NM_001106138 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) assembly chaperone 2 (Psmg2), mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62579926:62594539:1 gene:ENSRNOG00000017729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ212569 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YJ14 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// FQ230678 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YH17 mRNA sequence. // chr18 // 90 // 71 // 18 // 20 // 0 /// NONRATT026145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62582448:62599238:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
XR_341995 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEH1-like (S. cerevisiae) (Seh1l), transcript variant X3, misc_RNA. // chr18 // 100 // 68 // 42 // 42 // 0 /// XR_361455 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SEH1-like (S. cerevisiae) (Seh1l), transcript variant X2, misc_RNA. // chr18 // 100 // 68 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000023145 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:62807103:62835427:1 gene:ENSRNOG00000017263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 23 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000023430 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:62705167:62795437:1 gene:ENSRNOG00000042879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 37 // 37 // 0 /// AY325252 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Da1-6 mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 61 // 37 // 38 // 0 /// XM_006222602 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoporin SEH1-like (LOC100911798), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 15 // 15 // 9 // 62 // 1 /// XM_006254891 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoporin SEH1-like (LOC100911798), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 15 // 15 // 9 // 62 // 1 /// GENSCAN00000052369 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62678163:62797828:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT026153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 27 // 27 // 17 // 62 // 1 /// GENSCAN00000007934 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62807022:62901899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 21 // 21 // 13 // 62 // 1 /// NONRATT026147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 16 // 16 // 10 // 62 // 1
NM_001100491 // RefSeq // Rattus norvegicus melanocortin 2 receptor (adrenocorticotropic hormone) (Mc2r), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:63381174:63391712:-1 gene:ENSRNOG00000016681 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF547168 // GenBank // Rattus norvegicus adrenocorticotropic hormone receptor MC-2 mRNA, partial cds. // chr18 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0
NM_001007688 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 210, member A (Fam210a), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:63227537:63298831:-1 gene:ENSRNOG00000016740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083687 // GenBank // Rattus norvegicus LEA_4 domain containing protein RGD1359600, mRNA (cDNA clone MGC:94550 IMAGE:7189262), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007945 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:63228058:63299397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000046907 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:64251311:64252282:1 gene:ENSRNOG00000033702 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:64234382:64252056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0
NM_053369 // RefSeq // Rattus norvegicus transcription factor 4 (Tcf4), mRNA. // chr18 // 94 // 85 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000020431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:64471371:64694030:1 gene:ENSRNOG00000012405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0 /// AF149284 // GenBank // Rattus norvegicus R8f DNA-binding protein mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 85 // 32 // 34 // 0 /// FQ221525 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA35YA19 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 63 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:64640037:64669445:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// NONRATT026169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1 /// GENSCAN00000008423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:64675554:64721339:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1 /// NONRATT026167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 23 // 23 // 9 // 40 // 1 /// NONRATT026170 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
NONRATT026164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1
NM_001077667 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 68 (Ccdc68), mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000039702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:67564700:67626011:1 gene:ENSRNOG00000021381 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC127517 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 68, mRNA (cDNA clone MGC:156733 IMAGE:7104038), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT026178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 64 // 64 // 23 // 36 // 1 /// GENSCAN00000006405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:67574397:67589173:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
NM_001007627 // RefSeq // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 6 (Stard6), mRNA. // chr18 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000002969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:68130750:68147692:1 gene:ENSRNOG00000026324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// AY555189 // GenBank // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer domain containing protein 6 mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 91 // 20 // 21 // 0 /// BC078976 // GenBank // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 6, mRNA (cDNA clone MGC:93858 IMAGE:7111945), complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 87 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 65 // 65 // 15 // 23 // 1
NM_001115025 // RefSeq // Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 2 (Mbd2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016112 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:64990486:65060940:1 gene:ENSRNOG00000011853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158877 // GenBank // Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 2, mRNA (cDNA clone MGC:188552 IMAGE:7934371), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000029544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:64990486:65062078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
GENSCAN00000029544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:64990486:65062078:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000021161 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:65912586:65913564:1 gene:ENSRNOG00000015806 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_001107377 // RefSeq // Rattus norvegicus mex-3 RNA binding family member C (Mex3c), mRNA. // chr18 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000041227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:68695439:68717238:1 gene:ENSRNOG00000015777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// GENSCAN00000050361 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68695489:68715467:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
GENSCAN00000028063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68927754:68960040:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_001057501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L38-like (LOC680512), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_003753068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L38-like (LOC680512), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000043108 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:68962401:68962616:1 gene:ENSRNOG00000033808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028066 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68962404:68962616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_006222614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro (Mro), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222615 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro (Mro), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222616 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro (Mro), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254938 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro (Mro), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030613 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:68984920:68993186:1 gene:ENSRNOG00000024426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071545 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:68984920:68993186:1 gene:ENSRNOG00000024426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075543 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:68984920:68993186:1 gene:ENSRNOG00000024426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222620 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro (Mro), transcript variant X8, mRNA. // chr18 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// XM_006222623 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro (Mro), transcript variant X11, mRNA. // chr18 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT026188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// GENSCAN00000028052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68991916:68993314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT026185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENSRNOT00000048310 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:69314561:69315801:1 gene:ENSRNOG00000031705 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 86 // 88 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000046522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:69314939:69315899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 8 // 8 // 0
NM_001079698 // RefSeq // Rattus norvegicus CXXC finger protein 1 (Cxxc1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000020472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:69335505:69340557:1 gene:ENSRNOG00000014614 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC087117 // GenBank // Rattus norvegicus CXXC finger 1 (PHD domain), mRNA (cDNA clone IMAGE:7193929). // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC128781 // GenBank // Rattus norvegicus CXXC finger 1 (PHD domain), mRNA (cDNA clone MGC:156837 IMAGE:7370019), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000046527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:69335558:69340290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026196 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT026195 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT026197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
XM_006222626 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557597 (LOC102557597), mRNA. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// XM_006254940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102553337 (LOC102553337), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006227816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102549642 (LOC102549642), mRNA. // chr18 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT004141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0
NM_001011924 // RefSeq // Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 1 (Mbd1), mRNA. // chr18 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032202 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:69390260:69404711:1 gene:ENSRNOG00000024104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// BC081932 // GenBank // Rattus norvegicus methyl-CpG binding domain protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:93958 IMAGE:7114194), complete cds. // chr18 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000046528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:69383894:69471842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
XM_001053914 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 11 (Ccdc11), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_344700 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 11 (Ccdc11), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:69405189:69471842:1 gene:ENSRNOG00000014585 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000046528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:69383894:69471842:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_017083 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin Vb (Myo5b), mRNA. // chr18 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000019512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:69568405:69866976:1 gene:ENSRNOG00000014104 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// U60416 // GenBank // Rattus norvegicus myr 6 myosin heavy chain mRNA, complete cds. // chr18 // 98 // 100 // 39 // 40 // 0 /// GENSCAN00000021734 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:69786999:69866606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000046517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:69666249:69780219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 13 // 40 // 1 /// NONRATT026210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 35 // 35 // 14 // 40 // 1
NM_130433 // RefSeq // Rattus norvegicus acetyl-CoA acyltransferase 2 (Acaa2), mRNA. // chr18 // 88 // 100 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:69873084:69901836:1 gene:ENSRNOG00000013766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000021731 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:69873245:70005051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT026213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 96 // 22 // 23 // 0
NONRATT026219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NONRATT026220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1
NONRATT026219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001173472 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC031181 (RGD1562987), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025198 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:70114130:70122605:1 gene:ENSRNOG00000018676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC162045 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC031181, mRNA (cDNA clone MGC:188006 IMAGE:7107313), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234675 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YB09 mRNA sequence. // chr18 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT026226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106133 // RefSeq // Rattus norvegicus dymeclin (Dym), mRNA. // chr18 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000024950 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:70132099:70449681:1 gene:ENSRNOG00000018425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000066336 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:70132075:70449686:1 gene:ENSRNOG00000018425 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// BC168151 // GenBank // Rattus norvegicus dymeclin, mRNA (cDNA clone MGC:187562 IMAGE:7459379), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:70109841:70281805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1 /// NONRATT026229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT026231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1 /// NONRATT026232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1 /// NONRATT026233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_030858 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 7 (Smad7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:70530559:70558925:1 gene:ENSRNOG00000018359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF042499 // GenBank // Rattus norvegicus Smad7 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AF159626 // GenBank // Rattus norvegicus Smad7 protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:70488502:70557333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT026236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT026235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001277450 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 2 (Smad2), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NM_019191 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 2 (Smad2), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006254945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMAD family member 2 (Smad2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMAD family member 2 (Smad2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000046847 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:71672969:71734982:1 gene:ENSRNOG00000018140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// AB010147 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Smad2, complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// AB017912 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Smad2 protein, complete cds. // chr18 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// AF056001 // GenBank // Rattus norvegicus Smad2 protein (Smad2) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// BC127497 // GenBank // Rattus norvegicus SMAD family member 2, mRNA (cDNA clone MGC:156656 IMAGE:8364718), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// FQ230791 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YA21 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000038228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:71694140:71732230:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT026239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_053337 // RefSeq // Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 2 (Pias2), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023886 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73147272:73203959:1 gene:ENSRNOG00000017493 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// AF044058 // GenBank // Rattus norvegicus androgen receptor interacting protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// BC078775 // GenBank // Rattus norvegicus protein inhibitor of activated STAT, 2, mRNA (cDNA clone MGC:93310 IMAGE:7111628), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000046119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73147363:73226174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_213628 // RefSeq // Rattus norvegicus ST8 alpha-N-acetyl-neuraminide alpha-2,8-sialyltransferase 5 (St8sia5), mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000035317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73242668:73302825:1 gene:ENSRNOG00000022691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000024138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73281365:73302825:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
NM_001106132 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoxygenase homology domains 1 (Loxhd1), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 67 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000023487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73377524:73492157:1 gene:ENSRNOG00000017410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 55 // 55 // 0 /// GENSCAN00000024141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73406054:73454968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 29 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000024148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73489222:73491770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000024149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73370731:73404580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 13 // 9 // 9 // 0
NM_001106132 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoxygenase homology domains 1 (Loxhd1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023487 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73377524:73492157:1 gene:ENSRNOG00000017410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000024148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73489222:73491770:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_023093 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1, cardiac muscle (Atp5a1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022892 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73830653:73838477:1 gene:ENSRNOG00000017032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061830 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F1 complex, alpha subunit 1, cardiac muscle, mRNA (cDNA clone MGC:72613 IMAGE:5599635), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ214146 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YJ10 mRNA sequence. // chr18 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// J05266 // GenBank // Rat mitochondrial H+-ATP synthase alpha subunit mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006723 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73830653:73855168:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001271281 // RefSeq // Rattus norvegicus proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 2 (Pstpip2), mRNA. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022833 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73912643:73961705:1 gene:ENSRNOG00000016987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000072053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73917172:73961705:1 gene:ENSRNOG00000016987 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73897769:74038802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT026283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1 /// NONRATT026282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
XM_006222637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog (C. elegans) (Epg5), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// XM_006254979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ectopic P-granules autophagy protein 5 homolog (C. elegans) (Epg5), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000022767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73973504:74068456:1 gene:ENSRNOG00000022159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000006711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:74044553:74068456:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 33 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000006771 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73897769:74038802:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 26 // 26 // 0
ENSRNOT00000030194 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:75536442:75540366:1 gene:ENSRNOG00000049581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000037767 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:75536442:75536894:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0
ENSRNOT00000021457 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:75827049:75827915:1 gene:ENSRNOG00000015965 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 82 // 100 // 14 // 17 // 0 /// GENSCAN00000010232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:75827309:75827915:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000031932 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:76121281:76121927:1 gene:ENSRNOG00000026428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:76121281:76121964:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:75940763:75941446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000010248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:76014604:76015287:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
GENSCAN00000010245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:76138092:76139664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:72244403:72268216:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100973 // RefSeq // Rattus norvegicus par-6 family cell polarity regulator gamma (Pard6g), mRNA. // chr18 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023801 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:72178893:72246274:-1 gene:ENSRNOG00000017675 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// EF210570 // GenBank // Rattus norvegicus partitioning defective 6 gamma mRNA, complete cds. // chr18 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// XM_003751813 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus partitioning defective 6 homolog gamma-like (LOC100909590), mRNA. // chr18 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000045515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:72178893:72239376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT026906 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT026907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000010240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:76215148:76234998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000010247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:76196959:76198830:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001013189 // RefSeq // Rattus norvegicus PQ loop repeat containing 1 (Pqlc1), mRNA. // chr18 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254952 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PQ loop repeat containing 1 (Pqlc1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:72002641:72038286:-1 gene:ENSRNOG00000017204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// BC079072 // GenBank // Rattus norvegicus PQ loop repeat containing 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7121966). // chr18 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// BC088186 // GenBank // Rattus norvegicus PQ loop repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:108854 IMAGE:7369419), complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045512 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:72003560:72038166:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT026891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT026890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT026892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 76 // 76 // 26 // 34 // 1
ENSRNOT00000053028 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:18:77887894:77888003:1 gene:ENSRNOG00000034905 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001025289 // RefSeq // Rattus norvegicus myelin basic protein (Mbp), transcript variant 6, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC084713 // GenBank // Rattus norvegicus myelin basic protein, mRNA (cDNA clone MGC:105460 IMAGE:7303731), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000023642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:78340901:78458039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// GENSCAN00000023649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:78465883:78491935:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT026304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT026305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT026306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT026307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT026308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT026309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT026310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
GENSCAN00000023651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:78645969:78646307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
NM_001191695 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 516 (Zfp516), mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006255007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 516 (Zfp516), transcript variant X8, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:78879100:78919207:1 gene:ENSRNOG00000016258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000038301 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:78879124:78922682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT026318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NONRATT026318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106129 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc binding alcohol dehydrogenase, domain containing 2 (Zadh2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021729 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:79987672:79997023:1 gene:ENSRNOG00000016239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ209386 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YB07 mRNA sequence. // chr18 // 67 // 48 // 8 // 12 // 0 /// NONRATT026321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:79987740:80031014:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_001061354 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 69, member C (Fam69c), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006222648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 69, member C (Fam69c), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_006255020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 69, member C (Fam69c), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// XM_574179 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 69, member C (Fam69c), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020858 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:80614800:80635777:1 gene:ENSRNOG00000015448 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034317 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80614800:80635777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000034293 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80669140:80672664:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_022245 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b5 type A (microsomal) (Cyb5a), mRNA. // chr18 // 88 // 96 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:80739205:80770883:1 gene:ENSRNOG00000015205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:80739205:80760034:1 gene:ENSRNOG00000015205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// AF007107 // GenBank // Rattus norvegicus soluble cytochrome b5 mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// AF007108 // GenBank // Rattus norvegicus membrane bound cytochrome b5 mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// BC086945 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b5 type A (microsomal), mRNA (cDNA clone MGC:108694 IMAGE:7322141), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// FQ210834 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA21YF09 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT026328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// GENSCAN00000038257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80750091:80825269:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT026329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001108436 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box protein 15 (Fbxo15), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000058199 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:80860288:80873947:1 gene:ENSRNOG00000038225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107371 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 1 (Neto1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 1 (Neto1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019384 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:82532693:82645708:1 gene:ENSRNOG00000014006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057191 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:82533106:82642886:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001012740 // RefSeq // Rattus norvegicus cerebellin 2 precursor (Cbln2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255024 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cerebellin 2 precursor (Cbln2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018682 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:82838798:82844063:1 gene:ENSRNOG00000013654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091341 // GenBank // Rattus norvegicus cerebellin 2 precursor, mRNA (cDNA clone MGC:109349 IMAGE:7315458), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:82839011:82842561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT026336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000003880 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:82954522:82955516:1 gene:ENSRNOG00000002909 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:82954522:82955516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000050147 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:139307750:139311589:-1 gene:ENSRNOG00000032629 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097440 // GenBank // Rattus norvegicus similar to melanoma antigen family A, 5, mRNA (cDNA clone MGC:114492 IMAGE:7455831), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047841 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:83222520:83223422:1 gene:ENSRNOG00000034073 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:139308003:139308905:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027281 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:83222520:83223422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT060204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001170436 // RefSeq // Rattus norvegicus rotatin (Rttn), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000058160 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:85154622:85286009:1 gene:ENSRNOG00000038200 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000064901 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:85110490:85151163:1 gene:ENSRNOG00000046098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 22 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000005529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:85242621:85296880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 18 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000045973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:85095964:85234305:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 22 // 22 // 11 // 49 // 1
NM_001107370 // RefSeq // Rattus norvegicus CD226 molecule (Cd226), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD226 molecule (Cd226), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:85337986:85431236:1 gene:ENSRNOG00000038197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:85344603:85430123:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_173320 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 2 receptor, 75 (Vom2r75), mRNA. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036914 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:11866:38002:-1 gene:ENSRNOG00000022955 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF016185 // GenBank // Rattus norvegicus putative pheromone receptor (Go-VN13C) mRNA, complete cds. // chr18 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT026348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006254384 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FUN14 domain containing 2 (Fundc2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NM_001135757 // RefSeq // Rattus norvegicus FUN14 domain containing 2 (Fundc2), mRNA. // chr18 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// XM_006254386 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FUN14 domain containing 2 (Fundc2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// ENSRNOT00000033618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:447545:453204:1 gene:ENSRNOG00000024066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// NONRATT025517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 79 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT025518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT025519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:445909:452434:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT025521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1 /// NONRATT025520 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 47 // 47 // 16 // 34 // 1 /// NONRATT025522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 41 // 41 // 14 // 34 // 1
NM_053461 // RefSeq // Rattus norvegicus centrin, EF-hand protein, 1 (Cetn1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021955 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:830098:830616:-1 gene:ENSRNOG00000016409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:830098:830616:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001008301 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 14 (tRNA-guanine transglycosylase) (Usp14), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006254396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 14 (tRNA-guanine transglycosylase) (Usp14), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254397 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 14 (tRNA-guanine transglycosylase) (Usp14), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:1221707:1259299:-1 gene:ENSRNOG00000014981 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085947 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 14, mRNA (cDNA clone MGC:95160 IMAGE:7130090), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ224668 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA58YN08 mRNA sequence. // chr18 // 92 // 38 // 11 // 12 // 0 /// NONRATT026360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1222227:1432347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 78 // 78 // 25 // 32 // 1 /// NONRATT026361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1
NM_031098 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho-associated coiled-coil containing protein kinase 1 (Rock1), mRNA. // chr18 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000051362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:1317208:1432455:-1 gene:ENSRNOG00000031092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000061777 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:1292383:1351929:-1 gene:ENSRNOG00000031092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 17 // 17 // 0 /// AY325220 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-154 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// U61266 // GenBank // Rattus norvegicus Rho-associated kinase beta mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1222227:1432347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT026364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
XM_001071711 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3-like (RGD1565904), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_226176 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3-like (RGD1565904), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000043882 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:1454600:1455055:-1 gene:ENSRNOG00000030649 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000023779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1454600:1455064:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001126299 // RefSeq // Rattus norvegicus establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 (Esco1), mRNA. // chr18 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000033312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:1823873:1862268:-1 gene:ENSRNOG00000014031 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC166441 // GenBank // Rattus norvegicus establishment of cohesion 1 homolog 1 (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187566 IMAGE:7461161), complete cds. // chr18 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// XM_006254415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus establishment of sister chromatid cohesion N-acetyltransferase 1 (Esco1), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 83 // 83 // 10 // 12 // 1 /// NONRATT026366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT026367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NONRATT026366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000036748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1821524:1861801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_006222503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATP synthase subunit g, mitochondrial-like (LOC680026), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000036748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1821524:1861801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1
NM_001106162 // RefSeq // Rattus norvegicus abhydrolase domain containing 3 (Abhd3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000041878 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:1925174:1979805:-1 gene:ENSRNOG00000029370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036722 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:1923857:1979759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026369 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NR_031879 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-133a (Mir133a), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-133a // miRBase Micro RNA Database // MI0000906 Rattus norvegicus miR-133a stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NR_032116 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-1 (Mir1), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// rno-mir-1 // miRBase Micro RNA Database // MI0003489 Rattus norvegicus miR-1 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000030793 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:2209054:2209505:-1 gene:ENSRNOG00000023445 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 92 // 68 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000011205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:2190037:2231892:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0
XM_001057715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 241 (Tmem241), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 241 (Tmem241), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029274 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:3456528:3565125:-1 gene:ENSRNOG00000023412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074766 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:3530988:3565125:-1 gene:ENSRNOG00000023412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 44 // 10 // 12 // 0 /// GENSCAN00000021326 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:3494333:3556554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT026376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_153624 // RefSeq // Rattus norvegicus Niemann-Pick disease, type C1 (Npc1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:3626015:3671642:-1 gene:ENSRNOG00000012016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021328 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:3629145:3671547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001190372 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 29 (Ankrd29), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067690 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:14:109244900:109274018:1 gene:ENSRNOG00000011856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000034467 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:109191133:109281192:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT018946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT018947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 89 // 89 // 24 // 27 // 1
NM_001107403 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 521 (Zfp521), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:5006330:5284770:-1 gene:ENSRNOG00000016874 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017214 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:5115793:5179517:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001100900 // RefSeq // Rattus norvegicus synovial sarcoma translocation, Chromosome 18 (Ss18), mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000032454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:5987818:6050274:-1 gene:ENSRNOG00000016800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC158635 // GenBank // Rattus norvegicus synovial sarcoma translocation, Chromosome 18, mRNA (cDNA clone IMAGE:7456751), complete cds. // chr18 // 100 // 50 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT026388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT026386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT026387 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// GENSCAN00000034656 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:5986953:5998407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1 /// NONRATT026389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_001100516 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 1 (Kctd1), mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000061504 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:6337410:6378501:-1 gene:ENSRNOG00000016467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT026390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000034654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:6337417:6346472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001142366 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 4 (Aqp4), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NM_001270558 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 4 (Aqp4), transcript variant 3, mRNA. // chr18 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NM_001270559 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 4 (Aqp4), transcript variant 4, mRNA. // chr18 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// NM_012825 // RefSeq // Rattus norvegicus aquaporin 4 (Aqp4), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048109 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:6720759:6737507:-1 gene:ENSRNOG00000016043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:6720759:6737507:-1 gene:ENSRNOG00000016043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// L27588 // GenBank // Rattus norvegicus mercurial-insensitive water channel mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 46 // 15 // 16 // 0 /// U14007 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin-4 water channel (AQP4) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 77 // 26 // 27 // 0 /// XM_006254430 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus aquaporin 4 (Aqp4), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1 /// AF144082 // GenBank // Rattus norvegicus aquaporin-4 water channel AQP4 (AQP4) mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 89 // 29 // 31 // 0 /// NONRATT026393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000056677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:6700107:6737564:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 77 // 77 // 27 // 35 // 1 /// NONRATT026394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 13 // 35 // 1
NM_001170470 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 9 (Chst9), mRNA. // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// XM_006254435 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylgalactosamine 4-0) sulfotransferase 9 (Chst9), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000021253 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:6791050:7035778:-1 gene:ENSRNOG00000015867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_031333 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 2 (Cdh2), mRNA. // chr18 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// XM_006254442 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 2 (Cdh2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:7997533:8212372:-1 gene:ENSRNOG00000015602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// AB017695 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for N-cadherin, complete cds. // chr18 // 89 // 100 // 32 // 36 // 0 /// AF097593 // GenBank // Rattus norvegicus testicular N-cadherin mRNA, complete cds. // chr18 // 78 // 89 // 25 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022898 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:7998827:8059622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001107402 // RefSeq // Rattus norvegicus desmocollin 3 (Dsc3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:11554588:11588850:-1 gene:ENSRNOG00000017159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:11553605:11578143:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001033688 // RefSeq // Rattus norvegicus desmocollin 2 (Dsc2), mRNA. // chr18 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000061417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:11625848:11700836:-1 gene:ENSRNOG00000039969 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// BC101864 // GenBank // Rattus norvegicus desmocollin 2, mRNA (cDNA clone MGC:124744 IMAGE:7939139), complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000016682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:11622027:11660489:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 32 // 11 // 34 // 1
XM_006254443 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus desmocollin 1 (Dsc1), mRNA. // chr18 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000016685 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:11677861:11706220:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0
NM_031740 // RefSeq // Rattus norvegicus UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,4-galactosyltransferase, polypeptide 6 (B4galt6), mRNA. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021764 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:15258330:15300179:1 gene:ENSRNOG00000015895 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF048687 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-Gal:glucosylceramide beta-1,4-galactosyltransferase mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000040662 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15294029:15296449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT025602 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0
NM_001106160 // RefSeq // Rattus norvegicus trafficking protein particle complex 8 (Trappc8), mRNA. // chr18 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021263 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:15077991:15154044:1 gene:ENSRNOG00000022202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15089961:15153213:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT025600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0
NONRATT025600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT025600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
XM_006254447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GRB2-associated and regulator of MAPK protein-like (RGD1562080), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108885 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 14 (Klhl14), mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020697 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:12314920:12428674:-1 gene:ENSRNOG00000015418 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:12273448:12339510:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
XM_006222512 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 178 (Ccdc178), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// XM_006222513 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 178 (Ccdc178), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006222514 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 178 (Ccdc178), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050933 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:12805691:12958896:-1 gene:ENSRNOG00000022156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000057961 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:12791289:12957190:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 29 // 29 // 10 // 35 // 1
NM_001107401 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar protein 4 (Nol4), mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254454 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar protein 4 (Nol4), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000041125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:13443296:13799530:-1 gene:ENSRNOG00000014775 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052274 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:13468203:13674194:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026414 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
NM_001107401 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar protein 4 (Nol4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000019446 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:13800603:13801131:-1 gene:ENSRNOG00000014506 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000052283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:13798012:13806801:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 77 // 77 // 17 // 22 // 1
XM_006222518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 30 (Zscan30), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222520 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 30 (Zscan30), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 30 (Zscan30), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254477 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger and SCAN domain containing 30 (Zscan30), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015790 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15633371:15639531:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_182955 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 191 (Zfp191), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022304 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:15680091:15687290:-1 gene:ENSRNOG00000016562 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY336973 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 191 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026438 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026439 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015772 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15683642:15736655:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT026440 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001017446 // RefSeq // Rattus norvegicus INO80 complex subunit C (Ino80c), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:15757173:15771806:-1 gene:ENSRNOG00000016532 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091281 // GenBank // Rattus norvegicus INO80 complex subunit C, mRNA (cDNA clone MGC:109171 IMAGE:7192011), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:15759006:15771704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT026441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT026444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XR_341830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ab2-143 (LOC498829), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_361263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Ab2-143 (LOC498829), misc_RNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325193 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-143 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031905 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 187 (Mir187), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053644 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:18:16149604:16149707:-1 gene:ENSRNOG00000035521 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-187 // miRBase Micro RNA Database // MI0000932 Rattus norvegicus miR-187 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000021624 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:16212386:16256735:-1 gene:ENSRNOG00000016036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_001056597 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A (Rprd1a), mRNA. // chr18 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// XM_214609 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A (Rprd1a), mRNA. // chr18 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT026448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:16212386:16301107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT026450 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1 /// NONRATT026451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 35 // 35 // 11 // 31 // 1
NM_001024745 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 6 (Slc39a6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 39 (zinc transporter), member 6 (Slc39a6), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:16282423:16302964:-1 gene:ENSRNOG00000028703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC097493 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 39 (metal ion transporter), member 6, mRNA (cDNA clone MGC:114567 IMAGE:7461645), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:16212386:16301107:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT026453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001014147 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin polyglutamylase complex subunit 2 (Tpgs2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000020148 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:17093464:17148510:-1 gene:ENSRNOG00000014957 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000047063 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:17094926:17106499:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT026455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
XM_003751756 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to KIAA1328 protein (RGD1562608), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NM_001134607 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to KIAA1328 protein (RGD1562608), mRNA. // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// XR_361268 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554593 (LOC102554593), ncRNA. // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000045150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:17157409:17429811:1 gene:ENSRNOG00000029466 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT025632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 96 // 24 // 25 // 1 /// GENSCAN00000047056 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:17147836:17182324:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT025625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001107400 // RefSeq // Rattus norvegicus CUGBP, Elav-like family member 4 (Celf4), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061151 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:17451658:17470521:-1 gene:ENSRNOG00000014503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// FQ211481 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA92YF19 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// GENSCAN00000041278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:17451658:17477827:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001109085 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC498316 (LOC498316), mRNA. // chr18 // 86 // 100 // 36 // 42 // 0 /// XM_006250489 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC498316 (LOC498316), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 86 // 100 // 36 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000061146 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:18898934:18899227:-1 gene:ENSRNOG00000039841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 81 // 26 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000073985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:13:114241382:114247156:1 gene:ENSRNOG00000048659 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 100 // 36 // 42 // 0 /// GENSCAN00000038670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:18898934:18899227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 81 // 26 // 34 // 0 /// GENSCAN00000047404 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:114243709:114295020:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 67 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT026463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 77 // 83 // 27 // 35 // 0
NM_001287621 // RefSeq // Rattus norvegicus lateral signaling target protein 2 homolog (LOC102547344), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000041707 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:19021891:19025030:-1 gene:ENSRNOG00000030156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000009817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:22097545:22121096:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0
NM_001013060 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras-like without CAAX 2 (Rit2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:23424107:23780916:-1 gene:ENSRNOG00000017568 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091382 // GenBank // Rattus norvegicus Ras-like without CAAX 2, mRNA (cDNA clone MGC:109463 IMAGE:7320994), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000051010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:23576447:23702921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_031693 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptotagmin IV (Syt4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:23893019:23902428:-1 gene:ENSRNOG00000017333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// DQ181551 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin 4 (Syt4) mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 57 // 15 // 16 // 0 /// FQ211592 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA86YM21 mRNA sequence. // chr18 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// L38247 // GenBank // Rattus norvegicus (clone PCR2) synaptotagmin IV mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// U14398 // GenBank // Rattus norvegicus synaptotagmin IV homolog mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051015 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:23877913:23902411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT026469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000051911 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:24030087:24030458:-1 gene:ENSRNOG00000030364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000013389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24030087:24030458:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT026470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001100515 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 46 (Slc25a46), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023032 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24086615:24114920:-1 gene:ENSRNOG00000017091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166810 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 25, member 46, mRNA (cDNA clone MGC:188621 IMAGE:8376140), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ234554 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YI10 mRNA sequence. // chr18 // 86 // 81 // 18 // 21 // 0 /// NONRATT026471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000013408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24088213:24122305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001108887 // RefSeq // Rattus norvegicus SFT2 domain containing 3 (Sft2d3), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021708 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24407121:24407774:-1 gene:ENSRNOG00000016216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// GENSCAN00000013397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24407121:24423964:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 85 // 80 // 17 // 20 // 0 /// NONRATT026474 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001071777 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 17 (Gpr17), mRNA. // chr18 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000036537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24448653:24449672:-1 gene:ENSRNOG00000025745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// DQ777767 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 17 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035866 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24448653:24450373:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0
NM_001191941 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin VIIb (Myo7b), mRNA. // chr18 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// ENSRNOT00000021405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24456652:24538352:-1 gene:ENSRNOG00000015035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// GENSCAN00000035869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24498126:24527721:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000035876 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24461176:24492899:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 65 // 30 // 30 // 0
NM_012803 // RefSeq // Rattus norvegicus protein C (Proc), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:24633207:24643549:-1 gene:ENSRNOG00000014376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC078879 // GenBank // Rattus norvegicus protein C, mRNA (cDNA clone MGC:93563 IMAGE:7122006), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ210323 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA30YE17 mRNA sequence. // chr18 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// FQ218652 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA50YK02 mRNA sequence. // chr18 // 89 // 97 // 25 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:24633309:24641334:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026483 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_001013233 // RefSeq // Rattus norvegicus glycophorin C (Gerbich blood group) (Gypc), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:25028316:25060325:-1 gene:ENSRNOG00000029939 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY234182 // GenBank // Rattus norvegicus glycophorin C mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC103641 // GenBank // Rattus norvegicus glycophorin C (Gerbich blood group), mRNA (cDNA clone MGC:124900 IMAGE:7189007), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ233315 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YF14 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 36 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT026487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000018326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:71278917:71346034:-1 gene:ENSRNOG00000013412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049654 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:9:71278917:71346034:-1 gene:ENSRNOG00000013412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211925 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA76YE07 mRNA sequence. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT057998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT057999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047935 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRG00125 (LOC498836), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000028924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:25085651:25086380:-1 gene:ENSRNOG00000025687 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026489 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:25086144:25114165:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001106159 // RefSeq // Rattus norvegicus StAR-related lipid transfer (START) domain containing 4 (Stard4), mRNA. // chr18 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000027755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:25698888:25712288:-1 gene:ENSRNOG00000020468 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1 /// GENSCAN00000003909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:25701216:25707985:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 52 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT026490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 62 // 62 // 18 // 29 // 1
NM_178096 // RefSeq // Rattus norvegicus neuronal regeneration related protein (Nrep), mRNA. // chr18 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:25900067:25926253:-1 gene:ENSRNOG00000020467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB072344 // GenBank // Rattus norvegicus NREP mRNA for neuronal regeneration related protein, complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// FQ214488 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YG20 mRNA sequence. // chr18 // 73 // 100 // 19 // 26 // 0 /// NONRATT026491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000003913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:25900234:25918381:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT026492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT026493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001107397 // RefSeq // Rattus norvegicus erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A (Epb41l4a), mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// XM_006254581 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus erythrocyte membrane protein band 4.1 like 4A (Epb41l4a), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000038247 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:26284360:26371053:-1 gene:ENSRNOG00000026050 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// BC168858 // GenBank // Rattus norvegicus erythrocyte protein band 4.1-like 4a, mRNA (cDNA clone MGC:189092 IMAGE:7097125), complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT026496 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000033064 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:26233749:26348472:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 18 // 45 // 1 /// NONRATT026497 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
NONRATT026498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001108888 // RefSeq // Rattus norvegicus receptor accessory protein 5 (Reep5), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:26842003:26873146:-1 gene:ENSRNOG00000020167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC167013 // GenBank // Rattus norvegicus receptor accessory protein 5, mRNA (cDNA clone MGC:189206 IMAGE:9032688), complete cds. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ213205 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YC06 mRNA sequence. // chr18 // 79 // 92 // 19 // 24 // 0 /// FQ214399 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YO13 mRNA sequence. // chr18 // 83 // 92 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000023383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:26844238:26873886:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026501 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
AY539904 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00153 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:26919303:26920230:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106158 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 13, member B (Fam13b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000027663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:26936705:27002904:-1 gene:ENSRNOG00000020384 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000043407 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:26937818:26998650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026502 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
XM_003751760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NME/NM23 family member 5 (Nme5), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_003753033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NME/NM23 family member 5 (Nme5), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027244 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:27071255:27087561:-1 gene:ENSRNOG00000020118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT026507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27065506:27137251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT026506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NONRATT026506 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT026507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT026508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006254556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain containing 8 (Brd8), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000034385 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:27089288:27108975:-1 gene:ENSRNOG00000024838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain containing 8 (Brd8), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// GENSCAN00000043392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27065506:27137251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0
NM_001008509 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain containing 8 (Brd8), mRNA. // chr18 // 98 // 96 // 44 // 45 // 0 /// XM_006254556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain containing 8 (Brd8), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// XM_006254558 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain containing 8 (Brd8), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 39 // 39 // 0 /// XM_006254562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bromodomain containing 8 (Brd8), transcript variant X7, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000048752 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27112312:27132659:-1 gene:ENSRNOG00000020340 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// AB180485 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for nuclear receptor coactivator p120, complete cds. // chr18 // 98 // 96 // 44 // 45 // 0 /// GENSCAN00000043392 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27065506:27137251:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 72 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT026511 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 26 // 26 // 12 // 47 // 1 /// NONRATT026515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 45 // 45 // 21 // 47 // 1 /// NONRATT026516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 20 // 47 // 1 /// NONRATT026512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 21 // 21 // 10 // 47 // 1
NM_001100659 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 23 (Cdc23), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000037888 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27146157:27165911:-1 gene:ENSRNOG00000024241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC098784 // GenBank // Rattus norvegicus CDC23 (cell division cycle 23, yeast, homolog), mRNA (cDNA clone IMAGE:7374967), partial cds. // chr18 // 100 // 40 // 12 // 12 // 0 /// XM_006254555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle 23 (Cdc23), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 93 // 93 // 28 // 30 // 1 /// GENSCAN00000043412 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27146514:27165668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT026524 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_053398 // RefSeq // Rattus norvegicus GDNF family receptor alpha 3 (Gfra3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27205218:27233490:-1 gene:ENSRNOG00000020309 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079378 // GenBank // Rattus norvegicus GDNF family receptor alpha 3, mRNA (cDNA clone MGC:94884 IMAGE:7110848), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043387 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27202419:27233434:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026525 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001107396 // RefSeq // Rattus norvegicus cell division cycle 25C (Cdc25c), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle 25C (Cdc25c), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 96 // 87 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27243054:27263496:-1 gene:ENSRNOG00000024008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043416 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27243271:27250812:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 32 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT026526 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT026528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
NM_001008344 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation termination factor 1 (Etf1), mRNA. // chr18 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000026398 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27409450:27436622:-1 gene:ENSRNOG00000019450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// BC085902 // GenBank // Rattus norvegicus eukaryotic translation termination factor 1, mRNA (cDNA clone MGC:94734 IMAGE:7193574), complete cds. // chr18 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0 /// FQ227237 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA14YD03 mRNA sequence. // chr18 // 68 // 68 // 13 // 19 // 1 /// NONRATT026530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 84 // 100 // 16 // 19 // 0
NM_001100658 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 9 (Hspa9), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_003749502 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus stress-70 protein, mitochondrial-like (LOC100912578), mRNA. // chr18 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000026696 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27441855:27459272:-1 gene:ENSRNOG00000019525 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27441855:27612187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT026534 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 92 // 92 // 23 // 25 // 1 /// NONRATT026533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001109469 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat transmembrane neuronal 2 (Lrrtm2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000075420 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27725459:27727003:-1 gene:ENSRNOG00000047085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27725459:27726970:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199376 // RefSeq // Rattus norvegicus SIL1 nucleotide exchange factor (Sil1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026895 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:27777578:28014973:-1 gene:ENSRNOG00000019826 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC062050 // GenBank // Rattus norvegicus SIL1 homolog, endoplasmic reticulum chaperone (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72590 IMAGE:5598825), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:27777727:27882487:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_017315 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 23 (ascorbic acid transporter), member 1 (Slc23a1), mRNA. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28127016:28139054:-1 gene:ENSRNOG00000019938 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF080452 // GenBank // Rattus norvegicus sodium-coupled ascorbic acid transporter SVCT1 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC078851 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 23 (nucleobase transporters), member 1, mRNA (cDNA clone MGC:93503 IMAGE:7127602), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000018048 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28131317:28141476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0
NM_001024240 // RefSeq // Rattus norvegicus marginal zone B and B1 cell-specific protein (Mzb1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28149658:28151751:-1 gene:ENSRNOG00000022009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093397 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2010001M09, mRNA (cDNA clone MGC:112758 IMAGE:7389084), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ234743 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YN04 mRNA sequence. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT026540 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28149965:28173448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_001069975 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich basic protein 1 (Prob1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_002725326 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus proline-rich basic protein 1 (Prob1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060696 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:28154937:28157990:-1 gene:ENSRNOG00000039596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28149965:28173448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025636 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 24 (Spata24), mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 24 (Spata24), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28159728:28167716:-1 gene:ENSRNOG00000019976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28165603:28167716:-1 gene:ENSRNOG00000019976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// DQ080016 // GenBank // Rattus norvegicus testis protein T6441 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28149965:28173448:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT026543 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1
NM_001013887 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 18 (Dnajc18), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254546 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 18 (Dnajc18), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000027194 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28179461:28206342:-1 gene:ENSRNOG00000019995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// BC079289 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 18, mRNA (cDNA clone MGC:94420 IMAGE:7134364), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// DQ158861 // GenBank // Rattus norvegicus DNAJC18 (Dnajc18) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28179548:28208390:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0
XM_006254618 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endothelial cell surface expressed chemotaxis and apoptosis regulator (Ecscr), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060689 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:28220121:28227831:-1 gene:ENSRNOG00000039593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072580 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:28220121:28228745:-1 gene:ENSRNOG00000039593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000018042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28219764:28228682:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001136151 // RefSeq // Rattus norvegicus neuregulin 2 (Nrg2), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28545126:28724922:-1 gene:ENSRNOG00000019093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025902 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28545126:28724922:-1 gene:ENSRNOG00000019093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000028713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28545126:28724922:-1 gene:ENSRNOG00000019093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000033501 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28554794:28724922:-1 gene:ENSRNOG00000019093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000049222 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28545126:28724922:-1 gene:ENSRNOG00000019093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000068321 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28566266:28724922:-1 gene:ENSRNOG00000019093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000008618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28545041:28618058:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT026555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001108427 // RefSeq // Rattus norvegicus prefoldin subunit 1 (Pfdn1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000025353 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:28940034:28997301:-1 gene:ENSRNOG00000018653 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ227006 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA15YK06 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 94 // 16 // 16 // 0 /// FQ234841 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YH13 mRNA sequence. // chr18 // 81 // 94 // 13 // 16 // 0 /// XM_006254598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prefoldin subunit 1 (Pfdn1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1 /// NONRATT026558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000032602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:28932277:29021528:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 76 // 76 // 13 // 17 // 1
NM_012945 // RefSeq // Rattus norvegicus heparin-binding EGF-like growth factor (Hbegf), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29036863:29046746:-1 gene:ENSRNOG00000018646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// L05489 // GenBank // Rattus norvegicus heparin-binding EGF-like growth factor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29037622:29046717:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT026559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
BC091105 // GenBank // Rattus norvegicus steroid receptor RNA activator 1, mRNA (cDNA clone MGC:108511 IMAGE:7381969), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NM_183329 // RefSeq // Rattus norvegicus steroid receptor RNA activator 1 (Sra1), mRNA. // chr18 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000024671 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29199079:29202306:-1 gene:ENSRNOG00000018089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// AY026354 // GenBank // Rattus norvegicus steroid receptor co-activator protein SRAP mRNA, complete cds. // chr18 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// AY542868 // GenBank // Rattus norvegicus steroid receptor RNA activator mRNA, complete cds. // chr18 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT026564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026565 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000032641 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29199287:29202286:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT026563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1 /// NONRATT026566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_053957 // RefSeq // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 3 (Apbb3), mRNA. // chr18 // 83 // 85 // 29 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000024313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29202946:29210069:-1 gene:ENSRNOG00000017849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000063841 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29202937:29210049:-1 gene:ENSRNOG00000017849 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// BC097935 // GenBank // Rattus norvegicus amyloid beta (A4) precursor protein-binding, family B, member 3, mRNA (cDNA clone IMAGE:7454462), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000032614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29203223:29209784:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026564 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT026568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT026570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1 /// NONRATT026569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
XR_341871 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein E230025N22 (RGD1565779), misc_RNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XR_361319 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein E230025N22 (RGD1565779), misc_RNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060583 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:29215748:29224664:-1 gene:ENSRNOG00000039522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000032629 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29215861:29225412:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_021744 // RefSeq // Rattus norvegicus CD14 molecule (Cd14), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29265353:29266946:-1 gene:ENSRNOG00000017819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF087943 // GenBank // Rattus norvegicus CD14 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC061733 // GenBank // Rattus norvegicus CD14 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:72467 IMAGE:5598794), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000032600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29265672:29266881:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT026573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026574 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001106153 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex, 2 (Ndufa2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000023811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29289478:29291567:-1 gene:ENSRNOG00000017571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// FQ211751 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA81YE10 mRNA sequence. // chr18 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// FQ224026 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA7YH07 mRNA sequence. // chr18 // 87 // 88 // 13 // 15 // 0 /// GENSCAN00000032607 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29289715:29291538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 71 // 10 // 12 // 0 /// NONRATT026575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001109379 // RefSeq // Rattus norvegicus DND microRNA-mediated repression inhibitor 1 (Dnd1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000022685 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29312395:29315019:-1 gene:ENSRNOG00000016894 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000032624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29312806:29332440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT026576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001025414 // RefSeq // Rattus norvegicus histidyl-tRNA synthetase (Hars), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000039291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:29315354:29332458:-1 gene:ENSRNOG00000028105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// BC097969 // GenBank // Rattus norvegicus histidyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:116099 IMAGE:7442005), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000032624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:29312806:29332440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT026577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT026578 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001106152 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier, ornithine transporter) member 2 (Slc25a2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30470724:30471521:-1 gene:ENSRNOG00000027359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032213 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30470724:30471683:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107394 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF7 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30475376:30477519:-1 gene:ENSRNOG00000020024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158715 // GenBank // Rattus norvegicus TAF7 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, 55kDa, mRNA (cDNA clone MGC:187853 IMAGE:9088638), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233384 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA62YB21 mRNA sequence. // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000032226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30475826:30496501:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107393 // RefSeq // Rattus norvegicus diaphanous-related formin 1 (Diaph1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060432 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:30665581:30734650:-1 gene:ENSRNOG00000019688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060433 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:30665581:30718464:-1 gene:ENSRNOG00000019688 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 46 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000032215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30724361:30762590:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000032222 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30665581:30723399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT026592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// NONRATT026593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_053448 // RefSeq // Rattus norvegicus histone deacetylase 3 (Hdac3), mRNA. // chr18 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000060417 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30764345:30782343:-1 gene:ENSRNOG00000019618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// AF321131 // GenBank // Rattus norvegicus histone deacetylase 3 (Hdac3) mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// BC061988 // GenBank // Rattus norvegicus histone deacetylase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72364 IMAGE:5599517), complete cds. // chr18 // 97 // 95 // 34 // 35 // 0 /// GENSCAN00000032218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30764856:30773453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026596 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1 /// NONRATT026599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 59 // 59 // 22 // 37 // 1 /// NONRATT026597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 41 // 41 // 15 // 37 // 1
NM_001107392 // RefSeq // Rattus norvegicus FCH and double SH3 domains 1 (Fchsd1), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_006254635 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FCH and double SH3 domains 1 (Fchsd1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000026381 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30784855:30797074:-1 gene:ENSRNOG00000039415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000072023 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:30784855:30797074:-1 gene:ENSRNOG00000039415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT026600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000032234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30789543:30895909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1 /// NONRATT026601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1
XM_006222551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Arap3), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006222556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3 (Arap3), transcript variant X7, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026342 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:30800660:30824085:-1 gene:ENSRNOG00000027025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000060347 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:30800942:30816519:-1 gene:ENSRNOG00000027025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 57 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000032234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30789543:30895909:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1 /// NONRATT026606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
XM_006254649 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin 1 (Pcdh1), partial mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:31017455:31023632:-1 gene:ENSRNOG00000019462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043938 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:30948585:31031696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_053944 // RefSeq // Rattus norvegicus protocadherin 12 (Pcdh12), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026065 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:31095554:31111129:-1 gene:ENSRNOG00000019265 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000043948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:31095864:31110796:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026615 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001106150 // RefSeq // Rattus norvegicus sprouty homolog 4 (Drosophila) (Spry4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254655 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sprouty homolog 4 (Drosophila) (Spry4), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018511 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:32272760:32287666:1 gene:ENSRNOG00000013851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039871 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:32283209:32284111:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025887 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012846 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 1 (acidic) (Fgf1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor 1 (acidic) (Fgf1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor 1 (acidic) (Fgf1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254652 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor 1 (acidic) (Fgf1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fibroblast growth factor 1 (acidic) (Fgf1), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000018577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:32013703:32034673:1 gene:ENSRNOG00000013867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:32018274:32049369:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0 /// NONRATT025884 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT025886 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT025885 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_012576 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 3, group C, member 1 (Nr3c1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000044287 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:31408742:31430004:-1 gene:ENSRNOG00000014096 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// AF455050 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/Ola glucocorticoid receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// AY066016 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/Crl glucocorticoid receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// M14053 // GenBank // Rat glucocorticoid receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 85 // 100 // 28 // 33 // 0 /// AB115420 // GenBank // Rattus norvegicus gr mRNA for glucocorticoid receptor, complete cds. // chr18 // 71 // 42 // 10 // 14 // 0 /// NONRATT026618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000055458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:31412671:31520993:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1
NM_001014150 // RefSeq // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 5 (Yipf5), mRNA. // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// XM_006254664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 5 (Yipf5), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:33075378:33088508:-1 gene:ENSRNOG00000014564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000040877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:33076635:33109160:-1 gene:ENSRNOG00000014564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// AY321347 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac2-256 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// BC083754 // GenBank // Rattus norvegicus Yip1 domain family, member 5, mRNA (cDNA clone IMAGE:7192681), complete cds. // chr18 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT026625 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// GENSCAN00000053343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:33057414:33106922:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT026626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
ENSRNOT00000041274 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:33725201:33726789:-1 gene:ENSRNOG00000002034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000008642 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:33725313:33818921:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_001271333 // RefSeq // Rattus norvegicus PRELI domain containing 2 (Prelid2), mRNA. // chr18 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025333 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:35886784:35953056:-1 gene:ENSRNOG00000018753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026630 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0
NM_001191078 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaredoxin, cysteine rich 2 (Grxcr2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060260 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:35976675:35989830:-1 gene:ENSRNOG00000039325 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:35962863:35989902:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026631 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
ENSRNOT00000032927 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:36032141:36032860:-1 gene:ENSRNOG00000021708 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 71 // 96 // 17 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:36032305:36033703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1
XM_002725334 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PLAC8-like 1 (Plac8l1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_002728543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PLAC8-like 1 (Plac8l1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025453 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:36160433:36180454:-1 gene:ENSRNOG00000018820 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
ENSRNOT00000060225 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:36164747:36165559:-1 gene:ENSRNOG00000039310 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 83 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000050123 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:36164639:36200931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001009637 // RefSeq // Rattus norvegicus leucyl-tRNA synthetase (Lars), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006254672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucyl-tRNA synthetase (Lars), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025284 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:36191060:36244275:-1 gene:ENSRNOG00000018304 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC087655 // GenBank // Rattus norvegicus leucyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:105585 IMAGE:7312531), complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// FQ212494 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YB14 mRNA sequence. // chr18 // 97 // 97 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050119 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:36201524:36242184:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT026633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_181633 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 151 (Gpr151), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:36555164:36556558:-1 gene:ENSRNOG00000027103 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000034521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:36555250:36556515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT026637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NONRATT026639 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 1
NM_012934 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydropyrimidinase-like 3 (Dpysl3), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydropyrimidinase-like 3 (Dpysl3), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:37372519:37474987:-1 gene:ENSRNOG00000018992 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF389425 // GenBank // Rattus norvegicus collapsin response mediator protein 4 (Crmp4) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AF398465 // GenBank // Rattus norvegicus TUC-4b mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U52104 // GenBank // Rattus norvegicus rCRMP-4 mRNA, partial cds. // chr18 // 95 // 67 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000054470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:37372519:37383620:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 47 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT026650 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:37386543:37406003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT026652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT026653 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001107391 // RefSeq // Rattus norvegicus janus kinase and microtubule interacting protein 2 (Jakmip2), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000025927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:37525249:37743590:-1 gene:ENSRNOG00000019159 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:37554643:37644282:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT026655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0
NM_012674 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 3 (Spink3), mRNA. // chrU // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000018110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:37878841:37898259:-1 gene:ENSRNOG00000013464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 71 // 12 // 12 // 0 /// M22162 // GenBank // Rat monitor peptide mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 59 // 10 // 10 // 0 /// M27882 // GenBank // Rat pancreatic secretory trypsin inhibitor type I (PSTI-I) mRNA, complete cds. // chrU // 83 // 71 // 10 // 12 // 0 /// M35299 // GenBank // Rat pancreatic secretory trypsin inhibitor-like protein (PSTI) mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 88 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT026658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 12 // 17 // 1
NM_152936 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 1 (Spink1), mRNA. // chr18 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000017969 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:37834363:37842749:-1 gene:ENSRNOG00000013410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000075695 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:34733432:34737171:-1 gene:ENSRNOG00000045991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 78 // 13 // 14 // 0 /// FQ210620 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA25YJ03 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 94 // 17 // 17 // 0 /// FQ218107 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA9YF14 mRNA sequence. // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// M27883 // GenBank // Rat pancreatic secretory trypsin inhibitor type II (PSTI-II) mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 100 // 17 // 18 // 0 /// XM_003751771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine protease inhibitor Kazal-type 3-like (LOC100911558), mRNA. // chr18 // 72 // 72 // 13 // 18 // 1 /// NONRATT026657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000008904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:37799912:37842672:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1 /// GENSCAN00000011288 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:34718589:34737171:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NM_001106149 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to AVLV472 (RGD1563060), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000060125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:37964748:37986639:-1 gene:ENSRNOG00000039260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:37964956:37986554:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT026659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:37987516:38188189:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT026660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
XR_006033 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus la-related protein 4-like (RGD1305704), misc_RNA. // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006226263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus la-related protein 4-like (LOC683071), transcript variant X3, mRNA. // chr1 // 67 // 71 // 8 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000074256 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:236363026:236363653:-1 gene:ENSRNOG00000050414 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:236361547:236393741:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0
NM_001195484 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to vitellogenin-like 1 precursor (RGD1559536), mRNA. // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:43256003:43259375:1 gene:ENSRNOG00000039250 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT058785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrX // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001170534 // RefSeq // Rattus norvegicus mutated in colorectal cancers (Mcc), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XR_361331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus colorectal mutant cancer protein-like (LOC100912151), misc_RNA. // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:35348808:35448391:-1 gene:ENSRNOG00000011271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001170534 // RefSeq // Rattus norvegicus mutated in colorectal cancers (Mcc), mRNA. // chrU // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:35348808:35448391:-1 gene:ENSRNOG00000011271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 81 // 30 // 30 // 0 /// XR_361331 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus colorectal mutant cancer protein-like (LOC100912151), misc_RNA. // chrU // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// ENSRNOT00000071678 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:35555291:35661647:-1 gene:ENSRNOG00000046709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// ENSRNOT00000072941 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:35555291:35661629:-1 gene:ENSRNOG00000046709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// ENSRNOT00000073335 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:35555291:35661647:-1 gene:ENSRNOG00000046709 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// GENSCAN00000023398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:77620875:77658845:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000023017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:35395094:35463696:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// GENSCAN00000023030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:35543948:35661619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 43 // 43 // 16 // 37 // 1 /// GENSCAN00000014670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:35337576:35375471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 24 // 24 // 9 // 37 // 1
ENSRNOT00000042653 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:39608222:39608521:-1 gene:ENSRNOG00000030301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000028339 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:39608192:39608437:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
ENSRNOT00000022325 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:39727916:39728503:-1 gene:ENSRNOG00000016644 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 79 // 93 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:39727916:39739890:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001106147 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 36 (Trim36), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254685 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 36 (Trim36), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022294 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:39737213:39789086:-1 gene:ENSRNOG00000016612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000028342 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:39749512:39759868:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT026663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_031082 // RefSeq // Rattus norvegicus protein geranylgeranyltransferase type I, beta subunit (Pggt1b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein geranylgeranyltransferase type I, beta subunit (Pggt1b), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000004723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:39829209:39871483:-1 gene:ENSRNOG00000003541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// L24116 // GenBank // Rat geranylgeranyltransferase type I (GGTase-I) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:39801139:39871476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026664 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT026666 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT026667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_001109124 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 112 (Ccdc112), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004742 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:39874113:39908103:-1 gene:ENSRNOG00000003559 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000039759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:39877907:39908019:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT026668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026669 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001108241 // RefSeq // Rattus norvegicus motile sperm domain containing 4 (Mospd4), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004747 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40106381:40106956:-1 gene:ENSRNOG00000003575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000039754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40106381:40106956:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106932 // RefSeq // Rattus norvegicus fem-1 homolog c (C. elegans) (Fem1c), mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40148636:40173809:-1 gene:ENSRNOG00000003578 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000039780 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40152396:40172522:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT026671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0
NM_001105758 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 7 (Tmed7), mRNA. // chr18 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000004942 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40233821:40240942:-1 gene:ENSRNOG00000003691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000039774 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40226762:40240703:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT026673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_052809 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine dioxygenase type 1 (Cdo1), mRNA. // chr18 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000172 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40348061:40362704:-1 gene:ENSRNOG00000000158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC070509 // GenBank // Rattus norvegicus cysteine dioxygenase, type I, mRNA (cDNA clone MGC:91599 IMAGE:7100321), complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// FQ219057 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YA20 mRNA sequence. // chr18 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// M35266 // GenBank // Rat cysteine dioxygenase mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT026674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039782 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40355325:40373232:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT026675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
GENSCAN00000039762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:40348726:40353227:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT026674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001038495 // RefSeq // Rattus norvegicus autophagy related 12 (Atg12), mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40367827:40378153:-1 gene:ENSRNOG00000000157 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// BC110056 // GenBank // Rattus norvegicus ATG12 autophagy related 12 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:125080 IMAGE:7443799), complete cds. // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000034749 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:40861363:40862652:-1 gene:ENSRNOG00000025556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0
XM_003751782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A (Sema6a), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_003751782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A (Sema6a), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000005446 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:41002740:41030839:-1 gene:ENSRNOG00000004033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000005476 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40975360:41030839:-1 gene:ENSRNOG00000004033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000040924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40975360:41030839:-1 gene:ENSRNOG00000004033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000049178 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:40975360:41030839:-1 gene:ENSRNOG00000004033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT026680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000011879 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:41001461:41044538:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// NONRATT026679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 31 // 31 // 13 // 42 // 1
XM_006254705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like (RGD1561114), mRNA. // chr18 // 96 // 96 // 23 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000041732 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:41535997:41538044:-1 gene:ENSRNOG00000030956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 79 // 79 // 19 // 24 // 1 /// ENSRNOT00000057099 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:41536421:41538044:-1 gene:ENSRNOG00000030956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 92 // 22 // 24 // 1 /// GENSCAN00000015809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:41536421:41557688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 61 // 96 // 14 // 23 // 0
XR_341894 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC291595 (RGD1561627), ncRNA. // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000015809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:41536421:41557688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001108431 // RefSeq // Rattus norvegicus DTW domain containing 2 (Dtwd2), mRNA. // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006251008 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DTW domain containing 2 (Dtwd2), transcript variant X1, mRNA. // chr14 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032060 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:14:46072253:46156847:-1 gene:ENSRNOG00000024695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006251009 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DTW domain containing 2 (Dtwd2), transcript variant X2, mRNA. // chr14 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000007228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:46073103:46087305:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 100 // 34 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000007232 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:46112063:46156790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr14 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT019475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT019476 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr14 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001106146 // RefSeq // Rattus norvegicus haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 1 (Hdhd1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus haloacid dehalogenase-like hydrolase domain containing 1 (Hdhd1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:44600358:44601062:-1 gene:ENSRNOG00000025422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007797 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:44600358:44601062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017061 // RefSeq // Rattus norvegicus lysyl oxidase (Lox), mRNA. // chr18 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:46716563:46791367:-1 gene:ENSRNOG00000014426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:46715872:46726391:-1 gene:ENSRNOG00000014426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// BC078861 // GenBank // Rattus norvegicus lysyl oxidase, mRNA (cDNA clone MGC:93522 IMAGE:7113042), complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// U11038 // GenBank // Rattus norvegicus lysyl oxidase mRNA, complete cds and multiple polyadenylation sites. // chr18 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// J02903 // GenBank // Rat aorta lysyl oxidase mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000025983 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:46691498:46735577:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 57 // 57 // 20 // 35 // 1
ENSRNOT00000024556 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:47253258:47253877:-1 gene:ENSRNOG00000018248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:47232397:47253877:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0
GENSCAN00000035610 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:47343987:47345138:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT026692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0
NM_001004215 // RefSeq // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase C (Ppic), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:47585436:47598040:-1 gene:ENSRNOG00000017416 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC078949 // GenBank // Rattus norvegicus peptidylprolyl isomerase C, mRNA (cDNA clone MGC:93799 IMAGE:7109986), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026693 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:47571023:47597959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT026694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1 /// NONRATT026695 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
NM_001191697 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 120 (Cep120), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000023236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:47868772:47930749:-1 gene:ENSRNOG00000017035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000032770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:47882705:47930933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 85 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT026698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 56 // 56 // 23 // 41 // 1
NM_001107378 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 608 (Zfp608), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033254 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:49033842:49138505:-1 gene:ENSRNOG00000023197 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:49024220:49072362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0
NM_001271105 // RefSeq // Rattus norvegicus aldehyde dehydrogenase 7 family, member A1 (Aldh7a1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:50814400:50846386:-1 gene:ENSRNOG00000014645 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000055215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:50808403:50838727:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 78 // 78 // 28 // 36 // 1 /// NONRATT026708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_001007759 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 3, E3 ubiquitin protein ligase (March3), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000039177 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:51040248:51192562:-1 gene:ENSRNOG00000023013 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AB048840 // GenBank // Rattus norvegicus MARCH3 mRNA for membrane-associated ring finger (C3HC4) 3, complete cds. // chr18 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// BC083738 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 3, mRNA (cDNA clone MGC:94648 IMAGE:7191669), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000005413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:51042802:51083882:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NONRATT026709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038678 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:51182425:51183114:-1 gene:ENSRNOG00000023009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:51139686:51183114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001131003 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaredoxin-like protein (LOC100174910), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254736 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutaredoxin-like protein (LOC100174910), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254738 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutaredoxin-like protein (LOC100174910), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018368 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:51225484:51241458:-1 gene:ENSRNOG00000013738 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098717 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7326091. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC166916 // GenBank // Rattus norvegicus glutaredoxin-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:188903 IMAGE:6918206), complete cds. // chr18 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// BC168769 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:188899 IMAGE:6891274, complete cds. // chr18 // 90 // 75 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT026711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026713 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NONRATT026005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009735 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:227645611:227646093:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 32 // 100 // 8 // 25 // 0 /// FQ232462 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YK12 mRNA sequence. // chr18 // 32 // 100 // 8 // 25 // 0 /// NONRATT032079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 100 // 8 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:52840885:52987569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// GENSCAN00000019965 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:53155131:53333255:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_173126 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 3 (Smim3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small integral membrane protein 3 (Smim3), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026426 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:54978252:55005211:-1 gene:ENSRNOG00000019536 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF313411 // GenBank // Rattus norvegicus putative small membrane protein NID67 mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// BC070515 // GenBank // Rattus norvegicus putative small membrane protein NID67, mRNA (cDNA clone MGC:91428 IMAGE:7100997), complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_024361 // RefSeq // Rattus norvegicus N-deacetylase/N-sulfotransferase (heparan glucosaminyl) 1 (Ndst1), mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000025881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55189496:55226907:-1 gene:ENSRNOG00000019014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// M92042 // GenBank // Rat N-heparan sulfate sulfotransferase mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000030789 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55159091:55211942:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001106143 // RefSeq // Rattus norvegicus Treacher Collins-Franceschetti syndrome 1 (Tcof1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000045041 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55316277:55350440:-1 gene:ENSRNOG00000026108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026488 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55329891:55350314:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0
NM_053996 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 7 (Slc6a7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254815 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 7 (Slc6a7), mRNA. // chr18 // 100 // 29 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000025209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55539473:55557598:-1 gene:ENSRNOG00000018644 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// M88111 // GenBank // Rattus norvegicus high affinity L-proline transporter mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000026500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55540196:55564410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026735 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006254816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus caudal type homeo box 1 (Cdx1), partial mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025141 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:55570839:55587775:-1 gene:ENSRNOG00000018624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55567494:55592973:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
XR_086085 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HMG box domain containing 3 (Hmgxb3), misc_RNA. // chr18 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000024704 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:55689442:55731997:-1 gene:ENSRNOG00000018132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 95 // 36 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000064347 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:55689442:55731997:-1 gene:ENSRNOG00000018132 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 93 // 35 // 37 // 0 /// BC085946 // GenBank // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC361335, mRNA (cDNA clone IMAGE:7128457), partial cds. // chr18 // 93 // 75 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55690323:55736619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT026739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 30 // 30 // 12 // 40 // 1
NM_057127 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 26 (anion exchanger), member 2 (Slc26a2), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55751800:55765475:-1 gene:ENSRNOG00000018082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// D82883 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for sulfate transporter, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026478 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55751950:55755947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT026744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_176075 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisome proliferator-activated receptor gamma, coactivator 1 beta (Ppargc1b), mRNA. // chr18 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000023661 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55857450:55959449:-1 gene:ENSRNOG00000017503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000066048 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:55857450:55880823:-1 gene:ENSRNOG00000017503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// AY188951 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1beta-2a mRNA, complete cds. // chr18 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:55857625:55882283:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT026747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NR_032139 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-378 (Mir378), microRNA. // chr18 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT026749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT026750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 83 // 100 // 19 // 23 // 0 /// rno-mir-378a // miRBase Micro RNA Database // MI0003719 Rattus norvegicus miR-378 stem-loop // chr18 // 100 // 96 // 22 // 22 // 0
NM_001100974 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 37 (Arhgef37), mRNA. // chr18 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000032189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56048375:56099677:-1 gene:ENSRNOG00000025502 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC168236 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7935073. // chr18 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254808 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 37 (Arhgef37), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// XM_006254810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho guanine nucleotide exchange factor (GEF) 37 (Arhgef37), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 81 // 81 // 26 // 32 // 1 /// GENSCAN00000016441 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56059730:56084285:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NR_031891 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 145 (Mir145), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053597 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:18:56198820:56198907:-1 gene:ENSRNOG00000035474 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-145 // miRBase Micro RNA Database // MI0000918 Rattus norvegicus miR-145 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031889 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 143 (Mir143), microRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053726 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:18:56200186:56200290:-1 gene:ENSRNOG00000035603 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56199165:56212000:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-143 // miRBase Micro RNA Database // MI0000916 Rattus norvegicus miR-143 stem-loop // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134542 // RefSeq // Rattus norvegicus prenylcysteine oxidase 1 like (Pcyox1l), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254806 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus prenylcysteine oxidase 1 like (Pcyox1l), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000026583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56249996:56259794:-1 gene:ENSRNOG00000019643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168676 // GenBank // Rattus norvegicus prenylcysteine oxidase 1 like, mRNA (cDNA clone MGC:188479 IMAGE:5598155), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000016457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56250405:56259764:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026759 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
FQ211638 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA85YB06 mRNA sequence. // chr18 // 80 // 54 // 12 // 15 // 0 /// NM_001106142 // RefSeq // Rattus norvegicus actin filament associated protein 1-like 1 (Afap1l1), mRNA. // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000026495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56282282:56342880:-1 gene:ENSRNOG00000019403 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// FQ231300 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA71YC04 mRNA sequence. // chr18 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1 /// GENSCAN00000016458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56283316:56320203:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT026766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1
NM_001191698 // RefSeq // Rattus norvegicus actin binding LIM protein family, member 3 (Ablim3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006254795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin binding LIM protein family, member 3 (Ablim3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// XM_006254796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin binding LIM protein family, member 3 (Ablim3), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000026227 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:56356317:56442746:-1 gene:ENSRNOG00000019365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// FQ217083 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA35YP12 mRNA sequence. // chr18 // 68 // 68 // 28 // 41 // 1 /// GENSCAN00000038947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56356734:56381280:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 39 // 39 // 16 // 41 // 1
XM_002729002 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus IQ motif containing GTPase activating protein 2 (Iqgap2), mRNA. // chr18 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:45296359:45569036:-1 gene:ENSRNOG00000025406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033372 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:56670731:56671243:-1 gene:ENSRNOG00000024970 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:56670731:56712279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:45296359:45363636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0
NM_012492 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenoceptor beta 2, surface (Adrb2), mRNA. // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY057895 // GenBank // Rattus norvegicus strain SHR/Ola beta-2 adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY057896 // GenBank // Rattus norvegicus strain BN/Crl beta-2 adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC086538 // GenBank // Rattus norvegicus adrenergic, beta-2-, receptor, surface, mRNA (cDNA clone MGC:105506 IMAGE:7114502), complete cds. // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// J03024 // GenBank // Rat beta-adrenergic receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 80 // 67 // 16 // 20 // 0 /// NONRATT026769 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0
XM_006222582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 38 (Fbxo38), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// XM_006254819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box protein 38 (Fbxo38), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000025790 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:57054085:57092175:-1 gene:ENSRNOG00000019063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000030986 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:57054085:57092175:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT026771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT026774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 38 // 38 // 16 // 42 // 1
NM_001002816 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 7 (Spink7), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000040936 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:57142773:57146245:-1 gene:ENSRNOG00000032873 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000030987 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:57142637:57146245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
NM_001109539 // RefSeq // Rattus norvegicus serine peptidase inhibitor, Kazal type 13 (putative) (Spink13), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000059276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:57161386:57306089:-1 gene:ENSRNOG00000038793 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026775 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026776 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
GENSCAN00000030979 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:57309255:57322293:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
XM_006222590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (Piezo2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006254834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (Piezo2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000065693 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:57577565:57948727:-1 gene:ENSRNOG00000038784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000037175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:57577565:57764929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
XM_006222590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (Piezo2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006254834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (Piezo2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025556 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:57634450:57646113:-1 gene:ENSRNOG00000038784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000065693 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:57577565:57948727:-1 gene:ENSRNOG00000038784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000037175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:57577565:57764929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006222590 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (Piezo2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// XM_006254834 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus piezo-type mechanosensitive ion channel component 2 (Piezo2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000000129 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:57671783:57948727:-1 gene:ENSRNOG00000038784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000065693 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:57577565:57948727:-1 gene:ENSRNOG00000038784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000037175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:57577565:57764929:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0
NM_080887 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin-like 1 (Txnl1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254827 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin-like 1 (Txnl1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006254828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin-like 1 (Txnl1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000025510 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:58276629:58304098:-1 gene:ENSRNOG00000018818 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF140358 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin-related protein mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC098908 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:114276 IMAGE:7386445), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026005 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:58279393:58317650:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT026779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000059208 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:58763595:58764440:-1 gene:ENSRNOG00000038756 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000054049 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:18:58822084:58822205:-1 gene:ENSRNOG00000035926 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108434 // RefSeq // Rattus norvegicus ferrochelatase (Fech), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024328 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:59152151:59185351:-1 gene:ENSRNOG00000018053 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026784 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000035504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:59153749:59171675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001025635 // RefSeq // Rattus norvegicus asparaginyl-tRNA synthetase (Nars), transcript variant 1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NM_001142949 // RefSeq // Rattus norvegicus asparaginyl-tRNA synthetase (Nars), transcript variant 2, mRNA. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024264 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:59196512:59212728:-1 gene:ENSRNOG00000017852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000059162 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:59196512:59212728:-1 gene:ENSRNOG00000017852 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// BC099099 // GenBank // Rattus norvegicus asparaginyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:116236 IMAGE:7459693), complete cds. // chr18 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000035506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:59197386:59212634:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026785 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT026786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT026787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1
NM_001106140 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, aminophospholipid transporter, class I, type 8B, member 1 (Atp8b1), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254843 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, aminophospholipid transporter, class I, type 8B, member 1 (Atp8b1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038652 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:59225406:59305493:-1 gene:ENSRNOG00000024952 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:59225793:59305493:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
XM_006222598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-kinase 2 (Alpk2), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006254887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-kinase 2 (Alpk2), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000042352 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:60159165:60253705:-1 gene:ENSRNOG00000017421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60145759:60184228:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006222598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-kinase 2 (Alpk2), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006254887 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alpha-kinase 2 (Alpk2), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000042352 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:60159165:60253705:-1 gene:ENSRNOG00000017421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044969 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60212113:60238839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
XM_006222600 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S acidic ribosomal protein P1-like (RGD1560815), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S acidic ribosomal protein P1-like (RGD1560815), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:60428091:60428372:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000037503 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:61481423:61482507:-1 gene:ENSRNOG00000024249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0
NM_013099 // RefSeq // Rattus norvegicus melanocortin 4 receptor (Mc4r), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:61799647:61800645:-1 gene:ENSRNOG00000018692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// U67863 // GenBank // Rattus norvegicus melanocortin-4 receptor mRNA, complete cds. // chr18 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT026815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006254853 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like (LOC291543), partial mRNA. // chr18 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// ENSRNOT00000039569 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:60034081:60035228:-1 gene:ENSRNOG00000023960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000044967 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:59974214:60035065:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// GENSCAN00000054729 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:61818321:61835488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
NM_001108435 // RefSeq // Rattus norvegicus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254879 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254881 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025164 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62133743:62151276:-1 gene:ENSRNOG00000018648 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC162043 // GenBank // Rattus norvegicus metallophosphoesterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:187998 IMAGE:7105580), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254883 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metallophosphoesterase 1 (Mppe1), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// GENSCAN00000054733 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62132044:62146397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT026816 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
BC091419 // GenBank // Rattus norvegicus AFG3(ATPase family gene 3)-like 2 (yeast), mRNA (cDNA clone IMAGE:7365290), complete cds. // chr18 // 100 // 28 // 10 // 10 // 0 /// NM_001134864 // RefSeq // Rattus norvegicus AFG3-like AAA ATPase 2 (Afg3l2), mRNA. // chr18 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000024632 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62325697:62369789:-1 gene:ENSRNOG00000017965 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 94 // 94 // 34 // 36 // 1 /// NONRATT026818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000052360 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62326187:62369614:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
NM_001107381 // RefSeq // Rattus norvegicus spire-type actin nucleation factor 1 (Spire1), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// XM_006254860 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spire-type actin nucleation factor 1 (Spire1), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000066103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62411829:62542260:-1 gene:ENSRNOG00000025324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000052356 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62400998:62542172:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 84 // 84 // 32 // 38 // 1 /// NONRATT026824 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// NONRATT026823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NONRATT026823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001100514 // RefSeq // Rattus norvegicus centrosomal protein 76 (Cep76), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006254857 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 76 (Cep76), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006254858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centrosomal protein 76 (Cep76), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000029431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62550817:62579728:-1 gene:ENSRNOG00000021918 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000052349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62551400:62579567:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT026829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 71 // 71 // 24 // 34 // 1 /// NONRATT026830 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 65 // 65 // 22 // 34 // 1
NM_053990 // RefSeq // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2 (Ptpn2), mRNA. // chr18 // 90 // 81 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023763 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62607293:62671878:-1 gene:ENSRNOG00000017453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000063770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:62607489:62671878:-1 gene:ENSRNOG00000017453 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// BC078758 // GenBank // Rattus norvegicus protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 2, mRNA (cDNA clone MGC:93263 IMAGE:7132485), complete cds. // chr18 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT026834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000052364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62607489:62671815:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 83 // 83 // 30 // 36 // 1
GENSCAN00000052348 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:62801458:62804825:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 59 // 59 // 13 // 22 // 1
NM_013182 // RefSeq // Rattus norvegicus melanocortin 5 receptor (Mc5r), mRNA. // chr18 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:63329399:63330432:1 gene:ENSRNOG00000016685 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0 /// FQ224332 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA6YD02 mRNA sequence. // chr18 // 97 // 90 // 37 // 38 // 0 /// L27081 // GenBank // Rat melanocortin 5 receptor (MC5R) mRNA, complete cds. // chr18 // 86 // 88 // 32 // 37 // 0 /// GENSCAN00000031815 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:63329439:63336155:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 95 // 48 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT026163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 60 // 25 // 25 // 0
NM_001008299 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA (guanine-7-) methyltransferase (Rnmt), mRNA. // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:63299070:63322520:1 gene:ENSRNOG00000016698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC085858 // GenBank // Rattus norvegicus RNA (guanine-7-) methyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:94587 IMAGE:7190303), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000031816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:63304233:63320897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT026159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1 /// NONRATT026158 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001271365 // RefSeq // Rattus norvegicus low density lipoprotein receptor class A domain containing 4 (Ldlrad4), mRNA. // chr18 // 86 // 84 // 18 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022717 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:63182678:63218616:1 gene:ENSRNOG00000016879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 86 // 56 // 12 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007928 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:63098944:63218616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT026156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_053459 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB27B, member RAS oncogene family (Rab27b), mRNA. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAB27B, member RAS oncogene family (Rab27b), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016369 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:67642827:67703841:-1 gene:ENSRNOG00000012176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AF325693 // GenBank // Rattus norvegicus strain Sprague-Dawley small GTP binding protein Rab27B mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006409 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:67642829:67661485:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT026848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
ENSRNOT00000035509 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:67858406:67860357:-1 gene:ENSRNOG00000021282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004599 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:67858533:67860351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
XM_006254936 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynactin-associated protein-like (LOC102552939), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222611 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynactin-associated protein-like (LOC102552939), mRNA. // chr18 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033631 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:67904664:67907866:-1 gene:ENSRNOG00000028712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004605 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:67904664:67907866:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222603 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynactin associated protein (Dynap), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222605 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynactin associated protein (Dynap), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254931 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynactin associated protein (Dynap), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynactin associated protein (Dynap), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006222607 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynactin associated protein (Dynap), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// XM_006254934 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynactin associated protein (Dynap), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000058894 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:68081047:68082788:-1 gene:ENSRNOG00000038598 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000004606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68061494:68127535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001017462 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to chromosome 18 open reading frame 54 (LOC361346), mRNA. // chr18 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// XM_006254929 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to chromosome 18 open reading frame 54 (LOC361346), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 79 // 79 // 22 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000014670 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:68106831:68129952:-1 gene:ENSRNOG00000028677 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// BC082051 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 18 open reading frame 54, mRNA (cDNA clone MGC:95201 IMAGE:7132090), complete cds. // chr18 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// GENSCAN00000004606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68061494:68127535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026851 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026852 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT026853 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001106137 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), iota (Poli), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006254902 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polymerase (DNA directed), iota (Poli), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016189 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:64930367:64950189:-1 gene:ENSRNOG00000012111 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000029564 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:64912397:64950155:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
ENSRNOT00000015731 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:65071211:65071799:-1 gene:ENSRNOG00000011816 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 86 // 100 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000029537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:65071458:65075811:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 85 // 62 // 11 // 13 // 0
XM_006222613 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E3 ubiquitin-protein ligase RNF149-like (RGD1561134), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// XM_006254903 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus E3 ubiquitin-protein ligase RNF149-like (RGD1561134), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000058869 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:65276228:65276920:-1 gene:ENSRNOG00000038592 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr18 // 80 // 71 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000029553 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:65276186:65277053:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 86 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000038065 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:65433071:65434060:-1 gene:ENSRNOG00000028525 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000055971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:65433029:65434060:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
NM_012841 // RefSeq // Rattus norvegicus DCC netrin 1 receptor (Dcc), mRNA. // chr18 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064947 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:65693812:66392627:-1 gene:ENSRNOG00000033099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// U68725 // GenBank // Rattus norvegicus Deleted in colorectal Cancer (DCC) mRNA, complete cds. // chr18 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:65797187:65888713:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT026845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_019275 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 4 (Smad4), mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021113 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:68773453:68802426:-1 gene:ENSRNOG00000015634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AB010954 // GenBank // Rattus norvegicus Smad4 mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// AF056002 // GenBank // Rattus norvegicus Smad4 protein (Smad4) mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT026855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026859 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68788455:68816788:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT026862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001107406 // RefSeq // Rattus norvegicus elaC ribonuclease Z 1 (Elac1), mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000000125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:68851118:68868465:-1 gene:ENSRNOG00000000113 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000028055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68852783:68910897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_001107376 // RefSeq // Rattus norvegicus malic enzyme 2, NAD(+)-dependent, mitochondrial (Me2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000049759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:68882367:68927780:-1 gene:ENSRNOG00000015582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028055 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68852783:68910897:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_019319 // RefSeq // Rattus norvegicus mitogen-activated protein kinase 4 (Mapk4), mRNA. // chr18 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000020851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:69040596:69087394:-1 gene:ENSRNOG00000015401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 48 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000047271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:69040280:69087394:-1 gene:ENSRNOG00000015401 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 55 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT026855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:68997884:69069503:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
NM_001106134 // RefSeq // Rattus norvegicus spindle and kinetochore associated complex subunit 1 (Ska1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020637 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:69317015:69327048:-1 gene:ENSRNOG00000015275 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC158659 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2810433K01, mRNA (cDNA clone MGC:187644 IMAGE:8369180), complete cds. // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:69317495:69326245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
ENSRNOT00000054518 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:18:69454910:69455005:-1 gene:ENSRNOG00000036405 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr18 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT026855 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012741 // RefSeq // Rattus norvegicus lipase, endothelial (Lipg), mRNA. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:70043855:70064759:-1 gene:ENSRNOG00000018694 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY916123 // GenBank // Rattus norvegicus endothelial lipase (Lipg) mRNA, complete cds. // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:70028877:70064759:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT026879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001108891 // RefSeq // Rattus norvegicus CBP80/20-dependent translation initiation factor (Ctif), mRNA. // chr18 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000024716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:70602149:70834596:-1 gene:ENSRNOG00000018342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 93 // 45 // 14 // 15 // 0 /// XM_006222627 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CBP80/20-dependent translation initiation factor-like (LOC679129), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// XM_006222628 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CBP80/20-dependent translation initiation factor-like (LOC679129), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000015081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:70922543:70960514:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 45 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT026881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000026450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:70602390:70693579:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
ENSRNOT00000039543 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:71680667:71681279:-1 gene:ENSRNOG00000023138 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 89 // 90 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000038250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:71661052:71681414:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 57 // 12 // 12 // 0
XM_006222634 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus katanin p60 subunit A-like 2 (Katnal2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_006222636 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus katanin p60 subunit A-like 2 (Katnal2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254971 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus katanin p60 subunit A-like 2 (Katnal2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// XM_006254973 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus katanin p60 subunit A-like 2 (Katnal2), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023967 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:72977452:73036597:-1 gene:ENSRNOG00000017788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048702 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:72961750:73036597:-1 gene:ENSRNOG00000017788 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000046113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:72961750:73019654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0
XM_006254974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552068 (LOC102552068), mRNA. // chr18 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// ENSRNOT00000072004 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:73241966:73242604:-1 gene:ENSRNOG00000045604 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr18 // 83 // 96 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT026914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000046109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73241896:73253212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
GENSCAN00000046116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73260519:73270410:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 64 // 64 // 14 // 22 // 1
NM_001164505 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 165 (Rnf165), mRNA. // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000075580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73505861:73553878:-1 gene:ENSRNOG00000048824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// BC166566 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 165, mRNA (cDNA clone MGC:188196 IMAGE:7317237), complete cds. // chr18 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73511611:73622080:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT026917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_001107374 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein (RGD1308601), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000038767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73693017:73737785:-1 gene:ENSRNOG00000017215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003752206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100909715 (LOC100909715), mRNA. // chr18 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000024145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73691525:73737710:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT026921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0
NONRATT026921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_138864 // RefSeq // Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex, subunit 1 (Haus1), mRNA. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73812930:73826001:-1 gene:ENSRNOG00000017067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000073597 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:73862168:73872651:-1 gene:ENSRNOG00000046666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// AF092207 // GenBank // Rattus norvegicus unknown mRNA, complete cds. // chr18 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC127484 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 5, mRNA (cDNA clone MGC:156590 IMAGE:8363325), complete cds. // chr18 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006739 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73815532:73826001:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000006759 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:73862168:73872639:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001191942 // RefSeq // Rattus norvegicus sialic acid binding Ig-like lectin 15 (Siglec15), mRNA. // chr18 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000045278 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:74076491:74082377:-1 gene:ENSRNOG00000033588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000006728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:74078099:74090362:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0
NM_019346 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 14 (urea transporter), member 1 (Slc14a1), mRNA. // chr18 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// XM_006254977 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 14 (urea transporter), member 1 (Slc14a1), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006254978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 14 (urea transporter), member 1 (Slc14a1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:74136473:74157285:-1 gene:ENSRNOG00000016753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000074572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:74136473:74161863:-1 gene:ENSRNOG00000016753 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// FQ211495 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA91YM04 mRNA sequence. // chr18 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// U81518 // GenBank // Rattus norvegicus urea transporter (UT3) mRNA, complete cds. // chr18 // 92 // 90 // 24 // 26 // 0 /// X98399 // GenBank // R.norvegicus mRNA for urea transporter. // chr18 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:74112057:74167182:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT026924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// NONRATT026925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_006222642 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET binding protein 1 (Setbp1), mRNA. // chr18 // 89 // 67 // 16 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000021717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:74772393:75106921:-1 gene:ENSRNOG00000016208 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0
NM_001127373 // RefSeq // Rattus norvegicus ADNP homeobox 2 (Adnp2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:72154072:72169317:1 gene:ENSRNOG00000017667 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC166606 // GenBank // Rattus norvegicus ADNP homeobox 2, mRNA (cDNA clone MGC:188386 IMAGE:7934474), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045520 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:72111710:72168755:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT026256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107373 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosome binding factor A (Rbfa), mRNA. // chr18 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:72092362:72102513:1 gene:ENSRNOG00000030116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000045524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:72092471:72102148:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 45 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT026251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT026252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001107372 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 2 (Kcng2), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 2 (Kcng2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 2 (Kcng2), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006254950 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 2 (Kcng2), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023089 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:71933314:71999524:1 gene:ENSRNOG00000017189 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:71971854:71999288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106131 // RefSeq // Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) phosphatase, subunit 1 (Ctdp1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006254944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CTD (carboxy-terminal domain, RNA polymerase II, polypeptide A) phosphatase, subunit 1 (Ctdp1), transcript variant X3, mRNA. // chr18 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000064209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:71828756:71889824:1 gene:ENSRNOG00000017183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000045513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:71828737:71889154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026246 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001244933 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 1 (Nfatc1), mRNA. // chr18 // 82 // 58 // 9 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000058382 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:76340752:76426095:-1 gene:ENSRNOG00000017146 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// FQ223020 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA16YE06 mRNA sequence. // chr18 // 91 // 58 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000004811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:76410794:76490363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001106130 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, class II, type 9B (Atp9b), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006254984 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class II, type 9B (Atp9b), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000041380 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:76446514:76638326:-1 gene:ENSRNOG00000032039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT026936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000004811 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:76410794:76490363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1
NM_001108892 // RefSeq // Rattus norvegicus spalt-like transcription factor 3 (Sall3), mRNA. // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006254985 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spalt-like transcription factor 3 (Sall3), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:76676425:76682692:-1 gene:ENSRNOG00000026116 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:76666910:76683023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT026940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_012958 // RefSeq // Rattus norvegicus galanin receptor 1 (Galr1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000022335 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:78302017:78317350:-1 gene:ENSRNOG00000016654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000022401 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:78302017:78317578:-1 gene:ENSRNOG00000016654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// U30290 // GenBank // Rattus norvegicus galanin receptor GALR1 mRNA, complete cds. // chr18 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000023638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:78302999:78317350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
XM_006222643 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 236 (Zfp236), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006222645 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 236 (Zfp236), transcript variant X4, mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255012 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 236 (Zfp236), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 236 (Zfp236), transcript variant X5, mRNA. // chr18 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 236 (Zfp236), transcript variant X6, mRNA. // chr18 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022086 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:78517629:78608816:-1 gene:ENSRNOG00000016303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000023637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:78551945:78598781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 34 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023654 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:78496301:78545376:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 29 // 10 // 10 // 0
XM_006222650 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus serine/arginine repetitive matrix protein 1-like (LOC102557220), mRNA. // chr18 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0
GENSCAN00000005586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:79666031:79735352:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_006222651 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus teashirt zinc finger homeobox 1 (Tshz1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255021 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus teashirt zinc finger homeobox 1 (Tshz1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021750 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:79912225:79915437:-1 gene:ENSRNOG00000016246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000015380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:79877702:79966118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
XM_006255018 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 407 (Zfp407), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000065201 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:80335599:80473948:-1 gene:ENSRNOG00000043357 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000058246 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:80216468:80255882:-1 gene:ENSRNOG00000016008 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT026958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1 /// GENSCAN00000015378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80152219:80251351:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
GENSCAN00000034292 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80260865:80262725:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT026958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001007687 // RefSeq // Rattus norvegicus carnosine dipeptidase 1 (metallopeptidase M20 family) (Cndp1), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000034970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:80511689:80534735:-1 gene:ENSRNOG00000027739 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC081877 // GenBank // Rattus norvegicus carnosine dipeptidase 1 (metallopeptidase M20 family), mRNA (cDNA clone MGC:93742 IMAGE:7107931), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000034312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80507348:80556742:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT026962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_001010920 // RefSeq // Rattus norvegicus CNDP dipeptidase 2 (metallopeptidase M20 family) (Cndp2), mRNA. // chr18 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// XM_006254998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CNDP dipeptidase 2 (metallopeptidase M20 family) (Cndp2), transcript variant X1, mRNA. // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021400 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:80566929:80584026:-1 gene:ENSRNOG00000015591 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC095904 // GenBank // Rattus norvegicus CNDP dipeptidase 2 (metallopeptidase M20 family), mRNA (cDNA clone MGC:93824 IMAGE:7110846), complete cds. // chr18 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80567492:80580401:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 63 // 63 // 19 // 30 // 1 /// NONRATT026966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// NONRATT026964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// NONRATT026967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
XM_002728571 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100359752 (LOC100359752), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_003753078 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC100359752 (LOC100359752), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000058219 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:80689255:80726603:-1 gene:ENSRNOG00000038241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001008343 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of inner mitochondrial membrane 21 homolog (yeast) (Timm21), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:80841881:80846335:-1 gene:ENSRNOG00000015142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC085823 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2700002I20, mRNA (cDNA clone MGC:94128 IMAGE:7126835), complete cds. // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026969 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000038255 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80834399:80847062:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 67 // 67 // 14 // 21 // 1
GENSCAN00000038268 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:80868032:80869773:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 58 // 7 // 7 // 0
NM_001271149 // RefSeq // Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 6 (Socs6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus suppressor of cytokine signaling 6 (Socs6), transcript variant X2, mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000058179 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:85006285:85007928:-1 gene:ENSRNOG00000038212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:85006285:85007928:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT026975 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr18 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
XM_002728569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chimerin 3 (Chn3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_003753075 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chimerin 3 (Chn3), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000058177 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:85031735:85033111:-1 gene:ENSRNOG00000038211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000045981 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:85031723:85033111:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
XM_001069809 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689166 (LOC689166), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// XM_003753076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689166 (LOC689166), mRNA. // chr18 // 100 // 95 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000006169 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:18:85317702:85318203:-1 gene:ENSRNOG00000004661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:85317702:85318013:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
NM_001191943 // RefSeq // Rattus norvegicus docking protein 6 (Dok6), mRNA. // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000058139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:18:85459997:85911591:-1 gene:ENSRNOG00000038190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000005531 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:85552620:85724051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr18 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0
NM_001100477 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2E (Ces2e), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000015724 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:86161:100942:1 gene:ENSRNOG00000011635 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ218265 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA6YL10 mRNA sequence. // chr19 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037821 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:86201:130987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// NONRATT026982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001190380 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2J (Ces2j), mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000061734 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:487190:494404:1 gene:ENSRNOG00000029744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 90 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000037832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:480160:494404:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 60 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000037558 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:536825:537526:1 gene:ENSRNOG00000026220 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 83 // 100 // 20 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:536937:537299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0
NM_001144854 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 96, member B (Fam96b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015811 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:545968:547833:1 gene:ENSRNOG00000011865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000051749 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:546006:547676:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026986 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026987 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026988 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0
NM_053338 // RefSeq // Rattus norvegicus Ras-related associated with diabetes (Rrad), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:556021:559187:1 gene:ENSRNOG00000011901 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U12187 // GenBank // Rattus norvegicus ras-related protein (rad) mRNA, complete cds. // chr19 // 80 // 96 // 20 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:555870:558827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT026991 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT026990 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
NM_001012055 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 16 (Cdh16), mRNA. // chr19 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016419 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:562589:572772:1 gene:ENSRNOG00000012222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC081996 // GenBank // Rattus norvegicus cadherin 16, mRNA (cDNA clone MGC:94217 IMAGE:7130691), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000051742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:564104:572539:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT026992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
NM_032072 // RefSeq // Rattus norvegicus NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1 (Nae1), mRNA. // chr19 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048221 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:646856:673674:1 gene:ENSRNOG00000033133 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 80 // 100 // 20 // 25 // 0 /// BC127481 // GenBank // Rattus norvegicus NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, mRNA (cDNA clone MGC:156584 IMAGE:8370668), complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// U90829 // GenBank // Rattus norvegicus APP-binding protein 1 mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:646899:771707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT026993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_006222653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 79 (Ccdc79), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255056 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 79 (Ccdc79), mRNA. // chr19 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0
NM_031026 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, cytoplasmic 1 light intermediate chain 2 (Dync1li2), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034472 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:739197:762114:1 gene:ENSRNOG00000025791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AB008524 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for dynein light intermediate chain 53/55, partial cds. // chr19 // 88 // 55 // 14 // 16 // 0 /// BC089794 // GenBank // Rattus norvegicus dynein, cytoplasmic 1 light intermediate chain 2, mRNA (cDNA clone MGC:108664 IMAGE:7115029), complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// U15138 // GenBank // Rattus norvegicus LIC-2 dynein light intermediate chain 53/55 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT026997 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT026996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 93 // 27 // 29 // 1 /// GENSCAN00000051744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:646899:771707:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT026999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001172151 // RefSeq // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 4 (Cmtm4), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:783437:822756:1 gene:ENSRNOG00000011009 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000051750 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:783441:821953:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0
NONRATT027001 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001013142 // RefSeq // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 2A (Cmtm2a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061648 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:878307:885427:1 gene:ENSRNOG00000025420 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078975 // GenBank // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 2A, mRNA (cDNA clone MGC:93857 IMAGE:7111936), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051740 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:878412:885926:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT027003 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106166 // RefSeq // Rattus norvegicus thymidine kinase 2, mitochondrial (Tk2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017269 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:918115:940133:1 gene:ENSRNOG00000012853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000051746 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:918599:938572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027004 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
XM_006222659 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialidase-like (LOC102556205), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sialidase-like (LOC102556205), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000037019 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:1525224:1526212:1 gene:ENSRNOG00000025325 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000001579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:1502254:1532074:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
NM_053392 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 11 (Cdh11), mRNA. // chr19 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018535 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:2374108:2531571:1 gene:ENSRNOG00000013481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:2482784:2495494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 31 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT027013 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1
XM_002729450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ig variable region, light chain (RGD1565617), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 48 // 48 // 0 /// XM_003753081 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Ig variable region, light chain (RGD1565617), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000043673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:24585556:24586167:-1 gene:ENSRNOG00000047836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000048879 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:3309621:3310196:1 gene:ENSRNOG00000038254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 90 // 77 // 36 // 40 // 0 /// GENSCAN00000003711 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:3211856:3310232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000018170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:24585556:24586167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000048351 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:21867886:21868493:1 gene:ENSRNOG00000049755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 23 // 90 // 11 // 47 // 0
ENSRNOT00000000269 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:3591392:3591658:1 gene:ENSRNOG00000000252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:3583442:3591658:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053393 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 8 (Cdh8), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067454 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:6024414:6417023:1 gene:ENSRNOG00000011274 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// XM_006255062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 8 (Cdh8), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// XM_006255063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 8 (Cdh8), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 74 // 74 // 20 // 27 // 1 /// GENSCAN00000000294 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:6206459:6416833:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000040529 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:8618237:8618483:1 gene:ENSRNOG00000050257 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 78 // 92 // 18 // 23 // 0 /// GENSCAN00000025858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:8580622:8618678:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000054530 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:9163053:9163127:1 gene:ENSRNOG00000036418 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 5 // 5 // 1
GENSCAN00000003023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9006983:9012422:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000003025 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9416992:9422431:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 14 // 14 // 0
NM_013177 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 2, mitochondrial (Got2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000015956 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:9572757:9598443:1 gene:ENSRNOG00000011782 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC061792 // GenBank // Rattus norvegicus glutamic-oxaloacetic transaminase 2, mitochondrial (aspartate aminotransferase 2), mRNA (cDNA clone MGC:72536 IMAGE:5597941), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// M18467 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial aspartate aminotransferase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000027480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9572875:9597497:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1 /// NONRATT027022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 8 // 19 // 1
NM_001003705 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 7 (Slc38a7), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061498 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:9607720:9621918:1 gene:ENSRNOG00000012007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY294328 // GenBank // Rattus norvegicus amino acid transporter mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC086369 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 7, mRNA (cDNA clone MGC:105833 IMAGE:7109456), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// FQ210493 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA27YM14 mRNA sequence. // chr19 // 78 // 100 // 25 // 32 // 0 /// GENSCAN00000027485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9612353:9621832:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027026 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001134840 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 1 (Cnot1), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000016563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:9653369:9746683:1 gene:ENSRNOG00000012271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000027479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9669210:9746406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT027029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT027030 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 57 // 57 // 21 // 37 // 1
NONRATT027029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001134840 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4-NOT transcription complex, subunit 1 (Cnot1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000016563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:9653369:9746683:1 gene:ENSRNOG00000012271 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC099150 // GenBank // Rattus norvegicus similar to KIAA1007 protein; adrenal gland protein AD-005, mRNA (cDNA clone IMAGE:7367094), complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000027479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9669210:9746406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 98 // 95 // 40 // 41 // 0 /// NONRATT027029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT027031 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1 /// NONRATT027032 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
NM_001013888 // RefSeq // Rattus norvegicus protease, serine, 54 (Prss54), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255072 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protease, serine, 54 (Prss54), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000033953 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:9880127:9896965:1 gene:ENSRNOG00000023092 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC079217 // GenBank // Rattus norvegicus plasma kallikrein-like protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:94280 IMAGE:7131896), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9880819:9896746:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT027039 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1
NM_001107409 // RefSeq // Rattus norvegicus casein kinase 2, alpha prime polypeptide (Csnk2a2), mRNA. // chr19 // 93 // 91 // 28 // 30 // 0 /// XM_006255082 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus casein kinase 2, alpha prime polypeptide (Csnk2a2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:9956493:9996387:1 gene:ENSRNOG00000011933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC168200 // GenBank // Rattus norvegicus casein kinase 2, alpha prime polypeptide, mRNA (cDNA clone MGC:188044 IMAGE:7114331), complete cds. // chr19 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// GENSCAN00000027483 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9956494:9987432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027043 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001037978 // RefSeq // Rattus norvegicus gene trap locus 3 (Gtl3), mRNA. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10009274:10022984:1 gene:ENSRNOG00000042179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099768 // GenBank // Rattus norvegicus gene trap locus 3, mRNA (cDNA clone MGC:124689 IMAGE:7932140), complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT027047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027048 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10009159:10040867:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001170478 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 319 (Zfp319), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10103086:10107065:1 gene:ENSRNOG00000013460 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10105320:10107065:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NONRATT027056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031809 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclic nucleotide gated channel beta 1 (Cngb1), mRNA. // chr19 // 85 // 92 // 28 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000060351 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10126329:10190456:1 gene:ENSRNOG00000031773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// AF068572 // GenBank // Rattus norvegicus cyclic nucleotide-gated channel beta subunit 1b mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// AJ224680 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for glutamic-acid rich protein, complete CDS. // chr19 // 92 // 36 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000017451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10125067:10190300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0
NM_001108437 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 102A (Ccdc102a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255116 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 102A (Ccdc102a), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 102A (Ccdc102a), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000030229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10516256:10531535:1 gene:ENSRNOG00000025843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000041804 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10520025:10531142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027068 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
NM_001108438 // RefSeq // Rattus norvegicus docking protein 4 (Dok4), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021037 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10558225:10568895:1 gene:ENSRNOG00000015679 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// BC158749 // GenBank // Rattus norvegicus docking protein 4, mRNA (cDNA clone MGC:187931 IMAGE:9101502), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041824 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10563128:10568644:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001007689 // RefSeq // Rattus norvegicus cytokine induced apoptosis inhibitor 1 (Ciapin1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytokine induced apoptosis inhibitor 1 (Ciapin1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000021769 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10591807:10607103:1 gene:ENSRNOG00000016234 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC083753 // GenBank // Rattus norvegicus cytokine induced apoptosis inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:94686 IMAGE:7192604), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ230885 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA82YO01 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10595981:10604191:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT027076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT027075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT027078 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_022533 // RefSeq // Rattus norvegicus plasmolipin (Pllp), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022277 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10725892:10746753:1 gene:ENSRNOG00000016558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC078823 // GenBank // Rattus norvegicus plasma membrane proteolipid (plasmolipin), mRNA (cDNA clone MGC:93437 IMAGE:7108239), complete cds. // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// U13617 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague-Dawley plasmolipin mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000041826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10720941:10746041:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT027081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001014014 // RefSeq // Rattus norvegicus NEFA-interacting nuclear protein NIP30 (Nip30), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006255112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEFA-interacting nuclear protein NIP30 (Nip30), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006255113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEFA-interacting nuclear protein NIP30 (Nip30), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006255115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEFA-interacting nuclear protein NIP30 (Nip30), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024120 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10821359:10850607:1 gene:ENSRNOG00000017841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC079145 // GenBank // Rattus norvegicus NEFA-interacting nuclear protein NIP30, mRNA (cDNA clone MGC:94160 IMAGE:7128234), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041828 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10828189:10849917:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT027085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT027086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1
XM_006255112 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NEFA-interacting nuclear protein NIP30 (Nip30), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027086 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 1
NM_053618 // RefSeq // Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 2 (Bbs2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000026076 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11360527:11395931:1 gene:ENSRNOG00000019020 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AF342738 // GenBank // Rattus norvegicus BBS2 (Bbs2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ222286 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA25YJ11 mRNA sequence. // chr19 // 95 // 65 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT027089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000037481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11324556:11395622:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 91 // 31 // 34 // 1 /// NONRATT027090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT027091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001012056 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 5A (Ces5a), mRNA. // chr19 // 94 // 74 // 32 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000049452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:23219490:23250277:1 gene:ENSRNOG00000025710 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 28 // 28 // 0 /// AF479659 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylesterase 615 protein mRNA, complete cds. // chr19 // 94 // 74 // 32 // 34 // 0 /// GENSCAN00000040578 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:23208027:23228701:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT027103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1 /// GENSCAN00000040579 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:23242459:23373399:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1
ENSRNOT00000053935 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:23787742:23787809:1 gene:ENSRNOG00000045575 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000018474 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:23999481:24000127:1 gene:ENSRNOG00000013812 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 85 // 100 // 17 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:23972443:24000145:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
ENSRNOT00000018492 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:24400007:24400384:1 gene:ENSRNOG00000013839 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000013647 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:24399950:24400435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_226269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 40S ribosomal protein S18-like (RGD1561919), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000047417 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:25205940:25206398:1 gene:ENSRNOG00000033451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25205940:25206398:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_001063896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intestine-specific homeobox (Isx), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_003751833 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus intestine-specific homeobox (Isx), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000061079 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:25313085:25332674:1 gene:ENSRNOG00000039808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 59 // 14 // 16 // 0 /// NONRATT027107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000042593 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25289822:25342028:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001107412 // RefSeq // Rattus norvegicus HMG box domain containing 4 (Hmgxb4), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255144 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HMG box domain containing 4 (Hmgxb4), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:25465206:25503029:1 gene:ENSRNOG00000013878 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HMG box domain containing 4 (Hmgxb4), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// GENSCAN00000027816 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25470479:25501120:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
NM_001008365 // RefSeq // Rattus norvegicus target of myb1 (chicken) (Tom1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000018880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:25505008:25539012:1 gene:ENSRNOG00000014093 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC083873 // GenBank // Rattus norvegicus target of myb1 homolog (chicken), mRNA (cDNA clone MGC:95142 IMAGE:7128979), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000027808 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25513137:25583307:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1
NM_012580 // RefSeq // Rattus norvegicus heme oxygenase (decycling) 1 (Hmox1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:25622556:25629372:1 gene:ENSRNOG00000014117 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091164 // GenBank // Rattus norvegicus heme oxygenase (decycling) 1, mRNA (cDNA clone MGC:108752 IMAGE:7384448), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000027820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25595066:25745433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106170 // RefSeq // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 5 (Mcm5), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064731 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:25637492:25681915:1 gene:ENSRNOG00000014336 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// BC166442 // GenBank // Rattus norvegicus minichromosome maintenance complex component 5, mRNA (cDNA clone MGC:187582 IMAGE:8362933), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027117 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000027820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25595066:25745433:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT027119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_133568 // RefSeq // Rattus norvegicus RASD family, member 2 (Rasd2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:25770392:25781108:1 gene:ENSRNOG00000014761 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF134409 // GenBank // Rattus norvegicus Rhes protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027826 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:25756363:25786838:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001008508 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosylprotein sulfotransferase 2 (Tpst2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosylprotein sulfotransferase 2 (Tpst2), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// XM_006249527 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosylprotein sulfotransferase 2 (Tpst2), transcript variant X3, mRNA. // chr12 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// XM_006249528 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosylprotein sulfotransferase 2 (Tpst2), transcript variant X4, mRNA. // chr12 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// XM_006249529 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosylprotein sulfotransferase 2 (Tpst2), transcript variant X5, mRNA. // chr12 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// XM_006249530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tyrosylprotein sulfotransferase 2 (Tpst2), transcript variant X6, mRNA. // chr12 // 94 // 69 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000000831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:52099687:52139825:-1 gene:ENSRNOG00000000664 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC086518 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosylprotein sulfotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:105657 IMAGE:7302513), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:52100079:52107607:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016132 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT016133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001008291 // RefSeq // Rattus norvegicus tuftelin interacting protein 11 (Tfip11), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:52077899:52090133:-1 gene:ENSRNOG00000000663 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC085809 // GenBank // Rattus norvegicus tuftelin interacting protein 11, mRNA (cDNA clone MGC:93943 IMAGE:7113767), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// DQ342031 // GenBank // Rattus norvegicus STIP mRNA, complete cds. // chr12 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000053382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:52078614:52088547:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT016128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001107148 // RefSeq // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 4 (Hps4), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006249543 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 4 (Hps4), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:52043359:52071054:-1 gene:ENSRNOG00000000661 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168901 // GenBank // Rattus norvegicus Hermansky-Pudlak syndrome 4 homolog (human), mRNA (cDNA clone MGC:189173 IMAGE:7385143), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053403 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:52040906:52052481:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT016124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT016126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// NONRATT016127 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
ENSRNOT00000048541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:12:51969552:51970995:-1 gene:ENSRNOG00000030948 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000053364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:51969610:51970986:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT016123 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 82 // 14 // 14 // 0
NONRATT028202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0
XM_006255351 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102552540 (LOC102552540), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000040473 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37383660:37519213:1 gene:ENSRNOG00000050916 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000019481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37342313:37407900:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ214467 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA41YI15 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001103359 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 1F (Ces1f), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// BC128711 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylesterase ES-4, mRNA (cDNA clone MGC:156521 IMAGE:7368807), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 16 // 16 // 0 /// U10697 // GenBank // Rattus norvegicus kidney microsomal carboxylesterase mRNA, complete cds. // chr19 // 63 // 89 // 10 // 16 // 0
NM_031565 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 1E (Ces1e), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XR_361638 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 1E-like (LOC102550862), misc_RNA. // chrU // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// ENSRNOT00000020775 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:26248609:26290279:1 gene:ENSRNOG00000015438 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 53 // 53 // 10 // 19 // 1 /// NONRATT027122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// GENSCAN00000018221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26255415:26277194:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 47 // 47 // 9 // 19 // 1
NM_133295 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 1D (Ces1d), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// BC061789 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylesterase 3, mRNA (cDNA clone MGC:72259 IMAGE:5623732), complete cds. // chr19 // 86 // 100 // 12 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000021812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26294247:26337106:1 gene:ENSRNOG00000015519 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 57 // 100 // 8 // 14 // 0 /// L46791 // GenBank // Rattus norvegicus cholesterol esterase mRNA, complete cds. // chr19 // 67 // 86 // 8 // 12 // 0 /// L81144 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylic ester hydrolase mRNA, complete cds. // chr19 // 67 // 86 // 8 // 12 // 0 /// NONRATT027124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 71 // 100 // 10 // 14 // 0
NM_017004 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 1C (Ces1c), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// BC088251 // GenBank // Rattus norvegicus esterase 1, mRNA (cDNA clone MGC:109055 IMAGE:7371252), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0 /// FQ210901 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA20YC21 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
NM_001190375 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 1A (Ces1a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000060929 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26436075:26462383:1 gene:ENSRNOG00000039725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000018218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26436075:26462179:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006222667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555594 (LOC102555594), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255205 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555594 (LOC102555594), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XR_342175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102555594 (LOC102555594), transcript variant X8, misc_RNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// NONRATT028002 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107413 // RefSeq // Rattus norvegicus iroquois homeobox 3 (Irx3), mRNA. // chr19 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000015583 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26917882:26920158:-1 gene:ENSRNOG00000011533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000009513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26797858:26920600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT027999 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001107414 // RefSeq // Rattus norvegicus Rpgrip1-like (Rpgrip1l), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255193 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rpgrip1-like (Rpgrip1l), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_361648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rpgrip1-like (Rpgrip1l), transcript variant X5, misc_RNA. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015876 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:28182502:28274100:1 gene:ENSRNOG00000011829 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:28182330:28270880:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001011926 // RefSeq // Rattus norvegicus AKT interacting protein (Aktip), mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// XM_006255178 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AKT interacting protein (Aktip), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus AKT interacting protein (Aktip), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000060865 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:28354290:28364162:1 gene:ENSRNOG00000011956 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC089985 // GenBank // Rattus norvegicus fused toes, mRNA (cDNA clone MGC:109405 IMAGE:7318380), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// FQ213781 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YL12 mRNA sequence. // chr19 // 79 // 85 // 23 // 29 // 0 /// GENSCAN00000051850 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:28354322:28363327:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT027136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT027137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 62 // 62 // 21 // 34 // 1 /// NONRATT027138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
ENSRNOT00000050750 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:29023891:29025039:1 gene:ENSRNOG00000030864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 93 // 11 // 13 // 0 /// GENSCAN00000045059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:29024168:29025039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 10 // 10 // 0
NM_001106171 // RefSeq // Rattus norvegicus TOX high mobility group box family member 3 (Tox3), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006255186 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TOX high mobility group box family member 3 (Tox3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000029415 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:29134067:29241334:1 gene:ENSRNOG00000028649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EU194254 // GenBank // Rattus norvegicus TOX high mobility group box family member 3 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045057 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:29212387:29257460:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT027140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001107415 // RefSeq // Rattus norvegicus spalt-like transcription factor 1 (Sall1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000018629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:34379544:34395131:1 gene:ENSRNOG00000013907 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000005270 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:34379569:34393980:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT027187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 42 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT027188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 89 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT027189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 63 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT027190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 58 // 58 // 11 // 19 // 1
NM_001024999 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 20 (Snx20), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:30428393:30436776:1 gene:ENSRNOG00000014202 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091194 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 20, mRNA (cDNA clone MGC:108869 IMAGE:7373920), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ232737 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA64YJ21 mRNA sequence. // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// GENSCAN00000027115 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:30431956:30436459:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT027145 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0
NM_001108440 // RefSeq // Rattus norvegicus bromodomain containing 7 (Brd7), mRNA. // chr19 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000064275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:30698186:30726814:1 gene:ENSRNOG00000014419 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 88 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006576 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:30698381:30726637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 97 // 32 // 33 // 0 /// NONRATT027147 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT027150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 26 // 26 // 9 // 34 // 1
NM_053583 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 423 (Zfp423), mRNA. // chr19 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:31295760:31396060:1 gene:ENSRNOG00000014658 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// U92564 // GenBank // Rattus norvegicus Olf-1/EBF associated Zn finger protein Roaz mRNA, alternatively spliced form, complete cds. // chr19 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000028440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:31280646:31306769:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT027159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:31147887:31220714:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:31373396:31403276:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT027161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001109127 // RefSeq // Rattus norvegicus cerebellin 1 precursor (Cbln1), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000000011 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:31617915:31621724:1 gene:ENSRNOG00000000010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000041715 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:31617915:31678745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
GENSCAN00000041709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:31848305:31856241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000034688 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:31855602:31856451:1 gene:ENSRNOG00000008483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
GENSCAN00000041719 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:31863956:31864282:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 9 // 9 // 0
GENSCAN00000012233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:32046579:32059898:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
XM_001068071 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Nedd4 binding protein 1 (N4bp1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_214648 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Nedd4 binding protein 1 (N4bp1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020305 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:32256303:32274348:1 gene:ENSRNOG00000015121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000049285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:32227867:32274348:1 gene:ENSRNOG00000015121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012218 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:32255154:32274348:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 46 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT027165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONRATT027166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
NM_080905 // RefSeq // Rattus norvegicus siah E3 ubiquitin protein ligase 1 (Siah1), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255213 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus seven in absentia 1A (Siah1a), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020329 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:32403161:32404557:1 gene:ENSRNOG00000015143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AB067814 // GenBank // Rattus norvegicus Siah1A mRNA for siah1A protein, complete cds. // chr19 // 100 // 59 // 16 // 16 // 0 /// AF389476 // GenBank // Rattus norvegicus SIAH-1A mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// AY681965 // GenBank // Rattus norvegicus SIAH mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000012223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:32381851:32404013:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT027168 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_199377 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 12 (Abcc12), mRNA. // chr19 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021095 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:32551493:32622091:1 gene:ENSRNOG00000015666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000042077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:32551493:32622091:1 gene:ENSRNOG00000015666 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// AY188179 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein C12 (Abcc12) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// AY188180 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette protein C12 variant A (Abcc12) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 94 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000031527 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:32559526:32602203:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NONRATT027169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 18 // 18 // 1
NM_133557 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin alpha FG-GAP repeat containing 1 (Itfg1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000021711 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:33289326:33410841:1 gene:ENSRNOG00000015843 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AF480856 // GenBank // Rattus norvegicus CDA08-like protein mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 92 // 31 // 35 // 0 /// BC085706 // GenBank // Rattus norvegicus integrin alpha FG-GAP repeat containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:93216 IMAGE:7189102), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000031440 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:33289469:33314521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000031443 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:33337236:33409438:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 53 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000031445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:33227337:33276806:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1 /// NONRATT027172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001107417 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropilin (NRP) and tolloid (TLL)-like 2 (Neto2), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021739 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:33456905:33493500:1 gene:ENSRNOG00000016245 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GQ149762 // GenBank // Rattus norvegicus neuropilin and tolloid like-2 (Neto2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000031781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:33462227:33493500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT027174 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 48 // 48 // 15 // 31 // 1
NM_032079 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 2 (Dnaja2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000022573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:33576436:33594574:1 gene:ENSRNOG00000016251 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// BC087010 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily A, member 2, mRNA (cDNA clone MGC:93325 IMAGE:7191358), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// U95727 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ homolog 2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000031783 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:33576456:33593995:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT027176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000023169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:33717642:33744546:1 gene:ENSRNOG00000017090 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// BC167107 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 4921524J17, mRNA (cDNA clone MGC:189564 IMAGE:7110902), complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// FQ235280 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YM19 mRNA sequence. // chr19 // 89 // 76 // 17 // 19 // 0 /// NONRATT027182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1 /// NONRATT027183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT027185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001110810 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin light chain kinase 3 (Mylk3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255355 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myosin light chain kinase 3 (Mylk3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:38373230:38407268:1 gene:ENSRNOG00000017546 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EU236721 // GenBank // Rattus norvegicus cardiac myosin light chain kinase (cMLCK) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000020754 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:38371695:38410166:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001105718 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 35 homolog (S. cerevisiae) (Vps35), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024020 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:38430733:38466263:1 gene:ENSRNOG00000017612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:38441858:38454004:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000051042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:38455130:38465522:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 38 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT027327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
XM_006222682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC684084 (LOC684084), mRNA. // chr19 // 61 // 61 // 14 // 23 // 1 /// XM_006227141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557241 (LOC102557241), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// XM_006227142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557241 (LOC102557241), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// XM_006255041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551760 (LOC102551760), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1 /// NONRATT028202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 47 // 83 // 9 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000071393 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:212180:216869:1 gene:ENSRNOG00000050134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 35 // 35 // 8 // 23 // 1
XM_006255381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685488 (LOC685488), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000047230 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:39204397:39208561:1 gene:ENSRNOG00000049674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39201871:39208581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
XM_006222692 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC100912726), mRNA. // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// XM_003748679 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC501467), mRNA. // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// XM_006255379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC685199), mRNA. // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000047660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:26359883:26364171:1 gene:ENSRNOG00000048976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000049208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:26359883:26364356:1 gene:ENSRNOG00000048976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT027865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 52 // 88 // 12 // 23 // 0
XM_006227140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC683878), mRNA. // chr19 // 36 // 85 // 8 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000047660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:26359883:26364171:1 gene:ENSRNOG00000048976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 39 // 88 // 9 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000049208 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:26359883:26364356:1 gene:ENSRNOG00000048976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 39 // 88 // 9 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000075616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:26359769:26364080:1 gene:ENSRNOG00000048976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 39 // 88 // 9 // 23 // 0 /// BC166431 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7132976. // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027329 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000041115 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:39715890:39721361:1 gene:ENSRNOG00000049890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 85 // 8 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000045972 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:47047471:47052669:1 gene:ENSRNOG00000029323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 43 // 88 // 10 // 23 // 0 /// NONRATT027865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 100 // 9 // 26 // 0
XM_006255379 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC685199), mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 10 // 10 // 0
XM_006255431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC685226), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000038605 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:47046376:47052870:1 gene:ENSRNOG00000029323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 100 // 12 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000045972 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:47047471:47052669:1 gene:ENSRNOG00000029323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000023238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:47041518:47048826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 62 // 62 // 8 // 13 // 1
ENSRNOT00000037766 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:37213564:37219645:-1 gene:ENSRNOG00000023920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37209499:37218843:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000071984 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37204310:37210169:-1 gene:ENSRNOG00000050444 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// AY383674 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00019 mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
NM_001047847 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 83 (Wdr83), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000005917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37164267:37169816:-1 gene:ENSRNOG00000004287 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000019476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37164418:37170875:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028193 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
XM_001064100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12-like (LOC685513), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002725400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12-like (LOC685513), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036953 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:37156766:37157072:-1 gene:ENSRNOG00000023899 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37156766:37157072:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001100505 // RefSeq // Rattus norvegicus arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial) (Asna1), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000067518 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37108650:37116734:-1 gene:ENSRNOG00000003747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37108941:37116724:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001108895 // RefSeq // Rattus norvegicus bestrophin 2 (Best2), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255283 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus bestrophin 2 (Best2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000067600 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37098504:37105242:-1 gene:ENSRNOG00000003737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019463 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37098865:37104325:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028185 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0
NM_021836 // RefSeq // Rattus norvegicus jun B proto-oncogene (Junb), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000067780 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37069075:37070109:-1 gene:ENSRNOG00000042838 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// BC061862 // GenBank // Rattus norvegicus jun B proto-oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:72460 IMAGE:5597977), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019509 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37069075:37078117:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT028183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001013234 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit A (Rnaseh2a), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046181 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37050610:37060302:-1 gene:ENSRNOG00000003504 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// BC086345 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit A, mRNA (cDNA clone MGC:105953 IMAGE:7302028), complete cds. // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// BC086539 // GenBank // Rattus norvegicus ribonuclease H2, subunit A, mRNA (cDNA clone MGC:105855 IMAGE:7114943), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37050657:37060254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT028177 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT028176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT028180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1 /// NONRATT028181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT028182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_181089 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule associated serine/threonine kinase 1 (MAST1), mRNA. // chr19 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000004646 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37001666:37029385:-1 gene:ENSRNOG00000003469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000046414 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37001666:37029385:-1 gene:ENSRNOG00000003469 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY227206 // GenBank // Rattus norvegicus syntrophin-associated serine/threonine kinase SAST124 (Sast124) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// AY227207 // GenBank // Rattus norvegicus syntrophin-associated serine/threonine kinase SAST170 (Sast170) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019532 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37001666:37037626:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028173 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001108896 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaryl-CoA dehydrogenase (Gcdh), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006255290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutaryl-CoA dehydrogenase (Gcdh), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36976120:36982593:-1 gene:ENSRNOG00000003307 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000019473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36977637:36982407:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028169 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT028171 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT028172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_022399 // RefSeq // Rattus norvegicus calreticulin (Calr), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000004091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36931420:36937294:-1 gene:ENSRNOG00000003029 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC062395 // GenBank // Rattus norvegicus calreticulin, mRNA (cDNA clone MGC:72450 IMAGE:5623178), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// D78308 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for calreticulin, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// FQ210587 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA26YA05 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ220096 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YD13 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36932945:36937226:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028167 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT028166 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001013190 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD23 homolog A (S. cerevisiae) (Rad23a), mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000004042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36925113:36930994:-1 gene:ENSRNOG00000003026 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC084695 // GenBank // Rattus norvegicus RAD23 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105787 IMAGE:7114647), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ235010 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA56YM24 mRNA sequence. // chr19 // 86 // 64 // 18 // 21 // 0 /// GENSCAN00000002133 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36925791:36930933:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028160 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT028161 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// NONRATT028162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1
XM_001064979 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DAN domain family, member 5 (Dand5), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044133 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:36906224:36911649:-1 gene:ENSRNOG00000033368 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_030866 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor I/X (CCAAT-binding transcription factor) (Nfix), mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255304 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor I/X (CCAAT-binding transcription factor) (Nfix), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255310 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor I/X (CCAAT-binding transcription factor) (Nfix), transcript variant X7, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039354 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36797568:36890319:-1 gene:ENSRNOG00000002983 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AB012234 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for NF1-X1, partial cds. // chr19 // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT028154 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028155 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36797173:36848073:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 72 // 21 // 29 // 1 /// NONRATT028153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_134413 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing (Nacc1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255214 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleus accumbens associated 1, BEN and BTB (POZ) domain containing (Nacc1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000003884 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36761771:36777149:-1 gene:ENSRNOG00000002864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF015911 // GenBank // Rattus norvegicus NAC-1 protein (NAC-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36761928:36765797:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT028148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT028146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT028149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001009541 // RefSeq // Rattus norvegicus immediate early response 2 (Ier2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061717 // GenBank // Rattus norvegicus immediate early response 2, mRNA (cDNA clone MGC:72578 IMAGE:5598375), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158596 // GenBank // Rattus norvegicus immediate early response 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7123013), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001037644 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 130 (Ccdc130), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006255253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 130 (Ccdc130), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36343741:36351556:-1 gene:ENSRNOG00000008319 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// BC107912 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 130, mRNA (cDNA clone MGC:125030 IMAGE:7460239), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36343923:36351341:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028139 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT028141 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT028142 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001010947 // RefSeq // Rattus norvegicus methylthioribose-1-phosphate isomerase 1 (Mri1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000003762 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36336479:36342471:-1 gene:ENSRNOG00000026211 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC089060 // GenBank // Rattus norvegicus translation initiation factor eIF-2B subunit alpha/beta/delta-like protein, mRNA (cDNA clone MGC:105780 IMAGE:7320396), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048007 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36336545:36342427:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_198728 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to LEYDIG CELL TUMOR 10 KD PROTEIN (LOC288913), mRNA. // chr19 // 81 // 67 // 13 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000072494 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36330664:36334796:-1 gene:ENSRNOG00000049931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC088453 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7127042, partial cds. // chr19 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// FQ216133 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA44YI11 mRNA sequence. // chr19 // 84 // 79 // 16 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048001 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36332375:36334776:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 46 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT028136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1
NM_001107163 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, SWIM-type containing 4 (Zswim4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000010050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36296871:36321978:-1 gene:ENSRNOG00000007582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048012 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36298124:36321926:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028134 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NR_031897 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 181c (Mir181c), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000053692 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:19:36267311:36267416:-1 gene:ENSRNOG00000035569 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT028131 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// rno-mir-181c // miRBase Micro RNA Database // MI0000924 Rattus norvegicus miR-181c stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NR_032266 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 181d (Mir181d), microRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000054529 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:19:36267151:36267233:-1 gene:ENSRNOG00000036417 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// rno-mir-181d // miRBase Micro RNA Database // MI0006132 Rattus norvegicus miR-181d stem-loop // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
NM_001105945 // RefSeq // Rattus norvegicus nanos homolog 3 (Drosophila) (Nanos3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000050214 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36262009:36265435:-1 gene:ENSRNOG00000031593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36264935:36265411:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT028130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_001013869 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 1A (Cc2d1a), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000009806 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36224013:36239011:-1 gene:ENSRNOG00000006747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000045180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36224013:36239011:-1 gene:ENSRNOG00000006747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC081948 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil and C2 domain containing 1A, mRNA (cDNA clone MGC:94029 IMAGE:7122187), complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36224393:36238853:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028124 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_001107162 // RefSeq // Rattus norvegicus DDB1 and CUL4 associated factor 15 (Dcaf15), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000008786 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36189603:36197003:-1 gene:ENSRNOG00000006551 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000048016 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36189994:36196969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 93 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT028119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028120 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1 /// NONRATT028121 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT028122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
ENSRNOT00000031820 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:36157945:36158416:-1 gene:ENSRNOG00000024754 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT028118 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_170667 // RefSeq // Rattus norvegicus relaxin 3 (Rln3), mRNA. // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000007775 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36140921:36143406:-1 gene:ENSRNOG00000005911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AB076564 // GenBank // Rattus norvegicus insl7 mRNA for insulin-like 7, complete cds. // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// AY112741 // GenBank // Rattus norvegicus relaxin 3 precursor, mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 89 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT028116 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000047997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36129074:36143383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_001105943 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 27 receptor, alpha (Il27ra), mRNA. // chr19 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000007726 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36128873:36140835:-1 gene:ENSRNOG00000005747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000047997 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36129074:36143383:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT028114 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001107161 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical LOC304650 (RGD1310262), mRNA. // chr19 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000007519 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36108972:36110933:-1 gene:ENSRNOG00000005619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36109834:36111245:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT028113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1
ENSRNOT00000060117 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:36040779:36041039:-1 gene:ENSRNOG00000039252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001012164 // RefSeq // Rattus norvegicus CD97 molecule (Cd97), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// XM_006255278 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CD97 molecule (Cd97), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000006152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35834144:35853867:-1 gene:ENSRNOG00000004489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// BC083857 // GenBank // Rattus norvegicus CD97 molecule, mRNA (cDNA clone MGC:95076 IMAGE:7125718), complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000002853 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35834653:35853841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT028103 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT028106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 12 // 44 // 1 /// NONRATT028107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1
NM_017175 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase N1 (Pkn1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000005770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35782679:35810655:-1 gene:ENSRNOG00000004131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// BC061836 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase N1, mRNA (cDNA clone MGC:72497 IMAGE:5599989), complete cds. // chr19 // 98 // 98 // 42 // 43 // 0 /// D26180 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for novel protein kinase PKN, complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 41 // 44 // 0 /// FQ222217 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA27YB17 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// L35634 // GenBank // Rattus norvegicus cardiolipin/protease-activated protein kinase-1 (PAK-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 98 // 95 // 41 // 42 // 0 /// GENSCAN00000002843 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35782751:35826099:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT028100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT028099 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 50 // 22 // 44 // 1 /// NONRATT028098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 13 // 44 // 1 /// NONRATT028102 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 13 // 44 // 1 /// NONRATT028101 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
ENSRNOT00000060034 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:35750372:35751520:-1 gene:ENSRNOG00000033036 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 63 // 84 // 10 // 16 // 0
NM_138549 // RefSeq // Rattus norvegicus trans-2,3-enoyl-CoA reductase (Tecr), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000037608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35684511:35711343:-1 gene:ENSRNOG00000021808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// BC059115 // GenBank // Rattus norvegicus glycoprotein, synaptic 2, mRNA (cDNA clone MGC:72691 IMAGE:6920522), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// EU000473 // GenBank // Rattus norvegicus neuroprotective protein 13 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// FQ215654 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YF08 mRNA sequence. // chr19 // 92 // 92 // 11 // 12 // 0 /// FQ215778 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YK21 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 77 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000002839 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35684615:35687715:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT028088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT028089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT028090 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 91 // 85 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT028091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT028092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 62 // 8 // 8 // 0
NM_001013235 // RefSeq // Rattus norvegicus short coiled-coil protein (Scoc), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short coiled-coil protein (Scoc), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006255294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short coiled-coil protein (Scoc), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006255296 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus short coiled-coil protein (Scoc), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000005124 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35562898:35592442:-1 gene:ENSRNOG00000003853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC076390 // GenBank // Rattus norvegicus short coiled-coil protein, mRNA (cDNA clone MGC:94774 IMAGE:7106066), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC086417 // GenBank // Rattus norvegicus short coiled-coil protein, mRNA (cDNA clone MGC:105643 IMAGE:7127948), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002838 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35564229:35574560:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT028084 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT028085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001109506 // RefSeq // Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 2 (Elmod2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006255302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 2 (Elmod2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006255303 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ELMO/CED-12 domain containing 2 (Elmod2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 94 // 91 // 29 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000014916 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:18:38501033:38506809:1 gene:ENSRNOG00000011225 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000031614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35445968:35465400:-1 gene:ENSRNOG00000028176 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000039484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:18:38501033:38501767:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028083 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000028909 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35443476:35456707:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
XR_342279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102556731 (LOC102556731), ncRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054527 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:35017374:35017480:-1 gene:ENSRNOG00000045527 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000054555 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:40391658:40391764:1 gene:ENSRNOG00000046882 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108443 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 330 (Zfp330), mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:34916045:34926423:-1 gene:ENSRNOG00000003461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000033695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:34916659:34927114:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028079 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 15 // 34 // 1
NM_013129 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 15 (Il15), mRNA. // chr19 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000004590 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:34532034:34598725:-1 gene:ENSRNOG00000003439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// AF015718 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-15 alternative-splice product (IL-15) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 48 // 15 // 15 // 0 /// AF015719 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-15 (IL-15) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 52 // 16 // 16 // 0 /// U69272 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-15 mRNA, complete cds. // chr19 // 90 // 100 // 28 // 31 // 0 /// BC097340 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7446199. // chr19 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT028075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028076 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
ENSRNOT00000030541 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:41227353:41227752:1 gene:ENSRNOG00000026960 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41227375:41248355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
XM_003751862 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 38 (Usp38), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_003753096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 38 (Usp38), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000035084 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:41576637:41606593:1 gene:ENSRNOG00000026880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000044125 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41561651:41606593:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027333 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 11 // 33 // 1
ENSRNOT00000036333 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:41630691:41631981:1 gene:ENSRNOG00000029167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 100 // 13 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000048646 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:41630954:41631981:1 gene:ENSRNOG00000029167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 79 // 88 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044116 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41626192:41631981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
NM_001108444 // RefSeq // Rattus norvegicus GRB2-associated binding protein 1 (Gab1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024390 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:41699636:41808268:1 gene:ENSRNOG00000017879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GQ140625 // GenBank // Rattus norvegicus GRB2-associated binding protein 1 long isoform (Gab1) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41770239:41817506:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT027339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001107419 // RefSeq // Rattus norvegicus SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 5 (Smarca5), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000024568 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:41841149:41873900:1 gene:ENSRNOG00000018149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000044112 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41841026:41872765:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 63 // 10 // 16 // 1
NM_001191817 // RefSeq // Rattus norvegicus Hedgehog-interacting protein (Hhip), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024616 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:42430120:42518700:1 gene:ENSRNOG00000018268 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000023650 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:42481648:42505001:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001108446 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily E (OABP), member 1 (Abce1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000024753 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:42771956:42796838:1 gene:ENSRNOG00000018345 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023663 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:42755932:42795314:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027349 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 20 // 36 // 1
NM_013130 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 1 (Smad1), mRNA. // chr19 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// XM_006255396 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMAD family member 1 (Smad1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025079 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:43085029:43145286:1 gene:ENSRNOG00000018483 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF067727 // GenBank // Rattus norvegicus Smad1 protein (Smad1) mRNA, complete cds. // chr19 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// BC061757 // GenBank // Rattus norvegicus SMAD family member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72530 IMAGE:5599977), complete cds. // chr19 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// U66478 // GenBank // Rattus norvegicus mothers against dpp 1 homolog (Mad1) mRNA, complete cds. // chr19 // 87 // 82 // 20 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43085464:43144058:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT027352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106174 // RefSeq // Rattus norvegicus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblA type (Mmaa), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255398 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblA type (Mmaa), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255399 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblA type (Mmaa), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:43204957:43222204:1 gene:ENSRNOG00000011618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079139 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7127801, with apparent retained intron. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43205006:43275215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027356 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
ENSRNOT00000015541 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:43240203:43275428:1 gene:ENSRNOG00000011671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC098038 // GenBank // Rattus norvegicus LOC498933, mRNA (cDNA clone MGC:116194 IMAGE:7456623), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000006249 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43205006:43275215:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001010948 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 10, member 7 (Slc10a7), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000015985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:43751269:43972967:-1 gene:ENSRNOG00000011991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// AY825929 // GenBank // Rattus norvegicus P7 (P7) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// FQ211514 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA90YJ11 mRNA sequence. // chr19 // 95 // 95 // 39 // 41 // 0 /// GENSCAN00000022855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43735260:43881350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 91 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT028223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
NM_001107420 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein, X chromosome retrogene-like (Rbmxrtl), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000041672 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:4:41774128:41775805:-1 gene:ENSRNOG00000028858 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 100 // 33 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000016184 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:43975806:43976912:1 gene:ENSRNOG00000012138 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053682 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43975806:43976912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000057762 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:41661280:41775568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 73 // 24 // 27 // 0 /// NONRATT027364 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT027365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0
XM_006222708 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L21-like (LOC102550668), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255415 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L21-like (LOC102550668), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:44022498:44022965:1 gene:ENSRNOG00000033487 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000053692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:44022498:44022965:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0
NM_134355 // RefSeq // Rattus norvegicus POU class 4 homeobox 2 (Pou4f2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000016422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:44051763:44055404:1 gene:ENSRNOG00000012167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000053688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:44052003:44053673:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 18 // 18 // 0
NONRATT027367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_178330 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 184C (Tmem184c), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255423 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 184C (Tmem184c), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017226 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:44923193:44938607:1 gene:ENSRNOG00000012860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC089112 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane protein 184C, mRNA (cDNA clone MGC:105290 IMAGE:7316181), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255422 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein 184C (Tmem184c), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 1 /// GENSCAN00000048081 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:44909955:44938306:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
NM_001109501 // RefSeq // Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 10 (Arhgap10), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// XM_006255426 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Rho GTPase activating protein 10 (Arhgap10), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000017867 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:45021146:45281603:1 gene:ENSRNOG00000013152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT027378 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000017683 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:45087757:45134923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 39 // 39 // 18 // 46 // 1 /// NONRATT027382 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 41 // 41 // 19 // 46 // 1 /// GENSCAN00000017679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:45174503:45194916:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
XM_001066030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-40S ribosomal protein S27a-like (LOC688462), mRNA. // chr19 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// XM_003753098 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ubiquitin-40S ribosomal protein S27a-like (LOC688462), mRNA. // chr19 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000051194 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:45494598:45495431:1 gene:ENSRNOG00000029317 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000038042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:45480545:45523580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0
NM_001106175 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2G (Ces2g), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006255447 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 2G (Ces2g), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000048385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:47890578:47898167:1 gene:ENSRNOG00000013808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:47864666:47912081:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001106175 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2G (Ces2g), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:47890578:47898167:1 gene:ENSRNOG00000013808 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001044258 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2H (Ces2h), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NM_001190346 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2H (Ces2h), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 29 // 29 // 0 /// XM_006255518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 2H (Ces2h), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000019072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:47917775:47932374:1 gene:ENSRNOG00000039079 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC107806 // GenBank // Rattus norvegicus similar to Carboxylesterase 2, mRNA (cDNA clone MGC:125054 IMAGE:7368719), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000049807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:47917815:47932092:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0
XM_006222709 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 3a (Ces3a), mRNA. // chr19 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// XM_006255545 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 3a (Ces3a), mRNA. // chr19 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0
NM_001106176 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 4A (Ces4a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255449 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 4A (Ces4a), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255450 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 4A (Ces4a), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019169 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:47955469:47973284:1 gene:ENSRNOG00000014257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000005669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:47955642:48073449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001013191 // RefSeq // Rattus norvegicus core-binding factor, beta subunit (Cbfb), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:47993674:48037234:1 gene:ENSRNOG00000014647 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC081946 // GenBank // Rattus norvegicus core-binding factor, beta subunit, mRNA (cDNA clone MGC:94017 IMAGE:7121452), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027392 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:47955642:48073449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// NONRATT027391 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1
NM_139040 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D230025D16Rik (RGD621098), mRNA. // chr19 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000020003 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48045945:48074039:1 gene:ENSRNOG00000014668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// U92010 // GenBank // Rattus norvegicus lin-10 protein homolog (lin-10) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ217375 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA28YH12 mRNA sequence. // chr19 // 94 // 94 // 30 // 32 // 1 /// NONRATT027393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000005669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:47955642:48073449:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 91 // 29 // 32 // 1
NM_001109128 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 8 (Fbxl8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255521 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus F-box and leucine-rich repeat protein 8 (Fbxl8), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48086910:48091423:1 gene:ENSRNOG00000015242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48089151:48101608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 90 // 81 // 19 // 21 // 0 /// NONRATT027395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106177 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock transcription factor 4 (Hsf4), mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000065013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48091910:48097634:1 gene:ENSRNOG00000015253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48089151:48101608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT027398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT027399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_053516 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleolar protein 3 (apoptosis repressor with CARD domain) (Nol3), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// XM_006255540 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar protein 3 (apoptosis repressor with CARD domain) (Nol3), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// XM_006255541 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleolar protein 3 (apoptosis repressor with CARD domain) (Nol3), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020908 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48100723:48102390:1 gene:ENSRNOG00000015588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U40628 // GenBank // Rattus norvegicus clone BB.1.4.1 unknown mRNA. // chr19 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48089151:48101608:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001271345 // RefSeq // Rattus norvegicus E2F transcription factor 4, p107/p130-binding (E2f4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48118651:48125266:1 gene:ENSRNOG00000015708 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48118651:48130446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT027402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0
NM_001030028 // RefSeq // Rattus norvegicus engulfment and cell motility 3 (Elmo3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000021362 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48126191:48130551:1 gene:ENSRNOG00000015800 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// BC099761 // GenBank // Rattus norvegicus engulfment and cell motility 3, mRNA (cDNA clone MGC:124673 IMAGE:7930411), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000005664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48118651:48130446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT027404 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 58 // 58 // 25 // 43 // 1 /// NONRATT027407 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 12 // 43 // 1 /// NONRATT027408 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 14 // 43 // 1 /// NONRATT027405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 21 // 21 // 9 // 43 // 1
NM_001106179 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 208 (Tmem208), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021723 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48147514:48150214:1 gene:ENSRNOG00000015974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48147642:48150066:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027409 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027410 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027411 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0
NM_138858 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 9, subfamily A (NHE5, cation proton antiporter 5), member 5 (Slc9a5), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000068299 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48170660:48190747:1 gene:ENSRNOG00000028844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AF100172 // GenBank // Rattus norvegicus sodium/hydrogen exchanger 5 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000005658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48170694:48203411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 94 // 32 // 34 // 1 /// NONRATT027417 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 50 // 17 // 34 // 1
XM_006255484 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 4 (Plekhg4), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006255485 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 4 (Plekhg4), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// XM_006255488 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pleckstrin homology domain containing, family G (with RhoGef domain) member 4 (Plekhg4), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000022439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48196258:48202946:1 gene:ENSRNOG00000016479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000005658 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48170694:48203411:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
NM_001004088 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255503 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006255505 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255506 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255508 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// XM_006255509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 36 (Lrrc36), transcript variant X7, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022622 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48236119:48286469:1 gene:ENSRNOG00000016854 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AY248698 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock regulated 2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005674 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48236138:48260039:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 37 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT027419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005689 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48272541:48286352:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT027420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_017081 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2 (Hsd11b2), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006255445 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2 (Hsd11b2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000023130 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48341841:48347084:1 gene:ENSRNOG00000017084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC087023 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid 11-beta dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93528 IMAGE:7130250), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// U22424 // GenBank // Rattus norvegicus 11-beta-hydroxylsteroid dehydrogenase type 2 mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005676 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48320221:48346549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001100660 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 65, member A (Fam65a), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006255471 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 65, member A (Fam65a), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// XM_006255472 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 65, member A (Fam65a), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000023710 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48445032:48452707:1 gene:ENSRNOG00000017604 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// BC099098 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 65, member A, mRNA (cDNA clone IMAGE:7459580), partial cds. // chr19 // 100 // 56 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000049110 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48445035:48468509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT027430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 20 // 8 // 8 // 0
NM_031824 // RefSeq // Rattus norvegicus CCCTC-binding factor (zinc finger protein) (Ctcf), mRNA. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023853 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48467521:48516377:1 gene:ENSRNOG00000017674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF133731 // GenBank // Rattus norvegicus 11-zinc finger protein (CTCF) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48496596:48515076:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027434 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 67 // 67 // 20 // 30 // 1
XM_006222714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD motif, leucine rich repeats, tropomodulin domain and proline-rich containing (Rltpr), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// XM_006255551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD motif, leucine rich repeats, tropomodulin domain and proline-rich containing (Rltpr), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// XR_342321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD motif, leucine rich repeats, tropomodulin domain and proline-rich containing (Rltpr), transcript variant X6, misc_RNA. // chr19 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// XR_361820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD motif, leucine rich repeats, tropomodulin domain and proline-rich containing (Rltpr), transcript variant X6, misc_RNA. // chr19 // 100 // 90 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000033136 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48524865:48531985:1 gene:ENSRNOG00000024452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 41 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000041970 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48519805:48531985:1 gene:ENSRNOG00000024452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48519542:48537038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 63 // 26 // 41 // 1 /// NONRATT027437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 22 // 22 // 9 // 41 // 1
NM_001003653 // RefSeq // Rattus norvegicus par-6 family cell polarity regulator alpha (Pard6a), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NM_001003654 // RefSeq // Rattus norvegicus par-6 family cell polarity regulator alpha (Pard6a), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000044971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48535376:48537153:1 gene:ENSRNOG00000017746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AY682586 // GenBank // Rattus norvegicus PAR6A-short splice variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AY682587 // GenBank // Rattus norvegicus PAR6A mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// DQ011518 // GenBank // Rattus norvegicus partitioning defective protein 6A mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049147 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48519542:48537038:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT027441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001109129 // RefSeq // Rattus norvegicus RGD1561415 (RGD1561415), mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000024125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48541870:48543779:1 gene:ENSRNOG00000017867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000049156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48542012:48543647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT027444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
NM_001109130 // RefSeq // Rattus norvegicus translin-associated factor X interacting protein 1 (Tsnaxip1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006255524 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translin-associated factor X interacting protein 1 (Tsnaxip1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255525 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translin-associated factor X interacting protein 1 (Tsnaxip1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255530 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus translin-associated factor X interacting protein 1 (Tsnaxip1), transcript variant X7, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000025686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48662195:48680195:1 gene:ENSRNOG00000018954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049149 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48670004:48679801:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT027451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_001107422 // RefSeq // Rattus norvegicus THAP domain containing 11 (Thap11), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48692347:48694164:1 gene:ENSRNOG00000019109 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049105 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48692565:48717475:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027454 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007629 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear transport factor 2 (Nutf2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// XM_006255480 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear transport factor 2 (Nutf2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000025608 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48697685:48718957:1 gene:ENSRNOG00000018945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC061569 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear transport factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:72930 IMAGE:6886638), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ228262 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA104YE08 mRNA sequence. // chr19 // 91 // 61 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT027455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001033068 // RefSeq // Rattus norvegicus enhancer of mRNA decapping 4 (Edc4), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000006345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48719601:48733123:1 gene:ENSRNOG00000045571 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000030967 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48719427:48731412:1 gene:ENSRNOG00000024025 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// BC103628 // GenBank // Rattus norvegicus enhancer of mRNA decapping 4, mRNA (cDNA clone MGC:124746 IMAGE:7939290), complete cds. // chr19 // 94 // 87 // 31 // 33 // 0 /// GENSCAN00000049150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48719601:48770735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// AY539866 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00115 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT027459 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// NONRATT027462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001108897 // RefSeq // Rattus norvegicus protein serine kinase H1 (Pskh1), mRNA. // chr19 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000026163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48740283:48772656:1 gene:ENSRNOG00000019290 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT027466 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049150 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48719601:48770735:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT027465 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001106181 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 2 (Dus2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006255479 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 2 (Dus2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48857360:48900338:1 gene:ENSRNOG00000019819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC158728 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrouridine synthase 2-like, SMM1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187881 IMAGE:9091646), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000049151 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48873010:48900021:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027469 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108447 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 3 (Nfatc3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006255515 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells, cytoplasmic, calcineurin-dependent 3 (Nfatc3), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025402 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48906477:48980756:1 gene:ENSRNOG00000018618 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000026528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48944175:48978219:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 36 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT027470 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027471 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT027473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001004277 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase A2, group XV (Pla2g15), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026996 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48996419:49013714:1 gene:ENSRNOG00000019859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AY490816 // GenBank // Rattus norvegicus lysosomal phospholipase A2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// BC098894 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase A2, group XV, mRNA (cDNA clone MGC:114208 IMAGE:7099635), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027475 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49007923:49043881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_001107424 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (amino acid transporter light chain, y+L system), member 6 (Slc7a6), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000027117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49029315:49045949:1 gene:ENSRNOG00000019943 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027477 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026546 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49007923:49043881:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NM_001014153 // RefSeq // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 7 (Prmt7), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000275 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49056853:49106846:1 gene:ENSRNOG00000000258 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC085121 // GenBank // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 7, mRNA (cDNA clone MGC:105858 IMAGE:7115238), complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// FQ211965 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA74YL23 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000026524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49058213:49106803:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT027482 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 37 // 37 // 14 // 38 // 1
NM_001025765 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 90 (Zfp90), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255565 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 90 (Zfp90), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006255567 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 90 (Zfp90), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000027209 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49466084:49476869:1 gene:ENSRNOG00000020087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC097467 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 90, mRNA (cDNA clone MGC:114532 IMAGE:7457672), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053528 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49444161:49481375:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT027492 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027491 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1 /// NONRATT027493 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001270388 // RefSeq // Rattus norvegicus ribosomal protein L28-like (LOC100360619), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_053938 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 3 (Cdh3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49537788:49587578:1 gene:ENSRNOG00000020129 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ220836 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA41YI11 mRNA sequence. // chr19 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// GENSCAN00000053541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49537822:49605476:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027494 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_031334 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 1 (Cdh1), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000027346 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49635965:49705893:1 gene:ENSRNOG00000020151 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// AB017696 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for E-cadherin, complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000053526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49680316:49704284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027495 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_006255569 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transport and golgi organization 6 homolog (Drosophila) (Tango6), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// XM_226428 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transport and golgi organization 6 homolog (Drosophila) (Tango6), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000030768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49713671:49834380:1 gene:ENSRNOG00000022524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000063977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49713671:49789732:1 gene:ENSRNOG00000022524 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000053537 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49713671:49914033:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT027499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_172319 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan synthase 3 (Has3), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027422 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49928282:49937713:1 gene:ENSRNOG00000020207 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AB097569 // GenBank // Rattus norvegicus HAS3 mRNA for hyaluronan synthase 3, complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// AF543196 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronan synthase 3 (Has3) mRNA, partial cds. // chr19 // 92 // 46 // 12 // 13 // 0 /// GENSCAN00000053530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49931841:49937080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT027500 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0
NM_001009640 // RefSeq // Rattus norvegicus cirrhosis, autosomal recessive 1A (cirhin) (Cirh1a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006255562 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cirrhosis, autosomal recessive 1A (cirhin) (Cirh1a), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027553 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49952333:49980521:1 gene:ENSRNOG00000020333 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC088461 // GenBank // Rattus norvegicus cirrhosis, autosomal recessive 1A (human), mRNA (cDNA clone MGC:95114 IMAGE:7127580), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000038305 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49952159:49980412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 67 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT027503 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
NM_001168674 // RefSeq // Rattus norvegicus syntrophin, beta 2 (Sntb2), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000027561 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49990515:50072998:1 gene:ENSRNOG00000020344 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038308 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50039745:50072998:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_145678 // RefSeq // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 4 homolog A (S. cerevisiae) (Vps4a), mRNA. // chr19 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000027607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50093882:50106670:1 gene:ENSRNOG00000020351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000050612 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50093779:50106218:1 gene:ENSRNOG00000020351 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB076398 // GenBank // Rattus norvegicus vps4-A mRNA for vacuolar sorting protein4 A, complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// BC070931 // GenBank // Rattus norvegicus vacuolar protein sorting 4 homolog A (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:91460 IMAGE:7096867), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// FQ213218 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA49YB02 mRNA sequence. // chr19 // 97 // 91 // 29 // 30 // 0 /// FQ219248 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YJ08 mRNA sequence. // chr19 // 73 // 91 // 22 // 30 // 0 /// FQ234555 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YI09 mRNA sequence. // chr19 // 48 // 48 // 16 // 33 // 1 /// GENSCAN00000038304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50093663:50106670:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_138847 // RefSeq // Rattus norvegicus NIP7, nucleolar pre-rRNA processing protein (Nip7), mRNA. // chr19 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000027653 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50121523:50123631:1 gene:ENSRNOG00000020391 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// AF158186 // GenBank // Rattus norvegicus pEachy mRNA, complete cds. // chr19 // 76 // 100 // 16 // 21 // 0 /// BC059114 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear import 7 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:72689 IMAGE:6921568), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC086589 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear import 7 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105322 IMAGE:7309991), complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000038316 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50121582:50123089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT027510 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_030586 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b5 type B (outer mitochondrial membrane) (Cyb5b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015006 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50221836:50255693:1 gene:ENSRNOG00000011142 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC072535 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b5 type B (outer mitochondrial membrane), mRNA (cDNA clone MGC:91666 IMAGE:7103272), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// Y12517 // GenBank // R.norvegicus mRNA for mitochondrial isoform of cytochrome b5. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// FQ215954 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA45YK14 mRNA sequence. // chr19 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT027513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// GENSCAN00000038307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50221842:50243851:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001107425 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear factor of activated T-cells 5, tonicity-responsive (Nfat5), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017005 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49315752:49403632:-1 gene:ENSRNOG00000011879 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026534 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49325508:49436397:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 59 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT028326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0
NM_001106184 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2 (Wwp2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000018837 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50405611:50476926:1 gene:ENSRNOG00000012937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// BC168152 // GenBank // Rattus norvegicus WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, mRNA (cDNA clone MGC:187565 IMAGE:7461024), complete cds. // chr19 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// JN712752 // GenBank // Rattus norvegicus E3 ligase WWP2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000035606 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50452678:50476712:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 60 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 83 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT027516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// NONRATT027519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 16 // 48 // 1 /// GENSCAN00000038313 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50362544:50437805:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// NONRATT028326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NONRATT028326 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031779 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-140 (Mir140), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053732 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:19:50471253:50471351:1 gene:ENSRNOG00000035609 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027517 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027521 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-140 // miRBase Micro RNA Database // MI0000611 Rattus norvegicus miR-140 stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000035602 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50481852:50482187:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 14 // 14 // 0
XM_226464 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger homeobox 3 (Zfhx3), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019408 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:53585376:53608565:-1 gene:ENSRNOG00000014452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000068594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:53585376:53608565:-1 gene:ENSRNOG00000014452 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000046072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:53579904:53608704:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0
NM_134393 // RefSeq // Rattus norvegicus polyamine modulated factor 1 binding protein 1 (Pmfbp1), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006255572 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polyamine modulated factor 1 binding protein 1 (Pmfbp1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000019577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52957681:53005895:-1 gene:ENSRNOG00000014505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// AF092090 // GenBank // Rattus norvegicus outer dense fiber ODF3 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000016466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52957916:53016399:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028396 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT028400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT028398 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1 /// NONRATT028399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 19 // 19 // 8 // 42 // 1
NM_001013891 // RefSeq // Rattus norvegicus thioredoxin-like 4B (Txnl4b), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000034676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52927031:52932730:-1 gene:ENSRNOG00000021379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC089962 // GenBank // Rattus norvegicus thioredoxin-like 4B, mRNA (cDNA clone MGC:109322 IMAGE:7314335), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_361828 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus thioredoxin-like 4B (Txnl4b), transcript variant X2, misc_RNA. // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1 /// GENSCAN00000055029 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52928215:52932660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT028393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028394 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1 /// NONRATT028395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_003751877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease 1 like 3-like (LOC100362565), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_003753108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease 1 like 3-like (LOC100362565), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000041395 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:52814669:52879420:-1 gene:ENSRNOG00000033737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000063840 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:52814669:52879420:-1 gene:ENSRNOG00000033737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071179 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:52839627:52879420:-1 gene:ENSRNOG00000033737 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000055024 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52816248:52866644:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
XR_086097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 821 (Zfp821), transcript variant X1, misc_RNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XR_342335 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 821 (Zfp821), transcript variant X2, misc_RNA. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// XR_361845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 821 (Zfp821), transcript variant X2, misc_RNA. // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000000279 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:52765875:52784091:-1 gene:ENSRNOG00000000262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC158722 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:9090572. // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000055035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52766180:52783572:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT028388 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028389 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT028390 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_134460 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, gamma 1 subunit (Ap1g1), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// BC166845 // GenBank // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 1, gamma 1 subunit, mRNA (cDNA clone MGC:188737 IMAGE:9029827), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// GENSCAN00000055030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52629809:52684799:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 67 // 31 // 32 // 0 /// NONRATT028386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 98 // 83 // 39 // 40 // 0
NONRATT028386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001109131 // RefSeq // Rattus norvegicus PH domain and leucine rich repeat protein phosphatase 2 (Phlpp2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// ENSRNOT00000021744 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52555245:52621851:-1 gene:ENSRNOG00000016108 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 1 /// FQ233871 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YB04 mRNA sequence. // chr19 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// GENSCAN00000055043 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52555245:52621272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT028384 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_012668 // RefSeq // Rattus norvegicus tyrosine aminotransferase (Tat), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52498945:52509800:-1 gene:ENSRNOG00000016348 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC089813 // GenBank // Rattus norvegicus tyrosine aminotransferase, mRNA (cDNA clone MGC:108738 IMAGE:7372826), complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// M18340 // GenBank // Rat tyrosine aminotransferase mRNA, complete cds. // chr19 // 94 // 92 // 31 // 33 // 0 /// X02741 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for tyrosine aminotransferase. // chr19 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000055026 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52499844:52508743:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 83 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT028380 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 25 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT028381 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 97 // 97 // 34 // 35 // 0
NM_001107428 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 612 (Zfp612), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255593 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 612 (Zfp612), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52384704:52394810:-1 gene:ENSRNOG00000016971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028371 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000034448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52367756:52415465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT028372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT028374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT028375 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
XM_003751880 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer protein 2-like (LOC100910419), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006222718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer protein 2-like (LOC100910419), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255604 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transducin-like enhancer protein 2-like (LOC100910419), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000059172 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:52367756:52369783:-1 gene:ENSRNOG00000038741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000034448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52367756:52415465:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 43 // 43 // 13 // 30 // 1
NM_001106186 // RefSeq // Rattus norvegicus cap methyltransferase 2 (Cmtr2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022952 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52255039:52261870:-1 gene:ENSRNOG00000017102 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52256137:52258440:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000035590 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:52097336:52176850:-1 gene:ENSRNOG00000023554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 42 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000059147 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:51995122:52176850:-1 gene:ENSRNOG00000023554 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000034449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52080674:52176805:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NONRATT028365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1
GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 81 // 21 // 26 // 1 /// NONRATT028363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034452 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51940619:52068109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT028361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000023117 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51863280:51954772:-1 gene:ENSRNOG00000017178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC091376 // GenBank // Rattus norvegicus hydrocephalus inducing, mRNA (cDNA clone IMAGE:7320438), partial cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000053495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51863480:51939149:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 89 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT028360 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
NM_177930 // RefSeq // Rattus norvegicus Vac14 homolog (S. cerevisiae) (Vac14), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000023383 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51753774:51855971:-1 gene:ENSRNOG00000017219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// AY220476 // GenBank // Rattus norvegicus VAC14 (Vac14) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000053492 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51785448:51855698:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028358 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000053487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51731405:51766604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001191558 // RefSeq // Rattus norvegicus metastasis suppressor 1-like (Mtss1l), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000023645 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51731405:51745922:-1 gene:ENSRNOG00000017500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053487 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51731405:51766604:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028351 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT028353 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
XM_001075132 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (LOC690662), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000049230 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:51689295:51689765:-1 gene:ENSRNOG00000033224 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000053496 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51689295:51689765:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0
NONRATT028428 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0
NM_001108449 // RefSeq // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 4 (Cog4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000023927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54191116:54224687:-1 gene:ENSRNOG00000017745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000033398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54191512:54224668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT028423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028425 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1
NM_031695 // RefSeq // Rattus norvegicus ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 2 (St3gal2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000024248 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54102746:54118616:-1 gene:ENSRNOG00000017932 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// X76988 // GenBank // R.norvegicus mRNA for gal beta 1,3 galNAc alpha 2,3-sialyltransferase. // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000033396 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54104846:54118548:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0
NM_001100517 // RefSeq // Rattus norvegicus alanyl-tRNA synthetase (Aars), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000025052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54018027:54040573:-1 gene:ENSRNOG00000018404 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000033400 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54018390:54037654:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT028416 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
XM_006222725 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exosome component 6 (Exosc6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255614 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exosome component 6 (Exosc6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025179 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:54016153:54016971:-1 gene:ENSRNOG00000018582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54016153:54017091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107430 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit (Pdpr), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000038452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:53934957:53967868:-1 gene:ENSRNOG00000022593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000033376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:53936995:53967818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_006222748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc and ring finger 1, E3 ubiquitin protein ligase (Znrf1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54557436:54640013:1 gene:ENSRNOG00000019028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000072229 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54557436:54640013:1 gene:ENSRNOG00000019028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000051594 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54558745:54640013:1 gene:ENSRNOG00000019028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// NONRATT027588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 85 // 85 // 22 // 26 // 1 /// NONRATT027591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
XM_006222755 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006255654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255657 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// XM_006255658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255661 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant X8, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255664 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant X11, mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006255665 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 1 (Zfp1), transcript variant X12, mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025761 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:54689936:54693524:1 gene:ENSRNOG00000019059 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027595 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 44 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000050351 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54660732:54700864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
XM_006247774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HID1 domain containing (Hid1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000004718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:10:104372280:104391897:1 gene:ENSRNOG00000003464 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000042246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:10:104372280:104391897:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000050346 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54834451:54868057:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT010176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// NONRATT010178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0
NM_001013143 // RefSeq // Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor 2, interacting protein (Terf2ip), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014660 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:55037928:55044772:1 gene:ENSRNOG00000010712 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC090335 // GenBank // Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor 2, interacting protein, mRNA (cDNA clone MGC:105533 IMAGE:7302641), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000011307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:55037978:55043864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027599 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// NONRATT027601 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_001107432 // RefSeq // Rattus norvegicus contactin associated protein-like 4 (Cntnap4), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000066057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:55878687:55952179:1 gene:ENSRNOG00000011231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT027603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000045431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:55809699:55926694:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
XM_006255674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MON1 secretory trafficking family member B (Mon1b), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MON1 secretory trafficking family member B (Mon1b), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NM_001107433 // RefSeq // Rattus norvegicus MON1 secretory trafficking family member B (Mon1b), mRNA. // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000065508 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:56763615:56770441:1 gene:ENSRNOG00000011552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1 /// GENSCAN00000009244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:56736563:56770032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027606 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
XM_006222764 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex central element protein 1-like (Syce1l), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255676 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex central element protein 1-like (Syce1l), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000044044 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:56771134:56781454:1 gene:ENSRNOG00000031097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:56771134:56781454:1 gene:ENSRNOG00000031097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000009250 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:56771134:56804326:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1
NM_001108450 // RefSeq // Rattus norvegicus nudix (nucleoside diphosphate linked moiety X)-type motif 7 (Nudt7), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// XM_006255677 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisomal coenzyme A diphosphatase NUDT7-like (LOC102555567), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000034012 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:57278776:57293046:1 gene:ENSRNOG00000011976 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027611 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031285 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:57284550:57306376:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006222765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus vesicle amine transport 1-like (Vat1l), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015993 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:57347972:57515078:1 gene:ENSRNOG00000011989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000075628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:57347972:57515078:1 gene:ENSRNOG00000011989 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ211768 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA80YK10 mRNA sequence. // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT027617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:57436754:57562000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// GENSCAN00000031276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:57406536:57432185:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001108899 // RefSeq // Rattus norvegicus C-type lectin domain family 3, member A (Clec3a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016307 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:57554455:57562032:1 gene:ENSRNOG00000012238 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000030506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:57436754:57562000:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006255666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000058779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:57582357:57870662:1 gene:ENSRNOG00000012030 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 70 // 18 // 19 // 0 /// NM_001106188 // RefSeq // Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_006255667 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_006255668 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_006255669 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_006255670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_006255671 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_006255672 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), transcript variant X7, mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// XM_006255673 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WW domain-containing oxidoreductase (Wwox), transcript variant X8, mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1 /// GENSCAN00000030505 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:57582357:57592271:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// NONRATT027622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
ENSRNOT00000016736 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:60072803:60073303:1 gene:ENSRNOG00000012542 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000055635 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60064323:60073244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001191786 // RefSeq // Rattus norvegicus ATM interactor (Atmin), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// ENSRNOT00000015180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:60273787:60290987:1 gene:ENSRNOG00000011422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 49 // 49 // 0 /// GENSCAN00000034138 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:74493254:74504003:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 98 // 98 // 48 // 49 // 0 /// GENSCAN00000036271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:180181125:180183557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 80 // 80 // 32 // 40 // 0 /// GENSCAN00000055631 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60273787:60288633:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 78 // 78 // 39 // 50 // 1 /// NONRATT027645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 64 // 64 // 32 // 50 // 1 /// NONRATT027642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 14 // 50 // 1 /// NONRATT051584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 46 // 46 // 23 // 50 // 1
NM_053648 // RefSeq // Rattus norvegicus beta-carotene 15,15-monooxygenase 1 (Bcmo1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016880 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:60424580:60460636:1 gene:ENSRNOG00000012027 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ219222 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA46YM14 mRNA sequence. // chr19 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056230 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60432342:60476060:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 79 // 25 // 26 // 0 /// AB062912 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for beta-carotene 15,15-dioxygenase, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001107434 // RefSeq // Rattus norvegicus gigaxonin (Gan), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016963 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:60482638:60528944:1 gene:ENSRNOG00000012671 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000056229 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60482718:60528106:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027648 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001163273 // RefSeq // Rattus norvegicus c-Maf-inducing protein (Cmip), mRNA. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:60579252:60790153:1 gene:ENSRNOG00000013178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60579252:60582206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001163273 // RefSeq // Rattus norvegicus c-Maf-inducing protein (Cmip), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006255683 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus c-Maf-inducing protein (Cmip), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000017941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:60579252:60790153:1 gene:ENSRNOG00000013178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000056240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60685071:60842344:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT027655 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0
NM_001271269 // RefSeq // Rattus norvegicus short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1 (Sdr42e1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60997538:61001006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_138889 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 13 (Cdh13), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019298 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62076973:62720152:1 gene:ENSRNOG00000014371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// AF494095 // GenBank // Rattus norvegicus T-cadherin mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// BC085699 // GenBank // Rattus norvegicus cadherin 13, mRNA (cDNA clone MGC:93172 IMAGE:7106186), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027665 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
NM_173119 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock factor binding protein 1 (Hsbp1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000019443 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62733736:62738068:1 gene:ENSRNOG00000014415 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF522937 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock factor binding protein 1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC058131 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock factor binding protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:72658 IMAGE:6919748), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// NONRATT027667 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027668 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0
NM_053477 // RefSeq // Rattus norvegicus malonyl-CoA decarboxylase (Mlycd), mRNA. // chr19 // 88 // 100 // 23 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000019923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62781487:62797312:1 gene:ENSRNOG00000014522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF304865 // GenBank // Rattus norvegicus malonyl-CoA decarboxylase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061845 // GenBank // Rattus norvegicus malonyl-CoA decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:72361 IMAGE:5621015), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:62765449:62861650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027670 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_138504 // RefSeq // Rattus norvegicus oxidative stress induced growth inhibitor 1 (Osgin1), mRNA. // chr19 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// XM_006255707 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus oxidative stress induced growth inhibitor 1 (Osgin1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 57 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000020225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62825694:62834030:1 gene:ENSRNOG00000014948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// AF549441 // GenBank // Rattus norvegicus OKL38-2.3 mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 91 // 31 // 32 // 0 /// AF549442 // GenBank // Rattus norvegicus OKL38-2.3A mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// AY081218 // GenBank // Rattus norvegicus pregnancy-induced growth inhibitor OKL38 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 77 // 27 // 27 // 0 /// BC091111 // GenBank // Rattus norvegicus oxidative stress induced growth inhibitor 1, mRNA (cDNA clone MGC:108541 IMAGE:7106386), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT027673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// NONRATT027674 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 74 // 74 // 26 // 35 // 1 /// NONRATT027676 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 69 // 69 // 24 // 35 // 1 /// GENSCAN00000050436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:62765449:62861650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 43 // 43 // 15 // 35 // 1
NM_133415 // RefSeq // Rattus norvegicus N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (Necab2), mRNA. // chr19 // 95 // 100 // 54 // 57 // 0 /// XM_006255703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus N-terminal EF-hand calcium binding protein 2 (Necab2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 51 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000020341 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62834865:62861089:1 gene:ENSRNOG00000015084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 57 // 57 // 0 /// AF193757 // GenBank // Rattus norvegicus neuronal calcium binding protein NECAB2 mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 100 // 54 // 57 // 0 /// GENSCAN00000050436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:62765449:62861650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 56 // 56 // 0 /// NONRATT027679 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 32 // 57 // 1 /// NONRATT027678 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 20 // 57 // 1 /// NONRATT027677 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 14 // 14 // 8 // 57 // 1
NM_001014154 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein, axonemal, assembly factor 1 (Dnaaf1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006255715 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dynein, axonemal, assembly factor 1 (Dnaaf1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000020917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62973796:62994143:1 gene:ENSRNOG00000015590 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC079038 // GenBank // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 50, mRNA (cDNA clone MGC:93967 IMAGE:7114363), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000017253 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:62973859:62993930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT027680 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
XM_006255733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine deaminase domain containing 2 (Adad2), mRNA. // chr19 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000021072 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:63007161:63011033:1 gene:ENSRNOG00000015690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 89 // 22 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63007161:63011843:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0
NM_133581 // RefSeq // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 1 (Wfdc1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000021630 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:63061866:63080767:1 gene:ENSRNOG00000015904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF037272 // GenBank // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain protein (ps20) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC063152 // GenBank // Rattus norvegicus WAP four-disulfide core domain 1, mRNA (cDNA clone MGC:72704 IMAGE:6887007), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ219958 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YL15 mRNA sequence. // chr19 // 82 // 100 // 23 // 28 // 0 /// NONRATT027683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027682 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// GENSCAN00000017243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63061149:63078669:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_001017511 // RefSeq // Rattus norvegicus kelch-like family member 36 (Klhl36), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255717 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch-like family member 36 (Klhl36), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:63259151:63280344:1 gene:ENSRNOG00000016422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081914 // GenBank // Rattus norvegicus kelch-like 36 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:93872 IMAGE:7112173), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017241 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63258104:63294616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001034146 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 10 (Usp10), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000022432 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:63314211:63356421:1 gene:ENSRNOG00000016509 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC105892 // GenBank // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 10, mRNA (cDNA clone MGC:124997 IMAGE:7367339), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63328585:63355309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT027686 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_138518 // RefSeq // Rattus norvegicus cysteine-rich secretory protein LCCL domain containing 2 (Crispld2), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000068389 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:63411526:63452565:1 gene:ENSRNOG00000016752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// AF109674 // GenBank // Rattus norvegicus late gestation lung protein 1 (Lgl1) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 93 // 26 // 27 // 0 /// GENSCAN00000017264 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63408240:63423368:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 38 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT027689 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000045384 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63428721:63454650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
NM_001107436 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6430548M08 (RGD1304884), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006255742 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 6430548M08 (RGD1304884), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000023478 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64452679:64469186:1 gene:ENSRNOG00000017431 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018207 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64428484:64466852:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT027697 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
XM_001078877 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Gse1 coiled-coil protein (Gse1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006222771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Gse1 coiled-coil protein (Gse1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255745 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Gse1 coiled-coil protein (Gse1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_226533 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Gse1 coiled-coil protein (Gse1), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023607 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64849291:64873898:1 gene:ENSRNOG00000017489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000068572 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64849291:64873898:1 gene:ENSRNOG00000017489 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018220 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64846996:64875749:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000053449 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:64889962:64890078:1 gene:ENSRNOG00000035326 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_017202 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit IV isoform 1 (Cox4i1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006255740 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit IV isoform 1 (Cox4i1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// XM_006255741 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit IV isoform 1 (Cox4i1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000024033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64965335:64971575:1 gene:ENSRNOG00000017817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC084719 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit IV isoform 1, mRNA (cDNA clone MGC:105470 IMAGE:7317602), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ214265 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YM19 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// X15029 // GenBank // Rat CoxIV mRNA for mitochonrial cytochrome c oxidase subunit (EC 1.9.3.1). // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000022382 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64969417:65033603:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT027707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027708 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027710 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 94 // 95 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT027711 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 95 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT027709 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
NM_001008722 // RefSeq // Rattus norvegicus interferon regulatory factor 8 (Irf8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000024069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65037338:65053996:1 gene:ENSRNOG00000017869 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB120371 // GenBank // Rattus norvegicus ICSBP mRNA for transcription factor ICSBP, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000022385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65037227:65053996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027712 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_022867 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta (Map1lc3b), mRNA. // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000067141 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64373068:64381399:1 gene:ENSRNOG00000017905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// AY206670 // GenBank // Rattus norvegicus map1a/1b light chain 3b3 mRNA, complete cds. // chr19 // 83 // 46 // 10 // 12 // 0 /// AY392036 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 (Map1lc3) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC083556 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta, mRNA (cDNA clone MGC:93422 IMAGE:7189855), complete cds. // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// U05784 // GenBank // Rattus norvegicus microtubule-associated proteins 1A and 1B light chain 3 subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000051352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64367214:64383493:1 gene:ENSRNOG00000017905 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// AY310156 // GenBank HTC // Rattus norvegicus zbs559 mRNA, complete cds. // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT027692 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000026868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64372880:64383493:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001107437 // RefSeq // Rattus norvegicus junctophilin 3 (Jph3), mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000025392 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65267451:65327679:1 gene:ENSRNOG00000018784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65267451:65326323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001106191 // RefSeq // Rattus norvegicus Btg3 associated nuclear protein (Banp), mRNA. // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000025894 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65485733:65559757:1 gene:ENSRNOG00000019140 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC160844 // GenBank // Rattus norvegicus Btg3 associated nuclear protein, mRNA (cDNA clone MGC:187571 IMAGE:8361869), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000004307 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65505795:65560583:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT027719 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// NONRATT027718 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 13 // 31 // 1
XM_003753125 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 469 (Zfp469), mRNA. // chr19 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000039644 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:65787859:65798862:1 gene:ENSRNOG00000028530 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// NM_001242627 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein, multitype 1 (Zfpm1), mRNA. // chr19 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000068452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65810197:65865945:1 gene:ENSRNOG00000043077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1 /// GENSCAN00000004299 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65771297:65865883:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027723 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1
NM_201416 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 18 (Zc3h18), mRNA. // chr19 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// XM_006255761 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger CCCH-type containing 18 (Zc3h18), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000039273 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65917257:65952371:1 gene:ENSRNOG00000028501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000045657 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65917257:65952371:1 gene:ENSRNOG00000028501 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 42 // 42 // 0 /// AY389807 // GenBank // Rattus norvegicus Nhn1B mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 95 // 40 // 42 // 0 /// AY389808 // GenBank // Rattus norvegicus Nhn1A mRNA, complete cds. // chr19 // 95 // 91 // 38 // 40 // 0 /// GENSCAN00000021221 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65932726:65951987:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 32 // 32 // 0
NM_001191115 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 17C (Il17c), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017358 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65957110:65958389:1 gene:ENSRNOG00000013007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021209 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65957110:65958389:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001037094 // RefSeq // Rattus norvegicus cytosolic thiouridylase subunit 2 homolog (S. pombe) (Ctu2), mRNA. // chr19 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000033316 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66009931:66014982:1 gene:ENSRNOG00000028270 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// BC079393 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310061F22, mRNA (cDNA clone IMAGE:7111976), partial cds. // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// BC107464 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310061F22, mRNA (cDNA clone MGC:125094 IMAGE:7454431), complete cds. // chr19 // 93 // 97 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021282 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66009751:66014949:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// NONRATT027728 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0
NM_001106192 // RefSeq // Rattus norvegicus chromatin licensing and DNA replication factor 1 (Cdt1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018923 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66090081:66095027:1 gene:ENSRNOG00000013970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021276 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66090122:66094500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
XM_001079424 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase family member 3 (Acsf3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_574249 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA synthetase family member 3 (Acsf3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000020313 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:66307158:66342053:1 gene:ENSRNOG00000015077 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000021212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66284830:66395665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 85 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT027741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027740 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_207613 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 15 (Cdh15), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000033352 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66375691:66396016:1 gene:ENSRNOG00000027954 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AB176538 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for M-cadherin, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021212 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66284830:66395665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_181388 // RefSeq // Rattus norvegicus spastic paraplegia 7 homolog (human) (Spg7), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000047754 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66586319:66618933:1 gene:ENSRNOG00000015150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY278739 // GenBank // Rattus norvegicus paraplegin (Spg7) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ224821 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA53YE08 mRNA sequence. // chr19 // 91 // 100 // 31 // 34 // 0 /// GENSCAN00000020158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66586370:66618740:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
BC086577 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7306528. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027751 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027752 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027753 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001108454 // RefSeq // Rattus norvegicus copine VII (Cpne7), mRNA. // chr19 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000068231 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66634979:66651622:1 gene:ENSRNOG00000015397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// GENSCAN00000020180 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66635094:66650986:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027756 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_053591 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidase 1 (renal) (Dpep1), mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// XM_006255783 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dipeptidase 1 (renal) (Dpep1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000021397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66688900:66704281:1 gene:ENSRNOG00000015880 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// BC072476 // GenBank // Rattus norvegicus dipeptidase 1 (renal), mRNA (cDNA clone MGC:91569 IMAGE:7100683), complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// L07315 // GenBank // Rat dipeptidase (dpep1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// L07316 // GenBank // Rat dipeptidase (dpep1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// M94056 // GenBank // Rat dipeptidase (dpep1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 91 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000020144 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66676827:66703463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027758 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT027757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 49 // 49 // 17 // 35 // 1
NM_001106195 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 33 (Spata33), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058216 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66715538:66727297:1 gene:ENSRNOG00000038239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000020162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66715658:66736922:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT027760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027761 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
ENSRNOT00000022324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66759591:66772638:1 gene:ENSRNOG00000016631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000066034 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66759591:66761781:1 gene:ENSRNOG00000016631 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 34 // 11 // 11 // 0 /// BC079416 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein (C2H2 type) 276, mRNA (cDNA clone IMAGE:7113470), partial cds. // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66759591:66772256:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027772 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1 /// NONRATT027774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001127538 // RefSeq // Rattus norvegicus spire-type actin nucleation factor 2 (Spire2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spire-type actin nucleation factor 2 (Spire2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66847908:66886394:1 gene:ENSRNOG00000016920 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC166756 // GenBank // Rattus norvegicus spire homolog 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:188506 IMAGE:7930322), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000020175 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66847914:66886277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027777 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000046155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66890051:66921560:1 gene:ENSRNOG00000017023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000066223 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66890051:66921560:1 gene:ENSRNOG00000017023 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0 /// FQ215148 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA49YI21 mRNA sequence. // chr19 // 97 // 89 // 32 // 33 // 0 /// FQ230504 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA96YF17 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66888607:66921463:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027778 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT027781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 54 // 54 // 20 // 37 // 1 /// NONRATT027779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// NONRATT027782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
XM_006222790 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus melanocyte-stimulating hormone receptor-like (LOC102552838), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255795 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus melanocyte-stimulating hormone receptor-like (LOC102552838), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000058145 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:66927934:66928887:1 gene:ENSRNOG00000038193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000035244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66927934:66940569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0
NM_139254 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin, beta 3 class III (Tubb3), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66931873:66940864:1 gene:ENSRNOG00000017209 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC097281 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin, beta 3, mRNA (cDNA clone MGC:114260 IMAGE:7461390), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66927934:66940569:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// AF459021 // GenBank // Rattus norvegicus neuron-specific class III beta-tubulin mRNA, complete cds. // chr19 // 88 // 96 // 22 // 25 // 0 /// NONRATT027787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0
NM_001024774 // RefSeq // Rattus norvegicus differentially expressed in FDCP 8 homolog (mouse) (Def8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000000281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66954015:66969849:1 gene:ENSRNOG00000000264 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC097376 // GenBank // Rattus norvegicus differentially expressed in FDCP 8 homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:114411 IMAGE:7444965), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000035242 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66949542:66968154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027789 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT027788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 53 // 53 // 19 // 36 // 1
NM_001108456 // RefSeq // Rattus norvegicus AFG3(ATPase family gene 3)-like 1 (S. cerevisiae) (Afg3l1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000030399 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66982824:67009036:1 gene:ENSRNOG00000026994 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035259 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66988077:67008925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT027794 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT027793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_001039030 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest specific 8 (Gas8), mRNA. // chr19 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// XM_006255777 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest specific 8 (Gas8), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255778 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest specific 8 (Gas8), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255779 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus growth arrest specific 8 (Gas8), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000029999 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67025621:67045030:1 gene:ENSRNOG00000026964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC099759 // GenBank // Rattus norvegicus growth arrest specific 8, mRNA (cDNA clone MGC:124779 IMAGE:7929646), complete cds. // chr19 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000035248 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67025644:67069284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_013019 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB4A, member RAS oncogene family (Rab4a), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000049337 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67296402:67323422:1 gene:ENSRNOG00000017467 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC062016 // GenBank // Rattus norvegicus RAB4A, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:72520 IMAGE:5621494), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027799 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// GENSCAN00000035252 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67252144:67320785:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_001135708 // RefSeq // Rattus norvegicus URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae) (Urb2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000036042 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67518507:67541817:1 gene:ENSRNOG00000026853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000000428 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67522263:67540586:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0
NM_001106196 // RefSeq // Rattus norvegicus polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (Galnt2), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065431 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67774647:67824801:1 gene:ENSRNOG00000019143 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC168926 // GenBank // Rattus norvegicus UDP-N-acetyl-alpha-D-galactosamine:polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 (GalNAc-T2), mRNA (cDNA clone IMAGE:7109082), partial cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000427 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67806607:67822458:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027808 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000437 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67755044:67802072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001110494 // RefSeq // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 2 (Cog2), mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// XR_361924 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 2 (Cog2), transcript variant X2, misc_RNA. // chr19 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000058074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67991564:68023917:1 gene:ENSRNOG00000018228 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// BC091434 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone MGC:109642 IMAGE:7368024, complete cds. // chr19 // 100 // 29 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000053155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67991632:68023457:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027810 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// NONRATT027811 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 21 // 21 // 9 // 42 // 1
NM_001271140 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain 9 (Capn9), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000025357 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68047188:68083089:1 gene:ENSRNOG00000018480 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000053168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68038729:68099169:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 34 // 34 // 0
GENSCAN00000053167 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68170665:68170937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 83 // 18 // 19 // 0
NM_001106197 // RefSeq // Rattus norvegicus ARV1 homolog (S. cerevisiae) (Arv1), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68189521:68201340:1 gene:ENSRNOG00000018909 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053169 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68189568:68199491:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT027821 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027825 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001135715 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 67 (Trim67), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000032359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68269785:68305962:1 gene:ENSRNOG00000019024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000053164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68232906:68307002:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0
NM_053410 // RefSeq // Rattus norvegicus glyceronephosphate O-acyltransferase (Gnpat), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026617 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68327864:68354395:1 gene:ENSRNOG00000019205 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AF218826 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-CoA:dihydroxyacetonephosphate acyltransferase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// FQ217065 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA36YE01 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// FQ219436 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA45YE09 mRNA sequence. // chr19 // 67 // 45 // 10 // 15 // 0 /// GENSCAN00000053166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68333453:68358278:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027829 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NM_001106199 // RefSeq // Rattus norvegicus SprT-like N-terminal domain (Sprtn), mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006255810 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SprT-like N-terminal domain (Sprtn), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000038257 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68363402:68367942:1 gene:ENSRNOG00000021330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68363410:68367905:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
NM_175596 // RefSeq // Rattus norvegicus disrupted in schizophrenia 1 (Disc1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000057945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68529791:68769050:1 gene:ENSRNOG00000019779 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AY177674 // GenBank // Rattus norvegicus disrupted-in-schizophrenia-1 (Disc1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT027836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000019524 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68585860:68641933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1
NM_001012504 // RefSeq // Rattus norvegicus SET nuclear oncogene (Set), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// ENSRNOT00000051397 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:69119722:69121240:1 gene:ENSRNOG00000034241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// AY325137 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab1-115 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// BC158573 // GenBank // Rattus norvegicus SET nuclear oncogene, mRNA (cDNA clone MGC:187306 IMAGE:9089104), complete cds. // chr19 // 86 // 88 // 6 // 7 // 0 /// FQ226736 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YJ14 mRNA sequence. // chr19 // 86 // 88 // 6 // 7 // 0 /// GENSCAN00000047763 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:69119722:69120591:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT027838 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_001277391 // RefSeq // Rattus norvegicus microtubule-associated protein 10 (Map10), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000031717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:69203373:69206039:1 gene:ENSRNOG00000028652 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047744 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:69145409:69214455:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 90 // 40 // 9 // 10 // 0
NM_001134573 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoside-triphosphatase, cancer-related (Ntpcr), mRNA. // chr19 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000026965 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:69262818:69276518:1 gene:ENSRNOG00000019922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 84 // 84 // 26 // 31 // 1 /// NONRATT027840 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 77 // 77 // 24 // 31 // 1 /// GENSCAN00000047741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:69227763:69276133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1
XM_006255822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to Mixed lineage kinase 4 (RGD1306091), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026986 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:69440677:69470233:1 gene:ENSRNOG00000019931 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030338 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:69440677:69470233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_021688 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 1 (Kcnk1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006255820 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 1 (Kcnk1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000027058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:69519245:69555914:1 gene:ENSRNOG00000019937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// AF022819 // GenBank // Rattus norvegicus putative potassium channel TWIK mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// BC061807 // GenBank // Rattus norvegicus potassium channel, subfamily K, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72470 IMAGE:5598415), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT027845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT027846 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 43 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000030341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:69484215:69555114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 52 // 52 // 12 // 23 // 1
XM_003749553 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex subunit 2-like (LOC100911033), mRNA. // chr19 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// XM_003753760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HAUS augmin-like complex subunit 2-like (LOC100911033), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013316 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118918628:118924603:1 gene:ENSRNOG00000048933 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000056210 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:118932552:118938528:1 gene:ENSRNOG00000046745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 57 // 16 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000073582 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:70580498:70581202:1 gene:ENSRNOG00000049634 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000075447 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:70585715:70586419:1 gene:ENSRNOG00000048700 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000000130 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:70580498:70586419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ222259 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA25YO15 mRNA sequence. // chr19 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT035547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_031235 // RefSeq // Rattus norvegicus par-3 family cell polarity regulator (Pard3), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255835 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus par-3 family cell polarity regulator (Pard3), transcript variant X8, mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000042623 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:70690939:71248880:1 gene:ENSRNOG00000032437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AB005549 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for atypical PKC specific binding protein, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255838 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus par-3 family cell polarity regulator (Pard3), transcript variant X11, mRNA. // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// GENSCAN00000011793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:70944616:71009912:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000011807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:71010886:71087171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_145098 // RefSeq // Rattus norvegicus neuropilin 1 (Nrp1), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000014492 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:71984687:72136034:1 gene:ENSRNOG00000010744 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// AF016296 // GenBank // Rattus norvegicus neuropilin mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 38 // 38 // 0 /// AF018957 // GenBank // Rattus norvegicus neuropilin mRNA, complete cds. // chr19 // 91 // 79 // 31 // 34 // 0 /// BC085689 // GenBank // Rattus norvegicus neuropilin 1, mRNA (cDNA clone MGC:93089 IMAGE:7109697), complete cds. // chr19 // 100 // 98 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000056000 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:71933250:72149962:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT027860 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT027861 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_144743 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxylesterase 2A (Ces2a), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// XM_006255047 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carboxylesterase 2A (Ces2a), mRNA. // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// AY034877 // GenBank // Rattus norvegicus carboxylesterase isoenzyme gene, complete cds. // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000015451 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:59722:64825:-1 gene:ENSRNOG00000011330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 67 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT027864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr1 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000061769 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:119000:121922:-1 gene:ENSRNOG00000026262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 83 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000074991 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:119030:121919:-1 gene:ENSRNOG00000026262 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 83 // 18 // 19 // 0
XM_006255046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC681364 (LOC681364), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000046676 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:459252:463699:-1 gene:ENSRNOG00000049312 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006222689 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC691712), mRNA. // chr19 // 52 // 95 // 11 // 21 // 0 /// GENSCAN00000037817 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:460009:463693:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041115 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:39715890:39721361:1 gene:ENSRNOG00000049890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 41 // 100 // 9 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:46978078:46995272:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 95 // 8 // 21 // 0 /// GENSCAN00000051062 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:38740069:38743571:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 95 // 8 // 21 // 0 /// GENSCAN00000013196 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39036023:39039869:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000051059 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:38665387:38668929:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1 /// GENSCAN00000058046 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39715896:39719450:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
NM_145091 // RefSeq // Rattus norvegicus pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 (Pdp2), mRNA. // chr19 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// XM_006255048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 2 (Pdp2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000016462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:591632:595934:-1 gene:ENSRNOG00000012343 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// AF062741 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase phosphatase isoenzyme 2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// BC072485 // GenBank // Rattus norvegicus pyruvate dehydrogenase phosphatase isoenzyme 2, mRNA (cDNA clone MGC:91445 IMAGE:7105072), complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051737 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:592288:625257:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 31 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT027867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001106165 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 7 (Car7), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255051 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 7 (Car7), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:630356:747530:-1 gene:ENSRNOG00000012371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// BC167038 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 7, mRNA (cDNA clone MGC:189301 IMAGE:9090629), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000051748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:630999:639748:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0
NM_001106164 // RefSeq // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3 (Cmtm3), mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000014234 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:829213:836125:-1 gene:ENSRNOG00000010691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC169107 // GenBank // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:189531 IMAGE:7130835), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ227380 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YI21 mRNA sequence. // chr19 // 95 // 85 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000051736 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:830106:836009:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001029914 // RefSeq // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 1 (Cmtm1), mRNA. // chr19 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// XM_006255052 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 1 (Cmtm1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 51 // 19 // 19 // 0 /// XR_361583 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 1 (Cmtm1), transcript variant X2, misc_RNA. // chr19 // 94 // 43 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000039025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:852928:862470:-1 gene:ENSRNOG00000025409 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// BC098029 // GenBank // Rattus norvegicus CKLF-like MARVEL transmembrane domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:116183 IMAGE:7456234), complete cds. // chr19 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT027873 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 62 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051745 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:846937:872042:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 25 // 37 // 1
GENSCAN00000051747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:897736:915627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 45 // 45 // 10 // 22 // 1
NM_139111 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine-like factor (Cklf), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017127 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:907067:915792:-1 gene:ENSRNOG00000012752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:907067:915792:-1 gene:ENSRNOG00000012752 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF253064 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine-like factor 1 (CKLF1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// AF253065 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine-like factor 2 (CKLF2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027874 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051747 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:897736:915627:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1 /// NONRATT027876 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
XM_006222658 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brain expressed, associated with NEDD4, 1 (Bean1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255060 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus brain expressed, associated with NEDD4, 1 (Bean1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017774 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:950519:956538:-1 gene:ENSRNOG00000013301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000064781 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:950519:983660:-1 gene:ENSRNOG00000013301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000051741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:942687:994537:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027877 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107407 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 5 (Cdh5), mRNA. // chr19 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:1022710:1037677:-1 gene:ENSRNOG00000013324 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 61 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000035375 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:1022868:1128035:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1
XM_001058123 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor BTF3-like (RGD1564126), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_226217 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transcription factor BTF3-like (RGD1564126), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047925 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:2591179:2591658:-1 gene:ENSRNOG00000031076 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000054684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:2591179:2591658:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
GENSCAN00000000297 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:6019298:6026214:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// NONRATT053125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 79 // 22 // 23 // 0
GENSCAN00000025752 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:8356489:8433301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1
ENSRNOT00000030597 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:8932485:8932688:-1 gene:ENSRNOG00000023805 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000025864 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:8911471:8932688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001106167 // RefSeq // Rattus norvegicus SET domain containing 6 (Setd6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255070 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SET domain containing 6 (Setd6), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:9747567:9750562:-1 gene:ENSRNOG00000012447 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000027473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9747023:9750535:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT027890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027889 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT027891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001107408 // RefSeq // Rattus norvegicus GINS complex subunit 3 (Psf3 homolog) (Gins3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:9820191:9828727:-1 gene:ENSRNOG00000011863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000027481 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9820404:9828685:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT027902 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027903 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
XM_006255129 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 113 (Ccdc113), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015849 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:9897186:9916806:-1 gene:ENSRNOG00000011883 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027482 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:9897186:9916806:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027905 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027907 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT027908 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1
NM_001106168 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 15 (Mmp15), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000017629 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10064056:10085300:-1 gene:ENSRNOG00000012622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000017461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10065355:10102506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001014013 // RefSeq // Rattus norvegicus U6 snRNA biogenesis 1 (Usb1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10089672:10102534:-1 gene:ENSRNOG00000013216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088280 // GenBank // Rattus norvegicus similar to expressed sequence AA960436, mRNA (cDNA clone MGC:109139 IMAGE:7383193), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017461 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10065355:10102506:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 75 // 75 // 21 // 28 // 1 /// NONRATT027912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_201655 // RefSeq // Rattus norvegicus testis, prostate and placenta expressed (Tepp), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018082 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10113530:10121992:-1 gene:ENSRNOG00000013465 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000017504 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10113494:10120969:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027914 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027913 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NONRATT027915 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001024746 // RefSeq // Rattus norvegicus katanin p80 (WD repeat containing) subunit B 1 (Katnb1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// XM_006255074 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus katanin p80 (WD repeat containing) subunit B 1 (Katnb1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000019770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10320410:10338205:-1 gene:ENSRNOG00000014626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// AY953248 // GenBank // Rattus norvegicus katanin p80 subunit B1 (Katnb1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC161823 // GenBank // Rattus norvegicus katanin p80 (WD repeat containing) subunit B 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:9102535), partial cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000017470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10320410:10337959:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT027916 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT027917 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 12 // 34 // 1 /// NONRATT027918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
NM_001106169 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 135 (Ccdc135), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000031064 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10342364:10360068:-1 gene:ENSRNOG00000025860 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000017495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10342515:10367103:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT027921 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0
XM_006222660 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 97 (Gpr97), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006255126 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 97 (Gpr97), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000020062 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:10372147:10400057:-1 gene:ENSRNOG00000014896 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000017433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10372147:10400057:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027923 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 55 // 55 // 17 // 31 // 1 /// NONRATT027922 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1 /// NONRATT027924 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_152242 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 56 (Gpr56), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10403029:10442272:-1 gene:ENSRNOG00000014963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AF529886 // GenBank // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 56 (Gpr56) mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// NONRATT027925 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017479 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10404218:10478469:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT027926 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT027927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001107410 // RefSeq // Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 114 (Gpr114), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G protein-coupled receptor 114 (Gpr114), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000061270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10492484:10510112:-1 gene:ENSRNOG00000039891 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041810 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10493399:10516575:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027929 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0
NM_001012473 // RefSeq // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide C (Polr2c), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021639 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10569862:10576683:-1 gene:ENSRNOG00000015720 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC089905 // GenBank // Rattus norvegicus polymerase (RNA) II (DNA directed) polypeptide C, 33kDa, mRNA (cDNA clone MGC:109156 IMAGE:7322752), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// FQ226282 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YL11 mRNA sequence. // chr19 // 93 // 90 // 25 // 27 // 0 /// NONRATT027932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10570173:10591641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 80 // 80 // 24 // 30 // 1
NM_001035257 // RefSeq // Rattus norvegicus coenzyme Q9 (Coq9), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021716 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10578663:10591651:-1 gene:ENSRNOG00000016190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC127449 // GenBank // Rattus norvegicus coenzyme Q9 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156484 IMAGE:8365327), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255119 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coenzyme Q9 (Coq9), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 88 // 88 // 23 // 26 // 1 /// NONRATT027933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10570173:10591641:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1 /// NONRATT027935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT027934 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT027936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_057151 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 17 (Ccl17), mRNA. // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021842 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10614027:10615478:-1 gene:ENSRNOG00000016278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// AF312687 // GenBank // Rattus norvegicus thymus and activation-regulated chemokine mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000041822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10614027:10615478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0
GENSCAN00000041802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10625181:10647931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_134455 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-X3-C motif) ligand 1 (Cx3cl1), mRNA. // chr19 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022128 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10638461:10647952:-1 gene:ENSRNOG00000016326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// AF030358 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine CX3C mRNA, complete cds. // chr19 // 88 // 96 // 21 // 24 // 0 /// BC070938 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-X3-C motif) ligand 1, mRNA (cDNA clone MGC:91495 IMAGE:7099250), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027939 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041802 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10625181:10647931:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_057203 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 22 (Ccl22), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022167 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10668403:10675173:-1 gene:ENSRNOG00000016535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF163477 // GenBank // Rattus norvegicus macrophage-derived chemokine mRNA, partial cds. // chr19 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// AF432871 // GenBank // Rattus norvegicus LEW macrophage-derived chemokine CCL22 (MDC) mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 73 // 17 // 19 // 0 /// BC088218 // GenBank // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 22, mRNA (cDNA clone MGC:108943 IMAGE:7384271), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027940 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041831 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10663914:10675150:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
NM_001024906 // RefSeq // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein (Arl2bp), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255120 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein (Arl2bp), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255122 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein (Arl2bp), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000023455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10747793:10757367:-1 gene:ENSRNOG00000016991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097448 // GenBank // Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 2 binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:114508 IMAGE:7456585), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027943 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1 /// NONRATT027945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// GENSCAN00000041833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10749157:10806747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// NONRATT027944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001100945 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger and SPRY domain containing 1 (Rspry1), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000023988 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:10764919:10820883:-1 gene:ENSRNOG00000017471 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC129112 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger and SPRY domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:156751 IMAGE:7112017), complete cds. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000041833 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10749157:10806747:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1
XM_001062196 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NLR family, CARD domain containing 5 (Nlrc5), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000073239 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:10897691:10959365:-1 gene:ENSRNOG00000048222 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// XM_006255134 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein NLRC5-like (LOC102553150), mRNA. // chr19 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1 /// GENSCAN00000037474 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10992884:10996537:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000041807 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10949213:10965679:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 29 // 29 // 14 // 48 // 1 /// GENSCAN00000041829 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:10893673:10939783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 22 // 48 // 1
NM_053523 // RefSeq // Rattus norvegicus homocysteine-inducible, endoplasmic reticulum stress-inducible, ubiquitin-like domain member 1 (Herpud1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000025559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11027635:11037998:-1 gene:ENSRNOG00000018796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AB033771 // GenBank // Rattus norvegicus SUP mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC061849 // GenBank // Rattus norvegicus homocysteine-inducible, endoplasmic reticulum stress-inducible, ubiquitin-like domain member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72340 IMAGE:5621877), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000037477 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11028206:11038179:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT027951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT027954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT027955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_019345 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 12 (sodium/chloride transporters), member 3 (Slc12a3), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000025377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11084948:11122657:-1 gene:ENSRNOG00000018607 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U10097 // GenBank // Rattus norvegicus thiazide-sensitive sodium-chloride cotransporter mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027956 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000037489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11059086:11122645:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
NR_031884 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 138-2 (Mir138-2), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000053766 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:19:11127479:11127560:-1 gene:ENSRNOG00000035643 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027957 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// rno-mir-138-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000911 Rattus norvegicus miR-138-2 stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001011925 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 93 (Nup93), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000025086 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11137505:11238898:-1 gene:ENSRNOG00000018564 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// BC081925 // GenBank // Rattus norvegicus nucleoporin 93kDa, mRNA (cDNA clone MGC:93917 IMAGE:7113037), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000037500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11127041:11229471:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT027958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0
NM_001137564 // RefSeq // Rattus norvegicus metallothionein 2A (Mt2A), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_002728917 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metallothionein 1M (Mt1m), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_003753446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metallothionein 1M (Mt1m), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000047663 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:20:5766751:5766936:1 gene:ENSRNOG00000028841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000067391 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11283094:11283867:-1 gene:ENSRNOG00000043098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC168768 // GenBank // Rattus norvegicus metallothionein 2A, mRNA (cDNA clone MGC:188897 IMAGE:6891160), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000037470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11273034:11301864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 100 // 12 // 26 // 0
NM_053968 // RefSeq // Rattus norvegicus metallothionein 3 (Mt3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025669 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11300015:11301422:-1 gene:ENSRNOG00000018958 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC058453 // GenBank // Rattus norvegicus metallothionein 3, mRNA (cDNA clone MGC:72731 IMAGE:6887014), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027967 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000037470 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11273034:11301864:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_001126084 // RefSeq // Rattus norvegicus metallothionein 4 (Mt4), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025694 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11315073:11317169:-1 gene:ENSRNOG00000019004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027968 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001107411 // RefSeq // Rattus norvegicus 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain containing 1 (Ogfod1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026118 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11399734:11425518:-1 gene:ENSRNOG00000019288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000037495 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11399734:11413008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT027971 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_017327 // RefSeq // Rattus norvegicus guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha activating activity polypeptide O (Gnao1), mRNA. // chr19 // 86 // 63 // 19 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026373 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11487578:11643367:-1 gene:ENSRNOG00000019482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 63 // 19 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000026429 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:11498629:11643367:-1 gene:ENSRNOG00000019482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 25 // 25 // 0 /// M17526 // GenBank // Rat GTP-binding protein (G-alpha-0) mRNA, complete cds. // chr19 // 86 // 63 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000012160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:11498629:11588023:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 16 // 35 // 1
NM_001108439 // RefSeq // Rattus norvegicus like-glycosyltransferase (Large), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// XM_006255140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus like-glycosyltransferase (Large), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000064105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:23595328:24054765:-1 gene:ENSRNOG00000013742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006973 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:23596544:23691740:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000006978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:23735890:23840347:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// NONRATT027981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_134398 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha- and gamma-adaptin binding protein (Aagab), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000011385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:8:68247490:68284415:1 gene:ENSRNOG00000008424 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// AF178669 // GenBank // Rattus norvegicus p34 mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// FQ224819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA53YG05 mRNA sequence. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000018484 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:24083293:24084208:-1 gene:ENSRNOG00000013826 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000013651 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:24083369:24084208:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 86 // 23 // 24 // 0 /// GENSCAN00000037730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:68247526:68266523:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 54 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT053460 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:68262055:68263009:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 44 // 64 // 8 // 18 // 0
XM_001080556 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SRR1 domain containing (Srrd), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006221389 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SRR1 domain containing (Srrd), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006249579 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SRR1 domain containing (Srrd), transcript variant X1, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_213799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SRR1 domain containing (Srrd), transcript variant X2, mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000000826 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:52073011:52078001:1 gene:ENSRNOG00000000662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT015231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT015232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053397 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:52074908:52078419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 50 // 50 // 15 // 30 // 1
ENSRNOT00000032928 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:12:52060094:52061614:1 gene:ENSRNOG00000025626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:52053293:52061470:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 81 // 17 // 17 // 0
NM_001009716 // RefSeq // Rattus norvegicus aspartate beta-hydroxylase domain containing 2 (Asphd2), mRNA. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000000823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:52030649:52037039:1 gene:ENSRNOG00000000660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// BC088863 // GenBank // Rattus norvegicus aspartate beta-hydroxylase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:105590 IMAGE:7313227), complete cds. // chr12 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:52030961:52036745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 91 // 42 // 10 // 11 // 0
NONRATT015228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134538 // RefSeq // Rattus norvegicus seizure related 6 homolog (mouse)-like (Sez6l), mRNA. // chr12 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000032193 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:12:51848836:51998895:1 gene:ENSRNOG00000025612 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 97 // 94 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000053368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:51953174:51961401:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT015224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr12 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000021476 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:51846270:51950605:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1 /// GENSCAN00000053378 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:12:51975203:52018572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr12 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
XM_006227136 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC100909409), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// XM_006255043 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC689453 (LOC689453), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 55 // 92 // 6 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000044037 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:342067:346819:-1 gene:ENSRNOG00000050034 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 100 // 8 // 12 // 0 /// NONRATT027865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0
NM_031343 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 6 (neurotransmitter transporter), member 2 (Slc6a2), mRNA. // chr19 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000022285 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26487814:26527769:-1 gene:ENSRNOG00000016311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000048470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26487829:26527769:-1 gene:ENSRNOG00000016311 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// AB021970 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for norepinephrine transporter a (rNETa), complete cds. // chr19 // 85 // 87 // 23 // 27 // 0 /// AB021971 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for norepinephrine transporter b (rNETb), complete cds. // chr19 // 87 // 100 // 27 // 31 // 0 /// Y13223 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for norepinephrine transporter. // chr19 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// GENSCAN00000009500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26480728:26575927:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027989 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001271344 // RefSeq // Rattus norvegicus lysophosphatidylcholine acyltransferase 2 (Lpcat2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022359 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26567387:26627661:-1 gene:ENSRNOG00000016643 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027993 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// GENSCAN00000009515 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26587893:26627661:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 11 // 24 // 1
NM_001109380 // RefSeq // Rattus norvegicus calpain, small subunit 2 (Capns2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000009508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26581903:26582646:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031054 // RefSeq // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 2 (Mmp2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000022679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26630488:26658966:-1 gene:ENSRNOG00000016695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 38 // 38 // 0 /// BC074013 // GenBank // Rattus norvegicus matrix metallopeptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:91653 IMAGE:7100171), complete cds. // chr19 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// U65656 // GenBank // Rattus norvegicus gelatinase A mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000009518 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26630488:26658675:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 83 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT027996 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 80 // 33 // 33 // 0 /// X71466 // GenBank // R. Norvegicus mRNA for 72 KDa type IV collagenase. // chr19 // 38 // 90 // 14 // 37 // 0
NM_001102413 // RefSeq // Rattus norvegicus iroquois homeobox 6 (Irx6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000014831 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:26813494:26819392:-1 gene:ENSRNOG00000011037 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000009513 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:26797858:26920600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001030044 // RefSeq // Rattus norvegicus iroquois homeobox 5 (Irx5), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// XM_006255198 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus iroquois homeobox 5 (Irx5), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000015272 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:27491960:27494654:1 gene:ENSRNOG00000011180 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// DQ109812 // GenBank // Rattus norvegicus iroquois homeobox protein 5 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000056948 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:27468723:27494654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT027130 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_006222670 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554898 (LOC102554898), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255202 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102554898 (LOC102554898), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027129 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_001039713 // RefSeq // Rattus norvegicus fat mass and obesity associated (Fto), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255175 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fat mass and obesity associated (Fto), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006255177 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fat mass and obesity associated (Fto), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000015718 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:27840262:28182203:-1 gene:ENSRNOG00000011728 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168239 // GenBank // Rattus norvegicus fat mass and obesity associated, mRNA (cDNA clone MGC:188360 IMAGE:5599736), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ211940 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA75YN10 mRNA sequence. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000051854 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:28003519:28164020:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028006 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_031094 // RefSeq // Rattus norvegicus retinoblastoma-like 2 (Rbl2), mRNA. // chr19 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// XM_006255200 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus retinoblastoma-like 2 (Rbl2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 82 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000017361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:28364201:28410920:-1 gene:ENSRNOG00000012153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// D55627 // GenBank // Rattus norvegicus p130 mRNA, complete cds. // chr19 // 98 // 100 // 43 // 44 // 0 /// GENSCAN00000051856 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:28365587:28428907:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT028008 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// NONRATT028007 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 14 // 44 // 1 /// NONRATT028011 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
XM_002725383 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 9 (Chd9), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006222674 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 9 (Chd9), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// XM_006222675 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain helicase DNA binding protein 9 (Chd9), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000018707 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:28476269:28496207:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 29 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT028022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001106172 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 (Nod2), mRNA. // chr19 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000065103 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:30375244:30409527:-1 gene:ENSRNOG00000014124 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000027122 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:30357271:30409818:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028034 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0
NM_001271381 // RefSeq // Rattus norvegicus naked cuticle homolog 1 (Drosophila) (Nkd1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000019301 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:30466493:30539435:-1 gene:ENSRNOG00000014293 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// BC168970 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7123004. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:30469137:30609545:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028037 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 97 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028038 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_053396 // RefSeq // Rattus norvegicus adenylate cyclase 7 (Adcy7), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:30730189:30752411:-1 gene:ENSRNOG00000014776 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000006577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:30731050:30857618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0
NM_001107416 // RefSeq // Rattus norvegicus PAP associated domain containing 5 (Papd5), mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006255263 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus PAP associated domain containing 5 (Papd5), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000067582 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:30800163:30857233:-1 gene:ENSRNOG00000024212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000006577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:30731050:30857618:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1 /// NONRATT028045 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
XM_001067127 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HEAT repeat containing 3 (Heatr3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_341654 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus HEAT repeat containing 3 (Heatr3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000020793 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:30884411:30921078:-1 gene:ENSRNOG00000015459 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000006567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:30884411:30956919:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028047 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001106173 // RefSeq // Rattus norvegicus CTD nuclear envelope phosphatase 1 regulatory subunit 1 (Cnep1r1), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000020816 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:30924101:30938400:-1 gene:ENSRNOG00000015534 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT028049 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT028050 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT028051 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT028052 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 94 // 94 // 31 // 33 // 1 /// NONRATT028053 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT028054 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 10 // 33 // 1
XM_006222681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680913 (LOC680913), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XM_006255322 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC680913 (LOC680913), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000032408 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:31494942:31519525:-1 gene:ENSRNOG00000024182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000060742 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:31494916:31519525:-1 gene:ENSRNOG00000024182 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041712 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:31468196:31519525:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 73 // 19 // 22 // 0
XM_006255340 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus wiskott-Aldrich syndrome protein family member 2-like (LOC102549825), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_001033689 // RefSeq // Rattus norvegicus lon peptidase 2, peroxisomal (Lonp2), mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020770 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:32410041:32501857:-1 gene:ENSRNOG00000015162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048345 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:32449454:32501857:-1 gene:ENSRNOG00000015162 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// BC166411 // GenBank // Rattus norvegicus lon peptidase 2, peroxisomal, mRNA (cDNA clone MGC:187259 IMAGE:7442740), complete cds. // chr19 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000031521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:32465017:32501769:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT028059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT028061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000012226 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:32410188:32457636:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NONRATT028059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001014152 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphorylase kinase, beta (Phkb), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// XM_006255270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphorylase kinase, beta (Phkb), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006255272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphorylase kinase, beta (Phkb), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000049624 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:33045255:33289198:-1 gene:ENSRNOG00000024101 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// BC085909 // GenBank // Rattus norvegicus phosphorylase kinase, beta, mRNA (cDNA clone MGC:94757 IMAGE:7096506), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000031444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:33045531:33218223:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028066 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 97 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT028065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001012057 // RefSeq // Rattus norvegicus glutamic pyruvate transaminase (alanine aminotransferase) 2 (Gpt2), mRNA. // chr19 // 97 // 67 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000022851 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:33607320:33638298:-1 gene:ENSRNOG00000016841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 67 // 33 // 34 // 0 /// AY325245 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cc2-5 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 71 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071992 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:33596261:33633089:-1 gene:ENSRNOG00000016841 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 82 // 82 // 42 // 51 // 1 /// XM_006255264 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamic pyruvate transaminase (alanine aminotransferase) 2 (Gpt2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 65 // 65 // 33 // 51 // 1 /// XM_006255266 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glutamic pyruvate transaminase (alanine aminotransferase) 2 (Gpt2), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 65 // 65 // 33 // 51 // 1 /// FQ223845 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA85YD17 mRNA sequence. // chr19 // 63 // 63 // 32 // 51 // 1 /// GENSCAN00000031786 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:33607494:33638272:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 67 // 33 // 34 // 0 /// NONRATT028070 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 45 // 45 // 0
NM_001177823 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00018-like (LOC100363129), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000040324 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:33722968:33725925:-1 gene:ENSRNOG00000029765 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0
GENSCAN00000031779 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:33765849:33870635:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 57 // 8 // 8 // 0
NM_001033690 // RefSeq // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 6 (Orc6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:38423345:38430600:-1 gene:ENSRNOG00000024043 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC101871 // GenBank // Rattus norvegicus origin recognition complex, subunit 6 like (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:124771 IMAGE:5621693), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000020760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:38423712:38425764:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 32 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT028197 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001000108 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1666 (Olr1666), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// XM_006255359 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus olfactory receptor 1666 (Olr1666), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000024040 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:38498265:38499203:-1 gene:ENSRNOG00000017868 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000051049 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:38498265:38510991:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
XR_349909 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546955 (LOC102546955), ncRNA. // chr19 // 45 // 100 // 9 // 20 // 0
XM_006255381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC685488 (LOC685488), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 12 // 12 // 0 /// ENSRNOT00000047230 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:39204397:39208561:1 gene:ENSRNOG00000049674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000013203 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39201871:39208581:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
XM_006255361 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus disks large homolog 5-like (LOC685160), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000049860 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:39017115:39020262:-1 gene:ENSRNOG00000032131 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT028202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
ENSRNOT00000072022 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:47022037:47026978:-1 gene:ENSRNOG00000050237 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000023235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:46999286:47026250:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006222682 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC684084 (LOC684084), mRNA. // chr19 // 56 // 90 // 10 // 18 // 0 /// XM_006227142 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557241 (LOC102557241), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 50 // 90 // 9 // 18 // 0 /// XM_006227183 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548325 (LOC102548325), partial mRNA. // chr19 // 53 // 75 // 8 // 15 // 0 /// XM_006255041 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102551760 (LOC102551760), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 56 // 90 // 10 // 18 // 0 /// XM_006227026 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC683963 (LOC683963), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 44 // 90 // 8 // 18 // 0 /// XM_006227027 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC683963 (LOC683963), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 44 // 90 // 8 // 18 // 0 /// XM_006227169 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102548475 (LOC102548475), mRNA. // chr19 // 44 // 90 // 8 // 18 // 0 /// XM_006227141 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557241 (LOC102557241), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// ENSRNOT00000071393 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:212180:216869:1 gene:ENSRNOG00000050134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 100 // 10 // 20 // 0 /// NONRATT028202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 65 // 100 // 13 // 20 // 0 /// GENSCAN00000058050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39659251:39690885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 45 // 45 // 9 // 20 // 1 /// NONRATT028203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 40 // 40 // 8 // 20 // 1
XM_006255382 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1562660 (RGD1562660), mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000058050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39659251:39690885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 63 // 63 // 12 // 19 // 1
XM_006222688 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1562660 (RGD1562660), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 69 // 100 // 11 // 16 // 0 /// GENSCAN00000058050 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39659251:39690885:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 69 // 100 // 11 // 16 // 0
NONRATT028202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 64 // 100 // 16 // 25 // 0 /// GENSCAN00000058053 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:39897111:39939783:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NONRATT028202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 100 // 6 // 12 // 0
NM_199404 // RefSeq // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 2B, member 1 (Man2b1), mRNA. // chr19 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000037699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37172460:37191890:1 gene:ENSRNOG00000023910 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// BC061819 // GenBank // Rattus norvegicus mannosidase, alpha, class 2B, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:72561 IMAGE:5599365), complete cds. // chr19 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000019489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37173571:37194682:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT027320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT027321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1 /// NONRATT027323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 23 // 23 // 11 // 48 // 1
ENSRNOT00000065931 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37169959:37171458:1 gene:ENSRNOG00000033611 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0 /// FQ225008 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YH01 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC166543 // GenBank // Rattus norvegicus similar to cDNA sequence BC056474, mRNA (cDNA clone MGC:188141 IMAGE:7300989), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 1 /// NM_001105947 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 83 opposite strand (Wdr83os), mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 16 // 24 // 1 /// NONRATT027317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 1 /// NONRATT027319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 88 // 88 // 21 // 24 // 1
NM_001004207 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxyhypusine synthase (Dhps), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000005656 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37160274:37164382:1 gene:ENSRNOG00000004219 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC079188 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyhypusine synthase, mRNA (cDNA clone MGC:94237 IMAGE:7131199), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// FQ214612 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA51YP23 mRNA sequence. // chr19 // 60 // 100 // 18 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019502 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37160362:37164257:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT027314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1 /// NONRATT027315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001081634 // RefSeq // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 9 (Fbxw9), mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000005581 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37149394:37156298:1 gene:ENSRNOG00000004212 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// BC084706 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and WD-40 domain protein 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7301700). // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0 /// BC166590 // GenBank // Rattus norvegicus F-box and WD repeat domain containing 9, mRNA (cDNA clone MGC:188354 IMAGE:7938435), complete cds. // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019514 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37149467:37155837:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT027309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT027311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_001107166 // RefSeq // Rattus norvegicus transportin 2 (Tnpo2), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000005571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37127523:37147431:1 gene:ENSRNOG00000003970 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37118409:37145290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001105946 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310036O22 (RGD1564093), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000005270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37118343:37121759:1 gene:ENSRNOG00000003863 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000028011 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:14:108145162:108145534:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 60 // 21 // 21 // 0 /// FQ210991 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA19YF11 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT027303 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000010291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:116697144:116697498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 60 // 14 // 21 // 0 /// GENSCAN00000019497 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37118409:37145290:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 66 // 66 // 23 // 35 // 1 /// GENSCAN00000054247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:23217427:23281353:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 54 // 54 // 19 // 35 // 1
NM_001100562 // RefSeq // Rattus norvegicus hook microtubule-tethering protein 2 (Hook2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000035987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37082461:37094975:1 gene:ENSRNOG00000003682 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000019521 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37082544:37094623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT027299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1 /// NONRATT027300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 46 // 46 // 17 // 37 // 1 /// NONRATT027301 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
NM_017169 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxiredoxin 2 (Prdx2), mRNA. // chr19 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000004799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37060473:37065716:1 gene:ENSRNOG00000003520 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// BC058481 // GenBank // Rattus norvegicus peroxiredoxin 2, mRNA (cDNA clone MGC:72863 IMAGE:6921522), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// FQ212735 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YK13 mRNA sequence. // chr19 // 93 // 79 // 14 // 15 // 0 /// FQ215547 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YM21 mRNA sequence. // chr19 // 79 // 100 // 15 // 19 // 0 /// FQ234566 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA58YH18 mRNA sequence. // chr19 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// U06099 // GenBank // Rattus norvegicus thiol-specific antioxidant mRNA, complete cds. // chr19 // 89 // 100 // 17 // 19 // 0 /// GENSCAN00000019516 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37061056:37065486:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT027293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027295 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT027294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1
NM_001107165 // RefSeq // Rattus norvegicus retbindin (Rtbdn), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064289 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:37041750:37048817:1 gene:ENSRNOG00000043215 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:37042135:37048402:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT027291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:40274062:40324363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
NM_138539 // RefSeq // Rattus norvegicus deoxyribonuclease II, lysosomal (Dnase2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014887 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36998478:37001146:1 gene:ENSRNOG00000023830 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF178975 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyribonuclease II mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC091124 // GenBank // Rattus norvegicus deoxyribonuclease II alpha, mRNA (cDNA clone MGC:108596 IMAGE:7375398), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019517 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36998606:37000915:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107164 // RefSeq // Rattus norvegicus Kruppel-like factor 1 (erythroid) (Klf1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004601 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36992005:36995176:1 gene:ENSRNOG00000003443 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ226533 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA26YP21 mRNA sequence. // chr19 // 81 // 100 // 21 // 26 // 0 /// FQ233857 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YC05 mRNA sequence. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000019508 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36992106:36994840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001191557 // RefSeq // Rattus norvegicus synaptonemal complex central element protein 2 (Syce2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255291 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus synaptonemal complex central element protein 2 (Syce2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36953712:36976721:1 gene:ENSRNOG00000003279 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000019485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36959306:36976721:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001024237 // RefSeq // Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit (Farsa), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004370 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36944878:36954400:1 gene:ENSRNOG00000003149 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC094515 // GenBank // Rattus norvegicus phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit, mRNA (cDNA clone MGC:105738 IMAGE:7314191), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36941217:36954142:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
NM_001100504 // RefSeq // Rattus norvegicus growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma interacting protein 1 (Gadd45gip1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000004027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36922599:36924670:1 gene:ENSRNOG00000003011 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217511 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA24YK12 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000002128 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36922602:36924626:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT027283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XR_342269 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546624 (LOC102546624), ncRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XR_361771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102546624 (LOC102546624), ncRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001007677 // RefSeq // Rattus norvegicus lymphoblastic leukemia associated hematopoiesis regulator 1 (Lyl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000003980 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36790826:36793693:1 gene:ENSRNOG00000002950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC081864 // GenBank // Rattus norvegicus lymphoblastic leukemia derived sequence 1, mRNA (cDNA clone MGC:93688 IMAGE:7096152), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027280 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36773373:36793289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001013870 // RefSeq // Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae) (Trmt1), mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000003941 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36778905:36789062:1 gene:ENSRNOG00000002914 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// BC085126 // GenBank // Rattus norvegicus TRM1 tRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:105886 IMAGE:7132178), complete cds. // chr19 // 100 // 97 // 36 // 36 // 0 /// XM_006255236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tRNA methyltransferase 1 homolog (S. cerevisiae) (Trmt1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 92 // 92 // 34 // 37 // 1 /// NONRATT027273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT027274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000002145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36773373:36793289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 86 // 32 // 37 // 1 /// NONRATT027272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 13 // 37 // 1 /// NONRATT027277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 11 // 37 // 1
NM_012918 // RefSeq // Rattus norvegicus calcium channel, voltage-dependent, P/Q type, alpha 1A subunit (Cacna1a), mRNA. // chr19 // 96 // 94 // 49 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000067921 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36502533:36725231:1 gene:ENSRNOG00000046731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 94 // 49 // 51 // 0 /// ENSRNOT00000068563 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36502533:36724307:1 gene:ENSRNOG00000046731 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 98 // 89 // 47 // 48 // 0 /// M64373 // GenBank // Rat calcium channel alpha-1 subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 98 // 89 // 47 // 48 // 0 /// GENSCAN00000002126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36600547:36706641:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 63 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000002156 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36713312:36725231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 17 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT027263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 16 // 54 // 1
NM_001025740 // RefSeq // Rattus norvegicus ribonucleotide reductase M2 (Rrm2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000011163 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36367878:36370407:1 gene:ENSRNOG00000008450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000037387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:6:60756211:60761048:1 gene:ENSRNOG00000023272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// BC099082 // GenBank // Rattus norvegicus ribonucleotide reductase M2, mRNA (cDNA clone MGC:116120 IMAGE:7443729), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000005034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:6:60756211:60761048:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000048014 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36367929:36369101:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 67 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT046644 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// NONRATT046645 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 98 // 100 // 47 // 48 // 0 /// NONRATT046646 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 46 // 46 // 22 // 48 // 1
NR_031828 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 24-2 (Mir24-2), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000053624 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:19:36295051:36295158:1 gene:ENSRNOG00000035501 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT027252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// rno-mir-24-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000855 Rattus norvegicus miR-24-2 stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NR_031833 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 27a (Mir27a), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000053720 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:19:36294924:36295010:1 gene:ENSRNOG00000035597 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// rno-mir-27a // miRBase Micro RNA Database // MI0000860 Rattus norvegicus miR-27a stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0
NR_031825 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 23a (Mir23a), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000053767 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:19:36294770:36294844:1 gene:ENSRNOG00000035644 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-23a // miRBase Micro RNA Database // MI0000852 Rattus norvegicus miR-23a stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
XM_006222695 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC304654 (RGD1306072), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222699 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC304654 (RGD1306072), transcript variant X6, mRNA. // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// XM_006255328 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC304654 (RGD1306072), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255330 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC304654 (RGD1306072), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// XM_006255333 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC304654 (RGD1306072), transcript variant X7, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000030658 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:36239995:36260885:1 gene:ENSRNOG00000025796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000071920 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:36239995:36260885:1 gene:ENSRNOG00000025796 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// BC099112 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7461682, containing frame-shift errors. // chr19 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000048019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36248782:36260606:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT027247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 14 // 25 // 1
XM_213845 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus podocan-like 1 (Podnl1), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000037453 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:36217276:36223427:1 gene:ENSRNOG00000006741 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36214406:36223427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001105944 // RefSeq // Rattus norvegicus regulatory factor X, 1 (influences HLA class II expression) (Rfx1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// ENSRNOT00000008104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36158698:36189544:1 gene:ENSRNOG00000006049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000048023 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36166301:36188508:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT027242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 42 // 42 // 0
ENSRNOT00000054528 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:36177982:36178074:1 gene:ENSRNOG00000036416 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_002728582 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paralemmin 3 (Palm3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paralemmin 3 (Palm3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255326 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus paralemmin 3 (Palm3), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000007535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:36120472:36128572:1 gene:ENSRNOG00000005729 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048021 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36120155:36128572:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027240 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
XM_003753094 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC686013 (LOC686013), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000007407 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:36100966:36103834:1 gene:ENSRNOG00000005533 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36055553:36103834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001100922 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, cAMP-dependent, catalytic, alpha (Prkaca), mRNA. // chr19 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255341 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus atherin-like (LOC102550189), mRNA. // chr19 // 100 // 24 // 9 // 9 // 0 /// ENSRNOT00000007281 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36077119:36096875:1 gene:ENSRNOG00000005257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000007303 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:36097608:36099114:1 gene:ENSRNOG00000043301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000041717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36073104:36096875:1 gene:ENSRNOG00000005257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// AY375243 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase A mRNA, partial cds. // chr19 // 88 // 46 // 15 // 17 // 0 /// BC129128 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase, cAMP-dependent, catalytic, alpha, mRNA (cDNA clone MGC:156823 IMAGE:7314651), complete cds. // chr19 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36055553:36103834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 62 // 62 // 23 // 37 // 1 /// NONRATT027238 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_001107160 // RefSeq // Rattus norvegicus anti-silencing function 1B histone chaperone (Asf1b), mRNA. // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000006964 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36055967:36070506:1 gene:ENSRNOG00000005115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// BC158705 // GenBank // Rattus norvegicus ASF1 anti-silencing function 1 homolog B (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187795 IMAGE:9030040), complete cds. // chr19 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// NONRATT027236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000048030 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36055553:36103834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_022962 // RefSeq // Rattus norvegicus latrophilin 1 (Lphn1), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041025 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36021690:36047247:1 gene:ENSRNOG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043971 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36021690:36047247:1 gene:ENSRNOG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045699 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:36021690:36047247:1 gene:ENSRNOG00000029134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// AF081144 // GenBank // Rattus norvegicus CL1AA mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// AF081145 // GenBank // Rattus norvegicus CL1AB mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// AF081146 // GenBank // Rattus norvegicus CL1BA mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// AF081147 // GenBank // Rattus norvegicus CL1BB mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF111099 // GenBank // Rattus norvegicus latrophilin gene, partial sequence. // chr19 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// U72487 // GenBank // Rattus norvegicus calcium-independent alpha-latrotoxin receptor mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// U78105 // GenBank // Rattus norvegicus latrophilin-1 precursor, mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048022 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:36021785:36046380:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
NM_053563 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 39A (Ddx39a), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000045974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35825685:35834039:1 gene:ENSRNOG00000004373 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// AF063447 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear RNA helicase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC072526 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7097268, containing frame-shift errors. // chr19 // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// BC086328 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 39, mRNA (cDNA clone MGC:105369 IMAGE:7132938), complete cds. // chr19 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// FQ231639 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YM01 mRNA sequence. // chr19 // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002867 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35830144:35833911:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT027226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 76 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT027227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT027228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// NONRATT027229 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
D88752 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prostaglandin E receptor EP1-variant form, complete cds, clone: RU461. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000005470 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35779888:35782528:1 gene:ENSRNOG00000004094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// D88751 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for prostaglandin E receptor EP1 subtype, complete cds, clone: RU621. // chr19 // 85 // 85 // 28 // 33 // 1 /// NM_001278475 // RefSeq // Rattus norvegicus prostaglandin E receptor 1 (subtype EP1) (Ptger1), mRNA. // chr19 // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// U68037 // GenBank // Rattus norvegicus EP1 prostanoid receptor mRNA, complete cds. // chr19 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT027221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000002837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35773740:35782114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1 /// NONRATT027220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1
NM_053341 // RefSeq // Rattus norvegicus GIPC PDZ domain containing family, member 1 (Gipc1), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255312 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GIPC PDZ domain containing family, member 1 (Gipc1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000005374 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35765788:35777379:1 gene:ENSRNOG00000003864 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF032120 // GenBank // Rattus norvegicus GLUT1 transporter C-terminal binding protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// AF089817 // GenBank // Rattus norvegicus RGS-GAIP interacting protein GIPC mRNA, complete cds. // chr19 // 75 // 89 // 18 // 24 // 0 /// BC061964 // GenBank // Rattus norvegicus GIPC PDZ domain containing family, member 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5620910). // chr19 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC070505 // GenBank // Rattus norvegicus GIPC PDZ domain containing family, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:91590 IMAGE:7097697), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000002837 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35773740:35782114:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 67 // 18 // 27 // 1
NM_001108441 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1 (Dnajb1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35726334:35730075:1 gene:ENSRNOG00000021824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC159430 // GenBank // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily B, member 1, mRNA (cDNA clone MGC:188751 IMAGE:9089687), complete cds. // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000002841 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35726473:35729310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT027214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_001108442 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 7 (Ndufb7), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035890 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35680097:35684435:1 gene:ENSRNOG00000028717 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ223670 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA8YI15 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002834 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35680162:35684377:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000009072 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:35666817:35667509:1 gene:ENSRNOG00000006900 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 79 // 83 // 15 // 19 // 0 /// GENSCAN00000002872 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35666946:35667527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 12 // 12 // 0
NM_001000537 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 1667 (Olr1667), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000038213 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35649329:35650273:1 gene:ENSRNOG00000028439 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027209 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000002861 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35592383:35656338:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001109472 // RefSeq // Rattus norvegicus calmegin (Clgn), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255298 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calmegin (Clgn), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255299 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus calmegin (Clgn), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000005071 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35523738:35555259:1 gene:ENSRNOG00000003755 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 93 // 93 // 26 // 28 // 1 /// GENSCAN00000002846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35474651:35555045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 54 // 54 // 15 // 28 // 1
NM_001025666 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to calmegin (RGD1310572), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// XM_006255248 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to calmegin (RGD1310572), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004982 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35474577:35510786:1 gene:ENSRNOG00000003695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC097408 // GenBank // Rattus norvegicus similar to calmegin, mRNA (cDNA clone MGC:114453 IMAGE:7454086), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT027202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000002846 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35474651:35555045:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 61 // 61 // 19 // 31 // 1 /// NONRATT027203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 26 // 26 // 8 // 31 // 1
NM_012682 // RefSeq // Rattus norvegicus uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier) (Ucp1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004900 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35434981:35442811:1 gene:ENSRNOG00000003580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC088156 // GenBank // Rattus norvegicus uncoupling protein 1 (mitochondrial, proton carrier), mRNA (cDNA clone MGC:108736 IMAGE:7380759), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// M11814 // GenBank // Rat mitochondrial brown fat uncoupling protein mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000072100 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:40304316:40308514:-1 gene:ENSRNOG00000046239 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 64 // 17 // 18 // 0 /// GENSCAN00000028918 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35435197:35442718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 71 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT027200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000001093 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:40274062:40324363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 32 // 32 // 9 // 28 // 1
NM_001134539 // RefSeq // Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 9 (with GRAM domain) (Tbc1d9), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// XM_006255247 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC1 domain family, member 9 (with GRAM domain) (Tbc1d9), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000065558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35307319:35408165:1 gene:ENSRNOG00000003496 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000028916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35350933:35406879:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT027198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0
NM_001191093 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 150 (Rnf150), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000004621 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:35023410:35242919:1 gene:ENSRNOG00000003479 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:35146957:35322175:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1
XM_001068022 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L22-like 1-like (LOC688712), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// XM_003753095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L22-like 1-like (LOC688712), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000045060 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:34816629:34816997:1 gene:ENSRNOG00000033819 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000033668 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:34816629:34816997:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
ENSRNOT00000045124 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:34748344:34749172:1 gene:ENSRNOG00000033135 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000033688 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:34723393:34749178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 90 // 18 // 19 // 0
NM_053917 // RefSeq // Rattus norvegicus inositol polyphosphate-4-phosphatase, type II (Inpp4b), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024981 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:40508509:40860035:-1 gene:ENSRNOG00000018382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000025013 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:40508685:40860035:-1 gene:ENSRNOG00000018382 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// U96920 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate 4-phosphatase type II-alpha mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// U96921 // GenBank // Rattus norvegicus inositol polyphosphate 4-phosphatase type II-beta mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:40508509:40628782:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 39 // 39 // 11 // 28 // 1
ENSRNOT00000024755 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:40711194:40712425:-1 gene:ENSRNOG00000018377 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 82 // 100 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000043473 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:40711194:40778363:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT028205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
ENSRNOT00000066076 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:41576281:41576782:-1 gene:ENSRNOG00000042410 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
ENSRNOT00000032406 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:41836619:41837526:-1 gene:ENSRNOG00000026809 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 74 // 100 // 14 // 19 // 0 /// GENSCAN00000044121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41836633:41837526:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 15 // 15 // 0
NM_001191699 // RefSeq // Rattus norvegicus FRAS1 related extracellular matrix 3 (Frem3), mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000059896 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:41877775:41936252:-1 gene:ENSRNOG00000039152 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000044108 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41877995:41887476:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 27 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000044107 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41909464:41917974:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
GENSCAN00000044104 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:41921451:41937600:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
FQ225301 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA54YH01 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ225531 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA4YL20 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// FQ233073 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA63YE19 mRNA sequence. // chr19 // 89 // 93 // 25 // 28 // 0 /// FQ233924 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YN11 mRNA sequence. // chr19 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// FQ234025 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YH06 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028210 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000030302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:42023575:42057570:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001108445 // RefSeq // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 10 (Anapc10), mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// XM_006255406 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 10 (Anapc10), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000024689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:42719406:42771825:-1 gene:ENSRNOG00000018296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168746 // GenBank // Rattus norvegicus anaphase promoting complex subunit 10, mRNA (cDNA clone MGC:188849 IMAGE:6920404), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT028213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_001191700 // RefSeq // Rattus norvegicus OTU deubiquitinase 4 (Otud4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006255404 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OTU domain containing 4 (Otud4), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// XM_006255405 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus OTU domain containing 4 (Otud4), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000024924 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:42803062:42846155:-1 gene:ENSRNOG00000018477 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000023672 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:42803351:42845930:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 64 // 64 // 25 // 39 // 1 /// NONRATT028215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 11 // 39 // 1
GENSCAN00000006233 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43175782:43176204:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006222793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 827 (Zfp827), mRNA. // chr19 // 92 // 65 // 24 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015929 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:43282075:43457175:-1 gene:ENSRNOG00000011697 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 60 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255411 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 827 (Zfp827), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 65 // 65 // 26 // 40 // 1 /// GENSCAN00000006236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43294998:43318091:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 30 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43333254:43445916:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 35 // 14 // 14 // 0
NM_001126085 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm6), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000050289 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:13:52469220:52471360:1 gene:ENSRNOG00000030374 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 76 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071471 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:43672737:43679724:1 gene:ENSRNOG00000049370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 86 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000023858 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:52469220:52469516:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027361 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 95 // 100 // 35 // 37 // 0 /// NONRATT027362 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 94 // 86 // 30 // 32 // 0 /// NONRATT027363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 90 // 84 // 28 // 31 // 0 /// GENSCAN00000022870 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43665172:43676203:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 76 // 76 // 28 // 37 // 1
ENSRNOT00000031937 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:43881135:43881471:-1 gene:ENSRNOG00000027523 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000022855 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43735260:43881350:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001010948 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 10, member 7 (Slc10a7), mRNA. // chr19 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000015985 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:43751269:43972967:-1 gene:ENSRNOG00000011991 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// AY825929 // GenBank // Rattus norvegicus P7 (P7) mRNA, complete cds. // chr19 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// FQ211514 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA90YJ11 mRNA sequence. // chr19 // 94 // 97 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:43956454:43972967:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 68 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 94 // 95 // 33 // 35 // 0
NM_001013890 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 29 (Ttc29), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006255400 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 29 (Ttc29), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016558 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:44098115:44315561:-1 gene:ENSRNOG00000012342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC078968 // GenBank // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 29, mRNA (cDNA clone MGC:93848 IMAGE:7111580), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT028227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000053670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:44128169:44195858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
NM_001191599 // RefSeq // Rattus norvegicus protein arginine methyltransferase 10 (putative) (Prmt10), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017347 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:44952070:44987000:-1 gene:ENSRNOG00000012928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000017669 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:44954314:44986878:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028228 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
AF465623 // GenBank // Rattus norvegicus truncated membrane-associated progesterone binding protein variant mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NM_021766 // RefSeq // Rattus norvegicus progesterone receptor membrane component 1 (Pgrmc1), mRNA. // chr19 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017101 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:123352162:123360154:1 gene:ENSRNOG00000012786 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// AF163321 // GenBank // Rattus norvegicus ventral midline antigen VEMA mRNA, complete cds. // chr19 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// BC062073 // GenBank // Rattus norvegicus progesterone receptor membrane component 1, mRNA (cDNA clone MGC:72462 IMAGE:5599449), complete cds. // chr19 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// U63315 // GenBank // Rattus norvegicus 25-Dx (25Dx) mRNA, complete cds. // chr19 // 60 // 100 // 15 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059785 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:45084626:45085205:-1 gene:ENSRNOG00000027022 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:45084626:45085205:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT028232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000029126 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:123352225:123358983:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT059207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 72 // 100 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT059208 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 67 // 96 // 16 // 24 // 0
NM_013131 // RefSeq // Rattus norvegicus nuclear receptor subfamily 3, group C, member 2 (Nr3c2), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000052018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:45289894:45639834:-1 gene:ENSRNOG00000034007 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// M36074 // GenBank // Rat mineralocorticoid receptor (MR) mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017677 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:45198610:45372947:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT028235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1 /// NONRATT028236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
XM_001065705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (pyrimidine nucleotide carrier ), member 36 (Slc25a36), mRNA. // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000018433 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:104412321:104413455:-1 gene:ENSRNOG00000013802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000037120 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:8:104412321:104441922:-1 gene:ENSRNOG00000013802 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// GENSCAN00000006558 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:8:104412321:104441781:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 100 // 30 // 31 // 0 /// NONRATT028241 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT055619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT055620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT055621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT055622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 81 // 24 // 25 // 0
XM_226431 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 9 (B3gnt9), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020349 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48075349:48076843:-1 gene:ENSRNOG00000015172 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005684 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48075349:48076837:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028243 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0
NM_001100480 // RefSeq // Rattus norvegicus TNFRSF1A-associated via death domain (Tradd), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000020405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48081092:48086780:-1 gene:ENSRNOG00000015179 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// FQ215613 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA47YI05 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000005695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48081486:48083187:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT028244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
NM_001044292 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC688736 (Kiaa0895l), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020927 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48103245:48110939:-1 gene:ENSRNOG00000015625 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000005680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48103316:48115339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 82 // 22 // 23 // 0 /// NONRATT028247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028248 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT028249 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001106178 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 1 (Exoc3l1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006255456 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 1 (Exoc3l1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006255460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus exocyst complex component 3-like 1 (Exoc3l1), transcript variant X5, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000021015 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48110992:48116641:-1 gene:ENSRNOG00000015641 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005680 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48103316:48115339:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT028251 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT028252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NR_031775 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 328 (Mir328), microRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000054525 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:19:48128921:48129004:-1 gene:ENSRNOG00000036413 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// rno-mir-328a // miRBase Micro RNA Database // MI0000602 Rattus norvegicus miR-328a stem-loop // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001195616 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 29 (Lrrc29), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255532 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 29 (Lrrc29), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000059663 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48132505:48147429:-1 gene:ENSRNOG00000025231 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC166813 // GenBank // Rattus norvegicus similar to CG8272-PA, mRNA (cDNA clone MGC:188635 IMAGE:7454853), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000005694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48132985:48136955:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001191600 // RefSeq // Rattus norvegicus formin homology 2 domain containing 1 (Fhod1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000021935 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48150419:48169181:-1 gene:ENSRNOG00000016241 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// GENSCAN00000005697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48150636:48169181:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 89 // 89 // 39 // 44 // 1 /// NONRATT028256 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 41 // 41 // 18 // 44 // 1 /// NONRATT028257 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 36 // 36 // 16 // 44 // 1 /// NONRATT028261 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 34 // 34 // 15 // 44 // 1 /// NONRATT028260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1
XM_001075666 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 19 (Kctd19), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// XM_226403 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium channel tetramerization domain containing 19 (Kctd19), mRNA. // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022497 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:48203888:48231231:-1 gene:ENSRNOG00000016760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066077 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:48203888:48231231:-1 gene:ENSRNOG00000016760 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000005687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48205149:48231219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 27 // 27 // 0
NM_001009639 // RefSeq // Rattus norvegicus tubulin polymerization-promoting protein family member 3 (Tppp3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000022863 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48289941:48293620:-1 gene:ENSRNOG00000016890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC087585 // GenBank // Rattus norvegicus tubulin polymerization-promoting protein family member 3, mRNA (cDNA clone MGC:105620 IMAGE:7317980), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ213895 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YP01 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// FQ216797 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA41YC20 mRNA sequence. // chr19 // 91 // 100 // 20 // 22 // 0 /// FQ220107 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YC23 mRNA sequence. // chr19 // 73 // 100 // 16 // 22 // 0 /// NONRATT028262 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028263 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000005690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48290282:48306086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 16 // 22 // 1
NM_001039099 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 1 (Zdhhc1), mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// XM_006255467 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 1 (Zdhhc1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000066636 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48294576:48306088:-1 gene:ENSRNOG00000017045 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// AY886520 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC1 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// BC160816 // GenBank // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:8361950. // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000005690 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48290282:48306086:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 63 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028264 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028265 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028266 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028268 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT028267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NM_001011927 // RefSeq // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal V0 subunit D1 (Atp6v0d1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000023606 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48347545:48391661:-1 gene:ENSRNOG00000017235 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC088462 // GenBank // Rattus norvegicus ATPase, H+ transporting, lysosomal 38kDa, V0 subunit d1, mRNA (cDNA clone MGC:95115 IMAGE:7127604), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ213716 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YC11 mRNA sequence. // chr19 // 88 // 100 // 28 // 32 // 0 /// FQ226414 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA2YE11 mRNA sequence. // chr19 // 75 // 88 // 21 // 28 // 0 /// NONRATT028270 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028271 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 25 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000005670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48347992:48393108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 88 // 88 // 28 // 32 // 1 /// NONRATT028274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1 /// NONRATT028273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 9 // 32 // 1 /// NONRATT028275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_033650 // RefSeq // Rattus norvegicus agouti related protein homolog (mouse) (Agrp), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255446 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus agouti related protein homolog (mouse) (Agrp), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059628 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48392318:48393910:-1 gene:ENSRNOG00000039001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// AF206017 // GenBank // Rattus norvegicus agouti related protein precursor (AGRP) mRNA, partial cds. // chr19 // 80 // 38 // 8 // 10 // 0 /// GENSCAN00000005670 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48347992:48393108:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 65 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT028276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0
NM_001037193 // RefSeq // Rattus norvegicus adrenocortical dysplasia homolog (mouse) (Acd), mRNA. // chr19 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000059577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48532000:48534691:-1 gene:ENSRNOG00000038973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// BC099222 // GenBank // Rattus norvegicus adrenocortical dysplasia homolog (mouse), mRNA (cDNA clone MGC:116400 IMAGE:7388035), complete cds. // chr19 // 97 // 92 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT028281 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT028283 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT028284 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT028282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 63 // 63 // 24 // 38 // 1 /// NONRATT028285 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 66 // 66 // 25 // 38 // 1
NM_001106180 // RefSeq // Rattus norvegicus enkurin domain containing 1 (Enkd1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031033 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48537328:48541781:-1 gene:ENSRNOG00000024364 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48537532:48541491:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028286 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT028288 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001107421 // RefSeq // Rattus norvegicus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 (Gfod2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255492 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 (Gfod2), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006255493 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2 (Gfod2), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48549438:48591884:-1 gene:ENSRNOG00000017953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC161901 // GenBank // Rattus norvegicus glucose-fructose oxidoreductase domain containing 2, mRNA (cDNA clone MGC:187621 IMAGE:8367133), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48550075:48562006:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 52 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT028289 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001135875 // RefSeq // Rattus norvegicus RAN binding protein 10 (Ranbp10), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48600923:48661834:-1 gene:ENSRNOG00000018000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48604105:48661752:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT028296 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1 /// NONRATT028297 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
NM_001024257 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein T (Cenpt), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036702 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48680056:48686495:-1 gene:ENSRNOG00000024178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC093396 // GenBank // Rattus norvegicus centromere protein T, mRNA (cDNA clone MGC:112755 IMAGE:7388929), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049155 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48680152:48686488:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT028300 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_054009 // RefSeq // Rattus norvegicus chymotrypsin-like (Ctrl), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255434 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chymotrypsin-like (Ctrl), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255435 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chymotrypsin-like (Ctrl), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000026361 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48772845:48774756:-1 gene:ENSRNOG00000019353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB020757 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for chymopasin, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// FQ211893 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA77YD16 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000049124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48772895:48805888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT028305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028304 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1 /// NONRATT028306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 43 // 43 // 12 // 28 // 1
NM_001025637 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 10 (Psmb10), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000026462 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48776577:48779068:-1 gene:ENSRNOG00000019494 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC098835 // GenBank // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) subunit, beta type 10, mRNA (cDNA clone MGC:112890 IMAGE:7378841), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ217478 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA25YH06 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 50 // 16 // 16 // 0 /// FQ233484 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YK17 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ228165 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA10YE07 mRNA sequence. // chr19 // 69 // 100 // 22 // 32 // 0 /// FQ227456 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA13YE17 mRNA sequence. // chr19 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// FQ229779 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA46YL14 mRNA sequence. // chr19 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT028307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000049124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48772895:48805888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 72 // 72 // 23 // 32 // 1
NM_017024 // RefSeq // Rattus norvegicus lecithin cholesterol acyltransferase (Lcat), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255441 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lecithin cholesterol acyltransferase (Lcat), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000026585 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48780369:48783847:-1 gene:ENSRNOG00000019573 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC091155 // GenBank // Rattus norvegicus lecithin cholesterol acyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:108718 IMAGE:7370790), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ218883 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA49YE18 mRNA sequence. // chr19 // 92 // 100 // 24 // 26 // 0 /// U62803 // GenBank // Rattus norvegicus lecithin:cholesterol acyltransferase mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48772895:48805888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT028308 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028310 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT028309 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_019229 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 12 (potassium/chloride transporter), member 4 (Slc12a4), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000026730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48784045:48805888:-1 gene:ENSRNOG00000019651 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// FQ219935 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA44YN05 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 23 // 11 // 11 // 0 /// U55815 // GenBank // Rattus norvegicus furosemide-sensitive K-Cl cotransporter (KCC1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 98 // 47 // 47 // 0 /// GENSCAN00000049124 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48772895:48805888:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT028312 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// NONRATT028311 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 13 // 48 // 1 /// NONRATT028313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 17 // 17 // 8 // 48 // 1
NM_001008383 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidase 3 (Dpep3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000026809 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48813854:48819507:-1 gene:ENSRNOG00000019757 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC085826 // GenBank // Rattus norvegicus dipeptidase 3, mRNA (cDNA clone MGC:94276 IMAGE:7131855), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028314 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000049152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48815428:48857668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 85 // 23 // 27 // 1
NM_001011928 // RefSeq // Rattus norvegicus dipeptidase 2 (Dpep2), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255481 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dipeptidase 2 (Dpep2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000034722 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48831093:48837523:-1 gene:ENSRNOG00000023303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// BC088195 // GenBank // Rattus norvegicus dipeptidase 2, mRNA (cDNA clone MGC:108872 IMAGE:7374282), complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028315 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000049152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48815428:48857668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT028317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 45 // 45 // 14 // 31 // 1
NM_001108898 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 28 (Ddx28), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026817 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48855707:48857329:-1 gene:ENSRNOG00000019817 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049152 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48815428:48857668:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT028318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000052818 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:48940983:48941100:-1 gene:ENSRNOG00000034695 gene_biotype:rRNA transcript_biotype:rRNA // chr19 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
NM_001107423 // RefSeq // Rattus norvegicus epithelial splicing regulatory protein 2 (Esrp2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000026873 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:48980165:48987331:-1 gene:ENSRNOG00000023177 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC166804 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 35b, mRNA (cDNA clone MGC:188606 IMAGE:7938923), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:48980713:48987100:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028320 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028321 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_139328 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7, member 6 opposite strand (Slc7a6os), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000027200 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49047661:49056771:-1 gene:ENSRNOG00000020049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000026530 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49048225:49056758:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 81 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT028322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_053605 // RefSeq // Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase 3, neutral membrane (Smpd3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255544 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sphingomyelin phosphodiesterase 3, neutral membrane (Smpd3), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49107658:49191221:-1 gene:ENSRNOG00000000257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000031977 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49107658:49191221:-1 gene:ENSRNOG00000000257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB000215 // GenBank // Rattus norvegicus cca1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000026538 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49110362:49151109:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT028323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001194951 // RefSeq // Rattus norvegicus CTF8, chromosome transmission fidelity factor 8 homolog (S. cerevisiae) (Chtf8), mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000070822 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49941868:49952168:-1 gene:ENSRNOG00000047246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC166818 // GenBank // Rattus norvegicus CTF8, chromosome transmission fidelity factor 8 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:188691 IMAGE:8367310), complete cds. // chr19 // 100 // 30 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000038306 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49944505:49945212:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT028332 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028334 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028335 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028336 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
XM_001073696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptide deformylase (mitochondrial) (Pdf), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_003753106 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peptide deformylase (mitochondrial) (Pdf), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000036634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50108584:50109917:-1 gene:ENSRNOG00000022303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000038314 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50108584:50109917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028339 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1
NM_001106182 // RefSeq // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 8 (Cog8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066312 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50110028:50121317:-1 gene:ENSRNOG00000020379 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168966 // GenBank // Rattus norvegicus component of oligomeric golgi complex 8, mRNA (cDNA clone MGC:189288 IMAGE:7124140), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038310 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50110187:50121306:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT028341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT028341 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001106183 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane emp24 protein transport domain containing 6 (Tmed6), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000027686 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50125752:50132047:-1 gene:ENSRNOG00000020406 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50125867:50132012:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT028343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108448 // RefSeq // Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor 2 (Terf2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NM_001242355 // RefSeq // Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor 2 (Terf2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000027695 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50136826:50164563:-1 gene:ENSRNOG00000020435 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC160846 // GenBank // Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor 2, mRNA (cDNA clone MGC:187576 IMAGE:8362263), complete cds. // chr19 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// HQ651915 // GenBank // Rattus norvegicus telomeric repeat binding factor 2 isoform (Terf2) mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr19 // 100 // 67 // 22 // 22 // 0 /// FQ212165 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA67YH01 mRNA sequence. // chr19 // 76 // 76 // 25 // 33 // 1 /// GENSCAN00000038311 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50137277:50187178:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0
ENSRNOT00000029568 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:50288763:50289413:-1 gene:ENSRNOG00000022005 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000038312 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50253276:50330851:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 94 // 64 // 15 // 16 // 0
NM_017000 // RefSeq // Rattus norvegicus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 1 (Nqo1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255440 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 1 (Nqo1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49291903:49306795:1 gene:ENSRNOG00000012772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC083542 // GenBank // Rattus norvegicus NAD(P)H dehydrogenase, quinone 1, mRNA (cDNA clone MGC:93075 IMAGE:7190779), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// J02608 // GenBank // Rat NAD(P)H:menadione oxidoreductase mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// J02640 // GenBank // Rat quinone reductase mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// J02679 // GenBank // Rat NAD(P)H:menadione oxidoreductase mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026529 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49291992:49306254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027490 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_199086 // RefSeq // Rattus norvegicus NIN1/RPN12 binding protein 1 homolog (S. cerevisiae) (Nob1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000034386 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:49267151:49279617:1 gene:ENSRNOG00000021890 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY341886 // GenBank // Rattus norvegicus nin one binding protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC126076 // GenBank // Rattus norvegicus NIN1/RPN12 binding protein 1 homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:156557 IMAGE:8366716), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000026533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:49267167:49284844:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027486 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027485 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// NONRATT027487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 89 // 89 // 24 // 27 // 1 /// NONRATT027488 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
NM_001107426 // RefSeq // Rattus norvegicus proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 7 (Psmd7), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000019104 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:50501208:50508494:-1 gene:ENSRNOG00000014097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000035613 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:50501703:50508364:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
ENSRNOT00000051721 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:53265161:53265763:1 gene:ENSRNOG00000032799 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001106185 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 38 (Dhx38), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019810 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52935420:52952669:1 gene:ENSRNOG00000014619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016469 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52938350:52952281:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027560 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_012582 // RefSeq // Rattus norvegicus haptoglobin (Hp), mRNA. // chr19 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000020197 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52921330:52925933:1 gene:ENSRNOG00000014964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050989 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52921330:52925933:1 gene:ENSRNOG00000014964 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AY325231 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ba1-647 mRNA, complete cds. // chr19 // 88 // 81 // 23 // 26 // 0 /// BC089816 // GenBank // Rattus norvegicus haptoglobin, mRNA (cDNA clone MGC:108751 IMAGE:7321960), complete cds. // chr19 // 100 // 78 // 25 // 25 // 0 /// FQ209592 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YK16 mRNA sequence. // chr19 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000055038 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52921397:52925794:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT027554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 50 // 16 // 32 // 1 /// NONRATT027556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT027557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 25 // 25 // 8 // 32 // 1 /// NONRATT027558 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT027559 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_001008553 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydroorotate dehydrogenase (quinone) (Dhodh), mRNA. // chr19 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// XM_006255601 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydroorotate dehydrogenase (quinone) (Dhodh), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// XR_361830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dihydroorotate dehydrogenase (quinone) (Dhodh), transcript variant X2, misc_RNA. // chr19 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000066733 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52891893:52905966:1 gene:ENSRNOG00000015063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000055039 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52891947:52907415:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT027552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT027553 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 69 // 69 // 22 // 32 // 1
NM_001017454 // RefSeq // Rattus norvegicus increased sodium tolerance 1 homolog (yeast) (Ist1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006255584 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus increased sodium tolerance 1 homolog (yeast) (Ist1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255585 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus increased sodium tolerance 1 homolog (yeast) (Ist1), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020365 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52793724:52815862:1 gene:ENSRNOG00000015144 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC092631 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2400003C14, mRNA (cDNA clone MGC:109331 IMAGE:7314864), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000055042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52803452:52814813:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT027546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT027548 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 79 // 79 // 23 // 29 // 1 /// NONRATT027550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 86 // 86 // 25 // 29 // 1 /// NONRATT027547 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
ENSRNOT00000059225 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52757281:52759320:1 gene:ENSRNOG00000038766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027541 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// GENSCAN00000055040 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52753267:52759320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XM_006255598 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MARVEL domain containing 3 (Marveld3), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NM_001109132 // RefSeq // Rattus norvegicus MARVEL domain containing 3 (Marveld3), mRNA. // chr19 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000021866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52533502:52548323:1 gene:ENSRNOG00000016291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// GENSCAN00000055034 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52533599:52541509:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT027538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001107427 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 4 (Chst4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255586 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 4 (Chst4), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255587 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 4 (Chst4), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000022749 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52455335:52463987:1 gene:ENSRNOG00000016953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000055027 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52461861:52488204:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027537 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053988 // RefSeq // Rattus norvegicus calbindin 2 (Calb2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000022943 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:52310641:52337700:1 gene:ENSRNOG00000016977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC087603 // GenBank // Rattus norvegicus calbindin 2, mRNA (cDNA clone MGC:105356 IMAGE:7312595), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000034456 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:52295358:52353510:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 91 // 30 // 33 // 1 /// NONRATT027536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NM_001025766 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 34 (Il34), mRNA. // chr19 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023823 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:51714803:51728622:1 gene:ENSRNOG00000017602 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC076391 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 34, mRNA (cDNA clone IMAGE:7106821). // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC098808 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 34, mRNA (cDNA clone MGC:112852 IMAGE:7376793), complete cds. // chr19 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027530 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT027532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000053490 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:51715718:51728596:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 52 // 52 // 17 // 33 // 1 /// NONRATT027533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001106187 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing factor 3b, subunit 3 (Sf3b3), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000023854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54224944:54262543:1 gene:ENSRNOG00000017724 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000033381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54242358:54261861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 58 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT027584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT027587 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 23 // 23 // 10 // 43 // 1
ENSRNOT00000053092 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:19:54235952:54236020:1 gene:ENSRNOG00000045722 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT027584 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT056152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT056153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
NM_001107429 // RefSeq // Rattus norvegicus fucokinase (Fuk), mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066566 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54167905:54190881:1 gene:ENSRNOG00000017794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033388 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54132799:54190366:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT027581 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027583 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NM_001005381 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 19a (Ddx19a), mRNA. // chrU // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000024793 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54077938:54100118:1 gene:ENSRNOG00000018033 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// BC079094 // GenBank // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 19a, mRNA (cDNA clone MGC:94068 IMAGE:7123989), complete cds. // chrU // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NM_001005895 // RefSeq // Rattus norvegicus DEAD (Asp-Glu-Ala-As) box polypeptide 19B (Ddx19b), mRNA. // chrU // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// AY303540 // GenBank // Rattus norvegicus zinc responsive protein ZD10B mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrU // 33 // 33 // 9 // 27 // 1 /// AY751756 // GenBank // Rattus norvegicus zinc responsive protein Zd10A mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chrU // 37 // 37 // 10 // 27 // 1 /// NONRATT027579 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT027577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 78 // 78 // 21 // 27 // 1 /// GENSCAN00000033368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54078008:54099097:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT027576 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 74 // 74 // 20 // 27 // 1
XM_006222726 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 18, member A (Clec18a), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// XM_006222727 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 18, member A (Clec18a), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// XM_006222728 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C-type lectin domain family 18, member A (Clec18a), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 96 // 80 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000048900 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:53987847:54000338:1 gene:ENSRNOG00000022721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 87 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000073721 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:53987847:54000338:1 gene:ENSRNOG00000022721 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 93 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000033383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:53988253:54014446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0
NM_017211 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi glycoprotein 1 (Glg1), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025570 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:53811076:53912971:1 gene:ENSRNOG00000018668 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000046070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:53811096:53912083:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT027569 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U08136 // GenBank // Rattus norvegicus Sprague Dawley Golgi apparatus sialoglycoprotein MG-160 mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0
XM_001075875 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger and WD repeat domain 3 (Rfwd3), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255619 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger and WD repeat domain 3 (Rfwd3), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 100 // 17 // 8 // 8 // 0 /// XM_006255640 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger and WD repeat domain 3 (Rfwd3), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 30 // 14 // 14 // 0 /// XM_341690 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ring finger and WD repeat domain 3 (Rfwd3), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 35 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000036972 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54320402:54341069:-1 gene:ENSRNOG00000042353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 46 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000074983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54320402:54341069:-1 gene:ENSRNOG00000042353 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 95 // 46 // 20 // 21 // 0 /// XR_342343 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus mixed lineage kinase domain-like (Mlkl), transcript variant X4, misc_RNA. // chrU // 43 // 43 // 20 // 46 // 1 /// FQ230829 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA87YO10 mRNA sequence. // chrU // 100 // 52 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000033395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54264743:54407028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 65 // 65 // 30 // 46 // 1 /// NONRATT028432 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 30 // 30 // 14 // 46 // 1 /// NONRATT027568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 17 // 17 // 8 // 46 // 1 /// NONRATT028429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NM_001135583 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid 2-hydroxylase (Fa2h), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54355772:54407097:-1 gene:ENSRNOG00000018950 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000033395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54264743:54407028:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT028433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028435 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
XM_006222739 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 59 (Wdr59), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006222746 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 59 (Wdr59), transcript variant X9, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255641 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus WD repeat domain 59 (Wdr59), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047179 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:54464897:54523339:-1 gene:ENSRNOG00000018967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000058934 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:54464897:54523339:-1 gene:ENSRNOG00000018967 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050343 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54453420:54533219:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 50 // 50 // 12 // 24 // 1
NM_001008893 // RefSeq // Rattus norvegicus lactate dehydrogenase D (Ldhd), mRNA. // chr19 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// XM_006255631 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lactate dehydrogenase D (Ldhd), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 74 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000044844 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54634157:54656104:-1 gene:ENSRNOG00000019036 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000050349 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54634161:54649495:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 77 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT028441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// NONRATT028442 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 15 // 43 // 1 /// NONRATT028445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 49 // 49 // 21 // 43 // 1 /// NONRATT028443 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1 /// NONRATT028444 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 19 // 19 // 8 // 43 // 1
NM_012536 // RefSeq // Rattus norvegicus chymotrypsinogen B1 (Ctrb1), mRNA. // chr19 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54713958:54718713:-1 gene:ENSRNOG00000019068 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ233595 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YD18 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ234339 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA59YF09 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050344 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54714015:54718691:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028446 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012931 // RefSeq // Rattus norvegicus breast cancer anti-estrogen resistance 1 (Bcar1), mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058891 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54739919:54762789:-1 gene:ENSRNOG00000019253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// D29766 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for Crk-associated substrate, p130, complete cds. // chr19 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// FQ212404 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA56YF17 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000041815 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54739919:54762789:-1 gene:ENSRNOG00000019253 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 83 // 83 // 24 // 29 // 1 /// NONRATT028447 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 79 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000050341 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54740318:54762789:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1
NM_199378 // RefSeq // Rattus norvegicus craniofacial development protein 1 (Cfdp1), mRNA. // chr19 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000026249 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54794746:54885270:-1 gene:ENSRNOG00000019326 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// BC067246 // GenBank // Rattus norvegicus craniofacial development protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:73005 IMAGE:6889499), complete cds. // chr19 // 94 // 100 // 15 // 16 // 0 /// FQ212332 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA58YK08 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// AB125856 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for BCNT, complete cds. // chr19 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// NONRATT028449 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT028452 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 63 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000050350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54870506:54902688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 75 // 75 // 12 // 16 // 1 /// NONRATT028453 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 56 // 56 // 9 // 16 // 1
NM_001134608 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 170A (Tmem170a), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074824 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54896017:54901828:-1 gene:ENSRNOG00000049019 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// FQ231264 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA74YA14 mRNA sequence. // chr19 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT028455 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000050350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54870506:54902688:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_001107431 // RefSeq // Rattus norvegicus carbohydrate (N-acetylglucosamine 6-O) sulfotransferase 5 (Chst5), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026262 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54922197:54942511:-1 gene:ENSRNOG00000021521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212819 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA51YD05 mRNA sequence. // chr19 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050347 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54922849:54924036:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001271031 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane protein 231 (Tmem231), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000031243 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54946388:54965717:-1 gene:ENSRNOG00000021517 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000011295 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54946868:54965706:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028461 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0
NM_001109611 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase, tRNA-specific 1 (Adat1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255637 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine deaminase, tRNA-specific 1 (Adat1), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000026309 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:54994610:55017852:-1 gene:ENSRNOG00000019434 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000011298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:54992581:55015920:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028462 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001006967 // RefSeq // Rattus norvegicus lysyl-tRNA synthetase (Kars), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000046126 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:55018816:55037768:-1 gene:ENSRNOG00000019456 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC083652 // GenBank // Rattus norvegicus lysyl-tRNA synthetase, mRNA (cDNA clone MGC:94484 IMAGE:7135143), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000011304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:55018986:55035039:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028463 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT028464 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0
NM_001004073 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm2), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// NM_001165922 // RefSeq // Rattus norvegicus LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) (Lsm2), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 39 // 100 // 9 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000070846 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:20:7040457:7043830:1 gene:ENSRNOG00000048725 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 96 // 8 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000014753 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:55240209:55240503:-1 gene:ENSRNOG00000011065 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 86 // 96 // 19 // 22 // 0 /// GENSCAN00000011291 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:55240165:55259831:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT028467 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
GENSCAN00000009247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:56733439:56733906:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0
NM_001191944 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 18 (Adamts18), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000015874 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:56829758:56925970:-1 gene:ENSRNOG00000011575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000009245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:56878878:56925945:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 12 // 12 // 0
ENSRNOT00000015903 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:56970197:56970697:-1 gene:ENSRNOG00000011957 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 81 // 100 // 17 // 21 // 0 /// GENSCAN00000031273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:56967550:57009532:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 95 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT028473 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_019318 // RefSeq // Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog (Maf), mRNA. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000016577 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:58998441:58999550:-1 gene:ENSRNOG00000012428 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// U56242 // GenBank // Rattus norvegicus transcription factor Maf2 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255693 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog (Maf), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// XM_006255694 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog (Maf), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// XM_006255696 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus v-maf avian musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog (Maf), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// GENSCAN00000042955 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:58998441:58999550:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT028481 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028478 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1 /// NONRATT028479 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT028480 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 65 // 65 // 17 // 26 // 1
NM_001108451 // RefSeq // Rattus norvegicus dynein light chain roadblock-type 2 (Dynlrb2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016713 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:59812610:59823939:1 gene:ENSRNOG00000012450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053614 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:59795601:59882840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// NONRATT027633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT027632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NM_001106189 // RefSeq // Rattus norvegicus chromodomain protein, Y-like 2 (Cdyl2), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255681 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus chromodomain protein, Y-like 2 (Cdyl2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000068440 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:59888243:59956167:-1 gene:ENSRNOG00000042888 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000055627 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:59953793:59982468:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028487 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0
XM_006222799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease protein 1-like 2-like (LOC691069), mRNA. // chr19 // 95 // 90 // 35 // 37 // 0 /// XM_006255702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus polycystic kidney disease protein 1-like 2-like (LOC691069), mRNA. // chr19 // 100 // 88 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000071130 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:60327038:60411346:-1 gene:ENSRNOG00000045626 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 90 // 36 // 37 // 0 /// GENSCAN00000055625 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60313944:60427144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 83 // 34 // 34 // 0
NM_024391 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 2 (Hsd17b2), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000018795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:61033234:61101460:1 gene:ENSRNOG00000013982 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC088134 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid (17-beta) dehydrogenase 2, mRNA (cDNA clone MGC:108672 IMAGE:7326035), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000048692 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:61028686:61113827:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT027661 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT027662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1 /// NONRATT027663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1
NM_017168 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase C, gamma 2 (Plcg2), mRNA. // chr19 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018678 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:60828451:60942301:1 gene:ENSRNOG00000013676 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// J05155 // GenBank // Rat phospholipase C type IV mRNA, complete cds. // chr19 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0 /// GENSCAN00000048687 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60931837:60989579:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000056227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:60881311:60926419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT027659 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
GENSCAN00000048691 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:61267899:61296460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0
NM_001192009 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 8 (Slc38a8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006255721 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 8 (Slc38a8), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000038580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62868486:62888115:-1 gene:ENSRNOG00000025503 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:62868486:62925807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_053569 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-bound transcription factor peptidase, site 1 (Mbtps1), mRNA. // chr19 // 93 // 96 // 43 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000020838 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62895290:62934742:-1 gene:ENSRNOG00000015173 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 43 // 43 // 0 /// AF094821 // GenBank // Rattus norvegicus subtilisin/kexin isozyme SKI-1 precursor, mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 96 // 43 // 46 // 0 /// BC061855 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-bound transcription factor peptidase, site 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:5623811). // chr19 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT028504 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000050434 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:62868486:62925807:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 65 // 65 // 31 // 48 // 1 /// NONRATT028505 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 21 // 21 // 10 // 48 // 1
NM_001024896 // RefSeq // Rattus norvegicus hydroxysteroid dehydrogenase like 1 (Hsdl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255712 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid dehydrogenase like 1 (Hsdl1), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// XM_006255714 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hydroxysteroid dehydrogenase like 1 (Hsdl1), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000020859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62959341:62965942:-1 gene:ENSRNOG00000015576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC097457 // GenBank // Rattus norvegicus hydroxysteroid dehydrogenase like 1, mRNA (cDNA clone MGC:114519 IMAGE:7457192), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017244 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:62954708:62970858:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT028507 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028508 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001014155 // RefSeq // Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, C (Taf1c), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006255716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, C (Taf1c), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000020990 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:62994282:63000801:-1 gene:ENSRNOG00000015632 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC061804 // GenBank // Rattus norvegicus TATA box binding protein (Tbp)-associated factor, RNA polymerase I, C, mRNA (cDNA clone MGC:72580 IMAGE:5598458), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// BC062077 // GenBank // Rattus norvegicus similar to TAFI95, mRNA (cDNA clone IMAGE:5599601). // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000017271 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:62994765:62999980:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT028509 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028512 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT028513 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 31 // 31 // 9 // 29 // 1 /// NONRATT028514 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1
NM_001107435 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 4 (Kcng4), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255710 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus potassium voltage-gated channel, subfamily G, member 4 (Kcng4), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021271 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:63018981:63030951:-1 gene:ENSRNOG00000015746 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63021054:63043095:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 44 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT028515 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006255734 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC/LysM-associated domain containing 1 (Tldc1), mRNA. // chr19 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021743 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:63155131:63168351:-1 gene:ENSRNOG00000016224 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 22 // 22 // 0 /// XM_006222800 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TBC/LysM-associated domain containing 1 (Tldc1), mRNA. // chr19 // 52 // 52 // 16 // 31 // 1 /// GENSCAN00000017257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63150436:63176294:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 71 // 71 // 22 // 31 // 1 /// NONRATT028518 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 9 // 31 // 1
NM_001108452 // RefSeq // Rattus norvegicus coactosin-like F-actin binding protein 1 (Cotl1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000021954 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:63210065:63243545:-1 gene:ENSRNOG00000016257 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// BC158746 // GenBank // Rattus norvegicus coactosin-like 1 (Dictyostelium), mRNA (cDNA clone MGC:187925 IMAGE:9100871), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ226664 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YN08 mRNA sequence. // chr19 // 72 // 96 // 18 // 25 // 0 /// NONRATT028519 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000017272 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63210202:63243581:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 73 // 73 // 19 // 26 // 1
NM_133394 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 7 (Zdhhc7), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023405 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:63480614:63497760:-1 gene:ENSRNOG00000017342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY040615 // GenBank // Rattus norvegicus putative zinc finger protein SERZ-1 mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// AY886525 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC7 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC061769 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:72319 IMAGE:5621307), complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028522 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000045398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:63479276:63491123:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 77 // 77 // 20 // 26 // 1
XM_006222770 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 92, member B (Fam92b), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// XM_006255744 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 92, member B (Fam92b), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000035651 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:64472240:64483385:-1 gene:ENSRNOG00000021714 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000018216 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64472240:64493279:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028528 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
GENSCAN00000018227 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64818074:64839421:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001106190 // RefSeq // Rattus norvegicus GINS complex subunit 2 (Psf2 homolog) (Gins2), mRNA. // chr19 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000023709 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64873928:64886488:-1 gene:ENSRNOG00000017575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// XM_006255735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus GINS complex subunit 2 (Psf2 homolog) (Gins2), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// GENSCAN00000018240 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64877273:64886199:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 66 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028532 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
ENSRNOT00000058502 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:64896689:64897105:-1 gene:ENSRNOG00000038412 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000018199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64896689:64897453:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_001078912 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC361424 (RGD1309651), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_341702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC361424 (RGD1309651), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023721 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64906830:64925543:-1 gene:ENSRNOG00000017646 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000022364 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64925308:64931144:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028533 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012165 // RefSeq // Rattus norvegicus ER membrane protein complex subunit 8 (Emc8), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023855 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:64955328:64965075:-1 gene:ENSRNOG00000017654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC089914 // GenBank // Rattus norvegicus COX4 neighbor, mRNA (cDNA clone MGC:109187 IMAGE:7305045), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028535 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000022372 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64955596:64966002:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// NONRATT028536 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 35 // 35 // 9 // 26 // 1
XM_344780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 14 (Zcchc14), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000058486 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:64385403:64425619:-1 gene:ENSRNOG00000018226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000074448 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:64385449:64425619:-1 gene:ENSRNOG00000018226 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_344780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, CCHC domain containing 14 (Zcchc14), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 28 // 28 // 1 /// GENSCAN00000026857 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:64385449:64404780:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
XM_006222784 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus kelch domain-containing protein 4-like (LOC102556972), mRNA. // chr19 // 100 // 86 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025424 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:65335010:65362339:-1 gene:ENSRNOG00000018801 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 63 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000022366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65333448:65394597:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT028538 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 74 // 26 // 26 // 0
NM_017353 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7 (amino acid transporter light chain, L system), member 5 (Slc7a5), mRNA. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000025784 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65412970:65441647:-1 gene:ENSRNOG00000018824 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB015432 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for LAT1 (L-type amino acid transporter 1), complete cds. // chr19 // 97 // 100 // 29 // 30 // 0 /// U00995 // GenBank // Rattus norvegicus TA1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000022380 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65414826:65420460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT028544 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028545 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_019293 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 5a, mitochondrial (Car5a), mRNA. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006255782 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus carbonic anhydrase 5a, mitochondrial (Car5a), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000025848 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65451132:65480782:-1 gene:ENSRNOG00000019098 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC088147 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 5a, mitochondrial, mRNA (cDNA clone MGC:108708 IMAGE:7323596), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U12268 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase V mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65442192:65480730:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 90 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT028546 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
ENSRNOT00000030142 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:65591770:65592172:-1 gene:ENSRNOG00000028578 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000004289 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65572831:65594236:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1
NM_181364 // RefSeq // Rattus norvegicus thyrotropin releasing hormone receptor 2 (Trhr2), mRNA. // chr19 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000017317 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65887433:65892403:-1 gene:ENSRNOG00000012789 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AB015645 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for G protein-coupled receptor, complete cds. // chr19 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// AF091715 // GenBank // Rattus norvegicus thyrotropin releasing hormone receptor-2 (TRHR-2) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000004278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65888512:65892191:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 57 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT028549 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
NM_031062 // RefSeq // Rattus norvegicus mevalonate (diphospho) decarboxylase (Mvd), mRNA. // chr19 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000018145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65918097:65978333:-1 gene:ENSRNOG00000013376 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC081784 // GenBank // Rattus norvegicus mevalonate (diphospho) decarboxylase, mRNA (cDNA clone MGC:93385 IMAGE:7135885), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// U53706 // GenBank // Rattus norvegicus mevalonate pyrophosphate decarboxylase mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000021247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65959904:66000118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028552 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_024160 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome b-245, alpha polypeptide (Cyba), mRNA. // chr19 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// ENSRNOT00000017564 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65959818:65967224:-1 gene:ENSRNOG00000013014 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// AJ295951 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for endothelial p22-phox protein. // chr19 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// U18729 // GenBank // Rattus norvegicus cytochrome b558 alpha-subunit mRNA, complete cds. // chr19 // 67 // 67 // 24 // 36 // 1 /// NONRATT028551 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000021247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65959904:66000118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1 /// NONRATT028550 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 47 // 47 // 17 // 36 // 1
NM_001107439 // RefSeq // Rattus norvegicus snail family zinc finger 3 (Snai3), mRNA. // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// XM_006255765 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus snail family zinc finger 3 (Snai3), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// XM_006255766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus snail family zinc finger 3 (Snai3), transcript variant X4, mRNA. // chr19 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000018387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65987300:65994015:-1 gene:ENSRNOG00000013586 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1 /// GENSCAN00000021247 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:65959904:66000118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028554 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
NM_001002279 // RefSeq // Rattus norvegicus ring finger protein 166 (Rnf166), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000018591 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:65999963:66009803:-1 gene:ENSRNOG00000013777 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY606065 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein (Rnf166) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC100057 // GenBank // Rattus norvegicus ring finger protein 166, mRNA (cDNA clone MGC:112557 IMAGE:7131133), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021273 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66000953:66008912:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT028555 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028556 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NM_001077200 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 38, member A (Fam38a), mRNA. // chr19 // 94 // 93 // 47 // 50 // 0 /// ENSRNOT00000058332 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66014941:66075579:-1 gene:ENSRNOG00000013913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 49 // 49 // 0 /// AB161229 // GenBank // Rattus norvegicus rMib mRNA for Mib, complete cds. // chr19 // 93 // 74 // 37 // 40 // 0 /// GENSCAN00000021238 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66015246:66045738:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 96 // 52 // 52 // 0 /// NONRATT028557 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 76 // 41 // 41 // 0
NM_001013061 // RefSeq // Rattus norvegicus adenine phosphoribosyl transferase (Aprt), mRNA. // chr19 // 100 // 61 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000064180 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66095570:66097799:-1 gene:ENSRNOG00000014405 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 61 // 61 // 25 // 41 // 1 /// FQ218973 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA48YL07 mRNA sequence. // chr19 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1 /// NONRATT028561 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT028562 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT028563 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 39 // 16 // 16 // 0 /// GENSCAN00000021205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66095804:66131568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1
NM_001047851 // RefSeq // Rattus norvegicus galactosamine (N-acetyl)-6-sulfate sulfatase (Galns), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255762 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus galactosamine (N-acetyl)-6-sulfate sulfatase (Galns), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000019528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66100429:66131568:-1 gene:ENSRNOG00000014461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028566 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// GENSCAN00000021205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66095804:66131568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 68 // 68 // 21 // 31 // 1 /// NONRATT028567 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 39 // 39 // 12 // 31 // 1
NM_001113779 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A)binding protein nuclear 1-like (Pabpn1l), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045052 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66139325:66142767:-1 gene:ENSRNOG00000029558 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC158789 // GenBank // Rattus norvegicus poly(A)binding protein nuclear-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188155 IMAGE:7306904), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000021228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66139682:66169894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT028568 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108453 // RefSeq // Rattus norvegicus core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2; translocated to, 3 (Cbfa2t3), mRNA. // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2; translocated to, 3 (Cbfa2t3), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// XM_006255772 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus core-binding factor, runt domain, alpha subunit 2; translocated to, 3 (Cbfa2t3), transcript variant X3, mRNA. // chr19 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000019820 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66150087:66218763:-1 gene:ENSRNOG00000014723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028570 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000021228 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66139682:66169894:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1
NONRATT028572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000031389 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:66410702:66443409:-1 gene:ENSRNOG00000027906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 95 // 35 // 35 // 0 /// ENSRNOT00000058258 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:66410702:66434973:-1 gene:ENSRNOG00000027906 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000020148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66422512:66443409:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66410702:66422084:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 41 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT028573 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT028575 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 38 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT028572 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 27 // 27 // 10 // 37 // 1 /// NONRATT028577 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 22 // 22 // 8 // 37 // 1
NM_001106194 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family 5A, member 1 (Sult5a1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_001201369 // RefSeq // Rattus norvegicus sulfotransferase family 5A, member 1 (Sult5a1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000051452 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66658233:66672599:-1 gene:ENSRNOG00000015695 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66658344:66672578:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT028582 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
NM_001083313 // RefSeq // Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 1A (Chmp1a), mRNA. // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// XM_006255780 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus charged multivesicular body protein 1A (Chmp1a), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000021483 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66707177:66715457:-1 gene:ENSRNOG00000016001 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028585 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028586 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000020177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66707967:66712651:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1
NM_001109133 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 2-like (Spata2L), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006255781 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 2-like (Spata2L), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000021968 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66737483:66741950:-1 gene:ENSRNOG00000016167 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000020179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66738825:66759008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028588 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028589 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107440 // RefSeq // Rattus norvegicus VPS9 domain containing 1 (Vps9d1), mRNA. // chr19 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000051945 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66745402:66759014:-1 gene:ENSRNOG00000028904 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// BC166767 // GenBank // Rattus norvegicus similar to chromosome 16 open reading frame 7, mRNA (cDNA clone MGC:188536 IMAGE:7933213), complete cds. // chr19 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// FQ221344 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA37YI15 mRNA sequence. // chr19 // 90 // 91 // 26 // 29 // 0 /// GENSCAN00000020179 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66738825:66759008:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028590 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028591 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028592 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// NONRATT028593 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001108455 // RefSeq // Rattus norvegicus Fanconi anemia, complementation group A (Fanca), mRNA. // chr19 // 100 // 98 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000022658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:66772420:66822658:-1 gene:ENSRNOG00000016706 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000073615 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:67117952:67132914:-1 gene:ENSRNOG00000049288 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 21 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000020170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:66772665:66824734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 74 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000035257 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67110605:67120841:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028597 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1
NM_001014156 // RefSeq // Rattus norvegicus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 1 (Dbndd1), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014090 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67012418:67021168:-1 gene:ENSRNOG00000026974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC088277 // GenBank // Rattus norvegicus dysbindin (dystrobrevin binding protein 1) domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:109128 IMAGE:7381798), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000035263 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67013417:67021157:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT028598 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107441 // RefSeq // Rattus norvegicus centriole, cilia and spindle-associated protein (Ccsap), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000023911 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67325675:67343393:-1 gene:ENSRNOG00000017690 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ212467 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA53YP14 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000035243 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67327944:67343393:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028600 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006222801 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoporin 133 (Nup133), transcript variant X2, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_006255819 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus nucleoporin 133 (Nup133), mRNA. // chr19 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024182 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:19:67397820:67418668:-1 gene:ENSRNOG00000017919 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// BC091416 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7365240, containing frame-shift errors. // chr19 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000035239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67397884:67418660:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT028603 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67423953:67488385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
FQ226831 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA1YE02 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028608 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028609 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001012166 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 10 (Abcb10), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024232 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67458448:67488456:-1 gene:ENSRNOG00000017993 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC089900 // GenBank // Rattus norvegicus ATP-binding cassette, sub-family B (MDR/TAP), member 10, mRNA (cDNA clone MGC:109142 IMAGE:7383307), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028610 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000000436 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67423953:67488385:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 92 // 92 // 24 // 26 // 1
NR_037621 // RefSeq // Rattus norvegicus cytochrome c oxidase subunit VIc, pseudogene (Cox6c-ps1), non-coding RNA. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// M20183 // GenBank // Rat cytochrome c oxidase subunit VIc (COX-VIc-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 93 // 100 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043529 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67693460:67693690:-1 gene:ENSRNOG00000032602 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 100 // 33 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT028614 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106198 // RefSeq // Rattus norvegicus piggyBac transposable element derived 5 (Pgbd5), mRNA. // chr19 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000058080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67835422:67900208:-1 gene:ENSRNOG00000026791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000432 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67835902:67868709:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0
NM_001106198 // RefSeq // Rattus norvegicus piggyBac transposable element derived 5 (Pgbd5), mRNA. // chr19 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000058080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:67835422:67900208:-1 gene:ENSRNOG00000026791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000000438 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:67880411:67900254:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 91 // 92 // 21 // 23 // 0 /// NONRATT028617 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NONRATT021607 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// NONRATT046792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 75 // 100 // 3 // 4 // 0 /// NONRATT046793 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 75 // 100 // 3 // 4 // 0 /// NONRATT058857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 75 // 100 // 3 // 4 // 0 /// NONRATT005672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// NONRATT042498 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// NONRATT042499 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 50 // 100 // 2 // 4 // 0 /// NONRATT002456 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT008786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT008787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT020652 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT022844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT022845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 4 // 4 // 1 /// NONRATT051305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 4 // 4 // 1
NM_134432 // RefSeq // Rattus norvegicus angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8) (Agt), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024917 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68026228:68038550:-1 gene:ENSRNOG00000018445 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078741 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8), mRNA (cDNA clone MGC:93198 IMAGE:7128542), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC087679 // GenBank // Rattus norvegicus angiotensinogen (serpin peptidase inhibitor, clade A, member 8), mRNA (cDNA clone MGC:105326 IMAGE:7318795), complete cds. // chr19 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000053162 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68025923:68032606:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT028618 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028620 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT028619 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001109134 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 2310022B05 (RGD1559896), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025512 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68101910:68127030:-1 gene:ENSRNOG00000018836 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ212098 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA69YG23 mRNA sequence. // chr19 // 89 // 69 // 16 // 18 // 0 /// GENSCAN00000053170 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68105211:68126988:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 62 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT028621 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001136162 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 13 (Ttc13), mRNA. // chr19 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// XM_006255802 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 13 (Ttc13), transcript variant X1, mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000025548 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68135050:68189367:-1 gene:ENSRNOG00000018884 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 91 // 42 // 42 // 0 /// GENSCAN00000053154 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68140863:68163007:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 48 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028622 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 98 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT028623 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 24 // 24 // 11 // 46 // 1 /// NONRATT028626 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 17 // 17 // 8 // 46 // 1
NM_001011711 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 89, member A (Fam89a), mRNA. // chr19 // 85 // 96 // 22 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025705 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68206966:68219573:-1 gene:ENSRNOG00000019022 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC107921 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 89, member A, mRNA (cDNA clone MGC:124908 IMAGE:7445343), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053153 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68207738:68219511:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT028629 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000025948 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68313479:68327797:-1 gene:ENSRNOG00000019169 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// BC105747 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 0610039J04, mRNA (cDNA clone MGC:124748 IMAGE:5597965), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028632 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000053159 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68313122:68328051:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT028633 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 58 // 58 // 15 // 26 // 1
NM_139043 // RefSeq // Rattus norvegicus exocyst complex component 8 (Exoc8), mRNA. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000026757 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68360729:68362879:-1 gene:ENSRNOG00000019766 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// AF032669 // GenBank // Rattus norvegicus exo84 mRNA, complete cds. // chr19 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000053165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68360729:68362879:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT028637 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000026767 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68375019:68412725:-1 gene:ENSRNOG00000019773 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// AY228140 // GenBank // Rattus norvegicus EGLN1 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 79 // 11 // 11 // 0 /// BC081694 // GenBank // Rattus norvegicus EGL nine homolog 1 (C. elegans), mRNA (cDNA clone IMAGE:7189949), partial cds. // chr19 // 100 // 93 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000053158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68395207:68413790:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 50 // 7 // 7 // 0 /// NONRATT028638 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NM_001009704 // RefSeq // Rattus norvegicus signal-induced proliferation-associated 1 like 2 (Sipa1l2), mRNA. // chr19 // 87 // 100 // 40 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000026843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68936975:69098880:-1 gene:ENSRNOG00000019791 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 98 // 100 // 45 // 46 // 0 /// AY043227 // GenBank // Rattus norvegicus serine-rich synapse associated protein SERSAP2 mRNA, complete cds. // chr19 // 87 // 100 // 40 // 46 // 0 /// GENSCAN00000047743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68929713:69010382:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 95 // 80 // 35 // 37 // 0 /// NONRATT028641 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 46 // 46 // 0 /// NONRATT028643 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 87 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT028642 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 30 // 30 // 14 // 46 // 1
XM_006222805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pecanex-like 2 (Drosophila) (Pcnxl2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:69280871:69429521:-1 gene:ENSRNOG00000028580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047751 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:69280871:69317833:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0
NM_152935 // RefSeq // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast) (Tomm20), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000027088 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:70530583:70540402:-1 gene:ENSRNOG00000019980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// BC078715 // GenBank // Rattus norvegicus translocase of outer mitochondrial membrane 20 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:93136 IMAGE:7127457), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ214253 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA42YO09 mRNA sequence. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// FQ220356 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA43YD04 mRNA sequence. // chr19 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// FQ230650 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA8YJ09 mRNA sequence. // chr19 // 89 // 100 // 16 // 18 // 0 /// U21871 // GenBank // Rattus norvegicus outer mitochondrial membrane receptor rTOM20 mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000000143 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:70423346:70540292:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 44 // 44 // 8 // 18 // 1
NONRATT028657 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028658 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001014015 // RefSeq // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 34 (Rbm34), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000027145 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:70541743:70562213:-1 gene:ENSRNOG00000020004 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC087155 // GenBank // Rattus norvegicus RNA binding motif protein 34, mRNA (cDNA clone MGC:95242 IMAGE:7133162), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000000136 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:70544529:70562196:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 82 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028660 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT028662 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1
ENSRNOT00000027154 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:70615271:70615898:-1 gene:ENSRNOG00000020046 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr19 // 86 // 100 // 19 // 22 // 0 /// NONRATT028663 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000000141 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:70591404:70617917:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 36 // 36 // 8 // 22 // 1
XM_006222803 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2-like (LOC679596), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006255840 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2-like (LOC679596), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047078 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:70663411:70663791:-1 gene:ENSRNOG00000033345 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr19 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000000132 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:70663405:70676946:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017022 // RefSeq // Rattus norvegicus integrin, beta 1 (Itgb1), mRNA. // chr19 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000014785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:72324612:72372323:1 gene:ENSRNOG00000010966 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// BC131845 // GenBank // Rattus norvegicus integrin beta 1 (fibronectin receptor beta), mRNA (cDNA clone MGC:156664 IMAGE:8366766), complete cds. // chr19 // 97 // 81 // 28 // 29 // 0 /// U12309 // GenBank // Rattus norvegicus integrin beta-1 subunit (integrin beta-1) mRNA, complete cds. // chr19 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// GENSCAN00000056002 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:72323890:72371232:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 96 // 75 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT027863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr19 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
ENSRNOT00000072364 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:19:72623689:72625540:-1 gene:ENSRNOG00000046437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000035376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:72432362:72860153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 53 // 53 // 8 // 15 // 1
NM_001047936 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC498971 (LOC498971), mRNA. // chrU // 94 // 93 // 48 // 51 // 0
NM_001011561 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 7 (Ccdc7), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000073524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:72702491:72749329:-1 gene:ENSRNOG00000050191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075053 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:72698629:72802986:-1 gene:ENSRNOG00000050191 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC079021 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 7, mRNA (cDNA clone MGC:93946 IMAGE:7113858), complete cds. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000035376 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:72432362:72860153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 71 // 17 // 17 // 0
NM_022262 // RefSeq // Rattus norvegicus translin-associated factor X (Tsnax), mRNA. // chr19 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000071827 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:68481972:68495992:1 gene:ENSRNOG00000049784 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// AF262357 // GenBank // Rattus norvegicus trax mRNA, complete cds. // chr19 // 92 // 86 // 22 // 24 // 0 /// BC081715 // GenBank // Rattus norvegicus translin-associated factor X, mRNA (cDNA clone MGC:93125 IMAGE:7130295), complete cds. // chr19 // 93 // 96 // 25 // 27 // 0 /// GENSCAN00000019543 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:68487393:68494688:1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 32 // 9 // 9 // 0
XM_006222805 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus pecanex-like 2 (Drosophila) (Pcnxl2), mRNA. // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000030077 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:69280871:69429521:-1 gene:ENSRNOG00000028580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000072170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:19:69362852:69429521:-1 gene:ENSRNOG00000028580 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 33 // 33 // 8 // 24 // 1 /// GENSCAN00000047760 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:19:69332279:69418454:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr19 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_001008967 // RefSeq // Rattus norvegicus vomeronasal 1 receptor 63 (Vom1r63), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000043828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:69455614:69456546:1 gene:ENSRNOG00000048370 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// AY510345 // GenBank // Rattus norvegicus vomeronasal V1r-type receptor V1re15 mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001024294 // RefSeq // Rattus norvegicus CLK4-associating serine/arginine rich protein (Clasrp), mRNA. // chr1 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// ENSRNOT00000075144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81757541:81781715:-1 gene:ENSRNOG00000046000 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// BC089090 // GenBank // Rattus norvegicus splicing factor, arginine/serine-rich 16, mRNA (cDNA clone MGC:105839 IMAGE:7111206), complete cds. // chr1 // 100 // 91 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000026398 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81757868:81780568:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 97 // 82 // 36 // 37 // 0
NM_001109170 // RefSeq // Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 7 (Gemin7), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228460 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 7 (Gemin7), transcript variant X1, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006228461 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus gem (nuclear organelle) associated protein 7 (Gemin7), transcript variant X2, mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040934 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:4:143643764:143644162:-1 gene:ENSRNOG00000034168 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074418 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81739987:81749508:-1 gene:ENSRNOG00000049772 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81740345:81740734:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043615 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:4:143643764:143644153:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001000109 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 387 (Olr387), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001039343 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, DHHC-type containing 14 (Zdhhc14), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000043521 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:47692788:47953571:1 gene:ENSRNOG00000029049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AY886530 // GenBank // Rattus norvegicus membrane-associated DHHC14 zinc finger protein mRNA, complete cds. // chr1 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000054332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:47948089:47985729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 89 // 100 // 24 // 27 // 0
NM_001000856 // RefSeq // Rattus norvegicus olfactory receptor 386 (Olr386), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000035433 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:63478627:63479601:1 gene:ENSRNOG00000023767 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:63478627:63479601:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001075949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 296 (Zfp296), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_345065 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 296 (Zfp296), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000074579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:1:81753959:81757084:1 gene:ENSRNOG00000049605 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000026393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:81753959:81757059:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106065 // RefSeq // Rattus norvegicus occludin/ELL domain containing 1 (Ocel1), mRNA. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000051802 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19627386:19629155:1 gene:ENSRNOG00000032575 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC169113 // GenBank // Rattus norvegicus occludin/ELL domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:189548 IMAGE:7445881), complete cds. // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000040709 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19627887:19629043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT022222 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022223 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT022224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0
NM_001169100 // RefSeq // Rattus norvegicus unconventional SNARE in the ER 1 homolog (S. cerevisiae) (Use1), mRNA. // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000022650 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:16:19623234:19625901:1 gene:ENSRNOG00000016619 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// FQ217580 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA23YC13 mRNA sequence. // chr16 // 76 // 81 // 16 // 21 // 0 /// GENSCAN00000040621 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:16:19623243:19625884:1 transcript_biotype:protein_coding // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022215 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022219 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022220 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022221 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT022217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr16 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000074810 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:271071975:271134597:-1 gene:ENSRNOG00000050742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000075661 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:1:271071975:271095809:-1 gene:ENSRNOG00000050742 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000023134 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:271071975:271111574:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
NM_030836 // RefSeq // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 (Erap1), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// XM_006231702 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 (Erap1), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000013625 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:1381110:1419644:1 gene:ENSRNOG00000009997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// AF148323 // GenBank // Rattus norvegicus aminopeptidase PILS (APPILS) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 89 // 33 // 34 // 0 /// AF148324 // GenBank // Rattus norvegicus aminopeptidase PILS (APPILS) mRNA, alternative splice product, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// BC098664 // GenBank // Rattus norvegicus endoplasmic reticulum aminopeptidase 1, mRNA (cDNA clone MGC:112613 IMAGE:7192921), complete cds. // chr2 // 100 // 89 // 34 // 34 // 0 /// GENSCAN00000018632 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:1385216:1419587:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028671 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028673 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// NONRATT028672 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 9 // 38 // 1
NONRATT041458 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 67 // 100 // 4 // 6 // 0
NM_017091 // RefSeq // Rattus norvegicus proprotein convertase subtilisin/kexin type 1 (Pcsk1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015185 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:111211103:111257642:-1 gene:ENSRNOG00000011107 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// M76705 // GenBank // Rat prohormone convertase PC1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 29 // 29 // 0 /// M83745 // GenBank // Rat homologue of Kex2 and furin proteins mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 97 // 29 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000071771 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:2274882:2307318:1 gene:ENSRNOG00000050913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000029302 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2142268:2307318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000036697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:111213671:111258167:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0
XM_006223944 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus elongation factor RNA polymerase II 2 (Ell2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000032974 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:2450088:2518045:1 gene:ENSRNOG00000027089 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// BC111075 // GenBank // Rattus norvegicus elongation factor RNA polymerase II 2, mRNA (cDNA clone IMAGE:7308699), partial cds. // chr2 // 100 // 22 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000006381 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2498726:2517620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT028681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT028683 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT028684 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1
GENSCAN00000029304 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2463774:2464052:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT028681 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
NM_022278 // RefSeq // Rattus norvegicus glutaredoxin (thioltransferase) (Glrx), mRNA. // chr2 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:2604443:2614390:1 gene:ENSRNOG00000012183 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF167981 // GenBank // Rattus norvegicus glutaredoxin (Grx) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 100 // 26 // 28 // 0 /// AF319950 // GenBank // Rattus norvegicus glutaredoxin mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 75 // 20 // 21 // 0 /// BC061555 // GenBank // Rattus norvegicus glutaredoxin 1 (thioltransferase), mRNA (cDNA clone MGC:72841 IMAGE:6889009), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028688 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106399 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 9 (Spata9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 9 (Spata9), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000017068 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:2728276:2765300:1 gene:ENSRNOG00000012770 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000006390 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2728623:2765121:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028690 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028691 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1
XM_006223946 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 37 (Ttc37), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006223949 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 37 (Ttc37), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// XM_006231718 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 37 (Ttc37), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000062017 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:2906498:2990393:1 gene:ENSRNOG00000040297 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000006385 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2948748:2990393:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000006389 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:2906498:2942738:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT028694 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1
XM_003749161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multiple C2 domains, transmembrane 1 (Mctp1), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// XM_003753501 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multiple C2 domains, transmembrane 1 (Mctp1), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000017828 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:3613029:3972025:1 gene:ENSRNOG00000013282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000064743 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:3613143:3818276:1 gene:ENSRNOG00000013282 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000034795 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:3703421:3838299:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 34 // 14 // 14 // 0 /// FQ232558 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA65YE13 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 66 // 26 // 27 // 0 /// NONRATT028698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 14 // 41 // 1 /// NONRATT028699 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 8 // 41 // 1
ENSRNOT00000031839 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:3998424:3999237:1 gene:ENSRNOG00000013650 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041901 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:3998553:4004387:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 16 // 16 // 0
XM_006223952 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC294603 (RGD1560883), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231724 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC294603 (RGD1560883), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000071535 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:4250417:4442634:1 gene:ENSRNOG00000045639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041916 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:4264724:4341516:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001106401 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 172, member A (Fam172a), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231726 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 172, member A (Fam172a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// ENSRNOT00000041541 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:5174044:5531001:1 gene:ENSRNOG00000013844 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000001673 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:4956926:4972490:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 24 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT028705 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000003985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:5312595:5417406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1
NONRATT028704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001081751 // RefSeq // Rattus norvegicus POU domain class 5, transcription factor 2 (Pou5f2), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000003985 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:5312595:5417406:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028704 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028707 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001009698 // RefSeq // Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 3 (Lysmd3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000021818 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:9409771:9412384:1 gene:ENSRNOG00000016298 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// BC088262 // GenBank // Rattus norvegicus LysM, putative peptidoglycan-binding, domain containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:109090 IMAGE:7376577), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000019793 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:9381847:9412310:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// NONRATT028714 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT028715 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001108934 // RefSeq // Rattus norvegicus metallo-beta-lactamase domain containing 2 (Mblac2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000021756 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:9458243:9501517:1 gene:ENSRNOG00000016252 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000012420 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:9500307:9500692:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT028717 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019809 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:9455671:9458944:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001191842 // RefSeq // Rattus norvegicus centrin, EF-hand protein, 3 (Cetn3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000072155 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:11965387:11977798:1 gene:ENSRNOG00000048563 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000074157 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:9561911:9574322:1 gene:ENSRNOG00000050877 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ234873 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA57YF14 mRNA sequence. // chr2 // 95 // 78 // 20 // 21 // 0 /// GENSCAN00000017393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:11969321:11975647:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000012445 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:9565845:9624668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 11 // 27 // 1
XM_006223955 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2C (Mef2c), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// XM_006223959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2C (Mef2c), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// XM_006231733 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2C (Mef2c), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// XM_006231735 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myocyte enhancer factor 2C (Mef2c), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000041296 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:11592404:11680469:1 gene:ENSRNOG00000033134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000041538 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:11592404:11680469:1 gene:ENSRNOG00000033134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000047689 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:11592404:11650867:1 gene:ENSRNOG00000033134 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000017394 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:11606845:11680469:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028720 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 9 // 24 // 1
ENSRNOT00000049131 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:13095957:13096957:1 gene:ENSRNOG00000032259 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000034742 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:12997313:13096957:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_052981 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin H (Ccnh), mRNA. // chr2 // 90 // 100 // 26 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000049423 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:13446659:13467469:1 gene:ENSRNOG00000031656 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// AF154914 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin H mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// BC059109 // GenBank // Rattus norvegicus cyclin H, mRNA (cDNA clone MGC:72647 IMAGE:6886953), complete cds. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000034743 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:13312430:13467345:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT028732 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028733 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 41 // 41 // 12 // 29 // 1
ENSRNOT00000043935 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:14723986:14724943:1 gene:ENSRNOG00000029703 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0
GENSCAN00000044978 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:16750619:16751233:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 78 // 17 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000042684 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:16750619:16751366:1 gene:ENSRNOG00000031476 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 73 // 96 // 16 // 22 // 0
XM_003753504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EGF-like repeats and discoidin I-like domains 3 (Edil3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000046758 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:17606363:17607563:1 gene:ENSRNOG00000033064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000061895 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:17606363:17864690:1 gene:ENSRNOG00000033064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 62 // 15 // 16 // 0 /// ENSRNOT00000064991 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:17606363:17874823:1 gene:ENSRNOG00000033064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000075550 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:17606363:17875057:1 gene:ENSRNOG00000033064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000028239 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:17576121:17691473:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT028741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
XM_003753504 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus EGF-like repeats and discoidin I-like domains 3 (Edil3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000061895 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:17606363:17864690:1 gene:ENSRNOG00000033064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 69 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000064991 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:17606363:17874823:1 gene:ENSRNOG00000033064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// ENSRNOT00000075550 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:17606363:17875057:1 gene:ENSRNOG00000033064 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1 /// GENSCAN00000028234 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:17787880:17969870:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1 /// GENSCAN00000028223 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:17710128:17768729:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT028741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 8 // 29 // 1 /// NONRATT028744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1
NM_019189 // RefSeq // Rattus norvegicus hyaluronan and proteoglycan link protein 1 (Hapln1), mRNA. // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// XM_006231748 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hyaluronan and proteoglycan link protein 1 (Hapln1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000042958 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:18229924:18291848:1 gene:ENSRNOG00000032002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000043196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:18229924:18291848:1 gene:ENSRNOG00000032002 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// BC128740 // GenBank // Rattus norvegicus hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:156657 IMAGE:8371477), complete cds. // chr2 // 96 // 86 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT028746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000022278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:18267880:18348612:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1
ENSRNOT00000048766 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:18371584:18372194:1 gene:ENSRNOG00000029210 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000022284 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:18371557:18372024:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
ENSRNOT00000022366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:18803359:18820412:1 gene:ENSRNOG00000016686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000022377 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:18803359:18818174:1 gene:ENSRNOG00000016686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// FQ213661 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA46YH24 mRNA sequence. // chr2 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0 /// NONRATT028748 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028749 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028750 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
XM_006231760 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus single-stranded DNA binding protein 2 (Ssbp2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006231766 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus single-stranded DNA binding protein 2 (Ssbp2), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000021857 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:20379437:20574043:1 gene:ENSRNOG00000016213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071139 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:20379437:20574043:1 gene:ENSRNOG00000016213 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// FQ221531 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA34YO04 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028755 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028754 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 69 // 69 // 20 // 29 // 1 /// NONRATT028757 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 55 // 55 // 16 // 29 // 1
NM_130747 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA thioesterase 12 (Acot12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000021675 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:48055055:48096606:-1 gene:ENSRNOG00000015081 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// AB040609 // GenBank // Rattus norvegicus rACH mRNA for cytoplasmic acetyl-CoA hydrolase, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT030779 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000012902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:48044994:48082242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 18 // 30 // 1
NM_001109174 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 34B (Ankrd34b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061812 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41203747:41219671:1 gene:ENSRNOG00000040166 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41200954:41218527:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT028762 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_130400 // RefSeq // Rattus norvegicus dihydrofolate reductase (Dhfr), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018259 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41137857:41163224:1 gene:ENSRNOG00000013521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// AF318150 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrofolate reductase (Dhfr) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 26 // 27 // 0 /// BC158583 // GenBank // Rattus norvegicus dihydrofolate reductase, mRNA (cDNA clone MGC:187341 IMAGE:9022774), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000043596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41137870:41162386:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
ENSRNOT00000054548 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:2:41148171:41148259:1 gene:ENSRNOG00000036436 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028760 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000017403 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:41370470:41372254:1 gene:ENSRNOG00000013016 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043598 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41362807:41371253:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0
NM_133395 // RefSeq // Rattus norvegicus serine incorporator 5 (Serinc5), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000065131 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:41398821:41516426:1 gene:ENSRNOG00000024039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ103710 // GenBank // Rattus norvegicus serine incorporator 5 (Serinc5) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// L20319 // GenBank // Rattus norvegicus developmentally regulated protein (TPO1) mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// NONRATT028766 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000007225 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41448924:41531284:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1 /// NONRATT028765 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1 /// NONRATT028767 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 12 // 26 // 1
XR_351276 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus metaxin 3 (Mtx3), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000061761 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:41632738:41640357:1 gene:ENSRNOG00000023837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000007235 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:41632738:41640357:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028771 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT028774 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
AY387047 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00061 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043748 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:42439173:42439646:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_139102 // RefSeq // Rattus norvegicus dimethylglycine dehydrogenase (Dmgdh), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006231771 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dimethylglycine dehydrogenase (Dmgdh), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 97 // 91 // 28 // 29 // 0 /// XM_006231773 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus dimethylglycine dehydrogenase (Dmgdh), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032783 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:42469965:42545053:1 gene:ENSRNOG00000023588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// BC085697 // GenBank // Rattus norvegicus dimethylglycine dehydrogenase, mRNA (cDNA clone MGC:93164 IMAGE:7108858), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043755 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:42469997:42494242:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 31 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT028780 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000043756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:42494906:42601297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 17 // 32 // 1
NM_033443 // RefSeq // Rattus norvegicus arylsulfatase B (Arsb), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// XM_006231774 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylsulfatase B (Arsb), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 95 // 76 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000014860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:42559883:42719688:1 gene:ENSRNOG00000011150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// BC168241 // GenBank // Rattus norvegicus arylsulfatase B, mRNA (cDNA clone MGC:188365 IMAGE:7934677), complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT028781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000043756 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:42494906:42601297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 45 // 45 // 13 // 29 // 1 /// NONRATT028782 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1
ENSRNOT00000014860 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:42559883:42719688:1 gene:ENSRNOG00000011150 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC168241 // GenBank // Rattus norvegicus arylsulfatase B, mRNA (cDNA clone MGC:188365 IMAGE:7934677), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028781 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106402 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 2 (Lhfpl2), mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006231793 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 2 (Lhfpl2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006231797 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 2 (Lhfpl2), transcript variant X7, mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// XM_006231799 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner-like 2 (Lhfpl2), transcript variant X9, mRNA. // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000014795 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:42942597:43023910:1 gene:ENSRNOG00000011032 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT028783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000043880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43013644:43020580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
GENSCAN00000043880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43013644:43020580:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 63 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT028783 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000075202 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:43013575:43014421:1 gene:ENSRNOG00000050458 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 58 // 100 // 14 // 24 // 0
NM_001107646 // RefSeq // Rattus norvegicus adaptor-related protein complex 3, beta 1 subunit (Ap3b1), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066302 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:43195234:43395094:1 gene:ENSRNOG00000010624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000043869 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43220364:43320650:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// NONRATT028786 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1 /// NONRATT028788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
ENSRNOT00000014099 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:2:43367948:43368054:1 gene:ENSRNOG00000010615 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028787 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028788 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000043882 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43356495:43394530:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_001100523 // RefSeq // Rattus norvegicus orthopedia homeobox (Otp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:43712391:43722342:1 gene:ENSRNOG00000010560 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000032160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43712529:43722072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028791 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 13 // 25 // 1 /// NONRATT028792 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 60 // 60 // 15 // 25 // 1
NM_001108541 // RefSeq // Rattus norvegicus WD repeat domain 41 (Wdr41), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000036748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:43827474:43875283:1 gene:ENSRNOG00000025462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000067022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:43827385:43876536:1 gene:ENSRNOG00000025462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC166792 // GenBank // Rattus norvegicus WD repeat domain 41, mRNA (cDNA clone MGC:188582 IMAGE:7937195), complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT028795 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028796 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028797 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000032158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:43858209:43877177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT028798 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
AY387089 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRGT00103 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY539874 // GenBank HTC // Rattus norvegicus LRRG00123 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025729 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, BED-type containing 3 (Zbed3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231816 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger, BED-type containing 3 (Zbed3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000040983 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:44199667:44210609:1 gene:ENSRNOG00000028941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC097974 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger, BED-type containing 3, mRNA (cDNA clone MGC:116104 IMAGE:7442124), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028802 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_133556 // RefSeq // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial Fo complex, subunit C2 (subunit 9) (Atp5g2), mRNA. // chr2 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000020676 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:7:142056432:142064809:-1 gene:ENSRNOG00000015320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// BC128726 // GenBank // Rattus norvegicus ATP synthase, H+ transporting, mitochondrial F0 complex, subunit C2 (subunit 9), mRNA (cDNA clone MGC:156595 IMAGE:7321526), complete cds. // chr2 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// D13124 // GenBank // Rattus norvegicus P2 mRNA for ATP synthase subunit c, complete cds. // chr2 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0 /// FQ209535 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA42YB13 mRNA sequence. // chr2 // 65 // 100 // 17 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024269 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:45222756:45223178:1 gene:ENSRNOG00000018045 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000049703 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:45217600:45223178:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028804 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 65 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000008757 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:7:142056575:142061677:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0 /// NONRATT052612 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 62 // 100 // 16 // 26 // 0 /// NONRATT052613 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 58 // 100 // 15 // 26 // 0
NM_053313 // RefSeq // Rattus norvegicus coagulation factor II (thrombin) receptor-like 2 (F2rl2), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024292 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:45371780:45376928:1 gene:ENSRNOG00000018054 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF310076 // GenBank // Rattus norvegicus protease activated receptor 3 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// GENSCAN00000049697 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:45371842:45376592:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 68 // 16 // 17 // 0 /// NONRATT028805 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001025647 // RefSeq // Rattus norvegicus POC5 centriolar protein (Poc5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POC5 centriolar protein (Poc5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// XM_006231822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus POC5 centriolar protein (Poc5), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000061507 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:46127645:46152889:1 gene:ENSRNOG00000018193 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 22 // 22 // 0 /// BC097489 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1200014M14, mRNA (cDNA clone MGC:114560 IMAGE:7460568), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000053770 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46127452:46149861:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028809 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001108935 // RefSeq // Rattus norvegicus collagen, type IV, alpha 3 (Goodpasture antigen) binding protein (Col4a3bp), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000021549 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:46477805:46582436:1 gene:ENSRNOG00000015686 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000049596 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46506099:46576659:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 63 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT028814 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT028815 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1
XM_006224025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64386-like (LOC100359720), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231829 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG64386-like (LOC100359720), partial mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032960 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:46744138:46855919:1 gene:ENSRNOG00000025321 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000049601 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46687012:46783507:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 14 // 14 // 0
XM_006223984 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4, core 2 (Gcnt4), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006223986 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4, core 2 (Gcnt4), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000052189 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:46827158:46828084:1 gene:ENSRNOG00000016500 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// XM_226703 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus glucosaminyl (N-acetyl) transferase 4, core 2 (Gcnt4), partial mRNA. // chr2 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000049586 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46799554:46868758:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
ENSRNOT00000032195 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:46937082:46937589:1 gene:ENSRNOG00000025308 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 63 // 100 // 12 // 19 // 0
XM_006223988 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member A (Fam169a), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231831 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member A (Fam169a), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231832 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 169, member A (Fam169a), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000022120 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:47016424:47049414:1 gene:ENSRNOG00000016505 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000028693 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:46937141:47049414:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028818 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NM_001100665 // RefSeq // Rattus norvegicus G elongation factor, mitochondrial 2 (Gfm2), mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// XM_006231830 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus G elongation factor, mitochondrial 2 (Gfm2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000052072 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:47063820:47094441:1 gene:ENSRNOG00000025285 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000028695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:47063820:47093088:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT028822 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT028823 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1
NM_001003401 // RefSeq // Rattus norvegicus ectodermal-neural cortex 1 (Enc1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000022144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:47160036:47171848:1 gene:ENSRNOG00000016541 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AY669396 // GenBank // Rattus norvegicus nuclear restricted protein in brain (ENC-1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// DQ282125 // GenBank // Rattus norvegicus ectodermal-neural cortex 1 (Enc1) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 54 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000028694 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:47163835:47165604:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 35 // 9 // 9 // 0 /// NONRATT028827 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_207595 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat, family A (RFXANK-like), 2 (Ankra2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006231837 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat family A protein 2-like (LOC100910438), mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000022525 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:X:82382242:82392794:-1 gene:ENSRNOG00000016622 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AY566568 // GenBank // Rattus norvegicus SLO-interacting ankyrin-containing protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// BC081975 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat, family A (RFXANK-like), 2, mRNA (cDNA clone MGC:94130 IMAGE:7126874), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000073183 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:47478035:47482645:1 gene:ENSRNOG00000048118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 19 // 19 // 0 /// ENSRNOT00000075673 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:47478035:47483065:1 gene:ENSRNOG00000048118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 48 // 15 // 16 // 0 /// GENSCAN00000040845 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:82382439:82390052:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT059862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT059863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 67 // 67 // 22 // 33 // 1 /// NONRATT059864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 55 // 55 // 18 // 33 // 1 /// GENSCAN00000042368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:47472164:47514681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
ENSRNOT00000061286 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:47513891:47515751:1 gene:ENSRNOG00000039903 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000042368 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:47472164:47514681:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 14 // 28 // 1
NM_134337 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box D1 (Foxd1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066819 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:47561301:47562668:1 gene:ENSRNOG00000043332 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// L13192 // GenBank // Rattus norvegicus brain factor-2 (HFH-BF-2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 54 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000042374 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:47561301:47562668:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006223991 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 366 (Zfp366), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000023180 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:48640720:48659336:1 gene:ENSRNOG00000017249 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047927 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:48640720:48659336:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001199192 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S27 (Mrps27), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000023286 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:48760336:48828144:1 gene:ENSRNOG00000017272 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 94 // 30 // 31 // 0 /// NM_001108543 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S27 (Mrps27), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// GENSCAN00000047926 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:48787169:48828079:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028832 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT028833 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 12 // 33 // 1 /// NONRATT028836 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 9 // 33 // 1 /// NONRATT028834 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
XM_001070716 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small EDRK-rich factor 1 (Serf1), partial mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// XM_577983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus small EDRK-rich factor 1 (Serf1), partial mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000024291 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:49506158:49511082:1 gene:ENSRNOG00000017945 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028839 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_022509 // RefSeq // Rattus norvegicus survival of motor neuron 1, telomeric (Smn1), mRNA. // chr2 // 81 // 90 // 22 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000024456 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49519267:49530311:1 gene:ENSRNOG00000018067 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AF044910 // GenBank // Rattus norvegicus survival motor neuron (smn) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// AY876898 // GenBank // Rattus norvegicus SMN splice variant mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 50 // 15 // 15 // 0 /// BC062404 // GenBank // Rattus norvegicus survival motor neuron 1, mRNA (cDNA clone MGC:72446 IMAGE:5621519), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U75369 // GenBank // Rattus norvegicus survival of motor neuron (RSMN) mRNA, complete cds. // chr2 // 81 // 90 // 22 // 27 // 0 /// GENSCAN00000022145 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49517508:49530279:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028841 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001037310 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF9 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf9), transcript variant 3, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 22 // 22 // 0 /// NM_184048 // RefSeq // Rattus norvegicus TAF9 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor (Taf9), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 20 // 20 // 0 /// AY325235 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Cb1-739 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// AY359819 // GenBank // Rattus norvegicus liver regeneration related protein mRNA, complete cds. // chr2 // 83 // 41 // 10 // 12 // 0 /// BC091109 // GenBank // Rattus norvegicus TAF9 RNA polymerase II, TATA box binding protein (TBP)-associated factor, mRNA (cDNA clone MGC:108535 IMAGE:7322630), complete cds. // chr2 // 100 // 59 // 17 // 17 // 0 /// GENSCAN00000022113 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49827055:49827834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 12 // 12 // 0 /// NONRATT028842 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028843 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028844 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 76 // 76 // 22 // 29 // 1 /// NONRATT028845 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 15 // 29 // 1
NM_001134761 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 125 (Ccdc125), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006231851 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 125 (Ccdc125), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// XM_006231852 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 125 (Ccdc125), transcript variant X4, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000031385 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:49845481:49863262:1 gene:ENSRNOG00000027410 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// BC166734 // GenBank // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 125, mRNA (cDNA clone MGC:188458 IMAGE:7936477), complete cds. // chrU // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000022135 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49858001:49862720:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 30 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT028848 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000022148 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:49830917:49856658:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 64 // 64 // 21 // 33 // 1 /// NONRATT028849 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 61 // 61 // 20 // 33 // 1
ENSRNOT00000048881 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:49920739:49921135:1 gene:ENSRNOG00000028763 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 92 // 67 // 11 // 12 // 0
NM_001106405 // RefSeq // Rattus norvegicus CD180 molecule (Cd180), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:51958964:51971767:1 gene:ENSRNOG00000010266 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000014798 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:51959085:51975687:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT028857 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
XM_006224028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein LAP2-like (RGD1562952), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006231900 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protein LAP2-like (RGD1562952), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000070796 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:53011409:53080898:-1 gene:ENSRNOG00000047137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000071565 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:53011409:53080898:-1 gene:ENSRNOG00000047137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000074229 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:53011409:53080898:-1 gene:ENSRNOG00000047137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000075196 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:53011409:53080898:-1 gene:ENSRNOG00000047137 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000045873 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53011409:53080898:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT030872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0
NM_020092 // RefSeq // Rattus norvegicus splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1 (Srek1), mRNA. // chr2 // 90 // 83 // 27 // 30 // 0 /// XM_006231892 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1 (Srek1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000040533 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:52939245:52957927:-1 gene:ENSRNOG00000032735 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// AF234765 // GenBank // Rattus norvegicus serine-arginine-rich splicing regulatory protein SRRP86 mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 83 // 27 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045852 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:52939245:52970431:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT030864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT030862 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT030863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT030867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
NM_181629 // RefSeq // Rattus norvegicus small glutamine-rich tetratricopeptide repeat (TPR)-containing, beta (Sgtb), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000016129 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:53314248:53350721:1 gene:ENSRNOG00000011937 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// AF368280 // GenBank // Rattus norvegicus small glutamine rich protein with tetratricopeptide repeats 2 (Sgt2) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// FQ212077 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA70YE17 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028863 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000045868 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53324942:53347640:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 18 // 32 // 1 /// NONRATT028864 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
NM_001100637 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 23 (Trim23), mRNA. // chr2 // 86 // 100 // 31 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016596 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:53383587:53416925:1 gene:ENSRNOG00000012354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016649 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:53383587:53416925:1 gene:ENSRNOG00000012354 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000045862 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53381054:53415446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT028865 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 15 // 36 // 1 /// NONRATT028866 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT028868 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT028867 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
NM_001106407 // RefSeq // Rattus norvegicus centromere protein K (Cenpk), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231888 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein K (Cenpk), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231889 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus centromere protein K (Cenpk), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000060962 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:53441765:53464775:1 gene:ENSRNOG00000039740 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000008860 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53444196:53462347:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 39 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT028869 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028870 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028871 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 61 // 61 // 17 // 28 // 1
XM_006224029 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 6 (Adamts6), mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006231896 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 6 (Adamts6), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// XM_006231897 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 6 (Adamts6), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000016997 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:53503157:53713513:1 gene:ENSRNOG00000012655 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 19 // 19 // 0 /// XM_006231895 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 6 (Adamts6), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 90 // 90 // 27 // 30 // 1 /// NONRATT028872 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000008842 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:53563688:53730468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_001008373 // RefSeq // Rattus norvegicus SREK1-interacting protein 1 (Srek1ip1), mRNA. // chr7 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// AY236996 // GenBank // Rattus norvegicus splicing regulatory protein p18SRP mRNA, complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// BC086553 // GenBank // Rattus norvegicus SFRS12-interacting protein 1, mRNA (cDNA clone MGC:105985 IMAGE:7303262), complete cds. // chr7 // 88 // 100 // 7 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000029462 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:54058585:54066232:1 gene:ENSRNOG00000024853 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr7 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
XR_344150 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG11883-PB, isoform B (LOC502504), misc_RNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// XR_351363 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to CG11883-PB, isoform B (LOC502504), misc_RNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000042526 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:54760129:54835686:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
NM_012585 // RefSeq // Rattus norvegicus 5-hydroxytryptamine (serotonin) receptor 1A, G protein-coupled (Htr1a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:55362662:55363930:1 gene:ENSRNOG00000010254 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000015686 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:55360120:55363930:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028875 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006231907 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L17-like (LOC499522), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000054724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:55604229:55604683:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 8 // 8 // 0
NM_001106408 // RefSeq // Rattus norvegicus DIM1 dimethyladenosine transferase 1 homolog (S. cerevisiae) (Dimt1), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000018527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:57227129:57239002:1 gene:ENSRNOG00000013596 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC158729 // GenBank // Rattus norvegicus DIM1 dimethyladenosine transferase 1-like (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:187883 IMAGE:9091721), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000023449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:57226951:57238864:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028878 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT028880 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 58 // 58 // 21 // 36 // 1 /// NONRATT028879 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 9 // 36 // 1 /// NONRATT028881 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT028882 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 14 // 36 // 1
GENSCAN00000027573 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:58366422:58366754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0
NM_001277209 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 15 (Smim15), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000047282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:58399574:58404108:1 gene:ENSRNOG00000031995 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NM_001277210 // RefSeq // Rattus norvegicus small integral membrane protein 15 (Smim15), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 88 // 88 // 22 // 25 // 1
NM_001107650 // RefSeq // Rattus norvegicus excision repair cross-complementation group 8 (Ercc8), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// NR_073139 // RefSeq // Rattus norvegicus excision repair cross-complementation group 8 (Ercc8), transcript variant 2, non-coding RNA. // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// NR_073140 // RefSeq // Rattus norvegicus excision repair cross-complementation group 8 (Ercc8), transcript variant 3, non-coding RNA. // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000013598 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:58518981:58556315:1 gene:ENSRNOG00000009968 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// BC161924 // GenBank // Rattus norvegicus excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 8, mRNA (cDNA clone MGC:187671 IMAGE:8370925), complete cds. // chr2 // 100 // 81 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000041587 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:58529102:58535665:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT028890 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028891 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000041589 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:58537962:58568538:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1 /// NONRATT028892 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 8 // 26 // 1
XM_001073916 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (RGD1560076), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// XM_226796 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 60S ribosomal protein L29-like (RGD1560076), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000050574 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:58592019:58592489:1 gene:ENSRNOG00000032097 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 100 // 64 // 7 // 7 // 0 /// GENSCAN00000041582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:58587123:58592489:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
NM_001191844 // RefSeq // Rattus norvegicus ELOVL fatty acid elongase 7 (Elovl7), mRNA. // chrU // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000014074 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:59446064:59459522:-1 gene:ENSRNOG00000010450 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// NONRATT030918 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// NONRATT028898 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 25 // 25 // 8 // 32 // 1
NM_001107651 // RefSeq // Rattus norvegicus DEP domain containing 1B (Depdc1b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014270 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:59075286:59147310:1 gene:ENSRNOG00000010701 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000036329 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:59041542:59146487:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028900 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_031821 // RefSeq // Rattus norvegicus polo-like kinase 2 (Plk2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000016768 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:60970300:60976058:1 gene:ENSRNOG00000011951 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AF136583 // GenBank // Rattus norvegicus protein kinase SNK (Snk) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC070878 // GenBank // Rattus norvegicus polo-like kinase 2 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:91616 IMAGE:7096750), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000004966 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:60970420:61012564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028909 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_001074373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphoglycerate kinase 1-like (RGD1560402), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// XM_574850 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphoglycerate kinase 1-like (RGD1560402), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000036860 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:61775511:61776728:1 gene:ENSRNOG00000026928 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000001205 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:61775511:61789231:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 7 // 7 // 0
NM_001106409 // RefSeq // Rattus norvegicus actin, beta-like 2 (Actbl2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000065528 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:61878230:61880977:1 gene:ENSRNOG00000043292 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000001199 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:61878351:61879481:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028911 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001168000 // RefSeq // Rattus norvegicus mesoderm induction early response 1, family member 3 (Mier3), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000017571 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:62316534:62339547:1 gene:ENSRNOG00000013121 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// JQ013732 // GenBank // Rattus norvegicus mesoderm induction early response protein 3 (Mier3) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000050588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:62244654:62349435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 88 // 88 // 30 // 34 // 1 /// NONRATT028912 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 34 // 1
GENSCAN00000050588 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:62244654:62349435:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 13 // 24 // 1
XM_006231943 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 55 (Ankrd55), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 44 // 14 // 14 // 0 /// NM_001270039 // RefSeq // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 55 (Ankrd55), mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XM_006231940 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 55 (Ankrd55), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000018438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63169817:63238388:1 gene:ENSRNOG00000013555 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// JQ013731 // GenBank // Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 55 (Ankrd55) mRNA, complete cds. // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XM_006231945 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ankyrin repeat domain 55 (Ankrd55), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 31 // 31 // 10 // 32 // 1 /// GENSCAN00000054379 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63139422:63238075:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028920 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 14 // 32 // 1
NM_001008725 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 6 signal transducer (Il6st), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018877 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63332284:63361404:1 gene:ENSRNOG00000013963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 32 // 32 // 0 /// AY310138 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1055 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// JQ013730 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-6 receptor subunit beta precursor (Il6st) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 84 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000054383 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63329904:63356723:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028928 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT028930 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 15 // 38 // 1 /// NONRATT028927 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001035251 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 9 (Slc38a9), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231930 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 9 (Slc38a9), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231933 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 9 (Slc38a9), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000013218 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63565645:63631032:1 gene:ENSRNOG00000009851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC092662 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 9, mRNA (cDNA clone IMAGE:7365694), partial cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC105869 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 38, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:125012 IMAGE:7442690), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// JQ013729 // GenBank // Rattus norvegicus putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 9 (Slc38a9) mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 97 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT028932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000048494 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63601895:63625311:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1 /// NONRATT028933 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 27 // 27 // 8 // 30 // 1
NONRATT028932 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 1
NM_022538 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2A (Ppap2a), mRNA. // chr2 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// XM_006231948 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2A (Ppap2a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000066098 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63751336:63766877:1 gene:ENSRNOG00000009980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// AF503609 // GenBank // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphohydrolase 1a mRNA, complete cds. // chr2 // 83 // 72 // 19 // 23 // 0 /// AF503610 // GenBank // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphohydrolase 1b-like mRNA, complete cds. // chr2 // 80 // 63 // 16 // 20 // 0 /// BC061815 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidic acid phosphatase type 2A, mRNA (cDNA clone MGC:72442 IMAGE:5598693), complete cds. // chr2 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// FQ229687 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA47YB08 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// JQ013728 // GenBank // Rattus norvegicus lipid phosphate phosphohydrolase 1 (Ppap2a) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 91 // 27 // 29 // 0 /// U90556 // GenBank // Rattus norvegicus phosphatidate phosphohydrolase type 2 mRNA, complete cds. // chr2 // 83 // 75 // 20 // 24 // 0 /// NONRATT028935 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 81 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028936 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT028937 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 66 // 66 // 21 // 32 // 1
XM_002729007 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 29 (LOC100362324), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013854 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63827375:63877478:1 gene:ENSRNOG00000010369 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63834084:63880323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT028942 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 10 // 28 // 1
NM_001109175 // RefSeq // Rattus norvegicus cyclin O (Ccno), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006231947 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cyclin O (Ccno), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000013871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63896130:63899197:1 gene:ENSRNOG00000010454 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000048485 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63896225:63898498:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028944 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028945 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001068366 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multiciliate differentiation and DNA synthesis associated cell cycle protein (Mcidas), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_002725890 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus multiciliate differentiation and DNA synthesis associated cell cycle protein (Mcidas), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000063859 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:63902206:63908136:1 gene:ENSRNOG00000039588 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000044544 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63905212:63908136:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000048500 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:63901943:63903043:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1
NR_037322 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 449c (Mir449c), microRNA. // chr2 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000054547 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:63933619:63933717:1 gene:ENSRNOG00000036435 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0 /// rno-mir-449c // miRBase Micro RNA Database // MI0015402 Rattus norvegicus miR-449c stem-loop // chr2 // 92 // 96 // 22 // 24 // 0
ENSRNOT00000054546 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:2:63935043:63935136:1 gene:ENSRNOG00000036434 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NR_031950 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 449a (Mir449a), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000053745 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:63935154:63935244:1 gene:ENSRNOG00000035622 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028946 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-449a // miRBase Micro RNA Database // MI0001650 Rattus norvegicus miR-449a stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cell division cycle protein 20 homolog B-like (LOC688823), mRNA. // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_022604 // RefSeq // Rattus norvegicus endothelial cell-specific molecule 1 (Esm1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014559 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64137199:64145936:1 gene:ENSRNOG00000010797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC070888 // GenBank // Rattus norvegicus endothelial cell-specific molecule 1, mRNA (cDNA clone MGC:91682 IMAGE:7098029), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// U80818 // GenBank // Rattus norvegicus pineal specific PG25 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 92 // 22 // 23 // 0 /// GENSCAN00000044539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64137336:64144544:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 52 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT028947 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134510 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to BC067074 protein (RGD1561161), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000060673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64214525:64273495:1 gene:ENSRNOG00000039582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000044555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64200609:64360892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 84 // 20 // 21 // 0
XM_002729011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1-like (LOC100359700), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1-like (LOC100359700), mRNA. // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64652108:64652440:1 gene:ENSRNOG00000047990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64652093:64652440:1 transcript_biotype:protein_coding // chrUn // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001134510 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to BC067074 protein (RGD1561161), mRNA. // chr2 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// ENSRNOT00000060673 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64214525:64273495:1 gene:ENSRNOG00000039582 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 19 // 27 // 1 /// GENSCAN00000044555 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64200609:64360892:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT028949 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_002729011 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1-like (LOC100359700), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_003753518 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 1-like (LOC100359700), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000070960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:64652108:64652440:1 gene:ENSRNOG00000047990 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000055103 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64652093:64652440:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_053850 // RefSeq // Rattus norvegicus biliverdin reductase A (Blvra), mRNA. // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000015843 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:3:126078456:126103260:1 gene:ENSRNOG00000011778 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// BC078766 // GenBank // Rattus norvegicus biliverdin reductase A, mRNA (cDNA clone MGC:93279 IMAGE:7126157), complete cds. // chr2 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// FQ231949 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA67YJ06 mRNA sequence. // chr2 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1 /// M81681 // GenBank // Rattus norvegicus biliverdin reductase mRNA, complete cds. // chr2 // 86 // 86 // 24 // 28 // 1 /// ENSRNOT00000016007 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:64801114:64801876:1 gene:ENSRNOG00000023242 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 89 // 96 // 24 // 27 // 0 /// GENSCAN00000055121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:64798697:64801635:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT035675 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 86 // 100 // 24 // 28 // 0 /// GENSCAN00000052224 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126087244:126103176:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 89 // 25 // 28 // 1
XM_006224015 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 15 (Arl15), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006231951 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ADP-ribosylation factor-like 15 (Arl15), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014761 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:64832935:65081235:1 gene:ENSRNOG00000011105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000071353 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:64824710:65081235:1 gene:ENSRNOG00000011105 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 79 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT028951 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001007633 // RefSeq // Rattus norvegicus molybdenum cofactor synthesis 2 (Mocs2), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// NM_001162413 // RefSeq // Rattus norvegicus molybdenum cofactor synthesis 2 (Mocs2), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015781 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:71520174:71532081:1 gene:ENSRNOG00000011797 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC079181 // GenBank // Rattus norvegicus molybdenum cofactor synthesis 2, mRNA (cDNA clone MGC:94220 IMAGE:7130858), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028979 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT028981 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 81 // 81 // 22 // 27 // 1 /// GENSCAN00000026506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71433123:71531362:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 15 // 27 // 1 /// NONRATT028980 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1 /// NONRATT028982 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 13 // 27 // 1
NM_001047941 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC499530 (LOC499530), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000049679 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:67341819:67350276:1 gene:ENSRNOG00000031115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT028953 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_006224031 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MLV-related proviral Env polyprotein-like (LOC102557105), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006229926 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MLV-related proviral Env polyprotein-like (LOC102555557), mRNA. // chr2 // 58 // 100 // 22 // 38 // 0
NM_053719 // RefSeq // Rattus norvegicus embigin (Emb), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015306 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:68054520:68107903:1 gene:ENSRNOG00000011365 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC061846 // GenBank // Rattus norvegicus embigin, mRNA (cDNA clone MGC:72351 IMAGE:5621074), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ213962 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA44YJ11 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT028954 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000013157 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:67959557:68165424:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 76 // 76 // 19 // 25 // 1
NM_053375 // RefSeq // Rattus norvegicus hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated potassium channel 1 (Hcn1), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016142 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:68473431:68874494:1 gene:ENSRNOG00000011522 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// AF247450 // GenBank // Rattus norvegicus hyperpolarization-activated, cyclic nucleotide-gated potassium channel 1 (HCN1) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000039881 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:68613654:68874494:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT028955 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_012951 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 10 (Fgf10), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000016485 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70046331:70120384:1 gene:ENSRNOG00000012278 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// D79215 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for FGF-10, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT028958 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001108937 // RefSeq // Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 1 (Paip1), mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231974 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 1 (Paip1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000066425 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70663730:70691621:1 gene:ENSRNOG00000017623 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// BC166996 // GenBank // Rattus norvegicus poly(A) binding protein interacting protein 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:7457176), partial cds. // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000024330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70663494:70729089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028960 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT028961 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT028962 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_006231966 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to 4833420G17Rik protein (RGD1306227), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000046174 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70696812:70718962:1 gene:ENSRNOG00000017581 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC078991 // GenBank // Rattus norvegicus similar to 4833420G17Rik protein, mRNA (cDNA clone MGC:93889 IMAGE:7112582), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT028963 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70663494:70729089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
XM_001076509 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein C5orf28 homolog (RGD1562550), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006224017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein C5orf28 homolog (RGD1562550), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006224019 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein C5orf28 homolog (RGD1562550), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006224020 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein C5orf28 homolog (RGD1562550), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006231978 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein C5orf28 homolog (RGD1562550), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006231980 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein C5orf28 homolog (RGD1562550), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_006231981 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein C5orf28 homolog (RGD1562550), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// XM_574856 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane protein C5orf28 homolog (RGD1562550), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000037659 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:70726147:70729089:1 gene:ENSRNOG00000027263 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000024330 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70663494:70729089:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 25 // 26 // 0
NM_053700 // RefSeq // Rattus norvegicus chemokine (C-C motif) ligand 28 (Ccl28), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023618 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70743251:70767578:1 gene:ENSRNOG00000017547 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// AF361490 // GenBank // Rattus norvegicus CC chemokine CCL28 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT028964 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_017268 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 (soluble) (Hmgcs1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XM_006231959 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 1 (soluble) (Hmgcs1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000023554 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:70800442:70809191:1 gene:ENSRNOG00000016552 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024336 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:70800465:70811229:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028966 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT028965 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
XM_006231983 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus annexin-2 receptor-like (LOC102547192), mRNA. // chr2 // 42 // 95 // 15 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000060511 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:71024179:71026204:-1 gene:ENSRNOG00000039481 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 71 // 92 // 25 // 35 // 0 /// GENSCAN00000039335 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:71014613:71027398:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 55 // 21 // 38 // 1
NM_001083911 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein P, plasma, 1 (Sepp1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// NM_019192 // RefSeq // Rattus norvegicus selenoprotein P, plasma, 1 (Sepp1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// BC059137 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein P, plasma, 1, mRNA (cDNA clone IMAGE:6890056). // chr2 // 100 // 68 // 21 // 21 // 0 /// BC072539 // GenBank // Rattus norvegicus selenoprotein P, plasma, 1, mRNA (cDNA clone MGC:91714 IMAGE:7104195), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 26 // 26 // 0 /// D25221 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for selenoprotein P, complete cds. // chr2 // 92 // 84 // 24 // 26 // 0 /// M63574 // GenBank // Rat selenoprotein P mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000057332 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:72142687:72147921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 26 // 8 // 8 // 0
GENSCAN00000044245 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:72744019:72748768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 50 // 4 // 4 // 0 /// ENSRNOT00000035080 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:72747867:72748824:1 gene:ENSRNOG00000025450 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 50 // 100 // 4 // 8 // 0
ENSRNOT00000020291 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:73184326:73185715:1 gene:ENSRNOG00000015106 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000005577 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73184104:73185715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT028994 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 50 // 10 // 10 // 0
NM_001107671 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphatidylinositol-specific phospholipase C, X domain containing 3 (Plcxd3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019524 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:73220198:73389440:1 gene:ENSRNOG00000014550 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000005571 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73325896:73388745:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 32 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT028995 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_176074 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 6 (C6), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000033112 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:73494912:73547355:1 gene:ENSRNOG00000024115 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// AY230250 // GenBank // Rattus norvegicus complement factor 6 mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 33 // 34 // 0 /// GENSCAN00000050424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73494912:73558135:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 71 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT028998 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0
XM_003753534 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 2B (Mroh2b), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 55 // 55 // 0 /// XM_006231998 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus maestro heat-like repeat family member 2B (Mroh2b), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 64 // 46 // 46 // 0 /// ENSRNOT00000060376 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:73689262:73713626:1 gene:ENSRNOG00000042327 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 26 // 26 // 0 /// NM_001127580 // RefSeq // Rattus norvegicus 3-oxoacid CoA transferase 1 (Oxct1), mRNA. // chr2 // 19 // 19 // 14 // 72 // 1 /// ENSRNOT00000065313 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:72891713:73037614:1 gene:ENSRNOG00000043094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 19 // 19 // 14 // 72 // 1 /// BC166478 // GenBank // Rattus norvegicus 3-oxoacid CoA transferase 1, mRNA (cDNA clone MGC:187935 IMAGE:9102243), complete cds. // chr2 // 19 // 19 // 14 // 72 // 1 /// GENSCAN00000050433 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73593883:73702244:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT029000 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 43 // 43 // 31 // 72 // 1 /// GENSCAN00000005567 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:72891811:73036565:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 17 // 17 // 12 // 72 // 1 /// NONRATT028992 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 19 // 19 // 14 // 72 // 1
NM_019142 // RefSeq // Rattus norvegicus protein kinase, AMP-activated, alpha 1 catalytic subunit (Prkaa1), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017626 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:73882080:73914818:1 gene:ENSRNOG00000012799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// U40819 // GenBank // Rattus norvegicus 5-AMP-activated protein kinase alpha-1 catalytic subunit mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000045462 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:73897905:73948811:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029005 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001106414 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 33 (Ttc33), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017665 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:73921832:73962356:1 gene:ENSRNOG00000013217 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ215757 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA46YM09 mRNA sequence. // chr2 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT029010 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NONRATT028698 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0
NM_024159 // RefSeq // Rattus norvegicus disabled 2, mitogen-responsive phosphoprotein (Dab2), mRNA. // chr2 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000043580 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:75489435:75510919:1 gene:ENSRNOG00000028930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000050655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:75489435:75510919:1 gene:ENSRNOG00000028930 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC097314 // GenBank // Rattus norvegicus disabled homolog 2, mitogen-responsive phosphoprotein (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:114312 IMAGE:7444786), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// FQ224185 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA74YG21 mRNA sequence. // chr2 // 82 // 82 // 23 // 28 // 0 /// U95177 // GenBank // Rattus norvegicus DOC-2 p82 isoform mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 91 // 30 // 31 // 0 /// U95178 // GenBank // Rattus norvegicus DOC-2 p59 isoform mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 82 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000024695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:75422454:75565321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1 /// NONRATT029022 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 10 // 34 // 1
NM_057146 // RefSeq // Rattus norvegicus complement component 9 (C9), mRNA. // chr2 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000018545 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:75517644:75683522:1 gene:ENSRNOG00000013736 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC091127 // GenBank // Rattus norvegicus complement component 9, mRNA (cDNA clone MGC:108614 IMAGE:7324872), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// U52948 // GenBank // Rattus norvegicus complement component C9 precursor mRNA, complete cds. // chr2 // 82 // 100 // 27 // 33 // 0 /// GENSCAN00000024695 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:75422454:75565321:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029024 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT029025 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 8 // 33 // 1
NM_001109176 // RefSeq // Rattus norvegicus FYN binding protein (Fyb), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232017 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus FYN binding protein (Fyb), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000018634 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:75633301:75722725:1 gene:ENSRNOG00000013886 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029027 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000024699 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:75651088:75691017:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 30 // 30 // 8 // 27 // 1 /// GENSCAN00000024700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:75694501:75844055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT029028 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT029029 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 10 // 27 // 1
XM_001055633 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RPTOR independent companion of MTOR, complex 2 (Rictor), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// XM_226812 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RPTOR independent companion of MTOR, complex 2 (Rictor), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000029565 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:75754852:75842492:1 gene:ENSRNOG00000011341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000075595 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:75754852:75831736:1 gene:ENSRNOG00000011341 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000024700 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:75694501:75844055:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 31 // 31 // 0
NM_031048 // RefSeq // Rattus norvegicus leukemia inhibitory factor receptor alpha (Lifr), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// XM_006232028 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leukemia inhibitory factor receptor alpha (Lifr), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000016036 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:76191377:76227874:1 gene:ENSRNOG00000011696 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// D86345 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for leukemia inhibitor factor receptor alpha-chain, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 37 // 38 // 0 /// GENSCAN00000009246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76191464:76227840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT029036 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT029035 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
GENSCAN00000005448 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76726500:76727834:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 9 // 9 // 0
NM_019139 // RefSeq // Rattus norvegicus glial cell derived neurotrophic factor (Gdnf), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000041288 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:76897561:76919745:1 gene:ENSRNOG00000012819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// EU068467 // GenBank // Rattus norvegicus clone 2d glial cell line derived neurotrophic factor mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// EU068468 // GenBank // Rattus norvegicus clone 2c glial cell line derived neurotrophic factor mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// EU068469 // GenBank // Rattus norvegicus clone 2b glial cell line derived neurotrophic factor mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// EU068470 // GenBank // Rattus norvegicus clone 9aE#1 glial cell line derived neurotrophic factor mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 91 // 88 // 21 // 23 // 0 /// EU068471 // GenBank // Rattus norvegicus clone 1b glial cell line derived neurotrophic factor mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// EU068472 // GenBank // Rattus norvegicus clone 1a glial cell line derived neurotrophic factor mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 96 // 88 // 22 // 23 // 0 /// L15305 // GenBank // Rattus norvegicus neurotrophic factor mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028880 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76884155:76941223:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029040 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 23 // 23 // 0
NM_053952 // RefSeq // Rattus norvegicus nucleoporin 155 (Nup155), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// ENSRNOT00000046069 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:77213963:77265544:1 gene:ENSRNOG00000013411 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// GENSCAN00000028890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77214035:77301978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 73 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029042 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 37 // 37 // 0 /// NONRATT029044 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 12 // 37 // 1
XM_006224034 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ13231 (RGD1310081), mRNA. // chr2 // 100 // 98 // 51 // 51 // 0 /// XM_006232032 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ13231 (RGD1310081), mRNA. // chr2 // 98 // 77 // 39 // 40 // 0 /// XM_006232040 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ13231 (RGD1310081), mRNA. // chr2 // 93 // 29 // 14 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000063899 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:77284221:77358709:1 gene:ENSRNOG00000042118 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 77 // 38 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000065364 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:78935591:78957358:1 gene:ENSRNOG00000014911 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 19 // 10 // 10 // 0 /// BC083908 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ13231, mRNA (cDNA clone IMAGE:7134040), partial cds. // chr2 // 100 // 19 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028886 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77308638:77355196:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 42 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000044192 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:78932329:78957094:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 19 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028890 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77214035:77301978:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 21 // 21 // 11 // 52 // 1 /// NONRATT029065 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 23 // 23 // 12 // 52 // 1
XM_006224035 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3-like (Ranbp3l), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006224036 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3-like (Ranbp3l), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232038 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3-like (Ranbp3l), transcript variant X3, mRNA. // chrU // 100 // 36 // 10 // 10 // 0 /// XM_006232030 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAN binding protein 3-like (Ranbp3l), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 50 // 50 // 14 // 28 // 1 /// GENSCAN00000005458 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:76761933:76819619:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 29 // 29 // 8 // 28 // 1 /// NONRATT029055 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 36 // 36 // 10 // 28 // 1 /// NONRATT029056 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 32 // 32 // 9 // 28 // 1 /// NONRATT029057 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 29 // 29 // 8 // 28 // 1
NM_001044252 // RefSeq // Rattus norvegicus NAD kinase 2, mitochondrial (Nadk2), mRNA. // chr2 // 93 // 93 // 26 // 28 // 0 /// XM_006232014 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NAD kinase 2, mitochondrial (Nadk2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232016 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus NAD kinase 2, mitochondrial (Nadk2), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022455 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:77550016:77592156:1 gene:ENSRNOG00000016691 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC105901 // GenBank // Rattus norvegicus similar to hypothetical protein FLJ30596, mRNA (cDNA clone MGC:125061 IMAGE:7375971), complete cds. // chr2 // 100 // 60 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029059 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000023405 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77550616:77590300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 73 // 73 // 22 // 30 // 1 /// NONRATT029060 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001109177 // RefSeq // Rattus norvegicus LMBR1 domain containing 2 (Lmbrd2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// XM_006232025 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus LMBR1 domain containing 2 (Lmbrd2), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000060018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:77621904:77678202:1 gene:ENSRNOG00000017337 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// NONRATT029061 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000023411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77629311:77849768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 22 // 41 // 1
XM_001057451 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP glycosyltransferase 3 family, polypeptide A2 (Ugt3a2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// XM_226821 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus UDP glycosyltransferase 3 family, polypeptide A2 (Ugt3a2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033513 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:77761448:77775038:1 gene:ENSRNOG00000025010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000074076 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:77761448:77765622:1 gene:ENSRNOG00000025010 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 82 // 42 // 9 // 11 // 0 /// GENSCAN00000023411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77629311:77849768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0
NM_001106417 // RefSeq // Rattus norvegicus calcyphosine-like (Capsl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000023378 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:77819899:77842887:1 gene:ENSRNOG00000017355 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029063 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000023411 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:77629311:77849768:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1
NONRATT031100 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_031835 // RefSeq // Rattus norvegicus alanine-glyoxylate aminotransferase 2 (Agxt2), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232069 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus alanine-glyoxylate aminotransferase 2 (Agxt2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000024035 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:84308027:84348773:-1 gene:ENSRNOG00000017821 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// AB002584 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for beta-alanine-pyruvate aminotransferase, complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 30 // 30 // 0 /// BC081765 // GenBank // Rattus norvegicus alanine-glyoxylate aminotransferase 2, mRNA (cDNA clone MGC:93330 IMAGE:7106995), complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// D38100 // GenBank // Rattus norvegicus AGT2 mRNA for alanine-glyoxylate aminotransferase 2 precursor, complete cds. // chr2 // 83 // 88 // 24 // 29 // 0 /// NONRATT031098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000044421 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:84253290:84345237:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1
NM_001106419 // RefSeq // Rattus norvegicus RAD1 homolog (S. pombe) (Rad1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232058 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RAD1 homolog (S. pombe) (Rad1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000024557 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:84204602:84212641:-1 gene:ENSRNOG00000018063 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000044395 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:84202573:84212112:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031097 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031096 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 66 // 66 // 19 // 29 // 1
NM_001134436 // RefSeq // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 3 (C1qtnf3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232067 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 3 (C1qtnf3), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000025170 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:83741942:83764184:-1 gene:ENSRNOG00000018570 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC162048 // GenBank // Rattus norvegicus C1q and tumor necrosis factor related protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:188012 IMAGE:7108655), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:83742836:83764118:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT031092 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031093 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 68 // 68 // 17 // 25 // 1
NM_012816 // RefSeq // Rattus norvegicus alpha-methylacyl-CoA racemase (Amacr), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000025323 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:83723121:83735159:-1 gene:ENSRNOG00000018662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:83723121:83735159:-1 gene:ENSRNOG00000018662 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// AY325250 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Da1-8 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// BC078885 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-methylacyl-CoA racemase, mRNA (cDNA clone MGC:93581 IMAGE:7110324), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC091163 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-methylacyl-CoA racemase, mRNA (cDNA clone MGC:108744 IMAGE:7130642), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// BC127505 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-methylacyl-CoA racemase, mRNA (cDNA clone MGC:156672 IMAGE:7325347), complete cds. // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// FQ218430 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA52YD19 mRNA sequence. // chr2 // 82 // 67 // 18 // 22 // 0 /// U89905 // GenBank // Rattus norvegicus alpha-methylacyl-CoA racemase mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 76 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000041489 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:83723474:83735159:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031089 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT031091 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 79 // 79 // 26 // 33 // 1
NM_001107653 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 45, member 2 (Slc45a2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000025490 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:83685368:83717569:-1 gene:ENSRNOG00000018759 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000041501 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:83685863:83717460:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031088 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106420 // RefSeq // Rattus norvegicus ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif, 12 (Adamts12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// ENSRNOT00000025693 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:83352798:83650251:-1 gene:ENSRNOG00000018865 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 48 // 48 // 0 /// GENSCAN00000041484 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:83399453:83522845:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 60 // 28 // 29 // 0 /// NONRATT031087 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 46 // 46 // 0
ENSRNOT00000029107 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:82997452:82997703:-1 gene:ENSRNOG00000023061 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 80 // 100 // 16 // 20 // 0 /// GENSCAN00000030109 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:82997481:83032813:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 100 // 18 // 20 // 0
NM_001047944 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00154 (LOC499544), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046715 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82672085:82699041:-1 gene:ENSRNOG00000030204 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031085 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001270972 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein (Zfr), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000016196 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82476890:82539304:-1 gene:ENSRNOG00000011627 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// BC161952 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger RNA binding protein, mRNA (cDNA clone MGC:187747 IMAGE:9026284), complete cds. // chr2 // 100 // 21 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003624 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:82478195:82533024:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT031075 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031077 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 10 // 38 // 1 /// NONRATT031081 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 13 // 38 // 1 /// NONRATT031080 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 38 // 1
NM_001012077 // RefSeq // Rattus norvegicus myotubularin related protein 12 (Mtmr12), mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232046 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus myotubularin related protein 12 (Mtmr12), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000036633 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82385608:82452818:-1 gene:ENSRNOG00000022929 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// BC089876 // GenBank // Rattus norvegicus myotubularin related protein 12, mRNA (cDNA clone MGC:109012 IMAGE:7325487), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000003618 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:82385608:82453221:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT031073 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 85 // 85 // 29 // 34 // 1 /// NONRATT031074 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 74 // 74 // 25 // 34 // 1
NM_023977 // RefSeq // Rattus norvegicus golgi phosphoprotein 3 (coat-protein) (Golph3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000017276 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:82299654:82327662:-1 gene:ENSRNOG00000012186 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF311954 // GenBank // Rattus norvegicus trans-Golgi protein GMx33 mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 73 // 18 // 19 // 0 /// BC092568 // GenBank // Rattus norvegicus golgi phosphoprotein 3 (coat-protein), mRNA (cDNA clone MGC:108683 IMAGE:7307277), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000047603 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:82301152:82327553:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 54 // 14 // 14 // 0 /// NONRATT031071 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT031072 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_001107655 // RefSeq // Rattus norvegicus drosha, ribonuclease type III (Drosha), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// ENSRNOT00000018032 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:81692861:81796037:-1 gene:ENSRNOG00000013451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000048026 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:81692861:81796037:-1 gene:ENSRNOG00000013451 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// FQ215440 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA48YD18 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 41 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000051204 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:81659462:81796031:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT031064 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT031067 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 18 // 34 // 1
ENSRNOT00000020434 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:80927482:80928478:-1 gene:ENSRNOG00000015194 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// GENSCAN00000003582 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:80927482:80928478:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0
NM_001168630 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 9, type 2, T1-cadherin (Cdh9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000043050 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:86724081:86810246:1 gene:ENSRNOG00000033837 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000027832 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:86692995:86809697:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029098 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 82 // 82 // 27 // 33 // 1
ENSRNOT00000075499 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:88037596:88038047:1 gene:ENSRNOG00000047083 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000019493 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:88037050:88037727:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
ENSRNOT00000036918 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:88696805:88697423:1 gene:ENSRNOG00000039049 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 92 // 19 // 23 // 0 /// GENSCAN00000052146 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:88636121:88825333:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0
NM_001168631 // RefSeq // Rattus norvegicus cadherin 10 (Cdh10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000013152 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:89140758:89362817:1 gene:ENSRNOG00000009771 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000042118 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:89189334:89362268:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0
GENSCAN00000031962 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:89927918:89928576:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 55 // 11 // 12 // 0
XR_338491 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// XR_357468 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus putative RNA-binding protein Luc7-like 1-like (LOC102556269), transcript variant X3, misc_RNA. // chr2 // 29 // 29 // 18 // 63 // 1 /// FQ217911 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA14YD18 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT029516 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT052176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 63 // 63 // 0 /// NONRATT059021 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 62 // 39 // 39 // 0 /// NONRATT035213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 41 // 41 // 26 // 63 // 1
ENSRNOT00000025809 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:91484997:91485294:1 gene:ENSRNOG00000019037 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000027044 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:91480021:91485260:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
XM_001062023 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 12 (Cdh12), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 32 // 33 // 0 /// XM_229369 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 12 (Cdh12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000034044 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:91863900:92268636:1 gene:ENSRNOG00000026392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000036827 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:92105265:92268636:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 25 // 25 // 0
NONRATT052739 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052741 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052742 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052743 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052744 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052745 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052746 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT052747 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT053125 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 85 // 100 // 23 // 27 // 0
XM_003753539 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 18, type 2 (Cdh18), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006224048 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 18, type 2 (Cdh18), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006224049 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus cadherin 18, type 2 (Cdh18), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000014013 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:94093007:94418627:1 gene:ENSRNOG00000010535 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000052139 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:94359349:94418627:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 42 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000005794 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:93917150:94348432:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 16 // 36 // 1 /// NONRATT029107 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1 /// NONRATT029106 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 22 // 22 // 8 // 36 // 1
ENSRNOT00000013435 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:96136877:96138365:1 gene:ENSRNOG00000010120 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 100 // 11 // 14 // 0 /// GENSCAN00000030246 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:96136877:96137981:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 14 // 14 // 0
NONRATT029109 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001107657 // RefSeq // Rattus norvegicus myosin X (Myo10), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000014022 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:97712779:97789261:1 gene:ENSRNOG00000010161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000065897 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:97589017:97789261:1 gene:ENSRNOG00000010161 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000022262 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:97524230:97840381:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT029110 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 39 // 39 // 0
NM_001034912 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 134, member B (Fam134b), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000063951 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:97821407:97972800:1 gene:ENSRNOG00000010589 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC089887 // GenBank // Rattus norvegicus family with sequence similarity 134, member B, mRNA (cDNA clone MGC:109057 IMAGE:7371502), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// AY310142 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1133 mRNA, complete cds. // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1 /// NONRATT029111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000003042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:97930357:97992514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 41 // 41 // 13 // 32 // 1 /// NONRATT029113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
ENSRNOT00000014052 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:97928462:97928904:1 gene:ENSRNOG00000010579 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 91 // 100 // 10 // 11 // 0 /// GENSCAN00000003072 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:97928462:97928904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 86 // 64 // 6 // 7 // 0 /// NONRATT029111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT029112 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 11 // 11 // 0
AY310142 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1133 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
AY310142 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1133 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029111 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029113 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0
NM_001009652 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 622 (Zfp622), mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// ENSRNOT00000066879 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:97978551:97992639:1 gene:ENSRNOG00000049087 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// AY310142 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ac1133 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 69 // 9 // 9 // 0 /// BC088214 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 622, mRNA (cDNA clone MGC:108936 IMAGE:7383802), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0 /// GENSCAN00000003042 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:97930357:97992514:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT029115 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 85 // 11 // 11 // 0
NM_001101828 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 11 (March11), mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000032027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:98502842:98603754:1 gene:ENSRNOG00000024461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// AB048841 // GenBank // Rattus norvegicus MARCH11 mRNA for membrane-associated ring finger (C3HC4) 11, complete cds. // chr2 // 79 // 96 // 19 // 24 // 0 /// GENSCAN00000047450 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:98503041:98508251:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 23 // 24 // 0 /// NONRATT029119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001101828 // RefSeq // Rattus norvegicus membrane-associated ring finger (C3HC4) 11 (March11), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000032027 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:98502842:98603754:1 gene:ENSRNOG00000024461 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AB048841 // GenBank // Rattus norvegicus MARCH11 mRNA for membrane-associated ring finger (C3HC4) 11, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000047444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:98567282:98720977:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029119 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000004997 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:99240022:99242039:1 gene:ENSRNOG00000032128 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 100 // 22 // 26 // 0 /// GENSCAN00000001884 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:99237331:99271212:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_053714 // RefSeq // Rattus norvegicus ANKH inorganic pyrophosphate transport regulator (Ankh), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000068484 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:99796579:99921970:1 gene:ENSRNOG00000010960 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// AF393241 // GenBank // Rattus norvegicus progressive ankylosis mRNA, complete cds. // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// GENSCAN00000003337 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:99857614:99921291:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 27 // 27 // 0
NONRATT029122 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_022271 // RefSeq // Rattus norvegicus sertolin (LOC64038), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015975 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:99934799:99935848:1 gene:ENSRNOG00000011997 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// AF107727 // GenBank // Rattus norvegicus sertolin mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// NONRATT029126 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000032408 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:100545143:100546637:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT029128 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 16 // 16 // 0
ENSRNOT00000017372 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:100825559:101000916:1 gene:ENSRNOG00000012624 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 47 // 47 // 0 /// ENSRNOT00000074252 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:100638574:100809390:1 gene:ENSRNOG00000048363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 71 // 54 // 55 // 0 /// ENSRNOT00000074689 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:100614638:100809390:1 gene:ENSRNOG00000048363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 59 // 59 // 0 /// GENSCAN00000013166 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:100858086:100981764:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 51 // 39 // 39 // 0 /// GENSCAN00000032431 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:100623118:100845427:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 59 // 59 // 0
NM_001271502 // RefSeq // Rattus norvegicus catenin (cadherin-associated protein), delta 2 (Ctnnd2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 44 // 44 // 0 /// ENSRNOT00000044871 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:103069802:103662662:1 gene:ENSRNOG00000010649 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014246 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:103675923:103767985:1 gene:ENSRNOG00000046408 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 36 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029133 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 45 // 45 // 20 // 44 // 1 /// GENSCAN00000022580 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:103380110:103560288:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 23 // 23 // 10 // 44 // 1 /// GENSCAN00000022591 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:103750217:103786277:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 18 // 18 // 8 // 44 // 1
NM_022526 // RefSeq // Rattus norvegicus death-associated protein (Dap), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000014439 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:103949819:104002894:1 gene:ENSRNOG00000010747 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC060569 // GenBank // Rattus norvegicus death-associated protein, mRNA (cDNA clone MGC:72827 IMAGE:6890457), complete cds. // chr2 // 100 // 63 // 17 // 17 // 0 /// FQ214163 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA43YI06 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 89 // 21 // 24 // 0 /// U05334 // GenBank // Rattus norvegicus rap7a mRNA, complete cds. // chr2 // 81 // 100 // 22 // 27 // 0 /// NONRATT029135 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029138 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 37 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000040324 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:103948717:104001969:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 17 // 27 // 1 /// NONRATT029136 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 12 // 27 // 1 /// NONRATT029137 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001008770 // RefSeq // Rattus norvegicus carboxymethylenebutenolidase homolog (Pseudomonas) (Cmbl), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015448 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:104317807:104339571:1 gene:ENSRNOG00000011260 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AY325197 // GenBank HTC // Rattus norvegicus Ab2-225 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// BC088459 // GenBank // Rattus norvegicus carboxymethylenebutenolidase homolog (Pseudomonas), mRNA (cDNA clone MGC:95111 IMAGE:7127481), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ209709 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA41YA03 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// FQ219760 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA43YD11 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 100 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000040333 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:104303530:104339216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029140 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001109178 // RefSeq // Rattus norvegicus family with sequence similarity 173, member B (Fam173b), mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// XM_006232099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus family with sequence similarity 173, member B (Fam173b), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000046325 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:104351684:104366724:1 gene:ENSRNOG00000022347 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 76 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000044931 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:104353794:104366206:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029143 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029144 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029146 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_023993 // RefSeq // Rattus norvegicus taste receptor, type 2, member 119 (Tas2r119), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000015904 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:104977928:104978935:1 gene:ENSRNOG00000011963 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF227140 // GenBank // Rattus norvegicus candidate taste receptor T2R1 mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029148 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107659 // RefSeq // Rattus norvegicus sema domain, seven thrombospondin repeats (type 1 and type 1-like), transmembrane domain (TM) and short cytoplasmic domain, (semaphorin) 5A (Sema5a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000016506 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:105049343:105480370:1 gene:ENSRNOG00000011977 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000047455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:105343692:105473500:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 60 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029149 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 43 // 43 // 0
XM_006232108 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 728-like (LOC102555565), partial mRNA. // chrU // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// XR_344224 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 457-like (LOC100360380), misc_RNA. // chrU // 93 // 100 // 27 // 29 // 0 /// XM_006224061 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 99-like (LOC100913005), transcript variant X1, mRNA. // chrU // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// XM_006224062 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 99-like (LOC100913005), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 55 // 55 // 16 // 29 // 1 /// XR_351516 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 457-like (LOC100360380), misc_RNA. // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// FQ217081 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA36YA15 mRNA sequence. // chrU // 92 // 45 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT029150 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 45 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000009637 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:106553026:106588803:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT029151 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT029152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1 /// NONRATT029153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NONRATT029152 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT029153 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 60 // 60 // 9 // 15 // 1
GENSCAN00000009638 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:106629914:106651254:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 76 // 15 // 19 // 0
NM_001024299 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 458 (Zfp458), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NM_001142962 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 458 (Zfp458), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000032909 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:106640560:106649928:1 gene:ENSRNOG00000017986 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// BC085784 // GenBank // Rattus norvegicus zinc finger protein 458, mRNA (cDNA clone MGC:93741 IMAGE:7107819), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029156 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_173314 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger protein 455 (Zfp455), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232100 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 455 (Zfp455), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000042058 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:106665557:106680474:1 gene:ENSRNOG00000031576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000070821 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:106665580:106679953:1 gene:ENSRNOG00000031576 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// U67083 // GenBank // Rattus norvegicus KRAB-zinc finger protein KZF-2 mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 96 // 20 // 23 // 0 /// NONRATT029157 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006224063 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of sex limited protein 1 (Rsl1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006224064 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of sex limited protein 1 (Rsl1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232102 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of sex limited protein 1 (Rsl1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232103 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of sex limited protein 1 (Rsl1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// XM_006224068 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus regulator of sex limited protein 1 (Rsl1), transcript variant X6, mRNA. // chr2 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1 /// NONRATT029159 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 16 // 20 // 1
GENSCAN00000045874 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:13:32743605:32824242:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr13 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0 /// FQ234065 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA5YE21 mRNA sequence. // chr13 // 100 // 75 // 6 // 6 // 0
XM_003753551 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus signal-regulatory protein delta (Sirpd), mRNA. // chr2 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// ENSRNOT00000042759 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:96649148:96666717:1 gene:ENSRNOG00000031024 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// GENSCAN00000005447 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:96418437:96839300:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0 /// FQ233589 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA61YE05 mRNA sequence. // chr2 // 54 // 100 // 7 // 13 // 0
NM_001047946 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00038 (LOC499565), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000047881 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:107732651:107745625:1 gene:ENSRNOG00000031320 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029162 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107660 // RefSeq // Rattus norvegicus carbonic anhydrase I (Ca1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000014267 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:107990494:108000765:1 gene:ENSRNOG00000010698 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// BC158888 // GenBank // Rattus norvegicus carbonic anhydrase 1, mRNA (cDNA clone MGC:188619 IMAGE:8373855), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// FQ235246 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA55YO16 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029163 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000013359 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:107989406:108043439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 12 // 20 // 1
XM_003749234 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361118 (LOC100361118), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// XM_003753570 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical LOC100361118 (LOC100361118), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000013367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:108094305:108121131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
XM_006232114 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1565641 (RGD1565641), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// XM_006232113 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1565641 (RGD1565641), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// XM_006232115 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus RGD1565641 (RGD1565641), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// ENSRNOT00000059467 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:108114927:108121186:1 gene:ENSRNOG00000038902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 9 // 19 // 1 /// NONRATT029164 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 13 // 13 // 0 /// NONRATT029165 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 79 // 79 // 15 // 19 // 1 /// GENSCAN00000013367 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:108094305:108121131:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 74 // 14 // 19 // 1
XM_006232128 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910852 (LOC100910852), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// XM_006232130 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC100910852 (LOC100910852), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000059380 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:110225381:110329227:-1 gene:ENSRNOG00000030039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 82 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000001013 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:110150475:110327562:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 53 // 9 // 17 // 1
NM_001007635 // RefSeq // Rattus norvegicus GTPase activating protein testicular GAP1 (tGap1), mRNA. // chr2 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000033404 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:112320851:112387922:1 gene:ENSRNOG00000022511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000065774 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:112333926:112387922:1 gene:ENSRNOG00000022511 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 16 // 16 // 0 /// AY631396 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase activating protein testicular GAP1 mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 91 // 96 // 21 // 23 // 0 /// AY631398 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase activating protein testicular GAP1 variant 2C mRNA, complete cds, alternatively spliced. // chr2 // 94 // 67 // 15 // 16 // 0 /// AY631400 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase activating protein testicular GAP1 variant 6A mRNA sequence, alternatively spliced. // chr2 // 89 // 75 // 16 // 18 // 0 /// NONRATT029172 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000046455 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:112330915:112572090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 63 // 63 // 15 // 24 // 1
NM_022289 // RefSeq // Rattus norvegicus sorting nexin 16 (Snx16), mRNA. // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// XM_006232135 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus sorting nexin 16 (Snx16), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 97 // 92 // 32 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000050987 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113278410:113299752:1 gene:ENSRNOG00000009953 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// AF068746 // GenBank // Rattus norvegicus PIPAS mRNA, complete cds. // chr2 // 79 // 67 // 19 // 24 // 0 /// AF305780 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 16 (Snx16) mRNA, complete cds. // chr2 // 88 // 92 // 29 // 33 // 0 /// BC061554 // GenBank // Rattus norvegicus sorting nexin 16, mRNA (cDNA clone MGC:72840 IMAGE:6890629), complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 34 // 36 // 0 /// GENSCAN00000004522 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113280335:113298939:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 58 // 20 // 21 // 0 /// NONRATT029175 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 35 // 36 // 0 /// NONRATT029176 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 75 // 75 // 27 // 36 // 1
ENSRNOT00000013905 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113412452:113422260:1 gene:ENSRNOG00000010342 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// FQ229099 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA49YH19 mRNA sequence. // chr2 // 97 // 100 // 28 // 29 // 0 /// GENSCAN00000050069 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113409728:113420616:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 48 // 48 // 14 // 29 // 1 /// NONRATT029178 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 10 // 29 // 1
NM_001025280 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 10, member 5 (Slc10a5), mRNA. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000045438 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113425482:113426786:1 gene:ENSRNOG00000032426 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// DQ074435 // GenBank // Rattus norvegicus SLC10A5 (Slc10a5) mRNA, complete cds. // chr2 // 84 // 100 // 21 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050075 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113425578:113426786:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029179 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_032057 // RefSeq // Rattus norvegicus Inositol (myo)-1(or 4)-monophosphatase 1 (Impa1), mRNA. // chr2 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// ENSRNOT00000014274 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113430723:113451415:1 gene:ENSRNOG00000010482 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 100 // 27 // 30 // 0 /// U84038 // GenBank // Rattus norvegicus myo-inositol monophosphatase (IMP) mRNA, complete cds. // chr2 // 80 // 100 // 24 // 30 // 0 /// NONRATT029181 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029182 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029183 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000050077 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113430692:113450032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 70 // 21 // 30 // 1 /// NONRATT029180 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1 /// NONRATT029184 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 30 // 30 // 9 // 30 // 1
NM_001134614 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 12 (Fabp12), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232145 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid binding protein 12 (Fabp12), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232147 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid binding protein 12 (Fabp12), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232148 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus fatty acid binding protein 12 (Fabp12), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000059326 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113468175:113521691:1 gene:ENSRNOG00000038825 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// EU733648 // GenBank // Rattus norvegicus intracellular fatty acid-binding protein FABP12 mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// NONRATT029186 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113515903:113556971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1
NM_053365 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 4, adipocyte (Fabp4), mRNA. // chr2 // 76 // 83 // 19 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014701 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113547680:113552343:1 gene:ENSRNOG00000010805 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// AF144756 // GenBank // Rattus norvegicus adipocyte lipid-binding protein (ALBP) mRNA, complete cds. // chr2 // 76 // 83 // 19 // 25 // 0 /// BC084721 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 4, adipocyte, mRNA (cDNA clone MGC:105374 IMAGE:7310595), complete cds. // chr2 // 100 // 83 // 25 // 25 // 0 /// U75581 // GenBank // Rattus norvegicus adipocyte fatty acid binding protein (A-FABP) mRNA, complete cds. // chr2 // 71 // 70 // 15 // 21 // 0 /// NONRATT029187 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029188 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029189 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 73 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000050074 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113515903:113556971:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_022854 // RefSeq // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 9, testis (Fabp9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014949 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113558532:113562107:1 gene:ENSRNOG00000011082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC078817 // GenBank // Rattus norvegicus fatty acid binding protein 9, testis, mRNA (cDNA clone MGC:93425 IMAGE:7133719), complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// U07870 // GenBank // Rattus norvegicus testis lipid binding protein mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029190 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113558566:113633318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1
NM_001109514 // RefSeq // Rattus norvegicus peripheral myelin protein 2 (Pmp2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000032059 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:113582541:113586204:1 gene:ENSRNOG00000022707 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029191 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029192 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 93 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000050070 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:113558566:113633318:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 16 // 28 // 1
XM_001056858 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus zinc finger protein 704 (Zfp704), mRNA. // chrU // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015026 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:114131352:114304907:1 gene:ENSRNOG00000011267 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000004296 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:114267191:114304907:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029194 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 33 // 33 // 10 // 30 // 1
NM_001106421 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor protein D52 (Tpd52), mRNA. // chr2 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// XM_006232140 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tumor protein D52 (Tpd52), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015327 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:114752028:114782627:1 gene:ENSRNOG00000011441 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 72 // 17 // 18 // 0 /// GQ499323 // GenBank // Rattus norvegicus prostate leucine zipper variant 2 (PrLZ) mRNA, complete cds. // chr2 // 83 // 72 // 15 // 18 // 0 /// NONRATT029199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029201 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029202 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000017655 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:114762541:114785080:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NONRATT029198 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029199 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029200 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001047909 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial ribosomal protein S28 (Mrps28), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000046368 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:114822876:114826124:1 gene:ENSRNOG00000032630 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029205 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000017664 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:114788599:114824355:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT029203 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1 /// NONRATT029204 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001191845 // RefSeq // Rattus norvegicus hairy/enhancer-of-split related with YRPW motif 1 (Hey1), mRNA. // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000015537 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:115062450:115064660:1 gene:ENSRNOG00000011593 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 56 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000007820 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:115032601:115087133:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 59 // 59 // 16 // 27 // 1 /// NONRATT029207 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 52 // 52 // 14 // 27 // 1
GENSCAN00000007822 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:115149728:115164715:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 100 // 15 // 18 // 0
ENSRNOT00000028990 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:116102339:116103344:1 gene:ENSRNOG00000022517 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 75 // 100 // 9 // 12 // 0 /// GENSCAN00000052661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:116102339:116216171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 11 // 11 // 0
NM_013110 // RefSeq // Rattus norvegicus interleukin 7 (Il7), mRNA. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000016091 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:116171567:116217455:1 gene:ENSRNOG00000011973 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// AF010464 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin 7 (IL-7) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 20 // 20 // 0 /// AF367210 // GenBank // Rattus norvegicus interleukin-7 (IL-7) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// FQ226549 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA25YO03 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232137 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus interleukin 7 (Il7), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 53 // 53 // 16 // 30 // 1 /// GENSCAN00000052661 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:116102339:116216171:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 14 // 30 // 1
ENSRNOT00000034757 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:11:75119356:75142410:1 gene:ENSRNOG00000024794 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000075655 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:11:75965739:75989510:1 gene:ENSRNOG00000048136 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ233817 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA60YE13 mRNA sequence. // chr2 // 59 // 59 // 19 // 32 // 1 /// ENSRNOT00000050814 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:1:231865222:231867474:1 gene:ENSRNOG00000029315 gene_biotype:processed_pseudogene transcript_biotype:processed_pseudogene // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000002466 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75902720:75988521:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000032010 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:117434871:117437090:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 100 // 30 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035671 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:1:231865222:231867474:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000047215 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:11:75119356:75142410:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// FQ231313 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA6YP15 mRNA sequence. // chr2 // 38 // 38 // 12 // 32 // 1
NM_017234 // RefSeq // Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 2 (Pex2), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// XM_006232157 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 2 (Pex2), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 83 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232161 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus peroxisomal biogenesis factor 2 (Pex2), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000011579 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:117991484:118007743:1 gene:ENSRNOG00000008748 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// BC063169 // GenBank // Rattus norvegicus peroxisomal membrane protein 3, mRNA (cDNA clone MGC:72871 IMAGE:6886755), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 23 // 23 // 0 /// D30616 // GenBank // Rattus norvegicus PAF-1 mRNA for peroxisome assembly factor-1, complete cds, clone:65T. // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// D30617 // GenBank // Rattus norvegicus PAF-1 mRNA for peroxisome assembly factor-1, complete cds, clone:65U. // chr2 // 96 // 100 // 23 // 24 // 0 /// FQ219520 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ABA44YL10 mRNA sequence. // chr2 // 59 // 92 // 13 // 22 // 0 /// GENSCAN00000034278 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:118006502:118007419:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 92 // 54 // 12 // 13 // 0 /// NONRATT029211 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029213 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029214 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 58 // 58 // 14 // 24 // 1 /// NONRATT029212 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 10 // 24 // 1
NM_001108546 // RefSeq // Rattus norvegicus YTH domain family, member 3 (Ythdf3), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000067556 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:120415579:120448585:1 gene:ENSRNOG00000010084 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029218 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000043480 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:120392270:120552674:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 74 // 76 // 14 // 19 // 0 /// NONRATT029217 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT029216 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
XM_003749244 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 28S ribosomal protein L42, mitochondrial-like (LOC100361098), mRNA. // chr2 // 60 // 100 // 12 // 20 // 0 /// XM_003753555 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus 28S ribosomal protein L42, mitochondrial-like (LOC100361098), mRNA. // chr2 // 60 // 100 // 12 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000032342 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:120696319:120697071:1 gene:ENSRNOG00000021867 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 100 // 12 // 20 // 0
NR_031867 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA 124-2 (Mir124-2), microRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000053622 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:122049028:122049136:1 gene:ENSRNOG00000035499 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// rno-mir-124-2 // miRBase Micro RNA Database // MI0000894 Rattus norvegicus miR-124-2 stem-loop // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
GENSCAN00000006186 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:122978699:122979067:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 68 // 14 // 15 // 0
NM_001108940 // RefSeq // Rattus norvegicus basic helix-loop-helix family, member e22 (Bhlhe22), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000033940 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:122425612:122428723:1 gene:ENSRNOG00000021745 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 100 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000050052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:122425998:122427056:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 40 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT029224 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0
NM_001100977 // RefSeq // Rattus norvegicus mitochondrial fission regulator 1 (Mtfr1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000045586 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:123742968:123761211:1 gene:ENSRNOG00000021359 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// EF221637 // GenBank // Rattus norvegicus mitochondrial fission regulator 1 (Mtfr1) mRNA, complete cds; nuclear gene for mitochondrial product. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// FQ217237 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA31YL20 mRNA sequence. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015599 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:3:126024633:126025642:1 gene:ENSRNOG00000011715 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054902 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:123748680:123782607:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 58 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT029225 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000052236 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:3:126010551:126025642:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 1 /// NONRATT029227 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 50 // 50 // 13 // 26 // 1 /// NONRATT029226 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 38 // 38 // 10 // 26 // 1
ENSRNOT00000049719 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:123480733:123481290:1 gene:ENSRNOG00000013038 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// ENSRNOT00000075816 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:123892553:123893209:1 gene:ENSRNOG00000050122 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000019535 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:123888977:123893289:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0 /// GENSCAN00000054904 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:123461667:123481323:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 58 // 14 // 14 // 0
NM_001109180 // RefSeq // Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 beta (Dnajc5b), mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232184 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus DnaJ (Hsp40) homolog, subfamily C, member 5 beta (Dnajc5b), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017387 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124014201:124105971:1 gene:ENSRNOG00000012851 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000019539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124081426:124152675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1
NM_001012218 // RefSeq // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 55 (Trim55), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232181 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tripartite motif-containing 55 (Trim55), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000017125 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124140061:124182027:1 gene:ENSRNOG00000012723 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// BC087100 // GenBank // Rattus norvegicus tripartite motif-containing 55, mRNA (cDNA clone MGC:94677 IMAGE:7192411), complete cds. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019533 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124155623:124165132:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000019539 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124081426:124152675:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1 /// NONRATT029232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 37 // 37 // 11 // 30 // 1
NONRATT029232 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029231 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 1
NM_001270961 // RefSeq // Rattus norvegicus ceruloplasmin (ferroxidase) (Cp), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 95 // 40 // 40 // 0 /// NM_012532 // RefSeq // Rattus norvegicus ceruloplasmin (ferroxidase) (Cp), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// XR_351549 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ceruloplasmin (ferroxidase) (Cp), transcript variant X1, misc_RNA. // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000016083 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124467580:124510450:1 gene:ENSRNOG00000011913 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// AF202115 // GenBank // Rattus norvegicus GPI-anchored ceruloplasmin mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 95 // 36 // 40 // 0 /// L33869 // GenBank // Rat norvegicus ceruloplasmin mRNA, complete cds. // chr2 // 79 // 90 // 30 // 38 // 0 /// GENSCAN00000008612 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124467595:124509985:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 81 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT029233 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT029234 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 26 // 26 // 11 // 42 // 1 /// NONRATT029235 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 24 // 24 // 10 // 42 // 1
NM_001106478 // RefSeq // Rattus norvegicus helicase-like transcription factor (Hltf), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000064828 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:124574548:124634236:1 gene:ENSRNOG00000000082 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000008616 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:124574327:124632549:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029236 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
ENSRNOT00000000104 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:129183810:129184177:1 gene:ENSRNOG00000000093 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 91 // 100 // 21 // 23 // 0 /// GENSCAN00000006413 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:129144448:129184217:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
NM_001108941 // RefSeq // Rattus norvegicus transducin (beta)-like 1 X-linked receptor 1 (Tbl1xr1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000015573 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:126968262:127093734:1 gene:ENSRNOG00000011216 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000008922 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:127058086:127087748:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029239 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001047948 // RefSeq // Rattus norvegicus LRRGT00202 (LOC499584), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000040463 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:130025168:130048447:1 gene:ENSRNOG00000033028 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000056393 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:129974416:130062653:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 54 // 14 // 15 // 0 /// NONRATT029242 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
ENSRNOT00000054542 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:2:132006029:132006119:1 gene:ENSRNOG00000036430 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// NONRATT029244 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_001063250 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 16 (Spata16), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006224093 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spermatogenesis associated 16 (Spata16), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000035263 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:132038130:132380853:1 gene:ENSRNOG00000024521 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000056087 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:132097136:132265505:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 33 // 33 // 9 // 27 // 1
NM_001127524 // RefSeq // Rattus norvegicus neutral cholesterol ester hydrolase 1 (Nceh1), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232218 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus neutral cholesterol ester hydrolase 1 (Nceh1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000017805 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:132589874:132649579:1 gene:ENSRNOG00000013313 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// BC166533 // GenBank // Rattus norvegicus arylacetamide deacetylase-like 1, mRNA (cDNA clone MGC:188126 IMAGE:7190480), complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000457 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:132616788:132648778:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029245 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_145681 // RefSeq // Rattus norvegicus tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 10 (Tnfsf10), mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000017758 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:132726333:132742550:1 gene:ENSRNOG00000013269 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// AY115578 // GenBank // Rattus norvegicus TNF-related apoptosis inducing ligand mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// EF030546 // GenBank // Rattus norvegicus TNF-related apoptosis inducing ligand mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 93 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000000460 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:132698338:132742564:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029247 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
U94321 // GenBank // Rattus norvegicus growth hormone secretagogue receptor type 1a mRNA, complete cds. // chr2 // 95 // 71 // 21 // 22 // 0 /// NM_032075 // RefSeq // Rattus norvegicus growth hormone secretagogue receptor (Ghsr), mRNA. // chr2 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// ENSRNOT00000034960 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:132784869:132788245:1 gene:ENSRNOG00000024119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 87 // 87 // 27 // 31 // 1 /// NONRATT029250 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000000451 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:132765433:132787990:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_001107663 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-like and EMI domain containing 1 (Egfem1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000030275 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:136243892:136287174:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 64 // 64 // 18 // 28 // 1
NM_001107663 // RefSeq // Rattus norvegicus EGF-like and EMI domain containing 1 (Egfem1), mRNA. // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// ENSRNOT00000039603 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:136659205:136807811:1 gene:ENSRNOG00000023908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 16 // 26 // 1 /// GENSCAN00000016905 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:136798073:136823814:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0 /// NONRATT029277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 69 // 69 // 18 // 26 // 1
NR_032312 // RefSeq // Rattus norvegicus microRNA mir-551b (Mir551b), microRNA. // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000054541 // ENSEMBL // ncrna:known chromosome:Rnor_5.0:2:136556511:136556608:1 gene:ENSRNOG00000036429 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029277 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// rno-mir-551b // miRBase Micro RNA Database // MI0006343 Rattus norvegicus miR-551b stem-loop // chr2 // 100 // 88 // 22 // 22 // 0
NM_030992 // RefSeq // Rattus norvegicus phospholipase D1 (Pld1), mRNA. // chr2 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// XM_006232206 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phospholipase D1 (Pld1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 96 // 88 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000039296 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:133400609:133554180:1 gene:ENSRNOG00000028156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 97 // 30 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000039308 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:133400609:133554180:1 gene:ENSRNOG00000028156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 94 // 29 // 30 // 0 /// AB000778 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase D, complete cds. // chr2 // 90 // 94 // 27 // 30 // 0 /// AB000779 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase D, complete cds. // chr2 // 93 // 88 // 26 // 28 // 0 /// AB003170 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase D1a, complete cds. // chr2 // 81 // 84 // 22 // 27 // 0 /// AB003171 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for phospholipase D1b, complete cds. // chr2 // 81 // 81 // 21 // 26 // 0 /// AF017251 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase D (PLDs) mRNA, complete cds. // chr2 // 87 // 47 // 13 // 15 // 0 /// U69550 // GenBank // Rattus norvegicus phospholipase D (rPLD1) mRNA, complete cds. // chr2 // 93 // 94 // 28 // 30 // 0 /// GENSCAN00000009449 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:133462283:133552303:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 63 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029252 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1 /// NONRATT029253 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 34 // 34 // 11 // 32 // 1
NM_001106422 // RefSeq // Rattus norvegicus TRAF2 and NCK interacting kinase (Tnik), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// XM_006232208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRAF2 and NCK interacting kinase (Tnik), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 33 // 33 // 0 /// ENSRNOT00000016799 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:133688980:134082229:1 gene:ENSRNOG00000012422 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050964 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:133922195:134008921:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 33 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT029254 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 97 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:134013566:134143561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 19 // 33 // 1 /// NONRATT029255 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 42 // 42 // 14 // 33 // 1
XM_006232208 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus TRAF2 and NCK interacting kinase (Tnik), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029258 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_012879 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 2 (Slc2a2), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000015866 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:134112905:134144457:1 gene:ENSRNOG00000011875 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 34 // 34 // 0 /// BC078875 // GenBank // Rattus norvegicus solute carrier family 2 (facilitated glucose transporter), member 2, mRNA (cDNA clone MGC:93555 IMAGE:7127751), complete cds. // chr2 // 100 // 91 // 31 // 31 // 0 /// J03145 // GenBank // Rat glucose transporter mRNA, complete cds. // chr2 // 94 // 100 // 32 // 34 // 0 /// NONRATT029259 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 94 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000050958 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:134013566:134143561:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 79 // 79 // 27 // 34 // 1
NM_001100697 // RefSeq // Rattus norvegicus eukaryotic translation initiation factor 5A2 (Eif5a2), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000015779 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:135035420:135047177:1 gene:ENSRNOG00000011859 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// GENSCAN00000031019 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135035420:135047177:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029260 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0
NM_001134615 // RefSeq // Rattus norvegicus solute carrier family 7, member 14 (Slc7a14), mRNA. // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// ENSRNOT00000036717 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:135373151:135484821:1 gene:ENSRNOG00000028097 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016160 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135436103:135507996:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 88 // 21 // 22 // 0 /// NONRATT029267 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 9 // 25 // 1
NM_001107662 // RefSeq // Rattus norvegicus polyhomeotic homolog 3 (Drosophila) (Phc3), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000066495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:135727661:135791251:1 gene:ENSRNOG00000009491 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016158 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:135681066:135790713:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 82 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029269 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
XM_006232238 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 88 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232239 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_226972 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000033267 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:136015535:136035323:1 gene:ENSRNOG00000027971 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// XM_006224096 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// XM_006224097 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// XM_006224099 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), transcript variant X5, mRNA. // chr2 // 75 // 75 // 24 // 32 // 1 /// XM_006224095 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// XM_006232241 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 31 (Lrrc31), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 63 // 63 // 20 // 32 // 1 /// GENSCAN00000030283 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:136012346:136035412:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001044696 // RefSeq // Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 34 (Lrrc34), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// XM_006232236 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus leucine rich repeat containing 34 (Lrrc34), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000031730 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:136066289:136085758:1 gene:ENSRNOG00000027935 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT029272 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000030279 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:136069387:136085334:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 50 // 18 // 36 // 1 /// NONRATT029273 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 28 // 28 // 10 // 36 // 1
NM_001108942 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-related protein T3 (Actrt3), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000030700 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:136110360:136112320:1 gene:ENSRNOG00000027908 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000030280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:136108224:136112320:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// NONRATT029274 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NR_001567 // RefSeq // Rattus norvegicus telomerase RNA component (Terc), telomerase RNA. // chr2 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029275 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029276 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 18 // 18 // 0
NM_001106423 // RefSeq // Rattus norvegicus MDS1 and EVI1 complex locus (Mecom), mRNA. // chr2 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// XM_006232243 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus MDS1 and EVI1 complex locus (Mecom), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000015479 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:137351160:137351549:-1 gene:ENSRNOG00000011640 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000010716 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:137341028:137354287:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0
NM_176861 // RefSeq // Rattus norvegicus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 2 (Kcnmb2), mRNA. // chrU // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000013410 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138218940:138256373:1 gene:ENSRNOG00000010094 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 79 // 30 // 30 // 0 /// AY191836 // GenBank // Rattus norvegicus inactivating beta 2 subunit of large conductance Ca2+-activated K+ channel mRNA, complete cds. // chrU // 100 // 71 // 27 // 27 // 0 /// BC081695 // GenBank // Rattus norvegicus potassium large conductance calcium-activated channel, subfamily M, beta member 2, mRNA (cDNA clone MGC:93067 IMAGE:7190722), complete cds. // chrU // 100 // 82 // 31 // 31 // 0 /// AB193522 // GenBank // Rattus norvegicus KCNMB2 mRNA for large-conductance Ca2+-activated K+ channel beta2 subunit, complete cds, transcript variant 2. // chrU // 32 // 32 // 12 // 38 // 1 /// AB193523 // GenBank // Rattus norvegicus KCNMB2 mRNA for large-conductance Ca2+-activated K+ channel beta2 subunit, complete cds, transcript variant 3. // chrU // 45 // 45 // 17 // 38 // 1 /// NONRATT029278 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000047547 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138196339:138283107:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 71 // 71 // 27 // 38 // 1 /// NONRATT029279 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 71 // 71 // 27 // 38 // 1
NM_022548 // RefSeq // Rattus norvegicus zinc finger, matrin type 3 (Zmat3), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000013858 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138382954:138411897:-1 gene:ENSRNOG00000010119 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT031287 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000016424 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138387321:138407622:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 54 // 54 // 14 // 26 // 1
NM_133399 // RefSeq // Rattus norvegicus phosphoinositide-3-kinase, catalytic, alpha polypeptide (Pik3ca), mRNA. // chrU // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// XM_006256822 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform-like (LOC685590), mRNA. // chrU // 94 // 94 // 30 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000014527 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138491967:138521470:1 gene:ENSRNOG00000010458 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 97 // 33 // 33 // 0 /// GENSCAN00000016453 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138491967:138518748:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000045491 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:X:23655728:23681126:-1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 93 // 82 // 26 // 28 // 0 /// NONRATT029282 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 38 // 38 // 13 // 34 // 1
NM_138976 // RefSeq // Rattus norvegicus mitofusin 1 (Mfn1), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000065144 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138586943:138627370:1 gene:ENSRNOG00000011057 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// AB084166 // GenBank // Rattus norvegicus mRNA for mitochondrial transmembrane GTPase FZO1B, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 27 // 28 // 0 /// GENSCAN00000016444 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138584355:138633631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 96 // 26 // 27 // 0
NM_001039033 // RefSeq // Rattus norvegicus actin-like 6A (Actl6a), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232253 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus actin-like 6A (Actl6a), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000015460 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138764113:138780203:1 gene:ENSRNOG00000011553 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC098698 // GenBank // Rattus norvegicus actin-like 6A, mRNA (cDNA clone MGC:112664 IMAGE:7386860), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000016430 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138765714:138779840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// NONRATT029291 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1 /// NONRATT029292 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 44 // 44 // 11 // 25 // 1 /// NONRATT029293 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 48 // 48 // 12 // 25 // 1
NM_001106426 // RefSeq // Rattus norvegicus NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 beta subcomplex, 5 (Ndufb5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016051 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138791054:138804599:1 gene:ENSRNOG00000011949 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// FQ224246 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA72YH21 mRNA sequence. // chr2 // 96 // 93 // 24 // 25 // 0 /// FQ224437 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ACA66YD13 mRNA sequence. // chr2 // 88 // 93 // 22 // 25 // 0 /// GENSCAN00000017277 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138791128:138804181:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT029294 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001107665 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 13 (Usp13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000048030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138848099:138965318:1 gene:ENSRNOG00000030639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000017280 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:138824863:138970262:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 95 // 36 // 36 // 0
NM_001107665 // RefSeq // Rattus norvegicus ubiquitin specific peptidase 13 (Usp13), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000048030 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:138848099:138965318:1 gene:ENSRNOG00000030639 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001107666 // RefSeq // Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 14 (Ttc14), mRNA. // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// XM_006232257 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 14 (Ttc14), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 22 // 22 // 0 /// XR_351625 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus tetratricopeptide repeat domain 14 (Ttc14), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000015192 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:139921787:139931470:1 gene:ENSRNOG00000011261 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000040052 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:139921848:139930925:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 77 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029299 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001012179 // RefSeq // Rattus norvegicus fragile X mental retardation, autosomal homolog 1 (Fxr1), mRNA. // chr2 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// XM_002727475 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG41429-like (LOC100366044), mRNA. // chr2 // 99 // 99 // 66 // 67 // 0 /// ENSRNOT00000074060 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:140165790:140167400:-1 gene:ENSRNOG00000047902 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 99 // 99 // 66 // 67 // 0 /// BC083807 // GenBank // Rattus norvegicus fragile X mental retardation, autosomal homolog 1, mRNA (cDNA clone MGC:94858 IMAGE:7109902), complete cds. // chr2 // 100 // 99 // 67 // 67 // 0 /// BC099129 // GenBank HTC // Rattus norvegicus cDNA clone IMAGE:7461680, **** WARNING: chimeric clone ****. // chr2 // 41 // 41 // 28 // 68 // 1 /// GENSCAN00000036923 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:141810341:141810880:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 26 // 26 // 0 /// GENSCAN00000040068 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:140172487:140254786:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 98 // 79 // 53 // 54 // 0 /// GENSCAN00000040073 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:140165541:140167457:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 99 // 99 // 66 // 67 // 0 /// NONRATT031317 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 90 // 61 // 61 // 0 /// NONRATT031319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 98 // 79 // 53 // 54 // 0 /// NONRATT031318 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 15 // 15 // 10 // 68 // 1
NM_001109181 // RefSeq // Rattus norvegicus SRY (sex determining region Y)-box 2 (Sox2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000016236 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:140810593:140813001:1 gene:ENSRNOG00000012199 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000018178 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:140810968:140811915:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029305 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029306 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029307 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 23 // 23 // 0
ENSRNOT00000008709 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:140910055:140910516:1 gene:ENSRNOG00000006662 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0
XM_006232265 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ATPase, class VI, type 11B (Atp11b), mRNA. // chr2 // 100 // 94 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000016961 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142002592:142080714:1 gene:ENSRNOG00000012421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 88 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000071658 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142002592:142051007:1 gene:ENSRNOG00000012421 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 61 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036919 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:141995552:142077304:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 55 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029313 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 39 // 39 // 13 // 33 // 1
ENSRNOT00000018963 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:142359181:142359635:1 gene:ENSRNOG00000014169 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000047164 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142352877:142372147:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 74 // 14 // 14 // 0
NM_181768 // RefSeq // Rattus norvegicus acyl-CoA dehydrogenase family, member 9 (Acad9), mRNA. // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// XM_006232270 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus acyl-CoA dehydrogenase family, member 9 (Acad9), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000019108 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142407990:142431623:1 gene:ENSRNOG00000014178 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// AY292988 // GenBank // Rattus norvegicus NYGGF2 (NYGGF2) mRNA, complete cds. // chr2 // 90 // 28 // 9 // 10 // 0 /// BC162016 // GenBank // Rattus norvegicus acyl-Coenzyme A dehydrogenase family, member 9, mRNA (cDNA clone MGC:187892 IMAGE:9092768), complete cds. // chr2 // 100 // 97 // 35 // 35 // 0 /// GENSCAN00000047168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142408029:142431098:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 34 // 34 // 0 /// NONRATT029316 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0
FQ231693 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AEA68YI20 mRNA sequence. // chr2 // 50 // 50 // 11 // 22 // 1 /// NONRATT029319 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0
NM_001047885 // RefSeq // Rattus norvegicus arylsulfatase E (Arse), mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232281 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus arylsulfatase E (Arse), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 90 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000033080 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142502844:142510517:1 gene:ENSRNOG00000028350 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// BC168644 // GenBank // Rattus norvegicus arylsulfatase E (chondrodysplasia punctata 1), mRNA (cDNA clone IMAGE:7453949), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000047177 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142489208:142510220:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029322 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029323 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0
NM_001025406 // RefSeq // Rattus norvegicus exosome component 9 (Exosc9), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000020662 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:142879824:142890726:1 gene:ENSRNOG00000014674 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// BC097413 // GenBank // Rattus norvegicus exosome component 9, mRNA (cDNA clone MGC:114458 IMAGE:7454278), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// NONRATT029325 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 36 // 36 // 0 /// GENSCAN00000008989 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:142858101:142889341:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 61 // 61 // 22 // 36 // 1 /// NONRATT029327 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 13 // 36 // 1 /// NONRATT029328 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 12 // 36 // 1
XM_006232271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19 (RGD1307100), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006232272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19 (RGD1307100), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000058552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143191113:143317876:1 gene:ENSRNOG00000038436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000008971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143177013:143279309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 60 // 60 // 24 // 40 // 1 /// NONRATT029331 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 8 // 40 // 1
XM_006232271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19 (RGD1307100), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// XM_006232272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19 (RGD1307100), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// ENSRNOT00000058552 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143191113:143317876:1 gene:ENSRNOG00000038436 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 38 // 38 // 0 /// GENSCAN00000008971 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143177013:143279309:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1 /// GENSCAN00000028503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143286451:143379904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 47 // 47 // 18 // 38 // 1
XM_006232271 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19 (RGD1307100), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// XM_006232272 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19 (RGD1307100), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000023150 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143374909:143380387:1 gene:ENSRNOG00000026660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 25 // 25 // 0 /// BC100102 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA D630029K19, mRNA (cDNA clone MGC:112866 IMAGE:7377390), complete cds. // chr2 // 96 // 53 // 24 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028503 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143286451:143379904:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 81 // 37 // 38 // 0 /// NONRATT029338 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 72 // 72 // 34 // 47 // 1 /// NONRATT029340 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 53 // 53 // 25 // 47 // 1
NM_001006977 // RefSeq // Rattus norvegicus adenosine deaminase domain containing 1 (testis specific) (Adad1), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// XM_006232278 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine deaminase domain containing 1 (testis specific) (Adad1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 93 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232279 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus adenosine deaminase domain containing 1 (testis specific) (Adad1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 23 // 23 // 0 /// ENSRNOT00000023282 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143404631:143438535:1 gene:ENSRNOG00000017246 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// BC105906 // GenBank // Rattus norvegicus adenosine deaminase domain containing 1 (testis specific), mRNA (cDNA clone MGC:124895 IMAGE:7453283), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000028511 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143408388:143438495:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 67 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029342 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
XM_006232289 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 12 (Bbs12), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// XM_006232290 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus Bardet-Biedl syndrome 12 (Bbs12), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000009898 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143662813:143664933:1 gene:ENSRNOG00000007510 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000028499 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143662819:143664933:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029343 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 60 // 15 // 15 // 0
NM_019305 // RefSeq // Rattus norvegicus fibroblast growth factor 2 (Fgf2), mRNA. // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// ENSRNOT00000023388 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143689407:143742070:1 gene:ENSRNOG00000017392 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 69 // 18 // 18 // 0 /// M22427 // GenBank // Rat basic fibroblast growth factor (FGF) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 25 // 25 // 0 /// X61697 // GenBank // R.norvegicus mRNA for basic fibroblast growth factor. // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1 /// NONRATT029344 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 73 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000028519 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143716177:143742051:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 42 // 42 // 11 // 26 // 1
NM_001108549 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis associated 5 (Spata5), mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000023584 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:143758068:143950578:1 gene:ENSRNOG00000017462 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0 /// GENSCAN00000026350 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143783363:143863032:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 28 // 9 // 9 // 0 /// GENSCAN00000028506 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:143762588:143777241:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 47 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT029345 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// NONRATT029346 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 47 // 47 // 15 // 32 // 1
ENSRNOT00000058495 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:144010431:144015081:1 gene:ENSRNOG00000025371 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 84 // 84 // 21 // 25 // 1 /// BC169059 // GenBank // Rattus norvegicus sprouty homolog 1, antagonist of FGF signaling (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:189453 IMAGE:7938818), complete cds. // chr2 // 80 // 80 // 20 // 25 // 1 /// GENSCAN00000026366 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:144012813:144014617:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 93 // 56 // 13 // 14 // 0 /// NONRATT029347 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029348 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0
ENSRNOT00000040470 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:144860211:144861221:1 gene:ENSRNOG00000029291 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 19 // 19 // 0 /// GENSCAN00000011619 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:144784800:144862072:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 85 // 83 // 17 // 20 // 0
NM_001191705 // RefSeq // Rattus norvegicus FAT tumor suppressor homolog 4 (Drosophila) (Fat4), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000038703 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:145350319:145477455:1 gene:ENSRNOG00000028335 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 31 // 32 // 0 /// GENSCAN00000029541 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:145792061:145879468:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 41 // 13 // 13 // 0 /// GENSCAN00000049298 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:145348409:145500919:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 91 // 29 // 29 // 0
XM_006224109 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inturned planar cell polarity protein (Intu), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 29 // 29 // 0 /// XM_006232293 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inturned planar cell polarity protein (Intu), mRNA. // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000014116 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:147064054:147130412:1 gene:ENSRNOG00000010556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000072675 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:147064054:147130412:1 gene:ENSRNOG00000010556 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 90 // 25 // 26 // 0 /// XM_006232294 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus inturned planar cell polarity protein (Intu), mRNA. // chr2 // 38 // 38 // 11 // 29 // 1 /// GENSCAN00000001913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147064054:147227654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 86 // 25 // 25 // 0
XM_003753566 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; adenine nucleotide translocator), member 31 (Slc25a31), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 26 // 26 // 0 /// ENSRNOT00000058476 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:147143798:147158747:1 gene:ENSRNOG00000038398 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// GENSCAN00000001913 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147064054:147227654:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 94 // 67 // 17 // 18 // 0 /// NONRATT029352 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001106428 // RefSeq // Rattus norvegicus heat shock protein 4-like (Hspa4l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// ENSRNOT00000015474 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:147228804:147280566:1 gene:ENSRNOG00000010819 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// BC168157 // GenBank // Rattus norvegicus heat shock protein 4 like, mRNA (cDNA clone MGC:187594 IMAGE:8363916), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// GENSCAN00000001908 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147228850:147273439:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 88 // 34 // 35 // 0 /// NONRATT029354 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// NONRATT029355 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 25 // 25 // 10 // 40 // 1
NM_001107669 // RefSeq // Rattus norvegicus polo-like kinase 4 (Plk4), mRNA. // chr2 // 96 // 84 // 26 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000016946 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:147290039:147308583:1 gene:ENSRNOG00000011654 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// BC166450 // GenBank // Rattus norvegicus polo-like kinase 4 (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:187673 IMAGE:8371068), complete cds. // chr2 // 100 // 94 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000019402 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147287209:147308966:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 75 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029359 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 32 // 32 // 0
NM_001025039 // RefSeq // Rattus norvegicus hypothetical protein LOC499602 (LOC499602), mRNA. // chrU // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// XM_006232311 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus hypothetical protein LOC499602 (LOC499602), transcript variant X2, mRNA. // chrU // 100 // 90 // 36 // 36 // 0 /// ENSRNOT00000068405 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:147374186:147429666:1 gene:ENSRNOG00000013692 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 100 // 40 // 40 // 0 /// FQ213753 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA45YO08 mRNA sequence. // chrU // 76 // 63 // 19 // 25 // 0 /// FQ212645 // GenBank // Rattus norvegicus TL0AAA52YC04 mRNA sequence. // chrU // 56 // 63 // 14 // 25 // 0 /// GENSCAN00000019419 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147387039:147442285:1 transcript_biotype:protein_coding // chrU // 100 // 40 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029366 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 100 // 28 // 11 // 11 // 0 /// NONRATT029363 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 58 // 58 // 23 // 40 // 1 /// NONRATT029365 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chrU // 23 // 23 // 9 // 40 // 1
NM_001014036 // RefSeq // Rattus norvegicus La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Larp1b), mRNA. // chr2 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000044804 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:147446540:147478242:1 gene:ENSRNOG00000038366 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// BC081895 // GenBank // Rattus norvegicus similar to RIKEN cDNA 1700108L22, mRNA (cDNA clone MGC:93806 IMAGE:7110249), complete cds. // chr2 // 100 // 85 // 29 // 29 // 0 /// NONRATT029367 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 88 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029368 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 68 // 23 // 23 // 0 /// GENSCAN00000019423 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147444921:147487082:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 56 // 56 // 19 // 34 // 1
NM_001109182 // RefSeq // Rattus norvegicus similar to FLJ10378 protein (RGD1565989), mRNA. // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000047544 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:147517608:147549615:1 gene:ENSRNOG00000013940 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029370 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 80 // 24 // 24 // 0 /// GENSCAN00000019399 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:147517747:147586116:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 17 // 30 // 1
NM_001107670 // RefSeq // Rattus norvegicus jade family PHD finger 1 (Jade1), mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// XM_006232302 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus jade family PHD finger 1 (Jade1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000018872 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:148061395:148114462:1 gene:ENSRNOG00000014066 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 32 // 32 // 0 /// GENSCAN00000053251 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:148072330:148111620:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT029372 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 33 // 33 // 0 /// NONRATT029373 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1 /// NONRATT029374 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 11 // 36 // 1
XM_006232306 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to protein C33A12.3 (RGD1359508), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232307 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to protein C33A12.3 (RGD1359508), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 91 // 20 // 20 // 0 /// XM_006232309 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to protein C33A12.3 (RGD1359508), transcript variant X4, mRNA. // chr2 // 100 // 77 // 17 // 17 // 0 /// ENSRNOT00000058366 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:148271821:148296647:1 gene:ENSRNOG00000038330 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// BC088236 // GenBank // Rattus norvegicus similar to protein C33A12.3, mRNA (cDNA clone MGC:109006 IMAGE:7325191), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// XM_006232308 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to protein C33A12.3 (RGD1359508), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 86 // 86 // 19 // 22 // 1 /// XR_351653 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to protein C33A12.3 (RGD1359508), transcript variant X5, misc_RNA. // chr2 // 86 // 86 // 19 // 22 // 1 /// NONRATT029376 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 22 // 22 // 0 /// NONRATT029377 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 64 // 14 // 14 // 0
GENSCAN00000007725 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:156317116:156318512:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// NONRATT029383 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 87 // 13 // 13 // 0
XM_006224117 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus protocadherin 10 (Pcdh10), mRNA. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000040187 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:156482756:156497925:1 gene:ENSRNOG00000031974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000064773 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:156482756:156497456:1 gene:ENSRNOG00000031974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000066542 // ENSEMBL // ensembl:known_by_projection chromosome:Rnor_5.0:2:156482756:156503613:1 gene:ENSRNOG00000031974 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// GENSCAN00000007724 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:156472873:156507797:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 80 // 20 // 20 // 0 /// NONRATT029385 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 72 // 72 // 18 // 25 // 1 /// NONRATT029386 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 32 // 32 // 8 // 25 // 1
ENSRNOT00000050224 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:156569310:156571025:1 gene:ENSRNOG00000030057 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 93 // 100 // 13 // 14 // 0 /// GENSCAN00000007728 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:156557190:156571025:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1 /// GENSCAN00000031741 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:151126229:151204515:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 8 // 14 // 1
GENSCAN00000043545 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:150449054:150449446:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 24 // 24 // 0
XM_006224076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG65904-like (LOC100365525), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000021781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:152494218:152571216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 100 // 5 // 10 // 0
XM_006224080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho GTPase-activating protein 20-like (LOC689629), partial mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 /// ENSRNOT00000058250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:152499262:152573368:1 gene:ENSRNOG00000031248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 75 // 100 // 6 // 8 // 0
XM_006224080 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho GTPase-activating protein 20-like (LOC689629), partial mRNA. // chr2 // 79 // 100 // 22 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000029028 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:106847219:106907969:1 gene:ENSRNOG00000023039 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006224076 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rCG65904-like (LOC100365525), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 61 // 100 // 17 // 28 // 0 /// AY631397 // GenBank // Rattus norvegicus GTPase activating protein testicular GAP2 mRNA sequence, alternatively spliced. // chr2 // 71 // 75 // 15 // 21 // 0 /// ENSRNOT00000058250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:152499262:152573368:1 gene:ENSRNOG00000031248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000021781 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:152494218:152571216:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0 /// GENSCAN00000058017 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:106847195:107150016:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 79 // 22 // 22 // 0
XR_344349 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus uncharacterized LOC102557175 (LOC102557175), transcript variant X1, ncRNA. // chr2 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000058250 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:152499262:152573368:1 gene:ENSRNOG00000031248 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 100 // 8 // 10 // 0
XM_006224118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T-cell activation Rho GTPase-activating protein isoform b (LOC365791), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// ENSRNOT00000048546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:156781232:156879832:-1 gene:ENSRNOG00000038242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 70 // 100 // 7 // 10 // 0 /// GENSCAN00000035168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:156781411:156830601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 7 // 7 // 0
ENSRNOT00000048546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:156781232:156879832:-1 gene:ENSRNOG00000038242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 80 // 71 // 28 // 35 // 0 /// BC081933 // GenBank // Rattus norvegicus similar to T-cell activation Rho GTPase-activating protein isoform b, mRNA (cDNA clone MGC:93970 IMAGE:7114567), complete cds. // chr2 // 79 // 96 // 37 // 47 // 0 /// XM_006224118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T-cell activation Rho GTPase-activating protein isoform b (LOC365791), mRNA. // chr2 // 71 // 92 // 32 // 45 // 0 /// XM_006232321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho GTPase-activating protein 20-like (LOC102550446), mRNA. // chr2 // 56 // 80 // 22 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000030247 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:156851060:156890429:-1 gene:ENSRNOG00000022085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 65 // 16 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:156851314:156890405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 55 // 67 // 18 // 33 // 0 /// GENSCAN00000035168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:156781411:156830601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 57 // 57 // 28 // 49 // 1
ENSRNOT00000048546 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:156781232:156879832:-1 gene:ENSRNOG00000038242 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 76 // 34 // 38 // 0 /// BC081933 // GenBank // Rattus norvegicus similar to T-cell activation Rho GTPase-activating protein isoform b, mRNA (cDNA clone MGC:93970 IMAGE:7114567), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 50 // 50 // 0 /// XM_006224118 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus similar to T-cell activation Rho GTPase-activating protein isoform b (LOC365791), mRNA. // chr2 // 73 // 96 // 35 // 48 // 0 /// XM_006232321 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus rho GTPase-activating protein 20-like (LOC102550446), mRNA. // chr2 // 51 // 86 // 22 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000030247 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:156851060:156890429:-1 gene:ENSRNOG00000022085 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 50 // 64 // 16 // 32 // 0 /// GENSCAN00000035165 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:156851314:156890405:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 53 // 68 // 18 // 34 // 0 /// GENSCAN00000035168 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:156781411:156830601:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 62 // 62 // 31 // 50 // 1
NM_138526 // RefSeq // Rattus norvegicus CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae) (Ccrn4l), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// XM_006232324 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus CCR4 carbon catabolite repression 4-like (S. cerevisiae) (Ccrn4l), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// ENSRNOT00000014348 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:159759666:159779874:1 gene:ENSRNOG00000010799 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0 /// GENSCAN00000056035 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:159759891:159778777:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 53 // 8 // 8 // 0 /// NONRATT029393 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 15 // 15 // 0
NM_001107674 // RefSeq // Rattus norvegicus N(alpha)-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit (Naa15), mRNA. // chr2 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// ENSRNOT00000017379 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:159946628:160009197:1 gene:ENSRNOG00000012385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// GENSCAN00000056036 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:159946858:160006007:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 96 // 72 // 27 // 28 // 0 /// NONRATT029395 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 97 // 100 // 38 // 39 // 0 /// NONRATT029397 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 21 // 21 // 8 // 39 // 1
NM_001108944 // RefSeq // Rattus norvegicus RAB33B, member RAS oncogene family (Rab33b), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017396 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:160016557:160027158:1 gene:ENSRNOG00000013035 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000056033 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:160012669:160024899:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 72 // 18 // 18 // 0 /// NONRATT029399 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001106430 // RefSeq // Rattus norvegicus microsomal glutathione S-transferase 2 (Mgst2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000017785 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:160180714:160202851:1 gene:ENSRNOG00000013296 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// FQ221155 // GenBank // Rattus norvegicus TL0ADA39YO18 mRNA sequence. // chr2 // 64 // 64 // 16 // 25 // 1 /// GENSCAN00000056032 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:160180880:160202754:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 80 // 19 // 20 // 0 /// NONRATT029405 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
NM_001191846 // RefSeq // Rattus norvegicus forkhead box O1 (Foxo1), mRNA. // chr2 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// ENSRNOT00000018244 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:161140308:161215605:1 gene:ENSRNOG00000013397 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 77 // 19 // 20 // 0 /// GENSCAN00000036649 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:161202251:161214480:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 38 // 10 // 10 // 0
NM_001109183 // RefSeq // Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner (Lhfp), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000019057 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:161947947:162146115:1 gene:ENSRNOG00000014153 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// BC091355 // GenBank // Rattus norvegicus lipoma HMGIC fusion partner, mRNA (cDNA clone MGC:109397 IMAGE:7318141), complete cds. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// NONRATT029412 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000054121 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:161941799:161951154:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 10 // 25 // 1
NM_001107676 // RefSeq // Rattus norvegicus proline and serine rich 1 (Proser1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// ENSRNOT00000014614 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:162370018:162389653:1 gene:ENSRNOG00000010980 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000028679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:162369601:162417840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 68 // 19 // 19 // 0 /// NONRATT029413 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0
NM_001106431 // RefSeq // Rattus norvegicus stomatin (Epb7.2)-like 3 (Stoml3), mRNA. // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// ENSRNOT00000014765 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:162400575:162410320:1 gene:ENSRNOG00000011006 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1 /// GENSCAN00000028679 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:162369601:162417840:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 83 // 83 // 25 // 30 // 1 /// NONRATT029415 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 12 // 30 // 1
ENSRNOT00000058133 // ENSEMBL // ensembl:novel chromosome:Rnor_5.0:2:162604569:162604945:1 gene:ENSRNOG00000038186 gene_biotype:pseudogene transcript_biotype:pseudogene // chr2 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 /// GENSCAN00000028678 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:162604569:162634968:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 90 // 90 // 9 // 10 // 1
NM_001108550 // RefSeq // Rattus norvegicus periostin, osteoblast specific factor (Postn), mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// ENSRNOT00000017453 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:163331262:163362444:1 gene:ENSRNOG00000012660 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 96 // 43 // 43 // 0 /// GENSCAN00000043944 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163331280:163361718:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 84 // 38 // 38 // 0 /// NONRATT029418 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 45 // 45 // 0 /// NONRATT029419 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 56 // 56 // 25 // 45 // 1 /// NONRATT029421 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1 /// NONRATT029422 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 31 // 31 // 14 // 45 // 1 /// NONRATT029423 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 29 // 29 // 13 // 45 // 1 /// NONRATT029420 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 20 // 20 // 9 // 45 // 1
NM_001025407 // RefSeq // Rattus norvegicus ALG5, dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase (Alg5), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// XM_006232333 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus ALG5, dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase (Alg5), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000058001 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:160317035:160330762:-1 gene:ENSRNOG00000013485 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// BC098039 // GenBank // Rattus norvegicus asparagine-linked glycosylation 5, dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase homolog (S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:116195 IMAGE:7456888), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// GENSCAN00000025114 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:160306310:160330755:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 89 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT031400 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031401 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 28 // 28 // 0 /// NONRATT031403 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 68 // 68 // 19 // 28 // 1 /// NONRATT031402 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 46 // 46 // 13 // 28 // 1
NM_138872 // RefSeq // Rattus norvegicus SMAD family member 9 (Smad9), mRNA. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// XM_006232374 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus SMAD family member 9 (Smad9), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 96 // 96 // 24 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000000102 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:163609443:163625679:1 gene:ENSRNOG00000000091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0 /// AF012347 // GenBank // Rattus norvegicus Smad8 mRNA, complete cds. // chr2 // 96 // 100 // 25 // 26 // 0 /// GENSCAN00000043947 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163609595:163618623:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 46 // 12 // 12 // 0 /// GENSCAN00000043954 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163619714:163625525:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 89 // 35 // 8 // 9 // 0 /// NONRATT029424 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 26 // 26 // 0
NM_001106433 // RefSeq // Rattus norvegicus spastic paraplegia 20 (Troyer syndrome) (Spg20), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// XM_006232367 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus spastic paraplegia 20 (Troyer syndrome) (Spg20), transcript variant X3, mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0 /// ENSRNOT00000057978 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:163938864:163963320:1 gene:ENSRNOG00000014155 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 95 // 81 // 21 // 22 // 0 /// GENSCAN00000015705 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163943810:163963557:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 78 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029429 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 27 // 27 // 0
NM_001109184 // RefSeq // Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 169 (Ccdc169), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// XR_351705 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus coiled-coil domain containing 169 (Ccdc169), transcript variant X2, misc_RNA. // chr2 // 100 // 97 // 29 // 29 // 0 /// ENSRNOT00000019018 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:163967597:163996902:1 gene:ENSRNOG00000038095 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// GENSCAN00000015730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163967645:164027826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 70 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029430 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 30 // 30 // 0 /// NONRATT029431 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 87 // 26 // 26 // 0
NM_001034961 // RefSeq // Rattus norvegicus spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2 (Sohlh2), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// ENSRNOT00000044424 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:164007688:164029997:1 gene:ENSRNOG00000038091 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// BC104697 // GenBank // Rattus norvegicus spermatogenesis and oogenesis specific basic helix-loop-helix 2, mRNA (cDNA clone MGC:125035 IMAGE:7113652), complete cds. // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// NONRATT029433 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 31 // 31 // 0 /// GENSCAN00000015730 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:163967645:164027826:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 58 // 58 // 18 // 31 // 1
NM_021584 // RefSeq // Rattus norvegicus doublecortin-like kinase 1 (Dclk1), transcript variant 2, mRNA. // chr2 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// XM_006232372 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin-like kinase 1 (Dclk1), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 71 // 30 // 30 // 0 /// XM_006232373 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus doublecortin-like kinase 1 (Dclk1), transcript variant X2, mRNA. // chr2 // 100 // 76 // 32 // 32 // 0 /// ENSRNOT00000072110 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:164277278:164286416:1 gene:ENSRNOG00000032922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// AF030089 // GenBank // Rattus norvegicus activity and neurotransmitter-induced early gene protein 4 (ania-4) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 19 // 8 // 8 // 0 /// U78857 // GenBank // Rattus norvegicus protein serine/threonine kinase CPG16 (cpg16) mRNA, complete cds. // chr2 // 100 // 67 // 28 // 28 // 0 /// NM_053343 // RefSeq // Rattus norvegicus doublecortin-like kinase 1 (Dclk1), transcript variant 1, mRNA. // chr2 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// ENSRNOT00000019748 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:164277278:164355201:1 gene:ENSRNOG00000032922 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 67 // 67 // 28 // 42 // 1 /// GENSCAN00000007949 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:164299775:164335631:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 29 // 29 // 12 // 42 // 1 /// NONRATT029436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 36 // 36 // 15 // 42 // 1 /// NONRATT029437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 33 // 33 // 14 // 42 // 1 /// NONRATT029441 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 40 // 40 // 17 // 42 // 1
ENSRNOT00000054537 // ENSEMBL // ncrna:novel chromosome:Rnor_5.0:2:164292977:164293062:1 gene:ENSRNOG00000036425 gene_biotype:miRNA transcript_biotype:miRNA // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029436 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0 /// NONRATT029437 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 21 // 21 // 0
NM_001109497 // RefSeq // Rattus norvegicus mab-21-like 1 (C. elegans) (Mab21l1), mRNA. // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// ENSRNOT00000040631 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:164587785:164590174:1 gene:ENSRNOG00000032941 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// GENSCAN00000007935 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:164586059:164589328:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// NONRATT029445 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0
GENSCAN00000025738 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:165284441:165348053:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0 /// NONRATT029448 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 92 // 23 // 23 // 0
NM_053785 // RefSeq // Rattus norvegicus transmembrane 4 L six family member 4 (Tm4sf4), mRNA. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// XM_006232381 // RefSeq // PREDICTED: Rattus norvegicus transmembrane 4 L six family member 4 (Tm4sf4), transcript variant X1, mRNA. // chr2 // 100 // 96 // 24 // 24 // 0 /// ENSRNOT00000022105 // ENSEMBL // ensembl:known chromosome:Rnor_5.0:2:166941149:166956371:1 gene:ENSRNOG00000016437 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0 /// AF205717 // GenBank // Rattus norvegicus tetraspan protein LRTM4 (LRTM4) mRNA, complete cds. // chr2 // 92 // 100 // 23 // 25 // 0 /// BC091131 // GenBank // Rattus norvegicus transmembrane 4 L six family member 4, mRNA (cDNA clone MGC:108630 IMAGE:7324973), complete cds. // chr2 // 100 // 84 // 21 // 21 // 0 /// GENSCAN00000024600 // ENSEMBL // cdna:genscan chromosome:Rnor_5.0:2:166941482:166956937:1 transcript_biotype:protein_coding // chr2 // 100 // 64 // 16 // 16 // 0 /// NONRATT029451 // NONCODE // Non-coding transcript identified by NONCODE // chr2 // 100 // 100 // 25 // 25 // 0