ENSRNOT00000001163 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:7047182:7047804:-1 gene:ENSRNOG00000000872 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000018000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7047182:7047804:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
NONRATT033669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT033671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NONRATT033669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_213559 // RefSeq // Rattus norvegicus superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae) (Skiv2l), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000481 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6599256:6609917:-1 gene:ENSRNOG00000000421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6599412:6609884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013197 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 19 (Stk19), mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000072446 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:6589829:6596880:-1 gene:ENSRNOG00000048929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// BC061571 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 19, mRNA (cDNA clone MGC:72963 IMAGE:6921289), complete cds. // chr20 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT033630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 76 // 84 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6575429:6597137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT033644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_031504 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 4A (Rodgers blood group) (C4a), mRNA. // chr20 // 79 // 62 // 23 // 29 // 0 /// AY149995 // GenBank // Rattus norvegicus complement component C4 mRNA, complete cds. // chr20 // 79 // 62 // 23 // 29 // 0 /// NM_001002805 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 4B (Chido blood group) (C4b), mRNA. // chr20 // 48 // 62 // 14 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000031704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6381703:6396071:-1 gene:ENSRNOG00000030729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 48 // 62 // 14 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000514 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:6575264:6587996:-1 gene:ENSRNOG00000000443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 51 // 51 // 24 // 47 // 1 /// ENSRNOT00000072377 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:4754571:4781010:-1 gene:ENSRNOG00000047657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 55 // 55 // 26 // 47 // 1 /// GENSCAN00000018443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6381803:6407167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 64 // 64 // 30 // 47 // 1 /// GENSCAN00000048367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6575429:6597137:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 51 // 51 // 24 // 47 // 1 /// GENSCAN00000052641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4677089:4836771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 60 // 60 // 28 // 47 // 1 /// NONRATT033626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 62 // 62 // 29 // 47 // 1 /// NONRATT033630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 47 // 47 // 22 // 47 // 1
NM_057101 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome P450, family 21, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp21a1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255906 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome P450, family 21, subfamily a, polypeptide 1 (Cyp21a1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6565575:6568637:-1 gene:ENSRNOG00000000428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U56853 // GenBank // Rattus norvegicus 21-hydroxylase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U56854 // GenBank // Rattus norvegicus 21-hydroxylase alternatively spliced mRNA, inactive form containing 3 introns. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048362 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6566048:6568629:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001004070 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-like-domain, multiple 8 (Egfl8), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NM_001165880 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-like-domain, multiple 8 (Egfl8), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006255976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EGF-like-domain, multiple 8 (Egfl8), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6457742:6459956:-1 gene:ENSRNOG00000000436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068712 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6457567:6459956:-1 gene:ENSRNOG00000000436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC127463 // GenBank // Rattus norvegicus EGF-like-domain, multiple 8, mRNA (cDNA clone MGC:156528 IMAGE:8362353), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT033630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT033633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT033634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000018417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6457513:6469355:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1 /// NONRATT033635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 19 // 38 // 1
NM_001109025 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 5, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6445602:6448046:-1 gene:ENSRNOG00000000438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088341 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:109637 IMAGE:7367801), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT033632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166354 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to butyrophilin-like 7 (RGD1624210), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000072694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6348954:6359267:-1 gene:ENSRNOG00000046294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000018447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6318976:6378447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 1
NM_001166351 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrophilin-like 5 (Btnl5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006255900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin-like protein 1-like (LOC100912021), mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000060394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4821316:4830921:-1 gene:ENSRNOG00000047304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000009261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4983375:5073282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 80 // 63 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000052641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4677089:4836771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
XR_361999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin subfamily 1 member A1-like (LOC102550513), misc_RNA. // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_212488 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrophilin-like 7 (Btnl7), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_003754623 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin subfamily 3 member A3-like (LOC100911938), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006255893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin-like 7 (Btnl7), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006255898 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin subfamily 3 member A3-like (LOC100911938), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006255903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin subfamily 3 member A3-like (LOC100911983), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000029409 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:4911244:4921302:-1 gene:ENSRNOG00000048841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000060389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5007213:5017445:-1 gene:ENSRNOG00000000446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000073990 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:4854922:4864980:-1 gene:ENSRNOG00000050170 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000052632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4854922:4982006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0
NM_001166344 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrophilin, subfamily 3, member A2 (Btn3a2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000029451 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:6319626:6326471:-1 gene:ENSRNOG00000049946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000018447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6318976:6378447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 67 // 86 // 4 // 6 // 0
NM_001166344 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrophilin, subfamily 3, member A2 (Btn3a2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000029451 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:6319626:6326471:-1 gene:ENSRNOG00000049946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_012708 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type, 9 (Psmb9), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000532 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6052972:6058393:-1 gene:ENSRNOG00000000459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091161 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 9 (large multifunctional peptidase 2), mRNA (cDNA clone MGC:108740 IMAGE:7366097), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// KC222887 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA proteasome subunit beta type-9 (Psmb9) mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// KC222888 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F proteasome subunit beta type-9 (Psmb9) mRNA, complete cds. // chr20 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// KC222889 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1I proteasome subunit beta type-9 (Psmb9) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// KC222890 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1H proteasome subunit beta type-9 (Psmb9) mRNA, complete cds. // chr20 // 81 // 96 // 21 // 26 // 0 /// KC222891 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1U proteasome subunit beta type-9 (Psmb9) mRNA, complete cds. // chr20 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6053174:6057666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT033617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_212495 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain containing 2 (Brd2), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7323527:7330397:1 gene:ENSRNOG00000000461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5990654:5996635:-1 gene:ENSRNOG00000045877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC100654 // GenBank HTC // Rattus norvegicus bromodomain containing 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7932198), with apparent retained intron. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017950 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7318000:7329847:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000018423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5987017:6002499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0
XR_362037 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64293-like (LOC100360320), misc_RNA. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000072646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5945907:5953586:-1 gene:ENSRNOG00000045855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000075724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7350805:7358485:1 gene:ENSRNOG00000047070 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001008885 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 7 (Slc39a7), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NM_001164744 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 7 (Slc39a7), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5898748:5902119:-1 gene:ENSRNOG00000000465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC079141 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 7, mRNA (cDNA clone MGC:94153 IMAGE:7127902), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ212833 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YC02 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5899265:5901754:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT033616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_212529 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 8 (Hsd17b8), mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255963 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 8 (Hsd17b8), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255964 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 8 (Hsd17b8), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255965 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 8 (Hsd17b8), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5896544:5898539:-1 gene:ENSRNOG00000000466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// BC091424 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365937), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT033610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT033612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5892017:5898523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT033609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT033611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT033613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NR_031932 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 219-1 (Mir219-1), microRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000053776 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:20:5895489:5895598:-1 gene:ENSRNOG00000035653 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// rno-mir-219a-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0000959 Rattus norvegicus miR-219a-1 stem-loop // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_212549 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 1 (Ring1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000543 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5891721:5895148:-1 gene:ENSRNOG00000000467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB568263 // GenBank // Rattus norvegicus Ring1 mRNA for ring finger protein 1, complete cds. // chr20 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// BC098635 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:112563 IMAGE:7098264), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040559 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5892017:5898523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_133553 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 4 (B3galt4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000550 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7504745:7506286:1 gene:ENSRNOG00000000471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB003478 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for beta1,3-galactosyltransferase, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC126083 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 4, mRNA (cDNA clone MGC:156596 IMAGE:8375818), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7504939:7506189:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT032862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001164718 // RefSeq // Rattus norvegicus prefoldin subunit 6 (Pfdn6), mRNA. // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NM_212506 // RefSeq // Rattus norvegicus prefoldin subunit 6 (Pfdn6), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7514596:7516060:1 gene:ENSRNOG00000000473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7514818:7515979:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT032863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001005878 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member C1 (Kifc1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006256113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kinesin family member C1 (Kifc1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7567671:7585186:1 gene:ENSRNOG00000000479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC083827 // GenBank // Rattus norvegicus kinesin family member C1, mRNA (cDNA clone MGC:94918 IMAGE:7112250), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7567722:7590639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0
NM_212538 // RefSeq // Rattus norvegicus PHD finger protein 1 (Phf1), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000059548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7585974:7590952:1 gene:ENSRNOG00000000480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC083843 // GenBank // Rattus norvegicus PHD finger protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94975 IMAGE:7114670), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT032870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000189 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7567722:7590639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// NONRATT032869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1 /// NONRATT032872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_213564 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 9 (Zbtb9), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 9 (Zbtb9), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7625764:7628014:1 gene:ENSRNOG00000026799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// BC100649 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:124529 IMAGE:7932768), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT032878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000000201 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7596792:7627554:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT032876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001009972 // RefSeq // Rattus norvegicus gametogenetin binding protein 1 (Ggnbp1), mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7684426:7690732:1 gene:ENSRNOG00000000486 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AY529104 // GenBank // Rattus norvegicus gametogenetin-binding protein 1 (Ggnbp1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC105838 // GenBank // Rattus norvegicus gametogenetin-binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:124911 IMAGE:7452960), complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7684489:7774702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_013138 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor, type 3 (Itpr3), mRNA. // chr20 // 95 // 100 // 55 // 58 // 0 /// ENSRNOT00000011516 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7711508:7774702:1 gene:ENSRNOG00000026651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 98 // 98 // 56 // 57 // 0 /// GQ233031 // GenBank // Rattus norvegicus inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 3 (Itpr3) mRNA, complete cds. // chr20 // 98 // 98 // 56 // 57 // 0 /// L06096 // GenBank // Rat inositol trisphosphate receptor subtype 3 (IP3R-3) mRNA, complete cds. // chr20 // 95 // 100 // 55 // 58 // 0 /// GENSCAN00000000208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7684489:7774702:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 54 // 54 // 0 /// NONRATT032882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 98 // 100 // 57 // 58 // 0
NM_017294 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 1 (Pacsin1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9482180:9489048:1 gene:ENSRNOG00000025083 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF104402 // GenBank // Rattus norvegicus syndapin I mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9472577:9488932:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT032952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001047939 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00097 (LOC499407), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRGT00097 (LOC499407), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000044760 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9532258:9563211:1 gene:ENSRNOG00000029402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9532258:9563393:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT032955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001271040 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide C (Snrpc), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9611426:9629603:1 gene:ENSRNOG00000000493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ209526 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YC21 mRNA sequence. // chr20 // 76 // 100 // 22 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023626 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:14348352:14348831:-1 gene:ENSRNOG00000017586 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 92 // 83 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT032957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9612790:9673740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
XM_002725844 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UHRF1 binding protein 1 (Uhrf1bp1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// XM_002728921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UHRF1 binding protein 1 (Uhrf1bp1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000049592 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:9633546:9673740:1 gene:ENSRNOG00000000495 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000039119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9612790:9673740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT032961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_001107613 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A (Anks1a), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1A (Anks1a), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000044395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9686588:9840938:1 gene:ENSRNOG00000000498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9744636:9792122:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT032963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9803284:9837699:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001271362 // RefSeq // Rattus norvegicus signal peptide, CUB domain, EGF-like 3 (Scube3), mRNA. // chr20 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000000593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9931818:9950181:1 gene:ENSRNOG00000000500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000000594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9931818:9947048:1 gene:ENSRNOG00000000500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000039147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9898292:9950181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 98 // 95 // 39 // 40 // 0
NM_001134755 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 523 (Zfp523), mRNA. // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9964697:9985907:1 gene:ENSRNOG00000000501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC168249 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 76 (expressed in testis), mRNA (cDNA clone MGC:188390 IMAGE:5598849), complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9965680:9985232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001191717 // RefSeq // Rattus norvegicus differentially expressed in FDCP 6 homolog (mouse) (Def6), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus differentially expressed in FDCP 6 homolog (mouse) (Def6), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9988008:10009186:1 gene:ENSRNOG00000000502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9987103:10009186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
NM_013141 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisome proliferator-activated receptor delta (Ppard), mRNA. // chr20 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// XM_006256168 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisome proliferator-activated receptor delta (Ppard), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042539 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10018464:10083772:1 gene:ENSRNOG00000000503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AJ306400 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for peroxisome proliferator-activated receptor beta (PPARb gene). // chr20 // 95 // 63 // 19 // 20 // 0 /// U40064 // GenBank // Rattus norvegicus PPAR delta protein (PPAR delta) mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// U75918 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisome proliferator activated receptor delta mRNA, complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT032975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10052139:10106292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_001191718 // RefSeq // Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group E (Fance), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10095446:10106503:1 gene:ENSRNOG00000000504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10052139:10106292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT032977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001113777 // RefSeq // Rattus norvegicus armadillo repeat containing 12 (Armc12), mRNA. // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10308966:10319455:1 gene:ENSRNOG00000000508 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC158769 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4930511I11, mRNA (cDNA clone MGC:188058 IMAGE:7115619), complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10308973:10368179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT032988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001135002 // RefSeq // Rattus norvegicus colipase-like 2 (Clpsl2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7827068:7829891:1 gene:ENSRNOG00000038807 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7823941:7829765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001013906 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 5 (Lhfpl5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7851367:7861665:1 gene:ENSRNOG00000022283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087673 // GenBank // Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 5, mRNA (cDNA clone MGC:105612 IMAGE:7316507), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000190 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7846564:7860243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT032884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031020 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 14 (Mapk14), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7968539:8028708:1 gene:ENSRNOG00000000513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7968539:8028708:1 gene:ENSRNOG00000000513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AB000783 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for p38 MAP kinase, complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF346293 // GenBank // Rattus norvegicus p38 mitogen-activated protein kinase alpha1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// BC092193 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 14, mRNA (cDNA clone MGC:105413 IMAGE:7313217), complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U73142 // GenBank // Rattus norvegicus p38 mitogen activated protein kinase mRNA, complete cds. // chr20 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// U91847 // GenBank // Rattus norvegicus p38 mitogen activated protein kinase mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT032886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7988625:8048092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1 /// NONRATT032889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_019231 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 13 (Mapk13), mRNA. // chr20 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8272098:8280990:1 gene:ENSRNOG00000000515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF092534 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase p38delta mRNA, complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// BC107849 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase 13, mRNA (cDNA clone MGC:124619 IMAGE:7936049), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT032896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8271968:8349770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1
NM_001107615 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain and PHD finger containing, 3 (Brpf3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain and PHD finger containing, 3 (Brpf3), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042143 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8307922:8337553:1 gene:ENSRNOG00000028641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8271968:8349770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191841 // RefSeq // Rattus norvegicus patatin-like phospholipase domain containing 1 (Pnpla1), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus patatin-like phospholipase domain containing 1 (Pnpla1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000033064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8355769:8393371:1 gene:ENSRNOG00000028622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8355769:8395866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
XM_001078592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 20 (Kctd20), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006223821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 20 (Kctd20), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006223822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 20 (Kctd20), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006256150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 20 (Kctd20), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256151 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 20 (Kctd20), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_006256152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 20 (Kctd20), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// XM_228042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 20 (Kctd20), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8459922:8468395:1 gene:ENSRNOG00000000517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8463043:8468395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT032903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001047907 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/arginine-rich splicing factor 3 (Srsf3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000000627 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8534915:8544847:1 gene:ENSRNOG00000000520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT032905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_080782 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 1A (Cdkn1a), mRNA. // chr20 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// XM_006256128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 1A (Cdkn1a), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8592437:8602879:1 gene:ENSRNOG00000000521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC100620 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase inhibitor 1A (p21, Cip1), mRNA (cDNA clone MGC:124547 IMAGE:7938247), complete cds. // chr20 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// U24174 // GenBank // Rattus norvegicus p21 (WAF1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 28 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT032911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT032912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000009537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8597441:8609770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XM_006223824 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB44, member RAS oncogene family (Rab44), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB44, member RAS oncogene family (Rab44), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000002553 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:8642480:8655402:1 gene:ENSRNOG00000001869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8629067:8662988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
XM_003751935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus allatostatin-A receptor-like (LOC100910615), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_003753469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus allatostatin-A receptor-like (LOC100910615), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000009503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8629067:8662988:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001170481 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidase inhibitor 16 (Pi16), mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000000632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9163205:9172499:1 gene:ENSRNOG00000000525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC100265 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7382429. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000049023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9163228:9175205:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0 /// NONRATT032932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
ENSRNOT00000072407 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:138003285:138004567:-1 gene:ENSRNOG00000051005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072776 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14596908:14598190:1 gene:ENSRNOG00000048504 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000072845 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:9184976:9186258:1 gene:ENSRNOG00000046314 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:54940686:54941968:-1 gene:ENSRNOG00000047509 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074538 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:59271854:59273136:1 gene:ENSRNOG00000048192 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:172047210:172048492:1 gene:ENSRNOG00000050867 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000075541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:5:165832069:165833351:-1 gene:ENSRNOG00000050976 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// U15425 // GenBank // Rattus norvegicus membrane- and microfilament-associated protein p58 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001107617 // RefSeq // Rattus norvegicus FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2 (Fgd2), mRNA. // chr20 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000041665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9212091:9228716:1 gene:ENSRNOG00000000528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// BC168916 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7192924, containing frame-shift errors. // chr20 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9212270:9228093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 85 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT032936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT032937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 31 // 12 // 39 // 1
NM_017034 // RefSeq // Rattus norvegicus pim-1 oncogene (Pim1), mRNA. // chr20 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10364285:10545832:1 gene:ENSRNOG00000000529 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10308973:10368179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001025059 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 22B (Tbc1d22b), mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000642 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:10434808:10477828:1 gene:ENSRNOG00000000534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AY380821 // GenBank // Rattus norvegicus TBC domain-containing protein mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10440971:10451560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT032993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1
NM_001025727 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 8, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf8), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256225 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 8, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf8), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger protein 8, E3 ubiquitin protein ligase (Rnf8), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000065629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10484895:10509126:1 gene:ENSRNOG00000047171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099079 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 8, mRNA (cDNA clone MGC:116114 IMAGE:7443362), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10484979:10505637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT032998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001014031 // RefSeq // Rattus norvegicus cap methyltransferase 1 (Cmtr1), mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10524633:10568580:1 gene:ENSRNOG00000000532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// AY539880 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00129 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// BC085799 // GenBank // Rattus norvegicus FtsJ methyltransferase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:93808 IMAGE:7110279), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10512060:10568185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT033001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1 /// NONRATT033002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001012175 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 3 (Zfand3), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10942042:11081446:1 gene:ENSRNOG00000000539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC085956 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, AN1-type domain 3, mRNA (cDNA clone MGC:95308 IMAGE:7134959), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10982303:11034112:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT033009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
XM_006256237 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein, axonemal, heavy chain 8 (Dnah8), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 84 // 84 // 0 /// ENSRNOT00000000651 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:11501454:11682367:1 gene:ENSRNOG00000000542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 99 // 84 // 74 // 75 // 0 /// ENSRNOT00000072949 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:11654512:11743556:1 gene:ENSRNOG00000000542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 22 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:11532601:11743556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 99 // 84 // 74 // 75 // 0
NM_012728 // RefSeq // Rattus norvegicus glucagon-like peptide 1 receptor (Glp1r), mRNA. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:11768514:11808416:1 gene:ENSRNOG00000001152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_362044 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucagon-like peptide 1 receptor (Glp1r), transcript variant X1, misc_RNA. // chr20 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000046026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:11768530:11880997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
XM_006223827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uromodulin-like 1 (Umodl1), mRNA. // chr20 // 98 // 100 // 40 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000042989 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:11825676:11880997:1 gene:ENSRNOG00000001157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000050744 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:11825676:11880997:1 gene:ENSRNOG00000001157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000046026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:11768530:11880997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 88 // 35 // 36 // 0
NM_053502 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 1 (Abcg1), mRNA. // chr20 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// XM_006256233 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily G (WHITE), member 1 (Abcg1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:11971328:12020646:1 gene:ENSRNOG00000001158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT033023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000035660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:11975954:12037823:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT033021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001107620 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, A (Ubash3a), mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, A (Ubash3a), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, A (Ubash3a), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, A (Ubash3a), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin associated and SH3 domain containing, A (Ubash3a), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12127337:12164639:1 gene:ENSRNOG00000001167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12111656:12163563:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001011944 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 37 (glucose-6-phosphate transporter), member 1 (Slc37a1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000001544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12216552:12278026:1 gene:ENSRNOG00000001169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC081990 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 37 (glycerol-3-phosphate transporter), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:94188 IMAGE:7129340), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000035665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12220364:12277215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT033028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT033030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT033029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_138543 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphodiesterase 9A (Pde9a), mRNA. // chr20 // 86 // 95 // 32 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000001559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12328642:12405854:1 gene:ENSRNOG00000001174 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// AF372654 // GenBank // Rattus norvegicus cGMP phosphodiesterase (PDE9A) mRNA, complete cds. // chr20 // 86 // 95 // 32 // 37 // 0 /// AY145898 // GenBank // Rattus norvegicus phosphodiesterase type 9 mRNA, complete cds. // chr20 // 91 // 90 // 32 // 35 // 0 /// BC161837 // GenBank // Rattus norvegicus phosphodiesterase 9A, mRNA (cDNA clone MGC:187334 IMAGE:9029236), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000035667 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12304053:12403541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT033032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT033031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT033034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 49 // 49 // 19 // 39 // 1 /// NONRATT033035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT033036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_022607 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 3 (Ndufv3), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000001564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12455139:12464611:1 gene:ENSRNOG00000001182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AB000098 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for MIPP65, complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000031099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12455226:12464539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT033039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT033040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 100 // 11 // 28 // 0 /// NONRATT041826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0 /// NONRATT041828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 100 // 13 // 28 // 0
NM_001013074 // RefSeq // Rattus norvegicus PBX/knotted 1 homeobox 1 (Pknox1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256188 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PBX/knotted 1 homeobox 1 (Pknox1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12522385:12544160:1 gene:ENSRNOG00000001184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC091397 // GenBank // Rattus norvegicus PBX/knotted 1 homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:109503 IMAGE:7323315), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031096 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12474984:12543992:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT033043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
XM_006223828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 1B (Rrp1b), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 1B (Rrp1b), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001583 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:13016119:13039473:1 gene:ENSRNOG00000001194 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000031982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13016131:13039473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031769 // RefSeq // Rattus norvegicus pyridoxal (pyridoxine, vitamin B6) kinase (Pdxk), mRNA. // chr20 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// ENSRNOT00000001589 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13102325:13124153:1 gene:ENSRNOG00000049937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// AF020346 // GenBank // Rattus norvegicus pyridoxal kinase mRNA, complete cds. // chr20 // 75 // 75 // 9 // 12 // 1 /// FQ213832 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YF24 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1 /// NONRATT033052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000031995 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13102429:13129012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 1
NM_001012073 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 1 (Rrp1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000001597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13153171:13164412:1 gene:ENSRNOG00000001203 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC087152 // GenBank // Rattus norvegicus ribosomal RNA processing 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:95206 IMAGE:7132167), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT033054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13153212:13260078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1 /// NONRATT033055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 92 // 92 // 33 // 36 // 1
NM_001106378 // RefSeq // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 (Agpat3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 (Agpat3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256246 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3 (Agpat3), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13285583:13314837:1 gene:ENSRNOG00000001205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC158873 // GenBank // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7933427), partial cds. // chr20 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT033061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13285269:13331287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_001173528 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 10 (Trappc10), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000032240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13338328:13398188:1 gene:ENSRNOG00000023210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13349982:13411867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001168653 // RefSeq // Rattus norvegicus PWP2 periodic tryptophan protein homolog (yeast) (Pwp2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000001605 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13398455:13412219:1 gene:ENSRNOG00000001210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000031968 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13349982:13411867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT033070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1
NM_001004225 // RefSeq // Rattus norvegicus homolog of zebrafish ES1 (RGD1303003), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001609 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13414047:13422143:1 gene:ENSRNOG00000001211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079380 // GenBank // Rattus norvegicus homolog of zebrafish ES1, mRNA (cDNA clone MGC:94888 IMAGE:7110981), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ213331 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YH09 mRNA sequence. // chr20 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// FQ216416 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA43YB04 mRNA sequence. // chr20 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13414057:13421678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1
NM_001106379 // RefSeq // Rattus norvegicus autoimmune regulator (Aire), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13535776:13550481:1 gene:ENSRNOG00000001213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13535834:13550292:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_013190 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphofructokinase, liver (Pfkl), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000001625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13563769:13585934:1 gene:ENSRNOG00000001214 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC061791 // GenBank // Rattus norvegicus phosphofructokinase, liver, mRNA (cDNA clone MGC:72281 IMAGE:5598160), complete cds. // chr20 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// GENSCAN00000009550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13563845:13585600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT033080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
NM_001011559 // RefSeq // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 2 (Trpm2), mRNA. // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13606332:13651945:1 gene:ENSRNOG00000001216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB193179 // GenBank // Rattus norvegicus TRPM2 mRNA for transient receptor potential melastatin family 2, complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// AY749166 // GenBank // Rattus norvegicus transient receptor potential cation channel subfamily M member 2 (Trpm2) mRNA, complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000009542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13606332:13660255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_145679 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 3 (Lrrc3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13659350:13660300:1 gene:ENSRNOG00000001217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB086432 // GenBank // Rattus norvegicus LRRC3 mRNA for Leucine-rich repeat-containing protein 3, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009542 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13606332:13660255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT033088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000045125 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:13778465:13778809:1 gene:ENSRNOG00000033928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001008307 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 207, member A (Fam207a), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:14030705:14064390:1 gene:ENSRNOG00000001225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC083697 // GenBank // Rattus norvegicus similar to C21orf70 protein, mRNA (cDNA clone MGC:94567 IMAGE:7189806), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14055493:14063353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000006500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14030739:14049012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001111055 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, RNA-specific, B1 (Adarb1), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001111056 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, RNA-specific, B1 (Adarb1), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_001111057 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, RNA-specific, B1 (Adarb1), transcript variant 4, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_012894 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, RNA-specific, B1 (Adarb1), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:14137260:14264944:1 gene:ENSRNOG00000001227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// U43534 // GenBank // Rattus norvegicus double-stranded RNA-specific editase (RED1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14229249:14261058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_053489 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XVIII, alpha 1 (Col18a1), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000045315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:14388743:14495241:1 gene:ENSRNOG00000001229 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14449917:14494259:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT033103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT033106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 15 // 39 // 1 /// NONRATT033108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 23 // 23 // 9 // 39 // 1
NM_001011945 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 3 (Pcbp3), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// XM_006256290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 3 (Pcbp3), transcript variant X8, mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:14590227:14789565:1 gene:ENSRNOG00000001245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// BC079196 // GenBank // Rattus norvegicus poly(rC) binding protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:94248 IMAGE:7131426), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT033110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000007532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14750601:14835059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// NONRATT033111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1
ENSRNOT00000001679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:14817563:14835866:1 gene:ENSRNOG00000001249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000007532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14750601:14835059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 93 // 84 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT033115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
XM_006256300 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 2 (Col6a2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_001100741 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type VI, alpha 2 (Col6a2), mRNA. // chr20 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000001695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:14931526:14959214:1 gene:ENSRNOG00000001254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// GENSCAN00000007575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14939634:14945920:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000034544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14946519:14958776:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 43 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT033119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001108529 // RefSeq // Rattus norvegicus ybeY metallopeptidase (Ybey), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15075086:15084562:1 gene:ENSRNOG00000021365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15075558:15080715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT033123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001191564 // RefSeq // Rattus norvegicus DIP2 disco-interacting protein 2 homolog A (Drosophila) (Dip2a), mRNA. // chr20 // 100 // 45 // 39 // 39 // 0 /// XM_006223845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pericentrin (Pcnt), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 98 // 51 // 43 // 44 // 0 /// XM_006256303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pericentrin (Pcnt), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 98 // 51 // 43 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000048218 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:15116797:15194771:1 gene:ENSRNOG00000001276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 41 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000066017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15201216:15285083:1 gene:ENSRNOG00000043212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 45 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000074737 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:15145894:15194771:1 gene:ENSRNOG00000001276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 31 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15102357:15284402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 99 // 85 // 72 // 73 // 0 /// NONRATT033135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 12 // 12 // 10 // 86 // 1
NM_001025144 // RefSeq // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 2 (Prmt2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15309078:15366940:1 gene:ENSRNOG00000001297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079112 // GenBank // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94107 IMAGE:7125748), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15350291:15368378:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
XM_001079755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 5 (neutral amino acid transporters, system A), member 4b (Slc5a4b), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15403024:15457768:-1 gene:ENSRNOG00000001298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000070992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15403158:15457768:-1 gene:ENSRNOG00000001298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000034590 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15403024:15426368:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000049232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15657534:15658115:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15743976:15744557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 62 // 12 // 13 // 0
XM_006223860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Homo sapiens fetal lung specific expression unknown (RGD1564162), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006256332 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Homo sapiens fetal lung specific expression unknown (RGD1564162), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000032257 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:15817930:15820632:1 gene:ENSRNOG00000028386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC160832 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7455757. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15818430:15820185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_012980 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 11 (Mmp11), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000031400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15825614:15834396:1 gene:ENSRNOG00000028344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099781 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 11, mRNA (cDNA clone MGC:124636 IMAGE:7933545), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U46034 // GenBank // Rattus norvegicus stromelysin 3 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15825629:15833652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 56 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT033143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
NM_001025728 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1 (Smarcb1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1 (Smarcb1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000029458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15836278:15858383:1 gene:ENSRNOG00000028302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC099195 // GenBank // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily b, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:116367 IMAGE:7383650), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15836474:15858136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_031051 // RefSeq // Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor (glycosylation-inhibiting factor) (Mif), mRNA. // chr20 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000008608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15885248:15886113:1 gene:ENSRNOG00000006589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// BC061545 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor, mRNA (cDNA clone MGC:72801 IMAGE:6920605), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// FQ222835 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA19YG08 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// U62326 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage migration inhibitory factor (Mif) mRNA, complete cds. // chr20 // 92 // 100 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000049238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15885332:15885993:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT033147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT033148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_012796 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, theta 2 (Gstt2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15913940:15950591:1 gene:ENSRNOG00000028188 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC061856 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, theta 2, mRNA (cDNA clone MGC:72535 IMAGE:5623709), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D10026 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for glutathione S-transferase Yrs-Yrs, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FJ179409 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase theta 2 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15914078:15920142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT033152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT033151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000040233 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:15957848:15958057:1 gene:ENSRNOG00000030787 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15914078:15920142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000053994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15954817:15958057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001109675 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, theta 4 (Gstt4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058314 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15968193:15975077:1 gene:ENSRNOG00000038300 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC097423 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Glutathione S-transferase theta-1 (GST class-theta-1) (Glutathione transferase T1-1), mRNA (cDNA clone MGC:114470 IMAGE:7455039), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15968193:15974981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053994 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15954817:15958057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 82 // 81 // 18 // 22 // 0
XM_006256341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhabdoid tumor deletion region gene 1 (Rtdr1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_001127557 // RefSeq // Rattus norvegicus rhabdoid tumor deletion region gene 1 (Rtdr1), mRNA. // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000041165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16760642:16769831:1 gene:ENSRNOG00000001315 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// BC162057 // GenBank // Rattus norvegicus rhabdoid tumor deletion region gene 1, mRNA (cDNA clone MGC:188048 IMAGE:7114691), complete cds. // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// GENSCAN00000039882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16760694:16769444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000039892 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16825424:16835219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT033173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
GENSCAN00000039888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16853229:16886194:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000033874 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:17414159:17414622:1 gene:ENSRNOG00000027153 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_001109337 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700049L16 (RGD1559903), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:19931569:19932366:1 gene:ENSRNOG00000000607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:19931629:19932156:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000034499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:20481342:20482055:1 gene:ENSRNOG00000024086 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000056131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:20481384:20481848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT033178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001106385 // RefSeq // Rattus norvegicus CDGSH iron sulfur domain 1 (Cisd1), mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:20659781:20673155:1 gene:ENSRNOG00000000610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC159419 // GenBank // Rattus norvegicus CDGSH iron sulfur domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:188705 IMAGE:8370407), complete cds. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ211256 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA14YD19 mRNA sequence. // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:20659705:20672841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT033180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001108530 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2D 1 (Ube2d1), mRNA. // chr20 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000000750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:20738031:20741952:1 gene:ENSRNOG00000000611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT033181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0
NM_031326 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor A, mitochondrial (Tfam), mRNA. // chr20 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:20760387:20772300:1 gene:ENSRNOG00000000613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB014089 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mitochondrial transcription factor A (r-mtTFA), complete cds. // chr20 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// AF377866 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor A precursor (Tfam) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr20 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// BC062022 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor A, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:72409 IMAGE:5623491), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:20760499:20771678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000056136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:20779569:20805863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001108531 // RefSeq // Rattus norvegicus BicC family RNA binding protein 1 (Bicc1), mRNA. // chr20 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000000754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:20939898:21092147:1 gene:ENSRNOG00000000614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000041543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:20953274:21091668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 65 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 98 // 98 // 41 // 42 // 0
NM_001012076 // RefSeq // Rattus norvegicus phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein-like (Phyhipl), mRNA. // chr20 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:21474055:21507653:1 gene:ENSRNOG00000000274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// BC078977 // GenBank // Rattus norvegicus phytanoyl-CoA 2-hydroxylase interacting protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:93860 IMAGE:7111966), complete cds. // chr20 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:21467184:21507653:1 gene:ENSRNOG00000000274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 77 // 77 // 23 // 30 // 1 /// NONRATT033185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:21426904:21507302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1
ENSRNOT00000053960 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:20:21871945:21872046:1 gene:ENSRNOG00000035837 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223869 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tctex1 domain-containing protein 2-like (RGD1564702), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tctex1 domain-containing protein 2-like (RGD1564702), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000780 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:22641378:22642712:1 gene:ENSRNOG00000000630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000057321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:22629450:22642632:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000031547 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:22673433:22673855:1 gene:ENSRNOG00000027983 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000057327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:22661841:22673855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
NM_019296 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 1 (Cdk1), mRNA. // chr20 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:22694920:22709859:1 gene:ENSRNOG00000000632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC091549 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 2, G1 to S and G2 to M, mRNA (cDNA clone MGC:112617 IMAGE:7388690), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000057323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:22697679:22709668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT033214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT033215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// NONRATT033216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001134576 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700040L02 (RGD1306739), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256356 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700040L02 (RGD1306739), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:23418565:23526792:1 gene:ENSRNOG00000000634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700040L02 (RGD1306739), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT033222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:23435231:23466806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107624 // RefSeq // Rattus norvegicus AT rich interactive domain 5B (Mrf1 like) (Arid5b), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000787 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:23939869:23980214:1 gene:ENSRNOG00000000635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// FQ229049 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA4YC14 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000033131 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:23665733:23889075:1 gene:ENSRNOG00000048473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000021455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:23920915:23995118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT033224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001025145 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 365 (Zfp365), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24159323:24183057:1 gene:ENSRNOG00000000638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087056 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 365, mRNA (cDNA clone MGC:94069 IMAGE:7124000), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24130488:24181707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001107626 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-aminoethanethiol (cysteamine) dioxygenase (Ado), mRNA. // chr20 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24434761:24509540:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_022186 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor binding factor 2 (Nrbf2), mRNA. // chr20 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000000794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24818944:24837210:1 gene:ENSRNOG00000000641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AB024930 // GenBank // Rattus norvegicus NRBF-2 mRNA for nuclear receptor binding factor-2, complete cds. // chr20 // 92 // 100 // 35 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000002990 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:10571469:10572332:1 gene:ENSRNOG00000002200 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000042769 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:215334735:215335598:-1 gene:ENSRNOG00000030494 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 55 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000013054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24769561:24836434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 68 // 68 // 26 // 38 // 1 /// GENSCAN00000015416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:10528344:10572332:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// GENSCAN00000021051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:215334735:215472677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1
NM_001106386 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor accessory protein 3 (Reep3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:25003934:25086732:1 gene:ENSRNOG00000000645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158870 // GenBank // Rattus norvegicus receptor accessory protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:188508 IMAGE:7930425), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:25019276:25210248:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006256369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Dynein, axonemal, light chain 4 (RGD1559781), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000000807 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:25235694:25236336:1 gene:ENSRNOG00000000650 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 95 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000004146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:25235694:25259938:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
XM_006223872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L36a-like (RGD1566373), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000047773 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:25549697:25550017:-1 gene:ENSRNOG00000032408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000015336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:25527514:25589022:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000040289 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:25796979:25797322:1 gene:ENSRNOG00000033677 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// GENSCAN00000015335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:25796979:25845779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001100860 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier), member 16 (Slc25a16), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000056047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29124028:29147931:-1 gene:ENSRNOG00000000387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166494 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, Graves disease autoantigen), member 16, mRNA (cDNA clone MGC:188021 IMAGE:7110872), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29126143:29147863:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
XM_006223878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA replication helicase/nuclease 2 (Dna2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006256397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA replication helicase/nuclease 2 (Dna2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_241671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA replication helicase/nuclease 2 (Dna2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000000438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29094517:29122979:-1 gene:ENSRNOG00000000389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000043709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29065440:29123373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 30 // 42 // 1 /// NONRATT034032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT034034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001168586 // RefSeq // Rattus norvegicus RUN and FYVE domain containing 2 (Rufy2), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006256393 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN and FYVE domain containing 2 (Rufy2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000037409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29061217:29090619:-1 gene:ENSRNOG00000000390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006256395 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RUN and FYVE domain-containing protein 2-like (LOC100910755), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// ENSRNOT00000037419 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:29021705:29048579:-1 gene:ENSRNOG00000050530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000043709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29065440:29123373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29025928:29048534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
XM_002728946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenazine biosynthesis-like protein domain containing 2 (Pbld2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_003753463 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenazine biosynthesis-like protein domain containing 2 (Pbld2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_138530 // RefSeq // Rattus norvegicus phenazine biosynthesis-like protein domain containing 1 (Pbld1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000434 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:28943839:28958143:-1 gene:ENSRNOG00000000386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC078735 // GenBank // Rattus norvegicus phenazine biosynthesis-like protein domain containing, mRNA (cDNA clone MGC:93185 IMAGE:7126368), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AY083160 // GenBank // Rattus norvegicus MAWDBP mRNA, complete cds. // chr20 // 81 // 81 // 17 // 21 // 1 /// XM_006256371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phenazine biosynthesis-like protein domain containing 1 (Pbld1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 71 // 71 // 15 // 21 // 1 /// NONRATT034027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT034028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 86 // 86 // 18 // 21 // 1 /// NONRATT034029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// GENSCAN00000043734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:28933358:28953391:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 48 // 48 // 10 // 21 // 1
NM_001170482 // RefSeq // Rattus norvegicus atonal homolog 7 (Drosophila) (Atoh7), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:28923499:28923948:-1 gene:ENSRNOG00000000384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:28923499:28923789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001012074 // RefSeq // Rattus norvegicus HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 (Herc4), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4 (Herc4), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000051367 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8063831:8138835:1 gene:ENSRNOG00000000381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC087104 // GenBank // Rattus norvegicus hect domain and RLD 4, mRNA (cDNA clone MGC:94698 IMAGE:7192894), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8066035:8138576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT032891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001034032 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 12 (Dnajc12), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8200164:8222140:1 gene:ENSRNOG00000000379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB062135 // GenBank // Rattus norvegicus Jdp1 mRNA for J domain protein 1, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC100072 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:112633 IMAGE:7325259), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8200212:8226533:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002725827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), alpha 3 (Ctnna3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:28580212:28654253:-1 gene:ENSRNOG00000000378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000057950 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:27189005:27896704:-1 gene:ENSRNOG00000000373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// BC166848 // GenBank // Rattus norvegicus similar to catenin alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:188744 IMAGE:9035703), complete cds. // chr20 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT034024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT034026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001013907 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 12 (Dnajb12), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31249072:31266937:1 gene:ENSRNOG00000030408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC090076 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 12, mRNA (cDNA clone MGC:94679 IMAGE:7192431), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ223748 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA87YP01 mRNA sequence. // chr20 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT033270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31258130:31271569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT033271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT033273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001007632 // RefSeq // Rattus norvegicus activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 (Ascc1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 (Ascc1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256408 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus activating signal cointegrator 1 complex subunit 1 (Ascc1), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31364396:31450468:1 gene:ENSRNOG00000000575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ226270 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YM02 mRNA sequence. // chr20 // 91 // 73 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000010119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31359532:31381832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000043610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31400120:31448379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT033278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT033277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT033279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT033280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT033282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001108533 // RefSeq // Rattus norvegicus sparc/osteonectin, cwcv and kazal-like domains proteoglycan (testican) 2 (Spock2), mRNA. // chr20 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000698 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31456801:31479643:1 gene:ENSRNOG00000000573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31456801:31478962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT033284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0
NM_001190236 // RefSeq // Rattus norvegicus prosaposin (Psap), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_001190238 // RefSeq // Rattus norvegicus prosaposin (Psap), transcript variant 4, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NM_013013 // RefSeq // Rattus norvegicus prosaposin (Psap), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000000696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31629576:31668604:1 gene:ENSRNOG00000000571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC061759 // GenBank // Rattus norvegicus prosaposin, mRNA (cDNA clone MGC:72521 IMAGE:5600088), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// M19936 // GenBank // Rat sulfated glycoprotein 1 (SGP-1) mRNA, complete cds. // chr20 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// NM_001190237 // RefSeq // Rattus norvegicus prosaposin (Psap), transcript variant 3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// GENSCAN00000043620 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31629653:31667787:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001044300 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC690899 (MGC112715), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31709059:31731463:1 gene:ENSRNOG00000000569 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC098723 // GenBank // Rattus norvegicus platelet receptor Gi24, mRNA (cDNA clone MGC:112715 IMAGE:7377326), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31709153:31730617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007601 // RefSeq // Rattus norvegicus pterin-4 alpha-carbinolamine dehydratase/dimerization cofactor of hepatocyte nuclear factor 1 alpha (Pcbd1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32402034:32491710:1 gene:ENSRNOG00000000566 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// M83740 // GenBank // Rat cofactor mRNA sequence. // chr20 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// NONRATT033293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32401425:32491316:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT033294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
XM_006223905 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thymus, brain and testes associated (Tbata), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006256486 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thymus, brain and testes associated (Tbata), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000000683 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:32582719:32595910:1 gene:ENSRNOG00000000564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000047394 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:32581738:32595910:1 gene:ENSRNOG00000000564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// XM_006223909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thymus, brain and testes associated (Tbata), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006256489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thymus, brain and testes associated (Tbata), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// GENSCAN00000003159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32566575:32595910:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT033295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT033296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
ENSRNOT00000035216 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:32691226:32691999:1 gene:ENSRNOG00000025046 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0
NM_017330 // RefSeq // Rattus norvegicus perforin 1 (pore forming protein) (Prf1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32706313:32711803:1 gene:ENSRNOG00000000562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089808 // GenBank // Rattus norvegicus perforin 1 (pore forming protein), mRNA (cDNA clone MGC:108712 IMAGE:7378633), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M33605 // GenBank // Rat cytolysin mRNA, complete cds. // chr20 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000003158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32704890:32711597:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109171 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 20 (Lrrc20), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32881662:32985238:1 gene:ENSRNOG00000000560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ223562 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA9YI23 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32887998:32982904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022291 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropeptide FF receptor 1 (Npffr1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33016962:33028398:1 gene:ENSRNOG00000000559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB040103 // GenBank // Rattus norvegicus OT7T022 mRNA for RFamide-related peptide receptor, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF268901 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide FF receptor 1 (NPFF1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF330056 // GenBank // Rattus norvegicus neuropeptide NPVF receptor mRNA, complete cds. // chr20 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32997176:33028398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001100834 // RefSeq // Rattus norvegicus pyrophosphatase (inorganic) 1 (Ppa1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33048101:33089923:1 gene:ENSRNOG00000000558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ212840 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YB09 mRNA sequence. // chr20 // 67 // 100 // 22 // 33 // 0 /// FQ214758 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YD10 mRNA sequence. // chr20 // 52 // 94 // 16 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33048267:33089684:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT033304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 73 // 73 // 24 // 33 // 1
NM_001007739 // RefSeq // Rattus norvegicus secretion associated, Ras related GTPase 1A (Sar1a), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33095744:33108149:1 gene:ENSRNOG00000000557 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079228 // GenBank // Rattus norvegicus SAR1 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94305 IMAGE:7132455), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ232554 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YE17 mRNA sequence. // chr20 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000027870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33100305:33106260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT033306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// NONRATT033308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT033309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT033310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001108932 // RefSeq // Rattus norvegicus trypsin domain containing 1 (Tysnd1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036719 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33110493:33116211:1 gene:ENSRNOG00000024839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC160877 // GenBank // Rattus norvegicus trypsin domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:188254 IMAGE:7373508), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33110551:33115660:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001139483 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis-inducing factor, mitochondrion-associated 2 (Aifm2), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256452 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apoptosis-inducing factor, mitochondrion-associated 2 (Aifm2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006256455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apoptosis-inducing factor, mitochondrion-associated 2 (Aifm2), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000035982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33137031:33152531:1 gene:ENSRNOG00000024823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027851 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33126339:33150261:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT033315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT033316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_021700 // RefSeq // Rattus norvegicus neurogenin 3 (Neurog3), mRNA. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33556854:33558331:1 gene:ENSRNOG00000024413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000057809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33553081:33557943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT033320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001106394 // RefSeq // Rattus norvegicus nodal growth differentiation factor (Nodal), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32822880:32831247:1 gene:ENSRNOG00000000556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32823166:32836622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003753480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus radial spoke head 4 homolog A (Chlamydomonas) (Rsph4a), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036449 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34234746:34250836:1 gene:ENSRNOG00000049696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064063 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:35706187:35721923:1 gene:ENSRNOG00000047471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027917 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34234746:34250836:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35706187:35721923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025113 // RefSeq // Rattus norvegicus karyopherin alpha 5 (importin alpha 6) (Kpna5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XR_362222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus karyopherin alpha 5 (importin alpha 6) (Kpna5), transcript variant X3, misc_RNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046268 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34297579:34353838:1 gene:ENSRNOG00000030109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY779029 // GenBank // Rattus norvegicus karyopherin alpha 5 (Kpna5) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34293650:34353785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000048735 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:34486350:34487033:1 gene:ENSRNOG00000030934 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0
NM_001106388 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory factor X, 6 (Rfx6), mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256444 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulatory factor X, 6 (Rfx6), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000030642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34502142:34548438:1 gene:ENSRNOG00000027949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34493868:34547814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35730736:35785919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT033327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
ENSRNOT00000000454 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:34814754:34816365:1 gene:ENSRNOG00000000403 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34814673:34815975:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000000455 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:34830239:34847800:1 gene:ENSRNOG00000000404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 100 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000015398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34830239:34847604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
NM_001107630 // RefSeq // Rattus norvegicus vestigial-like family member 2 (Vgll2), mRNA. // chr20 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34858272:34864128:1 gene:ENSRNOG00000000405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT033329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0
NM_001009344 // RefSeq // Rattus norvegicus transforming growth factor beta regulator 1 (Tbrg1), mRNA. // chr20 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000039729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:40115616:40123274:-1 gene:ENSRNOG00000023850 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// BC087142 // GenBank // Rattus norvegicus transforming growth factor beta regulator 1, mRNA (cDNA clone MGC:95119 IMAGE:7127799), complete cds. // chr20 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000045139 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:34956668:34964019:1 gene:ENSRNOG00000033891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 91 // 100 // 30 // 33 // 0 /// GENSCAN00000003949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34956714:34957931:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34962610:34963827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:40115811:40123189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT054750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// NONRATT054751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 88 // 100 // 29 // 33 // 0 /// NONRATT054754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
XM_006223911 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus discoidin, CUB and LCCL domain containing 1 (Dcbld1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006256492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus discoidin, CUB and LCCL domain containing 1 (Dcbld1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000462 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:35139175:35232665:1 gene:ENSRNOG00000000407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000074758 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:35139175:35232665:1 gene:ENSRNOG00000000407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000003961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35139175:35232665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT033330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001107632 // RefSeq // Rattus norvegicus nephrocan (Nepn), mRNA. // chr20 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// XM_006256491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nephrocan (Nepn), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:35306004:35321920:1 gene:ENSRNOG00000000410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000003956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35302876:35321664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001164157 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear undecaprenyl pyrophosphate synthase 1 homolog (S. cerevisiae) (Nus1), mRNA. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:35336831:35363789:1 gene:ENSRNOG00000000411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35336922:35361118:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
GENSCAN00000023194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35982367:35983503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000037406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:35982435:35983503:1 gene:ENSRNOG00000026980 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 65 // 100 // 15 // 23 // 0
NM_001109338 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 35, member F1 (Slc35f1), mRNA. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:36017841:36174319:1 gene:ENSRNOG00000000412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35992011:36019546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT033335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000023193 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:36068961:36171291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_022707 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholamban (Pln), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000469 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:36390886:36398875:1 gene:ENSRNOG00000000413 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT033337 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106389 // RefSeq // Rattus norvegicus anti-silencing function 1A histone chaperone (Asf1a), mRNA. // chr20 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000000471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:36651864:36666710:1 gene:ENSRNOG00000000415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032568 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:36651930:36664698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT033341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
XR_147067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative deoxyribonuclease TATDN1-like (LOC690068), misc_RNA. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070909 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:7:99382591:99403953:-1 gene:ENSRNOG00000047198 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025267 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:38280412:38281086:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT051764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT051765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 90 // 84 // 19 // 21 // 0
NM_001014032 // RefSeq // Rattus norvegicus male-specific lethal 3-like 2 (Drosophila) (Msl3l2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:39332020:39333479:1 gene:ENSRNOG00000000801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079056 // GenBank // Rattus norvegicus male-specific lethal 3-like 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94000 IMAGE:7115468), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:39332347:39337017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT033344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012567 // RefSeq // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 1 (Gja1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:39612108:39624547:1 gene:ENSRNOG00000000805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY324140 // GenBank // Rattus norvegicus gap junction membrane channel protein alpha1 (Gja1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY555737 // GenBank // Rattus norvegicus connexin 43 (Cx43) mRNA, partial cds. // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC081842 // GenBank // Rattus norvegicus gap junction protein, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:93610 IMAGE:7105924), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// X06656 // GenBank // Rat heart mRNA for gap junction protein connexin43. // chr20 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
ENSRNOT00000034243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:39646032:39647028:1 gene:ENSRNOG00000028722 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:39646168:39647028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT033348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0
GENSCAN00000018122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:39781721:39782724:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000045365 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:39781721:39782724:1 gene:ENSRNOG00000029603 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0
ENSRNOT00000032954 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:40082358:40083164:1 gene:ENSRNOG00000028692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 75 // 100 // 15 // 20 // 0
ENSRNOT00000072283 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:40271203:40272258:1 gene:ENSRNOG00000047889 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000009713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:40264536:40272258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT033349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_031694 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock transcription factor 2 (Hsf2), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock transcription factor 2 (Hsf2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256507 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock transcription factor 2 (Hsf2), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:40673635:40701124:1 gene:ENSRNOG00000000808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF172640 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock factor 2 (hsf2) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC086554 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:105394 IMAGE:7302950), complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000022033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:40645399:40693417:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT033352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_030832 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 7, brain (Fabp7), mRNA. // chr20 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:42501163:42504695:1 gene:ENSRNOG00000000814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// BC088132 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7321937. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// U02096 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley fatty acid binding protein mRNA, complete cds. // chr20 // 93 // 94 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT033362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT033363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT033364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42411992:42587384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001005539 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3A (Smpdl3a), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:42510561:42532381:1 gene:ENSRNOG00000000815 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC082029 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase, acid-like 3A, mRNA (cDNA clone MGC:95161 IMAGE:7130096), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42411992:42587384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// NONRATT033367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
ENSRNOT00000030348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29996973:30079806:-1 gene:ENSRNOG00000028598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// FQ211923 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YG05 mRNA sequence. // chr20 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29999034:30020739:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000035415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:30022595:30037520:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
NM_001108933 // RefSeq // Rattus norvegicus dermatan sulfate epimerase (Dse), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dermatan sulfate epimerase (Dse), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000001093 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29528501:29603844:-1 gene:ENSRNOG00000000824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC168891 // GenBank // Rattus norvegicus dermatan sulfate epimerase, mRNA (cDNA clone MGC:189153 IMAGE:7110121), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29508081:29578359:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000057317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29505896:29507582:-1 gene:ENSRNOG00000037757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC093379 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 26, member F, mRNA (cDNA clone MGC:112673 IMAGE:7388112), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ230614 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YL17 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013418 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29505967:29507519:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT034039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000057313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29476309:29482652:-1 gene:ENSRNOG00000000825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089225 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 26, member E, mRNA (cDNA clone MGC:105561 IMAGE:7309006), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29476976:29482545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT034038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001053163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 26, member D (Fam26d), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_574768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 26, member D (Fam26d), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000708 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:29402840:29405551:-1 gene:ENSRNOG00000000580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29402840:29405551:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XM_003754670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger E-box-binding homeobox protein zag-1-like (RGD1563747), mRNA. // chr20 // 76 // 77 // 31 // 41 // 0 /// XM_006227180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diencephalon/mesencephalon homeobox protein 1-A-like (LOC102557400), mRNA. // chr20 // 25 // 25 // 13 // 53 // 1 /// GENSCAN00000022075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:36793667:36794839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 45 // 62 // 15 // 33 // 0 /// NONRATT034136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 43 // 9 // 23 // 0 /// NONRATT034137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 43 // 9 // 23 // 0 /// NONRATT034138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 43 // 9 // 23 // 0 /// NONRATT034139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 43 // 9 // 23 // 0 /// NONRATT034140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 43 // 9 // 23 // 0 /// NONRATT034141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 43 // 9 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:36790193:36791365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 25 // 25 // 13 // 53 // 1 /// GENSCAN00000054430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42615113:42648024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 34 // 34 // 18 // 53 // 1 /// GENSCAN00000054439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42601819:42609765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 26 // 26 // 14 // 53 // 1 /// GENSCAN00000054440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42610874:42614362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 28 // 28 // 15 // 53 // 1
XM_003754670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger E-box-binding homeobox protein zag-1-like (RGD1563747), mRNA. // chr20 // 60 // 96 // 15 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42615113:42648024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 100 // 8 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42601819:42609765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 38 // 100 // 10 // 26 // 0
XM_003754670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger E-box-binding homeobox protein zag-1-like (RGD1563747), mRNA. // chr20 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// XM_006227180 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus diencephalon/mesencephalon homeobox protein 1-A-like (LOC102557400), mRNA. // chr20 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42601819:42609765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42610874:42614362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001013033 // RefSeq // Rattus norvegicus TSPY-like 1 (Tspyl1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:42813240:42815798:1 gene:ENSRNOG00000000549 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081955 // GenBank // Rattus norvegicus TSPY-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:94049 IMAGE:7123128), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42813271:42814410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 93 // 60 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT033368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012075 // RefSeq // Rattus norvegicus TSPY-like 4 (Tspyl4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:42829886:42831871:1 gene:ENSRNOG00000000547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC082023 // GenBank // Rattus norvegicus TSPY-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:95153 IMAGE:7129838), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42829943:42831166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT033369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001053056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type X, alpha 1 (Col10a1), mRNA. // chr20 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000000655 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:42913374:42918535:1 gene:ENSRNOG00000000545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// AJ131848 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for collagen alpha 1 type X, partial. // chr20 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42910511:42918535:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 89 // 36 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT033372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_024368 // RefSeq // Rattus norvegicus fyn-related kinase (Frk), mRNA. // chr20 // 96 // 100 // 55 // 57 // 0 /// ENSRNOT00000000653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:42996503:43114433:1 gene:ENSRNOG00000000543 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 41 // 41 // 0 /// U09583 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley src related tyrosine kinase mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 55 // 57 // 0 /// NONRATT033373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// GENSCAN00000056778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42990767:43114905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 33 // 33 // 19 // 57 // 1
NM_001106392 // RefSeq // Rattus norvegicus heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 5 (Hs3st5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:41969878:42279750:1 gene:ENSRNOG00000000605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42265887:42278907:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 65 // 15 // 17 // 0 /// NONRATT033354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053447 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 2 (Hdac2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:44811967:44835337:-1 gene:ENSRNOG00000000604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:44792197:44835218:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1
GENSCAN00000022118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:44711283:44722452:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000035261 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:44711283:44712272:-1 gene:ENSRNOG00000025078 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0
ENSRNOT00000073740 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:44690978:44691353:-1 gene:ENSRNOG00000046812 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_006256537 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551702 (LOC102551702), mRNA. // chrU // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000042191 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:45318461:45334146:1 gene:ENSRNOG00000032548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// AY539909 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00158 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000000737 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:45787184:45926467:1 gene:ENSRNOG00000000599 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// FQ221747 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA32YF16 mRNA sequence. // chr20 // 92 // 97 // 34 // 37 // 0 /// GENSCAN00000043761 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:45847876:45878894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 26 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000043768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:45883786:45969362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1 /// NONRATT033383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_001108536 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, epsilon 1 (Tube1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000047194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:45947864:45965854:1 gene:ENSRNOG00000000598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000043768 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:45883786:45969362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT033385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT033386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT033387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT033388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1
NM_012755 // RefSeq // Rattus norvegicus FYN oncogene related to SRC, FGR, YES (Fyn), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FYN oncogene related to SRC, FGR, YES (Fyn), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000000733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:46161060:46352027:1 gene:ENSRNOG00000000596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// FQ232093 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YA17 mRNA sequence. // chr20 // 83 // 41 // 10 // 12 // 0 /// U35365 // GenBank // Rattus norvegicus proto-oncogene FYN (p59fyn) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46292010:46324964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT033391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001044248 // RefSeq // Rattus norvegicus Traf3 interacting protein 2 (Traf3ip2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Traf3 interacting protein 2 (Traf3ip2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256531 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Traf3 interacting protein 2 (Traf3ip2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Traf3 interacting protein 2 (Traf3ip2), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XR_362260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Traf3 interacting protein 2 (Traf3ip2), transcript variant X5, misc_RNA. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000000728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:46401898:46445444:1 gene:ENSRNOG00000000595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100099 // GenBank // Rattus norvegicus Traf3 interacting protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:112844 IMAGE:7376204), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Traf3 interacting protein 2 (Traf3ip2), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46354142:46683022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001083966 // RefSeq // Rattus norvegicus REV3-like, polymerase (DNA directed), zeta, catalytic subunit (Rev3l), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000057227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:46526299:46683995:1 gene:ENSRNOG00000000593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000001009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46354142:46683022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 33 // 33 // 0
XR_343914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551463 (LOC102551463), ncRNA. // chr20 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XR_362272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551463 (LOC102551463), ncRNA. // chr20 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT033402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0
J01884 // GenBank // Rat U3A small nuclear RNA. // chr20 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT033403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001107634 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 19 (Cdk19), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47178053:47318293:1 gene:ENSRNOG00000000583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47305901:47314282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT033407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109465 // RefSeq // Rattus norvegicus D-aspartate oxidase (Ddo), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003751978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus D-aspartate oxidase-like (LOC100911156), mRNA. // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000000710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:50384344:50403396:-1 gene:ENSRNOG00000000582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50384344:50520965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000002514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47377340:47405469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001025038 // RefSeq // Rattus norvegicus methyltransferase like 24 (Mettl24), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:50231978:50352320:-1 gene:ENSRNOG00000024221 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000023146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50271642:50309968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
XM_003751979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate kinase domain containing 2 (Akd2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753496 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate kinase domain containing 2 (Akd2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057187 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47754258:47799402:1 gene:ENSRNOG00000037688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47754258:47827243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
ENSRNOT00000000342 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47770834:47772319:1 gene:ENSRNOG00000000311 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000002512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47754258:47827243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 10 // 14 // 1
XM_006256557 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate kinase 9-like (RGD1560386), partial mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47754258:47827243:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_006256557 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate kinase 9-like (RGD1560386), partial mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47833565:47859183:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001098667 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 24 (Zbtb24), mRNA. // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006256544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 24 (Zbtb24), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000057175 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47865623:47882126:1 gene:ENSRNOG00000000308 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009718 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47864947:47880656:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT033415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001106397 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated monooxygenase, calponin and LIM domain containing 1 (Mical1), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47892301:47904250:1 gene:ENSRNOG00000000307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47891975:47904109:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006256545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 6 (Ppil6), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256547 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 6 (Ppil6), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47907699:47929203:1 gene:ENSRNOG00000043186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47907699:47936062:1 gene:ENSRNOG00000043186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47907699:47930341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0
NM_031812 // RefSeq // Rattus norvegicus CD164 molecule, sialomucin (Cd164), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47942770:47954348:1 gene:ENSRNOG00000000304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062064 // GenBank // Rattus norvegicus CD164 molecule, sialomucin, mRNA (cDNA clone MGC:72385 IMAGE:5599253), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ210726 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA23YJ07 mRNA sequence. // chr20 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47942787:47950943:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT033421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106396 // RefSeq // Rattus norvegicus sestrin 1 (Sesn1), mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256561 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sestrin 1 (Sesn1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:48347551:48437686:1 gene:ENSRNOG00000000302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:48416084:48436634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT033431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT033432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_001047940 // RefSeq // Rattus norvegicus Ab2-018 (LOC499469), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071045 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:48386743:48402644:1 gene:ENSRNOG00000049990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:48377548:48402639:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT033429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001029925 // RefSeq // Rattus norvegicus osteopetrosis associated transmembrane protein 1 (Ostm1), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// XM_006256577 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus osteopetrosis associated transmembrane protein 1 (Ostm1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000057116 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:49062741:49092280:1 gene:ENSRNOG00000037647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC097978 // GenBank // Rattus norvegicus osteopetrosis associated transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116111 IMAGE:7442765), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000006421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:49062772:49105754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0
NM_001107637 // RefSeq // Rattus norvegicus SEC63 homolog (S. cerevisiae) (Sec63), mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000036365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:49156193:49225366:1 gene:ENSRNOG00000000314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000006428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:49156423:49221925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT033438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT033439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1
NM_001107638 // RefSeq // Rattus norvegicus sex comb on midleg-like 4 (Drosophila) (Scml4), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sex comb on midleg-like 4 (Drosophila) (Scml4), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256573 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sex comb on midleg-like 4 (Drosophila) (Scml4), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:49258821:49350697:1 gene:ENSRNOG00000026110 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000007670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:49325028:49347690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000006420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:49315191:49321212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT033440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001109496 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688390 (LOC688390), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038842 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:49571819:49573769:1 gene:ENSRNOG00000026080 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:49570598:49607734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001014249 // RefSeq // Rattus norvegicus prenyl (decaprenyl) diphosphate synthase, subunit 2 (Pdss2), mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:49627299:49851499:1 gene:ENSRNOG00000042962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC085898 // GenBank // Rattus norvegicus prenyl (decaprenyl) diphosphate synthase, subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:94721 IMAGE:7193369), complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// FQ227135 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YP16 mRNA sequence. // chr20 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT033444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
ENSRNOT00000040519 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:49871134:49871424:1 gene:ENSRNOG00000032964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 78 // 86 // 14 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:49871134:49871463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_012752 // RefSeq // Rattus norvegicus CD24 molecule (Cd24), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:49989320:49994626:1 gene:ENSRNOG00000000321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC064439 // GenBank // Rattus norvegicus CD24 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:72544 IMAGE:5623514), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC081851 // GenBank // Rattus norvegicus CD24 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:93641 IMAGE:7110912), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212648 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YB20 mRNA sequence. // chr20 // 75 // 77 // 15 // 20 // 0 /// U49062 // GenBank // Rattus norvegicus heat stable antigen CD24 mRNA, complete cds. // chr20 // 83 // 69 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT033448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT033449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 91 // 85 // 20 // 22 // 0
NM_001107644 // RefSeq // Rattus norvegicus reticulon 4 interacting protein 1 (Rtn4ip1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256589 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reticulon 4 interacting protein 1 (Rtn4ip1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus reticulon 4 interacting protein 1 (Rtn4ip1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:50523654:50565353:1 gene:ENSRNOG00000000279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC082054 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7132213. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166465 // GenBank // Rattus norvegicus reticulon 4 interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187808 IMAGE:9030981), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000102 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50524176:50564892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000000093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50701296:50803458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// NONRATT033454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000057081 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:50619824:50620368:1 gene:ENSRNOG00000037628 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001014250 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 5 (Atg5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:50951130:51026118:1 gene:ENSRNOG00000000322 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// AM087012 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for autophagy protein 5 (Atg5 gene). // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083602 // GenBank // Rattus norvegicus ATG5 autophagy related 5 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94348 IMAGE:7133143), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT033460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000025837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50883734:50968312:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT033459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_031324 // RefSeq // Rattus norvegicus prolyl endopeptidase (Prep), mRNA. // chr20 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// AB012759 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for rPOP, complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000040926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:51872483:51899634:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT033465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:51785313:51812966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT033467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001108539 // RefSeq // Rattus norvegicus HECT domain and ankyrin repeat containing, E3 ubiquitin protein ligase 1 (Hace1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:52261205:52394868:1 gene:ENSRNOG00000000327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:52317674:52384083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1 /// NONRATT033473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_001109482 // RefSeq // Rattus norvegicus UBX domain protein 2A (Ubxn2a), mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006239861 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UBX domain protein 2A (Ubxn2a), transcript variant X1, mRNA. // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:40892611:40914105:1 gene:ENSRNOG00000004950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014702 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:110032587:110033364:-1 gene:ENSRNOG00000011067 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041101 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:55675396:55676173:1 gene:ENSRNOG00000031969 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrX // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:110032587:110033364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:55675396:55676173:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000021624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:40874385:40914105:1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT046480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001277057 // RefSeq // Rattus norvegicus activating signal cointegrator 1 complex subunit 3 (Ascc3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000057016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:57025333:57156837:1 gene:ENSRNOG00000037604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// BC169103 // GenBank // Rattus norvegicus activating signal cointegrator 1 complex subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:189522 IMAGE:7442293), complete cds. // chr20 // 100 // 33 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000024874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:56874745:57013212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000024884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:57016960:57156235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 47 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT033482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 17 // 43 // 1
NM_001107641 // RefSeq // Rattus norvegicus single-minded family bHLH transcription factor 1 (Sim1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000057010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:57195047:57274557:1 gene:ENSRNOG00000037600 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:57195477:57221390:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001000267 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1668 (Olr1668), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001101012 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to olfactory receptor Olr1668 (LOC686288), mRNA. // chrUn // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:316210:317148:-1 gene:ENSRNOG00000050246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// BC128716 // GenBank // Rattus norvegicus similar to olfactory receptor Olr1668, mRNA (cDNA clone MGC:156542 IMAGE:7128779), complete cds. // chrUn // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:316210:317148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 68 // 100 // 17 // 25 // 0 /// NONRATT033488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrUn // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_001000266 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1671 (Olr1671), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:384602:385649:-1 gene:ENSRNOG00000000726 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:384747:497631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT033489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000075806 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:393730:394669:-1 gene:ENSRNOG00000046373 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000894 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1675 (Olr1675), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:421641:427304:-1 gene:ENSRNOG00000050389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 32 // 100 // 8 // 25 // 0 /// NONRATT033491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_001000893 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1678 (Olr1678), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:456639:457577:-1 gene:ENSRNOG00000050513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:384747:497631:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000892 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1679 (Olr1679), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000040820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:470340:471278:-1 gene:ENSRNOG00000046412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000048277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34404:35342:-1 gene:ENSRNOG00000047267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000269 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1683 (Olr1683), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:540050:540988:-1 gene:ENSRNOG00000047702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001373 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor gene Olr1686 (Olr1686), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:891318:892271:-1 gene:ENSRNOG00000048314 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000073707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:621866:622819:-1 gene:ENSRNOG00000048079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:621866:622819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:891318:892271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000889 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1689 (Olr1689), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:918723:919694:-1 gene:ENSRNOG00000046312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072457 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:737359:738330:-1 gene:ENSRNOG00000048940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:918723:919694:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046959 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:737359:738330:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000274 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1690 (Olr1690), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000049250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:759975:760946:-1 gene:ENSRNOG00000046933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000071753 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:940600:941570:-1 gene:ENSRNOG00000049494 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000046947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:757680:760922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT033497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000273 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1691 (Olr1691), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:778789:779760:-1 gene:ENSRNOG00000047094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:778789:779736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000888 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1692 (Olr1692), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000040957 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:804838:805806:-1 gene:ENSRNOG00000032716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000046962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:804838:805806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT033499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000557 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1693 (Olr1693), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:814959:815921:-1 gene:ENSRNOG00000000749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046956 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:814959:815921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001110 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1694 (Olr1694), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:831646:832590:-1 gene:ENSRNOG00000000747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:831646:832590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000272 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1695 (Olr1695), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000973 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:844754:845719:-1 gene:ENSRNOG00000000746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:844754:864720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_206850 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1696 (Olr1696), mRNA. // chr20 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051315 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:863755:864720:-1 gene:ENSRNOG00000046355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AF034896 // GenBank // Rattus norvegicus olfactory receptor-like protein (SCR D-8) mRNA, complete cds. // chr20 // 76 // 100 // 25 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:844754:864720:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT033503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NM_001001112 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1699 (Olr1699), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000074812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:954429:955393:-1 gene:ENSRNOG00000045959 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1076376:1095913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000046971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:954770:984532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1
NM_001001113 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1700 (Olr1700), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1076376:1095913:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001001114 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1701 (Olr1701), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:1095289:1096282:-1 gene:ENSRNOG00000050316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066600 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:973203:990595:-1 gene:ENSRNOG00000045845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT033506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000000968 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:1002565:1003200:-1 gene:ENSRNOG00000000741 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000052857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1002451:1003074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000052864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1126543:1127166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000049791 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:1009573:1010024:-1 gene:ENSRNOG00000028968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 81 // 81 // 17 // 21 // 0
ENSRNOT00000061795 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:1197959:1198405:-1 gene:ENSRNOG00000040158 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1197959:1222645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_214456 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1714 (Olr1714), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000043674 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:1293517:1294446:1 gene:ENSRNOG00000049354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000052866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:1293517:1294446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT032552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_214460 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1718 (Olr1718), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000040673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3559403:3560332:-1 gene:ENSRNOG00000049971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001001116 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1720 (Olr1720), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3549213:3574735:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001001117 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1722 (Olr1722), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000044713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3591849:3592778:-1 gene:ENSRNOG00000048093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000055656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3590243:3592778:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT033509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006223810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1729 (Olr1729), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006255881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1729 (Olr1729), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075635 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:3657194:3658454:-1 gene:ENSRNOG00000049251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3619820:3668145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0
NM_001000896 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1726 (Olr1726), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000048085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3622612:3623679:-1 gene:ENSRNOG00000047390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000074574 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3622612:3624098:-1 gene:ENSRNOG00000047390 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT033510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_574713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1876 (Olr1876), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075084 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:3667300:3668235:-1 gene:ENSRNOG00000045813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000055663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3619820:3668145:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 67 // 80 // 8 // 12 // 0
NM_001000510 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1733 (Olr1733), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000045525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3737725:3738654:-1 gene:ENSRNOG00000049648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT033512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT033513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NONRATT033512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_022921 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus M3, gene 1 (RT1-M3-1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3856748:3860887:-1 gene:ENSRNOG00000000763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AJ249342 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for M3 protein (M3 gene). // chr20 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// U16025 // GenBank // Rattus norvegicus class Ib RT1 mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000055646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3857317:3860860:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001001425 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1743 (Olr1743), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3886817:3887758:-1 gene:ENSRNOG00000000765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3886817:3888158:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053299 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin D (Ubd), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000995 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3917783:3919728:-1 gene:ENSRNOG00000000768 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AJ312394 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for diubiquitin (ubd gene). // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3917903:3920134:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT033517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_031028 // RefSeq // Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid (GABA) B receptor 1 (Gabbr1), mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000040232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3996333:4025427:-1 gene:ENSRNOG00000000774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000051634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:3996333:4025427:-1 gene:ENSRNOG00000000774 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 46 // 46 // 0 /// AB016160 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GABAB receptor 1c, complete cds. // chr20 // 100 // 77 // 40 // 40 // 0 /// AB016161 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GABAB receptor 1d, complete cds. // chr20 // 100 // 77 // 40 // 40 // 0 /// AF283276 // GenBank // Rattus norvegicus GABA type B receptor 1f mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 46 // 46 // 0 /// AJ831472 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GABA-BR1i receptor. // chr20 // 100 // 85 // 44 // 44 // 0 /// Y10370 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for GABA-BR1b receptor. // chr20 // 100 // 77 // 40 // 40 // 0 /// AF312319 // GenBank // Rattus norvegicus GABA B receptor 1g mRNA, complete cds. // chr20 // 17 // 17 // 9 // 52 // 1 /// GENSCAN00000032314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:3997640:4024798:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT033518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 52 // 52 // 0
NM_213565 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 57 (Zfp57), mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255874 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 57 (Zfp57), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4054824:4061113:-1 gene:ENSRNOG00000022730 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC127468 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 57, mRNA (cDNA clone MGC:156546 IMAGE:8368087), complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001048045 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus M5 (RT1-M5), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001168353 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class Ib, locus M5 (RT1-M5), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052311 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4078537:4080801:-1 gene:ENSRNOG00000033136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032345 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4078296:4080801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// DQ813342 // GenBank // Rattus norvegicus strain LEW MHC class Ib antigen (RT1.M6-1) gene, partial cds; Rps15 (Rps15) and MHC class Ib antigen (RT1.M4) pseudogenes, complete sequence; and MHC class Ib antigen (RT1.M5) gene, complete cds. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT033525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166303 // RefSeq // Rattus norvegicus ZNRD1 antisense RNA 1 (Znrd1as1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006255877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ZNRD1 antisense RNA 1 (Znrd1as1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000001011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4118986:4120402:-1 gene:ENSRNOG00000000778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FQ213683 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YF24 mRNA sequence. // chr20 // 95 // 100 // 38 // 40 // 0 /// FQ214505 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YE19 mRNA sequence. // chr20 // 83 // 100 // 33 // 40 // 0 /// NONRATT033527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT033528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT033529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT033530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0
NM_001166303 // RefSeq // Rattus norvegicus ZNRD1 antisense RNA 1 (Znrd1as1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ZNRD1 antisense RNA 1 (Znrd1as1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4118986:4120402:-1 gene:ENSRNOG00000000778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213683 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YF24 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214505 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YE19 mRNA sequence. // chr20 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT033527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_134374 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 39 (Rnf39), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001014 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4135089:4140578:-1 gene:ENSRNOG00000000781 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB070897 // GenBank // Rattus norvegicus Rnf39 mRNA for ring finger protein 39, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032303 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4135861:4140408:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT033536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT033537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_001106376 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 31 (Trim31), mRNA. // chr20 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4183577:4196772:-1 gene:ENSRNOG00000021518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4184272:4196525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT033538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0
NM_001009176 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 10 (Trim10), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001016 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4219706:4228396:-1 gene:ENSRNOG00000000782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC129078 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:156534 IMAGE:8371876), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4219435:4228039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT033539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001011665 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 26 (Trim26), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001019 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4239932:4248757:-1 gene:ENSRNOG00000032930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4241315:4301758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
GENSCAN00000032321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4241315:4301758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
GENSCAN00000032347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4321872:4324002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000039155 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:4299572:4324002:-1 gene:ENSRNOG00000031384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 72 // 95 // 13 // 18 // 0
NM_001008850 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus M1, gene 4 (RT1-M1-4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000038626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4419459:4421679:-1 gene:ENSRNOG00000027873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT033543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4414230:4421679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1
NM_001008849 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus M1, gene 2 (RT1-M1-2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006255885 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus M1, gene 2 (RT1-M1-2), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// XM_006255886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus M1, gene 2 (RT1-M1-2), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000038820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4438941:4441142:-1 gene:ENSRNOG00000031065 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4438635:4458891:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT033544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006245671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus igE-binding protein-like (LOC102556423), partial mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF057564 // GenBank // Rattus norvegicus putative retrovirus-related gag protein mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0
ENSRNOT00000061415 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:4669962:4672771:1 gene:ENSRNOG00000000790 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000052637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4650270:4672777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_212500 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein-like 1 (Gnl1), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5388710:5397660:-1 gene:ENSRNOG00000000798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC129081 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:156548 IMAGE:7442774), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5388812:5404655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT033563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_022951 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 10 (Ppp1r10), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000001053 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:5428220:5441580:-1 gene:ENSRNOG00000000803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AF040954 // GenBank // Rattus norvegicus putative protein phosphatase 1 nuclear targeting subunit (PNUTS) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// BC134805 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 10, mRNA (cDNA clone MGC:156638 IMAGE:8362313), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000009262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5426703:5435418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT033566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT033567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 81 // 81 // 34 // 42 // 1
NM_212496 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 16 (Dhx16), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000065025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5466494:5483190:-1 gene:ENSRNOG00000030157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000009277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5466581:5480209:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 70 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5480716:5483055:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT033569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT033573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1 /// NONRATT033574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// NONRATT033576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001126287 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 18 (Ppp1r18), mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006255952 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 18 (Ppp1r18), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255953 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 18 (Ppp1r18), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5469936:5494142:-1 gene:ENSRNOG00000000816 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC161960 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 2310014H01Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:187762 IMAGE:9027646), complete cds. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5485934:5517624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT033571 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_212508 // RefSeq // Rattus norvegicus nurim (nuclear envelope membrane protein) (Nrm), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5494940:5498418:-1 gene:ENSRNOG00000000818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098637 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7135542. // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5485934:5517624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT033579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT033580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT033581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001166275 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator of DNA damage checkpoint 1 (Mdc1), mRNA. // chr20 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000046798 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5502121:5516934:-1 gene:ENSRNOG00000032813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// BC085955 // GenBank // Rattus norvegicus mediator of DNA damage checkpoint 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134653), partial cds. // chr20 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000040531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5485934:5517624:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT033585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
U60976 // GenBank // Rattus norvegicus RAREG-2.1 mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// U60977 // GenBank // Rattus norvegicus RAREG-2.2 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NM_022701 // RefSeq // Rattus norvegicus flotillin 1 (Flot1), mRNA. // chr20 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000001098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5524710:5535207:-1 gene:ENSRNOG00000000826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// BC064652 // GenBank // Rattus norvegicus flotillin 1, mRNA (cDNA clone MGC:72438 IMAGE:5598180), complete cds. // chr20 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT033587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000040561 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5524948:5536758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT033590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT033591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT033592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_212505 // RefSeq // Rattus norvegicus immediate early response 3 (Ier3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5535617:5536820:-1 gene:ENSRNOG00000000827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099831 // GenBank // Rattus norvegicus immediate early response 3, mRNA (cDNA clone MGC:124532 IMAGE:7933804), complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT033594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001166267 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2300002M23 (RGD1562885), mRNA. // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000039998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5778823:5780379:-1 gene:ENSRNOG00000030676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000040557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5778966:5780331:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001002807 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 1 (Clic1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068435 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7113249:7122091:1 gene:ENSRNOG00000029682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099823 // GenBank // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 1, mRNA (cDNA clone MGC:124526 IMAGE:7932557), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// EU148064 // GenBank // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7113202:7121864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001008843 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE5 (RT1-CE5), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NM_001033986 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE5 (RT1-CE5), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000060980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6968850:6973135:-1 gene:ENSRNOG00000000723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC098841 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class I, CE5, mRNA (cDNA clone MGC:112896 IMAGE:7379095), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// U50447 // GenBank // Rattus norvegicus clone 4 class I MHC heavy chain RT1.A(n) antigen precursor (RT1.A(n)) mRNA, complete cds. // chr20 // 57 // 74 // 8 // 14 // 0 /// NONRATT033673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT033674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048331 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6952335:6973099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1
NM_001008842 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE4 (RT1-CE4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000041151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6994667:6997483:-1 gene:ENSRNOG00000039744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000064734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6994667:6997474:-1 gene:ENSRNOG00000039744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6976923:6997474:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT033679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001008841 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE3 (RT1-CE3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000050099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7008109:7011516:-1 gene:ENSRNOG00000031607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000017942 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7001449:7019708:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001008840 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE2 (RT1-CE2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000047779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6851806:6855292:-1 gene:ENSRNOG00000050183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000048311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6831736:6855286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT033657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_133300 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 39B (Ddx39b), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000001115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6886514:6898958:-1 gene:ENSRNOG00000000841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC080243 // GenBank // Rattus norvegicus HLA-B associated transcript 1, mRNA (cDNA clone MGC:91440 IMAGE:7100155), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// M75168 // GenBank // Rattus norvegicus liver nuclear protein p47 mRNA. // chr20 // 77 // 94 // 23 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6881437:6897447:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT033663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NONRATT033661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NONRATT033663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
NM_212490 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V1 subunit G2 (Atp6v1g2), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6901681:6903894:-1 gene:ENSRNOG00000000840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6902600:6905434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT033666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_212507 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3) (Ltb), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6941754:6943598:-1 gene:ENSRNOG00000000836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC088208 // GenBank // Rattus norvegicus lymphotoxin beta (TNF superfamily, member 3), mRNA (cDNA clone MGC:108924 IMAGE:7381953), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6941917:6943515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT033667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_181822 // RefSeq // Rattus norvegicus natural cytotoxicity triggering receptor 3 (Ncr3), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7243480:7249038:1 gene:ENSRNOG00000000854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY273824 // GenBank // Rattus norvegicus NKp30 (Nkp30) mRNA, complete cds. // chr20 // 67 // 100 // 18 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7243783:7249521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT032838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AJ430418 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NK receptor 1c7 (1c7 gene). // chr20 // 58 // 96 // 15 // 26 // 0
NM_001033968 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 6 (Bag6), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NM_053609 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 6 (Bag6), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BCL2-associated athanogene 6 (Bag6), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7198938:7211343:1 gene:ENSRNOG00000000851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060832 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7198938:7211343:1 gene:ENSRNOG00000000851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AB018791 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BAT3, complete cds. // chr20 // 88 // 89 // 22 // 25 // 0 /// BC100141 // GenBank // Rattus norvegicus HLA-B-associated transcript 3, mRNA (cDNA clone MGC:114288 IMAGE:7315623), complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7197540:7211272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// NONRATT032831 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001003975 // RefSeq // Rattus norvegicus G4 protein (G4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7191265:7193591:1 gene:ENSRNOG00000039658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC101859 // GenBank // Rattus norvegicus G4 protein, mRNA (cDNA clone MGC:124525 IMAGE:7937508), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018004 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7192024:7192905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT032828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034157 // RefSeq // Rattus norvegicus G patch domain and ankyrin repeats 1 (Gpank1), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256075 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G patch domain and ankyrin repeats 1 (Gpank1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7186598:7189641:1 gene:ENSRNOG00000000848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7187869:7189476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT032827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_198739 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus G5C (Ly6g5c), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001122 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7173674:7177753:1 gene:ENSRNOG00000000846 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT032825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7153096:7177519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_212531 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 16A (Abhd16a), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000001121 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7153000:7168192:1 gene:ENSRNOG00000000845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC091227 // GenBank // Rattus norvegicus HLA-B associated transcript 5, mRNA (cDNA clone MGC:108968 IMAGE:7317323), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000017996 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7153096:7177519:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT032815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT032822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 55 // 55 // 22 // 40 // 1 /// NONRATT032823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// BC078964 // GenBank HTC // Rattus norvegicus T-cell, immune regulator 1, ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 protein A3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7111385), **** WARNING: chimeric clone ****. // chr20 // 40 // 40 // 16 // 40 // 1 /// NONRATT032817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT032818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT032820 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1 /// NONRATT032821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// NONRATT032819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_001001972 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6E (Ly6g6e), mRNA. // chr20 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// XM_006256072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6E (Ly6g6e), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000037482 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7140226:7141962:1 gene:ENSRNOG00000027157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// GENSCAN00000017977 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7140288:7141467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT032814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001001969 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphocyte antigen 6 complex, locus G6C (Ly6g6c), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7130631:7133328:1 gene:ENSRNOG00000000843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7130631:7132863:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT032813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001165936 // RefSeq // Rattus norvegicus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 (Ddah2), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_212532 // RefSeq // Rattus norvegicus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 (Ddah2), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7122435:7125498:1 gene:ENSRNOG00000000842 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086443 // GenBank // Rattus norvegicus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2, mRNA (cDNA clone MGC:105993 IMAGE:7303579), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097930 // GenBank // Rattus norvegicus dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2, mRNA (cDNA clone MGC:116040 IMAGE:7388716), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213713 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YC18 mRNA sequence. // chr20 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017991 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7122401:7125314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT032812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_212499 // RefSeq // Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 7 (Vwa7), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006256067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Willebrand factor A domain containing 7 (Vwa7), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001153 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7081524:7092056:1 gene:ENSRNOG00000000860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000017985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7082015:7092729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT032806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_053292 // RefSeq // Rattus norvegicus valyl-tRNA synthetase (Vars), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000001160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7066750:7081273:1 gene:ENSRNOG00000000867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7067070:7081208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_031522 // RefSeq // Rattus norvegicus neuraminidase 1 (Neu1), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000049344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6690982:6695245:1 gene:ENSRNOG00000032942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// AB035722 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sialidase, complete cds. // chr20 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC100639 // GenBank // Rattus norvegicus sialidase 1 (lysosomal sialidase), mRNA (cDNA clone MGC:124600 IMAGE:7929913), complete cds. // chr20 // 93 // 97 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT032784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6673383:6694727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT032786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_212541 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 44, member 4 (Slc44a4), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000001174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6673376:6689628:1 gene:ENSRNOG00000000878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// BC079178 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 44, member 4, mRNA (cDNA clone MGC:94213 IMAGE:7130369), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000048355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6673383:6694727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0
NM_212463 // RefSeq // Rattus norvegicus euchromatic histone lysine N-methyltransferase 2 (Ehmt2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6656521:6672961:1 gene:ENSRNOG00000030630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6656049:6672736:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0
NM_001134991 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 12 (Zbtb12), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6652087:6654932:1 gene:ENSRNOG00000000418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169087 // GenBank // Rattus norvegicus Ng35 pseudogene, mRNA (cDNA clone MGC:189499 IMAGE:5600062), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6644010:6654167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT032777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001165901 // RefSeq // Rattus norvegicus negative elongation factor complex member E (Nelfe), transcript variant 2, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 63 // 63 // 0 /// NM_212548 // RefSeq // Rattus norvegicus negative elongation factor complex member E (Nelfe), transcript variant 1, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 63 // 63 // 0 /// XM_006255921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus negative elongation factor complex member E (Nelfe), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 98 // 97 // 63 // 64 // 0 /// ENSRNOT00000000478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6610221:6615882:1 gene:ENSRNOG00000000420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 63 // 63 // 0 /// BC079427 // GenBank // Rattus norvegicus RD RNA-binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:94972 IMAGE:7114415), complete cds. // chr20 // 100 // 95 // 63 // 63 // 0 /// GENSCAN00000048361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6610652:6615785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 57 // 57 // 0 /// NONRATT032775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 98 // 97 // 63 // 64 // 0 /// NONRATT032776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 83 // 55 // 55 // 0
NM_212497 // RefSeq // Rattus norvegicus decapping exoribonuclease (Dxo), mRNA. // chr20 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6597106:6599188:1 gene:ENSRNOG00000000422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// BC082083 // GenBank // Rattus norvegicus DOM-3 homolog Z (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:95256 IMAGE:7133445), complete cds. // chr20 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6597408:6599144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT032772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT032773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT032774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000048985 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:6547861:6565849:1 gene:ENSRNOG00000033581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 43 // 15 // 17 // 0 /// BC168181 // GenBank // Rattus norvegicus tenascin XB, mRNA (cDNA clone IMAGE:7096552), partial cds. // chr20 // 94 // 45 // 17 // 18 // 0 /// BC168189 // GenBank // Rattus norvegicus tenascin XB, mRNA (cDNA clone MGC:188001 IMAGE:7106185), complete cds. // chr20 // 94 // 43 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000048336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6515775:6565849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 95 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT032764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// NONRATT032769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_001002809 // RefSeq // Rattus norvegicus activating transcription factor 6 beta (Atf6b), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000000492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6493788:6501639:1 gene:ENSRNOG00000000431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// BC098631 // GenBank // Rattus norvegicus activating transcription factor 6 beta, mRNA (cDNA clone MGC:112556 IMAGE:7103893), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6493666:6506497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT032759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1 /// NONRATT032760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001002818 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein-like (Fkbpl), mRNA. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6491232:6492720:1 gene:ENSRNOG00000000432 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC086532 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein-like, mRNA (cDNA clone MGC:105545 IMAGE:7305083), complete cds. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// FQ231484 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YF02 mRNA sequence. // chr20 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6491648:6492691:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT032755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT032756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
XM_006255981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 1 (Prrt1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC089986 // GenBank // Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7318446), complete cds. // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NM_001032285 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 1 (Prrt1), mRNA. // chr20 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// XM_006255980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich transmembrane protein 1 (Prrt1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000000495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6471982:6475627:1 gene:ENSRNOG00000000433 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// NONRATT032752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000018429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6471255:6474720:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_212458 // RefSeq // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1 (Agpat1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1 (Agpat1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1 (Agpat1), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6450325:6457628:1 gene:ENSRNOG00000000437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC085852 // GenBank // Rattus norvegicus 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 1 (lysophosphatidic acid acyltransferase, alpha), mRNA (cDNA clone MGC:94573 IMAGE:7189891), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6409313:6456653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT032746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT032745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT032747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT032749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT032750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001002828 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B-cell leukemia homeobox 2 (Pbx2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000509 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6437161:6442086:1 gene:ENSRNOG00000000440 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT032737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000018436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6409313:6456653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1
NM_001003974 // RefSeq // Rattus norvegicus G-protein signaling modulator 3 (Gpsm3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6434602:6436463:1 gene:ENSRNOG00000000441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088220 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein signaling modulator 3 (AGS3-like, C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:108946 IMAGE:7384543), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6409313:6456653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001002827 // RefSeq // Rattus norvegicus notch 4 (Notch4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000513 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6409150:6433141:1 gene:ENSRNOG00000000442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6409313:6456653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT032730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001113183 // RefSeq // Rattus norvegicus testis specific basic protein (Tesb), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255999 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus testis specific basic protein (Tesb), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000060378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6268248:6315301:1 gene:ENSRNOG00000039398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC083628 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7134317. // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// BC097390 // GenBank // Rattus norvegicus Tesb pseudogene, mRNA (cDNA clone MGC:114433 IMAGE:7453125), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT032726 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT032723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT032725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT032728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001002803 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrophilin-like 3 (Btnl3), mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255989 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin-like 3 (Btnl3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000039553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6236996:6251243:1 gene:ENSRNOG00000039396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT032721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000018442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6223459:6250586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_053815 // RefSeq // Rattus norvegicus butyrophilin-like 2 (MHC class II associated) (Btnl2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus butyrophilin-like 2 (MHC class II associated) (Btnl2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6223459:6235116:1 gene:ENSRNOG00000028541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018442 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6223459:6250586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001164826 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class II, locus Db2 (RT1-Db2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255912 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class II, locus Db2 (RT1-Db2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class II, locus Db2 (RT1-Db2), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6186327:6204918:1 gene:ENSRNOG00000030431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KC222923 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA RT1-Db2 (Db2) mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// KC222924 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F RT1-Db2 (Db2) mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// KC222926 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1H RT1-Db2 (Db2) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6156189:6201775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 84 // 73 // 16 // 19 // 0 /// NONRATT032720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001008846 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class II, locus DOb (RT1-DOb), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000526 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6099931:6105533:1 gene:ENSRNOG00000000454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// KC222915 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1H RT1-DOb (DOb) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// KC222916 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1U RT1-DOb (DOb) mRNA, complete cds. // chr20 // 80 // 93 // 20 // 25 // 0 /// KC222930 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1H RT1-DOb isoform 1 (DOb) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// KC222931 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1U RT1-DOb isoform 1 (DOb) mRNA, complete cds. // chr20 // 80 // 93 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6070407:6115917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT032706 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// KC222912 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA RT1-DOb (DOb) mRNA, complete cds. // chr20 // 60 // 93 // 15 // 25 // 0 /// KC222913 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F RT1-DOb (DOb) mRNA, complete cds. // chr20 // 60 // 93 // 15 // 25 // 0 /// KC222928 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA RT1-DOb isoform 1 (DOb) mRNA, complete cds. // chr20 // 60 // 93 // 15 // 25 // 0 /// KC222929 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F RT1-DOb isoform 1 (DOb) mRNA, complete cds. // chr20 // 60 // 93 // 15 // 25 // 0 /// NONRATT032705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT032707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_032056 // RefSeq // Rattus norvegicus transporter 2, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP) (Tap2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6075092:6089133:1 gene:ENSRNOG00000000455 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000074261 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7259451:7272501:-1 gene:ENSRNOG00000046031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// BC091140 // GenBank // Rattus norvegicus transporter 2, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), mRNA (cDNA clone MGC:108646 IMAGE:7381526), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// KC222910 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1H transporter 2 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// KC222911 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1U transporter 2 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 89 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7259451:7295132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000018439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6070407:6115917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// KC222907 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA transporter 2 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 56 // 89 // 18 // 32 // 0 /// KC222908 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F transporter 2 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 63 // 89 // 20 // 32 // 0 /// KC222909 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1I transporter 2 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 56 // 89 // 18 // 32 // 0
NM_080767 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type, 8 (Psmb8), mRNA. // chr20 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6070357:6073320:1 gene:ENSRNOG00000000456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// FQ235267 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YN14 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// KC222892 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA proteasome subunit beta type-8 (Psmb8) mRNA, complete cds. // chr20 // 76 // 66 // 19 // 25 // 0 /// KC222894 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1I proteasome subunit beta type-8 (Psmb8) mRNA, complete cds. // chr20 // 76 // 66 // 19 // 25 // 0 /// KC222895 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1H proteasome subunit beta type-8 (Psmb8) mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 66 // 24 // 25 // 0 /// KC222896 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1U proteasome subunit beta type-8 (Psmb8) mRNA, complete cds. // chr20 // 92 // 66 // 23 // 25 // 0 /// KC222893 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F proteasome subunit beta type-8 (Psmb8) mRNA, complete cds. // chr20 // 72 // 66 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT032702 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT032703 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT032704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000018439 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6070407:6115917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 58 // 58 // 22 // 38 // 1 /// GENSCAN00000017941 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7259451:7295132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_032055 // RefSeq // Rattus norvegicus transporter 1, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP) (Tap1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6058583:6069216:1 gene:ENSRNOG00000000457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC101854 // GenBank // Rattus norvegicus transporter 1, ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), mRNA (cDNA clone MGC:124549 IMAGE:7933924), complete cds. // chr20 // 79 // 100 // 26 // 33 // 0 /// KC222902 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA transporter 1 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 87 // 91 // 26 // 30 // 0 /// KC222903 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F transporter 1 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 80 // 91 // 24 // 30 // 0 /// KC222904 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1I transporter 1 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 87 // 91 // 26 // 30 // 0 /// KC222906 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1U transporter 1 ATP-binding cassette sub-family B (Tap2) mRNA, complete cds. // chr20 // 77 // 91 // 23 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6058909:6068777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT032698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_198741 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class II, locus DMa (RT1-DMa), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7302037:7305439:-1 gene:ENSRNOG00000047864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:6015060:6018462:1 gene:ENSRNOG00000047854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091107 // GenBank // Rattus norvegicus major histocompatibility complex, class II, DM alpha, mRNA (cDNA clone MGC:108532 IMAGE:7377707), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// KC222882 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA RT1-DMa (DMA1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// KC222883 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F RT1-DMa (DMA1) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// KC222886 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1U RT1-DMa (DMA1) mRNA, complete cds. // chr20 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7302286:7305384:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000018414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:6015115:6018213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_183051 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class II, locus DOa (RT1-DOa), mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5968763:5971742:1 gene:ENSRNOG00000026762 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// FQ233351 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YD16 mRNA sequence. // chr20 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1 /// GENSCAN00000040527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5968822:5975280:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT032695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT032696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT032697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1
NM_001008848 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class II, locus Ha (RT1-Ha), mRNA. // chr20 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// XM_003751931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain-like (LOC100911800), mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000036900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5955149:5960851:1 gene:ENSRNOG00000026669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065330 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7344007:7349242:-1 gene:ENSRNOG00000045908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// BC099182 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class II, locus Ha, mRNA (cDNA clone MGC:116352 IMAGE:7383188), complete cds. // chr20 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7333158:7349242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5955149:5967989:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0
NM_212528 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XI, alpha 2 (Col11a2), mRNA. // chr20 // 97 // 97 // 62 // 64 // 0 /// XM_003751932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen alpha-2(XI) chain-like (LOC100911886), partial mRNA. // chr20 // 100 // 45 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XI, alpha 2 (Col11a2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 63 // 63 // 0 /// XM_006255928 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XI, alpha 2 (Col11a2), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 100 // 98 // 65 // 65 // 0 /// ENSRNOT00000045533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5909495:5938415:1 gene:ENSRNOG00000000463 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 97 // 62 // 64 // 0 /// GENSCAN00000017963 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7363296:7400019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 38 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5909707:5937530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 88 // 56 // 58 // 0 /// NONRATT032694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 66 // 66 // 0
NM_206849 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoid X receptor beta (Rxrb), mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255961 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoid X receptor beta (Rxrb), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000041613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5902519:5908469:1 gene:ENSRNOG00000000464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC092637 // GenBank HTC // Rattus norvegicus retinoid X receptor beta, mRNA (cDNA clone IMAGE:7316409), with apparent retained intron. // chr20 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000040534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5902600:5907545:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT032688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT032690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT032689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT032691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NONRATT032537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 100 // 9 // 25 // 0 /// NONRATT033716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT033715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_033097 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 52 homolog (S. cerevisiae) (Vps52), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006256112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 52 homolog (S. cerevisiae) (Vps52), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000000549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7490618:7500200:-1 gene:ENSRNOG00000000470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC166419 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 52 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187352 IMAGE:9029985), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7491491:7500078:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT033717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT033720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT033721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT033722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_212491 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 46 (Wdr46), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7506474:7514244:-1 gene:ENSRNOG00000031171 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085934 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 46, mRNA (cDNA clone MGC:94931 IMAGE:7112671), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7506843:7514284:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT033723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_033098 // RefSeq // Rattus norvegicus TAP binding protein (tapasin) (Tapbp), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256111 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TAP binding protein (tapasin) (Tapbp), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044975 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7526668:7534619:-1 gene:ENSRNOG00000029500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC062007 // GenBank // Rattus norvegicus TAP binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:72337 IMAGE:5599850), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// KC222917 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA TAP binding protein (Tapbp) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// KC222918 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1F TAP binding protein (Tapbp) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// KC222919 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1I TAP binding protein (Tapbp) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// KC222920 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1H TAP binding protein (Tapbp) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// KC222921 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA.1U TAP binding protein (Tapbp) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7528357:7537375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033730 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_212547 // RefSeq // Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2 (Rgl2), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7517123:7524877:-1 gene:ENSRNOG00000000474 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// BC107439 // GenBank // Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2, mRNA (cDNA clone MGC:124925 IMAGE:7121126), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// FQ211603 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YB07 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7517534:7524555:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033724 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT033727 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001009172 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 22 (Zbtb22), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006256123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 22 (Zbtb22), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7534957:7538123:-1 gene:ENSRNOG00000000476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7528357:7537375:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// BC095905 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger and BTB domain containing 22, mRNA (cDNA clone MGC:95306 IMAGE:7134939), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT033731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_080891 // RefSeq // Rattus norvegicus death-domain associated protein (Daxx), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006256103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death-domain associated protein (Daxx), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256104 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus death-domain associated protein (Daxx), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7538716:7544462:-1 gene:ENSRNOG00000000477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AB064671 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Daxx, complete cds. // chr20 // 82 // 82 // 23 // 28 // 0 /// BC128729 // GenBank // Rattus norvegicus death-domain associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:156601 IMAGE:8366304), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ223571 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA9YA14 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7538879:7543509:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT033733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
ENSRNOT00000000560 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:7549885:7550097:-1 gene:ENSRNOG00000000478 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// FQ220821 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YJ03 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT033737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT033738 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000000220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7547855:7559807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_053812 // RefSeq // Rattus norvegicus BCL2-antagonist/killer 1 (Bak1), mRNA. // chr20 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000576 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7675062:7683674:-1 gene:ENSRNOG00000000485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AF259504 // GenBank // Rattus norvegicus BAK protein (Bak) mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC089784 // GenBank // Rattus norvegicus BCL2-antagonist/killer 1, mRNA (cDNA clone MGC:108627 IMAGE:7366192), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006256102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BCL2-antagonist/killer 1 (Bak1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 65 // 65 // 20 // 31 // 1 /// GENSCAN00000000214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7665779:7681239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT033747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_003753453 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inositol hexakisphosphate kinase 3 (Ip6k3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035977 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:7797844:7809537:-1 gene:ENSRNOG00000025883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7797844:7809537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
NM_001039032 // RefSeq // Rattus norvegicus LEM domain containing 2 (Lemd2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8789657:8800115:-1 gene:ENSRNOG00000025864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098775 // GenBank // Rattus norvegicus LEM domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:112806 IMAGE:7373953), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8790499:8832858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT033780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1
NM_001110056 // RefSeq // Rattus norvegicus motilin (Mln), mRNA. // chr20 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000067667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8809892:8814591:-1 gene:ENSRNOG00000042186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// AB092487 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for motilin, partial cds. // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// AB111861 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for motilin, complete cds. // chr20 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT033772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8790499:8832858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_022666 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, metabotropic 4 (Grm4), mRNA. // chr20 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000066115 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8986551:9013774:-1 gene:ENSRNOG00000000487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// M90518 // GenBank // Rat metabotropic glutamate receptor (GLUR4) mRNA, complete cds. // chr20 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// U47331 // GenBank // Rattus norvegicus metabotropic glutamate receptor 4b mRNA, complete cds. // chr20 // 98 // 82 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000049025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8987446:9072433:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT033772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT033773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT033782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0
XM_006256169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564450 (RGD1564450), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// BC168874 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7379564. // chr20 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// XM_006256171 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1564450 (RGD1564450), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// GENSCAN00000049049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9342812:9344547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT033794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT033795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
NM_001024243 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 3 (Nudt3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9358099:9410646:-1 gene:ENSRNOG00000000489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093618 // GenBank // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 3, mRNA (cDNA clone MGC:105578 IMAGE:7311727), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9359448:9371641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT033798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049051 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9377252:9410701:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001109530 // RefSeq // Rattus norvegicus SAM pointed domain containing ets transcription factor (Spdef), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SAM pointed domain containing ets transcription factor (Spdef), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9495176:9509626:-1 gene:ENSRNOG00000000491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166744 // GenBank // Rattus norvegicus SAM pointed domain containing ets transcription factor, mRNA (cDNA clone MGC:188475 IMAGE:7938752), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9495610:9527513:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000059426 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:9533345:9599034:-1 gene:ENSRNOG00000038883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC112320 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 6 open reading frame 106 isoform a, mRNA (cDNA clone MGC:124820 IMAGE:7933524), complete cds. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033806 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033807 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT033808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001008350 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF11 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf11), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TAF11 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf11), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9678689:9684785:-1 gene:ENSRNOG00000024601 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086421 // GenBank // Rattus norvegicus TAF11 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:105516 IMAGE:7300732), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9679162:9684706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT033809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT033811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001007695 // RefSeq // Rattus norvegicus t-complex protein 11 (Tcp11), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000045044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9848951:9858712:-1 gene:ENSRNOG00000000499 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083899 // GenBank // Rattus norvegicus t-complex protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:95257 IMAGE:7133508), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus t-complex protein 11 (Tcp11), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// XM_006256201 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus t-complex protein 11 (Tcp11), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 97 // 97 // 29 // 30 // 1 /// GENSCAN00000039135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9849124:9883060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT033814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001098216 // RefSeq // Rattus norvegicus TEA domain family member 3 (Tead3), mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10111923:10131306:-1 gene:ENSRNOG00000000506 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC085938 // GenBank // Rattus norvegicus TEA domain family member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7122897), partial cds. // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10112928:10175161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_001107642 // RefSeq // Rattus norvegicus tubby like protein 1 (Tulp1), mRNA. // chr20 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006256219 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubby like protein 1 (Tulp1), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10132031:10143932:-1 gene:ENSRNOG00000000507 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000033499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10112928:10175161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001012174 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 5 (Fkbp5), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006256222 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 5 (Fkbp5), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256223 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 5 (Fkbp5), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FK506 binding protein 5 (Fkbp5), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033119 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10177067:10219361:-1 gene:ENSRNOG00000022523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC085868 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:94621 IMAGE:7191081), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT033824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000033495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10179057:10261903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
NM_013139 // RefSeq // Rattus norvegicus colipase, pancreatic (Clps), mRNA. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7838977:7841137:-1 gene:ENSRNOG00000000510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M33333 // GenBank // Rat colipase mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// M58370 // GenBank // Rat colipase mRNA, complete cds. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7839066:7841573:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 90 // 80 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT033750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025726 // RefSeq // Rattus norvegicus SRSF protein kinase 1 (Srpk1), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7867103:7900809:-1 gene:ENSRNOG00000000511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// BC099089 // GenBank // Rattus norvegicus SFRS protein kinase 1, mRNA (cDNA clone MGC:116186 IMAGE:7456350), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7867103:7900962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 97 // 85 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT033753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
ENSRNOT00000059264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7916763:7962295:-1 gene:ENSRNOG00000000512 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// BC166448 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 26, member 8, mRNA (cDNA clone IMAGE:8366708), partial cds. // chr20 // 100 // 40 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000000209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:7917174:7968722:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT033755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 98 // 89 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT033756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 55 // 55 // 26 // 47 // 1 /// NONRATT033754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 20 // 47 // 1
XM_006223816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689561 (LOC689561), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223817 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689561 (LOC689561), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689561 (LOC689561), mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023028 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:8400927:8416031:-1 gene:ENSRNOG00000016997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 87 // 86 // 27 // 31 // 0 /// GENSCAN00000021312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8400176:8436101:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 64 // 22 // 23 // 0
XR_362043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisomal, testis specific 1 (Pxt1), misc_RNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000623 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:8441861:8442921:-1 gene:ENSRNOG00000000516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021320 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8441861:8454932:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001015025 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 38 (Stk38), mRNA. // chr20 // 100 // 68 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 38 (Stk38), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000059194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8472800:8506129:-1 gene:ENSRNOG00000000519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// BC091415 // GenBank // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 38, mRNA (cDNA clone MGC:109574 IMAGE:7365181), complete cds. // chr20 // 100 // 68 // 32 // 32 // 0 /// FQ216844 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA40YP07 mRNA sequence. // chr20 // 98 // 91 // 42 // 43 // 0 /// GENSCAN00000009509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8474501:8506196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT033763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 68 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033764 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 72 // 72 // 34 // 47 // 1 /// NONRATT033765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1
NM_001107616 // RefSeq // Rattus norvegicus copine V (Cpne5), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006256133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine V (Cpne5), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000000629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8664244:8745116:-1 gene:ENSRNOG00000000522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000009534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8666675:8742232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT033769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT033771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT033770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_001034188 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 1 (Ppil1), mRNA. // chr20 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8760185:8761635:-1 gene:ENSRNOG00000000523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC099188 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase (cyclophilin)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:116359 IMAGE:7383385), complete cds. // chr20 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// NONRATT033772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT033773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000049054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9095110:9104669:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT033774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT033775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001100833 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial carrier 1 (Mtch1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000635 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:9177064:9200859:-1 gene:ENSRNOG00000000527 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC158661 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial carrier homolog 1 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:187651 IMAGE:8369713), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT033787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:9177668:9200851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT033790 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// NONRATT033791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1
NM_001109548 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 167 (Ccdc167), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256231 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 167 (Ccdc167), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256232 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 167 (Ccdc167), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000000639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10569147:10583904:-1 gene:ENSRNOG00000000531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000042322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10569728:10584011:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
GENSCAN00000042321 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10693295:10693730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 56 // 5 // 5 // 0 /// NONRATT033833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT033834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000030972 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:10693295:10693730:-1 gene:ENSRNOG00000026374 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0
NM_001107618 // RefSeq // Rattus norvegicus MAM domain containing glycosylphosphatidylinositol anchor 1 (Mdga1), mRNA. // chr20 // 97 // 67 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000048845 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:10707850:10766161:-1 gene:ENSRNOG00000000536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000042319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:10698799:10809819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT033836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT033837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1
NM_001013073 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 9 (Btbd9), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006256185 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 9 (Btbd9), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000000649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:11090808:11437886:-1 gene:ENSRNOG00000000540 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC087068 // GenBank // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:94353 IMAGE:7133235), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT033842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 60 // 60 // 29 // 48 // 1 /// GENSCAN00000048471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:11376253:11450409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1 /// NONRATT033845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1 /// NONRATT033846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 19 // 48 // 1 /// GENSCAN00000048487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:11154946:11221634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 23 // 23 // 11 // 48 // 1 /// GENSCAN00000048493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:11082906:11102140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 19 // 19 // 9 // 48 // 1
NM_207594 // RefSeq // Rattus norvegicus glyoxalase 1 (Glo1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glyoxalase 1 (Glo1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000000650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:11461658:11479676:-1 gene:ENSRNOG00000000541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC061570 // GenBank // Rattus norvegicus glyoxalase 1, mRNA (cDNA clone MGC:72954 IMAGE:6918143), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ210595 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA25YO03 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// FQ232727 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YK10 mRNA sequence. // chr20 // 54 // 86 // 13 // 24 // 0 /// NONRATT033847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:11464943:11488855:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_013042 // RefSeq // Rattus norvegicus trefoil factor 3, intestinal (Tff3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066266 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12030960:12035618:-1 gene:ENSRNOG00000001159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078873 // GenBank // Rattus norvegicus trefoil factor 3, intestinal, mRNA (cDNA clone MGC:93548 IMAGE:7127312), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U48825 // GenBank // Rattus norvegicus P-domain neuropeptide P1.B mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// M80826 // GenBank // Rat intestinal trefoil protein mRNA, complete cds. // chr20 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// X66956 // GenBank // R.norvegicus rITF mRNA for intestinal trefoil-factor. // chr20 // 67 // 60 // 10 // 15 // 0 /// NONRATT033849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033850 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_053844 // RefSeq // Rattus norvegicus trefoil factor 2 (Tff2), mRNA. // chr20 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12052826:12055719:-1 gene:ENSRNOG00000001162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M97255 // GenBank // Rattus norvegicus CD spasmolytic polypeptide mRNA, complete cds. // chr20 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12046504:12055690:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT033851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_057129 // RefSeq // Rattus norvegicus trefoil factor 1 (Tff1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001538 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12071835:12075695:-1 gene:ENSRNOG00000001164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D83231 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for pS2 peptide, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12068438:12075666:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
FQ217911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA14YD18 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT059021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001107619 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protease, serine 3 (Tmprss3), mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000001540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12090233:12109416:-1 gene:ENSRNOG00000001165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12091118:12109361:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001012176 // RefSeq // Rattus norvegicus radial spoke head 1 homolog (Chlamydomonas) (Rsph1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12177328:12195013:-1 gene:ENSRNOG00000001168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC084704 // GenBank // Rattus norvegicus radial spoke head 1 homolog (Chlamydomonas), mRNA (cDNA clone MGC:105519 IMAGE:7301243), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12177476:12194959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033854 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001135667 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 4 (Wdr4), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12429884:12446081:-1 gene:ENSRNOG00000001181 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12423257:12446139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT033856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_012522 // RefSeq // Rattus norvegicus cystathionine beta synthase (Cbs), mRNA. // chr20 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12550129:12574252:-1 gene:ENSRNOG00000029528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000045275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12550129:12574252:-1 gene:ENSRNOG00000029528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000048219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12553827:12574252:-1 gene:ENSRNOG00000029528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// D01098 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for hemoprotein H-450, complete cds. // chr20 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// M88344 // GenBank // Rat cystathionine beta-synthase (CBS) mRNA, complete cds (type 1 of four alternatively spliced mRNAs). // chr20 // 97 // 87 // 33 // 34 // 0 /// M88345 // GenBank // Rat pseudo-cystathionine beta-synthase mRNA, complete cds (type 2 of four alternatively spliced mRNAs). // chr20 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// M88346 // GenBank // Rat cystathionine beta-synthase mRNA, complete cds (type 3 of four alternatively spliced mRNAs). // chr20 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// M88347 // GenBank // Rat pseudo-cystathionine beta-synthase mRNA, complete cds (type 4 of four alternatively spliced mRNAs). // chr20 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000031107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12550694:12570768:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 72 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 95 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT033858 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
NM_021693 // RefSeq // Rattus norvegicus salt-inducible kinase 1 (Sik1), mRNA. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12845510:12855040:-1 gene:ENSRNOG00000001189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AB020480 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for salt-inducible protein kinase, complete cds. // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AF106937 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase KID2 (Kid2) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12833300:12867903:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT033863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001127683 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock transcription factor 2 binding protein (Hsf2bp), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256254 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heat shock transcription factor 2 binding protein (Hsf2bp), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000001580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:12930027:13014181:-1 gene:ENSRNOG00000001193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC158765 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock transcription factor 2 binding protein, mRNA (cDNA clone IMAGE:7112979), partial cds. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000031974 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:12966938:13014179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
XM_006256273 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyridoxal kinase-like (RGD1566085), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000051678 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:13061351:13084547:-1 gene:ENSRNOG00000049970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000031990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13057900:13084517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_012838 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin B (stefin B) (Cstb), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13137897:13139938:-1 gene:ENSRNOG00000001201 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC084725 // GenBank // Rattus norvegicus cystatin B (stefin B), mRNA (cDNA clone MGC:105499 IMAGE:7318993), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031980 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13138083:13139814:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT033871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
XM_006223829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inducible T-cell co-stimulator ligand (Icoslg), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000038547 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:13502479:13510230:-1 gene:ENSRNOG00000023109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inducible T-cell co-stimulator ligand (Icoslg), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// XM_006256264 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inducible T-cell co-stimulator ligand (Icoslg), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// GENSCAN00000009533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13494880:13533565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT033876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT033877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT033875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001003964 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like (Dnmt3l), mRNA. // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// XM_006256250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like (Dnmt3l), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256251 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like (Dnmt3l), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000001610 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13514654:13528928:-1 gene:ENSRNOG00000001212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000009533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13494880:13533565:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
XM_006256252 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1810043G02; DNA segment, Chr 10, Johns Hopkins University 13, expressed (RGD1309594), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13587480:13594340:-1 gene:ENSRNOG00000001215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC085944 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1810043G02; DNA segment, Chr 10, Johns Hopkins University 13, expressed, mRNA (cDNA clone MGC:95110 IMAGE:7127440), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009557 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13588433:13594292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT033879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT033881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT033880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT033883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000046763 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:13667813:13668171:-1 gene:ENSRNOG00000030677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13661365:13668183:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 87 // 56 // 13 // 15 // 0
XM_001079415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeats (Tspear), mRNA. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000038419 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:13671813:13694360:-1 gene:ENSRNOG00000001219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000009549 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13671813:13696956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
XM_002728931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 12-1-like (LOC100361702), mRNA. // chr20 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
XM_002725856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 12-1-like (LOC100361739), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_002728932 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus keratin associated protein 12-1-like (LOC100361739), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000073009 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:13803487:13809490:-1 gene:ENSRNOG00000046323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001106380 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 2 (Ube2g2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13866883:13887894:-1 gene:ENSRNOG00000001222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// BC166733 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2G 2, mRNA (cDNA clone MGC:188457 IMAGE:7936238), complete cds. // chr20 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009536 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13851496:13887717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001024295 // RefSeq // Rattus norvegicus small ubiquitin-like modifier 3 (Sumo3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13892796:13903349:-1 gene:ENSRNOG00000038489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083728 // GenBank // Rattus norvegicus SMT3 suppressor of mif two 3 homolog 3 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94630 IMAGE:7191303), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13893812:13903273:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT033891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT033893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT033894 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001013238 // RefSeq // Rattus norvegicus pituitary tumor-transforming 1 interacting protein (Pttg1ip), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001638 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13912729:13930028:-1 gene:ENSRNOG00000001223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061813 // GenBank // Rattus norvegicus pituitary tumor-transforming 1 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:72587 IMAGE:5598663), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ228848 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YC21 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ230211 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YO03 mRNA sequence. // chr20 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT033895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13914380:13929927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
BC099151 // GenBank // Rattus norvegicus integrin beta 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7374316), complete cds. // chr20 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NM_001037780 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, beta 2 (Itgb2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000001639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:13944200:13966161:-1 gene:ENSRNOG00000001224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// BC166721 // GenBank // Rattus norvegicus integrin beta 2, mRNA (cDNA clone MGC:188433 IMAGE:7932515), complete cds. // chr20 // 97 // 97 // 31 // 32 // 1 /// GENSCAN00000006496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:13949797:13966161:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 56 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT033899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000037297 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:14095197:14095667:-1 gene:ENSRNOG00000001226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14095197:14147569:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 55 // 12 // 12 // 0
NM_001107621 // RefSeq // Rattus norvegicus protein O-fucosyltransferase 2 (Pofut2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein O-fucosyltransferase 2 (Pofut2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000001644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:14281734:14292670:-1 gene:ENSRNOG00000001228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14262649:14292602:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000017748 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:14581218:14582491:-1 gene:ENSRNOG00000013206 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 78 // 96 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000007562 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14581079:14662181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_053567 // RefSeq // Rattus norvegicus formimidoyltransferase cyclodeaminase (Ftcd), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:14965125:14978653:-1 gene:ENSRNOG00000001261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF079233 // GenBank // Rattus norvegicus formiminotransferase-cyclodeaminase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC091134 // GenBank // Rattus norvegicus formiminotransferase cyclodeaminase, mRNA (cDNA clone MGC:108634 IMAGE:7369085), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14965351:14993721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT033913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001024296 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis and centriole associated 1-like (Spatc1l), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis and centriole associated 1-like (Spatc1l), mRNA. // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000001704 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15318496:15327599:-1 gene:ENSRNOG00000001262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079291 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Putative protein C21orf56 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:94423 IMAGE:7134390), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074268 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:14983389:14989988:-1 gene:ENSRNOG00000045929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15288833:15327562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT033928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:14965351:14993721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_031049 // RefSeq // Rattus norvegicus lanosterol synthase (2,3-oxidosqualene-lanosterol cyclase) (Lss), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256313 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lanosterol synthase (2,3-oxidosqualene-lanosterol cyclase) (Lss), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000042499 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:15001945:15027496:-1 gene:ENSRNOG00000001267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// D45252 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for 2,3-oxidosqualene:lanosterol cyclase, complete cds. // chr20 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// U31352 // GenBank // Rattus norvegicus oxidosqualene cyclase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15002544:15074149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001106382 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 3 associated protein (Mcm3ap), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15036956:15075014:-1 gene:ENSRNOG00000001272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15002544:15074149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000017141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15085295:15096866:-1 gene:ENSRNOG00000012714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC128753 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Protein C21orf58, mRNA (cDNA clone MGC:156707 IMAGE:7100076), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15085810:15098379:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT033923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_013191 // RefSeq // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein B (S100b), mRNA. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15287748:15296457:-1 gene:ENSRNOG00000001295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087026 // GenBank // Rattus norvegicus S100 calcium binding protein B, mRNA (cDNA clone MGC:93559 IMAGE:7193740), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213774 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YM04 mRNA sequence. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ214486 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YG22 mRNA sequence. // chr20 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// M54919 // GenBank // Rat S100 protein beta subunit mRNA, complete cds. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT033926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15288833:15327562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001106383 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (glucose activated ion channel), member 4 (Slc5a4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000001750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15558116:15598211:-1 gene:ENSRNOG00000006786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072183 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:15500218:15529399:-1 gene:ENSRNOG00000049734 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000049235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15500223:15529270:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000049255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15558121:15598120:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106384 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 280B (Zfp280b), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000033298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15635322:15650135:-1 gene:ENSRNOG00000028441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000071184 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:15724991:15726589:-1 gene:ENSRNOG00000049027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000071486 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:15626101:15627699:-1 gene:ENSRNOG00000047542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000049247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15638549:15640147:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000049254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15673354:15726589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000049260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15626101:15627699:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT033930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001127556 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to sodium-glucose cotransporter-like 1 (RGD1563815), mRNA. // chr20 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// XM_006256317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sodium/glucose cotransporter 1-like (LOC100909546), partial mRNA. // chr20 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000058343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15761870:15808472:-1 gene:ENSRNOG00000029979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// BC161883 // GenBank // Rattus norvegicus similar to sodium-glucose cotransporter-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:187451 IMAGE:7131276), complete cds. // chr20 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15673354:15726589:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 95 // 66 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15759797:15808418:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT033930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 97 // 27 // 28 // 0
NM_001108930 // RefSeq // Rattus norvegicus pre-B lymphocyte 3 (Vpreb3), mRNA. // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000032290 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15812246:15813556:-1 gene:ENSRNOG00000028394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// XM_006256323 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pre-B lymphocyte 3 (Vpreb3), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// GENSCAN00000049231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15812388:15813506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT033933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001007008 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10 (Chchd10), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15820607:15822447:-1 gene:ENSRNOG00000028356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC082751 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10, mRNA (cDNA clone MGC:105647 IMAGE:7300825), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ223849 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA85YB07 mRNA sequence. // chr20 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15820753:15822010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT033935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT033936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109577 // RefSeq // Rattus norvegicus derlin 3 (Derl3), mRNA. // chr20 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000038623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15858311:15861768:-1 gene:ENSRNOG00000028243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// BC167034 // GenBank // Rattus norvegicus Der1-like domain family, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7303301), partial cds. // chr20 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// XM_006256324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus derlin 3 (Derl3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000049245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15859877:15882306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033941 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// NONRATT033938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// NONRATT033940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001106381 // RefSeq // Rattus norvegicus sushi domain containing 2 (Susd2), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000066773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16153343:16160769:1 gene:ENSRNOG00000033389 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC168843 // GenBank // Rattus norvegicus sushi domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:189067 IMAGE:9089070), complete cds. // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16153419:16163209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT033167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT033168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0
NM_053575 // RefSeq // Rattus norvegicus calcineurin binding protein 1 (Cabin1), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000001659 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16025715:16151225:1 gene:ENSRNOG00000001237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// AF061947 // GenBank // Rattus norvegicus cain mRNA, complete cds. // chr20 // 97 // 97 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000053997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16128767:16150839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000054005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16016910:16082918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 62 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_024131 // RefSeq // Rattus norvegicus D-dopachrome tautomerase (Ddt), mRNA. // chr20 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16016818:16019307:1 gene:ENSRNOG00000001239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ210521 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YD16 mRNA sequence. // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT033160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT033162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// GENSCAN00000054005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16016910:16082918:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_053293 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase theta 1 (Gstt1), mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000001669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:15989083:16006507:1 gene:ENSRNOG00000049771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC086426 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase theta 1, mRNA (cDNA clone MGC:105379 IMAGE:7301492), complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// FJ179408 // GenBank // Rattus norvegicus glutathione S-transferase theta 1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000054000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15989113:16014384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001137643 // RefSeq // Rattus norvegicus glutathione S-transferase, theta 3 (Gstt3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16007776:16015160:1 gene:ENSRNOG00000001242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ225600 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YH19 mRNA sequence. // chr20 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT033155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:15989113:16014384:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT033156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT033158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_053845 // RefSeq // Rattus norvegicus ureidopropionase, beta (Upb1), mRNA. // chrU // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000058237 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:16352597:16378709:-1 gene:ENSRNOG00000038258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// BC078767 // GenBank // Rattus norvegicus ureidopropionase, beta, mRNA (cDNA clone MGC:93280 IMAGE:7130296), complete cds. // chrU // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// M97662 // GenBank // Rattus norvegicus beta-alanine synthase mRNA, complete cds. // chrU // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000054003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16352802:16378709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT033944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 57 // 57 // 17 // 30 // 1 /// NONRATT033947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT033948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_053294 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine A2a receptor (Adora2a), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000001759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16449385:16466147:-1 gene:ENSRNOG00000001302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF228684 // GenBank // Rattus norvegicus A2A adenosine receptor mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// BC081727 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine A2a receptor, mRNA (cDNA clone MGC:93190 IMAGE:7121208), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// M91214 // GenBank // Rattus norvegicus putative adenosine receptor mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000039887 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16450209:16457422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT033949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001039455 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1-like (Specc1l), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006256339 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm antigen with calponin homology and coiled-coil domains 1-like (Specc1l), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16472453:16577173:-1 gene:ENSRNOG00000001303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AY884296 // GenBank // Rattus norvegicus cytospin A mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000039891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16505602:16667592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT033950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
XM_228091 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus breakpoint cluster region (Bcr), mRNA. // chr20 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001766 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16604841:16664083:-1 gene:ENSRNOG00000001304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039891 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16505602:16667592:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT033960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001109589 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB36, member RAS oncogene family (Rab36), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000001772 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16740316:16755556:-1 gene:ENSRNOG00000001311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC167029 // GenBank // Rattus norvegicus RAB36, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:189269 IMAGE:8368465), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// FQ213589 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YO08 mRNA sequence. // chr20 // 97 // 88 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000039890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16740559:16755948:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT033964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_013189 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha z polypeptide (Gnaz), mRNA. // chr20 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000001779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:16776281:16801749:-1 gene:ENSRNOG00000001313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// J03773 // GenBank // Rat guanine nucleotide-binding regulatory protein alpha subunit mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT033969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000039893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:16776728:16824279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_134417 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate multikinase (Ipmk), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256346 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inositol polyphosphate multikinase (Ipmk), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000000748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:20623399:20655922:-1 gene:ENSRNOG00000000609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY014898 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate multikinase (Ipmk) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:20627487:20655812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT033977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT033978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT033980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
XM_006223865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 13, member C (Fam13c), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051491 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:21507803:21625228:-1 gene:ENSRNOG00000000275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:21509164:21605279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212141 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA68YB22 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212194 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA66YB06 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223865 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 13, member C (Fam13c), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000756 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:21524775:21625228:-1 gene:ENSRNOG00000000275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000051491 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:21507803:21625228:-1 gene:ENSRNOG00000000275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// FQ212194 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA66YB06 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000014890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:21509164:21605279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
XM_001077030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 6 (Ccdc6), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006223886 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 6 (Ccdc6), mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032159 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:21869694:21916820:-1 gene:ENSRNOG00000024019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000014900 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:21869694:21918110:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT033996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001107622 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho-related BTB domain containing 1 (Rhobtb1), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256352 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho-related BTB domain containing 1 (Rhobtb1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:22756929:22831478:-1 gene:ENSRNOG00000000633 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:22768562:22799013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT034000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001107623 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 26 (Tmem26), mRNA. // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000038095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:23740900:23789900:-1 gene:ENSRNOG00000027859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015769 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:23742776:23777771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107625 // RefSeq // Rattus norvegicus rhotekin 2 (Rtkn2), mRNA. // chr20 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// XM_006256367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rhotekin 2 (Rtkn2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000068778 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24031447:24102848:-1 gene:ENSRNOG00000000636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24033607:24120967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_053633 // RefSeq // Rattus norvegicus early growth response 2 (Egr2), mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB032419 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for zinc finger protein krox-20, complete cds. // chr20 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// AB032420 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for zinc finger protein krox-20/egr-2, complete cds. // chr20 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// U78102 // GenBank // Rattus norvegicus krox20 mRNA, complete cds. // chr20 // 92 // 87 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24551942:24556227:-1 gene:ENSRNOG00000000640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 87 // 87 // 26 // 30 // 1 /// D83508 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Krox-20 protein, complete cds. // chr20 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT034011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24553143:24557999:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001191719 // RefSeq // Rattus norvegicus jumonji domain containing 1C (Jmjd1c), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000000804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24842479:24972937:-1 gene:ENSRNOG00000000648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AY327507 // GenBank HTC // Rattus norvegicus liver regeneration-related gene LRRG06 mRNA, partial sequence. // chr20 // 93 // 36 // 13 // 14 // 0 /// FQ225499 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YO02 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// FQ230372 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YF08 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// FQ231799 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YC11 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24843264:24886755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 97 // 82 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT034013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 90 // 90 // 35 // 39 // 1 /// NONRATT034012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 18 // 39 // 1 /// NONRATT034014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1 /// NONRATT034015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
NM_001191719 // RefSeq // Rattus norvegicus jumonji domain containing 1C (Jmjd1c), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24842479:24972937:-1 gene:ENSRNOG00000000648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24843264:24886755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191719 // RefSeq // Rattus norvegicus jumonji domain containing 1C (Jmjd1c), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24842479:24972937:-1 gene:ENSRNOG00000000648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24843264:24886755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034018 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT034017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001191719 // RefSeq // Rattus norvegicus jumonji domain containing 1C (Jmjd1c), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:24842479:24972937:-1 gene:ENSRNOG00000000648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:24843264:24886755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT034021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
ENSRNOT00000035259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:25645596:25646786:1 gene:ENSRNOG00000000651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000070978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9761439:9773323:1 gene:ENSRNOG00000048834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// FQ230643 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YJ20 mRNA sequence. // chr20 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9751885:9772777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:25645482:25646652:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
XM_002725827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus catenin (cadherin associated protein), alpha 3 (Ctnna3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000057950 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:27189005:27896704:-1 gene:ENSRNOG00000000373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000047301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:27244506:27396845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
ENSRNOT00000000302 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:29201150:29267359:1 gene:ENSRNOG00000000277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 83 // 94 // 25 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000057939 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:29201150:29267359:1 gene:ENSRNOG00000000277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 82 // 88 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29152612:29267359:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT033250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1
NM_001108532 // RefSeq // Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 (2H9) (Hnrnph3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 (2H9) (Hnrnph3), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3-like (LOC100910795), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29053262:29058096:1 gene:ENSRNOG00000026849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073617 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:29013728:29017770:1 gene:ENSRNOG00000048193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29009057:29017770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29051151:29057281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012463 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate kinase 6 (Ak6), mRNA. // chr20 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000061166 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49824043:49836090:1 gene:ENSRNOG00000039848 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// BC089989 // GenBank // Rattus norvegicus TAF9 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:109428 IMAGE:7319327), complete cds. // chr20 // 83 // 75 // 5 // 6 // 0 /// DQ323055 // GenBank // Rattus norvegicus adenylate kinase 6 (Ak6) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000031053 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:28969826:28970344:1 gene:ENSRNOG00000026813 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001107628 // RefSeq // Rattus norvegicus myopalladin (Mypn), mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000057872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:28840499:28914635:1 gene:ENSRNOG00000000383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:28840500:28895856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:28901108:28913615:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT033245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0
XM_006223877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sirtuin 1 (Sirt1), partial mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256146 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sirtuin 1 (Sirt1), partial mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000000427 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8141451:8159506:-1 gene:ENSRNOG00000000380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000057829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:8141451:8159506:-1 gene:ENSRNOG00000000380 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000021324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:8141439:8161448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT033757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT033758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001135260 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 167B (Tmem167b), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000423 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:28597911:28598135:1 gene:ENSRNOG00000000376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:230818557:230822325:-1 gene:ENSRNOG00000042160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:230818790:230822139:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000033424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:28593250:28598135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT032163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT032164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0
NM_001106387 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat transmembrane neuronal 3 (Lrrtm3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:28060837:28233801:1 gene:ENSRNOG00000026466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:28029185:28063256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT033243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:28186428:28232258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_080906 // RefSeq // Rattus norvegicus DNA-damage-inducible transcript 4 (Ddit4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31315030:31317123:-1 gene:ENSRNOG00000000577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF334162 // GenBank // Rattus norvegicus RTP801 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC062021 // GenBank // Rattus norvegicus DNA-damage-inducible transcript 4, mRNA (cDNA clone MGC:72327 IMAGE:5623446), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31315878:31330523:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006256433 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 16 (Anapc16), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006256436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 16 (Anapc16), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000000702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31349977:31364636:-1 gene:ENSRNOG00000000576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ209472 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YH20 mRNA sequence. // chr20 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000010131 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31350735:31354460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT034048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000000700 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:31383225:31385285:-1 gene:ENSRNOG00000000574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000010132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31383225:31383524:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_053408 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (chondroitin 6) sulfotransferase 3 (Chst3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:31536785:31539327:-1 gene:ENSRNOG00000000572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF178689 // GenBank // Rattus norvegicus chondroitin 6-sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31536785:31539345:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053644 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin-related 23 (Cdh23), mRNA. // chr20 // 95 // 97 // 62 // 65 // 0 /// ENSRNOT00000048029 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:31669366:31817711:-1 gene:ENSRNOG00000033087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 51 // 51 // 0 /// AB053447 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for KIAA1774 protein, complete cds. // chr20 // 95 // 97 // 62 // 65 // 0 /// GENSCAN00000043614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31669366:31707535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 46 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 67 // 67 // 0 /// GENSCAN00000043607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:31732386:31829271:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 31 // 31 // 21 // 67 // 1
NM_181639 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 29 (equilibrative nucleoside transporter), member 3 (Slc29a3), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32099778:32135978:-1 gene:ENSRNOG00000000568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY273196 // GenBank // Rattus norvegicus equilibrative nucleoside transporter-3 mRNA, complete cds. // chr20 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// BC078678 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 29 (nucleoside transporters), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:93033 IMAGE:7132846), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038435 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32100079:32144342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_022207 // RefSeq // Rattus norvegicus unc-5 homolog B (C. elegans) (Unc5b), mRNA. // chr20 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000038537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32150986:32214979:-1 gene:ENSRNOG00000000567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// U87306 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane receptor Unc5H2 mRNA, complete cds. // chr20 // 88 // 100 // 30 // 34 // 0 /// GENSCAN00000038411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32150986:32214979:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034058 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_173116 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingosine-1-phosphate lyase 1 (Sgpl1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000065127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32497280:32543194:-1 gene:ENSRNOG00000000565 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000003162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32496171:32555116:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0
NM_001107636 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 14 (Adamts14), mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000063875 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32605126:32679770:-1 gene:ENSRNOG00000000563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000003164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32604975:32679770:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT034062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001034128 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatase domain containing, paladin 1 (Pald1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006256446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatase domain containing, paladin 1 (Pald1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006256447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatase domain containing, paladin 1 (Pald1), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000066794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32729253:32765198:-1 gene:ENSRNOG00000000561 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000003160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32730892:32794971:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT034063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001135807 // RefSeq // Rattus norvegicus H2A histone family, member Y2 (H2afy2), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000033529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33152565:33200486:-1 gene:ENSRNOG00000024751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC161981 // GenBank // Rattus norvegicus H2A histone family, member Y2, mRNA (cDNA clone MGC:187793 IMAGE:9029999), complete cds. // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33153204:33175847:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001109172 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type XIII, alpha 1 (Col13a1), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006256469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus collagen, type XIII, alpha 1 (Col13a1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000046537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33254962:33395041:-1 gene:ENSRNOG00000000552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC162018 // GenBank // Rattus norvegicus collagen, type XIII, alpha 1, mRNA (cDNA clone MGC:187895 IMAGE:9098304), complete cds. // chr20 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33249360:33365030:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 73 // 27 // 37 // 1
ENSRNOT00000000662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33529902:33531720:-1 gene:ENSRNOG00000000551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC158618 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2010107G23, mRNA (cDNA clone MGC:187501 IMAGE:7389133), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ218901 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YD05 mRNA sequence. // chr20 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// NONRATT034072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001033069 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2 (Eif4ebp2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:32841631:33048246:-1 gene:ENSRNOG00000000555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC100638 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 4E binding protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:124760 IMAGE:5600115), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003161 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32842480:32858077:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0
NM_177425 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine and glycine-rich protein 2 (Csrp2), mRNA. // chr20 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000067011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:53641861:53660495:1 gene:ENSRNOG00000003772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// BC086356 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine and glycine-rich protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:105286 IMAGE:7303714), complete cds. // chr20 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// U44948 // GenBank // Rattus norvegicus smooth muscle cell LIM protein (SmLIM) mRNA, complete cds. // chr20 // 56 // 100 // 5 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000000670 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:32870174:32870753:-1 gene:ENSRNOG00000000554 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000003166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:32870277:32870753:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000042975 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:53655719:53660285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 78 // 5 // 7 // 0
NM_001012462 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of var1, 3-like 1 (S. cerevisiae) (Supv3l1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33844946:33864105:-1 gene:ENSRNOG00000000392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089883 // GenBank // Rattus norvegicus suppressor of var1, 3-like 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:109049 IMAGE:7369752), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000057812 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33844988:33866601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001007740 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe) (Vps26a), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe) (Vps26a), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067883 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33875000:33903564:-1 gene:ENSRNOG00000030683 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC079150 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe), mRNA (cDNA clone MGC:94168 IMAGE:7128580), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// FQ211877 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YJ21 mRNA sequence. // chr20 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33878510:33903303:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_020074 // RefSeq // Rattus norvegicus serglycin (Srgn), mRNA. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC088144 // GenBank // Rattus norvegicus serglycin, mRNA (cDNA clone MGC:108702 IMAGE:7384101), complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// J03224 // GenBank // Rat proteoglycan peptide core protein mRNA, complete cds. // chr20 // 79 // 85 // 22 // 28 // 0 /// K02934 // GenBank // Rat chondroitin sulfate proteoglycan core protein mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256482 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serglycin (Srgn), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// XM_006256484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serglycin (Srgn), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000000443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33908574:33921685:-1 gene:ENSRNOG00000000394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// FQ220127 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YB17 mRNA sequence. // chr20 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// NONRATT034077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000027924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33909296:33936566:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_001031627 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC606294 (LOC606294), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000444 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:33976300:33995859:-1 gene:ENSRNOG00000000395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33951650:33995826:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001037201 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box helicase 21 (Ddx21), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000068184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:33997712:34017196:-1 gene:ENSRNOG00000043099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC105878 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 21, mRNA (cDNA clone MGC:124980 IMAGE:7126328), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000072722 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:20149054:20153461:-1 gene:ENSRNOG00000048990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 91 // 100 // 32 // 35 // 0 /// NONRATT034080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33998033:34049845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 94 // 33 // 35 // 1 /// GENSCAN00000018148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:20085409:20213813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONRATT034079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_001013198 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 50 (Ddx50), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006256461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 50 (Ddx50), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000000446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34024312:34053709:-1 gene:ENSRNOG00000000396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC091427 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 50, mRNA (cDNA clone MGC:109605 IMAGE:7366491), complete cds. // chr20 // 100 // 55 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027943 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:33998033:34049845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT034083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT034085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001191720 // RefSeq // Rattus norvegicus storkhead box 1 (Stox1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000035355 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34061421:34137583:-1 gene:ENSRNOG00000023712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34061421:34088638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 18 // 18 // 0
NM_001108535 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle and apoptosis regulator 1 (Ccar1), mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_003751966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle and apoptosis regulator protein 1-like (LOC100911233), mRNA. // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000000447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:35637781:35670159:-1 gene:ENSRNOG00000047049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000067004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34157349:34199950:-1 gene:ENSRNOG00000000397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34152930:34200140:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000046970 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35620823:35670349:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT034089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001008308 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger with UFM1-specific peptidase domain (Zufsp), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34255577:34285599:-1 gene:ENSRNOG00000000398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC085885 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger with UFM1-specific peptidase domain, mRNA (cDNA clone MGC:94667 IMAGE:7192192), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027936 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34263909:34284008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034094 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1 /// NONRATT034096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT034097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT034099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001271106 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor, class C, group 6, member A (Gprc6a), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000000451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34391557:34412835:-1 gene:ENSRNOG00000000401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34391781:34413265:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000000453 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:34627658:34628142:-1 gene:ENSRNOG00000000402 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 81 // 94 // 13 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34627658:34628142:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 59 // 10 // 10 // 0
NM_012874 // RefSeq // Rattus norvegicus c-ros oncogene 1 , receptor tyrosine kinase (Ros1), mRNA. // chr20 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000000459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:34881357:35027503:-1 gene:ENSRNOG00000000406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// M35104 // GenBank // Rat lung-derived c-ros-1 proto-oncogene mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// M35105 // GenBank // Rat lung-derived L01 c-ros-1 proto-oncogene mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// M35106 // GenBank // Rat heart-derived c-ros-1 proto-oncogene mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 98 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000003945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35039272:35097143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000003955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34881841:34947818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000003971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:34964926:35035396:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0
ENSRNOT00000052653 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:20:35146359:35146475:-1 gene:ENSRNOG00000034530 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107631 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing (Gopc), mRNA. // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000057476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:35250250:35299383:-1 gene:ENSRNOG00000000408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// BC168160 // GenBank // Rattus norvegicus golgi associated PDZ and coiled-coil motif containing, mRNA (cDNA clone MGC:187605 IMAGE:8364776), complete cds. // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:35252907:35295136:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0
NM_001177829 // RefSeq // Rattus norvegicus rCG22129-like (LOC100365935), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000063920 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:36333903:36441228:-1 gene:ENSRNOG00000000414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC160895 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:188337 IMAGE:7453022, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:36334106:36367176:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT034111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006223913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 9 (Mcm9), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 9 (Mcm9), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:36606873:36687699:-1 gene:ENSRNOG00000003281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:36606873:36626777:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0
XM_006223913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 9 (Mcm9), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256499 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 9 (Mcm9), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004499 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:36606873:36687699:-1 gene:ENSRNOG00000003281 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000032594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:36668200:36810875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
XM_003753483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 184, member A (Fam184a), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000475 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:36692972:36756728:-1 gene:ENSRNOG00000026407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000032594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:36668200:36810875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT034119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT034121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT034122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1
NM_001033656 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 1A, member 1 (Man1a1), mRNA. // chr20 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000057422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:37015823:37203609:-1 gene:ENSRNOG00000000800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// BC090336 // GenBank // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 1A, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7302739), partial cds. // chr20 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// AY325164 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Aa2-166 mRNA, complete cds. // chr20 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT034125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000042111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:37017196:37049846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT034124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1
XM_006223915 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane cofactor protein-like (RGD1559810), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038249 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:37812339:37815508:-1 gene:ENSRNOG00000026207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000054188 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:37812318:37813244:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
AY539947 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00196 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
XM_003753484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 32 (Tbc1d32), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223916 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 32 (Tbc1d32), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000001051 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:39211898:39445181:-1 gene:ENSRNOG00000000802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:39359151:39445181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000044035 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:39805165:39806141:-1 gene:ENSRNOG00000037804 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 78 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000018104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:39786533:39805850:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
NM_182951 // RefSeq // Rattus norvegicus serine incorporator 1 (Serinc1), mRNA. // chrU // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000001066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:40703831:40722882:-1 gene:ENSRNOG00000029360 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// AY339894 // GenBank // Rattus norvegicus tumor differentially expressed 1-like protein mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC088852 // GenBank // Rattus norvegicus serine incorporator 1, mRNA (cDNA clone MGC:105269 IMAGE:7315523), complete cds. // chrU // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// DQ103708 // GenBank // Rattus norvegicus serine incorporator 1 (Serinc1) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// AY539942 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00191 mRNA, complete cds. // chrU // 82 // 82 // 32 // 39 // 1 /// GENSCAN00000022023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:40705150:40775553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 69 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 90 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT034133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NONRATT033356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT033360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001053950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 138 (Ccdc138), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006223889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 138 (Ccdc138), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006223891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 138 (Ccdc138), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 138 (Ccdc138), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_574765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 138 (Ccdc138), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_343859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 138 (Ccdc138), transcript variant X5, misc_RNA. // chr20 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XR_362207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 138 (Ccdc138), transcript variant X4, misc_RNA. // chr20 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000030005 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:29897985:29974911:1 gene:ENSRNOG00000028581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000035396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29897985:29988644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1
NM_001191604 // RefSeq // Rattus norvegicus RAN binding protein 2 (Ranbp2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256402 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 2 (Ranbp2), mRNA. // chr20 // 100 // 37 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000001044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29846539:29896149:1 gene:ENSRNOG00000000796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29846539:29896149:1 gene:ENSRNOG00000000796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000013417 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29825004:29891600:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT033265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001145456 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen-like domains 1 (Lims1), mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// XM_006256385 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen-like domains 1 (Lims1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006256388 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen-like domains 1 (Lims1), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen-like domains 1 (Lims1), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256390 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen-like domains 1 (Lims1), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000064288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29774111:29824244:1 gene:ENSRNOG00000037765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FJ640984 // GenBank // Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen-like domains 1 isoform D (Lims1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// FJ640985 // GenBank // Rattus norvegicus LIM and senescent cell antigen-like domains 1 isoform E (Lims1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ222665 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA20YH17 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29774111:29817270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT033257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001107633 // RefSeq // Rattus norvegicus GRIP and coiled-coil domain containing 2 (Gcc2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000001092 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29653463:29699347:1 gene:ENSRNOG00000000823 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000013412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29652100:29743738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT033256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
XM_003753476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 3-like (Trappc3l), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000047000 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:29419771:29489157:1 gene:ENSRNOG00000031290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006223887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 3-like (Trappc3l), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1 /// GENSCAN00000013415 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29485408:29489157:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000013396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:29421571:29458719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
XM_003754670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger E-box-binding homeobox protein zag-1-like (RGD1563747), mRNA. // chrX // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// GENSCAN00000022075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:36793667:36794839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// GENSCAN00000022079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:36790193:36791365:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 74 // 74 // 23 // 31 // 1 /// GENSCAN00000054430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42615113:42648024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrX // 32 // 32 // 10 // 31 // 1
NM_001106393 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-nucleotidase domain containing 1 (Nt5dc1), mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:42836806:42938666:-1 gene:ENSRNOG00000000546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC162021 // GenBank // Rattus norvegicus 5-nucleotidase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187900 IMAGE:9098589), complete cds. // chr20 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-nucleotidase domain-containing protein 1-like (LOC102554902), mRNA. // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000056773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42848468:42875547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT034144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000056777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:42923330:42972342:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT034145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT034146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001271090 // RefSeq // Rattus norvegicus myristoylated alanine rich protein kinase C substrate (Marcks), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:44693601:44696898:1 gene:ENSRNOG00000000579 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:44693634:44697726:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT033376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000028944 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:45127733:45128442:-1 gene:ENSRNOG00000024987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000045135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:45052002:45169685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0
XM_006223923 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ret finger protein-like 4B (Rfpl4b), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256538 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ret finger protein-like 4B (Rfpl4b), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134695 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 229, member B (Fam229b), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256519 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 229, member B (Fam229b), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:45931980:45947726:-1 gene:ENSRNOG00000024918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001170483 // RefSeq // Rattus norvegicus WNT1 inducible signaling pathway protein 3 (Wisp3), mRNA. // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006256534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WNT1 inducible signaling pathway protein 3 (Wisp3), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000000735 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:45964515:45980204:-1 gene:ENSRNOG00000000597 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000043779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:45970558:46028868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001134547 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to Na+ dependent glucose transporter 1 (RGD1304770), mRNA. // chr20 // 71 // 67 // 10 // 14 // 0 /// XM_006256523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Na+ dependent glucose transporter 1 (RGD1304770), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 71 // 67 // 10 // 14 // 0 /// XM_006256535 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Na+ dependent glucose transporter 1 (RGD1559971), mRNA. // chr20 // 58 // 90 // 11 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000066856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:46738156:46746616:-1 gene:ENSRNOG00000042918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 67 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46719744:46729784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 63 // 76 // 10 // 16 // 0 /// GENSCAN00000001012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46738914:46804071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 71 // 67 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT034170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 71 // 67 // 10 // 14 // 0
XM_006223920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sodium-dependent glucose transporter 1-like (RGD1561777), mRNA. // chr20 // 93 // 100 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000072256 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:46765071:46775941:-1 gene:ENSRNOG00000050425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000001012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46738914:46804071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0
NM_176080 // RefSeq // Rattus norvegicus Na+ dependent glucose transporter 1 (Naglt1), mRNA. // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:46815193:46827493:-1 gene:ENSRNOG00000000590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB089802 // GenBank // Rattus norvegicus NaGLT1 mRNA for Na+ dependent glucose transporter 1, complete cds. // chr20 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// BC098651 // GenBank // Rattus norvegicus Na+ dependent glucose transporter 1, mRNA (cDNA clone MGC:112591 IMAGE:7130354), complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000998 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46815801:46827581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT034174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
FQ210617 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA25YJ18 mRNA sequence. // chr20 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000000720 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:46841630:46845915:-1 gene:ENSRNOG00000000589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT034176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46841630:46856531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_138831 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 16 (aromatic amino acid transporter), member 10 (Slc16a10), mRNA. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:46863306:46979589:-1 gene:ENSRNOG00000000588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AB047324 // GenBank // Rattus norvegicus TAT1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46909278:46918239:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT034178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:46864051:46900420:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001106391 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosome production factor 2 homolog (S. cerevisiae) (Rpf2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000000717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47041320:47062618:-1 gene:ENSRNOG00000000587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC158719 // GenBank // Rattus norvegicus brix domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:187864 IMAGE:9089752), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ213429 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA47YO09 mRNA sequence. // chr20 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT034180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000001128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47041586:47076090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 9 // 18 // 1
XR_340386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102547700 (LOC102547700), transcript variant X1, ncRNA. // chr20 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT019636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT019638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT034180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:80414923:80436854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
BC159437 // GenBank // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 6, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:188773 IMAGE:9102105), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001108537 // RefSeq // Rattus norvegicus general transcription factor IIIC, polypeptide 6, alpha (Gtf3c6), mRNA. // chrU // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000000716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47067523:47076603:-1 gene:ENSRNOG00000000586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT034180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT034182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47041586:47076090:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT034183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_031011 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosylmethionine decarboxylase 1 (Amd1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47103762:47119440:-1 gene:ENSRNOG00000000585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061532 // GenBank // Rattus norvegicus adenosylmethionine decarboxylase 1, mRNA (cDNA clone MGC:72695 IMAGE:6921099), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// M34464 // GenBank // Rat S-adenosylmethionine decarboxylase mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT034189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000001094 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47082663:47137010:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001108538 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 40 (Cdc40), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:50156118:50219885:1 gene:ENSRNOG00000000581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC166724 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle 40 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188440 IMAGE:7933637), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50184094:50202706:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 33 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT033452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50204513:50228541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1
NM_001047096 // RefSeq // Rattus norvegicus FIG4 homolog, SAC1 lipid phosphatase domain containing (S. cerevisiae) (Fig4), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000000343 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47625556:47747494:-1 gene:ENSRNOG00000000312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// DQ666853 // GenBank // Rattus norvegicus SAC3 (Sac3) mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000002531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47617622:47747491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 98 // 88 // 41 // 42 // 0 /// NONRATT034193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT034194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 38 // 38 // 18 // 48 // 1 /// NONRATT034195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_031360 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase 2, neutral membrane (Smpd2), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:47904392:47907503:-1 gene:ENSRNOG00000000306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AB047002 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for neutral sphingomyelinase, complete cds. // chr20 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC091139 // GenBank // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase 2, neutral, mRNA (cDNA clone MGC:108644 IMAGE:7378100), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000009758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47904411:47907242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT034197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47997513:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074162 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47977948:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_362277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X10, misc_RNA. // chr20 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT034199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47997513:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074162 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47977948:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_362277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X10, misc_RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47997513:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074162 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47977948:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47970228:47987238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006256550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XR_362277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X10, misc_RNA. // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47997513:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057150 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47976107:47981464:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47970228:47987238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X6, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_362277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X10, misc_RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47997513:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47970228:47987238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_362277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X10, misc_RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47997513:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47970228:47987238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_362277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X10, misc_RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47997513:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47970228:47987238:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006256550 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X3, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_362277 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X10, misc_RNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000340 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:47964110:47997513:-1 gene:ENSRNOG00000037668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47998459:48130362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X7, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006256555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X8, mRNA. // chr20 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// XM_006256556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X9, mRNA. // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000075224 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:48066385:48084525:1 gene:ENSRNOG00000048216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// GENSCAN00000009745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47998459:48130362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006223934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006223935 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006256554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X7, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X8, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain-containing protein 162-like (LOC102554658), transcript variant X9, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057148 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:48031462:48055476:1 gene:ENSRNOG00000037667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000009745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:47998459:48130362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
XM_006256580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein C6orf183-like (RGD1561147), mRNA. // chr20 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006223942 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative uncharacterized protein C6orf183-like (RGD1561147), mRNA. // chr20 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000009730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:48226904:48314492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0
NM_001017448 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 57-like 1 (Cep57l1), mRNA. // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006256562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 57-like 1 (Cep57l1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// XM_006256565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 57-like 1 (Cep57l1), transcript variant X4, mRNA. // chr20 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006256566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 57-like 1 (Cep57l1), transcript variant X5, mRNA. // chr20 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000331 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:48291080:48346877:-1 gene:ENSRNOG00000000303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC079256 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2410017P07, mRNA (cDNA clone MGC:94355 IMAGE:7133287), complete cds. // chr20 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000009730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:48226904:48314492:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 66 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
XM_006256579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 2 (Armc2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_574794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 2 (Armc2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:48446099:48543912:-1 gene:ENSRNOG00000026217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000022261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:48446099:48505253:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT034207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT034208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
XM_006256579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 2 (Armc2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_574794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 2 (Armc2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:48446099:48543912:-1 gene:ENSRNOG00000026217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006256579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 2 (Armc2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// XM_574794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 2 (Armc2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000031047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:48446099:48543912:-1 gene:ENSRNOG00000026217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006256579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 2 (Armc2), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_574794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus armadillo repeat containing 2 (Armc2), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:48446099:48543912:-1 gene:ENSRNOG00000026217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:48537925:48543912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000051185 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:48670161:48671515:-1 gene:ENSRNOG00000029059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:48670161:48730968:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
NM_001106395 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box O3 (Foxo3), mRNA. // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000000327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:48112118:48202608:1 gene:ENSRNOG00000000299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT033425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:48180963:48224472:1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000057111 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:49145369:49146880:-1 gene:ENSRNOG00000037646 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 83 // 82 // 15 // 18 // 0
ENSRNOT00000000346 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:49256771:49257158:-1 gene:ENSRNOG00000000315 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr20 // 90 // 100 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006410 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:49256771:49293921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 52 // 11 // 11 // 0
NM_001104640 // RefSeq // Rattus norvegicus sine oculis-binding protein homolog (Drosophila) (Sobp), mRNA. // chr20 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000000348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:49411760:49571386:-1 gene:ENSRNOG00000000316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// DQ503410 // GenBank // Rattus norvegicus JXC1 mRNA, complete cds. // chr20 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT034214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000000351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:49963289:49963955:-1 gene:ENSRNOG00000000320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000023132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:49931447:49963934:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 73 // 73 // 8 // 11 // 1
NM_001014034 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing)-like 1 (Qrsl1), mRNA. // chr20 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:50498408:50523506:-1 gene:ENSRNOG00000026049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC089213 // GenBank // Rattus norvegicus glutaminyl-tRNA synthase (glutamine-hydrolyzing)-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:105526 IMAGE:7302358), complete cds. // chr20 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000000099 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50384344:50520965:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT034222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT034225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
XM_006223941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus absent in melanoma 1 (Aim1), mRNA. // chr20 // 98 // 96 // 42 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000036753 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:50569639:50619735:-1 gene:ENSRNOG00000025998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000000092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50569639:50628095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 76 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1
XM_006223941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus absent in melanoma 1 (Aim1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036753 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:50569639:50619735:-1 gene:ENSRNOG00000025998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50569639:50628095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
XM_006223941 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus absent in melanoma 1 (Aim1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036753 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:20:50569639:50619735:-1 gene:ENSRNOG00000025998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000092 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50569639:50628095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107639 // RefSeq // Rattus norvegicus PR domain containing 1, with ZNF domain (Prdm1), mRNA. // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XM_006256594 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 1, with ZNF domain (Prdm1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000048270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:51096616:51118240:-1 gene:ENSRNOG00000000323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT034232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50992243:51118472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1
XM_001069344 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lin-28 homolog B (C. elegans) (Lin28b), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000034485 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:52098670:52176647:-1 gene:ENSRNOG00000025938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000057064 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:52165717:52191595:-1 gene:ENSRNOG00000025938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000064466 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:52098670:52175804:-1 gene:ENSRNOG00000025938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
XM_006223940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin-dependent kinase 2-interacting protein-like (LOC689146), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000031008 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:62001981:62002525:1 gene:ENSRNOG00000024424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:61993985:62052961:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
GENSCAN00000038863 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:54501728:54510286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
ENSRNOT00000073994 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:55379701:55381505:-1 gene:ENSRNOG00000049150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089066 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical LOC100125377, mRNA (cDNA clone MGC:105770 IMAGE:7319366), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034237 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_019309 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate receptor, ionotropic, kainate 2 (Grik2), mRNA. // chr20 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000037559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:55397877:55872312:-1 gene:ENSRNOG00000000368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// Z11548 // GenBank // R.norvegicus cDNA for glutamate receptor subunit (GluR6), kainate subtype. // chr20 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018540 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:55532026:55662571:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000027098 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:55806218:55973897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT034238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr20 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1
NM_001008836 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE13 (RT1-CE13), mRNA. // chrU // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NM_001008837 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE14 (RT1-CE14), transcript variant 1, mRNA. // chrU // 61 // 58 // 11 // 18 // 0 /// NM_001033985 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE14 (RT1-CE14), transcript variant 2, mRNA. // chrU // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// BC083799 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class I, CE14, mRNA (cDNA clone MGC:94828 IMAGE:7108728), complete cds. // chrU // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001008834 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE11 (RT1-CE11), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001025114 // RefSeq // Rattus norvegicus WAS protein family, member 1 (Wasf1), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006256586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WAS protein family, member 1 (Wasf1), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:50107711:50155913:-1 gene:ENSRNOG00000047476 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091322 // GenBank // Rattus norvegicus WAS protein family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:109303 IMAGE:7313558), complete cds. // chr20 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:50108472:50125318:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0
NM_001009178 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 5 homeobox 1 (Pou5f1), mRNA. // chr20 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000072288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:5833974:5838736:-1 gene:ENSRNOG00000046487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// BC158566 // GenBank // Rattus norvegicus POU class 5 homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:187285 IMAGE:9092936), complete cds. // chr20 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000040539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5817853:5838656:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0
NM_001008839 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE16 (RT1-CE16), mRNA. // chrU // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// BC090028 // GenBank // Rattus norvegicus RT1 class I, CE16, mRNA (cDNA clone MGC:109587 IMAGE:7365633), complete cds. // chrU // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U50449 // GenBank // Rattus norvegicus clone 109 class I MHC heavy chain RT1.A(n) antigen precursor (RT1.A(n)) mRNA, complete cds. // chrU // 85 // 90 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000049540 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:5857674:5876456:-1 gene:ENSRNOG00000047706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 83 // 79 // 19 // 23 // 0 /// NONRATT033602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000040564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:5857204:5878729:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT033603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001008838 // RefSeq // Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE15 (RT1-CE15), mRNA. // chr20 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006255891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE11-like (LOC100364500), transcript variant X1, mRNA. // chr20 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000048535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:4805694:4808439:-1 gene:ENSRNOG00000048951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0 /// XM_006255892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RT1 class I, locus CE11-like (LOC100364500), transcript variant X2, mRNA. // chr20 // 56 // 56 // 10 // 18 // 1 /// GENSCAN00000052641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:4677089:4836771:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr20 // 100 // 78 // 14 // 14 // 0
NM_001034012 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAMTS-like 4 (Adamtsl4), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006232944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 4 (Adamtsl4), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000074156 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217293458:217305079:-1 gene:ENSRNOG00000049385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC085819 // GenBank // Rattus norvegicus ADAMTS-like 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7124600). // chr2 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC099119 // GenBank // Rattus norvegicus ADAMTS-like 4, mRNA (cDNA clone MGC:116260 IMAGE:7462597), complete cds. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000028785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217294007:217300944:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 19 // 19 // 0
NM_013115 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin F receptor (Ptgfr), mRNA. // chr2 // 79 // 76 // 22 // 28 // 0 /// XM_006233487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prostaglandin F receptor (Ptgfr), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 54 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071195 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:275684139:275716415:-1 gene:ENSRNOG00000046468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// D28581 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prostaglandin F2-alpha receptor, complete cds. // chr2 // 79 // 76 // 22 // 28 // 0 /// U26663 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin F2a receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 51 // 18 // 19 // 0 /// U47287 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin F2alpha receptor mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0
XM_227820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interferon-induced protein 44-like (Ifi44l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073547 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:275643169:275656977:1 gene:ENSRNOG00000049994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000075385 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:275643169:275656977:1 gene:ENSRNOG00000049994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:275643316:275661033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
NM_001007797 // RefSeq // Rattus norvegicus arrestin domain containing 3 (Arrdc3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006231728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arrestin domain containing 3 (Arrdc3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072849 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:8617992:8627696:1 gene:ENSRNOG00000045649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:8617992:8667467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0
NM_001033974 // RefSeq // Rattus norvegicus endosulfine alpha (Ensa), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC059135 // GenBank // Rattus norvegicus endosulfine alpha, mRNA (cDNA clone MGC:72842 IMAGE:6919652), complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NM_021842 // RefSeq // Rattus norvegicus endosulfine alpha (Ensa), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000075511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217239506:217246826:1 gene:ENSRNOG00000048617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000028780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:217239630:217281882:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_001007698 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi phosphoprotein 3-like (Golph3l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000070919 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:217210324:217235987:1 gene:ENSRNOG00000047620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC081987 // GenBank // Rattus norvegicus golgi phosphoprotein 3-like, mRNA (cDNA clone MGC:94181 IMAGE:7129067), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
XM_006252536 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho GTPase-activating protein 20-like (LOC680627), mRNA. // chr1 // 75 // 89 // 18 // 24 // 0 /// XM_006242569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho GTPase-activating protein 20-like (LOC102555809), mRNA. // chr1 // 38 // 89 // 9 // 24 // 0 /// XR_358220 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552992 (LOC102552992), transcript variant X1, ncRNA. // chr1 // 31 // 96 // 8 // 26 // 0 /// XR_358221 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552992 (LOC102552992), transcript variant X2, ncRNA. // chr1 // 31 // 96 // 8 // 26 // 0 /// XM_006232468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691046 (LOC691046), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// XM_006232469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC691046 (LOC691046), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// XM_006244399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC685976 (LOC685976), mRNA. // chr1 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// GENSCAN00000007622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:42332192:42335344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 40 // 74 // 8 // 20 // 0 /// GENSCAN00000008723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:40254182:40318726:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
XM_006224380 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurexophilin 2 (Nxph2), mRNA. // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// XM_006233553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neurexophilin 2 (Nxph2), mRNA. // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000062080 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:68829:303856:1 gene:ENSRNOG00000040333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:275374:303856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0
ENSRNOT00000006710 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:256526:257997:1 gene:ENSRNOG00000005062 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036206 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2903:257789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 7 // 7 // 0
GENSCAN00000025306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:531492:537444:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001113790 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 36, gamma (Il36g), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1278763:1284912:1 gene:ENSRNOG00000005701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC158611 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 1 family, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:187491 IMAGE:7384725), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001106554 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 36, alpha (Il36a), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007540 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1323993:1328542:1 gene:ENSRNOG00000005722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1290146:1327509:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001107814 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 36 receptor antagonist (Il36rn), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000007593 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1378833:1385430:1 gene:ENSRNOG00000005751 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1369320:1409373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
NM_001108571 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 family, member 10 (Il1f10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1406826:1409754:1 gene:ENSRNOG00000005800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1369320:1409373:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
NM_022194 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 1 receptor antagonist (Il1rn), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 1 receptor antagonist (Il1rn), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 1 receptor antagonist (Il1rn), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1456036:1461446:1 gene:ENSRNOG00000005871 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000055520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1423126:1488682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1
NM_001134881 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 4 (Psd4), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// XM_006233591 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 4 (Psd4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233592 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin and Sec7 domain containing 4 (Psd4), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000008161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:1471353:1507762:1 gene:ENSRNOG00000006079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000020216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1499642:1506450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:1493393:1496926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT034260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001143750 // RefSeq // Rattus norvegicus Notch-regulated ankyrin repeat protein (Nrarp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2377426:2379972:1 gene:ENSRNOG00000009354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2377779:2378123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000032589 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:2386552:2386974:1 gene:ENSRNOG00000024412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2383623:2386974:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
XM_006233601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 166, member A (Fam166a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XM_006233604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 166, member A (Fam166a), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 166, member A (Fam166a), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000013335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2419378:2422989:1 gene:ENSRNOG00000010019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// BC097396 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 166, member A, mRNA (cDNA clone MGC:114439 IMAGE:7453380), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2420168:2422879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT034288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT034287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1
NM_001109195 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 208 (Rnf208), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000014087 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2443879:2445203:1 gene:ENSRNOG00000010607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2444237:2445034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT034291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001107819 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 203 (Tmem203), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2456385:2457213:1 gene:ENSRNOG00000010894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ220407 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YP22 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2456596:2457006:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT034293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024309 // RefSeq // Rattus norvegicus taperin (Tprn), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2461645:2469118:1 gene:ENSRNOG00000010896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC083928 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA C430004E15, mRNA (cDNA clone MGC:95335 IMAGE:7135551), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024475 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2461645:2468654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT034294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001100532 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 2 (Anapc2), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015099 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2471941:2483659:1 gene:ENSRNOG00000011295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// BC166796 // GenBank // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 2, mRNA (cDNA clone MGC:188593 IMAGE:7938000), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// FQ224461 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA65YG16 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 96 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2471956:2489043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_002726088 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 210 (Tmem210), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002729150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 210 (Tmem210), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061987 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:2486107:2487079:1 gene:ENSRNOG00000040275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2471956:2489043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001014053 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 26 (Lrrc26), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015242 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2487839:2489165:1 gene:ENSRNOG00000011457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061729 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 26, mRNA (cDNA clone MGC:72588 IMAGE:5598709), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000024476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2471956:2489043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001109196 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 1B, member 1 (Man1b1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 1B, member 1 (Man1b1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2529399:2550462:1 gene:ENSRNOG00000012559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166449 // GenBank // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 1B, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:8370469), partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2518708:2549704:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034302 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001109418 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor APC domain containing 2 (Sapcd2), mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000017466 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2572744:2577996:1 gene:ENSRNOG00000013069 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// BC158701 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG3880-PA, mRNA (cDNA clone MGC:187776 IMAGE:9028527), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000039798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2572839:2577690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT034308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_172030 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 (Entpd2), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2599308:2604675:1 gene:ENSRNOG00000013102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018560 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2599308:2604728:1 gene:ENSRNOG00000013102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF276940 // GenBank // Rattus norvegicus testicular ecto-ATPase mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// BC086558 // GenBank // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2, mRNA (cDNA clone MGC:105301 IMAGE:7302083), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000039790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2599309:2604461:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT034309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT034312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT034310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001004231 // RefSeq // Rattus norvegicus neural proliferation, differentiation and control, 1 (Npdc1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2606428:2612083:1 gene:ENSRNOG00000013895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC079156 // GenBank // Rattus norvegicus neural proliferation, differentiation and control, 1, mRNA (cDNA clone MGC:94179 IMAGE:7128989), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000039733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2606492:2611679:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT034313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT034318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT034314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT034319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_199491 // RefSeq // Rattus norvegicus fucosyltransferase 7 (alpha (1,3) fucosyltransferase) (Fut7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fucosyltransferase 7 (alpha (1,3) fucosyltransferase) (Fut7), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// XM_006233587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fucosyltransferase 7 (alpha (1,3) fucosyltransferase) (Fut7), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000037169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2625023:2627899:1 gene:ENSRNOG00000014156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AJ276068 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for putative alpha (1,3) fucosyltransferase (fut7 gene). // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2626398:2627354:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT034321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_024396 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily A (ABC1), member 2 (Abca2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000020339 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2630278:2650182:1 gene:ENSRNOG00000014268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// AB037937 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ABC2, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000039778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2630345:2659607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT034322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0
NM_001013080 // RefSeq // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 3 (Clic3), mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000020497 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2657749:2659658:1 gene:ENSRNOG00000015184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// BC089933 // GenBank HTC // Rattus norvegicus chloride intracellular channel 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7308966). // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039778 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2630345:2659607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001025730 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 5 (Fbxw5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233623 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 5 (Fbxw5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006233626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 5 (Fbxw5), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2708665:2712619:1 gene:ENSRNOG00000028674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000048494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2709098:2712619:1 gene:ENSRNOG00000028674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC099179 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:116348 IMAGE:7383052), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039787 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2709263:2712142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT034330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT034329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT034334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT034336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001106557 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelial differentiation-related factor 1 (Edf1), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000022196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2762582:2766887:1 gene:ENSRNOG00000016272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 15 // 15 // 0 /// BC158849 // GenBank // Rattus norvegicus endothelial differentiation-related factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:188333 IMAGE:7445841), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000039794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2762521:2766717:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT034338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1
NM_001128183 // RefSeq // Rattus norvegicus lipocalin 8 (Lcn8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006233632 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipocalin 8 (Lcn8), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023062 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2853444:2856428:1 gene:ENSRNOG00000017161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ537491 // GenBank // Rattus norvegicus lipocalin 8 (Lcn8) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2853466:2855709:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT034344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_024136 // RefSeq // Rattus norvegicus lipocalin 5 (Lcn5), mRNA. // chr3 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000061855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2858706:2877019:1 gene:ENSRNOG00000028074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// M12790 // GenBank // Rat epididymal mRNA encoding androgen-dependent secretory protein, protein B, complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT034345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2858762:2874760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT034346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001001519 // RefSeq // Rattus norvegicus lipocalin 6 (Lcn6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000029655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2869516:2874908:1 gene:ENSRNOG00000028095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF303086 // GenBank // Rattus norvegicus epididymal-specific lipocalin ELP16 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000039788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2858762:2874760:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_001128137 // RefSeq // Rattus norvegicus lipocalin 10 (Lcn10), mRNA. // chr3 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000028997 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2876115:2879667:1 gene:ENSRNOG00000028074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// DQ537494 // GenBank // Rattus norvegicus lipocalin 10 (Lcn10) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 74 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2876137:2878609:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT034348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001128139 // RefSeq // Rattus norvegicus odorant binding protein 2A (Obp2a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000064745 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2891496:2894775:1 gene:ENSRNOG00000042407 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// DQ537493 // GenBank // Rattus norvegicus lipocalin 13 (Lcn13) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000039752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2882600:2898797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001013163 // RefSeq // Rattus norvegicus brain expressed myelocytomatosis oncogene (Bmyc), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2898075:2898834:1 gene:ENSRNOG00000042556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ191782 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/SsNHsd B-myc (B-myc) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ191783 // GenBank // Rattus norvegicus strain ACI/SegHsd B-myc (B-myc) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ191784 // GenBank // Rattus norvegicus strain DA B-myc (B-myc) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ191785 // GenBank // Rattus norvegicus strain COP/CrCrl B-myc (B-myc) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ191786 // GenBank // Rattus norvegicus strain F344 B-myc (B-myc) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2882600:2898797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT034350 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_173148 // RefSeq // Rattus norvegicus odorant binding protein 2B (Obp2b), mRNA. // chr3 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// M76734 // GenBank // Rat odorant-binding protein (RY2G12) mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 100 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT034351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0
NM_001106560 // RefSeq // Rattus norvegicus lipocalin 9 (Lcn9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8634275:8636629:1 gene:ENSRNOG00000027821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ537496 // GenBank // Rattus norvegicus lipocalin 9 (Lcn9) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8634286:8639395:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_021853 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily T, member 1 (Kcnt1), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000023542 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8687852:8725541:1 gene:ENSRNOG00000017283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061773 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:8673193:8725541:1 gene:ENSRNOG00000017283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AF089730 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel subunit (Slack) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// AY884213 // GenBank // Rattus norvegicus SLACK-A isoform mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000033017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:8668661:8725541:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT034354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001145469 // RefSeq // Rattus norvegicus G-protein signaling modulator 1 (Gpsm1), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// NM_144745 // RefSeq // Rattus norvegicus G-protein signaling modulator 1 (Gpsm1), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067840 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9127874:9155506:1 gene:ENSRNOG00000018666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// AF107723 // GenBank // Rattus norvegicus activator of G-protein signaling 3 (AGS3) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// BC086535 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein signaling modulator 1 (AGS3-like, C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:7104788), complete cds. // chr3 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// XM_006233670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G-protein signaling modulator 1 (Gpsm1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 86 // 86 // 32 // 37 // 1 /// GENSCAN00000049790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9132528:9154239:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 81 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT034365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 49 // 49 // 18 // 37 // 1 /// NONRATT034368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1 /// NONRATT034364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1 /// NONRATT034370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
NM_001003673 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidase (mitochondrial processing) alpha (Pmpca), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9195490:9203287:1 gene:ENSRNOG00000026775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9195490:9203287:1 gene:ENSRNOG00000026775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC079004 // GenBank // Rattus norvegicus peptidase (mitochondrial processing) alpha, mRNA (cDNA clone MGC:93916 IMAGE:7112945), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9195496:9203108:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT034375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_139104 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-like-domain, multiple 7 (Egfl7), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AF223678 // GenBank // Rattus norvegicus CBL20 (CBL20) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// BC078725 // GenBank // Rattus norvegicus EGF-like-domain, multiple 7, mRNA (cDNA clone MGC:93163 IMAGE:7127696), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000026318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9395191:9404525:1 gene:ENSRNOG00000019388 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT034378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT034380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1 /// GENSCAN00000049775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9400377:9403916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT034379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT034384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT034382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NR_031871 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-126 (Mir126), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-126a // miRBase Micro RNA Database // MI0000898 Rattus norvegicus miR-126a stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014178 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 69, member B (Fam69b), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006186 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9442976:9450728:1 gene:ENSRNOG00000004532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// BC089911 // GenBank HTC // Rattus norvegicus family with sequence similarity 69, member B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7304825). // chr3 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049785 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9443054:9450560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT034386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT034387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 74 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT034388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 38 // 15 // 15 // 0
NM_022945 // RefSeq // Rattus norvegicus von Ebners gland protein 1 (Vegp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006233710 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus von Ebners gland protein 1 (Vegp1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000042910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:9591815:9595626:1 gene:ENSRNOG00000033761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000042194 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9591870:9595562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT034389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000035050 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:9644092:9647249:1 gene:ENSRNOG00000026208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:9644092:9692641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_198770 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 19 (Zmynd19), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 19 (Zmynd19), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006233598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 19 (Zmynd19), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006233599 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 19 (Zmynd19), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000010270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:2140257:2149618:1 gene:ENSRNOG00000007752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088093 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, MYND-type containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:108530 IMAGE:7368043), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2135947:2149270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XR_344802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810443J12 (RGD1304868), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046898 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:2151723:2160261:1 gene:ENSRNOG00000008102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// BC086405 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7306830. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097959 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7382192. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:2151781:2160207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// NONRATT034265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT034267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT034269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_023094 // RefSeq // Rattus norvegicus globoside alpha-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 1 (Gbgt1), mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// XM_006233867 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ABO blood group-like 1 (Abol1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006233868 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ABO blood group-like 1 (Abol1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000006553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10462331:10479426:1 gene:ENSRNOG00000039906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10404586:10479421:1 gene:ENSRNOG00000039906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF264018 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetylgalactosaminyltransferase A blood group-like enzyme mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AF469945 // GenBank // Rattus norvegicus blood group A glycosyltransferase 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// AB081649 // GenBank // Rattus norvegicus ratABO2.66 mRNA for histo-blood group ABO transferase, complete cds. // chr3 // 39 // 92 // 9 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10468945:10479421:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_006224383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipocalin 4 (Lcn4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipocalin 4 (Lcn4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046109 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:10517897:10521198:1 gene:ENSRNOG00000030708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10515453:10581683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
ENSRNOT00000074467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10794216:10796389:1 gene:ENSRNOG00000047465 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0 /// GENSCAN00000000231 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10781024:10794694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 6 // 6 // 0 /// NONRATT034391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001033866 // RefSeq // Rattus norvegicus surfeit 2 (Surf2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10826488:10830321:1 gene:ENSRNOG00000005167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000075095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10227892:10231316:1 gene:ENSRNOG00000047187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// BC059157 // GenBank // Rattus norvegicus surfeit 2, mRNA (cDNA clone MGC:72956 IMAGE:6918490), complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// FQ219299 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YE03 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
NM_001107822 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase-like domain containing 1 (Stkld1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10843780:10862695:1 gene:ENSRNOG00000027911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC161886 // GenBank // Rattus norvegicus similar to gene model 711, mRNA (cDNA clone MGC:187461 IMAGE:7133966), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000258 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10847091:10862591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT034394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006233878 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 13-like (LOC102554393), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 13-like (LOC102554393), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000007640 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:10882195:10919906:1 gene:ENSRNOG00000005780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000070873 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:10882195:10913447:1 gene:ENSRNOG00000005780 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000000250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10882195:10928043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
XM_006233756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calcium channel flower domain containing 1 (Cacfd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:10920444:10928043:1 gene:ENSRNOG00000005840 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NM_001106561 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel flower domain containing 1 (Cacfd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 1 /// NONRATT034396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10882195:10928043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NONRATT034396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001078833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 2 (Adamtsl2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_231125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAMTS-like 2 (Adamtsl2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000036995 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:10988786:11016680:1 gene:ENSRNOG00000027742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10988785:11016680:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT034400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
NM_013158 // RefSeq // Rattus norvegicus dopamine beta-hydroxylase (dopamine beta-monooxygenase) (Dbh), mRNA. // chr3 // 94 // 97 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000061201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11073477:11095366:1 gene:ENSRNOG00000006641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000070887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11073477:11095366:1 gene:ENSRNOG00000006641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000005339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11073483:11094983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// L12407 // GenBank // Rattus norvegicus dopamine beta-hydroxylase mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 97 // 30 // 33 // 0 /// NONRATT034401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
NM_001039034 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 5 (Wdr5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11423443:11441547:1 gene:ENSRNOG00000008212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC100156 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 5, mRNA (cDNA clone MGC:114572 IMAGE:7462311), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003749434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat-containing protein 5-like (LOC100912075), mRNA. // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT034409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11391107:11466325:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000018982 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:10296172:10388584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
NM_012805 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoid X receptor alpha (Rxra), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000012892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11570610:11654513:1 gene:ENSRNOG00000009446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// L06482 // GenBank // Rat retinoid X receptor alpha mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000036044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11624431:11653959:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0
NM_134452 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type V, alpha 1 (Col5a1), mRNA. // chr3 // 95 // 96 // 62 // 65 // 0 /// ENSRNOT00000012334 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:11789103:11935751:1 gene:ENSRNOG00000008749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 64 // 64 // 0 /// AF272662 // GenBank // Rattus norvegicus alpha 1 type V collagen mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 96 // 62 // 65 // 0 /// GENSCAN00000036016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:11849738:11964361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 54 // 54 // 0 /// NONRATT034417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 34 // 68 // 1 /// NONRATT034415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 19 // 19 // 13 // 68 // 1 /// NONRATT034416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 12 // 12 // 8 // 68 // 1 /// NONRATT034418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 13 // 13 // 9 // 68 // 1
ENSRNOT00000065953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12127562:12134872:1 gene:ENSRNOG00000009862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 35 // 12 // 12 // 0 /// U03414 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal olfactomedin-related ER localized protein (D2Sut1e) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// U03415 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal olfactomedin-related ER localized protein (D2Sut1e) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 44 // 15 // 15 // 0 /// NM_053573 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactomedin 1 (Olfm1), mRNA. // chr3 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000013443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12127562:12152486:1 gene:ENSRNOG00000009862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// U03417 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal olfactomedin-related ER localized protein (D2Sut1e) mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 82 // 28 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000044951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12115220:12152486:1 gene:ENSRNOG00000009862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// U03416 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal olfactomedin-related ER localized protein (D2Sut1e) mRNA, complete cds. // chr3 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1 /// NONRATT034422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12115220:12151476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT034420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// NONRATT034421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1
XM_001063635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 26 (Ppp1r26), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory subunit 26 (Ppp1r26), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12386168:12389893:1 gene:ENSRNOG00000027193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015924 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12377306:12389893:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001108576 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S2 (Mrps2), mRNA. // chr3 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// XM_006233832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S2 (Mrps2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12402368:12407371:1 gene:ENSRNOG00000010164 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12404211:12429661:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT034427 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT034428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_019250 // RefSeq // Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator (Ralgds), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233751 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator (Ralgds), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233752 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator (Ralgds), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000013809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12460022:12481565:1 gene:ENSRNOG00000010219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// L07925 // GenBank // Rattus norvegicus guanine nucleotide dissociation stimulator mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 95 // 33 // 36 // 0 /// GENSCAN00000015922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12454656:12480770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// NONRATT034434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
NM_021854 // RefSeq // Rattus norvegicus tuberous sclerosis 1 (Tsc1), mRNA. // chr3 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// XM_006233846 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tuberous sclerosis 1 (Tsc1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000016904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12588006:12615637:1 gene:ENSRNOG00000011470 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// AB011821 // GenBank // Rattus norvegicus Tsc1 mRNA for Hamartin, complete cds. // chr3 // 98 // 100 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000030073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12588006:12615637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
NONRATT034437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001004266 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate kinase 8 (Ak8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate kinase 8 (Ak8), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate kinase 8 (Ak8), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenylate kinase 8 (Ak8), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12630119:12742333:1 gene:ENSRNOG00000012761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079446 // GenBank // Rattus norvegicus HypB, AroK, ADK and rho factor domain containing protein RGD1303144, mRNA (cDNA clone MGC:94995 IMAGE:7115585), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12637762:12708423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT034443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001107824 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 31 (Ddx31), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000064323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12773312:12837612:1 gene:ENSRNOG00000013040 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// BC160917 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 31, mRNA (cDNA clone MGC:188660 IMAGE:7457829), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000030063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12776859:12829094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
XM_006224322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription termination factor, RNA polymerase I (Ttf1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006233884 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription termination factor, RNA polymerase I (Ttf1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XR_344823 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription termination factor, RNA polymerase I (Ttf1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// XR_352207 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription termination factor, RNA polymerase I (Ttf1), transcript variant X5, misc_RNA. // chr3 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000061029 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:12988356:13006428:1 gene:ENSRNOG00000039777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000013788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12988356:13085854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
XM_006224324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus senataxin (Setx), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus senataxin (Setx), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XR_352208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus senataxin (Setx), transcript variant X5, misc_RNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017984 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:13035150:13077865:1 gene:ENSRNOG00000013491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:12988356:13085854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// FQ222225 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA26YP08 mRNA sequence. // chr3 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001106565 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 27 (Med27), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13233711:13407329:1 gene:ENSRNOG00000013933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC167032 // GenBank // Rattus norvegicus mediator complex subunit 27, mRNA (cDNA clone MGC:189274 IMAGE:9092805), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13335452:13407060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
ENSRNOT00000060977 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:13580866:13648176:1 gene:ENSRNOG00000014316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019220 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:13580866:13648176:1 gene:ENSRNOG00000014316 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// AJ249986 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for C3G protein (c3g gene). // chr3 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// GENSCAN00000021390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13562462:13648127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT034469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT034465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001031662 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q4 (Coq4), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038602 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13692575:13700907:1 gene:ENSRNOG00000026691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC099123 // GenBank // Rattus norvegicus coenzyme Q4 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116264 IMAGE:7462864), complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13692582:13700491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001100706 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 4 (Slc27a4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13707126:13720047:1 gene:ENSRNOG00000014369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13707373:13719244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034472 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001011962 // RefSeq // Rattus norvegicus cerebral endothelial cell adhesion molecule (Cercam), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006233768 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebral endothelial cell adhesion molecule (Cercam), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000060969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13774537:13788191:1 gene:ENSRNOG00000026604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// BC085782 // GenBank // Rattus norvegicus cerebral endothelial cell adhesion molecule, mRNA (cDNA clone MGC:93732 IMAGE:7107449), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13776120:13787468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT034475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001137562 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin related modifier 1 (Urm1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13732444:13749414:1 gene:ENSRNOG00000026636 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC169094 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin related modifier 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189512 IMAGE:7933748), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT034474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021414 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13732464:13764592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT034473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001025731 // RefSeq // Rattus norvegicus GLE1 RNA export mediator (Gle1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006233836 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLE1 RNA export mediator (Gle1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006233837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GLE1 RNA export mediator (Gle1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13842293:13871572:1 gene:ENSRNOG00000015237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC099088 // GenBank // Rattus norvegicus GLE1 RNA export mediator homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:116182 IMAGE:7456179), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ217346 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA29YF01 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000021379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13842372:13870683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT034491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT034493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_171983 // RefSeq // Rattus norvegicus spectrin, alpha, non-erythrocytic 1 (Sptan1), mRNA. // chr3 // 98 // 98 // 54 // 55 // 0 /// ENSRNOT00000045827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13878433:13950970:1 gene:ENSRNOG00000015396 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 55 // 55 // 0 /// AF084186 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-fodrin (A2A) mRNA, complete cds. // chr3 // 98 // 95 // 52 // 53 // 0 /// BC070885 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-spectrin 2, mRNA (cDNA clone MGC:91394 IMAGE:7098134), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 54 // 54 // 0 /// GQ502182 // GenBank // Rattus norvegicus alpha II spectrin mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 94 // 96 // 51 // 54 // 0 /// GENSCAN00000021412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13878595:13950629:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 53 // 53 // 0 /// NONRATT034497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 56 // 56 // 0 /// NONRATT034500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 14 // 14 // 8 // 56 // 1 /// NONRATT034501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 18 // 18 // 10 // 56 // 1
NM_001047861 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase N3 (Pkn3), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase N3 (Pkn3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase N3 (Pkn3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase N3 (Pkn3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006233775 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase N3 (Pkn3), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000050528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:13979910:14008349:1 gene:ENSRNOG00000025892 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000048591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:13984802:14008349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT034516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_001077153 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 13 (Tbc1d13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_575106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 13 (Tbc1d13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021431 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:14054961:14068345:1 gene:ENSRNOG00000015970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14042111:14068345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT034518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT034519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001034938 // RefSeq // Rattus norvegicus endonuclease G (Endog), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14094225:14096950:1 gene:ENSRNOG00000016033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB221075 // GenBank // Rattus norvegicus endog mRNA for endonuclease G, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ232745 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YJ13 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14094299:14096890:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001024782 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member A (Lrrc8a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member A (Lrrc8a), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000033934 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14155802:14181483:1 gene:ENSRNOG00000025296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097371 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 8 family, member A, mRNA (cDNA clone MGC:114406 IMAGE:7444090), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048609 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14155665:14180775:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT034527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001013081 // RefSeq // Rattus norvegicus phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1 (Phyhd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006233780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1 (Phyhd1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14185690:14199073:1 gene:ENSRNOG00000016794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC091389 // GenBank // Rattus norvegicus phytanoyl-CoA dioxygenase domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:109475 IMAGE:7321523), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ212963 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA50YH10 mRNA sequence. // chr3 // 81 // 90 // 22 // 27 // 0 /// FQ219402 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YI02 mRNA sequence. // chr3 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// FQ219572 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YG16 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 80 // 22 // 24 // 0 /// FQ223356 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA12YF02 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048604 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14182908:14199716:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000030996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14205291:14261380:1 gene:ENSRNOG00000025185 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000048572 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14217910:14261015:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT034533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 15 // 43 // 1 /// NONRATT034531 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
ENSRNOT00000065300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14281314:14303962:1 gene:ENSRNOG00000017513 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ231217 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA77YO04 mRNA sequence. // chr3 // 84 // 100 // 27 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14281530:14302523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001106567 // RefSeq // Rattus norvegicus dolichyldiphosphatase 1 (Dolpp1), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000064557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14310907:14319391:1 gene:ENSRNOG00000017663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034539 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14310637:14317526:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_001108577 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 2A activator, regulatory subunit 4 (Ppp2r4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14334896:14365358:1 gene:ENSRNOG00000018457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC166861 // GenBank // Rattus norvegicus protein phosphatase 2A activator, regulatory subunit 4, mRNA (cDNA clone MGC:188770 IMAGE:9101723), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ223957 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA81YN18 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14335078:14364061:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001025019 // RefSeq // Rattus norvegicus N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1 (Ntmt1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233920 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1 (Ntmt1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000035805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15002396:15018993:1 gene:ENSRNOG00000024809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC091294 // GenBank // Rattus norvegicus methyltransferase like 11A, mRNA (cDNA clone MGC:109213 IMAGE:7307721), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ216821 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YB05 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15009214:15018581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT034554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1 /// NONRATT034555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001105739 // RefSeq // Rattus norvegicus paired related homeobox 2 (Prrx2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000008270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15040949:15077369:1 gene:ENSRNOG00000006299 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000024218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15041103:15077040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 69 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT034556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 11 // 16 // 1
NM_001039197 // RefSeq // Rattus norvegicus torsin family 1, member B (Tor1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000066618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15151511:15157600:1 gene:ENSRNOG00000006435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC111704 // GenBank // Rattus norvegicus torsin family 1, member B, mRNA (cDNA clone MGC:124854 IMAGE:7936904), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ222570 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA21YK20 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15151585:15155698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT034562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001107827 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 20 (Usp20), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000010786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15181259:15214732:1 gene:ENSRNOG00000007710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000024210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15190576:15222611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT034563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT034564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 12 // 46 // 1 /// NONRATT034565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 10 // 46 // 1
NM_024366 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal calcium sensor 1 (Ncs1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006233925 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuronal calcium sensor 1 (Ncs1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15914623:15960622:-1 gene:ENSRNOG00000008761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// L27421 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal calcium sensor (NCS-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 95 // 68 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT036923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15913294:15927148:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001107828 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 107 (Gpr107), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000037742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15992527:16053874:-1 gene:ENSRNOG00000023589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000000623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15989650:16053841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006233927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hemicentin 2 (Hmcn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15842351:15895098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006233927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hemicentin 2 (Hmcn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000054666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15842351:15895098:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
XM_006233927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hemicentin 2 (Hmcn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1 /// GENSCAN00000054670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15744597:15833132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006233927 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hemicentin 2 (Hmcn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000011676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15744597:15753612:-1 gene:ENSRNOG00000008820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15744597:15833132:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_013157 // RefSeq // Rattus norvegicus argininosuccinate synthase 1 (Ass1), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000012075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15686795:15728491:-1 gene:ENSRNOG00000008837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// BC063146 // GenBank // Rattus norvegicus argininosuccinate synthetase 1, mRNA (cDNA clone MGC:72667 IMAGE:6888536), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ218831 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YK12 mRNA sequence. // chr3 // 94 // 60 // 17 // 18 // 0 /// M36708 // GenBank // Rattus norvegicus argininosuccinate synthetase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus argininosuccinate synthase 1 (Ass1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// GENSCAN00000054665 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15687038:15730464:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT036916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001039337 // RefSeq // Rattus norvegicus far upstream element (FUSE) binding protein 3 (Fubp3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus far upstream element (FUSE) binding protein 3 (Fubp3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus far upstream element (FUSE) binding protein 3 (Fubp3), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000021871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15581981:15628976:-1 gene:ENSRNOG00000009139 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// DQ144645 // GenBank // Rattus norvegicus MAP2 RNA trans-acting protein 2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ212354 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA57YP12 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000054663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15577680:15628976:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT036912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT036914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT036913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XM_001067974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 12 (Prdm12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002726082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PR domain containing 12 (Prdm12), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15541726:15555965:-1 gene:ENSRNOG00000009218 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15541726:15555962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001108952 // RefSeq // Rattus norvegicus exosome component 2 (Exosc2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15511096:15521359:-1 gene:ENSRNOG00000009245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ227372 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YJ09 mRNA sequence. // chr3 // 90 // 78 // 19 // 21 // 0 /// GENSCAN00000054660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15511654:15521339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT036907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001100850 // RefSeq // Rattus norvegicus c-abl oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase (Abl1), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_003749439 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosine-protein kinase ABL1-like (LOC100909750), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006224342 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosine-protein kinase ABL1-like (LOC100909750), mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_006233918 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus c-abl oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase (Abl1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012617 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:14770456:14807962:-1 gene:ENSRNOG00000009371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000042495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:15401182:15504438:-1 gene:ENSRNOG00000047356 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000043661 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:14770456:14807608:-1 gene:ENSRNOG00000009371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000024217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:15397712:15440156:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000056938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14765518:14807962:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_001107830 // RefSeq // Rattus norvegicus laminin gamma 3 (Lamc3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000013172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14627439:14686842:-1 gene:ENSRNOG00000009769 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14627439:14661237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT036884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001108578 // RefSeq // Rattus norvegicus allograft inflammatory factor 1-like (Aif1l), mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:14598261:14622945:-1 gene:ENSRNOG00000009951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NM_001107830 // RefSeq // Rattus norvegicus laminin gamma 3 (Lamc3), mRNA. // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT036883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:14591038:14626734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT036884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001168559 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 214 (Nup214), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000037164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16351779:16423232:1 gene:ENSRNOG00000023393 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// FQ234243 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YK21 mRNA sequence. // chrU // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// FQ235273 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YN04 mRNA sequence. // chrU // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000072628 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:14588194:14597174:-1 gene:ENSRNOG00000047244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16349133:16439454:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 69 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000000646 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16349133:16439454:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0
NM_001012349 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 3 (Ppapdc3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16467145:16481233:1 gene:ENSRNOG00000010068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089948 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2 domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:109271 IMAGE:7311891), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000013546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16556389:16597339:1 gene:ENSRNOG00000010217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000066368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16556389:16597431:1 gene:ENSRNOG00000010217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000056485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16547248:16600267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NONRATT034581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT034581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_053406 // RefSeq // Rattus norvegicus protein-O-mannosyltransferase 1 (Pomt1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XM_006234001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein-O-mannosyltransferase 1 (Pomt1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006234002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein-O-mannosyltransferase 1 (Pomt1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XR_352227 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein-O-mannosyltransferase 1 (Pomt1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000015214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16602896:16620742:1 gene:ENSRNOG00000010477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AF192388 // GenBank // Rattus norvegicus protein O-mannosyltransferase 1 (POMT1) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// BC070912 // GenBank // Rattus norvegicus protein-O-mannosyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:91582 IMAGE:7104668), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000056474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16602984:16620169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT034586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 83 // 83 // 35 // 42 // 1 /// NONRATT034587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT034588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_022596 // RefSeq // Rattus norvegicus golgin A2 (Golga2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006233992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus golgin A2 (Golga2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16666198:16686435:1 gene:ENSRNOG00000011884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U35022 // GenBank // Rattus norvegicus cis-Golgi matrix protein GM130 mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056464 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16666282:16685130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT034592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001106568 // RefSeq // Rattus norvegicus CDKN1A interacting zinc finger protein 1 (Ciz1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006233943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CDKN1A interacting zinc finger protein 1 (Ciz1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000037399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16741661:16756128:1 gene:ENSRNOG00000013442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000064792 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16741661:16759565:1 gene:ENSRNOG00000013442 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC166776 // GenBank // Rattus norvegicus CDKN1A interacting zinc finger protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:188554 IMAGE:7934431), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000056472 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16736868:16756001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT034600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT034602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT034601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT034603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT034605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001107832 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin E synthase 2 (Ptges2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:16773065:16780249:1 gene:ENSRNOG00000014050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:16773576:16779871:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT034608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT034609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108579 // RefSeq // Rattus norvegicus SH2 domain containing 3C (Sh2d3c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000031511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17095296:17130517:1 gene:ENSRNOG00000022552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000065915 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17101653:17125052:1 gene:ENSRNOG00000022552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// BC158641 // GenBank // Rattus norvegicus SH2 domain containing 3C, mRNA (cDNA clone IMAGE:8362309), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000036026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17116337:17130087:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NONRATT034612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001007744 // RefSeq // Rattus norvegicus torsin family 2, member A (Tor2a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006233981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus torsin family 2, member A (Tor2a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000030694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17132599:17136663:1 gene:ENSRNOG00000022514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067500 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17132599:17136663:1 gene:ENSRNOG00000022514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC078943 // GenBank // Rattus norvegicus torsin family 2, member A, mRNA (cDNA clone MGC:93778 IMAGE:7109352), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17132434:17136186:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT034616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000039151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17148955:17150741:1 gene:ENSRNOG00000049034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ220792 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YK14 mRNA sequence. // chr3 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// XM_006234014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog (S. cerevisiae) (Ptrh1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000060258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17148932:17162610:1 gene:ENSRNOG00000049034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT034618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001109885 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 129, member B (Fam129b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17257993:17307290:1 gene:ENSRNOG00000015845 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168248 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 129, member B, mRNA (cDNA clone MGC:188388 IMAGE:5598117), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036018 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17258184:17306047:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT034628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034634 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034635 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133569 // RefSeq // Rattus norvegicus angiopoietin-like 2 (Angptl2), mRNA. // chr3 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:17596289:17626134:1 gene:ENSRNOG00000016678 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF159049 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensin II type 1A receptor associated protein mRNA, complete cds. // chr3 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055847 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:17576001:17625875:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034636 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001011964 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase associated protein 1 (Mapkap1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023889 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:18809022:19021959:1 gene:ENSRNOG00000017583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC079073 // GenBank // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94027 IMAGE:7122012), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:18983440:19021599:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT034641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:18895270:18966455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT034640 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT034643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT034644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
GENSCAN00000047933 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19216385:19225973:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0
NM_013083 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 5 (Hspa5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000025067 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19157874:19162332:1 gene:ENSRNOG00000018294 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC062017 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:72275 IMAGE:5621611), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// M14050 // GenBank // Rat immunoglobulin heavy chain binding protein (BiP) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19158137:19161916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 83 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT034646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT034647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1 /// NONRATT034648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_001109341 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to divalent cation tolerant protein CUTA (RGD1564854), mRNA. // chr3 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// XM_006233991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to divalent cation tolerant protein CUTA (RGD1564854), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19256352:19275220:1 gene:ENSRNOG00000018832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT034653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19256814:19273686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
XM_006224374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centriolin (Cntrl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// XM_006234052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centriolin (Cntrl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000007776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19623108:19689507:1 gene:ENSRNOG00000022015 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000015903 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19623297:19689507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT034655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0
NM_001004080 // RefSeq // Rattus norvegicus gelsolin (Gsn), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006234038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gelsolin (Gsn), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:19799929:19826452:1 gene:ENSRNOG00000018991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC079472 // GenBank // Rattus norvegicus gelsolin, mRNA (cDNA clone MGC:95032 IMAGE:7122783), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ223877 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA84YF03 mRNA sequence. // chr3 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000015895 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:19799939:19826223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT034661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT034664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT034663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_138710 // RefSeq // Rattus norvegicus DAB2 interacting protein (Dab2ip), mRNA. // chr3 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// XM_006234062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DAB2 interacting protein (Dab2ip), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000059993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20284382:20371266:1 gene:ENSRNOG00000019237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 89 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000066877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20200937:20371266:1 gene:ENSRNOG00000019237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// AF236130 // GenBank // Rattus norvegicus DOC2/DAB2 interactive protein mRNA, complete cds. // chr3 // 75 // 80 // 21 // 28 // 0 /// BC061865 // GenBank // Rattus norvegicus DAB2 interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:72307 IMAGE:5598046), complete cds. // chr3 // 96 // 69 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20326136:20368542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NM_001047912 // RefSeq // Rattus norvegicus MORN repeat containing 5 (Morn5), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000036495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20688321:20716464:1 gene:ENSRNOG00000026111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043200 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20688321:20716464:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1
NM_001008354 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosome recycling factor (Mrrf), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000033047 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20773165:20829830:1 gene:ENSRNOG00000025997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC085779 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial ribosome recycling factor, mRNA (cDNA clone MGC:93722 IMAGE:7106905), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT034675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT034676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 9 // 14 // 1
NM_017043 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin-endoperoxide synthase 1 (Ptgs1), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000010218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20869935:20891509:1 gene:ENSRNOG00000007415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// AY523672 // GenBank // Rattus norvegicus putative cyclooxygenase-3 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// AY523673 // GenBank // Rattus norvegicus putative cyclooxygenase-3 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 37 // 14 // 14 // 0 /// BC081816 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin-endoperoxide synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93510 IMAGE:7129759), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// S67721 // GenBank // Rattus norvegicus cyclooxygenase isoform (COX-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 78 // 95 // 28 // 36 // 0 /// U03388 // GenBank // Rattus norvegicus cyclooxygenase 1 mRNA, complete cds. // chr3 // 78 // 95 // 28 // 36 // 0 /// U18060 // GenBank // Rattus norvegicus prostaglandin H synthase (PGHS-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 79 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043198 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20841017:20890593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT034679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 11 // 38 // 1
ENSRNOT00000048374 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:20952848:20953782:1 gene:ENSRNOG00000031148 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000043199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20953195:20953782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000559 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 395 (Olr395), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:20993472:20994410:1 gene:ENSRNOG00000048909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:20993478:20994410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000831 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 396 (Olr396), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21044752:21045690:1 gene:ENSRNOG00000025931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21044752:21045690:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000025833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21066872:21068208:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000010275 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:21066872:21068208:1 gene:ENSRNOG00000007816 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
NM_001000380 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 397 (Olr397), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21083542:21084471:1 gene:ENSRNOG00000046032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025836 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21083542:21084471:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000830 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 398 (Olr398), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000560 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 399 (Olr399), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075496 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21125871:21159851:1 gene:ENSRNOG00000049538 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 100 // 11 // 15 // 0 /// GENSCAN00000025838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21095909:21233848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001000379 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 400 (Olr400), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000047879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21197583:21198512:1 gene:ENSRNOG00000046801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT034689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000025838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21095909:21233848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
NM_001000829 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 401 (Olr401), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21232910:21233848:1 gene:ENSRNOG00000045719 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21095909:21233848:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001014 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 402 (Olr402), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000041987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21294631:21295569:1 gene:ENSRNOG00000046228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000025825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21294631:21295569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000381 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 403 (Olr403), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21329700:21330623:1 gene:ENSRNOG00000030855 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025835 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21329700:21330623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000382 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 404 (Olr404), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21406729:21407667:1 gene:ENSRNOG00000045690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21406735:21407667:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000383 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 406 (Olr406), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21437671:21438606:1 gene:ENSRNOG00000046849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025830 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21437671:21438606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000828 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 407 (Olr407), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21526197:21527135:1 gene:ENSRNOG00000047961 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21526197:21527135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034696 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21556023:21593719:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001000384 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 408 (Olr408), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045825 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21600451:21601389:1 gene:ENSRNOG00000047092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042401 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21600442:21601389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000827 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 409 (Olr409), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21624978:21625919:1 gene:ENSRNOG00000048611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000042407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:21620524:21625919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000969 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 410 (Olr410), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073976 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:21631829:21632762:1 gene:ENSRNOG00000048499 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT034688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1
NM_001000826 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 413 (Olr413), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26120364:26121302:1 gene:ENSRNOG00000047478 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26120364:26121302:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000386 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 415 (Olr415), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070947 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:26135336:26148327:1 gene:ENSRNOG00000049460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// GENSCAN00000015597 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26126440:26135797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000388 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 417 (Olr417), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010450 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26211396:26212349:1 gene:ENSRNOG00000007954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26211396:26212349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000968 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 419 (Olr419), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010465 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26238850:26239797:1 gene:ENSRNOG00000007962 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000389 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 420 (Olr420), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26261911:26262837:1 gene:ENSRNOG00000007965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000391 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 423 (Olr423), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000044947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26360501:26361487:1 gene:ENSRNOG00000031803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000015592 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26360501:26361487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001000823 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 427 (Olr427), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26453661:26454584:1 gene:ENSRNOG00000031763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26453661:26454584:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034716 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000394 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 428 (Olr428), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26521274:26522209:1 gene:ENSRNOG00000030460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26521274:26522209:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000395 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 429 (Olr429), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26538057:26538986:1 gene:ENSRNOG00000025721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002352 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26538057:26538986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006224387 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor Olfr367-like (LOC100364629), mRNA. // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// XM_006234135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1G1-like (LOC690140), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000036335 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:26560599:26561441:1 gene:ENSRNOG00000025713 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26559064:26561441:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001000397 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 434 (Olr434), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010520 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26603044:26604027:1 gene:ENSRNOG00000008003 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002371 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26580461:26604027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000002354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26749041:26749349:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034721 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 83 // 100 // 10 // 12 // 0
XM_003749469 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC100911251), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26786341:26825483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT034722 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
ENSRNOT00000030332 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:26822843:26825432:1 gene:ENSRNOG00000039141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002340 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26786341:26825483:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 91 // 17 // 20 // 0
ENSRNOT00000018792 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:26851672:26852123:1 gene:ENSRNOG00000014043 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0
NM_001107841 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB GTPase activating protein 1 (Rabgap1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:26937207:27053941:1 gene:ENSRNOG00000009402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:27017836:27052360:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT034725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26963367:27005067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001109554 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 21 (Gpr21), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000063938 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:27002939:27005862:1 gene:ENSRNOG00000042269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26963367:27005067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT034725 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000043621 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:27221818:27222309:1 gene:ENSRNOG00000030143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0
NM_001135761 // RefSeq // Rattus norvegicus crumbs family member 2 (Crb2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus crumbs homolog 2 (Drosophila) (Crb2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000037257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:27274066:27294580:1 gene:ENSRNOG00000025498 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:27274066:27296590:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001106571 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM homeobox 2 (Lhx2), mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XM_006234072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM homeobox 2 (Lhx2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006234073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LIM homeobox 2 (Lhx2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000014452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:27870027:27887928:1 gene:ENSRNOG00000010551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000064507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:27870027:27887928:1 gene:ENSRNOG00000010551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// L06804 // GenBank // Rattus norvegicus LIM homeodomain protein (LH-2) mRNA sequence. // chr3 // 64 // 85 // 14 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:27870086:27887305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT034734 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001277232 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA-related kinase 6 (Nek6), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NM_182953 // RefSeq // Rattus norvegicus NIMA-related kinase 6 (Nek6), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NIMA-related kinase 6 (Nek6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28080322:28113347:1 gene:ENSRNOG00000010897 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY334013 // GenBank // Rattus norvegicus NIMA-related expressed kinase 6 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// BC160820 // GenBank // Rattus norvegicus NIMA (never in mitosis gene a)-related kinase 6, mRNA (cDNA clone MGC:187307 IMAGE:7459041), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28080372:28112926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034736 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT034737 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
GENSCAN00000015594 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:26040245:26083467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT034709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// GENSCAN00000017075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28202818:28219039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NR_031898 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 181a-2 (Mir181a2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053753 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:28374769:28374885:1 gene:ENSRNOG00000035630 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-181a-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000925 Rattus norvegicus miR-181a-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031900 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 181b-2 (Mir181b2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053686 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:28375872:28375959:1 gene:ENSRNOG00000035563 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT034740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-181b-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000927 Rattus norvegicus miR-181b-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001106572 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactomedin-like 2A (Olfml2a), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28455740:28481133:1 gene:ENSRNOG00000014034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28460653:28516445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000018921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28513535:28516643:1 gene:ENSRNOG00000014102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// FQ213095 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YL23 mRNA sequence. // chr3 // 88 // 77 // 15 // 17 // 0 /// GENSCAN00000011833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28460653:28516445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// NONRATT034742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 55 // 55 // 12 // 22 // 1
NM_001037767 // RefSeq // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 5-like (Arpc5l), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:28523340:28530898:1 gene:ENSRNOG00000014317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098820 // GenBank // Rattus norvegicus actin related protein 2/3 complex, subunit 5-like, mRNA (cDNA clone IMAGE:7377370), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021996 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:9:49466038:49466499:-1 gene:ENSRNOG00000016444 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:28527934:28530155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:49466038:49466499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000021212 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:28804594:28805211:1 gene:ENSRNOG00000015828 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 67 // 100 // 12 // 18 // 0
FQ220555 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YH08 mRNA sequence. // chr3 // 83 // 97 // 30 // 36 // 0 /// NONRATT005713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 100 // 31 // 37 // 0 /// NONRATT005714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 100 // 31 // 37 // 0
NM_053902 // RefSeq // Rattus norvegicus kynureninase (Kynu), mRNA. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// XM_006234138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kynureninase (Kynu), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:33622183:33770768:1 gene:ENSRNOG00000029993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC078762 // GenBank // Rattus norvegicus kynureninase (L-kynurenine hydrolase), mRNA (cDNA clone MGC:93273 IMAGE:7128911), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// U68168 // GenBank // Rattus norvegicus L-kynurenine hydrolase mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:33613540:33770458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1
NM_001013917 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 15 (Arhgap15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 15 (Arhgap15), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 15 (Arhgap15), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// XM_006234143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 15 (Arhgap15), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000049884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:33831452:34442266:1 gene:ENSRNOG00000031168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC079103 // GenBank // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 15, mRNA (cDNA clone MGC:94091 IMAGE:7125019), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 15 (Arhgap15), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// XM_006234142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 15 (Arhgap15), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT034754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000035353 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:34103888:34369611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1 /// NONRATT034752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT034753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
GENSCAN00000024876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:34655116:34655466:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000037022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:35194081:35196003:1 gene:ENSRNOG00000022006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:35169469:35210111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT034763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_031571 // RefSeq // Rattus norvegicus activin A receptor, type IIA (Acvr2a), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:38113728:38197535:1 gene:ENSRNOG00000005334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000039406 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:38156188:38196822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XR_009624 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 5 (Mbd5), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034632 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:38600058:38662936:1 gene:ENSRNOG00000027596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:38600058:38633187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT034773 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1 /// NONRATT034774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_001108581 // RefSeq // Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila) (Epc2), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// XM_006234155 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila) (Epc2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// XM_574397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus enhancer of polycomb homolog 2 (Drosophila)-like 1 (Epc2l1), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:38799078:38897923:1 gene:ENSRNOG00000029447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000072193 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:84689817:84692243:-1 gene:ENSRNOG00000050758 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023595 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:84689817:84692243:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT034775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000015742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:38786755:38919407:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 86 // 32 // 37 // 1 /// NONRATT034777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
NM_001107730 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 5C (Kif5c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:40279088:40366547:1 gene:ENSRNOG00000004680 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000025025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:40274240:40365274:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001134580 // RefSeq // Rattus norvegicus LY6/PLAUR domain containing 6B (Lypd6b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LY6/PLAUR domain containing 6B (Lypd6b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LY6/PLAUR domain containing 6B (Lypd6b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:40398135:40555551:1 gene:ENSRNOG00000004614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017140 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:40546449:40554409:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT034784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006224409 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LY6/PLAUR domain containing 6 (Lypd6), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// XM_006234161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LY6/PLAUR domain containing 6 (Lypd6), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:40794415:40818938:1 gene:ENSRNOG00000038980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:40794415:40819124:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0
ENSRNOT00000007800 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:40862579:40863403:1 gene:ENSRNOG00000005951 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000017147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:40860236:40863403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001047951 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00012 (LOC499796), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000038906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:41286945:41334625:1 gene:ENSRNOG00000028112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001013915 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 134 (Tas2r134), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030442 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:42257458:42258447:1 gene:ENSRNOG00000027510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY916511 // GenBank // Rattus norvegicus strain W T2R34 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000035553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:42239875:42304657:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT034789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003753723 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap1 interacting factor 1 homolog (yeast) (Rif1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000008201 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:42697604:42745556:1 gene:ENSRNOG00000006267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000008240 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:42697604:42745556:1 gene:ENSRNOG00000006267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:42667383:42745556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 23 // 23 // 0
XM_001059859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 5 (Dppa5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006227666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100360362 (LOC100360362), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_236761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus developmental pluripotency associated 5 (Dppa5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000000215 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85265568:-1 gene:ENSRNOG00000000199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000040010 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:7:70164190:70164543:-1 gene:ENSRNOG00000032335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000047129 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:14646133:14646486:-1 gene:ENSRNOG00000031089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000049144 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:43466258:43466611:1 gene:ENSRNOG00000029793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000720 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:14646133:14646483:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:85264716:85273561:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000018960 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43466261:43466611:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000047581 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:70164190:70164540:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XR_344924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formin-like protein 2-like (RGD1560248), transcript variant X5, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43657159:43771437:1 gene:ENSRNOG00000004617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000059388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43657159:43772884:1 gene:ENSRNOG00000004617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43657159:43772955:1 gene:ENSRNOG00000004617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075441 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43498861:43772884:1 gene:ENSRNOG00000004617 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43733941:43772955:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT034797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001024310 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 6 interacting protein 6 (Arl6ip6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:43839905:43867541:1 gene:ENSRNOG00000005074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079329 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation-like factor 6 interacting protein 6, mRNA (cDNA clone MGC:94747 IMAGE:7096035), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222449 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA23YE03 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XR_352316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation-like factor 6 interacting protein 6 (Arl6ip6), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// GENSCAN00000018961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:43839915:43847578:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034803 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_199106 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 (Galnt13), mRNA. // chr3 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// XM_006234197 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 (GalNAc-T13) (Galnt13), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 94 // 92 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000048804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:45130269:45710879:1 gene:ENSRNOG00000005335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// AY371923 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 13 (T13) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 92 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000049961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:45310657:45424655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0
NONRATT034809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031610 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member 3 (Kcnj3), mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000007335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:46103575:46266134:1 gene:ENSRNOG00000005369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// L25264 // GenBank // Rattus norvegicus G-protein-coupled muscarinic potassium channel (GIRK1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// U01071 // GenBank // Rattus norvegicus G protein activated K channel (KGA) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// U01141 // GenBank // Rattus norvegicus G protein activated K channel, subtype1 (KGB1) gene, complete cds. // chr3 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// U09243 // GenBank // Rattus norvegicus GIRK1/KGA inwardly rectifying potassium channel mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// U72410 // GenBank // Rattus norvegicus Kir3.1 alternative splice variant deltaB mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// Y12259 // GenBank // R.norvegicus mRNA for Kir3.1 protein. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT034812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT034813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_012736 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2, mitochondrial (Gpd2), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// BC083565 // GenBank // Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate dehydrogenase 2, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:93605 IMAGE:7134834), complete cds. // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// FQ223746 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA87YP10 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// U08027 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley glycerolphosphate dehydrogenase (mGPD) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// U83880 // GenBank // Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate dehydrate dehydrogenase (mtGPDH) mRNA, 3UTR. // chr3 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000044419 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:48327068:48426568:1 gene:ENSRNOG00000033824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000010026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:48399365:48426443:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 20 // 40 // 1 /// NONRATT034818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT034819 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NM_031796 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 5 (Galnt5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:49141855:49185390:1 gene:ENSRNOG00000004645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF049344 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-GalNAc:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase T5 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:49141533:49184783:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NR_003722 // RefSeq // Rattus norvegicus glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, pseudogene 1 (Gapdh-ps1), non-coding RNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049603 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:49855478:49856481:1 gene:ENSRNOG00000033635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000003797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:49855481:49856270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT034826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106481 // RefSeq // Rattus norvegicus uridine phosphorylase 2 (Upp2), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:49922719:49961766:1 gene:ENSRNOG00000005341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033575 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:49941226:49951074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
XM_006224440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plakophilin 4 (Pkp4), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006234216 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus plakophilin 4 (Pkp4), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000007531 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:50393961:50530402:1 gene:ENSRNOG00000005504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000059246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:50393961:50530402:1 gene:ENSRNOG00000005504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:50432824:50530402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT034829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001108582 // RefSeq // Rattus norvegicus death associated protein-like 1 (Dapl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:50655568:50675511:1 gene:ENSRNOG00000005743 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168756 // GenBank // Rattus norvegicus death associated protein-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188869 IMAGE:6887254), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:50655629:50696337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001002854 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat, ankyrin repeat and coiled-coil containing 1 (Tanc1), mRNA. // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000038983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:50829732:51028013:1 gene:ENSRNOG00000025394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB098072 // GenBank // Rattus norvegicus TANC mRNA for TPR domain, ankyrin-repeat and coiled-coil-containing protein, complete cds. // chr3 // 89 // 100 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000015447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:50931904:51027866:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001177816 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00075-like (LOC100361645), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051344 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:51294500:51343046:1 gene:ENSRNOG00000031951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000015455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51283922:51425193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001012087 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 7, E3 ubiquitin protein ligase (March7), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234226 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 7, E3 ubiquitin protein ligase (March7), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 7, E3 ubiquitin protein ligase (March7), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 7, E3 ubiquitin protein ligase (March7), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008464 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:51400038:51432100:1 gene:ENSRNOG00000006241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083842 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 7, mRNA (cDNA clone MGC:94971 IMAGE:7114399), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ222785 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA19YP16 mRNA sequence. // chr3 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT034844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT034845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000015455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:51283922:51425193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001164073 // RefSeq // Rattus norvegicus TRAF family member-associated NFKB activator (Tank), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NM_145788 // RefSeq // Rattus norvegicus TRAF family member-associated NFKB activator (Tank), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000011794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:54111817:54239689:1 gene:ENSRNOG00000008859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC088854 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF family member-associated NFKB activator, mRNA (cDNA clone IMAGE:7317281), partial cds. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// BC129086 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF family member-associated NFKB activator, mRNA (cDNA clone MGC:156587 IMAGE:7365827), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000015346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:54082015:54187806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// NONRATT034869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1 /// NONRATT034870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// NONRATT034871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001106483 // RefSeq // Rattus norvegicus grancalcin (Gca), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:55291465:55324447:1 gene:ENSRNOG00000007359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:55291411:55323035:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT034882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT034883 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000059006 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:57078107:57078366:1 gene:ENSRNOG00000038650 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:57078175:57078763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
NM_012647 // RefSeq // Rattus norvegicus sodium channel, voltage-gated, type II, alpha 1 (Scn2a1), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000007069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58322638:58454329:1 gene:ENSRNOG00000005018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000014292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58372554:58417492:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 42 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58419350:58454329:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT034891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001271225 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-serine-rich nuclear protein 3 (Csrnp3), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000007197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:58735636:58752630:1 gene:ENSRNOG00000005359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 50 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017217 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58726152:58752630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT034895 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
ENSRNOT00000007670 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:58951662:58952457:1 gene:ENSRNOG00000005846 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000051693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:58943530:58952285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0
ENSRNOT00000058819 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:59934221:59934676:1 gene:ENSRNOG00000038559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:59923196:59995184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0
ENSRNOT00000028905 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:59977171:59977743:1 gene:ENSRNOG00000021989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000056633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:59923196:59995184:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_201989 // RefSeq // Rattus norvegicus xin actin-binding repeat containing 2 (Xirp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048300 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:60181189:60274632:1 gene:ENSRNOG00000034258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF466694 // GenBank // Rattus norvegicus L-NAME induced actin cytoskeletal protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000056635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:60247467:60274266:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000056632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:60007404:60237032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001108954 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 1 (B3galt1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:60870422:60883765:1 gene:ENSRNOG00000007625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:60881373:60882353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT034907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000075187 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:61305910:61306564:1 gene:ENSRNOG00000047008 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:61304302:61333734:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 12 // 12 // 0
XM_006234310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 36C-like (LOC685184), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034341 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:61351964:61358758:1 gene:ENSRNOG00000024700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000034482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:61351976:61412503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006234310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 36C-like (LOC685184), mRNA. // chr3 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// XR_344968 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557583 (LOC102557583), ncRNA. // chr3 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// GENSCAN00000034482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:61351976:61412503:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
XM_006234306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 26-like (LOC685215), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// XM_006224622 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain-containing protein 36C-like (LOC685184), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000036244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:61419864:61627668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0
XM_001058193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5-like (RGD1564400), mRNA. // chr6 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000033258 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:61636588:61637505:1 gene:ENSRNOG00000024655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000036241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:61636603:61637505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr6 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
XM_006224472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceramide synthase 6 (Cers6), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058763 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:61708611:61906524:1 gene:ENSRNOG00000024595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001024260 // RefSeq // Rattus norvegicus nitric oxide synthase trafficking (Nostrin), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000067161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:61980713:62045299:1 gene:ENSRNOG00000006611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC088446 // GenBank // Rattus norvegicus nitric oxide synthase trafficker, mRNA (cDNA clone MGC:95089 IMAGE:7126459), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ226667 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YN04 mRNA sequence. // chr3 // 82 // 97 // 27 // 33 // 0 /// GENSCAN00000022374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:61980761:62045171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT034914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_130819 // RefSeq // Rattus norvegicus dehydrogenase/reductase (SDR family) member 9 (Dhrs9), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62230668:62252887:1 gene:ENSRNOG00000006773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// AF337953 // GenBank // Rattus norvegicus retinol dehydrogenase mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT034915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62236393:62253480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001108583 // RefSeq // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 5 (Bbs5), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234317 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 5 (Bbs5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234320 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 5 (Bbs5), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62498548:62519537:1 gene:ENSRNOG00000007127 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC167024 // GenBank // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 5 (human), mRNA (cDNA clone MGC:189245 IMAGE:7123978), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000032433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62486727:62543022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 25 // 31 // 1 /// NONRATT034918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT034919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT034920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_057191 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 41 (Klhl41), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000009969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62521998:62535124:1 gene:ENSRNOG00000007461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62486727:62543022:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031793 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase G (Ppig), mRNA. // chr3 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000010216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62571744:62600506:1 gene:ENSRNOG00000007673 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AF043642 // GenBank // Rattus norvegicus matrin cyclophilin (matrin-cyp) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// BC085723 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase G, mRNA (cDNA clone MGC:93333 IMAGE:7123868), complete cds. // chr3 // 97 // 78 // 28 // 29 // 0 /// FQ227838 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA11YK05 mRNA sequence. // chr3 // 84 // 51 // 16 // 19 // 0 /// FQ234592 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YF24 mRNA sequence. // chr3 // 79 // 51 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62580685:62599185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 49 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT034923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT034924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 89 // 89 // 33 // 37 // 1 /// NONRATT034925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_001007642 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatase, orphan 2 (Phospho2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010489 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62667716:62674876:1 gene:ENSRNOG00000007979 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081926 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatase, orphan 2, mRNA (cDNA clone MGC:93920 IMAGE:7113082), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006234315 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 23 (Klhl23), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 23 (Klhl23), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001134504 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 23 (Klhl23), mRNA. // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000010508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62692399:62705970:1 gene:ENSRNOG00000007981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// FQ217393 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA27YN24 mRNA sequence. // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62694234:62717822:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT034931 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_031119 // RefSeq // Rattus norvegicus Sjogren syndrome antigen B (Ssb), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// XM_006234321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Sjogren syndrome antigen B (Ssb), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000011174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62727509:62737009:1 gene:ENSRNOG00000007998 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// BC081780 // GenBank // Rattus norvegicus Sjogren syndrome antigen B, mRNA (cDNA clone MGC:93380 IMAGE:7192454), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 10 // 10 // 0 /// BC097252 // GenBank // Rattus norvegicus Sjogren syndrome antigen B, mRNA (cDNA clone IMAGE:7458071), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT034933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000072395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62759980:62809258:1 gene:ENSRNOG00000008616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62806280:62914683:1 gene:ENSRNOG00000008616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT034939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62759566:62880705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
ENSRNOT00000011380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62806280:62914683:1 gene:ENSRNOG00000008616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// FQ212201 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YM20 mRNA sequence. // chr3 // 94 // 100 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000012059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62900625:62914683:1 gene:ENSRNOG00000008616 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1 /// GENSCAN00000032419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62885122:62910807:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 30 // 8 // 10 // 0 /// NONRATT034939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032429 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:62759566:62880705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
NM_001191901 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin IIIB (Myo3b), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000037188 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:62983082:63336893:1 gene:ENSRNOG00000030022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:63098822:63242801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 17 // 39 // 1
NM_001024311 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate-rich 2 (Erich2), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:63420706:63456910:1 gene:ENSRNOG00000034124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC082109 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4933404M02, mRNA (cDNA clone MGC:95314 IMAGE:7135070), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 82 // 82 // 23 // 28 // 1 /// GENSCAN00000000045 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:63410642:63471093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1 /// NONRATT034947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_017007 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamate decarboxylase 1 (Gad1), mRNA. // chr3 // 94 // 90 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000008 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:63479963:63519877:1 gene:ENSRNOG00000000007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// EU791557 // GenBank // Rattus norvegicus glutamate decarboxylase 1 variant GAD67NT mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 93 // 75 // 28 // 30 // 0 /// GQ468528 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley glutamic acid decarboxylase 67 variant GAD67C mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 85 // 32 // 34 // 0 /// M34445 // GenBank // Rat glutamic acid decarboxylase (GAD) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 90 // 34 // 36 // 0 /// M38350 // GenBank // Rat embryonic glutamate decarboxylase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0 /// M76177 // GenBank // Rattus norvegicus glutamic acid decarboxylase (GAD67) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000000050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:63488689:63537140:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 68 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT034948 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT034949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_001007720 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi reassembly stacking protein 2 (Gorasp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000039065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:63767465:63782078:1 gene:ENSRNOG00000023386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// AF110267 // GenBank // Rattus norvegicus golgi stacking protein homolog GRASP55 mRNA, complete cds. // chr3 // 76 // 94 // 22 // 29 // 0 /// BC078731 // GenBank // Rattus norvegicus golgi reassembly stacking protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:93180 IMAGE:7112220), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000047 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:63759163:63781323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT034951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000012403 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:63607283:63607674:1 gene:ENSRNOG00000009361 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 89 // 82 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:63602578:63607674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 16 // 16 // 0
NM_001177688 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 17 (Dcaf17), mRNA. // chr3 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000031463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64142533:64167836:1 gene:ENSRNOG00000009403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// BC160919 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4833418A01, mRNA (cDNA clone MGC:188663 IMAGE:7458373), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234347 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 17 (Dcaf17), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1 /// GENSCAN00000007606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64140720:64168879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT034954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_001011954 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b reductase 1 (Cybrd1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64212933:64240161:1 gene:ENSRNOG00000009620 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC085768 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b reductase 1, mRNA (cDNA clone MGC:93676 IMAGE:7108043), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000007611 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64212944:64272423:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001009657 // RefSeq // Rattus norvegicus histone acetyltransferase 1 (Hat1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234353 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus histone acetyltransferase 1 (Hat1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002085 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64510903:64558567:1 gene:ENSRNOG00000001524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC087663 // GenBank // Rattus norvegicus histone acetyltransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105743 IMAGE:7315259), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64510941:64558393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT034972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT034974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT034973 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NONRATT034974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT034972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NM_001107812 // RefSeq // Rattus norvegicus methionyl aminopeptidase type 1D (mitochondrial) (Metap1d), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000002081 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64572489:64646083:1 gene:ENSRNOG00000001522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT034976 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT034975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 70 // 23 // 33 // 1 /// GENSCAN00000050002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64621878:64653442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_001100531 // RefSeq // Rattus norvegicus distal-less homeobox 1 (Dlx1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002078 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64650292:64654882:1 gene:ENSRNOG00000001520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167073 // GenBank // Rattus norvegicus distal-less homeobox 1, mRNA (cDNA clone MGC:189409 IMAGE:8364673), complete cds. // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000050002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64621878:64653442:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT034979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_053725 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha 6 (Itga6), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002075 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64931887:65000973:1 gene:ENSRNOG00000001518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045394 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:64931857:65001002:1 gene:ENSRNOG00000001518 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AJ312934 // GenBank // Rattus norvegicus partial mRNA for integrin alpha 6 subchain (inta6 gene), 3 end. // chr3 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:64931887:65001002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT034983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1
NM_053826 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 1 (Pdk1), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000002072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:65019116:65046273:1 gene:ENSRNOG00000001517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// BC089783 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 1, mRNA (cDNA clone MGC:108625 IMAGE:7321326), complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// L22294 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase kinase mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000047126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:65019220:65026574:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 26 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047137 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:65029893:65046103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 57 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT034988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0
XM_001060956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 4 (Rapgef4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006224482 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 4 (Rapgef4), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:65349112:65408826:1 gene:ENSRNOG00000001516 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AB031229 // GenBank // Rattus norvegicus CAMPS mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// U78517 // GenBank // Rattus norvegicus cAMP-regulated guanine nucleotide exchange factor II (cAMP-GEFII) mRNA, partial cds. // chr3 // 75 // 50 // 12 // 16 // 0 /// GENSCAN00000047144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:65339831:65393811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
XM_006224483 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif and leucine zipper containing kinase AZK (Zak), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000002067 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:65449437:65598050:1 gene:ENSRNOG00000001515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000002068 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:65449437:65550151:1 gene:ENSRNOG00000001515 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 22 // 22 // 0 /// FQ209892 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA38YF08 mRNA sequence. // chr3 // 97 // 78 // 31 // 32 // 0 /// XM_006224484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif and leucine zipper containing kinase AZK (Zak), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 30 // 41 // 1 /// XM_006224485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif and leucine zipper containing kinase AZK (Zak), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 30 // 41 // 1 /// XM_006224487 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sterile alpha motif and leucine zipper containing kinase AZK (Zak), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// GENSCAN00000053003 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:65475697:65597383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT034997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 11 // 41 // 1
NM_001025693 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 (Cdca7), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000002066 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:65630826:65641459:1 gene:ENSRNOG00000001514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC098690 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle associated 7, mRNA (cDNA clone MGC:112656 IMAGE:7386103), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:65630911:65641299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT035003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
XM_001061418 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 7-like (Ndufa7l), mRNA. // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_345369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 7-like (Ndufa7l), mRNA. // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000029710 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:65990497:65990838:1 gene:ENSRNOG00000028492 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
GENSCAN00000019498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66061785:66100222:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000002062 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:66061785:66062242:1 gene:ENSRNOG00000001510 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 64 // 93 // 9 // 14 // 0
ENSRNOT00000040114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66292577:66313657:1 gene:ENSRNOG00000032195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AY321349 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-282 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001191902 // RefSeq // Rattus norvegicus trans-acting transcription factor 9 (Sp9), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66454296:66456826:1 gene:ENSRNOG00000028187 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027714 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66419552:66456800:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013162 // RefSeq // Rattus norvegicus secernin 3 (Scrn3), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234358 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secernin 3 (Scrn3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus secernin 3 (Scrn3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:66507926:66525084:1 gene:ENSRNOG00000018657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC088234 // GenBank // Rattus norvegicus secernin 3, mRNA (cDNA clone MGC:109003 IMAGE:7324882), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:66461653:66535677:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT035006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
ENSRNOT00000046997 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:67177217:67177852:1 gene:ENSRNOG00000038283 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0
ENSRNOT00000002166 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:67837381:67838709:1 gene:ENSRNOG00000001595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000045083 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:67837381:67843185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 53 // 9 // 9 // 0
ENSRNOT00000035978 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:67893959:67894547:1 gene:ENSRNOG00000025666 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 75 // 100 // 12 // 16 // 0
ENSRNOT00000008592 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:68021837:68022339:1 gene:ENSRNOG00000006571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0
NM_001105886 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box D13 (Hoxd13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:68056713:68060029:1 gene:ENSRNOG00000001588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:68056736:68058565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191903 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box D12 (Hoxd12), mRNA. // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000068636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:68063896:68065017:1 gene:ENSRNOG00000001587 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000043466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:68063971:68064935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107094 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box D10 (Hoxd10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:68080469:68083678:1 gene:ENSRNOG00000001581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001173469 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box D9 (Hoxd9), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC169092 // GenBank // Rattus norvegicus homeo box D9, mRNA (cDNA clone MGC:189507 IMAGE:5599968), complete cds. // chrU // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000065426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:68086882:68088227:1 gene:ENSRNOG00000001580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 9 // 21 // 1 /// NONRATT035013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 93 // 71 // 14 // 15 // 0
NM_001105885 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box D4 (Hoxd4), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000002145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:68099689:68116740:1 gene:ENSRNOG00000001578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234376 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box D4 (Hoxd4), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT035015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:68080695:68127339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NR_031815 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 10b (Mir10b), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053677 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:68113662:68113770:1 gene:ENSRNOG00000035554 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035015 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-10b // miRBase Micro RNA Database // MI0000842 Rattus norvegicus miR-10b stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:68080695:68127339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001271038 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box D3 (Hoxd3), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box D3 (Hoxd3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box D3 (Hoxd3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus homeo box D3 (Hoxd3), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000033511 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:68131906:68134972:1 gene:ENSRNOG00000001577 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000043471 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:68131954:68140732:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0
NM_001105884 // RefSeq // Rattus norvegicus homeo box D1 (Hoxd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002140 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:68151156:68153295:1 gene:ENSRNOG00000001572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:68151260:68152556:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035020 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001008286 // RefSeq // Rattus norvegicus metaxin 2 (Mtx2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234370 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metaxin 2 (Mtx2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000002134 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:68216583:68279581:1 gene:ENSRNOG00000001559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC086360 // GenBank // Rattus norvegicus metaxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:106000 IMAGE:7303884), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ215582 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YK11 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234371 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metaxin 2 (Mtx2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// NONRATT035021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043459 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:68258977:68328511:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT035022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1
NM_053350 // RefSeq // Rattus norvegicus alkylglycerone phosphate synthase (Agps), mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000002111 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69193349:69241491:1 gene:ENSRNOG00000001547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF121052 // GenBank // Rattus norvegicus alkyl-dihydroxyacetonephosphate synthase precursor (ADS) mRNA, complete cds. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT035034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153306 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 45 (Rbm45), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000042968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69794037:69809015:1 gene:ENSRNOG00000010595 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// AB036990 // GenBank // Rattus norvegicus drb1 mRNA for developmentally regulated RNA-binding protein 1, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// GENSCAN00000012842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:69794087:69805810:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT035038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT035037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001107735 // RefSeq // Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 6 (Osbpl6), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 6 (Osbpl6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000068199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:69952408:70024414:1 gene:ENSRNOG00000010812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:69951356:70023777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
XM_006234406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxysterol binding protein-like 6 (Osbpl6), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
XM_006224498 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deafness, autosomal recessive 59 (Dfnb59), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus deafness, autosomal recessive 59 (Dfnb59), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058093 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:70083454:70091308:1 gene:ENSRNOG00000038165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70083454:70091308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013077 // RefSeq // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain-containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 3 (Plekha3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234401 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain-containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 3 (Plekha3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016132 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:70109902:70131097:1 gene:ENSRNOG00000011830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC083759 // GenBank // Rattus norvegicus pleckstrin homology domain-containing, family A (phosphoinositide binding specific) member 3, mRNA (cDNA clone MGC:94699 IMAGE:7192931), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032721 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:70111079:70130589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1 /// NONRATT035049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSRNOT00000041090 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:71946437:71947074:1 gene:ENSRNOG00000047157 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000003855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:71946437:71947080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 100 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT035052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001047857 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2E 3 (Ube2e3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_006234405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2E 3 (Ube2e3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000006429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:72378562:72434857:1 gene:ENSRNOG00000004544 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 11 // 21 // 1
ENSRNOT00000053043 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:3:72568809:72568921:1 gene:ENSRNOG00000034920 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
NM_001107737 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, alpha 4 (Itga4), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:72754339:72825872:1 gene:ENSRNOG00000004861 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:72742337:72825482:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0
NONRATT035061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000005348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:72857684:72857983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 46 // 11 // 12 // 0
NM_001107738 // RefSeq // Rattus norvegicus sperm specific antigen 2 (Ssfa2), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000008046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:73152918:73190192:1 gene:ENSRNOG00000005865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000024990 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:73153135:73188168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT035062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0
NM_001109200 // RefSeq // Rattus norvegicus protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 1C (Ppp1r1c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:73232214:73334814:1 gene:ENSRNOG00000024990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001106486 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 10 (Dnajc10), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000009839 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:74098922:74138865:1 gene:ENSRNOG00000006803 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000004108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:74064311:74148364:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT035068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT035071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT035070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 23 // 23 // 11 // 48 // 1
NM_001107739 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 19 (Dusp19), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057826 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:74406311:74418820:1 gene:ENSRNOG00000008868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000015314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:74412780:74452300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001004229 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 35 (Nup35), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoporin 35 (Nup35), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:74426913:74452803:1 gene:ENSRNOG00000009290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC078914 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin 35, mRNA (cDNA clone MGC:93680 IMAGE:7126643), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000015314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:74412780:74452300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
XM_001068316 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 804A (Zfp804a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_230042 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 804A (Zfp804a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043974 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:76091997:76116669:1 gene:ENSRNOG00000038004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000056951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:76058695:76116669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
XM_006234434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrous sheath-interacting protein 2 (Fsip2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000039841 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:76827737:76840834:1 gene:ENSRNOG00000047292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:76819879:76829670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_006234434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrous sheath-interacting protein 2 (Fsip2), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:76838785:76890723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0
XM_006234434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibrous sheath-interacting protein 2 (Fsip2), mRNA. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000050701 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:76838785:76890723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0
NM_001010963 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 15 (Zc3h15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000007276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:77550919:77570542:1 gene:ENSRNOG00000005256 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// AY377983 // GenBank // Rattus norvegicus brain Zn-finger protein mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 71 // 31 // 32 // 0 /// BC088438 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 15, mRNA (cDNA clone MGC:95079 IMAGE:7126102), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000054893 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:66350342:66351622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT035085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT035087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000031386 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:58159884:58161095:-1 gene:ENSRNOG00000023038 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 36 // 56 // 9 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:77525676:77569856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 73 // 33 // 45 // 1 /// NONRATT035083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 18 // 45 // 1 /// NONRATT035084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 21 // 45 // 1 /// NONRATT035086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 19 // 45 // 1
XM_006224633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus integrin, alpha V (Itgav), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006961 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:77644078:77727811:1 gene:ENSRNOG00000004912 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:77644078:77727811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
XM_001068767 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member B (Fam171b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006224503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member B (Fam171b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006234436 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member B (Fam171b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_575160 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 171, member B (Fam171b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006504 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:77735636:77787817:1 gene:ENSRNOG00000004783 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000049132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:77768950:77787817:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035095 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
XR_145877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRG00114 (LOC499823), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XR_146872 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LRRG00114 (LOC499823), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY383656 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00001 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY539865 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00114 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000046112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:77956966:77970532:1 gene:ENSRNOG00000029652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001107741 // RefSeq // Rattus norvegicus mediator complex subunit 19 (Med19), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78601276:78611797:1 gene:ENSRNOG00000006050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052681 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78605860:78610121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001024369 // RefSeq // Rattus norvegicus yippee-like 4 (Drosophila) (Ypel4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78655402:78659863:1 gene:ENSRNOG00000007428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083749 // GenBank // Rattus norvegicus yippee-like 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:94678 IMAGE:7192422), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000052675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78657973:78659012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT035102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001024755 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2L 6 (Ube2l6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78712108:78727220:1 gene:ENSRNOG00000030467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097364 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin-conjugating enzyme E2L 6, mRNA (cDNA clone MGC:114397 IMAGE:7443068), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78712574:78726739:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT035103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_172074 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 10 homolog (yeast) (Timm10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234474 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 10 homolog (yeast) (Timm10), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000010619 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78747542:78751013:1 gene:ENSRNOG00000007883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF150091 // GenBank // Rattus norvegicus small zinc finger-like protein (TIM10) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC091116 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 10 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:108564 IMAGE:7366212), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035104 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035105 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78748107:78787072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107742 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 43 (amino acid system L transporter), member 1 (Slc43a1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78760224:78784936:1 gene:ENSRNOG00000008243 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// BC161926 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 43, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:187695 IMAGE:8373798), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052666 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78748107:78787072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035108 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001107743 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 43, member 3 (Slc43a3), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78845160:78865582:1 gene:ENSRNOG00000008347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78846138:78865396:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_031619 // RefSeq // Rattus norvegicus proteoglycan 2, bone marrow (Prg2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000011168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78895715:78899281:1 gene:ENSRNOG00000008394 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D50568 // GenBank // Rattus norvegicus MBP mRNA for eosinophil major basic protein precursor, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78896537:78911258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106487 // RefSeq // Rattus norvegicus proteoglycan 3 (Prg3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000057616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78905677:78911282:1 gene:ENSRNOG00000037908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038766 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78896537:78911258:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_031121 // RefSeq // Rattus norvegicus structure specific recognition protein 1 (Ssrp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006234476 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus structure specific recognition protein 1 (Ssrp1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006234479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus structure specific recognition protein 1 (Ssrp1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000012022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:78958627:78968273:1 gene:ENSRNOG00000008825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC083588 // GenBank // Rattus norvegicus structure specific recognition protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:94298 IMAGE:7132288), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000038770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78958172:79033793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT035121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT035116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT035117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT035120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT035122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1 /// NONRATT035119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1 /// NONRATT035123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
XM_006234485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tankyrase 1 binding protein 1 (Tnks1bp1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000012209 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:78972444:78993394:1 gene:ENSRNOG00000009195 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000038770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:78958172:79033793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
NM_031349 // RefSeq // Rattus norvegicus apelin receptor (Aplnr), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79052120:79055764:1 gene:ENSRNOG00000009227 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF184883 // GenBank // Rattus norvegicus putative G protein-coupled receptor B78 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// BC072494 // GenBank // Rattus norvegicus apelin receptor, mRNA (cDNA clone MGC:91642 IMAGE:7097318), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000285 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 443 (Olr443), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072310 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79477236:79478180:1 gene:ENSRNOG00000050082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79543195:79544139:1 gene:ENSRNOG00000048830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008355 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79477476:79478180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000008369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79543435:79579933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001001123 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 444 (Olr444), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051165 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79558561:79559505:1 gene:ENSRNOG00000046578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79543435:79579933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001001049 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 445 (Olr445), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79566008:79566952:1 gene:ENSRNOG00000049448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79543435:79579933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001001050 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 446 (Olr446), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000071646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79571309:79572343:1 gene:ENSRNOG00000046122 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000286 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 447 (Olr447), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051010 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79578989:79579933:1 gene:ENSRNOG00000048739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79543435:79579933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000289 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 453 (Olr453), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008354 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79632285:79658406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000290 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 454 (Olr454), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79683245:79684180:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000687 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 456 (Olr456), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000008370 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79706422:79707336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001000292 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 458 (Olr458), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79730188:79731126:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000294 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 461 (Olr461), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79773002:79773937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000934 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 463 (Olr463), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000008360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79804150:79805103:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT035137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0
NM_001000296 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 464 (Olr464), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79818266:79819219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000297 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 465 (Olr465), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79823129:79843913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 96 // 15 // 24 // 0
NM_001000298 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 466 (Olr466), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79823129:79843913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT035140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001124 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 468 (Olr468), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79871478:79877379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 54 // 96 // 13 // 24 // 0
NM_001000299 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 469 (Olr469), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000051690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79876456:79877488:1 gene:ENSRNOG00000031426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79871478:79877379:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000300 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 470 (Olr470), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000042537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79903705:79904679:1 gene:ENSRNOG00000033994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_003749504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 5M11-like (LOC684683), mRNA. // chr3 // 47 // 95 // 9 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071299 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:79896384:79897397:1 gene:ENSRNOG00000049901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 47 // 95 // 9 // 19 // 0 /// GENSCAN00000017357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79903831:79904679:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001001125 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 471 (Olr471), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79913003:79913941:1 gene:ENSRNOG00000031124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79913354:79935643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001000301 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 472 (Olr472), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000012814 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79920908:79921891:1 gene:ENSRNOG00000009670 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000017366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79913354:79935643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_001000302 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 473 (Olr473), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000044979 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79934711:79935643:1 gene:ENSRNOG00000033395 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79913354:79935643:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001000686 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 475 (Olr475), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052240 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79958907:79959839:1 gene:ENSRNOG00000030468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79959141:79959839:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT035147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000304 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 477 (Olr477), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000040714 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:79994440:79995399:1 gene:ENSRNOG00000031811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017365 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:79975916:79995399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
XM_006226678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3 (Ranbp3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006244357 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3 (Ranbp3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XR_146891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG44996-like (LOC100359701), misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071228 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9341273:9378345:-1 gene:ENSRNOG00000049785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9341273:9378345:-1 gene:ENSRNOG00000049785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:9341273:9378345:-1 gene:ENSRNOG00000049785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ212208 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA65YK02 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006226682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3 (Ranbp3), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// XM_006244361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3 (Ranbp3), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// BC105832 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7383858. // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// GENSCAN00000058019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:9:9341818:9378338:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80437299:80442738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001000315 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 515 (Olr515), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80640957:80641922:1 gene:ENSRNOG00000032722 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80640951:80641922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000317 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 517 (Olr517), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80705550:80706542:1 gene:ENSRNOG00000032434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000676 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 518 (Olr518), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000041668 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81020581:81021531:-1 gene:ENSRNOG00000029222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81020581:81021627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT037490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000318 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 519 (Olr519), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:80991897:80992865:-1 gene:ENSRNOG00000009852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052498 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:80990850:80992865:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT037489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000675 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 527 (Olr527), mRNA. // chr3 // 76 // 75 // 16 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000043964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81097478:81098425:-1 gene:ENSRNOG00000050009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 75 // 16 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000068048 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:80947897:80948852:1 gene:ENSRNOG00000049043 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT037491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 75 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000052487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81097478:81153252:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001001375 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 526 (Olr526), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81061814:81062779:1 gene:ENSRNOG00000050654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000052491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81061814:81062779:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001376 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 530 (Olr530), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000051533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81173844:81174809:1 gene:ENSRNOG00000045546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
ENSRNOT00000013190 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:81235309:81238888:1 gene:ENSRNOG00000009952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001000323 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 554 (Olr554), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013319 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81915420:81916370:1 gene:ENSRNOG00000010035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001001377 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 555 (Olr555), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81949178:81950158:1 gene:ENSRNOG00000010052 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:81949574:82023062:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT035158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000929 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 556 (Olr556), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000066249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:81972340:81973263:1 gene:ENSRNOG00000043492 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_001000669 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 557 (Olr557), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000050634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82003314:82004336:1 gene:ENSRNOG00000031264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001000324 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 558 (Olr558), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071725 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82099337:82100257:1 gene:ENSRNOG00000048361 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82099337:82123420:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 76 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT035162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000668 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 559 (Olr559), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000037577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82109916:82110860:1 gene:ENSRNOG00000045869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000325 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 560 (Olr560), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82131759:82132739:1 gene:ENSRNOG00000037837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82132110:82134589:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001000511 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 561 (Olr561), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000042246 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82156575:82157546:1 gene:ENSRNOG00000033422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001028 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82156965:82157546:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 40 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT035165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001000667 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 562 (Olr562), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057479 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82183821:82184777:1 gene:ENSRNOG00000037834 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000666 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 563 (Olr563), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000057478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82196401:82197345:1 gene:ENSRNOG00000037833 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000665 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 566 (Olr566), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000074642 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82206761:82427757:1 gene:ENSRNOG00000045792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 80 // 100 // 12 // 15 // 0 /// NONRATT035168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001109342 // RefSeq // Rattus norvegicus preferentially expressed antigen in melanoma-like 6 (Pramel6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82276474:82279946:1 gene:ENSRNOG00000021920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82277479:82279832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001000664 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 569 (Olr569), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000327 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 575 (Olr575), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82428912:82429841:1 gene:ENSRNOG00000046025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82428912:82429841:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000047083 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:82508161:82509068:1 gene:ENSRNOG00000030827 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0
NM_001000663 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 581 (Olr581), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000049950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82523694:82524632:1 gene:ENSRNOG00000046632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT035172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001000662 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 582 (Olr582), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000043371 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82549195:82550127:1 gene:ENSRNOG00000046448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000046252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82549195:82550127:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001000928 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 583 (Olr583), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000042996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82563117:82564049:1 gene:ENSRNOG00000049657 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT035174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001000660 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 586 (Olr586), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82620576:82621511:1 gene:ENSRNOG00000030946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000329 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 588 (Olr588), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82650744:82651688:1 gene:ENSRNOG00000005793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001000658 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 590 (Olr590), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82672137:82673069:1 gene:ENSRNOG00000049292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000330 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 592 (Olr592), mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000075834 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82685138:82686073:1 gene:ENSRNOG00000049572 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NM_001000657 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 594 (Olr594), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82685504:82760521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001006596 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 595 (Olr595), mRNA. // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT035180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 75 // 12 // 12 // 0
NM_001001056 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 596 (Olr596), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000075375 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82750232:82751158:1 gene:ENSRNOG00000047421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001000331 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 597 (Olr597), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000049471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82484292:82485224:1 gene:ENSRNOG00000032521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000071912 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:82759589:82760672:1 gene:ENSRNOG00000046348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82484292:82485224:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000046238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82685504:82760521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001000332 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 598 (Olr598), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82487182:82488114:1 gene:ENSRNOG00000046501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82767324:82768256:1 gene:ENSRNOG00000045832 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:82767324:82768256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000007732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:82866898:82867777:1 gene:ENSRNOG00000005898 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 83 // 95 // 15 // 18 // 0
NM_001000927 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 606 (Olr606), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:82948482:82949423:1 gene:ENSRNOG00000005921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
GENSCAN00000045553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83125515:83177419:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 10 // 23 // 1
NM_001000338 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 619 (Olr619), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000037779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83176448:83177419:1 gene:ENSRNOG00000021473 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000045553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83125515:83177419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001000649 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 625 (Olr625), mRNA. // chr3 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// NM_001000651 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 623 (Olr623), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000051292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83331832:83332767:-1 gene:ENSRNOG00000050217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// NM_001000339 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 631 (Olr631), mRNA. // chr3 // 58 // 100 // 18 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000050173 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83424036:83424956:-1 gene:ENSRNOG00000032712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 100 // 18 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000071021 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:83225391:83226227:-1 gene:ENSRNOG00000047555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83290870:83332422:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 65 // 15 // 20 // 0 /// NONRATT037529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT037530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 100 // 26 // 31 // 0 /// NONRATT037533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 100 // 18 // 31 // 0
NM_001000648 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 633 (Olr633), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040604 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83457732:83458643:1 gene:ENSRNOG00000049129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83457732:83781141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001000647 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 634 (Olr634), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000047382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83473991:83474932:1 gene:ENSRNOG00000045745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT035187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001000340 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 639 (Olr639), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000040581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:83999376:84000317:1 gene:ENSRNOG00000049429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000041690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84047269:84048210:1 gene:ENSRNOG00000050271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000000486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83457732:83781141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000047773 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83935853:84027102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 5 // 5 // 0
ENSRNOT00000074443 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:83673083:83709695:1 gene:ENSRNOG00000049365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000074919 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:83496318:83709699:1 gene:ENSRNOG00000049365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 58 // 12 // 14 // 0
NM_001000642 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 646 (Olr646), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074928 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:83680289:83906601:1 gene:ENSRNOG00000049094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001000641 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 648 (Olr648), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000486 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83457732:83781141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 11 // 23 // 1
NM_001000640 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 649 (Olr649), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000637 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 653 (Olr653), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000000483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83861996:83862925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000342 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 655 (Olr655), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047775 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:83905920:83906582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 48 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT035195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 68 // 100 // 17 // 25 // 0
NM_001000345 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 659 (Olr659), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000047910 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84242528:84243457:-1 gene:ENSRNOG00000048520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000047782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84242528:84243457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT037542 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000635 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 660 (Olr660), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84225718:84226641:-1 gene:ENSRNOG00000034028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT037541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000347 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 664 (Olr664), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000046926 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84074822:84075757:-1 gene:ENSRNOG00000047937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047788 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84074822:84075658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT037540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001108750 // RefSeq // Rattus norvegicus copine VIII (Cpne8), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:131298537:131472968:-1 gene:ENSRNOG00000026128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// BC168840 // GenBank // Rattus norvegicus copine VIII, mRNA (cDNA clone MGC:189063 IMAGE:7125016), complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006242229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus copine VIII (Cpne8), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 59 // 59 // 17 // 29 // 1 /// GENSCAN00000037757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84681375:84689138:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:131234254:131390598:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT052386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT052387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 90 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT052388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001001378 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 684 (Olr684), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042021 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84717235:84718152:1 gene:ENSRNOG00000030991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84717235:84718152:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000355 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 686 (Olr686), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042640 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84741763:84742698:1 gene:ENSRNOG00000045702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:84741883:84742698:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000630 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 691 (Olr691), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:84819100:84820050:1 gene:ENSRNOG00000048259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000008636 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:85411331:85412235:1 gene:ENSRNOG00000028442 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000004618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85411331:85412170:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_001000572 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 722 (Olr722), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85462434:85463363:1 gene:ENSRNOG00000006669 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000004623 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85462434:85463363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001000514 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 725 (Olr725), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000008762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85551352:85552284:1 gene:ENSRNOG00000006716 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035206 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85517130:85578357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
NM_001000620 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 726 (Olr726), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006234542 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 726 (Olr726), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000049936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85592356:85593285:1 gene:ENSRNOG00000034114 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_003749528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 726 (Olr726), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000043370 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:85568110:85568940:1 gene:ENSRNOG00000047981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000004615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85592365:85593285:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000004622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85517130:85578357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT035208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT035209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000619 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 727 (Olr727), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000048921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85577428:85578364:1 gene:ENSRNOG00000047705 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 87 // 100 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000004622 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85517130:85578357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001000363 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 728 (Olr728), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000578 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 745 (Olr745), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:85901623:85902552:1 gene:ENSRNOG00000048155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:85901722:85902552:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107744 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 160 (Nup160), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000030750 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86204592:86267431:1 gene:ENSRNOG00000028215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86206536:86267431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 16 // 37 // 1
NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013159 // RefSeq // Rattus norvegicus formin binding protein 4 (Fnbp4), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000009687 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86277504:86317615:1 gene:ENSRNOG00000007241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// BC089201 // GenBank // Rattus norvegicus formin binding protein 4, mRNA (cDNA clone IMAGE:7123616), complete cds. // chr3 // 100 // 25 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT035216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 98 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT035217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000029693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86277645:86373313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 70 // 70 // 28 // 40 // 1
XM_006224513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 2 (Agbl2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// XM_006224514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 2 (Agbl2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// XM_006224517 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 2 (Agbl2), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// XM_006234540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP/GTP binding protein-like 2 (Agbl2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000011467 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:86320664:86354270:1 gene:ENSRNOG00000008467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038696 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:86320664:86355102:1 gene:ENSRNOG00000008467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066828 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:86320664:86354270:1 gene:ENSRNOG00000008467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067067 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:86320664:86354270:1 gene:ENSRNOG00000008467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067769 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:86320280:86351504:1 gene:ENSRNOG00000008467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000029693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86277645:86373313:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
NM_001106488 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial carrier 2 (Mtch2), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86385047:86404835:1 gene:ENSRNOG00000008682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC158687 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial carrier homolog 2 (C. elegans), mRNA (cDNA clone MGC:187702 IMAGE:8375010), complete cds. // chr3 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// FQ229291 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA48YH03 mRNA sequence. // chr3 // 71 // 48 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT035222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT035224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_001107745 // RefSeq // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 4 (C1qtnf4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86422687:86427145:1 gene:ENSRNOG00000009140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC168928 // GenBank // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:189221 IMAGE:8368551), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86426003:86426984:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 82 // 68 // 14 // 17 // 0 /// NONRATT035225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001107746 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 4 (Kbtbd4), mRNA. // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// XM_006234506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch repeat and BTB (POZ) domain containing 4 (Kbtbd4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86437916:86444958:1 gene:ENSRNOG00000009397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// FQ224219 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA73YH07 mRNA sequence. // chr3 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000048323 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86438887:86443235:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT035228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025421 // RefSeq // Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 1 (Celf1), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86477674:86553296:1 gene:ENSRNOG00000010379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC098012 // GenBank // Rattus norvegicus CUG triplet repeat, RNA binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:116159 IMAGE:7454358), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// FQ222063 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YI14 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048319 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86532711:86550475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000014484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86477674:86553296:1 gene:ENSRNOG00000010379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213273 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YM12 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ222063 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA29YI14 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035230 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108584 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor-associated protein of the synapse (Rapsn), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86568960:86578239:1 gene:ENSRNOG00000011208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86569122:86591003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_031595 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 3 (Psmc3), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86585691:86591072:1 gene:ENSRNOG00000011414 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC062019 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, ATPase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72399 IMAGE:5620971), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// D83522 // GenBank // Rattus norvegicus liver mRNA for proteasomal ATPase (TBP1), complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// U77918 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenic cell/sperm-associated Tat-binding protein homolog Sata mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// FQ214351 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YD04 mRNA sequence. // chr3 // 71 // 72 // 15 // 21 // 0 /// GENSCAN00000048291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86569122:86591003:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 83 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT035239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_001005892 // RefSeq // Rattus norvegicus spleen focus forming virus (SFFV) proviral integration oncogene (Spi1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86627764:86646458:1 gene:ENSRNOG00000012172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB154364 // GenBank // Rattus norvegicus pu.1 mRNA for transcription factor PU.1, complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC091185 // GenBank // Rattus norvegicus SFFV proviral integration 1, mRNA (cDNA clone MGC:108838 IMAGE:7366435), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86616247:86667383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT035241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106490 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin binding protein C, cardiac (Mybpc3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86649314:86667483:1 gene:ENSRNOG00000012307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048266 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86616247:86667383:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_016988 // RefSeq // Rattus norvegicus acid phosphatase 2, lysosomal (Acp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018620 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86730222:86739116:1 gene:ENSRNOG00000013594 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC081823 // GenBank // Rattus norvegicus acid phosphatase 2, lysosomal, mRNA (cDNA clone MGC:93543 IMAGE:7107570), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// M27893 // GenBank // Rat acid phosphatase mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000048283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86730122:86738385:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT035248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT035249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001009966 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3 (Pacsin3), mRNA. // chr3 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_006234509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3 (Pacsin3), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000057176 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86781242:86789804:1 gene:ENSRNOG00000014204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AY858802 // GenBank // Rattus norvegicus syndapin III (SdpIII) mRNA, complete cds. // chr3 // 89 // 62 // 16 // 18 // 0 /// BC100636 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, mRNA (cDNA clone MGC:124517 IMAGE:5620884), complete cds. // chr3 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT035251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000048308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86774653:86801200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT035252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT035253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// NONRATT035254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT035255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001033707 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor GTPase activating protein 2 (Arfgap2), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000057161 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:86790400:86802349:1 gene:ENSRNOG00000014429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC101917 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor GTPase activating protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:124884 IMAGE:7935829), complete cds. // chr3 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// FQ228393 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA9YA15 mRNA sequence. // chr3 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT035256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000048308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:86774653:86801200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// NONRATT035257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_031322 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor-related protein 4 (Lrp4), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000021353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87062818:87116798:1 gene:ENSRNOG00000015285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// AB073317 // GenBank // Rattus norvegicus LRP4 mRNA for LDL receptor-related protein 4, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000015992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87062831:87225369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT035258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
ENSRNOT00000021837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87146238:87225432:1 gene:ENSRNOG00000016067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000066005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87146238:87225432:1 gene:ENSRNOG00000016067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// BC107910 // GenBank // Rattus norvegicus cytoskeleton associated protein 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7453732), partial cds. // chr3 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000015992 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87062831:87225369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT035261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 23 // 38 // 1
NM_001107747 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 1 (Arhgap1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234559 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 1 (Arhgap1), transcript variant X10, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87254431:87275981:1 gene:ENSRNOG00000016610 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015988 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87258290:87274559:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT035272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT035265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT035269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT035271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT035273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT035274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001134341 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy/beclin 1 regulator 1 (Ambra1), mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000045644 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87368296:87528736:1 gene:ENSRNOG00000017422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 82 // 35 // 37 // 0 /// BC100094 // GenBank // Rattus norvegicus ischemia related factor NYW-1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7373916), partial cds. // chr3 // 100 // 20 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000015987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87368296:87375275:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 29 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000044756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87489241:87527714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 22 // 22 // 10 // 45 // 1
NM_031547 // RefSeq // Rattus norvegicus cholinergic receptor, muscarinic 4 (Chrm4), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000023583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87531940:87539674:1 gene:ENSRNOG00000017556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT035284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006224527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 21A (Phf21a), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006224528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 21A (Phf21a), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234610 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PHD finger protein 21A (Phf21a), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008061 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87933979:87975301:1 gene:ENSRNOG00000006063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000008241 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87933979:87975301:1 gene:ENSRNOG00000006063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066219 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87933979:87975301:1 gene:ENSRNOG00000006063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067664 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87933979:87975301:1 gene:ENSRNOG00000006063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// AY724487 // GenBank HTC // Rattus norvegicus clone UI-R-FJ0-cpv-f-20-0-UI unknown mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045020 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87880426:87977733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// NONRATT035291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_001012088 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 16 (Pex16), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 16 (Pex16), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87986605:87996037:1 gene:ENSRNOG00000006539 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 94 // 32 // 33 // 0 /// BC089938 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 16, mRNA (cDNA clone MGC:109242 IMAGE:7310024), complete cds. // chr3 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000045025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:87990792:87995913:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT035295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1
NM_001109201 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700029I15 (RGD1563263), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000009068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:87997743:87998495:1 gene:ENSRNOG00000006884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001011955 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (keratan sulfate Gal-6) sulfotransferase 1 (Chst1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (keratan sulfate Gal-6) sulfotransferase 1 (Chst1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000010510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:88201237:88216361:1 gene:ENSRNOG00000007989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086551 // GenBank // Rattus norvegicus carbohydrate (keratan sulfate Gal-6) sulfotransferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:105963 IMAGE:7302418), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211655 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA84YH09 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT035298 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030839 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin XIII (Syt13), mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000011459 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:88516918:88555227:1 gene:ENSRNOG00000008000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF313453 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 13 mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// AF375466 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 13 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:88516996:88558825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0
NM_001107749 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible protein 11 (Tp53i11), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:88784314:88799475:1 gene:ENSRNOG00000008738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC167758 // GenBank // Rattus norvegicus tumor protein p53 inducible protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:187439 IMAGE:7123311), complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000034569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:88788149:88797623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1 /// NONRATT035305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NONRATT035303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106553 // RefSeq // Rattus norvegicus ALX homeobox 4 (Alx4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000009 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:89249578:89286113:1 gene:ENSRNOG00000000008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:89235227:89285739:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_019352 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast) (Timm23), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026932 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:8241068:8267099:-1 gene:ENSRNOG00000019811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// AB006451 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Tim23, complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// BC083559 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:93478 IMAGE:7135081), complete cds. // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000048004 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:84786045:84787147:-1 gene:ENSRNOG00000031285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// FQ216447 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA42YM11 mRNA sequence. // chr3 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000051579 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:89672367:89672996:1 gene:ENSRNOG00000032900 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// NONRATT022959 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:8241437:8267756:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT022960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
ENSRNOT00000044595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:93303511:93502229:1 gene:ENSRNOG00000029798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NM_001107753 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 4C (Lrrc4c), mRNA. // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT035309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000043571 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:94732010:94732491:-1 gene:ENSRNOG00000031079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007800 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:94732080:94732491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
ENSRNOT00000006091 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:97489132:97490193:1 gene:ENSRNOG00000004607 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 94 // 73 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:97489918:97490193:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 8 // 8 // 0
NM_001100528 // RefSeq // Rattus norvegicus recombination activating gene 2 (Rag2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006097 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:97851318:97859615:1 gene:ENSRNOG00000004623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051758 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:97856286:97857869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0
NM_001107754 // RefSeq // Rattus norvegicus TNF receptor-associated factor 6, E3 ubiquitin protein ligase (Traf6), mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:97912483:97931261:1 gene:ENSRNOG00000004639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// BC168921 // GenBank // Rattus norvegicus Tnf receptor-associated factor 6, mRNA (cDNA clone MGC:189208 IMAGE:9024408), complete cds. // chr3 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000039105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:97920263:97930337:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001033692 // RefSeq // Rattus norvegicus COMM domain containing 9 (Commd9), mRNA. // chr3 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// XM_006234637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus COMM domain containing 9 (Commd9), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000006628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:98121989:98136421:1 gene:ENSRNOG00000004755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC101873 // GenBank // Rattus norvegicus COMM domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:124765 IMAGE:5621281), complete cds. // chr3 // 95 // 100 // 20 // 21 // 0 /// FQ213255 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA48YN17 mRNA sequence. // chr3 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// NONRATT035318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000039110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:98025537:98136295:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 57 // 57 // 12 // 21 // 1 /// NONRATT035323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 8 // 21 // 1
XM_006234644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 (Pamr1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NM_001107755 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidase domain containing associated with muscle regeneration 1 (Pamr1), mRNA. // chr3 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000064282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:99054239:99145372:1 gene:ENSRNOG00000005348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000043019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:99073484:99151568:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT035330 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001106492 // RefSeq // Rattus norvegicus APAF1 interacting protein (Apip), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009797 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:99612153:99638003:1 gene:ENSRNOG00000007446 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:99624163:99637924:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT035338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0
NM_012520 // RefSeq // Rattus norvegicus catalase (Cat), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011230 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:100021859:100053940:-1 gene:ENSRNOG00000008364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC081853 // GenBank // Rattus norvegicus catalase, mRNA (cDNA clone MGC:93644 IMAGE:7109889), complete cds. // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// M11670 // GenBank // Rat liver catalase mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026634 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:100017681:100046736:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT037731 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT037732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_134403 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and BTB (POZ) domain containing 2 (Abtb2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000029922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:100136624:100289999:1 gene:ENSRNOG00000008510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AB000216 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CCA3, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000026632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:100226762:100293415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108585 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA A930018P22 (RGD1563222), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:100675069:100677051:1 gene:ENSRNOG00000010963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:100675132:100676884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT035357 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001037358 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain only 2 (Lmo2), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001244779 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain only 2 (Lmo2), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001244780 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain only 2 (Lmo2), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NM_001244781 // RefSeq // Rattus norvegicus LIM domain only 2 (Lmo2), transcript variant 4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:100560598:100572022:1 gene:ENSRNOG00000009401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC105772 // GenBank // Rattus norvegicus LIM domain only 2, mRNA (cDNA clone MGC:124678 IMAGE:7930561), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT035346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT035349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001077672 // RefSeq // Rattus norvegicus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 3, 77kDa (Cstf3), mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016318 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101210946:101228401:1 gene:ENSRNOG00000012089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// BC127520 // GenBank // Rattus norvegicus cleavage stimulation factor, 3 pre-RNA, subunit 3, mRNA (cDNA clone MGC:156746 IMAGE:7110287), complete cds. // chr3 // 100 // 78 // 31 // 31 // 0 /// FQ223256 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA13YI18 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101190148:101232413:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 75 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0
XM_006224541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 73 (Ccdc73), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 73 (Ccdc73), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000041362 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:101493266:101614072:1 gene:ENSRNOG00000022660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000014215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101493266:101612756:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0
NM_031534 // RefSeq // Rattus norvegicus Wilms tumor 1 (Wt1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101756493:101802591:1 gene:ENSRNOG00000013074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:101756493:101802591:1 gene:ENSRNOG00000013074 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000014209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101740392:101834162:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT035368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1 /// NONRATT035369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001144862 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691083 (LOC691083), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000017952 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:101854193:102019988:1 gene:ENSRNOG00000013437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000025113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:101992092:102019153:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_013001 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 6 (Pax6), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box 6 (Pax6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box 6 (Pax6), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:102327021:102348393:1 gene:ENSRNOG00000004410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:102327021:102348393:1 gene:ENSRNOG00000004410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY540905 // GenBank // Rattus norvegicus cell-line RINm5F paired box 6 isoform 5a (pax6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// AY540906 // GenBank // Rattus norvegicus cell-line INS-1 paired box 6 isoform 5a (pax6) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// BC128741 // GenBank // Rattus norvegicus paired box 6, mRNA (cDNA clone MGC:156670 IMAGE:8363963), complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// U69644 // GenBank // Rattus norvegicus Pax-6 mRNA, comlete cds. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000025078 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:102331508:102347504:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
BC158667 // GenBank // Rattus norvegicus similar to elongation protein 4 homolog, mRNA (cDNA clone MGC:187663 IMAGE:8370237), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000006385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:102353885:102575106:-1 gene:ENSRNOG00000004787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000045652 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:102452818:102575106:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT037781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
XM_006224543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP1 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp1l), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006224544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP1 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp1l), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006234669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IMP1 inner mitochondrial membrane peptidase-like (S. cerevisiae) (Immp1l), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000006406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:102617787:102646088:1 gene:ENSRNOG00000004829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000045654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:102617787:102646088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NONRATT035379 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001114621 // RefSeq // Rattus norvegicus doublecortin domain containing 5 (Dcdc5), mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006234676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin domain containing 5 (Dcdc5), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000041494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:103873584:104051445:1 gene:ENSRNOG00000022178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000004569 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:103933467:104054262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_198778 // RefSeq // Rattus norvegicus metallophosphoesterase domain containing 2 (Mpped2), mRNA. // chr3 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:104336355:104510581:1 gene:ENSRNOG00000004863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AY093422 // GenBank // Rattus norvegicus unknown mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC161828 // GenBank // Rattus norvegicus metallophosphoesterase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:187303 IMAGE:9033590), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:104501262:104516596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT035389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NONRATT035386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000028762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:104501262:104516596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_012971 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 4 (Kcna4), mRNA. // chr3 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// XM_006234674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, shaker-related subfamily, member 4 (Kcna4), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:104901966:104905092:1 gene:ENSRNOG00000004918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// M32867 // GenBank // Rat potassium channel protein (RHK1) mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 93 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:104902043:104904007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001137642 // RefSeq // Rattus norvegicus kinesin family member 18A (Kif18a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:106967785:107028416:1 gene:ENSRNOG00000005037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021911 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:106976791:107105293:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_021851 // RefSeq // Rattus norvegicus lin-7 homolog C (C. elegans) (Lin7c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:107611000:107621494:1 gene:ENSRNOG00000045698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF090136 // GenBank // Rattus norvegicus lin-7-C mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212254 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA63YH02 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049357 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:107586244:107618344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000073258 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:107611000:107621494:1 gene:ENSRNOG00000045698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212254 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA63YH02 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_173328 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine-rich repeat-containing G protein-coupled receptor 4 (Lgr4), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000007681 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:107652228:107752743:1 gene:ENSRNOG00000005715 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF061443 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor LGR4 (LGR4) mRNA, complete cds. // chr3 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000049351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:107704132:107752107:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001108587 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 34 (Ccdc34), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:107756836:107791987:1 gene:ENSRNOG00000005902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000049359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:107756991:107791238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT035401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001108588 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 5 (sodium/monocarboxylate cotransporter), member 12 (Slc5a12), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046937 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:108389336:108430898:1 gene:ENSRNOG00000028008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000046104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:108353428:108429093:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001044301 // RefSeq // Rattus norvegicus mucin 15, cell surface associated (Muc15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mucin 15, cell surface associated (Muc15), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006256 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:108497266:108509387:1 gene:ENSRNOG00000004703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083925 // GenBank // Rattus norvegicus mucin 15, cell surface associated, mRNA (cDNA clone MGC:95326 IMAGE:7135360), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046106 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:108503556:108509113:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001000365 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 748 (Olr748), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000051827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109056566:109057504:1 gene:ENSRNOG00000045847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001000615 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 749 (Olr749), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000051083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109071080:109072018:1 gene:ENSRNOG00000049966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035406 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109056806:109072018:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1
NM_001000367 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 752 (Olr752), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000040444 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109128478:109129410:1 gene:ENSRNOG00000029895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000024860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109128472:109129410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT035407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001000921 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 753 (Olr753), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109149643:109150560:1 gene:ENSRNOG00000046847 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109149934:109150560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000368 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 754 (Olr754), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047138 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109175723:109176640:1 gene:ENSRNOG00000050411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000614 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 756 (Olr756), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000040285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109216027:109216944:1 gene:ENSRNOG00000048607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000024875 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109173893:109216944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT035410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001000613 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 757 (Olr757), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109226374:109227309:1 gene:ENSRNOG00000032386 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109226614:109227309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT035411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000369 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 758 (Olr758), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109254928:109255866:1 gene:ENSRNOG00000004938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 4F4-like (RGD1561276), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// XM_575198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 4F4-like (RGD1561276), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074880 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:109260746:109261642:1 gene:ENSRNOG00000046070 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 82 // 52 // 9 // 11 // 0
XM_006224641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 4F4-like (RGD1566059), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// XM_006234699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 4F4-like (RGD1566059), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000046220 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:109279414:109280310:1 gene:ENSRNOG00000042991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0
XM_006224642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 765 (Olr765), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// XM_006234700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 765 (Olr765), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000040298 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:109319738:109320673:1 gene:ENSRNOG00000046942 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 10 // 10 // 0
NM_001000372 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 770 (Olr770), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109437089:109438027:1 gene:ENSRNOG00000047449 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109437089:109438027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000610 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 771 (Olr771), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037906 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109455289:109456233:1 gene:ENSRNOG00000026885 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109455289:109518338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT035414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000609 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 772 (Olr772), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109517400:109518338:1 gene:ENSRNOG00000048092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109455289:109518338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 96 // 18 // 24 // 0 /// NONRATT035415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000373 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 773 (Olr773), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000071260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109539497:109540435:1 gene:ENSRNOG00000048326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033454 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:109539488:109540435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000916 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 786 (Olr786), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000043710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:109840190:109841125:1 gene:ENSRNOG00000049431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000048907 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110055880:110056815:1 gene:ENSRNOG00000050749 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001000378 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 792 (Olr792), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110152530:110153480:1 gene:ENSRNOG00000031514 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_578154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 4F3/4F16/4F29-like (LOC502660), mRNA. // chr3 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110152644:110153480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110193845:110268452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 45 // 80 // 9 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000073004 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:110193731:110213479:1 gene:ENSRNOG00000047116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001000601 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 795 (Olr795), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110193845:110268452:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
NM_001000600 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 796 (Olr796), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000075514 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:110234006:110374464:1 gene:ENSRNOG00000046306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 78 // 100 // 7 // 9 // 0 /// NONRATT035420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001106494 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidylcholine acyltransferase 4 (Lpcat4), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000006776 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110320624:110328662:1 gene:ENSRNOG00000005058 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000023741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110321100:110328219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT035422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
NM_001126100 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP10 ribonucleoprotein (Nop10), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000006887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110342516:110343601:1 gene:ENSRNOG00000005184 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ210519 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YE07 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT035423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT012834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 71 // 100 // 24 // 34 // 0 /// GENSCAN00000049111 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:77474241:77512846:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 88 // 13 // 30 // 0
NM_001109630 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 12, member 6 (Slc12a6), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006234710 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 12, member 6 (Slc12a6), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000007144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110348100:110446527:1 gene:ENSRNOG00000005196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000024054 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110387125:110441650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001109645 // RefSeq // Rattus norvegicus katanin p80 subunit B-like 1 (Katnbl1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000007688 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110490944:110499724:1 gene:ENSRNOG00000005814 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000024053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110483559:110559361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001106496 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1305045), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006234706 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1305045), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000008364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110539195:110549807:1 gene:ENSRNOG00000005884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// FQ220631 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA42YD10 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// NONRATT035430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110483559:110559361:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT035429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_001107757 // RefSeq // Rattus norvegicus apoptosis, caspase activation inhibitor (Aven), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006234707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus apoptosis, caspase activation inhibitor (Aven), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:110635712:110709919:1 gene:ENSRNOG00000006419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:110698873:110709582:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NONRATT035432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001080546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5B (Tmco5b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006224548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5B (Tmco5b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234713 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5B (Tmco5b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_575205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5B (Tmco5b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000010 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:111335116:111350242:1 gene:ENSRNOG00000000009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035184 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:111335116:111337942:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0
XM_006224644 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formin 1 (Fmn1), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006234717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus formin 1 (Fmn1), mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000041910 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:111483682:111636340:1 gene:ENSRNOG00000031760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000042103 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:111520584:111635622:1 gene:ENSRNOG00000031760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 55 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000008719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:111574721:111725549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 15 // 40 // 1
XM_001080629 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CDNA sequence BC052040 (RGD1563680), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_575206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CDNA sequence BC052040 (RGD1563680), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000006177 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:113709868:113813616:1 gene:ENSRNOG00000004571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
XM_006224551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5A (Tmco5a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006224554 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5A (Tmco5a), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234788 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5A (Tmco5a), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// XM_006234789 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5A (Tmco5a), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane and coiled-coil domains 5A (Tmco5a), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:115103800:115117533:1 gene:ENSRNOG00000005100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:115103800:115117533:1 gene:ENSRNOG00000005100 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000037794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:115104821:115117508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 69 // 21 // 22 // 0
NM_001047089 // RefSeq // Rattus norvegicus sprouty-related, EVH1 domain containing 1 (Spred1), mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:115352442:115414136:1 gene:ENSRNOG00000005209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// AB121675 // GenBank // Rattus norvegicus Spred-1 mRNA for sprouty-related protein with EVH-1 domain 1, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:115402140:115416948:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT035456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 27 // 32 // 1
XM_006224645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 98, member B (Fam98b), mRNA. // chrU // 91 // 100 // 29 // 32 // 0 /// XM_006234792 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 98, member B (Fam98b), mRNA. // chrU // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_343883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein FAM98B-like (RGD1560464), mRNA. // chrU // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000034950 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:115501131:115533474:1 gene:ENSRNOG00000005366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073403 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:10:34098573:34098900:1 gene:ENSRNOG00000050786 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chrU // 80 // 31 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000052579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:34098540:34108627:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:115471798:115538735:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT035457 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001105744 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 2 alpha kinase 4 (Eif2ak4), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000009222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:116705333:116791037:1 gene:ENSRNOG00000006027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000004834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:116705425:116790854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT035462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
XM_001080736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase B (Bub1b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// XM_342494 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus BUB1 mitotic checkpoint serine/threonine kinase B (Bub1b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000010406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:116912841:116964033:1 gene:ENSRNOG00000007906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000034522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:116851317:116972012:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT035465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 28 // 44 // 1 /// NONRATT035467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_001106498 // RefSeq // Rattus norvegicus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 6 (Pak6), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XR_352523 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 6 (Pak6), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XR_352524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus p21 protein (Cdc42/Rac)-activated kinase 6 (Pak6), transcript variant X2, misc_RNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000010471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117007787:117026619:1 gene:ENSRNOG00000007925 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117018990:117026572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035468 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
GENSCAN00000034517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117081052:117085598:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XR_345134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline/histidine/glycine-rich 1 (Phgr1), ncRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_352541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline/histidine/glycine-rich 1 (Phgr1), ncRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107759 // RefSeq // Rattus norvegicus dispatched homolog 2 (Drosophila) (Disp2), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117115017:117130512:1 gene:ENSRNOG00000026787 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117121495:117128257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0
NM_001004264 // RefSeq // Rattus norvegicus kinetochore-localized astrin/SPAG5 binding protein (Knstrn), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000012454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117157780:117177432:1 gene:ENSRNOG00000009334 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079438 // GenBank // Rattus norvegicus TRAF4 associated factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:94986 IMAGE:7115344), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ226275 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YL18 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117157849:117200394:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_012592 // RefSeq // Rattus norvegicus isovaleryl-CoA dehydrogenase (Ivd), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000013829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117207297:117228098:1 gene:ENSRNOG00000009421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088401 // GenBank // Rattus norvegicus isovaleryl coenzyme A dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:93591 IMAGE:7193077), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// J05031 // GenBank // Rat isovaleryl-CoA dehydrogenase (IVD) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000034514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117207297:117268034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT035480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006224558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromo adjacent homology domain containing 1 (Bahd1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224560 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromo adjacent homology domain containing 1 (Bahd1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234794 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromo adjacent homology domain containing 1 (Bahd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromo adjacent homology domain containing 1 (Bahd1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117261470:117268034:1 gene:ENSRNOG00000010428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117207297:117268034:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001109639 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 14 (Chst14), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000073587 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117272097:117274097:1 gene:ENSRNOG00000045997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166542 // GenBank // Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 14, mRNA (cDNA clone MGC:188140 IMAGE:7193817), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117272170:117273297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035484 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001135845 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA pseudouridylate synthase domain containing 2 (Rpusd2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119064464:119069713:1 gene:ENSRNOG00000010528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072130 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:117373333:117377075:1 gene:ENSRNOG00000046797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118998444:119068242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117373333:117377075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001170594 // RefSeq // Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 5 (Casc5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 5 (Casc5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein CASC5-like (LOC100911204), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117392643:117453522:1 gene:ENSRNOG00000037304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041727 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:119083810:119104903:1 gene:ENSRNOG00000026378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119076337:119147914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000054361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117385170:117492625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0
XM_006234759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 5 (Casc5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// XM_006234822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein CASC5-like (LOC100911204), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006234759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 5 (Casc5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006234822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein CASC5-like (LOC100911204), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001170594 // RefSeq // Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 5 (Casc5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006234759 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 5 (Casc5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117392643:117453522:1 gene:ENSRNOG00000037304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117385170:117492625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT035487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1
NM_001109204 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD51 recombinase (Rad51), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000056432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117468881:117493555:1 gene:ENSRNOG00000037302 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC168875 // GenBank // Rattus norvegicus RAD51 homolog (RecA homolog, E. coli) (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189128 IMAGE:9022295), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117385170:117492625:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119076337:119147914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_133595 // RefSeq // Rattus norvegicus GTP cyclohydrolase I feedback regulator (Gchfr), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016458 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117526535:117530595:1 gene:ENSRNOG00000012290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC086944 // GenBank // Rattus norvegicus GTP cyclohydrolase I feedback regulator, mRNA (cDNA clone MGC:108604 IMAGE:7325198), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U53710 // GenBank // Rattus norvegicus GTP cyclohydrolase I feedback regulatory protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// U85512 // GenBank // Rat GTP cyclohydrolase I feedback regulatory protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001068693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691418 (LOC691418), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030754 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:117533191:117533736:1 gene:ENSRNOG00000025980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034948 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 19 (Zfyve19), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234785 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 19 (Zfyve19), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000016854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117564491:117572476:1 gene:ENSRNOG00000012528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC099795 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, FYVE domain containing 19, mRNA (cDNA clone MGC:124714 IMAGE:7936116), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000054360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117565920:117572160:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 85 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT035493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT035495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// NONRATT035492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT035497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
NM_001004265 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type 1 (Spint1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006234763 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type 1 (Spint1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117599950:117612634:1 gene:ENSRNOG00000012811 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// AB154834 // GenBank // Rattus norvegicus HAI-1 mRNA for hepatocyte growth factor activator inhibitor-1, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// BC097253 // GenBank // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kunitz type 1, mRNA (cDNA clone MGC:114209 IMAGE:7459422), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000054364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117600177:117612096:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT035499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT035498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// NONRATT035500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 20 // 38 // 1
NM_001106499 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 18 homolog (S. cerevisiae) (Vps18), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117648071:117658924:1 gene:ENSRNOG00000013689 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC169083 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 18 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189490 IMAGE:7936869), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054358 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117648327:117676056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT035501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107760 // RefSeq // Rattus norvegicus delta-like 4 (Drosophila) (Dll4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117685738:117695768:1 gene:ENSRNOG00000014011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000054359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117686053:117713638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001173437 // RefSeq // Rattus norvegicus ChaC, cation transport regulator homolog 1 (E. coli) (Chac1), mRNA. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000019392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117711150:117714352:1 gene:ENSRNOG00000014387 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// EF688602 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 7 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000054359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117686053:117713638:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000020846 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:117860389:117861432:1 gene:ENSRNOG00000015542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 100 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117860456:117861432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_001107762 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar and spindle associated protein 1 (Nusap1), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000052312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:117970749:118001101:1 gene:ENSRNOG00000004921 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC161947 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar and spindle associated protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:187740 IMAGE:9025380), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000047287 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:117945480:118000133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT035512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT035514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001108958 // RefSeq // Rattus norvegicus Rtf1, Paf1/RNA polymerase II complex component, homolog (S. cerevisiae) (Rtf1), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000056392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118026883:118086227:1 gene:ENSRNOG00000005183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// FQ231962 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YI14 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 36 // 13 // 13 // 0 /// FQ233654 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YA09 mRNA sequence. // chr3 // 77 // 36 // 10 // 13 // 0 /// GENSCAN00000047318 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118026851:118083733:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT035516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT035517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT035518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 72 // 72 // 26 // 36 // 1
NM_031045 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol-trisphosphate 3-kinase A (Itpka), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000007247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118093293:118102049:1 gene:ENSRNOG00000005284 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M29787 // GenBank // Rat inositol 1,4,5-triphosphate 3-kinase (lp3k) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118093365:118101671:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_017092 // RefSeq // Rattus norvegicus TYRO3 protein tyrosine kinase (Tyro3), mRNA. // chr3 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000007656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118146800:118165787:1 gene:ENSRNOG00000005531 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// D37880 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Sky, complete cds. // chr3 // 95 // 97 // 36 // 38 // 0 /// GENSCAN00000047300 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118146818:118164729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT035522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT035521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 14 // 39 // 1
XM_006224646 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MGA, MAX dimerization protein (Mga), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// XM_006234798 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MGA, MAX dimerization protein (Mga), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000008528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118247721:118308351:1 gene:ENSRNOG00000006378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000064345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118247721:118308351:1 gene:ENSRNOG00000006378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000064395 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118247721:118308351:1 gene:ENSRNOG00000006378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000067865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118247721:118308351:1 gene:ENSRNOG00000006378 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000047307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118215265:118308351:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT035527 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// NONRATT035529 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001108589 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen activated protein kinase binding protein 1 (Mapkbp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000009430 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118316138:118364509:1 gene:ENSRNOG00000007018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006951 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118338543:118364501:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001107764 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group IVB (cytosolic) (Pla2g4b), mRNA. // chr3 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NM_001114656 // RefSeq // Rattus norvegicus jumonji domain containing 7 (Jmjd7), mRNA. // chr3 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000066685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118373799:118382163:1 gene:ENSRNOG00000007447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000067181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118366787:118372848:1 gene:ENSRNOG00000050072 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 31 // 8 // 9 // 0 /// GENSCAN00000006945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118366764:118381791:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT035536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// NONRATT035535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1
NM_001145840 // RefSeq // Rattus norvegicus glucosidase, alpha; neutral C (Ganc), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// XR_352522 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosidase, alpha; neutral C (Ganc), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000011369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118721646:118773762:1 gene:ENSRNOG00000024563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118722766:118825348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 79 // 18 // 19 // 0 /// NONRATT035541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_017117 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 3 (Capn3), mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000011761 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:118776658:118825810:1 gene:ENSRNOG00000008609 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// AF052540 // GenBank // Rattus norvegicus calpain isoform Lp85 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF061726 // GenBank // Rattus norvegicus calpain Rt88 mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// AF173834 // GenBank // Rattus norvegicus calpain Rt88 mRNA, complete cds. // chr3 // 91 // 79 // 20 // 22 // 0 /// AF184950 // GenBank // Rattus norvegicus calpain Rt90 mRNA, complete cds. // chr3 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// J05121 // GenBank // Rat p94 protein mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// U96367 // GenBank // Rattus norvegicus calpain Lp82 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000006972 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118722766:118825348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// NONRATT035544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
XM_003753760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex subunit 2-like (LOC100911033), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000073582 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:70580498:70581202:1 gene:ENSRNOG00000049634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000075447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:70585715:70586419:1 gene:ENSRNOG00000048700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// XM_003749553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex subunit 2-like (LOC100911033), mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000013316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118918628:118924603:1 gene:ENSRNOG00000048933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000056210 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118932552:118938528:1 gene:ENSRNOG00000046745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// GENSCAN00000000130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:70580498:70586419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 90 // 26 // 29 // 1 /// FQ222259 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA25YO15 mRNA sequence. // chr3 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT035547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
XM_003753762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006224570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048141 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:118974028:119202861:1 gene:ENSRNOG00000010050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118998444:119068242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0
XM_003753762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048141 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:118974028:119202861:1 gene:ENSRNOG00000010050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118998444:119068242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003753762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048141 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:118974028:119202861:1 gene:ENSRNOG00000010050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118998444:119068242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003753762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006224570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000048141 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:118974028:119202861:1 gene:ENSRNOG00000010050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_003749562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// XM_006234864 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stAR-related lipid transfer protein 9-like (LOC691920), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// GENSCAN00000022909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:118998444:119068242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000022929 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119178467:119202861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
ENSRNOT00000030065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119459037:119493418:1 gene:ENSRNOG00000023874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000050896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119471550:119497188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 43 // 12 // 12 // 0 /// FQ210040 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA35YN06 mRNA sequence. // chr3 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT035558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// NONRATT035556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001013204 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin D-type binding-protein 1 (Ccndbp1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006234859 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin D-type binding-protein 1 (Ccndbp1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000015472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119494100:119504496:1 gene:ENSRNOG00000011379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC091256 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin D-type binding-protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:109078 IMAGE:7375652), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// FQ233751 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YJ10 mRNA sequence. // chr3 // 94 // 97 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT035559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT035560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// GENSCAN00000050896 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119471550:119497188:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 34 // 34 // 12 // 35 // 1
NM_001014047 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase-like (Adal), mRNA. // chr3 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119641987:119647770:1 gene:ENSRNOG00000012166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000072305 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119633204:119634337:1 gene:ENSRNOG00000046523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// BC089959 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Adenosine deaminase CG11994-PA, mRNA (cDNA clone MGC:109297 IMAGE:7313149), complete cds. // chr3 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119633530:119649043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 13 // 39 // 1
XR_345139 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin, gamma complex associated protein 4 (Tubgcp4), transcript variant X5, misc_RNA. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// XR_352548 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin, gamma complex associated protein 4 (Tubgcp4), transcript variant X5, misc_RNA. // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000017818 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119671767:119695749:1 gene:ENSRNOG00000012798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000018460 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119671767:119697871:1 gene:ENSRNOG00000012798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000074613 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:119671767:119699292:1 gene:ENSRNOG00000012798 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// FQ226171 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA33YM09 mRNA sequence. // chr3 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000050882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119671947:119698219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1 /// NONRATT035568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT035570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
NM_030995 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1A (Map1a), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1A (Map1a), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019320 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119797486:119811427:1 gene:ENSRNOG00000014230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// M83196 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1A MAP1A (Mtap-1) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050888 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119791808:119810102:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0
NM_001012738 // RefSeq // Rattus norvegicus creatine kinase, mitochondrial 1B (Ckmt1b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus creatine kinase, mitochondrial 1B (Ckmt1b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119859003:119864004:1 gene:ENSRNOG00000014573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091335 // GenBank // Rattus norvegicus creatine kinase, mitochondrial 1, ubiquitous, mRNA (cDNA clone MGC:109333 IMAGE:7314893), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119859202:119863880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_017319 // RefSeq // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 3 (Pdia3), mRNA. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119916837:119941739:1 gene:ENSRNOG00000015018 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC062393 // GenBank // Rattus norvegicus protein disulfide isomerase family A, member 3, mRNA (cDNA clone MGC:72503 IMAGE:5621329), complete cds. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// D63378 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ER-60 protease, complete cds. // chr3 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// FQ211627 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA85YE11 mRNA sequence. // chr3 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026566 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119916837:119940543:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
FQ234114 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YC03 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001098782 // RefSeq // Rattus norvegicus small EDRK-rich factor 2 (Serf2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006234861 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small EDRK-rich factor 2 (Serf2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000056151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119955927:119957588:1 gene:ENSRNOG00000015277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 57 // 13 // 13 // 0 /// BC160811 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7324539. // chr3 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// NONRATT035580 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 57 // 57 // 13 // 23 // 1 /// NONRATT035583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1 /// NONRATT035584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
XM_006224580 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Huntingtin interacting protein K (Hypk), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:119963812:119964965:1 gene:ENSRNOG00000015703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000026525 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119963836:119964965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006224581 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 76 (Wdr76), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 76 (Wdr76), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006234877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 76 (Wdr76), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000036209 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:119988996:120018334:1 gene:ENSRNOG00000022491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026550 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:119988996:120022085:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001271283 // RefSeq // Rattus norvegicus cancer susceptibility candidate 4 (Casc4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000038291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120358106:120424427:1 gene:ENSRNOG00000016357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000044158 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120358106:120424427:1 gene:ENSRNOG00000016357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120358106:120424427:1 gene:ENSRNOG00000016357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013639 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120358106:120424523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 89 // 90 // 24 // 27 // 0
NM_001014048 // RefSeq // Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase like 2 (Ctdspl2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234854 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase like 2 (Ctdspl2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000037168 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120446018:120496804:1 gene:ENSRNOG00000022141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC083672 // GenBank // Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) small phosphatase like 2, mRNA (cDNA clone MGC:94517 IMAGE:7135706), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120445183:120517401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001077670 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J (Eif3j), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000022437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120516661:120538895:1 gene:ENSRNOG00000016459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// BC127509 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 3, subunit J, mRNA (cDNA clone MGC:156679 IMAGE:7454886), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT035594 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_012512 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-2 microglobulin (B2m), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000023017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120627499:120633521:1 gene:ENSRNOG00000017123 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ219455 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YC02 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// FQ221619 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA33YN06 mRNA sequence. // chr3 // 81 // 87 // 22 // 27 // 0 /// FQ225690 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YC23 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ227192 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YI11 mRNA sequence. // chr3 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// FQ227468 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YD24 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// FQ230183 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA9YP21 mRNA sequence. // chr3 // 87 // 97 // 26 // 30 // 0 /// FQ233273 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YI03 mRNA sequence. // chr3 // 81 // 100 // 25 // 31 // 0 /// FQ227193 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YI05 mRNA sequence. // chr3 // 61 // 100 // 19 // 31 // 0 /// FQ227685 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA12YE24 mRNA sequence. // chr3 // 71 // 100 // 22 // 31 // 0 /// FQ227203 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YH01 mRNA sequence. // chr3 // 45 // 100 // 14 // 31 // 0 /// NONRATT035597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000013613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120627519:120641947:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1
NM_001013160 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 69 (Trim69), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006234856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 69 (Trim69), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120642563:120663687:1 gene:ENSRNOG00000017157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC079281 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 36, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134203). // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091171 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 69, mRNA (cDNA clone MGC:108781 IMAGE:7132390), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120645259:120717195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT035599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT035600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001109652 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC691952 (LOC691952), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000056119 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:120669991:120688368:1 gene:ENSRNOG00000037178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035604 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013626 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120645259:120717195:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_017052 // RefSeq // Rattus norvegicus sorbitol dehydrogenase (Sord), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000023350 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120716970:120746949:1 gene:ENSRNOG00000017291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC088398 // GenBank // Rattus norvegicus sorbitol dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:93504 IMAGE:7112546), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC098919 // GenBank // Rattus norvegicus sorbitol dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:114337 IMAGE:7373210), complete cds. // chr3 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0 /// BC128707 // GenBank // Rattus norvegicus sorbitol dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:156505 IMAGE:8373758), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// FQ210296 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA30YM14 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ209461 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YI23 mRNA sequence. // chr3 // 59 // 59 // 10 // 17 // 1 /// NONRATT035605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// X74593 // GenBank // R.norvegicus mRNA for sorbitol dehydrogenase. // chr3 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000013642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120731310:120751655:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 65 // 65 // 11 // 17 // 1
NM_001191965 // RefSeq // Rattus norvegicus dual oxidase maturation factor 2 (Duoxa2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120776164:120779532:1 gene:ENSRNOG00000017805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120776164:120779532:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_153739 // RefSeq // Rattus norvegicus dual oxidase 1 (Duox1), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000046843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:120792928:120826088:1 gene:ENSRNOG00000033348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF542180 // GenBank // Rattus norvegicus dual oxidase 1 (Duox1) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:120792959:120825560:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109647 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 5-like 1 (Spata5l1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000043414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:121285518:121298517:1 gene:ENSRNOG00000000169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:121285574:121298318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035616 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001008518 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC302884 (MGC105649), mRNA. // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:121310711:121314263:1 gene:ENSRNOG00000050251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// FQ216036 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YC19 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// FQ221053 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA40YD11 mRNA sequence. // chr3 // 77 // 92 // 17 // 22 // 0 /// NONRATT035617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 92 // 100 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT035618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 75 // 18 // 24 // 1
NM_001025714 // RefSeq // Rattus norvegicus biogenesis of lysosomal organelles complex-1, subunit 6, pallidin (Bloc1s6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:121407586:121418323:1 gene:ENSRNOG00000037160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097469 // GenBank // Rattus norvegicus pallidin homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:114534 IMAGE:7457729), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:121370264:121527426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT035621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001047913 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfide quinone reductase-like (yeast) (Sqrdl), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfide quinone reductase-like (yeast) (Sqrdl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006234888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sulfide quinone reductase-like (yeast) (Sqrdl), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:121438451:121477299:1 gene:ENSRNOG00000000172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC158559 // GenBank // Rattus norvegicus sulfide quinone reductase-like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:187237 IMAGE:7456444), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:121370264:121527426:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107768 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6D (Sema6d), mRNA. // chr3 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234919 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6D (Sema6d), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000066101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:123424951:123482782:1 gene:ENSRNOG00000004812 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000027338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:123468078:123480371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 72 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT035625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 91 // 39 // 39 // 0
NM_001107769 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 5 (Slc24a5), mRNA. // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000043611 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:123859070:123878338:1 gene:ENSRNOG00000005158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT035628 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:123854345:123877358:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001162935 // RefSeq // Rattus norvegicus cortexin 2 (Ctxn2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cortexin 2 (Ctxn2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234893 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cortexin 2 (Ctxn2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000056054 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:123940156:123940597:1 gene:ENSRNOG00000037146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000031588 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:124290175:124290581:1 gene:ENSRNOG00000024256 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
XM_006224597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S14-like (LOC102547425), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// XM_006234936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S14-like (LOC102547425), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000042949 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:124378662:124379188:1 gene:ENSRNOG00000031585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000047828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124378694:124379149:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001109205 // RefSeq // Rattus norvegicus EP300 interacting inhibitor of differentiation 1 (Eid1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000042411 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124462790:124464446:1 gene:ENSRNOG00000008452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC162030 // GenBank // Rattus norvegicus EP300 interacting inhibitor of differentiation 1, mRNA (cDNA clone MGC:187926 IMAGE:9100917), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000047821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124462829:124463308:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// NONRATT035647 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_001013919 // RefSeq // Rattus norvegicus galactokinase 2 (Galk2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012447 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124669033:124793301:1 gene:ENSRNOG00000009289 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC083716 // GenBank // Rattus norvegicus galactokinase 2, mRNA (cDNA clone MGC:94607 IMAGE:7190694), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus galactokinase 2 (Galk2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// NONRATT035649 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035651 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000047825 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124742299:124793493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1 /// NONRATT035650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_022182 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 7 (Fgf7), mRNA. // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000012700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124841487:124891019:1 gene:ENSRNOG00000009425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124841563:124891019:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035654 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013921 // RefSeq // Rattus norvegicus DTW domain containing 1 (Dtwd1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234910 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DTW domain containing 1 (Dtwd1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006234912 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DTW domain containing 1 (Dtwd1), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000012966 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:124955129:124966716:1 gene:ENSRNOG00000009593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079068 // GenBank // Rattus norvegicus DTW domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:94022 IMAGE:7121624), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006234913 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DTW domain containing 1 (Dtwd1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT035657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:124916853:124966402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_031736 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 2 (Slc27a2), mRNA. // chr3 // 88 // 97 // 28 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000013605 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:125543564:125580197:1 gene:ENSRNOG00000010128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000067700 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:125543564:125580197:1 gene:ENSRNOG00000010128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC081766 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:93337 IMAGE:7106977), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// D85100 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for very-long-chain acyl-CoA synthetase, complete cds. // chr3 // 88 // 97 // 28 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125543564:125579891:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT035661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001106502 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 8 (Usp8), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000015124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:125699400:125747040:1 gene:ENSRNOG00000010729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000050660 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:125661686:125746375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT035664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 86 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT035665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
NM_001177822 // RefSeq // Rattus norvegicus Aa2-296-like (LOC100363112), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000046977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:125876306:125907457:1 gene:ENSRNOG00000033429 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191742 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 4, epsilon 1 subunit (Ap4e1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// XM_006234921 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 4, epsilon 1 subunit (Ap4e1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000037390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126010551:126074320:1 gene:ENSRNOG00000022938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000052238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126038202:126074265:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0
NM_001100977 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial fission regulator 1 (Mtfr1), mRNA. // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000045586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:123742968:123761211:1 gene:ENSRNOG00000021359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// EF221637 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial fission regulator 1 (Mtfr1) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// FQ217237 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA31YL20 mRNA sequence. // chr3 // 94 // 100 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015599 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:126024633:126025642:1 gene:ENSRNOG00000011715 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126010551:126025642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000054902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:123748680:123782607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 86 // 68 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT029225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// NONRATT029226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1 /// NONRATT029227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
ENSRNOT00000015843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126078456:126103260:1 gene:ENSRNOG00000011778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC078766 // GenBank // Rattus norvegicus biliverdin reductase A, mRNA (cDNA clone MGC:93279 IMAGE:7126157), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NM_053850 // RefSeq // Rattus norvegicus biliverdin reductase A (Blvra), mRNA. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// FQ231949 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YJ06 mRNA sequence. // chr3 // 63 // 100 // 5 // 8 // 0 /// M81681 // GenBank // Rattus norvegicus biliverdin reductase mRNA, complete cds. // chr3 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0 /// NONRATT035675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001037766 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein 200 (U5) (Snrnp200), mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000043895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126165542:126194857:1 gene:ENSRNOG00000012157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 43 // 43 // 0 /// BC099211 // GenBank // Rattus norvegicus activating signal cointegrator 1 complex subunit 3-like 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7384540), complete cds. // chr3 // 100 // 16 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000052237 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126165652:126194601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 47 // 47 // 0 /// NONRATT035679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 66 // 66 // 33 // 50 // 1
NM_001100978 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 127 (Tmem127), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000031577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126202793:126215584:1 gene:ENSRNOG00000022727 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC131850 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 127, mRNA (cDNA clone MGC:156781 IMAGE:7125680), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT035681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001106503 // RefSeq // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 7 (Stard7), mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000066114 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126224026:126251262:1 gene:ENSRNOG00000013479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126224368:126279402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 74 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT035685 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT035684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT035686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1
NM_001012089 // RefSeq // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 2 (Dusp2), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126303199:126305373:1 gene:ENSRNOG00000013862 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC088205 // GenBank // Rattus norvegicus dual specificity phosphatase 2, mRNA (cDNA clone MGC:108907 IMAGE:7380627), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035687 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000052228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126303265:126318855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_001106504 // RefSeq // Rattus norvegicus astacin-like metalloendopeptidase (M12 family) (Astl), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000039043 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126310094:126325827:1 gene:ENSRNOG00000022603 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126303265:126318855:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NM_138505 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenoceptor alpha 2B (Adra2b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126332394:126334420:1 gene:ENSRNOG00000013887 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// M32061 // GenBank // Rat alpha-2B-adrenergic receptor (RNG-alpha-2) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126332701:126348898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT035690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001168529 // RefSeq // Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial (Gpat2), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006234956 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glycerol-3-phosphate acyltransferase 2, mitochondrial (Gpat2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000018677 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127329508:127338061:-1 gene:ENSRNOG00000013906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000010253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127329654:127342038:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT038062 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1
NM_001106505 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S5 (Mrps5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020451 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127150028:127166611:-1 gene:ENSRNOG00000015192 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127125554:127157919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001106508 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA oxidase-like (Acoxl), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000021740 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126606586:126919638:-1 gene:ENSRNOG00000016179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT038057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000025127 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126607332:126798232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// GENSCAN00000047158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126850823:126919638:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NONRATT038057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001024312 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4933411G11 (LOC499886), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4933411G11 (LOC499886), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006234982 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein 4933411G11 (LOC499886), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000055882 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:128876442:128883792:-1 gene:ENSRNOG00000037081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000032726 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128877157:128915203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_022943 // RefSeq // Rattus norvegicus c-mer proto-oncogene tyrosine kinase (Mertk), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// XM_006234988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus c-mer proto-oncogene tyrosine kinase (Mertk), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128669942:128777039:-1 gene:ENSRNOG00000017319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// AF208235 // GenBank // Rattus norvegicus MERTK (Mertk) mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// FQ221127 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA3YE07 mRNA sequence. // chr3 // 91 // 92 // 32 // 35 // 0 /// GENSCAN00000048797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128671362:128785537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT038086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT038088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NONRATT038086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001191854 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 87B (Tmem87b), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// XM_006234976 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 87B (Tmem87b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000023569 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128621323:128654288:-1 gene:ENSRNOG00000017443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT038085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 21 // 40 // 1 /// NONRATT038084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1 /// GENSCAN00000048794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128571581:128654277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
XM_006224608 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibulin 7 (Fbln7), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006235001 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibulin 7 (Fbln7), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128571581:128604148:-1 gene:ENSRNOG00000017550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128571581:128654277:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT038082 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT038083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
ENSRNOT00000023913 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:128518651:128521556:-1 gene:ENSRNOG00000017740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000048789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128518697:128521556:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0
NM_001107772 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH type containing 6 (Zc3h6), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000024322 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128463042:128513173:-1 gene:ENSRNOG00000026277 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000048792 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128464446:128500714:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT038081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_138536 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase (Ttl), mRNA. // chr3 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// XM_006234946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase (Ttl), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128391316:128417936:-1 gene:ENSRNOG00000018205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF207605 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin tyrosine ligase (Ttl) mRNA, complete cds. // chr3 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048796 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128391417:128422004:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_031773 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) I polypeptide B (Polr1b), mRNA. // chr3 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000024882 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128358264:128382727:-1 gene:ENSRNOG00000018349 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// AF025424 // GenBank // Rattus norvegicus RNA polymerase I 127 kDa subunit mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128353138:128382675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT038078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106509 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5 (Chchd5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128353804:128354758:-1 gene:ENSRNOG00000018491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158612 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:187492 IMAGE:7384755), complete cds. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT038076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT038077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128353138:128382675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT038074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_031148 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 20 (phosphate transporter), member 1 (Slc20a1), mRNA. // chr3 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:128276543:128289618:-1 gene:ENSRNOG00000018567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB000489 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for RPHO-1, complete cds. // chr3 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// XM_006234992 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 20 (phosphate transporter), member 1 (Slc20a1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 45 // 45 // 15 // 33 // 1 /// GENSCAN00000052939 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128277297:128313697:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT038070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT038072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
XR_345186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556777 (LOC102556777), ncRNA. // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// XR_345187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556785 (LOC102556785), ncRNA. // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// XR_352603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549265 (LOC102549265), ncRNA. // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// XR_352604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549325 (LOC102549325), ncRNA. // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000052930 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:128227793:128268734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_013016 // RefSeq // Rattus norvegicus signal-regulatory protein alpha (Sirpa), mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000006408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127864146:127901869:-1 gene:ENSRNOG00000004763 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// AF055065 // GenBank // Rattus norvegicus signal regulatory protein alpha mRNA, partial cds. // chr3 // 76 // 66 // 16 // 21 // 0 /// BC099773 // GenBank // Rattus norvegicus signal-regulatory protein alpha, mRNA (cDNA clone MGC:124545 IMAGE:7932298), complete cds. // chr3 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// D38468 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BIT, complete cds. // chr3 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// D85183 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for SHPS-1, complete cds. // chr3 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127874418:127903356:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT038066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT038067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1 /// NONRATT038068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001107773 // RefSeq // Rattus norvegicus serine/threonine kinase 35 (Stk35), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 35 (Stk35), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000008071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127680155:127708598:-1 gene:ENSRNOG00000006002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006234975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/threonine kinase 35 (Stk35), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// GENSCAN00000010259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127697834:127712071:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC085830 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7134196, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr3 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT038065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108959 // RefSeq // Rattus norvegicus transglutaminase 3 (Tgm3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000063828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:127438622:127474675:-1 gene:ENSRNOG00000006753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000010261 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:127439093:127486884:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT038063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006224653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transglutaminase 6 (Tgm6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006235053 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transglutaminase 6 (Tgm6), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000009097 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:129162948:129179990:1 gene:ENSRNOG00000006830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000032731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129117937:129179990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001106510 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane channel-like 2 (Tmc2), mRNA. // chr3 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000009323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129221627:129289966:1 gene:ENSRNOG00000007017 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129214189:129308190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 76 // 25 // 26 // 0
NM_001025732 // RefSeq // Rattus norvegicus NOP56 ribonucleoprotein (Nop56), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000009564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129303487:129308275:1 gene:ENSRNOG00000007128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC099149 // GenBank // Rattus norvegicus nucleolar protein 5A, mRNA (cDNA clone MGC:116301 IMAGE:7366316), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000032724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129214189:129308190:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT035741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT035742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT035740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 53 // 53 // 10 // 19 // 1
NONRATT035739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT013496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0 /// NONRATT013497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 100 // 15 // 27 // 0
NONRATT035739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT035739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L31-like (RGD1561317), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// XM_006235054 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L31-like (RGD1561317), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000045604 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:129316639:129317016:1 gene:ENSRNOG00000031034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000032728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129314666:129317016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001191076 // RefSeq // Rattus norvegicus early B-cell factor 4 (Ebf4), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129335397:129391670:1 gene:ENSRNOG00000007408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000037235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129321543:129391670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0
NM_001005541 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 16 homolog (S. cerevisiae) (Vps16), mRNA. // chr3 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// XR_352611 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 16 homolog (S. cerevisiae) (Vps16), transcript variant X1, misc_RNA. // chr3 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000028821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129448274:129469256:1 gene:ENSRNOG00000021222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// BC081963 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 16 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:94090 IMAGE:7124985), complete cds. // chr3 // 100 // 98 // 48 // 48 // 0 /// FQ212033 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA72YA08 mRNA sequence. // chr3 // 98 // 100 // 48 // 49 // 0 /// GENSCAN00000037250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129463268:129469182:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT035749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// NONRATT035750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 33 // 33 // 16 // 49 // 1 /// NONRATT035752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 24 // 24 // 12 // 49 // 1 /// NONRATT035753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 20 // 20 // 10 // 49 // 1
NM_012763 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, A (Ptpra), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000055801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129475269:129582697:1 gene:ENSRNOG00000021223 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// BC081828 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, receptor type, A, mRNA (cDNA clone MGC:93561 IMAGE:7107006), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 42 // 42 // 0 /// L01702 // GenBank // Rat protein-tryosine-phosphatase (LRP) mRNA, complete cds. // chr3 // 79 // 88 // 33 // 42 // 0 /// GENSCAN00000037260 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129521556:129582456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 81 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT035757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT035758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT035760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 12 // 48 // 1 /// NONRATT035759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_001013206 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S26 (Mrps26), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129591392:129593055:1 gene:ENSRNOG00000021224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037254 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129591439:129593892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_012996 // RefSeq // Rattus norvegicus oxytocin/neurophysin 1 prepropeptide (Oxt), mRNA. // chr3 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000028829 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129604822:129605662:1 gene:ENSRNOG00000021225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// M25649 // GenBank // Rat oxytocin mRNA, complete cds. // chr3 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT035763 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000037262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129604858:129605542:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001107774 // RefSeq // Rattus norvegicus inosine triphosphatase (nucleoside triphosphate pyrophosphatase) (Itpa), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000028838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129707739:129719394:1 gene:ENSRNOG00000021233 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ216056 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YA11 mRNA sequence. // chr3 // 58 // 97 // 18 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129710346:129718870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT035767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035768 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
GENSCAN00000031208 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129884690:129887980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// NONRATT035769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
NM_031351 // RefSeq // Rattus norvegicus attractin (Atrn), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000028847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:129934530:130067263:1 gene:ENSRNOG00000021240 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB038387 // GenBank // Rattus norvegicus atrn mRNA for attractin, complete cds. // chr3 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// AB038388 // GenBank // Rattus norvegicus Atrn mRNA for attractin, complete cds. // chr3 // 96 // 83 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000031212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:129934590:130062897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT035770 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT035771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001107778 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 12B (Hspa12b), mRNA. // chr3 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028856 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130168347:130187026:1 gene:ENSRNOG00000021244 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC168906 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7103977, with apparent retained intron. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000031213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130171067:130185879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT035775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT035774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT035776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT035777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_133572 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 25B (Cdc25b), mRNA. // chr3 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// XM_006235003 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle 25B (Cdc25b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130229228:130239028:1 gene:ENSRNOG00000021248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// D16237 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for cdc25B, complete cds. // chr3 // 91 // 94 // 29 // 32 // 0 /// GENSCAN00000031214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130229461:130238191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT035780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1 /// NONRATT035782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT035783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1
NM_001134618 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 5, sigma 1 subunit (Ap5s1), mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000034201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130251743:130255035:1 gene:ENSRNOG00000021249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000031210 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130252620:130254403:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT035787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 80 // 40 // 8 // 10 // 0
NM_001005556 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial antiviral signaling protein (Mavs), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006235035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial antiviral signaling protein (Mavs), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial antiviral signaling protein (Mavs), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000034146 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130273622:130287787:1 gene:ENSRNOG00000025295 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC081869 // GenBank // Rattus norvegicus virus-induced signaling adapter, mRNA (cDNA clone MGC:93707 IMAGE:7106026), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130278162:130286659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT035794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT035791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1 /// NONRATT035795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001106513 // RefSeq // Rattus norvegicus pantothenate kinase 2 (Pank2), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000033554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:130303289:130337378:1 gene:ENSRNOG00000025286 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000005419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:130321262:130339488:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT035798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NR_031860 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-103-2 (Mir103-2), microRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000053619 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:3:130329252:130329337:1 gene:ENSRNOG00000035496 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// rno-mir-103-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000887 Rattus norvegicus miR-103-2 stem-loop // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NONRATT035801 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_012631 // RefSeq // Rattus norvegicus prion protein (Prnp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prion protein (Prnp), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131010028:131025366:1 gene:ENSRNOG00000021259 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC072692 // GenBank // Rattus norvegicus prion protein, mRNA (cDNA clone MGC:91417 IMAGE:7099864), complete cds. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// FQ211780 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YD15 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ228577 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA6YJ02 mRNA sequence. // chr3 // 92 // 52 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034090 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131004116:131024144:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT035812 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035813 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006235058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prion protein 2 (dublet) (Prnd), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131039403:131042596:1 gene:ENSRNOG00000021260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053643 // RefSeq // Rattus norvegicus CDP-diacylglycerol synthase (phosphatidate cytidylyltransferase) 2 (Cds2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131392178:131430664:1 gene:ENSRNOG00000021265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AB052898 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for CDP-diacylglycerol synthase type2, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011645 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131392257:131430562:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035817 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006224618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG26214-like (LOC100365845), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006224619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG26214-like (LOC100365845), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC681292 (LOC681292), mRNA. // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000028891 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:131874304:131880404:1 gene:ENSRNOG00000021268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000036491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131858199:131880404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
NM_012526 // RefSeq // Rattus norvegicus chromogranin B (secretogranin 1) (Chgb), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000028892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131912219:131925372:1 gene:ENSRNOG00000021269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF019974 // GenBank // Rattus norvegicus chromogranin B (Chgb) mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// BC128743 // GenBank // Rattus norvegicus chromogranin B, mRNA (cDNA clone MGC:156676 IMAGE:8370781), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000036500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131912301:131925270:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001106514 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 8 (Mcm8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000028898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131954329:131984573:1 gene:ENSRNOG00000021272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000036463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:131957513:131984130:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035826 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001014258 // RefSeq // Rattus norvegicus cardiolipin synthase 1 (Crls1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006235078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cardiolipin synthase 1 (Crls1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000028900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:131987548:132005390:1 gene:ENSRNOG00000021273 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 70 // 16 // 16 // 0 /// BC085849 // GenBank // Rattus norvegicus cardiolipin synthase 1, mRNA (cDNA clone MGC:94564 IMAGE:7189638), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035828 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_017178 // RefSeq // Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 2 (Bmp2), mRNA. // chr3 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006235073 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bone morphogenetic protein 2 (Bmp2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:132822229:132830717:1 gene:ENSRNOG00000021276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000073728 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:132823406:132830639:1 gene:ENSRNOG00000021276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000022791 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:132823337:132830705:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT035830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001077641 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, beta 1 (phosphoinositide-specific) (Plcb1), mRNA. // chr3 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000006389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:134642689:134801508:1 gene:ENSRNOG00000004810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000051184 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:134642689:134801452:1 gene:ENSRNOG00000004810 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 24 // 24 // 0 /// L14323 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase C-beta1b mRNA, complete sequence. // chr3 // 97 // 97 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000057531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:134771156:134804630:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 27 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT035834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000057532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:134622483:134768793:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1
ENSRNOT00000055679 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:134969419:134970141:1 gene:ENSRNOG00000037010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000002223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:134962213:134970141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0
NM_024353 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, beta 4 (Plcb4), mRNA. // chr3 // 90 // 98 // 35 // 39 // 0 /// XM_006235087 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, beta 4 (Plcb4), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006235090 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase C, beta 4 (Plcb4), transcript variant X9, mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000042853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:135243862:135458277:1 gene:ENSRNOG00000033119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000045393 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:135243862:135458277:1 gene:ENSRNOG00000033119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000049855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:135243862:135458277:1 gene:ENSRNOG00000033119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AF031370 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase C-beta 4b (PLC-b4) mRNA, splice variant PLC-b4b, complete cds. // chr3 // 80 // 88 // 28 // 35 // 0 /// L15556 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase C beta4 mRNA, complete cds. // chr3 // 90 // 98 // 35 // 39 // 0 /// U57836 // GenBank // Rattus norvegicus brain phospholipase C-b4 splice variant PLC-b4b mRNA, complete cds. // chr3 // 81 // 93 // 30 // 37 // 0 /// NONRATT035837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000024551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:135374813:135518914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 63 // 25 // 40 // 1 /// NONRATT035840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
ENSRNOT00000030200 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:135182739:135183438:1 gene:ENSRNOG00000024692 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000002219 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:135175704:135183438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT035837 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001014183 // RefSeq // Rattus norvegicus lysosomal-associated membrane protein family, member 5 (Lamp5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:135507575:135519611:1 gene:ENSRNOG00000005457 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087680 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Protein C20orf103 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:105629 IMAGE:7318802), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024551 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:135374813:135518914:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT035842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
GENSCAN00000055084 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:135919948:135946644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106516 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat and EF-hand domain containing 1 (Ankef1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007893 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:135984715:136021352:1 gene:ENSRNOG00000005792 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:135988404:136063494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001270575 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein 25 (Snap25), transcript variant 1, mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_001270576 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein 25 (Snap25), transcript variant 2, mRNA. // chr3 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NM_030991 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein 25 (Snap25), transcript variant 3, mRNA. // chr3 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000007998 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:136083976:136269421:1 gene:ENSRNOG00000006037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000008734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:136084283:136269421:1 gene:ENSRNOG00000006037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// AF245227 // GenBank // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein SNAP-25 mRNA, complete cds. // chr3 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// BC087699 // GenBank // Rattus norvegicus synaptosomal-associated protein 25, mRNA (cDNA clone MGC:105414 IMAGE:7314318), complete cds. // chr3 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT035847 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055079 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:136259271:136291320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1 /// GENSCAN00000055088 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:136228294:136254544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001271320 // RefSeq // Rattus norvegicus SLX4 interacting protein (Slx4ip), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009743 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:136488328:136545079:1 gene:ENSRNOG00000007430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000070972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:136488328:136545079:1 gene:ENSRNOG00000007430 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1
NM_001107782 // RefSeq // Rattus norvegicus BTB (POZ) domain containing 3 (Btbd3), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010835 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:137825258:137831600:1 gene:ENSRNOG00000008088 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000025495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:137814040:137831172:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035856 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000022676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:138381488:138381901:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT035857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001106517 // RefSeq // Rattus norvegicus serine palmitoyltransferase, long chain base subunit 3 (Sptlc3), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000005920 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:139023075:139151792:1 gene:ENSRNOG00000004443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:138973498:139121095:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001126371 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 5 (Ndufaf5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006235097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 5 (Ndufaf5), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000006412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:139688332:139717715:1 gene:ENSRNOG00000004784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC166551 // GenBank // Rattus norvegicus similar to dJ842G6.1.1 (novel protein), mRNA (cDNA clone MGC:188157 IMAGE:7307233), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT035860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT035862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 20 // 33 // 1 /// GENSCAN00000042556 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:139702339:139724902:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT035863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
XM_006235114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MACRO domain containing 2 (Macrod2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000045312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:142644462:142719566:1 gene:ENSRNOG00000033096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// XM_006224678 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MACRO domain containing 2 (Macrod2), mRNA. // chr3 // 59 // 59 // 20 // 34 // 1 /// XM_006224620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MACRO domain containing 2 (Macrod2), mRNA. // chr3 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// GENSCAN00000033265 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:142712838:142790982:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
ENSRNOT00000072928 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:140888478:140889823:1 gene:ENSRNOG00000050784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT035864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001108592 // RefSeq // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B (Snrpb2), mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// XM_006235116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B (Snrpb2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:143580422:143589939:1 gene:ENSRNOG00000004967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// BC168760 // GenBank // Rattus norvegicus small nuclear ribonucleoprotein polypeptide B, mRNA (cDNA clone MGC:188877 IMAGE:6888886), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// FQ213679 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YG11 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT035871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT035872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 95 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000028276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:143553628:143589750:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 90 // 90 // 19 // 21 // 1
NM_001108960 // RefSeq // Rattus norvegicus otoraplin (Otor), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:143596458:143599713:1 gene:ENSRNOG00000028721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:143596475:143626431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012746 // RefSeq // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 2 (Pcsk2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000007249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144059121:144362761:1 gene:ENSRNOG00000005438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// M76706 // GenBank // Rat prohormone convertase PC2 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// M83746 // GenBank // Rat homologue of Kex2 and furin proteins mRNA, complete cds. // chr3 // 97 // 100 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT035874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000013390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144332222:144349824:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1 /// NONRATT035875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1 /// GENSCAN00000006883 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144203414:144227569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 23 // 23 // 8 // 35 // 1
NONRATT035876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001033666 // RefSeq // Rattus norvegicus destrin (Dstn), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000007794 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144462864:144489654:1 gene:ENSRNOG00000005924 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000000975 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:829357:829854:1 gene:ENSRNOG00000000748 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144479580:144488587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000046957 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:20:829357:829854:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT035877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000034790 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:80990003:80990519:1 gene:ENSRNOG00000026891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 63 // 69 // 15 // 24 // 0 /// NONRATT035878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 86 // 86 // 30 // 35 // 1 /// NONRATT035879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
XM_006235132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus barrier to autointegration factor 2 (Banf2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235133 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus barrier to autointegration factor 2 (Banf2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus barrier to autointegration factor 2 (Banf2), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235138 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus barrier to autointegration factor 2 (Banf2), transcript variant X7, mRNA. // chr3 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000007946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144612403:144622045:1 gene:ENSRNOG00000006032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 59 // 15 // 16 // 0 /// NONRATT035880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000013402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144610393:144617663:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001009655 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial genome maintenance exonuclease 1 (Mgme1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mitochondrial genome maintenance exonuclease 1 (Mgme1), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000038865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144832022:144840677:1 gene:ENSRNOG00000028196 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087676 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 8430406I07, mRNA (cDNA clone MGC:105769 IMAGE:7319345), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// GENSCAN00000040025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144831518:144839782:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000071288 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:144934673:144939289:1 gene:ENSRNOG00000045899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001191855 // RefSeq // Rattus norvegicus CSRP2 binding protein (Csrp2bp), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000009437 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:144939294:144979526:1 gene:ENSRNOG00000007160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:144939553:145038232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035888 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT035889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001024313 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 133 (Zfp133), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:145027552:145046045:1 gene:ENSRNOG00000027955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC079070 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Zinc finger protein 133, mRNA (cDNA clone MGC:94024 IMAGE:7121746), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107784 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide F (Polr3f), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000010468 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:145114599:145130969:1 gene:ENSRNOG00000007548 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000040042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145114810:145126849:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000040032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145140235:145173120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000030148 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:145140235:145141231:1 gene:ENSRNOG00000027574 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 100 // 6 // 10 // 0
NM_001277235 // RefSeq // Rattus norvegicus Sec23 homolog B (S. cerevisiae) (Sec23b), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// FQ211753 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA81YD22 mRNA sequence. // chr3 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064723 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:145145484:145186894:1 gene:ENSRNOG00000008411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT035882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT035892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000040032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145140235:145173120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT035893 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1
NM_001106520 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1566320 (RGD1566320), mRNA. // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006235125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1566320 (RGD1566320), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000055588 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:145194837:145196325:1 gene:ENSRNOG00000036971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// FQ222387 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA24YB06 mRNA sequence. // chr3 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT035896 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035897 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000040035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145194779:145256411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001108594 // RefSeq // Rattus norvegicus D-tyrosyl-tRNA deacylase 1 (Dtd1), mRNA. // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000012510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:145200442:145361886:1 gene:ENSRNOG00000008746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000066986 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:145200425:145361899:1 gene:ENSRNOG00000008746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC159413 // GenBank // Rattus norvegicus D-tyrosyl-tRNA deacylase 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188693 IMAGE:8367451), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035899 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145194779:145256411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
GENSCAN00000011777 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145347711:145375853:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 91 // 92 // 20 // 22 // 0
NM_001107785 // RefSeq // Rattus norvegicus SCP2 sterol-binding domain containing 1 (Scp2d1), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:145405170:145405920:1 gene:ENSRNOG00000009461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035901 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000011772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145405248:145471363:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_053505 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 24 (sodium/potassium/calcium exchanger), member 3 (Slc24a3), mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000012683 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:145760074:146259491:1 gene:ENSRNOG00000009480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT035902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
NM_001107786 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras and Rab interactor 2 (Rin2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006235142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras and Rab interactor 2 (Rin2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006235143 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras and Rab interactor 2 (Rin2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006235149 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ras and Rab interactor 2 (Rin2), transcript variant X8, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000064695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:146317465:146510342:1 gene:ENSRNOG00000010131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146445113:146508659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT035904 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT035907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001108595 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 20, NatB catalytic subunit (Naa20), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014046 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:146527794:146545208:1 gene:ENSRNOG00000010523 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC167020 // GenBank // Rattus norvegicus N-acetyltransferase 5 (ARD1 homolog, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:189228 IMAGE:9025632), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146539097:146544674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 33 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT035908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035910 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// NONRATT035911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 71 // 71 // 17 // 24 // 1
XM_006224680 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulinoma-associated protein 1-like (LOC100912563), mRNA. // chrU // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006235176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus insulinoma-associated protein 1-like (LOC100912563), mRNA. // chrU // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000011772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:145405248:145471363:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// GENSCAN00000014035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:146843011:146855508:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_006224674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polo-like kinase 1 substrate 1 (Plk1s1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polo-like kinase 1 substrate 1 (Plk1s1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XR_345262 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polo-like kinase 1 substrate 1 (Plk1s1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// XR_352685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polo-like kinase 1 substrate 1 (Plk1s1), transcript variant X3, misc_RNA. // chr3 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036527 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:147486152:147591738:1 gene:ENSRNOG00000025141 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT035919 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000163 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:147555763:147591738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001108596 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-3 exoribonuclease 2 (Xrn2), mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// XM_006235156 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-3 exoribonuclease 2 (Xrn2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006235158 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 5-3 exoribonuclease 2 (Xrn2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000016351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:147642886:147716287:1 gene:ENSRNOG00000011785 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000000154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:147612483:147712794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0
NM_001107787 // RefSeq // Rattus norvegicus paired box 1 (Pax1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006235152 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paired box 1 (Pax1), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000067983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:147995989:148008334:1 gene:ENSRNOG00000024882 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022009 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:147891217:148007207:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
ENSRNOT00000066588 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:148341786:148347303:1 gene:ENSRNOG00000024844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007653 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:148310689:148342250:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_013036 // RefSeq // Rattus norvegicus somatostatin receptor 4 (Sstr4), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149151003:149152866:1 gene:ENSRNOG00000004641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U04738 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley major hippocampal somatostatin receptor (SSTR4) mRNA, complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT035930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044643 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149124084:149152215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001106521 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transport factor 2-like export factor 1 (Nxt1), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000006205 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149404160:149407137:1 gene:ENSRNOG00000004700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC167042 // GenBank // Rattus norvegicus NTF2-like export factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:189309 IMAGE:7444530), complete cds. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// FQ227988 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YO21 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149369474:149406872:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001107788 // RefSeq // Rattus norvegicus GDNF-inducible zinc finger protein 1 (Gzf1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006235154 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GDNF-inducible zinc finger protein 1 (Gzf1), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149414356:149426464:1 gene:ENSRNOG00000004735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149410794:149424576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1
NM_001106522 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin-like 1 (Cstl1), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000006362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149493397:149498394:1 gene:ENSRNOG00000004779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_147137 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin SC (LOC257643), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000006555 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:149518206:149524925:1 gene:ENSRNOG00000004858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF442205 // GenBank // Rattus norvegicus cystatin SC mRNA, complete cds. // chr3 // 69 // 100 // 18 // 26 // 0 /// NONRATT035936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149518248:149550119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT035937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_153734 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin 12 (Cst12), mRNA. // chr3 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149528541:149532394:1 gene:ENSRNOG00000004946 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF440736 // GenBank // Rattus norvegicus cystatin TE-1 mRNA, complete cds. // chr3 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT035938 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149518248:149550119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT035939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_019258 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin 8 (cystatin-related epididymal specific) (Cst8), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cystatin 8 (cystatin-related epididymal specific) (Cst8), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000006667 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149538121:149544758:1 gene:ENSRNOG00000004989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF090692 // GenBank // Rattus norvegicus cystatin-related epididymal spermatogenic protein (CRES) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149518248:149550119:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001109343 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin 13 (Cst13), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235163 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cystatin 13 (Cst13), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006850 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149560578:149570330:1 gene:ENSRNOG00000005103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149564861:149578244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT035942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108597 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin 9-like (Cst9l), mRNA. // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000006869 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:149581044:149583857:1 gene:ENSRNOG00000005162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000047369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:149581107:149585870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT035943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_053748 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 3 (Dpp3), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:227097125:227120710:-1 gene:ENSRNOG00000031485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// BC107673 // GenBank // Rattus norvegicus dipeptidylpeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:124585 IMAGE:7938129), complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D89340 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for dipeptidyl peptidase III, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029713 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:227080515:227133876:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT006972 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 52 // 100 // 13 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:150210281:150226056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// NONRATT035944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001108961 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin D (Cst5), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:150943493:150948103:1 gene:ENSRNOG00000005545 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047633 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:150943802:151049845:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT035950 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT035951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001025020 // RefSeq // Rattus norvegicus synapse differentiation inducing 1 (Syndig1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000068210 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:151405855:151571800:1 gene:ENSRNOG00000031536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC092131 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 20 open reading frame 39, mRNA (cDNA clone MGC:105581 IMAGE:7312153), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035952 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:151470606:151502267:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
GENSCAN00000051682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:151539703:151670273:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
AY539901 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00150 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000049940 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:151672142:151672954:1 gene:ENSRNOG00000023402 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT035953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000051689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:151672142:151723867:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006224677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase X-like (LOC102548147), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_006235187 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sperm motility kinase-like (LOC100911984), mRNA. // chr3 // 64 // 100 // 7 // 11 // 0
NM_001034953 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// XM_006240704 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// XM_006240705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 like (Cdca7l), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000064868 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:154655200:154699230:1 gene:ENSRNOG00000005410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// BC098734 // GenBank // Rattus norvegicus cell division cycle associated 7 like, mRNA (cDNA clone MGC:112726 IMAGE:7385105), complete cds. // chr3 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000055514 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:152338609:152339908:-1 gene:ENSRNOG00000024613 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:151830915:151850687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000020185 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:2672890:2710282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 93 // 56 // 14 // 15 // 0 /// GENSCAN00000042274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152313778:152339896:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000041397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:154692630:154698027:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT047605 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006235199 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102555217), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000075429 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:152165990:152171823:-1 gene:ENSRNOG00000050729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// FQ210125 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA34YC18 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT038268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166814 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7456820. // chr3 // 71 // 71 // 20 // 28 // 1
XM_006224689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 596-like (LOC102554315), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 596-like (LOC102554315), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235189 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 596-like (LOC102554315), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008047 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:152003144:152005643:-1 gene:ENSRNOG00000006112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000008101 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:152003144:152005643:-1 gene:ENSRNOG00000006112 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006224692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 596-like (LOC102554315), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// XM_006235192 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 596-like (LOC102554315), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// XM_006235191 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 596-like (LOC102554315), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
ENSRNOT00000013677 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:152626057:152626453:1 gene:ENSRNOG00000010304 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr3 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000042273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152612798:152677233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
XM_006227224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102549291), partial mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// XM_006257210 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 120-like (LOC102549291), mRNA. // chr3 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000042110 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:152244001:152244392:1 gene:ENSRNOG00000050230 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000073416 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:X:100466780:100467171:-1 gene:ENSRNOG00000046638 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
XM_002729212 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein S100-A11-like (LOC100362296), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_575255 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein S100-A11-like (RGD1565648), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000055508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152676511:152677185:1 gene:ENSRNOG00000036943 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr3 // 100 // 48 // 11 // 11 // 0
NM_001106523 // RefSeq // Rattus norvegicus cystatin F (leukocystatin) (Cst7), mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000008865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152726308:152735075:1 gene:ENSRNOG00000006767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000042288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152726440:152734040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT035966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_053498 // RefSeq // Rattus norvegicus ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 6 (Entpd6), mRNA. // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152905477:152927857:1 gene:ENSRNOG00000007427 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152909811:152926912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_013188 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphorylase, glycogen; brain (Pygb), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000010157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:152941739:152988415:1 gene:ENSRNOG00000007583 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC166475 // GenBank // Rattus norvegicus phosphorylase, glycogen; brain, mRNA (cDNA clone MGC:187917 IMAGE:9100353), complete cds. // chr3 // 95 // 95 // 38 // 40 // 1 /// GENSCAN00000010630 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:152941848:152987200:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT035974 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT035975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001109207 // RefSeq // Rattus norvegicus GINS complex subunit 1 (Psf1 homolog) (Gins1), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000010955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153056224:153077643:1 gene:ENSRNOG00000008091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// BC166989 // GenBank // Rattus norvegicus GINS complex subunit 1 (Psf1 homolog), mRNA (cDNA clone MGC:189121 IMAGE:9098732), complete cds. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT035978 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035977 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
ENSRNOT00000011365 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:153324144:153326763:1 gene:ENSRNOG00000008568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 87 // 92 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153324144:153326763:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_031981 // RefSeq // Rattus norvegicus NSFL1 (p97) cofactor (p47) (Nsfl1c), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153337781:153361981:1 gene:ENSRNOG00000008604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AB002086 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for p47, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC072464 // GenBank // Rattus norvegicus NSFL1 (p97) cofactor (p47), mRNA (cDNA clone MGC:91611 IMAGE:7096463), complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027675 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153337889:153361752:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT035981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT035982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1 /// NONRATT035983 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_013102 // RefSeq // Rattus norvegicus FK506 binding protein 1a (Fkbp1a), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000012608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153399455:153418856:1 gene:ENSRNOG00000008822 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC070519 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 1a, mRNA (cDNA clone MGC:91525 IMAGE:7103884), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC126071 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein 1a, mRNA (cDNA clone MGC:156543 IMAGE:8363608), complete cds. // chr3 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// D86641 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FK506-binding protein 12, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// FQ214119 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YM17 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// FQ228836 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA51YE14 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0 /// U09386 // GenBank // Rattus norvegicus immunophilin FKBP12 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// U69485 // GenBank // Rattus norvegicus FK506 binding protein FKBP12 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 53 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000027661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153389135:153416803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 58 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT035984 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_001025692 // RefSeq // Rattus norvegicus syndecan binding protein (syntenin) 2 (Sdcbp2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006235228 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syndecan binding protein (syntenin) 2 (Sdcbp2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235229 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syndecan binding protein (syntenin) 2 (Sdcbp2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006235230 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus syndecan binding protein (syntenin) 2 (Sdcbp2), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012690 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153429292:153455399:1 gene:ENSRNOG00000009528 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099095 // GenBank // Rattus norvegicus syndecan binding protein (syntenin) 2, mRNA (cDNA clone MGC:116231 IMAGE:7459023), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000027656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153423577:153452449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT035987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
XM_001060786 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 74B (Tmem74b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006224705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 74B (Tmem74b), transcript variant X3, mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006235259 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 74B (Tmem74b), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// XM_006235260 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 74B (Tmem74b), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000012765 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:153578609:153579307:1 gene:ENSRNOG00000009635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000027678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153578705:153579307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0
XM_002727458 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R-spondin 4 (Rspo4), partial mRNA. // chr3 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006235261 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus R-spondin 4 (Rspo4), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000012951 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:153710696:153741167:1 gene:ENSRNOG00000009662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000027669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153710696:153741167:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1
NM_001106526 // RefSeq // Rattus norvegicus angiopoietin 4 (Angpt4), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000006786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153772190:153805765:1 gene:ENSRNOG00000005008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033322 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153786156:153805091:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT035994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT035995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001037198 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3 (Slc52a3), mRNA. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3 (Slc52a3), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235240 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3 (Slc52a3), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3 (Slc52a3), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000006828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153861418:153866041:1 gene:ENSRNOG00000005132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC099097 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310046K01, mRNA (cDNA clone MGC:116234 IMAGE:7459579), complete cds. // chr3 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006235242 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3 (Slc52a3), transcript variant X6, mRNA. // chr3 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// GENSCAN00000033343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153861436:153865230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT035996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT035998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT036000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_001191905 // RefSeq // Rattus norvegicus scratch family zinc finger 2 (Scrt2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus scratch family zinc finger 2 (Scrt2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000006833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153934774:153946487:1 gene:ENSRNOG00000005148 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153909257:153946487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
AY325205 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-390 mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NM_001047858 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfiredoxin 1 (Srxn1), mRNA. // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000041456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153952796:153981628:1 gene:ENSRNOG00000031167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000033327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153957922:153967141:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT036004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001168579 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 15 (Tcf15), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:153992077:153998331:1 gene:ENSRNOG00000000012 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153992140:154137101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_053824 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 2, alpha 1 polypeptide (Csnk2a1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 76 // 76 // 0 /// ENSRNOT00000007558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154062024:154105941:1 gene:ENSRNOG00000005276 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 74 // 74 // 0 /// BC091130 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 2, alpha 1 polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:108626 IMAGE:7367296), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 76 // 76 // 0 /// L15618 // GenBank // Rat casein kinase II alpha subunit (CK2) mRNA, complete cds. // chr3 // 99 // 97 // 73 // 74 // 0 /// NONRATT036006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 76 // 76 // 0 /// NONRATT036009 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 76 // 76 // 0 /// GENSCAN00000033314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153992140:154137101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 62 // 62 // 47 // 76 // 1 /// NONRATT036007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 42 // 42 // 32 // 76 // 1 /// NONRATT036008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 34 // 34 // 26 // 76 // 1 /// NONRATT036011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 27 // 76 // 1 /// NONRATT036010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 13 // 13 // 10 // 76 // 1 /// NONRATT036012 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 12 // 12 // 9 // 76 // 1
NM_001004281 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 20 (Tbc1d20), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000008713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154120296:154137199:1 gene:ENSRNOG00000005766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079383 // GenBank // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 20, mRNA (cDNA clone MGC:94895 IMAGE:7111239), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000033314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:153992140:154137101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT036014 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT036016 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT036017 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001025060 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC502684 (LOC502684), mRNA. // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006235249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC502684 (LOC502684), transcript variant X4, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006235250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC502684 (LOC502684), transcript variant X5, mRNA. // chr3 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000055415 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:3:154241684:154259517:1 gene:ENSRNOG00000023721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000033309 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154232707:154259321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT036023 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT036025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001037517 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 20 (Defb20), mRNA. // chr3 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000031922 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154300300:154301592:1 gene:ENSRNOG00000023384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// AY621351 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 20 (Defb20) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154300300:154301592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT036027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000055412 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154337607:154339481:1 gene:ENSRNOG00000036900 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY621359 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 28 (Defb28) mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154337607:154346626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000055410 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:154346450:154346983:1 gene:ENSRNOG00000025097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 67 // 95 // 12 // 18 // 0 /// GENSCAN00000002172 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154337607:154346626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
ENSRNOT00000055409 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154449644:154449904:1 gene:ENSRNOG00000036898 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// AY621350 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 19 (Defb19) mRNA, partial cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154447944:154449856:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037512 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 21 (Defb21), mRNA. // chr3 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000031613 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154454147:154455520:1 gene:ENSRNOG00000023154 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AY600147 // GenBank // Rattus norvegicus DEFB21 (Defb21) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// AY621352 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 21 (Defb21) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000002171 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154454181:154455495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 69 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT036028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 69 // 69 // 29 // 42 // 1
NM_001037515 // RefSeq // Rattus norvegicus defensin beta 36 (Defb36), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000009930 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154488910:154496897:1 gene:ENSRNOG00000007558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// AY615297 // GenBank // Rattus norvegicus DEFB36 (Defb36) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// AY621363 // GenBank // Rattus norvegicus beta-defensin 36 (Defb36) mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154488916:154496795:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 94 // 63 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT036029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001025753 // RefSeq // Rattus norvegicus RAS (RAD and GEM)-like GTP-binding 1 (Rem1), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000010149 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154514770:154521666:1 gene:ENSRNOG00000007567 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// BC098946 // GenBank // Rattus norvegicus RAS (RAD and GEM)-like GTP-binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:114556 IMAGE:7460067), complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002173 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154514100:154521666:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT036030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001107789 // RefSeq // Rattus norvegicus histocompatibility minor 13 (Hm13), mRNA. // chr3 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000010251 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154555181:154594098:1 gene:ENSRNOG00000007738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 96 // 67 // 23 // 24 // 0 /// FQ218565 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA51YF03 mRNA sequence. // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// FQ231155 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA7YB19 mRNA sequence. // chr3 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154574153:154590176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 50 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT036032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT036033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// GENSCAN00000002179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154523433:154573371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// NONRATT036037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
XM_006224707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus malignant T cell amplified sequence 2 (Mcts2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006235283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus malignant T cell amplified sequence 2 (Mcts2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154523433:154573371:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT036032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT036033 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT036036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
NM_012797 // RefSeq // Rattus norvegicus inhibitor of DNA binding 1 (Id1), mRNA. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000029660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154620033:154621183:1 gene:ENSRNOG00000021750 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// BC127448 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of DNA binding 1, mRNA (cDNA clone MGC:156482 IMAGE:8372348), complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// D10862 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for ID1 protein, complete cds. // chr3 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// FQ225977 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA3YH21 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// L23148 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of DNA-binding, splice variant Id1.25, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// M86708 // GenBank // Rattus norvegicus inhibitor of DNA binding mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT036041 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT036042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154620123:154648372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_053472 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 (lung) (Cox4i2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235280 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 (lung) (Cox4i2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006235281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 (lung) (Cox4i2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000010418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154637663:154648535:1 gene:ENSRNOG00000007827 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF255347 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit IV isoform 2 precursor, mRNA, complete cds. // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002174 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154620123:154648372:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT036043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT036044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001107790 // RefSeq // Rattus norvegicus TPX2, microtubule-associated (Tpx2), mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006235270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TPX2, microtubule-associated (Tpx2), transcript variant X1, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006235271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TPX2, microtubule-associated (Tpx2), transcript variant X2, mRNA. // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000010851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154730957:154773179:1 gene:ENSRNOG00000008165 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ215534 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YN18 mRNA sequence. // chr3 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000002170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154749229:154779789:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT036046 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT036047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT036050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_057209 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin light chain kinase 2 (Mylk2), mRNA. // chr3 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011255 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:154789184:154800005:1 gene:ENSRNOG00000008235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// J03886 // GenBank // Rat skeletal muscle myosin light chain kinase, complete cds. // chr3 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052327 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:154781618:154799983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr3 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT036051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr3 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0