrosine phosphatase gamma A-type isoform mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 84 // 29 // 31 // 0 /// AY177704 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-like protein tyrosine phosphatase gamma B-type isoform mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 81 // 28 // 30 // 0 /// AY177705 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-like protein tyrosine phosphatase gamma C-type isoform mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 62 // 22 // 23 // 0 /// AY177706 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-like protein tyrosine phosphatase gamma S-type isoform mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 30 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000003371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:16953386:17091476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 51 // 51 // 19 // 37 // 1
GENSCAN00000012450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:18150414:18151826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000009426 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:20813819:20815074:-1 gene:ENSRNOG00000029224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 89 // 90 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000042661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:20759188:20815074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001107253 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 6 (Kctd6), mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22452635:22456037:-1 gene:ENSRNOG00000007817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC158799 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel tetramerisation domain containing 6, mRNA (cDNA clone IMAGE:7318329), partial cds. // chr15 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT021053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001047931 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00055 (LOC498460), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22484018:22488995:-1 gene:ENSRNOG00000028821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_182821 // RefSeq // Rattus norvegicus PX domain containing serine/threonine kinase (Pxk), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000010763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22515247:22583048:-1 gene:ENSRNOG00000008024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AY327408 // GenBank // Rattus norvegicus PX serine/threonine kinase (Pxk) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC098901 // GenBank // Rattus norvegicus PX domain containing serine/threonine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:114238 IMAGE:7127537), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// XM_006251777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PX domain containing serine/threonine kinase (Pxk), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 85 // 85 // 34 // 40 // 1 /// GENSCAN00000033724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22515583:22593457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1
NM_001108372 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 14 subunit (Rpp14), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001141929 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 14 subunit (Rpp14), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061123 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:22593558:22598956:-1 gene:ENSRNOG00000039829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001007680 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 6 (Abhd6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22614365:22661344:-1 gene:ENSRNOG00000008167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083826 // GenBank // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:94917 IMAGE:7112208), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ219067 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YP10 mRNA sequence. // chr15 // 83 // 38 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000033709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22615480:22641866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107288 // RefSeq // Rattus norvegicus filamin B, beta (Flnb), mRNA. // chr15 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000066546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22716610:22849363:-1 gene:ENSRNOG00000009470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 98 // 46 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000012796 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:21940054:21975677:-1 gene:ENSRNOG00000050900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 42 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000033714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22717609:22801310:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 94 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000057892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:21940048:21985746:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 44 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT021065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0
ENSRNOT00000031100 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:22961799:22962052:-1 gene:ENSRNOG00000022642 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22961537:22971959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003751447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cirhin-like (LOC289953), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_003752786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cirhin-like (LOC289953), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22975122:22976952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_003751447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cirhin-like (LOC289953), mRNA. // chr15 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// XM_003752786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cirhin-like (LOC289953), mRNA. // chr15 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000052712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22975122:22976952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
ENSRNOT00000030280 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:22981001:22981972:-1 gene:ENSRNOG00000009874 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22980995:22982981:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
XM_006221901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (UBC7 homolog, C. elegans)-like (LOC100363427), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 1 (UBC7 homolog, C. elegans)-like (LOC100363427), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2 G1-like (LOC100909665), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073793 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:23017660:23075852:-1 gene:ENSRNOG00000047502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23018783:23023298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000039197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:9203711:9205028:1 gene:ENSRNOG00000026456 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 67 // 86 // 20 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9179473:9181593:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 69 // 46 // 11 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9202429:9204549:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 69 // 46 // 11 // 16 // 0 /// NONRATT020105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 62 // 83 // 18 // 29 // 0
NM_001135164 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin D2 receptor-like (Ptgdr), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000042545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:22064758:22073554:-1 gene:ENSRNOG00000031535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AF120101 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin D2 receptor mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ222068 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YH07 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000057894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:22066550:22208586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT021051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000039197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:9203711:9205028:1 gene:ENSRNOG00000026456 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 61 // 100 // 20 // 33 // 0 /// GENSCAN00000048407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9179473:9181593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 61 // 12 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:9202429:9204549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 61 // 12 // 20 // 0 /// NONRATT020105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 61 // 100 // 20 // 33 // 0
XM_001072487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 16 (Txndc16), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// XM_006221905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 16 (Txndc16), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000008372 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:23438880:23507088:-1 gene:ENSRNOG00000006334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000057065 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23447071:23490379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 39 // 14 // 15 // 0
ENSRNOT00000043897 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:23540606:23541007:-1 gene:ENSRNOG00000031251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000057081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23540606:23541007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_138528 // RefSeq // Rattus norvegicus ERO1-like (S. cerevisiae) (Ero1l), mRNA. // chr15 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000009404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23583076:23620342:-1 gene:ENSRNOG00000006462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// AF489855 // GenBank // Rattus norvegicus endoplasmic oxidoreductase 1 mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// AY071924 // GenBank // Rattus norvegicus oxidoreductase ERO1-L mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr15 // 84 // 100 // 32 // 38 // 0 /// AY071925 // GenBank // Rattus norvegicus oxidoreductase ERO1 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr15 // 80 // 79 // 24 // 30 // 0 /// BC071175 // GenBank // Rattus norvegicus ERO1-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:7099384), partial cds. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT021072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000057073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23592453:23620342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_001134756 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 (Gnpnat1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_001134757 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1 (Gnpnat1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000012036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23685449:23697742:-1 gene:ENSRNOG00000008641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC160861 // GenBank // Rattus norvegicus glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:188219 IMAGE:7322586), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// FQ222000 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YD19 mRNA sequence. // chr15 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT021074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT021075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000057069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23689530:23693661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
NM_001011915 // RefSeq // Rattus norvegicus fermitin family member 2 (Fermt2), mRNA. // chr15 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23771818:23840399:-1 gene:ENSRNOG00000009102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC083876 // GenBank // Rattus norvegicus fermitin family homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:95154 IMAGE:7129898), complete cds. // chr15 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT021076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23761524:23823696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT021079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_001033066 // RefSeq // Rattus norvegicus DDHD domain containing 1 (Ddhd1), mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23929560:23996564:-1 gene:ENSRNOG00000009481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC103649 // GenBank // Rattus norvegicus DDHD domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:125147 IMAGE:7314879), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23930329:23996495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_012827 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 4 (Bmp4), mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:24735177:24738725:-1 gene:ENSRNOG00000009694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// AY184241 // GenBank // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 4 (Bmp4) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC078901 // GenBank // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:93647 IMAGE:7121295), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// Z22607 // GenBank // R.norvegicus bone morphogenetic protein 4 mRNA. // chr15 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:24730549:24743116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT021087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT021088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001106029 // RefSeq // Rattus norvegicus cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1 (Cnih1), mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:27512057:27523878:-1 gene:ENSRNOG00000009811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC158747 // GenBank // Rattus norvegicus cornichon homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:187928 IMAGE:9101224), complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ222749 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA1YG23 mRNA sequence. // chr15 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT021090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000027627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:27481284:27523799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_031032 // RefSeq // Rattus norvegicus glia maturation factor, beta (Gmfb), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000075602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:27541339:27554439:-1 gene:ENSRNOG00000047250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081778 // GenBank // Rattus norvegicus glia maturation factor, beta, mRNA (cDNA clone MGC:93372 IMAGE:7192655), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ222145 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA28YD06 mRNA sequence. // chr15 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:27544891:27547706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT021091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT021094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_024356 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP cyclohydrolase 1 (Gch1), mRNA. // chr15 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:27876253:27910213:-1 gene:ENSRNOG00000011039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ220953 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YB13 mRNA sequence. // chr15 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// M58364 // GenBank // Rat GTP cyclohydrolase I mRNA, complete cds. // chr15 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT021098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000027629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:27844672:27909090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001107255 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat and HMG-box DNA binding protein 1 (Wdhd1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:27962416:27996815:-1 gene:ENSRNOG00000011167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:27913364:27996591:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT021101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT021101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1
NM_001135802 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 5 (Dlgap5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:28108228:28138753:-1 gene:ENSRNOG00000010721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC162031 // GenBank // Rattus norvegicus discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:187927 IMAGE:9101206), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:28108468:28136652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT021103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107258 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 14 (Atg14), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:28278546:28309904:-1 gene:ENSRNOG00000011873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:28280441:28401343:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000052658 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:15:28527443:28527561:-1 gene:ENSRNOG00000034535 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001100566 // RefSeq // Rattus norvegicus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251807 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox protein OTX2-like (LOC100911492), transcript variant X9, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XR_359875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus orthodenticle homeobox 2 (Otx2), transcript variant X8, misc_RNA. // chr15 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:29442026:29450586:-1 gene:ENSRNOG00000013406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:29426094:29430790:-1 gene:ENSRNOG00000048322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:29427118:29473249:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_022204 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 5 (Exoc5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000067735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:29811329:29855876:-1 gene:ENSRNOG00000013804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// BC128739 // GenBank // Rattus norvegicus exocyst complex component 5, mRNA (cDNA clone MGC:156649 IMAGE:8362342), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FQ217124 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YM22 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// U79417 // GenBank // Rattus norvegicus 71 kDa component of rsec6/8 secretory complex p71 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:29811649:29855646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT021113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XM_001063155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35, member F4 (Slc35f4), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_224014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35, member F4 (Slc35f4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30080358:30100470:-1 gene:ENSRNOG00000014982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30080358:30372054:-1 gene:ENSRNOG00000014982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018724 // ENSEMBL // cdna:genscan scaffold:Rnor_5.0:AABR06110381.1:212:509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000034803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:30016222:30104130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT021118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108374 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 3632451O06Rik protein (RGD1310110), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30512209:30604270:-1 gene:ENSRNOG00000031849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:30513029:30606106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001000093 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1608 (Olr1608), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30927155:30928108:-1 gene:ENSRNOG00000012522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:30927202:30927994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT021126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000973 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1609 (Olr1609), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30957800:30958780:-1 gene:ENSRNOG00000012526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000094 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1610 (Olr1610), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000096 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1612 (Olr1612), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016727 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31066249:31067190:-1 gene:ENSRNOG00000012545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31066249:31067190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000041248 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:31090058:31091121:-1 gene:ENSRNOG00000033642 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
ENSRNOT00000043588 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:31345676:31345972:-1 gene:ENSRNOG00000029613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31345676:31345972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000089 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1624 (Olr1624), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30704833:30705759:-1 gene:ENSRNOG00000045711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:30704833:30705759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000971 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1625 (Olr1625), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30728504:30729433:-1 gene:ENSRNOG00000012491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000090 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1626 (Olr1626), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30781449:30782420:-1 gene:ENSRNOG00000012497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:30781449:30789407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001015 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1629 (Olr1629), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000067148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30851103:30852037:-1 gene:ENSRNOG00000043459 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 56 // 100 // 10 // 18 // 0 /// NONRATT021124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 56 // 100 // 10 // 18 // 0
NM_001000092 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1630 (Olr1630), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:30865222:30866193:-1 gene:ENSRNOG00000012515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:30865222:30866225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000837 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1631 (Olr1631), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31419925:31420899:-1 gene:ENSRNOG00000047042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000836 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1632 (Olr1632), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31434284:31435258:-1 gene:ENSRNOG00000046582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000835 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1633 (Olr1633), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000970 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1635 (Olr1635), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31484022:31485008:-1 gene:ENSRNOG00000031108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001013131 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 5 (Ttc5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31530805:31548395:-1 gene:ENSRNOG00000008850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC091207 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 5, mRNA (cDNA clone MGC:108914 IMAGE:7381272), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31531391:31548376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT021136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001025141 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin B1 interacting protein 1, E3 ubiquitin protein ligase (Ccnb1ip1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin B1 interacting protein 1, E3 ubiquitin protein ligase (Ccnb1ip1), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin B1 interacting protein 1, E3 ubiquitin protein ligase (Ccnb1ip1), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006251904 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin B1 interacting protein 1, E3 ubiquitin protein ligase (Ccnb1ip1), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000029488 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31552648:31566210:-1 gene:ENSRNOG00000026056 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC091423 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin B1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:109591 IMAGE:7365771), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31553193:31558886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 35 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT021138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NR_002703 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA component of mitochondrial RNA processing endoribonuclease (Rmrp), RNase MRP RNA. // chr15 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// L08800 // GenBank // Rat RNase P RNA subunit gene sequence. // chr15 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT021139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT021140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0
NM_022591 // RefSeq // Rattus norvegicus telomerase associated protein 1 (Tep1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000012235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31583613:31631251:-1 gene:ENSRNOG00000008964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// U89282 // GenBank // Rattus norvegicus telomerase protein component 1 (TLP1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// GENSCAN00000026498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31583717:31682202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 51 // 51 // 0 /// NONRATT021141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 34 // 34 // 19 // 56 // 1
XM_002725067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 33 (Klhl33), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002728195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 33 (Klhl33), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032992 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:31645818:31647686:-1 gene:ENSRNOG00000025868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31583717:31682202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_002725067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 33 (Klhl33), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002728195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 33 (Klhl33), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067400 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:31651052:31651801:-1 gene:ENSRNOG00000042516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31583717:31682202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_001100510 // RefSeq // Rattus norvegicus O-sialoglycoprotein endopeptidase (Osgep), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000012790 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31674874:31682291:-1 gene:ENSRNOG00000009333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC087140 // GenBank // Rattus norvegicus O-sialoglycoprotein endopeptidase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7126956). // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC158592 // GenBank // Rattus norvegicus O-sialoglycoprotein endopeptidase, mRNA (cDNA clone MGC:187386 IMAGE:8362956), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000026498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31583717:31682202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT021149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT021150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001014233 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 55B (Tmem55b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31684579:31688424:-1 gene:ENSRNOG00000009948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087604 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 55B, mRNA (cDNA clone MGC:105582 IMAGE:7312219), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31687159:31688322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 30 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT021151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT021154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT021155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT021153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001008561 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 9 (non-active) (Rnase9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 9 (non-active) (Rnase9), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000040616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31797573:31801127:-1 gene:ENSRNOG00000029516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY303815 // GenBank // Rattus norvegicus epididymis-specific RNase-like mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31798160:31830579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001012209 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 12 (non-active) (Rnase12), mRNA. // chr15 // 100 // 33 // 17 // 17 // 0 /// NM_001012476 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 11 (non-active) (Rnase11), mRNA. // chr15 // 100 // 48 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31806255:31808240:-1 gene:ENSRNOG00000039543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31813995:31814432:-1 gene:ENSRNOG00000042612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 17 // 17 // 0 /// BC128714 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 11 (non-active), mRNA (cDNA clone MGC:156529 IMAGE:7134188), complete cds. // chr15 // 100 // 48 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 54 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31798160:31830579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 58 // 58 // 30 // 52 // 1 /// NONRATT021157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 33 // 33 // 17 // 52 // 1
NM_001012209 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 12 (non-active) (Rnase12), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31813995:31814432:-1 gene:ENSRNOG00000042612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31798160:31830579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT021157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000503 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1637 (Olr1637), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034647 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31829584:31830579:-1 gene:ENSRNOG00000025640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31798160:31830579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013232 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 1-like 1 (pancreatic) (Rnase1l1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033809 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:31874160:31875078:-1 gene:ENSRNOG00000025615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000026479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31874773:31875225:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001029904 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 1 (pancreatic) (Rnase1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000041822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31897124:31898680:-1 gene:ENSRNOG00000031577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// FQ225649 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YF03 mRNA sequence. // chr15 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31897384:31897842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 62 // 7 // 8 // 0 /// NONRATT021161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
NM_178103 // RefSeq // Rattus norvegicus epididymal protein 3B (Eddm3b), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31880764:31881956:1 gene:ENSRNOG00000033532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:31920677:31921108:-1 gene:ENSRNOG00000030110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31920677:31923683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012359 // RefSeq // Rattus norvegicus angiogenin, ribonuclease A family, member 2 (Ang2), mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000032536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31932544:31933047:-1 gene:ENSRNOG00000025562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31932065:31933047:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_001007015 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 2 (liver, eosinophil-derived neurotoxin) (Rnase2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000050820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:31984003:31984812:-1 gene:ENSRNOG00000032133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AB005291 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for pre-eosinophil-associated ribonuclease-2, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT021166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_002725055 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease 16-like (LOC100361814), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_002728191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease 16-like (LOC100361814), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:31997312:32022808:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
NM_001012232 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease 17 (Rnase17), mRNA. // chr15 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// XM_006251897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease 17 (Rnase17), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000048941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32034173:32034640:-1 gene:ENSRNOG00000050295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT021168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_001012231 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease, RNase A family, 13 (non-active) (Rnase13), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32136026:32136487:-1 gene:ENSRNOG00000039500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32136026:32136487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT021183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001007681 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 219 (Zfp219), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 219 (Zfp219), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006251880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 219 (Zfp219), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32213649:32217278:-1 gene:ENSRNOG00000011544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082017 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 219, mRNA (cDNA clone MGC:94294 IMAGE:7132141), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ221971 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA2YH18 mRNA sequence. // chr15 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32214101:32217109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001000834 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1638 (Olr1638), mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32256531:32257466:-1 gene:ENSRNOG00000011615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32256531:32257439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001107261 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of Ty 16 homolog (S. cerevisiae) (Supt16h), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32385107:32422226:-1 gene:ENSRNOG00000011953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32394743:32423023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022933 // RefSeq // Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 8 (Chd8), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000022593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32423199:32482730:-1 gene:ENSRNOG00000025011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF169825 // GenBank // Rattus norvegicus beta-catenin binding protein mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000007100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32423636:32506226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT021192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NONRATT021192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001037645 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB2B, member RAS oncogene family (Rab2b), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000060467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32487246:32506322:-1 gene:ENSRNOG00000012488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC092636 // GenBank // Rattus norvegicus RAB2B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone IMAGE:7316063), partial cds. // chr15 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// BC107443 // GenBank // Rattus norvegicus RAB2B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:125131 IMAGE:7307807), complete cds. // chr15 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007100 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32423636:32506226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT021198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT021199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT021200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT021201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001024794 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase-like 3 (Mettl3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32520600:32531328:-1 gene:ENSRNOG00000013111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC097400 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:114445 IMAGE:7453630), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000007111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32520646:32596555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT021203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT021204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001107262 // RefSeq // Rattus norvegicus spalt-like transcription factor 2 (Sall2), mRNA. // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006251884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spalt-like transcription factor 2 (Sall2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000017730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32538672:32556550:-1 gene:ENSRNOG00000013287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32520646:32596555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT021205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_001000833 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1639 (Olr1639), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32595740:32596681:-1 gene:ENSRNOG00000050975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32520646:32596555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT021206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000099 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1640 (Olr1640), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32616398:32617339:-1 gene:ENSRNOG00000048857 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32613667:32617213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT021207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000100 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1641 (Olr1641), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000060439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32665836:32666792:-1 gene:ENSRNOG00000047787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT021208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000007092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32665836:32684578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 59 // 100 // 10 // 17 // 0
NM_001000832 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1642 (Olr1642), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000060437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32683622:32684578:-1 gene:ENSRNOG00000047738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000007092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32665836:32684578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT021209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000029243 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:32728916:32729417:-1 gene:ENSRNOG00000024637 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 94 // 76 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000007118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32728909:32729417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 52 // 10 // 11 // 0
NM_001000101 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1644 (Olr1644), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:32740494:32741483:-1 gene:ENSRNOG00000039435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007089 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32740566:32741498:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT021210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000102 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1645 (Olr1645), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006221932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1645 (Olr1645), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000060427 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:32766026:32767030:-1 gene:ENSRNOG00000039434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000007106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:32766026:32767030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT021211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006227156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG140239-like (LOC100361213), mRNA. // chr15 // 75 // 62 // 12 // 16 // 0 /// XM_006252036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mCG140239-like (LOC100362949), mRNA. // chr15 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// XM_006252037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554516 (LOC102554516), mRNA. // chr15 // 56 // 62 // 9 // 16 // 0 /// DQ340291 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha chain mRNA, complete cds. // chr15 // 67 // 81 // 14 // 21 // 0 /// JQ074230 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344 nonfunctional T-cell receptor alpha chain AV14S5 mRNA, complete sequence. // chr15 // 62 // 81 // 13 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34347420:34370569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35170939:35174834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33588945:33634932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 96 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33075792:33106671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 96 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35182255:35212673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 62 // 81 // 13 // 21 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35948387:36056481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000003749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34588970:34591530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
ENSRNOT00000072888 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:35971976:35980921:1 gene:ENSRNOG00000049867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 50 // 100 // 14 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35948387:36056481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 55 // 71 // 11 // 20 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 71 // 100 // 20 // 28 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 71 // 100 // 20 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33725969:33763259:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
GENSCAN00000040973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35762728:35764054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 66 // 100 // 21 // 32 // 0 /// L11025 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 50 // 100 // 16 // 32 // 0 /// L37973 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 63 // 84 // 17 // 27 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 72 // 100 // 23 // 32 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 72 // 100 // 23 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000060392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:35539362:35539868:1 gene:ENSRNOG00000039408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 39 // 88 // 11 // 28 // 0
ENSRNOT00000060310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:35887930:35888482:1 gene:ENSRNOG00000045525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 29 // 100 // 10 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34268990:34335732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 59 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000060399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:33966148:33966803:-1 gene:ENSRNOG00000047855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 100 // 16 // 34 // 0 /// L37966 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 47 // 100 // 16 // 34 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 100 // 12 // 34 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 100 // 12 // 34 // 0
GENSCAN00000032478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33173456:33193693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060297 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:35854807:35855337:1 gene:ENSRNOG00000048808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35847391:35863738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35467991:35502212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 75 // 11 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34982285:35059044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 75 // 12 // 21 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 61 // 100 // 17 // 28 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 61 // 100 // 17 // 28 // 0 /// NONRATT021212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000060310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:35887930:35888482:1 gene:ENSRNOG00000045525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33658603:33719469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000023138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35888196:35894840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_002725076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T cell receptor alpha chain (RGD1564212), mRNA. // chr15 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000060357 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:34276633:34277204:1 gene:ENSRNOG00000042119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 28 // 100 // 8 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000040046 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:35876655:35877169:1 gene:ENSRNOG00000032211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35678977:35716355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 38 // 72 // 8 // 21 // 0 /// L11029 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 33 // 83 // 8 // 24 // 0 /// L11034 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 38 // 72 // 8 // 21 // 0 /// GENSCAN00000012319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33955820:33976801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33658603:33719469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
GENSCAN00000018146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33410196:33432416:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000047778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35349852:35372336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35524113:35534844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0
XM_002725076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T cell receptor alpha chain (RGD1564212), mRNA. // chr15 // 37 // 100 // 10 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060357 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:34276633:34277204:1 gene:ENSRNOG00000042119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 37 // 100 // 10 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000047082 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:33165092:33166032:-1 gene:ENSRNOG00000033801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L11034 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 78 // 67 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000032466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33151269:33166032:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 100 // 14 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34982285:35059044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 100 // 14 // 27 // 0 /// L37959 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 59 // 63 // 10 // 17 // 0 /// L37964 // GenBank // Rattus norvegicus T-cell receptor alpha-chain mRNA. // chr15 // 56 // 59 // 9 // 16 // 0 /// GENSCAN00000012319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33955820:33976801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
ENSRNOT00000060297 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:35854807:35855337:1 gene:ENSRNOG00000048808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35847391:35863738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:35467991:35502212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT020335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33173456:33193693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 100 // 16 // 28 // 0 /// L11027 // GenBank // Rat T-cell receptor alpha chain mRNA for RT1L haplotype. // chr15 // 64 // 79 // 14 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:34982285:35059044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 41 // 79 // 9 // 22 // 0 /// GENSCAN00000018140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:33446592:33462858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
ENSRNOT00000046980 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:36590635:36591018:-1 gene:ENSRNOG00000033109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000040244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36590584:36648010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT021220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_138910 // RefSeq // Rattus norvegicus defender against cell death 1 (Dad1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36679092:36699071:-1 gene:ENSRNOG00000009090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061530 // GenBank // Rattus norvegicus defender against cell death 1, mRNA (cDNA clone MGC:72685 IMAGE:6917861), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232125 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA66YO14 mRNA sequence. // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT021221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000052060 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:36727853:36728209:-1 gene:ENSRNOG00000033186 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr15 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000040236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36723025:36728209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_001000103 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1646 (Olr1646), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:36736034:36736978:-1 gene:ENSRNOG00000009703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36738857:36806453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000040248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:36736034:36736978:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108867 // RefSeq // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 5 (Prmt5), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37041740:37051125:-1 gene:ENSRNOG00000012046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC168161 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8364878, containing frame-shift errors. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT021234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37042348:37051111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_001013995 // RefSeq // Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex, subunit 4 (Haus4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006251956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex, subunit 4 (Haus4), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37067372:37078759:-1 gene:ENSRNOG00000039284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079109 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 14 open reading frame 94, mRNA (cDNA clone MGC:94104 IMAGE:7125564), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37067638:37083168:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT021239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_053503 // RefSeq // Rattus norvegicus ajuba LIM protein (Ajuba), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37092305:37102545:-1 gene:ENSRNOG00000012791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085802 // GenBank // Rattus norvegicus jub, ajuba homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:93830 IMAGE:7110970), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_359918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ajuba LIM protein (Ajuba), transcript variant X1, misc_RNA. // chr15 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT021241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000052250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37093564:37126880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001109101 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931414P19 (RGD1565222), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4931414P19 (RGD1565222), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37109233:37134202:-1 gene:ENSRNOG00000013317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37093564:37126880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001105727 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 5 (Psmb5), mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000018005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37143059:37147105:-1 gene:ENSRNOG00000013386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37143107:37151205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT021243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_001054792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 24, type 2 (Cdh24), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_573774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 24, type 2 (Cdh24), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036150 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:37163508:37170574:-1 gene:ENSRNOG00000013503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37163508:37170574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001170468 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptotic chromatin condensation inducer 1 (Acin1), mRNA. // chr15 // 98 // 91 // 40 // 41 // 0 /// XM_006251962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apoptotic chromatin condensation inducer 1 (Acin1), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 82 // 37 // 37 // 0 /// XM_006251963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apoptotic chromatin condensation inducer 1 (Acin1), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 51 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apoptotic chromatin condensation inducer 1 (Acin1), transcript variant X8, mRNA. // chr15 // 100 // 53 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37173169:37218052:-1 gene:ENSRNOG00000013533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000052243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37173731:37242479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT021246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 25 // 45 // 1 /// NONRATT021249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 14 // 45 // 1 /// NONRATT021250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1 /// NONRATT021256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
NM_017095 // RefSeq // Rattus norvegicus CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), epsilon (Cebpe), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37241081:37242479:-1 gene:ENSRNOG00000014282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37173731:37242479:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT021260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053442 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (amino acid transporter light chain, L system), member 8 (Slc7a8), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000019618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37253915:37317161:-1 gene:ENSRNOG00000014311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AB024400 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for LAT4, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// BC105854 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7453435. // chr15 // 100 // 34 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000052248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37255808:37316561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// AB016962 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for synGAP-d, complete cds. // chr15 // 34 // 34 // 16 // 47 // 1
ENSRNOT00000019955 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:37382791:37384760:-1 gene:ENSRNOG00000014810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000003543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37382791:37384505:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
NM_152849 // RefSeq // Rattus norvegicus homeobox and leucine zipper encoding (Homez), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006251929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeobox and leucine zipper encoding (Homez), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37397308:37413881:-1 gene:ENSRNOG00000014887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY126016 // GenBank // Rattus norvegicus homeodomain-leucine zipper protein HOMEZ (Homez) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC084701 // GenBank // Rattus norvegicus homeobox and leucine zipper encoding, mRNA (cDNA clone MGC:105306 IMAGE:7133916), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085694 // GenBank // Rattus norvegicus homeobox and leucine zipper encoding, mRNA (cDNA clone MGC:93137 IMAGE:7135570), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37398428:37423860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT021265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001169575 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 3E (Ppp1r3e), mRNA. // chr15 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000019992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37422932:37424092:-1 gene:ENSRNOG00000014904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000003539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37398428:37423860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT021268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_177421 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 22, member 17 (Slc22a17), mRNA. // chr15 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37456778:37463273:-1 gene:ENSRNOG00000016414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// AB040056 // GenBank // Rattus norvegicus rBOCT mRNA for brain-specific organic cation transporter, complete cds. // chr15 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// BC099072 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 22, member 17, mRNA (cDNA clone MGC:116043 IMAGE:7312276), complete cds. // chr15 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NM_001106033 // RefSeq // Rattus norvegicus embryonal Fyn-associated substrate (Efs), mRNA. // chr15 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// XM_006251931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus embryonal Fyn-associated substrate (Efs), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000022514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37466899:37476240:-1 gene:ENSRNOG00000042029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// BC161942 // GenBank // Rattus norvegicus embryonal Fyn-associated substrate, mRNA (cDNA clone MGC:187730 IMAGE:9023909), complete cds. // chr15 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// GENSCAN00000003580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37457106:37475881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT021269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// NONRATT021272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// NONRATT021273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_017239 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 6, cardiac muscle, alpha (Myh6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37492599:37516191:-1 gene:ENSRNOG00000025757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// X15938 // GenBank // Rat mRNA for alpha cardiac myosin heavy chain. // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37492667:37515810:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NR_031922 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-208a (Mir208a), microRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-208a // miRBase Micro RNA Database // MI0000949 Rattus norvegicus miR-208 stem-loop // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017240 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin, heavy chain 7, cardiac muscle, beta (Myh7), mRNA. // chr15 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37521021:37542688:-1 gene:ENSRNOG00000016983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// X15939 // GenBank // Rat mRNA for beta cardiac myosin heavy chain. // chr15 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37519464:37542680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001098803 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger homeobox 2 (Zfhx2), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37607644:37639750:-1 gene:ENSRNOG00000025634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AY237644 // GenBank // Rattus norvegicus retina zinc finger homeodomain protein (ZFH) mRNA, complete cds. // chr15 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37608540:37627669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001098803 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger homeobox 2 (Zfhx2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37607644:37639750:-1 gene:ENSRNOG00000025634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37608540:37627669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001098803 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger homeobox 2 (Zfhx2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37607644:37639750:-1 gene:ENSRNOG00000025634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37608540:37627669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001098803 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger homeobox 2 (Zfhx2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000034102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37607644:37639750:-1 gene:ENSRNOG00000025634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37608540:37627669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001098803 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger homeobox 2 (Zfhx2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37607644:37639750:-1 gene:ENSRNOG00000025634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37608540:37627669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001098803 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger homeobox 2 (Zfhx2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37607644:37639750:-1 gene:ENSRNOG00000025634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37608540:37627669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001098803 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger homeobox 2 (Zfhx2), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37607644:37639750:-1 gene:ENSRNOG00000025634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37608540:37627669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006221937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor protein complex AP-1, gamma 2 subunit (LOC100362547), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// XM_006252029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor protein complex AP-1, gamma 2 subunit (LOC100362547), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000033977 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:37646285:37653522:-1 gene:ENSRNOG00000025619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000003547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37646285:37653522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT021291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT021293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1 /// NONRATT021294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001003711 // RefSeq // Rattus norvegicus junctophilin 4 (Jph4), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:37655680:37662194:-1 gene:ENSRNOG00000025589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AY341260 // GenBank // Rattus norvegicus junctophilin 4a mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC160922 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8362268. // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37655680:37709273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT021298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
GENSCAN00000003549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:37780439:37780765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0
NM_001106036 // RefSeq // Rattus norvegicus neural retina leucine zipper (Nrl), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neural retina leucine zipper (Nrl), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024991 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38087388:38089116:-1 gene:ENSRNOG00000018528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38087388:38089116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008296 // RefSeq // Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 9 (Emc9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38149137:38153351:-1 gene:ENSRNOG00000019162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086432 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 158, member A, mRNA (cDNA clone MGC:105938 IMAGE:7301648), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38149179:38160044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT021309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT021310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_017257 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 2 (Psme2), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026279 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38155752:38160046:-1 gene:ENSRNOG00000019246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC058486 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:72873 IMAGE:6918985), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC097331 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) activator subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:114338 IMAGE:7389180), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// D45250 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proteasome activator rPA28 subunit beta, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ227049 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YH03 mRNA sequence. // chr15 // 94 // 100 // 33 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:38939274:38939990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 94 // 31 // 33 // 0 /// NONRATT021312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT000262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// NONRATT000263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// NONRATT000264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// NONRATT021314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 1 /// GENSCAN00000023021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38149179:38160044:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
NM_001106038 // RefSeq // Rattus norvegicus importin 4 (Ipo4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38194620:38204540:-1 gene:ENSRNOG00000019553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38195020:38204469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT021316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001012155 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily member 1 (Tm9sf1), mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006251990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily member 1 (Tm9sf1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006251991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily member 1 (Tm9sf1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38204851:38212312:-1 gene:ENSRNOG00000019710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC081891 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane 9 superfamily member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93788 IMAGE:7109579), complete cds. // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38205116:38213804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT021322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001106039 // RefSeq // Rattus norvegicus magnesium-dependent phosphatase 1 (Mdp1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38226257:38229155:-1 gene:ENSRNOG00000019840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38227733:38229037:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT021324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_138878 // RefSeq // Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8 (Nedd8), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064916 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38230806:38242650:-1 gene:ENSRNOG00000019895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF095740 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-like protein mRNA, complete cds. // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC084728 // GenBank // Rattus norvegicus neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, mRNA (cDNA clone MGC:105320 IMAGE:7315541), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001006962 // RefSeq // Rattus norvegicus TERF1 (TRF1)-interacting nuclear factor 2 (Tinf2), mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006251942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TERF1 (TRF1)-interacting nuclear factor 2 (Tinf2), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38250951:38254058:-1 gene:ENSRNOG00000020189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC083766 // GenBank // Rattus norvegicus TERF1 (TRF1)-interacting nuclear factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:94711 IMAGE:7193196), complete cds. // chr15 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000023004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38251564:38253804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT021328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_031659 // RefSeq // Rattus norvegicus transglutaminase 1 (Tgm1), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transglutaminase 1 (Tgm1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38268114:38281590:-1 gene:ENSRNOG00000020136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC097305 // GenBank // Rattus norvegicus transglutaminase 1, K polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:114300 IMAGE:7462186), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// FQ210559 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA26YJ04 mRNA sequence. // chr15 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// M57263 // GenBank // Rat protein-glutamine gamma-glutamyltransferase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38265848:38317962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT021331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_031654 // RefSeq // Rattus norvegicus Rab geranylgeranyltransferase, alpha subunit (Rabggta), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// XM_006252009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rab geranylgeranyltransferase, alpha subunit (Rabggta), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38284054:38290398:-1 gene:ENSRNOG00000030483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC086547 // GenBank // Rattus norvegicus Rab geranylgeranyltransferase, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:105396 IMAGE:7301723), complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// L10415 // GenBank // Rat rab geranylgeranyl transferase alpha-subunit mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT021335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// GENSCAN00000023047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38265848:38317962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1 /// NONRATT021334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT021338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT021340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001007621 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 1 (Dhrs1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38313184:38320467:-1 gene:ENSRNOG00000020264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079263 // GenBank // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 1, mRNA (cDNA clone MGC:94370 IMAGE:7133513), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38265848:38317962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT021343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT021344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT021346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT021341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT021345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT021348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1 /// NONRATT021349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001108869 // RefSeq // Rattus norvegicus cell death-inducing DFFA-like effector b (Cideb), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38328205:38332605:-1 gene:ENSRNOG00000020377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38328900:38332429:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT021351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_019285 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 4 (Adcy4), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38342436:38358253:-1 gene:ENSRNOG00000020401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38342436:38358253:-1 gene:ENSRNOG00000020401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC081813 // GenBank // Rattus norvegicus adenylate cyclase 4, mRNA (cDNA clone MGC:93493 IMAGE:7125413), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ223268 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YG03 mRNA sequence. // chr15 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// FQ223451 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA11YD01 mRNA sequence. // chr15 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// M80633 // GenBank // Rat adenylyl cyclase type (IV) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38342489:38362559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT021353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_139342 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor-interacting serine-threonine kinase 3 (Ripk3), mRNA. // chr15 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38359307:38368247:-1 gene:ENSRNOG00000020465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF036537 // GenBank // Rattus norvegicus homocysteine respondent protein HCYP2 mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// BC158580 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-interacting serine-threonine kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:187331 IMAGE:7378607), complete cds. // chr15 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38342489:38362559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT021358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT021359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT021360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001109330 // RefSeq // Rattus norvegicus cerebellin 3 precursor (Cbln3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38436838:38439148:-1 gene:ENSRNOG00000020503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38437743:38438948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108378 // RefSeq // Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 39U, member 1 (Sdr39u1), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 39U, member 1 (Sdr39u1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006251993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 39U, member 1 (Sdr39u1), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064643 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38452084:38455017:-1 gene:ENSRNOG00000020544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC167001 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7191392. // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000041085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38452524:38458657:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT021367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT021370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT021371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_013092 // RefSeq // Rattus norvegicus chymase 1, mast cell (Cma1), mRNA. // chr15 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38490971:38493753:-1 gene:ENSRNOG00000020563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// D38495 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mast cell protease-3 precursor, complete cds. // chr15 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT021373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 69 // 100 // 20 // 29 // 0 /// NONRATT021372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000027895 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:38813735:38815450:1 gene:ENSRNOG00000050460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NONRATT021373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 1
NM_001277668 // RefSeq // Rattus norvegicus mast cell protease 1-like 1 (Mcpt1l1), mRNA. // chr15 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38499895:38502535:-1 gene:ENSRNOG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// FQ219938 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YN02 mRNA sequence. // chr15 // 82 // 100 // 18 // 22 // 0 /// U67915 // GenBank // Rattus norvegicus mast cell protease 1 precursor (RMCP-1) mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000072304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38499891:38790387:-1 gene:ENSRNOG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 58 // 86 // 11 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000073868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38499891:38665717:-1 gene:ENSRNOG00000020633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 58 // 86 // 11 // 19 // 0 /// NONRATT021373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38499484:38584304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// NONRATT021374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_001106041 // RefSeq // Rattus norvegicus cathepsin G (Ctsg), mRNA. // chr15 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000059677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:38998316:39000903:-1 gene:ENSRNOG00000020647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// XM_006252041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cathepsin G (Ctsg), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT021377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// GENSCAN00000009784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:38937467:39001671:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
XM_006252042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), transcript variant X8, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39016683:39019399:-1 gene:ENSRNOG00000049074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39016683:39019399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001191116 // RefSeq // Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), mRNA. // chr15 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// XM_006252042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 80 // 74 // 16 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000050660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39037798:39040751:-1 gene:ENSRNOG00000029860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// XM_006252045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// XM_006252048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// XM_006252049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme N (Gzmn), transcript variant X8, mRNA. // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000009781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39037907:39053158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT021380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_153466 // RefSeq // Rattus norvegicus granzyme F (Gzmf), mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000044840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39071311:39082672:-1 gene:ENSRNOG00000028810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000073741 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:39147931:39149054:-1 gene:ENSRNOG00000048542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// U57063 // GenBank // Rattus norvegicus natural killer cell protease 7 (RNKP-7) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_003751478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus granzyme G-like (LOC100910060), partial mRNA. // chr15 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39071423:39082665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000009786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39147931:39187123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XM_006221942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Granzyme B-like 2 (Gzmbl2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006257470 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Granszyme B-like 1 (Gzmbl1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000071692 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:123165263:123167945:-1 gene:ENSRNOG00000050198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:123165263:123168970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000045209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39971756:39974660:-1 gene:ENSRNOG00000046301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// X76996 // GenBank // R.norvegicus mRNA for granzyme-like protein III. // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39971865:39974590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT021386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_134332 // RefSeq // Rattus norvegicus granzyme C (Gzmc), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000028058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39275249:39277940:-1 gene:ENSRNOG00000030018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40302984:40305717:-1 gene:ENSRNOG00000045641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ229002 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA4YL22 mRNA sequence. // chr15 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// FQ229690 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YB04 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// U57062 // GenBank // Rattus norvegicus natural killer cell protease 4 (RNKP-4) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ229398 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YB04 mRNA sequence. // chr15 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0 /// FQ229477 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YM10 mRNA sequence. // chr15 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40211939:40362783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000009790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39200629:39300313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
BC127475 // GenBank // Rattus norvegicus granzyme B, mRNA (cDNA clone MGC:156565 IMAGE:7124652), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// FQ228927 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YH15 mRNA sequence. // chr15 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// NM_138517 // RefSeq // Rattus norvegicus granzyme B (granzyme 2, cytotoxic T-lymphocyte-associated serine esterase 1) (Gzmb), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// XM_002728257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Granzyme B-like 2 (Gzmbl2), mRNA. // chr15 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// ENSRNOT00000041430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39296942:39300403:-1 gene:ENSRNOG00000049976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// ENSRNOT00000059660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40323424:40326360:-1 gene:ENSRNOG00000045973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// M34097 // GenBank // Rat natural killer (NK) cell protease 1 (RNKP-1) mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 92 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT021383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000028188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40211939:40362783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
NM_001107265 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein J (Cenpj), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein J (Cenpj), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40599809:40658983:-1 gene:ENSRNOG00000022597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40600149:40652432:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT021389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001025672 // RefSeq // Rattus norvegicus paraspeckle component 1 (Pspc1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_359949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paraspeckle component 1 (Pspc1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000028219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40822487:40882550:-1 gene:ENSRNOG00000020782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099204 // GenBank // Rattus norvegicus paraspeckle component 1, mRNA (cDNA clone MGC:116378 IMAGE:7384173), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ226982 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YM06 mRNA sequence. // chr15 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000028093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40824981:40866410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000051077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40867761:40882410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT021399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT021398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_002725096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Zinc finger protein 198 (Fused in myeloproliferative disorders protein) (Rearranged in atypical myeloproliferative disorder protein) (RGD1306353), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XM_006221947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Zinc finger protein 198 (Fused in myeloproliferative disorders protein) (Rearranged in atypical myeloproliferative disorder protein) (RGD1306353), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XM_006252083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Zinc finger protein 198 (Fused in myeloproliferative disorders protein) (Rearranged in atypical myeloproliferative disorder protein) (RGD1306353), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40894102:40907132:-1 gene:ENSRNOG00000029220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT021400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NONRATT021403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT021403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 1
NONRATT021404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1
NM_024376 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 3 (Gja3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252077 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 3 (Gja3), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000011699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41147150:41172590:-1 gene:ENSRNOG00000008847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// X57970 // GenBank // R.norvegicus mRNA for connexin 46. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41102982:41148508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT021406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001004099 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, beta 2 (Gjb2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gap junction protein, beta 2 (Gjb2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000011711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41224500:41230461:-1 gene:ENSRNOG00000008855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078952 // GenBank // Rattus norvegicus gap junction protein, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:93804 IMAGE:7110122), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228230 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YA14 mRNA sequence. // chr15 // 85 // 52 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT021407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053388 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, beta 6 (Gjb6), mRNA. // chr15 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41248073:41256852:-1 gene:ENSRNOG00000022116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF170284 // GenBank // Rattus norvegicus connexin 30 mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC078753 // GenBank // Rattus norvegicus gap junction protein, beta 6, mRNA (cDNA clone MGC:93246 IMAGE:7132296), complete cds. // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT021408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_175757 // RefSeq // Rattus norvegicus crystallin, lambda 1 (Cryl1), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006252058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crystallin, lambda 1 (Cryl1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000012093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41389716:41509443:-1 gene:ENSRNOG00000008989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY040223 // GenBank // Rattus norvegicus CRY (Cry) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC078685 // GenBank // Rattus norvegicus crystallin, lambda 1, mRNA (cDNA clone MGC:93049 IMAGE:7110482), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41395682:41509311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT021414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001134990 // RefSeq // Rattus norvegicus N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 2 (putative) (N6amt2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 2 (putative) (N6amt2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41658553:41671647:-1 gene:ENSRNOG00000009849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168660 // GenBank // Rattus norvegicus N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 2 (putative), mRNA (cDNA clone MGC:188401 IMAGE:5621479), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ230419 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YC15 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41658698:41670630:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT021416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0
NM_001106042 // RefSeq // Rattus norvegicus exportin 4 (Xpo4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_006252063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exportin 4 (Xpo4), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000013901 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41680885:41771826:-1 gene:ENSRNOG00000010137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// FQ225683 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YD07 mRNA sequence. // chr15 // 91 // 24 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000054212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41686473:41771624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 76 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT021421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_001107267 // RefSeq // Rattus norvegicus large tumor suppressor kinase 2 (Lats2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014031 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:41788720:41828704:-1 gene:ENSRNOG00000010544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41790387:41828704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0
NM_001108379 // RefSeq // Rattus norvegicus spindle and kinetochore associated complex subunit 3 (Ska3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000032723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41918700:41937666:-1 gene:ENSRNOG00000021847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC166461 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 13 open reading frame 3, mRNA (cDNA clone MGC:187796 IMAGE:9030107), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41921663:42006533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT021425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001039336 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 20 (Zdhhc20), mRNA. // chr15 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41950264:42006537:-1 gene:ENSRNOG00000011024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000063962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:41950094:42006527:-1 gene:ENSRNOG00000011024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AY886539 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC24 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr15 // 89 // 87 // 24 // 27 // 0 /// BC098018 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 20, mRNA (cDNA clone IMAGE:7455172), complete cds. // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// BC127440 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 20, mRNA (cDNA clone MGC:156467 IMAGE:7456492), complete cds. // chr15 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 20 (Zdhhc20), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT021429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT021431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000056497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:41921663:42006533:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT021430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT021432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_134396 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial calcium uptake 2 (Micu2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000015233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:42032272:42113082:-1 gene:ENSRNOG00000011168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF327513 // GenBank // Rattus norvegicus SMHS2 (Smhs2) mRNA, complete cds. // chr15 // 35 // 98 // 15 // 43 // 0 /// NONRATT021433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000056491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:42016885:42113071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 80 // 35 // 44 // 1 /// NONRATT021435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// NONRATT021436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 61 // 61 // 27 // 44 // 1 /// NONRATT021437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1
XM_001079856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691850 (LOC691850), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752814 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691850 (LOC691850), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006221949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691850 (LOC691850), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006252158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691850 (LOC691850), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43388228:43391154:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000040358 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:43385095:43395458:-1 gene:ENSRNOG00000029170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43385184:43385939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43394702:43395457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001162899 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1563302 (RGD1563302), mRNA. // chr15 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006252122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1563302 (RGD1563302), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:43414404:43423316:-1 gene:ENSRNOG00000038917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT021445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT021446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000007854 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:43475013:43475893:-1 gene:ENSRNOG00000005972 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43475013:43475893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001024272 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 11 (Phf11), mRNA. // chrU // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// BC088433 // GenBank // Rattus norvegicus PHD finger protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:95064 IMAGE:7124805), complete cds. // chrU // 54 // 54 // 13 // 24 // 1 /// FQ233247 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YJ23 mRNA sequence. // chrU // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
XM_006221962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain, bifurcated 2 (Setdb2), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000036781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:43533876:43566314:-1 gene:ENSRNOG00000021680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:43533876:43566314:-1 gene:ENSRNOG00000021680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:43533876:43566314:-1 gene:ENSRNOG00000021680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC093383 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7389109. // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000005477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43514812:43559662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001012156 // RefSeq // Rattus norvegicus cytidine and dCMP deaminase domain containing 1 (Cdadc1), mRNA. // chr15 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytidine and dCMP deaminase domain containing 1 (Cdadc1), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000068353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:43686834:43715716:-1 gene:ENSRNOG00000012209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 32 // 32 // 0 /// BC083736 // GenBank // Rattus norvegicus cytidine and dCMP deaminase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94645 IMAGE:7191631), complete cds. // chr15 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// FQ213068 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YO10 mRNA sequence. // chr15 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT021456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43692192:43756351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// NONRATT021458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// NONRATT021459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 49 // 49 // 20 // 41 // 1 /// NONRATT021460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1
ENSRNOT00000018337 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:43755662:43756261:-1 gene:ENSRNOG00000013726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000005466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:43692192:43756351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XM_003751492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable phospholipid-transporting ATPase IB-like (LOC691889), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006221969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable phospholipid-transporting ATPase IB-like (LOC691889), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006221972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable phospholipid-transporting ATPase IB-like (LOC691889), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006252161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable phospholipid-transporting ATPase IB-like (LOC691889), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006252164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable phospholipid-transporting ATPase IB-like (LOC691889), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011451 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:43903107:44204400:-1 gene:ENSRNOG00000008053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44050795:44180226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_139091 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin like 1 (Nupl1), mRNA. // chr15 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// XM_006252093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoporin like 1 (Nupl1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 97 // 76 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000017204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:44324078:44357949:-1 gene:ENSRNOG00000012644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000063943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:44324078:44357949:-1 gene:ENSRNOG00000012644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// AF000900 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin p45 (p58/p45) mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 69 // 28 // 29 // 0 /// AF000901 // GenBank // Rattus norvegicus p23 (p58/p45) mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr15 // 92 // 60 // 23 // 25 // 0 /// BC085690 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin like 1, mRNA (cDNA clone MGC:93109 IMAGE:7190650), complete cds. // chr15 // 97 // 81 // 33 // 34 // 0 /// U63839 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin p58 mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 86 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44309149:44354621:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 67 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT021468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AH007036 // GenBank // Rattus norvegicus p58/p45 (p58/p45) gene, partial cds. // chr15 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// NONRATT021469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1
NM_001044229 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 19 (Tnfrsf19), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45064736:45127279:-1 gene:ENSRNOG00000014265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// DQ466087 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily member 19 (Tnfrsf19) mRNA, complete cds. // chr15 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:44975334:45127279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001006993 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcoglycan, gamma (dystrophin-associated glycoprotein) (Sgcg), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45357062:45401752:-1 gene:ENSRNOG00000014603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083748 // GenBank // Rattus norvegicus sarcoglycan, gamma (dystrophin-associated glycoprotein), mRNA (cDNA clone MGC:94674 IMAGE:7192349), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000047433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:45357589:45444562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT021481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001108381 // RefSeq // Rattus norvegicus emopamil binding protein-like (Ebpl), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45472249:45495637:-1 gene:ENSRNOG00000014659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213140 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YI05 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014792 // RefSeq // Rattus norvegicus karyopherin alpha 3 (Kpna3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000034400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45502394:45574246:-1 gene:ENSRNOG00000014945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY779027 // GenBank // Rattus norvegicus karyopherin alpha 3 (Kpna3) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000047451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:45502896:45550523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT021487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT021489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT021488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001009635 // RefSeq // Rattus norvegicus SPRY domain containing 7 (Spryd7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:45673596:45693135:-1 gene:ENSRNOG00000015095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088471 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330409N04, mRNA (cDNA clone MGC:95134 IMAGE:7128422), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:45673872:45694685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
XR_340678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547628 (LOC102547628), transcript variant X1, ncRNA. // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT021492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001106043 // RefSeq // Rattus norvegicus deleted in lymphocytic leukemia, 7 (Dleu7), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deleted in lymphocytic leukemia, 7 (Dleu7), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49135932:49151896:-1 gene:ENSRNOG00000009181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC158600 // GenBank // Rattus norvegicus deleted in lymphocytic leukemia, 7, mRNA (cDNA clone MGC:187450 IMAGE:7130710), complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT021535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
XM_006222004 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554746 (LOC102554746), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554746 (LOC102554746), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49335341:49336626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000057819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49353749:49359752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000057820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49339722:49342155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001271488 // RefSeq // Rattus norvegicus integrator complex subunit 6 (Ints6), mRNA. // chr15 // 100 // 67 // 30 // 30 // 0 /// AY383679 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00024 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 47 // 21 // 21 // 0 /// XM_006252186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 6 (Ints6), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 69 // 69 // 31 // 45 // 1 /// XM_006252187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 6 (Ints6), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 69 // 69 // 31 // 45 // 1 /// ENSRNOT00000035888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49667494:49713060:-1 gene:ENSRNOG00000009873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 47 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000057817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49626073:49713060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 64 // 64 // 29 // 45 // 1 /// NONRATT021540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 47 // 47 // 21 // 45 // 1 /// NONRATT021542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 20 // 45 // 1 /// NONRATT021544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1
GENSCAN00000057821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49732499:49732816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0
NM_001037532 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 42 (Defb42), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49925455:49932279:-1 gene:ENSRNOG00000038762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY621369 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 42 (Defb42) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001037531 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 30 (Defb30), mRNA. // chr15 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:49987502:49989379:-1 gene:ENSRNOG00000038758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY600146 // GenBank // Rattus norvegicus DEFB30 (Defb30) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY621361 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 30 (Defb30) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_019238 // RefSeq // Rattus norvegicus farnesyl diphosphate farnesyl transferase 1 (Fdft1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000032089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50104043:50132096:-1 gene:ENSRNOG00000021314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC081810 // GenBank // Rattus norvegicus farnesyl diphosphate farnesyl transferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93486 IMAGE:7188993), complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// M95591 // GenBank // Rattus norvegicus squalene synthetase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50105874:50145103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT021551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT021552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001107270 // RefSeq // Rattus norvegicus nei endonuclease VIII-like 2 (E. coli) (Neil2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50137279:50146761:-1 gene:ENSRNOG00000010696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50105874:50145103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_144730 // RefSeq // Rattus norvegicus GATA binding protein 4 (Gata4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50151499:50197708:-1 gene:ENSRNOG00000010708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L22761 // GenBank // Rat DNA binding protein (GATA-GT2) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50152926:50222177:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT021555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001025751 // RefSeq // Rattus norvegicus B lymphoid tyrosine kinase (Blk), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50317880:50355727:-1 gene:ENSRNOG00000010798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098683 // GenBank // Rattus norvegicus B lymphoid tyrosine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:112647 IMAGE:7385175), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50318292:50335986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106044 // RefSeq // Rattus norvegicus L-threonine dehydrogenase (Tdh), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50429955:50443496:-1 gene:ENSRNOG00000011342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000046511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50430300:50443576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001005761 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 9 (Mtmr9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:50459294:50481325:-1 gene:ENSRNOG00000011560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF526269 // GenBank // Rattus norvegicus myotubularin-related protein mRNA, partial cds. // chr15 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC083644 // GenBank // Rattus norvegicus myotubularin related protein 9, mRNA (cDNA clone MGC:94471 IMAGE:7134963), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:50459617:50481084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001109103 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 4930578I06Rik protein (RGD1565212), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:51081452:51098325:-1 gene:ENSRNOG00000012402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:51081590:51102776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT021564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT021569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_020097 // RefSeq // Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 3 (Extl3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 3 (Extl3), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252211 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 3 (Extl3), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exostosin-like glycosyltransferase 3 (Extl3), transcript variant X9, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:52169314:52192414:-1 gene:ENSRNOG00000013581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB033367 // GenBank // Rattus norvegicus RegR mRNA for Reg receptor, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52297899:52319332:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000056631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52169740:52192395:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT021573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT021575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_013007 // RefSeq // Rattus norvegicus prepronociceptin (Pnoc), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006252198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prepronociceptin (Pnoc), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006252200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prepronociceptin (Pnoc), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:52547686:52574352:-1 gene:ENSRNOG00000014231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ214340 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YE03 mRNA sequence. // chr15 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// U48262 // GenBank // Rattus norvegicus pre-pro-orphanin FQ mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT021579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52550899:52660439:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XM_003751505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG52086-like (LOC100362548), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_003752820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG52086-like (LOC100362548), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019262 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:52683591:52744094:-1 gene:ENSRNOG00000014291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52725083:52740702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT021580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:52672550:52714020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT021584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
XM_003752821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 (Esco2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000021320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:49075099:49090208:1 gene:ENSRNOG00000015921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000041958 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:71568902:71570683:-1 gene:ENSRNOG00000033952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:60898258:60900042:-1 gene:ENSRNOG00000029520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49070369:49090208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60889361:60900039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71568902:71570683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001108870 // RefSeq // Rattus norvegicus scavenger receptor class A, member 3 (Scara3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48953960:48986864:1 gene:ENSRNOG00000016177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48969265:48985570:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022220 // RefSeq // Rattus norvegicus gulonolactone (L-) oxidase (Gulo), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000022702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48898799:48921150:1 gene:ENSRNOG00000016648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC089803 // GenBank // Rattus norvegicus gulonolactone (L-) oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:108695 IMAGE:7324344), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ219632 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YP11 mRNA sequence. // chr15 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT020614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000001749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48876036:48920348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT020615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT020616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_020077 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 2 (Adam2), mRNA. // chr15 // 95 // 100 // 42 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000066478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48842797:48883837:1 gene:ENSRNOG00000017027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT020611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000001749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48876036:48920348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 25 // 25 // 11 // 44 // 1 /// GENSCAN00000001750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48842812:48870201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// NONRATT020612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1
NM_022936 // RefSeq // Rattus norvegicus epoxide hydrolase 2, cytoplasmic (Ephx2), mRNA. // chr15 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000023385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48799895:48836847:1 gene:ENSRNOG00000017286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC085732 // GenBank // Rattus norvegicus epoxide hydrolase 2, cytoplasmic, mRNA (cDNA clone MGC:93421 IMAGE:7188942), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// FQ213968 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YI21 mRNA sequence. // chr15 // 89 // 95 // 32 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48799941:48836525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT020608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT020609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT020610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_017318 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine kinase 2 beta (Ptk2b), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC101921 // GenBank // Rattus norvegicus PTK2B protein tyrosine kinase 2 beta, mRNA (cDNA clone MGC:124628 IMAGE:7937929), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// D45854 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CAK beta (cell adhesion kinase beta), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// U69109 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-dependent tyrosine kinase mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000030007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48646435:48766707:1 gene:ENSRNOG00000027839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 97 // 34 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000030036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48646435:48766707:1 gene:ENSRNOG00000027839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// GENSCAN00000019936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48712600:48765963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT020605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0
NONRATT020605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001105717 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydropyrimidinase-like 2 (Dpysl2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydropyrimidinase-like 2 (Dpysl2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:48053084:48120298:1 gene:ENSRNOG00000009625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT020604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:48053303:48117871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NM_053999 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2, regulatory subunit B, alpha (Ppp2r2a), mRNA. // chr15 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:47862028:47921334:1 gene:ENSRNOG00000011158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// BC128731 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2 (formerly 2A), regulatory subunit B, alpha isoform, mRNA (cDNA clone MGC:156605 IMAGE:7370343), complete cds. // chr15 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// M83297 // GenBank // Rat protein phosphatase 2A (PP2A) 55 kD protein regulatory subunit B mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// M83298 // GenBank // Rat protein phosphatase 2A (PP2A) 55 kD regulatory subunit alpha mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT020593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:47860566:47971802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT020597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT020594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001107273 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle associated 2 (Cdca2), mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000031163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:47186191:47231339:1 gene:ENSRNOG00000025302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC105847 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7456584. // chr15 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:47179631:47230810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT020590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT020588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT020589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT020591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
M15527 // GenBank // Rat SH-4 protein gene encoded opposite gonadotropin-releasing hormone (GnRH), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M15528 // GenBank // Rat SH-1 protein mRNA with gonadotropin-releasing hormone GnRH complete coding region encoded on opposite strand. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// M15529 // GenBank // Rat SH-2 protein mRNA encoded opposite gonadotropin-releasing hormone (GnRH) gene, complete cds. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000017939 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:47154240:47154916:1 gene:ENSRNOG00000013433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT020587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:46998457:47154640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_003751494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 5 (Dock5), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000030384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:46969737:47083809:1 gene:ENSRNOG00000024703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 34 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000058887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:46969737:47143689:1 gene:ENSRNOG00000024703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000026801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:46998457:47154640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 50 // 50 // 0 /// NONRATT020582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 53 // 53 // 0
ENSRNOT00000045844 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:46816903:46817381:1 gene:ENSRNOG00000031139 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000033324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:46816945:46817295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 90 // 48 // 9 // 10 // 0
NM_017029 // RefSeq // Rattus norvegicus neurofilament, medium polypeptide (Nefm), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018637 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:46736822:46741141:1 gene:ENSRNOG00000013916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071069 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:46736822:46741141:1 gene:ENSRNOG00000013916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// M18628 // GenBank // Rat NF-M middle molecular weight neurofilament protein, complete cds. // chr15 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// Z12152 // GenBank // R.norvegicus mRNA for neurofilament protein middle (NF-M). // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:46658630:46741141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT020578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_020301 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 7 (Adam7), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:53152057:53200285:-1 gene:ENSRNOG00000014054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT021587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:53154256:53296130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001106046 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM-like, decysin 1 (Adamdec1), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000028974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:53218722:53238664:-1 gene:ENSRNOG00000030724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:53154256:53296130:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT021589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_181693 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 28 (Adam28), mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000058715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:54088439:54158960:-1 gene:ENSRNOG00000014518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// AY283187 // GenBank // Rattus norvegicus ADAM28 isoform-1 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:54091183:54158939:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 72 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT021592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 95 // 88 // 36 // 38 // 0
XM_006222000 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SSX1-like (LOC102550885), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// XM_006222002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SSX1-like (LOC102550885), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// XM_006252232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SSX1-like (LOC102550885), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// XM_006252234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SSX1-like (LOC102550885), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// XR_340722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SSX1-like (LOC102550885), transcript variant X4, misc_RNA. // chr15 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// XR_360028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein SSX1-like (LOC102550885), transcript variant X4, misc_RNA. // chr15 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1 /// GENSCAN00000046874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:53340153:53577842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 80 // 8 // 10 // 1
NM_001013996 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial iron transporter), member 37 (Slc25a37), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:54858326:54898186:-1 gene:ENSRNOG00000015495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC082071 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 37, mRNA (cDNA clone MGC:95235 IMAGE:7132913), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ230259 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YL13 mRNA sequence. // chr15 // 86 // 81 // 19 // 22 // 0 /// FQ233513 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YI11 mRNA sequence. // chr15 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT021595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:54858744:54906660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT021596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001024239 // RefSeq // Rattus norvegicus endogenous retrovirus group FRD, member 1 (Ervfrd-1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endogenous retrovirus group FRD, member 1 (Ervfrd-1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endogenous retrovirus group FRD, member 1 (Ervfrd-1), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endogenous retrovirus group FRD, member 1 (Ervfrd-1), transcript variant X6, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:54904791:54906660:-1 gene:ENSRNOG00000021823 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:54858744:54906660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006222007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain and coiled-coil containing 1 (R3hcc1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006222010 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain and coiled-coil containing 1 (R3hcc1), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252286 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain and coiled-coil containing 1 (R3hcc1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R3H domain and coiled-coil containing 1 (R3hcc1), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:55096848:55113932:-1 gene:ENSRNOG00000016777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55096848:55128253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT021604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001108872 // RefSeq // Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 7 (Chmp7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022706 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:55096848:55113932:-1 gene:ENSRNOG00000016777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 70 // 92 // 16 // 23 // 0 /// NONRATT021605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55114441:55128253:-1 gene:ENSRNOG00000016939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NM_001108872 // RefSeq // Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 7 (Chmp7), mRNA. // chr15 // 97 // 97 // 30 // 31 // 1 /// NONRATT021605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55096848:55128253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1
NM_001013133 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho-related BTB domain containing 2 (Rhobtb2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55195153:55213442:-1 gene:ENSRNOG00000017373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091309 // GenBank // Rattus norvegicus Rho-related BTB domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:109268 IMAGE:7311705), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000022689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55195472:55221025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001170472 // RefSeq // Rattus norvegicus cell cycle and apoptosis regulator 2 (Ccar2), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000024895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55545044:55560184:-1 gene:ENSRNOG00000018295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC169115 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2610301G19Rik protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7128975), partial cds. // chr15 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// FQ211644 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YL03 mRNA sequence. // chr15 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000054714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55545762:55565421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT021615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 21 // 42 // 1 /// NONRATT021611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT021612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT021616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT021613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_001134571 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to 9930012K11Rik protein (RGD1308117), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55561684:55565495:-1 gene:ENSRNOG00000008351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT021619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55545762:55565421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT021618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001007622 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 2 (Pdlim2), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 2 (Pdlim2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 2 (Pdlim2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 2 (Pdlim2), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 2 (Pdlim2), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55569718:55581479:-1 gene:ENSRNOG00000008543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AY531526 // GenBank // Rattus norvegicus PDLIM2 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC079091 // GenBank // Rattus norvegicus PDZ and LIM domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:94060 IMAGE:7123600), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000054706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55570077:55612088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT021623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT021624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001005762 // RefSeq // Rattus norvegicus sorbin and SH3 domain containing 3 (Sorbs3), mRNA. // chr15 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// XM_006252242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorbin and SH3 domain containing 3 (Sorbs3), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 44 // 44 // 0 /// XM_006252243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorbin and SH3 domain containing 3 (Sorbs3), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000012056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55585616:55616959:-1 gene:ENSRNOG00000008829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// AF439378 // GenBank // Rattus norvegicus vinexin alpha mRNA, partial cds. // chr15 // 100 // 70 // 33 // 33 // 0 /// BC083666 // GenBank // Rattus norvegicus sorbin and SH3 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:94509 IMAGE:7135547), complete cds. // chr15 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// XM_006252248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorbin and SH3 domain containing 3 (Sorbs3), transcript variant X8, mRNA. // chr15 // 43 // 43 // 20 // 47 // 1 /// GENSCAN00000054706 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55570077:55612088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 79 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT021627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT021626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 60 // 60 // 28 // 47 // 1 /// NONRATT021630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 18 // 47 // 1 /// NONRATT021632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1
NM_134367 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 3, catalytic subunit, gamma isozyme (Ppp3cc), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079027 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 3, catalytic subunit, gamma isoform, mRNA (cDNA clone MGC:93954 IMAGE:7114037), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GQ376198 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma transcript variant 1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GQ376199 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma transcript variant 2 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GQ376200 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma transcript variant 3 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000012993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55622790:55692739:-1 gene:ENSRNOG00000009745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55622790:55653660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT021635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT021636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001107275 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 14 (Slc39a14), mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55707607:55752619:-1 gene:ENSRNOG00000009832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55710626:55717107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT021639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55718975:55768481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT021640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001107276 // RefSeq // Rattus norvegicus piwi-like RNA-mediated gene silencing 2 (Piwil2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000013284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55760795:55839495:-1 gene:ENSRNOG00000009871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000054710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55779549:55811985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 59 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001031653 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide D (Polr3d), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55852988:55857657:-1 gene:ENSRNOG00000010028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC099167 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide D, 44kDa, mRNA (cDNA clone MGC:116334 IMAGE:7382125), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000001703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55831663:55873822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1 /// NONRATT021644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_031323 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 1 (Bmp1), mRNA. // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000046054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55889918:55934263:-1 gene:ENSRNOG00000010890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000001678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55890473:55934144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_017342 // RefSeq // Rattus norvegicus surfactant protein C (Sftpc), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55935061:55937997:-1 gene:ENSRNOG00000011177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC072693 // GenBank // Rattus norvegicus surfactant protein C, mRNA (cDNA clone MGC:91727 IMAGE:7099876), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55935681:55941410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT021650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001170474 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 160, member B2 (Fam160b2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000016209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:55995013:56012410:-1 gene:ENSRNOG00000012014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// BC168691 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 160, member B2, mRNA (cDNA clone MGC:188555 IMAGE:7934515), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000001686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:55996555:56012381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT021654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
NM_001108385 // RefSeq // Rattus norvegicus dematin actin binding protein (Dmtn), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016555 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:56016282:56040736:-1 gene:ENSRNOG00000012273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:56016282:56043902:-1 gene:ENSRNOG00000012273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC166453 // GenBank // Rattus norvegicus erythrocyte protein band 4.9, mRNA (cDNA clone MGC:187700 IMAGE:8374835), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000001699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56017374:56068025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT021655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT021656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_019198 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 17 (Fgf17), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor 17 (Fgf17), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000017723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:56050174:56055493:-1 gene:ENSRNOG00000012912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB008682 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FGF-17, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56017374:56068025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT021663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_203340 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleophosmin/nucleoplasmin 2 (Npm2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000032832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:56060924:56068025:-1 gene:ENSRNOG00000025638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000001699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56017374:56068025:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001108386 // RefSeq // Rattus norvegicus exportin 7 (Xpo7), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:56082710:56122236:-1 gene:ENSRNOG00000013288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56082710:56138732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT021668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT021671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XM_002725133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L31-like (LOC100359986), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_002728271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L31-like (LOC100359986), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000039731 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:56435817:56436318:-1 gene:ENSRNOG00000025536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000054923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:56403831:56436315:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001109331 // RefSeq // Rattus norvegicus dolichyl-phosphate mannosyltransferase polypeptide 3 (Dpm3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045477 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:207997009:207997524:1 gene:ENSRNOG00000029077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:207997252:207997464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ223927 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA82YM05 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107278 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 3a (Fndc3a), mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006252301 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 3a (Fndc3a), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000066888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:58102193:58290602:-1 gene:ENSRNOG00000014478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:58099430:58167924:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT021673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENSRNOT00000058371 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:58529818:58530777:-1 gene:ENSRNOG00000015025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000040178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:58501047:58530781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT021679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_133413 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteinyl leukotriene receptor 2 (Cysltr2), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteinyl leukotriene receptor 2 (Cysltr2), mRNA. // chr15 // 78 // 88 // 18 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:58626639:58627568:-1 gene:ENSRNOG00000015042 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB052661 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CysLT2, complete cds. // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:58626639:58627568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_017045 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoblastoma 1 (Rb1), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:58804732:58942062:-1 gene:ENSRNOG00000016029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:58857026:58990839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001006963 // RefSeq // Rattus norvegicus integral membrane protein 2B (Itm2b), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:58977919:59000926:-1 gene:ENSRNOG00000016271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083735 // GenBank // Rattus norvegicus integral membrane protein 2B, mRNA (cDNA clone MGC:94644 IMAGE:7191589), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ210227 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA32YA06 mRNA sequence. // chr15 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// FQ210419 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA29YA15 mRNA sequence. // chr15 // 80 // 86 // 20 // 25 // 0 /// FQ219414 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YG12 mRNA sequence. // chr15 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// FQ219676 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YL09 mRNA sequence. // chr15 // 76 // 86 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT021686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:58857026:58990839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001106049 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 15 (Nudt15), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 15 (Nudt15), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:59141909:59178909:-1 gene:ENSRNOG00000025239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:59141912:59174075:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT021689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001134727 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 1 (Lrch1), mRNA. // chr15 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// XM_006252311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 1 (Lrch1), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000047192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:60507567:60691597:-1 gene:ENSRNOG00000009412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// BC166585 // GenBank // Rattus norvegicus leucine-rich repeats and calponin homology (CH) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188329 IMAGE:7444640), complete cds. // chr15 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000014813 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60527339:60642562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT021695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT021696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1
NM_001024803 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 63 (Lrrc63), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252325 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 63 (Lrrc63), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252327 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 63 (Lrrc63), transcript variant X3, mRNA. // chr15 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:60845440:60881742:-1 gene:ENSRNOG00000038291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC097406 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG5407-PA, isoform A, mRNA (cDNA clone MGC:114451 IMAGE:7453994), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT021699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60819719:60885028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT021700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_003752821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 2 (Esco2), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000021320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:49075099:49090208:1 gene:ENSRNOG00000015921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000041958 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:71568902:71570683:-1 gene:ENSRNOG00000033952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000045917 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:60898258:60900042:-1 gene:ENSRNOG00000029520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000001774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:49070369:49090208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:60889361:60900039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:71568902:71570683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT020621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_001012157 // RefSeq // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 3 (Cog3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000000168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61462682:61512608:-1 gene:ENSRNOG00000000155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC083901 // GenBank // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 3, mRNA (cDNA clone MGC:95259 IMAGE:7133573), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000021535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61462799:61512529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 46 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT021703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT021705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 70 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT021702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NM_001013187 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 30 (Slc25a30), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001389 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:61519038:61534942:-1 gene:ENSRNOG00000001052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC087106 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 30, mRNA (cDNA clone MGC:94707 IMAGE:7193157), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000021527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61521328:61534942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT021707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_031042 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIF, polypeptide 2 (Gtf2f2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000044254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61647681:61771945:-1 gene:ENSRNOG00000029316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 100 // 16 // 17 // 0 /// BC091112 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIF, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:108542 IMAGE:7381243), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// D10665 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RAP30, complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// FQ232071 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YB21 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// FQ233324 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YF04 mRNA sequence. // chr15 // 79 // 82 // 11 // 14 // 0 /// L01267 // GenBank // Rattus norvegicus helicase (RAP30) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001024875 // RefSeq // Rattus norvegicus GPALPP motifs containing 1 (Gpalpp1), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61855088:61872506:-1 gene:ENSRNOG00000001037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC097485 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1200011I18, mRNA (cDNA clone MGC:114554 IMAGE:7459542), complete cds. // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// FQ214079 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YA03 mRNA sequence. // chr15 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000025209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61855190:61877433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT021713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001109104 // RefSeq // Rattus norvegicus stress-associated endoplasmic reticulum protein family member 2 (Serp2), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006252341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stress-associated endoplasmic reticulum protein family member 2 (Serp2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:62376861:62400750:-1 gene:ENSRNOG00000038228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:62385150:62523418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT021720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT021720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000032295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:62895970:62898184:-1 gene:ENSRNOG00000022094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000032301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:62892256:62898184:-1 gene:ENSRNOG00000022094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:62892256:62899893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
NM_001106050 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 15 (Dnajc15), mRNA. // chr15 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// ENSRNOT00000012530 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:63670037:63734653:-1 gene:ENSRNOG00000009063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// XR_360079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 15 (Dnajc15), transcript variant X1, misc_RNA. // chr15 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONRATT021728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// GENSCAN00000039014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:63670208:63734494:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONRATT021730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1
XM_003751515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 216, member B (Fam216b), mRNA. // chr15 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// XM_003752831 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 216, member B (Fam216b), mRNA. // chr15 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:63952657:63962575:-1 gene:ENSRNOG00000021943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000024974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:63952676:63962575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT021731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_057149 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 11 (Tnfsf11), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65727594:65757778:-1 gene:ENSRNOG00000009559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF187319 // GenBank // Rattus norvegicus receptor activator of NF-kB ligand mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049056 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:64155680:64186116:-1 gene:ENSRNOG00000049547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:64155680:64185972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT021756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65727594:65733985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_012773 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 11 (Akap11), mRNA. // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000013333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:64392749:64411608:-1 gene:ENSRNOG00000009987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000058148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:64390133:64420079:-1 gene:ENSRNOG00000009987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:64396935:64440298:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// U48288 // GenBank // Rattus norvegicus A-kinase anchoring protein AKAP 220 mRNA, complete cds. // chr15 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_002728276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diacylglycerol kinase, eta (Dgkh), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000044063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:64471270:64535926:-1 gene:ENSRNOG00000010065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:64471304:64625227:-1 gene:ENSRNOG00000010065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:64479078:64535459:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 53 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT021739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001177863 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00053-like (LOC100360244), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65536300:65537142:-1 gene:ENSRNOG00000029808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65536300:65540166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
ENSRNOT00000049690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65538411:65540166:-1 gene:ENSRNOG00000033141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY383709 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00054 mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65536300:65540166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_030854 // RefSeq // Rattus norvegicus leukocyte cell derived chemotaxin 1 (Lect1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65587063:65611651:-1 gene:ENSRNOG00000012821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF051425 // GenBank // Rattus norvegicus chondromodulin-1 (Chm-1) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC127493 // GenBank // Rattus norvegicus leukocyte cell derived chemotaxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:156632 IMAGE:8369609), complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65585619:65605535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT021753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT021755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_022868 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin 8 (Pcdh8), mRNA. // chr15 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AB026154 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for arcadlin, complete cds. // chr15 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000017599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65857394:65861171:-1 gene:ENSRNOG00000013101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:65857394:65879970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT021758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT021759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0
NM_053766 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain binding protein 4 (Wbp4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000015605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:65410542:65436878:-1 gene:ENSRNOG00000011678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC089052 // GenBank // Rattus norvegicus WW domain binding protein 4 (formin binding protein 21), mRNA (cDNA clone MGC:105552 IMAGE:7307299), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT021744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006222071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (LOC100361180), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006252376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S17-like (LOC100361180), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000013868 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:67829332:67829898:-1 gene:ENSRNOG00000048927 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000037917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:67827012:67829875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 80 // 63 // 4 // 5 // 0
ENSRNOT00000046240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:69146646:69147756:-1 gene:ENSRNOG00000030871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000005547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:69147239:69147688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT021760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_001074393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diaphanous-related formin 3 (Diaph3), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002728299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diaphanous-related formin 3 (Diaph3), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:73786132:73958786:-1 gene:ENSRNOG00000008986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000044837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:73778439:73850414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107280 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin 20 (Pcdh20), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:75353079:75359335:-1 gene:ENSRNOG00000013306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000057935 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:76750683:76752215:-1 gene:ENSRNOG00000038078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000007614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:76750814:76752215:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001191688 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin 9 (Pcdh9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000057924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:81283365:81286488:-1 gene:ENSRNOG00000038068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// FQ211505 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YE17 mRNA sequence. // chr15 // 96 // 62 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:81269974:81383493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0
NM_001191688 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin 9 (Pcdh9), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:81283365:81286488:-1 gene:ENSRNOG00000038068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211505 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YE17 mRNA sequence. // chr15 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:81269974:81383493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000048659 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:81524807:81525579:-1 gene:ENSRNOG00000033239 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:81524920:81549725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
AJ566901 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for putative connective protein (cnt-1 gene). // chr15 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001106054 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 1 (Klhl1), mRNA. // chr15 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000063800 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:83811191:84250457:-1 gene:ENSRNOG00000031100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// GENSCAN00000032368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:83811358:84200228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006222073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like (RGD1559682), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000037377 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:85116003:85116720:-1 gene:ENSRNOG00000022492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:84991079:85116680:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT021779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
XM_003752836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dachshund homolog 1-like (LOC306096), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011926 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:85751724:85766068:-1 gene:ENSRNOG00000008834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT021781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:85620280:85702587:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000047227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:85753076:85863291:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_194353 // RefSeq // Rattus norvegicus SET translocation-like 1 (Setl1), mRNA. // chr15 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000011656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:85614076:85615417:-1 gene:ENSRNOG00000008814 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// AY366388 // GenBank // Rattus norvegicus liver regeneration related protein LRRGR00002 mRNA, complete cds. // chr15 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000020363 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:85614540:85615398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT021780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_001075637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L27-like (RGD1560069), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_344446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L27-like (RGD1560069), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000057891 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:86115132:86115542:-1 gene:ENSRNOG00000038041 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:86063193:86115542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 86 // 61 // 12 // 14 // 0
XM_001081273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitotic spindle organizing protein 1 (Mzt1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039400 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:86948035:86953141:-1 gene:ENSRNOG00000024813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001127483 // RefSeq // Rattus norvegicus DIS3 exosome endoribonuclease and 3-5 exoribonuclease (Dis3), mRNA. // chr15 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000037588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:86977711:87005406:-1 gene:ENSRNOG00000009125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC166824 // GenBank // Rattus norvegicus DIS3 mitotic control homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188706 IMAGE:8370691), complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// FQ210067 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA35YC21 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000055135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:86978481:87005511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT021788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0
NM_001107281 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 12 (Klf12), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 12 (Klf12), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252412 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 12 (Klf12), transcript variant X5, mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_360139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 12 (Klf12), transcript variant X9, misc_RNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:88095615:88331655:-1 gene:ENSRNOG00000009145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000000082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:88091136:88203904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NONRATT021798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000012600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:89697677:89871384:-1 gene:ENSRNOG00000009431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:89697677:89871384:-1 gene:ENSRNOG00000009431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:89714160:89871384:-1 gene:ENSRNOG00000009431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// GENSCAN00000039418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:89697677:89706802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:89709343:89719863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000029855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:89739061:89785016:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_003752840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome b-c1 complex subunit 9-like (RGD2320734), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:89888371:89888805:-1 gene:ENSRNOG00000009521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT021800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000029850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:89888389:89888777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_001109105 // RefSeq // Rattus norvegicus COMM domain containing 6 (Commd6), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057830 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:89902294:89908870:-1 gene:ENSRNOG00000038012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COMM domain containing 6 (Commd6), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT021801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT021802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:89904481:89908715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSRNOT00000057823 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:87779723:87780141:-1 gene:ENSRNOG00000038010 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:87774013:87823629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSRNOT00000037179 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:90889560:90890329:-1 gene:ENSRNOG00000024294 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:90889346:91039580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100568 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 3 (Fbxl3), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 3 (Fbxl3), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:97135296:97155065:-1 gene:ENSRNOG00000010102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC092649 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7319310), partial cds. // chr15 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000056834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:97137135:97151157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT021837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// NONRATT021838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001106055 // RefSeq // Rattus norvegicus MYC binding protein 2 (Mycbp2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 85 // 85 // 0 /// XM_006252421 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase (Mycbp2), mRNA. // chr15 // 100 // 26 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000014583 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:15:97165491:97355788:-1 gene:ENSRNOG00000010479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 99 // 95 // 80 // 81 // 0 /// GENSCAN00000011702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:97183914:97360544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 69 // 59 // 59 // 0 /// GENSCAN00000037610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:90889346:91039580:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 45 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000056825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:97166314:97183442:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 11 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT021839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 94 // 80 // 80 // 0
NM_017333 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelin receptor type B (Ednrb), mRNA. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:91502602:91531979:-1 gene:ENSRNOG00000010997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// X57764 // GenBank // Rat mRNA for ET-B endothelin receptor. // chr15 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:91502828:91513051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT021811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NONRATT021812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000012828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:92116230:92118075:-1 gene:ENSRNOG00000009669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000010364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:92090252:92116868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT021815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT021816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108389 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 219 (Rnf219), mRNA. // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:92127751:92165948:-1 gene:ENSRNOG00000009690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000010377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:92147019:92152594:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT021817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0
NM_001277160 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 26 (Rbm26), mRNA. // chr15 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000013255 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:92760863:92831253:-1 gene:ENSRNOG00000009836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000013297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:92760863:92831253:-1 gene:ENSRNOG00000009836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 85 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000066433 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:92760233:92831253:-1 gene:ENSRNOG00000009836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// XM_006252425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 26 (Rbm26), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 87 // 87 // 40 // 46 // 1 /// GENSCAN00000056211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:92760993:92831241:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT021822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 74 // 74 // 34 // 46 // 1 /// NONRATT021823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// NONRATT021829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONRATT021819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// NONRATT021824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// NONRATT021826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
XM_001077161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit g, mitochondrial-like (RGD1565438), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_344452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit g, mitochondrial-like (RGD1565438), mRNA. // chr15 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051173 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:92840303:92840693:-1 gene:ENSRNOG00000032106 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:92837554:92840693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
ENSRNOT00000039190 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:93223199:93223553:-1 gene:ENSRNOG00000023974 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:93221882:93224021:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001012046 // RefSeq // Rattus norvegicus sprouty homolog 2 (Drosophila) (Spry2), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252438 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sprouty homolog 2 (Drosophila) (Spry2), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:93662947:93665780:-1 gene:ENSRNOG00000010058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089116 // GenBank // Rattus norvegicus sprouty homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:105639 IMAGE:7320532), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000037429 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:95604843:95605734:-1 gene:ENSRNOG00000024486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:95604828:95605609:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0
NM_001107283 // RefSeq // Rattus norvegicus SLIT and NTRK-like family, member 1 (Slitrk1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:96793133:96797171:-1 gene:ENSRNOG00000009209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:96794358:96796448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106057 // RefSeq // Rattus norvegicus SLIT and NTRK-like family, member 6 (Slitrk6), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:98989211:98995830:-1 gene:ENSRNOG00000022337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:98990389:98992911:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT021846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000012902 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:100757969:100758450:1 gene:ENSRNOG00000009655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 69 // 100 // 9 // 13 // 0
ENSRNOT00000040732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:101340954:101341908:-1 gene:ENSRNOG00000032205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 76 // 100 // 13 // 17 // 0 /// GENSCAN00000021992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:101302708:101368404:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 71 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000021995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:101579517:101579723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
XM_006222051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S16-like (LOC102548369), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252448 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S16-like (LOC102548369), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041344 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:103760163:103760624:-1 gene:ENSRNOG00000031960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:103760163:103770538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopachrome tautomerase (Dct), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dopachrome tautomerase (Dct), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:106648825:106680979:-1 gene:ENSRNOG00000008671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014696 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:106661331:106680979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT021855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001107286 // RefSeq // Rattus norvegicus TDP-glucose 4,6-dehydratase (Tgds), mRNA. // chr15 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:106757794:106778765:-1 gene:ENSRNOG00000009661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// BC166991 // GenBank // Rattus norvegicus TDP-glucose 4,6-dehydratase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7309713), partial cds. // chr15 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000014700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:106736112:106780577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT021858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT021859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_133411 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 4 (Abcc4), mRNA. // chr15 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000013366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107127439:107356997:-1 gene:ENSRNOG00000010064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000031036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107127439:107356997:-1 gene:ENSRNOG00000010064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// AF534126 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein C4 (Abcc4) mRNA, complete cds. // chr15 // 91 // 100 // 41 // 45 // 0 /// AY533524 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance-associated protein 4 (Abcc4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// AY533525 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance-associated protein 4 splice variant (Abcc4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 96 // 100 // 43 // 45 // 0 /// GENSCAN00000012498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107241598:107255937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 64 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT021869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 42 // 42 // 19 // 45 // 1 /// NONRATT021870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1 /// GENSCAN00000012504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107258617:107356997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 18 // 18 // 8 // 45 // 1
GENSCAN00000014712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:106880561:107032928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_133411 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 4 (Abcc4), mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 92 // 95 // 0 /// ENSRNOT00000013366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107127439:107356997:-1 gene:ENSRNOG00000010064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 96 // 91 // 91 // 0 /// ENSRNOT00000031036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107127439:107356997:-1 gene:ENSRNOG00000010064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 95 // 95 // 0 /// AF534126 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein C4 (Abcc4) mRNA, complete cds. // chr15 // 96 // 100 // 91 // 95 // 0 /// AY533524 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance-associated protein 4 (Abcc4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 97 // 100 // 92 // 95 // 0 /// AY533525 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance-associated protein 4 splice variant (Abcc4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 97 // 96 // 88 // 91 // 0 /// GENSCAN00000012505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107157720:107207736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 27 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107258617:107356997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 42 // 42 // 40 // 95 // 1 /// GENSCAN00000014705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107127942:107151371:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 26 // 26 // 25 // 95 // 1 /// NONRATT021867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 35 // 35 // 33 // 95 // 1 /// NONRATT021868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 38 // 38 // 36 // 95 // 1 /// NONRATT021865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 14 // 14 // 13 // 95 // 1
NM_133411 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 4 (Abcc4), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107127439:107356997:-1 gene:ENSRNOG00000010064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107127439:107356997:-1 gene:ENSRNOG00000010064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY533524 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance-associated protein 4 (Abcc4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY533525 // GenBank // Rattus norvegicus multidrug resistance-associated protein 4 splice variant (Abcc4) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF534126 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein C4 (Abcc4) mRNA, complete cds. // chr15 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107258617:107356997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000038596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107541022:107591804:-1 gene:ENSRNOG00000010311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000038611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:107546280:107591804:-1 gene:ENSRNOG00000010311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000012497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107541880:107607896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
ENSRNOT00000013475 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:107614426:107614863:-1 gene:ENSRNOG00000010144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0
XM_006222078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 2-like (RGD1563520), mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 2-like (RGD1563520), mRNA. // chr15 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:107659772:107796393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT021878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
GENSCAN00000047085 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:108784743:108793921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000047384 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:108789583:108790589:-1 gene:ENSRNOG00000033283 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0
NM_207588 // RefSeq // Rattus norvegicus oxoglutarate (alpha-ketoglutarate) receptor 1 (Oxgr1), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:108806845:108807858:-1 gene:ENSRNOG00000037884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY191367 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 80 (Gpr80) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:108806845:108807858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
FQ227921 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YD24 mRNA sequence. // chr15 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000034723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:110022517:110073160:-1 gene:ENSRNOG00000011511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 86 // 86 // 12 // 14 // 1 /// NM_001127494 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 24 (Stk24), mRNA. // chr15 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// EU371958 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine Ste20-like kinase 3 (MST3) mRNA, complete cds. // chr15 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1 /// NONRATT021889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 64 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT021890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_057121 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 15 (oligopeptide transporter), member 1 (Slc15a1), transcript variant 1, mRNA. // chr15 // 99 // 100 // 105 // 106 // 0 /// ENSRNOT00000015890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:110194618:110238806:-1 gene:ENSRNOG00000011598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 106 // 106 // 0 /// D50306 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proton-coupled dipeptide cotransporter, complete cds. // chr15 // 99 // 100 // 105 // 106 // 0 /// D50664 // GenBank // Rattus norvegicus PepT1 mRNA for oligopeptide transporter, complete cds. // chr15 // 99 // 100 // 105 // 106 // 0 /// L46873 // GenBank // Rattus norvegicus proton-dependent peptide transporter mRNA, partial cds. // chr15 // 77 // 65 // 53 // 69 // 0 /// NM_001079838 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 15 (oligopeptide transporter), member 1 (Slc15a1), transcript variant 2, mRNA. // chr15 // 22 // 22 // 23 // 106 // 1 /// AY860424 // GenBank // Rattus norvegicus pineal gland-specific PEPT1 (Pept1) mRNA, complete cds. // chr15 // 22 // 22 // 23 // 106 // 1 /// GENSCAN00000017879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:110144606:110240378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 86 // 91 // 91 // 0 /// NONRATT021892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 106 // 106 // 0 /// NONRATT021891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 22 // 22 // 23 // 106 // 1
NM_001105759 // RefSeq // Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 9 (Dock9), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 52 // 52 // 0 /// XM_006252497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 9 (Dock9), transcript variant X17, mRNA. // chr15 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// XM_006252498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 9 (Dock9), transcript variant X18, mRNA. // chr15 // 100 // 98 // 55 // 55 // 0 /// ENSRNOT00000064705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111337693:111600206:-1 gene:ENSRNOG00000011969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 52 // 52 // 0 /// GENSCAN00000016354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:111373790:111510801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 75 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT021893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 98 // 55 // 55 // 0 /// GENSCAN00000016362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:111340760:111368436:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 14 // 14 // 8 // 56 // 1 /// NONRATT021897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 16 // 16 // 9 // 56 // 1 /// NONRATT021900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 14 // 14 // 8 // 56 // 1
ENSRNOT00000036001 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:111663471:111664285:-1 gene:ENSRNOG00000025918 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr15 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001079710 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 18 (Gpr18), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111710735:111714463:-1 gene:ENSRNOG00000012628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC128782 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 18, mRNA (cDNA clone MGC:156838 IMAGE:7375738), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:111710829:111711824:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT021903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001109386 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 183 (Gpr183), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:111752257:111763777:-1 gene:ENSRNOG00000025094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:111734883:111757213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT021904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108391 // RefSeq // Rattus norvegicus Zic family member 5 (Zic5), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:112280174:112286885:-1 gene:ENSRNOG00000014358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:112280174:112285476:-1 gene:ENSRNOG00000014358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:112273274:112286529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT021912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025634 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-glutamylamine cyclotransferase (Ggact), mRNA. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006252512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-glutamylamine cyclotransferase (Ggact), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006252513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-glutamylamine cyclotransferase (Ggact), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// XM_006252515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-glutamylamine cyclotransferase (Ggact), transcript variant X4, mRNA. // chr15 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// XM_006252518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-glutamylamine cyclotransferase (Ggact), transcript variant X7, mRNA. // chr15 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// XM_006252520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-glutamylamine cyclotransferase (Ggact), transcript variant X9, mRNA. // chr15 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000019158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:112688814:112712357:-1 gene:ENSRNOG00000027040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC098699 // GenBank // Rattus norvegicus AIG2-like domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:112665 IMAGE:7386922), complete cds. // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT021915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:112689304:112691802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1
NM_001134414 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4 (Tmtc4), mRNA. // chr15 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:112720474:112776171:-1 gene:ENSRNOG00000014310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// BC166723 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 4, mRNA (cDNA clone MGC:188439 IMAGE:7933541), complete cds. // chr15 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:112720718:112786842:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT021919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT021920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0
NM_153630 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium leak channel, non-selective (Nalcn), mRNA. // chr15 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000006624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:113117194:113455059:-1 gene:ENSRNOG00000004752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000057404 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:15:113117194:113455059:-1 gene:ENSRNOG00000004752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AF078779 // GenBank // Rattus norvegicus putative four repeat ion channel mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// AY555273 // GenBank // Rattus norvegicus four domain-type voltage-gated ion channel alpha-1 subunit (Nca) mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// EF427668 // GenBank // Rattus norvegicus brain voltage-gated cation channel mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// EF492985 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley brain voltage-gated cation channel mRNA, complete cds. // chr15 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000005263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:113132929:113205977:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT021923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0
NM_022223 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 14 (Fgf14), mRNA. // chr15 // 88 // 76 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:113765455:114450472:-1 gene:ENSRNOG00000009288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:113762510:113991719:-1 gene:ENSRNOG00000009288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AB008908 // GenBank // Rattus norvegicus Fgf14b mRNA for fibroblast growth factor 14b, complete cds. // chr15 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AB079500 // GenBank // Rattus norvegicus FGF14 mRNA for fibroblast growth factor14, complete cds. // chr15 // 88 // 76 // 22 // 25 // 0 /// AF348523 // GenBank // Rattus norvegicus fibroblast growth factor-like factor 4D mRNA, partial cds. // chr15 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:113765455:113800402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT021928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// GENSCAN00000028661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:113822696:113943635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_031529 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoic acid receptor, beta (Rarb), mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006251701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoic acid receptor, beta (Rarb), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:14166625:14306790:1 gene:ENSRNOG00000024061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:13963828:14306790:1 gene:ENSRNOG00000024061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:13963828:14306790:1 gene:ENSRNOG00000024061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:14288223:14306790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0
NM_001017506 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatid associated (Spert), mRNA. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatid associated (Spert), transcript variant X1, mRNA. // chr15 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// XM_006252329 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatid associated (Spert), transcript variant X2, mRNA. // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:61353105:61361569:-1 gene:ENSRNOG00000047413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC079300 // GenBank // Rattus norvegicus spermatid associated, mRNA (cDNA clone MGC:94437 IMAGE:7134526), complete cds. // chr15 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:61353273:61387231:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0
NM_001107287 // RefSeq // Rattus norvegicus FERM, RhoGEF (Arhgef) and pleckstrin domain protein 1 (chondrocyte-derived) (Farp1), mRNA. // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000015271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:109829728:110020013:1 gene:ENSRNOG00000011203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000021811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:109739137:109833947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XM_006222080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553140 (LOC102553140), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553140 (LOC102553140), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_001108393 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MIZ-type containing 1 (Zmiz1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006252537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MIZ-type containing 1 (Zmiz1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000014004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:1726706:1932218:1 gene:ENSRNOG00000010488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000017862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:1878926:1928478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT021940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NONRATT021940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_172243 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase F (Ppif), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:1955697:1962447:1 gene:ENSRNOG00000010558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// BC086977 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase F (cyclophilin F), mRNA (cDNA clone MGC:93084 IMAGE:7193156), complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// U68544 // GenBank // Rattus norvegicus cyclophilin D mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr16 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:1955759:1961616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT021950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000030848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2037228:2037500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT021951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_001011918 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A11 (Anxa11), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A11 (Anxa11), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:3833120:3877953:-1 gene:ENSRNOG00000010984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// BC083812 // GenBank // Rattus norvegicus annexin A11, mRNA (cDNA clone MGC:94870 IMAGE:7110191), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:3833832:3854368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// NONRATT022875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
XM_001056921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytoplasmic polyadenylated homeobox (Cphx), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035065 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:3753930:3756936:-1 gene:ENSRNOG00000025433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:3723296:3761986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006252678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus double homeobox B-like 1 (Duxbl1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_224643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus double homeobox B-like 1 (Duxbl1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000052224 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:3723311:3728726:-1 gene:ENSRNOG00000025408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:3723296:3761986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
GENSCAN00000030847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2156880:2168696:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001134467 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 116, member A (Fam116a), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000016233 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2252208:2302165:1 gene:ENSRNOG00000011636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000030849 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2271649:2300127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 48 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT021954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT021957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NM_024151 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 4 (Arf4), mRNA. // chr16 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2313285:2330255:1 gene:ENSRNOG00000012623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC063167 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:72808 IMAGE:6921397), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ228422 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA8YK14 mRNA sequence. // chr16 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// FQ234248 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YK16 mRNA sequence. // chr16 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// L12383 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor 4 mRNA, complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000030842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2320053:2329411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT021959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT021960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
GENSCAN00000030846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2356183:2478637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 57 // 57 // 0 /// GENSCAN00000031464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2490338:2509031:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 13 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT021962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 11 // 11 // 8 // 76 // 1 /// NONRATT021964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 11 // 11 // 8 // 76 // 1
NM_001170749 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and SOCS box-containing 14 (Asb14), mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2511996:2531483:1 gene:ENSRNOG00000013346 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2517882:2537916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT021968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT021969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001109106 // RefSeq // Rattus norvegicus HESX homeobox 1 (Hesx1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2607470:2609575:1 gene:ENSRNOG00000014133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT021970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001191937 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17 receptor D (Il17rd), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2643153:2704143:1 gene:ENSRNOG00000021966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2678221:2716507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_006252576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 3 (Arhgef3), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// XM_006252577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 3 (Arhgef3), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NM_001106061 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 3 (Arhgef3), mRNA. // chr16 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1 /// ENSRNOT00000019511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:2925678:2994155:1 gene:ENSRNOG00000014363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1 /// GENSCAN00000031478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:2923557:2984099:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT021973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 68 // 68 // 27 // 40 // 1 /// NONRATT021975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1
XM_002725148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 208, member A (Fam208a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_002725149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 208, member A (Fam208a), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006222091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 208, member A (Fam208a), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000020271 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:3019039:3073894:1 gene:ENSRNOG00000014750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000074069 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:3019039:3073200:1 gene:ENSRNOG00000014750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000042902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:3019039:3073894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT021977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 13 // 43 // 1
NM_170787 // RefSeq // Rattus norvegicus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 (Erc2), mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELKS/RAB6-interacting/CAST family member 2 (Erc2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000020427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:3260477:3645293:1 gene:ENSRNOG00000015148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000047118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:3260477:3645293:1 gene:ENSRNOG00000015148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// AF541925 // GenBank // Rattus norvegicus ERC2 mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr16 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// AY049038 // GenBank // Rattus norvegicus CAST1 mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT021982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_022631 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 5A (Wnt5a), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:4414512:4432113:1 gene:ENSRNOG00000015618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB244721 // GenBank // Rattus norvegicus Wnt5a mRNA for wingless-related MMTV integration site 5a, complete cds. // chr16 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// AF188333 // GenBank // Rattus norvegicus Wnt-5a (Wnt-5a) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// AY819646 // GenBank // Rattus norvegicus WNT5A (Wnt5a) mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT021991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:4385912:4431508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
XM_006222148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1-like (LOC102547963), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000071042 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:4936582:4943456:1 gene:ENSRNOG00000047131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000074596 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:5021072:5027946:1 gene:ENSRNOG00000049723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:4934174:4943456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:5018875:5027946:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000023857 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:5158163:5158935:1 gene:ENSRNOG00000027058 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 79 // 82 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000037057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:5158163:5162190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
ENSRNOT00000048438 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:5930388:5930866:1 gene:ENSRNOG00000031826 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_207589 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein K (Selk), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000020284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:5967057:5975370:1 gene:ENSRNOG00000014624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AY319924 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein mRNA, complete cds. // chr16 // 82 // 92 // 9 // 11 // 0 /// BC088086 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein K, mRNA (cDNA clone MGC:108512 IMAGE:7326199), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// FQ217552 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA23YL21 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT021994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_003752868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ARP8 actin-related protein 8 homolog (yeast) (Actr8), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006222147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ARP8 actin-related protein 8 homolog (yeast) (Actr8), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020750 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:5979233:5993600:1 gene:ENSRNOG00000015280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:5972918:5993600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT021996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_198731 // RefSeq // Rattus norvegicus choline dehydrogenase (Chdh), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021407 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6009402:6042912:1 gene:ENSRNOG00000015859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY365023 // GenBank // Rattus norvegicus choline dehydrogenase precursor, mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// BC085787 // GenBank // Rattus norvegicus choline dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:93763 IMAGE:7108667), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6036021:6041558:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XR_340993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ac2-086 (LOC361108), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_360331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ac2-086 (LOC361108), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012906 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:6370277:6413849:1 gene:ENSRNOG00000009738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY321331 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-086 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6397310:6460347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001191831 // RefSeq // Rattus norvegicus decapping mRNA 1A (Dcp1a), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6476320:6517715:1 gene:ENSRNOG00000016015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6476380:6568354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_022592 // RefSeq // Rattus norvegicus transketolase (Tkt), mRNA. // chr16 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// XM_006252662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transketolase (Tkt), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000021862 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6543527:6568461:1 gene:ENSRNOG00000016064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ232736 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YJ22 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// U09256 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley transketolase mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6476380:6568354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001135866 // RefSeq // Rattus norvegicus RFT1 homolog (S. cerevisiae) (Rft1), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252581 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RFT1 homolog (S. cerevisiae) (Rft1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6645368:6679675:1 gene:ENSRNOG00000021805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6645421:6680237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_031647 // RefSeq // Rattus norvegicus Scm-like with four mbt domains 1 (Sfmbt1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006252655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Scm-like with four mbt domains 1 (Sfmbt1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006252658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Scm-like with four mbt domains 1 (Sfmbt1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000022865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6708903:6821329:1 gene:ENSRNOG00000016645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB032164 // GenBank // Rattus norvegicus Sfmbt mRNA for polycomb-group protein, complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// BC081770 // GenBank // Rattus norvegicus Scm-like with four mbt domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:93349 IMAGE:7132495), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// FQ235313 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YK18 mRNA sequence. // chr16 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1 /// GENSCAN00000040548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6702231:6820839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NONRATT022017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT022016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6702231:6820839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NONRATT022016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_198774 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 110 (Tmem110), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6829242:6885526:1 gene:ENSRNOG00000017051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088092 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 110, mRNA (cDNA clone MGC:108529 IMAGE:7368117), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6873845:6891155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT022023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_181368 // RefSeq // Rattus norvegicus musculoskeletal, embryonic nuclear protein 1 (Mustn1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6889473:6891725:1 gene:ENSRNOG00000017369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY254906 // GenBank // Rattus norvegicus fracture callus protein MUSTANG mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158570 // GenBank // Rattus norvegicus musculoskeletal, embryonic nuclear protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187300 IMAGE:9092791), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6873845:6891155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_019369 // RefSeq // Rattus norvegicus inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain family, member 4 (Itih4), mRNA. // chr16 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000048344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6897103:6912272:1 gene:ENSRNOG00000017381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000061294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6897103:6912272:1 gene:ENSRNOG00000017381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC089806 // GenBank // Rattus norvegicus inter alpha-trypsin inhibitor, heavy chain 4, mRNA (cDNA clone MGC:108706 IMAGE:7326076), complete cds. // chr16 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// FQ219717 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YH23 mRNA sequence. // chr16 // 77 // 45 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6897118:6913789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT022026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0
NM_001013134 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA-related kinase 4 (Nek4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 4 (Nek4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:6961230:7004141:1 gene:ENSRNOG00000017997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088323 // GenBank // Rattus norvegicus NIMA (never in mitosis gene a)-related kinase 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7326028), complete cds. // chr16 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// GENSCAN00000012782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6965857:7025663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT022030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT022029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001007683 // RefSeq // Rattus norvegicus glycosyltransferase 8 domain containing 1 (Glt8d1), mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000013291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7011033:7025985:1 gene:ENSRNOG00000018179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7017059:7025985:1 gene:ENSRNOG00000018179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AY325256 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Da2-24 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// BC079066 // GenBank // Rattus norvegicus glycosyltransferase 8 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94018 IMAGE:7121464), complete cds. // chr16 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000012782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:6965857:7025663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// NONRATT022031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT022034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT022036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
XM_006252683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polybromo 1 (Pbrm1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016581 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:7037836:7128727:1 gene:ENSRNOG00000028227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016599 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:7037836:7128727:1 gene:ENSRNOG00000028227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017492 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:7037836:7128727:1 gene:ENSRNOG00000028227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7037836:7128727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001009271 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-nucleotidase domain containing 2 (Nt5dc2), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7141051:7149109:1 gene:ENSRNOG00000018358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC088431 // GenBank // Rattus norvegicus 5-nucleotidase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:95062 IMAGE:7124640), complete cds. // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7141109:7149032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001034105 // RefSeq // Rattus norvegicus troponin C type 1 (slow) (Tnnc1), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7220777:7223907:1 gene:ENSRNOG00000018943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ062205 // GenBank // Rattus norvegicus cardiac troponin C mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000012805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7220777:7223730:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001100882 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, immunoglobulin domain (Ig), short basic domain, secreted, (semaphorin) 3G (Sema3g), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7231864:7243496:1 gene:ENSRNOG00000018952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7231901:7242250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107292 // RefSeq // Rattus norvegicus BRCA1 associated protein-1 (ubiquitin carboxy-terminal hydrolase) (Bap1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7265075:7273901:1 gene:ENSRNOG00000019097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7265479:7272777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT022050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT022049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001030037 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 7 (Capn7), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000026323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7371493:7407436:1 gene:ENSRNOG00000019273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC099770 // GenBank // Rattus norvegicus calpain 7, mRNA (cDNA clone MGC:124688 IMAGE:7932056), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT022056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000012803 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7371646:7408421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 55 // 55 // 24 // 44 // 1 /// NONRATT022057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001107293 // RefSeq // Rattus norvegicus ELL associated factor 1 (Eaf1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7523081:7537830:1 gene:ENSRNOG00000019559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7523977:7536291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001012047 // RefSeq // Rattus norvegicus biotinidase (Btd), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252612 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus biotinidase (Btd), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus biotinidase (Btd), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006252620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus biotinidase (Btd), transcript variant X12, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000061063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:7706028:7712859:1 gene:ENSRNOG00000019656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC090017 // GenBank // Rattus norvegicus biotinidase, mRNA (cDNA clone MGC:109548 IMAGE:7325227), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:7706046:7712562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT022074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT022073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT022065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT022066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT022067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT022068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT022072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_003752864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 (Galnt15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252732 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 15 (Galnt15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000065618 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:8046389:8091707:1 gene:ENSRNOG00000019718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8046473:8094869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001107295 // RefSeq // Rattus norvegicus oxidoreductase NAD-binding domain containing 1 (Oxnad1), mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006252624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxidoreductase NAD-binding domain containing 1 (Oxnad1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8124248:8153317:1 gene:ENSRNOG00000019760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// NONRATT022079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT022081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT022082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT022083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000008689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8132843:8217712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT022084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_019188 // RefSeq // Rattus norvegicus microseminoprotein, beta (Msmb), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8197305:8217885:1 gene:ENSRNOG00000039786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U65486 // GenBank // Rattus norvegicus beta-microseminoprotein precursor (PSP94) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8132843:8217712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT022085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT022089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001034007 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 4 (Ncoa4), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NM_001034008 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 4 (Ncoa4), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8226271:8240323:1 gene:ENSRNOG00000019768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8219983:8240323:1 gene:ENSRNOG00000019768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC160817 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 4, mRNA (cDNA clone MGC:187270 IMAGE:7454028), complete cds. // chr16 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8232194:8238591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// BC061839 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:5600078, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr16 // 93 // 82 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT022090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT022088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT022092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_031339 // RefSeq // Rattus norvegicus poly (ADP-ribose) glycohydrolase (Parg), mRNA. // chr16 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8267358:8375027:1 gene:ENSRNOG00000019978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB019366 // GenBank // Rattus norvegicus Parg mRNA for poly(ADP-ribose) glycohydrolase, complete cds. // chr16 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8274195:8390503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT022095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
NM_001106062 // RefSeq // Rattus norvegicus oxoglutarate dehydrogenase-like (Ogdhl), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000027054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8417213:8439689:1 gene:ENSRNOG00000019955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000008688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8408432:8439225:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT022099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT022100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1
NM_001107296 // RefSeq // Rattus norvegicus excision repair cross-complementation group 6 (Ercc6), mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// XM_006252734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6 (Ercc6), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000064255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:10703928:10770565:1 gene:ENSRNOG00000030017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000008828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:10703928:10767540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT022131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT022132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_145767 // RefSeq // Rattus norvegicus dorsal root ganglia homeobox (Drgx), mRNA. // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// XM_006252733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dorsal root ganglia homeobox (Drgx), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:10789827:10819506:1 gene:ENSRNOG00000020045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// U29174 // GenBank // Rattus norvegicus paired-like homeodomain transcription factor (DRG11) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:10789923:10818173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
XM_006222114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 170, member B (Fam170b), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027193 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:11038525:11040780:1 gene:ENSRNOG00000020077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11038525:11040780:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 77 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT022142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0
NM_001029920 // RefSeq // Rattus norvegicus V-set and transmembrane domain containing 4 (Vstm4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:11056305:11135814:1 gene:ENSRNOG00000020078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11079687:11134665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT022143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT022144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001013999 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 18 (Lrrc18), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006252739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 18 (Lrrc18), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// XM_006252740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 18 (Lrrc18), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// XM_006252741 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 18 (Lrrc18), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000027204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:11196541:11218931:1 gene:ENSRNOG00000020080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC081908 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 18, mRNA (cDNA clone MGC:93841 IMAGE:7111390), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1 /// NONRATT022147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001107297 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 22 (Arhgap22), mRNA. // chr16 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0 /// XM_006252742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 22 (Arhgap22), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006252743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 22 (Arhgap22), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006252744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 22 (Arhgap22), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006252745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 22 (Arhgap22), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006252748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 22 (Arhgap22), transcript variant X7, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 22 (Arhgap22), transcript variant X10, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000035915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:11523404:11572152:1 gene:ENSRNOG00000024728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000003408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11553512:11571805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT022148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
XM_006222106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain-containing protein 2-like (RGD1565652), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006222109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain-containing protein 2-like (RGD1565652), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain-containing protein 2-like (RGD1565652), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// XM_006252769 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain-containing protein 2-like (RGD1565652), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000048001 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:11726204:11811825:1 gene:ENSRNOG00000029131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000003394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11734013:11827692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0
NM_001080149 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 20B (Ptpn20b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:11866189:11922331:1 gene:ENSRNOG00000020203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC129117 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 20, mRNA (cDNA clone MGC:156764 IMAGE:7114504), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:11846830:11938598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_024375 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 10 (Gdf10), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D49494 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prepro bone inducing protein, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8531702:8582627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT022101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT022102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001191832 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol binding protein 3, interstitial (Rbp3), mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8598417:8606885:1 gene:ENSRNOG00000020265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8598492:8610174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
XM_006222097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anthrax toxin receptor-like (Antxrl), partial mRNA. // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// XM_006222099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anthrax toxin receptor-like (LOC681303), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// XM_006252713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anthrax toxin receptor-like (LOC681303), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// XM_006252714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anthrax toxin receptor-like (LOC681303), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// XM_006252719 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anthrax toxin receptor-like (Antxrl), partial mRNA. // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000031473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8704377:8727490:1 gene:ENSRNOG00000024590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// XM_006222102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anthrax toxin receptor-like (LOC681303), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000050791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8664321:8751939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_001031654 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A8 (Anxa8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006252627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A8 (Anxa8), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin A8 (Anxa8), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8737581:8752766:1 gene:ENSRNOG00000020270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC099106 // GenBank // Rattus norvegicus annexin A8, mRNA (cDNA clone MGC:116246 IMAGE:7460531), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000050791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8664321:8751939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1
NM_181632 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin XV (Syt15), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin XV (Syt15), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8872758:8883549:1 gene:ENSRNOG00000020287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AB109021 // GenBank // Rattus norvegicus syt XV-a mRNA for synaptotagmin XV-a, complete cds. // chr16 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// BC084685 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin XV, mRNA (cDNA clone MGC:91393 IMAGE:7100793), complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8869616:8880883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_012570 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate dehydrogenase 1 (Glud1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8980462:9014001:1 gene:ENSRNOG00000010222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081841 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate dehydrogenase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93608 IMAGE:7107138), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8971962:9032745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006252722 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multimerin 2 (Mmrn2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:9055402:9075350:1 gene:ENSRNOG00000010662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ218167 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA8YD12 mRNA sequence. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9055499:9074353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006222149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wings apart-like homolog (Drosophila) (Wapal), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT022121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
XM_006222149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wings apart-like homolog (Drosophila) (Wapal), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:9357510:9432068:1 gene:ENSRNOG00000039630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9353719:9432068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT022122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XM_006222149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wings apart-like homolog (Drosophila) (Wapal), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:9357510:9432068:1 gene:ENSRNOG00000039630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9353719:9432068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT022124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
XM_006222149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wings apart-like homolog (Drosophila) (Wapal), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:9357510:9432068:1 gene:ENSRNOG00000039630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9353719:9432068:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT022128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr17 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_024378 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, delta 1 (Grid1), mRNA. // chr16 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// U08255 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley glutamate receptor delta-1 subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000033838 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:9920690:10248222:1 gene:ENSRNOG00000023300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000013485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:9966084:10011423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NR_031790 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-346 (Mir346), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000053687 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:16:9574933:9575030:1 gene:ENSRNOG00000035564 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-346 // miRBase Micro RNA Database // MI0000633 Rattus norvegicus miR-346 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_024378 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, delta 1 (Grid1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, delta 1 (Grid1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033838 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:9920690:10248222:1 gene:ENSRNOG00000023300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U08255 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley glutamate receptor delta-1 subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:10173140:10247784:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:12199230:12272963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000033185 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:10261329:10262211:1 gene:ENSRNOG00000022935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0
XR_360349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (RGD1563356), misc_RNA. // chr16 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060751 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:12849120:12850475:1 gene:ENSRNOG00000039624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:12729416:12850481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_001064537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (RGD1562641), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_224663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (RGD1562641), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000048912 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:13841598:13842558:1 gene:ENSRNOG00000030299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000045657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:13841678:13844809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
NM_139331 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 1 (Lrit1), mRNA. // chr16 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:14209199:14218946:1 gene:ENSRNOG00000012790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB028461 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for retina specific protein PAL, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:14209262:14216823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT022155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001191938 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 2 (Lrit2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine-rich repeat, immunoglobulin-like and transmembrane domains 2 (Lrit2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000038771 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:14221994:14226425:1 gene:ENSRNOG00000022726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:14221994:14226425:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000036611 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:14712546:14714519:1 gene:ENSRNOG00000022621 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000037823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:14663543:14714481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
ENSRNOT00000042262 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:18012794:18013623:-1 gene:ENSRNOG00000032676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18012794:18102536:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1
XM_006222160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DPY30 domain containing 1 (Dydc1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DPY30 domain containing 1 (Dydc1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DPY30 domain containing 1 (Dydc1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DPY30 domain containing 1 (Dydc1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014862 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:18525181:18535300:1 gene:ENSRNOG00000011165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18525817:18537230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_012860 // RefSeq // Rattus norvegicus methionine adenosyltransferase I, alpha (Mat1a), mRNA. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015190 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18511779:18578745:1 gene:ENSRNOG00000011351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// BC089770 // GenBank // Rattus norvegicus methionine adenosyltransferase I, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:108563 IMAGE:7368255), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// X60822 // GenBank // R.norvegicus mRNA for 5 non-coding region of S-adenosylmethionine synthetase. // chr16 // 94 // 91 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000053986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18560657:18578605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0
GENSCAN00000053981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18601554:18610386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_012599 // RefSeq // Rattus norvegicus mannose-binding lectin (protein A) 1 (Mbl1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18604722:18610776:1 gene:ENSRNOG00000011706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18606846:18610776:1 gene:ENSRNOG00000011706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// BC088159 // GenBank // Rattus norvegicus mannose-binding lectin (protein A) 1, mRNA (cDNA clone MGC:108743 IMAGE:7326244), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ218582 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YD03 mRNA sequence. // chr16 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT022178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18601554:18610386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001135252 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 7 (Smim7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18838290:18842195:1 gene:ENSRNOG00000042037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107300 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 26 (Med26), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mediator complex subunit 26 (Med26), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000016355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18863765:18913578:1 gene:ENSRNOG00000012270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18908989:18925266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT022180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001109107 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member E1 (Slc35e1), mRNA. // chr16 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18915079:18927347:1 gene:ENSRNOG00000012287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18908989:18925266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT022182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106064 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein (Cherp), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18931534:18944588:1 gene:ENSRNOG00000012323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18931550:18943455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT022185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1 /// NONRATT022187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NM_001012212 // RefSeq // Rattus norvegicus calreticulin 3 (Calr3), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18960142:18985150:1 gene:ENSRNOG00000013260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC079049 // GenBank // Rattus norvegicus calreticulin 3, mRNA (cDNA clone MGC:93986 IMAGE:7115321), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18960331:19063950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_001029921 // RefSeq // Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 15-like 1 (Eps15l1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 15-like 1 (Eps15l1), transcript variant X9, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006252809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 15-like 1 (Eps15l1), transcript variant X10, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000018960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:18988863:19064343:1 gene:ENSRNOG00000013502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC098004 // GenBank // Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 15-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:116150 IMAGE:7453598), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:18960331:19063950:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT022195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001191081 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium and integrin binding family member 3 (Cib3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19182818:19191176:1 gene:ENSRNOG00000014600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19182818:19191176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001033686 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 18 (Cyp4f18), mRNA. // chr16 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19269139:19385552:1 gene:ENSRNOG00000015751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC101918 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 18, mRNA (cDNA clone MGC:124833 IMAGE:7935301), complete cds. // chr16 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// GENSCAN00000036836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19358300:19388681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT022199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001107313 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 7 (Cnot7), mRNA. // chr16 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000016882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54602180:54621341:1 gene:ENSRNOG00000012263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0 /// BC167766 // GenBank // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 7, mRNA (cDNA clone MGC:187537 IMAGE:7455944), complete cds. // chr16 // 56 // 90 // 5 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000060549 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:19479724:19480038:1 gene:ENSRNOG00000039505 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000040700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19479724:19485265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000048715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54598102:54619883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 70 // 5 // 7 // 0
NM_001271066 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IXb (Myo9b), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// NM_001271067 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IXb (Myo9b), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// NM_012984 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IXb (Myo9b), transcript variant 3, mRNA. // chr16 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// XM_006252824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin IXb (Myo9b), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000045099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19529581:19614175:1 gene:ENSRNOG00000016256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 93 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000040690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19546789:19613402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// AJ888904 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for myosin 9b (myo9b gene), splice variant 2. // chr16 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT022208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001169100 // RefSeq // Rattus norvegicus unconventional SNARE in the ER 1 homolog (S. cerevisiae) (Use1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000022650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19623234:19625901:1 gene:ENSRNOG00000016619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// FQ217580 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA23YC13 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000040621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19623243:19625884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT022221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001106065 // RefSeq // Rattus norvegicus occludin/ELL domain containing 1 (Ocel1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19627386:19629155:1 gene:ENSRNOG00000032575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC169113 // GenBank // Rattus norvegicus occludin/ELL domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189548 IMAGE:7445881), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19627887:19629043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 72 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT022222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001006964 // RefSeq // Rattus norvegicus BRISC and BRCA1 A complex member 1 (Babam1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BRISC and BRCA1 A complex member 1 (Babam1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000022938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19652971:19658999:1 gene:ENSRNOG00000017071 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083685 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5430437P03, mRNA (cDNA clone MGC:94542 IMAGE:7189038), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ225590 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YI12 mRNA sequence. // chr16 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT022227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19653543:19668441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT022226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006222166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and LEM domain containing 1 (Ankle1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and LEM domain containing 1 (Ankle1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and LEM domain containing 1 (Ankle1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and LEM domain containing 1 (Ankle1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252960 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and LEM domain containing 1 (Ankle1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and LEM domain containing 1 (Ankle1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023065 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:19660584:19663917:1 gene:ENSRNOG00000017156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19653543:19668441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001006965 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L34 (Mrpl34), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L34 (Mrpl34), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L34 (Mrpl34), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19735400:19736134:1 gene:ENSRNOG00000017552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC084718 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L34, mRNA (cDNA clone MGC:105750 IMAGE:7316058), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19735425:19735864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT022232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001134790 // RefSeq // Rattus norvegicus DET1 and DDB1 associated 1 (Dda1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DET1 and DDB1 associated 1 (Dda1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19739276:19746866:1 gene:ENSRNOG00000039417 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_001062430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DET1- and DDB1-associated protein 1-like (LOC682635), mRNA. // chr16 // 35 // 100 // 9 // 26 // 0 /// XM_003749224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DET1- and DDB1-associated protein 1-like (LOC682635), mRNA. // chr16 // 35 // 100 // 9 // 26 // 0 /// NONRATT022233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071652 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:94440980:94441288:1 gene:ENSRNOG00000046150 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr16 // 35 // 100 // 9 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:94428418:94441288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 100 // 9 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19739254:19745404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001011919 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP binding protein 3 (Gtpbp3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000060355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19758699:19763790:1 gene:ENSRNOG00000023403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC087083 // GenBank // Rattus norvegicus GTP binding protein 3 (mitochondrial), mRNA (cDNA clone MGC:94548 IMAGE:7189218), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19758749:19762953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_199375 // RefSeq // Rattus norvegicus multivesicular body subunit 12A (Mvb12a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024413 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19833920:19838783:1 gene:ENSRNOG00000017949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061799 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 125, member A, mRNA (cDNA clone MGC:72581 IMAGE:5598467), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ233380 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YC03 mRNA sequence. // chr16 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006252860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multivesicular body subunit 12A (Mvb12a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000040618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19834003:19838587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT022244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT022241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT022242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_053580 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 1 (Slc27a1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252952 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 1 (Slc27a1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// XM_006252953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 1 (Slc27a1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006252954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 1 (Slc27a1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19859540:19876618:1 gene:ENSRNOG00000018170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC074014 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:91570 IMAGE:7104661), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U89529 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid transport protein mRNA, complete cds. // chr16 // 81 // 93 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19858377:19875550:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001106066 // RefSeq // Rattus norvegicus 6-phosphogluconolactonase (Pgls), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19880872:19886358:1 gene:ENSRNOG00000018326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233522 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YI01 mRNA sequence. // chr16 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19882384:19886268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001100908 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 129, member C (Fam129c), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006252918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 129, member C (Fam129c), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 129, member C (Fam129c), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000034589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19887776:19899604:1 gene:ENSRNOG00000039357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19887778:19898069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 74 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT022253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT022255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001106067 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen beta(1-O)galactosyltransferase 1 (Colgalt1), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000024866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19900825:19913462:1 gene:ENSRNOG00000023317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC160899 // GenBank // Rattus norvegicus glycosyltransferase 25 domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188342 IMAGE:7453718), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19901900:19912306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_012855 // RefSeq // Rattus norvegicus Janus kinase 3 (Jak3), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000025312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19970616:19981122:1 gene:ENSRNOG00000018669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 45 // 45 // 0 /// D28508 // GenBank // Rattus norvegicus JAK3 mRNA for protein-tyrosine kinase, complete cds. // chr16 // 87 // 94 // 41 // 47 // 0 /// GENSCAN00000027433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19960351:19980702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT022258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0
BC098653 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:112595 IMAGE:7386551), complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// NM_053680 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like 3 (Insl3), mRNA. // chr16 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// XM_006252820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulin-like 3 (Insl3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000025347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19981806:19983156:1 gene:ENSRNOG00000018757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// AF139918 // GenBank // Rattus norvegicus relaxin-like factor mRNA, complete cds. // chr16 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT022260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19981806:19984030:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_212510 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L18A (Rpl18a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000025421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20150821:20152827:1 gene:ENSRNOG00000018795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC058498 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L18A, mRNA (cDNA clone MGC:72957 IMAGE:6919102), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT022268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT022269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NM_052983 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/iodide cotransporter), member 5 (Slc5a5), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000025576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20154958:20164944:1 gene:ENSRNOG00000018822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// U60282 // GenBank // Rattus norvegicus thyroid sodium/iodide symporter NIS mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// NONRATT022270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20141905:20164040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_001106071 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 124 (Ccdc124), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 124 (Ccdc124), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20174990:20180809:1 gene:ENSRNOG00000018932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213322 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YI02 mRNA sequence. // chr16 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20178633:20180339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_019313 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium intermediate/small conductance calcium-activated channel, subfamily N, member 1 (Kcnn1), mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20194361:20205054:1 gene:ENSRNOG00000029264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AF000973 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-activated potassium channel (rSK1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20183232:20214855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT022274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001107303 // RefSeq // Rattus norvegicus arrestin domain containing 2 (Arrdc2), mRNA. // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20209578:20213710:1 gene:ENSRNOG00000019009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20183232:20214855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT022276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT022278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001134796 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated serine/threonine kinase 3 (Mast3), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// XM_006252941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule associated serine/threonine kinase 3 (Mast3), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000037756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20257645:20271835:1 gene:ENSRNOG00000022753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000027422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20249622:20287438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 95 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT022279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0
NM_001134796 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated serine/threonine kinase 3 (Mast3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule associated serine/threonine kinase 3 (Mast3), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20257645:20271835:1 gene:ENSRNOG00000022753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20249622:20287438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_022185 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 2 (beta) (Pik3r2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000026210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20273500:20282048:1 gene:ENSRNOG00000019228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC089805 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 2 (beta), mRNA (cDNA clone MGC:108697 IMAGE:7381613), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// D64046 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol 3-kinase p85 beta subunit, complete cds. // chr16 // 90 // 86 // 27 // 30 // 0 /// NONRATT022282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT022283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20249622:20287438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 83 // 83 // 29 // 35 // 1 /// NONRATT022286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1 /// NONRATT022285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1
NM_001030026 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon gamma inducible protein 30 (Ifi30), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20283634:20287840:1 gene:ENSRNOG00000019387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099774 // GenBank // Rattus norvegicus interferon gamma inducible protein 30, mRNA (cDNA clone MGC:124690 IMAGE:7932222), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ229307 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YG04 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// FQ233063 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YF18 mRNA sequence. // chr16 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT022288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027422 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20249622:20287438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT022289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001106072 // RefSeq // Rattus norvegicus MPV17 mitochondrial membrane protein-like 2 (Mpv17l2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20289807:20292193:1 gene:ENSRNOG00000019394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20289867:20292098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT022290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_201988 // RefSeq // Rattus norvegicus pyroglutamyl-peptidase I (Pgpep1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20379057:20388077:1 gene:ENSRNOG00000019639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB098134 // GenBank // Rattus norvegicus PAP-I mRNA for pyroglutamyl aminopeptidase I, complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC098645 // GenBank // Rattus norvegicus pyroglutamyl-peptidase I, mRNA (cDNA clone MGC:112578 IMAGE:7108516), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20379075:20387235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_019216 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 15 (Gdf15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20411167:20413750:1 gene:ENSRNOG00000019661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20411167:20413750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001014236 // RefSeq // Rattus norvegicus single stranded DNA binding protein 4 (Ssbp4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006252910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus single stranded DNA binding protein 4 (Ssbp4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20433840:20444999:1 gene:ENSRNOG00000019698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC079147 // GenBank // Rattus norvegicus single stranded DNA binding protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:94162 IMAGE:7128392), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20433978:20444761:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT022295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001025143 // RefSeq // Rattus norvegicus KxDL motif containing 1 (Kxd1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006252922 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KxDL motif containing 1 (Kxd1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// XM_006252924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KxDL motif containing 1 (Kxd1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000027053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20512578:20522058:1 gene:ENSRNOG00000019971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XR_360383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus KxDL motif containing 1 (Kxd1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr16 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1 /// NONRATT022300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1 /// GENSCAN00000038163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20512454:20526538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 13 // 21 // 1 /// NONRATT022303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// NONRATT022302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1 /// NONRATT022308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_031687 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin A-52 residue ribosomal protein fusion product 1 (Uba52), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20524449:20526604:1 gene:ENSRNOG00000019974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC061544 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin A-52 residue ribosomal protein fusion product 1, mRNA (cDNA clone MGC:72766 IMAGE:6922034), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ221238 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA38YO18 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ211746 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA81YJ03 mRNA sequence. // chr16 // 55 // 100 // 12 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20512454:20526538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT022311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
ENSRNOT00000063780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20527853:20530325:1 gene:ENSRNOG00000019990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// FQ209730 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA40YJ05 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ221766 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YC11 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20527865:20530178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT022317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001271055 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 59-like (Tmem59l), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20547483:20551145:1 gene:ENSRNOG00000022432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20547513:20550762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT022319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT022321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT022322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001106075 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 26 (Klhl26), mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20557872:20582253:1 gene:ENSRNOG00000020088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20557946:20583440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT022323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001047115 // RefSeq // Rattus norvegicus CREB regulated transcription coactivator 1 (Crtc1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006252936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CREB regulated transcription coactivator 1 (Crtc1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000038057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20593197:20644901:1 gene:ENSRNOG00000022421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// DQ538521 // GenBank // Rattus norvegicus CREB regulated transcription coactivator 1 (Crtc1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000038145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20593080:20645100:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT022325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
XM_003751566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF1 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast) (Upf1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027268 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:20677669:20697168:1 gene:ENSRNOG00000020134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000038148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20677669:20697168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_001115023 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 49 (Ddx49), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20725435:20733081:1 gene:ENSRNOG00000022368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC158855 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 49, mRNA (cDNA clone MGC:188385 IMAGE:7930984), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ216881 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA3YO16 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20725461:20733014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
ENSRNOT00000027550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20789968:20799539:1 gene:ENSRNOG00000020280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// BC166821 // GenBank // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:188699 IMAGE:8368184), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NM_001107306 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 6 (Armc6), mRNA. // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000038122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20793257:20803847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT022335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001127590 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 42 (Slc25a42), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20826789:20835169:1 gene:ENSRNOG00000020345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC160887 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 42, mRNA (cDNA clone MGC:188302 IMAGE:7387602), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006252951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 42 (Slc25a42), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20812201:20833375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001013136 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory factor X-associated ankyrin-containing protein (Rfxank), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006252899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulatory factor X-associated ankyrin-containing protein (Rfxank), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20879467:20886949:1 gene:ENSRNOG00000033318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087111 // GenBank // Rattus norvegicus regulatory factor X-associated ankyrin-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:94730 IMAGE:7193515), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20878010:20886819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT022341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_031653 // RefSeq // Rattus norvegicus neurocan (Ncan), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:20968687:20989629:1 gene:ENSRNOG00000020448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064308 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:20900031:20925162:1 gene:ENSRNOG00000048036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// M97161 // GenBank // Rattus norvegicus (clones BS72, BS41, BS13, BS18 and BS21) neurocan mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20904395:20925162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:20968687:20988296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001106077 // RefSeq // Rattus norvegicus MAU2 sister chromatid cohesion factor (Mau2), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000027846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21047385:21075417:1 gene:ENSRNOG00000020526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT022347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21047435:21182033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT022350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT022353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001013881 // RefSeq // Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 2A (Gatad2a), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006252879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 2A (Gatad2a), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21093916:21184110:1 gene:ENSRNOG00000022173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC089902 // GenBank // Rattus norvegicus GATA zinc finger domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:109147 IMAGE:7383529), complete cds. // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000037456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21047435:21182033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT022356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT022357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
XM_001071564 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YjeF N-terminal domain containing 3 (Yjefn3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006222183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YjeF N-terminal domain containing 3 (Yjefn3), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_573886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus YjeF N-terminal domain containing 3 (Yjefn3), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065345 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:21202779:21204490:1 gene:ENSRNOG00000039191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21191395:21204490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001107307 // RefSeq // Rattus norvegicus cartilage intermediate layer protein 2 (Cilp2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006252902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cartilage intermediate layer protein 2 (Cilp2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21204960:21211953:1 gene:ENSRNOG00000020622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:21204960:21211439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_006222199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 869 (Zfp869), mRNA. // chr16 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000034446 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:21313542:21316847:1 gene:ENSRNOG00000011492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT022368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// NONRATT022367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
XM_006222199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 869 (Zfp869), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000015611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21358627:21362836:1 gene:ENSRNOG00000033351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// FQ211569 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA88YD21 mRNA sequence. // chr16 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// FQ223058 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YO13 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001009538 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 868 (Zfp868), mRNA. // chr16 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// XM_006252916 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 868 (Zfp868), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 94 // 90 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000015635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:21432872:21438285:1 gene:ENSRNOG00000028919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 70 // 13 // 14 // 0 /// BC062078 // GenBank // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AI449175, mRNA (cDNA clone MGC:72612 IMAGE:5599629), complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// BC089094 // GenBank // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AI449175, mRNA (cDNA clone MGC:105514 IMAGE:7125789), complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT022377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT022375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1
X71442 // GenBank // R.norvegicus mRNA for LINE sequence. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
X71442 // GenBank // R.norvegicus mRNA for LINE sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_006222190 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102551257), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006252988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 709-like (LOC102551257), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006222192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (LOC306365), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
NM_153470 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine zipper, putative tumor suppressor 1 (Lzts1), mRNA. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006252996 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper, putative tumor suppressor 1 (Lzts1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000015799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:22147127:22202135:1 gene:ENSRNOG00000011826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB075607 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for PSD-Zip70, complete cds. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:22192085:22199293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT022385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013152 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 18 (vesicular monoamine transporter), member 1 (Slc18a1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006252993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 18 (vesicular monoamine transporter), member 1 (Slc18a1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:22256519:22289704:1 gene:ENSRNOG00000011992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M97380 // GenBank // Rattus norvegicus chromaffin granule amine transporter (CGAT) mRNA, complete cds. // chr16 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// XR_360409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 18 (vesicular monoamine transporter), member 1 (Slc18a1), transcript variant X4, misc_RNA. // chr16 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000044425 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:22258610:22289145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001107309 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (Csgalnact1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (Csgalnact1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:22868157:22963258:1 gene:ENSRNOG00000013024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC168857 // GenBank // Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:189091 IMAGE:7459880), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:22917405:22961817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
XM_006222215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X14, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X15, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X17, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X12, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X13, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253053 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 3 (Psd3), transcript variant X15, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213961 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YJ12 mRNA sequence. // chr16 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// NONRATT022397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012869 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y5 (Npy5r), mRNA. // chr16 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// XM_006253011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y5 (Npy5r), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y5 (Npy5r), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuropeptide Y receptor Y5 (Npy5r), transcript variant X7, mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000018976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:24680527:24688482:1 gene:ENSRNOG00000014172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF044264 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide Y Y5 receptor mRNA, complete cds. // chr16 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// U56078 // GenBank // Rattus norvegicus Y5 receptor mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// U66274 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide Y5 receptor (NPYR5) mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0
NONRATT022399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001169102 // RefSeq // Rattus norvegicus translation machinery associated 16 homolog (S. cerevisiae) (Tma16), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000019363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:24862193:24878384:1 gene:ENSRNOG00000014188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:24866540:24870512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NONRATT053001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 83 // 100 // 5 // 6 // 0
XR_360422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin, cytoplasmic 2-like (LOC100910404), ncRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000059797 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:26394916:26395278:1 gene:ENSRNOG00000039101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:26395018:26395308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT022404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
FQ214304 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YI03 mRNA sequence. // chr16 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENSRNOT00000065453 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:26476082:26477475:1 gene:ENSRNOG00000042099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0
ENSRNOT00000059787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:26499584:26500254:1 gene:ENSRNOG00000039094 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000037859 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:26461022:26500252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
XM_006222219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 2 (Klhl2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006222220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 2 (Klhl2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// XM_006253056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 2 (Klhl2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253057 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 2 (Klhl2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047223 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:26635307:26729968:1 gene:ENSRNOG00000029441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:26710037:26728373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
NM_080886 // RefSeq // Rattus norvegicus methylsterol monooxygenase 1 (Msmo1), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:26738367:26754806:1 gene:ENSRNOG00000032297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC063155 // GenBank // Rattus norvegicus sterol-C4-methyl oxidase-like, mRNA (cDNA clone MGC:72715 IMAGE:6918081), complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// D50559 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RANP-1, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:26743650:26754062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT022407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000054504 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:16:26967379:26967487:1 gene:ENSRNOG00000036388 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106081 // RefSeq // Rattus norvegicus tolloid-like 1 (Tll1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000065642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:27269834:27466134:1 gene:ENSRNOG00000033528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000045558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:27345186:27360666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:27431082:27465069:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT022413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000045578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:27373565:27427445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT022415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
NM_001109110 // RefSeq // Rattus norvegicus annexin A10 (Anxa10), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:29535821:29604513:1 gene:ENSRNOG00000014339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:29559608:29604316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006227050 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 (Ddx60), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 55 // 55 // 0 /// XM_006227152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like (LOC102547355), partial mRNA. // chr16 // 75 // 22 // 9 // 12 // 0 /// XM_006253060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60 (Ddx60), mRNA. // chr16 // 92 // 96 // 49 // 53 // 0 /// ENSRNOT00000019667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:29667540:29799350:-1 gene:ENSRNOG00000014541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 87 // 96 // 46 // 53 // 0 /// XM_006253066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus probable ATP-dependent RNA helicase DDX60-like (LOC100911190), mRNA. // chr16 // 38 // 38 // 21 // 55 // 1 /// XR_349503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556583 (LOC102556583), ncRNA. // chr16 // 18 // 18 // 10 // 55 // 1 /// GENSCAN00000002428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:29667540:29847369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 80 // 41 // 44 // 0 /// GENSCAN00000006840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:30997433:31168573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 25 // 25 // 14 // 55 // 1
XM_002728399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus palladin (LOC100360205), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31748095:31784275:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31748095:31784275:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:31744302:31775712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_002728399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus palladin (LOC100360205), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31756192:31782654:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31748095:31784275:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31748095:31784275:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:31744302:31775712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002728399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus palladin (LOC100360205), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31748095:31784275:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002728399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus palladin (LOC100360205), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000013636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31756192:31782654:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31748095:31784275:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000066265 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:31748095:31784275:1 gene:ENSRNOG00000010107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000045854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:31779156:31784275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000045838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:31744302:31775712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_053363 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride channel, voltage-sensitive 3 (Clcn3), mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chloride channel, voltage-sensitive 3 (Clcn3), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chloride channel, voltage-sensitive 3 (Clcn3), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:32284020:32353988:1 gene:ENSRNOG00000010682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:32292440:32338108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT022428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT022429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
ENSRNOT00000029071 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:33314348:33314720:1 gene:ENSRNOG00000024304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:33276896:33314614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000029032 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:33722946:33723592:1 gene:ENSRNOG00000024299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:33723072:33723419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001025624 // RefSeq // Rattus norvegicus high mobility group nucleosome binding domain 2 (Hmgn2), mRNA. // chr16 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:33775173:33776354:1 gene:ENSRNOG00000043004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC099178 // GenBank // Rattus norvegicus high mobility group nucleosomal binding domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:116347 IMAGE:7383003), complete cds. // chr16 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// BC099815 // GenBank // Rattus norvegicus high mobility group nucleosomal binding domain 2, mRNA (cDNA clone MGC:124667 IMAGE:7929654), complete cds. // chr16 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// XM_006221156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-histone chromosomal protein HMG-17-like (LOC102549131), partial mRNA. // chr16 // 54 // 97 // 15 // 28 // 0 /// XM_006248440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus non-histone chromosomal protein HMG-17-like (LOC102549131), partial mRNA. // chr16 // 54 // 97 // 15 // 28 // 0 /// FQ219745 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YE17 mRNA sequence. // chr16 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// GENSCAN00000019827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:33775288:33775560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT045664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// FQ214356 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YC22 mRNA sequence. // chr16 // 72 // 100 // 21 // 29 // 0 /// NONRATT045665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001135756 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074353 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:34815067:34937326:1 gene:ENSRNOG00000047809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:34899205:34941671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000043510 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:34623697:34624647:1 gene:ENSRNOG00000032890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:34623697:34624647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000051096 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:35020198:35020706:1 gene:ENSRNOG00000033535 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:35020201:35026627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0
NM_001135756 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:35390465:35619230:1 gene:ENSRNOG00000038976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:35379562:35397466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135756 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:35390465:35619230:1 gene:ENSRNOG00000038976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:35379562:35397466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135756 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:35390465:35619230:1 gene:ENSRNOG00000038976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:35480455:35486499:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135756 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:35390465:35619230:1 gene:ENSRNOG00000038976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135756 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase-like 6 (Galntl6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:35390465:35619230:1 gene:ENSRNOG00000038976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:35546604:35619230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0
NM_022926 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 7 (Galnt7), mRNA. // chr16 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// AF076167 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase T6 mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000016474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:35751116:35876429:1 gene:ENSRNOG00000012037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 95 // 36 // 38 // 1 /// NONRATT022436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT022438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:35844180:35876252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// NONRATT022439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1
NONRATT022436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000017652 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:35925240:35930358:1 gene:ENSRNOG00000013218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:35902409:35930358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// FQ235288 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YM05 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000017913 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:36218386:36219391:1 gene:ENSRNOG00000013405 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 88 // 94 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:36218386:36219391:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1
NONRATT022451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037181 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 44 (Cep44), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006253088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 44 (Cep44), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:36982024:37001397:1 gene:ENSRNOG00000010566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC107470 // GenBank // Rattus norvegicus similar to KIAA1712 protein, mRNA (cDNA clone MGC:125247 IMAGE:7457548), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000029284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:36985247:37004258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
ENSRNOT00000048192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:37148395:37149789:1 gene:ENSRNOG00000033295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 85 // 100 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:37148395:37218918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NM_053724 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine receptor, alpha 3 (Glra3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003751592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycine receptor subunit alpha-3-like (LOC100909864), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003754571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycine receptor subunit alpha-3-like (LOC100909864), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M55250 // GenBank // Rat inhibitory glycine receptor alpha subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:37482429:37670061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:37706435:37811271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_133404 // RefSeq // Rattus norvegicus lon peptidase 1, mitochondrial (Lonp1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000074253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9425780:9438104:1 gene:ENSRNOG00000046502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB064323 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Lon, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041894 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:55973931:55974386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:38400395:38400850:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000058041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9425460:9438003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
GENSCAN00000043099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:23203120:23204036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
ENSRNOT00000054098 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:16:39078407:39078525:1 gene:ENSRNOG00000035975 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_003751594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 21-like (LOC100910087), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_003752906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 21-like (LOC100910087), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006222229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 21-like (LOC100910087), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006253092 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 21-like (LOC100910087), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_006253103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 20 (Adam20), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// XM_224829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 20 (Adam20), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042018 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:39130473:39132731:1 gene:ENSRNOG00000028454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:39130674:39132791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:38931981:38934098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_001191073 // RefSeq // Rattus norvegicus signal peptidase complex subunit 3 homolog (S. cerevisiae) (Spcs3), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:39826990:39832408:1 gene:ENSRNOG00000038933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170346 // RefSeq // Rattus norvegicus nei endonuclease VIII-like 3 (E. coli) (Neil3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006253110 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nei endonuclease VIII-like 3 (E. coli) (Neil3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:40849291:40908352:1 gene:ENSRNOG00000011688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000012574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:40849401:40890378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000012579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:40896172:40977632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT022458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
ENSRNOT00000027298 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:44174398:44174747:1 gene:ENSRNOG00000020128 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 71 // 56 // 10 // 14 // 0
FQ217715 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA1YA02 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT000134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222890 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YF20 mRNA sequence. // chr16 // 45 // 80 // 9 // 20 // 0
NM_001077670 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J (Eif3j), mRNA. // chrU // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000022437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120516661:120538895:1 gene:ENSRNOG00000016459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC127509 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J, mRNA (cDNA clone MGC:156679 IMAGE:7454886), complete cds. // chrU // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:45122218:45123553:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000059473 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:45116539:45123553:1 gene:ENSRNOG00000038907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// GENSCAN00000013612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120523133:120537960:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT035594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001169133 // RefSeq // Rattus norvegicus teneurin transmembrane protein 3 (Tenm3), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000017624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:46462637:46657495:1 gene:ENSRNOG00000012802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0
NM_001109111 // RefSeq // Rattus norvegicus WW and C2 domain containing 2 (Wwc2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000017966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47091900:47254470:1 gene:ENSRNOG00000013248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000031764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47092616:47251907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT022468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_001014000 // RefSeq // Rattus norvegicus CDKN2A interacting protein (Cdkn2aip), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47385309:47388586:1 gene:ENSRNOG00000022736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC085832 // GenBank // Rattus norvegicus CDKN2A interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:94451 IMAGE:7134740), complete cds. // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC098694 // GenBank // Rattus norvegicus CDKN2A interacting protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7386250), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253146 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDKN2A interacting protein (Cdkn2aip), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT022469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000034227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47266711:47388388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001106083 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 2 (Ing2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 2 (Ing2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006253132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 2 (Ing2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006253133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 2 (Ing2), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47437446:47445331:1 gene:ENSRNOG00000013480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168652 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of growth family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187953 IMAGE:7097301), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47437891:47470149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000034252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47493995:47494228:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_001169115 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 11 (Trappc11), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47594590:47640419:1 gene:ENSRNOG00000022482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47597282:47624574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001134863 // RefSeq // Rattus norvegicus storkhead box 2 (Stox2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47836086:47942379:1 gene:ENSRNOG00000009590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XM_006253155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant X8, mRNA. // chr16 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:47892425:47940824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT022482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006253153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus storkhead box 2 (Stox2), transcript variant X8, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF548355 // GenBank // Rattus norvegicus spinelinin mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NM_001134863 // RefSeq // Rattus norvegicus storkhead box 2 (Stox2), mRNA. // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000068562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:47836086:47942379:1 gene:ENSRNOG00000009590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT022483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT022482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000044934 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:48225746:48226000:1 gene:ENSRNOG00000030778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48225746:48251028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 64 // 14 // 16 // 0
ENSRNOT00000029868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48584457:48613173:1 gene:ENSRNOG00000022320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48584460:48612996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// FQ230438 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YB15 mRNA sequence. // chr16 // 79 // 92 // 26 // 33 // 0 /// NONRATT022489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
XM_003751600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helt bHLH transcription factor (Helt), mRNA. // chr16 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// XM_003752903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus helt bHLH transcription factor (Helt), mRNA. // chr16 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014360 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48897557:48899290:1 gene:ENSRNOG00000010785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48897557:48899290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_053515 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 4 (Slc25a4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:48981575:48985393:1 gene:ENSRNOG00000010830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC060533 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 4, mRNA (cDNA clone MGC:72639 IMAGE:6922056), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ213612 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YM02 mRNA sequence. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ215583 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YK08 mRNA sequence. // chr16 // 62 // 93 // 16 // 26 // 0 /// FQ216172 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YD22 mRNA sequence. // chr16 // 67 // 96 // 18 // 27 // 0 /// FQ227255 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YA08 mRNA sequence. // chr16 // 48 // 96 // 13 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:48981709:48990199:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT022495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000014828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49076062:49159354:1 gene:ENSRNOG00000011116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC086510 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 25, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132845), partial cds. // chr16 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49114300:49158902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NONRATT022500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001108400 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 37 (Ankrd37), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49189582:49192471:1 gene:ENSRNOG00000031335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166884 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 37, mRNA (cDNA clone MGC:188821 IMAGE:6887335), complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT022502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49184186:49190990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
XM_001061230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to LOC495042 protein (RGD1564308), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006222240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to LOC495042 protein (RGD1564308), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006253170 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to LOC495042 protein (RGD1564308), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_577523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to LOC495042 protein (RGD1564308), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059317 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:49213628:49236161:1 gene:ENSRNOG00000038819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_003751598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF0602 protein C4orf47 homolog (LOC100911106), mRNA. // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49213628:49236280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:46772579:46878809:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_198791 // RefSeq // Rattus norvegicus toll-like receptor 3 (Tlr3), mRNA. // chr16 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49739814:49753269:1 gene:ENSRNOG00000021726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB116229 // GenBank // Rattus norvegicus Tlr3 mRNA for toll-like receptor 3, complete cds. // chr16 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051946 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49740094:49752299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 50 // 13 // 14 // 0
ENSRNOT00000034448 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:49773192:49828133:1 gene:ENSRNOG00000021693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// XM_001061521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 149, member A (Fam149a), mRNA. // chr16 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NM_001135600 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily v, polypeptide 3 (Cyp4v3), mRNA. // chr16 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000019302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49834760:49859697:1 gene:ENSRNOG00000042426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// BC131846 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily v, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:156697 IMAGE:7098966), complete cds. // chr16 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000038502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49796032:49856925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_012725 // RefSeq // Rattus norvegicus kallikrein B, plasma 1 (Klkb1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49875019:49898363:1 gene:ENSRNOG00000014118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089815 // GenBank // Rattus norvegicus kallikrein B, plasma 1, mRNA (cDNA clone MGC:108748 IMAGE:7369524), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M30282 // GenBank // Rat plasma kallikrein mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// M58590 // GenBank // Rat plasma kallikrein (rPK) mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT022509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49880015:49924330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1
NM_001047848 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor XI (F11), mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coagulation factor XI (F11), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:49902415:49924330:1 gene:ENSRNOG00000013684 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:49880015:49924330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT022511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
GENSCAN00000038510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:50217514:50221475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 86 // 88 // 19 // 22 // 0
ENSRNOT00000019327 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:50774741:50775288:1 gene:ENSRNOG00000014423 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000002688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:50774762:50775288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
XM_006222245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif family-like 1 (Triml1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif family-like 1 (Triml1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019474 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:51895811:51903463:1 gene:ENSRNOG00000014502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:51895811:51903463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000019496 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:52380034:52380490:-1 gene:ENSRNOG00000014539 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000000553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:52314184:52399846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 91 // 69 // 10 // 11 // 0
NM_001290133 // RefSeq // Rattus norvegicus FSHD region gene 1 (Frg1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT022519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT022520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
NM_053407 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acylsphingosine amidohydrolase (acid ceramidase) 1 (Asah1), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:53712315:53743716:1 gene:ENSRNOG00000010034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF214647 // GenBank // Rattus norvegicus ceramidase mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC061540 // GenBank // Rattus norvegicus N-acylsphingosine amidohydrolase (acid ceramidase) 1, mRNA (cDNA clone MGC:72746 IMAGE:6919949), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:53732767:53754295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 50 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT022521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_172010 // RefSeq // Rattus norvegicus fibrinogen-like 1 (Fgl1), mRNA. // chr16 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:53866814:53900248:1 gene:ENSRNOG00000010714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC088107 // GenBank // Rattus norvegicus fibrinogen-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:108569 IMAGE:7368731), complete cds. // chr16 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:53878159:53896583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107312 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 7 (Mtmr7), mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253194 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 7 (Mtmr7), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 7 (Mtmr7), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54469056:54560062:1 gene:ENSRNOG00000011420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54483439:54559607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001107313 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 7 (Cnot7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006253197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 7 (Cnot7), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000016882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54602180:54621341:1 gene:ENSRNOG00000012263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC167766 // GenBank // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 7, mRNA (cDNA clone MGC:187537 IMAGE:7455944), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT022536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000048715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:54598102:54619883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_023961 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 20 (Fgf20), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:54855241:54861845:1 gene:ENSRNOG00000000109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB020021 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FGF-20, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000038224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:55538530:55682905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001191939 // RefSeq // Rattus norvegicus macrophage scavenger receptor 1 (Msr1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus macrophage scavenger receptor 1 (Msr1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:56517029:56597077:-1 gene:ENSRNOG00000012779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ227774 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YO18 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:56526914:56582240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT023412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
GENSCAN00000018699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:55902448:55974132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NM_001108875 // RefSeq // Rattus norvegicus sarcoglycan zeta (Sgcz), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sarcoglycan zeta (Sgcz), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:57717161:57893289:1 gene:ENSRNOG00000022374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:57821183:57921034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0
NR_032106 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-383 (Mir383), microRNA. // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053712 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:16:57201649:57201722:1 gene:ENSRNOG00000035589 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-383 // miRBase Micro RNA Database // MI0003478 Rattus norvegicus miR-383 stem-loop // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006253244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deleted in liver cancer 1 (Dlc1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000045197 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:58478602:58644196:1 gene:ENSRNOG00000022358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000043493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:58469486:58514822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001127446 // RefSeq // Rattus norvegicus DLC1 Rho GTPase activating protein (Dlc1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deleted in liver cancer 1 (Dlc1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006253244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deleted in liver cancer 1 (Dlc1), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:58878663:58926658:1 gene:ENSRNOG00000010780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:58878156:58931015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006222299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LON peptidase N-terminal domain and ring finger 1 (Lonrf1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000015142 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:59243274:59272339:1 gene:ENSRNOG00000011349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000034712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59243387:59288469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT022555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT022554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001033062 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 23 (Cldn23), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:59664248:59665971:1 gene:ENSRNOG00000011424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100630 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 23, mRNA (cDNA clone MGC:124737 IMAGE:7938080), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59664350:59665237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT022556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014143 // RefSeq // Rattus norvegicus exoribonuclease 1 (Eri1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015239 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:59982385:60002473:1 gene:ENSRNOG00000011448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089828 // GenBank // Rattus norvegicus three prime histone mRNA exonuclease 1, mRNA (cDNA clone MGC:108797 IMAGE:7322740), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:59982512:60048942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001106084 // RefSeq // Rattus norvegicus tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase (Tnks), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase (Tnks), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:60596310:60737794:1 gene:ENSRNOG00000011625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:60698203:60715374:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000053577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:60719537:60739794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT022562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0
NONRATT022566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001198725 // RefSeq // Rattus norvegicus gene rich cluster, C10 gene (Grcc10), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// XM_006244638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein C10-like (LOC100911713), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000019570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:224281979:224283614:-1 gene:ENSRNOG00000025810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// FQ231953 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YJ01 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// FQ234499 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YL19 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000042609 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:60800724:60801408:1 gene:ENSRNOG00000031879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0
ENSRNOT00000058905 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:60852318:60852579:1 gene:ENSRNOG00000038603 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:60852318:60852533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0
GENSCAN00000002478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61367757:61368112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 55 // 6 // 6 // 0
NONRATT039965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 100 // 8 // 33 // 0
NM_001013188 // RefSeq // Rattus norvegicus leptin receptor overlapping transcript-like 1 (Leprotl1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61424726:61435440:1 gene:ENSRNOG00000012601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058504 // GenBank // Rattus norvegicus leptin receptor overlapping transcript-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:72989 IMAGE:6887991), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61424786:61435241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001106085 // RefSeq // Rattus norvegicus dynactin 6 (Dctn6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61461230:61480355:1 gene:ENSRNOG00000013254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234632 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YD17 mRNA sequence. // chr16 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61466270:61480039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NONRATT022573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT022574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001106086 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 8 (Ubxn8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:61911951:61933546:1 gene:ENSRNOG00000015109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:61913365:61932385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT022586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSRNOT00000058805 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:62174295:62279989:1 gene:ENSRNOG00000015440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000075088 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:62174295:62251116:1 gene:ENSRNOG00000015440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// GENSCAN00000020379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:62196207:62232797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001014002 // RefSeq // Rattus norvegicus MAK16 homolog (S. cerevisiae) (Mak16), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015297 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:64386704:64395256:1 gene:ENSRNOG00000010783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC090035 // GenBank // Rattus norvegicus MAK16 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109625 IMAGE:7367321), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:64370493:64394477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT022600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001107319 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-5 homolog D (C. elegans) (Unc5d), mRNA. // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:66680943:67223786:1 gene:ENSRNOG00000011858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:67180986:67223786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT022603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000004434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:67108966:67159955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NONRATT022603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000052083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:67693474:67775881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0
NM_001100944 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 (RGD1562638), mRNA. // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// XM_006253281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3 (RGD1562638), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000039592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68212743:68268251:1 gene:ENSRNOG00000022181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// BC128761 // GenBank // Rattus norvegicus similar to MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, mRNA (cDNA clone MGC:156759 IMAGE:7113007), complete cds. // chr16 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000033083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68224395:68268071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000033086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68165735:68223514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 50 // 5 // 5 // 0
NM_057184 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, nicotinic, alpha 6 (neuronal) (Chrna6), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68486608:68493308:1 gene:ENSRNOG00000012283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68479315:68503738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT022608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_013108 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenoceptor beta 3 (Adrb3), mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68673983:68676747:1 gene:ENSRNOG00000012674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// M74716 // GenBank // Rat beta-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr16 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT022610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68674203:68698214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001014003 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 1-like 1 (Got1l1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006253291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 1-like 1 (Got1l1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_006253292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 1-like 1 (Got1l1), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_006253294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 1-like 1 (Got1l1), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000035985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68692899:68698294:1 gene:ENSRNOG00000038473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC079187 // GenBank // Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 1-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94235 IMAGE:7131193), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000009749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68674203:68698214:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT022611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT022612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 59 // 59 // 26 // 44 // 1 /// NONRATT022613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 43 // 43 // 19 // 44 // 1
NM_001191555 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 1 (class I) (Rab11fip1), transcript variant 1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC107469 // GenBank // Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 1 (class I), mRNA (cDNA clone MGC:125251 IMAGE:7458514), complete cds. // chrU // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// NM_001197241 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB11 family interacting protein 1 (class I) (Rab11fip1), transcript variant 2, mRNA. // chrU // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000070993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68742619:68753634:1 gene:ENSRNOG00000045531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68743666:68749403:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT022616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001024773 // RefSeq // Rattus norvegicus BRF2, RNA polymerase III transcription initiation factor 50 subunit (Brf2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:68763911:68768629:1 gene:ENSRNOG00000012739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC097435 // GenBank // Rattus norvegicus BRF2, subunit of RNA polymerase III transcription initiation factor, BRF1-like, mRNA (cDNA clone MGC:114485 IMAGE:7455454), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:68763979:68768105:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT022618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000045955 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:70307846:70308055:1 gene:ENSRNOG00000046342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70307846:70308055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000012406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70306044:70306794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
ENSRNOT00000019281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70420811:70495812:1 gene:ENSRNOG00000014275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000019356 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70407095:70495811:1 gene:ENSRNOG00000014275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// AY310154 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1288 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NM_001136098 // RefSeq // Rattus norvegicus hook microtubule-tethering protein 3 (Hook3), mRNA. // chrU // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000012382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70420830:70486531:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 48 // 13 // 13 // 0
NM_012847 // RefSeq // Rattus norvegicus farnesyltransferase, CAAX box, alpha (Fnta), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70499606:70519062:1 gene:ENSRNOG00000014462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085758 // GenBank // Rattus norvegicus farnesyltransferase, CAAX box, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93617 IMAGE:7189836), complete cds. // chr16 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// M81225 // GenBank // Rat farnesyltransferase alpha subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70499662:70520640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001024883 // RefSeq // Rattus norvegicus protein-O-mannose kinase (Pomk), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein-O-mannose kinase (Pomk), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000019630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70523618:70533991:1 gene:ENSRNOG00000014628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097466 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930444A02, mRNA (cDNA clone MGC:114531 IMAGE:7457667), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70528615:70532387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT022630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
XR_085644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to D8Ertd354e protein (RGD1560755), misc_RNA. // chr16 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_360586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to D8Ertd354e protein (RGD1560755), misc_RNA. // chr16 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019755 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:70540588:70573814:1 gene:ENSRNOG00000014646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000012403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70540867:70570673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 25 // 35 // 1 /// NONRATT022634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 14 // 35 // 1 /// NONRATT022635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
ENSRNOT00000019755 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:70540588:70573814:1 gene:ENSRNOG00000014646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088231 // GenBank // Rattus norvegicus similar to D8Ertd354e protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7324007), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166540 // GenBank // Rattus norvegicus similar to D8Ertd354e protein, mRNA (cDNA clone MGC:188135 IMAGE:7192549), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ209998 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YH14 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// XR_085644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to D8Ertd354e protein (RGD1560755), misc_RNA. // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XR_360586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to D8Ertd354e protein (RGD1560755), misc_RNA. // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT022635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106089 // RefSeq // Rattus norvegicus ash2 (absent, small, or homeotic)-like (Drosophila) (Ash2l), mRNA. // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ash2 (absent, small, or homeotic)-like (Drosophila) (Ash2l), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70676024:70697836:1 gene:ENSRNOG00000014875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// FQ233069 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YF08 mRNA sequence. // chr16 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// GENSCAN00000019011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70676029:70696954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT022637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT022636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001025130 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 4 (Bag4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083608 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 4, mRNA (cDNA clone MGC:94364 IMAGE:7133487), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70722539:70779434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDHD domain containing 2 (Ddhd2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006222272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDHD domain containing 2 (Ddhd2), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006253337 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDHD domain containing 2 (Ddhd2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020832 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:70752801:70779434:1 gene:ENSRNOG00000015501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065062 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:70752801:70779434:1 gene:ENSRNOG00000015501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065770 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:70751370:70779434:1 gene:ENSRNOG00000015501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70722539:70779434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001012158 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 2 (Letm2), mRNA. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000030489 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:70902112:70921166:1 gene:ENSRNOG00000026180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:70902112:70921166:1 gene:ENSRNOG00000026180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// AB296367 // GenBank // Rattus norvegicus LETM2 mRNA for leucine zipper-, EF-hand motif-containing transmembrane protein 2, complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// AB296368 // GenBank // Rattus norvegicus LETM2S mRNA for leucine zipper-, EF-hand motif-containing transmembrane protein 2S, complete cds. // chr16 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// BC087079 // GenBank // Rattus norvegicus leucine zipper-EF-hand containing transmembrane protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:94537 IMAGE:7135920), complete cds. // chr16 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000019023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:70879499:70920203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT022656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT022657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSRNOT00000058436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71095553:71096359:1 gene:ENSRNOG00000038375 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71088020:71095982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000016714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71187141:71248972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001004107 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming, acidic coiled-coil containing protein 1 (Tacc1), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71284600:71335563:1 gene:ENSRNOG00000016423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71284843:71330493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
XM_001071937 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain-containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 2 (Plekha2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022097 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:71389796:71434116:1 gene:ENSRNOG00000038365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71344849:71434116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107321 // RefSeq // Rattus norvegicus HtrA serine peptidase 4 (Htra4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71438259:71451530:1 gene:ENSRNOG00000034140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71438391:71450858:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_001014772 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 9 (Adam9), mRNA. // chr16 // 93 // 96 // 42 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000041330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71459144:71536608:1 gene:ENSRNOG00000017231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 98 // 96 // 44 // 45 // 0 /// AY953138 // GenBank // Rattus norvegicus ADAM9 mRNA, complete cds. // chr16 // 93 // 96 // 42 // 45 // 0 /// GENSCAN00000016716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71459171:71513488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 97 // 64 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT022666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// NONRATT022667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 19 // 47 // 1
NM_001170582 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 32 (Adam32), mRNA. // chr16 // 95 // 95 // 37 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000038266 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:71538135:71647770:1 gene:ENSRNOG00000025728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000016723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71557209:71642494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// NONRATT022669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT022670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 41 // 41 // 17 // 41 // 1 /// NONRATT022673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1 /// NONRATT022671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// NONRATT022674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_020303 // RefSeq // Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 5 (Adam5), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// XM_006253321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus a disintegrin and metallopeptidase domain 5 (Adam5), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 98 // 95 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000058330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71658575:71724724:1 gene:ENSRNOG00000017518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// BC091169 // GenBank // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 5, mRNA (cDNA clone MGC:108772 IMAGE:7112347), complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT022676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000005283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71658519:71783763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 65 // 65 // 28 // 43 // 1 /// NONRATT022675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1 /// NONRATT022677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
NM_020302 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 3A (Adam3a), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000023756 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:71733809:71783769:1 gene:ENSRNOG00000017554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC078839 // GenBank // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 3A (cyritestin 1), mRNA (cDNA clone MGC:93469 IMAGE:7114315), complete cds. // chr16 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000005283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71658519:71783763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0
XM_006253340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase domain 18 (Adam18), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000023805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71786279:71860905:1 gene:ENSRNOG00000017683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// Y11490 // GenBank // R.norvegicus mRNA for tMDC III protein, partial. // chr16 // 100 // 52 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000005278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71786279:71850616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 62 // 26 // 26 // 0
NM_023973 // RefSeq // Rattus norvegicus indoleamine 2,3-dioxygenase 1 (Ido1), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051363 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71866330:71878339:1 gene:ENSRNOG00000031189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF312699 // GenBank // Rattus norvegicus indoleamine 2,3-dioxygenase (Ido) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71866330:71878339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_003752920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus indoleamine 2,3-dioxygenase 2 (Ido2), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006222273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus indoleamine 2,3-dioxygenase 2 (Ido2), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000032116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:71894288:71934105:1 gene:ENSRNOG00000025365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:71896124:71946338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
NM_001007731 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin A7 (Golga7), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73198501:73213640:1 gene:ENSRNOG00000017956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC078959 // GenBank // Rattus norvegicus golgi autoantigen, golgin subfamily a, 7, mRNA (cDNA clone MGC:93825 IMAGE:7110849), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73160853:73250019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_001030027 // RefSeq // Rattus norvegicus GINS complex subunit 4 (Sld5 homolog) (Gins4), mRNA. // chr16 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// XM_006253313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GINS complex subunit 4 (Sld5 homolog) (Gins4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000024301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73218779:73230596:1 gene:ENSRNOG00000018040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC099741 // GenBank // Rattus norvegicus GINS complex subunit 4 (Sld5 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:124661 IMAGE:5623828), complete cds. // chr16 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT022688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT022689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73160853:73250019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1 /// NONRATT022690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001047849 // RefSeq // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 6 (Agpat6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73249356:73282217:1 gene:ENSRNOG00000018077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC161809 // GenBank // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 6 (lysophosphatidic acid acyltransferase, zeta), mRNA (cDNA clone MGC:187236 IMAGE:8374387), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73266335:73295074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_133305 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, mu 2 subunit (Ap3m2), mRNA. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025675 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:73709144:73724608:1 gene:ENSRNOG00000018650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 66 // 23 // 23 // 0 /// BC086993 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, mu 2 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:93230 IMAGE:7131933), complete cds. // chr16 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// L07074 // GenBank // Rat clathrin-associated adaptor protein homolog (p47B) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000016989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73705032:73723135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 95 // 63 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT022698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1 /// NONRATT022695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT022696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT022697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1
NM_053355 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase beta (Ikbkb), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000025851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73809853:73863635:1 gene:ENSRNOG00000019073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AF115282 // GenBank // Rattus norvegicus IKB kinase beta mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000016984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73799924:73892964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 89 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT022702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT022704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_017141 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), beta (Polb), mRNA. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026039 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73869833:73895208:1 gene:ENSRNOG00000019150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098668 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), beta, mRNA (cDNA clone MGC:112619 IMAGE:7386894), complete cds. // chr16 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// J02776 // GenBank // Rat DNA polmerase beta mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// M13961 // GenBank // Rat DNA polymerase beta mRNA, complete cds. // chr16 // 87 // 94 // 26 // 30 // 0 /// U38801 // GenBank // Rattus norvegicus high molecular weight DNA polymerase beta (rnpolb) mRNA, complete cds. // chr16 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016984 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73799924:73892964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT022707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// NONRATT022709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_031355 // RefSeq // Rattus norvegicus voltage-dependent anion channel 3 (Vdac3), mRNA. // chr16 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73924417:73940558:1 gene:ENSRNOG00000019277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000047440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:73924417:73940558:1 gene:ENSRNOG00000019277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB039664 // GenBank // Rattus norvegicus VDAC3 mRNA for mitochondrial voltage dependent anion channel, complete cds. // chr16 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// AF268469 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent anion channel 3 (VDAC3) mRNA, complete cds. // chr16 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// BC061780 // GenBank // Rattus norvegicus voltage-dependent anion channel 3, mRNA (cDNA clone MGC:72403 IMAGE:5623339), complete cds. // chr16 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// FQ216191 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YB22 mRNA sequence. // chr16 // 60 // 50 // 9 // 15 // 0 /// GENSCAN00000016996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:73928700:73940145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
ENSRNOT00000036506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74042995:74055583:1 gene:ENSRNOG00000024930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// FQ214349 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YD10 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT022715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74002626:74055102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001047880 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 15 (Slc25a15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 15 (Slc25a15), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006253351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 15 (Slc25a15), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 15 (Slc25a15), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// XM_006253353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; ornithine transporter) member 15 (Slc25a15), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000050637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74169024:74189301:1 gene:ENSRNOG00000011881 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74132998:74189301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT022717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT022719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001169139 // RefSeq // Rattus norvegicus cytoskeleton associated protein 2 (Ckap2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_003753354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytoskeleton-associated protein 2-like (LOC691173), mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000029266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74383677:74410206:1 gene:ENSRNOG00000024650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000039493 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:184890450:184891902:1 gene:ENSRNOG00000036773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 94 // 74 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:184870039:184891902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 67 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74383677:74409688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT022722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT022724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 45 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000013131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:29820178:29822176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 25 // 76 // 8 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000030657 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:29820178:29822190:1 gene:ENSRNOG00000025795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 21 // 90 // 8 // 38 // 0
XM_006222274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 3 (Nek3), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// XM_006253359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 3 (Nek3), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000017106 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:74416303:74436641:1 gene:ENSRNOG00000012757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000058091 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:74441430:74477776:1 gene:ENSRNOG00000048769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 47 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000064316 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:74416297:74436620:1 gene:ENSRNOG00000012757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 93 // 41 // 13 // 14 // 0 /// XM_006222279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 5 (Nek5), mRNA. // chr16 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// XM_006253364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 5 (Nek5), mRNA. // chr16 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// GENSCAN00000041005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74416303:74481285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_012511 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, Cu++ transporting, beta polypeptide (Atp7b), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000058072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74495179:74574801:1 gene:ENSRNOG00000012878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// AB017791 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATPase 7B, complete cds, strain:ALB. // chr16 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// AB017792 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATPase 7B, complete cds, strain:BN. // chr16 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// AB017793 // GenBank // Rattus norvegicus Atp7b mRNA for ATPase 7B, complete cds, clone:WKAH. // chr16 // 98 // 88 // 41 // 42 // 0 /// AF120492 // GenBank // Rattus norvegicus night-specific ATPase (PINA5.1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// U08344 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley copper-transporting ATPase mRNA, complete cds. // chr16 // 91 // 92 // 40 // 44 // 0 /// GENSCAN00000041012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74535822:74573658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 85 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT022731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT022732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001037520 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 15 (Defb15), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74742481:74745112:1 gene:ENSRNOG00000045897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74663812:74666453:1 gene:ENSRNOG00000048359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY621347 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 15 (Defb15) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000016398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74660632:74667976:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001037850 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 11C (Spag11c), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// NM_001037852 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 11C (Spag11c), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74763444:74765458:1 gene:ENSRNOG00000031111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000047761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74763464:74765458:1 gene:ENSRNOG00000031111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 89 // 90 // 25 // 28 // 0 /// AY600145 // GenBank // Rattus norvegicus SPAG11C (Spag11) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// DQ012092 // GenBank // Rattus norvegicus sperm-associated antigen 11 variant C (Spag11) mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// DQ012093 // GenBank // Rattus norvegicus sperm-associated antigen 11 variant C isoform 1 (Spag11) mRNA, complete cds. // chr16 // 88 // 84 // 23 // 26 // 0 /// AY600144 // GenBank // Rattus norvegicus SPAG11T (Spag11) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT022734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0 /// NONRATT022735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 90 // 94 // 26 // 29 // 0
NM_001033073 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin alpha-like 1 (Defal1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000049394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74984417:74985252:1 gene:ENSRNOG00000029462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY623756 // GenBank // Rattus norvegicus defensin alpha-related sequence 1 (Defa-rs1) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74984417:75011120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_001033076 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin alpha 6 (Defa6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000050112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75017486:75018360:1 gene:ENSRNOG00000029522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY623750 // GenBank // Rattus norvegicus defensin alpha 6 (Defa6) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75017486:75018360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001033077 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin alpha 8 (Defa8), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75043248:75044141:1 gene:ENSRNOG00000046075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AY623752 // GenBank // Rattus norvegicus defensin alpha 8 (Defa8) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT022738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000039969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75068230:75069126:1 gene:ENSRNOG00000046453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY623753 // GenBank // Rattus norvegicus defensin alpha 9 (Defa9) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000016407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75068230:75074152:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
XR_341208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-defensin-related sequence 1-like (LOC100909484), ncRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_360594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-defensin-related sequence 1-like (LOC100909484), ncRNA. // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75141807:75187027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT022740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000071338 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:75141807:75143694:1 gene:ENSRNOG00000050439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001037547 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 51 (Defb51), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75156001:75160105:1 gene:ENSRNOG00000038130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY621373 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 51 (Defb51) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001037524 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 52 (Defb52), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000043486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75173219:75175695:1 gene:ENSRNOG00000038129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ012091 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 52 (Defb52) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75141807:75187027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001037514 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 12 (Defb12), mRNA. // chr16 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000044094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74737487:74739902:-1 gene:ENSRNOG00000038155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// AY621344 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 12 (Defb12) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT023568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000016410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74727424:74739902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001037522 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 39 (Defb39), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000040406 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74720690:74724494:-1 gene:ENSRNOG00000034275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AY621366 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 39 (Defb39) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000016404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:74686335:74724425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 80 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT023567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001037552 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 38 (Defb38), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000050296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74705206:74708438:-1 gene:ENSRNOG00000032089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY621365 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 38 (Defb38) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001037551 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 37 (Defb37), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AY621364 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 37 (Defb37) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000058002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:74676330:74687465:-1 gene:ENSRNOG00000038115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 72 // 100 // 13 // 18 // 0
NM_001037511 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 40 (Defb40), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75302719:75305861:1 gene:ENSRNOG00000033538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621367 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 40 (Defb40) mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025698 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75302719:75305861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001012228 // RefSeq // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 5 (Xkr5), mRNA. // chr16 // 96 // 68 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000032368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75349398:75367303:1 gene:ENSRNOG00000028636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// AY534259 // GenBank // Rattus norvegicus XK-related protein 5 mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 68 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75341318:75402763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_134454 // RefSeq // Rattus norvegicus angiopoietin 2 (Angpt2), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:75572301:75621967:1 gene:ENSRNOG00000016696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC161931 // GenBank // Rattus norvegicus angiopoietin 2, mRNA (cDNA clone MGC:187710 IMAGE:9021835), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000025692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:75571334:75621263:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001037327 // RefSeq // Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 1 (Csmd1), mRNA. // chr16 // 96 // 100 // 66 // 69 // 0 /// ENSRNOT00000057897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:78123917:78434380:1 gene:ENSRNOG00000030719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 59 // 59 // 0 /// DQ124115 // GenBank // Rattus norvegicus multiple domain complement regulator 1 (Mdcr1) mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 100 // 66 // 69 // 0 /// GENSCAN00000055897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:78181163:78382316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 39 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:78393197:78466956:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 26 // 26 // 18 // 69 // 1 /// GENSCAN00000055892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:78118644:78165273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 14 // 14 // 10 // 69 // 1
GENSCAN00000043293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:79110076:79162346:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001127680 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate-rich 1 (Erich1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80168261:80234542:1 gene:ENSRNOG00000042114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC167071 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate-rich 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:9091442), partial cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80159961:80260649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001100791 // RefSeq // Rattus norvegicus testis development related protein (Tdrp), mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006253399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis development related protein (Tdrp), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000036383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80296809:80322591:1 gene:ENSRNOG00000027245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC100251 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2610019F03, mRNA (cDNA clone IMAGE:7454791), partial cds. // chr16 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC168702 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2610019F03, mRNA (cDNA clone MGC:188636 IMAGE:7455266), complete cds. // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000044565 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80291665:80333327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT022755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_001169121 // RefSeq // Rattus norvegicus coordinator of PRMT5, differentiation stimulator (Coprs), mRNA. // chr16 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000000123 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80390902:80396012:1 gene:ENSRNOG00000000111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT022757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_031574 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS p21 protein activator 3 (Rasa3), mRNA. // chr16 // 98 // 91 // 47 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000067508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80808492:80922641:-1 gene:ENSRNOG00000017671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 91 // 48 // 48 // 0 /// D86045 // GenBank // Rattus norvegicus R-Ras gap mRNA for R-Ras GTP activating protein, complete cds. // chr16 // 98 // 91 // 47 // 48 // 0 /// NONRATT023632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 92 // 92 // 49 // 53 // 1 /// GENSCAN00000041180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80788151:80834062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 32 // 53 // 1 /// NONRATT023629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 66 // 66 // 35 // 53 // 1 /// NONRATT023630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 51 // 51 // 27 // 53 // 1 /// NONRATT023633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 30 // 30 // 16 // 53 // 1 /// GENSCAN00000041193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80835409:80870865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 23 // 23 // 12 // 53 // 1
XM_006253432 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700029H14 (LOC290876), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// XM_006253433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700029H14 (LOC290876), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NM_001037182 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700029H14 (LOC290876), mRNA. // chr16 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000057803 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:16:80790213:80802378:-1 gene:ENSRNOG00000026740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// BC100249 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700029H14, mRNA (cDNA clone MGC:116066 IMAGE:7135908), complete cds. // chr16 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// NONRATT023625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000041180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80788151:80834062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT023626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT023627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_057100 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest specific 6 (Gas6), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000024677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80701561:80732410:-1 gene:ENSRNOG00000018233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC070881 // GenBank // Rattus norvegicus growth arrest specific 6, mRNA (cDNA clone MGC:91537 IMAGE:7096665), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000041202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80701942:80732280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT023623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_012510 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+/K+ exchanging, beta polypeptide (Atp4b), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:80624778:80633691:-1 gene:ENSRNOG00000018543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M35535 // GenBank // R.norvegicus gastric (H+,K+)-ATPase beta-subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M55655 // GenBank // Rat stomach H,K-ATPase beta-subunit mRNA, complete cds. // chr16 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:80625202:80633516:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT023622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000026370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81075538:81102636:1 gene:ENSRNOG00000019473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ224263 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA71YL24 mRNA sequence. // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT022774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81079294:81089357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001013054 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylhydrolase like 1 (Adprhl1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006253439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylhydrolase like 1 (Adprhl1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81119661:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC083773 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylhydrolase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94724 IMAGE:7193406), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT022775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81140235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT022775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81140235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81140235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006253439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylhydrolase like 1 (Adprhl1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81140235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006253439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylhydrolase like 1 (Adprhl1), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81140235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81140235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000057740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81104734:81154361:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001170477 // RefSeq // Rattus norvegicus growth hormone regulated TBC protein 1 (Grtp1), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81153618:81173894:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NM_001031813 // RefSeq // Rattus norvegicus growth hormone regulated TBC protein 1 (Grtp1), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000073240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81153618:81173894:1 gene:ENSRNOG00000019504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// BC097985 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone regulated TBC protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116122 IMAGE:7444444), complete cds. // chr16 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000043411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81153709:81173894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AY383707 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00052 mRNA, complete cds. // chr16 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT022780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001169144 // RefSeq // Rattus norvegicus PCI domain containing 2 (Pcid2), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81242949:81268414:1 gene:ENSRNOG00000025222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81263566:81267264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT022781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81242963:81259928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001107323 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, gamma complex associated protein 3 (Tubgcp3), mRNA. // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000068416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:81670485:81729860:1 gene:ENSRNOG00000017085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// FQ222809 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA19YL11 mRNA sequence. // chr16 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000015569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:81648719:81732329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT022786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT022787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 17 // 44 // 1 /// NONRATT022788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
ENSRNOT00000039584 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:82143921:82144171:1 gene:ENSRNOG00000024649 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr16 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000054503 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:16:82144082:82144189:1 gene:ENSRNOG00000036386 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr16 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82143921:82167763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001271219 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 10 (Ankrd10), mRNA. // chr16 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// XM_006253453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 10 (Ankrd10), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006253454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 10 (Ankrd10), transcript variant X2, mRNA. // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006253455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 10 (Ankrd10), transcript variant X3, mRNA. // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006253457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 10 (Ankrd10), transcript variant X5, mRNA. // chr16 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000018870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:82674223:82697364:1 gene:ENSRNOG00000013618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// XM_006253458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 10 (Ankrd10), transcript variant X6, mRNA. // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000013582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82619473:82696413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT022791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001177684 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteinyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Cars2), mRNA. // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006253463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cysteinyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Cars2), transcript variant X4, mRNA. // chr16 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000019993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:82756705:82792874:1 gene:ENSRNOG00000014526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82756741:82792759:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT022796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 10 // 31 // 1 /// NONRATT022798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001109535 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB20, member RAS oncogene family (Rab20), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:82824911:82848168:1 gene:ENSRNOG00000023991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:82825093:82847571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135009 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type IV, alpha 1 (Col4a1), mRNA. // chr16 // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// ENSRNOT00000057386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:82987857:83097435:1 gene:ENSRNOG00000016281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// GENSCAN00000013593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:83041898:83086302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 74 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT022802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 64 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT022801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 28 // 28 // 16 // 58 // 1
NM_001168633 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin receptor substrate 2 (Irs2), mRNA. // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000032918 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:83287185:83311239:1 gene:ENSRNOG00000023509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000009057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:83275299:83301328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT022807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001047978 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00175 (LOC689713), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000043188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:83919905:83949832:1 gene:ENSRNOG00000033703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT022811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000010825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:83939626:83949832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001106095 // RefSeq // Rattus norvegicus ligase IV, DNA, ATP-dependent (Lig4), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006253477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ligase IV, DNA, ATP-dependent (Lig4), transcript variant X1, mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:84770909:84776812:1 gene:ENSRNOG00000014605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:84773903:84776638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT022813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001076507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 155, member A (Fam155a), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_003751632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 155, member A (Fam155a), transcript variant 1, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// XM_573950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 155, member A (Fam155a), transcript variant 2, mRNA. // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000057354 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:16:84967014:84967958:1 gene:ENSRNOG00000037783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000043518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:84955397:85022945:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT022814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_001024972 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine and glutamate rich 1 (Arglu1), mRNA. // chr16 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:86014418:86038236:1 gene:ENSRNOG00000024142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 96 // 96 // 25 // 26 // 1 /// NONRATT022817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:86014627:86037543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1