NM_001009500 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoreceptor Ly49i7 (Ly49i7), mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227908413:227922172:-1 gene:ENSRNOG00000048253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000075161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:214021141:214034900:-1 gene:ENSRNOG00000048144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AY659934 // GenBank // Rattus norvegicus immunoreceptor Ly49i7 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:213964997:214034900:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000019147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:227867617:227922172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001009486 // RefSeq // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 1 (Klra1), mRNA. // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006237457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 1 (Klra1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 1 (Klra1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000035522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:227988909:228022115:-1 gene:ENSRNOG00000031515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AY649835 // GenBank // Rattus norvegicus Ly49 inhibitory receptor 8 (Ly49i8) mRNA, complete cds. // chr4 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// BC085917 // GenBank // Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:94821 IMAGE:7108565), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006237456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus killer cell lectin-like receptor, subfamily A, member 1 (Klra1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT042265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT042266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1
NM_001191105 // RefSeq // Rattus norvegicus mago-nashi homolog B (Drosophila) (Magohb), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228076684:228084406:-1 gene:ENSRNOG00000010316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:227999921:228084406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
XM_006225094 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), transcript variant X6, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine/tyrosine kinase 1 (Styk1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013833 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:228091334:228103354:-1 gene:ENSRNOG00000010347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036610 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:228091334:228103354:-1 gene:ENSRNOG00000010347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000019149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228091334:228106341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_031979 // RefSeq // Rattus norvegicus Y box binding protein 3 (Ybx3), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228170272:228193494:-1 gene:ENSRNOG00000005480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228170272:228193494:-1 gene:ENSRNOG00000005480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// D28557 // GenBank // Rattus norvegicus RYB-a mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// U22893 // GenBank // Rattus norvegicus muscle Y-box protein YB2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC105778 // GenBank // Rattus norvegicus cold shock domain protein A, mRNA (cDNA clone MGC:124554 IMAGE:7932542), complete cds. // chr4 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0 /// FQ216542 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YE17 mRNA sequence. // chr4 // 47 // 68 // 9 // 19 // 0 /// NONRATT042267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228181014:228209082:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT042269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NONRATT042267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000007435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228309823:228310761:-1 gene:ENSRNOG00000005645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AF240766 // GenBank // Rattus norvegicus taste receptor rT2R6 mRNA, partial cds. // chr4 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0
NM_023995 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 107 (Tas2r107), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228336760:228337686:-1 gene:ENSRNOG00000005646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF227142 // GenBank // Rattus norvegicus candidate taste receptor T2R4 mRNA, complete cds. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT042270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166680 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 106 (Tas2r106), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228350305:228351228:-1 gene:ENSRNOG00000031185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166681 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 104 (Tas2r104), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228373030:228373938:-1 gene:ENSRNOG00000032448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023999 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 105 (Tas2r105), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228391702:228392631:-1 gene:ENSRNOG00000005664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF227146 // GenBank // Rattus norvegicus candidate taste receptor T2R9 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000007497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228395211:228396140:-1 gene:ENSRNOG00000005692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_023996 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 114 (Tas2r114), mRNA. // chr4 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// AF227143 // GenBank // Rattus norvegicus candidate taste receptor T2R5 mRNA, complete cds. // chr4 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT042272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
ENSRNOT00000013859 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:228531707:228532695:-1 gene:ENSRNOG00000010432 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000073498 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:212385358:212386148:1 gene:ENSRNOG00000046495 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr4 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000057004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228531707:228532549:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT042273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:212383563:212391445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1
NM_172064 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich proteoglycan 1 (Prpg1), mRNA. // chr4 // 78 // 75 // 21 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228551814:228554909:-1 gene:ENSRNOG00000010449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// K02247 // GenBank // Rat parotid gland acidic proline-rich protein mRNA, complete CDS. // chr4 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// L17317 // GenBank // Rattus norvegicus proline-rich proteoglycan (PRPG1) mRNA, complete cds. // chr4 // 78 // 75 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057008 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228551800:228555871:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT042274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_172065 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich protein MP5 (Prpmp5), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228579818:228582925:-1 gene:ENSRNOG00000010485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L17318 // GenBank // Rattus norvegicus proline-rich proteoglycan (PRPG2) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228580165:228583961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT042275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012632 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich protein 15 (Prp15), mRNA. // chr4 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000007139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228738622:228741215:1 gene:ENSRNOG00000005383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 87 // 79 // 26 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000045884 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:228749426:228751540:1 gene:ENSRNOG00000028983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// M83567 // GenBank // Rat basic prolin-rich protein mRNA, 3 flank. // chr4 // 81 // 82 // 25 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000007119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:228738622:228741215:1 gene:ENSRNOG00000005383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 45 // 12 // 17 // 0 /// NM_001024983 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1559532 (RGD1559532), mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// GENSCAN00000057009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228749426:228751540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT040520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000057005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:228738655:228741215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1
NM_023997 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 121 (Tas2r121), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229397091:229398008:-1 gene:ENSRNOG00000005717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF227144 // GenBank // Rattus norvegicus candidate taste receptor T2R7 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166683 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 129 (Tas2r129), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229553175:229554122:-1 gene:ENSRNOG00000031107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002726469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative taste receptor T2R14-like (LOC100360076), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002729433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative taste receptor T2R14-like (LOC100360076), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109596 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 125 (Tas2r125), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229596599:229597531:-1 gene:ENSRNOG00000021397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166689 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 113 (Tas2r113), mRNA. // chr4 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229616822:229617751:-1 gene:ENSRNOG00000030752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166677 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 110 (Tas2r110), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000040860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229658691:229659692:-1 gene:ENSRNOG00000050637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT042282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000012377 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:229658691:229673792:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001166679 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 116 (Tas2r116), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229672818:229673792:-1 gene:ENSRNOG00000021366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173336 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 123 (Tas2r123), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229682753:229683754:-1 gene:ENSRNOG00000046088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF240765 // GenBank // Rattus norvegicus taste receptor rT2R2 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166690 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 103 (Tas2r103), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229708086:229709024:-1 gene:ENSRNOG00000031836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:229683842:229709024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT042282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001085397 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 140 (Tas2r140), mRNA. // chr4 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006237469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 140 (Tas2r140), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229729536:229730474:-1 gene:ENSRNOG00000021329 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_052802 // RefSeq // Rattus norvegicus kidney androgen regulated protein (Kap), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:230077260:230080304:-1 gene:ENSRNOG00000005858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U25808 // GenBank // Rattus norvegicus kidney-specific androgen-regulated protein KAP mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT042287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:230019206:230080147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_006225151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 102 (Tas2r102), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006237482 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 102 (Tas2r102), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000050359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229452241:229453185:1 gene:ENSRNOG00000030993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 91 // 79 // 10 // 11 // 0
NM_001080939 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 109 (Tas2r109), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229522579:229523541:1 gene:ENSRNOG00000032724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166682 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 117 (Tas2r117), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229515260:229516216:1 gene:ENSRNOG00000033896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023998 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 13 (Tas2r13), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000007538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:229487376:229488320:1 gene:ENSRNOG00000005732 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AF227145 // GenBank // Rattus norvegicus candidate taste receptor T2R8 mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT040523 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001107892 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 6 (Lrp6), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000066575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232477066:232579512:-1 gene:ENSRNOG00000006338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000040510 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232477817:232605849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT042306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
NM_001109603 // RefSeq // Rattus norvegicus MANSC domain containing 1 (Mansc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232645471:232657452:-1 gene:ENSRNOG00000028526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232645471:232664717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106624 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 16 (Dusp16), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232753988:232798358:-1 gene:ENSRNOG00000006628 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232753988:232798358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT042312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_080579 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 19 (Gpr19), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 19 (Gpr19), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 19 (Gpr19), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:232913212:232929837:-1 gene:ENSRNOG00000007126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089971 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 19, mRNA (cDNA clone MGC:109351 IMAGE:7315466), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:232913330:232914559:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT042313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001109254 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, class C, group 5, member D (Gprc5d), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233143883:233155649:-1 gene:ENSRNOG00000008439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233144141:233154222:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT042319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENSRNOT00000000025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233174078:233203299:-1 gene:ENSRNOG00000000024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168221 // GenBank // Rattus norvegicus heme binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:188220 IMAGE:7323058), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ229464 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YN03 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// FQ218116 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA9YC12 mRNA sequence. // chr4 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NM_001108651 // RefSeq // Rattus norvegicus heme binding protein 1 (Hebp1), mRNA. // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT042321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233158938:233245148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT042322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001013166 // RefSeq // Rattus norvegicus germ cell associated 1 (Gsg1), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011295 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233291209:233307476:-1 gene:ENSRNOG00000008518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC079000 // GenBank // Rattus norvegicus germ cell associated 1, mRNA (cDNA clone MGC:93908 IMAGE:7112802), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233291280:233350590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001105756 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylethanolamine binding protein 2 (Pbp2), mRNA. // chr4 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000011461 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233361095:233361658:-1 gene:ENSRNOG00000008667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000024667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233361095:233394300:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0
NM_012574 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 2B (Grin2b), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006237514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl D-aspartate 2B (Grin2b), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:233824034:234258927:-1 gene:ENSRNOG00000008766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M91562 // GenBank // Rattus norvegicus NMDA receptor subtype 2B mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// U11419 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor subunit mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233824494:233833553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000053864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:233863052:233874972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001013927 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase B domain containing 1 (Plbd1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:234823110:234879736:-1 gene:ENSRNOG00000008933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC085851 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1100001H23, mRNA (cDNA clone MGC:94571 IMAGE:7189866), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234823216:234851232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234856671:234888846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT042332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_013170 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase 2C (Gucy2c), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// ENSRNOT00000012212 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:234917958:234998564:-1 gene:ENSRNOG00000009031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// M55636 // GenBank // Rattus norvegicus heat-stable enterotoxin receptor/guanylyl cyclase (GC-C) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 65 // 65 // 0 /// GENSCAN00000052467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234986427:234998554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 23 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000052455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234918499:234982673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 66 // 66 // 43 // 65 // 1 /// NONRATT042336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 18 // 65 // 1 /// NONRATT042337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 18 // 65 // 1
NM_001009661 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain binding protein 11 (Wbp11), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000007402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:234414449:234427819:-1 gene:ENSRNOG00000005505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000072528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235030919:235041997:-1 gene:ENSRNOG00000049593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC087082 // GenBank // Rattus norvegicus WW domain binding protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:94547 IMAGE:7189215), complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000003182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234414928:234426006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235030919:235041997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
XM_006237547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912450 (LOC100912450), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006237548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912450 (LOC100912450), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006237549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912450 (LOC100912450), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006237554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100912609 (LOC100912609), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073808 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:234454619:234455293:-1 gene:ENSRNOG00000050031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073975 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:235069685:235070359:-1 gene:ENSRNOG00000047561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075717 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:234388919:234389593:-1 gene:ENSRNOG00000048926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234442900:234455128:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:234377200:234389428:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// GENSCAN00000052466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235057877:235070194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
NM_001173509 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosyltransferase 4 (Art4), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235087831:235098167:-1 gene:ENSRNOG00000005670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235087255:235097932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT042340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_012862 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix Gla protein (Mgp), mRNA. // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235113772:235117160:-1 gene:ENSRNOG00000005695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086394 // GenBank // Rattus norvegicus matrix Gla protein, mRNA (cDNA clone MGC:105492 IMAGE:7303359), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221407 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA36YL11 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// FQ224403 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA67YL17 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// J03026 // GenBank // Rat matrix Gla protein mRNA, complete cds. // chr4 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// XM_006237560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix Gla protein (Mgp), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000052447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235113981:235117091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT042342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106625 // RefSeq // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum protein 27 (Erp27), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235150711:235169448:-1 gene:ENSRNOG00000005787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235143177:235169398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1
NM_001009600 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho, GDP dissociation inhibitor (GDI) beta (Arhgdib), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho, GDP dissociation inhibitor (GDI) beta (Arhgdib), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006237565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho, GDP dissociation inhibitor (GDI) beta (Arhgdib), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235170740:235189433:-1 gene:ENSRNOG00000005809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088209 // GenBank // Rattus norvegicus Rho, GDP dissociation inhibitor (GDI) beta, mRNA (cDNA clone MGC:108926 IMAGE:7382227), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ215399 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YG02 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT042349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 93 // 93 // 25 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235171199:235257028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT042350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT042351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// NONRATT042352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSRNOT00000030850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235327142:235433770:-1 gene:ENSRNOG00000027592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235318788:235340637:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// FQ213782 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YL11 mRNA sequence. // chr4 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT042354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000029424 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:235458801:235459581:-1 gene:ENSRNOG00000027568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235432954:235459581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
XM_006225118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 (Eps8), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006237583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 (Eps8), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006237584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 8 (Eps8), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:235734054:235794456:-1 gene:ENSRNOG00000007047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000037031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:235734054:235817531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT042359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0
NM_001192015 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 15, member 5 (Slc15a5), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:236224617:236317092:-1 gene:ENSRNOG00000007717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:236220915:236317092:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
XM_003749863 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain only 3 (Lmo3), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// XM_006225152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain only protein 3-like (LOC102556832), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 59 // 59 // 0 /// XM_006237585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain only 3 (Lmo3), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// XM_006237588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain only 3 (Lmo3), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// XM_006237590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain only 3 (Lmo3), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// XM_006237591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM domain only 3 (Lmo3), transcript variant X8, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// ENSRNOT00000072450 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:237202548:237256241:1 gene:ENSRNOG00000047450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// AF353304 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal specific transcription factor DAT1 mRNA, complete cds. // chr4 // 82 // 98 // 51 // 62 // 0 /// FQ213730 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YB03 mRNA sequence. // chr4 // 95 // 100 // 60 // 63 // 0 /// NONRATT040620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// GENSCAN00000048631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:237192772:237220016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 13 // 13 // 8 // 63 // 1
NM_001109355 // RefSeq // Rattus norvegicus immunoglobulin (CD79A) binding protein 1b (Igbp1b), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:236961010:236962360:1 gene:ENSRNOG00000008125 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:236961010:236962044:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT040619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191979 // RefSeq // Rattus norvegicus RERG/RAS-like (Rergl), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:237872435:237881842:-1 gene:ENSRNOG00000008130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:237866443:237881804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001012234 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, zeta 1 (Plcz1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, zeta 1 (Plcz1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:238378339:238433672:-1 gene:ENSRNOG00000008514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY885259 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase C zeta mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:238378339:238408178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT042367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
GENSCAN00000026208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:239201336:239238402:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_030838 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1a5 (Slco1a5), mRNA. // chrU // 100 // 61 // 31 // 31 // 0 /// XM_006237648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1a5 (Slco1a5), transcript variant X8, mRNA. // chrU // 100 // 41 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000049569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240661028:240719895:-1 gene:ENSRNOG00000031249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 61 // 31 // 31 // 0 /// AF041105 // GenBank // Rattus norvegicus organic anion transporter protein 3 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 49 // 25 // 25 // 0 /// AF083469 // GenBank // Rattus norvegicus organic anion transporting polypeptide 3 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 61 // 31 // 31 // 0 /// FQ211722 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA82YG17 mRNA sequence. // chrU // 100 // 59 // 30 // 30 // 0 /// NM_017111 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1a1 (Slco1a1), mRNA. // chrU // 65 // 45 // 15 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000049154 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240150576:240447522:-1 gene:ENSRNOG00000036984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 43 // 14 // 22 // 0 /// FQ209854 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YO12 mRNA sequence. // chrU // 71 // 41 // 15 // 21 // 0 /// L19031 // GenBank // Rattus norvegicus organic anion transporter (oatp) mRNA, complete cds. // chrU // 65 // 45 // 15 // 23 // 0 /// NONRATT042382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 61 // 61 // 31 // 51 // 1
NM_130736 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1a6 (Slco1a6), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1a6 (Slco1a6), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1a6 (Slco1a6), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240560523:240596725:-1 gene:ENSRNOG00000030894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF053317 // GenBank // Rattus norvegicus organic anion transporting polypeptide (Oatp5) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091571 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7129830, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr4 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT042380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:240556239:240664753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT042381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001012098 // RefSeq // Rattus norvegicus RecQ helicase-like (Recql), mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// XM_006237617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RecQ protein-like (DNA helicase Q1-like) (Recql), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006237618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RecQ protein-like (DNA helicase Q1-like) (Recql), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000065576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240795680:240820165:-1 gene:ENSRNOG00000012602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// BC079026 // GenBank // Rattus norvegicus RecQ protein-like (DNA helicase Q1-like), mRNA (cDNA clone MGC:93953 IMAGE:7114009), complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000000804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:240796270:240831425:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT042385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT042388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 51 // 51 // 20 // 39 // 1 /// NONRATT042384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1 /// NONRATT042389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 41 // 41 // 16 // 39 // 1 /// NONRATT042390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT042386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_013089 // RefSeq // Rattus norvegicus glycogen synthase 2 (Gys2), mRNA. // chr4 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000066553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240852458:240896372:-1 gene:ENSRNOG00000012783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF346902 // GenBank // Rattus norvegicus liver glycogen synthase mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// J05446 // GenBank // Rat glycogen synthase mRNA, complete cds. // chr4 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:240872874:240896327:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0
NM_012595 // RefSeq // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase B (Ldhb), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240918028:240936001:-1 gene:ENSRNOG00000013000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC059149 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase B, mRNA (cDNA clone MGC:72914 IMAGE:6919339), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212899 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YM08 mRNA sequence. // chr4 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// U07181 // GenBank // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase-B (LDH-B) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// FQ213158 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YG12 mRNA sequence. // chr4 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// FQ213341 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YG01 mRNA sequence. // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// GENSCAN00000051933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:240918219:241001818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_017099 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 8 (Kcnj8), mRNA. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000018057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240996202:241003064:-1 gene:ENSRNOG00000013463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB043636 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP-sensitive K+ channel subunit Kir6.1, complete cds, isolate:A4. // chr4 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// AB043637 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP-sensitive K+ channel subunit Kir6.1, complete cds, isolate:A7. // chr4 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC078863 // GenBank // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:93524 IMAGE:7128284), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D42145 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATP-sensitive potasium channel uKATP-1, complete cds. // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT042397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:240918219:241001818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_013040 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 9 (Abcc9), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 46 // 46 // 0 /// AB045281 // GenBank // Rattus norvegicus SUR2b mRNA for sulphonylurea receptor 2b, complete cds. // chr4 // 96 // 88 // 44 // 46 // 0 /// AF019628 // GenBank // Rattus norvegicus sulfonylurea receptor 2B mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 46 // 46 // 0 /// AF087838 // GenBank // Rattus norvegicus sulfonylurea receptor 2B (SUR2B) mRNA, complete cds. // chr4 // 89 // 88 // 41 // 46 // 0 /// D83598 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sulfonylurea receptor, complete cds. // chr4 // 100 // 87 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000067489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241024263:241139051:-1 gene:ENSRNOG00000036960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 75 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT042399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000055540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241021683:241139051:-1 gene:ENSRNOG00000036960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 81 // 81 // 42 // 52 // 1 /// GENSCAN00000051935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:241021683:241132935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 73 // 73 // 38 // 52 // 1
NM_001271267 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 5 (Sox5), mRNA. // chr4 // 100 // 82 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000020729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:242271079:242371664:-1 gene:ENSRNOG00000027869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 30 // 30 // 0 /// AB073719 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Sry-related transcription factor Sox5, partial cds. // chr4 // 100 // 16 // 9 // 9 // 0 /// BC086415 // GenBank // Rattus norvegicus similar to SRY (sex determining region Y)-box 5 isoform a, mRNA (cDNA clone MGC:105885 IMAGE:7131922), complete cds. // chr4 // 100 // 55 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055542 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:242454081:242589655:-1 gene:ENSRNOG00000042587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 20 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT042414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 53 // 53 // 29 // 55 // 1 /// GENSCAN00000007257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:242271255:242318390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 36 // 36 // 20 // 55 // 1 /// NONRATT042415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 27 // 27 // 15 // 55 // 1 /// NONRATT042416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 22 // 22 // 12 // 55 // 1 /// NONRATT042417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 15 // 15 // 8 // 55 // 1
NM_013040 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 9 (Abcc9), mRNA. // chr4 // 96 // 100 // 66 // 69 // 0 /// AB045281 // GenBank // Rattus norvegicus SUR2b mRNA for sulphonylurea receptor 2b, complete cds. // chr4 // 94 // 100 // 65 // 69 // 0 /// AF019628 // GenBank // Rattus norvegicus sulfonylurea receptor 2B mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 66 // 69 // 0 /// AF087838 // GenBank // Rattus norvegicus sulfonylurea receptor 2B (SUR2B) mRNA, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 66 // 69 // 0 /// D83598 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sulfonylurea receptor, complete cds. // chr4 // 96 // 100 // 66 // 69 // 0 /// ENSRNOT00000055540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241021683:241139051:-1 gene:ENSRNOG00000036960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 99 // 68 // 68 // 0 /// ENSRNOT00000067489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241024263:241139051:-1 gene:ENSRNOG00000036960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 99 // 68 // 68 // 0 /// GENSCAN00000051935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:241021683:241132935:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 64 // 64 // 0 /// NONRATT042399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 69 // 69 // 0
XM_001074172 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC75664 (RGD1561551), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_575715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC75664 (RGD1561551), mRNA. // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:241231034:241248575:-1 gene:ENSRNOG00000036959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075667 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:241240014:241248575:-1 gene:ENSRNOG00000036959 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:241227735:241248575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT042400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT042401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_012813 // RefSeq // Rattus norvegicus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 1 (St8sia1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241274172:241351774:-1 gene:ENSRNOG00000014018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// U53883 // GenBank // Rattus norvegicus alpha 2,8-sialyltransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT042403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NONRATT042403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1
NM_001134581 // RefSeq // Rattus norvegicus C2 calcium-dependent domain containing 5 (C2cd5), mRNA. // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:241450858:241536419:-1 gene:ENSRNOG00000014382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:241422757:241575061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT042404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_017253 // RefSeq // Rattus norvegicus branched chain amino acid transaminase 1, cytosolic (Bcat1), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:243444839:243491574:-1 gene:ENSRNOG00000015514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AJ278701 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cytosolic branched chain aminotransferase (Bcatc gene). // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC087710 // GenBank // Rattus norvegicus branched chain aminotransferase 1, cytosolic, mRNA (cDNA clone MGC:105472 IMAGE:7315507), complete cds. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U35774 // GenBank // Rattus norvegicus cytosolic branch chain aminotransferase mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:243447382:243493384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT042423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106627 // RefSeq // Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 1 (Casc1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 1 (Casc1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:243622215:243658236:-1 gene:ENSRNOG00000027630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC160907 // GenBank // Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 1, mRNA (cDNA clone MGC:188640 IMAGE:7455489), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:243622382:243693775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_031515 // RefSeq // Rattus norvegicus Kirsten rat sarcoma viral oncogene (Kras), mRNA. // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// XM_006237655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kirsten rat sarcoma viral oncogene (Kras), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000012588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:243672433:243693788:-1 gene:ENSRNOG00000009338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000012887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:243667401:243693788:-1 gene:ENSRNOG00000009338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC126086 // GenBank // Rattus norvegicus v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:156626 IMAGE:8362025), complete cds. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// FQ230946 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YN20 mRNA sequence. // chr4 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U09793 // GenBank // Rattus norvegicus p21 (c-Ki-ras) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// FQ230759 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YC20 mRNA sequence. // chr4 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT042431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000013317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:243622382:243693775:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT042433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001191980 // RefSeq // Rattus norvegicus lamin tail domain containing 1 (Lmntd1), mRNA. // chr4 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006237662 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intermediate filament tail domain containing 1 (Ifltd1), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// XM_006237663 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intermediate filament tail domain containing 1 (Ifltd1), transcript variant X3, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// XM_006237664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intermediate filament tail domain containing 1 (Ifltd1), transcript variant X4, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// XM_006237667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intermediate filament tail domain containing 1 (Ifltd1), transcript variant X7, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// XM_006237670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intermediate filament tail domain containing 1 (Ifltd1), transcript variant X10, mRNA. // chr4 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000021306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:243839627:243879814:-1 gene:ENSRNOG00000015910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// XM_006237665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intermediate filament tail domain containing 1 (Ifltd1), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 68 // 68 // 15 // 22 // 1 /// GENSCAN00000051624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:243861046:243879814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// NONRATT042437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1 /// GENSCAN00000051630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:244309725:244335258:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_031046 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor, type 2 (Itpr2), mRNA. // chr4 // 90 // 100 // 53 // 59 // 0 /// ENSRNOT00000040645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:244585712:244960183:-1 gene:ENSRNOG00000001804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 98 // 58 // 58 // 0 /// AF329470 // GenBank // Rattus norvegicus IP3 receptor isoform 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 91 // 98 // 53 // 58 // 0 /// AY313846 // GenBank // Rattus norvegicus inositol trisphosphate receptor type 2 mRNA, complete cds. // chr4 // 84 // 95 // 47 // 56 // 0 /// GENSCAN00000006109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:244567512:244844766:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 71 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000033750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:244849716:244960183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 22 // 22 // 13 // 59 // 1
NM_001109608 // RefSeq // Rattus norvegicus asunder, spermatogenesis regulator (Asun), mRNA. // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245015507:245046757:-1 gene:ENSRNOG00000001808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ221916 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA30YC05 mRNA sequence. // chr4 // 90 // 31 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000033747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245008721:245046520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001011970 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 7 superfamily member 3 (Tm7sf3), mRNA. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000002486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245073413:245110560:-1 gene:ENSRNOG00000001817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC090030 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane 7 superfamily member 3, mRNA (cDNA clone MGC:109599 IMAGE:7366240), complete cds. // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245073666:245110464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT042452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
ENSRNOT00000054563 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:4:245135691:245135794:-1 gene:ENSRNOG00000036452 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr4 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
NM_001044299 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690784 (LOC690784), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690784 (LOC690784), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690784 (LOC690784), transcript variant X5, mRNA. // chr4 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000033743 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:4:245496210:245499007:-1 gene:ENSRNOG00000026864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001077890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MANSC domain containing 4 (Mansc4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MANSC domain containing 4 (Mansc4), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:245618389:245627159:-1 gene:ENSRNOG00000036925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245618389:245627159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_012636 // RefSeq // Rattus norvegicus parathyroid hormone-like hormone (Pthlh), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M21967 // GenBank // Rat calcium-mobilizing parathyroid hormone-like protein (PTH-LP), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M31603 // GenBank // Rat parathyroid-like peptide mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:245793355:245832721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001024984 // RefSeq // Rattus norvegicus ERGIC and golgi 2 (Ergic2), mRNA. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC083597 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1200009B18; EST AA408438, mRNA (cDNA clone MGC:94334 IMAGE:7132841), complete cds. // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ229098 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YH21 mRNA sequence. // chr4 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000067970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:246724725:246734389:-1 gene:ENSRNOG00000001852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT042458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT042463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT042464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_342788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 1 (Tmtc1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_342788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and tetratricopeptide repeat containing 1 (Tmtc1), transcript variant 2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000002535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:246760019:246960998:-1 gene:ENSRNOG00000001854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064320 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:246760019:246960998:-1 gene:ENSRNOG00000001854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000021691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:246760019:246800211:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 42 // 16 // 16 // 0
NM_001008333 // RefSeq // Rattus norvegicus antagonist of mitotic exit network 1 homolog (S. cerevisiae) (Amn1), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus antagonist of mitotic exit network 1 homolog (S. cerevisiae) (Amn1), transcript variant X1, mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:247795755:247822690:-1 gene:ENSRNOG00000036917 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086357 // GenBank // Rattus norvegicus antagonist of mitotic exit network 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105998 IMAGE:7303722), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:247796167:247824748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT042469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
GENSCAN00000007444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:247887460:247933334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
XM_006225038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal modification protein rimK-like family member B (Rimklb), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal modification protein rimK-like family member B (Rimklb), transcript variant X2, mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055433 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:248214033:248215196:-1 gene:ENSRNOG00000036910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020866 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:222281854:222293504:-1 gene:ENSRNOG00000023814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000032690 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:222285403:222293504:-1 gene:ENSRNOG00000023814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:222285403:222303735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:248214033:248215196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr4 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001100964 // RefSeq // Rattus norvegicus leiomodin 2 (cardiac) (Lmod2), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51440008:51447139:1 gene:ENSRNOG00000049639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000073466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:51329520:51337212:1 gene:ENSRNOG00000045831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB331240 // GenBank // Rattus norvegicus lmod2 mRNA for Lmod2, complete cds. // chr4 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC128755 // GenBank // Rattus norvegicus leiomodin 2 (cardiac), mRNA (cDNA clone MGC:156737 IMAGE:7104774), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51440008:51455343:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000051972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:51329662:51336373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 93 // 52 // 13 // 14 // 0
XM_002729454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member e41 (Bhlhe41), mRNA. // chr4 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070957 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:244395779:244398201:-1 gene:ENSRNOG00000048961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// AF009329 // GenBank // Rattus norvegicus enhancer-of-split and hairy-related protein 1 (SHARP-1) mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_001074956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member e41 (Bhlhe41), mRNA. // chr4 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000006106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:244360761:244452462:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_131906 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 1A2 (Slco1a2), mRNA. // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000043374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240195849:240251531:-1 gene:ENSRNOG00000047493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000046598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:240194947:240251561:-1 gene:ENSRNOG00000047493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// U88036 // GenBank // Rattus norvegicus brain digoxin carrier protein mRNA, complete cds. // chr4 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// U95011 // GenBank // Rattus norvegicus brain-specific organic anion transporter mRNA, complete cds. // chr4 // 90 // 91 // 18 // 20 // 0
XM_002729450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ig variable region, light chain (RGD1565617), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ig variable region, light chain (RGD1565617), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:24585556:24586167:-1 gene:ENSRNOG00000047836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048879 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:3309621:3310196:1 gene:ENSRNOG00000038254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:3211856:3310232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:24585556:24586167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_013067 // RefSeq // Rattus norvegicus ribophorin I (Rpn1), mRNA. // chr4 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:185243186:185264600:1 gene:ENSRNOG00000046345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB100593 // GenBank // Rattus norvegicus Rpn1 mRNA for ribophorin1, complete cds, strain: F344/Crj. // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AB100594 // GenBank // Rattus norvegicus Rpn1 mRNA for ribophorin1, complete cds, strain: LEC/Crj. // chr4 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// BC061756 // GenBank // Rattus norvegicus ribophorin I, mRNA (cDNA clone MGC:72518 IMAGE:5600029), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000008677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:185243190:185264205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001024339 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, alpha 8 (Tuba8), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220863728:220880837:1 gene:ENSRNOG00000048169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079185 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, alpha 8, mRNA (cDNA clone MGC:94229 IMAGE:7131106), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ217798 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA17YI08 mRNA sequence. // chr4 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220864700:220880819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106618 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 26 (Pex26), mRNA. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000073303 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:220837560:220849661:1 gene:ENSRNOG00000049982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC166463 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisome biogenesis factor 26, mRNA (cDNA clone MGC:187801 IMAGE:9030430), complete cds. // chr4 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:220837876:220847195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr4 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0
ENSRNOT00000032637 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:567883:569513:1 gene:ENSRNOG00000022854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0
NM_001106630 // RefSeq // Rattus norvegicus junctophilin 1 (Jph1), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus junctophilin 1 (Jph1), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:1413721:1507659:1 gene:ENSRNOG00000006110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:1453679:1496447:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000022058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:1413132:1426709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000038402 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:1863510:1864014:1 gene:ENSRNOG00000022589 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000016957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:1851069:1984763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_001109258 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 70 (Tmem70), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:2019520:2036983:-1 gene:ENSRNOG00000006608 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001100534 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L7 (Rpl7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000009431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:2621855:2624860:1 gene:ENSRNOG00000006992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC159431 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein L7, mRNA (cDNA clone MGC:188753 IMAGE:9091211), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ220373 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YC02 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000020829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:2618205:2651791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_001063197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus somatomedin B and thrombospondin, type 1 domain containing (Sbspon), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_216317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus somatomedin B and thrombospondin, type 1 domain containing (Sbspon), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009530 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:2803062:2832814:1 gene:ENSRNOG00000007258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT042498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000020835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:2803062:2840533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_003749882 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 2-like (RGD1564405), mRNA. // chr5 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// XM_003750867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2 (Nufip2), mRNA. // chr5 // 83 // 100 // 29 // 35 // 0 /// XM_006220733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear fragile X mental retardation protein interacting protein 2 (Nufip2), mRNA. // chr5 // 83 // 83 // 24 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000011083 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:3657788:3660120:1 gene:ENSRNOG00000008382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 83 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000030501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66425460:66448921:1 gene:ENSRNOG00000024964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 24 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000056276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:66425460:66451772:1 gene:ENSRNOG00000024964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 71 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:66388736:66448921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 24 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:3648705:3660120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT042503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 46 // 16 // 16 // 0
NM_207608 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily A, member 1 (Trpa1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:3764788:3818026:1 gene:ENSRNOG00000007354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY496961 // GenBank // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 (TRPA1) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:3730584:3814841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT042504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001191754 // RefSeq // Rattus norvegicus musculin (Msc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237731 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus musculin (Msc), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:3934953:3936298:1 gene:ENSRNOG00000007540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 77 // 50 // 10 // 13 // 0 /// NONRATT042506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:3934992:3986940:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT042507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT042508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006225168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eyes absent homolog 1 (Drosophila) (Eya1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eyes absent homolog 1 (Drosophila) (Eya1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225173 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eyes absent homolog 1 (Drosophila) (Eya1), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 96 // 69 // 24 // 25 // 0 /// XM_006237739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eyes absent homolog 1 (Drosophila) (Eya1), mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064946 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:4349987:4485882:1 gene:ENSRNOG00000007590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:4383109:4490722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
ENSRNOT00000010231 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:4713951:4714778:1 gene:ENSRNOG00000007776 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000021029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:4714021:4714811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000010277 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:4846867:4848587:1 gene:ENSRNOG00000007797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// NM_001106631 // RefSeq // Rattus norvegicus recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region (Rbpj), mRNA. // chr5 // 60 // 100 // 12 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:59785053:59859229:-1 gene:ENSRNOG00000046327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 100 // 11 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:4823193:4848587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:59787707:59818389:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 85 // 9 // 17 // 0
NM_001024247 // RefSeq // Rattus norvegicus lactamase, beta 2 (Lactb2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:4950859:4973620:1 gene:ENSRNOG00000007829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093378 // GenBank // Rattus norvegicus lactamase, beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:112672 IMAGE:7388096), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ215541 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YN08 mRNA sequence. // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:4950908:4988418:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT042515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001007701 // RefSeq // Rattus norvegicus translocation associated membrane protein 1 (Tram1), mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:10062171:10138209:1 gene:ENSRNOG00000007892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000045373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:10120169:10157544:1 gene:ENSRNOG00000007892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// AY387055 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00069 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// BC083851 // GenBank // Rattus norvegicus translocation associated membrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:95042 IMAGE:7123274), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 36 // 36 // 0 /// FQ223598 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA92YA11 mRNA sequence. // chr5 // 97 // 69 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT042518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000014139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:10062327:10236191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 37 // 48 // 1 /// NONRATT042517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 77 // 77 // 37 // 48 // 1
NM_031822 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor coactivator 2 (Ncoa2), mRNA. // chr5 // 83 // 91 // 34 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000011026 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:10456313:10547228:1 gene:ENSRNOG00000007975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// AF136943 // GenBank // Rattus norvegicus transcriptional intermediary factor 2 (TIF2) mRNA, complete cds. // chr5 // 83 // 91 // 34 // 41 // 0 /// GENSCAN00000031843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:10483933:10533084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT042521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
XM_003749884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 14-like (LOC100365184), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 14-like (LOC100365184), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034525 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:10550222:10570255:1 gene:ENSRNOG00000021792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:10550222:10688767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107898 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 5A1 (Slco5a1), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier organic anion transporter family, member 5A1 (Slco5a1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:10704801:10824591:1 gene:ENSRNOG00000008966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031844 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:10770931:10824524:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT042530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XR_145970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Tubulin alpha-2 chain (Alpha-tubulin 2) (LOC680435), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XR_146959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Tubulin alpha-2 chain (Alpha-tubulin 2) (LOC680435), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:11526342:11531287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001107900 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxypeptidase A6 (Cpa6), mRNA. // chr5 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13269769:13383787:1 gene:ENSRNOG00000005655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13351631:13383378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT042531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001277056 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor guanine nucleotide-exchange factor 1(brefeldin A-inhibited) (Arfgef1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006237756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor guanine nucleotide-exchange factor 1(brefeldin A-inhibited) (Arfgef1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000007766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13474693:13567432:1 gene:ENSRNOG00000005703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000000516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13491467:13569910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT042537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 22 // 42 // 1 /// NONRATT042535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001025695 // RefSeq // Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 5 (Cops5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237757 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 5 (Cops5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237758 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COP9 signalosome subunit 5 (Cops5), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13684313:13702371:1 gene:ENSRNOG00000006499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098736 // GenBank // Rattus norvegicus COP9 constitutive photomorphogenic homolog subunit 5 (Arabidopsis), mRNA (cDNA clone MGC:112728 IMAGE:7385252), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT042540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000000515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13687190:13690992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001127569 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 42 (Ppp1r42), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000066395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13718715:13763664:1 gene:ENSRNOG00000006804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// GENSCAN00000000511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13740748:13776980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000000514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13723992:13732024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_006237790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor 24 (Tcf24), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13740748:13776980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 73 // 12 // 19 // 0
AF272707 // GenBank // Rattus norvegicus small nucleolar RNA U87, complete sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// SNHG6 // lncRNA Db // rn4 chr5:8,840,469-8,842,569 // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_353828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongation factor 1-gamma-like (LOC362473), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13996706:13998575:1 gene:ENSRNOG00000021692 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT042550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000048937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13996718:14057818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_176857 // RefSeq // Rattus norvegicus valosin containing protein (p97)/p47 complex interacting protein 1 (Vcpip1), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:14031200:14059036:1 gene:ENSRNOG00000006980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB045378 // GenBank // Rattus norvegicus VCIP135 mRNA for VCP(p97)/p47-interacting protein, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AF289091 // GenBank // Rattus norvegicus p97/VCP-binding protein p135 mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13996718:14057818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT042551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001106632 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloblastosis oncogene-like 1 (Mybl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237750 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myeloblastosis oncogene-like 1 (Mybl1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:14079943:14113762:1 gene:ENSRNOG00000021669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048940 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:14074323:14126091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001191981 // RefSeq // Rattus norvegicus syntrophin, gamma 1 (Sntg1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:14977623:15286329:1 gene:ENSRNOG00000007294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000011830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:14976611:15400872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001191981 // RefSeq // Rattus norvegicus syntrophin, gamma 1 (Sntg1), mRNA. // chr5 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// XM_006237792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-1-syntrophin-like (LOC102556429), mRNA. // chr5 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:14879760:14969548:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000035699 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:16451035:16451966:1 gene:ENSRNOG00000042765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 92 // 11 // 12 // 0
GENSCAN00000004995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:16845188:16846704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0
XM_006225204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S acidic ribosomal protein P2-like (RGD1564095), mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// XM_006237797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S acidic ribosomal protein P2-like (RGD1564095), mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000061899 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:17181248:17181592:1 gene:ENSRNOG00000040219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0
NM_001014784 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptides B/W receptor 1 (Npbwr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:18149038:18150027:1 gene:ENSRNOG00000007640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY577901 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 7 (Gpr7) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:17972393:18150027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001127495 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 20 (Rgs20), mRNA. // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000010682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19197565:19275849:1 gene:ENSRNOG00000008100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// BC160842 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 20, mRNA (cDNA clone MGC:187568 IMAGE:8361585), complete cds. // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000049283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19264293:19275051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
ENSRNOT00000011619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19392158:19402384:1 gene:ENSRNOG00000008566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// FQ216110 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YK10 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// NM_001106633 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L15 (Mrpl15), mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19392114:19400399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT042569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001107902 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 17 (Sox17), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19675585:19681084:1 gene:ENSRNOG00000027357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19678621:19680329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT042574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
ENSRNOT00000049609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19767450:19768442:1 gene:ENSRNOG00000032840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NM_133594 // RefSeq // Rattus norvegicus small ubiquitin-like modifier 2 (Sumo2), mRNA. // chr5 // 50 // 100 // 10 // 20 // 0 /// BC078746 // GenBank // Rattus norvegicus SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93211 IMAGE:7125132), complete cds. // chr5 // 50 // 100 // 10 // 20 // 0 /// BC058446 // GenBank // Rattus norvegicus SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 2 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72702 IMAGE:6921523), complete cds. // chr5 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0 /// L79949 // GenBank // Rattus norvegicus MIF2 suppressor (SMT3) mRNA, complete cds. // chr5 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19755077:19767845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT042579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NM_001195676 // RefSeq // Rattus norvegicus retinitis pigmentosa 1 (human) (Rp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19828034:19844587:1 gene:ENSRNOG00000008807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19835388:19955357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001017380 // RefSeq // Rattus norvegicus cylindromatosis (turban tumor syndrome) (Cyld), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 58 // 60 // 0 /// ENSRNOT00000011720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19868622:19871856:1 gene:ENSRNOG00000008861 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// ENSRNOT00000018888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:30298400:30348647:-1 gene:ENSRNOG00000014048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 80 // 46 // 48 // 0 /// BC082001 // GenBank // Rattus norvegicus cylindromatosis (turban tumor syndrome), mRNA (cDNA clone IMAGE:7131198), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 58 // 60 // 0 /// AY383658 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00003 mRNA, complete cds. // chr5 // 33 // 33 // 20 // 60 // 1 /// GENSCAN00000043819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19835388:19955357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT042581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 60 // 60 // 0 /// GENSCAN00000027119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:30298400:30348647:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 38 // 60 // 1 /// GENSCAN00000030132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:78356844:78365978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 15 // 60 // 1 /// NONRATT028033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 13 // 13 // 8 // 60 // 1
XM_006225184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipoxygenase homology domain-containing protein 1-like (LOC102553195), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// XM_006237818 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552996 (LOC102552996), mRNA. // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// GENSCAN00000043819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19835388:19955357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001011971 // RefSeq // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 4 (Xkr4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:20529390:20531948:-1 gene:ENSRNOG00000027276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// AY534258 // GenBank // Rattus norvegicus XK-related protein 4 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AB089205 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ischemia related factor vof-21, complete cds. // chr5 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
NM_001107904 // RefSeq // Rattus norvegicus trimethylguanosine synthase 1 (Tgs1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21194620:21228145:1 gene:ENSRNOG00000008156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:21194774:21219721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001111098 // RefSeq // Rattus norvegicus v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral related oncogene homolog (Lyn), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_030857 // RefSeq // Rattus norvegicus v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral related oncogene homolog (Lyn), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006237834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral related oncogene homolog (Lyn), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21307089:21422838:1 gene:ENSRNOG00000008180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF000300 // GenBank // Rattus norvegicus lyn A tyrosine kinase (LynA) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// AF000301 // GenBank // Rattus norvegicus Lyn B tyrosine kinase (LynB) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 81 // 25 // 26 // 0 /// AF000302 // GenBank // Rattus norvegicus Lyn B tyrosine kinase (LynB) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// L14951 // GenBank // Rat lyn protein non-receptor kinase mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// L14782 // GenBank // Rattus norvegicus lyn A protein tyrosine kinase mRNA, complete cds. // chr5 // 63 // 75 // 15 // 24 // 0 /// L14823 // GenBank // Rattus norvegicus lyn B protein tyrosine kinase mRNA, complete cds. // chr5 // 62 // 66 // 13 // 21 // 0 /// NONRATT042585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT042586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:21372362:21398410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NONRATT042585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003749892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 7 (Chchd7), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000047889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21622037:21624182:1 gene:ENSRNOG00000031769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT042588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000000043 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:23302351:23306655:1 gene:ENSRNOG00000000039 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
XM_006237840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 110, member B (Fam110b), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237842 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 110, member B (Fam110b), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:23688479:23690112:1 gene:ENSRNOG00000009114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091289 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 110, member B, mRNA (cDNA clone MGC:109194 IMAGE:7306431), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:23688752:23700865:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000012081 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:23762370:23762881:1 gene:ENSRNOG00000009126 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 44 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000055235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:23754626:23762926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_001107905 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 2B (Ubxn2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012551 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:24070790:24093957:1 gene:ENSRNOG00000009137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000057026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24070815:24093484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT042601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
ENSRNOT00000071334 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:24222855:24223378:1 gene:ENSRNOG00000047411 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071377 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:24520121:24520644:1 gene:ENSRNOG00000046387 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24520121:24520672:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000057029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24222855:24223406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_031986 // RefSeq // Rattus norvegicus syndecan binding protein (Sdcbp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:24256128:24283025:1 gene:ENSRNOG00000009683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AF248548 // GenBank // Rattus norvegicus syntenin (Sdcbp) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC064651 // GenBank // Rattus norvegicus syndecan binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:72376 IMAGE:5598152), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ226774 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YH11 mRNA sequence. // chr5 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT042606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// NONRATT042608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT042607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT042609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000057035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24275506:24281828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT042610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_031718 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB2A, member RAS oncogene family (Rab2a), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:26385975:26448949:1 gene:ENSRNOG00000005963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// FQ228812 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YI19 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ229541 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YJ03 mRNA sequence. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT042614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:26400476:26448098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001135894 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like (Wdr25l), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100363570 (LOC100363570), mRNA. // chr6 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006240544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like (Wdr25l), transcript variant X1, mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:141975870:142103153:1 gene:ENSRNOG00000004733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166712 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 25-like, mRNA (cDNA clone MGC:188413 IMAGE:7930656), complete cds. // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:141976373:141989932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:26481820:26535092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT047373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr6 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003753988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 7 (Chd7), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000008901 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:26581851:26700143:1 gene:ENSRNOG00000006689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000048334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:26617751:26700143:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT042617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NONRATT042617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001108969 // RefSeq // Rattus norvegicus clavesin 1 (Clvs1), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:27115709:27312485:1 gene:ENSRNOG00000006919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:27221870:27289951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_001013038 // RefSeq // Rattus norvegicus growth differentiation factor 6 (Gdf6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:27786775:27803096:1 gene:ENSRNOG00000007810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:27800225:27803198:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT042624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001007746 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2610301B20; EST AI428449 (MGC94199), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037547 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:28873221:28892513:1 gene:ENSRNOG00000026672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:28086560:28104063:1 gene:ENSRNOG00000049287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC079168 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2610301B20; EST AI428449, mRNA (cDNA clone MGC:94199 IMAGE:7129828), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:28086560:28120456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:28873322:28907910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
GENSCAN00000028644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29015459:29019422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034574 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:29018816:29019350:1 gene:ENSRNOG00000007820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 42 // 8 // 11 // 0
NM_181084 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible nuclear protein 1 (Tp53inp1), mRNA. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_006237869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible nuclear protein 1 (Tp53inp1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29136810:29142800:1 gene:ENSRNOG00000007964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB107917 // GenBank // Rattus norvegicus SIP mRNA for stress induced protein, complete cds. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_006237870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible nuclear protein 1 (Tp53inp1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT042628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29079135:29170302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT042629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT042630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001108656 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin E2 (Ccne2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006237873 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin E2 (Ccne2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000010696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29160461:29171995:1 gene:ENSRNOG00000008055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT042635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29079135:29170302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
XM_003749906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA-binding protein with serine-rich domain 1-like (RGD1564278), mRNA. // chr5 // 52 // 100 // 11 // 21 // 0 /// XM_003754001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA-binding protein with serine-rich domain 1-like (RGD1564278), mRNA. // chr5 // 52 // 100 // 11 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000046945 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:29485995:29486849:1 gene:ENSRNOG00000031491 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 52 // 100 // 11 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29486001:29486849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 100 // 11 // 21 // 0
XM_006225208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 antigen-like protein 2-like (RGD1559441), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// XM_006237886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 antigen-like protein 2-like (RGD1559441), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// XM_006237888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 antigen-like protein 2-like (RGD1559441), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// XR_353887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD99 antigen-like protein 2-like (RGD1559441), transcript variant X5, misc_RNA. // chr5 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000042810 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:29582046:29624703:1 gene:ENSRNOG00000024953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 39 // 39 // 9 // 23 // 1 /// ENSRNOT00000051311 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:29582046:29624703:1 gene:ENSRNOG00000024953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1 /// NONRATT042641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29582046:29625034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_001191755 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD54 homolog B (S. cerevisiae) (Rad54b), mRNA. // chrU // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD54 homolog B (S. cerevisiae) (Rad54b), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000061370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29863341:29928098:1 gene:ENSRNOG00000039949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29883352:29931864:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001106637 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP binding protein overexpressed in skeletal muscle (Gem), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168988 // GenBank // Rattus norvegicus GTP binding protein (gene overexpressed in skeletal muscle), mRNA (cDNA clone MGC:189328 IMAGE:8369626), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:30058938:30062666:1 gene:ENSRNOG00000015160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:30046714:30061607:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT042652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_006225219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrinogen silencer-binding protein-like (LOC102550523), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrinogen silencer-binding protein-like (LOC102550523), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29883352:29887996:1 gene:ENSRNOG00000015004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29883352:29931864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT042648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000054591 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:5:29929215:29929317:1 gene:ENSRNOG00000036483 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_053977 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 17 (Cdh17), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006237900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 17 (Cdh17), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:30100265:30152642:1 gene:ENSRNOG00000015562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000002816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:30100091:30151829:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT042653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// X78997 // GenBank // R.norvegicus (Sprague Dawley) mRNA for cadherin. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0
XM_006237894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 12B (Rbm12b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// XM_006237895 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 12B (Rbm12b), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// XM_006237896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 12B (Rbm12b), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// XM_006237898 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA binding motif protein 12B (Rbm12b), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// XM_001054639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA-binding protein 12B-A-like (LOC679087), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 87 // 87 // 13 // 15 // 1 /// XM_006225224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA-binding protein 12B-A-like (LOC679087), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// XM_006237910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA-binding protein 12B-A-like (LOC679087), mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_001171802 // RefSeq // Rattus norvegicus triple QxxK/R motif containing (Triqk), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000061328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:31193979:31266991:1 gene:ENSRNOG00000039924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT042660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000051071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:31236889:31266015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
ENSRNOT00000007460 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:31796955:31797961:1 gene:ENSRNOG00000005638 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:31771445:31797961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001108657 // RefSeq // Rattus norvegicus runt-related transcription factor 1; translocated to, 1 (cyclin D-related) (Runx1t1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237901 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus runt-related transcription factor 1; translocated to, 1 (cyclin D-related) (Runx1t1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006237903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus runt-related transcription factor 1; translocated to, 1 (cyclin D-related) (Runx1t1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus runt-related transcription factor 1; translocated to, 1 (cyclin D-related) (Runx1t1), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000066191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:32018815:32131170:1 gene:ENSRNOG00000005673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:32061973:32123204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_001024900 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 55A (Tmem55a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:33079533:33126619:1 gene:ENSRNOG00000006697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097492 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 55A, mRNA (cDNA clone MGC:114565 IMAGE:7461463), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:33079595:33123543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT042671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
ENSRNOT00000074213 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:33263784:33264335:1 gene:ENSRNOG00000048899 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0
XM_003749909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 64 (Tmem64), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_003754003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 64 (Tmem64), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_006223305 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC686461 (LOC686461), mRNA. // chr5 // 91 // 81 // 20 // 22 // 0 /// XM_006225228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 64 (Tmem64), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006237917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 64 (Tmem64), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009759 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:33529654:33545931:1 gene:ENSRNOG00000007426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:33529654:33567313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT042676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_031984 // RefSeq // Rattus norvegicus calbindin 1 (Calb1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 71 // 71 // 0 /// ENSRNOT00000010845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:34217914:34242322:1 gene:ENSRNOG00000007456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 71 // 71 // 0 /// BC081764 // GenBank // Rattus norvegicus calbindin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93326 IMAGE:7110962), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 71 // 71 // 0 /// M31178 // GenBank // Rat calbindin D28 mRNA, complete cds. // chr5 // 99 // 100 // 70 // 71 // 0 /// NONRATT042680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 71 // 71 // 0 /// NONRATT042681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 48 // 71 // 1 /// GENSCAN00000040135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:34152578:34241519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 33 // 71 // 1
NM_138873 // RefSeq // Rattus norvegicus nibrin (Nbn), mRNA. // chr5 // 91 // 97 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:34300932:34335368:1 gene:ENSRNOG00000008580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF218575 // GenBank // Rattus norvegicus Nbs1 (NBS1) mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 97 // 29 // 32 // 0 /// BC085700 // GenBank // Rattus norvegicus nibrin, mRNA (cDNA clone MGC:93174 IMAGE:7130978), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:34300967:34333619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_080776 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 16 (Mmp16), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000050137 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:36239487:36479703:1 gene:ENSRNOG00000005708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:36343056:36416328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT042693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
ENSRNOT00000037468 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:36560597:36561273:1 gene:ENSRNOG00000025197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0
NM_001271238 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclic nucleotide gated channel beta 3 (Cngb3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008087 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:37999121:38158576:1 gene:ENSRNOG00000006084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000044578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:37938757:38034489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001031663 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of microtubule dynamics 1 (Rmdn1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of microtubule dynamics 1 (Rmdn1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:38235426:38258968:1 gene:ENSRNOG00000025145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079473 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 82, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7122806). // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098713 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 82, member B, mRNA (cDNA clone MGC:112702 IMAGE:7322407), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044574 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:38235439:38258584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001012100 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (anionic amino acid transporter), member 13 (Slc7a13), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:38439678:38460856:1 gene:ENSRNOG00000024903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085796 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 7, (cationic amino acid transporter, y+ system) member 13, mRNA (cDNA clone MGC:93794 IMAGE:7109760), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:38440149:38466687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT042699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_013048 // RefSeq // Rattus norvegicus tocopherol (alpha) transfer protein (Ttpa), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:38661253:38681785:1 gene:ENSRNOG00000007139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D16339 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for alpha-tocopherol transfer protein, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042701 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012960 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-glutamyl hydrolase (conjugase, folylpolygammaglutamyl hydrolase) (Ggh), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:38693591:38716694:1 gene:ENSRNOG00000007351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087602 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-glutamyl hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:105496 IMAGE:7312627), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U38379 // GenBank // Rattus norvegicus gamma-glutamyl hydrolase precursor, mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:38693746:38716450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000042209 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:39712062:39712900:1 gene:ENSRNOG00000032779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// GENSCAN00000029805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:39712293:39785863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
ENSRNOT00000061181 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:40403771:40404210:1 gene:ENSRNOG00000039851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:40368908:40403938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006237946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock protein HSP 90-beta-like (LOC366329), mRNA. // chr5 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010058 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:40431839:40433778:1 gene:ENSRNOG00000007522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 95 // 16 // 20 // 0
NM_001100472 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin C (Ccnc), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:40521921:40537695:1 gene:ENSRNOG00000007719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC161908 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8367702. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT042705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001107918 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 45 (Usp45), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000066043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:40573111:40639486:1 gene:ENSRNOG00000008688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT042707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:40491682:40646384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1
NM_001025274 // RefSeq // Rattus norvegicus PNN-interacting serine/arginine-rich protein (Pnisr), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000061139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:40646030:40672914:1 gene:ENSRNOG00000008782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC091301 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine-rich 18, mRNA (cDNA clone MGC:109235 IMAGE:7309546), complete cds. // chr5 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT042711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000016374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:40652657:40710012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1 /// NONRATT042713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_001271065 // RefSeq // Rattus norvegicus failed axon connections homolog (Drosophila) (Faxc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013599 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:40729491:40787422:1 gene:ENSRNOG00000010106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000016391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:40729491:40778988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001107919 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 4 (Fbxl4), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:41196942:41270900:1 gene:ENSRNOG00000005641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC161859 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:187392 IMAGE:7096047), complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:41209563:41312719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT042716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT042717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_001135780 // RefSeq // Rattus norvegicus MMS22-like, DNA repair protein (Mms22l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006237954 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MMS22-like, DNA repair protein (Mms22l), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000009545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:43473598:43590298:1 gene:ENSRNOG00000006996 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC160888 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG14803-PA, mRNA (cDNA clone IMAGE:7389063), complete cds. // chr5 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// GENSCAN00000018877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:43561117:43599789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT042725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000018873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:43440061:43518641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 15 // 41 // 1 /// NONRATT042724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// NONRATT042726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 10 // 41 // 1 /// NONRATT042727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
ENSRNOT00000047860 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:43610490:43611373:1 gene:ENSRNOG00000033953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:43610490:43612497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0
NM_198783 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 4 (Ndufaf4), mRNA. // chr5 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000010073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:43880679:43885850:1 gene:ENSRNOG00000007506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// AF283900 // GenBank // Rattus norvegicus hormone-regulated proliferation-associated 20 kDa protein short form mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// AF283901 // GenBank // Rattus norvegicus hormone-regulated proliferation-associated 20 kDa protein long form mRNA, complete sequence. // chr5 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000018874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:43880715:43884359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT042728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT042729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT042730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 61 // 61 // 11 // 18 // 1
NM_001106640 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 63 (Gpr63), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 63 (Gpr63), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 63 (Gpr63), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:43958430:43999913:1 gene:ENSRNOG00000007675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:43997914:43999191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054589 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:5:48073505:48073595:1 gene:ENSRNOG00000036481 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000056685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:48093942:48189567:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_134331 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor A7 (Epha7), mRNA. // chr5 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:48230146:48386459:1 gene:ENSRNOG00000007030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000061033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:48230146:48386459:1 gene:ENSRNOG00000007030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 36 // 37 // 0 /// U21954 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine kinase receptor Ehk-3, full length form, mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 95 // 35 // 36 // 0 /// U21955 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine kinase receptor Ehk-3, truncated form, mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 58 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:48350127:48386388:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT042735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 16 // 38 // 1 /// NONRATT042736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1
NONRATT042734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 1
XM_001062203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S12-like (RGD1562265), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_233076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S12-like (RGD1562265), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042939 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:48896396:48896794:1 gene:ENSRNOG00000032454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000029257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:48896396:48902678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_001107920 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase kinase kinase 7 (Map3k7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:51794811:51852669:1 gene:ENSRNOG00000005724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:113540005:113597318:1 gene:ENSRNOG00000047516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000035141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:113540161:113576825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:51794967:51850106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000023544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52034960:52043712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001135754 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to BTB and CNC homology 1, basic leucine zipper transcription factor 2 (RGD1562865), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237967 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to BTB and CNC homology 1, basic leucine zipper transcription factor 2 (RGD1562865), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to BTB and CNC homology 1, basic leucine zipper transcription factor 2 (RGD1562865), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to BTB and CNC homology 1, basic leucine zipper transcription factor 2 (RGD1562865), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:52151470:52410900:1 gene:ENSRNOG00000006170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52312330:52405452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001107921 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 8 associated protein 2 (Casp8ap2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:52451857:52489179:1 gene:ENSRNOG00000006487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52459977:52622663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT042745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003749919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus midasin homolog (yeast) (Mdn1), mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 59 // 59 // 0 /// ENSRNOT00000075501 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:52561738:52570313:1 gene:ENSRNOG00000047513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 10 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52459977:52622663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 87 // 87 // 0 /// NONRATT042747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 13 // 13 // 14 // 105 // 1 /// NONRATT042751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 16 // 16 // 17 // 105 // 1
ENSRNOT00000009588 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:52789947:52790314:1 gene:ENSRNOG00000007321 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000054978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52777538:52790439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_001106641 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras-related GTP binding D (Rragd), mRNA. // chr5 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000068028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:52808853:52844544:1 gene:ENSRNOG00000007331 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// BC167014 // GenBank // Rattus norvegicus Ras-related GTP binding D, mRNA (cDNA clone MGC:189214 IMAGE:9034554), complete cds. // chr5 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000054989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52808952:52831818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 50 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT042754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0
NM_001106642 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2, J1 (Ube2j1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000041271 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:52858667:52874903:1 gene:ENSRNOG00000007434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52858667:52875109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_017292 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 2 (Gabrr2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:52888136:52924364:1 gene:ENSRNOG00000007490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// D38494 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GABA-A receptor rho-2 subunit, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52908097:52924173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT042758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_017291 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, rho 1 (Gabrr1), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000010172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:52956762:52993589:1 gene:ENSRNOG00000007603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// U21070 // GenBank // Rattus norvegicus GABA rho 1 subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52931594:53001676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1
NM_001135711 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 12 (Srsf12), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:53038883:53066076:1 gene:ENSRNOG00000024247 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000037777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:53038883:53065951:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT042761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001107923 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase (Rngtt), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006237990 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase (Rngtt), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase (Rngtt), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237993 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase (Rngtt), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:53143346:53362337:1 gene:ENSRNOG00000007867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168990 // GenBank // Rattus norvegicus RNA guanylyltransferase and 5-phosphatase, mRNA (cDNA clone MGC:189331 IMAGE:8364610), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:53096290:53174631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT042762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_012784 // RefSeq // Rattus norvegicus cannabinoid receptor 1 (brain) (Cnr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000010850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:53881982:53904008:1 gene:ENSRNOG00000008223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U40395 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal cannabinoid receptor (CB1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:53894404:53900117:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT042767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_001106616 // RefSeq // Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Csgalnact2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006237180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Csgalnact2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237182 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Csgalnact2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:216081812:216113012:-1 gene:ENSRNOG00000014713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038090 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54392863:54394490:1 gene:ENSRNOG00000023101 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:216083440:216104886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54251160:54394490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT042029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001039914 // RefSeq // Rattus norvegicus akirin 2 (Akirin2), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54571138:54585493:1 gene:ENSRNOG00000008288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB234867 // GenBank // Rattus norvegicus FBI1 mRNA for fourteen-three-three beta interactant 1, complete cds. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54571347:54584815:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001106643 // RefSeq // Rattus norvegicus arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Rars2), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006237986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (Rars2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000011688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54644487:54685987:1 gene:ENSRNOG00000008643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC158744 // GenBank // Rattus norvegicus arginyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:187923 IMAGE:9100690), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54683003:54685891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54644314:54673290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT042774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT042775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT042776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_053918 // RefSeq // Rattus norvegicus glycoprotein hormones, alpha polypeptide (Cga), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54950198:54962321:1 gene:ENSRNOG00000009269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC063160 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein hormones, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:72733 IMAGE:6922315), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// D00575 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for pituitary glycoprotein hormone alpha-subunit precursor, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// J00757 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein hormone alpha subunit precursor mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54959545:54962102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT042780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// V01253 // GenBank // Rat mRNA encoding luteinizing hormone alpha subunit precursor and follicle-stimulating hormone. This messenger was isolated from pituitary glands. // chr5 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0 /// NONRATT042781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
GENSCAN00000022509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:55127347:55183201:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
GENSCAN00000022483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:55273231:55274000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
NONRATT042785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000034205 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:2831295:2832561:1 gene:ENSRNOG00000028339 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0
ENSRNOT00000050030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:59030556:59031928:-1 gene:ENSRNOG00000031013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082086 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RAN protein, mRNA (cDNA clone MGC:95264 IMAGE:7133820), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:59030885:59047084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017321 // RefSeq // Rattus norvegicus aconitase 1, soluble (Aco1), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 37 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000008337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:60972004:61027705:1 gene:ENSRNOG00000005849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// L23874 // GenBank // Rattus norvegicus iron-responsive element-binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 37 // 42 // 0 /// GENSCAN00000038197 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:60990823:61027046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT042791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NM_001109613 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690918 (LOC690918), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067992 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:61336232:61339489:1 gene:ENSRNOG00000042246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61336875:61338470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT042795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022934 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 (Dnaja1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 (Dnaja1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61562288:61573199:1 gene:ENSRNOG00000007029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062009 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72435 IMAGE:5621557), complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// U53922 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ-like protein (RDJ1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61563462:61572904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT042796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT042801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT042798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NR_032107 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-207 (Mir207), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006238099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 1 (Dnaja1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053719 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:61562680:61562757:1 gene:ENSRNOG00000035596 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// rno-mir-207 // miRBase Micro RNA Database // MI0003479 Rattus norvegicus miR-207 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
AY539927 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00176 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_001008871 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 4 (Spink4), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 4 (Spink4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000060714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61770345:61781920:1 gene:ENSRNOG00000008252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61709053:61781920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001025410 // RefSeq // Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 5 (Chmp5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000011907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61798614:61815784:1 gene:ENSRNOG00000008672 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC097963 // GenBank // Rattus norvegicus chromatin modifying protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:116091 IMAGE:7387550), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ214132 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YK23 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT042804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001024784 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding 1 (Nfx1), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61822485:61863007:1 gene:ENSRNOG00000009015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000060692 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61822485:61879030:1 gene:ENSRNOG00000009015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC098037 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear transcription factor, X-box binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:116193 IMAGE:7456610), complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000034820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61802595:61877889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT042805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSRNOT00000015575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62002658:62061597:1 gene:ENSRNOG00000010727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// BC167074 // GenBank // Rattus norvegicus similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2R 2, mRNA (cDNA clone MGC:189415 IMAGE:9101454), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000026040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62002833:62061169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 6 // 6 // 0
ENSRNOT00000015955 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:62257440:62257866:1 gene:ENSRNOG00000011990 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62257440:62257745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0
NM_001012190 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-associated protein 1 (Ubap1), mRNA. // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000063849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62265514:62306294:1 gene:ENSRNOG00000012004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// BC083594 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94328 IMAGE:7132783), complete cds. // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62265541:62305375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 67 // 14 // 18 // 0 /// NONRATT042813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT042814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0
NM_207596 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 2 (Nudt2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62373679:62388693:1 gene:ENSRNOG00000013110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC058156 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 2, mRNA (cDNA clone MGC:72999 IMAGE:6888562), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000007284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62387969:62388285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT042815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000026036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62373611:62385181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001024342 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, intermediate chain 1 (Dnai1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000067657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62474510:62544534:1 gene:ENSRNOG00000013734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// BC083662 // GenBank // Rattus norvegicus dynein, axonemal, intermediate chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:94497 IMAGE:7135392), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000007287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62531113:62544356:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62496518:62520432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 51 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_001013089 // RefSeq // Rattus norvegicus galactose-1-phosphate uridylyltransferase (Galt), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus galactose-1-phosphate uridylyltransferase (Galt), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62669071:62672295:1 gene:ENSRNOG00000014766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098756 // GenBank // Rattus norvegicus galactose-1-phosphate uridylyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:112778 IMAGE:7370278), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62659417:62697213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT042817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT042818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT042819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT042821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT042823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT042824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_139116 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 11 receptor, alpha chain 1 (Il11ra1), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62676351:62683438:1 gene:ENSRNOG00000015068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF347936 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 11 receptor alpha chain precursor, mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC070921 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 11 receptor, alpha chain 1, mRNA (cDNA clone MGC:91472 IMAGE:7105297), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// GENSCAN00000007295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62659417:62697213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT042828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_001061613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1045 protein (RGD1559864), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238121 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1045 protein (RGD1559864), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to mKIAA1045 protein (RGD1559864), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62902412:62910270:1 gene:ENSRNOG00000000129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62902399:62910270:1 gene:ENSRNOG00000000129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// FQ211775 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YI02 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62902412:62946295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1
NM_001108004 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 5 (Dnajb5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 5 (Dnajb5), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000000142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62918616:62927261:1 gene:ENSRNOG00000000130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62902412:62946295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT042839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XM_002726509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG55159-like (LOC100360821), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002729473 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG55159-like (LOC100360821), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039366 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:62941879:62945795:1 gene:ENSRNOG00000022601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073151 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:62941837:62945795:1 gene:ENSRNOG00000022601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62902412:62946295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001042579 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-13 homolog B (C. elegans) (Unc13b), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 95 // 95 // 39 // 41 // 0 /// NM_022862 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-13 homolog B (C. elegans) (Unc13b), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000043216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63075168:63240229:1 gene:ENSRNOG00000008237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000064755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63193718:63240229:1 gene:ENSRNOG00000008237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000067281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63076255:63240229:1 gene:ENSRNOG00000008237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// AF159706 // GenBank // Rattus norvegicus Munc13-2 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 95 // 39 // 41 // 0 /// U24071 // GenBank // Rattus norvegicus Munc13-2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63193718:63240080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63076094:63170109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1 /// NONRATT042844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
XM_006225261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 5, pseudogene (Atp8b5p), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006238129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 5, pseudogene (Atp8b5p), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006238133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class I, type 8B, member 5, pseudogene (Atp8b5p), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000030116 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:63278594:63319900:1 gene:ENSRNOG00000021704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000071201 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:63278594:63356176:1 gene:ENSRNOG00000021704 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63259565:63355208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT042847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT042848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_031578 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific kinase 1 (Tesk1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 69 // 72 // 0 /// ENSRNOT00000023695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63463575:63469304:1 gene:ENSRNOG00000017532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0 /// BC081773 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93358 IMAGE:7131899), complete cds. // chr5 // 98 // 86 // 61 // 62 // 0 /// D50864 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for TESK1, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 69 // 72 // 0 /// GENSCAN00000040654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63464704:63468742:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 52 // 52 // 0 /// NONRATT042849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 72 // 72 // 0
XM_006225271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 107 (Ccdc107), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 107 (Ccdc107), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023411 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:63519844:63522846:1 gene:ENSRNOG00000017253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// FQ229548 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YI18 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63519914:63521928:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT042851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// NONRATT042855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT042852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001107956 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 9 (Car9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63533527:63540122:1 gene:ENSRNOG00000017073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// EF187254 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-bound carbonic anhydrase 9 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63533576:63539419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
FQ219084 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YN07 mRNA sequence. // chr5 // 85 // 93 // 34 // 40 // 0 /// NM_001013092 // RefSeq // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 3 (Creb3), mRNA. // chr5 // 56 // 56 // 24 // 43 // 1 /// ENSRNOT00000065909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63588152:63592782:1 gene:ENSRNOG00000016452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 25 // 43 // 1 /// BC062241 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP responsive element binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:72980 IMAGE:6887761), complete cds. // chr5 // 56 // 56 // 24 // 43 // 1 /// GENSCAN00000040663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63588308:63592551:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT042859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT042860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT042861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 27 // 43 // 1
XM_006225274 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGP1 retrograde golgi transport homolog (S. cerevisiae) (Rgp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGP1 retrograde golgi transport homolog (S. cerevisiae) (Rgp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000021888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63605359:63609104:1 gene:ENSRNOG00000016309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000064419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63605359:63613117:1 gene:ENSRNOG00000016309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63605359:63609104:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT042864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_053838 // RefSeq // Rattus norvegicus natriuretic peptide receptor 2 (Npr2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000021802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63653695:63672094:1 gene:ENSRNOG00000015991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// M26896 // GenBank // Rat guanylate cyclase, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000040632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63653767:63671818:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 90 // 42 // 43 // 0 /// NONRATT042867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT042869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 13 // 48 // 1 /// NONRATT042870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
XM_006238139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 8B (Tmem8b), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021227 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:63703638:63716765:1 gene:ENSRNOG00000015664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63690155:63716765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT042871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT042873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
XM_002729475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histidine rich carboxyl terminus 1 (Hrct1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histidine rich carboxyl terminus 1 (Hrct1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63752989:63753309:1 gene:ENSRNOG00000039336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006238151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547791 (LOC102547791), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067415 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:63757026:63757231:1 gene:ENSRNOG00000042718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 78 // 72 // 14 // 18 // 0
NM_001000414 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 840 (Olr840), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63850377:63851336:1 gene:ENSRNOG00000030761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63850377:63857429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT042876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107954 // RefSeq // Rattus norvegicus reversion-inducing-cysteine-rich protein with kazal motifs (Reck), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238069 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reversion-inducing-cysteine-rich protein with kazal motifs (Reck), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000060264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63871878:63938183:1 gene:ENSRNOG00000014863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63907212:63937192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT042877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_001054584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLI pathogenesis-related 2 (Glipr2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002726512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLI pathogenesis-related 2 (Glipr2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLI pathogenesis-related 2 (Glipr2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLI pathogenesis-related 2 (Glipr2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019916 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:63950141:63968973:1 gene:ENSRNOG00000014838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63942197:63968973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001005904 // RefSeq // Rattus norvegicus calicin (Ccin), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63974871:63976756:1 gene:ENSRNOG00000014831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083832 // GenBank // Rattus norvegicus calicin, mRNA (cDNA clone MGC:94933 IMAGE:7112736), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63974931:63976697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031974 // RefSeq // Rattus norvegicus clathrin, light chain A (Clta), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:64013646:64031649:1 gene:ENSRNOG00000014635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:64013646:64031649:1 gene:ENSRNOG00000014635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC087577 // GenBank // Rattus norvegicus clathrin, light chain (Lca), mRNA (cDNA clone MGC:105384 IMAGE:7307624), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// FQ213034 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YB12 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ213766 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YM22 mRNA sequence. // chr5 // 77 // 85 // 17 // 22 // 0 /// M15882 // GenBank // Rat clathrin light chain (LCA1) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// M19260 // GenBank // Rat clathrin light chain (LCA2) mRNA, complete cds. // chr5 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0 /// M19261 // GenBank // Rat clathrin light chain (LCA3) mRNA, complete cds. // chr5 // 83 // 69 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000015738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:64013769:64031387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT042882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NONRATT042882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001108662 // RefSeq // Rattus norvegicus maternal embryonic leucine zipper kinase (Melk), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006238083 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maternal embryonic leucine zipper kinase (Melk), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000066277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:64307464:64367854:1 gene:ENSRNOG00000013598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:64311798:64367073:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 86 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT042886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT042887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_001106658 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 7 (Zcchc7), mRNA. // chr5 // 86 // 97 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000017707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:64759112:64938825:1 gene:ENSRNOG00000013078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 97 // 26 // 29 // 0 /// BC161967 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:187773 IMAGE:9028474), complete cds. // chr5 // 86 // 97 // 25 // 29 // 0 /// NONRATT042889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:64890414:64938501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001106658 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 7 (Zcchc7), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:64759112:64938825:1 gene:ENSRNOG00000013078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC161967 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:187773 IMAGE:9028474), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:64890414:64938501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT042892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001113754 // RefSeq // Rattus norvegicus glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase (Grhpr), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051445 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65037813:65047242:1 gene:ENSRNOG00000012794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC158680 // GenBank // Rattus norvegicus glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase, mRNA (cDNA clone MGC:187689 IMAGE:8373346), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ210026 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA36YA18 mRNA sequence. // chr5 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// FQ218443 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YB20 mRNA sequence. // chr5 // 64 // 100 // 18 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65028257:65047020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT042894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT042896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001107938 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) I polypeptide E (Polr1e), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65081629:65097153:1 gene:ENSRNOG00000012664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC111080 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7385923, with apparent retained intron. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC158699 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) I polypeptide E, mRNA (cDNA clone MGC:187771 IMAGE:9028317), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT042899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65081655:65096896:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT042902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT042900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT042901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_003754013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain containing 1 (Frmpd1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006225279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain containing 1 (Frmpd1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006225281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain containing 1 (Frmpd1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain containing 1 (Frmpd1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238145 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FERM and PDZ domain containing 1 (Frmpd1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016839 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:65288586:65346162:1 gene:ENSRNOG00000012546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65302025:65346162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001013090 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 10 homolog B (S. cerevisiae) (Trmt10b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 10 homolog B (S. cerevisiae) (Trmt10b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016720 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65359591:65373925:1 gene:ENSRNOG00000012454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC086603 // GenBank // Rattus norvegicus RNA (guanine-9-) methyltransferase domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:105746 IMAGE:7315452), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65350048:65373634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT042908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107935 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 10 (Dcaf10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65409106:65446189:1 gene:ENSRNOG00000011655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65439588:65442842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT042909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001011975 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member B1 (Aldh1b1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65898607:65903614:1 gene:ENSRNOG00000011497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081884 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 1 family, member B1, mRNA (cDNA clone MGC:93759 IMAGE:7108511), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65901495:65903054:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT042912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025276 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC298077 (RGD1305807), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006238038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC298077 (RGD1305807), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// XM_006238039 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC298077 (RGD1305807), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000064113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65942318:65983012:1 gene:ENSRNOG00000010497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65930688:65982484:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT042913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
XM_006238152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 180 (Ccdc180), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000013930 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:65990073:66057645:1 gene:ENSRNOG00000010412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 88 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000014538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65990103:66057645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 88 // 34 // 35 // 0
XM_006238152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 180 (Ccdc180), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000013930 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:65990073:66057645:1 gene:ENSRNOG00000010412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_006238152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 180 (Ccdc180), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000013930 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:65990073:66057645:1 gene:ENSRNOG00000010412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000014538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65990103:66057645:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_138871 // RefSeq // Rattus norvegicus tudor domain containing 7 (Tdrd7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006238108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 7 (Tdrd7), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tudor domain containing 7 (Tdrd7), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000013650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66079898:66147306:1 gene:ENSRNOG00000009985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000013726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66079898:66147306:1 gene:ENSRNOG00000009985 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AB030644 // GenBank // Rattus norvegicus Trap mRNA for tudor repeat associator with PCTAIRE 2, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC090066 // GenBank // Rattus norvegicus tudor domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:93175 IMAGE:7122915), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66077575:66122599:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 28 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT042918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000014547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66123606:66227081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT042916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT042917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
NM_013044 // RefSeq // Rattus norvegicus tropomodulin 1 (Tmod1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66173406:66228499:1 gene:ENSRNOG00000009761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC072521 // GenBank // Rattus norvegicus tropomodulin 1, mRNA (cDNA clone MGC:91767 IMAGE:7105834), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// U59241 // GenBank // Rattus norvegicus E-tropomodulin mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 82 // 24 // 27 // 0 /// FQ231210 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA78YG21 mRNA sequence. // chr5 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT042922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT042924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66123606:66227081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// NONRATT042923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// NONRATT042921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_001014785 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear cap binding protein subunit 1 (Ncbp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000030825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66250579:66282943:1 gene:ENSRNOG00000023605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// BC092199 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear cap binding protein subunit 1, 80kDa, mRNA (cDNA clone MGC:105807 IMAGE:7314745), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// FQ220875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YF21 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 28 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000014554 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66249177:66282561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 83 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT042925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT042926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1
NM_138909 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box E1 (thyroid transcription factor 2) (Foxe1), mRNA. // chr5 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66467889:66470697:1 gene:ENSRNOG00000023497 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66408851:66469594:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT042928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_131911 // RefSeq // Rattus norvegicus acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member B (Anp32b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66591103:66624323:1 gene:ENSRNOG00000009266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB025581 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for proliferation related acidic leucine rich protein PAL31, complete cds. // chr5 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// BC086508 // GenBank // Rattus norvegicus acidic (leucine-rich) nuclear phosphoprotein 32 family, member B, mRNA (cDNA clone MGC:91514 IMAGE:7103152), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000041655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66552957:66653138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106655 // RefSeq // Rattus norvegicus N-acetylneuraminic acid synthase (Nans), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66637340:66654050:1 gene:ENSRNOG00000008945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161979 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylneuraminic acid synthase, mRNA (cDNA clone MGC:187791 IMAGE:9029956), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT042931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66552957:66653138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
XM_232988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12 (GalNAc-T12) (Galnt12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011112 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:67239253:67271476:1 gene:ENSRNOG00000008099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:67239253:67271476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001100535 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XV, alpha 1 (Col15a1), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000017217 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68988937:69056130:1 gene:ENSRNOG00000039197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000017631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:67393150:67468931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:68984563:69055265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0
NM_012775 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta receptor 1 (Tgfbr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000009452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:67575722:67639194:1 gene:ENSRNOG00000007036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC087035 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor, beta receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:93659 IMAGE:7098473), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// L26110 // GenBank // Rat transforming growth factor beta type I receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 82 // 26 // 27 // 0 /// XM_006238153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transforming growth factor, beta receptor 1 (Tgfbr1), transcript variant X2, partial mRNA. // chr5 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000073192 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:69079544:69096929:1 gene:ENSRNOG00000050760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000042056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69082365:69099313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT042941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000017641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:67570399:67633685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001106654 // RefSeq // Rattus norvegicus Sec61 beta subunit (Sec61b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:67711881:67720091:1 gene:ENSRNOG00000006345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167110 // GenBank // Rattus norvegicus Sec61 beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:189573 IMAGE:6887572), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT042942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031628 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 3 (Nr4a3), mRNA. // chr5 // 97 // 71 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68298772:68339859:1 gene:ENSRNOG00000005964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 39 // 39 // 0 /// D38530 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NOR-1, complete cds. // chr5 // 97 // 71 // 35 // 36 // 0 /// DQ268830 // GenBank // Rattus norvegicus neuron-derived orphan receptor 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 76 // 37 // 39 // 0 /// X86003 // GenBank // R.norvegicus mRNA for neuron-derived orphan receptor-2. // chr5 // 86 // 55 // 24 // 28 // 0 /// XM_006238097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 4, group A, member 3 (Nr4a3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 61 // 61 // 31 // 51 // 1 /// GENSCAN00000057128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:68299611:68325658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT042947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 55 // 55 // 28 // 51 // 1
NM_145723 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 17 (Stx17), mRNA. // chr5 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68383379:68440085:1 gene:ENSRNOG00000005801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF115435 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 17 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// FQ225936 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YK07 mRNA sequence. // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// GENSCAN00000013754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:68378168:68430042:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT042949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001107932 // RefSeq // Rattus norvegicus inversin (Invs), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000011622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68566901:68726568:1 gene:ENSRNOG00000008632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000013764 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:68577517:68693618:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_001108664 // RefSeq // Rattus norvegicus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 3 (Msantd3), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Myb/SANT-like DNA-binding domain containing 3 (Msantd3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68798535:68820976:1 gene:ENSRNOG00000008159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT042959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_023020 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1 (Tmeff1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000065775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68842285:68926413:1 gene:ENSRNOG00000008034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC129093 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:156637 IMAGE:8363015), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006238098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein with EGF-like and two follistatin-like domains 1 (Tmeff1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1 /// NONRATT042961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000013762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:68842593:68873527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT042962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001107931 // RefSeq // Rattus norvegicus muscle-related coiled-coil protein (Murc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68926895:68934739:1 gene:ENSRNOG00000008027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EU487255 // GenBank // Rattus norvegicus muscle-restricted coiled-coil protein (Murc) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:68926895:68983669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_201271 // RefSeq // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphatase-related protein type 1 (Lppr1), mRNA. // chr5 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:72309081:72594906:-1 gene:ENSRNOG00000007575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY299399 // GenBank // Rattus norvegicus plasticity related gene 3 mRNA, complete cds. // chr5 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// NONRATT044809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:72296831:72341171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001107930 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 189 (Zfp189), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69280868:69292223:1 gene:ENSRNOG00000006972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT042966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69281910:69293340:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107929 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 20, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf20), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000059869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69386859:69411969:1 gene:ENSRNOG00000006087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000054231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69388052:69411078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT042968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT042969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
XM_006225292 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cylicin, basic protein of sperm head cytoskeleton 2 (Cylc2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cylicin, basic protein of sperm head cytoskeleton 2 (Cylc2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:70783415:70793419:-1 gene:ENSRNOG00000022406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:70772487:70784869:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000054236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69646086:69742685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000054236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69646086:69742685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108666 // RefSeq // Rattus norvegicus structural maintenance of chromosomes 2 (Smc2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:73152087:73198318:1 gene:ENSRNOG00000022325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73151902:73197753:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
XR_146969 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930547C10 (RGD1309291), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007515 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:73343592:73345580:1 gene:ENSRNOG00000005721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73343592:73345586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT042975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0
NM_001000405 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 841 (Olr841), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000073545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69133633:69134586:-1 gene:ENSRNOG00000049788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000042031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69133633:69259061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT044791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0
NM_001000398 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 853 (Olr853), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:73948759:73949697:1 gene:ENSRNOG00000018357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73948759:73949697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001161846 // RefSeq // Rattus norvegicus nipsnap homolog 3A (C. elegans) (Nipsnap3a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XR_354019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nipsnap homolog 3A (C. elegans) (Nipsnap3a), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:73973488:73984223:1 gene:ENSRNOG00000039113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73973384:74023281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT042978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_001009422 // RefSeq // Rattus norvegicus nipsnap homolog 3B (C. elegans) (Nipsnap3b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:73997164:74012019:1 gene:ENSRNOG00000010332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087643 // GenBank // Rattus norvegicus nipsnap homolog 3A (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:105691 IMAGE:7307943), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ219476 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YA04 mRNA sequence. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// FQ229719 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YP09 mRNA sequence. // chr5 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NONRATT042980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73973384:74023281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT042981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
AY325248 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cc2-36 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:74014076:74023281:1 gene:ENSRNOG00000033271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73973384:74023281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
ENSRNOT00000037614 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:74347220:74347641:1 gene:ENSRNOG00000023626 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:74333589:74349470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 100 // 15 // 21 // 0
NM_001033852 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 44, member 1 (Slc44a1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// NM_053492 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 44 (choline transporter), member 1 (Slc44a1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 97 // 89 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:74448193:74528471:1 gene:ENSRNOG00000017846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:74448193:74543855:1 gene:ENSRNOG00000017846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT042982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:74480074:74528660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1
XM_006225300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibronectin type III and SPRY domain containing 1-like (Fsd1l), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000038184 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:74616611:74664963:1 gene:ENSRNOG00000017823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000066030 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:74616611:74664963:1 gene:ENSRNOG00000017823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:74631261:74733461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT042985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_001108667 // RefSeq // Rattus norvegicus fukutin (Fktn), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000036799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:74697863:74751515:1 gene:ENSRNOG00000028129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:74631261:74733461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT042987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT042988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001109462 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell acute lymphocytic leukemia 2 (Tal2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:74768707:74775264:1 gene:ENSRNOG00000028082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:74749204:74850799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT042989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014191 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 38B (Tmem38b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:74816786:74852684:1 gene:ENSRNOG00000028063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079336 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 38B, mRNA (cDNA clone MGC:94772 IMAGE:7106021), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ229075 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YN05 mRNA sequence. // chr5 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT042990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:74749204:74850799:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006238178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 462 (Zfp462), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_006238180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 462 (Zfp462), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000047225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 gene:ENSRNOG00000032048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000064623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 gene:ENSRNOG00000032048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000050727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000059740 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:75708989:75710836:1 gene:ENSRNOG00000039059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:75709013:75710362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0
XM_006238178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 462 (Zfp462), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 gene:ENSRNOG00000032048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000064623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 gene:ENSRNOG00000032048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// NONRATT042995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// NONRATT042996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001025275 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD23 homolog B (S. cerevisiae) (Rad23b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:76267574:76305116:1 gene:ENSRNOG00000016137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098674 // GenBank // Rattus norvegicus RAD23 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:112630 IMAGE:7190031), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:76296256:76303897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT042998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:76267866:76292962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT043000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001011973 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-like 7a (Actl7a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:77653984:77655458:1 gene:ENSRNOG00000016641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082101 // GenBank // Rattus norvegicus actin-like 7a, mRNA (cDNA clone MGC:95295 IMAGE:7134568), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:77654000:77655322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002726530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 206, member A (Fam206a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002729478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 206, member A (Fam206a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014053 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:77711085:77714698:1 gene:ENSRNOG00000010532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:77710630:77714698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000030913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:78911292:78931548:1 gene:ENSRNOG00000025558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT043008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:78862734:78919301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT043009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
GENSCAN00000051236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:78966518:79035284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011974 // RefSeq // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 2 (Akap2), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 2 (Akap2), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:79083351:79123669:1 gene:ENSRNOG00000011504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC085790 // GenBank // Rattus norvegicus A kinase (PRKA) anchor protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93771 IMAGE:7108964), complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:79084069:79123016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 51 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT043011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// NONRATT043013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_031061 // RefSeq // Rattus norvegicus muscle, skeletal, receptor tyrosine kinase (Musk), mRNA. // chr5 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:79560900:79649636:1 gene:ENSRNOG00000033567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 60 // 20 // 21 // 0 /// U34985 // GenBank // Rattus norvegicus muscle-specific tyrosine kinase receptor MuSK mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:79592893:79666264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 57 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT043015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1
ENSRNOT00000020076 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:80131124:80131473:1 gene:ENSRNOG00000014899 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT043016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_133422 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 483 (Zfp483), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:80236726:80247403:1 gene:ENSRNOG00000014975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// AF277901 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein HIT-10 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80236750:80252739:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT043018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001025021 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 25 (Dnajc25), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:80295287:80315200:1 gene:ENSRNOG00000015340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80307349:80330124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80295345:80295947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_053660 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 10 (Gng10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:80325905:80332784:1 gene:ENSRNOG00000025040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC105759 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), gamma 10, mRNA (cDNA clone MGC:124511 IMAGE:5623275), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 39 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000049967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80307349:80330124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1
NM_031795 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-glucose ceramide glucosyltransferase (Ugcg), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:80530140:80562612:1 gene:ENSRNOG00000015644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF047707 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-glucose:ceramide glycosyltransferase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000001605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80516729:80560065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_001025697 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid dehydrogenase like 2 (Hsdl2), mRNA. // chrU // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:80949471:80982918:1 gene:ENSRNOG00000016692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// BC097407 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid dehydrogenase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:114452 IMAGE:7454038), complete cds. // chrU // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80886936:80982602:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT043029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENSRNOT00000022680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:81059693:81101145:1 gene:ENSRNOG00000016780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000022866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:81059693:81131097:1 gene:ENSRNOG00000016780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006238215 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG31991-like (LOC100361585), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XR_354053 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG31991-like (LOC100361585), transcript variant X3, misc_RNA. // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:81059693:81101145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:81103089:81131097:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT043036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001106651 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin family member 30 (Snx30), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:81185823:81292332:1 gene:ENSRNOG00000017132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:81229766:81290855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
BC099751 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 31 (copper transporters), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:124776 IMAGE:5623519), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_001033693 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 31 (copper transporter), member 2 (Slc31a2), mRNA. // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000019379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82242402:82252907:1 gene:ENSRNOG00000013631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// XM_006238230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 31 (copper transporter), member 2 (Slc31a2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT043044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056915 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82250442:82251686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_133600 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 31 (copper transporter), member 1 (Slc31a1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 31 (copper transporter), member 1 (Slc31a1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82342331:82369096:1 gene:ENSRNOG00000014475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF268030 // GenBank // Rattus norvegicus copper transporter 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY539951 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00200 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// BC078745 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 31 (copper transporters), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93210 IMAGE:7126088), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ223114 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YE14 mRNA sequence. // chr5 // 78 // 100 // 21 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040801 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82365260:82368406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1
NM_001106659 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 4 (Prpf4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82386980:82400904:1 gene:ENSRNOG00000014777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087165 // GenBank // Rattus norvegicus PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:7135397). // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82387055:82399949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_022261 // RefSeq // Rattus norvegicus B-box and SPRY domain containing (Bspry), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000020366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82453655:82475831:1 gene:ENSRNOG00000015105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// AF245225 // GenBank // Rattus norvegicus zetin 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 73 // 26 // 27 // 0 /// BC166587 // GenBank // Rattus norvegicus B-box and SPRY domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:188347 IMAGE:7937509), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000040810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82453693:82475033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_001024346 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4933430I17 (LOC500475), mRNA. // chr5 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034978 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:82503506:82531126:1 gene:ENSRNOG00000024506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82521237:82555513:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT043051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_019340 // RefSeq // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 3 (Rgs3), mRNA. // chr5 // 95 // 73 // 38 // 40 // 0 /// XM_006238260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 3 (Rgs3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000059183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82606811:82690341:1 gene:ENSRNOG00000024501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 40 // 40 // 0 /// AB055153 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SRB-RGS, complete cds. // chr5 // 95 // 73 // 38 // 40 // 0 /// BC085710 // GenBank // Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7193526), complete cds. // chr5 // 100 // 40 // 22 // 22 // 0 /// XM_006238263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 3 (Rgs3), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 53 // 53 // 29 // 55 // 1 /// XM_006238264 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of G-protein signaling 3 (Rgs3), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 51 // 51 // 28 // 55 // 1 /// ENSRNOT00000059181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82606811:82644239:1 gene:ENSRNOG00000045849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82570581:82689583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT043055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 82 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT043056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 22 // 55 // 1 /// NONRATT043060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 15 // 15 // 8 // 55 // 1 /// NONRATT043064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 18 // 18 // 10 // 55 // 1
XM_006225344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 618 (Zfp618), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 618 (Zfp618), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000008742 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:83030001:83067089:1 gene:ENSRNOG00000006719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 61 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000037313 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:83013558:83084797:1 gene:ENSRNOG00000006719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000074195 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:83013558:83084797:1 gene:ENSRNOG00000006719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83027009:83048832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000031961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83053126:83084797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0
NM_198747 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XXVII, alpha 1 (Col27a1), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 60 // 60 // 0 /// ENSRNOT00000010333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83170172:83284999:1 gene:ENSRNOG00000007657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 60 // 60 // 0 /// AY232999 // GenBank // Rattus norvegicus collagen type XXVII proalpha 1 chain (Col27a1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 98 // 60 // 60 // 0 /// GENSCAN00000031958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83170172:83284999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 57 // 57 // 0 /// NONRATT043070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 16 // 61 // 1
NR_032279 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-455 (Mir455), microRNA. // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000054389 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:83211456:83211533:1 gene:ENSRNOG00000036266 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// rno-mir-455 // miRBase Micro RNA Database // MI0006148 Rattus norvegicus miR-455 stem-loop // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0
NM_053288 // RefSeq // Rattus norvegicus orosomucoid 1 (Orm1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83293896:83297056:1 gene:ENSRNOG00000007886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211008 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA19YB16 mRNA sequence. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// FQ222489 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA22YM17 mRNA sequence. // chr5 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// J00696 // GenBank // Rat alpha1-acid glycoprotein (AGP) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83293937:83296938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106660 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit G1 (Atp6v1g1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83481867:83488047:1 gene:ENSRNOG00000008163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 96 // 21 // 22 // 0 /// BC166422 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H transporting, lysosomal V1 subunit G1, mRNA (cDNA clone MGC:187391 IMAGE:9088893), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// FQ221371 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA37YE08 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83482014:83487477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 52 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT043075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT043077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 93 // 61 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT043076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_001106661 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330416G13 gene (RGD1304595), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6330416G13 gene (RGD1304595), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000011799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83497715:83521432:1 gene:ENSRNOG00000008712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83494386:83527381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001107939 // RefSeq // Rattus norvegicus pregnancy-associated plasma protein A (Pappa), mRNA. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000040898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:85017066:85247883:1 gene:ENSRNOG00000033527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT043080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:85116668:85237150:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001012103 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 32 (Trim32), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:85530389:85541239:1 gene:ENSRNOG00000010303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081980 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif protein 32, mRNA (cDNA clone MGC:94163 IMAGE:7128474), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091385 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif protein 32, mRNA (cDNA clone MGC:109467 IMAGE:7321183), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000013942 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:86244069:86244384:1 gene:ENSRNOG00000010494 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:86202042:86253953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_019178 // RefSeq // Rattus norvegicus toll-like receptor 4 (Tlr4), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:86690666:86704298:1 gene:ENSRNOG00000010522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF057025 // GenBank // Rattus norvegicus toll protein mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GQ175880 // GenBank // Rattus norvegicus toll-like receptor 4 (Tlr4) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:86600922:86703706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT043085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000046813 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:88665584:88667982:1 gene:ENSRNOG00000029367 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000011093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:88665584:88667982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 16 // 21 // 1
ENSRNOT00000069581 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:90854260:90854328:1 gene:ENSRNOG00000044314 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000072126 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:92276448:92276928:1 gene:ENSRNOG00000048774 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000053724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:92247053:92286970:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
XM_006225962 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560314 (RGD1560314), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006241112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1560314 (RGD1560314), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U78121 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 10 (AZF10) mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT051068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001277334 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS and EF hand domain containing (Rasef), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:94491098:94549846:1 gene:ENSRNOG00000024190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:94480021:94541161:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT043089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001106662 // RefSeq // Rattus norvegicus FERM domain containing 3 (Frmd3), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000065792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:94097585:94202350:-1 gene:ENSRNOG00000006503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:94095709:94212243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001106663 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 4C (Kdm4c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000009083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:94876819:95110733:1 gene:ENSRNOG00000006644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// BC158850 // GenBank // Rattus norvegicus jumonji domain containing 2C, mRNA (cDNA clone MGC:188335 IMAGE:7446605), complete cds. // chr5 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000047205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:94971492:95055428:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 50 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT043091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT043094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NONRATT043091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006225346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, D (Ptprd), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:96910961:97206174:-1 gene:ENSRNOG00000005711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:96910961:97093539:-1 gene:ENSRNOG00000005711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:96910961:97206174:-1 gene:ENSRNOG00000005711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:96910961:97206174:-1 gene:ENSRNOG00000005711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074491 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:96910961:97206174:-1 gene:ENSRNOG00000005711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:96910961:97206174:-1 gene:ENSRNOG00000005711 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:96910961:97203267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000071427 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:102944140:102944842:1 gene:ENSRNOG00000045890 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000022968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102931789:102944664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT043102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001106664 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosinase-related protein 1 (Tyrp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosinase-related protein 1 (Tyrp1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046503 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:102430674:102449645:1 gene:ENSRNOG00000029318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102331637:102448819:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001025022 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich adaptor protein 1-like (Lurap1l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:102512705:102558783:1 gene:ENSRNOG00000033740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091300 // GenBank // Rattus norvegicus similar to DNA segment, Chr 4, Brigham & Womens Genetics 0951 expressed, mRNA (cDNA clone MGC:109234 IMAGE:7309480), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102512817:102558415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT043101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_111961 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich coiled-coil 2C (Prrc2c), non-coding RNA. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004410 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004513 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000030419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000014383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102704547:102743756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 100 // 23 // 30 // 0 /// NONRATT017578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// NONRATT017579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25841585:25849583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 100 // 22 // 30 // 0 /// NONRATT017580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT017581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NR_111961 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich coiled-coil 2C (Prrc2c), non-coding RNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004410 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004513 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 gene:ENSRNOG00000003290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:85439057:85489378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102704547:102743756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027805 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25841585:25849583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 93 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37342313:37407900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT017574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSRNOT00000072330 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:105523063:105524184:1 gene:ENSRNOG00000006107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0
NM_001013212 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 3 (Snapc3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:105539242:105565938:1 gene:ENSRNOG00000010825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091186 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear RNA activating complex, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:108839 IMAGE:7366548), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000038012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:105539258:105565800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NONRATT043117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000035976 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:105812257:105918738:1 gene:ENSRNOG00000047047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000036233 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:105772478:105809828:1 gene:ENSRNOG00000033445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073253 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:105812257:105944755:1 gene:ENSRNOG00000047047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000038007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:105665227:105808974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001107942 // RefSeq // Rattus norvegicus ladinin 1 (Lad1), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:57693625:57707987:1 gene:ENSRNOG00000009144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035806 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:106005996:106007554:1 gene:ENSRNOG00000025809 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:106005996:106007554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000053037 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:57693653:57739859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT016436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0
XM_006238371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centlein, centrosomal protein (Cntln), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// AB369315 // GenBank // Rattus norvegicus centlein mRNA for centrosomal protein, complete cds. // chr5 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// NM_001114402 // RefSeq // Rattus norvegicus centlein, centrosomal protein (Cntln), mRNA. // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000008757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:107251787:107366588:1 gene:ENSRNOG00000043151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT043122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:107090044:107292196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENSRNOT00000033708 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:107402295:107402800:1 gene:ENSRNOG00000024551 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:107396588:107411864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_053935 // RefSeq // Rattus norvegicus SH3-domain GRB2-like 2 (Sh3gl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000008999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:107614520:107653528:1 gene:ENSRNOG00000006761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000040406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:107604896:107653177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
XM_006225382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058520 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:108500765:108698799:1 gene:ENSRNOG00000006956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000004207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:108487357:108552705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 41 // 11 // 12 // 0
XM_006225382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 1 (Adamtsl1), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000009127 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:108684130:108737201:1 gene:ENSRNOG00000006956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000058520 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:108500765:108698799:1 gene:ENSRNOG00000006956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// GENSCAN00000004203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:108671322:108738616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_053973 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras-related GTP binding A (Rraga), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:108928889:108930465:1 gene:ENSRNOG00000007051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC061850 // GenBank // Rattus norvegicus Ras-related GTP binding A, mRNA (cDNA clone MGC:72342 IMAGE:5621998), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// FQ214652 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YL15 mRNA sequence. // chr5 // 81 // 64 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000019101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:108901982:108930043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT043132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006238375 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DENN domain-containing protein 4C-like (RGD1308489), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000058429 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:109101564:109164418:1 gene:ENSRNOG00000008036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:109101564:109180856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001107943 // RefSeq // Rattus norvegicus alkaline ceramidase 2 (Acer2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010056 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:109217448:109266599:1 gene:ENSRNOG00000007637 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238364 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alkaline ceramidase 2 (Acer2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// FQ229191 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YM14 mRNA sequence. // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT043138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT043139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000071791 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110426894:110489935:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT043144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238378 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus focadhesin (Focad), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000058387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110475204:110709662:1 gene:ENSRNOG00000024402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ233601 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YD10 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110472007:110709662:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT043145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT043147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_001076062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha family, gene 5 (Ifna5), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// XM_003754052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha family, gene 5 (Ifna5), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046931 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:110928385:111011098:1 gene:ENSRNOG00000031068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000014568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110928385:110928954:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
XM_001055007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-12-like (RGD1560539), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000068178 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:91433835:91434389:1 gene:ENSRNOG00000042840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_003749976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (LOC100909643), mRNA. // chr5 // 32 // 92 // 11 // 34 // 0 /// XM_003754661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (LOC100912859), mRNA. // chr5 // 32 // 92 // 11 // 34 // 0 /// GENSCAN00000037035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:91433835:91434389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000037036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:91409586:91410137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000005992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111405545:111406099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 92 // 11 // 34 // 0 /// GENSCAN00000014567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111024676:111168545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 92 // 11 // 34 // 0
XM_001055007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-12-like (RGD1560539), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000068178 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:91433835:91434389:1 gene:ENSRNOG00000042840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 51 // 51 // 0 /// XM_003749976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (LOC100909643), mRNA. // chr5 // 20 // 20 // 11 // 55 // 1 /// XM_003754661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (LOC100912859), mRNA. // chr5 // 20 // 20 // 11 // 55 // 1 /// GENSCAN00000037035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:91433835:91434389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000037036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:91409586:91410137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000005992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111405545:111406099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 20 // 20 // 11 // 55 // 1 /// GENSCAN00000014567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111024676:111168545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 20 // 20 // 11 // 55 // 1
XM_001055007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-12-like (RGD1560539), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000068178 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:91433835:91434389:1 gene:ENSRNOG00000042840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// XM_003749976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (LOC100909643), mRNA. // chr5 // 23 // 94 // 11 // 48 // 0 /// XM_003754661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (LOC100912859), mRNA. // chr5 // 23 // 94 // 11 // 48 // 0 /// GENSCAN00000037035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:91433835:91434389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000037036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:91409586:91410137:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// GENSCAN00000005992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111405545:111406099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 23 // 94 // 11 // 48 // 0 /// GENSCAN00000014567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111024676:111168545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 23 // 94 // 11 // 48 // 0
NM_001047867 // RefSeq // Rattus norvegicus methylthioadenosine phosphorylase (Mtap), mRNA. // chrU // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000029486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:111679661:111746208:1 gene:ENSRNOG00000006615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006238382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylthioadenosine phosphorylase (Mtap), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// NONRATT043153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000005974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111642307:111749748:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// NONRATT043156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 26 // 26 // 10 // 38 // 1
GENSCAN00000005974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111642307:111749748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001107945 // RefSeq // Rattus norvegicus DMRT-like family A1 (Dmrta1), mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000038972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:112243272:112249812:1 gene:ENSRNOG00000024093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000037405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:112012634:112247362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT043159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001109357 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 352 (Zfp352), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000049470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:114271852:114273531:-1 gene:ENSRNOG00000033600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:114255660:114289744:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 82 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT045059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000039295 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:113392309:113392887:1 gene:ENSRNOG00000022643 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:113392309:113417327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000035284 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:113718098:113718547:1 gene:ENSRNOG00000022506 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 75 // 95 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:113652434:113718553:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000001029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:114954119:114996411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000007487 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:115847907:115848297:1 gene:ENSRNOG00000005681 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:115796552:115848297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_001007001 // RefSeq // Rattus norvegicus intraflagellar transport 74 homolog (Chlamydomonas) (Ift74), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006238398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 74 homolog (Chlamydomonas) (Ift74), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// XM_006238399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intraflagellar transport 74 homolog (Chlamydomonas) (Ift74), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000011336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:117537609:117629815:1 gene:ENSRNOG00000008075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC083611 // GenBank // Rattus norvegicus intraflagellar transport 74 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:94371 IMAGE:7133514), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000051317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117577603:117629702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT043165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1 /// NONRATT043166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 10 // 39 // 1
NM_001105737 // RefSeq // Rattus norvegicus TEK tyrosine kinase, endothelial (Tek), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000032248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:117672484:117799345:1 gene:ENSRNOG00000008587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000051315 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117705582:117781592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000021154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117788868:117816483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001013932 // RefSeq // Rattus norvegicus FGGY carbohydrate kinase domain containing (Fggy), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238410 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FGGY carbohydrate kinase domain containing (Fggy), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:118461635:118848789:1 gene:ENSRNOG00000008907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC090077 // GenBank // Rattus norvegicus FGGY carbohydrate kinase domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:94804 IMAGE:7107754), complete cds. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT043177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000012006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:118715215:118782949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000012016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:118425064:118520619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT043178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001107946 // RefSeq // Rattus norvegicus hook microtubule-tethering protein 1 (Hook1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000012396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:118887278:118948329:1 gene:ENSRNOG00000026226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000041131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:118914199:118945294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT043180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 13 // 44 // 1
ENSRNOT00000054583 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:5:119171081:119171184:1 gene:ENSRNOG00000036475 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
AB060652 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for transcription factor NF1-A1, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AF112455 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor I-A2 (NFIA) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AY572794 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear factor 1 A splice variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 93 // 33 // 13 // 14 // 0 /// NM_012988 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor I/A (Nfia), mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 33 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000004017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:120364845:120695028:1 gene:ENSRNOG00000006966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 36 // 42 // 1 /// D78017 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NFI-A1, complete cds. // chr5 // 79 // 79 // 33 // 42 // 1 /// D78018 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NFI-A2, complete cds. // chr5 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// D78019 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NFI-A3, complete cds. // chr5 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT043186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// X84209 // GenBank // R.norvegicus mRNA for transcription factor NF1 (L21). // chr5 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT043183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// NONRATT043184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// NONRATT043185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1
XR_340386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547700 (LOC102547700), transcript variant X1, ncRNA. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT019636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT019638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT034180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80414923:80436854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1
ENSRNOT00000010112 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:120995203:121039917:1 gene:ENSRNOG00000007551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000010211 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:120995203:121279827:1 gene:ENSRNOG00000007551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 98 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000065197 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:121125937:121279827:1 gene:ENSRNOG00000007551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 40 // 17 // 18 // 0 /// FQ212190 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA66YC19 mRNA sequence. // chr5 // 38 // 38 // 17 // 45 // 1 /// GENSCAN00000037101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:120995329:121159762:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 27 // 45 // 1 /// GENSCAN00000037107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121180254:121279477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 14 // 45 // 1 /// NONRATT043194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 15 // 45 // 1
XM_001063462 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1td1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002726556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LINE-1 type transposase domain containing 1 (L1td1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074042 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:121295915:121301775:1 gene:ENSRNOG00000050670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121295915:121314713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001015015 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 1 (Usp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:121525009:121536377:1 gene:ENSRNOG00000007890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092574 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:108773 IMAGE:7113947), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000030019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121527678:121535644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT043200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001025065 // RefSeq // Rattus norvegicus angiopoietin-like 3 (Angptl3), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011486 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:121639582:121644267:1 gene:ENSRNOG00000008638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC088192 // GenBank // Rattus norvegicus angiopoietin-like 3, mRNA (cDNA clone MGC:108861 IMAGE:7372069), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// FQ210243 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA31YL18 mRNA sequence. // chr5 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1 /// NONRATT043204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121627759:121647236:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT043206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1
NM_001107948 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 4C, cysteine peptidase (Atg4c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000011631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:121820649:121868749:1 gene:ENSRNOG00000008767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000042327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121822593:121856975:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
XR_346633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556219 (LOC102556219), ncRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XR_354161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556219 (LOC102556219), ncRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:121910013:121910365:1 gene:ENSRNOG00000008914 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 76 // 100 // 19 // 25 // 0 /// NONRATT043209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000011962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:122277524:122278453:1 gene:ENSRNOG00000009021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT043210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
NM_001033709 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG6, alpha-1,3-glucosyltransferase (Alg6), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:122348215:122398919:1 gene:ENSRNOG00000009045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC101850 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 6, alpha-1,3-glucosyltransferase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124652 IMAGE:5621707), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ210318 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA30YF14 mRNA sequence. // chr5 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0
NM_001191866 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 7 (Efcab7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:122470265:122629531:1 gene:ENSRNOG00000009782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:122581019:122743916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT043214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT043216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_017033 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 1 (Pgm1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000013785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:122648579:122708212:1 gene:ENSRNOG00000009889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC099807 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 1, mRNA (cDNA clone MGC:124624 IMAGE:7937943), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC128703 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglucomutase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:8367784), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ220427 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YO18 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 39 // 14 // 14 // 0 /// L11694 // GenBank // Rattus norvegicus phosphoglucomutase mRNA, complete cds. // chr5 // 82 // 92 // 27 // 33 // 0 /// GENSCAN00000039674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:122581019:122743916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108671 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor tyrosine kinase-like orphan receptor 1 (Ror1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:122797878:123141864:1 gene:ENSRNOG00000029449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:123095750:123141864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT043221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT043214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative) (Ube2u), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative) (Ube2u), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035949 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:122503319:122570958:1 gene:ENSRNOG00000023895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073755 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:122545270:122570958:1 gene:ENSRNOG00000023895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000039677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:122548604:122570958:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:122506042:122545168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONRATT043215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001191758 // RefSeq // Rattus norvegicus cache domain containing 1 (Cachd1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:123487662:123714027:1 gene:ENSRNOG00000010514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:123604931:123714027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
NM_001191867 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonucleoprotein, PTB-binding 2 (Raver2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000033933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:123786082:123863622:1 gene:ENSRNOG00000023812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:123786157:123863267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT043231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
GENSCAN00000000633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:123916157:123927436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT043231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_017135 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate kinase 4 (Ak4), mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000070967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:124130328:124189158:1 gene:ENSRNOG00000045738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087024 // GenBank // Rattus norvegicus adenylate kinase 3-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:93541 IMAGE:7107348), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D87809 // GenBank // Rattus norvegicus AK4 mRNA for adenylate kinase 4, complete cds. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000000652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124181939:124186152:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT043235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107949 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 6 (Dnajc6), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006238446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 6 (Dnajc6), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:124221010:124370645:1 gene:ENSRNOG00000011968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000017719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124276509:124387192:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1
NM_001109398 // RefSeq // Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase (Mthfd2), mRNA. // chr5 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:179592814:179604331:-1 gene:ENSRNOG00000010833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// FQ234580 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YG19 mRNA sequence. // chr5 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// FQ234392 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YC09 mRNA sequence. // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000057772 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:124738254:124739298:1 gene:ENSRNOG00000037974 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 79 // 100 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124738254:124739298:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:179593750:179604256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// NONRATT041601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 83 // 100 // 24 // 29 // 0 /// NONRATT041602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
ENSRNOT00000057697 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:124817576:124829168:1 gene:ENSRNOG00000023286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 86 // 19 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124827200:124849986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
GENSCAN00000032874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124827200:124849986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
ENSRNOT00000008712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126257868:126358529:1 gene:ENSRNOG00000006357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000009030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126257868:126358529:1 gene:ENSRNOG00000006357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000043261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126257868:126306109:1 gene:ENSRNOG00000006357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000044184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126257868:126358529:1 gene:ENSRNOG00000006357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000046609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126257868:126321365:1 gene:ENSRNOG00000006357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000050999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126257868:126358529:1 gene:ENSRNOG00000006357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064567 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126257868:126358529:1 gene:ENSRNOG00000006357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001135030 // RefSeq // Rattus norvegicus Tctex1 domain containing 1 (Tctex1d1), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006238459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Tctex1 domain containing 1 (Tctex1d1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126375714:126388803:1 gene:ENSRNOG00000023100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006238460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Tctex1 domain containing 1 (Tctex1d1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:126372485:126388571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT043259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT043260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001131012 // RefSeq // Rattus norvegicus mesoderm induction early response 1, transcriptional regulator (Mier1), mRNA. // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126512781:126559155:1 gene:ENSRNOG00000007175 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC168252 // GenBank // Rattus norvegicus mesoderm induction early response 1 homolog (Xenopus laevis), mRNA (cDNA clone MGC:188399 IMAGE:5600058), complete cds. // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_006238480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mesoderm induction early response 1, transcriptional regulator (Mier1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT043264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:126507429:126556238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT043261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT043262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001106669 // RefSeq // Rattus norvegicus OMA1 zinc metallopeptidase (Oma1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OMA1 zinc metallopeptidase (Oma1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126714757:126767291:1 gene:ENSRNOG00000007214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:126719505:126767045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000040785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:127325472:127326299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_153621 // RefSeq // Rattus norvegicus Dab, reelin signal transducer, homolog 1 (Drosophila) (Dab1), mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238490 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Dab, reelin signal transducer, homolog 1 (Drosophila) (Dab1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:127881438:128125734:1 gene:ENSRNOG00000007410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AB072426 // GenBank // Rattus norvegicus Dab1 mRNA for disabled-1, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Dab, reelin signal transducer, homolog 1 (Drosophila) (Dab1), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// FQ214424 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YM08 mRNA sequence. // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT043267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:128107529:128128467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// NONRATT043266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT043268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001191759 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 8, beta polypeptide (C8b), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010100 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:128159874:128196920:1 gene:ENSRNOG00000007639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// FQ211372 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YB05 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// BC105904 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7374807. // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// FQ210898 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA20YE19 mRNA sequence. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000027679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:128147347:128206536:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
XM_006225419 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to novel protein (RGD1564074), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006238496 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to novel protein (RGD1564074), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000041922 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:128300829:128420702:1 gene:ENSRNOG00000030938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006238497 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to novel protein (RGD1564074), mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// GENSCAN00000007098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:128903413:128936362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 23 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000045667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:128298171:128433084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// FQ228543 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YC12 mRNA sequence. // chr5 // 94 // 97 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT043273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 80 // 28 // 35 // 1
NM_138905 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2B (Ppap2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:128551196:128626137:1 gene:ENSRNOG00000008116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC072544 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2B, mRNA (cDNA clone MGC:91483 IMAGE:7105872), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:128551613:128624414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001271206 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 24 (Usp24), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 69 // 69 // 0 /// ENSRNOT00000029228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:129744412:129876157:1 gene:ENSRNOG00000005802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 69 // 69 // 0 /// GENSCAN00000000537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:129769390:129875360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 52 // 52 // 0 /// NONRATT043278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 23 // 23 // 17 // 74 // 1
NM_001271206 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 24 (Usp24), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
NM_001080148 // RefSeq // Rattus norvegicus 24-dehydrocholesterol reductase (Dhcr24), mRNA. // chr5 // 93 // 57 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130011403:130034921:1 gene:ENSRNOG00000006787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 27 // 27 // 0 /// AY310319 // GenBank // Rattus norvegicus 3-beta-hydroxysterol delta 24 reductase mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 57 // 25 // 27 // 0 /// AY921220 // GenBank // Rattus norvegicus 24-dehydrocholesterol reductase (Dhcr24) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:129995247:130034921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 62 // 62 // 29 // 47 // 1
NM_001106671 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 22 (Ttc22), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130071415:130088219:1 gene:ENSRNOG00000007189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 22 (Ttc22), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000000528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130071522:130087480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014064 // RefSeq // Rattus norvegicus prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (Pars2), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006238512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative) (Pars2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000057471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130099179:130104237:1 gene:ENSRNOG00000007327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088403 // GenBank // Rattus norvegicus prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial (putative), mRNA (cDNA clone MGC:93730 IMAGE:7107369), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130101169:130102596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT043282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000010288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130179452:130192201:1 gene:ENSRNOG00000007799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081977 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 151, member A, mRNA (cDNA clone MGC:94145 IMAGE:7127557), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130179484:130192176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_053358 // RefSeq // Rattus norvegicus single stranded DNA binding protein 3 (Ssbp3), mRNA. // chr5 // 87 // 95 // 33 // 38 // 0 /// XM_006238532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus single stranded DNA binding protein 3 (Ssbp3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000011408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130364179:130499466:1 gene:ENSRNOG00000007920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AF121893 // GenBank // Rattus norvegicus sequence-specific single-stranded-DNA-binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 87 // 95 // 33 // 38 // 0 /// BC107666 // GenBank // Rattus norvegicus single stranded DNA binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:124589 IMAGE:7936459), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT043285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000054322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130364524:130499016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 30 // 40 // 1 /// NONRATT043287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 78 // 78 // 31 // 40 // 1 /// NONRATT043286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1
XM_006225439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB domain containing protein 2 (Cdcp2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006225440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB domain containing protein 2 (Cdcp2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006225441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB domain containing protein 2 (Cdcp2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006238552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB domain containing protein 2 (Cdcp2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB domain containing protein 2 (Cdcp2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB domain containing protein 2 (Cdcp2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000012427 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:130549339:130559519:1 gene:ENSRNOG00000009221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130549339:130565986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001139465 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 59 (Tmem59), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130632416:130653535:1 gene:ENSRNOG00000009778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ214069 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YA21 mRNA sequence. // chr5 // 87 // 100 // 26 // 30 // 0 /// NONRATT043289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130632471:130678989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT043290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_006225442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 (Ldlrad1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 1 (Ldlrad1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057372 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:130661857:130669420:1 gene:ENSRNOG00000037795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130632471:130678989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001131002 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein family B (small), member 11 (Hspb11), mRNA. // chrU // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006238524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock protein family B (small), member 11 (Hspb11), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006238525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock protein family B (small), member 11 (Hspb11), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006238528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock protein family B (small), member 11 (Hspb11), transcript variant X5, mRNA. // chrU // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006238529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock protein family B (small), member 11 (Hspb11), transcript variant X6, mRNA. // chrU // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000057362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130705939:130732192:1 gene:ENSRNOG00000010241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// BC162011 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein family B (small), member 11, mRNA (cDNA clone MGC:187878 IMAGE:9091347), complete cds. // chrU // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// NONRATT043295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT043296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_199383 // RefSeq // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 1 (Yipf1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 1 (Yipf1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// XM_006238505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 1 (Yipf1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130781795:130817034:1 gene:ENSRNOG00000010512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC062239 // GenBank // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72975 IMAGE:6887537), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130781549:131081379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT043299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT043300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT043301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT043303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001025023 // RefSeq // Rattus norvegicus NDC1 transmembrane nucleoporin (Ndc1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000014275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130824420:130868755:1 gene:ENSRNOG00000010620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC079443 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 48, mRNA (cDNA clone MGC:94991 IMAGE:7115485), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000046301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130781549:131081379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT043307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
ENSRNOT00000032433 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:130892706:131081379:1 gene:ENSRNOG00000000138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000075624 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:130892706:131081379:1 gene:ENSRNOG00000000138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 35 // 10 // 11 // 0 /// XM_006238559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLIS family zinc finger 1 (Glis1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130781549:131081379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0
XM_006238570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 8, apolipoprotein e receptor (Lrp8), transcript variant X11, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000017575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131252608:131320255:1 gene:ENSRNOG00000013064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000017584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131252608:131320255:1 gene:ENSRNOG00000013064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000020472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131263434:131320255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT043315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1
NM_001100536 // RefSeq // Rattus norvegicus mago-nashi homolog, proliferation-associated (Drosophila) (Magoh), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131328664:131335510:1 gene:ENSRNOG00000012778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// DQ359101 // GenBank // Rattus norvegicus mago-nashi-like proliferation-associated protein mRNA, partial cds. // chr5 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131328735:131335371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT043319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
XM_006238509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610037L13 (RGD1559786), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000065275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131337314:131345189:1 gene:ENSRNOG00000012724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC100100 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610037L13, mRNA (cDNA clone MGC:112851 IMAGE:7376782), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ228722 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA52YH08 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131335665:131344313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT043321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001108973 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 1 (glutamate transporter), member 7 (Slc1a7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131418724:131463643:1 gene:ENSRNOG00000011644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000072263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131418724:131463643:1 gene:ENSRNOG00000011644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// JF422064 // GenBank // Rattus norvegicus EAAT5 variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// JF422065 // GenBank // Rattus norvegicus EAAT5 variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// JF422066 // GenBank // Rattus norvegicus EAAT5 variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// JF422067 // GenBank // Rattus norvegicus EAAT5 variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// JF422068 // GenBank // Rattus norvegicus EAAT5 variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131418966:131462782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001106675 // RefSeq // Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase domain containing 2 (Echdc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase domain containing 2 (Echdc2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006238507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enoyl CoA hydratase domain containing 2 (Echdc2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000047653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131619158:131638155:1 gene:ENSRNOG00000029333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131612824:131637713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001106674 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase assembly factor 7 (Coa7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131772051:131782841:1 gene:ENSRNOG00000010636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131772088:131780787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT043328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107953 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 11 (Zcchc11), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131941061:132009237:1 gene:ENSRNOG00000009720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000031997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131924317:132008842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT043333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT043334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_177931 // RefSeq // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 1 (Orc1), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 1 (Orc1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132031219:132050956:1 gene:ENSRNOG00000008841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB105378 // GenBank // Rattus norvegicus ratOrc1 mRNA for origin recognition complex subunit 1, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132031219:132069429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT043335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
NM_001270984 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 1B (Cc2d1b), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132057675:132070250:1 gene:ENSRNOG00000008634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC089922 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 1B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7306876), complete cds. // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// FQ212419 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA55YK08 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132031219:132069429:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT043339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001100840 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 12 (endoplasmic reticulum) (Txndc12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132291196:132316221:1 gene:ENSRNOG00000008090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT043343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001044288 // RefSeq // Rattus norvegicus KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae) (Kti12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088196 // GenBank // Rattus norvegicus KTI12 homolog, chromatin associated (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:108874 IMAGE:7374597), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214494 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YF23 mRNA sequence. // chr5 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// FQ215456 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YC21 mRNA sequence. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132304309:132305457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000061 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132308839:132320690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_031091 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB3B, member RAS oncogene family (Rab3b), mRNA. // chr5 // 93 // 93 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132343181:132408834:1 gene:ENSRNOG00000008001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC060562 // GenBank // Rattus norvegicus RAB3B, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:72799 IMAGE:6918181), complete cds. // chr5 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT043345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132356508:132408465:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT043346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT043348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_012993 // RefSeq // Rattus norvegicus nardilysin 1 (Nrd1), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000010440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132471876:132534126:1 gene:ENSRNOG00000007111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000010462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132471876:132534126:1 gene:ENSRNOG00000007111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ218095 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA9YI18 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132415744:132534126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT043349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000045544 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:132667527:132669281:1 gene:ENSRNOG00000024166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132667530:132669281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006225453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calreticulin 4 (Calr4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006225454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calreticulin 4 (Calr4), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calreticulin 4 (Calr4), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000057216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132720501:132739231:1 gene:ENSRNOG00000037710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000068697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132705288:132739231:1 gene:ENSRNOG00000037710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000067 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132705288:132739231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT043356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001009424 // RefSeq // Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 (Eps15), mRNA. // chr5 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132763093:132861698:1 gene:ENSRNOG00000010299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AB262963 // GenBank // Rattus norvegicus Eps15 mRNA for epidermal growth factor receptor pathway substrate 15, complete cds. // chr5 // 92 // 92 // 22 // 24 // 0 /// AY190609 // GenBank // Rattus norvegicus epidermal growth factor receptor pathway substrate 15 isoform B (Eps15) mRNA, complete cds; alternatively spliced. // chr5 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// FQ223380 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YB03 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010182 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132763218:132861487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_130406 // RefSeq // Rattus norvegicus Fas (TNFRSF6) associated factor 1 (Faf1), mRNA. // chr5 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000011765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:133203185:133570250:1 gene:ENSRNOG00000008523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AF293459 // GenBank // Rattus norvegicus fas-associated factor 1 (Faf1) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// FQ215100 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YO05 mRNA sequence. // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:133290119:133497492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT043363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT043365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
ENSRNOT00000072754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:133040746:133213800:1 gene:ENSRNOG00000050523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// AY321322 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1-290 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001107951 // RefSeq // Rattus norvegicus DMRT-like family A2 (Dmrta2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:133586293:133592040:1 gene:ENSRNOG00000008105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:133578116:133594025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001100981 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 4 (Agbl4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:134118550:134138041:1 gene:ENSRNOG00000033097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytosolic carboxypeptidase 6-like (LOC100911395), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:134595467:134788914:1 gene:ENSRNOG00000045708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytosolic carboxypeptidase 6-like (LOC100911395), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:134595467:134788914:1 gene:ENSRNOG00000045708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:134775126:134800276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytosolic carboxypeptidase 6-like (LOC100911395), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001108672 // RefSeq // Rattus norvegicus BEN domain containing 5 (Bend5), mRNA. // chr5 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:135084714:135138954:1 gene:ENSRNOG00000008025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// NONRATT043375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT043376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 92 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:135084883:135138555:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
XM_003749999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytosolic carboxypeptidase 6-like (LOC100911395), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010548 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:135206776:135280577:1 gene:ENSRNOG00000008011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000033902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:135266278:135400416:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:135203824:135220859:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT043375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NONRATT043379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134392 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 6 (Spata6), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:135542967:135626738:1 gene:ENSRNOG00000007568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AB046606 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA, testis specific expressing gene, complete cds. // chr5 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// AF291466 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-related protein HASH (Hash) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033906 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:135541084:135652483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
XM_001072020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T cells 8 (Skint8), mRNA. // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// XM_002726591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T cells 8 (Skint8), mRNA. // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000057169 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:135718087:135721282:1 gene:ENSRNOG00000037680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001135916 // RefSeq // Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T cells 1 (Skint1), mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// XM_002729517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T cells 3-like (LOC100362122), mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// XM_006225514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T cells 3-like (LOC100362122), mRNA. // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// XM_006238600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T cells 4 (Skint4), mRNA. // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000041421 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:135830327:135860295:1 gene:ENSRNOG00000042047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000064863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:135739813:135767454:1 gene:ENSRNOG00000043194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// EU650232 // GenBank // Rattus norvegicus skint 1 isoform a precursor (Skint1) mRNA, complete cds. // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000020194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:135757719:136010487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_006225515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5-like (LOC100911772), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006238610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5-like (LOC100911772), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000036812 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:136404725:136414289:1 gene:ENSRNOG00000023054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000002416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:136379745:136433653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001191570 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 13C (Ankrd13c), mRNA. // chr5 // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000015170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:283426167:283473209:1 gene:ENSRNOG00000011340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 100 // 32 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000034614 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:136459509:136461051:1 gene:ENSRNOG00000023004 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 89 // 100 // 33 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000039164 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:211475002:211476581:-1 gene:ENSRNOG00000026718 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 77 // 84 // 24 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:136459509:136461051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000011741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:211475002:211476690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 81 // 20 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:283426456:283471202:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1 /// NONRATT030589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 14 // 37 // 1 /// NONRATT030590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
XM_003754079 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TraB domain containing 2B (Trabd2b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TraB domain containing 2B (Trabd2b), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225459 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TraB domain containing 2B (Trabd2b), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225465 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TraB domain containing 2B (Trabd2b), transcript variant X9, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137017122:137214659:1 gene:ENSRNOG00000029141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137017122:137026868:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137138422:137219559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT043386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000053202 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:137413376:137433779:1 gene:ENSRNOG00000035079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// XR_346694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551075 (LOC102551075), ncRNA. // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// XR_354219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551075 (LOC102551075), ncRNA. // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006225518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Scl/Tal1 interrupting locus (Stil), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238621 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Scl/Tal1 interrupting locus (Stil), partial mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010410 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:137593818:137641722:1 gene:ENSRNOG00000007858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137590877:137641722:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001107958 // RefSeq // Rattus norvegicus T-cell acute lymphocytic leukemia 1 (Tal1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006238617 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus T-cell acute lymphocytic leukemia 1 (Tal1), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137662331:137670144:1 gene:ENSRNOG00000025051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137662065:137667330:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_130401 // RefSeq // Rattus norvegicus PDZK1 interacting protein 1 (Pdzk1ip1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PDZK1 interacting protein 1 (Pdzk1ip1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137687648:137692231:1 gene:ENSRNOG00000008161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF402772 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated protein MAP17 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137687745:137716614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT043401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
GENSCAN00000011531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137832791:137954962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_175837 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp4a1), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp4a1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138283579:138297977:1 gene:ENSRNOG00000009597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138283579:138297977:1 gene:ENSRNOG00000009597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138283579:138297977:1 gene:ENSRNOG00000009597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC089761 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:108515 IMAGE:7324500), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138283618:138297063:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// M14972 // GenBank // Rat cytochrome P-450-LA-omega (lauric acid omega-hydroxylase) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT043404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT043405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001106677 // RefSeq // Rattus norvegicus EF-hand calcium binding domain 14 (Efcab14), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138378955:138416616:1 gene:ENSRNOG00000010091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138378121:138417943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107959 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 (Atpaf1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 (Atpaf1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138426066:138451527:1 gene:ENSRNOG00000010169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138426305:138448478:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107960 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB kinase activator 3C (Mob3c), mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006238657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MOB kinase activator 3C (Mob3c), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006238660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MOB kinase activator 3C (Mob3c), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138464738:138471205:1 gene:ENSRNOG00000037620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000036189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138468382:138513316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT043413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT043414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT043415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001044267 // RefSeq // Rattus norvegicus MAP kinase-interacting serine/threonine kinase 1 (Mknk1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006238694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAP kinase-interacting serine/threonine kinase 1 (Mknk1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006238695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAP kinase-interacting serine/threonine kinase 1 (Mknk1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138476361:138513933:1 gene:ENSRNOG00000010381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC098754 // GenBank // Rattus norvegicus MAP kinase-interacting serine/threonine kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:112775 IMAGE:7370127), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006238701 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAP kinase-interacting serine/threonine kinase 1 (Mknk1), transcript variant X8, mRNA. // chr5 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// NONRATT043416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138468382:138513316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 31 // 36 // 1 /// NONRATT043417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT043418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
XM_002726579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinocilin (Kncn), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_002729513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinocilin (Kncn), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000057061 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:138520504:138523457:1 gene:ENSRNOG00000037618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066161 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:138520504:138523457:1 gene:ENSRNOG00000037618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000036178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138520504:138523457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0
NM_001134960 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD54 like (S. cerevisiae) (Rad54l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138732243:138762035:-1 gene:ENSRNOG00000013148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC169034 // GenBank // Rattus norvegicus RAD54 like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189414 IMAGE:9089933), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ230836 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA87YF17 mRNA sequence. // chr5 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000036166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138732376:138747173:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT045249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001009480 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein (Uqcrh), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016751 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138702848:138711012:-1 gene:ENSRNOG00000012550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// BC086954 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquinol-cytochrome c reductase hinge protein, mRNA (cDNA clone MGC:109658 IMAGE:7368408), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221648 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA33YI17 mRNA sequence. // chr5 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// FQ223893 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA83YL23 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// FQ224007 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA80YB10 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138703023:138710937:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT045246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106678 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP2/Sun domain family, member 4 (Nsun4), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016013 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:138670430:138689188:-1 gene:ENSRNOG00000046192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138153151:138173265:-1 gene:ENSRNOG00000012020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ226854 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YC17 mRNA sequence. // chr5 // 74 // 84 // 20 // 27 // 0 /// NONRATT045235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000011530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138122400:138173163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// GENSCAN00000036187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138638363:138689132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_024132 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid amide hydrolase (Faah), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// XM_003750001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty-acid amide hydrolase 1-like (LOC100911581), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138638363:138655428:-1 gene:ENSRNOG00000045949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138120675:138139527:-1 gene:ENSRNOG00000011019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// BC091148 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid amide hydrolase, mRNA (cDNA clone MGC:108682 IMAGE:7370226), complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// U72497 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid amide hydrolase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000011530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138122400:138173163:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// GENSCAN00000036187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138638363:138689132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1
NM_001007747 // RefSeq // Rattus norvegicus protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-) (Pomgnt1), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XM_006238683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-) (Pomgnt1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000035312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138791235:138801110:1 gene:ENSRNOG00000023455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC083641 // GenBank // Rattus norvegicus protein O-linked mannose beta1,2-N-acetylglucosaminyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:94463 IMAGE:7134894), complete cds. // chr5 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000031971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138792285:138801090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT043422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT043423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1 /// NONRATT043424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 16 // 16 // 8 // 49 // 1 /// NONRATT043425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1
NM_022213 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, regulatory subunit 3 (gamma) (Pik3r3), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138859028:138926835:1 gene:ENSRNOG00000000145 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// D64047 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phosphatidylinositol 3-kinase p55 subunit, complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138880266:138926835:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT043429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001106679 // RefSeq // Rattus norvegicus intracisternal A particle-promoted polypeptide (Ipp), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006238643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intracisternal A particle-promoted polypeptide (Ipp), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139150941:139184255:1 gene:ENSRNOG00000016183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// FQ225549 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YK20 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139150941:139183787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001014067 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 17 (Ccdc17), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000034464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139238283:139241972:1 gene:ENSRNOG00000023216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// BC087059 // GenBank HTC // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 17, mRNA (cDNA clone IMAGE:7124434). // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT043438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT043439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139211847:139241758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 30 // 38 // 1 /// NONRATT043440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// NONRATT043441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT043442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1
NM_001025656 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 163 (Ccdc163), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139358209:139364237:1 gene:ENSRNOG00000022953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC082064 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610037D15, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132639). // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC098949 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610037D15, mRNA (cDNA clone MGC:114580 IMAGE:7131942), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139358601:139364084:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT043444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT043447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_133396 // RefSeq // Rattus norvegicus testis-specific kinase 2 (Tesk2), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XM_006238628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis-specific kinase 2 (Tesk2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023416 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139370347:139456132:1 gene:ENSRNOG00000017282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// AB049402 // GenBank // Rattus norvegicus TESK2 mRNA for testis-specific protein kinase 2, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC081737 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7114966). // chr5 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// BC128727 // GenBank // Rattus norvegicus testis-specific kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:156597 IMAGE:7111312), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139435148:139455172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 43 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT043449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_133316 // RefSeq // Rattus norvegicus mutY homolog (Mutyh), mRNA. // chr5 // 87 // 94 // 27 // 31 // 0 /// XM_006238626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mutY homolog (Mutyh), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139459661:139471463:1 gene:ENSRNOG00000017887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AF478683 // GenBank // Rattus norvegicus MYH mRNA, complete cds. // chr5 // 87 // 94 // 27 // 31 // 0 /// BC128728 // GenBank // Rattus norvegicus mutY homolog (E. coli), mRNA (cDNA clone IMAGE:8368650), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// BC088752 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7318089, with apparent retained intron. // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// FQ230684 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YH08 mRNA sequence. // chr5 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// GENSCAN00000032762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139466608:139471400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT043452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT043454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT043455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT043456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001107963 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 5 (Zswim5), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// XM_006238664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 5 (Zswim5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000068267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139532215:139647709:1 gene:ENSRNOG00000018160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139609515:139647709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 85 // 85 // 17 // 20 // 1
XM_003754080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HECT domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 (Hectd3), mRNA. // chrU // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139655809:139662950:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT043463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT043464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT043465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_003754080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HECT domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3 (Hectd3), mRNA. // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// FQ234294 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YI03 mRNA sequence. // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1 /// NONRATT043466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_133609 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 3 (Eif2b3), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// XM_006238629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 3 (Eif2b3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// ENSRNOT00000024841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139677837:139744382:1 gene:ENSRNOG00000018375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// BC072507 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 3 gamma, mRNA (cDNA clone MGC:91499 IMAGE:7099973), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 55 // 55 // 0 /// U38253 // GenBank // Rattus norvegicus initiation factor eIF-2B gamma subunit (eIF-2B gamma) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 92 // 52 // 56 // 0 /// XM_006238631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2B, subunit 3 (Eif2b3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 61 // 61 // 37 // 61 // 1 /// GENSCAN00000032753 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139680886:139747790:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 56 // 56 // 0
NM_001108975 // RefSeq // Rattus norvegicus patched homolog 2 (Drosophila) (Ptch2), mRNA. // chr5 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000023468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139757433:139776704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0
AJ973123 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for putative tctex1/2 family protein (N22.1 gene). // chr5 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000024921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:139790302:139790961:1 gene:ENSRNOG00000018463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000023476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139790197:139790961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
XM_001066317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bestrophin 4 (Best4), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002726582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bestrophin 4 (Best4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139806969:139810629:1 gene:ENSRNOG00000018749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139806969:139810629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT043472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// FQ225254 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YJ09 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1 /// FQ233867 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YB12 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1
NM_001107964 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 53 (Tmem53), mRNA. // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_006238665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 53 (Tmem53), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139905905:139921464:1 gene:ENSRNOG00000019186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139916722:139921074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
XM_006225478 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ERI1 exoribonuclease family member 3 (Eri3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ERI1 exoribonuclease family member 3 (Eri3), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140195744:140261296:1 gene:ENSRNOG00000019381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000072492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140195744:140322806:1 gene:ENSRNOG00000019381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// XM_006225480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ERI1 exoribonuclease family member 3 (Eri3), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// XM_006238737 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ERI1 exoribonuclease family member 3 (Eri3), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// BC167080 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8363520, partial cds. // chr5 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT043479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT043481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000023471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140223909:140239047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT043482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
GENSCAN00000011535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138220925:138250639:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 63 // 80 // 5 // 8 // 0
ENSRNOT00000044921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:138232580:138235480:1 gene:ENSRNOG00000033231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 77 // 45 // 17 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:94924849:94964406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 61 // 61 // 30 // 49 // 1 /// GENSCAN00000011535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138220925:138250639:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 45 // 45 // 22 // 49 // 1 /// NONRATT045235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 22 // 22 // 11 // 49 // 1
NM_053818 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, glycine), member 9 (Slc6a9), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140458723:140492746:1 gene:ENSRNOG00000019484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC128732 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter, glycine), member 9, mRNA (cDNA clone MGC:156610 IMAGE:8364347), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// L13600 // GenBank // Rattus norvegicus glycine transporter mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// M88595 // GenBank // Rat glycine transporter mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 73 // 25 // 27 // 0 /// M95413 // GenBank // Rattus norvegicus (clone GLYT1) glycine transporter gene, complete CDS. // chr5 // 96 // 70 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140459120:140491656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT043485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
XM_002726584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxypyruvate isomerase (Hyi), mRNA. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_002729532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxypyruvate isomerase (Hyi), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000056815 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:140977015:140979672:1 gene:ENSRNOG00000037518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041129 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140977033:140979595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ211344 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA12YH15 mRNA sequence. // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
GENSCAN00000041141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141027524:141049457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001044275 // RefSeq // Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 1 (Elovl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000037160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141046751:141049945:1 gene:ENSRNOG00000028448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC085795 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Elongation of very long chain fatty acids protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93791 IMAGE:7109632), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000041141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141027524:141049457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT043496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 98 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT043497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT043499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 73 // 29 // 29 // 0
XM_001053588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 258-like (LOC679583), mRNA. // chr5 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// XM_001074464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to UPF0197 protein C11orf10 homolog (RGD1560328), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// XM_574622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to UPF0197 protein C11orf10 homolog (RGD1560328), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000050090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61233464:61233703:1 gene:ENSRNOG00000032740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// XM_002725983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG47273-like (LOC100363048), mRNA. // chr5 // 45 // 100 // 15 // 33 // 0 /// XM_002729047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG47273-like (LOC100363048), mRNA. // chr5 // 45 // 100 // 15 // 33 // 0 /// XM_003752111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 258-like (LOC680191), mRNA. // chr5 // 45 // 100 // 15 // 33 // 0 /// XM_006221647 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 258-like (LOC690138), mRNA. // chr5 // 30 // 100 // 10 // 33 // 0 /// XM_006250601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 258-like (LOC690138), mRNA. // chr5 // 30 // 100 // 10 // 33 // 0 /// GENSCAN00000015145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61233464:61233703:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// NONRATT003176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// NONRATT056563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 94 // 25 // 31 // 0 /// GENSCAN00000055009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:106486162:106515229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 100 // 15 // 33 // 0
NM_001108674 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2610528J11 (RGD1305347), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2610528J11 (RGD1305347), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141144722:141147874:1 gene:ENSRNOG00000020259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141131871:141147625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001107967 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 125 (Tmem125), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141158990:141160370:1 gene:ENSRNOG00000045872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086537 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 125, mRNA (cDNA clone MGC:105818 IMAGE:7106780), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008721 // RefSeq // Rattus norvegicus EBNA1 binding protein 2 (Ebna1bp2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000072245 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141456563:141461139:1 gene:ENSRNOG00000045760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141245090:141249664:1 gene:ENSRNOG00000050287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC087738 // GenBank // Rattus norvegicus EBNA1 binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:105572 IMAGE:7310934), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ219880 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA45YA09 mRNA sequence. // chr5 // 83 // 80 // 10 // 12 // 0 /// FQ213511 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YG21 mRNA sequence. // chr5 // 67 // 100 // 10 // 15 // 0 /// GENSCAN00000049882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141245602:141249563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// GENSCAN00000049887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141456658:141495997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001000409 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 855 (Olr855), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141284000:141284947:1 gene:ENSRNOG00000048998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072631 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:141494832:141495997:1 gene:ENSRNOG00000049373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141456658:141495997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141284000:141284947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000584 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 858 (Olr858), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141544357:141545295:1 gene:ENSRNOG00000050546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141333279:141334217:1 gene:ENSRNOG00000050162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141333279:141334217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141544357:141545295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000585 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 859 (Olr859), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141572327:141573274:1 gene:ENSRNOG00000050481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141361136:141362083:1 gene:ENSRNOG00000047595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141550680:141573274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049897 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141339600:141362083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001106682 // RefSeq // Rattus norvegicus L-amino acid oxidase 1 (Lao1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141822023:141831907:1 gene:ENSRNOG00000007232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168679 // GenBank // Rattus norvegicus L-amino acid oxidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:188490 IMAGE:5621187), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141822051:141930744:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_138827 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1 (Slc2a1), mRNA. // chr5 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141964114:141992634:1 gene:ENSRNOG00000007284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC061873 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72306 IMAGE:5598829), complete cds. // chr5 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0 /// M13979 // GenBank // Rat brain glucose-transporter protein mRNA, complete cds. // chr5 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// NONRATT043511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141960546:142000792:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_001038992 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 23 (Ccdc23), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NM_001038994 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 23 (Ccdc23), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142055373:142060684:1 gene:ENSRNOG00000007404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142055067:142060684:1 gene:ENSRNOG00000007404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC099226 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 23, mRNA (cDNA clone MGC:116404 IMAGE:7388643), complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142055576:142060411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT043515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0
NM_053667 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine proline-enriched proteoglycan (leprecan) 1 (Lepre1), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000010395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142091634:142106916:1 gene:ENSRNOG00000007538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// AF087433 // GenBank // Rattus norvegicus leprecan (lepre1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC161838 // GenBank // Rattus norvegicus leucine proline-enriched proteoglycan (leprecan) 1, mRNA (cDNA clone MGC:187347 IMAGE:9101602), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000039719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142091609:142106592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT043517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT043518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001008514 // RefSeq // Rattus norvegicus claudin 19 (Cldn19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000047151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142113780:142118387:1 gene:ENSRNOG00000007922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000063931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142113780:142118475:1 gene:ENSRNOG00000007922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF497645 // GenBank // Rattus norvegicus claudin-19 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// BC079172 // GenBank // Rattus norvegicus claudin 19, mRNA (cDNA clone MGC:94203 IMAGE:7129992), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142113864:142117603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_001073839 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 30 (Ccdc30), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 30 (Ccdc30), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_342899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 30 (Ccdc30), mRNA. // chrU // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142180663:142261056:-1 gene:ENSRNOG00000008560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 92 // 76 // 23 // 25 // 0 /// XM_006225506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 30 (Ccdc30), transcript variant X7, mRNA. // chrU // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000073705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142206115:142218907:-1 gene:ENSRNOG00000008560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 24 // 24 // 8 // 33 // 1 /// GENSCAN00000039693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142169729:142235101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT045381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
XM_001073803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase H (cyclophilin H) (Ppih), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// XM_006225498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase H (cyclophilin H) (Ppih), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// XM_006225499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase H (cyclophilin H) (Ppih), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// XM_006225500 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase H (cyclophilin H) (Ppih), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000064712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142169743:142177993:-1 gene:ENSRNOG00000008489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000067943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142169207:142177993:-1 gene:ENSRNOG00000008489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 15 // 20 // 1 /// GENSCAN00000039693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142169729:142235101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0
NM_001107970 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 12 (Zmynd12), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 12 (Zmynd12), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000064073 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142280330:142312575:1 gene:ENSRNOG00000022199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142292492:142312382:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107971 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box J3 (Foxj3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000011683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142408836:142478023:1 gene:ENSRNOG00000008787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT043528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000045636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142458256:142476925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
NM_013118 // RefSeq // Rattus norvegicus guanylate cyclase activator 2a (guanylin) (Guca2a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142487928:142489769:1 gene:ENSRNOG00000008849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M93005 // GenBank // Rat guanylin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M95493 // GenBank // Rat guanylin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// X67669 // GenBank // R.norvegicus mRNA for guanylin. // chr5 // 90 // 38 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000045617 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142487940:142496991:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT043530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000056687 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:142573931:142574296:1 gene:ENSRNOG00000037451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142551056:142574296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107972 // RefSeq // Rattus norvegicus human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3 (Hivep3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142797806:142865048:1 gene:ENSRNOG00000009341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142828656:142864078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012549 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelin 2 (Edn2), mRNA. // chr5 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000012569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:142891221:142896115:1 gene:ENSRNOG00000009390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000035793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142891221:142896115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT043536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109669 // RefSeq // Rattus norvegicus sex comb on midleg homolog 1 (Drosophila) (Scmh1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000045954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143168705:143249138:1 gene:ENSRNOG00000032183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC131847 // GenBank // Rattus norvegicus sex comb on midleg homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:156716 IMAGE:7100459), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143123584:143240930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT043538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001024347 // RefSeq // Rattus norvegicus schlafen-like 1 (Slfnl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus schlafen-like 1 (Slfnl1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143251801:143256272:1 gene:ENSRNOG00000009906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079280 // GenBank // Rattus norvegicus schlafen-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94406 IMAGE:7134187), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143252745:143256129:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT043543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT043545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053699 // RefSeq // Rattus norvegicus Cbp/p300-interacting transactivator, with Glu/Asp-rich carboxy-terminal domain, 4 (Cited4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143379104:143379995:1 gene:ENSRNOG00000046607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF361477 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor MRG2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232635 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YP18 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143379307:143379846:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT043547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022931 // RefSeq // Rattus norvegicus regulating synaptic membrane exocytosis 3 (Rims3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143583599:143612220:1 gene:ENSRNOG00000011171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF199334 // GenBank // Rattus norvegicus NIM3 (Nim3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143599028:143612022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 68 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT043548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NONRATT043549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108675 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type IX, alpha 2 (Col9a2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type IX, alpha 2 (Col9a2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000048506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:143756118:143773305:1 gene:ENSRNOG00000011502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ211982 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA73YP05 mRNA sequence. // chr5 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:143756508:143776250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT043552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT043554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001008521 // RefSeq // Rattus norvegicus twinfilin actin-binding protein 1 (Twf1), mRNA. // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000016814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144276852:144277908:1 gene:ENSRNOG00000012595 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000038032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:135495110:135507004:-1 gene:ENSRNOG00000022507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// BC086536 // GenBank // Rattus norvegicus twinfilin, actin-binding protein, homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:105817 IMAGE:7106678), complete cds. // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// GENSCAN00000057970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144276852:144277908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000054628 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:135496926:135506999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_022502 // RefSeq // Rattus norvegicus palmitoyl-protein thioesterase 1 (Ppt1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144329251:144350133:1 gene:ENSRNOG00000012616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC126089 // GenBank // Rattus norvegicus palmitoyl-protein thioesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:156647 IMAGE:8361877), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ213911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YN13 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// L34262 // GenBank // Rattus norvegicus palmitoyl-protein thioesterase mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144329265:144348806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT043560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001191763 // RefSeq // Rattus norvegicus v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene lung carcinoma derived homolog (Mycl), mRNA. // chr5 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// XM_006238795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-myc avian myelocytomatosis viral oncogene lung carcinoma derived homolog (Mycl), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000019101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144483332:144487332:1 gene:ENSRNOG00000014259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000057973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144482879:144487332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT043562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0
NM_001108676 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA isopentenyltransferase 1 (Trit1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144503063:144546565:1 gene:ENSRNOG00000014274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000057969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144503076:144545905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
XM_001054775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 8b (Bmp8b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_002729526 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 8b (Bmp8b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 8b (Bmp8b), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000050949 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:144594118:144611108:1 gene:ENSRNOG00000033209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000057978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144593378:144615067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT043565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1 /// NONRATT043566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
NM_001012221 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-oxoacid CoA transferase 2A (Oxct2a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC083681 // GenBank // Rattus norvegicus 3-oxoacid CoA transferase 2A, mRNA (cDNA clone MGC:94532 IMAGE:7135892), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000048664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144797729:144997304:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 62 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144593378:144615067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 64 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT043565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT045435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_017357 // RefSeq // Rattus norvegicus hippocalcin-like 4 (Hpcal4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144660374:144672320:1 gene:ENSRNOG00000050983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D13125 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neural visinin-like Ca2+-binding protein type 2, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D14819 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for calcium-binding protein P23k beta, partial cds. // chr5 // 89 // 79 // 17 // 19 // 0 /// FQ212482 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YJ17 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144665915:144668582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001107976 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IA (Nt5c1a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase, cytosolic IA (Nt5c1a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000020524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144678889:144693912:1 gene:ENSRNOG00000015283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144678956:144697673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT043569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107977 // RefSeq // Rattus norvegicus hes-related family bHLH transcription factor with YRPW motif-like (Heyl), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144713817:144730808:1 gene:ENSRNOG00000015318 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144714128:144728317:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
NM_001100538 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein, cytoplasmic 4 (Pabpc4), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000056592 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:144769098:144784395:1 gene:ENSRNOG00000015642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// BC166452 // GenBank // Rattus norvegicus poly A binding protein, cytoplasmic 4, mRNA (cDNA clone MGC:187687 IMAGE:8372968), complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000067752 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:6052650:6055814:-1 gene:ENSRNOG00000028592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 95 // 34 // 37 // 0 /// GENSCAN00000017259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:6052933:6055456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 74 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:144769466:144783593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT043573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 74 // 74 // 29 // 39 // 1 /// NONRATT043574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT043575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
NONRATT043573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT043572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT043573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001106684 // RefSeq // Rattus norvegicus rhomboid, veinlet-like 2 (Drosophila) (Rhbdl2), mRNA. // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000034839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:145279874:145296831:1 gene:ENSRNOG00000026592 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000011746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:145276278:145319415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000056546 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:145318714:145319415:1 gene:ENSRNOG00000037368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:145276278:145319415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:145348772:145354755:1 gene:ENSRNOG00000017166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NM_001271324 // RefSeq // Rattus norvegicus Myc binding protein (Mycbp), mRNA. // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT043579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:145344779:145439351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT043580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001048184 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras-related GTP binding C (Rragc), mRNA. // chr5 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000023514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:145361045:145379290:1 gene:ENSRNOG00000017426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// BC105622 // GenBank // Rattus norvegicus Ras-related GTP binding C, mRNA (cDNA clone MGC:125018 IMAGE:7454011), complete cds. // chr5 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// NONRATT043582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000011754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:145344779:145439351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT043580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_138838 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 3 homeobox 1 (Pou3f1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146414652:146417633:1 gene:ENSRNOG00000047686 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M72711 // GenBank // Rat transcriptional repressor of myelin-specific genes (SCIP) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146414689:146416045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107979 // RefSeq // Rattus norvegicus four and a half LIM domains 3 (Fhl3), mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000010007 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146460220:146466971:1 gene:ENSRNOG00000007541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000057462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146464764:146466840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025698 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 3a, subunit 3 (Sf3a3), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000010373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146473837:146493458:1 gene:ENSRNOG00000007629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// AY387079 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00093 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// BC099183 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor 3a, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:116354 IMAGE:7383264), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000057458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146473900:146479394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT043587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000057468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146482327:146609630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT043588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
ENSRNOT00000054581 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:5:146492737:146492842:1 gene:ENSRNOG00000036473 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100755 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase B (Inpp5b), mRNA. // chr5 // 98 // 96 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000067762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146503106:146566949:1 gene:ENSRNOG00000048506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 96 // 42 // 43 // 0 /// BC098852 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-5-phosphatase B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7379694), partial cds. // chr5 // 97 // 78 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000010885 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146080005:146105671:1 gene:ENSRNOG00000049397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 76 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT043591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000057468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146482327:146609630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 38 // 45 // 1 /// GENSCAN00000002765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146030901:146149034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 31 // 45 // 1
NM_001108677 // RefSeq // Rattus norvegicus metal-regulatory transcription factor 1 (Mtf1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metal-regulatory transcription factor 1 (Mtf1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XR_354269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metal regulatory transcription factor 1-like (LOC100909856), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000031928 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146568010:146612766:1 gene:ENSRNOG00000025724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000072841 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:146109526:146149034:1 gene:ENSRNOG00000050240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146030901:146149034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057468 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146482327:146609630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_175604 // RefSeq // Rattus norvegicus yrdC N(6)-threonylcarbamoyltransferase domain containing (Yrdc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039870 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146615909:146620749:1 gene:ENSRNOG00000025424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099797 // GenBank // Rattus norvegicus yrdC domain containing (E.coli), mRNA (cDNA clone MGC:124843 IMAGE:7936110), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY172974 // GenBank // Rattus norvegicus BmTCTP receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000057470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146615922:146620082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001135709 // RefSeq // Rattus norvegicus EPH receptor A10 (Epha10), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EPH receptor A10 (Epha10), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146646393:146678719:1 gene:ENSRNOG00000037340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057465 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146646393:146678057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_001109264 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20508 (RGD1560436), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238898 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20508 (RGD1560436), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238899 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ20508 (RGD1560436), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146702472:146707778:1 gene:ENSRNOG00000025065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000057466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146704043:146707698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT043598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0
BC168963 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9029771. // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NM_001107980 // RefSeq // Rattus norvegicus R-spondin 1 (Rspo1), mRNA. // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000012811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146755088:146776423:1 gene:ENSRNOG00000009656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146736407:146821966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT043600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001025736 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar) (Gnl2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146796615:146821993:1 gene:ENSRNOG00000009430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099173 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein-like 2 (nucleolar), mRNA (cDNA clone MGC:116342 IMAGE:7382617), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146736407:146821966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT043603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0
NM_001014069 // RefSeq // Rattus norvegicus Smad nuclear interacting protein 1 (Snip1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146831845:146839470:1 gene:ENSRNOG00000024889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:23241829:23248168:-1 gene:ENSRNOG00000046920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// BC087118 // GenBank // Rattus norvegicus Smad nuclear interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94754 IMAGE:7096408), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146831878:146838367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000052708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:23241829:23254787:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_001113784 // RefSeq // Rattus norvegicus MYST/Esa1-associated factor 6 (Meaf6), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XR_354270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MYST/Esa1-associated factor 6 (Meaf6), transcript variant X3, misc_RNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067204 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:146848980:146870851:1 gene:ENSRNOG00000009309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ215854 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YF07 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:146848888:146870278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT043609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001112716 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, kainate 3 (Grik3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NM_181373 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, kainate 3 (Grik3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000045513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147265647:147480507:1 gene:ENSRNOG00000008992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF027331 // GenBank // Rattus norvegicus kainate receptor GluR7b mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// M83552 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate receptor subunit kainate subtype (GluR7) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147393756:147479804:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001106685 // RefSeq // Rattus norvegicus colony stimulating factor 3 receptor (granulocyte) (Csf3r), mRNA. // chr5 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// XM_006238849 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus colony stimulating factor 3 receptor (granulocyte) (Csf3r), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147796334:147820326:1 gene:ENSRNOG00000008759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147796357:147819885:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001007653 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S15 (Mrps15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147824053:147834646:1 gene:ENSRNOG00000008279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083856 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S15, mRNA (cDNA clone MGC:95073 IMAGE:7125450), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT043617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147824130:147852998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_001029923 // RefSeq // Rattus norvegicus organic solute carrier partner 1 (Oscp1), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147837067:147867531:1 gene:ENSRNOG00000026978 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB299031 // GenBank // Rattus norvegicus OSCP1 mRNA for organic solute carrier protein 1, complete cds. // chr5 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// BC098048 // GenBank // Rattus norvegicus organic solute carrier protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116206 IMAGE:7457181), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147855039:147867336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001108976 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM10, U7 small nuclear RNA associated (Lsm10), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238895 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM10, U7 small nuclear RNA associated (Lsm10), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM10, U7 small nuclear RNA associated (Lsm10), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LSM10, U7 small nuclear RNA associated (Lsm10), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000035637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147876338:147878244:1 gene:ENSRNOG00000025716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166902 // GenBank // Rattus norvegicus LSM10, U7 small nuclear RNA associated, mRNA (cDNA clone MGC:188864 IMAGE:6922293), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147877503:147877871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT043619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_183056 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 40 (Stk40), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 40 (Stk40), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000035597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147883548:147920182:1 gene:ENSRNOG00000025679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY336055 // GenBank // Rattus norvegicus Ser/Thr-like protein kinase lyk4 mRNA, complete cds. // chr5 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// BC100062 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 40, mRNA (cDNA clone MGC:112582 IMAGE:7124923), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT043622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147882738:147929960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1
NM_001108679 // RefSeq // Rattus norvegicus eva-1 homolog B (Eva1b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eva-1 homolog B (Eva1b), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000064972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:147928855:147930156:1 gene:ENSRNOG00000024818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167091 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 176, member B, mRNA (cDNA clone MGC:189523 IMAGE:7309362), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234971 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YP08 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT043626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:147882738:147929960:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001008376 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 3 (Trappc3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148049331:148062968:1 gene:ENSRNOG00000010550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086377 // GenBank // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 3, mRNA (cDNA clone MGC:105948 IMAGE:7301917), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214189 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YF07 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT043631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148035928:148085080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENSRNOT00000014388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148097757:148100436:1 gene:ENSRNOG00000010841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000049726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148097757:148100436:1 gene:ENSRNOG00000010841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000041718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148097757:148100436:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001106687 // RefSeq // Rattus norvegicus claspin (Clspn), mRNA. // chr5 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// XM_003750033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claspin-like (LOC100912530), partial mRNA. // chr5 // 100 // 34 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000015227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148352777:148387685:1 gene:ENSRNOG00000011332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 100 // 46 // 47 // 0 /// XM_003750035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claspin-like (LOC100912611), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 17 // 17 // 8 // 47 // 1 /// GENSCAN00000005643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148352926:148386493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000024248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150012749:150063294:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 26 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT043637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0
NM_001106687 // RefSeq // Rattus norvegicus claspin (Clspn), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003750035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus claspin-like (LOC100912611), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148352777:148387685:1 gene:ENSRNOG00000011332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107981 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ38984 (RGD1563072), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ38984 (RGD1563072), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// XM_006238915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UPF0500 protein C1orf216 homolog (LOC100912566), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000029395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150080050:150084713:1 gene:ENSRNOG00000021609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075558 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:148405493:148406173:1 gene:ENSRNOG00000048060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148405072:148406173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000024250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150081871:150082972:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0
NM_017284 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 2 (Psmb2), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000015618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148472364:148504751:1 gene:ENSRNOG00000011463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC058487 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 2, mRNA (cDNA clone MGC:72875 IMAGE:6891616), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000005654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148472452:148504623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001159655 // RefSeq // Rattus norvegicus dyslexia susceptibility 2-like (LOC100294508), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000016493 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:148550212:148642557:1 gene:ENSRNOG00000012204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000005642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148604090:148649213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT043639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 20 // 46 // 1
GENSCAN00000012168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148800568:148819219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000031724 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:148800259:148800906:1 gene:ENSRNOG00000023237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 100 // 14 // 20 // 0
NM_001025271 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor proline/glutamine-rich (Sfpq), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018049 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148850564:148858900:1 gene:ENSRNOG00000013154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC098731 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor proline/glutamine rich (polypyrimidine tract binding protein associated), mRNA (cDNA clone MGC:112723 IMAGE:7384804), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000012188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148844061:148864384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT043649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001108681 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MYM-type 6 (Zmym6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019135 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148909099:148956295:1 gene:ENSRNOG00000013865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ221018 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YJ18 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT043655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NONRATT043655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001271137 // RefSeq // Rattus norvegicus ZMYM6 neighbor (Zmym6nb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:148958175:148961378:1 gene:ENSRNOG00000028083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 44 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT043655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:148958333:149008763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001276304 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 3 (Dlgap3), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NM_173138 // RefSeq // Rattus norvegicus discs, large (Drosophila) homolog-associated protein 3 (Dlgap3), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:149027227:149073369:1 gene:ENSRNOG00000014302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY530298 // GenBank // Rattus norvegicus synapse-associated protein 90/postsynaptic density-95-associated protein 3(+) (SAPAP3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// AY530299 // GenBank // Rattus norvegicus synapse-associated protein 90/postsynaptic density-95-associated protein 3(-) (SAPAP3) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 82 // 85 // 18 // 22 // 0 /// U67139 // GenBank // Rattus norvegicus PSD-95/SAP90-associated protein-3 mRNA, complete CDS. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000012181 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:149028727:149073302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT043659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001276483 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 12 (Smim12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:149083705:149083983:1 gene:ENSRNOG00000014352 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:149078409:149083983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001276483 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 12 (Smim12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
XM_006225531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 2 (Csmd2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 70 // 70 // 0 /// XM_006225532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 2 (Csmd2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 70 // 70 // 0 /// XM_006225534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CUB and Sushi multiple domains 2 (Csmd2), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 65 // 65 // 0 /// GENSCAN00000024292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150399817:150481252:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000024297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150302923:150397811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 25 // 25 // 0
XM_006238930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polyhomeotic homolog 2 (Drosophila) (Phc2), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// BC090339 // GenBank // Rattus norvegicus polyhomeotic homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7302250), complete cds. // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// BC169102 // GenBank // Rattus norvegicus polyhomeotic homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:7933693), partial cds. // chr5 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// NM_001013169 // RefSeq // Rattus norvegicus polyhomeotic homolog 2 (Drosophila) (Phc2), mRNA. // chr5 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// XM_006238927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polyhomeotic homolog 2 (Drosophila) (Phc2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// XM_006238929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polyhomeotic homolog 2 (Drosophila) (Phc2), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000067912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150620498:150668954:1 gene:ENSRNOG00000006004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// GENSCAN00000024295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150592383:150667788:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT043670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_138524 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha 1,3-galactosyltransferase 2 (A3galt2), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150671102:150683390:1 gene:ENSRNOG00000005935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF248543 // GenBank // Rattus norvegicus iGb3 synthase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC061714 // GenBank // Rattus norvegicus alpha 1,3-galactosyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:72309 IMAGE:5598151), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150672319:150682578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT043675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001033967 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate kinase 2 (Ak2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000000134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150910956:150929525:1 gene:ENSRNOG00000000122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// BC061727 // GenBank // Rattus norvegicus adenylate kinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:72419 IMAGE:5598607), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// NM_030986 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate kinase 2 (Ak2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// D13061 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for adenylate kinase 2, complete cds. // chr5 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1 /// NONRATT043679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150910973:150964789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1 /// NONRATT043678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_001108003 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 19B (Rnf19b), mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000066268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:150992439:151005653:1 gene:ENSRNOG00000000123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000014909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:150980692:151003963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001034151 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 54 (Tmem54), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151023461:151029951:1 gene:ENSRNOG00000024259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC101399 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 54, mRNA (cDNA clone MGC:124700 IMAGE:7933358), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151013244:151029685:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT043682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001270981 // RefSeq // Rattus norvegicus fibronectin type III domain containing 5 (Fndc5), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047152 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:151057693:151062818:1 gene:ENSRNOG00000030238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151057693:151064259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_001025696 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosyl-tRNA synthetase (Yars), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151109967:151138472:1 gene:ENSRNOG00000007213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098795 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:112837 IMAGE:7375769), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000014899 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151110115:151137774:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000014908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151193587:151193937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000029550 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:151193587:151194043:1 gene:ENSRNOG00000021679 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 71 // 100 // 17 // 24 // 0
NM_001108683 // RefSeq // Rattus norvegicus syncoilin, intermediate filament protein (Sync), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syncoilin, intermediate filament protein (Sync), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151209094:151231142:1 gene:ENSRNOG00000008118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151209217:151216305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT043688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT043690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_003750036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand (Zbtb8os), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_003754126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 8 opposite strand (Zbtb8os), mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000010941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151257317:151266695:1 gene:ENSRNOG00000008226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000074628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151257317:151268014:1 gene:ENSRNOG00000008226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000026560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151257317:151268014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001008292 // RefSeq // Rattus norvegicus diablo, IAP-binding mitochondrial protein (Diablo), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011308 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:151327329:151328075:1 gene:ENSRNOG00000008548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047861 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:40372113:40385230:1 gene:ENSRNOG00000029197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086366 // GenBank // Rattus norvegicus diablo homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:105680 IMAGE:7305418), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151327329:151328075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:40340931:40384654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT014964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT014965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT014966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000043325 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:151356275:151356712:1 gene:ENSRNOG00000030173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000026539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151356419:151356763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_001106636 // RefSeq // Rattus norvegicus BSD domain containing 1 (Bsdc1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011054 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:151382663:151410825:1 gene:ENSRNOG00000008338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000026571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151394244:151409452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_030862 // RefSeq // Rattus norvegicus MARCKS-like 1 (Marcksl1), mRNA. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// XM_006225645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MARCKS-related protein-like (LOC100911158), mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006228635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MARCKS-related protein-like (LOC102550530), mRNA. // chr1 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000012663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:86018382:86035603:-1 gene:ENSRNOG00000009113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151444126:151444725:1 gene:ENSRNOG00000046775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151391004:151391603:-1 gene:ENSRNOG00000046423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// BC081789 // GenBank // Rattus norvegicus MARCKS-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:93399 IMAGE:7134056), complete cds. // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151391004:151391603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000026562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151444126:151444725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT004845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT004850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:86019115:86035421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006225544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPOC domain containing 1 (Spocd1), mRNA. // chr5 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// XM_006238988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SPOC domain containing 1 (Spocd1), mRNA. // chr5 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151857973:151890111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 92 // 34 // 37 // 1 /// NONRATT043700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1
NM_001107914 // RefSeq // Rattus norvegicus brain-specific angiogenesis inhibitor 2 (Bai2), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151919830:151950961:1 gene:ENSRNOG00000014375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151919845:152029908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001015033 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XVI, alpha 1 (Col16a1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 69 // 69 // 0 /// XM_006238955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XVI, alpha 1 (Col16a1), transcript variant X10, mRNA. // chr5 // 98 // 88 // 62 // 63 // 0 /// ENSRNOT00000067663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:151976658:152030103:1 gene:ENSRNOG00000031475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 99 // 96 // 68 // 69 // 0 /// BC092654 // GenBank // Rattus norvegicus collagen, type XVI, alpha 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7320488), complete cds. // chr5 // 100 // 28 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000035068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:151919845:152029908:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 76 // 53 // 55 // 0 /// NONRATT043709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 21 // 72 // 1 /// NONRATT043704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 13 // 13 // 9 // 72 // 1 /// NONRATT043705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 14 // 14 // 10 // 72 // 1 /// NONRATT043706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 19 // 19 // 14 // 72 // 1
NM_001007651 // RefSeq // Rattus norvegicus penta-EF hand domain containing 1 (Pef1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152039075:152062360:1 gene:ENSRNOG00000013972 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC082028 // GenBank // Rattus norvegicus penta-EF hand domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:95159 IMAGE:7130077), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// FQ219120 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA47YI11 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152055005:152061720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT043713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_024162 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 3, muscle and heart (Fabp3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152246244:152253006:1 gene:ENSRNOG00000012879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ217465 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA25YL22 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J02773 // GenBank // Rat low molecular weight fatty acid binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M18034 // GenBank // Rat heart fatty acid binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT043716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152246284:152252763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT043717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001134556 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 40 (U5) (Snrnp40), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152294724:152327111:1 gene:ENSRNOG00000012219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032187 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152285640:152326677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NM_053538 // RefSeq // Rattus norvegicus lysosomal protein transmembrane 5 (Laptm5), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000015198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152749594:152771632:1 gene:ENSRNOG00000011054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB046592 // GenBank // Rattus norvegicus gcd-10S mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC060517 // GenBank // Rattus norvegicus lysosomal multispanning membrane protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:72357 IMAGE:5597893), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152749601:152770353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_001006979 // RefSeq // Rattus norvegicus matrilin 1, cartilage matrix protein (Matn1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014666 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:152779325:152788646:1 gene:ENSRNOG00000010932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083869 // GenBank // Rattus norvegicus matrilin 1, cartilage matrix protein, mRNA (cDNA clone MGC:95132 IMAGE:7128388), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:152779289:152793605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT043729 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017209 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial trans-2-enoyl-CoA reductase (Mecr), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:153680464:153705789:1 gene:ENSRNOG00000028047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB015724 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for nuclear receptor binding factor-1, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// FQ210707 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA23YO05 mRNA sequence. // chr5 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:153680479:153705610:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT043733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT043735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001108685 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 4 (Srsf4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:153711721:153739487:1 gene:ENSRNOG00000010007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:153729243:153759648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XM_001068178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 200B (Tmem200b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047917 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:153758794:153759648:1 gene:ENSRNOG00000032018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:153729243:153759648:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106635 // RefSeq // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 1A (SWI-like) (Arid1a), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000009173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155592619:155635649:-1 gene:ENSRNOG00000006137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000042841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155593932:155665825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT045657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0
NM_001039339 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 18 (Zdhhc18), mRNA. // chr5 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155520908:155546083:-1 gene:ENSRNOG00000007021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// AY886534 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC18 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155513267:155583534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT045645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT045647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT045649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XM_001065560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stratifin (Sfn), mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// XM_003750048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stratifin (Sfn), mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// BC099129 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7461680, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr5 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT045644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_017271 // RefSeq // Rattus norvegicus nudC nuclear distribution protein (Nudc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_003750056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear migration protein nudC-like (LOC100911422), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000009933 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155443982:155457375:-1 gene:ENSRNOG00000007399 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC065581 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear distribution gene C homolog (Aspergillus), mRNA (cDNA clone MGC:72493 IMAGE:5623848), complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071368 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:156118742:156126890:-1 gene:ENSRNOG00000046269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONRATT045643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000026708 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156118742:156205692:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// GENSCAN00000042836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155444186:155457297:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
ENSRNOT00000072337 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:156113426:156113966:-1 gene:ENSRNOG00000049922 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075055 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:155439135:155439675:-1 gene:ENSRNOG00000046716 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT045677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TMF1-regulated nuclear protein 1 (Trnp1), partial mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032841 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:155371380:155372027:-1 gene:ENSRNOG00000026483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042840 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155370770:155414027:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107908 // RefSeq // Rattus norvegicus WD and tetratricopeptide repeats 1 (Wdtc1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155153929:155201755:-1 gene:ENSRNOG00000008377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155127916:155219882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001113780 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 222 (Tmem222), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155127137:155138924:-1 gene:ENSRNOG00000008564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158875 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 222, mRNA (cDNA clone MGC:188544 IMAGE:7934037), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155127916:155219882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT045636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001025651 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin-like 1 (Sytl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006239013 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptotagmin-like 1 (Sytl1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155113818:155124211:-1 gene:ENSRNOG00000008600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// BC098679 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:112642 IMAGE:7384784), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000050681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155113886:155121969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
NM_153727 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 3 (Gpr3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 3 (Gpr3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155061363:155062328:-1 gene:ENSRNOG00000009540 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155061363:155062352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000066549 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:154755365:154784446:-1 gene:ENSRNOG00000011254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// FQ222884 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA18YI07 mRNA sequence. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154757350:154784446:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156043840:156086406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT045677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT045678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT045680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NONRATT045616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT045627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT045628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT045677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT045678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT045680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_022939 // RefSeq // Rattus norvegicus syntaxin 12 (Stx12), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154712006:154740248:-1 gene:ENSRNOG00000011804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF035632 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 12 mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// XM_006239066 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syntaxin 12 (Stx12), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000014471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154713416:154720356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// AF044581 // GenBank // Rattus norvegicus syntaxin 13 mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045624 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107911 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 8 (Ppp1r8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154679818:154696564:-1 gene:ENSRNOG00000012935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC162025 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 8, mRNA (cDNA clone MGC:187911 IMAGE:9099457), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154680268:154696551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
XM_006225573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA repair protein SWI5 homolog (RGD1561465), mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// XM_006239107 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA repair protein SWI5 homolog (RGD1561465), mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000075506 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:154662411:154662659:-1 gene:ENSRNOG00000048439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000014469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154662411:154666170:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001271480 // RefSeq // Rattus norvegicus thymocyte selection associated family member 2 (Themis2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017340 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154639451:154653218:-1 gene:ENSRNOG00000012965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000014477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154639451:154653218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001025737 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B (Smpdl3b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000067905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154592756:154614208:-1 gene:ENSRNOG00000042326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC097983 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B, mRNA (cDNA clone MGC:116117 IMAGE:7443444), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001012099 // RefSeq // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8 (Xkr8), mRNA. // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// AY534262 // GenBank // Rattus norvegicus XK-related protein 8 mRNA, complete cds. // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT045617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154593171:154607903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT045616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NONRATT045617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001012099 // RefSeq // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8 (Xkr8), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AY534262 // GenBank // Rattus norvegicus XK-related protein 8 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001025737 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B (Smpdl3b), mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000067905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154592756:154614208:-1 gene:ENSRNOG00000042326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// BC097983 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B, mRNA (cDNA clone MGC:116117 IMAGE:7443444), complete cds. // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT045616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT045618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154593171:154607903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001012099 // RefSeq // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8 (Xkr8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154586204:154592456:-1 gene:ENSRNOG00000024312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// AY534262 // GenBank // Rattus norvegicus XK-related protein 8 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC105851 // GenBank // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 8, mRNA (cDNA clone MGC:124905 IMAGE:7191341), complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 16 // 16 // 0 /// NM_001025737 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B (Smpdl3b), mRNA. // chr5 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000067905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154592756:154614208:-1 gene:ENSRNOG00000042326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// BC097983 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3B, mRNA (cDNA clone MGC:116117 IMAGE:7443444), complete cds. // chr5 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000014476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154586770:154592444:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// NONRATT045618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_012915 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase inhibitory factor 1 (Atpif1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018038 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:154387824:154391541:-1 gene:ENSRNOG00000013300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC126065 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase inhibitory factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:156492 IMAGE:7442425), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// D13122 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ATPase inhibitor protein, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ221416 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA36YJ12 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// L07806 // GenBank // Rattus rattus mitochondrial IF1 protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:154352264:154391501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
XM_001066449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus absent in melanoma 1-like (Aim1l), mRNA. // chr5 // 100 // 66 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:155987651:156007400:1 gene:ENSRNOG00000023423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000026735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:155951942:156007400:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT043784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
NM_138853 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 11 (Ubxn11), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006239001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UBX domain protein 11 (Ubxn11), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 96 // 72 // 25 // 26 // 0 /// XM_006239005 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UBX domain protein 11 (Ubxn11), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// AB072920 // GenBank // Rattus norvegicus soc mRNA for socius, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC078730 // GenBank // Rattus norvegicus UBX domain protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:93179 IMAGE:7134156), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000021342 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156019009:156042873:1 gene:ENSRNOG00000015476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// GENSCAN00000026659 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156024560:156042856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT043786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT043788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1 /// NONRATT043790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
GENSCAN00000032970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156225346:156228433:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_080903 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif containing 63, E3 ubiquitin protein ligase (Trim63), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156292566:156306092:1 gene:ENSRNOG00000016543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY059627 // GenBank // Rattus norvegicus muscle ring finger protein 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC061824 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 63, mRNA (cDNA clone MGC:72330 IMAGE:5599072), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156286578:156366828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001083122 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2 (Slc30a2), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NM_012890 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2 (Slc30a2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156318531:156368724:1 gene:ENSRNOG00000016650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000071588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156356575:156368724:1 gene:ENSRNOG00000016650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// BC168237 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 30 (zinc transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:188352 IMAGE:7938890), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// U50927 // GenBank // Rattus norvegicus zinc transporter (ZnT-2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156286578:156366828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// NONRATT043797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// NONRATT043798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_177932 // RefSeq // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 2 (Pafah2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 2 (Pafah2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_354330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase 2 (Pafah2), transcript variant X4, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156397032:156417572:1 gene:ENSRNOG00000022288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY225592 // GenBank // Rattus norvegicus platelet-activating factor acetylhydrolase II (PafahII) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156397046:156417568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001034081 // RefSeq // Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member VII (Paqr7), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006239130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus progestin and adipoQ receptor family member VII (Paqr7), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156503752:156504789:1 gene:ENSRNOG00000022054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ027002 // GenBank // Rattus norvegicus progestin membrane receptor alpha mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156490779:156504789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001071529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aurora kinase A and ninein interacting protein (Aunip), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002726638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aurora kinase A and ninein interacting protein (Aunip), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006225577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aurora kinase A and ninein interacting protein (Aunip), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006239131 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aurora kinase A and ninein interacting protein (Aunip), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000039322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156507651:156520014:1 gene:ENSRNOG00000022030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156507651:156520014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022505 // RefSeq // Rattus norvegicus Rh blood group, D antigen (Rhd), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000023187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:156971024:157004412:1 gene:ENSRNOG00000017130 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB015191 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Rh blood group protein, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF531096 // GenBank // Rattus norvegicus Rh blood group protein RH30 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC127471 // GenBank // Rattus norvegicus Rh blood group, D antigen, mRNA (cDNA clone MGC:156556 IMAGE:8374048), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000010397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:156971059:157004333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NONRATT043810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
BC085888 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 1 open reading frame 63, mRNA (cDNA clone MGC:94676 IMAGE:7192402), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NM_001014193 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine/serine-rich protein 1 (Rsrp1), mRNA. // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000023289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157029893:157033632:1 gene:ENSRNOG00000017309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// FQ214327 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YF09 mRNA sequence. // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT043813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157030210:157045999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_133417 // RefSeq // Rattus norvegicus SYF2 pre-mRNA-splicing factor (Syf2), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157038590:157046520:1 gene:ENSRNOG00000017742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF366369 // GenBank // Rattus norvegicus GCIP-interacting protein p29 mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC081735 // GenBank // Rattus norvegicus SYF2 homolog, RNA splicing factor (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone IMAGE:7189694). // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097289 // GenBank // Rattus norvegicus SYF2 homolog, RNA splicing factor (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:114270 IMAGE:7445525), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010391 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157030210:157045999:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT043818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT043819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_130425 // RefSeq // Rattus norvegicus runt-related transcription factor 3 (Runx3), mRNA. // chr5 // 96 // 50 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157275533:157300516:1 gene:ENSRNOG00000018058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 50 // 24 // 25 // 0 /// AF421886 // GenBank // Rattus norvegicus runt-related transcription factor 3 (Runx3) mRNA, Runx3-s allele, complete cds. // chr5 // 96 // 50 // 24 // 25 // 0 /// FQ230848 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA86YB08 mRNA sequence. // chr5 // 74 // 74 // 37 // 50 // 1 /// GENSCAN00000056068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157265163:157300516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 50 // 24 // 25 // 0
FQ230848 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA86YB08 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025772 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm-tail PG-rich repeat containing 1 (Stpg1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239258 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm-tail PG-rich repeat containing 1 (Stpg1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm-tail PG-rich repeat containing 1 (Stpg1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157611549:157654873:1 gene:ENSRNOG00000031448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC098937 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930555I21, mRNA (cDNA clone MGC:114440 IMAGE:7453388), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056076 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157622194:157653794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSRNOT00000030881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157742356:157744668:1 gene:ENSRNOG00000026676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087049 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700029M20, mRNA (cDNA clone MGC:93909 IMAGE:7112813), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191868 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon, lambda receptor 1 (Ifnlr1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon, lambda receptor 1 (Ifnlr1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000049459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157802698:157822018:1 gene:ENSRNOG00000033984 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157802698:157924661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001191869 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 22 receptor, alpha 1 (Il22ra1), mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157843037:157867847:1 gene:ENSRNOG00000027976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157802698:157924661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NONRATT043832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003750060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myomesin 3 (Myom3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000044969 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:157876941:157930025:1 gene:ENSRNOG00000032994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000017023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:157802698:157924661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT043834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0
NM_001025738 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 10 (Srsf10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000064925 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:157970240:157978639:1 gene:ENSRNOG00000007992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC098831 // GenBank // Rattus norvegicus FUS interacting protein (serine-arginine rich) 1, mRNA (cDNA clone MGC:112885 IMAGE:7378554), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ227288 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YO05 mRNA sequence. // chr5 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONRATT043835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT043839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_012562 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosidase, alpha-L- 1, tissue (Fuca1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158034147:158051396:1 gene:ENSRNOG00000009325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081844 // GenBank // Rattus norvegicus fucosidase, alpha-L- 1, tissue, mRNA (cDNA clone MGC:93614 IMAGE:7192716), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158034168:158051318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT043847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_024386 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase (Hmgcl), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158059688:158073434:1 gene:ENSRNOG00000009422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061797 // GenBank // Rattus norvegicus 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-Coenzyme A lyase, mRNA (cDNA clone MGC:72427 IMAGE:5598033), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ209616 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YI14 mRNA sequence. // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT043848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158059708:158079487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_080783 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-galactose-4-epimerase (Gale), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006239134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-galactose-4-epimerase (Gale), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158075304:158079806:1 gene:ENSRNOG00000009712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// BC097293 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-galactose-4-epimerase, mRNA (cDNA clone MGC:114277 IMAGE:7443707), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000017017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158059708:158079487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT043850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT043853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT043851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT043854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_013058 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of DNA binding 3 (Id3), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000035788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158263301:158264888:1 gene:ENSRNOG00000026124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// AF000942 // GenBank // Rattus norvegicus Id3a mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// BC064658 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of DNA binding 3, mRNA (cDNA clone MGC:72531 IMAGE:5623701), complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// D10864 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ID3 protein, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// FQ212997 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YE22 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158263360:158263834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 85 // 46 // 11 // 13 // 0 /// NONRATT043856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001015008 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription elongation factor A (SII), 3 (Tcea3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158368889:158402119:1 gene:ENSRNOG00000011794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC091180 // GenBank // Rattus norvegicus transcription elongation factor A (SII), 3, mRNA (cDNA clone MGC:108819 IMAGE:7325833), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000050046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158326041:158400909:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001106691 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 46 (Zfp46), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006239151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 46 (Zfp46), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158417871:158422371:1 gene:ENSRNOG00000049975 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158418127:158466557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT043860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_012852 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1D, G protein-coupled (Htr1d), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158566277:158567401:1 gene:ENSRNOG00000012038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158566277:158567401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000034353 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:158586476:158586917:1 gene:ENSRNOG00000022457 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
ENSRNOT00000050473 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:158634754:158635619:1 gene:ENSRNOG00000029467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050041 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158626874:158635619:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_030830 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine zipper protein 1 (Luzp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_354341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine zipper protein 1 (Luzp1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:158664309:158673014:1 gene:ENSRNOG00000022402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF181259 // GenBank // Rattus norvegicus putative transcription factor LUZP (Luzp) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158664423:158669134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006225581 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552669 (LOC102552669), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552669 (LOC102552669), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000029077 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:158741472:158745479:1 gene:ENSRNOG00000022257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065592 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:158741472:158745467:1 gene:ENSRNOG00000022257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:158745204:158745479:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT043871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_053402 // RefSeq // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 4 (Wnt4), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159405834:159424674:1 gene:ENSRNOG00000013166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF188608 // GenBank // Rattus norvegicus Wnt-4 (wnt-4) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC098752 // GenBank // Rattus norvegicus wingless-type MMTV integration site family, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:112773 IMAGE:7369699), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159405860:159424532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001109567 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690206 (LOC690206), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018127 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:159551158:159554136:1 gene:ENSRNOG00000013566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159549258:159554067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000039341 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:159568698:159638494:1 gene:ENSRNOG00000021437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055950 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:159630654:159668805:1 gene:ENSRNOG00000021437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000056099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159568698:159668805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 96 // 96 // 0 /// NONRATT043888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 29 // 106 // 1 /// NONRATT043881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 8 // 8 // 8 // 106 // 1
NM_198785 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 48 (Usp48), mRNA. // chr5 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000031855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159691521:159758705:1 gene:ENSRNOG00000013602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AB073880 // GenBank // Rattus norvegicus synUSP mRNA for synaptic ubiquitin-specific protease, complete cds. // chr5 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// XM_006254970 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48-like (LOC100911993), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1 /// GENSCAN00000046115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73086361:73144102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000056104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159691425:159707989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000009651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159712395:159832071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001100713 // RefSeq // Rattus norvegicus Rap1 GTPase-activating protein (Rap1gap), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap1 GTPase-activating protein (Rap1gap), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239195 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap1 GTPase-activating protein (Rap1gap), transcript variant X8, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// BC089979 // GenBank // Rattus norvegicus Rap1 GTPase-activating protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7317741), partial cds. // chr5 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000046802 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:159782996:159829864:1 gene:ENSRNOG00000013825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT043894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159712395:159832071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT043893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT043897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
GENSCAN00000009656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:159919766:159925058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
NM_053596 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelin converting enzyme 1 (Ece1), mRNA. // chr5 // 97 // 86 // 37 // 38 // 0 /// XM_006239276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endothelin converting enzyme 1 (Ece1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000067616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:159968569:160070310:1 gene:ENSRNOG00000014241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 91 // 39 // 40 // 0 /// BC072504 // GenBank // Rattus norvegicus endothelin converting enzyme 1, mRNA (cDNA clone MGC:91568 IMAGE:7099038), complete cds. // chr5 // 97 // 86 // 37 // 38 // 0 /// D29683 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for endothelin-converting enzyme, complete cds. // chr5 // 93 // 91 // 37 // 40 // 0 /// NONRATT043900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000009652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160017056:160150448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 36 // 44 // 1
NM_001106693 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4 gamma, 3 (Eif4g3), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160146094:160313421:1 gene:ENSRNOG00000014368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003548 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160212663:160313013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT043915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
GENSCAN00000009652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160017056:160150448:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT043910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_199108 // RefSeq // Rattus norvegicus heterochromatin protein 1, binding protein 3 (Hp1bp3), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019696 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:160336477:160358537:1 gene:ENSRNOG00000014445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC061837 // GenBank // Rattus norvegicus heterochromatin protein 1, binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:72624 IMAGE:5599940), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ217687 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA20YA03 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160336961:160374322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT043919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT043920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT043924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_001070433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 5 (Sh2d5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 5 (Sh2d5), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// XM_006239282 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 5 (Sh2d5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SH2 domain containing 5 (Sh2d5), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020069 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:160369031:160374322:1 gene:ENSRNOG00000014909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160336961:160374322:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
XM_006239287 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 17 (Kif17), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:160377365:160414628:1 gene:ENSRNOG00000014970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000055910 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:160377365:160402192:1 gene:ENSRNOG00000014970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 48 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000067117 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:160377365:160414473:1 gene:ENSRNOG00000014970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 77 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000003570 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160377365:160414628:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_001012104 // RefSeq // Rattus norvegicus dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferase (Ddost), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160417822:160424369:1 gene:ENSRNOG00000015079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC082075 // GenBank // Rattus norvegicus dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:95243 IMAGE:7133207), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ229122 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YC05 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ213865 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YC16 mRNA sequence. // chr5 // 64 // 47 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000003573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160417855:160424369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT043927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
ENSRNOT00000055904 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:160559204:160559988:1 gene:ENSRNOG00000037091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001106695 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial E3 ubiquitin protein ligase 1 (Mul1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160603417:160612730:1 gene:ENSRNOG00000016010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160603417:160627233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_173337 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium/calmodulin-dependent protein kinase II inhibitor 1 (Camk2n1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021864 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160625616:160627396:1 gene:ENSRNOG00000016322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF271156 // GenBank // Rattus norvegicus CaM-kinase II inhibitor alpha mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160603417:160627233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
ENSRNOT00000036895 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:160646597:160647080:1 gene:ENSRNOG00000027882 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000003564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160646597:160647080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
NM_019202 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IIC (Pla2g2c), mRNA. // chr5 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// XM_006239142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IIC (Pla2g2c), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 90 // 27 // 28 // 0 /// XM_006239144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IIC (Pla2g2c), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160907867:160927153:1 gene:ENSRNOG00000016647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC097325 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IIC, mRNA (cDNA clone MGC:114328 IMAGE:7456563), complete cds. // chr5 // 96 // 77 // 23 // 24 // 0 /// U07798 // GenBank // Rattus norvegicus 14 kDa phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160914087:160926289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT043933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_001013428 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IID (Pla2g2d), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase A2, group IID (Pla2g2d), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:160963984:160970152:1 gene:ENSRNOG00000016826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091221 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IID, mRNA (cDNA clone MGC:108956 IMAGE:7125035), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:160964020:160968725:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT043935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031598 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IIA (platelets, synovial fluid) (Pla2g2a), mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161024073:161026647:1 gene:ENSRNOG00000016945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// D00523 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase A2 precursor, complete cds. // chr5 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// FQ234749 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YM20 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// M25148 // GenBank // Rat phospholipase A2 gene, complete cds. // chr5 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// FQ220554 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YH09 mRNA sequence. // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161024906:161026382:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT043936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT043937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT043938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT043939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1
NM_001106696 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IIE (Pla2g2e), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161068641:161074026:1 gene:ENSRNOG00000017024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161070302:161073575:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001109592 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 186 (Rnf186), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161156805:161158029:1 gene:ENSRNOG00000017244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161156838:161209193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT043943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034949 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 4 (Tmco4), mRNA. // chr5 // 98 // 100 // 50 // 51 // 0 /// XM_006239262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 4 (Tmco4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000023431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161163107:161240392:1 gene:ENSRNOG00000017401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 51 // 51 // 0 /// BC099755 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 4, mRNA (cDNA clone MGC:124660 IMAGE:5623720), complete cds. // chr5 // 98 // 100 // 50 // 51 // 0 /// GENSCAN00000056792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161209608:161239772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 51 // 51 // 26 // 51 // 1 /// GENSCAN00000009398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161156838:161209193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 21 // 51 // 1 /// NONRATT043944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 13 // 51 // 1
NM_001005903 // RefSeq // Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, beta (Capzb), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, beta (Capzb), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, beta (Capzb), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161383344:161482714:1 gene:ENSRNOG00000007330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC083861 // GenBank // Rattus norvegicus capping protein (actin filament) muscle Z-line, beta, mRNA (cDNA clone MGC:95097 IMAGE:7126848), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ218507 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YL08 mRNA sequence. // chr5 // 89 // 82 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161470022:161481993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT043947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 88 // 29 // 33 // 1 /// NONRATT043946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1 /// GENSCAN00000056790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161412539:161458531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_134407 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 7, member A2 (aflatoxin aldehyde reductase) (Akr7a2), mRNA. // chr5 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161499565:161508610:1 gene:ENSRNOG00000017780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AB037424 // GenBank // Rattus norvegicus aiar mRNA for androgen-inducible aldehyde reductase, complete cds. // chr5 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// AF503514 // GenBank // Rattus norvegicus aldehyde reductase AFAR2 subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC061816 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 7, member A2 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:72311 IMAGE:5598724), complete cds. // chr5 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161499726:161508456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_013215 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase) (Akr7a3), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161540977:161553468:1 gene:ENSRNOG00000017899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF045464 // GenBank // Rattus norvegicus aflatoxin B1 aldehyde reductase (AFAR) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC078872 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:93546 IMAGE:7127297), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089811 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 7, member A3 (aflatoxin aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:108733 IMAGE:7126881), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161511545:161553257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT043952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT043953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001108690 // RefSeq // Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 1 (Emc1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000068168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161560620:161585938:1 gene:ENSRNOG00000018097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000056793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161560645:161582581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT043954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_001039026 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 4 (Ubr4), mRNA. // chr5 // 99 // 99 // 108 // 109 // 0 /// ENSRNOT00000039663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161587918:161695703:1 gene:ENSRNOG00000018183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 99 // 109 // 109 // 0 /// AY850927 // GenBank // Rattus norvegicus ZUBR1 mRNA, complete cds. // chr5 // 99 // 99 // 108 // 109 // 0 /// GENSCAN00000056798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161587949:161695491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 105 // 105 // 0 /// NONRATT043955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 110 // 110 // 0 /// NONRATT043956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 15 // 15 // 16 // 110 // 1 /// NONRATT043962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 16 // 16 // 18 // 110 // 1
GENSCAN00000001316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161756187:161777831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0
NM_001134703 // RefSeq // Rattus norvegicus intermediate filament family orphan 2 (Iffo2), mRNA. // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000025000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161829335:161853377:1 gene:ENSRNOG00000042920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000025090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161829335:161853377:1 gene:ENSRNOG00000042920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000066203 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:161806691:161867202:1 gene:ENSRNOG00000042920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NM_001134698 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 4 family, member A1 (Aldh4a1), mRNA. // chr5 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// GENSCAN00000001324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:161781339:161874412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY325227 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ba1-651 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT043967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
XM_006225651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of chromosome condensation 2 (Rcc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of chromosome condensation 2 (Rcc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008940 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:162927687:162941028:1 gene:ENSRNOG00000006327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000027877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:162927239:162941028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT043970 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 1
NM_017226 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidyl arginine deiminase, type II (Padi2), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010183 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163141202:163182415:1 gene:ENSRNOG00000007574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163100182:163181329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// NONRATT043977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_001100539 // RefSeq // Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex, subunit B, iron sulfur (Ip) (Sdhb), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163197045:163217312:1 gene:ENSRNOG00000007967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC158620 // GenBank // Rattus norvegicus succinate dehydrogenase complex, subunit B, iron sulfur (Ip), mRNA (cDNA clone MGC:187514 IMAGE:7446362), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000025081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163209385:163217213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT043980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT043984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001173432 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase type 13A2 (Atp13a2), mRNA. // chr5 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000010884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163224537:163243882:1 gene:ENSRNOG00000008052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC168672 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase type 13A2, mRNA (cDNA clone MGC:188455 IMAGE:7935928), complete cds. // chr5 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// FQ212004 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YO08 mRNA sequence. // chr5 // 94 // 97 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000025077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163217415:163251600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT043985 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT043989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001107989 // RefSeq // Rattus norvegicus microfibrillar-associated protein 2 (Mfap2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163246454:163252003:1 gene:ENSRNOG00000008257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163217415:163251600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031111 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S21 (Rps21), mRNA. // chr5 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// XM_006235823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein S21 (Rps21), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000008458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:181484785:181485814:-1 gene:ENSRNOG00000006325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000051693 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:163318971:163319321:1 gene:ENSRNOG00000033916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ223473 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA10YO12 mRNA sequence. // chr5 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// BC058464 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S21, mRNA (cDNA clone MGC:72789 IMAGE:6918340), complete cds. // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT038842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT038843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_001004447 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 21 (Spata21), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163325257:163350448:1 gene:ENSRNOG00000009058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB168097 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for spergen-3, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089089 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 21, mRNA (cDNA clone MGC:105642 IMAGE:7112067), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163319015:163350102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT043994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT043993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001108691 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 42 (Fbxo42), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163382899:163441506:1 gene:ENSRNOG00000014305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163387388:163441256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT043995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT043996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
GENSCAN00000025092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163444279:163456297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001108692 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000036739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163483734:163494854:1 gene:ENSRNOG00000023313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// XM_006239256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// XM_006239257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 19 (Arhgef19), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000067574 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:163477911:163482218:1 gene:ENSRNOG00000047967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT043999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000025075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163477911:163494185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_001108977 // RefSeq // Rattus norvegicus Eph receptor A2 (Epha2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000012328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163558779:163586206:1 gene:ENSRNOG00000009222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000025084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163558779:163606259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
XM_006225588 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 131, member C (Fam131c), partial mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006239326 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 131, member C (Fam131c), partial mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037202 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:163642831:163647134:1 gene:ENSRNOG00000023008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073605 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:163637351:163640896:1 gene:ENSRNOG00000048826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163624033:163647134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_031607 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein B7 (Hspb7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163688616:163692100:1 gene:ENSRNOG00000029079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169050 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein family, member 7 (cardiovascular), mRNA (cDNA clone MGC:189442 IMAGE:7103781), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163684920:163690912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT044009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001012105 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 17 (Zbtb17), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000014399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:163713685:163734604:1 gene:ENSRNOG00000010436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC083577 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 17, mRNA (cDNA clone MGC:93950 IMAGE:7113925), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:163713661:163734604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT044012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT044014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NONRATT044018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001048185 // RefSeq // Rattus norvegicus agmatine ureohydrolase (agmatinase) (Agmat), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164019284:164033407:1 gene:ENSRNOG00000012315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC105628 // GenBank // Rattus norvegicus agmatine ureohydrolase (agmatinase), mRNA (cDNA clone MGC:125053 IMAGE:7322772), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164019298:164034301:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT044021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_031632 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase 9, apoptosis-related cysteine peptidase (Casp9), mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:164067768:164085301:1 gene:ENSRNOG00000012944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AF262319 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-9 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AF271996 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-9 (RNCASP9) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AF286006 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-9 long isoform mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr5 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// AF308469 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-9 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 58 // 18 // 19 // 0 /// AF517560 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley caspase-9 dominant negative form mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// AY027667 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-9 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AY124461 // GenBank // Rattus norvegicus 25 kDa caspase-9 dominant negative protein mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 27 // 8 // 9 // 0 /// AY008275 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-9 CTD isoform mRNA, complete cds. // chr5 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000048522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:164067400:164084352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT044023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
ENSRNOT00000042123 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165623810:165625284:1 gene:ENSRNOG00000032459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000008014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165623810:165625284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT044026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001109617 // RefSeq // Rattus norvegicus preferentially expressed antigen in melanoma-like 1 (Pramel1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:165855489:165859100:1 gene:ENSRNOG00000027328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165855489:165857840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165822945:165849889:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001135782 // RefSeq // Rattus norvegicus PRAME family member 8 (Pramef8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:165877921:165891643:1 gene:ENSRNOG00000027278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165888998:165891531:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
XM_006225595 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oogenesin 1 (Oog1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// XM_006239344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oogenesin 1 (Oog1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000046115 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165937706:165943376:1 gene:ENSRNOG00000027142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:165937739:165943376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
NONRATT043103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000022975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:103040608:103051537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 94 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT043103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT043104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
XM_006225656 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 6 (Pramef6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034546 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:103137690:103139705:1 gene:ENSRNOG00000027197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000022958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:103137714:103210504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT043103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XR_346936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 25 (Pramef25), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_354399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 25 (Pramef25), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037478 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:166105486:166107948:-1 gene:ENSRNOG00000027000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002101 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166105486:166107693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001134522 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to arylacetamide deacetylase (RGD1308878), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:166197556:166207168:1 gene:ENSRNOG00000026782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166197615:166200261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000027835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166202491:166207049:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000021054 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:169975662:169977253:1 gene:ENSRNOG00000015706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169976873:169977319:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0
NM_001037199 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 3 (Dhrs3), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:166490225:166524733:1 gene:ENSRNOG00000015736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC089105 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7309627, with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC107450 // GenBank // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 3, mRNA (cDNA clone MGC:125166 IMAGE:7322355), complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// EF125189 // GenBank // Rattus norvegicus retinal dehydrogenase/reductase family member 3 mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166490968:166524306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT044036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT044037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
GENSCAN00000024308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:166802502:166802860:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0
XM_006225657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361514 (LOC100361514), mRNA. // chrU // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// XM_006239354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361514 (LOC100361514), mRNA. // chrU // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// XM_006239355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 845-like (LOC100909858), mRNA. // chrU // 100 // 41 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000027407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:167521142:167667327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 89 // 8 // 9 // 1
XR_346868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 845-like (LOC691257), misc_RNA. // chrU // 68 // 97 // 21 // 31 // 0 /// XR_346869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 53-like (LOC100362123), misc_RNA. // chrU // 57 // 94 // 17 // 30 // 0 /// XM_006225657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361514 (LOC100361514), mRNA. // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// XM_006239354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361514 (LOC100361514), mRNA. // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// XM_006239355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 845-like (LOC100909858), mRNA. // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// XR_346870 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase I isoform gamma-3-like (LOC691266), misc_RNA. // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// XR_346872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1565622 (RGD1565622), misc_RNA. // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT045908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 75 // 100 // 24 // 32 // 0 /// BC099078 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7442534. // chrU // 27 // 94 // 8 // 30 // 0 /// BC168232 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7442581. // chrU // 27 // 94 // 8 // 30 // 0 /// NONRATT045912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 43 // 94 // 13 // 30 // 0 /// FQ231232 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA76YF22 mRNA sequence. // chrU // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT045909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT045913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001135781 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2510039O18 (RGD1305350), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2510039O18 (RGD1305350), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000010558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168409903:168416143:1 gene:ENSRNOG00000007968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168410038:168429132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_031545 // RefSeq // Rattus norvegicus natriuretic peptide B (Nppb), mRNA. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168454331:168455633:1 gene:ENSRNOG00000008141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228997 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA4YM13 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M25297 // GenBank // Rattus norvegicus brain natriuretic peptide (BNP) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT044042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168454388:168455417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_012612 // RefSeq // Rattus norvegicus natriuretic peptide A (Nppa), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168466309:168467618:1 gene:ENSRNOG00000008176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158590 // GenBank // Rattus norvegicus natriuretic peptide precursor A, mRNA (cDNA clone MGC:187382 IMAGE:9036379), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M27498 // GenBank // Rattus norvegicus atrial naturiuretic factor (ANF) mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168466385:168467888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001074061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) (Mthfr), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006225614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) (Mthfr), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006225616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) (Mthfr), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) (Mthfr), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006239418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) (Mthfr), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_342975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate reductase (NAD(P)H) (Mthfr), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000011384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168504579:168518702:1 gene:ENSRNOG00000008553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// U57049 // GenBank // Rattus norvegicus methylenetetrahydrofolate reductase mRNA, partial cds. // chr5 // 74 // 54 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000010873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168504951:168518702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT044046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT044047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 51 // 51 // 18 // 35 // 1
NM_001012106 // RefSeq // Rattus norvegicus MAD2 mitotic arrest deficient-like 2 (yeast) (Mad2l2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006239390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAD2 mitotic arrest deficient-like 2 (yeast) (Mad2l2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239391 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MAD2 mitotic arrest deficient-like 2 (yeast) (Mad2l2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168609827:168614293:1 gene:ENSRNOG00000009134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000055658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168609827:168614293:1 gene:ENSRNOG00000009134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC087687 // GenBank // Rattus norvegicus MAD2 mitotic arrest deficient-like 2 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:105558 IMAGE:7307981), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168609896:168613987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_053511 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 2 (Fbxo2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 2 (Fbxo2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168630521:168635950:1 gene:ENSRNOG00000009409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF098301 // GenBank // Rattus norvegicus neural F box protein NFB42 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214021 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YE07 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168630588:168635605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019906 // RefSeq // Rattus norvegicus mechanistic target of rapamycin (serine/threonine kinase) (Mtor), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000014167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:168920401:169030568:1 gene:ENSRNOG00000009615 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// L37085 // GenBank // Rattus norvegicus rapamycin target mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 98 // 57 // 57 // 0 /// U11681 // GenBank // Rattus norvegicus rapamycin and FKBP12 target-1 protein (rRAFT1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0 /// GENSCAN00000040593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168923969:168964735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:168976317:169030441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 47 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 58 // 58 // 0
XM_003750088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exosome component 10 (Exosc10), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_003754116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exosome component 10 (Exosc10), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169031609:169054708:1 gene:ENSRNOG00000010719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169031609:169054708:1 gene:ENSRNOG00000010719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169031678:169048981:1 gene:ENSRNOG00000010719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000040604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169031609:169086458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT044057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT044058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_053464 // RefSeq // Rattus norvegicus spermidine synthase (Srm), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000014934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169061723:169064921:1 gene:ENSRNOG00000011078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000071712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19900147:19903299:1 gene:ENSRNOG00000046379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// AF337636 // GenBank // Rattus norvegicus spermidine synthase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC128733 // GenBank // Rattus norvegicus spermidine synthase, mRNA (cDNA clone MGC:156617 IMAGE:8366755), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000015900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19900209:19903026:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// GENSCAN00000040604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169031609:169086458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1 /// NONRATT044064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 73 // 73 // 11 // 15 // 1
NM_172043 // RefSeq // Rattus norvegicus mannan-binding lectin serine peptidase 2 (Masp2), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169071761:169086477:1 gene:ENSRNOG00000011258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC128700 // GenBank // Rattus norvegicus mannan-binding lectin serine peptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:156488 IMAGE:7324989), complete cds. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// Y18568 // GenBank // Rattus Norvegicus mRNA for MAp19 protein, partial clone prl-5. // chr5 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// XM_006239400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mannan-binding lectin serine peptidase 2 (Masp2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// Y18567 // GenBank // Rattus Norvegicus mRNA for MAp19 protein, partial, clone prl-4. // chr5 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000040604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169031609:169086458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006239425 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691354 (LOC691354), mRNA. // chr5 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000031978 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:169111338:169137980:1 gene:ENSRNOG00000023452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000040596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169121387:169174689:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT044068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
GENSCAN00000024832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169212106:169237923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000055621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169405556:169412027:1 gene:ENSRNOG00000013474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// XM_006225624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus castor zinc finger 1 (Casz1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// XM_006225625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus castor zinc finger 1 (Casz1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000018000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169401538:169425050:1 gene:ENSRNOG00000013474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 26 // 27 // 1 /// NONRATT044070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000024848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169380677:169428121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT044076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT044077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT044078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_006225624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus castor zinc finger 1 (Casz1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006225625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus castor zinc finger 1 (Casz1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000018000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169401538:169425050:1 gene:ENSRNOG00000013474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000024848 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169380677:169428121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_053679 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA fragmentation factor, alpha subunit (Dffa), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059522 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:169573104:169586002:1 gene:ENSRNOG00000013603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF136601 // GenBank // Rattus norvegicus caspase-activated deoxyribonuclease inhibitor short form (ICAD-S) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// BC100067 // GenBank // Rattus norvegicus DNA fragmentation factor, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:112608 IMAGE:7389030), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:169573172:169584674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001013241 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing (Lzic), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000021822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170076691:170088575:1 gene:ENSRNOG00000016200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC087098 // GenBank // Rattus norvegicus leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:94660 IMAGE:7191966), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000041102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170071251:170111576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONRATT044088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
ENSRNOT00000055562 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170131839:170159318:1 gene:ENSRNOG00000016313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// BC098773 // GenBank // Rattus norvegicus catenin, beta-interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7373895), complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NM_001173388 // RefSeq // Rattus norvegicus catenin, beta-interacting protein 1 (Ctnnbip1), mRNA. // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT044089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// NONRATT044091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000041099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170130243:170181071:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1
NM_001007092 // RefSeq // Rattus norvegicus calsyntenin 1 (Clstn1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000045063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170179472:170247833:1 gene:ENSRNOG00000016398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170210682:170246486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT044096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 19 // 40 // 1
NR_031850 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 34a (Mir34a), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053746 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:170733242:170733343:1 gene:ENSRNOG00000035623 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-34a // miRBase Micro RNA Database // MI0000877 Rattus norvegicus miR-34a stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012107 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 157 (Gpr157), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055536 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170750442:170766069:1 gene:ENSRNOG00000017528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC090013 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 157, mRNA (cDNA clone MGC:109533 IMAGE:7324631), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170750679:170840417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_031741 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose/fructose transporter), member 5 (Slc2a5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000024054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170782871:170808467:1 gene:ENSRNOG00000017693 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC076378 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose/fructose transporter), member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7107876), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC161843 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose/fructose transporter), member 5, mRNA (cDNA clone MGC:187361 IMAGE:7127817), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// D13871 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for glut 5 protein, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L05195 // GenBank // Rattus norvegicus fructose transporter mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT044106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170750679:170840417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT044108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_006225659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 7 (LOC100362644), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006239507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 7 (LOC100362644), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000055520 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:170826805:170839326:1 gene:ENSRNOG00000036951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:170750679:170840417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
NM_053885 // RefSeq // Rattus norvegicus arginine-glutamic acid dipeptide (RE) repeats (Rere), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:170960573:171292512:1 gene:ENSRNOG00000017940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U44091 // GenBank // Rattus norvegicus atrophin-1 related protein (rARP) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006239441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arginine-glutamic acid dipeptide (RE) repeats (Rere), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// GENSCAN00000047860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:171192722:171290108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT044118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:171084497:171187239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001014071 // RefSeq // Rattus norvegicus ERBB receptor feedback inhibitor 1 (Errfi1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083845 // GenBank // Rattus norvegicus ERBB receptor feedback inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:95004 IMAGE:7121187), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:171529356:171541439:1 gene:ENSRNOG00000049653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000047871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:171539011:171541264:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025773 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9 (Tnfrsf9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000055506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:171587145:171613565:1 gene:ENSRNOG00000036942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB164643 // GenBank // Rattus norvegicus 4-1BB mRNA for 4-1BB homolog, complete cds. // chr5 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// BC097483 // GenBank // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:114552 IMAGE:7459228), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_019160 // RefSeq // Rattus norvegicus urotensin 2 (Uts2), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:171655843:171661230:1 gene:ENSRNOG00000018393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF172174 // GenBank // Rattus norvegicus urotensin II precursor, mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:171638575:171666250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
ENSRNOT00000072407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:138003285:138004567:-1 gene:ENSRNOG00000051005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072776 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14596908:14598190:1 gene:ENSRNOG00000048504 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072845 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:9184976:9186258:1 gene:ENSRNOG00000046314 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54940686:54941968:-1 gene:ENSRNOG00000047509 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59271854:59273136:1 gene:ENSRNOG00000048192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:172047210:172048492:1 gene:ENSRNOG00000050867 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165832069:165833351:-1 gene:ENSRNOG00000050976 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// U15425 // GenBank // Rattus norvegicus membrane- and microfilament-associated protein p58 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000043314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172591832:172602078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_001108694 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 11 (Dnajc11), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172668492:172712646:1 gene:ENSRNOG00000008802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC161936 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 11, mRNA (cDNA clone MGC:187720 IMAGE:9022755), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ219957 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YL16 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032507 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172688848:172713065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001107996 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 21 (Klhl21), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172740028:172748683:1 gene:ENSRNOG00000003334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172734252:172746647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000013535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172771378:172789897:1 gene:ENSRNOG00000010109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC098821 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar protein 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377815), partial cds. // chr5 // 100 // 44 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172771378:172808108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_201272 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 5 (Plekhg5), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000064841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172803041:172846760:1 gene:ENSRNOG00000022694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// AY499658 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal RhoA GEF protein (Tech) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000032536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172827834:172851320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT044139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_001137644 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25 (Tnfrsf25), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000055466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172847322:172851588:1 gene:ENSRNOG00000021814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000032536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172827834:172851320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// NONRATT044141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT044143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_019236 // RefSeq // Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 2 (Hes2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 2 (Hes2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000014035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:172892611:172893656:1 gene:ENSRNOG00000010490 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D14029 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for HES-2, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:172886788:172913721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT044144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034855 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 153 (Gpr153), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173005832:173016052:1 gene:ENSRNOG00000010718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:173010773:173015453:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT044149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133310 // RefSeq // Rattus norvegicus isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (Icmt), mRNA. // chr5 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173028513:173035369:1 gene:ENSRNOG00000010953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// BC083923 // GenBank // Rattus norvegicus isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase, mRNA (cDNA clone IMAGE:7135269). // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032552 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:173028666:173037641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 63 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT044151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NONRATT044153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271226 // RefSeq // Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 5 (Chd5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000024732 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173072897:173118930:1 gene:ENSRNOG00000011268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000067364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173113679:173119043:1 gene:ENSRNOG00000011268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000067892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173072897:173118930:1 gene:ENSRNOG00000011268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000032506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:173072897:173122209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001047958 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00162 (LOC500594), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000031564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173186077:173190906:1 gene:ENSRNOG00000023112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001037650 // RefSeq // Rattus norvegicus nephronophthisis 4 (Nphp4), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nephronophthisis 4 (Nphp4), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nephronophthisis 4 (Nphp4), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000066623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:173212951:173298420:1 gene:ENSRNOG00000011967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC107905 // GenBank // Rattus norvegicus nephronophthisis 4 (juvenile) homolog (human), mRNA (cDNA clone IMAGE:7455102), complete cds. // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000028988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:173219360:173298010:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT044169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
ENSRNOT00000032859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174734521:174738965:1 gene:ENSRNOG00000025034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087640 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA A430005L14, mRNA (cDNA clone MGC:105699 IMAGE:7308844), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT044171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT044172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:174699581:174738577:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT044173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_145082 // RefSeq // Rattus norvegicus glycine-, glutamate-, thienylcyclohexylpiperidine-binding protein (LOC246295), mRNA. // chr5 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000031138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174757446:174786094:1 gene:ENSRNOG00000025000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// U53513 // GenBank // Rattus norvegicus glycine-, glutamate-, thienylcyclohexylpiperidine-binding protein mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 63 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:174759458:174784520:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT044176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 54 // 54 // 26 // 48 // 1 /// NONRATT044174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT044175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 23 // 48 // 1 /// NONRATT044178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT044177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_001135666 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 47 (Lrrc47), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174789385:174799217:1 gene:ENSRNOG00000024796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054889 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:174789385:174798067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT044179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022955 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple EGF-like-domains 6 (Megf6), mRNA. // chr5 // 99 // 99 // 143 // 144 // 0 /// ENSRNOT00000000169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174960465:175048912:1 gene:ENSRNOG00000000156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 99 // 144 // 144 // 0 /// AB011532 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MEGF6, complete cds. // chr5 // 99 // 99 // 143 // 144 // 0 /// GENSCAN00000054885 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:174999967:175092237:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 134 // 134 // 0 /// ENSRNOT00000055386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:175084094:175092801:1 gene:ENSRNOG00000050618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 48 // 145 // 1
NM_001014262 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat containing, antisense to TP73 (Wrap73), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000019873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:174926481:174935895:1 gene:ENSRNOG00000014805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC082062 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 8, mRNA (cDNA clone MGC:95221 IMAGE:7132552), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ234352 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YE14 mRNA sequence. // chr5 // 77 // 68 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000054888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:174923505:174935763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT044182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_001077214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 34 (Ttc34), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// XM_006225660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550274 (LOC102550274), mRNA. // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// XM_006239619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550274 (LOC102550274), mRNA. // chr5 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// XM_345615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 34 (Ttc34), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000037211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175715172:175724866:1 gene:ENSRNOG00000024526 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// XM_006225633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 34 (Ttc34), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// XM_006239605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 34 (Ttc34), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000023777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175685201:175724866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107997 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane metallo-endopeptidase-like 1 (Mmel1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006239567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane metallo-endopeptidase-like 1 (Mmel1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175729188:175759867:1 gene:ENSRNOG00000012593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175729188:175759867:1 gene:ENSRNOG00000012593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064738 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175729188:175759867:1 gene:ENSRNOG00000012593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC161870 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7111555, containing frame-shift errors. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC129124 // GenBank HTC // Rattus norvegicus membrane metallo-endopeptidase-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7132040), with apparent retained intron. // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000023761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175727182:175759649:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_024383 // RefSeq // Rattus norvegicus hes family bHLH transcription factor 5 (Hes5), mRNA. // chr5 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175820392:175821159:1 gene:ENSRNOG00000013850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// D12516 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for HES-5, complete cds. // chr5 // 88 // 86 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175820444:175821120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_133531 // RefSeq // Rattus norvegicus pantothenate kinase 4 (Pank4), mRNA. // chr5 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000019028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175823559:175840289:1 gene:ENSRNOG00000014044 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// AF399873 // GenBank // Rattus norvegicus FANG1 (Fang1) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// FQ223969 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA81YG20 mRNA sequence. // chr5 // 97 // 93 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000023758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175823568:175840134:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT044196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT044199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// NONRATT044200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 66 // 66 // 27 // 41 // 1 /// NONRATT044201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1
NM_001109405 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 10 (Pex10), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175925857:175931023:1 gene:ENSRNOG00000024012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175925948:175930390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT044202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_001005544 // RefSeq // Rattus norvegicus MORN repeat containing 1 (Morn1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:175945054:176002862:1 gene:ENSRNOG00000014642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC082091 // GenBank // Rattus norvegicus MORN repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:95274 IMAGE:7134071), complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT044203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:175944708:175973013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT044205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001108698 // RefSeq // Rattus norvegicus LOC362678 (RGD1308923), mRNA. // chrU // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LOC362678 (RGD1308923), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000055361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176107841:176114290:1 gene:ENSRNOG00000036876 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
XM_006225634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hCG1647286-like (LOC100362748), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// XM_006239607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hCG1647286-like (LOC100362748), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000050630 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:176295749:176324539:1 gene:ENSRNOG00000023627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000068525 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:176283341:176325863:1 gene:ENSRNOG00000023627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 51 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000023730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176283341:176342477:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0
XM_002726665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 52 (Tmem52), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_002729579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 52 (Tmem52), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 52 (Tmem52), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006239606 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 52 (Tmem52), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176345520:176346915:1 gene:ENSRNOG00000016618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176345520:176346915:1 gene:ENSRNOG00000016618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176345520:176346921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001109678 // RefSeq // Rattus norvegicus NAD kinase (Nadk), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NAD kinase (Nadk), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176461415:176490616:1 gene:ENSRNOG00000016936 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC090019 // GenBank // Rattus norvegicus NAD kinase, mRNA (cDNA clone MGC:109551 IMAGE:7325365), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023732 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176482701:176489098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001107998 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member E2B (Slc35e2b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006239572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35, member E2B (Slc35e2b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006239573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 35, member E2B (Slc35e2b), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176499465:176521324:1 gene:ENSRNOG00000017075 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000023727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176494197:176553620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0
NM_145766 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 11B (Cdk11b), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// XM_006239529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 11B (Cdk11b), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// XM_006239532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 11B (Cdk11b), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1 /// GENSCAN00000023727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176494197:176553620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0
XM_001058198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680656 (LOC680656), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065877 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:176614966:176615643:1 gene:ENSRNOG00000042062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176614966:176615643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001025657 // RefSeq // Rattus norvegicus SSU72 RNA polymerase II CTD phosphatase homolog (S. cerevisiae) (Ssu72), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176628574:176658329:1 gene:ENSRNOG00000017829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099142 // GenBank // Rattus norvegicus SSU72 RNA polymerase II CTD phosphatase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116291 IMAGE:7300601), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176649785:176658139:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XR_346933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547290 (LOC102547290), ncRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_354484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547290 (LOC102547290), ncRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109428 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L20 (Mrpl20), mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000025213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176723859:176728389:1 gene:ENSRNOG00000018647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC166541 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L20, mRNA (cDNA clone MGC:188136 IMAGE:7192827), complete cds. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000032209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176723987:176728208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001013094 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin L2 (Ccnl2), mRNA. // chr5 // 96 // 64 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176732433:176743690:1 gene:ENSRNOG00000018691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 82 // 31 // 32 // 0 /// BC088316 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin L2, mRNA (cDNA clone MGC:109544 IMAGE:7325177), complete cds. // chr5 // 96 // 64 // 24 // 25 // 0 /// FQ211043 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA18YH03 mRNA sequence. // chr5 // 87 // 100 // 34 // 39 // 0 /// XM_006239544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin L2 (Ccnl2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 31 // 39 // 1 /// GENSCAN00000032199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176732450:176751705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 72 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT044243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT044240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 26 // 39 // 1 /// NONRATT044241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 62 // 62 // 24 // 39 // 1 /// NONRATT044244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 17 // 39 // 1 /// NONRATT044245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT044246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT044247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001004237 // RefSeq // Rattus norvegicus aurora kinase A interacting protein 1 (Aurkaip1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176750389:176751784:1 gene:ENSRNOG00000019156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079171 // GenBank // Rattus norvegicus aurora kinase A interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94202 IMAGE:7129954), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ215450 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YD08 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT044249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176732450:176751705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT044248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001007002 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix-remodelling associated 8 (Mxra8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006239574 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus matrix-remodelling associated 8 (Mxra8), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176764184:176768533:1 gene:ENSRNOG00000019244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC083849 // GenBank // Rattus norvegicus matrix-remodelling associated 8, mRNA (cDNA clone MGC:95024 IMAGE:7122386), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000032233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176764215:176767614:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_031820 // RefSeq // Rattus norvegicus dishevelled segment polarity protein 1 (Dvl1), mRNA. // chr5 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// XM_006239600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dishevelled segment polarity protein 1 (Dvl1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176771886:176783561:1 gene:ENSRNOG00000019423 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF143545 // GenBank // Rattus norvegicus strain WKY dishevelled-1 (dvl-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// AF143546 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHRSP dishevelled-1 (dv1-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// BC062070 // GenBank // Rattus norvegicus dishevelled, dsh homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone IMAGE:5599217). // chr5 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// BC090034 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7367216, with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// BC160920 // GenBank // Rattus norvegicus dishevelled, dsh homolog 1 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188669 IMAGE:7461890), complete cds. // chr5 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176771887:176782695:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT044259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001033892 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 3-like (Cpsf3l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006239552 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 3-like (Cpsf3l), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006239553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 3-like (Cpsf3l), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176794095:176812548:1 gene:ENSRNOG00000019712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC089825 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7320892, with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC105303 // GenBank // Rattus norvegicus cleavage and polyadenylation specific factor 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:124975 IMAGE:7110348), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000032223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176793817:176812452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT044265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT044264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT044266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001107999 // RefSeq // Rattus norvegicus ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 3 (Acap3), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239578 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with coiled-coil, ankyrin repeat and PH domains 3 (Acap3), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176815678:176830373:1 gene:ENSRNOG00000022307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176819520:176862367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007655 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2, J2 (Ube2j2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_006239555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2, J2 (Ube2j2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006239556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2, J2 (Ube2j2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000026752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176848287:176862700:1 gene:ENSRNOG00000019749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// BC079115 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2, J2, mRNA (cDNA clone MGC:94113 IMAGE:7126201), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// FQ215240 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YP23 mRNA sequence. // chr5 // 59 // 92 // 13 // 22 // 0 /// NONRATT044272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT044278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000032228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176819520:176862367:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1 /// NONRATT044273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// NONRATT044274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// NONRATT044275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1 /// NONRATT044276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001108000 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 132, member A (Fam132a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176866521:176870896:1 gene:ENSRNOG00000019864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176866783:176897487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_130412 // RefSeq // Rattus norvegicus stromal cell derived factor 4 (Sdf4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176901518:176918493:1 gene:ENSRNOG00000019981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF405545 // GenBank // Rattus norvegicus calcium binding protein Cab45 mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 75 // 22 // 24 // 0 /// BC086996 // GenBank // Rattus norvegicus stromal cell derived factor 4, mRNA (cDNA clone MGC:93237 IMAGE:7192272), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ218523 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YJ12 mRNA sequence. // chr5 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// FQ219323 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YB11 mRNA sequence. // chr5 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// FQ231393 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YK14 mRNA sequence. // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000032202 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176905008:176918242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT044281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT044282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT044284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT044285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_013049 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 4 (Tnfrsf4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176921804:176924494:1 gene:ENSRNOG00000020106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176921818:176924307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024349 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 18 (Tnfrsf18), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// XM_006239596 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor receptor superfamily, member 18 (Tnfrsf18), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:176934649:176937246:1 gene:ENSRNOG00000022012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC088265 // GenBank // Rattus norvegicus similar to tumor necrosis factor receptor superfamily, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:109095 IMAGE:7377562), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176934704:176936963:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT044289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 35 // 11 // 11 // 0
XM_006239579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9430015G10 (RGD1311517), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9430015G10 (RGD1311517), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006239583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9430015G10 (RGD1311517), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177016247:177033648:1 gene:ENSRNOG00000020199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083613 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 9430015G10, mRNA (cDNA clone MGC:94382 IMAGE:7133773), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// GENSCAN00000032203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176998302:177040246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT044292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_003750095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 223 (Rnf223), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// XM_003754122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 223 (Rnf223), mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000055314 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:177039402:177040246:1 gene:ENSRNOG00000036856 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:176998302:177040246:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0
NM_001108001 // RefSeq // Rattus norvegicus PPARGC1 and ESRR induced regulator, muscle 1 (Perm1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177114820:177120113:1 gene:ENSRNOG00000020244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033897 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae) (Noc2l), mRNA. // chr5 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// XM_006239584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae) (Noc2l), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000066561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:177134961:177146499:1 gene:ENSRNOG00000021392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC101911 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar complex associated 2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:124822 IMAGE:7934070), complete cds. // chr5 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000032214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:177134981:177146410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT044302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT044303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001134963 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 1 (Crispld1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:665941:706220:-1 gene:ENSRNOG00000017773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC169118 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189557 IMAGE:9029822), complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:620446:704561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001106917 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidase inhibitor 15 (Pi15), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023899 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:786324:814420:-1 gene:ENSRNOG00000017686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107897 // RefSeq // Rattus norvegicus ganglioside-induced differentiation-associated-protein 1 (Gdap1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:1323590:1342573:-1 gene:ENSRNOG00000005850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:1315168:1342482:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001024279 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 96 (Ly96), mRNA. // chr5 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// XM_006225164 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 96 (Ly96), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000062050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:1968030:1984825:-1 gene:ENSRNOG00000040315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AY963291 // GenBank // Rattus norvegicus MD2 mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 90 // 26 // 28 // 0 /// FQ234779 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YL02 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000074965 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:2183756:2184165:1 gene:ENSRNOG00000047857 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000025685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:2183756:2184165:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_181478 // RefSeq // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 10 (all-trans) (Rdh10), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009096 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:2593904:2620243:-1 gene:ENSRNOG00000006681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY178865 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase 10 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:2593925:2613394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001013928 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S8-like (LOC297756), mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000009490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:2789994:2794284:-1 gene:ENSRNOG00000007238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:2789994:2799675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT044318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001012464 // RefSeq // Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor (NIMA-interacting) 1 (Terf1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006237729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor (NIMA-interacting) 1 (Terf1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049741 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:2843154:2872363:-1 gene:ENSRNOG00000007291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC089888 // GenBank // Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor (NIMA-interacting) 1, mRNA (cDNA clone MGC:109063 IMAGE:7374057), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020819 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:2850964:2872363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT044321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_054000 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 2 (Kcnb2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 2 (Kcnb2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage gated channel, Shab-related subfamily, member 2 (Kcnb2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000045460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:2969360:2971917:-1 gene:ENSRNOG00000028991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// M77482 // GenBank // Rat potassium channel (Kv2.2; CDRK) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:2963148:2988517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT044326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000009926 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:4186433:4186832:-1 gene:ENSRNOG00000007554 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:4186554:4195820:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_001012229 // RefSeq // Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 9 (Xkr9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 9 (Xkr9), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006237734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 9 (Xkr9), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006237735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus XK, Kell blood group complex subunit-related family, member 9 (Xkr9), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000062006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:4914571:4943947:-1 gene:ENSRNOG00000040289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY534263 // GenBank // Rattus norvegicus XK-related protein 9 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_134378 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfatase 1 (Sulf1), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// XM_006237740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfatase 1 (Sulf1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000012610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:10836868:10919822:-1 gene:ENSRNOG00000009037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// AF230072 // GenBank // Rattus norvegicus sulfatase FP mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 43 // 46 // 0 /// XM_006237741 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfatase 1 (Sulf1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 87 // 87 // 40 // 46 // 1 /// GENSCAN00000031846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:10847354:10863101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT044334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 61 // 61 // 28 // 46 // 1 /// GENSCAN00000031850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:10869888:10919822:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 37 // 37 // 17 // 46 // 1
ENSRNOT00000032209 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:11048847:11049607:-1 gene:ENSRNOG00000021774 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000039302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:11048847:11049544:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001109259 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1564053), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:11756424:12289040:-1 gene:ENSRNOG00000005375 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004334 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:12053708:12306931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:11793563:11955675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001107899 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchange factor 2 (Prex2), mRNA. // chr5 // 97 // 79 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:12451146:12694003:-1 gene:ENSRNOG00000005391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054058 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:12496749:12638165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000054064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:12646255:12698849:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001191864 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006237773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X15, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XR_353817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X21, misc_RNA. // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000008480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13569515:13672474:-1 gene:ENSRNOG00000021718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000000512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13570135:13663517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT044347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT044349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1
NM_001191864 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X15, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_353817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X21, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13569515:13672474:-1 gene:ENSRNOG00000021718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13570135:13663517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT044348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191864 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X15, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_353817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X21, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13569515:13672474:-1 gene:ENSRNOG00000021718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13570135:13663517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191864 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006237773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X15, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XR_353817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X21, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000008480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13569515:13672474:-1 gene:ENSRNOG00000021718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13570135:13663517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT044348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_006237773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X15, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_353817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X21, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001191864 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr5 // 25 // 100 // 8 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13569515:13672474:-1 gene:ENSRNOG00000021718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 25 // 100 // 8 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13570135:13663517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001191864 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X15, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_353817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosome and spindle pole associated protein 1 (Cspp1), transcript variant X21, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13569515:13672474:-1 gene:ENSRNOG00000021718 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// FQ233235 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YK13 mRNA sequence. // chr5 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000000512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13570135:13663517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
FQ233235 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YK13 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001024340 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance domain containing 2 (Mcmdc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance domain containing 2 (Mcmdc2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:13787106:13839762:-1 gene:ENSRNOG00000021702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237787 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance domain containing 2 (Mcmdc2), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000000519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:13788193:13836972:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000054593 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:5:13812161:13812249:-1 gene:ENSRNOG00000036485 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT044356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0
NM_001109260 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110035E14 (RGD1561849), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000039237 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:14155561:14181247:-1 gene:ENSRNOG00000021663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:14157832:14172825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001025423 // RefSeq // Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase, iron containing, 1 (Adhfe1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:14202076:14228623:-1 gene:ENSRNOG00000007069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097945 // GenBank // Rattus norvegicus alcohol dehydrogenase, iron containing, 1, mRNA (cDNA clone MGC:116068 IMAGE:7323001), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:14202378:14226904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT044360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT044363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT044364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT044365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001079699 // RefSeq // Rattus norvegicus RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae) (Rrs1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000009482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:14230035:14231132:-1 gene:ENSRNOG00000007240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// BC128746 // GenBank // Rattus norvegicus RRS1 ribosome biogenesis regulator homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156696 IMAGE:7098944), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000048942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:14230035:14231132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT044366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001257345 // RefSeq // Rattus norvegicus protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 1 (Pcmtd1), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:16914995:16951164:-1 gene:ENSRNOG00000005730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000004994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:16914995:16951164:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT044372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
GENSCAN00000030023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:16982523:17084786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_153310 // RefSeq // Rattus norvegicus suppression of tumorigenicity 18 (St18), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000059625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:17213494:17337689:-1 gene:ENSRNOG00000006200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// AF031942 // GenBank // Rattus norvegicus neural zinc finger factor 3 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 82 // 35 // 36 // 0 /// U67080 // GenBank // Rattus norvegicus C2-HC type zinc finger protein r-MyT13 mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000030032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:17210174:17301226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
XM_006225181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM150A-like (LOC100910984), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM150A-like (LOC100910984), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073694 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:17668934:17697947:-1 gene:ENSRNOG00000048703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:17653289:17697947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0
NM_001107901 // RefSeq // Rattus norvegicus RB1-inducible coiled-coil 1 (Rb1cc1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000061884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:17805493:17868916:-1 gene:ENSRNOG00000006833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000032337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:17807529:17897575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NONRATT044379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107901 // RefSeq // Rattus norvegicus RB1-inducible coiled-coil 1 (Rb1cc1), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:17805493:17868916:-1 gene:ENSRNOG00000006833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT044379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:17807529:17897575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_017167 // RefSeq // Rattus norvegicus opioid receptor, kappa 1 (Oprk1), mRNA. // chr5 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000010254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:18516575:18534375:-1 gene:ENSRNOG00000007647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// D16534 // GenBank // Rattus norvegicus ROR-D mRNA for opioid receptor, complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// D16829 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for kappa opioid receptor, complete cds. // chr5 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// L22001 // GenBank // Rat kappa opioid receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// L22536 // GenBank // Rattus norvegicus kappa opioid receptor (KOR-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 76 // 20 // 22 // 0 /// U00442 // GenBank // Rattus norvegicus kappa1 opioid receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:18519908:18622053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001013929 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H (Atp6v1h), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H (Atp6v1h), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19044666:19149940:-1 gene:ENSRNOG00000030862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC083669 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit H, mRNA (cDNA clone MGC:94513 IMAGE:7135583), complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ212744 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YJ20 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:19044835:19137098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT044384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT044387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_013006 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophospholipase I (Lypla1), mRNA. // chr5 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000011312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:19341836:19370923:-1 gene:ENSRNOG00000008320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC085750 // GenBank // Rattus norvegicus lysophospholipase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93566 IMAGE:7190638), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// D63885 // GenBank // Rattus norvegicus liver mRNA for lysophospholipase, complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 19 // 20 // 0 /// U97146 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-independent phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// XM_006237799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysophospholipase I (Lypla1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1 /// XM_006237800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysophospholipase I (Lypla1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 65 // 65 // 13 // 20 // 1 /// NONRATT044396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 70 // 70 // 14 // 20 // 1
NM_001107903 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 68 (Tmem68), mRNA. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// XM_006237828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 68 (Tmem68), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 68 (Tmem68), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XR_353843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 68 (Tmem68), transcript variant X7, misc_RNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012215 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21163802:21194571:-1 gene:ENSRNOG00000008872 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:21165233:21188876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT044404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_020102 // RefSeq // Rattus norvegicus Moloney sarcoma oncogene (Mos), mRNA. // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// X52952 // GenBank // Rat mRNA for c-mos. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT044414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
XM_002726488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L19-like (LOC100364265), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_003749891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal protein L19-like (LOC100364265), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000072844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21544713:21560336:-1 gene:ENSRNOG00000012088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:21544713:21559239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0 /// AY539877 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00126 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001008316 // RefSeq // Rattus norvegicus pleiomorphic adenoma gene 1 (Plag1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006237824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleiomorphic adenoma gene 1 (Plag1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000011721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21569212:21577465:-1 gene:ENSRNOG00000008846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085871 // GenBank // Rattus norvegicus pleiomorphic adenoma gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:94626 IMAGE:7191202), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:21570661:21572674:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT044417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106634 // RefSeq // Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 5 (Sdr16c5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 5 (Sdr16c5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011813 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21681674:21703750:-1 gene:ENSRNOG00000008871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:21681923:21703531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001109356 // RefSeq // Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 16C, member 6 (Sdr16c6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21748772:21770996:-1 gene:ENSRNOG00000040151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:21744841:21824086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT044419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_017139 // RefSeq // Rattus norvegicus proenkephalin (Penk), mRNA. // chr5 // 92 // 86 // 23 // 25 // 0 /// BC083563 // GenBank // Rattus norvegicus proenkephalin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93514 IMAGE:7112833), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:21834414:21839739:-1 gene:ENSRNOG00000008943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// FQ213928 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YM01 mRNA sequence. // chr5 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// M28263 // GenBank // Rat enkephalin mRNA, complete cds. // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000006668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:21834728:21839030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054592 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:5:21837686:21837763:-1 gene:ENSRNOG00000036484 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT044420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT044421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 6 // 6 // 0
XM_001069820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase type IVA 2-like (RGD1563405), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_232654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase type IVA 2-like (RGD1563405), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011900 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:22178063:22178578:-1 gene:ENSRNOG00000009002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:22178063:22178578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008772 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol monophosphatase domain containing 1 (Impad1), mRNA. // chr5 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000033151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:22416519:22446253:-1 gene:ENSRNOG00000027079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91854047:91880941:-1 gene:ENSRNOG00000046647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073534 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:91850971:91880941:-1 gene:ENSRNOG00000046647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY321340 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-190 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:22424699:22446262:-1 gene:ENSRNOG00000027079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000035724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:17:91844425:91880714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000040126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:22344075:22446253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001170327 // RefSeq // Rattus norvegicus Son DNA binding protein (Son), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:35415351:35446496:1 gene:ENSRNOG00000002021 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:23234968:23263793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000023600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:35415404:35445602:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT012899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT012900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT012901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT012902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_012942 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 7, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp7a1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:24143589:24153286:-1 gene:ENSRNOG00000009488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J05430 // GenBank // Rat cholesterol 7-alpha-hydroxylase (CYP7) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J05460 // GenBank // Rat cholesterol 7-alpha-hydroxylase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J05509 // GenBank // Rat cytochrome P450 cholesterol 7-alpha-hydroxylase (P450 VII) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24145587:24156069:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT044425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_181389 // RefSeq // Rattus norvegicus neutral sphingomyelinase (N-SMase) activation associated factor (Nsmaf), mRNA. // chr5 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:24284202:24330127:-1 gene:ENSRNOG00000010234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY163240 // GenBank // Rattus norvegicus neutral sphingomyelinase activation associated factor (Nsmaf) mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT044426 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24284217:24331672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001108654 // RefSeq // Rattus norvegicus thymocyte selection-associated high mobility group box (Tox), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:24669152:24965951:-1 gene:ENSRNOG00000010777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:24626134:24727485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT044428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001009662 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 8 (Car8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:26010376:26106856:-1 gene:ENSRNOG00000005669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087586 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 8, mRNA (cDNA clone MGC:105764 IMAGE:7318288), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000025997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:26039131:26070167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:26083937:26198607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_006225185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartate-beta-hydroxylase (Asph), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// XM_006225187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartate-beta-hydroxylase (Asph), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// XM_006237850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartate-beta-hydroxylase (Asph), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// XM_006237852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartate-beta-hydroxylase (Asph), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// XM_006237856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aspartate-beta-hydroxylase (Asph), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000024611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:27314017:27394022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT044440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT044442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
ENSRNOT00000075018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:17:45475734:45475986:-1 gene:ENSRNOG00000046746 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr17 // 89 // 72 // 16 // 18 // 0 /// AY936210 // GenBank // Rattus norvegicus pro-histogranin mRNA, complete cds. // chr17 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108655 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 2 (Plekhf2), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:28967292:28982656:-1 gene:ENSRNOG00000026662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161902 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family F (with FYVE domain) member 2, mRNA (cDNA clone MGC:187622 IMAGE:8367141), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001276441 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6 (Ndufaf6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006237867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6 (Ndufaf6), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29024405:29048252:-1 gene:ENSRNOG00000040040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ215404 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YF19 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ217575 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA23YD16 mRNA sequence. // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000028650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29025711:29045202:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT044449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT044448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XR_346387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrator complex subunit 8 (Ints8), misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010789 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29171674:29219259:-1 gene:ENSRNOG00000008124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29171674:29357015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT044451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001072543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 4 (C. elegans) (Dpy19l4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_216331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dpy-19-like 4 (C. elegans) (Dpy19l4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000037869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29230401:29280664:-1 gene:ENSRNOG00000025416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000041286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29230401:29280664:-1 gene:ENSRNOG00000025416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000028635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29171674:29357015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// NONRATT044459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001127564 // RefSeq // Rattus norvegicus epithelial splicing regulatory protein 1 (Esrp1), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29309314:29357287:-1 gene:ENSRNOG00000008184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29303696:29357287:-1 gene:ENSRNOG00000008184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000028635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29171674:29357015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1 /// NONRATT044462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT044463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT044465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001107915 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to mKIAA1429 protein (RGD1559904), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000061385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:29771165:29841000:1 gene:ENSRNOG00000014664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000017867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29811385:29876851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 53 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT042642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT042643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT042644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 66 // 66 // 31 // 47 // 1 /// GENSCAN00000017857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:29714748:29810166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 23 // 23 // 11 // 47 // 1 /// NONRATT042646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 19 // 19 // 9 // 47 // 1
NM_001271108 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 (Pdp1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NM_019372 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 (Pdp1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237908 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1 (Pdp1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:30284176:30290060:-1 gene:ENSRNOG00000016180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF062740 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase phosphatase isoenzyme 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// BC129095 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2C, magnesium dependent, catalytic subunit, mRNA (cDNA clone MGC:156655 IMAGE:8369880), complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001107916 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 67 (Tmem67), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:30371964:30424943:-1 gene:ENSRNOG00000016187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:30364687:30429355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
XM_002726513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 92, member A1 (Fam92a1), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_002729463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 92, member A1 (Fam92a1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022249 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:30436531:30454713:-1 gene:ENSRNOG00000016338 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:30436531:30439716:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT044479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT044480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT044481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000005003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:30447763:30519998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT044482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
ENSRNOT00000045483 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:31873299:31873970:-1 gene:ENSRNOG00000032078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000033252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:31873161:31873970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000019682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:32332745:32405155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001106638 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 7 (Slc26a7), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:32679000:32816595:-1 gene:ENSRNOG00000006096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000031545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:32679381:32816192:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001134624 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 69 (Lrrc69), mRNA. // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:32818530:33001959:-1 gene:ENSRNOG00000006498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:32956869:33001963:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT044486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT044487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_001106639 // RefSeq // Rattus norvegicus OTU domain containing 6B (Otud6b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006237914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OTU domain containing 6B (Otud6b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000008725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:33018928:33034090:-1 gene:ENSRNOG00000006636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:33022657:33033969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT044490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT044491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_022302 // RefSeq // Rattus norvegicus N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 (Necab1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006237915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-terminal EF-hand calcium binding protein 1 (Necab1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000009718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:33184793:33414046:-1 gene:ENSRNOG00000007256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF193755 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal calcium binding protein NECAB1 mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:33127012:33254582:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_057197 // RefSeq // Rattus norvegicus 2,4-dienoyl CoA reductase 1, mitochondrial (Decr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:34253236:34280749:-1 gene:ENSRNOG00000008236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC059120 // GenBank // Rattus norvegicus 2,4-dienoyl CoA reductase 1, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:72723 IMAGE:6920489), complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// D00569 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 2,4-dienoyl-CoA reductase precursor, complete cds. // chr5 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// FQ218372 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YL12 mRNA sequence. // chr5 // 55 // 97 // 16 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:34253329:34280704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT044495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT044497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
XM_006225229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 (Osgin2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006225230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 (Osgin2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XM_006237918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 (Osgin2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// XM_006237919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxidative stress induced growth inhibitor family member 2 (Osgin2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012394 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:34342398:34360423:-1 gene:ENSRNOG00000009358 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:34342398:34360929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT044500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006225284 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GA-binding protein subunit beta-1-like (LOC366320), mRNA. // chr5 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:34438405:34439601:-1 gene:ENSRNOG00000009365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 100 // 13 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:34438491:34439271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 8 // 8 // 0
NM_001191865 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor-interacting serine-threonine kinase 2 (Ripk2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000012963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:34512875:34543807:-1 gene:ENSRNOG00000009389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC107468 // GenBank // Rattus norvegicus receptor-interacting serine-threonine kinase 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7458993), partial cds. // chr5 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:34513703:34543673:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT044502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
XM_006225232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide binding domain containing 1 (Cnbd1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006225233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide binding domain containing 1 (Cnbd1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006225234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide binding domain containing 1 (Cnbd1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide binding domain containing 1 (Cnbd1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006237927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide binding domain containing 1 (Cnbd1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_006237928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclic nucleotide binding domain containing 1 (Cnbd1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034921 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:37250693:37420682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000015019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:37552757:37617863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001107917 // RefSeq // Rattus norvegicus copine III (Cpne3), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000008281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:38183598:38214447:-1 gene:ENSRNOG00000006298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:38181922:38214447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000042468 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:38215325:38215568:-1 gene:ENSRNOG00000045881 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 75 // 100 // 21 // 28 // 0 /// NONRATT044520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001024757 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1 (Wwp1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:38263540:38318839:-1 gene:ENSRNOG00000006328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// BC097386 // GenBank // Rattus norvegicus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 1, mRNA (cDNA clone MGC:114426 IMAGE:7446512), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044584 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:38269689:38318818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT044522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001011972 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit D2 (Atp6v0d2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:38499088:38547691:-1 gene:ENSRNOG00000006926 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC089917 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal 38kDa, V0 subunit d2, mRNA (cDNA clone MGC:109196 IMAGE:7306609), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:38468295:38511821:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001109540 // RefSeq // Rattus norvegicus Na+/K+ transporting ATPase interacting 3 (Nkain3), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006237934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Na+/K+ transporting ATPase interacting 3 (Nkain3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:38786929:39151521:-1 gene:ENSRNOG00000013085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:38950024:39116752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006225237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 13 (Prdm13), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// XM_006237947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 13 (Prdm13), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000010126 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:40480622:40488351:-1 gene:ENSRNOG00000007683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 62 // 14 // 16 // 0 /// GENSCAN00000016394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:40480622:40488208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
XM_006237948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thiosulfate sulfurtransferase (rhodanese)-like domain containing 3 (Tstd3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:40549091:40558531:-1 gene:ENSRNOG00000028185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089864 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7191107. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_019187 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q3 methyltransferase (Coq3), mRNA. // chr5 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:40679635:40710202:1 gene:ENSRNOG00000009974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// BC126094 // GenBank // Rattus norvegicus coenzyme Q3 homolog, methyltransferase (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156658 IMAGE:8370738), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ216025 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YD23 mRNA sequence. // chr5 // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// L20427 // GenBank // Rattus norvegicus dihydroxypolyprenylbenzoate methyltransferase mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:40652657:40710012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT042714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0
NM_172085 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 3 homeobox 2 (Pou3f2), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:41323989:41325326:-1 gene:ENSRNOG00000006908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:41314654:41352652:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000050653 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:43602094:43787137:-1 gene:ENSRNOG00000007441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068465 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:43602094:43787137:-1 gene:ENSRNOG00000007441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:43613580:43636003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// BC087711 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7315085. // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT044537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1 /// NONRATT044538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
ENSRNOT00000034194 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:43949988:43950489:-1 gene:ENSRNOG00000024161 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0
NM_001013088 // RefSeq // Rattus norvegicus four and a half LIM domains 5 (Fhl5), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus four and a half LIM domains 5 (Fhl5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:44191771:44238901:-1 gene:ENSRNOG00000007680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079327 // GenBank // Rattus norvegicus four and a half LIM domains 5, mRNA (cDNA clone MGC:94508 IMAGE:7135490), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000286 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:44191841:44211960:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001126279 // RefSeq // Rattus norvegicus Ufm1-specific ligase 1 (Ufl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006237959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ufm1-specific ligase 1 (Ufl1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010421 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:44245076:44277549:-1 gene:ENSRNOG00000007831 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC166498 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1810074P20, mRNA (cDNA clone MGC:188046 IMAGE:7114599), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000000289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:44245384:44277502:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT044541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
ENSRNOT00000046713 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:44313273:44313995:-1 gene:ENSRNOG00000032999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:44313186:44313995:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_053465 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosyltransferase 9 (alpha (1,3) fucosyltransferase) (Fut9), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:44660497:44863523:-1 gene:ENSRNOG00000008475 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AB049819 // GenBank // Rattus norvegicus FUT9 mRNA for alpha1,3-fucosyltransferase IX, complete cds. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF345993 // GenBank // Rattus norvegicus alpha1,3-fucosyltransferase IX (Fut9) mRNA, complete cds. // chr5 // 89 // 33 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000003421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:44661222:44662301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT044545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_080785 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, endo-alpha (Manea), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006237961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mannosidase, endo-alpha (Manea), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:45469290:45491135:-1 gene:ENSRNOG00000008626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY599499 // GenBank // Rattus norvegicus endomannosidase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC161805 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7131655, containing frame-shift errors. // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FQ223109 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA15YF10 mRNA sequence. // chr5 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// AF023657 // GenBank // Rattus norvegicus endo-alpha-D-mannosidase (Enman) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT044548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047120 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:45472016:45490070:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT044550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001173508 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 10 (Gja10), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:52433349:52434869:-1 gene:ENSRNOG00000006478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52430347:52446042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001134969 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 6 (Ankrd6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 6 (Ankrd6), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006237980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 6 (Ankrd6), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006237981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 6 (Ankrd6), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000065912 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:52640129:52778272:-1 gene:ENSRNOG00000007110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC168675 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 6, mRNA (cDNA clone MGC:188478 IMAGE:7939387), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:52642278:52713017:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107922 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidase M20 domain containing 2 (Pm20d2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:53002968:53019197:-1 gene:ENSRNOG00000007755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:53002968:53019197:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_173322 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich nuclear receptor coactivator 1 (Pnrc1), mRNA. // chr5 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000010271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:53083526:53086483:-1 gene:ENSRNOG00000007793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ214116 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YM22 mRNA sequence. // chr5 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// U61729 // GenBank // Rattus norvegicus proline rich protein mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0 /// FQ212818 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YD08 mRNA sequence. // chr5 // 60 // 79 // 9 // 15 // 0 /// NONRATT044564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT044565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000010838 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:53262201:53263065:-1 gene:ENSRNOG00000008207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:53254548:53286186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000010012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:53726263:53728562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0
NM_001191982 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm acrosome associated 1 (Spaca1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:53995063:54010179:-1 gene:ENSRNOG00000008232 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:53995144:54010179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT044569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001025282 // RefSeq // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 3 (Orc3), mRNA. // chr5 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000011085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54590014:54644408:-1 gene:ENSRNOG00000008314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// AB219142 // GenBank // Rattus norvegicus Orc3 mRNA for origin recognition complex subunit 3, complete cds. // chr5 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009095 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54590470:54638150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0
NM_001107924 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35 (CMP-sialic acid transporter), member A1 (Slc35a1), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54688835:54707429:-1 gene:ENSRNOG00000008908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54693864:54707382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_001079701 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1310641), mRNA. // chrU // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006237999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1310641), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238000 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1310641), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54717643:54762483:-1 gene:ENSRNOG00000009061 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// BC098003 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7453594), partial cds. // chrU // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000009083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54712967:54761457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001065262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1563056), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1563056), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006238003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1563056), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_575796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1563056), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54779331:54789852:-1 gene:ENSRNOG00000009178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009071 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54779331:54789852:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 91 // 88 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT044576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
NM_001106644 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 8 (Smim8), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_001201374 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 8 (Smim8), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_001201375 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 8 (Smim8), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006237987 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small integral membrane protein 8 (Smim8), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000035840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54799587:54808380:-1 gene:ENSRNOG00000023035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NM_001201373 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 8 (Smim8), transcript variant 4, mRNA. // chr5 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// BC167112 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1810030N24, mRNA (cDNA clone MGC:189575 IMAGE:6887495), complete cds. // chr5 // 94 // 94 // 16 // 17 // 1 /// GENSCAN00000009086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54799881:54802001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT044577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT044578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT044579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT044580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001008879 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 292 (Zfp292), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54851038:54931298:-1 gene:ENSRNOG00000031031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54852854:54890796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008879 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 292 (Zfp292), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54851038:54931298:-1 gene:ENSRNOG00000031031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54852854:54890796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008879 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 292 (Zfp292), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035808 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:54851038:54931298:-1 gene:ENSRNOG00000031031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:54852854:54890796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENSRNOT00000072407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:138003285:138004567:-1 gene:ENSRNOG00000051005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072776 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14596908:14598190:1 gene:ENSRNOG00000048504 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072845 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:9184976:9186258:1 gene:ENSRNOG00000046314 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54940686:54941968:-1 gene:ENSRNOG00000047509 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59271854:59273136:1 gene:ENSRNOG00000048192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:172047210:172048492:1 gene:ENSRNOG00000050867 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165832069:165833351:-1 gene:ENSRNOG00000050976 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// U15425 // GenBank // Rattus norvegicus membrane- and microfilament-associated protein p58 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000038213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:55704968:55705207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 87 // 65 // 13 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000012267 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:55704659:55705249:-1 gene:ENSRNOG00000039674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 65 // 100 // 15 // 23 // 0
NM_001108970 // RefSeq // Rattus norvegicus MOB kinase activator 3B (Mob3b), mRNA. // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:55007530:55201845:-1 gene:ENSRNOG00000009453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// XR_353955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102550026 (LOC102550026), transcript variant X1, ncRNA. // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT044584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000022484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:55015866:55044870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// GENSCAN00000038206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:55729718:55746713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000012543 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:55202890:55203542:-1 gene:ENSRNOG00000009463 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:55202872:55247394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0
NM_001007702 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110043O21 (RGD1359108), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:55229460:55254965:-1 gene:ENSRNOG00000009478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081927 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 3110043O21, mRNA (cDNA clone MGC:93924 IMAGE:7113146), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:55202872:55247394:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_001107926 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat and Ig domain containing 2 (Lingo2), mRNA. // chrU // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:56027971:56030029:-1 gene:ENSRNOG00000005634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:56028752:56034723:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000025479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:60378573:60379564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
XM_006245671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus igE-binding protein-like (LOC102556423), partial mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF057564 // GenBank // Rattus norvegicus putative retrovirus-related gag protein mRNA, complete cds. // chr9 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0
NM_138517 // RefSeq // Rattus norvegicus granzyme B (granzyme 2, cytotoxic T-lymphocyte-associated serine esterase 1) (Gzmb), mRNA. // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// XM_002728257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Granzyme B-like 2 (Gzmbl2), mRNA. // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000041430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:39296942:39300403:-1 gene:ENSRNOG00000049976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000059660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:15:40323424:40326360:-1 gene:ENSRNOG00000045973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// BC127475 // GenBank // Rattus norvegicus granzyme B, mRNA (cDNA clone MGC:156565 IMAGE:7124652), complete cds. // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// FQ228927 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA50YH15 mRNA sequence. // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// FQ229866 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YG19 mRNA sequence. // chr15 // 53 // 76 // 10 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:39200629:39300313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:15:40211939:40362783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// M34097 // GenBank // Rat natural killer (NK) cell protease 1 (RNKP-1) mRNA, complete cds. // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT021383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr15 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0
NM_001106645 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 58 (Ddx58), mRNA. // chrU // 88 // 91 // 28 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000060765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61054910:61080662:-1 gene:ENSRNOG00000006384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 91 // 63 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000038200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61034862:61080662:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 86 // 80 // 24 // 28 // 0
NM_001108658 // RefSeq // Rattus norvegicus topoisomerase I binding, arginine/serine-rich, E3 ubiquitin protein ligase (Topors), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61098862:61110393:-1 gene:ENSRNOG00000006485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61099430:61132161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106646 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 6 (Ndufb6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000029712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61110999:61120566:-1 gene:ENSRNOG00000024539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ216998 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA37YP16 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT044598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000038205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61099430:61132161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
ENSRNOT00000072285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61308077:61310253:-1 gene:ENSRNOG00000049451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000073045 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61290387:61292562:-1 gene:ENSRNOG00000049016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 11 // 11 // 0 /// AY318964 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa1027 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_148889 // RefSeq // Rattus norvegicus aprataxin (Aptx), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aprataxin (Aptx), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aprataxin (Aptx), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000046463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61522038:61542988:-1 gene:ENSRNOG00000006582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AF398235 // GenBank // Rattus norvegicus FHA-HIT mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// BC078716 // GenBank // Rattus norvegicus aprataxin, mRNA (cDNA clone MGC:93138 IMAGE:7132044), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ214915 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA50YI12 mRNA sequence. // chr5 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1 /// GENSCAN00000034814 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61522126:61539340:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT044600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_057195 // RefSeq // Rattus norvegicus smu-1 suppressor of mec-8 and unc-52 homolog (C. elegans) (Smu1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006238011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus smu-1 suppressor of mec-8 and unc-52 homolog (C. elegans) (Smu1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61576564:61595134:-1 gene:ENSRNOG00000007671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY029526 // GenBank // Rattus norvegicus brain-enriched WD-repeat protein (Bwd) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000034823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61576725:61594931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT044602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 9 // 35 // 1 /// NONRATT044603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 11 // 35 // 1
NM_053287 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 1 (B4galt1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61653278:61700179:-1 gene:ENSRNOG00000007966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034818 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61654148:61699961:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT044604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT044605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001106647 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene (Bag1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001256084 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene (Bag1), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61785751:61798332:-1 gene:ENSRNOG00000008277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC159418 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene, mRNA (cDNA clone MGC:188704 IMAGE:8370352), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61785931:61799238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 89 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT044608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT044609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT044610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_019157 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 7 (Aqp7), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000012975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61888637:61902549:-1 gene:ENSRNOG00000009686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB000507 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for aquaporin 7, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// AY120935 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 7 variant mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// AY157737 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 7 (Aqp7) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC072695 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 7, mRNA (cDNA clone MGC:91424 IMAGE:7104684), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000026032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61888833:61952563:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT044612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_031703 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 3 (Aqp3), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013803 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61954830:61960349:-1 gene:ENSRNOG00000009797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127490 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin 3, mRNA (cDNA clone MGC:156623 IMAGE:8366493), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L35108 // GenBank // Rattus norvegicus water channel protein (AQP3) gene, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61955685:61960282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000014211 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:61976812:61981741:-1 gene:ENSRNOG00000010409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// EF688596 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 1 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000026038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:61976682:61985646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001107928 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-associated protein 2 (Ubap2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62064695:62156277:-1 gene:ENSRNOG00000011725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62065530:62134989:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT044618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
XM_006225248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 24 (Kif24), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member 24 (Kif24), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000035541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:62308159:62344056:-1 gene:ENSRNOG00000012735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017112 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:62308159:62344056:-1 gene:ENSRNOG00000012735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000026029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62308159:62344056:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000033235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62402428:62409756:-1 gene:ENSRNOG00000023208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ228576 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YJ19 mRNA sequence. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62404326:62450805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044627 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109616 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 219, member A (Fam219a), mRNA. // chr5 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62425370:62474180:-1 gene:ENSRNOG00000039559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 96 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT044630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62404326:62450805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT044631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001282336 // RefSeq // Rattus norvegicus adropin-like (LOC100912292), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066977 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:62545002:62545232:-1 gene:ENSRNOG00000043300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT044633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62545002:62620998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_001106648 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 25 subunit-like (Rpp25l), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribonuclease P/MRP 25 subunit-like (Rpp25l), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000049032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62620312:62621688:-1 gene:ENSRNOG00000039556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62545002:62620998:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108659 // RefSeq // Rattus norvegicus dynactin 3 (Dctn3), mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000019561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62622817:62630771:-1 gene:ENSRNOG00000014208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 11 // 11 // 0 /// FQ222216 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA27YB19 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT044635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000007293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62623189:62639043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 8 // 17 // 1
NM_001173981 // RefSeq // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 3C (BRIGHT-like) (Arid3c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62631772:62637618:-1 gene:ENSRNOG00000013416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62623189:62639043:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_030996 // RefSeq // Rattus norvegicus sigma non-opioid intracellular receptor 1 (Sigmar1), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62645891:62648669:-1 gene:ENSRNOG00000014604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF004218 // GenBank // Rattus norvegicus brain sigma receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// AF067769 // GenBank // Rattus norvegicus sigma1 receptor mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// AF087827 // GenBank // Rattus norvegicus sigma 1 receptor mRNA, alternatively spliced, complete cds. // chr5 // 95 // 72 // 20 // 21 // 0 /// BC061978 // GenBank // Rattus norvegicus opioid receptor, sigma 1, mRNA (cDNA clone MGC:72418 IMAGE:5623693), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62646740:62648635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT044637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT044638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_001108661 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 19 (Ccl19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62705391:62707335:-1 gene:ENSRNOG00000015668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62705593:62707153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT044649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001066316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S12-like (LOC689481), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_002726516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S12-like (LOC689481), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000043975 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:62709262:62709660:-1 gene:ENSRNOG00000031220 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000007290 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62709262:62709660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001008513 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 21 (Ccl21), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62722616:62723743:-1 gene:ENSRNOG00000034290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086571 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 21b (serine), mRNA (cDNA clone MGC:105669 IMAGE:7304213), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ225478 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YP04 mRNA sequence. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT044650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62713119:62723670:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
BC099085 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7453114. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000007292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62731776:62833272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
NM_001024343 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4931430D02 (LOC500445), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4931430D02 (LOC500445), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031509 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:62828987:62834812:-1 gene:ENSRNOG00000022751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053864 // RefSeq // Rattus norvegicus valosin-containing protein (Vcp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000046102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62952000:62971402:-1 gene:ENSRNOG00000034242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC060518 // GenBank // Rattus norvegicus valosin-containing protein, mRNA (cDNA clone MGC:72335 IMAGE:5597843), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U11760 // GenBank // Rattus norvegicus transitional endoplasmic reticulum ATPase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62952562:63001693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044656 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT044658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
XM_006225256 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group G (Fancg), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group G (Fancg), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013903 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:62973516:62981572:-1 gene:ENSRNOG00000010424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC100266 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7383234, with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62952562:63001693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT044661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
XM_006225259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class O (Pigo), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class O (Pigo), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_353986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class O (Pigo), transcript variant X4, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013213 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:62987512:62994935:-1 gene:ENSRNOG00000009930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000002877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62952562:63001693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT044665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT044668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001031646 // RefSeq // Rattus norvegicus stomatin (Epb7.2)-like 2 (Stoml2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:62998100:63001725:-1 gene:ENSRNOG00000009535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC099164 // GenBank // Rattus norvegicus stomatin (Epb7.2)-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:116331 IMAGE:7382023), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ213146 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YH19 mRNA sequence. // chr5 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002877 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:62952562:63001693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT044673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
ENSRNOT00000012386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63002711:63010762:-1 gene:ENSRNOG00000009323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC087107 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA B230312A22, mRNA (cDNA clone MGC:94713 IMAGE:7193207), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212427 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA55YG11 mRNA sequence. // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63003828:63061107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT044674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031136 // RefSeq // Rattus norvegicus thymosin, beta 4, X chromosome (Tmsb4x), mRNA. // chr5 // 44 // 95 // 8 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000071708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:28985069:28987071:1 gene:ENSRNOG00000047931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 95 // 8 // 18 // 0 /// M34043 // GenBank // Rat thymosin beta-4 mRNA, complete cds. // chr5 // 44 // 95 // 8 // 18 // 0 /// NONRATT044677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001015016 // RefSeq // Rattus norvegicus Cd72 molecule (Cd72), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000060442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63468973:63476331:-1 gene:ENSRNOG00000017485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091196 // GenBank // Rattus norvegicus Cd72 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:108873 IMAGE:7374499), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ233803 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YF18 mRNA sequence. // chr5 // 83 // 100 // 25 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63471174:63476250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT044679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001024344 // RefSeq // Rattus norvegicus signaling threshold regulating transmembrane adaptor 1 (Sit1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000035040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63510512:63512132:-1 gene:ENSRNOG00000021546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088199 // GenBank // Rattus norvegicus signaling threshold regulating transmembrane adaptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:108885 IMAGE:7377221), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ225852 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YO22 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// FQ233921 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YN14 mRNA sequence. // chr5 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT044681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63496170:63511797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
J05014 // GenBank // Rat gene for small nuclear 7-2 RNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106676 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 39 (Arhgef39), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000031336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63522806:63526373:-1 gene:ENSRNOG00000021433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63523584:63526356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT044685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT044686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001039025 // RefSeq // Rattus norvegicus talin 1 (Tln1), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// ENSRNOT00000022400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63558230:63588186:-1 gene:ENSRNOG00000016630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 56 // 56 // 0 /// BC100262 // GenBank // Rattus norvegicus talin 1, mRNA (cDNA clone MGC:116305 IMAGE:7373937), complete cds. // chr5 // 100 // 67 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000040616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63558670:63582312:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 55 // 55 // 0 /// NONRATT044695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 30 // 58 // 1 /// NONRATT044696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 39 // 58 // 1 /// NONRATT044700 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 16 // 58 // 1
NM_001013091 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosidase beta 2 (Gba2), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000022002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63592957:63604807:-1 gene:ENSRNOG00000016364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000066708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63592680:63604807:-1 gene:ENSRNOG00000016364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC088200 // GenBank // Rattus norvegicus glucosidase beta 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377825), complete cds. // chr5 // 90 // 26 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000040636 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63592982:63604313:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT044705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// NONRATT044707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001271322 // RefSeq // Rattus norvegicus rCG54858-like (LOC100365008), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068105 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:63609317:63610270:-1 gene:ENSRNOG00000043023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63609814:63610270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT044708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
NM_001173555 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm associated antigen 8 (Spag8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000040641 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63672205:63674417:-1 gene:ENSRNOG00000032539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107955 // RefSeq // Rattus norvegicus histidine triad nucleotide binding protein 2 (Hint2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63675137:63677391:-1 gene:ENSRNOG00000015866 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63673671:63677391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT044712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT044713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013934 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 221, member B (Fam221b), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000029035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63680873:63689832:-1 gene:ENSRNOG00000025453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63680910:63687698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT044714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_001000408 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 833 (Olr833), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63722490:63723440:-1 gene:ENSRNOG00000015652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63722490:63742342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000407 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 834 (Olr834), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63731910:63732848:-1 gene:ENSRNOG00000015646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63722490:63742342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000406 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 836 (Olr836), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000050490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63788861:63789805:-1 gene:ENSRNOG00000033862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000040685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63788846:63789805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT044718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000897 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 837 (Olr837), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63801775:63802722:-1 gene:ENSRNOG00000033505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63801775:63816518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63407888:63440665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001000581 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 838 (Olr838), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63815577:63816518:-1 gene:ENSRNOG00000050363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040648 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63801775:63816518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT044720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63407888:63440665:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001000415 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 839 (Olr839), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:63836307:63837263:-1 gene:ENSRNOG00000049174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:63821424:63840088:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT044721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053765 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase (Gne), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// XM_006238006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase (Gne), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006238007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase (Gne), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006238008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase (Gne), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:64035390:64065617:-1 gene:ENSRNOG00000014365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC062011 // GenBank // Rattus norvegicus glucosamine (UDP-N-acetyl)-2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, mRNA (cDNA clone MGC:72348 IMAGE:5621384), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// Y07744 // GenBank // R.norvegicus mRNA for UDP-N-acetyl-D-glucosamine-2-epimerase. // chr5 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000015726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:64035695:64169743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT044723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001109261 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 5 (Pax5), mRNA. // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000033373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:64530218:64707752:-1 gene:ENSRNOG00000024729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000002977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:64530218:64572265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001106657 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 5 (Zbtb5), mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// XM_006238046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 5 (Zbtb5), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 5 (Zbtb5), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// XM_006238049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 5 (Zbtb5), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000017046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65047763:65067167:-1 gene:ENSRNOG00000012726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT044732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
XM_001071167 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 10 (Fbxo10), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_342829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 10 (Fbxo10), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65100612:65126031:-1 gene:ENSRNOG00000012634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65100612:65126031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT044737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001107936 // RefSeq // Rattus norvegicus exosome component 3 (Exosc3), mRNA. // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006238067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exosome component 3 (Exosc3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65377252:65380455:-1 gene:ENSRNOG00000012409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000020985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65375461:65380456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT044740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000034217 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:65394734:65395608:-1 gene:ENSRNOG00000024388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000004937 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65394698:65396891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT044741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0
XM_006238147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Src homology 2 domain containing adaptor protein B (Shb), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000015338 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:65479897:65586265:-1 gene:ENSRNOG00000011503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000004954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65630750:65868521:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT044742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT044743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
ENSRNOT00000031646 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:65551184:65551542:-1 gene:ENSRNOG00000024269 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// NONRATT044742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000004944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65532346:65551542:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001108972 // RefSeq // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein-like 1 (Igfbpl1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:65911664:65927068:-1 gene:ENSRNOG00000011320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158647 // GenBank // Rattus norvegicus insulin-like growth factor binding protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:187600 IMAGE:8364465), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:65911920:65926887:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT044747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106656 // RefSeq // Rattus norvegicus xeroderma pigmentosum, complementation group A (Xpa), mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006238036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xeroderma pigmentosum, complementation group A (Xpa), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000064685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66266229:66309390:-1 gene:ENSRNOG00000009576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006238035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus xeroderma pigmentosum, complementation group A (Xpa), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT044755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000014521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66285749:66346779:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001025652 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Nef associated protein 1 (RGD1305420), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66505324:66513879:-1 gene:ENSRNOG00000009492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097981 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Nef associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116115 IMAGE:7443366), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66475302:66529381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT044758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_133294 // RefSeq // Rattus norvegicus hemogen (Hemgn), mRNA. // chr5 // 93 // 87 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000042649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66517088:66529462:-1 gene:ENSRNOG00000009436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC078739 // GenBank // Rattus norvegicus hemogen, mRNA (cDNA clone MGC:93194 IMAGE:7111835), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000041652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66475302:66529381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001107934 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 14 (Trim14), mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 14 (Trim14), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 14 (Trim14), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 14 (Trim14), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66657038:66681424:-1 gene:ENSRNOG00000008922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// BC166777 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif protein 14, mRNA (cDNA clone MGC:188556 IMAGE:7934596), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66658780:66681749:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001012101 // RefSeq // Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 2A (Coro2a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238057 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 2A (Coro2a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66684828:66714854:-1 gene:ENSRNOG00000008901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079209 // GenBank // Rattus norvegicus coronin, actin binding protein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:94271 IMAGE:7131801), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041657 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66684967:66721717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT044769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001107933 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 2 (Tbc1d2), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66739641:66785976:-1 gene:ENSRNOG00000023348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66739641:66785976:-1 gene:ENSRNOG00000023348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC168982 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:189320 IMAGE:9030533), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66741014:66878347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031802 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) B receptor 2 (Gabbr2), mRNA. // chr5 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000011573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:66802348:67142203:-1 gene:ENSRNOG00000008431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AF058795 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-B receptor gb2 mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// AF074482 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-B receptor 2 (GABA-BR2) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// AF109405 // GenBank // Rattus norvegicus GABA-B receptor 2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT044773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000038601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66879653:67052210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// GENSCAN00000041654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:66741014:66878347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 45 // 45 // 19 // 42 // 1 /// NONRATT044775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001015028 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 (Anks6), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_353965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 (Anks6), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000060005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:67163440:67204853:-1 gene:ENSRNOG00000023309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// AY661303 // GenBank // Rattus norvegicus samcystin (Pkdr1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XR_353966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6 (Anks6), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// GENSCAN00000038608 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:67145952:67204702:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
NM_001100710 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG2, alpha-1,3/1,6-mannosyltransferase (Alg2), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000008913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:67707027:67711584:-1 gene:ENSRNOG00000006369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:67708737:67711519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT044779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001008317 // RefSeq // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum protein 44 (Erp44), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68454074:68548279:-1 gene:ENSRNOG00000005841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY158662 // GenBank // Rattus norvegicus BWK4 mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// FQ211910 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YM11 mRNA sequence. // chr5 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// FQ227706 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YD17 mRNA sequence. // chr5 // 83 // 100 // 30 // 36 // 0 /// FQ231009 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YJ23 mRNA sequence. // chr5 // 81 // 100 // 29 // 36 // 0 /// GENSCAN00000013759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:68444223:68553771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT044781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT044782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT044783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT044784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 93 // 83 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT044785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT044786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT044787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_001106653 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 10 (Tex10), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006238034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis expressed 10 (Tex10), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:68695431:68742028:-1 gene:ENSRNOG00000008618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013765 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:68695994:68733012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT044788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT044789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001014063 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 2 (Acnat2), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000059897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69174931:69179186:-1 gene:ENSRNOG00000039153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC089827 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:108791 IMAGE:7321838), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// XM_006225295 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 1 (Acnat1), mRNA. // chr5 // 68 // 100 // 21 // 31 // 0 /// NONRATT044792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69133633:69259061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT044793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001014063 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 2 (Acnat2), mRNA. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006225295 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 1 (Acnat1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69174931:69179186:-1 gene:ENSRNOG00000039153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// BC089827 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-coenzyme A amino acid N-acyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:108791 IMAGE:7321838), complete cds. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69133633:69259061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 64 // 12 // 16 // 0 /// NONRATT044792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT044793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_017300 // RefSeq // Rattus norvegicus bile acid CoA: amino acid N-acyltransferase (glycine N-choloyltransferase) (Baat), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69258776:69268754:-1 gene:ENSRNOG00000007395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088153 // GenBank // Rattus norvegicus bile acid Coenzyme A: amino acid N-acyltransferase (glycine N-choloyltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:108728 IMAGE:7368634), complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// D43964 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Kan-1, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ218773 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA4YD13 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69259986:69265904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108665 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L50 (Mrpl50), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000009678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69275963:69280730:-1 gene:ENSRNOG00000007328 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_012496 // RefSeq // Rattus norvegicus aldolase B, fructose-bisphosphate (Aldob), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69297012:69313010:-1 gene:ENSRNOG00000006807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC081697 // GenBank // Rattus norvegicus aldolase B, fructose-bisphosphate, mRNA (cDNA clone MGC:93076 IMAGE:7109764), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ209819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA39YL01 mRNA sequence. // chr5 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// FQ218365 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YM20 mRNA sequence. // chr5 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// M10149 // GenBank // Rat liver aldolase B mRNA, complete cds. // chr5 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69297595:69346735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT044797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 62 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT044798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT044800 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT044801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001014190 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 246 (Tmem246), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 246 (Tmem246), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 246 (Tmem246), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089972 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810432L12, mRNA (cDNA clone MGC:109354 IMAGE:7315559), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001198583 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl-D-aspartate 3A (Grin3a), transcript variant 2, mRNA. // chrU // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_138546 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, N-methyl-D-aspartate 3A (Grin3a), transcript variant 1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69420058:69564696:-1 gene:ENSRNOG00000005723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// AF073379 // GenBank // Rattus norvegicus N-methyl-D-aspartate receptor splice variant NR3A-2 (NR3A) mRNA, complete cds. // chrU // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// L34938 // GenBank // Rattus norvegicus ionotropic glutamate receptor X-1 subclass mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// U29873 // GenBank // Rattus norvegicus N-methyl-D-aspartate receptor-like subunit NMDAR-L mRNA, complete cds. // chrU // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69420563:69434915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000054235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69458907:69634468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT044805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
NM_021701 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 3, regulatory subunit B, beta (Ppp3r2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:69437021:69438018:-1 gene:ENSRNOG00000005368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D10393 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for calcineurin B-like protein (CBLP), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:69437486:69438253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001000404 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 845 (Olr845), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071002 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:73681775:73683243:-1 gene:ENSRNOG00000048481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000072171 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61556217:61557170:-1 gene:ENSRNOG00000048647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015878 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73681775:73683252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000035093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61556217:61557179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT044811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000403 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 847 (Olr847), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:73712313:73713266:-1 gene:ENSRNOG00000049595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072957 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:73605545:73606498:-1 gene:ENSRNOG00000046038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075727 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:73613302:73614255:-1 gene:ENSRNOG00000046095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73613302:73614264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73712313:73713275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73605545:73606507:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT044812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000401 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 850 (Olr850), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000073293 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61595251:61596201:-1 gene:ENSRNOG00000049769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035080 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61595251:61596210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT057889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001000400 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 851 (Olr851), mRNA. // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:61656423:61657382:-1 gene:ENSRNOG00000029023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035086 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:61656423:61765076:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr9 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000399 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 852 (Olr852), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:73915317:73916267:-1 gene:ENSRNOG00000018362 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:73915317:73916267:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178095 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 1 (Abca1), mRNA. // chr5 // 91 // 96 // 43 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000024564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:74023652:74112802:-1 gene:ENSRNOG00000018126 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000031623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:74023847:74131029:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT044816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0
GENSCAN00000008091 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:74986039:74986407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000023703 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:74986022:74986407:-1 gene:ENSRNOG00000017629 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 44 // 100 // 8 // 18 // 0
XM_006238178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 462 (Zfp462), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006238180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 462 (Zfp462), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 gene:ENSRNOG00000032048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 gene:ENSRNOG00000032048 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050727 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:75910137:75985296:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
ENSRNOT00000029187 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:76164450:76164806:-1 gene:ENSRNOG00000027547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000050735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:76164450:76261778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_053713 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 4 (gut) (Klf4), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000022255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:76447645:76452001:-1 gene:ENSRNOG00000016299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// AF390546 // GenBank // Rattus norvegicus gut-enriched kruppel-like factor (Klf4) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// BC085720 // GenBank // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 4 (gut), mRNA (cDNA clone MGC:93286 IMAGE:7190219), complete cds. // chr5 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT044825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_001058861 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S18-like (RGD1565912), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_232915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S18-like (RGD1565912), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043909 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:76483683:76484120:-1 gene:ENSRNOG00000029600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:76439304:76484120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000037440 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:77595415:77596313:-1 gene:ENSRNOG00000027471 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 71 // 100 // 12 // 17 // 0
ENSRNOT00000032389 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:77599974:77602378:-1 gene:ENSRNOG00000026670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:77595415:77633247:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001025417 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-like 7b (Actl7b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:77650646:77651899:-1 gene:ENSRNOG00000016621 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// BC097412 // GenBank // Rattus norvegicus actin-like 7b, mRNA (cDNA clone MGC:114457 IMAGE:7454223), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:77650646:77651899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT044826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_080899 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells, kinase complex-associated protein (Ikbkap), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000022836 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:77661316:77710707:-1 gene:ENSRNOG00000016725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF388201 // GenBank // Rattus norvegicus IKAP (Ikbkap) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000013484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:77661873:77708375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0
NM_001106649 // RefSeq // Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), alpha-like 1 (Ctnnal1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000014888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:77719359:77778979:-1 gene:ENSRNOG00000010593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000013497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:77720698:77778870:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT044831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
XM_006238188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 245 (Tmem245), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000032299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:78073998:78141161:-1 gene:ENSRNOG00000026271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000064043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:78073998:78141161:-1 gene:ENSRNOG00000026271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000022096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:78062135:78141161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NR_031846 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-32 (Mir32), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053635 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:78089043:78089112:-1 gene:ENSRNOG00000035512 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044835 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-32 // miRBase Micro RNA Database // MI0000873 Rattus norvegicus miR-32 stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001127565 // RefSeq // Rattus norvegicus erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4B (Epb41l4b), mRNA. // chr5 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000015114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:78259812:78344997:-1 gene:ENSRNOG00000030163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// BC166749 // GenBank // Rattus norvegicus similar to EHM2, mRNA (cDNA clone MGC:188486 IMAGE:5599589), complete cds. // chr5 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// GENSCAN00000022082 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:78189046:78355586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// NONRATT044842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT044843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
ENSRNOT00000059627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:78401874:78516924:-1 gene:ENSRNOG00000011425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC092605 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7308722), partial cds. // chr5 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000036426 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:78359935:78611791:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT044848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENSRNOT00000059621 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:78683458:78684341:-1 gene:ENSRNOG00000038997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000075432 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:78683458:78684341:-1 gene:ENSRNOG00000038997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000036445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:78683670:78686603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_003754032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685849 (LOC685849), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016068 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:79154525:79159469:-1 gene:ENSRNOG00000012068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT044860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT044861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_053800 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin 1 (Txn1), mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:79201252:79209403:-1 gene:ENSRNOG00000012081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF311055 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// BC058454 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin 1, mRNA (cDNA clone MGC:72735 IMAGE:6886988), complete cds. // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// FQ210839 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA21YE04 mRNA sequence. // chr5 // 81 // 100 // 26 // 32 // 0 /// FQ216849 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA40YN16 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000051235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:79201398:79213369:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_001004092 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin domain containing 8 (Txndc8), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042788 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:79238776:79271622:-1 gene:ENSRNOG00000029073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY496270 // GenBank // Rattus norvegicus SPTRX3 (Sptrx3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
XM_006225310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain containing 1 (Svep1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000047200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:79301113:79470394:-1 gene:ENSRNOG00000033110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000021959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:79357214:79448753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:79302571:79356616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT044866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 16 // 46 // 1
XM_006238204 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102550203), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006221045 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102548076), mRNA. // chr5 // 41 // 100 // 9 // 22 // 0 /// NONRATT044867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_053936 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidic acid receptor 1 (Lpar1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysophosphatidic acid receptor 1 (Lpar1), transcript variant X8, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// XM_006238203 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysophosphatidic acid receptor 1 (Lpar1), transcript variant X9, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000044348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:79707135:79824358:-1 gene:ENSRNOG00000013656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF014418 // GenBank // Rattus norvegicus endothelial differentiation gene 2 (Edg-2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AF090347 // GenBank // Rattus norvegicus putative G-protein coupled receptor GPCR91 (Gpcr91) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// BC089227 // GenBank // Rattus norvegicus lysophosphatidic acid receptor 1, mRNA (cDNA clone MGC:105279 IMAGE:7320884), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001000582 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 854 (Olr854), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:80054588:80055529:-1 gene:ENSRNOG00000014263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80054588:80055529:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_346529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to KIAA0368 (RGD1306148), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// XR_354044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to KIAA0368 (RGD1306148), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 96 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000019959 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:80076567:80161883:-1 gene:ENSRNOG00000025076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000059529 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:80134520:80156355:-1 gene:ENSRNOG00000025076 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000049976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80102193:80184165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 49 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80076567:80097893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 31 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT044877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 51 // 51 // 26 // 51 // 1
NM_138863 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin reductase 1 (Ptgr1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:80255193:80273709:-1 gene:ENSRNOG00000015072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089775 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:108590 IMAGE:7307365), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ229147 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YP01 mRNA sequence. // chr5 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// U66322 // GenBank // Rattus norvegicus dithiolethione-inducible gene-1 (DIG-1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80255304:80278802:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT044884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_006225311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC686050 (LOC686050), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80360858:80429469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0
XM_006225315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi domain containing 1 (Susd1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006225317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi domain containing 1 (Susd1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi domain containing 1 (Susd1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sushi domain containing 1 (Susd1), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80683280:80744060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT044885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_031346 // RefSeq // Rattus norvegicus polypyrimidine tract binding protein 3 (Ptbp3), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022107 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:80811877:80893823:-1 gene:ENSRNOG00000016334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AB023966 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Rod1, complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT044887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000001613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:80751478:80849264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT044890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
XM_001061972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus INTS3 and NABP interacting protein (Inip), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus INTS3 and NABP interacting protein (Inip), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus INTS3 and NABP interacting protein (Inip), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_216387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus INTS3 and NABP interacting protein (Inip), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:81152939:81162816:-1 gene:ENSRNOG00000017047 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000024502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:81152663:81162816:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT044891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001106652 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 46, member 2 (Slc46a2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:81300022:81307920:-1 gene:ENSRNOG00000017324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:81292135:81309011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_058209 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 37 (Zfp37), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// AF072439 // GenBank // Rattus norvegicus zinc-finger protein-37 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC166844 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9029689. // chrU // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// XM_006238224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 37-like (LOC102555249), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 67 // 67 // 8 // 12 // 1 /// NONRATT044899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// NONRATT044905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 67 // 67 // 8 // 12 // 1
AB039828 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for alpha-2u globulin, complete cds, clone:PGCL7. // chr5 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000056919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82087627:82161073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_006225341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 15 (Fkbp15), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 15 (Fkbp15), mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506-binding protein 15-like (LOC102556352), mRNA. // chr5 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000002083 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:82255154:82304918:-1 gene:ENSRNOG00000024663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065445 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:82255154:82311236:-1 gene:ENSRNOG00000024663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067076 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:82265619:82304918:-1 gene:ENSRNOG00000024663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074973 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:82272280:82304918:-1 gene:ENSRNOG00000024663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000056920 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82255682:82350213:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ230831 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA87YM16 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT044907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT044910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001013240 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 26 (Cdc26), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NM_001267054 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 26 (Cdc26), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// NM_001267055 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 26 (Cdc26), transcript variant 3, mRNA. // chr5 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000040894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82373129:82386784:-1 gene:ENSRNOG00000029785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// AY156922 // GenBank // Rattus norvegicus BWK-2 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC086343 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 26, mRNA (cDNA clone MGC:105942 IMAGE:7301739), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ217142 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA34YE05 mRNA sequence. // chr5 // 83 // 75 // 15 // 18 // 0 /// FQ213015 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YD07 mRNA sequence. // chr5 // 67 // 75 // 12 // 18 // 0 /// GENSCAN00000040799 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82374182:82383940:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT044911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT044913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
XM_006225342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 183 (Rnf183), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 183 (Rnf183), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019924 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:82404611:82405183:-1 gene:ENSRNOG00000014861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000040826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82404611:82424077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001011976 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 31 (Wdr31), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000048904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82425258:82444010:-1 gene:ENSRNOG00000014869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC079286 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 31, mRNA (cDNA clone MGC:94416 IMAGE:7134286), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT044918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001109511 // RefSeq // Rattus norvegicus haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 3 (Hdhd3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82477554:82481021:-1 gene:ENSRNOG00000015195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166898 // GenBank // Rattus norvegicus haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:188859 IMAGE:6922018), complete cds. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82477731:82478486:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT044919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012899 // RefSeq // Rattus norvegicus aminolevulinate dehydratase (Alad), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// XM_006238235 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aminolevulinate dehydratase (Alad), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82488238:82498717:-1 gene:ENSRNOG00000015206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC061806 // GenBank // Rattus norvegicus aminolevulinate, delta-, dehydratase, mRNA (cDNA clone MGC:72551 IMAGE:5598340), complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// FQ213585 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YO18 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ233724 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YK18 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// FQ234573 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YH09 mRNA sequence. // chr5 // 95 // 88 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040823 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82488318:82493176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT044923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// NONRATT044922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1 /// NONRATT044924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001007652 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), epsilon 3, accessory subunit (Pole3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000020722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:82500187:82503419:-1 gene:ENSRNOG00000015392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC081988 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), epsilon 3 (p17 subunit), mRNA (cDNA clone MGC:94182 IMAGE:7129121), complete cds. // chr5 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// BC083800 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), epsilon 3 (p17 subunit), mRNA (cDNA clone MGC:94830 IMAGE:7108773), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT044926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_012901 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-1-microglobulin/bikunin precursor (Ambp), mRNA. // chr5 // 86 // 100 // 25 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000009248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83093784:83104012:-1 gene:ENSRNOG00000006889 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC088166 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-1-microglobulin/bikunin precursor, mRNA (cDNA clone MGC:108765 IMAGE:7368246), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ212473 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YN13 mRNA sequence. // chr5 // 47 // 59 // 8 // 17 // 0 /// GENSCAN00000031955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83087859:83129751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT044931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT044932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001012102 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 12 (Kif12), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000010040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83119956:83126591:-1 gene:ENSRNOG00000007080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// BC085798 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin family member 12, mRNA (cDNA clone IMAGE:7110267), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT044933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000031955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83087859:83129751:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT044935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001108668 // RefSeq // Rattus norvegicus AT-hook transcription factor (Akna), mRNA. // chr5 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000010516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83298322:83336921:-1 gene:ENSRNOG00000008005 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000031960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83299217:83331585:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 98 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT044938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT044939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1
NM_181088 // RefSeq // Rattus norvegicus deafness, autosomal recessive 31 (Dfnb31), mRNA. // chr5 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83349718:83431410:-1 gene:ENSRNOG00000001700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// AY227205 // GenBank // Rattus norvegicus CASK-interacting protein CIP98 (Cip98) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 84 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83349718:83371890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT044941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT044942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
XM_003754040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688893 (LOC688893), transcript variant 2, mRNA. // chrU // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000002389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83535931:83546758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT044949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT044950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000041811 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:83614143:83615152:-1 gene:ENSRNOG00000042051 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000002386 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83556459:83615149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 89 // 7 // 8 // 0
NM_145765 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 15 (Tnfsf15), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238268 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 15 (Tnfsf15), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:83661234:83677273:-1 gene:ENSRNOG00000008930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AF520787 // GenBank // Rattus norvegicus TNF superfamily ligand TL1A (Tnfsf15) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000002392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:83661234:83721607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001271363 // RefSeq // Rattus norvegicus astrotactin 2 (Astn2), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_003749958 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus astrotactin 2 (Astn2), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:85643128:86266662:-1 gene:ENSRNOG00000010313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000034945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:85643128:86266662:-1 gene:ENSRNOG00000010313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000007237 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:87334271:87334895:-1 gene:ENSRNOG00000005466 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:87334271:87334904:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0
XM_001065499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L31-like (RGD1561195), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_213029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L31-like (RGD1561195), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000046725 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:87738017:87738391:-1 gene:ENSRNOG00000030383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000055614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:87738017:87738391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_080482 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein/retinoic acid inducible neural-specific 1 (Brinp1), mRNA. // chr5 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007578 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:89013128:89158671:-1 gene:ENSRNOG00000005561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB051356 // GenBank // Rattus norvegicus BRINP mRNA for BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein, complete cds. // chr5 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000032976 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:89013191:89158518:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT044958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_173134 // RefSeq // Rattus norvegicus CDK5 regulatory subunit associated protein 2 (Cdk5rap2), mRNA. // chr5 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000007710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:90474208:90641322:-1 gene:ENSRNOG00000005788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// JX524852 // GenBank // Rattus norvegicus Cdk5 regulatory subunit-associated protein 2 (Cdk5rap2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 84 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000053798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:90477265:90619010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT044961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// NONRATT044959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// NONRATT044963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 9 // 44 // 1
NM_001107940 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple EGF-like-domains 9 (Megf9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:90674194:90783779:-1 gene:ENSRNOG00000005932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:90675476:90783572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT044969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000030099 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:91515654:91516186:-1 gene:ENSRNOG00000027584 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000037040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:91515953:91516186:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
GENSCAN00000053722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:92219437:92241508:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:82087627:82161073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 96 // 11 // 25 // 0
NM_001173433 // RefSeq // Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 1 (E(sp1) homolog, Drosophila) (Tle1), mRNA. // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// XM_006238289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 1 (E(sp1) homolog, Drosophila) (Tle1), transcript variant X9, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer of split 1 (E(sp1) homolog, Drosophila) (Tle1), transcript variant X10, mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000058906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:92618609:92701144:-1 gene:ENSRNOG00000005882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000009446 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:92619078:92750800:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 18 // 22 // 1
NM_001013930 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310003M01 (LOC298139), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058882 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:94400064:94410445:1 gene:ENSRNOG00000045733 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// BC083698 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310003M01, mRNA (cDNA clone MGC:94572 IMAGE:7189881), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217875 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA15YD15 mRNA sequence. // chr5 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT043087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:94341380:94410445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000044921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:138232580:138235480:1 gene:ENSRNOG00000033231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:94924849:94964406:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 85 // 8 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138220925:138250639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001206675 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 261 (Tmem261), mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000031852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:96088255:96089351:-1 gene:ENSRNOG00000023946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// FQ227858 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YI14 mRNA sequence. // chr5 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT044981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT044982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 59 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000037321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:95979617:96090815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 9 // 22 // 1
ENSRNOT00000046187 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:101380796:101381722:-1 gene:ENSRNOG00000033469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
AY387071 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00085 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003749966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box/LRR-repeat protein 18-like (LOC100909844), partial mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// XM_006248905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 18 (Fbxl18), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006248906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 18 (Fbxl18), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// XM_006248907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 18 (Fbxl18), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001479 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:15764431:15781260:1 gene:ENSRNOG00000001117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102614270:102618342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000027168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:102584179:102591896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 39 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000029485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:15750205:15785888:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
NM_019196 // RefSeq // Rattus norvegicus multiple PDZ domain protein (Mpdz), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 46 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000051028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:103442809:103596543:-1 gene:ENSRNOG00000007894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000010922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:103443958:103646997:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT044997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT045001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 22 // 48 // 1
ENSRNOT00000063530 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:5:103647307:103647431:-1 gene:ENSRNOG00000041777 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
BC089062 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7308494. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
BC089062 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7308494. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_031566 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor I/B (Nfib), mRNA. // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:104470528:104676353:-1 gene:ENSRNOG00000009795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000067538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:104469935:104676353:-1 gene:ENSRNOG00000009795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AB012230 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NF1-B1, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AB012231 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NF1-B2, complete cds. // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// AB012232 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NF1-B3, complete cds. // chr5 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000013092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:104469935:104676353:-1 gene:ENSRNOG00000009795 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT045006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// GENSCAN00000018079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:104494912:104579467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT045005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001039009 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 21 (Zdhhc21), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:104956427:104999765:-1 gene:ENSRNOG00000010484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// AY886536 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC21 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:104927244:104991898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001115031 // RefSeq // Rattus norvegicus cerberus 1, DAN family BMP antagonist (Cer1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:105024886:105028238:-1 gene:ENSRNOG00000010518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158726 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cerberus-like, mRNA (cDNA clone MGC:187879 IMAGE:9091451), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:105004655:105162991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT045011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106665 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 39B (Ttc39b), mRNA. // chr5 // 100 // 30 // 20 // 20 // 0 /// NM_001191757 // RefSeq // Rattus norvegicus Fras1 related extracellular matrix 1 (Frem1), mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 38 // 38 // 0 /// XR_354088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Fras1 related extracellular matrix 1 (Frem1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 53 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000058611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:105326437:105422721:-1 gene:ENSRNOG00000042603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000058615 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:105042311:105160290:-1 gene:ENSRNOG00000022309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 38 // 38 // 0 /// XM_006238350 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 39B (Ttc39b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 27 // 27 // 18 // 66 // 1 /// GENSCAN00000015393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:105004655:105162991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 34 // 66 // 1 /// GENSCAN00000038003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:105327007:105400001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 27 // 27 // 18 // 66 // 1 /// NONRATT045015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 24 // 66 // 1 /// NONRATT045016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 23 // 66 // 1
GENSCAN00000015393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:105004655:105162991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENSRNOT00000039708 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:105140179:105181288:-1 gene:ENSRNOG00000028647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
ENSRNOT00000040968 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:105446242:105446644:-1 gene:ENSRNOG00000032203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 83 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:105446306:105446644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 90 // 83 // 18 // 20 // 0
NM_175765 // RefSeq // Rattus norvegicus PC4 and SFRS1 interacting protein 1 (Psip1), mRNA. // chr5 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:105568811:105600711:-1 gene:ENSRNOG00000011498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB285525 // GenBank // Rattus norvegicus SBP75 mRNA for supercoiled DNA binding protein 75, complete cds. // chr5 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// AF339084 // GenBank // Rattus norvegicus lens epithelium-derived growth factor a (Ledgfa) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// AF372090 // GenBank // Rattus norvegicus LEDGFB (LedgfB) mRNA, complete cds. // chr5 // 88 // 53 // 14 // 16 // 0 /// BC093606 // GenBank // Rattus norvegicus PC4 and SFRS1 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105284 IMAGE:7317952), complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045019 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:105569666:105661161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT045021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT045022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT045023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001106666 // RefSeq // Rattus norvegicus basonuclin 2 (Bnc2), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:106424110:106751748:-1 gene:ENSRNOG00000006553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:106424814:106451277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT045026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:106675644:106789275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT045027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONRATT045026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_006225387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 154, member A (Fam154a), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006238373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 154, member A (Fam154a), mRNA. // chr5 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:108757131:108835778:-1 gene:ENSRNOG00000048197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000019097 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:108815825:108875840:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000035939 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:108934526:108969204:-1 gene:ENSRNOG00000024854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
FQ230383 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YE15 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT013998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007144 // RefSeq // Rattus norvegicus perilipin 2 (Plin2), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006238361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus perilipin 2 (Plin2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238362 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus perilipin 2 (Plin2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:108985563:108999161:-1 gene:ENSRNOG00000007060 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085861 // GenBank // Rattus norvegicus adipose differentiation related protein, mRNA (cDNA clone MGC:94591 IMAGE:7190361), complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_006238360 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus perilipin 2 (Plin2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// GENSCAN00000019136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:108973435:108999210:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT045034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_017160 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein S6 (Rps6), mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// XM_003749971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S6-like (LOC100911372), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000010383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:109196750:109199600:-1 gene:ENSRNOG00000007663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000073270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:109184689:109187016:-1 gene:ENSRNOG00000049025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// BC058149 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal protein S6, mRNA (cDNA clone MGC:72867 IMAGE:6918741), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// M29358 // GenBank // Rat ribosomal protein S6 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000019106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:109184725:109212322:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 15 // 15 // 0 /// FQ223150 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA14YP12 mRNA sequence. // chr5 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0
NM_031743 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 2 (Slc24a2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000010827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:109317349:109564102:-1 gene:ENSRNOG00000008169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AF021923 // GenBank // Rattus norvegicus potassium-dependent sodium-calcium exchanger (NCKX2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:109329709:109373336:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
GENSCAN00000019174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:109696724:109703835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
NM_053718 // RefSeq // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 3 (Mllt3), mRNA. // chr5 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000015094 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110089251:110183696:-1 gene:ENSRNOG00000011280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AJ006295 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for AF-9. // chr5 // 95 // 100 // 36 // 38 // 0 /// BC129089 // GenBank // Rattus norvegicus myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia (trithorax homolog, Drosophila); translocated to, 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7129264), partial cds. // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT045043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000014481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110089354:110105255:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1
NM_001108669 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 2 (Ptplad2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 2 (Ptplad2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000033651 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110713013:110738698:-1 gene:ENSRNOG00000005772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ234476 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YN09 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238377 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase-like A domain containing 2 (Ptplad2), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000053711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110711251:110788483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_019127 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon beta 1, fibroblast (Ifnb1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008224 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110843902:110844456:-1 gene:ENSRNOG00000006268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014560 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110828980:110844456:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106667 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon, alpha 4 (Ifna4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000046207 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:110900533:110901102:-1 gene:ENSRNOG00000033823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_003754056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (RGD1564897), mRNA. // chr5 // 38 // 100 // 11 // 29 // 0 /// XM_578466 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (RGD1559679), mRNA. // chr5 // 38 // 100 // 11 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110846661:110901102:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000045433 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:111331216:111331792:1 gene:ENSRNOG00000032524 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 38 // 100 // 11 // 29 // 0
XM_001053102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-5-like (RGD1561246), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_578464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-5-like (RGD1561246), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014563 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:110972455:110973024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003749976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon alpha-1-like (LOC100909643), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000005988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111359126:111362566:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000005991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111314765:111331785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// NONRATT043152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001107944 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 9 (Klhl9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:111299137:111303302:1 gene:ENSRNOG00000006335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168717 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 9 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188774 IMAGE:9102826), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111299412:111301420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002726563 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon, epsilon (Ifne), mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_002729499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon, epsilon (Ifne), mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000029976 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:111209796:111210371:1 gene:ENSRNOG00000024204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000014569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111209796:111210371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
NR_031845 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-31 (Mir31), microRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT043150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-31a // miRBase Micro RNA Database // MI0000872 Rattus norvegicus miR-31a stem-loop // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000037500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:246496970:246553306:-1 gene:ENSRNOG00000027161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC079346 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110059E24, mRNA (cDNA clone MGC:94797 IMAGE:7107242), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC093390 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1110059E24, mRNA (cDNA clone MGC:112742 IMAGE:7388009), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000029509 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:111575736:111576203:-1 gene:ENSRNOG00000024197 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr5 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111575736:111576203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034211 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:246497811:246537199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT007411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 42 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT007413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT007414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1
NM_031550 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 2A (Cdkn2a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:111793602:111801220:-1 gene:ENSRNOG00000006664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// AF474976 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI/SegHsd cyclin-dependent kinase inhibitor 2a p16Ink4a (Cdkn2a) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF474977 // GenBank // Rattus norvegicus strain COP cyclin-dependent kinase inhibitor 2a p16Ink4a (Cdkn2a) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY679728 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/SsNHsd cyclin-dependent kinase inhibitor 2a p16Ink4a (Cdkn2a) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L81167 // GenBank // Rattus norvegicus p16 protein (P16INK4a) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF474974 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI/SegHsd cyclin-dependent kinase inhibitor 2a p19Arf (Cdkn2a) mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// AF474975 // GenBank // Rattus norvegicus strain COP cyclin-dependent kinase inhibitor 2a p19Arf (Cdkn2a) mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// AY679727 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/SsNHsd cyclin-dependent kinase inhibitor 2a p19Arf (Cdkn2a) mRNA, complete cds. // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000006010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111790482:111793874:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_130812 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4) (Cdkn2b), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000008898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:111820712:111826334:-1 gene:ENSRNOG00000006735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF474978 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI/SegHsd cyclin-dependent kinase inhibitor 2b (Cdkn2b) mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// AF474979 // GenBank // Rattus norvegicus strain COP cyclin-dependent kinase inhibitor 2b (Cdkn2b) mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 72 // 21 // 23 // 0 /// BC086995 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4), mRNA (cDNA clone MGC:93232 IMAGE:7134283), complete cds. // chr5 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4) (Cdkn2b), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// XM_006238381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 2B (p15, inhibits CDK4) (Cdkn2b), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT045052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT045054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1 /// GENSCAN00000037400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:111815599:111864189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
ENSRNOT00000042302 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:111933884:111935181:-1 gene:ENSRNOG00000033300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
GENSCAN00000042423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:112436103:112436996:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_173309 // RefSeq // Rattus norvegicus ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 2 (Hu antigen B) (Elavl2), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 2 (Elavl2), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 2 (Elavl2), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238388 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 2 (Elavl2), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 2 (Elavl2), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238392 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 2 (Elavl2), transcript variant X9, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000009034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:113450855:113577382:-1 gene:ENSRNOG00000006853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AB098713 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RNA binding protein HuB, complete cds. // chr5 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT045056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:113453884:113548354:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT045058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_002729502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IZUMO family member 3 (Izumo3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_003754059 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IZUMO family member 3 (Izumo3), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033781 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:114650813:114653039:-1 gene:ENSRNOG00000022488 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000003011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:114650813:114675699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000042380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:114681712:114683652:-1 gene:ENSRNOG00000029434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000003013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:114682640:114707268:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_001135749 // RefSeq // Rattus norvegicus CDC28 protein kinase regulatory subunit 1B (Cks1b), mRNA. // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000052379 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:114776113:114776352:-1 gene:ENSRNOG00000032516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// BC167077 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1561797, mRNA (cDNA clone MGC:189430 IMAGE:9023967), complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// BC168780 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1561797, mRNA (cDNA clone MGC:188935 IMAGE:6918892), complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000003004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:114776113:114776352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_001057166 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 10 kDa heat shock protein, mitochondrial-like (RGD1561150), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_233177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 10 kDa heat shock protein, mitochondrial-like (RGD1561150), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:114890226:114923061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0
NM_001034154 // RefSeq // Rattus norvegicus caspase activity and apoptosis inhibitor 1 (Caap1), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:117425195:117477566:-1 gene:ENSRNOG00000007299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC105829 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 5830433M19, mRNA (cDNA clone MGC:125002 IMAGE:7382013), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC088436 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7125407. // chr5 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT045063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT045065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117425747:117574828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// NONRATT045066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_053866 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, activating protein (Plaa), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:117491919:117523679:-1 gene:ENSRNOG00000007753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ211509 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YC16 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U17901 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A-2-activating protein (plap) mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117425747:117574828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045069 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001109413 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 19 (Lrrc19), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037206 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:117565571:117570556:-1 gene:ENSRNOG00000022225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117425747:117574828:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001039345 // RefSeq // Rattus norvegicus equatorin, sperm acrosome associated (Eqtn), mRNA. // chr5 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// XR_354122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus equatorin, sperm acrosome associated (Eqtn), transcript variant X2, misc_RNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000029441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:117817763:117827457:-1 gene:ENSRNOG00000026323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// DQ336136 // GenBank // Rattus norvegicus acrosome formation associated factor mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 94 // 29 // 31 // 0 /// XM_006238401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus equatorin, sperm acrosome associated (Eqtn), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// GENSCAN00000021153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117817890:117822579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 27 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000021158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117824163:117987378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1 /// NONRATT045071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_001058020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myb-like, SWIRM and MPN domains 1 (Mysm1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_006238405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myb-like, SWIRM and MPN domains 1 (Mysm1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_216460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myb-like, SWIRM and MPN domains 1 (Mysm1), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000039554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:117853355:117885569:-1 gene:ENSRNOG00000026299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006238409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myb-like, SWIRM and MPN domains 1 (Mysm1), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000021158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117824163:117987378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
NONRATT045074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_021835 // RefSeq // Rattus norvegicus jun proto-oncogene (Jun), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078738 // GenBank // Rattus norvegicus Jun oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:93192 IMAGE:7124370), complete cds. // chr5 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:117824163:117987378:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000038196 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:118887221:118887589:-1 gene:ENSRNOG00000026234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134980 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 10 (Cyp2j10), mRNA. // chr5 // 96 // 62 // 23 // 24 // 0 /// XM_006225422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450 2J3-like (LOC100912642), mRNA. // chr5 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// XM_006238416 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450 2J3-like (LOC100912642), mRNA. // chr5 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000012503 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:118969594:118987643:-1 gene:ENSRNOG00000030466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000045686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:119015483:119130878:-1 gene:ENSRNOG00000042224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 49 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000058163 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:118969665:118987643:-1 gene:ENSRNOG00000030466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 31 // 11 // 12 // 0 /// BC168751 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 10, mRNA (cDNA clone MGC:188856 IMAGE:6921777), complete cds. // chr5 // 96 // 62 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:118969594:119110203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 77 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT045083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 56 // 56 // 22 // 39 // 1
XM_001058738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 16 (Cyp2j16), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_578474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 16 (Cyp2j16), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:123318431:123393240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_023025 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 4 (Cyp2j4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:123437432:123455817:-1 gene:ENSRNOG00000031004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC091149 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily J, polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:108684 IMAGE:7323516), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L81170 // GenBank // Rattus norvegicus CYP2J4 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:123438066:123478015:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_175766 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 3 (Cyp2j3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC089766 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 2, subfamily j, polypeptide 3, mRNA (cDNA clone MGC:108550 IMAGE:7368342), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U39943 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 monooxygenase (CYP2J3) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// U40000 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 pseudogene (CYP2J3P1) mRNA. // chr5 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:119126692:119167893:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
NM_001134625 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein MGC34837 (RGD1560146), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:119266307:119333195:-1 gene:ENSRNOG00000026169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041117 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:119266307:119280575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT045085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NONRATT045086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001108670 // RefSeq // Rattus norvegicus TM2 domain containing 1 (Tm2d1), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006238418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TM2 domain containing 1 (Tm2d1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:120939559:120981789:-1 gene:ENSRNOG00000007527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT045090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_001107947 // RefSeq // Rattus norvegicus KN motif and ankyrin repeat domains 4 (Kank4), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000066139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:121318387:121381170:-1 gene:ENSRNOG00000007779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000030003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121318965:121328903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121331005:121366171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_145184 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 15 (Usp15), mRNA. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:66793581:66884024:1 gene:ENSRNOG00000023202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF106657 // GenBank // Rattus norvegicus deubiquitinating enzyme Ubp109 (ubp109) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034247 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:121498907:121499586:-1 gene:ENSRNOG00000025786 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:9682909:9683595:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:66802716:66828046:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 80 // 80 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121451133:121499586:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT049654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// NONRATT049655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001191574 // RefSeq // Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 7 (Dock7), mRNA. // chr5 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000011405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:121537643:121694484:-1 gene:ENSRNOG00000008298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// DQ124295 // GenBank // Rattus norvegicus dedicator of cytokinesis 7 mRNA, partial cds. // chr5 // 100 // 25 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000030031 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121537977:121618812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 58 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT045099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 35 // 35 // 17 // 48 // 1 /// NONRATT045105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// GENSCAN00000030009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:121655754:121698572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001135174 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 7 homolog (yeast) (Tomm7), mRNA. // chr5 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000065962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:7844007:7850847:1 gene:ENSRNOG00000043114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// FQ223270 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YF10 mRNA sequence. // chr5 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000011847 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:122159152:122159320:-1 gene:ENSRNOG00000008953 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr5 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
NM_001013213 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin beta 3 binding protein (beta3-endonexin) (Itgb3bp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin beta 3 binding protein (beta3-endonexin) (Itgb3bp), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin beta 3 binding protein (beta3-endonexin) (Itgb3bp), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// XM_006238439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin beta 3 binding protein (beta3-endonexin) (Itgb3bp), transcript variant X7, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:122404718:122470214:-1 gene:ENSRNOG00000009116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC086363 // GenBank // Rattus norvegicus integrin beta 3 binding protein (beta3-endonexin), mRNA (cDNA clone MGC:105673 IMAGE:7304501), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin beta 3 binding protein (beta3-endonexin) (Itgb3bp), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT045109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1 /// NONRATT045111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1 /// NONRATT045112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// NONRATT045113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
GENSCAN00000051710 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:123318431:123393240:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 95 // 100 // 18 // 19 // 0
NM_053466 // RefSeq // Rattus norvegicus Janus kinase 1 (Jak1), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:123865518:123966233:-1 gene:ENSRNOG00000011157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC090029 // GenBank // Rattus norvegicus Janus kinase 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7366052), complete cds. // chr5 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000644 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:123866209:123906734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031859 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-101a (Mir101a), microRNA. // chr5 // 84 // 89 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053722 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:5:124050122:124050204:-1 gene:ENSRNOG00000035599 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-101a // miRBase Micro RNA Database // MI0000886 Rattus norvegicus miR-101a stem-loop // chr5 // 84 // 89 // 21 // 25 // 0
ENSRNOT00000057774 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:124613875:124618059:-1 gene:ENSRNOG00000037977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000017740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124613755:124650641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
XM_006238457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 22-like (LOC102552143), mRNA. // chr5 // 96 // 62 // 25 // 26 // 0 /// XM_006238458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 22-like (LOC102552337), mRNA. // chr5 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034566 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:125317841:125319210:-1 gene:ENSRNOG00000045614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000046921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:124795161:124796545:-1 gene:ENSRNOG00000050228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 71 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:125315457:125333467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124778705:124796545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 62 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060618 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:17721608:17723604:-1 gene:ENSRNOG00000039548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 66 // 69 // 19 // 29 // 0 /// GENSCAN00000029615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17721236:17729091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 36 // 36 // 15 // 42 // 1
XM_006225404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4732496O08 (RGD1561212), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006238456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4732496O08 (RGD1561212), mRNA. // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000043949 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:124746061:124749208:-1 gene:ENSRNOG00000024283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124746061:124749208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0
XM_006238457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 22-like (LOC102552143), mRNA. // chr5 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// XM_006238458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PRAME family member 22-like (LOC102552337), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034566 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:125317841:125319210:-1 gene:ENSRNOG00000045614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000046921 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:124795161:124796545:-1 gene:ENSRNOG00000050228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000026966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:125315457:125333467:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:124778705:124796545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 93 // 77 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060618 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:17721608:17723604:-1 gene:ENSRNOG00000039548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 86 // 20 // 30 // 0 /// GENSCAN00000029615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:17721236:17729091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 62 // 74 // 16 // 26 // 0
XM_006225426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulin-like peptide INSL5-like (LOC102554482), mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// XM_006238474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulin-like peptide INSL5-like (LOC102554482), mRNA. // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001024786 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 78 (Wdr78), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000046691 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126419824:126507661:-1 gene:ENSRNOG00000006999 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC097402 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 78, mRNA (cDNA clone MGC:114447 IMAGE:7453940), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:126389922:126495835:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT045126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001106668 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35 (UDP-GlcA/UDP-GalNAc transporter), member D1 (Slc35d1), mRNA. // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:126567574:126612299:-1 gene:ENSRNOG00000022967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000020339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:126593192:126616418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000030112 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:126632423:126695960:-1 gene:ENSRNOG00000022890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000074118 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:126632423:126695960:-1 gene:ENSRNOG00000022890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079057 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7115648. // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// BC105617 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical gene supported by BC079057, mRNA (cDNA clone IMAGE:7453214), partial cds. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:126632951:126688491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT045131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000040783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:127678606:127679514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
NM_001106670 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 8, alpha polypeptide (C8a), mRNA. // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000067850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:128207204:128261785:-1 gene:ENSRNOG00000007697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// FQ211202 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA15YI03 mRNA sequence. // chr5 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000027702 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:128212453:128251491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0
ENSRNOT00000074422 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:128357442:128358466:-1 gene:ENSRNOG00000049055 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_023991 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, alpha 2 catalytic subunit (Prkaa2), mRNA. // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000010680 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:128436023:128503874:-1 gene:ENSRNOG00000007706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// U12149 // GenBank // Rattus norvegicus 5-AMP-activated protein kinase catalytic alpha-2 subunit mRNA, complete cds. // chr5 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT045136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:128437686:128526839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
ENSRNOT00000030319 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:129710308:129710731:-1 gene:ENSRNOG00000022150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_199253 // RefSeq // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (Pcsk9), mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:129878797:129900625:-1 gene:ENSRNOG00000006280 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY847775 // GenBank // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 (Pcsk9) mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC133063 // GenBank // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mRNA (cDNA clone MGC:156508 IMAGE:8371686), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:129879864:129900435:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_138979 // RefSeq // Rattus norvegicus barttin CLCNK-type chloride channel accessory beta subunit (Bsnd), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:129918878:129927577:-1 gene:ENSRNOG00000006543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081725 // GenBank // Rattus norvegicus Bartter syndrome, infantile, with sensorineural deafness (Barttin), mRNA (cDNA clone MGC:93168 IMAGE:7127281), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:129920316:129927347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006225427 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909776 (LOC100909776), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909776 (LOC100909776), mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036793 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:129933451:129939542:-1 gene:ENSRNOG00000026594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:129933970:129962058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001109262 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Hypothetical protein MGC58608 (RGD1559493), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000052130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130042066:130066959:-1 gene:ENSRNOG00000030914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130057494:130066915:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001013214 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 4 (Ttc4), mRNA. // chr5 // 100 // 49 // 27 // 27 // 0 /// NM_001100965 // RefSeq // Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 7 (Mroh7), mRNA. // chr5 // 100 // 42 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130118034:130127367:-1 gene:ENSRNOG00000042467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 49 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057428 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130128910:130167347:-1 gene:ENSRNOG00000022624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 42 // 23 // 23 // 0 /// BC083794 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 4, mRNA (cDNA clone MGC:94792 IMAGE:7106983), complete cds. // chr5 // 100 // 49 // 27 // 27 // 0 /// XM_006238519 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 4 (Ttc4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 49 // 49 // 27 // 55 // 1 /// GENSCAN00000000525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130108024:130168627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT045150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 32 // 55 // 1 /// NONRATT045151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 51 // 51 // 28 // 55 // 1 /// NONRATT045152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 36 // 36 // 20 // 55 // 1 /// NONRATT045154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 18 // 18 // 10 // 55 // 1
NM_001271383 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 11 (Acot11), mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006238498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 11 (Acot11), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130192237:130212638:-1 gene:ENSRNOG00000007837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130192237:130255705:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001004235 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L37 (Mrpl37), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L37 (Mrpl37), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000012102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130507127:130517640:-1 gene:ENSRNOG00000009078 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079328 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein L37, mRNA (cDNA clone MGC:94649 IMAGE:7191681), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// FQ215540 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YN09 mRNA sequence. // chr5 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// FQ227038 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YI04 mRNA sequence. // chr5 // 39 // 96 // 9 // 23 // 0 /// GENSCAN00000054325 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130504751:130517575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// NONRATT045166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001177827 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00106-like (LOC100363867), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130541857:130542282:-1 gene:ENSRNOG00000033165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000054324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130567523:130625380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001014260 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription elongation factor A (SII) N-terminal and central domain containing 2 (Tceanc2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238522 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription elongation factor A (SII) N-terminal and central domain containing 2 (Tceanc2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130594909:130632086:-1 gene:ENSRNOG00000009398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083757 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2210012G02, mRNA (cDNA clone MGC:94692 IMAGE:7192791), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000054324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130567523:130625380:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001025653 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 42 (Lrrc42), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 42 (Lrrc42), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013575 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:130684407:130705517:-1 gene:ENSRNOG00000009983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098685 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 42, mRNA (cDNA clone MGC:112649 IMAGE:7385408), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130686635:130760651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1
NM_021653 // RefSeq // Rattus norvegicus deiodinase, iodothyronine, type I (Dio1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083557 // GenBank // Rattus norvegicus deiodinase, iodothyronine, type I, mRNA (cDNA clone MGC:93462 IMAGE:7110283), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ219288 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YF03 mRNA sequence. // chr5 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// X57999 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for type I thyroxine deiodinase. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT045174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:130686635:130760651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001191761 // RefSeq // Rattus norvegicus DMRT-like family B with proline-rich C-terminal, 1 (Dmrtb1), mRNA. // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000057341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131114908:131121740:-1 gene:ENSRNOG00000023213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131114908:131142732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_012930 // RefSeq // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase 2 (Cpt2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131353542:131370821:-1 gene:ENSRNOG00000012443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ216442 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YN17 mRNA sequence. // chr5 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// J05470 // GenBank // Rat mitochondrial carnitine palmitoyltransferase II (CPT II) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U88295 // GenBank // Rattus norvegicus carnitine palmitoyltransferase II (CTPII) mRNA, nuclear gene encoding mitochondrial protein, complete cds. // chr5 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131353799:131370759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT045180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138508 // RefSeq // Rattus norvegicus sterol carrier protein 2 (Scp2), mRNA. // chr5 // 87 // 74 // 27 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131495400:131584319:-1 gene:ENSRNOG00000011413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015466 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:131467884:131477254:-1 gene:ENSRNOG00000046561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// BC081713 // GenBank // Rattus norvegicus sterol carrier protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93120 IMAGE:7109192), complete cds. // chr5 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// M34728 // GenBank // Rat sterol carrier protein-2 (SCP-2) mRNA, complete cds. // chr5 // 94 // 40 // 16 // 17 // 0 /// M62763 // GenBank // Rat 60 kDa protein and non-specific lipid transfer protein mRNA, complete cds. // chr5 // 97 // 74 // 30 // 31 // 0 /// XM_006238575 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus podocan-like (LOC102552895), mRNA. // chr5 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1 /// GENSCAN00000020470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131467884:131477254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000020477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131496310:131584275:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// AY539911 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00160 mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 26 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT045185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 76 // 76 // 32 // 42 // 1 /// NONRATT045187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 20 // 42 // 1
XM_001066935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zyg-11 family member A, cell cycle regulator (Zyg11a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_233348 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zyg-11 family member A, cell cycle regulator (Zyg11a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014514 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131641931:131676983:-1 gene:ENSRNOG00000010885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131640796:131663378:-1 gene:ENSRNOG00000010885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000020481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131640430:131676983:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
XM_001060075 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zyg-11 family member B, cell cycle regulator (Zyg11b), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014436 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131695011:131725479:-1 gene:ENSRNOG00000010859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131695011:131752925:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_001070397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 159, member A (Fam159a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_002726590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 159, member A (Fam159a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000043054 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:131813634:131829246:-1 gene:ENSRNOG00000030641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 159, member A (Fam159a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// XM_006238576 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 159, member A (Fam159a), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001106673 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione peroxidase 7 (Gpx7), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000013913 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:131847356:131855200:-1 gene:ENSRNOG00000009751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131847772:131855142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000044933 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:131895961:131896463:-1 gene:ENSRNOG00000032749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032006 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:131873682:131896463:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 43 // 43 // 9 // 21 // 1
NM_001106672 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-mRNA processing factor 38A (Prpf38a), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132015346:132027043:-1 gene:ENSRNOG00000009451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000032013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132015713:132026841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT045198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107952 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 9 (Zfyve9), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000037523 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132073607:132233186:-1 gene:ENSRNOG00000027183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132075420:132174316:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT045201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001044234 // RefSeq // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 9 (Osbpl9), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000065280 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:132534676:132679332:-1 gene:ENSRNOG00000033593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// BC089838 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7365348, with apparent retained intron. // chr5 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// BC105828 // GenBank // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7381705), complete cds. // chr5 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// FQ228495 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA7YL09 mRNA sequence. // chr5 // 97 // 95 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000000062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:132535266:132597616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 68 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT045206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT045207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 29 // 29 // 12 // 41 // 1 /// NONRATT045208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
NM_001271399 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689589 (LOC689589), mRNA. // chrU // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000012112 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:132993356:133008007:-1 gene:ENSRNOG00000009138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 67 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT045213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 83 // 15 // 15 // 0
GENSCAN00000010191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:133144182:133182344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_131902 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 2C (p18, inhibits CDK4) (Cdkn2c), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:133181576:133186731:-1 gene:ENSRNOG00000008956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF474980 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI/SegHsd cyclin-dependent kinase inhibitor 2c (Cdkn2c) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// AF474981 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 2c (Cdkn2c) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// BC088864 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 2C (p18, inhibits CDK4), mRNA (cDNA clone MGC:105252 IMAGE:7319164), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// GENSCAN00000010191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:133144182:133182344:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001077651 // RefSeq // Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 4 (Elavl4), mRNA. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006238591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 4 (Elavl4), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELAV like neuron-specific RNA binding protein 4 (Elavl4), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000035252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:133839926:133919410:-1 gene:ENSRNOG00000023601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// BC158558 // GenBank // Rattus norvegicus ELAV (embryonic lethal, abnormal vision, Drosophila)-like 4 (Hu antigen D), mRNA (cDNA clone MGC:187234 IMAGE:8371379), complete cds. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000008379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:133840120:133850793:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSRNOT00000071209 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:136695844:136747345:-1 gene:ENSRNOG00000049865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000075778 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:136712113:136747345:-1 gene:ENSRNOG00000049865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0
XR_145997 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T cells 10 (Skint10), transcript variant X1, misc_RNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_346687 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus selection and upkeep of intraepithelial T cells 10 (Skint10), misc_RNA. // chr5 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000033163 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:136847788:136865945:-1 gene:ENSRNOG00000022988 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000027717 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:136847788:136892061:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
XM_233422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus forkhead box D2 (Foxd2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137500467:137501951:-1 gene:ENSRNOG00000007759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137500467:137501951:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_134339 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box E3 (Foxe3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137517035:137517895:-1 gene:ENSRNOG00000007770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// L13207 // GenBank // Rattus norvegicus HNF-3/fork-head homolog-7 (HFH-7) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000032163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137517035:137517895:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025655 // RefSeq // Rattus norvegicus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 1 (Cmpk1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137551830:137578247:-1 gene:ENSRNOG00000007775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC098727 // GenBank // Rattus norvegicus cytidine monophosphate (UMP-CMP) kinase 1, cytosolic, mRNA (cDNA clone MGC:112719 IMAGE:7379366), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000032148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137552894:137569468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT045229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_145675 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily x, polypeptide 1 (Cyp4x1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000011985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137721033:137750571:-1 gene:ENSRNOG00000043513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF439343 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450 4X1 (Cyp4x1) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137721033:137750589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT045230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_031605 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 8 (Cyp4a8), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137769866:137799167:-1 gene:ENSRNOG00000008842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC081771 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 8, mRNA (cDNA clone MGC:93354 IMAGE:7108258), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// M37828 // GenBank // Rat cytochrome P450 mRNA, complete cds. // chr5 // 80 // 91 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000011532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137770801:137799153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001044770 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 2 (Cyp4a2), mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000051252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:137989329:138000280:-1 gene:ENSRNOG00000030154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC078684 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 2, mRNA (cDNA clone MGC:93048 IMAGE:7109305), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// BC098705 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 14, mRNA (cDNA clone MGC:112691 IMAGE:7106510), complete cds. // chr5 // 100 // 90 // 18 // 18 // 0 /// XM_006227245 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 2 (Cyp4a2), partial mRNA. // chr5 // 50 // 50 // 10 // 20 // 1 /// GENSCAN00000011538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:137989938:138000264:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 71 // 70 // 10 // 14 // 0
NM_175760 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily a, polypeptide 3 (Cyp4a3), mRNA. // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// M33936 // GenBank // Rat Cyp4a locus, encoding cytochrome P450 (IVA3) mRNA, complete cds. // chr5 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138259232:138274801:-1 gene:ENSRNOG00000009741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000045571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138263979:138316810:-1 gene:ENSRNOG00000009741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1 /// NONRATT045235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138259232:138274676:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// NONRATT045239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_016999 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily b, polypeptide 1 (Cyp4b1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138299565:138316870:-1 gene:ENSRNOG00000009741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC074012 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 4, subfamily b, polypeptide 1, mRNA (cDNA clone MGC:91453 IMAGE:7100197), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M29853 // GenBank // Rat cytochrome P-450 isozyme 5 (P450 IVB2) mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000036175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138299933:138316858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSRNOT00000013371 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:138332170:138333222:-1 gene:ENSRNOG00000010062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 79 // 100 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138332170:138333131:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001109566 // RefSeq // Rattus norvegicus testis expressed 38 (Tex38), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013480 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138421214:138422399:-1 gene:ENSRNOG00000010162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107961 // RefSeq // Rattus norvegicus diencephalon/mesencephalon homeobox 1 (Dmbx1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057055 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138550553:138559364:-1 gene:ENSRNOG00000010835 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000036153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138553498:138564867:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009710 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 41 (Lrrc41), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 41 (Lrrc41), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138711342:138732260:1 gene:ENSRNOG00000013642 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC087037 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 41, mRNA (cDNA clone MGC:93681 IMAGE:7133544), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138711446:138731772:1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT043420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001109263 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich adaptor protein 1 (Lurap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138775907:138785616:-1 gene:ENSRNOG00000023459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138754533:138785510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001004236 // RefSeq // Rattus norvegicus tetraspanin 1 (Tspan1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006238638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 1 (Tspan1), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006238639 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetraspanin 1 (Tspan1), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138803952:138808976:-1 gene:ENSRNOG00000023320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC078938 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspanin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93753 IMAGE:7108356), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138801935:138812942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT045252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001108005 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated serine/threonine kinase 2 (Mast2), mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:138933880:139079273:-1 gene:ENSRNOG00000000147 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:138933933:138966607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT045258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001035001 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 69 (Tmem69), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000050434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139190201:139195856:-1 gene:ENSRNOG00000029152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083906 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:95268 IMAGE:7133962), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC161923 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 69, mRNA (cDNA clone MGC:187670 IMAGE:8370867), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000031988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139191788:139209472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT045260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001005543 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear autoantigenic sperm protein (histone-binding) (Nasp), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139243239:139268227:-1 gene:ENSRNOG00000016454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC081913 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear autoantigenic sperm protein (histone-binding), mRNA (cDNA clone MGC:93869 IMAGE:7112076), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212041 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA71YN01 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139243342:139246994:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000032754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139251476:139267706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT045263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_031000 // RefSeq // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member A1 (aldehyde reductase) (Akr1a1), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139278242:139295142:-1 gene:ENSRNOG00000016727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC059133 // GenBank // Rattus norvegicus aldo-keto reductase family 1, member A1 (aldehyde reductase), mRNA (cDNA clone MGC:72802 IMAGE:6918695), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D10854 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for aldehyde reductase, complete cds. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// FQ214642 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YM15 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139278335:139287575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT045267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001107962 // RefSeq // Rattus norvegicus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblC type, with homocystinuria (Mmachc), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139351762:139357898:-1 gene:ENSRNOG00000017233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139352620:139355728:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT045271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001106680 // RefSeq // Rattus norvegicus target of EGR1, member 1 (nuclear) (Toe1), mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus target of EGR1, member 1 (nuclear) (Toe1), transcript variant X4, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139456024:139459589:-1 gene:ENSRNOG00000017561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139456364:139459461:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT045277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT045278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT045279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001014068 // RefSeq // Rattus norvegicus 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like (Hpdl), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139472196:139473311:-1 gene:ENSRNOG00000018143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// BC083702 // GenBank // Rattus norvegicus 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase-like, mRNA (cDNA clone MGC:94580 IMAGE:7190108), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032784 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139472196:139473311:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT045280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_019209 // RefSeq // Rattus norvegicus uroporphyrinogen decarboxylase (Urod), mRNA. // chr5 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139650565:139654649:-1 gene:ENSRNOG00000018211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// BC158690 // GenBank // Rattus norvegicus uroporphyrinogen decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:187707 IMAGE:8376316), complete cds. // chr5 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// FQ218910 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YC13 mRNA sequence. // chr5 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// FQ216162 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YF04 mRNA sequence. // chr5 // 50 // 96 // 13 // 26 // 0 /// FQ219934 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YN07 mRNA sequence. // chr5 // 58 // 96 // 15 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139650638:139653256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT045282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 92 // 96 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT045281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT045283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT045284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
XM_006225472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 19-like (LOC100361234), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 19-like (LOC100361234), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006225475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 19-like (LOC100361234), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 19-like (LOC100361234), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238729 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 19-like (LOC100361234), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238730 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 19-like (LOC100361234), transcript variant X6, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067675 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:139782809:139787901:-1 gene:ENSRNOG00000042163 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT045286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139782641:139787901:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_022187 // RefSeq // Rattus norvegicus polo-like kinase 3 (Plk3), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139790975:139796149:-1 gene:ENSRNOG00000018484 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139791307:139796036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NONRATT045289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT045288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT045289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NONRATT045288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000023474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139813939:139816358:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045290 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001085369 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 2C (Kif2c), transcript variant 1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 94 // 94 // 0 /// NM_134472 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 2C (Kif2c), transcript variant 2, mRNA. // chr5 // 100 // 97 // 91 // 91 // 0 /// ENSRNOT00000025903 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139821001:139846482:-1 gene:ENSRNOG00000019100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 94 // 94 // 0 /// ENSRNOT00000068395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139821001:139842907:-1 gene:ENSRNOG00000019100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 91 // 91 // 0 /// GENSCAN00000023464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139821506:139846367:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 97 // 91 // 91 // 0 /// NONRATT045292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 91 // 91 // 0 /// NONRATT045294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 94 // 94 // 0 /// U44979 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin-related protein 2 (KRP2) mRNA, complete cds. // chr5 // 98 // 97 // 89 // 91 // 0 /// NONRATT045293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 71 // 71 // 67 // 94 // 1 /// NONRATT045295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 12 // 12 // 11 // 94 // 1 /// NONRATT045296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 20 // 20 // 19 // 94 // 1
NM_001126297 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1563714 (RGD1563714), mRNA. // chr5 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000050195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:139866869:139905832:-1 gene:ENSRNOG00000031494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// BC160855 // GenBank // Rattus norvegicus RGD1563714, mRNA (cDNA clone MGC:187608 IMAGE:8364945), complete cds. // chr5 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT045297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139867052:139883488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT045298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
BC105775 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7932112. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000026201 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:139923825:139940470:-1 gene:ENSRNOG00000019236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000056882 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:139923825:140134648:-1 gene:ENSRNOG00000019236 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:139923825:139970684:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT045299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT045301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT045302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT045303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001015006 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA methyltransferase 1-associated protein 1 (Dmap1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140323215:140331218:-1 gene:ENSRNOG00000019407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC092651 // GenBank // Rattus norvegicus DNA methyltransferase 1-associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:109435 IMAGE:7319534), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140323263:140334576:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT045308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT045310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0
XM_001072022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 17 (Klf17), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006225485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 17 (Klf17), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006225486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 17 (Klf17), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 17 (Klf17), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006238743 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 17 (Klf17), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_233437 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Kruppel-like factor 17 (Klf17), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140392341:140399080:-1 gene:ENSRNOG00000019479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000038791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140351566:140399080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001134626 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 24 (Ccdc24), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 24 (Ccdc24), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006238711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 24 (Ccdc24), transcript variant X3, mRNA. // chr5 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000068130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140492723:140496047:-1 gene:ENSRNOG00000019586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140493269:140495952:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT045312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT045314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT045313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001107965 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4- galactosyltransferase, polypeptide 2 (B4galt2), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140496559:140505030:-1 gene:ENSRNOG00000019609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ214130 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YL01 mRNA sequence. // chr5 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140497278:140504732:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT045316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_001106681 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit B (Atp6v0b), mRNA. // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000026704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140507405:140508839:-1 gene:ENSRNOG00000019655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// BC159422 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal 21kDa, V0 subunit b, mRNA (cDNA clone MGC:188721 IMAGE:8376284), complete cds. // chr5 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ225932 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YK12 mRNA sequence. // chr5 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// NONRATT045320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000038806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140507686:140515319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT045322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT045319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT045321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001015007 // RefSeq // Rattus norvegicus DPH2 homolog (S. cerevisiae) (Dph2), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140512447:140515407:-1 gene:ENSRNOG00000019735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC092656 // GenBank // Rattus norvegicus DPH2 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109459 IMAGE:7320904), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT045323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038806 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140507686:140515319:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1
NM_053778 // RefSeq // Rattus norvegicus importin 13 (Ipo13), mRNA. // chr5 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000026844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140517789:140538029:-1 gene:ENSRNOG00000019758 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// AF110195 // GenBank // Rattus norvegicus late gestation lung 2 protein (Lgl2) mRNA, complete cds. // chr5 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// BC100658 // GenBank // Rattus norvegicus importin 13, mRNA (cDNA clone MGC:124583 IMAGE:7935813), complete cds. // chr5 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000038794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140517857:140537417:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT045324 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT045326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1 /// NONRATT045327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 28 // 28 // 11 // 40 // 1
NM_053397 // RefSeq // Rattus norvegicus artemin (Artn), mRNA. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026852 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140548766:140552035:-1 gene:ENSRNOG00000019842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC079078 // GenBank // Rattus norvegicus artemin, mRNA (cDNA clone MGC:94034 IMAGE:7122331), complete cds. // chr5 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140549165:140552100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT045328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_031697 // RefSeq // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 3 (St3gal3), mRNA. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140555257:140753537:-1 gene:ENSRNOG00000019843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// M97754 // GenBank // Rattus norvegicus CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactoside alpha-2-3-sialyltransferase mRNA, complete cds. // chr5 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000038773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140555257:140603201:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NONRATT045330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NM_001107966 // RefSeq // Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 4A (Kdm4a), mRNA. // chr5 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// XM_006238668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lysine (K)-specific demethylase 4A (Kdm4a), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 78 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000066165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140755996:140802764:-1 gene:ENSRNOG00000019956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 74 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000041122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140757250:140804934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 76 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT045331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT045332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1
NM_019249 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, F (Ptprf), mRNA. // chr5 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140826095:140893372:-1 gene:ENSRNOG00000019977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// L11586 // GenBank // Rat leukocyte common antigen-related phosphatase (LAR) mRNA, complete cds. // chr5 // 91 // 91 // 29 // 32 // 0 /// U00477 // GenBank // Rattus norvegicus LAR receptor-linked tyrosine phosphatase mRNA, complete cds. // chr5 // 90 // 29 // 9 // 10 // 0 /// GENSCAN00000041132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140822146:140901205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT045336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// X83546 // GenBank // R.norvegicus mRNA for leucocyte common antigen-related protein (3941 bp). // chr5 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 95 // 100 // 40 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0 /// NONRATT045344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 43 // 43 // 18 // 42 // 1 /// NONRATT045343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT045346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT045346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT045348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142619255:142734850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006238777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142619255:142734850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001069457 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// XM_006238777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seizure threshold 2 homolog (mouse) (Szt2), transcript variant X5, mRNA. // chr5 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000039235 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141025836:-1 gene:ENSRNOG00000028659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:140980270:141022276:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000045631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:142619255:142734850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_171993 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 20 (Cdc20), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141050192:141054395:-1 gene:ENSRNOG00000028415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085691 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 20 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:93111 IMAGE:7134739), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U05341 // GenBank // Rattus norvegicus p55CDC mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141050274:141070762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT045349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000034762 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:141058965:141070762:-1 gene:ENSRNOG00000028377 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141050274:141070762:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0
NM_053545 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine kinase with immunoglobulin-like and EGF-like domains 1 (Tie1), mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000027414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:5:141084010:141111588:-1 gene:ENSRNOG00000020173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC085911 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine kinase with immunoglobulin-like and EGF-like domains 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7098279). // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC169020 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine kinase with immunoglobulin-like and EGF-like domains 1, mRNA (cDNA clone MGC:189394 IMAGE:9099086), complete cds. // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000041143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141084365:141111538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT045350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
ENSRNOT00000009061 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:141159039:141159689:-1 gene:ENSRNOG00000006924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000041140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141159039:141159689:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT045356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 80 // 37 // 8 // 10 // 0
XM_003750006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 65-like (LOC679641), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009196 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:141170381:141244598:-1 gene:ENSRNOG00000007037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141170381:141244603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT045357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr5 // 86 // 85 // 19 // 22 // 0
XM_003750006 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 65-like (LOC679641), transcript variant X1, mRNA. // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// XM_003750021 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 65-like (LOC679641), transcript variant X2, mRNA. // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000009196 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:5:141170381:141244598:-1 gene:ENSRNOG00000007037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141170381:141244603:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:5:141436842:141456071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr5 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0